Mercurial > repos > jpayne > snp_pipeline
comparison test-data/samples/sample4/reads.sam @ 0:eefdd97a6749
planemo upload commit b'7f6183b769772449fbcee903686b8d5ec5b7439f\n'-dirty
| author | jpayne |
|---|---|
| date | Wed, 24 Jan 2018 14:18:21 -0500 |
| parents | |
| children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
| -1:000000000000 | 0:eefdd97a6749 |
|---|---|
| 1 @HD VN:1.0 SO:unsorted | |
| 2 @SQ SN:gi|9626243|ref|NC_001416.1| LN:48502 | |
| 3 @PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.3.3.1 CL:"/usr/local/bin/bowtie2-align-s --wrapper basic-0 --reorder -X 1000 -p 2 -x reference/lambda_virus -1 samples/sample4/sample4_1.fastq -2 samples/sample4/sample4_2.fastq" | |
| 4 r1 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11151 42 75M5D61M = 11292 364 TCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGNAGGTGGACAAGGTCGCTGNAGCCTTCGGGGACCACAGACCCGACGTCGTGGCTGACGGCGATGGCTCNCCAGTTCCATAACGTGTCGGCG @@@6E$66+E,3H%D%92!;7F357@6,/9'3+!=F(2!HB=89,1")!B5%=%.<-:)2789!<"4>3'F>-5.--!4G3&"7H+18.?-D)E2G;8*-+-(?!8:@.0>E;G%D&-G+!(%E3CH1!F1FB!&A AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:45G18A10^AAGCT19G18G22 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 5 r1 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11292 42 223M = 11151 -364 GAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGNCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGGCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGC E4%-A'H5C6G3<,5C#A(F)@<3151,@-4H6#@C144$<CG&#;""1F+?B>782#@+.':E+F@.$D1@8;5.7A2?1?"8+!(7*&C6)5*0"FHC%22))+#:(8<6,8%-A*)?'*7154A:%.2.:'A.!)0E@/8>(@E..AAG&5(>?E45E9<716)%)+F*&&$@'A=3#F2+D@E$-;;5/5HA%;H'"*'"%C%;8C0A5@=7.+85,!, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:107C89T25 YS:i:-26 YT:Z:CP | |
| 6 r2 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5239 42 259M = 5194 -304 CATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGNGCGAATGACCNAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCNGCGGTTGCGGCAGAAAACAGCCGC BE:/5,%C:6+3$1/".<7A2<HH1*012=*/!&.+353,6"5-$9()C00-"E?,&A('.A",@ED2G,D85>:==9F7@G6CF5+/890#+##5D((4,H!43G<3+5;&3,>28%C@E,=7*7@F9-/H/H&>6/.?3F@3F0&'&!>4'DF.?D1*A5/4D5,D/1*2&/&-><%)!GF&3G=&,9<3CG#0F31G.)9&&H$!)E6/@G+B@+9F/@%B>&,E5E/)5>G1#8*ACB27B53G3)5%G<!?"D3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:98G10A124A24 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 7 r2 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5194 42 45M = 5239 304 AGNAGTGCTNGATACCGAGGCTGCNGTGTACAGCGGTCAGGAGGC '#!"'''')!*#$+*))*%"!+&#'"%$#&&*#*!#&*$%*!)(& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G1T0T5G14A20 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 8 r3 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45260 42 125M = 45510 333 TGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCNCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGAC :B&27>.5:,/&1!!-0%;<C23:$'!*2,*HE-54B#,>A,F5-'FF/+#%&#A-AHF'+6",!@;;2E+:)<H'<7<'!?%,7-$DB2GA.)H:C;@+E0/+*7>(?'>4E'<%+9$!CD<:( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G101 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 9 r3 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45510 42 83M = 45260 -333 TCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTCTN *-?)/$;HG:9AB;A,4#AB4'#C8#=6(@%F+1.FC'0E;1:>0);9%A$8"G9="+E%4<HG"4G4=%F/16G#>E63C.$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80A1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 10 r4 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30517 42 67M3D45M = 30705 302 NGGCAGATATAGCCTGGTNGTTCAGGNGGCGCATTTTTATNGCTGTGTTGCGCTGTAATTCTTCTATTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAA $8@3=:D8*F/5*;>8!&"D4C">AAC-)&&6,!,<1B6#E=;@9)0-,#>F"GH$18'(B30!5#6&:003'+FGE)<86=E;933&8HH6A7*$:<!?8F-'87F":,E2 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:0T17G7C13T26^TTC45 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 11 r4 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30705 42 114M = 30517 -302 TTCATGTTCATCGTTCCTTACAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTAC F*09+2+%.*!2D4+G@GE7'"'0<5:G)<G-32..45.5&*"3:F$(:B3A1&;G-1D#*&E3,@34DG8A1,-$E6/29;#=(2??=685:1"!"D/22H*'F53?-AB#F- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A93 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 12 r5 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39743 42 46M = 39602 -187 CCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAG (F.**2B3<FA+*<5!#<-#4%8"&.=7;G@30654)=?5E4?EC' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 13 r5 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39602 42 55M = 39743 187 GATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCNAACAACATGCCGGAA )840?8.,!$3.).-<@-D,9*C'?>05##%;1,&&:E::->$?396+--@C?1, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C15 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 14 r6 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21085 23 80M = 21318 312 CGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAATTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTG !.'#H,'..AF.,/!/;)>"8G0#&A-B0,;4<60=&;1;-0+G#!%-85'/3=&3/5&%<51H8?%#A'"#1%/B$!1* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A79 YS:i:-35 YT:Z:CP | |
| 15 r6 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21318 23 39M9D31M = 21085 -312 AATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCNTCGGCNGATATGCGAGGCTGGNCAATCAAGGGGAA $F>*"0E-H!5%/'B62E765(@/))GH>+$.G%&;>,+(0=7720?@-F53G,ED7B5GGE+52<#,8- AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:9 NM:i:12 MD:Z:34A4^GTGTGCTTC1T15A13 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 16 r7 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9090 42 206M7D52M = 9355 313 ACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCAGAAATCTGCNGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGTAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAATTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGA -#>*5H35BB:G6G/)#7AADB4:6G3A@+..)5,&41@"@GA1(DDA4#.@&5'!#DF!/3)'?H1,&19"!D6)47#*F@/9,&FE';:5,(?=(<G7H,3/6.*#95$E76.<5G>('C06;D;>G$.1!C/=C(E"?9=;"5E5>(F?E?()%A6$3),&$;(*%%(!.50<GA&*;(#4@='=-@=%<++B+F090":/=;!8D=46D5$=G?#:4C"')<>,.F409>H3EC13>0-)40A08507H>15>; AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:95C48C61^CGGCACG0G51 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 17 r7 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9355 42 48M = 9090 -313 AGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCACCAATGTGGGACGTCCGT =D9,,9$DH2$9&6FD'@!,2370E46-<'>@<@9."<0G2B;/641H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-31 YT:Z:CP | |
| 18 r8 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15720 42 71M = 15870 251 GCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGACTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAAT :5;&93#;:*<"+D,3;9+7EF%8),?H@C%")AA,72$.1C85-2HD98(,34(5-:D<)1"978EAE(4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G32 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 19 r8 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15870 42 101M = 15720 -251 GGAAACCACCTCAAAGGGTGACNGGAATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGNGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTA ?#D2):9*!.CG#.F$C6#"=?DF<)*?!307*;)G!9(>9-0.=B@H%*CA4@DEA=)+<#@)H#?<<6C(?E-@'/8B*,B9C.70C'#'G./H9:C>; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A46T31 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 20 r9 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12576 42 54M = 12424 -206 AGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAGTTCTGCTTAAGCAGGCA =:1E/3HF"2=1DBE7G7,845G:#';(;)/3;=)-"<4'3$>/@63*7C%>0' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A17 YS:i:-13 YT:Z:CP | |
| 21 r9 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12424 42 16M2D76M = 12576 206 GCTGGATGGCAGGCCTAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTT ";*:3<<HGB(1ED)/1%H*>5"5*#H<)A14F*1"('8?E'<7483E-'/?-'!((595H**";6D6+#1EH*7@(22#/>B/1'F4<:/! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:0A15^GA76 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 22 r10 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15070 42 58M = 14872 -256 GGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCG /2,:>4('?8@@>%D!DD"H<>G3D#75")!#>,1#:H4=5=F5/!G)5E5G+6("$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 23 r10 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14872 42 139M = 15070 256 GTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTAACAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTAGATG ')+&#)(+(!!%$)%))!$)+%($(+!+!"!'"%*$'+#&'&&"%"(++($))##)(""%!""&$'(*(#"&'()'(#&'&#$&%(("(&$$*#&"+(#+(*$+$&%')"$*!!#''&'&(#"*(&**%&#&(+)#%&( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80T54C3 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 24 r11 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16092 42 90M7D15M = 16271 307 AACGCTCTGGTCGTCATACNCTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAAGCCAGCAGGTGAGC <D.G"1<0#-EG20@:!4;0105!7"?,0?702&3B.*!%<F/)>=3?$-;,(&)'0*8B9>D2"5=?7'..19)?'A7&83&*E?.HE6&:)E#F0B0958!4) AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:19A70^GTTCGGC15 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 25 r11 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16271 42 128M = 16092 -307 ACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAA .G4(!#AD4:33&7,?01%0<0D,/>"15H8:+2"C.A8(C@<))?<)A@"#8:/+/12&120H*G6ED:4*"&+E%2<-C(.,:"."F@&F;'D&(3G=4#!A!:-HH9#*-*-&B-7?C"*$B&;& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:-27 YT:Z:CP | |
| 26 r12 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3220 42 141M = 3053 -308 GAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCCTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATCCCAGTTCATCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTCAGCCCGAAG :+&!C>,B((*4B%B6DA99*&.2HG);!0D@A;<4H(>11!A05B#AB/2&E6+-'<.8E5:*D0#=38-<HC;%.33G5+AG?!;3E@"+?"F/"=EG96;%>5,D3:(%C4'*E%$<8!):<8BF,AB8F:%91G)0E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54T35A7G42 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 27 r12 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3053 42 167M = 3220 308 CCATCCAGCTACATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGANGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTT 5(7'<.F!EAH"!9C@(6*-$E!/8%5H!*9/**A=6G#,!;G@<D0#8?;=:/E@;-B<4!+20@D3=$6H$,!>*"/)$>#G7%0-67>DC<!"%29H3"A"'370F?>,B!G"'4F3F:3E$,;8601!B">&:F5&2)(.-,C!:'H=9*C+>8:B4(4,$G2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G80A75 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 28 r13 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29061 40 62M = 28850 -273 CTGAAGTGTCANGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACGNNCACGTAAATNCCGCNATNTGG $##((##+$(!%$%*(!)'*$))&(++"*'()!%')+#!%'$*!*$$'*'%'*'#"#)$#'" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:11A26A0C0G2A1A3A0A4C2C0A2 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 29 r13 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28850 40 78M = 29061 273 ATTCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACGTGTTACTGGTCGATTTAAGT ?@++2/9<BG-/(>C;=HA49)#(@?89/H="60:"%>!*A.2AC6!?44?#F860<5&)3'H);9>C,3C2A&G2B+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C54C20 YS:i:-16 YT:Z:CP | |
| 30 r14 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39972 42 377M = 40349 442 TACGAGTANTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACANGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGTAAGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGNAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCC G)1%H/8!AA3C4+%57F'+FA69#4$D0$C7:$#BA4F<(F,H:%1$&B35E:7+9595?HC5=2-#%::=5HA'C+?-!H..E-*A'6>4=(>1F=5G==>3*)404",%0%H=.&H8)<2=.1>A)&B=#4+0%HF</H$;1D/9B203*C.-.'190</6):F(B04.7"(4<51F*/>18,60.$*/8C1A9G/28&1D)0A+A"#30'?=A*1@$%69>G.H**>"DC4,2?-3"2;'1-54&2F56,9(HG>5+2A-)/)!/-3!)@$6,)2@,DD"=9/D!%=3*,3GG.%00$81H#2"385"A';%:5EB-#F*>0,3*'%42#?(#E1BE7B&5+H=H(@/286&9;(1G)>:64$9</!533A<) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T91T129T146 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 31 r14 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40349 42 65M = 39972 -442 GCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCT *2D'E1+GEH2#5:.#32>",A+=%>?"?F*05;1H?<D6?$=H#=#)H-#6B#D-@(6-.2H(D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 32 r15 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8748 42 86M = 8493 -341 TTNTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGNCG %2/B3.%D81704B*?B.>%-D';F,A3AD0')";.)/<"8F3G?&G3;5"0;8:@7&:?$5C'=F(GF0:FE8<:F$E09;.#%! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T80G1A0 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 33 r15 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8493 42 255M = 8748 341 NGTCTTCCAAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATATAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACNGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTNCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAG #8AED$(;<3,'.8A<)<;#BE(+1%@G84A39D0?!/&9#/!@/%F'H==!B.+8)!DC/!,.)G,7'D-G=7?2C#;=$?.#CE39$E3"&"519C9"B#'82A)00/@=8G7,F"5%.A(E**HB?8()(=&@"*B"B9-%.-BG0F)%/<;#H)4H'5,9>'92/=0B"8,6F*"4-C#DD51D5:AC+5=>(=>A)7A<6/+3<#E6%EGD7H?F413,8D(21"9B+5B1=/?!B:/@A-929>(3GG8 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C7G45A35T76C87 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 34 r16 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28124 42 80M = 27992 -212 TATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATN $/;;#4<99+=BG8"FH6E&#!'63HB:130D3&$397=63.3.1+:=G630ED"/C4&/671"7*)@&:*;GH*@1-*% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79C0 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 35 r16 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27992 42 63M = 28124 212 ACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAANATACCTTCATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCG :@3H%1@+580A;D0(E7)!#$E5.(878)';&H-+:**$-)"B0G'C6G*+%7;-0%;8*1C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A7G28 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 36 r17 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32090 42 104M = 31895 -299 CCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGNGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTG %$-,;G.-59E(H$0;)D.,/DA.+88"FA1,+*GB9H</B3%H&,2"2=*5<59)"9CAED1$$D*DBF!$5HE)*6*HEH3=E79)G,!"B"(,8"%74,(F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C48 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 37 r17 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31895 42 195M = 32090 299 CNAGGNTTTGCTNTCACNTNGTGANGTTCTGNAGCNNTTATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCAACATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATNCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTACTGCTTCGG %%*#%%(%(%#)'(%&#!&)*(*#!(&%$%*!&'$$%*!"+'$''()+*(!$%$$"("#'%''+!)#(!$("%($)$+*"$%$)!%*$%$*)!)#!"!(##%)("((#%**'&)**#($+'"'$$#++$%#$(")*%#&&%(%+$!&*)""*%)'"!%%%##'"*#($)+*#++#$"#"$+#)*&#&%#%$$(&! AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:1G0G2T6A4G1T4A0C5A3G0G1G30T64G60 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 38 r18 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8759 42 80M = 8985 315 GCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTCTCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTC 2.DE"0$.(8&H8?3=*/<%7,!:3%GF@5%DG/A,$4A8A&@)8%=>;3=4/*9G9&=D622=;:)%@:4!.B<9&+G" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A30 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 39 r18 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8985 42 89M = 8759 -315 AAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGTGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGC >3:%<A8(>H<.G4@0#'=EEF'(>$%$+C"=,DAC?90H(,8.#$"+!03*&:#<5;12->2/3.8<"@GG@E8&+$H07::;&76HH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 40 r19 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32252 42 40M = 32143 -149 CTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTC B@!D3;":(?A!C,H&>0F68G%*(4A%%A:>'@3*-%2- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 41 r19 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32143 42 109M = 32252 149 AGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTT .DCCB#+-F;,;C6(5+AF.#83!!F,-D'A3/)-CDC3&(B4&=7"&$1A+%/,&(18+=*-BB&3?D88>+0?+=5$F5=?9%H*@D)(>HD!C=DG!.&.H)33C# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 42 r20 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26240 42 71M = 26146 -165 GAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAA &&)%C7B)3-,%HC8?.?&).,2FG!;:-0*&GCC%+4H+*H9/44-C.G;H?8C6?54,).*@=A2!H:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-15 YT:Z:CP | |
| 43 r20 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26146 42 55M = 26240 165 GGCNNTNNTCTNGAGANCCGNATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGT (*('&!!!(**##)#''$%'%((()+"()$#$&&#$%&!"!""!#$(##++*%*( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:3A0G0C0A0T3T3T0C1A0A0T34 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 44 r21 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30189 42 44M = 29990 -243 ACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCTTCGTTCTCCTGGN #"*'$&*!%!+'("'((#&$+%+'!&"+!$""%#%$++)&)+$* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C12T0 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 45 r21 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29990 42 119M = 30189 243 GCAGAAACTCTTCCAGGNCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGCCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCCGTTTANCAATA A?'"+7B3=,C<0?"C4'?,9%:H<C>:B+?G("+1F<$(D*:),?<1@747/=0(B,((6C5A#5C)=?9HFHEF@-CB$@F&*-7.5?H?:?8A%A"<:62'DF!8E.;GD7*;&<E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17T65T23A5G5 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 46 r22 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29041 42 76M = 29117 267 CGNTGGCGTGCGTTCCNCTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGNAAAAACCGCC E)'>41=5$B8E:3.,692.&G,*7B,A/(64.95F/23"<9$;B%)8.=3G,&:$-6,F(&1!)/0H7A7C68!* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C13A48A10 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 47 r22 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29117 42 191M = 29041 -267 ATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCTCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATANCTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTACCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAA A7*=D8%7*5/-)4('A#3%-480<.7"8712%5%G!A,,#,:F)D@30A'2(27B>;1'8A7!*A<"3?H<E=C*2:0(@<H,5FD-9C;(9C<'G$/+!*=:);H#FA<0@'0+C##G'CA-,?G"C0;8'EH#&,2B2&%.54E82:;9*.6.&($,4?:4B!2(%*F1C;F*'@>*@;+:+485?F+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:68G50A27C0T42 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 48 r23 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41346 42 122M = 41101 -367 CTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTNCCCTTCACCAAATACGGNGNNGACCATNTCGGG +%'&"!(%*%$!%"''*#(&%%*%)"("+#'&%++!!(')(#&$%%"*&!(!*&!'*$+'+&)*!+()")!'*&*&*%(!'+%!")"!(%"!+$''&$#+#+%&'&#)&%#*$%()%'%))' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:88T15T1T1A0T6T5 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 49 r23 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41101 42 106M = 41346 367 CTCCGGTGGCAGGACGTCAGCNTATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACAGGCAGGTAAAGACGTGCATTACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCA *F0-3<?E<B?!&0F$++;.00+'H?18*.)*0"F774."-G++:+(H94336)(A5>H=3853/0'9<!%/,@>'F)6:D:5-A=9H&!:@F&3'2GD3/<'/99 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21A31G52 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 50 r24 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24617 42 60M = 24465 -212 AATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTT 7D7H!H,'=4C@!6F,;*'2<:79EF$;0/@(22"6."B8:+6#(@EA"/;BHAH7*65$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 51 r24 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24465 42 81M = 24617 212 TTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGG ")4(7:1.32H,F;/4$=HA&$%32!/<GE''%B3E,1.=*'/&;8;:$#33)%A/1<=C1>@?D-:)*D<99#;9H!)<F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 52 r25 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34310 40 26M4D106M = 34547 277 CATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGATTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACA /-<!*@<&.53=!607C>A)=/@:BG?:G<**"0E,.CA-4E2.AH<"1%F1H<=?7*-!70+403/)'CF76!2"-""@D:474B7;@30+!70,H):C7@.(/!$2H!(3D7&A8H3"CB&(#,=5:,), AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:26^ACTC30A75 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 53 r25 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34547 40 40M = 34310 -277 GAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTG 2*E?#101G'0#B&=/-($&2<0&E$2=3%>*F+837>B- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-21 YT:Z:CP | |
