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comparison test-data/test_8/amrfinderplus_nucleotide_output.fasta @ 6:3e93d920163b draft

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planemo upload commit 3773c71b3fac75f58b5af497e19d54dca0d81dfd
author estrain
date Thu, 12 Mar 2026 20:38:44 +0000
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comparison
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1 >contig_26:6581-8545 strand:+ optrA ABC-F type ribosomal protection protein OptrA
2 TTGTCCAAAGCCACCTTTGCAATTGCTAGTACTAACGCAAAGGAGGATATGAAAATGCAA
3 TACAAAATAATTAATGGTGCCGTTTACTATGATGGTAATATGGTGTTGGAAAACATCGGT
4 ATTGAAATCAATGATAATGAAAAGATTGCTATTGTTGGTAGAAATGGATGTGGAAAAACA
5 ACCTTGCTAAAAGCTATTATAGGCGAAATTGAATTAGAAGAAGGAACTGGTGAAAGTGAG
6 TTTCAAGTAATAAAGACCGGTAACCCTTATATTAGCTATTTAAGACAGATGCCTTTTGAA
7 GATGAAAGTATATCAATGGTGGATGAAGTCCGTACGGTATTTAAGACGCTTATTGATATG
8 GAAAACAAGATGAAACAGCTGATAGATAAAATGGAGAATCAATATGATGATAAAATCATC
9 AATGAATACTCTGATATCAGTGAAAGGTATATGGCTCTTGGAGGTCTAACCTACCAAAAA
10 GAATATGAAACGATGATTCGTAGTATGGGTTTTACTGAAGCAGATTATAAAAAACCCATT
11 TCTGAATTTTCAGGTGGTCAGCGAACTAAGATAGCTTTTATAAAAATACTTTTAACAAAG
12 CCAGACATTCTATTACTTGATGAACCTACTAACCACCTTGATATAGAAACAATACAATGG
13 TTGGAGAGTTATTTGAGAAGTTATAAATCTACATTGGTTATTATTTCCCATGATAGAATG
14 TTTCTTAATCGAATTGTGGATAAGGTTTATGAAATCGAATGGGGAGAGACCAAATGTTAT
15 AAAGGTAATTATTCAGCCTTTGAGGAGCAAAAACGAGAAAATCATATCAAACAGCAAAAA
16 GATTACGACTTGCAACAGATAGAAATTGAAAGGATTACACGCTTGATTGAACGTTTTCGT
17 TATAAACCTACGAAAGCTAAAATGGTGCAATCTAAAATTAAATTATTACAGCGTATGCAA
18 ATATTAAATGCACCAGACCAATACGATACAAAAACTTATATGTCTAAATTTCAACCGAGA
19 ATCAGTAGTTCAAGGCAAGTATTAAGTGCTTCAGAACTTGTGATAGGCTATGATACTCCT
20 CTTGCAAAGGTTAATTTCAACCTTGAAAGGGGACAGAAGCTTGGAATTGTTGGGAGTAAT
21 GGTATTGGTAAATCCACGTTGCTTAAAACACTTATGGGTGGTGTGGCAGCATTGTCTGGA
22 GATTTTAAATTCGGATACAATGTTGAAATTAGCTATTTTGACCAACAGCTTGCTCAAATC
23 AGTGGAGATGATACACTATTCGAAATTTTTCAAAGCGAATACCCTGAGCTAAATGACACA
24 GAGGTCAGAACTGCTCTTGGCTCATTTCAGTTTAGTGGAGATGATGTTTTTAGACCGGTG
25 TCCTCTTTGTCAGGTGGAGAAAAGGTTAGATTGACATTATGTAAATTATTATATAAACGT
26 ACTAATGTTTTAATCTTAGATGAACCGACAAACCACATGGATATTATTGGAAAAGAGAAT
27 TTAGAGAATATCTTATGCAGTTATCAAGGTACAATTATTTTTGTGTCACATGATAGATAT
28 TTTACTAATAAGATTGCTGACAGATTACTTGTTTTTGATAAGGATGGTGTAGAGTTTGTA
29 CAATCTACTTATGGTGAGTACGAGAAAAAAAGGATGAATTCTGAAAAGCCATTTAATAAC
30 ATTAAAGTTGAGCAGAAAGTAGAGAAAAATAACACAGTAAAAGGCGATCGTAACTCCATT
31 GAGAAGGAGAAGGTTAAGAAGGAGAAACGAATTGAAAAGCTTGAAGTGTTAATAAATCAA
32 TATGATGAAGAATTAGAAAGATTGAATAAAATCATTTCTGAACCAAACAATTCTTCTGAT
33 TATATAGTACTGACGGAAATACAAAAATCAATTGATGATGTTAAAAGGTGTCAGGGTAAT
34 TATTTTAATGAATGGGAACAGTTGATGAGAGAATTGGAAGTTATG
