jpayne@0: @HD VN:1.0 SO:unsorted jpayne@0: @SQ SN:gi|9626243|ref|NC_001416.1| LN:48502 jpayne@0: @PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.3.3.1 CL:"/usr/local/bin/bowtie2-align-s --wrapper basic-0 --reorder -X 1000 -p 2 -x reference/lambda_virus -1 samples/sample1/sample1_1.fastq -2 samples/sample1/sample1_2.fastq" jpayne@0: r1 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16266 42 97M = 16003 -360 GCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGCGTCTGTGGGATTTGCTGACCCATCCGCGCTACGGC *5:441C0)"E,A%72$9-"1%A:8%-0<80-;6H8%7643HB>9*;8BED.D#.2?44:4'5)0<6F6F1*C71A.D;G0G<2<9.6/B:3")?4' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61T11A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16003 42 58M = 16266 360 GTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGC );A!/,6B:8=(*2GE1FGA>0/,?>),%.,/3+@D(C=<53!$H"HE-$79*HD?4< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35315 42 60M = 35108 -267 CCTGTTTCTCTGCGNGACGTTCGCGGCGGCGTNTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGT E*CD88'0F(71,0A>GA4:@@+CB%@/8369*H2%!"0CE/BE<:4F)3&1BF&:*7#2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C17G27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35108 42 112M = 35315 267 TGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAANCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTAC F*E;2#!93)*446F)3G)>7@@9!?&"'/6+*8#3:H**C&H7B@+G!(E<",(&"G.* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T21C19 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31746 42 170M = 31597 -319 TGAATTNAAACAGGGTTCTGGCGTCGTNCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCNTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGNGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATNGNNNNG %!**$#""+!!#%$+*)*$%$'(("%#!*&+('$#)"$++*%!)"+)*!"!#'#))&"%*++$&&"*#)%!$(#())"&(('"'%&((*)(#+'(!###%#)(##($')&'+)+)")(!'))##&$#*&%*'"$!''!($()&'%*+$)*("('&(%"*)!$+#!&$"") AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:6C20T27T47G59C0A0C0G0T0T1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31128 42 184M = 31312 316 TCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAG 987F5F:@3)/%+DG2%&*3B2D070:'B1599:($(3#/%9*"&>F!82"@H.@#A+?6>?+D%@:.D*"D;3(D2#;:4)F2D2A2&41464#(#@D?G0=@$@$".2*#+.=HG@/.6:6@BD>*=9.3%%>G1>CA1.(%A&E;.??>F70278#'6$F963ACF&.F7@&-A?B.C=09;/A!B+)F57'B<>@@D((DF"/!-DB>+58&D>:6(6=@(9:?C-*D&3>;3>2=-C2*5A=:>-G"H*;CEC,E%85)::)H!-$'#@:; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50G25C51A78 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29000 42 133M = 29133 340 CCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTTCTGACGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGNAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTG "(+,,3=$)%;3D.E49:!E86=ED=DA2/8?BC&6#<+%G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60C4A26C40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36535 42 85M = 36709 231 ATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAA 3;&*-=>HH89E&.C$70FB%=1>;6#!B,">C&G&(:38+A*H.%A(+*+?'0(A>8$?@7A!*H/EDE'-AGA*/,"A+F:"! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36709 42 57M = 36535 -231 GCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAAT 7H6>$/@&77"+7!5B6)C'?8#8@FH53>*EF)#3(4C233"0!5<34!0;?;56F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9398 42 246M = 9644 364 TNCNNNNATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGANAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGNGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATC %!%!*('(*+"("%$)'&*'%#&'''')('%*+"*'&+"$%**$*$+)''#&"&""*&"%%#'!))*!%+%!"""%'+'&+!)('&)$$"(&+$%+$&+!)#!(+'(%$&$%$**)*&$)#)++$*(%!"&*(#++!$&+)($+$&#)(%+"('%!"!!&#$+!('((+**+%*$++$!!$%#&(*++'$+""!)'%'%((&+&("###)%#&!+'+(*$)$+)!+!!$&%(&##"$'$)++*$"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C1G0T0C0G73A129C35 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9644 42 118M = 9398 -364 CGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAANTTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTNCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCAANCTN *%''%$+&%""))#%!##"!'%+)*!'($()"!+)'+)'(%"&&*$(*))$$!%+&'&)%+!&$+''!%)'((+!%+)#%'+$%!+%%!+"*+!%!)!(&!)*)&%*'''+"'"#''! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31A39T41C0G2T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11633 42 112M = 11769 262 TCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCNGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCNGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGNAATATACCGAAGAGGCG #.''@7EE*=',:;B*%58$H/%HH4-67@;>/D2FH,?%C4&=6@1$-$G)@3036(90?$$.*))"59-5:#/A4E!C1"/B1B+'?0A!;%G(GA+;-+:?!G0,&E@< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30T37A25A17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11769 42 126M = 11633 -262 ACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCAGNGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAANACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGANGCGACGCTG )*/FAB+*=3@D#(/=H360@>1;?!!(/@A9B3/9F13"?G@&'G9:+38,?C=0'C4@F*13=*,D"C&=GD+4B#;+%D3#,!35/8@B31@06/@3",56!.,"H)%D%A45)(>;A<)1.# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48C0T33C32A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4296 42 87M = 4070 -313 GGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCNGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGA !$&)%(+($'%*)$$%)$+)(!'+($#**"%)%$!#%!%&(!*"!"+))'#!)(!"'%%!!%'!*&#"&!&++$%$#&#(!$)&"*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4070 42 118M = 4296 313 TTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGG /EC(.EE4#,=G34#?-2#A7=539G7?88?+6E>8'*D3;8HH(H9A7<81%A6;@=?B@<,0%82C<<%-B*0&/H2"%##?)+(3H8?<=)@(><)D:# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r10 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33727 42 142M = 33451 -418 CCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTNTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCC '%%*+"")*$($%"%$#(!&&+**($$'&)"!*&$%$&#)(*%$')+&&$&''"''%!$&*$!&'+*&(!%))&"'+%%$$&)&%($()&$++!%%$%+%)#'($"$)&(!(*#)&#$&+$*)*'+(*'#&#%")"&&#+#" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G104A0 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r10 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33451 42 276M = 33727 418 TGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATCTACACATACCGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTANGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAATTATACCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGANCTCACACACAACANCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCG E?;15/+:E.D691G8,1*<7#"6B5C3.9EG>@6B/:9<,4;@)!"'9.H!=;=.2/!!!>&H.+#>=B5C46(>%-2#66=;79B-!$14?/)'1++E:'-G<+3")7GG4>8+*2:/9&3;H6G:A52;(+E*'$-9@>;#GB?@.(@)*>A"G=08*="D64F/$$*/6F*11*3<4<:D59?3%:)&7!=7><,2>+-+!E%+G?@?9@7$**-<@!0,F29EH;1AADA(HF(C*:H>!1>H$)CC,023:;E>,&B'3*C,HG/H$%%2 AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:27T2T5A32T50A3T15T72A13C48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r11 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22373 42 47M = 22420 253 AAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGAT C+&9(DC57H3B(@,GB9@'=+8-.::83F")@;,@(0A':*&0;.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r11 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22420 42 206M = 22373 -253 GCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGANACCTCGTTGGTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGNTGAACCGTGNTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTNTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATAGTAAA B,)$#,1("=<"0*=<9:H97>H:&3-%++8%B/83F++80B7/)*55B3&=$*!2&'B)FG2E4(+38&B>E6B6EH?(F&?#)FFGFGB+%$2B7>!5&.58,>9($&+=@*A+6">A9.5%**=.$64?$CD&"=C24-9*/$%'.C>#6,%C2,F!B9<(*'D20=C1)"300497""788+40;<@2"?:22<-5@B;B*,/57&&>7!B$!F<<"4C082!'$%3H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120A20 YT:Z:UP jpayne@0: r12 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16225 0 * = 16225 0 TNCNCTCNNTNCNNCGTACNNTGAGAACANCGGNTGGANNCNNNGCTACCCGAACACCACNNTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCATTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCG '($"&$'!!!!!"$$!*&($!""*"&"$&!*%#*&)*!!$&#!(()*(')*''&*&'$'*'#'+!%+#'!)('%+$(')#""$%%!$!%(+)("$%!#&!%&"))(!'**++(! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r13 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14098 42 209M = 14307 269 CTACTTTCCNNTANNNAACTTTCGAAGTAAATCCCATGACACAGACAGAANCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGNGGAANGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCNGGTGAGCCGGAGGCTATTTTCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGCCAGAAA $$!%)%$#))#%(&!##(#)*'()$+$+'"'%*&((&+$%()!+'!%(**+$(&'&#!%)!)&$'*&*)$"+)#&#$(*%&)!"%+"&&+'('#"$&&#%+(&$#&"&(%$$%%&$#&++$+!'(!'%*'$%")!*&#*$+#!&+")&!+"!%)"&!%!()+%#*!+&"((+&$+(+!$)*%(($*+*()*!%*(##"''!!"%%(+)( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0T1C6A0T2A0C0A8C25T72G4A25C19C27G6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r13 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14307 42 60M = 14098 -269 TGCAGGNTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCNNGNNTGAGNG #$#!**$%*!!+'+($$#)"!#%"*(*&+"++)&&''%(#!+"$')+(&$#(!"*&&##$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6G42C0T1G0C4T1 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r14 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7945 42 81M = 7787 -239 GCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCA !%,=B#)='6C43C+D""+-?%#7A(20%'.51(95AHC>--1BF>"('$0+7H21%2D03+6=9(?G?FA6(AH4.=40> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r14 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7787 42 56M = 7945 239 AAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGT -/H17,6G3>'$<"H-$13BA90$BF%:D+H620<>;==8B9G0'@:8-&=DE7.6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r15 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32442 42 51M = 32273 -220 CATCCATTCGGTAACGCAGATNGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCG A9.:?#*-!7?$H''H>$*'F(%FG<@"8$02G6$>2#DH3(.H2$"$E>/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r15 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32273 42 59M = 32442 220 CGACAATGCGCTCGGCTTCANCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGG (+#!#')()(+($&)"+)&"$$'&%!(&('$))#"***+"#"(+(&$"+$'&%*'$'#( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r16 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28679 42 82M = 28355 -406 GATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCNGTGATTGCGATTCGC G+&9*/140%;6?4+9?"G30B8'E&)>2(B=?$?#&F>+G--322><#2<9+!7$+'C!8283"1ADH7=$G(,2%!%>8G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r16 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28355 42 324M = 28679 406 CCTTACCTCTGATTTTGCNGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGNCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTT =0!".3B<)B86>)6+G9A8,%/;566&A5DA9+D:+%:4A4>#F15222><2C>=);.*+$27:+/(/15&-(7E$5D9(8'$/:2B/A#:.9E,0'+E%E6)F+548C%EDE3%@8(<<+2.+@$H1:3;*-@'#BFF+7=+$+03#=-.8%=8/!9$(6$%-,+A//"2D;+3>7B(2=4/H3B5H,1/B""1>"'8D?9$E5&*(6,"-+;6H,)D:),6)#)69=#?15#8<69"2%=//9(<=4$51%A";@G1=/#C3+C98C,*#!$E:$DD(+93D%(<:$%'/E6/D&;56=;0% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T223T81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r17 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5528 42 124M = 5318 -334 CACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGNATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATC +B-FG*A811501F/;8.($EF+>+1H.#!E$#5'*,EF6%7<);9BF$A;').#E&2EFAA)D4@&F)9&6&:$"9?E!59E62"(&A500H%D39D(?>>1':9)/$%4E2:'4@+2B=#:% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r17 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5318 42 106M = 5528 334 AAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGANTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGG 8B>60B'!7!G9"2+*!8,B3D<0;+E$GE60!>D+(%FB?5-3C+3,E?643/"-:'FAC::F09AC2D,'>F1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r18 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31466 40 67M = 31325 -208 ACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGTTCATAGTTGGCAAAGTACCATGCATTTTTTC <*?FA$-?E/,00$%&4,6H<-A4C.4A*7'&?64"/*7)=78G-1H&?3=!22=H5G?/'F=$8'; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G20G10 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r18 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31325 40 106M = 31466 208 CCAANNATNNTCGTGCGGNNGNGNCATCGCCATTGCTCCCCAAATACNAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGNACGATCTCGT (*%!*%%*$"#'($)"))!#(!'#(!')+%('"!%)"!(*%($('$(*#*!("'#+))'''"+"#')"(++('%"'($'%"'#+*(%%!)$"$#%$$"(#$$+)&% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:2G0G0A0T2T0A5A2A0T1C1T23A47C10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r19 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3783 42 196M = 3979 276 CAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTNGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCCGAATTACGCCCAGATGAGC ;E9:@02&"$&G'4F330#@9+A';A4*-E@52<2?$<;';#(&."=D/C*;?0C4.;!16G?AB38F@%+)B(D83A!;*(&44('D0%#<8F2137#<',C67=-@3F)<"01:E""81;.%5$:&>1C8>;?3'3)4/$ED6.2>2!;91**1-#5=HGHB7F(GD5:,H@.(D(0D$60D4B,@3.B++18AA AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A61 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r20 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27082 42 86M = 27214 191 GGTATTGAACTTAACGGGGCTTCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTT '+&(#!&'(**"(##&$!(#'*"((((**'("'"!$&%"$#&)$+'!&(($!)'++$)+""&+)%('++&"##&)%%+#)&'!(&$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A19A65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r20 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27214 42 59M = 27082 -191 ATAGTATCGCCGAACGATTAGCNCNTCAGGCTTCTGAANAAGCGTTTCAAGTACTAATA 'A*$07%B*8@60,0&82C-)3=)1E*DF+/-;>9;.=2"(/0H<1=%F%;4)?967(0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22T1T13G20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r21 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8452 42 98M = 8706 323 NCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCCGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAG $)+#$*##''&&%$"$$+)&!!(&%+%!&#!))&()!"*"!(+*#&%'$#*%)$"!!"!$$*(%"%*+&!)&$$&)(#("+&*$+(#"&+!'%&)&"( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C56T40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r21 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8706 42 69M = 8452 -323 AGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGANCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGTANN "'(%++++#$++(%)!)+"%"'"+!#&!))!(#(+))$$#")#("&#*(&+(!&(&"$!+$+"+&(+"$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28G36G1T0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r22 77 * 0 0 * * 0 0 TCGAAGGGCAGCATTCAAANCAGAAGGCTTTGGGGTGTGTG !)A;4>.E#+7A)@E'E8+?$+8 YT:Z:UP jpayne@0: r22 141 * 0 0 * * 0 0 AGTGTANCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGANTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGNTTTCCATNGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTACCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGNCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTAT #(G-.'BE45)GD'(&9+B&7<87HGE6=7%!>-$*48/H>0(,)6DB#C:<=7"F2)'D,0A@6'/&9;3$)97$9E76)H&0!G9+%<7:E753,A%2C%*EB%98)64#GBH4F57((,",&!!$.70#@=&%1C,1*4D3!>))F%/,1!2%+&):CHD1B@EF9A:(7C75?"&5'7*!G?",?+/4B&$(6-D&#)A7%1-):)D545"+9*/=19)(9GB4%(8(:HCA,DE$8'0A-<;*&2B(1BB7B YT:Z:UP jpayne@0: r23 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 618 42 60M = 391 -287 TGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGNCANGAANAGATNNC )"&$(#!&(%#*#(#%&)&"+!(*(!+#&##*%(!$"**$%(()*&+()*)%!!!(&)"& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:45C2T3C1A1G0C0A0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r23 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 391 42 90M = 618 287 AGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACA '6/!@>,.#:2B.1H>256%@+?E1;F@0'>35C7D43+25B9#G@=A+; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G77 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r24 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47190 42 23M6D100M = 46915 -404 AATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACNTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAANACGATG B>)-@0B@H,.0(DG$8E."$G2@<5G,7B9=%B$A340<@*!/!D8G/8,A0E.EGH==&266-,FB:>8"H:7D28(!/8H.:AF;7018H"'$$4ABB.EF8&"D;B&0DAD5A))A(8;CH+=A2&;+/#(-+>%;'E7-196%.F0>:!5):=,-1C&7),A>2D8+%!.C=,<1=%F/*%HB1(-0GC-B5/;E;+3;AG"89B75.66$B;+<,=D6%7'8D",+'4;;=4+.A$/0< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:206T68 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r25 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37229 42 89M = 37025 -293 AGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGG 7".':1:02C;;$)'/A2E<,&F0H,)5'2F72#+C,,E%3,0&#$E6G!$+H4<$;8C(=F7?: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T23G66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r26 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16659 42 199M8D61M = 16927 491 CCGCTANAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCNGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTA )>!>BF1"@=4CE7C!$(#B2@="1:E.C39<8>;4"BC,%0#&)B!%G%>?E7#6>3>'4#%E37H&:0(BF0!H0!$@.G3FC2<%3EB9>=;0?'EF@CA+8'F":'5DB>!?+',F!/7&?#69#@'/4C,B54"25#?H%E?ACB(3=80%=)5B(BE:+B1F5839983,1E2>@#,!1-1':*E*($?12*%C**1#(?,6$B9C",E$.D;/(0B!D"99-04;D-?:"6/?;0'",-G*2#;)6;6@!GH*B;/9(.4"%D;A.!**H<%%;/''..&##3<,.=9!A6?#31F%>-G)DF=.$5<%3-0'1G68=&)9>5"4$@4@A<"1&5:%6ED,%>(42*C+8#>F8.8*8(4!AD(#&H!CHC4H)2C5>#C.<=7=+A-8G2H%C0D3;".<"G8(&)5.&,##8;++ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8T12T85A62C0A51 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r27 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3862 42 84M = 3568 -378 ACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGNGTTTAAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGAGTCTCGTAT )H8*1'7#7AA($**/'30B&=F;,?+H@0$1E<>7'"A$28"6=730F"&-A:7=E4#=H)"'$@3/D(36<3A2@)<8#CA5 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T4G37T9 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r27 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3568 42 217M2I60M = 3862 378 ACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACNGCGTGATNGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCNATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCTGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCCGCTGNATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTG E&D4$6,&=F8-(7"4%C%#?!9%8A,AHG"/#B0=8:B&4;$96H*$6$'?5/2E21,<63G/-9)@(4*.+#)?3>%))49B)*&1G'E6/*@E'.5E'"C-ECA;;AG"(B$!D2!H8%><,73)H>C$'C2%9C@73>F@8$%(C8=C0GG>6!H52&@F>DE,5A?E:C@9%#B1.->*".D!*FB,)+.":&A6D,;>?:*$& AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:24A7G55T51G28A22G4G79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r28 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4364 42 104M = 4131 -337 GGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACNGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAA H=*/)$:"$!667F8A@B&5)D6<));E&#G)2;17!D$$=4E;@7>2(@!4&"C8C4H3@$F!/5)$E/"*7!C69(*8=&)B=G5*19G1$>038*+4862,8013C!=F<#97*4-5.8*H+C1(.02G#,$()97&.;3)D#DEH*"1#9C%,5)!% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:123A0G0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r29 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16730 42 40M = 16883 279 GCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGC <'D7+"88F:%&@"(!%2*AF5)7<+&@<=#,A1@7438% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r30 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42660 42 61M = 42881 264 CGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACC :4!+/*%:GC./95.2=HB:$@F60@.D=5;#E&,C->9C?!H,=1<-4%;FC'B@"2<+'+?*/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G1G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r31 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42371 42 41M = 42566 258 NNNNACTGCNGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTC "!!")((*&*+*#)+*%'"#'!$&$!#**"%+%!!!$$%)$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0A0G0C5T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r31 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42566 42 63M = 42371 -258 CGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAA E:.F847*=81D1@'#;%0/G#$'#H':-/0D(;*49@!>#=F;=*D)A,3:@>#-".-H?"B/20639&2/***=##'09/!3@.%G4,&C9A9FF&6C(5HC:C%4(,DD(+30D6/3EAD3((1-)CF5(C2F/,E%?2'8AG13&7E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A107A20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r32 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 54 42 54M = 156 270 GTTTNCGTTCTTCTTCGTCATAACTTATTGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAA *D-F,$HE$2(G"'<>1G)CD?70!.8(2G.->&C2<*5&EB;FB29%,:,6(4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C22A26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r33 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15138 42 245M = 15383 330 CCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATCGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACANCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGNAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTT %2FH"9D6"31)7818*1)$C+A1&>6H,!D=%6C>-D@EE676<.:=77D?"F71:9'+2E&%<+-E"6"@*+G%@+40)GA+*7)B99#B#:E36,/55E$!0B08>0AHG3B:HE'=;?%637C/:6)"5'/CE;-46>2;�'/B-@0A#7*#;8/&G:;$)-3C@F*.4=C4B'B:C3$F7(?)'7% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24T130C62A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r33 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15383 42 85M = 15138 -330 CTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACC :/3&#G5!A=E76*)!,+5,/6F#,H/82=#7&6EA2?92:C?)G"?'&8;/7;=",B;0#/;,6*$H49=')/)3-C"BA$DCF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r34 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38419 42 70M = 38300 -189 AATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGANNCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGG :(2&C)A?"/6C@*HB'F+E:/A07*36@$!$D0-#.HB3:?+&@&2#1/2G@F2;@-%2*#1E559491 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A0G35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r34 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38300 42 62M = 38419 189 NTGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATAT !3-+9-G4,*+9;D71'-'-,,#E;8(D8(#7@E8;.H#%7D:2"+4/(.,G,=!H#126CD?HG'!F,:1"9A"0:EB0)<+60B';-9F+&0"6"BA2#7D>(;H!(-ECG5@!3-:9B2=46H<*6 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:0G7^T98 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r35 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41076 42 50M = 41165 196 GCTGTATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTGAGCATAT ##*&$*&*+)+!('"'!%#())%'*((*'%**(#!!)%''"#'!'(%$%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C37C7 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r36 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19845 42 111M = 19956 332 GNTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATNACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTG ++*)((!+"*++"$"##&(*%)+'$$%('&($++"&"%')+%*%)&")""'(++!+&('+)"#"("$"!%!#!)+%$$*(+(+'%''%''!*#&""%)%%%#!*(#!)#%# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G81G27 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r36 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19956 42 221M = 19845 -332 CTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGGAANGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATNGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGN &D))C6=@'&AG@=;.D?F3#!:+.D<-=4)?.AECB@7(&+8;;.<(HAC==@<20E'*:#1/01G=*5+*3@(;%-?,-H.@G*F8@BG1,C?E0D4$)G7"D=C+.&*0:?!64EE'&E2/$95,8C?%1C#9D#&4#$GG6'--"*9'-'5;-C%G*90$*+<3GF->.6+57D',/<9F/9F(@=3&0'3(**.G@!+A$)4#='>.;,<=E24*# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:38T2C101C40C35C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r37 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48098 42 72M = 47861 -309 ACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTANTCTCCGACGN #"$&"!*!%!!&&%#'"'"&'!!(#'$&&+"+&(!(!''$"!&(+!)&)+$!#)!'$'#%'")&&('#++&& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G9G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r37 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47861 42 204M = 48098 309 TCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCNTTGGTGNAGCACGATAATAATANGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTANTGCAATGCCCTCGTAATTAAGT -/"''*%--##'4A.7?-*'8G#H(F;#6@1G"-EG"AB@>,?4*$8G-/418:,49'5>G@-E#)>?C')A&9C$?18HG:E@(#?2##%>$975(89H4@'/HD((9501/D&)!<9D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32G6A15T125C22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r38 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31977 42 103M1I64M = 31875 -269 CGACAGCTCTCACATNGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATAACTGGGAACAGA '"$+&%*""$)!#((%&())"('$+%%"*')(&"&'"&'$%("#+#'+%#%&'%$"'$'%'!'*"+(#+$!%$*%*+)!"+*"+&+(!'&%#$&&&)'&"*!&*("*$&"+!(+(&&)$!"*&*("'#+&%*)"#!)$*#!!'(#()!%%%%$"(%&!+((*&(')&+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:15C93T45T11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r38 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31875 42 102M = 31977 269 CAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCCAGCCGTAATTTGTGCCACTCATCATCCCCCTGTT 5H,;#A*">AC-/-.A::(!&"!@#$2-H+6>0$-501:+A*8',B6>/@+/'A'GE6$'*2++.A(:30?/8'61AF88-+0;<=H%/C.GEG,H7HA3,1 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67G18G15 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r39 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24955 42 73M = 25103 235 CCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAANTAAATTANTAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGG 6+.6)4/0)+$"E9<.;@3G9D:>$7'2=:=49?-8%'E!63")!:5+=75>$5>5$.,&2@4%(.F7D<1:" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C7A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r39 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25103 42 87M = 24955 -235 GTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACC EE2!($.FE5335%*#F3)?6659:-3#?2D;4)./:'C01,@8B9*B/8<729#))6.A@>"3#=1&C4H,@EA@(2D<.*$@:,) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r40 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28827 42 99M = 28963 292 CTNNNATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGNCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAA ))%%!+&+%+&%*)'*"(($%*"*$%*(*&(*#"(($)$&)$"')*&"%&(%*%$((+$$*$+"&$)"+&*"#')"*"*)*&$&%!&+)*)'%#!&"#% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T0A0T24G69 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r40 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28963 42 156M = 28827 -292 CTTCCATCGTTAACCGGAGGTGGGAATATNCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGCACGTCGCTGNTGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCAT @@*,)3@?$''G%(BA%H8+*1.4<8.@(/9#;=>9="0A?-)#<69(@C$8+7-AC2'%'8;72E7@'/,*@(6BA8,$"G2$#/+#04*1#BA:=1%<516()8?+5"D1!)46+6B2&*+:=0#6"CF&(1+?EB1+' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8C20C43G9G0C71 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r41 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40563 42 43M = 40291 -315 AAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTG $(5G(&C*%;4%HD*@7;CG:9B$8&*-?++F#?:@.5;7+,1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r41 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40291 42 52M = 40563 315 AGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGAC >-<&G-68#469E5@,E@=FA%'H9;AG-DD&.DG-F(6.B71G?15%%)/6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r42 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4120 42 108M = 4253 204 TCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGNTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCG 9-0-*BE53"@3.;2:'"7*&)/E4C@/G9?'15+"'#!A*7=&>H@'*4:;/DG<.42&(+/5:)/9?2=?+?*)7::0BCE/,)+D8829=1,+:4;7+!-F<$8B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r42 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4253 42 71M = 4120 -204 GTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATNTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAA */>.)192!64F$(!6A1DG5"E0!57>E0,9:&747-/&,#'350+=?EAD)9%F,$'CDC,E@80"9?B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r43 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22840 42 64M = 22840 0 TNATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTA $#)+(%+%*(*&)$$*&%%))+!&'&+!!*!+('(")%&)%&%&"+(!($"*')*"%)$$('(( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G62 YT:Z:UP jpayne@0: r43 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22840 0 * = 22840 0 TTGAANNCTTNNNGCNNANNNATNNNNANNGNTNGNANAAANCANGCNGNNGNNNNNGCCNNAGNATNAAGCNNCNNNNGCTCGNANTNNNTCNCACNACT $!!#!##!$!!$$$#$"$!"!#!#""#"!!$!#!#!"!$$!$$#!$$#$""#"""#"""$"$#"#$!"$$!#!!$$$!"#""!!#$!$!"!"!!#"##"#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r44 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41943 8 19M4I34M = 41943 0 AAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAANCGCG (1:((EB;,1=(.H%.E1"?4!")!70+0H6.BC9,A.)CB3!3A5<(:7%=$4BB% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:48C3T0 YT:Z:UP jpayne@0: r44 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41943 0 * = 41943 0 NAGGNNNANNNTNNCCANCNNNNNNTNTNNTCCNNGANGGTNTANNGCNNGCANTTAGANTNNANATNNNNTNAGTTATTTCNN "$#!#"$!"$!!"!$#$"!!""!"!$!!"#!""#!$"!!!#!#"#!"!#$"!!$!#$!#!!$"$$"#$!$#$!$$!$"!#$"!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r45 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5956 42 224M = 5888 -292 CACCACGCTGGCGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGNCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGANCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAGAAGAGNAN (""!$)*'%$%"%(&%"+'*!+###&#%"$#%"**(##(+!+#)&&*&&++(#((%%#$%+%#+'#*"(&)"#%$('!)&#'#)!&""$"(+"*!"()$+#(&()#+'*$!!++&"%!&&+!%*)&()!$+!"$)%*'**'(+'!+''&#%+'*$**!%$+&$'%#+%!"&)(((&*%%'&(&)%+"#%#'!"(*#+")'*"%$)!%++()'(*##)$'*&&'! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10A44C33C125A1T3C1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r45 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5888 42 56M = 5956 292 GTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCNGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGC <:C5".G4/,3F*6/:-E.<4F)+@6F)<&C3G'%=;,"$A:C7+#9/.;00:@/* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C23 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r46 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27418 42 42M = 27552 251 CGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGG HE9$5@:A?,00@EC:@952:623(.42<1;?-ED<0)1:!9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r46 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27552 42 117M = 27418 -251 AGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTNAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTCTGTAGTCTGTTTTTT (;:.1'0<<@F;/:6-3:@9/((!?+&!>(@$"+G,999=0GB7*(//%6=1F@7!>:35<'-G$D2C5-4:*,2D"E+;8G?A8<.2D890-+,&'?0'5(+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55A45A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r47 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24017 42 265M = 23826 -456 NCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGNACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATNTTTTTTGCATGAGAGCATTTGT #C%0;HA(C-*!/566'=4?-CB&1CB23&H34:>+/89A148$&?B0;1G049@=:F'>A"*)>1/.'7./;%$"31@@H>E;#0@E+AF(87+=A1)1,='D>;EEGH>,),%H/%5#F8=@//8EA9CB451%+:B1@-(8?;=#3>-/33<1"0.$6'.3.A?3$56$E(0:'8=0G$E(:#H>2G@&$2>"A34&"'=>4-!(AH8G$H5D:=1560225=+!:!%5"#D+:;41"*-*)17A!#17,#?!F#(3;7A,B4,.),%!)$,;@#-&86!=G$3=.&$:$=?;:$+?@9B)<7CG:7H7F, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106T84 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r48 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33966 42 123M = 33852 -237 TAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATC 6.%$,@$?7A73BHB39%80D<(5-77.)7'8'+,F36%(*">=G%=#24G+1?"(#$2E$$(:7540AC6<;B(7+11-8E?)=-&=1A<&0%#D/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r48 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33852 42 114M = 33966 237 TCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAA *1B.?;9<1.21,HF;(E*<@!"E-3GHCC7-$"A.>2A8;2D/A@1:D;>20'9<64->:7C;/!4,>,A6=4*9-1<+;>,D$#?%4'A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r49 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42136 42 171M = 42307 457 GCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAANAACCTTAAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAGGGTGAATGACCAAAATGGAAGTTACGAACAAGAAAGCGT 4/&6'"(119.=0;C)1/0-'171&-7H##)'B*4.+)H465>'$@-?5/!EC,A):7/$'"':/@2)<<)885H&@#&@H!?#725B%$E$@!B=;*8*;/19F<*C-*ADED#$,;303>2$,E%B04FH>=?!)#4&:$E),:5.4E:GBD=4*GE*6 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:66A6C57A5T10C22 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r49 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42307 42 286M = 42136 -457 CGAGCGAGCTTTAACGTGAGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGAGGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAANAAGCTGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACACTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGNAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAA 9*$F:9#+9"?'F0<2-E2@:9(B#<5%&87)A.%=.3G-$(DC'A9/+09'4;/>HC2C/*:>*%CBGA#$-E2%D7H6DG'6+)53&$B0!8*(@=93B"0);/)1;EGF):A0(F-;?E'D=G802:(!.2<#>!4)A(A!-!"7"8$"(571=.F6H*B'6(@34-0+@B79B-G&:B8;=$0@B04!8+D(+"29%7&&0=-:**( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r50 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15127 42 48M = 15285 226 GCCGGAGCCACCCTTTCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGT 5@@F(C9-BCA%2;HH$?'"6$!7C;3!'E$"BHB(G;HH01;(/G/5HB*<>!50)"52)7,2+0$?3)ED)>;:5++/B0AE"*GD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C64 YT:Z:UP jpayne@0: r51 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34173 0 * = 34173 0 TNAGAACGGNANTNGTNTCGNGTGANNNTNCNGCGTGTCCCNANNGGTTCNAATNAANNANNNC $#"$##"!!"!!"""#!#$#!#""$!""#"$#$$!$$!"##"$$$#$#$$#"$"$"$##""!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r52 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39544 42 66M = 39637 179 GACCTGACNAACNCAGCCNGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTA $&(**''("*'""$*"!)+#+''##)*$(##!%('!'#!##)&+&&$$$(#&()&+*+%$)+'('( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A3A3A1T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r52 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39637 42 86M = 39544 -179 TCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTA ):6F?B@36>.'219'F7B5)3?41-95)@>D7,'BHA1%*"/6.2?'8*0@B30"E3@!58E?C0"4A:!#9'BA7C);,?!/>9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r53 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26938 42 73M = 27061 241 ATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAANATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTT C+A8C$$=H8(>'C1-<-F7";C*G%,"8B4D?)0,@;)EB2/.5B+H@B&,*86.?GA))@"=D.17&$#G9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r53 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27061 42 118M = 26938 -241 GTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTNTTGTAGTTTTCNATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCANTGTTATTCATGTTGCATGGTGCAC 40-)=H1F5G,:2".11.B="CB!4&>1A72<"D;;EC@;C0*>?+&'+CEG6;15>54#"119#"'6CA6#8ED9)A@?;95%(4$9%:3;-5(;+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A11C34C24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r54 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36452 42 44M = 36191 -305 TTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAA 33DDG>A2:A0@-/>C%'C4$F37C8%;"%B4"+DHH,13");3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r54 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36191 42 41M = 36452 305 ATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGT 6C-#.H45%6:&!A3G=*!$#6@@G5-#27,,,"A;9CAA# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r55 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12335 42 81M = 12456 206 GGNNCNGGATNGCGANAANCCGNGGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCT *$"!'#'"&)$("((""&*''%#+#%&"#!'#%&&""$)(#)#&+'&'#!(*#*'&'*$'"&%'$%#*")%'!'&%())%( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2A0A1A1T2G4T2T3C0T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r55 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12456 42 85M = 12335 -206 GAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGG =&$8&@.5+,E6H.@/%B3H09("5HE8=E$.6-7-)51G:485<"/*HG(@0#/!<0'')*+4F%@(<-'0<)$@'+;&4D:#. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r56 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15246 42 49M = 14978 -317 AGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAANCAGNACACC $%)*&)'*$#(&+(!*(&!"'+&$!$+&)+(!*&$*%+)+*"$"(*"%% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G3A5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r56 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14978 42 88M = 15246 317 TCAGCNCATTCGGNTTNACAGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGNTGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCNGGGGCCAA *"%&'!#!)#&)&")("()$+*$+#$)+"**%"$(&$&"((&')!%"%)#((&)#%"&*#'&&(#(%#+(('*'!!)"$#*'%!"!"* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5A1G1C3G2A2G25A33C8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r57 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2319 42 193M = 2203 -309 GAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCNAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGNAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCCAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCTATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATNA #'$+(&&*$$%%#)#''$%#%'&%"'($'$!(+)"++'!"#+)%!(#*+#$+*&'$)&$"(%)+#&")'*('(''%*%#*"'%*)"#'&$'$&$"'#'$+&*($**!!$(%#%&")###&))*%$+%%)"*+%*!!%#++++)*"*%&(*%*!*$$)"$)*)((#"#(''''&+#'!!'+!+$#*")##+*#% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29G28A31G53A46C1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r57 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2203 42 116M = 2319 309 CNGTNNCNANNAAGCCACGTANGCGAAACAAAAACGGGGTTTANCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGGAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGAT *&)($%$!)!!*!)+'$##'$"*&!$")&&+'+)%"*&%""&'!!%+#)!!)#(&)(#''(!+&$!!("$+)$!!!'')%!)+$))+&!&*%''+&+&*!("!)"(!(%"&)+#$* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1G2G0G1C1G0C1T8A21C33C38 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r58 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1872 42 172M = 2044 333 CACGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTTCGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGNAGATTATTATGGGCCNCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCA **H:58;,CE/58"B=?&77+/=/&(H2-.3;>*B%4B3'9.@->.-?C?41-536/A;%;E,(3?;#:,F%9$($7'C9(&%?%F=?'351H< AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C56A55C15G41 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r58 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2044 42 42M5I119M = 1872 -333 TCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGNGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGNAAAAACATGGGCTCTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCG '###*%%++'!"!')"&(#%*')&&'(+*%(%$#!"##'&$)*)'"*$$&$&++!(&"!(!&+)"%()''*"*+!!")!(!))#)#()(&!"#)'&$!)%&+"(&"$%'$$'(!(&++&)!&"&(*$(*+$+*)"'%'("$()"()*&)"!+(%*+)!#&))"))( AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:67C11G21A13G45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r59 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27181 42 92M = 27326 215 TTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCNTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATA 47D@;/$B$#*"32B$1>""!*C$84G383+5=?.23&0+:7FF.DH?;5$3318>(=8.447'*"1D+%"$$:8B%:/#4"5>?(=6/F'G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r59 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27326 42 70M = 27181 -215 GCTCNTCGCTCATAACAGACATTCACNCCAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTC !$2E%8F,#22E1977(;C.?AC:+FE7-#&$>.CEE=C6!*;&#'!&1@<$1"->)3?>!27C/*0#+0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C21T0A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r60 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27985 42 59M = 28044 380 AGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAA E'4G7,:'44%#2?$#;91%6*&(4<9%0+,<-(4(9C#:(;1$E:BE::-!HF<14#@F2<0%)*G&9C5@7B<;(4?#6?3B2?2%G85B'FE)1C$8B*)(3.4;#<&95CF&&@@A%1"%(A.%:$9:11)#@#0),CF=(/%BB4A:6)=*2-+:#,%9GF)*(E6AH8F"76$CB8&3A!'BEG#A8A0!,$)%<+9;'H%*H+BG67+F3'B>'>,DA=77?(@A7-:BA5C&*!($ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:150T17A149T1T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r61 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21544 42 156M = 21420 -280 CGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCAC @,?(3%<;!/4+/:=F16CC-$+:5(>:/>$1D93D,2+?><.2>8=A41<&C'B5*#5$49*HDG%07"FCA@>:91$2"28#&=E2#,8A3-6%,7G14/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:156 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r61 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21420 42 44M = 21544 280 TGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCC 20%0CG$'*1&C?CH5CH;<$2=@D0&A7$HG:%23@8C4:>C2G6CG,'(>H"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r62 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28154 42 101M = 28020 -235 TGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACNACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCN +)C+5H#,"59,-?954G/2.;GE;A%A'B;2@(189.>;0;2C)#E@F20,?9<:0951)$E<&.,1B7%1HF+@6$%$,+!.E?!E&'CC16(7G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r63 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46686 42 124M = 46810 208 TAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTNGAAAATTAAAC B%'6&;!1,:4@.:*&9#"(7("0#8C""5(=:'+96?;0&H6!G7&*1$F<*<+D92HG"#=5B$H8@GGA6$&0./,56=:!:!04.&!F=B*&3%?&1? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r64 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6585 42 218M = 6517 -286 GAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGNACGCCANCGGTGTGGTGNATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGG A,F!?B@(D#)<6'(*8/4E.:8>B%;-6H.2+%0C,B%!9A%G>G1%B#5-$=2)4;"2!%5H&%A*#30E,76!%.C3?D21$0!+,0+,!=,'E3H3)=?B+GC90:H10E/G019(0+<:%&D7')8"0=/,5F0<5;:D!--&+=<%150H/@*$='!/F;6#06)+8$%5212/9$B( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:117A6G10A82 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r64 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6517 42 53M = 6585 286 NGATGNANGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAA %)')$###($+!((#$'"('($$(*!'&'&"+&%!$!$'&!'*&*&$$*#&*' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A4C1G45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r65 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45147 42 49M = 45371 308 CTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGC /4<03D/!C6?DB?=-B:6%+01-*H=1%;F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r65 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45371 42 84M = 45147 -308 CGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGAT >+H%?/5/*"'?%210&@2G'8?=7>8DH!F,01!8!>6H%01<6'F9*##"5.0,:4)@>5&A?8D2$GC=8$7;:1C&(5F$5/8#&+$#49<38*6A,B%-+&>-C3(3A!,$B356%H2&17?<,7;3E&A=*/&858:02%"*94$<*+35HA-&E*F6,%)+"7$8<$.G..'D9E%@-0F$D>B:#%G7110!&64BDB,4&82/#%A57?2F>G;*=$2;9/>H",4.D@>'-B4489$:!/'@3BA/)8D'7:::9(GC>8!,C$A: AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76A105G158C28C56 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r66 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29648 42 80M3D20M = 29221 -530 ATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAANGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGA 2<%?%5/6926C;$C--F<.AC/<=C;+->,<29#."G:!@9#'85=63/23%F/*)*"7H#"//970G3HC+>(>@"+:")*-+5D%GC>BGD4,,/#1 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:68A11^ATA20 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r67 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5263 42 186M = 5487 283 ACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGCCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCGGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACNCCAGCGCGGCGCAGCC #E"6F"$$0&6H26'8)2"HF@<($9.$/B&2&B#+*%=0<3.G4:4-'//@-?705E2<6%9>*C$.*$"#*.D70&1%8D(1771@A$6@FE>1!&9>/:67,8DD0+@,=6H, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T31 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r68 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38197 42 47M5I392M = 38156 -480 GAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGTGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGATGCTGCGATTCTCACNAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAA F*2F!A+;GF7D*-7"6%-2.B6&1%4GD##>37%;3,#@=3;BH&-HC4,C-3CD*9')A9C?*H,!7)))526>B3>>"B:519=>%9G?)D9B8A+C>)6+"&286F:AE?(*?@1*1$H8867"<"($6.4@7D7=2G()971-CG##&<>)2G4@B4?"->+.?H.%HB)94%>#>("+$@!4%EAH=.(#21!CG4:>0/;;&5A=-H$@CE<7$'<,,550!%-51>)B3=H0D;)=1:671<@)3#6$53&#>=7?/689H,76FD'H!1-.5?G==?46F3H,7A"*,5*/"@<$$,@,D&+)&A#+(55((+)'$&.-/2'2H'@*0;!>8A!A>#&7FE045""$HD4#1)/CA'2CH#47'G=/C35)ECH;*@90!*($C;#@3*-+./A@0E$90+D.A#,=.(BA;#><+G$.8D?9 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:81G301T15C39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r69 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25168 42 159M = 24928 -399 ATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAANAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTA ;5*,%B$);:!DD<7*2=E>E@/G-#<'A-D>@H-.$?B+6:2*40.EH"3A/+6*>5DB-)0:%-!=?5)6.ED@6;03/;?A-5AC0,&F8=>CE:('$6*2)".4=@B7C>*$D<,A89)2!G>$".1,)$'3E94%<0,>?9=F5/!,H15$()B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120A38 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r69 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24928 42 240M = 25168 399 GTNNCGCGAANNNNNNACCTNTCANTCNCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAANGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATNTCACNACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGCTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGNTTATTTTCATAAAGCTTTTCTA #&#%$$%*#&("#"$!&(''!#""&"+$)+"%++'"$##"#&""&!)$&&''!#&!!!))'+($%*!"&!*(%(!#%)&%#'+(##%*!()'!'%+")(!$)&((*"&("#&"($'+"!!&+)%&&&!+$*)%$"$!'#+"''!%"!%)"&+%&('*#+!#%(+'+$#&&&%%)+)#)"&))"*##"%!$"#$!'*(")(*%+"+%*&'%)')'%'%%++#*#%%"+#()!!"$)'$&'" AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:0C1A0C0T5A0A0C0T0T0G4T2T0C2C61T43A4C50T27A22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r70 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35879 42 108M = 35746 -241 AATGAACGATGCAGAGGCAATGNCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAA @3)8H32/C!-B>6;$>794BA"2D>"=(C1+$;AE366G=./'3;83BH38F@=<-@$(+3E0A,F5<4FCD>H'!C?!7?C90=,$1C"*'AH'$&HH4@D7&858 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r70 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35746 42 58M = 35879 241 GTNATNTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGA !%"&"$+&'+!!*%%""$(#+*(*!%"+)##$++$%$#*!'(!)#**!"*$*#$(($! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T1T2T52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r71 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21527 42 58M = 21585 399 ACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGNGGGCTCATGCTCACA >1.)(A=62&9,3+-$2%$1%2%F@A1%@>6*A*6C0E/=@A3/1!@2:6AD6C.1)*)FC@!2H,?. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r72 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29257 42 49M = 29103 -203 TTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTAATCATCTCCATAAAACAA (2'9"-1/4)<7?8!B33,59*62><1%;1(2$,9HD'F73=?$91:>:>/%':-09BED)HG@:/-C0$CC0%:<1G@,..%*?5,4BG$6,1=91#/(?*'#3$0D3)C8?61-<-A;3AD.;/61<:D'GB+F?:24&A*>,$!/7:1"&"0A;1EC/-<=6++-B>.C!2="53<1:GHE*,EG93D!/@*#7$0+E3EA#+=B=8%2<8/*;D@C6''>&:(E("(H>;)%.AG@/2#)($+*36'-H+>(459(;8,+&1>($,-54@#-+A7@..C2*;9>F)!=3EH9-6#2:.A<,# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:44C84T2C6G7A38A17C2T2G21C34C50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r73 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35422 42 111M = 35104 -429 CCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCTAAANCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGG 6+A>42?3$F!>'$!7)0?A@%/BC7+%29B!1A+?8"'E,G2E:>%);'@C"587-!H;*#(E69"H71F3*?B$!3"CB9*-G,?"H!A:".#/32/1:77E1>65'B) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74C3G32 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r74 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4441 40 62M = 4574 204 ANAGTATTATGCCNNCATGTNCNTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGG ""!)"#%!!&#$*"!))(!"#*!+%&"*('$(()&"'()$(($%!!(*$'"**("&))+%%( AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C0C0C1C2A0T4A0G4G0C1T39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r74 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4574 40 71M = 4441 -204 ACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTA ">F8.(1E!8F&=%;182A$/AB?,H9>,H0(63+9*AB3'/B=13?C"H#G4GG@(-2-.#<=G>,B23? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r75 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34760 42 109M = 34614 -255 GCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAATCNN )%+""$+)%#))$!"'*!")&*%(+"$+)'%*#(*+!"'&()#%&")&*+&**!$#&*'%#)$%)&$(*"'%%%!#'"()'($(#'#%#*'%++&*%+!!*$!#+!!"! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52A52A1A0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r75 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34614 42 54M = 34760 255 TNTGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCT @<,-=B$-,5!;(64#E=8()B27#3&"3.816#'384?1:"&$<#2@/B;371 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r76 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3429 42 132M = 3429 0 CGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGNATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCANGTTTTTGAACCCGTGGAGGA (3D:605!?".(F%?-$"*A4E/F.%!)-F@3H'@304#D.0/C,F?C(%A*321(64A"8@<*)75B+<25C0812$-59%2*;(8?:1186%B#:*5D+<@((&@;+%@&H@E7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10G56C8G26T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r77 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7816 42 42M = 7584 -274 ACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACC 8?*D8#$AE,&H0<,A=,9&C051@+G9=>#;(,,"F)76=%F0$2G&#'G4)0D6P?7!;='>D*'AE$?1)818=&5@;30+045.4;(,/$2C&D",.+0#E: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r78 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43877 42 51M = 43737 -191 AGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGC B?C7CFD:/B/*".FG7C31@"@F7(7C1':%)."@8CE0$+4"G6+(>$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r79 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46816 42 102M = 46623 -295 TAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGA ;%24-''+&:4%&-<''=--?:*2+$A$3=8+$AFA1+<1(93:G#E)7)CF7E1,>=1B?39<12!:#=(?66%9)/97?/5/83%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r79 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46623 42 70M = 46816 295 AAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCAGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGT ?88:>%CG'?;.CFE.5.C*;>2&96? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r81 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9795 42 448M = 9657 -586 CTCGCCCTGATGAAACGGCCGGCAGAACAGGCGGANTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCANAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTTGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGNGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCA C5C?;;=C:5"CD!9E(F,0*#:H)'>H7:%670EA@?2+%H0511EG+#:-EE8.6?-,+?A%C*6'H?&!>3H".>A%2F$BC?H4)4&$D('7*C.,@4#A*C>2@ADC6F)E+='BF.E9),";*D&.38.6>-@%';'-368,*+A8"(F$H$)B.558-5@6H=AB,%.:'#A@*A7;$5B*8@!/?:2;,(2)7/BD((,""(E7$;H@->A.37A+G*8*8*-2.F+'+-F<,2:<210&D,C!=H/5.!1*9!&%*,H8@9B3>78G0D(7+:+C>+?#BA:>:1-D7'E$!HF?C"$/G>F">2158591=+?27@GBC1B8/$A*+=G#.,HC)%C("+>*?1D>,">=*)D4-'-*8,/)2F.9+2$+1$E0ADBH)'C9093#?;A$=G'6>:.D;:A;$)8C!*1@; AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:19A15G89G199C73G48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r81 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9657 42 138M = 9795 586 TTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCANCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCAT C2/!)DB0":=%AED?HE>!(-7?02:5B-BH:D/:5H09F!-F:BC&&4(EB!3H&&EG2>)9@/%0D<94%A6914&"5HGF83=E%8DHH1<,!"C">>&6;$-?%.:><"6A7*4?1@:+(AH*D!0(7,/;(: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G86 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r82 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32839 42 160M = 32669 -330 CCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCNGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGNACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGCTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAG ==1>HD336-3"7+!>32HG'D%&;.!A,;)1B2;@C6%;FF42AC),/!G0)--.&8%"H%>0G*3C'E2H&;;;%55543/)EDE1#G?-4=+'$B&D)>@BC,'@C9/!>$400&84*")*E"B(6<#'?FAB%&(1@/F,F-2H"2364.F+F01E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33G47C33T44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r82 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32669 42 170M = 32839 330 GTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACGTTTTAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAA 7B8/5D2-#E.A4*.A25<'+/(63F?=EG&H<-9%F%*G4(E'>9G*E35;8G'1/>'!D" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C3A132 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r83 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7360 42 120M = 7617 321 TCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTAGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATAC '590(-;):DD!?E)06A)4,4=+8<7?<5"4)B:G/5E=9,#;,,(E,,"2"6BCG'#$/-+H0A/#,-(;E+8;4<#-*,GBB'E&*-!61B+?;G%2"#C6=--"#/,G%'$D,D1" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r83 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7617 42 64M = 7360 -321 TGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATG ,#H,96B0,&>*"!=8F2H(%0$C<15C,@+51974>G-(C'G';(E:4*5D>AGEC&1E8230 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r84 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15924 42 114M = 16130 257 CATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATGACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAA ))+$+'")&*$)(!#(&"('%&#("))(+$$&)#"'!*++')#&!#%+!''"')'%'%&(*")(+('"+#*&'!)*$!*!!%*)*+)+('"!'%#"!!"$$+%"''"#(%&#"( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G38C74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r84 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16130 42 51M = 15924 -257 AACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGC 8G9;99GG#;;F$B1)G?-@66@1?6!D>%,;6"?E=+HHB"A9BBGA/!;6=G4@/4C#(A*' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r85 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23111 42 40M = 22848 -303 TTAAAAAAGTCNTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAAC /454&2=A233)$47A,G522G#FH68@:?7)+(=4F@@6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r86 77 * 0 0 * * 0 0 TACCGCTTCACGCAAATGGCGCTGGGGAACTACANGCTGACAGTC :E#)A2,)2C?-5.*?0+2$&3C18-'H4,F3#;$DF*&$<&,#% YT:Z:UP jpayne@0: r86 141 * 0 0 * * 0 0 CTGTCTGATATCCGCAATCTGCTTTTCCGAGAACCAGAACTCAAACTGTACCGCATAAACGGCAAGATGCGGCGTG C-::,#'+86(DG)-'H45.A5?11D'37*F!5##A)2:!#/(:&9F.$:*+!F(.@2$',4.*03!-6&.+6(*' YT:Z:UP jpayne@0: r87 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16448 42 43M = 16240 -251 GCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCT 47.$+$>15/F@G08+1D!(?0%12+(E=;0FE:1;F''>!2D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r87 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16240 42 208M = 16448 251 NCGTCGAACTATAACCCTCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACG %>=BB8@3.,1$@"GHA>4231,;;$*CA/:-,0794"'&:42.5>*+1<.&?604,D'$),@,A132(3?E!?H:%(1;>%+&DE;4C$C!*48).=D")57F!!BCD!/8)8A1%+2D6!F77?(=1>>E&6D!2=GB.@A/%6,)A:+!F<>3"9,?FEAC#37D?:&36-)??2H9/8=DD>3>-'>+"(;!)>7BH3.(G7"4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C16G190 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r88 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48277 40 56M = 48277 0 GNNGNGNNNTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTNGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGAT !!##!%"#+($($#(&++!%$#+""%)$&*&"'(*)%!'%*+&'&*)+)!'+#!(( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T0C0T1C1G0G0T23T23 YT:Z:UP jpayne@0: r88 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48277 0 * = 48277 0 GGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGG 32BH,/!!HE2==D>)E(DA!C,+!G+&+,5#:#1-@G6%;H69+#$ YT:Z:UP jpayne@0: r89 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41715 42 97M = 41482 -330 TTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGC 0*1'76G9&#@"C;=,CA!?8!"@-0)=D;%=7E>-?&4/A2=21.0@9*8A:)E5(5F6%):<*!*&##EG>:G+HB69(,4G08.* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r89 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41482 42 173M = 41715 330 AACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGATGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTTGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCANTA %%1%9FA*2%B1E?=7BDC/5=;E@7(D2C=1:.;C">':229;BH*#!4.*$2.-GG<#?DF?D1(8BAB-14B0,'%9:D&9CA&E-.1>"$:E32>/'8%A+4*F=A#A##4:(E:9(1" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C92A32C43T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r90 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8489 42 124M = 8404 -209 TGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCANCTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGG 8<)*E$A,977%2F',215G:3D-27!H417E=>6)*!D%H3016-6%*!5?+H$!0713&6'()*@;51B9+81<0GH/23=23#EGE27D';$6@+:@A>?4854;>+D5G8- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A81 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r90 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8404 42 85M = 8489 209 NCCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATNCGGCG #H10)'=1.51E:4()3H2>(/F5G>!!D/)-(.0E"&.)!A&"G#HF"D3&0C2/,B$214(CC';$-A2@)39;,:/7G%#0A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A78A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r91 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20122 40 140M = 20299 271 ACACCNNAGAGNNTNNTTCNTNATCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTNAAAANACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCG #&#''!&(&#)$!*$$!*%!%#%"&+"*"%%')#)"+(&*##)%#*&$+!*(!$%#$%)#!#+()&%#"**!++&&%*#*#+(&#*+'$"!%!%'#&'&(!!#&+&%)!%(#&%(%(('#$**&*""!"')%(#!"""&) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0C1G2G0G1C2G0C1G0C0A2G1C1G81C4A29 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r91 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20299 40 94M = 20122 -271 CAGCCGCCACGTCTGCCTCCACNGCGGCCACGAAAGCGTGAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAAAGGAACCTNANTN '%*)""(+++$&$!)%!&)$)+!''+"'!*"%+$&(')!'+!$#''*'"&*("'$&"))"))''(&#*#%'*(!*(+'+'!)++#%"'"(&!#! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:22C16C40G3C1G1A0A1A1C0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r92 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43740 42 60M = 43800 323 GTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCA >F?A*/*!G>G"+D%;B8.2:#.%52;/FH17/B-6*/B>*.6"A84)FH5/4-7-H;@( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r92 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43800 42 263M = 43740 -323 CTCAAGTTTGCCAACCGAATGTATATCGATACCGGCGCAGTNTTCTGNGTAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCCTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCCNTATNGCTGGAGACTGCNGNACGAANGAACTNNGC "&&*)+**'++'*$!"(%)!#"**+!'$"'*"!($*(*()!&#$%*()*&%$&#!*)'**!%'&!$("%")$)()!%(&*#$'*+(+"+(+"**$+()))&"'&$+!&!%*$!*$+$!!!)'!%"*'&#+"+#$"%(#"+'*"&!""*)+!%'+"*%$*"('#(%('$+(*)))'#"''%%())&$#+!)+%)')%%)##!""('+!'$+&)'"+&)"()&'%)&'+!&#&'$)!$'!&)#&)('(*((!##)((*(%')!*# AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:16A24G5C1G51G125G0G3G4C1T0T4G1T1A1C1C5C0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r93 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41286 42 257M = 41151 -392 AGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGNACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGAAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAANACTGTGATGACCANTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATNAGA ,,GG><;1*?!$H&:C;8"+BF*?8G7G<"+,.6@)<%HC-&2!%H>AH42D2E--*!D7$27A#';**8H:,(E"',?GC#6#":4B<#/<00HE*F%%,"5HG.$3>*.@89$%F!-5()(?=%C?3646@H4CD#5&8))?<(,0(+D;9%)(<>(3BF;#*:*!$-?21?F;%G,C=>4>*0C.-'D4('7D$3>@5&E>&$*(-6H74A&B65;:!.%,A'H/,;8H0<;99G.<$G?0@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33A53T73T13T77C3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r93 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41151 42 22M1D112M = 41286 392 GACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTNTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGNAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGG 'A6B8@54!1&DC.)C<94E$#4(G-.!7;6/343+'='?9&!=#!?<(,5%9/$E1E0BF#AA52@$/D>7'%2<1!G%@;7!>!F?C$'.@< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:22^T22G40A48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r94 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9774 42 133M = 9676 -231 GCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGTAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACNGCAACGGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACNGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGC "+&(#*")$#$+%*)'%'$'**$!#'))''(*+*)$"*"***%%+)!&&&*$*$#$++#$!(%(*#*+(!$)%%"#!&"!'!!+"*!+$%+!$!+$#(&(')(!&()*(%*!&$!+!$!)"&&"&'%*$&+($ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33A29A5C31C31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r94 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9676 42 98M = 9774 231 TTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGANAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCA 6D:)'C/.H6'<7=<*!3#$)4F$<'@2'4HF+3C6;6DC&@B='.E&/":?:1#BB;+#;/=AG./"949%!)D."+;;.A'9$&E6@G?30DHBE:B%C1=?2B*H3G(;>'@A2.8G>C1G:02B:/<8;(@!4@'DC8%#%A>E/%(A24(2/6#C1!3B AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:139 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r95 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6571 42 130M = 6376 -325 CCTTCGATCCGGNTGAGGTGGATANGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAATCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGNCCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCT %)$+!'++72B!@"37:2C>#-F)%>:?,,,-0*&;9(*1B3"@?->"2*12$B!139*'4=#.1"4-6$2@?9=F*"$0E1*/.&E5#-/$$@%D@/ED''."7&D3C!()(?=>"(-*30!AD!2-70 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T11T30G43A30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r96 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6176 40 47M1I29M1I90M = 6124 -218 GCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCATTTCTTTTTCCGTGTAGANCTGTCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTNCGTTTGGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCC :2*>-,A(:-1"20#/;#:B&*7(077.B3'<3)+'"&%%11"@64)3<6@")2F%82%+',)E#<%88D;"D,)%*F/(H?*9@)3.&"C&/9#")7@$5!*7%6@1'"!HCB(F"@/16?C965?*/7-(42<*)$F4AE=@,5>/8<3'=!@B8*0-=- AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:32G1C15G2A62A5C43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r96 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6124 40 52M = 6176 218 GGGATTTTTTTATGTCGATNTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGA B3!B6>F&,:,F320<$3%0-1,3877=8<909=)E55@:1.?D9'@& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G32 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r97 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18927 42 133M = 18760 -300 GAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGNGAGAGGTGAACGATGCGAAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGT $HF0:'(&C>9,)E5-B/*'5E.2?,8=9=88(1%E5C"A;..9*=6?C3)6(49#%07#.!688)91'9/.G(H-)B7E2.%G%;:;#.0"1B7E07.?$=FBB+?3E"&4>$104=C)%-D"H%EHE?90(<)!)H$5>007<>E@04=CF%A960-(#'(D*4F;:)(2#>4+?F@D93517G97H=E+#=91>7!5F9-;*"17A8!;/G&3F87H<2H:5"D)8HC7$$3CDH$H%,==A&E5HE1A8; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21T4A38A53A22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r98 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43031 42 84M = 42794 -321 TGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCNAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGA $5=D"CG!285"",4+-1':EB9:->:<1=C9@)0,))8C<.(;)4ED?)-F6'1$((9+784(71(.?55F3H<7H1%5%<26 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C49 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r99 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38716 42 81M = 38490 -307 GGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATNCTGCTT 5A9"GHC@41.:'<71=A,+6BBD-?@=61C$F;DC@3!=)G+EB432?3(9=:!A1&9?#%H;A-&#FC%'9H*D!8/A: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r99 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38490 42 48M = 38716 307 AGAGCGACTGGATTCCAAATTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTNTTGAAT ?-(A#=7!EF AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G14G21C6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r100 77 * 0 0 * * 0 0 AGATAAAAAATTNTTNGAATTACCTTATANGTTTTTTTCCTTAGGTGA &%*!&"$'$)#%!!!!#%(#*#)#%!#!*$#+&!)*#!+!+(#*)&'" YT:Z:UP jpayne@0: r100 141 * 0 0 * * 0 0 CTAAGTACTGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTAGCCATACTACTAAATCCTGAA 0)GB>?;6G9;>/FDF';?)3*539A@)4+B5GF4>$8?$GD5A31*D28B0E'H+#>G%>9A866.E:**&2$6& YT:Z:UP jpayne@0: r101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41745 42 212M = 41952 272 GTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGNAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATNGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAANCTGCATGATGC <-C-?1B:-'F95'#2+45)).HEB81<7GG,3&#;'=1GC?9??C2F,"?G#+/:72%D$'@)#9569.D@,"8!*.5;91;$%7HE;1<23(*?(HG?<7!'%D2=8#6C15E00458"'#C):-)>0)F3;"#&.;$@:&)"0/:&96*A,C*'0H:"#5C'7G#$,*"(<819()28)$):20$>18=?88EGC/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68A43G87G11 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41952 42 8M1D56M = 41745 -272 GATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACG !'D3&*2!$A?1.4B4&8E@."7?*#,1#B=(,&?@5:$8@B&G,".692;B1)>)82#G%;2" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:4C0G2^G0T54T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r102 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42836 42 293M = 43129 415 GCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGATGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGNGCAAGGCGATCAAGGCANANTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGGGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGNAATGTAGTCG EC'@5+:$A9!B@D9"961*!F8<"E0B1<*90@+,3:3C&5:/AF4>4E>88F+H!4G#D8'B=1G*=1,@3!/7":$&=,ECGH"?G)2'<)H9**./8,-."+H1F2-0'4-(<'(0,D,=$C;6E7F=EE(%"?2&)G9F!;C AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:81A54T17G1G38T86A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r102 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43129 42 122M = 42836 -415 CGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCGTGGTTCATCGCGGANGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGC &-)6&86&&H086!,3E"7F.;*F1A3B=02>9.-+$+@$.=/#F4C!3A6G@9%%E#G8C@432(2$1+"9)182G(&*A:0,.=!.C3";617 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67A14T39 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r103 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23316 42 54M = 23442 176 TAAAGAGTCGAATGATGTTGNCGAAATCACATCGTCACCCNTTGGAATGTTTAT 1E<"7H89@%#3#2-8'F7G'"9H%8;33H+4'AGA-DF4D85'63..%CC2(< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G19A5T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r103 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23442 42 50M = 23316 -176 ATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATG 'G.(0?BE6@HF0F3'G#"64:!"''7*D25<(8&9:,G>-C3.:;,=>7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r104 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46305 42 284M = 46589 348 GCAGCCTCCCCCCGACTAGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTNCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTCTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTG =H8G$'AE15>3(",#A>0B/G1E?3F@+49:;<6C@+)D3?GH%*4?)8)"#C,FA(8G$54-6;C3#G7#H$G=4G$9;7A",B#'7H74"@1%3HB3,>@37=61A?"&D5!7)6>E?"CEG'3)D=CCE?&BCD,@0(4(!"2?>6;+@C9C((">2D3,/75/;G7<<9D,!BE2:",5EB,<$%)E3:A9<)20,$:$66;#0+,)*H@-@27=":>&7DH"C5E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G162C70T32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r104 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46589 42 64M = 46305 -348 GCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGNGTGATGGTTTCCT /EFBA:/$1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r106 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39289 40 44M = 39446 267 TTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAA 1'=9D$AF8.?-'$':,.=3(G784@*-9?1+6?"7+=7=06;7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39446 40 49M1I61M = 39289 -267 ACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTTGAGGTGCAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGGCNAAN ""%"%+!#"'')'*&&)'$$!(+"''+#%+'')+#$*$()**!&'!!!)&$+!'"*#*!&#&)(")#+"$#+(!)&#)($&&+('&&$*$!)*)+&&!(+)(#'+$%!&"! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:39A3C2A0A56A1A2C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r107 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22577 42 69M = 22683 184 AGAAACGTTGCATGAAATAACTTTCTGCGGTTAGTTAGTATANTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTG :-9D+0'A8>5"=:;9%(4C.0A,)..,DE6CC=EA/&'8B!$B23!/0."1.??)%=$'C<><*:6)4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T10G20T26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22683 42 78M = 22577 -184 GACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACNGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATG C.>;8,10''+6E3!)*1:/:F8/,1-#)G<:&(7$%C..!?$2!B)"71+:F/>B'G'=- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48T29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r108 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35809 42 68M = 35600 -277 CGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACNAGGATGCATATA 65,D-6A%C*&=H!'(CE'!)7"8H<:A/*@$=A.%6:)=?8D%,814#HC(9@$H:=1#&F3?9+2D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35600 42 45M = 35809 277 NAGTGGTATTNATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCA %$<@H&C=#8FD4>G:*(?2%BB8FAE*22:=FF=D.9H@B@<;- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C9T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r109 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18872 42 129M = 18762 -239 AGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGNGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTGTTTGCC H4&?B:!3*.A@D2,3!D=A=!!;!)=8!C;6(-D3<=-0#32$C/D>G.4($H/#;GFG/,7:$4CH8830/+1-54B"'-D)A4-DG.B3B8<-06><2"+>!8E3<=+9$$";A>D256;&!B-F+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A90C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r109 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18762 42 59M = 18872 239 GCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGG ;/.,-F@?+!!'*'+822E0=*'G;+0#E-)AD0=$(),@@/:E)!>D$%@AA9D%2;4>%H+6!5>>,?(*+H9@,45D7D:.9$"#'*A+?-9H=(53#64)(<#)?.%6%(,H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r110 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21931 42 157M = 22088 305 CGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGC -<:1<,F670C%1+".F(FF4A#B#4$-/@#4@FFC=.#D1)--E-*@,@.EG/;+.A0/9<$((+,+;&.CAH#D+45)H+;#8;&,!0$!$�*?@!60+98=9@8@$-!.4;G3D2HE6; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:157 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r111 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 483 42 194M = 442 -235 AACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACNTGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCA (%"!((+(%$%&%&)%&'#"$%*)("$%%##!%$#'&"$#'%*')+#)'$#!+)(')%($##(+%%%'"!$!%''"&*&'*)!(+'!*(*(!)"*$##"#'&)$&!)()(#!((#!($())$#!)')(%+#&%'#(+!+)+%+)$$(!+*)'(&(*)#(!$'%))+*%*"%+#*"%$)!!($&)*'&(!%+!"+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:147A46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r111 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 442 42 41M = 483 235 CGAAAGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGG ?/=9534<1/5=(0&%GC/40E?%F$'91!95G/?''*=?1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r112 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8051 42 190M = 8001 -240 CGCAATGGCCATTACCCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTNGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCTAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCG %.5$54%B%!H-FF4!;#7;:489'G(;!.D3H&$0?H((@#*=)GG8,$;'C)(2=0FCE:4-D*$$-A#&!%>9%?%'':C5/=969>D>%2:>2(;%8:AB3:!A,A):<4"4""D29EE$++-C,CC(119%5A-?A42>"6;D>@H-%EH2,B@&8=)@.$;5.B;9CG765(!C"59*1;/>;) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A29C79A65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r112 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8001 42 50M = 8051 240 GCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGC +%*#!$+"%*&"'&(%*#%'&'*!&*"&%!('%"&###'$&$"#*'!*$) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r113 77 * 0 0 * * 0 0 NGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGANGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTA $@D''D$9&AE1(FD;!0GA@?3<>B+7AC:")/HH:,2@&?B(//)/8+E9.;4D+)7$>HC6E9@7!&8*&9&G%41*#-'+231*$1:G(=6&%D0A5FD96E->8#)=*G.8,G;'&55 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r114 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 657 42 74M = 515 -216 TCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGNACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCNAACAGTCN <.F4D3/+@!/GG$?.=8H-;=#"92400AGC'8E(6A=5A6?8"8A68C!+!!>4:3H!BF54@/:$;1(@-1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33A31G7A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r115 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44649 42 79M = 44728 368 ACCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCG #?76)@(;E%?!*93*:A0A#)@$C*5,!A4)2D9!=4?."8;F251E3%@)?1;7+);!C0(,?8,?+/(1:H$'.2? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r115 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44728 42 289M = 44649 -368 AAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCT 5FH*&4B3)6%(;B)$6"4=&E)<>,?A@#AD2!(+C?%E&1&DG=3($>8D:6/"=;-)B=*@(D*H%93DD>5+#13-C?A+4C+-*?H$B69F/H79))E%#%9H5>B**B0!5)#&9-!&H29H//18C-445BE;6F,:6AF4:G/E@,"9B202*5>$:!-1;..5B<#2E4(B'F:>)GG:!7A%;50??EA>=704D(25AD> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:289 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r116 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12026 42 64M = 11861 -229 CAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCG (:#1C/#BFC7+G)#?H.FC/2C.1&D=!.:)$8D;1=DB/>@+#$&)6H$0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r116 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11861 42 67M = 12026 229 NGCGNCNNCGGAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCT %)&'""$('()*%+(#")&(+('%(+$$*&&$'**)&&%&))!%&%+)!+#%$#+*&))%+*'#%+$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G3G1G0G2A56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r117 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7018 42 53M = 7018 0 GCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGC 0+2F(/#0F'DD4;B*G7BF1?&@/:E%.'%(**(&-;>,:;44?<1"CD/45 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YT:Z:UP jpayne@0: r117 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7018 0 * = 7018 0 ANNNTGAGATANCNNGCGNAGNNGNTCTACNNNTNGCTNCNATNTNNCGNNCGNGNATCCGNGGNTNNNTCANGNNTTGACNNGNGNNNCNGNNACNATCNCCCNCGCGTNTTNCGNNCAACNCTTNGGNANGCNNNNNTNNGCGGNNNNTCNNNNTACGCGCNNANTNCNNNGNNNNGNNGGNGTGNNNANNNN #$##$"!"$!"####$$$"""$!$$$"$!""!#!$$"#!#$!#!$!!$#$#"##""!"!$$""#""$!"$""!"$"!"!#$!"##$!"!$!$"""!!#!"!""!!###"#"$#!$#$$""$#"$$$#!$$!"##!$$$""!"$$!$!"#"!#!"!""!$$#$$!!#"#""!""$##"###"$"$#"$"!$!#$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r118 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38682 42 99M = 38682 0 CATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGCAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATNTCGATGATGGTTACGCCAGACT %/(3@&C1$#031(F*7*=&&/0&6:=+&.;F1D2-;D/$2%(.C'DG>HHA'C?!;H<+47#E->B$2G%9(:+1D6D1=3'%3C.%*4/,- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G15T4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10547 42 255M = 10465 -337 TGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTNTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGNNA %$#'")"#(%)#$&**"%$'%*%'"#'*")#("'''%$"')')")""(#%#*$)%$&%'**#''***%'+&()#*%('#(%%&&&%($$!")#((!)"%(#((#"(%$*&"+++!*#$)(*(!(+#$(#%((&##(!*$#*$")#"(*#((')&+"*&(%*"*&#%#"#&"+(!&'*(%'#!#)++%%("*'+*)"(!)&$"%+'#!'#('#$'#*&+"+%&$'(&(###"$!""%*&+&*!""$+%*)+))%)( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84T167G0C1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r120 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10465 42 82M = 10547 337 CANGGATGTGGCGGAGATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATCACAGTATCAGAAGGGATCGCAGCANGAGTCCGGTATGGC '(!+!'%*'($&)#!""+"$$&('((*!$)%'#+('*)%&&'!*&%('&*&"('$#(''+))'$"$&#$*((#&'")*+&(' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C0C12C26G22G1G14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r121 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8417 42 299M = 8716 737 TGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGNGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAG '>:;5A:G(F'#B9C/F$H*6FF>85"-01*6F)A/.C19:&9%-+--6&/A@$FF26$.-.C-#$74.!+):HC1!"#A:1,3G/&"@,C+E6*,7-E39*!$./5G*.1".!%:(>6<*9<1=?E"(0-H5;4F>"@8G#5>-;@,7F!!0F=6@>/:.$-:'G"7E&BED?4!)E>::="#%5CGC9."!&#,6$44;)??<52)?C'H%>3&#?+=G2*;- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r123 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14471 42 91M = 14364 -198 TTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGNTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATG ;:886G-0)0?D--48D/-*%7H="*#@92"9F*4$*:/$,0*!$;6=8)F5)-$/*/**8>9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14364 42 107M = 14471 198 GTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGC <-A-0;D!=,'F(%3,=.;!#(%1*>(2':F14/614;=96D28.932=G$5G<07*9GGA!2$#&,/B#B&(16A=C(0C-:A8A"45(/?!6$20$#<"C9) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r124 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18233 42 137M = 18148 -222 GGAATGAAACCCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGNCGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTG H*;=B.25<32@+$D8/0>E;9>,-6#)E4A$#<4H:B(7.*D8<:A%*)<@,C#E(2:AG2*3;,">*9-F:0#E0>.83C9@182C0,#"=3>B=8BA?::9,5=/9-..C.>929@09@4'8BG!"C4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r125 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5997 42 190M = 5838 -349 AGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCNACGAGACGAAANAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTNTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTA (4G15(3C0E=8G'=771&<#?=GHG<'.$4!&2(190'HD46,?<'>.@5B'+;534?8=+.9!'.>&4/'(AAG:#'3G?-?81'."4F@H?<6+;';C%*BCA;?&@%:1D=G",BHB?B@<3F-CB#)4BE*F%;&.(72=6B5C1A8G11&H-)5:*):8;0,8C;!-@03@E.*6=90*,,:,= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G11A81T66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12898 42 42M = 13004 220 CACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCNGGCGTCCGGGA >-%DHG4!B5<47*<>#=H9?"G!;!E.G2+--6&3BDGH"6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13004 42 114M = 12898 -220 TGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGG )3<#)HC@<$98:(1,0GF-6E8"$80;$*3"!4><-H7;D303/:4=CCD+??$@%'8G:;<9/)?>!':7"B$6$12F*)#9E.4/,>0E.%8.(<&"#1,7>(3*?%%6/" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r127 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11508 42 57M = 11657 355 NAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCACACGACATCTGGAATCTG !1(&18H@=+=/4'@A%)G3*1?0@<;)/6E/2#@4A)G(%:B@1B'DC1/)(.H6DC1/C)E'=>(E+%/@==3-8->&-8C#7=?&;"!)-9B>>--'0=CD28C7AD)?:$1'#$92,G@@,G+->H)A<)5A<4G&G28.:@5A7C19F3HA(@C,C2:G?)H&G>??5!C)>36G"8G0;G.#4A=922B>(>+11.4F,#1FC(4F1#, AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2T65A17T93A25G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r128 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25847 42 221M = 26068 451 GTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTNATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTT 8<0:/81)@+3"G(H95,6.@B"(+;%!+D1A+0&,1)7%F$F.9+-7D*+1%8@#8!5H"G3"7'6-E:?$*D0!@=!H,E16'HE(&=9?-A7/531=)))4C39-=5;A$3EAA:FG$?.0%7?;*"&(1/+78:&'!ED$B-@@%+=.B7#FB-7/+9>@'6F3122H*&?G12 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C185 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r129 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37712 42 296M2I60M = 38068 517 ATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCANTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCTAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATCGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGAT ())&&+**(+(!*!#!&%$(%)(#*&&!%'#+&%'#+)("*'+'(*'&'($%+')%!')*'%"+#"*)%+')!#*&#"('#'!$(()**%$!*)&#!+)%"$"&#"(%"'#!*$!"%*%*"#%&*)%!)"%+*!+**!+!("'$"*+*('*!$&(%$+&!&*#"$')$")(#$&'*%%)(&$###'+)+$"%&&"%(!#'##*+(*'*)!!"%*$#&&*%$'+&!))$*+#+*#$!"*+'!(%&"*)$!#"*!)+*+&*(&)'"(%"$")$(#'$(!('##()*"+"%'"&()+*#"%!)"$)*$'!+%('#)()'$+("#%%)*(!+)(+"##(()"+$%#%#"()(**&%*)#$(& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:71T118A114G50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r129 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38068 42 161M = 37712 -517 TATGCAATGCNCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAA '674'6!.69'9/40D24C)316#'*$)CD8?$)E&@A.%)<=>;5G!2G1?&$<:?8;@E/=FE=/,B@4/*6/B'2,.:!1.$E&2G<1&D'$&D"0118%E':#E4>;=#D<'9.F>DC+C4*%&3?%"6+&:'-5!+@F-94D%8,"0;/9$>>/8( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G86T63 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r130 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14511 42 176M = 14454 -233 ATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGACAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGNCGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACNGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCG +#)37G&'*;B47'806?@0%#:<,G3.'@@=:'18%<@?;A<>F@-99.C#4H!F9%876GCH?%&%7%1B)=FE@&7%3FCB">%?<9+E!?)C+D<&7GB<0CD&'%-((=#0,-3-88H5B>'51C;?>'6==(:(4@8-BA=96'(4,7124A?<&A>39@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:67C30A33A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r130 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14454 42 57M = 14511 233 ATCTCACCGGGCGGCGCTTTGNGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGG D?-A2+9$H/>=&"'24<0&A8.,'&*E0<8EB0*"3:"D@*E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21A35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r131 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19261 42 102M = 19078 -285 GCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGANTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGG /;6&.'A6>A+9G=319$:!)@$'4-2+3.9/@:5A<$/)BH$;:5#A&?$1#,#9H>1',.83''83.?&+%+GG=H"D<*+15>/%*-C:>.0;64=)@H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19078 42 183M = 19261 285 ANCGGGTACGTTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGACAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCANAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCT &!+$&$)*+%"&+)!*$%!*+)*"$+&(')+)$)'!$))))*&!)(+**!$('&*&%'*&#'()%'!('#'("$(#!))+(*!(#%"#!*##!+(%$%"!(%&&%&**"%%$*"'))%$()&%+%()+'*#**%)$#)%*%#(()$('&)&"!+")(++#%+$("+&*)*#*'#*##+##+"' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C7A43A89C39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21890 42 79M = 21642 -327 AACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAGAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTG :+>A<)63%<$=+0B+4(;+49B20E5348;:<>.9'492,+"'B60$2FF+'2?GD98#333DD=/F$$BH>(!CF8: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C45A32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21642 42 248M = 21890 327 TGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACNGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTAGTGGTTCACACGGA F+0/-(F//A0)($:893:D,#2?7>11FE/*-9$0?B&6,5;6D8*=G6.#D25G5))A>/D>&.$3,9&%2B.&@@)!=0=6<6A%A#&/,3"EE:H0%)F9:&HH$2$5=%"G:;D='5<'C3*0-,G("7G'2./G/:0/FF.G0!*=1'>/086999$';+=E&9/D-F>@:-67C;@/E:G+*671*.:E6?+<#&68"8#5,=C!)HC AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:122A111T13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39687 42 184M = 39588 -283 GTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATC ,8+?1=6'==9F8/$(4>>112*?B#4AE%C?C(39''%BB<=8%B91574+C>;<229#)=C!9!0.)1"6!@"@9HA#:G%"/39!13:7F*)(3)-:@6&69G'#83;B>?%.@*83!C%49;5$C#0<$A)#&=501G=E(7(:8&B8&1B- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2G49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16606 42 56M = 16350 -312 ACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCG 4'+H;;G71?:>B0)-<9<;%/8" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r135 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26988 42 101M = 26819 -270 TTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGNAACACAGGATCTCTCNTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCACCTAAAAATTAGTAGTANNA (*(!)*"'$$($%'!#$#%&#)''$'')'*!'+&+%)#'&!%)*+$$#%&+)%#"$!&(%##(')$+"*&**#!&&$!$((%##)*%"&%%!"*#+**(!) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:32C15T32T16T0T0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r135 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26819 42 123M = 26988 270 CCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATAC >"'C,FD'2=%,9'G=E"?%#%##D?$*.,/-E'D'F+34(@GC:?=7BAF&B/.5HB:-8+!G4.$3>F%&4E)-C6&&G0=@2# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r136 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28885 42 76M = 28961 484 CTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGNCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACT 51H?EGF+05BF45:5$4:2#A+>*0!>5939?F49H:A:&08,D%2,G%)*#?,*@:&G&6D9.GG+&)/=3-(# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T33 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r136 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28961 42 408M = 28885 -484 CTCTTCCATNCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCGGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCAGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATNTTATAT 73H*#,D&?HE?C70+5;;%'!>?B>!-H&@.F/>&(>?H/'7"/'$"?/.FG%?'"-;@.C921'B3-2#9A841=%57>@F+;4!C2@7;3C.6&E!E)7$=E%HH-G6A&73(#H4/*&@470@?1+37!@C'GG!-4DG#5'=<."-DB1<)7*$F>2@*.@936!=:%!*7/%4#AF,#79,.&*:/9--)F,=>1C?F=H3D53)',)&'G?<&6/D'7B'7$$+8'6>37H.G-+?C4,1$);H&42")%H0+&A+E?<%E?HB;=/H!D82$B'),69.0+-#-.0'8C(F AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9C269T35G85G1A4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r137 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34097 42 48M = 33903 -242 TTGTTGTTCTGTTGACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGT D9#F4FC,D8H6<10"(G-(.31B2CB(1*+?#@*&4BA/F-"?"'"@*,9-C??F1/&?FDH=#AA?3/B8#7+E>C7*+4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A1C28C26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r138 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19927 42 147M = 20100 241 NGNCNCCGGNTGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCGNGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCG !%'%%#"$)&&'+*%%"")%")%)#)*+##%%&&'&$!)$%*+*#$%!&%%!!)+$'+**#((!%&%+##!&&*&%$(!(*+"('!&$("""''!*(&'$!'%#)*'))!!('%#*%&)(+)%%*+%&#")+***"#'*$&'"'*!# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T1A1G0G0A2A105C0G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r138 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20100 42 68M = 19927 -241 TCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGC 7):-.-"B$,7C/8#&.1&,;%H1+?2+%5(@).'+7)(56%D86GB>EDB>!E5@0C5G'-5)%>(- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r139 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13908 42 60M = 13908 0 CGCTGTTTTTCCGGGAGGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGA 9-E?3*B#7EH/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C43 YT:Z:UP jpayne@0: r139 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13908 0 * = 13908 0 NNNNACNAGNGCACNNTACGTCCNNCNNNGNNNTTACGNCTANNTNC $!!"!#!!#$$"##!"#"$$$"$#"$!#!!!#!"$$####!!#$$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r140 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36169 42 60M = 36169 0 GAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCGAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTNCAA +'""!$*"$$$!+&*"%$)!#&&(&+#*"$#%'))($"!*%!*)"#!&'*)'")+'&'#' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27A28A1T1 YT:Z:UP jpayne@0: r140 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36169 0 * = 36169 0 GTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTNTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAG ;C39.!D#.8&94#(?="'>%4G06B;&-.;-8=/&C=1),:?6"F2A$:G+*8!)"<31<>9"@=<<2?"?1363AA>8'0:';G2,8+5;'FD1:5(H@/:")#H#*C.2@FBAEEB$1;!*+*#E>,(1>(5C)8G0:#G6H*D*>E"5$4$0=/4F5<9+"H3+:%,&+F!735.7''#& YT:Z:UP jpayne@0: r141 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20664 3 33M7I66M = 20895 292 AATTCGGNAGACCGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTNTCGCGCTTGAGGAAGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAAC %*()(('"%(("+*&$'#")(*#)"'(#&*+&!+"##+#'&)))!$(##)*(('"*+%+*)$*"+&*(##*"%))&#)$*)&#&*'+)*)&#)&)!+')*%#'+'% AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:12 MD:Z:7C1A1A24G13T48 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r141 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20895 3 55M1I6M = 20664 -292 ACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCCGCCGNNGAANTGANGCGTCAC !(''+)!#&&"!$'"$(+%%!!("&"$+%(("&!$##+)*!"$**%")*!#)*&#&()!(&( AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:13 MD:Z:40G0A0T0T1C0A2T0G1T1T2A1G1 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42993 42 152M = 42891 -254 TCCCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAAAAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGNAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAA $6&#C+$)A-23-&.2,*A27'*,6G%'+#:<=D:645%"!(B.E/8:GAAA?:)6E9)G0&20GFDB(B:?:>0F<>$4):;.22@38:(9*.>A?3>(;$0G-8"-'<.0'CC$-'%6F>-0,C%CE8/&=3H:?-73>D#"0F:8!;B2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A27T57A64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r142 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42891 42 102M = 42993 254 GAACTGATTAGCCGCATCGGGCNGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAG ;=3:6$6A-*#/9@,E(4)7./C@:)C2+;+C7-AG7B?=026?//9&5(+B<'E+!8;/=8,)D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A79 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r143 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25607 42 103M = 25768 256 TCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAA 21#DH$03D!!/@G2H3..8F%H)H/@B=995+"7?;"$C$$?9/D40''33H1,+2;%-D.5;>@DC;!?DF4A,G<#HG@2+8C%--87) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r143 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25768 42 95M = 25607 -256 GAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCNTCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTANATAAAA /?H$(=&)=@#=6.1%"3$3F%2DF-+B)&&B:1!@1>C!'&5)3=:?:>7@1*#C!.*5E;C3E5/A8B(8'G*8-7.9/#D4@1,C.BC:AC5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A54A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r144 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17001 42 681M1D35M6D497M = 18221 1272 CAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGNGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCTGNATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGNGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACCGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTAGGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGATGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCCAAATTGAGCAGACCAAACACGGCAAACANTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTG )B/=&(@&!:")>,$=)&6$7&+00?:%E"E-E57E#:=>;"/C#'+7F@".-<5;G@"=9-97*,;1.;A@*)?-+24:$90"7/2?A?7@@(E3!?E*=G.--$7+H>6-7=)06A#&9=6$85E&3B:--0#B383%B6%4F("2(D8;8$E6"CF$D@(9G?'!%'2G)5%.)B2C<,--:@<,836A>("$=@%,G"972+.0,A?00<=;C(!!1/E3D%,,/%'?7+92)*0@C?:##?0G.>(A%(8B>D56D0!8/'817,DB;+"0=610#C&#+0633.A;&G")(>C9.<1/.@HB=-9C,@E3/)!$'C<;5)B0E(;3+(;@C")1F3&E/7=4=E"'B'C0--(*:,-:,D7..-68%//!D,4A5=3H5!"(B"(E256;5HC0?,%.#D?F;?G>,&#"-G:6H:"0DC>H<1"2:/!BA4!2/H8C&*"75$H>H=79*!)5&'$?G2C'091!)0/1/'#<2*%=+$D&FF"7>?'/)%"'3=00<:H*%5H9#8EF8.;5A.74D(.B'<8B@2((:8@/BD/%#7H;D735-AG(15#2>9'04.%EB?;G>)>&.)@?D7%F'."?%6597>'E!=2@,.?F'4>7E92(AFH=A>"$>(4$D>%!CE8.A!>8:G)8G-.EE05C@4*>C5H?%FABDH;=3!9F(%/+&;8+'#4;D32="89%A*B%=A'D*?+!#=3BG:GAH+?8H(-8F"3.DA:@92)9==0FG>E#8+B=@F8;%"84H4?&>7B0-C@HE#4E5:G-90;0E;41@>(/<5-().4%4.7(#.CC%%6>)4,F&/:*>"#&0=.);&+<'?A5="@-50<&22"B89@7":&)'%,>G">?:@?=9#E;($0#>13%0:D)0#?A=:$9.D733!(8C,4<@1E37EA#8@#7F(4?7(,!-C8""@+B'D#61%+743;;4>!83?4>561%#6;!&*6*#;'E(@E8A0,H9+7>G7.8!/AG!F72&#";&<6;D(E$#,!-5>4,736%1('91@:'E88"+3&C:!;$"HAH1F$F$ AS:i:-59 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:17 MD:Z:236A35A1C177T60G167^T35^TGACCC1A162T211A17G10T91 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r144 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18221 42 52M = 17001 -1272 ACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGAT -(95:974><":$?,/!2*3=7C'5"3/6%4A(!A6C)46H(:F2C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-59 YT:Z:DP jpayne@0: r145 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10135 42 201M = 9929 -407 TTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGANTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGNT #$+!("$(#+!)#$%*$%(''%%*()#""(!(""'+"!!**(#")**!"()(!()#+*)*##!%&'(&"'**&*&'%+$+'+$'$%)#(#'!+!!**)*'(!)""%&&&&)+$)''%")!%#$((#&*$()%$"'+$)((("%(+&(!#'%)!+*&*(!!+*$%'+$)$))!%'+$&'$$)!%&*'")+)$)#('!("+#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:84C114C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r145 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9929 42 206M = 10135 407 GATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGNCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCNGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAG )4B/:>8"F/@F&>>+%/#,D4<'37.(-8>H:-'')2.H(@):;&9%8(98D8G(?9F7=2G=?1!1F5-,><;)>.)&B*;CG@1#<25*.3.'.E9H*;(*'/?4$31-,0A.4F@(+:7BE9"-%@E>5A!*)G!D0G7D+3EA37A00.*"(497+1$+<9,F(E)G-;(BF3.BFDF8/)'A0,-C@/@-F%".$!!7A' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:99G65A40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r146 77 * 0 0 * * 0 0 AGCTGGCTGAACGTGNCGGCATGGATTCTGTCNACCCACNGGAACTGATCACCACTNTTCGCCAGNCGGCATTTAAAGGTGATGCCAGCGATGCGCANTTCATCGCATTACTGATCGTT +$&!*)+!%*&!&+%##%')+(**'+**+$$*$'$#&%)!*)(*!$#)*&"%(#)*+%#(#)#++#%%%&$"&)!+$#'()))!('''"*()#*%%%$##(&!#%"'###&))")$*'$ YT:Z:UP jpayne@0: r146 141 * 0 0 * * 0 0 CCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGNGTTCCGGCTNACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATCCCAGCAAATCCGAAGGCCCGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGNTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTANAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGTTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAANGCCCAGCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGC ?G6%=+1$G-1F"&;B!C>$(>=6/<&8%E#GA8;AD6*F+F47DD'B9<#+E.807,16?6.;7HH+)0+'1)61<('9'=%>&C1,@#8C<'2>#E"-(/(=.+.@=!,70(F2F?59>/AE*D.'!";A;>01;$):A1H'F.&$:#A+/0EEB)3@B##A4,%B03"6;:+"6%2E?06C@F(67":7-:283$5)&E%:F8@*C7D@,:%3E""&5.$'1H(;9.-H;(D4B'<="7/8AD$%E4:=);!E'*>2,=>E.3!#//,,$G6="8B"'"&&*7*0-5?:G;(*!*$"B1.=*/FC#=/.D6,B46',<2>#:":47(EB% YT:Z:UP jpayne@0: r147 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12457 42 82M = 12282 -257 AGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGANGGNAGTCCNCAGNATNT "(&!%')(*'!*)&%'*$!$+'(++"%#(!+'*'#$$+"*++&$+$&!!)%*!&+"&$))+$)+"'%&'&%&$&*&($$)"( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:64T2T1T1G1A3A2A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r147 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12282 42 79M = 12457 257 TGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGG !1=*E8E$1905"A4:*3.>AA$(7*(70?GE9"G73+2'004(8FD?8.&"?7*B6B"=A4+.?.$H.,./@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C78 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r148 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24114 42 207M = 24321 311 TTGTGGCTTGGCTNTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTNGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTNTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCNCCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTT 7;F"?.05?%?'F%6!DG"++4&$>3&,5B)/4/9F+A$&827?+(72*<$;"5<%C@E+:D/=>,72*%:D,C,.416H,:?5-.1=#3+:350:6H:1E1D2C,<2)"C'*+=<"'!<.+5(:.42DE-=*A>.F,!4.C(0@=!51(143/G=(>3%)FG1,;"3//!*.-5/6)(F?;HD/-($9=: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13C99T25T31A33G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r148 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24321 42 104M = 24114 -311 CCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCNAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCG 71BE%#'18#)-8%.:0.>.>.-B69A3HB/+88#1%="70+>G,=H*A*3);3"1G><8%"8=!%(<-<(G,F"6:=E5B*!.(=GB=.DH(%B1/EB335,3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T26 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r149 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38417 42 84M = 38501 261 AAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGG 4D>%%9+)=(+08B&?*FG+F):B;$"C"8;F<(4*%A&10H@%%8!.0*G7<:AB59?6AAH0!68$1""2,536.=D24,)% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r149 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38501 42 177M = 38417 -261 ATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTNGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGANCGTTCTGAACANATCCAGATGGAGTTCNGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAG 30.=)!3%)($*/4:#3(!%B6G37((''$=<@+*8;@9F-!=7-B@<@;C=0$D219HD%3=H>01E",G?%;HB?HB(*831F)1"8E,H0C!B.E7#)F2G&+$AC.39@"*G#6/';/A.+08,@;'5GF0-9,38##?8#1=@CD5>8H1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:80T41G11A15T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r150 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35321 24 47M = 35107 -261 TCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATT E825(8+B6??A'&3A+&=3&-4$>81-B+9=#1+EFA(3%'(9!0( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r150 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35107 24 76M = 35321 261 NCGAGGTACCCTTTTNCGTCATNCATGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCA )$$%"$*'#&(&%'"#"'**''!(%(+$'(%#"#*!#)#''($&!+$$*)*"**##*+$*#*!!')%#*%!!%$#' AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0T0T1C0T5A1G1G0C0G0C1G2T1T16C34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r151 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3979 42 67M = 4095 257 TNCTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCG 7H9$H/@C<9E?A8AG=)GG'F9367"!!(0%;072A0(;H;G#+#'&5;?"!4"5" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A65 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4095 42 141M = 3979 -257 CGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGNGGGAGCTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCT 8E-C@A<;@"=6(/F(E>GA3/3E24A.7*AB57,.-?%*&G/#:9*'G6G04AG&/D4>8%G<%B!397$F&%9'H$=26;208#BG;',+$:)7*8(+&G0"!0E;!D+45A(/(G;H->$GH655!7;9-H;EG?:B$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66G4A69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r152 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35513 42 129M = 35426 -216 AATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATNTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACC ;*?!#4@1#3'/D;.$$<(C8E94G?--<&<9?3"F#AH.*=C4$?!F>5D)9ED26)E#=00;'@:GC"">&H(;=(+E2EH01@(;&(74A6*.E+D9H,BH58B!:,'8D77'A%E;?3*/1>!H= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r152 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35426 42 87M = 35513 216 GCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTG )9%19:?=-*514=-C76:>@H(G2490370%#>5"6E3FB6&17'6D"=:1'B:%-GDG:;1%>,C*/.!B;:/0E0,.7DD>.@< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43255 42 306M = 43158 -403 AATACCNAAATATTTGGGTAGTTGNCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACANACTGGATACTATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGTTTATCTCGGTGGGGGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCNGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCNGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGNGGCTGGTTCTTTAATCTNGATTCNNACNNNNAATCNCTGGCGN +')++')$#$%$+)(&(%"!!#)&%"+*$&)"'&!!+&")$*("!)"*)))""%%'+%&+%'()!'%(*$&$+!%(%"("(*&&)'$&"$$&'+"+#!)(!$("!&*"&"#+"(%(!"&'()$&$"+!$+"+#'#'()$&!*('*"*!*"!$'+"$#+#'""(%+()%*#)**)$))$%("&('$#"#"*#*$*)#%%"(%!&#!!'*$*$*!+$*)&(!#&!)%!%*##*"($&'*)''$*%(&"((%!&')+''#!")))&*$!$()#&()%"'%($%*#"+%##)&('#$)''!'#(%)$'"' AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:23 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:23 MD:Z:6G17G26T8A9G27C13C37T25A85T17C4A0C0G2A0A0A0G2A0T0T5T0A0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43158 42 97M = 43255 403 GAAACGANAAAANCCACGGAATNGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCA #'!((%")'$**#'((##!")("&*+*%")(#(%('+))&++&'#))!"*'))$"+()&"&#%*&")&'")(*""%"%%*$(&((')"'#+#**$(( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A1G3G0G4T0G4C0C2C74 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r154 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5714 42 131M = 5898 297 GATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCC +*((F+7ACE*A$2AA*#-A,C3@*".=A-(ACDE89!B'A-+'-6?.90'835=AA4<*H+8D5B45@8B223C#A8D<82:#(:%?@2:G&=)=9#3/%'.4'<+0!F&G*0H)?'GE"#%>H**,A64 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r154 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5898 42 113M = 5714 -297 ATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGNCCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGG 1H5;7#.:*E$'4H"F>&5H+E>/7%$0*9<7&=<@CE8'#0D@@'=E2*!$'<2"C)#&00!2/4#:,&?A>D0&3;7"*7D3E$0E1>(27+4#98==9+<4F1%C2F!01 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r155 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4460 42 83M = 4331 -212 GCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCCGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAG "'9%,7@=-EH/H&,/"$.E53##?:3GA8#A!$2!)C-2'1C61-55+;)('7C3-7( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r155 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4331 42 89M = 4460 212 AGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACNGAGGAGGAGAAGAGT @H3%826D/=-=@;<2B**))*D'E2HD/&+%3/'AE?+%B'$?(A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r156 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12489 42 227M = 12489 0 CAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTNTCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCA =B(B*7(/0<"GB(51$@@5*5,D&3&)(>3!#0C(2=%&<6E+A3%7:$C>>1.3ED00@G.A.&C(0:('2%$551'<0,B-%B')?*;3!6B-D5-"86B!@:H-5,GC-H$@-?=1*2-*5.!H!C2;FB6<7:971A:!%,%054.F!H*3)$C:-F/)D=+/4><.AF)%)H#"0:2(?,!1)A#2.B(H<-4,<4"@*#90$?<:*)E:.0@5D)F?D;& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:162A64 YT:Z:UP jpayne@0: r156 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12489 0 * = 12489 0 NTTANNGNNTNCNCNNCNNNNNNNGNNNGNNCGNNNNANNANTNCANNNTNTCNACGNAAAANANNNCNTNCTNNNCNNCTNNTGNGNNCGTNTNACANANNGNTNNCNNNNGANNNANGNANNANNGCNACNGTGAGC $#$$!!"#"$""!$!#!!"""!$"$"$#$#!#$##$"!"!$!"!###$$"#$$#$##!####!$!!"##"!$$#"#!#$""""#$!"!#"$!"#""$#""!!"!$!!##"!$#$!"##"##""#"!""$!!$!"!!""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13606 42 64M = 13742 223 CCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGNACGCGCCCCACGTTGACGG $#656&929D0,4@8,FH%%B>2",&$1H8E3'/984?;HG/724$051D)17H(F=F-5$:AC AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44T12C6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r157 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13742 42 87M = 13606 -223 GGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGANTANNNGGTGGTNAGNC &$%'&+))&'#$+#))#*%"(!)%%%"*)*+*"!#'+*##(!"'!"##*!'!&%+!)**(+(%!#'()"+#%(*%&&''%$'"(($* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:70G0C1G0G0A4A1C2C1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r158 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14716 40 97M = 14845 178 CGCGCTGNNGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTGACCNGGCA (%$)*&%"#&#()+!(('"%&!&*##&(&$+&*"+#*($$&*&$$(%()#++!"%%**#)#%*#%$$+"%!%%!$)!%#+$+**&((")$+%)'&!) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A4C0T79C3G4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r158 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14845 40 49M = 14716 -178 CGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTNTCANNACGGGAGCTNAANCGA )&*"#*#+&+)"%&#*+'*+!*%+'%(!%"!&!"**&%"$)("#&&%'& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:27G1G1A0A5G3G2G1C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r159 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32091 42 56M = 32277 252 CTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCG B,$C&?&E.C?5B.)A5>,)A+.0"-5;D/B2!7$(6$(9?!,=(8B$9HD7<@:/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r159 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32277 42 66M = 32091 -252 AANGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAAT E@*2<7/:4,G-:H3B4-3-5G'#7F+1(<917@!48$6*H7"C:#'G5/F$!A>1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A4T52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r160 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9025 42 50M = 8839 -236 GGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCA A:H&9(,?$$(C7H*!@;1+!#A-H;HE-!(?AB?6A5+0;:?1:%*GE4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r161 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1293 42 76M = 1097 -272 TTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCA F5("1.5393+'D?;3(9-"+#:<(C$;8'B&5.64"8**'G$-.41F19)2081&;01B%CA&9?55,$&-!!=8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r161 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1097 42 49M = 1293 272 GCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATCACACGCAC ?AACH*9!37&!6)@>H7$09&,*>(A6&(#D%/DGA AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A6T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r162 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7160 42 66M = 7025 -201 ATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGNGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCC 8;:,>50,(#9CD3?"D?>::#%31759!BFA-+&62(=A-H3>9?:;#C8*CC33(-&*$H415+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r162 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7025 42 107M = 7160 201 CATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACNGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTG 8>.D/#08!'4@(G@!*6'A:=D72&4&"GH:8.)<#'0=D,#;>?@>4*>,()84F)<:GG!EA1'9?!@GGAD49'40)FD(.963'7G(>7'F8A9AD!.H6D) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45389 42 118M = 45177 -330 TAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGNGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAN '*8-E(C5;0$3H=?9%+%%E8+CHC2'.7.(@3A=1E,16)+6!1C1"/5%4D+":3=AE!->:& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r164 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32159 42 59M = 32329 222 CATCCCATGTTGTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTNTTAATCTCCTGCATGCTTTCATCG -<&C:,'8*"6;9(2;,+'1D@D=G<-;5+>H?39*2E"/736H4C31@3:$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11T22G15G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r164 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32329 42 52M = 32159 -222 CGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTNGGATGCGACT 62-B>0><8F1G23%/&E9-4E-E)7GG>637A$DF5/"!%1,5<"&E#F4H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G10 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42222 42 110M = 42332 215 CACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTCCGCTAAC D<;9<346%;25F?E9D93>17*#78)H*''(:F4*6%C,D#'3$>5'1D/F03."#5)C1-.!.9+6"&D45&GF)#*$06:-?2$)//-CCAH.8'3('1;2@&4=6* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102G7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42332 42 105M = 42222 -215 TGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGNAGNTNANGGC )*)$%#**+'&&+"%*&+('+('*%')%'"+*'$&$%!#!($$(#($+'"+($$+)'%$%*'#((*!+%#(&"$#)+)&$#)(%('!+$)++$*%(%"*!'!(** AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:94A2A1G1T3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r166 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44721 42 92M = 44595 -218 AATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTNCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAANNANGNATNGA #)!#(!)#!+"&%+"!&#%$("#(!%")**)!+)!+!%!*$$'+$%#')%$'!'("#+*()&'&'$!*&!+*+*!&()*+""''"#"")&($ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:36G43G0C0A0T0T1A0G1C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r166 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44595 42 126M = 44721 218 GTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGC G#E5)!#$3?B!27$,8D)"H6)#%('#61H=<3A1+>4$3?E1B>@520;+-7D*!G,?=CEH6BG26.&'0#,3+;;A>D2-4>2?!;@7'*$2,'9H,8,#+21%#+=0"4543#:49B2*1? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r167 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32250 24 57M = 32032 -275 TTCTGCAGTGTATGNAGTATTTTCGACNANNCGNTGGGCTNCATCCTTGTCTNTGCN +"%*"&$*(&##"*!")*!!%%'")+)#%'"%(!%#*%(*"'(&()$$)&%(*#("! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:14C12A1T0G2C1C4T10A0T0A1A0T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r167 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32032 24 47M = 32250 275 GCCACCTTCTGCTCTGCGGATTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTT 6D;4"3-H"49D5(#F89,>/?F,<<233)7<+*B@(%?-:9H/:!@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C27 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47454 42 201M = 47345 -310 GGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGG 'G,!.)'1!=7;0*2=E(.3?'&GD5,,;6%E,0@C',91<6#!723.*6=,$27H/A/E7%)-&6*F@%,7=!<0.*,,H<2G&A64&:F#C"3/,?7A5->'7E(7?014!>02D4-3%!#H)!C-&!!3&%#?)A$05/01,6',.7"8?)B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:201 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47345 42 109M = 47454 310 AATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACNTGAGCCATT -:*3&*H2=).&/3,%">8,*>5@-,D;+$.A$9$H%2D'5;3=AB"H/,A9&@1*?>&*-*?.+1D9C$8:3&C&&AB/">? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19549 42 76M = 19401 -224 TGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAAC @F!'+%BGF)60E:%9,;6C5+'1C-;:&"'2$8-C*)/%0AA69AG3"*/&,B8&A?):;F.3#&=A/,,$E9// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r170 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47411 42 162M = 47221 -352 CACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTNAAACCTTCCATGTGAAACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATNGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGANCTCCTTCTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTT ++'**!"()*&!#+"+"#"$+!''")++(%%!(+"&+$#"$(+"&%*$(+$(+!*!("+&#!!&)!!%%%""$(""+"(&#&!##&"(+!)&%!"$"'"%##'*#!%&$%!"'#"(#')((%#!#*!')!%"!&"#*+"+*!$*&!)$##+*"!$')!%+'' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:46A15T24C26C6G40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r170 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47221 42 190M = 47411 352 AGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAANTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAATACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCG =0$=$H@53(=64@DD5=;:$1)%0=F;.!)&H97!2""!-7D=7)C4<."!G$!HA#$?;G@'!-A4A68?(8>1;*&>)G9.-(0B=!78=<0AD';4&9@#8$B=4"8A,7;#(8@50&34A2A#31F.A( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T129A25 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r171 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 993 42 150M = 915 -228 GAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCNAAAAGCACCGGGATAACACN 9#B7E15>94+G*"E;8?>H3-C7E:0-0(7B/D!';9$;@D>73D&=;3=F7H%-4E4/4B!)A:?E6FH="0)@0''0>.>-$?'F/F2"#:=;=2&*/#C0(?>044767+?8<)036':D%C/&+=+8<<>5?D%>G4H&B<"B8" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86T42A19G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r171 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 915 42 74M = 993 228 ATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTT C%A&4-:403(29+!'C(@:C>/,9,,+D&7#"D:'G/@=-!;A);99D9.7AD&9/"$)5-F=&.D4$"0/H" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r172 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3063 42 106M = 2873 -296 GCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTT 8(F&5?BD9EDEAC$71EC,=BB8624&D<3:113A(@1'@FF7D>1#93%=8*78'+1/#609+- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r172 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2873 42 64M = 3063 296 ACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGGGGGCA ,0B=-"<'E7/<59FG8-B0?D2;/:$"4>3E90E6/0/-F0#:E#2%%6$=EEE6@!-*BC?( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58A5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28928 42 332M = 29260 448 CAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCNCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATTCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTC 23B&@!8GD9H1$7G"9-8B/C3794=3.D45?<;9D2%+-/;%=+<5:D"7*68<4&0",$=@$>!GE27+;CF(+/@=@*/FH03BF"F-@<'CG)(:(2BA3:5'0AA2F?2(">98&5DH<$8D3>4.$H?H*8,F-&5)F(=!1!3887F/"4*=+<$4GFEH?H=(:)/C=A9@<5&:'$A6551/'-+7+07%!"';>,-:1B<=?11'E4?HF5.A<$.EG-B0#=>%*/D!2>=>B/3@.21@F0A'G6),0BG55/)!'E6"2@49(.7++D(04-6"'*@('(@<4*&7+'-#=F!?D)&/4<:(-95"F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:160T107C63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29260 42 116M = 28928 -448 CATTCTCCTGTGACTCAGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTT &!)C!DF20E<3:E$0(B)D<,-<$,*CA<18+(?933)C;H.)6+++,:/898-8CE06/.8$+%47#A=)1>34F":!<1BC$#*DB4CH?F!!=,C<>,%/?9,>7:7)2*?E"H,33"7?2.FGH6$"F8B2DEGG>(;D;",3AC-/D6&A..-F$H%&",<*=&;#F.B;9F/9/0B*DF1E7#004'C81G"%/,#F8%CF%1&6)6;).5>% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:82T85A0G11A24T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43678 42 137M = 43443 -372 CAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAAC FH<8E8C*:.":&C$=$F?'FADH%8-@;,46:70E=?+&,&*B!%8=9=37/B8"C&+(G95=F&A($*#B5C0"!22:C-51..:D655=*!%E%D<#98?:/// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r175 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38161 40 102M = 37896 -367 TTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAANCAACAGCATAAATCATGCAACCCNGNTCNCTC $(+'$!"')*!+#++!**$)#""&#%(()")'$"!+!$)*)+&*"#("%%"*%)+##)+)&''$(%)'!*!++#!!((*&&)(''*'#%))#+'"#%#!&#& AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:4T64A13A1C0C1C0G1T1T0T0A0C0A0C0A1T0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r175 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37896 40 112M2I153M = 38161 367 GTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTNCGTGTTGACNATTTTACCTCTCGCGGGGTGATAATGGTTNCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTNAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATT @)118G"(=;&!=F3G@@F6)%#<9G;;C:-5BGH>#2+;9@(""@0H,.E1!.9:9!#,82;9G*8,2B5#8..902+#'+4F!#A7$A=9G,/0%&%?BE.;64*,16/D)8#:@#0D%8(977;+'/#6!$<:/?/6'A0A0%+5HE?+)?52%B(>@D>FA"DA*,"=99*3>58$1)<711=@*!#"-('(A4.7??.EH:B:A92,4#AG5!-$:147)7--3FA70%#@D=:$%D. AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:87G9T11G15G39G99 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17476 40 206M1D8M = 17691 268 GTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCNGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGNTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCNTCGAGGATTNAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGAT ":+,41/BG.8E)7+)9A?@+"-(A*//(;A?>.7%=/-%5%<5+=3G8)2)8!FDD60"1#/3%?>3+?&'G!@?.08HDCD&!B0;(A1:>'$834<:;.(9GC0<"6@.3<*%?82GB14(+GE4=H0:0;@;@3*F#?.?(!-&G4EG0!=6,H79-#GC'CG(B?,B>3$%*A<"A8$9":=H9H:,HHC!F85,11#G+<=E7+2E41 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:105C47T25G9G16^T8 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17691 40 29M6D18M = 17476 -268 AACCGCCACGCCGCATTTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCT $+'$%+*(%$'%(#$*"+!(++#%%"((%'**%&&''(())#&!#+% AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:16C12^ACCCGA18 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r177 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15296 24 44M = 15296 0 ATTTCACCTCACTGGATACCATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTG +-G*==?#=#D&=,25B3A<>@=F29)+-><@-1)G4E2H7+(- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T12A25 YT:Z:UP jpayne@0: r177 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15296 0 * = 15296 0 NNCCTTTGNAGCANAGGNANCCANNNNNGGGGCCGGTGGTATGACC '$*%&*(*$()')!"#)!#$&!#("'"++#!)$*%$&**!&$$'+' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r178 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32038 42 42M1I63M = 31886 -257 TTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAG #ACF,98=(87?(3)H8;<*(<;=-7'")9-*/3:8&#&!#00!)B&90,(A@-"H,5A$D9@HA,:7*HFFD6$-/C,9DCB62$D7+-+$B,)#A>">0: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T37C38 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r179 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29796 42 53M = 29868 264 ANNACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATNTTTTACAAAACCGATCTC ($#+#+%%#!*)(#*'!'!+&(&$&'+*'$$%&$*&+*+$+**#$+"+&#$"( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C0G31C18 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r179 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29868 42 192M = 29796 -264 GCCAGCGTCAGACATCATATGCACATANTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCCACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTATNCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGNCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAN )%(!!#*%+)%(+$$"!**)"%+%'#*'+++##&#'&*&!!'*"+*)&"*+!*%%"(""&*)''$')%#(")"#$+"$#)!&%(+!+++%''&&))!"#")!")(&++!("%(##&&*)##*!!)"("&*&+(+*!"')(++!+#')+(&$"+*!'(*"%)'+($&%)%*!$(*&#%$$+""*)+*(%$#+# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:23G3C29A73C1T33T23G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r180 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8493 42 56M = 8597 175 GGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAA "-19=?&#C/E=65@*9FE$G5+<=6?6%:H@85)9E==?%34;46'459>@8D$= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r180 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8597 42 71M = 8493 -175 AAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGT .&+80<6/9$4EB).*#77&3&.@*@)E99.(#'E?>46*-9&A(G)24':5?$,5.C*>F1*3H6"%;H= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20361 42 135M = 20263 -233 GATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGN *=?#1)5$6E3E<8042,BF'@725)!/2"6(#('<30>#@(<%A@;=:A:(F1,!;,"AA205H)2*(?=.+76%!*71(!$,;1;("<.&674;%@%,,>*E/;+G2-!C6>'7<:3+%AD#E5!H>3") AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A17C21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r182 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5179 42 40M = 5396 271 CNGCTTGNCCNTGNATGTNGTGCNGGATACCGAGGCTGCA &%()&'*!%'!&)"'!&*#&)*)"*&+'#+"(&!!)*"%( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G2C2T2G2C1G2T4T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r182 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5396 42 54M = 5179 -271 GTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCG 9D**'6HF18#3#>!&2AC(+#:A886"96$+6"%"8.)+%706>$)-*#8.3/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28653 42 125M = 28778 194 TGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATANCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCC %D?;2B='4HA7D1.@%C"1*B=H7(782>FD(1,%$DA*5%+=0DD+B2?515D<1+8'6A5AE*6&*DB;59:1E5G/#?D""+1+2=<=C',*%*04**5=7=>89A0+/DGH;H6,!213"+F'8;.74+A!,@C+*1,D4B@4B.,7=D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15904 42 104M = 16008 347 GAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCANAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGT 8:6="4,6,1C"D'CBC/"$GB#D>F/0D#E0!G:@-!GH"BGA(F@697*'%B*'E+((32,1'">;GF46>)D9.5H1E7/H;$1"/$!C2;%"B(=?H&9AH)5=-?::,8'.A<';+439@H<:5;7@*#&0>,1/==).,>1>/!:7!(9*-=@.>0"/)>#GG?7-5>:$"&5F)."&'-";'F*E?->/"E'++,9"4.B@4CA0?B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96T2G32 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r185 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40596 24 16M7I13M5D68M = 40361 -337 AGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAANCGCTATT 4H!(;@;>$:)D82G"%"E1E*/?%!!C48=<$50DE?>#5-*6B59#;4/?";6)0E.'8*8@'0D!$5,<*"(D>,"H.!(%+86'(5ED3E"'E%E%/7H< AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:12 NM:i:13 MD:Z:29^TTTGG60A7 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r186 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20559 42 108M = 20771 286 NGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAAT (4!:"5G.2*8?/)FDG0,H"><(*189=B3F,8-F3%$4;*3/%37'*+*(7>F7>+;+<0'9?&EH"<..&.!0.G&!.(3"1-%C>HB)>();,.49/):>"!G: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G107 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r186 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20771 42 74M = 20559 -286 TGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAANAGAAAAGCCCACTGGACAG AD45/9:7>8??<$/4/##'=#BF6@AD-"(G#-E5&&6;,%/$4:<0C-6.AAE>=.&#/'3F@4G!";5/?( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32392 42 161M = 32563 262 GTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATT B=>48@836@>8F6D$"E2.>3G0$A#H*9E90?9=.-40'AA&293G2(A"'3=5C5#5>4/*0/%8<8?/3E;(&6C5$@AC-/&B8%BB233+"!+*E/D:)@D*7=C2D=!'+%)"BD#8..84-'D+9A&-@:6".A7H"4$91B9:7&6#7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:161 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32563 42 91M = 32392 -262 GACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAANTGTCTTTCGTCCACGGANTAAGGCCGTAAC %)%"&#!!"$!&(++%%'!(*%%)"%"&#'%!"+($%#$)'*(')"(%(+'+*)#*('"+$*+#)""*!)("&(#*%!+'$('!+&#+("" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:60A1T15T10C0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r188 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38782 42 115M = 48327 9721 TCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGANCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAANCCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCA .*D6:&#*,*,22?3.15,F?",;%CG4%HFB#!G(9-)(*+F3<*%0>%F$A&4C=E7B$;#2F.$!6>-+2H#13E(-+!,1H2:H*9#A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35T45A33 YS:i:-26 YT:Z:DP jpayne@0: r188 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48327 42 172M2I4M = 38782 -9721 NCTGATTTGTATTGTNTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGG *>)@453;3366(!%!9)'4+DF'/0A")A8/9:3=!+2&4*1C)4;@C+'B1-@+D-4H/D!>@D+FF21==()8@<&1,.4+!8)1#3*A8%29-?H-G%/9)+"B"=:C3"B10(-B#&.,$<>9.#&'@1&?#3>@&A/<5@H6CCB9-D;B:B&H1H;%C12=:5/5=D.%2: AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:0G14C137T18T0A0C1 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42409 42 96M = 42555 267 CTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATC ;1,?B,'3?)>&,)@F)/6<8?=FHG)$-5&".):80C)>!"/?6*8:A#F6/3D=>/,="7DC%)/1)634A72)%5DH##B4''BA&%16-;(%27*(2A.9?%"(!$#:% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:99T46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r190 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31874 42 86M = 31987 259 TCAGGCCACNTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCA 420'*A(3C=F(46&5%4)54$5/;*0D,#"(B2:,@.8/3@%+,A62G0H,':.9G$-*3+<(.!772(($;%66H3H?=>@%'" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T76 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30825 42 19M2D61M = 30982 240 TGTCATCGACGTTTTTATCNAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCCGCGAAGGG 8F'.4()$(E;CA4?<4*$#B;D:8=,@%,?('9-+04A4#$6/HB?01*$"0(/;2@#%;!56"<-)4;;<-E$A;5;D;H.G. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C54 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9293 40 92M5D8M = 9478 228 GAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACG :=;#66'E':B-5(:)%/!?7)*'F1<.-HCG.F@@01,178!&547>%>5:)D=12F>=<1,/H%A8,-A=&G+;,H4@'(FH60*ED$?-1,D?9.,E AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:92^CCAAT8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9478 40 43M = 9293 -228 AAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGG /3$!,:<01ED84?6$8F?BB.),"8+A#0;:@"5,F0=&*@F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r193 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31964 42 43M = 32142 230 TCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCT &//)'8$38.C5&GB5F%%<.'/G$0(07=B#"F,.0+(E+'3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r193 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32142 42 52M = 31964 -230 GAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTG @E0C8.3F(&AHB*-@EDA<*H!D!#,>+!0&;@)=$!C=6D)*!)C&C=H> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7808 42 204M = 7746 -266 TTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGNAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTNACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAA FHE?0-7!C/&"&/*<8*1)$)84+)42(H(':/AE,F-.AF9=+FE32'>88:%+4%3?1:!%=C1*,'"5B-)B4HA&@#F>;!.$1<>:4?46!88<6H49(2"C><0=4';*"6&C2*(4428G44D>CD,G@,?*;DH68#"0EA(<'C,B**50G+36+!/:.,#20;;C/)DE,69F*;=1>,'G#2$F4*&!4$2E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C22G42G114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7746 42 54M = 7808 266 CCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCC 9,4;'@A9B36)=.'28G50+(6&&:'%FDG8&F#8H"&==B!$=?7'&54537 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23881 42 74M = 23694 -261 AAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGC "'*!*$!#*$%!&&*&$*!#(%&*(((+&*+(*'!$'(!#)#+**&&%!##*%$%$)'"#%#+")$)""#++"( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23694 42 129M = 23881 261 TAATGGATCATTTTTCCATNTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATT 7+1,?65,F1B6&G!$0?=:?;$)!A32(2F/-24HH8$%+B3A?0+%#9C:'A'?15"D:B&<:5-5>5&<)1#F*#?H7*&+-B,=@'*C>A(73B4$C&;?'D+!/G.1H$%6@B!D5"H.?,64) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r196 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23734 42 70M = 23846 158 TACCAAATGTCATATCCNATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTT ,A38,("-*!B(!2$48+-,&C+,$#1=;@H+%*?D469!7D>D/H/4(F9-#3:=G6)D1DF3D9'H(< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r196 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23846 42 46M = 23734 -158 AATATGTANCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAA =GGB0!(9$7(8/F"A;F:.%'!/!:4'-:)7B0<8@=G;)%F'($!0/F92G?B@0$@-6$D73E;*:B13.'DF4;?-%$5H1.9?4':/%:$2E@'E=@888!%-!:/-"E0E02)CD4096C5F9F5%7A:%,G&B0B!0%:5*."+EEH"?1H916$E0+!/=472<2#3D"9!%'<#"!/0/7/:95F,75##?59-:D%/:!;!'==GC/D41FH.7+E)F'''<0B4/,%?98*4@-D?;;+/&EB+!6/0AAFHD6#4#=-+*8ACCC9$/5/E-6@H2.=3!7+=A;4=HD32#3"+6!8"=6G$1G7(.@A%8(: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C145T147C66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16378 42 159M = 15985 -552 GGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCG /G"C&04+44B$?<=#<(+7@+$/2?GE>>==<+C(!EA4757/3!F1'G5H4976=64@-%;G96A&;@>9/")"20B'3783$*'"%(,%A%:"41F07+A.43@%5B'(A%D+#9';3&%C0+9/>*&8<:$3!&@G*7<=-*3>7#22'?C!498$<7<$(C'B"2">"><)E;G@G71(#C.*/$)7* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r199 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34881 42 111M = 34881 0 AGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCCATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTAT C#5@B7F2-=-3EAEF1&11'3?4E:5:CB0D3'=>"7/F>:(/C@B$+&/DG)-A6,"<&B4F443:>&53/@;'6/D8D'&@/&&?!1,724+/A/,9/95E780A%D9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39T31T39 YT:Z:UP jpayne@0: r199 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34881 0 * = 34881 0 NNNNGCTNNANNANNCNNGNAAACGGNGGNACANNCCTGNGNNNNGCCNCNAANNNNNTANCNGCNGNTCNNNNTGTNTNGGNGANNGNANNNNNTCNNGNANGTNCANNGACNCTGGNCGN !""$$##!"$"###"$$!$!$!#!#$"$!###$!!$###!$!$"""#""$$#""$"!#"#!#!##"$"!"!$"!""$#"#$#""!!###"$$!!!$#$!!##$$#"##!#$!""!$#$##!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r200 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33356 42 80M = 33146 -290 TATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAN 7<53D!EH2,9F5EFGH1G%8>8C1F?B,77/$F3?9($/ED14(%**C,@)9&)<05&BD?+')*##C@14&C)GB'<# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r200 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33146 42 84M = 33356 290 CCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATC EH:2D;&6*)':,'824*0?0$$>?(::>,&13)6#0-?+H0?D++.6=D8:=(G')C00>?(%*=)!,6%0:-=B4.E$64?A,&<@A@5'51. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r202 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27330 42 149M = 27557 308 CTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAACTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACA H(*9583D31A4A8$!6.H!,F7F>;6;2)6CH"5954H,&5>;&<&:1>/><+.<@A$7CA=#D6)0(!AGC6B@:B*"?; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61T19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r203 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48285 42 97M = 38753 -9629 TNCNGNTCTTCGTNGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAANTTGATGCAGATCAATTAA )"$&(#(+%+*%#&'+"+'$$!'"!"!)*"$$++!(+(+#!#('($""))&*$"#++&("$(*++*!+!!(#'%!$$$($*!+"*!(!#+$!+)%)* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T1T1T7T64G18 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r203 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38753 42 120M = 48285 9629 CAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATNCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGT ,,71(C@("<*$:.4:*>25)!(F(5H8?""GF,(7*E,:;+#0C99A;+E8.)7()<$2%;5@.;>2&().6F/!6H%A(<&G('0$GB.5+D":1=.@;+'$/#(B"@542H9"*BD3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G82 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2560 42 46M = 2325 -281 AGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATCA 4(!>#&5<$9!FB:%6/'=5"17G41$("* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2325 42 117M = 2560 281 CTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCGGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTG <:!A.E@1(<9+D>44.%'#7.F(972925:%15CG.A37(2!:5??&$-E5B,H77'D501;&:,!D.7%E1#D6F*(#+56>5'B?;*8%B.,5C32E:-1=%?D,28F=DD1,2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r205 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9008 42 18M1D30M = 8822 -235 GGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGNATCCGCTTTCAGACGTT 280E)+)7;"0%)1DBC9!((GD"C/8'D'H)=@.1*C51):=B7+'& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:18^T12A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r205 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8822 42 59M = 9008 235 GATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCG .CE&@-.C;44H2E0>B%)D(/:#;"+>167A,*+/3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r206 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29782 42 60M = 29842 227 GCATCGCNGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAAA CD.82HHA;A!H75<,$2G*1/,>@5AB/>B.#18#.;60"7"$,#F228=5$6&6>BA= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T51C0 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r206 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29842 42 167M = 29782 -227 CGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCTTCAGACATNATATGCACNTACTCACCTGCNTCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATNGCGATGCGTAATGATGTCGATAGNTACTAACAGGTCTTGTTCGATTANCTGCCGNGGAANCTCCNCCAGATC +*)#$"!$**+*"$*&%+('%)!(!)(+'$&)$(""!$%'#+!""!+)&'+$%+*(++%"*+"%("())%'*")$+(!'*!"'(("!)!$*!*"%$#'&)""!)%%$%$$!)#(!#&)*+'&!&*("#$&$"*)%+*&&$"#*&)+)&!+'%&'!(')(%$%**#&& AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:32G8C7G0A11A31A23T7G15A6C0A3A3T0T4G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r207 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12097 42 118M = 11706 -509 GCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCN >!524*'$D'=/(&:(,60F;00$:>76>GD763(%C?!#HFH7D"D'A*D%H$G=>%82-=*=&:(:$9-#C/)"@&A'&>=*2#)74/";!'*3;E9B7208;/816!%)@7)C6( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r207 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11706 42 391M = 12097 509 GATACCGANGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTTCAGGCGGATTACAACATGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGCCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGNGGANGCGGNGCAACGTC E*2":G7/F2;2E.7#E/!&57/-+!4F93H!;$/)?)5,>B6-/G"F1828+%C>H1G:C'+73F:$!24):3%FB!!GA#?/F%C&$3G6$/<,=H>5;*:D*51%H',EH>*)01(.%2?$*+*@,)0%C)5/+..*96A'?)';>3(F>=)%08674=30-39"G+G9'#$9@<+&1!=;?&=<9<-"&B&7%D%;$C?'*H0',.6($92AE8/<)65D'2D>AEG!E!(F.9(B4H87'*B0!0=C9+4G-4D#$B.E1F<-B!!D(&*7*719339/82+D2B;3F584H23:;)>$9C$0.C$%D$!$8) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:8A122G16C55T168A3G4C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r208 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46341 42 125M = 46479 201 NGNNNTTNCACCCTCNGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGT $$(!&&')+&*+&("*##"+*"$$"#"&#(!(%)&"'')(%'#!'#$"&$&&$#&)'+")"&$&*$("$+(&!('"%(+##)"(%#&"'"!+)')*%")$%$%%+&$'!!(#&*$!"%&%%$$$$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G0A0T0T0A2T7A109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r208 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46479 42 63M = 46341 -201 GCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTT 3?).!02'%37>,G@5B*$8E;#2F=*#3-HA%7H56 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r209 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21844 42 89M = 21731 -202 TGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTNACGCGGAANNCGGCG *'!!(&$'#++$()%+%!*%+'#(("'##&*"%*&+'""+&+%'%"%+&#"&"&+%#"!##)&$+&+%++#$''%"*%+)"$+!*"#$) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:73A8A0A1A0C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r209 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21731 42 58M = 21844 202 TATTTATNGANAANGGACANTCAGTGNAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCG (('(%"#((%"$&$"%)+"##&&"*"($'(!*$)*("$""*!"!)"%#*%!+')#!"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7C2A2C5G4G1C31 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44393 42 179M = 44238 -334 AACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATCTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATT '9=",6(E(H@>4E=<&1G&5F),D&F14)*G%1,$+/F="1+>4/?(00;7'?#.+BB9(?H+*2>B::C6CG",*7$$)D+230;!GFDD*A395+/!.E:.9B-)C:F8GF4%6.:$1=/#F.&?'&0&E46?20B;#-@5BC7H#3$4H-"294;E<-4--?-0?D6,'GFE%.H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95T83 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44238 42 155M = 44393 334 GCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGNGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCNAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCA .!&B1;'2!<'9!H0F)<&7>*-2E1.(2G9"H(:H<:#$.);/:'>H8CHA*;%,5#3D!D:#+6=-GB,F;5%(AD0(EH3(:1B+:;=7'7D,/5BH1)BE3DFE1!2&8-6"&$A)9D=6.6<7;46E?'H%+#5$,>3=>4,0!4C&/$4@<1,*<>?G!7C/:>15&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r212 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8113 42 109M = 8333 346 GTGAGACAAAGGNACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGT B7F87F&"842F>C$*F="7#$1/2'&4;)81#='5>;"@E@6".,),-=C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r212 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8333 42 126M = 8113 -346 TATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGC *<<6<1G,2/'B$E"A@.)@EB@@%40$%6;#%G&<0)&BG,A2BH>HAE2)06'"#G%;4->-6&.9$35$7?230-8B>$C;A-:A0"!"-@7( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r213 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10696 42 103M = 10541 -258 CGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTNTAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCGTGCAGGCGG HE0&@"+G!-($4H/!C8*H+"'48C:,:-,228971)**156,E9H!-H*$1$-;GF'3E"$=&+..-!E7/E%H/G*5G#+@G&2$*9A/*2:H(@80?-6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A53T9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10541 42 132M = 10696 258 TATGGCTGAACCGGTAGGTGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCNGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGT F%>66583:$G-$"#"$%06B)B/.>@>$/<.E:$F<)'4>63*C@"*E%5'=+C!H?-?-&E%-?AH?8&.((@-40+;H,B>5=4")'%79C@$*2"*;=5!/1B'@=*9*"$%(18)-G6+2.(*@C.= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18C29G83 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r214 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13846 42 119M = 14088 289 NNNCNCTNAGTGAGCGCGGTGNGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTNTCGCGG %#!'!(#%++&%+))$+%+"*'%(%)%)&)$!(*)$)"#(###&&%)%$""")!#*+%%$"#%%+&+%)***""*&!&*!$$#+%")($)&&'**$+&$**!**%%%&)+*)#%!(()' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0T0G0C0A0G1G0A1C11A90A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r214 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14088 42 47M = 13846 -289 CTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCAT HG0#@9%':;1C46G-;+F7*2@EGDH.# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40060 42 48M4D179M = 39974 -317 TGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCNAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAA #:D7B#&:=$2:40G9';F&3:"C$)0("*C?..,8:,=G+5,'*0,>24,?@+9'2.&@0'$3.@2@45CH;2G('4A5)!6=9-)*8F53/)0;E*5)5)%9#.-,,58*HFH%224#>!F7*),5&=5>G=316=EG AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:48^GTAA136A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r215 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39974 42 86M = 40060 317 CGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAANCGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACC ,,84#+5/-+&3#4.++A$@%4GD8D<1CC<4%F631C++*8C$3!"421'H(<9BG,55@52HA8$)F+H7;&0F8)0+(@A<>1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59A26 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r216 77 * 0 0 * * 0 0 TTCNCGTAACATCCGTTTGGTATGCGNCTGCCACGGCCCCGTGATTTCTC &*&+(*$*'*&()!&))%(&#)"*%%&$#*'$'%%#$$*"$%%'##)''* YT:Z:UP jpayne@0: r216 141 * 0 0 * * 0 0 NCANNGCTGGNCCCGCATCATCAATGAAAACCAGCAGTTTGATGGCATGGACTTTGAGCAGG $$&*"++##!)*'''%"(%!&+%"*(+%&$*&)&(+%(*$&%$!%!"%'*$)*&)"$#'%)* YT:Z:UP jpayne@0: r217 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35188 42 157M = 35419 287 GTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCGTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGNCGTTCGCGGCGGC F5>915@=4F,8)83-/;"G0888&8#'?:1?'%C6;+GG5,'7+;@/7+-H:B+F.GE#B0?%B,G6"EF?7"..3=B<-+&,BD)+,)(:?C29%BD?0#<0G.&')F?;%07-G-)?,*6C@D#6*=9*?E-#8!G'E4<$H#!7H=77=8979E-H6H;><9BD02-)8<%0").#.GD5G-3'.*H.$,D31900;D:G/2H+CA$84<'E@%&-+582<1B,??>4&++,->>3:5CH?2> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:148T10T16 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r219 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30337 42 102M = 30243 -196 TCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACNCCGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGAAAAGTTCCAGATCCTCCTGGC :89&@)0-'$=@01!%2D)90E<<4!E2!E;@>?!0D&*?$8F8?2-+8<@8@(9$5A7-4- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r221 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18425 42 184M = 18044 -565 GTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGANAGG #(#*$)#)*#+"&!(&(*+&"!))++!$&!)('(($$&'#&!'''#)")((#+&**&+'!#*""&+(&"+$#++!')+*#+%(+%()+&&!)#!"#!+!"$"&($)!&!*!#$#)*&'))(***(%'*"$%()+$&&$%#&!)*%")*+$&&!(&#"&$(%$')"!)(+$(%)'')++*(('*& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:173C6T2T0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r221 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18044 42 381M = 18425 565 AGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCCCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGAAATGNAACGCCNATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTGTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAGCTCCGGGACGCTCA 3A$$B7F/7@6"/0,FA:8:!&BA&5C)GHD:-37C=$@F-6)6&3;6/7(($<6;E:*G@!-3G0"->46EA!G;'9)G:,5<%/18)>?.=#?/#1HAHG9$<")B=C06!*A,<%?16B#H$"+<*B,@<72A(>:5!=#'E5<#";&!H:;#AED<2G@;H?-@@%55.=0*18%.8A-.*H/.3C"@.H%F2)6/:83G(,<9!-:E746A($3F>:"%!B!1!A2*/68@03-C<5.#@?.'71*+-'9'7+DC?7GE#)B+CD#9/3>F,9.!!GF=-93+?:'1$B&0-5$#3/"#HB<-);H196:#,91H%:$H:0=!. AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:92G97G4A6G97T65A14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r222 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45970 42 95M = 45872 -193 GCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATNATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCNATTACCTAC +E6*;$>#"27F(@?>;G.=%B,@'F+",*4C&3)A&3%ACG"@DA@A29C(1@C"$!5))-H.(9+132:@G@#*EGH$1&+!!5EC'D/#H=C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C44C9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r222 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45872 42 12M2I36M = 45970 193 TGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGA A@'C$3;:/,%24B4G=?=>!35H$6E4$>/0?35;+G;9F.!0*;?C6C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r223 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34339 42 137M = 34511 276 CTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTNTCTTTTAACCACATNAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCC 8>"561=*/:!+57$001GF52;GD>G,HC<@>BA%@37-.42C2#A0,/-.9'FH#1.9=!F(!3,!#!44/&>E78(,E85B>!@=;D=)8G(06E0<4>58+2.7<3*2;7!563-609>?5+1.-';D" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A30G14C59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r223 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34511 42 104M = 34339 -276 TATTCTCGGACGAGTGTTCANTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCACATAACTGGCCTGAAT H4&7-GE8C4G3-2E)4CG6;&>C57/,%<=3;(5(/23#,;+>B>(#(.6!E40?AH>F4$6?')&"FG9B,/-2/#1CC!>%-A*+$8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G67G15 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r224 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13284 42 45M = 13113 -216 TGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCNGAGGACGCCGCCTT +D8!B:6'D<8%;1&?:-/9!)F6+,C9$=F:1056#?6,8337* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T1T12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r224 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13113 42 68M = 13284 216 GCTGGAAAGTGAAACCCGGNATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGAT B)+789->:H#-!GC0G'45A@=G7?0#-8">":<4H?0#B68G8*G12149,88<8.93-+(<7:(9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16599 42 93M = 16452 -240 GGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCA ),5D)/,653E=95,,)F"&HG<*EA.>2<399;1"AC+/2+8C(?+0%%+99,AFB="6%H.5,+/-40&G1?B@)$%-@B7*<<*!50:5. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r225 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16452 42 147M = 16599 240 TGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGNTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACNGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTC D@&<+A&./'D4'B%&"HB+B@:,+G9;3'H>5#9'2<3<4"+7%&=!(#>@7E/(:60'=2(..16F8@#7<30C(F$8;7<663<25'+6C8) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81C30G34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16352 42 40M = 16092 -300 CGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGT 7<-2G$F00#099.61>GD$)H++GFFC!F;)H7?FAG2= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16092 42 109M = 16352 300 AACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCNGCAGGTG @,)=-;-:-7D439$.)(+"%8151B&)*&=(;53@@$&F"F9.!"&B8A*D(@:F*48A2+=HC3#;62%&9"-"&CB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r227 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6262 42 162M2I186M = 6610 478 AAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCCTGGCNGCNCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTAGNGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGNGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGG EE/A;/GH59!9FE837814;B8-;A;?.>@C;=#;"!$FCD@@;8#6)",/?,>B@&'/B;(E=-F*15HB2"0B8)3(-@(%%ACB<5)$A>8&9-G)GA5#>G@5%@*HGGGDF=?>#%C67/:!@GC!A<=42&.4,3=19!"+.?.H/GD2$G#?@8.D,'"%A='9/<1AE8!@C,9F6)%%8B/5)('>@=C9)F+)82F*8F3;8F/E-DC#5?<1>A0&&6A(:+FFB).0?!3(+2C0 AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:69G4G2T112C0C31T124 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r227 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6610 42 130M = 6262 -478 AGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATANCATCGTGTTCGATCC .8?<,9!63/&?09)F*$$.F(:&:8<"?5H.4%/E?E7&.C-*=:*C4?3!G@F/')%C#7')#!$BH'&?/C3!@.D.00<$7(319"=):?B0')?0@'>74B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114T15 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r228 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21499 42 91M = 21263 -327 ATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTG ,+9.EH-2)F8H&#(#+@A"4&54A'0)4"6-AB9.H+@4E;FF*;B0)094.;<<:0<"=?>F1'2)9/0646/152#A*1G'93>:%$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r228 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21263 42 236M = 21499 327 CCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGATAACCAC $G)$977>$8::;&"/0C6@/$H)1;%6>=3$!8%H;(B=?H;/3*17+&'26D+'0""$1%BEG*++%E<&31B:86@##"">;()C!G:-E708BA:)8/(6F)(4&5$F+>,1-:4+4?8@F@0*".26-9+6A'3<+.5A!8*#&&4;8=?G@3?C?H!3>B!.1+#F4($("G$,F2<8&'*@+>9).EBA7*=#&0=?0!9E3D-"3!1.7,<(BA53=C% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:229A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r229 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4967 42 85M = 4834 -218 GCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACANTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGA $$&A#.=..=!5!1=!03968A871$"7)=>"DGGC*&".E(@>,!17=**.B0.*%2+:=3GD$75C8/$'4)=+!;4<@,7D2-E"@DB*"'=%&D4%9@HD8EHE/.)A9"D87*D-=?.()?5B'H%,3DCG8-7AA!G'&.%4F@%/.BC97)3>%*!8<7787/0?!;71H#?F"A>63;/.=G5G-'#AC4,137@?2B.'H?7EA$3A5!%1(ACB)?!A2:<#H&7"*3,A55#F82AC,7C@E%#AEF966)G:.%1+A<9.-@G93*6!%.>>$33#:5-/B78B:GF,3F$<*50!GFH6>0FB+AG6F,@F=C&,%$G!E'!)+$!8"27 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:14G33C10G82^GG0A19T93A33T3T25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r231 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30605 40 42M = 30836 296 GTCTGCCATCTTTCATTCATCCCTGAACTGTTGGTTAATACG #*+$$&('$'("+!$!*!%*+($&$&(##*!++#+)++)%(* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A24 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r231 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30836 40 9M2D54M = 30605 -296 TTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCNTGACGGGCAATGCTGC A5=/F9'/;#A+7E+04-,2?D.":1A7@/;EH-$4@%(CC<.;*7"80-A@''7*+A=&3#F AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:9^GG37C16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22682 42 110M = 22535 -257 TGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTCGAGTCTTCTGTTGATATTTCTAAAGTC 8@F4):6#H*F"(;C$%0*B#$E0=-%:)%"/FC.8+*"4C7!"/6C>#F/7-#HF1BB-=E"?"G1H9<=>>2(%/!?HE9>:1=532@:)7$*6A0?54>8H?),-71 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82T6G20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22535 42 63M = 22682 257 GNGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATAAGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAAC !)F(@H!.=/?!!C25GE/-%+*B#7?'FH@/DE/H9&4C<:3!8/C;,:.;(+*>&#H&.)- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C0T34T26 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r233 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1659 42 74M = 1744 209 GAGCCCCCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAA $"%+!!)++##$))'')++'$(!+!+*&&*&#&$")+*$!)'&%"%$"!%*#'+)!()!&""#!#'""!$))+" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A68 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r233 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1744 42 124M = 1659 -209 AAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTNGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTANTC 33!/5+$2+*:H&%-B'*B0-C>C?(/3-&!<+BD8:)%285:">:>&7/B5C0;#2C'7.?490H!&4E(&19'6+,@9CF,(*=//&A,FE0/A5(A>1*"))44$:)6;>F@!-)4254*F90:3"G4@A%',,C+<1-(B-1;5)0?F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r235 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43566 42 195M = 43414 -347 CTTGCCCATTAAGCAGATGNACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCNCAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCG !,)#B3:?E02@#+C6!@%8?4=@6(=B3"F<7207$5!<3*C1%5AG:B:>:.D44)D/$6BG1"#:1#9#06-69#A045(-&'B)2?#;$$C2H.1%B!?06$=-+-A9C3@@.?(C45&D,!6(&&D*-825$.8C,6**#F#GF&8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A9A141A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r236 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15656 42 136M = 15656 0 NGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATA &+?);.61'#*,F##&#?H6-#6'!B/"42&.H#*!,;*6.6F$&2*+%;?6'A)<'F6B3#.*+8GF,BC?8D")95+G?D4)3B7648 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C135 YT:Z:UP jpayne@0: r236 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15656 0 * = 15656 0 NTGGTTTCNAGGCGACATTGTCATCATANGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGA %)'$&!("$!(+(*&+$*%*"!$'(&'*((""$!$"&(!"*"%')&'")&"*+!+)+'#))*)#)*&"""'(%%*&"**+#""('((+*&$#'%*")%(%*!*$+$+"!"'#(*& YT:Z:UP jpayne@0: r237 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42035 42 84M = 41880 -239 GGTNTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGA FCB4?-$>B3G*,%@4)"B85*.)',+)<<:E2#?H9=!(F746-+1-'A(+5-682A&1(D7G:2*@G$5.G8'$3G0"C*74 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G80 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r237 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41880 42 47M = 42035 239 NNNNTACTTGTTNTNNGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGAT #&"%$#%'')$("(!")'("&)(++$")!'&%)%(*'''%*"!++(" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0C0G0G0C0T6C1G0A31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r238 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34707 42 6M2D55M = 34831 199 GCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGAT FCC7C51/?6!(:5A7A9*+C7.9"*&%7E?.%G;!<;4*0&*B@*#-.0# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:6^GC55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r238 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34831 42 75M = 34707 -199 TTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTATATCAAAACAATTCCCATNCATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGT "G-FB,":($9,>5?,+F<2,A#/DA#);/)";G!+2=(4BH/5#+715- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C17A29 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r239 77 * 0 0 * * 0 0 TGCNGANNTGGGACTTGTTNAATGACACCTCAGCAGGAAAACCCCCTTCGC $*#"%&#!)+%&#*++&&$+!""#"+#')&+"'#%*&$(&$+#*+)*!#!' YT:Z:UP jpayne@0: r239 141 * 0 0 * * 0 0 GTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCNTCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCT (+++$)*+"#(%%&)$%#"$**"!$!"!%)!$(+%'+%'#'(%$#"&""'%! YT:Z:UP jpayne@0: r240 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27572 42 91M = 27375 -288 CGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACANTATTATGTAGNCTG 1?)4G2:"1+/'/C9)G<6A.!3+F9$HFF>/7""++F8;*$1.D6!!=F25,"-)@$15%@B-&>@$-13(6:48600 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76G10T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r240 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27375 42 197M = 27572 288 CATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTG ,E07+/;=%=3!41F>%B"!FC.>=4<=&8#FC")4>'12$>&EC'#1B%=."5A(C"-4H129:/@&E!F.C)E/=,)H$78+9-)7F!-=1+)?67%/,@F4G!>F;4=+*//AE!A-*@>>'>$7D00$"))-4#+CE#.(A#@DB78:89>&F6="1F/E-A*H36E&&?<"G022;C. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:197 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r241 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19324 42 120M = 19145 -299 GTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGNCGGAAATCACTCCCGGNTANATNAAAGTGACGACCACTGNCAGGGACGAANGTGCAAT #(/'!27A-;DF.*3.*!#&-GD;4'4F8("C<.C1*1?*6C%:A&$&9.,11)+1B+7.B&D5&"9;+C3A&47<8H/@',?2%FA-A!;2;73E,'@?.:$?+GD(502:=9+G6>E: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:61A16G2T2G4A11C10A7 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r241 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19145 42 179M = 19324 299 AAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTNCCTGNGGTTCGCCGNGNCGAAAANGAGCAGCACAGGGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGC :;/;A8!G0>@4:?-3@272,*B6+$892!5*EG(EF;-C$>88B.82E90%($!68B13'.G/E-<<./8(:C8*?=4*60;=2&#>,)#G+1BC03)E)H-82-'%F)67%5=5GAF5$9@#"&9D"84;&D?+)95(/91(,;<&%;(;5=3%5&5,"0E.G%C+A');!**>6C%/&&H6+CGB*%/4 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0T48C21G3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r243 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2277 42 264M = 2541 366 GAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGNCGGAAGAGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACNCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTNCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGNGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCNGCTGGATCTCAGT -,:0GB.8>"')!/C1!D)0-,#:C6C/,'H"&@:/:G04F-+'F,74;9>:B!;/'4@/A1C6F:.'57.0G%)-&);29.GF:0-?1FC6.9/E7G'HB.%E,@33D#B57;9'2@$A<&=3418<965H!53=%>D9F?:'HB@A+-5;6*BAH#%E,C?5G()#.?0!'"7)063"*>&E4-!$72+09=DE-*3,80GE#(*)!1G*.192&!7/!5B++C,$/)1?5)1'%)426HHE05)D*;0*.#G9;06@7$%' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:30C6G40C38G22G109A13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r243 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2541 42 102M = 2277 -366 GCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAANACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGAN F#+#."9'(@>=!4?#:<+<";63E*)&)/,@,:"A$F6*/H1%(C(+$7H@-<%F# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50A50C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28181 42 40M = 28349 241 GTTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGAC +%4<23!BDA90C$>3!!A!HD1,:)8';B45/3H7>;"' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28349 42 73M = 28181 -241 TGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATT ,B>!@!2"E1>=ADCH3C9:++'HHH99A*:0;/@1.8"'%7H=F$)C"H:8#3/.,7C,B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47595 42 60M = 47408 -247 AACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAACA 2<37@@)>%G534?%-4>BC:C(997#*=;*@4*F.8$B.4=HBF@F;5E%+&5,C1#"$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58G0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47408 42 165M = 47595 247 NCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTNTCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTT )-+=#70:"9A+/#B@D==<,*56GE90',";-H;H;AG))!*EA1?C@+>0-200%3;9;-:10:F=<6:-08;(/@%%H%9%=)=8G2),D9=?6++?C4,)9>A%,$'0=E>G&(((? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T87A76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r246 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13150 42 82M = 13379 272 CCCTTCTGTANGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTAC GF=6#5(63(;"HE7A;',B&,-D4FC,>D'&#F:*F'/0>/3;@9,36;=# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r246 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13379 42 43M = 13150 -272 AGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGG *B-(<*0C351'/#B0B"9C/,>?(.-H&16"A;=>=H#-%58 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r247 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46089 42 72M = 45903 -258 AGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCNGNTNCGNAANCGTGATNTTGCTGCGCTGGNT %*+)+*&$"!$*!!'#'("+%"'*%(+)!('')$)$!&!&+)$(!(%"&&#*'%#*))%'&%'**'*$$&"$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:40A1A1G2T0C1G6G10C1A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r247 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45903 42 44M = 46089 258 TAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAA .@G*5D"GC/@:&=C@#F":)=B2H:1168@.G.HF44)-3&=# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5357 42 40M = 5475 259 CAATCAACAACTGTTTCAGCCAATGCTTCGCAGGCTGACG %8&57A7>?;C=F.H)"6@2F$+G?."'956)5=,'=9+* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r248 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5475 42 141M = 5357 -259 CGGTTGCAGCAGAAAACAGNCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCAC !F@75*234"0('E*);6(94<.&+1:03:80&G=96!61*&%+*,G4:&7!@@+&/%)?9(;E@H!+,C%?A8"HBB)!#>EC#7'@7F2@*2,:(F3GC?-00$2:"=3>""A(+4&0'(FGHF5+$1DD(@+'F:C+3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G11C21T99 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r249 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6630 42 180M = 6582 -228 GACGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAGGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCTAGGAGAAGCTGGATANANGTNGTTNCTCTAAN '*(($'+&+)(#&'+$!&$&%#"$(""#++"')+(!&++"'*&($%*%!))!&&+)#)!")%+&!%*&+!!!)$(#*+''#'$%%)&+"+!$+*+**'+'$##"*$%$)"'+'%%+&+'+*%%%$%#%*%*'#"&!!)"+*!'$!("'#$(("%)+!%&"%&+$*%($&%*)''%)&'%& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1G111A33A15C0C0C2C2G0G6T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r249 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6582 42 48M = 6630 228 GTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCC :$)B:%@:?F32@G!>4?#3.B)$$F3B$F#$()@A"=0$'DA.<6<$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r250 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7429 42 86M = 7294 -221 TCTGGATACGTCTGAAATGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGG *%'G,;=18H9*0-/#D488%;1D07#$H'-,&>F47%BD#*=9?>6>*.BE(+/)-,76@"$3"#$.'%/A6"/>#539-:AFAA AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C69 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r250 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7294 42 120M = 7429 221 CCCNNCNNTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGNTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGAATCAGCGAA %)'#%!#('+%"$$(!!#%"('!()%'+#'!+(*)(%%%#$#$$$!*%!*!##+*&%(#*!$*)*&'!#$)$)#++#((#(#$$%%"&"($!"$*$#&"'*$++"*(+!+&+$$'#($() AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0G1T0C0C0G0T0G45G56G7C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r251 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32588 42 95M = 32400 -283 GAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAAC +B>&A",&?/=1!53C%4@7*E$/0F$<<%@11//7;A-(>C6.=%65$A:/&G1&;E6=EB3#/="'A($'H+DF8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r251 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32400 42 63M = 32588 283 TCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGAT /G4C7/&$.F>H*+/''1*;9<#":<"HG"A'=E00@'&=0A$4=A4-"(;7>;2+E,>,E@9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r252 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14245 42 109M = 13967 -387 ATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAANGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTG $%&'=H?-0#0HH@E*H3A-(A)*,1.8E?(34+A?;AA))-*D2#5">E8)"F*/*$9C67G7=)1?;@"F0H*D>>1C&G*7?>;A51F-9690$A@?H&&A6>B0"D!:7>#,:94)@'B*742;/89+$#;2;<@>GG,*$!6.6#4+49+&?.15"!&E-C)7A'&'>%?HC";,,2,?)A!?0*.5>$0'"&'/,9?#G.92$35DH$B41<;-9%D> AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:10^TTA19G121G21C17C19C29A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r253 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41257 42 308M = 41067 -498 CACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTNATCGCTATGGTNAAGAAATATGGCACTCCTTACGTCGNCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCNTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGGGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATGTTGCTGAACTGTNAGACT <4"&B#,5C$+$GD"C>?+%)-1"-=-2")GG+GC9'>6?)D-B.D>HE=3;;E5'2'8B&3B52"64E!@06=G;D>2@D9#;464B:.8$1?>"0G(>F/!,4%)'19FH''7?2#4=)&$(@*+5.-@)4-!4/=.A+%+*: AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:105T4A6A17A7G31G53T59C12C5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r253 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41067 42 106M1D83M = 41257 498 GGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCTTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGNTATACCGCT %CH4F/::%+%1H$"=8"-,F)+G86==41$>3$F3%72!&'E%F<,834!,51148*%?3)4B!'&(,=))4BF4*)7*AF)-!E?D?E5*(41*728%:#E:2=!EH<-<3@C@#$=AE5A3!&*9"C1:8&0@4C/7/1D5>)!?'C-541.*(80:1+8@>3(;"6$8/>D/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65C45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r254 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44577 42 109M = 44466 -220 AATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTNTCGTCTGNACN *()$!()#'&'##&%(!#*(!$'#%#&!+(*%)(&$%'!)")(!%#'&%+%$!$$*")&"("#+*'!#'&#+&$+(#$($#!*&&$+)"&!+!&!+%#!'#(%#+!*!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:97A7G1A0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r255 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18999 42 107M = 18900 -206 CCGCACTTGCAGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATNGCCGTCGTTGTCGGGC ""()&+&%(!('+($%$+!)&#$")&"!"*%'+%+*"(&++"+*#'##+"$#"+!*+%#(+%+!(#'"!"+$+(#+#'&*!)%!+$+$()&))))#'+'!'(!%)+) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G79T16 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r255 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18900 42 49M = 18999 206 CGNNNAGTGTNACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTTTAGAA (#$!##'*'&*'+'$%$(#(*)***!$)&)%%)$(&'%+'#%*&)'+(! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1T0G0A0G0T4T32A2A2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r256 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5806 42 141M = 5673 -274 TACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGNTGGTACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGA CA:A08E4%E):*==2B+2"F@A:2.8@5F6G$&D.2@,+?-%.3AG;$083(1(;?;$B$6E0%1>$.H55#AC'2##1!1:B+5:'D+B$B%?:1F2"A(H=7$E<%1439-G39#1!-@H:6#/B14(+=-FH2: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:92A3C44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r256 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5673 42 45M = 5806 274 CACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATT +A@$'C0-7FG@"'&@;*6;&H9,2:/..-DG;(=.26"98*-;4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r257 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30196 42 59M = 30365 213 CTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTG !+)&)"!*'&))&)!!#$''($)"#)#&%%*)#*%#+$%)#($(!''"&&('!(#(#$) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r257 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30365 42 44M = 30196 -213 CACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCT 5;B!+#2'"<3":?CE?/,A1"'H;,@.@)0C.%HCH)6&5A=- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r258 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41052 42 41M = 41208 255 TGGAAAGCGAGATGNGGAGACAGGGCTGCATGATANATGTC *#EH/1?27,F/"04D6E-',1,/&:!<7%%.8>F2E0F:) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G20A5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r258 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41208 42 99M = 41052 -255 TGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGAATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTT EF:.GC+BG:;>H86=DF&>E(AG+!4<)'HA?F)3+1%350>E&$1$"&'/G(,@/)8@=+E$C;,757,?H'"2569<'3HE7*,;%9%B(H(;?"H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r259 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23819 42 75M = 23819 0 AATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAACATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTC ?(G:?6D47921>G-")=+*0$4F?A,,)D.B%7*9F/14E&G(H;"1G24C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T45 YT:Z:UP jpayne@0: r259 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23819 0 * = 23819 0 GNCNTNGNCANNNANCNNANCAGGACACNTTCGNAANCTNTGCNANGCGNCANNTNNNGGAGNNNNNNGACCCTTCNNGCGNNTNNNAANT $"""!""""!#!"#!!!$$$!$$""!$$$""!$!!"$""$###!!"#$$#!$$#!"$!$!""$$#!#!#"#!!##$"!#"##"$!!"!#!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r260 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41163 42 10M1D124M = 40952 -346 AAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCNAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGC 4D(CA5/">D1)D)9.25?C=E'*4+>4B((,'G9@H27<'1<;?)>$..;6A*&6:%2DE4%#0>+81!<8>G3'0B-196C1<392%/(1?!#6#1=?B*2"B:=A42A9E8?G<+373>-H.6D:3*$'7; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:10^T31C92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r260 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40952 42 211M = 41163 346 GATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGNGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTA F/,F5*>C$0:HF/);,4<)*87FBE#HG545GF=F+$(*%>C33#C(-7/0H!.?@8+?G/CA=?.,7=.E;G??:D:>92(HFC@>-DF->G)6A?=@=(('&036'&<,!B)=A)#%';&4&GFH#)@80!G,:G,*'AC,E8E1'*#+!A0"(."A(+$6F+>5/#%% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:16^TATC91T25 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r261 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21068 42 156M = 20931 -293 ACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGTATACCNTGGGGCCGGT .=!A//8*$>E,'#?E@$$?"HA61D&89>';$3(HA,:"27?%"*A@&2D1#1B@0=*12:%0"/D=.C@(.F7D/:8A-)'F0(!5-/@2?F0DCB"(,-*1,<):H?C25HB/,*G=?A#%$9EFH=?C*.)<*?-F)2%#)>1HB<>!-+(D AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42T96A5T10 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r262 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5608 42 60M = 5675 300 AGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGC G*BH8*"-;1@H'>#=%%A&ECC&H*,9&=BBA+#1E5C*H1:#.7%#:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r262 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5675 42 233M = 5608 -300 CCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCNGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATNGCACCAC G*!B1ED4G%A(!C3*GC"@899/1$1D)6?#.A*,F<.8++)/:F9D*,>/E8EC&@8#)6;0F2;G0G30+4;;0B7F2'+<20+*-A=4;B%))6<)51G1'=)5#,8E2G2>"%)85#/9C3H;5>49%#=3BEE)%7958>%44&2$A6D2$D#2HC;3C?!==;:@!.F8E#34H?,6&7E:FAE$G!9)E>H-?:;B0+C>)08=8=:)13E5-*3-9/E##6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:109A15G99G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r263 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36512 42 85M = 36345 -252 AACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCT +:F>3($/8;G'5<>*DGB8)F"3,;4.,H4>GB?,#1<'<4'1;0D*.85@.5*&<6,-<;=6)+(F/E>)?8/1!A4&G6&/-=6"%5+)&%HCB6"-2A1:<2'425>%&6#@>#CHE98&(('(36=/D4876, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r264 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-156 XN:i:0 XM:i:34 XO:i:5 XG:i:9 NM:i:43 MD:Z:378^T0C4^GG3T1C2C0T0G1T2T1C0A0G1T3A0C2A0A1G1T0G1C2G0G2A2G0A0A0A8A1C2T1A0G0G1C2 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r265 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46329 42 113M = 46329 0 ACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATANAGTTGCCCATATCG *BC"B!43??=:249CA56..=2=4'7H*;F0>2(=%5/5(3&8;1.9;H6@$96&!E-G/$5#A3+E9?.8:G0)>47')7.:$A3D:">9,4%"#HG!3H7' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98G14 YT:Z:UP jpayne@0: r265 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46329 0 * = 46329 0 AATGTNGGGCGCGNGNNNNCNGGTANNGNCTNTNNNANNNNNNTNGNAAANN #$!"!""""##"$#!!#$!!""!$!!"#!#"!$$""$!####!$#$!#"!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r266 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36578 42 45M = 36578 0 TTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATAC 4'0@-<@*$,=$4#'H3$-?1!@H/)"9=.63@6@;GF;%)3;B> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YT:Z:UP jpayne@0: r266 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36578 0 * = 36578 0 GTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGC FF&<3DEA>@',C:&&>@96<#-AA,A;86#G0*$4);(39,<8%(%,:#&=HGE:, YT:Z:UP jpayne@0: r267 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40722 24 13M3I83M4D111M = 40609 -324 GACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACNGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTNGATGCAGAAAGCTGGAACTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAA E?%5<09E4D@$@6*)@(6+B0/);9&-9@7>4*%:B9<7.(5>;EF)8C0&/<5)G%-,80'?-?$CH(;8/&;C"HD?1>$3:D$A)*7H?6?B8-?!/6&9?"-AF7=-F17H7092&+$F,&*;@H)0.62@(!%)?(&:"5G1?:@?2#8%;=6G5'58/?"E:AH14+@;/D7$D'%6*A#7)HC51B7535H>1408-2H%?= AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:42C53^CAGG22G17G70 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r267 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40609 24 16M5D92M = 40722 324 TTAGCAGGCCNTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAANTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGNACAGCAAATCCTTCCA !;A&<@<82A+7#E8#3D<>C<($AF#@2&>H,+#5#<"))B2@5=>)E%C?&!FF)F5.7GH01#2&#")1888==08H+%#$D89+CE/8<(78"(%F#EA(">3' AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:0A1C7T5^TTTGG23C51T16 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r268 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18244 42 108M = 18431 290 CAGNTGTTTGTGGCGCAGNGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTG &$$+*('+%")'!$)(+%'"#*#$%"*)+$'*$*#('!#%&)(#)$+!*$&(#&)'+!'')+$&#*+#%(#%!%!'("'%"*)"&$!##%+)#%#)*%+'&#&*&)!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C1A14G89 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r268 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18431 42 103M = 18244 -290 TGACGATAGCTNAAAACTGTACGATAAACGGNACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTTCGCGCCAGCGTGA G*):B3689"(E9/:3A,+?>9.+@DBABB9D*$=,>*"E#?**!B,9=AF!(>'-7/9$1$H@7.;#*DF,F("!;G8!0./A=-@H;$"2$A)5)#1CH&, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G19T57C13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r269 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21956 42 44M = 21689 -311 ATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCA 999D$D&H6-(,$#4:D/E'+(D&<#74035(#((25#6!,+// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r269 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21689 42 46M = 21956 311 AGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTAGTGCTTATT C64=E(G('@1H9<8(%F+2)$)H;#DE(F*7E5B#!F<09'D-36 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r270 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36348 42 86M = 36348 0 GCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCNGTTAA 408=44=4>;&*!?G4:*848/)#.43)6;G&>;C$+-1:73C=>-&%2)/EAFB"$:D-,<=<%;?3(2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r272 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16454 42 108M = 16300 -262 GCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGNCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGTTGTATGCCGGTATGGA )(('""(()))+))#%%")!+%"!+%&*#$"#)&%&*(#$!%&!)!)%''%(&#*$+'$#&*!!#$$!)"%&$#++)'&$'#")##"!+**"''""*$+&*%##+(&* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G37C16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r273 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38613 42 104M = 38464 -253 CGGCAACNGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATCCTCAANNCCG '*!(%#&*"$+$&$$""'&$$)&$*%!%**%(')&+)+*#'"*+)%+#!(!*(*'#*)$+"&''%!)"+")(#""")#&++)#&*""*+')*)&&(%$#&%")) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7C85A5C0T0T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r273 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38464 42 149M = 38613 253 TNATAAGNCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCGAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGTGATTTTCACNAATAAAAAACGCCCGG (#5<>)!2=(>&%!"=?$7C+:#.;>'C(/D'G,<1*885B@::=671*7@%"@B($/'905:7/+B(>03%3!H%:',C.H5$$G?EC6.E8#495.2:*'2$!&@+26*/H09??<'87''!&#>)2G#),3%EG AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G5T33C80C4C4C16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r274 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20875 40 72M4D43M = 20677 -317 AACCGCGCTCAGGGGAACAANCAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCG ;EFA$'.;=&+A'2,?+8EH152!HF1#*F!-B>#>76F7.,B.".D4,./?56)$(04"<9+!C!#<6A@:94907F$5?("'1;+!,;D'8E/".85C*G4)0.FH1#+84=AB*"F;/,9A64*-H2*C#9(,>CG@E,B)A;$4*-@',=?,AA(?=.&7"91#G"A'3$E==*)$D9C.A">D2'A-+H7@/1''+$4677>F;6$$8%H<,94G8E-F";FC;8H(:")C.$"018/B);7,<+=<-H4(5&>913&'E-88/+?26 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r275 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40333 42 63M = 40464 190 TGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAA .6;GD7?A(7!/GFF4,E=/H,E04E+%1F*+6B>=&):,#A!*?3-04#G4#15A@8/+EH: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35506 42 140M = 35342 -304 TGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGANGTGCTCAGTATCACCCCCAGTGGTATTTATGTCAACACCNCCAGANATAATTTATCACCGCAG *!$*$)%"&##'$#*)")'&#'*+""(++$(!"'*#*)$$&'&&"*+!""$+$("'!!*'&++!)++")%)&'!('(+*($$)'+%+$&+%"#$&*)$)#%'%#+!%+%)'+%'())*#&$*(&&!%"(&&(+*"#+##+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76T15G23G5G17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r276 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35342 42 127M = 35506 304 GGCGTGTTTGTGCATCCATCTGNATTCTCCNGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGC 51'FA+>),9.B@G?F"12%)$"<"7/3$/;-&E$D3C8F*=")!H;8?GE(E3'05&$G'97)!*=05=@>;E(,/5E?'$0$.#&%7#8=5?*DE*#?:F84C;5%'?:=8@5?/GGA$B8%(+C6+3#B.22)?GCA-B49>.8#,>H"D9D3(F$F>>4; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45C51C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r277 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26577 42 47M = 26333 -291 ATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTT ;EE9B/%>*92$?-..+90&CE>)H<)$@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29078 42 266M = 29344 460 TCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCNTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGC '>/+D/3+E0"&5,/H3=7*BB;;F+41;:02)0@'&F'H*:C=E*:)1F!0BC?02%2264@EC4:'@5*9C9@9-%A5=3C"@0+*5),!HHH&';+!:HD1D,)%45:03->6&.&?=4*5.G,<>)5)$>7C?1&DF?:%)*((,A.4#00C"1<=<"GD,G%.B2AD*?%"13=B<%6?D"7@4*H@.2?$1:58E>>-<417680BD3A+@B0$?=7&G"30<9-14=;'=43CA0.!4E&C43G1,'=7@05.= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:189C76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29344 42 194M = 29078 -460 GAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATAT <%6$@3#G7-,3"5<*!DD&%-2GDC?4/"G,6)F-1*&1%=$@1;$BD:5<%9>8#-:G+C*G*++0+,"#2,F6C-@B"*A151@7/G&BG'%B@=&,&)745&+54$*5EC9C?.:6=2C!;2-E&@)=E'28%09:50E-F?9%/'7-G(%.4:G:G8364*+?HG=/79&"BF("(<.@=1($GC. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:194 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r279 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47024 42 189M6D267M = 47024 0 GAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTNACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGANTTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTNAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGT $,3A;,-05E4>9=31<-GH$0++3E"0&;G41'&*CH4%$2,?GF53D?ED0G%C<+(@4;)3?A>?<:HCB0/F=$H:3'1HD,)HG?F9.HCGG/5@*!.,H3,C?2D49,*!.4!8?C?G)2<0A*"3F'$)/4(")022):AE'-FA<:#772-(((;G;8?A',>=.%4B+4:!F'$"&2>>0#;E>$H'(@502&%E6*>,.38)%GHH$E:73,08AH8)744=+("2#&15"HD?):*/GH;.//($=$562%E@?D/@>4<4?1$.!/+8&,-%D#?F,B$?4B&35+#(8&8--%85-3F$=3-B3/D!FD9=F$H-!$A8(+=)<)*8:(+>$A8,AD+>?.'>?8/.:"78(%**F(2C5%!95GG=;<'*+<3%4=%H17&72BF'+%1(@(1&8E>0:"E?(-?/.5#H/!:4,@3$@F?#0;?9AE;:/.60C.>!G$/7 AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:117A71^CCTATC35A117T113 YT:Z:UP jpayne@0: r279 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47024 0 * = 47024 0 NTNNNGTTGNNCANTANNGAATCTNTTCGTANAANNTCNATACAGTCGATTGANGANAATTTNTNNNNNNTNNCANGTGCNATCAANANNNNCNTNAGTNCNCNATANNCTNTTTCNCANNNTNGNANNCNNCTGTNANNTNNNGNAGANNNNCCGCANANTNCANANNANGNACANATNGNGCNNNCGTNNNCCANNNTNCNNTGGGCTGANNGCNNNNNGCTGNCNGGNNN $$"###$"#""$#"$"$!$#$"$$!!!$$!#!!!!!"""#$$!!"$"#$$"$$"#$"$!$$!!#""#!""#!#"$!"###""$!$$#!"!!"!!"#$!!!$$"!"$!!$$#!!#"#$#$!!!#!##$"#$"#"!####$"#"$"#!!#!!#$!!$""$$#"!"$$!!"##!""$"$!"!!!#!"""$!"""!"!$!!!"#$!"#$!!!$"$#$"!""!"!#$##"!#$###"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r280 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9612 42 185M = 9485 -312 CCTGCAGGCAAGGTNAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTAGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATNACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCT F8#DD:&05=.5:78.-H3'6%18;G/.(+7*;4%AE)9@1CE=9";&;F50%?*.:;8F)-10F?(665G,D8>>4=*<="1-;8D7650)2<%*A=FDA&<;A('6HF4)F#47C?977H#8%:8=?7#GH'%$4'',7E#9*-63A.A,?G9'%%=A?&?4&#-43?B8!6H?C,3F96;++ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G13C32T81A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r280 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9485 42 127M = 9612 312 GNGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTT '"321EDE%EAC2-(:B=HH7'=10.C">A$HC0,8H?E9G@*2(2)?@B,(&;).@9.5#(%G+19.8$5'<84?E51F$8#@%==,4+H6!H,?A4EE87AC>57&&&3!$/D%++E;9$06%)E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A125 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r281 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3215 42 265M = 3171 -309 ACGTTNAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACTAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGAT %:,1F4!"6)F,DD)@)G/1-6'G./1$)0+>'$@G:02C*1#'#(&-(D;5=,B5'C.(&9#+?AHG/@)@)7$=:/1>"F@<37/B"5H@@7!)$HH2#(%H6,):.33#:&3H8./'3$5'4,?4GC*F*=!E32H;,4A=!A%:GDH* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G91C38C128 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r281 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3171 42 44M = 3215 309 AGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTG .::&3@C79:'C21=G17??=.&4H1?9H3?8!39&>6E)A@3D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20202 42 67M = 20357 214 AAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCNAAAACGT @+?>8,D#/?H2(?@!;/$A7GE9,/=C5&/@99"=8#:!;"H4$;@;%7;E''+?3GG6*((H,D; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20357 42 59M = 20202 -214 ACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCANAAACGAACGCATCATCAA ":$=1%4%'G"19F,DB,#@02<.&$:7:7:?C+3-'(>"-" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r283 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33827 42 161M = 33754 -234 CATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTNCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGANGNCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCT >8'3F>6@5F'6<""A8:.76E=+91"0&!G=23!1D*&3E?83"?1C<&38&-0"(1>7/(?A19D3">AE1;9GH779G:8/+/%5?(:CA&E9,=4A>1,6#37=9E4/B*+/EAA'3@+@F1>D?.CE5+;H2E3:$*&C':(H6B# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38T81G1G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 859 42 87M = 1011 234 GCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCC B&781+(G4C/1C"',"C>>".>@H(%8;%1#9C-!=,7)=1*<8':->6%3G2)6%EA-:"23;>?0'"*6=)0-=D"2:367H,2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1011 42 82M = 859 -234 ACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGT )H->3@2$#F+?!!G56 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r285 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41464 42 194M = 41327 -331 CGGGCGAGGGAATTACACCGCTTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAA B,@#CDF"G-G7HC<+G4%4FDE'5&)$6:+$A!5:'G?E>#::"7G?.(+4*#,5FE":,B%F50F=1!$G+D,E:&,;$.D3>!(D$1C<''..*0C8$G+0418!.777/"%7'*-=,5/84&=;D.GA,40!/=C9#D$,B@C$GA7447+3>6G74E-:<3C2@!?E!C2:4=.B$%.51$/"/2(4!> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A1G172 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r285 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41327 42 137M = 41464 331 GATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCNTTCACCAAATANTGTGATGACCATTT <$&,>,55D0?.B9-47'B5'5E.6D;'D"BE2"B!9G*A8H!*0?B!*56/,G-E1C+4?"8.H(F#.;/(-&:."5'FH*=2?,H)4G&;(E75,H+&(>0.:;8@=!B!/<+#98,*3>F(F;B#@3=5(86:; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:110C11C14 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r286 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 272 42 110M = 493 293 CCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCG 52"&7<#@7:''/F&,5%8?',15$(3#7>F8#0*!AAB/08;. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 493 42 72M = 272 -293 TGCCAGAGACNCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAANT #+&$"))"()("**&"!'+$"*+'"'')#*$(+!+#+&)!*+&*'!$!+&$%$)!$!*!##*(&+#'#++'& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T59A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r287 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2444 42 99M = 2220 -323 GGACAGCAAAAAGGGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTNC &&$$**%&'+'('("%$!"##$&!!#$#"#+!*%$&(#*#$&&()')!"&)%&+%'#)"&'+)!(#'*+$$'%'#*&)&+(+'(()))#*"$!*!+*!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C83G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r287 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2220 42 78M = 2444 323 CTTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTC (#H-,>:94'0?8$;2/A5:-A66(8'(#4%0-?A!A#;G:F,&($9+1F8!*G:)<917$&4&=-,?0+4A&!?.FA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r288 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32350 42 100M = 32271 -179 TTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATT EA#BB($!.'C@<83-;111H(7BA:%/#4,4D>91#1&;B2")7=E';<)90#ED@89#1,C?CBB224=*A*E9('-DBC-#8=%H:,.;2:C488/F=42#/0.E>//H(-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r289 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40015 42 41M = 39768 -288 CTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACC .2#$50+;249F7EA!@$!)$@'5;,?,0+9*=?D>)?$#= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r289 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39768 42 108M = 40015 288 GTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTNCGGGAAAACGAGATCACCNTGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCA ','1A+-,78#8==)D0$!;B$B@13<&0:BB$<4H1/*&6B6>!+./'*87>"3..-).?<@.4=C%3+B(57;%G=E#A2%HH?/G1$4.3;=$<@87!;.(#/G0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35T10G7A0C52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r290 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7616 42 58M = 7742 252 CTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGG 5$2>"'"1">G=5%?90F6+47"H?%=",35CE6/.?#/<1/4,F8:16"!.6=*046 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r290 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7742 42 126M = 7616 -252 ATGACCCTGAAAATATCAGCGATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTNGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGG 483AA@438=>2/-:=<48!.F;5>".*#!@?6@;(3?,A7/BE5/@H/&,/&,?)?>-=?2;"+9.C!!18D7B64F64&G!EB786/)@6?89FBF=779!$96"%E1=(G11##6*/)$-B9; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T22T82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r291 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4838 42 154M = 4703 -289 TTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCA EF--E./G:C"$)&ED*D*<+,5!*G/F3H1(=/$8*DC;6"A&F3A2@13&1!G###H68<$/.!'H/$(2E$:(8/4(#5@*:$=%:&/=87:@).?E'&:).)!!;6.(30)G:'BA92=EBB).=7A&(D#&!-< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:139G14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r291 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4703 42 135M = 4838 289 CGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGTTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCA 3A7FAACACA:F'A;(<97EA29@5G,?@FF9..5A81A27'$-E;(5D)2%:+"'76=!$D8$>4%6.9D0,4H1EF4;BC0H@2<%4H;12)E=C#.1H$/&D)(0C&4!'GC7)2C/;(5F28&G4?70HEG AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r292 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29577 42 69M = 29385 -261 ATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTATTTGCTCAGACTCTAACTCAT 91(H68/<2?<#0C#7$.D)%F(<458%8?0$(G(>H'9C/.>"#:(-)B(7>B3=?/""6E1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r292 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29385 42 96M = 29577 261 TATGTTNTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGTGG H$D<).HC.0!1F")"/(5@2)*1/H+9&<%D5/)?-%,&)F*?9B6/=@"D8(77"+@@/"1;.;&/&C3&?*G@4!8E>*1=)&F=H)#E3,%4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T86G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r293 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45287 42 60M = 45053 -294 TAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTAT ;!=/*BG*$(F*EFA--'-A#G<(!="=5'CB>&7,$**;DA)"4><4//FG4$#$%+$? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r293 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45053 42 55M = 45287 294 TTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACAC &.+2.*8@82!6HFG(52$8)3/$#7-4"*7,#@=)%>6$3)"+HA-@1>G& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C54 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r294 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45737 42 69M = 45524 -282 GCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCANATTAAGGAGCGTGGCGCTT >*2:"H#=9'F2<9)$.&'4)10C2+$E'A.'#,"BFB1&9()>?=F@>,8B4>527>#&=<3E+''2$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r294 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45524 42 213M = 45737 282 TCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGNTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTG C5&)-D)@*,,5&'=&G40??66:-;3E(D2:.<*;+>B.#.F=*322G(+.&'98<+0*E'.6<8'F=9:275:1D+//7?74@2H3G;:(A,?.F;22$&C7<,>49:=A3*"&%GD65F,.&5E8"5@A>G5,(D'GA-11?B/4$B5,)&6D''+*FDA22:-2#"GH@3?D,3;;E'A8'8=*9"?&11)"*277G1AF02#'+7=(6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89C123 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r295 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19738 42 137M = 19899 218 GCACCACGGTGGCGGTGAACACGGTGGGCTCACAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATC FH62CF<"7C@!@)@E(7D<#B*5H@@E1C<80@(248*44C0*3;60:E$2G.4A#340)&1%7*$925&784F(H"6#0;%%E@3/8'8$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T19G104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r295 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19899 42 57M = 19738 -218 GGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTG .;2-E9*4?E)7:/::(3(&/-ABB!;!'=C8F9&E$;5HF"4->E&!-//-@4F>) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r296 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14788 42 95M = 14600 -283 ACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCTCATAGACCTCCNTGTNAAANNNCG +'!#*('+&#("($)%%+)(*%#$!!%$!$+))'+%$%*'%*)'!!%*$$!*!'&&&$#)!(+&+)*$'("&$+##%($%!*$&)$!%**!)""% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:70G3C5T1G3G3A0C0G0G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r296 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14600 42 188M = 14788 283 CTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCAGAGCCGGGNGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCAC F=$/0@))B@6##!%+##AFH4F3A.%6F)C7$<219E10:2A4'(-!B!!>=46?7(@H1)D211F)BD-27<.53>7!C)7",>);2-3,=)?9=-?8:!/="G"&A:+F2?C/7"8"769.16=#-@%????5.E=*>=!"B'B"@29C(FBF5(44@#9A%9@A*@17/@+!#.5&8#7!F&97G,67(/=/C/!!7A:D#/8"D;53@8;-03#<>/)6$>30@&0.>9G?E4%D79$+-<).E9E+1/>.G0='@H&H26-7+=B)-A2++++ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:90T41T15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16308 42 80M = 16158 -230 CAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGNTACNGCANAGNTNAANGNCTNGGNGCGNTNG $)!&$&)&&'*$(&"%##)"!)#(!"(##+'#&(%&''($#'&'&!"!"+'*!'*#!(&""*(!!%#*)#*'$%))*!(! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:48C3G3T0G1G0G0A2C1T2T2T3G0C0G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r298 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16158 42 138M = 16308 230 CGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCNGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTT ;::0-2)H:59?-D!(.";%/61<:*$;1B--@#.=98(1:H1B*&@7GB".3HG&(5B=E=$?0DD;*)B'E@G&7D,%A>8'?F,<$"7D.,%102/;"#/0%7.068.8-88.*&A3&-5E?CCD?-)?'.8D?5@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r299 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22269 42 50M = 22073 -246 GTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGA "6?/1"%$",D=0!F,G<%@DE"9215;A:)/E??2H2C9<$A<8=14C4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23345 42 60M = 23405 206 CATCGTCACCNATTGGAATGTTNNTTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTC F)CC&:,>C?F5E-1%8C@$*D03&<4-%H#B5A3/E=2,.8)*39DF,D-*0?3G#D*# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C6T4T0A36 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23405 42 146M = 23345 -206 TGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCNTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTNAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCA +DC$G;CE')!GB.$!"@*2CG*4,E)BAC+@.A/:.A>6:B32B4*4)6=.H3B?)H'92"&*G(#@-3268".5@?4,0C7."CF*.AD+G03)$B5("8#<:A!F7HF6E,+!%6>:0@662H1H3-0=:0.H4+&#.)%!':+=#2.;?)H>G#@8.&0"&1E'&?;FF'AC&>=)6.$B'"%+",%.&=02@5D)B/@GE5-%7A!=3?*:2;E#B?!/$#)5>H3:.?A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G5A27 YT:Z:UP jpayne@0: r302 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22177 0 * = 22177 0 CNNCNCGTNACNCGNANAACACNTTCANAAACATTGNATTTAACT %%%'"&#'#&#"")%*)**)*#)!(#)$&+&!!("!#%(%+*#'! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10119 42 132M = 9993 -258 TCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGNTGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTC ))83=2/8(/).'>A6H&"F42?:#"".4+;(C-..+CH.,0A?8!;:50,4204B48+20C8C)(3EBH<.,G98E8,5G"A>C"!A7231> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77A54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9993 42 83M = 10119 258 GAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTATCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGAC 2#4F@C69E=066'*?7G!/@<3BE5<=;+5F:198=&,)2>9A"B='/<3G"6;61!@*;4(F,B.5F/"6>:<:9@"H?.=)?#DH>#%E=5=!%"*FA672)$1'C>A"1(.#=A1?'H61G@C.)0&3.@8(50.@5:7.0!=96$7>-0#"/;*-)B265'($1@*(+G/1?4'+<65A6@:8:B'D:+74H2@2(G/>41<)9'G@;.C;86?2= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G107C39 YT:Z:UP jpayne@0: r304 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18470 0 * = 18470 0 ANATCCTTCGNANTGTNAATNCGNNCNCCGGGACGCTCAGTTATGTGACGA )"(')'"&"'#)"'#($*'&)!&'&(+%$##&&$'%*!'$''+!)($+$(" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r305 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3220 42 85M = 3406 269 GAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTAGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCT !HB&./(%6>,'%:)EB/7B@B&9#&..,C6DC4-E>B:H040$-4:09(5.$D39?C($"*9/)#+9EFE&H$>9:E<%8< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r305 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3406 42 83M = 3220 -269 GCCGGTGTGCAGATTAATGACNGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGNGGACGGGTATCCNGGCTGGATGCCGCGNNG *&*!+$)**$!$+)#**+%*$($"$'&%%""$(&!*#'!%+)$(#(##)*"!*$"&(%#+!#')!+"")"!!'$!('++%'$% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21A30A12T13A0G0A0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r306 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43023 42 167M = 43190 363 AGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGAC /A/C/.2$2GE-+BA$D:EH"(2"4%&6&E2:GD(4AGE45?(0DCF.A.DG@G?,/BD!8A+#'2)&64'90C'."/G23!86<-D5(29?$C!H!)C%8:4%<%#"'*AF+E4%EE/G"*0H*!=#2@)>/#,06D:7=>=:5!?.$<*&2+7+-,4,"'D23+0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:167 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r306 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43190 42 196M = 43023 -363 GTGCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACAAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGT -<#D;1.E'*6,4#*HE93;'.82A#'.B!?*15#$4*8"01*H,119%(!,/%=+6HB9G7$?1F$=*).3$H*6:/*9+>F0EH;$55GH#-'%3,D&:5&06*D++:/$:4HE!(=1C..AD2;F,<7=E)!@<293"'492C53+BB)79;)%-/>7C=D=0F92+>==++%'48G5,AF8F8H*641 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T43G69T79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11203 42 66M = 11367 251 ACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTC (>(1G(0G8";9B$B4>!:$F$F*,96'2)'#@C15#+<)=)3BE0./1!0&(2B==6-8@22:E,)C5'= YT:Z:UP jpayne@0: r309 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34208 42 118M = 34326 358 ATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCGTGAATTGTCCACACCATNGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGA 1'11C;/>2:88<.H/9))>E;?0="221283=E61')->;06BB?#AB;70$41(C90HAEB5(F+D5!@/&(;=5B@./5;.'(;A031781B"EGG$4-/3.9-AF2/H*H/+=" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T17T63 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r309 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34326 42 240M = 34208 -358 TGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTNGATNGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTCTTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATC #<)$F@D00<=#!>'CE9"1G!25#;>.E'97"/#=C0<16.)65;E,$)<671&?F'@87)4<.$%1@)!@B5.*F&(H(@0?-@E=0%<4A?%#:%/7F8A-'C111+(:5;*8*BB@5/)!$1;-:@92C&:6("E>.#=G.%9"<@6=,#C-,."<5?(39+%C;=1DFE:H*6G6E5>*7!6?C%/*H AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:44A4G3T85A100 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r310 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16932 40 71M = 16688 -315 CGATGTTATTGAAATCTGCGANGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGNCNCGTGCTNGCGGNGGNCN &#++$%))$'(!&&##&(&(&#$+&!)*#%"'!!!&))#!)(#''%+%'(%")$!(!"%()#((&%&!'%$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:21T29T1G0T5G4T1A0A1A0 YS:i:-42 YT:Z:CP jpayne@0: r310 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16688 40 170M8D66M = 16932 315 GCCATAATGCCGTTGAGGTGAACNGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCNGTTACGGTCGTAATGATACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTTCCCGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCNGAAGGGCTTCGCCATGTAGCGGG +*%('#"&&%+'!'%&'('+$%#$$("&"&+")+&!)!+*""#!+#+%("$"#)%+#!!+&)&%$*&*$+%"&''%*))(+&+%""**$"(*($'%(+'**$()!'!&+)#!$%""'"!#+(&++)+%*!&$(!##)!$$*"&'%#!(*+$!#!(")$&"#'*+!$$$#!*$&(+&)&$$($"*)*'*!!$&")&"&"*$&)"+'#"++#&%&+)(!)+"(!'#+"+'&&(")*"$ AS:i:-42 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:16 MD:Z:23T3T61C15T25A2A35^ATTAAAAC42A18C4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r311 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34416 42 248M = 34277 -387 CAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATTGGTATTCNTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTT A<%.#+E(,)$,F2"?5@>C6$E"FE#&D:4*A8D!!::>9EA$.%;#&(%=/AD?/$"137EE'B<@6);=,/3'(,"B"*!(<;='-?"(.H8<%6;8?9@:49"7H&0=A4G.-%$.8E4.7*3F'%'D);GC7,@1&6=.0H>G).",;AC@C66(@>1+(3FA950A@E?F*?5DD21G&:5;DDG'%7#?=@.$>$0)9C-)!F7DG6C7><+@.3DE/!+BF%7GD!1BG=8-4.BG/:0-3+!2#$4&?5#(+)7B/6),)(B),,##5DD@4&?/*&:F'/((-0$97!5>,0?&9'!8+C@?GH!*>1/23#:D-/2C)-3,/HC195,)F:G>,%< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28T19G33A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r313 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12985 42 82M = 13208 321 ACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGAT >"E>C0F@@6G"3BH7'D4==4@+'97&H3>1!<<%=:1(?.:B#*&@6,>AC4/'"703C120?HAA0=674<&-EFA'#? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r314 77 * 0 0 * * 0 0 TGAAGGTGTCTGCGGGNGATCGTCAGGAAGACAGTNCTCATGCTGC @@40"-0>('*7#/+6;@/#556$DA*A;?'D##21C<%896%GDF YT:Z:UP jpayne@0: r314 141 * 0 0 * * 0 0 TTCTNCTGTGCAGACAGCTGGCGACGTTGCGCCGCCTCCTCCAGTACCGCGANCTGACTCGCCGCCTTC >:B0$81A#@,*;;/,4=0:C/"#2B9GE$/7'#*G3G2(>G'>.<9D;@+8(582.>!-54/!696@& YT:Z:UP jpayne@0: r315 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19574 42 232M = 19417 -389 TATAAATTCTGANTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCANGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGAT ;<2A1?'60'$G5GB0!F7+"+'=;-!")9+;7+$H*B-D:888F=9-'73CE82$?@@E4<)=/4$;@"9!3(B089->E+=??CB-#-D#G(&,">A5:34?BGEC&H@*H@F14,>(H,E27;<68E4%.;%G;'C#(%1F(9'B;3D6E=2?G"3,',+39E.,?,BH<4+,%'+&-+5+!F5<-D16-'-B4C1/C8B-F:C->$!65'?;:=?-$FF-??3%71:%)8B>55)/943* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52G49T54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14674 42 133M = 14595 -212 TTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCAC +G"*5-H.BF*4A1;/>'-1%<><5!,1=(G"(D56=;)'5D55D7.,.%GG'6A1*.6:!+H?E)(6''H2>%:0@4.A%D<&(/*=!1,<9??$A6'FC'#0)5.&1,6A'6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14595 42 52M = 14674 212 ATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCC ,3DC26%1(/H5B;!E:@@)!+>22B$06#)AG:>H2>+6@5%B2=#;*02@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r317 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42337 42 134M = 42537 317 TCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAA &/0FA-4:+,09BH>.>-E6;.B#8A5$>2$,$62851/(1C8!9#AG6&3)&?C3(/8/:?%7C31:*?-4=A6@9C27A,G@H>B&AE--@;>*(<&A*?&BC3BH(@B"H5-%-'=9C076;27@62(2&!A)*1)@?C"(<=5GD9:57'+E8"*B/C8*'9B0'+34H#E$C))1'?>!#E!+48/63F0*1E?#=5&'H&F9,<=DG-GC:G+07;&";,(528#("42F999E3/.(<820:H7+G8'"5!.H(03:A3'BE98>1DGB&D04!//&/@=D@1H(:.6+).4-A(178$EC2?#C.0;9B:#F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A145G85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r319 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13250 42 94M = 13344 328 CCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTCCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGA ;C7@%?A@*G2.?D9!.+),&1/G7?F*GF=?5#4:C1-($1:%>'>0A6?A*@H-B69/1?,A8H=:,-EE$C/EF--$3*A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r320 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27670 42 49M = 27512 -207 TGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTC H'5@>6>3&4>F7F>;>$F?9FB4<3=093*"@/-*0=3,+E.4F0.8" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r320 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27512 42 46M = 27670 207 GTCTNGTGTGCGACANGTTNGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGA !'%&'')#+$!(#&%$$)!!$'+"(""##"%$(#&*"&!%+&#"*+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C3G1A8G3T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r321 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43266 42 99M = 43092 -273 ATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGTTGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTG 6).?2B-HEFH,B'7=>B+2(H($49$$!1::%%1B%7"=H+*7G3@31=&9A05?$42+??-%.C1;:EB*@,'+'E/4"94,1F<&6+"*C4;)#6+(DF49D&1C'%G8::A0.F&>3(FD.G<9<.=%G3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C49 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16110 42 78M = 15966 -222 CACTGAAATCATCGATGTGNAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGG -DA#2'GEB890AB4,!8%%2:#@9="5@+#0@($3%?'41(*357&68>4571%0"%-3AA-@E+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T29C52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r323 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11387 42 96M = 11551 239 CCAGNCCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGACAGACNGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGA %$*&-->-!5#A137G'15B5&:0*F<;16EG/5&H50&%? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A41G5A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r323 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11551 42 75M = 11387 -239 ACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAA 7>?G$(*?3A13:4&/2(5C#>.GD@2>$+B7H*+.;"?."<#CF!:>93",2).1>'-(8=,GB472"5FB78- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18848 42 77M = 18675 -250 GCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTTC +5H&G)$5:"<,2450&*83#98"/<*'#'*!H9'A=-") AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18675 42 71M = 18848 250 ATAACTGAAACNNCTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCT "(&$&'*&*)%!""*+$#(%&(&'$)')%#'''$""($#*#+'"$+!'"%&"#'%+!"*"+*&)"%+))'+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T2T6G0T0A58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r325 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41445 42 67M = 41312 -200 AATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACC %3&;"(009GA#($%,;<6;&;HE;4/$,GF<@E@72!"%%?>!-">8.;F,!>-FB5.A'59G,&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r325 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41312 42 53M = 41445 200 GTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTAT /,$FC+'?6D'/()01&%8*1+'#-875#57G3H;/?785BC**5C809F4:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19410 42 77M = 19621 266 NAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCANGTATACAGATTAAT '%E1GDE3(-84,+-%38-;1/7:+;<,H-'@:GA:3H'91-,,C10=H)E!/"7/:D-DG;B(?GHB"8EE@7-1=@D: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A15 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r327 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43640 42 111M = 43753 273 CGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGANTTTGGAAAGCCAGTTGATCANCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAAT D,(008&*%6FCAB7"C*@6#H<>+C)%+C6&H8E+D?G1B9G9AA%B4%)5E&-DDF$6>='$*6,<$/10+8A/40'7>'CBF")4?$G4"D-D<0=6!=C>5845D/18/2&1-D*;(86+#;G)D&"':CG/3#*7384<%.DC8?EB8"&:297)4!:*7CC%@F?&A9!85%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4C13T81C4C29G24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r328 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22523 42 51M = 22634 194 ATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGC *E<#D%9??@/8(4:D>/A84G@(,<:+.:"03&B),)?-)#,+)5?$<!0B8C0A-$:98"-B(*E6%545C9F*:*/+3H(C5?;B893EH:=,%9"D0<;1??*57*%3BA)@(A(<4DD7.,#-&/#)=">@HE7"7G.C!(%>C!@$5/>(4&022<$#B4>C=B$1G=D*/*3":<+(?;4<+7C=$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r329 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6490 42 55M = 6548 185 AAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAA G#?7.=2?(@:*+8*@)'9?H";%;.49?7@.F1)1"#%8@403(50D:16/429 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r330 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32101 42 61M = 32164 213 TCTGACGATNCACGAATGTCGCGGCGAAATNTCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTTAT E+*>8@-(;:A+-'D=<@4%@FA$*:7<@A+9HE3/$A?"1H7=+#7"$%7DB"',"A7-2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G20A27C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32164 42 150M = 32101 -213 CATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTTATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCA G$G6"&,G2%(:1%C:6!6*7H>4&9C2BG&H'A17-:51.:H2#H38#A832F01,+"H4$6"EGF(@"/"FD*27(HE.,1';8$:C>!AEHB*".7)9C%%#$0$$4&7# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G84 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r331 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36697 42 67M = 38951 2319 CCCTTATCNGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTNAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAA (@>C!>A+H2;#7%6G59E,#90B5/+5//>.8>,G20:0F;4!?)9**A@B.F;<1E66@%"=A08 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C3A31T26 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r331 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38951 42 65M = 36697 -2319 CCAAGTTAGAANTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATNAA ;1B!&7D>/+#;*"3C;79H7801>+:(:2"9E+G=<(192'5#HF-.?$:F6+%G9B4AE$1GG*)>.%#-#F@3;2( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r332 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38791 24 134M = 38686 -239 CTGCTTGAGGCNTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGG ))%*&"(*$+$'$"%&'(#+)&($!"%%&&%#+&(*+*)$%*&*"($&++!&**%"'!$&)*%*'(%#(%$##*#"!)'"&#+%!$$((!*!$"##*(&%%%!$*""+!+"%%!"!%()+%'$(*!!)+$%!+" AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:21 MD:Z:11T97A1T0C0T1A0A0C0T0T0A0G0C0G1G0A0T0T1C1A0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r333 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20833 42 114M4D67M = 20768 -250 CCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATG <"@B>-46=8!C.G4%B'E2@D$:31'7B9-*%8D'GH04)7;A=$6>3$011<%95:>A+>.3!'67E'/=EB=5D!,-)86;F;6#&$=9'H<&,CA"E#4G$B?008>F992-7>*<,+!150@;/?%$90F=0F();G&%(A%711' AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:114^TATC66T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r333 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20768 42 65M = 20833 250 GTCTGAAACGGTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGGTGAAACGAACAGAAAAG :58A,H4F:9<7HB*<$H.9%52"5F!9G1<4;6@>5)1E@A;HB485)B&1F+&D%83,:5;HB;1'9-05-#H-8D155>0A0>9-4G>8D056)=6/)"3%90.$>=D9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r334 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41621 42 48M = 41740 217 CCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAA )62C"/,;<6,87)C./8%!1:=!DA>*;H@HB*;(?59==:-354)H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26566 40 121M13I113M = 26800 284 CCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGNAAANAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATNTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTAC $$3#H#7*=%9*,7;!=9<%9ACB'-%$'8&%9@C>?+4D'BH3!B47+6,+61D5"6(2"%6EE<>!)=G%<.0=7<5&@?##6F1542%5;;'67)($3H$#AA-#)05>73<9?,89659CE5(C"&E*C8.!290H3>&?AG%(2%H=/H5B*,.B),/8!5*,9'!2"=#:;?$@;'%HF*5D?:;H>,,7$84C?(D;$.5(03.;&#$$+,1H*2.F8<*7.>;G818,"&84EB&$HA? AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:16 MD:Z:157G3A25T46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r335 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26800 40 50M = 26566 -284 AAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAA D*HE/;6B/?B=.#,0;<81=@3(-0@:7?G-7)4/>$.6FA/:EE-(5) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47243 42 127M = 47370 305 GTTTCTTGAGAATTTAACCTTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGT 0H):*'C).+F*#D,6&!&86)DA>C'E-=99B)%/CB>/)C.57A1G0;H,0G;>:0;9=,B''F5),*.*<<$-<%$/H!!:BHBF8,DG(E#2965>?$,%CE>?91%5,F18)E(!*(4$&<-$4B0)25-G@=-%$"*&:1*%EC76+?(H075C5;C*?'$-AE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A48A46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r337 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14945 42 49M = 14758 -236 GCTGGTATCAGNTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTT G:*("?""F.:C+=.8?+>9&"B+"A,&3*@4'=E;/:D>$>'<#H"GF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r338 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24516 42 215M = 24475 -256 CCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCNTCCCTGCCTCCAA '5;0.;(D!8?"@B:<#;'GF5.!F.*&71B!'#0&:7(?EH&-635A%0?;-98-%<-2=-1G$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:201T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r338 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24475 42 41M = 24516 256 ATAAGCGTCGTAATTTTCTATNTTTCATCATATTCTAGATC AE4+3#);7>E#H'/=8H3$0"F'FFE?='%*%%&)BF%D< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r339 77 * 0 0 * * 0 0 GGACCATAAAAATTTATAATCNGGTGGCCGGAACTAATGAATT A-F//=,-4-)21+F5@B&2C&5?/!>46E62*&#,;F=2H1. YT:Z:UP jpayne@0: r339 141 * 0 0 * * 0 0 NTNCNNNNCNNNNNNNGANTTNNTNTATAAAAANAACGGAGCCNNCNGTCNCNNCG #"!$#$!#"$!!##!$#"!$"!#"$$$$####$##!$#!!$"""!!$!#$#$$"$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r340 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21153 42 54M = 21207 393 TGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAANTCCGTTGCAGATGTTCTTG F.700;-&/96EH.H.B16%F15B4EEB#'C'D),B<7"/8H"D$.ADD=+6./ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r340 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21207 42 339M = 21153 -393 AATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAANTCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGNCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACG ")4D3<4:2#BH,;/4$229+6#8@6:&E5H18E7C1)B*=H".<#*A2);A6!*+D0A?2!$B5<51#B+'3<=;%-?0=D$@@,)D,H,7&-D-BA7H66<"D/,(83A#G!BAH4&?H+=G=/-F;*)#%<>$93!0)A'1H::GB-B92617&+2/9=6CH($=79@C7-.BAG?71;87@=+"&H85@0AD!G($8&;'A,/0;0A6,"0(69!>30F#2CDH$-GF*+B26F4(BBD--:H/<%:,.0+"/G$D%&3",>E%+:-72C&+%=H0/$D/!,E"0C&03'@'40!?*G2E@6!4FE.0>$0*92++9G19,<2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112A89T136 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r341 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43372 42 103M = 43475 463 NGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTT "%A2'4>BEG6*;E2B3&#<4,HG*#1/27*4=<874'!(,!9:4<***.A$EAB2@B:(6B)%.93@96-@5%";'GF/:;&C$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T102 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r341 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43475 42 360M = 43372 -463 ATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCNTAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCAGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATTTCGATACCGG HE1E-#H;6B/C4B&F7"#,;:&9@#.4@#FCE-/B7@8)))2B;'=<)&F&7'*6>E0'>(,8.,&E9A*E('()#7/3$C?#'G30=0CD'?9.H!E2E8E+B;@3?0C184<;95,A>?E03$069(64<%BD?)28.,6(9.7$:!"72!.($F#.>G;0FE.3-A&"-9GE6D<4"D!87$$A<2A5$991;>GD0%(4*FEH=;'57'3A7/&!!@3*/+='3,=&%6&A571+/EC=1;HC"<#8D0:(G;3,6=$=@%271G;-+/B'$>?7#=#.;B7%%A++*1?+/G@(H,$,$24!7:):;&' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r342 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4358 42 146M = 4127 -377 CCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCNACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATTGTTGAACCCGCCTATGCGCGGGT GGB>*2,@1*1++,H80*"/)8)8$1A-C@A&4';//4+08#0B-28+"#C8;83A;9%9FDC.."?+<9#+0$?>$FG;A(;+H0%!*BF!$;,-<.!-$H*)=:&**8A/*(6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G85G0C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16143 42 49M = 16192 238 GAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGC 7,!8!>729F-06"D&B(10,@!H>#7H><@+(,".6+C,#1'E>83;= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r343 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16192 42 189M = 16143 -238 CAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTACAACCCGCAGACGCGGCAATNCAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGT 4"C=%.,#D6G#@F+HB%$,4C*%691GG3#;3;$4!=%*?1F=C9B#"87H4B9.,41D>!(7);B9E(1)*4E<,'%=@%3*A%D;9C?.50A#>;4.+98;9#!*>+70@;.#6(;-69!<2('?$:,'AD:1H/-"!B/-D/<1,';+44!,*G'9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59T19A109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r344 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45514 42 246M = 45277 -483 CGTAANGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTNATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAANCAACAGGCGCCGGACGCTACCTGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCACNA H>;(@C+):!+G=E%=.H%B*%0/$5A83F>00'$C4;G,DBC(!F1>38/2B<&A:08?5E#G2;-@3>D+B69&,'+FH5'1:B,.8B)>%3-H+.;#291#,@3/.H%.";,.5A=-/A6,71E9>@?=8A0G%#C#(C7*;09)796?"D5C9#0*A?%&;90<6/0(=DCG<'?3>!!$( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5G36G116T21A60G0A0A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r344 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45277 42 237M = 45514 483 ACCTTCGCGGCNGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAANACAGTAATCGACGCTACGATGTGCGCCANTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAA .H>H1;8/)5+'2-C)<9?,$?#+AF;A8>5;15:)+74*$95FBE15$>?'!&+FB1;8E6@!@@(#(1:E4;/*72GD/6;2$.1''*#808D--$E5B&5:<',D/C/4<&%)<-B:CEFC-EE;=#''$*8#@';6-.D5?-7+,:68&.!1#A9>G/?6C3$::<7%0,+A?98C)C71,GEE/1?1!D/(HE-)$(A0'#+!.2'/.FC3C33<*6;AH3:1D(>6H*/(3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A25A14A13T170 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r345 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35827 42 41M = 35625 -243 ATTCTTGTTCTCTGGNCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGN .1/8:.>4.(-#.#C/.D,=0%5H1D:'A,5#29"1'%B/, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T24G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r345 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35625 42 45M = 35827 243 AGAGATAATTTATCACCGCTGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATA (=*GF8**5"79%7,GF;9>0.=:#H?"H;#6%H-H+BGACB486 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r346 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47400 40 46M = 47245 -201 AAAANTTTTCGCACTTGATCNAATATTTCCTTAAAAATGGANAACG $$+!#%))"("&$)%!'*)&!$'!)(%+++*#+"$(+"(+"&$!(% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3T0C15G8T10C0A1C1T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47245 40 47M = 47400 201 TTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAAC /0!.5/"?"A4-.'/E<)9H$B=3H2@!6*,?>=#.E.?G.6A./C/!<-2)/3?E*>!?83+2@!4G5+)-..@0!+1A/85%3;(-F8H(&88.+3)##, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C63T66G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r347 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4346 42 91M = 4481 304 GTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTA 6>,>!,=6)?.-(@6"<2E/@6%3!/>%'2>=*@3$>)198>@8/AD1BA<'BB1'"+C@=.+A0G.!F8"#(3"GD+9@*?&E-:3E=>- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r348 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13777 24 54M = 13911 219 AACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCAATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGC B9&*#D9*8049564500!C<-5AE<&C%%1757#:)'(?"<442,AD6D%6@? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G26 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r348 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13911 24 66M3D16M = 13777 -219 TGTTTTTCCGGTACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGTGGTGACGAGNGCGGTAGCGGTCCGGCTGTC ,9EG&.D-5=65<,#3G16B$$?E*E(DG,>"39>BG1.8$A:(*G4/:0"HB>F#+#E=.2+>F;23E><=3?(642;"%F AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:11G39C9T4^TTA16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r349 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44104 42 146M = 44250 418 TGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGTAAGATGCAGAGATTGCC >=<;46)9-C,E'DG1!&#>'/(&"FG1"B@-5E/+EB.-B$?'/-?&0;C(H>'C$#C"=?=<""%A;?)*;-*@"&#?@3+FFAB:=88A$=G.-;3)=20::)4"5(,3"8E9H*,G8=@%3!$3:!H27:.87:3@(GCD,8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128C17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r349 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44250 42 272M = 44104 -418 ATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCANGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGCGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGC A@+,-3C(BD@&;@>76>?0G6F(40HA*4*<577<7+H6-B#>.:A>0=(>;,;CD2*/&*,!5.":C"%1D2=H);GAC,H159,(!3!5B=0A$@3D:$F""!"0<,*/!/-B9>A5#G!72H*&91#GE42$@5)G&D57(8EG-2>)B1'-G+,F&"EE.* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:167C51A52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r350 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33519 42 55M = 33354 -220 ATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATA &+@%8#G4&D:E;+&H1&>G;6&"%!<*A(<>AE#,@)*49A*F17"E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r350 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33354 42 165M = 33519 220 AGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATCTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATNGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGT 0.-(:50GE,=7E2#<=@)>4&C2-<*+6>B!G/)'$?G!)#47C"0$&59"9H"GGED',@?,37ABG4B5'-8=.F8/;:#2)3(H!A,+)B(%,1/."7*5.9&6C0/*"2!H+G3.C*4FA'GD1BF!?E7;(GB'!#E8*HB9/A,3'G:7<8.5.H0&- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T68T59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r351 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7581 42 53M = 7581 0 GCCTGGCCAGAATGCTATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGT CBG(#'&25C@37F6*@9%DE2>'#?&H%$)H(H" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T3 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r352 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26639 23 48M13I64M = 26479 -272 TCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGA .140*;:44@.*$5$D@?--CD4@GF+6%G)08:'.%)@5*&621,5)?+"<"*,"G.E,!(5G-DA/C&2D*+?H,4E,C;1%6/0)D'4EA2869,"0*G*G3G4H.B-?31/4/2-A AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:112 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r353 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11 42 55M = 15975 16069 CTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTT G$38H4?G";*F,/0&+6)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r353 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15975 42 105M = 11 -16069 CAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCA 7/3F#)A-3:;B'$:B27HH;,@%0*?;&2?&0#D9-52=!A=.:9AC)F(F>7+H02=H2/4@;01/.;*"4H4&C"&*6HA6E7G/#$D-56=!=B%=3:6B+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r354 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38494 42 252M = 38494 0 GGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGNTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAACAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGNCAGGAGCGT "(((&)(&%#$'(!#$$(#"(+!&!$)%&('(#)$!&"#(&&%(&%#$(#**"!"')*'(+*#$#!()&%%!!"''%#%*#!**+&%"$(&(%!&(&%!$%"%$+!+&##'$&#**(''&*!+%&*)*##!#*"$*('))%()$(%"$(&$#"$'"'$!(+&+)"'"!)%!'&%$+'*(($+*!+*!!+"'*($!$!'#!+$)'&!#)#))+)$)+(&$"$!'#''%%&'#+*"&)$!+)&!*#("($)#&+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68C40A132A9 YT:Z:UP jpayne@0: r354 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38494 0 * = 38494 0 ACCNGNNNGCNNTGATAAGGCGCAGNTCAGCAGGTGGAAGAG )&&"$&(!$'!!'#)'((()!#%(#"%!'+%'"($'%#**'# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r355 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42610 42 121M = 42487 -244 AGCAGAAACANAAAGATAAACTTAAGATTCGANAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACC 2>D!C(:;$36+&D9<@9#?8DCG8,7H86.((0%?D3E:HE-.#>)C2@D+8F:2(>=9,&A*/,5!5!H9C%2)2G0@:/B-*H5&F8/')%=("H5119.A8)GC$''"78?6D3;%0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G21A88 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r355 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42487 42 55M = 42610 244 NCCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCACCAGAGTGTGGAACCAAGATAGC *:*0"+"*/()*)34!'A:(C==3@-'''<&/6;7E"/'7@1<41)B9-152,#E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A30T23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r356 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9020 42 6M1D94M = 8801 -320 GAGCGGGACCNTTACGCGAATCCGNTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTNANTCGTNTG !"%'++)'*&+&"(!#$%**%+*"#'#'$&(!$&!+*)+"$#*%)!!#'+'$+#"$"'%#"(#!&)%)'"($*"'*)$(&*&+*#()$*+!*'(&"(&&( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:6^T4C13C65G1G2C1A2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r356 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8801 42 211M = 9020 320 CGGANTTATCCGGTGATGANCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCNGCTATGACTACCNGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCNGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATNAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGANAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTT *$*$!)+&$)$+*'&&'+"+'$#&'()%$(#*&('*+!'(#"!%&)#+"(%'('(+)!+&!"&)#$%'*'!#'#+'%'%'"'*!$+%%#'$+"%!&"!%$$!$#)$(#*&$(+#&)"%$+%(*$"+'!!)+!#$#")+%$#!+&+#'+%)'&$"#$*+(%!*&%%***)#!("+%$%!($*"'#!(!+*!)('(((+#'!"'$!"+)(!!+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4T14G46G12G30A27G46A25 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15474 42 122M = 15373 -223 GGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGGATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGGCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCA :>CE"48@9E:90DB=?H@D$%,,>>%9-5):>%/D<>A(7919%BF?FCC0%83'D9.1)589%F98G:"%-7)@C)6@66&9+94C=?.!@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r358 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2802 42 42M = 2570 -274 CACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAAC ,8849#+F(="$/8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r358 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2570 42 146M = 2802 274 TGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTAAGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAA ;;4C60E?9!'&F4C1'99GC;!@/:+15$/+'+@>%:F"=2F)'%FC)EEE,;&C@@GF!%:61=/$@@1:DE.075H7G!C:,7=.<5HCH9?E?"E8'.D"6>+3@!@%&1FH=?02*B:01'(G4-,007"?!',9%64F#>+,2*GB&7)D%6"4,#E40>&4C:.8+))7+3,>!1.,;(3*7'/-$)>/3/ AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:0T41^ATTAAAAC32G31G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r360 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9338 42 44M = 9435 326 TAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAG 7:/:.&.:>0G*@E/&'@>A#FG0E-26(5;'A&@C2;8##68= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r360 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9435 42 229M = 9338 -326 GCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGGCCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGCCAAGAGCTTTCGTGCGGTGTATGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCANTGGTATGACCATCACCGTGAGCGACGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAANGGTNAGNATNCTN #!!(+%"(*""'((#'$*%+$**+&%!%*'""$(&)%%'##%(!'(#&))('!&''%!*)%*%*+"++(!')#(+#!*%""*!#$$*$##(#()%*+(&()*&!)!'#+'!+!+)"$$#(+&&+!+*($&%!%$('$+'#%%)*$)&)%"&#")&*%)$!+(&#'))%&("%#&'*#%#(!!((*%+%$'!!%+))'%%#&"*)($$$)*)"!&+!"*""'%#"'(*#$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:63A30A20C32G20A2G42T3G2T0T1G2G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r361 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10958 42 461M = 10884 -535 GTATNAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGNAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGANGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGANGCCGCAACGAAAGGGTTTAAGGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCN ,<0.3-0A98BH7E!C&@&;+BEE%(8=!$:%E),=-(H?0"42HB:&2A;/0+'?F"@;;?)#:8%=+!DC!.+"*E!G!5A)+@?"8B<>6&A@"9$(>*856D0>:HF7%/2E21F@3#)A(*/F?",C'HBC$<05)H:,;6B)=D;=7@(8/H5&B=$)?!,(%A;#!:)B>.6AB*!$>62"F+@+?;&8@:B!G+G8'6@/3,D('F!>H7.*AHE,B>5E-)&)"*#*/4B$,21/>@&<2B2+H-.+33"FD'&-633;,#=;,*$6=ABD!1H'@3+,;EDB5B.!9C1D027.=>0HH"#>**2!.G'"C>/$(AFH''1,<.A"! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4C262G37T99G18G1T33A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r361 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10884 42 74M = 10958 535 NCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTG #=+06;9&6.,C%265<>D#@2<51&?1G5*A7%6<4?G("#*B3BH/"C:F;HB31&4>*%8AF1.?&?$$)B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G73 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r362 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16744 42 114M8D145M = 17011 420 ACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACC H'(!A"=>*-54:>&6)-/C.A1*:FB$,E/-D7>GC(0H1>&@?/F!(0B%8%8'54B8"13B?B1.,HGD243.,9A-(4$H>%-!5(>))G4@.38.#&8%9))<'<>+05!3+/-H.A65A#%+&'$$.(FDD/*@!20>?=7$B>HABCD##."#C=5;'@:0A5&53C;&!),,A12>/4*'8D799EA9&H&C$&8&(#,22&#%2.-9/A?#-,$81?A'A2%/0BF$6-A*1'1 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:8 MD:Z:114^ATTAAAAC145 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r362 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17011 42 153M = 16744 -420 CGGACGCTGACGCTCGACCGTTAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTT !>A%*$2?,B3/#H',/$,CB6//?'+A>80*,(;=!3*C94+*BA"(042EH<-01"3/#>E.7748$;9522E*33+-"%>7BG)HF/@C*!D1%E3G9)09B8'72'BE3"GD6%6F=8(G"/6($5-7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G131 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r363 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10646 42 162M = 10389 -419 TGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGNTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCC )<@=9D99029(93GF*;!5AE$&6CD0&5FF!52'%?<18!4'#@D#6@D":$F*,G*@A35@C5:A@?2H5,3,3D:-!1D=?)C606,;G&%E9),2?,/"*)1(:91==-(3@GB".D4+0/''AG2&2CB;0$>B"4$>&2)8;&("G8' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C124 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r363 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10389 42 257M = 10646 419 TNCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCGTGCCGGNGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCGCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGGTGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGNCATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAG '+%+*((&((&+#++"*+$+#*"""%+)'&%$#!($)%&!#!&!#)!"#()&'!'''#$$%'$+%!""!"$+($"'))+"!'&!$'(+!*!$*(*&*('!**)#$)!"'"%+&&+#+++'))%"%*&*'+(*$!*$+"+!&#%('%"%!((#!+!)$((')$!***$)!!!#%"*(&!*)(##&''%$+**++&+#"(($"#*(+$%&+$'++*+)+"(%$#"##((**#+#$#%'&"&#"'&!)"$"))#'"#$!' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G22T6A36C47A53C0G85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r364 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42242 42 227M = 42469 280 GCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCNGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCNCGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATNCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATG -8)9A=+6'9'B$7>#1B13+7&.C>@'!&G49==%HF0=71C1.HBBHE9);)4>DC$='=6A$)7+DC,??4,?+59=/98G=+3='=D%)#;'+'&<);5)DD@6-?+,!F*A90!:-%8*''6&2&;@?!F215F'82C0@H=CH89$.+?71,;E@)08@9<4%>',0FB=.B-4%C%!)GF? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G7T38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24526 42 217M = 24377 -366 NATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGNGTNCAANCGATNGGNGTN #$+(**%*'#%*$*)&*#)'"*&!(!+#&!&&!#%%$%%%($*&)&%)%'!"'&&'!$(*)+*)$&')&"*#*&"%"&+)))'"('*(+$!$(($$)%!$$&'(%!*(!#+!"'()$%%)())%'(%()$)'!(&""$&*$#$*''($!!%$&*(($$!%'$")"&+)+"&&!'+%!!(*"$($!%"$"$''%!++(&!"&$&'""((&(!)!#%*# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A197C0C1C3A4A0C0C0T2T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24377 42 149M = 24526 366 TACNCTTGCNNATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTNCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCANCANANTCTAGATCCCTCTGAAAA !'*!""(&('$"%*$%(+)"%"%!#!#(%#++*%&!+%*')($"+$!()'$"'*)&&+#%#%')!'&&(+!"#($"!#&!$&$&*%#%#"'(**!**&%!(*&%#&!'(+$$'$)&!%+&(+&&"#!(!'""*(&&&"+'(&("+##+* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C2T0G4C0A57C56T2T1T18 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r366 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43496 42 49M = 43296 -249 TCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGAC 4=)<=770H26>2;'+'%81%*="F#@!.:684A8F(B02#/!B>;$9* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r366 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43296 42 127M = 43496 249 TACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCC 3H8F9B&HA&E'$89A&#!$B0=%:H"1.:/A)19%?/((F>!>6#3EEB#53;BG78G#@#'9$$8%%9,9DEA18#;/0C.>B5!!7.=CF+;4%A8><>384%/+CFB8=C".%:C49=8#:G;E'+('+?&*F9634"*D:"3A@4'/?(1<0C!D)*>C!49H.=G<&;#*.1#4DE>@C.3>D3BC?=F',"79D492-=G'>,)3)&B#&#F9@*%%HA1;0.9-:>8H:A??6.4,*D2)B:3/B!C5H;$>+F:6(?)0.+C=G,@.-4;63(657$G='/)8%F%?3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T217A18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r369 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1926 42 106M = 2120 238 CNCANTGANATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCANGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTG ''(#"*%)!+!&&")'*#&("#%))'&%!&%+"%%)#$+*&$##%+&&)!+'*%%&'!"&%&"$$("&")+!&("%!(()#&$)*&"(*!(('#("**$$+)(!$( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1T0A0C2A71C25 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2120 42 44M = 1926 -238 CCCCACCATGGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCC ;?'#-=$%@"'9,C%8+2F'5&GA8"HD&C+?'*/AG+4-:/"0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G5T34 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r370 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23358 42 54M = 23184 -228 TGGAATGTTTTTTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTANACATTCTGCNATA /60F4H:2GC;CD4B-A<6-C!7G0H@&*A51+=$2/?%:%/3E'F:$AD!$(! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T5A29T9C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r370 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23184 42 104M = 23358 228 ATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAAGTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTA :3<2D,D-=30=/;,*H+,A$:#H(7$>,.39;1<243AG5EC4F:<9:%:$;E$E%,52?H:&#*05@:3:8'50*<;2B>*'5E@/#0$/3"F(-),"'72C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T28 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r371 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17850 42 102M = 17742 -210 CCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGNTGATGCGGAAGGTTACCTAGG .G+G+1E$-=16C'(*&,(2*#2C6G'4)3.&1)@G90637"BD7G,9B5.4&=#D<)&,?%H/5*:7ED%<5$G:E&""+@2==*!(4523:"5@8AF$'$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80A18G1A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r371 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17742 42 65M = 17850 210 CTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACNCGTTATCTTNGTA @8!163F')<;38.$3/>.$(589>F-)-B+"F#!F;.,!#HAA*7E9>:%=5*"7"38%,-BB/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51G9G3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r372 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39190 42 189M = 38968 -411 CAGNCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATNCTGCAATTCAGANCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCTGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGAC CF>>)4)/6771/A1F+9.'5%C.9!B$F<@+@BA4>C5F@F58*E=55"5%>#&6*6$CCC"%&@$%.ADD63#H1@<&A).2:$9?:H/"#':'+,25=*)(%&?2A$E+05023(;F84C-*?(3@5$';"-B@8=;B%2&**!2&73$08G+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C32G12G82A56 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r372 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38968 42 207M3I15M = 39190 411 AGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAACCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAANACACTATTACANAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGAC 7G<#%1!/$8=>/9,95!F82F3!5//69!?CA;;@-)B?F:)1$G?'945=1A&)F,G<1'!"A.(#+$/"+C$F=CCF5D*;9)&*6(7;9"#HG60B%DH&HC(%)/:0C@/H4GDD$A=6FA7)27(6*"?D;8G%*6,#?7B?">$!1,F*-?%?'D<,)5B='(($0'B!H.7)E?%*A1#7294A71-2:G?==,@*"$B"7*0"?F,E=121%>H+H AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:87T71G11A50 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5821 42 150M = 5709 -262 CGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCTAGCCGTAAGCTGGTTTCGTGGGATGGCACCCCCGACGGTGCTGTCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTT +!%!&()#+$!()%$'$$(+$&))!+"+('$(*"))#+&'+#*(!%*(&'$)(**%'!#+(#+!$)*()"')"()$+'#$!#+($($)*%&+"$"%"('%+!("'!*'"+$(%(%*(!'*$!"#%)&""&+&#$'&(+"!"+!#&($"&+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:54C15G14A12C51 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5709 42 73M = 5821 262 CTAAGGNTNTGCTGAANACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCC !%)$'("(+&+*"(&')$&!(*(&#(&*'%+$&""$(+(+')#)!$!+("%'!&$&+"&*"('+)#'#&"'!' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T3C1A1T7C56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r374 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41805 42 60M = 41702 -163 GTNTCGCGAAAATGTATNCAGANAATGATTATCAAGCCNTGTATCAGGACATNGTACGAG "D0%39FA"'6F%*:H38@&2"2G2F58?19BG,"-;)$##))?E!BG<3,;.$)&'.D@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A14T4A15C13G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r374 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41702 42 103M = 41805 163 TTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACG $$9>,B().4*16*:'C(#E&/'*B(H%09:C,;G!!&/0(H!">C3%7G4E8B/A$&F#G$#@?8&,2D19D>A=B>86C"-+*?@"=G"*G0*F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r375 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39417 40 78M1I92M = 39599 250 GGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCGAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCNTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGNCNGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGTTTTACGGGGTGGATCTATGTA @(B!8,+B1+:A@!!'.&EC5B&:=3BFB30@8-27D#BA83@,B@7$9#F):B51=.3<".($F+<0$?CB*"??*-5+-(5:04'3%4/:0#'G-F3AF"5'HE+1%E:6+81<)<=?((793=A@3"'?D<4*!1;)E/+-<9839?D;$+CF91A3="B,5;;"*(: AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:45C22A6A0A6G26C1A35A19A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39599 40 68M = 39417 -250 ACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACG 4?&!<$0=DB:8=&F*B3/:FB#;.;D,*HFC68;1@.:*>#*BD--'4/;>0D%;D:)B73!6AD/" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r376 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10454 42 68M = 10307 -215 ATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGNATCANGNAG *#('(%%#$&$++!""&)!+('!#'(&)&!&!&%!*%##$&#"#*'*)#%"!&")&*+)&+$#!!")( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:58T4G0A0A0G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r376 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10307 42 81M = 10454 215 ATTTTCAGCGANCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGANCCTGAAGATGAT $87E@85#.=5=(C3:#0@#:0G.=?@?&=D06822,*3()B,3&&0"8D(B"59(FA-?"G(H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T10T56G12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r377 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41083 42 90M1D84M = 41010 -248 GATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACNTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTC %,1'5*6HC;3%#B2!27+>E>,@*4!C76%&)A(3>$=HFH<(>94(@12&.#%B:,9:F@"F-C-&@+D2'6-3>'+@!B+;&8#6;'>B9&FBH51/G2>.?5#-.3@3)DA7@(&'D36+<(;.A)>$G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:90^T3G80 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r377 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41010 42 69M = 41083 248 CATGGGNTTAAGTGGTCAGNCGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAANGCGAGNTGGGGAGACAGGGCT %$')("++"*%$%!$$%(""&%%#(+$#*&!#*%(""*#)#*%(('&+++"(%+(+"%&!"**')(#)! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G3C0G12A27A5A15 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r378 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48345 42 81M = 38816 -9610 ANGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCACATCAAGTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGG &%&(++)+!)!$)!%*+%&'#$'#!+"'+&*&!'#"$&)!(&()&(+&+"')*('%*"*'#'*(%+$))&"&!!$$#!(%* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A25G5T47 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r378 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38816 42 62M = 48345 9610 ATCTNACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAANACCTATGGGTGGAAT 0"451E:DB5)9<(,'-.7>3!GA;28-"-$8)FA)!+71"A"&'&/58")>.F"5*61>$B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G41A15 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r379 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17687 23 33M6D11M = 17469 -268 AGATAGCCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTN 5:%E*"/G91A&/77//<6'7""0:/?AD4=E5D=.27"CFE-# AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:5A27^ACCCGA10T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r379 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17469 23 67M = 17687 268 NCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACA $+%%"+%$&+&"!*#%%#!"($"!#"+!&%#+(!")'!)((%*($"'+!)**+*"+%#"$!!"$#"& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T66 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r380 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13978 42 94M = 14240 334 GGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAACTGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCC @AH=:)>9$E??D;?95A%6!'$-(6336C$3:)7+@D3?B%)E%+=/:=48073-%5,!>;C8@B7BF')<:2&28*%!G='5.+2%#-HB>0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0A69A22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r380 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14240 42 72M = 13978 -334 CGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGTAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAG @-++<2832E@"E/=(+2:HCH;-#$B714B#GA/CD@:2$-FD>.6%7+";+*%G?#-$48'HH)326)(3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G26 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r381 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3808 42 92M = 3900 336 CTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGA )/D@7'C1A0+&;#:">D#,0130-8&H+C>:?--<'.&/>H16%'1D$56:6:)68E-8D)'077!E1B?E90B7&)2"@!F4#@*9C9.( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r381 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3900 42 244M = 3808 -336 GCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCNCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACNAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCNTCAGTTTTCCC "2,:.*:,/%EF$8E7F!:>$H7=DG:<3!!4,9D48B$9%72!'/B(&@B47C;,?&5=>?0$GG:#;"E51D=>=>1(>F6;1).!?D,E"7%A<1672.3>D@G2>8,.0"C72"B3?&GB?*F3FH=;9<&>,5AGH2H%-/*.HF/F4FF%1A#,07!#4&./H*?B2$)-!&1!5!F,/=6+07(& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:69C36G125T9A0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r382 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37585 42 104M = 37429 -260 AGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCNCGTAGAT <9:55H#-.5DE38G2.@HD?1<9.!.#(-,0!91GC)#*&B/2C59,:(=*@*,<#@)H(0!4C'.879*A+>*"",*C$A%BE9#1:E!)&@48-/" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T26A1G60A24 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r384 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39611 40 68M = 39481 -198 CTTTGACCGTGAGAAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGN !'+-7GH/=)7A,79;2@9!2/H?,0C0+69/31;%C0(A=94#":H# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C53G0 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r384 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39481 40 16M1I88M = 39611 198 ACNNTATTNGAGATAANACNGTAACAAGCAACAGGCNGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATG *")#*&)("&*(!**&!*$$&&*+*+!&!'&"$)#$##$!"#"$++!"%(%("&*%(('''&"!##!*(*"'!$'(!"*+"*"+&!$+!++$!+"""'###"!"' AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:2C0C0A1C1C2A2C3C16A68 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r385 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34352 42 337M = 34352 0 NNCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTATAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGNCGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATNTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATT '#7C30+D#=14-H9400'<@$>B/0;/?;'2F<6-?')0'8DF+G:@1;D@'5!4?:6AG@A.=G47:BHA#+6G2?3(0"GHD1&H?F();87A:58'9(&G*;%0D#@5&.)C4'@#;7$-')BD.#9+>D;G2'0F*.9";8<6GB13;&"":4A:E7+(:+/!6H<19)$@>2?3-9<-%4:(1/8DAE*>69H=H0D>*DE&526,@;;H%5!>' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T0T16A98C50A132G35 YT:Z:UP jpayne@0: r385 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34352 0 * = 34352 0 NNNNANNATANGTGATANNTGGCNGCNAANNNCNNNTGNGCNNNCCNCTCT $"#""#$"$!!!$$#"$!"$!$!$!#"#$$!!"#!#$!!!!!##$$""""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r386 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28074 42 60M = 28140 205 GTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTGCATTGATATTCCGAGA 7<@%59>@/HG30A'?.?,AB+D3,-5.!.EEA@5.2'<1)/)9D.EG)';-+'4C$EF8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T16 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r386 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28140 42 139M = 28074 -205 ATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACANCNGNCNNNGCNATNG "$+*'*$!#)*)(%%)++++&'*"#(!"#&'+"')#(&(+*&&"(&)#"'+#!###'+!")*!&$*)#()%!+")+'$*+$&*)(#*+'!((#)!*!""#'((&*++!()+#'!#+++*"*"+(##*"(#&%!"$$''$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:123A1A1C1A0G0T0T1C2T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r387 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42101 42 40M = 42232 299 GCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAA 3,1&!$4'>-D>/G():A+(?)$(>F/6%>*1494708$; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r387 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42232 42 168M = 42101 -299 ATATCCGGTGGCTAACACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGANGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCNGGGCTGNANNGATGAANGA $#*#+$$%+"$%(++('$"+'!*)('!(##)++'()#)&*!$*)&+&+!*!%&!$$%$)+'"&$&&&$%%+)+$%*#)'('*)+$")(&%(&"(+!"!%&'*%"#%*$*#%)'$)'#""+#'''#!%#+%+""%&!!+*"!'+$#+&*"&#(*#*'(&!'$*((#%*( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:15G94A37T1C2A1A1C0T5G0C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r388 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27769 42 40M = 27960 241 ATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAA B@GA8"A6D8$8%/H4F0-9)4,F";B(G4<'B-">=91* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r388 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27960 42 50M = 27769 -241 TGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGC GE2A-CFFB+!G;%'D@?11)!A0834+*?6F/>2766(!3B?H&5&399 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6457 42 117M = 6575 233 GCCGTGGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCTAATACACCATGACCGGTGAAGCCT %*+#%%&%)&'+!&'$)(*!&&!&%+##$&)#$#!"+""$&'&#'$"$(!%(#*)*&%!#*)#%%%%+*%"&'(&%!$+)'#*#"(&*"(#""+*%'#*)%!&$#+*")++&$&#"& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C86A24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6575 42 115M = 6457 -233 CGANCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACANCACGCAGTCCGACGGCACGGAGTGGAGCANGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAA B-;F%1&$7@-=B5+38@#84)&-<==1A'#6+?):B"073>/-".2D2*#B31)G0CD*7>>,?G:AD;!4?>742G(C)E>88A#?F$AGD:,D2'F&!3DC)<=B?@8@D>? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3T40T11G17A40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36879 42 60M = 36986 204 TTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGANCCAGACTCTTGTCATTT H==G/F,*0EH,"1>E*-F3<<.'.,07"4@+(F+(=C:H%"224CCF6-3>1;!&%)9H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36986 42 97M = 36879 -204 ATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTG ,D4+-!>#;3%?A(.:G:*@;-4)7'99=C9.30*?!9?HC28)4<&.F561844:>!G59G#-CH&84/4,F)F%5;%&02"7'#/$D.?"D4@4. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r391 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29504 42 53M = 29644 287 ACCTTCANGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATA ,FAD",/<1$A,>>0D0(GF>D@,!'=+A9@%%8(!)C/-G(),04>5/5AD> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T45 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r391 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29644 42 84M3D60M = 29504 -287 ATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGACGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTG $8"43?4<*!<+=B'=&'B-.HG%BD1=3##'859,6F?9*!*4*7E2)'6@=',$@:'3+3E=4%=?C8;;781*36.DC;965.5.=9+4F/BG< AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:84^ATA13T46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r392 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47618 42 90M = 47428 -280 TTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCNACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTNATATTTTAACCGCT &22-4;/(>6*:5>H1!4:H+2A=H<20:D+7A96C$!GG"6*(,F8>:GF46!D1G!!H1'<3-EC(8!AG?AF5+69D>#CH068E!B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r394 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45155 42 50M = 44974 -231 ATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAAC <@"4+%8?-!";.0)A.?*@4C)#F=$A8"!+!"-7':-,<;1&1(EA>' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r395 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1061 42 77M = 978 -160 CCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATA 98G2:+3;F#G>&$?.77"%(;#E"4(A#6-3*!)H!*8;4$2$-6(4B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r395 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 978 42 56M = 1061 160 TATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGN 7@:1B(F&;6!.!<.*E,96*=7!$&(?/91F/-2'%26')8G")3H*'0! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r396 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20295 42 102M = 20482 261 CANTCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCA /;'-A>H?.BA($$?@7,(78266&8@-/?.A25!>?:)A)-A7BE&=A#$/5#2=+6("8>"/5G"F%H:#BB?+4(0:5631GB7"G-,216"-:03=F61$&@9C5$.$G3F,DA5(@?C>C8,"4+9?4C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r397 77 * 0 0 * * 0 0 GNATGATTCTGTTCCGCATAATTGCTCCTGATAATTAATCCTTAACTT $'C0,F=D&!1-/;G"2.F.:56#9514!4-#F/8+,8H,C,).8D($ YT:Z:UP jpayne@0: r397 141 * 0 0 * * 0 0 NTTAGCCTGCGGGCAAAAGATGAGGCCGGAGATNTTTTAACTGAACATTATCTATCAGAAAAAGGCCATCTCTNAGCGCCTCTGAACAAGGTCACCAATGCTGAGATAGCTGAAGAGATGGCATATTGCTACGCAAGAATGAAAA ";%-><9,D-5!@=/B*H-G!F18E;-;%?.?0(*!>1D+2E#6,E+;E$1(:4(5#=!'B%F@!'#*3->EC,*?4C=D#95(/77#B.(@.%61$/+$5/D??H@?0#G/%8<2>>:G,%H(H'(1@0-(0E(*.5A<'E?>A1A/%E##0D/"C@6?-2F/C2G,8/&?A-7.6?@;A;(5=2HA)G,EG#7<(!"'$=7747B?7G&<-B#4/3.B&3&-A0/,,')4A7DC97&))!H;,7!!'!.%"D6@?41<(=2B/@9D@9:A?1BC%4/$G,%?7*4D:<3!FA/%<( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:147T7T80T36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r398 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10214 42 62M = 10276 335 GCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTG %=B("&:',?*9=%1C";09:$A$/>%?,#!2(1'%D)$&HAD%55,='@651@;29D(C/1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r399 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33851 42 207M = 33702 -356 TTCTATNGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGANTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAGTGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCT 03"6(C6-5#'B.B!:A3#$-2!8>*1'*/*D#A2&4%(6,60&115>1"23?7.D%E=57F&!+#C9#ECA!CE9'1$1!BA873G9?298D'8"-50"<7A8GF84E;CB/E%>9*=#A#2C0=E*GBFG-:7;/0C5A88>$0($34/G3-%!0!$5$:5/@7?6):@!5%>(9?#5E6(?5F*+8=='!H-+*2."4F##7C! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T101T71A26 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r399 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33702 42 149M = 33851 356 ATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCANGATTAATACAGCATTTGATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTCCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAAT A9,1,(6);?8E8?564)=-G9FHFE;",,/CG$.4$6=>0A7(2.E3!-"H'4,;#;&8C76F%-%.1498&7G*&B):=14D."<:):1:1/@HHB'18A:,-G=A8D'3>DB>.,C9/#%A:H$9:@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T16A68T31 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18261 42 47M = 18412 229 GGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGANGG E.D2-4*@,,:5&@#*@#!(>,&F'*@(D(A!7E0,(@8.1+4DD-+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r400 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18412 42 78M = 18261 -229 TCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGG 81C>(@DH06B?+<"H%;C/7$9D,+#2#&!C=9@<1DGF"(8+:5DC08#&6E&@4>7D.AB@-+,A$7G7"16F4> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r401 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1783 42 102M = 1554 -331 ACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCACNTGCCTNACC &*&'+&)$**+&'$+)*)%!%'$+&'$&*%+)#))"(+(+'$!#&'$+$(!'+$&'"$(*+()(#+$(!)%!%)(*""!!!*)&!+)+%)!&#'**)#!)'& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21G68C1G1T3G3 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r401 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1554 42 229M = 1783 331 CGNCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGNNATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCANTCTCTGGTTTTCGTCATACNGTGAAGAGATTGAGCCACCNGCCAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGNCAAAGACTGTATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAA *));.>+@4D?@G(1B)F.68(*00!%(;0?=&@>C0622(=1B7!%#0?>4'"=;,+'6!F8B@.$:*81;F>D,"5//B<7H7G)H7-F9D.)B>*'=,#4:0)H9B(4@$+-$6!/+8D#)C0;"!.,&+,FC-A$>@70C.01:G1<;,1+%)$"C?#&$G!,">3//06B/EA-?>)>/,:E?7:,E%C*9%)H<6!'B!D@EB=<@+46%=1,19'B094A<0%9>9!>(@!?B%05'8AE.!?9AG&:1$A1?D$4!-E8)E7FB6'"0?G@.C<8>?D"!"0;FG'))+';4'F AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:19^GTAA9T13T29T108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r402 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40019 42 70M = 40089 255 TCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTT *A"3%C:&;$G(56!DD!9#9-?BGBD&-26H5;>359F1::G/,1%!F,%"+.*%9DED(;0/-:.)+;?4/4*6CD##EH;"?0H""D.F@";7)/@(H&:B*>,&37463FGB2H83'C7B6@1/;,B6'2#*/94=@5C<6"51E*16E(=)-F#,34FF89$=#H,%:B@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124A26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r404 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26455 42 63M = 26259 -259 ATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATNCTGGCAA ,.5!H+4-)44>&62;&)/F$$CE%F83F;%$*=D(""/!C(()G:4%FACF5E!.25*52"A-!H.CD(8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r405 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45458 42 80M = 45243 -295 CAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTN :-;>'9$86)$)G4(/692"512$H+"C%&>81:8;(**49H*98-.4+""%%>&7!?ACCH9?,>19)$*,C6' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r406 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39023 42 55M = 39023 0 CAGAATGGTCCATNCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAAN H(+)7*;"4&#;+8(%/(4,)='="13AB&+*6:'5(:305,B:45,:%&)/70! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G3C40C0 YT:Z:UP jpayne@0: r406 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39023 0 * = 39023 0 NNANTNCNTTCCNATNCNANATNNGNNNCANATNGGNNNNCTATANAGNGGTCAGNCNNNANNNACGGNNNNNCTNGNNACTACTGNNNNNC ##$!$!$#$#""$!!!#$$!$$$$!$#$$"!$"#"!!!#$#!"!"#$"#$#$$"#!"""!!#!"###$"$###!""#!!$$###"!#!!$$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r407 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7273 42 151M = 7483 271 GGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTAATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACC '>F8,;:4%H79;3(>-696BC3424&?&.=G:$+:"!CB5HB?5+"#F(*8>)(!(*-+D0)-G!=%@>@5(!D3.E1;E8D,D7.+=&F7:!G51DG68G:-7A&=CD#1G'EE>/?5'D-.C($%. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T25 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r408 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35412 42 53M = 35412 0 AACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTA 8477EE=--#:1E@C"/6;128:CD6<<<-6-!(?!6FF%3@7DH%C3%8C.) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YT:Z:UP jpayne@0: r408 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35412 0 * = 35412 0 CGTNNTNNNGNTTAANCNATNCNGTNGNNTNTGNNNNNNNNNNNNNNGNNAGTNNNTCANNNNTNAGATGGNNNNNATAACNGGNNNNGCGANNGACNCCNTANANAANNCNGTNNNNCCTTTCN !"$!$"#$$$!"#$!##!##$!""$$#"!"##!"!!!##!#!""!!!$!$!$"$!!#"""$"!#$"""#$$!!#$!!$!#$##!#$$"#$!!""$$#$$"#$!""!""$!#"$$!"!#"###"$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r409 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2834 42 209M = 2731 -312 GTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCNTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCNCAACTTTACCAGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTAT /*.94H',84@2.39&?1%#F-!?EA3CG/):?#D,'EFGCB,H#A.@+*E1*,":,4!81*%?>B#C5*,!5HEF;#!02<@".,)@@19/+C%D"'H&5E5>8G%8349==?H<1&,>:998B9=C9-(D@B/)H75 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27T125C10C44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r409 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2731 42 103M = 2834 312 GGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGNGCAGACCNGCATGTCACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTAT >3H>09'!636=5$B,@<%'&B3.=6"?D8;@&E42/%*,+4")4D$G@#<:;5,8@5!&&*D65*>&62*A4:7B3E#>E1HA8%)8A) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56T7G5A32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r410 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 257 42 79M = 473 256 CAGGANCANGGNATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTNATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGNCGTCATAAAAN #&%$*#"*!&(&#+&$*)!)$'(&#(&$&(*)++%$$"!"$%&!&#+("')++'#&!+&+#$!!+()$$"$#%'*$&$* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5A2G2A30A24C10T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r410 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 473 42 40M = 257 -256 GACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAG &**<:76C75.#@CH$./BG@2A!<('+AB.4//972B5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T18C40C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r411 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 958 42 95M = 1078 189 CCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTNTAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCNGAGAACTTT "0#*).:./@H!894:!F$3-,:E'DB9H7!66#<%;2>H-+G#7C0F%GC0;7;=$!GG7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r412 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 157 42 41M = 336 235 TTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAG ED?'0H)C6A.A&?.GC1:DF-:7%74:<46%=#==%90-2)F9)2:F<>)6'D6H7)/9%B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80T9T31A39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r413 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27116 42 147M = 26954 -309 TTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGATATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCNGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGANGCGTTTCN $,-@8D)-(97%:$@28?:;EC7>?/*(7D&:%8=94);3=0#>G<@>0A2H%;?%>;7#9?H)2>3E,>,B7,F4,/1BG&E+<('=?@(+@E@<-,"+AE6(6-+D?H5B,$" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11A6G31T0C23C44A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r415 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37064 42 126M = 37190 247 ATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAAT H:F&0,$/#$.E)F$D/8$B$%H=9861D"(7EGF3.C89F@)EF+61478E1:0FC/>AA/2"11&7>;E/<5?+56>(/A8-3.!1>"!DBD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r416 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42568 42 137M = 42705 181 AAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGNGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTC .C47?;6/F6>(0$*%/F&*E"2"61&,F".7;(/?D=80*10,EE?=D=7(<*&;C4,B=!+E-->30;&D,F?6?7?-2)7'=3"FG'8!!;@+/"&> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21A115 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r416 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42705 42 44M = 42568 -181 ATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAAN #5?(-/%ECH8<&=71)4(8H.=-;2!*+82D(;%G"C5%G=")@:DE3H:3%H5$,0(?;'(((03A-.;%1*=-1-&6?G,C:/3&A=487/C#5*D49B(%-62:F8H=).#*FE+-93)00HC'$)64:A2$5;E$GA6C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A2A143 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r417 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6212 42 11M1I29M1I172M2I40M = 6065 -399 CTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACNTGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACNCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCG /)F?/*@?C>,GD8<.;->.;0;>H%?>*G$:'!8/A/-!8?0A)@2"?6F:"-%G(1&<,E=0'(=/73B-#4CA5@;=B@#*/;#+A<%!A+D/=,)"792F2)F#?E+=23(73=@B-)7%",!(1/5?9"A2$5&811,1)7"=G!C@E>"&-FF8'%CEF#!;<9&&/*C;B>3,B AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:3 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:70A73G107 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28547 42 140M = 28687 327 NNNCGGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCANGATNTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATNTAANGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCG "#"*&*+$&#%(""++(%(#'#)&%)'*!!#!%)%$&")"(++"*$+(+**%(")(''#((%"!)#%+$)"#(*(%$%#$(+!'&%*'$+((&+$()"!#+)++&*)!!$##&"&#&%'#)"+$!'&"'!'(%&))+!)! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0G0G1A72G3T25G3C28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r418 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28687 42 187M = 28547 -327 CTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTNGGTCCCTNTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGNCGCTCATGACTTCGCCT 03&!2634.3'(,C<;D6'F"3(1@'F/,70,6D/&%(F84'3)DG8-<4*(=B0>B*$G'%'>%8-864?C#/@-$@>(B22?;8HF!554(CD0CGE1!??1CE.H?G.?B)&BCDC@=4D1&#C89=AC0=':'2)0'9AH%/'F2!$66,)":A86*2=94")1*6+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110G7G50G17 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27409 42 62M = 27634 320 AGTCNGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGT @1@$8+C;0(.#E&18,&1(*AC90=02<0>A0=G:*GE"B'G-EA>C),!"?G8C?:7?;* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27634 42 95M = 27409 -320 TGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTN 0"9)%'(9A9,BCD!+)#.(G'6&D),;2&A<0=8<4:GF9(),?;-6H'$)"2?=& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59C21A7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24850 42 63M = 25004 243 AGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCG !D>#E90G%#4:(-=(7#!03-AC,+)8G:97:&-4#)E/+-BB8DF37".E5,*C+G!84@D*:=E,G@1:%:%B;<(=00@@$,9#1(."!=,77>:'@&?""H>9-@&>E3C>()EC=@6" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G4C90 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r422 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9220 42 70M = 9290 212 GAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTT +1@(H7+?91-@CE=3B64!1:88$F'E/359->C/**!3;G@(-6@F5:%8($5,=;".@H;A5*092C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r422 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9290 42 95M5D42M = 9220 -212 CCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACA 9=A2>.D;@##;>"3"#510+,@"2+?:E??<1+-4=67+$6>6H0$9?(6F6>B>*E@BDHG7E&)*,"CH"30-2<4#%H'4;40*D7()0C;9*>8#"8@H%7E>CC2<%C%6,+/C4,53A@F5/@4C6*4>/ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:95^CCAAT42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r423 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25990 42 237M = 25858 -369 GAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGCTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAACTGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTNTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATC (>>>1)?"6@@)#%<(:9+0!=36;F+H8C294*5)C1+;0EA+'.0&;.'/AABD81HB9A'D(B09F?-47@'85HC3A*5AA=09A;F,=EC$("H&EB5E(;,5H!(@9!3+$)1'9?%/&=4'&B?#>&"GC#.3,.$,*?7,E0ED4B3>*B#BG<'B8A#48;"EGA>E+F6F?85&+$%.2>.%A!.-D4<(.)<36=($',@7<05/G-C)*+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69T42A84T39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r423 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25858 42 132M = 25990 369 TAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTNGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAAT AB!;%BD)AD/$#@,7"$A0A-#43>1<;.!+;3GE8+)3,+=<9+304-F&D3D/2"6!:-;2##%<@F*1E'%"3.A'0@C2-D#@9CFF%0"+?;*8G+9:%:#H->3,3E.D4!5/BE3;(16BF;#? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88T43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r424 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15236 42 90M = 15058 -268 TGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCNCTGGATAACATGGTTGCCT 0=)13@8<=1#=1&"%"1?$.=C8DG;#-!=0;G'<=<:&)7@$%!F(D:+01?;3,(FE"'B/AFDD5F-!&-F2(C4*'!E="BA(G! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70A18C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15058 42 178M = 15236 268 NGGGCCAAGTCAGGTGGNGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGC "2%C<2508?!8C!(5AB42!,(#8:EG&@6D0.@633C!'6'4:/-<(,3#/5:'CG05026!?$/?E.EG95F-*:@(<%7"59>D$HGFB@&009GCH99&4C4<'GC1-A*&&8D:'=:>.+<@#:!$/&'0E>@*3?;/9"'/77&&&F:)7)5-21@>"?*=B#$E$974.E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G16C160 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30678 42 85M = 30498 -265 GCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGNCGATTGCCAGGCTTAAATG ):566F)B6F2$5-0E*C8@=%G+/;24@7,A03B'203-C=BB;,89%/H8=@)+9?:H<8*)D>*%,1DCHG6++=!973CF: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65C19 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30498 42 67M2D27M = 30678 265 CCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCT ;8-%-;9*F!6C0#!E$B&D%9&,,6+#B,E20:+E+!$;6<@)@0G("(=%9'?1->0$:A;B9G9/+C)#H.HD-,/=>A!H*$:7!DF7G% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:67^TG27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r426 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19135 42 75M = 19210 219 GATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCNTGGGGTTCGCCGCGTCGAA )=84C,A40"8#F&E.%@2.97G%C;8:1F88C;D&E9*F4D.0A3@HF5:+C:(:6;<4&<#GA,')'3: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r426 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19210 42 144M = 19135 -219 AAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTANAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGGGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCG (B362(''BG>>6-@&<$52>41=*6)6"F.77B@==4,'/D$AB$AC@BA40!@7=?&B9GF%/@*G!<<2)%%9*<42:=.>>AC4)8&D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91C21C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r427 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46916 42 68M = 46810 -174 GACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGNGTAN )!'++#*+$*##%$&#(")#%')$#"*!!))'&&!**((#"%)#$#(#"'!"*)+%'+)'')$"'#%! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C3C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r427 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46810 42 69M = 46916 174 ATCCTCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAANGTATGTCAGGTGCGATGAATC ($!)&('+&%!"!'")$)&'*#&&(&%*'*'"(*))(((#("%%)+("%(!!)'"!""(!)+&%"%*$$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A0A1C42T21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r428 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1644 42 210M = 1854 270 TCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTGCAGCCCGTTAACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGAATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGG B>42(?G=AGC6F9$CH:;3.EG71GD9%1!G!C.*"8-D23F7D=$)(B=>6<'A=0@!A*$.?8:0-&FH&,>*:!"0)0+15=E!8#1D@<3<@;*5+;1>$;?B1#HGG@(-#8>5:7(GC#4=1G- AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:55A9C94G25G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r428 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1854 42 60M = 1644 -270 AAAGAGCATTATTCAGCGCCNGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGAC D#/&-2H*F6H6$(A("G?@@;4*C1,2=/*E2(@B6/$B6#1630,<@H5G.>9?=2>* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C39 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r429 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34682 42 31M2D45M = 34884 281 ANCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTANTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGAT 6@)>A)7873#4H<:*/C"5)579'<#<+957+*?@$+G#A.H26,42$<>!9A221)?280BG AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:1G27T1^GC45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r429 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34884 42 79M = 34682 -281 GAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTNTTCCCTATTGAGGATA ;?E#"A+92")642#*19==:G*H;9?>3G59698;$798DFG2<%+">+-%0E0$B.E<;,9&5(&385$.0((4$?1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T25A16 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r430 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39135 42 40M3I155M = 39330 269 TACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCGCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAANACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACC *F-G+3&+50'9=98G4+.(C",!3B21.D4?#%2$&CB/@)8'$"8/#46=EAAH2B>FC*H,925'392F68@49+9+!E#1H)!&4@E8G-8'G-:@=0%2%"!A>7>,8.<*>,F&66.2.7)G@79DC3H08<#82!=74+9094A)22(*"7.B8AG"#1D>GH$C2'>#7!,+A9)@C'34*5:H/.1!29 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:39T90G64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r430 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39330 42 74M = 39135 -269 GAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAANGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTG !0**8;DB9&,##C1:1$69)"@;9-(5336C06=E1#49))A8"+1#"?.#,3B&8B+%1B%-#5;9<)D::: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C30 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r431 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36515 42 247M = 36515 0 CTTTTTTATATCCCTTTTANATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACNGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCNTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTTGCTCTATCTNAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCNGATTAAA 7"A)C8/>G<8//8&;A@H-+0!=G47C!1HB7H*'5>%61,%:84D67A<'A9E!"*#<$"7D;>0.>8F)C)$C8*;'F2$=&9./0C?=4F@@C(25,0%!'$+9D,'.4,(;+>59%96'6%5E'5%1$':5E'3';57BE'0H&!=>+F%$477,@9';>-'C@:H>9?D2H>(?H$(/%7G!'?H'%8:%44.FG$:C5,F6")H6'9/5B27.16)431'D2%70((##E1D-F?,D;5( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19A88A62T21G9G35C7 YT:Z:UP jpayne@0: r431 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36515 0 * = 36515 0 TCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCTCCGATCTGACAGATTT /1E8);8!5)'58961*93G;"-34=1.)9?4@1D5.%;G$1A" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G27C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r432 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10277 42 57M = 10403 185 TCCGNGCTGACGTACACCGTGCTCAGACTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCG E*,E4=%E6!8CH5?H0(%%H6362BH*#1!0')24;*)4C:-2!=<#!&D*A$7(3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G21C30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30485 42 80M2D39M = 30270 -336 ATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGNGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGNGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATG 1)(.$?'$7C>7#D,<+?=09!<5=$H6;<=%.$F:*+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:49T27T2^TG39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r433 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30270 42 215M = 30485 336 ATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTC 3F93),9GCB7?7(D@<,9)."H:?97@-3F0DF<8D@-B3(-<%1"G>,)G*A:8*9C#B6@HD8(:-%"7(<,B(1(6<8,F3%-<,H(B8F4!/"@(E/! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r434 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8698 42 47M = 8448 -297 GGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCG 6%E&24G3.)(.C/!.B;77B.B*6GA2.@> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r435 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36604 42 95M = 36299 -400 TTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCN H.;.A1@/2$5&./55GH(/)>AHH:8:)$>-88<%:H.DCG&B5;6AD6@F;*?/4,/0:9)F154!.1:C(=(5:+3C5>#*DD3D*'=.739?%"$"GC,/<(=&FD-7<;A24&7%+7;?6D3=%"BFC,00'/9*F#&<8+0.+7"D'24?1)-15!;E:4"&"+3A>*(:<=C$,4H,:5;@.G3)AFC<&C/.,<4;!=F&/$>=*B7@F&=5@;!'.(6+,).<2()>A-;%4)D!C-*!!$9:.CCG?,19F*3*6"4/""5D5;.3<'87.:F>.?A/*'/"C9EE810#="H")#?A%"7<0%($8-F1,B,'B8!'223(@1#!68?EA+5C99>696FC44?49-"!A=!3;?551=HF-+<1% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T192T84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r436 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15192 42 275M = 15192 0 TTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGACCTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACNNATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCATGTTCTGTACGGGGAAANGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAAC :G1,E9+/6.-C($@$'*++,4(/0'H&18BAF?&2C%#/FCB>+<:&EC&B<%#F3*+B#H,A0=:)A>#)(8,1G4D+!1!AGA8GABF;,F)$F;4?":,=7)*%71?(!E08G,<,C%A;BE.57H@+%D8%E@3=-*H07%*!@"D3HG'H#6:E0FC"0"%-3&8')0-=FC=B@,(2*,$?:+D@-+6'<49#?6<4,;0?>.(< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:61A40C0T45C17T107 YT:Z:UP jpayne@0: r436 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15192 0 * = 15192 0 NANCNAGNGCNNCNNNCNNNTCAGGGNNGGANNNGNANNGGNCTANCNGTATGC !!!"$!#"#"!#""!"!!$$!##"#$#!"$#"""!$#$!"$!#"!!##$#$""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r437 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28905 42 112M = 29051 237 ACCTGTTAATGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCCCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCNTTAACCGNAGGTGGGAATNTCCTGCATTNCCGAACCCATCGACGA <'$C%<&6$;78.(C-$"3?28!8H=9F:0:==7A25)EH,G)+G7E'0H.1?;C;7&63!*4?3EH*='@:C(E;G;#0='&=A9&1?CF3?(G AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8C25G31C7G10A9C16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r437 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29051 42 91M = 28905 -237 CGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAG C=9'-B);83,?:6?740-3$@GC'157G8"1')@HF:>2=#!."?6*)"$FC;:;"@7A0BF$H'@+E=>E#7F8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r438 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21385 42 45M = 21232 -198 AATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGA -$(5=4><$2$,C;199F*7F6->.F.+91G<)B%&2;E7)!04< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r438 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21232 42 62M = 21385 198 GGCAATTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCC )&%##!+('%&%$"###+$)&$)!"$$""&*')("**&(&$)%&&!+()$&$#$&"#&)(%" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C0T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r439 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28549 42 45M = 28313 -281 GCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATNTTGCTCANGTAATTTATGA 3F"3/FEFD0$H!*<).H)=*9G7"%-+<$@FG4>$=<,2;'1D4/&:#4:4?,#!&?F!)'>B, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A8C30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r441 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32390 42 129M = 32273 -246 CCGTGATTTCTCTGCCNTTGCGAGTTNTGAATGGTTCGNGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTAAGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTAGAGGATTCATTGTCCTGCT $''6F*=4%42)3C@B'@*3:,6>5'8=D<,@G4&C%;5*<1"/.E'7:.7H327C!9>B1"0>F-080)53=AA4?:?F$#E?>1B8)55<<6:;/GA34<>F(;$*35?)48,"8FH/E#1%/.:96==;B84;96;$G"860;8-; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C54A3G27A29 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r442 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29890 42 211M = 29760 -341 ACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACACTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTN !++%EC79D)C(?+&1.B3*E/,>B2@D!5)+4-5'@*#%.)<-5E&8/4=8*@"",@BB;DG6?26.D8&79CAA>(0#9"G76".,??A?C29G1+>91@#!3H8(3.<7:6:F36411#"6/;,-17*1HF?8".H9$F!52FH?705-!;5<'+5G'+3E63BA25,<0G1(/8H#D7)7)E5C,E8<);'?-C4+0C+$#,".7C# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G106T101T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r442 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29760 42 130M = 29890 341 TNATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGC 04D3&D.2A+6EH!?-;*'&?G-,@5)0?<&"BH/$3$!5;D784=%2A#"7+=728(2&7?7'&0DAB!%CEA=/!/4<">:B7&*)4:6>F:3A.C#7/5*/"2F&211H)'0'"A=*+$*G1346'% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C128 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r443 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15267 42 84M = 15141 -210 GACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTNCTGTA )#0#,#F66#'90/HG.@D)3"'*>A'E>&HC3#?;50;+!@@HE,H;#+;%?%E8$C35;#$15,<@1->H8(:9? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r443 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15141 42 76M = 15267 210 TGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTNTCGGTGCCAGTATGGTGCTC 50(4>4<&7;8(=-3".)@'@+6GE!!=5'0B8>03,%9@1D7="=*#G?1?>/*#7.2#B$8:)B15,3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r444 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29106 42 125M = 28950 -281 AAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCANGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTT E"0906G01A>18/:0/9,C"HB=">48$7AE0H1&2((3:"2#351:.&+)38EGA)3?@2+.-,7DE@6H%?H13,21C@?#7!=@+24),9=.*/&&)E'$6$);20/%!H9)340=@;)"3"5;0);!FC!9(>22B;7B!62,DF>E/+-$>$,=HG@,8G,'HF"D*650),$G"9BB- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21854 42 73M = 22025 233 GCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAA $(+&5?&0:EE)D0A0A6=/?$@-2D:DE7F&B?F-)<5(;5-)"2&85>;'%/-1;6/@,984.,7+51=&H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22025 42 62M = 21854 -233 TGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTG *#HF'#7""825!:H)*+11230!??3/=F(:3#($78E3B,$8@+5=B+'4/;3G(A,6(A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37592 42 55M = 37706 260 GTGAGANCATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCNTACTCACTTCT ?87()27?8H=6$*.;+'0G*=<,E+H<'!&%0/C5?E@3:<2'D(?6H1'E+5) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A36A11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37706 42 146M = 37592 -260 GGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGNAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGAAGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAATCCA =G=-$#)72.@5D?5G$'>D%F<%7D*;+2B&/?(C/7>;,.)E"!B"48;4+,6*!:?0&'CF#$)A@(!E%@"+%3/""D0&A7C0/4.4A-:+"!G;?'%#7FAD,<$?:'7<("*8''.2*#,.G'2-.(7A!"7)*91A/7C/#!!=-/E39/%>6E'?;.%4HE)"/60/0@--0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47710 42 61M = 47536 -235 ATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCC %8,0'*EG4E4"#2'E!,BEE>2)$.&$&945A%/$>?6D4670#/7:)#@(2#/+G#18*?@;H0:*&?0-'@G4&586&@33*;3@3(=?G=#8/#+5='B&8%34C.:3?4&;8AD:,@7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A69 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34693 42 20M2D191M = 34941 323 TGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAANCGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTNTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTATTGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTNGGTGTGT 7$,21G7G4&HA?'89:94#H?&@"(/A(/DBG/*1E"69*?(9@;0:02/.!/E-/-6.9"::5>8>H.&G22=9*(G-0:HF-+DG<>1!.1C.91B+(545G-?E,$";?F-!5%$('<93$#10&-)8B/5F*DD/";"/,2E%&A!11?:G(H@0,3+:A AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:20^GC33A63A21A63T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r449 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39469 42 26M1I101M = 39342 -254 CGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGN .D5HC.6A);@;;A=><>!.68#/@>3"<76G.%1?"?E4#''=)4*C2"1(==)*6#%7*-?%18?-99!F*B& AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:16A6A0A101C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r449 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39342 42 96M = 39469 254 GTTGGCTAACGATATCNGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTG ))#C+F3;/F60@AB(6+,G7=04!$<>4,?939/>A9<;(%)?1A6,C/=;<#?<-3E?7D-??(GCC(@HF<*A(:<.,=(#-0>G1"2,@$(4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G13C79 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r450 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38085 40 62M = 38201 238 NNAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCANAGCGCGATCAACAAGGCNATTCATG %!:<;G26:%70B#..1.34DC:#)&8C4F1"4:'/1<;H'5B$.FA4C,-064>'06>14D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0C34A17C7 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r450 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38201 40 43M5I79M = 38085 -238 AGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCAN :33.G(1D$2CD6*#6;8=0GD>*C@E4/1F4"@=53#.8H"F!=7(G,;8$GD9&:/=BA$(%/!1D#:A2,F,&'*8>+8G&4F(+*&BF?0E165<-C*7@F.7>!=B3%4 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:121T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r451 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13268 42 74M = 12934 -408 GTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGNA !$*"*$$+)"")(%'#!)$)+$'(*(%%!"&#!(!")+)'$*$%&&#&%"%$)!$$#)'%&'!"*)%!+#%))* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72C1 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r451 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12934 42 334M = 13268 408 CCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGGGGGCGGTGTATGACATGGCCCNCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCAGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTTTTCTCAGCGAGCGGCTGCCGGCCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACG +!#)$#%!&!"%(**)%'#+!"((&%*'$+')+")()%%+&%%')&#*&!!#%+*!!#'%""+!(&('+'+)%+!&#*%%%')'$#+%%&+)!))$!++#"+#!#+%'""'"'(#*(''()%%#"+!*!!*&&&&('%+*%)$$*#(!&"%$$'#($+*!)&&%!"(((%%"+&*'#!&#!$+"+($#%(+(%'+(%#)%*%(%"')+$)""%!%+)%$!+(##"!)(&)!%#+%+*%)"#'#+''*)#+*+#))*")*")*($%$"'*"+'(+!#!&$!$"''#$!""("!#(+'(')((!$%$(#+($'##*&)+&"(*&$*($&*(!%&() AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:25T51A0A20G47T103A13C7G60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r452 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5792 42 73M = 5792 0 AGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGC D./&'.4'C0?2;:A*639C>9"CAC36AD8'>%3;=&:"2B*F9CB#<:%#9=4E"H$,7C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G64 YT:Z:UP jpayne@0: r452 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5792 0 * = 5792 0 NCNNNTGNNNCCAGGNNNNNANANTNCCGGGANCNNGACGGTNGATANANGGGCCNNTNGGNNNGANNGNNGCNCGCNATNNNGTANNNGANGTNGGCNNCGNTTAANAGNNCNGGACNGNNCNANNNNNNGNTATNCCGCNCAACNNANNNAANGNTCNNNANNT ""$$"!"!##!#"#$"!$!"$"$$!"#""$"!!"$##!##!$!#$!!$"$$$#!#!!"#$$$##!#""$!!"!""#!$##!!"!!#!!$"#"!"##!#!#$$!""""!$#!""!#$$$#$!$"!$#!""$""$$$"!"#""!###!!!$!#!"!!!!#$!"#"#!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r453 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4570 42 329M = 4436 -463 CCTNACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTNCAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGTTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCA ,B35A7>.1G+849<58#,=4!93C09'8,DFD:312?)@9<=BE6>,&:,1%21,'?@EED090.?/055:?*A2,!!F@2)@CDB?&E/,D',B:177A30'(>68<0E+/*B?B/00;"$5+37/H="/?0@F-<):D.E9H/-E&$>$1,&$;8$!%:,$H-<'4%?&8B,%,2!,#E-/44B1#D:.+>,61 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G163A29C131 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r453 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4436 42 134M = 4570 463 AATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAG 0D>:=?"#9F0/3+"=:!2G<"9&>?"*'"7&-4<;;C+/@9F)ACE)<77A#D(7&*(F!H!(=6AB"#+@E27''G+-$*&46;##9%D)'250D:6#CC$4(4AB)895F2.H2/6H=<"6G"')0+55FE"F:�F)'67'??0.G?+&7@3AF"8=?B1114GC+)7*9?1,.;(A?D'6<,*DG*7/12FA-5A+E8!8/*85A.8C+,9#ADA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r455 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22871 42 87M = 23015 342 GCACNNTCTCATCTANAAGNGGNNNTGGGTNTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCNTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAA %%(!#"(%)()"&)#%$)!##)$!!&##$&&+$!*)$!)$+")("$!*&*#!"!#+($*+$!''')%(('*"!$"&%*&(#*+''$$ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:1A1G0T0C1T7T2T0T2C0A0T2T0A1G27T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r455 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23015 42 198M = 22871 -342 ATTTATCTCCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAANAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATAN *<"<#9+&(6>)A3E247D!(;E&2E&82%*<66#%?:/HC5C'7=2=3?/CA!=+8?-)"?GC3?76%0%FH5BEDDF=%A38A-".-*)&7;E'2&9%'F&;0-+'G"'0'E;D+68)8;64(B@&*BG?5DG";6?1&C9H!780A4'"0C0F'B=H<0A74D36HB@C.,@A,A:8:) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G57A130T0 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r456 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44534 42 102M = 44490 -146 CATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGC F%>):)<:8+%F2'9*:;+1931?+:C48-%&5>0?F>""8>!*E3EC;@D.H5D()D@,-9/'=&>.F<;"4?8$7(%"3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T38 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r457 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38598 42 74M = 38797 247 ATAAAAAACGCCNGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGACGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTAT <%:8564C'";;**,=$;:HB=91-@7=/D*/>A)A#?H/53DB2-F:8G,#?,2GFA2-<"$&9@G3?$,%16 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C32T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r458 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2737 42 204M = 2587 -354 TACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATANATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAANATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTG /(5?#*17C@<(.#53:3=6@>;.&"(A/2*@D/>28:-&C(&8GDF47E2?*.$"B(?B:+%.0!<80B=++G4*$9-:6)4=E=$=#0F6327&"21:C389CH2*!%G48$;EG)5)0$9@/";2!4EEB2&7-45,'DA),2*6G40=E:@33F'$><9>;';0'!;*H6G.*)1E26"1EF6::E7A;53 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T125T44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r458 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2587 42 150M = 2737 354 AGAAAACTCTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTT 8HH#A*>5%7F4"=>2.@2&E8@&D)5H'5*>&8",;?C+.90GE/-F3F@5825*.'!C&5>.D-D$EC*,F0.45@!.B2C2F.G/)75*A?:=2245B*;692'7@%"6:-#2/=A"/"G.)69,1@%05$B1G';+<4,. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A142 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r459 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28076 42 58M = 28076 0 TTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATNGATATNCCGANA $&%(+)"*!)*%!&#(&$"&"&$''!+)'(+)$*!$+#%&"*"'*"#""!$&#%+*"( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45T5T4G1 YT:Z:UP jpayne@0: r459 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28076 0 * = 28076 0 CGNCACNNGNNAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAANNAAG (&!(#)!(%#+!!!*')&"*%!!+')!"$'(#)(#)%"&'! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r460 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19557 42 94M = 19738 264 TCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATA =49493:-G?A*(5+",A<5/?:"&/;(E7*FE4G)H4A11B<2<0D89(<.(8,#;D?04);0/7+)25=$+GH+*<#(!0010G5:7&GA"- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r460 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19738 42 83M = 19557 -264 GCACCACGGTGGTGGTGAACACCGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAG D*53>G>=218&;23;D-1>@8/+?359-B?80H2>''D@H*E&"8CF+E*G.C:3.A:):<;14:)>.680E-3>D.$%C.% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r461 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22507 42 383M = 22890 480 ACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAAT 9>C+>/=#6='+H=:/%2(G>-F?>&&839B099=A'E@A#,!2@<)--H/;'/014!%="?:C3%78?=E:C,-/96-C>;B7A8E*"96)@E'?)>BE9#2F%2'+:+9%03A&,@%EG;G<$*@:=-2/+5:B:F45"$,)1*H='),;"A09%H#$BBB+A72.+=-8&A!%@'?*7#&8?E*-B'/&)0)D:;6)5'20H4.?-9=%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:383 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r461 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22890 42 97M = 22507 -480 TGGCATTGNATGTATTGGTTTATTGGNGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCT /<9G/(E)$$,/CFH=C*!2,C,?+C<,'2:B-7/B"1;D;3:#-).(4/);#1#&7CD1!6#@'C8-+0E!C3$G)1>'?'<04H!=A/7#H#)F0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T17A70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r462 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22482 42 114M = 22349 -247 TCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCACCTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATNCCGCAGAAACGTTGTANGAAATA 39*5.>@1FF&,>-2G$'+/EGF6.*HA:5@A"#=""49EG:B>$)7#7@&8&*D:72=38"2E<8E87D!5G+B/G!G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A58G16T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r462 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22349 42 67M = 22482 247 TCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCA ,,59=B6*G4"8*A+4;A/DF+)B49B2/"-"07@'2/32$59;#5455$B;@%B3F52&CH*,2H@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r463 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44516 42 122M = 44725 249 GATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTANATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGC :'3G(4($A#$3@4(,C/#6=C9,!+G.'0!("<341)H,G!2:19BEF;0/@1=1*<(,F9&B>BBD?-3."+C(6&H3;2)9(=-@*G4<%1/%3"%(&:H:"E5!#1!7'.8;(D*(-9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r463 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44725 42 40M = 44516 -249 CCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACG !D+'C>+33!92$0(.#@)C('@29566/A&4,2=H">53 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r464 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27093 40 63M = 27187 149 TAACCNGGNATCGNATTGNANTCTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCAAT '&**$"()"$"%("(')##)&'$&&*+++&($$**&#%#&)$%#)"''$+)!(%)"*+$)&%! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4G0G2C4T4T1G1T38C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r464 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27187 40 55M = 27093 -149 CCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCTANCGATTAGCTCTTCA %5':!93-C$30>=?>/%6<84G+H)0#7%(:-DA6-,96)'#/0>"@&&&H:;F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G1A14 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r465 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43691 42 80M = 43771 191 GCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCACCTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCA =C!9#:6%7(1HE>=@9*4.+.B55>5=9;0)2D9122.?&!H);)0->$?:+;D6A"9%F53@;83;1F"(.&*>>9+G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r465 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43771 42 111M = 43691 -191 TCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGNAACCTAACATTGATTCNGGTACAGGGAGAAG 2BA4,!BF6;:(F?50-!835D4?E$C:5"260=,)&64H+>!$<@)=+()!2+CG0)#C:#=8%.#FG79/'03+:"53B4//&06E1B-G>79B2@":=,,8'#9C93F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79A16A14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r466 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33430 42 67M = 33595 218 CAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACG 4D'A&28-$D,/.8D5!*<)%&+'+.7?DB6-0).=.1+-3$!CH5C:77$(;G+1AH)3+F*1%E- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33595 42 53M = 33430 -218 TAATTCTTATTCCTTCGCTANCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTT HFC:*);2*/H*!)%130C(!2E=E#F=0=F'B>-8CD!%'A/!3E+;9B3.,+#1&%3:239#/F>@$<,A5=GC@-,?<@",+1?,<(%2(6=;<,=4"-$G)E>($G@<=!>>B)9<'"89A3#5%37(A?3<=F0(#4CG>5>1*7*!B7C/.6!04E"CD=;E<%A**E;C2E<'D!>06C%89E.0#<-#"-4&B.@>/;H@',3A>"/0B1(830.64&FGE$# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:61T9G4G0C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r468 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23650 42 234M = 23884 309 CCTTGTGTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATAACAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAA 2E(0&/4@6'@"!@C::-+;-EEC#6AC+F$AC2,5?#:#"AE-/;&0;4CA(+<%53=."(B!>E*((5%;3%&=D!'@2,A'7%-B="E/)C+*1$)B*(5<50*-G18<%B5;4=7HE,'%>5%2%)-3E=21(D:<:C/E-$%(!():$H:EB7%(67CHFB%?'B:9"#3&.&9<02+>.++(G(HH=%&&2@%F(%$E!8%7';+*9167+C?@*0D".:?(<.)*9A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T79C147 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r468 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23884 42 75M = 23650 -309 TCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCNCCATTTTGATAGGTTGCGTGCTAGATGCTGAT +#HG3FC;*&(&'B)91=+$81$E;C>92D+,(G@(/;)B8,>+9A)'02-3$&-'@D3CH4'EA#:C!$/-"6' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T17A14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r469 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26841 40 91M = 26673 -259 GCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGC "*$*")"#+$#$)"$)(')#(&+++%&%%&)'+(*$+*%"%+&!%*)*('($(*"++#'#"(%&&+*%*#&(%)"'#%%++!(()$!!+"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r469 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26673 40 14M1I138M = 26841 259 TGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAGTTTTAACATTTCCGATA 7+(@-D@$"='+?B%>C7D#6-7A5G0FF&B4B+83"B9>EDFA?;E7)FH$:D42%H*@0G0G%#6361$341#E=<2;H'-79<92GB$2*@:)'HH3126/C;?F3=E1FC&?A5&HB**BC%:EF2&$.4-8;1=7?G AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:0C0A2G1T0T1A0T1T121A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r470 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15527 23 81M = 15608 410 NGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGAGCCGA .6F2/8@7(H"A<6D:ABE2F?,&<58A42'EBD',%+7$E$4@9D19C&(4"@CF>((#B7>>F+B9&/&3;21:>D;84 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G74G5 YS:i:-110 YT:Z:CP jpayne@0: r470 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15608 23 291M1I9M9I29M = 15527 -410 TTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCANCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGAN (90?)C/#B?8';HH03G*!?*2(@3;!$EH?G#-;>A2A"8>GB*6>;6?,2+.79$16-"0"4E(>)$G,B4"6,H"'%%+'0.'H=%??@>$"2;7HD<.B2*24&@.@84;=(B(""67=6G2**DC%@#5;2'+G%@4"F:D*5.FE!$%GH12>=;79@8#6BH636"A)?%#;+973D4BFD=5&/)=' AS:i:-110 XN:i:0 XM:i:24 XO:i:2 XG:i:10 NM:i:34 MD:Z:289T1C0G0T0C2A1G1C0C0G0C0C1G0C6A0G0A0T1C1A0C0G1A1C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r471 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33901 42 200M = 34101 323 ACATCTGTACATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCNATAATCNGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACANTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATNTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGT FC':1($)@0@/@,)6G9.A?8'1)>1"16(.!C07"9>$A?8F"=>E18(C9.0'$D!G0)A0*;3,?+1$66<8+'!1%+.).E37A1?*%HG?0$F5.#?@*7+8G6/%E%9:(4-%57#;?G6E*@"*4B$96G<#6=&89:-&4D8@@#@=B"#GA<)B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8T54A6A34T56T37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r471 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34101 42 123M = 33901 -323 TGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATAGTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCA 09/C>=0$FH%;45,.C.BDG./H"+(-.!=&A/59*52G>7850C$7?+/&47!.4):'D0=FF@;*(=#F7:)!4(1:DF53"5#62&4DBC#52%"">0%:"6G&;,):?&1F@$DC16> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r472 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35097 42 41M = 35348 341 TTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCT *.+,61<#(=DC;C/;+3H39F;0"A@.+6@27163#;4?; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r472 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35348 42 90M = 35097 -341 TTTGTGCATCCATCTGGATTNTCCTGTCAGTTAGCTTTNGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCACCCGCGATTGGCAAA ")(&"'&)%()()(%(#'+($())(%&%(('$$!+'&*)*"((+%")*$$+*)("$!*+'$)(!"'!!%"!(!#+%(''!#%''&'$+!* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20C17G35C13C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r473 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24289 42 123M = 24191 -221 CCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTTCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAN 07%2:"-$#4<4#?:,AB*2$8*#B+;'DH8<$&D=1C;?2'C7/G#1$0%&0!A):=@A57!G94E4?9=@/9F:'2*'HD?C?7;?<+1C/+,7D?#E1*B".AGG))70.?(D3#C,3)# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G64G26G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r473 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24191 42 97M = 24289 221 AGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACC *+BDB62B:DG++$868&%#1/CD!C84D6+C//%:A&?FBH##1.$,1"7??B/G-(9%6H9.*34!';7<,-'FG=">&"E#5AH% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T96 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r474 77 * 0 0 * * 0 0 CGACTATCTGGCCATCAAATGGATGGTCATCGGTCACGGTG '$*AGD>"EF1,,80)H@A0+B@6#E<2-@$&76%>@=8B> YT:Z:UP jpayne@0: r474 141 * 0 0 * * 0 0 ACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCANTACCAGCNGNGGC )$&$+$%!*&)+%&($#(+')(#'"$!+)$$'$&$#)+*+)!*!'*+ YT:Z:UP jpayne@0: r475 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45001 42 88M = 45124 238 CTTTTACANAAGACCTNCNTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTTGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAAC :E->@62$1,>.34A9"HG6<#C!3,E":7.?!0>A?D7;&D4",' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8C1T5T1G21C47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r475 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45124 42 115M = 45001 -238 TCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGNCATTCTCGCGGCAAAGGA *09=0'5@B'F.$*?'HC6):3E6@B3,'.BF04%""36?'@1:D)4F+!1$;B-19@0?+G$9++F0>7+):D/F!)4,4$!F0#81+5&BG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96C18 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r476 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47481 42 246M = 47481 0 CGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACCGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTNAAGTAATATNTTAACCGCTATATGAAGAGCAAGCGCAT 2=9-3%3@H)8DECG7":76F%GA66HH7!9*/1;,.,C;(229E4'+";$4,C$#,?'59E=C@5&()G8=1>-46#)"6%+'E42->!/-/6;9-!?1BC8==A<@633B->FA39-65)5.+2?%>,D,*1@<"8CB%@)A).$'/;G384(,8HGH-+(;C3G!>+=(?!'(E"-5GG*9(!<-27$3%>?G8=396"=5)E@FF<@=85:19%21$F#; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r477 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4204 42 42M = 3932 -314 GGTCTGAAAGAAGTTCAGNAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCC 7;7$:3)-'AF07,&;2F!@(/,7E(&,(51!$0%;B:.)@6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r478 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25117 42 51M = 24900 -268 TTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTA <='08%8>'@H1/,6.884H>!05>C(GB=3D2?!%4A?@"4H=G8=DA(@$26B:*9A&'76"$C1%'H&=&?+($G&//. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r479 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24840 42 108M = 24973 220 GTTCCGGAAACGAAATTTACATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCNCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCT ?.C*B1904'%*><6;63.+:3DD2-F8,F-E0(E9/FA9<52<*+6)!;#&B<@=B(+$5E9-0?$?8?H//H&H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G53G35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r479 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24973 42 87M = 24840 -220 ACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAANGATCTATATTTTTTGTCTGTACTA A-)F9H6&F-0BHH-/E+8EE+2GA=836)=-0=#+>'-2@)*EF.H1&7?4@%H'G$=.43&.!F/2''@7H6E$;D)61!=7?)9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T20C3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r480 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18884 42 279M = 19163 333 TGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTCAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGNGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTNACGTGAAGTACCGTTNTGAGCTG <>,>%4-D!18+&@B.6DE,C1@+:C@-$>@?#071@'7)2@()<((/D$!#7.3.G&D;-/*/A+%/-%9D))#6HH(AF29<$7:57C;&6E<,+<974$3'.:,5644)&+C)?.3.486>C0*.A4A%&(-'%DB7+CF2H+;#,?0:@4%'-3$B3A3'"/@/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76G146G31A15A7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r480 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19163 42 54M = 18884 -333 ACGGNCAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGC =G/#F#(A*,79B.AE&7.(9.>?;2,=>$=:<:4.-+.6::3F2-7$$"651( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r481 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13773 42 82M = 13655 -200 GGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAA 2".3B2)8:$<**)+.%/9E<1383H88GG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r483 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 819 42 51M = 1001 233 TNNTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACA !"!G%H+1(@-A?G3?76'6%8:$DB<>G&934%')+7"H-)"6+-"!B4$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0A0T48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r483 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1001 42 51M = 819 -233 GCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTT G;?=+!-*7/%!'@+!B-/2"0!1F/'5E=88D@1.C,36C:/-31GD(2H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24941 42 54M = 24774 -221 TTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGG &"&$H$*8#$)=F"#+82G!(@";,8=37C,@@FFFF"<91H9;:5*H18D+ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:0G0C6T58T0T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r485 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2672 42 196M = 2868 583 CTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTGTACGGCCACTTCCGTGTCTCACCTGAAAAAATNTATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGG +&(*%*'$#*(+*"'#%+$#(+#)"#+!%%$)&"+#%)+#(""#(&"'&*#*!*(#*%!(*'%())#"&'&*#'#&!$#)+'%)*#')$('$#+*%"$&+"#'!%*!*'*%$%$)%&(+)#&*(!!#&)#%&+""+()+$'#!%((&&&!$&%('#!*##('$"**(!)#(%%"()%**(&&("'&&""&$&'*'* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64T19G12A98 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r485 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2868 42 387M = 2672 -583 GCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTNTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATATGGTACGCAATAACGNCTATGCCGCCAACGCCATCNAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGCCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGA :?-4;+.6>8B$/8;%0+=F2*9"E.32H=-6$GE)(2127?'+#A>2A-H%+<0%@>D2@'<'53=B/#>#>%.1:C"G53A!"B%F!)3G9C2E"5'2A=/;2#.:8>!FF+77&(@@B41/7A8E!A'.!2-.$.)#!!H>8)6*>6H+&<<7',1',3,GD216?1=';0":6%;H:&*!"$H!)&H5$(++$74C>B7E:)5B.GA7/;4/9+.=+0#B4$"D?'@$+2;/;;<7($,.".!CB!)H732@4E$!.>--$/%1'&,!005C+A&G1AE50=95-><&AB9;> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:114G39C15G19C116G79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r486 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35187 42 175M = 35362 295 TGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCNTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGNCGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATC G4(03E$F/G!=86,A@GG5"&6/A#*A06HB7B84'.A>99?!%'5042$?$00,!A<&54F4?8F98H94263&"&CF/7,#H.,1(*HEB&-=B/6!DH?!3B!5$")>?/%4C,6C6,42"0G2<3>$B83)B%/51+<@*E7B6<+9+HG/*.=F,)4"7<5'?518#4G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:117T26A30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r486 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35362 42 120M = 35187 -295 TGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTT "G"/,?:@."D52$!4'?E(*C(D69%E,8;?<,*?.-@*38G@+$=#5+F-2A::<&=7:2CG*"H/CC34*D61@,',$0A%$;;&H%-&9F2*;,?=.;3,184='/3HD4F$B<5F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r487 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33149 42 47M = 33266 170 GCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAATCAGGANAGGGGGTTAGTGAAT ,4&3+88&3"7-?F#&;C9H3&;&>6);&H-":E!,F'#<1;B82 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44161 42 46M = 43934 -273 GGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTAT *!#&($!%+&"*)*&"''())&*'**%+$"%*!%'+&#%+*&&)+' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r489 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2100 42 40M = 2275 268 TGGGGTACTGGCGGGATTGACCCCACCATTCTGTATGAAC 0&;21+0F.')??+$':@2<;G4*);,)F0'(9(/A:!8! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A18G6G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r489 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2275 42 93M = 2100 -268 AAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGNCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTG 4D(&)"CE2A&/!4+5G(+#//"B.?E5671#3!&B3=*6>>"9B2>A#>@<6D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C32 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r490 77 * 0 0 * * 0 0 NCCATTTATCGACATATTTCCCATNTTCCATTACAGGAAACAT !F.@+&,G2:(+:-"1&8@C9B95"6.DD-C6..(?75HGG22 YT:Z:UP jpayne@0: r490 141 * 0 0 * * 0 0 CAGAGCNTCCTCAGGATGTGATGGAACAATACCAGGACTATCCGTATGACTACGACTATTGATAAAAATCAATGGTGTGGACAATTCAAGCGATGCAANGGA !67B=5FC.::0902#A.B4GHC2)5BEG<;6'>2-@(H)@F(&>7!;0>1%:4B##)97.5F%2#5@A>(&6++:-C/00(;:75%-"7="<8C9>!9.1=&<&3/(4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44821 42 354M = 44713 -462 AAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGGCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGGGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGANTTGTTCTATNAGTAATCGACCTTANTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATT H'"+<5H,3"D.(#2@+216)?G9"EF3=)#'>B2-5E8G3D5$,E5<(-(6/,F)/?(F#G,AF1*:C5#/+*>?+1870*-9@8=G0+B".%-,8>@8*2>E.=H=>,F1A.:!A5F3F/'98@/:)/57#D:08E!,*G:@/775-4?$FA=@BA!+1H)-4*#1E96>G9=%B/=7,!.1+=@!E/6C>G.-(@(1"2B68:F7-&>>1C$@D60!!13!.(2?F!4>%$?F666C$4:1FF4?6!6$89E(/B)F0-)1GC.;1(38&%:/:">H94@#,F$#B1(!1)6DF;D$G+<-ED2?$*;C6():8H>;?5%%>*C5(6!9F4G5@ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:104C145T47T9C14T30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44713 42 108M = 44821 462 CAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTG 21?9F1=%+0>:BFB'6H((;@%0F9-%:,A?6*:7%"/&BCFF;)41%>=GC@48-G0#3B)7,9F$5, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r493 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7202 42 95M = 6971 -326 ATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGNACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCT 321+EA-6?(-?%#:H/C73E42(/!8"(>!1;CB'3!>*#-(1:G'=(;&"*EB'-'@77:09+B.$F;<4.71;'())23=F8!D:>?6A6A? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A51 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6971 42 231M = 7202 326 GCGCGGTCTNCGCACCTATGGNTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATAAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGGCCANCGGCGATCCGGCGCGTGAGNTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCNTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCC "(*(@G-(<$109'8"0%@B$B#;3'"%8C27(!%,),2)75!=B'615?+.+F&4.F+'@6*=1-2@D$9D=9:1A'3FC=+?3.7@A;/6&C(1,?/%;?A"G$110AB%;4$,"EG,6?8)8%+!-C*2//F)E.*:-E14GF2=%8',:-*:>G!4*;7/EB>;2:#H;90*,1/*?.*',:H>0B;?):AE' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A8G11C35T33A3C19T59G55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r494 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1382 42 102M = 1197 -287 GCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTT >38,()8?6)8<=&H3.+:?2'&5F"B*G7H?BC.C=0-+C31F:"7H$3E??"0+>;6-@CD''/-C-((%7,&>-=5<;4((!?@GB)"<073#$,/%,; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r494 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1197 42 185M = 1382 287 CNGGCAAAAAACTACCGNGAANAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACATTCCTGGGTGACAAGCGTNNTGAAGGCTCGGTCNGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGA $*($+'(++!()'*+!$+#*&%*%*%*&$%$)"'"&""(!(#"++'$#!#(!&"(+$$+%)''!)&#!+%#)(+(")%!+($!*"""+!$$''$+$*&&!&(!)!")#$%)!**'$(#%$&%+$$"%*$#%(('+%'%%$%!)!)+%)!")*)#!!$!!$%%!)*)+%$#+!!&###)%')$#%* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0C15T3A73G18A0T13T55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r495 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9026 42 52M = 9026 0 GGACNCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGNCAAAA 1)A?E*;0:9BD",-A40@"-+%C24@!=<<4B'4*;E&;8D>E0E3-&?#; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T3C41G5 YT:Z:UP jpayne@0: r495 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9026 0 * = 9026 0 CCCNNNTCGNTNAACNCCNNCNCGNNTNNACNNTATNNCNCNGNCNGNTTNTCGCA $!!##!#$!##$"#!$!!""$"!#""$!#"!"""#$!$"#$"$##!#$$!"!$$#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r496 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44924 42 153M = 44826 -251 GCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATA ?.GH>2>.--&E&0:-(1%#C8:.*A'=886?)H;/;/#)GB6@/>1<1)!B:7(42E=:C8C64)=&)B8+5'/',#<8.&&;G?$">;8,.*05;+'<%(BDB6A"3';:A$88G@GB&!01G?*/?(G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44826 42 98M = 44924 251 TCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAGTACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCC =$4%,5$/H"-.'*%EA)F"@,5=4)@8;<>=%C&:G44>9BE<4)E+4*>- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8736 42 57M = 8942 265 TGCATATCGAAGTNTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGA A&E>>678-&324/%@CD63#F@B8=:))+?/=CA8(G(.6>&HE0GGB%8!7F?%6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8942 42 59M = 8736 -265 ATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAACGTGCCGGGACCA FGFA#+@+,>6H2&34:1A)5F($!3&,H'(8E136C!B@/"%5$7B$==8:B(3;A/= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r498 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5831 42 57M = 5654 -234 AGTGNGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCNTGCCANCTCNAGCCGTANGCNN ('!%'$(&!%%!)'*%++&(()#')(&#+$)*+!!%#'*"!&#)))**)))$$&&$! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:4C29T0G1A2C3C7A2T0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r498 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5654 42 90M = 5831 234 CTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATNTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATG 3-D>8/F@'8D**D*G;904B29?%%:2&%#03!#0$EE',(/($9>F89?8=C.+59>"7?E@(B9-5CG<>D-&>)2!@$>.='1*3G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63T26 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r499 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5346 42 100M = 5124 -322 CCAAAGNGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGNGCGAGAACGCCNGCGCGGCGCA ;.8?;(,9<=++A:0(E5-D@9+/''#%("/)-7H7F$'5;%=B&#B492,/A"CD-!/2.'.>$6E-$?)&-$)B-!<17,&A0-=(*,/*8+.(B@?6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A70G11A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5124 42 45M = 5346 322 AGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGT 6/AH12%/,"/*7(D00E4>=+7>/GH(H5(91&6#B1@A)A*..H?+;619%%6)$&F%"#/H8,F(H%G36&="B"&"B)D*!H@A3. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r500 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46739 42 113M = 46563 -289 AGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTGAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTT &"<"/$/8G5+<;@DD7%??/2B6(%6'@,86EAF!'1)""A#E:@B!31;!!,$C<$0(*=-A"&@"$*6C+#5/3$)/+;'C?HD=HCG/B-G02',G//1C@#0=+5GF. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r501 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30201 42 98M = 30014 -285 TACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAANCNAAGGNN %)+!(+(&%+(%"!)'$$##)#)"#'&%%"!#)%&($$(&'$+!)!!*)+'$#+*'"+&(")(%)#+!%!"%)&%(!$&!*+$)*#+*%#%')*%&&) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:89T1G1T2T0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r501 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30014 42 73M = 30201 285 TGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTC 6#F:C%7+61;5)4/!E2+$G+&>2D2(7-.94G!(&H--><:&3#7+(*BB6#G-8<9G.G7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r502 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16186 42 129M = 15923 -392 GGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATNATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCNATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTCAACCGGCATACAGCAAC 702E5;:$;;@+H(=;*E7FE<,E8,68&$&<<0:,A#",6&#$3+6(<;'5HG"-*1&(%!4@D&0?%3+;@!-E)3'9BC1F:%>?>E'4+$'$.222.3%2F6<:CFH-!$B,B=)5C$H:@3'46$H:115E?BF2%A,6F,)B.>E26*5/H%7%<>DH?#6=)@A:7'3A20<-:3A&=%51?:7G.:%G8'183,H#4<%$1" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r503 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43952 42 72M = 43756 -268 GCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGNATGGCGCAATCANNAGCNGGA '"*)!"((*(!("$)%+!+"+%"*&+'+!)$)&%+%%+#%$((++%#!+*%*!"(+(##)$$*("&$)%'!) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:50G12C0A3C3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r503 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43756 42 93M = 43952 268 GNGCTGACACGNNCATCTTTGGTCATNCGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCG )"&*!*')")#"#&%+%+#%$"*"!""(**''$'*#'&##"!#*+''&%"*%&+%&)$+!+&"+!)+""+&+$)$!))+&+$)"*"'$!"&!& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C2G6T0T13A66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r504 77 * 0 0 * * 0 0 GCGCCTCTNAACAAGGTCACCAATTCTGGGATAGCTGAAGAGATGGC 09-#%8;03#B7D:(7$D>F:5@34%/<##EC6A#0=1A$A57=1<> YT:Z:UP jpayne@0: r504 141 * 0 0 * * 0 0 ATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGNGCTGAAAAAGAAACACCTGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATA =0F+#".'()8H+8;BA-255$A$#%'A0;(,FF99*0$!=3>H30'&4&F.)8:+9'+(5$$9?,7(C,),,:@.&=1HF6&1$1-.0/1,4." YT:Z:UP jpayne@0: r505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10035 42 62M = 10234 268 TGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGA !5A;;73<50D+1=>*AE<>$HD!G0@36A%!%29*@#772C5<%0C,%/H8AFH.<:C/C@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10234 42 69M = 10035 -268 CAGTACCCATTATTTTCNTGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAG +,1+FC>,B>BC98,(;:'7E6.8G&6/:?;C;/,97HE):%CH(EB/CF2!6< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34571 42 92M = 34678 271 CTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCT 4H#5G/?=A!GH(@1B6?64-*$D:)1(FA#(A(A6G9B>1'<43,8)91+FF1E;;;782)65#66C4'#9'&!1"GB70B,?+'%487<> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34678 42 35M2D127M = 34571 -271 CGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCANATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAANATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCNTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGC '(&!(&'%$%'!++$)#!(*"&$$')$+&"*%!#(*+$("#!!'!$!&')!!"$*'*%+*&"'&'*"$&&"%$&'&#'!$'"*#&&"#!!&(&'")&%&(#'("!"+!$!"($'%)"()*"*$++#"#*$'(!#'*%%*++'&!&#!$$"+&(*%#)$()+& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:35^GC8G33G37T16A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6236 42 16M1I167M = 6143 -276 CACCACGGAGAAAGTCTTATNTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGCTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCNGA ''"*&'!+'+%"*&)+$%*!!("%*$&&'"(!&!*+)#)$%+%&)%&(*+&%#+'&'!%"%'+&"#!+!%!#!*(("+**#++(!*(!%$%)'#*"($*'')"&")+&#)&$##!!##%+(%$%")$**('(&&!*'$%*'"++&'))+)+%(#&()(""#$!*%)*)#'"'+)"%##!+)")& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:19C39T120G2 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6143 42 80M1I13M = 6236 276 GTACACAACCGCCCAACTGCTGGCNGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCNCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTT 2&=G3977%,+1=4;+<"3B2:9C4F4E>'6?<=B4B"=;D(#CGF*#'>.8<1@4?/D61#F--**=4>>4,HBCH3H4&"7 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:24G43T24 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r508 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 612 42 209M2I116M = 426 -511 CGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGTTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAATGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGNTCAGGCCGGAGNCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCNGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGGGAATGTGGTGA 9&62::'+)=&-D"'/$(F>;G@*23+04&0+EG605#%2"1BAD"51,3:.HE;%E.5!*981'3)/G3(;B(012DD5&CA2D:%A(6A=>;%;10D#>'DFG#%.=D.'7*-3'"+01*-H?)4+.'@*-&A$+3;#EDD50A.-"HD+*"3?,@(#2F114BGA2D.6CFB=<)D$$<(&4$!6+-.4%+8:2;>'62@636=6G>-G!*?'+*-<#86*$AC-))8A#,2:A6E205+9)6+%<8EHEF(!HE4/,,B,(@4/:"!'8B-+)49<1G8,,0<;>$H((&3.@./8B#$"9/97=?+ AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:71C27G41G23T11C93G41T11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r508 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 426 42 186M = 612 511 CAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGNGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCNACNGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTC 7C296;A0#5;D+0D$"'5;'55,?!E(79?GD/4.0EC#.!4C4H"#8/-%&(4$E#"*(9GA#!@80"?4'EC6:<+0D70D7%79BDB1+'A;-+4+6G'3?F((6FA8/B64">&&?$;*B..00!D*"$9A>*/E+0FH2G?G*$H!FH"@=%2BG=9?257$/F%+47&A';61"/)!5, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73A78G2G30 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r509 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27681 42 47M = 27468 -260 ATTTAATATATTNATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTNCAGCTT ;=A=E37DB5?G"+06%8$=D5-0C%7-BE.@%B;0<<0F8F*$6'>5--7,.A76:-1>DF;DF4$$%&A7596DD5.0A$'9,4%:; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r510 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25026 42 87M = 25250 286 GGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAA )'><4,@:5!=*2,:E<+A+B-'.<1-3G5B):20;7F-#5;/>!BG&:*4?C'H;2(1=9A+F)F22&,6&/@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25250 42 62M = 25026 -286 CGAGCNTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAACAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAAT E,:A7)@'?G8'%FC,,7%7E+@8+($8)/4!*2-3H;-H;/5187*;C):.>2=4="E.6& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T31A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r511 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3637 42 152M = 3787 312 CAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGANCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAANAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTNCNGCGTCAAT .$8>/>3/(-05=(G2*8%4'E%#1C@@53E7'+-(H6+E.$!(!48*6&2"2%,:>D!2"$:=;8E*)*7@"@#%*66"8,!5C8#$G>B,,'F#?2'"!B.<*,=(6+237>'7A-(.&)"2/''; AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:19T33G41C45G1C4A0T0T0A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r511 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3787 42 162M = 3637 -312 TACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGNCGCAAAAGTNCCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGANGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATTTCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAG :2"6E9;;.*?."A?!EH(>A602?8E5@70%17#.$;)/3@-)&2*4"AG4GFH;;7#*C9@#,53-%9G)1C$-%%52##@97!?&;9,.0>4.5F!;'0.)A8-150!+H+,,:"=C>')!%A%&A@=2'$!77!++)2@FD9C/C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r512 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32373 42 257M = 32264 -366 ATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGCCGGCATTCNTCCATCCTTTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATNTACAGGATTCATTGNCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAACTTCTT *&*'%!"(#!+'&$)*"'&$'%'%$**#!"!'&")%+&%'!(''#!(!"*#)"*(*+"(!("')"&'!$"'##&#(!!&+&&'&'!'+&'&($(*$!##")#(%+!)("*)*(")()$*(+)##$)'(!!+*!+'("($"%)%*)$#'+'*)%!"'#*!(+%#!!%%()!!+%"!$&+"##*$&$#%&"+'&*++(+#"#&*+#+%(*%!!'(*&+*$"'!%&(%(%&'!'+*%+&#+%)%)*%('*$%***&(+'$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:57G8A7A49G14T111T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29327 42 43M = 29084 -286 ATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATT 1,D-$H$H+2A#.$/660;$72AH937-76,B*@9($A$#9GE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29084 42 119M = 29327 286 AGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTNGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGG <"&&;D?H+1"G%"D4<:/HB7+0#;H)4?<*@A)'8CD"'-?3>!4AB&($!@>#E$B:E*(55'#*G#H+'5-2A2BBF88!63*#H,8@6;F#5+2D':+2&G4&27#(G($1@!6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r514 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34854 42 84M = 34854 0 GTTACANCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAANAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAG FB>0=*@%2*55E1"?E?(@'$44=-!E%/7H=CC@0*67>+1H0;$3"#6')->?(A46:-@='.*93=-6DFC7AC(;+3F9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T49C9T17 YT:Z:UP jpayne@0: r514 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34854 0 * = 34854 0 ATTAAGGGANNATGNATNNNNTTATCTANTTACTTAGATNTTGGCCTTGG %)*)*&&)(#")%($%%!"!#*+%+#(&)$%'(%(#(*%)'&"#%$"%'# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r515 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26076 42 88M = 26076 0 CNNNCATACAACCAATAAATGCNGAAATGAATTCNAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATGGCTGGCAGCATTCTNGAGTCC ''""&("(%+#('!%("%"(%'""#'**%)%'&')+&*%*))&(($*&'"!%)$'*)"(%(""$$(*+(#$"((!))+(''#+%'%(# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T0C0T18T11T31T14T6 YT:Z:UP jpayne@0: r515 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26076 0 * = 26076 0 TNNGTNGGTNNNTNNTATGNTTAGANNNGNAANNNGCCTNAAGTCGNAT $$"##$##!"$!""##$!#"#$#"#$"$!"#$#$"!!$""!$#!$#!$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r516 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40061 42 47M4D74M = 39973 -213 GTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAAC '$#("*&$%"&'"+!'#"$)+%$()+'%("&#&&'+%*#$+**%(+)$&$($&#""(!%&%**)('+!"!"##!)$#%("*#!$))'&)*'#*(!&!$&(&(()'&(""##"(!#&+!*)) AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:47^GTAA74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r516 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39973 42 50M = 40061 213 ACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCG BDF*9!/2G&;E#@#D3H%$86:'H?>*83@HD$=&:!#!/,4E0C/&+; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r517 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40060 42 48M4D104M = 39942 -274 TGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATC 2!502D,;!8"?;E(G*2?93>,G@B0F0!9'*A;HF-:CC0%?(1<8CC37(%:-%@AG#(H$>:;:,(C@!43%(F* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:48^GTAA104 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r517 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39942 42 118M = 40060 274 CCANANGNCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGAATCCGGNTGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACC *!(#&#*$+!"$+'#'"*+)""(!)')'(*))+)")!!%'"*($!&)()*'+'+'*+$"'%'$)")$('&"&'"$&&!%""!")'&"!(+"!((*$)$*)%(*#(#)*%$)""#'$&+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3A1C1T49T6A53 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r518 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41559 42 92M = 41559 0 CAGACTNTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAANAGCATATTCTGC =DB9#0F4!8EC.<9%>"5A;6<0,H,!H*H=8&H3E2#;$G5%5.$B%;.D()+$2:B@?'+%77:0EA"C8/"(4E)5%G,$-*:;66BB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T72C0T11 YT:Z:UP jpayne@0: r518 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41559 0 * = 41559 0 CCATTTTTNGGCNANNTNNNANCAANATNCTTCCTNGGTAC *'**$%$""##!!&!"%!"&&%#)%$$&*'')'%+&*#&%$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r519 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19721 42 51M = 19536 -236 GAAAGCCAGACGTAACAGCACCNCGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGN C')/%;49HE#%"..FF%#*!+%5/FC:E/H'C<.F"=)3#=2H#"!2%9" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A27A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r519 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19536 42 157M = 19721 236 GCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAA "H9/!FC4!&'95AF0E1?)/D?"/E68F&87F44C%(>-4BH'?B;=(%-579%!31>5+/9A+A686.A/9#!16<1"2GB6%> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:148C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14833 42 71M = 14684 -220 GGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCCACCTTCGTGTGCAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACT )42;D,?.B9B>2C?E*)45-7(@)@-8437.'*=.8H(/; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G11A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r522 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38773 42 120M = 48327 9610 GCNAGACTATCAAATAAGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTNTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGAAAGA ((!A!%G.4G#-681B#BGBFF!?9EE.#?B.0@>76-,.H;@):++,>/(BC+FE95A$!9?A!9;H:BF:87A2:-B&>9H;E!?;?G'21"F@>H8-A9A8D-@)15'DB!E@%#-? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C13T64C34C3 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r522 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48327 42 56M = 38773 -9610 GCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCATTTAAT ))#0/6;!'=9D,,-05$5GA1.3E>*8A.5&4>:0E(H@&%6!3<18>+@0'7"< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50A5 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r523 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47103 42 68M = 46897 -274 AAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTANCCCATCGGAAAACTCCTGCTGTAGCAAA $)$##+*&'(&+(!%++&#*'"+"$&("%)&%'!*(*(!$$#*&*+$%"'+('%'"%&%%!*()&+&! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39A20T6G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r523 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46897 42 124M = 47103 274 TAACTANGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGANGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCNNCGCCCCGGTGCTGACACG 38G)E>*?->?7,!;G4G<")$57/&:"<<:$$2D+@61:8>3919H9.8";#G6"E5"'E968*B@2>7%%@=B-,42D,G+BH:4GB(.*"7$"C)%#2*3%8/B'>@#@9)@2HF7GG.H@27?*D"G"#;-$83A$;>!+*0C6/HD:/' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45133 42 135M = 45005 -263 AATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTG 1)B47&,HD!--@+$72+62",2D72()0.H57!0>?'26=*+F%4"4+(A=G;1>>34-*;1,;G$2%/C!2&H,G/&:,;5)1E8D/&5=24D#HG3A!=<,#4"3B'12('1CGDGFF<4-349/*4C'(8) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45005 42 128M = 45133 263 TACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCGGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTATTAAACNCAGTAGCCTGGNTTTGTTCTATCAGT @$F42H$80CE;";1=E@(#%3>&(23&?7(0.-&8)'16C#4F31'H43C15&+A&5;+H#400$?,B4!&/9%?,/C0)@)4.C1D4C+1<+5"E/*//?7)7C+32!D4!!(D&@."6BGDEF'9%#&!..67&-45'*B()5#E"$@BC2D-,9H7&*5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36T24A38C8 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33221 42 220M = 33441 329 NTNAATNANNNTTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAANATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATNCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCANCCAGCAACAGGC #$*&)*!&*#'*)''(++*$"'+$'#!&!!""#(*')+&#)+*"%''&$*&*!(!(%&'(''+!"$!(+'$!')'*!%%&!+!#%#+')*#$$+(!%"#!*&*#%!#$$''##&"!(%&%(("&%'"$&*$"%%%*'!)'&$($+"+**&!!&"&+&')$'*#'#)$"("$&"#%("$+#()#$%**)*+!$)&+)+!*$%(*&*#"*&%%$(*$"!!'$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A1T3A0T0C0C0A30C115C49G12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r528 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14656 42 300M = 14576 -380 GCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCANGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGNCGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACNGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAG *@+!65/<(F#&$>CB30*$$4$!17<'31'9*#,;:5F+.>@4#$*)0,5$D@3>*$)'-#;4(;/8H1GD-63%=:3)01&:A(%1$!775-#C0:?7G#$-,<>)3HD+=9/BE#;.#;"F=:<+1>&4C:0/#+$),G7D<%0,G?'B6=8+-6/F=:.$7::=9E=6*8.:GH''C?EE=?BH9E.0%8D'4+>#/65@:==2':8'C(%"7681,B+@8/*/A/->FD>(21+*F+,!.,?#H43.-DG'4$%)(6'FH?+CGD)=)121%,D.G?/0!(D3;:H94D-'H$,@$/2)5.#-/HC*(3B;%;!?@<#H-0.'@'.3AD9#;=)>)>%%03D(+A*C:E4.4:.!0 AS:i:-66 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:22 MD:Z:0T0G0G1G1A0A1C0C3T0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A22G40A3C30 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r529 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 123 8 89M = 15866 15871 AGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAG &+GE.84H,-(6B/D9>;A2$+4G&@@@F<)!&"+"/?$)3*35!+;C&;;<'-<=&/=CA4G(B$0>03.#>.17-.&'>4C0203&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-66 YT:Z:DP jpayne@0: r530 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48314 42 76M = 48191 -199 CGTATTCAGTGTCTNTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATAC ,DG(<*6%B>*!2$E80$>2/'%.4+#6FB!&?((>+'2%G@0.B:+'&@<2'5E+GG#".$4HA@=8DCAA2/=9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G0C61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r530 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48191 42 77M = 48314 199 GAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTNAGGAAAGCGGANGTTGCG <1=0E'F$+,0%#C0GC7@G=&07!(2'..)E?7;2G8)B;4,G@B4,-17D#5B2:&:#AD5:05F##'2-1EB+% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58T11T6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r531 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28029 42 114M = 28227 281 ACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATA G&G.G););<>%F-.3!0BC$;49C+;?%;??@2G:>@H+0,&,/3,"'0#23-D;-33#>;728!8?),::*5D-08C'>681/1:,B6!3:=:8*;&-=F&1E!095-#(H@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r531 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28227 42 83M = 28029 -281 ATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCNGC -F@F?99%91(*>$=F/5'H!1,;BE9G2$=8;&(H*"*0?82/#"@0?*6%:!(:"'+1>4#HF+B%89D.@B!5G;$=8@$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r532 77 * 0 0 * * 0 0 GTTAATCTCAGTCCATGTCGGTGACAAATTAAGCGATGGTTT 36A4?07"-!18%>@)B0)&'%&,'&8':/;.*8.&".#)0E YT:Z:UP jpayne@0: r532 141 * 0 0 * * 0 0 ACAGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCNTCTAAGTAATGAGGTG E9!$0?:8#;,;)*0F;"/C#C9A/6;B%,G$>H:0:017;7>"(2( YT:Z:UP jpayne@0: r533 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47971 42 90M = 48159 254 TATTTAGTCTGTGACAGAGCCAANACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCANTGCCCTCGTAATT )*+'#&(+!#'$&#%$+%%"*(&&)('%%(!+'+*)#)*)*'*+&#+"#'(#"+%)#!!#)(+)+#%&"&+$''+$**)+")"+%##*($ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C52A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r533 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48159 42 66M = 47971 -254 GTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGA 9FA6>>(E#,@@030"@C-/#H4@GD4!<0D+;A,25&,G::@%B+*4/& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r534 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41681 42 62M = 41887 267 GCCNGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGT @E5-(0#;FF16FF".#3#'D##?/?CG%%E/9G52CB"4="*273D!G1..A5FA*B?8@"71H:(5F=!'<2$3FC=#02"6!:$GB"<6(F?GD6;>83947G'8B;*553-GC/=$E;.7*0@4*6!A=>0C?111.1=B.BC0(0%#:H:3:$>H5D6EHG:"/4:>03A?,28AF>C1A!E.?@. AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:22^CCTATC60T7T9G43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r535 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47376 40 97M = 47191 -282 TCAGNATAAAACAATTCAAAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGG %'*#)&)&#&'$!#%"%$*(+!+$(&('%&%'"($(!()&*&+$+(#)%'++#!"()+$!++*'$%!)*(')")!%(#"!')($+&)*'"($&+(%! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A13C77A0 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17516 42 166M1D37M6D92M = 17434 -384 CCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGNCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACNGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTAC &#$32>47,!F)76;@=.7>)F>84%3E>C!%0$69D67+GA#-?4/;*CE9&".=0"70+!0G>$##984G$40>669059#$F7*6-C13);95/39D8C7:H!*1%-=6"D&4#)"D>9;@E480F*!?G!H"237.,?6)'=$6&A)B,*/%99"$17!6B06-GC7%CA&*%>=<5;+"@E..>-&9@C38G6>H:BG+/1?AG>%#6C?,,A78.&/#847EH1(B"6?"4)"'%*0>"2E;)&BH#"$@8/-?6&2.>/6DG02$8D"<,1:"=0C2&C6<.E-530& AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:131G34^T37^ACCCGA6A85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r536 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17434 42 82M = 17516 384 NCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACCACGNCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGG &?F0&>')59A5.FB4BH&0G,(@4;B?4?E@"/*#=.-<@!?==G?%)?AC*-C#-0G>%+#7(;+E"E)<2H<+F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33369 42 82M = 33213 -238 CGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAA ;<;/@7<87E'$(&5FB#,24#"F1"8.703F".71&,"=:H<>A6$D1/"<4F!$(62A84#07:*%H?1<57*B2!,$5= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r538 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33732 24 47M = 33732 0 ATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGNGTTNNTNGTATCNGTA $"%$$&+$(')##"%)(!$+!)'#'"+*)+!'*(*('!)#"&(')#( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:30T3T0A1T1A0G2G3 YT:Z:UP jpayne@0: r538 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33732 0 * = 33732 0 AGTNCNNNNNNNNGCAGACCACCCNNNAATNCCTCNNAGCANGGNTCGCNNNN "!!!#"!$#!"!!!$"##"$#$"#!!#$$"#$"$"#$###"#$#"""$""!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r539 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8291 42 9M1I187M = 8171 -316 CCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGNGGCTGGGNAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGNGCGGATACGG 8/'6A8BG=?,,",#/0F?@D>.F%@&542&+6+E?2:6)5C74?149.,&;#.;"::B)*G6)$:5,'<.+'DG+1&+5;$2&=B'7,F#98(1G@<($%2/3<+,"A)A6A'&H(7(.2-=/8#8H3=9*E4)0$3B%G5-3!G/;'?'7$;E>";*F<;.14>:.:$72D>2DCCEGE+;D2?!G'?=GE+G/#C@C(+4--(DD&7+21-?+E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r540 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33686 42 50M = 33686 0 ATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGA ;>?">0+./E5.3CF@>B/+=CE:<*!686>&*A=94->9$!0%@; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YT:Z:UP jpayne@0: r540 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33686 0 * = 33686 0 NNCANGTNNTGCTNCNNNTTGNTNCNGGTACANNAGNGCTAANNNNTAAGCNNNAATNNNNTNCGNTANNACNNCACN !###!$$""""##!$#$!##""#!#$#!!"#"!"$!"##!!"##!!$$$$"#"#"#$"!!"$!#"!#$!#"#"!##$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r541 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45525 42 91M = 45700 261 CCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATNGTTATGACGTCATNGTAGGCGGAGAGCTA C0.;6G.,.80/(4F(?>4!48,,@B4GD.3<2D3@=6519"3&1G3-E&')-->E9(!E$GH#F7&(D-C+"C$GB,'8?95!$;!4BE4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G13T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r541 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45700 42 86M = 45525 -261 CTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCA 27FE$/*;211D$&/2CG+8?=&7H&:2(;$2(G26?;.$7*"3$H7(4H<(9/!F'883GA<)2B!%5G,G??H!8<"HEC,4E3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r542 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47753 42 72M = 47941 263 TCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTAC 95GB5)//14:+&.&:%E;=<29(B7E)+!A6":3&<9D%0%.<"3B@5G5)&72,+&%7<%#ED>?-=;/# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r542 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47941 42 75M = 47753 -263 CTGATCACCATAACTGCNAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGG D35*9635+*)@H=894.1BGB6*21+"9(;!1!CBB=A(C:*5/):"-!*94%971;5*%3.F(&>E7F'"G88 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r543 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40797 42 21M4D92M = 40949 212 TGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTNTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCC .#B#E";&6(57>3E.=114=*-%=:0A'&;=07G1E7(6+'EAE=%FH($%2?H5:%BF55:G;AE1"A9%0BH79&>$!8*5B'1(1),4)B8%>AG1.:&";%/%38F;, AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:21^CAGG44G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r543 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40949 42 60M = 40797 -212 CAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGA 99D4@?=&+9B3!%E7CC1!C$AG4<64,CF+4@"9">59%CG24F39GF(&#%(:78B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r544 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21788 42 145M = 21693 -240 GTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCG GF%*43=%13A1'6%6$H2!5*=+4<0!C-?:$32F!$51A4H-(D!<3<*H5G?H0#*%CAGE"@4?4,G.7."H9$(F6,-8::B,3.B#<=+G94F)<18F+?(G1D$',;1H?=H&0,!*G6CCDD+';9H%E5?<-,;-D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:145 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21693 42 87M = 21788 240 TATCCACAGTNAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCGTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCN &6"0G6C?A@:'##"FH.4A!&>5$>.88"C>17H<64';(9>)B.D'"BB5->68H3.E7,.14BB7..6)7C;12 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T26T48G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r545 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18355 42 76M = 18159 -272 CCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATG 7F:&%H07>F.4H*!39@@%>$@=)0</8<17F*G5<0;>10>?1C5D:%6+H07B&,/:9= AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G38A16C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r546 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34579 42 51M = 34766 257 GACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAA 7')0:6&#->*. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r547 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47070 42 118M = 46923 -265 TGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTCTGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATNGCT %*+*(*'!*%)+"(+)"*)*%"+&'")))%&)%""$%)+!%""'"'&%$"*#$($+%'*(%$"!(#+(&"&$#+(&$*&**#"')#)#$+((#"$##*'(*'#)!()+!&&%!+&''* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53A60T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r547 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46923 42 100M = 47070 265 AACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATNAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGATACGGA (+&&##()"!#%!!"(&"$#*+'!"&'(&'!)$#&&'$$$++)"#%++$+*&*&$!*)*'&#&*%('+!!+%&"+'!$$"&!+)$##*&$(""+&!*$#$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T63C5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r548 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13977 42 71M = 14138 259 CGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCA CC962E$"H5+'-'+C0@.9'8)!2,*.9 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0T0A68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r548 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14138 42 98M = 13977 -259 ACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCNGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCC )B=%)3C?1F994G1?:A,B>%1?7<6.1<89">00&'"E3HB+2D&F:EB75;6!E8"C#G6F$A4!C?B6,.;*G55!,;D,FB?D?085EEB"?* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C66 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r549 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26089 42 101M = 25923 -267 AATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTG >/$DB.D"6!A=,%=CHHH*,./C<*?4&CG3,AAB%8#"E=49=1@/B9C;H+>?'G6#H>4.#<(62H?':56*>6+H.#$HB>9E'9FHD**%&#-:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r549 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25923 42 78M = 26089 267 TAGTGAATTTATCATCGTCCNCTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGA '(*+)&+&)*%)'%)$+&(&%'#$%#!!%$(+"%#"!)$*""#((!#&'***%''%"!*'!#*%)%&+"#+'()&&$! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6557 42 81M = 6638 284 CATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGCTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCAC 11.!CBD-5$19;-:5G1C6-#5D%5#@(5D>A/)!-5(F-'*G?72!+#E08D+:96?3@A,&C572C=A=!68!B386# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T54 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6638 42 203M = 6557 -284 GGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATACCNAAGCCTACGCGCTGAANNCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTNCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAANACCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCAGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGG EG@1->#;;)@0.+->?%?-%!81-&B>->*0F9$C,)3D))*(G%=>&57;E+6%C.E592:G?F=/B@-69,!+!D.6(E2@?<:G'0&9'!5,%=1'F+>4;H9#A4E7)(7=A8)+07%8A@$'&H;$)%.E?+54=&:!)#B%B@G#.'56%72(,$8E+-<0<*>&>+;A85 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:47T1G16C0G27T36A0G23C28A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r551 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37944 42 51M = 37734 -261 TTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCNTGCNTGTTGACTA ''24'G<72&%43A%;H&*@+8!2G'E+/C>)D6A$))#$$:2.)B1C0%3%:$!+/.""A?4C!/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48G12C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27594 42 233M = 27827 297 ACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGNATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTNATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAAT .CF3!<2:'(2!&,(%-/17=$!)21#?'>7(?5G9>'GH8EC"!*%;>+5!;*(*&6"@373$CA&*@H9-A75$3-AH2BD)=.EB7@2+>.;"8A#!!!E7+%=(,+6$&E8;&'-D31D8/3398&AC,+D;?6;(.*B9+(:!#=E(82%BA5,;&C)A0.<.1:?")%*G> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36C37T121A36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r553 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20217 42 94M = 20367 258 GCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTNCGGCGAAANCGTCAGAAACGATTGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGT 5+D:&&H217*-67$8-";D'<;*,5"$1-47H#)(5;@C$);<-;H+D$/"$6F;2E1C"40!8)>3*$;48.13<=>"A1)H#4>5>CG(G, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39G8A12A32 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r553 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20367 42 108M = 20217 -258 GTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCNGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCACGNCGNCAANN (%(!"#))!+"#*#+$'()%)"!%$#%(#)"%)++!'!!%(%)*$&&&"**$"*"$+'!&'$!%!*#*'!*&"'(+!!!!%&)*'%(&""+&('+'("(#$&*('(!! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:71G25G1G2G3A0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17712 42 8M6D240M = 17660 -306 CGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCA 6&F8*C@((8HGD%H2GH;*B2(.=2=3*$@@9./>G"9,;6*.84"15?3)$=C4%=-=*G.97**-?@=,HC&%D,!3"-DG%D'6-<<%<&'BE:+<*<)?G7'BB1;<"?5!70>!+D$HG>6FF5C0AC<':#0/9:4?2(B(@-:4+;&9(/?96(,6%4+82>@H@!!&-%#0C?:-,6$8D*;1+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:22^T29 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29086 42 80M = 29241 229 TCTCCGCAATTACTCACAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTAC ;=9CFA6"A"41A>-<(95"05A*8,";;)92/=-E/"G-G/5%#>B51-,>#G@C3:$90+GA2'85H&%E@$+AD5*C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A1G64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29241 42 74M = 29086 -229 GTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCG D4@$;*1(#329F4G*'2F*/8!-C(,F11=!>$0,#G@B#-8D9#,8(!6*%0DD2D4@D=<4EC'"&+<)E. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r556 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17520 42 48M = 17371 -197 GACGTCGGAAACAACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTA 93*9)@69C.>3@7C1-5E=0-64CA+%C9,G5,?7@#(;-0G9F:"H%4.&,:2G+5=H%4$B$$?D/%;8?*HD<#))$94@=+H53.-%@06G4?,)!!74%E-D3)2G/-9<.)=*-1A#9F8H:.!005B;C4@"'2!/DA/G;C=>'@H%)!7%7?4<%"!#64A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:154 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r558 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5402 42 151M = 5248 -305 GACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAACACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGACTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCG )+<<"*#<*C=131>;>+H+.8:EH2#=8'2H8**7.