| 54 r26 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35697 42 97M = 35481 -313 GTTTGGTAGGAGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCTA 6@=(<-@0*$:@#&;B=!$59:4.HKBEC@5%8*C7:!9D!!:86D*4H<*H:2;1D<*F$&*#2GF5E=!CE1>896=%C%&2.440(,->#" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T84G0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 55 r26 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35481 42 53M = 35697 313 TCGTATCACACACCCCAATGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGC ;=B3@2/,8)F6(8D5G=0+-8$8>!5'8E&$:"*03577H1&<738"@$':" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A34 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 56 r27 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13872 42 126M = 13683 -315 CTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAANCGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTNTCGCGGTGACGAGTGCGNTTATAGCGGTCCGGCTGTCGC +3!8-0)+,&'+C'+;.'H+5;>H(=&3$/C=/#5';),,*:?7-4#3EE;F8:B"$*E,A87&69H=.9>07!;=&B<54G5GE&,:7BD<?0G5?"873A(/'?"=1@/%2<$3;73.&=C&D+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28A57A17G21 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 57 r27 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13683 42 56M = 13872 315 CGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGG 12&(BB6!+"2&C51G&F699-3'E*$>'17G;3>9=@>0%B?.$H*;76<FD!<. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 58 r28 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7289 42 44M = 7406 202 CTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACAC @.43F:4*7%74192'A/&DA9"%$'((.8BDF>)C3#76=A"& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 59 r28 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7406 42 85M = 7289 -202 TCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTC B):B'C#B>9?:B%)A3/)6EE)@2+-:7B=2$A*7!"#:..%9?0;$+C5E&)5'$!G9!"E0.3.GF8G>&8F$!+.&9&#*4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 60 r29 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7089 42 66M = 6979 -176 ACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTG 27E;*9/F08((!'6#2BE9+D'!?B%59&8C%G*H.#6B#F2$5?47:7@F2(5*"=EBG@;H$9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 61 r29 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6979 42 80M = 7089 176 TTCGCANCTATGGCTGCNTTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGG @,DH6=5.?-G8,?9A,*:?,D.;4B#D#<C0/58@6>.9G!!163+?@%HC6;.%#?E?@:!0#B8?H?EC7H5:-#'F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G4C10A62 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 62 r30 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11733 42 163M = 11925 241 ACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGGCGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGACTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGA 5,861G7$G6."A$C8*$A.)::0E+,-E?F78#E-'32#:5D(94&7$#,3#2=*612*+A%8D",&D;'(#@"C0D"/9.-80,,C<=)6C;4?-"$7)A1H3"E;':@B*@;C'B998B+71.AE<<:@<-%:AG:9#EE*D('D2H55#;))6"3@@G( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A76T49 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 63 r30 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11925 42 11M1I38M = 11733 -241 TCTGNGGGCGAGTCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGN (*<6,AB'%/0=+>#G@;@EC=*D$*&F(8BG77*+858%/=AA'2?4=! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:4C43C0 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 64 r31 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11508 42 210M = 11718 488 GAGATNCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGNCAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCG &)+""&)"$(!!&(")"!&)(+&"$&((!()&(&!!!'!*)("&+)$+"$'%$$!))&'%&"$'(#%+(&!&"#"')#&'$$*&&$&%()!&&)+&("%&($!))*%(+%&++%&!#&"($%#&$+%)!(!))%+#&#+#'%#***+"!*+'&*#"#$'%$###!*)+**+##"$%#"+&#)!$#!)'!'#()$%##&+(**!)#)$'"+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G169A34 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 65 r31 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11718 42 218M1I60M = 11508 -488 TCACGGCTGAAANATACCGAAGAGGCGCAGAAGGNTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACGACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGAGTCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGATGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCT $6=C"4.;E5#8%=E*@(/<@*&A!13(7D&4*$3*"'=!14#@F0!+2G)-7&;G:1365C/*7</#"<>,0<?#H6(F2&@5,,7H4.BFBB-="/H=7:>H=B2?!)A&)4"<DA@@B/(.>6',143=B%=/$.'>--:1=4:"#!*3:)F>D)=.)8B+0)C$%3&*9!&5-"H>7%:D8%CA&)&*>9E4!B#5?!="A&C@5+,*=B479!!;%E&:=/GF3@E#*@;;:CH/G/)9(#'0D3;4$%59-4B:=#G,AB).23$B3>>112F AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:12T21C97A120C24 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 66 r32 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32997 42 85M = 33234 319 NGGCCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCT !<@+4?<8'G5A,!ABDC*D5&<#;FEB#G,8!*8F&CG82A.?7&;E<),?FHA@-@?'$D"&E"&A/5%1%8-?#@2CCF3>8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A84 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 67 r32 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33234 42 82M = 32997 -319 TTTTATAAGCGTCGACNGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCAT 3:E86%!DH",>H6<)0>+8.8##<6,/12*4A@*FA*E=>5@?<+A>B2HD&?F"84@F1+=9+1=F@)9D**>/H4;#%, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G65 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 68 r33 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 452 42 51M = 221 -282 CGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACNCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGAC &FCAE:;'7G=!=2054=7#<17.1(5CH</7;9)-$-824*<>-.B)%!F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G26 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 69 r33 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 221 42 72M = 452 282 ATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGN 92!&+CB?(/229&83D8AD/,A*H;2&@<.=(?./'+<%,;848-(!<$D;@6?;(2'64@H'!D=&B-E+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C0 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 70 r34 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47017 42 76M = 46876 -217 CACGGAATAAACCGGACGTTATGANTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAG )%'"('($%+&)%&+$+$"'*'"#+$%$)'+)+"&%%#!"!#%"'('+''%$))%&)$!"!%$$%%!')#*%")+( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G16T50A0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 71 r34 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46876 42 86M = 47017 217 NGCNTNATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGAT "("#'!"%)+"(*$$&!+!((#+%))%&&**(()&)!)"&+$&#%%")"$&$'&&''"##''!'""))()(&+'%+")#(&(#))" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0T1G1C80 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 72 r35 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15382 42 49M = 15494 245 TCTCAGGGGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGG A(10,')F9/(5;//83*31%<..&$&3"B8%D833%F@82G<$1&,27 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A41 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 73 r35 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15494 42 133M = 15382 -245 GAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATTAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTCGNTGN "#'(*#*#!%"*%"%)'&$*'#"$(*$)&")"")(&&%&$+!!&$!'"#*#!($(#*)!%%'""$#&#'()"#$%#!'$+(&!&'%+!("#')(!'&&!%++)"")"+"+*'$")(""%!%((!*+(&$&$#% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:100C26G1A2G0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 74 r36 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27834 42 43M = 28021 289 CACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGT 1B!G1BD;@-E;#:8D+9*,9C(64B?1(G'F4F3.,>%?,+D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 75 r36 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28021 42 102M = 27834 -289 ACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGANTCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTG $1?%2>HD;+A.&$0A4;$D6(;%6<E!8&'4/)50!@FE9C0)85>E@&/.):/38E6C=4(0;A>E0F$%0.620#08:%'1%(<!6*B;,G+!3)<6EA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68A33 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 76 r37 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13868 42 67M = 13689 -246 GTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCT 5/<1G1"EG)53?-<;A+!6;=$*/>>A1&-9-4867&.3F*4)AE!6B+:<3,1//!006'>")E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 77 r37 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13689 42 119M = 13868 246 GGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATC 6A'81F=29='FH?=#79&.7;68$G%H1E((DEF!8;AA2&6;A'F"&6G.)2--0E@;28+20,24G80%D7?"&1?7(E&@%*,2#=1C!;"4;.C/=2<5*9;/5+#-8!A<&88 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 78 r38 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46152 42 358M = 46041 -469 GCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCGTCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCNTGAAGCCACGACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCGGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGNGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAAAGCCTAAAGT 0?/AF-H&C&*7G0,#C-;013'=9C:/130&,B@>D459,)=*".B5D<>;&<(F4"F5(&A4/$3>2ACF$A&6@@+-,;9/63G!F1*1E:B7/,)1B@0!%5>:$CA%'C(DC9A:9.>?('A1-CE7$:A'6G,<&=&F$/16)@69:@&+2/E8;>F,16;>"60$F"8=B3D:#B8=8-/C,.%B"C.=%)+B)!(D(9212)49=H-7AC.G0G:#@F-9&5$8CE0/;"@)8"7(0&<CFHB0A2H!#%.>$16?2!9<%./%77@//&<=9$6/0/8//=5<@"$#(6%7.HD@0C!:D=.%;D$%:!=5%E>C:#C0B0F+%=6D0B2G8A58*@*>(!.@3<EC)) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:121G9C50T130T34T9 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 79 r38 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46041 42 111M = 46152 469 TANCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCT ;0%)39CG.A;!2A'?A=D55!)!*81)5B(:H"A6!F/9:"1<&=#B"B)&#;4=#=42D4#>/+1+%G&:50BC2@8,F-33,7@;.)F*$;8?%?75-E>%D"F8+&C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C108 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 80 r39 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32737 42 210M4I15M = 32626 -336 TCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGNTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTNTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCGTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCGAGTCGTGGCGTTGCAAAN <C),5'7#.H<G-13$>FFD*><*H7.$BAG7&/21F6-"3:;6C7B'CA:'#D,@#,613%83FG;.?G./FG2#&D3($$?*&!F#'&-;+8(:9H4#&G"'/9/5*/F8!H;>+'#$;".<<5(=43"F55-G5.'C)&=;35(.=#(-">(6))/0CG953B<:%=-*6;%7)DB53A"3=)8>E6-,:(C/@?<"DF5F)39:>(81"C<=*)7&B?7AB?94% AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:55T23T77C66T0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 81 r39 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32626 42 102M = 32737 336 TCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTG 9,8,!#CH6D$H=!&1#?*",%</9/5*:335#6A9,*?<6$?8-AE!3(B)6"(212&$C8@1*5@8%-9;F3:3CD&%57+4#'8;=EG9;-"?E',#1= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-22 YT:Z:CP | |
| 82 r40 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22230 42 181M = 22411 262 TATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGCACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTTTTCCGGATCCGGGAGACGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCG ,9=E43E:7,32A);1!?8AGC3A$#,<24=*+@,!04+-.+80H5A00<>%0?*B%/&1@5%-!H/:B/E#&6-G43*&>*2+?D-#'(-D"A'C&+&E16";D"!"7#!-/A$.*%<:!C:1D).46$@G.;"4D0.(*;%""==;<9/>9G<!C1++'$>(#>B"A#+D.16DA@9(1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:70A40G15G53 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 83 r40 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22411 42 81M = 22230 -262 CTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTC .2E%=)",$91C99H@:1+)5))"/489*?-D'>5GF1(#=B!4H##$@=;=$<4(;EC5!,::4/3+&>!*9=,>2*27! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80G0 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 84 r41 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15654 42 136M = 15501 -289 GNCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTNGTGTACCGGGCTGGTGANCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAA &%6&F&2#8A@=:)%8F%%@A3;:=*0$@(E9=?,<?B/;H:;B.:&,D50<"GCA;=D=299=$$3F*%"D!20,0G1?<@%*8+GD<<8HAE@2EH'E;&:=.*=2-#39A&;1#BA03F7%5?!"4=,)'*EG AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C46G4T12G69 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 85 r41 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15501 42 153M = 15654 289 AGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGCCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTGGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGCAGGTCCGGTGGATGGCTGAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTAC B&H:<<B.0,+=!&B#$;>H(,9):<2$=$3G0#!:D39!'2A46?<*1>+FA)A%,A1/.F),+55FC01*F)B2!)6A/$;D+?*D=1H6F9!>8:@CA4D%"3/0&6;99G0-7(-H&0<<4/#..3<19FA7?%%C6<.F7FF40&H.! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27G43T38A17T24 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 86 r42 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13186 42 70M = 13391 284 TTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGT F%2;%)1&=H91//4%1B92*$/27:6&(G%"3$F$C?;$+9.4>,94,763A31(6=F-7H@H:&E+<7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 87 r42 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13391 42 79M = 13186 -284 GTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCN 5+#D""2H<G4:+"E9"+-<:3.@B$69B:-A8%):8)E6!:#,%4,;8(D*20/3"C<#-",+9-%%9@#:0?9+!4" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78G0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 88 r43 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 785 42 62M1I129M = 976 347 GGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAATTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATAACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCNTTCAGCGGNCCATCATGAATGCGATGGGNAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGAGAAGTCTGCNCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTG $(GB:/"7"-6341).?":.C9G84,:841*"#4<BH?0241:;3"$47*(+D$H1+,0%EH>""!"E?%F>E$>!1)>.1<1'5H+(*.73:8G0;H+CF,C%-(8&>086>'H85!.!/B5<<-41,D882!4&4A449@)E?5A21FH#1E(4<3E3(2(+";!6&B@84D0:5HH0G656"*CD"5C" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:91T8G19C28T9C31 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 89 r43 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 976 42 156M = 785 -347 TTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATTTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATTCGNGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAANAAGCACC *-28?.C)"%<H#G*$'5-9:"F4G9C&)72A808"67>)!'-==;=G@<'>!&).F@5A<4;F(=&*E5.('39&/&6GGC@"E&$!%B4>)$B:/87(6C1@@=@A#;%EF#4(0)C%G$$@*/"E1.;>"4#:1F9>%61?2F$7?-/(%GH9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43C62T41A7 YS:i:-17 YT:Z:CP | |
| 90 r44 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16094 42 88M7D109M = 16298 329 CGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCANCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTA >'(?;.?0*#2!D4GD84A&80=1B8<6E;3,7&/G>&?8(0;2/41FA.A*5A=@'.C73&B+EC-G""F=@-A5+(+,@%<-+D$5'-";B<9@!."C18.7(>'D*7&"GD7,"=F25AC#%0@?*>%02G8B:261/5(:01-E'3'?C&A1%%,BD&@$(*7975&!1%-?D$H,52?5H@1,AA',HFG:3 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:88^GTTCGGC26T82 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 91 r44 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16298 42 125M = 16094 -329 AACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGNCCCATCCGCNCTACGGCATGGGGNAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAG 8=>G%#<-F'!?=(?&!A**F#*61F6G=//25EF-+-%73(*,;E$B=$42"@F26,=?E;155<%/91,(H)<?)B/DBH2=#-G:5D@2='C"@9%5%H8#+$5D1/;1$#FC0%(H/B-*A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47A9G13A53 YS:i:-27 YT:Z:CP | |
| 92 r45 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43023 42 132M = 43262 279 AGCAGAAGTGAGGANGCATGACGTTCNCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATG :FB-,("H<4-D9H@30AF!;C;F&G,;C/"A#6,15356/2'$/("6%,&=F8(D-<:/&#?+)G:44-*@;=(/7#;HH+$(C*6="5+GAE'!8'2.%"<3#G5A5#D<!"0>-,&>#:#GG=<6(D%H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13C0C11T105 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 93 r45 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43262 42 40M = 43023 -279 AAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACG A7=5243;$H#$="!+630<;5*=DF6?+*929@(G+E0* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 94 r46 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39027 42 174M = 39201 244 ATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACCATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTGGCGAATCCTCTGACNAGCCAGAAAA ($A5H$%-0>1.:,<7@,=C?B+,?%68*<,<0H"$.%!+86C<?#6..-'8*DC'0.F0?.(C!%)A*6*"8<6�*#504"DF<F'$'!D6C--7/F5F2#!1!"/*D,EG>7',$G$.;:@95A.F;@<.#,>"A3=G(;,H-8E:;822$A249GHCB3.;$8D/;9*C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:105T57C10 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 95 r46 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39201 42 70M = 39027 -244 CGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTG 2"(7,6=5540=;3G!!;7>%>)#&H)$GG11;<,0<)>9AC+%<75&(>F8;C-+B7/1'<0-;>><=C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 96 r47 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42275 42 238M = 42513 366 GACCAAAATCGAANTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTNAGANGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTAAACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGG ++%*%+#)#&!%&%!&!&&(!$%+*$"+)&(')!#)'&!#+)#$*&)%(+"')&&%+)(''##((+++!((!##)("%!)%"$%$#'')"*$)##((+!""$*%&%"+&+"'&#($#+"#%&&&*!)%#!'$+('"'+'())*)%"()'"''&($"!")+'&%)*)&*($'+*$%'$!'#&%#%$&*%)*'%*((+)%"'&&###&%)%'*%(#))*&(('(!$&!&+$')+!##'"$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13G49C3A170 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 97 r47 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42513 42 128M = 42275 -366 TGCTCTCCAGAGTCTGNAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGNACGCGAAAAAGCGGAAANAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACCTAAGATTCG D>:5F(7B-/*:&F+*/*8>"$6D,CE";/!):G)A>1+E2?-+:/2.,;(B9*!6@#@:59F+,0294-$14&(!<A!2&;AHAFA$@+E.A8G8B1(3:7!G"(A$!1H=+(17DA$5!HC;4EFD AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13G2G32A17A50T9 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 98 r48 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7719 42 126M = 7662 -183 TGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACNGGGCGTGCGCTTTNAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGAGGCAGCTGCGGCGTGT +%$##&%!#!%$+*+'(#(%#)(''&#'#%*%""(!#$*"!)+%"#%"$"(+"**)!"$'$$#$)%&)%*"''#+)($%*#'#*)+%#&"("(!#+"%$+'*(*!%%**%%!#*(%*%$#'"+'(' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:53A10G2G41C15G0 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 99 r48 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7662 42 48M = 7719 183 AACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGATAA <F?&.C676!(>884*!H5@+'#?E9?;,"((8?F%-*CH6D%+*;&! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G1G1 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 100 r49 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3594 42 147M = 3756 227 CGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGTGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGANTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGA D/586!%B',"<)@9&0A.*FB4?0.57B9&)A)G/&9>)*12?D?!AA./)<#%)98>#653*3<$B?4,,=C,5+D!1&//#2)"8-+$4;1DF;A()'&8/HB36/7%7>6:D.7++4;962F6"00G.2"81FE5D,A84<8B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120T26 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 101 r49 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3756 42 34M1D30M = 3594 -227 NACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTATTACCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAA @,8&;>4'2$F5"!/BF%ABA<5704?2+:FA>+A)5A'980*8)!=91>!4A7EAB5?H>&7A AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:0G33^G30 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 102 r50 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35578 42 130M = 35448 -260 CTGATGTGCTCNGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCCCCGNAGATGGTTATCTGTATGTTNTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTNNGGGAGNT "&!*#!%%'**$'#!"$$$$!$""(&$&!#!%&+*#%&#$%"%)&&#(###'*$'%%#%&("%("$")(!#+"&')!&$%*''%&'&"&*%"%*(&&#+'%"+(&*()+(!%+$)'(&+&+)$)%&()$) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:11A49A3C19T35T0T2T2G1 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 103 r50 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35448 42 80M = 35578 260 ATCGGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCTCTTCTT *;"#5F.0BDE"08E+C*H)):51&6=0/8=C8($<7;4'2>#"D&F7(D131$"H,-F7/4?&(/,35!!.+DEA1%57 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C69C6 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 104 r51 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30764 42 59M = 30823 254 GTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCA .,:8/'4@+30#"1$4=D3>('.$<<@G4G82?3/'*:,8C+$H8('D;"53H;GB**" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 105 r51 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30823 42 195M = 30764 -254 AATGTCATCNACGTTTTTATCCGGAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCATAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTNCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCNCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTT !E0.$G$;'F4<)@$G.04C=16@:@.H8C.3F5815'C*8A:"02#8:H%+2+BC;G<-*A"H9F:/=)&!B<.-!>*H46CAE!,4;C0*:)7D2/>*&5<?!*+*7F/+A/6E"7&?&B>G47.%A%,40,#B+2+<16'@',4@:"605*-13=</FE3?BA778*3%(2$!D=996:9$2D3869(,=6, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9G43G35T62C42 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 106 r52 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9918 42 44M = 10063 257 CAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGAT 4BB"F(,E="=">F27ED16$)<-%&2?((!2?*:A+H<!B48; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 107 r52 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10063 42 33M2I79M = 9918 -257 CCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGACAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGAC 58678C(1)G!9%D:)""F(,55/"G:$E6,&B#1F!'C?F#):*-:(=H'G?!(<.).2+0E8<::E:%$9H?5),04=4"H,D7FFH')%>H=@D4F9H&"/HA&-+3,(%4 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:112 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 108 r53 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1952 42 151M1I48M = 2162 336 GGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGANTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCCGTATCTGCTGGAGATACTGGCGGGATTGACCCGACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAA ;.);A<6G829F5:!@CA/(8!5588=8#E+>9-D80G</E$ED;:=E=CHH?4H*;%>H$D:*=BD.;0,:A+H$?*D%A.!FG3C<&4*)"90<5/(6=C:><"2H#:B'#B/=:G"=EH66$)C*0>DH;6B#=,:%6GB#.4*.,$-'8*?"*EH/(=H>?B)/)H;=<:0%+DB2AACD.&0A-9*&H0:H*8'E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:26T172 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 109 r53 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2162 42 126M = 1952 -336 CCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATCTN #%!!"*!#)&)!*+#*)%*"!*!()*''$'%"'#$'%()#($(*#$#'&**'''+%#%&'&#&'#((!#$&%$*!('&+$#(""+&)())""(##!($((&'+'#""&'(&($+'+""%!)!+&($ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:123T1A0 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 110 r54 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47317 40 79M3D9M = 47090 -318 TGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGAAGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACATAAATCTTT 'H@!C0F"==%+.A#>*B60(@.+*.HA/--;#:-6@>(+'?'::B7>6%7ED&C*6/%GE360G-(3/."(B!/"G4*+/=.>,H#7 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:42C36^GTC9 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 111 r54 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47090 40 42M = 47317 318 TAATGANTTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATG (16B<510;:!&'-E,A@,96/!*A;"G"<8>H5.8D5-HF3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A35 YS:i:-16 YT:Z:CP | |
