Mercurial > repos > jpayne > seqsero_v2

annotate output/forward_25k.fastq.gz_mapped.fq @ 14:496f5f2b5e75

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author estrain
date Tue, 14 Feb 2023 12:11:27 -0500
parents fae43708974d
children
rev   line source
jpayne@1 1 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:8195:4770/1
jpayne@1 2 CCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGCGTTAAGGCCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTT
jpayne@1 3 +
jpayne@1 4 >AAA?>A11AAAEG?AAA0EEEED2DGFFBFEC?EEFFFFHG1FFB1A1EE@/B1@@1@DGHHEGHDFEGC?FGGG1GE>A/>>E?EECEFEGHBFGFFH2BFFHGHH1FCGC/CCG111<>112>GFGGC/GB1DDGFFHFDHH1<GFHHGB<<DBG0D/.-<./C<</:./GGG.:..-.9;A-9B000:0;B//:9/;B0B0FA?-99-;E///-;--9;/;BF//-9-9-:9-;BB;FB/9//9/9/
jpayne@1 5 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:8912:6914/1
jpayne@1 6 CTTCATTAAGTACAATAAGTGTATTAATTTTCTTAAAAGCTATTCTATAGAGCAGAATCTGTATTCTTTTTAGGATTTTTGTCTTTTGGGGAATCCCAGATGGTTGTTCGGTAAATAAAAAACCTAACCCTTCAAGCATCGCGATAATCTTATGAACACCAGCATAATATGCGGCAAGCGATCCC
jpayne@1 7 +
jpayne@1 8 AABCCFFFFFFFFGGGGFGFGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHIHIHHHHHHIIIHHHHHHHHHHGHHHHHHHGGGGGHHHHHHHHHHHHGGHHGGGHGHHHGHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGGHBHHHHHHHHHHGHGHGHHHHHHHGGGGGGGHGGHGGH
jpayne@1 9 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:11251:5664/1
jpayne@1 10 GCCTTGATTGTGTACCACGTGTCGGTGAATCAATCGCCGGATTAACGCAGTAAAGAGAGGACGTTTTGCGGAACCTGGTTCGCCTGCGCCAGAACGGAAGTACCAGCCTGCTGCAGAATCTGCGCTTTAGACATATTAGAAACTTCCG
jpayne@1 11 +
jpayne@1 12 BBBBBFFFFFDFFGGGGGFFGGHGGCEGHHHHHHDEDFFGGGGHFGEFFGEGHHBBGHFGHGGEEGGGHGGEEEFFHFGHHGGGFHHGGGF@GFHGGFGGHHHHHGHGHHFHHHHCGHHHHHHGGGGEFFHHGHHFH1D1DFCFHHHD
jpayne@1 13 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:12690:3621/1
jpayne@1 14 ATCGGCAATCTGGAAGCAAAGTTTAATGATAATTTTGCAAAAATAATGCGTGGAATAATGATGCATAAAGCGGCTATTTCGCAGGCTAAGAAAAAGATCGGGGGAAGTGAAAAATTTTCTAAAGTTCGAAATTCAGGTGCCGATACAAGGGTTACGGTGAGAAACCGTGGGCAACAGCCCAATAACATCAAGTTGTAATTGATAAGGAAAAGATCATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCG
jpayne@1 15 +
jpayne@1 16 ABCABBCCFFFFGGFGGGGGGGHHHHHHCHHHHHHHHHHFHFHHHHHHHGEGGDHHHHHHHHHHHHHHHBHGGGGGHGHGFGGGGGHHHHGHHHHGGHHHGGGGGGGGHHHHGHHHHHHHHGHHHHHGHHGHHHGHGGHHHGGGGGHHGHGGHHHGCGHGHHGHHHGEECGGFGHHHEGGGGGGGGGGGGGGGGGBFGGGGGGGGGGGGGGGFFFFFFBFEFFFFBFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFE
jpayne@1 17 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:13382:2591/1
jpayne@1 18 GGTTGGTAATGGCTGAATCAAAACGGTTTTGAATTGCCCCCAGAGAAGAACGAACTGCGTCCACTTTTGACAATGCAGAATCAATTGAAGCCAGTGGGTTAGCGGTACTTTTCTTGGCTGCGGCAGCGTCTTCATTGATTAATGTACTTACGCCAGAAGCTGTTTTATCAATAAACATGGTTTTGCCAGCTAAGGTGACCTTATCACCCGCGGCGTTAGCAGTATATTCAGCCCCATTTACTGTAATTTTA
jpayne@1 19 +