#=0&G(D)-";9=FD<2#4,*>?GH5317ADD+A;3)/<-#A>$26CG5$C>'6B+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:80G6A26T8G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r559 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8743 42 57M = 8379 -421 CGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGANTGGAGNC !+%#((%*()%$*#)(!%$*#$!(#$*!"%&)#+!'")%)#)!*+)(#"('%'*)'( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48G0A5T1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r559 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8379 42 364M = 8743 421 GTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCNTTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAANATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGNCNTACTGGANGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCNGGCAGGCGGAGCTGCATAT 1GH5=C55E6?*42(:5DC)92H+H2&*;G$-1A'==0)34@'HF7=HA!&&,F*:.'D.2*$9D@(#(G9=8"E3))C2/2$!(!:?#7<:E15&=-<&"D60F?=*=4?.1-BD?&C.B4G.@CD?:H-:<0>+4!H+">F((<+C3G36@,.,5H4.C?>8.4-'!F>5/'7338"<2,GB;12+.#%A#.?<3*?FCD+),5+CE*?!C>'0A-D!:(:&5+>>==H9.(85&-:$8*0'026A=A.<.H(#:>1(4*1-%$)',#?A!A2 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:23T58 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r560 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32145 42 489M = 32063 -571 CGGCAATTAGTCGTCATTCCATGTTTTATCCAGGGNGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGNAGTATTTTCGANANTGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACTGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTCCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGNCATTCATCCATCCATTCCGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTATGCTTATCAGGNAAGGCGTAAATTNATNNNTT *&)()+(%'#*($++*%#)"+%'"*#%"'!&"($&%&&'%))$""%+#(*%('&%&*""+"(+#(%(+$%"+'+&'"()'#&&%'+(!%%)+"+'%*&!")$+#&%!!+(+"&#%'"'"'%(#""!$+($&#)&)"($"'&('$'#%%#&+#&(!+)+%%*&%((#+%*(*%!)"&&)*!(!$*"%$%)$#!)#'*)$+!)""""%+%&"#$&)&'#!+*'++%+$''#%*()$&))"%%%"*#*)++$&+&"%($*)"")#'($)$#&*)"'(+%')))*&"&**!#**)"%(*)&&'*%#+)%*&#*#"'+'!#+(*%)''%!*$!*#&!%#+$'&!###)))&)$""%&%(")&"##&(+*'++#)*+*%(*!&$#)*&*!('(#+'+)*&'#$&!&($("&%##"&'&)#&("#*!"*(!)')*)#'&!%&&(*++'#*#"$%"#+$!'#(++'$$*)!()($#!&&$+%*##(%!+!%*)!$'* AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:7A9C17C83C11C1A51G72G29G17G149C11A12T0C1T0T0C0G1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r561 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9429 42 72M = 9672 315 ACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCANCACCTTGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACC E&>;@0H!-+(0,&D&G6C%F&D8:%A.&&B?',,:9$;=#19D?#(;B,@$(63EE%-%;-/++0EC5"F= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G5C31 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r561 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9672 42 72M = 9429 -315 GAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCTGAGAGTCAGCGATGTTCCTGANNACCGANCNAGTTGNNCNTAAC )#"#!$*++'%)+%!'(%()(+!!+*+#+)##"&!#!$'""%!!'((#'+$'%%!(!"$)*('#)#*&))%# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:27G21A0A5A0T0C1T3A0A1A4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r562 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32421 42 72M = 32308 -185 TGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCG (%=G#;6#+0B2:##73:$;@A563H/4.2A61):*5'%8DE@8-"'6F"<=-F/E1#;/<+)FHB-;4E7- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r562 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32308 42 66M = 32421 185 CNANNAANTCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGA "#)"%))!$+#+"%&'+('('&"'!*!*'"&"#%(&%#!$$%&#))%#$"'!)*#!'++$*%")+% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C1G0C2A58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r563 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3824 42 145M = 3969 210 TACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTAAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGC 05*9'"=B.!';BBG0#2->,5*4BG349&?34'7E%D40!,<9C-G!&G!71E&A'$AB"6-D)+> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G116 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r563 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3969 42 65M = 3824 -210 CCAGATGNGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGC 68--$5.9#-7$:=5%/C!&39:&H%)!)3?/#D+;@H'65'H%,49=>4H$(>>-/H;:1;;&B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r564 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33560 42 64M = 33406 -218 ATCTGAATCNAATATTCCTGATGTATCGATAGCGNTNATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATT !"'+#'$&**)##%"($('*()''&!(''"$+'"*$'&(')*$'&")$"%+)%*%$($++*+&% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9A21T2G1A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r564 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33406 42 78M = 33560 218 CAAGTANAGATTCGGAAGGGCAGCNAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCNTATTTATAC )56"C+01<--,;<2%.85HC4B.8?-.$E%;?!C2+$"3?#4.1;%EF-65A54E$0H>E#F%B5'GHBBG$":EB, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A17C43T9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r565 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8103 42 66M = 8169 248 CAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCC /!=#'@47+.3:D.BD:5:<330:-(71#:6HA864$.5--#G:*CC5C;F3EA>(%1F$D;B0E# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r565 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8169 42 131M1I51M = 8103 -248 ACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTAT *"#.65/C+C7#05;E&4")-HA7BC#=<2H((E,A$6C-/&7/#4572(+(46%.7B!/D/$A+"AC:/'3%+HEA*15#D.-=5&&<-2?6GG?C!E.4E-9*)6.D$87>%+>'?,,+2F%%3691-G<8GD&@)H/'4@4B73/2'9>#7-51:!*<5-"&(5G;D3B'1%< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:182 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r566 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21588 42 96M = 21816 313 TGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTA +##++*+)%%"+)+%+#)%)#)&'#*!$#))"($!'#&'%+'*#$+&#%%+&&"'")'$#"&)&%&)#&(&$"()*(%"*%##+$&#+*)*'&++) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r566 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21816 42 85M = 21588 -313 TTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCAC @,H1=F+,,D:.'>.1;):'):5985.;)5:(E=D@D'BH$/F"<,6"($):4A33!>1'$!($-.,3A4$A*27A8!)A?&C+F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r567 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28009 42 232M = 27766 -475 CGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTNATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGANATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATC -D"'E:H:+"A18!<#"%=,D6,;*9".)?2+03.8%)E@E7B!1.A#)!<25,@):(>0C,-4@H<@A:-8'9*#A&*@-GD"D.$$3B6);(#:'1<2)!B-8H4=;:022DG'(@1A>"8-#&'3;>H;!$8$314H'..";6@7$GA2*;0DG AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109C73C48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r567 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27766 42 243M = 28009 475 TCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTCTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCNGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGNCAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTG H;H15-<*H"?!$'7'0-+FF5(!@$;@AD66D4'8?17;(E2>,$2G2#$>*C-G8*)0@C=&A4%B$,@F!+*F#);'$1E8AG3B'.2*1@?$;8F6H.+?4F,>G)=7(;66><*<"<8C.39'13%.:@$/+3%C%@B4FH.#C1-;()C6(9/%0!"@C.F(E8'))=')A'8-#H3(E&42E+8CAE0E>%H(@<3A2#BF.1*7=1<2,C:C(0*89'B8$=+*1;1,/D'C49!"C0;?1'&7+<2F-+;98:$F:13B>-%.%0'%+!%$.A56=/G) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37A3T8C11A45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r568 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34942 42 80M = 34775 -247 TATTATTCCCTNTTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGG 9<8>-6;G;>60!G+GG9-:F/%G+)"4?%!C&'1=@'0$*3EFH<"6&EH;/3D(""='.F3)4(39+#(3-*4%'A8H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A68 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r569 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19626 42 159M = 19785 250 GGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAATAGGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAA 8/4):B"/.>"*%>?%603).6E?!2*=%00%81?*"A,0?8+-?:9-%$G#$##D#5&%3@$'8+*A7C10"+H%!#'77#.D:!,A"(-&#A=*:,:,%5.<#=./,F@#:>$)53;(H-%$>74"-CD95!!7..H!'7";+$*+6C) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:131C1C25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r569 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19785 42 91M = 19626 -250 GCCGNGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGNTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCA 9G?-B;A5;BF+:EB%D8.%7B?*&*F**4%">EFB/$7$3FD7">D?:+G09G:3?<@9'G0%-=A+C@&=&-%E8'?8<=B'+>9=GD: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G57T28 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r570 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42475 42 222M = 42346 -351 GGGAANGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGNAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTNATTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAA '("#"(!)+#&#*"*"$+*(&'%&&'%'&)'#%$%"#(%$&%'!()$#!+(%*"#+(''&$**%$&)"*++%(&&%#)(&)%"))#"&()!*"#)'#!#%'$(*)"("*)'"*&##%(+$!#'*(&(%(*&(*(&%*)##$'(!$)('!"'&$''(!*$*+&)(+)(!"))(!%")+(&"++%*#"%!$)&&)"+$(!('%%!*++"#()'&*(&&)$!++% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5T87A97T1C28 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r570 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42346 42 129M = 42475 351 GCATGTGCTGGAAGNTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGNTGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTANAAACGATGAATGCC %';HG6E20-@$5-'.C3?,*>H6E1>&6C!C$#F7/(*AB*C4CD4>)F3:.)!H2(F<(!97,-C--3.%%$/+;*45;0*7B$.D<(@:@6A>D'3A0)+B3GE!,@6A.0! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T31A46A20A14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 267 42 180M = 218 -229 GAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGNTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAAA ):%>+((E'C:HCFD59"&!;H!>:9A-$$D$265*(!#>#<-E./3-5:!B0%'4%+&B6><=,3B&>>A$G23@D(#.0>B#!%8E:8$AH;.*/)0!2;$&!3ED1C#/,0/98-:3;*74E"<%F2A+%*%;B2AG,2H)/%G%0>4;'.#5?D=H;:$-%@H),7;GH/H$DDA! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:119G16G42C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 218 42 49M = 267 229 GACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGG 7H8--5002:H*$03&/#$=D;+)/"'<)'B+8B%-(8.21E6::0#D! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r572 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9414 42 41M = 9189 -266 GATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTNAA &"!*#$!*++("(&&'%)#"%)"!(*)#&'%)"*)+'#%(# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G1C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r572 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9189 42 61M = 9414 266 GATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATCCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGT '8CC1!321(E76G(7"'.6>D%),0F$#9#'<$<)0H/#*'15()==*,00C+1.D-F:1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8522 42 47M = 8597 141 GCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACT )5&&'9>97$4#:+((+$3*>%:#2+/,,9.B.@3E>600<&B4H2$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8597 42 66M = 8522 -141 AAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTNTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCG G?+7H)H(963)CFD&F%24$!,+38D;:,2713F7DA3(H$&E$+<(4;3% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r574 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18987 42 417M = 19404 463 TTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAANGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGAGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGNACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATNACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACANTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAANCACNCCCGGGT -H=B:-E;6H-&4-+;9#.G=C'8.'<)0;9"@B1&#+-)C;?F&>F+,*/2,!"1-451B%$$@E>*>'6+,(@EG+7=%96")F8H)0'$@.$(FH;20H)7-'7"7B.@;;+!057F:@H"7-%2(0>FDDD4:"0'/>,4%94?*%?H>;G!#D03/C;H-&C"?%(,FC")9995!9H>&A2G(=@?G:7DCF)72;A16>G+/&'<<5(H/5C4=B%A,C-.?6+=.?(03+FE2+C-?@6=43D'+04G$*)4)+.F7)8$E*-EE&+%7:?EG"4CF+(%5$F:HCG'&*88,H3.<8)A42*@4*E=8A"*$EF:"3E>G59?%,+C$F?%H/<5E? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:50G96G31G61G121G41T3T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r574 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19404 42 46M = 18987 -463 ATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCA H5(.00BB-&&A53B>'82$B4?9;0"A*(G141'>0'#.C""*E4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r575 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17043 42 172M = 16953 -262 GCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTNAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTG 7"@)B8(D6387A##,6C*'""9,%H>4@"@",HB(*;!.<4G,+'&G$>!<*A:1./2!GB7H1$98#,*:2C:!7$<7(B/.!5('B>59 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:144G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r575 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16953 42 73M = 17043 262 TGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTC =.@<%>379!$,6>@G=;<3?A?%+D9*#A#:89,98B,8F$5AF!!##E.$H.5DB0F+1!CB>G!&B9%(*0$,!";6)2/A-B&))$3C$,3B!CB9(@1"9=F2A>G-!CA'.FB-9/@167#2?33;2!6(@%&'$"FB=#,:2(1E)%.2$?8@#17/0>-/'6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132T58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r576 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19906 42 71M = 19715 -262 TGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTNAACTGATG 77AC54(*$)<17/A.:49;!*+3D1C08#GG1'*0)@5G8)A5-HE+(:?2D4.#*:16,(:5&'BBE+.#26+4-D(>F@?(.%$@4*?$H38.?2G*&()5)58+<:!1$G2?@F2>$>*%87)';$>/-4"A?G&D5/82&:B7>9(FG%=8@2F7C@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50G5G67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r577 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 139 42 158M = 347 332 GCTTTTTTGCCTCTGTCGTNTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTNNAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGTCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGG +)%+!$&*%(!*#"%'&#$+)!+)'+**#$'+!"&%&+#)')$+#!+$'*(*)%%+"")'!'$#"*'!'(%!#"+#$*'''!+"%$$**'*($&!'$'"*%!%"+!+$*)&"+#!$$)"$'+%%)&!*#!&**!#%"$!&(#+%&#'**)#(#)!""( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7G11T22G0G73G40 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r578 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6483 42 114M = 6626 280 NNTGNCCAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTACGGGCNAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATG !!*%!*"+&*%"!#%'+($"""$#!#!)"*#"(!!&&'*$+#+!&)($&#&$%")""$(('!**&$'&#+$*$'*#&$)+&!!*+#'#')'$)$")#'%##*(+!!*"%(!()% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C0G2A1G54A4A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r578 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6626 42 137M = 6483 -280 GTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTT @(?66>3<1!*5B$:)C;-,03GE?--7G!67"#"#=,8#8!33G(HCH=(*,'6E$@4=(05-<''=1G.=/)-E4:FB%F,H4D*.49BG-1G<.6H#F>%G;':06=?F3<=%*88+G'+9FD%,..*7,F5C) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r579 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1723 42 79M = 1556 -246 AGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAATGGGGACACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGAC 9+,)DC)'!G)9+6B<$D%-5D97;D50.E,4=-2G2>*"49+%"CB9:"4#")?B:1G=F)-6>D+.?C++,A(5=@A>7&23"E-$D3>A=38-&#>/B+4'*)/B#,A):@F%0GH8<4#8.+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39396 42 53M = 39156 -293 CATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACG 16;-.5%7B#%E=F4'=-"!/4!H%AA6<-1$=(2HGD#4%*9(60G8:C%&0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r580 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:106T26T30T12G47T110A89G83T7C121C81A112 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r583 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12917 42 100M = 12739 -278 CAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCG <02/4,B'$339#C)34!:H7E-*%1$.?1?8=-GFG&=1E0()7B*F'@H?84;%.$5%9)/C".()86+F=7:8B@'"30.D8<:,),$G!=!6/19* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T57 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r583 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12739 42 70M = 12917 278 TTGCAANCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGCCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCNTGGTGAGTT 20!'C2>&.@+*,B8%E5+5#FA>.!0*56$319-&9'#B<,*%+!1(*3*"'66)1=4(H9G/(B60>) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6C23G25C3G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5468 42 64M = 5588 265 ACCGCAGCGGTNGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCATG ;E,)-B+?"9(0<23C2;2/".,3E/EHF2)9261#=5*'B)E=C9DA.,+0!!>!@&/7=EHB AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11T2G33T13C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r584 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5588 42 145M = 5468 -265 GCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTNGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAG 1+72??1,7+H?B994-6+0$5-H>&H,$'/B/E883H03!%6)'%#:B1972403@=;*-+D/F*):43'E2D(0(:C>:#?8"54?#5%5=4-#,363 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G85 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r585 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13133 42 107M = 13296 236 TTAGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGNTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGANTGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGAC !*#2)#>-*',G%>13?'=--<"F%7,<34F$99'(@-#"/,C:HD,-6)#(,2F5#E9+"'<1;*!1H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A1G35C40A27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r585 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13296 42 73M = 13133 -236 GGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAATATGGTC 9::4:;7A/'3F8-*%#13&!A%/'&%C37D>.("5.+75>9&'@)?,C+6C%(6A:/)%=?C?E,7CCEA5; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7849 42 155M = 8004 481 ACTGTGACCATCGGTGAGGAAAATTNCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCC ()%"+"++*"#*%"+((&''#'$'()!"$)"%#%(+*')(%$""')"(*%%)'*#)&($#&*(%!!#'")'"$)*!++"#+$*"%+))++#*!)&)&+!+*)%)+&+(+&!+")'&$*+")!"$*&)*&%+(#+&$+(#()(%&$#%%('*%+!# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G0C21T22G106 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r586 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8004 42 296M1I30M = 7849 -481 GTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCNAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGNCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGNAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTNGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCG 6+GG(@27#',&21+29.@>A!#>-=%087*?!E-;&257.E)=B8D,=,F+0<);02?1)9C;7G.19;36F<&;<(EG=G)>A1CB)C9!=:8&5A=/,:)42;!F-D.G5&?A&8#D#:<2GB'*(A?%!*.?3&0>A( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:24A127G77T66G28 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45363 42 150M = 45290 -223 GACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAANAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCA )7@1)B2DG0/%640:,8:>"3A0"!A7%6>B;79>*C><1E89+=EH!+.))F3$9.2/FC31+<::(B4)/?;3:(H666!;':,38G9E@;>-6-%%F<(-=5'5#D1"9.H6)#;:G"2%F*F#;"G:!CG+$"D!5F.%#!%H8E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:115A34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45290 42 73M = 45363 223 ANATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCNATTATCGCCTGGTGCATTCGT )!";;')$&#$8.B*DA*A=%E1)65FH&B75@68G(4.$H.3F49"44/GG#&B<,.3C-<>':A8#7<=#: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T49C13T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r588 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7067 42 62M = 7158 249 CGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACC 0)%8>8C:)3C1.A5=8=H()8(.'D);B80$0A6;G!%# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r588 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7158 42 158M = 7067 -249 TAATCATGGCCCTTCGGGGCAATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTNAACCGTGATGTCAGTCTGACGGGGACGNAAGAAGAACNGGCGCGCCGTGTGGCAGAGCTNAAA */&#?=!46E"HG3"519#8C31+G!5@1%E6G1;"+2858FB0$+3.,+3:$(;9"F>5G9D=D@$'#-+5D&;%0*1B<%>8'4A1D9B"21&ABG<)G+ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20C73G14C12A9T5T15G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35094 42 52M = 35247 257 GCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGT F'B;<8A5*4AH8B!A,B?<+7#(/554*?&7H4:8)"8;!6!$-86(E'0/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r589 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35247 42 104M = 35094 -257 GAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTT 6;84?;86=3-4/'8.1AB/B7!?>'9@$$+D?D#4#@H*?2;3H/F<,"D<7<)<,-&)>>53&$'&:D?5=05H$3$)"<0+.)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r590 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32665 42 57M = 32722 544 ATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGA 0;D1H("$'5C5<%69A6+6$F#0+;-G20,>;BF88,%?3"/3&2B#5/78"@"B( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r590 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32722 42 487M = 32665 -544 AGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCNACCATGTACCGGATGTGTTCTNCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTNNATGNAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCNGATTAGGAAAACAGGAAAGGGCGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGAT &,'?D%$$$(2<#C5.4:BD&#B!(-4$6.(,$A,%$'B)"/>.:!&GC&(C'E4F<*(9,:5:-,7H*B-@/FF/00>"&+?5:*&0DEDG+;$+,H"4:>23C81553,./H%BF:G>,+C-*9.?-BB!,G<&(D$;5,2H-)*@>5%@E5G:#47+%%:7?6&=(#%F>4=9B)-@9)1;+?$>D=22!-@C9<-$2A"((C),<)G':<-=!C.,0C-*0$4;69,&85@=B!*.0$)A=-!0&>!-*(6//#=CF;!7-*7=5+A&</9./;GA?88G21>>3939:!!<,7#?7**3-4(C)31=<5H!1(4C5EA8E-58)F/16-7'C($=2'@A;(*#'1A00-*D=A:1%#)*?$'*$(!1.%6.=:;##4H? AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:139A21G116C93G0A3T63T21G23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r591 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1811 42 85M = 1980 272 GAAAATTGGCGAACGTTCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTAC 1HC?A.19?1AB"=D-(%BC#@:(8F7!C8A20$D)70?6H%/84&>7?7)H@HF-?>%3@-9=B'=793C$.&:8$H002HB&$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C68 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r591 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1980 42 103M = 1811 -272 GACCGGCTCATTATTATGGGCCGCCACGACGNTGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGT :E'B.=?-*DB(#7)6*5=/%,/B9@HGA*G74)4A8AA"FC"8+F*A4C@"8<;!<9)/5;?1FE)$H11:04,5@A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A0G22A71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r592 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1389 42 42M = 1163 -268 GCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGC !;+7B6>!4-.6+@AG*HG5>B'C/3?(.5F:"1/#448-@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r592 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1163 42 74M = 1389 268 TAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGCGGATGTGGCGG <6*E%<,6(7'(BB8B(7B%,A5=C;!&9*>1?'@')/G1CA=2/F9)*&7A)+"':HH+9-5#*"!1'.6:-/-!EH(E"'>('EA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35C11G23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r593 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18643 42 85M = 18485 -243 ACTCTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACG 4(C,<@A$312&'G16!B;B-8C-?!37&)?3G5+@)3/)+0>HC,.#.A'1B7:6$5?B'=(>&!0C5#DH"2-'1.,228;F> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G81 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r594 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29547 42 170M = 29407 -310 CATCTANATAAACACCTTCGNGATNTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATNTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTGAGANTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTNCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATNAGCAATGTTTATGTAAT /C>-$,&:G"4GG7E<#E;GC7:E22/C**H$D?0;1")&/,@?:G.@$=63@-9(;(*2/5!!=#)?E=>?",<#.67&0H$?A"5E&01'$<"D(7-8*,.G',*819&/F6.'5<;CGE>8>5&?C!.G'*>H&AAB/;@+",)@-)0:/@+842!"5136,C:+%( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:6C13T3G25C33C3C33G29C16A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r594 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29407 42 140M = 29547 310 AGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTT FGC0C8H-F$HC-2H048!6(!3@8C7=)G10A45$5H&7E&DA<@,.";>81%-0'=#9:H21:4/#D!&%:+%@%A.!!&36&2@#G*"9.C$E1*6+(H%2,-23<$F1@H!((6@4#E791=/>9B,??4A1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:140 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r595 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36484 42 64M = 36579 174 GTGACGGGTTNAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAAT G"@59&=?A1+-=@HC+8.6"?D5.>#76D(E&#>=;7;H$?$E9B?G3/BG%10+1*>< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r595 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36579 42 79M = 36484 -174 TNAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCNTTGTTCGGC 7"- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C67G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r596 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28671 42 130M = 28503 -298 TCNCTGTTGATTCTNGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTNGCCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTNCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGN $$'%+&")"$)((!$%)+*(&!+"#*&&##%*%$#(!&'&$!$'#'+#)%&+')')"#!+#'"*%'&*#%##&#"#'+&+!''#&(('&$&(+)*&$#(("#&)+$%$)('#!"%+'(&+)+))*+(**! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2A11C43T1G37G30T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r596 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28503 42 168M = 28671 298 ANTGCGNNAANTNCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGGGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCCTGAATGTAACGNAACGGAATTA #$*((%"!$'#("%+('%$*%+%!*%'"%'$&&+$)'(&!##$+""*""+(%)##(!%'"*(&($(%&#)*"(+!!&#!))*#%$'#+(")!#'*)!&'!"&('!+%(%++&'!'%%(#'#&+"#&*'+(%!$+#(&*)(*$#+*!#!*!*!+(%#'"""*(#!(&"! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T3C0G0C2T1T25A106A11T10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r597 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15756 42 131M = 15661 -226 CGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACATTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTAAAAGG 7F'F)(14!-55483!*,5A'$-A">=8?9.HE,:&::":7<8;;&CC6:D",$;D!F=G'2500.,(B7'B&E*#GA'A%> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:93C31C5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r597 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15661 42 95M = 15756 226 ATGGACACTGAGGGGAATACCAACATANCCGGTGTCANGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCNGCCGGAGGNATTTGAATCCTC (<1(&):(?(/$&D353.>FA,?ED#3:&9,17CH%3=:&;/"$)+7*)"@?3';-FD:#;9>4;-HC&G;4?CG/F17.H;;0G(0)?@)5C9' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C26T9C35C8G12 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r598 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25488 42 185M = 25673 409 TGGTTTCNTAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTT C92;<.6'/26(.8A:D:>827A$!F;:/')6*86D#%<-H$(@$@H3#0*?2':4A)4F+(%4+."6H1G'// AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A177 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r598 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25673 42 224M = 25488 -409 GGAACCTCTTGCAGTACNACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGTCATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCTGAGCTCATTCGAAGCAGATA 6A36@=)E%&-.*%&3(8,#9,7B=?0,0(.G11/C;'H(+)/C6H-' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T141A43A20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r599 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 557 42 98M = 655 296 GGNGAANNTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGNAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATAT (((**)#'+$)*#)*&+&&%+$)()+('$%#+*%$$'#%)"%)'#"!'!#'$*"!&(''+$)#+#+++('**%&"!*%+)$)+'!"+"*&&#*!&$#+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T3A0T49G40 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r599 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 655 42 166M2I32M = 557 -296 CATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCTGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGACGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACTAGG $!"!'*'(#+$!%!*("(!($("!')#%"&'!*!#+*"'(%('"''&((*'!"')'*!($&+"+'')")'#*#+$*+)$*#"(#)'"#+%$&+!%*"(+)!%$"(#*'*"'$#)*#%##+")&'!$#*$!)&"#+'"#&(+*+*&%%#$(&+&%*#$&#(%*+'+%*')+&)&""'!!'$!"#"*+#$*$*)"++!"!"& AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:98G30C25G38C3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r600 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18146 42 67M = 18302 269 GCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGC 3*2H)('.:BH&H8=,(E"F7+33-)EA6<&7'G2.1C61>!G4@+;C2+GG3B:GHH)F<+854() AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r600 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18302 42 113M = 18146 -269 TGACGGCCCCCACCATTACCAGCGNCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCC >3@9E@+"0./H)+:."D)%D=$H!359.5(F/C)6HA(F/"G$A#FGB@<&$B71-9<50/A+@2"G2A?%/++3-C/94%=3%H?H6%2-<$'32=6'DEA*;B<$0+G"= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43905 42 42M = 44154 313 CTAAATTTAATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGNCTCAC ;F(,4&E(21F=&&D-@/6):7HF1>DHG.1C&B3C.G@#11D.EC4!"96@?!D)<6CA&3,4,'!-D8($+69F5DF&=H)$@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r602 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11008 42 133M = 11141 265 CCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTANGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGC -6DE5CBF&<,H2H.4EG$*7>)$-#/%0$B89#!%*-&"<)=90++/&"<1DEE$@=0;C1=G=*?#5280+FHA-6$7A>"':/&2(4)>.+=F4;=<-47'6?$C)G;148<$E7."947H420=*@/*7A&:H$%<,=A=?,$('B%/>'6%9H#2D.>C2,%$0FB3$"H87,2E$.?#+$"9#C+9/;3=1<=/-A@'%E>7A,-<2(0,++540)FH?# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:27G33G3A21G43A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r603 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44458 42 58M = 44600 265 CCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATGTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCAT =ABG)>A,!A"A66+FB*.067;!5,=:&6D'>6E+7!<&9&DG-7@=:A15:3"=E- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r603 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44600 42 123M = 44458 -265 TTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGNAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAA '@;B:4;628FC6'2,.B)=2#&5-?#<)EE>006<'80'7;3B"+)-C@'$0D8$F%!!%1%;7E7$*H2?$!:-1G'+=G3E;FG5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r604 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17667 40 15M1D37M6D114M = 17495 -345 GCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGNAAAAGCAGATTGCGGATCTCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTNATCTTGGTACGGCGCTGTACNGGATAGCCGCCAGTATCAATA F8/D%=)C4%9@7,=:/-$=;9>6;%H2=)9B47.E"2D5C==*H3:G$06H0/@,,;2223C$!,9-$4"A)!-5!6<@%$.4EG8D10@?+>E+$7&/>0=B)/;9.@,F:*A#+;#,%%,<59'%:&1&)6E?,#*DD"(3AD77FEE.?)FA%(&+1FA+-03 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r605 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12476 42 107M = 12230 -353 GGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCNGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCNTCA /A?:A!#+=7&FC<>"0/@E2((935-"(5;*4:(),(6E.#:99AF#*6(HFB*&6%B.E-H0=*":B(6)'/G<)9)0"F(E-;6B2;F4!6@>=<8A&)9H4%-$/-C005)-!>2.&5+@#A33#(DCF1)4%?F?=A>2;E1:&.+*;8@/85B7CD.?,A424?&:E>)3)EE9->C9!H.-D39#HBHE1!///A-"==@?/? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A49G8C75T107 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r606 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31547 42 77M = 31624 327 CTGTNCTGCACCTNGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACTACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGA >&A%"@4H0#,;4D#G2=G)5'#;$A@"#8/3$1($+E*7HH5FE<9BA18*)!>&#.(@$"76!CGH4.22H+-4H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A8G32C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r606 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31624 42 250M = 31547 -327 GGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACANCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATG &98B,*%3/9023-@(,A"<*/1;D()1(?/6"?::<%*A@?G7&G'C<@0C9C8G#.1(B?>CFH?=(A&(2)4C!-.G0*?:3<:1!3)?&4F#:G#*,#<3'EF&2A0<>E"H'152!1"(*BGH)DB%,'@;C"2-!+=93$<,$=9)1*&+2<6/!'.'?DB"5%G<3"@HA9@$>?:!A/A%G8FFA0-0*@G1/2.(=!3@=9+"%%)8-$< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:202C47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r607 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10329 42 99M = 10235 -193 ATCCGCTAGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGNGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGCGCTNGCCGGTGGTNTCC 9332G37.)@?A99#64211D'."'/E8!?">:=*53?)@F(>+6"!/A%5*??BC&7@C-/1F<%%:*&7!F<6/-:*"A><)H(184&&+8,B/%"+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7G23C49G3T5A3G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r607 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10235 42 83M = 10329 193 NGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGA "C7B>/A&?,!6F)'66%<.B2..110,942"H/11$$HG32(86++! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A82 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r608 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18840 42 168M = 19025 241 GTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTGTGGTGATTAAGAAACGGGCGCTGGGCATGAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTG C2++82:<6,?H$:GC!$1?H!A!20<@B2E@.7,?A!+D(1C,C!10+>G$E8,8G4G(*+3+@%#2DB<$(&1)C'22*03E0'94773'#/5=#>#)5(007 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22A15A12C116 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r608 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19025 42 56M = 18840 -241 GCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGGACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACC '2;4E(2/8DA*')?3H)'C!:/;8?6=6D&!)13*46,*&61C)+@(!185E?>: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T32 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r609 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32815 42 132M = 32705 -242 TTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCANTGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAGCATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGACTTTTTGCTGCCCC */2H&F.,A=D>DF3-E+,-BD7+0*1E=9+3G6H(65'<8G11C$=,@!8'D(BD/-H:'),=A5GG404$><$)%:!'7CG1A;?8BD231',*H3/:B165A@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38A50A28T9G3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r609 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32705 42 89M = 32815 242 TANATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTCNCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTN '&&+*"$$!*))$#!)#""#!#%+*%%*!!")#'(&$)&)+%$#%'*"*(+$*))!+"('##)#('!*%&!(*!&()(#$!')++&)*( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A29T0C54T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r610 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16364 42 109M = 16473 234 NGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCCGATGTGGATAAATGGGCGCTGNATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCAGCGCAT !+($+"**&(*'%&$(*$%%&++(#(*)($+)&"!*$#))&&+&#*%(&)+'*)"%('+)'")+"+!+')'&*&'""%+*%%(%'$%"*'!)!(#!"!!%'!%%%&#!# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T21G21T57C6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16473 42 125M = 16364 -234 CACNTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGACGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTNCGTNCAGGACCGACCGT H%=;%G2#72&<;BA8<9"?B59<2?6H&@8#%=<&DBC%8H"C+?6<#'-AA?*7G9-9//G0'B.7/%B4!B6(<@.8."1CD(0'C0#=="/@'-:5C+$"64:6EB$7&FC-64=E/8BC? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C75C27T3G13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45839 42 45M2I50M = 45964 255 CNATCGACCGTTGCANCAATATCTGGGNTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAA *0*#5%3#8<0%;;H#;:$/>"C=%B76"2*,A8F%;5%"%' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34G41T50A0G1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r612 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34003 42 55M = 33781 -277 ACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACCGNGCNANGTTTATNAT !*#$'(*$+&()((*+%'"'**(%+*%#)!$&$#(+"$%(!"&!%))**%*"!"' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:38A1T2A0G0T6T0C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r612 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33781 42 65M = 34003 277 NACAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATT #*#'+&#+%$'%+&&+''!%'#)$)(+&&*")('"()(!)+#*!$$(#(%#'%%()+($%!"(&& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C1G62 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r613 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13308 42 175M = 13156 -327 CCTTTCTGTNGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGACATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCG **()!+!*+##$(%)*(+!$!(&"(&'+%'+%%++!#+&+%"%"+&*($$$$)"*+")(!*+)&($*#%*"")++)$('##')'"#"$#"""!+*$(%"!!#"')"'$"!(!##'*'&&*"'+))"+)!'!')&"+("!!(&'*(("#+%#$)#$&)%)))*+!+"$""*$)($+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G119T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r613 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13156 42 152M = 13308 327 TGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAAT 6E=!7F5A"5C6%879<22E*H#$.F9(%A8=*D($%+>H3B/E$/(>@%<=C@1,,:C,@+2@H$$3/G6>7(-C46H'50A4,/")'!B'G;HE0/G3#,.5F0(>-=BC95EF+DA>AA%B@'2A0H6&@1H5,8*/(4%#.)!-8&A/E!89/:B!&,4=6G343)3F@:@=,.$$0&D,#: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A35T25G112 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r614 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2579 42 186M = 2391 -374 AACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACNTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACGGAANGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTNACCTGAAA %...'?99>2D&/*>:*G,0G-)1,9'6A9%HF9C4+)95?4$"&7#E$7+G=8!9(DA1//AB'$;&4(#:(*$;&HE#C74>&/158)7*54E&6F,$"GH7@?-A@F.822E71;9(#7HG8.53"EB!=5/A5/%.*>E*H1><4E@8%8=#0'4A;.>:2'G7!3/+BA=%-?8A3(!'#1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73T59A3A39G8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r615 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28989 42 120M = 28842 -267 TATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAA A=GBE;-8;6&+$B96;*:3"-:,2;(B!D2!4@C@#E=05<.":=CD67791"A?:CG5"#D3*.G*26+#1G5'98'/!+CF4);58%*F'/6G&+-'5H%7$G7D.2D""4@D6B/B->86*A&HH0C94,=+43+C0B!5/D37D(#A!H'<@:<9A42!&.13 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r616 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26898 42 68M = 27047 219 CTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAAC ,D8'??C,2C,BEE<'862;=A&2%BD=BE6F&.0E1+6/";*F8&F.0$7E096.41$)8.24"&C% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24003 42 75M = 23789 -289 TACAAGNTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTANCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAAT 8=DH,E7%9-@,?1DD;/0:#-E5#,@+0,;75+26=0);HGE/A@=:H+G?0E.FG&F:4F*3)B+D%/G0CBE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T25T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r617 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23789 42 148M = 24003 289 CTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTNTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGAT :9'A-;F7-4@G:=/1180GA&"$(AF/+;C*!8$.HE$@HG#4C4),>79;@',#@/H6GGF=H5C8#-0.@7H=,"<.G-@9&<+,@/-'$%$70C?>:!7%3ED4>@0=;B5>+;&831*#4C&H"'3)356B05BA3)E(EG1-E=!3G7;'<=4.:35:*1HA$G!A@.B$"7!0&/%<1G5590;70=06"EB'3?;" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47G15C107 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4875 42 74M = 4704 -245 TAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACACGTATNGCANAGNANNTCAGTTNNTTGCCAGGTCCGCCNACCGG %!)"%%$""(**'#'')%(%+*)'&!$)++$$#$!)''(")*"%(''$)%$*!#&%$)"*&*"$)&()*!*%)( AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:30T1A1C0T3G0T1C1G0G6G0C7T0G5T0C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r620 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11462 40 42M = 11261 -243 CATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCNT +#(!%'&!#(*!"%#%'!!('*&"+%%#($')'#*!&*$+'& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40G0C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r620 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11261 40 63M = 11462 243 GANNGCTNGGANGTTCCATAACGTGTCGGCNGAGCANATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCG )%"#*&"#*"$#+%%#'!$*'(#!)##$'+#*&)($*!'()""#%)#'*(#"(#"$$!)**$) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2T0G3C1C0C0A18G5G26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r621 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14762 42 289M = 14660 -391 TACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGAGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCNCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTAAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCNCAN H;%A@?+GF/%(&3AF+">(E;!B7E.@+;,9-/70#D(=F")<6-H@2,8@:%)!<*-,:#<#*7%F8*#2/C'/+@@A;E4.6=HA6*<<(!-076==6;F@E7!#D)(C,*:(DG1-.CDG/B#(7A?!(-%3#$/C,@G+F#1*3$B6A>(#$D#3(/2>A,:/-H8F-D%#CCC$4-B=4G5D;1?$F+99F8@%9B9%44F;&$G+G$%(.(<,/<5=C27:73%*@2"<6.!77$.8@533G/ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:120G32T77T53C2G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r621 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14660 42 102M = 14762 391 CTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGNATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGG B:G51C%,5EH6A),?;<'.GC)7@241A&56-34%4;>%!D4*3'8"E.."D,1(F:#&*>$8$5@$%A"E+5$<14,'4+C/-;8%G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A74 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r622 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4503 42 118M = 4687 283 TTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGA <:<7C@A<2<8",)5>1494EH0G/,/=CF;5$4:/2==#?%4*)3H746&,#5E.&1=-D)5<&G%%+H(;9G$B<,=#.;>28G1)A<8B21B319'2F:<,HG9=!=F.A)0E"3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r622 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4687 42 99M = 4503 -283 GCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACNACGGCATTNTCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGT !"%($+%$)&%)*)**!()'+%#"*%(+++&"(#!((##"))'+!##(&(!#$'$!+$))"&*$"$)')((+)(&)#%&%&")("!*+(&%)&&'&#"+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52A8A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r623 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37580 42 102M = 37682 221 ATCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGNAAAAACAGGGTACTCANACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCT "F.$A4B/.5A&%1&>139#E+#-$%/$()E(D414,+8;)>"4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T38A16T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r623 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37682 42 119M = 37580 -221 CGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACG C28,74B15G&9'7$8."%F5?>32:;%@G:#;.8?>-$21:-F?";C0B%+5717%%G)3)@03F,9890DG.8>:<<:4"BA46/4!<,-4(DF8!('9*"9@+98@/@8(8?AD<.' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103G23T0 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r625 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15803 42 88M = 36142 20467 TCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGTGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGA <.9@7$3**E14&=%E#F?%*&(BH9?%!!+"H(>9)%4:+4946B-3*@E=H;44/E0-H-2?/5?-<1=D!$!?#A89%1#:006# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C49 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r626 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33398 42 215M = 33613 339 GATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGNGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGNATGCGGTNATACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGC =%*''"D;(>@-=,;5$/:(A642G8@9-/<=4E$3=(7C5+"(,/1=(&D>!="8++F=85,'9"!!9'7?#'("&(H"7&?=H9=,)?>-G#B8=E.#C,!AE?;B$&!*'E$C++&$:<7#H18)$(1<:BF%B6GH$B%3HBE8G<%>1,>=;2*7!-)>;C!B.:3;,$%$*,.F241$57@(F'=$-1DEF80H9?/-D5B#!/)?DDA7)H9>153D24E:9*B#<832,=.&.>AD"HD:A2#+A0%)=% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100C23 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r627 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7294 42 166M = 7526 301 GNTCCGTGTGGCAGAGCNGAGAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAANGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATCCCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTG '%+()*%$+"$$&$*%&*$%*$+#'!%**)#%#")!$&"'+(!*#"(*$&'))''*+"(#%'"$%&*)'$*#"&$&%'#'!#*(&')$')++"+%%"!*"+&"&$($)%!(!'##+#*('&&"!**()!+#$"'%+##%%*%'*!(+)*+'&)#%&$*&#"#$*$) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C15T2A60T45A38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r627 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7526 42 69M = 7294 -301 CCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCNGTGTGGCAGCCGANATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATN +,:5-*5,0C:'<.+@+52&"<$-!-?7>B!EA&6.(=#!6D.@$6$8)?!&$2@A9/".%-:#H%62' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27G13A26G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23137 42 166M = 23021 -282 GCNGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTATGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGNAGTAATCTTTTAATTTTAAATANGNTANANTTC &'!(%'*#"$"))!*&&%*&"%#'++#)'!'%)(#(''&!$!+(!"(#!'&&"!#"!&!%'#"*+)+%'+$$"(##(''#+(+""()#&!+%"%%+##+*%"!#%#!#%%&&##*&"&!*)+('))*$+&!+'*!)'#'*%%(%&*(*()%'#)*+('((!"&*&% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2T39G89G22A1T2T0T0C1C1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23021 42 66M = 23137 282 CTGGTNNANGTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATNATAAAAAATTA &(!!(!&(!+)#)))'++(+")$%*!'"($&%#%($%*"'&*$'")+#&++%'(+))!'#&!%(*& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3C1T0G1T0C44C11 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r629 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31433 42 107M3I157M = 31697 361 ACACTCGCCATGTACTTTTCANCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAANCCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATA 80%%?&.:4.&!71,6#DA=?'-88@-*<5D:(=G7E>4=,8C.H#9G<9D-A"@.<$DB405?C8B902.2<):"#%-1=8(81=+5!D#8#($20C#'B5.0$D"+.?!.8?-4A,1,1C*63-5*H>F@,?((37E@@>0*@G"!"6#;!;F2?>5#E:70?G)8"%(.1#B%C##3F16DA2+/9-/G2C(?3H1<$@$G6:;=.EB*/2-4=A-:!)(+CH&86A.59 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YT:Z:UP jpayne@0: r630 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36948 0 * = 36948 0 NGNGCNANNAANNNNNNNGTTNTANNCNNNGNNNAGCTNATANGAGNACGGNAAGTANNNTCNNNGNNTTANGGNNNNGCGNACTGCNCN ##!#$!$!#$"!"#"$!#$$"$"$!#""#!$!!!##$$!"#$!""!#$!"$"$$""$!!"#"#!!#"!"$$""$""$#""!"#$$!$""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r631 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 129 42 233M = 362 294 TGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTNTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGNANCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCNGTGGCAAGGGTAATGAGNTGNTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATT G$/;:!?9.)4:0"&C67G353BDD8HC:'6$F/84:-"/6D(!!3A5+;:<)#!=DH:*0<,6H%)G@+$/7DD6%G);E1/65A9?8=F9A+6?-7.8@;4$>:"3F#,($7,@G806C0(D@7@;G?-0C@@;A"'G:-H% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:36C43C1G75G17G2C53 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r631 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 362 42 61M = 129 -294 GAGAACGAAAAGNTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCNAGGCAGATCTCC <:1*6/2&7@B5%B8B@#-;'+3EG%HEG3"$;=''/-(05#,D-,2.C"(,.-=H28G'# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C28G6G12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r632 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15647 42 209M = 15647 0 ACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCANACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGT 9,0*GF/>H58!'?.@35&DG!C'6"1B)(.H#"/%68"0#E2*28=&@4"#%%!?2*,'AF+=:6"!*D/$;+!#=),4$<&/C242,-92',#?4#9,5>,7$('0+@D7D8?.2:5%C<'##H>+<153?$12FF.1D"F8B9C5&8?*'@(3A3#@GC*++8+*'((E"-18'*)%??H=.@-1#:8"&&>0;@%%>>"F')>6E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82G126 YT:Z:UP jpayne@0: r632 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15647 0 * = 15647 0 GGGGCGACATTGTCATCATNTGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTAC C+:H/B8/3:2D'-$=.F:HE9-H%6#9*!#?B!*%6595A*6 YT:Z:UP jpayne@0: r633 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46667 42 76M = 46547 -196 GCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCTCATCCTGTAATAANCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCA >=D983CA&+#G74FA@038"9@&:)GD<71.?.(?F76B*B@.A<7+:/23G9,A.BHB5.5& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A13G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r633 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46547 42 50M = 46667 196 GTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATC D&-?&@+<+*?C@3#-7@B=9'%$D&717"'H='C#2!!6(;88&% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10950 42 67M = 10814 -203 TATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATC /+@>@4!%>9@)69=5%D<"5,8$/H"*EE89*0$!0G?1F!E96$1"A?>7$HD(&&*HD3=#'=, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10814 42 88M = 10950 203 GATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTG &0F&%-C>B:'?>$!<12&8#;8*9!5+H#%H1?.=9$F#3C5!B;-##0EF23:$=&964*;G0GE0'1<"B$;G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25G3A46G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r635 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45066 42 93M = 44812 -347 GCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTNTCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAG "(7-B!*823("H+F3>%"%+A!-E5>GE8A@.>*C;6/B21=;?=#/>.&94+H08$5'#>FA##+'5:#40!<).#4>G1,, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A31 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r636 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15504 40 47M = 15504 0 CATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAATCGAAAN "'$%631"!"-5$@E4>2'#;7)-9&*H)1-*18)'8D%!$@HE0!! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A39G4G0G0 YT:Z:UP jpayne@0: r636 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15504 0 * = 15504 0 GTTGNNNNGNTCATAGTANNGTTNNTNNCNGNNANGNGCNTNCNNNNNNTNNNANNC #$"$$#!!#!!$$"!$$"!!$"#!!$!$$#"##!$!""#!###$$##$!#$!$$"!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6376 42 48M2I84M = 6254 -254 AGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCNGNCCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCNC $%%'(%)**$)($$*$+!$!(&+"'"**))'"!"&+#!!%$!()$"&#'!+))&(#!$+%*%#+"$()!*''(!(+""))+(!"*)%!%'&+#$#(!###)&"+&*&(&!"&*'$(''+%*(#%#)#"*+&'!) AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:64G1A63T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6254 42 48M = 6376 254 TCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCCGTACGTTTCGCC %*(*+$!+*'*'+%%!"%*+!'##!'#"#""*"$%%!")))!*$&('+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T12 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r638 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7536 42 120M = 7536 0 CGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATNCTGCCATTGCCCGCGC 7'/!768CA5*G@"//C)@E$'(=#B'!1##:348@#7D<"3A:D'(2+4(1%*(HG9,$&.;F,8&:"H3)+>EE0G!(3+*!=:,C1A'2?150.,5?;B8G0<.3<&%852%A?!*A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103G16 YT:Z:UP jpayne@0: r638 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7536 0 * = 7536 0 NNTNGNGNAGCGCNNCTNNACNNCTNCNNCTNCNNANGTNNTCCCTCNNGACTAGANNGGNNNNGCNGCTNTNNNCAAGGGCCANANTNCGNCNGCCNTCNNANAGNNNNTCNANGNNCNCCAANTNCCNCNNNNCNCNCACANNNNAACNNANNNNCNGGCCNNNTGTNGGNNNNNTNGCCNNACNNANNCCTCACATTGCANAT ""$#$##!$##$$#"$#$#$"#!!#"#"#!"""$$#!!#"!#"#$##$!#!$$$$!#!#$!"#"$#!##!!$"!"$$$""!"$$!!"!!!#$"!$##"$!!#!"$"$$"#!!!#!##!"#"$$##!$""#"####$"!"#$"""$"!$$!"#"!"$#!"#""!!"""$"!$"!!!####$#$#"#!!!$#"#$$"#"##"$#"#"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r639 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8555 42 99M = 8305 -349 AAACATACTGAACTCCGTGCAGCNGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTNGATGAGGCN 5+(@F%+:/."#*B91HF24,%#(B188H,(0&61#G=F1E+'+?!&,;F%'AC@()8%(AG?92,5*G$F:4D?253D+=G2BG@)G*2'2&74BH" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r640 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36536 42 86M = 36338 -284 TTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGAACTTTAATATATCGCCAAATN '+00H;6GE3#158&!;?-C8/E<+=?5(F6E8AG+%),?*H+B**(4),"6=9@/5?5@/B*=.7.H+-&D.A0'5G"E#D!(@! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65C19A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r641 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22296 42 79M = 22117 -258 GTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATNCGGAAGNAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAA ?;;()82"&,$62;C3EC%01-A9DA>3)4>>,=F4+D!/',5)9H?*@?9'A:A6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A6C43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r641 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22117 42 59M = 22296 258 AATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGT !-*7G/3=H,*%<4"5@?70-7:F(.(G2"@@)9A7F!;$2?1-B&H<74>G<%?H:/> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r642 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46650 42 55M = 46765 276 NCTTTTNTNCCNCTGCTGCNGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACA ()*)&!%)%(!+)"$'&(#!!($$"*%*'!"&%)*+(!)%)+*!$$!&%"'*"+& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C4G0G1G1T0A7C35 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r642 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46765 42 161M = 46650 -276 GATGCTTNTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTANACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAAC 9,##67,2$=.8".'CD'GEC!?:+"0-=ED-00,/EA))B::!G,B!#$FC&9$F,6BC,A1E3#7<:9D26/!#*=*9$5'%#E12"A@-/7094B!#;D"B7E2)A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T45A107 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r643 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14580 42 42M = 14710 248 AGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATC -*##1.4?.;C08.'><:HF,H=B=*;E2EA0-"-5!,@<3# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14710 42 118M = 14580 -248 CGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTNAACAACNGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCTCGCATCTGCC <%6F4#.C.47D2,27B?1F>8'E!F'(=3,F10#9:C6;B!"8*;51E@,>//30@F/"FEA"2;:-&9)#5BGF(B%+/*9,4*$$@7/?.%GCC+-D2/@+23>:;2='0#'&)D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G6T71G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11202 42 64M = 10997 -269 GACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGG 9E(C'47:BC:=!<@H,+)()$)@?B8)$!!EE-'#F?9@!0#A!2:$"CE@4+)*1@7"750C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r644 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10997 42 58M = 11202 269 GCTGGTCCTTTCCGGCAATGAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCC <,'?->&0C%@'.11C#'A,*CB7//:?(E7&/"<90GDFE;56.E(1/!5@8?2658 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r645 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34612 42 91M = 34703 288 AATATGTTAATGAGAGAATCNGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATT F$0,23*#:B$;D$2=C2$'H67/&2%6>$@><+&;D"%E2)2+"D6;$H8'A/-F/5H&,,G=;#';:"7C.:AE?DAF(G/1:!%7DC< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G70 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r645 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34703 42 10M2D185M = 34612 -288 ATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGATTG *"$.*-+'(A-+3G5-,C,&+%+/*"($A146"3!1A:.@/.C+4(6;7A/%-=#10%-CE=(2<:7,::)E;0D@6B;D0;F46B?#2?GB<#1(0C)#!8<+&0--"8(4.%!(;,"'!)(5;,"9A(.7'"C4.%!6DEH.:AAD"BGA!'><;>.),/>8@*=+4!>6@<.DA)>*9:(8*B."6#!&$%9 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:10^GC97A83C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r646 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35475 42 54M = 35216 -313 TTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTACTAG %#$"(($%"!*!(#%$$$$#%*#%!#*(+%'+("*(++)*++#&**'!+$%*"! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T2T0C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r646 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35216 42 49M = 35475 313 CGACTCGTGATTTCGGTGTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAAC %3E?)$9@.%C=1>-B#,3/(6H*5=@B$*:;.8#,2C,.@/'CA17(4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T15T31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r647 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4587 42 52M = 4639 298 CACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCG GC"+;1(D2CB3+2,F/>E2$#-4;6@',)7<-*7D$%3?A,1< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r647 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4639 42 246M = 4587 -298 CAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTNTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGNACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCNTTTGACTGCGNTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGT "!1D/2%>(<,(0>1-AH>983885G?@F8&H@3=D!E8.!4&41#::9/:<3G60B93!%!4$-76E85).-9/H!"2B#.,*$2/H,@84(0:*/<+?F:&-((>D0#/21H'594)=@"6&#'";/.;A!&>F8/>G9.H=0E.(-&0%:FGF1!G58.0GH":$<&4"9BD(&0A,3A'3%:$++82?B91#%0:8(1$#@#=D1,7D78, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:118C29G49A10C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r648 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37398 42 86M1D136M = 37236 -385 GCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGNTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCNGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCTGCATCACCTTTGGTAAAGGTTNTTAGCTCAGTTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAA '++'$'#!'#$&&("($+)#%+&#&'*(%+(''!)#***#"$%!!$"#*''!$!*#$+!$*)(!#(&#$#(&"%##*'$(!$$#&#+%+*#)$%(*#('"*(!+!*%+!!&&+###%#(+&*#+"&$'(("$"'&&!#!"(('&)%#%'&!('+(&*($#)("($)&+*((+$&*$&)+$$!'$)"(%(&!((*'*+)%(#(!+*$*"(+(+)#()+*)((* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:27C25C32^C75C21C1A7G28 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r648 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37236 42 162M = 37398 385 CGTCTCTTCAGGCCACTGACTTGCGATNACTTTCCCCACAACGNAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTANTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCNGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGGTAT A5/#+5=+2G78D"2BA3'%#7(>:3-=3H:(@7C+*3B#$(D=-(-F6D$>83>(:$!==3!#A,!C'-E'-402F8?;53+9-H:GB0?$-F(,E0@1EGAD)&B-@"EH?&=2;$6?!D3,6>%2%%3*,3?><4 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:21A5A15G31C40T41C3 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39639 42 111M = 39497 -253 GCCAACAACATGCCGGAACAGTACNACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTNGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCT +*&!%"!+)*)$%$%+'$&+#%*$''$'(&#)!+)&)&!)%*'+&%)()#!*%%)#($($%$#!$)(*$%"*'"&"*!#"%)%%'+"#(!$"&*+*&&$%%(+"'$*&+(# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24G61G24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39497 42 90M = 39639 253 ACNGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAA "**+#*&*%&"("+"$$$'(+!$()'((!("))$""!+%'$++$$%*(#&"+"*$#&"%$"*#"##*+"$(##+#)+")%+*(%'!"%') AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C87 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3318 42 93M = 3128 -283 GTCGCGGCTNTTCCGGACACAGTTCGGGANGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGG E%.."4,-D=/,B;2,5<138F-G3?0#B,0#@&9-82( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9T15C3T3C59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r650 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3128 42 40M = 3318 283 GCATCGNGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGT 8$B!>+;!(6B5A*)5.7CH)/B57/>;C'974+.F%>&< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G33 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r651 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33396 42 90M = 33200 -286 GTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACAT 3"@G@>H#9%65"AC21=,?D<927$$DB!62D;;*((#C4!-B''2(01,G-)&@1):=H(7A%%#%,+,->>,A2/$G= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r651 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33200 42 120M = 33396 286 TTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCANGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGANAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGT 7+H/0/;'+<<7+9D*(C%?D3-C(E:/-2GF2A-9<'#)'A5.51H%!0*:*430+/4BH>';5,:@7? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57C33T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22191 42 63M = 22387 241 TAAANCCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACG )(((+'&*$($")"*&"!$)$&)"##&&%++%#$'!(%)"*)!#'$$+&%$##%"()%&%"%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A57C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r652 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22387 42 45M = 22191 -241 GTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTG 9'8A%-1H,38D(5F=#":D>>7(,-C&H)96C2F)$F>4F<3F/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r653 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47023 42 89M = 46868 -244 AGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTGCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATTG 1E9.()<.:G*E68*A,?;8/9!H@%F:G2D8/&3H/&&6/9B((,;BC4--H0;=>6&G;=66#3"7E:<5,792#<4*<)8.1H,#% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45T41A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r653 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46868 42 155M = 47023 244 TGCGATGAATCGTCATTGTANTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTNTCTGCGGNAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGA 0)G87%#'!!8(%H*!>.5"@$3D42C418'=53=79.(H9BF;2'.7"0C2'AE*=+#,&=5?5?F2H:A/@B,:/33?6:""@AB.+,(C0EC+1D!&"23G1;<%.@;E76F.3F&14*6GB0D:$-;%7;46+H#*=*".@.G);'/@/?5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T39C7G86 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r654 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20492 42 57M = 20257 -292 CAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAAN )$%*&)!'$+&)*%$"&*))!*&**'"+#+$#*"("&#$#)#&*%")')*'$"*&+% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r654 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20257 42 63M = 20492 292 CGGCGAAAACGTCAGNAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCA +9"&B"8=3C:96*@/>G!.D.5H/7%+4A1(72>,1!+D)10,H<=C=(7@+@,$15(H88A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r655 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47387 42 69M = 47520 261 CAATTCACAGTCTAAATCTTTGCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGG A*9G<&:74+66/0+?D?C:4++F-C$3%)":-*FH.9;*?63?#-E.2D#)(?,4G8,>)+E%21*C; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r655 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47520 42 128M = 47387 -261 TCTGACCTCCTTGTGTTTNGTTNATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTNGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTA G7*'10@8@F'ED8:-<&0"B'"9G!7HE&0!9>)"/G<1-1.26.5G<'>/>3&9;E2;(">&3*4>F,;'&<10H81@BCE7'!B'?(D02!/*1;'!?A9/A+4!';75D>B00=(@C"<%1.+'A<2',B$H1-G+&@B3,0HC1>(2,8,!5)DA-ACE0+2-05/%A4+F%F/483;&/CA%F<$%*:'0;'-;"!E4*>D&$%(A?(>E2<)*0#:<%;40'=.1FD1/,&0>'G=$3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C158 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r656 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48358 42 129M = 48197 -290 GTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGANATCTGCGTCATAAGTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGT A%H1-(6.?"$*,-)F-%=48=!'C')%=-3243,)!'FD6F$5:G.'AG5)HC?3:/FA4B510@D<>+EDB2,%17A4F/7,>902"#5C>!72.)!E!*:!33GEC'2($/FF).+8'($,;)C@/ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:29T1C11T78T6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r657 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37233 42 150M = 37412 233 AAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACC >,#,6F*H!=*%/E9H0/@E<7!>+>&5@>".=>G57:+31H2385G;C,47DH$@D,;/?#4&073'(.++F?B:0:#(>$&H+-26.>(2!@C)!FB1=>!"027?*H3*@<03$)G2C%G1HG7=!<.B:.=B"%'2D63@!=31E& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r657 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37412 42 54M = 37233 -233 GCTCAACAGGCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTG E--476HH2)"%3@H'4*?&.C!73$!1DDH/1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r658 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12818 40 55M2D7M = 13034 267 TAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACC 2,,,#+6BF,)C&7."AG%+->&#C!*-%7E/@+B AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:0G54^TA7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r658 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13034 40 51M = 12818 -267 CAAGGGCGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGNGGCCTGTT C+9F3C&D?G'D#&-&<0-%+'-".;B.E+BGG$:4D185+4!&F>@<'G) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T35T8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r659 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15263 42 130M = 15052 -341 TACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCNCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGAT $""&"*!$&%))&%")$(""!%%$*#()%&)"%#))*#'$$*'+!$(%#!(&++#!$(')#'+$+&*""$$+#+!"!&#&$&'('%')'!"*('%$%'+"+)&")"%'$)$+&#'")+*'""#*&#%#"+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r659 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15052 42 211M = 15263 341 CTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTA !4H4H5(2!<=*8<<,,.89)4?@2;-+&#&+DAB2CH"15F<1F)64,6.>5659/"0F62!-58D)!D.:=,D@D9C#',;18(!?H-4H-"0%&:4@H,),C)/%FD1&F7"+8<2'@).?%HD=$+$1=;2*E0HA=3B58.)!++"H"<9):=B-(9(,@C-=B='>%<<58();9D9BF@)G./?A$5(>*E@.E6+@%1>3?)-(*G/::.&/D%9)&9', AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40T26T12C19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r660 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22427 42 150M = 22577 250 ATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCNGGAAGCCTGNAAGAAGTATCGGGTGNTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGC <*?5/6;A,84)("3'*2+4*=>$6$)/;4*(78CH!CC/*6@+0=B=)'/F+F>%<3BG!%(<"3@9"@%>HD&4&*@4+0!=0*F-E4"3D7&440@3.40@E@A=B'$%=F0)608524C>5,2,7/8*$!12/0&;D(=:CC'3/+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36T9G15T87 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6449 42 44M = 6276 -217 TTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAA <2);*A9.<6&1"0=2/*,G-8(E7<@85H<<&HD*!8B<)E8+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6276 42 41M = 6449 217 GTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGA @F'A$D9F."7BE;D<%H2$8/=6<):%.5H($#;+8#3"# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r662 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9591 42 406M = 9490 -507 ACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAANTGTCAGCCCTGNAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGTGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCNGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTNGCCCACGGAGG 3,8%>G=#D(04"00,B!EC4="6D('+A7+#9%;E,A")-$HE&'+'H7,B'2+=8B>%;1#G.F4BG>>$GF3,8H>72$G:!E'D>>>4C6$@!D>"@H)1BEEED-5D9G45/7/$>FC,@:0"'FE(G>7+'C$?@<<*-62/&HE0@/3!DDB'!%.H7:>F8?293(1-1@($:B5=$B)??,.:B>9=(HE@'5'G61D7&'2B.0??)5+:<9F$78F;G/1G>)65-,'D!05(4;6<$0=*D;H@-*",36&61D57D@.C!#,#9FHE0B7-F61:H.C0.7E?H93F;D."@."$'!7434C*4#!&.%9C4A@( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:177C11C111C57C34G11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r662 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9490 42 101M = 9591 507 CCNCGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGANAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCANCGTGTCGGTCAGTGGTATG GG@@A3#5'2;G@3:2AE(&2/(@6:85$1:5,;;C5<7-;9D5E/;)+6<%5A>G@!'='B(/-9%#'/5(9.24G>@#($##C>7286=.H-0C>2;'57(<<1,&72:$AG;4&E/!=FG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r663 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43938 42 550M = 44488 594 GNGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGNCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGNTATTCAAGGATNCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCNAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTAAATCGCAGACAACAT $)=D7%5(*9+)7:=/E)7,G9/HC#)@@D2)1-G!A,-A,(*G<86?&"<,;1,'(0D3%8((CDHCFA2$#CD)*#%EF)AG?7;6%1#3407-"H5&:;C@+=)!.#&G=#=,C'2;G98,5@'F>'!&:%(")E8%@(E+='C65D)%,(;C*?"!&!G'+9!CG3/&96D4F)-B$5>D4>#B#F6A!:5:C%*2(A,&55&99D42?%%6''")B.*A#>@-!E#+20.A<"$,8*:-02131?4C9CB"EFD,G56D.7+0C>:.,#)*>&,,.&(',2@'#@";?4)CB%)A9H9AF'A@&0-HEH?E,E318!,/B=).G*0G#--E+"$#1@"AH45A+?762B3DAF@:06,;#@%>8G(597=B$02C4;,)!"F*?83DH;'D+B)) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C16T88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r664 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43517 42 42M = 43256 -303 TGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGC 2=F8';=++=0G2;;6@5$1G&2%2@$7A).G5!)'5H$-,7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r665 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46318 42 58M = 46060 -316 GACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTAT D*;H&03$'3+G4:@)E>@)6%;C-"9"()F#8F5HF0'#-'>6/3H1)CA!0"5HA)@A@2>4A%4F!D1%2<1CF,/BB1!-H?F#&2).G42<5481:G+;'<%:C181E"7E>@F1D:(?-);9$H:&3E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r667 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27520 42 144M = 27725 254 TGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACNAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGATGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGT #B@,&8)6$+)7:&+!9,7'CE!.(;#*H'5'5'H,.B(2.,4(8B$D686>AA#@)+G2GA+$2$G#&88)3@(H@(/%HC"G-4:>6E80FA7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A76T27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r668 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:165G145T6T48T13A66 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r669 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6397 42 27M2I19M = 6443 494 TNNCCCTNCGTCGCCGGCCGGANGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGA %$!((')!'(%$++*%%'&&#%%'"+!#!*%#("&%"(+&!'$'#+&+ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:1G0A4G7T6T23 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r670 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28112 42 233M = 28020 -325 TTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCNGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCNCCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAA A=:2H:FF13=?2EC!&:A.?C47B-';H->;<+@<5F!9D-/.HG$*,)*/2>?E.040:;>&8/.!.:'0F*<* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39T89A103 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r670 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28020 42 92M = 28112 325 TACCTTGATACTGTGCCGNATGAAAGCGGTTCGCGANGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGT =7/6H5.>G/E%>!2+.)(8*%:##3*%(7:AH6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A45T37C44C29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r672 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3226 42 148M = 2853 -521 AAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACC @?(-G/E,#?G;171=>+E@&F(9E.,8&3!C(H#)":;/F"%A->1H-46!$0@&.,6.D5;>:/9$<"$C-1HH@B48*B@0",/2C+'!G69:4H4D.8!96;+,1(;E37?9;2H+5E@H@292H#:?&?BED?-;,",.FCB"-=7:4H&?!!@7G.GC.H*.,6*6?$+CEBC>.5?-G&B9/-*7"*D?2=-41(%F;A#?).%;*!.B'B9B(8@.6@9$<2,")4$E+G6&$$*68G)*?=4>/17;=A2"-/73)'A1EGHA"-G=E&;<%0!@:18.;,@@.>#B,2$#)*"1C9#16DG853,(HGE#$'5"&!?/$0#-'#;$&@'D9!2C"0E$27&=92;':3;?-%C%='">;C&$6!)86:($?<2CDB)D AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4A28G19A73C27C51G63C45A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r673 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44949 42 413M = 44784 -578 GAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCNCNCG 97?$,A4CH".@%9"?9AG4+,6=+,&#>8&4>CH8#(AAF'D?1:(EB7@;&2A)8'6E=&7"DHE#(=C+@A0-4;>3.5&>&6,*-H!9@@@+==4!)F6F@CA1C!:3(?*)0*%3"G!*83!=+(#@'D-'9AF94A.+384;?*H(,7G1>@>AD3F);+@8>5+6'!<)<*:E93+!>7<:.D2/12'%1.5E=:&(6E1'7H=E46FF,'H3@6)9G5%)/':D17DD<.6*#>@#&H509%.GG076352.;<=-.75H&@5A*#<'1',(,@C@1D(&:6?-?4-<@@.2@A)?%DC&-3;9<)E=+#=:66)%?.GD#!GE'.E:%;)2E.E:6"H?.&H8C>@..-;1:A(F;.!38!G<5-""(*" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:408A0T0T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r673 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44784 42 165M = 44949 578 CTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGACCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCNAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACT G/(0;<@5+1@.FH&E4C(H+"C1$4)C'//G@;3#A351#6/'"8".&$#-AF7(%CA(1'+)3/23"70,-.>E=)6+7$<&8.*'514:0'.E?+&-("(1C56!9=),01:"6/H2/>)A"F9''(4-FB320/5GB557@9F5"!:?125D&,::BAC'@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G67A47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r674 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5335 42 124M = 5199 -260 AGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAAC ',C)=E!8?5B:D"CE,,2(4081%)0:-B.8D:-+$67D=C4/7,,:A!05)&:GGG"$D93H".??9-.2!*,>B;*54,)+?%,'5>'=7G8+3/F2?3-1C)7*69->-#4&./?9&1C9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r674 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5199 42 136M = 5335 260 TGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGG >4B%&1(2-'2-(%4@>/G7*C,:7+A2HE?A8/:)%!F.;ED(?;?+H,4E.7B'+<7-H+335%&>$8C"2-499G1*2%5CH/G;+;?A';+&6:5(+*7GDH%!F:0%&%?(7!2/6F#.H?$G:-F8F578 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r675 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23280 42 112M = 23064 -328 TATTTTTAAATAAGTTATACTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAN 9!AA60>>8G=/.8<=;0=85>2%(/-('@EB27A(>7!2ADH6&!1('*3/C&&;!&ED6E63=+,(-39#"?G;>;#>$<@"2C8%)5!2*"D*H"7A=(&'@7.3'+(% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A15T63T28G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r675 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23064 42 216M = 23280 328 NNATTGTTTATCATAAAAAATTAATGNTTGAATGTGATAACCGTCCTTTCAAAAAGTCGTTTCTGCNAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTATGCTTATCTACNAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTT !&(-E=$A8C?;A)=3&'&FE;((1"8'&&9D++EH3"H002-'>8",15CE'+$G'4.65BE.93:#6'D30H3:*D:E9/B,A"D(H-H#/F$=. AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G0A24T22A16A48G10C89 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r676 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7614 42 114M = 7728 281 GGCTNATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCNCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGAT )"'E(>80(C3B=?7!:E48>>#D6D1+-?=)?4./1#-"B$"0E*-=@$1+3($:CFC26,,C'*#(194.>-83DA7.2G+H&"0?28H-<<#CH(@#/A$6%@C,A9@,%D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G33G75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r676 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7728 42 167M = 7614 -281 ACGNGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCACCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGC >"1&C0A-6::06:;12$G:?7+&H5!AE0$40*&17B*?1(B!/0'$0#3G&4!%$8'?;F619DF#EE>7,C1C9%.)>..?@:G)+235FHG(2F30#)5A((GA=H46H9,+A$31@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T101G61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r677 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24037 42 61M = 24262 348 AGAAACCATATAGTAAATTAGTTACANAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTA +>A3&BH,8!*D5%."G7;389%,H$/$/)<8'*B3<<-C). AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C34 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r677 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24262 42 123M = 24037 -348 TTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTTCGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTG #$)('(#&!%&%%)*#&$)$+%$!(%$)"$%'#!!$'+$%!'$"("%**!")($**&'!+$"$$%&(&%"(*'&%+#)"&#)!)"(+$)+#"$#++#+&))*'*(%$$*#)*&"*'$&)"+*& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49A7G65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r678 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38226 40 18M5I68M = 38395 224 NAAAACNACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGNCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCAAACCTATGGTGTATGCA "++"'+$**%($'#$*("')$%((%'('!$+&))*"##*+")'"+!'(%&%!"*(#*#&%%'++&$%$$'("&(*)$++%%#%'%(!*$+* AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:0A5A34C27C16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r678 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38395 40 55M = 38226 -224 AATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCN BA:CA/<)D,DB70(6C,70$);/@7;1$+A,=?*=%/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37A28A64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r679 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44218 42 240M = 44087 -371 CGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATG :?@B&3!3=+.$/*@@>FG"'F5%C9C2"GG)-1;+,<=B8!??A$G,',"&HH>@12,D4@)-<2#H!CH:C#??,1$#"$H4E(DGF?$C36$7:E4B-*'A*@72!:B,E@!'BE&;+4=71&%87>D!68-;)8"C.9-5"7;B!+>E51FA;%"9.(E!A/F+#1$,75$8"!#)2<9(; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46073 42 195M = 45966 -302 GCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCNAAGCAGTCTGTCAGTC <2B>H0:D!F?.(24939@F.).=BD2'8$+/D#"6@#2@D'+=B04H9/=00HFB.:A,'9=*"(7D,B&D?93&,:,9>H-E(=D+8.75)F;4#'$544A#G*.4+=G7!>>=F%79C$=DD#3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:164G13A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r681 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35498 40 47M = 35652 289 AAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAA 8;-#.C02&0=0=29+B82=-&48/E5<>$0D/H9*:?"?5<(!;(& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r681 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35652 40 135M = 35498 -289 ATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGANCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAATTNNAANCAGTNATGTNTATGNGNAA )%'!""*$*#"**!''*(*(*'"(+')#$+()*'"('+*""!$))&#!%%(++&*($(!)#+!*!!'#+#)&"!(#"+*$!#&+''$*+*'*)"(*(%'!#%(*#!*&+')&$($(&$'($#%%*%(#&$('&"& AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:62T46A1A0C2T0T0G2T4G1T1T0G1G0G0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r682 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24084 42 52M = 23868 -268 ATTATCATTCATTATGTANTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACA :((.4!)$12+!>DF>#G$H#)3>4?37C%@B./-1?-"=/+7,.FA.+422 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r682 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23868 42 60M = 24084 268 GAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCGATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTC $+!(#*(%#&*$&'%")&&+"*$&)%+(''*)"")$*)''&$$$+$(%%"$(!!%'*+#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r683 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24869 42 291M = 25160 387 TTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCNGCNCGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACANAATGGACATNTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAG )2!)(>,7>1;H;>GEHH3<+5$6'84*"1&BF,2B0!ED7*=*GB40"/=04-4A-;+580=$:)21++:=-B@044:4,20'<0(2G5,"&=5-EA771=1.,E>6#,BD57&$F1")>*9'F)2)%?-')EB51HD-2E!E#?#G+8;4/"5E$@//0$>)9&9&26=(52@0<:',B"G/*((D+2321H5A-6902!>A>3'-?*F30A9.H?0HD6.>)13"%$G2@!*1F),GH330&16!1&B5&%%G+*":9B4BB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:101G2A96A9T79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r683 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25160 42 96M = 24869 -387 CTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCT -B28>)".8BDE$DD9'DC72/-E>%2*:#0H:6%7F&F*"'=G?#)6>,E@H$DB$',88,=8'9EE1"C(+42.D)#36*%F-'E#8-&. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r684 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47611 42 83M = 47415 -279 GCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTA *4(":=D=)C@,3.%)<$")';@$3@= AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T31A36A5T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r685 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14430 42 154M = 14275 -309 TTCATAAGTTCCGCTGTGTGTCGCATCTNACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACNGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACNTTCATCGTGAGGATGACTGNTGGCGTAACGGCCAGAA *D!2$?#29FF9!8E$<%;D3&6)/3%FF=*&#F),?$+FE747A)%F,:BA3D.!D2+D78A&#C0216#C"#6E6)(E?(%>4-+0#8'C&@%15B!)>G$:(D61:46(G7@A=G-9$.:',5?F7$+&,47GA$#B!77C8)7!+"9/0.;?$-)=%)7G3/@E@=#8,03%89"?8856(5B"* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:155 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r686 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17632 40 50M1D43M = 17799 236 NGNANTGNCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGNTTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTAC ')!&"$('%+"+'!**#()#%*$####+'&&#'))#%&!((""+#*+"$"&#'%$#!#("&'$*(!&)"#"+*"!$)#+(#*!"**#%*"!&& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:0C1G1T2C22A19^T37A0C0C0C0G0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r686 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17799 40 69M = 17632 -236 TCTTNGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCNGGCCATGATTATTACTTTTA AFE*:#A:D='*3C'$2F=D63!BBG5%0C<;/2!-=G#>#5+C+DA**;F/;D##/*8.F)3E=+73>"9!5A;?7CC/,'8742(-%'*': AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:63G46G58T7T2 YT:Z:UP jpayne@0: r688 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36278 0 * = 36278 0 NTTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATTTGAAANGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGTTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCNCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGNCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTA "E3A,.7%9'G7@G8;,3=".83:6E$>,,8?50$B%.B=DC%F##C,=&@4F/C+&/$A;/%%>(#;,7,@/DE1.0.(8="3:410:;C24(?8,G=;6/.=>*6H'G1/8>+>8;2'F/2HB.B4G1F;?&03(?2H93!/3189*G*H,>5"733'-=(G>A%"0;)8'FD:1/$-%E>E!?9D26%G)9#,69CECEH,F;E*5,"68,*&4#*-&@&3">+",?:D;DA*"%0G%#%:-7),F4F&/8;@;?+4?,&C4'%%#))8*F,D4.-B9F%#9,0D!;-1)>3!&(.C@2%%/"&>$.,F($;>/0,9;E!D<"BD0">G=!AD:@= YT:Z:UP jpayne@0: r689 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1482 42 190M = 1672 274 TTTGGCCTCAATTGGACGCCGGATGACCCCTCCAACGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGNGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATGNGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACA :7#'E3GA>?C%F,=B87>10:+%%B:BGF%7@:'35H.!2H,1?"970AD7+6&FEB<(++05=:+0#9#5*;?4)'*-:C::-4;&=<"EG7C&:*%F&%)912@#,;4E1*#9584CE4@@!'+=DBH/H:&;$*73/4/,-+23F">)':97H14:7G<,5@EE$%+23#H3#)AB;E@)5.B:8E AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11A22G23A0T68C0T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r689 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1672 42 84M = 1482 -274 GTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGG D353/C)B6<2+8?-F0H:,E<@,*/;/+B@F!7(=20;/6'$:=<9F7,8F&((,/H#@;#D6(2.2F:E/./D00C;;;".8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47874 42 263M = 47834 -303 TCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTA "=!!(:$.)/E9!.)%>,&@(0H$8$')/+5&638C#,"*H62<8"#*&#+:2@G$4*E,-"%6D!032+.7C7:#@46='9("(<1'HC*HE:320.)211F:.(%(-'340&)4;:!F@-=D09+$H&2-3'&6H05F'*<3>>5/7BE)8&0;:,..$#1C.)78:;5@HE@,"F,!@,59:)H$C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G243 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47834 42 40M = 47874 303 GTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCAT 51)((-A.<&,#4?@;"%=&>(3&:%1)(HB)*3<#BB;1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r691 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25643 42 55M = 25698 263 TACGGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCNGTACTACTGGGG %&)(+%*()+*'#*&*+%'&$+#('"#!%#+($*&"(#&+*)#%(+#!$!'#()) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G2C38A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r691 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25698 42 208M = 25643 -263 AATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGNGTGCATCGAGTAAGTCGNTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGAT *)EF#:-H*(=?9*@1B-*;170;;56!GB/=1*;,22?<@%<2:;DA'>&>.FB6G.8)?5+FCG&%%),G@&?>-ABBG>*2>+(0(29B:>D.26&DF1,=9%05F:9'/%?-E1G#$;3$B7< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C17C160 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r692 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13477 42 82M = 13581 193 NNGTCGNCCCCCGTGGGGCTCTGGGAAANCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACG "#(#(#!$)##)(**(#"'+"%%)#(*'"#+'%$%*"'%'#'+!+%"%$'(!(!"*'*&$+($*!'(()*&+%'+"&%()#& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C0A4G2A0G5T11T53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r692 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13581 42 89M = 13477 -193 GCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCACTACGCGCCCCANGCTGACGG 2,0D>&.F!H/$3F23G3@D<<2+C?A?>)"FE4@4-9#>@G-/0?..BGE.8#6..F?G7!4)-AD'7?*9>9''H>&@2=C%H@#%: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68G11C8 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37252 42 232M1D6M = 37539 337 TGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCNACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGGATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCAT 22@07$AD)!*&6H>H>16%8H%%+";1?0'E)!<@4(%<07+A431B285B#$EC*@H'4$/90FF65B5-=$>;96BCA4:/.>!"5E(03;0.-G*CF:9-#(8B2><80&-D("?,2+H6H4:2>4@.0,D):#&AFH8>6D@4/AF0?8;!1>>*90/G.1$-7-://'+D-?!-'+38'%;1B@$*(/C$B:G'9?)=<:$)9=?%=2G+39$& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:164A23A43^C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37539 42 50M = 37252 -337 GGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCT &E(%A%FE=?/,HB%;@=*/9(:B5.=3$$EF+.A%3@:$,$:<3>66H' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r694 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12656 40 148M = 12804 317 CAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGNCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGNCGGCAAATATGANCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGT ?HB-,-)A.>4.5%F,1D3*:A9'%8D)4'5=()#E-*643HB*9C'@6.+G?"7*,19(50&:@,2:9>*0GG)C<#.-5)4G.$,DDE&=$1%0?,A6.!3!7>59(&3+H'#B?&.,B)=:773-53'$F<4+8C7",0/?G?D( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29G31G48G12G15C8 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r694 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12804 40 11M4D54M2D98M = 12656 -317 GAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTANGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACTGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACA @4'!;<1+1&7"4>73H,.-#2B.''F;=A)!3-!+CEB$0&/*8"/'.!&5@A/-D?'9HD#5':4,'21:FFB>?->C%E?<+7;H#C")?* AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:11^CACG54^TA15T27A40T13 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r695 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14115 42 97M = 14212 219 ACTTTAGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCA )&-0.4A<1,C1(;"(8'>+>>(H+7>+()3-B7C#=99%+=,"5%CC56,226-/)*EH$7<<8?BF$'*D>=H.@@#C)-)>>05A1!95C3B&;F'0.:BD-/1C@%:%"H>"6?B:(E#G.C($*+&B-3#/B@:8B.H@3C="+@HD9@:F6#(1@42-779$,2<@$?/)%D;*;,:GA56&.D/BHE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7G10A36T51T5C8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r696 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47947 42 80M = 47733 -294 ACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGNCAACACGCAGTCTGTCACTGTCANATACNTGGTNNA *+'!%"(('&'+%+*'#''"!+*"%+#++$*$"+&%$$$'"*(!%!#!(%+""%+$&+('*$("+$%!*%*%$)&%!!"* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:43C23G0G0A1A0G4A0A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r696 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47733 42 175M = 47947 294 CCAAAATGAATAAAGAACAATNTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATANCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGA %**+)&$#(*%#!"%&%%(&"")%$(#&$!%($$(*%$%)!)!"**%!$*+&''#$)*"&+$*+*$(#("+"%%'&!)%)"#)))#++(&)"#)($+"%!#"%##%*"+*#%"&*+#''#!%*(&*((%"*''&$+!))'+()%$#&&*+$+&*&$&#$%"&!"+*+&')%#("" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A20C50G87G14 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r697 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30914 42 107M = 30777 -244 CTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTCCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTC 38:C?5?A)),(-/>C??7+2&&$-5@?&$4%CC"G4>3(2+@C3E;).:A=CGGH&)F'GH7?E2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66G40 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r697 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30777 42 68M2D67M = 30914 244 CCATCAGCGTNACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTATATCCAAACGGCTGTCTGGCTTTNTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTNCNAAGGGCGTTTTC 0:C=#?.G7F?H>38"(9.9)F13EC-&A9GB/)2@5';)@$9EG53%=$%(')C@;G?)A9.E8G92;D(E.F/*E72=>?(&(D1A"%@AB43C8D@1';6315:0(2G@35!!C%*;+9E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A115A11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22560 42 100M = 22365 -295 GTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCCN 5/F2D2>;*16?HG.9+A*/4=?*24%&(2B&DE%D.#+2?4%G(#A;<47.$="E?6>:1!5-2/07C2-;B7*831!C*,(='=&-77:C".<(4F.& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98T0T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r700 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44082 42 154M = 43984 -252 CTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATGCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAG 'C<2%7!/"H#8.->BD1<3,6,>C;:F7193*DE+&(5='./4"8/B#A3**80DD/,,%'*-F5H8&8*E>7<++6&,79;G--'0,8=<7$#:G8)%A@5''0)3E&:B>,4"%-2.6;D/:+;B=76$+D63=4)#$=6=#*%1'B&?,1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108T45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r700 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43984 42 98M = 44082 252 TGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGTCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCTAGAACGACAAACAAAAGG 6GF<9E1!="65604;(,F+F0C6!'1?+A"!H/(>,!/B%/@D72;F"CE?/7&-C<9,-4#31#%?E:+%?/'F"4;">3984#C65.:#EF?:D= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G29C18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r701 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27426 42 47M = 27225 -248 GACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGG (!%,7'?>(9,3&#E&<(3"H103F'6ECH.E/$92&H:5H.3@E1. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r701 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27225 42 104M = 27426 248 NAACGNTTNGCNGTTNAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATANCNACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCT ")('&*()%%'!%))!#+&!')"(*)+#%!)&)&*"+)#')%+$!**+%!+#!*(+!*''**%%&'&&(&+#('##(%'%+%+)!%($"#)#"'*#&"#%)(** AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G4A2A2T0C2C44G1C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r702 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21298 42 62M = 21421 188 GCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTG 2)!;9*@B=;8"-=H2AF=+>379?>H'0):#?7>A:<9=&5.=1"<=(0DC#<+F%?6"?$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r702 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21421 42 65M = 21298 -188 GTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGG %(+*#*$%&$&$))(!)(#!&#&)%$$#*((!*%!#+%)*++*"()#(%!+#!##%#)("(#%+$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r703 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35879 42 191M = 35749 -321 AATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTNGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACAATAACTATCGATGTCATATACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCGGCGCGTTCTGCTTCCTATTA 6H-12E171F%C<$G9301F)4?+E%<+@'.&"#94B$+7&;&6H&-74?36$.A/D'78:4'DH'9<=+4)+7'A7!4>$//:$%('$:=*#3*2$5BDC%?E=!9 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G94C54G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r703 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35749 42 43M = 35879 321 ATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATC 9FH&=;+<64,91H4G%B!2$!@,32G,49$<;*C+="H!<,> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r704 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7329 42 131M = 7175 -285 ACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGNNCGNC +#*)'#$'"%')#!!%)"!')"&!&$*&('$%""+$"*'%*!((&!#!%$)!'%'*'(*)*%&$&#+$)+("(#")!&+'")+%'')'&%#&*$*+*"*(+'$$**+*(")("&*($"$(&(&%+(#))'& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:125G0T2T0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r704 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7175 42 50M = 7329 285 GGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGC 8%AGF#85-#@H=2&46:DF#!+BAH1=+!+FC527&>A'.*B*)8@=?: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r705 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38011 42 96M = 38243 328 GANANTGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGAT *#')$++"($!''"""+"+('!#"'(+&#)*+*!$%*!%'!"()!(*!&(%+&++*"#%+!(*#!('!+)&%+&"#+"(*%+!'%!*(&*+)%)*! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T1A91 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r705 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38243 42 96M = 38011 -328 CAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCNATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATNAATTGT ";$?@-+0)B*F==F5:!,="90+7+AD4BE,61'$>0D15,C)"<)$1G6&=7+C:.<>!D5$:):@$H+9.36: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T55T32C6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r706 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39177 42 282M = 39177 0 CGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTNGACATGNTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCC 6D@:64(C*3'H5205/FB$A2:3$@D.7=C'0<0*$(A(A!1,H7>,:5<3:+,E4:(7!E05-&5."8;HE#@;>66*"464F?2H>E,+FG+H%/-DD9F/A2H@H:$6-/"G$<($F;+'$G#D;)93BC2")4=4099%&2#(=#>&/E5"?!@'.'1D'H;(AG!C)2)031F!E&/)4*4E+730(#/#"6*"0(*9>552%/;<+"FA;&3D>,70-H*7H$BD/>=(DE3E1D5#8-#7)),:18(A. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11A18A28T12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r707 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4574 42 54M = 4372 -256 ACTGCCCAGGAGGCACGCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCA #(7G94(*,;*A#:+'&*2+26#>,">-9&HC"'"?=7*@@E4#C#4EH&&9"5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r708 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46261 42 78M = 46261 0 GTCAGTAAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAAC $!#(&%+%""!))'&!'"*!")$'+)"%(%*"(%'**")!'$(%+"(!(!'&$))*!'))%(!'&**!#!'*+'"++) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6C71 YT:Z:UP jpayne@0: r708 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46261 0 * = 46261 0 NGTNTANNAANNANAAAANCNTNACACCNTNNTNTNGNNGTCGNANNCNCNNNTNANNTGCCAAGNNNNGNANTCC ""#"!!#"#"!$""$"$"###!"$#!##!"!!$"$"""!"#$""!!!!!!#!""!""#"""!"#!!"$!"$"""#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r709 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40867 42 43M = 40641 -269 TGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCT *#'(*)'**'*(&&'+$(+"!&&$)%!*!'#*$"*%"%)+*+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r709 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40641 42 76M = 40867 269 GTCATAAGAAAACTAACCTTNGACATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACTCAGTACAGCAAATCC ""*%&+'*'(!$#$+'!'#!*('*'%*!($''%$'&&#"**###%"(+'(!$#!*(($%''*)#&)($(+&!#++$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5G1A12T2A36G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r710 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20640 42 63M = 20411 -292 GAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAG '0''3.#/.2'3=,3#?C(5!<@14-(-$9/9E24,.(*<1,+A?(4CAH&CC!D$@E/C";A AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58C1G0T0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r710 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20411 42 78M = 20640 292 ATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAA +!%(++'$'&%""+%')$$)&(!&"!#$#$'%"&''#')")*%(("'((+"$+%!#++++*%*#&'*!&%$'(&&%&% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r711 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13679 42 51M = 13760 242 TGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCG ,A),6;D@"!),!"CF=8>->C??6)A7GH4?+2B4B'8>6FF&-DH(=("62A7E7&G,@0.//D0A5BFHH+<&!FF=DA"=C5E0-%2AHG6H17%0/8)6!"9=@0$2A.A&#;=::'7;:.0FC788$-D%$6-2 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T41T1C28A83 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r712 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19963 42 76M = 20111 255 GNCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTTCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATC @B=@"*('F*:)48&-$CF5H0D$9EDF258C8";&8"&/,,(C+(<2H8->6+=5&%9C/-D./4E;D)#)#6#) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T37C36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r712 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20111 42 107M = 19963 -255 CGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGTGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCG &:;F>5867-EH+>D08>H11B19=6CG+=39&A20";%1/D8.,1"A7$9.B69!)C#+D>'&1:3FHA?-H@3EA&A"@H,6F9B$<&2#(=*,9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12893 42 147M = 13040 246 CGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCNGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGACCGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGNGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGG ;-7&.-63.>;!(B4@E4B>8?>=;$#1*13!;*.44$$=0'3HG19?,!4B=+7?C/:)/,-@F61BB.40*,+@83GE"<@BB*#/5+$+F@85*80$G:0997A6*895B0A:8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:42C23T25A29C24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13040 42 99M = 12893 -246 TGCCCGTGATGAAATTCAGACACNGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGAT =9=!>1$E=@/D1=.@A(7D,&1@4?0,994H;,)>F?9&G$:4#'?H!&&&4%-*EHC3&%%=F:-%!#101(.;-)7HE1C9;(-E9-D+6H@'8A? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A75 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37697 42 100M = 37797 228 CGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTNAATAAAGCACC H-F,B2"#3-)6@0G$4$D9G,,=0)1,917@2@$"+-$AAF/")'(EC%E!8D?B1"G6&(1%>C7**!=7:449D" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88A11 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37797 42 128M = 37697 -228 AACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATANATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGCAANTGTNT +$$*"(")$'*$)$#*!%((%&+"(%%$#$&"!!"&'**+!&*(*)+$(*)%!&"()+'$$*""$+%*&)$"!"%")"!)+)%"*!%%(")+#%*!)$#!""!!!*&+'&!))+)*!%#+$#&%("$( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:78A40T0T1A2G0T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28022 42 143M = 28284 339 CCNTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTNCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAA &%!'(+$+('+))'$%(&)'%%&&%'&$'&"!+(+(!!"*!!&%&!&*%*#*$)$$%+'%(#"%+%'&)"')&"'()+(!&'$#+%*'"+#")$("($!+&((!%#)!*!%&'))'$*(*#!%&$!%#)()'$')*"$+&"#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T89C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r715 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28284 42 77M = 28022 -339 CTGAGCCAACATGGTGATGATTCNGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTAC A"EC@+C@2,H%?-6&$=:@8=/0#B&,==6G/?*$F'<74'C)!%=2(8'8-D')1%6'F0?>>=%(@?D8+9H;B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r716 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17937 42 66M = 17665 -338 GGAAGGTTACCTGGANTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGN D!9""*'$E"!3B#B>!3D8&2AE'G;+G+G)E9972?GH?,+1A*:'A1?%<*;>@EC#4>&C.$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T49A0 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r716 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17665 42 17M1D37M6D211M = 17937 338 GAGNTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATATTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTNGGTCGGGCGAGCGATGATGC 5*H%;=A+11%0%<'G,E6#+FF:3/BH:!D,*2G6G=6%&/77#1>#5=+6?G=(*067(82.&-907-A8AC/)F;?,(7?/95=9?=9C8D2-F8%9EA1@9G9&:EA3>9HG..3A(*<-47!D#050@C*9EF'H.)5C$.$&=44>-56E!;!EF<:5>C97(-5F=H),-87=(H(>"*%,/H=5)A#F"0216-'111?.H&/B2@<05.;367()"3'*)F'>%1@#:$9**)G081F2,))$1EG$F,*)383,@+:./?';@%C-=:F$EH5:# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r718 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47952 42 142M = 48107 215 AACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGG 937=&.D/<5;1C,?>"@..!.H31?.!.*78A?13!-(.23)#8B;5=E//7+)F"4@/&=FG9-#7GE5-F"78B98&==/10-C@",G-3/#-4@.C@B/3,9*GC@=140AE!)D)C4>@E,@G'>#8A8,>.'B9/8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:142 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r718 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48107 42 60M = 47952 -215 GTTNATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGNCTCCGA #*>;$!5@-3):5B,""@G;-;C14=7!$9>50A<91=C"!2),5B$A+%*%8*ECE#C7".EF48B+2'A)H1&:F2*4"27C:13H3(=A:/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r719 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25301 42 233M = 25534 306 AGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTNTCATTGTNCTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTG 04+0/+.B:7HB592,A,@36;B01#0G*>)A?%+B*5EA>E/HC0;H2@2H.(=F/A2)9G+>A-(;"2H?G6;EH=%)'7AD5&:6.+,D1/3$AE#.B%!4GB%G'92A>5"2:=;:1='5,3D2-&A8HGE@5:$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:94T7A130 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47131 42 82M6D58M = 47016 -261 GGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGNGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTA 1H@&@/5#<-4B9@0:9:&,(D*"F$!?199GE4>E)"##:,%H'#:BD?5A?&.CB0F/!-6@B44A#4F#0D,32B$:.4:8<&);,AF'"HG-'A AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:63T18^CCTATC58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r720 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47016 42 82M = 47131 261 ACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAAT -!&$60(+06-/5,&2$$:E.'=C*4F:*-D3':>H0@F4-)0'8!95=E+>011A%!?'8(F-,?3!AF@G"=6.>;,+C< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r721 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20755 42 91M = 20944 267 CAACCAACAGCACGTCNGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTNAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGT D2030E%..!*D)E?F71C$DA6$1(#&(2?3:..231"'9"51<:+."8849H3E+C1F2*6,0>/=3()').AC AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T29T44 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r721 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20944 42 78M = 20755 -267 CAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGC $$#+*#($%"('+!"#)&*'(%*)'&)$(($&&%)")&+!%$%**#)+*$('*)'+"&%''#%+%'"#*!%)"*&++' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T0G0T0T0A0T0C71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r722 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45329 42 205M = 45534 268 AATGNNATGCACCATTTTCGCCTGGTTNATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGNTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAANGCGCTCCTCCATAT (*)(#"%)%"!+*!++%+)%!)!#(+&+#*($(')!(#%+##&'')!''#)#(%%#$&%&)+"&+!%!(##"!!$#!!#*&$&*%+++'$$'*#*#!#("+++$!""!()"+')!(&&!#"!%!!%)("&&%)*%''(("($$*&&#&))'$)($+(%$&)'"$)"*"&#'!"**''$)*'%#*%'(!("+)!$)'(&"$#'!'( AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:2C1A0T0G3G5A10C68C93G3T5G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r722 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45534 42 63M = 45329 -268 GCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGT B2##-?>(ABHFD2,/3DE@-'>C94$"(%-F:/0H>8/,-00=%&8D+.'3=D&G0?81?&; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r723 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33525 42 116M = 33729 255 TAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGGTAGTCATANCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATAGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTG +<18(2<)>1=BH*+4G3D%<@&4<$B?;3*>E797G'!1.F.02=30CG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r724 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20810 42 65M = 20883 217 ANTGGATGAAACGAANAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACC !!+#%!()*%##")+")&'!&!'!('!+"*+#*'%$''%"!$$''$#!'+#$+#%*+#%%'&'"" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A13C49 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r724 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20883 42 64M4D76M = 20810 -217 TCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCA !+*#**%"*'!!!$%'('""+!%!+!&#&%()++*(#*"!'")(*$#+!#*&*(&&'%"'*#"""('($(+*!$%"$$!'+*&+)%'*$$++#"$!$*!++!+&(($"+*)#%+!"##$#$+*"&$*%&*%&#*+##%+' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:64^TATC76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r725 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33441 42 235M = 33260 -416 CACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCANTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATCCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTNCNGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAN %?E!0+B6$F053F$GG8F;7C2.)$:32.1&GF/$84*-A,73(#1D7&(8<>&#D%B9H-GE&:%/*C*9/HG:$H&)4;"9<7=4')5%6?/9@!0%DD=,";*8CH#C9.3D99/5E7+5.E&8B>C,119!67$!%G5?@7*3:&AD1!E26D"!$HG'&+C77>?2C,D'939-0=%$77'5666:!#$C$.&A,FC01/#+/5% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:94C55T13T31C1T35A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r725 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33260 42 181M = 33441 416 AACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTNGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCATTCAAGTAAAGANTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGC <*)5>?,&9A?00<>26#-+*A)HE!)BF4&"B2%B7"%.?*??C0(>1'2*)5554"$+@500(@6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:76G66G12T24 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23143 42 150M = 23295 215 TAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAA (=#7D4@A0!E;>#FD<8FH#=(..C05A1&0*@81#8#)E3/HH:H=-$"$9!@D*5.F8A&-%#&$,$(D@)"#"553H+G'?C8H33>45A:C=.%2G(46+5:E"0(7%(H=0'=/)23?&*,6.)8-DG"B'H-E="9&;: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r726 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23295 42 63M = 23143 -215 TATTNTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCAT ,84/&@"%."(&0,D2#$88?E-.8+F1@$F;<4(.>B2F:96B:9>5#@+>7'#C@./@(9)8!)4B8>B0:89&4+#""1,#97978B)BDG( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C40T0 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r728 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46934 42 216M = 46853 -297 GGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAANAAACCCGATGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTGATGTTCATGGATATTNGTNANCCTTCN $(%))#!''*$)+&!$&'+##$%*&&'!*%"#(#*#)%***!%+)&*+*!$(&!(%"#)'('*%)*"#$*%!""(+*$&!!&!!#''$#"$(&&"!("$$!'*%!+(*&&($#"!$!%"#*&$&#++)*(%!)$"')$&*$&"$)&'%)'!')$))(*)%&#"())&'*"$*"*+&"(&#$&(&)"(+%('#$"*&(($+'%+#*'$#!&%*$))& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:90G5G2C88T15T2A1C2A2G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r728 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46853 42 81M = 46934 297 TTANTGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACGATGNCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGC &&%()++"*#&)**$#(#'$+%"%))#!*#")!)(#**+++$++'"!&'#*&%*$##&(%+'+'*'#('$(%#+)&+(%(+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A44T3T28 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r729 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15014 42 84M = 15276 332 CCCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGG )%+$)!$!((#"'+%*$#%("$+#''$#%*#)("))'*"")*&+*$*+&!%(*+'&#(*+!(!+%*#%!$)##'%))&&&(%*& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r729 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15276 42 70M = 15014 -332 TAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTT 5);G!=;"2'#C-/=).*3:B2G4*:/>%5<@10@#6@1E622-+';<"-$'2.?$72(*D?*6CGC!63 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r730 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4842 42 200M = 5072 275 GCTNCGCNNNNNTNATCGCCCGTGTTCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGNCTCCCGGCGGCTGGTCACGCAGANCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAA !(%%'')'"!(!!!&$+"&%#'$%&&!+!&*)''("($!*(()&!!*$&&&$%"%%"*!"!)!(**"))#!(#$$$&(%#"*)!!')&+&!$)$#"#*&+!"%)+#%+"*!!$#(*$*%&)%(&&!+'''")&!##%%&!$++%&)##"$"*!#!(!)!($'%++''$$#))+$*"&(!'$%+!!&(+$'!('!+"+!(" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0A2G3T0G0A0C0A1C11G73C9T13C11G64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r730 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5072 42 45M = 4842 -275 GTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGANGACGTCCGGGAG $+!'635.$DCHDF.:>0/DD+DC<0*4-+'&=3)1%"$-3%05G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T12 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45907 42 58M = 45709 -256 GCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATG DCDAB5*6"E=;660)=",'$/%4F1*>)(!.-6@H,>7*@>=539&.""(!!8./)C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48G0A3T0G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r731 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45709 42 87M = 45907 256 TGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAG >0")8(B8$97,7#F-!4->8+:$8"9GHE"=C*D(;6*)3-DED"E?!=748"0+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r732 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5520 42 92M = 5701 235 AGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCACAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCA C57.@+=<8E6/0(>39,(<%F31>?!#4;HG82?E5-2,@.!C<3$20&F2E$F=#'C@BD(-B;;/(/)&"$5=#90<0=;$20:%28 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26314 42 75M = 26182 -207 ATATTNATTGTTTTCTGGGTNGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCNATTCCG C5/2D;C?(&@?!)?:!E6(8E<+H$%(7.%><+"8=#+3.*<-A@EB:4D%"@D@>G!(1*,H<52>97?73#D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C14T47C6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26182 42 66M = 26314 207 NCNTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGANTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGA "*!'(+'&$)'*%!!*$+*!%+&)$$$&%!#**!!%'#!$$!%&%#'**!"&&)#"(%*(%&*()* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A1C31G31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9797 42 71M = 10040 283 CNGNCTGNTGAAACGNCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCA *$&#*%*+%!)%)!($($$"#$*"%#*#(!)')**%')!*%*$%#*&%*%$*!%&$!!%!"&+*+"(')"$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G0C0C3A7G55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r734 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10040 42 40M = 9797 -283 GTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAG %*A3G%4106491$*F5)B7.?-2#D'+03D'?DD,?>B?=6"G47:*.A>5C'!*FHE.%($)9H2D%1:F2F-/.3-3C3*94:B,51C57"H(&+/<'8.,A32:1<3*.9/B4B?(EDG'3E*3D8;30".)<,F3995'$)>3;?F+==A48:;5@>(H56-'5)?+8$&H8-69?#(.=@#%=A@52A!7$6&:'D+,*< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:40A45G35A25G29A66G55 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r736 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21073 40 95M = 20938 -230 GACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATNAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCN )C<;!8@G2!F,58E#1?&$=C??1F$>4,;8&=."-8%A()&5E8'5:;3A7G$@)E=2$F$+G1%)/B"D,#":2!7"G1*9)*?E;81C:784/+27EB=86?1+17H=4'*$C=@2DD<@;C=('098;$H&H->D-.D/$+B8*C AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:9^TATC24A9A25C61 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r737 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16739 42 44M = 16509 -274 CGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATNCGCAGGCCATTGCCCGTTAC .%-A"$5832#;E?/@E)9@7)3;/0H$5.H.0* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r737 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16509 42 63M = 16739 274 GTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTCTGGAACAGGCAGAC 6H-7)"")"(>)4%,%8E?;-55C2:@B11C>;<1(B09F+0H(*,">960(:>$!-;&?1%* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A6G7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r738 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6837 42 80M = 6667 -250 CTGGGCAAAGCGGTGTCCTATANGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACTTNGAACATGA ((')(*&+(!%"!#"!%%*!!*'"*#)+#'*+#%''%)&*(!'#'$)+#$((*(("#+$$)$#+#+)+*"&!"$("*#'% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:22A46G1G3A1C1G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6667 42 170M = 6837 250 NTGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGNACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCATCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGNCCGCGGTGAAAGAC $8HA="%(9#*B*6!%&7E*:)#+'8$!HE?>B;?8>33=;B#:,#&$5#0:B2F)0!%,A/,&;";'GF&>,.,%1&;5,>:!A,.0.16=4+?4//#65"@47(.HF7<%"C&**D&8)&H:/#$>;E21-()?=<50%2FA#%.2*<;29(G#HG>.*2=@1=+4G>:+4=:D8,9>8#/@F1"!8)-*6)9!%B*1(";4#@@0!(G@-<"CA3$%4-B/#F&*"!B,;(%7H! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69G93T31A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r739 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47428 42 55M = 47483 251 TTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCG %D=F74#4/%;4"$C)7?(A*;G?G)"#2@2%,!;%/@#'7C3@+DC,)&;HC)# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45247 42 95M = 45131 -211 TCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATNTAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCC ,65.840%6@?H4%A%1;51:'3;/)H6H,9"3#E,"6:">2?2;?(4:3<'A(>G-'.1:@!#GGF5;>.@)2=H%>-<,$D3:'*,"D-(H6C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r740 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45131 42 83M = 45247 211 GTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGANCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGT 8'<%#<8&4?:!E,+<<5,(HD)=E9"16A"$"B%?C.!A)#0E;)A,:2:DE9%B0!6'G#086$D#F%@6:*/+8F348<% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r741 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1683 42 58M = 1741 213 CANATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGA ;!!29@@E!!E$&5@4-2,@@3G23)-/*(>1! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r741 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1741 42 155M = 1683 -213 TGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTAC .FB2/>DEAA.BH-F+2-A13*4D6=6$10CC.C>=9"$=EH;>8,1+B7H2=;5+'4%?G%(+#G"8A?F>#A%>?<908;3("=05$G)(7)F/)08G0)C5><(7(%%-=5&%2FH6&0'(-BF.@9C//>>A7$!.2.!='5(#2G752FG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r742 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2607 42 66M = 2701 275 NCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCAC #+")('&!!!)")#**)%)&!")#'*!(+!%&('*)#"%*&*)!$+$#(+#"!'**#*!!)!"&*& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r742 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2701 42 181M = 2607 -275 GGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGN 0:HF7$G2%3+D';D8683?5>9*$;3$$$(BF"B&?=%E:3%"(D)<4)9?7%(F*"+C.9(A'-2.D%>7/!D+H<=8$@0)%ADE,6,'B7C60H0*A#<".#G?F%7#*1".D&.:-E7*)-%4475B4E29%/2E,#A5/2=BA&4@$=8<08=59.8-$;D/*1+B.?E=D#>*& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:180A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44919 42 106M = 44762 -263 TCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTNAAN +H.A&G@GG<.*4D"">**H*%B.@'*3B5ED6@6=D<1)57>'8*/)'=H35G5;6AG>>-4'97"-+-?;5(F<+2+A&DHABG)#6'2)@8!<3-3/.9??=" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102G2A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44762 42 100M = 44919 263 ACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGT -A1A&:1H5/=A!1/2HA$%/9G;(&0;080A7!#$2E7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r744 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29839 42 101M = 29940 196 AACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCG >A2#$>@?17&&"=3(*0H7;908.A20@23*GC6+!A/+**CA897"55C!(4((9A!/"5G?+46+F6D.EEGHB&76#;C!8G@03<#2(E?2*(,3A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G48 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r744 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29940 42 95M = 29839 -196 ATGCGTAGTGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCAACAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAG 1D-?!H,5-C26&G'0D*1B81A@<#93>?4$)>H,#2407>1"=".)E>')E<""45A288A"@$#.&3982<#F#4!>D139B/G4@4@%D,1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A62C24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r745 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32752 42 117M = 32488 -381 GAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGNGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGT =#F4!53278CG?F@';8:%5F$),B;*;C&7?755-88@D(#1;*@>#:;6;=8D53C'4(#:.8)046;?;880!:"5;,;2'8-$>-F%H?6@.$#"2#-DH=3F/HH#*6%8& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92T24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r745 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32488 42 86M = 32752 381 ATCNGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATC (&#%$+*(%%+*'('*+"&+"'+"&%$%'!"###(+#)$(%!!(#)#"*!#"$*$'#&)*'+!!")$"$*($%+&'%'!*%)%&*' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C82 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r746 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43583 42 70M = 43418 -235 TGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCC A$@=&553)D>?C5:6,?%-B=#$G$=C#'"'/HF2<)59*.H.-!EB:10.+/8,#B=6160<0>=2(4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r746 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43418 42 150M = 43583 235 ANTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATNAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCT /:D*5C+D5#&+@B&#'"@')HG&$B+A/CD<%4-1'$:*,,/$9,E$+)&//!)!7@!-@=('"=&<'3,31DB:HE-5//:%,$+>%<>1@HF)*B;?=DD6,0+G=42E%&G"*=&@=A;(.($>2.*D;3(E,DD>!6A9#+2/.3$%71=5351?DB#?-:8#=$-1G0%(<7#9=+42(E7*=B4-F22CC1<;,C1?2D5-*%(,:A147<80C,0C-"+8H;!.#>;0&5)@1#*D@#/8&03B%%%=%(0@H?1:-,A&7E30< AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:0T38T21^GC80 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r747 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34823 42 40M = 34652 -211 CGCANCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTTTGTGGTTACATNN !#!)&+%&!&!'&#&''&+))$+*!$$'(+#)%*)+!+"! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G21A11C0A0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r748 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25129 42 166M = 25304 228 TGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAANGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTANGCTCAAGAGGGTGCGTNCTGTCGTAGGTAANTAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTCTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGG (>:%/$6>E35!1,=:!1(:;#"+F8>E4D.+4'-7$B:+()4C0<62.!@+6/=:=971B84>FG69:%%2H6E871.,/9-*;2D!2*A/A57$2B1>3%81-!FG6/87@<0068B%>,$H8;4>'1F!&2*#)1//)95FE!/)((AF+?E?4+2@G?E;?AG# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r749 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20923 40 24M4D28M = 20775 -204 TGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGC 8<&?!C394>D>%0-$0(2E3C-B.1HD==-%4G/>/+";<)=!4'(7%*=: AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:24^TATC28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13820 42 49M = 13631 -238 TGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGNGCGCGGTGAG 7AH+#=&>>5-)*.%DEE''406:=*?4C(BF<%71$5/C5%D5!5=.-5DD4C-HA/(60D,<5+8--'4)-H!FD+4+%,E:H&%#/D@6))H"78/C4-0C:5B+-9"3(=&2FC3;D.B&#C"AB0%#A3!)4G*C5A)""6&:H:+/@?4#=3!@"!==3F-5$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r752 77 * 0 0 * * 0 0 GNGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTANGAAAAAATTGATGG 9.27<1?A>+1"!/C39=?#"&?@#C9%0:795(F19>#50H=2 YT:Z:UP jpayne@0: r752 141 * 0 0 * * 0 0 TGNGGGCTTGANCTTTAGCCAGAATTTNTTTGTCGTAATCGAGATTAAAGAACNAGCCACCGCATTTAAGCAGCCAGTGATCAACGTTTCCACGCTCTGATAAGCCATCAATCATCATTTGCTCATGGTTTCCACGTACAGCTCTGAACCAGGGAAATGTGATTNATTCCAGGCATTCAACGTTCTCTGCACCACGATCAACCAAATCGCCCACCGAGATAAGCAGGTCTTTTNTGTTGTCGAATCCAATCGTATCCAGTTTGTTCATCCGGTTCGTNTAGNATCCGTGCAGATCGCCAACTACCCAAATATTTCGGTATTTGCTG '#'**(""$("#+#!$#**&+$()%"("#%($'$(')&)#**"+""+'")($(%$%!#"$$&''&(!$)***(+!+''$!%!"*#$+#)$%!$%$)'$$!("+#'')'#%*!#&"#((&!$%"!*&+$'"#)()#"''"#$"&&)")("*(*'*&*''$!#!'"&&*$""'!%%%&("$("+&*'#""$#!"+*((((%+&!%!%!"$+%(*&(!"*$#(!#&+#'!!"'#)&+)('("(#")&&*+''#"&$)$&$&&%#+$%"#'$&"%))&)*('#*##!'#!&#("!&(*')'#&"&'#'$+!++*+++!&'&$#%#&)''( YT:Z:UP jpayne@0: r753 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39892 42 56M = 39892 0 GGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAAC 3,.,+20,FG*'D/=C.1(3""+%<8GFHB7<-$($C':;?G)1E$8@?"@'E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YT:Z:UP jpayne@0: r753 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39892 0 * = 39892 0 NNGNTNTNCTTCNCCAGTNCNNNGCNNNNNGCCCNNCGGTCACNCCGAACTGTNNNNAGANNTNNGTTANNGTANNTC ""##$$#$""!""#$"$"$!!!####"$!!"$##!!$$!$$!"!!$#""$!#$#""##$$#!$!#!#""$"$!$!!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r754 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41929 42 33M4I37M = 42091 278 CGACTTCGGGATGGAAGCTGCATGATGCGATGTTNTCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTNC =G+D3$F)659=*-'D34D837:4+1?G,D!0DEH/8-:'..)8<(<(;>0/+B10H8H);GG&C%0'@*:(#2 AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:11G56C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r754 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42091 42 116M = 41929 -278 TGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACC 7*#'0/#46#!'A>$E,67'?-G/&7%&'!%G#B4E"?<)=C70*&)#+0><"-'D&C;-"#>F;1:(95::B-!@CC,&FB%.7B',/8C;CFC@;=%G.2#F; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r755 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20464 42 43M = 20279 -228 GGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAAC 29=<396B$H;9="F*:(%1&34#<;(C=#//+/7FD>?%&?: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r755 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20279 42 56M = 20464 228 TGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCANCGCGGCCACGAAAG 45G-$G>9&D:('?H/15.-%AE/1;#'B"F0>F:-59250&64*1*!DF*B%,.- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r756 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26800 42 208M = 26690 -318 AAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATATGCTCGTAGGANTGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTATATTAAAATAACCGCAA *A7E5':,@!C;43*C5H:-/8)&;AD&G.=6A)F?C%4#G268!2#.544'G$9B;&A'(4"9(A">A/+):,!$7&:$'!-E=<*E600819C8A'9/;(*@D>=4A7.@7?9>(D."DA(EBG@://2G"'<12"7,>-H27:*@CEGDE?9?H9%9-C??"'2D+#2A'=1*D<.7F<,C6>&0+638%1>#8 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:98C11A79T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r756 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26690 42 110M = 26800 318 AGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTAC +/$H8>1B8B&4:36#=2;C"#933GHH,CEE-3$=102+!@E31'&:F5.6-'C<@!"1<;;#%3.B#(";9:#51G7#7+(+-9"+*%59E3'&A8D1G'$&$+F9;0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r757 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10039 42 114M = 10153 275 TGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCNCCTGAACAGACANAGGACGCCGGGCCCGNAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGNGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGC &*+*)("(+%+'+(!'+#!!)$)")()("+''!#*$$*!)*))#!+)+&&!%""*+&))%!%+*)*&$)*)+(%)*(!!)))''")*#))#*(!$#'!'&%))+#++''+&+&! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25C12G15C32T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r757 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10153 42 161M = 10039 -275 GCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCA 3)B+/6$')G'3%B4(5H7@'3F:H$/-G?9B+9"E+07*/>FH<2-@"49%*DE$(.*E3!34H@-11G($<99*;/?=9= AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:7^ATA40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r758 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29380 42 341M = 29721 391 ATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAA /(6A00BCFA(5>-*6&:H<>/*0"&G0A)2!1A00E+:4>7;:(5(3#<*#>=25/)/5/$!1%>-?#;6849*B8F7*/C?B!2(#$#+8D(6+56B4!.!:$7D!80C)B>F0:(F?#8G'/,4%,;F*E6:,2+>;(9E+/B3,G5,D8#(5$"8:-8,/9&D&H6'.HB-EB7!)$@5@>-26!817?6@,75' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:341 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r759 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11208 40 76M = 11360 233 GTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCNGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATCGCTCGTCAGTTCCATAAGG 0)6H::)9'B@G#B8$(G(!*7*?-/#?BH6G(E8$#).2#4?9A1?*)D;7C'0;;(D'G=%D')9!73C(=8&" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T33G5C11C1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r759 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11360 40 81M = 11208 -233 CGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATCNTNACGNTGGANNCNNNGGCATACAG $(%&#%"")!!#&#(&(%#*%%*+#((+))+'((*$&'()(("!!*+#%*+&*)!#!##*&"("%'!!)*!%($(("'''! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:54G0G0G0C3C4G0A1C0T0G4G4 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r760 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24524 42 80M = 24652 244 AAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTCTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTT '=5H$404(;-3AC@C/BD*$,&,1C6BDB&.!8&%:?#"9D+5B4:3"B"=@)G;/-.=>F!EH03BG-8'C$9H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r760 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24652 42 116M = 24524 -244 TTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGATTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAN H)$(G0$:,37"A+$=B'":;BG9DA4','8A='7:B3E>+8;E,/"(:A:!@05F0/H!D=-),?'88.>2='G,41BC!;3386H$9-CD/+$+9-BE-5%/,"8;H5+3&;G! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G69G0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r761 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18162 42 115M = 18021 -256 CACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGNCCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTC 9.;0$@9++40D--/E&2A=$?A(?>%,1C14G2**F9GC0=6H$?-:3@-9-$!FF=?06!@*503@=4!.)'0DGA2F-,'G,).GA4((G1F'#>:@=;A$%17>8(5?'C5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59A55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r761 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18021 42 77M = 18162 256 GGATAACGCCAGCAGACTGGAGGTGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTG +,6:@C3"2H5D&.GF40)11=.?A=-=1;**@/781)$=12D>61)+??-FB+C72;9&AE""*;+6@#!2C&52B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r762 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40206 42 49M = 40074 -181 CCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTA C=?DG10GE,91#6:*A0-/911*E-91#5@+:4BGA&7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r762 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40074 42 34M4D94M = 40206 181 CGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGA &&4#4E@;9A-D&1G27,958(6<>1-1&7$!E;)9*6$2$)/H+*1!0C!H=4@($*&E$):41?)8=689/:A'6,,@CB(:7?F;%43<'=B)2D-8>-*"7H+))(H3@-+7:::C2!>,G?9? AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:34^GTAA94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r763 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26925 42 223M = 27148 387 CTACTNCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTANTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGAT ?#!H79-8C>"6H2@C&B@%$?:@-;!&8?"!="F/0;7?"%-8&,+4!D0G2*1$+8CB8*1@&B%B211)2&0A)//D!C@D:&2?1))+;4B>:CA*=0A(B"B(G-:>EE#<$A;$C*+;31E,EB=!C%*)3B=HA!AE;@1AB>3):1@>47@F"+A-'F/-&F53#B%GE5#$( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G177T39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r763 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27148 42 164M = 26925 -387 AACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGNTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATNGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTNAT "$&E$1:7&$@$2"?D?#&>%1G3:9G-(!@,B5C4!&>,&)$6:#B!:'78<#3**>4B0@!GAF4C;<)A1@2(G':*C32#.64EA70)'DA+"!7F4&G-:/2*3&:$(>H(G"E#2=B31?%;+=**@*"=H@/2F!,/0A4/'H#+.:: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33T39C87C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r764 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9875 42 110M = 9726 -259 CGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCT .FC"F;)91C<24+!+D3A468%292,B"D"!>70)8D-E;D'<4(B4*,<'=&5+E'!)#:D'!F>G"?1E&B'(,�F0E+'8.486>>:!E379A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r764 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9726 42 43M = 9875 259 GAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTNACGCNTTCTGAAC 674D!>+>27/B*$%2+A$$C22';)#D,!1$5HA26./607: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C4T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r765 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2020 24 72M5I52M = 1869 -275 CGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGANATCCNTTCCGGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTC (H>5E>2;853F,%C!:/%%8F&#+9(&@6#$+0.;##9':HGH@;*"1:2?)6C1&0">(+@:3F-1,'H?@=$",B"&3H)2)"57FD''4<:,&&BGE##<;F$$F!!G0'#0B=4,"-3#:02G: AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:66T4C31G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r765 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1869 24 43M = 2020 275 NCGTNCGTTCCTGACCGTGTGGCTTANCTGACCGCCGGTATCG !$(("+&+%"$*#*'''#&&+")*#(&%##'()(('+(*!*)% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G2C0C21C16 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41317 42 139M = 41187 -269 GGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGAT DE!>B6'/4F:9=20!!//(C,,0DA.0G22@):--7/8/#6/14:(;28G6$=*&5@H;62A;3C=1!4;6G"@3/2.E<-?6E4G$$F1>74G&68/&C%<"DG@G>#:46A%2/11'?-@)AH31.F>#=9"7%C' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41187 42 74M = 41317 269 ATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCANGGAAGTTGTGAAGTTCNGGGATATNCCGCTCACC D'(#/:$EG:=.8&@4"6@;&".=!8*',8#'2HD&85$'&");42#;6@!"4A7(:).1,--@?5+-#/@4A* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39G16T7A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r767 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1386 42 48M = 1473 197 GCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCG 7,G&(@09H!>BD>776,+5E,)C!7<-=:=F#++9B<%,>"?$A"0/9A,)"0C4E<-/87>-2D;GBE3?EB+<253$GG50E2=(&0-F6C8A),A(BC$/9A#:)/;8,D87-9"A.1A!/$.B5*4118$CC6#7=F-8F+.1//E>?+&(?4-,?'4-;?$$.)!!?=6GA*@,<933732'G=8D$$DH06.;5H<0!'/<0A#.C!:F$2B.@>*2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r769 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20007 42 45M = 19814 -238 GTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCC ;E6.,"#%/91G=%3'(35D(%:EEG-9'?'G3A681$,2D")'@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r769 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19814 42 129M = 20007 238 CGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGNGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGC B,/22)FB:(:'.#)7)@B+!%,#@1B$F&C<=%!567"94=EH!"96C@.E9-=0(GA?8H!6B/7=3=-@6G829H=$(9GD6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30207 42 134M = 30108 -233 TAGCGCAATGTCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTNCTGGTTTCTTTCCCGTTTATCCAGNAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACGAATTTNTGGAAAAGGTCTGCGTCNAATCCCCANTCGN *!%'+*))($!*+#$''+$+#!)%($%""*))*#()"'&"#+&'*#"!%)!$!$&++(!'&&"&)('#)"%*%*'%)$(')*!&'*&"!%$*($%('"'#")($)""#&"&)$##++)"*"'$+"$'*'+%()! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:9A34G17C6C26C4C0A17A8G3T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r770 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30108 42 99M = 30207 233 ACGCTTACTCCCATCCTAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGT %+$)&#*)&!''#"#))+'*'+&""$!'$!&*('$(+!&'+**&+)""'%+***'%&#*(*&+&%*""&$%'$##'+!'*$''!$"*$(+"#(*(&%'! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G82 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r771 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21816 42 167M = 21816 0 TTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACNCCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCA /,3B:?3#1B;1E"8"/+2"H&>?)A?CG;@9"B7:!@/4BC#-9CGEF.8:,-?!@#6F%<:.BBDH03H56#D4--'@<)-AA9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r773 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13967 42 10M3D364M = 13841 -503 ACGAATGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCNGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAAAGTCGGCAACTTTGNCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATNCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGGGAGCCGGAGGCTATTTNCGTATGTCGCCGGAAGANTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCC ,,1(52&$4(%&1036$87;>%<,78==&3.:#H%8"?$4C/:-%)<=+FA,#,7.512E!930G5=@!E%!9>.C'7!("1C"+'54!+F1/,"++43?%.!&;E%&?;/5?6F=-(?*E@BH/*1,@==CE-@C00()$816(%D-?:"2!.20/=4%7?:((CD-F<'$E5008?07%/H.7$=$&CA;8'6-.;/-@$DH2*(,F2!)">47E$&(0D1*=:E;;G662?23C6?$/=0D>0(6948(3D0+>(>;?40%$=E=.-0!.3B(9?9:=@F08*@>6G;5=B$92E*@:."0:#0H=<9&+85642<7#GEA*E>DA)/'-@,H5 AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:11 MD:Z:4G5^TTA18G80C13G62T98T16C17C53 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r773 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13841 42 126M = 13967 503 NNCNGTNNAGTGNANTGGNNGGGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTG "#$"%*)!*))%%'%*'&!!(&&!+($%&&+&!$"'(#$%%#'+!+#"*'$+!*##&)##!)*'(%%%+*!"!#(%+%"+++"!#%'#!(+("%$*!"'!&*"!#*#$#"$%+&*(*'#+!)$&*( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A0G1A2G0C2C1A1C2A0G0C1C104 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r774 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16436 42 40M = 16228 -248 CAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCAC :)@4B#(2=)@(=&)&!=B+&FC&&>;#7,G$09>'+$$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r774 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16228 42 55M = 16436 248 ATNCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCT G*?A7,3(;D!G))@31'BG5.,9<=F1(@94;#BE,$--A$1,B3+/6=5A-!' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r775 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45753 42 52M = 45620 -185 TCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCT "3+-*?7@#"?$0B%@>2;6%3A#-&43;G:BH(1H-##!D'8)*=4B@C56(A&2::$0'F@BF2*E31)493 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r776 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5317 42 105M = 5210 -212 TAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCNCTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGA 1C'?.E4A)69,6/E#:>946-G96-<:"*)#A>!%<$8D@F86>;")==507#,"3D+>-<5AD4*E,>5,!$879#&<*%FB%&A*>C>?46/>!)?13"@8G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r777 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20805 42 142M = 20724 -223 GTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGTGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGT *%*?:#$4/2(15#%*9428#H11941-*C,3*(62)1=':1H@$1E6=(E2'3&3;>9=E4":%!3@1G5.";H%G,DA(DHC-D';H7>0:B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82G59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r777 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20724 42 44M = 20805 223 NCGAGAAAGGGGNTAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCAC %6AC:0)',0*C>5+3270$-)5+',EC13C;*D)?*@*(?#$A'B%296.G7!'7,%+8=)9<,02)22!%&D12BG@<%=3D>215'=7(927F/@$5<9@9C!*6';B&0&!@"6!%D7H@C$51>E*$=(CF5!'@C54*B0'A4C>/F=44862A-HDA.-9,.C:+8*B0ADB3:5?<@"A>)>B5DB- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56C5A49C18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r779 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34257 42 197M = 34126 -328 ACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTGGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAA .5B7(>D!B?8%/*2.,/FDG?!*)6?(!B1%3A;**>@2*7H,G<2.FB.()B%"(1%HD5<<1?5!"=?%-/(/;5913A51025.:9#B@,62D#8"6$+*B>);!E#3%4E*:=@69D+E%#69?>E=408",AG/!DH4$6G$=1-1!?/9@"%?@4H1.&H9==+@<,9:3%8.(F,&63=%"06F25($0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:113A14A68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r780 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11745 42 100M = 11428 -417 CAGAAGGCNTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGATGAACTGGACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGG G@("BH!7>!=6$@)A&D/;/:2./,4'E.46$?'!,(%7##H+74DB4+?"A%=7'3H,=4&E;D!E(5F1$?:G#@(*1A>6B-F+#:C$14$8@:%8'/128/@8",&/G=0H+D?A"7GG/GF<="3*2C2C(6.*D(8,1&8%?"HB?6?,2;BH*..?/3)CF/@7"B,F%;4A3>8)3>:;1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:301A15 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r781 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33414 42 105M = 33519 443 GATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGT /C!G7;-81,3C2#8H?B*4"A,6$%8*&>'F::5+$,00B8.!GE!6CEG:.F.&:;(6E931%6>!+'7'C.E;:(GG64!36 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r781 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33519 42 338M = 33414 -443 ATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTAT @:,@G::&9:12)G2D9=?!H?D'3(+<:0/390'$0-0>27>)':1.CH+(BE;"3!!359.3$@;(51;@4C#@37H<9A@:$3+9:%-)B+$4F:+EA?!,$.C5+&$&",=-E+/;!+/%-?@CC-G<+7G+14>!(A0(%'B;9(.D0$A1%'&(E$:?/?2,;$:?>G79""";"$%0!F5=:(&&%D/?995'E3:@6(BH30A:6GEDD%6"<7B;GC=C'*5/#,?HF,1%886>88$7G+2/D0><(..,<(C-;<>;81),"!5=9F.20<%04)@@<%1.(A5+0)?34B#C!6G)12#*D>GC> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72T265 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r782 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43474 42 53M = 43682 269 TATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTC 09.35>)*,@59@B(C&$&A26D:%"%)7&?E(?7(/8,!;E,8GE&*>;@3% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r782 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43682 42 61M = 43474 -269 TGATCATCAGTAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTG 2=@/"40=E*?#2D;9G;C#3F">)<*,;($-*C94HD%?GHE'@C%,.4)>@5@E.')6H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r783 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10750 42 107M = 10603 -254 GTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGNGGGNAGGTGAAGGACTNCTTCNGA +"!%(+(+$'!'+#$$#&)$)&!)'"+%+$$)!)$+)(%*+'#&$%""")'$#&+!(&(($)#(+*%)$%!)*#"!#(**&)"#&!#+$&&)!))+)'%!*$'$$#) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:82G3C12C4G1C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r783 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10603 42 147M = 10750 254 AGCAGATGGTCANAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGC =*)!>?"1%7@2;)1;+>E89F->@3%6H>C%FD.GG5<#3&H:--+H92,GE)G.G0*($AEG.A+%+7,C%?(C$;&@?>+C971?;+?"G>=50";D"#/A<&:G.%B,D.H9-F=AA;C',H.5!(F40:9G4C5C-55>233 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C2G134 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r784 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9498 42 237M = 9372 -363 ACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGTTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCNAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTT E:FAD5%4@-BA46@71!7.,*=7.0>2E"C$**83&1'51A6->4H1+)/,G?3"/*5&4;;:>'EG3A:$75'%:'2)+GHFC%<*@"4A-;@H@.=$.+<001C/6;)AC>56'02BH12*65G*%8"F4*B.C(B346F239:?0:GCH5>)>"?HA=76&9?1G2@&/5'9AD:5"./9?!6!C@#//G"E.9D)F4G9/=A>>EGC@90,' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C84A113 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r784 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9372 42 13M5D108M = 9498 363 ACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCTGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTG =<6:'D=<+)HA,)(,%H8$;"+HB;.%#-?!G<)E-$7)'=!G*#F=9BH?*/<4''-A":D=F(/*:G&68(.G0-3BE(=&<79G>9>=27*=8=%9)6"+3/5%.!4@$(3-;DCAC AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:13^CCAAT30A77 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9873 42 172M = 10045 236 ACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATNCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATG ;H(G53#B6F78389H6?&%#')3+E?"%!>%49H,/(G1C/*56)+5E#84-?H@1'?E5#"=<*!GCG,3=B:2AA>:=55/>E>,"G%D1D/*0+7E@6-;-*$7=-9H2C:%+,B10(F!B3#GGF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G112 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10045 42 64M = 9873 -236 AGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGC 1!8EE4G:6<:0%)1..;"<"EF9.E+91E,G7103<0'D!(4B5,B:&-6*9F?)(!0:30<( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r786 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 387 42 119M = 387 0 TTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTANTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTNCGCNGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCC /+5F0>E4-,G?$F3#&=9@&7(GG((.!?E407A3A2H0FB/-.B+'G&6%@*3((<=/&8+A1:>)1#+H==(0.'%(0B5(&&)1-"<#,0AHC3A#9#GE8?@C""?-,47+F#, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16G31T28G3A37 YT:Z:UP jpayne@0: r786 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 387 0 * = 387 0 NNNGNCAANNNNTNGNCNTNNNCGANNNNANGANNCNNATNATANGGAANAANNTNTNANNTNNNGNNCCNGNNNTTCGNCANGNGNNNAANGGT !!!!$"$"!!#$!!$!"$$!#"$$"!##!#$!"#$$!""##$$!!!#$!""$$""""$!!""#"!!"!$!$""#!#!$$#!!!$!""$!#$"#$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r787 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36081 42 221M = 15819 -20483 GCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACNAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCT >.(%<;70-63F9#20E4#:ED:1,7)#)'";:1'C+D&AA'E231?-CG,H'!,?A88/:(D!39+D9+?'>&F&+32'2#".H4C0="<%/(/C:!/,2*>:>30A1H5(>FG).B5/89303BCG=,5%.:44=6(D$D1!3>>9<5:$D$81"1"/9)>/F%AD/70<+%'B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157C63 YS:i:-27 YT:Z:DP jpayne@0: r787 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15819 42 78M1D8M = 36081 20483 NTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACANGAAACGTCAAG #BG>(68E)):85>:F(,6@62=4GB<1'8<>C45@= AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:0G73G3^T0C4G0G0A0 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r788 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31723 42 81M = 31831 189 TTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTT 9,D"F8C&*BG$?19!G<(6F':=E"02@+B;=C&34:C0:/10$6680.A%-7-3*(@899"G0:&E/CF<3;3+?;:/5C*'A8:CC#82*4>:.%4BH AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11C32C1G34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r789 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21708 24 44M = 21963 326 GAACCAGCACACAGGGTATTGCTTANTTATCGAAAACGGACAGT /.(=??#E,351!F=++'=&9?*23E.$F11.#=!FD:'88H/* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T18 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r789 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21963 24 71M = 21708 -326 GNCTTGNATAATGGCATTCAGAGAGANTGCACAACCACNGACCCNACAAAATNATATTCCGCNGTCCGNAA ((#+*&"&%($%$*+!(#!#+'(!()#$)"*#&*('&)$*&**""("*'$$)!%(&(&&!))!(!)))&%% AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:1G4C15A0T2G2A8G4A0T1A3T1T3A2T2T1G3G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1020 42 96M = 1116 265 TGGTTGCCGACGGATGGTGNTNCCGAGAACTTTATGAAAACCCACCTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGG +@;G>>(."H,/1="5(4%B)6#6/$EH2@1BC/H##/@@BC3B)4B.%H?63;&";BE1#!D)?'6/607"22AG)3=+)6@;2@D4.<+1H(&4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19A1G23G13T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1116 42 169M = 1020 -265 TATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCT -=!*#0GBC&*$9H0*4-3=:H)%H*G"301(-$=D@F+.+.!3BH<>8229#))/!.DA0"5>6);;AF&5#B!&F&A;,"A*)C2%C@%7F?$EGA=@!H))6(2/#'8#"04;*A3*;FG875 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T1A13 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r791 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2002 42 84M5I263M = 2349 403 GTCACCANGATGAATACACGNTTCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTNTCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAANACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGCCTACGGAANGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACNGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCG &%&#&$)!$#'*$&")&)%%)(!+'(!&($('&+"&)+'#"%!+(#$#'#$!)%%))*+&&)!"*#&+(+&*#%++#)"('&+'+$&)))$*#&(#*$''%&#")#)+$#"("*&$#+'('!#!$(+&')'*&&"%+**#%%)(!*)%#&#'"$+$"''*$"%(%('$!!)&$)((#+"')"""$!'$#)!+")*%(()!%#*)##*)!"(&&''*(+%$!&((!'*#+'#''(*+*""($$%$+&%&"%*)(&!'""$'((()('()**#&#""'!(&$*+&"++#''*"$&#$+"%*%+#!'+*("#'&%'"()'"!)&&#*'(%!&&)!'*"(!+("&'&'++&!%%)* AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:18 MD:Z:1C3G1C6C1G3C1G69A28G25A41T8A51C96 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r792 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43393 42 42M = 43531 261 ANGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAG '#D66,G!C9H(7>G"G+3.7:%(A?1-E8@H"#=5/@4988 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r792 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43531 42 123M = 43393 -261 ATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCT 89*CHB&3.%"E.'0*13C?!&)>G%$)=HB>B+H-=0A3+5?45E(,1&>"3D1107=C6;!D*9+<9"BH8#G.*'-3@)0786?C4E@/+84(6/>2B26?=1*,<0?80?".,E%:B@C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r793 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12509 42 306M4D54M2D55M = 12385 -545 GNAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCNTCACCCGTTCNGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCNGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGAATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGNTTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTNCCGGCTGATGCGCGGCTGCCGCCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAG ($*)*%$*"(('+$*&!(#"(!'&%*)(#'$($+$')"%*'*+"$$*((+*($"%!((#%*+"$+(&)'"(&&!"$'%'$%)+($+*)(*#)$)(()##"%'!)$#(###!&))#'&!*&*!+$")+*(%&+)'!'&!$%#$((%#&%+#$+(++"%*))(%$%"$#+%&)'#!(%%&$++)**)%+#)$$##'($*&$"!#*+')(++*+%$%!&!"*$(*'!""'(''&$$"(##!&!((!*#''*!+("&#$$*&!&$("#"!#%#%'!)%+$&'**%%#(*#&$"!'#%*+%$&+#(+"(#((#!&"!!)"#+#%++*$(!#%)$')&!&(!)%(%*%&!!%'(&'&%%")*#&+#")#&+&#*)"*&&+"!)#*!!"'#&&$)("$#*"%&"$!'*%$!))'*%)'%%'+ AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:16 MD:Z:1C68T10C25T71C28G71A5C19^CACG37A16^TA4A50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r793 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12385 42 124M = 12509 545 AGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGNCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCAC :*E#34@'A5AG0A>#!&H#-041)F,=!.+G;3,D-((;>34,$EB!72)).>?2#:"9.3$"GH,!>91A3!D+&'6$?=:1.A&2?4B@E8<8#-GD'=G;/)5.)>DEF)>&C@5D="623&C78@0";GA79+0<(E1(%G-05)G"AA';:G3FB1)&,:.&E'H=1:?$3(#B&E,4EA-A,(0/'*5170H)F#+-;D377*!A>+>5C:&08;BB'559,!AG;%4A26B,9*A#36=B!$/@45B1"'=D)82>:H>1H0$:#,:&D)$%@?%B68*(68899@EB.=H)A5=1G0#5,%:63'6$H**)H&A!C.>;1'<96)D3@F0+.7E,.H2FFG->E7 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:283^GC76A15 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r795 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47624 42 75M = 47699 348 AGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATT )'..9/B9'?<7C=7H2H/--0<36!C7.$2D-9)<+7EB.=0(@<72>"+/8D79=#)7;GC.:&$8"B5::1$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r795 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47699 42 273M = 47624 -348 TTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGCGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTNGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACT 7:.22.+0+366&>*==)HD#F$@$*84;F'(E-E=?;6.G39(4)#<61!,5/1647GAB4G@9>8((5A'%0""?49D:#G"/(?,FC.=#79&,+'4H'?""(1/;?G77)5&+?2*4%A$28E2B=2/3-74B(&CF$".B7E"G=C)(@5?(=G$1(C<<252?4, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r798 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38105 42 93M = 37970 -228 ATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGG 5<@H2>0F%0'03"4&H7>(23">4,$H(F:*'DH=-1=-H4B$'@/D/*9"=9-*C2%99.G/.D9CF@;1;+7,-7$?6""(@!A$>;4=/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T32 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r798 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37970 42 38M2I97M = 38105 228 TATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAG A/151F!*)G;,")?D4C-6F%9>03*;:3%H%%%/(!$.@7D'53:3G,D+3B(,G5D29,4=9E'!AC*<65*!,A51-&43*5)(@HC"H%GF%+D>D?5/*!G&57B&2238;10("6((%$D+./.!9@306 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:135 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r799 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42438 42 132M = 42570 342 NCACNAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGNGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAA +*"'#""&+%"+*!)&%%**%%**)+#)('(%!"#)!!!&'+$'*++#%'(&)*"*&!*$(($'*())!'%$+($%(*&+""#(!!&()"++!*&)!)*+%$#('%&!&*"&$"*#*&$&%+!(!'%($+!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A2C33G93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r799 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42570 42 210M = 42438 -342 AAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTNCCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACAT 5-!$G%(B>@)6(8)*.8G1C6=*4D92*A8-6-(H)(2=&C0.:G&>.57A6/C/7,FF8D+4$"3+-"G5G<##9(7%G;1GG0>-$G*);>@@H@H9-0")"+B;C@,HC*C#$E61<6>@=;&1A0!2F$@><9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:158A51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r800 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41528 42 57M = 41275 -310 AAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTC "%13#.13($D=<#&A0005GB:A@!&(:!&&D?H9952=-B@E;@DE+8GA>&@@* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r800 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41275 42 78M = 41528 310 TATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTANGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCT D(.9H69+2(E(A:&5FFC!$@02("16@#H4:$;98=C+;9,7G:#/1C"D17**466C!8*(44),>,09:F"#.A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r801 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19060 42 54M = 18920 -194 GGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATAC B633@1$-B=*-+=:A@1717#)(+9=7C6B4=<-:+D#'ABG5G+:C'%C>B= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r801 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18920 42 129M = 19060 194 CGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGNCGTTGCTGTCTTNGCCGCACTTGCGNTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGT FEB?/7F1&!7A=,A35C>A8:+A;3&+%*!0E+9:0)#H00#6BAA,B(1/&H>E>/>/"$>F-0A$3#-C2*6"HGH.5,D*99$C6A>A?D"6##H$8EFCF>!HFF3CHB,/CC1E/0&C$:BC2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64C12T12G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r802 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24156 42 87M = 23929 -314 GTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTNCNGTT %$$()(*$)&('!'"(%'"!#)('*)(++)'""(%!#&+$*%*&)')+)"*)+!*!#+&&+%$)""!(++##(!$*$&#+!#&#*'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81C1A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r802 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23929 42 43M = 24156 314 ATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGT H$1&CB%=FF:E0&4E##;1*<9D7;B;>H)&E40E9F?%(GF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r803 77 * 0 0 * * 0 0 TATCCAGAATCACGGCATCCGGCTACGCTGATCCCACCTCATTTTC $*#(+&*+'"($%(+$(#+!+'#*!!%+%)*%!')"'&+&#+"&($ YT:Z:UP jpayne@0: r803 141 * 0 0 * * 0 0 TGANCAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGNAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTNGATGAC @3$="644B./FA!GE/(>;47(8=*0@=/&@'8AE,10?')H=%BG"???(7B YT:Z:UP jpayne@0: r804 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46170 42 45M = 46215 292 ACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGT .!7+&1@)%'#"4$,;@A'3.49&4.C*5E6*5(*1*@78@(1>< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r804 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46215 42 247M = 46170 -292 GATGATGTTACCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGACGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAATGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATAACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTNATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTA 483,#)=,=*D?";=B4'12C'<<(A=!1-%=D6<0H:FFA0.H30A0'A+5G2*C4H5*"/)4$:#!&C1H;3.D:##))=32*.!-$&E,;+/%G$;AC%"B@BG4@8>/C%B;0$!*:670B.4",A309E3GD;>$AA23#1=H9B:;H:,:-"GE)9./'>H,<;+-F94=35'(57=1,64B??E*D*#4@G'2"17<$,59A AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9G12G56G43C31C39A51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42299 42 260M = 42559 300 GAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTNACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGAGCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGANGAATGCCGGGAATGGTTTCTNCNTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTA 'D//;3@88G0<*HF!38/@$>'@7/&G'>-@"%),%G!1D@9<9!7/*-/-G)!C:)*ECD0.'=250A$?*;;'9:5F+.!%2G#33?@/(*2D9+0:=$?>%9%C6/!#77=; AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:63C37T38A27T19A0C1C68 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42559 42 40M = 42299 -300 AAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGNNGCATNGANNAAACN +*'&(&"!%#+!$#'$&$!&))%+$$(%*'''#"!)"*'$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:24C0A3G0A2A0G4G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r806 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39883 42 229M = 39842 -270 CATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTCTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCC =,1,4*7%5%8-$?1@5&9>8(34C:F.21'#.!60?<1?H2D'&.317D,>,,%#<,H32>7:@9GE.C5*>BA?B8!4=&=:0*9/$3$#1;9H!%;(39?< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r807 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15400 42 76M = 15578 259 GTNGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGNTGTTGTGATTGGTCGCTGANGCAAAATGTTTTANGTGAAACCGCCTGCGG $%'#+$"%%!)&*%$#'#'"+$(+')#(%*)(+#)$+!"*(&)%!$)"!#)+'++$%(()'$#*'##'##"%&&() AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C0A22T3G15T13T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r807 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15578 42 81M = 15400 -259 GTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGG ?>"!3/7):(;#:B9%-B17:$*H4-A&B:/?12<(/@?CE.=% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26248 42 76M = 26406 223 AACAAGCGATCGAAAGTATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTG ;0%#FA80$335E!H/5G)C7/&:B-DD//341&-@4&AF%'2H6.#><#7#F;>/+;H4;F-?+BE55&,9.*A? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r808 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26406 42 65M = 26248 -223 TGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAANTCNGGA &&$*)"&()()$"&!!*+#")&#"%)"!!$"!("%+)**!*"%(&"$*)(+*&!+&*+*$(%*&( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58T0C1G3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r809 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39445 42 44M = 39445 0 AACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACT #C=G7,/-9.BHG$!;%?4@34D,C5'F?9"*-'C)2B+H?9@A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A3 YT:Z:UP jpayne@0: r809 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39445 0 * = 39445 0 TCNGAGGNGCNAANCNNNGNNAGCNNANNTNGNANTNGNTNANAA "$!"#"###!#"!###"#"!"$$$!!"!"""$"$!###!#!"!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r810 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12381 42 62M = 12468 267 GAGCNNNAAANGNNNTGGTCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAA (&%(!!"'#"!$$!"*&"+)$(*+#"$%+"'#"&'"'""+)"(+((+(&%!+(+$)%(%!!* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4A0G0A3A1A0C0C3G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r810 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12468 42 180M = 12381 -267 AGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCNACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGG '53"7#'C@E3(6F2BECA$3(3!'*8@#1%",95&71***8"@0F!360&8<22/6/:>(%;<#2%="/:2A7FE=B0E3+$BB%H;#48CF1FD@(>,(=+:B3/&'-&*G*49E03AA3>?E1A;2>"F8%,#B6H-&+("=17:#('1H&B&,$%;.1G,9(*"14 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r811 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20541 42 106M = 20728 239 GCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGG $B1F;!>)C.+-&(8@2?@;?7%?)92=27&$*%?:F(2A43(1>?D;B#@(D5/'H1B!?=0A'@5!%.38BC9/H?","2H336#7203;'1;=(51?2'A?6+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20116 42 48M = 19864 -300 GCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAAGAAGCGTCCTCCG :>-F,7=1D79/2B,4H90%?:!7>&@(AF#7*::9%$1;!/9;;4@:1#8*-=;"BA7B&$CDH'G3G2G-;D*2%G&66/1E:@#G3+=C:BD.>737".<&.-@>-"2*D-88$'3F1#C=D09-=@$92(A/'HB(2HGD+:.??0>6)A4"6+"E*D!B3,.@*:)3>"0& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:235C16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r813 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46264 42 59M = 46084 -239 AGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTN ,.9??F.%!9:=?&FH9;;"?.?&",H0>,?G!12?;AA+>D45F5.-*13G-=34!:! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r813 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46084 42 113M = 46264 239 NTGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATNCAAAATAGACGAAAGAGTTAGCTGATGCTAAAGNT !D'G"+A&#E+DH;A*%1<C(D6=+-2.(@!,.%6;BH01A:7-(>>$C!30;C?8D/:9;+F)/59E2#:1!7@$DE,B4,*E=G/ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A76G7C5G19C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r814 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21151 40 88M = 21151 0 ACTGATTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGNCGGTGAGAATAGCCCNNTT +!')&(**)*&)&##'')$#%!%+!'+#+$("+#(!+$''&*)')*''&*!($)(++$*"'(!'"%"+##&+'$+!'+#"$)!("!(' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5C62C10T0C0G0G1C0T2 YT:Z:UP jpayne@0: r814 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21151 0 * = 21151 0 ANTGNTNNNNNNNNGACACTCNNNNNNNNCAGNNNNGGNNNCNCATCGGNTTNAGCNNCGNNNNCCNNCCGAACTGANNNCANNTGCANGGAGTNCNCNGGNGNNNNNTAGANNANCNCNTATNNCGCTATANCNAACNGCCNGAANNACTGC ""$!!""$"$"!$"!#!##$$$!!$""""$"$!"!$#!"#!"#"#$$""!!"!#!$""!"#"##$#!$$""##!$"#"!#$$$#!"#$!##!!#"$!"#$$!$""##$$##"!"#"!$$#$##"!#$$!""#!!!!!!!$$!!#"!"!#"#$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r815 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46912 42 195M = 47107 249 CCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCNAACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGANGTTATGACTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGG /"9(<:=(/C4>!&58F+#)>?:A0EA.=D51232%+AE&61::4A6G(D*-<+26C/*:&88-4F2=//F.!(:"/:%A<0&?+$!:=AB<;GD;C*%2/((''D';<2!<:E9,3!01(4.H)$@6C/'?!+9=!C'*5/2?20'0.!$++$1)F(<& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52A0C67C7T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r815 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47107 42 54M = 46912 -249 TATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTG $F+,$1!=CHHB*@"!,H)4DAD=!<#930)(!>?6352$D03'<".8DE(8+DB0%2<@1=?D4-8$2?#.> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:85C13G26T8 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r816 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6183 42 40M1I27M = 6005 -245 TTTAAGTTTGATNCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAG 2!1FF,<"#>325051"A?7;.?C-'?%8"-06:/$A&>;&+E3;H(D&1970##!-3DA;?(:1%,>G?%$CG28GD142EF;9+)=5+9$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T30C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r818 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33042 42 115M = 32940 -217 CGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGNTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGGTGTGAAAATATAGCCCGCGGANNG ((''+(!&#!()*'*'#!%"&$*%"#!*$!!)""%)+!&)+#)&(%'$)&$#!+(""#*'#*'+$')+%'%%%&+#)'+$#"'!)&"'##'+%')+'+)('*$*'"$"%+!''#$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:30C59C11C7A1A0T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r818 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32940 42 69M = 33042 217 CTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCC DD>GG9H-G-3=/'B8+:;5("-;%(!?A?=2<(+FF)-(?-;1;&&%H&@5BF?:C=(4=D#'1:!-E-%?C=D'E0+@>@C?E6A((*<7$,DG-&E>;$6H.1)7)/A1;D;!@@#%&0'02CB>A/3;%1<(;B)A>':BC2$7&0))>3E*14@8)C).(5#A/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:129 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40082 42 26M4D66M = 39875 -303 TGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCNGATNAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGT C.9((A$B7@%8"*+E*&9C7)#,4(?%@>"0&<9-<=&7F!D)5!&":&(/+65(=12CB84:DC*1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41624 42 201M = 41440 -385 GAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGNGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCA D?!&4C)2$""+62GG?">(72:3<@0-@4BC>&4$+,63>=H9#9#=<%?!'#6+;C!2B56DHH!)7H1B/?9#;18%E-6F3&6%("+:.@6(1@5.4:/7$42(+;*!%><21=&84 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:122T78 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r821 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41440 42 184M = 41624 385 CACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATNGGCANCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGGATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCNAATACCG F:538G3D(819?3;?.9?H56+4G?*0)#3>50.-+/)%9;<+CDHA8F,<8.=1!:4/.94*;(.7(!=>9FC%%CAG/C:2B+>3E14&2%/FG:9B=C48=*9'(6F7A!H#*/7B'@3G@3&&($H((:,?#6843!C3D$-'@-+F:-51G8$(<)E$D59&8;F&+H=?BC703 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:51T4T89C29A7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r822 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42665 42 88M = 42408 -345 TTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAANCGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGGTC @6<+)60B9@.-2,A!1.*69+72C18!C4H(8&#,0C/6E1#,4$%% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A52C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r822 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42408 42 62M = 42665 345 GCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGA ?6C7/6/B=H1",>D?."8!&=@,E=2%>!?.05C/"3821/B&>78).?E7>/C3("F.G1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r823 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5105 42 65M = 5105 0 GACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTC =G?515?%#83$<:%=#?+CBB<>H<5!F:G>"@F&13H@G'5&*#DH>8!A65 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YT:Z:UP jpayne@0: r823 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5105 0 * = 5105 0 CTCCTNNNNCNNTCNCTCTCCNNANAGACGGGATTTNCGTGCAT %()#(""!!&(#($&)#%%*#*'*+$&"%''$$'%'&*)+&$%' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r824 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45729 40 44M = 45858 270 GCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCATGACGCTG <,#&<$@<8*1>'"D51<;>$DA!C*/E1;4C)!F!*2.-3D*9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G7 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r824 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45858 40 26M2I68M4D43M = 45729 -270 TATCTGGGCTTCNCTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTG 2.8;98<36&6@0$28;.$/$8%(.-3,G?3HF$"/#E,HC=5%)($3&4H<>$?:.>3'H!#+1?=0D29%&0&A/H'$'?C,<')%C:5#-5##*:EC)%9>":A6<.* AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:12A81^AGAG43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r825 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 299 42 129M = 94 -334 AATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTGGAAGAACTGCGNCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGNAN ))(&($+)%)!$%'(+)"&$!")*%%%!*()$&()!('+#&)(+"$#(&+)!&)"%+$%&&!&"#)%*(%!!'!+'')+!$&&))($)&&%))(#!*%!+)*'"*&'"))#&*'(+!&)'*'%#+!+$& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:89T11G2G21C0C0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r825 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 94 42 55M = 299 334 AAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGC ">0@<5E7-*54D+%B&0+>9;,&26#< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r826 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40120 42 139M = 40274 272 NTGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGANCGCAGAAATNAAAGCTAAGTT !H(90,:$BHD>+*>&7$>3(8B>-?>AEC+85&G7HH;GFF=#(F)0AA-6?%H$=7(AFE6*0G>3'#7/>"0;!97,2,D/F&AC%1-A*11+G"6#'68D+:6%8>72,",C0":(?2C#,05)$%/$(1-"*0. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A116T9C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r826 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40274 42 118M = 40120 -272 AAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGG +#*&+')$#+*')($%(%'%(*"*"*!$"$("""!'*(!)%"*")%%!#(&$"$%"*'*!)+($%$&*)#%)*("!#(*%"!!")"!%#%!(%""&$)!"*)+%$)(%(*%*(!$'+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r827 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1321 42 63M = 1121 -263 CGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATANCGC *'&%"++)+!!&&#&*!+"!*'#(")#)+++'+%''!(!)"#('"&!&(&)&$(%(+&!"!'* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58T0G0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r827 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1121 42 42M = 1321 263 CAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCAC C1*0F:A3BC<)"A?0A-!D"-?3.=F0$F$&!;**EE6HD% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r828 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36282 42 121M = 36213 -190 TTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTAAGAGAT &0%2-7>E-=62F<*<,.E?B9G;G!;).144*<)<@&@;$8>7?4G;-7"G;4::>%@>()#;(H96:#9HCC<6A)@D91!4G:=#8<$#&B$/G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r828 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36213 42 69M = 36282 190 TAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCC +D9.:/G85;<>-=!':4,5*'8<'(*("..'<1%3B%0C:-4F56D..%>56#2#918B45; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42398 42 47M = 42546 201 GATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAG ',(;<=3:C'<0-*!.9)/E4)%BB=+%(EH8A;6&.4>1"3$559& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42546 42 53M = 42398 -201 GAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACG )!""&''+$"&+'#&#(!+'+$)%!!')*"%*&%*#&#*!*!%+!($#&!'+$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r830 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9156 42 54M = 8945 -265 ACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCG !<:$.9*0G48>8?%?#)43,A-2G%+26%7&E7,-7;3-@F19#@46+!()DF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r830 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8945 42 75M = 9156 265 TGAGGACNCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGG )E!-:@%"H3;-H=":#8+79?!E;@,5;)(/>)/$9"@8:<4FG0097B5G$5#:/1).A(&!E*;)&B2G-+1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r831 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 936 42 100M = 774 -262 AAGTCTGCCNGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATANGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATN @/,;20+1!,5:,0C@G!&920@92BD@)H<5/;74;(F%H2B7:?F2!:-+=A92D::;C,68'7F=.87F=33!H/$-@:$:CE@<.D2HG,4G4E@" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C54A34G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r831 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 774 42 47M2I73M = 936 262 GNNTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGANGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATG ""!%E1)&9>+DFD)9"199E)#-));?749A5<2%8G7+=HB%D"F?-+B46D,)A?4;D9<.3?&86=5>'./$3%=84H=#+DC;4#A<.6'::.>)0*'*C274;8%?CA*(58%4#* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0C0T0G38T78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r832 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21390 42 74M = 21464 217 AGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCC *G;5)B00*%>$;:6E,'B)8D!.:5<-&B=$8.H%*7-D@)%-;$@(9DED9H"$99@(&61/'!8; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r832 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21464 42 143M = 21390 -217 GGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGCNC $!#'&&*'$*)*$&'##'$")*!#+"%(&$)(#$#%''*+$"*+(%$"&)'(#*!&%%!%!#*!)'*(+%$!)(+#"$!+%'&%+&'"!&*&+!$+**"%"(!+%+&('+)*#*'$(!")!%+'!&!%"%)#'!)"('+)##) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A139G0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r833 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1469 42 47M = 1516 273 CAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCA /?A&8?=?-;+"3.:2975=;*.*EB9(?E7%-9'9B:34'91:."D%6.:HA+4,A!!%D?9*%2"E,*>#F;$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r834 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2799 42 48M = 2618 -229 TGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCC "257/#D.G:>0D9(D0<(C8/#HD5$=GC#2,FE"A9?F5=!#B'404(7;$7@B5G"'(2,'683#3%?)C,"5:EF:?7,F$'F37CC/-8E.%8+&-.4D3885%+E)$% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G14C62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r836 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45047 42 67M = 44867 -247 AACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGNACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGC A5&5"C<,,AE47#E=(9*C/47>G)19>2*"E4F$@($.F'*HF;4H0?48?1,58!$.-G!?*>, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r836 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44867 42 146M = 45047 247 ATTAAGCGAATACCNGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTNTCTGTTCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATG )+!)!%($%+&!*'!&#'+*"+#*%(*"("#*+$$#+")"%#&'!'*"#$+#"+!!'&%&&")##"&*$$)&)%''+#*!%#)%%%$+'"((''$+(&#($((&&!"!+(#!&)#!+*$)$('+"(#%("*!&$)%$'(&"((&$# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G81G5C43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r837 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11624 42 98M = 11471 -251 AAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCNGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAATAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCAC .5$#8&1E04A&">C$9).'7A;3"G@%8F-2D-G;3=B8C9;D)A02$C%5>AC9F=?#@FB93@G*F="#%&2;$=A1(060/#H2/.?3B"2@0. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C26C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r837 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11471 42 65M = 11624 251 TGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGT '5"*$C<#;84G/=G*C?77&F&1C=!G5%HE&=%4;%*A$9C-B,4"89D2+1*@;D3-7170= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r838 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42304 42 64M = 42304 0 CGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTG B8)H8F2?&+2H:-'FH>&56.,@D.:;C!':-*3/%1#:449?&6&(H&52D5;BC8$F/"H0+*#A2@(;0%72AA7GD),)@C)):,2:=*>@540053G-%39&.)%?'E-H(8@DH?!&254B!>8/&G-)G"G5C5HG$@#*EB+%-$8H3:&"H'B3/);2AB*.5D!'0=.;8D8H=(C%0E5DB8?$B!853 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48237 42 84M = 48342 201 CAATCATTTGGTTAGGANAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGNTTGCCCCGTATTC (>*$F)?;)1//6--/!%8B7$6631D5:@E4H#1(<%F!+#$7+A60EH*?+82!&1;-529.1?H-E*0#/?CE.E:2<-1= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A52G13 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48342 42 96M = 48237 -201 CTGAAGTTGTTTTTNCGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGANGTGGTTTGATGGCNNNCACGNAAG *++""$'(#%+(!)'*(#'!)&!'*%##"!&!($&#"+!'%*'()$#%$'")"&!())#$%&*%+"+%#$(&&''#')"+)*"%+$!!%*&#$(") AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:14A56C13C0T0C4C1C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r841 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40203 42 146M = 40067 -282 AGACCTCTAAAACGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCC HD00'9&H*$A6GC"&,.8#B<3,3&D54/)=2%F=(38C(="4"'4(%F8')D-2".&/7D=*,8%'0?%5626H6?((D> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T134 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r841 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40067 42 41M4D40M = 40203 282 GAACATGCGGGCCAATGCNCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAAC 9E5F;!*C,(=?E-:/.8CB;&#HE>G3$8/-4D9>#!HHGF7-%!A3E;-19/2>8G?659=3)5%?1'%">%F#+9,G7 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:18G22^GTAA40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29929 42 146M = 29670 -405 NCGTAGTAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATAAACTGCCGCAGAAACTCTTNCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGGAACTGGTTTCCNTC "&%*"$!%)'#!++)(!&!('*('#"**!*$#!!+$'*$()#'(%&(%'$$!&++*+&*"!)#*!"***+%)("(+$$$&'"#&#((+(%!)"$#'#('(%%&'&'!"'$*))!(#+'")#$##$)(''&%!*&"(+(!#+&()&% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C4A47T19C57A11G2 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r842 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29670 42 58M3D198M = 29929 405 NACNCTNTGTCNTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAGGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCTTCTGACACTACAGACTCAGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAGGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCNAATTCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACC !$&"#%+)%#(#)$(+(()!$+!"&&(*+)!(&!'&*)'*&&'%)!&*+%$"#))"(('("+$(&"(!++!(!%")*!&&('()%$$##)(%'#")"'&!'(#(!)*'+"#$)*#)#(#+(+#(%+'$&*%&"$"$#*%)#()%%%(%+)!$!$%!#)&'#$''+"")$!$&#"$#+&)+)")!&!!'&'!$)("$*&'+)!*('"&"!(&)%%%**&*"%%'*!(%)(#"'**&%)%)$!)%%+#$)&#"*'$)( AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:16 MD:Z:0C1A0T0G1A4G34A11^ATA31A17T41A41G3G22G37 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r843 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15785 40 50M = 36063 20369 NGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGAC 'D8(@1E,%>*F;563-#;>%7?/6$%+=AFD@=--/2(>3:/.CG2(8, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T49 YS:i:-19 YT:Z:DP jpayne@0: r843 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36063 40 91M = 15785 -20369 GTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGGTTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTG *+8G2&#?68#!*1'7::C0&'E+1#8%DA0=43 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C0C2T0T0A23A60 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r844 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22301 42 225M = 22229 -297 ACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTNCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGATAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGNTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGNACCTGATA F:*6%)%%A(7!%.'EAB4(4C#2-5C/!A%B+"%E92<'><*!76<-C&--H(=+0)#>5>A6>A#C"F+8EF0BE>!)"2/-7"?@#@(8(*%6%,E;!$?E)+1=@#@B%).%,>7(F*4D*;>$%?)B7D-9H*D94.#*:0GA*,+3EC.8.044(,BA**+;;F1#D=#89#5?$48;1#4GBH$G:'>*:&".##=;.(417A0"&"/%+@!$?@&-> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:42T43G98G30C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r844 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22229 42 56M = 22301 297 NTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGG #;H4-2#!63;>H*%;A,(DH%.:'?=+>DE=(./@EE420)*0=")#H:F">A8, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T55 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r845 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39453 40 42M1I14M = 39180 -329 GAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACACGC ((*0<)2#)A+="25#!'4=(26#B3@:&#GF8!+=6G2:1)1%!C.33BAA!: AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:32A6A0A12A2 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r845 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39180 40 273M = 39453 329 CTCCTATGANCNGCNCGNNANNGNNTNTTCTGTNGNGAAACCGGATGCTGCAATTCAGNGCGGCAGAAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGNGTGGNTGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACTGCGACATGTGTGGGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCNNTAACGTGCT '&%#'%&&$$""($!%$)!&#"*$"*"')*(*##((&+!%'&*)%!+'%"%$'"!#$'(!$#(*'))&%*#)"%($'$)%&)"%&!#"!)+!%#+#!(&)%*!!(!++#!))+%*%!+$&)!*#%"%$(&$*$&%&'")"##$!&!*$$$%*'+"*("$('#%""&#$$''))&%#%&))*&'+'!*+''+!#%$*$"$(#+&!*!%"(*$#*+#*!"&'(""*$'+)$$"+$**)((&$+*(%%*&+&!!#'%%+%#!"#!###()#*'#)& AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:24 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:24 MD:Z:0A4C3C1A2C0A1A0A1A0C1A0C0C0T6G1T22A7C34A4A104C12T37G0G9 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r846 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13037 40 71M = 12827 -281 GGGTGCCCGTGATGAAACTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGCN C2?*%!#)57-);/'4'40/4+>;1:6!&4;(H<22"7#23<35;+:7=BDA8FA5"+D!B6<@/';:/$$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T51A0C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r846 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12827 40 46M2D21M = 13037 281 AACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTANGTCGG 0B;F3/B*F>#F("*"*,"?GH)82CE%57+G>6 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:46^TA15T5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r847 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13124 42 54M = 13326 248 AAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTNTAAGAAAGGTGCGCTTTGGT ,G6G<:1?@$='%E5>@1&(+"=0A@6&,B>8G<%1B%/:8(>E(F62)?+)59 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r847 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13326 42 46M = 13124 -248 CTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTN *((*'*"+(!%'%)!!*%$%%!%)"''("!'+)"(&#'+'!**#+! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r848 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42440 42 138M = 42440 0 ACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGANTGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAATGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGA ?@$:?!6)+C7!1!;(E>>F1AG;;F89:%16*48H$D@';:6.9&B%-863.)?)'/=(E-:@.EC30;;!2#->(2=5.A84::6%?)!%9.,%8C7..'D#00:"4$#.=9C?=+A+5C1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A69C28 YT:Z:UP jpayne@0: r848 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42440 0 * = 42440 0 ATANNNTNNATGNGNNTNAANNGCANNTNTNGNNNNATNNCGNNGNCGGANNANNNNGNGCNNNNANTNA #"$#"$"#""##"$"!$###"$!"#"!$#$$#$!"!$!$!$!###!#$"#"$!!$!!$#"!!"!"$"$!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r849 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6773 42 54M = 6971 266 CGTCAANGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGC E5=G2)EA>>9?AF;<5')?.>',&9";9%=#>/B93A(=@H<::#@=;&27A= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G44A2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r849 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6971 42 68M = 6773 -266 ACGCGGTCTGCGCGCCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTNACGCCTCTG +&&"&)"&!))!'$$*)#++'"")%!&)"&+$&*!"("!#$"$")'!#+&&#"!($%!!$!%)"!)(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A44A9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r850 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29367 42 111M = 29265 -213 ATTGGGTNTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATANTAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATG ;"56=>6(H413D8&%=7@B()6E4&<<*.G&.;B+C+&(1H02F0F8?+(C4+-!5%:(8G0AG'?F7/*#>$:$2'H,!6)F3GB)7/*2E/E!HDB>(C!"BB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T59A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r850 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29265 42 73M = 29367 213 TCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAAT F4D@&"#6D$)5D3C8"9$=)9@,747<2$?9-12=D&4G?@G*(<'9,@+!!++&*4=?86F">A99H-F3H@#4$F2:+=B0H(>6A0"2B!&+1<>EB*D3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5T14C3G23C12 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29497 42 40M = 29239 -298 CTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGANTCTNCN %*!($*&%($&$!'"+&!%+$%$'()#$!)%*+#"(&"!( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C3A0T0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29239 42 77M = 29497 298 CTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGT H@6;!<,9+(G(<55&!@&$#(1HFH7?.%H;+D(-/?F5#/&@A7CHFGE"+F72D>?,B*B;@;-*F7!F>2*&4EF!>D41)%837)%-%E1(A398" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A43A9C4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r853 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35110 42 167M = 35277 236 CTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTNCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCT H,=?F.8(3"+-0;E1.H'<$(*1.&;2F*F;0D?>G)@F28+/EDEH"2>#E/?"!EFE:C!@89+"0@51"@'&16C$!")97080B4=1B48!*,>%B(-%DE/@#7/#%8)'-52.A25.7C7/;;3G9"B502?7#3#9!<4D##%+">"6G<1!2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C5G122 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46977 42 192M = 46872 -297 CGCGTACACGTATTGCATTATACCAACGCCCCGGTNCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCA )8$8*.F3B893"'"73*E="G)?0+%,<9>-E9./6+#'$G1#$8&B*&F-)*0A0)@C:/3HC"**!+HE@@GA,..4E+FH)&@&49/F8,<457#B4H+80H)A6C3E9H;<3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G13G156 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r854 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46872 42 105M = 46977 297 ATNNATCNTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAG )"%")#)+!*!"&)!)+!#&+&!%!++$)+$#('"$"*$!""+%''()!#&!$+#(+"$(!*&!)"!+#$)+'*****&!&$&&'$!(&&#*+'"$(&!%++(&) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G0A3G97 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r855 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44558 42 180M = 44498 -240 TATTGAANAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCAGTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGACTCAGNTNG )%++(*""%"+()++*#+**&(")%(%%%%&#"$'+*&#"!*!!(+&!(%)##'%&+"%$$!%"&&(&!'&*+)+)##)"&$""$#"*"!"!'%&+$*+'(%''''"$)%#'#&"*"+#"&+!$'!("##*'")!!(!'""#$"*#()#!&"#!"&*&%(%)!#$#+*#''##(*$$"#) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7T99C63A0A3T1C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r855 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44498 42 60M = 44558 240 GTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGCTGGCAACATNTTAACGGCATGATATTGACT +#+*'(&*%+'!!)#(*!"!&)+!%*+')&#)$&!**&**!+(!$"*'*$%&&($$*'+$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A9A20 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r856 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14713 42 87M = 14894 251 CGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATNGCAGCGNCGCACACACTCCCTCTG 7A!3C0?'2@':F',7"%#:'3;9:C1*?CCD$9:D-C3A/1"*,>.!EF(#7;C?/H,$127*E89A8+0"+D7(B5)FH9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G6A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r856 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14894 42 70M = 14713 -251 TCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGAT ,G7G$)FG1A9-G:CA+AC//%&@;,;&*16B#--?1=3@@,(6;?,7$1?@6?'60C@?:#=.%B5F,B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r857 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41263 42 148M = 41411 442 TTTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAANTATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTC !E,#6/E6HFG-F%$F$!B)%/($2-H9F<&+C5@)#@E1GA7B6>4'=,/'*+C56&D0E82/04@%67(3'3<&#+@/E,9$9$6"4/545+H638/H.53551-8;05"4*B8'G@6418ED<1'F8E9=%@4=40*6B7$*6AB,!'*;"2-2(,5'0&%/9@$!%*:B:@(!0D@/#@D68$-+4"(G.4A'+,=<(1(-6B&(D)757A"D,G+>7HHA<*G$?/!=6/GE5@GFC%2,:0=/1#3)$&'A9G#G,F9*C74;"28!A*>9(2$;CBH?<%7E;=5*9GE/?'F#:(@CB$7:,2<.(?%8)A"@=4;,H/*2#?&5B485!@054-*F@8A>=&'"B6E2/,@:&@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:260A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r858 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30394 42 89M = 30251 -232 ACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGANAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGT .$B)6C4$:5E:;43&&F)#041?9)1/(@H/F4:/,E2!!AD*4*1G#5=+83<=;+:/B2AH+-)1,*>2;B'27$+" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r858 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30251 42 116M = 30394 232 GATGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACACTCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGNTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCA ))$+$#&%"))'&+%'%$"+''"&%+#('"&%($(*)%$'+"$!&$+%#%($&%!)%$*+)*%!!(*&+!%#!)#)$%&#$(!%#+#&'$#+"+()('!*%&##&)+*(($#$%!* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C36A28G48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r859 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36088 24 154M = 15845 -20397 TCAGGAATGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAANGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTTNAGNCCANN (*++%')#)(!#'#*'$"*+$'(*'"$)$&!$!#)!&)*&#%#)!%$""(!'%*'&#'(*'&)!(!#%'*%)$)$$(#!#%)"+%")$"+)$&)(&!""&"$*'*!#"%$+)*'&"$+&)"#(#(++%*+##*)")$)(#"*&#+&*%#(%(!# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:6T30T106A0A1C0A3G0G0 YS:i:-35 YT:Z:DP jpayne@0: r859 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15845 24 52M1D5M2D10M = 36088 20397 TTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAA 32<,=)7"CD-"8$9D"66;9-H<"456#20&+H7)5D"C-8/!"F2/.)1#39$=/()/A9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A14 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r860 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23789 42 153M = 24078 331 CTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAANTATGTATCAGTGCAGCATTTGGGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGNCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTT >E*(*,48CD+.9&C/C"4F@DGE4@94C,1H6!084AHC6;@,%F,0*>''D;><1?1HA%C:0>;89B,1#H/?B=0:40)"<@H)A&?::8D3G21!0,6$-BB+/A1FB39"*"4@'=H/#/E)2$!B?D&$-&7/A$1C47:=5B?'G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58A9A11A45T26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r861 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29819 42 48M = 29552 -315 ACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAA /!4-1((>'/5H,75!G'&;0%!!6$.H7="G3#%+;F#2A(5% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r861 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29552 42 61M = 29819 315 ACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCNTGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATA 2:$H57"F>:7B4B/*9?B-7',D8/(">/G>&==:?$&!+(*#=,-06#.F:EA)>,A,, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4272 42 65M = 4194 -143 CGCAAAACGCGGTGANGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCC 4#7",0F'D/%$,03'+;14.*4BABGD!A88GG:'@##62<@6/@? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4194 42 41M = 4272 143 GGCCATCGATGGNCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGC G0F'C6"$3"/:-E@4=-GE<%H8HCC"@=3'DBDB7?47H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r863 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6782 42 127M = 6572 -337 GAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCGATAAGGGGATGTATGGCGATGNGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTAGGTG $*'"&!%%#"!+#)(!("""()#'"#$*''#(#&)$$!!''&(%'*##''$+)!)+*(%'%$#$$)%!+)%*!)(+!""#$+")'+*("++%#+)$!#*#)+&*)$!#)'%%#'')))(&+#%(#*# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:42A30T21T27C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r863 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6572 42 51M = 6782 337 CTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCAC 17>.9C7.>-2/#AF+3C0*04!89*9C$!#0/2:E&>5G9!'.6A58:.,F?9?81D.>>>94$=E?H+031$*>G0?GB6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33543 40 52M = 33271 -324 GCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTNCTGTTGTATCGATAGCGA %(3!7G?B#3C4/?8DE;+5385G(4>)=<#%GG=&?DB>'9H:0(@>A*7# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C3A10T2G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33271 40 93M = 33543 324 ATCGCCAATAAAAGTGGCTATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGA /==;*255++@:#:1()GF=#+/:C);:%63*5G<15GF66"EF32D'-;)25C5%#C9FE>%#'/?E+:H!FF9<#3=>)10(.,A2DD0>E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G74 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r867 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30844 42 93M = 30937 406 TCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATCCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAG F,GB6*/>>)*E348@*+GE%<=(F>?!%1$*F1(*-7@G.%%DH%#5D1D'/&4E+#=$;DA,*;8<(@:4,2#DB$EFD*# AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C0G0G49G40 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r867 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30937 42 313M = 30844 -406 TCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGNAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTNTTAACTCNACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTNTCTCCTCAGCCAGCCGCTGTTCTTTCAGTGG G>-'&$)5%C?E5-4;)*7CG9;;B6"-BEB$$?1)!)&(06A@0'>%*',,=.:.;'%F#5.BH#8+;=8H8.#"+GG($A41+/F2&#7>78B",(/@)+#GF)1-CG48=H1!*587*24<=-@#CD*3@@B352B3,$A2DB;@!85:=/,./&/H;6G--9?0C:6/18G'!("$5-;F55(#FA/(#-!+!%*4#%?D,(G!>/+F;0=&C2.!2);!4/%*327*C402-G&@=0$1A/H/D$;>,)"/"=;E7*5E(1G6"79G<.-"FD-#01H"E'D4A!,H-!!H!):*22HE9B#%/45#;%<;;:FA=#4,2?%'.8?F!2!#C3'5F"$&E-"&DA.@+,?%!4!?-7?#-97??E)B>>==='8H0H#"91@1E+H+D6#58,3H:<;BB03E>A+*'B..B/$D90,54+"%=9"!'$::''(D-&C:3$9>)B+H YT:Z:UP jpayne@0: r870 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22869 42 128M = 22769 -228 CTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATNGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTN )&)#+**%&'!$)+)(#$(&)('%))%&('+"#!#+("!"#"#!!'*$+#%*$"'%'*$)!'*$+%%&"%$!%%'%(()'#!+")$'$"'#!)("*#+!*#))$#%###%$$+!#!%%%$+!*%#$+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T99G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r870 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22769 42 40M = 22869 228 CTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTGTTCTTCGTT ::3.6,D@<(H262'=F.,;))A3HH=++'<1A.=GB AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r871 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42555 42 239M = 42794 391 NGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTANGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGC !=/(8("&,)3&@1E"8=*$,9,D.?5,+AA)<"(F';#-,,(3!<#0(6C*7"B0+!.2-:A9<0=*<7%+%(/!@@G5EA+*C@<$%&+AGE:79A)'6,@&"4'.!-;$EC;4'(,>)''$BD2EB3DF,EH)? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A78A159 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r871 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42794 42 152M = 42555 -391 TGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGTACGCAANATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACGANA #(+#!(%#**&"!)**"!#)&""($#&*$"#()($++('$)"$(%$'$'!'($+('#+'%'%+$"!$&%&')!)(")$&)##""('$##!"+!$)(*$()%"!"+)($&")+%%#'$+'%!"+("($&**'&)%$%'!)%''+'$'++"&#) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26A6T114C1T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r872 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26393 42 63M = 26204 -252 ATAAAAGCATGAATGTTCGTNCTGGNNATAGAATCNTCCGTCGCCTANAAAGGTATAGNTAAA !)$%'))"&+(+&%$$!('"*$&&%'!'")''%+!"#*)*%""&*&""&%)'%"&!#&!#))$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:20G4G0C7T0A0A5A3C0A10T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r872 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26204 42 189M = 26393 252 TCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTNTACCACACCCATTCCGCCCG 4*HF;,@9A-D8F&3@>&AA9;-H4#%@&2":>C*17>+!E$+1&&2"23=(+ED"*G/14F!3.+4F/)((9**3$:H(2+;#&349'>,BC16&8<8:C@)AF5;%<4#F:F@)@C.#3:,=#&0?/?#2='D&F4,$)?@/:442F!G@,8H1'F59@<4&?A76B.50(>-/$9+E7&6&E06C? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:168T20 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r873 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17783 42 131M = 17982 287 NNNCTANNNCGCNTTAGCATGTTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTCTATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCC %!"#**)$"*%*!#('$'(&*#)+)("&'!"$#*"%!'"#$*)"$)#$"#()&"*)#*'+%)$+#(#+#%$+#*!')!))&+$()(%''%'#$"!#!!%"%")""#)#"'%'(%!'%&##++'(&#%$$'& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A0A0A1C1G0C0A3G3T1T2G62A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r873 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17982 42 88M = 17783 -287 TCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCC 70(6%B/4;-5H;'73?(*)$<7@?/C0.$2>#!!-!,8:A3,*"H*%,6%-E$<9G(32DB&?G1.@00(.F=B*'"&G$0!(#4$> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r874 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12590 42 82M = 12372 -300 CGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGNCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGG %F&H(%+2><0"F?7*DH22CG9/.&H,B/!-'E376*D3>?:EC?;@#1(#7$7A('="1E1)*4&#D?>+F#5:G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r874 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12372 42 218M = 12590 300 GTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCNTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGNCNGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTC H'#G,3):.*)7(=AC@39!E#:=DEA)5F3>2;<&G0%)B5@@F/0-6'@7DH.2;9&,1'?$E#3$%65E24,"$3&@>D@E"H8&=="'"&B;B)!;$A%7.H+(/29C>4>8'.<27EB9,*B=:B!?A$G&(CGA?*71"@$F@5"49$%!+&?%7(1A:8"2B!'.BG-%=!+-(5BCF%>;&27!5-.?A)$:5A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:66C39A1A109 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42063 42 93M = 42258 278 ACCACTACCGCAGGAATAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTACCAACGAAA G>E2+=E:>3)!F"*C0;#+=1>)(8"9&)H-F'7-3@6G6C1?!5D=0E=-58:-D73?.7)7DE>'4,BH$-<#"$EH!H&:$$6#9<,C+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A66T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r875 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42258 42 83M = 42063 -278 AGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGCAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCNAACTGCGGTCAN CB&34./(&F=<6E9(@:FH!$4!F3(81>((D$-;$:@$F7FG,$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42A27T11G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24039 42 110M = 23940 -209 AAANCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGG :1%5=A,;3((&GA+*3,%,2G($"/0D,@5(C8&$:-5)+D6B?'F;.D;669241>A?@AD<8;1:"D")933E,$;C?=7@E;9:)?C(.?%02-+%9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23940 42 71M = 24039 209 TTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTT $FD.&5!(#5?<2B*0392'6D61C&;F,0?1/5;G'78*&>'6.120<#>6-<%5;;=F/01/G?3.?C5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43994 42 328M = 44322 377 GCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGTTATGGCTGTATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAAGACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCNGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGTTATTGCCAANACAGAGCTGTGGGGNAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAA @)(.;$).*.@:/(D-7'C2)>/>4+,:86'':0H=&")'B2E(A'"G)2+*@H<;E$-)@&2(17);+,46$!D5DD!%'#G!3?+A/#D8:.9(%A%)6D8>;8:C=6$%79-EG8>G220B1@-C7A4E2$=2CA1>*.(7#D.!6?%=CD/:'6*B'<(,)&:B@,?$?!@2;G52,99")G:E"#"B08@H#/.!C5.5A6-..5'HF8:.A2@B"F;%*609/+>;#85!E"1-=4+".,&0.1#).8H><"/1@E1&F=C,4F92F"$BE+)>1&/<6$G+7@52%6H7,(+H&"/*,D3>G= AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:34G8C117T62C52A9A14G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44322 42 49M = 43994 -377 GATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCG &8D7@+?-"14(*F,$E&C*CB$,$/84<'#2*"93,624;>0'92E#3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r878 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23169 42 73M = 23029 -213 GATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTANTGTCATANTCT **%!&"%!!#%'$)%)*'+$$(%%+*)%+)!&(!$)%(')%%')')!#"+*()%*(#*'+)!)*)'#')!'"# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61T7T1G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r878 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23029 42 56M = 23169 213 TCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCAGAAAAAAT F(/*:2"7"%%779?:=,3@0#/H$*"123?>%F;?8B/-(!'..-:-?$,GFDGA1?$-3@%E.A;(++,:1&%(HD)A2!$95F%/A48)#:B9*77=)G,&;>5.,,:55H>,=H42+7",< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r879 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28061 42 83M = 28155 190 AGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTNCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATAT #+&*&&%+*('%+*))!*&((#*(''!&)!%$"#"(&%$&%&&*)#*#'$")$)"%*!*("(+#&)#(*)"%$*)##!((#&+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r880 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18113 42 101M = 18214 270 CCAAAGACGNCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCANGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCA :%35@+43$;:?62EH$9F($#<:>1%-47))E#>G!B:'.>/1(@3-""74@85:198.?#)7#5/<32=%7H(/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G32T58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r880 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18214 42 169M = 18113 -270 TTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCATGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATG -*@E2'0!07E-6"G"51=5$7"5E?65C%!*FGF@'HD!F<6E>9*8E?*GH'7."??C=FH<56)C2E;D<.$A"""H#6A1-?1= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G121 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r881 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14989 42 152M = 14989 0 GGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCNTTCTTTACCGCCGGAGCCACCCT 4-9/3;@A-?):.53,(!*GA'1=9#EA459G*C-2(?G9:F?#@C0)5$'),+FB=')7:+5&-1:#EA#8$(:#4/2>33F%C"63G"@494"78F23.'B,(H6:B("!<7=B3%G@B.<2CG"2@@>"@!C*.0=!#6;D>#&8;*?$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128A23 YT:Z:UP jpayne@0: r881 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14989 0 * = 14989 0 TGGCTNTCNNTGAGANNGTCNNCGCCACACCTCNGANCNCNATACTGGCACCGAGAGAAAACA &%%(("(*'"#)$)%#"$"("#)%#)'%*)&!%%*#"&!&(+&'!((&'!&!+'()&'#("(* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r882 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20888 23 59M = 20688 -259 GGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGANTGCAGATGG 6.*-124G<>).8HB.$G*!%&<@'+"E!.;-+96*:ADD-@D!A&AGH:!+40.%98" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49T8T0 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r882 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20688 23 9M7I49M = 20888 259 ANAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGC '$'A0=("6%7.B=59-F0'67A+?,%(87)0E"9:14<1@0C!,/F=@A3*;=A3+C+9C*.B%!0+?#+>"7!3:/D###=H"<:HE9&=0,. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G35A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r884 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1638 42 41M = 1801 225 TCNTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGAC %&"G'06$EA'/.B57);8D+)A#B-"B7->A6EE5#DC6=>-34@48"EA+=:**>B";6>/&5H"9".00F5!.>> AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G37A20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r885 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7599 42 74M = 7325 -348 AACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCG /"-0B2+(=B47>&<@E+%9G<9@384@?>C'(B*"F58B/-"A$/!6B/9+8A?8*;H$7&1>>&>'C#37/> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r885 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7325 42 119M = 7599 348 GATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGA FE"'<%,3B'E4"*3-1;D'7,(,+)1++$1+5C%9=166!A5#+(@$)F!"3)B(G:,*7;#*-?+%0D-%08)D'9ADGDA:A+&DE%C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r886 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 42 123M = 36597 0 NAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTATATCTGA ";9(.%!>9(E')#)H+@D1@>5@;6''%(,-#,5FFH13<�:.&3H".1)>BA-"@!$-:8HAE33:2#>&+'4+*G89&E2(&E30:'G1AG56";(@8G$?B66@*8=%FG!(-0(?E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A114C7 YT:Z:UP jpayne@0: r886 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 0 * = 36597 0 CGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACGGTTTGACAGNTNACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATGACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAATGTCATTAAGCAGTGCAGAGCGCGT 0&,%+%26<59�A.1-3#1=#F!')3-A"21&%F*$F.ECH-)(4>AH00!FC"G.5-%D&6?+.GC&6-A,5;>=?8-DC?B1;.3+B+4:!"&02@!-.-%)**-G50#@1,1.GFG$A&B)##A3B'E'2#4=7FC'.-4++&F**FC./C74 YT:Z:UP jpayne@0: r887 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14896 42 178M = 14838 -236 CGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGNCGTCAGCATGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGNCGGGGCCAAGTCAGGTG F-F:F!&?GB+GB!D?,C/DE004C&EA5'7>/(D88EC-=5&3308*05GA6+.!@??E?AD;D#G#:-70<+@3/-/$3#9&A9@D+6,"E/&51!8#:%1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7336 42 166M = 7268 -234 TGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGNACATGAAAATNAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTCATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACNTCACGNCACGCGG #!*("'&!&""!")+"%#&#*&#)*#$!+*!&#"#%+*)&$)&&"%+#))*&($)+$'$+"((*!!#*#*$*$!#'%+$!'!")'+)!!&'&'%#+"($$)%+!&#%+*$##(&!#)+')'#)+'!')$"'(*#&##$&(+'**+#'$'++'$"%+*#&%")&!++ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:50G10G28G61T5C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7268 42 68M = 7336 234 CTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGA .8G19*,;>9,$)7*4H*5-*,77"?0=/E&0C%,EA07=2:E-,;B%5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r889 77 * 0 0 * * 0 0 TCGCAATATTCACAAGCAATGCGAGGTGTGCAACCAGCACAAAAGAGGAAATCTCGTTCCGTAT (D;9279*H>>.>2?7*1.A>:CH',/1G>/%C";(C"'F:@:2&3.07@#76=2,)5B.A&HB YT:Z:UP jpayne@0: r889 141 * 0 0 * * 0 0 NTGTCTGGAATGGTTTTTACTGAGAACGTCATGCGNCCTCACTTCNGC #1.C6!'4:B*3G)3:858&9@D'%4+'@7C@;?15.36>/G!2'89# YT:Z:UP jpayne@0: r890 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18227 42 159M = 18386 308 CAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAAAGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGNTNAAAATGCGG 6A2G>F7+:2?1C1(#,(+@@,D.!?-DG'%--!"FH.)E7054$)4726F?>>5**3*98>&5;D?5*<)!C1E)(""F2C<"@@)=?5>D4B@"5;9("3!F),;%%9!6?=++7DCH)#4-1BFCF#D>.1D25?9-#8-8#G:+'4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55C91C1A9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r890 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18386 42 149M = 18227 -308 ATANCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATNGTAAAGGCGGCGNGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGNA C<02C68?:*C+#0<'.F2;-B1?B=B&!84D<-$EC0,$<7<(%%CA:>/D);(7F"4*'%+7.5*#G$$H8,$66&@<)&!F@GE56'?8C%4'>74,?;B-EF,9B*)G0,AA1*<*%=:;H:.B0+3:96;8F@3%C(9')H8!? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3T105T12A24A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r891 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41030 42 145M = 40949 -226 CGAAGAGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATAATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGTATAATTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATA D<$'$'(("$7(=3;:=)%.4='!%#."<0.1D&5)17G=#&#$>411=&>3#%7/BH6F4%!36E:2)0$F:G*?$+<6;/4)&)8;6:F6-E*@-;..#5CF9":?+F23<5/;E$;@1("'&'>$"H*0-&5A$(':@+6.5 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C47G37C3T48T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r891 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40949 42 48M = 41030 226 CAGGATGCGTGTAGGCGAACTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGC (A375.%>334:/D:@9,<<@5@,2)#A""):*D0/.BF44;$E5:*' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T28 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21561 42 117M = 21678 292 ATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAA %6)0HA%(*AF*..8)&D*<)!26320#!-@8)A#!7*&,?H5297/**GCGCG8#E>-.075F0@)F5?))0?#'"-3!>1<:541BF!F0;E=H36G0-<::2#10(G"8,G71<=!)14(C76H6"H>G;+B#2A.%1@0E,HF>E9",,B8"&':G((<>$06$=/G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C53 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9301 42 84M5D38M = 9221 -207 CGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCANCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCCTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGT >6F$((@/A)29)-8(+,94='8,2#!*7?1#+%B88(&7&%#'=12F=2583*0;1<5'9"F;:$"3>/1719=1>2?)F899E><(":7*+$;&CH$/)(8/F("%)C67,),>A?5G&2 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:66C17^CCAAT11G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r894 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5954 42 100M = 5815 -239 AGCACCACGCTGACATTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTG %*#9:G:CDG+2&=%%'%#.85#$H3>8'18*5C7>>:8+)!"CC&(!"5H%=E+G25-3'!+E5%*!'64BAAA7&4%:15-%0<5:E:H9=%@*1;*/=<#4GA(CD1:E$(6894A$'%5>'.',4!4D.AA). AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T11C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5811 42 147M = 5965 250 CAACCGCGCCCGGCGNATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCNCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCA @88&%F?!74+#A&!2D-C#0D;/.6647GH!0G@:10D0%$.*-15)>(8:3),>&93DG:!EA)481-2>2>+/;0>6)%>-'0!)/=">';H126-=(!@3C-AD",#:*(>-7"%#7#$.-&#A0!8;.H7%34CA?&%&F(C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G28C102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r896 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5965 42 96M = 5811 -250 GACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGANNAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAAC 0E@C+DHE"$@G9H333=7=E4@H'7+2C)C;",.'@#8$0<&<;&=>+D<1.,=F?!87 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C0G31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r897 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2068 42 18M5I218M = 1985 -319 ATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGNGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTG A=D'CC",$!:=:84?!53?B/911D)+&'%'2BH'F%>-A?0)@#8'C:+=@5(9>:;:*.D!&)@A+2C<&G"&,?/+6091,'D)C.)E>6(E4!5)DB"HB8"+*6F?>%+)E29(<&$8?7E&/6202<;>1>"'"A"?C794*<.B2A.%2>':D7E@?%?G>9')H%77!>@)&3E)&--*>&' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A12C7 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r898 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29230 42 44M = 29366 316 TCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGAC 2($<(>&%DA/+2(/D.;!2'A'GF?"58 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r898 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29366 42 180M = 29230 -316 TATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCNAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACNTTCATGGAATATTNGTATGCCGACTCTATATCTATACCT E?!?38&(-)D.!C.1!F<72-D55>$$#*H@1.$8.>.&%0>%4D-,<>)5*7#%8("?G*-1-$7E/;/??E&/3/@37,#.='+F""C<2,,!#-8.E<=<7-3A@'47#H!<#9%3">14=BG':&01-?#.56@H6E;)>3+E9F-!::G51'684>B2-.;04::F$&7BF:+? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40A99C13T25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30685 42 160M2D104M = 30625 -326 GCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTNCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAA F&$D786:A4#$A93/=#=&=42>0$BC@B:!#@=>-C/;B921H)!,,F8E&C*19332+,0;A,=%A<0-),-"225"5$7%DCH<5?C1D$E,;;6=H"CC)--BA&#".6G6$3$1C;H(../8.H%C.,57$B.2%.%"H;G6"933:"8!A=/@0H4$>:D"A/%7EH"+#E.0H4@!:H?$+685<$%C)A+2A#9>2"EGB*"=;FF0G(5C9$F-*&<#*)0==9(3;A4F:!"))*G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:160^GG65T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30625 42 60M = 30685 326 CCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTA 1<09@BB8EDD=9?E6(B7A*=./"@%>77)*GC.>)D&@458E.?F7:?% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r900 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2832 42 54M = 2973 253 ATGTANGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCAGGGGCCGGACGGCATGACATC <.'"/A(7;DB()9%E4#GC=BD8H&7E3D!93(A$415AE)51B&;81%%94G9,.,14-)!,?27.=2F)54EA;5E+/6A>@33&-B7A.:%6".@B2D>.<(G+><5B"--'DG#*< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r901 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10886 42 240M = 11126 319 CNGTGNGANCANNCTGCCNATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTNTNAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCATCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGG "")%*$&%!&(&$&&(#(&+&%)&#+$%*#+'#&)'*)%&+**+*()('+$"#%!+()"(!#%+%&$*'&$(&+""*"#&&$&%((+*)))+#!+*%)!'(%%(%""*%*%(#$+)($&#&'#+'*)$%#&!('#*')''%&"(%!"%%#*'#"$%!)"#*)*$'&)("$*&&!*%'+%!'"&(&'"*))$&#'!*'$)#'$*'))%!'!$$!)'$"%'%(('$%"""!%(!#$*"*#+# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1G3C2T2C0C5G55A1C132G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r901 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11126 42 79M = 10886 -319 GGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGAC E/F8>C+1;$:F!81;6%F-)"1D07(:,6E-&,H#)G";@9=&)4)%*)/"*426#,(3%8;-;!#:1C'C(&?/6.H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r902 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27752 42 122M = 27874 360 NTAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCNCTATCAGTCAAAATAAAATCATCATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGG &!7&$H5B@D5&-?/!@E4-4D6G31+()2'/5>H*5@>7.=5('+?"1%!=7+3@*)2B5;3G3@&1*E0&;6$#=<(?D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49A1A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r903 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13467 42 64M = 13292 -239 CCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAA .,>:D.?F;-/FD9A9)<'+*$0G"H/C"$5-*,)":F'8.;%2+5:%HC)';A-E?>#+*.6& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r904 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30523 42 42M2D7M = 30727 265 ATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTNCTGTGTCGCTGTA :!.F%D34AE;,974'F=ECB@/@%B+F!@82B$5;-;%'F/EC9>$2* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:35G6^TG7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r904 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30727 42 61M = 30523 -265 GACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTT (*,E61F.6;#G>G9@A)0>3?9$'1<0&7:'('*6<1'9'(?6@1#/#,.<.H?5- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r905 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9112 42 62M = 8933 -241 AGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGG B%B*))>C,2*+<34'&5<#9!F84;+G%7H*(;&#*!B)")+>,0*EB1+)1@",+/#8H( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r905 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8933 42 41M = 9112 241 ACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTA ,C*GA!*GB-16A5+!,8&:/46,+D40:.9(D)+((%7./ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r906 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43519 42 63M = 43627 207 GNTGGANCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAG $##'*#$*+###!'+)&#'('+#&)!'*$#*''*"(*)(+""%")&$+%"(*'!''&+#")!) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C3T0T56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r906 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43627 42 99M = 43519 -207 ATGTTATCTGCCATGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGNNGCN *&'+$&#(&&'*!)!(!)&'*)'""'&!%'(%*++%+"'&'(*&#")"'+%!'#)*&!$"*((*'#!+"#*&!'#%)"%#"+&%"!$&'!$++&##*%% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13C80C0A0A1T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r907 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48224 42 111M = 48038 -297 ATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTNGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTT FC62321;B:G3AGBH(3.6)4!',/=G=B7=E681E1"?8)-?*.6H3<86%#"(&7#)3HE!/'>0H5%1$!H38($.@"9&A=#&CH@1(1:4"%9,3$55)F*;".+-7$'D@4F/'#"46=(<<2#+-.>=3&?H")+/!"@F45>0:*/-*,7;3,62(&24BGHF'6/-<60C#B7&@1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13661 42 108M = 13503 -266 CGCTGACGGTTTCTAACCTGTAAGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGNTTANGCCCGTTTTATGG '!=$2<2"A>$E.A5H65+E,>B0#7);BG:)''-,FC'H'-<7./F#@GH%*;3?9/,)"3)<9.1?'@2@&G.3G/107*=E*4+G<(/&/9?H>8)&516:17@?@AEF7*272C6,&FA84"5!4->.)FD>C>G!2#>/:3.EBB7+8<<8)-G'*CC=5)(/0-F6&F;")D:0E3%H69)",<-F90*%!+9G)7>"C14$7/A++B#8EA(C5<7!3+8B7BH5+6B.5'0*B9E;,5=+6D@&B-?A@D%AF-$@@?A?@E/>!80C9):'/E('-@CF7,%43.5>?4@>!4='H<4*5@H88!28%2<467408925=5*H3)<,!6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G26G107 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r910 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9259 42 126M5D78M = 9259 0 AAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCGGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGGCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACC &+!*$#$%"(&$&&$+&'"'"+!&!$)$!)+&!!&#!%*+%+(+'+&&%')$!*(*&*!*#)$"**!)%#+%+)+)$)')#&!)"'$*++'+'"+)"("&)#!++')&!'#(++**&!($)((&")(&"%&)%(#$#%$")%&!"$!!$$)"&&+#!&$+%#!)*(!"'%')($$)$$&+%$'&#+)%+)*'$"+%!*"*%%+" AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:62T63^CCAAT12T65 YT:Z:UP jpayne@0: r910 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9259 0 * = 9259 0 CCATNAANNCCANANTNNCNCNNNCGNNNNNACTNNNGANTNNCNNNNNGCNGNTNNANCTNNNGTGTNANNNNCGA "$#$"$#!##!!""!!$""#!#!"$"!!!$!"$$!!"!"!""!$"$$!#$#!"$#!$#$$$!!"""##!$#"!!"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r911 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18854 42 105M = 18973 164 CGCNGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACGGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGG '<788D/>/4H<-"8B6=@!1+"6>$9/>-?#0FF6"'9#<4*A@$@21.=2@<2;D884CH$1!/F0&E0B?E,1H3A$7.-21%<&,8GH).:?&/9'%+.=> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T2A55A45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r911 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18973 42 45M = 18854 -164 TGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGT #'%!')%#+%(%%&'"*&%'###+%'"%$+*)!$%!#*#&&!!$+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r912 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20266 42 50M = 20355 194 CGTCAGAANCGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCC H$6H9=19B6617?"?A94!=(/D6DG-9"?'.<'52E+H+:631GE2B% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r912 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20355 42 105M = 20266 -194 GNACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAANGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCT %%!'!(ECB5G;,BCD);DF5>99:'%:+%/*=&$H1:G:2)=D"$,630;/7,/=""5:CECG@@7(1C,99)5B<4D(G+)'2*7;$(=@??%#!+F93;6:G00F:/:=(4!#&G&5+&;%C?5G'?1*"<-87(B)) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A73A51 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r914 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20705 40 84M = 20509 -280 GCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGGGCAACCNACAGCACGTCNGAAACGCTTGCTGCAAG *4;/&>D&''*@"4!!A/+(!',$@D!57!HF#??$3.8G,H2'D1)#63C20"G1<.'AF43'?A2C(:3AE'9*4# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48T6A10T16C0 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r914 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20509 40 188M7I8M = 20705 280 CAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTNCGTCAACGGCATCCANGAAAGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCNCAGAGCAAAANTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCTGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGC 0'<*"70#C/+'8A:<#=;2&47*2;5767=C%4A!@#<=/,)B+$"(1)/H2(:53D>C&+@A(;=DH*(9D0%;G)-50E?<)>EF+FG-:C,8E2B+!,;@F2:?C'4DG(&F**&3'21/-#107F!4B-,:'8)'A-@"D84@3.!28/>&@8D#$E(>@G1%G#>B*?B84E;,D:*":"HG2"*03'1-C= AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:56G15C3G35G10G48A23 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r915 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33357 42 93M = 33130 -320 ATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCANCAGGCCACCCTGCA "777";G9-.8.9F/#;#",01:0/(36$0>!,4+7;74&5!??%?7-9#:(74%),1-=)."2F#=EG0G?"5E/@95E#)*D41 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r916 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27990 42 42M = 28063 164 ANCNCNGNTGCTTTTNGTGCGCGCATAAAATACCTTGATANT #("&("**("'"'&#+*&$"'"+$#%!'$"$!*!#"$+!%+# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G0A0C1T1A7C24C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r916 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28063 42 91M = 27990 -164 ATGCNATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGT @9,,7E:*A"E;:.7$@#>7@4C&@'HH%%*G:,((8=937-56DB&3'750*7@@61@FGHCH$:E2<;D1@@!E*'29%>51F@%-FB3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A86 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5419 42 153M = 5275 -297 GGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGNGCTGGCAGAAACCCCCGG ,91!#%*&;.E6<,+-;;%&1585)C=9406G34+3=1!+:H:1F>&A;<6G.H01<61)4(=-/8FF,@>;145FC+7,&82>,=6FD01*!55E-EB(?$>($3@F3,*=F=CFH((5C!;3+2H*65'EHB/8G)'F2/:5&0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63G33T36T18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r917 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5275 42 144M = 5419 297 CANAGNTNCGATCANCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAANAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCGACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGAC &#"%(((!(%*&)(#+*(*$%'+&&&+%&*$%'$+%*")('('!+&(""*&$%''(&%#&+&$&!("$+(+"))#'+!$%$!+&)'"*((&+(($"*%($$!%*#'%#+"*))+$#&)+&%$$%)*)#%%))'#+((!*&+)+* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C0C1A1G6C61G25C41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r918 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A26C10G108 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18757 42 107M = 18569 -295 GACATGCCAGCGGGTCNGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTNACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTAT %""@:7/)343<*('F;4=B@?6748@E+@D@+G45E72!1829+>#<9!.#1"H#67B3+*@@9:1"-3#0$2C:&@!*#E!!5E8!4--=7<:4G+4$0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G27T62 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r922 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34662 42 51M2D45M = 34407 -353 TTNGCTCTTGCATTNTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCNTTNNGAN +*"!'*)%#$)!*$%"$!*&!"#&+($++$'(*'*)!+*(""'+(&&')#+!)%"*#&'"%)"$')&&"!#!)#&$+((+'!#*'#'+)*'$!*(" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:2T11T36^GC37A2A0A2T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r922 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34407 42 255M = 34662 353 TAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCAACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTC 9;,EG'B$D;"%>DHA&CH="'<2$40#D1A.%B71*C"/;<78G7/FDBBE5()<9"-92<%8?H*(<:$(BB2+8<014>FH!(%E)?-+-';/'(!G2H57;(#'90:9@EFBC/91>E!B?+##5DA0%6@D:B'<%-+"EHH.C%C/>A3/:%8A.4=2>%:1#0@3+&84",4(?-#F"5C$26825,;(?6D!#;=/(#BH1*"(3;&6.":',3E!$6E"AG*"-'=7F%/1'<8)<<2-F.@7"-3-B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r923 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30184 42 128M = 30494 353 NNAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATG )'H1'&"2E%>)CG83+CA',<18&6E?-7H1F-C4>FA.;<;64$9EH70-F=AD=!0@528$@5-,;;F01BCF!GG! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0C126 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r924 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6261 40 61M = 6261 0 CAAATTACGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGCTTCCGGTGAGGTTA "?1%340#;>%GA!8<(2/+,"@%A$>A=*:47(#DG(C":F<>/0DE?/5#E4'!F;832 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C39T14 YT:Z:UP jpayne@0: r924 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6261 0 * = 6261 0 NNNATTANGCNNTGCGNNNNNNCNTCTNCNTNANTTACNT ##$#!#!#$!!#$"#"#"!$#$""!#$!$##!""##!"!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5473 42 113M = 5676 266 AGCGGTTGCNGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAA .%'FC*.$*&9D+"B)"5+00+?D9#!HH")>?2+.;9#E22E*EF02"@7),9F9$C%6;-(/4D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G33T69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5676 42 63M = 5473 -266 CGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAN -2D9"27#7#7G@D@=608+)C7B&9:3?B2'>780.8H*>3,-76=!58D?A43=0,**#<$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r926 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4957 42 84M = 5212 305 NACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGA '?=C(B$.'.H0(7#65=(7.!;':?-00<%07B6#AD"4*-*5-F:421.F/:''0=)(6H+0-'7B69&F&*/'E("@'4=+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C19G63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r926 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5212 42 50M = 4957 -305 GGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATN -#-E/,%A2)<(!*A%'AC.6->-23A'(;A#E00626)8:+&(&(1"B":!6<=<&*CH<*!?2<<6;5E3B& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r928 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28231 42 279M = 28178 -332 CGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTNCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTATTGATCTCCTTACCTNTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGATGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGNTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCNCTCGTCTATGTATCCNTTGAGCATTGCCN !!&)"$!'**$!)!)(*%"')&%'%&)!%$#%)%"!)"*#(*$"'+'%+#++!&"!&&!#"+(&"+'"&'(#+)'%$!#'#*((#*)!%(#*&*%&%#&#++(%")&+$*'&(()+##+"'+'$!!'%&)"**#+&&*$$&*))##+"""#&)#!++&(*)'&)$$%%(**)*(+)$%('&(*+'($+$"$+%*"$&)#!!&*%(!'!'+!')'&(+*)#+*!)!""#()&(+&+%((*##')($%*+"%$!!(+()#'(+"#*%!'%'$&#*(!%*+% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:42C73C15C35T47T32C15A12G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r929 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31618 42 66M = 31745 239 CCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCNAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCA ,=D0=BF'D(9F#8H9-$&F2604?D20)&@F"*93$).=7:,C@'/HF%*D?(%(/:D/.@49E!F%4-/@AC@4>!*5D)E:,2!FB+%3=6B5&'>88..;%DB5G,5E*"@!.%,<0D/9GGE@(,H2E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r930 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33682 42 209M = 33639 -252 ATGCATNTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCATCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTT FC=A3=8=E09-DCA$+!9$$.+6&&:">+BAE.0+(7%,'G&*3?<9D$*4=D7:$.:)&E9-5-;->;=.@09&5)0B5E7+9/.77(5&?>/0AA;@6%219"9&%29!9*#2C6*()3/:&:C6>&C%C9#-?@=42=#;2*CA@6?>9><7FE@4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T41G160 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r930 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33639 42 43M = 33682 252 NGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCAT #6B1+=$16'/H78+&;3*5;(48<.FFA-<:?!.28@:%?;& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r931 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42626 42 187M = 42586 -227 TAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAATGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGA !,-BAC#-@/*7$@.?7F*5+&".2!G..96*..)D/G/=2B2!7#.?7#%=4F!:5G$GF-E#4!$D-(-)+;&>;)5H+H"27*=!5$))3<&61";G7.?"(%*C"2?%42CF+/GB:,0'>0-,421/&1E;+84?@#;C4@B"FHE$;.D)5GGG.EGC5&!*9-:-0-5"8:EA=!F;HGH AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:122C64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r931 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42586 42 40M = 42626 227 CAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGNAGAAACAGAAAGA )B.%,A4<:2E$G9;8&F#$56:A)H"'%B91?ED>/5,$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r932 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46036 42 195M = 46257 270 ATTATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATACCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTCCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTG =?.'/&"*C8"9HD%;=)E!*DE&!))@9=DC=,)C073,CH(9$!$FE@>C;;"(&?&@%#;B(*;(8B%A%"CE.53H>@7*&@!'3*-/%9H;3E@??1B@!@-""FCE<>A?6?6;C6)"D@C;368AA/);,3%?#B8B28BDC;E204(7+#-,A&1.0?=9;%%05DBA(@23H$7:<+7$-;H"4DE AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C47G65G78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46257 42 49M = 46036 -270 GTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCCCCGCCTCCGGCGTGGATAATG 7'(C&F'D/(H>;1'$*987<#A-,0(":72"$')A!H<:G@$&F-7)8H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G1A46 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r934 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14270 42 69M = 14155 -184 TTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGN 6"*00%&H2*!35H&48#1:=+0>3"B##654G8'C?)-E!60G$;(),0H,H&# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r934 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14155 42 98M = 14270 184 GTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGACTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATNTCCCCTGCGTGAATATCTCC "=;"<3&5GAB?$.<:G7F*.ACFH)HF)#91G*F.=%&H(?#!(E=1B(!9>3-*-93?,:&+4"4%6(/E@?7($(28?8>?*-*=@6!->%%DE4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T41G34T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r935 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46753 42 98M = 46898 202 GGTGTTATTCCCGNTGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATT >=@"*;7&"(6A,7&#@,G3;.D/#9(F1?+)#>9&,0$E*1E',)+=,$1'5D".0A/F=)>#$,/.D*:*,$A3..;'?5/::=)+;2!?DG2>8" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46898 42 57M = 46753 -202 ANCTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTA .%H,FC1D"ACBA?"&$>&70&0+)D3?C0'(<4H5:7.(/"'H9G2@:=("98:GD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r936 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29923 42 220M = 29838 -305 CCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCNTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGANGGCNAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCNCGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCNATCCGAGATAACACNTTCGTNAT !!%#)'+%+"+'%%*!&&+&##*$*'%'!*&)%)#+###+%*$$$*%'+!(!!("*#+%)((%+*"&%+$)&+%*"$+&$#(&**"#'((**#%!*&!!+$!&"+')&)'%&)"")#*++!#'''*%&(+'$!++""''(%$"$**+)"'&+'++(&++&*)($%)%&$%&!**++&&)%%#%$())*%!#)""+&)*%&"!&*!#&++!+))'"$+'(* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:99T23T3G27A40C14C5A2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r936 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29838 42 85M = 29923 305 AAACCGATCTCACTNTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTNACCTGCATCCAGAACCCATTGACNT 9,<131H(+C7G3A,2@!!5?;*7)."'!8D.:A:39H65+<7.!7*"3:*.?G+A5-3,51'H>)B)0?/1=3/1-5GG6;*.- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14C38G5C10T12C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r937 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47851 42 69M = 47920 167 ACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATACNAATATGAA E+%947"%4'0C>3&C>9&.'FED'6>12,)@.#BH;>:G'97:7#'#<;$&'/,.'(3'E&F7;-4+< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42G16A0T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r937 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47920 42 98M = 47851 -167 GGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAAGTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAA ?E*('1*)67/:"1!:;!.5&&-FE7A8/$.AE%<631+$-(!0E.D.(&A4-&78F;#=<7!&$&7@%<1$B$-,:3CC"@?>?:6DEC3HD"8A+8:F5H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C37 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37150 42 152M = 37040 -262 AGTGAAAANTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGAN 7)$5F>+HF!(%2,,%9AH,$/>!8=2B'?@=?#:&5=;;;?:0/-37@@624>((&F71DC><4=<0+*#';6:922,HB?A#>@):#=>/.D2-7,<*>6:-EH2=>E0>-),7E$F6"F<2#(;(8&>.H*!(,>@;)>7@G,A!G>G" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T49G92T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r939 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28045 42 127M = 28172 403 GCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTNCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGTGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTAC !?58/07(/2*!2F"95>HCF(5#(+=,*0AG1A;%4?E5?+9$#)$7BAF&D'F=/9-(9..76-541&='AG0*"9(?85+%E0H+-6C4*:;$-@16;3@B$$#-@+?E<8+%2!.=+"$0))" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52G35A38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r939 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28172 42 276M = 28045 -403 GCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAANATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGT 7='H16HE,-';EC/.8!&451?AH=##7';70H5C53/!GGA@?0F/?!1A'087+!";B=:(28+',0&A?F"8=H,7H&(>59"83'874&2@F(2+57D3,,*;A-EH4@&HC-;>)+>(@:#BBDF/D":&0!3*59=:)E*@C=7DA2<:'+;=,'G0-A5FE;H;E70$G*((FF*?-;DF!9#E&%C#?<524AD"F<+::H4. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G249 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r940 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29986 42 141M = 29869 -258 TGCCGCAGAAACNCTTCCAGGTCACCANTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTNCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCGTCCGAG D$&9C39F'B8C.9#(2G?!B-C"+-/&981<"1)F=-:5,0&1@)CC'HE'+C+326":C;)B!@:-.3H7&(DF&?8**GG"'A?(6>&',%--&1141'2!E;(9+H/>7H3F:E*-5D#E'0#326562(,<&4D+% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T14G62T43A6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r940 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29869 42 58M = 29986 258 CCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAA @&15$"-04C'@?/4"/D:#8*CCH!/4<3)7!1.G0*7A"'>38:C.@882<5(006 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G35 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r941 77 * 0 0 * * 0 0 TTACTAACNGNTCTTGTTCGATTAACTGCCGCGGAAACTCTTCA *5",118HG/*"?1>AEA060#5<@:D;D"#5E%,*62)<="E$ YT:Z:UP jpayne@0: r941 141 * 0 0 * * 0 0 TGAATTGGTAACACCATCGATTGTGCTGGAACTGCTGGATGAACGGGAAAGAAACCAGCAATACATCAAACGCCGCGACCAGGAGAACGAGGATATTGCGCTAACAGTANGGAAACTGCGTGTTGAGCTTGAAACAGCAAAATCAAAACTCAACGAGCAGCGTGAGTATTACGAAGGTGTTATCTCGGATGGGAGTAAGCGTATTGCTAAACTGGAAAGCAACGAAGTACGTGAAGACGGAAACCAGTTTCTTGTTGTTCGCCATCCTGGGAAGACTCCTGTTATCAAGCACTGCACTGGTNANCT B4A+."&"8G74..DD!%<'EFGB9,3H4<>21!!#$"A=,533!@;<0(5-57)H"23E?8*?'CG,4>AG?F#(7*-GA>B!/!,?54#@:/*+!2A)5-!$.;D-?2"9EHA>*@!'4;@;A!F'E=;4H-%.#?H:0-4-3H.9,%9."!>''18+?B-3,B;&-.!59A?")C;?E'3&=D707/E4$53@H"8?H/-7":+A52(A:5/=-<. YT:Z:UP jpayne@0: r942 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30119 42 95M = 30218 178 CATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCA .%2*8;G10>84&',$$:%79CG/EB7<#.3!&,C8<1,>&.A$/>$/E@?#63G#AG/$"9$-0$F<#BH477B9(D>9D*7,'6!G@5@C'*/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r942 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30218 42 79M = 30119 -178 CCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATTCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGG +GC=@G7>=9!0A&A/G%A;.*973<.;&H3/HG-.1,@>5;?>77>G68??-8=.#8D#0;: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43295 42 111M = 43557 307 CTACACGAACCGGATGAACAAACTNGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCT :2&D9:G>?HBB8C>H?8.("3B*H02"H%8,9.!2@;DG72D$+H&";&$0'.2.92;>5;:4=08/CAE*=@08$,+"%/:*5*E,@!4:.A5*/@0(::*.33CE")" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T12G86 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43557 42 45M = 43295 -307 GCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGNTGTANTTNCTTTNATCNTC )*("'&"!#)+&'++('&)()"!#+'%%$%'#'#)!%)(&)&%)* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:25A2A1C2C1G2A3A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r944 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3992 42 88M = 3873 -207 GGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCNTTAGGCGAGCCNGATGTTTCTGTGCTG 2@E70!&)=D,3>2=:78=;)C<5&0"%-7G??F*/+.!$0E4D)%50<*>(B.G6C.2CG.(@.>,F8H"5*0%,2;&.>3&)<5D' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60G1C9A15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r944 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3873 42 119M = 3992 207 TACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGNTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCNTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCAC B,"4-)G08C*,(&0#;7=&+@1(EG@1.G#9-:GF>8;A')4,C5B0+3?!6;"?>)'=51!3"F=F=$0D%G+.CB&!0/!45@-='FB#CF4+(!&0D476)-(D76%?H)'A0=4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C31G49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r945 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19569 42 99M = 19359 -309 TCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGNAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCA ":#?;.3(-HG18B!0$0+AH@->GA2*1&H2'#=&@7#43;=".(D)'F"GH45<0"4G45!!E0D"(1607/BG+B3)3(#0'A!:%$+#?7-/003 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r945 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19359 42 45M = 19569 309 CCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTNCCGGGT D+B,"3:*B%C* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r946 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29870 42 81M = 29710 -241 CAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGA 58$+F;E*F-?A=@2%9:41;*7(H9F$)*ECC"DF2D!!C2+2),2CA7A:.!9-,%HD78A0/8.(''*"9#/<3F9%="8&5.0=9@A/. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r947 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24711 42 41M = 24482 -270 AAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATN :A0-60@:.-DA/1F=0+@"80;'BD=G.H2"'C=6(1%8H*+=*(H:: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r949 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11734 42 118M = 11924 245 TCGAAGATGCCGANAACGCTTACGANCGNCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTANGA #*'"$'&%&'&%%$#*!$#''(*#'%%)$((('&+$%!%)*%#&(%#!!!'+&+&'#')""'%"$!%!"(""#+*!#)+%%++#'#'&!'&$&!$%"")+##!#*()(%$")(#%)"$ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0C6G2G0C1G2G8A2G86C0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r950 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24904 42 43M = 24904 0 GATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACNGCGAAAACTTGACC .:6**0F9;"0707F-H#)8,C5$48%>%F6&<;A-)%"60G> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T14 YT:Z:UP jpayne@0: r950 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24904 0 * = 24904 0 CNGNNNGNTCANNTNCANNCGANNTANTTGGNNNACNAGNNNCNAGNTGTNNNGTANNNNNTNANNGNGNNNTGNNNNNNCGCNG #"$#"$$#!#""$"#$!!$!$$!##$###$!"!!$!!#"!!$!#!$##$$"""""#!$!!"##"!$!$$"#$!#!#!$!""$"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r951 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39615 42 71M = 39746 182 GACCNTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCA )5))?8<--<$91.=4D,)D@F09>$C<:4$D9-/&EG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G66 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39746 42 51M = 39615 -182 GGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCNGTCGCCGGTGGGTTCT 7/-1E>%:/EB-#6@E:5%9G*+H9B)/>F0#%6EG.9#8)E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C6A9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21068 40 75M = 20919 -224 ACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGN EAE54BE(GC$9!,82>2=%41%+6%5<@+821/74,E)#2;9<('#>%-914#!.#90)H@8F9./@,1AH2*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T31C0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20919 40 28M4D117M = 21068 224 CTTCTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACNGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGNTTGCGGGTAGACAACCGAAGAATGCG C=0*>+4--2""4DD7H7/6,10#4<;:E6H&;(9*?E9HB(2=9C>E6!,@E#AA)H'..2H50+>52D5!>@04G=15$E#(96>/=/G9=-,"(-?47+(E5;??C"7(;"/=%G7@=!(*:1*9/=;C)C:/D%E+4=7HE AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:3T24^TATC19T70C9A16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r953 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47664 42 354M = 47586 -432 TCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGANCGACAAAANGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGNTCACCATAACTGCGAATCATTCAAACTATTTANTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAA A=/,1$!G&/?/'+B>A$%3#F'6#C)F;7EB*?<$GFF-0=73"<'&#!*#8$?0<$9("'>8>>263/G-AD:'7#*'$7E8AG9"*5!D"/:2,A,CA24;08>(B,6C/$&,9A>7*#BH5F+4H-#B;D88(2*"60)+HD'-5ED9C@D3+EAF-E*3+$&)=%@&2(8-DD;6'30%F0<=8,((+7EC2685B5""9B@=!D&%F&"71"?5GA9?H$H? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:66G8T153G50A13T18G40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47586 42 78M = 47664 432 TGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTNCTGCTGGNATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGC ;9H>2A!A/+42+#G52(<1H5:>&(,+0*-C#5H$/%>80/.%5='5;3;G79<,*1@BEE0+(0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C7C47 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r954 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34526 42 187M2D123M = 34457 -381 GTTCAGTAATGNACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTATCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTAACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGNGCGCAGCCCTTAATGA *E(#0)5/?#,)'2(C6>C581+$->>%+$-)=6@5=BEH)2%H:F<"@AF:/E.CG4,0/>4F4,4F#'!(4H/&BF%3@7G926E!;"3),;,D'?0B*H$G/572.B&F+/8BF#9+08:3@):""C128(6HB(B';"!E!4B$@#+755!9:GFG>*7D;>#5E2:B)0:DBF(?*#56BA?3-8...@;*#$(":317*/7#1DCD,-A)=&'#()%@#?/2057C444D>/?4?(A(%-@!/DCB@9.H:B2:0EE#129;+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r955 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11687 42 64M = 11790 241 AACTGCNCAGTAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATNTACCGNAGAGGCGCAGAAG %(&&"%$+"&*"*"'&"'&$$)+(#%%"&+$!%$$&''*('*$)#()&#(''&"')*%("%")) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A3G3C33A5A13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r955 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11790 42 138M = 11687 -241 GCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTNTGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCT D0H+3:!*C3.?-E2.-($H"GG-:7&'#.-HA8:HC>-,?.-"!=#<8?0(3673<83@BA1@CEG38A9432059/D-/1':3@#&- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91A46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r956 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48059 42 150M = 48258 256 TTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAANGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGANCCT =244AA3/@C:ED6)AB8AF?F)&G$,HBF!95$3+/#?-)E870/C3E./$"A&%AFG@BE4015D576?"7;A.9%645E#0,#5,4"<4.#(1C< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:121T24C3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r956 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48258 42 57M = 48059 -256 GGGTGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCC :>=+''6!34AA99(8#3#207,#2H(/)A)))-F.5=F5E52;$=;:9,%.78-$D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r957 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11694 42 78M = 11397 -375 CAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACG *>2*A5*(>.1"22%H9GA-$93FF/C,'10:>!==9".&5*>D!!&3F21G%4$/6$C$?),"/!?/4"+=';G451 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r957 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11397 42 67M = 11694 375 CGCCGGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCA &'"+'(%+&)#!$*%&))'"!$'$&&#$&%*)!*%"*(#(&&)%#!&("%!!$$+(#)+%&'%+((# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r958 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14616 42 61M = 14375 -302 TGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTC GA$=93E.D!%">F3B/C29FA6CF68B(?=BB*8;,+249GE3&0,)H5B*2*97A;,%1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r958 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14375 42 142M = 14616 302 NGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGTTTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTT "A73*"=C=?6=3+5=D=)!?.'4;>)#=/H8D7-#%5%60*EB?/&')(=:7G?5EF>$/:(F,>"E;F%>6@891$:)0B%65F#3955:B=;'C3">89HH"3:5F6%$8%6$.#'=#5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C53A87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r959 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 542 42 71M = 716 261 CTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCC >)>)-=37E?'2+5+!"<-=7<"=9G91A'59?<9D&8+'#G&(>#:2?71HGH'B@&615=55B;(>3'( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r959 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 716 42 87M = 542 -261 TATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGNCCGGAGCCACAGACCGCCGT 60H-:".*+;*GF9&F?<7H=@0,0!0>;,!A";G)86$7=.5;"E,-!):#5:8=/6,6:9E!B;'&!<4HH+,H39"@C/.73@=C"H!)6;, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C31G71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r960 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10489 42 126M = 10298 -317 GGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCA 4,(E/:)(8'B-5/G<:1C>:H/)9D2G(3.9E+D=%CD/$3<*,$GC9-7;B/3093!3G?;&*E>E+.7721<)()GG@D)E3+(A."+*."5&7,%'=)+<2.,/2+2)9H<9&F&9F5<19< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r961 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36484 42 69M = 36644 250 GTNACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTA 9,,FE268>.9%-20:%)1(6("6.<%9B=;A"&E:30%.C<%F7F<40ED&/B3&>)HH32"2)-.-< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r961 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36644 42 90M = 36484 -250 CANCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGNTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACT 0':*)C&+D'&6;%33=5#.'5H004;-4(7':&8E-8HE9$:*%,)<2+"A$(G*5#1F,7GH%?./$5+B791.ED"%.;,5+95BF9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C43G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r962 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31379 42 43M = 31193 -229 ATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCA +9(?97+B1-HC-65***D0A!F,?=+1:;>*?970(@6*"<; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r962 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31193 42 113M = 31379 229 GCTNTCANCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGNTTTCGGATAACAGAANGGCCGGGAAATCCCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGA (&#!#&'$'!+)!!+"%"!#)%+*+"$+&%)($""&$)'')*%$+($)&')'&!'$"()&&"++$#('(!+!*))&"+!&++()&##$)+!!$!!(!%#)'#%*&'&&$%)!$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A0T0A2G49A15A11A27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r963 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12647 42 102M = 12521 -228 GAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGG 94#2>&*/>)+3*&)G?4:-39A7:A-*=B9..D:7:D9"!;5:';@71>8HD:9EBC-/;6")''*+5@*172'%CE<+FF"9,!B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r963 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12521 42 70M = 12647 228 TGGTATTNCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCC 56%A',';G?<>7!DC54?F),(6.1$#=6=>*4H*E!/F&4H2H2&0,9HA%5)(=>.*;C,;$F2*4# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31907 42 173M1I6M = 31805 -281 ATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCNGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCT 7>1A6#H@/H?74*.EH$+-.0@2=&26%'F*9D=37B8-;H>*G#.6/<%6)2(+3)=#2C?:*:-<:%=%$D*<&#,53)>1/H>2%(,F#1DF>C*>/B7&9+*'42AB"4(H-0/8@E.=AC1%;@:$:<'F$CG=BE48@**8@1#7$37!%<38=H<@B#'!?3/?<9()*A+C AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:124T54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31805 42 84M = 31907 281 GCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTT 4<&H6/2$B,D;=%;-,$1.%?<770>'A:%B2(@'F5938E6%45+$&:-%.+1DD>/H&2;0,!)&A::>?=193H9/$E61EF:&;E6!&'?&'6)771G>%#/D69#H'>'&@D#FB94C@%DA**.)'%4H;. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26C1C34T29A11 YT:Z:UP jpayne@0: r965 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36567 0 * = 36567 0 ACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCGCCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAATGTCATTAANCAGTGGA D<"1C>732C"9)0=&!",&00+:"@DE,F(*:-G2&4A6.-6B:;B)>#F,*'*A"E:6*9>@9H YT:Z:UP jpayne@0: r966 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10746 42 134M = 10638 -242 ATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGG F#?@3))$&)$$((7-D1B5AB!#C/D*>(+F>AD.-,"D#">>,03>H&A?,-8E+>3"-BC0)$5G3"4&&0H3!,#F01$C(34)C-#HG&9!!/6HC,";A67DFA=HH9GG6E"=-'5)7G/$4G=:73 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10638 42 61M = 10746 242 NCGGAANGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCNGAGCCGACAGGCGC &-C'=@F6B1;D5!.'*:<#0%98E!(%-.1$,16&-)B9@8"9D)='2<@8E/'H6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A5A39T14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39818 42 83M = 39592 -309 CACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTG +9-3A;8(.7'E;1,"+-E=.?(E,%2(?B5*/,F-86G@7/*:"D#)=745E755 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r967 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39592 42 52M = 39818 309 TCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAA H%B")/12,?:#-.G1""E9H#<%H>1/0;#*-CD+.4@D@@@9G00&E?60 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5503 40 94M = 5389 -208 GGGGATCCTAAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGACACACGTTCTNGCANAAACCCCCGGTAAGACCGTGAAAACGGCCCGCCGC 'D"&#'2@:=A!!@>:=!'@'%,/8H9G,!ED(!//+>38,1-C$4D%3)=&58%?=C+13$9.=352F/%EA2C?3-,F;;"E8AF)#G61H1 AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:9C3T29G3G3G2G3G12T22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5389 40 111M = 5503 208 GGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCAT /%;7+7#$E#6'>F$>4%A==FC>A1?)E(D+4":!H>48:D*$#/743BB&2'4>>H3*3.*-CFE=GE!:1E-'C3?/5H7?A*#4:!%((20!+=A:CG.A!=G,0$-#2*A;$F5G(9)A3$)G'; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r969 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31076 42 97M = 30883 -290 CTAACGTATGAAATTCTTCGTNTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAA 2E#H0"E58*D!8C..4&*=(<GG@%0E&G);GBA:A8;+*)D>??D6.&!@A>0+$E"6,6@5:*B/-2#D5'$A$D8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r970 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17961 42 58M = 18026 237 AGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACG 6"H;/?A(("?10AD)9A3<1B1?0H1=8@1)-0=4-2?324$A8FAC$61$G/$7.* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r970 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18026 42 172M = 17961 -237 ACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGACAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAANCTGAGCCAGTTTCTCGTTGC 3!6=69G!6%639)-4H9"804!*36!C6-'%'.9&/B%>D=72#8'$"<5C>!@(H4B073+7D78-;4"G%(.5H?9+-@?4='98E-8=30=;"+(E6(8)4,0&3>-H78(+//C&%7?4@&)"!(,(#",>DE9A@6;A+"B=H?>E+6+$3<78DGB<42>:>3EG AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T101A14G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r971 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33645 42 157M = 33802 313 TNNNCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAANTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTAT #"(+#*+!)&)*%)!%+'')!&"*"!!!%!$*&$)&!&%!(!#"&('(%)(+&"!#$"!($'("()"&*()*$"$%&%**%!%''(')%#*"+*&%$+)(+*(#""$#!+%&+"+(')"##"'#$'!+*"%'$()!)*("'*&$#$%(&$!!+("#$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T0T0C54T98 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r971 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33802 42 156M = 33645 -313 TAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGNCGATTTCAATTTCTANTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTNGAGGGCAAAGAAG /;965A,G'&!3A"361B!&%0%,=5?296'9D$-31A7>1"DE*9A>.-94F@/3.3H;D4!3H6E!;)@@/>F<+@:+,3A!./0A$=*0A:A?:1@4?#C(7E?D"==F8(BDB2/D!1/8E$BA"#.8*')8>+@3AF<$/0.D#@+'=F@9"#-167, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87A16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r972 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20950 42 118M = 21219 373 GGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACNACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCG (D5"7+*ECE!F28G/)*(+6GC"68F>)#B:5G=7D43DG%1%>!8/*3-,A7120?F03H':+*,"!66C20,A&H8A:E855#!3=A6;;:#E>1)!A8-H:.,F.+5"C9&='B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C74C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r973 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16473 42 63M = 16580 263 CACCTGTAATGCGTACCTGANCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTC <"D!0C4.&75($++D?&CG2"3'6<@">%;1.-5@:F$(4=2?4,?8G%#51.;=@"C!!.4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C42 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r973 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16580 42 156M = 16473 -263 TCGTGCAGGACCGACCGTCGCATAAGACGTGGACCTATAACNGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGNTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAANGACCGCCATAATGCCGTTGNGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGNTGNG "+!#$&(*$$*#(&"&*#)(#*"+&))&!%&%**$""%+!*%)!*!''$(*'!#%"(&*!!'''')(&(+(%)')'(&++"((*'"#!$%*(!))+)!+"')(%"!#$'$+!#+(#(!!#!*((''**"*$%+*$&$&!)(")(+(('("+"$$!$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:20G20C32C2T25G19A11T15C2G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r974 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21643 42 153M = 21419 -377 GAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACTNTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGANAGTCAGGGCAGCCACANNCACTCATTGTCCNGTACAGCCGTGAGTGC $6"D*$;73&4'=%9F*,G5B>=62A4?98:H&3E/)30&$25<7+C0(++!/*"?5))FGH(:9H):B)(>,,.&((#9454DB?B@C5F230 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:57A0G46C16G0T12G16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r974 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21419 42 224M = 21643 377 TTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCCTTTGATTACGGNACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACNCGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGAT <):G332>&8:214&2$-6D7433(1):>4)=E0$>$/,3!$60D%9<4$+>C3&@<<1A&B4E*.(*431(H.=(H%F2HE/5!2/1,?601'*!/,$3$3C-!053=6),.?:FA$10!F$-$F5,"=<=2AE529F=(,7F&=*-E(@'A6D@F!)BF590-*HF8$4+=20:%+'/2%+@/3<=%2.A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86G11G48A76 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r975 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47898 42 159M = 48057 247 TGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACAATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCANTCTGTCACTGTCAGGCAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGT 2)-6)5EG;-95$6B!*D:/B#/-!E>@../&(&8./8-(:*3>>266*):@+:.E;B>(;/6@9<7D5*G#2&B=(!EHF4D*158=+A-)8"!!FE,2:$FHHA9&>F>5$.21<5.B1&G>//*:2'C>";EB+8-B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51C50G15A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r975 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48057 42 88M = 47898 -247 AATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCT ;&7);>G&)H);D0)%*)?2"6)C+&12%+B,!,A,7$F29!!E*#AG/77=CED*)&9,C3$.:#G5671F=#+!5'";.36//*?8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r976 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11765 42 88M = 11692 -161 GCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGANCTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCGGACGGATTACNNC +$(#!)%%$*##)#&$&#&+&!&&*$)!%)(+'%)&++"$$'$!%$*%*#*''*!$('(*"'(#%&+!)*+$+*!#%($$(#*&'!%) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:39A34A1G8A0A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r976 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11692 42 73M = 11765 161 CGAAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCT FHCD4D?('+&+0F3)?22(*6'(0)4B?%''F&%+;-("?DB*'6G4C%G&$G:'*/C8.E0%2C?E.5E"7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C70 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r977 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47494 42 47M = 47292 -249 TTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGT G6)8'".2*1BF#)#851$$)"&1<3D3>*&!"9!A@:=A&-=EA*1,.&"55+H3.F"4C08CF9H0,.+0=F-@H!/8(0;/.:B,?+3975.?-H$.88$='@E4!G27?>.,8-38;@77/H1/F! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r978 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25586 42 51M = 25445 -192 CCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCT 64?+E#/&<2>+G-3GFG,7@&2G7;B=3F#30:)14;$/D3EC(/.DA:8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r979 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30853 40 51M = 30548 -356 CTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAA A*3>961"H4(?,87$?E%)<7B><*4(E,8FH+4:15;&,">4$AH<%G* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r979 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30548 40 17M2D60M = 30853 356 CATATTTATTGCTGTGTCGCCGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCC 6583>+;7&-B<1H43BFA5E?47-:C9@)G7C$+E$%?*G4,/02E3'F&)5&>FH:9<2C5;8/F-$DAH$'C39 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:3T13^TG3T56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10950 42 85M = 11129 242 TATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGANTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAG /.(H4BHH=#CB,0/-=G2.#@+'H..$,"D-*7D@93F/8)6F%-H6842%?F=12B/8EH;."BF2CE:5"E=.=G@'6.>839H)$%F><@3A?H>&/%B=,?)22&':%9;G=C@/-.2-"(;*BG>-H,0.7-:7EE.FF.6D<9F5>*+/-=42/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C10T65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r981 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29088 42 102M = 28994 -196 TCCGCANTTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTATGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCA )4#%"?A"1G:#EH678#E)&%3;/%6'E.,58-(?:C,BH#@-(AHE>;<>7$/!@-<':"6$2=0-,%'(<)%24))$,#0$BH>-1-"'?&!1,0F"'; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A70C24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r982 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35423 42 42M = 35200 -265 CCCGCGTTTNGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTA C>$G<&=;A7(B**-)A&5/,3B'5<)D:-!@;62.24@G6' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A2G32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r982 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35200 42 53M = 35423 265 NGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTNTGCGATTCAGCGAGAGAAT +G#,2F0&#-!GHEH$>H(194569*DC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T37C31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r984 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11307 42 156M = 11590 354 GTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGTCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCANACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACNGGACTGCGCGGGCATTCAAATCC 6.,5.,H7-;"&!E7/8H3-H5/)'"/!4)%#E2DDD98:C*@?#-.=8*>G>0??+9/%"78D9C(*$.*B!;CEC)6-/')&+66;'>1+43&A(?+F,H%)+-)&8+G>>9','*24*!=#+E%3;//A9D.BC(4#*!+5*9-&(9%<>2#1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C51G48A23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r985 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4960 42 83M = 5113 216 GCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAA ;,H"<9?@2A);9("<$&F"A2><>;;(!#0-,7@7:D8+0'%>8>*-"7/:,*B@&'3"0#0=@0)7H.G'/,;>%"B,BG% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r985 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5113 42 63M = 4960 -216 GGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCANATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATN #$$(+((%*(*)$*'%)#!%))%)'')$!!#""+%"''"!#!)(%'""+)*(**#)*)($'+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G25A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43952 42 49M = 44099 196 GCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTNCTATGG D)-*H&547F!9??#78097DA5?&5C!#&!GD",=3C#@2.*-+@G## AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r986 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44099 42 49M = 43952 -196 CAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTG C1'**B!.&#;9"2"'9B:DBF87(*6F)9-*0''4>E$(;%%0)2;1$./88C9H=E0F#6A:93#%E84"0&(D.%A8=5E(G*8=-'A-G*"=39=7;/F)%86D3822.!&H@8"DH.(867+0G>6?5#/2,")=;G47%%GG8>*'$+;+!8=)AD3&D5DG>(;&&?=7A,4/*(-C10*A=!((819)6:)&9#B)8&4,2,$/4$G+.G1)15)1C(A$=D-CAG(@$+)BC%4C,? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G9 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r988 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14149 42 93M = 13909 -333 CAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGNCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGNTNAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCG .9D'460''E3?2$*?'7"@C9,.'B.F+3%6,8=A/-5-(7.,?;-4F?0&2;*.'.4*:F%)FC))D0,2/>C7<&(C(=#%%3*C.G1C1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C23G1A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r988 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13909 42 64M = 14149 333 GCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGT 2/5/(7==)@)+3,=4A*1F2$$B:+'G"2)H:-147C(B3,86C)85E4C9C$5?&7>/G//F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r989 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32456 42 101M = 32300 -257 CGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATG ,A$CCAG:%4E$@;F8@.E=8/?..0;C2;/@6(>4.A75!H%-B$/0<(0.//"*52*';C2!@)H3294+%1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r989 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32300 42 114M = 32456 257 CACAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCNGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTANGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTNNCGAG ($"<>6)A>+F.)=,HG'-1)=>>3>/.<,$)@3@2$<)BA1,GC'&=4"H:3E%9>GDA:A'H-3&FC%F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2T23A26T54C0G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r990 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4461 42 189M = 4388 -262 CCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCCGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTNACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATAAGN #*&&#"$!#(*!%*")&$")*)&(++'&"!"#!!)%'%)!')"(("'+%%'"'%'#*+'*''*(%(+'(%!*+&%$*!'!$")(%'%$%$+$'+'%#)&&*"%&'))"$+&%(!!+"$)+)+)+(&#')+)%+*!'*)""*#&$'(("!$!(!'&*#$)!*"#"((%%"#%&(%("(##"#*%+*"'*" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:80A31G72C2G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r990 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4388 42 40M = 4461 262 GGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAG >>"6!6B83D-1$?4F;E-0'F)HG2BGE:)?6(/18!,2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r991 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14808 42 61M = 14916 212 GGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTN B5:.0(+)1+*?55=(7F.@=7>2H,>F%F"&##5E6#*H'G'@:"'@(#=,7!6&,&==C.*2#,9"?-='0(?&@&4F$&/",-;)')E:91<176=' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78A24C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r992 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17576 42 91M = 17411 -256 CAGTCCGGNCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGCTTGT !"&"&++*'*++"$%%*((+*%"#(%)#'((+&($*%(#"%(""*#*#)(&!*#*$''%+$$(#!'!*+**"*!+$"$+**"($++(+""$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G77A3A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r992 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17411 42 143M = 17576 256 NGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCNAAGGTGGNGAAGGGCGTGAGTTTCCTGTTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCANCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTG !%+'$''#)#"+$'&%*&%"!$)%#"#+#!&*%$!")$%%*!"'"$#*#($$%)($!&"+$'*!"+#!&(%#+%&#)%#+"!++$)!(')$''''%"+!#)+$'!&'"")*!%$#)%'+&$#*%&!'$'&(!($!$#*'&$*+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A24G7T19C45G43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r993 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30659 42 186M2D83M = 30930 412 TGCNAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGGTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCCTCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATT (2<")*9,4=:"#+H>;,>&==F-*/'#!/@4>&HA85"&6;1C+'&5HD,D$:>B0,2%55!9#20CB4))6?6#/2B?'=8-@/GE5E2@&C<623C,3<#0-@>'.##,;.10'(--4-G9!9<-FH"$8BE;2A)H-#'&F!,%$(8/8/0DF3"+C"A#/?HE6D4%@+61:;->*<$D!!<4/3%A2D6)%H6%115B,;7 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:3G39C126A15^GG83 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r993 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30930 42 141M = 30659 -412 GAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGNATTCCTTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCAATTCCAGCTTTTGTGCAAGGGA =@2<%"C)'/5?.>D$+53'C&:!:=H56@1G35#$%82'$"D"!&/CD@$%'9%FH91@"C:#<(@*664C"A8##*=6$80!>0 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:62C5G50T14A6 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8389 42 116M = 8640 292 GTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTCAACAAAAGATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAA =F;*+%G?A&>5=@$,,8@?4<9,G+<"D&*=9>$6((9H6&@'-!3#>"G62E?5$?#:DA=??E44&<4E,> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r995 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25196 42 129M = 25402 285 TNNTGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATT )$!"+*&%$$+%#!)(#$%!"'"'"#+*$&+&&&$'!("(("&$($&#)#+($*&))%(*%++$"!&"(+('&(*+$)""((&!)+!+*"+"$$!!*(+&*'!$%'!")%$("#&#&$!((++%)")#* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A0A0G125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r996 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24806 42 43M = 24543 -306 CGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAA 1FBA:$(@2@#>DH?!).+3'*DG0'H9=D39$0F.">E",0> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24543 42 86M = 24806 306 NGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATGATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGA #:%B"<8>A5C/&E,./*=*63)/:01%).A"(?4)41)'<*1H++="./>$HE=.")<;4/%DF-=!!C"!DBE2E64/6:-=H2F.D,E'-.9:GD?1@44(??(>!0G9<@B=&;5:@D?F,E&.AH(H9%)7=,,;< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G69C89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r998 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7422 42 139M = 7256 -305 CCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGC :0(,.?39HC(&:+*9:F$#2CG(1BHAF;#.0#1023&0D,@!:AD>91.BE6%4=H1HF(F2'(#D$->?%,=.G+/$!H:C.?C#BD(*(=$!>.67AC@#HF'A4+C';51H,(%4<62?H()A11<80G0;, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r999 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12895 42 59M = 13102 248 GTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAAT C:*8547"*$>)%4EG*62/C.;H=0*>(9&9'E0+?77;D'>5@%%!<2>'D1?8&G( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1000 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9372 42 13M5D92M = 9233 -249 ACGGTGAAAGTCANTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGG 3B,@G(5B#'E':!#3,);B'($99F78.7/<19B*#1D=ABH,H/4(3;G;2"=*;,A!6@FD$@69H5D*(F8@(.6@'5C!;=6618+!?+84@7.*&'D6. AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:13^CCAAT0G91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1000 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9233 42 139M = 9372 249 GCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGC ?>;(86BHA+"9=&HG=!C?..**(3.3H=:',+1EC?.85&*5>='9;2$::@@+5.*-39'4#0*:G(%015"1?021;6?2*@G,H3>$H&G!A?6;H=>/6%54;!B?/:83<>*;3"B5E7# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1001 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40154 42 130M = 40011 -273 TGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCANAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAACAAGTGTATGA #%()+&#&+$(&!($!+&&))('("%&%(#)&+'$)!++#&()")%&"&*%%('%+))#*("#$##+%($!#!''+!+!'+"$*+*#$"*()(+#+%&!&#'"%$)"+!%%%!&')!(&)%*##+)("+( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95A22G11 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1001 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40011 42 97M4D42M = 40154 273 GAGGCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCNAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCG (%#$('+!)(+"%#**'&%&$#'%+$#$*')(&#"+(#%$)#*$"('(%&#%)!*+$+(*&"*)%+')#"+*!"%'#!&("$#+#$++'*(%(($)+&+%*"&!$)!((*%*(##$&&')!+)+'!#"#&%%*(($)%) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:3T64C28^GTAA42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1002 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 42 89M = 36597 0 AAGACCTTTAATNTATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTC EF-#H%"A00@C2#F)(/:6!5'2DC7=C/CE1'F4D@08"B$@?C!?6$A#C"9?$#9+GC9'&D4E!,?=2.9<@!4F7-@4%*/E; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A76 YT:Z:UP jpayne@0: r1002 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 0 * = 36597 0 NNCANNNTNNCAAANCCANTNNNCTNGCNANTATNNGCNTAGGNCACACGGGGNTATNNATANGNNNNNCGANATAGNNNAGTNCNNTCNCANTGNNGNNNTCGNNNNNANANNGCNANNNNNCAGNN #$"#!"!"!$!$$###!"!!!"##"""#$$$"$###$##"##""$"#"$$"!#"!"!####"!"!"!##$"#"$$!$!#!#$""#!$!"#####$#!#!!"!$#!"!$""$#"$"$$$!$"!!!##!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1003 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36101 42 111M = 15728 -20484 CATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAAT 0:GD?E'@6%>>2HH320F.-52-(D8C9D@$;%$/"92%7>?(HEC"'!=.@#52-=D*HH=/("B'F:8G8<,(*A(&3A9' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110C0 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r1003 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15728 42 71M = 36101 20484 AGACTCCGCCGGAGGGATTTGNATCATCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACG 52+=CF87/0)B0%+'8776-&)63G3%,>#H8C,!G#CF"32H,/%$;FA6+:<)&E(8AC6:>+'E#$? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21A3C45 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r1004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44237 42 221M = 44076 -382 TGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGNTGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATG 0E&!2'HG#BH99(+1A%2A.$3"&:BH,0F"H2+3D?:9D8/>2H!'1G?$G6+F$?+"C&5<9.8?02G(9.B#8/":H>07CF$&*"%"=*#91D@F4704H?-D**%!=*'>9C"*&>F%@"0C*&H9@(1GE%CE3"7@ABDE2,6&<4H:<9'F")008HE>38%C==6@6F%$*/=C8/9!1#E!>2@0B#E&009";($E*=4D88*H7<"?< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86A134 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44076 42 161M = 44237 382 AAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCANACAAGGTATCGGGGAAATACNGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCNCTNATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGA 2%+F5*D+H%B>;G)G9="&1B;=A929!*EB+$$("F%.@)@@@!2C!=1@4)>='<=1GA+1)2";A50+C)'3C778:'+@)?;#B35=E"@2;0.2;C/!8))%+)$5+?405 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32C20C62G2T41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19860 42 350M = 20210 419 CACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCNGGNGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCNGCGATGCCAGTGCATTAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCNTCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGC +*""#+&!!'+!&$"!+%$$'%++)&++%*%'"#(+$()*'&(#""#"!**$%+$+(!!((+!(+*#(%+)+%$%&%'$)$(#!*'###&##%*#(&)$!%)+"'!!'$!*!$((#"*$&*%'*%&$++!&(%$$'%%(('$)'!)'$('+++$"!(#!!&("'&!(++"&&&&!"('*(!!(%$+'$%&*%"%#+)&(!$%)+$'++'**"+&%*%*&%%($$")*+"#%%"&$'$"&*%&#!'!"#(%!%$*"&)'!)'%%'!&&)!"$+)+"$$'%&($""$"$'(')%&&!!+'$&+'!%)"#)%()+'*&(*#)!&#$$('%#%""%*((%)%*"%%()+(%"!! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:88C2A91G15C39C38A71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20210 42 69M = 19860 -419 CGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAA +5=:>!H()*E-!?;G="#@'<2'F/+@4(-CB;?0@*$!2-#2,3D/:@52%DC89FG*- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1006 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22945 42 59M1D51M = 22813 -243 TCTGANATCCAANTGNAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCA @!47;,/G1(.#@-/FB!C65)#$G@%E4#(+5A(:DGB18)112:3GHE9@1@#4<9527D#((;-!2=6"B2)&E21(D AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:5T6A2A43^C51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1006 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22813 42 50M = 22945 243 CTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCC 48@9CH6G07?GG"*6EG!H:17DG,%2"C!<+8+&1&B8)<,FFAAA@"A&F0C@*$(8*'2/*AG).3/H)A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1007 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15200 42 79M = 15382 246 TNGCCAGTNTGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCNCGTATACAGACAANGGATAA #!%('$()"#&+!+)()(%#$*'($"%#*'!))%$*'()$%)%&#!#+)"%%##'($)()*+$$'$&()#$%'!+##'( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0T6A49C13C6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21538 42 44M = 21328 -254 CGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTC -8%?:#':/:=96:>8-*)>BHA#8,G(=?&(HA>+'@"D0-0H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1008 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21328 42 210M = 21538 254 GNCAAAACTTGCTNNCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTNTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTT !!&'''')&(#*(%"&&'+&'&&!$$"+*&$$")+(&&#(%$&&**"((*#)&!(!))$*$*$!'*"#%+#)'&"##(+))!$&'%)#%%#%'*$*&&*(*#"!$##(&&""!##''(+%(*'%"%#)%%!"%&!(#*+)('+&'++"($++"#'!$!!%&%+(#)*)&!"$)$)%(%&(#*(()"#"+!#%+#+(+$&)!##$#)+"'( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0C11G0T73G121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1009 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12992 24 71M = 12784 -279 GATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGTCATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACAC +F$):++"$+?!CF,1?GD6G&AE3'?'6E-B(<@%%G%ED;!50*@2/+.1@,%!BE=;8",2.G-EH(< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A38 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1009 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12784 24 31M4D54M2D20M = 12992 279 CGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACNGGCGGTTATGTCG @-34#H/2.(?&*4$>=<*3%71B';4+%CDF0#-;623:)$8'1?.'>+//(*$/C03(#&72.A.EA+($>C7.GAA0>?2#1B!B>(!'=B:7'?)<-.;//- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87G13 YT:Z:UP jpayne@0: r1010 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36484 0 * = 36484 0 TTNTGTTAACATANNTCNNGCCCCATNTTTTGNCNNCACGCTAATGTCTGAAAATTGAG )'!(*%'(#"&)*##$*%**)*''*)")"'&##)%&)$%+()&&"%($&#%%"!*"''' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1011 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46711 42 76M = 46944 328 AATAAGCACGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGNATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTCTGAAGTTCGCAGA )&(++'!*"+((++'%!&#*+'#%+!!$&"$&$#"!#$*'%%#%('('"!%(#%**&*'(*!+*#+&*%!%'+&&& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G21C31T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1011 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46944 42 95M = 46711 -328 GGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTAT -(3CE20:7>8%"!+(",?64,<,B2,%%C9G=.-B!<;'E92.:+2(&56!6'@/+EH:%@HF&%6(6%*?6E*3@2"'%"GEB;BHF75B>A- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1012 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31376 42 164M3I44M = 31086 -498 CCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTANTTTTCATCCCGNTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCNCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGTNNNTCTNN )%%'#+"%'#%!""('#+$!#"*("!($*%"*''&%##!#*(%&&!&"%#"+#)"%')(%!'*(!+"##")*%#&*'+#')!*#*&"%$%'+#&('($"))$'$$(%%**!%("&%**&!&&!*(*$+*'"%++&('*#++**)$!&&%'*##)+!%("&(&(%+)+")!"%''#$!'*$%!)!))&!!%*"(*("((+(%("#!$("($" AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:14 MD:Z:71C11C73G17A23A0C0T0T1A1G0G0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1012 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31086 42 290M = 31376 498 AGNTTNNTCGTNTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAAGTTGAGCAATGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTACTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGGGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAA '%!*'#$)*)*((+$+%(!#"#*)*$+)+#$#!***&'!")'&)'*%&%#*&!%+!)$)$$)!!+(""%)+#%)+##$'()*%&'#+"*"'$+*+)#%'%+%"!++&"*"%'!(*&(+)!$#&%('+$(!&""$'$()'*+$("&*')&%!(++''**'*"$##+"%(*%)$"#+#("+'!+*%&+'&("'&!+$%#'%**(&#!&#)'+**#%$)%()&)'!*(%&"+)'&(*'$'++""&'#!%&*&)(%(&!"!#+*+#%++!")#+$)&')$'*%("%!*("('#' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1A0A2C0T4C35T8G79C77A75 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r1013 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43721 42 108M = 43968 313 CAACTCACAAAACGNGATCGTGAAANAAATCAAAGGCNCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTNTGCCAACCAAATGTATATCGA $+'$'')!)*'!!%%*!#"$%'"+*&##""%("+!#!$"'$$!()'+%#'%'&!)('''$((%*+$&*"%!"!")''!+*'***++"&!&+(()%(#%&))(+%&'#! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14G10G11G48T21 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1013 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43968 42 66M = 43721 -313 CTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTNTGGGGATGGCGCAAGCACNAGNNGGANTNGGNANGG !#)#&&$&'#!%)*"#%#""")('!#)"++"!'#+#*&!+#'$"'%+(##)"&('$!%!*(#(!%( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:29A14T3A2C0C3T1C2T1T2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1014 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4174 42 73M = 4294 271 TGGATNGGCTCCGCTCGTNTGNCNATCGATGGTCTGAAAGAAGTTGAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCG *)((&!)*&#&%("''(#$')!)&+#"+!!(*&$%'"")&$%(#)%++(*'+(())%**+)+$((%$#!#&#* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5A7G4A2G1C21C27 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1014 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4294 42 151M = 4174 -271 CAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACNGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGCAGAAGAGTGACAGCAAAGCTGCGTAATCTNCCG (,A:10&+?E>"EB<"24C"1/D>,/A*3:,.;,/%44B"><=H(+!<&"/#9338)-'@1*0>8H;(!B@-6G=3/53@(7*G7./@),.(A&.*5F2*5*<:;$E.:2?7>8%+(7>'-')4!&!+HEA//$1<,$(@!*02H$CC#/%5-(1#D"/$HA(?3(0@<"+03,EA%)'& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C45T14T31 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44001 42 49M = 43839 -211 GGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAA (4&#$D,!,;@@2.=G?99F-=46GG8-F55B&'*'6<6+3)='>'"B( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1016 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43839 42 42M = 44001 211 GNGTNCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAA %)**!$'&%%*#+)')$"$*'%($&+*)*'(!!$&&$&#'$' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T2T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1017 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32051 42 29M1I101M = 31646 -535 CTTTCTGTTGCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACNATGCACNANTGTCGCGGCGAAATATCTGGGNACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGC )$&$!#&+#&!*(+&+!""*#)+")!"%%"%!(++$"%&()*+*"("!+)'*#!$)'##$+%!""(%$$#+&$!*&+#())((*#$$*)&!+%!#$$%+%+%!&"$$"&($"*#$'#()''$+'#%!#$+# AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:9T25T20G6G1A21A42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1017 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31646 42 405M = 32051 535 AAGCCGTTGCCGTCACTGCATANACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGNATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTNGGACNTTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCNGAGCCGTNATTTGTGCCACGCATNATCCCCCTGTTCGACAGCTCTNACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGG +*(#%*!'!%**#&''%+$$*)(*!%)%"%)(!+'("#''&!)#$)(%+"&!$!&*$"###%'!)$#!'+$&#(((!&*&!+&*#)))&!$((#)&%'*+)&#$'$+(+%%"+#(!'(&*'+*("'&%!*&(!++)'*%))!($&!&$!&$"!)'!(!)*"&&")#+"$')(&'$+*)%#)(('())#"$*!&*)&('*+""!#+)(++#"(((&!#'%''$$!!#*%%&&!)!*"$'**)!!%""&''(&&!#&!*)(('&"!*%+)++!%'$&'(%+$+&"'()((#&$#$*()(*)(&(((!$$#$)**!%!(*%()+!'')#!#'#%)'*&"'!(&#'#'#"'"'#(%!&&+($$&$*(++!((!&&&!%')'$&&#*++"##"")!$$)!*%&$)#+)#' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1G20A79A111A4A75C7A15C21C63 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27625 42 133M = 27526 -232 GACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCACNATCTAATTTAATATATTGATATTTANANCATTTTACGTTTCTCGNTCAGCTTTTTTATACTAAGTNGGCATTATAAAAAAGC (22*$"?0,AF-AA2')@@9489)667$!D=!".H1--4.E7*<%(9843/D=7";:!?FF)H%4(1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T80 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15551 42 132M = 15685 219 NAAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGTTGAACGGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCA %"(+!!&(%(!'"$)'('#!"!*%%#!)&'((*")!'$!+$%'&&*%*(##(+!*#&+&"'+&"$#&!&#')"+)#*)$%+'!#!'*)%(!("")+(+"!!*%(&+$&+(%)$$'*((((%%!&&*'(&'"& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0C90C5A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15685 42 85M = 15551 -219 ATATCCGGTGTCACGGTGNTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCNGAGACGN @.>0?,H/HF'##()%;*%07+$&';:)B.&>(/(:!%#9%>#>=4<1E&@/8%'2F(!8;CA>)/C%7.<1F983%&1,<,!D-*#(+=&B?&*.*08"%A;9#<;*(57;;$#)"9'G52B?8A"$!*=%5#F;:4.8D70="=0?,9A#+95$@+@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C23T9 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1022 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17259 42 49M = 16993 -315 CATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCTTGGATAAC H;-$FE6<9334)+=4?C'(#H698F3+;G8&/1'%1D#D*#A;%H,+E9=1FH8,3GH62>!D,HE<6-4*)G@/!1@3FEFAAAE;0.?/(39-50##/'<3C(683=6?%)A>D5?8767!&6,+-'8!H2(-F;(4BC+1$%G;;B&B<.!3C.1$7F5A&&G#!'64:<$A"(#")+F6EF@A45FF2D?/+54+&!-");.HHC.CCE7">BF>'>(<>5=,@@3G01&3A7/?&04D%#>+=@F@;1!$E?4,E$0!/F,<6#*/=9(@)$@&"#9@-7A07**;@=28+D)**++;@'"E3&6?21=8*);FE4DGE)!&F4!>FB-0E'$*08(-F9><)?/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1025 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24602 42 51M = 24361 -292 TTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGT E#)9.0-BGDC!E#/E;B&9>'3!7!0"&F$%%=&(@*%><82D0$A.+?9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1026 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8520 42 100M = 8399 -221 CTGCAGCATCAACTGAGCATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTT 8'6>4(305&2.063$@A,48D/CD)B5,=1,=>68!));G)5),H@3!-33%.#D:+/(0/H:!3A#&@G$!C9?4,B,)9;F->@-6#E?).1*2@H8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G82 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1026 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8399 42 66M = 8520 221 GNAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAA +G$E?!225E"E>27=G/#+1*"*6C$*3'1H/.C8(+08>#?%;F'&+/2E8-2*:C?0$1"..9)>4GD<"*"3E"?!)5HB?<2'++,$FH&(+- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31C13C3T24A20 YT:Z:UP jpayne@0: r1027 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26774 0 * = 26774 0 ACTGNNGNTCCNTTNCNANNNGATCGNNCNCTTNNNNNANATNNNNTNTTCNNANNNCNTTAGNNNGNCTNCNGNCCATNNGATTGANCNNNGNAACTNAACGNANANNNGNANNNGCNGGGTTCNNNTTNNANCGANCNATTGGNTTTGCCCCNAANCCGCCANNNTTNAANGTAATNGTNNATNCTNTCANGNANGGAATANNTANNTTANNNGCGNTGGNTGNNGNNNCNNGNNCTTCAANNTNNA "$!#$!!"$$$!##""!!$!"$!"!!$#"$!!$#"#$!"!$#$"!!!"$!"!!$$!!!!$$#!""!"""$!$#"!###!"!"#$$""!$!#""!"$$$!$"!"##!$$$#"!!""""$"#$""#"!""#$"##!#!##$##$#$"!$!!!$!#$"$#$"!"#"##"$$$!$$"!$$"$!#$!!$$""!!"#$!!""!#$$#!$!"!!"!$!"$!#$!$##"$!#"!!!#""$""$!$##""$!"!""## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1028 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41855 42 109M4I11M = 41997 215 ATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTNTCGGTGCGGTG .1@!<%1'8-:5..4H,B,$'F,F&?!+!CG1,0%(?!:,1$/)';*67$5@EBB?=FC,,G%)+*;?(=7*(<8G18"?);<,G%<7*.E7&8G5;A#@#C0!5+'8D>?")H2(4=4-'H1& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:120 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1028 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41997 42 73M = 41855 -215 CCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTA C42"AH$,0A3-G#D4D,H?4H5.C23B#2#.:%F<16./7875@?F84E+)DBE+1,1>>)C.('.#;H1B> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1029 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9601 42 41M = 9694 173 TGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTA 9"4>0)"E8A'13-F2!-5D8C*:4"=*, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1029 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9694 42 80M = 9601 -173 AATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCA 5B><2408.4&75+H9.3%3<%+2A&E<4D5;@7&4%&($,D*"!4F9;2"F0!'&,50*@9!F-!2;!1&(?">0G'7# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1030 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14162 42 73M = 13989 -246 GCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTC 2H0;4'E#%HFE%E7!3')1/+:4G)=(*1F9?#+G8C&4DEHAH2#/$1D49(8(;G($./.';-7*%E?/< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1030 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13989 42 163M = 14162 246 GGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGTCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATCACACAGACAGAATCAG B$C;@=C20B?$BBGC:+4)6/$.@@&)#/"D(=8="F%D<&)>#&4/)#D'$AD;,33E33H.H?/A:*#).9%D@&C6&'@9*@@G?&9+0"E;9#3=<.(4H#@A?;F>4DC&CD,>G%2A4-;6>(H438;-@F,E)$6B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95G50G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1031 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46899 42 78M = 46751 -226 ACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATNAAAACGATGCACACAGGGTTTAN :+F@!",0=)H1+#!*4G$8.-B@E2/4%+$*<(/($+C""!"DA5A-!#%;=.$%-$)H&+)E'/,HC8$A2G" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54T22G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46751 42 100M = 46899 226 ATGGTGTTATTCCCCATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATTTT 8HA<(:A9,>>*+*'%FG7'=*C-7>:&9G>;&/A/+821(?B%-56@A8">6):,)&-=EB4A(H3<#">@2?D':>B>&6)7//9%B"3%/9>/<**:@185G(0AEA89E9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A111T6 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1032 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34320 42 101M = 34439 244 TGAGGATGCNCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATTTATCACCTTANGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTNTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGC 5-1::&+$G:+('=@=25A17834707B<"(AB5<9C5(HB@A9B:"8&=!4;>/!=&;8:!H59%%-;H/,9'8!;!D59&0)*;=5F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9T28A10A0A24G25 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1033 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1113 42 84M = 834 -363 TGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCANCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAA 35#8%@44= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1033 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 834 42 279M = 1113 363 AAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCG 9'8(17.2-#C6*'!,24=5ADA<$12<7E;F?D=()E33$4B>$'"G-7H$A%C1+9+<21E?E=E5@$8A*C;=%@(G/>15D)2:56>,&DC'",1*2,F?<:'?*C+"#E8/2E;H"!9>F$(2(-4D5+GB-0-?&*;'+4D9G),A,.4:#$>/D'%8'/1(-0>;&<?.5"!:)5G61%9$A5E;5%0"D9E%>&@D&<83-.9H66E*<.@$34,5GB@4<<>F*5*G3/576?:5( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40G45C19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1034 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 887 42 51M = 713 -225 CATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGANGTGAATGTGNTAAA ($$%(+')&(!'!"()#+$!"(&!"#!$%$!)'*"+)&+&&+$**'$&"&% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G9G1G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1035 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32209 42 44M = 32380 223 GTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTGCGGCTGACGTTC +#(&+&!)&%'""+!$!($*&&&#'&"(#"!"''%&!&'%("(* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1035 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32380 42 52M = 32209 -223 TGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTCCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGC >B=@BH-8?64:+#6?(E1)<6&*DA<7D;@?2&!F/59&)A4(!?,95/DG%?<59&"F!*25B%$89)%6,)!#D46H8#'%@'#$!9%.>!$002B53D@(9/C+8<-?#G/73#93)"'&@<8H5C%,B03<.6A2=28"+24D!71>?H(+9@362FD4>#'@E$>G&1%'-G/?CA2*.E(A?0("5@H3=*#+D(:98<4'2231/,1B')"@<*H&94**8+,(+=)!G/3<="C;$D?#<-F@4:1A6,078H;'>F7*)%0!C93*?>43+=9*A?,";&"4C!?A:A#%:D458='?+!0'0),9D>A9.?E?H&73'(AH;H3-0B,=5H9< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79T287G4 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1037 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47257 42 75M = 47416 246 TAACATTTACAACCNTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTG F(7$>"%F=6'!A24D-G/0H>>0","H!AF(1,-50*)7)4+!-G>3H@8DD6?:=*?(=)2B$1G)#;0A**> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1037 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47416 42 87M = 47257 -246 GATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTT E:E5!!'797H:E"'"B-6@?1;E@!/&)D)(6*97%<3C@5/.63?/"C,*:6@,3EF>C7$3B2D8E33)B84(#!=7-"H88A$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1038 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38490 42 60M = 38600 178 AGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCANTGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTG <2E%EE*0E<:5H",/?")0%#&FE%1;D61)=35BC$G=@C<)*98)>#2(A'-0:2G< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1038 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38600 42 68M = 38490 -178 AAAAAACGCCCGGNGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGAT ?;<*7DAD28;:54<'0@/,G;E&B#7D$510F$0929?";3),%BEA%#%!8#02";@8(*!3$,H/GH9+%'*HC&*.4C;?:0723 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:0G33^GC38T27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1039 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34836 42 73M = 34679 -230 GAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGNTTGAGCTTGGTGTGTTGA $'+)"';=;02#=5B%+D"BH6$#F*$:.><:$G:20,8D,;#.%?-&9H";!>(892A.C9-H$+>8$F+)E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A18 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1040 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35368 42 99M = 35554 268 GTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCTCTTACG $B'@H%5'"H9D696":1)?BC!EF74#4399#"'37#.:3F:D+0<-:D& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C91A6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1040 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35554 42 82M = 35368 -268 CTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGNGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATANATT G4401148??(*-A,+:?:?H9H=/FA<>F%#BHH3,+E%>01)B(@HAC902,));:;?H<2F.)='7#5A*0<;.*E(7G'5'E+'D8';/6?7,5+0>D76<#%A&D73)9+1;;!,652A<,?1>''=1$72(B?$C0!-;)F3)/2$D7!""46.!G5,/@58EC2C(>(H6%.0?-,5>2:=!6,)>:=3=#+*4.G6/&=7+!)':!@9B)=#9<.D?.;$):*7=$%==3'&F=;D-B(*)@-9.96/%8/E"F$CB3;">%3A'<$*H?/0'?76//G*0E,F;FE&!7%2;*,5D+8)*!520=E8!+:$:=;+B!1#.E?H@/E4=;%?0A+(."/F=*6:/H$D"36H5>3!65%1;//(9")$@CH AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G95A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1042 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14931 42 74M = 14800 -205 GAAACTGAGCGACGGCTGGTATNAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGT @<"#4!G@/)#'(5,%!1+,++#C)@C#9B.5H""1>.'2$-D"E96D1(+&$<".$7";7%;7%3HDA)?/HF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1043 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19216 42 50M = 19419 294 CAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTG +B,3/319$06!>%1%/(6/A42:)'="48;!:9E26@805'50B18*#$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1043 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19419 42 91M = 19216 -294 CNACTGCCAGGGACGAAAGTNCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTATTGN (''!%$#"%+!"$&&*%)%!#($!!"%(*"&+*(!%((+*'#*+(&"'+)#))*"#'%+)*$*"&$%$#)(*!#(("'+"+!(&&*(')$! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C18G29G35G3A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1044 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31569 42 118M = 31405 -282 AAGCTGACTTTATGGCCTCNAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGC 0(4!;4@@AB%.3:"?<@B'9=,54-&1(&7<5@,'F?BDE&H*/0:3&(0E<-H(@B";="8F@<7'))$'G7D?3H><61E%41H./;()G6-&=AA"(6@$?('"6>/A'F+H''!G%H5&C?1:*@$6-F+7DB--0%$:*1FF5064/#+9=."=#>3)//,5(=0F)$.1())F<"*612;%6385"4EH72@1=4D?)D>&E#>B-((+4'+.0;H,+:$9*4/FF AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:146A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1045 77 * 0 0 * * 0 0 NACNTTNTGTGACTCNCTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGANAACGGCTACTCGGTGTTTGAGCAGTCANTGCTGCGGTATN '%"%"#!$+!(%)%(("%(&(+!$*"('''*)+")"&*+)#("*(%)#&++)('('$(%'+**&#!&%##+$!($"($!!*)*"!+ YT:Z:UP jpayne@0: r1045 141 * 0 0 * * 0 0 CGGGCTTCCTNAAAACTGAAGCGCGCTTTTGAAGGTAACGTCACCACGCGGCGAACGATGGCCTCTTCCAGCCNGCACAGAAACATCTGGCTCGCCTGACGGGATGCGACGAATTTTCGCCGCCCCATAAAGTACGCCCACGACTCGTTCGCACTGGCCCGTGCCGTGGAGTAGCTCATCTGGGCGTAATTCCGGGAAAGCTGCTCATACGAGACACCCAGCCCGGCAGCGA $H>F:%/?E1C(>43"1?@H8GFD#-/AB.;B('.)E6;%1&D1(>@0@7@C!*;B'#,:*3C*C-@4!*&,8@(B!E+$;.="3.A)3+!-,&"//;1(7>0&9>?,@!+H++F+".:?+C#1C:*(129>%/A;*GE.<1#8:&>&)/=2CDD#131$@"(;H<&15F4@8+!'"HC(32GB%#A8>A38@%5#=#FD:BF'#64>>,).@0<.B/+1+D/"3#FE=='E YT:Z:UP jpayne@0: r1046 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23258 42 142M = 23099 -301 ATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATCAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCANATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATA G+/4+G84%7,H&=3C6=CF(4G3F"?A-&/)GGD;CD0"#&)@F0@FG)?A"G:BEH(4B;-5@B?@0-8**/-5';0F+*)G3B348")7"=/:39#CBE9:=.(=0)1&BA>H%,6'/."5#8%13 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33A53C16T37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1046 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23099 42 97M = 23258 301 GATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTACTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACNCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTT 1B-*CF51-8F/>5#">AE/04)C""/286(C%%4G?;@FB11?954*7)EGDC2G-&0(8!CH)11-!F)"ACH/C%6(,+?B)%"=(3!**967' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T29T40 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1047 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18663 42 135M = 18809 271 GTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCAC G>:"#=0F?8GH9H;'#+?6<7%/<0::$+?7?9$<42)*D*==3,=1$+(%-<+!>+<':;75(:5)F52C0B.:G>;0"D!@9=%F-@A5'G"-/"3$D&&.%!EAHH*1+"E#H6"CCH(B=4:""G#&>85 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1047 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18809 42 125M = 18663 -271 CACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTNTGCCANCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGANCGGN !%%()%!$)+!'()'$!&#%&&*"!)#)"%&("'%!#)"()*(&&*#+!+*!+'%$*")"$$$'%")%(*)!')*""$''%$$##*&+(!"+)+*$!+$*!'(*')+((*#!&"(!+$$*#*&&* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33T5G80A3G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1048 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3229 42 69M = 3003 -295 CGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTNTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAG &!'**"$+!"'%)!%"$#$'++"!($%*('&+$$!(*+!*"!%('#!!$%##!($+#'$&!#*%'+"+' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1048 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3003 42 226M = 3229 295 CAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCATCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGNCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAA +&($'%+(()&#+(!!!+"(+$"#"'")'+$('*+$'$+$+"!*$&("$)*"!""(#$")$+(()'()'*!#"%%%()(&+('!"!'"(%!)'*(&"(''%+"!$(++%)$)#%(#)##**#!)$'$!'")&%&!"'!$'!'!*&*+#*('*)+!)%%*'##!"(#&%'+(*!&*)#!'#$!'%"(!*()#+'$$"%!!+!#"*%'"'*"!!"&)""!)+$%%+!' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76G37G111 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1049 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21442 42 93M = 21339 -196 TANGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAG 8%4D4C)*>C"?4?$B:-GC-:5<-73A8!%5F31)6>2<>7<+-%2E:,!-("#6@E%":48$9#/8/63.;?1B&,'@B(<#;AH:DF8GD+>6BF!1A!ED:4B,7#-09"9)=+)A?-C&D?03.64>B9;.GC?A-=C6=)'9*0$)A35;#HH5B'&$/?46/,7G9,/8/:'73*FA5!6)@.)D,5HB/5,E,"24@#=A>*1,GA44?75!=F/F0@G=C:3&+DC"9+A"57@'A.#*6">&=6FD&!(6037FC!/4H<3=H#H*.G<=$9-"$$H$+;(G;!&@91C-=)$@G=:,'9-6@-D#";!#.9D6:%29/G&#,-H07*E&!.$<@#.08.70B/53::&#'HDA;C2C$:(E AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:66T24T3C11G70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1051 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18681 42 46M = 18503 -224 GAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAAC ?77"1,81HC@;(@/9)B:,@':>?$B5#;C#A=7H4C2>58:4/2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1052 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43732 42 68M = 43924 260 NCGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCA &D>G@H(0H76=F)>525">H$@!8@CE,80#)>'F+F10F32((G<6)<6!F&.51/%:5H*G2"$4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1052 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43924 42 68M = 43732 -260 ANGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCAGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGG ,!CH@,6G1E*2+A,)7C!5D;#0D#.;;.FH?+64FE,<7B-H?5!GFHC>,!73+(G<'7F("==. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A37T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1053 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47222 42 152M = 47050 -324 GGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACNTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGNGACGTTGTGACGTTNTA 7=4H@E!@&(D.:!&C5$<;>-D>D7)%EH*6@F-4'$',5!)A-2/*'$84>?=2BGE1A+$>;-5',2(8;9%A9@'1)C*260>=#);H4"581C-#CFH/>!60.)95=FFH42C"3@H:-CA4?>"-G6H,D4?3F&%?4?>6)!() AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48C85A14T2 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1053 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47050 42 166M = 47222 324 GAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTANATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATA 53HBH#=2$80HG4=5<92#7FC2H=:-"(A:G4)<#"74(+#*2>=.;8+/5.1+H='7/$69.A8()#D68D/!76;!,58=,A&&;>:/G7C*A3)@E(-E=..9)E*4?H#H5H=''H$41B@$@+.G>;#(?"E63':*7;6H.!GF41,HE@0#11!/20 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35A127C0C0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2014 42 53M = 1808 -259 AACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGG 6&7A'BFC+E-E*&6&,'5.(:*<<5=.1<;@:EFB>;$+C)C6D%* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1808 42 59M = 2014 259 GGCGAAAATTGGCGAAGGTCCGGATGCTNAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATT 08B&282:+G"H?A$(&>D5#$)'H$)3(H4GA(4)-%$6*+70FD3D5?/1+=!)F5E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C11G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1055 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2599 42 55M = 2400 -254 CAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTT 5>E<7#8-?DF@&?>F)B1!B?F+?!CBC,+8:CE'E1278C($%8=B1:"):-+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1055 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2400 42 51M = 2599 254 GAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTCTGGGACAGC 6,C<+@(@671@B7#6E&#!!6?7*'#05%:<3;B@62;"AC78B"H@B=$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1056 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36323 42 145M = 36323 0 ACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCNGCAGGCTA .$%*')/(=B:!7.:1459>"FD)3.B=B/"/!#"0.3$B7<*5G5*,>4G+6/E*FF6??.&=>,7-!.,*'#4%D<>8C?:315DG7!5C0=&E+2>(+%"CB$D7>6+$(97%"$.%'=@>?@<5+@3)?(A550E*2:3C*0?,GF&'-0/)3*$C-.DB)'%>6.1@'08.>D9+!G0/1$A$?(/&@'&%?(4"(?1%GG:7@6E0>?18!9>F,F$/3H)1HE.@&FA3E5;'-3E46C*$*CH;.&!24"@:)3'.D#245D='7<6&E&16GB@;=C"<9A*'+H7,?&6<38;EE'7=B"C%/F-?2>(D?1:5.;+75?9''+01!=54/,964%)'6?'=?@/@$5#''+*5/GF)548=$6F>*'3#;1A??0:#&D$?E#*0@<.8.G68; YT:Z:UP jpayne@0: r1057 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13014 42 471M = 12974 -511 GCGGTGTATGACATGGCNCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGNATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGNGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACATGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGN 4>)@530DC76.>+/(&5AC?:?D&/;,3#-*&>,"#;%G8C-A'0%!9+88;1!+G:+C6EEG,!7'F5/1@C<->'B!3C-(<)8",G.1=2+DF'"C&=A<6;974":69(%4>D6E!A>%@@*(6=$%D0G'%D=E79!'="G<40!:.C=,*A3&(7H=2*B6$!6-*2&/D")0GC<6),2<@=>++:#3H)7/5#90E=(2"",,0F=F;>+0<(3,8?((97C%%=474E#HE39B?!2C=!&$E9,/&">:C@1>7!B'%?3H7="#C6;>#E,:5,H02G,-HC7*A.84++%E:!%4C=+%A$1!-B;8,C3(/81*CFAE+DF:$:8@3A.D@%H:8.D"$.# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:17C104G179T100G66C0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1057 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12974 42 40M = 13014 511 NGGCTTCNCGACCGTCCCNATNGGTCCGGCTGCTCTGAAG &)"(!!&!'''#%$$$"$%&&!!*#+!&+"+++'))"'() AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C1A1G0G1A3A2G0G1A0G2A18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1058 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9790 42 42M = 9677 -155 AGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGT B9'#C:76?3B996E;C5"3.%G6@)88'3,H85-722C8AH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1058 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9677 42 73M = 9790 155 TNCCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTNAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTG '"+)'+++($$+#+#)+$*%$(#!!'$&&'(("*(+%+&$+!(($)++#")%!&*&%$"#'!$"+&#$#$))$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A27C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1059 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16589 40 137M = 16740 283 ACCGACCGTCGGATAAGANGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGANGCCGGATGATGGCGCGGCCTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGNCCCGAAC $++&(%)%+)"+")'%$)"(*%&*((*%$!*&"#'!$!*%$!'**##*!"'+&!*$*!*%%+$!")!#%!)"'!$'""'(%&(+'&*'$+#!&"+%%+!*%'(%$*')'!"++!+%"*'#)#'+)#(#$(%)$!*+( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:18C29T16C1G58T2A7 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r1059 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16740 40 128M2I4M = 16589 -283 GGCGACAGAGCTTGTNGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGNCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACNGCTGGAAACT !:$+&+:"4)$B*+1E=:1#=&E289C9&7?E$>*04(,,$4%#8G0,$%=3<1&,A0*4/$,'6;$C7*9C2/3F$,4=+=='0&?$&!H%BA%(@/6CA4#::84&!/''>6H/%C'0H!4D<&*8*30@@! AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:15T68C34T0T1A0A0A1A5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1060 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8602 42 223M = 8517 -308 TGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATCGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGNCAGGCGGAGCTGCATATCGAANTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATNCAGANCNGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGTGCGAT 835$AFFF:037"C;'*"G'1""+$%%%./#$DH+<"2@$../+852'E=4HA3'!%!)89='"&-5E23CG?E'6'>9),@0(G<+&-,-6!A<'BG0>,384<++A4!?%4%7,7!C%"599C=+=G"!C+2#?F:B>#FB>?5:F8*A)4;92$*A;#-$-;A?@,+>98C&9/+$!1+16$0:/6811@G$A(77*E.HB=!5(99<<* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92A9 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r1061 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20578 42 119M7I58M = 20812 336 CCACGNAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCNCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAANCGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTG ($++!)*$%(+'''*$'"'#$'$&(!%*$(%'%%))$$&"'%'$)&*#!)+!"+*#$!((!"%&+%!&!)")&)*%)#'++(+)*'))&&&%'++%&'#&(!*!&(!!+*+'+''&!&%!+%*+(&%*!%"#&*"$&(&')(!((!*)"#'*##"!*%'!#!%%!*%#*&#&'#&"!(#"$)#( AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:5A37G53A79 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1062 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40404 23 74M = 40487 255 GGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGG 2;%*.)-E&9--*(/"3A/.>?9<41G6?7#157./E.?>G/*!,F2A:75,,=)7E(4@,70):GC;'"(*8H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T20 YS:i:-61 YT:Z:CP jpayne@0: r1062 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40487 23 76M3I49M7I13M5D29M = 40404 -255 ATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCANCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACC )G%9?:D)#4<(?GE/4F>B<4?E3871"3'&)9;@00G.7F+E3'<4$,$-A85-=2;6!F';/=<;EB:+4(42C@>939'&*-/>$*!7-2;'5/G4,2C$/?"D"!)*51>'B<-E*?4+17=H/EG;2D'0>5BH7"HE26<1A%*?97162<><,#.(%H:.FA6B6(1*4,8+A;2H/2/'CDH"=4+:4'-73.0'"BB=48#-'*5-BG-:1-!>(D#<23.H"B=8).B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72G53G7 YT:Z:UP jpayne@0: r1063 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15524 0 * = 15524 0 NNNTCNAANNNGNNNGTNANNNAANCNANNCNNNGNNNGNNNNNAANNANNGCTCGNTCNNNAGNNA $!#"$"##"!"$#!#$$!#$!$#"!$"!"!#$$"$"#"$!$!###!$"$$$$$!##!$$$#!"#!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1064 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40040 42 65M = 40244 253 CTACTNGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTAC -2A=%21C%>B&D/!9)%5>!D8)-D=!3+-%*$15D&$738&H0?B'BB9D<75#$;&G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1064 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40244 42 49M = 40040 -253 AATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAG G@8%175B4/1C+")0/)#A6+#6!<*,D%4!.@D//(0%3G$7901,4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1065 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32338 42 314M = 32292 -360 TGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTNACGCANATCGGATGATTTCGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCNTTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTATATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTA @$D/*C8"C3H!(,2C9E(83;%$D8CGC$9*:-*0**1H0>3C%DD$"8+0,;>!/G#&G%@B4/-C0C(,&/77/=)9C2.94D&B(75+&G)109)@>@%EAB>=0.G5"<,1>$DF5?1<3%.6;>H*'0(3=>+,G;-HB$)DH23@26$(%*G"D,6$%,-,(EF-49&(BBDA,:BE$0H?H%BBE"80>?8?.:)834>4"$!GCEC?C*,@:0,.!$D!1.+>)##'B&46.&%(*D249 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:116A5G11A125A23A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1065 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32292 42 46M = 32338 360 ATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACAC "$*+#)%*"*!''*%)'$)&+'(**(!*$'(!$&#(#+*')'&"!' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1066 77 * 0 0 * * 0 0 TGAGACTCTGCCTGANGGCGCTGTAATTCATATNGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCNAAGTCAGGTGGCGTATTNCAGATTGT FH('!!6#%G"(/!7A."?"-GCD5EC2?"61#)&<$50)$>1>$5EDBA?:B39@6"C)&/$=51H3D30'/83E/&:H; YT:Z:UP jpayne@0: r1066 141 * 0 0 * * 0 0 ANGGCTCTACNTTNCGNCGNTNGCAACNNNGNNNCNCNNNNCNNNNNCACCNTAGNCCNACTNNNNNNCAAGNNGACTNNNGNGNNNACCCNCNNGNNNANTCGNCCNNATNNTTTANNNATGNCNCCGANNGTATNNAATNNTCCNGGAATAGNNANTGCGCNT $!"#!$$"#!"$"!$!"!$!$!$#$!#"!!"!!"$!#"!"!$!###$##!#"$!"$!#"#"!!!!"#"#!"##!"""#!###!!#!#!##$"""##!$""!"""##$!!#"$!!"!#"!"!"$!$"###"!"$$$!#!$#$!$"$$!!#$"$!$!#"!"#$$#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1067 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16160 42 265M = 16094 -331 GCGTGCAGGTNGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGAAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGNACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATTGGNCAGAN )!+'"#%+#&$"$"#"%&''#*&$*%$%"%%'$%+#+**+!!*((%#&*$)("#%+%$(&#$"*(*&+#'"%)&"++))#+(")!(##!")#'(#+$&%"#($"$'$$%%"))(*('&&*$%&#+*&"&*%*&&$$*"+!(&&'!+"(("""#!!*#!")+'$*"#($'"$($)#*""*")(#)%'$**'#$*('#&%%&!'%!'#+$&($%')#&'#(''('!!#$!%*!'"(("%*'+()+)$'+#(*%%"+'('%&%'&*!! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10G87C31A125C2C3T0A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1067 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16094 42 66M = 16160 331 CACNANNATCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCG *%("$$#"'+&"+!##%(#&$%'&'%(!++%&"$%$!#"&+*(+"(&%**$%($"%%'"#(%!)+" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1T0C0T0G0G58 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1068 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3902 42 46M = 4011 209 AGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTNTCGTATGA -2@&%1D)$"9.F7'$<.@!2):)*4>BD5'-+H>E1$+0A9*B.6=263G+93C1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1069 77 * 0 0 * * 0 0 NAGTCATATGGCCAAGCTCATCTGCGGCCGGCGTAATTCCGCATC #EC-,6$00$->"D(&,+4,7>C@5&?+6&D#3<&.0BF%7:$.' YT:Z:UP jpayne@0: r1069 141 * 0 0 * * 0 0 ATCGNNTATTTGTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCNGAAG '&')&"()%()"("+$)(*#'&)'$)+#$$#(#"(")#!!)#'#'''($#$*+)$*&$')%'("+$)!%*$('!%+)$'&&*#+$+'"*(&%$"'(%!%&$!%(!+#$%*!#$*''!"+"+$ YT:Z:UP jpayne@0: r1070 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41860 42 48M = 41860 0 ACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAAT "A1B0).7?11"D6GA6E#0B'&E!,=!.:=F$?)<"@F+65-= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YT:Z:UP jpayne@0: r1070 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41860 0 * = 41860 0 NGGANNCTNCTGNANTNATNNNACAGGACTNNNNCGTGGANTNGNNNNGGCNTGCNCN ##$!!"$#"$"#"$#!!!"!!"#!!$#$"##"!$$$"$!#!!"!#!!!$"""""!""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37369 42 115M1D86M = 37274 -297 GTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACAAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCNGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCNTCTCTCCGCATCNCCTT :4DC+G%1'#'-&-8!;&%15AEE;4;;%&(+CCE$6,2@7E)3(1!D*'(5+C.&-$H)"0#55=4C,8=(C5B@0EH'7H7240&/3D+H3ED7#DAE)GG46B8;+F/"H-:1,'".&@60E,1)8F>4=;&A;"8(A2E AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:68G46^C29A38A12A4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1071 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37274 42 95M = 37369 297 CAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTNTTGAAG BAD?/B79%*0G6?=D18"@!,*:;!$H7-9*2A@41H/H1H009A9CEA/C>@3-@0D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88C6 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1072 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46990 42 163M = 46902 -251 TGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGANACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATATTTTCTGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAA <6")!?B9)A/86$CF,,5!&6**?6-"*D./?9=17&6*"9(;2!#H1#(?H&*(23:"%;B#F,;H67H..>E$6@3/H;*+#34?B-E(;-:7A=&&(*,$:*$2:2+A<75 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C100C4A29 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1072 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46902 42 88M = 46990 251 ATGTCCNCANCTCNAACNGGNCNCTTCTCTGCGGGAGNGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTAT %%%%&$"')#%!&"($%""&(%!+)*!$&('(&!)"&%!$%%'$#*'(#%!$%&**)()%&!#$'("%"#+"$#*'$%)*&#&!'#*' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:6A2G1C1T0G2G2G0A0A14T50 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31969 40 91M = 32136 234 NNTNNNTNCGTAGNCTCNCCCNNCGATCCCGGTGNGCTGCAGGATNATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGNCTTTCTGTT '*"&!##$('!*""*)*&$&!#('+%!+%(#%%)"#%'+)#*$"+'+$%")+)'"$+)*%$)*#&('"+)+)&&&#))!%"%$!)((%&!( AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:0C0C0C0C0T0G1T2A0C0A0G3T1A1A0T10A0C10A35G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1073 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32136 40 67M = 31969 -234 GGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCT $)&$*&*!"'""#*!&*)+#*))!!('%)(((%!)*&&)'!&(+&!!(*%!!#)%&(*($+"()')+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66C0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1074 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16406 42 52M = 16054 -404 TGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGG 0GC;E&$:#36"7:,/G"/=/):*G89&+$?&93:B:F<%>BC=@E05H.B5,B)-(><1:@'D5<.,F%?>;F7#D90?("2?,"$H5;BH=0?5/0D0+C?#>@%&;=::B'1/C9F4=<@C/.<);;@+E=C5+'/A47CG-+A126(3/)79G%&,*,;)/2$;*"&(E4=A21(=3&77D!#,*.C=$#"1%0,H-.%1-00'B#"3:08?B?A!+E++6G31'+5<-7E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G36C63T7 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1076 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29225 42 54M = 29338 224 CCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGA 9F881&2F2124'04+A'*/):FA=31!:1%4"."9"%"A6F::=.11?AF=># AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1076 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29338 42 111M = 29225 -224 CCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATNGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGT /%$79DE?%=9,=#<1;$;B*$B)>"@@06$!6+7!)**A5>F<*,/"#G5.#B#B&;-'G?C:&'-(&6B63/GBFA-H0@"F;.3="5C(6%F@3;4A14..(?(4+&$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1077 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36593 42 55M = 38940 2406 NCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACC (49C,?CF()79:,+E;*9(&-E3$6CE'CH4>/4- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C54 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r1077 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38940 42 59M = 36593 -2406 GTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCA )'"&#!*%&'&#$)!*))''(#*"+'"&$++$!('+*($&#+#&&+'()%((&!&#++# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r1078 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2772 42 148M = 2650 -270 TTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGTCATGACACAGCGACGCAGGGGACCNGCAGGATTTNATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGC 2!D1+2,;9*94*3(%+'G@+??=*CF:!F$F$<)96!7;=+';0)*3-"<.-0#-+AFG8BG/F-"0=B3';2@3E+*(@+%.BH9629C$,8E/&31G,G:0G+G9EF$"$#?H51,'#9*%'/B-CF=D9/C!1C%';>=.&0)3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24G24T9T88 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1078 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2650 42 76M = 2772 270 ANTTGCCGCTGCCCGTGCGGNACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGANAGACGGACGA )&GF-CH&8C*ED(=G!B<:(<+G/8/E=!0H?:/(@4&%"?;/G1?/;'0+">,C6)$#''#/<'4-%#7.@18F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C18C44A10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1079 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25494 42 80M = 25288 -286 CATAAGATAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCA 6H%!%'<<@;;/4DHE!DB.<>=?9+!90HB9)52CE AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1079 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25288 42 206M = 25494 286 AAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGNTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTT )-:;;FB&G48/C?/((84-1!F/64B#G23>C607*D9""&+418&E"6!%%!/D>&F<-81F:.C9+B=74==H)+!@C060/$(%D!#?B/94!,"8:CGB50>*<)+)#:""88AH@D*!2A.#!F/)!":E<687<37&9:2+0"?%<*"A7E=8>,3D74;!96DHF4)3!=&.7B/;!')<3#:5B%;#!*@+42,+C+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157G48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1080 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23913 42 71M = 23984 273 AGTCATAAAACTCTCCATNTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAAC *+%(#)$')*#!("&$*)#+$"$"%%+$%$)#""&*)")!''!&$$+*$#&+!*+&$("$#$+"%(&(*%! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1080 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23984 42 202M = 23913 -273 TGCTTAACTGTCAATGTAANACAAGTTGTNTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAA ;0")8-$GDD35#/)*%D&6;E.*E0?H*9-)'%0#63)7G@D5*/-##=)3G'15;G49!6&8@2(H0/F&1C+-4&'+/(29/E>6+30D--0#B;5!G8F1B&1E8C165/1,1BGE*H!,$&:1'AB#F5G"'6C!B0773<28%8''!C:@D:5E,!"?#>=(!9"C(&C)C6F=40BF<:0:3B494+>-><,'!A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T9T172 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1081 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34065 42 64M = 34281 283 ATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAAT 443(*#(:=!2"#!9H-)#2&F-+"@C>07E:++-A++:*D:3.3E<''?E5C?8G/9'-A;5$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1081 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34281 42 67M = 34065 -283 TAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATN 0:)C#CA"-(=+C7B>+-%./0?8(!'#)*@#/E2+9H=+E=8D.;0&/01==18?*G!5+3)@08" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1082 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8836 42 65M = 8632 -269 GTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCT 'B"F)(HD=0#>>@@&!?C.@-3#."$G+3E0'D%'!;+4&6!2.?BH#CAACG$*D+@+G:1:0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1082 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8632 42 130M = 8836 269 CCCCGCTGTTTTTGATNAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCTAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCT &6,&%;H;>-E<3&>!H&30301((A!-#C;'&(#F!."'?)EA=7.@3,,D*/@H?1&)="(9,,D-$;)F&+>2/%(92/@,3D@4#.(#2H.G>-5?79E!"3*0A'5%+D8<783'5?7H%)%&(/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G53G59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1083 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38776 42 44M = 38555 -265 AGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCT A*(F)77*G/H9-/2>-C3=!6((#?G,1$'635B>A.76B-:& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1083 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38555 42 69M = 38776 265 GACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAG 9,AGH$6=@GG0G:@F?EFA@=E1&=7A&(4&38(3<2&H:31@%F?+9&$5%@//>9?*18*;3'D><962F9777"+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:12T33^TG11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1084 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30684 42 146M = 30519 -311 ANCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCNCGGTACTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCA E;F/3(5$<=27#?:?4"8DG-)>&(7<;00.,2>"*D'?1!5=%@..6@/4!&H-5%G,38+$.A*.G+%?%BDBB#ABFD85B4B??.*67!!&,'.#@#4=9E22<;-;.(%#:;#!D.@(E=+>4'$+%A;0!/G2(& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G110G4G28 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1085 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12803 40 12M4D54M2D181M = 12743 -313 TGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTNATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATT >>DF!H*)@,3B5C5#)%=/E!=E(>FF16E0AH=%.E)D31$GD@3@977%?9*B0(!2CE4=*0;72F+FHD<42:<7G:A2/+>94"D,,B3F>'/6;F=9*=4'B-;CE'B))2C' AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:12^CACG44G9^TA84T96 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1085 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12743 40 60M = 12803 313 GACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCNGCGGGGATTGTTTANCGTGG .+2-E9B0A%?'.0(.%2<&<$#-8)(8->,5?)":#.*C>+;,4"45H$1G*//#F)G@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A38A12C1C5 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r1086 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45740 40 42M = 45839 192 TGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGC E7*-B.FH%%$035.+&2@DF+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1086 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45839 40 45M2I48M = 45740 -192 CAATCGACCGTGGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCNGTAGTTATGGTNAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCA <1$"15H>5<&=6)6;#4837?-G5#8.+A=G+ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:11T31T9C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1087 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27444 42 55M = 27604 214 TTNCTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATNGCG !)"32'+AC.8A)+%$*?C=F3"D=-,C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A48T3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1087 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27604 42 54M = 27444 -214 TCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACATTATTATGNA #GC(6(0?#G67&6H)F=+EH3,,(3085?#1D.1&C+8(4G"3A"3.E&C,1> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G7T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1088 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25692 42 50M = 25871 283 CTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAG %924'3'C;,!F.6>=7'H2:G86%98'7)/))*"4C('>#&1":A07>: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1088 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25871 42 104M = 25692 -283 TGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTC >!5H*7.0,>A94A*;76;<$>8*=H"49*GC66D'0F)%:(5=8AF.0<*G,3?G+6'8C!'/0B1C;*-:H*&%E&*>531?.;#F!$6?28=-1#)D4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1089 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27413 42 58M = 27273 -198 AGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGT %+CFF2E8<-+6G;$+FGH,8<;7/C6'*H*<)!6(,;F6!41H=#:>6$@/@GB@7G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1089 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27273 42 140M = 27413 198 AGCCGATAGANAGCCACGGACNTTGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACGTACACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTC #'++()*!)"*'**&"&%#*)")#%#)+!()++&)(!*+&#%(!)'($+%!)*%"&)+$*))(!'$+&"!%(+!(%$)%+"$'#!("&%&*$"$)&%$#"(&$&!#$)%&!)"'##)*(!&'))'$%"'!''+'$$+*)( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10T10T1C49A1T64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1090 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7364 42 57M = 7579 298 AGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAACATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGAT 9(/8-,75%(7$91@#H6B"1$5"99(27>#"+%FF(?"&*B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1090 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7579 42 83M = 7364 -298 CGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGA E%:*%(G74%&B-++$3>>3>:=86.+D!"7:A-0:7-:!:3:(D0E>DFC8(>>2/6=!/C"G,0+&:?##656'1H<)"H6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1091 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3403 42 65M = 3208 -260 CGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTA 9@5:6-'"D2?D561,4"=#,&5!F;A8<"7G#4*'@5'<<3:A?!<(B)+(HC-(;(F5%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1091 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3208 42 170M = 3403 260 TGCATAGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGANGATTCGGGAAGGTGTGGCNATGCNCGCCTTTNACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCGGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGANGGTGAGCCCGNAGCGCATCAGCAACCNGAA +)*")'$($'!%!&"()(!"$"+*'!!$#)*%%)(!("&(!+*'%#'*$')"+"()$(!+(+%!'"&$)#+"&""&!'"#'$$%"'$)(#(&%"#**$#')%!*!('$"&($&$*&*'!!'(!%""*#'&+!$"&!*+*&)($+!#+!"+#)'"(#$'%!+"!&&*%)%& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:5T31T18C4A7A26T42T3C6A15C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1092 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40085 42 23M4D131M = 39942 -301 GCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGANCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAG ;&.:B5:30(9.3?*A:FC.7*9.E#!.,=H.E9.H@)-/5!2++'?A*H@1G&(G(7:9-F!G+@-D$'!G4H!:,B0;(<,E5H3,G+6;$..2+B1,+9.().%C95G%,0:.<'(1$/9'!9% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:23^GTAA94C36 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1092 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39942 42 143M = 40085 301 CGNAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACTAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCNGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGN "!%:%,D113+1.57D;EF,!F:"D>9%(0G#<2=09)@1;+:06&A-05C6<;E4BG(0C2>G4D/FCG=0H*:6*=4CC&0D>!.F:F=9C,+00$!<==%4D:!//"6=/GHG(6%>6.68F,E;9$*,DB-$+/6?58" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0A30G45C62C0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16974 42 293M = 17267 397 CACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCG "9;1.*CG;F/!11?D6>$3D@1CG87A?<"/H31A:88':;;H(+C9B##0&=/7(&6(D$?,=?8?%<68(0=-D".1-*$B>,>-C=8&'+14:H"F=&89$79=*E#562<@)&/4!@%9/260<&69?(?:$$C(,"@H61F,<7!H!'9CG&367A(1;H$FB;);HH&7'+G/G3#$07.B35D"+H%+?":AD/$8>E?FA+6*05/2('#1&:&4>F.743'B,D5C6C2"FA1%,E,.H/:-93E-3?9E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:293 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17267 42 104M = 16974 -397 CCGTCCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCACCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCAANCNCTGNNA +"$'#)*#')!'("*%(*#+)$$#&'*!(+%*%)+'+!$(($'#!#'++)'%#*$&&)")%%$*("*$#)!*#"')*%#((!(#'()"'**+""#)("#)("!" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:4G25T62C1G1G0G2C0A0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22320 42 48M = 22492 300 GGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAAC -1!*<"<#7:CA!&#.+.=$C#H8@4;(9@=.>!,>$E9D3*:>F''+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1094 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22492 42 128M = 22320 -300 CTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGAATAT 4HC)8&/1>A6=/!.3.$*,@8($7D,>#*/F3;$+%459:C4>'*6>8+>*!D=::F).0BG%&3)C?2!@$/H8.08?4H8/7>!?3?:E?B>6C<3<.?D8FHB)'!2#=10'A$,:65;"81*1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1095 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14246 42 151M = 14129 -268 TATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGNAATGCAGGGTNAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCNGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTN 4-C9D>C1322)=$F,2?*F6('/4?DE*<"9C*A74=4"+5&>.&=D78B(,$4>75$%$+#,$AD4<,=$(/9276/A*C;)$F>/BG(4AG190B5<9:CA>:5859%3!24=!-=6&9&F'738@>#*/)=.%D2.46D$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58A10G45T34G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1095 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14129 42 99M = 14246 268 TCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAG 4(4E46G2H.=:283)"=1;(F6(!B*"*.'!G!?52%;@"2,"$B$E4H!8A5G<;#"HF?G/A(18<>'"9G.?39/##"?"$#C1?'2?)//,H+B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1096 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24238 42 114M = 24083 -269 CAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCNACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATNTGCCGGANGGGACAA %")%(((%&*((!&!')'%$)+$*#"&*#"*!%$)%!%*)#)$$+%)+!&&**$!###')*)!)!'#%&(&(&!$'&))#'((*(&%)%$!'!%!(%$&++'+((&(!'*&*%$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:57G23G16G7G0C5T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1096 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24083 42 122M = 24238 269 TATTATCATTTATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGNTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTANAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGT :&3H42D;*A'E!996F#1?,H%F"5/=.5@,"7="#('(A$97!!&@%DH&.'*,'4,!22/77/2E0%E>0E!?5$))/AG'#(0&F-(:%CCBAB0,B579'%)8H(49E@C;*":%8# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C26C38G45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1097 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20144 42 172M = 20447 353 NGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTTCC "';29*A#%*1"?%,.&(*(>1#E3C#:D.2CH!37>A+A45F3?D9A)>A8-%E)99/@HH-:2;4*81$9&87(/31D7+A/7?!>1:)BG('3)$$7A5'2(*/F:);C4'+6'!;B<<:!/B:'45(D1=,3A02F+2/"&'=58"5@< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1098 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32016 42 64M1I106M = 31954 -232 TGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCNGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCNACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCA G(B2C'2C>@;'!(6C9H?%*B@)>44?A)!D:'>$0(&"0=9"AH7>0.0?>E1C@6=G>!BA=F3%+8/(3@/>#12%'+@HA&!D&9D31G13,&94H2F;?2D&#?C+>B=0!3D6FH."EDE(-'F1C31?9%6BH1,!=>D):<=3D4///@72-?1 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:33G35T0T99 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31954 42 62M = 32016 232 GTGCAACGTATTATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATNCCGGTACGCTGCAGGATAA 1@$D-(B,)?19'$B#->5A2":D',?*$.$8%B'="+F=?'2A4AC,8%H:/'81A25(:C AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4C3C2C30C19 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1099 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18424 42 63M = 18487 243 AGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGNAAAAATCGTC =5:!GA1(7-,">8,G?8!?%3(36:=F?BB*0)=$D3).2/E,7"+9$,=&#:D7?428@4F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A10 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1099 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18487 42 180M = 18424 -243 GGCGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTAT $2@<3;=#&9:FA'7%&<05@&%9,#0@;'FA>0F<1<&DF+=9)9.<4,9$*F2=C'H+//#%=<-"-@4H38'$%+#G!8'F>@H77A+E0G*35941%.3%$:"'H0E=/>+GF!$H#;+5=!&8.EEG,",(/E:F2/0)5B?.*3(/8=A@1B'<.5C04)@$3$(&:-9,;7!3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G108C68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1100 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40661 40 74M3I21M = 40756 257 TGAAATTNGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACNCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGG ?703($8/8C3>+.C82.5>!:EA9#+2!*E:?3H52!/G";2!5@1+6-GCB51=85")*(!&%@&13&$-@%*>,C$!<1%*;+G%!9F9<5F%*C AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:7C56C30 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40756 40 62M4D96M = 40661 -257 AACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCNTTAAAGCAGCAGGATNTTGTTCCTAACCTTGCCGGGA .%D*H?(C7-);(F#D"1F---9D2!*9'%"G78/7G18*"DE;);-4"43H)"E&#-/0;B>C7'F"AB$(C,*84:G)0C".0:2B6&@&37),*":*93E%$*-@-1/6$B6?/)2'2*G>87(:#H>6=(=2C&C";!H9%/H06(<@BEH4;& AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:62^CAGG58A15G21 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4262 42 41M = 4530 361 GGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATT $<6+:D'0*HDG5;*FBF>0!E($'++85CF4%,F>5(9<& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4530 42 93M = 4262 -361 TTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACG )1E1>$9-A';5'*F?:0%%?&858=!#>@<@<$::?#59F$3:96@+C1>.EF<GD>4+A;FFCF4B(/!61*58,#7/A#B/B"'&3>/. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G17C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1103 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21294 42 113M = 21294 0 TGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACACAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGC "7B'@G,*;&#!>8$?:D9E3B@)<-&60?.B..5/.@F@$=%C?F0H/@<52#:"@8$#;E,!7-#>(<5H/=5+@1EHD>@>#+7EA;* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C77 YT:Z:UP jpayne@0: r1103 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21294 0 * = 21294 0 AACNNNCNCANNNTANCNNNNTCGCCNTNNCNANNANTNCCNTCTCNGNCNTCCNNNGNNGCNTAANGCNCNTGNTNNNTTNGCCTN #$$"$$""$$!!#""$"!"$#"#!!""##!$#$$$$!$!"$$$!!##$!!$$"#"#!!$$!###!$!!"#$"#!##"#$"#!"!$!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35443 42 67M = 35198 -312 AGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCT <#!G%-HF!GG=0,!HH56=$:68):1)>D==-H,5&:27#34:?C064F;>%)7F4,> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1104 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35198 42 110M = 35443 312 TCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGANAATAGNGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTNCTGNTTTC 6:+&'?1=<'!/<-':85A-<<-&4=:&,C+<%:)<>$GAD-07,H'>H!&!)>(8(39%75 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:51G5G43G3C4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18871 42 47M = 18560 -358 AAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGG !+$+=99.#"*A#=8.:6-"/H>>)D55:$<17-$0H,D5CDB24>G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18560 42 311M = 18871 358 CCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCTGCGNCAGGACAACGTANTCGATGTGTGATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCTGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGNTCTCCCGTANTGTTGACATNCCACCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCNTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATN 1H01/4DA#2HG0)9H!=A0(*20*!'@GG<"&7-=*H-1!=H:CH,/;@F46=>4%@&:"6.9D*C0>H0<70&;5C=780'=:DH9C(?!8/#C65C9*56#?#2"C.8-#9@(">G27#!@,+>31,34)0E5")4>,&:9>.>72>2>9*0%AF')H5.178@)-B',?D!*4(41+22'4("/;%1H@@:6!A,@8)9"3<-=./15>(1,?=@@D55>)/3$%EE"E1.B=>9!6!2H-AG?B?0":?C7B&&FH:(*>16@=-"$EFB$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69T2G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30606 42 81M = 30496 -191 TCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAAC 5=)95C0@3%+E"1:??4450D8"2.(6@%+:'D".!7A7;*/7++@%!9$903F,:1BG'83."!D1$,H5FF<0C)*<"'?39)&.>6B-G65F5 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1108 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3994 42 42M = 3732 -304 GCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGA -DF&<;FE;A>/!4FH7@&"17);5"9&=?/.'6:H8,2;@6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1109 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29442 42 218M = 29316 -344 GCACGGTATNAGTCANTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCNTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTAT /9F=B:("/;G8%.EA7HDD.3/GA+!@G"5C8$6FE/.F(%84=EDD<87;9?A7#H&=(+B2;&CHC&09-4*)0:!@.:A,4:&-E$:E,%)>D8?/5G2?<8)D!<&7;E6H%>E:,B(,(D$)%.5$*-7*>BC'@2<@#02A?H=G$,,CE:!0)<%&-5A4H655!9G*A@F"A)8GA58>G$H%D%.=;%-?F4>;1CH514G**$1D92 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C5T105T96 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1109 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29316 42 126M = 29442 344 AGGNNGANNAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGTGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTT ('##))!$!+#$($'+$'""#(!$*(%*+(&&"%*&)!*$%#(#$*)"+'%%&%*#+"!)'(+'*)#*'$&)'('%&$(+!#&%%!+($#!)&)+&#"#%"%%"&##'"#('+(&*&&$&%%%&)! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C0G0A1T0T0C78G38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1110 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45514 42 112M = 45363 -263 CGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGANNACGGCCGTAAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGNGGAGAGCTATTTAATNATN &!%$')+!&($*)"!+%*$$(("()!!+&#)&**!$&&!$"#"&*!))"#"$&"&*!$*("&'&#"('#'*%''+*&"#!#'#+&*&"")$'!+#)*+#'##%+$+!*#%*" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:44T0A4A3C37C13C1G2T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1110 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45363 42 151M = 45514 263 GACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAA '/AC8<%@2G6H4/B=:(@1>91-:?C:?:,<237A.C@@/4)<)@/6!H?"%$00C<'#>66?&-E1+*2"?=:(%!29@H7:9-E3DG'* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1111 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1939 42 40M = 1755 -224 GCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGAT AC#5,1@3B41.CA*HC1'CEE921A:F5-((/?@9)#'4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1111 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1755 42 184M = 1939 224 GATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACANCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAAGTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGNTGGNCCGCTACGAAATGC +'#$'*+('+$##""(!)+#!"*$&"#*%"()'&)*&+&%(&%#!!*%"&%#&"))#!$(&+#)(##+#%($((*%&*(*)*+()#'+#(+'&+!$%#!+$(((#*((#*#%*$)"&$$&'#!!$&$(!%)$+)(")+$$$!!)$#)%'"!)%!&)*("%!"#'!(*+!$&%%"&"$#'+)""+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31C17G11T103C3A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1112 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14441 42 69M = 14616 293 CGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGG =".1,>7#+E)-03>37":H(#D#4,)23C21')0F.3@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1112 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14616 42 118M = 14441 -293 TGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATATACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATAT #%!)&+!)##'*&'*#*(&"'*!'($)''!#!)(&'+"*''+%'%""+$+&(##'+$)+#)**#*"++!'$&!#+'**!!%('#"$%(!&'%"!""''#+()!!)!%&"!%#!*++$# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1113 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47220 42 106M = 47220 0 TANGACGTTTCTATAAGATACGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTNAGACT "#&#%#$+%+&'!*!*"$$"#'!')"%#+"%++($$)**$")'*")#'+$'!!(+*((*'(!%)**#%')+&$'!!*#"'""+%%*!*(&(&++&(#%')+('#"& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G16G80G1A0T0A1 YT:Z:UP jpayne@0: r1113 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47220 0 * = 47220 0 CCGCANNNNNCCGGTATNNCNGANANNTGNCTTCTCTTGATTTCAAA )#"'*(!"("$'%&(%%&$##)$$#!&($%"+#"&$%%(!$('+')" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1114 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41628 42 51M = 41628 0 ATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATGAACGCAAAAAATCGGAC ;FG7729D#FA2,C?-D/&D&AE)1'G60'#=F"A%&'%8>D;5H&H2F0E'9.9.2=2242 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1115 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29062 42 43M = 28819 -286 TGAAGTCTCAAGTACATCGCAAANTCTCCGCAATTACACGCAA $30H"0$*D&#)067B"5.6563@14",=/?/778363".E-5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G16G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1116 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1951 42 84M = 1762 -273 GGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGNTGAACAGACGCTGCTGCGTGTGN ''F>'>CDBE)3)2C5CC+"'2&"'6.?3&+(359/&-2+"F9>'E=<9*4&38*H362>49>>;@)1<8&6@>/7>(?23#B-%EBDD172*,;)BCH>AH2"0')F*D88'D:@G->&%@*6G@?"F=#6%;0?HB:0"6=0#.BE.3-E-64?*%("?-+#)+GF*?/&:E86,!%/E>)DG!C"?)4!(E::09/H4'(D11?G3,05 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G41 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43949 42 79M = 43747 -281 CGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCT >DHC0A4-(/<6$;4AA15#,,4B8-/@25@G)<7C"%AD;!*-+2G=/:4A?)GD#6)1*;.$(H6BBG(&B0;"GG% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43747 42 53M = 43949 281 AAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCANACGCCAGCAGTGAANCCA +"$8%.+'<;@'2.9@")$#9,$$*1")*8)4,C'@<.',CB"8+1"H,%<;G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T14A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1119 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19166 42 43M = 18838 -371 GACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCTA ($&%&"'$**)((%"#*&)&)+&&&%(*"%+'"$$!#%#!!+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G1 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r1119 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18838 42 328M = 19166 371 ANNGNNNCCNNNGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGANACNGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGCTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCCTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGNAAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGNTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGNATACCNGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAANGTGAAGTNCCGTTATGAGCTGACG *""$%&#'$'"#+%#+%**+#!$*#&')&'+))$('&&*)$"$")$*'%!"%+*#'!*"$)+!#)"!!'$"'&#()'*+(%$&##)$!((""*)%"$(!)$*"'*$*!#&)'%*%(('%%$*$%!#$"&#%(!!&$("#"#'!*++%!#("'"'+)#$&")(&**&&(!%"')'+)))""#!)%"*$!((&)%"#!)($"%&('%#(#)#'"#%!'"##''&+%)&*("&#)*)(!%%!"&#*%#'+!*#"*'*(+$)+)+(*!(%"'"*$)*%+)('())*)))(&+'#'$*"%#%"+#*&#"$'"*(%"'+*)&*#("+!!*")%' AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:20 MD:Z:1C0G0T0T0T0G2A0G0C25A2A57T32G43A0C68G25G5G25C7A16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12427 42 44M = 12281 -190 GGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGC 3@B5/G%F7/!:$&B3@FF,*%.E@!:;1CB,D,E3:<*C)?1E2$7@/@C0,9=!#;#1D*??.?.6*'7+;-%;#&%B7!B# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1121 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1412 42 290M = 1237 -465 GCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGTGAGGAGCAGTAGCTTAAATTTGGCCACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCNTGCGTCATCAGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCGGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCNTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGCGACCTTTCAAATCTGGACAGCGTAGA )%!*!##%"*!"(%(+"$#!#!%%)($*$#'$!*&((!$')%#&&+&)$#*'#%)!$%#%+&(&))+$%$&##)%+&!%*%'+!)&+"'*(!*%"%'!!)$+*"(#"(('&+(!*%%#+*(""'%)*$+(+)%+("'&#**++$#&"'+%%$*+$#"!(#*%')'$'#"(+*(*%+)(!")!%++))&&(#''#$!%%')!"%!('($$%&+"+"%$*"#%)($+(%)%&%"$*&%!)!!!&)'$(*+$&"$)"'#"'%*$!"##$!#&#"*$(*(%!&*!"*"!)$+") AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:30G11T12G72A3C9C38T46G34T9C14C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1121 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1237 42 175M = 1412 465 GTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCNGGGTGACANGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCCTCCGTGGCTCCACGCCANAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTAT +"#"#)!#*'+&%%"++$(!""+++%&'"(()$+#$"(%!$!')#)'$&##%'+##%#&('&*$*!(!!$)")"$**&"&)#&$"&*)*$"+!+"!%+($"'$(+(#($"&+++++&$&#((&*))#!($"%(&!*+#'($!+&&$+!!*"%)%"*)&#%((#!!&+#'"$()&+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60T8A31A17A55 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r1122 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10129 42 135M = 10299 244 GCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCT 3'D&.B=.HDC4B+66;-7$D175,716@):=%FB*'(?$=B!H0%9G!=6-#D-B=6.2=;<4B.7"+5CD@C0#4&9>8;:BH<#.C>CH+'/2??.B)''%63-G-!(*"+0-%)5#%2:'&8/'A0>7&8& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1122 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10299 42 74M = 10129 -244 TCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGNGGATCACGNA +'(((&*%&'(&$%*$#+$'+!#&'*$+!)')&&)#!"%!'&$(&+#$)++"###!!(&"+(++(($#%*)*$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:63A2C1G3A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1123 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35609 42 68M = 35419 -258 TTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTN C,6/*96$=;@D<)D?