| 112 r55 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47357 42 39M3D86M = 47487 290 GACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACATAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCANTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCG <@/4+)@>.@%1%@)G:EGB,&B6@2H824<1!$6-(6(>(%'@*<%">,E9=)"/F';@:%5G',%EA=6&1.BGF;9>+G,57EG@H/=0G/F7G.!6?%=&*65?@'$36F!:<1D$/<:"8 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:39^GTC53T32 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 113 r55 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47487 42 160M = 47357 -290 GTTGGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGT A"+)548H:G.(!3B@#&(E6/.9+1:"@@!&*<B@>B:13A@8"<=-,7*&C+4#'6+4@1:,E,3$4:+@.:G'=?(?8:-F*?@!?@:"8DD="@/@F+21%69B%;#.G3D@""F#6./#/:%@23->/03EA44;?H6,%*;(=;F6E72+GBG> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T156 YS:i:-15 YT:Z:CP | |
| 114 r56 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30901 42 174M = 30797 -278 GAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATNCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCTCCATCATTTCCAGCTNTTGTGAAAGGGATGCG %BEA=H8BHH)5$.,1%%7$/)5-;!E&6)2D&:)"78%<E:1>5<D)F,&20D/(2',E"@"$7BG;2-#&*9HF:>?A*($4A.9);5%!7-E>BC*36B:7:*G4G>02918B,A6*15/.9>2>,5('.AE21+F:'@=?.C66C#C07:<146$G/#3#(ABA!%'>:2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:94T46A15T16 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 115 r56 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30797 42 104M = 30901 278 CGNTGATTNNTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCGGAANCTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGAGCAATGCTGC #)"'#$&'"+$"+$(!**(*$&''+*#(!%$)*'%('"$((&+("*)"#*"!%#"$!("$+#"'(%"#'!#)#%+$*"$!%"#'%$&)'"((+%"'!'!*)$#) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G2C2C0T42A40G10 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 116 r57 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5005 42 574M = 4929 -650 TAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAAGGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCGGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACTGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGNACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACC &@*H<>@8'!"<:E<:7=1BE:-=5;C(8E84,?B7)$.$H864>E=D,>&>+=-"B'4(F240,@))@76%5F8G18B*21@A3'G./(4<5D:1!2>(D*8:<726C&G,6%!=#%%!/9/9.?-:;-)9+FB3BAF,A-#B(<.(F<=47&$E5.(9@G+C#>H;!D$!2GF90H9%(HCBC$$96AD8))0:'H0="/<A&<9'E9F6"G&E70'(A#$01HCF:E6G>4'5)1%12>"<*C$796)8%"@"6*(#HC4"$3(<9C@,2%"'9:7,*-;35!@AE4/H8D=',!@6-D(#(H:+D+G":DG%(*3(.;=#+(C7A)F*DF0A+3F)E4'-$63:75D,A#6*9>:H57E+A&?6'80;$@86#8=B8*FCH'-,;@G$9'$(>822;F4'!B!?@'D(#2!.$+=9,>(C>3'1:1#?%G<@<H,5?'>@,!9E7E-,F8/*AA.-FB(B.=D:7.C"AG<&=&;C&2?4'G@6$7943#$B>7.E-C,=&--GFE5"AH$)0>4FH.",3)+5E!C.;"9@8"'$8&=.H>(,5##'!4'-*$"?1>@24570.HDH>* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:338T197A37 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 117 r57 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4929 42 76M = 5005 650 TTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGGCTCAATCGGCGTCATGATGGCTCACAG 1'95#>7?(F%7<EF?@%0=/7-H?C/7>".5$F144$C);)";H-6&4D&:2=7%.F")29+E6!*6,/9+,<,8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52C23 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 118 r58 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21242 42 115M9D102M = 21135 -333 GCAGGTGCGCCGATCCNGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACAGCCACAGNGCCAGTC 8:E8*4(99';24H5"&#@2B-D:C;4/).(/5G9GEF;96+'FD<8/9&8H6?+>1A-""-8<(#@,EEC1A"5'A*@G&=56,=#4<FD)H!H>.,E?8)6,">:$9E:'"'6B,C:A!%+)?*6:'(7"%94.!44>$#?D'"!;0B:,47C@0"@?&>H'.-3)81$.$,H$0/H74>8)8=!57//G:%:E%:$->,#$CGEB<$1")?4%" AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:9 NM:i:13 MD:Z:16C98^GTGTGCTTC87C6T6G0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 119 r58 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21135 42 107M = 21242 333 CCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCG 44?FB(60*+@!C1C-7;D:BD-8"&*(.>(9C74F&E/!561@5AH%5(1,%%#@D$8*E')064+&-><A:*&3H#2@$>#BFC1+A/C&&.'0H8'H44,B";" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-38 YT:Z:CP | |
| 120 r59 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45427 42 41M3D167M = 45272 -366 ACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATTTGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATNATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACC !E?6%8$@)C@C">8'G(#=)+?653B=25-(#:C<(,G<:CBH:4))&)4.9&'#B>6*E#=99E;'#F!+0-!0'FH*E6$(;>&&-6@:6#49&E"B4A5?0C/?8H8!C8ED,A)<>8FH&E4A2"H2.?DC,'</.HD2*(:?:0+AB&&>7"2643<0.A-6)++E@23=8;?;1E)G')(&$"1F1F:H?C(?8D,/+(BC AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:41^GCT61A50C54 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 121 r59 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45272 42 155M = 45427 366 TGCGTACCTTCGNGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGCTCATTCGTGACCTTCTCGACTNCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAAGGAGCGTGTTTATCGGCT "+&$&)!(++)"('&)&!'*##(#!'(+"(##)+"$"&!$$#$'*%#&'!"!)##$)*%*'+#$%$$+&*%!'%*#"*)!*+!%'#"*(*(!*"&!%%%+!++'&+$+*#""$$"%$$+*)+(&**")*#'+'*"!'#"#+*#'%$'((*#&&$* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G11C69T21T32C17 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 122 r60 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11025 42 201M5D74M = 10927 -378 CTGACGGCAGATCGTATGCTGGTNCTGTCCANAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCAGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGAAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATNAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGGACCACAGACCCGANGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTCCGT :AE516*@GDD3:'3:1*7F*E)5.!F,0!GCAF2:5)G7>6999/@<9"?"#!?G@<8=-"FA"284:*A@.C-->'&C+;7!B2/-B&3&7;3E2F>:B/!:8A6H);!F0=7,0%>6*&.*8?H%9>;20H:(#<?+'E2:1;F;B)!.4#<50;-=3&0DE8EG/*("6>B#7B1!'%01%;44HD>F"H5,"+)6!;-1%26,;(@1DG57E<%G'!DE&34+.!?1*)E)798><(B(A!'F)2:.;75"@&./4.$!2-B@',/!C?@ AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:12 MD:Z:23C7G20T50T27C69^AAGCT14C55G3 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 123 r60 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10927 42 98M = 11025 378 CNGTGGCGAGCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCTTTTCCGGCAATCAGGCGGGA /7&+3C0B-<1+%'&;5<8*/?#6#++56*4,>/>A8+#%/2,<,"9-4)8G/*!4B<3$3HH90:E-$-52-69,>6:E.F5(5(?3$(32<%&%-B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G7C67C20 YS:i:-32 YT:Z:CP | |
| 124 r61 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22958 42 82M = 22697 -343 TGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGT 2%7C!4E5H9C/D*CH!+4<-"A9#+$A"@HF4E(;4F6$=;=*'H"155%(>C64)@C,23=$,7.>77$!&D#,/*1#$7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 125 r61 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22697 42 261M = 22958 343 TAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAA 9%C?@E&H""45H4EAE$'-?.<.';'5).3@3<1CCB)*6!HB04@:%(>9?$B=HD3586%6C3#7!&:%(C9<B;?#33,)97=2=@()-BF/010+2,+.!F=),78C3D3G$&$2<."1@B@)7.HA2D)"%;8+7CC!"D-F67C8!)#G*2C>4$&7.B7D&*'35/2A40H&.-22?>!02HA)+-4%->E-8A$=&)?!+9<68.+#<C:F/F<$'<?;6'?)&52=%+&6C6H<,A1:<=G+D?0G893!G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:261 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 126 r62 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38885 42 63M = 38988 210 TGAACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAANG 817"&.G;/--/:B7(#'FE8&77/$$),?@!5::=D)B-8($6A05<=:/1%"2>#)>-3C: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G58T1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 127 r62 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38988 42 107M = 38885 -210 GCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGG DE-6@A$0%-;!1G265%@,5@2.'G+3)-B+?>FA+!+H!<D(!%EH@H@#6(+@><+5C1/3G/&?H:2>"4>90;$=F-=!A/8CD5A$7"*>#8<0!3D+*=" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 128 r63 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39223 42 97M = 39434 273 GATTNTGCAATTNAGAGCGGCAGCAAGTGGGTGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGACTGGATGNTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAG %&#$"%)&$""&$&(&+!(&"'")$('+%*")#'+))&***")$!)&$#*)**'"+'&)$)#(%%!*%%(%&%$!&'*+"&"($*"*&#)')##&+( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3G0C7C18G27G6T30 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 129 r63 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39434 42 62M = 39223 -273 TCTGGTCCGGTAACGTGCTGNGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGNGGACCCAACTCGAAATC #%(!!!"!&!($*+")!$!))"(#+''&%")&(&$(!)(+$)'&)!)#%%$%!*+$)#"!"+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A23T17 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 130 r64 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31756 42 110M = 31499 -367 CAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAANCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACA H*6198,:#CD21+B2C+$)?#">>34+-24(,(FG#4@#:4563"A;%#1,.C1.!9,*-,!3;,(8(?9C&9#9:2""9<F"<C45.B7)D%875:H1=:HD3E3-DB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80C29 YS:i:-14 YT:Z:CP | |
| 131 r64 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31499 42 257M = 31756 367 GGGTCCTAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCACATGCTGTACTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATTGCCTCGAAACCACCGAGCCGGACCTTCATGAAATCCCTGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGATACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGANTTCAAA .(C2.&9;*,H!G9.8"B84;$-H>-,10H98@'#0(72D+3!!"#&,H<*.%@>5?5(".ED30!GA#+B<F=&2;?;D&$='+:#@49F*&2G6?,$?#'(C*:"?%."E04>3,#/56/$(0+*0/!#7%#'6!F4<&7-.EF1*E)B$=</E68'80@/=85#)%B>9H.;*0*1365)=3*-CB93H@(GH7BEGA($9A5.>-25E-=%F#:8*;>(;57C-+CE91H5"<F:*D*H&:?45!<+0"5(&= AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5A77G22A14G67G60A6 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 132 r65 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11410 42 76M = 11251 -235 ACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATAT 997-",!7+B&'7-HDC?*D)!"#B0EG#+3<-A,0D"<+$1=,4<0@HE:<F,-()G;21+/)/2>+52'!6B,/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 133 r65 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11251 42 51M = 11410 235 NNCTGACGGCGATGGCTCGGCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTG ##<44$:-805(C#-/40C(;%C1+$07%558?.5!>"-$?B>'->.-;H? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0G17C31 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 134 r66 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42172 42 189M = 42361 428 CCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAANACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGNGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAANT B#68.17,?#?BH+732F.0/5E>F%@7DA5>>&'DF'6DDBH90.=-H$D:0&86?#"<@=8&E/-3DH-2E8@/5F+&2-4<DE14FA/;3#79%(.CGC!;@8*4);C9'A>FHC,!#$G16C>2*%<2=E36/B)+%0;2G(A"-/8>6H+-*F>AH@%:!A-,$#2F9BG&+F+D'2.:=86#) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A109A45G1 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 135 r66 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42361 42 239M = 42172 -428 TCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTAAACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTNGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACNN )'C04D-:'#()00+/=<*=/2&0.@;E;BAE+1+H%-746H.;7;HH$5<2?"H9#99FF+(?0:A-#1!D:*,1G3;6?5E$(72%6'EC7-</$13)6=-841,A=24>94$E/@<G7#5<$(?4%@15$!<4D/)24F(3&!!=<.673B<*B-":H"E<."A?.H76!'$?7-1D#F'549;&/7,(803D4,"G:54!%FD3>"==>$4(D*?.A:$;/D:9>+C1,2(;2#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:136C100G0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 136 r67 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17311 24 80M4I15M = 31274 14162 ACGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACNCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAANTTCGGATAACAGAAAGGCCGGG !*#C;@@H1,=(>(G0:7A=);AC!EC<E'!40@<-?-:!5E69FCF8H(.=#!,HF."$$;C@0.:79.#<(0:#"/51749@&!0$2FE)C2%%-B, AS:i:-49 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:17 MD:Z:0G43G30G0T0C0A1T0G4C2C0G0G2A0 YS:i:-10 YT:Z:DP | |
| 137 r67 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31274 24 199M = 17311 -14162 AAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGNATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCGCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCTGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCNGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCNTCCCGCTCAATCACGACAT 96906)=@";CD6B33<0"317)?<72.$<*693H9C:("=.1GC34=1G2<=5(3>!$*@7=&39@<($=+0776(.=;A*-?7'#40@/AE9-/0-#D=3*.:?".(%><1!$0A1*-0D8FCF&6?3B=9)#:A8*0(/:F/>@?,(0<@1;'"AE!B)E>705:59-B,&/)BB4:()*B(2,(@E!:?'$8D-@ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:54G34C24A28C35A19 YS:i:-49 YT:Z:DP | |
| 138 r68 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25786 42 56M = 25907 214 ATNNNCCACTGNNTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTA *$'""$%%')$$%*+$"#!+"(%"$#'#%$&))""#(")!"&%+$&#!!"!"(")" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G0A0A2T3G0T43 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 139 r68 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25907 42 93M = 25786 -214 TTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTCTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGNTG 5EC@(6/H7=//=="&;3::1#<6)4E:E8H/'0?;9*)<1%@&:(=$$@:B:F;(6+(&)0D'/"+%<B!E:H;*"47B,HA="*?(A>"%< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G43A2 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 140 r69 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31244 42 5M1D124M = 17247 -14127 CAGAAATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGANGATGCGTCATCGCCATTGCTCGNCAAATACAA E3,6),B#4;6'6<82+5:"><4,D-H(C;))<'#5DE+@/A4G"'+'A,$3*&71.2?&DC<@7-&@.!'"4B4@.G)C>6C3,.28G+9?)20!F;$'>@79DC1F<43D"84A97!#8&!7=$B(4 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:3T0G0^G91G21C0C9 YS:i:-2 YT:Z:DP | |
| 141 r69 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17247 42 134M = 31244 14127 CGNCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCNGACCG &.>+)%->*0F$82>,H':F#,5.:&A==3%3A.3'G8EA"(FDH5<-):3=+=/6$;"G.C?17D:<%52;)F:&@%B(5'&1B11"*5,,8#+4;=1"#"<#%6C=*5E25$!!5)F@!?$*3:99C!#?G@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G125T5 YS:i:-18 YT:Z:DP | |
| 142 r70 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11846 42 90M1I14M = 11639 -311 TTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGAGTCGTCAGGAAGACN 7F<5H.A"&&4+&&*9+5<,%<G6-:4'%2=/1,(!&**+,3.<:<8@59CB22)4%.>738G$-H*4?D8),)DC4.29/E+$("C(EF@2<1BE3.HD4=5.& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:103A0 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 143 r70 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11639 42 45M = 11846 311 NGTGGNAGCCGCCCGAAAGAATGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGA !"&#)%+#'!)!*#!)((*"#!(*%'&$*)*$($%*!*)&$$%*) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0C1T1A15G23 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 144 r71 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11476 42 128M = 11281 -323 NNCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGAAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATANGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCTAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCG E6(C%'&/7<?H9+6+!ACA2A>8*C#7C=C7'+>3$!>28-;D?1;<>>@=8,B.@*4'7.*?.40??'E*E?*4?<BH(/7)<<4GA0>)&5D&80!C:7;.)<-=".&E5'0203@'%:'4$()- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T0G30G30A28A35 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 145 r71 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11281 42 195M = 11476 323 AGGTTTNGGTANNCCAGATTGCGTATGTTGCACAGTTGCNGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGNCGAACGAGGCCGCANCGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTNGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGG ##'%")!)%!"&##++!*(#!%()+!%%"'#(&*%!$($(&&*&+"#!*$*"!+*"++*))%$+')#&!'(*!!$)#$'!#)+("$*)&!#'*"*)!)+&%"%&(*+(*#%!"!*%&&(%%!$)(+"'+%&!$''##(&!&%)$%"*!!)$&#"&$%!($$#$"'+)&#%*"#%'#"(+(#+%+#(*+%$%"#!* AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1C2G1C2C0G0G0A0G17T7A34G14A52G52 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 146 r72 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33063 40 56M = 32870 -249 CGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTNA D74@C$/9GA6+A:G>1G#+==$>D3@'8!#<0$:;H9"=")%)/1)HE<+/4'#' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G1 YS:i:-23 YT:Z:CP | |
| 147 r72 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32870 40 77M4I53M = 33063 249 CCGGATGTGTTCTGCCNTACGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCNGAGTCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGG =<)%C,;1D,4)H7B%!+>.&C&$43%E%!!5/D*CAC@?&'!)3+B5D,C175B0#:3B?6,-<+#/H>D/14$*,,7<*,.,"$E-27"//>,@6*9>;7(5FH;(+8C<A-44478.,+'E-/-7,43>%' AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:16A1G57C53 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 148 r73 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45395 42 73M3D100M = 45339 -232 TCTCGCTTATATAAGGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGNACTGACTCGATTGGTTCGCTTATNAAACGCTTCGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGNACGTCAG F@/HA++6"B.@&4*(-2/,15+=7!@F/.8)F0&>53#;E,:?5$60"!%:)H9?+:*8):B:2@-+7G//:92@"$37#=A.$/:6":7%B#7/%,+9&:G'88/7>7!F&<*6H?#F!"+B$,5%#?15?'A=.2CA4<;)HG/H#BCGEA,??817>"&%D#G6&;/@@ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:14C24T23C9^GCT92G7 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 149 r73 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45339 42 56M = 45395 232 GCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGNAA "8("25;&5<=)*C#G??*2#H(7:$=B/;!?B/<%3@+/$?95,/399H%2G%#A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C2 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 150 r74 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41612 42 72M = 41492 -192 TTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCC *B-8&)B5C:?*="1%CD!A1D8DB.*&E&!6/=G78EC4:+,"A=68A%+0,>;1/:913<%.9FD4-8$1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 151 r74 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41492 42 47M = 41612 192 GGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAAT ,%G$"0()0)DH/85A&<!"'0A,8'A0=:?*H=#B<C$<$5;0G52 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 152 r75 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40106 42 85M = 40344 321 CCGTAAGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCT H5'?5,99H,#$D()9-,D@#-.B780).?:%F>03%=F09/7>:E*'#!*".8$-A3)15@(6$0&.7848>18$#?4D:5A49 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 153 r75 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40344 42 83M = 40106 -321 TTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAANGGCACGGGCAGGTCTTCTGATNANNGNA !*($'+*+$#)*%#*(*'#)*)"&'!+(+('*))%'##%!''+#&!%$&$#""%&((&%!++")('&&#$$"!+""#&#"*## AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54T19G1T1T0C1A1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 154 r76 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28525 42 56M = 28383 -198 TGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTNCTC A%>*8&=;5(H5+,1%6!0.$BB.0!A.<.?CH0*.?4,9+/-!62B.4$5/2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G3 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 155 r76 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28383 42 61M = 28525 198 NCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCA !+7-6!&G)G04;!08+*@@0:;.4&3D+(*2.BCB59-&=@704!C'55+.85,:76*)C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G60 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 156 r77 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34824 42 208M = 34689 -343 GCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTTCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTA D,)H$+>FBE8@1@G&$'7!8??9$-F@9&/G+B?24>BF<"'!"<2+(4;B(B&:=C4E#>B58A.G"C<;$D'C'*)+B)F#:A%9>,D!&A8;.8DGA<;!G7'6B&!)D396F3>$0.#A$67"11>=7<G#B9,DC4A0*.+.'6@CC$-:E9A@D91(;@<<;&5,&$(B7)'/#H7$@%"C>E.(,F08&*#)<5"=AF8B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:208 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 157 r77 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34689 42 135M = 34824 343 NATGTGCATCGATTATCAGCTATTGCCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTATGGTTTTGTNC !$7#C=!+."FA-93D9,9FB"!*'3**;G4'$;0G&3)8!9#$0)/#.4!2,C?76?F#6D4-F7@,28)&0+;:,77*G1"5)0/;:02H886426:H/#4%C))7$E4H5D=F;H1"(FF@EB$A=)"7.#4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A132G1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 158 r78 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32516 42 141M = 32712 240 ACTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTNCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGT "$5=0,(GGE8E+.)(B),1:(485*?125HF:D#&$D*CA02!>&2E":?!C8.,3*8$:,04==;<,')9%/#G5G.!/3(:*!47DC4.6<$;G:7";%#"B?E'><1!*A?.G@B</'#285>+3'0:FH6!'35=B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G86G53 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 159 r78 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32712 42 44M = 32516 -240 CGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAAT #%5:./@HG?56:$%#1A20.3<H#'*<7(?9;?C'':D./$+@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 160 r79 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17215 40 96M = 17076 -235 TTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGG H>'$&B/:E%4="=?0G18;?9!#@D(!:)==7%7642&0,8896BA$?A*@14'G4:1<D>!1"913;'(8AA/9//1.,*D(;A'!&2H+,@&D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-33 YT:Z:CP | |