35 >contig_46:2435-3229 strand:- aph(3')-IIIa aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3')-IIIa
36 ATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTA
37 AAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAAC
38 CTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAA
39 AAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAA
40 CGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAA
41 GAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGG
42 CTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTA
43 GCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAA
44 GAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCC
45 GAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGAT
46 GGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGAC
47 ATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTA
48 TTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTG
49 GATGAATTGTTTTAG
50 >contig_46:3322-3864 strand:- sat4 streptothricin N-acetyltransferase Sat4
51 GTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTT
52 GAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTA
53 CTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAG
54 GCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGAC
55 GATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAA
56 GATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATA
57 TCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAAT
58 AACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACT
59 ATGTTATACGCCAACTTTGAAAACAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTT
60 TAG
61 >contig_47:3993-5912 strand:- tet(M) tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M)
62 ATGAAAATTATTAATATTGGAGTTTTAGCTCATGTTGATGCGGGAAAAACTACCTTAACA
63 GAAAGCTTATTATATAACAGTGGAGCGATTACAGAATTAGGAAGCGTGGACAAAGGTACA
64 ACGAGGACGGATAATACGCTTTTAGAACGTCAGAGAGGAATTACAATTCAGACAGGAATA
65 ACCTCTTTTCAGTGGGAAAATACGAAGGTGAACATCATAGACACGCCAGGACATATGGAT
66 TTCTTAGCAGAAGTATATCGTTCATTATCAGTTTTAGATGGGGCAATTCTACTGATTTCT
67 GCAAAAGATGGCGTACAAGCACAAACTCGTATATTATTTCATGCACTTAGGAAAATGGGG
68 ATTCCCACAATCTTTTTTATCAATAAGATTGACCAAAATGGAATTGATTTATCAACGGTT
69 TATCAGGATATTAAAGAGAAACTTTCTGCCGAAATTGTAATCAAACAGAAGGTAGAACTG
70 TATCCTAATATGTGTGTGACGAACTTTACCGAATCTGAACAATGGGATACGGTAATAGAG
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72 GAACAAGAGGAAAGCATAAGATTTCAGAATTGTTCCCTGTTCCCTGTTTATCACGGAAGT
73 GCAAAAAACAATATAGGGATTGATAACCTTATAGAAGTGATTACGAATAAATTTTATTCA
74 TCAACACATCGAGGTCAGTCTGAACTTTGCGGAAATGTTTTCAAAATTGAATATACAAAA
75 AAAAGACAACGTCTTGCATATATACGTCTTTATAGTGGCGTACTGCATTTGCGAGATTCG