jpayne@1 20 BCCCCCBFFFFFGGGGGGGGGGHHGGEFGGHGHHHHHHHGGGGHHHHHHHHGGGGHHHGGGGGHHHHHHGHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHEFHHGGGGGGHHHHHHGHHHHGGGGGGGGGDDGGHHHHHHHHHGHHHFHHHHHGGGGGHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGGHHGHHHHHGHGHGHFHGGGGGGGGGGGGGGAGGFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF9
jpayne@1 21 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:13999:9488/1
jpayne@1 22 GTAGCAGACGAACTAAAAATCAAATTATTTACATTTGCACTTTGCATTGCAGCCAGTAGAGTCAAGGTACCTGTGA
jpayne@1 23 +
jpayne@1 24 CCCCCFFFFCDCGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGHHHHHHHH
jpayne@1 25 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:16523:9396/1
jpayne@1 26 CTCAATAGCGGAACTCAGTGAGGACTGAGATTTGTTCAGGTTATTCTGGGTCAACAGCGACAGGCTGTTTGTATTAATGACTTGTGCCATGATCTTTTCCTTATCAATTACAACTTGATGTTATTGGGCTGTTGCCCACGGTTTCTCACCGTAACCCTTGTATCGGCACCTGAATTTCGAACTTTAGAAAATTTTTCACTTCCCCCGATCTTTTTCTTAGCCTGCGAAATAGCCGCTTTATGCATCATTAT
jpayne@1 27 +
jpayne@1 28 ABBBBFFFFBBBGGGGGGGGGGGHHGHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHGHHHHHHHGCGFGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHFHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGHHHHHGHHHHHHHGGGFGGHHHHHHGFHGGHHHHHHHGHG@FGGGHHHHHHHGHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGDFFFFFFFFFFFFFFFF
jpayne@1 29 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:19007:10881/1
jpayne@1 30 GACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAATCCGGCGATTGATTCACCGACACGTGGTACACAATCAAGGCAGCGAAAGCTGCCTTTTTTAATTCCGGAGCCTGTGTAATGAAAGAAATCACCGTCACTGAACCTGCCTTTGTCACCCGCTTTTCCTGTTCTGG
jpayne@1 31 +
jpayne@1 32 ACCCCFFFFFFCGCGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHGGCGGHHHHHHHHHHHHGGGFGHHHHFGGHHHGHHHGGGGGGGGGGGHGGHHHHGGGGFHGGHHGGHHGHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGGCHGHHHHHHFGGGGGG<GFGHHHHHGHHGHGHHGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGFGGGGFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFDFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFAFFDEFFFFFFFFFFF
jpayne@1 33 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:20513:9766/1
jpayne@1 34 CTATAATATTGTCGCGCGAAGAAATGGTGATTTAGACAAATCTTGGGCTGATACTGAAAAAGCCAGAAACCTCCTGGGGTGGGAGGCAAAATATGGAATAGAGGATATGTTGCAAGATG
jpayne@1 35 +
jpayne@1 36 BBBBAFF@DDFFGEGG?EAAF?FEA535A5BABABGDA2GH355AFFAGD1AFGHD5GHHH1GEHHGB3?1BGFFE3EEFE/EAFGGE0BE3GHH3333BD3B0GCDGF4F44F???DD
jpayne@1 37 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:20726:2390/1
jpayne@1 38 GTTGATAACATGTATTCTAATGTCTTGACATGTCCTTCAGCTAAATCATCTACATGAATATAATCTCGCATGCCAGTGCCATCAATTGTGTCATAATCACCACCATATACATTTAAATATTTAAGTTTTCCAGTGGCAACTTGTGATATATATGGAATGAGGTTATTTGGTATTCCATTAGGATCTTCCCCAATCATACCTGATTTATGAGCACCAGTAGGATTAAAATAACGAAGACTTACTGCGGAAAA
jpayne@1 39 +
jpayne@1 40 ACBCCFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHIHHIHGIGHHHGGGGHHHHGHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHGHHHHHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHIGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGHHHHHFHHGHHHHHHGGGFGGHHHHHHHHFCGGGE