| 161 r79 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17076 40 39M7I47M = 17215 235 TGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCCCCCAACGTCACNGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGACGTGTTCCTGACGGGG 2.'B"?5'5,DE,!<?825;.$%7%*97(9:?3B!%$==.A4GC*62EGAH/>%,#$8B>4&032%*9!@2&#&@8'3;<==D0>="#%>7:B AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:45C23C14T1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 162 r80 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32217 42 98M = 32217 0 GTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGNTACCAGCAA D@)@$H'-G42+)844$%>7.+,#)=A9"-!<D;<'--,GE-);%DG4E);=5,H49).((GDH;,;#>0435:!*9@2<#%*/AE/"G%/63!5'&/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88A9 YT:Z:UP | |
| 163 r80 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32217 0 * = 32217 0 CCNNGCAGNAATNGNNTTACGCNATNANTNNNCGCNNNACNGANATNNNCNNNGATCNNAANCAGNT """#"#!"!$"$#$!#"!!$#$!""###$!$#$$$$!#"#"#!""#!"#!""!"""#"!$!#"#""" YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 164 r81 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25685 42 162M = 25847 204 NTTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATAAACCTCTGGTTCATCGAATAAAAATAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTT #'B=;G4<5+)>4:H5AG$@-,6H8+*677.C-3A9H-$++>*(F)!B*1.@)#D7C1,";G!-;233DH-/$-*(2!37D?-0(B67C86)A6(D94.FCB2%B)D:2A.G#6$53#'6$9A,2$7@<-&F$(F24=A<0,:3"6:D7*+3,9&''EH#H; AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0G101G23C34 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 165 r81 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25847 42 42M = 25685 -204 GTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGA "+8.5FA5!*"(33%,!2&E>0?:;->#!E($5'2"E7E9#@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 166 r82 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9916 42 83M = 9763 -236 CGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACNGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCAACTGGCCCACGGAGGCA A1>C@07G:,D@G31,-<@@F*B#4-"+.-#)/#D3$2:91D-&07)D,B>-@?05!G,>A'>-*>@=557>0ADAHH9DD7$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A23C16 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 167 r82 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9763 42 81M = 9916 236 CTGAACTGTCAGCCNTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGTGGGGTCAGACAGCAACC 5>@5B418('A&6:1.%'(F/!.*)=E.$D73>6&@'9%F)'?$)CHG)01%@G'.20E$.B%C2/H(:7<A=.F8H?G"; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C48C2A14 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 168 r83 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40664 42 63M = 40421 -306 AATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACANCAAATCCTTCCAGACCC 70H>2+-114A/.D@3B@H#>$73!D6G:=7*G)BC)EG,$H@>)6:F9.(+!H.E!+(:F,9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G17 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 169 r83 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40421 42 91M = 40664 306 ATCGAAGGTANGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGTTTGCTACCAGGGAAGAANGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGG >35:#7!#D(.@>D>%*D#0.AGH+-)86C''#?=4-(BA91;("2&,+/6-F&+4827*.F"&,31(3?/701(;4>$#HG/=4'7CB.G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A43C36 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 170 r84 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9368 42 151M = 9561 297 CCGTACGGTGAAAGTCACCAATGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACNGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAG *(&!+'&+!!(##()**$%'$+&&!()'!$("$#"%"''(%+%&)!#""%#*'++)%)($$&+#"!%%"*%%*)"&&%!!("'(%!'#("+!($'#'+#"!%"*#*!#')$*%+')&+!"+&'%)'#&"'!#'*!)$&"#%%'$&*&'&&& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C77C69 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 171 r84 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9561 42 104M = 9368 -297 ACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTNC *8:,%?'.>/+=6"D5?@269$5-'4.%%5+D1H16BB@&+39:*;,$/C#;:=0":>A95=@E?@9?0,?(,63--F;)26&(><&-5$,&F'9$4=75$9!( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102G1 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 172 r85 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12258 40 47M = 12424 238 CGGGCCGCCATAGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGC @39+G=7*2'"%*+/$<)'A?:"9;$&;$!G"6,/E$.&=.$&-2>2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T35 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 173 r85 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12424 40 16M2D54M = 12258 -238 ACTGGATGGCAGGCCTAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACNGACAGTATGTCGCAGGTAA <"H4<8;2==<-G(D<*/F')'2272'#F=4H#(,.4!2;.+37$>9*-G!!!G5H%:+0'6)''+:HG7 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:16^GA34G19 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 174 r86 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14994 42 50M = 14769 -275 AACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGATGTNNTTCATANNC )!!'+'&%'#'+*(')'&(%"($%(*#"#($"+"%!&#%!")%&*))!#$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:35C3A0A6T0T0G0 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 175 r86 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14769 42 209M = 14994 275 NCAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGNCTTTACGAGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCNGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGNCGGGCGGGACG !(?-),<)&(*-F35'CH#$5A59<)2?$C-/A:0B.D5-GB8D$>#+2/.)?F8$$+6"1G8G<5>4H-+A-/:/=#?)G#?F*>;!E%=:67;)@#G9;",C4C+$FD4<&40H)9+#-DGD1HF'?B*!8'D#@H1B@="G91!;-+1>E8B@%66:9B(;H'=;&EC+:$.#3:(1??G1-$G6'8=F88%%F3;?8,"1B$.;' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A56C7G95A35C11 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 176 r87 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44008 42 46M = 44154 324 GCAATNACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTNCNGTAAGCAC *('&&"+++()$&*)"#()('#&&%$$'*!'*"!))$+&)#%))!& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C29G1G8 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 177 r87 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44154 42 178M = 44008 -324 ATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGCATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGCTGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGNAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGG #CH3//7-;@F<E;.F2D=>))-94E:"H590B9?-:4G%(08:A5A7D=C!(:667)-8%,D:&!80;!G13HD2C5H+"5E7:8+5G9<>?;C30../%)@&!!<9))$6)=6,*!19"2A:0BH!<)=AB5G%#>%5-.%9/E*AH(6E<%,(=.*4<'*@GF5#/;/4/HE7G& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47G34A59G35 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 178 r88 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46790 42 59M = 47019 284 GTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGNAATTTCATATTGTTAATA $#D96.?@2?DEH$72!8?%E6DB'92D3&B6&C-G>6<+F?+:!8*.@7'F!=#3$4! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A18 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 179 r88 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47019 42 55M = 46790 -284 CGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAA C%H#+9?C$;=+3%+);1'$=?:H<35*"4G)6$@9AE;%)5G*FBC'=E"B89& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 180 r89 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26939 42 180M = 27119 287 TACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACTTATAGTAACCCTTAATTNTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGTTCTCTCTNTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACAGGGCATCGTATTGTAGTTTTC =4%F6:8(7C$H=56(*.C(*'!*<)*'-.>"C-!%&))#F9G?(6G8#D:C(=,G"%>!#?"A@343&(-*9/>36$76.&(C,.=!B.5:13)BF-%+*49&=85&?H-A&'&75F"1;:(#%<GA=@>4%=423&FF84EA91451F<=,:1@1$!8HH*07$FFAH*==71/;0B6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33A17T38A7T59G21 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 181 r89 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27119 42 107M = 26939 -287 CATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTNATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCG ((.->!!<3A.,<B=2'&(:/'$8E8+"A);;73B&,>7<G48EA@!,H4/4-303:-$H'>H2(!5BD!>>;"(6(G->#&"B71,3'8B9CH51*2E?B56;=?9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T67 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 182 r90 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35263 42 228M = 35157 -334 NCTGGTTNTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGANCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAGAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGNAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACA -4#"C>D))*>$"F6G8(:FHB=(+?>$3$*$5+$$5;FF=D-;"<FC"-7@.&(!4@3D+HG6&GBD/$<:0!1E(98>6GBF7A*D@B-0"4$F:7H$7D(;1$,<+?.H$E&A946,"5C@/G?3(H(1A*&-+("D"*1G%,?>AA.(6D+1>3H(3<16@'F9/7.F4<(&H754DH%9<+F&2.)"F5,A>7;!9=%;GC7/E./?>4C:A$(H=9@>$@!? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A6T43G102A35G37 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 183 r90 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35157 42 104M = 35263 334 TTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTATGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGNATAGGGCGGT B#"A;$=9@9@"#)-,2$B>#0#*(/7>)36;9$'=:,1#->B:<974$?F'H;2+3<!+(@4H,?90BE!!6/C@@A,!6BE**9!(2#D;9#*(1()+&6@; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A58A10 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 184 r91 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13702 42 41M = 13477 -266 GCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCG 9.:6B-9449.?:-''-5?.,5((G.AH&;37<$2H/A<2# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 185 r91 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13477 42 64M = 13702 266 CAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTT 6B3*&,7;&+,?8BF&61*?(0@A/3:?&84,:G3)8$#;DB/C&((8&+:618,@D,*2++6/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 186 r92 77 * 0 0 * * 0 0 GCCANNCCCTGNCCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGG '#&*'##%*%'%$)&)'"+&(%('+$)&'*+(&*'&$'&)" YT:Z:UP | |
| 187 r92 141 * 0 0 * * 0 0 CAACGGCCTGCTCAAGACCTTTTATGGCCATAAATCCCCCTTTCAGCGGCGACGGTTAACGGCAGGCGGTACGCCCCGTCCAAGCCAGAGATGACAACTTCCGCCATCATCCGGCGAAACCCGATCTACCCAGAAATTTTCCTCACCGATGGTCAGCGTGTCTCCACGCCGCAGCTGCCGCACCTCATCAGTCCTGACAAACAGGGACGGGCTGGAGCGTTCAACGCGCACGCCCTGTCCGGCATAGCTGATATTTTCAGGGTCATCAAAAACACCACGTATCACCGCACCTGACTGCTCACCGGATGTAATGGCGGCTGACGTT 2*B6-DF"=.4F$.F)2H0%A*@;13:D@.'>1.*%C)*B7E4F$D%:GA$B(#8)%B65D(>GG=$F=?6<G/GD,%+0##,BE50)!?"-.0!(>>,#3B==->1-64'!!*4E%&BE3;09/CG262F16<99'+2GEF)H:2D-.@240@'#H+;:?+,(.HCA-3"#$4*7E>:4+&F(#,?"C)E,3)6=!1E>+'#(+!<4<?1++44@0;+#6@!3E$,.1A75>1"G6>71$&7/4.9;BA!'!&,<C&56H/#79*(8"H",("72B+<$:!7/;-3)7C7"6.AB&-H(4039G>F-4@20@(3,2,CH*!-1H YT:Z:UP | |
| 188 r93 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20582 42 78M2D57M = 20435 -284 GAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGNTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCNGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGG $(8?C8>=<E#<4#E5.A.=,,;%,C356&;5C>60:@!,B6,*C!0.F:"%1;HFE'%*?,1/#)#"4)=')F8;>&3?5C8A,:'>=!3E@B?9=87F@&B&/"57=@$:H0/$>4B2H'C-<$.?B&0C1A; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:28G25G23^AA57 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 189 r93 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20435 42 44M = 20582 284 CNCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTCCCAGGGCGGCAAAAACGT *()(+&(!!"#&&!%&'$$$+'))%#!&&*%*$"*+!#&$&+## AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T23G18 YS:i:-13 YT:Z:CP | |
| 190 r94 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18965 42 22M2D42M = 19204 284 ATGCGTAATNTGTGTATTGCCGGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGT ,'-05"ADG0$"93,%?5C&,A-1F)A+@CG7A,,/33G;/8%"&'5/;,E60!'B;BA"@3/( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:9G12^TT42 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 191 r94 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19204 42 45M = 18965 -284 GTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTNA $1(1DB?:-?</;8>5;@HF=)1FC!&!/4"H151H6>4B/1/$) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C1 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 192 r95 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44126 42 277M = 44079 -324 TACCGTGGTGTGGCNAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGCATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCNCNATGTGACGATGCNAANNNCANATCNTANCC ''&$"$+))"%#)'#!*+$%'&'&$!$&+%!+"&(%#)"'&+$+'#+(&")!$*&)'+*%')$')"**##%')+))()&')*)+"!+"!"'"#')$&$%&&'&+)+#')'$(#(!+(*$'+""%#%!#*""$&&$##!&+%&(($)*!"%$!*"'+""#!&&&((("(#'&$*!(+('$"%!+%""()#+&"*(#&+)$%)!)))%&!%*)'#"+(!!'$$&+"$$#+$***$'+"#!##"""&%#)(*+$&#*'+&(&%")"#!(#""$'!)'"$' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:14A60G168G1G0C11T2T0C0C2A1C1T2C2 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 193 r95 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44079 42 47M = 44126 324 AGNCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAA &$!GH#"$CH>66,@1=C1@51;F-4@2/6;H.9:'B44&(-,-E%, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G44 YS:i:-16 YT:Z:CP | |
| 194 r96 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5776 42 92M2D32M = 5902 280 CCAGCCGCAGGGCANCAGTGACNCGGCTCATACCGCAACCGCTCCCGGCGGATNGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGG (<(8@5'D<".?HB,5<7:-G",:E6G32C$AF&#&E*@%*D5A+@94F;HA-E%<081%A)#+96H#5CB:=DC:0A8H+@<$?@F$/*H127?$H)763D*8!:!B3!G@7)<:0A"?.H$= AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:14A7C19G10T38^AC32 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 195 r96 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5902 42 154M = 5776 -280 CACCACCGACGGTGCTTCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCC ":#1&$='3%9;1E0)>7:9-.F>9F$',9>>A#9B4A#%6(<4&211D-<#,>B9!C,=F>67?B%F-BG8>6&G8(B.B%--E>2@C>4%G>)/B12$9F07%,DE9:%B?,,@C(<?@BF758/H/<#9D205,G.4,B=!F/0;,:@)9@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G137 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 196 r97 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26003 42 40M = 26003 0 TCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGA <1.:A@?-5%D.-,<43F;#53<$94*<CF!)4C$',/G3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YT:Z:UP | |
| 197 r97 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26003 0 * = 26003 0 TNCTATTTNNTNANNNGCCTNCNTTNTTTNTACTNTCCTTATAGATCNNNTNCNANTNNCNNANTGGCGNCCAT !"#$!#"$#$#!#!!#!##$!"!"$!$$$###"#$!#$$###"#$"$!$!""!""#"""##!$""#!"#$$"$# YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 198 r98 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41672 42 50M = 41780 215 ATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGA F1E"0"C4H6#1/-/:9=DAE"%0E0F?!34D.(,"E::)*1$.DBD;C9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 199 r98 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41780 42 107M = 41672 -215 TACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGNATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTC >8@#'G!6<52'D7G<'HH/&HAC5+DC5$342G7'#FF?>'6,@.6#/4577-,7;D3%E$*C65%A.9'A92?86H!%:+;<E"*);3:28;H%>.!3BF1CEE: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T40 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 200 r99 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34299 42 37M4D51M = 34134 -257 TGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGATTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAATAGTGGATTGCGGTAGTAAA D<99F1')EB#4*31AB-A!6B9<&-=B?5($A0GB@1?F&7"=#(9B9B5)';*'B":A!"'EA"B:AB<2$3680&70*='!;G@> AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:37^ACTC51 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 201 r99 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34134 42 165M = 34299 257 CCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGNCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCANTAGTCGTAGTCATACGGATAGTCC E-'<B,8""&4(9D$B&F#&=:!.HH@<,"1G4<>,C'@)+03?%H?3#"D1<E8!DE93A.C/"(%2?B-&*C5=A'F))-#G@7-6H-F2A61)'6-H$+$-E16>%?><2@EG4++D(-+?-0!5-!A.>0&B2827+?>&=6;.2C53B2D#<,.73(B9; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66G73A24 YS:i:-17 YT:Z:CP | |
| 202 r100 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1186 42 62M = 1248 244 TGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATNAA ,9/:-6%C'7<61F8)>3A<!BBGF%HG<F@)H?,:=9:8!D#3!7".%:A8:,86AFD=A) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G2 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 203 r100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1248 42 182M = 1186 -244 CTTGCNGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCTNTCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTANGCGTTTNCATGTTGCCTG =HH88+"?F--!=937/&2"&.D.*7@"A'5*0?.E,7CB@C+!)9#'"FG',5H53?&!&E/94'-)=F-/C0))B+E&0A";D<76(E=..-*D<-$8+3(=8+7'&'+H.10>A1*3.?;)6.F'$HD:5)F/78/.:9,54:!./G?>";:!6&>..6*6&0:B+H0B''(.9@(A$? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T83C0A72T6T11 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 204 r101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26949 42 42M = 27169 287 TTTCAATAACACTAAACTCCAACTTATAGTAACCCTTAATTT =&A"1F,&>019=-B:F4.DHG);'"8;<0,(D;8%1,EE;> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A18 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 205 r101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27169 42 67M = 26949 -287 CATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGC $''!$(+$&+&&!%%%%(*'!&'$)!*)'(+(+!)%#%+!($#*)($"#'%&""$(!!$&'*%!!"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 206 r102 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10418 42 118M = 10302 -234 GGATGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTAATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGTAGGGG )%*'&"&+#!'"#'#$!''#"%(+$+'+&##%#"(+&&)$'*$()%&)**+**#!$)"%)'&""#((!&#(*"''#**&&!"&%$#(%+*('%$&(%))#*('$"$$!$$(+&'$%#% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G82G25G3A1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 207 r102 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10302 42 87M = 10418 234 GCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATG 8F92@!A1#:2'(E"%2D1??*!,()5'@4=%.2,=$"$<92/50D0,#5+C96E;E6.-EH7(#FF)CA,FC)'%/5-*)D*$''+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 208 r103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2968 42 222M = 2783 -407 GTGGATGCAGCCCTATTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCTGCTACATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCNCAGTNATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAATCCCGTGCCTTTTNCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTT #>D848?D?C-:("/,<7'A5=!DD:3(H<.2A!?@C$-9$>1;=?)(:"1%$.!F&?;1#!'C8GG;D0D!8C#);8:/5:9B2@)!(<C.9#,,/H'"03,,1(4H.-9*9.+/8,G6%#H7"%!EA1E$6,.BDH+8='7@);0AH;,5$E,H(@06&@;AC*GF;$9792@!68&5=G.-A3'>D")="=;A+!#<6@*'+@F2,&76D4?712C*9: AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:14G76A3G34T4C41G12C31 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 209 r103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2783 42 185M = 2968 407 GAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATNCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGT 6E7;D-+4.@=%"@>2,5+=5-0;=7A//0'6=,B"@%@;<#,#+/@$?';9>C+>(#EA&6:?(E3!>DB"<4H(FAAE$F0-//G8C<CE/#"F"<=!+4%2!#FB7,(:#C9.(D)5"3AFB$A!9HC*#)4-A'"D?A<4C.)%,G-?;0,&71?"+FD>>'.=D-983:5<%+?+@@$A* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116G68 YS:i:-16 YT:Z:CP | |