(@9:#BEA7$+"32<)<6.",'7>H!=??)*#EC5=C,5*<&(;@B!6H2=" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35419 42 105M = 35609 258 ACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAANCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCT >=58=2!=CG@&.%-GF1-8'1=7#12B-,C944%%0E)>E3F,A#$6:B4=?E%4216!%D:#"F+?.!6:%8E8-9!2/G!+!,08F>&F(/$?'*9G/;0<4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1124 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25386 42 61M = 25499 301 GGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGT D7,5;BH%-FC.&C):G7/#*4?22G#0#CG8.*(DC%@$F<72+%?<8@A9/D=B8.@>% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1124 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25499 42 188M = 25386 -301 GAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATNATAAGTGGTGGTATCCANAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCCGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGANTCTCTNGGAN #$"*!$%"%*)#"+%#('#&+#)(&$+((")%")%%"&!()&'&(')%)#!)%+))!+'$!&#$)*"(+"&("#$'$!*%*"&!)'(#$&$$"!+)&&$($'$*+"!(!'%!%)&))++$())$(%"+("+$!'('$"*#%&*&(!)%(#'!)($#(%#!&(*$'"(&"#'%'(%%+%""(')!($$$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:27A17G71G59A0C4T1C1G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1125 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40202 42 240M = 39942 -500 TAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGNTCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTATTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGA +06=.7H6+?'';*1"?0.H=H4C!"=/(7'+H!04F#9$?:990F!>;)$1E10/B<>H1:B2@$!>!<#A;@C22#(-CG#'E!&4%:B!#$$F#";7%<0!AB+;'3,)?&*-D.B"&3H#/3%"0F:A>E0C"@@$D2C'59HE-,DF6(EG:4DA0+4G-&052+A8G.6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A175C29 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39942 42 166M4D90M = 40202 500 CCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGNAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTNAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGG G&@(+F53+92(?*9$.!8:#"7)<2@#/:.=#4*(C?+2G//20-(D13,'+2%(@H<'1F-?#/>C.&H>*A):F<&C:'#>A820#6H40!G"D(-!?4-/6A4(H74-0E&;/5!(-=9=CD*4#"(.%8(7H186$,35"0*HG!(74(2<4@;F92(&@2;01-1--3A1004+7$,B+E!E1&CB+@:E*5611$8(94?EGE7;A;9))HG#E<%#A"A7>%=80-B(@5,FE5.+AH: AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:44G121^GTAA58G31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39316 42 41M = 39507 276 TCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATAT G';AA8>%?0)-D-BB&*$>!B%EB.;)3@?+.E6E$(.3@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39507 42 85M = 39316 -276 GCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACA ;7%"<93?39'=64-D<#=(?>.2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1127 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9020 42 6M1D101M = 8808 -320 GAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCCGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAN ="$193A5.E0*E%/4*",!7-77>54>?B'<$.=5<.1;>'A3&G&!4>?#BH2/870E?H)10-E&&7?"CG=B>B.@+*<"*><:B/5'5,3$C@3/6+0:&G! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:6^T43T56G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1127 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8808 42 212M = 9020 320 ATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGG 8%(?2HD!2;,62)7@GDE-9@0A":(//?DH5*9.=C0(55$%!>?-2C?D2-)E&"=>(;/4?$B>8E355+6AF#$&2.6$>%AH5C?7(-5!;GE-2#ACDF#H3=?35/?';8&)>#(+(G9!CF0A2CF+-B!&(@/'F-76@!&+"2?"%032+A5H3D'7(>345:+)<%'2)!.6=3?1;5,?@7C.),>>;5$F=)((>A1# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:212 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1128 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42950 42 46M = 43184 297 CCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTAC &>!7/'FA/F165-,328E:?%1<%11BA3+?!-0!2%!+A)H"GC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1128 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43184 42 63M = 42950 -297 AACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGA ?"#35+5@-B.80B,@./'-*+.,4=$E,A%@A;+E$&3$>6=./E0&$,E03483.G49)H? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1129 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5583 42 75M = 5658 303 AAACGGCCCGCCGCATCCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGA C6$)3F84A/#"21=?:$(@;1:/54$.*((8=523 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T58 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1129 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5658 42 228M = 5583 -303 TGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTACCCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGC 9#A+!5?6DDF&;G*/H0?%6&E*65<0;%F&/#FGAB>D;9H*21'-16:-&?!;.7A:3)+!C6>8;0:5;@+)$E<4)E"@./"/&:&FF>;/?5B.!?&>83G'+B5#7-=.*ACH=*%%-?!<@!/$*/>F>;@.=@6#&;+3"A:,D4*746))C(!/A1/2>.?A(G!6?9;F5'??D'&;:G&).>1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1130 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17282 42 147M = 17429 219 CNGATCCAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTNTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATNGG *#%%*"&$%((*'+)*#))%%$%(%("*$&!#($(*)&"('%"+)%!$()&!%%('+"!$(&!'#++$'"&)%)*+'#%#!)%&$$!'%(&+(++*%(++%"+)%($&'()#)"+$*$*&"'#+#%##'%''%($%)"*"+(&(()' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G2A0A0A61G75G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1131 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46638 42 120M = 46520 -238 GGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCNGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGT #(F<:*$GD'HD&6');(5+BGC'2*04!==2;<(;#%E&;+/D50+;5@.6F0ABF,)()';5G54.@)D#2C!C(B"$/96.735-=6927!'+;G#2:6$@=B;HEFH%>* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C88 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46520 42 93M = 46638 238 TCCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCNACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGC "!>3,3H1?")?5:=,EF.H+02HH%$<)A#7,DC/?'*!8;58$+G!<&1;$D4%G:A6E)'(EC11''-:./B=3-<" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0G56C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1132 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47620 42 59M = 47679 435 CTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACA <)+B0=/C!!F10#),G%-C-+@CC"6&C>#;#F&,+D=(4E$@C>?*#796:@*%8/A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1132 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47679 42 376M = 47620 -435 GAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGNAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTN H$'%C2)97>6%%?&0EE/!+!8B;)9G5A49%/=*D;=91*6'DDDG(E33!8(@(G9@5!#B'&@AG>(;.*@7&/<',2::*,9%"3*%7:CE"<5+A'2$89;(/6'3>#.'%!'.&8)"588?FA6E53<94@6!?5/8182C!58@+!('&?'!55G$HG3#$"/%B+>*A276%,!9$#A#B7?"."H()/F?8A+7)48E+2*>5/E2&F?";;7GF%C638*#%#B)2(C->8C399G9%B*E=1H80(A@D)HE)8F2#..1+6DF.&8?4"F;91:<.->05:C1D$>0':"&(FHE-2H35%35/D'9)>6$1.7)&?,*<0/H5E6(D!3?&76357,5<3* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:201C12G160C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1133 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22055 42 67M = 22242 267 GTGACGCATATATTCCGCCTCATACCNGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATAT D?+A1G%*>@+C$E*+@*8&!=$&9314FG8E+DB?3<+?22/9>8%5@%5F9!<4>14;-!!"*,@4@0!E9)2@B4&)?%#@E14:=!:-!:&B'0F!0A,1<&<#$*-+<+:A=*H/328><@F$4B02:.(5A3(,$1?#C>.67#H85C5E-/19@'@B%6&'8"!2%H#2'CFE@4)C>8EH")-!1&?C.1(=::80HA2#=='@C"1>/B"7BG%7>)FE%/-)"1-#/"22<%&)0;D4BD0',3!%*(;=D*:F45>3%&#A2&/>?<,?';: AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:30G31C7C12T0C130T2G2C0C30C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1134 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28684 42 150M = 28834 415 TCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATAT 7"08=4/)%8830-EA4)<'B&-/@@:F<$D76?0EF7*90FD$2G48G!$"E-");.A7-:*>1*$"!'>6,+'//C,-+"91&897;/"/)1#<+H(>7>57%-,+5$C33"13C!&G%88B$1#-F'#/4"0BEA*/:H9&44'H+3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1135 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34754 42 59M = 34754 0 TAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTC /;2)@H6A=E/5(D=9G*=8?>&@A5&D->>4=4?(B9=&%-%-8/>.B=/2*7:76G7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58A0 YT:Z:UP jpayne@0: r1135 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34754 0 * = 34754 0 TNTNTANTTACANNGAAAANGNNATTGNCTTTATCTCAATA #%*)&%$()%)"#%((&#&!#$!%$%')(&(+###$!))%* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1136 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35060 42 67M = 35326 324 CCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCACGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTG '+%)#)!%%*$"+(++'%'$#&##!#%*!"')#)()+#(()##$*(##!'+"!!%"!#+#+$)!!&+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1136 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35326 42 58M = 35060 -324 GCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCT 0$-;1#1!A5E;@;-7!B:H,E"&B:67GE7(<,'G#5G:$9A""9%>"3'92+?!C* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1137 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25173 42 62M = 24985 -250 ACCTTNGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTNTGNGCCNTNGTCNAG &!)#'''&*&++&&+!$%&#(&(()**)+'')#$&))+#$)$$'+*#''$#($))")'!!"! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:5T40G2T0C1T0G1C2A0G0G0T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1137 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24985 42 164M = 25173 250 AATTAATAGGCNTCACCGAAAATTCAGTATAATGTGCTATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTNTGTCTGTCCTATATCACCNCAAAATGGACATTTTTCACCNGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTA ?D'!C@F7.$151<;7"88?F'',D3#A42.GA6(1@.*).3'@#>>B/A$A)D(<7#,C?=,B8+9/"=H81/.'+EDB"-.'#*/*H%A'<<7G#8;-7:F;>42//$8C#CC+2551?G AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11A15G9A25T18A20T60 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1138 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40890 42 154M = 41044 265 CAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGNCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATNCAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGG /D1%?GD@':(-F'?"(;!C(.4"22=.%+2H--'':4E(&1/9%:#C%$29<988$!E&,:&,:&?$3>C-?,>4H+6>G>C%@!D1B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51T49A52 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1138 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41044 42 111M = 40890 -265 CTCTGGAGANGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCCAGN ++$')$!$%'"'$#*'$&%**)+)%$!&&#'''#())+!%$#!$')**+)$'"*"&%&+&+*(#+&#%#'*&(*#"*'"('+(&+")!&)&&"$%#(#&!!*&)*+%"'&" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8T0G97G1C0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1139 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20360 42 77M = 20471 222 NGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGNATCATCAAGNGCCGGTCGTGCAGCTTCCT %$+'!%*#!+!+)!#&!(!"%%$%+"**#'!*)(#+)%!+('&))(%'$"##$&%(%()$+#&'$*%+()%"%#)*$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A46C9T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1139 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20471 42 111M = 20360 -222 AAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTNCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCAC 1#5>1#.&A-?G$#3/HH6>AA9<):GF#B@"'!%>7$1:';.)G+*;2@-&/?'"!!>$&3%79/3).>+E=E$@.:@:3$>"?-"+?H!5C;2"!?";#+>$D->&>(6"D)=?"B(C*E0)29$GEE7::.6:F,+=(EDEB/+)(#7;D>>E611:H<'=*B$;(14%$7/,F):5!HB34,:477='7!D,@;(;3:@EB8-$*$A?/$"-6.H'."?8;14'*E4A8223=E0'#78D8)7,:!B+9)>B%D*B=E+$?HBH@>/13+?@!2#B29'80G7!>"!<-%/.+C0<3"@(C5>44=7+AD'@F?>3(!.)+124,=27&1'/879@E@H AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:3 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:273T48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1141 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3382 42 42M = 3176 -248 ACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCNGTGTGCAGATGAAT ##%!$$%%*&+##%))!&&%!"*&"$*)*+!(&*"+)*!%!' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G10T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3176 42 48M = 3382 248 CATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACAGCTGCTGCATTGACGTTGAGC #6>,B,6#?=F+$61.2"@;$(E2*5-9GHE)E269!<#@H$-74)00 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12881 40 47M = 12655 -273 CGGCGGTTATGTCGGTACACCGGNCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGC 4GE-0#(8+?.,(2(.:028E* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G23 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r1142 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12655 40 160M4D56M = 12881 273 GCAGCGCCATTGGCGGGNCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGANAGGCGGTACANCCATTCAGNCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCNGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACNGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTG ?G!4&!GC/5:3!?D=&E8.A;D42818>/A2?;0)!4@0*G9,%!*/$33D?&?9BF<2?8C.-;68CFF2B5EDBE9)A9.G)"++'CF>F!CF*5+1C-%BB1F+5.B8#AE6G392.D)@!C:&B.GHH+9H6<>@F:C$>/-#/?%#B+>5%H=2A74><21E-@6*@-4BH?1(00/7,-/1=(D0/8?/*89G:/76,H>002$*-49>F(FD#?,),4"C1>H8!&!C!3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1143 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23243 42 185M = 23131 -297 TCATGCTAAATGACAATTTGCTNATGGAGTAATCTTTTAATTTTANATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATNGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCN H+F060)A-.%37G@#;-HG!"BD:B4@H(6@+%/%?1839'#*")"?G>E-$&HCF?G+#!88%&&&5B83*+A6670$>@>A! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:22T22A69T3T64A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1144 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23282 42 89M = 23371 255 ATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACANCGTCACCCATTGGAATGTTTATT /;4G"*GEE,"7-)(1#1AH<<>:8>6*737(;=#12>!4?(+;A=8H21(,!,#5@H*%A2='-<9$3C$'$1C2;F!7%..$/(?-.C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:166 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1145 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37786 42 45M = 37596 -235 AATAAAGCACNAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTANCTGCG *$%$(%$+(#(#")%#(+&%&"+")$+#!$$!&*&*&+$"')*)$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C27G0T5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1145 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37596 42 76M = 37786 235 NANCANNCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCAGACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTNACCGCT !)!&"#!+&*%%)#&'"&($+)#"#)#%*$+*")(#""#*+)$($$&"%+#)'&&&((+#%($#&)!$#*%'%+&+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G1A2T0C33T28A6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45513 40 93M = 45392 -214 ACGTAAGGCGTTCCTCGATNTGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCNTTGTAGG 23"5B-0F/(7#)D,<%G"=@,&D.8;6B1(0GAE+.5,)(2/"6?1&B0)(3(;,8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A65A7 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r1146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45392 40 70M = 45513 214 CAANCTCNNNTAAANTAAGGNCTNNNTNATCGGCTACATCGGTAATGACTCGATTGGTTCGCTTATCATA %&)"%)*!!"&#**'"*"(%#(""("$+&*'%&)#('$#$#'!*&$)+&(%)*#(!+)$')$"+(#"!"$ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:3T3G0C0T2T1T0A1C1A0G1G0T0G0T1T16C23A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1147 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16361 42 75M = 16489 209 GCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGT #)<5$$0*8/56!:=!&8EGG&1/+G3G8@'615A&$#/C#%$C#-1'>5GF;0%(&%,B8D$<4(.*>4!3)#4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1147 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16489 42 81M = 16361 -209 CTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAG ?/#5G(D;1#)A#.<&0B*F/#3%!>#5B<,>8C>!E2+;AHC##->066B5(C1E-!!>8AD4#B<<>$'7-@:1>4B9- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1148 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13813 42 164M3D22M = 13725 -277 CAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCNTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCNGTGACGAGTGCGGTAGNNATNCGNCNTTGGNNNTT !+%&%%!!!%#&+")$('(%')+"+"%&""&%*"$(+*#&()$%($#$"$&!(*"'!#!)#&#+#*"'%)&#+'"$"!)#+)")"!+&*$#&"&+"&*!+'('"")!""&+%(&#%#*%"#(('&"&)"""'%#!%+$*$#)+(#"##"+$&*#+)"$$'()*)(!+&%)($%%")$!"'*!&%$( AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:17 MD:Z:59C90G13^TTA3C0G0G1C2G1T0G1C1C0G0G0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1148 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13725 42 88M = 13813 277 CGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAG :&+1"$<64*0%%7==/-:9AB6B(170+,C%/>H5!C#B/+5.94<@1#0%7.3!5EC#("C6B)&'28H#?<*>**52:8%/4:*E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20743 42 139M = 20611 -271 AGCTCAGCAGTGCAANCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAAGAGCACCAACCGCG '10H=804)D&C9;)E69>:?,+3$0*==H)+=*;E9$<'H,$*&=96;43C?1";H,CC!=(GD,!*>*&0E.*'0-"E%DG$!-9+1G($C)%'81@.4C$.13A&'F,BGB@>'*:)11"%@("$2EBG7-4.FG@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C109C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1149 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20611 42 71M = 20743 271 TATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATNCGGCAAAACGTGCA D>H*&)35(C"8B7:!@91+>E!+7308<>#259F; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32875 42 50M = 32964 155 TGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGG F*AD-!*G)6.FB'*"A#/)6?>E!1?*C/'CH7>94+:)*C>HE>HG7: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1150 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32964 42 66M = 32875 -155 TCCATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCC 58;*4&>7"-56'&=48?3/6-B*>,#H-??A5H)08#D:1>-"AF:*$F%8;%/$?G9-FH7D-@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G33C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1151 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15478 42 85M = 15277 -286 GGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGT =9D/(3*@??;7GB7>;D.%(A#$&)30(A'EG)EC0B,0:".36.4#&$5&)#67*#=C+;B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1151 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15277 42 191M = 15478 286 CACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTNCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTNGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACC !DH?D"6$GC!&"43D<--=:1%&D9AGC1)!5!6A7B;?C02(,!8=1+!.'C*2E*C;9%B:E-'DH8+/%AHHD+2:>A55,?E=,>9DG6A;,5??!35.-<20A$7D#"*EF+=!8?@B*(BG'9$0D="*C79DC#9%,G#3=5D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A24C133G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1152 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42493 40 107M = 42362 -238 CATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTNGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGTGAAGACNNGA '+!!""%'+$!+)&$'%++)'%((*$++)'!'(%$)&+$'&!#$!!&$+$"$'&+#)'"(#%$'($+#+"*!+!)$$(#($")&+%()'+$((("+%')&#%"!%"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:52C43A5A0A0C2 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r1152 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42362 40 106M = 42493 238 CTNGCNNNTGCGNACTGNCACGCAGACNTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCNGCGCGAAGACGATGTAAAAACGAT $%%$"#)'%$*&!&)%$#!!'$&)'("#+'+*)$!($(*%$"'$$$#%"!+())&#!$'$%&"(&&'(%*'(!+)'*!"*#")'*&(*$*!&*#$$'"&*"*$*++ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:1A0C1T0G0T0G2A1C4C0T0G6A0C49A3A24 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1153 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43805 42 52M = 43919 245 GTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTA &*G3>&-BE69:6)&?9D8+>&2'A+5>$E2E(4$D<(C0&-"9#*$HC*A' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1153 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43919 42 131M = 43805 -245 CCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACNACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAA =$)#!926=367"-A*B,B2E)!32E#B0/<40'#;+:-+(2C34D1*:)$:*D/C=.:8,)(,/#61:$8-62<4;-%"BF1;9-*:B=&'(&%3=163;7DE8>A%?",!2-"#:8B6>#17B$()?9G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1154 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8460 42 64M = 8710 337 NTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGC !$#A3--(':%5"$0G,!*7*%E+51'?9'5-D#'5'A%!#2/,-&0%.2>+>+4/2*:!7751G##-6)3(4'?@A;+-/B1),18/2#E@-,BE8*74B#%/7+&=7!/&6<0.@;@B8(+&BE8?0&B0)."A)**5$/9<.2+"B,189585+1H65.8!4)A"$39B&(<*1B64?'(@G*@&"%A>HH40>E:+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G13C56A1C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1157 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12658 42 63M = 12498 -223 GCGCCATTNNCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCG +42B8<7"&.&&:#44""'H62G:57,;-D!8==8E5@'#+4F>45/F@85;B:326:;H;82 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G0G49G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1157 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12498 42 79M = 12658 223 NGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCA $,4:%5/#3?%4+G&G!"$=0!4-/+2?*7&?8.))E52%2?$6G&;@7DC@D713+17D,*,'<9* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A78 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1158 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22477 42 76M = 22314 -239 AAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGG 2#D*?,(<$0;0EE@7"!CG54BF4&164>"5'$2(.B698. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1158 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22314 42 98M = 22477 239 GGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAANTGCTCCGGATCCGGGAGGCGGANGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGC +@7&9;E9(4-86$HC#!2@7,A?'B=%1C:G0$*9204C2@A*5?5D(C'&93E/57)!",F/B559;"61'=)#CF!2&;05&A/@82G':F,0D@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C2T19A49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 379 42 47M = 147 -279 CCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGC /D(C/9)"$<6.9@1&;3E2G7@'D7?5-D+(FB%;D0"'";9G3B4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 147 42 48M = 379 279 GCCTCTNTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGG H>DC?D0!DBA60..(+;.52B,?D(3&@;6BD-18(7(#H.02)6=7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1160 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4796 42 52M = 4566 -282 CTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGNG +,(5<1>1.<2/-+(ED.>5@"-8,(17:E)$005&?B4@%,D,$)C3FC6- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1160 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4566 42 142M = 4796 282 ACAGCCTNACTGCCCAGGAGGCACTCGCGNCGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCANCCGGACGCGGGC 5+,:*)/'=#6H',&*/!'5)'2:6*#$CD+&G-HC6:'E%D6."D2$F6$).>$H8&!&6-'/51D:@C/F%?.)!%$11*F;E?B,?=,9.1F+H;3-2-D$?)HF4H!)9D;!@:7?$/%(534)&5391#0A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G21A99G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44416 42 61M = 44616 272 NCGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATC &(3@;F'2E1(C"59*!1%?#,'4F.E3?)"#&"4;8+4-5G$<1GG4HF1%7F6DH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44616 42 72M = 44416 -272 GTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGNNNNTC "#)&"%*!&%'"!$#"!!*&"#%&)&#**'%))!+%$!$(*$')")!%#%&'#)!+(+&(+))&(+$%#'($ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:66G0A0A0C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1162 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6303 42 121M2I225M = 6649 685 ATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGNACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCNAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGNGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCA D?&B),2"65"G48G;DF+1E%B,:@#&<3/*H(GH#;>4?6'9F,;+(:.@F(6;-2&1);#4!"=CF+&45B46*08%.-,2@G8:9/+1G2)*'EA7-&GDA9H17<36!/E"@'F5;=#2G!GB",).F;&1,@";064F6"3.D-2;3D+%!>>'D:>)+9*=><4"$29:6F;;)=6B%D<44("5:9748:H<132B@)96(*EC@@GA&GH@/0:24*3:2+HE?"@B233AA+DA(D=7*0(8<)H-7+F>:@$30-!B@1G>7*?9A-0#?6H4-H%?@CB//?)E-#'?"@#"$".>DD8/9D-/9-@8-?4BE6$)".>AE/@BA4B<5;1D8:!,5G2F8(:*%>,:.B!!0G&6!A=,":!;1C&<4%C?G'/6-:<;A#$8@3-8'"G)(!EDA075H*,!!&0.*@5(1<>1C!<.*"H'1FG=&!4+/5$HE AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:175A5G36T120 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43702 42 266M = 43616 -352 GGAACCGCGAACGNATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACCTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACT $%(!H89!7%D6%"D2HC.D2#B+"?2!3.@@@#7;'?DCF77--,C2D"2E-(5!.5+G3<=4.94AA1$=C'<1#:A)1*A::H-&F<,+3DDD<2,,?+(F29<$>6FH2E/<.$;A%A@#+"0E&G1)101A+%H*5!83.@.53".)"E(/$.@E/.3*#5%F@(&$<3B*#G9C,68F>E258;@6/HH!.7?!)(20E$)@H@65#25!4)49)?C3;DA0,@5B@82/$GH9,(E;*414=H'"9$@"C; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1164 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 322 42 159M = 633 352 CGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACNGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCNCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACA >;>95"-A:B3)-9?!&4H/$()-6?"/<@&6)2)F0?3+=0A1.)D">D<&/-"D/3'6F*.C1A;,%@;H.A),8==.5=.!8G-"(E)/71=6FFC@;EF@H=#.#5@7?2.,83H#%>@:#=-053)ABH-B0.,@(F1:7F=*A94$!0H)+7, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:74T6G16T60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1164 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 633 42 41M = 322 -352 TTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAN H(B,/??B;$D"@EA!,1BC/!/C,D1F,5==D?A4G!?D! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9251 42 56M = 9307 217 GTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCG GD4!@1?:6-"H>C9:#0=/!$56,5;"98%-@#@B2/10')H!D': AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9307 42 78M5D78M = 9251 -217 ATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGNCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACC %:(.+,4>H#EHG7&!DB,&4>4."1GH%%F$/=G+A%#00!H8'7E$16=?GF?>;1@E-H*??@/$'=06,E9$%<'5,1+&3$)B6A&"<("-C-41'2CH53=(@H<5.+9#H'>,H>3298F'1((*!$*2%??:#?31"D2#;/:-?/8F AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:44G33^CCAAT78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1166 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47307 42 46M = 47099 -254 TCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAAT /3+6A#9753@>A4F7"6-5&)7<<.$A&G./==4DDA#CGGAB=5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1166 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47099 42 60M = 47307 254 ATCAAAGGTATAGTGATATCTTTTATGTTCATGGTTATTTGTAACCCATCGGAAAACTCC 09:D>!,!C7/16&!.H/8*C>@-40CE!%9DA?%0;BH*;E)'$#37 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A19A25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1167 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39443 42 50M1I10M = 39260 -243 GTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTA *94=?7D"EAD+@*8><'F2/"(B,@32$402/A621-!:%6F9&>;$:(H*%D>-360+< AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:42A6A0A0T8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1167 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39260 42 164M = 39443 243 CAGANGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGACTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTNGGCATGC 3)A949*;@E6.,1?,!G'E92:7(,)863':77C+"G529*C#!)>C!="2&F%&EH(7*.$,BD&'E%20<%/C3/;%D>%?G(+2$$=:D1-!,7:41B-+=&&(%-+DDBCH!H241(6&,H(3+"15E9:/C6%2#AH7"B%.$A6-#"F<):96FC&' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A81G69G7 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1168 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11397 42 145M = 11542 457 CGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTNCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGA ;@//)F85$*#@-?>4-/"+(.01CBC!;?B*8@8,45%:80+6**)*(B6>=(0$7?;7?6-,A'8G@;#77E&&GHB.,$2&G+$:;A:C').?+#1&'*@$'*11-!:/$.$(41.&%)0,,<.A'H:=G8:H=%D5@:;B1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96C48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1168 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11542 42 312M = 11397 -457 AAGCAGACGACATCNGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTGACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTCGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCCCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAANTCCTGCANGCGGATTACAACA 8$+=*A<;<#>H0/1)%*E4D+32:9,.#=*21;D-"D.'4*B5#,-=$0?H+65,E.)(@/BA-26B;-5H=E=!7&9.,/#0'(6F5:!5"'*C')9<2D!B3(H@57E5:?;G(>3>B@"=*/EG!='(&;=;E/F'/.74G-,4>#C*63:%?<,=57?/;7'.''>(2B8!*%%6F3GD"0=+"-<:- AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:14T50T34T147G41A7G13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1169 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21980 42 169M = 21872 -277 TCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAA 7=CD=B623(,(,$41;%+*.-H%,B!>?@-60A74&0;H1(C)@CBF,&+0F&B=%'$EG!/@#7)1$!*9E=B/,-F$:2-D$.5FB;E81<*E-"4#8D,6/8>0D.C"0E874CE=G(!F2*!(8D)86*.'(!()G2@G$,D@=/<<3)4>=%9+=::!1$#/'ED0%!@;!&0.#74*5;E6!04"35B.4((B!?%8.68=,(,5/-,81>% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C17G87 YT:Z:UP jpayne@0: r1170 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48154 0 * = 48154 0 CAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCNGTAACCTGTCGGATCACCGGANAGGACCCGTAAAGTGATAATGATTATCATCTACATATCACAACGTGCGTGGAGGCCATCAAACCACGTCAAATAATCAATTATGACGCAGGTATCGTNTTAATTGATCTGCATCAACTTAACGTAAAAACAACTTCAGACAATACAAATCAGCGACACTGAATACGGGGCAACCTCATGTCAACGAANAACAGAACCCGCAGAA E;G<*0C+:%A8-?-,>6=D)'3D'=&G)"H&(4-770!%,?;;428:=BB+"@4C$E(%2/+%;.;9H%=G74?=//;<07D8C"9CF7+(5C#&E;3",%FB!)(E%9A=E?-3&>:;CA;08H2:C%$5&H;HH:@9,!,#7D@*!H(1(C%%927B&@D&2.A7$D1#%8?@)9)@=B&)(/C;;)*+.?E4 YT:Z:UP jpayne@0: r1171 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10589 42 200M = 10445 -344 GGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTNTCTGGTACGNAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCNATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGNCCACGCTNN +':3-4)E;G>D;A0H7<71A+G1!C;H6A),BD5<=B3EH?3+GBA0.D>($&G>9A!,6B<0B=8);;3"65*D#9H",'9%,B2.'53!-.'A%EGG6(&5?B(<4?:9)F@982G284?B-6'&HDA"HF6.E=4HD->EB8)BA9?#441?8;.22C=8A:*(( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:42T9G103C33G6A0G0C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1171 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10445 42 144M = 10589 344 AATGAAGTTATCCNCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACTTGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAANCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGC @DA@3D1$$E4(A#2B5<(D31G'*%,C=4<77-#&0-915:EC3@<:F-'E@@%"':2'->8!%>$;/AED,>8@>D4802D:+D7$&#+?-15.4))/G0F%H1,-%?7:%#DD>3F!$F*60CD372=6*!%;*0:2$/@,!H;>6@(G'"D>1285&@*7F'%E)0'5$6!1;+E*/-;A4BC7)DA9 )F7>;ECA&$D"2B'74=:G>84H7#& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1173 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8714 42 83M = 8497 -300 AGCGATACCTGGAAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGNTGCGTGGATGGA ?-7>HA"(1/!'A#D4C:'*#E403+&!+$7=1),/?(;,GG554+4>H%&D%9'3/*9DAE7$E,0E2FH@5=/!"92$'=4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C57A12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1173 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8497 42 166M = 8714 300 TTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCNCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCG >@+67.+)&?!6FB%H12:23?/:4@.>,;.!H!73AE2#8D-B0#2.9?+'9.*';1(4."470D>#<#*,/1@*0%%4B(=$F>)?@%+3&4=+58C#8(=16C;B'*$5<>@CCDA(*G8;*/&6/8;A.')=4;)>>8&HBG(0%'HHCD&-)!32:*,"G& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G143 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1174 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45325 42 111M = 45562 281 ACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTA 'H',0+E$<5D-/7.GF*=.G2<3>!#.?<7)AE*(AE=FB-%2C.@G%5=8@GEE2'6,=G!BB'BE)!%>7B6+H8$*&896:;96H$,4@A373"/94A*AD)#$$/4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45562 42 44M = 45325 -281 GGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGG =,30$0G3(+95!.)H09*E4A1=HDGG-A.@@',F@6"&?D1- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1175 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13789 42 155M = 13706 -238 GGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGCCGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCNGGCCAACAC .H-CFC8)-4)#-94(F$7,G(@2E3&-3$1!?D))3&'"9=/H#F+>$'&B61462'$B3!!:H)?1?!16,/=2C-+C*,AFGE+71:+79G3>%9(D9;H,C1;881&8/E=G+4?5/@=E7&.8*-GF#4@0<<#6!5+? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:105A39T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1175 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13706 42 54M = 13789 238 AAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCC )D3".H41F"1$$HA808;/EG!B7)H.1AE/.67C+%8+9$C7<)73G'(=42 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1176 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2572 42 156M = 2572 0 GCGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAG ;?/D:#=HB+&=5:;*-D,.GBA5.4;?81DD6)/8?$B**9B&>&62'5,>,*@3%8-;)>72E?+-.#8,,7$7=,12.7>4=1F>"$E'<3;C""4:958D19A60B,A4)('+;5"4G?AE=?8"@=D%6=$E==$/C"5<->@:,*;D*%+;D?+8A@66B9&/$;83*G>#H5FG:C<2/*73<=C%;CC?""$9GA)B>3?%,#"*%$)3/7?,,G,E-=(&=9F,D;2;B*"!@C>;E3,9,0$$9??'3HGH"*F?B*0F@CB0:2?.9F(3AF9@,2(#DG(,C9";2B2/"/2B3"=$;@8@2?4-2&/5G;;1*4:55GC$;C$E<95';8#-829&$1,>9&>H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:120T15G142C52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1177 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 599 42 65M = 267 -397 CAGCGGCGTTTTCCGGAACTNNAANACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGC CG,<9?''/4E8D,!>*57*E3+?F#:>BD8GHA(,,7D&5C:6+E6,9'B4/?#F;9<',* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G0G2A40 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1178 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45305 42 147M = 45452 250 GTTTACAAAAACAGTAATCGNCGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGNGACCTTCTCGACTTCGTCGGGCTAAGNAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTC :1:13B@BDFH"B7+'.=+:6A*EDC:@@%&>!'-=ECD)BD68'!C0871#7/A:AE(!%E8@/9360G'%!@=GA&180F1;-!13?B"55;!'E-6)1#+0'DH40/$9#1!98?##/*GDH?:BC( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20A36T16C3A5T62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1178 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45452 42 103M = 45305 -250 GCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACNTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAAC =19F-85G#FA$3=B+&&0.<$2HF8>5*,8262$2,>BF9BF!=!F%8!;B:G"24,;$H:(1@-,0#.'$E/=D-G8HD(*H32!??(83/#D);B7"#+7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G39 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1179 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2717 42 86M = 2606 -197 GACTGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGAT ('$+!"%!%$$"+'$%+$*"$**$)&#+!#(&$)'*%%&$%*%**%)%$*%'+)+")))*")*#)%*(+))%&*"'('++*(%+#% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G81C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1179 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2606 42 56M = 2717 197 CGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGANGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGC (:$BDB*C,47E30F91,<=4E>69=/6%"E(<&!DAB/'<%6#$C9'/<"A$6'3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1180 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40715 24 20M3I41M = 40405 -371 CCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGAC 32F+A?@:60=-C0H,)34HF#BG#/0'A+,,50AC4>@"/<856AD.@90C!&4(-)7(68$3 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:61 YS:i:-69 YT:Z:CP jpayne@0: r1180 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40405 24 158M3I49M7I13M5D85M = 40715 371 NGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTNCCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCNTCTACATTANTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGNCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCANCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAAT &25;B=4'5#!A?3GH38=EF1F7/<;+!#7C"B>=AF>D-7&F&-D+@(3?4*'E'="8*+6.>E1DH'C%02&"0,1.3!E!)#?8DB1%&?;CGCG**=%.,70=!D86&2%0@G#?*:!)&;%0DE/?;7:335"&0*&A4;D)%"B565/B9/;E2'F,GF'&%!'"!A9';+C'EA+H4$8$+;0='C%?9#'=@BG1"5*,,-50(%01><>D7%E&H@A;63#E'CB6"3H=+*??/)"2>6*+=5BC$''EA4!#'C7$9=2?G$(G1D45-G-:!G"$8'111-:6@AB20 AS:i:-69 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:22 MD:Z:0G51T5A109A9C32G8^TTTGG55G29 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34503 42 104M = 34286 -321 CCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTG .0&B?6+9%+(6%-8/'9!93.D84H+@3+?/5$+.==>@&B/2B;'9*#CH#((G",5"+F1HA7D-;H2-<#A%8H&,&(=05C2GH?/A94/1.#=370*7*#C!,*2<+A1/H@9G42$:=-)"@(;A+153AC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24315 42 121M = 24436 243 CACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAA -0/!-H(D0:$2.'HB>/+=?<>?*CG;%7994&5#7-%-(9"?>=0%4.=G#0*&'$0H-+!2;"#H,,D8<"-G.G#E,5%0.2H4*/>9BH'!C(A?;+.F,#94F86"%F72( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G116 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1183 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24436 42 122M = 24315 -243 AACAGCCCTCCTAATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGAGCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTNGCTAGGCACTGATACATA H-/,)B?.9D@%%H15=#H?3,CAF('$,'E.,:12.-2!0)$3<-A=<:D8,8H=!040*%F*H28,)3G)9?430?)HG)H502.GA9+C9B).?/8+2DE9"F4H4?'A/BG-?4"%;. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C65T24T18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40354 8 97M = 40559 262 AACAGNTNCNNNNGTAGCNNCCTTTAACCGNGTCGCGGCTNAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTAT '')&)"##$$"##"$)!%'!!$')"(&"&""$!(*)&*)%"&#'+"!!('++'(#*'+*+)'"&+!+%!"&"+"%#(*%&)*))%"$+#!%("$'#& AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:5G0C0G1A0A0C0A3A1C0A0G1A1A2T1A0G1C7A56 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1184 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40559 8 4M3I53M = 40354 -262 GTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCN CE).H/%/+27+GH=E6C3%$B*5*+F<-G$&#"DG67$*H7?:;(!CFFH4#8'2>%=! AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:53G0C0A0G0 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r1185 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6858 42 42M = 6637 -263 AAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGA *#%)!&)$)'!&!+*!'(%!$'*+#&)#(*+*&!!+)$$&** AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1185 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6637 42 203M = 6858 263 CGGAGTGGTGCAAGCGTGACAAGTCCANGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACNCGCTGCACGNCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAANGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTG +#"")()+)($%&&$!""')$+$+!+))!"*$*#$*$&%"$"))+&*"&'''*!(!!!#%*#!+"(&"*((&$#!$))*"'+$)!%$&((&$%#)'+*('&'$'(+*'(&($+%"'#!!%*!+#)(&&%))!"%)(**&$($#(*)""&%$"*(#)#'''+&+&)"(%(+*$#*!$&$)%%*(#$*'&"$$#($)#)#&(!%( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:8A18C31G5A3C63A53A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1186 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22804 42 105M = 22652 -257 TCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCNTTGTATGTATTGGT >/,(A#B'"C,7<#F2071%&GD5;H6)-B4:*9=HB5/C*8.42&('F)H=-3A*D6#?5-31=34HD9";E%%B)7CC&09!B*8'-!77 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1186 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22652 42 152M = 22804 257 ATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCT %A/35#$:0?*."-<--@)F:-@>@:!G.;H?7DEG,<'@H!=#5+@++:%A2!/BA=F2>::'6<4*9732?E2-1'<9>7F$H+3<7/9G*=E4:8678%0@>@-&2&$@.6//E.F"G,C5=,2.9!8;F,>(,(:,60E3':,;12:2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1187 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30828 40 17M2D39M = 30613 -273 CATCGACGTNTTTATCCNAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCT 62C#<.&*>"3F>F!07F+84!:?6(*9'EHC)A#9&CD4<7&/<%C.D3+C5C20 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:9T7^GG0A38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1187 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30613 40 62M = 30828 273 TCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTAAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAA 79D-"85#,7C+4.C06%A0;+@/H'"70%#>9#H,7!EB< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T34 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37935 42 67M = 38137 285 GCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACC 8/%:@+2CE&+<38,)B!:A'=%/2'790;C10'6)&.F<6C2@#'*2F>+82&>1:./+F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38137 42 83M = 37935 -285 GCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGNA @!6D3777A01>!=&<;?F=27AE0:84G/#FC-13H4##9",'G=G<:%-(1(7!2C(HG,1E*D;H;!C=0D%1(E(H>2" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28T52A0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1189 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28708 42 289M = 28542 -455 GTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGNCCCTGTAGCAGTAATANCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGC 3"+<':F6..?:H46%DA,)@G&)//&$25;G#31G!>=-=592@8*8,200)G#2512G@&,8-?#575C:#'G@;489*@*+G>*(6A=@@A(F;0(%.,=,9-0&E=2"91;@6D#B6)A,+H):.6G=(E-%9.2/HA0;@6!@&;$=D187$/E4C0*<:-=*6'-C.<,HA0552+=<*9(#(&H,.>B@!;,$13F*>=->>@2DB8A0-87D<65A/*F386*1,5'+;83/@C6:8C"(8F;$@#!678,@:B(+:G;*+>=G=B?$*90<<.&*"HGH( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:92T16T179 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1189 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28542 42 166M = 28708 455 NCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTNCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGATTTATCACTGTNGATTCTCGCNGTCAGAGGNTTGTGTTTGT %+&%&$!"&#*%+"(+$))!#'"$*)'$%%++($++(&(%&('%!'%$#++#(()+''#)++'(")$$'!%$*$')"'$**!$)#%''!'#+#*+#*)#!$+$%*%)''&+(('%%!)!"$%&$%$('!$+!')!*+#*%'$*(*#()"%$#"#'"%#$+!&'(+$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G73G50A10T9T8C10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1190 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1468 42 173M = 1405 -236 ACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCNGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCG )9)G;<"<>%:63H4-85<)3-=&;B,6<.?-A-@703/)=B/")81?5HDH&BFA)6;B)"@9+$&'.6!D"1'C"35DB;B@.'+F!FG"'-07HCE'59&766!7%>!G4/%";&9<"-@6.A"@,C,'(/C)=E58B*CG!F;'31&4A$#%9#2"AFG5)*9D(!1)C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72A64G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1190 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1405 42 46M = 1468 236 ATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCA F&,A1$=1H??3;C;(4=79%4&-.',F"8/7CBE4-:9/!2;)?8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5292 42 50M = 5509 293 TCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGA E;)B#<#*6-B?9+2*-!/F1/%"C8;/&E-98A"*':(E):C&*%F-8+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1191 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5509 42 76M = 5292 -293 CCTCAACAGTGAGGAGGCTCANGCACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGTTATGACCGTGAAN **#*#*(!"'$%''+*(+())"$(+)'$#+'$$($("%(%+(+%+"%$$)#*"$$!)+&#)#$)"!"$"(""(+)& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7T13C1G38G12A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44547 42 80M = 44647 290 AGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTNGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGNGATAAAA $,&G878&5>G?**G2'!BH.,<>9GE&(?6#2'"E2)F%+.8H)B@)F,",F$E"(G*@3@2D:+BD/H13A1*0E98& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T33T37A3G3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44647 42 190M = 44547 -290 ATTCCGCCTAGTNGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCANCGCAGGCAGAGAGGTNTGCAAAACGCAATCCCGAAACNGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTANATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCC %&("*&)!$%%+(!&&&%(&($*!*"!'!+#'(&*&#("%#'"%"(+$#%(%&)#*%*'"##&'$(("#'))%&)"*'#)*%$'')"''!)&$"(#&%"'+#*$%(#""#!$+"&)++!&$#"+""'**$%")#!"$('(&#"*"+'!()%"*'(*'$$"+#%(&'*"!%$!#*')(%#!#!(%+!+&(" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:12T34T15C7T13A48T54T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1193 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14703 42 85M = 14452 -336 ACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACNATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCAN ?>1:C+AH5;4!&&34!G"EH4624.#45G#G!4?A#AG*9A>2&:">G3$88GC@!4)F.#F(-"D6979DFDF4>%F=7&3#( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26C57C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1193 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14452 42 251M = 14703 336 GCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATNT 4/%:&:;2/69,&G485A>-1HD269:.HE(=;&>23!<5@H,*%(!&:(0<6;#5!5*8AB:#AC"<3*.H)*9"#-,(/E4>9DH.:&C.(*1FF!)#":5"""EF*1+/@-<: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:249T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38568 42 42M = 38367 -243 TGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCC :&!)9(/'.'!C%0F<-HA@*H?)!6!B@"?(:**H!DB>GE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38367 42 144M = 38568 243 GACTAAGCAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAATAAAATCGNAATGCTTGGAACTGAGCAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGT &(!$)#!&+)*)$&!!'"$!!!%)$!"$+$*&%&%*'''!!&*(!*)'(+*&)$(%"&"&+%"%*"#*#!%(%)*++")#!"+*+#+")*'))+%#!("%!++(!%)&#*$'%'!(!%+#&#+"$"('(*%%'+')$*$&+*#* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T0G0C2A42C7C16A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47204 42 9M6D50M = 47031 -238 TGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAA :@H AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:9^CCTATC50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47031 42 173M = 47204 238 GACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCT *73G@H214(($"(078252/,,C.-(.C9>(-88#"(H'0$(A-()&=;?)5G<6$6>."3$C<*4;+FH3"?7;@A,!GBHF,F:,'92'GH3"!;CE8=F772?;7,0%*EB3?4D42BF;>F0;# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1196 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35027 42 18M1D75M = 34810 -311 ATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGT .("7C>,8EF>410?6>/D637:;C(0F9*@$?(86&0&9%C*.?(5H.!0G7?DA91C4$&9?G&6<&+6=6C8/$4B>%3*?$?9-<1G:>FD):&-7C455#2-$;06!B;2.-" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T108T29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1197 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42210 42 158M = 42210 0 AACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAATACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCNGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGCG 3(!:;*D&!G"<*%H$2C25&D1#&#@09(5%8B,.=4:*887>5B8288"A&D9AB,:4G;@+BC0+" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53A75A26T1 YT:Z:UP jpayne@0: r1197 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42210 0 * = 42210 0 ANNGNNGTNTNNGTCTTANCNANCGNCNNNGTNNAGNNANGNNGANANGNNGAG #!!$"$###$"#$$$!#$$$!!!"##!#"!#"!$#!!!#!"""##!#!"!"$#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1198 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47771 42 51M = 47940 280 NTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGT &6,0)70F9&00;1908:A$CH,1G/0#(:<9%55*;70;5+DH0>8B>&E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1198 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47940 42 111M = 47771 -280 ACTGATCACTATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGNCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGC .E7/A"21C660'>,4(1G>5H7A-8'4+4.>D?*$'@'A9#E;,(%9=*"/'%-,$78-&((31H@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C40C60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1199 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20411 42 111M = 20596 229 ATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTNCCAGGGCGGNAAAAACGTCCGAGANGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAG :?H@&.G?!C7*;D3":*-/$.&*D%7)'!@.1H><5'0@>$+C46-,'7)4?A.A$:,E,>)*1H&5(4.('%!#$58/;(*A;#D#6'F0-B81AA.21@B9D?#:@GD8C;"'41@/2C4EH2=B%# AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:19^ACCCGA113 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17839 40 210M = 17701 -348 ATCAAACNGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCTTTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGNGAGCGATGATGCGGAAGGTTANCTGGATTTTNTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACTCCAGGAGGCTGGANNTGNGT "*'#&(&)'&#&!*+'("%#'"('$"(')&#''*''+)(()*%'%*#*((*%%))$**+#%)!('!$(!'#"!!!!$'')'!%#*)+#!!&)!*&((%+++#'$$'$(*#(!%(#+*!*))%!%"%!""%!"%%**&!&!))*'#+$(*))*&()((%))')$!**+*+)+*%!$#)#"&%&$'%!&*+"()'%)*)"&)%#*"!$&"#! AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:7C54A22C21C9T71G4C2A5G0G0A1T0T1 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1201 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2925 42 76M = 3103 318 NNTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCNTGTTGCCCANCTTTACCCGT ##,=1:4=%'3%!;(,C>&(:G&==74=EH6?7/0,%93F"+.<1'076-E/>5$)1)2F,5?$FD1%2+1D.@9G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0T53C9A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1201 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3103 42 140M = 2925 -318 CATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCAT -@,(+*&%,6E*""H,GB%'8$'>EA2.H31@DF9'1<%?&63%5>?-@GE85$HHA%03>2:D?96!G46$F5-/F%0=2B.#2;"9+#H7/.1E49145BDA,68'+!3$8=3$'@'G29)H:5?::%5F&<$A@H&G'/F2+C5:,0>=AH9.2"'.'(;5'"0ADB%E'2C%$3(%4A-E5(D2"@#743417C69:#/ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:37G4^T6T46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1203 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30399 42 56M = 30592 297 GANCNTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCG &$&)&+)()**')$%'%*$*'+!"+"#+'))&*+&%'#$#)($"*$)(##*)!+)% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A1C51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1203 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30592 42 104M = 30399 -297 CTGAATCAATGATGTTTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATG H2&EB4:A"8#!24*/+#?@9/&H1.1(9?)GD0BC20$,78E?,=9=$)4@:&!@4D(5A-2+.93<#$?;C/#7A".=%(BG+.@4(40.>H%:9BF6!>#A>HC7E*D7C(?E-;&'3(04A@:&8=?<<8E(3/'C)C$C*,*1$)3EC,$6A)7?.!(1!934$7?CH"#B.G4F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A16 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r1205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20659 42 38M7I129M = 20550 -276 CAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAAC )5/.(>7.24,=&?#G+0B%FA&5>H4,28#.3G2E%$'"6<>&"6/.(+'%0HC(7>!24;7(BB-0)8!$#'C)5DCF.<%)>.;(;6-9*+G/">18F09B,$#&=0=7A6>:1;+B4?E6948E5;7D,D)'+->9 AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:167 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1206 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22828 42 176M1D156M = 23161 400 GAAANACANTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCNAATTACCCGANGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGCTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGANATCCAAANGAAGCCATAGGCATTTTTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATTTATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGNATGGAANTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGNCTGTATAGTCAACTAACTCTTCT 0)!%3D7%/7'>574.06*,&+"3=&1A;C,*"%*:385#/8=3#*A/.7=C"!F%F(+4H9E..(;FG9-"6F4;'2>=./%<:;*E*C+(;1?G:3($E:>3'3/!'+><0".B@<.&+<,H@)/D(-$9/6>2B/0H&(2GF*+F;:,(&>+39@)(%7@78'%70'9HFFB>2G7:A&A%9>$A:'%$=>@9FHDGE'%><+,H/DHH@E2C9D&2AG(G6B59<,3%(5-$?2$F4.H4-;0).,)'$!-EF-7>.)+A:;3BF5),F?71FG61$3HB>?E38:>1D."C#-.#% AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:14 MD:Z:4T3T25C7T2A34T41T7T16G28^C8A46G6T69G23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1206 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23161 42 67M = 22828 -400 GTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTANCTANCAGTTTTAGACGCNCTTTAATATCTTCAGGAATTATTT 33,2H7".$;!.0&FHF49B#&-63":=;.4.C,FE9=D%E!?3"60/5H+';H2#+@7=*1A/"/: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24T3C13T24 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r1207 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17074 42 61M = 16890 -245 GTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTNCGTCACCGACGGCGTGAAGG 0+1"2(GB)C#>.:!?HG"C7F.>79D'>EG8A8?B#!:344'+:F7$*A&?0:'$50C82 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1207 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16890 42 184M = 17074 245 GGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGANTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTG ?4@80GF#>''.&7>:4A4;D"BA"G*99./5+13/G8F'AD>H',G1=A#=:?69*CD.%9%@8%?-4(A**)">9/*EE2F6H,%"$BGFC:E(3!(@2&//6+BDH%9"HA3G?0A<@8A6@!5123C&$A&<.C$2F, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69C114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1208 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 562 42 168M = 496 -234 AATTGCCCGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTC .)6(7FA*$:FD8582D-7-!)D$"@><3'9,.A2$3"=;%7&)/A@"(@!3B(%%6)C;,2/2%9*6%D2.&=7A4<,@8)3G.&8+)@.9#HG*;>$!5(;>87?#C261H,$:G!7%03(7%*(0.D1?-+'*@197+3E65A$&@((* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A160 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1208 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 496 42 66M = 562 234 NAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTCA )+$'''+&)''(!*+))!*)!"!&#*)"*"#&(*+"#)%$$)!**#$$!!#)+%+%)!&$("*!*# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C63G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17566 42 116M1D37M6D29M = 17755 440 TTCAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGNNTGAGCAGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAA '!5!.32(!3D$#8:E!4?@#9+;.+8#%)<0B4*3#),#!8&&*H!4<4-G+C#FF5EB*?GF02?'AC3A>?3H7)+!$8?-4!(F#>+4%;D:',A&G(3!<74F#C7C><2G+.C.,2BBD6+GEG>F%A>*F6?)B(8A)@?G?B%",G8:0:7035;+CG!:.(=H19<$1;H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:251 YS:i:-40 YT:Z:CP jpayne@0: r1210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24896 42 134M = 24762 -268 GATATNGGGATGAATAGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCNCTCCCATATTGCAGTNGCGGCACTATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGNNATACGAA ##"&'!#')+!)$$!#+#%'')&*('%%##"%%$!""**"%&*)#)+"(#*(#&%##'#'#!(#$*!!!"$##"!$)!&"(+#")+'(("#&))!+!#*%%!!"(""$"*#(%#"$(!$)"#$)+$#*%'%(#) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5A9C39T15C7G45C0A3G3 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24762 42 42M1I92M = 24896 268 ANNTAANGAAGAGCTCTGTGTNTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGGCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCNCCCGGAGTTCCGGAAACGAAGTTTGCATATACNCATNGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTC &""(&'!&''*+*+%&$&*'##$#**"+$%')")+!*#!!"$)!"))"'&!*$'*#%$((%#&$#'%!+)'&"*!%(()&*&"%"##!'"*+%*#%(+!%+!&%!&!*$+$#$&#%)'!!(*''('&'#*$)$)+ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:11 MD:Z:1A0A1G1T14T21C27A20A11C3T25 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1211 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24629 42 155M = 24784 270 CTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTT 6&51/:F(B,+E"EDH*,4F+B&6H7EG*4"5/(H3@*$CG#2A26$-?D+?:<CC&1H/83/=&6=A+;<9DE(0;0<;9*G'@.C74%5F="&(G1&%6"'$(>BBC&+!7#F%'8%?-1A0)HC$=,3=:E+6=7"7>> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:137G17 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1211 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24784 42 20M1I95M = 24629 -270 TGTCTTCCTGCCTCCAGTACGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAANGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGAT 1:/>4D>#98=C39#40$*D-0A5E)4.GB*5B><=,148H%$E=)58@6>#C8((-5H0<013!$*', AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:18T47C48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1212 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44671 42 154M = 44523 -302 CGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCACAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGA /5,%A/*>2%10D=.,;F;H$@<1*!5%4<0=4A0A5>$BE.194,,B7/047(/G>,.8+4C4- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G128 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1212 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44523 42 56M = 44671 302 ACGGATGGCAACATATTAACGGCATGAGATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAA .'#$C"49D5>@3163"35*(7@.?C/%;+D+:2%+"DB1EF-!&69818#0E1?? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1213 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9108 42 41M = 8898 -251 GCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGNCNAGNC #&#+(*$#$!(')$#(%"""))"+$&#('$(%'+!!!("%' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34A0A0G1T0G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8898 42 128M1D18M = 9108 251 GCTTGTGGAGTTCAGCCNATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCG C/)H&FF*A$7$"=EF-@4$5A&*::0B>)B1@44>:'H58F"8A9:0'%,G2$'4$@)5;F1?2&=()*#26484=F#43<*-*9;$F$&G)3FB#>;F@)E:,*') AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:17G110^T18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1214 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10279 42 338M = 10204 -413 CGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTNAGCGATCCGGATANGCATCCGCTGGATTTCAGTCTNCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGNGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGA %HG>=(-D+?"-7@DG3=D??4)';)34HE'F5E6+H+/)+7C*&4-20"@"*EF--EF="9"EC.H7F*-.#60B,59:!5<<=0)(846D*5*;C82<,)''/998<+-BF@"**780A=9G3+A)GB@";/3@-;D$.C=,41:G(C$G902F)F?2*<'4+HD"+';)+75$G*"DCF'@09-646%#=38(8C:<:%7,&#$=.3;@903A$"(":1AH)0057H*0)%,.9F-#7#A:A*;>F&9H'<3G-B#6:D;6<;8*F+C5*%H&7#(@HA0',-+)>+B<2+@4:/)B9D.&#BBA.;B=&114<-'G54271)D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C13T21G55C212 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1214 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10204 42 75M = 10279 413 NACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGNATATGCACTTTTC !'+&!)%'$($($!$&$&!%)'&"(*$(+)""+"##!'+)(!&(&*)!(*"'#%&+')+!*++"%&(!$($()'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C60G13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1215 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34809 42 67M = 34999 255 TCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCAT .08,AE)B!'F'=>&/E/FC=:"1.:=>!7B>FH5;'AD&0:=='7A<2@G2<$3B7@+%9A%F)@/$GA+)DH#5.)"%1:%.C9'?'7'<%@H%;=)DG2'4B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:46^G18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1216 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35066 42 143M = 35209 549 TTTTCTGGCGNCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGT 8%7/06-D@B!/:2'01747*@C/#5'E/3+D&8)>:*6"BD72747*$A7D6,8!A(-G4B@.;1**B<.>"3*-.5FD'!?!#F"!E/FD)?-*+;.7G$,D2/1)4A/&'!;HE$H$8@;GF2H/AF$85)<39?6/!G% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T71C60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1216 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35209 42 406M = 35066 -549 GCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGCATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTNCTGCTGATGTGCTCAGAATCACCGCCAGTGGTATTTATGT 49?,5.!&5#G,7"*(E%!2D4&G<@%)D?@DC&-%;!3-<)*C(=8!7!$B531"..G>"@?H-&%;/#)#:7BHA,8%3,+-F.G;87)?&";".1#!(G$&39<5#):*")CA(/?.0F8/<@.,:3%#5D8.529:3,*!?7C%1C5F-B.>)$)6'0B2:*@2*#+*-0#;F"/$05FGBH!1"E3<'+$F&+(F8!,3BD-#CH5,A3FC?/%A"G?4E5)>24<*.=+46@!F2DH+$2%+,?!BDC$G/38&D%"%9=9**7F2*2/!.B+/DEC$+1:/#B=+/F:A(G*7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:275T89C16T23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1217 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21728 42 61M = 21909 233 GCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCG G&@')7DG88BB#:C1;0>9*2-9?%)6G=7+!:65-/&%,#.2DE6/G0!=?4EB64$:@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1217 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21909 42 52M = 21728 -233 CTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGT 1&H%;87@5&9B5();%$;".A0A06B68>!(4% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1218 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1807 42 41M = 1524 -324 AGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCA 658$?3,E?B36#"7-1E>*BH'6F+=7BC*DH5>@#$6-, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1218 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1524 42 238M = 1807 324 TATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAATAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACANCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTNTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGG G'HHG$2--'G-$!F,=DHDG(*<=,>/(+>*FG72%-?$387&;"7)3*D,,;/#61/>>$9"!&8:67);$C*B00%&<>0!$BE#B*H@(*"&FBCEC-)G?H0;<(C=8+*0)1,%C'/=-@B05">#>85#=328(0""%35,9*D812%=)(,CA)@E2>>.76D#'D#'@/#29&F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16A112G41G32G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8344 42 89M = 8493 243 NGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGTTGTGGTGAAAATC #D>#<1@<((H@+G.%81''H>/#<6B3<8;-1A9HH,&"G$$B))%B5>'9-C56+AE:4>$@64.B*"';F(=?D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1220 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8516 42 43M = 8402 -157 TGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAACC 3E>&!7)(*$0%<;0:3<@G0D56&#@G@=+5<5(=372F64@?.9D(1>@381'2"%B1A19F=E(1"90G6#4H<568#:4HF3+81(57(&9)4+;*7#"'6%.%,%7?$A'8*,:7.C",8!2*"9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A89 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1221 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47806 42 51M = 47636 -221 CANCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTANAGAACATAA B<&1,')"3#>>GF'=.@1:&&!*.5*'-:83D(29#$G?#)E#$1&1%86175(2$4E<#1>**';/<*+H==;2+"F)AC>8;!:;#9>)H?&(H7187F64>G7B12A''"4"6=<" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C44T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1222 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8802 42 67M = 8935 217 GGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGG C,67E@62CH';6>)(<#-3;->=!6*:A8.<+!=)!-B0.EAD=AA983GH!5F#C%?C4:.84/1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1223 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26685 42 81M = 26872 260 GACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTA %F>"*99=BA$A=E"(C$.&C<3&E@&%C(-,<7.1(C6F4!6"&*A"5;A'A&&2)DFE/,,H4+%)D;!G4;,A4$8>A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1223 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26872 42 73M = 26685 -260 AACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCG <%"2D<4)>:3>09$3E5(805.EG-("F1-2",@?05$E%C-0@A36@@4$F+5%>;!:=<3$H/"8C,FC9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1224 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43605 42 43M = 43790 258 CTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATT '&>)+7&7-FE).@>A#&8@D$9*C!)%2!(#&%A8!=#5B9> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1224 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43790 42 73M = 43605 -258 AGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCANATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTG 2A4%5)@H>3HC/60,5F@98A!DC54>6">%,!6'*!,*BAD&8#.G;6"C&'79FE@+GB?4#:G6,?#79 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29540 42 52M = 29333 -259 NTACCTNCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGNAGACACGACAC )%###*#(&+($+'*!)!%#%)'%")""&#)$$+(+""'*'#''))"")&&( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A5T33G5A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1225 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29333 42 207M = 29540 259 TAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCNTTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCT B1'&=%5,4'!6940#F+B+0'@2:'9<&041@E1@4(*;$C,+:(2)5*3+#=8%#8'"*/<6%-696=0=/07."F-887AC8$%#4:/>'".*G*>,273*(68>9$CB=6?E=*E>%,)&3#*"(42<;1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123A83 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30629 42 216M2D73M = 30536 -384 GAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTANCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTNTNA *((%'!$(%)$$"%'"&++*#))!!($*%'#$+%!$&**%(*#&(%#&*#)*''&+*!%#(!!)%*%$+$"*$"%"#*++#%(*")$$+#!&"+"##+(*#!+*&&#'""*+&%&&+(#!+$##&&+))&%!#&$!*&"'+$*#*!''$*'&*&#'"%#"'$%$#)'#+*#"#%")%*&*"&$'**+!'(*'()''*&)$"$(!#+(%$**)$+"%*+'%+%('!'+)"!$)&()!)#))"(+!*#&#*%&$!+!#$$"!'#&)*!*!)%)!$#()&#+#&)!)&!"&% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:213T2^GG69G0C0T0G0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30536 42 29M2D62M = 30629 384 GTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTNGTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCT 2+*66%!7C87648.5??-((#;14>%$#.2;'8EH2B@$9481@#4$60;>'565:H(C@C1<."66,7.E3!595&D'A"$D:'A'G,*,E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1229 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21371 42 113M = 21554 261 NTGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAANTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTT &,56C&'8@2@G)F??.2??7F'G1A)&);9CC!-!/$%*4.H<9C** AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A69T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1229 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21554 42 78M = 21371 -261 TCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCNCACAAGT 3=B%?36'BE31#1,<,$GH3F8*G',97@'A53C7'3B+1;C;/!0(0AA:?4/1;6B:0:.B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70A7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1230 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41577 42 161M = 41738 221 ANATCNNCGCNNGGTGGAACCCACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCNTTAAAAAATCAACGCAANAAATNGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATGGCAGCGTGTATTTAATGAGGTCATCACGGGATCC &$#*#)$"*("!))'%'(#')!%+'(+#!$&#)++%&'('+)()*$&$"##*#'##*!#"#)!%++!)*&*"!*"))*)+'#(*%##%!"#+#%$$%*+$%!%*!%"*)(($#!#'($$)$%"*$#"$!(&*$&+$%%$$#$'*'")$('$$&+')"*$(% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1T3C0T3A0T7G1A52A17A4C28T9T24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1230 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41738 42 60M = 41577 -221 CATGTGCGTGACGGACATCGGGNAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAANGTCG G;@777--)3>0>%>10!'<5%=-2"H%A(%";7.*.*?@'9+GGG:7793;;'6,)$?E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A32T4 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1231 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11996 42 133M = 11812 -317 GGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGNTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTG $G'B#&B"8,B=62/-=#0.$>69(G=.@E+$66+&=A)).G,3++9E!(3,;=D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16335 42 84M = 16202 -217 GGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACNTCTTGGTGCGGCGGATGTNGATAAATGGGCGCTGTATTTCATCGG <%A84G<6#28:F2BG!-'%;$(5?9(CA;BG8(85EE('#B.7"94D3>(A,=F10179925D8;"6/,H*GA"HC/A8)9,. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38G18G18G7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16202 42 50M = 16335 217 GCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTANTCTGCAGGTGCCGTCGAACTAT @H%;$F,B@,6:FH'"?H<*-:G:'4G!(4&BE0>2':8<6"$0:AH053 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1233 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8167 42 59M = 8354 254 CCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTACTC H>/EA!?H?0@<-,&(,(-7>G@DH"$3=A/3-+/*?8$'<(3,"C-G7&.&)3FD3?$7:830151"&4*#*-()((':;H-A- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1234 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2284 42 83M = 2529 318 TTTATAACCNCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTT E:.75;(8'/0-$:7?6D.=504,E4/;93-F!+0,:4E4$=EE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A43G62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1235 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9282 42 74M = 9167 -189 ATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAT ?.(?".?:(1,AB:CC:G#F"(C(!95H"$96=A5#9@).)##?ACF)&0"E280*,8( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1236 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44262 42 129M = 44413 232 GTGCGGTTGATATTGCCAAANCAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCC 4!9?+<%%5G%)9HC&F(B>#;=G9H@@!E,F85A6"?*H/%:A=+(E39"$28%F:'/66=:B8/>H,,FAGA8&H("C5/G&.E!&C#7,0B=?:8)4,B$1;@2D0FB:70H:%+%D">38-;2?? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A108 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1236 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44413 42 81M = 44262 -232 GTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTNTGGTGGTGGAATGCCACAAAGAAGAGNCAATCGCAGACGACATTTTNGA %%'$$#(*("'&!"'%(((&+"&"#"(!&$!!%$++%(++'!$#("&##"(+#)%)&%"("+$)"*"#!#($+$$+))"#" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:31C8C17T11A7G0A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1237 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20456 24 60M = 20663 298 TTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGA =(C#G!21"32153!&<4&.#2H>4;@/534+BA0#<"F)-,3.!(#66%&3A&/,1:=B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1237 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20663 24 34M7I57M = 20456 -298 AAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGANACAACGAGAAAGGNGATGGTGCAGCTCAGCAGT -3H-=@2/-.1@->B?.85-)=881G5)'0(>6'/C6A.&>6)$7*?5*#'(323,,.,<%:-D25(2"A=-*;?A<"4;!?88>8D@6H&H'$*1H9 AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:57C13G3A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1238 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26426 42 43M = 26255 -214 TTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGG ':=!.;#>'?;0G.E9&"-3FE/8%;2G?=)7(#FHH,$B8'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1238 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26255 42 50M = 26426 214 GATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTC CAG$;0+.&$22EF#%(HGB90GH4&?G<+$7E$G"=.-,.0C;F%=.;D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1239 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26097 42 47M = 25979 -165 CTGAAATGAATTCTAAACGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTG :5!$H4&8.<0-"!@&%AGF%'<#C+B96&9/$,7*-%AA1#40053 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1239 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25979 42 69M = 26097 165 TATTTAGANCTNNGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACNTAGTTTTTTGATAGCT ))*(%(%&'"$")#)++((#(#'($'&$$(!*++&))(*$($)))##!"#)(*$#''(*!%"()")"#( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8A0A1G0A39T16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1240 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4366 42 271M = 4637 383 GCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATTTCCCGCATATTACCAGCATGGCCTTNAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCC @./,.FE36&E@9A6:)$79G13(E9&C?8GBC#!CD@%1D7&F&#+>F$2">=?763CD8%>3*#*$9%?@/*>9+#):G:,:$>$'34'"!F#8+G?@%E=&:'2,>E*?<4F&:-&1&#!;683#05-0&AH?CF:+,@3,F49E?/-3DF6=?5,&.9*$3"C.E.3$E2.-'0+05GAG<;H$$+=5(@*3;@9=HGH:0& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73C11G13T171 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1240 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4637 42 112M = 4366 -383 CGCAGTNATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGGTGACCGGTTACAACGGCATTA 2EB7-6/?,84%C4%=D0E4%6'A-65+36F&#!;,=>3!8F#-%'4"+DAB=4H2##B(B>B?2H=?@.!C<-&$)G;'$8C--)23;F#@6ED6AH0(,&+4A#73%:-6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T83A21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1241 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33756 42 275M = 34031 372 GAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCNTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGA -/*7@2'0/&<3@4(DG4$2E81<339/4=@<*@?77,)C'=6H#6##D,)F!:A&<'-A)7-@BD24D64/*9!->E'DF$-$1E%6G(?B76=,4+;&"1BD6?B88)$E9*%43@>540$C+:5?#<8B&3#&/A:H9*8=?>?F'*'#F4$=0#4()$64GA;F:8-=,GC)-:D>4#A+)H?7:!4-5)&BB6795/<7?C4"0&*G+?6#-7GE.--??::/!<#&G**(H7:0)(DDA+'01!63'=0F77H@4,4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65C209 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1241 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34031 42 97M = 33756 -372 ATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTANGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGNGAN %#++"'!%&)%%(%'#")&"'+%*('&(($#$"&(!("(#&(*+'$&!++$(#'&*!&*)(##"#'('"++#(+'#"*%+#$#*$"%**+$'&""$$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35T57G0C1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1242 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28656 42 77M = 28387 -346 AACATAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTNTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGC :601@+'8,89++@*2:51687D.3!E(C%9@!4,A!*;/:*G;#4$3!32;EE(3->$>-'D3#<%$"-/+1B!&; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G48G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1242 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28387 42 269M = 28656 346 CGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGT )35<7H6.;G5=G5D#!?$9>1*'&5H@H77E5+9/=DA;'3'+9-"!1/F1(;G*;B'+?H%=98>B>#*20*+.*/C9@8,@$<9%-A4&95)!'%,$!6>14<-02$(*.-6G0($&(19?G,#!;*.'(4;3'*=5&21F8)%911#:6)AA!9&F8)+3/:#91;11*9&C% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:269 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1243 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36984 42 131M = 36861 -254 AAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTANTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCAT B)>#!,11-,5BE7#8=>>)GFA.=6>)A<<318'E4H#G1*F(7156$:GF+:3D-E#GC!,C%96()C$@*?#2,".:>+G@C#F84$F#!0E)A62&";+D#0:7/34/8*3D);@8%5&@G?D=EEH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93T37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1243 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36861 42 123M = 36984 254 TCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCNTCTGATCCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAANTTTTTCCATCGATTTTATGAATATAC 0'0%AC:5/4#0-88G>HA/22#"/;:0H)$3+E=G79(5GH:1.$3+=$>H-87&;*4%,+%@-DDE#3%5,A6DG"@&)'E=G(F@H"-$#2&!F(=D239@G4@9@-.+1/BB)9-(;1: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54T5A35G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1244 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36699 24 79M7D34M4I32M = 36432 -419 CTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCCCTCTCCACTGCTTAATGACATTNCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGTTCNGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCANTGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTNN (+&$!"*&)'''*%(%$*)(%!&)"((#*&&#$)%&#*+&'$!($&#%!$)%"%+()&('!'+%))$&'*%#)'''&$#*#(#%!!!()+)%$$(+'*$(*$%#*+$*&+'%$#%(*+$#$"*$*&++&"!)$+"")%*%''(+'"+!# AS:i:-87 XN:i:0 XM:i:23 XO:i:2 XG:i:11 NM:i:34 MD:Z:25G22C25A2G1^ATGTGGT28A7G0C3C0A0A0C1A1C0A1A4A1G0G0G0A0A1C0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1244 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36432 24 267M = 36699 419 AAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCNCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCC 2H!")?716'<24=9$83;:"@/C<@B48%-2'0"B3$FD2#?<7D74)(-#/9,.)"?6.1>6@C:G.'B<14%7!#5@E/C(-;H9E::23?,)"1'.=B=#61$C-D,-A49<>0?+95!?&+E=<2<$0,G#,>+E=";9D**<&&6FE8)"@$@5ACFD;8>B-'4;"&7-6522"> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G238 YS:i:-87 YT:Z:CP jpayne@0: r1245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27356 42 176M = 27242 -290 GTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTT 9/!'!<,89"?216;:.<$;<@"H<@;68G'<-377=07**?2=H3-@8;;2;@02;6#396G="GA'5*),.#?/1*""=$/-E,:(/2@G"@8865=@!44<#=/;6/!9&:')79E?56ABF7'-D5H/H9@)=/H(;?+%=$H7E>(+EFB2D47D),/:3.B%:76.C/6B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:176 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27242 42 91M = 27356 290 NGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCGACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTC )G'*G">@)+!D@->)A.2."B=,6*CA4+!G'?>$<0E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G44C45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26687 42 136M = 26460 -363 CTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGA %E9$0D-:F3#"73;"1CH&A1):'A@EDB(D4:*)(6$"3HDD%C(;48C#:D?BE2613'/5*9?--(+98$??)-6/9H"***@@%'<,D#@29-//:)D.%!8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r1246 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26460 42 229M3I8M = 26687 363 TAAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGANATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACNAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTCGTNACCGACATGGA B3&6C@75,,:#A,+G2*F8E&&'#)F$!&<,A9%:E&'0+19CE,08?HH%?-:4;."0BH>/G59FD+)E?>57".>B;."0D,1(DH5+:-H."&4+#.,:(4="'"3FG8.=A>>5"9?;*5(,B:,+E*6?-9%.'FH4H&A$*/@E?-<6%F@@CBF+*,740@:@..C0G!''),&7H<&?)GEE(5?"2!#3/*4C(7'F61=!;G)G)>?&*'>;;H:2+A%(E'?04.C;H%#(D2<68B*,-$)%/HD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88A60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1247 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46798 42 117M = 46935 286 AGAAAATTAAACAAACNCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCC 6G),('F)&.)G4D!7G7-#+6(8))6.:"5$&"2010)FE@G-!(<(3E*#.#>8>%B!,?%=//-<),+0F.+B8@G,;4G4-#9G1144G0D&2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C100 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41008 42 44M = 41230 269 AGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAN ?;-$?95%=913(31,,''.$8>*3GC"C?4#%:,+<'F'&*:G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1248 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41230 42 47M = 41008 -269 AGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATA >GF6=C!F"*9,DG:"A$*>.2E*;H$87B,'65>E1>4$6H4F1G1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1249 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46106 42 107M = 46334 271 GAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGC >=433B.GDB)C,=#204E-9=%FG3:/*&0;0@C&28=1''3$6*:)/242?.F0D%F#<$)G9C@0;%8ED=3A72F0.H,?",,)2?'#>G/F3!,".9G.9$/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1249 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46334 42 43M = 46106 -271 TGAACGGGATTATNTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATN ((B/19)#&)>-.=A;H&(H/0D967505*2?B"3A8?+//:# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T28G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1250 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15372 42 158M = 15578 273 ACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCTCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCANTAAGGGGC 7F,,$(9=?3".8H!.<'8GH3<.GC1$2$&&4)?28&,8BGA9D;D*4)="*$G26-?%7ADC9!'==.("7*A+5;/F)==/*D6580(:'4A/FE4=?"2-6*$(G&F=G3>@"/:6&E6AB;>3F.44AE"(,;8=H<02:#+&!8H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96G52G8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1250 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15578 42 67M = 15372 -273 GTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCGGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTANAAAGCGTGCTGCT #!")'+("(##*#)")+++$!"$"%"&%'(+'++"!%#+%#)++''$!##"!(**("!"%)!*#*'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C25A13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1251 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5511 42 136M = 5511 0 TCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAANAACAGGCACGCGTGCTGGCAGNAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCNCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACCCTGCGCT -8&<6>9,6/:D<@3)B33"2#***=FD,1$9"*$&+>.F0"!CHHF;!.9=,,-6>/,'"@=;+<$B'+#)(;>E)!@' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T23G21A29G46A7 YT:Z:UP jpayne@0: r1251 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5511 0 * = 5511 0 CTNNGNNCCNNNGAAGNANGCNNTANNCTCGNGNGATNCGNCAGNTNNNNNNNNTANCNNAAGGTNCGNNNNCNNCAGNNNGNCNTNNNNTNNCCCNCTGCANTANNNNNTNC ###!#!"##!#$!$!""$##"#"!#$#"$$#!#!"#""$#$#$#"$#$!!$#!$!$"#$!$"#"!!##$"!!#!#$##!"##!#"$$"#!!#"$$$##!$"#!!$#!"$$!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1252 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18132 42 74M = 18132 0 TGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTGTGGTTGCCGCCAATC 4$08,???EH+B2'$C&./5E4%H>A@&H?>A;)5H!909G1+%G*.<48<7!G,3A6E4@/256@0@<<;'8! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C15 YT:Z:UP jpayne@0: r1252 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18132 0 * = 18132 0 NNNANGGGNGNNGNNNACCNNNNCTGNTANTNNTNGNNGNNNGNANTNGNNNCNGNNANANNNCNNCCCTNAAN "!$$"#"#$$!!$!!"!$#$"""!$#$##!$!"$!$"$!#"#$##!#$""!!$!#$!#"#!!"$""""""#$"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1253 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33018 42 48M = 32885 -181 GCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACNGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGC "@2*DG=/"7?B=56<89*BGA:CF*28/"+33E.3F,1BE-4<1184 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1253 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32885 42 92M = 33018 181 CATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCG >DC3/@0">B/+@3DE0(05&C823-7-;.))6*'C4D"45;>H3-*H'H+#'(1G2+?A#$?'?;5C'+3)&8=;!9C&H:6F@9,:/C4<=H??1B0805?(HE+7/H'7=(/:4&"F:HG9"AC'3,DC/C*-E@,('@(:9C//8,/4H?#'9-+0$FAB7&'D5#A5>/=+C;D.;5F)-:&.&H=@&"'%/B+>..(=''-&&10%):7=!)",%3B@D9)3DF8B@4/E)/3$D!!A0BD, AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40G17A79C65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1255 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23963 42 59M = 24103 212 NTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTT &.5!9;!G5H>$/DC>(B7,0$'2AF1'7+0=42!8::"F;D12DH4*"$4CD4"3%$: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T58 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1255 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24103 42 72M = 23963 -212 TAAAATCAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTCACACGTTGCTCATAGGANATATGGTAGAGCCGCAGNGNCNNC +)%!!+""%"+%#'%(&'&&($&#"#$+"+%($!+*$!&&!#"&')*+((&#)!!%+("*(!("+!#$$#"% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:6T22A17G17A0C0A1G0T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1256 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20802 40 145M4D14M = 20965 252 AAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGANAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGNACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGA A.&8&2$:B&-#$(/F#('(G4)'<-<0B=!C9D0E75+E?+.!#?B:2>A9:=C=%@"=E.,=+'&8F?*4861;$6'(*0-6GB79GF6:F?DE.&2?HD>H(=1'0(-$0B@9>E/-13.!-)= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20261 42 52M = 20509 296 GAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCT '?@/21%0B5+8($#/6+H'"(B-6A4A!904$H4'86(,*$!H!F5D1H8# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1258 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30450 42 85M = 30300 -235 GTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCNACACTCACAACAATGAGTGACAGATATAGCCTGGT (-,<(;@G80"#=/,1@/#C5,5*@+$!%1(.+3/*G+'=#122H#;366-G"C$D(6(5%/BFB$E?B';;1F*%)<-=%E/2- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49C19G15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1258 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30300 42 44M = 30450 235 TACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTNGTCAT *56'/7;@.-%723#&+.F7(!3&0>1;""!-0:1'/'#?7;+? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1259 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3016 42 240M = 3256 318 GACNATCTGGTACGCAANAACGGCTATGCGGCCAACGCCATCCTGCTGCNTCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTNGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATNGACGTTGAGCGAAAANGCACGTTTACCNTGATGATTCGGGAA ?A/B7GCHH$5-6=B1>"A,=%<-<*=D=2@&,?@B$7A099&AA;&2H1;@F!F(0;/E--$9C&68'DB&).:@/8*)<1A#<9!F*.56#>56+082414E&.!AFH/1);E%$)(.:!-B>-F.@921&?7#7%(.9''G343C1'B<(;E46#;.#>&:>?+$0=EB8-. AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G13T11C13A5A102T44T15C11A14 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1259 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3256 42 78M = 3016 -318 GGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTCTTACGG .*='GD"6D!-/3(9B/7?C8D/G-7E5)CG"&%66==;;"%?:(@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:71T2C3 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1260 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47269 42 139M = 47501 278 CCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGANGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTT E+BA'@ED-H13G1(>(#>@*E2@)F.02.&:08D5%C2;=68 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90C48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1260 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47501 42 46M = 47269 -278 TTTTATCGTATCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGA #D<,().G5CFDHB.HC=B9#,D'A<)>;!9H$&,6!663/")E8$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1261 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17467 42 168M = 17635 399 NGTCTGACCGTAACAGNGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTCTCGTTCCGG "A!+.A..),H;6(DG3>6=5.6':AF8@$C5F='(%<%5CD82'E,!*@.<#HH8-@=:2=%C7.(!<@,$(>F20BD27+00.9@%CB+0-/<:'@<52EG)0+"8+@@')<#F.A+(D2%C80'7>7*:2@4;#3H33"*:(FFA-82D!.): AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C15C141A9 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1261 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17635 42 47M1D37M6D140M = 17467 -399 ATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTNCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTT #:5D>4=&D6*$4!!B41A(#<%:3@@=()!!;'39#1=2%@,A>9@+7,15@'-,/@E8?'D<.E>C11@@/0/+D40$>/GDD4201$F2($FBB$7+F>!6B3%,&)'D6G:,49FG2;6?.??+$1/<>8'FHB,2/78%DE05B&#"!'.13>8F??0(1B7:-(G*0*AD@-F1%E.#/?E@9)(*&,3C1D?98?C@.9..-8E5>DBA/=H,.)+/6/#576>#8F:=H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T43A88 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1262 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30205 42 117M = 30322 268 GTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCATGGTCGCGGCGCTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATTGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCT 0'%#30:B4;48*A?A7>70$G>09$<'C3;+--'>#7,&=0>2E924,B==,&&4?.0/B&5:,5GA#/CB'"91(16):?%%#(A*FE(/C5/7:%8;70D8>..+7E'$(7<'D AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C11T54G26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1263 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24001 42 43M = 23771 -273 AATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACC 6C8@>"2BG:1F8*0=*)HH3CHD46H3=-0=3.'%)4/)35G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1263 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23771 42 196M = 24001 273 TTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCCATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATNCTGATATATTTTA .'C=.#&.>-'8-E-"4)?5G0G'8!)=C'0(A"+""4G-$=1(5E&A.58-CD+@5;E:!,&,8>>#?:0;&&D76@A00#DA'D'@H/37C=C2D>B@A@B*.1(C&$C(B<&=0:@3$?>#"F@,+6C#+1G5HB'3H7F>@D@3:5959<+F>)@0457+@/?G72$-4-4H&$/41<43AG2%.-A$!#56!&908<,8@,D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1264 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3691 42 48M = 3485 -254 CTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAG *$6+(#-:$'-&FB31>9+.42@.45$>?.3(C)<)E19;B$!5@1FE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1265 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26707 42 86M = 26515 -278 AATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGNAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTT #!)'('++#%"#+"!+#&$+#&'")#%'*$&&)$#('*)*!(#"+%"!&!&%&+%#+'+*)*+%$(+'(&%""&)'(*$##+$$+% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1265 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26515 42 51M = 26707 278 CAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTAC C:4G?E4-'?6/3H29$"4@F.F=2:D#E?3HE6=2.0D1B8?,%,>=6&7=F+*C>1/-<.52$D9-%H.";%3*#@D41"EH5/;?D'469:H&&22-4G1'1FA..A+&"#2<12)71@8++CBH!/?51//58"&F1!>H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1270 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39862 42 137M = 39730 -269 GGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCTAACTGCCAAACGTCAGCGNGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATCGCNGGAAGCGAGGCCTG 2."'.C7?#):D,'2"#);$5%?195#5>'F?%4A7$G#+&>A9E'4:G6%2,,'A9#!;;-1,/C!;&%@,!9%=/8@H,7F83,HB0GE?F##8<-536>@4#03%#?H!5E8"F,D6-)-C<@@0H%:&638A@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:74G0G17A25T2C14 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1270 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39730 42 132M = 39862 269 CTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACTGGNTTACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTC >)"=<)3<.H@9D8!2D+'7/(>9@/&.+:?**21?0+)0821+1AA76G*79#="4)&3&!!@G+6@7HG3=:F2)G/5;H&%!/F303=2'7C567*GG+;+45')!18>C.':3=,'>G?C%0H$#EA;&C6*E2?.'8'B%H:5+CH2#7.?E10?(;"+H-);B$&3E";8HH<2B,,B1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A93T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27699 42 211M = 27607 -303 TATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGAATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAANTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCANACG <#%H!=3??!,.F8!'25$'>>86E!(>).030<;"H?6;/G%F+(>"$%7C?-B.0E?.081!<',6/E!BE->>7(?(?=>B12.B!12)?@0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1273 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32127 42 105M = 32286 235 AAATNACTNGGAACNNANCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGNTTCATCGTTAACCGGAGTGAT )&))%*)'%*'*'*!$"!("'"+#&(*"&&$)'*&+!)'*)+**#(*%"$&"*#!$%$$$&'%#"+$)&''"+!#!'"'))$'!)%*&''%%%%%&!!""('$%% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4A0T2G5A0G1G65T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1274 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42800 42 115M = 42607 -308 ACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAG ;/?"F2HE80-&7!<)-H1;0!7:D+B1;2D-'<.9/662?"$&2'G!!-'64C@*B7"HA0>=#'6:A;69"2BE/3$6;=;-D(.#H(7'13(39G$3DA>G-:06"5$-%1(*1?&C7C47DD,AG@.8=)@8F+:)G1,*F'):H?%)$G? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1275 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14442 42 69M = 14096 -415 GCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTNACGGACTGTTACACACTGTTCCGGN *'E'F("C)E9EFF3",;&?!&CB4)D<=@=G'=:9@8@5&)!(E"&2HB! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G24G0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1275 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14096 42 346M = 14442 415 GCTTCCTTTCCNTTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGTCGATGTGCGNCAGNGGAGTCGTGCNGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGANTATCTCCGGTGAGCCGNAGGCTATTTCCGTATGTTGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCNACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCNGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGNTTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCANAAGTTCC @C7>636.G564??2HA:1.?%4B:*?/1F'7(=>5>7%!+(>5%69'+,$&@2+')7A&?F(480,)B://09-7@:&G(2(-+E8;714:E!#D;.H/$523""A")$!:2H>)CD$%F./!B$8<-G!<=:0.==:1/-":7/)C.DBC-?0E?G%-71)F6->*0H7-HG;H/-4=#615%G"#/F7H"1<#EC&$:)#=28.7*:(%C>8=6C'#G1GH93BD>",,/5A<=A+=+0,H=??!"GBD$F',3A2392/#'8=D@=!$-5E5C%AD@/GAA";D1!>'65.E0E?,<0 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:11A63G9C3C10G48A16G17C58C31C25A36T7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1276 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21457 42 78M = 21656 306 CAGTGCCNGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAG CE966E";*:8B<(:72#G3!;G4D?$HH638'H@//::5F79.50#8.,44?C7!+',<;FC$):5,9=40.C%"$; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A70 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1276 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21656 42 107M = 21457 -306 TGGAGTCAGTATGGGACAGCAANCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTNCTTATTTCTCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCA C$1'@97$D@3957,?5&#'8..+1*3-5F!G;"/+68A#<&6%62F94%48%7+A3?%,8)%-.0)2D> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14A7C49G7A26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1277 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1609 42 111M = 1484 -236 TCTGGACCCGTGATGGCATTNTCTGGTTTTCGTCATCCNGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGAGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTNACCACCTGGG ="CF$48:-5/G4'#*&AA$4A*;=/;<)+C%C2H%$5.AC2/+)H*@-)AA>%6B9"!F2G2"B0#;,-93D:'(3@3=)'GE##">/68C*!C;#9-5"8-',1+$'?: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20C17G27T33C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1484 42 88M = 1609 236 TGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGAC AAC33CBE9EG.880%$?58'?$+H+04*3D46:@A7A4>B7+'6:+.!B(=4F:DH60/1!E<(A:,BG3C9252C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1278 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32596 42 93M = 32432 -257 CCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCNTTCGTCCACGGATTAAGGCCGNACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCA (;C*"5()%>D-:7>"9*07-B"D>29:>4!D=B3/4:BD**1;9%.(H: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T21T38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1278 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32432 42 59M = 32596 257 GGCATTCATCCATCAATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATC AH*787@CG.3166!,8G+-7;F7:.#>;6.(:E1&@+1.!H4=*+#(.8<,C%,/@H( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1279 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16590 42 41M = 16366 -265 CCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATG D#1GG(5(B7B=90,)38?2<,0&%0%4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1279 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16366 42 104M = 16590 265 NGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATGAATGGGCGCTGNATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCG "AA'C1>:60D6=G)48G-2E$/5G#E08.E/56&;C;H"#/8:HD1G'F8;&6$5*'>0&3(9B1.>$3E#*.8$6.%GG3#2:39@::9(:E5$E/E/=?@H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G29A11T61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1280 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18080 42 77M = 17889 -268 GGAATGCCATNTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATG H*/.0?;9@8.F=D%5C"%+C7),@:7H;A<;96'2'D<3>>/>A;H16E*DG3,'0$52*15B)$F155,-%)!&F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G66 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1280 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17889 42 111M = 18080 268 CGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGNGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCT !22E52F1D'6CH(4**$.6+!@#3'25(),#E(/?29,E3(@F**;#,;7'<;">@D>;':(#:5CE>B'$A+:7A1;)"7+0)0C-G5*&%)+4,0*B.G<)4(A?G:9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T38C71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1281 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47030 40 91M = 47194 283 NNNNGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTT "'&%+++'")'((#!''#$*)##*+"%)*"+%+++%')$($&%#(&**#*&&"*$&#)"%("%$"(!*%#%!%$&!)*$&$#&##($*+'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G0A0C87 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r1281 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47194 40 19M6D94M = 47030 -283 TGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACAGTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTTTTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAAC 7==.6@4-%"E""G$525*E;2BA"BDD8,*"93D15*+:+A.F,)=94G*H#%29>69D;1)"3;BEF>"&8,18&4=*==8?C3!C:5F+0298G'?+D"C9="G?53$)1 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:19^CCTATC43T23A26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6666 40 41M = 6814 274 NATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGC 2180%/@'G<5!37"&*)(>%">&0(*G$6(/2E?H>>(5$F0F/>9,B;2;&)98&"B$2B)(C-1G#B;/D0G:."A$B.?"27@55=H: AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10A103A8C0G0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1283 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1971 42 86M = 1857 -200 TGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCNGCCACGATGATTGACAGACGCTGCTGCGTGTGGNTGAGGCCATCAATAAAACCTA G83G39/(&+.:@@9F3@E'<206#D6H?G/C-06%$-<:B:A>9C1!.GDC;158=3D4)EG,37%!<8*8(8;#&%&"?99#',*)9!HF: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C25 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27097 42 375M = 27472 596 GGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCAGAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATNGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTG 3F(*&?.!943/!'/(4'9<>?C*B@**'2,!7,D6;+*7=1$8BF<(3/&BC8$F=5.)#,17=:35F6>0*BA76E#:&;)-9%).0(,,/B&539=:).5@(E'D=<+G'5=4=F9!59=>/!&?6+<#*FD"7<%1,8%&%<#%%0+!1<0C-,"#00B,C#D@3C#!8C;18,BCH%1F7&8.".G;.).*@'"'!=C!7BDE+>!",3(&)@&(@/&,("D!26D$H&DE9FD+=6'?*FE%836 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:214T49G110 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27472 42 221M = 27097 -596 GCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTATACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAANANANT **$!'(""&&$(&*!&")"++&(!#(!"'%"*#&)&(%%$)$#*(&&'*"+'""%#)(+&#)+'('&'*"$#$!#('$)#*#%!(*'*)'$'!())#+#+$%)*'+'+&'%)+(!*%&)*$&+))++!$*")&*%+$"("'*#$*$(%&#"!&*!'&%()%)")+*%(&'$')()$!"&&#!)$%$&((+'#'%#&*)$+$#'(!")$($*&+'!+(")$& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:171T43T1T1T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17292 42 312M = 17604 444 GGCCATCGTGGATAACNGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCAGGCGCGATGGGACACACCGANGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTNTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGNGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCA 21B:+'#,?;/;F%A%H,.H":9F$'F-""A$GG/48,6#8'B-E9!7:)9B8!71'.(/D%.?5(5H=:"@&>4<,/8H,;&(0<,7-HG29"H!/8F3-.3'',;0!=.8@96%@4G0-?1@:/>F7$?2*.'#/E,$64#:AE$/*3@8F@E#"D?9B6)3:*HD2!(E4';4&A0:<+CHE?.3DB7,B#?4/36#8.H>!>@*;-G-;<""C>,*:#.57(,#16?3$3C(>$,F.;;&!3H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16G108T20A31C89G43 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r1285 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17604 42 78M1D37M6D10M = 17292 -444 GCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGNACCGGCAGCACCGTCGANGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTT &@H!9G0/$&/$(F$E9EF#!E AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:38C17G21^T37^ACCCGA10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1286 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46042 42 69M = 46111 207 NCCGTGATAACGCCATTACCTACGAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACG +(&!&)#&"#+#'!*$(')'"!+("!(!%$(%(#"!"&+**+%'$"%('($(#+&'&)%$+$+!&%&!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A22A45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46111 42 138M = 46042 -207 CGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGANGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTNGTCGTCATCGGTTGCACA 5A<.#$>E98F")"@8--)<'$9>-EE1,,B)*E?'!A$,&6B$34$C2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63A55G6G11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1287 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37869 42 43M = 37678 -234 TTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCT 1'4++B!@-C@EBG(82,F0/%."!:2&&1,E/!:6>%.H:B< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1287 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37678 42 91M = 37869 234 ATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTACCTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTA 6F3%,.2D?)4>!G+,4B;8:=#E;/+H5?#E(>@-<#-&4+ACE&613';<1"=1A7B.(#,2#)"'#4#*/!01#AF()+&=DE8,+): AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1288 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9664 42 92M = 9491 -265 CGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGNC )'!%$#*+)!)!!"'((%***+($#%'$'(#%*!&'($(+%)+&#!$*)"$(*"+%"!$")*#!!+$$)&*('*&(*)!&#''*$('%+%## AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1288 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9491 42 121M = 9664 265 CACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTACGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTT 5!!H'(ED13*20?"C39DF@$C=B&0E#F>=%#DE"C;F&$C5B*(3:<(A.=:08,%(23!A%,@%0.'@;>#=6)151#0BFCC@(=;%/59G&D$72B:B@/H5,;!)9)5$(=<4:G)@%:=*!,F4?-#@2GB87'<$>F76.:<<7&D,@H@*<+#,2:/3+2,<>9"1>+-*'%+'2".5A!(6%491&'<29-*H%":F24B9,-.,%/46*0:9#C+5:**'4 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13G101C3T17A74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1290 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45296 42 92M = 45424 259 TGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAA =0@/(F!F+%#?F'66?''@.!6"#5)8'9F(?6.=?!3.24#"AC<%))19>B-CCG!8&$ADB)$:$9&GB&.H01.%+&=,7"C*F6<< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1290 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45424 42 131M = 45296 -259 GCTANATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGNTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAAN <1@.(';0+:E8'F4EB*G!-"%<3G1D7;H!F$E20810)978'(=DDF%<-'>*>D5B2'!C@+3*'$;;468:2$!--;E=.1?44-41C#(8G!HFB6#,*D6"=5274D(9)B6"&%-.3)#34;+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C94T30C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1291 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35329 42 72M = 35171 -230 CGACATTCGCGGCGGCGTGTTTGTNCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAG :#@4C,C>(+B3()0<*F99A)!.789B'<.+0460')/20A"F$$54&F;/%.9GDG>D1@"&D:./23:( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G19G47 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1291 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35171 42 120M = 35329 230 GNTATTCAGCCAGCACAGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGANTCAGCGACAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACA ;6ABHC4*>"!="?@%D5+)12GD9)@55%"><):'@E94$.*,4;C?9<)-'=@1@HA&8)H8.;HD*+:G>!-AA?=$G!-)H?&+F'A0316#)'>(?<:?F?H$-EA<:.B*""D: AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G14T51T7G43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1292 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18833 42 181M = 19014 311 CGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTNTTTGCCGCACTTGCGGTGA /978:76>30,4>F!A:?)A>0F$=C*AG$=2C=,9H-#9")F,1;07B#<;:C%@(4G(-$G@A00..B/2+/<1>EA,$6G8?67G=&H*&/#GH88;B9'4=/)<(CC) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:161C19 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1292 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19014 42 130M = 18833 -311 CAATCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATNAACGT >9H($;*)5@2"!!:*))'7?B3E9905%;G$:,8(@CA3D='*4B=@/B0<,!2%<34$56*:73F8/!6%59'BG>8=:. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G121T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28025 42 55M = 28226 254 TGATACTATGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCT +&$!+#((+'%"'!'(&%)*+"**%++($!+&&!"+(%+&%!''!%"*!&&$$*! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1293 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28226 42 53M = 28025 -254 CATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTG =A'$<+!#"A'@;-(C'*HH,=CD<'%).3<<3@'B&G:=7:*!6+4#-0@F- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1294 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25365 42 42M = 25143 -264 CTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTT 70%2#:$C!=0E-:/(E0%73"D28&G???=446<#F@-6'< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1294 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25143 42 99M = 25365 264 AGATTATTTTCATAAAGNTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTNCTAAGGTTGTANGCTCAAGAGGGTGTGTTCTGTCGTAGGTAAATAAC "*+*%)'$#%+!&"%'$*#)&*&&%(!*!)+*("!"'%%#%$$#%&*'$&#&(#"($*+&'&+(!'&%*$')")$%)&"%++%'&)*(**"'%'%!()& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17C33A11G16C18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1295 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45025 42 42M = 44715 -352 GCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTNCNGTTTTG #?/.BA9+%9848@-8(;/2@@!"8(#56$@7;'#7:6B=/E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33G1C6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1295 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44715 42 90M = 45025 352 AAATGCAATCCCGAAACAGTTCNCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCAT H3#8*:'?'HD::HE@>!H.";'24"?13))=!*.*8#1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1296 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7617 42 60M = 7730 196 TGATTTCGATNACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTA 0HCD'86A#'&7ED%#>!8@'-1G)54>.HF24%.?4C#G0@(2**?7'*7DG2>4.*+A3)B0+=F0G"7>9((3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T16A45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1298 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27162 42 149M = 27311 285 CANGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATCGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCA '+$!#"*"%"*%"(&'+!$*$"!)*!#*&(%$*+#('&(!&&)*!)*&$"$(*)"'*$#++'('"&$"))#$+%!#'(((%$$*+"('$'$%***%)%$$$$*"'$(#%*'')!!!#'+*"'(*"")$!*&'$+*!(+#"#)"#"*)!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T119A26 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1298 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27311 42 136M = 27162 -285 TACGTGTTAACTTCCGCTCNTCGCTCATAACAGACATTCACTANAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTTGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTA *E%9>C0E/-<;#G<,@C!!H#$!E7*G"2'.0+:1GG47@#HD+E$.5;#HD=;B=?&#$+&"%#&31>6%"1!!B5.(*?D0D7/H2)A9*#47%%(?8;8B7D6=6,#2=26=3EBECG6(9/(<):?;"C!D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A16C23C66C25 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1299 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21090 42 139M = 21229 248 TCNCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTANTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACNCAGGTTGGCAGGGATAATCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAA %$!+$&#+!&*!#$$)'+$)+*((*+!$!$"($%#)'(+%$#&('##''$'#&+!++(++*($+%)($#")$&!%#*+$($*"'$*#"*$'$$(%&#&)+**&&)'&$&((*&!"+($!%)"!)"&&#((+"%%$$&++ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T0T17T7T38T16T54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1299 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21229 42 109M = 21090 -248 TTCGGCCGTTCNGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCCTCAGATNTCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTNATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTANCCAAAACTT (4%8:#7-'A6D2HGA>/'((8;"5EC="<7F@G::14';9H3,B6C1G.CAA-'B1$*'264C$-HC(!*=A8F#87+B":2&:9)83!/E@*>7>>9'D(+#8AA1% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7T3C24A6A22G32C9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24160 42 68M = 24290 282 AGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTT 3.E2)'HB.$!)&9H?"7>;F8#D&B4.#AC>2',DG':D52)0/8>1)CB*87#.$D2/7.?'5<6? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24290 42 152M = 24160 -282 CCANCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAANCAGN %$479$.EH%55*:8.+DC/9<"$G3:6A9.18F%,H5'5+">5(%A.*4,!=4);7'3%7AG1:4;<5996/;G>3<.#2)",C24F"07;.>71#0196?=!H.BA%:!275,6?E>/B$9/?%>%C1@>6/7?>2AG::5F*'3AD<7$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C25G117A3C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1301 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32529 42 184M = 32713 345 GCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCNTTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAANTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCC %E6H%1*HGF6?5F7=BE7,A%8GAC67$36"4C<31/D7*AG8'%+?6)D/01+77(&)>5><#%@93<'H@#G05$*4>.'5:27-G)F:(.C?&-H?:+0/3E(%EBH35F(%BF: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69A25T88 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1301 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32713 42 161M = 32529 -345 GTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTNTCAACCATGTACCGG B80.9%&,4#CH-'8(CF/'-B2B%262.H8G(;/,F>&EE0B@62#&A;)+"?8$B'(#"E,F!59(",2&(2%C/?B&+#'@;+7$.+.<%A3(8=BC,+'4>)!/'E:$D/(,B7,=$(3@;A:9C!GD+'HC#1*6?#8@/3DF@1%2$!)%(+BB1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:145T15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1302 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27085 42 56M = 27193 181 ATTGAACTTAACGGGGCNTCGTATAGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCT ?G@21G*+-:5'79$">A'=0>8&H)@#7/;C;.H"!31A2=$%0.H+,B6*(H?; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A6T31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1302 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27193 42 73M = 27085 -181 ATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATNAGCTCTTCAGGCTTCNGAAGAAGCGTTTCAAGT 4>67%5$:-+21B?#76%&&'#D@<%,@*!C)"616!.)5'72B(43<&<7?)-&0D.8@7#-%)-=!GC#:5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39T15T17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1303 77 * 0 0 * * 0 0 TGAAGCGGTTATNAATCTGCTCTTTCGCGGTATCCGTACCCATTTCGGTAAGGTAAACCCCGTTTTTGT )%AG82A1)4:@05*0;7E'-#4+(,$#B$"0(A9$:01=)F86C!991"EF70&A"$8$@G&G"#+6? YT:Z:UP jpayne@0: r1303 141 * 0 0 * * 0 0 CACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATCCCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGNATACTGGCGG EA+E18;H0C6",&EB".B8,=E(('-B*86-./%>*(.%D-+D8?/?1D5+85'+%0.;G0?:9,""*G%%"H=*:H"5/*'2:C(!@=-.16"A,0089%)0=)79!%<&5/E29H4*;(?B#-"&%,F$9G)&1*B%&4-4E.!HF>>"#@/$2>11%.D7A4:$6/$,-(=;),-200$:3D/8C,C4/>*;+05F.7"+H5*;!G;%0.6(/*F%0"52;-B)HA"&B:3#&%E"(6/?G=3"C@:G,6G?8+4$/E=F-3E6'7G:-/H(+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95T20A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1305 77 * 0 0 * * 0 0 TGNNGNNCNCNTANTGNGCGCTGCTGATTCGTTCGCGGTTCCAAATTACCTGCTGATGATCAACTGGCTTNCCAAACTCNTATTCGTCAAAGGGATAAT )&$""#')$($)!$*)"()#$&('*+$*!!('!+#+'$)&&%&%#%+"!"+$*!&*!"$)*)('("%*"!%%)('!"+%$%(&*)&'%#&#)&$#!+%' YT:Z:UP jpayne@0: r1305 141 * 0 0 * * 0 0 GTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTANGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCNTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAANTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCG H66";%-5;+,A?"02@9@A6&?;%A*HH:69D4.H%4*G9;2?F-3)2A8&G"=-#1,1;A,6=BF?8B@F#73B?%@(1#<.=,0B3&4C.-@$8-HG$D0<912!@!>A#)E$'6!%19%@*$/;!>E3$#D(G=<16E8,,4BCD+(>677!6'DD)*=;>'-);61$;,+'329?,">3(.(+6"A2;"G:G*7<8F@)F6?".=$,GH(05$0+76.;5"<:/3D#2+=#F4;F&=2.(/+-2;!=09;9B-3-F&FH,?)28-GB$9>31#*:"<7>?)?"3D<>.2+-1/E:-6.%@!>83*9B%7""4"C2C-#,"C"F)C599-A"A9D,C.99*)&'F*'*-46G!)#<8<,)0$3+F$G#E'H!44)(;#(@C5G."#E;)(1> AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:75A49C69T16 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1307 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37987 42 21M2I43M = 37804 -247 GTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGNATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAAC C%+>6#09#27/.7;5!@H"0+4;3**8?600FHB'"11+B"A>E'D173=H''A"6'A?2$7$-! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:35C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1307 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37804 42 161M = 37987 247 GACTGCCCCATCCCCANCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGG 4A(>.E2.9+#1&?0@$/:+'/#-:"%*%8GGD42&G0>>D+)(4!1CF.:-/,$6#4>'%6B.(A$GGDC/=7A4F+&(='&3""BD/F'3*E*./#5&:4)5=-B/E"-06GB3'53(!>=0D-?B0'2.H$;!@(@CA;&.=/G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T144 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1308 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26716 42 167M = 26883 217 ACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTTATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAAT ((G0&!-;8?DC>5(FC=?GF6$7*?-5)+=E(579H)A#5%'>=>;/#@.#HH'1?->F"C09-?B9.:0@G9.'9H,><;9>6=6G7#AFDB2-2.*;4+.50H5&,*/1;>*(A"2;#G3(%"8GF<,$GC!6F=%$2,0*1..B%9='82D:5H/+:!'857, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1308 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26883 42 50M = 26716 -217 AGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCA G@=;':;!H9A6!49"0@:,:A'#'61@<(?&&C09#A&:BE@,7"$!F">,1//8=6&=/->4"(2,,:9:4G$GF<7@".@%4-+'4A1(C.DG>&#*2%4=B3@+49<;E*6++"?!+905E6'..D6&C9#F132-'%H1(A22=(@!8.EB1$D-,,($&C"")6)C2-5*'B"*(7'=%@+3H2&'3+0@60#B".7G*4D7$6F/?F$>C,H01 YT:Z:UP jpayne@0: r1310 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29883 42 70M = 30063 272 CATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATG 871%3?"&%?9>/'C6=/H&*&$!*H-2H?++A9GG+!=:@5@;F$!;FC0C>,'9+H/C/*4("&:7!G>>F&@>*$HHB6'C8'FH270;HA>%(+(<$#:?;500A625;01F,(F.-@8?&&"(HC.+;+,@=4#6858 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1311 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40344 42 58M = 40412 133 NTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGC %9F9(>-B3*8G<)#F39/!% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1311 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40412 42 65M = 40344 -133 CTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACG A,!DF/7&2.=&%(,=E-6=$E5/.+.2"9,A!'-CE2'&&>+/00%@$BG+,2))(+@;@=1#H:'A1/0EF6F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1312 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15160 42 95M = 15300 205 ATTGGGGCCNGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAAC 6(>(6:@2;(F>!5?FEB=$&1@@(:5/17=GC:>7@A5'*%*&E"A&-@/$0D2)9',2( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35940 42 53M = 35714 -279 GAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAG G8"2*1@2::":5B#H,6#,#6&BBG((+#+H+//>2.;FE,H$!,%33CB78 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1313 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35714 42 48M = 35940 279 TCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAA 18)-@<<'4G1/D@>G>FD7'F8)4&'/=G/#9D6#9(:'%3C*@8A=AC@8BF1D<%B"6+!64-0G)#6-*)*?F+3B,@/5,14,9E70'C6!9@"(+>0!(7"@H(<7.G8$32G(<*76!B%F5HDA+04*:",;.('@5B$%H+3&*FD)>):$*"4E0$9!D<+<%%$H>"/('4@3G0:)1%E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:52C19G20G0A35A38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1315 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31653 42 129M = 31824 222 NGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTNCGTCGCNATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTNGCGCCGTTCTCGTACT $?'G(B=1%6+1+D!$5B2E%54'D/%&%0>&$?+:<;>F:CE:D83/DDC-5H)8'G;!.;BF@=0.%=97.:@@-33&G)>?(8%*2;E?D4*04<*050+#%D,G7)"HDC+2;773D+'F:&+7( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T46T6G57G3T12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1315 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31824 42 51M = 31653 -222 CACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGT -7C'?H3FAAC1:)/')"@$?'$7E""?+8>AD>F"E;1.&F:>G7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3083 42 100M = 2964 -219 GGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAA 3/677*59%%<$5H:+/$#32>F@40<>A2,(>=3?65GA>H1.5&B&&=.0B>%.'B4#D',FD6&1G&F8<-%9H)-::3:=7>G9&$@;#:B2!B+> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2964 42 119M = 3083 219 AAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATNACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCG FD-,(2<96:79>,9A%=*.!;(3!;-9%%E<62;0-%"90!)&9&3C37@1.'F-30":1B<2,;6/ &C0B;&1,.A%C?4?AG?3BH@>&?$$8A>%@)"67/-1B0:/1A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70A48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1317 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14173 42 114M = 14288 177 NATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAACGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGA "5.:&G=,89<;7"1;81.@E(61A*-D(8C;5E+.7(<,!>D>()5:EF)0<=B7""B9")?2A@F(C0&$"= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G52A60 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1317 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14288 42 62M = 14173 -177 GACTGGCCGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGCTNCNNANCCAACCAGTTGN "'"+*&*$(+%"%&''$!++!($!()##$%%)')&$)&+$'*''&)'"("('&"#$!'**&& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:7T34G1C1A0C1G3C2C1G2G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1318 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19487 42 79M = 19703 260 CTGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTG )%%+%&*$')$($!'&"&+#"#+"+%'(+&"")'$&!%#!$&'"'%*##"+%'*+)"$*+%%&'+)(!!%&%*#!+$+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19703 42 44M = 19487 -260 CAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGG :E=A2/H2E':*:',9A*#*3#0>-##0+.,=.:$F<:3F24*5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1319 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22223 42 82M = 22018 -287 CGNTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACAN ?%4"7G;?6A6&-"G,1@;$GG0'82=*AC+)/G5>?&.$'9F9.,G@#,=6@00C7GC+;'%13&B%72:@*4G:*/'70% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T77G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1319 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22018 42 84M = 22223 287 AATCTGCTGNCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATAAATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACC ?C>76E%@0,A,4/E#)!,9H*7<66G@,0093:'6D,.A146,$4;#3%)<8FC6#&46F>:-ECFH),-&0D401#.#F%36 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G37T36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1320 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44029 42 80M = 44109 252 NATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCAC #67H;A%<'B5=<2H.?@.%F>$&@&46<"E3(42!A)1HAA+E>57<6A@4(*#<5H>9<#27E=(.&7E+;7>/0/:-0*#87)9>>>*(@'+H*%$!D+&/<91A>=9$H.HA?9#&60F!4E0/AA:C%#(2:7@:%/.64>E9',#)@?F2%/+&1BB=<9)%E-;(,AH+:1G9-CF52?,6%2", AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26G6A107A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1321 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38822 24 80M4I12M1I8M = 38594 -328 CCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGNTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGAC 6'E;@(A4>0A7!8>H@C!")5F=9G#?4<0;)F=&->1?#4@@G5:<#5:7"DC:2=5$0HB#A<(!;#::2G/G:;92,6"C!6=B-:)4;400<+*=%;$<@ AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:16 MD:Z:49G28A2C2A0A0C1T1G3G1T0T2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1321 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38594 24 228M = 38822 328 ACCAATAAAAAACGCNCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATNATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTNCGGCAGNGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGNAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTNAGGCTTATTCGGGCGCANATCTGA 5H6AE2*:0$7+190&?.7";!0?":9&G;)/=!8//*-@???F&EG=2,B+D2(*-E2G,/(=$8:0*).=C'*"1A5/".:?A",)/A92(#8291333>@>9,9G5%"$@5$$&49.!2-517)'963'/3@+9;:-C>4A96-?88C;G.,4="B/4H*72;H+?E*@>!?7*9)$32EA3H-'0882%A0+6.;-.%%4#E)=F+>')5!):)B,D,+%4=D@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:15C75T28T6A31C43G17G6 YS:i:-60 YT:Z:CP jpayne@0: r1322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14333 42 109M = 14260 -182 CACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCC *09CH7H>,&G&CE#5>2#G316F.B6*2BF><%E1-0"<<$7>@@)@+==39@!E;3"9%%'''1&F/D6DH#,A@;*'?><9):5;!30-D1<9?294%6B0F*.$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1322 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14260 42 66M = 14333 182 NGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCNGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGC !+!!*($*$&#"$+&!"(%"&+&&"&(##")#%)$$)'&#+'*()$)%'+*(+#$&'+&#*"#)*% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C22C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1323 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30067 42 221M = 30067 0 TTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGNAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACNTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCCCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCNTTCATCCAGCAGTTCNAGGAC $''++#&&("($$$#+'!*)'+"(*"'$#!(*+'&"&('%!(%$'""(%%%&#)$&%')*%"(!(%!('%+")&&"%$)#$#"#)'#+++(&$'%)"#(%&++$$")!'*)!%&#&+"#"+"%'!#%"'*!!')$%))%&'%"&+!#*"))+*$$+!%$(%&('"&"++"+!$%*+!"**#+*+*$$*(#$*'()+(*$*$$)&#*"&+#!)"'+#)%!*! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:37C29C85T45G15C2C2 YT:Z:UP jpayne@0: r1323 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30067 0 * = 30067 0 NGNNANGNCTNCNGNGGTNNCTGGGGTGGNNNNGGNTNTCNNGAT !#"#$!#!!#!!!"$$####"##$$$#$#"!#"!!$"!!"#$$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29833 42 179M = 29775 -237 TTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGGTGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACANACTCNCCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACC @43#&#FFB)2>4H2C7:-7F/E<.6=A#4>,G"%36):1<>D.5#G.?H(+-74!("A6BD+:=E;(-5FG4;5!?<<"$D$G3.@'2F=:4B)6>'&GEG?@'=&&'2H"*7A09!"(0@4(H&=252547E!7.B), AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27A30G1T4A113 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29775 42 58M = 29833 237 GNCTCTGGNAANCNTGTGAAGACGACGCGAAAATCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTT *"*'$'$&%)"""%+"&+'+$'#%'($'%''"'$&%)')"$$"++!+)%)!!"'!$*" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A6C1T0C0G0C18T25 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1325 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31446 42 71M = 31691 293 ACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAG -><$D*(6#<886&,26!C/&0>*+D1:)"=604238*B'*@%;3&;:@F4A4+#&9E=&@(E@2":@%B* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31691 42 48M = 31446 -293 CGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACG /&4*7F2G;?&1CC!0*:)H(;G:'CG++'$.9>%9$D)G&7:-E@7@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1326 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35857 42 48M = 35719 -186 GGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGA *E'"@*4,@2(G<=57?.&>8"69&%(0&2/G;/"#GDC*:B<@<%2> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1326 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35719 42 50M = 35857 186 ATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATT ;#:A<#"?0;&@8+-"EA*3:0390$F6=9AC)/03&*%?>F';+%%-#4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1327 77 * 0 0 * * 0 0 AAAAAGCCCACCGGTTCGGGCGGGCCGTCATAACACTGTGTTACCTGGCTAATC ?':G07&+E:3;&*?+CF3:2$;H+2#-H0+5$0%"2"0'B;?("45:18C6/" YT:Z:UP jpayne@0: r1327 141 * 0 0 * * 0 0 AGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTGTGAAGGCTCCGGCAG >>B*B(F;'.-B#&9+1(8-(/2H&3C.,7BE#<3H/7:79$>F&$B'D-5>DG=&!!*1&4E88A'GCH>,%&5*2/&/7&1ED8E>=)36A@@H&%@!-+A>9;4?:%=0G;B(@,?2&*4'C;G5F*#G1'%F)G@$D"@(!@:'-;7=G43%=!*C(FH'=05=#+=/A,3@/$,!,*/)69>!2B<)F-1/>%4.=*2D'!(&0/!4.%29#$1.3=7.11'0>G;@.$"EB?:45.)D%49-+-84?:D:(3D.##8:4>'%67533(?%0--0B#EBE"A?=-B?DA!G&A8G9G)(;:G7&,3+6:H@BA4)?/(?C25D%+8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0T17T61 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38132 40 112M5I48M = 38019 -273 ACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAA 3?!940%64'*2@<-!(A@8)<.-*'/H;+E-GC3E>;*C@:4E%74*%#<*E!.@!06H'0H:*B$#G;3&&1D$B4%=#.9':G.7'G'+'0&G*%/9$;)+4BBF54.$*@<;?'G>$$09D46>8&=D:"?=$;&G%)", AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YT:Z:UP jpayne@0: r1331 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3670 0 * = 3670 0 NGTTNNNCNGGTGNTNAACTNNCNATAANNCANGNNNCGCTNNNNNNANGANNCANCCANCNNNNCNGNGNNCNACNGCNGCCACGTTGGNNCNTACATGAANNGNCAGTTNNNNGTATAANNGGGCGTNACCNNGCNTNNCNAGNACNCNGNCATATNNCTCGNTCCNNATTTANCANANNGN #!$!!$!!"#"!$##"#!"#""!"""$$""$!"#$"#"""$$#!$!!$#"$$$$$""#$!"!"#!!##!$""#!#$"$$"##!"$#!###"!#$"##$"#!$#!##"#"!!!!""$"#!$$!!!!!"##$!"""!$#!!!"!!#$!!$"#"##$""!"!$#!"#$###"!"$#!#""!!""!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1332 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5949 42 132M = 6081 272 NGATNAGCACCACGCTGACGTTCTACNAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAANACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAAC $$&$"+))#'+!**(#(&(%"%%#'"#()!"$!%("+(#(**&("%)'"!&)""&+*$'"&+"%*$(!%+$$($'"!+'!#%)%$%&*%"*(&)(&#"#&)!'#(#*+$(!"'"+&'))$)*"$#'%!%#&% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A2C0C21A63A41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1332 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6081 42 140M = 5949 -272 TTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACGCAACCGCCCAAGTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTNTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCG 8<0F5E,.>*)D*EA(*"%;+&@+:*B2"$9G4#1D14**F"*&5;*C)2G;E9-1$.#97%-61?G0>0C@(7G&8,7C!#>'<0:+6?+8)G+(0F(=0(EA/.583*6'>%:#D@?F5:E"=::#8=5D'5-'B?6$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:66A11C30T30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1333 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43984 42 78M = 43848 -214 TGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAG +<7CBC,FBG/:4G6AE!@,3!?(>B=74'4*:1/A=DG$G0">24AE*>@!!461.=)"3)<3G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1333 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43848 42 42M = 43984 214 AGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGCAGAAGGCACATGA "-A)>"6G+)D(65)?):(G2)57>H>E5-$:'-#3%6*%?' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G27G7G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1334 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38109 42 60M = 37866 -303 CGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAAC ;-/-25)606FF-5)H+1'H48"!1'<7=3H3,%25+9@E,%4D@*!-9#?5@E+5+D@& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1334 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37866 42 41M = 38109 303 TTTTTCANAAGNAGCANTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCT ()'&#&))(&&$!%)"%+&+)!%)'))'*!"!#)(+)!$!( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7T2A0T0T2T0T24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34890 42 102M = 34992 338 GANNAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGACTTAGNTGCCANCTAT !!(+''($(&$$%(#$)(%%+(*$'"+)((&#(')*(+'#'$!'"&%'&$!"+*!"&"")#+'""')!##)!!+#"*#'#!!*)%#'%'#($'+!))"++$* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0T0T0G26T55A4T5G4 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1335 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34992 42 53M1D182M = 34890 -338 TATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGNCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATT +08!6)1#2:G6%!"'/3@D*5'%A#$*%@4,:A!$A06GD&%3:B6;0.*5>*B#E.H0E.,2/E:'9,H;,4*@0$0//B(B0H7#-9BG?8$GH&.,"GB@(@85F)6+#<>,,1A1@0=%$#&6*$=+7H$$2D%3*,A<08GC4(2;; AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0G28G23^G102C79 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1336 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47437 42 94M = 47308 -223 TGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTNTCANTCTGGTCTGACCTNCT )**$$)%$(%%*#"'*+'$*%('+*&)'$+*('$%*')#*"*'#!'#(%#"$'(!+*)&$%*()%***!%$*'&&&+*!*#%!*!)!+!"+#!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73T3A13C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1336 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47308 42 44M = 47437 223 CTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATANAA *,1.<@-(BC*$%-E7)%<9(8,".A%3BF/4)17E:H%5.:;- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1337 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37766 42 149M = 37923 229 TTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTTGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGNGTCCTCAAGCTGCTCTTGT )21:'1.4'?<-F3A)#9?EB63$3F?8*.?0&-+D5"8=5G35(';B;7!C>%G,.0AGG<%*7EC1*$@$"733%!;%"H,8F0-GC(.2B+(/H""G-E/9#)@5H@2B=$CH1;/5:,&'(%'5*G!B1#$D=G'//!,F#1$HB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75G53C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1337 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37923 42 72M = 37766 -229 TTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGNGTTGACTA 14D?A)D+3,>??+%#@1EC%E,9/0>,#E622?>DD27EB=0<9H?%.+>E!;6;6%@B)6&$%E-:/2E> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1338 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21204 42 160M = 21204 0 TTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGNGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCNTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCT E;@!"09E67A=H(0A+$BA6;FE'H4'#$=:>,C=-!*,455;A;"0D7&$#<(%D7@%'!;C6<'08:16,H,4H*;-F%.#-=2.$=<9?,1845/+-7H;HG=$6;*/A-A;A!%-0CH:/893/-F1'78(,,)#"3BF&H$(5>+>:88>1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45C30G83 YT:Z:UP jpayne@0: r1338 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21204 0 * = 21204 0 TNGANNCNNCGGNAGGATCCACANTACCCTANNNTNNNNNANCATAACCNTCCNCGCNNTTNNGANNNNNNANNNGNGANGNNNGAGTNGNACCGCNNNGNCGTNGCATTNNNAGNCANNANNTANANGACCNNTTGNTNNNGCGNNTTANCTCGNNATGNGGACCNNNCCGANNCACNTNGGACGNGANCANNTGGNNTCNNNTNCNNTGGCNNNNNGAC $$!!#!!!$$$!!!!!#$#"!"$$$"!!$!$!!"$"$!!!$"#$!#""$"!#!"#"$!$#"$$"$!#$"!!"#""""!!#!!!#!#"$$#"#$###!$$"###!!$$##$"#"!""$#!$"$""$"#!!#$"$"$"!!$!""#""!!""$!!!$"#!##"$!$#$$!"###$$!"#"#"$$"$"$#!####"$"$$$!!#"$!#$!$"###$$##!!$!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1339 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1687 42 142M = 1835 205 NNTGGACNGCNTAGNGCNCGTTCACCACCTAGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCC %(')$%$&(*)$%'%$*!&*%+$+$&&)('#&"(")"%&%(%()*!&*(*&"')&"#")'$+)"*&#'!+))+!')&(+")&)*'#)#%&%"&""&(%&")(%)&"+&')+)$$&(!'!$&!&#(%%+!((()"("(#''+$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T0C5A2G2C0A2C12G86G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1339 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1835 42 57M = 1687 -205 TGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGC -*?92%8?!(@5@)11;1<,6$E(77;-.890*1B//2,%#C?;09(.C3)=25#G. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1340 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11517 42 52M = 11271 -298 ATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCA +G1>71.H9"10B$7D*B3G%'#(=@HF+.&A*%!#!&26E?.%$-",.*BE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1340 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11271 42 240M = 11517 298 CAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAG 4/@.?E8+D/@<GDA/=8#!'E'/$'/'G!"%'%?;"2#?0)>G!,(@+'/9!?B1G70(&;"")9*"/9B9+7'B:@;G;%6:3& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:240 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1341 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1377 42 173M = 1303 -247 ATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGACGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGT 451?+:90C%>+;H2379/<1;540-3,#2,1*D$D!;*B4A+(E+$;.>/(BC)&98E$;%6*$E01)14D!:)3$B8)$--0&6=@2/=-31*76<$9<)5HC%#28=676B!BB=-3B62)01;?$:"@,,CB?4(=20#,8(6-AF$>@37*3GH(,D&33D3*8D37; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:128T34A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1341 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1303 42 74M = 1377 247 ACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAG ?!?3H+<&>*C6G0?4D;7>4;1',"#5A:>GC?:!$.=7@2B/12!5?'CF!HH@5'"7$#87E5'A$A#D+)$6'.4@@"=B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A24A11T27 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1342 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39119 42 56M3I77M = 39315 271 ACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTNTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTG G?+>?''2?1"*$D8>+.-&4)*).$;;-.&.2>#9B""#+#B&+33H4'$(5&37A--G<%%;@#E:>F?#D?H==>#!-2B-;:!+E6:)(;<;,8>*205$7HC- AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:133 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44556 42 65M = 44761 298 CTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGNCTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAG +&"++%!+%++&$*%"!(&$'&$!+$)#((#''%(*%(+""*(&%+'&$)'$#%)'(*!'"!"$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A37 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1343 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44761 42 93M = 44556 -298 AACGGTTTCGGGATTNTTTATATCTGCACATCAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCNGGTNAGCCAGTGCTCTT 1A2%2,26H<#&:,>=7F'?/*H,-)#3-@297BA*8#8BDC(.5-%)"(@F2,?$+F-"6?/,D&+9FD%A8=8:%FF+G1(#*"*(8(3E53G!+/;$1A<=21:E6#49.8E=54C3(/)F;6)C/0@';A AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:86A4^CCAAT11G37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1344 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9176 42 118M = 9294 263 GAAATCTNCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCNGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCG @C/8D!!-9+2:EF,(65@C$)1*+1$E:-4)#38$H?!-F.GH;7,@5F)5(*?H-7$(B0?<8=,7.G&2GHCE.*.E#F24A*:"%7%34>/?/@5)=9%B>=>1D-@AF8?<@, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G34C75 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r1345 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16180 42 79M = 16003 -256 CAGTTCGGCTGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGC ?'.,0373F*C=D?32%5("#'H'9/$#32'E?!9)FF0BH0B*5@B<==5'4"D'2::,B3,5:!/9;'!A<"5-"(#DGD=7.'<%'G4?D1H);EF)DB/B)!C#=:9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1346 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26969 42 70M = 27179 257 AACATATAGTAACCCTTAATTNTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTT "6-C2.2BH&*:E'+,"!"-0G1*&#-?-24.$9D<27#4%4.0022&0##,8/@:3'EB4D+*('@.8( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1346 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27179 42 47M = 26969 -257 TGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGAATCGCCG -*5@"A25?%$9)B*0E<.B;85:8A*6)3;9()#):>0!41$!?:9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1347 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42912 42 164M = 43076 442 GAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGNCATCGCTGGACTATCGAAGNGTGCAAGGCGATCAAGGCAGATTACCAACAGAAACTCCAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGNCATGCTC '+'&$!$'*$#)&(*$"(!$!!(*#)*&*)!"#!"$+*"(%#'$%"#+!)$"#('()('"#(#$!"#'&")*!+$%+&(+#'%$*&*"!%&#+*+&*(+"!*#("*"!("#+)&!&%"$&!*')")'#%(%%$"#)*$#+!!''"*&#+%$!*))('$'#%*#( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C37C19A21G15A59A7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1347 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43076 42 278M = 42912 -442 GTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGC G;5-0=/>D>.-!G71*#F,%HD#B/(?"B18C=D/=15,:C)'08+C:%">793D1,6H13,+9*-;:=",,.C?>92&#+?5;@*@B)"60E18@:$$>%H%'#E76/@(,61?3"3->3+H3HCC5E)(3.'>?$1'@1+>F&$#6<40B8&'"#?,H8<>F8>G%#:/2:;4'>!)=A-7>GGA);A+H)/3D?"($7H/5?)#=$B%,:(,?!,1.>'-G9"AF>"!71-(9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:230T47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1348 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26013 42 59M = 25809 -263 AAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTACAAGCTAGAGTTGNCTTTTTCTA 8AC;GC!;!9"8/3&=5!;(BC179-2??E?9%G1$2=$$AD26$C1C<(<6%F0AD@@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T5C7T9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1348 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25809 42 132M = 26013 263 ANANTCANTANTTTTCGNCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGNATTTATCNTCGT ("(%)#!&#("&!%$""%+$*"$))!)('(%#'#'*&+")&!&!!(+"*)%*%!()#)")$$$%'$!+"!**$%+"(')"%(###"##+)*&'!"')'#)*"(!+#'')$*+*)*#)$&"$$&((&$)"#!$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1A1C1A1T0G1C6C101A7A4 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1349 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7297 42 97M = 7096 -298 CCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCTGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAA 4=EC3!2@.,0&;7,:>2#ED!$'-;#"&@1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1349 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7096 42 150M = 7297 298 TTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGANGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGA 329?0F;&GH9:?5(H.7=37&#"%8)G(#"&,!/!CB/0BA)0-C&2&:.1%EEG#0?":3C-)6&+*991DC;4'/.&.<3$602;C7"DB+@*;7;1CA#H+95C4F,,:)FBB''&1C3*F5(E+81AH$+;,57&)3:H7#)&!1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110C39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1350 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47588 42 92M = 47734 236 GTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACNGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAG %A>!?17&H/F2)*D$8(%3H:>9=7&0.88E>)D!?D!@C(C9H:.(H!3B-?:%'$+1+ED5,F=0=G;>>+@0<;2A)!(3F?#5($2F0,0'862(!C79C%.0-)C,45:2,C?3:=!H87@?46;#D0'C;$'H8-51;*-FG:A31A/H?E#E'1@?E%= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C8 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1351 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37589 42 59M = 37789 269 NNGCTTNGNACNTCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACANGGTACTCATACTNACTTCTA #!$"($!("*)#+""!$(&*$'+#&$$%*!'("+$")!!"")++%'*&+)##!+&"%#' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0A1G1G0A1A2A26G12C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1352 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13014 42 83M = 12866 -231 GCGGTGTATGACCTGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGG %*$/6>A0=H@:322G8.%:.@*E7181<%!3A@#H)35>?.AF9"->C0H2,1B)D,#@$!;$-H0A4EH!-500@*GC:AF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A70 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1352 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12866 42 7M2D139M = 13014 231 GCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGANAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAG 14;=7B!0+28DBA%9!AHC17%('"!'0%!@?6(*>@=<"?96,E;D1"H:F@+.=0<-*+0:+%@8$*<-GF55'3(E;$>521HE,B:A<@A6=!"<:'7-0@"2@-.1+66,?%;,5?'@"=8,&G$?878"H*'"715-A/ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:7^TA42C41T54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1353 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3770 42 15M2I157M = 3601 -341 GTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAACGCCGGTCCGGCTNGGAGGCGCANAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGNACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGNTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTC (31#115H=!+&=@3*AE9G4".7>6-/!&H!3E9/&2*(AHD@(D?3C*8>4HD2./$:1/.8-2*A-:EE++10.)5$B,&)=.C2)?'AA8+BHF9>BCH+)>""8&6<$/!9F'F62G)/H2'A+3@$:F*B9:9#$F",0&"F+;$A,$ABA/A9$7/0A@"3 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:26G13G9A32A56C31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1353 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3601 42 78M = 3770 341 GAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACC ;?"4+$D!78+<,*=$;1$+E+G=78'!67>2E%?6C68#<><-+:)<*6D0=**4(-GF0&;+6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T22 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1354 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14326 42 69M = 14102 -293 GCTNGTCCACGGCCACCCCGGTGGTCTGCCCNGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGNTNCAAGG #+'+(!#!'*&(++%('("(%#+$&+(%'#!!&%+)'+%))"%%$"#))*+"#$$"$!"+("%!'%'#" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3G6A20T29G1G2G0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14102 42 74M = 14326 293 TTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGAT G,E<'+H7'F0&@;$28H.A2F/?:B0&"2:/3!3+;>E>)>.B@<83<$(.4/&84@.(.:1C$GD,6*!F<8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1355 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37921 42 41M = 38020 278 TNTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAA !$/#D6."+57,+!9#&D69A$'E?A<7,4>/9?AB5!6<+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G39 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1355 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38020 42 179M = 37921 -278 TGCATGTACTNAGGAGGTNGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCATAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGA =C;#1-+A.!&%*%:C<;98G*G4*+(/D>-%;B)&@:#0"6'H#E35=;0&<92D6;C3"+6H)8C*?'/4753-4.(5#-2="=>-@@5;@H&*0@E<@-.#(1';"+1+)H5";78=@9/05><.#97:#D/(&.H&"-=+#(=H>F7"=?,9F% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T1A55C21G53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 523 42 106M = 392 -237 CGCATTTTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCCGGTGAAATTGCCAGCATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAANAGNGA '#(%(%$&%'#)*'#+)(+&'####(+"!'(!&$$##'&)$"$%!""'")'"*#("##%+'%$$*)))##"+(!+*''%'#'++!'(%"#)$(+$$#+&+($"")# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6C26A14T51A1C0C2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1357 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 392 42 78M = 523 237 GAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTNCGCGTGCGCAG :05'%(A753DF13139*D7)(*"'&#F/*1')F29&:=)H$H1$'ECF4:,F:!-9/A!1@1E@/.0,>#%."'CF, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11G54A11 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1358 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5261 42 55M = 5316 215 GAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCANCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCAC ;-6GFB52A=5-G&&2%.9D8*@62,';7"A6(CG18?11,"8''G54*$<<>!H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1358 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5316 42 160M = 5261 -215 GTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGANCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGATTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGC ?)2:=$E/36+?&BF+.E>9.91?6$*"6H2/.>>&0625*;$E*#2B9''=8*0?<76/="78*E3#&&>7&D$D%>%F,'"C.:2,7A*,C:3@.03>HD?&#;**(+)8-67E5!&-:CF4,)!38)4B7-8$(F*;>+)6,-DD$7%GEC+%%A-B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C35C93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1359 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7391 42 171M = 7304 -258 GAAAATGAGGTGGGATCAGCNCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCANTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTNTGCCGGTGTGGCA *(''"(+&#'+'&+*&#++$'**%!!*%"&()!('#&%'!)')''")$%)$$(*!'!!!%!#(#%$'"%($#!*$%(+#)'%(##%)'#+(')'$+$'%)'*(!$(!$!!'*"#"*&(()!!)*!*'&&&&"&%*%#+#('*''&)('##%*"$!')'(!&*%*+')++%* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G75C60C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1359 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7304 42 59M = 7391 258 GCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCT .;6,''@+);D(1&34<@:%C2)>A0;0*8,+,/=*CE%A:C70'56=!#4G/9+H5.! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1360 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28096 42 134M = 28096 0 CNCANTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTTCTCGACATAAAGATANCCATCTACGATATCAGACCACTTCATT "##*&+*)#!%)&"&++!#!$$"$(%$#$+&%#*%$"#(&$&*&$)($#!'!##&&&")"+%)*(+'+#)&%&"$+#!&%"(*&))&!)++'%#%$*!)#!#*"&*%)''+(*+*)(#)"#+$&&!*#&&(&)) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T0G2T85G15T27 YT:Z:UP jpayne@0: r1360 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28096 0 * = 28096 0 NNNANNNNTNNGAGGNTANTANNTNNAGTCGNNNTNNTGNAGANNGNNGNN ##$$!!!"!#$$#$$!!$"$!!!!#"!$$$!!#!"##$$!!$$"#"""!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1361 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10343 42 137M = 10170 -310 AGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAANGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGA !#$!#%)'(!"#%+$(&&(&!*#*&'("!&(*++++)+'(!*%*)%#)*$+$'##!("%+(+&"($!#(*'&&"#*!&'*)#%$""!"'""%'("(''%$+&$&*#+#!$*%(!$#'%)("""*$+&$*#('*$'+$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104T32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1361 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10170 42 173M = 10343 310 CCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTNCTGCTGGATATNCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTC E@8;809/5*2"##6#G2!7GCAG*D):7?31A<.?D4>2$/??8F*15BC'A:9';::216?&F0.$70B#@4!)H.64$<.'44#%,?.%>1,GE=!E%6<2@>18.#E%C<(B&/)G>&;'"F)'8&F@)/.8G*#EB.AC!-8AA#.$4;9=$3A'?6-! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88T11G72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1362 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40704 42 31M3I83M4D87M = 40909 438 GTACAGCAAATCCTNCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGNTTAGGNGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGAAGCAGGATGTTGTTCCTAACC :#4GE0?@86(>.%C1!F,$ED+8$4C!<8';+>GBE,3&B.6CD*H@?B@#8*0*1828:6@)#$?<.GB?B:;4E.=$'1$90;87>G4F16E$*5$$7'F'8/C+6-4C1$!/;G!;$//8=5#%!C6./$F)",4$?&)$ AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:14T80C5T12^CAGG65C21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1362 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40909 42 233M = 40704 -438 TTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCCGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGG 9FD74F+H&B+435@?*E-#5F&"'G2)!!E,")+3#F"'(3F/,;'B@/C'/1>8>!6!C79&#"*013$'A7<%#<76+<0'>B0>676E(H55&&1.03'$,D+9#?*F7"/*A02+30&7H"F#)(=D,!+6AF+57*;:H*7*&6+@D4D/F$2@H()/!,3H76C)G,?E@2C8"'0"38>>->#32(EBG'7(5BG05/A7*7-28&9#'H&E!!A)99281 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92G140 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r1363 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28738 42 47M = 28460 -325 TAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCT !D9)H(;,H583E>6D56E"D$#09*'"%4,-.3!-!E2+2G4*)-C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1363 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28460 42 72M = 28738 325 GTTGGCTGACGCCGCCTTGTCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTC &,%7+$$'=A::F&.%81) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C18C52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1364 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16601 40 257M8D61M = 16927 404 ATAAGACGTGGACCTATAACCGGAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCNGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGNGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGANGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGGTGGATGCCTTTGGCTTTACCAGCCGGGGGCAGGCACANCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTA 0D50B0!2(32':,A#D2;5+*0/!%?5'20HA4A(5C>DD0&5C@6E!@G,"#8>E&G*B*4/GC;733$.1H63%G;%:/<2>?*BH:1.7(&8/G"?HF6"#@":%B19(%1,F+:.@?><-7,;44+:5/"63,;@>%'/,)?:E.D"915C72H)(+4'#CB8C.A)1(/)C?EE2B;@F%@9/+,GB.-2!=,<8A&<(%H<-5@0(4, AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:17 MD:Z:22C30C24T23A11T23C61A15G21C18^ATTAAAAC61 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1364 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16927 40 78M = 16601 -404 CCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCANCGGTGGTCGTGTCCTGNCTGNGGACTGC !$&"+(#$&%+)!&(("(()#$''")(#*%''!'+($*")&#!'!''%"#+"&%#"$&'*&+#*)*)$""&*"''!*) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:49C12G3G1G1T1A2A2 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r1365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17467 42 57M = 17186 -338 CGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACG A71-H?!A8*"#D=(.%E2!@?'A>E!;'2&H((#AF-A,$.G=)(%/&1>H#*01/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17186 42 60M = 17467 338 NGGAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACG "%!33',*?28*!780B)=-ED;:89*'9=:B'"/-//-#3*3$/,05FE.C41=@:32, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T1A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1366 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1383 42 84M = 1383 0 CGTGCAGCCAGTGAATCCCCGAATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGC /$:C<;#=?,;?!@- YT:Z:UP jpayne@0: r1367 141 * 0 0 * * 0 0 ATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTCTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTAT @:D95>%26+.#$'#!);%@B>(>?"AH,1B!A(D.+5C?$&.2E52/>GG:)@/:&F(HH/E3@E?663*+(B@F;,==/'+8?68%') YT:Z:UP jpayne@0: r1368 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9480 42 209M = 9253 -436 GGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAACTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCTGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATNAACNTCNNCGC '&$!$%$)#!!"%($"!""&%!(!!"$%(*(+"''"#+$+&!!*+"%"+$+'('(**""($(#!#))&&#$((%%(*%!$!)"(!"!"%%*$!"!(*'&+!)"("!%%!$*(#%#!$#"**$(+&+)'$$++"$(%(*##'&"%!%!)#""+(!*#($&(*)"$"$$*+%$%%!#()!%)#&%%#"#!&!'*('()+'&&(")!"'(&" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:55G98C42T1C1G2A0C3 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r1368 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9253 42 132M5D90M = 9480 436 TTNATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTGAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCATTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAA ;+'?8B1<>=*9.A%/2)<#C.?**,%F$=09<8,6"B!"EC8.?%0-21H-1$5AC9?H4&!'85B!$F9G/1C4GA.,H=A;$3E7847!+6.#6;@<!+D3(?D#F51#/&D(;"H&!4->5$.(0:H(9;.'7GG&70>>+*6"/C:""72";2!$B"4"F8.*<@)5@$(4,14#%D'&*?#*!*ABGA(?1"@"!F!'9B)D;3-5 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:2A83A45^CCAAT0G89 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1369 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21130 42 131M = 20984 -277 TGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTAGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGNTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGCGCGCCGATCCCGT ")!F3:C&6H*F'<"H6,::4/0:4=60>-?7G0;'0F>$."F-&!;8-:>/>'4H("94,'EG&-'/G7$$@"0/),<07,G'9>:4F+*4GA7F!'8H/H4<2?*$G3,0+*E!5.2<3G*)"A6=>8C(-BB4?1C4<)=?A5C6'9G$0:85/!,H6F->:H>46G>.89$?6!>$C702.:E:<'8"CA;%!C,G0!3'@%9482H&22CHB.26)A&)$:-", AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A9G123 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1370 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16630 42 88M = 16718 228 NTGGTGATGCCNGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCNGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTG $5:0=B,/9$,,=9.:FB"=E*E#9-E&2;74D(/?AH;/G;)#50%.F<#,%=-?8G<34+(?3D.%/C70FD58>F+7#$%-$E#A;%6&4+@G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4539 42 166M = 4450 -255 GCAGCCTGACGGATGCAGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCCGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATNATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCG $$?)>-E3,%3,C*!B5#,5F;3.2)EG4EHHECF5#,$/B>6:@,D>8D+>"&&G$3A0@=/3&<$H!%(DBC2(E';?3*04C;3<;#%G(B!$&C6!#0"1+(&%168/(D@5-?#12-%7,65=8,)$<*+7+#E;&E>*/9>34/G,0"/&*$.CDH6H2+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16G25A23T99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1372 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:64G14T21^T21T87A38A73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1373 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35648 42 41M = 35830 234 GGTTATCTGTATGTTTTNTATATGAATTTATTTTTTGCAGG @!<.5!4>68&3E&1/@H:AGG@/95(#4"$:A?$#(3HD* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1373 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35830 42 52M = 35648 -234 CTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGNAAAACAAGGATGCATATATGAAT C":/!+1!B*#&BD,E::C%!C;-,*B>7E>?.002?=:6/"=DE6G<&,0' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1374 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38939 42 201M = 38939 0 GGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCNGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTCCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAA 3%."?6B/.59@G3=0A1'/3/<%FH(,)F?$&4''7&H(/90D&8>60&'/<%F"?#%(("=:222'D"+54B+8',?D1&C1E)"C?766E1,;15<:DA#D9(>5>B?"@0CE6):?#1!,!<:.-D,F(5-;=7.B)H/E&;'8,4<9'&?D%F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46520 42 81M = 46391 -210 AGCAATCCATTTGCGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACA ?%#E!HF.<4C>6<5->0H5H%D)31"(=3C66'C09%%C=$'#(3)D0E:'>-+FD,?G7B%+D:8&3)(@C)>..=B2; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1376 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42163 42 165M = 42328 246 AAAATAAACCCAAGCCAATCACAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTNACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGNCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAGGTTANGAACAAGAAAGCGTCGAGCGNGCTTTAACGTGCGC )5*<0=?-')8E5'9)E@*-:B">212B50*C<0.29H)@0'H*&/8+4?D018"#G.'3:@$;8E6H'8G=B%#EC"8<+<:!'5&4(;E6-$43A,!/>4-0$?=#G;/0(BHAG>;%666:ED#F3"0@77GGD#1D!(*-,<@DG>B+.*=H@B6B8BE#8 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G19C38C28T35A4C20A14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1376 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42328 42 81M = 42163 -246 TAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAACTGCACNTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAG "+$))++&!&!)$&"&!("%$$&!')$$%+$"!*%)+(")'((+*""%)#!*!"%*+#*%$!&'$$+$)*##%*&$%&(#+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G1T3G43 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1377 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40475 40 88M3I49M2I78M = 40278 -412 CGGGAAGGAAAGATGAGNACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGNNTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCNAGCANAANAGCCAA *("")%$%(+$#"'&%('%"%$$"+!*("''(&*&*"(&+*(*$''*'"(#"!"$)&*(**&%)$*&''&)+$!&#"''(")(+*$+'+!#%"*+&#*"'%!++"'!$((*()!+"*%)#%%$#)$'))'$&+''($)'&'*)++'#)(+*+&%+&**#!)!%'(&)("%!("+)!("&&%+")!(!(*!*'!"#"*$(())$&)"!'*#+*"!$&)"&$ AS:i:-65 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:26 MD:Z:17C30A0G87G1A0G0G0C1T0T0T0T0T0A3G0G45C4C1T0C3A2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1377 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40278 40 197M = 40475 412 ATATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCNGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACNGGCTTGCTACCAGGGAAGAA +!"!*"$'%!#$%+")!#*+#""(&'+$#+)%&($'!&+*'))$$#!()+%'#&)*$(('****"#&'#())%**"#"'"**++*%%)&*!%"#&"&*!'%#((#'%)!'!'"$#('$)%))()!"$#+(+)#%#'+$)!'(*'(')(!#%*$'#')'"&!)'$*%*""'+*&$&)*)"+&"#%%++$&!*!#$$$' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G32T142C2T17 YS:i:-65 YT:Z:CP jpayne@0: r1378 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47974 42 114M = 48116 304 TTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAANACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTC 'AA$A-F>-&91>3/@$&9$*;6&C#)5%;4AH/;,F35G):($CE$'=8,A0*@@9(4.-5E4F<1;1,F?F$@!65-!>!GB7!9C)#5'$C+716GDG!!@")1#@5;17! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1378 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48116 42 162M = 47974 -304 TCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTT 1:.-=@H&/,G?5#*D:3D@.$*8=2FC*E(%+5*G@0<$H$G<2%.>(@#A,<%%<.5:(E.>>--3%'E!C?A"B'+E31:4!-+H6@<3/.67@2D!-+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:162 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1379 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25847 42 201M = 26048 384 GTGATAGTAAATAAAACACTTGCAGGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAACCAATTTAGTGAATTTATCATCGNCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTACAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGNAAAGTTTTCATCACTACTTAGTNTTTTGATAGCT 0,.&4%>5DE6:.%,88?1EC%37&GH*3H!0%1D?7/227#)?6A8F#:.4#.G9*+:0=(29">")46=!4(H$,"-=.9(+/;9-4*E9"%E.??;(4:$C&:6A<+9?;'A1-0&51E?3)75)>G<8?%3;%.CF5$E2-;A9!F=6%!'=?1+/17(F86%+;,246 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:18A5T45A22T44G27A22T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1379 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26048 42 183M = 25847 -384 TCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAAT 1?C4B6!7(31*'4H;31."7$#6*26+-+F=.#BG<1"2#48E7C;>E-$51%+"5D!(((8F+2<=H4G%/-!EH7B>4C.:76D;60423D"(:5A71&24HD!/)HD/!!#B8!A=679:!?,)"97,5/9C88.C!'13#:8(+;4& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:183 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1380 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40675 40 60M3I83M4D17M = 40839 233 CAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCANAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCNCTCGTTTGAATGGCATGGTCGC )5@7>6<"7)/GC&F;:-?B4226;2!1?;!3@!$%3$/=+?'3*&$65@*30;G",>D4(>#B3,?F)=A-7'C88;:.(=:'E0@="FDA;=,/)8F&D3H;F-"F$7<9@@(!E>3C,5-%FH?":BBB0.>((A94!C7$E03!6%*0$A(#9FD4/"D AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:103A33T5^CAGG17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1380 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40839 40 69M = 40675 -233 TGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAAC 0:(E<<7D*"@#,40-.;;=CC$*1C+1/AG57H)H0/D$:0-?,'+?D4"1*E9/<8.&7CHF6;,=@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r1381 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33026 42 50M = 33207 276 TGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCT E3(>49=H659?5H'/+($H!4+1D3,E+=.=/322.28=D(9E2*63C9,/(.,0"+/;4*GD*?"=:@=4,"/C84$CDF%#?E:#8=>(%7#A8>100>D0%+'?)1$2(:)5>@2H.'6/F'4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:149C0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1382 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26336 42 202M = 26538 353 NTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATANAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAANGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGA +?>(1%BD3"A7>>,*=6!;8#8%8-G<2>-=0'74?HH#;C::<-?1?.$9A>-8*:37373#@254=9!:6H7>E0?9?%'FD:#<=$DE/58DC0+1:D1@F:/2H<*;(FH,<&AE'D9%16G;.F%E?",$=E./#.(+4=2#-:E4BE@74G5'*C7,26$%>10"EGC48E908#GDA;&<4*-4F;>:H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G86G69A44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1383 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6305 42 92M = 6054 -343 TGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGA -"B!!:=E!@14H;&!"!:B+4.)H%HD9$%D6?D9G':EE-.)//0.=68+.1409-:,&%-0(25,(%08A#%,:B:4(@/6-+2CE40/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1383 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6054 42 63M = 6305 343 NCNGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTNCCCTTCATCACTNAAGGCCGCCTGTGCGGCTN "*#+&"('#!#&"+*+"'$'(&&(&#!*%*)")*(%)(+(+*"%*++(%#'")!&')*+*##( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C1G27A12A18T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1384 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6909 42 28M2I108M = 6822 -223 GAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGNCTGCATTCAGGATGCGGACGCACATCGCGAAGGCATTAANGCCTCTGCCCGTT 0/$4E#B:83:$?:2$#G4)4&/%'?)D(G0?8<#9*+-<:E2#@G<>@B1G.'"+9;B-%%%CD64("$*E)1*3&AC5/@:%-5>?10,+?*37;CB#!?8>1A@#:C:',G5@687DA5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:82G24G14C13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1384 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6822 42 87M = 6909 223 ACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTG 6!G&!A*!<3#B5*01,)51H@G:;-E'CA1B)+:3-C?.EH3#E:0CE%C4&;:'?5)%'76!4$!BGA:<";!(+"C44(47@,) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A84 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1385 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16283 42 116M = 16158 -241 GGGACGGAACGTTTAAACCGGCAGACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAA $+/11=%5.F-+*A0#E'7$.>/)3%H<0C,0;3)+F'FGG&;">.#2@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T92 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16158 42 123M = 16283 241 TGNNNTNCNAGNGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTANCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTAT "'")&$'&!&'+%$'#&+'#!%)#+$*$&("$"#$!#$%+&$$(#$""&(!*($+*"((%"(")"!"!#))%#&+($+)!#)**&*!!!&+)#$%+$%&(#"&"&"+#(%!%''&)$+&!++& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C1G0C0G1G1A0G1T42T68 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1386 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37304 42 180M1D12M = 37217 -280 TTGGGNACTTTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATT F=E"B9851D$4.'AE?2HH.%1%6-.6BE2?%7&C4E=?-0;E@.,5;&%#/C$%5,,+5DGAB6?'FBH4@:<2@=0(,<5=1@H>'/<-6112")&>H3?B>&*(G?>C-0#24A@323/)9GA@1G3;A::D(!*3CE*8+<34)9=-AD->G54=: AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:5T3G170^C12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1386 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37217 42 46M = 37304 280 ACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGAT 3$07C6,3$%1./?+H01B!-?3<0+)&6=/!1>&4*'1$/> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6034 42 73M = 5812 -295 GAAAAAACGGANCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTCACCCTTCATCACTAAAGGCCGCG ,:15D8@/E#<*>(9=4:DG94A:,C$HH9%7.>53&DA!G,A)@@()G-795,C<4&6@(3BBB;@!FD=#, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11C37T22C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5812 42 126M = 6034 295 AGCCGCGCCNGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCNAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCAGCCGTTGGCATTCTTGCGGT @?&H>/"<'6H3)B>:>7A:!=@=B/-=:11@6G+/26B99FDA<&!996<;<%#E7C@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A7C53C41T20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1388 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45428 42 148M = 45428 0 CATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGNTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGANGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAAC G>,'1H5-<2F#;"<-6HF(BF!A*9#F#,F&(A#;+:@%C6E#7GDG"@/-G5$6D4=H',-+&*#<2+&-,*)9@(+;C55-&5CB/F-H&G$:#$%4+)C&5:&+D6'8/E'G>"E$D+"2/:@))?$0;9EE/)(6,+%6D/*3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C79G26 YT:Z:UP jpayne@0: r1388 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45428 0 * = 45428 0 AGTNNNCNANAACAGTAANTGNNGNNANGATATNCGCCATTATCG !%(##*($'"&)*(()(*&"*"#(#!%('(%#&$(#+(&"&($)# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9520 42 50M = 9570 769 ATGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCC %",EH@A?/@*1!@)8$BH!!58$'H6$&.3@+A*/47)(-7?>4",>0" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0C48 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r1389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9570 42 719M = 9520 -769 ACCGTGTCGGTCAGTGGTATGANCATCACCGTNAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTNATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACNGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTNAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTTAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGNGTTTCTGGTNGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCAAGAATGAAGCCGTTAAACAGATNGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAGTGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTNCTGCGGGAAAGTGTTCGATGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATCTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACNGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCCGATG '!"(*)&$$*+$%"(!#&'#)""(%)')!)*%$""%+&#*'%*+(&+*")&&"+&)&+!!%(*&+##$*#%'!+%!&#$+*%$("&*&$!((**#'+!$%&()+*%%&+!'+*'"""""%%!$)&)+)%(!&$)$''%*$#%#!)(+)&()""$%$%+++&%('$**)")+%$+'"+$$"+!*''()((()&##*&$!$'*"*)*+('#)(!%(#%('&&"))(&!'+""+""%$")!($&!)"(&#%+*&&"&+*$+!$"#('%*)(''!$$)#'"+#'(("($!*%%(*&'&(&*%$*"')"$)(*"'*+%)!$$)"$+)"*+%&*'""%++)*!'(*"#'!"+(")!!%$%)!)#(+('$($"'"+%%)'*(%"!%*+'%#"#($+!"(##**!!""!$*(**)"'$))&"*#+##!%*'''#+%+!"&*((+*&(**&"$()*!!!*#*+*')'+$'##"&"#+!!($*#)#'*+)(&#&$))"&'#)+&%%($((#*&!#+%%')&$("'"""$#!)!(&$&$+$&%+$$'+!("***#('%!')##%$"+!'%(#%&"'!&*##"(#+(*!')%+$'&*($$'*(%*%'+++(+#&')!%$(*)"($*'+*(')*#%')#*"%$+#+"&*&+#$!$+*%$)+(#+$$*#)(&'%&#("!+%')")%&'''!+(!)++)%%($"%%$%+++#$#'%)$)$(+!'#++$("($#( AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:22C9G45A37C32G112C47C9G49T21T97A43T18C74G27C57T2C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1390 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 42 70M = 7916 0 ATCTCTGGCNTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATTTATGGCCATA 7?F>;,D.!70*>G:3)HA?HA2C(6D0"&1=-%8?4=C($*@/?>@D(@;#?%'E#0(E>+6C;5$#/1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T49G10 YT:Z:UP jpayne@0: r1390 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 0 * = 7916 0 ACCANTGNAGCTNANNCNNNNNNCNCNGATGCNGCANNNCGGNANNCNCAGAGAGNTGGGNNNCCNNACNNCNNNNANTTGGGTNTACTNCNGANANNNNCCAAGGC $$$#!$$#"#"!#$!#!!"#$!$$#$!#$"#"#"#$!!"$"###""$!$!"#"!$!!!!#!$"$"!!""$$$"""#$#"$$"!!"$#$""$"$$#!"!#"!##!#$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1391 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11477 42 53M = 11300 -230 GCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGG B6:)(491<@E!D267#9.:'7E>7C=427;0-H9*$8/"750$>/0F1813D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1391 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11300 42 54M = 11477 230 TGCGTATGTTGCTCAGCTGCAGCGTTCCGGCNATGAAGCCGGGGCATTGCAGGC 8C41-)!81%.F54%<))<2+.+1@%HC2?H9,A'7G(--1A.E;C2E,@$#2& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T14G22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18215 42 164M = 18379 243 TTATTGACCCGGCAAACTGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGACAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTNAAGCGCCTNACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAA 7.B05''"-4F)-A.058/G4/B"D>$=4H+?5DHD0DD(60B,3=3&G/5)4&H&"(5"8%0C-B!;H4!A9/<,+#E<58741:==-!EED"G78H$:-19/@FH.FE/.>%C70@2$@?6-44)3!C@5/6!H@+%,1)=691:ED(3'9937D)B31C8&1&E,C@+?1@@<*D/:E41> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36418 42 59M = 36165 -312 GATAATGTNCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAA )4/-7)!D3#&37?*=8>%@.@"5C#3-GH-$F>/3+?#+=25BB>!6,48@C:9H81G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1393 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36165 42 82M = 36418 312 CCAGGANTGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGA >C/94B)?<,,5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1394 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28805 42 93M = 28607 -291 GTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCA "5*67:!G/8.3D5;A-#3"@:==A/"3+/0'>=+4H<*;2#/%.F:6B=@02A):#)-;*)8(2?!@".A@23%$:50#%-9:/%@%:*,HF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1394 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28607 42 123M = 28805 291 GATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGANTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTT H)4&5?.H=B?3=%%E73%06&)@*C.8>A8D(149'4G/6H/==G/@!.%#%'9!'?"C>D?*=$C#C;8**2(B!0(83>2#,CD006)3$+2+890G"7A/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74T48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1395 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26525 42 54M = 26579 399 AANACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAAT E312+$2=$,;(=!60+3<$'1E!)D(5?#/:899'G%=4)2:4$H.8H?5<2& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C51 YS:i:-48 YT:Z:CP jpayne@0: r1395 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26579 42 108M13I237M = 26525 -399 GAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATNTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTNAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTNACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTNGGAATGCCTTATTTTTT "7#335AGG4)C);)B#+#FE2@:=8!@&$@5&!5H,-FH'-*/F6:8G$3&@2B%G-&*)3:FA"=G9/F*749??51+HH-;C+-9&%#8&$!<$HG.-3E2@9??><7):.>,4!%@4,FC1/4**);&+C7":8.?5+#&#D@/8(E;'@7)(+.$-19G(/0<3E%9*=93G:!4)#:A>%)!6#1CF)(,'#F7DD*E9C18F;%->EB5;&2$:;E0%%40)'H(=9>"66+&+!0?=&2G*91@4*64HCC?/5A.=<4.#4=,EH)0)>.=-;*$$9;*5?$)+2);$8946+*374H!CE>#&<*%EF+7,*"-=%E1H>E@E4.BA++->;+/!.3.2DA,E?/:%3=98%5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C59G26 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1396 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44503 42 245M = 44748 347 ACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTCAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTTCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGCCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGNAACAGTTCGCAGGTAATAG @F5*EA36&+4AD(;4?D>B<$F:'C$0H.B:.:>%3FF+>A/G'+0D=22D=D9-C!'C13:02D6$.1AA8B9?%/CG0)*(',)F.A?H7*=D7*+.,$A.'35&3+$H,4&0<#G,>@!C*64H)9;403:("81(+.=+)G4-65+$H-0@(5$!:.DH&,(/'-(>#&"308>2@+<1B9+"GBA+#.B%=)HDG,ABA2?1%6B?6=% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59G87C27T49A19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42502 42 170M = 42407 -265 ATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTNAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGG '=,&*--33B'2=%;:(@-=5+#?8G&6/9*+/*0#2/D>A*84,.H8/:6>H&>.0@@:E6$1"#2%01G%&*EG4"+&6*4/8!!H44'/?2:1!23""38=1"&DCF"4@9-*F=&HB5/18((-=!E@=AG?:C.57F>1'')6/6:*?*"<+$@%-()6GA&!