diff test-data/test_2/amrfinderplus_flanking_output.fasta @ 6:3e93d920163b draft

planemo upload commit 3773c71b3fac75f58b5af497e19d54dca0d81dfd
author estrain
date Thu, 12 Mar 2026 20:38:44 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test_2/amrfinderplus_flanking_output.fasta	Thu Mar 12 20:38:44 2026 +0000
@@ -0,0 +1,37 @@
+>contig_26:6431-8545 strand:+ optrA ABC-F type ribosomal protection protein OptrA
+GCGCTAGCGACTTGGTACAATAAGGTGGCAATTGAATTATATTAATAATCGATAGGAGGT
+AGAAGCAAATGAAATCTACAACTATAGTAACATTTAAAGAACTCCATGTATAGGTGGCTG
+TGACAAGCTTTACATGGAGTAGAATAATTATTGTCCAAAGCCACCTTTGCAATTGCTAGT
+ACTAACGCAAAGGAGGATATGAAAATGCAATACAAAATAATTAATGGTGCCGTTTACTAT
+GATGGTAATATGGTGTTGGAAAACATCGGTATTGAAATCAATGATAATGAAAAGATTGCT
+ATTGTTGGTAGAAATGGATGTGGAAAAACAACCTTGCTAAAAGCTATTATAGGCGAAATT
+GAATTAGAAGAAGGAACTGGTGAAAGTGAGTTTCAAGTAATAAAGACCGGTAACCCTTAT
+ATTAGCTATTTAAGACAGATGCCTTTTGAAGATGAAAGTATATCAATGGTGGATGAAGTC
+CGTACGGTATTTAAGACGCTTATTGATATGGAAAACAAGATGAAACAGCTGATAGATAAA
+ATGGAGAATCAATATGATGATAAAATCATCAATGAATACTCTGATATCAGTGAAAGGTAT
+ATGGCTCTTGGAGGTCTAACCTACCAAAAAGAATATGAAACGATGATTCGTAGTATGGGT
+TTTACTGAAGCAGATTATAAAAAACCCATTTCTGAATTTTCAGGTGGTCAGCGAACTAAG
+ATAGCTTTTATAAAAATACTTTTAACAAAGCCAGACATTCTATTACTTGATGAACCTACT
+AACCACCTTGATATAGAAACAATACAATGGTTGGAGAGTTATTTGAGAAGTTATAAATCT
+ACATTGGTTATTATTTCCCATGATAGAATGTTTCTTAATCGAATTGTGGATAAGGTTTAT
+GAAATCGAATGGGGAGAGACCAAATGTTATAAAGGTAATTATTCAGCCTTTGAGGAGCAA
+AAACGAGAAAATCATATCAAACAGCAAAAAGATTACGACTTGCAACAGATAGAAATTGAA
+AGGATTACACGCTTGATTGAACGTTTTCGTTATAAACCTACGAAAGCTAAAATGGTGCAA
+TCTAAAATTAAATTATTACAGCGTATGCAAATATTAAATGCACCAGACCAATACGATACA
+AAAACTTATATGTCTAAATTTCAACCGAGAATCAGTAGTTCAAGGCAAGTATTAAGTGCT
+TCAGAACTTGTGATAGGCTATGATACTCCTCTTGCAAAGGTTAATTTCAACCTTGAAAGG
+GGACAGAAGCTTGGAATTGTTGGGAGTAATGGTATTGGTAAATCCACGTTGCTTAAAACA
+CTTATGGGTGGTGTGGCAGCATTGTCTGGAGATTTTAAATTCGGATACAATGTTGAAATT
+AGCTATTTTGACCAACAGCTTGCTCAAATCAGTGGAGATGATACACTATTCGAAATTTTT
+CAAAGCGAATACCCTGAGCTAAATGACACAGAGGTCAGAACTGCTCTTGGCTCATTTCAG
+TTTAGTGGAGATGATGTTTTTAGACCGGTGTCCTCTTTGTCAGGTGGAGAAAAGGTTAGA
+TTGACATTATGTAAATTATTATATAAACGTACTAATGTTTTAATCTTAGATGAACCGACA
+AACCACATGGATATTATTGGAAAAGAGAATTTAGAGAATATCTTATGCAGTTATCAAGGT
+ACAATTATTTTTGTGTCACATGATAGATATTTTACTAATAAGATTGCTGACAGATTACTT
+GTTTTTGATAAGGATGGTGTAGAGTTTGTACAATCTACTTATGGTGAGTACGAGAAAAAA
+AGGATGAATTCTGAAAAGCCATTTAATAACATTAAAGTTGAGCAGAAAGTAGAGAAAAAT
+AACACAGTAAAAGGCGATCGTAACTCCATTGAGAAGGAGAAGGTTAAGAAGGAGAAACGA
+ATTGAAAAGCTTGAAGTGTTAATAAATCAATATGATGAAGAATTAGAAAGATTGAATAAA
+ATCATTTCTGAACCAAACAATTCTTCTGATTATATAGTACTGACGGAAATACAAAAATCA
+ATTGATGATGTTAAAAGGTGTCAGGGTAATTATTTTAATGAATGGGAACAGTTGATGAGA
+GAATTGGAAGTTATG