| 210 r104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6211 42 121M = 6087 -245 TCTTTTTCCGTGGGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTATCTCTCACNAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTATCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCG D&!)9)8=+5//G17(*!<@B;3-.><BB'7F;HG%E9)&F6;'#A",F&&E/</F&44$@A?FCF8/'9+67,H,H6<4H((5+6>7,-CG2:'8#7:'?61,G>G::31-<2=F,#(9E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12A38A33T35 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 211 r104 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6087 42 63M = 6211 245 CTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACA 5%<F?:G9&5:F$9@6CC;7-$EBE-(8<1*(*%6.F9G,#%''E+HA*8145-?2#")><4G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 212 r105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13534 42 148M = 13434 -248 TATTTTTTCGGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACTAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCNAACCTGT >758A8.0257+"$"#=!5"H6#+-#8.()6,.G4?5&5//!6HH*,5@H"/>:G6$',+'!4G&:#-)(!:6+5=0+);=2@E";="&3*A)?C1*:DC49(G,<:#1/D.#$F+$'"-8:A6&)+0!4"90+89=*DF"0H:):#+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T103C26T7 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 213 r105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13434 42 55M = 13534 248 AGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGC $8C%!'"1D8E34""+H#&.++9G+86?.+")8%2'6+G=C-D>!3;B%A!2=/0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G54 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 214 r106 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41695 42 159M = 41534 -320 GGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCANGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATNAGGA D9:,%5;<!&G:6<7H+E1F(C%5!D6!+/'E./E5</1AD3:7G)'/6$>84E&101?C$+(&H2$9#(6%94>?)?4:H<D4!D=194F6/E.1H<A!E8B)0CAHGA&933:*4D,(+5*8&8*.E8++"@G(<7.=D/@8-?B@3-B&AE%H)(, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45T108C4 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 215 r106 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41534 42 161M = 41695 320 NGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTNGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACNTCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGA 1,2"E7')@?H@"-*7"57$E6";7:>!3#&B.GFF=#$%C%6829)<4E%?'>45&B.F-6GB*)!#77?H:%8):./@E0)F23+4!<C45&4FEB)-+"0$BH%2#$/2G=@E8<&1E>H>.5="0931<G;;GD(#G&:3-$C%75(0(9=$D*,:D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G49C43A66 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 216 r107 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20156 42 71M = 20354 263 GTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCT H'+$$@/-F/5@*11.-66B!:,1':?-8B<0!0".."03=D;"FH68C?D6.9#FF'A)+E%1G"7".HA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 217 r107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20354 42 65M = 20156 -263 AGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGNAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTN ('#+!(*%'%)%&!('&)!)+*'((**#*"%!!!*"""+'$*#$'')+!*!+"!"#)')*+'()! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32C31G0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 218 r108 77 * 0 0 * * 0 0 CCGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATAGCAGGAGGAGTC (#=@#'21E826H")617.F6$,;9;#H)&!@&.DDBCH'06F4 YT:Z:UP | |
| 219 r108 141 * 0 0 * * 0 0 GGCGGCTTTATACTGCCCGACNGAAATCCCCGCTTTCTGTGCAGCCAGCGCCTGTCGGCTCAGCGACTGTTCAACGACTGCCGNTGTTTTTTTCGCATCACTTTCCGTACCA 8D8+*)#*DF2G!2+E-/5)@;4%&/46C:%=A,)9*",E7%;&/.1%A.%;G14$5+A2(85(23#1<8D;:"!@B?G@"'EH/*@5F%7/-(4G87B9D%%2,.C,7.)H YT:Z:UP | |
| 220 r109 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6323 40 74M = 6529 303 GCGATCNCNTGTCTGCNGCAACTNCTAATGTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGA #)'!'*#)"$%$"'*$!#))"%*!$'*%#!)*#++&#!*""++*)!$%+&!*#"*&)""&$%&'&"'"#$!%%! AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0C2T2C1G2G1G2T0C2C2C0T0G3T44 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 221 r109 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6529 40 97M = 6323 -303 TTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCA $+)?C),BE!7.6!B#E,@2"*":&65;%/'@:FG"B&B!"#F/F386(F)4,>513BF+&28@-7/>%<#=<=5E694712-/A%@#<9>"'%%2; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-22 YT:Z:CP | |
| 222 r110 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8174 42 152M = 8174 0 CAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGNCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTA 6-#)1("FA6GA'86008H6BD?@#G3=@D6%-;84&>*A=)'B1HDE*'8>E4<0:9=/8B!*1,5G*<"AB'<?C=%4)#/?)B7!:,9'#D4'1!FG,.7&C8C!%F-8-,9/(>=DE.94;3'&A<!!G"82>;@#$8;:'DG-4??G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93T58 YT:Z:UP | |
| 223 r110 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8174 0 * = 8174 0 NNNNTCCNNNNNCNTNGNGCCNNCNNGNGCCNCNNTNTCNANGGGGNAGNGCNCNNNGNTCNGNTTCNTGNATANNGTAANCNNCGGCNCNANTGNGNTNTCNNNGCNACNCACNGCNTNNNNGTNNNANNNNNTANGGNCNANAANCNAAGG $!"##"$!$""!!#!!$"$""#$##""!"$#$!#$$$$$#$""$""####"!!!"#$$###$!"$"!$#!#####!#!#"$#"!""#$"""#$#!#$!!""!$!!#$!#!!#!!""$!"#!$###!!"""##!#$#"##"$#"#!"$"$"#$! YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 224 r111 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37412 42 113M = 37683 314 NCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGCGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAA #6,@E:)B#7HA&F>>@0<%4:#:E+'."**8.9.=@)94029+(@>0<;HE+H)$?73!<1<?!#+:.6;++A7/F),E60%H=/$1$+30&5&"G5&2!A'::#>E04;,% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G112 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 225 r111 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37683 42 43M = 37412 -314 GTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTNAATTCTTCAACGCTA 869G0'=*61F;1DF.4:"B(A$060*9<=/1;-H8.(*4C4@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A15 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 226 r112 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31655 42 275M = 31470 -460 CCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTNACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGC &)!"&")"+#*)&)!(($"&*&+(+"$(!'%+"(%((''%(%%#)!!!'&$&&'&#&$*%)+$%!!!")("'))#+)(&$*+%&#'*&)"%)!$$+&)!%'('%(&"()')&(%%$!!"*)+%++"*")#(*&+%&$$'%""!(*!'+%"*+"(*'#)#"+"'()$&)#+**)#&(%!%'#!(()+!&!$)*+&")'!%+%'+*+'!*('%'*##$(*(+('*(+'*#)'++"!(((%%&#!$#)'&!!++$&(&"!!*$*$+)&*)!(+$()+' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A200 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 227 r112 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31470 42 185M = 31655 460 CATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCACATGCTGTACTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTG >(AHB21.(!3#E;6D!5+"4A%,!F2B4=B9EG5/:A31G)C)%7#C'!H7.4*C<+@9;4+@2$*:A556F/#,>3%%,-$=E7<8E!B2G,3+6>#3EC/9'B7%7-:7(075)$'5.(-AE)%+<(:=,12"6!;:1@?$(9H=%7H.(.F2E7,1==<=7#=@5D0H$?@,B:"3CD""! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:185 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 228 r113 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22900 42 157M = 23057 197 TGTATTGGTTTATTGGAGTAGGTGCTTGCTTTNCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCCAAAAAATATATTTATCTGCNTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAA @"!)H3,"8)$4=%D8%,,(G7.@%(745)3</=:B=15<!CD"#6;D>G7G#":$#G(BF8<F-$#&2A6:=*0041"65F#?634@HH1DH+9#G:%%"%FB)'25540)(&6/!@G,+6>8/+333,%A4=G5D$;:4H3$<(17'."'A!3FA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A10T92T31 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 229 r113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23057 42 40M = 22900 -197 TTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGACG #'+($'#)!!(+#!)&&'"#'#'!+(%+"(*"%*)+'+!* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38A0T0 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 230 r114 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41280 42 97M = 41150 -227 ACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATNGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAA <+&55F'68:+)=$E1,9B!7&7'G"(?.9A(H<*".9&73<*:%384,H5#&#*2"H,("C*#+B,/E,:99=C>!%)9.57:&59*.(59+? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G73 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 231 r114 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41150 42 130M = 41280 227 CGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATTACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGNAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCA 8#?BC=6./>D::D-3=DA/)#5;A<;3A%'C@./%.4,82=7E0$28*(;AC&:A>8;(1412>&.@1E-2%%8!/<#F6D8/98/=-?#(./DF'7:'4A"#8A56@D'@@+0#-H8.CD5+G2&1/G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87A42 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 232 r115 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1313 40 77M = 1449 222 NGANGGAGCGGNCTGGNCANAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAG )()!()#!"%*'''$*(%*&+#"$#"*('&!!&$'!!+$*%&!*+!#)$'+()(%$()'")%&#')#+**'*)'&#* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T2A2C0T3T4C2A57 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 233 r115 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1449 40 67M4D15M = 1313 -222 CAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGNTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGTTTTATCTCTGCGA G35)A)?D01'><*E-4F84D*3:195*5>1A62=714"0*55F5<04$1+1,4F#@E.'F&-!H25749)G815E&-?+=3 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:33T33^GCGT15 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 234 r116 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43272 42 289M = 43562 524 GTAGTTGGCAATCTGCACGGATGCTACACGANCCTGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACCAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGNTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCANTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTA A/F;6-?G:4&6*/-.H"@3.;6$)#?!$A'6*"@*:!>H=%41.9CE740&4$H'5GDF?'D,?HB;")5<:#%!&E8%CF>5!94D%>,+H>@&1F9C33'-&+)6.25#@G"/%D;7'10!BG/G0(*%EA+,#-*3(,8,->'&&7(&.H7+G*-A'A/%C>7300E&,.*:><+E92>,>,41<:71#%3+7+0>C6.E.()#A65-6+E<7G*A298B#.(%%#&G')A'*:,8*(>&A=093="?6BB2'E+8:F,-55DCC"C'%D$E?GH5G<6.*A6&E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9G21A37A54T102C61 YS:i:-17 YT:Z:CP | |
| 235 r116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43562 42 234M = 43272 -524 AAGCCTNGCCCATAANGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGANCTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGTCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCNGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAAGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGNA C(*!@&"+;/=4@)#3"'.@;/<(HG)@,9408-(@BEA3,;G/9@9&"*1-H0B.9H&!?4)0%*%5>G>!11;!;=96H!9#9F'C>"F)0B2;2'$1@CC0B4&C<CB&%-/8(E13"$4GD8@*8/1<A&8B)=&9/*7)H?)E*:*DH3C-DF4>H%,@@CH,.?*#!-578+@B>:7FDF'-:>*C0'0C=630+8(3%/9788>8@:$7;/797=,=)<;-.B;3DG AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1G0C0T2T8A26A72C41A35G38A1 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 236 r117 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9396 42 115M = 9525 262 CGTCNGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGTCNTCC 62#?-#6G@G0B9GE1/*@(!=?$C5=A;?1/?*6?5=97C427:8H/,.(=@*#!69+"G1<9*E;=6:)3%1&(=((,0=?5=*<'&:5-/=7'3$"!:!8F1:F?-#C?1;" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C104C1T3 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 237 r117 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9525 42 133M = 9396 -262 ACCGACAAGAGCTTTCGTGCNGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAANGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTNTATCCGGTAATGGTGAGT +=:4;;F4'8.>"*11+:8)(,)DB3FBD67$&$#E.91#5++;8BH(C%%-D?894!3"D.24-28544450?6"1E-#>/7-!@/@$++?,5,E<C?H:.>09?-0C>*D:E5F?H5+54%+.D&=G,EAE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G59C33G18 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 238 r118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45941 42 62M = 45749 -254 GCGGAACGGTCAGAGAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTA H)<A@F>"0DA6,G&C)C3'$B$?GD<:+.8(D,'1@;.(.7?=2A>4=D;&6"&)67)*50 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 239 r118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45749 42 40M = 45941 254 TCTCTCCGNAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGAT 2+<(+@0C85B?EHG*7C>.:<95#,974#5",G&<GG;D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A31 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 240 r119 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10336 42 184M = 10268 -252 GGATNTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGTAGGGCTTGCCGGATGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAANGCTGATGACAGTATCAGAA !A.<G=BG(2,E(*59.D%A3&E((4=&1*781;.!#.H611;*ED5$6$?,5"'D!@*=)$B9<$+D0GC89:+D698@/"2*=%$))!;+;467-)H@2C+"D0-33D8;(0?*+(@:!."'$"#@F8A(%+?!-@&D5??F,#1:<8)21:HB#/66$@(,-74"F:>(A:E'C$$1;F8- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T66C13G78T19 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 241 r119 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10268 42 44M = 10336 252 ATGNAANTTTCCGGTCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTT )$*##$'+))'%(#(!!*+))!"("$(%%!%%+*"'+!&#%*(* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C1C0T7G29 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 242 r120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18193 42 105M = 17974 -324 GTTNCCGCNAATCGTATGGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAAGGANNTGTNNCTGTAG '"&+"!""+"$"''!"&"#$'!+)!"&#"+(((!!&+"'#)()&*#"$"'$!*!+)((&(+&$*+&!"!'#(!))'#("*$$)$")'#+%##!!%*#!"%&''%# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G4C8C71C2C0G3T0C3A2 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 243 r120 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17974 42 105M = 18193 324 GAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAANAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAG :78=F$5+C'8@5@C<6B)-):H1?F3?51-1'+88C(BEC:&-:@A4)004B>5F)!G883,01&5&,G@B!GF6H"??H)>0G,E)"H/=))=,.;06",;HG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81G23 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 244 r121 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25996 42 63M = 26129 268 GATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTATTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAG >0GAD)@?:7"-&"?C;6.7#?D/@=2'$A9?1,CG4<(8#%F)97>C><G>;)E+F$4FA:H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C28 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 245 r121 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26129 42 135M = 25996 -268 GATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTNTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCGTNAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAA HF@%.FC,7%<A"1:>%,==77EF".F2%(*+&G+,5H5#H4?7=3+(*CC8(09'?DE*C;-:3@.8<,D'(%/%;99*1$1.*'&<&&B#7A)/,EH:$6B-6-+HH92"AG22G;)9/.89G#-DGF$-(25 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26C50T1T55 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 246 r122 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46899 42 66M = 46899 0 ACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGNGGGAGTGTCTGGGAATAATTAAAACGATGCA :"<=39>7@;+33*"85F$G-=.@*9+(1+#>&/8..'=+C34(,#!1$59(12$##+4!"2H'6/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C9C21 YT:Z:UP | |
| 247 r122 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46899 0 * = 46899 0 NNGTTANNNCTAANGGNGNNNATTTNNTTTNNTANGNNNNCNTNNNTNANGCNNNCCNNTNTANNNNNANNNNNCNANANNNNATATAANT #!#$$"$#$$!#$$!$""#!$#""""!"!#!!$#"$$!!#""$!#!!!$"!""!#$#!!"!####""!$!""!"!$#"#!##!##""#!!" YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 248 r123 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11987 42 174M = 12161 652 CCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACG 9!#1?:HC+@?H7?%F:"8H:E(A35'E=E%*(=$F(7;5!&(B%E;"40&:C89C<%7&3@=8&&0*)DGD/73&*4:8B..D#::416":.<>0CB9$&F,:$C+*0!>1F)EH0#3-87#E():&/B!>#3C"C8>76?)=;#E2"(>)3*,C*+!1/6392<='+5A8C1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:174 YS:i:-16 YT:Z:CP | |
| 249 r123 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12161 42 279M2D197M = 11987 -652 CCAGCTGGCTGCACTTGGCGNCAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGNTAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCNGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCATGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGG A@97>)"@($5D*+&#(()+96?'/)E87A*6>0:=4%$@*E2"52+-956&0C'.E+<(',0&1/('D#$E,02;9&<0*/5?6AHF>-=3:B*(&';&-+"15>@GC!>9E;AA3,.(3,3"+D)3;6DFB>H&/!#/8CB6;5!2C8;EA7)?A@64A%+5.G="*!(C#/*C#3!D=-)('&"B2H#;%0:*E2!0!$5'@@2B*:+5':+##&""%*;"#*2':(G&33C-/""*F:'!9<0):+)?62*@;)>AG'DF@5*$73464$$F=1&&+7@,?$=5-<;(8'2!!B1DG@G(%/"H.*E0=(-('F4>21DA=G:E65&(,?8D,<"6D63G9&*(?:2)DGB0$9D#18)C:&A$93,5..#*@!7C2@<>'$5*7E)&2>F&4>.#+C$?H(:"DG$(83:!%C'AC6*:3)@#"8BD?$;,1H2$0A-2F(#@:)0#403/=4BF-+:'8:<?$"B>" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:20A47A166T43^GA33C163 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 250 r124 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34638 42 115M = 34411 -342 CCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTGCCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCA E&"$<@=02176'&3&,!72G%@)"<(@A,6"+.(=>B%41D<98H'EG7DE"B333"07??C<92/:7+)2B,7>.@+8HG#;FC(,@,%4**'E7-&.H8-:/'3568>.%24 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 251 r124 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34411 42 181M = 34638 342 NNCNTNNGNCTCGGTGGTTCTCGTGTNCCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGNATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGCACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTT %#%#%&!+'$)()"*%*#&$'!!')&+"'(*#!"&)%"+)*')%!#'%+%%&%&)#"$&"&!+*'&#')!&&+*$(&"('$)&!!(')%+%"*!#%##'+'!*(+*))+!%(*')&'$%$")'*%&'+%(++$++&)%!"##*!##$(#**%++**$')+)$$'&)+!)!$)"*)(+"%+& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0A1A1C0A1G17A52T46A54 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 252 r125 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31546 42 220M = 31404 -362 GCTGTACTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTNTGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTG 8;!"D>9;9F4?'"@DA3-@-")0DB0A@60B,6FF@>(%>1*D+??3@26*?,2#++,F=2;"8,6$>+A6-FF<CD-9:#$7;70@:-B-@2(C"*0H@E6!0>8(=EE<!/-('F(3,1'B??-/<6DC63,607F3%6?=+79::3D>,#,5(F.$":6!'$'%-1A097:A&"4"@F@C!=;0##!%66!+H@(G:;9G1<B,H=:;3#74H>$- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A185 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 253 r125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31404 42 142M = 31546 362 TTTCGATGAACTCCGGCACNATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCGTTTTTTCGCGTCACCCACAT 12%8,13<F,803>"@'<(D)B9/03A*E<#;542?->F/4?E<-3'3=+;/D(;D81#D?;EF*.D%4;BHC(//.2A07!.)5BH)AB63!6F2,7%22#$2:;8(?4<$:<4>+..'1=,=)1(286+<CF;:27/<5! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G101A20 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 254 r126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26939 42 75M = 27080 256 TANCCGCCTCTNGCAATAACACTAAACTCCNACTTATAGTAACCCTTAATTTTATTNAAATAACCGCAATTTATT E.>(13>B0BG!<)B;*B(H>;6;'+D/?-&07))/D/$;A.F?)$G7>H635A6&H*)6B4*E!*(+>%*2-17 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C8T0T17A2A22A18 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 255 r126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27080 42 115M = 26939 -256 GTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGAN <C4>7.'4@',$/%7/2&2.45#E-G5G?77"GD'15>)<9;&9&@?F-3AB2F(1045%;EF),:*@*=+-1($49+-4F)*,C9%7#FA%F,6)%D-:7#=B/)B+C#528'" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114T0 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 256 r127 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35335 42 47M = 35508 248 TCGCGGCGGCGTNTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAG 1CD,E419(2&4E<-!A=HE$7H/.!):)<+-1=F>@."D7.;?$ED AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G34 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 257 r127 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35508 42 75M = 35335 -248 CTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCATCCNGNT !!'(!(&%*$))+'(#($+)+'*$"+((#(#)"##%!!("'%')+)*"&*#%'*#*+)$#$+%)*$)!%"*''#% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:67C1G1T1A1 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 258 r128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46728 42 246M = 46671 -303 CAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGNATCGTANGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATNAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTT ;E$6+>!E,/C!)$2#+?F8.29"961G-8D/$%A/!7D5&"'<7(1(B86?0!24#>!D>,&=B%?A9GG61B#H@!G;.3.99!C$FA%;H4?683(%%.G/)=1&B7.C'(H=(30>:@)1$<+)"0/!/G<;8)*5AH'!2E2#41#$*8>3+,G?"+4?)HH.6)F?!=%(0E%5E6@=5;H7;/=%=/$$D=H*A@?;$F,0%,-6A(36,5%&G26(#@/.,+2=DE+'")'#<B/.%- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58A6T80G99 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 259 r128 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46671 42 57M = 46728 303 GTTTGTTTTGAACAGTAAANGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCG 91EBD:6:H*%%17,-FE/,&,$"3&*<C#F;5EE=%<B'28'H,=%43DGA*6;:) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C37 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 260 r129 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25859 42 144M = 25712 -291 AAAACAATTGCANGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATANTGTNATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCGCTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAAGGAGNNTGAGGNGT !#*(""%!"""#&"&$&"'&*)(&##")'$')!*$#(!#)'*#'*!%')*)*%+"#(+&&%!'(!*""('')+&%#&"$*'%'$&''#*%#*$*$!!(($)&"+!#(%%#%!"$'%&!"%()$(&%+#%+$*#"!!#*)(#&#' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:12T35T3C31A45T3G0C3T1A2 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 261 r129 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25712 42 119M = 25859 291 NTTGNTACACCANTGCGTGCATCGAGTATGTCGCCTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAAC &@9@2A&7-)B#&C.#B1:>4(82(%D0"(>1*)FGH3"+@.&GD.$,'0?1$>%4E>+4)=B0200G#G,*E@5/@,)@E77.H+-'"B9D3H=8%&;?(HG<7.C>G8E"C%!5#05 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A3C7T15A5T84 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 262 r130 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46381 42 159M = 46256 -284 AACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGNGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCANCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGANTGT $'!)%#)$%"!)*"!"$+$%(+*+!%$!%#)#')*()+&*$$'*+#"(*+!'*$)%(+*$)*%!#++)!**'))'$#)$!!+!+(+#&+*)*)%#++**!$*$'!&')")!%&('$+%!&"!'$$"#%)+#('*+!&))*()##!+*)*"+%!##!+$( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38T68G47A3 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 263 r130 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46256 42 54M = 46381 284 AGTCTGTCAGTCAGTGNGTGAAGCCACGACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGC -7C;4<4@#6F>'"=>.>7:6H3"D/,:2=),=<+<C)@80&!A08;/+7$-D4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C10C26 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 264 r131 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2900 42 41M = 2630 -311 CCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGNAGTTG @+DE&66:>F,>H47H!<$<%G(&H(E#B9E0E:F&!!4<$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C5 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 265 r131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2630 42 84M = 2900 311 TGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAG -D!A59GE*+D$B?4902?E#3F2E6,</E4%?E?%6,F/!EA/$D3:"BE%'F#8!=5?B2%:F31-40-.2>G6/B>FHGEC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 266 r132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24102 42 193M = 23999 -296 TTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCNGGTGTTGAATGNTTTCCAGTTGNTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACC &6'@H*BDA)80@?+18'0@164:7H=5F$DFAB(@D.:G6#@'#FB9((((G>D;<*!#>7&2.5(+C(2F2?,-D0&F#1)A+>>B/'/>'FA$13H3/@H):15!7:E?EE(4FE?'?B)<>G*E9!H939=?@42*:C&(GF:"!G>HH87!"36%)C"=!;D9?3B(+F:B9<F<!:8<3B&$'2:%6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:119G11A10C50 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 267 r132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23999 42 103M = 24102 296 NTAATACAAGTTGTTTGATCTGTGCANTGATTCTTATCAGAAACANTATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTTTGTC #0<0-4HBE%8,!>D,&F8$9CH@G9,>/1,H#F8&);;C<F9@=+7<2<F!+"3@G#'3<,;=?&%>/>E5$<)ED'%-DH*1?G/,61<@//!E>1"1-4D AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G20T4A17C0A52A3A0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 268 r133 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45207 42 129M = 45336 341 GACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGGTATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATG $+!!)'$$'!'$*(#*$***+$*"%)&'#+')!"+")#+))*%'$)&$*%*''$$$&%)'("))%''$%$$"'()$%'%)"!()'$&+"&*&!!+&#'#+#$)*(*"*)&$(""#+*(%""(#%"*"!" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83A45 YS:i:-17 YT:Z:CP | |