%8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A49A53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1399 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10760 42 114M = 10537 -337 TGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCGCCATGTT 1EAB:#?BF@E.B-53-23$F>D-C;D3.C%4)*E@B91;'3-9.:<&<&9,.2B,8C5CCF')%%GFD(()5H80%A3/=%6;E#>'B(3H"E=.H(,9,+D8E&739@:2,F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1399 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10537 42 223M = 10760 337 CCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCNGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCC '@6(4;'>.F;!D',*6)95:.E?7*&C&!6//;1,.A#:@;5=(A5E25E>H5(E.8,0*439!4$#'FE#+=EG'@!7?'F:+H@=@@@8*DD"),&A)'(;?E6D/?&GG-09;169+G,?:="0@<)2F!#'*6.@,'E0=D@G<*'7*&C4-B69".;A0;&1;>' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:166T56 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 520 42 104M = 719 247 AACCGCATTCNGAACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGNGGCGTTTTCCGGAACTGGAAA 0B3*'(@&4$7.2#+>>$52*GC4%'=0FE@+BC1HH'C+4$(1D1>??2(GC&;3)7$2+!=E<9D'B$E,>"8;18>'-3)8B8%/3-E3.9>B->HF"'F91!B- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1401 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39552 42 44M = 39706 299 NAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGC "@F8@72"*..>H,?8BBBH6(F%&.(0E)D>+'69":G%5!/9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39706 42 145M = 39552 -299 GTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATNCG #!&#*$&#&"'(%"&#!+!'$##$"*$+)*#"!&*"*+$')*#)!#&+&#&)*'+&'$%#%$!$(!""**!"&!&%)%#+%(**!)#""&"!+"*%#(*%!$($**)()%$%$)))!'()$(++"'+*""(&$+)($$$!#+")* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:142G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1402 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1000 42 128M = 863 -265 AGCAGCGCAACGCCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGNCCCGTGGTATNGCAAAAAG >$AF8$B!3->85"':%"<0F(239-@H02>8146$)@;2+D$:==E9@8%>3G(A12+(;$0-*.%+=:>++,$-B+BH:%0,F.5F&0DE(39+&>@/7%B,=&,?.:=5?GE;<=6/):G);6A1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A67T28C10G8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1402 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 863 42 137M = 1000 265 GGAAACACTGCCCTTGCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTNTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATA D*$)#7*8)2&?26",A/G%?70",#G>@(?&>*!!9'8->.$F640H:5H)/=:(1?/2"B<8#"4=94'%AE8,:72<6)'6?+?1664/1E%*9C,<3>'>E4*2A+F: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T61C59 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1403 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33126 42 56M = 33271 281 ANATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAA +%#*"*!++()$%*&%()$!#+*)'+%""#$'*+**&$""$*+"$!$++$"!%*%& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1403 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33271 42 136M = 33126 -281 ATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGNTCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTC /#44++*D4)?<>B*C7.>HFF5.437HH>8<1$$,+E8:#)FBH,H(/->CC#7$A&!/#=;!:!9(HH"*/-)#.%C/;-<62%C64H98=23-=4;E'45H%4'%!.E'3)+'?+> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G17T115 YT:Z:UP jpayne@0: r1405 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29371 0 * = 29371 0 CNNCANNANAGAGNCNGNNTNNCANNANNGTNCNNCATCNNNCNNNNCTANNNNNGGTANCTNCNNTCGACTNAGNCNNNNNNAACNTNGNTANANGGANNGNGNNNNANCANTNGAGTTTGCNNACNANNACTCNANGAGNG "$!$$!"!!"#!"!$""!$#!$"#$""!$$"$$#""$$!"!"$#!$#$!#!!#$#"$$"!!#!!"#$#$#$$!!""$!$!##"$$"!"##!#$"!!!#$#""$$#$!##"$!$$!$"#$###$#"$"""!#$!$$!"!$"#"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1406 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14760 42 170M = 14603 -327 GGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTC $+@C3B08(@B8@HF/H&%1;&.,4G1;2"+69*H=E&/.;%@8.0)D#H%7)A"5%2%HG9>3,0-%36E-7G+C#9A'.'$G;H,AGD03F37&E%E@$*";191BB-9+,06B'861:03:(',3G'+*&*'3D%:=G>!(C7$83E;E!0%>/5@#D"39>D?8=F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:170 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1406 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14603 42 83M = 14760 327 NAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCC !'H)4G!0F=766=80&(,+EE@>8:3D/$70&&'A1*G*@;"1?3>F.)HH11)A+@:7A)=D$%48/)<6D<.D7?'1@16 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1407 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19603 42 58M = 19748 246 TGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGGGGGCTTTTTTNTGGGGTGNATATGGCAGTAAA 53?1#@:;BE0/?@G(5<;-E1BC>:BG9-95-9&2*F)..0-##<5H)B?'98?;B* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T10G7A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1407 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19748 42 101M = 19603 -246 GGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTT F'@'=7H5AB#A=D-9>5C<7;HAE=B=*!8/$F:2(/'0G$$1?%"F.!((.(1#(,2";0D63?C0&C#(A34#2)*;;A.8?#E:2&&B.7.BD$=H, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1408 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36157 23 87M = 36032 -212 AAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCA =GA">?E+.&%+!2/!868(A&3'0<7@<%)380<1+)>=/'<,"G)C?#*'5F12+F>*!((3G0+*#9+F04$2;'1/%;&9HC8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-59 YT:Z:CP jpayne@0: r1408 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36032 23 125M = 36157 212 GNGNAGCTACNGGTGGAANCCACCTCAANGGGTGACNGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGANAATGTCGCCCCAAAACCATNTCTATGAGCTGAAA *!$"(&!(&$')*+&("+!"$"#$"!'"+'+!*#+$'"''"$$)!#*($)&$'*'')(%)&$'#&!(&('$"$*&*%**#%%""""%($&'""$)#()'')*#"(+)$&'$&!&('(*#)"#$'& AS:i:-59 XN:i:0 XM:i:32 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:32 MD:Z:0T0C0T0A1T2T0G0G0C0C0A1T0C0G0G1G0C0G0T2T0G0C0T0T0C0C2T0T0A52C13G5C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1409 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16606 42 80M = 16447 -239 ACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGN &'%%'(%")%*%$+#+(!#!!(%*$+!(')(#"!$(+'#*++'(+!%!%))!!"(($)!+!!'$&($(#*$)(*#++)(! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C30A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1409 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16447 42 127M = 16606 239 GGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGANGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCATACGC /+'=;1%:#(;(;)+:&8(-AF4@+G)&<5,B$8H#8-2@29'+A=!#;4C)?3%=F+.7!E'$<%7/<>3!3D:3>&3)2(/A"94EDH54G:+<3%A2<459;>5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T53G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1410 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27433 42 72M = 27138 -367 CTGCTATCTTCTTACTGGTTNTGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTT 9#!&=!&F$8A*!$1A>@/+?&=7/D-H&41$;H7F?&%2,?.0/'!<#+5H7E,;<+B75-"&5A896<4<;&7)59'E;0@D@,:%50.=@&>!E*D(A&C*A92,5+C/F9*(D69!8'#6?;#96(!59;B7'8858AAD=)1%G6b&D-D(*63!21$C:.5#F)%3&C-(<#"65'D@.@@&B*9'!4?A$47@""+&;4'7$7A(,@@%84)E0C9!=,GB.A!C@$87;8;2+DG9H')D9BH4A+7G"D-E?&HH7$8'-=%?(:H?<&&F%BD AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10A10A78T7T19A63C93T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1411 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6407 24 17M2I39M = 6407 0 TCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAANCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTC #E=E=&%>1:<-4-$3655F&5"D/8""9!<;9='3641#)569FHC@F0#2E2H)E, AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:27T28 YT:Z:UP jpayne@0: r1411 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6407 0 * = 6407 0 NTCGTNGGTCNNGTGATNNGTCNACCTTNCNCGNCNTCTCCACT ''$%)"((#*$%(&!(##")&$(&$(!!!#!&*!'#!#+!*&*) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1412 77 * 0 0 * * 0 0 CCCAGGTGCAGCACAGCATGTGGCGGGTGACGCGAAAAAATGCCTN ;A'>!.6B4D1"HH:"0.@"F2F2'CG%+3.!G3!A&2!#/3%6F" YT:Z:UP jpayne@0: r1412 141 * 0 0 * * 0 0 TCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCGAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATCTTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCATCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTNCTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGAAGGCCTTCACGCTTCATACTCGGGTCATAGTTGGCAAAGTAC :3CD"C+1@D1,9A%G6+C(%,//8>0=>+H@(8$")!%DH!G@9@5":/*#GC*B*6;!B;1?9*-4(@B?H?7$$A>(DD=.38'-8E=E=6BG$<(3;*;GG&&=EH9FE2F8(BF,"/9"0;-04G%H?H$33H;;A)H.'FBA'?2)?617-=E/*5F4A1#-!779H:"7(7+>9?EB/ YT:Z:UP jpayne@0: r1413 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12947 24 70M = 12766 -251 GTAGAATAACCAGGTGGTGATNAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCNCTGAAGGCG /H(4C0D#0#-"#2-2F-8-3EA'>=B<705452645H)HD'62E07,16;=5;: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C10T8T38T9 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r1413 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12766 24 49M4D57M = 12947 251 GCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGCCTGC 8)*);=;0>;"#9,B+E*GCC96(1%A?GGHAE#3%(?**%@%.D=C5>6!=B$+(&-<#">.)).CG,6=&B3/'<74#;'8-C<>F2H==:B>91:A@A4B.%B"=5&,C34F(;?6HH?.@;64DC!5>4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101G96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1415 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14461 42 163M = 14263 -361 CGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAG :-,-&+.0-F;!?D/5)'!%(AE+1;/2&FC<$+$=7=!1@6$GC@>8=78?;,0G-=?7A#'"$@(9A6*79=?$%3!;<10FA4=1/D5)D,4%.9F.G17-%:'0<84<*3!F<9//)#8C?;$3<1>B;<*2,4-G&@75B@/?9.77@,E'C&)35$.1>4CG><<" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T48A28 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1416 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23550 40 47M1I18M = 23334 -281 AATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATNAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATNTAANGNGNAGTAA %##$&'%*!#!$$'!'$"('%+#&))')(''(!)$+"%)*$"&)*""()&$*"'#+&!#"!(#"$) AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:27A23G3G0A0T1A1A3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11354 42 173M = 11263 -264 GGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGNCCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGTACTGCGCGGGCATTCNAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAG 55=B%%"@33=2#*,>BC969+%%"58>2$:90E*54(-<;+**6!?G(@?,?!A3F85=(<39&"4A8C(79C,@=B1193"*>7CA;AC*!8<<9(B/3"=03$!A)A-:5#'+(!&6'/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T49 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1418 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45564 42 115M = 45361 -318 ACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTGATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTANTCCGATCACCCTCGCAAACTTNTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACA @:;$&66-@@DE+%=.6.#5+7A83'89H>:!D=/*0B81!+B94:CF!8+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T37C21G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1418 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45361 42 153M = 45564 318 GTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAA 3#=B.30G*4%5*;4*)@=5H9EHD,=58*!!C$#E32!/E+1@F63)B94.G<"8#E44&?""B/59"F+G.(.(2F54408B3@:6:&A&<4$;*=-8((G0->C88/5)C%@C:.>4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29295 42 47M = 29402 268 ACATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCC #.?!>+8:?/,'8$D0=2C173,DC0@>B7?@$F>!%:-C=)CDD9B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29402 42 161M = 29295 -268 GGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTNTTCATTAGACTTATAAACCTTCATNGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCTTCTACATAAACACC 8=$%G2<>H,!1:6*:/.+,->G21&2D'F1&F"20BE%>1"?)%1+,7*G?3-*03=?H,=);>;!B<&1F'$698A@8)=+G2+=FE#59D76+="B:C2)D?<8E9B-"$G);'<0&A!&"F%#9'H1(.AA2977B&612!:?5,"B113>+7DD#D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:85C24G35A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1420 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4083 42 116M = 3859 -340 GGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCANAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCA %'(+')((&#$((!*''!(!%'($'#+*"#('"%!*')"+&&&#(!$!)!#($("(#*))((("$+&+&$+$&&(+"+!$$'!*#&%'(**&&***$""#""&)$#%!&$)(+((+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3859 42 175M = 4083 340 CAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTGTGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACNGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGC ">&)>-*G2-C"-0#&3$8*0H$7*?5@0,H(A46B/A>FB(01AG27+6+CH(4;F4<4>G=75@CG$%H0G!?A7E!?&3@"B%A:!&3!'?EH-2CDD#H9&A>!C)AD>8/@6G/=C$@C4#4C0#;9;@/9*<5D0-3"E%E+302-,5!H.6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85A47G41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1421 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35647 42 233M = 35525 -355 TGGTTATCTNTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGNTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAGAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCNTATNTGA $&)*$#'#'$&)%"(#%&(""('(#+)#$"!!""#!)&$+&"+&%)&+*#+)')+!#&+'!*!!*'#"$$'&+("""#%*'#++'(*"+%#"$$%$)(*#)"()%!#'%!%!#%!'$)*"(($))'+"#%!$*!#)*+"+#&"'%%(#"!'"#&%)''$"$$)($&)**!!%#&((%$%'*%!!"'($"")$!!$$)*&#*#(!*(*(!%&*"+&+**)$$'+$$!')(('&* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9G45G97A71A3A3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1421 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35525 42 122M = 35647 355 CTTCAGGGCTTAATATTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGNAGA >+9)(=0%@H<)9'@-F%7)74)5B&+>?26"6H3F@-=//.96,BE*3:7/,*>=9F+6B/39@AD#D#A$H67*GH&@6D>D),B9,&7G7'005@2&E60<5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T103C3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1564 24 41M = 1349 -256 AGCNGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGNGAAAAGACC #:@-,+."9B0(B1,?(E-$E.(-G;D);7,/9,E/GD9*&;7?*#/#'B2:@9/(17>) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6465 42 44M = 6201 -308 ATCATCATGCAGAACATGCNTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCA *$6#:/7#A)$?!"3-.A/*):-1.DF'"=+G*-H?D&#/D;> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14983 42 113M = 15163 274 ACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGCGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGG %?4,3/B&&7+#AH<3=9%1!5FAD9%*')A9B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3224 42 152M = 2976 -400 GAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGNTATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCTCGAAGCGCATCNGCGCCNCG &!))+%()!#*)%++&+##'$**($#*$!#+'"#"&%%"$(*'#!"+&)$%%%#%)('"*"*+)(!$("**)%)&*((&'"!'+*!%!##&+'$"(*%!)!$'*"))"&$$)*'+%!!'$((+*!)%+$$&%"*+$)#**+#''*'!!%%&& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:82G0G43C3C11A2A0A1C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2976 42 248M = 3224 400 AGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGC &(7?;-A?17F.A)!4CF+"3))*9=,1H/D/=8%9/HA69D$@(E8D3CCE7E!D)9(D<'G@E>&+2!E3:G1<1+")-D>7%/:';<9$>%3G+H*G@+.-C2+@G"46E@:3H50./0%*)#/3-7*@4>:9&/>,@:.$G*%%-$+*/)H'A AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:4A49^T83T8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1426 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8843 42 60M = 8972 276 NGGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTG $)/)/!7A9<*<,:6CA:77:!B!ADE%;=>83HD15749)64$=9,%A1:@5:3BB*F0+DE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G10G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1427 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30104 42 44M = 29855 -293 CAATACGCTNACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCA G4#8,5H;+2&6:82*%'"DBBB'D)F;FH>3";.,%;";*3&D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1428 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39083 42 43M = 39083 0 TCAAATTGGGGGATTGNTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAA C&2?F884A?3/%/:"">)91D-?8:B2E5@;5,H@(&,-H8! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C26 YT:Z:UP jpayne@0: r1428 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39083 0 * = 39083 0 CCGATTAAAAAATCGGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCA -=?*D6>#)!%90=.>#:C2!);&*-+'=$?!8&GH+1<5'G@7D69"$D;:87H/ABAF<5>:/< YT:Z:UP jpayne@0: r1429 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10541 42 100M = 10641 324 TATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACG ?(G6D?5G':@"FC5$;27GE,'1(32@EG:+4"G":)(1'E424FD;B!;"#!:.E&++'3E2+>/!3")343:&B!&50,(0)' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1429 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10641 42 224M = 10541 -324 GAAAGTGATGCGAAAAANACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGNTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACCGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGAT 7E<$BG-/FCE7=(D.*0BB:3+6'0#"$,F=1*,-3E1#D5>1G+(.00E3+G/:+',,'F4=5>'?FCE59@;$>2/-@D,,B===B#:8'H8@**=#89F6905$5!A/5%)2)!1951#:3(,.=*)=?$1::1=?9%BH2)4-F3,(G8'H,(7:66?F%%"/23H:>C6$$.=!.%*8!>3A=))+>7G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17A39C129A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11221 42 57M = 11057 -221 TCNGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCC @52.*;G$?#()2?+D&E8+C6(H4-B.E5>//&&65D"G!162(+,7%GC:C8:-- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1430 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11057 42 144M = 11221 221 NGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGACCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGT &%+$+($%$+('#!+&&$%(%"$'!'!&%+!*&!!*("$!%)$"%)&$&!+!&+()*+"')"&%'*#+'%'&**#&&'%+%!"%*'%&"&!$!*$"+%('*$*!!!$&%*+"!&(!*%%#&+'+*+$!%"&(*)&%&*"")$&& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A93T49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1431 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45244 42 50M = 44977 -317 GCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATAT /0)F46HEC3>H0DB)'.+71(:((/:?EC5,"#-44@@('3E8C)7?<,#1D5370/'>D.+$H.!9E=$;<@@&>B:/:?+=)@B#A'+"&:.BC,".,- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12896 42 63M = 12680 -279 TACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCA 3<&,)H20B13@9)+H)%'BA82%,$,2//8D.+G1E7@G15+DE&&=F2BD($.(1@C+$$158302>>/A%"6,8.582"A"&)#C@5$=':*(*472*6C!(G(@-!?.B-+8@9B)A$,4--FF%A?&?(,B,!(1C-'EAD(5&@#+"F1D)+<"8%>@/C!>B"#-#F/,3GF-9+933;"9=G3#2.()#F(/3-?"2=$7;B??*#"!/C6*8C"+>A#+.0<:.!2H1E3))A70302*#E-=(@97@H0930"'A8&;37-9H;'4,E9?<1%1-@%&G#B@)BE@$"G!B(,#9G)=>'EBC&.$=4$5F9$A5/8(&&6<":FC%6(/7>1*$G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:125A27C5G103T25G49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1434 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2741 42 88M = 2402 -427 GCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGAT G9@:>A:&"99*,*/<)*.=24F7=*,*1D19B),'E;E"8A%$3?975;D$5G;F:A.9$12@C9>9586E/9&*01A,D(#53=92@<@&*AH:#@0/%F$BA4G5="4/:E9C+89BD@/:1;0A@=GC6";H5%1#;6&.26&-5F..52C($?@8'>=5405A7:,B*?;7DC8:0<27$%"0=:=6FA)6)FD+DG>''9F*+5&8H1AA$&%!;2:<6-+0+:D+*B.:$C/?)(9.-76@B(!A-@G.2'<(92&"-8G181E-=C45<:BD8.,.,=C.@!!5B4@$6#C1!G*>F$;)9*E>@BHD;#(F6AGG*:9B*H2*D&*:%E4?@+B)9+%+ YT:Z:UP jpayne@0: r1436 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25522 42 99M = 25724 244 CGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGTACG +3#$@(A6&3#)16;H!-8'8>1'830B:8&8A>-"**G,,92502H>$#%+//3H$<39G-EF/;@>++D:9H?F&EAD"!-C2"#H?%EDH-GD#*- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1436 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25724 42 42M = 25522 -244 TTGCGTGCGTCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCA 6<<+485G@!G"G3?0%'/.,(<3:9H=/:&6!AA/6B'/?/9;B-:$?.).%B2.-37:%,9*B3(*;*D4:B(/-E$9G$5*=93AH=6@+D$H*5)$D0#><& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C50G4G59T27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1438 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22157 42 134M = 22361 280 AGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTANGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTANCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGNAGGGGAATAT 5?6&F!%=D?*$GD1+B;"G+@5D&E21C"&!:=F,9:/@D$.=-D2!B.0!)D80@$,(,2-:/D?'5:,?-;2(>C-E>..9#.1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T21G26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1439 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8017 42 161M = 8214 306 GCCGNATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGNTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGNCAAAGGTACGCCGGAAACNGGTAAAGGAAAGGGCCANGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAA &)'"#+$"+&"))"(%)"(*$&"&**&#''$&#$!*'))'*+(&$(*'$&%'*!&+"!""&&*+*(#$*($"&%(&''%&""$#%'&%"!)*!)&!&))$&(''(+&+)*&#&%"#"++*##&"#$()$#$$*%#!+#)#%%&%"$")"%'$+"%+'!"+! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T49T46A18T17G22 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1439 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8214 42 86M1I23M = 8017 -306 TTGCCCGTAATCANGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGG %-!=%$3E5'34:@0AH85+%7C>%*=)2"56D74@%1/2/#(GC*#F%D=A>A+17386E,@;+;4@"/E$#EH//&@C?$F59=4E-AF<,-9G,)1:D<7G=93#"= AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:13A95 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1440 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4586 42 68M = 4770 262 GCAGTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGTTGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCAT -,(4:"D0C>&6;'H7G0-G?(4&'FH"0$#9>9H&.1FF#<9309*&&B*5A*.*+6=?GH7AD-%H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C27A36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1440 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4770 42 78M = 4586 -262 CCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACNCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGNNNTTTGANTGCG $*&*"'(+&')%)%$!"'#$!"&)$(%+("+)&"(*)$(*$+$&')&%('%#")(%"+"#&&+(+&'#)$)&)$"*(' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:43G21G0C0A5C4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1441 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30276 42 107M = 30423 208 CAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGT /F"'@E$-F)&/?&6B*@G4F87+-AE?:4G,?,53/&'$B%A*76115!9=:>*B$))54B68E!'"&B:@":0F43'!#4*8)CDB@!%<5!B=2-8F1G$07?. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1441 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30423 42 61M = 30276 -208 TCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACNCTGAACNNCCAGGCGTCTTCGTN *%(!*#&)$+!&#*&&&($*!$*%$**%&!+#)*$*(&&#!*)&!#"%$*)*&%&&$*+%$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37C6G0A14T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1442 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20894 42 53M4D85M = 21068 296 AACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGCACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTA B+0=(*"+<4:C,9FD=AD)A.D';1D13C&!'.>(':H&3G6FH-6'89A;(4#$)%C"FH3(?F4)2F8651,""D(=*$E>>(H-@)22H5H(,#!48/#.D7"?.F771*=2G+$7-5E3)&2(BF<1*3':<9 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:53^TATC34A50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1442 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21068 42 122M = 20894 -296 ACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAGATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAANAAATTC 968;A%-$!:FH.$EB<.43#2>(2=72"/D1C>-B=(=A788?@"--E$54-BH1F4;539H>?!$.;+;.2"$FE?B3B?,15%@C!8H)5!,A0AE>0CGF5:2G2F)"/;$-* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42T17A54A6 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1443 77 * 0 0 * * 0 0 ATNNTNTTGATTTAGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTT !#*#)%&'#+&$'$&$!"&&&+)&$(#)#%&&"'+$*&"* YT:Z:UP jpayne@0: r1443 141 * 0 0 * * 0 0 GGCGATCCGATAGATGAACGAANACGCCTGGTCGTTCAGGGTTGTCGGACTTGTGCAAGTTGCCAGGAGGATCTGGAACTTATCAGTAAACAGNGAGGTTCGAAGNGAGCGAAATTAACTCTCAGGCACTGCGTGAAGCGGCAGAGCAGGCAATGCATGACGACTGGGGATTTGACGCAGACCTTTTCCATGAATTGGTAACACCATCGATTGTGCTGGAACTGCTGGATGAACGGGAAAGAAACCAGCAATAAATCAAACGCCGCGACCAGGAGAACGAGGATATTGCGCTAACAGTAGGG 8"69H695C$>8D?-(=<<@;"B/1-'&-:56'%:D,'#F;.=;C=5C7<$79*:-A&#BCH(.;F>?%%$9C>.@825)+=(4,2:BE@1$7577C58?,3:09"4>;27$8#&H2F@2HF'??;%',2;;"*7:CE.C.F#'=0,.44!/E9F>15$2.-D2='B<=7A5@A55F62@0#!+>C,,*2(<+0@45?0>E<6<(%680+B6H5:,H%?='4:>)%!5@+D3-++8A-8$H9:(:D:-8/C%29$?$6!1G6>'-@D/E4D=6+/8'C(<&9A#H#% YT:Z:UP jpayne@0: r1444 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47453 42 95M = 47240 -308 TGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGAT $@8C3<86.$4@5!3%9((;31(:F>%A.+"F?5$52'#&6,B1G3:%7+8!8%'3>&1?:?4/$=,*.<9D?/,#?06E:B-/H051$2:>>#-,8)D2=G3A""AD%"$#ED:,<+)B@#..5*F(,08!<)4-%41DB5=)/:4-(@>+=H>AG9D9%@$9F:H#2G7(7$$A9(A8,@A$HE:9%-F8"#(?E($;?-5:=4-60,9,<+#?48)>D,+H@')+CE?;0F1++,,&*9%=8!H;7/E'3+#+"''>@5=%1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25406 42 149M = 25326 -229 TTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCAN $#*$%$%!!$&')#&&#'&""(+"')%&(#!"!+$%"'#%()"##+#!&*#'*##'*++&&&*!'!(&#)+&!#!'(!$$%'+'#%%&"!'#%#&%%'"(#+)!$!%%+&$)*#%+&%!#+)*'%'%%#(*'*#'()%#))$++))+"" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:148C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26119 42 86M = 26402 324 NTCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTT 26%/*=D&#?)&-ED3"E,<2:%4!.?A? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26402 42 41M = 26119 -324 TGAATGTTCGTGCTGGGCATANAATTAACCGTCACCTCAAA =9%'46>H@!0H?+4;$=4-;8B3GF2"%><@8"#2.<%!? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13547 42 59M = 13606 258 NTNNNAAGANCGANANACGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTAT "#""($)(%#))(#(#*'+!!)(*&#%+$!!%+""$!)))(''*$&#*%&'#(%$&)"& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A1G0A0G0C3A3A1A1G41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13606 42 199M = 13547 -258 CCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGNTGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCNG ?>-.@66D3>B!CC,&/20>&-)CB<)&G:@;=)*;+#724%G=C+E<<5@">16<=@D>?3(H@0GH7+2$4$0@DEAGE8G6+5G3"4DG1+H!@FB@%?+(A&*@#128?C'%%)F9/,=.FDG/77+"F/0:"1--9.<&3/&,95-*D&<1>79CA"6"1%8)"=!*F3+:B$%$H3(7.1(A--E>,<#E"*# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:163A33C1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1448 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23999 42 46M = 23734 -311 GTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCA *7#*!-=7">1,/,6"93*?H2&&4,EF=.<90)C6>$.H882D>E>6<=-.13")H%',3,*35!=@(&@0'D5%&7=A??7.-38&4&8@1&'A*B6=:'+CD1&E4%;)9)7H;A42) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:134A13 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1450 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11248 42 88M = 11372 176 CGGGGCTGACGGCNATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGGGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGA +&()$*%!(%"!%+""++%#*%)$%+%#'!'&+%!!#'$'+&)#%+)++"!&(#**!$!()"#!+'%&"("')+%&$*(%%)"%%$#* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G28C45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1450 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11372 42 52M = 11248 -176 GAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCNG %+-C8G.F70"4B(+6<3H"=$5),B#F&F&$C2)(GDC2@-2*!5H+?E@, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1451 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28768 42 97M = 28562 -303 TGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTATTATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATG 69'F&F>DB*F"$<#-D&B>4&1,>48F$*/(8".A4>?"#5E."F90G"2%>&C??>=,A41,/H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1451 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28562 42 64M = 28768 303 TATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGG .EB(G+E&H='9H53@83+91,4A/,#/&9C$E7+G1<%H3../:1A,8B>C,:E64)H*'4CB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1452 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4791 42 98M = 5022 273 NCNTTCTGNTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGG %("($(*$+'+))"%$+$*("&$+(+#*'"&#'+&+*+$(**%++(%#)"$))$"('+$"!*'"$$'#$+&))+!(!%'*+*%'&"$())!'%'%)') AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G1A5C89 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1452 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5022 42 42M = 4791 -273 TGGAGCAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGNCTNAGANCNGCN !#*"(%&$#"&%$"+!#+*&$)'###+''!#'"%"'#("$'" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5A23A0T1T1C1G1G2A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1453 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39036 42 78M = 39036 0 CCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGNATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAANGCN '*%&"($!+")&("'%%'")+#$&$&%'%"&'+%%(!+)$+'!)%##&$*!('&'#$'*#&"+$!+!'%*%$++"'*' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34G39A0A1A0 YT:Z:UP jpayne@0: r1453 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39036 0 * = 39036 0 GGTTCCCCTNATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTNTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCAN /B4+DC2D3:H'47)%1"+(+4/,2&H/741/(: YT:Z:UP jpayne@0: r1454 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26120 42 141M = 26307 242 NCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCANCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGA !AH>&6;CB1,>5&'8=.&:7!EB8?>0:D1:6#A'2,(%42/-&&4%0?23+%E=14<1>0(AC4;0D4BF%(-E!@+$9#%0&H*347)54 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T29G110 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1454 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26307 42 55M = 26120 -242 AGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGNTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAC ,1-*14'DF(,+=F?/.8'>F?D+4@*C0:8-2F'.G40CDFE8C&'C.)6;B2! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G28A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1455 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20188 40 190M = 20108 -270 CCCCTGGAGCGGNAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTNCTCAAAAAACGCGGCGGTCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAAAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAA /@B>,3?4<'!)&<667!2%GD:H61)$E%H)4H=)/,7G1)15(,=&'.D)1"B)(/*AA4E98"!E77D;.*5"%$;/+B9:?)&,1CG"=517$"4+:/&/+29:9)=&.E&@AH*:9(>9'49.:.3'47<#(H63*$!AC#':<6*;7FC@8B%/E(!&8:#!E6@)) AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2A3A5A23C17C97G37 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1455 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20108 40 47M = 20188 270 CGCTGACAACACGTCCGCCGGCCAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAG '%'!)'&)&!+%#%$")!$"%+(&"))!)&**#)("%&#*%(#%*$" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C1C2G12A25 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1456 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11193 42 87M = 11421 296 GTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCAT A$+B@:.HC7*')79?50$7:=E4";47<24:(H71$2*+*)4-"/@3'?+8A;<*0*->??DA>D&E69@>91'E@*=#/.(8!B7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1456 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11421 42 68M = 11193 -296 CTGGAGACCTGGGCAGACANGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGG C%D"!.FB0%%-4'+@57B94%?3%7)8";G1+/5,:5##'>1B:D?(4)2D1F5G'2%>0/E>.@>: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1457 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5999 42 56M = 5776 -279 GATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGC )!0B<3&='-=&'+DA6=1B"40C196(+#030=6>GF/B>A9+2G+A9(D0*<49 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1457 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5776 42 79M = 5999 279 CCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACC /,G(.+&12C8"=C09%BA@.0B$!.8%'17EA'A<1%.50>C53))1E&7;C=:*8?,F',G##4:1-0@A2*3-HGF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1458 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15014 42 96M = 15110 200 GTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCANATTGTTCCCAGAGNCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGNCCTGGGGGCTGCCGCCATTG ,;B!<%6E+677E,?%#(,?F"+?(F/4H/3D/) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C24T13T35T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1458 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15110 42 104M = 15014 -200 CCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTG 2-"G(*0ED&>GDB:D=*F2B-E3B"'+=G2+1&7A(<1E!=F+4'<2HB=*C8=%BA=3*6C(?>.12+3=.<-D;/A-C/%C$?E29=>E9D=)53< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1459 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5844 42 120M = 5733 -231 CTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCNCGC 6-";7@%=97+/=9&+7(1'"*+D&4G8+469//ED;BD(2!/D,,1;.'.'H"*1$#F.E3+'B<=%?$5F9C8A@G8<&GC<*/2!1D;'<:/!3;H;@*9310=?,6<()2"6F4;% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1459 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5733 42 85M = 5844 231 TGTAAGGGATGTTTANGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGC E(*?3*5':H/1G5,-#)!@%A.'F$2?9&@%8)<.D!#@C1$5GE&$-7=$33-@>43'4.9&3*5#8H>F)@0H/B6F31?0G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T51G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1460 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20934 42 13M4D297M = 20850 -398 CGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGNCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGT @G;&/+4!62A+8-*+,AG@'5D?>-@,;"'E+7%G';+7(A8H?>'8?+,20&#+&$)291A((>=6$5&353=4GA.'E+%FF$9#>A4*.'94AC@=,C=G$@%7&23%0D'597<,G;'!<<)8)?3!A"*@'=:A#D5$=:$H/$%B;@D:6;"DCEGB2):(),$<8#8GF!))E9*-!EFH!2(#<9?>?;#B#:)$!%,D';'.&3/B:%38;H>=,,-29&.*G6H*FE-!%"H#8/(/G#?04$(:E>1@8B)FDF"H791;=>/8 AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:13^TATC40C118T137 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1460 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20850 42 84M = 20934 398 CACTNACCGGAATGCCAACAGCGCCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCGG '+(*!*&)"'$#)"(#)%"!')$#)+&#$%'**$#%($*&$&(*#")$#+(!*)!'*$*&#%&%*('+$'%!'&#++%&"'+(# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G7C9A59C1 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r1461 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16011 42 101M = 8 -16104 GGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACNACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACA A<&@(929<@4A?@/>5;003HH:G:!C38)0"?,1&+<+>E#5/8E3C,$GC!H+3C(%D2!+G;21"&5G@HB@7#C1/C3:/3@4F6A&H$FH-**&3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C40 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r1461 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8 42 98M = 16011 16104 GACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAANTTNTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTG 9"5'E#!F?#(<-A)A4..@(:5:;G0@.#*0.183%-6)'(G$%;F#(8"+?;:-.7917',%50#++7F+,<6H/3:)-DA.G?7.5B*0AF8'?">#!:6%60/,C><G5C-B>965=;4)-5DC0'2+D%)')BAHGC--@C+3<.B4EC,3#6F!"'101502C,+-6&+B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1464 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37992 42 16M2I115M = 37992 0 CTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGNCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTANATCAAA ;ACHBA(&=D:**&$%E"3DC?FH&=@200.G-+@&(%%B:EG+"<#33!>4/52=7H0)F>,1-0)D;2A91#&=*4HEH7*B2E:01*BFB'H;0:B8,*"*D?E##:(:BF4!$4:5=+73'%)+0(?D678=C))7-7+B9A45+E/,6=GDG-:-$7:C%D)$B*,&@-1F;<$1?$59B/D;HCC#GH%.7'GC14>0%'31D"*43AD";#824#B?((,+'"=9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:133C8C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1466 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23795 42 99M = 23916 213 TTGCGGTTTGGNGGAATTGATTCAAATTCAAGCNAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTC 7*A8;,0"$@G4*.)$-&+B<.BAD#6D+H=*!!?::(C;?7F?,A;35DH)35G4336:=;&''?$7C4.C:4G8(H%$5%0&G7?+13+&*(=(3$- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A21G65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23916 42 92M = 23795 -213 CATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACNA +1?G7"6#6;F!?*=.DFD@:*5;?)=?#"=*ABBE%0"D.D/=21$%5B(C@F@5&/$,190"2(%#&A3*,$'@95:)D-@#G#306134 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1467 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14573 42 46M = 14455 -164 AACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGT 5CG<2,D-@$8:FDD-(!+;3&8/.,/3D@+*-',25H>$D1"5+C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1467 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14455 42 118M = 14573 164 TCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGT >,#,>+#+#8/4<+#'3*'""H<6A;%;+:#H&'>9:287D,4FDB'"(F'+15F8".G.3=H@&D<%D+!.CD:%'8:#%*G-3,>(G'+(B:',<&%+$F,D2)(9B,,4B%)@6# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1468 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47579 42 221M = 47800 290 ATAGTATTGTTTGCGTAACAAAGTGCGGGCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCT :A/GE*:5<9:5BFBD+;69H-GG<:&*A+!A7!$@8%&E1+*CB421.-4)4)H@5$E(?H7,E%1%(B5)A2:7G6%*?:.6<&7&B2@;(G:"D/.#E*-'#!?0E#8@C<"+*#@7G4AH6;@2F3=A/=HB$$+7.!85'#?@/<"@E!&B/,@GBC-/A4,/#A",&;/GC5"&56-0D9)D3?F6G<. AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G18T192 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1468 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47800 42 69M = 47579 -290 TATTAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACNNANNGTGTCTCTNNN ++!!&*(#!"+!+#+!($*$!)"&()"'!&&)#*!'!''"'%**"#*+')'"+"&(&!#'*(%%)*)!" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2A50A0T1A0G8G0G0A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1469 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23972 42 250M = 24222 297 GATANCATTANGNGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATANAGTAAATTATTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACNCGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGNCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCG "($(%')#)(&)+++*#&&'#'*&"'*&)$+*"%")&'*#!"#('!**+'$'""'#$&$*(#'%'*#!(#*+++#++%))#&('#%'*&#('#$$(%%!%*"($&!+$!#**%'('"*#!&!%)(%')"$$)&&*$!#"&&#!+*%*'')+)!&#%+#&$!)&!*&$('$"(##$%($"*"'&"*!'($!"'##(!'#'*(#*+&&'#&&)(&*((&#!#*(*+&')+"*%()())*)+&!*($&#'&&& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:4A0A4A0C0T62T9G77A59G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1469 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24222 42 47M = 23972 -297 GGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACNTATTTTTTGCA D!5E5/0G,#@=*AH6?>D45=6AB"11C)CF#H.&-,230)8%%'9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1470 77 * 0 0 * * 0 0 ANGCCATGGTGTCCGNCTTATGCCCGAGAAGATGTTGNGCAAA '*+&&)'()$&++&&'')"$!#('"(*%&$')&"('("+%*%# YT:Z:UP jpayne@0: r1470 141 * 0 0 * * 0 0 TCTCGGAATATCAATGAAGGAAACACTTGATAAATGCAAAGAGATTCTTGGCGGANAAACCNTAATTGCATCTACTCGTCGCGAACCGCTTTCATCCGGCACANTATCAAGGTATTTGATGCGC %0A==6"GCG:0G9='C3>-B%F7<1H=!9/")0F,%E8D"C:59,91;);.$9>?+*+6##(B2':G(+'9//9??A4-<%$'$&".6/'7**05BG4(=#)9$"&%"9A2E2%A0E2DE@D$ YT:Z:UP jpayne@0: r1471 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25389 42 124M = 25214 -299 AGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGNATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATC ,%(2%)&?'1"9?7;87290/>)?D-@2#7BG926::GA=65CF?%=:5"6#1;+$9=!9(>7*:">@<0<"+:"B%+38B(!/78D#1::5@(C#7#2+80H'%0FB08$!>5'?%6BB5!C<:BD57889/CF&HG8'7">-D/";B,#!D/07!!"E'>'=92-?:6%E+F-9E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1472 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37457 42 27M1D272M = 37757 370 GAAAGNTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCNGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCNAGCAATGCGGCGT ?$!:0!.,G-/+"A2''.=>715%)(E-40596&F*8DG*/6?D!,-+5GHC<@!0?>+-/.=E$$!A-)-.B$;#-#-*@99.H$$6>G4:B:7;-0#:$6=25A(">DG3#A0'<3;2@13)A)4!;GG12C,C,*%)B.*3508?:8!,&*")?*G7B7G4<'0<'49-<&8-34>>&!A2+%E<4@$%H":.(3&5B*&H$!*H":/1;+H;6?8G;4F#9#;93@?8/)8>&H9F&C!&5'C@C:<(2@AG'##==8H6HD(/GA.8#CG+7;86/(%A>F'1F/E):E6!/10:)(:?&-89*!/%=F<7*"/,??94?<>"@30F*(@9,"3,@:/7DFH<29'/+=),?D&+;5>FH)>?;"!00$5G-==FD(&"F=7,B2'EFH--"HG)8(2#--?'&'832+)73&"AB3?B;7;30AB03&&6080*D%!"#.B"A',8#3: AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:24C31C19C33G71C14G108C70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1473 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1562 42 45M = 1607 422 GGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGG C1*G?F:2092,&-''4F0;;-'#"310%2&!%1B-'C!D8(;3C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1474 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 189 42 42M = 25 -206 CAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTG EF(B.'F"/'DEA'/-BF"7,=3?.;1C%8B:8H!=#>7BAB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1474 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25 42 89M = 189 206 CTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTNTTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAA "89?<%$(1)GG0;C@.-/766<&F9,.G/C7$5/'>;D74%"(>"?0,#)6!?G8:0@8.DF,6'@EH-38G*D8!H!/%"B*,6:)- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1475 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 815 42 6M2I60M = 632 -249 TGCTAAATTTNCTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCA -?;D;;3F)E#/D."".)83;@*1$5C-<$.4:!0)09F!"->'#H9%E2,;).!GE)<84%?7:19? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:8A57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1475 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 632 42 51M = 815 249 NTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCG !(3"9%!(6"3B";A/41+610B7-G&)#+234B;<$G0+7B3#67H-&?9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G50 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1476 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8416 42 60M = 8476 499 TTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTG 4$)>%*(A$4+HED542H#/A%$G-/@7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1476 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8476 42 439M = 8416 -499 AGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGNAGCATCAACTGANGATGGTAATNAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTNATGAGGCNGNTTTTCCGGCAGTTGTCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACNTNGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGNGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTNTACGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCC ?/,A:29;C0ED>'#+4G:,>;/%46:5?3$:A:<9BC=$""@A-&0*$'@F*>$3/6*$-*'')47A%#&?1*($+!6@B1C8=008"#A5-(G6#+<9/EDA0365B#>%!@CC'1F3<5F39"+B+=E&9:".8#9$?$05"7+:44859G:CBE+F'6:?8-02!(<7H*(..!:!2*?24!C:@H*?1.("7,)B<.3+<==&9F2<).!!*=1.$<&>:1G5?4C9*3C%D9)4+671<5>>0/))-237-C0"?/3310"F40.#F<@3C!06>:/#@#$>5#>(A?"EDD9A/EH,*4>A8D'E4@H=B+8@6$.>5:H5)B17><+HA!$7+G4@5(9B8E@3<+>E"&+D(HC(;14GE,1295F6%*9>B-46CF.C85AH;&H0 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:47C12G9A98G7G1A14C51C1G53A29A1C104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1477 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30329 42 187M = 30329 0 ATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGANAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGA 74>FF'0$A9,F<5G4@<4.35)EH#(?=E?;F3#06D+5<=!7GCC-4+"%>0@0"D3*4-0D"H2&/E8!=+(/E98,H(>-8G7F1'4;>,)+?=/>B1B5G$*:<3*261.!B$;E-%:F)C.H:(-;0-H=H%-%3=%/2<6)F#)>9#@-'48 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127C59 YT:Z:UP jpayne@0: r1477 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30329 0 * = 30329 0 NNGCCGNGAANANGNTNNTNNNNAATNNAACAGAGACANNAGTNNCGNAGGGNCNGCNNNACCNCAAGNNTTTNTNTGGCAC "!!#""###$#!#"!#"##$$"""#$$!#$"$$$!""$!$"$$"!!"""$!"!$!!#""#$$$"""$"#"$!"!#"$$#### YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 906 42 133M = 1039 360 AGCGNCTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCATACTTTATCGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTG :CFH#-"F="<&=B.D,A/?$B3%=$614;D=!*>*=)'<@G2'6'D!EA260%5E!1@57B+C($)0!'F856D"=.H;&>49+-C4F>@#*">7>!E+3>%.1'1H@2@'%6"B-#" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A72C8A46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1478 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1039 42 227M = 906 -360 ATGCCGAGAACTTTATNAAAACCCACGTTGAGCCGACTATNCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTNATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGAT ,/H8/HC:@4H75E'A$37$6,*3<9GD''3>&.%0<.+9H)BD#%5""=B;=H./39H<14:$%4:1F8$*1.*..%C1?8+FB0EFG/,518?%B@:2C:&&B@H%G101F(&),4C>%880A'F(?3"%3C"#"!?3'-@B&1&"H24'(&H2.=?4&!+A; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16G23T159T26 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1479 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18851 42 103M = 18773 -181 GTGTGCAGGTTNTGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTG ;B9$""&)7(3"!H%.+8=7"FH>+.$=.#!$3:*0E;(@G;4G2D9>!GA*+?;@EE)D=0&8H+D015E-@HE.>0F5/*'BF2DD-0$6%"E"+"&50<<7:/:"E+-CA!29<2G==77##4@E/<>+)6!+>?0!2-:<1D%-()"8:-6-3(**=4)*;8<".9G>,H4,$)*<:=!"H3@;#,0D-9:914.1524-*%0ED>4:@E@116;!;=HC9=1*2@-*<0;-04&#%63H*>CF+$GA$#7/CA99'-F;/B'$%F*'?6HE<$1H4-$#"%H@:6D=@G"0)F:4*9'+@F*79>DDA1$DD"418+$- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1482 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 206 42 58M = 411 255 AAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAAC B(2*C"9;")&73B@G9<)75$=!>@?1/3*/@#6F<=4AG"*B73,C<(+6?H'8E= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1482 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 411 42 50M = 206 -255 AGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACG ".?/%41*6>/E@=&8&;%?$BC*H618+C"-@E)')C7H9"&"@:&&H, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1483 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11282 42 55M = 11410 238 CGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAA HB+54@#%%7%-<804=D*7$=>H71?3E<:#40F4@'F&&+3)/E12;(;%)>&%.9;H3)34=DA$(;9>;028/!;!5E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1484 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37290 42 84M = 37055 -319 ATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAA C2!H(<2D52A:..*?+7"3;+H-"4?)C@!C<8D(&G(':339)!)@=A5F:'/<<>(&(8<,.%79(D1=*!:>'!.0&1G) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1485 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22513 42 116M = 22361 -268 ACTGCACCTGATATTGAGTGGCCNGNTGTCCCTGTTATGNAGTAATCGTTTTGTGATANGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGGTAGTTAGTATATTNTANNGCC (""%*($*+++*&+'*&%"$")!*#(!+(*")+$)$''%"))$#$#$)#+!(*&+)'(&+)#+&)%")+)%))$'*+"*!#)+'"+)$!)(!'"*&'()+!+!*'#'%+#%%!#$" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:23T1C13G18T35T13G2A0A2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1485 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22361 42 152M = 22513 268 AAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGNTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCA <'.&.860;@C-/F7,8.$@;$2B"F2$/E>/15@4!%.:3$@5B)4B'BH"0>,A/+("?2G%DA1>=/3-;E$5%;G>*;12..!A=G/73!*2&/%>DD#"=;('*(<6&+C#$3E9('?*D?,B,0"2DH4(')6'EF,?D)0H1':" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G125 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1486 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3114 42 128M = 3004 -238 CTGGCGCNATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTNCCA #"&'*'&&)$))##+$*##*$#"!%*"+')+!$)%*!'*&!+#((+('+"*!*#)+'&*'!)$+#*)!$+("#&('*#'&&%%)!)!!+'(%#)*%#$!#(&"*"$(!"&+$#('"$(*'!"*&+)'* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T116A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1486 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3004 42 110M = 3114 238 AATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATTCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAG +:;C+.,>9*?2&@&227%::33E;&'*062G;.5(66+*,@"128,/6:,()0BG;4C-C<&C2,7H7>/*:A2CC21&"@;$"C@/+15&1C"6E+*@7-;;@@45@3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41145 42 28M1D29M = 40964 -239 AAAAGCGACGGGCAGGTAAAGANGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACA 21HE2%"G:.<9A3131GGD+GG#=H%60G,6.A0=$<33B5/:7G.;0H3/A1"!1%=G0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1488 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7259 42 113M = 7072 -300 GATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGTGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGA ,F$9>@D$'&EA#?!!7:!.,5999/CFD22HG?!E#;D"F*:'F00)":D596H(-'+;45>A'18DA&G7HEHB),%4=C%',5C&3=,7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1488 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7072 42 94M = 7259 300 ATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATG ,-D!*>3-&D3)1D.'&D+#'B+FG@'+8,&B/=1/,,47?#/%-""B0@$!%@B"'!&78D"!=:1,+75-*"2,.")EA70:;@$@H.EB:G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1489 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8348 42 162M = 8232 -278 TATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCNTCCGAAAGAGCG =A,0,9#C0#E9+$78G5!$<,E&>9>"A09C#A+D2D=:CF0:*8.(DB810*2'D,'835#+*>,38>)*E83D35?"9,;FH21&)@-319'1&>+A!7$B73-8*,(3%6B&'A+H4578%+7'*796<0>E$2'*3C*&EGA#62/>?#4A21BE67B0<460/388H3AD.47"@A?:4&4->4*:53G,:@0G+9&D3H,-5'9)B1($*E"2./63'?(?')B/##"E7AA':!'%C21E'H0),@;+)6D&=9A3#GD7D!;)+,F'95!53%HDF?>4(H#BA&A,-+:>@-&@7$4'<6( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:43A65C7G15A83A27T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1490 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27705 42 62M = 27456 -311 ATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTAT <:;G4&'1!G;&D-,/)+#D07<"D0.">-)301D"AE3DB-1*'#$>1*/0&$:"0='$)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1491 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29131 42 55M = 29298 253 TGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCG C0?D/=/7/-2B>-*">;1GG/"C"/,&DA"4:&5*39B9B'"1H4G-:>EB'>/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1491 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29298 42 86M = 29131 -253 TAAAACAAAACCCGCCGNACCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGNGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCT $-F<4-;6$'*>">:B>5-4G%$:/?5*:/$;/@F)!/'C?(C$/F1(0.>9!D='01!5).#CF+8#/&D)8=(';63&01$>'0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T1G29T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10290 42 116M = 9951 -455 ACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCNGCGATCCGGATATGCATGCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGANGTGCTGATGCAGAAAGCG B")&!)A-7@?1;,660&:'9D?./G-F'<*!E.:')38-((/?H@#*C7-",-'<< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A17C55T18 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9951 42 339M = 10290 455 GTTAAACAGATTGAACAGGANGTNCTTACCACCTGGCCCACGNAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGT D4%6$<;D@2D:&8-5'2=<&GD+EC:,2*)5,01H=+#'$?-#F;3??@&'91A5B6H.#8A*;($(?B9DH'<(&)$9#E;(8)-2&F!D2*%%)7@?;F0)",D26H7)H>@/-$7#,F9A1.=2;@"7G)/;=.."2$!,G.$D@E33183:B18<$'9?;F@?4B22DH>7%1*FA0.B5'(D%:"D;*!!,--+34("">?@5?-,/7=0"==(0==37+F#6A0$H.C3"%8;&4,=64<"'',$3<32!4='2F#GC?&*#-:<9D)0,5EG#!%"<..7-!&(/3$H??.2@5/G/GH;3#4%&F?*?+6AH7F4C>!0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14G5A2G18G296 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1493 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39263 42 194M = 39457 292 AAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGC =3''=39>"HF("FC22GBB*<@)>"A#+'%7?G,2>"E-480<'2/;41:F8&8)G?FB+'0:2DB"AH0!%'39'?">(F3%>(+,>.=4E;E)D<-+4'");(&'!)//C@-!-%*+)/D&57.2AF)7GE06EA&$)/C/01&CG=).;<)52F,:3H#$(.6A.-4E1.8,B<6D/=?:"088$)5(A" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:194 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1493 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39457 42 38M1I60M = 39263 -292 CCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACNTGACATA 7;=2@.?H6+>"CB7"C1%.?')!E0/8))B&%G0+(0$@!9*+&%*(;8@:@>)&D29(<.)C#&(**?F<+H+(.:9#4/287EE>F+7;%0/E8!) AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:28A6A0A53C5A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1494 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29831 42 107M = 30024 265 TTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATNCTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAG 6@.36?36>&G:66+@&>",00GH"<3B*,#/)?'H@,.7$9>FH(:7;/E&;C(!F&FC85,<57H>A"E-4-+E%??@07,='E#1@=4#3))?3E<2&+"4'61 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60G2A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1494 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30024 42 72M = 29831 -265 GATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTC 5A8"+@9>1C61,'!658'/A&!DDF:/G=9!F;'G5-)"B*-;;?&+?.AED1'# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1495 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40855 42 95M = 40950 354 GCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGC 0:C3;?91:8"7-9G+?0<'(6;/9(G"&4:,EGE-3>H=%,?EA.&0-#B=6HH&E6/,-'B$;7"857-5"<"G3-*8%;E$7%HA5BEC.3= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1495 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40950 42 223M1D35M = 40855 -354 AGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGNTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAAT =!539.#D4;6<7E%"+!:!8=%??.12BC"@;F:086?!>6E*5G@3H>"24877>-:7F(F/0-"H=!H9F8/')H5)+0@F!DHG#/<>#3&'=DE=.4D?%C:(G=;HBB!6F58%E09ECH'G2>/>G3@3H)-DE&/=5:2!*B?1+H2#8EH'.9%H8?/-4=.>@D='0GG:*51-<3& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:127C95^T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1496 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20020 42 148M = 19919 -249 CGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAATNCATCAGCTNCTCAGGTCGCGGCCCTTGNGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCNGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGC /2%G...(F:)'-*FG>39.E7%5>$<;!%F1$B!@)<7+)$9%/$C2/)(G42E/85:7ABH(EC/F,2FB5B&?5F:"!D>C+A1?939%1D$8,D?!+/-5:!D>-DG>0-F;G8*6.(F-E7$7>26EE'F9BC68,A*:1,)F AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33G1G8G18T15C35T32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19919 42 77M = 20020 249 TTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGNTGGAAGAGGTGGCGCGTA '@:+H5171)?<77>/<,#,5:;4E7.G?/9;6A6A'04>&#FFH#*,EADH<@%"<:&C:D:),38C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C57G18 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45872 40 12M2I68M4D96M = 46052 306 NGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCNTAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGANGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAA %5&B:!;<740A5>7/F9D/4C)8,*:+'(C#;E+.C-<5H#-7*!8'031%F;:(+(5624)>E3-@.FF)H(,(/A51G*#EE58D5+/9F3$*C54@9',55-/=14G;4F6F(G!(HE558G-!2A/9*58/(5:B'<25$05A$7@=&$C!3=;A9&?:1?4F*E&B*,C=$F AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:0T29A33A15^AGAG96 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46052 40 126M = 45872 -306 CGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACNCGGCAATTACTGACATGCANACGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGNA B:53A>.08?F(:B4+%8+GD($',,*H$+6EH>&&7)++!4":D>9A,F/A;*F292+$*=1FHGGBF="6(+8$1F56C,/<;1A@4&1+=-1)%.B:-E,30@B?$6(B4C)B,H9-.1@7#& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58G19G1T43G1 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r1498 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13939 40 38M3D8M = 13674 -314 ANCACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTC =:'F)4)66:EC+CH-A?A%3-82/-.%=C042#//'+D#<'(F/3 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:1A36^TTA8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1498 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13674 40 78M = 13939 314 TNATCTGTACGGTATGGTGACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGT ("$!)+#+&)!(%+&*&"**#%&("+*&!!%%$"((#"*%"%%%)*$#!!&"'$#"%!!$&!%"$+*"'%*""'$&+* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A1C14C59 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1499 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2415 42 141M = 2415 0 TGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTNCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGN A#?62E"G$B*$H!5.8'84)@$-B%=A),G#0CA&2+26@1;5?.3362#,8=0F2((D0935?:C-C,2$>;B/#C@#2,".,57@@0$90C&1/G//F3A=@4H'$2!488.&0B55%7#)=+?#(H@DFA8'>9.=- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:89G50C0 YT:Z:UP jpayne@0: r1499 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2415 0 * = 2415 0 ANNTCGNATTNNTCTNCNNAAANNAGNGNNCCAGGGTNNCCCTNNANNGAANNNANTNNNNGNTNTNNAATCCTTANNNCGANNCNGATANGNNNANNNNGCNGANNNCNAAANTATTNNCNNTTNCNGCNCNACNAGANNGACNGNNCNANAGGCTCGNTCNNGGCTNGGNNNGNCGGNNTATANNAGNCNNNACACAAGACNATNAGCNCNAACNCTANGNNNNNGTNNNGACG $####$!##!$!#""###!!$$#"$#"!$"$$$$!#"!!""#$!!"#"$$!!$!#""!$!"#"!!"!$"$$#$##$!$"$""#!$$#####"!$!$""#!$$!#"""!!#"$"##"#!!!$!"$""#$!$####""#$"#"#$$!$##!!!##$$"!$$"#!!!!""#!#!"##"!"!#$#"!$"!!$!!!!"""#!$$$#$#!#!"$$$#$!####!##"$!!!#"$$!#$!#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1500 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1155 42 40M = 1155 0 CGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTA -3!&8$DG.)83>75D>F20**+<;,1@C.GB'&0$.#@G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YT:Z:UP jpayne@0: r1500 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1155 0 * = 1155 0 NNCTCNTANGGNCNNNGNNNNANGNTNANGAATANAANNTAGCGTTNANATACGNTGGGTGGANTAT "!$$!"#"#$"!!"!!$#$#$"!$#"$!!""!"$!$$""$"#!#$!!"!"###$"$##""!"#"#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1501 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32085 42 79M = 31962 -202 TACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACNGAGCGGCAATAAGTCGTCATCT =22&DD.9725>4D%E?8,+..#%-0H4<%=$AH2:8A@6.H1$&2/'40"H968.3G*<:4D723?*@&7?/3')4#! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T54A21C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1501 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31962 42 118M1I5M = 32085 202 CATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGC (*=98D3?@=<7*A3C0,BC4)/9%:*F08"BA"*"&3=*A5E$F0&A9>9CHBC/#?"%G#B'8.A79!6"8/';93/3H-4*4:;AFDD/9;3!056<&.779)"(3#0H74"+1@+H,24" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:123 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1502 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16618 42 55M = 16347 -326 AACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCNGCTACAGCTTCA '?B-*+$85&>#+D<.E;%47)<5A4B>%5AD*:812D7+33D57BE0E8+F1=3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C5C12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1502 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16347 42 41M = 16618 326 CCATCCGCGTTACNGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGG ?%&-)!$@!<""E:'B"76%CE<=BC3-1''+C71 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C3G27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1503 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14733 42 181M = 14733 0 TTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGANGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGACACTGGCCACACAN %*$%%!%#**$'#$+!)"&")!)%"#*!#*('($#+!%(%)%()!&&#*&(#'#+()#")$#*$)*"$%")+!$!(%(()!&$!+$+"!%!'+)&!*+"+$*("&!!)'#(*$(!&+*(''#$*)(#)&$%%#)*(&$(%"%(+"%'+$%)"**#)*&!&(*%(!"%&(+""&"#!$&#+! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50C115G13G0 YT:Z:UP jpayne@0: r1503 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14733 0 * = 14733 0 GNTATTNCNGANTNACGACNNANTTTANTNCTNCNCCGGNGAACTGATGNCCCATA "##$&%#(!&*&*!%$"$'$*)&($)(!##%##(&!&'$'%(!"'%$()"!+##"* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1504 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48413 42 63M = 48272 -204 CGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGG FA3>87.5H#'C2@=B/::BD>*)1+<&(H'%>70ADA-99!;,HD,5'1#@;#F7F4(H%14 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1504 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48272 42 60M = 48413 204 GTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGA F*2@A*.:A6:94??E)!4/+=%6H33,6B-.<-9./"A@'&8. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1505 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18261 42 111M = 18014 -358 GGGCNACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCNGACGGCCCCCACCATAACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACANCNGACGGNNANCTNNA '*!"%)&$%(!*"%$*'"$)&+&+)($*++&%'*#")#)!+)&#'(&'!)%*%+!('))*(*")'+&"&(!+*"*!'#'+$*+*)+!)$)$$*'!#+!%+!(#&#$)%#"# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:4A36T15T36C1G5A0A1G2G0A0C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1505 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18014 42 141M = 18261 358 NGNNGNNGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGGATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCNGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCNGGTATTGGCCTCNGCA !(#%#)%**)%+##$*#&*!&&$!(("(!#+!*)(%!&$)%!*%"+%&*$(!$&$&&)!$!))!+%$(!#++%*$(+()''!*#%")'(+$+#*"(&&*'(!*&")##$)*''$*!%$+)$(*#'#!"')##*!%'*"&'" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T1A0C1G0A61A27A27G12A3 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43786 42 316M = 44102 443 CAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAANGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCANGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGAATCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATCTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAAAAAAAGGNTATCAACTATCTGATGCAA E/8:()#04G&)1&-?!09(4B;BGD(>>/A'9060%-#-!*$?(;"@**$8HAG0+8%(?'4$0%5:)E)(CBG1HC6@"H"())-@(8<"D3F!57)"12+":A!F='-'97C.(:=A$4'D-?&&!33#9,2B"%E)"E73HHD;-8!<3)!#(>>;=8FCHC!0"'>4)-"?CD6+:<::,@%H$*@).4!"5>-?>?@$H:1>D,F;)@(H%4G%B3;>0-;D=@73*2<$,/:!+C1$E$)F-907:*"85D/D):,8'G4C,?(0G;37*,GE1@4;D0,>;B<63,@C%0 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33T48G23C92G89C6C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44102 42 127M = 43786 -443 TTTGCACACAAGGTATCGGGGANATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGG 5-%;21HA3G&:14%)0+6+>241:C:#&76?9?%D@C"6:*8!,H(G=+0!3*8,D;@C5)=;<)5'@%,E2=6<;FFHC96$H?);&EE)373BG!+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A104 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37780 42 45M = 37461 -364 CCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTG >9H/GB35.<1.@-.1G(F/29A+8!B@/A@+A:;G5)A(;<;BB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37461 42 23M1D295M = 37780 364 GCTNGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGGATTACCTTCTACCTCAAGCCAGAATNCAGAATCACTGGCTTNTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTNCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATNTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATG ,=%F&?;:6923+@2H/#*??/)3<($7?*G,!E60E>.5)>>C?'9C<38$B672>13/2%;<5DCC=57H$369=E=B>C-?C<71@@HG76C.BE$GG-F34C;,E(>-1D+;G42/G*G&:0&'(B%2<7C!&HH&:5*,$B'D)=6#?=(H(B,2&6DC'1'C0H?.3*G24CD";5(EA!D@!6/60D1.*+#-!/C57%E@8A=<=F&!4+AE/#%/A.C/+9*B=/&,HA8:&(E*+=<12C,E$)?4444%*.1"9$FDADDA"EA2=38@3CA/DCE8"G#@7!H2C$%.".$(#%(H41B%E@;'EC/7G#F?=#?)!,0CG?8.D9#5)?HB:>2A!F5,*-CF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A33T88 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1510 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39071 40 104M3I37M = 39071 0 ATNNCACAANCCTCAAATTGGGGGAATGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACANAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAGAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTG %(!##')%$'+*")#%&!&"#"%'%*+"'$"!*#'##(%&%*""(')&(*$*+%#*"&$%#%'%$%$#$((+'')')"!#!"(*$%$""('())&#(%'%##'$)!+&++#!%$#"#$'""&$##$+#!*#&!#(#&)'$'&!' AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:11 MD:Z:2A0A0A3T0C15T25C29A59 YT:Z:UP jpayne@0: r1510 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39071 0 * = 39071 0 TNCTNNGCGCNTCCNAGNATNANANTGNNCGANANNNTNTNNNNCNTNNNNCNNTCTGGNNANNNNCTCCCNGCTANNGANNNCGNNNCCNNCAGNNTGATGTCNNTTCNNNAGCNTCGCTNANAAGTTTCNCANNANCNGGCNNGNCNNANGNTANNCNANNTNNGCTNNCNNNTTGTNNTNNTNNTTTNTNCNNACGCNTTNCGNCATNTTNNNGNNNAANNGANANNTNANCNNNCNTNGNNTGNNNNCNANTTNNNCTGNTNTNTCGNTANNNTNNGCNTGCANANAANACNTCCCCTGNNTNNNGGNGNGGGTNNNNTNNCNCTNNCGNANNCTCNTCNCNTTNGTNANGTGNNTNGGTNCCNANNNNNTNTNCNACCNGTTTNNGNNTTNNNNCGGANNNAGNGNNNTAGCGGAATNNNNGNNNNNCCGNNCTNCTNANNGGCNNNNCANTCNNANNNNGCNNTGGTNNNGTNNNNCANNTNGNCTNNNNANNNTGATANNNNCAGANNNCCNANCNANGANNNNTNTNNNNGCCGATGNCTNGACNGNGTACCNANANNCNNGNATNCNCTGAGNNGAGTTCNGAGCCTNTGTNGTNNNNNNCCNNTGTNNGTNGTCANTNNCNGCNNANGGNTNNNNNA "!"!$####$!""#!!$"##!$!!#!$!##""!#""$"#!$$"!#!$#!#"#!$"#!""!$"!!"!#"!$!!$$!$$!#$!#!"$#!#!$$#"!#!"$####!#$$$""#""#!"$$$"#$""!""""#""!$$!"$##""$#"$#!"!!$!!"#!#!"$$!!#"!##"#"#$"#"""#!"##$""$#!#!"!#!$!!###$"##$!"$#####$!$$##!#!"!$$"#"$"#"#""!""#"!"$"$!!!##"$#"$!!#$!#$$##$#""$$!"""!#$!#"!"$!!"$$#"$$#$#"$"#!$"###!"$!##$$$#!!!"!#"#!$#""$$!##$$!"$####!!$"!$"##$$"$##$#$$!""!#$#!#"$"#"#"#$"!$$$!$!#$$$""#$#$!!$$!"!#"!"""$#!$$!#!#"!!#$$$"##!$"$"!""#!"$!!!!#"###$"#"#"$"$#!!#""#$$""!"#!$!!!!$"!$$!$!$!#$"$$"!#!$$##"$""#$$#!$!#$$#"$#!#""!!#!#$$!!$$#$!$$"!$$##$###"$!$$#!$!!!""$#!"!!$##!"#!"$#!#!!!"$!$!!$!#!##!#$"""!"!"$!!$!"!#"$#"""!$!$!##!$"!#$$#$#$!!!!"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1511 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15536 42 65M = 15371 -230 CGCGCGAAGCGAAGGACAANCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAACGAA (!$%%$(+%+&#)&$%"+$+$'!"#%$*(%#*)+"&'%"+$+'!$*!&!!($'+)(!'+(!*&%% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19C40G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1511 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15371 42 64M = 15536 230 CCCGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGAT (((*%+")&"#'""*$%&!"+&"#'()$&&&!)((((&%)'+#$"()!$*&'((#(!&$+++%' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1512 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34354 42 46M = 34171 -229 CCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCC ,HB@#H)59+'C<2:30"1#H7$1E5B')%-'D:F7$.'A?.2,(. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34171 42 40M = 34354 229 ATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATG C7B>26;&F>4,7'@-+,5<+(G2H81A(()5:#'?,>%& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42146 40 43M = 41935 -254 TCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAT /*!$:H&+%H2)/;3:%2)%9#@3,<'B14*7$+&H3'5BCD, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41935 40 27M4I98M = 42146 254 CNGGANGGAAGNTGTAGGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGNATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGT (!*()''$#!#"*'$'%+##*$)()###*)"*')&(*'*($!$&!'""+'!#)'*%$%)!++!**"'#*++"+")'))+""'+&#$$'&%!*$)+((*)&'$%($!)$!)""'%&(%('#(&"%+#!(* AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:10 MD:Z:1G3G5C2C1T23A84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5148 42 41M = 5255 148 AGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCC (#G/A.4ED4;G%C78#G-#??2??3C'46&3(0>-BH-.6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5255 42 41M = 5148 -148 GCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATNACCGTCAT D&A)F8-D!@(652$"E>F-1GC3>+A-*?)95"=C(/H;D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1515 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35382 42 185M = 35567 242 CTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGCCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGNACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATNACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTGTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTNCATGGTGGTC @5'*B9@:/7;9:*3;-(H(+*%8,0-8A6;D;@;(%3$E>?7@>-2@9@?B;&%@=5"'@$@"1F-7)C0?E,2"#/%'2AE)/*>.0)CC#6*6*));%/$>3B-3?-C=HD;#*%>5#&+1GC(2.H$3+-D!99"-18"&HA4B"%"*3BF"E@3;%A03E57&/B93%1A5##-5D"(:9 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:51G25C27C37C30T10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1515 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35567 42 57M = 35382 -242 AGTGCGTCNTGCTGCTGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGC 7DA9?#3.==%'4/8;>5C@'1*4-F#<8E'$5H< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C5A42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1516 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25974 42 61M = 26166 245 CTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAG +H;C.,6G0+($(B.1:.<,5.:#?>+5.3-!#)"H.??845,<.;+C;)8>G8D&'2.#3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1516 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26166 42 53M = 25974 -245 TATAANAGTATTGTGTACCTTCTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTA 050-7+.:&%.$-3%*D;*(B$:1,D83?,"?8=87<+4C#"9G9,$7ED.E" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A15T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1517 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46290 42 43M = 46008 -325 TCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCG +3(#6>,:)D(:"AD-2?->!F>((3,>.;E<94$%A-*G;85 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1517 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46008 42 64M = 46290 325 ATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCC =GCCE6@08%"/*H;E<4,G!A94'27)!;A"";)@:3+5$-;C108":8052?"E=6*#=1>8)@=15"&;)2C960%:,B(=@!E62#=(310083)>=,$H-3AG6(78>#042>5E-8EC(1G"41(:C#4.061H.F8@<<+B6!)8%79/?% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G17G7 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1519 77 * 0 0 * * 0 0 TNTCNCAGCCNTATTCNGNANCTGACCATAACTACAGCGCCCGGCAGTGAA $$&"")"(($(&*(!&%$"&!*+'&)%*&!+*%$+'+*#!)'(&*%%"'"# YT:Z:UP jpayne@0: r1519 141 * 0 0 * * 0 0 GACTTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCNAT ,+B>/@74#%7@*0&,79+FE9=)88!%#0GE'=G6>8,'&9 YT:Z:UP jpayne@0: r1520 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5158 42 95M = 5324 220 GCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGAC 5C'56G=0;.E+B%;1?>'**!69/#(**1H1@:4#8201:!FC&'&CB/<0B.G*D,%E#)&BD4C(:$9E'60A#/;+>."27$5/A$9?9/" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1520 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5324 42 54M = 5158 -220 CGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGNCTCAATCAACAACTGTTTCAGCC <.<$A3'(!,/4?A?>GG71%G:F9<3#!-+/'77"A378844%!/774%&+%= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1521 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20849 42 46M = 20629 -266 GCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAA C?BHAC@55*&H+2@.1H;"3#+,ED@8,2*&*/C5/H*,>?F27H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r1521 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20629 42 68M7I116M = 20849 266 AAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGNATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACNAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAAT B:*G?7GG,%/H:**-($DE%7*8E!C-#8?(;3'BACC1=?F=!@A++;G!)55:<&%<>;E521,..";&+F>,,7!;1<8.=G1*D#(#"D*?&5G&D20:*#"'G-H=+;!57CB2"A3DB5#!>F&:,7/G5H;/1A+#@'<%67%$"D?'7=7#0B26&5B,;3F).6DC8/@==H%F-6+!B<,CG@)<&F/6/'8G/08.FAE.&$+)D'624'D;E34&+B$$82:/4(DD5/10B<35%(<89/8>.0A4@G2#=3<@?&E#<=+A%C8313$!>#,21&;<8,,0F#<7:#4?@@F<,G"AD;, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56G24C66A14 YT:Z:UP jpayne@0: r1522 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28630 0 * = 28630 0 NGTTCATCNNTNATNNTCNTTNNNACTNATNNNNNNNNCCCNNNGNNANNGNCCCGNNTCNCNNTC $$!""#""!#!""#"!!"$$#$$#"#$"!!#!#!!#$$"#!#"""$!"#"""$$#"$##$""$#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1523 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29025 42 111M = 28863 -273 AAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTC )#*"&#*))(&'$!#!%+#$**#!#'$*#&%!+""&)#+!'!'(""#&$#'**+!%#(%*'"%$&!"+)&$!$'&")##$%%*('+$(#&(""!*##&($&''%%++"#&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1523 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28863 42 162M = 29025 273 TNNCTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCNGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGANGTGGGAATATCCTGCATTCCCGNACCCATCGACGAACTGTTTC (##+!*'%#(&"#*%")+*+!%%%$!#!(%&*'#'$!)'*!("((!&()(+))**)&&)#!)$++$$*)%#!++*+&"*#$%**+")$&"'%%$$#)(&**")'+)+)#*&+&%%&(''!)%%#"!#)%*(&"++")*""$()'#($$(#"%$&(+((&+(( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G0A75T39G22A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1524 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33658 42 125M = 33521 -262 AGTCGAACTCACACANAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCA 8%'"*2C&(.B.0?*1:0GAA!F34E)*,+B8=98@**)B#@C%<5"'3:67@(',+F-4)7>@'+!7&6ABCDHG*!?,.DH;G6G3+!*):*+!A&9A7#'%2+0*2;%#HG4C.D#/@0&$C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C109 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1524 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33521 42 99M = 33658 262 GCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATC 2%&/05=*-B+,%#?$'@!%")-&C46?4=#)3/(92>:$#9>:@)"F86+>C4)88"+!<6(3./F.6>>;@.9=-/C4;&-$B#?/?4*5@8H19H=B6<40:E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1526 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45451 42 56M = 45616 211 CNNGTANCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGNTGGTAGAAATCAA '"!++()"$%*#)!))'+#%%&*'#*#)$&)'%'"!''*#&&&&+!!%'#)''#*" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G0C0T2T35A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1527 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34491 42 95M = 34586 169 ATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAATGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGACAACCATGTATATGATCGTTNTCTGGGTTGGACTTCT :!A4987F39F.B:D+.724=5'0!!CG4'524/H,<=%0)65F3@H+:.B+=+4"@D#A+9#H43F+!.-6)*58/90 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33G24G19A16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1527 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34586 42 74M = 34491 -169 GCTTTTANGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATNAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGNTTTCG 9?!2>.H7EBB:!8A3B(<1=%E5C>4,8%!B)$(5(F0/9B.<@*3904&$E9,G&33D98+'3#3GC-,(B# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A29G30T5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1528 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25854 42 89M = 26033 236 TAAATAAAACAATTGCATGTCCATAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTNC .?AGC#>@*BB;C!8F;F)*4F.9F3&29'C84CE&E.;#69(CF%#$G-,8B$"HD(/: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G63C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1528 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26033 42 57M = 25854 -236 AGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCA B$"<#1;(ED.7,$>A'*>""$=5>!.!D%:D(C)?7@<30(.4F+EDB)-AC>;?C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1529 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 663 42 47M = 763 235 NCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTG !-.*E*-2))#4/%=&*;1-&&*?0E.,EG,%EB-(+':56;D/#)E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C46 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1529 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 763 42 58M2I77M = 663 -235 GGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTATATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGGGGGCCATCATGAATG -+B%B-G?=8886)?D3G'0#F.1E@';<8+(($G>",<639B;4*#)90EB+*@F147D81;;G"2?B!H%17E%:$,'!,+/-,H!A9A(;"@#<+D8A/@G55"H"3*9A35%+<-<=E%+(9@9/(G;34.-4G)92E09B$6*!3F9>5D;4(/B43'=/",>4$,?>E4?D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79G13T44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1530 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 354 42 320M = 674 458 NNGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGNAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCNTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGANAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAA !";?&G:$B!#@/@C8/2:E)A/'(E0265!6B&/0AB.H.?5?5=D;?*C#HHC/?5+6+CH83,19:C"@(6*#5/@/(!3G9+/@#;4'&%G(11249>F(,?+31$C+B>,?D"?%&>74&#HH(<+@A23))46%EC54;+.FE/=;5:"A/13363>;@6-)9/G0+D59"HG$#>)!#1',;<= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C0T34A12G58G159A51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1531 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21548 42 75M = 21729 329 ACCNAATNGACNAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCNGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCC $)%!*)*%$*%#)&"'$$+))&"&#&*)%&**$!"&$#"&!'((%((''!"'#%*"#*$#$!#)(%"($'!()'% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A3C3G33G29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1531 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21729 42 148M = 21548 -329 CTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATANAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTNCTCATGCCCATTCTTTCAGTAT 8"&*'+2F*2.#&+B:G%@(?0CCB(231"BA$/+5>-!E)&>)5=!;(A2B<,A6>8"09CBFG;$<&H4#8;1$,*E(/&5-93."3)0/=@.'8H<9%%<>HFA-(6,(?57E03;*(7%?1C/.+=@7G<843-9)<%:'!H<@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:84C40G22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17317 42 296M = 17613 347 TTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGTATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGTCCGNACGACGGNAACCACATAGCGCTTCACGCAACAGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGA ?90'1E2G-E65!+C2)E/>*C65,6,?!3G"-/4F=:1;;!G3?,.#6G;9(;4F99FDGB+@:>C'#4.=:>7-29%1F5(EA;.$63/%<#>4A73'H(%6D&"$B,,'B4)D688A'EH&9FH#/=%,6'@+:3$;:1!#B*64203D-%B(A;H-#>3/%$F?@::<+:"=?5/7:=5%?99!.C$+1/&9+5B+H.>1G@4:-*0#7(D*79H($.1BA0@D<485(;D!%A/GEGA1+!3?,.>?1 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:27A171C3G7A9C13T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1532 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17613 42 51M = 17317 -347 TCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGAT D8./1)?-,=;;,#1(%?=6#*%,3,HB*,$0.#->!;4@+1%='(F2<7D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1533 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 114 42 41M = 289 217 GGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGT ;H($)*'C=B<<)+A>?8G*C1H(%F<:/BD,<8-9,%#!6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1533 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 289 42 42M = 114 -217 TGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCAT 7,*E3084A%30"#!D3+(5<$/&2.F#!EH&&6('.&1FA' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1534 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22335 42 106M = 22468 277 AAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGANCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCA B5)BD&"55-%C+4;%=*;94*8HDC,%G.>7@3(<>A)?C/F3#@?D.6=172G#.5G);"D:;4&861*&%D+)D5B6+%9-B"A5,=>AC.=-)8'A8.4"5$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1534 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22468 42 144M = 22335 -277 GCCTGGAANAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTTTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGT &(@+"-$E08+A(!&G#D/D3EG,3F2#2,9H8$C)$A)5H+1F-6@13@;:D5#EC/7.'*.+'%6G>+84D+<1+.>3=&:+9@2+(DG7>#F9B>93-/3B+C<>!6&4$H6B!>-7*@E?F'!B>851=,2) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G63G71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1535 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10167 42 48M = 10262 204 GACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGNATGTCATCCACGGAGTATG :,7%G"?>1"/)%F<$%F#G&'1/-/5<@#F27@D$@C@5%90/EH)E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1535 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10262 42 109M = 10167 -204 CTGGATATGGACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCNATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAANCGGCGCGAGGCTGACG &&!8;DB"/%$@;=9&,,/,BE$:*7*"3DAAG1(#G;4))11@=B4B?6"9G.'@?B3+9;:2!:0H&FDAF2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C44G37C16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1536 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18040 42 42M = 18123 239 GAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGG ;2,':46@8(%3??4/)@>8/#<2/BA#-":3("<:6.>?)/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1536 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18123 42 156M = 18040 -239 CAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATNGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGANCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGNAGGGCAACCAGATATTCNT -:?4'C2FB8%@>5*52%E+!-/,6B%!5CE9B?5@@(&'2.@DEF@C3-AGD,.C@9'<21F33-0;>+9081:)H'7!(!G$(E%9"H<8>B'2+<@!G/?-1:B"*4>0=@<)E>@: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33G25G76C17A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1537 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46585 42 126M = 46711 274 TTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTACTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGT /,7628,A4,B%>-+"+5>*)#1,?$1/E1:G.#E#4F1?4;>B@7A+6#(!#9C)=B<=B!8=)=#&E*D"'$*74?<2-4+94'+!"-*#244-3.84H%#+9/-&"/&H!C.-!+!G80,65= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T102 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46711 42 148M = 46585 -274 AATAAGCAGGGCCAGCGCAGTNGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAANCGTATGTGTAGANAATNAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTCATNTTTNNNANTG !$%$)*)!))')*'("!&+#(!&)!#+$%$&)!!#%*%&!!"&!#!*+()((#*"&'*&)+#)('#&'%#*(+!!%"*!&##&()*$"#'**)%(&$##+%'+(#)"$&+%(&!"%&")%#"!+#(*%'"%'+'''$$')$&)'&)&# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:21A55T12A3T39A2A3A0T0T1A2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1538 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37199 42 113M = 36997 -315 CTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTAC HDF-C836$A,:->7,@9%6-8AA0-906:-"*A&-5D<6-A$'C@".D*-9E<7),'FE-<,>*HC#2,.6BD=E@)6+)#H-E7/*8+),99+H!,8+CH:!A"/=!9%B( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G103 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1538 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36997 42 44M = 37199 315 AAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAA +*+%(*'!$*)$!&+&!!++)'$"#$)%($%*("+$+*#!)#%* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1539 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15648 40 60M = 15484 -224 CAGTACGCNGGTGCTGGACANTNCGGGGAATTCNCANNTATCCNGCNTCACNATGGTGTT *("+'*!("(+#'&"!'+"+!&!!*"&$#&*")!&('#&'))(#%!"*$**#"(''*&)% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:8C11C1G0A7A1C0A1C0A5G1T0G4G0G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1539 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15484 40 58M = 15648 224 GTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCG >8?*(4=#H6597$1>6%/(2H!76?"-A4.-0%"G7""=8F7&E$HCF,2'45B2G4F%13E44+F(@-;$A$:AC6&:)H#8B#.".BF;A%#-<$!0$:;(/A.EB=0/-E(C$3@2C+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G38T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1540 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47371 42 76M = 47473 226 TTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTG 3!<'"B2@#E8.:#/.6A?"&!4??.614?E;6:DF@'3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1541 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20215 42 60M = 20016 -259 CCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGACGAAAAGCGCCGATA *'&!!"+%#("$*"%#!+#$((%&)$'&#*))(+#*$)!+"!!+*)"'(*&&%%#"''$* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:44G6C0G0T1A2A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1541 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20016 42 126M = 20215 259 AGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCG #9?88'##/C9!%?-;G*@H!@8(!@=&6A1<'6CHDA,99/1C4HC@-FA)- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83C42 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1069 42 226M = 969 -326 AGNCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTNCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTNAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGNN !*""%"'#*$#!%))&$#!&"%+&'("&))#*#$)*(+$**!*'++$!$"*%((*(!'''%"!'&)$+!)!$$%&"#))+%)&)*))%('$#")!"*$'%%%($%!&&$"+(+(*"+&**"*()*(*("((#'$'"(%)!&+"$""&#!$%!&'*$#!!%%'%!!*$"#)#%"(&('&#'$&)""$"%(#""((#&'*+$%+)(!++#$+"!)"$$('*&('$+!& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C7T103G31G77T0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 969 42 49M = 1069 326 ATGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTA )E$??B5D11$G9&A88."3/3!;HE:0?7F#79E"-H;24,C>>7.G4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1543 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3200 42 60M = 3282 192 ACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTG =C2&4>?=4>960:2>)943*;A#$+=/524 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1543 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3282 42 110M = 3200 -192 TGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACA ,ED@75&/=6E!B#+7!C*C+,>/!0@;5<7@D<+E)"?81D9E6;')).6F983!<650;>%"A;(G3?%(-(2D%FD,>,=1H3E'=F,2((',E3B?+AC/>5%8D9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69C40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1544 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28307 42 109M = 28141 -275 TGCTGCTTGATAAATGTTCAGGGATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGANATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCA ,4>(F"9D<0+.($9H-#=$$/890A"5+F-=;!H"H'$F0%,GB2(8(",=*?/5D39(C6#0!"+26E.G6D/4#GDGG!%F/%E237D&C/.,?/">?2'==? AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T6T60C25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28141 42 111M = 28307 275 TATGCAATGCTGTCGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTT 6B+H)&F55'-1:C@**AB+<8>/FE'4/;&6A08>2?*30!6$A2$C/!5!3G5./C2477!@/H=,>:8&4"'@C2!C4CB)#'%0H7'9+2!B8-!B-8)70@5@D2/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T97 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42414 42 63M = 42550 335 TGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGG >9A!+-#1:!E@!7D('C5%4C:,2=9F$1;%9':0E(3*""'7=,&B=783G.'G3;,36:& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42550 42 199M = 42414 -335 GACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGTCGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAAC 7G?+*.&A&6F&6+7E8@0/$3?FF)5%,=G.:):"<"<3>D#>$-."!?<7=9?#1**A#&,,#'89/?DB/(557D/C><6-/35/BC%7/BE6$<9'8C,!7B#?G+C)3#@'<(&=0;E;'4'"0&07&=)>";;2?)?3.?621,8286HBE//;-!%9E*<,7$<):G4GH"1#7""4:7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A149 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1546 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43458 42 58M = 43229 -287 ATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATNGCG 9BG.8C?:1)0D,0'%>+);9,3/?%=)./#8)H;'%=1=/E1"#F#C5(4:D*;A"5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1546 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43229 42 169M = 43458 287 CTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGANATATTTGGGTAGTTGGCGCTCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTT :.@:8.<+H6G>/2?)E;D30#=.7($GF*5.5B5%@3(4B:9'2$6.57**7"/+*8C3$?DE/B?5;?65*:$H3=/83"-.&#AF?<*:F1D1)%#*>=4H*>C$2G5AHBF0AD<.9#:G?4DC(F;7:(8)$50+"974!)C#07'$)8!B!5'G"HA5CA AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34A18A23T91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1547 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1233 42 106M = 1075 -264 GCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGNAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCA .@H76((GH59+3,:30/6:!<+ACH!=%B921<:>E'-.$;,C>4*--F*(4BD;=)18*"9)3*:GG$EBA8$'D6F!#G0<13C4A4?1<%1@2#D#$?,)?>D$)3"#3##?D)#1A,+-:C&!26'A?>=14E*?2++>&5.2!% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1549 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12713 42 64M = 12519 -258 TCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCANTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATAT F"C60A3>/@<887"8-!=(43FG76&#AC3B/H>413@.H664!53C<"H$;1&4-6/D:*CC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G19T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1549 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12519 42 194M = 12713 258 GATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGATCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCNGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCAT <8FH-FE)6"<'D2,,,&@2:%2+B:?*6>3*BGF%/7*0C>A(;9(%3!<--83F'9B3221;@D"B@C/$*+$.EA48!!>@3@G54/"+>E3*9-7"%/#BG9">FA1=%1:5AG#9B+0C@B.H?$&&A--)%)>E60@95=D=:!G-,;G=-HD'!4,4,:E-=,:8@-B6C?H:@&GF*3GE)7C-)+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G61A87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41577 42 70M = 41647 326 NTATCCTCGCATGGTGGAAGCAAGAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATT $+('$*&$$)"$)'&*%'!)($)'!#*&%"%#&((()#%$"*&+*)%$#'"')(#%&"+)!+"#*'*)(" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A22C46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41647 42 256M = 41577 -326 CTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTCGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGCGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGNACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGC 855B<)3,8:4'82A9+"('7:/;*0/6./5-?6@$.4A)8#-'.96&?1@A22'<&>3=6'&72=<*%?'*6C=*9?',2*>$31(14C"B,$B949-C;C>$E!"*2F>EA@>G>50;)-.F38(%;CC9&736H/<%/"A!8);!E'030/=E!/77:'1$F'/(=")A,8&9H5"6:6'-$>A=CBE?(DD,!2HD5@%A01$5H7BF&=+& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33T29T141G50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1551 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31148 42 56M = 31204 415 GTGCTATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCC C9,.B+<15C=DA3.D,F%=)+'*%A5"@6#)-2'($DA7-G0-'>(>F28D-,!: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C51 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r1551 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31204 42 336M3I23M = 31148 -415 CTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTNTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCCTCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTNATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGG ?2G#(,C)@3+>H3#)"&GC*AG@9286<$(-G%%)-C;$:GAF>+C%*!?05A*:&D?DDB++F"-GA+<,%G7$1@(;=@G5$H5/??A(0,,6-)%7?;#=6!99?2).;+&,?E2'21:?(.'>8-#4EFA2!%-#5!+;FF'/G/?0:1-7EE3-4='#B/$97;!!9G0(&2;)G>E<=;9D@66&(<*!873C>;426-@.*; AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:89G159A49C47A11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1552 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8810 42 216M1D104M = 8745 -386 CCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGANGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTAGAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGNAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACNTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAANGACCTGACNCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCGN AF'H7?H-')@CC2+79"(A2&C5(6)(G!?'@.:<9A!C'&!BH80-H"$#3,%H!G<66283D@F0@;!5;<+6F%596>D3"9%<6.,C>?+3@%!#<5?((<&G?7:/./16;(8.%8=DB00&2'0@6=0$-?/)G4-*58/::%#9C2A93F6#G53/C,BF/<=#;$<=2D<(F4H8=*9>=@@66<9#@38):.?7+"DGB1"+AE!G+#'%+#D#<-9*,"='@!*B!)7*2F+=,28?=3:3H7E=76A1" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:83T80C45G5^T27G28A8G36T0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8745 42 65M = 8810 386 AAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTAT $-%;&;B($AA7G$1.@86DG=1$7+"AGD.H16./0)-?,"4B$;;*#=HE8':01'#F*B*-3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1553 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17947 42 164M = 18111 354 CTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGANTGGAGGAGTTTTCGAAAGANTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGNTGTCAAAATTGAGCA FB&5$=94.A-72@FC//("48DC#,F#?E:$F4@238D&@E72.1+1.)H91=/>0=""!9-0"$&)5/A:$/;A<32-)A,@1+!3)B,<$(26(;#62:@46E0?G2G$00G/">86:0.1/@HH$17B2&-@<7HH"43!C!?-H#@F'33"%?BF".(& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:90C19G37C15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1553 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18111 42 190M = 17947 -354 GACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGC <&-;F<"*86'-)G;14:D0.:*C?,!!B+CHH77?&?.+8)5<#DE?FE!#;49E:71+96<&+*8A8"*-%.8>:48@#G22'&(0#.:,.%,7E"&H4+#.2&+,=@(1F?702G3F;/35E'7(A46<>>7B2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:190 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5932 42 60M = 5706 -286 TGCGGTTGNTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCA :B)"C(9DB2)&1?45,5%-2C:7#'?=:&"(E?,(-CF?F0!DF><:*,2>D=!37;5$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C50G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1554 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5706 42 76M = 5932 286 CCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCC B<(.,1FG226"?29$2*3)!60DDF./0(H47#*0=1CE/,@9514$H(B"/D')#@(54*!D$,37"+-"*=C3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1555 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6322 42 92M = 6121 -293 TCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTG B'E?D90A79,$GCFEG&-1A;'8C@66>B2F:3F8F()#+9F*EH#?(4@F#:(!5+;F++GD6:82$%*-*-%HC$=7:2*B;?G(=,"G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1555 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6121 42 48M = 6322 293 TACGGGATTTTTTTATGTNGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGG :?@,*<%:?C.BE7:!E;*-.7"E=5D+>G&$1"",7!FEA!4+)@FA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1556 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7774 42 129M = 7612 -291 GGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGAN .6=?CG12;/H(!C@$,23B!B)'772A,<$E4,061):7D7$2,=,A/!#;3=3:G'HF6(D932DG@=<:>C!':-),>8D3??#,B@?B.6=+@,3?AC+*-*$3"GD"6H/D015943H&9+E1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1559 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35161 40 45M = 35027 -179 ATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTACCNAATNT &&!($((%#%&!(&%!(")*+**&&&&!!&$"(#*!&'+!($(#) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37T1G0G2T1 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1559 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35027 40 18M1D115M = 35161 179 ATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTNCATGTTATGCCGCNTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAAGACGTTGAAGGTTGCTTTCA ;&?<5&'-F*5BH?D+2E;7/$2()<88:065:68(H"F*<*6"6&6?#.#;!='C'::=7+D,*0'"%6';#>94*3*(B1/1(/-;31!&6C2HA>83"+4,F&?*H838CB9(1C$@#?E@0?E)'6$:" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:18^G36G13G44T6C12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1560 77 * 0 0 * * 0 0 NAAATNNGAGATACTATANNNTGNTGGTTGGTTTTTTGAATACTAAATGTAACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGNATTGAT (&'**'*%'#&$!##$(()"!()$$$!+*%'%%"&'*"'!#&"&+')%++"%%&*$+()*%'$"("+(&#%$*'!#')* YT:Z:UP jpayne@0: r1560 141 * 0 0 * * 0 0 ATNTNNTCACCTCTAAAATATATCAGCATCTAGCATGCAACCTATCAAAATGGAGAGTTTTATGACTAAACAACCATGGGAAAGAAGACTTAAAGATTTATCGCACTTGCTCAAATGCTGCATTGTTACATATTTTGACCC )(%"!"&(*+((("(#($"'$&!+%*&%#%$&+#'!$$)**&(('+&*)))"!''("$!'#%((#!"!(#&")#+#(((+'!'$!*'+(##%$"$"#$')+(#!'))%$(!!"'""""!!#+*!''&$$#!%)##%&'&$# YT:Z:UP jpayne@0: r1561 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28450 42 49M = 28134 -365 ATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATT ;0G#C#%G"AH.5:"'9<@9?/))B.<%;C.A4@B+D'&0>:-*0$?E% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1561 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28134 42 42M = 28450 365 GCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCT 320'HA=+265;,*0H!AGA%4A/<@%'/E7$78C&"$(G/F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1562 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30770 42 42M = 30812 232 GTGAATCCCGTCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGT ?91@/D8:-%/6-09.57C"1C.B8A1'3)/B984D;//#2A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9A32 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1562 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30812 42 33M2D155M = 30770 -232 ACGCTATGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGACATTGANCAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCNGCCAGAAAAATGCATTCCGTGN 04)G&08E$1>'+!96-6/<*,@2*G..8:&;6>.-A@$A2-#-46*GE.5&6?61C1()52$242GC;4DB8).$8"$0+#B/90F!?1$HAF<$6E#G"D;+%G!9<>B"4?'E'3D>H=(+F41F2-H6:=$E&" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:6C26^GG78T6A46T21G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1563 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42931 42 209M = 42794 -346 TCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGCACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAANTAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTNAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCANGCAGACTGAAATGTTNTCGCGGTACGGTCA <#AD4,B-&'�*:+.*#50.8.420<+6.2C2CEE>H"$3;=29.2?;">467#/H$).;=,-.'?HG@2=A1+2?'.9>>5@282$=@63/-"$7FC!C?H0;.)9')?#4.+!FEH14$5&.81%55FB&(70DG<8CD$=E;.3*"1E9B#.@A<1:=,H:EC'H31'@:4(:#<.F"31 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:28G61A57G29C14A0G14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1563 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42794 42 137M = 42931 346 TGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATNCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGNTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGNCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAA 6/>$<>78'#*7@G?F!?6E-D?HAF.E*7G;F!+H+=F2'**!@+#+4;E%*//AE/,*00*'8$?#E&,46?%GE(28B-%3(.31<--6G9D0:93/7,;+*A4.HC-H:AE?1(+"GG3)+D)4F=H.-?8DG! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1565 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41776 42 186M4I26M = 41988 507 TATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGA /"(A$$#)$))(>@D&?;3(,580*<)0DF,,BE!8"E==":7D=6921C?7"B/9!8(E@/4<>-')D1(22!E)!7H2F2,::@:*A#*CHAG(?9F9H@1*'&6>/G8)F3?B)A42-)3*788'%7D70C)D6&>:B:/*C!:?*)$4-=)3G,'78!)#,#,78<*);(*6."6H>5!--)5+@:&%7100A$$&A@E7!)(*-,GF=%:, AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:212 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1565 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41988 42 295M = 41776 -507 TAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGANAACAAGGTGATTGACCAAAA -##((D8F1&=#)G)?)$4)=>5";4;89A=0"##?CC;36)2G43HF@%.:7+15E.?G$(>!:?+#50.2G1"C$?"+$51,#A;%5&06E=47*8$7/50B1GD>;02-.F9(4-@*!?)>HE%#9A@#?)>3@E"<$-2/!B-?DC(7?$A*0<@,=*.4"B;4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:274A20 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1566 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4223 42 84M = 3817 -490 AAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTG 7*8*<'<9E4+A)D#82*@!3%?8A?H"D**D!*!..0G$?,8+;5*%4H-3,:3?937:-@D9E)!2C(/7)F!-5*:%.FD/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1566 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3817 42 406M = 4223 490 GCGAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGNATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTNCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGCTAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGG E/=+D>'='4C:D%9>&4*A/'F<@A5EA)6.?"*-@,0?)<'H*&3"#4'D(G#A*/?6B#(30CE<&/+G3%'"%G<@7#%8:+4'97?,1CF/76DE78A<-?05=$%"FH/*'&0&@*AF?B<3F.:,@*4EC;EE)6EG>A36(F-@@.H9'/1A;><9)."#-D-,#)%$&)<6)4!6@+:F@=-*,/&+F/8,24$?E)C)39?'<5:9B#=27#(01:''F:"2*DD")92>/H3G/5;=2@=H//E'0(!#F*;$)?)A+0*B!F9H( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A51G83T221A45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1567 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18171 42 55M = 18341 249 AGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATNGTATCGCATTTATTGACCCG ')))+&'#(#$$!%"&&(*$)%#!"%)*&#%'#*%$%%&#)&(*(#'%!"$#!#! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18341 42 79M = 18171 -249 CCTTTTCCCNGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGAC ,9,,84A!2=:/5:/?-:B*>6!;HC?E-88"3:E/)=(,.8)993F!:5643C,D.;H#2:+&&!0(E%<. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1570 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21921 42 75M = 22092 298 NGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACA (;,"4;6#3)GCC:=H==B?B4#@+6&2:!6;D''93B'$D':.E&3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43790 42 170M = 43613 -347 AGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGANGGCTCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCAATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGC >A8E#F9-D0"/4;;(C&95"35B16$5BG&C&BF;B9,59?35=E'>H),'<+*603F)-'7$:,,2=:(;D)(&D!<43A+'%35CH7-.==AD:*=>9@/F6;20@1'4;%BC(";?G0".F!'85 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:90A3G45G29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43613 42 70M = 43790 347 CAAAGATAAAAAATATGTTATCNGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTT <9)=-@!244,B;A(B!*>%G.+%#1:7<3/37E(,4D"+E>B;7-E)H@E$/5@%E%,;72(,=$-7>7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1572 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 336 42 41M = 132 -245 GGTATGCCGAAANGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTG A"H'49A66&8*2)75HHF>=65GH?8%7=3D2HAB19E6: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1572 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 132 42 66M = 336 245 AAGCGAGGNTTTTTGGNCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAG 4H9?$=%G=-%C"G+64E,4B.H&,%>>""4(&"':4/7B,:+5E@2#%1>?%#5560FF*BEDE?A-+F;;GC=*8986-*)D5D5#76945-F(>;0C!F860??F&<@F<92?/$!0?@:;'EBF,7-E('97:6:('.B/G##.C98:H(H79=8-$2,;@$$E-8471!4(630!;B+))5D=7/D0(A?0<5>8&E,$11$0316G5D#%1H&*654$5(*H+8+G,*C$,(9A0A<$'#=B9:>;!6@'1/) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77C143 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1574 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45013 42 150M = 45163 354 ACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAGATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCA 4$-"*D?0CH-4(57GA"1%&B./"G$"*%0@A7&C#"$2096-2*0<6D.$+?#?56=G4!848F$&C$991>?!EG*:G(33A>!62?5>519F$!-?9,G;(-0%*89<8D07B94-+6A=9<&:H<2'*&B+!/#&>!?+6-*%&' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77A72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1574 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45163 42 204M = 45013 -354 AATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACC 9,B&?A(+,EB(B<'3$/?7*3HE9''.*G79G*+:6<)4--8',($-31CA+.4C2"97=F&C$G%:,)<'&(@(!*8-C)=HD8:<(("96?+:#35A#E:#@:4>(C(C6D6E?77B.EB='-&')+85B+79'F*<0;E(6EE8D$:@98++)&AE8(8)@=796F9%5!#G>5H:B$22>C+,@.B#$AD6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:204 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1575 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3270 42 201M = 3471 285 CGNCTNTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGNATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCTAAGCGTATCAGCAACCCGAATANTACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCACCGAGGAAGGGTATCC '*!#+')*"#%%#'"%&""*++&&+&*+$!&*(*"("()(%+#+%%"$%!!"'!)!%&'++"#)!"&+!)()*(%&##%(*#%&*#$%+"%("$!&"'*"&$'#*&)'%))&%"())#!!"#$(&&"#+#$&"&#!#!$)#*&$&('*#$)$)%)&*"###'('%$*!*%"'&)+"+("%&+''&&'+%+!)$&(!!#'(! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:2C2T31G43C5G5C14C1A74G6C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1575 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3471 42 84M = 3270 -285 TGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGANCCCGT 0*C2(7+4+AC;>&+,-*,4-3;$,D/?'%A5#A=05G=?/??17/6=@4/9-B*:0).:&7&"!1384#BB)934B90=@7.'@F%1>H$9B.@4>;462G/G5"8F+A1"!%1#);F5?-0=D7E@1<0=B&-!>##+"B),9;;E-&#):D&HCEH/,6C:7"$-">!=?9=%$4C7'?H?&B.=$F3G(.)C3C1@63=/.1#03'-?D8>9+>E66"<@BE:9+0+/#:,@5-*2#7H)HC@,A8"'++133)@+5E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:61A11T27G6C4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1577 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3632 42 49M = 3417 -264 ACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCAT F58@;G>"E=-,;@7G>>A$!58D2F9E;5D6(;8<,@0(HEB):3F22&2B6#'!0H50&(@G/!(E0-.!%'53*B.A+A;%&0-4.(3(%E$C',(/@9$?,<-)(=77>H6-;210$C-G?A%50'7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:139G23 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1578 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8233 42 67M1I35M = 8070 -265 GTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTA >&B&/C?F#5"E=01>A5,>.BA%7G9;0,%=="@6%-*&!7!:&$H?8/=!1=-&DE,+="(==;).>F;=8!H3,(=A%AGC(:+@(C8((;25('>.0== AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:102 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1579 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18747 42 69M = 18587 -229 CCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCA E70@$!&'3@A28C/$-&D'FC#8>$/166AB*1;"C$71/$,/6E$"!8:!*,><6@E/H8'E,%F43 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1579 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18587 42 105M = 18747 229 ATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTATTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGA 5#<0:&B"F$@((6*"9/=$!#0&*>-=/FC,B2,30>40F&?CAD/-*AD8@;>F5&7GE/;&:92>34"16,18+%5A"E;6E-6E=@G.>(G'>"@=?< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C45C47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1580 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4630 42 340M = 4970 412 ANANGNCCNCAGTGATCAGGTCATGANCGGCATCGCNGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTNACAACGGCATTATCGCCCGTCTNCAACAGGCTGCCAGCGATCNGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACANGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGGGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGNATGGGCGCTTGCCAACGACNTGAACTGCAGTGCAGGTCGGTTGCNTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCC %!%#(&('%&#&$!#'*%)+$'$))*"$!##''(!#($!!'*#'''((&*+$#(&$"#*'+$(*%#!'+%")"*)%)+*)!#&'"$*"#%!&%'#")$!'(('$(""(##")#+&!%)#!%'%#)(&(#+'"$$%#*'&*(#!('*%($$$$'('))'&+)+)+!$#'("!(()*)$(*&#+'"#"!+&%$&+)$++%*$+)&&#&''$*%)%#%+$*#&(%'$($'##%%)(&""(+&(*##**"*$()&!&''!+++$"&*%&%+*#+'%"""'*$%'+'!%$#$!)+!$+'''*!*+++!*!%(+!$!$(!!''''&!$(&('$*!&+!*#'(*'$# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:1C1G1C2G4T12A9C69T22G19C32C33C37T19A18A5T40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1580 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4970 42 72M = 4630 -412 CGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTNACAGTAATTACGGTGCTGNGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAA !$(*"$%&+!%)$)$&)(+)%$")(++&$'#&%"+(()'%"*!*)&*!*+(*)%(()&#+"&)+((#!%'"+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G22C18C22 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1581 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22569 42 97M = 22399 -267 TATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAG 5*1?G8,>:;)6CH-&3"C-#$326A*C6"0F*4*8$4%+7A/35;*@/-;6.6)H!!4D:3G6$E+?$<*6.>D"0(5-4&$8':?E!#C3=?FB+@E107,E"@8.@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T20C9A8G42G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1582 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21608 42 287M = 21544 -351 GCGGGTGCTNATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTNATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGTGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACAC #.@/<&:*A2'-B-/F!83C80@A/2=>9E#!;>+&?0@7'B'1B1C4@!1:E4569!!@EA6>6?-)64*-7674'(*C?EH+4>B/;:1F&."4$H50>:H,GC5706B"4F(4<3"71C2:!3448B88& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C117T92C66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1582 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21544 42 64M = 21608 351 CGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCANGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCC +@H;#-5;8*%3.FGB=;,)C4C'A0'+H0.37<6H,'0D7H<6F:*(=7.*&'G@(<93&D83 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1583 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42999 42 220M = 43219 378 CAGAAACTCAAAGACCTGCGAAANAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAACAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGNCATCGTCAACGACGTTCTNATGGTTCATCGCGGATGGAGTGA 50)7H*F3D&1&&46;A/-316)*!6(D%2*B'BA297D4<;/'E$#4BD@;0=4@FG0%6A538:*#."'C5E0D20)B44+'C)A5$E>0+@!8E<8";"="5.29,04,DH("%9(@8>$A2GBH5:2/866"/$96/>1"GA1C>;/FCHA'00F/B4B!F:@.-!61-,77:DD&@E5"3A&-(8!B+40"-%4,%17(;259%"&3DD1B!@CC AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23T33A119C18C23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1583 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43219 42 158M = 42999 -378 AAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGNCGATTTGGTT 69G#+AHC/'?..03,@07#:$;#*D?@H,5B"4$?)F%"2,,GB-1B2@9/H,.AC+42$9$9>B8>%/,E9)">7>03;1$$52AF>(C)%E+H<=A$:195B9(8-A>1.4F/@=6GE'&9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87T59G10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1584 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6444 42 125M = 6297 -272 CCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGA 97+*!C9,8(:)'C,H?!3(G8B(%/=/1)49>>@D"&&-H:=:$E77)=$00".6(3#41@4>2B**%360=H*,'/'$*1C-"5<3B.E)6F!2#C5A;5B,->C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1584 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6297 42 127M2I20M = 6444 272 TCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGNATCTGGCGGAC @(=##B%+>-?E6C$'B1*;/(/.+*C3)'4/.7.)$E8*>D&GF!'!1C,)6%?#6-(41&8>/@#6(5+8$EB01@';F1C*+*DB>1C+@ED9=-%;3B2''3,:?@A!5/*GGG>462=!.$-B=(-?>:'<"9B/($11<%&%' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:135A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1585 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4262 42 294M = 4262 0 AGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAACTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCNTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGNG 2E!H/H9C'-;'FC!;&*&"#DC#:!/5D%E!7B%$6E.<0*26:)@70(+A..(6,#A?+G?4*2.1!'!*<$<7#9(,H',(2;A;70##;&E).+;)*'@2H62<.4;@-(CF42;#F%*D"3(#<0*?8)C:G?-DH"(H)D4G=$#0,D/E-+7D4+">F:#%4.*823D>34-@11D&?3B5-:-2,+;7H;;CBA<@A-1A.#@?G3?4,+#*!$E:CB"A//FE="4B>B:!>$)(8AF9F%;'E$?D2C4/! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39T161T90C1 YT:Z:UP jpayne@0: r1585 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4262 0 * = 4262 0 TNAGGANACGGTGNTANTGNTAGAANNCNGNCTGAGTNCCTACG &#$"#(("%*#$*#'!#("$**%')$$'$)+*)#!"#%)&"!%$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1586 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16788 40 70M8D166M = 16788 0 TAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGT 4')#)/+"*)228F=*$9/B5@6G5/2H4/&!*<.0F"=4#>()4?<%&&&'A*F20,A,B7*7!"=(=G,,$38C<85B=<4)(#,4,HC1+H+@8>=0G80.,%%'.'A>GBF1((:=:17.3 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:8 MD:Z:70^ATTAAAAC166 YT:Z:UP jpayne@0: r1586 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16788 0 * = 16788 0 ANCNANANTNGNNGNTTAANNNCCNNNANCCACTNGNCATTATGATNG ""#!$$$$"$#$!$$#!$!"""!#"!$!!####$#!"#!$"$#!$$$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41785 42 65M = 41576 -274 AGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATC G%+DD8!1/(+8A0-:"-H?:3C>8:78-@21$A#!0F*?(G!)6;#E7+(C=&&H>! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41576 42 55M = 41785 274 GATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTTCAAATACCNGAACATC 77+0"-4',C)G::153F!>,>?7;;)(;"*2AA+C/@8A".>D);+4(@5?+,E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G8G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1588 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28925 42 60M = 28534 -451 AGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTG (&EF'53,E%"$HE@3%:#?<="/62HH--!)H@952!A*#F<2%.*<4:!?H'E-.)8-,B,4B-5>@4@;4<2,>41$H28G<)@;@@8<3*4HA*4"F,A6?E1A+8CAAF(%:(&G-0B,/4"9<@>))H7(+'#@B9+@>D)%@;7!.51%,F5!=H$<;$F&F<5C#211GBB))3=8.B&@,A:A"5)2B*G7E0(/F@@-!-07E&5H'HG.*H9F@*<86??8G8F-'G-H@:%7GB2-%%B&).&')'06:@00'#4=13@G!632,E'))?#+$&A7.*>*=;$"H/'E1C/,$B0G!(:(36-%$(-499302F;$@3CE(;D*#<;3D!5.3:'A8-#%$@;0?,1#.)2.E;1F5=A,?5&$H/33/0A).#=!D+E<5/44AA8'!8F#A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:44C81T10T141A46T2T61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3166 42 129M = 3295 330 GTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATNATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTT )1D#"!;*2H=%#;-F=2*!8<3(..(5D:;$CCF8H(,.A*6-#A3H&++%>?.@0!&50%@1%@*4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80G48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1589 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3295 42 201M = 3166 -330 CAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCGACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGCACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACA ?G!,&;F9+;&=,A$4%E.6@.31:7+)AFDA/82%%+8&.G'?'H:2BE8'%1G;3F;B,(52H+#6#%$6&G466"@%$!()"'B"/*6-8!=3.11?/;GFF1;?<7;&GF/<9A25:E>F8FG6F(''5#6&A-$?$#$D0;?B42*=(?D@G<,/%<9?/&4=D1;(-B>&3..)C2&7/&G9)8C72G&2+28G, AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56C18A26A98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1590 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6430 40 46M = 6208 -268 AGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCA "":*FG%0G!"B9,3451HC6.43AG%=#5#((5<*>3*,9C?A*< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1590 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6208 40 15M1I29M1I14M = 6430 268 CTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAAT "*DG:=E4B92(B$,34,$;H'D,GHA21%60"3==,@+:&=@%+5> AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:0G57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1591 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30516 42 47M = 30587 283 GTGGCAGATATAGCCTGGTGGTCCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGT 6;@%-$:#)+*;,:>2E/7(.)%:4A<&*-)F*7<@><'622H"F21'8-D8F(H4;16!0C,70,$:7"!$D?%93=4-28+)%":E0D*E(-$7#?>2(?HB:=$8?:7;<>-1F98(#+9E&7+C;62-:#GBDD3!51?(G9(#:+@#366A&!=/F0-9C$0!F,.@F;>@,DA$*9E$94"F9)623062+GF9(9-6ED2/-$/C*.CC;7.2";7.(C!.231>CE."@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:100C9T23C39A10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1592 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3149 42 68M = 3217 253 TTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAACAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGNATTGAC *<$>9C1&"4!'F*%,6'%(E7EG<;D1"B24.)&%20,&+7>?6,77GE?6B%1@$DG:;C,:#!#! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G34G25C6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1593 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3338 42 70M = 3408 195 AGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGGCGTGC 1BH4.GF+&C&)#:/0C:8)+E2):*2=0G$D@D0CG:FE7@E.3>;A%1B!='+#6E)AF:BE:10:GH83!9).HB4.*2.'+C0,0*#:CEH9%,#=A+& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G108 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1594 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42403 42 89M = 42209 -283 GAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGNTGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCT .-(*'@=)8E'9,:1:+5)!1=&/:!+0.-FHGE%/,E.7)/:FFB@-&!,,F8H&#E3602=$;9;9)+.!32)@5F'&07;A/!8(!*E<">>"6 YT:Z:UP jpayne@0: r1596 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8773 42 120M = 8646 -247 TTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGA A')=:"%.1*8A0=#7$0?=;<2/BH=D-1)',&'A$>D6"?D4G/E>=,GE-F5!&80#2EA:6.%!@+3-1-=EB"1>$B#6.18%!@=3)*;,@":?8/D1=<%E,DB)C<8/*(3! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1597 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41233 42 94M = 41327 253 TGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAG 8,%>H81*8E;5,31*@E>.&C"?1>4H><3,-?5)D0?(7BAC=*D*B5!,B-#)2B=-!>F9BC0;=)*1D/A/G;;0D4#1&(=(/!=B5A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1597 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41327 42 159M = 41233 -253 GATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATNTGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACNATTTCGGGCGGGGGAATTACACCACG H0$6%EH%4.,,4E.F);=A$G*@6>=F4FG()#*!<524"*C@.62:%A-)F*=1B8#+3$=04@.D8%#9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55A76C10A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1598 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34076 42 69M = 33860 -285 AAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTNACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCNGTCGTTCGT 55)3*8?#F:2?'*=*&D#@"%#(9H0';+1#'@?$B@9"!6:".4B/+*35C,'>95E1?21$(7+-5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T24C9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1598 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33860 42 98M = 34076 285 TGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACAATGGAGGGCAAAGAAG 0,A57HG1%)0"8#/)F<,:)+,)AD'*0!,AG"/1?!1'8E":E&;;F+(!:G"./,$A,37)911;#D(?7=!94.9B%=9"+9(7"#%'A8+AA/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82C15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1599 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27232 42 74M = 27101 -205 TAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATN &580*((<-E7C2D&;5$$?%"+7G.18?63?57'7&@%;'H(C>5H+'G&5CD)(;6%%:5BGD#+%;#$A>$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1599 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27101 42 55M = 27232 205 CATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACT @%'>2#""#G+1H9>2G2>>3;)-))E=F;CB#7A(7'G<%AD2@G2-9E35*EC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1600 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33499 42 45M = 33286 -258 TCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGG @&3:*4*>*69$G!E3C:A,78,-E($=/,'@'A;*'F$'">4B) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1600 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33286 42 100M = 33499 258 GGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACG 9G7%=,?3($?/38(*8-F)&B;&,(=$440G#;*5*,0&/24'2<<=.:2=91B;2>D++:8?'F7H3,@3B"23:7:?),*>D!=,5$3A+H-E9&1G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1601 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13788 42 189M3D104M = 13745 -339 CNGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGNAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGNGACGAGTGCGGTAGNGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGNCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGATNGGTTGTAAGTTACGCAATAACGTCG =-G#*-*+!?1B'>C70/.3'719F72&*(&78D-84$,&F(D*;%$H%;GD.9F,E<,@>.9>2)'4ED.@'.1;%9?+C#919H;89@$%/C$?4G3(D$G/#+"A+5H!D0=5,6B!G71E1+C/9C73&5+20:64:-?@38'48:#=E#0:428-7-=E1'6$*$$91!43FD7?-8AEF#=CC,-,?=>$((:<6%$5$$?,?E"/*858%2-#@$99GC0319E2&6(&$5(2=6!;'430-(<11:G'D5/)'A5?.. AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:11 MD:Z:1G107G67T11^TTA3C30C42G0C11C13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1601 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13745 42 43M = 13788 339 GTAAGGTTTACGTCCGTTTTCTGGATGCGGCGAAATTCGTCAA F*2,E7G/:F&5"8A2F=@#73:<*'-) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C17T3C8 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r1602 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12997 42 97M = 12764 -330 GTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCCGAGG *$)'/A:@'<(;*1G.1%>-95-<%80H*..@/;;$D%;1G,E,,4F,?-.+1*?&>"?5DE>'?*)A1&6='HB927A@=#1,B+F)$H2;.)A)< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92G4 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r1602 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12764 42 51M4D54M2D122M = 12997 330 CGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAG 9B:2;H**?7.):;&-9(9="$/,-74<=D-'2:1!-5A&-;$#;@=*252"#'1'04:H/<<(HFB85-=DBHA-0012#F=#D2#'$"+'>6A6+,-/B88*4627>E-75!),4@08'31,$*& AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:31C19^CACG54^TA84T37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1603 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2181 42 173M = 2382 246 GGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAA FC:;.&CC6.$>376#7$F@3$!H7+B/0GA2(74>;(4@A;@,4&.'<56(D-'(33DAD):&0%B4-+$-,0-D5C)!$'%1=,4:%2?>C/D0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1603 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2382 42 45M = 2181 -246 CAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGC &-H68(96=>,-C8-/(E>G6)FC*=,/0'G,"=>HG*AE91298 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1604 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45863 24 21M2I68M4D36M = 46004 200 GGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTACGAGCAGAGTCNCCGCGATTATCTC 8+1AC=<=?7AH/7-'51H*<;9B",-?A+B176; AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:89^AGAG11T10A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1604 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46004 24 59M = 45863 -200 CTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCT 6E-8B8"$:*(=B'=!?28*8%H?:(DB2*G/'$98+*74?1(/2&@*$$*=#E(8+A1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r1605 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21573 42 195M = 21809 298 CTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCNCAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTC 7$#;640$00E;8D7-H7!=(3*1C/!!F80EF6!(),DH=,0<*<>21,@6(<;%1?-;.),&95H;>H4D:,13<#!=*3;2%$*'HC"-23F$71DG8,0*3D3F4!CA64D57F7*/9H=F*+.C:BEF>3F)H<5>0CB)57& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G37T28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1606 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3019 42 55M = 3158 222 GATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCNNCAGGATC 5.:D9G:A/"+C8%'0B;'4!F";8:=1CFH,25"1-9*6?A+=:1>D%.86&+* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46A0T7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1607 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1333 42 268M = 1601 343 AGTCNNTCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCNAGTGAATCCCCGCATTTTATGNGTTTTCATGTTGCCTGCCCGGATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGNCAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCANATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAA )(($%%+*"('#!!("&)(")'+*!%%)"#(#&!%)!&!'!!&$))"((%+%#!&)"'#*$+(+(#(&)'+$&'&*#)+%))&%'')"&&*%("("*!+"))'!#!")(!$+'#!)%'%%)'("!$(&)+###+(*(+#*%)*+(&)*!%&*"'+""'"(*")$#&+#''&!&)%+&$+'%"%$%+!'"''&'!"#%!($%#*"&#$(%))'"))'$'("*"*"$$('!+$!&'(%#"!"#+)$'#&(&##$')&#"++*")$**"&' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4C0A52C21C20C33A23A47A60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1607 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1601 42 75M = 1333 -343 NACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCANTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGT 6"%'#.+H+-F603.=>,/$,4*H2>'6*86%:*EB-37.3CFCB,1D<&"D&9=!D6)E3!$A03"B;9&1CB<8"B/.H1)@+9*FB&;#?&-)7:>#<-4;/7=%:0# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A12A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1608 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9671 42 47M = 9889 290 AGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGGTGTTCC 38HFAA/*>5/?,;-5#+8@!%+;"H,H>4;EDF@"?/.40?4%#A5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28175 42 53M = 28243 172 TGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCA 9?H=9%%;)H/12D2*#%8(#4.4+,??$F:GG75:+&4@G9@>82FA<:4=) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1609 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28243 42 104M = 28175 -172 CAACTAGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCANCATGGTGATGANTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGT 9.55@7G2$3:.6!B-D:'+'8>26-7G;E"'=5/6!'2D7404C$=0/(F%1"H><,65?A..63B>B75%-!; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C43A11T42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1610 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16785 24 73M8D43M = 16642 -267 TCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGGA '("))$$!"$$%*#($#+!!!"(++!%*!&"$&''(!"")%!)#"))&%()"$+*$$**(+!&'#!%'$#'+")##$(""*$*#+!+()#$$&'*""""'*)*&%$+*'%*''%#& AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:9 MD:Z:73^ATTAAAAC41C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1610 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16642 24 40M = 16785 267 GATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGA HH)?H+&3$*-57H07E4'2C%CF.9356$6"-8:()=;$;"-"-EG>1F)"D>G+2)=!&36-8C'&%%F'-G*<')::0>+??7!D?0,$.A6+:+EGH.$C,*>;226>=+@F6*9&:62)'D#!E>F0/>-&D*'+3-E56;BF1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C65 YT:Z:UP jpayne@0: r1612 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15958 0 * = 15958 0 TGTCGTTTCCTTTCTTTTCAGAGGGTATTTAAAATAAAAACATTAAGTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAA 4<>.0:0.!8D"B@A(=@(D>EB3H>B<42?;!32$G+(6E@FH/HC#36#B75@6%(06C:"1>(E.32#0(#.4"=!E38*,7@#><6G9&G(.;*D*+#>*DBED#@+B/C.9<9"!7G.7B.=(EC+1';0C)95(0($E372(GE0:3$@0,9,F9&HE%0(:DG<@&9@!&;?#8-9(& YT:Z:UP jpayne@0: r1613 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26985 42 129M = 26837 -277 TAATTNTATTAAAATATCCGCAATTTNTTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTNGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAG B%D<=9G8$6A*;B'9<3"9F>*'#0'HB3;"246(554&3@A63G<8H+*4:<2/:(42!&?,/0#1&/.E+83-H34$;7D6@G9'C;/+#B5DD>HGED,@.+!HD>1@)/"32(-E&D/,-$0.4>#1))7604=/+/E"(0"8>'A<*F&+=30<=C5B190H4@-0.+)$@BH?@>/9;;%3&F?)<$(H.,=+;;$-@22E.6778AAFE)F'D,/HC;(*AE.'=);HD"B?GF)4HB4379,?)0=G7"5=!@84G/(7CE6C7G".*=CBE@?"03+<%<"784+E:>4G6,%.)B78G=D90H+GEH>%>24).FF%&!'@A.-G:/@$83>)?!9F2F: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A86A6C60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1616 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47586 42 58M = 47720 289 TGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGA /(*6,CG@5/@#*!7'8*-8'C*?A53DH'=8F0:-5&:*5.(BG/C$$C9G@7H,H* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 944 42 60M = 709 -295 CCGTNTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCANAAGCG !"!(!)#$$'!%#'%*'!$&+"!")'!%!*%")(%#&("$''*$%+&'!!)'$(#$)')! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G49T4A0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1617 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 709 42 112M2I123M = 944 295 GAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACANACCGCCGTNGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAANCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGNCAGCGACTACATCCGTGAGGTTAATGTGGTGAAGTCTGC ,2=A-G4B0",#*?'?G.#+:FED'E3<7:(>?#)*C%/"#7$0';"959)4<10?6!&)A9=1':<"4<9B<(B@2'1A6")7*G#>!'9@35@BE5"3A&8">7%#3*G$=F%3E=8";;*6"6;471BB(&$*,A5+=)FA0!"1,'E<"#)$GADGH9A*%+D:D>%,H1D=-F,0.(.#A"!'08>.-1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G101 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1618 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38070 42 89M = 37873 -286 TGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGA 0EB4(C)))"B?D#@)F@6*%2&*>:/(.5B-:CH+57%H3=D,=2,*!6*>+?<>48=A#'0&6=E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G12T71 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1619 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14126 42 115M = 14241 213 AAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAATATATTTCCCCTGC 9*%73/1)-/CG1BB!:=%86<'+%86$)1G1H<,.(,D7AF7/(=79?9G70C8"?9,20/)5?H)H88@-E*8+D"6->/#7)$)(+014:B0GA AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101G13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1620 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45736 42 97M = 45584 -249 GGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGAACGTGGTNATATCC /$8G58;).H:<.!7B/.=.$6>-=EDE?H#C,<'#(3595;1B=99?;,)>&D?A8&-)1-HA%#A%GH5)/:/<97&AG;'@-A"4+$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83T6G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1620 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45584 42 68M = 45736 249 ATGGTTATGACGTNATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTC >.@,(E4(>FD9)!:%DF.BH6=HG@*@<0-,E)C+$=;H@69<#?=%B#HH4$!(=D<*&4F/<<9A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1621 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36583 42 44M = 36583 0 TATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATNCAGGT ,6D8?5.*6*-96E)!?!<97F69!D4:"%?2",-7A7!4'BB634%3<:7"(45E4%8:"&5B?H3EE1--=8$$-G2#H584AG@:17)$3B56H,5.B-&,*3=@.41.FCC-)H5*!0B#:'3>*-D)H.4-97>4=9$E(#G"#FAA/,>!3-@**"! YT:Z:UP jpayne@0: r1622 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6910 42 27M2I23M = 6689 -271 AAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGG F81!3E!?4F8#<'<,&,33A,'0#+,A9.4;9H.16.2@.":>=,H,HH/5 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1622 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6689 42 42M = 6910 271 AGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGT 9,$FD<,)>0%-E(DE/6=3;;A?,)24+A0&((C4)GG=>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1623 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38464 42 55M = 38690 292 TGATAAGTCGCAGANCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATG C)?,;@B88(F&95H3#>A:%G7$@$>G727/EC6/=G.!AFCE>#,D,!6/;22 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1623 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38690 42 66M = 38464 -292 CAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCNG +D45:-%8>)+8/'4$5A;?#<;>%"2<8&D7/C/>76EG*A58677-A!B5C27)79$)(/?4$6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1624 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45784 42 40M = 45558 -266 CAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTN 6+66FC$4>'A,"-=)H<""8=&B"6603(4?9/&@C3&& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1624 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45558 42 172M = 45784 266 TAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAG '6+51/+?.@&,;)H7!3GF&"8.51:D%=,HA=@09;?F4?;2:)5+1/%*?-#B.5A;80+;,HC6&*=,AD=>&,2=2$7-HB.D1F?9./B!;#F,*HAA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1625 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36477 42 41M = 36652 268 AATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTT ;*%@%/D<<%CB0/-'%;464D9"*A819>A-&:B5B37(*C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1626 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16973 42 51M = 17024 308 GCACCGGTGGCCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCTGACCCGGACGCTGACGC .890?:';F%/9H94('':)$):0F9<)@1=B!7B>GA0@E<;,1'0+6&0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T22A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1626 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17024 42 257M = 16973 -308 TCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGNCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTG &#$&*"#$!)*)%!)+"+$$"$'("&)"$%''')""&!*(($*'&'"+)'!)##!&##*"+#"$$"'&*&%##$((%'('!(!%'!*)&*#+%+)+#'!")'#&+#%*$"++$*(#"#!""%+)*+++&!*"#!'''!%(#$&$&$$&'&*!")%$%#)()&"'!%')(*")!'#)$%"$)!)!%*$&)(#+'$+##&$&&)&%()&%!+''%')&$&%$+*$"!*&&"$#(%')%"$+*()()''"&*($%*#+#+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:181C75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1627 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16678 42 140M = 16620 -198 CTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTAGGGTCGTAATGTTACGAAGCTGGATGCCTTTGGCTG %>)27F'C&;3$H#"(:*7';5,@#-.5,;>"!446)"B.?D)8G&%>8D>"-(G=1-(C5?95*G@;$&)D6.9F@7&4=<("-(E(07=46"@(4"0./2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37T66C18A16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1627 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16620 42 58M = 16678 198 TCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCC !:2+%)/C(@.74<3!@6B#C7.B6A-82=@';%,0';0#F/%'>E@13&!;0>87.4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C33C23 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44611 42 91M = 44422 -280 TGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGC !DC;8H'"53>"'D'1>$8#!8!6;!,?C=D&D23#<#/2*7/&;F$61<:>=-?"$816..3F(E%:<)!B27#.+5?2?%;@?)+"&BC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44422 42 54M = 44611 280 NGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAAT 'A&)'59+BGB/$&GFBB-4?5&B2@/51A*6&"4)C$52@,'$)7;>>-4=AE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5792 42 297M = 5591 -498 AGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATGGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTACCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAANACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCT #+)*+'"&'*!"#!+$'""&("+(&!)'&&%)"#(&#'#"")$%$!*("($"+)#(++'&&'$"$(+*('$'$!%$#"$()'&*"%$!#%+$"''(&$!"!$&%")(%("#)#%)''(($***$"$!*%*+&"#++"!%#'!$+*(%*#(''!&$(!(*$$)"%'"*"!&*#&"%$"('"#()#!*#()(%++")#)!#)"+)(!#%!+**)+*+#+'+(!%($$#&'!!()++#!#!("+"')*(#(*"$+*"#+!&+"%$()!!$)""#'%)#'%!%)$!#&**&&#'%"*++)+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G28T158T50A49 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1629 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5591 42 201M = 5792 498 GGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGNAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCGGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAAC "7"45)"<6.+#,=:;4+:4;H);77B!A8&5$5"=!&?4+0%%'+0=G(+#;D5+DA5F41693+(:DC?1!#"!'+'%28B/*'=969%*&)=#:5;)/*!GE<:!*5<"8)GD/>C(/@A'F8*.8>.E8+,)D?:.DACFC$00(:H''1#;37"6)"07GH3(-G5H.#H=,(%=.>!*D;:?..'02@?++@<;% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C93C35T70 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1630 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3738 42 47M2I194M = 3979 282 AAAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGNTTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCNCCGGTCCGGCTGGGAGGCGNAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTNCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCNCGTNTGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGC ''E9H0'96;0E&2C6:=37=F8&+-)HF(,A5(,&(7@?277%:=F28:=(%/BA$D@HD@%+3;30:>;$9>(,6;8;-A!/3AG,>@9>3<8(1"14*+0-9F81=3($=1?5*H$%H65>3>!2A& AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:0G0G26A31G19C39G81T3A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1630 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3979 42 41M = 3738 -282 TACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTA 2)99E#/EG'G57/'&HB<7&'$/&=(C=0:AH5E0DB"35 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1631 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46364 42 106M = 46209 -261 GCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGANN GG/1823=*E02H"FCFDF;5>&%E=E8947:/E""89%,(?9H18'7<"0E$,45(*E=)!31/&F2E8!/F40?B8&?+F-'F47#'21?3*14,3>90*+(@67%;#G@:==$2@>"@"#49>FGGD-'%(C.2G7#;= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3734 42 51M2I19M = 3962 285 NTAAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGNTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGT &%!#%%**+"+!$"(%&+*'#(#"(+()!%""#&)'(#%*)#!($"+*!"()($+&%+!'&'(%!&(!'$*$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:0G1C25C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1633 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29647 42 81M3D95M = 29540 -286 GATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGCTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTNAACCCGAGGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTNAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCG '@#=6@8B2"+F&(H4'B:D8=!16!:8=4%+94E2$$*2;4(9+;30D5B*4E*F8"C=A;,G.:8FA>((C):4D'#/,D.)(3;$G;9*#&)8E6!&)@0!+.#8FD8,!6!@=:GH%6#?B%B.7&5BBG@;F9=##;":G(+ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:60T20^ATA5C7T47G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1633 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29540 42 107M = 29647 286 ATACCTTCATCTACATAAACACCTTCNTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCNCAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATT 20@!>!CG(C";*E$%=?.0*/F>9?A;3,?+,G%::7GBFE47>G1//)-9F?;EG/15+F@H#3(=E=?HD-5B!*!9$237.$;42@=40=F+#!1A%7,#(@" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26G34A45 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1634 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22709 42 128M = 22853 204 CACCGCCAACTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTANTTTCCCTGAAATACAT ((+%)$")''+'+'')%#)*$%%+$#(%++&*+#")'!!(!!!**+%*%))!"+'+((!$+('(!"')*%(#%&(%"%+""*"'*(**""*+&$$''%+**)&%#'&$'$%%!%&"#&#%(*)()("+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T101T5A10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1634 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22853 42 60M = 22709 -204 AATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATANTTGGCATTNTATGTATTGGTTTAT "HD58>?(0/35.:.9C(F75$7"8B@3CH2?8,2/H:.,*$"E)%,2>?3+)B>DE,(: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A8G15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1635 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45257 42 87M = 45387 197 CCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCAT '0A'?3%-#&D;@-GEGB@*F)(4.A'<40,F.1&+09?A/$G9H1G+H1"BD#.146C??%0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1635 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45387 42 67M = 45257 -197 AGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTAAATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGC ++")*'*$"#%)"*!("#'%#(+!#+('(+''"(#)(&&$(%)%+*+%!#(+(!(*''$**+"$+$% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1636 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24313 42 54M = 24367 397 GCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCT ,7,G!D!-#EB0)5=@;3)=,46(;="1>)(AE#!$:,;)(84;8,D00A,;A7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G47 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24367 42 343M = 24313 -397 CGGTGCNTGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTNTGTAAAAACAGCCCTCCTCNTATNAAAAGTATTCGTTTACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTNGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACT B253<+:.+="33,8<4>H3%9@=.>$A)CCA0>"=)G/;CE#-H#.D7)B2!7(@4(.@74?H?!2G0B84H610%+,'F*2.;3>A#'"-9>.>6!1.234?9!74=HG(D5'?$5B@FDA3GEC;@<=+A==9B@@%!BD30A#@"A2/B7GF?8HF424#&--4510#)<(H)6&,5(>.%;.-:%7%<;#%1;87':#E#8:5A9'**>(*(A<'>-?2@;A1?E#@0DD*+C8914!:24?G"B7>,46.@"2'0$AGH,9D+FC:#/=G)>B562B)49BE=H;2)(A.5%*5,B!.##<*$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6A55T19A3A13C179T62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14841 42 64M = 14640 -265 ACAACGATTTNGTCGCCGCATCGACCTTNGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTG .B*'C?12!$9D01&AE<8$E3=;0D)%%&-0>#@?%B:0!A"/5B6-AF6&,("@+<+&74D? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G17C35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14640 42 164M = 14841 265 CNCAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACNCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCNTATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGT ($;!/)(*C83:ABB41,AE'79E5=@5'+&*$,-1/8D)2(*?@E#5(FA1.'.<1F1%37:3D>1)9,+.1.,03,#C37)5445C40,;AE+#106?>;:&>#:5#2.-%B8:D#'19,"D.(/+D>F76="487,>B#3#(&9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A51G36A73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1638 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31259 42 118M = 31183 -194 AACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGACGCGTNATCNCCATTGNTCCNAAAATANAANAN "+#$(+)*&$&!)%%'%")#))*#"%$")$+&#"%)#"%$"!+("')!&(#()+!#+'!#+&*++)!%$%#)&!)"!#!&*(##$#+&(!!&&&#'%$'$'!)"'#"*$*##*')#$! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:85T4C3G6C3C0C5C2A1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1638 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31183 42 76M = 31259 194 GATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGAT 1-53&#D;#>,E$E(?<:9(/3'"/=B&,A#CFE(CC*E&2C":%'*"-".=&#?*@B',8B4&@+C!.0F585<' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1639 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22243 42 47M = 22406 214 GGTCCGTTGCCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATA '+/./21)C78>&%5/>B)G*,?1="A3D=FC1?@%F5'32F>8%@* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1639 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22406 42 51M = 22243 -214 CGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGANACCT E,-$;&-H"&F4(*ACC.&;E2:G'!G(BE.AHG8H&'4><$C..+F<76D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1640 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24813 42 68M = 24900 210 TCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGACACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAA 5$D0#$@*(1(6=3*=72$2D.!G"*.6,)!&$E@)!"6#$A!9!0<$/66D,9:;?3G?.(,9,*%,F8.@D<(8C/@)0;@*4D>#:+D'?4A*D08.G+) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G39G20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1641 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30909 42 106M = 31116 316 TTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCNCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGG '$+)!#&!"&%&)%(&)#")(!(!&'"#%#)'#$%)!(($#"')++&&**&%*%+!*"*##+$"+$)'!"*)*$&)+$*%&$)($+**!)(%++"$*(($%+#*&$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1641 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31116 42 109M = 30909 -316 CACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCT &:$C.4=66:4:$'E@:!F97/(1-F-.7F@9-G/.-".$6@)9"F=A.1249B@9?0,9!A7F'/?96*D+@!8B-,-0D705=B7FF1/+-+"# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1642 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17272 42 70M = 17342 257 CAGCATGTACCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGNCGAACAGAGTGGCACGG $+!"'#()#$%&!$*%$*#!"##'!$'###'"(+)#)&+(#$##+!*!!&!$'+!#*"&")##!#!*"(& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G43G17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1642 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17342 42 187M = 17272 -257 TGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCCGACAGCGGGGAATGTCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGNCAGCACGGCCCGGACGACGGA *2%3>83D73(!'#%'"(.*+G: AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52A13A98T21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1643 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37540 42 61M = 37818 346 NTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACA $3;D?)*,%65C$;1&+7@"?%FC;7F40<-**$$G#+#85)1$-7H/)0'"F(1C?5GF= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37818 42 68M = 37540 -346 CATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATANGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAA D'C=@*0EBA@0;EFH0'?G&-(/$B5(>BB7E9DG!6.'@8F75?%H+' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29A38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1644 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31985 42 95M1I387M = 32467 679 CTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTNTCTGTTTCAAGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTNACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTTAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGA 32B2*3/62$H'1)B)!(;GC->5&GB,<='%7'38&A-'$:&=40)"GE$--"F"7:C"!-065<%?B7>9"?,"93=G!,7>>>'%)$0!(%5.***<+)H.6877.?.>=!//:9@A'!3?;-F4A"!,"F-/>*@EG2)";2%4B+&&07/-6CE;03/3CE.+-D=3(H?G?#H92==E+&0:'4@G:9+H97+)#C.>C:@!848!D/22G+!!EFF#(B=.7+@5//;@GF;F!5!4)56%0$;92<%04B*<+H.+&B20#E+2),$8+<92B8&3E=#E'>0>D=9'%4@0&E$)HBC,E&45>=D*C@1*7'A$B%$<,E!8DH8-(:F'7'H%&5E1D)6@&951A+"(5F!;84BE9@'?8'9#'!2$F!/G'26,*:*=):F@0A36'$%D"7&29(* AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:68T9G22T272A58G48 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1644 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32467 42 197M = 31985 -679 TGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTCATCAGGAAAGGCGTATATTTCTTTCGTCCACGGATTANGGCCGAACTGGTTGGCAAC AA@AE+;3D#8%3G;!*&<&"AD'<;&*D:"D60?!EH6-02('B7%-H,%F+4H&--CF%=04-.'4=:!FEF;:6#=,5?(<1&FA&>7@H":-639!">$'%G6*G>;)38B3!C)4A5D%%#4":%-FBB%)4?33$*/B>=:.@4,-9.68(E810H"%D==G6,E.B8-::479=3#EC!?G<5$<7-E*B AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:139T15A21A5T13 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1645 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24463 42 106M = 24676 276 CGNTNACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGACACTGATACATAACTCTTTTCCA )*%&&++*&(%""))&(('$')$#''##(!'#+#(&&(+&+)$((('$&)$)%+"($#'*"%)+*($+%!%%%*$$&!()#$(%)*&')##&(!*(('"$#""!)) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T1C77G23 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1645 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24676 42 63M = 24463 -276 TTACGATAGAGTCTCTTTNAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCACACGATACN *&(&!'!($$(!**'$)*%&(#$%+&%()'$**"'*!'%+$"&$!*)($&(!'+"!'!"#++! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6A5T5G35A7C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1646 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4251 42 87M = 4379 210 AAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCCCCG "4&4.A98,F;D9--$""C&6(6>-&EF4@5328-!4@6'&$"9@!77$2-01&/-#0C1?72>B7@>&*1+&3+95-9?;&#'/1" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G82G3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1646 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4379 42 82M = 4251 -210 TTGAANCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGAGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGG >7B9G4/2A,8:.3,/*/#;:)("*G-$198DF1*F/,14H+F?*D<1D9H%53,/0DD(2(3:A$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1648 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16903 42 44M = 16711 -236 GGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAAT $+)HB/9G-34#428,0=-F7,E&7A$7<7';*C'-B%7)EA8H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1648 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16711 42 145M = 16903 236 TGGAGTGACCCGAACAACGGCAGGGAGACGGCGACAGANCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATNCCTTTGGCTGTACCAGCCGGNGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGC ;)E<*#.H;9>!4H5&:C?<"CAG<&3'(:10.E;$E(,?0(##/E84')#<2?09A..AAH(#0!EGA*+G6.6;0)0';71.&C@::D+:FAA7F3$&&A-$A!)D2$*0.:;68,:$6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88T41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1649 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7785 42 73M = 7655 -203 TGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCNGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACN $"#(%')"#))(%%+'%''#&%+(#!'#%$$"+%&!"&"*+#"%)&!&%"$$)%"#+"%$!+!+)$!#(%(+$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C43C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1650 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7398 42 101M = 7516 225 AGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCGGCATACTGATGCACTTCACGCCACG /@,/9G!720:(7*:0G<2#9C$9/-C?5:EG6048H6/0/>'@*,:03&0-0/'901DF'$:/CE(E&(-)0>$)"@'9:34!2-B490)18/39<&@*C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1650 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7516 42 107M = 7398 -225 ATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGANATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTN ,="C/+0%!$?>(C0H3&@>2442@#%FA73,+?5!3!(FH&41&1%'A$F&#!?:G$<5D>5'E8/7,++8C;=?+C0*C55$'2?0+.0( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51A54T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1651 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42959 42 275M = 42875 -359 GACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCNGAGTACCAACAGAAAATCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCNGACAGAAGTAGCNCGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACAGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTTAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATT ?HA2,8$:'9EH5HBG5G8.A)D;;:?<%9.=E:-/'0H;?HA8F",20+/1/6F"F)/='@C>:C/=#)%;+68347D1/3<7!-"'F8(=<$%>$%HG!:3!69%5C/2C57!9$2F95:;#$.G1&8'EH*3G9@5H,&$H33*HB7(!1F&8$="6GB3GE6EB.0D,="/,BBBFF2#+.A6A!7%E'EH.56E$F'/( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:30A15C89A12A26G47C50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1651 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42875 42 84M = 42959 359 CGTTCCNTAACGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTG B?/"<.:B<-$H0/1!08/;$C>EG9@$)88&4*%7"-+7A!%%;<"71!$+B@0F#)B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G2T74 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13642 42 112M = 13782 246 TGCACCAGTACGCNCCCCACGCTGACGGTTACTAACCTGTNCGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTT 07/C1F?049?EF>)57/5;1:=EC%257?(GB%D<<@/B!$3'E6"=69!44!/'7#,3(>/2.GE;.0&F;+%,)G/:48/F7&9&F:8B!3$1@<)2):2B)8)1%/54 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G12G16T9A71 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1652 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13782 42 106M = 13642 -246 CGTCAACGGAAACAGTTACGCNNATCCGGNGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTNTANTATNC %"%(('$#*()%+"%)'*+&(+')$#*$*()"(&+(!+#%%+*!""&#+%!&#!%%*$)#*#!)#))$!))+'*'+('*$&'$&"('$''*)*'&$+$"&!("$&' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21C0G6A67G2C1G1C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1653 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1952 42 134M5I67M = 1910 -243 GGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCNATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTTGAACAANCA %'#!"'''('&&'##$$+)&&++*(&&&!'(!(%($))$#)"'!!+#"*"#&+'#(&'"$)(""+#'$)'(&')))#&$*'&!&'%"!#!(&$(&+)!#%!'!+'$%&%('%+#))*!')*%*'"!!+)&*%##'&#))!)&+*%')'#*(%*%!!)$('*'+('(+$*&+$#)$"#*"'"++()#'+*#$)(!(+"$$&)&(!"( AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:90C80G19C3A2A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1653 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1910 42 42M = 1952 243 CGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATG ;H3A,BCB:?(/=D3.BHF"$&:2%C3+#&HC-HG(1@?1>= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r1654 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30777 42 68M2D63M = 30659 -251 CCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGGGATGCNGCGAACGGCNT %'&('$"+!%&$*!*"#')*(")*++!!))"*"'"%%+&*+'$*$%++'*+)&%+&$+)+"('&#$%&'#$'"*!*#%+*($"$)#*"*##&(!"%$+$"'!&!$*&&+*+%+#!"*$&!!'&)'"&$&#( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:68^GG45C0A4T5G3G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1654 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30659 42 88M = 30777 251 TGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGA >7>(*<;5!=:%A,':C'"E,C88";7'5"A-%6B&!E)0G&$B:;.+:.-!%(EB71H,4EC%+%>=B><1@)6F!7:=8C0G!18> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1655 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9020 42 6M1D124M = 9201 246 GAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACNGACCGCTGAGTCCTATGACGNCAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAG H#D204,DA,4>*#=E@B95@CH9+&&4C%;G%F=E,8$%$D'D7?C8'''A@5@+D&*E8:*'7;)01(0B""<&48B=6/1D<.D!>4D9FEA+?5$009-E6B%:16%-A7+9H+37/&@6#A%C6! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:6^T76T20A26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1655 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9201 42 65M = 9020 -246 ACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGNTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGA EA<5F*:G:(G7);3BCD5$A$*(3.(G57339B3(H5+53GBF$6,6=9=6B'/+F2?0+6H=B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C25 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1656 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3269 42 63M = 3503 278 ACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCC >FD/2$!+25(D'/6*A86(9D55++D#>,E5'A"'*.$8;"='5<$<>5<)$7+7*C282!9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1656 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3503 42 44M = 3269 -278 CCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTNT 6G+5"&$G9,F/6)B9>B8,28D5))FD;)7G8";4%>,@&F!% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1657 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8925 24 59M = 9017 197 ATGTCNTANCNTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTNTACCAAATCCTACAATGCCGGT &)((*$$"&("+**#'+*#!*"$#%*&*#+)#'##*')'%!'*"*"#)#!%+$*")%&% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5A1T0A1C25G22 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r1657 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9017 24 9M1D95M = 8925 -197 GGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGNCGAGNNGNAGNCNGAGTNTNCANA )$!+*$''$&!"&"!!)&&"+%%!$*"&(*'%&$(*!*%$%(()!+&'"")&'+!$+'#'*)*#'+(*'()%%'&+$*$&)#(&!)%#!!*$#('$(!%!&#$' AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:16 MD:Z:9^T70G3A0C0T1A0C0C0G1T4C0C0T0A0T0G1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1658 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2879 42 68M = 3099 268 TGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCG /.G95!*'/-@=C&F'$&C/F'>'HH/?8986A&DHEH0>1(E6'$F00<33#G3H<84<3/+H93,- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1658 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3099 42 48M = 2879 -268 CAGTCATCGCCCAAGCTGGCGNTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGANGC !&&")#$&%%'$*%+!+!+"(#+#("%+)(!(+)&$!"+(')'(+!'$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C23A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1659 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26808 42 41M = 26966 235 ATTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCA (@"H7;D/0)/<&GB*'99%F!'7?2:3?!3DA2@:8% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1659 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26966 42 77M = 26808 -235 TCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATGAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACNGNNTCNCTCTTTTGNG &$$$%!+$++''$(#!!!##*!#%)#%#&+&(+#"&%'")!+#%)!)$$"$%++#*%*+('+"#*#%&%&&'"*"&& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:28T31A1G0A2T7A0A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1660 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19997 42 51M = 19798 -250 CGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGA 05!54-&E#5058CFH..9=*$3?AF@.#)@>(04:4!!84E706$2'56C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1660 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19798 42 141M = 19997 250 GNANNGTTGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATTAAGATTCACAACCGGGGNCGCTGAATGATTTTCTCANTGCCATGACGTANGATG %(&$&+%!$&&#%+%)))"#$'"#'#"")(*%'&%$&##*#%$%%"(!%!+*#&)+"#%+&!)"$)%"$*")"++")#!##+&$'++"#%$!"#&)&&%'!++*%(+$&!(%(#'!*&+*!*"#!%'!"+)+$*'$$#&(& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1C1T0G1A79G17A17T0G10G1G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14338 42 238M = 14195 -381 CCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTNGCCGTGGTGGNTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTCCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGGGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAAC >'8.>B6H<2.1>:C7GB+GB(787%)8>)1;8!1*4G*'>AFG+5317%2+;5@1#@7?$%)-BAA?.'4DCE04+C39E+2:4'-3@=%C1>!2"-(5.F7CA'*96E9C'".6/9,%<77"F%+BH09%G9;GHC4B%6?:+?FG,)4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:62T10C37G34T91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14195 42 143M = 14338 381 CGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAG ,F*5F5'(E!E9C>3;!92B4):11DA1G$%(!8"C86"*)0H&C2=9079!75(307:A@B";1-%":0!G7;*"'78@/$!8E%718!23>G-/;5!$>,&4:0&8FG?H$C+0&6)1H=A5>-&@>5E&.3-HA)!*?:@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:143 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1662 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28017 42 58M = 27813 -262 AAATATCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACTAGTTGATGCNATTAGCT $!!)*$%"!%)#)!)(+)(+)*&*')%$"(#'"%($(*%(!')"&'*!#!!$$+%+!" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5C34G3A5A4T0G0G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1662 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27813 42 204M = 28017 262 CACTCGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACNATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGTCGGATCCCCNTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATA (")'+('*&'(")(**#%*)&"!)%$)%)'"*"+##"+!*&"&*!+"(*!$'+()""**(#")+(+"%!(!*#&)%$+('&*!!#((%$+*"('#(%)*!"&&#'))"!'('*(&'')(#($)&"$#*!&**#$"&++!*+"($*&#+(('"'!)*"+"$+(*(%+'$('$'*$$%%&+*))!$%$(&"+")%+()))&+#+## AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T1T1T38G113G9T36 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1663 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6742 42 47M = 6516 -273 AAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGNAGCTG -$G9=3*&)<6D21$9(0')-/0-*8E9$'.E9?F:67DA-+(E$$"A&E/84) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1664 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16095 42 54M = 16095 0 GCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATNTGAAACAGTGCTACCCGAACAC */!8H/DE+F3E'D="-.<+=4/"/*%9=7HEC!G=8&>&8)1*35-.*9<>C/;23+."* YT:Z:UP jpayne@0: r1665 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45987 42 125M = 45987 0 ATCTCCGCTCTGGTAATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCNTTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGNCCAGCNCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGC 03F?H"'8/#5030&"1'H5!)5&@+1>H23>,%"6@?,-8*4!$&#A$BE/)&@7-A@=C/"'>60'%?2;%E":"1>H*0$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T37A29C5G36 YT:Z:UP jpayne@0: r1665 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45987 0 * = 45987 0 NCNCGTCATCANNNNCNNTNNGNTCNGNTNNNNGTANCGNANGNCNTTGT !##"!#$"#!""$"!$"#$#!#!$!$"##!!$$"!!###!"""$##!$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1666 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41992 42 244M = 41944 -292 CGCTTCCGACCAAATCAACCNTACCGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAANCTGCGAAAACTGCAANTACCTTCCAACGAAACGGACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAANAGAATCTGACGTNAAAACCTTCAACTACNCGGCTCACCTGTGGGANNT *$)"%%!!)(+&"!*%'#$"%##*(##!!")*%&#%((+'""&&((#!+"#*!($(#%*!&'"&))#*(&&("$%&()!(!)!")$#%+*%%%'(%#)%!)#)$(*$$)+"!!)#+(+*++)&"#%+)!+)+%&))&)#!&&"%')*(%%'*$"+('()'*#%"(%$!+#$)*#((+*$)!''"$+*$)%!$''%+(!+&*')*)$%#(+#!&'"(!%#%%*#&))'($#(*+!(!)"'+'!!! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:20T3T107T15A17C28A12A15A16T0A1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1666 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41944 42 18M4I30M = 41992 292 AGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAGGAAGATAAC :E1*H9?@6;)9?7D;((25<1*A:C9?B"-$?$FC/4@D#?'"A+9.8&9F AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:38A9 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1667 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27871 42 63M = 27871 0 TGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGA !'+*"&(('#%+$*&*+#%##"*%&%"#)&'!!!*%#))'($%*'$"#)%!!%'%"&!#''*+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YT:Z:UP jpayne@0: r1667 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27871 0 * = 27871 0 NTTGACNANNTNCGCATTATGAANATGCATNGNTNANNAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCC !*"!&*!(!!("!%**!#%&!#&$%"())($(!(&)&"'%+('))%&!++#&)%%$#&%')! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1668 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42909 42 69M = 42713 -265 GGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGANTATCGATTAGNNCNAN %&&*+&%)"#'*'(*%#'"'%"))*&!+"&*$*%"'+*%)$$+++%*%"()(&(()$)*!'#$#'*$)( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:52C6A0G2T0G1A1G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1668 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42713 42 135M = 42909 265 AAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGT 4?3"-$F#DAFD>,D8&!G@6.1-H)-4913BA/)*:%6%-/@5AE5(3-FC62"%;1/C2$03A486%<;&'>>1564*H897H!:A+C#F;9<2H.>@"=/,38&G-D1B$C42A$!$6/>?@D<3%7;>0E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1669 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17331 42 80M = 17523 264 GAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATC *8:1;;7(B4E>:;1H2=?EC&D"@C-/(D$%7>637./;;9&1/*/(&*D7@-8%?>5>*F@$(41#:B?A!266)6,) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17523 42 72M = 17331 -264 GACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGC 5F95@2E=&-"F713A7$;E;98<==1B,B:/4H+%$&8&4B.F*D>>0!(H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1670 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28766 42 115M = 28601 -280 TCTGCCTAATCCAAACACTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATNAAGGTTANGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTNCNTNCC &*%*'$))&*!#"))#"#*+%+'!!(%'&!%!'&&%)*+#)&+$!&!&**+)&&&"!'("'$'&((!$"$#*#%'#%#$)'+#))*'($%#'!&'+*"*"(%(%+*!+#*"#$"( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:16T51A7G31T1T1C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1670 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28601 42 165M = 28766 280 CTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAATTAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTC =BF))%;?-&>EC?.;-#2H0#AC+4)3#7-,A/&E'@C;"%+)0:8&#'=$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116A48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1671 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3973 42 100M = 3878 -195 ATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCNGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTC 90+=9%#/+1D@F='=1-$0;*G!%'!E&!=3H#=232*G?:+.%*3!HGD/+H;6.A!D<'="$'@:@@%;4E?.@6B'%?67)(2%='414"A7":#8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1671 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3878 42 87M = 3973 195 ATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTNACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGNTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATT <8E'D%E1+C,-&C8;6:.9A=#>A8G>@8<6?3&,9.1:6&4C$2H1AA3-@5D"*=)/*E.7#*&%F@.D"1D&'+D:7*<649! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C25C33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1672 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2996 42 54M = 3148 217 CCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCA 33$+C==DA#..%#7GG#7-@7-94<5&;C$"B4"),6?%4/#1C.D0*C"45>BHB9H&B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1673 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34333 42 85M = 34165 -253 CGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCA /=5&?;/63B%=H%05*D6H(-H0A;6%'-BC@*H,3*:8,-&%!B1D*7:F&,8;.,(#'.C=-%A@"=E6$EA5+14-F,5+1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1673 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34165 42 129M = 34333 253 TTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGAT H==758E??#+#1&&&B"E9C4&GA-6B3+(;H3,A&/E6'H@4,F=*3EE"=DH**);1F8;=*B<8'-!H8*14-)F2$F8@!B$-@6B7BE?!7F;6D3)1)1-F2&(0B7&B5$%E3-A?+3&.@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:129 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1674 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2664 42 130M = 2794 306 GTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCCCTTCCCTGTCTGACCTNAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGAC '+%!!"!*&"'+()*$)'!$!%*"+*$$+$+(##"'(#!'()%("!(#+(&$&!'!##"'%%"*+$$)$(#)+)$()*$$"')+('#+"%"+#"+%('%%"*%!$$")!&!*"&&)''%!#$$*"%+&#% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80A5G10G32 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1674 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2794 42 176M = 2664 -306 CGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTANGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGNTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGNGGAACCCACCGAGCNANNGTCN $+!!(&"!&#+)$$*$$$%&##'%*)(%&"#*!)"+'$%!('#!#!+)+%&*&$**!()##$*$&'*#)%#%"$+'"&(+"*%+"$%*$#"!!($#!*$#&+#$'$!$##)#*&"(!!!&)&'&+!&)''#)#(*+''+)%+#(++)*!*#*#+"$(%)&%+%++$+'#%!!*$#" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:43T65G43T13T0G1A0A2G0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1675 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23055 42 151M = 22957 -249 AATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTGTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCNNCCAGTTTTAGACGCTCT B5H3B#7F**C+D.3%+3;6;5)+B6'.#2:)9A'&34"A"$!>+F3%F/DC;/$)&&'&EEA2(++F2H-7D7F9C4FG7+00;$$5G#;G8+:F6$;C.$::H9%($2C?%07@+8";;/>.-=@#(9H613)6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69T62T0A17 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1675 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22957 42 47M1D22M = 23055 249 ATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTNTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTT %/*#=?8<)1.F@BH)39*%E14?<;F3*9D/:5#5?D79+-8#,9?('0-6&FD31-=@,D$B8)#$# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:32G14^C22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30181 42 40M = 29902 -319 AGCTCAACACGCAGTNTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCT '9B!.$?GA#,#0-:?+C3D('@%*(8"6'4H,&7F0.3: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T24 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29902 42 279M = 30181 319 GCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATATCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGNCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGGTTTGATTTTGCTGTTTCA -5$C$0A(G'9%79"+4;2$$1FC@&G&F+?#4C>620H>*30,49:.>2&&8=G'6E2*=(7&3'H:9%"F@;AD8?'H!B'.6>>&$/B$5/A;*@6D:>>41=8**:234G$FAA'"+1))F@)!*G$%252,;?:(>)G;,EF;D#465A9'.@,-HE@E:H?.;0D,+:<2134#*+;5+A�+3B-+&&4)@:3*H#2-*7%7A-F-5'.<'3E#*5#-4(=/F"0&,&C4F<0992CGDG/.H$,&1>9)%)HD2/=*?3H(@0E24CA<8,:B#>&>:#53H*;HH"&%5%C,GD$=( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:97^G7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12683 42 61M = 12541 -203 CGGCGCANCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCA +8?<","!4D&!'G)>-AF+D281:(D+)"97.1B><:$"!5:#5?CA*/!>!/-0#.*2* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T26G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12541 42 47M = 12683 203 CNGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGT %%&&*+$%+()!"+%"(##%*+')#"*!((++!&$+&+#'+#"&%(% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1679 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8635 42 57M = 8434 -258 CGCTGTTTTTGATGAGGCGGACTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGA 8$A01DE-FC.E:DH2,!4,E=H,"D206@#32H%=50;4A40=D/B/@0C5,)>FH AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1679 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8434 42 46M = 8635 258 CGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCG 9*EFC(;03+'2B(A@07B0C3!-F+;297$F0$*?.+3;-#&E:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1680 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25041 42 88M = 24874 -255 ATATTTTTTGTCTGTNCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCGAGCGGGTT "F86//20/;BF?#->/D#F)>;8?)+9//',7F.#G(B'"B#.(H10!>0!1:,HF;.+?-!./0+&;=2$70B2)E:+6.HC"7B: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C63T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1680 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24874 42 54M = 25041 255 CACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTNGTGTACCTCAT A(,2G;A)?0%(<6&;8"1#D%F%A!6:=%>86F=+0C*E7@#'4;'A!>%GB.,CFBC&195&-H3(*(*0#-7G.B@>#:'8'?=#,>?9?6FB1A?CF$E2;&$:G-%"% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1681 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18084 42 112M = 18291 285 NGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGTGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTT !'++(*(#&)%!(!(+!+#(!%&#*)!$('&(&'!!!""$&))*'(!+'%%$%#'!%*"*!&+!$%%)!)%!"+!)*(&""#&*(#*)*#&*+&&$)"(($(((*"(+'%+! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T22A88 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1682 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37424 42 52M = 37218 -258 GCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCC "F'>G"G:4!!,#8//"?H*%/&G$8>%42A>B;E@@5&$6@&+05810"*5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1682 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37218 42 43M = 37424 258 CCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTAACTAGCG +AA(0*1G*D'34H9G)6,612E%+/G+*;7.<==9H$?(0;& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1683 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43289 42 67M = 43080 -276 CGGATGCTACACGAACCGNATGAACAAACTGGATACGANTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCNT 2999#&B,A@B>3%-6F?!H2,G=#$:E9*0F18!@$'8+HH<89B-%%:5?$D8::$%#6:-,?,@=+/3@$@)<28>"BF9C:C2?D:'6/+<3;6F,E$:FD"G.@(H>'%"B:,0?<<2D:<',4? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106T3 YT:Z:UP jpayne@0: r1684 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 65 0 * = 65 0 CATCACCACCGAGGCCAGATACTGCGAGGTGGTTTTNCCCTTAATGGTGATGTCTTTTTCCGTCACCCAGCCACCGTTACGTTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCT A/H-4G8B!H-A6D+BB6E?G,A5=4AE*37.$%=5/+):->');ACG7)7DB;)-!-@*>GA="1B(EE+%(%F;/4,"(DE<+#:'0-D?H;=#$4.A$@H22A)"51B7@(&:EC4.&%8G!7=;,A.>=DB:.00H2)=(,D2-4&""4H46C3=A22F'#$H/$=3D>@?;??'= YT:Z:UP jpayne@0: r1685 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5631 42 413M = 6044 491 GCAGNGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCANTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGNGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGNATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGG $%2=2))1)#$=*8%G6*G='C.EGF1@B'#GE'9F=897<3HDBD5>5*1*"*8BF9)0H?.9*B3'=(+/6-D(3:FEF!:&@:3EHHH)G4HC!'.7+E%63>7.&:F0B05=)+<&5*>.<:C!E8'!AA!;/0=H.'-1A41+1->,.0*9(*7/4)7FFG29.*G476593"?&G/+%C.2''C;.<0-7%2.4!:"+D4347*A(HC1%'(?;$:70'?1$01321/EHBDGC2/C:F$35%F!