jpayne@1 41 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:20739:5221/1
jpayne@1 42 ATCCAACTACGATCTTGATGTAGATCCCACTCCTGCATTTTTCCTGAGAAACGATTTGACTTAGTTTTTGTATGGGAATAATTTCTCCTCGTCAGCATTGGATACAATATCATATATCATTGAT
jpayne@1 43 +
jpayne@1 44 AAAAA1CBFC1A1GFFGDGFA3F3GHHHFGAGEGFGGGFGDHCHFEGHFDF0//AG/FGHBG1GBGHHEEADGGH00FGBDHHHBGHFHGG>EHEFGDE@11F2CGGFFFHDEDF2D@@FGFBE
jpayne@1 45 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:20761:10965/1
jpayne@1 46 CCATTTCTTCGCGCGACAATATTATAGGGAATCTCTTTTTTAGTGACGCGCTCAAAAGCTTTAATGATTTGCAAAACACTATATGCTCGACCTGACCCCAAATTAAAAACATCATAACCTACTTTTGTTGATAACATGTATTCTAATGTCTTGACATGTCCTTCAGCTAAATCATCTACATGAATATAATCTCGCATGCCAGTGCCATCAATTGTGTCA
jpayne@1 47 +
jpayne@1 48 ABBBBFFFFFAAFGGGGGGGGGHHHHHHHCGHHHHHHHHHGHHFGHHGGGFGGGHHHHHHHHGFHHHHHHHHFHHHHHHHHHHHHGHHGGGGGHHHHHGGGHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHGGGGHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGG
jpayne@1 49 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:21158:11838/1
jpayne@1 50 GAGTATGCCGTGATTTCCATTCAGGAACATAAAAGTATTCTGCAAGCTCTTGAACTTCATGATGAAAAATTGGCACGCCAGCGCATGCGCGAACACATTATTCGCTCGATGGAGAATATGCTGACCCGCTATGTTGGTGACCCTTCTGCCTGATCTTTTCGCCTGCGTGAGCATCGCAGGCGCTTCAACCAATTCTTCAATTCTATTAATCACGTCCAGTAACGATCCAACTACGATCTTGATGTAGATC
jpayne@1 51 +
jpayne@1 52 BBABBFFFFBBDGGFGGGGGGGHGHHHHHHHHFHGEGGHHHHHHHHHHHHHGGFHHHFHHHHHHHGHHHGHHFFGHGGGGFFGGGGGGGGGGGGGHHHGGHGHHGGHGGHHGHHHFGHHFHHHHHHHGGGCGHHHFHAFHFDFHHHGFBGHHBGHHHHHHGCDDHFFGGDGFHHHGGGCCDGGGGGGGGGGGFFGGGFGGGGGGGGGGGGGGGGGFGGGFFFFFFFFFBFFEFFFFFFFFFEFFFFFBFF
jpayne@1 53 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:22383:10770/1
jpayne@1 54 CCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCC
jpayne@1 55 +
jpayne@1 56 CCDDCCCFFFFFGGGGGGGGGGHGHHHHHHGGGGHHHHHHHGGGGGGGHHGGGGGGGGGGGGGHHHHGGGHGHHHHHHGFGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHGHGGGGGGGGHGGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGHHHHHGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGFFFFFFFFFFFFFFFFFDFFFFFFFFFFFFFFFF
jpayne@1 57 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:22842:11880/1
jpayne@1 58 CTGGAAGCAAAGTTTAATGATAATTTTGCAAAAATAATGCGTGGAATAATGATGCATAAAGCGGCTATTTCGCAGGCTAAGAAAAAGATCGGGGGAAGTGAAAAATTTTCTAAAGTTCGAAATTCAGGTGCCGATACAAGGGTTACGGTGAGAAACCGTGGGCAACAGCCCAATAACATCAAGTTGTAATTGATAAGGAAAAGATCATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAG
jpayne@1 59 +
jpayne@1 60 AABCCFFDFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGEGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHGGGGGHHHHHHHHHGGHHHGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGHHHHHHGGFHFGGGGHHHHGCGHHGGFHGHHHGHHCEHGGGGGHHHGHGHHHHHHHHGGGGFGGGEGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGFGGGGGGFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFEFFDFFFFEFF?