| 269 r133 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45336 42 132M3D77M = 45207 -341 TGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAAGGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTANAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGG 0%G5'&A<%E:-%?'1:;*'C)4)95,C(H9&&;EE,-7'>:-"2>#0;6;0C@'.&D&//?2AF1,.2-F)>&!+81'D+G=/#)1D=%;(1;12)C!-1<');7%6<GC4:FE,:D,?6!:A7=#%E.*DD*A''E#>8-;*)-H#G$!F'7@@E3G!A@,=FC4%C(-1)22B#07.3%=B4&E)4=9!8>(='-+F5#*1)?D&4 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:73C58^GCT28G48 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 270 r134 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17062 24 53M7I24M = 17291 272 ATGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCCCCCAACGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAA %B107')FE3;A9+#=7"<'.D13&=9E=!4D1:?!"'<$;/E%$1?-&1=1H9</@A49F7<EF"5=H!#>"&D,"8$1B<18 AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:0C76 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 271 r134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17291 24 43M = 17062 -272 AGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAG *?)E0,"AC.74;$A$;F0.&)('4B#$:9:*&E*1H22..:) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-28 YT:Z:CP | |
| 272 r135 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37437 42 90M = 37657 311 GAGAATTCATATTCCGTCNGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGCGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATC -@0CDDG-<#'AB"E*'DD+,A39B8?*G)GE.:G1;6;?!!F3;E:F9").0@=58G*)7CC#4-1(==:7)@77?+,:9F!3*9B#>7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A1C8A71 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 273 r135 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37657 42 91M = 37437 -311 TGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCA EG(($.F%>.18@'<E.%!145./@8**A!5*B("0-3CCHFH*'7>DAG+C0=;1#/H"4/%BB7CFD>#'+<HEHDA9?'A;D7GF;%= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 274 r136 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17295 23 110M = 17153 -252 GATAGTGGATAANGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTGACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCNGACCGCAGAAATTTCGGATAACAGAAAGG $##!#&!%+'*%'!%!+#)%!!"*!!%#+#&'%!&''#('!$*)#))#'$)!+*+#)++(*)#)&*&&&"'#+"!(%*!+#+('&!')*%+()+%!)*"*#$+!*+&#') AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0C2C8C44C22T10G1C0A1T1C0A0G4C0G0G2 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 275 r136 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17153 23 42M = 17295 252 GNGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATCGGAGCTGAAGCAGC ((-;7;D3'F=(/A5D0>+/*G@834,,,A+5A43E=<9)*1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C0T25G11T2 YS:i:-31 YT:Z:CP | |
| 276 r137 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8706 42 120M = 8706 0 AGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCNGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCNGGATATGNGNNATA !&%##"&$((!'&*&)%%(#%!(+#&&*)#$"(#$"#+(!$%&!!#$($))**#)#!#""%))#%$+*((&*#&+#"#($!$#((""#")$"))++("*($%*!+!%*#"')%&&!"('' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:25G79C2T0G3A1C0G3 YT:Z:UP | |
| 277 r137 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8706 0 * = 8706 0 TGGNNTATNNNCTCCANNATNAACTNCGNATGGGTATAAAGCGATGAAACAT ((#'!"*&!"(*($)'$*&""(%))!!)"(%&*""+!!)$(%"('$))$)%' YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 278 r138 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43135 42 112M3I75M = 42781 -541 GGTCAGAAAATACGTTGATGATAAANACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCACTATTACGAAAAAATTGAATTTGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCTGATGAACAAACTGGA CF1;C,#.-<7<%&>9#F.HG)1F=68F-@"<E5#)4&$@E/HEF71$;+6B(";.4):9F4)/<=AC&A8+$1D!7,E6.05(67#8$5=9F>C-7%/4*$+#BG!#$EF40E,4+DE30*--2+'.$A!3H+5!/A0!<>*/6F83,@9*?3<#-@F64>9A?"9#&A0:/"!1&>28--774B6@,4 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:25G67G93 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 279 r138 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42781 42 354M = 43135 541 ACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACTAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAAGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCNTTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTAC C1630F:(:(!??//>D/4=-C>B15E5A'8A",)3,4)A")C"67?B@5-&;,+';&0(F2/>"7"?7C;A)+,5GGHFE(?/8F6*107).F+(!3>B<:)#;=28-EB!'EG;G;/4??"GAE?$?0B;;?8%-&/0,48,$0-8<H+/6H#-@'0+62<FF;1DF*1?!'D4#0;60:F$7D$)B,!&?0+#/?&"*#;?H7/;/9#=.5@;!2':)/#69C92H?H/.8"G)78+6<!68E6CH@$%A,%<.$);?*9BGB:5/18#B%(),-F9,@A8//88>4%"3)B!A29BE3<.B1?<(,<&?/%A#6B<*"A@!&C;?2.!5;!@!'.G*H&@1/++-$):!6 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80A124G74A73 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 280 r139 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6394 42 50M = 6165 -279 AGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGATCCGCAGAATCTGGCTGAC @1;8$!"%+(A=E$9G-?>(@D%<FGE1(GE%9,#)"&?&,-4<$H*0>? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G3 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 281 r139 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6165 42 93M = 6394 279 GCGGCAAATGAGCAGANATTTANGTTTGATCCGCTGTTNCTGCGTCTCTTTTTCCGTGAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTATCTC D686D;8$;*!B)H*>8/?4C%?E4;:-+%!+42D9B"5C*0*H?D6@!:&%,HF"$B!B4=?"&?);'"/8/F:#@"@H)G8@)-B50=(9C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A5A15T54 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 282 r140 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32612 42 58M = 32834 271 GATAGGCGTNAATANCTTNCATCCANGNATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAG $*")()&*%&&*(("%)(#)+)$%+*&&#!%""++#+"$&"++++(!&$!'#$(&$*) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2A6A3T0T3T1G4C1G30 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 283 r140 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32834 42 49M = 32612 -271 ATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCT 9>&6$,B@@<4$<*8FB"-!1*24.:%9<..HD#C0D,3@?62"/#$CB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 284 r141 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5685 42 57M = 5910 345 CNNNTATCCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGA *"%"(&!$%+"$)+$%!(%$#)'')!()&+*&#))!*)%%"%(#!"!'(#*(&'))' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A0G0G2A50 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 285 r141 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5910 42 120M = 5685 -345 ACGGTGCTGCCGTTGGCNTTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCAGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGANN #,&0G5-AC:>-"DCD>+F:+<4B%',/*-96E$),HH!A;;%,A?EF8E(/#)<&"'/#B'G;5>G<=A2B"2*?E&H9,G%#?1&,9&"/.78H#;,C>,&F5>)+&8E5;.7:A4!! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17A53G46C0G0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 286 r142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26387 40 245M = 26296 -336 CGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGNNTTAACCGTCNCCTCAAAAGGTATAGTTANATCACTGAATCCGGGAGCATTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAAGACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCCAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGAATTGGCCATAC F><5&9#<&G7)18B$2:2.*;2=&..+7,"$.1'*2.+6>67H6!;*)-AAGA0=.89A0F=:%-,!AB4#1E%8=)C;$C?5<A@!*F4<=G49*B93>*$<+E2!$9?67:/5(<(%H:.8A!)4E?'?EA8'6B-"?/F/*D!H"F,5C"9CG5$G9/5.+)+-$+++<?1#4<B/H500?C?'C4%=C04G73/>%<)7.G&GE/79H.F?HB4+.290E0!086!"9!!@9/-C$D!A0 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:37A0A9A18A19C52C43T49T10 YS:i:-31 YT:Z:CP | |
| 287 r142 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26296 40 45M3D43M = 26387 336 NTTATNNTCNCNGNNANNATTTTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATANCAATCATTCCATTCAACATTGTTGTTTTACCACACCCANTC #''&!!&)("!$'&"($"('#$+&*&&%(!((#&$#(*###+#'"*"!*)!%(*++&!"''#$&(##"*&&!!+&(!'(%$$+)%#($ AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:17 MD:Z:0A4T0T2A0G0A1A0A1A0A2A24^TGC1C16A21T2 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 288 r143 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2260 42 120M = 2147 -233 GTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGNAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCTGGATATTTTTGATCTGACCGAAG 0*0/A:7!-('=H>$%%G*8:=5D=?!G<E/#7(A5#$C9G=G+6#*%2,0FDEC(49-D"@!,;+135FH-6'F8000;=D2<=<B/#/$+D?1,/8D=-(/1=5?9(H4#($(G'"D' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50G45C23 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 289 r143 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2147 42 107M = 2260 233 NAANNNNNGGNTATTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCG &&("(%"%#%"$$+()&'''"%'!''""+"!!"!&#)(++!+#)&'!%**(('&*&+)#$+)'$&+$)$+'"*%$*$#&''$*(+'&%')'*'%"('#%%!$$%%$+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A2A0C0A0T0G2C1G94 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 290 r144 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23534 42 41M = 23320 -255 CTAACTTNTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTA E#$%-'$C:30#20738>+-G5%0,>=(C!,8-!92=(#81 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T33 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 291 r144 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23320 42 111M = 23534 255 GAGTCGAATGATGTTGGCGAAANCACATCGTCACCCATTGGATTGTTTATTTNTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGT D=@4+$E?&*5B0G%3>D.*C#87D7'2=*2$@4E3.=1F%6E;!;6-9E>(13;#'/5*<<+7#D&B,!'(8C(G+G&F>C@470:+A@$.*':*.C&*"40=A.1/9/> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T29G58 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 292 r145 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47524 42 133M = 47725 247 ACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTNTGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCC F-C#3A?ED59E+)!<3*8?#4>%"84)9B$)5$,@#%C1%B$#C;53?D?0.=#FF%%%7*:B".F"0;2$<!,D#H&;?>GB+3"EA4B'620;H?3G%2$#<>.7<<=C(C*7!A0C&4;)(/5'H$'<$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A106 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 293 r145 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47725 42 46M = 47524 -247 ATGGAGCGACAAAANGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCC #/5.:9#$E$<#1DH8$B!$!=))9;3?280-1D#!=$#;8',<B- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T31 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 294 r146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6471 42 71M = 6211 -331 ATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCT *9&+8B$/F6##-A!+8)6A+3%$G9:D=9(:%1<4<24.B01'$=34/$3G2:/0>9&<7@!.5A,#,4% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 295 r146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6211 42 260M = 6471 331 TCTTTTTCCGTGAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTATCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACCCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATC C1DA<?"*.71C<5:*+=+'G,03/%%1+G:;-*.19@?3#@D.%4*$9G'?4+;8,7B1,($)7DF(%&,*:9):C%E<#17=)FB4@!B*-4A1"E?8H4<":8DD+8+*AD&E.:;0>;,4EDH$=EH(F"#/)>@/H59D1-G@"8$()44<>1@=4%1G2C=(G-9,:C#B4?-,=%.,7B97()AH%D$=D&@-*3?C!AC6<96%/G!76.(,E2B=9;H4&B+$*-D4=++($'*&&4+F%1>2!4=(.8:% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85T59G114 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 296 r147 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21659 42 80M = 21659 0 AGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATC $31"B;,$D5(A"9+%'!#%10"<1=?GF/3:F-2?*B3-!6:*+5"3@5E46!F-=@%3E@1/GD9;1;G7*1-?-54@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YT:Z:UP | |
| 297 r147 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21659 0 * = 21659 0 GGNGNGCTANNTGANNNNCTNTGNNNNTNNNTANANGTNNTNTNCTCTNG "!$"$$"##!!$$!$"!"$$!$$$!$$##$$!"""$#$!!"!"!"#$!!" YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 298 r148 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45904 42 67M = 45971 211 AAGGCTGACATCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGAGAGATTGATGTATGAG 29:B=4&>A?2761;F9B)<*%("<+@A)3BD+'4)E+=#;AC#B4A!EB<?7,-0%3C9/E>?9&! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G56 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 299 r148 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45971 42 144M = 45904 -211 CAGAGNCACNGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGN "@/E=4<->E"<8;;H)5H8.%BH;G./$@&GF5!2!!#!'5>?!H%0=(9!55.'3G="=)1E!42,(B<%/>E+,-:A(/B2CB8A2"/9&34?5/5*0H1@&D*@HE%1'?F-C@!G$A(.(-74<96)$,!-9;=(?8.( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T3C133C0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 300 r149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26070 42 65M = 25939 -196 TATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTT 4?-(;/H6)$,C#G3@E7F?,36$F'7&+;#A<4'@&/++.#4F6%0<"1'87.#:56+-05,?@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 301 r149 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25939 42 76M = 26070 196 GTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCNTATTTGAA EFB8-A0(C!;BA,!8@)$7:.:,6)"C4D29:,CF1B2/-B/=&9A61"?*@!.D!%-+2758D4&5F&(>C>9% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A8 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 302 r150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9320 42 126M = 9446 354 CTGGGTCAGCAGCATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGNAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCACCAATGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCAT ++#&&$&*#$#+!"'$$!!$'**++%#**($*$"*#!+%#+)!#!!'&+($*"')'()%"$"#&"'))%!%)((**#*!%$")($'')+"$'&!%"%)"&'%$(+''($'$'#&*"+'*(*##+!" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T25A87 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 303 r150 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9446 42 228M = 9320 -354 GACGGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGCTGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTNGCAGA 3D7#.(:($:&4+:?;$B=:.%&B-G3*9-C#8+A@4'7.5/E11;9:#+>5,$).C@.!(9B!#'*?7C2/6';3H(,4-?1-@H#;!?&#FDF#C>6FH/(995#(08A"2C8!&9+=43<C4F&&(*71E!%0#C7-$86BH;+3:*-E;&9D>%E!H>C')/)5;1,),'2&'1+#23,%7-A4!E2G!=(37G9541D&.BH"87:?.!&A72%C#-&8?+H+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C126T0C90T5 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 304 r151 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33267 42 170M = 33085 -352 TTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCNATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCNTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGANGGGCAGCCAGCAAC '#!)!##(!*"*)"'()')&(+')%!'&"(#$"($'##)#&$*&%*%$%"(""#*$(&%%$))(&&$*)"%!)#'(*$#(**$%&(+"+**$'($)$#*"&"("+'%")+))&%#%%$!#*&%++*#$#)&"%&)")%!!)#$*+"#&%%+%!((+#**(#*!#()%+$% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46C66G41A14 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 305 r151 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33085 42 182M = 33267 352 GACGATCCTGATTGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTANTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTATTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCT A?@3C#7=50&)"C-GAF(B3$.AE,5825!=43/B./@30$=:DH+)AH<8D1%<0;1D)%D2?(6*;"?6D8:F,1&=3%-"+A>B3$):G)9/3??B)&=2!#-(.=<A!;27BC0*8.D9/,+%!.6'AG>(!HGD9C&B17?7*@G#>)H.286/;(H,-''1-<3+$41*3>BG"( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11A93G43T32 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 306 r152 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18130 42 248M = 18378 403 TNTGANGCGGNTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTCTCTGGTTGCCGCCAATCGTATGGCATTTATTGACCNGGCAAACNGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGNGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGNGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAA ))$##+#)*)$(+%*"'&&)'&+##&#*('!+$)"(%'*!%#%(&)*)&"""&($+!"($))%$''$+"(**(!%!+$!!!!+)('*(**$"'!#"%&'#!+()$("$""()&"(*+*+!)*#'(+%*+++(""%"!$##"*+)$)(**$%'#")'''%&%#($(&'%('*"(*"!'%&**#("&!*&#("%'&$+''!+%"#&$!*$%"("(')')'$#+')*$$)*%$!&"'*%!$((('++!*(# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1A2T0C4G47T21C13C7G65C25C53 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 307 r152 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18378 42 155M = 18130 -403 AAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCCCGGATTTTCCGCGCCAGCGTG &%!$$!!)&+*##&+!(+(('++'"))&"!%(#*'&")"'%&''!&%)**%"*)'(%&'(!#("+*!+"')((%"$+&"&&((+%'$+*+#!!$$)'*"#*(+$+()($+&)"&*!&*+)+)!'"%)"%&%#$'+*$!"!()$%$*#'$(+'&$+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:133G3C17 YS:i:-13 YT:Z:CP | |
| 308 r153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22173 42 76M = 21984 -265 CGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGNCGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCN /&-0$,=5DE6A8*BF9<3.#)$&;H';1;-&))@/@#,9;H>&9&+GC07F*A52F/5&3C$+@3&>@11)1B+( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47A27G0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 309 r153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21984 42 124M = 22173 265 AATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATT '<7EC>H=5$)=H7C2F?5%&3%4H87'?<B38@6,2<B+%#3'(DE="F-CC&(DE39?.E:>&+#*=&:;?-''&8&=5"2#=%&GC!-7A1:<)!5).#E-4B$F)<6B7*))=*E;&0=. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 310 r154 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43526 42 39M1D14M = 43694 220 CTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCCTTGCCCATAAAGC >,!'3'0-"A#2?"&7%H+H2>282+3*!8/#G:C?/@$F!*%@A?+#<G442 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:39^T14 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 311 r154 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43694 42 52M = 43526 -220 GGTAATCTGGAACCGCGANCGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAA >66*(39-*0.46)9;DH55$@23#08E>C#B>&B:+)'58&:>'?=A8<0: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A33 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 312 r155 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22804 42 98M = 22930 260 GCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATG !8>DD1;88;,%!&3$&68C"B:4@.9-#/64F,00-27'!-AD:F6F4.2&D;!'H*3%#@8AB2=*0=4>=&3)A;0$44$><>:792@>*+"2EF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T97 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 313 r155 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22930 42 134M = 22804 -260 TTTCTGAGNCATAGCTCTGANATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTNTTGATTAAATCAATTGGATG -&7<048&'H'$A#16591E7;24G3A%D6>A>&8.3>@9=)&2?=>*'?+>/F>D:CDE!BC,1)BA7:6C:+*&&B.)!(F,9HE68'(14*3;8@',3.0%(F?%B(>=>4CH($G71$,4"F8*'-)1!, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8C11T92A20 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 314 r156 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5542 42 326M2D22M = 5892 507 ACAGGCACGCGNGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCGGCTCATACCGCAACCGCTCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGANGCTGGACCTCCNGCCGTAAGCNGGTTG 4'3;!#<'&?'C'7H'%.;C+6,&E890;B0'6D-6=7.$.'8$!6&3%%D*#).H+F,:@(F*3><C<2>)B'&44.#1&=83?=2"<)E3E9/3G&"B"A?&FHH90A2?<325.%,:*D&/@"E"3'21HG.:)8A/7?4G#3*280G;>:E?6)<550=C#H-'":!!:A9-:8A)A:4#2.6'H@6'-E!G20;!2+$C7.502"/"($&"$*'>)=AC4H26/(".-,H;D(;E6D3<+7)=1=H*%A7FE"*>%!EF<&$2$23'(#<%1/58.$2-'1F0>&'.=H=E<(2%6BB>%$=6+B4$=%8&'*A!6G*$4">"*EC710.;6:G,#/H',/>4 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:11T264G43T5^AC6A9T5 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 315 r156 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5892 42 157M = 5542 -507 CGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCNTGCGGTTGCTGCTGCCCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACANGTCCGCCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGC 9=;#>9F>!*,7!9D.)1+GG'E@6+"C&)$57*55@?0:>96!':H.A+B9A:B@<536(55+)5;)%$D"&>B=>('#*,B1+.?G239GEH(7/3:..#B34G#(%80(6-*@F%=<'.E=F#85<#!0C%<)#?=/21)+8::%8/9G(0E;; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39T14A29A5G66 YS:i:-18 YT:Z:CP | |