<:#'-1B8#&&!"DC+2/62#*&63*'+"G5>&99(->$5DF$53C2".G*&%'C6B:7$@:)D5*6'28-+52"().A#7%CA1>%6-4>-D.4>/C,'?$>7")*2=20F7<=H:&/."<*)&.E9;(G,FD/,BC;!/;HG$=D1"*&0>7@F9;=5$B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T137T26G16C181G44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1685 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6044 42 78M = 5631 -491 ACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACNAAAGGNCGCCTGTGCGGTTTTTTTT =*4"D:&&)F=,!15!A(F'!B%<=3,;) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52T5C11C7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1686 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10579 42 162M = 10494 -247 GTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGNTGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAATGCGGNGATTTCCGTCGGGGAGTNTAAAG *+')#+'#(!!#(!'#!%%!!('("#+(+!*#!#(&+%$$+#(+&%'!*)(!%!'('$$+')+'"#)'#!+##")*)""')!#""%'(*!!##"&"%*)+*()+(+)++%$$(+++((#"#(#')*#""#"$!"*"))&(!'"*%('#*&&#+$$)#%'*)% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29A103A4G13C3A5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1686 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10494 42 74M = 10579 247 ACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAAGCGATCTGGT BC=AD167;(2D@D,.6G:G!*1(EC332+?7%,G'+%(5AH+;*6,920D>=$0='=1H96-##576B+"6A- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1687 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39163 40 12M3I53M = 39008 -220 TCAGAGAANTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGC $?*7$BF20?/00E'E",#,-7*F5H;@CH8B>#(FD,B*A=4*79@A(A+BH8D1&'2.><+5H%.F AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:8T56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1687 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39008 40 41M = 39163 220 CAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAG 7H">B<>&"B2)$%?D=1F%;A<#*6" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1688 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7586 42 141M = 7254 -473 GCCAGAATGCAATAACGGGAGGCNCTGTGGCTGATTTCGNTAACCTGTTCGATNCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATGCGCGGGTACATGGGTACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGA *A'E'%5:",7;94<#B/E1A-:33!9!'>11#6F?:8,C&47"=CA5>&09AD#57/9:CE5*'-7"F+-G4>803.#@A;F?!+(F.7;(C5:A/*8%E/$FC@%4E=*5(* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23G15A13G28A14A43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1688 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7254 42 332M = 7586 473 ACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGNACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTNCCGGTGAGGACACCCCTNTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTNGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAANGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTG )D&E&!21/;E+(%5,:?.>480>/(;9=6&4?+6**&=@?/E<<=!+D0:4409-0D.4#%.02>)<*$$6A8:+#D")F(F#G@G&341A4'?1#"+$,$$-*$4A*63),8D@821*!H@F>E<2)B0=;"/;#96:@%B#,'"&/"'(@$EF+'A2#C0E"25FC&E4D&@.2'7DC1C/7B%>*A#-5@%.F2C6.4!'9:*570?4A(>&>F8=C<,))69E.7EA?%;H3BC,A="G28@AF/D'%1:.$HB!%DH44)97,(G)A<23;&D2?AG7+,0.E75""#CC2F#!6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33A55G5C11C85G85C52 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1689 77 * 0 0 * * 0 0 CNGACAAACAGGGACGGGNTGGAGCCTACAACGCGCACGCC (&<5662-.#,7#D5/E%="#7@#1))<2=&B6;%;.91", YT:Z:UP jpayne@0: r1689 141 * 0 0 * * 0 0 GAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAANGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATNTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAA G=0;+*+03";3F-D$=.&<(<6('0>3$)+$,%BB3"?D@G@>>)5-.!=)D5D:?&C>!6'42%2?#<=)47,0.-AF1+?7@AC,9)H?4:-=.? YT:Z:UP jpayne@0: r1690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1719 42 106M = 1523 -302 GTNCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAAC %0A4AE?)D6B9#4&9$>1E+@22<#5.=0>!+1""(@B),+7G/@:3-#$H%7G,-@6"+=<0%H)"A;>%-:6H==1?889<2#?(.=;ABB?:+<@F=6-D#> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G82G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1523 42 159M = 1719 302 TTNTCTCTGCGAGCATAGTGCNTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGNCCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTT $$!(+'+(*'+"&(*+'#)(!$'!$"$"'(!&%)$"!#!+!$*"(&!$#'"$(#)&)(!'&##'#*"!"+&)+"(+!'$#$+*)))&)+*+*$$!+$%'(!()'"!$*$*#'%+*')%!+)(+'+*#&("(#"#&*+$*&")&$%#&&(!(*&('#'*) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A14A3C69A67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1691 77 * 0 0 * * 0 0 TGCCAGCAAGCGTGCCTGTTCTTCGCGTCNGTGAGCCTCCTCACTGTTGAGNATCCCCATAATGCGGCTGT ()**&&&*+('&(%)*#&))!(*#$$"&"%%+!(*#(''!*"#$())'"")!+*)+"&+%&#!!&'!&%%$ YT:Z:UP jpayne@0: r1691 141 * 0 0 * * 0 0 GNTGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCTATCAACANCTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTANTGACGTGGTNCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCNAG '&+")*)*&+$+('+(%'"$*%+&+#'+'#%"#!!&#!$"'"')&#'+$$&!"))&+)+**"%$+$)'("!'%#!'#&'"#!((")&%&*%+"''*!(!!#*'")+"*(%+##)()"#(*%($&$'!$ YT:Z:UP jpayne@0: r1692 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25993 42 220M = 26213 297 CCTGATGAGTTCCATATTTGAANAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTAGTCATTTTCTATCTTCTCTNATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGA !DF!@:=6)=(;A&.>/)=22=B$8%GF!.ED%*/@+@6B##"/$,>?"%,*%0.,-#&&E%+#&':2-(=B"1$3*:D,A6D1F5'@AFA2:,?C@!A$E,48EB?3F4A(<1@-#F-"7#3A,(/404##1CB>/B*%?E&G66=<&&):A.C'A;A:<+4!4)!63=7533F60G;10;!>?B$.'>"1=80E!9;==0:@#,5,,8;08'9=.2+C AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G21A44T3T10A4C132 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1692 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26213 42 77M = 25993 -297 GGAGTAAAAGGATCAAATACACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGAA '+$&%#)#&(!#'*($(**#$(+#%#&)&+*$'%)&"&)'%'*+%"$#%(&!)%"*$&#&&+)")#*")$&"!&)+# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G57T0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26845 42 154M = 27020 228 ATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCATCCATCTGCTAGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGNATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAAGCCTTAATTTTATTAAAA 33AB$902"044?AD60;-G'/C>%C9:!F54<014."9)":E%,-<#A<:,(;3E>$7+G,;C'E*&!542!4.7#:7DE2547(C!7%@4..%EEBD7';<*?.2)E:07=3<5H(9219587:*?72*+;?=,/>@G>G$4/+A*F),FC9 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48A9C31A45C17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27020 42 53M = 26845 -228 CAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTA F02).D,C$1!=6F$&0HC@@5;4>#'9A56$3*C2D5+;!,2&F!;"&?BG' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26375 42 206M = 26290 -291 CCACACCCATTCCGCCAGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGNGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGA /@1B$38-'E)>6#?'#.--"&5)<)(9B@$6;%+1A/EC5$=64.23DF;?"4G'##)3!'=C/C6C<3C?://>9%)C-)-3#,E6F34H4$7=1%-2*/=,--9(*;>9/?H:7-%;+F4:=1*;(+>9&F/1F%0)-!0!*5.!A7;1@2BH:056GB- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C103T85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26290 42 85M = 26375 291 AAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTA &-F*"#-6'D#,2E3*"5)=1&8&4+B9A:E9C:#=.!>C!);/3&-*G$F+1;EF1&>/0F2(@%<+2G76:'D*?>=+0.%A? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1695 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47576 42 59M = 47635 393 TTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGNGGGAAATACA 06,&6((45C$!/>B8??B02"00314+#+"/3/A?&:'F6F#08BEB5<;AEH5$/-5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A10 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1695 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47635 42 334M = 47576 -393 ACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGCTTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAANCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTATATGCGTTACCCTGATGTTGTACTTGCATGTATAGAACNTAAGGTGTCTCTGGAANCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAACATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAA 5B:+)=$1AF.3>!-G0AH$@5..(*;A:,%C4&9*2@!,-F?;&'"#/<$!!:(>>,-C8)-D$.-()/"A"C':*'29H6GE")'1--H,%-)8=3//+!??GB#85;CG#&&7;'7>72(-0-B/!-&ABEAC2>C*/>*="7-#<&!")&9%=AH5H6B'<"0840#":*-:=>A52()7*:=?:F-3;BF'+A$;C09*A'984H0H'C$0B/+)4?$)45'$0<":>(GB*%#4+&<,@+,$H="%E&)A$+#8"$&.C<:82+("G$!8;=!<>"!'/B4-3)0827D9!1-:E#)!G2@-&&?697$C+%1>+*)!$G5=;-;%28=.':'#A=0!7D824'5D0@!H$/:8-0*8+%(1=@"+*#!,&9,-#E*3F6%+H8+F.D,/@F$#.4-D!0D5#C-5C&&%<;,3<49;E<:)")B&$6*<#!G=AB*4*2'&C!1(03,@;%.+(E74>,,8>*'1/-;H>D014136E*'$'-AHFH8EC#3.6=5H4'H)H5EB6?A5G/F$#2=/D-.,-/;9@/G,>-6+4E:*?>,:/0,6+;!,@8<-(#2*1$B1",BC*@(97G4>GG(B5/5>$46?:08D=9D+@1@+'1;;9"96 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:109C43G83T45T3T141 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1697 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25595 42 120M = 25715 549 TCACNGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTNGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACNGNGGAATGAGTTGCAATTATT ($$#%+('+!%("+$#+*"#')&)#%!%!!)%)(*)#'))))&*%%$"(#!$%%$*&+*%")''%+"!&&)%))$&"&'%%&")!!)"%"$"')$&!$!'*&$"%"*')#!#++))!*#( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4C49A43T1G19 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1698 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24323 42 144M = 24473 190 CTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTNGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACACCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTT A;'FD;A)8*3;2H+C':)6<ADC5'4$@0<=29&4':*8:?C9F/BA6C*E-.#.F!1GF+(-4=4!&976G*71.44@0-%9.@178+':,5,C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83G33G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1698 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24473 42 40M = 24323 -190 CGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAG .F+.3*'1@?8E:B-F00(@GG58??$/.:'&'>0>-FDH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1699 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14010 42 130M = 14010 0 CCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACAC /7=$:D?6?E&1&H==C4;&4,(:0CG;(#"@*'%4.%A7#3H-$08)H":4+&A@*A-"7C-7:,2./E,@':%+?)(9=;-:E6B/BB$C=@H+G(5D$!),'0,0H!DE08""2(6!6F&;2$,C01 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:130 YT:Z:UP jpayne@0: r1699 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14010 0 * = 14010 0 NTGNNNAATGNNNNNTNAGGNNNCAAGCGNGNTACGNCGNAANANGNGNATGGANNNCCNGCANNCNAGNCNNNANCNNCAGNCNCNNNNANGCTGNNNNCCCANGNCGNCCNCCCTCANCAACGGNNGNTNAGNGGNCGTGCTNNAGTNCAGNGNGNCANNGNCANCCNGNNNTTNTNCNGNCNGGNNATNAGCNNNCNACNANNGNNNTCNNTCTTNNATGNANAGNNGNTNTNCNCGNANTTGAANNTTCNTNCNNCTNNNNTNGTNCCGNNGNCNAANCGGNNNNNNGNGGNAGNNCTAAATANTNNNGNNNGCNCTNNCANACANNANNGCNTTT "#$!"!$"!#$!"""#!$"!$#"!$"$#$!"!"$$""#$#"$#"#!##"""#$#!$!##!$##!#""!$"""#"!"!!""$"$$"$!##$!""$$$!#!!#!"!"$!"#"$$#$!"###!#!##$"#""""!"#"$$"!!"##$!#!#""""""#!#"$!!!"##!!##$$$#!"#!"!$!"#$$"$!!$$"###""""!$"!!$"$""#!$!##"##!"#"!###"$"!""!"$$""#""$""##$$"$!#"#"$"#"$"!"##"#$!$"#!!"!!$#!#"!"#!#!#"!"###"!#$""$!!"$#!!!!!$#!"#$"$""#"#!!!!!!#$#####$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1700 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12322 42 88M = 12129 -281 AACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGA (+)()%*"#&'+'+*+&""#)#(*++"&#)*($*#!++!"$!+&&*&!('+#&(')%!%%!&(!$%'')#&!##"%&((+'#('"'+' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1700 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12129 42 193M = 12322 281 GCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGCGGAGCCACGG E'&&.59?;1AF0A;7E74,:0C$)97A=G$'E*6*%858!3B<#'%!E*#7+D'F'DE+A3.42?F:C%1@3=!B@E92A5;@'H.15+B!;D15C"/9'@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:182G1A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1701 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21790 42 115M = 21690 -215 GAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTT 6;G9<'%B>'-;2>A85#(A'&>'&.@A.H9F=8'*<'?-62?B2F(%A%>$$0F?G<<2+%$4C78C@;/<"?@(/?:%6'G0HED>);>!E)15>) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1701 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21690 42 55M = 21790 215 GTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAAC .'+'#5B72-H65-%#>@'G-4!DE'B6,=BH7%%0$H0GCD#"BH8'5#5$$AH87"-A8?1DH9;9&6D3'4733;!05>'->%7?;'-='->"')0!33@#C>'.,H?@$*$:A@:4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1703 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18057 42 313M = 18370 420 GTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCNTGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGNCCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTG .+(4G>05(;$-<)H%=0';B=0C>!=&+H>8".@-/0>AG%E.?F#@'4B52E*C7($AF"'*:B;AF-H)4/9FB#".-3(26;:"37DE"*&,$;=$6=-&C@4.A+#9(:F:$>%G,(C-=C-C#5'=>(;1-+7(4937.'8%,535C'@2;!"1660=-5.2#:#//&E;133%&56#,:<40&/+/4D<9/D-';!-")4"81$684#7849606F/$:E(G(7?6195%?=<%/5?D77:D7%.<(0/E.G#-2G0%4D/&1#6.8(/'#'+1*C=;."1* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:97A66A148 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1703 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18370 42 107M = 18057 -420 ACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTGAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGA E%=<566E5$5>)338-C1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1704 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30869 42 121M = 30657 -333 GATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAA 8!1C!;;9D=0'7AD45>H'C(8.'FG>F,F86:CC4F;F72?>=3H*&*/5.19;'#E9A:C*B)@;,+F1))8E,H/04.;B7!3(&@;4B9D>(* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1704 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30657 42 188M2D22M = 30869 333 AATGCGAATAATAAAAAAGTAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATNTTCATCGTTCCTTAAGGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCNACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTT 7#<=(@-@4.#A"7;)!6C0?'"4?C'%24&,3?+:A234+'16G"G.'?+%<3,H%!=170-&<9C+8.#.H5>GFC;B%G?**.!)F/%29/=+3C:$,=3&B4'$.,3F.>(!G(;/.0=G#:0+/>&F>>@@!?76+.>,+<=>)E%( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:19G33G15A105G12^GG22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1029 42 50M = 832 -247 ACGGATGGTGATGNCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTAN 0D13$H?E%2>8=&6#2H#,;A2$7=9EH#&.(G:>8>9*CB+%+&H=B* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C35T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1705 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 832 42 53M = 1029 247 CGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGG 62H1&-%&,6?485+C205H(7'0C7B%2%&)(CG11<3-+A6C?:-H%!;1'C43'(-=D@=!F#!HG@->6.DB6>/3!6":*=;A;A(':C<;F#DC1%%"G8).50H=)%9'6:;G=6".).D<=:/,*H?*C5-);4*+@/;:/$DB1772!CG?H"1&8?4<%'G69:H105$3%);?'50DAG3E*)46.CG97?E=>' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22C4A80G31A79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42687 42 73M = 42467 -293 CAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGCGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTNCGGAACGCTCACGTCTG :-E.,,$$%)D:1$A1',6,H5E4D/F;$8EGA41<":624%4C0&!BE3+5.":"<785@-#"88&"DC=E@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A31G17 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1707 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32992 42 105M = 33097 372 GGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGNTGGTACTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAA 5D+/+/DF?">7B'HD857C3A@5$(F4?'#B%&+,*;0H(708).C&GC%-#92+!@-H=C>'5,?'!&H;)0BHG)'1+>$D?B$!'!4,.!,7(4&'C'E25=$!+(B5;8-16&6+"%A;1GE=C2E+G2FAD=G?+4C-H)B-A3'F85@060G%A(C+DEB"C'BB;>(&?ED30314,(?8,7&%66'1"3C#..4HD#"9*+;.46A)!G!,4->&)AHA!&5";@+!,,,&HA$+A2);;$'#21@?2%<)",*=C$EGFG?C<<7-G3+<$+;*F>158C8G+.5$/=E(<2F.H(FF112(36 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11T7T25A79T24G24T91 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1708 77 * 0 0 * * 0 0 TTCAGCCATGAACGCTTATTANATTCAGGATCCTCTTGAGG FC64H'"#=.EE<%C,1H74'&,0+8#8,!9.FEC/<2"#8 YT:Z:UP jpayne@0: r1708 141 * 0 0 * * 0 0 AGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATANCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGNAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAG ,,1DEADA+D:9*(B%:'A;AA@?H.')H?5@F@!:"1'H@670"=2635#:$2,F"?-@@+C-4.3-&">@/*AB2:7;F5-/3G9:$:52&<9FD6;E!$223C-G@E)1C;%F"G6-1;-87EF,--E'4*&"B?9#.13>-7FDFE+=D@!.)8?@"GG,!CG4?A#=2*?*#E1:H>-H"8-.6//'#&E#4$&<63+,9BF@74D:)?:7&E#A"(11$6A/#8!05"HEC+*!0/C/3?)HG*%AD83=$!E3 YT:Z:UP jpayne@0: r1709 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15147 42 56M = 14901 -302 ATGGGNGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTT 81;(G5<.E$(;=E.;=5D;=87@,A;;B5F0B)+$-)G+',-&C:#<,@0G*DF.H!::%/(>(?%-9+%.,#?2$B8.+"B!9$-(,:1=,5)4%H6A=6F' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1710 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15155 42 92M = 15155 0 CCGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCCGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTNGCGCAGATGCTGGCACCGAAA =3-"FG=+BC"F?3-2%@?=,HH'02>2&%4@G:%$%%*3#8?;92>6:(>$!7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43370 42 70M = 43547 246 TTTGGTTGATCGTGGTNCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTA F)B--@*A3'*;A4(01/67%@$"#?2'H,@:<:>.)E$'F=@&B2H)<,):>#E;@'?G*1%CG?0G%1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1713 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20293 42 50M = 20055 -288 AACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTNAGAG *9**;01(7$&3D2$3&><69H6G56)*-HAH"E%1(:21;2A6&)*3%!1=:#.,EG;=C),<8BC.%/9/3=5C@?(#.(H-E#)?7B537CCB1BF(=-7$@B'*E1AC;"'H'F?C883C/A%EG2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44C36G16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17193 42 61M = 17361 215 GCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGAAGGCACG <=4*67F;60;6#&<+1;G"7*;($8.(9AA.$@,(<%D=HC+!08+%01'1,7<81" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17361 42 47M = 17193 -215 AGGGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGGGGGGAAT :9-'G8H+)'7+B./B0HB;)&=2E+931*5$,@.)E;E;9#&=:E< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C36C7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43245 42 119M = 43377 244 GATGGCAGCAAATACCGATATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCNCGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATGCGACNACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGT EF9>C8/?->*<8;@"C/1,@&5-+3&.$;$'&!+2+?+1*620B<1'2)?;%81!ED37H6"5;>C;=::7EB2?5%;("30!-8F"")D,'E<&80G669!C$59"71-9EE$=531 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:18A24A17T26T4A25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1715 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43377 42 112M = 43245 -244 GANCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAA =:-D").4%,C34-(#0B<*;623"D*&6AE2:<#?'*H0)A7)G'GF6(;=C@%@=)#:B!B??>5$#/0:?5H"D=DA$65A1-)/'8'H9+%--%.)<"'!5$599#@; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T109 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1716 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23202 42 75M = 23413 258 NTCTTTAATATCTTCAGNAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATC "EDGA<25E)59!?5,2E&.-#!="$D3G1E*8&8=8BC6//A&H+$2;G%8A4)+",);BCE/1H)07)0F9A7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C16G57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1716 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23413 42 47M = 23202 -258 ATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGC 8!H(,"D@*E-%B1"B?>5HH=ED-!'&1#:10.>H+F&CD=A4E;+?73'H1.>(&02G-)>-E5:*=)+*/4>*@'9<:?.?.02*$(:15H?$*H+<)'8+>21#F>&B/GA4%$D&=F<=$=?)93+E@-5=>C1H&C?(+2#4@>G0<2).:6)A7@'8H>6,-$+F)9!>"=2%4!F,+$DF6-".H=1(#A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G42 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1719 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39013 42 162M3I10M = 39185 283 AAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCNATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGATACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCT )-&:B#C'G>,%%"5&G5'7>H(H.25*(&,"9E/A2/-"8<%3@BBF<3@E:B2?6(5+:-=;#&0@H$'3%(3F"5=98H0B9./E%?E:/?0C5(*C1/G=)1H8!4!@:1C((8(:0F882#5$3+$8-F6:4FB0>D@0,@:#*=G(;B3D%/>!=E'(=9C>/)5!CH&',40F!1>G!7=)#DAAB-!4C/43"E+B?/B,99B>9(24=,?3D/+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T46C7C43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1721 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32905 42 42M = 33118 294 CATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCC 8*<2D2)A0H4GD>C'#GBFA'0)D/&C<3'.6CDEC=FE$- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1721 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33118 42 81M = 32905 -294 NACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCNGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCT +;),:?56&<-9A@1#HF@-50@:5H+2+-1>A8;A/855;-)$24D<%@-B$(G?D#@$#B&$73G=<<1(4@'E7<:F0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A29C50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1722 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21184 42 54M = 20978 -260 AAATTCGGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAAAATTCGGCCTT 314>(A+*1->3F)"(H5-B),E3:+)26C5)2#4CB'643''"!93<=;(%&C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C35G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1722 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20978 42 45M = 21184 260 CTGAATGAACNGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCT G;723C9.8(#"!&$;/,>7;>592,(,A#6/HH=1"/6'9HC@% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1723 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6008 42 58M = 5867 -199 TGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAA 67@*5/4$CCHG"6".036"%)$-2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C23G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1724 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10899 42 48M = 11126 307 CTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTG 2/"52=?*F='=<<.,E#0:'"":-:,*G69:E-.23H)1-.9%D4G/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1724 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11126 42 80M = 10899 -307 GGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCNGCGTGGAGGNGGANA '%%&*%%''%#%)!#*%)"**#'#!!($""$(&'&!%"$&*)#*##('%#$&(%$!!+()'&++!(+""*&+)&!''$"' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64G9T3C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1725 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17160 42 101M = 17295 210 TGTAGCTGNANACNGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCA '"&%('$*!&#()!))**%+#&)"&(+$+"+""$)(#)$(%(+(+'!%"$+#%#%&*!)+&'!*"!+%&()*(!("%#&'&'%)%"'*$((!*))(%*(!+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3T4A1T2A87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1725 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17295 42 75M = 17160 -210 CATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCA 4(.37+$""1,F153':2'%8<=38A,)22)9#<1'*73+A!,;59440%;%%54=)B6.=2"*6/?1=9./@GB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2639 42 61M = 2700 465 CGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGG 98!E>?&;<-A8-1F=2D0BF;:C$)1""A/350.E4"C<'=12$H<#,(03;6C@&)?92 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1726 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2700 42 404M = 2639 -465 TGGCAACANTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCTGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGATAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTC @B0'=77.<0<;0.#H="#1'98&05E<0#-.HB>'=."4;58""7-7$4E6!,/"G'8';>5F19B*A#@AEB)F.3H.7C88?6D4*7&0??7+B$.A>6%H,C?:,!4028D<%!-A:";81*/&2!C=)*&;B9D7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G161C93A139 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1727 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13179 42 232M = 13411 299 ATAGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTACCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATNAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTTAGTTCAGCGCAGAGTT F%A/7E:+B8D5&*52.A7*-F%/G5+6/AH##*-/H'2'BA5<0&58*5-(E@4/@#2%&+C('8(;,)0?'/&<+8<68BE&B!B3*=,;'@3C??F)*D8965C"C25;3%3?:F0#D616/==B/@HG0'/28@E%4)&A'?+DE7D242H$>D(3.=>A3<,<54F-FH28AC0>+1'"4;'H)+3("*@%!-5: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G67C95A48G16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1727 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13411 42 67M = 13179 -299 TGAACAGGTGGTGAACTNATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGC /&:9+H/0+0A&;0+5*3/9H5C?'H5E*)3:.4;4H=2+(>>'E'@H""41F;.5H;1%E-<+7(8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G49 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1728 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41803 40 94M = 41897 172 CGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATNGTACGAGCTAAAAGATTCGNTACCGGCTCTTGTTCTGAG ";$:%C<<:&5GD!498"";':2H:(D67"#&>/?'2;0A>+41&@,9'/=GD86B21FF2>*$<6A9C-8DE-6&A1GH+;#0.>>A;"0E%.H7!@5!AAE.8+@%;H)A AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:74G3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1729 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40660 42 75M3I52M = 40787 430 TTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAA 8D8,7A:<$&/"2?4-54=A;4H&,1!#CB//H)BFA(=->='BA"56!45%:<1$3>@DC-<+;*;DC?AH03:D$%07(B%?(E:+://&#)1*:0?4/,%=-.9&G=A4E.EC7($/?@:%':G$=. AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:127 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r1729 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40787 42 31M4D268M = 40660 -430 GCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGCCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTNATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCNTGTAGNCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCNCTGGAGTGGAAAGCGNGATGGGGAGACAGGGNTNNATGNNTAAT *&*!)#%)%!'&&'"&&%(#&&*)'#(+%%'(('!%%'*)'%'++)*("#$)%$"&"%"+$$)+*&&'+#*#($$)!$')!#!+("!*'&%))#*&$&()')+"%!"*+&$$(&#$&()%"("#(&'')'&#'$*+&**+"'&&*(#($!*&)&*(%%*!'$&&!&#)('(#"!+*(&!'&)++&#'(%%!$%#%#!'(&"!*$('#%%&#"(*"+*)+"&!!'$%))+"'($+*##&+#!#)$%*)($!('$!&#$(!')+$(%#*"!"('*#)+$(#"$+)&)&'#!#('(!""(!$ AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:16 MD:Z:31^CAGG19G89A25G5G81T15A15C1G0C3A0T0A3 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1730 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42607 42 396M = 43003 742 GNNAGCAGAATCAGAAAGATAAACTTAAGATTNGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATTCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTTNGATTTAATGAACGCANNATTGACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAGAGCGGAAAGNTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATNAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATNGAATCAAACCATTACNGCGATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGA $(!)'+#$+$$%"$(+)+$*(%+"$*&#*%$$'#+"$+#+$)'#('+*(*'#'%'$"+#$%(("+%'$+!%''&''&")"*+%*++&(#*%)%&*)'**"'+%#*###)++!(#!'*&"+%&(%$%*#+!*"&!)'%)(($)++%'!%#(*#%!*")+"#%($)!$$)'%'%)&$%&"#!!'(%&'*$&&+'+*$*'%"&()#!%%))&)&!*!()'&&++##!#*%'$!*'")"($#"!'"$+%*)+&'*&"'!$!%(&!+&'#%'!)*#'$*&%'!!"*'!'(*%""+"*%$'+)'#$$"!")#+"())%*!#'(($"')#+")(#+!&+"&*(%&!*)*&!)!%!+*#+*#(+!!%))$**(*&*+*+(($''($#")'&')%$$+)&#('"* AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:0A0G0G7A21C131G37C0C15A0T3C31A8T0C25T32C12A2C2C51 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r1730 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43003 42 346M = 42607 -742 AACTCAAGGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGACCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCANACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGATATTACGACAAAATTGATNGCAGCANATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGNACCNGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAANN !#0C1(+E-(G7G-?E2*&CH"@?D;?1B3(7H@(FDB5"07B'3@--H1>F(*2(+BD"?%H!.=5$A:A&D+&)"@>',%5*@;&)<215$6+)F!/3.776+!6.D++>?G89,6='-<=&6(F91A+:?6"0&57443+@/E*+)5?A$=G78:62'@<.2@?/%%F*-;14"BB,#3/#%F4H&CF)0@5?:=>>H6*6F**4$1$FG8,%>+#E'3<1C*D)C3@16$@$("/D+& AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:7A24G77G115C8A9G6A46A3T40G0A0 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r1731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24548 42 116M = 24377 -287 CTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCANTAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATN F3:>)2$=2;7'G*!06#":?!61,.*<,#@=2E5!#"'1-4:,@>6#&-C.-//0:;"-%4*'F9(23F+5;7C>-9#<$E2,4)>%-&)@52<"G<.@6!-=9-+G8!%D&5;! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70A44T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1731 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24377 42 171M = 24548 287 CACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGACGTAATTTTCTATCTNTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCA -&'=7'G&7)H1"7D$#.2!:7--5G=?;:F(D&8=35!/F6A#;G5$*290F!2.<7%<.-330(*0!7'#G5.)G6D.:AC+EF!CDE0E54G:#$8*'-"E5C?:E-)/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1732 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39661 42 156M = 39893 309 ACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGNGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGA A+0>(3$.;4AF$HF,)68B)8(74<-*2/F%1CDD!F1A3<.26@.)A/-)?0#6HAF=)HC-@E5*=2>9)>;!0$A1G?AC41371&FA17:;90C.%#.@%'!30?$;;/%EGC%7EC4'A'!C;A<3'>CBB+2EE.5@>-% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23325 42 106M = 23106 -325 GAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTGTTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGT $BD8@*4D>-#6A"B2%>/8'F/91="=G6= AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37T5A62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23106 42 57M = 23325 325 NTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGT !?CB.7*)*"#-/)72D>2))>%64?(!27,$@+?AH.5+/")991!2E&9"5#$/9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G56 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20953 42 72M = 21117 269 CGNGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTAC 72<1=17H?G71*)@@D#2F&63*-9#%F'@HC+:;?',C0>*;H$"$<"5(8&!H&E40G94B2.:+!2&&4'C'C*G4A#E3"&5AA6H!6E/+93.>&."@:G6!@#&8%H"@B0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1735 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3387 42 98M = 3169 -316 CGNCAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATGCTGGCTGGATGCNGC /DD1E>"7$C%+B@H02E-H)%#+($,12C?$3'G@.32,1(*B5=(7-,:'(<437@B1/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A51G25T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1736 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35464 42 148M = 35339 -273 ACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATNCTGCCCTTCTTCAGGGCTTANTTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATNNA $#$!%(#"&**)%!%"&%%*%)&$"'$)+&(&%&++)($($$&'%(''"%!#%'$)&"!#)*!$*%%&&(+%"+*(*&)!%!(!$(#$#)+*!($#($'*)$!%*$'$""%)'")'*$("++*"""''(&&!"'"&*%("%('%+"!' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52G20A71T0T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1736 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35339 42 125M = 35464 273 NNCGGCGTGTTTGTNCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTNGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTT '!).'+836CD14@#%%H#AFBG>4F=8;62-9&+*(8?7A*,<#1843:!/!4D./'$>0::)4A)(&:$(?,C+6B72D7"6A@0&EF)@6%9A58"$-7;%A"HC@,D-&:H-0/>CB7@6' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G12G35G74 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1737 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10205 42 90M = 10418 272 ACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACC EH!:';&15@:HA0@A1-!"<#1?@>>'%6(8F$7-A<&=6>0!.!-::'6-2>>F%H;!8,C&CC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1737 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10418 42 59M = 10205 -272 GGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGC 7@C.6<+?$%)-C=F:&;6;&263(@$4/=(07&!!5B1+>%F=2&'>30@%E&&@:@!HE?@:/:H?.9B-8:8,??:#9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C69C17G54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1739 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1903 42 130M = 2033 211 CNNGNNTCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGT &"")#%(#$+)#&%"")"'!&%$"(+&+)!)'*$)*"+(#+*'+"*(&+$**#$')&*)(%''+$$&##*&)+"%#*(%(+&+!%##'$&($$#$)(""!")"*!$*($!#%*)(&*)!"!)&"'%'(!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C0G1T0A124 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1739 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2033 42 53M5I28M = 1903 -211 GGATGAGGCCATCAATNAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGG 1.F1H01-!40*E.?)H0G><4:?/BG2'H;,<-)/9E+&%#57)0(5/0E<>7G&B+-$1B.:C*A9>4=/D8>)->9B-8G%(:4.:?%B*<>EH)'/-D$6F!9/B17,&)3.@>26F:-G45@72.A7/!#?C)-/$=6-?)-71E1+@B*85$7B$!:+>G30B@B+D746$..@-/<>#8)3=@4<>77C=#+D3.50?6,@-,@F:03?:5%;4B1@ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:13^TTA65G43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1741 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31544 42 125M = 31457 -212 ATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTNATGTAATCCCGGGAGGNAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAA &("$!*+*#*)%+"#'%%&$!+%+(*$%'#*#')%("$!"&!#!*$(''#'&+'!%#$'!"&+*"*#'!*")$'$)(&##&""(+%"'%(*$)**%""*&'$("!&#&+"'&+**$'*$#(%$&+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7A57C3A12T42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1741 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31457 42 63M = 31544 212 CGACNNATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTAC ((!'$')+%"*#'+(+"%)"'*+!"$*#("!#&(("+#&'"&!'()!!(*)%"")"""'&#&' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C0T0C0A57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1742 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47993 42 70M = 48128 188 ACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTNGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAA 23D)*.H>8.++H:@%")$@A+EC;"#@;,)4-.+$)@F8#:@+.6&?@3)3F87:0$6<5@48/)$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36585 42 140M = 36381 -344 TCTGTTGCCCCTAAGACCTNTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGNTCTATCTGAACGCG 14B80F#$*5(49>.B;5'?;F'5%*D@FE+5+E,5(/76#3'.E"!"2661-"9A%/9EE$*#!;B"F1A-**+H6$;F3=F&G*&3$2C3$/B;9"C8E:>#&:6&*?D1//@.=+%>9+(F24FAHG#(G> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T105C14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36381 42 204M = 36585 344 TTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCATGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATNCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCNCTTCAATA ;)?8."EH59/@!<62,0*6HCC>?08&%D.B#,H7$3(:C943("%=G$7>9>@C<$!02,$0?E7,-#-C(>(!.3>0B7G;.=6B?>.D&D*G)H4FH+3G.7?,:=>&E,'C(.?:;,&?)!<'@+54!+.&HF-A7315"DF@A8<.15F(36DC:D75/&@B+C='@-',-<"A42:$:F/912@"+%9@<<$;4$4# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:82G41C70C8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1744 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5226 42 151M = 5109 -268 NCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTGAANAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGC ;B3B77--3*7F?B:6,41;E5*G+'&6>(B2"93>>>>-$F.*AC0+/:-71A(D-/E3(C17:.;-'@2.46+C.<>1!G44";"/>A(F59'2;)"8?H5.,0CH/C23AF)- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G42T2C104 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1744 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5109 42 67M = 5226 268 TNNGGGAGACACTGNAGTCCCGGATGGACGCAACNCGCCAGATGTCTGCGCAGAAGGTGTCGGCATA *!"+!+$&$$%+&!&+'%*'()$&*&!'*)%**%('#!)+#++*+*'#*'("%$'%(()+!+%%$%$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0C11C19C10T21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1745 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19642 42 227M = 19642 0 GGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGNGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGACCTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGNCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAATACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCNCACGCCGGG CC2"/!D)H355$27+F5753">*H/G4+H+F2C=69>(AFB:!D6GA9AG@="@/1,:#>98"E")*@"60C#4/E);E$$$!-&/GE(9G5?6.D<,;7@C,&-%G8)E$'%/<*'9>!.2.+*+.GC><8+)A7G8;3FB6=A#F,>88"B*B71;91C0C6%!1&F!GB;(<(>,(G5:8?5"8@(7//7$E??'$>+!91*9%37*5>(F);&G,E(?2:&?<73G?C#$4'<&6;C59*@39D+:(>8D*G+9;/$&;C/(&G/G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60T53T11T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1747 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27106 42 88M = 26925 -269 TATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGG .&/)'@>::=;=76D.*3&C#>715869&D#:@%E(<")0D@*$8D(B"G:6-5D9:+=;9!"145?.%+36?/6D=0$B)%&82.0$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1748 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46890 42 95M = 46733 -252 CCNGGATTAACTATGTCCCCAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGNAGTNTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTGGA '(*"+!)"!$$%*+!#&)"'&%$*!*($&((#'#+)+#'"'(!'$%'!"$&((*!'('$!)("+)')&%')!+#!#'!"*''*!&!&%!('+*#( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C15A27G3G41A0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1748 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46733 42 51M = 46890 252 GCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGC AC=/-2A@B;;(81<,'"CAG18/B@885B<0/?.07?E-B:"EG:> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1749 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28209 42 47M = 28284 202 ACGATATCAGACNACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCC *@>B/234292<$54?B=DE-!<5F!96#=/>4'$9>.A3+E!)#;. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1749 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28284 42 127M = 28209 -202 CTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCNGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCNCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTAGTTGTTATATGGC ,#+.>/GCA&=.*9B,5>@E3-A/-5H(FCF@A>'7-"C5&%:!(2E+$H'*6,6B"!E7%G2-+6)H**>2G$9$07!3F7*(DB+.>?6.AEF>>--!(473$F89(#?(60*E?1.6&:@G0#0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42A35T34T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1750 77 * 0 0 * * 0 0 ACGGAAGTGAAATATGACANGCCGATCACCCGCNCCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTC @>/2&)H/)9#/'9G01-16#!@'16''=.:2(7"F$9H1;EF-=6:FH111(@F%)4(.*1:#@2B;DB373<#%?"%37%E6B>"*#"(G8(&."-E1?+<""3#>E.2B6,C#8F"?F$.?&CD/9GH*!6/=:C)GFE(7;.@C:)8D7EG()*6#@7G3A),D;%#,*8D-#0::;GEA,?EF!;;@!,;DD)<95D#=0H<71'G*?2:734-4?!'!+'8#24-1,= YT:Z:UP jpayne@0: r1751 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15834 42 60M = 36215 20452 CCGTCTGCGCTTTACCNTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAG B?!6/&+1H=-H(8:HC)=.G0?,':3)?/!(F/!%:<:CCC3--046:HG$9(1?%=A! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T43 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r1751 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36215 42 71M = 15834 -20452 AGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAA >D:-B5G2+@>3#!+!@/C,=B*>/,?13:=070<"0&)8<=6/">(-#!9#?<>C1H831H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r1752 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8468 42 63M = 8585 204 ANATATTGAGCGGATACGGCGCGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCA 7C>/);2:1-*-&A70;;%#11,DB+*79(/6&636%#<1%">'63889/-1'"187.:-?*E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A19T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1752 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8585 42 87M = 8468 -204 GATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCC ,G0B=A?BC$7.F1!F)G:C/.*A,.6+*&*&@8B4./47-/8<340#B315C(&38 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1753 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41555 42 108M = 41685 241 CTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAAACATTCGATTTGCAAACACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCA 0.0"?9!CACDG:D<)B&4)HH39D0-!,B5)),>%,>+:.--4?A22!"$>=9$H<,=<.8+;&6$;B?"6@C0G':<%62DB+;4$)6HHD$0+@!<56D<$(A$E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C15T43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1753 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41685 42 111M = 41555 -241 GCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTTTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGT 91:&1DD$>!9E"946//)+B+0>A+ED;3G)%-,?#><$B7;/9<;F!/:.D"5;@C!3F<>C**3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G84 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1754 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6221 42 31M1I95M = 6121 -226 GTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTNACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTC >./+B).A6E/B#6%B<$FF46%A>72FG##!++2+,&!/C2$/BF$G<6"3>$,66B#=C9CH>&8$A&CG9=<06=<F>&%,4,!%5@&2%=5A@,9/>15,?(F%".457=,7BCD&!+2$+<2HD(+":HAG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1755 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21520 42 199M = 21429 -290 GAAANCAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGGCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACANGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGACCCAGCACA )5"(+.C$7/8:@')C$!F-?DHBB9,><1$#B+<2#+&2&9#):*.,AD&7';B=$9?6E<>3>/@9/<=%*A)*$90*/(F@$=.1,2$#E!),>>G7<5-/68:9),3>@D?B>#A!+F(."$79!B*@'2?@3#C*<;7+B29G6-&8!"%6!':8=%"D=+#79$9"-AA.A=/175CA&4?$@-D+,@70/A' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A81C79G23A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1755 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21429 42 91M = 21520 290 ACCAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACNGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGAC (#'%+%"$"%)('*"$*'!)$""""#!)%'!%%+#&$($$)&"(!$"'(#*''%"!'!+'%&!$&(""%)!$$"%+)*""$((!!("'#%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A47G41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1756 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3731 40 54M2I32M = 3897 218 ACAGTCAGGAACAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCNGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGC E;@>5$@%=9&*2A783-0*<*D9E06,,<,.;?)9*-C==56+4:7#C3F+A>0>7CE=8#;6F")9D!:/?C-,D%6=8')!H&)+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:10G53A21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1756 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3897 40 52M = 3731 -218 TGAGGAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAG 82!.-=#5@1)'C#8'1,<.65/14%(3H##/@7/.6)1F@>>B4:8FG)3& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1757 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45284 42 192M = 45476 249 CGGCAGATATAATGGCGGTGCGNTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCTCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCNCTGCTAA ;=AGB#5BB>$>9&7&H9C*'!+3@(E46,?)<<@:;141A10AE310(',8+5"F4(;(1.?;+-7!&C&4.,(+G9"+=H5'858:9;B;50#!6%/1(A?*!-?.:.?&0).8)82#?(<>(=D!'H"G;;':$*D)995.'#F9ECC(%@'+@><046;3B'//$%1C#-:3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22T71G89G7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1757 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45476 42 57M = 45284 -249 AAAAGCCGGAGTAGAATATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATN 7.'5#@7=2G).59/&"8=%F2D@!5.&<2G3)%*"=8CC@;:?"(E!,540CB?8$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G39A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1758 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20602 40 95M7I229M = 20926 420 GAANTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGANAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGNAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGNCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGCACAGTCCGGCACTGACCGGAAAGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGT #&&!&#($+$!&*$*)&&!%)(*%*$&*!!+#($"!!('#"(#$()%%+&$"'%$'($)()%&#%"!)$'+!*&"&)'*'!'$)'))&&!!#!)+"$()++#%(+(!()%%!$!&&%+'&!*'&"$)$$*&")))('#()%*)"'$(+(**+%!"+*'*"*&)++(&+&"$($!++!"#"'"&+)((*"&("+)"#"**$()$''$+%+%(!#$'$$$'+)')#(*)#'"$&'"$!!$#%$)&*#+#(()#&)#'%('!'"&++$!(*+(''#!$%"(#*#%*!"$)'&)"%(()$#&()#""%""#"*$*#!%$%%*'&*&$#%+%($'$ AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:12 MD:Z:3G144C39C49G21C63 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r1758 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20926 40 21M4D71M = 20602 -420 ACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGNTGAATGAACTCGCCGCAGCGCTNGGGAATGATCCAGATTNNGN &%'*)"*!%"*#&+&&)$*")%#$&"%('"##()'+%$'%)*"$)$#'(&!&$%!$##**&$!$'%"!""#!)*$!"$$"+)+&#)!)"#)! AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:10 MD:Z:21^TATC27C10G11C16T0T1C0 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r1759 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17656 42 26M1D17M = 17473 -227 TCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCAC +0E'$*G;0A$E"B.BE2%'@0$58C!@A0>4'/$F;;#%9+> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:26^T17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1759 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17473 42 75M = 17656 227 ACCNTAACAGCGGACGANGGCAGTGAGCGGGTGGTCGGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACG $&'%(+#+'&$#)&"&"!&#++&&)++&*#$$!*++)'+)"'!#(#$$$*"(&)&&!#$*#$$$(&%$('$$**' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G13C12C5A38 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1760 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17212 42 227M = 17439 269 CTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCATACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAA /(>?"/.7?74F7E6(7.$<4@'!E<;4;31;2F3$"H6$17E1!8'@=FF66!>.%%:0H$,"A:>32!(.9C=-EBD8?:A!B..63D;(H'32("@1H/+,1%7&;%?3/9>2@B!(B7.,?5>#'19.C25&(2(%#>2.56#@32H.$-&-3D@4A?1;@0$),>95<."<++ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A25 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1761 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10034 42 150M = 10197 258 TGGTTTGTATGANTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCC 0'98+"2>'B2B..2G.;34$"/.HBC?C5-7DG0:6&,.-334:G046D-",AF8E:97A-*E!,,EG AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A7G137 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1761 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10197 42 95M = 10034 -258 TGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATNATGTTCTGCTGGNTATGCACTTTTCCGGGCTGAAGTAC $'%#')!)$#"("#++*!!%$'$'(!&(&#+*#)%#''"$+!'#&("%*#&(&+(*'!*"$***")"$*)*)*)'&(+!&""!*%'*($)+*%$$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56G12A20C4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1762 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6064 42 80M = 6064 0 AATCAGCNTCGTTTANCTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCNGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATG ='2)*6*/@/@9$HG51E((@$C6019!@7%!DH$+H7G1=@'<#DF,'.2&&(D/)=:#FBF!H/E$)"E?%9)83/>2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A7A27T36 YT:Z:UP jpayne@0: r1762 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6064 0 * = 6064 0 NAGGNNNANCNACNGNCCNNNGNNNTGNNCNNGANNTANGANNCCCGNCNCTGCTGCNNNTCCNNATATNNNNNNCGNTNNTGTCCNAAACATNNNCNANCTGACNNTNTNGAANTNNGN !"$""$#"##!#$!###!"$"###!!!$"#"##$#""!$!#!#!##"###!$$$###!!!#$$"!!!!"!"!#$"#!#$#$#"#$$"!$!$#"!""""!#$####!!$!$#!##!$!!$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1763 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39540 42 47M = 39315 -272 ACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAA %66!41"(>07A&FGB"H2&3, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1764 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10220 42 92M = 10043 -269 TGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTNCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTT ?:@,9.3%2%:5-FB"-2/$&E@C;!F?,!AHA90C5&GE3'(<)1CC8)#G$E/B9F6F9FB.H:+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1764 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10043 42 92M = 10220 269 TGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGAGGGTGAGCTGNG !%)+!!!+")%+#&%))&(&('"!$#*""(&""*!%#**&!%)""'")'"%("!"$&%+"*!#(*$$!!"!!+")*"!+#$%((*&&!'##" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80C9A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1765 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4459 42 43M = 4292 -210 GGCCTTCAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGG H;:9#7/C!7;C"@%3)C-9@$9E;&@%3467,286(&!/C$4*H!7D';-4:#%+F19''">."@".=FC;)7785H&(85+F15>!387,2.A;@D,AH7588:5:';E(EF$:D0@B>:>++C1&,B=FGHEC,H35GA>#9@0E)(9B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A9T53G97 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1766 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23532 40 65M1I11M = 23716 243 TACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTNCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGAT #-0=8E/!FG3,7&#?.(G?36?CD2,,!E++;)5)H:5"H-D8"+@;-2&6$=(.+3D;/6@!@.&&:9'*$1G-@ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:0G33T41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1766 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23716 40 59M = 23532 -243 TCAATAACGTTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTCGG '##)&$+%&#(*'$)$""##$#$#&)*%+$%(""$%"+'$+)%#'!"!%%!+'&)+&#% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A47T0T1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1767 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17787 40 64M = 17659 -192 CAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTAGCAATATCAAACCGGNC +,8D/-,14"/B=$A9,(?A=E$D1E9%",5*9C60%E3/3BA=(3>C$6D>3()+*6(E8;@1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47T14G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1767 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17659 40 23M1D37M = 17787 192 AGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACNGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATG F#=G4;FE!+A(=(@%B*2,"/F5.)=9;'HB).:6+%A>5$>F,FG070$C!F?5E@!4 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:23^T11C25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1768 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13115 42 53M = 13168 251 TGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGT 9,&2%/@"3:,#7G*'#6A"/=C#02;DG$/F*#6C=/),@"9DB8*>DF)%#G-A1)"5AC&716D=.BG?AF:*A)8<""DC2:F0C(3-49!>):BG)*,??#@C5!@7*-85+%B#:*=#*H1B(66-8E1<8EE?48*+E3"4)G*6!&)C'('81CF35H66>0"*>-96=/&BB;+%C2GH/:#&>&*;H<9""?)9'0"6GC))#83C;5;*>"3* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:50T20G38C14T50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16164 42 85M = 15988 -261 GCAGGTAGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGACN %.;4DE!" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G76A0C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20400 42 142M = 20279 -263 ACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAGAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACG (@@"3(G&88+)9B+E:G)1;$G)$-72.'A9/:(:@>;F373%$9#4>.A5C0250'7?%"A"F-28:F5<#A1;C&?C%+&H#D6#.-)-3C,(/"209=*81:'59)6A%*=D=!D>"8<.+"5&"+G%.A9+1*0/@) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1770 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20279 42 47M = 20400 263 TGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGG ?.70=-;(3,!-;="6>'%'05GE-%$B++D2"1/8)5/.&"2:)4+G1+2F9'9">B<&<-8/#%!%1>/6+))2!7"5-/#7E9#+D&4113E8)'7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26C3A1G34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1771 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33288 42 81M = 33056 -313 CGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGNCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTNGCTGATTAAGTATGTCGATAAGG &'&&#&+++&'#)$((&()##&"*!$'&!!!!*)$*+$"%"*'*')*'&))')(*+##)*#('$*($$%"#'"*)#!()&+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C32G23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1772 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11033 42 67M = 10876 -224 AGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGTCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAG ,1)2/6H:@2(@%/')D"!2E#"'">%67B%'76/4,"6&-A'2D">5&3"*)&66!5;:%?30#.: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1772 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10876 42 122M = 11033 224 GGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACG 9@;6'H.',G/"/8$=>:E@0483!%E")4D:C(A<@:"E=*9@%$=;;G15AG0,>"G3B66'>*:<+<3)5G3@0D=7(9#!-;;D!@;<"9B=C9+$"&A9#-$*>*!$@96A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1773 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29115 42 80M = 29272 214 CCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCA .FH:0.?9"+(4E,6@DGDF0H74$H:#@4;-46F333!,="E7*#E$*5(;>G,@G6#'29$7H@H59B1HE:0#%)0; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29272 42 57M = 29115 -214 ACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCNAGTTCAGAT #H;F#2A210=G$G/E014'(5C#.&?98:C(G5'AE9&G1*(H8A86-6?,2%F"H!6B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T33 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1776 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30359 42 140M = 30572 253 CCGCTTCACGCAGTGCCCGAGAGTTNATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACNAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATNGC 6"1%@/2/=BH@:.+=CB3;<$"B50@)8)%/C=D$*.2B'E#.+6C=D,=))=?+E1+(=-2)+5-,9-"&FEC"66A"77*/>E,6.G@+H,>621E$!B5;*08.D"3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17T7A85C25C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1777 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24416 42 61M = 24524 319 TTANTACCGGATTTTGNAAAAACAGCACTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGAT F6"&A%DF"!8>D'((:47ABG1'D0CGC9,A)"G+@=9C:%B2%,=/H>$*+?;5,<:$? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C12T9C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24524 42 211M = 24416 -319 AAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGNTTCCCTGCCTCCAAACGA $D:#:>B;78-$G,D#"FE@0?0HC$1D,+<+B98"!@F17B%=FGF/8<=/:H;=G84>%!5@-/%D&&:3.'E047@(>,C&;A(%7EH>B,F<))4H@:&4+#@+'#,)-7!?#297)8GC,+@C-(51,B1D;D#*,2',/06,@-(=81%;*=2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:192C18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1778 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33749 42 156M = 33499 -406 TAATACAGAGCCGTGTTTANTGAGTCGNTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTNTTGATGTTTGACAT %95/+3%'4E%A4B8=B9(',=*..<0)E9;G:=%:23'5.7?.8:>#H',6;1<94),+")?@(%%$00&:&=:CG$#;8;$@#.?!3!$!9'"?5,@=@30G?!/(G!B<(@-6CC>D0(1$?4>200=-@=71FCD@5,-D(6(!7@?F%9$$/0>@"B#E93G(%.1D2)1%(-,%!H.CG0<61%,:=H.+FDAE/+H/D+D0G$/:4=3C<,$B$6H#&5+9C.;1+3H-;B:-038<)>7B AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:85A6T34A14A76C30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1779 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15020 40 66M = 14843 -243 CTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGAGGCCAAGTNNNGTNACNAANCNNAGA $(%(&'%$"###+&+'$&)$+!'()(")!+&*%*)!$)$(#*#$+&)*&&$*(#&$"!(&%!&)(* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:39G8C0A0G2G0G1G0T1T0T0C0C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14843 40 47M = 15020 243 AACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAA 0*:@&19B@"526=%3-E@!BH;(*5%9;B7'(&(7;)+?;=.$/;9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1780 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20356 42 109M = 20465 297 CACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGNAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAANATTCTGCCAG (F":-1EF8H@G4@(5,G5)HH$,.21?2H*+=&A7;+32F90&?(+0254>&<(59=!)3)/'"7,A-'"*),,F7>*@G0!H#(/H.H:@<$+@4!"6"(H*#$+0A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C70A10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1780 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20465 42 188M = 20356 -297 GGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCAGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAANNGGNGGCNA (("()!#$#'%"%(%'+!%+)&##+)'#&$'(#)(#""(!!"!$%%""!+!(###*&!'+*('&&$%&&)*)$'#*"(*%*!**')+*$'+)'!#'##(!"%$)$&"*&+!$#)*((*''$&(''##$)%"%+(%*"&+&"'*+&+&"%)+(+'"'&%()''$%)#"!*'("&)(+$*!###'*#(** AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:90G87G0C2C3A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1781 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37777 42 68M = 37962 238 ATGCCATTAAATAAANCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGA A05?AE;,H+$H""--4FF6H#?'9(%?37)-C8A3*C":1-1/G'.:3&3<%!C(E":1A)(2EB"<($C56EG8#13,*:-+D<9+?7:C3*EB09)44129.$A)/#+(8&;H"?1+-"HA%-(!%A$9):.*8'B#<@,.(%-DDD%=.+82+@- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C84 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25322 42 158M = 25501 219 NTCTATTTGCATCATACCTTCCGTGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGTGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATT "%$&&'+(%*++!!$&)%(+%"')$'+&+%+#!*&#'+&+(%**"!&%&"$!$'(&%*&+#*!(*&(**+"")$(&$"'$")*#%!+)%)#%&!&++%"+#+")$++%!$")(%"+')#)"%!!%#&*'%)#%#*&%(&'&!#!$#$*%*(%!)$%"( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1T3C16A39A94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25501 42 40M = 25322 -219 AAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTAT A%>H+&G6A@'&9E'@%*/2>6&7</B)B-.F8/42!,84!3+:0!'E(%/3<:1A>.63'F!AE@>%D(0FH96C%9A:4.?8CC<7$5E"- AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:24^AGAG55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1784 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46029 42 165M = 45928 -266 GCTGTTAATCATTACCGAGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCNATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAA 6F!):0>$;/=:><=,#(-3G+060H63?=%#)%?>CA5/61;))3A:!DE5>FG?$50D2;!E#,)@C&)";4B*D'.;7&=:E59.6-9?6/.0D&,)/&A*!##!4+$0.D&1H?%71(A2)F?5(0=52"C+=*:A7>*)(8H-&-$C!2C/>5)//F:4% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T111G35 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1785 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25418 42 45M = 25258 -205 CTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCT D!2(<7GA6#(#(8'"G+BCE:7BF.4H/,C5F/6B)%C@!++*0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1785 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25258 42 126M = 25418 205 ATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAANAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCANCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATANGTTCTCGCTGGAA ,$9))-A4(*%!=GFADE9(4@7FH&0A<2)5'>/>=24/"25#0-'&!G6%A&:,,H2$"*<11(E>4H1)>F5A.?2@C,<'B8-@!8'0A(0<-1B=8BB%$,&9?7BH-3?=8/.C*2G(6F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A45T36A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1786 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37609 42 245M = 37567 -287 TGAACATGAGAAAAAAGAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGNAGGGCTATATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAG .2'!3(:+@5-->!08A2A1+E04:*@6:)H=F8=85G<"$G':E'HE%=0A1A:+#AD9%'F3D=&32-(G8B7$!BAD@F9",'4,@.7/G!=/D!>2)*H>)HC2:,+AD21/E5H48/$5(2%%76C(/C@A.$44!,-7*&A%>9?697(:7G4HC$0?(6H2=5C'0&G>8'H-.>)B52=:-)GB70*H+5-*5(@"@2&?(?'G<<&8&13@HF538EF!#-'G86749C8E4H AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C77A7A142 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1786 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37567 42 42M = 37609 287 CNTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCC )#&+%!$*(#&)&'*&%$&%$*#")+(+#)''"&($&+#&(' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C40 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1787 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39423 40 72M1I45M = 39272 -268 NCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAAGAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAA B-+>2*0C20.F!!2@G$=:)@<9D)&)1.@>4?.#'GD!27G:0)#6CG,B=D#2/%!F,!A"E4)+!7DD(A0+2H*C!2F):7*@H".A//30)0C,7H+<.13D#<+$(&B6=F(=4>>EDG%8/1263#-&@<@7!<8#%*.!AF,H%A:C6C@%,H#G%D.7=>169/1F6A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60A20 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1788 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7507 42 52M = 7272 -287 ACCTNTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTG G20?#7"=!6A"33$=7C!8&%9B7G6!-57>7E3H?"=6'C#07D,.$>H4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1788 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7272 42 134M = 7507 287 CGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTNATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCNGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGA .9,5#)79;#(,E8GA1FA;C"!&B1,@'5!/#5E91%=?6#/F)#BH9(+;25>=;>--5E1#07-,?1(AD3.:=9C4""FF4"&1*8$>":A29E/FG942#$&E3F%0)&&B%"14?@'2/'56;)DB"#135:CE?A8/>3=?8F"(<9'6;)<2#%?F3*.$?:>,'BF,"@?''%#$B4+,.(7#17GD!<.$'DH2<')==H!@#089='H#F" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G64A36 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1789 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39545 42 111M = 39701 311 ACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCACCAACATGCCGGA 080-'A63B.DF"?#!;1562D!D(4(802B<+);A(1()2,0=F)E?B"(C#!#A3"D#;&1!2.),@+*7,,1%(439&;F)&F.6F(/?$91D*&(<"0H,$>DB.18 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98A12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1790 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20747 42 104M = 20747 0 CAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGAGGTAANGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGN ('!B1-B,92B/!6DD'AHG/C"+B72/CF&#F?D1A:!?4@CB+8;5F4:$;!>/E3&%7D?<';8*BA6C1@$$D88&36BB<-707% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59T5T37C0 YT:Z:UP jpayne@0: r1790 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20747 0 * = 20747 0 GCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAAC >)BG/#17A2/-?(BC8ADH=F;B?5.261DCBB41CE43'7 YT:Z:UP jpayne@0: r1791 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40627 40 108M3I85M = 40824 330 TTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGTAGTACNGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTANTAACCATTCAGGAACGCAACTGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTNACGTCTCTCGTTT .5?$GCHF,'B.7#)<33?$>>5C@.),29F(39G1;@G3:D67B3:"B-,>HC#7?GEA:-:4-FHBE<&4?(=D78)&,;4!8'/'5E):44>*(A%.6"1*'."F&$"5554AA4B472C!>E1F,<;F#"G16B:12B,7@?4.)>+&"%+&&1)'4,(?;;F;,#1<,0C5(.F&*01%7!G2! AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:12 MD:Z:1G0G72C5A34G20C41G11C0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1791 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40824 40 133M = 40627 -330 GAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTNTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATNTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGC #?0B%%.&>8<<%:E&4-D$H"&'/6'AG64H*!'<>4F05215@04E0"-@A<-3E-)'2!:B:,@-+60A,BF@E%.3H+&F4*"*=+<+"#G)7:!)!8#F7"(40.BB6/7:'C"H(3&'6:13F(@8; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42G29G60 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r1792 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17217 42 63M = 17280 207 CAGCGGCGTGAGTATCNGTGAGAACGNCGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCANGT *'$+#'%+(&"'%*$+##"&+'&'+!'"*'*("###*)'")!$*"!&$!*+(+!!&$)!&**! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C2T11C9A33T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1792 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17280 42 144M = 17217 -207 GCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGNGCGCACTTTGACGCCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGAGAAGCACCTGACCGCANAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGNG +.CG"/@,#E$0#DE@3(1-"36A)8=4C%%7,&50'.%,/+;=7C085=(*@$&35.7DA/;B8AD$#7<&7-G3AD0@/?::3:726A';A5%:@;4<$?&18.>G%'F?<E00EG4*36!1'F2F-$AA@H,7G2:36)!A3!F4D),A)%B9,.F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1793 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28718 42 46M = 28902 234 TAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTG /)31+G)$2!E6?2):/DG(!7F66EF26;5*+=$+#6#$(3*?)/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28290 42 170M = 28153 -307 CAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTNCAGGNATTCGTCANCCGTAAGTCTTGATCTNCTTACCTCTGATTTTGCTNCGCGAGTGGCAGCGACATGCTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCNTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAA $$/(:@&@;0A:2,DD!9!0+G@''!=+,3/79"6(&=+B$&C,9A-%@9B*/2='0,9B"?<#AE4/F@%9G9?.#A&!H/E"4-(BFH68%>4''1?A#F>9AG/65-A<@%?2=-#E,:%"$,B1>?,&,)/*4>G<=77>66!%CCG6=C64':3A9=F*3=HGH+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:34T4T8G16C18G19G29C35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28153 42 91M = 28290 307 TTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACC H-1$'-8)"GB=#E//=-G.F(/9HH(-"#:F83;)/*A1/:FC9;7<;@9(E$4%#: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1795 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 784 40 37M2I24M = 1057 332 CGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGC C*006**DA93&%<(CH2+56=0*1)%38DB@9F.:D@E"EF"32&.&A0HH1<+E"+8+@5D AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1795 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1057 40 59M = 784 -332 AAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGG 9-&1,5///9A4@07,2/C,DE<3:6>#47"B7AB6(!!>31+,D79+<"A=541AAC7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T36 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1796 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21169 42 148M = 21169 0 GGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCANGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCNGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGAC ;BG916B="<<.;&-8B.**=.&!6'>!'A1(-+G@*DC$6/86F:,656->3H1)'%&,>1;!'.;FG0!58&C#6G6>>23<>!5G#3HG90C?'?G.6E9"!6-G6.&).GA,H2A+17C7CAC)/.'A,8*-@A@4;5@A=2/C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76G33C37 YT:Z:UP jpayne@0: r1796 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21169 0 * = 21169 0 NNCNNTTTNTACNANANNNNNTGCNNCCNNNNCNAGCGNANNGTCANNGNNTGGGNN ###$"$#"!$!##"!#"!#!##$""#$!$!"$!!#""#$##$$#$#!!"#"$"!!"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1797 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41889 42 73M4I211M = 41817 -356 GTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACC 56F3,(*?01*+'F5)D*?0(&A%"=G@6.!B4=B:A34H!<<;G/0=;3H#8=G0$;4*#&::+;<#,)"4@/G08)&C;@B*<:&*#79.0??'EB()%74;?%6C"(F/212D0>F.!D3?,11F2'1-$)=:D:*9B(699HD:C&B7#GE2+8':-C(5;%$A5;.+(#2!%,>.(G&6?.D$";"@GH/9?.@#5"1E6##C+#AE+!G0>%9=D>$(9!+(&A$36"EA+455B0D(F&G;G9B(:'"E.;/0#/*2@G*5#'+!2#%E AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:284 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1797 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41817 42 72M = 41889 356 TGTATTCAGAAAATGATTATCANGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTT (>C%HH;@5(%,HA:3.A)+!!9A6F(C2(!G9C!16A'6')1#9D-E"F?/1"4&HC?*.8?A<105*"6/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A49 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1798 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18498 42 40M = 18212 -326 AAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAACN B=+@2G6#)=4&"@&<=-8:H'!A%;#(G(DC(=:=77!& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1798 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18212 42 159M = 18498 326 CATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGA H&5-4+)300@A>!3AG0).#16#'?96'EEF*F/@>3&/6A9'0"(3D3D+E+%05H=;<+*7+19A"'1G(GB#+/H++'.A7H-&2'()B41H:AH"AG&>0B8; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:159 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1799 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10529 42 135M = 10733 261 GGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCNATCTGGTCGTTGATTTGAGTCCGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGC 7"3/@@84!+;#48H<"%42E.;E4!@#0;;;$CG27"8.8#8-)-2%==)-?,>#"1><*997?B?'.AC,46>H=!22=13$1$1&#$%??*!069+>$B52"-":B/8;,EC:):ED()H*FC21AF.8C4? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G21T81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1799 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10733 42 57M = 10529 -261 GTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCT 7&;=)58@(@$G?FHH9/7F63A+"EGG76(H,4#B3?1?H=5.=B'73(0>-5>(C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27600 42 94M = 27731 219 ACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTANTATATTG :5AG:>&C94F3H(B,6E"0.'1H1$7HH>*:9B=&7/22'+&;#6#.;5)<<,H($?'-5$3C9(F<&E%&'=B==G17,+6!8?-6/>&C;5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86A7 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27731 42 88M = 27600 -219 TATACTAAGTGGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTG ?!D7/:#'&79?&A7:'1./!F.-!%/A8)-D39B18++*""8929>==2G>-E7@?B&,(="2+-<21E%+)!3+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T48A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1801 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3933 42 42M = 3744 -231 GCGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGAT =)/"9<37C:/'D@:)1D'>BB-;.F/D7(!)0+0%>;.85H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1801 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3744 42 41M = 3933 231 GCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGNGAAATTGCCGCGT ?CG*/;>-+1F7C+C'B''H*10B1=(20$6%##>*%>80< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1802 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32480 42 110M = 32684 270 TGCGGTAAATCCGACATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGNTTTTCATTGATGNTGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGA @A:AG.;:)>D:C0D3.+DF%$++G#4$=C/91.E?B89;&&06613EFD6H@B$"43*-:11((")'93=-13<)F$6'6@5E#("6&"*A*<5*.E:3>5.02?;.84 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13G50G12A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1802 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32684 42 66M = 32480 -270 GCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTNTGGGTCGA "&"*#%$'))#+'%%%%*)'')*%)#'#!'!()!!"'%+)#'%&()&*)')'##'!+*&!%+'&%+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57G8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1803 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15508 42 244M = 15774 306 TGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCNAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAAT !&=G$C36H/%<=G$.>H8D:A#)?D(9:!E>=4(=3>>>>?-#+A!-D.9:A%/73>868%#=1?F-CHFH'/=0C)),**,&??&$A()-FH.H18GA$6">>A0;-48,.,,+:';;(7#CF0!AC'063??0C-3#*"C*/&4F"?7A)9+(,!9>9=/-)# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G32G210 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1803 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15774 42 40M = 15508 -306 GGGTACGGAAGNGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACC <"HG/C(?E);:0HB%H@6DB)<>6>G6C89,C9<(CB?6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1804 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8944 42 82M1D146M = 9173 339 GTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGNGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCNGAGTCNTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCANGG A&-%1143-@9;:<77GF=H#)(HE&@*,/9CDD?+1%C10B&7:,!3CA>G8$*'-<#%"2@*?903#=BB2><(H*3$+:C(>+C6:@/&8<@9B2-)F<.7B4192E120D3&$2E7)1E(+:64>#H38'31'=%>1B$,$1>=H#5@E/9BB!>E(.#HG:(C(6A.,F'66A8(6-824-9.7G"D'750'*@D6=H%?)"2@/+009;,2B/>%C AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:75G6^T83T5C53G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1804 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9173 42 110M = 8944 -339 GCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAA -'CD3<-<,9)A%7B(#<;570"%A*&'.?<.>897HDH4B;2##3#"%)B>5;,41?C'5-.@?>DA#=@@40@:&-690,BE>B";H0A2B"C#??DC<:,G=#("9' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A107 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31560 42 71M = 31789 290 GGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGNANTCCCGGGAGGTAAAC 5.6DFA17.2*<4"G.5"6;F0H'B$;%#%&-!H+424*52, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53A1A15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31789 42 61M = 31560 -290 CCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCNAACCTCAGCAAGCAGG "2E/%+72?-E(C)D4G??/H4):?=-H$@+@9-9B15"1B5?&+6?#(6DC%DC(B(#'> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1806 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9443 42 47M = 9694 298 CATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGNTGGTGAAAGGGCAGAGCA F:B*49!H.:19A1C7D=4@:%-,$@9D;*96%"05=,$:B9A(=9F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1806 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9694 42 47M = 9443 -298 AATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACAT 3*$<3%')+H$>"!A/*&%DB:&-#$>=F(@F"(G-/(63C*#=7(; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18432 42 44M = 18173 -303 GACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGG C-&F6>(?A&%*$)AC?B)FB)'F3@>52>?#5663H&ED.,GF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18173 42 206M = 18432 303 GCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAA .(=E%E8%+CE:;<43,/F#A0B094C8?8?=%H?#;!24H5-4&"@2E-?+569DB$(8*%'#1&)GA05(/*=)C4?$56;':@-:(+F$=FA=A:>50/.-'FB?8%)%*":34B.F??$A?A+;&)9C(G@?'<3=?A35"'4%/55=+'0E?HB@A@>*-75%7F;'@&8&9)2(&CE7:%F+BB83-1-?C*0=6H> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:206 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1808 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13309 42 128M = 13161 -276 CTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGNGGCAGATAANGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGN 24!D3D>@%CE@&7GE,+37E/+)%#/C*8@!#>)/*H$?9/4*D7(D$/;E%9(-C6+#$&H):?C&*8"8!>?//=(:1%'?9>!*BFA$.F"B?C4$EA;A'2E!,/2:AH"%A2:07=! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28C9A88A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1808 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13161 42 148M = 13309 276 GAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTANTCTCAGCGAGCGCCTGCCGAGCTGAATGCCAACCTGAAANCGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATC ,G?3%!G7G,&$38HF168$8*)6)E6>$DF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G24 YT:Z:UP jpayne@0: r1809 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1573 0 * = 1573 0 AGAGNTATCTNTNNGNTNANGCGTGCAGNNAGTGNAANNACGCATTTTATGCGTTTT "))(##)#&&#''%)#(($)&$'&($$)!(&%&!%%!"!"+%+'("%&+&&)#!!#& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1810 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3970 42 87M = 3970 0 CAGNTGNCCNACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAG *&'#*####+"'%**%!*%&('+!(+$$&$#$*)(%'+%)$%!)*!&#+)%##'#"#$('(&*+%&+'*&$')#"#)$*(#)*)&)* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A2A0G1T77 YT:Z:UP jpayne@0: r1810 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3970 0 * = 3970 0 AGNNTCTGCNNCCGCNGCCTATGNNNTGNCCCNNCCNTNANNCCCTNTGNNCNTTNNGANANCNANAGCGCGCTNTNGAANNNGTNGTNACCANGTNGAGAACNNTGNCCTCCTCN "#!!!!#"#!!##$!!##"!###!""#!"##!"$#"!""$$!"!"#!!$#!$!$""$#"$#"$!$!#$$!#$$"#"###$#!$#!!$#!#!#!!$##!$!#"#!$"##"!"$"$"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1811 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27846 42 120M = 27596 -370 CTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACANACTGCGCAACTCGTGAAAG !)FH3F2$11+1"*18/C%3:21AD;35@1!).C+0!=>+3<'2&@CG5(,=C';6/A@9@/.5$83#53&E-!%)9/)1G"'1C)"$)A!%#,$D/&?(7=*"/A2/@%"'"CD&@'.= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100A19 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1811 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27596 42 250M = 27846 370 TAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGNATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTNATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTTTAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCAGTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCT ;+6;9=C5;CGA;"!8.40&+G"8@(>:)A<8DD"57596AE!&%@%:G(H&0%H-/F=<95""3.3=@6"H!=!H891@!A.-@EE>5G7!:.3397)8+!$*E/1''AF;*AE'!>?01:,3H0:9-G;*2<9831)2!?.G>H7!2/0GC*8&"9FA375,+&%+69!8*!%B#H84E+.6+>+6*B<%9#9.6'!2"A?@@B1"/"*H'C!0'-$0(025?-:HE AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34C49A67A41A21T33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18652 42 80M = 18498 -234 GGCAGCACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGNGCGGCGAACGAGGC "*0%1%;((1"'B#-&>::"%EB$2B*-7261,,%"3<&(G,+)<37#@,$"!',:F(F%E,(8A$@.G+(?08-$&%10 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G59C14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18498 42 49M = 18652 234 AAAGCCGGCGAGCGCGGCTTTTCCCCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGAC D55E'+H;?@->)9385!*2G;F24/30D-B!%3"0-G=01&818!+B8,G68D?,=,0(D0DC3,;;A1@=0"9F<-+!&8?D,!G>7.A8A9#9*(;9%E(:?79/+B(>>D6"83;78<=&:2:B%.33>.#<8(4+3=E)$';C0,)65:3,H5%A@D1B#G71:%#1%"F?#!(>1'7E)/D$4:.E/41'#B;H& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1814 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21706 42 244M = 21490 -460 AGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGNGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACNCGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTT '*0??+9?<<1:)5+&8%-1DE930F1/0)<."HE5F9*H1&#)C!#%(G=*E"(;%3$<:370;H5%9-?3?"2;','2C8B$DG"$+7=F+;CA602%5&9358"%:!?.7"5&".)1;'&<%%H0.6*,;G=H0!8.>E;D?39)2A$.:9>?=0!A-"5(')!E!A=,+EE?"-*7?/"(%44+$'9C>F>$)"C-(GG'+H4G?&"$7<*/H"9+&GC&'B= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:120T58A64 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r1814 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21490 42 216M = 21706 460 GCGNANCACANCGTNGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCATTNTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACNGGGGCTCCTGCTCACAGTCTGAGCGCTTCAACANGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAANGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAA '"!!'!(#&(!$"&#%)+&)(&)#'!%''%$"!%"!)#("(#"$'')%"'()('$''&%+%$&%)$'*%*+&#'*)#)**(*)''"%&+&$*%)'$(""+&##$""**"%#$#)'%*(#&!$%(*')&"%&""%*"#$$$*)'+"%'+)"("#%"(#(&("("$&%%%((#!*&$$%'$!)%&"+&&**$!)$++*(&*#("&++'!"%!$)&#&" AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1A0A0A1C4T3C29G1T31G7A17G7G36G66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1815 77 * 0 0 * * 0 0 CAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTNTAGGGAGAGGGAAGTCATGAANAAACTAACCTTTGAAATTC E6@)$276;6C>!H,)A"G,=+@/26*0;ED3&25GG6E:@!(AC2<$H+F$$%1D5=HF5<3#=*>85-*#-E=0 YT:Z:UP jpayne@0: r1815 141 * 0 0 * * 0 0 CATGCCANTNAAAAGAGAGACGTCACCTAAGCAGGCCCATAGCTTCCTGTTT *")#"(&")''$*+*'*&+#"#"%%#$*!)##''&$$"$'*!%!#$''***" YT:Z:UP jpayne@0: r1816 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22807 42 192M = 23001 242 TTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATNATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGNCATAGCTCTNATATCCAAATGAAGCCATNGGCATTTGTTATTTTGGCTCTNTCAGCTGCA E?('.%(6'D.D%5?5%.944A7!8:!C:.E>B13>.2,'!H#(>!A*:;01,;G>,76'2(,E>0A;=+(4A46<$?0,&=HG<9B$3>$.E;9-38#%18.>;/:B5@H"@<35FG0*17:H!1,3G)/!+0A/*)$6+>++H'>C:?+F1,>7%7@3'@5)3$%.BC1$7"0&=%:=&(>E:$0+7'/- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:40T90C9G18A21G9 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1816 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23001 42 48M = 22807 -242 AACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTNGTNCNGGT &%!&$%'#&(($&*$##+'*(!)&+&#(&##+"&&#"#+&#&%#")!! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1C0G0C35T2A0T0T1A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1817 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6857 42 80M2I100M = 7037 220 TAAGGGGATGTATGGCGATGTGGNCATCGTCGTNTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCCGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCNGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTC ?-/;");33>589-C5,"HA6)2"/F-=<.?+*,G98DB9F2;677?D?&&-?852)+:>,579>82G$A@&)/:F)'..H2'HF#@;1=;,D@>H-/$A52<+A7D=)$G6HB@8G.<;B;0BCAB(7#DD:+=$58<%8$30F$,;!7/'7<.@!5$=&10,$7'+2$F+/6H>-,&<@= AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:23C9G43T32A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1817 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7037 42 40M = 6857 -220 TGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCG %6%935(,69#0=8253-'G'0>'A,52%3E?:H.$/F.E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1818 77 * 0 0 * * 0 0 NNGANCCTGGTGAAACTATGTNTNNANNCCNNCNNNGTNCNNTCTNCAGNTGNNNCNNACCATNTCGNANNGTANCGNGNNANGGNCNCNGNNTCNTANNNANGNANANNCATNCNTTNNNGATNNTNNCAGTNNNGNNNGCNNNNNTNACNAANNGNTNNCNNNNCNGCNGNAGNCNNGGGNNNTCNNNGNANNGNNTNNNACAANNGNGNGNTNTGCNTGCNCANANNTNTNNCNANCNAANNGGNANNNTGNAGTNANNGNTCNGTNNNNNNAGNTCTNNCNTGNNNNNANGNNCNGCCNTTNCNNANTNCCNNCNTNNTNNNNNTNTNNNATCNNNTTNNCGTANNNGAGNGGNNCATTNANNNTAT #"$"$"$$"$"$$##"$#"$"#""$#$"$#"#"!!!$!!$""$##!!$!$#""!"!!"!$#"##$#$#!#$$$!$"#!$"#$!$!"#$!"###$!#"$$$$$"#!"!$#$#$!$#!#!"#!#"!#"!""!#!!!"##!!!!"#$!"$$$!#!!$#"$#"""$""#""##$#!#"$"$"!$$!#$#$#!!$$$!#!$"##$#!#""###$"$!$!$#""#"##"$$#!"!#$##!!"$$"#!#!$"$$"!!!!#!###"$""#"$$$#""!!"!!"$$!"$"##!$!"!#$!##"$#""""##!"!"#!!#!""$"$!"!$#!""#!#"$!#!!"!#!##!##"$!"$"!$!!!$$!""!"#$!!##$$"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1818 141 * 0 0 * * 0 0 TGNNTANANCNTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCCGTAAAGTGATAATGATTATCATCTACATATCACAACGTGCGTGGAGGCCATCAAACCACGTCAAATAATCAATTATGACGCAGGTATCG (&!#%)''$)!*(+$"'(&)&!()!!*'%+!!"$(!(#%+#$!*+(&!++"$+&)&$)#"$#)"+)(*)$$!$!"!%""'+*!#''#(!!"$!!$!"!'&!&(#&*%)"$'")"('#'*((+)!%"&$$&))&"(*'+)&+$'*%''#%$%)!$$+%(+##!) YT:Z:UP jpayne@0: r1819 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14817 42 42M = 14817 0 GCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCG ;,%64,(8D07!%94+?-&$4./*+4!D9H!3$5B5<71=F$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YT:Z:UP jpayne@0: r1819 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14817 0 * = 14817 0 ANGNNCAGNTNGNGNCGNNGNTCNGAACNGTNGGNNTATNNGACNNANNCNCGGCNANNTTNNTTTTNNNCNGNNACGNTGNACGNNNTNGTCANCANNNCCCGCTNNNANACGGTANNNGCGANGCGNNTACAAANGNNCANNGANANCGGAGCCCNCGNNAGNGNNNNAT "!#!$#!#$$##""$""""$!#"#$""!$#$$"$$#!$!!!!$!$!##"#!"""#$"$""#""##"""!!#"""""####$#!!"#!!!#"$""!###!#$#$"!$#"!!$!#!$##$!###"$#!"!!!"#$$!"##!"""!"$#"!#$!$##$$#!#"##"#!"!!#!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1820 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13818 42 159M3D396M = 13777 -599 GGTGATCAGCCGCTGGCGCATGGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGNGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTACCGCGNTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGCCAGANTCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTNTGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTNAGGCCGACC <'#H'&"$/4!:?B-24G*G1;B2?*1EECD2'1%-G>H:C2!.7"E8-+2)>-?HEA:@/C?H>A+?3@A::5E'A1&+?*DB*1'$G!(8E!$2#>$1!F=/+A="A/@2GA4B=!81?B>9-;+37.--E&,H#)".+39#D>1$H6"C*1=(7<06@-E?@0!=0))/215/H?3:,?<>4-E#8);,+?'A),'>=3'E.5:#=&43&-/%"B(D>BD>E$6A/559.->HC!?&;:B#H/@##2,FB&"4H">::F<8GBH(7'B)!=;,47C*2>7$2&1@8%>=6!C(9GHG9".<5%5@.4;843H,;%3$%BG?<3EC/,F#<-0G87A:9!9(84.?&<.1E?H<'6*$38C&@)G996G*C&1<.-(%?5$.D?)%.0+H2H?5+71A#$%@ AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:11 MD:Z:21T25T93T4G12^TTA162A4A128A89G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1820 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13777 42 41M = 13818 599 AACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGA <>9H&H;*G*01*#E@,E#0-%3*B$$(4-".4(6@E&25* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1821 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17294 42 163M = 17488 273 NCNTCGTGGATAACGGGGCGCANTTTGACGGCCAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGNGCGTGAG %,5E)>?>;%?#$0>/&!70<.-F=E3-"8!A89>GD=1+=#%261!F?C(FE>C1(&9)!()?D1B'*9E0934)'9?CG-FFH!8H$#(-*,B364-H&(C"<(7461<;(C:0(&3&<':$GB3!:+".!(#(.E2A#;H$42-1/CH4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C1A19C9G122G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1821 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17488 42 79M = 17294 -273 GACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACT )<0,E=..$/8*>;2&8@;&C1B59,<%EC;?H?G*8A>2?(B2A4<:DD#=)%G?35,G0:F@+=)5>G!%-:&@*7A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1822 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36183 42 137M = 36183 0 AAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGNATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCNCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTAT $&)&&#!+)")"#!+*"+$#*)!$!*(+#(#%*'$%#%('#!#")+("("$'+%%+"+%&$!##+&$%'+#"%$+##'+"(%!%*)%*)'%("$#(&+*%$$%$)!+"%&*)&'$&($%)#""$&")*'"#++'"$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59C49C27 YT:Z:UP jpayne@0: r1822 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36183 0 * = 36183 0 GACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACANGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCNAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGNTGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGG 3?,<%4-*B:<(D$&?A$(<'/.H*':<+6/6-6(7'##*E170-.65?)0*($80:,G:H(D7!H;?-EB$4H3:%:%(CA58DC6F4?+E7C+1CA%"D:AD"=$$G%D3(H?3=.B4H$7)$!2CE*+&):$1(;?/#H(@FH1,9DFF714%B&/746 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r1823 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37449 42 35M1D213M = 37384 -314 TCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCANTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGNAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGTGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCGCTGGC DD>1C07@&GB"1:3#.)-9352C(<0:1H?(9&CA>3$$"+3>8%;08)5.6"/%8E!B+95:33F.%<:0%AC=*E;#G;.,3(D';E00H;;#/%79H").DD:85F(.';@D(C;0BC0*$#&53",@!HF!1.#)B?CC.E=-!$9=//5@<$5&&8D+<*;=-H!.9H>-BF)6E4?%9.6H$2-5:B4.::@5!61BG*G52((#:/9408@&0C AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:35^C43C45T53G63T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1824 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24641 42 163M1I13M = 24817 291 AAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGNTTGCCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAA B*<5%;!GDBA)2=)-:=E,22!H?/%5C&H8C&?*H8/,<8*4<8D2D2#D+3EF+#86!!E;.F0:*5AH2#H)++ED(%+D!:';G!+C+#(8(?4;%'&5;@-#?E&18$#D@=F2&>,=C/H:7"/.&@A,<"0AA?E53E*BEH?:%D@'74;.&:HB5.A&7:0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102G12 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8874 42 97M = 8971 250 ACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATC ,77E5<84H802@(*)9/=)%559/@<*1)AH"'52*<0"EE42#,D.$@E2-4==(D!-D-6#D04&$A!:!A,C"*#3;G,;9$C!))#-A?6)4A AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:12 MD:Z:37C12C15T65G36T1C9C5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1826 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1903 40 88M = 1991 275 CCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGAT ;H9=1#H!CB1#4:(F*@%(5GC9:2*,A&!;&F/8";)B#"75+7>$!B%8)H%$CA3,$:;/D(=/B-B902"@(00@7%C!7*98!;,4$%4144@5-&(.35@+B@B2F-1=<#;3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C79 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1827 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23983 42 132M = 23854 -261 CTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAANTAGTTACACAGGAAATATTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTATAGT #$&+*+#+$)'(%"#'#"$)"%%"$*!&+')+%&!##&%!#))*))*"""!"&%('%'"#'$)#*!%"'$!*($&!)*+$#!+$$)%&+#$!$'$)+'!'*$(+!)""+)'*++)!"'''(+&)(#%+)))& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71T16T39G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1828 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20517 40 82M = 20677 239 CGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTG .:9!%$9-,G'&7-5=-@,<.6C5C1$'3ED,G;%$<=E?C7A)5&H)7B?ECE?->6?,#,9.G00 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:6A72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5905 42 76M = 6061 245 CACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGANGTTCTACAAGTCC '(F;'0?CG4C1!B7-812""D0('#-%@?%5,G*8F@/B15,"D%'!65;>B4,1+>1!;=F)#C36E4B987;: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6061 42 89M = 5905 -245 GGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACNCC '#&#*$)++)##((**%+#'"#+%(&+%%')!(&!(!"*"!#$+$)%*')&+$$'!&%+!!#*+#)*)"&'(%!(('(#!)''*#+!$# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86A1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1830 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9760 42 131M = 9589 -302 TTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGNCGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTG /C)C?CE2G=&,83>HE28)3=BG*0300E)?:?%!00!'B8"';"7(5:):%,5+$F;0G=!@8'5'0>?C><@A7(H0F.#AB1/G,,@+?9,#=2701G&,"53>H781/CC8904*%<1+455%8/1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102A28 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1830 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9589 42 160M = 9760 302 TGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAGATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAATATAACGGTGT +H3&D304='+:!1C'>AB!D:$>DG@EHGB1+,:=E1;B>E99G3+6?:!!'1C&58(6>:<-!C#8=GG;'F@=.C%G-#*&AD$?60G.#HA;G:>@&:*A);4/'4.4"B!<6B-9??:D-0"$E)%C1:D%%.E;#BE/@+,0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85A63C10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21736 42 47M = 21783 291 ATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCNACAGTCACTCANTGNCCGGTA +.A+#A;".6/29>$A?#D51B*?-7109@<7)=@3(9,+4DAAG4E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C11T2T6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1831 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21783 42 244M = 21736 -291 CAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCATCAGCATCCGGTCGTTATGGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGTCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGNNG "#%)$'%$!""#()'%(&!""##'!")''&*'(!&%%%'*#')$+*$'(($*%+"')'!+##&!#&')((+'(!!)!(+#()***)"#(&&&"*)**"&'!"(!!#(#(+)"'*)"*)$%('+)%+%#(!'+)%%%'*'*+$+**!"$%!$+%$&&#+!###"!"$''&$+$%()$+&"(&&%$"$%(+*'"#)++$)"&#*)")###)"%%'&**')$%)')(+%$)&')!((("(+''+#"% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:49C11T5C113G59C0T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1832 77 * 0 0 * * 0 0 NNCCTNNNCATACCGCAACCGCGCCCGGCGNCTTGAGTGCGA #"'("'$$('+%&!"(+"*(+#$"'('(&%+$!'(%#%)"*' YT:Z:UP jpayne@0: r1832 141 * 0 0 * * 0 0 CATCGACATAAAAAAATCCCGTAAAAAAAGCCGCACAGGCGGCCTTTAGTGATGAAGGGTAAAGTTAAACGATGCTGATTGCCGTTCCGGCAAACGCGGTCCGNTTTTTCGTCTCGTCGCTGGCAGCCTCCGGCCAGAGCACATCCTCATAACGGAACGTGCCGGAGTTGTAGAACGT <@-H>8=EB2'C%4+H;&!<%#:*F36+!DB=&B'CD6D6-!2F#FG0#?3-=30@:/HD;3.E=#'/+52)4';!/-F(:-#&?'-/'9(D>,H9@2.?7?D1*E7'8=C&=H*,6!@8(&G%B=DD7#()E:E64HE2A!B@0..=11A9G0G(7A,+,"2F8.7<@-##=H,C:"E;!42DB:: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G73T15G88 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1833 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32251 42 76M = 32327 260 NCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTNATAGATACCAGCAAANCCGAAGGCCA !+"!!!)%&+#&%("!%+$$&"+'##&"*($!%##**!+)+*&'%)"$%##"')(&!#!&*"!*"+""+&!)!%+' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T48C15T10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1834 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40775 40 43M4D71M = 40911 301 CNAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTNTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGNATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAG #!5+"/DA>;+F=96"?8D/<#1/>&BC!=A/-*;17$4+.$G?51@*H>5F**'DGC;?&&/;E,9%'F$B*9>+3G23*7)1%@+>DH3;/>"5=<$'@$9HD9CCD AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:1C36C4^CAGG23G47 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1834 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40911 40 165M = 40775 -301 GCCGGGAAGGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGACGCGTGTAGGCGAATTTGCGGTGCTATTAGAGCTTATACNGGCATTCGGTACAGAGCGTGNCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCGCTGGAGTGGAAAGCGAGATNGGGAGACAGG @<782@=G9F/@:B<81$&1#/>E.<;?<5'A#-1*!C,B3".*F:&4"A7".&@.D2#9G/5.07:>''*/+D:4"+>!-B(,G.1.7<=)2.5%$*%#A=><9,-$CD!D94H*-B(:/#+=*47'("(0>028.D>:>%@H!*: AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:8T34T20A17A20G30T19G10 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1835 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13324 42 123M = 13530 280 GCANTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTNGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTTGTGAACTGATTCAGGANATCCGGCAG !#!#+**(&&("')*$($%%+%"!&!$('$'$#))()*%!%(()#)%**!(&$*$($!'))$"*%(+"+)!%%%#&!#'('#"$+(*(#)'(&)(&)%')"+!$()')(%)+#*&(%&"%$+& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C0T40C51G10G5T9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1835 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13530 42 74M = 13324 -280 ACGTTATTTTTTCTNTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGCNGNCAGTANCANCCNN ")')'&*#'#&#(&#'#$#(+#&'')&)%+'#$&$"*')#%)*!(+*(%%*%%&!*&+$()#&&)(#*(!#)#" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:14G42G0C1A5T2G2G0T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1836 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40908 42 87M = 40671 -324 CTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGANTTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAG 1"&(..:D#1$."8$9652A!C-49%>B%B,9702%#.8160'FGF6AF:.3=1;A8E10)3-)*G%21,2,':@=";;#9E6+%G, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59A27 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1836 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40671 42 64M3I83M4D44M = 40908 324 TCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGNAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGT 9$;.0&-<%))<+441+4@(4,6750<":C*D:H-;0?A2/F$&>;1&H/)'HF@A%-+D4=#?A?8.H4F8"6;$"7B#8 AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:31C115^CAGG44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1837 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6349 42 75M2I42M = 6179 -287 AATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCA A.BDG)03A89.7>>@+23:6-'<>E/)(&!9#F'EH1E7H210'@6:"4'3-AEF'9E8AE#B5;)>1HA!*)2*$$'$-<@&=BB#+-=03?$=*(E(E2-=)-?7*'7B0*'GG#H AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:117 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1837 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6179 42 44M1I29M1I97M = 6349 287 GAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTAAGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTG *>D62A8G(!F$<>=>*-7%5(9HCD.30<.DE!>>)E+;4C-B9.5@EFA>%#!(3%>/7G;/EGD44A"5!A!+C='>'(F:()G+@%'C!)E=F$(-7"<:4!%G"67"**##9;=<;-A9"?-;:=FH!&3-HA6:&<=5=D?8E.(*B9'#,!:6*'F:>*H-?+H# AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:114C55 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1838 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30740 42 105M2D14M = 30603 -258 ATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCNGNNTNG *%$("%%'(&!#!&'#((")*#()!*+(%++!*+()+(#("$$(*!!#'++(!(+*%"%$!!(*!&&"#"*+#(*%)+!!##&++"%)&$'$*&*''%(*()&"'+)&#'+!)*!*&!) AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:105^GG7T1T0C1G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1838 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30603 42 67M = 30740 258 ATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGNGTGAATGCGAATAATA 5B0>=9)B"-.8#92;.."%4"C!)8)GD388(@5<8?&D,7GE64 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48G26 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1839 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39074 42 101M3I14M = 39297 298 AAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACCAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGACGAATCCTCTGA 7(2#D@E)9+3:BD#2'"&:A69E3>!/'7$3B-3&4392%5@)";$;!G?-C%FBD7&A&,72<,&"A,<*-)/+-0(@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r1840 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17580 40 102M1D37M6D43M = 17769 249 NCGGGCGGTAAATGCGNGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGCTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGA %75$,(1G=BG!@=;63C(3!AB=:G)-"1:F=&?D*(1BG?.9+15<+-?"34E,<":C!H'&-,-4C!!-#025-$B!44<.@#0C9,;:G<3E@ AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:0C15T32T52^T37^ACCCGA43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1841 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33074 42 207M = 33074 0 CTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTNAAAATATCGTCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATANGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATA D=C);A+/&4E";CE3#':"3+GAAD<&436'GF:B4%>3',7&D"4E,G.<035#1"G5G)+4#+G",=''0D3*H*-?$H*0%!54.A=B8#$/#4D0":-81,A1)D-"BAA2?F./?(86)@8?B!;-;@, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:62G9C94A39 YT:Z:UP jpayne@0: r1841 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33074 0 * = 33074 0 ANGGNNNTTNCNACNNTNTNATNGNTCNANCAGTCNNNNNGCANNCNTNAANCNCNCATGNCNANCNNGNGNNNANTNNN "$#$"!!#!$#!##"""#$!$"$"!!$#"###"$$$$#$$"!$!!$"#!$$##"$#!$!$!"!#!"#!$#""#!"!#"!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1906 42 60M = 1675 -291 GTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGG CAD"<2'1GH+8:B=+%;A,.C@)-8193CC%(B7,A&**1>-)FC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1842 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1675 42 165M = 1906 291 TNNCCTTTTACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTCTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCNTAAACACCACGCTCGATGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAG '!$%))+%%$!"$+#(!("")'#'()'+!(#"'!!$$""*!('*&&%$"*'*)%(#+")()"!#(*%!"$#)*+#"'#'*+(('!'#!&!(&!&'*)'*!*+"'!"$$&$#*#*%&+'"&+)")()'*$%)+"")*"(*(")"))%#!'$&"()$"**"!)(+'& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G0A5C44G50G15G8G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11119 42 179M = 11022 -276 AGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGGTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGTCCCGACGTCGGGGCTGACGGNGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGNAN ##$*$#'!*)+)'#)"%!)'+$)!&#+"'&!)*!!**"((((&*(#%!""%&+)+&"!%!&")#+"'%"""**!!%%'%*"&!#&!$"''(*#('+#))+&%$)#**!""!))'*$$("&''+$##"(#)*#&)"$$%!%(!)+(%)&*(*$!!%'!)(!*)''#&'*&(+(&!+##'% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:93C26A20C34C1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1843 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11022 42 97M = 11119 276 GGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGNCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTA 94$C8.C(*B#+@0<7>$.CA3&5C&4F*@,":*3/E"46DB8:>#*7'+!F6;(%%#&,!@9G9$FE09*A:/2%;<:%G'8B>21/$>'D?7.&6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G55 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1844 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36214 42 291M = 36505 488 AAGGAATTATTACTATGTAANCACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGGATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTATCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTNCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGNGACGGGTTAAAAATAATAT (((+!(!'&#+!%"(#"(*%)"#+)$%+#"&'#%*!%)('(&(+')#$("%")"%$$%#&'!)*&+)')(#%#+*$"+*)'""#"#)($)((")"$#$'&&+#*+!&%$")(#"&'+'+)&)**%'+*#%)!")"'#*($!()%+)(#)!$""!*#+)%)&*"#&$'$%(('"""+*"#&&!)++&")##$%")&&%$!)+'&%)(!%$*(%$"*('")'')"*+!$)"+%($%$&'(#"'+*$#')(*(!+$*#'"&+''$#$')++")**)"%$%+!*!("(%!&$+*) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20A135C39T45G28T19 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1844 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36505 42 197M = 36214 -488 CCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGATAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGCGGTTCCCCTN '"*(&*;/@A=*:D+#10*!&6./.(@"(''$:)4/=<8,3H3F$$81CC!66@@$:!@3-/E3.BGEF%4CF5+<&-F"E0+FA"*'AG,$)&9C6*ED3F.?GA+&4*C*D.<<#1-D97F82';#E991HG<$F%F0A7,G@-$BH,C26H"=;$(E/.##)4=)B%")B")2635-5@!A+).:0/-":@:,) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:120G65T9C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1845 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40065 24 45M4D36M = 39948 -202 CAGAACAAGCGGGCCAATGCGCTTNCTGATGCGGAATTACGCCGTCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGANTGCGAGAATTA ED8/1%!7B@%+>=-32A)2A>+E2(=4:-#!.FG'(@"G!2E)=C18.&&"&!G/%+D;:?"=:$*&/E:7>@D( AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:7T16A20^AAGG24C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1845 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39948 24 44M = 40065 202 GTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCG :C'@&&$!(6$9):G18@=/'$*$906'1@842,375@4A'5:D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26865 42 63M = 27082 286 ACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTA 9E$*+6*B)4(:B<9B"@,=)+AD+;>F.6<@4<.D$;*C8C=FC(!1>*:7DA="=%$52&* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27082 42 69M = 26865 -286 AGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAAC ;ADA2D26)=D5FC.+#812(199"616$-)&GH!3%=69;@&"$)!4B8E?"9A(F!5+)243B$?19 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1847 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29933 42 198M = 29816 -315 AATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAA @$4A$H7E&353:9C8&?"34GD<1!)"6--9%D#38%>.E($70.%%B;"=>H":),"*G%4&5=H@;&F0#(+:.7,(&?*).#@:#!-#=G/E*FC./D-8B.H"4E>'7"1,=(D+38+@7?5A+4'693&$,@$B%,3A8($HC/).)+!!C>;,-5)1-.'(;2?!A$()5HBCG"G7/42F9&-#HGF',&.A<)43(0/-:3%2=/=%!/G/H2"")/+@3A0>;5+%4D=H:;4@)G/1:@D9/;HF+D-&"3/6,E3H?$%%*')%(!0.''D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:129 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11399 42 93M = 11249 -243 CCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTNCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCNGGATATTGGTCG *(ACG-E40:EB0.BA27"9982,8A1F>';?2-,.$620=C$808@H-6=?)2::/)=F9*(6'0&33)>:19#5,9D986(?A'4(?2#:0=@#,6'1:.HE0=!/%'$!2#99AD''3/!H*G#>)(B%+@,$$;'F0$32$6&99,G& AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:12 MD:Z:0G6C1T15T98 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1850 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 137 40 150M = 3 -284 AGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAANGCNGCTGGCTGACATTTNCGGTGCGACTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGC F975(4H'=+80(GH$:.G829>H#4>/+#@A*-/"B=!6'#"!)H!3H%4C?%0F&C!;5H2)?,9:D:G,%!.A=9":$"@@0GCG(B'.G#.3+!7:*@3H.9.1H(F4$0E=@#@5@911-B?:/+)"8368@B+%D7EH;C2!F@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:70A2A14T8G52 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r1851 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45554 42 92M = 45441 -205 CTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAN ;*2-:(7$;=*"22#B;&'&(;$H"#E%H.=#,C;DC<2C<0H.?%B:34!$&F'FF@H3+5!314D+7<@)-:/0D;AA=H?1FG#F) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1851 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45441 42 77M = 45554 205 TCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAGAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTA "@-G20-"9,F?HA"HB9:'#.#(%E0+63#*;!F=2.2C@E9?6<7>;:*4C/=&E$%>5%#+;!-$6@;'7>F1+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1852 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34722 42 262M = 35006 366 AGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAGAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGAAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTNATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGNTGGNATNGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATAATTACTGGACTGAATTAGTTG -23C(&0<&-#>(7@H=A!@695%/,9)4$CG/>8;4%+)D?>CC/%>2;4!.*F70E%&>.DF1E2;14A)!E)?#:4&76/74!@$',3$7>#190>#9<6-A')(1>B$1@*.@80''B:,"-0/2(0%4B'F=:)-=-)G;GD6/840>.49D6>?CF,H>F4#H:,=8);E#3;=?,:E9.H89/AA%0-173,#7F.,(";9872>(1&E7."8>;H#=*"6"+D@2A6*/)E'9> AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:68A21A12C63G30T4A3A2G30T20 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1852 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35006 42 39M1D42M = 34722 -366 TGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATNTTCTGGCGTCCACTGCATGT 1??8E:57(1)917?C@%(E=-@&1A733+9-@.:?>:#$F(324+C=@E(%?:)-B; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:39^G21T20 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r1853 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7207 42 47M = 7085 -169 GAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGA (80=2&B=;D?6*6GG>?7C/5.#,3=-&!*);.3(G,&"3>'*);2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1853 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7085 42 55M = 7207 169 GTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTC )+#*$)+*"%&$)+)'+%!(!*$"#&(##)(()#"*%'%*%#'$""$!)&!*%&$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17610 42 57M = 17411 -256 CGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGA 4H++%@!G0-.@)/,?$%E=#1>@%;-&0/7,<86/F@$E;*F0$/("HG!&A0E). AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1854 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17411 42 176M = 17610 256 AGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAANAGCGGACGACGGCAGTTAGCGGCTGGTCAACACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCANGCAACTGGCGCTGGNGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCG ?A7!%.!/9C4GB)2=7C5+4>F64/-%*&&31!)D69F#E&"C7("G4>)1(!*0B*;7+-5;H,E";)%$3$2+;!(9,#'AD(>6A6+5'*EH%1FB&)A"G5@(?"389<*>*F3-D$8<%;4*D?0=59E?$=;DEGC9E-?0)GE$1:/C AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:41^CCAAT9C15A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1855 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9166 40 144M = 9344 251 GGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACNCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGAGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATG +"'')&$!%'$%&!$'#$()%!#!$%&'*&"&"$(+)*)"*)$'(#*&(*"%'!'##&*!**+%#+"("$&&(%!&)($*'($+"#(!#')"#*(*"$*)&*!&)+($"&!+&%$!%!"'!(!*')%$$"(+%"*!+&'++&$# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A27G43C62 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r1856 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39865 40 80M = 39945 271 NGANCCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGNAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCA &#(!!+&$)+!!&+#$')$$%+(')!"%"&##""!++(('!)%$"'""#%))!$))*!%"$!'!"#+*#&*"%"!$&$(* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A2A0T49A25 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r1856 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39945 40 163M4D24M = 39865 -271 AACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCNTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGNGCCAATGCGCTTACTGATGGGGAGTTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATGT BAG1:92<7@+5;?,C/#<20(F-5+%G+H.=E7>H?G?D=HA:$767+3H?5%1B7F-/3$##G<%35="+C-0G)- AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:51C79G19C3A7^GTAA22A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6706 42 120M = 6529 -297 CCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACTG &8'5>21>.9?CA+7G3*F&1.A@G?0)@B(259=&9C()+*4-C60D=D8#4G!;H)83$(@,;C+B3%CE3'*/3>6'"*F0='$64#@2<%>F'/396D?BG.B9@FC9:"7H,'3+#;&86C('-)7@E),E:C/#,9>$$D3*$/4F9+: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52G3G20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29729 42 48M = 29909 235 AGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGA 1/C+D00E"4+5+D0D.=$#>91)G8F@2/1G"#:A7F'F9B.35>-, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0A46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29909 42 55M = 29729 -235 GAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATNTCGAGAGTTAC *C<'&(:3>/?(H!$>BGEFG<&1@34/4#"<=2%++E+!7B4;"@>;",22>3, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G4T6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1859 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3351 42 192M = 3062 -481 GAGCCCGAAGCGCATNAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGT @H8>%@6:%,#?F%5@11#7=>C)2=A&@$,'B#7G.C1*A.,?2B?;78!#+2HD@G(;(*:(E.CB7"=-A#)3!-HD#%1&-'E31.?3*.-CD5F#+.%EE8;(!)"?/(&0A?G2$#3.2-)1=?=H:A)(7@81.A0+.'/'?:)@6%"8?>H,-H<+3#E4&3<#>F0*>@#/;)7*"5>CH;AC AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C14C176 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1859 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3062 42 289M = 3351 481 TGCGTCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATNACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCNGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGT 'GB!7'E5:HF8;7F#$.)F076#DG>@>%+5G&G:3.$62.!D=!7&6$5D>8+4FB)28%3;2.=)"$<(83!,=,(<:<%6.0-4FC#"F74@4H5;:62;6<9">8,(B@+8(A(3,H%H//@;6.<<%#20%5+4:?B3.A>3#:(#9=HH(4):"BF-@>G#,8:$@57>1:,+DG,/+G2)65*D*)-&@!6DB8;DG?BF14:&"(#%F*'-EF4A"-(%"EA&9?1H,8(3G=FB+6E>%;&5A$;+#B6"4(9AA AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A133G51G99 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1860 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39859 42 67M = 39623 -303 GTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATC ,A$&6?1#76H$6=H2:(6,?**B==C#95501-8)'2E!84)5-66/8,06D1!>0@#BG"0?>B4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1860 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39623 42 117M = 39859 303 GCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATNATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGC 38-/G2,).D&.H)2F!%@";9DCE0$CB(;(9E57D==H"4.%1'6DB$?0B';A3'F$%=A)5;AD6$1,)F:5.2*./7DG?->!132;F(/*@%@@?8)()FG.1'/@B:-!# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1861 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38993 42 63M = 38993 0 GCGGCATGTTTGGACCAAATNAAAACATCTCAGAATGTTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAAT 687';=;:-,'84,E@):,H=0@+51=7AEB-@->@$>E0/&A8$;)1D70"7$/H%*B4,;? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A16G25 YT:Z:UP jpayne@0: r1861 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38993 0 * = 38993 0 NTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTNGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAG !2+9=?+4C2(E><:*5F;($E-1!-9*,G1?06B?.C<&AB07F-91(F=;@46)?/G1B/>:)525/5$-)#883:.3616'HF;!FCA!$=CH7<=5=$*>2+'5H@7-1"8&,G(58+>12A)G,65 YT:Z:UP jpayne@0: r1862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26062 42 141M = 26011 -192 TCTTTTTCTATNTACTCTCATACAANCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATNGCCTAGTGATTTTNAACTATTGCNGNCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTACNNGNNCANGTNG #"#"'#(()$"*+!&!$$'+(#&"!((%!)%&*&$+&("'"!*')'#*$#&))($%)%%")*(#!'#*$)#%%')#))+!"'+#+'*!+*(!%!&*'""#'&+#%$$)#(+(%"&&%+"&'(""!%+%##!$%%'#"%'#& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:11C13C33C13A9T1G41G1T0G1G0T2G2T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26011 42 49M = 26062 192 TGAAAANTNTTNATCACNACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGT !!*"&)!)%')&+!("$)&"&+&(!$)$)%!$(!(*#%*%&+!$(&'!! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6G1T2C5T31 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1863 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24555 42 45M = 24555 0 ATAACACTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATA &C>/-8+/?%&9:74+&,6"9&&,G5C+(E3;4A5/+)/.=G)20.1F->22%58@-5+@/,A552C<)'H6&->2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67T3T6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39995 42 91M = 40235 318 NCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCANTANTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCG !/:A$-B,H<3-A?@4#**85@A8440D'5)+;;>-+7$5()?=C$-)/'=(;&;#@B)36(*2?',:!FBG.7@(G;?E3477G6B1D3= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C44C2C42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1865 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18301 42 207M = 18508 533 ATGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATGAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGNGGACATTGTAAAGGCGGCG &4!*7E"9AH(0.?H;F$7$>3:'@%.1E+#=,B<)F"GG58/'9%3/#>&%GF+$?88-<'CG;2=0-&C#E?9!B%2.+@)7G!A=$%D?3#3D#:2?6F-)+.A,)7<3E0:+>F?F%6,D"7'3#9D="626;74:@*$!B7+%0:0F1,!8?8G63G/D&'?;H)6&0"5#+A69)0BH:"#*>7(H;<&:":"6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C88C97G19 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1865 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18508 42 326M = 18301 -533 AGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCATACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCC 2F-74=8H;,1)':'FF>@69:03!#F@E@13*B?$44&-==D1("1H',)1>D943570":(H/'F<>A-5+%)1&G$=/5!E?B$/!(E.!!0"0G(E(8BD:7C8!*/7)56)3<(FD353*B%1+"5"GE-78@EG-89$9@3#>5;D$#+A#A;5$HD5.;8$*CD3@0C!&$@8+>?'A#,))G:892C6G1*<4+0$3#@C;9>F.:C8!1@D#5;-(:3:/<2%=DH+;=)>)>"?&5<<#->HH941&.6@2<#787!H,&,C69"$>.@>+(.*">D.;>=",;C39)*$!++E:86,0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G34C235 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6865 42 72M2I102M = 6682 -357 TGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCNCCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTG @4()BFF$*%-=2*5>=E**61C6!'HC%?C06>'4/$04<$:.A=&*1FC41(H-"07)(474=5!.04&)2D3C"6(?1F?+32-5&,B%5@#0<="/CD0,;D("=CFBCDF$.4D3:()4,9-%7!<=F(@:8;3-989749%;07H+/"3<"6!&C1A'," AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:119A54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6682 42 183M = 6865 357 ATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTNCTTCAAAGCCGTCAAGGAGCTGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCNAAGCGGTGTCCTATAAGGGGA +#2!D79H2%:*?0?)64A(@.@09"'/82@?4?)7A',8!65=2136+6EH<+%G!.4=:1)/4!@88+?A560H8E$%F+++?'G1A.3'6711''D+;*2&!8*4D0:96D5#?"+>&?0 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:81C19A0A39A18A21 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r1867 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14733 42 97M = 14571 -259 TTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGTGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCNGGCATGGCGCGCATCTGCCTT ?D&H8*HB5E-C?F-F,-4<&"39*?*8'0@05#A8!/.)BEE8,.-@23++>0/D"+!23##2@-:H"4'-$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A48G21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1867 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14571 42 162M = 14733 259 GTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCNGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTNGTTCATCAGTGCCGAATCANGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATA ,C<(4?>+D.;9(F@8;@E,?A:<*,"#A?(B"0'.&:$)?2<1#;D'"'?2-E##C:>9-0)=:*-8D/G@8$+&"*4)8?+D/?730DB0A4%@/GB.7-E-@/G0%3.?%..:?C%FD0?$8!4G4DF0-(:&5!2.3?8%G'2DH6?0.G!C-FB,=3=@+"5)0&03;@C."/1#''4AC'@=+$%",$=-G60H& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1868 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24157 42 147M = 24066 -238 TAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTA $&$"+(&+"#+&&)&!%$)%%'"&$#)&**%++)+!&'&("((&*$)%")!+'!"**'*'#'$)&""!#$#""($'&'"%"%+$$#"(!&$%#'*)()#%(!'+)+)"*#$++("%%%*)*)#!!&&%)#(#++%++!*(''$&$+' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:147 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1869 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42040 40 96M = 42136 246 GAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACNGCAGGAACAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGNAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACT +/$/64,1H5+19>.+$:>0:-01?,&!*>H04).873"9$/>>*G6!@.B*!9C+.=C3!9C&:@.C>=33F?"8<(;@/@@!(EE%2F-G0DBF4AG8HHG#*B(=2A,-(#'A:0?+!76F>3$H076>#B.*D)*"$<$-E-@C25H7&30AA="76A8H0!- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C6C18A47C69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1870 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28642 42 53M = 28744 255 CAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGA (%++("$'*%+%*&#'"$(%*+$")((''#%!!!"#%+*"&'%&+(!"*+('% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1871 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46228 40 64M = 45998 -294 CTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTC -G48G->,*&0++;7B7>>%+8<%6C%FHA5?.9#&5@)1:#F>,5E@?,:C:=/59H0?;GAG AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G54 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r1871 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45998 40 76M = 46228 294 NNNTATTTTCNNGATCTGCTGCCTCTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAG !!$*%#$%!%%!#(&&%#"#$&'#"++*&!(*&&*$$%"(+&*!%#(++''$$)('"%"%)*+()+((!*)!!'*) AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G0G0T3C1G1A0T0C3G0T6G51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1872 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2081 40 5M5I79M = 1918 -247 GTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTNTATGAACGCTCGAAAANACATGGGCTGTTCCG $3B*@8=E->2A98!--%/!E.(7?/C3*H9!."5*?A<.,74HD54E"*>5$!-2G?D)/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r1873 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24317 42 450M = 24258 -509 CTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGNAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTCNCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCNTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATANCTTGAAATA ?A37DB&*>((F6H0>:-?9%C41!%+B46";+'G&,,G<:.GC'1)B8<)9@&,3G0!-+!@1#?);*/5!*H<=EHF8<@&C:.6CEF&)4<&!6E!50HGF(9'G72&*0:B=/1/5=;-,+!84,(HF@8+.FF;$&E9)@EA2$5A"E+-/C#(!!81/>D'1:!)H;#&0;065>3DH9<"1GCC+A'B5=@2H38!5F;G:23"?<5=2/:*)(:'C*07;)):?H*5G#7?='$4?DCE)&)8!G>#(F%+F3'B=A#(1'E&95,(::F&&*"?)8%(-E0H4+#F@"E+"C$'(%,&.#&34ED4&4$*%29,08&;H:/, AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G81G245T0G42T65G8G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1873 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24258 42 59M = 24317 509 TATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCA ,!@83A+"61!/.B6&59#"!>8E.;4+1-9>9D4?232F?-G5?#'2%D.40(%E(+6EF#<$&D-#79:0?:%&=>223E<%,,#3GE-/=(9/5H8,;)'&A95>(!?.#?E60%5'E5F+3;+A)C;)$+G.3,1+6(<()-B*0+2,,7:=<'D:20G:;F744>9F3;6!( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:192 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44 42 69M = 247 254 GNTTTAANGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAA $+)($""%$%"'))'&%$*+%$!"'+"*%&&)+*'&)*$'%+$'#*%"(%&(&""#'')*"*%"+"&$) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G5G61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1875 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 247 42 51M = 44 -254 TCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGAGGTGGCAAGGG $;=2:H<>6->'-A655;F?3%*@)#CA047D:A92C#F-,@3HF%%")CG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10201 42 74M = 9981 -294 ATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACT 49"&0:G-?:F1)&:.*'05A:.'=C?AE@/!-+=)!=-#:B$9-<+;>78D5G$"7-68H/63=GA)8'#@4= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9981 42 75M = 10201 294 ACCGGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTTCCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTG $E71BD*.F;$9FB2G;'C097,G$E)#*&-803?2C!EH'#,$!!0.-0&4,G07E:76*=H>/F#7%,0A-/+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T39A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35014 42 31M1D154M = 35200 321 AGTNAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTACGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAANGTTGCTTNCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATC *)%!$(+('%+"%!%&(!*!%*!*%+"%%("')#*'*$(!$#$"%**!*#'%")+##%''#+#&'#$'*%'&$+'&+&(!(%!"!"!!+)#"'+!)"*'*''$%)"('('##''*"('!)%'+&$&'!$+*&&%'&)%#+"(&'*)%#*+$(+(&(#%%$!#(!"$#))%'*(*'#)#''%)$++ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:2C0C27^G44T57C1G7T41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35200 42 135M = 35014 -321 GGANTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTNACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCAGTGAGCCTGTTTCTCTGNGCGACGT =3<9);1,%7F5'=:+*"-:GF>B:EB$1B,8!AG4*G#B.-/3?2+7<; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1878 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10968 42 86M = 10892 -162 AACTCAACCCTGTCCGATTTCAACNAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTT ?'?,8001$9#;(.1'CHF1E#$@-/&92@$2>'*?B<%>>>6'78#=4@3B--1/1!H#C'>-'*5D9<2B6?+0'::BG6>,"' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A60C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1879 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15351 42 72M = 15611 357 CGGGGAAATGCGCGAGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCA 1B8(,%-AE=GF.)?,D=C.12:).,?#A5;=6&772"C48;@(9=6:9*;(?A'3:2*F,-(.+E0/H4"H(#378D6;0>B/D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T59C9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1880 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7060 42 161M = 7221 324 TGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCNGACCCTGATGAGTTCGTGTNCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTNTATCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACNGA 0$735B)CD+3H3:(16=))F%($A;85@&!$0/?/1:DE2C*B*1C@)2@C:131<2*>&EG0B).62C4'/*/??><8"-:)8AB6&%;/9#D0>./")4'G-A86D.0'F=4-<3:!;,*E;H;>=&!#%5.H2@FB*@+4:.E=D*/*:B*$($&E: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:64T19C37G1T33T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1880 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7221 42 163M = 7060 -324 TTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGAC $EG89!51.D==A47/<'@>67!DE"1".;6,%4#C9CH!6:%/6F*@$57,0GD"/A#"4D"1G%!G1G,84%%?#2;+!3<'9B+)A2D)>25+7&D!:8E28/"3#2+'0+4H0((*1+#'>9$@5701!.%72&>8/0*A++5>$A)<95%@$+='' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A2G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1882 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1462 42 400M = 1862 543 TTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGNGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTANATCTGCGAAAAGACCGGNATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGTTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCTACNTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACNACCTGGGNGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCA EBB$,009E83,G5H;&=3G?3C$#>G9G,HF*3B@E5'"%#1+&:*(9$:4&$@3!@<@HGF+%6/"8EH".143:*08/G>;B;.(>=>1:B,1/.'?.D.:'ED@:$7:++#2>F)57:8HA*8=8(CB#6+B+G4%'%2/'C$%C5:(731;+(F8+?*4<1#6+=%'21H99:B(1E!EH3,7-'15&%+6%D;$%#8>;***B@1:6HH-&-5!H5"7.);-22$#G@D/8;(!/##60)>2*@?BG*>%$9"+C7?'+76'>*D5"%,4;C.4*+55GB@!G&&&4F6-?*"-<#B,&8:A?D$"'!-536?$=A&+5:,-?=6H#<;%%8C=14!-.:(&**C!A89":(3<4)='E/8)*)22D!':%/<%#"1,25%6,H=2,F1'/:87)+EHAGB.*>AH=B23(/>,B08/4";B?C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1883 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14559 42 232M = 14791 344 ATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCANACA >2F:EB"4B(.3/"AB"1H1E07H<6@8@3?A@#9D-);(#?<=A'05=!<@$(5?8FA/*#@E(+#5G:B=*40$B94>#+!$#);.$(,?!CG1!32<>:H<7$!%D")-!,;$+;/<3)+GE17?C:A?,<+-B-->.B2<9;*!.**7EA)&0*EE7/2>/E/4FB.(7A5%.6'#F7560F6$'"E"&0&-C"H.31D:!+/=3BFF"8A&%)=C.A3(8C(>4G>G/4-<0*@1D$$*/6CE1':29 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:66A26T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1885 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42539 42 268M = 42807 335 AGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCTGCAGAGAAGAANCGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGANAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTANCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAA 8A">$,?#5>02."><=4&3&:!@-6!5%41"(),*-)4*G0.&<0&'3-(;F8(&?054-'D11(8779;"';-#)$60G/($$AA?&8+1"&5')=.&C@32>.@&49B">(%344!;F=,>"=8)D6<6%.1HC)A44F,@G9FC><%.G5')"&0)H)-?)<$5@*BHC+4:F@&12=!C*6-=/(E'5$2?D$E'?C$3$2AA7#5@#:&$6A'C1,#;*+%F-&:/@'#A2G>8!1=B%H.7 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45A11A45A139C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42807 42 67M = 42539 -335 CTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATC ;/D?8)>=):9.)%'=7$*F+"-/D$B2@=@9)=0,42&*?H%0%+6!)0+E*59B"<.+&A18/*4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1886 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17417 42 59M = 17178 -298 TGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTNCTCCGTCTGACC 8'.D%67%%"&$*E;7842/3(HA(A7EH(!2+:A3H)G#532*;+7>B33(5/+,-C; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1886 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17178 42 67M = 17417 298 ATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGAC )>C-=1A!H+BF+/,?'<7!G%'HE/!%HG(457-<-*95>;F%;F<2> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1887 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14564 42 64M = 14409 -219 TGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAANCTGGAGGCGACGGGNATNTCACANCNNN (%)($((&'%$''!!%$""(#+")#("+&'((&(*&'+))($+""$#+)%(%%'!'&''$#!)! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:35T14G0C1G1A0T2G0G0T0G0C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1887 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14409 42 111M = 14564 219 AGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATCAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTNTGACGGACTGTTACACACTGTNCCGGGATGCTTATC $+%*$")'"+$%!'#('+)!"(#!!*"$'&!++)%"!))%&%!%))#)%'("('$+&''*"%%*$!!!*'&!#!#&$$()&*&%"$%*'!"(+&&&+*+$#'*+("($(") AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G25A47G21T14 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46311 42 41M = 46141 -211 TCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCAC %96,B+;.-E?+8>H7BG!*))B9?)'0@E&>>5#!!@@$< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46141 42 54M = 46311 211 GTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAT -*BA+$$!,@H73.;:80)F%"!0559(<37)#34.)109;?:&#H2G4'<78-$23D:C7*E*:H),$E;884;!$.18$;G$=DA3>:&0>#&H!B7.D13?)"35;.32&**G16#(:2G*&&B?BB6**2-,)8;)&@*.C;%$'!%,($"@&B0="E*8'D*)D,7,!%-H-02*7$@7ED@@%@#D;"3E#5B,:7!H?6-675/#0+3DF3$''H!:>/!-H13392A+0(>D;1<;*A22)4;B3:"F#%AEGB5/,<3"'1$)2'&G'-65?03@("36F#$H!'/+-DDA*(:+ AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:9T19G29G19T5C113T105C1G83 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1890 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17544 40 64M = 17721 258 CACGCANCTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTCACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAG (/-#6EA!7ABD1%!AB*!/H-H)!@H7AC)G6DA9#ECH*G!9&/,A)A5!#3/+-/')H'90 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A23G33 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1890 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17721 40 81M = 17544 -258 TTATGCGGTACAGTTTGAGTNCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGNTGAAACCAGCACGCGTTATCT D+6(7B5#E<..>.>&8)0D.3C=4@(:@$E.&"#B4=G+$8D AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C0C0C0G0A15T38T21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1891 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1501 42 145M = 1453 -193 CGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACNTTACTGATGCCCNTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATC !9>'/)BH7!2(?>),&0H!9%HCD.7B@H8F"7'H)(%%,(,*A1&>3'*1HE=;"*?>$/0<+@<75)'@(>%%#7F.*@3@(8C! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32638 42 94M = 32779 221 GGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCANTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGA ,#0!;=*3636;CA>#&$-.;AE-=EC.%G:0@B3@%D7D5'9?!7*7&)9:B23=-H>8F18,">#?H93+48=C'&0+/8/(5,-E@C5:6- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1892 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32779 42 80M = 32638 -221 TTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATNAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTT *)#'%!)"&"+$(#!)"++&()*(#(&)!"'(%'&)"&%$'"'!*&&!*&"&%!$+("'+%($'+#)!(#))+'&%*%+" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1893 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16182 42 46M = 16337 256 ATTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGT *F00+9!!>%%#6>.!&*@1,3B62$#)G"4+#E)(#;A;8/*74@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16337 42 101M = 16182 -256 ATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCA A7(C1>1,/2'7(/3E"7C01$'!++<70+0;:C-69,@=?(F5;-229$93.8'4%E?>%,#81)%%+>*2:>//%H9607.C9(5;5H!$B6H-5G25=?8496+8.B,0@;<>9(+40,F08F)+-3(,4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r1895 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9964 42 245M = 9907 -302 AGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCNCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTNTATATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGNCAGAGGACGCCGGCCCCGCAGANCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATATNATCCACGG >.(AD"D@$'97D$19+;EE7#7+5?8),*1,(;F3&G,);@-<*B!3#'-$03,68*>9A.8/*-'>*65):HD6->16F@-"-9$GH2;<",/:;+2H$))F?>,-D-8#BC5(&)2(,*D)+0/3@&CF9'-41%94!(($=;BF/'4:C&/00?07.?;2#$;3-&%:>*9#%/20..CD)?3<++G(//?"<4D!F6="/4; AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:40T33A1G33A13G8G100G1C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1896 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29238 42 73M = 28998 -313 TCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCC !=H80)'@4*6':3DC@B,3)=E"38'+BF!HH.>+<"3"FH3$!*G,---?4(43)?!D=)G?(862+$8&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1896 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28998 42 105M = 29238 313 GTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAANGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCATTCCTGAAGTGTCANGTACATCGCAAAGTCTCCGAAATTACACGC !+#%!!!!&'(#%')))+'#!$&$#+)+($#*(&(#"*#)))*+*%(($!+#"#$*%&')+)!#%*)*$)+&')$*'#&%$$'&!''#'#)('*(%"*++'$$)+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T28G30C13A19C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1897 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14522 42 78M = 14353 -247 CTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTGTCATCGTGAGGATGANTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAAT ;0#?9-C%@&8.2EE)G/B,A)6;5>D32,'H1$7*C+D-A,,,@9.C,1C'>2-E,'<%<961$$D685(,2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25T15C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1897 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14353 42 145M = 14522 247 GNCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTAC )'C1:*H4D>'F<75'%@!@B8+)8C*%.+"::EA9;+%7)H*G:-63=6"$9@A%.'GD$B'A8@(..%)1@H$E%F/4G+0*$?66;C&%HH!G=/"FB;/73<*%4::$C3!*.76?18F<0';)>"(.621*!6?0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C143 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1898 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14116 42 80M = 13940 -256 CTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGC :0A.%E99=95@@!G3<@6%-&?DA.8";7?:@"2$@B3)2FB7*D#D7@$6-BE"0;E;.&<9B$9%*1;:.; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1898 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13940 42 37M3D44M = 14116 256 ACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGNGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCG )'+&('()#'+""&#+*$*#%$*')$%"'"*#!*)*#*##"'"*&&!%$'$!%(+)&%"+"(++(%)+&#("&"''$*#%( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:25T11^TTA44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39635 42 85M = 39523 -197 GATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAG ,'.G2!F%(.=;9$C5&*G8%9"+D&:,'*H$D2#A:.##'?A8>:7BH7GG4B?68&2!.E08,;:;(G'=5?2B&D*3()02> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39523 42 46M = 39635 197 ACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACANACACAGACTGGATTT $A:>=#@*###3!&G-62<0;32:=$=6F&1%- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1900 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14146 42 134M = 14000 -280 AATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGCTAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGT 8?0,A9)G<-CE,+5!F6-C#1A7"(>=(*B>A=&7D8/6;1.;?'/)B=:($'.$>;-<-6>>F>GC*F4%+.>@>%C31;&58DD>=H:<1,@A>*8*.<5HD?(/%2F$F6$*&'A6"5E<0,>4D*8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78A0A54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1900 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14000 42 146M = 14146 280 ATGAATATGACCAGCCAACNTCCGATATCACGAAGGATANATGCAGCAAATGCCTNAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCNGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGANAG 5'BBB5!4:1*#E#=94/D<#;)EFG!#!06@15)=7HF1DH9E92DH#*<0H.($*&8D=66#+"B03+GED8)+6D#(&)AHCF5C636AD&'+!F4";? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1901 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41422 42 182M = 41604 305 ATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATAATGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAANCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAAC 9/-24!.H)D5D//A"-33BC0,13B1"8(A$$/1;1!3<.CF)F?"8D,@D*7-H.ED$-2D&D'AA8FH,D!?9FG61C+(!,8>A5(6"@%#8G3"'4@'746C%AB1H/1;E(B.17H2=9;%43>G@)9&4F*;F'(1;;1:+@CB-G?3AF@*"4A%/5D#/,BC99H?3$)6HGF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C80G73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46074 24 64M = 45807 -331 CGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACTCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTC >=/(=G,.E@1E(&0+0%6#(8(EBH.4+0-+49,#.)EFC-3!D61=9(#'?1H1(@.+14"&;,/;5$!7AA9+!:(B(@/D$#.>-6!76H1B3>9('>4+6(F$8%9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24292 42 54M = 24346 178 ACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCNCTAGNACTGCTATGTGCCGGAGC :(,0*6H=$<*E'&D%GH<<<46'0G*H58<&''2@&>&-4)/A2!3<%)!D*' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27G2C4G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1904 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18188 42 79M = 18105 -162 TTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGANTGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAG 3,,11.@1=&5C(0F)'(&>! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A29A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1904 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18105 42 75M = 18188 162 TNAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTNAGNATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACT %!+#(+!%"(%"#!*#+#$*+$('!($(!#!)$'%&)#$+!!*&&&"**&+$)'*!%'&&#+(*#)"('##&+#+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G43C2C26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1905 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 368 42 66M = 581 255 GAAAANCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGNAACT .$2+#5((1,!-2>C"):;*F8"65-H1=8A46&6G2-:GG+?G3'E9$%B06$27*F",&;AE/(,6?&!$7%+?H(<>"E*(1-:#B*7+D7<+021D&?DF"9?1H6@D&0CC*7B/4%#-B$':04F$D7("7(4F5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A112A24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1907 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16229 42 49M = 16348 267 TTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATATCCCNCAGACGCGGCAATACAGCGG 12@*%C)83E"9H.5726698=/9&*&)D0H:2(/$4'E(+/-?*43$1:%5C#D-= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25039 42 52M = 24840 -251 CTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAACATGGACATTTTTCACCTGA )E"73$"*!/+;+3+;0,0C-63@(,5F$,F-ED>&*7+@+E!E@-"C8&"1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24840 42 68M = 25039 251 GTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATG ><@6+?3;&.($"@-"/9&9<'0E7?H,8F!;3)B%731>+!%),92B!F4(*)27039!7,6F((/0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1910 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6007 42 100M = 5833 -274 CTGGCCGGAGGCTGCAAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCC %@,D*B$?@,5;4$@HH0@D@3H,7E.0"@G,BF:/%>3HG5!FC9EC':E;&#HE!8> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1910 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5833 42 51M = 6007 274 TGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAA >?+2!?4?A>92$3787"F&C3@)7-)#0$.66:#(&EAH0/($G@8)?*@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1911 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17332 42 41M = 17084 -289 AGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCA @"GF2#A)7E*#7:'';0%"08F&"!1,;>964#!(5;&H) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1911 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17084 42 67M = 17332 289 GTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACNGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGT 4<=4BD>8BH*-0&FE-;@G3$/:. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1912 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2019 42 73M = 2198 222 ACGCTGCTGCGTGTGGATGANGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCT 2#=!#89F@16F*+&5A595A8@-%;4:@/G9@::4.6.)<""2-%<%)1-84305+?481%,*G;13>A.3.(!)3ECB83D&>B(9C&49HA)-FE!1D-:%E3(/$+BG9=&#A:E%"8C#"<$/@50%>9B:(E6/CH50;427C=?.=:%B%4"%6(159'BC?'63F8H.8;F*BH$2/5H%76?%3B&,0.<-2&DCB(+4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:105C69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1915 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38250 42 59M = 37970 -339 GCTCTTACACATNCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTAT G13@9:CH-1H,#3:@=+&8,'-@G$)&/#-2E./2/GG&!5D,-A!/CB3>36!4G/E99.%,E$,='C/"1(&7&GG&D?A1!B0-9')F=E>$>84:0*/H/#E5*!(*-3%>$0"($!8EH/D439H3)@F/7E%E/:H):;GB2123,.)<'B@-F.?G-D5HH&=,0!B)EA$*)@<42$'D<;:@<2B3:!";$176HHD).50D")FE/%>5(H:BD.,#1,<#@%='11!E9B-*7:G@/($&>=9B"/;04G@5)6+7( AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:132A40C21T57C26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42057 42 161M = 42011 -207 GGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCATCGAAACGCACCATAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACAN 1D%2EAD6/D*=&+6B+:G;$;F.999%;(H2;B6)$%'=,3'8@$!;*5C/E.$E,+DE?();6D@2A.#5+&A:-'-'<)0B=F8/%%$><#6'&4D>".D>A&$A4DD2..>HG0&3#+<*F)!8)GD#/4E:977!1=4))8(6E5#E44;D%7;A! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:93A12G53C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42011 42 46M = 42057 207 CTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGG *G>&HD<@,2--D0D)A$./93G7.9)@-%>%D?3)(-9)B1D'&$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1917 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5187 42 156M = 5421 274 CCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGNACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAA ;;#A7@80E),/?(!'+-7<<;)F?*1@:"",F/;&*)*#"5+>"D@=?6H?G>>1!>"<*F(B$D=3;.A,D26#EB&87B>13/795(D";D5#3&3!!>))9?@8D58'3EG3)EC0HEEF00*+*+89.A39@'?:+#G<-(H2A.*)F()! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75A80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1917 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5421 42 40M = 5187 -274 AGGGCGAGATCGCCAGCGCGGCGCAGCNGGACGTGAACGC ?;=BD2?0()#0H%"%1*B.'>A2$,0"@B><"/(!?4'& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A17C12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1918 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33720 42 274M = 33583 -411 TGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAG :AB$=$E/%'("+-/;F*216((%D7D)<0A35.;8&1"E2='A=!33.EF$)-#@6:"/"034;#5%,A$(EH*;!0=92+#!4B+?0>6%6%B!E43@-$!5!$'33),!+.#..29C>4/(5$2E)%?+$+2+$,,(@5!+?A>'(C=B#-.G7*F:":;<7=&@BF.@>4,$1D3"0&#.0FH70":=151@FA##(-E!$)%&4(E5B!<6E""@D,/F'(B2B9&.:,@98A1#.4*::*.721D%H#?!CBA4%">E<)<8<4/#>& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:274 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1918 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33583 42 137M = 33720 411 TATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATNTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGNAGAGCA (6<*-)5C4B5D;%>C-38H8GA("@%)B1'4079*'*46C#-@5.5A3&E!23*A?@2=/9$;5':=$207G.G-B%6&G6!%+1!G6'5;3"4*;G-A&?=%!278E@-=G?HA+9D'*C* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T96T24C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1919 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18208 40 73M = 18420 278 NTNGCATACATAGTCNNGGCAAGCGGGAATNAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGA *$!'!($"&*)#)%%#"')'&("+$$+*)&''+$+(%#!("%'&*#*)'&%%(&#$**$+*%$%++$"(&$%& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A1C4T0T2T1A1C0C5A7G42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1919 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18420 40 66M = 18208 -278 GCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACAATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGT F8%CG*2C)B7"1"-,5-/8E!95#)43A41/E3/6*1,5!*2-;*81/$& YT:Z:UP jpayne@0: r1920 141 * 0 0 * * 0 0 AAGNAGNAGCAGATGAGAGAAACCAGGTATGACAACCACGGAATGCATTTTTCTGGCAGCGGGCTTCATATTCTGTGTGCTTATG $*##%&!++!"!)"&%#$'($"%"!##%$)""+'*$"$$(#'"%%))!)+(!#"(+#!&'"!(&"&'#&*")(%)!*"&%$&"'' YT:Z:UP jpayne@0: r1921 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2401 42 89M = 2247 -243 AGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTAT *-C8#E<2C,DE,21:0B>)%30G+2/;(@#H4D,E!A,"$!*E.C%EFA,,8%2G,26)&*F'?&B-C>"F#E?0#A5%G).,,E%12 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r1921 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2247 42 154M = 2401 243 CTCACNGAAATCGGTACGGATNCCNCGAAAGAGCAGATTTATNNCCGCTTCGCACTGACGCCGGAAGGGNATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTNCCGAATAACCCGGATATTTTTCATCNGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAG )*"'#!$*)+()!$#(+)*$%$("+!)$&'"'")#"*!)#!&*""%+*!&%+%&%#$""'%)+$+$*%)%"#$)$*%++#&"(&%$##%$')"!"$"$#")!)$!+"&#%$%*+"#%)(!"&'$(*#&()##+(#*&#++++#$))+#("(#!* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:2T2C15A2G17A0A7A17G28C21G3T29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1922 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12457 42 111M = 12116 -452 AGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCCGA :<8%"DAH-1&/8D4#5&9@/4/!GHH8?E,.1,3?$.A:D$/GG(=92@0>)G>7.$/-:@3"#!",*1)%<.-1,= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108A2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1922 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12116 42 341M = 12457 452 GAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGATCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAACAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGNTGGAGTG =%,(3+>8H9!.3><(A?05!D4)>)4#!"6,*0A!!1=/!.$H$2CGB212<"E6+,"1"6+)#C2F-$F*$A':<98B(5"4#''&3;(AA=2,6HA8EE)>*'74.?9=5%<(!-607&!)E;6"G=/6'H+H$B/323%+(>>F"H8(&'"=A!B=2*0:26.;'?4(51F."@B>>08?1<1*-..($(**+4/@%B3;E%@3=<>!07A4!DG;'!C$%E13+>@>*H57?%F8"2G4D2:D16C)++B#!&0*@$4"B.-63>1#/19-''9"65#0>4>9&+;6-HE2. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71A27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48238 42 59M = 48065 -232 AATCATTTGGTTNGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCG H03!?00@23/4)@:EGD5-';-9>>.@'814"8+?FC:DF1%$6G4;3+-H'*23#!"D:H$@9<7<6'HED(?5DAF;=/,>$'@#3E7EB,:,>6#C/%=2&)?F&&B&E4;CAD.$+(+GE4=(2CE+-.(:&1%.05=F/'!<#(",&-5/"A3835%&>::+3+,6G+.(!%B?G-$1C(8>&63"8!8BA'"F-6#G&A=@2'"("<-A61--H@/-&BG/AF7,G5H.2,&;DH3E4>'D'C30$5F,BC-@=D9G AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C19A13T37G85T7A74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1926 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16489 42 93M = 16248 -334 CTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTA )2/@:=>@@@@"8%<+"E%=.#:D4G@(:'8B+F0&(:&%4E,9E6&E)E6''%F,&(BD-9B&C<&;<10G>/%% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1927 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43280 42 123M = 43403 257 CGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGATCAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATG '9G=HG19F'70D.4A(C5:H%(G=6#=-4(*%C$1(%?*"B/(<'G55H:081<>9B)HH?H@%.D+$03,@C7,!+5%5F#%CF467$(#!)2@,===+721$2%.><"#<7'/>HG,**1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T5A90 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1927 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43403 42 134M = 43280 -257 CCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAANGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCG 47B;='?)G=(&2*=)-728<$?B+,/EB65)915=00#5&1%7@1#;A&3<4&/5'$"2B@44((D65,9G#C'))C,.A9&F!BH>3)>E>CC:@"5AH=,;1"&-E22$2D;%G/$32+!BG/&.9;+@F+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1928 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11905 42 58M = 12006 309 AACAGTNCAGCGTGACGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGC ;:65'A(61??8G+9>@>.=F?,7?*=$:8A(8G3:F(293()B+@?D11:7?*-+6@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C8A42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1928 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12006 42 208M = 11905 -309 GCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGAAGTACAAACGCCAGCTGGNTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGC /83H&17/C)30!1H$*%HA+>/6D)B&6>'4B,C;A;-9:8H2*2)&.3(816:H5#-(7H0/B"D51E>%C>()0B19H!-5'=!@9@$.7G:8:-75@E&?H2+));0%E8<':D93<&8DF;&BCFC!=*'CCE0%=8/D0(+2>'2+!699"4-.'.*9A@A)FH3A3$-H>5?";"/E%:#2?@D5*<59.+-B=71=,AH8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:144G18C44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1929 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12761 24 54M4D54M2D20M = 12895 213 AACCGGCGGCNAATATGAGCCAGCGGGGATTGTNTACCGTGGTGAGTNTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCG AA%1%!!:?*6?$)/*+G/5B72#CDH?8"0B5.&G%1?8C-&(032-D1"5;':3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64T6A7 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r1930 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19215 42 89M = 19412 259 GCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAA C>2A9#'&+C6<9419E7?D/E20H'C5'7%'6>D-=179=)56./=*"%;>)+D0(E*)((4@95=CC@,H,FG02#@'C'*-3(*=E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1930 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19412 42 62M = 19215 -259 GAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGANTTCAGG '-(60/01@-'A"DA(+3'7B3@2H=+G+=D"+6G55!CA.,1G=0?#E=9HB41+(G9%@6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G1G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1931 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47693 42 62M = 47537 -218 AATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGNAGCGACAAANTGAATAAAGAACAACC &:&;@A.1*C+?*;G?2%-$?12"46/07>(&$1;-? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G9A14T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1931 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47537 42 133M = 47693 218 TTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTNCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAAT G7$',!*4H*#''&,&$H2<=!-HE17">7!"A5@=*<1<7:/D("'6*6F4%(D@5E%&>G71///1='?82&'&$6*E+1AB,7FF8+017&2-7.H,-=1D:@6CC&-2B"';*1#9'10!"1@@CED9> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G78 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1932 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5849 40 82M = 5730 -201 ATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTATGCTGGTTGCGTGGGATGGNACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTC ?#D@?#<>=5%0?B%B8)2A>$$54&<3.G2.A7(=H$)&/FE#"$-B7#*.!!C6:%/2#4&1C,@+##):7&1#,.;1G"7=%5197+=*'87)DB+H=8@>G,/:AE-G;#<@6F7(,537A4A"5":">3)@(BE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T50T68 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1933 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32866 42 60M = 32658 -268 TGTACCGGATGTGTTCTGCNANGCGCTCCTGAAACTCAACATCCTCATCAAACGCACGGN F2=C0ADH!BH@G>C*BH>#95H90D4"/449<64@/(#AB)1062<#,E9=3F( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T34A26 YT:Z:UP jpayne@0: r1934 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18112 0 * = 18112 0 GATAACNCGAGCAGNCNGNANNANTNGTTGNNNCAGTNCGAGGATGCTANTGATAAGTGGAATGCCATGT #(#(&*"#*&())'"(&%!#""*"%!$&%(!!""$$""!!$*'(#'!$#!'+)%')'%&$$+%&$(+$++ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1935 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26061 42 134M = 26268 294 GNCTTTTTCTATCTACTCNCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTATAAACTATTGCTGGCAGCANTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGAG ()*+&)%$&%&(%(""#+')*('*)(!*)+"'"!(')!!%"&(%"'*"'#&$"!!#&+"#((+$##*!"*!"'&"%'%&)+#*$%&!($$)"!))&(*"##""(**#+)"%$#$&!*&&!&%$)&)!"!!&')% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T16T53T19T39G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26268 42 87M = 26061 -294 CCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGANAAAAAATATTCATTGTTTTCTGTGTTGGTGATTGCACCAATCANTC ((!##$$%'*&*"&#*"*('$$+)**+'#&"!'$'+*)!&&&!#))&"#'#&#&)$!$')%&$*%!'"*#()***"%!"&')!*+($ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40G22G20T2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1936 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37131 42 181M = 37069 -243 TATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCATGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTAN '5(EA%0#+$?5;GF,.4.B,F+E=C0#E94)F1&*-A"1'")89D<:.$A3!G;46:6D/?*.&5$+EH#,D;5=$&-*4*4E?@"A,.+(58H&@7>7?=1:(!$&:6H&6>5$0?3!4H(@#"F653#,89BEC3+4(=%7%+DE,;/=;5@B)B;F% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:77G11T90C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1936 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37069 42 52M = 37131 243 TCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCA D>--2.%&F<7D#0*G62999EC",>B86<)-.&A+/3@D<@(G2*>9&!E0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1937 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27923 42 69M = 27627 -365 CTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAG 8#FG>%!.BE(*3>!7H$A(%##9%E$B$;(#>&".!0+$24*#=.3%D.,@+)B*'<19*+!%>?+&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1937 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27627 42 86M = 27923 365 CTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTCTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGANATTTATATCATTTTACG G!/<&?H)H62B:4?.@'>&*&:7!2"64>/<+('G"?>D8*=#'- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A41T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1938 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9520 42 124M = 9726 270 GCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATC E@)2:,#;>;:>65;(/!:.6G#95>,@$%*0@FE?<9F(8+-0.E>A*)$/8!*,#5'%6:,61-96+"(&73>CF'2825-"!)F=@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9726 42 64M = 9520 -270 GAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTN -DD$B62=H%:'>>7G;9A11$;$5H=2+.?!B"6'3>#$'"H:'%;BF;04D7H2@A3.=B%G'$&$,,&$:,9&G.0B/E,-98C'58/.;G;!;36;CA31%G.-E)-=6F5D!,55'5?;7:1H!0.@?<2G!="!*"@D9%0-0/:*F)>':**%:6(*$C%+#33D43;4*G1;#?/F!7;;;#4+CD0/BC.=>+0'9#4F!6!.:)G%3E/C&$.CG#,66"?42=5,(2A&/6C9),48A@)G/,0F$/94A&A!):;>4C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A27C133 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1940 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13213 42 54M = 13341 294 CGTTAANCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCAC $)'"#&")+#'%"!$'(($+'()($+%'#)%%$+$(%+!%%*+$$+"(#+'"(# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T1C0C2C47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1941 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13603 42 95M = 13471 -227 TATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCNGTACGGTATGGTCACCGN )?D7+"@2,7C,)/7B/9E/;/9":H.3<85.<<7FE)--DEG28/.@*3BE;;@5E9G@/H.;@".88!;D+:>;)D=8<)-/!.>$&$G6(.*!-/+5&'#B$&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1942 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17305 42 101M = 17533 287 TAAGGGGCGCNCTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCANACAGCGGGGA "&%,2<23.!F:%@12&&@1,.DG11"$&@)C!1)7H(H:8<&/G2E/848,H#.'58-C+$'H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A1C7A79G10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1942 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17533 42 59M = 17305 -287 ACATACCGCTTCACGCAGCTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGANAGNCCNNNCGGTAAA '#)%"&%$(!##)*+%$&*%%"!*+')')$"$$'%("#!"+%+"%'#&)"!$#&$&$(' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:17A25C2T2G0G0G7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1943 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8032 42 88M = 7831 -289 CGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCNTCCGCTATATCGCAGTCGGCGTCACAGNNNGCCNGTGGGAN $'$$+&!($*(%**(')$&$(&+#+&&##++%!#!+($"#*(!##'!!"+&(++%'"+)$)(*$*+#&+%%+&'")"&%%!&(%$)%! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:46A5G21G0T0T3C3A2C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1943 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7831 42 142M = 8032 289 NAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGTAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGG ".F/!+)B>/?%9;+->F#=H6;877!D?>@";H5DF/G@(%B.)>HB30*7".-86;1"ECE"0".6#!!C*+66H-.=E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C35G29G75 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1944 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37221 42 123M = 37395 312 TGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACC G(8:.AC"D4>/?3:E$.7$'8?E';3%HC#/.*?(>*3H<(&H1(%19A):-79$0'1*%;9++(+.-&9AB,*A.=.%=FE&!"G,"&5B873:C0H:!3F-7+.!B+B2$*0F18*$0@,%>>E;HC6=%6D980EC.G+6#6$86HG@8")/@%9<06-;>)%/H=4$@'=*<1(8EDB!E+/<-/-D@;59BHF7?5'>/6?&FH5(E'%(&3=2E:+$'(<@H#65B,,5?GCE609+A:?'!EE)DE<=DG:@';.60,B#>#HA(#&$9GH,D;E1(=.-"2);B3A#G?,217:%CG,H54$)9#7*?@E!47H@01&?D()/1>.+;9/6'04>0AHE1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21G35T81G33T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1946 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26201 42 65M = 26311 344 TGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATA CG&>=G78*18FGCD"3!5C&&5.>B-2FH: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1947 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43120 42 90M = 43306 285 NAGTNANGNCGAGACANTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGG !%')"!!!#&)&#''!)+('&)'$$('())""+)#!('%'"#)&$!("!*!$*&&''!'*")%$*"&*'%'%#$&'('!&(%"#)$$+'' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0A0T2A0G0T0C0G2G0T2G0G73 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1947 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43306 42 99M = 43120 -285 GGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCNGAGAACGTTGAATGCC "3B"0?!EB/>#;3?".@$<3=#@*F#>D&01%/.*&C)>!+7(6;G8<=@D'$;!40?3/?F*0@8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34195 42 42M = 33965 -272 TTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGNAGCTTGCATCCATT A/>7*2E,;*0;$6.333(*3:",H/*"G!0D7EE&?>@3(0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1949 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1487 42 89M = 1143 -433 CCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGANCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTA #79G%#3@'7B'A:05/8.A2&2&.5&C"#'(8DD"D>(H4B3&'A>5*B>-A1-6:8<59F!8G;'&(*D5>3F0>56D$A"><>)+!6!1*C88%B@4%$&"/"07>8;EG"E6!A)H<132$0.,1B(?/(3;>=.E?3##HFA%"8B@4B$F.18@.-C%#H6+8@9/"/B5%/><3&3=311&//@98G(,5#F5.!DE&,2;F$H?,9"03>,""B:F!1+=D.*..F@E>&C%;F.1"13E0-)(E/(>/3H#HE>;2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:24G27A133C11C19G125 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1950 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32577 42 46M = 32749 256 GCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAA GFA*57#,93'"B,26+@>:38#=,3!&&8D@D'A; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C11G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1951 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41921 42 41M4I246M = 42208 501 CTTGATTTCGACTTCGNGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGANTGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCT G*/"B=8H2)5/%(?/@-H;=H;=+?,>@@?05;'86$;;GB7#0)"=B6B)A'7-A5H!41*C+66>34)'F.B/52A::6<+2>>8.&*,3?7HD4#.G30+"=))F<%DA'D><'F7)(-)A+)#AD/;'!%,2#"CDC(0B#$;0BD1(CE$#=1"!?F8@/B43*7#5;"4=36C7@4&*)H*>E9-D,E2G?/6E!18#@:2#!227:A&D8DD+;873,G5.:CA,<9H@2,=>A<$<*&(()(?A7C);6,'4A*AC'20C!(7<+#0'.:7&-G>;%EAHE> AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:16G38A231 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42208 42 214M = 41921 -501 TCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGNGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGNAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAG ,'&>1**@-+>7#$B?;@4)-5$"$H+?D.&:;)<*%:-F?2./A:G4?.17D4FHACC$6G"D>97,)$@@%:>5'"G3@/*&F9"!@2$2"?&+>5A4AGDD#1-/772,G$HEB/5239B++0;?:>!'7(D=$1<"--@E)&7)E4%E1C4?.-/'F/7>>G!148-92"6H11?/-C15E29+=<9B=G@)A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50A27A135 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r1952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1324 42 56M = 1103 -277 TCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAANGTGAGAGGCACCTGTCAGANT -,1,2C"D8!3C&2;E1><,A;+A94!D(85A=#57?/D$!C"9:@.1$->14&,G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A19T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1103 42 57M = 1324 277 GCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTT &HB@2'%$B):/(#>&/317=.@A5A&1605A38GBAH.9AED+8A28.#H&D1<4: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1953 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42832 42 100M = 42720 -212 ACAAGNAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCTGGAAGCAGTAGACGANAT CC#'9.-$?"B$5.8")C0B+H2D1DD!%=.?.B$8CB!.>A3(%0&(47!12)#?H%.5@A.>@&(F;F56DD#A94,>E(67'@4@(1C7!+AA?9*= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C75A15A2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42720 42 69M = 42832 212 CGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCANTGGGATNCCGGACATTACCGGACA 1!?)D5>.DF/74H:!,#".5C:&/;:G<@3+>/A5G7&;!538C3-CE:5,,B-6)55+CG0,*340? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G6G17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1954 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7646 42 66M = 7869 274 TCGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGNACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGC &"-!4"<6A*,:)1&"%E45/+=$8'#G;91B>8)9C@%:<,0/@>+/!E:448&/%6G!C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1955 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42196 40 76M = 42272 258 ACGTAAAAACCTTCAACTACACGNCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTG />/%A/(2!327<89'H;9*8+H)6;'@"5;B3,*A;4!;@&!0H:!#E;@:-$=%.$2=)D-"7FD79%/>C+D$@; YT:Z:UP jpayne@0: r1956 141 * 0 0 * * 0 0 TCTCNTTGAAGACCATCGGGGTNAAAANGTCTATGANGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACNGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCTGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGNGGCGGAAGAAACN %$'$!+)'&&(($**(&%*%+'"*%*#'&%*(&!&$$'"#'&&!$#+#(*&&#''%)'&$%"%()&'*&(+%&%##)!!(!+%*$#$#++"%*+*($*&)"*'+)"$)(")$!%$#%&!(!*%%$*)#%%+!%&)'!*$'$)%!$'&!&%")"$+!&#%%&"!'"!'*'!*)($+#+*!%$*"%&!&(#$!!+#+$$(' YT:Z:UP jpayne@0: r1957 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47952 42 91M = 48129 245 AACTGCTAATCATTCAAACTACTTAGTCTGTNACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTAC AG+GA=>(032+#,#49CF*"?>6$BFFG)G).FC#BD%32B(=$;$A77(98:E&:DD3(&E@F0:5)4%1+32E)G$?8;;*8-,=F?/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T9G59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1957 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48129 42 68M = 47952 -245 TTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCNGGCTGAGAAA (3!9B35&0/C702)=:2/A",C'31'@&=)$F%$*>73=H9.,G*#'A/,:%B%1!5BG63,/+'FE'"FGC#HCG:>!+?$4,.@61C(D%:!,!4-'+E10C1,6>:AD-C<:2#.%.7!.&E2AA+@AF>2?7F/:.>#74342@/B7;3#4>7DD%$,%>3!7.@",!7'01C3(%0!E+?"8!E>"*A140%0,C069/>+@!GC-E<2'/.%D*7H"',H"AAH2#9(@9B?@**FH#=$"8!4?(,4")*F@7#D760@!8(%"H::7.@1.:,?F.)B&2!'=G!3A/(&"?<>A":&1!8F6A?,+H/9-#%4>!5E#,D#+/06BD&)H!>(90$C@;2 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:14C8C77A51G31T77A9G50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1959 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6611 42 122M = 6287 -446 GAATAACATCNCGCAGTCCGGCGCCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTNCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGT *.*2&*@)6?.6!=!367+7.;(9-)+)!7H",C"D4#!)/+$:9@<"5!/&("DH<(+3=(C"#0?;1FC,C(H%+92-4'+7=!B6@'.5-0,/'GAE(.%<)/(,5?"2F*?.A:*#:8&(%%BGD2@??1(44@'!DG15>,)-6:<2'!D2C!72@#F"')58@'E+D9#=9%B;?-A?4B9>9112%312++:!(80%4?.:&08529)-G;!9;@":5(/"1+3HF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:141 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r1960 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36101 42 42M = 15670 -20473 CATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATC !999(D(:5$'0/41H(!'(8@<=B:?<-49A'(=#%4H>F2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r1961 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44500 42 40M = 44266 -274 CACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATT ?G)$C(67"CG6F5$C'4G7/;$'!%)03,87*.?AA"/< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1961 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44266 42 54M = 44500 274 GGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGNGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGG H&2/8B;6A6%<4:=;.FB9G*H#='-H4)&E3?;7.,985*&:<9=A4#;4(8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1962 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32995 42 107M = 33149 244 GCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCNTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTNA C,1(F!$C(=C)<=)8+H.>8EBA0%&;.%;+AG;3%7=D8:"5%'(.@D$<3##+?'-53E,$*01.>H+:CC!?&1!@FG;A(27*!E0)$#%2"=2(2:GDH)% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C37T61A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1962 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33149 42 90M = 32995 -244 GCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGTATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGNATTAATATCCATTTTTTA :2@?=B=/,10219:>F408F?1<94*=D@8<(B.D0A3G@82+.0F;&,6>9G-&3G"DB(,=$&/B@E<@-++"F$D!3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44A26T18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4354 42 183M = 4537 338 CCGCCCGCCTGGNCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATGTTACCAGCATNGNCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCNTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGAT 88!5%*>D1B:.53!?@7"GG3%G-$,FC941H.BB':+B:ECAC;;!G14>E;=1;)/B6;:B"@9#.111D%4+(%/C=%F:.!455"@?2=:D<+4?#32D*#6C00D=$*7G*6+A*:%7%(#5/8'+7H?#GC<#89%:74A*/7E)?H,2;5,DC-?043H'C3#"'G@A$.01%#! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:12G81A2G7G1C46T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4537 42 155M = 4354 -338 CAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTNATGATGACGGACCACGACAGGGCCGCAGTTATCAGGTCNTGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGG #%&&%$"&&%)'$)((&##"#(!&!)%&"!#!+"'$+(($+'$%'*$*%'&)"(%#%'"**("%+!''!'+(')#)*%(*"$)(+)%*%"%(%&!$&()'"(!**(*'$%!"")$")$*%($$!#"("+)#'*+!*&"&""!)(!+$&(!%#+*" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:76G21C16A39 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28444 42 83M = 28298 -229 GTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCGTTGCCCTCGTCTATGNATCCATTGAGCATTGCNGCAATTTCTTTTGTGGTG +%+'+!(!()'$""&("#*!&+*"*+)('$&$'")$)$'&###!+$$#"+('#$"%()#$(!#!*()**+*+$%(&'!'&+$" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C15T16C18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28298 42 61M = 28444 229 TGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTT <#58D(6/(2%F"'<+3';/46""5'"),3<8GF5+2<,,.5($&=@A41<2A-,-5F!*#/&,/H8B;(3BG4;8;>#@G1H2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A80A5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r1966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12388 42 111M = 12499 229 AAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCCGGAACTGGATGGCAAGCCTGAAGACCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGNGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAA 14981"82$?H:9%4+/:5>.=7;,EA16?5@-(2=GF49C4D,#0GD+G!!)($B;3D003/4B62/&.6$7:2@("<<5=6F);EGD>'565$?F:&8.:#$9:HG7H( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32G14G8T25C28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33898 42 146M = 33762 -282 TTGACATCTGTTCGTGTCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCANAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATANACAGT +4+?@1-+-'-8,&7)'::72+!4EB(B'0H;*4(G&F<"89480@<5<76B6F">?'EAG2*EF:CH-1C1#-A5=61>&@93=)F5?D#@7D"-BF7C?E15D-''"E@&::;1C25F'"?$!AF89?,!C3DA,56B@2/'D, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13A1A38A85C5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1967 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33762 42 111M = 33898 282 TGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTNTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCG ?E6@10A(4:0(/><;48910./@"9%@D??A0,"G-;,#@?:A$E,&)'.?!;;@E#"0<,5:9!=H-2>;<,F!&27.G%FB>*,1%79@18FG/+&$'.4)FHH2.$9$1F=*6&<;'2!,F;:".*:E;?)<4(/;95*9&C063)6*><.9/A9!/6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C26A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13850 42 100M = 14052 287 NCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCGGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCAC !=*32%7>D2;0/&H'99+E(B8?9?!@$#<:.E%:%4A9D?54>3C#A") AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57A0A0 YT:Z:UP jpayne@0: r1969 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33038 0 * = 33038 0 TTTGGTATATNNATATNNTTCANTCNAAACCTGGNNGTNANCANCGGNTTCAACCNTG ))$$#("')'%%!(!*('%"*$%$')&&%*'&$$'!))!$#)'!#'*"%+(!%$%%#) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1970 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8134 42 109M = 8355 274 AACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACNGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCG (E6C=)&")0/<'G94&CDBA4%G*FB)#;&*8!H'=+'=>9.""?D7% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1970 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8355 42 53M = 8134 -274 CAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCG B(BH,B-=7<&@;3>*B-3H';-?/(@&7@$/4*D:$'/*?95&26!>3)9(B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1971 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38616 42 41M = 38150 -507 CAACCGACCGTTCTGAACAAATCCAGATGGANTTCTGAGGN CD>;5'-20)FHDC!D:/A0D8#;,8)(#78:<;3&$+5G( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G23G8T0 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r1971 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38150 42 94M5I372M = 38616 507 GCCGAAAGANTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGNTGTATGCATTTATTNGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCNATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGANTGGCGCGGCAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGG 8#<2H$1@%!>/BCD@5=5)389DA8)"EC*@/AH"GB9:6:@0B="%8>>')?'?+*E5:4,370,56>=>3F2%D:@E$)*>;=&G4@A=-D")&0E@*?F)=E&4.09*,D-&/4B(0F2*,B1E?9,.G-F0*97D/03#/=%!$;>$?D953=HFB$6<6+2-->.80+:=.F*'E-@&<7'A!A+#G6A#;FH4"37,0D$9>E$H,/52H-1-A/0;+>(6AD#=*!G-A5/?&F><3";@08C9=4)(AD(7C#E>7>9%!@D>07H@#7?DA,;+1!2G0E";B4/FC>@-(+'FH;!;8)FA8()6/&*+F:+:115>7&)'@=&DE&$(+9",==><'$*52G&&,#3&2D';7?1663F2##;?A(@!G53&;"?06@BE6H+AF;=6.<-9859D0'>61C$)#&15A?-#.:+>)H/;,3GA511@=,/5; AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:12 MD:Z:9T5T137G14T106A141T7A40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1972 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20854 42 93M4D310M = 21261 491 GACCGGAACGCNAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCNGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGT .$#EC/G);H06E(G8-DBE35"9"8.H3<>B.<6FD?@,>-DC*;(@GAH*/:@*#=$H&G'$81A4CD::AC(.DG+:C/97.E.>7G8(B;=:4+&FCB*&GA!;.526-#?6?&E/4,:?A!0G+&85E7!,$76">9+H=)#(>-72"":;6A!58-H61H>AD()2GF-!5:(AF#@%CF$*D2'G97AG>A$#((.>%39*88+/A6&-,C8.7/.4+!28#;21!.%%G$?1D%$F=593':41@71@H2E-+-(7*3"D96ED9D:/H@%&"@'#1/,,@+AHE401#&3C/&@B%=1F!E1H>?-C15@*?#B.*8F7,:,6&29??F:%% AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:11C81^TATC159T110G39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1972 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21261 42 84M = 20854 -491 GGCCATCAGATATCGTGCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCG .E-!F45&3)A6H26#$5<#G7?1"">,FC1'H%85<(=<(D0#&BB0G#BG02B.4$86,5-:>!C<'&1,"!7C1<9%F;1= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T67 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1973 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39456 42 36M1I107M = 39656 241 NCNGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTNCAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGANCTATGAAAAACATCGCCGC ()!C$E%0G3==:#6E''?7%@7B;9->=?.;.$%4;3D,57-/57C",6E#.<-)(;B5$B$)*&2)?E%'6.4 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:0C1C26A6A0A0T84T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1973 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39656 42 41M = 39456 -241 ACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGA ?7,'!:.F*H(27C=/A5A))16%=32(3)+<8+09@@5+) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r1974 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32815 42 112M = 32590 -337 TTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCCTCATCAAACGCACGGGT ('$)&)%!'+&"$')+)"*'$((!!!"