76 GTTAGAATATCGGAAAAGGAAAAAATAAAAATTACAGAAATGTATACTTCAATAAATGGT
77 GAATTATGTAAAATCGATAAGGCTTATTCCGGGGAAATTGTTATTTTGCAGAATGAGTTT
78 TTGAAGTTAAATAGTGTTCTTGGAGATACAAAGCTATTGCCACAGAGAGAGAGAATTGAA
79 AATCCCCTCCCTCTGCTGCAAACGACTGTTGAACCGAGCAAACCTCAACAAAGGGAAATG
80 TTGCTTGATGCCCTTTTGGAAATCTCAGATAGTGATCCGCTTCTACGATATTACGTGGAT
81 TCTACGACACATGAAATTATACTTTCTTTCTTAGGGAAAGTACAAATGGAAGTGATTAGT
82 GCACTGTTGCAAGAAAAGTATCATGTGGAGATAGAACTAAAAGAGCCTACAGTCATTTAT
83 ATGGAGAGACCGTTAAAAAATGCAGAATATACCATTCACATCGAAGTGCCGCCAAATCCT
84 TTCTGGGCTTCCATTGGTTTATCTGTATCACCGCTTCCATTAGGGAGCGGAGTGCAGTAT
85 GAGAGCTCGGTTTCTCTTGGATACTTAAATCAATCGTTTCAAAATGCAGTTATGGAGGGG
86 ATACGCTATGGCTGTGAACAAGGATTGTATGGTTGGAATGTGACGGACTGTAAAATCTGT
87 TTTAAGTATGGCTTATACTATAGCCCTGTTAGTACCCCAGCAGATTTTCGGATGCTTGCT
88 CCTATTGTATTGGAACAAGTCTTAAAAAAAGCTGGAACAGAATTGTTAGAGCCATATCTT
89 AGTTTTAAAATTTATGCGCCACAGGAATATCTTTCACGAGCATACAACGATGCTCCTAAA
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92 AGTGTTTGTTTAACAGAGTTAAAAGGGTACCATGTTACTACCGGTGAACCTGTTTGCCAG
93 CCCCGTCGTCCAAATAGTCGGATAGATAAAGTACGATATATGTTCAATAAAATAACTTAG
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99 CACCAAGATATTCTACAGTTTCAATTCCCTAACAAACAGAGGTATAAAATTGTTGGGAGT
100 ATTCCTTACCATTTAAGCACACAAATTATTAAAAAAGTGGTTTTTGAAAGCCATGCGTCT
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103 TGCTTTCATCCTAAACCAAAAGTAAACAGTGTCTTAATAAAACTTACCCGCCATACCACA
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108 >contig_48:4344-4988 strand:+ catA type A-7 chloramphenicol O-acetyltransferase
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110 TTTAATCAGCAAACTACTTATAGCATTACTAAAGAAATTGATATTACTTTGTTTAAAGAT
111 ATGATAAAAAAGAAAGGATATGAAATTTATCCCTCTTTAATTTATGCAATTATGGAAGTT
112 GTAAATAAAAATAAAGTGTTTAGAACAGGAATTAATAGTGAGAATAAATTAGGTTATTGG
113 GATAAGTTAAATCCTTTGTATACAGTTTTTAATAAGCAAACTGAAAAATTTACTAACATT
114 TGGACTGAATCTGATAAAAACTTCATTTCTTTTTATAATAATTATAAAAATGACTTGCTT
115 GAATATAAAGATAAAGAAGAAATGTTTCCTAAAAAACCGATACCTGAAAACACCATACCG
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117 AGCTTTTTATTGCCTATTATTACGATAGGTAAATTTTATAGTGAGAATAATAAAATTTAT
118 ATACCAGTTGCTCTGCAACTTCATCATTCTGTATGTGATGGTTACCATGCTTCACTATTT
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121 GTGAATACATCCTATTCACAATCGAATTTACGACACAACCAAATTTTAATTTGGCTTTGC
122 ATTTTATCTTTTTTTAGCGTATTAAATGAAATGGTTTTGAACGTCTCATTACCTGATATT
123 GCAAATGATTTTAATAAACCACCTGCGAGTACAAACTGGGTGAACACAGCCTTTATGTTA
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130 ACTGTTCCGTTTCTTATGAAATTATTAAAGAAAGAAGTAAGGATAAAAGGTCATTTTGAT
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