| 316 r157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16387 42 108M = 16604 275 GCTGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGANCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGANC )%7/,499!=80'D,G8'%F>!92+,*(#@)?9B':?&H<("G,/!0<GF>F3"=*7C49*E<,2#2H>-=)2/,CH:;!60H?AF(?%?/F,G3&*9)+%+6GBE7E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A75G28C1 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 317 r157 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16604 42 58M = 16387 -275 AGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGCCGTTCCG ?8$1':FA-FG%&G80<140$$)>>-7@/.$A/?&+@>2H(/8)/D=8=!),*/-?>> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 318 r158 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4291 40 60M = 4379 218 TATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTT )"7:E19G@:()C<%+BCGD%B::#564'6159%!!11?CE@(':*1=H)H/?$33AD>D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-23 YT:Z:CP | |
| 319 r158 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4379 40 86M3D41M = 4291 -218 TTGAATCCGGGCTNCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCNCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTGAGCCGCTGNTGCTTGAACCCGCCTATGCNCGGGACNTCT %#"#$+'!!!'&&%+)*!''*'%"#''+*&&*'*))$*(")%)%*"'")&'"+"**(#$%%"$(!%(("#&%*)!#%$#"(%)%*+)!%"+!))!%*"'&+*&$!)*"(%)#+(&)!%%(&"%"%#) AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:10 MD:Z:13G47T24^TAA10A19G4T0T0T3 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 320 r159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36828 42 137M = 36689 -276 ACAAACAAAAAAGATGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCC *4=?'"+5/>/GF$<'F,F%3;/*#?+A,..CD@H-4>2*9AA6-&%:2F?-22F!,G/02>'-$((4$<F8=G@&ED!%(?B"1D!?>.8+1=?HA04/@<100<74?<2E">43=:G3E/!5CH#+&(.B"7387 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 321 r159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36689 42 139M = 36828 276 GGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGATGTGGTCGNCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGTCGCCTTCA D>",A#,)07D+-/+5E?.62"(3=#E"E*9E/C2;H#=*:%H10=.*,$B"C$2"!>AD=-G1/%G7&HC1='6+8A5("G8.0';ECF=9=.A!5<#(.#//#D,4#!!!3)EB@AF28'AG7.>"&>'.9#?))4G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98G40 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 322 r160 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32143 42 49M = 32427 342 AGCGGCAATAAGTCGACATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAG +:05<25G-**@F+'+<5B26530467@&2#&&7H-6)D76B:"EGG/- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T33 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 323 r160 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32427 42 58M = 32143 -342 GCGGCAGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGG /;)@*>+/-//,<16&&F#;39:"-B/@,).9-!AH4%5.?$"1;)%:/#<G.@C3A' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G52 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 324 r161 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32852 42 95M4I156M = 32735 -368 AATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAAAATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCGAGTCGTGGCGTTGCAAATCATCGAAGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGCCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAAT <H-5.0>)/C'9.3/>2),B@9BGE/&'%'7@9=-@0'.ED@,'@D$-5E+%<D:5)?G=20:/>;:G%2'4E%-<#@H<'=8@"3/@(E#.>)%?=A=-'#1B1<9)*5419!*)';G3E<$:>B//#-G&9G(6C.B=$4,AA$C:;>D;9%@;5.8!,'4C555E)>)$+4&(?%92+540&',0,(50!!6)4+@A(!*(:%$&:6!F%#HA3'BHC8DF4/">-:)(4@B!,&.%,G0C%,>?H)2%/<F AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:53C56G5T134 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 325 r161 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32735 42 117M = 32852 368 NTTCCTGTGGGTCGACNGAATCCATGCCGACACGTGCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGC !&"(++)+&%&)!$)&&+'""#)+"&*$*'+)#$+%#*''*('$)##+$#&(*##!*(#(*+'"%&$"))*$!$''()"#)*+&!()"#+#'$#+()#$(%$(+#%+*)+&#($&*# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G15A18T81 YS:i:-29 YT:Z:CP | |
| 326 r162 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35016 42 74M2I123M = 35213 304 CCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAGAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTAACTGCCGCGGTCGCCAGGCTTGCTGTNCCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGCAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTTGTGCGC 1:749CH;;A'9(E33E$5?68;4-#2@7%C+#$*%2*D'A57&E>?AF101%)-AF<!:9F4;&C0:#>2?9=3!)D$9+:'@3#=?H#2$HF&!;EG!E<@FEF1.B+C<1$)..5'4C$F$'C5&6%&+75,.:2%84B1<HGB>E-(%,6@?A!>,!GF'356CG%)63D+)68GG$,D"B"B"(#9=%G"?'!% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:81T16A91A6 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 327 r162 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35213 42 107M = 35016 -304 TTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGT -<':!H)+6?8+!@82E>$73,"!-*/=9>'(D2:BH;&@1:4/%+;FB>/-:<(/2?!?@)0B4?:GCC(1%'H7%*#G01/*H&HE?52H/A+<*"3%>@,-&?F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 328 r163 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31192 3 25M1I33M2I97M = 31347 262 CNNACTCATTGNNACGNTGAANGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGC )""$*!!()(#%(!$&$%%''!"%%++*'+!$%&"&'!$""&!""*)($+'&")!&')%+"&%'&&"'+%"('!)(#%$$(%'#$())!%'&)!&('(&"!#()*&!#''!+$($"#'"(&&'+&"$&#$#+*!("%$$!'#!#&$!$)'&"$**&%) AS:i:-89 XN:i:0 XM:i:38 XO:i:2 XG:i:3 NM:i:41 MD:Z:0T0G0C1T0A2G0C0C0C0C0T2T1T1T0T0A0T2A0T1T2T1A0G0C1A1C0C0G0C0T0G0T0G2T0T1A1T0G98 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 329 r163 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31347 3 107M = 31192 -262 GTCATCGCCATTGCTCGCCAAATACAAAACCGATTTCAGCNAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGNTGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCA 9D=2%41,&&(.6)4GFF.'G(/3#?*BD:EG02)(9>$:C.>%F:=#;'&8+BHC!B79'EB4:ED7!0C=C!1<%!6:>(EC=!D1",0?+(.E:%H933$("BF AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16C14A8C21A44 YS:i:-89 YT:Z:CP | |
| 330 r164 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16350 40 69M = 16133 -286 TCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTNCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGG %!#$&!#&("+)!#+'%#'"++('*%!($&)()!%$*+'!%&('#"%(!%"#%%('+&%)!"*+()&#+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G37 YS:i:-38 YT:Z:CP | |
| 331 r164 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16133 40 49M7D161M = 16350 286 AGTGCTACCNGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAATCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTNTTCTGCAGGTGCCNTCGAACTATAACCCGCAGCCGCGGCAATANAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGNGTCTNTGGGATATGCTGACCCA D+(!2G5*D?::$'!!:F#F=2$3$G!0(;FBD(#4(D?%<<9?:9=?&?9D/GH$>157)+7.1)>F5@3B&&A'>C37H=--,F)'?7#@4H47&86?";CC:)H%$F,+'#36!5!#E*>2H'2=,,(H7/E@$4!#$")F#$'")H?C80C$D($3;A2C6(*/:2H1B8C>!!C#2H/&"$E0.>2472C,G!7#=(2&;F,++@ AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:15 MD:Z:9C39^GTTCGGC1G37A13G18A10C54T4G17 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 332 r165 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14850 42 108M = 14610 -348 TGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGNTTCGTCANAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGT F&.&(C!%C#$=FC1/(57,:-99"$H4@6623::3(9,.C)E+B#*5#4(5CAC("%>B.$@B(257E%$6D+23(8+ED:30)41=.F+AE?B-$?!=2:@=;4!1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73T7G26 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 333 r165 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14610 42 77M = 14850 348 CGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCG =4:H"G.AF;;/A119<A/C3!%<-%/C@2A%&9?---4F'1;3/&8.H55E"A7>C*0B>4E3*$H2*+7,%(88D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 334 r166 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31440 42 227M = 31667 323 TATCNTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATNCAGGNCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGNCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCNACATGCTGTACTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCNCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCNCTGCAT !%(%!+##%'(+($'%)%)!%$(""(#!(+#$&#%%!*'"#"$"*&%+$"%$!*+!%#%#*'%&!*%&"#'+")'((*#&+%*#)+*)$#)$!'$+%(!&#(%*&(")(%)#!%(*#""+"(&("***!*!%#)+"('+"*+&)$$""("#$$(*"!%"&&+')&$%'#$(&")$'#(""('*!(*!)!%&#*(%'%!&)%$)#*)#%!)$'%*#$'$#)#*&")$# AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C0C0A0T0G31G4C29G29C44T73A6 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 335 r166 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31667 42 96M = 31440 -323 AAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTCCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTT 2>B*0&09E'13.')%,/=13EA*))<)1$;$&)15%1()D@9')&+*;&E#9&=8C"GC<?HH974/.:9;.C=.#B5>F6@B!7,295;4+D"< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T62 YS:i:-15 YT:Z:CP | |
| 336 r167 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36874 42 71M = 36722 -223 TGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGNTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTG '<?,.?3"(=B!.;4#6)6F7AF23BA-<A0)##G3<;F78<69C9<.$5.:$2F73-0G2-%%4.126GG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C46 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 337 r167 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36722 42 54M = 36874 223 GCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATC $($&9".>9@&/=<57'$3?%7G-A27#87+15F,=/1)F0>5A<;FD/*,@10 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 338 r168 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43701 42 79M = 43897 237 TGGAACCGCGANCGAATCANNAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTC ,C,,;)6=;80/!1/@.*(%80-=;=#%'&$D)D3=23)G+A48B:H+!A-H240)!,G7H#7@B<8;B)5:;'!"%*' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11A7G0C58 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 339 r168 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43897 42 41M = 43701 -237 AAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGG 1)80$*GEE$+??6@6?-9+G"(</F:@,CGF!-6%4:1,$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 340 r169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42162 42 88M = 42375 278 AGAAATAAACCCAAGCCNATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAATNCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGAC @"!$8H(4>A7!,<&.@5$'5-C>F=<9?DF7@H4*?-B0>''@==##(%'H9/0A9"&@/98E$$*3$$4-43&!:@E!)*)D&+89 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17A24A0C44 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 341 r169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42375 42 65M = 42162 -278 ACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATNGCTAA 00-3<02$6.;.*42+,!>%55)08;%!G&/C"3#)@7B?.=>6$H95:A1G7H&2!.*+(BF+( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G5 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 342 r170 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39292 42 167M = 39292 0 GACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGTAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTCACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCC C613<+D:HE(.))D,719.%"4."A..B,/>'*;;>)5("A&6%CC>/*8@?$652:?E<;)CAFH(6,?70A@1:%?/)%D42)C/<#&##.$B;A1"@$"#5C!(6?>&G(44:#E1>).7&39&'8/#'5:+0&9D#=+85.H&F'@--.)$+957DD)"A6( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A60A73 YT:Z:UP | |
| 343 r170 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39292 0 * = 39292 0 TNNTANGNGNTNATNANGTTNNNNNCNGANNNGCNGGNNTNCNCNNNTANNANTTGNGGNNNAAGGTNGNTTTNNNNATNNNTNNCCNNTNGNCAANNANNGNCG $$$$#$""$!$!"!$""$$"!$!!$$$!##$""#!#"!"$!"$"!!"$"$#""$$$""##$!"!"#!$!"$$!#"$$#"#!!$"#!#$$"!#"$#"#"!!!$$$! YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 344 r171 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29680 42 51M = 29761 161 CGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATA .5!$2%#*<!C37*H,@(4')"(;E)1%<''D:..)1,A1F820BH=*E45 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 345 r171 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29761 42 80M = 29680 -161 CATCTGACACTTCAGACTCTGCCATCGCTGTGAAGACNACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAN *%'&$!!'##+"++!"##%)*!*%%)"'"++*&#!$")!%)'%&$*%$"'%*$%*'(+"+"$&'$!**!"')*%&%*$+# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A9G15G41A0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 346 r172 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2780 42 47M = 2511 -316 CTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGG 15%84;E"G.D6%<6=(917:.>8EC'"2.@20;*0*>7;8?;:3@. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 347 r172 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2511 42 11M1I75M = 2780 316 NGTATTTCCCGCCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGNCTGCAGGAAGAGGATGGTGCANCAACCAACAAGAAAACACT %&+'%*!&%&()#*+#&%!'!%((%+"(!++'%&'!)(')#+&$%+!*#%%*)$(!)$+%!+#*#&*!+!*$$$#&'&%&')'*)%' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0A43C21G19 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 348 r173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46966 42 81M = 47117 231 ACAGGGTTTAGCGCGTACAGGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGC D"!4%"&0'!+A8=1:2"4"GA9)&&5$B10DE3*C9===?19;GC:C=<!)"#$-.F7,()#2&E9360"+$#@!>#73: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C61 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 349 r173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47117 42 80M = 46966 -231 TCTTTTGTGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGNAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGNAATGTGN -A6-=E:19+A9+!(5+5+."#DE#3@E*+@$"B1H;3"*AH#7"/)4-#")$;*-7B&<1D1-7H4(&0'%<3,<:+@+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A27A37A6A0 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 350 r174 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34208 42 128M4D132M = 34472 513 ATGCATTCCGATNGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGATTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCNTAAATAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAA 33"5@(*F40EE8>0!A<=/6H<F8@CG262;#H5%&2HH:48AH,8AB<35F/6-!E+0!#GC,%@'H:F:A)C<9H0/E6>#@0&7-5G4.E+$*87;>2@B9;,)2C=8BE6D>#+F(1,0@@1-;*<C,0FC-7C)+1%)3902):2,-A/88-4'G1;<B$.++6+@/"C08;@%)4+3<&%@?$&!475#8<)%F5&>,<;(C35C/>%7D&?(>=$<D1!)0F+#AG6H;,3=6%()H16H2*.#:*F,6)2% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:12T115^ACTC26T105 YS:i:-11 YT:Z:CP | |
| 351 r174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34472 42 249M = 34208 -513 NCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTATTGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGTGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGNTAGCAATTAATGTGCAGCGATTANCAGCTATTGCCAGCGC "B=)#-*132++2E!A*(-?1.DE%2F>+-,"H4=#5BH':***D5B9,&B:5?(,-C:5)@!H$/''>/<C>35@(4,:'+4G*=5?'AA152#C7H(9CE2)=(9?E?9(:-:$"A-%#>8E9#FEB!E?9),#@##(-3'$AA?CE<7)4>5BA/D)'=0,*CG#)D60#C;!#+=D!9C-6*?/2G..H=%5$1,-H&H+,#*)/-D:>&(8*/9+'HF">.:)?2!;F$1F00=&3-=!(+2)$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C61A89A55C16T6T16 YS:i:-19 YT:Z:CP | |
| 352 r175 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42627 42 55M = 42800 276 AAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGACTAAACAAT "&<0+>C+:.,2.<3+5%.&6"=6H<8:*E!'(30%%EH89?;?"03(729F39/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T7G0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 353 r175 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42800 42 103M = 42627 -276 ACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGNGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTGTCGCGTCGAACTGATTANC =G-2=34G70..)6&>()-*#74>%.BH?!*,H4H(@"#@B;4F$$/7D1D=#,"G:B)A-F6//GHD+%6==+.=C3G!6-'+!:/+&A#.18AE9D-.+$) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T33A17G1 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 354 r176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 882 42 50M = 1113 284 CGGGCCATNATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGT ,<<'2G8;/08+9D?&/9)=>5=%)<D(='8$%#6$'F27#*/A,3@#+" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C41 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 355 r176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1113 42 53M = 882 -284 TGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAA +!'#'!'!"%'&&"#"$#(!$("$&)*%$$%$**#$#'%)"&+*!'*+*#+*( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 356 r177 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22339 42 73M = 22177 -235 CTGTTCCGGATCCGGGANACGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGANACAGGTAGCCATTNAGCATATTGCGCCGC 8;B;%F=#8)<4.&%*89!%CDE#8$A;61)/%0?D#9.!('!DDH:"$DG*?C/B7#!F>>97:D$C21985 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:17G0G24T0G10G1G15 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 357 r177 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22177 42 59M = 22339 235 GAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTC 3*;GFA'4CG;C?=#!/0$(D8F)B:8E#.C1**.+,(D9+'&;8!5?/4?;F-2)'+. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-15 YT:Z:CP | |
| 358 r178 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30834 42 118M = 30764 -188 CGTTTTTATCCGGAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGCATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAG !@+2)<GG#'70&@0,$)=<F)DF85*@"7)0$5#(2$$$3/*,;3AED!EB-<%"?+!?3%'#"/3?5&"%H1AC"F=:7?'7#5((:"*E!+!&')#"CF-ED#F>G(8;:%D:?) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A74 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 359 r178 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30764 42 70M = 30834 188 GTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCANATGTCATCGA ):9!8>(4),<)3BE7'DD;&BG+63D&).F8+5G3A;AH*#B'<$?5801176?4!B5>A3)$+D0$!, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59A10 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 360 r179 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12973 42 165M = 13253 337 ACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGATATGGNCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCTGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGA 31%H::>".'F-A:2E!;C*?,%.@6980?@6,3,6+036C@2C(,A$@F.3)(>1:G*GB&./?.;B,D34>%7H."=!22@BB5-*1D!E@?GE(<.9A*2%7&=@&H&/5)5B#"EB3;/)8F**!<$,G1'%4191#,@>DDGD<3.78:E55<C-4G$4A AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52C4C26A80 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 361 r179 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13253 42 41M1D15M = 12973 -337 CGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCAGGGGGCTGGAAATCC +2744A7!8H%,G0D="G60H/!*-;$1,>9HD15902"5C<6.)<&7E;689=(& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:41^C15 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 362 r180 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29407 42 56M = 29209 -254 ANTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTC H>.5&A%D.'51)#$#?'29?9%=,''""F,$+;*:*H3/2CFFA*6@-C$8@0"D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G54 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 363 r180 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29209 42 49M = 29407 254 CAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCAT 57)*(2:C74'%"/F0<EG442G9!@%C%:A8&9C/?F:&(?A8"6'C2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 364 r181 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5139 42 40M = 5243 145 CAACCCNCCAGATGTGTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATAC %DD3)%)@H%A(%)">+E:7&!D.41.$8HE6),*H"?F) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G8T24 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 365 r181 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5243 42 41M = 5139 -145 GATGCCGGACTNGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGC )3!98G&&$(/:;*:1'&>%HE8D@+7-4F!*G+!7>&<;1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G29 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 366 r182 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38957 42 113M = 39191 281 TGGAACTCGTCNGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGG '#.G<.#E)H%/$:#H/$E)<39F?0%;!4(5&,(@H,-"+.::4><E7D$=?442'1EGE,2F!!9-1+!A&AAC@AE"@*=G=,%&,F$D&(!2=$&$C1<1D*1>1CDH- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A9A101 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 367 r182 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39191 42 47M = 38957 -281 AGCCAGCAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAG >-4=&9G:?D9=GF:?:%.C4)E"6H%?@@(751@#>C4;@6->#:H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A40 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 368 r183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35197 42 90M = 35360 278 NTCGGGTTNANNGCNNTTTNTANNNGAGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACC "*$%&#!%%*"'''"$'&)'%*$"&$%$+#(#+)((+'*&'#!#)()!'(!)+&$%*%$+)&$+"&"$($*$+'!%("$)"%$!#*+(+# AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A4A2T1G0T2G0C3C2C0T0C1T63 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 369 r183 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35360 42 115M = 35197 -278 TCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTNGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCNGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCATTGN %($#)'"!)%#&'('+&$%))*+()!#&%+%&##!#(!&(%)+*#&(("+%&&$(#&$)')"!($)''!&%*!"&*+%('&***')+#$")&(!'+'&)+*"#!"!%*&+&#'%! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26G23T60A2C0 YS:i:-14 YT:Z:CP | |