jpayne@1 61 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:23876:5926/1
jpayne@1 62 AGTTACTACAGCACCTGAATTAATATCTACACGATATTTATCGGCACCCGCTGCATAGGTGTCGTAACCCGTAACATTCTTGAAGCTGGATTTCAGATCACCCACTGTCGCTTCTTTTGGCCCATTAACATTGAACCCATCAAGGCCAAGGCTTTTCACATCAATTTTTTGCAGATCGATGGTAATGGTTTCACCATCGTTAGCACCAACCTGGATTTTCATCTGGTTGTCCTGAGACAGGACTTTAACA
jpayne@1 63 +
jpayne@1 64 BCCCBFFFFFFFGGGFGGGGGGCHCFFGHBFHECHFFHFFFGFCECFGDEFGGFHHHHFFFFG?AEGEHHGEGFGHHHHHHH4FGHFGBFGFFGHGHHHHHHHGGGFHHEHGHGHHHHFGHFGFHHGBGEHHHHGHGACGBD@2FHHHHHFHFHHHHHFGHHHDHHHHHGCFFGGHFHFHGD<0GHHE<GHFHH00CGFHHHGGHEGFFG?FFF/BFGGF0FFFGEFFDDGBFFFB0:BFFFFFFFFB/B
jpayne@1 65 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:27485:7939/1
jpayne@1 66 TCAGATTGGTTACCGTATTGCCAAGGTTGGTAATGGCTGAATCAAAACGGTTTTGAATTGCCCCCAGAGAAGAACGAACTGCGTCCACTTTTGACAATGCAGAATCAATTGAAGCCAGTGGGCTAGCGGGACTTTTCTTGGCTGCGGCAGCGTCTTCATTGATTAATGTACTTACGCCAGAAGCTGTTTTATCAATAAACATGGTTTTGCCAGCTAAGGTGACCTTATCACCCGCGGCGTTAGCAGTATAT
jpayne@1 67 +
jpayne@1 68 AAAAAFFD111DG11AGGBA3FBCGFAFAE0AFB2FHBGF1FDFGDA0AEAAAC0/A22FA1FFGEAGF01BEH0/E/>FHHGGE/>1DFHH1FGE1EGFBFFBFHHHBE1FG1GAG0FFBF/B0B1B//>CF1D1>>FD@?1/F/A@--<->ECCDDHHG0D0<GFG0DD0CGG.A??C.///::;FF/;BFFB0;B0F0CB/;0;.909CBEG0C9909CFFFFFFBFFF-@@@@@@@@BEBFB////F
jpayne@1 69 @M01659:202:000000000-BLMFJ:1:1101:28780:10887/1
jpayne@1 70 CGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGT
jpayne@1 71 +
jpayne@1 72 AA>AACFFFFFFGGGGGGGGGGGGGGGGCFGGEFEFAGFGGHGHGHHHGG@EFEFHHHFHHHHHHHHHHFHFFHHHHHHHHGHHHGGHG?EGGGGGGGHGGGFGGGGHGHHFHHHHGGGGGHHFHHHFHHGGFHDCGFDFHHHHHHFHHHHHGHHGGGGGGGGGFDGGGGGGGGFGGGGGFFGGFFFFFFFFFFFFFFDFFFFFFFFFFFEFFFD?DFFF/BFFFFFE/BFBEBFFEFFFFFFFFFFFE