| 370 r184 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25558 42 68M = 25352 -274 AAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAG &1&<9%=)G4E,+<F)>H44%$/G9/5?&B@B;?"#.9162G4&4&=9?C&226CA),30<0GB)0"$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 371 r184 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25352 42 165M = 25558 274 ATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCANTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAAAT B8C9.4;C3"3/6#>#H<88,:B73:,-!-*0;8&E-AE77;0AA(("*+4D,5#18%9*<G/F3E-(@(4?=$>28,53G++F"D32A(9'#82&:<<$((/3<+8FE-<%&B9459!:4B&:D-*+7=+4"C@C2E%8<&716.2."#1D.=GA*@'@&5;"( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73T89C0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 372 r185 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23353 42 181M = 23281 -253 CCCATTGGATTGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGN #HA/<<+".82<6?G'+FGH,)$44&&.,8FC$&@=F>8+A*#(+;G%"<9FB9!6B&%H015.76?6&/(F@3(!1,"8,E"DD10BF)7E/2";)($)2B5,HG,D$1)&*G::F4:C>'-<5(H3A4!C@64""?/<)?D=+;(.9.-'>4>!@/88:-E40&-D?7;/+C;%=''2' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:180A0 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 373 r185 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23281 42 58M = 23353 253 TAGGTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAANAGTCGAATGATGTTGGCG 8H!)"86AH5<9(-8)$?%#%.0#,&3:.B058#D'+)/6/3,"A.=)'<E@'10CD% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A1T0T35G18 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 374 r186 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32160 42 125M = 32033 -252 ATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCT .C"!&>*H.+%/),57F,5!-6AF/50E@1":2:@EE71@--6'"HC#?%8E#74$-2>%$7-B(?6GG4$H#'/9C/6=6*(<258<?H+*;8874("-@8-4H3&C-@F<D%?0G0>.%C(81 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 375 r186 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32033 42 127M = 32160 252 CCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTACTGCTTCGGCCTGTGTCAGTTCNGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTC GC0-7#;36$G,,2#7!"@&!937EF;A9&3H,B:5.?;6.B&#.B#,=*D(8.+G$(/B9DCGCC/@)A%0&:67F?-E!#2(<>./?HC!88)>8.;3GE#@,63;.'@$2,1FC1H:20<21?0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T56 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 376 r187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38630 42 124M = 38754 369 CGACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCNACAGGAGTCATTACGACAAATACAGCANAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAANTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGC &3GBH%/"9B)=13-,*<*)F<.*B3$3,05$$).B$!#B,%G-!+6!F8-;6G0)F'4-+1G.>1+71>..9+(9!841*5'(4@A+4GE&#@2,@2+:?+"3"&?'0.:+5H<-C,B18>?1 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0A41A13T13A25C26 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 377 r187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38754 42 245M = 38630 -369 AGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCATGAGGCTTATTTGGGCGCAGATCTGACCANGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCNGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCA ;<E24H2C2$7$C"1<,1*G,1;='/6B$$5</>:;9DD5)4-#HE,-509=01!1*31>H(H8H"%28C'<-@)5A+B$00-00H$.1A-@=D>D1%DD*>=;78%1!&4$-AD;$3#%!7%84?*,%@<.%.7H6EHDE!<+-&D@#1;96/60&GFH3!9<@%CBE!4<+4&0$,;D@@2:,/,FC<<9,9EE4!&F;64.2-GB5480F1/%/87B-30>,.CA"0?&6%(9>DFF41$%6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41T11C17A29T143 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 378 r188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8254 42 179M = 8467 286 CGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTAATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATC 1(!*?'):574'5'%=+/'8)GA81:0?B9C*0C)60<):5#6?9E7C&B4G/1/@;F:83?&3>"B7GA67(#;13=19$*5:60"($A-#!EE6376B5B,GG#B)#B)3$E>:@C'7:,#D/5GBE1001/03B@E%0+!"<C3:107=&8@<&33C,.8?)=.G35+""2(B<&A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T84 YS:i:-20 YT:Z:CP | |
| 379 r188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8467 42 73M = 8254 -286 AAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGNGCTTNNGCCTGGANCNNCNANTGGNGAN '%+!"#**!!+*""*'+$"*'%*(%)'$!%+#'$"!&*%%%*(''&"+$$*%"#%#"'')!#%#'(%##!')& AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:44G3A0T0G0C0G3C1G1A0T1A1C2A0G2T0 YS:i:-5 YT:Z:CP | |
| 380 r189 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35453 42 123M = 35308 -268 GAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGNNTGTNNNTGANTCA &"!"%'%$*($'"##&+'*!#($#*"*%"()($%%***%%""$"(**)&("(&)!'#$!&)!(*!)"%($(*#%'""*!!"#"#&+"))&#"'%((&'&%*)$$++&)$%&&)!#$(#"!&*! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:108G0T0G2C0A0G2C0G2C0 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 381 r189 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35308 42 45M = 35453 268 CATTGAGCCTGTTTNTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGT F,0%+$$*7DB/=C?&/278%3>7'$!<.:+D)>:#B>G<&5%0% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C30 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 382 r190 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37592 42 55M = 37836 317 GTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCT %3"4D<*'*A3>.!:4$)%!7%&A3*-*3)":(@+$&<F:%@B&H-4#+)?#5H" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 383 r190 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37836 42 73M = 37592 -317 TTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGC AC#?)+#A8=&F3&0!+EHH3.)&C3-=;@7C6D4=2%C2HAF2=)=/G'7<60+G<%$=4*;3A<2D2/G4G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 384 r191 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47869 42 63M = 47712 -220 AGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCN "9))B;?>H3G/20')F&.2E=:&>5;9;GG6<'>;;)3GG9:((.7")(A9*@1<B:+2F;# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62T0 YS:i:-10 YT:Z:CP | |
| 385 r191 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47712 42 142M = 47869 220 GAAGAGCAAGCGCATGNAGCGACAAAATGAATAAAGAACANTATGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTTTAATTGCATGTATAGAACA G8*8$'2'*F=05E:0,%@0!0E%>6+A9&$<H8>2"6+'&=D($$.9*+<'#97F90%@F"3,;0F$!%+!FCA'E5/9."5#$8"//"!=;CH'><>C#5/2@&5+#;@)H;>H71>*."4<8G"=E!6"0'+;(!B72? AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16G23A1C79G19 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 386 r192 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44203 42 69M = 44106 -166 TTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATACAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGA &'#*&$)+*#*%+"$*"$$+%*$#(!%&!'$(+$))$+($*&"+$'()+!$!)#+&%'*!('"#+&(*( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G33 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 387 r192 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44106 42 97M = 44203 166 CACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGCA ,B9F53;G&-A/*DBEED##10CG#'"@H<'+C%=)&B/AD(+G78;!H5>E:"4/D!)"00:-F$;93#CH%+*!H*&H)96E)(?FG-HF-1;=. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G1 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 388 r193 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5024 42 57M = 4770 -311 GAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGC >;4G.$#@#&$>/#0D(')1H9#2##""F3=%2<.H@9A,;FG3E&"GF.-)E-"'4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 389 r193 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4770 42 99M = 5024 311 CCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGC B/?$+3.+3C=4$"':?B=#/)H$<-/>'(;@@:<**8+B?F++//:8&3450'')C=B)E26.'+!";=%,G?+;7/>BCC"4=,!6%1098HEG0F, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 390 r194 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17493 42 50M = 17493 0 CAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCT *26>C4FB>>(96G**!@%@-A?#("3;/#1=@F#@5;C,"F#2>6&'*: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YT:Z:UP | |
| 391 r194 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17493 0 * = 17493 0 ACCCGCNAGGTCGCCGCCCGTCACTGCAGACAGCGGGGGATATCAGGTGCTGGCGCGATGG :8?!C?',6+CD)&+5/.+-0%/1H-)D*$?/?+G2A080G)/&AEF$3,)?E=078263G YT:Z:UP | |
| 392 r195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23633 42 241M = 23542 -332 TATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGNATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATAATTGTTATACCAAATGTCATATCCTANAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAAAAAATGTTACTGTTCNTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCNAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAA E@EG&B1*17"&D74,>;&C8B=A6(/$86#(>$>69!!&D(?2)126?4>!6>%;+="6$D-"?<4.@0F19D=/$>,D7'?:H:1+4-6$F801-5/:5C<9D#GHB>2,3#7ACA8,.#2/7+*H-/")1>;A3=+%#2!<*C>82/.!+3$4&9%#9F&(;5F<#*0?E7$8C4!B56?$!%7D)3-(:'$1@+#*!H09DH;/F09368$$!8$3?23+!6&4:",5B+%8EH*.6 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:66G26T26T26T14T22A55 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 393 r195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23542 42 91M = 23633 332 TTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGC @$3!)7?+B)9+H7?.)?-0#B!0*@.,,47@A-7(,H/D9G@@':%(>4/E?</&>G8!1;8?3A+E,H$!G@#,A<E#9+;C?CE6B)A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 394 r196 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33912 42 161M = 33828 -245 TATCCTCACAGACAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTATTATTTATGCCNCA $"+#'*%)''#*#!+&#*#'%!)("$"*$+(+"#%%&!$''!'+()"&''&*$"'**&!#$$+()"'#$%'*)#&%!(&)(*$+#%($*$&**')&+%#$&*#!&''"!)(%$)$#!$&)"('*"()%(($%*!#&"'*")%!++(%#(")#%+('&*!$* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T133G11A0A1 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 395 r196 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33828 42 42M = 33912 245 ATTACNTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAG -.?:"88H%#=:93/,#&2*$?@!AA7/EG1'FC8GBG:"DE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G36 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 396 r197 77 * 0 0 * * 0 0 NGNNNTGNNNCNACTTANNANNNNNNNTANNACANTNTNNCNATNGCNGNNNGCNANGANGGNNNNAANNACTTN !$$$!$#"##!!!#"!#!$$!#"#!"$$!!#"""#"##""##$#$$##$"!$#"$$$$$"!"""#""$#!#!!#" YT:Z:UP YF:Z:NS | |
| 397 r197 141 * 0 0 * * 0 0 ACGCATTTGGTGANCCGGTTGTGCTTCCGGTATTCGCTTAAT #%&++'$%"'+"%*()$"!!($)%*($%(+"")!)%%($)!' YT:Z:UP | |
| 398 r198 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17151 42 51M = 17151 0 TCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCT +9#;67D5-=5>E2'C08%&)113;2.*FD,,4/@!27<>H8/;+&+13@9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YT:Z:UP | |
| 399 r198 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17151 0 * = 17151 0 AAGCGAGGCTGGGTATTTCCCGGCCTTTCTGTTATCCGAAATTTCTGCGGTCAGGTGCTGCACCGCTGGCGGC 4(''9)2,F2;1E$!,#&0G0&4)/D(#%<42@.4>@'0#3DG;("6H40;G>=,=E,*9-63>#(>2,2G.B YT:Z:UP | |
| 400 r199 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42107 42 61M = 42307 285 AAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAANACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAAT &"F.8A0=&1"!?A08.))GB(2H!A"6#:@-91":H6'"4/4D<!.5891#-E.5#=D?- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T26 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 401 r199 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42307 42 85M = 42107 -285 CGAGCGAGCTTTCACGTGCGCTAACTGCGNTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTG *)%+!H'D(6G)A23,"<16A1>>,;6@$:A.31!>/,7E-*(;(&E:.<;!G&+(E;#=8A14/4#A(0%&5>G'(;':<-*3& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A16G55 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 402 r200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36302 42 76M = 36490 236 TTTAAAACATTCCAGTNTATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCAATNTCAGCATTGGTG ?>)&978#G2!2:<G;*&A=C#/!6F06$5&.!0#E:@+;2H>:=,0,1/=8B?D:/%A4D<6E3G+!FH-29*+# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A43T2C12 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 403 r200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36490 42 48M = 36302 -236 GGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATT $17!3E'/E!-=$.><69C%.@:&A/HD&E#=A05!00F*7F)8$'*) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:CP | |
| 404 r201 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9253 24 50M1I4M = 9104 -203 TTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAAGCCGCTTCCCGATCTCGATGTGTTC G7>?(7)3?A%$8D(+(+)/*H&#.GG+,0"D*(":.8D35?#F'G'>#?=7B*+ AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:30T11A1G0G0C1C3C0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 405 r201 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9104 24 82M = 9253 203 GACCGCTGAGTCCTATTACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCAGAAATCTGCC 0C+;6495A+H067A)161(%0+6D-C!)8=:G,;<79:/B.(,?C%.4*+8E'0<D,&D(C39!'B.G+">B>!:<.5:D# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G65 YS:i:-28 YT:Z:CP | |
| 406 r202 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44884 42 153M = 45037 399 AGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCANCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTANCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGG BA3,.247B60A2,D=:)'F"0%5)9;3!D:B9(-=+81CD4D?2.*!$8::#B"?:*:=?69"*=6G6#-9EE&E)&-(H/:)<15@0#F%H5/G=02,G4;+5=E"+'71&,21F%9/8,93",>@<G.A9(5'0209-7,>=&+)*=889 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G27G79 YS:i:-6 YT:Z:CP | |
| 407 r202 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45037 42 246M = 44884 -399 AGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGNTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTTTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTNTGCAATGGCGTACCTTN $:D+;/'<=8,99-:71EA;)F65<92"&%?"@6E@634;C09284264?$>#?>2384-1*!7$/'$B,A5(,<=D#2,;<H.'2".9157@B?2?$A!F2/+8EH)&/*A5<;1(<*E(C2B5&*<<0-*E!$BE;">F*/<170"6AEG*;(@-<@<&F-E#'F;FH6+@/329%+84A2@40G$>?E@4796(C*79+>'-#D!.4')2"1HB1%!2F886=.=F$&A:":.AE>,-##51$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25T59G142T16C0 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 408 r203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8512 42 173M = 8377 -308 GCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTTAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTNGATGGTNGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCACACCG 2)@CD3%()G%4+94A8<9@H;",.$:4,"H(4@;6F?#41=B&#/AF);3-5H;.(!811B17A8F91HGF=;8"7C7=412+G#3*9;H)G4+<%*E7,:@G50*AA#E>"!#;<!!/BCC<65?C,.B&F8'/:@F)<AD:1;,'<!%(</?;C&(+<H";<G=)>.+(/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52G58T6C48T5 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 409 r203 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8377 42 71M = 8512 308 ATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCG 8@'6?80GG#F:>),8;:1FG//B#?AG>C-6)A5,GE?7"&.79&"GA-*'"'H#!?5H8")F=.!$3:E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 410 r204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12647 42 89M = 12512 -224 GAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGGCCGCTGCGGCGAAATTCC ?0=G+2A'%#;D?$="BE)!?88!FA9<7/>;>$*FFF(39:=7@21A'65)(7&3DD!*'18040"<C36%!!*-@!<2;(62<+<@5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-4 YT:Z:CP | |
| 411 r204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12512 42 50M = 12647 224 TACCTTTGATGGTATTGCACAGAGTATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTG !#&#+#%(((!%*&+('''('*+%"$"$)(!("*''&""*!!#$#('#(% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G22A26 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 412 r205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3712 42 78M1D141M = 3932 457 GATTTTATTCNGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCNGNGTATTACCCGCAGTGCCGGTCCGGCTGGGGGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGNTGACTCACTGAACCTGCAGACAGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGC DGEB4%BF=F/@'9%%<=24(D:69-9-<<8$?,D%-E1$E<">E"(HF=G"56(38<H;F&C0G8=")-*0<":H2("(:?B91".6+'"2;GD:1+:5&:-86<B;&.(BEB.&58))#/3;/BF!47+0A8F,7F.,'5*.2&&+*/(.$&-.2?C,?%,*()5@*(H"D.>?1#>(*?(1$'F*@*()/#1)$-:):!+:0,6D,B"F+>6>'6! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:10T57C1C7^G6C15A28G21G67 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 413 r205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3932 42 237M = 3712 -457 TGGGTGTCTCGTATNAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTNCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCNTCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACT &-6E*4@4?G443>*?*C>!A9%'F>>66!4-(4A.137AC36/H$=FD/629'E4AG2H=&"4HA%%H6G+#A&@9(B;G%,,%'4/1;1:00B-G0E*,2E<,@(:!*+)@70?)->%=(D#G$#@C,=2A",B/97-8%,7$3B2"!86.)C97/HBE2F8H!$/C%-"!/GBF:#'GA;<.5A)?ACC.131)3-<D546H.;1%*'"29+31D<@!E)@7:</0.+@5F.3- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G36C109A75 YS:i:-20 YT:Z:CP | |
| 414 r206 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13257 42 37M1D60M = 13393 196 AGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCAGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACC 92/-/3<);%D5?>F:1$=(A)-<)C%;$>?+!,(*C!240D+$3@="7C&FAA83>-9*%<'@!2<3EB#)!<3<H9D)1D&?8"4A+HC?#(?'. AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:37^C60 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 415 r206 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13393 42 60M = 13257 -196 TGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGNTGCAGGATANCCGGCAGGAAACA FD@,C3"#->2/.!$95@$=2+F6'2H"<($+928+=+?FF#(276F;>+F6'8*G(.5@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A9T13 YS:i:-8 YT:Z:CP | |
| 416 r207 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45547 42 220M = 45769 267 GAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGNTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGG *+'!%'!'(#$'%$!!#$+))$)#*#))%#&"$#++)*+"##$($#(!""%$&+""*%'%)$)$!!&#)!*%+"**$*#''&"$&&&'%'*!*%%(!$(+&*(&*)&"))"#*&)''!%!'#'##"&#&$!"%!%*#+%%%"++(&))*)*!#"*"(("$"(*+*#"(!%%&&"*')%"%"++$!"!("+$")(+'(&)#"*$&$*')+#(+')$"*$"% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66C153 YS:i:-2 YT:Z:CP | |
| 417 r207 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45769 42 45M = 45547 -267 GCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATA @C#/DB3((7E?6&<9%)&76$744B'4G5(@?5<638*3C@!B% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G0 YS:i:-1 YT:Z:CP | |
| 418 r208 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17589 42 173M = 17470 -292 AAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCNATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTANGACCNGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGA 8!@?C$'8<96A?51,3H*HHA@D=>$E6;<FG%C$0>%64(@"E<+@<15#D.'4,1+94*GG:;5HEC5%8!1E%!'%8/#BG-ED;!6",@D/6F)506/0!:2;3;H;EB=4#.HE?1?91CF9+*93"11@F&6&*=6;A@B1H;.E"!.&G/3()$C?7=#:%C,4@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:91T37T4C38 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 419 r208 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17470 42 54M = 17589 292 CTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACG &/!(*8:$(&#H,C*B,*).9/($=,;7'66;@?>>?"@):07D=3:F4471-B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-3 YT:Z:CP | |
| 420 r209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36820 42 146M = 36966 234 CGCCTTCAACAAACAAAAAAGATGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCA H2F@/4.>.+F</&H.%5$CC:GG8=*38:09.G26>4F=A/.*->$1.:"#%6:H%EA@@(161<A0?9!8;>$)(=8#99*>3-F-C<)'H%/E&HH(?G'/4(%/(7,#/8:?9C7(:G3)B<+C<"B*<+:8@G+DE;E,(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:146 YS:i:-12 YT:Z:CP | |
| 421 r209 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36966 42 7M2I81M = 36820 -234 TCGATTTTATATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTN 41#,FG&;+,1BD.$D</)D-D&4!24"&=4<&=%H/9G3:'FG!8/DD)4<@9=+4B429HB!3H-G1?A#:7'#E**5+9'?.$#H)" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:87A0 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 422 r210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9967 42 56M = 9780 -243 AGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTG *0.?(8,?+(-#C(2/%1&7?#)FB7%3"CHHC=95<;%(;;>D!#'(&H*BE%CG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 423 r210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9780 42 62M = 9967 243 CAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAA /<,HEC-8>#60@<7#&$G$>E?8;-$0*%/A7@@%!!E'D0,)E0C3B:B,2(11>&B(@1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP | |
| 424 r211 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44089 42 48M = 43628 -509 CTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTANCGGGGAAATACCGTGGTGT <:3+H/5<%,:$$@A(-G;&G"=$+H+1!BC&".?89-.=8'0*0+&$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T19 YS:i:-9 YT:Z:CP | |
| 425 r211 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43628 42 461M = 44089 509 TGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTNGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAANGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAANCCACTCAAGTTTGCCANCCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATNGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCATAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGANCGANAAACAAAAGGCTATCAA +*)'*!)*!!)()&&()%"%*(#*$++##)&)&#&!++#')#"&"$(!))&"+*#+$%&&"$"*+!"%$"!+)!+&)!#&%%&*+)%+!!$'(!!*$'%)&$'"##!&*('%&!')"+$$+)###&++*!&+$#)'*&)*&"!*!"&%&")('!'('"$%!%"(!&"%)+('$+!((""!&(#"("((!*%*#++$($!$"%*$')'*&+)$*)$!"(#()!'(&+('$&&$&$#*#"+!#)!*!)(!*'$&'&+'$#*+!+!&$#!%"+"''))!*!"%'+#'!&!&!(#!('%+$"*+*('*$"!%+$&**(("((!*!*%*&!)#%"#)!%)#""($)#"'+%(#$'!**)"*#)%&*'(#**#*"!&%#&'$$%&*$"#!&"&(&$#+#+&%%**(!$###&)%&")+!$%!%+&*%'+)'%!%%)"'(&''%"%()!$()$+$%!#*###&!#%!( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i |