#(&*$$&$&+"$"&!!"!!$!*(*&"!+)*!+()*!(%($&&*)$!&&#$+*!#$(&%*!'#(("+*!"*%!*&)(+%'$+#!&" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G17 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r1974 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32590 42 70M = 32815 337 TNNATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCCCGGATTNAGGCCGTATTGGTTGG $"$+&'$))!+&+)*)(#$"&*&$+)!&&$$#($%#+)"%%+(&!'+"!)!&"'))'(%("(+(&'$$!" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0C0G43A6A8C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1975 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23761 42 71M = 23939 220 NNTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAA "1F2;*&!:;(5(@1B/=1/&4"9$1C:68E.8F9B#DB=1%:E$?5.@''*,E%5>3FDCA/G+5("'2F($#70'F,GA69&2;?*(CA>.+.?,4.E!)7$F%#9*#'D9:&#%?C<;.93,G>B!77,%GG3F1222%D=%*7-(=A=21.6$6'0B,#D/BC73'CC)3F,7.905%1+$/;+$'%'HD=!E:G9.6E#()C*EBD?(.*BG1$7'+1<47'A3H5=AC#.(9G&:)8F&A7"+$E=/2$5-16E'*8B"E/(.(G6/F5/"$6,/C.#4/),F!F2-)1+$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81T172G96 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1976 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46827 42 72M = 46476 -423 TTGAAATTTCATATTCTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATCN B:A#!5DB/)/(=*=#,EC76G=B0@3>BA,:CF6@64B$G?#C7F*!)F7=6?A9!2B)EG*!B"GC$>&$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G54T0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1977 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5529 42 76M = 5786 326 ACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCACCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGC 2.!>*&=3CGB$2>&C.$-47H<8<997255A+8?;!369.C=EC+H4B));<;A#B1@G38BA0+7%'$@>H(&# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r1977 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5786 42 69M = 5529 -326 GGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGANC 2@/!(/FGH2:1H<'6!346G:>,1?%3'%H'A!* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G52C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1978 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7879 42 49M = 7985 192 GTAGATCGGGTNTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTG A7A:*4-<;5C?,+A5/)F-855;3=41";C1C+4.G(7.+&0$H>=H>A'743E43#1)F5#>"FE%@.:.4?<5&42"#FB,'-%#07B4H)"D1%&=7& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1979 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36874 42 82M = 37029 249 TGTTCTTAATATTTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAA D'-"'@?$CD!*",E6A-G0#="6+7G2A)B?E"A65B%248'/>B"D0.7>,@)AF-ABC;C7F73 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r1981 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16014 42 67M = 16087 177 TAACNTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAG 3)>2E*!65'8&55E6.&+2D4/*:HA88F66!.2+,G)$?+)0?-@<')?)(9/$+1.;=),,)%9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1981 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16087 42 104M = 16014 -177 AACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAN 51D=C+=5DD7B&E8<@64.4$5%@&(#:35#)<&E7/2>+D?3;"*93GG*52G-5-6$(;>D2D0B!>8($6<4(*"@=&0&F7&A;265G27:/.=0<65$.">!$C$D%#B:$)968297,'''GC-895G72?%3HA<67/?B60G$34/+C!$3H*($#D)8%1:>+=00*//67$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7T5G51C107A87T8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1983 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26697 42 105M = 26514 -288 CATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAA 7%D;/A+A9B6B94%:E!77!=?A<.H)>/:5+)>-4B=0*<40G)/3<'4E/"CH9D/-"$#0;A4C1>-HD8,)64!D)F":C)EG66).G6-)D#"!87F=6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r1983 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26514 42 49M = 26697 288 GCNANCCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGT )$%*!+&&($&*"'#&+*$#$!&""+!*#)+*++&##!)(%))**%+#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A1A44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1984 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35736 42 76M = 35553 -259 GTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCCATCGTGAGGCAAAGNANNCCCGN '&+)+&)!)!('(#%*&)((&!(("+'"&#!*++*%#+$")+#"$%!*'+(("%*'!)"&%+**)!++)#'$)%%* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:52G14A1A0A4G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1984 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35553 42 44M = 35736 259 CCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCAC A$$711%=CH%7B)!;%9,)#(4.!5C;!4/?AD>,;!36;:'$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1985 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15507 42 390M1D5M2D28M = 15344 -589 GGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAATGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATANCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCCCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGNGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCACNG +(!$()$*(%)!$%#*%($%*(%&#%&%&+!%#'(*(*&'(""'$%!+&(!%!$"!(%"!"*$"#)+#$&''&"$&(&"%$&')(*")&'#&))#!%"&"&%)%&%&!%&$#&(##((*$%'$!*(!+$)!*++)$(&'%)#$(($))%(#&"$!+#()$)*!&"+&''*&&)#'%$$%*$('!*%(&(+(#)"$")%$#*%+"'&%"$!($(&$*)#++"*"("!&&(*)!*#$+($!""(&%!+&"%)&$(()*)+#'"%$()!)('*)#'!&"$#('$%)($(&$*!%'#+'*$$'#('&&!%("(!+"$'"')')'$&"$+!#%+*&#)(%++&&#*+#"$*''$%")%)"+!!&&%(**)#+%(!$)"(+&!&"(&!'!+'+#!!)&(*%"*#*&&&+$"(&%%#$*+('&%#)(*(' AS:i:-55 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:2 XG:i:3 NM:i:22 MD:Z:71G109T71T127T8^T0C4^GG3T1C2C0T0G1T2T1C0A0G1T0A2A0C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1985 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15344 42 163M = 15507 589 TTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGANCAGCACGACAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAAT 36/'D&8.57=9"F#'&C";&5D)=0"C/D,=?'?-B;*"(B)+E@,D.,;@4"%>#="(F:(5%9<<6@AHHG-?=0+?"!4+0;B45D/55226(=,G1+E(HE,"F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T7G106 YS:i:-55 YT:Z:CP jpayne@0: r1986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34392 42 158M = 34555 255 ANTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGTATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAG (!+%&'(*$%&#!+$+)*+"*#!*('+$(&+#$+&$!#&"!%'&++&+*$+$$*++%)"')"(+!&*$%'"#**+'"(#&"$(#'")!&(!$*!#'"$#&)+'!)*!()(%$$%)&#$(&'"!!)'##'&!((#(+%&&('(%(+#*!)'*%&*"$#+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T63G92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1986 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34555 42 92M = 34392 -255 TGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGANAGAATCGGTATTCCTCATGTG ,D.+'97$C9!!?1245#./74+E#@F1"01950&%4!3<8B=DEAF*(D.8)-!79?9949>CC',0="0!G:8F@&F>-0.03A3'$95@:4=&!29&:DAE7B9>#>B80-:C0=?B2B9&?H$><%0>%A?(/?4$8+:6B;:1F58'GGEF.03%F6+4@!+A2G*6#2E99>=3%7>;AA==!6605CA>'::*HE<::3,>/E*561"F<7'/B?@25*&)5*AAD'E;):)9<(5$DD1$(7@*?#+*:.53&@%?FE1%G->4E4(AA2E:78.$'3)D6;&.<-+"834-*6,<-=+2D#*)9$'?F):%%8-+2)8CHF6'/="32*6>7$@6*F((?( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:99T22G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1988 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34230 42 95M = 34230 0 GTCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGAAGTCATACGGATANTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGG ";"<:-'*?12>7;'$CHEB-='BD'2&>/*D9"5!+!9B1"-1G@D%3;C-E$4E4321%.3-BF?24D?2/2.!B%%="0@/++C2:2-"24@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A50T13G29 YT:Z:UP jpayne@0: r1988 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34230 0 * = 34230 0 AAAAATCAGNNNNGTTNGGNGNNGGCNNTCNNNNTTNGNNNTTTNGGACGANGCGAGTNCCANCANNCNNGN ##!#$##!$!"!""!###$#$#!$"!!##!#"!"!$$$"$"$!#!""#$$"!!""$"##""$!"!#!""!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1989 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47176 3 37M6D27M = 47176 0 CNCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTT 2:@A5;#D0!'>A:@-A/9G:-$**H5?1!)?9F4D'E!$='H.-0<63"(83G9+7,&0GCGD AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:1C35^CCTATC27 YT:Z:UP jpayne@0: r1989 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47176 0 * = 47176 0 TTTGANGNNTNCGNTCCTAAANNNCNCCNGGATNACGNCNNANNNNNNATTTACGAGTCA $!###"$"$$"!!!#!"#!"#!#"$!#$!!##$"#$#!$!!$!!$$!$$$$$##"$$$"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1990 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4931 42 83M = 5061 263 GCCAGTGCCGCCTCNCGGCGTCTGGTCANGCAGNCCGCCCGGACAGACTCNATCGGCGTCATGATGGCTCACAGNAATTACGG 0;8;B8CA".>=':-&>>;G)G?&$<)F0"*8',/'!@H6E'/7$B7*!*.4+8"8F<:#E1#E6B-@B+C?2;H#,-4':7. AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:14C13C4A12G3C23T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r1990 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5061 42 133M = 4931 -263 GCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCN 0C4?>-;F-E=0!>5+5)$C"69=$H:H;C2%4.BG06)1:#9?G9B4!,1="*=?HA+>F&7/4,8@6(?'90)H45*9+.(&(A94A,/;@(5D9!%<;A/H9-:H$0A(/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r1991 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11071 42 77M = 10945 -203 CAGGGCTGACGTTATACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATT 4A>".G2GCAB8GE(>#6AB57@*)8;&$!F!/@A!=.8%!8=2:#3(>6$;3%)H>=EE.B/*/&651!7<)*!,' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T0A62 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1991 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10945 42 116M = 11071 203 TGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTTAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTATCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCC ?B3C'F5%$4+29G8D.0).C*6321%2.!D6&8!&?(A//D!B22E*-@%;4&"6'5)F#2&!=*'73++F<"22*$D%98$#)9$,C'=3BG0:"-0,$&,36- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C33T54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1992 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23739 42 345M = 23739 0 AATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTAGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGTGGTTTGGNGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAATCATAAAACNCTCCATTNTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATNAACTGCTTAACNGTCAATGTAATACATGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATT (E1B75!F%*'$E=*F!5=!8B%/@43254=!E/::-=FB,)*1980(E).!H8:/A(C1/C3'53)3F31G#*B0H&,45@,*<8>A;*=)7B357"2E>#5E9>&G";94GF%:+99$)23#;B4C/8&F#?;2FAH%<@'*19.G10:5(47$9#&:;20''4'-,)5H$,01:*,064?8HB:0>0@7*B"%G?-()>G:65=5#H<'+B/-<5(-?CH+E%3=>1-G".AH*6%!@!4E0A-:5-F.=9-'+C/(,G=38(,*"#2H56"C37?"AH>;-$(4FHB(*-'"/'H22.;6=/DGA!'@&B5,>*6G(F1 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:26T32C7A107G9T7T47T11T14A76 YT:Z:UP jpayne@0: r1992 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23739 0 * = 23739 0 GCCNNGCCCCNNNNCTNATTGNAATACATAATGAATGATAAT ')!!&)#&#&%""#(*#)*#'+)&$(#&)'+*$$$()'&)"* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r1993 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47521 42 60M = 47736 310 CTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAAT F)6B;DAE$95,"E$4'B@1F>.A5$D2>G(,.:.,*#"3*/%;G&31&,$*DA5F,"G1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r1993 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47736 42 95M = 47521 -310 AAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAANATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTATCCTGAT #A$2:/,#G@7HG$@2F,4"1&3=9@EA'/%.@H64:2;7D?<%C+:E=D!3C')7H>:'4=99E;)%;";@.AC+/)#6B&@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T20A52C8G5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r1995 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6974 42 94M = 7081 197 CGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGTACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCTCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACC <@>19>6!'.-D(#2(./!DF-4+(B*:.=8.(+,;GE0#1B!@:625?DCFCD:!0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C27C27 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1996 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42593 42 164M = 42757 235 GAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGT <0!;37:!C!D$7EB?/!C<%284=F&2FH>'G;@&4;4?.,G(&;B3..?";:$%?4'E7?8(=&%GD6/H7#0?D?*C9/"'5'6D!)F>$*3+D4F3%(900*?C=//!65<8>BC8:2:;$31"B#?'?&8*9/*8:GG'B?$/8C6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1997 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33980 42 215M = 34195 293 NGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTACGCCAAAAATAAAGGCCACTATNAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCATTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTNCATTACAGGAAACATNTC $+%&(($!!#&((*$($"!'+$'())%*%&"+""%+&)'*"&#'#!"##%("$*#(&)*&*")!+$)(((%"$'#$#((+&'$"*(*##)$"#'+&!$""&&&'%)$#*#)%$#!'$*!*"$#'"**"+'+#!'(+'%%!+%*#)&#&)+**%(*$'+&')&&%+)"$!(#%'!&+#)#&!&$!#()$+)*+(!%+#"*%'"!)*()*()(++!" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C85T21C50G36C15T2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r1997 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34195 42 78M = 33980 -293 NTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGNATTGTCCACACCATTGATTTTTTTC '))(*+)'*"*#&'+(+%!"'+'#)!!#$%"$+&#!)'*#+!&)!*+%""$"#!#$$$)!("&#(("#'&(!#""+'* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T51A22A2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r1998 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6746 42 191M2I17M = 6662 -292 CTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGANAAAACGATGGTG "F//);(?73(@"67>%98=('2G"771&"(D!G%2&67)!C'<-F1/9/027D!6@GH:CADF1@DA($1);)C*'*0?6<<"945$9&DF"4DF:0-"/+?><5C+")7,"@(>AG*0!B3.@+0FC$--95)52('@#43)%??#E8%5&7*#7'!E8'D#3D=%B8A%%G@'C"<7#!G-(:+)@(F.;7=E+BBEE/8"63#8?( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:78A116C2C9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r1998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6662 42 45M = 6746 292 CACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGC 3C.D@B-.D8;G+ABAE85"6>C+6@9C-H0:@@8.E1F,.68%/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r1999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22033 42 180M = 22262 281 ACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGNCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCT >&78AF!!A>=%)&?+5,1)%4H!4)*>%56*!(!B2#6@7./)27B#A&8E1;/--)&$?1"E0?6(AFC(?GF45<;)";8*@,22BE$F!;(#9E3"HC%;."?G;-5/3#338%61$<6/4B0)@>D@.G=@G!6CD3-4A1*=GDF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C98 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r1999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22262 42 52M = 22033 -281 TTACCTGGTTATTGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTN 08<<$88:>A<82+7(.C:%+,/#0<1"069<@B9*H&8+EAE5C8=+C)&+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C38G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2000 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42995 42 52M = 42771 -276 CCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGT *?23)126F?DD2<&D6&921H:,+!?>8G>:,-="3',-)*:98..9=#A+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2000 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42771 42 174M = 42995 276 NCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGNTTTAATGAACGCAATATNCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAANTCTCGTTCCGTATCGCGTCGANCTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAANCGAATCAAACCAT "+#''*$")$+'$+(%+("(#('!)$&&&"+'"&$$("!'!)&)"!!"*("$+*%%*"''&!$#+%!#+(!*()$&+&%&'&"!#!!%*+#&'&((+#%&$+')')$''#+(*'$#+$((!&&$%)))%#"")$&$!*%#%(%"**)('%+%')(#")++#'&&*"*(%$+)+* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G40A17T40A21A37T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2001 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42637 42 53M = 42505 -185 TTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGANTAAACAAGCCCAACAA 8;A35:$A'9#=E?*18C+E=$1%:@#...:;D(+-<0C21@CFF(=*%37)4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2001 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42505 42 114M = 42637 185 AGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGNAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCANCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAAC /!-F$/-/.1@A;260C)(#*+"4H*F01#"#2-#4+!?0?:G?,A46A2+0,A$5,GH9H3;38G:F7(H-G%, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49A30G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2002 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20850 40 66M = 20695 -221 CACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGCTNGCGNNNA )%+#)')()#%(+%%&)'%(*+&(!#+*!+!$#%*&)"&"*'!)((**!*("'%(+"($"'&!""( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:56A1T3A0A0C1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2002 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20695 40 66M = 20850 221 GGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGTCACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGNAACCA ,-679+C=6D>4B=#(!6*DD.0-?"(H"A5B91:>H!F+1CG8E8/8"H-9F*@-.H,)$&,H;5@D73),B##D1E+G(9@=G9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YT:Z:UP jpayne@0: r2003 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47086 0 * = 47086 0 NCATTNNNACAGANNNNNNCNNNCGAATNCNAAACGGNNNAGGNTGNNGCNTNTTGNTNNTAGNANTNAACANTCNCANNNTATNACGTNTNANNTACNANNAANGNNCAGNGNNTNNTCAAANCNNCGG "#$$$$#!$!$#$$#"!$!"!!"$!#"$$$"#"$$$!!!"$$!!#$"##""$!"!#!!#!"$!""!"!#""#!##"$#$"!#"###"!"#"$$!#"$#"$!"!$$#!!###!#"!$"$""$!!#$"!""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4643 42 77M = 4523 -197 TATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTA DB?8F9>;7B83673*$6)%CG26/CAE2)")=::?5?E$BCD/H7,?AB/7**0&!.#7237;FG&#$;(*:*0C) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4523 42 54M = 4643 197 GGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACT )+EF2H%#5@F0GF@C#6H9*@7*0:0/8?0%&G?7":A3"%(?@?H<6)1#GC="H"%80,&G&"C>%B65@,=/44:*DF8@".*&0A+2*-FB?2$",(3C@C,4!:.:*8?C1<.:!36H&7=.3;CD"A4C:(&==5E,@)E:B6H$&"),"8G%?>G'=1%+4;A083?/"?G;>@"$G.:B!+=D/CB=9&*<$C?G<76+;-04:9#ED>7'.8:#A,5$C AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:17A96G15T36A60T37 YT:Z:UP jpayne@0: r2005 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42650 0 * = 42650 0 GNNTNNGANNGTNTCANGNTANTNTNCCCNAATCTANTTTNNNNNNTTGANAGTNCNGCNATGGCTCTGANANNNNGNTTCGGCTNAGC ####!!$$"""##$$!!#"#"!$!#$"#!"$#"$###""$"#!##"$"$#!$$##$""$$###!###$!#$$###"#$!$"$!!#$!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2006 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2627 42 185M = 2812 242 GGATGAANGACGCGACAGGAAGNACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGANCTGATGACAGGTANACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGNATGACACAGCGACG 76221-8H5C+/1#>7GA./'8@3;85#5$7H58C3H(.;398:5141;@"&9($!#)&%")?,<)(E($6#)2FE;0-3?"70:=)-8:B=9B6=51C&-,2706"'E0#'$%'E@A.00GB5G2F1D099#9##=H,A+5=>.H/9!C<>@9,.-63$925;#$*$<#!H@!%>E@%*5+143 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7T14A30C13A102C14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2006 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2812 42 57M = 2627 -242 CAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGNGG 2F?9)+-CC79*',F.;#58C%,"1-3/##G(4@/D)@,DCF"#=@4<$B36F1#BF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2007 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6711 42 50M = 6504 -257 GGTGTGGTGAATATCATNGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCG '!,%*4@GDA7F/"8#9C+1"5;1AG*2@#-F6B2DE0;2*%"#1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2007 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6504 42 207M = 6711 257 GCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGC FG-G:D)F$7@H%8E10)!B0EB+94)2B@70$#DB4;/CC$2E9-@!>7(,@++F5.=F#;$"*'D%A&%.0G(7(H8G1A9=7E&,*7+,9:@54">A@'H=325:;-E:'5*6H21;A7-: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:207 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47842 42 128M = 47748 -222 ATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCCTTCAAN 5G15+*4EDG&'!1D.5/#?6,6*3)(#6D,C50;D7@@:8C,>H$6"CF:H"@'?%H;0H4&65=4EH2GG&GE;4ECEC1-4?*$9CC!)8F*.?8GGE2/&;-"E-+3-%"FH5$:%! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51G69A5A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2008 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47748 42 46M = 47842 222 AACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAA 3A0>(GCC<26:31B@4%*<- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2009 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48306 42 176M = 48306 0 NGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTANTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTAT !8$D-@'61;%@:5$$96%:<)4$$65#GC=C?"92C,8?6C*A%(F'4$2?(E10G+>;D3<$;5&,E.&A1+7?';7BF322CC>(?#!"-5:1@"D328',<72A!':C%4+53#?."&-'%)$),44*AF"A:*H>.D?A&+! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2010 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39846 42 90M = 39979 198 ATGCGCGTAGCCCGTNGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCC 9=+-6+?;0*:C),3=%=BA.C'"2,F@";'F@,>>A-!"H66A72(-4+A$)GA.$G1#<0ACB5G.EF'0@"1&2"B7=90=:;&8F3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36712 42 67M = 36515 -264 CTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTGAAAAATCTGNCAGATCGGC #(#**)&(*#)%#*&+$"))$$!++'')$""($('))&*)*!*%"#&"(**%(&*$'%''("+*)$+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47A9T8A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2011 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36515 42 72M = 36712 264 CTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATC D:"H$;HE-'C#5#G>/AC)85*!;59@27('2B;F%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2012 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34900 42 43M = 35050 247 GTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGANGGAATGGAAAGCATAT H,DB8&6C5E.81-&/$D*/4"$H?&CE$19A43$CC58('37 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T5T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2013 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44808 42 98M = 44724 -182 GTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGTCAGTGCTCTTTCCGTTGCGCTGAATTAAGCGAATACCGGANGCAGAACCGGATCACCAAATG %'+&#!!*(#)('**(%%)+#&%)"!%$+'')'!""#'*&$#'('$"*$*%*$&#+(')(!(+!'")!#!)*!$#&+!*'$()$+'!$+)($#()*#% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35C17T22A21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2013 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44724 42 69M = 44808 182 CCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGGGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAAC FCG9GE7:3(+D$!2)8&C'"3(=1D?+/5.++7.7805'D?$D6")"(1G?>%EE9>#-@*-89%C!. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2014 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21032 42 183M = 20942 -273 ACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCACTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATGCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTT ,>8894+9$+!''$,A$CEDDBG6>H/;'C$,#D+1FEAE@E.%D7&8@284%C/5/2'50'&+B.895@>9%(+!.'49;%0EA/H0H)!,/C)8303.)E4G%G:6=+'CB04C>*.07*9)2E"75)=4!07.&/@1:$95#57F$A#2.D*D7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47G30T64T39 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2014 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20942 42 90M = 21032 273 TNCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATNCAGATTTTNCTACCACCATG (#+%'#!$*+)&"*!$%(*%$'$$#("(*!!*""*(&!*%&!++!**$##"+!&+(+'"#!(*"))*)+!&+!"$(!$'')#%)*)"$+$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G0A0T0G0T0T0A0T0C60C8G11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2015 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3780 42 5M2I90M = 3708 -167 CGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGACTCAGGATA *$;(33#B6"30(,B>C*-4".;?>HGF)B8?="#(0#*G?!'!*G'#,3,81138,(,*7)+5H$H*@.=EC>%:C67.).HGA%H%*4%E@+:*2 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:85G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2015 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3708 42 44M = 3780 167 GATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAA 9D$*;&*GDE0!)E'.=@;)?H65>2(-AB!8##A"*)>$,)<: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47414 42 94M = 47185 -323 TTGATCGAATATTTCTTTAAANATGGCAACCTGAGCCANTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATC 0=?!3*<:B!6<*/8?3D4,AH;EG<-4!*@1(A4<;4.>7F2'856*-:@9)5A9-!2$C4-!++F"04.<>7(4'>7:'30.@=@?#79#*B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21A16T55 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2016 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47185 42 28M6D106M = 47414 323 GCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATA DCHF55=;<>=B>-=6(9.<5?=<"A%&5@9C45482,0:?9,@>>+:!(F>@C:#D6E'EC.HA.A9H3B7:EAH+44#+D#0H"C,4@E@<3&?(3#27';83H,(2/59&E6E?83&396B92D' AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:28^CCTATC106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2017 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19292 42 52M = 19512 275 CCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGG H*74&"=%(3$D'E9@'420A"8>"2H1B!5-:+-41#D31=H".(<"67'( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2017 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19512 42 55M = 19292 -275 TTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTNG =?F@G)=/*(8G#<0$@4%.++&$"261#74,7H(-?9:/H(3>)>ED50!.(!( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2018 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23660 42 41M = 23807 204 CTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGA E)!5D!5H(,*#?A8(-,%C(%@);56(3?H6$=7-?257: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2018 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23807 42 57M = 23660 -204 GGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTNAAAATATGTATCAATGCAGC !3/:?(A$@$+%E7'$,F:=2%A@A,E%(';A!>$#"87:F@-&A!26@7#11&A)- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25450 42 70M = 25604 307 ACCTTCTAATCCTATCTGCCCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGAC >GF<17EABB0/!+9B5(2C,",A$11"F.>6$"EH.!*3/0$G4$18():*"C'9#B2E3%@'71.(&/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A51 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25604 42 153M = 25450 -307 GTCTCAATATCCGGACNGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCANATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACCCCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTTNT "6=?.43F(:#3,;*=0>*%*2#&:8@-?<1<16D<;A/B<:=H$D"!,@AG>,">)7D?(A5E6$.*@+!C)@-..0('D.(4A2D%08B?$*( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16G39C59A33C0G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2020 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26390 42 61M = 26469 287 CCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAG 9/++#(B6H73#9"*F%G6=0?<2=&5A-",0F,0,##34B5=0:HG(-&)-G'61+'<8" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2020 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26469 42 208M = 26390 -287 GAGCACTTTTTCTATTAAATGATAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATC A;@@%.)*C:G99E:'.7!<&4?%C7&>)8>A-=,6+CE.9.%1&#>:<@C88CF6D9C6+%0@3'$$'/1G'C!2<(D&,ACF>('B5.8E.(.8C219*$*9#6)>'3$?-A,7'":A*$(G9)8*"E,E5=;+:HA)H'%980>CFG@;+>A0+G"4B9#F%0&=$:C7(2):-'=':+7>7/+6*,#%2.AF)1:&.<8.C1:1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A185 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2021 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17817 40 143M = 17666 -294 CTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTAGTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCA F.5#%,H,-#73=$@%!.$&E?'*)G)%<(7@)4?E'"),%5)G4$/(3@B'=.55;'.E>@?E&)%:@589,4E="?>5F-<'&,A5>E%:(;'2&%0.D=!2&$=),;:,)HB'AH;+D/C7.A9!/GE%((+,!?$)HD7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T100 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r2021 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17666 40 16M1D37M6D91M = 17817 294 AGNNGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAANAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTA **%+"($!#"&'!+$)$(*&#'(*'(+$!!()))*&&$"**(&!#!%(%"((+"%#$#+&!*+(%&+*&(!!&+%+)$')()!'*'+*("!#""!%!*'"#$#"%*#%"*"%(*'*#'%$'%+'!"&%$+!)!($+!(*+*#*+ AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:2C0T12^T37^ACCCGA29A61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2022 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6494 42 89M = 6347 -236 GCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATNACCGGTGAAGCCTTCGATCCGG C!1>G9@1:D(AA:"AA4G&EF"G';)&B@./@.B"::(F.6&>0@5E69H2425F:-HC;;&,E5*DF1C5(-:29BB%-&-&8.0!5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2022 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6347 42 44M = 6494 236 TNAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATC .D))0"1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2023 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37041 42 86M = 37232 239 ACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAANTCAATCCAT 2'5<.9B(-/@8@%(509".:-#'G>.BF/$1+,B(("!'H>8D:!7895+8*?'6A+<>/F0/@)39"FB80"4F03<3C::+7" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2024 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20435 42 262M7I17M = 20714 358 CTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGNCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGNTGCGGGACGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCNAAAGTGCNGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCNCGCTTGAGGA 5&'#E87AE(/;59H77(,2-('5.F7EA6F"=(%E9<2C$48'2>>@=8?"EB3/-*-E*.@9=#37779*72%H7F0%=B;43>)/68,.(!,B3!!0$7$+)G4:06035!.B(6%.,G4')*G-0B<*@-0-A"@-$"H::/#,5%!E(9D'37*(D=*>?7))0 AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:133T27C7A23A7G66G10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2024 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20714 42 79M = 20435 -358 TGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCATCACTN %+#)(&+!("*$&%*&%$*'$&&#+#!+)$+%&$"#'"$'(*')!+#"*'&*"&%"+$'!*"%#*%&$#*''+"&!#$! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73A1G1C0A0 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r2025 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5418 42 46M = 5123 -341 CGGAGGGCGNGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAAAGCGTA #'($%!)%&!*&!$)!(((!))"&!$%*'&"&%)+')$$#(+'"#% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A30C3C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2025 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5123 42 170M = 5418 341 CAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATNGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGT 72.,+-"!0'<5.8E;7AH@#647)51">1*0/';1?$#57C$%1,HED>D"#*72<(41%;=A$!!G<@.(:F=8H@,"D*0G=7F4)!54$C.%A0(H639@0143F%;:H!(9?:91.D+4$%AB2"$*G)4@&1:'1<>(""BD4,8@E224>-2(/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:119T50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2026 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9703 42 64M = 9838 302 AGNCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGAGTGACCGTCACGCTTTCTGA #*%C=FB$-$$/>6;@+08*$?0%8B7.<$!9EA,+=+=*1E!&BH?=*D(:").052?-?-+9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T40T20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2026 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9838 42 167M = 9703 -302 GCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGNGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATATCCATCCGCAGTAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGCGTCAATTTAT (!$"(('$##$))*$'*##'*)#**$!%$"+&&*)"#%)!%##'#'&$*&(#'!!("($$)!%!*+**$$+#*#"*"%$(%("!+$""*#!**"%!(#'&&")(!*%#'!(#*('##$&#)!'&#!#%'*%*&'%%'#('!#+)#)!$*%(&*#$&!+%*'&)'%'! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:40C31A10A72A1G6C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2027 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34165 42 79M = 34374 258 TTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCANCGC @%<()HF0=34)F7;@#/':HB?)52)"2#C097>:01(3%H3+'.%-/"'%@"?<58!)@#B#<>CC:G/=>D(B0):)1"""G+5<"%HBCD0C9CA)*70F"$>B>9/<8C,;#3"<)6?$#;#787F<4!B12'%9<<8CD?/@-;==G"'0)9161A';3"61A+,?CH">"@5?5$/C4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33A91T29A15T8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2028 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25334 42 298M = 25154 -478 CATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCNATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTNTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTA 3B=C4=)F68#A9=(485.@8;)>C@19--04C.7A=C%%F*F!=#A2>)@D:AA-*09'-6->H9,H47:E-'14)$(C*8D%?='.$H(84#48@;E09"/"'$C%29%!9B&*4,D)C69!"21;,/4#.!*'9>2E'B&"':-4)6CE&4B&%%.@!;DF5HH7CB:#(+7;:%06>:E?5.<%%G9<5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T139C125 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2029 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19831 42 52M = 20068 381 TGNTNCAGGTTGACGGTTTTNTACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTA '!)*!+%**%*&%)%'%+)*#)""%")$%#++#+"**#*#"&$'+'+#'&(+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0C1G15C0C30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2029 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20068 42 144M = 19831 -381 AGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGGACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGCAGCGGAAAAAAGTGCCG >>%4B6*1DE1?-4+G*D90"H,1E%<*>/?G?%<',!.;5,#;&(/#HH?-H!*2.0#-B7C;49##2?#A;''?$28 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C4C89A17 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2030 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29135 42 69M = 29318 279 CTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGT -$B19G3&)4&.>;ED;",7A2&:8=%04B6#7E="?58!+2"=HE+7&=,!&=0)7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2031 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25108 42 78M = 24881 -305 CGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGT C<'A44=9'DG4G*%:3:;(A&@E0B4';CC!&4'%C<+"2D28>9=)84F)?80?B>,-B%E$HH"E00(%@2%A"3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24881 42 227M = 25108 305 AAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCNCAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCAT &./7#E2)8(D?E?F8-985D'H%/=:8*5"----*"/!8;C0=EG4"*8)4,E.F1(*4E3B*G,831C@6D/1"7/,!E=7(1,5F!#"D"??*)>.'1,4,F-;&D>?>H$(/(<35"@C2EH,!=/-G).)2='()5+<'=E6E-@+B3+&F,'>A"B=''.*EAC6<(G1>6*/,49GC-BA:,*-%*#++?.>41$@;534(>,7>0"2?#?(%>F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:186A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2032 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13886 42 92M = 14076 332 CCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGNGTGCGGT 4"!:0+:#G:"28F?6G?)8%D&9?#3-@+:'2*1H5CGB95#GHC7=$8%:6D"C=EAC!B*)5"3.F8;;E>5E-E.;8)%A?BB;=#8: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2032 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14076 42 142M = 13886 -332 TAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGG +4G.!;37"*B@C@/;;6(+>C,EE8:6(%")@H:1F&E&9<:.><4E@,6@&7D>%.$2-/?A-; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:142 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2033 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 102 42 144M = 2 -244 TCTGAAAAGAAAGGAATCGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCA 8*99A6(EF),?=$%?E8D)=B@--/,H?7!0C*#BDCC::52"C5-'-!&G8:$@9CD,.;::.*5G:>$#B>4821(;'BH>@0A"0,<5';(.E/10>!BF#00#!7(42D.:3*E0)<>&21?(9D/()E'#)+);H--+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A127 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2033 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2 42 81M = 102 244 GGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGNTCTTCTTCGTCATAACTTAAT $&+'%%&'"!'")*)(*##&(''))$%+$"*#+'$&+#&*%$"%$'#%()!$&$+$*)%#*"+)&#%("()*+)$!*%)'$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2034 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24597 42 56M = 24450 -203 ATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGT 0?,2)%.0>";(-//H@F-B)(@G&B2+##C'18/EB4#-E8B4)3+B&7&+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2035 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A48A32 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2037 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8493 42 52M = 8283 -262 CGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGANGATGGTAA 6)#/-&&3E*2B,1&D;@/*<-G(6>"/>B#G,>8%(G6,'=85;15<)%(, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G8 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2037 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8283 42 17M1I193M = 8493 262 NNTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAA #))H87C?H,(=(%)#>,%$$#.*G*(@;)#"2%/,'B1+=@!8D>)%'$)65&0F*G>,&A<15?:51=,A#1""::D"4&H.D8/;&";F9>0+*@(/4A41E584E)*71&2!4:49*?-8<72D+CE($(GD6.05:$&9D6/)%%.@@&"8E59!$E9@);(5D(69>5"#F& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:0C0G208 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2038 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4741 42 80M = 4915 248 NGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCG "3)++(@#(!A1)B0EA=79<2,5.%=/$/8A,,F),*/&=.F@*8A"98-7+2F3D)3DG!44#;),2E8@>(.D2$.-G((/H:H%13%"*!'*414$-47'++!5C7:E:'B&9-@G';$:!G3C2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G52G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2039 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20300 42 54M = 20480 228 AGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTC <$-78&$/+B<"#!'%B))D##B4H"?E.7(?8F-A6DG2.*6ADB1;99F:=% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2039 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20480 42 48M = 20300 -228 CGAGACGAATGCCAGTTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTC 6%91@?10D1''%"%!,)FF<*<.@3,B==3-5!"61E3<,324;B$B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2040 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9091 42 74M = 9214 181 CGCTCNNCGAACTGACCGCNGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACC ()"!&""&'+)))"%&*'"(!+"%+$$'$%++$$')%'#&&!'"&$&#(!+#'%)&#!*%%')++))*$$#"%* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C1G0G12T54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2040 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9214 42 58M = 9091 -181 TGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATCCCCG &F;'+B8562?&@<2E3$-4>3B954C4844427<%@1EH1<)@<2(H0.9! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2041 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43111 42 49M = 42953 -207 CAGACTGAAATGTAGTCGCGNTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAA <-G+C3D8!(!H>+%1)069$@:;9H."?.!0H:,@D/949/)2(*2-> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2041 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42953 42 98M = 43111 207 TCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTC 178&6G5B/)%>"*+&B?54!0A'1FA)-/-<(/6:2:*!!!"&3-99!3:+.#4?3G;E$=<7A6%D@,(B/H7-,?=-H<)6$6"(*A%82?G<)- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2042 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18920 42 237M = 18832 -325 CGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCCTCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTAT 7D('>F6&A%@-$(A=''$>G?CE-F%7"'4:07?,)D8;F/:@/2>E@!"39"0;F9#<$F1!2=29&>H"-$(FG66A(&F9-"G.8)@)"(09248#G02#(A.-)3:=D@-?=*?%'$5G;,AHH>;&E@1--8CC!/:03(9=3">.C?*5F771!?0G8*,F#1"@%,D9FG*-<>G&>E%>E;1#-D5!26A:,:E?/?F+"'%D(@D$B9.'H;87%'E9,AG.6!2EE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:205A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2042 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18832 42 88M = 18920 325 CCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTT >07@)@?:)E1*!!;24'HG/05.9%"F)4#=<&4;29$(/8E>D+G,0/%%F9/C0"F.0,D&#.1:B@C!GE#B4.CC$.DHFG8F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2043 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15286 42 65M = 15524 296 CAGAACACCTATTTCTCCTCNCTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTA HCC?4B)2B"-)62C<>!1A58/)-H1F54!=1()A?E2'$2:EDH/"&FF83 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2043 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15524 42 58M = 15286 -296 AGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGT 4@7-#(-'3F&5CH9"44BD/H1D6@(+34')98!08@1.<.1C(GGGF"@8*4?!0: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2044 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46660 42 107M = 46563 -204 TACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGGGTTATTCCCGA ?.6H@3()C;E;>E/CD0(?C?22/2"69"#=C,5#&.&?/*=-@"%E?,,@30%6.E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2045 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8201 42 99M1I76M = 8431 310 TAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGTCAGCGTTCATCCCNGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATNCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGG 17::#(:30;%@6/D"7?0$'-->!(1G8E-87F=7*;F&05-4(>@<2E7@@.,>(-0#829*>&3,C9<:.6%".5@A+(-(9#;37>.2;$G<35(>B#B:5%=<.;91,/CBFB5-'E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2046 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16420 42 169M = 16325 -264 CAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGNGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGG %$"")"$$!()!")"%&*'**'(+#!(!'$)!**#'("!'%+%$)!+("+(+$+('*"$(!!!$"#)#(*&$+(!(('!#'"#%+#($%)))$)$''#)*)!"%%%!)%)!#!**"&%')'*)+#!'")"#+)'#**&+*'&#"$##)&$*)")!"#+($(%%%)&"+& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88C80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2046 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16325 42 40M = 16420 264 GGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCAT +G)!8'2B<.+42FCB?,3..AE)9:C=:$9:>$D4-!=6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2047 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29571 42 48M = 29679 278 NTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCC )4(;C,+>!.+(8;=E?(2(5"G6H>-28&F5G.4;2<018%B06))D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G47 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r2047 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29679 42 49M3D118M = 29571 -278 TCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAATGAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGATGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTC A@A=B$E438@6A04F!HAEF0'"><.C::?H+04>?(A2#;B"4..@F$C!(6E-=3!:)FD=7:8A@5B8<,D)/5;%9(2(B1>:F&79,$2E&4+1#3';*=#A06"#/95%H1(70,D:E)3A>/.&17%8"'@F+66D!'2!<@<@E@=B$)+E+:@E%16 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:38G0A9^ATA66C51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2048 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10404 42 45M = 10244 -205 CGGCAGGGCTTGCCGGNGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATG 1&?G8%":!-H)(!,&C%;.10+19B/'>?.>'4G"5%#F!2'9* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2048 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10244 42 85M = 10404 205 TATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGC ?%5,9#F()#+#:!"F$';9%;59+$E>!6@E',%1%2&/,0A@+C(2/::?<:.H-/= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2049 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27227 42 303M = 27154 -376 ACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATNGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTNCTCTGGAGTGCGACANGT 02AF#+5@!/$5'4G8(64F36G80.C<9+2%;=59""&0ECA!6E)>79>4?@G31G#-/HC'$:2.%C.5;82-$8E**>)%F4.4*$*1):6;"E7C852@@>#:#:4>*/#,.9072!-06/&6*64(D6$=F53(1C&H;$:0"-%./&B&F!:-,)!,4-.=%&@#5'DE!D/DH#.!95)E%>%AH2>".07"$0CB/-AHB&3?0)7B&(8& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57A226T15G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2049 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27154 42 73M = 27227 376 CTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGA H@'5:82(0"/F!5:29CD!E#EA2$*FA%H=72B'476$?3/!GCG+>/*!;+#CG2*G3!F/##A>C1/F5!0'A&;:GH6294+10#;>-=F<%2/33C63'=)F$'%#6E$9<+5A?D1(+>$DB#:A'!F82GG5?E/E?H"?H8*$"B?<@*7@C&7*:.6:"::@"(:>>&&D4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C31 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2051 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22161 42 71M = 22008 -224 ATCGTGGCATCTCGTTAAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGATATTTA &?B->9A1+*<7">.B*!"41),+,2;0(D61FB@-!'F&@8-(7'-;A$<#1%&>>.',./CA1A9+!,&#!F@,&#C!20#F#7#,'?:"88" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T21A35 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r2052 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40108 40 5M3I75M = 40022 -166 TTACGCCAGCCGCAGATCAGCTTGTCCATATGNCTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTN "8=6)H46HHE?CE=*!>-6=4*7HAD4%H/AF+9@F89)!*>>=0+?ED#:C14"BG&G#/6.;!$!C4G&=%>-B>>1F)% AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:0G2A10G14A49T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2053 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15731 42 55M = 15731 0 CTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTANGGAAGT >B8),!0%E5/1C9H!;6,-G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C6 YT:Z:UP jpayne@0: r2053 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15731 0 * = 15731 0 AGTAATTATGCGGAACAGAATCATGCCTGGTGTTTACATAGTAATAATTCCTTACGTTATCGTAAGCATTTGCTATCTCCTTTTCCGCCACTACATTCCTGGTGTTTCTNTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGNGCGACATTGTCATCATATGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAGACGGTCGATGTTTGCAGACGTAATGGTGCGGGTGATCGGCGTGTCATATTTC ,D-2C(#$-310(F!5E6)A)@'$.$.9-H(>%7D5A,54@%!=/?<'89;G3,=F'./8AC*>(8(?H/&,+2&.,3:6F9A&"$?%:B(F36/3B,55@1BB'&9-)"6B4-8F5@:(8,=!1#B=FH63!=$C/>2A+=D#-42<.1'F6F'!'??-.5+9H98!&CF8;F269H?D<&E+7-&2>?(3-&!DD+"(,(7"7(7*982%61")#)/?9*'*-;$&E039&7*58>:?"*?#%/ YT:Z:UP jpayne@0: r2054 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12470 42 95M = 12634 218 CGNCACGGACAGTATGTCGNAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGC A2$D-&CAB'H"6<4$5#G%G/:A<%09?B%5;8;!=D,1C5>$$'9=,&65+2EFC/E,E'!-7A-:08&702+'%A".$&'H4D:!$4;!4'6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C16C75 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2054 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12634 42 54M = 12470 -218 TGGGGATTGTCGGNAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTNGNNGCT &&'*(#&'#!&'!'!''(+(#+(!'#*#"#)%!(+&%!''"%**%+"+$$$)'& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13G33G1C0G2G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2055 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12325 42 224M = 12549 455 NGNGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATANCGTCNTGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATG *$"(#+"+)+%$&+)(")!'(")%$()('+#")$##*$'"#"&!#!*)!!#'%(#")$%)(*&$*&&!$%%(+))+')'''"#'''"$&!(!+"&!**#*%*%!")&!)!&(&&$)'**!+&%%+&&'"#*)%*""$")*$###"'+!)%#)+)*#($"!")'$"++!$$)(+)#('"##"(!*$!!(+)+*&%#+')$!+&'**&"&"!#)&&$$!""(&()* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A1C42A4A173 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2055 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12549 42 231M = 12325 -455 CTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTNGGTGGNGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATTTGAG A:D*.#>F+&F.$H%'("!!*D3HE-@',(:-,+614&43BE$@CHD&C":-<$5-D*;@&7-6.&:A/=5$C:0!+E=,>=8,2))0A'!+G5#!=2!>*3D#"1G@9<8"H:+/DD/"@9.<:4A<)>7E-862%25>.3)F$271@E6'5C;DG17=@5&9-:+1")H->'1+>,F59+=?!++>C2;@5+F%=E>?3/,$5;"@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:128T5C33G57A4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2056 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39971 40 95M = 40099 276 NNACNACTCTTGCCGGAANCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATC %$((!""*"'+&"!$*+"'(""#+""("+)!#&#%"()%++%"!&$&$+""'&+++#!$$+#+*'$+%)&&)+#!+!""!"*)((")+#&+$!#+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T0T2G1G1A9G76 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r2056 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40099 40 9M4D135M = 39971 -276 AATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCGCTGGCGATGATCGCAGAAAT :#38-+CE?A&0:<0616$0.)G!?,-?,A+5/B&6%@FG&+8?&D0&@C@@$-;=E:(AC+@D!E247!*:"=+81D;:A%&(+#+D91B(#<,28%!FE AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:9^GTAA114T7A12 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2057 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 991 42 80M = 1162 285 TAGAGCCTAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAG -F)-C9<#+8"%09;;010'<.G17<"*6.-E<(1'@88E#&BD=5#;15$E@C3.HH?;5'7':5;5504$E&)$.@!D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A73 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2057 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1162 42 114M = 991 -285 CTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGANGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGTTGATGATATTGAAC ".*&($F+F6@$!G:,)!=8&1("#!9@A@2:%7$-:/5/'2C/A$/0)B=-&E:(E2$!<-"33*&,$@<8)<&:A)E$55+=894H: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2058 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33723 42 295M = 34018 340 TGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTNATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAANTCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTA /#=05(G.=22<=)D9'."%?64$.#8)?=&!(:71CD?-<-/*!;>A>C(G>+EF>0.);G*5&)11?."813H0844A<>,+%!$=,&8$!:,0F='1:H?<<-.(F'1DA>.3,.956A7H0E5-/,,@:0'.A5=,%4;A;>#D-/,GE#1$60%:($"-=4)BA:05#.! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112C94A87 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2059 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16212 42 211M = 16423 297 TCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAGACGTCTTGGTGCGGCGGATNTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAG 32G@,%;C)&09BH1(E-F,5,3&=5;6G4/)$%$-/C;G;92>"'57+G@GC1H<,,*30:''7#F(*;//D2+783D9;,->4(2*!$?'@0/0!*E;3/3&12930D!=0=8>$1H)$;5'B:G.)>F%'#>AB18B@"*H;D*'&4?%7A;7*($*#)4%,,+/5FF/+/% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:158A19G32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2059 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16423 42 86M = 16212 -297 TNCTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTNATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGC 42$.,.1H29(3:F8A+A@.1%G'3'>!.2>C5/:+E)3DG,5#*+/G%=>/6:<(.4D97;2C&5*+)%2'%,!%A#-.71.E=/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A55A28 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2060 77 * 0 0 * * 0 0 TGTNCNATATCNTNTTNCGACGGCGGCGGTAAGCNGGGTCCGCCAGATTCTGCGGATGTCTTCATCCGGCATGCG !('!&!)!!($!(#"+&''(*&+$##(+!"'')!"$")!!))(+')")"%#&()#$#%*(&!!+&*')!$'*+*# YT:Z:UP jpayne@0: r2060 141 * 0 0 * * 0 0 TAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCAGAAATT =6?2E'(=G%'$'<6'&>$!&'H?B0(4B!(AE-%;0A8?8GCE'# YT:Z:UP jpayne@0: r2061 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38725 42 98M = 38725 0 ANNNNTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTNNATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATNCGGGCGCAGATCTGAC *#$"!++!*''&!*+(!(")("&'&"$$!'"'+*#'&*&&!%(%)""$#%!"*%#)!&+!$!"&+"()+!)#$*&+*#%$"!("%%"##)"&'$#)+& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A0C0T0T30C0G44T16 YT:Z:UP jpayne@0: r2061 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38725 0 * = 38725 0 ATTGNACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTAGCGNTATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGANAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGTT )""!'+'+(&"&#&!'&)%%&$"!(#!"*+)"+!+'*%!!%+#&)'&)!"$$)!!"*+*'$&$$!%"(++'#&)'*$'##$!)#$!&'&(#&+)"'!"()'""+()**')'#)*&' YT:Z:UP jpayne@0: r2062 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36271 42 43M = 36445 262 ATAATTAATCCNTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTC +9<;E$%77'==?6<'?"2H#HD14DC6(,A!,"#?6,@0+CF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2062 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36445 42 88M = 36271 -262 CCTCATCTTTTNCCCGCAGGCTAATGTCTNAAAATTGAGGTGANGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTN )%$+%(#$(()**"'()!"%!)$('$+$!&(&)"+)&+$'+&%%%#*(%+&''*)#&**($$%*$#%+*!)$"'''%!%#+'!$))!+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11G17G13C43T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2063 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44561 42 133M = 44694 194 TGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCNACGGATCGTCTGGAACTCCAACCA ;@*CF)<5$@<((<+%+)697+(C/3>,>9@13%A,#8H66A--0)02B#9E;@,E5*&,D"@BC%=4=?4.ADEH8A%DA:0$;:(9@-3<3?=(2,+66))4&-##55/7?G+72)/.8)F$G/@)&E:.8D69"D6768E105C#13C.=11(9D-5:E8DA$?B9"+/4#D0-87$:GB@7A%+0(.?BEH=FA5DG32@)B"E4?/-3.%&&8E'B3A$A;";D0';H3*F2F4"E+3E4==F# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:151G10G25 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13545 42 229M = 13774 417 GAATCANNACAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATNGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAANATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCG *$%&"*$!(#+$$')#'(*"!)*(%"#&$+%%#")%"+"&%($)%#!*)*!(')')'%(&$"*#'*+'*%!$$("(+#%$&***(*$%)!(*+*$'#"+$!#"*("+)'%$$+&++)*!)*'+$((!"*$('%*%*$((("+#&**$")+$$&$'#+"'%"%'""'()!(!$('##+(+"'!*'+()+%)"$!!&%#*$#$%$!#$+)!(#*#"*%)*#$%""*"!(** AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T3G1G0C1G81G71G65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2065 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32691 42 85M = 32892 310 GCTCGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGNCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTACAGCC (1*//3-'!;,*>2E*5@*G9(A$:!C-<1BCGD##:?=E,'?&)C1H?/@%#(&'9847=(=%,#?*<:9E=$)8==GH$D(;H AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G23G51T5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2065 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32892 42 109M = 32691 -310 TCCTGATACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATNGTGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGT G:A4<7&)2EF.99(GE#-F+68/CE>*-!,:7':>=&=%&'E52-*2<".4*6"#,#.C)'$16*6'=$D#C:D'7>=3"@9)/;=%"/F-D-B1&G*)>.3+3FC2" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A74A1C24C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2066 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5073 42 66M = 4857 -282 TGGATGGCAACCCCTACAGCCNTCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGGNG (#"$%'&')$'(&'(*+!!%($%&"*$*%*")*+*(#%!+'+%!+'$&'$)'*##%")$#)+$'"" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A41A0C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2066 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4857 42 62M = 5073 282 TCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACANGAACTGNAGTGCA 10C96>%(%60)0--)9)&&/#DE(57=7=%@!47-!A:=)5@257>H26A$)6+.1#D*!' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T6C6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2067 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26787 24 81M = 26594 -274 CTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACA *8A)0H!'4"!B')5?<6$F#,A$(98>>/.3.+9#;70G$+083:'<9A),)(%;!9'E";)@&-E.$GE9A3;.!+),B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-63 YT:Z:CP jpayne@0: r2067 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26594 24 93M13I95M = 26787 274 ANNTCGTTTTNNAGGTNNNCTAATCGATTTGGCCATACTACTAANTCCTCAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACNATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGNGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGANTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTAC !'#((#)((%#$*%((%!+))()$"&$$'+*+($!"*!%#$$&"!!$!%!$(+&#+#&&'')!(#&+)%#**")!+)%!"%$($)%+$(")*)*((&+%""#(+)+*!%)#++%!(('#!!%"$#!!+$&$#*+%&'*&""("!&+$($%!)(*!"&'(#'#$'%*'$(""+%+')%#!(+*#+&!'!+%"++!)'+"(!! AS:i:-63 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:28 MD:Z:0C0T0T2A4C0A1T2C0G0G25A4G29C16A51G39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2068 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16272 42 155M = 16454 255 AAGCNGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGNCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCNAGTACT !73!#A,CD/58.'E0E+4'E/&2F=#%!;3<5<2-;1E(<'$8=/23H/7B",$(#D)%>C7.%DFCC$#!9%'4%1?>8:=&*8&%2F-%C;B(31?+)-=*7,($7>=(DD+.$/0<@&.@H%AA)&+F>)F'@8FAB<>!3A=5B:"%!D/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C3G44G98C6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2068 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16454 42 73M = 16272 -255 NCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATNTGCTCAGCGA 0;A7F?F?EH&&B@;<-+#%<9?H)1(F#G/6(?(0;,@*>@E;!;*89@.3G'320.EE;=#.-189DD;H; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G61G10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2069 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37435 42 49M1D14M = 37203 -296 ACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTAC 7@'?D(@G?G18)'G(%&7!"+&2=E9E,AF282;927B+6+'4B$-+2=$$FC/,$E0AE?48.!"E!!>9-8=(F79&A>>5+$(2%6DHF+E3#E.@>#F55 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G18T47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2070 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14351 42 102M = 14478 216 CTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGNGTGCCG .A7,EF<9>@;1?-1D$-4,#5-5+>B0'2;:+@<>CE9)?A:,13$;5(.,%6/:/$8@.@=464:59@:$70%.-/'5:?,*=&/%.>;F,"!8"%">1< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95T6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2070 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14478 42 89M = 14351 -216 ACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCTGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTNN :>79.5@!?'% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29C57G0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25088 42 151M = 24961 -278 TGATGANACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCAGAAAGCTTTTCTAATTTAAACTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAAT %+#&!%+"!)%$!&!''&++"'#+&*$!+*(("#%*+"$!'$&()(%!$%'$+$+$!#'$$(%#+++%&'$"+&*((%)$!%#(#)"&!")+!"#!"$)'"#)#+##'%'#!!*!!(+$()#!%$"'&%)&!#+"($&+"**")')*+'+) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A60T18C64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2071 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24961 42 127M = 25088 278 TNCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATANCACCACAAAATGGACATTTTTCACC '!+')'('!$$)%)!!"#'*!#+)#(++'+'!#++'%(#""'#'("#%+!)*#&%+&''($$('($!'$&$#"%***&'+**#(#**+%&&$))*'!&)+&)(*''%*(&&$&(&'&&"*"*$)**( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G99T25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2072 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46137 42 84M = 45933 -288 CAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGTT :H?)6<*:3/':@8C4@/<=%;E"09FD;6@C"&97B0-@+FBB*?$@D*-=EE14%) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82A1 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r2072 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45933 42 19M4D119M = 46137 288 AGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGNTTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGC ?:/==AH6:G/0;7F@,4%68*0:4'CC5A(4*8,31.-0?4C$?A.8&>>H,A?(+78("%15/D)@9@5!?1>0;+6(5!=GD#%;DA2H2!0D,27B.7H(-B%9E#B@.FC>D;E?'720,$H=>@!*H/%>A2G8C3&-8?$$2@.D@; AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:55^CCAAT7G37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2073 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9435 42 136M = 9330 -241 GCAACCGGCATGANCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCA $$%"$!+(!&(#"$+'!*(!+)#!+)%("*!&$$$"''%%)##")$#+#$!')&'"!$*"'+)*!"*#!)+"%!*!%$!)#"*""'(&*)+%%%")$%'$#!#*&"(%%#&'')$+#!!!"&+#'()+%"+$&%*( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C122 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2074 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40266 24 185M = 40451 377 TANNNANCNTTTGTATNACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGCAT ""*!!($$$'!+*!!''$)%(%(&$&''$&*#))"(%&%$)&%)!"((#(!)$$!)%)(%*&$$!$&#$")!))&!($**#*#!!&$$$'!*(*#('((()&")'$!!#(&"()!"!+""($!%&$%"##%+%!&!$(&(%!&'%"&#+$)&&++("*&%!#""$+!%)))")""%#))'*$*&% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A1A0G0G1G1A0A0G5G165T2 YS:i:-57 YT:Z:CP jpayne@0: r2074 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40451 24 112M3I49M2I31M = 40266 -377 TACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAANGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGANGGANNT !&&%+(#+'"*!'!+*!%$(*)'!+%%)%!)%!!'+#*#%())*+$!("%*!%%'&&#'"%)+!'&++!!+%()+"$%#((''*))))%'$)&+!"')!%%!(+'*!+"')!*$)"!#*+!+#()*&#!%!%'++&'"%("$*)&"!*)#'""$$+%++*%!&#+$)*('&'((!!!%)%#%$'&!!+%"#()+!$' AS:i:-57 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:23 MD:Z:6T27A126G1A0G0G0C1T0T0T0T0T0A3G0G6G3A0G1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2075 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40346 42 58M = 40166 -238 GCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCNC %'?5%9D$=0/(@-@@G)C?@3921%(.G?G!5-+5G"C)<+?18D70A.'E1F>@$( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2075 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40166 42 55M = 40346 238 CCCTGNACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCA D=;&7*C#BF>(D9H7BE>A'.;+GD"#99>$,+!5.C?2:7=05091$H#=CA3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2076 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42117 42 67M = 41994 -190 GACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCNAAGCCAATCC F!1<.87+(;,G08&+?30'#&<5.)G6A>H:2G*)@/H4=38B;E+"?C3G9C/,G%"$>G,A$1-9:-%E#8*05"F*).E"1A*C6<;B$"C%E@7BG75:2.'>;81@D?731BC/0/G*=&:8H3-49B3G$,<2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2077 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48137 42 50M = 48279 270 TATGCTCTCNTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCA ,$0-GC*"7:(<(&G6"<(06'3/H-@?D$4=8@BE&?A-><5;A18E'5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2078 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1483 40 69M = 1575 203 TTGGCCTCAAATNGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCA ->5/1@4+D))?=A.(;*HA??G(2.)6%1D<%:CG*5&;**('!)?#,=D*;,?-8@'+?( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48T33 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2080 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 977 42 161M = 1138 243 TTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATA .??E-<&.D1DD=@/+D;('BF5+;&,85*G"$@8E;05$334F3:#(C3G$1>:+&D;?GD!4.'G6/*0E"!G:=!%>F.7"-(5(8E(B#:<)A1::$7CBB9*C''7.C*<2$C;0CE.5=DD*.DGCB)D:89HGGH+565@3)F1E<,'9%H5?0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102T58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2081 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31211 42 80M = 31051 -240 ATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCT $)51F8=9GH<3,?,45A3F8@$(#&'+3/5>;8?!#:??+*@A.()H*,1,&D2!>GC!BF%)*#9% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2081 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31051 42 49M = 31211 240 TCCAGCTTTTGTGAAAGGGNTGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTT #*++('+!*'$$##!)$!(*!"&)#&("$+&#'#)$#%*"#($')!'&( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A28G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2082 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33050 42 114M = 33164 588 CTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCT 0#33=28D.3:?EC;B-$4E;D&$:7"D+2B.,6E#.69*!55+437C;@G-"=442<0-B##+D30//?,28;5+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2082 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33164 42 474M = 33050 -588 GATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGGTCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACAGCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCNGGATAGCCATAAGTGTTCGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGCAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACANGCCACCCNGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCNTATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCGNCCANC &%*#+'*!!+%)()!%#"'$$'$&%%%*)#(*$')*%$()!*+**$"##*)'!)%*)#'!(&$#!+)'+$'"*$&++%#)($*#)*%'!%)#'+*&&%+!#"#"*#*$"**&#*$$#+#'*'*+*!&()"&+%#!"&!*)'$++$*($$(#'%#!#%'&*'+"#%""!$**)'"+$*%#)!*)"&"!(!+"+$$%*!*"+&(!&'*%&)(*#$&)($("+')#"#)'##"+!(*"%'$"###"#*&"$%!))**&"##!(#&#&!'#+)"!(""$$(%$#$+!*$#!*))%+$'("%*$(''&"%($+!'$)(&#"+$#'#*'"'$%)#!'+('**"!!'$!%#)$$&&##+(%!($)#!)#!&#+&+*)'#+#+!'&(##($#!+#+%%"#%")+$'&"'%('")*#%"#($*+)%%!!("'*)(%!*#+!#"!$%&$+)**$')*#"+*"$*+$$!$)'"'"!!+#!)%'!! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:43A56T40T17T62T51G7T108A35T39A0T2T0T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2083 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23289 42 92M = 23161 -220 ATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGTAATGTTTATTTGTATGNTAC )+'!%%&*))!''##$#%)+!$'%$(('"$#!&")*'"!)!#$*&!#"%+$&*"!!+!))+!)'#&%&'!"!"%%""+%+$'"+!'&#+$"" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:71G1T14C0C1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2083 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23161 42 77M = 23289 220 GTCGAAGTGATATTTTTAGNCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATA EE8DB:9-,),F&#!14-?$8<<=*@'*1./=';5F9@@7$/96<+H#7/!%;7F:?$.@FH9:<4#7=+8/++H45 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G57 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2084 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28098 42 59M = 28253 278 CATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGG $))'+'*!%()'"%&++"+(!'"+"*)&&!!"(""%&!#!$$()!&%&&$#&#%+(!$! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2084 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28253 42 123M = 28098 -278 CCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTGTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGC %&@-*),G2,1>!7E7'!54#0>++7#?D8$)(.):H"8F8B=%#":F@+(8D5'C%#1-5"!!"3;)5$7=9D>2F'?=>D&E-CE35=/G9;7>:<6C601EC,H''=3ADC.44E%=,$7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2085 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41469 42 42M = 41622 218 GAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAAC C>:H"7/46&(0>0H/2)4&@<;->:7C&4-*-5#7-*23C5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2085 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41622 42 65M = 41469 -218 CGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGC *;G7BAEA7<;1HB@6A/&$F"8DFD8C1C;=@6#6=,273DB5%@D7?;6C$>)=HDH*##<11 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2086 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15544 42 250M = 15544 0 GCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCANTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGNCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCANGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATTCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATG 8<,4@#,G."'57$BBE2='3+1H7$D?;A-5D(*-!.+H=++4:3-=FC56GD.?%*E%6##2D):"!.6B?F<:++B?:FF,E24C/"!1;%=?@G4C2**D1,?%/"G!*%H2&6G*;"D(#-81!A/D?1!H++E:&4E59G3=C%GED&&#=>=3G:8A1&!@%F)C80.,@EG;*;>?.D,;.8%<=$GDAC7&=F?D#G76.'$75!:=@6H/48'4!+BFH/+C72=E5@,A:="A*'")C317?;"=/CBA).=&'(;:)1:A''0;:AC"%0>2.-1/<.EB9,G36#<-5:-8699HA+4GA*1(,)CH9F9$;1$7G:4@@G"%A86.."<9B.'6/'G>)=2HB)#'#2) YT:Z:UP jpayne@0: r2087 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4657 42 112M = 4466 -303 CGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCNCGCTGGTCAGCCGNANGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCCCCCGTCTGCAACAGGNT (&"("&#**'%)!!+#)"#!#%#"$!!)"%'$'&)"%$(("!)'&"+)'##'!#$&$+(#!&&+&!*#**)**+"&)#!%%$&&+&$'!#++)"#)%%%')(!%$$*))+*+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28A13G1C49G15C1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2087 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4466 42 123M = 4657 303 AATNAGCCGCTGATGCTTGAACNCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCGANGAGGCA 11G.2@G.?*.>H>'D&EH#/,0C1,<);4G6*?<-*D3CD57<<&G4'B6)?G#<0"/638E9'#!'E:0;CF)6$$C2H=1-@*C"'%1:5'6$$1-6(B%81"$+7@*"E/F@)&E$A:3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G18C91C1G6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2088 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31023 42 71M = 30672 -422 ATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTT <:8076'2D3>$G)965"E.H'6F@$)-@:<1E8&E<+2:3>)9BD>5A:*?&++$1=E6>2*&85/(@!()+:9G+-6%-6E!,5FF278;C:B1B"D!C98;/7$2,(%!2DF95*(2;:+>+H64>,,090:C472):*)0+(D)=@68E)1""'7!-*4AE8G"@1,##B(B?0)5?>'F';#G71F/D/H+3F!'=FD-AH.AF!3323.*!@%1&#G28*2C5%)7*4!%*7C26=@A?"!;@8@#4:C,)DA-'H&EH79*2B()2)7E94B'@/5F46$F>(.8&*':+,13E:H2&469(>7#EH7A AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:26T71G25G19T28^GG154G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2089 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29612 40 116M3D66M = 29572 -225 AACGCCCAATCTTTTNGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAGAGAAACAGNAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGATTCNGGCCTCGCNGTTAATA %!!"%$)!+!#)$#*!+!"!+)###%*&*)$%"(!$$#*'%+&**((%'$"#)''%&#%(*')!)&*&++%'!##&"$*+!&*&(&!)'$%('"**"#+'%&&'!*%#%(**%$'##)&%)('((&%"%"+)"$*"(&"#*!#%"*"%"*)*$*#()%!#+*"&'#!)'$%$)%$"(!%*!( AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:12 MD:Z:15T87A8T3^ATA46C2T3A4T2G2G1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2089 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29572 40 40M = 29612 225 TTNGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGAT 85?%C!=G7.?D7=3&:D3&;*$/=.==2&1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C0T37 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r2090 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2241 42 94M = 1850 -485 GTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTG $)&H=184$GBH(:B!9$7A:*;6*>?"=FGBBAGH4$0>!1!/;.3)?+*'/3E*@-;B7.F"3B>!4A%D%.(H@4:E-D>)CFG66+"9?4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r2090 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1850 42 236M5I155M = 2241 485 GCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTNCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTTGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTANGGNCCGCCACNACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCNATCANTAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCTGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGG $@46??#7=?/==(H/B#.E=.*G6H*9''4B1!83!/#0&'0D<(B95*;C)(GF>C+)*-8/1<":-.A--.EG)4(7H!;=5%*@-+:3<34H%B;H,%>$48'-2F+.H.;"!,F*A)*B*5032:AB()"=84)F(.B0FE)5*%F2**<27H>$D(3&'F!D7-25(+0#'1.%B)H9=>&7A>./.#?*@'2(.:);3E(1/+H#B5215-2?+-":7D+EA=B/2C26"+@#/!1F-$A AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:14 MD:Z:28C43G73T2G7G34C4A43C31G117 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2091 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33342 42 76M = 33171 -247 CCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTNCCATTCGTCACGNAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGANT 6.480)@?*>$H$G7&*.3)-&CB+4(.&+5!) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31T4C7T29T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2091 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33171 42 61M = 33342 247 AAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCCTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCA +"%(!''**($#"!&+**&%%$"$!!+$+(#+')%%)$"$+%##)!#$($!)$)&&+('&$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T33 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2092 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28854 42 153M = 29007 371 CGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAANATCCTGCATTCCCGAAC /(G7.#!=98?35=)0#1$A:G78+$%H+(7"8+*!&+>8:7A*4)%B%F(97:$3<%9%'@9H(-D=BGB1%+>!#$%9108$A<,G0H>?/"">(+H5,15+@."-'FD(F*58#+2756H"".D1EEB"?AC%5;F84<8/*>+0=57AA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:135T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2092 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29007 42 218M = 28854 -371 CCATCGACGAANTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCT ,0!%!,@('F*9D38DC!*3.,7-?/5".6C@@7&+E'##05-(,+@3/&*D6D&&E#$.#&-1F)$=*1".?0#G6'-"73<=((#A;H+A,52C0GF*H(@1:!E*G"+D#,!?"?F.628+3<.A13 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C206 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14305 42 46M = 14399 265 AATGCANGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGT H%#.%;*99"&5>DD%(DH7(2%-?'9D?"28EH>(4DD595/#/5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14399 42 171M = 14305 -265 TTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCNTAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGNGTGACGGACTGTTACACACNGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACNGGAGG %&%)+#")(&''()%(%"""!%+$$$*)$+"""$%!"&)"!)*)!(('#'((*"('#**)(%'!'*%$%#")*$'**%(#)+"##&''&$#&'+#)%"*'((#""#+)+"+)%!!$"%#$*'()$!&#!%'&)%)(%*(!#+*%)(!$"!'"!'(')#$%&)'!"')!+($ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34A48T19T61T2T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20990 42 48M = 21079 234 GCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAAC '@-=-F@?81'&1FE'20*!#5H20%D,%1:":1$*!<6G!,D/!)-+7":A76A=>.#(G.=70B?)#3!>E4H&9%'>/EH-?,F*396?B<34'9$@/7.B%0&*2E-F5F8.F<5&5145>G71$:1A@%3,#-0(@.6+%&50>+%;8$14:7*C@>C'AF<;("$1(*>%!$G31@*7HF@<5>DEE4E4='.5B,*+;@'@-+5-C=!)H>C8-$3*!@!1:A6''-&/B)463B)C>3297 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20A34G8C25C61A60A4A52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2096 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44149 42 65M = 43878 -336 AGGNAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAAAATTCGCTTATGCGGACTATTGNCGTA &"&$$''+$#$#+!$&*(+%$(+%))%%'&"!""($)%#$%#!#&())#'$)'(#!$%++&)%)) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A34C15T5C4 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2097 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23436 42 108M = 23261 -283 TTCGTAATCTTTTAGCGCATTAGCGACCCATCNTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTT B:E*0!?4<2(;>F79'C#05/?,,!BC186B4.%6/8)E=B>1@*"%90>#@+2FA9>3F=C/+.2C.9+G-!"#;G-;'8$F.@2009:!6>5!6H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T14G75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2097 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23261 42 118M = 23436 283 TGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCC 98*=?@E7#0&B+?D+12A&$@&:(:.46BF?2C/-9'414;!97 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101T16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2098 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8375 42 342M = 8334 -383 GCATGTCATGNAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGNTATGCGCTGCAGCNTCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGNTGAAACATACTGAACTCCTTGCAGCCGTACTGGATGNACTGGAGAAGCATGACACCCGGGCGACGTTTTTTGANGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGNCNNC *&((##++!*+)#)($&&$%&%$%%'!(&!*#"&+!!*(+($)#&%$)!%$!$!#*%(+('%)&'"()!!(%$')((%$''+)$($(#$'*+)#"*+()&*+(&*%$&!%#"$!"(!$(*%&*%(%"#$%!"$$!)+*'(*'$*()')!&!)'"%)+*))$#'''!+))+$(!!#%&+&((+#"$##&*%%&!$&#&(%))"*()&'*#$!((%''%(""(+$$&#($"(%*)$%))(!!))!!!!""$((&('("")''$%)#&#$+$(*+""+#"$'!(&)!&'#)$!*&!$!#*(#!*++!*!!+$#($"#(#$+%%$&""%""!"(''#'#+(%&"!$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:10C127C13A24A18G17C19G16T85A1A0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8334 42 41M = 8375 383 ATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTG ;CF@$1!-4.>(1FDF/7H2+,599B8BGH&0/"AA94+;6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2099 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27162 42 345M = 26910 -597 CATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCANGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGANATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGNTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTG $%*6C:;/-E:%B$?'*;2/.D(-=8%G*+)7%7%A-04G)HB.2F$8$$)<0'1H>>2'#5G)3::$,;CF"446)-7<@.B')E'G@7&?5H=+=)$5B:5>%E?!./%0&/H@1?):&&&H"=&0E;H3%+1=9H5E1H&68)A.A66!=>:G#84B*487D>6#.(.CGEFB9!/9B;HCC"@C@D>9#2/3B8#;=!4:B20@5D#9$>#:#/HFB,1?1#C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:101A81C123G37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2099 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26910 42 252M = 27162 597 ATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTANTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATT (">:-':)37>1E82(<;<-5'4C1(FC)'E335*/G%%+0%<3G)G*)#)"CC8,)+76'&'0:)$66?@5G&!@)4F'554"*E(&H5;"/6C:)@"*E+&%+A/G:CD/A$/&D::G*D'+FE?7,#9:!'@C'416*?G*#E/%5*78710.H+D2D?5G+/;CF22./6DB47';1(6<6(9F(9A3F!&D?,!9B>,#$/.@(@'%"H(37*B-H8%+C1H5.>3HD,6;9"B#.A-.02@H*G4E3A'+5+A>E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60T27G7G76C31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2100 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3838 42 66M = 3904 271 CCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTNTTTGAGCAG :''H6H-"99H/#0,0>178+&0*:E6:)=@74-#E#*2/(6+!'5AH4!22'0")8HA8*%2.!" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46423 42 224M = 46647 293 NATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGG &@/'69F8(GE4B;'7-80(@(8@/)1'?!):4CF7.037A5>B223.+8:*+G!&;(ED!@)E,+(6?H:G55C3;!!G5F6E3?<9-A559403B9$+E/B<(3'5"D7A#D%G+C2B)C67)E#::::1"?D/"E&E??1#061-=-88&@!C6;83*5<@"3H->":8&E>E$B=HA-7-(#/:08/23;CE'.GG;C0:?9HD.0D/?11H/14D6<&2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G223 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46647 42 69M = 46423 -293 TTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAA 34F9#%D7;+>,D"(*D@0",BH:'8)'$A6*(.B2",21<8E72C13;1A.&$,C,5=:),?7AA#;7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2102 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31323 42 139M = 31323 0 ACCCGGACATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCANAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTC &5.2+!D0"FB>%GH*?(H;/C&E$*0C,$%*32*@=)34+C1>4$<3)6?#$??%$*;H-'7/;%E7<-&EG/4D)8!((@$04>=5@';5H).GG*6/*(!*=3*%7E90>!"61;CG,? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T102A28 YT:Z:UP jpayne@0: r2102 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31323 0 * = 31323 0 NTNNGNTGCAGNNNNGCATGTGGCGGGTGACGCGAAAAAATGCC !'*'*$$&''$'!%%)+$$#&'"(+*))"**%#%!#""*#("%( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2103 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21021 42 167M = 21188 289 CTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGAGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTCGCAGGGAAANTCTGGCAAAAAAT 5%'7'AA.093)CD*%>'-C;?0$,4>0:30-7066E#A(:)A'0-447C2H0=+>?-31CBCA$:>)#",.(>&+5),8@=D$('2)1+@0E*(1E1:;$0*E$3/#<*#58&E3CGB0=&+@?*<,=C/C@F().BG:F$>5/A#3&22, AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:66G22T53G7T1T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2103 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21188 42 122M = 21021 -289 TCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGNC -8.1)<3*<5D8H?=$C)$(<'F9D.&)&A@F*EDE#"<47"12-,":@$01D#17'A-+C4"/GA'+-&F,""(-E9C#(H:327G'*H18=B(*).2#/#>!="H2&%C<-8DAE)'%&( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120G1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2104 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48060 42 140M = 48200 391 TAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCATGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTC 4(C(7*#)'D)*9#8/?+*?*&)?C@=#+!F/AG="#B@6?,5HAG$>8H$AG0A,3A38=H=/(10?:,&HFED64?H00G=/H#>/G=0@H)G512&32"D.G=:5+9C2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112G27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2104 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48200 42 251M = 48060 -391 CCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGNCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTNATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCAGGCACGTTGTGATATGTAG *#'#"!&)$)!$()!)%*%#)$&&"!(&%"&&$+$*%&!)&&(&!&'!$)$+#*$((*((*&#'+&"$&&!#(!&!!*#'++&++++&$*!''&$#(!'%*+)*%')&''$"(%%*&!#$+!%*%$%()#%$!)"%*&()%$%")+#)'(+%+%+&%%+#!"''*('&&%)#%%+($#$'')$*%&+)+'!&""++%#"$))))')!*&)('#(!%!(%&$&&%')"((#%%!!&"$"&#"$))!*)'#%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:111C91G28C18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27823 42 107M = 27764 -166 CAATTTTGTCCCACTCCCTGCCNCTGTCATCNCGATAGTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCNCTTATCTGCTTCNNA (%#%!((&''('#*!+!&*%&%$%(("(&$+(*$("'&)$"%!%*+&'""&&##+'&#%+%)""&#"##)++#"(''$+"#'(+%"%)%)!%**(!'!"(&)+'!!* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:22T8A5C53G12T0C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27764 42 57M = 27823 166 TATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGAT ,?3A?3$<(2036?H:?=(HDF;A?;*4?7;%,:'.@"+*H:@4/#A,8;(332/@G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A30 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2106 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20361 42 78M = 20560 299 CATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCG !9?%?!$G2='@A=(&37!$A.-FC%*)3@7*D$5>92?;1B@/43'C@A.!9H9D1->>1%3;6-/%>,4@H.9*H" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G77 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20560 42 100M = 20361 -299 GGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAATGCGACAGAGGNTGCGGGAAGTGCGGTATCNGCATCGCAGAGAAAAAGTGCGGCAGANGCGGCGGCAATACGNGC "*&")($#&*()%$!)*%$''&#)'!*&#**)+$!#$*$%*(&*%*(#*#*#%%+!'"*"()!"($(%"&+")*#(()(%+#!*'"&&&!&!'&(#+!*( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:25G10C18A11C14A14T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2107 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32105 42 118M = 32223 302 ACGATGCACGAATGTCGCGGNGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATNGTTTCATCGTTAAC GH+F$16?F+#<6!!33@1'3G"9-F0)EE:9?H*C0@76,815C6:&',F)?"!>G9-,E=/83$G*'$72!,%):&C=(4<+%@%;8)-118G:$'EH,B#@+97)=*=#$F7*HE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C82G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32223 42 184M = 32105 -302 CGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCT CE.8B/,/6C2<58+30)1"C,6>A9:&3,HD6-/$?B2H1.$(=)8G18>GEG$:;6;/1<;+5&> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:184 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2108 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30406 42 62M = 30170 -298 TCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACG -D8/22#!!F+B>6/C<<('-D#!&*C!811GH:3$%:65>'?5?C)("%F(=0$9%-:C)% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30170 42 75M = 30406 298 TTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCNGGTCGCGGCGTTTGA .<,B=?F%"B-318$>6$D9%H2DB2+G47"!$77"6A.!&E+!@2H+56+"4<%C#'4H0A"DHF>0%9F)3!!/G42D?:9$5#B%=E,E1=#076G#D(9#0)6DD/3;D?/-CB884(>794/)&/548-!+=:,.*"AA$H9315-@A89%'!3(C@&G*#.;(-25"-9<:8@?F.>:)DD4*>3G0>50(%0=!!CGF!:%9HH*$2:BA7.FG=!7<@(1,2@!0D?)9-7:2!613=CA4,,.0@4@?(.;#,5.BG$B13!*G-DB#",8";;5-)4(+0*#@*':=>&6,A9***@;=:?-8B7#G0F8C.GB2A6/4G;$?7/4H=0:,B")3;&G29H%>7>!>;H&/""59@)7E50,/%>D62** YT:Z:UP jpayne@0: r2111 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2078 40 8M5I39M = 2152 184 AATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCA ;G"B9/$<8&=F+(D/!35,;)G5D(G;%;.">>B0"268/(;8FH%F8"0" AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:45G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2111 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2152 40 110M = 2078 -184 ATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTCCCGAAATCNNT $*!!+''()%%'()!)$##)+&%"""%$"&'"&*)+&(!!$(*"*)'$%"$&%$!++*$'%!$%$'(++&"!''%+&(%'+%%#$&!")#+!)"%+)!'"++*&"#*!') AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:98A8G0G1 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2112 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35260 42 98M = 35366 150 ATANCTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATC #*)#(+!&%#$*'#*+%%(*"##"())"'+)$"%!%*)+%&*$!!'#+#&)(&*((""($)+(*$'%*(#)"(*"!$"#++)(((#*!!++)+)*"'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2A94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2112 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35366 42 44M = 35260 -150 TTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGNGNCNGTTGTAGTCC C-;#/AA&.H+$9>26@C?3*?"?01"&E.H*#+,3:B:/0A70 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T1G1A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2113 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28916 42 52M = 28666 -302 GTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGANTCGTGGAACAGATACTCTCTTCN ''"#+%$'!"&"#*&+#'+*"&&%#'"++!)"$'+*#'*+)'"+!**+#(&! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T22C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2113 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28666 42 102M = 28916 302 AATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTC #92;9-3G@%>=/&@;(:,9,CD/@/F%:-1!0,6"99BF1-E3B@D=?*:?(!-2<1#E(?=)DF7%+%>B'&#(83)CH#.=1!;6E';+;C-( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2114 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47091 42 97M = 46912 -276 AATGANTTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCT G+*-E.===!B,G:HH0#"2#:2#28!270,3574&+?B<@/-G2"C%&>C$!;?+%GGA(*#(C?1CD'H%48500:E"G$70(*#/-%#18))$7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A91 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2114 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46912 42 89M = 47091 276 CCCTGACGGGGAACTTCTCTGCAGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCC 44$B&,70?.#<>3D(8E+;#$%5D#3F==D=?4%$#-3?"".$-%44(">!<(9=4+0C;)-9H>;/14,-=C><2=E<(7,88) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2115 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29991 42 44M = 29802 -233 CAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAG H>#9=++.-4"1!1'#1-65F$9;*:C63HH>!2;+/6*!0$6G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2115 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29802 42 65M = 29991 233 CGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATNTTTTANAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAA ;543*3B1:!6./=-H@)4?H2)21'=5$%)$::6?22:E=75C%+0(;'C3=?15,16H#)))76'/.F@';:H?7?8A"4C' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T12 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2116 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11891 42 62M = 12124 288 GCTGAAAAATCCGAAACNGTCCAGCGTGAAGGTGTGTACGGGCGATCNTCAGGAAGACAGTG *(%$('(&)%+'#'#+*"*$)+)!&$!!'&'*"(+(#'%"%)%$')%&##)$%(!+'!#%#+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9G7A17C1G9G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2117 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36501 42 91M = 36674 281 ATATCCTTGGCAACCTNTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTG '$%+!(&%"#%!%')"*'&"')(%!'*&!+#)%")$#+'($!*#&!$'&!($*+*%(!&&#"*()!%'%""')(')+%)!**#+"++#*!$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T74 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2117 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36674 42 108M = 36501 -281 CATAACNTCGNCTTTGGTGGTTCCCCTCCTCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCNCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGC "'))*(+!#+%+'$)!#$*&"#'#"+"!%&(**((+(+#&)&"%$!*(*'!#'#(")*')+&%'#!(%)'$)''**&(&*&")#!&$(*(&+#%*%*!+++*"$+(+" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:6A3T17A23T51A0T1T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3585 42 40M = 3403 -222 GTTTTACNGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACN E8'$;)53<%0>5=+CD"%&>?0<6C4<6/7>((!*#*+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A31G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3403 42 67M = 3585 222 CGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATC D,4")C&E?.+!!C;?2;"A7(..D48DG>."<'7!'>0)77&1G<=*F550$>%0@@:!!D8C(AC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2119 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14078 42 56M = 13804 -330 ACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCA >96G7"993.9;$:8%-0::@8'@,H1?/B.?@%8;#/?#%.28#@&)C7A6B/.> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2119 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13804 42 165M = 14078 330 GNTNGGNANCNGGAGGTGATCATCCGCTGGCGCANTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGCTGAGTGCCNCCTTNGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGAC $$#))#$%)$"&%+&((**$&+))%((($(%*"#'$#!%%)*!+%&(((&!)$!(+$+(!$'*!*)$&"+*#$')'%%#)#)''#($)%'!#&$#)**&*('(+*!*%()#'#*(&%#!'*&+%!""%*)%+%%!!*)"!*+)"&'#%&%#%+!#%&+(&$'!$+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1A1C0C1G1G1A11G11T25G8T4T90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2120 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14504 42 98M = 14602 306 TTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCT HBC(,%.H0;=H3&1:<;G19G)9/8+9%@63;22@:8))8,F3*7C#/.@-/DCD%6DE@C!?H&;62G<2B&<#1<<$-62A"5'7C/01)/BF"?-DC+-@8!1;3%?D5>*/4'1>%A=F*6!+>"0AA61E85+#$A&+CBG4D4%5,G0&"G:8D"*#C;HE=F:&@-E(GG@?!*, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G27T47T31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2121 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1633 42 129M = 1793 279 GGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACNGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGG 0+@'&4B.?-E;D,130G+/424--65)>!C28G4D.:54;"2/$.E*&4>8.FFE+&CAF+-4/)C/%<&,"'EG!:"%$#H2!B+H082:F)(8B"//H89G5>,*?9-.=+C:D8&*)"$9573;C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68A60 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2122 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47075 42 51M = 46857 -269 GCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTNTNTG #(&#%!*''%*+!(!!"$)*(#&%'%+#%$'"!**&$$()#$"##+"%&%% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T1A2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2122 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46857 42 218M = 47075 269 TTTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAAT !"/=/#?>5<8E507,4!EC2:?2.;,G?*0':1/13'%#C&;6E*/1?'775CGA40<;1"4$2#)0E&<98;<8?DH2.:5C%CB:<:=B7$&2C"7$G)@85!G:0"5-8+;3(H21F"%>3+D6G:>0&FH;',/*0*;773C@5(4)7-@*4CF6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G216 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2123 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 623 42 168M = 812 340 AACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGNTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCC $(B>E2687C.4@5G13&B3B?6BC:DG+:>7CH<>0,"@>F&D2*=>>.8:/">8F>!='E#+4(H:-%*"1+2F!,A?')'791+4:$;D9231-."E=G(,(FE;!>0/.@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81T48G37 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2123 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 812 42 9M2I142M = 623 -340 GGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATNCCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGAAGCGACTACATCCGTCAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAA ?'F;A>'5-)+E.A)>23@9$4()&)99/=2,@#1B9A.=H0:6&B8$,11"E@9D=!&//-3F/3#'9).AA>2F49/+*A<;?7GE"C)2!!:/+%F2&7F'A4%9(+8G261/+?2.+*,,"530!FH$C8%!-D#*H4A>+2E2@616"%%G7(BA8&;/=@"EC/FB,"!&2>>6FG"#)26>(-8?A AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T23T22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2125 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30538 42 27M2D30M = 30244 -353 TCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTANTTCTTCTATTTCTGATGCTGAA @H2294339>507C)"75$55F;F8E@FDE;(14C6D&9D!HH,%999,)8;1+(9% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:27^TG7A22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30244 42 294M = 30538 353 ATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTNGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTNTCGTATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGT F&">$D!7*;H)>A/01*<->3G78?1$>=2DC3E@8B/$/*>4<47A$:$A=>><(7.3;6*-7E,<>GC/?@B,?F&9+3"!9(!<:"7&9E8"/3+)&A'D-.,)@0*?.=810$6HA26#:8+B3(97?9&/8$<8>.'9EA+!5B5,6&%73<'6$>''.;37':.(.B6+4H1#FE5G'>/8D3'1)E6(8%-)&G0+!!:87>-&?*43F9=4H;'.-C1%E2G+!B#DHA2%:DD/CG-+:=?1>8( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:145C99A3G44 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2126 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36539 42 40M = 36539 0 NGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCT *-G@::@>)D<*=HE&H!@+E*H28/F!?--,8.$@<<<& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T39 YT:Z:UP jpayne@0: r2126 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36539 0 * = 36539 0 GTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAATGTCATTAAGCAGTGGAGAGCGCGTTCA /%;5G/6"E5D7BCB4C11C+!$6DE.G0F'0:@--HAF>@?,F:1G.E2H/A95;;+).C@;?9+EH$<"8DDF'"00-DFA;@>>E?-;&=!3D%1$+<(+=% YT:Z:UP jpayne@0: r2127 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5592 42 107M = 5443 -256 GCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCA B=:A!:D,:BD+?'=8(58?.!'*#"$0'9./=AB?!5;1&3(G.E@-/=*:;0.1*7"2?;7G0D9;H-B#D98-E"1=FA:AAF=&!='G:9@5)+(#E.>9BH8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2127 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5443 42 54M = 5592 256 GCNNNCGGNCNTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCANCAGAAAACAGCCG **#"!(*&#)"+(%'+#$#**)#+**())&#(*!!)+!!#(*)')$%!("&($$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A0G0C3A1G28G0G13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27230 42 50M = 27039 -241 ATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGNAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGAT 1-6+*?>F&'1FF3.1=:E"D.G0)AA-::BG:)4C.>;*;%:+*%?/H; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2128 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27039 42 191M = 27230 241 TNAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCAGATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTGTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACG ?86C(-+29?,AG(-:5.)3G24A-D))$?>$:+.=GB4.6)%$8@7+>&D/A%BB<)H<&7A18*3E?H33675!1-&'5>.<-0.(7*(?>F#D=+-#1)9C8$6/G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2130 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2595 42 123M = 2458 -260 CTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGNACAGAAAG /*D44DF@=0"!61B@!@74*8A@66+D3=:18='3&/+4G8$4F(C/3F*CE,+>=";E$A'D%08>E164G,+!C;33<-G4%H*8,9,2>$,&+E5,+@4#3+D$(FC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2131 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14129 42 122M = 13999 -252 TCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGGAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCT !%A'%61$"@H3$%02DA0=>*A9?69%/<(A2\";F$./A@$0+657)'4?+EB)5&*#)4;'27&C5# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13999 42 55M = 14129 252 GATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCC 7#1)4D;7398C1,=CB&>B>"H@(&BAG/4$)G*$A*G?$-=%.A?$;*F-E- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26939 42 69M = 26756 -252 TACCCGCCTCTTTCAATAACNCTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAA ''#+"'#&#')!*('('(%+((!&#!%)!#)&$*#%*'%+")'&'''+#)*'!()("+&!$&)!%+*%' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2133 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26756 42 97M = 26939 252 TTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAACCCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGA +3$!&+#5=,,9DE8>A4F">*:&:.36G?9B4@A.8:'1H&@6AC++2C"H=);,:(4*$B6GG744)98"GH+"9H#7;)8064102@)A'E1#7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2134 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15383 42 58M = 15158 -283 CTCAGAAGATCAGCACGGCAGAAGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCG !)'@@6C;'3.F#$F4)C%-;@60E-F*;-/A8-9&29F85%(6"73&+D%7*H1>?> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G16C35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2134 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15158 42 46M = 15383 283 CCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGC 'FB'/;CA6%G57B@D2&B!!"743!@24CD'+(;$=:3B#399+%.D2>+G,'4*/4-99+<>,G$8GG/:A!#.3+2BA331?.:E7/G=%#:><(,(-#(/(8?486'69/G$*?3?1B@-$H%7<+,;?,F0?A))$9";AAHH'43&C5A)A'H.2>)?,34/"2A.'>,:=D89707%25&<0&;F-!+?')(7&73/D+<8><53:'4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2136 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15680 42 68M = 15501 -247 CCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGNCTCCGNCGGAGGGATTT .G':+%)4(*H">0#/(,=>;7%HGA0%%7&=D<""'97,@$B.=06'44+.-.!/8E&-;5D$E!/? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50A5C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2137 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20008 42 141M = 20149 321 TGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGNGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCTAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTC 3B/<0/@))9%;*74/!!CC<'98<0H)$@G8#":A"7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:75T15C14C34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2137 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20149 42 180M = 20008 -321 AGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAANANACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCA )1(*+:*9!F)"G$&)1=2=H#0,>,07+75DFG/-+61G7&>-?45D:+@:,0<@H=FD>??<*#D>2?)(@;E3B7+$+=B,&>3?7%!C!47&6"=#($*5363604 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81A1A96 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2138 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20924 42 23M4D107M = 21058 235 GTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACC G5*0.!HC,B<2%6%=F.#//:$2:'F$C)$.E33>*"-2@H08E'H/?DC3=6+"/%,GACB*/-H:.+4-,H(GF6,)@D7<=*#%.?;H!#%- AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:23^TATC107 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2138 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21058 42 101M = 20924 -235 GAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCACCCTGACTGAACTGACTC H.(H+A'%"'.+?H9?H+"0;/12*'C(2!,)9DF@1AGE@#4D@1=C9!9<5??,3/&GH-@:;/6C7EAB0.;@$8-,H?GH$9G34:@5543'?#%:3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52T30G17 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2139 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23150 42 70M = 23275 204 CTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGG )*28(E"4F<19D/**(B?F9D5-*@5@E?><@0'16>!#(B;G+-."C3'$5?)8/:'5;HBBH),3H? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2139 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23275 42 79M = 23150 -204 TCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCAC $0,=*G!F&G@<03#,83B%6"!2@AHF/=>2/(430!BG(+:*%#%4-1>')($%7("H*7;<*4:*1=3D7D3E.'G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2140 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8856 42 136M = 9098 282 TGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTG ?GB9G+D(AH3?FH0:8,-A)?6.%77&8=++!C.<>57$2'>?9H$2=F#;<3,:4G8CA"F>7&:!;2(2(!--(5@944$;E<7!,8&+8(0$?)2>E?A+3H>;F$=(.(/.>(H4:E:;AFE!+C, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2140 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9098 42 40M = 8856 -282 CGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGAT 1/=0%#.=E$1=>@+@!5#$+31?(HCDE8DH#*8C627C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2141 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4278 42 74M = 4170 -182 ACGTGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGNCGTGCAGCCGGTCTTT #E6?<3,3E%'3>HD(8>1G:G"==+'#!#;F>+*$2<6!D.#:4#+8%!B.+B)0H8B972;(("+,99">@% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C53C15A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4170 42 47M = 4278 182 CGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAG F09G5'*?9BG5<4F#':*8(.A&:*/)+AA%,<29),"=346+G.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2142 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44035 42 42M = 44090 273 TGCATTCTGCGGTAAGCACGAACNCAGCCAGAACGACAAACA *,$A5.@4B)1F.$<(2%D4!0A-.B70E)5*8)8'G@,HD< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2142 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44090 42 218M = 44035 -273 TATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGATGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGNCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCCGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGTGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGA !(+(&%("*$**!'("+$*%*$(&"%*+(+!)("&)+))*&+"&&&#&(+*#+'&)%('%#&&$+%$+!##"!*%#!)$!+''#(%%((%**!"#'*$$#%($""(#)*"%')%()+%($*&'+%$!*$*)%'+)+""($"%$!+!*!&!)!+%*(%%"+)%%&*(*$!+)%)'+&$"%))()+""&!+)$+#&*#!("++*('%)!#(("$!'&*+* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:43G28G37G28G78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2143 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38555 42 179M = 38422 -312 GACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGGGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCC E)CH.HG1E5'F17B@#980):7%8;*5#$<;'?H650B;!;EC=F%6@8&3@856#?G#74HEEF9!EB;96D6?19H92157H!?%#@CC9#)@5#H$8)/@- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91A87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2143 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38422 42 133M = 38555 312 CNCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGATGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGNCGAC '&'+#&(%*"+'"+&!#+"!$*(*+)("&#'%)**!'%!!()+!'*"'%$$!)(%&$'+*%+'(%++++(!#"*%'!#*&)!%$)(++("#!)&&&#%$+%$&%#'!$&)))&!&#"&+)%#$!&"#+%"(!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G28A97A4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2144 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45099 42 74M = 44917 -256 ACTAAACACAGTAGCCNGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCNTTA *##)$#+'$$+%'+%&'*$)%()!%!!'+$!&&%!"!%)&!("+*!*!!))#&%&&&%'!*!()""&%(+$)'* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T53C3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2144 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44917 42 47M = 45099 256 GANCNCCGCCCAGCAACAGCACAACCCNAACTGAGCCGTAGCCACTG (%!)%(*%"+++%'"+!)$*)$&%%)%()$'+!'$)")'%)!'"+(& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C1T1G22A19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2145 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20699 42 248M4D91M = 21042 397 TGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAANGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAANCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCANTGACCGGAACGCCCACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAANGANCTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGC ,%H0D=29#.AC$3!H'F6E&>G>5;@#DG1%'>5A1/1;/$1,07/6>?-.DG'D;71H*,38/00<-*(70@H5BAA-A1%58'?&=E?'7BF&=?-5G(($F?CF.G.&$;8G7"73/A('>B4=7BHG>/'&)H0#+E4?"A9E$.,!12#:&6?$&'50>*@GE.",A?;+FG&-B3"D98?/F)4+:062&/>33-3$?!:=G=D#E+2)!!-.@5A/D0:=F6 AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:10 MD:Z:32A26C93C13A80^TATC32T2A55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2145 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21042 42 54M = 20699 -397 ATGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCA ("@:E4<3@2+E*HF55&E"BD7&A),2;E9)68#:$@?)-8;A5'-!>::751?B47D:5F$2!5A#/C)@H:$+(>-:8!7H+A0@H24",F.,?%8E8GH<:)$32&E!1;#FCB2)G6G3-259EG04:"*BD/-+;.9#);,@9BHC:;"G?4DA:07C-F>43#!(E/9@GE68,"*%':7@7(8G.0>''(7;9<1'#G-/9H?B&6,G10;2=F0*'66),CF)6>)0*46E<,.73@2,'7'&:177GA!*!?*A1FD"%')76)!;C&-G..07E,3G/C(@2)=:,0=GF5BG!>,>!=%.693084>E1.*B,D3G:%39B.*'-9>?=+0)(!E1+45B>9C48B3#)))"7??6CE#91@E;'#>G78"#&&27!$D#+*0'6E++544"(D)! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20C75A5C127C48G31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2147 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44101 42 149M = 43790 -460 ATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGANGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCTACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCC %&A1*:E",1;./='DA7D6G'$1D;HH2D,/*9,-C7'BBCDFH+',6DDB<":BHB.D66,6*-,"F,:(F.$D.E,D;);A9.;'51DC)$0#;DE+F(> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A35A64 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2148 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1641 42 112M = 1482 -271 TCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCNCCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAG ">(?/,/4@16G?'(?95;F73+6?B6.<:+>)$BF=@<4,#9<=F.9>?!#=H547H06C8F/=326&-%>F'3:&B'?:8+1#9:;+8.;0250$3>BC9,"94F=A%A< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2148 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1482 42 46M = 1641 271 TTTGGCCTCAAATGGNCGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATC ++3<;H:67EE67>+6*1%A*=@&05@A@CBA/=GH)+62/?'&*B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42501 42 46M = 42270 -277 AATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCG G4.B?6BBGF$%@&*(,'84>>$F$?>F-D:'E'/6,65&6:0$E5@7"5'**E(%=#.5=;A60D?0%47 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2151 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19047 42 110M = 19229 288 GTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTNAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTNAT $D-51C>%&;#@D-.",G2$CA5#6B=23#:++A.,&3&HG1B87E<>C%)99CC-B7,/3H>:C$:22;4G3;1!&"6)!6G>+/'*%*FB>AG<5,(-F./8#%E6$( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G78T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19229 42 106M = 19047 -288 ACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGG #&-?B(C'7/;11*!84/4?,7)!G@HHC#6/#8GHDG(::F*."+H9C+1D"&3+DF-$?A>!@A$C58+($..;=) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2152 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44159 42 78M = 44305 209 AAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGA (*2:(*/>.);CD;169%H',>B0!*.83B2?4,-C,*!)%H0?.B4(5A:2@A/3B$&5..70;#,59/3@;!"3CB!5;+F!&C6H$FG'(5;).>.-&6:3&7/6?4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A26A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26667 23 20M1I77M = 26548 -216 TTAATTTGTCACNGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTAT DH'5.)(5:7/0"G.14%8AEB.:4!420.H-=6+F:/7B<:;B$0>(.E-;D8"E=;&%#"?">F#38-+-1:ED111!=:&F4H%H@B);D%G0,/ AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:1A2A0C0C0A2G1T0T1A0T1T78 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26548 23 68M = 26667 216 TATTNCTGCANGAGTTACCCNTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTA !*(&#)*'$#!+()*)#""')"****+*"&*(###+$(##(*+)'%!*!+#*!()(!#)*&+%'*')% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A3T3A1A9C47 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r2154 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30688 42 84M = 30551 -221 CCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCACCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATNGCCAGGNTTAAATGAGTCGGTGT 66%3%:-81C88-E1$>/2&7$%A/&C>(D=3D=#-4==-,-4H(9*2FC3&.0-/?%:/6%H;@3.3((B.=#G>#@"'-?&= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27T32T6C16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2154 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30551 42 14M2D46M = 30688 221 TTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCA .08?%5!3,/F&)!A6/%2)5H"!@@C9<340G&CH9(8!#%?6?01!)("042=?4.?E AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:14^TG46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2155 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17916 42 71M = 17701 -286 CGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCG !CB;*=-4E*!8.9;0GH+!,/#!=4!0#%C5%4!CD+0.@9-)C,"3H.B'E,,!#H)6$)D''8F5-9BC51(8(F/F6F-.22C.1B1?"#2:06<,%?09=;2.+0((;G>.4-!*;*C#/(:&)1"(>9=DA$A9=+7D9*.:H73=H!="5&0B/5=)FE?'2,1">904G4':%.#E!-H3ACB6#-1H*E>/B>00DA&--7%EA1E')<"@73H AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:1C0G16^ACCCGA190 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2156 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10043 42 124M = 9951 -216 TGAGTTTGTNGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGNGAAANTGTTCGACGGTGAGCNGAGTTTTGCCCTGAAAATGGCGCGTGAGATGGGGC ""'#*$$&'')%('+#"$*&%#"&!##($(*%&+(&+$+"%&))$&*"&&&%(*(#$*+&!#%$$(*&*'$#()*+%!!(#%&$#+$)(+(#)*!%")%$##*))&'%(##!%!+&%%$&+%%( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9G57G4G15T16C18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2156 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9951 42 45M = 10043 216 GTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCCCCTGGCCCACGGAG E?BD+G",@H=;.4=#@;(C7*1=("!#AD3BDE&:8497#>H;A;2E?*%DHC8!809H49,9#@3(:85E:A6@5(8C"4+('G/;C<-.# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2158 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36542 42 101M = 36542 0 CTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCT -D6C!*"9A<();G*537B"H7=*)#+7)3&@%!<"-22C%B73H"4A@).'G04*=/).*26;-0-FE1E3.C1?6:7-F/9HG70=-*H1CE(0F(<<- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YT:Z:UP jpayne@0: r2158 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36542 0 * = 36542 0 ATTCTGGCTGGTCAGAGGATTCGCCTAGAGAATTCTCTGACGAATAATCTTTTCTTTTTTCTTTTGTAATAGAGTNTTTTGTGTCCCCCTGTTTTGAGGGATAGCAANCCCCCAATTTGAGGGATGTTTTATCCCTCGTTTTAGGGGATTTTCCCTCGTTTTGAGGGANGCACCATTCTGAGATGTTTTTATTTGGTCCAAACATACCGCCTTGCTGCTTGATAATATTCATTCTGACGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTACGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAATGTCATTAAGCAGTGGAGAGCGCGTTCAGATAGAGCCACTGATGAGGGGAACCACCAAAGACGATGTTATGAATATGCATTTCATCGGCCGAACAACGGTGA '=,G*3&(544,E30;%$<*A2D4/8-*0*(;-"&?(852'#-A.DC-28=%<4BC49/:<#&/8&+'&=19=@3D$<,.%6$,(F0A1H#8A19,#2955C3E&&0GA.-'1"$D6&9(794,@??%*4)<1;68%2%&7G8$3B.D<>:<@!=",2%'!,08%1,..-7/A4.3EF6))H4@-<.@79/E(B::'9$AG.D%C,'?4>/9:*4F)G%*#.BC=6'&=9*9<8E$17B*FB&:1@$1G1H&.=&&>F2">;+%+>4/47:=9$H*$.%1/!+2@&B-<;25>$5A5/F62F;99&?7&B1;03#37E+(B4ED*B>6;=,,89E0:7.$@ YT:Z:UP jpayne@0: r2159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8358 42 144M = 8227 -275 CTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAANAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATCTTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCG 21/C7@$FE?&#F<8<3'C"2782D415$)A9D=G3/D%=>,/C?%&89G=F228F8558.#'%3?!+)2B>8<8AB$(-C=+"!@*D@.&31D%($/8"''%7.%%8A8E-;$#>HF->->=61@84,81%)$&(>0-5)$49 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44A69A29 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8227 42 73M1I5M = 8358 275 AGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCNTTTCGCGCCGCAGGCGTCGNAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCG ,7,+@+21(B%*H6B)C6B1+?..&<4GG$=,%(A<-8;3!+G9/=G')HBB>+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:23C19T34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2160 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14813 42 50M = 15070 306 TGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATC &,A2D8&#%9!:<6??2G523%&;-05>($4/2(?1@@.7+@=/(=6>-E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2160 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15070 42 49M = 14813 -306 GGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCAT 3<%:4).-BE%*A8D/5"#G:+H<:*1;&:-4./2!,"/.."9CH+/@/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18948 42 96M = 19102 246 ACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGAC 2)94.=5,$3)A><(08;B"2/+D6$1;G7$B!A4C0<,;H/"A'=#''G4+*6*&CH4(7A(@9)";"'*9)3&#.''@,"27A<5<+$*A!),+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19102 42 92M = 18948 -246 GGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGNAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGG D6H759!!A-7?$:,/F,09@A%->C5'7=3;9@*0*);1DB6?"B?"96F=!6)??C%61:;.06&2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2162 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35381 42 79M = 35193 -267 GCTTTGGTNGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAAACCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGC *G.-<$02=7%'A8!&5H,A%=9#=H4-,D+?DE+A/+H@DD7"*7);$@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G30C39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2162 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35193 42 63M = 35381 267 GTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACNCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGG 8<0&?.>B4B"5-?&3!=D7&+"*14$$/>AD4&*&B2!9!&!F4+.C'?3.<&0-&7G%7<'5A(:77;4=?H=76+C=?:"A1D3F20/F#3G)6B)/=H+0&,;@).?(7%A;:>(:!*<)"%CC+-#7;@5AD9B'=EB-G72<4&4,4E:>3"D#7=/47A2*!*?3C!)%0+%A!@*%9A--=.#+=#%+2#"#&E4>?294='HF974<:&G6E@;%E+>&,-$D%B/C5.97#&"'<373,)695/30C023D5;1:>*G53@'F!+%/&'229+%/G5"C%!";:-9905B==>*!G4&)#&@8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:232G116A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2164 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36200 42 156M = 36356 563 GCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTC 62-"A&>E3(,C!A,#1%+G:6EB1C11&$-BG"G/'"??*'5&B:">")D-F&957@:1;E*,.4!3)/"$%?-2'!4E!A/?6'>8,.B@72#GB91:#0H!?=25):#0=)#!6(3D6>37BH&*<;!>2CE)7?-&ADB5+0GG":G-<0G3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:156 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40264 42 51M = 40393 225 TGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAACAGGCAATTATTCATTACCTGGG 2B+E25;'%=EHC,)1H1A>*#:?;"B)3AD@6:/-6=A6&C:F&F:%-#2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40393 42 96M = 40264 -225 TAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTNAGGTCTGGCGAACGGNGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGAT $:!9"!%770'#GCE2G,1))1>:=1,FBAA#?7'F'95,,C++-<=F=AEH2<63+>4;H?.-B!3GA)B:,6<=B7-/4!&";2&H",+24)DH AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37A15T10T31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2166 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29319 42 89M = 29150 -258 GAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAA 8;!2%A';;C7A.?8D@16AD%&8;A/7!9()G.> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2166 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29150 42 78M = 29319 258 TTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCG B<:HH=&,5;;"(E4,-?32=8D,;'G0)+<@4:C8,4?"=G4%9,@B$17E767GG)7!!*1;=6A2/%':,7(E@2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2167 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44143 42 257M = 44400 501 NCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTNAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTA #&2-#&;&#?!EHC>"B*)6F;%8)'(1F.7(32(E$H968=F6D%&HD/&@5,>32D<53$A>;.4(G.?5170*%0"G.@)F$C06!F2)3.0=H57-8CFA92.7%;&&*'0,&;C'!17:5EFC<.7%#C?7/!5<,E?(8%:7:#=2/C>45!C*&=2,+,,@0).$D*+.D57B41('EE1A0B21H(H?*G+:%.FC&4)5.9??@A.)? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G199C56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2167 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44400 42 244M = 44143 -501 CCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGNTATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTNGACTCAACGANGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTA '$5;/*-&:?1->#H5+'6%<0(2E0"EH;;20-CCC%(4G'?@@60*3:55?E0F@"#8469+,1;D22"<6.;,G72<307()/FD3=HH'@&7&)->%*$/B-@1==%H2C#22<:6>A60%E)9,?E(:1=4<,5.:09-> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:149A31T10T51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11969 42 185M = 11827 -327 GACGCTTCAGGAAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCNGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCAAAAAGATGAGACGCTGAANC (+()&#$*!#%+#)"+%#!'"+&#$(&%##+$#")'!&(!*)*)&$"!+'%&!#)((*('&#%**"!"%"%#)!%)&()&+**('((+"!#*+&)(#('+)!+#'*%%(#!+)$!)*"))#!*#*"&&"#&&)"$!'#%%$*#()!%")!&'$%#**"%**'((('!+(**&+')*'&"+!$+"# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11C58C94T15G1G0T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11827 42 142M = 11969 327 GGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCNAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAATACAGTGCTCATGCTGCCCTGCT 96'E:EG156C(,,:;F'#E9#A(18#'7>*62.6.)*<+B37.:'H.%D!)..(6#)*H7@91;7D,?.+>8,098E+$5$=4C8.G>8,)B&D%$E2>))903B-">://+9AEF"9D92!5#$C<"9+/)835@9/$83 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85C33G22 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1179 42 150M = 1422 299 TGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGG =CG+:=:B$)*=7H<(0!<=0,F:%*'7*%"-F:8+C%*>8/>60"1):D*@$.(45=>%7*7'67>)<"H9@B3.1/-F1D)6@"'>?3!+5="'DG6).A*/180."B%063,*&BG&7'C@)G#C5(.A-F2';')(3%:C"7-640 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1422 42 56M = 1179 -299 GTTGCCAGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATTTTAAATTTGGCGACATACANAC '*##*#&&*&+""!%)$#'""!*"+(*!+$##"+)*(*+*%('")#''!#"($"*$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6T26C15A1G1G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2170 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13864 42 41M = 13864 0 GTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGA :B.AE1&.!.%9!-0A0@&.*;*:>6, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YT:Z:UP jpayne@0: r2170 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13864 0 * = 13864 0 CNGAACGGNCGNNCGGAGTAAGGNNTNCGNACGNCCCCTNGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAA $!#)'$&'!!'$!&#($#*#('&"'%$"&"%(##&!"$'+*+'!!%&$+$$*#!%#$(#"(")(& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2171 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28724 42 251M = 28975 328 AATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTNCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACNTNTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTA (A#(.69E#-+1($)0!+39&2?23C$2>05-!=018.G+$CHHC+9=#+9(!(-B85!91D48G&%9H8066'60*)@9G)!7H#H@$?:!'8!*4*E(&("0C-C+7=22#2FB/)'("D:+,#/D9F41H9F!G<896&GE9'+4341EG"E7$*,&/E&-,3C9/4&(31/(0?F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G179C1T40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2171 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28975 42 77M = 28724 -328 ACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGNCGTCNCTGGCGTGC ++#%%%%%'""*"&'%!'%#*#+#(**'(%)#&'#"'&$()#$+'%$$&%)&)"!+)#&''')!"&(#(*&&+$)"+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A4G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2172 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14657 40 163M = 14530 -290 CTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGNCGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACGAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGTG 9@#<@@!C($078E9*,9!<";E'5@8!G%:"C>'E=A3E/B!;8:&4:G,5;<6C=*'.@5C;=#A;;%2:):(B5"8@$"7@+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55A58A46C1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2172 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14530 40 59M = 14657 290 NATTNNGTNGCNTNACCGCCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCGCN "))($!)!$"((")))%!#+&'($)$!'"#!+"!"*%$)'*)))!$+#%#)##)("'!& AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G3G0A1A0T2C0G0G2T0T0T37T1T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7236 42 124M = 7431 269 CGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCTCTCCGTGTGGCAGAGNTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCC %6#%4-%:8/?F:)16H<6/BFAA5+B(FE!F;51.%;493.6!;/":E8B9&/2@6%,2@H18&?&/434<$$=/&,"0FC$7$E*()F;D')+)2:5%&?/+0F3;+E8'*2H;=E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2174 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 894 42 103M = 1056 254 AATACGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGANTGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGC >=$.+1EH9C0=A)1(>$>E"/A(61>C#>"'?3?(?;+2<+!/F-%@A&+)+50DCD%320DF434B*!7AFF):/@8<%"/?/,$4$-)!>E;7=-7G*%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G30A68 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1056 42 92M = 894 -254 AAAACNCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTNCGTNGCTGCTGGCGCTGGCCTCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCAC 1@79-E"1:#,F%)<6?D$,05??(1>+=&G5@BH$,>;@:3963@E4*&%C(.8%&#!9C::F36#*"8,;F*/04E$B7020F4C$=40; AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C17T9C3C16C37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2175 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37854 42 125M = 37696 -283 TTCATTTTTCTTTTTTTCATCAATTGCTTTGAGGCGACNTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTNTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTANNA :BC=3(H&B=/E)%6//E)+!>H)H)'/;":4#"7%<5-2'.E&%,7)*2=;7F#?C1=>3<"&*68*:C$-4A,&('D%"7C=8:2E/<<>&1.?G+A/?,'"2%-G7:G94>B'") AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:20A9A7G33C49A0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2175 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37696 42 71M = 37854 283 GCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATT >A+78;84.5-.7;3:0'@9G'A%6A)/(G*-%A2!#;$@?E-4+("(E81>9CGBH*-!AC-&B6;>BG! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24120 42 42M = 24162 346 CTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAG +"#!#(+$""*"++(&+!$+&(#')'+*#")%+#)*$"!")$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24162 42 304M = 24120 -346 CCGCAGGCACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATTTGCCGNAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGNAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGT "@3H+HD?F:H,09)C=,B5C3(!-D#%=H7;6&=$C+A1>C.*E.5$>6-!:#1#/E/C2.CE%A'=(:@%#B)33B(#$@&F;?"DDG!-41&C=@'9C7'+'F@+DF%)E3!EBG5:$$!9<5<%%89?75?$&3D/D!40;&EGE$G60?E4',,./#4):*!C'=;8<,3&-3&)0@>;&.%'/9%&1E2$?('&-40">*981D561((+5-D=*4<3>#@ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6A150G16G5G69C53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2177 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3198 42 72M = 3312 211 NGACTGCTGCTGCATTGACGTTNAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCA &96)5"A,G95G!91.$A>?9C:%),)A6184AFB*!/9H/0+)/4)6'40"4"'HD>%,A>B"952?9@60 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T21G49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2177 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3312 42 97M = 3198 -211 CAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACNGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCC !+&))""'"&"!!')+(&*#'#($&!'+"''#$)(+%+$&!%&""*)+$($$+**%!(*("('!"&%%%($(%#)'#)''*)%#"*+++!*$%+'$% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39C32C24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2178 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23608 42 218M = 23826 449 GAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCANGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAANAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATNGATTCAAATTCAA *1C41*#5,,7'*9@"6;F>E7&4<2+94H.1$2#:*65-#CE8$E44:D-D;BH"D%%C!-*+4E@C*"11=2A&4:!+)*=<"-E5-0(.=7>)AF#$3<@H%*D$B75/1B!2&144(F+H9C&0H3'C8762)+=D>&%;,C8=#,F3:5DG4>2=?:5/7HB85"D>)'13)$65;;1/335/!EG*$D37.EA9=)=#&CB;>+%>:H5-=>F<(?,4-6-%,(#0&6@6>HCECG+1<=;?:@6E87@>B0"/7?!F3%$74>@$;>;&/4<&5428#E?H*H;5?21!2>-'0%57(D4!(5B1(&$;@!0F7'($4&:!2E;%/@34A=4AGD62#,/>/7F*&;4#+3C%'FA)#-@2.FF9/;,!),$G+9@%#@,H/7*A=>*- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57T46G16A13 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2179 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4668 42 75M = 4873 340 TGTNGCCGCNTTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACNCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACG (&"%)%)%)"#+%%!#*+%"'!**")!!$*&#*"$%)%%))"'+&&$")%&#!#$"*'(%!*!(!+$&!)%")$) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C0T4G0T0G23G40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2180 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37701 42 78M = 37522 -257 TGAAGGGCTAAATTCTTCAACNCTAACTTTGAGAACTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGAT 9;!+(>A:,>C)4/;28+9:%0E!2,%.">4=@.2&C"A114D?6#32A:D4*71;1)!;4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G13T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2180 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37522 42 48M = 37701 257 GAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCNCTCCGCATCACCT 3'%E"%EC/%GG=1<8%B)6,"BD5F!1'!96E++//5F;7!F)&C2$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3778 42 7M2I93M = 3695 -183 GCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGACACNN &%!HH,?+'6;>&$(GB&B-,5BB16':'/:#E9,$9"G!:C,D9A2)7?:8+260))8=<1#.,9:2BF=:-'?A;/G>')GG.068('=:-+4;&"E>#$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:95T2G0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2181 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3695 42 59M = 3778 183 ATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGG %6!*@1':E61-?,'D5)D$"'"@%.4645$):C&1@G67BD5;#?6'E!?1,(;D,@! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2182 77 * 0 0 * * 0 0 NACCNANANGTGTATTTCCTGAAACGGGCTATCATCAAAGCCATGACCAAAGCAGCCGC %&(%"('#$&*"!+(('#)*)"%!"'$"!(%'""&&&%%!#+(!+!&+&+++#'&(&&' YT:Z:UP jpayne@0: r2182 141 * 0 0 * * 0 0 CTNNNATGCGGATTCTTTCNGGAGATAGTAAATTTAGCATCCGCCCATTCAACGGC &%%!#%+*()!()**$&$!&*'())$'&"##!$#+#+!%(!##)&%(%!)+*%('# YT:Z:UP jpayne@0: r2183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17767 42 50M = 17868 295 GATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTA ++$'($#++(&&!+&!++"""*$)!*+$!)*''"#'$')('+$+##'%#! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2183 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17868 42 194M = 17767 -295 TATCCGCAGTGTGAACACCGGTGGCAAATCGGCATTNGTGGAGGCCGTCGGNCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGA G!@5;FD-$+/3:.@C%$97$C=C?,33+G(C*+8:?)F;++.=CG4"#&0'F<3-$>DG=@E@H5)?CD%#(1%F.3/H7&-)4G/;:8%57'B#>,,->6'=$7"@(9HC!/>4/8<<(7"E,4!!.":1-@?<2+4$8(A*/3';68:3=B#D:.D+3%%1='%&@>9!195$')+AG<#,-,0&6013B5#5@575F@F2/A5!8G,"3@#9DFHBGA-(C83.@$$*6/E9H18!4>4=1.%CFE&&%%7(FF(?3$?B1*#@>;5#CG=0*?@<+H+3+0)7#;<>!B,2;!>AG) AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:17A15^T11C25^ACCCGA41G12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2184 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17780 40 168M = 17649 -299 TTGAAACCAGCACGCGTTATCTGGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCNAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACC #H"CDB$:%B,))=@D)E@A>F?ACE,=DA#@0'.9B!74+*7?E#"D"#-C$7$%4,>(4D+9'#'!F%28)?B@4!H0!;!,$!0;#A/EB@/33FA4F96(A37'6%#@$.E)+G>/1A*(E"7.1./:'3.A1"#8=%A'B=%B*+GB2F555>(BHB/,./A8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T90A54 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r2185 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9272 42 101M = 9412 213 TGCCTATAAAATCCGCTCCCNGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCANTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCA 6E."-B!?2(0C%1:9'3$%HC1HC1>+%:-(GA* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T2C38G41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2185 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9412 42 73M = 9272 -213 AAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAANCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCA *3!5!@=:8)5#$E3(()1?;<=,+8DH!0&9>!C1B6:9C(A97!;A'0*%F0H>;C*&/'2#D&&=01.8: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2186 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4643 42 55M = 4431 -267 TATCAGGTCATGAACGGCATCGCCATGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCC ,E#96-9:9.&&5D6G:8$4!"E"E=2#C,&='/F1.C.!9A3B2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2186 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4431 42 188M = 4643 267 TGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGANCCCGCCTATGCNCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTNCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGAT @!1"0'-0F>H?#@.**,'6(!2"#B6%;17".F/>349C>%045<<)$4C0"GF)H8B/0'1?0-7-?&7(%@E>*!F<2>+.9029F&.H&#&&75#'!9+C#7B#-2(,E!1H9.9E"5HBF6"-(@.'B",*4=7"#-8$*9?8+C(152'9:>/A%&HF-;9$8<.#?.0*248?"71-,C9" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55A11G21G98 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47974 42 66M = 48231 319 TTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAAT :;*@D8<(#>?:.&D-F'?$FDA:-*&6AC4?FDCD:5?B6G?%(7C?'4C9F5.*1$69:;? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48231 42 62M = 47974 -319 TTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTC )C6+'EAE/"1E@F5-:%<'D##',12F/09'%.8;1CD%)- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2188 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3378 42 53M = 3228 -203 CAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCG 4%9./G"-DBFB.HG/@G&#FD,//8@&:516;*0!=%((=0::/C;GD,G5@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2188 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3228 42 150M = 3378 203 ACGCACNTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAA GH#"H4(2B2?H'F@0-"07(E>BH,8<;4=,##9!!D5);94!C/:,'=?@*'8(,<@=(0:AH4>H49F?9<0#=2,G.@$7D>/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G116C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2189 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43780 42 69M = 43545 -304 ATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCG 6!65)D49%75&&H+&7:4%'CB!:HH5%7B/5@#)63BF$=3F;!'"7B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T19A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2190 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35744 42 64M = 35993 310 TATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTNTGTGTTTTGGGGGNGATCGTGAGGCAAAGAAAAC #"+#&))(#+"*)!%"((+*#%(+(!&#%')*%#$()(%%#""+#&!)#$"$!)))))#!*"!! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A13C20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2190 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35993 42 61M = 35744 -310 GGCAGAGACAATAACTATCGATGTCATATACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCGGCGC 82DE"%6;973;G,6= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T12C43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 452 42 126M = 578 212 CGACTTANGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAANGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTC %=/%?=%?8"7/D85.";;?:H4"F)5E$"&8,&.3'.H.;1;8=<;(GH'@#4H&F=GE965H?:7F0?6*//B$$A7'3';7C(>$1HFD<59-*:$&".>&5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C33T84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2191 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 578 42 86M = 452 -212 GACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGC !9@E7:9>47(C$2<4H6&-9BC)8F=>,8<=4A!*">4-?C2*:D+=73E6G7+C6@CG<9A+=1C8*:'<>,*2?"$(;CE0*' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44425 42 380M = 44805 472 TAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCAT F-5G-@@4-@2<7,C%B4#1B'+>4(54A,)3,@B<0F/%1G&!?C9'3"A,2GF24,#C/>)B,,&/#'80FAF@5C.,'8*.F%&5E@D*A6*30#%B>HD.2B"60"<5'5/%>>F(,/#6;G.;2:<'B&C0E-,'*=F@A"<869+=1CE)/F&(!+0-14G&7";6G4+E/0D&21=0G8>'0?F!1@+;C*D+9H(6A?.0H5E1@-(0;35=+)*">,=C'29'3?AG::94##G(<7)FH9?8&,(!B*?*1GA:7/'G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:380 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44805 42 92M = 44425 -472 TGAGTCGATAATCTTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGAT 2?:5.(9A!H*.=#,H(B;!3C:E=FG5F*!?(5,0CH$!D=609F""(0A:9D@0B5F(74&&89/"*3!:&D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2193 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15864 3 16M3D104M = 16066 242 AATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGNCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCNGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGANGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTC ?4$79)D!)02@'>(E-+B/6H3-&)3=&&A$AH'8H@/D#$&),,=(F9*A(=.648)$!32A/?$?0!(&.@.%:1H!$#1H,/D@,"H4/B9.>$:='-'GF(D'FD7D2:91)2F! AS:i:-57 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:19 MD:Z:1C1G1T1G5A0C1^TCA0A3G0T1A1A0G0G0A18T35C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2193 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16066 3 40M = 15864 -242 AGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAANCGCTCTGGTCGT E2':)"&3+H43@!0CF8+7,.;E97*@$=$!2/=D0D'0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A12 YS:i:-57 YT:Z:CP jpayne@0: r2194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28552 42 50M = 28284 -318 GTCCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTATNA %$$%!%&**#%&$"*)+%"(*&"$"$!#!$'%&)(#&')$$'+%+'#*!& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A44C1T0C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28284 42 97M = 28552 318 CTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCATACCTCTGATTTTGCTGCGCGAG C@.F/5<*5)G20D2(-1+3=:'C&9*D0(0&!;/.FC1A'9%)@3<'7!=3$>$+4++-3@"::D*5$A-!8:&@9$7?;<,-B?&=D,C"BG:*1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T23 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2195 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20140 42 51M = 20211 207 CGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCA =CG-;>/?DEA+1D??E;//D/$#=*0H%*ED??D!>8G+FA#:E*BE9-- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2195 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20211 42 136M = 20140 -207 GCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCTACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCG ':D9A,H)+%%?;6A8280<">B+*17+3F*+:3>%1#G5B$%3A?&"@5F%?7&+4>>5#-+&FF"D9B1G5+:/9#A:-.HG?E&$F7!%/"EEC'3@-'/G@342C+1':@/")/;';C<8D<<5;"9B1,@B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107C28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2196 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2730 42 61M = 2554 -237 TGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCA "()#)&++$%'$($$#%%*+'')%'&)"+(#%%)$'%*%*&)'#'#&!&&+"*+"*%(+*( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2196 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2554 42 75M = 2730 237 GCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGG B5+#?!#,BF4'E39#+#8738'!F1"?%6;.A3,+=;,2<>;@B6'65>1+D>D?'!$*4#(>!;&EG*<+@CC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2197 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38760 42 69M = 38760 0 CGATGATGGTTACGCCAGACTATCACATATGGTGCNTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCANGCG ):HG&?%3=*@"!BF+A4A+5&8=/'!?2!+1<2+(1F*5/?12$9%"C$A"(0F-70@.$A8/4H$4, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25A5C3T29A3 YT:Z:UP jpayne@0: r2197 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38760 0 * = 38760 0 ATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGTTTATTCCACCCATAGGTTTTACGCAGAATGGCAAGCAGCACTTTAAACTGT ,57D'HG,$=/1&:6,+8&";*1<:1*1&B*G;<0#$24;**&?3;68E:,A=0!2$.C<#4"6GG1+D2(H)/+GG%)'7;"F2@.67*D8;D:%:?:)!8)(5#G'$A01;E>5!(%H#B6792B!3,:!"8G*!#&'=F'B"C%7!GF):;#"6?:6H2H*H*:CH7D)3?7!#$/?,'D-@E;0&'&E6F@7!FHB?/>0<22B;"4?-0$=H&1>%@E<&)A>-:A/$->3.?/=- YT:Z:UP jpayne@0: r2198 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17824 42 100M = 18058 287 GCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCNGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGG ;11+G@9?4,+@"%F0;>*:4!'"$&%+B&FC($*2$.3,+"7"=.*+7?8:E:=C?84".'(+(?C@,@-)22!2AE*E8-A4B" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G25 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2198 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18058 42 53M = 17824 -287 TGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTANAAATNGNACN "&&"&$"*&)+!%('"$($((&!"*($')!*!!""+%%)'!*"(*)#'%)!## AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:41C0A4T1A0G1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2199 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2256 40 76M = 2052 -280 ATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATNACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGNGGATGAACCGCTTCCCG @"G)A7C)/)A/68G*%/4)E?29B4(;F444=,50%B)59?"?8/.=?6&7$5F7'>D?5+0-+1G%2-F(=4'1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A24G17 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r2199 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2052 40 34M5I82M = 2256 280 ACCTATANCCGCCGGAATGGTGCAGGAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGAGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGT ,C,#0-F,DC<18>$31(6/24F34@3+9''@31?2'D8A519#@@+GA?3;:;>.;?74H86-!*$<5E"8%CD-#DHA;.@&& AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:7C17A24G20G44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28784 42 62M = 28967 224 ATTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGG (-0A:7;/@33?$?%!@A;"$3,3-09*);8C49%B?2:5:8D5($@595D:.-<#A"=BG! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28967 42 41M = 28784 -224 CATNCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACC /=4/H!C2'@C2GAC8ACE#72A:D,('CA0?)--+5A0G2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2201 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3681 42 57M = 3844 236 TGNGANNNAGATGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCA )")#""$$*("**!+*$+!#)()+!$#"&$!*$&%$*$')!*"#'+$&*%()+$"*% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A2G0T0G2C46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2201 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3844 42 73M = 3681 -236 GACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGT /86,=*'//57($3D69&9%E$0EH%$!HDAD2/!1=(")70@B-H$C"C%+(%##%56%E0$#?,* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2202 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27307 42 84M = 27130 -261 TTCATAAGTGTTANCTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGNTATNGCGGAANGGTATGCATGCTNGGTGTGGGN +'$%"#"")%!"&!**&#&$+*"+$""&)$('+)&*###*!%"%&"*)"!+#"#"*$+)+)#%$(""#*$)#$#+))'(!(#+' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13A36T3G6A12G8G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2203 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7776 42 84M = 8057 336 CGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCAT D#&9"@?B"G?63"@!CA+4A@;;&/F5@4FD>9;134D;+++15+&53!C/$:&H.<:*D,D+>!8"F1B6"/6'B4@B2A*B"D2F"??,(?5@&C#C>37$C1#A>6E--H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21243 42 43M = 21097 -189 CAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGG 0"=>8!/+/61)G::,5&H0*8#53/@3)=B0E#;>D)"?>9C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21097 42 78M = 21243 189 NGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATAT #B?"'=):=C$(>:,@=#$H40<$1A<0&!8;/"'@%;F@H?H+&9288,E#24:*%8*;$('%A!;-=<&GG>F(&> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G12T64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2205 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29821 42 55M = 29602 -274 AAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTNACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGT /=(7>=4A5<,H7%:H(;)$2'BB8'B(B,HG!16#--HEHBA313;+@*92C#< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2205 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29602 42 115M = 29821 274 CAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATTAGCAATGTTTATGTAAA *G-3!"*+<1?-15:B;/D@/"#5E$"=-553%-0&(54='@/#6%7:*DB$)&>7D3:5<71:>@26:D8+:)99&2"7@A"6A!CA9"12G>HA"9G+*="8'(D2>-317;+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2206 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9981 42 141M = 9822 -300 ACCTGGCCCACNGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCG C+=/%>#)D:91A.,)>/.;E"CC7'-*;$7=A01/;,9"E6*6."FF,;C/192+0/-/=!)6-37EGG<#GB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G129 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2206 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9822 42 153M = 9981 300 CAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCTATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTG (1G.A:%25;@'$&B4++F"B88*)4?'H19)&7*46$275?$@13':+(F,A/<)5B''8B;1G62<>&;-,0)4?/39>=?0F8#;95@-<-G8";>D;CAE:"%0A%>5-/#(H@%H=?--' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71G81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2207 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46804 42 95M = 46899 291 TTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTA >H.;6C983.B18:(%D43-+=-??(7'&?.95=H'/4("/(B-16B*-/,-0=?1HB2B#G8+.";G?#$,!1--*6@37C;!(0A/6$1E5": AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2207 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46899 42 196M = 46804 -291 ACTATGTCCACAGCNCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGCAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTNCTGACACGGAAGAAACCGGTCGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCNGAATGCTCTCAGTAAATNGTAATA '$C9):=C,-&'1-4(2#;=2:59F0$7'"'>((6=580)<;80.<"&-59,(DC=!.88!//,<2CC5B17D*;7E@E762662$(/C<0(F?G"HH*<2ABH8:'H<)@FBB/-3586/>"/(.2'7=:!D,!&?$#:=%>51,B8+9AG,!*G*";"@B!+;A662'!'!A717F($0.9GA3.9<;BD YT:Z:UP jpayne@0: r2208 141 * 0 0 * * 0 0 GCTNTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGNTTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATNATGTAGTCTGTTTTTTNTGCAAAATCTAATTTAGTATATT #&(#*()+(*'+!!&&"+%)+&"&!!!!"$'((&('!$#&'(#&"&$)%%&!$###&((&%)(&#"$!'(#$*$%$&#"%&')%!)#'+&*)$*%)#)&"*(%(#(("$*%&#( YT:Z:UP jpayne@0: r2209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6352 42 72M2I6M = 6430 375 CTANNCCGNGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACNCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGC !&)"!*((&&"+'$$(!*""$")*%!$('&)$$*#!('&"!'&$###(("%&'"#$#!+#!*(#$"(*+(*#))'&+%'& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:0T2C0G3G40C28 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2209 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6430 42 297M = 6352 -375 AGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGNCGTCGCATCATCATGCAGAACNTGCGTGACNAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTGAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGGGGTGGATATTGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAATCGTGACAGGGCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCA ::?B)*8A%:HGD";?>B$>,8%;;@4(1%,B,;4=-,8:=?&;G-(84"!':D"".!:0A&,0C7/BE#27*D,E"&C55".>/B@=C8"@$>1B%)DH2-->;(A:E4,D$F@HG#F$&6"@64>7F;8&$<8EB/-6F/BA1D2+9F#G#&B:32,F.G9HA#>2%=@@9=%1+32$7AA+=,$%.;H+A)01*.49)8D;0/,;"(;E1!C5%'A??&4"?(!D)?7H+*HD;<*==(@8C?3$/;,2>A.1G.$71#@B48'DD@7:),23+H@52#%71@AD>($5=#86: AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:28C21A8G52T43A9G53G7A1T66 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44908 42 79M = 44703 -284 TACAGGCGTCATCGNCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAAN $%$)"+$(#&%%$)($*$#"&)!'!%%"+'"#'(#+##!!%%+(+&%*+&"(&"&#*!$))%!%*$#*$!!&'+"'*"$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C63T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44703 42 148M = 44908 284 GAGAGGTCTGGAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAAGGGTTNCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGNATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCT ++%)()&*"(&)*%%*)+$&%$#')!*%'&"!!&'**$#%(#+!'!)!$$+*+$!))"!)&%!")''"+++$(&++&++*&#"!#+'%%!!+)!'(!#++*("#+&'((''"+*$#$#!%(!"*++$#'!((*$''$%!+#""*'&"# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C49C4T33C48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2211 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33397 42 128M = 33289 -236 TGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACNTAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGNATGCGG <7!'7?9$736"<0&H,E@+,=A*=0=))>.+H2C+&F8/5G5&<4@$5+C$+HBA9B==@:-36@-5-/*GB(!C<*<=.5/786;:&<9;7.F,C<@//F5"!<0",44H*,HE(7-5B$E8(?CE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87A33T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2211 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33289 42 106M = 33397 236 GATAGTGAATTTAGTCTGGNTAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACG %:"4>!"=012EH+&AG7F.?#"$56C435-6"0#96'$*C8.?1AG5*>A6.>:C>4"62&##"'+? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2212 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36236 42 49M = 36236 0 ACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTGC 0)F0H*'BA:!!'@%%89F:B?86:?/-!35H'5!:6,8,'E(8=3:!& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47T0A0 YT:Z:UP jpayne@0: r2212 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36236 0 * = 36236 0 GCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGNGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTNAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATNTCTATGNGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAAC 7)8.$@#1>GG2(6!?68/=:<*#H)G20,F9=EHA*!1+"61#-25)HG)/EE"@)9EE%34??(&.+#:7*H%2;.35<*-B5,->7@2+<*+9H8?>.9;?E/&?=C15-6"(<.25'7<@%;29+8"24>H,9A>BA!98$6B):G=+#G+(/H-'8@/,B;-:/(/8..#H59>E6->8G8';@)--34<@*%&,;B+AA:455;2='!F#364G&E2>C@@@$93"4@80;679D?B/4;<;!@A@%-6?F83$-B?*,,G3F=)6CB2),2DGD,:$(;('>1EG@!HD72H,%+34'E7.2+2EA@@!6"C#B8@>,B&0"=A6>B.?@('&D.A(F98&+C) AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:65C102G0A57 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1914 40 41M = 1955 268 TAGCAGNTNCACCGCTACGNAATGCNCGTATGGGGATGGGG "%&())"$%*+$#!!!)!'%(+&!!+$(+)(%(+)'()")! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C0C3C1G0G9A5G15 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r2214 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43247 42 42M = 43304 196 TGGCAGCAAATACCGAANTATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCA -.1,5CA87.:15!7"!@)"1E-8#1=DH?&):&H/5F);76 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2214 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43304 42 139M = 43247 -196 CCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGANTGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGT '8;=,$*1DGD(#=<&A=2$!,?87/GG.G<&7#C@;(4'8B;=038<*738&7B$1&;A6''7H>HE&!@/>2,D'4A$&5$&-4A"$1(10!6"?/A%G(040*7(5':5C04@/F*"++&A,D3H,2+6!2>+GB" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T93A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2215 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34904 42 64M = 35093 280 GTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTAC :6H%CC7A6!@2EA!93(!FH<)&.?1?/(:7$EA99")5;&G20#4(:0!FA-A$84=HD!/- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2215 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35093 42 91M = 34904 -280 CGCGTTCGCCAGGCTNGCTGTACCATGTNCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCGT "&'#('&***&*+)&+!+%"!&(!"')(%$&(!&#$%&+'%)(#'*"+%'&($**"+'$"&'$$"#'#+)#)%#&'+%!)*'+)&)*(+"! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15T12G26C33A0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2216 77 * 0 0 * * 0 0 NNNNNNGNNAGGCCNNANANGNGNGAATNAACNNGNCCGAAACGANNGNANCGTNNATTNANTCTNNCNNANNNNNCTNNNNNNCNNCTGANGNGGCTNCTNCTANANNGNCNANCNNNTGANN "##!!$#!#$#####"#$#!"!$#"#!!""#$"!"!#!!$$##$""!$"#"$##"$$$""$""!$$""!"$!#"$"!"$""$!$"#!$#$#!$##"$##!#"$"""!"""#$#""#$!$#!$## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2216 141 * 0 0 * * 0 0 NCTGCGATGCTGATACCGTACTTCCCGCAGCCTCTGTCGCCTTNGTGGATGCCGTTGACGCACACCCCGCCGCCGCTGTTT *'8C$G,E5:B56$4#B:%#)@:BCH5-FH22)?9%*'-:+0-2E%*!2>4?.?1?,B4!:#F9F*5&:6,3.1.;:5A;G YT:Z:UP jpayne@0: r2217 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 839 42 102M = 955 316 ANCCGCATACCAGGAAGGGCGCGGGGAAACACTGCCCTTTCAACGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTNGTGAAGTC (%D2&%=&8B8D'&)AE81:C2./%*"7$D*@):7--)D4+8$)!+5G*D9%H@76DG-(53C'5((4'9@GH28)(@%*@2+';H/?#?01(0;,2B.A*. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T20T19G50G8 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2217 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 955 42 200M = 839 -316 ATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACANCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTTGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGNGACNNCGGTCNCCGNTATG "'*%$"***%((#)#+*(&''&)%&"!*$'#&#"!+(!"(++"')')'+%&)%!#!%%'&*##$!++!$*'(#$"(#'+$#'#!*$%$((*)!'($$&*'(&("#*$&#+"!#!!''&(#(&!)$')*%$$(!*$"+(""#!!#)*%**&(&)'#$!&!+)"(#+($(&)&)%+$&+(%*!'%($"%"!')"&$%#%)!( AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:57C66T20G34A0T1A0C0A2C2A2A0T0G1A1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2218 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1299 42 83M = 1179 -203 GGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTNAGAGGCACCTGTCAGATGGA >CF'=3D0!-'@=1C5B7GFA33&/*8;<6@A@H+;E$'4/;1/;83@;,/"721'G#>B>DC#4C?/;-/B?%9"EF;7$F< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G17T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2218 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1179 42 120M = 1299 203 TGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGGCGTTCCTG C/#3$7$,=H'+08.?6<,'*3D+?4"().!(A:=2<&5$<@-39<)4#")H&-A'D;0HE:G$BF*A;A$&0A4.#8BG9,8=@6?;B5<.9@C,G(/&$*/1FD/-1G%*4#4@.E@**!9*93?6H50*9&DCE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2219 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41968 42 44M = 41743 -269 TGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCCTCCGACCAAATCGNNC %&"#)(*%&)*!($&!&$+"'&%*&")%*!)***##"#+$!*$$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27T12A0A0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2220 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44522 42 75M = 44619 220 CACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGT 6-H-(?$D>5#+,%A1*"C#AHHE(;6?3!3,&"0+CDD$?+6!,9'@9*H>(&#(.D>60"=#AG)E1!?#+/' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2220 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44619 42 123M = 44522 -220 AGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGG 7&E39H7+A';@/F)D4%5H!!%'1:)%@(=4BB>DB!7@G$!=BG?90/%>49-7*G@>D=@;?;%3&35&HG7/$5H=422+(G=GA07".10,/1("9%6=<#$C!H6(1EC2"**08=H-#&-*'13"?@?2'5*C9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2222 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31005 42 46M = 30766 -285 TCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATT E1+1(0H086?!'<1::;)2%9B2>,+B#D!921-E=/A9>9G5+)$.()(!!&/9B>2=5H3(C2F->''<#(A?+8&E4(E/27B$1,9EC2='5(!B<3&D$!D26"<;>8C3.!C6$3DE>)'C*!D#*#7$38E1(=+HB4)CG?-<=C,G1H>.%F-=HD?#H>9F4C*+';:94?$8&E-"14'H>CF0'FA%B:.B4>H%*AB8F"EC/96:;@/0*57F%A)16<(<1<1>#B,5!9DG149D@;EFB:D(B:<:'C!9'AC'$01@4@@B'D)EE-@0"-GA-4&C94+/);0B(8C2DC"9A(,C,01?*=.2,.13-D6H&6,-;7/54+;.(/*<12)/<:!EG#)$%/"@4H86$) AS:i:-77 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:4 XG:i:18 NM:i:21 MD:Z:114^TTTGG5A69T6A43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2224 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13583 42 237M = 13538 -282 AGGGGCGACAGTATCAGGCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGNCACCAGTACGCGCCCCANGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGANGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTANGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGNCNANCNNNNNGAGNAAG ''"("*#&!)!#*#%+(!(&*%))+(+&&#$&"&(&#*"##&+'#*$")"$!%(+))(%'#%#$(*"$*&%&+&*%(+!&*'!#(+)&+)"*'''("!'+')#"$%&$'%+&)&+*!#%#+"%!!)%*&*((!$$**)!"#+*+!%"&)&&(%$%!)'&&$)!$)('')($&!+(%('"#&"&!%+)'!!+$+$*(%$'!"%%$+$+**$##!!+$$()"&"(%*$"!"')&%$("* AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:17C42G17C38T47A53C1G1T1C0G0G0A0G0C2G1G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2224 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13538 42 45M = 13583 282 TTNTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGC 55*5&'##.)@0>-;'':D3,6,"2$*&$E=70E?7%H$&>-'$D6A$3=8,41,5F25%&/E66:H46;1C'&FD"$)4(<':(4--97%:2.8=>H@=,-G((HH!&48A)<90:>@4ACH8A3@?ED#!+25,24+B5,=9A7@F)4:B5G7@@=(-*1&F&%E!G$)!,(";E1HD2A-?,2((E8/4F1$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:52T33A13A33A9G7A35G2A0 YS:i:-98 YT:Z:CP jpayne@0: r2226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 23 3M26I255M = 259 450 AACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCANAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAANTCAACAANAAGCANCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCA H6!H?=34(G42;-:/=%G+D@0C%3+29%44"/5805".???B(5!#HCE+1A=@5./HC@*$@7#(1EG8>E3DHF3$&1$6C59@B'.?;&G$H2.)?+&??#;'H@H;3(:A9?$>G'"(E,;8+(+:F)4#)2%53/!8H*!5&$.'B"**:!:C=D&86%F6:!&F#)#4EH57&$"-=.078/841D3;!)9@=3A286,AD AS:i:-98 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:26 NM:i:33 MD:Z:0G0G0G70T122G7A5G47 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r2227 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18949 42 79M = 18795 -233 CAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCC &?A((4:B;*(8!AB(+06:*<%?4.A!3?G+6C=G$'D,"24@A3B?(GD7?*'<,,%F$D*(5/B.G05E639$G#*:4!8E$'*#?*)##%:+?:G.)F+"%DA8C&"H2/?0;?5(78H*G-;(>8;7+(&7:3)A7)-!2C"B=C>%G-)>;#2BA,*,98G+#*"*.1<7:-'DE('!EH<+:;"(;+G=<0583;:)3F+;6EHB!B%'$#-=-*2"/;>F!:>=46+#=D"906-?@5:7;3C.;;7'G?+(H&@+"87@95@:1A0$3"='>:%0=CH04&66@<'16+)>/G$F:>/E!-(0'(=+""(/)D%F?13EHB$C35F%2!)H932AG!?%*5)H6?=>&F8,?:AF++.-:!=-+;=1)%D&.4)1%%-4#)-H2#6.E02347A3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98G244A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2229 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28203 42 151M = 28081 -273 CCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCANGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATC A1?D962F*0>?C>.,6/)4(63H;*5G$3@0$,*8)#7E@-2.3C6A64)""+99!?ACDA,2!;83;/95(9)C4#8H?6/.496,)"7B,%@4&.8?/#.15=HFE=3(/B7:@42/;.B(E%(E+GG>3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2229 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28081 42 84M = 28203 273 CGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTNGGATGGCAA :81DC!E&.#5A>"'.795F?<(48D50.4=3)D&"70C#G3+AH.D,6B''7(+?$A)0&>70=:36*B+G&F;6,F%A<#:1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2230 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33810 40 56M = 33966 218 NGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAAATTCTANTNATGCTTT $+**#(((!!*+)($&)$'!!'"$%!$%!&("+%$%!!#())+)+*%*$%*')*($ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T39T5T1G7 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2230 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33966 40 62M = 33810 -218 TAATCAGAACAAGTCGGCTCCNGTTTAATTACGAGCGACANTGCTCCGTNTTTNCNCNCGNN $"!!!&+"!'"#""%&%+#%*&"'(&"*$)''*#'++*'"+''(*#*()!$'%%)**!'&!& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:21T5G12T8G1A1T1A1T2T0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2231 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23639 42 163M = 23639 0 TTTCTAAATCGCCTTGTTATTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGG B1/%*,6(2==#=!G.5+ACH>1(2>'3D<6BB@4(H=)<:1;:;=F35$1->:/.C05D-77@GD:A#C.();/8:37%!7!D,92?A9634.-1E$279B$-()##;'/=C0%G2!1:5! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T143T0 YT:Z:UP jpayne@0: r2231 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23639 0 * = 23639 0 NNTANATGTANNACTAGGAGNGTNNNTNCNNNGCNCNNGTAGNAGNNGATGTTNANGCGNTNNTNCNTTNTNNATCGCNATNNTTAANNTNNTNTNNTCNNTAGNNANNNNAANANNAGNNTNCNGCACNTNNNNNTNNAANTNNCCNANGNNANNCNNCGGNATNCN "!"$!$#$!$"$#$"#$"$"$"!"#!"!$!""!$#"#"$$"#!""!$"!$#$!"#"$!!#"$$$!"$$#!#""#$$!$##$$"$"#!#!"#"$!$!!!"!!$$"!##!"!##!!""$"#$!#!!#!$"!!"##!""$!#$"!$!!"!""!$#$!""$#$#$#!##!#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2232 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12642 42 117M = 12642 0 GTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCCTTTTGCAACCGGAGGATTTACG AF/3B2F%99"7'*>;8'D?/(1-9:.8;4-6C&'(27'2EAD;?G)67'=<146.7: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75G18A22 YT:Z:UP jpayne@0: r2232 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12642 0 * = 12642 0 NNGANCGNNGCNAGNNTAAAGNNNANNCNNNCNNNCNTNTATNNNNNTNN "#"!!"$!!"$#"#$##""$#!""$#"$!"!""!"!""##!#!$"#!$$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2233 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44288 42 75M = 44575 378 CTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCA 72>*D6#$"&?<=)8'.'$2:3G!1)HB*1FHB>>*$8%E2E62+:3F5;#B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2233 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44575 42 91M = 44288 -378 TAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACNACCGATTCCGCCTAGTTGGTCAC 0"H)BE409?C+!8*>:--F0BC:6H<2(F&<3.2>3H&(77&B(D@7G!3-;=D;8FF/F,2CGB0F#+AF%HACH$84E0!G)4/30== AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2234 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14253 42 137M = 14390 413 ANCGNGCCGGAGGCTATTTCCGTATGNCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCNGAAATGCAGGGTGAGATCGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGCCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTG ''$%)+#$%%"+#"*$"&+'+'&(!(%(#*$&&'+!%##!!'&%%(!'&+*"+(#+*$+(&&(!#&()!#&"$**(+)*$)()$'!'"!%$(**"!"'%(*&"&'''"**"+%"&$)*+##&$"%$!*'&#($$"*& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0G0T1A21T22A17T38G30 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2234 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14390 42 276M = 14253 -413 CAGAGTGATTTGCCGTGGTTGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCANCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAAACTGGAGGCGNCGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTNC #%(+$%$+"#)))'#!%)($)(*$$'*$$)""'&$"*))*##*#*&)(!')%(!)("(!"+$()+#%"&%&$$"%%$!*)($+!'!+#$"$+)*#%+)%#$"$''*+*!+#)$'&#$'%'&#$"(&#"'%%&*"!!(('*"'"$+()'")*(#($!+"#(++('%&$%+*$%)(!'*&*&'%*+'")&*%"+!!#(()"%")!'$'(#')%#$#($**#)(&!!"($!$&&!(##%$'#(("+#&&$')'(#"!"%++"&")%+*#&)'$$%+#!' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:19G141T47T9A54G1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2235 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32186 42 215M = 32401 295 GCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCT H*9>C,-FA)CD,##$D%1D17FC+(7?+*3+:!C$&D,549"+1<@/2@!'=$4H%*8BA+B@35)AG!H9F.)<=)?6D58E$@%795@2%9@=E$!)DA?>%5$97$",/>-F&()C2$B)=F.C/$$(3B=8D@&?(5"H6HG2"9D2-"!?#E-3820-&H)6H'*!<%)GG*(<2@HC1G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:215 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2235 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32401 42 80M = 32186 -295 CTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGTCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTT ,($.=<(AC/:7E5F@?B;<8G0(B<',,03C('?;-,)"8=%-4"97-91D?!FA(-+'1+>2;+ACCH78A:G'C%'9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2236 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7493 42 65M = 7642 199 GCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGT ?H8=;6=3D5$3<2"FC/D@4-//#+69/E1(8)40<$A,B";)4>D,5"F&+:8/>%2!C2-$F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2236 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7642 42 50M = 7493 -199 GCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGC 64@8:#G7G72%9:"(H0C$"5'F,(G):$2E8CB+D%?<4.>D(8-B@8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2237 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5009 42 78M = 4786 -301 TACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATNTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAANCCC &/#/#*F75A/@FEF$,E&!%E2'944HG:D5997/.?8@'(DGC?1:F"0*C:C1(7GGH($!9735+=0,/#5=.# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44T29C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2237 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4786 42 42M = 5009 301 GGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGT *F193@*1;@*@,.51?=G,*&>48.>8$E0*E1)8>&G<1!#8""!/0E7. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r2240 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16743 40 123M = 16878 253 GACAGAGCTTGTTGAAGATACTCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGNCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGC *F/AF(D:=@?7505&!;5:HC6C5*E:1$GBF8)G-;'3E29=-D&4;)C2G5>4&F-&%EBGH.1C#:=2,@(+2&&"10@0.A-A/B6HG42=6)18D&@7)$'6G#CAAH#:$9,G74+ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21G65G28T0T1A0A0A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2240 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16878 40 118M = 16743 -253 AACGCAGACCGTGGAATTCAGCGGCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGACGATGACTATGCCGGTATNAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCC *.!;CA'-/<3G)",'??H$5G)A;D%&92B(?14(<$-(DB1HH.DH9+9E&;51-/!H;)-'2D,:D='#H?!*D)"*F/40("#(H)0A,>&C'"-*+))BG,=@63$#,/B0'" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15T7T51T17C23G0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r2241 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28114 42 141M = 28255 273 CCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACNTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCC ).+:9F9H7/>B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:132 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2242 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4856 42 130M = 5042 235 ATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCG C;+DG$#2/++*/<+#7GH4/F)D63,+(?(,'0<>D82+5A$:+A6>'98)<:8F3FF#<-":%F2890;+A:393HG4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:121G8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2242 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5042 42 49M = 4856 -235 ATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACA 52/B*B/38+!<)B;&E!)!0D.!)FD:;%:))%"B32$B>5>5(G?%/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2243 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1221 42 98M = 1083 -236 TCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAAG .A(H/>7(,@*H!"HA24=A=:;(00H)/5E@)=#D6/F440".'2'=0&>4$' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96G1 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2243 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1083 42 102M = 1221 236 GATATTCNAANCCTGNTGGCCCNAGCCNAGTGNTATGGCAAAAAGCACCAGNATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGC %$$**'%!#!&"*&$!*)%&!%#!$')###$%+&++)$&$*'#"%)("(%*+&##)*%%!$'!*'""'!"'!%+($'""!'+(!($&*("$+!!&(!))%(* AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:7C0G0T0C0G3C4G1T0G3C0C3G16G1G50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21957 42 54M = 22011 441 TTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAA 7D4%).3-9=",7&;3!6C3F88D6;5B,:2DF+#4<(1++0HD83!H1?#,.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22011 42 387M = 21957 -441 AATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCAGCGCCAGATATTCCGGCTTGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGGGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAANTCGGTCCATTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGNCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGNANCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAATGAANNNCTGNTNCAAGTANNCNNNGN )%$&#&)#'*#$'%+#%"!!(%#+$"%!")&&+&"#"'**)"'!%)$&&)%"$%))&$#$'*#()+*'$*#")%)'#$$($%)+$")"))(+&&+#("$""*""##+""#%$!*)')($)&*+(%%*"*(*(*(++*)'$'"*##(%"*%'++%#%**&"*$*!'&'&+("'"'%+)&"%)$)')++(%""!(!!)&+!%'+)*#*("#(&&!!%#$$$#*#+*+%*%!'&#$'*#)#%*!+('&+(++!")*&%++"'!'"'!)&$+'%!+"*(+'!++&+(#%#!(+)()"*""$%'+!#+''!+%!%#)$%*&#*&+#)(*+"(*#!$()'$#(#)")*(#'+%$+&&'('+"*!+'!#$($!"&$))(!!'#'*)!))!%!*! AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:22 MD:Z:100C17G22T87C7G55G23A1G40A0A2A0G0C3A1G2G3G0C1A0G0T1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41098 42 51M = 40842 -307 TTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAA +.7F#/5.,<=:HA'B%5#03<*=""&2&!G57GH*)23;?%40:8H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40842 42 141M = 41098 307 CTGGATGCAGAAAGCTGGAAGNGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCNGTCAACCAGCAGGATGCNTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTA %)+&+%%'*%#"&#&'(!!!"('"#++!!!()#)*(+!'&#)%%)!$&&&$!*(#)&!&)*$%$%!+#+%$)$*&%%&+!&$#(%$"%)#(+"!*%%*&#%#"()$"'+($%($#&(!''')#'#"&&!!)(%#'&(#%"! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21T75A17G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30258 42 111M = 30146 -223 TCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGNTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACG :==(.3%F##->($4$GE!+=5G(-B56.-F)&)03CD91H/A!,//-1/@#%$G$$G/0A<,"G"669:0.>;:&>,*.*C$;E$(-6-2$?-#A.-89/D-4>BC".B4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G72 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2246 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30146 42 112M = 30258 223 CACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTAAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATANCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCCTTTGANGTATTGCTGGTT +*+%##*"+%%+%!)"(#*!))!"'#+*"*'**%"%#'"%)("#!''#&%+()'#**&$%+*#$%!'()%$((&$+&&%++(#''(!'*")+'+'&$+%**)%&$&+!&#"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39C31T21G5T12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2247 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2810 42 153M = 2543 -420 CGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCNCGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACNGAGTG $4!27?BG3<C"*##;A/2<$)8#.:&*,8,$H:>1A9HF4!$#+@?'@208%9$9@A7H3-$&!*#!#CG%'H$&/*+#AE"&F1AD=$)+@C3+(<%#8B??.5:HD'D?A..=C1<+2&5H163-''#G6)F@H?"D3,'G-."D5$265@@"%,!=/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G3C203T49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2248 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7770 42 391M = 7627 -534 ACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTNTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCAATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCANCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGT 3666HGH66A07-;36?7FD<>.DC8"0,/:*?00.(G-@E9%E(31(%@.),G@?/)FE/?5EDG>$-C9*F/9/>;FD$7;?#B#)-HC%-;+=)9C:>+'#1E.&&B?F,12;%("?+-H%58:'#:94;G)/5>+"C06?E>-B1$G$FG7+1'-+A#"5>G?)C+@8'";9,(+"0#:,+="HH3B63C&$1!&:H26&!.E-3%$#GF:8H(0?FE%'&29B=12G@(.7#AAA$(5"H$590C%?@D;):==+?%860$!7(%;46!/!"D0*+%+?:=@H#;%$C!<$B@E!6@@,EC/&G6CGF+%-/;+D#A(?-AB?G&82#$E6*'6(F79/>C" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:36G90G84C34G142A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2248 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7627 42 143M = 7770 534 AACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGG +9"3>@)5-**7/'/G=>-6>32$%AA17:(*='--6&-1ADAD)(@H?"F4'<*%"DH#:$&A.4H%+7(,6-'(:8&CB'<:./D;,!16F0#%GD1"9F;%".A$:&@AG""21-8%(2-&E:*"6-/A8?..@8'C;;,.):D#B72CC&.2!,(1/";F$+=$H"D%*;#"3D.!=0:$230@%57:GEH#%48(AE*':@>+3"A9>EA(&<(FG5=H(GFDF5A/6600'9>@92%'",G.5C8$/%E6EH AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20T13T6G32C10G42T59G7 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r2249 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8052 42 248M1I249M = 7856 -693 GCAATGGCCATTNACCGCGTTGCTTCATCCGCGCTATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCNGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCTGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAANCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGGGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCTCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGNGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAANCCCGATGGCGGTGCNGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGGGNATGGTNATAAA )+#&$#+""$")"%&$!(!*+('($#!'%'"'*!&#+&)&!'$%$+!(*'(#**)+)&%(+'!)!)+'%+('&%"!#$$)*'"$$%**!&#($!&*&$+#*+)#'('*%"!$%#(*&!"'%#$($"&(*"('*(*!(!#'$&))+(#&()#&$&##$(+$(*)+#!#')%$$**#)!()!$)'!())'%%'")$)$('#(&#+$#$%!!&'!"))%)%%'!')!"$++'&"+)(&"&+("$"&*$%)#(""%(##)#"!*)**)*)#")%#%'*!$)&%"!)')'&+'"()%("$(*))*(+")%#!*$)"*&'+#!#(+)%+#!'#!&+)("%%)#'#*!(!$'**!$!&'*"&$##(+))%+)(&&'!%&%$$#+)++%'#%&&#))+"!$*)#**!#$#""+%$$''!)%!*"()"!$#$%%#$$$)#%*)+$%#'')(('%!$(#&+'$)%#"#"##**+!"$+'$(&!$+#""'$!%))%#"+*)(+(''+"* AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:14 MD:Z:12A20A44C23A49C112T25G46T40T14C88A1G5A5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2250 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29425 42 185M = 29327 -283 CTCGGGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATNAGACTTATAAACCNTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGNAGACAAGACANCGGATCTGCACAACATTN E!2+@C.4%;2C500-A15?B(*%$0C58E+!2+A6=:@#%?7&6;A2#AE6G,B5D$"2B?D7!3<>B0+2G:(?*)G.*(*E#B6.<<#FC:4-+":1%3$%)H;94E<(CD.('4#&.BA&@316E$)4.G0G2!,==&H5F,,@B*>9+;G8E1()3)$D@< AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5G29G27G0T0G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2251 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21551 42 127M = 21402 -276 AAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAA C;E>5246!@=*>&;,:;;0/F2(7:260:G&A521+2<&/81!C4/@35//D2"#.,7,H=*%'=%=(E+-$;)-G*8B<6-$46A.F-%"%'"3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2252 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3695 42 43M = 3933 301 ATNCGCNGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCA <0/&E138=0+G+#')<;D5@6"*C#32&;916(7*+9(D.4C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A3A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2252 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3933 42 63M = 3695 -301 GGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGC @#!#<=;<8.*#:'1<9"%#;E/6,0:&1(9-@E<0E/F:5HG)4/00#BE+=#!7+&(D%+/?!84"@&>*H@C%3,3#2A**G2(",.>3<=9/D01;'1+-H>9#3CB;>GC?%"9%2A5'8A16D($&'(4+!D'#B,7*(&A6(B1F82%(;/)2CB'F+F$""945>%7&%D>#.)!.C"8<7=:$/"4(#=<16&)%#EGB-+9G&1?(2;<2-!/H>#G&%,+>EH;$/4(5)+6-#9EC2;>%H7>6$!58D7.'06B6*#$$,@$.#A/##5)4/E>4?5A*%5AC5:=&G>'+A;'',2?5',)@ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:30G119T59C7G87 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2253 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21913 42 182M = 22095 488 GGGTAACGCGGNAAACAGCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGNGGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAA 6B8%=)#/;-HH&?E<#2=)#3HA"'C$HEB:GG4)+D&EG?<(H6-=(EH#D1*?4'.233B&+'>D<;CHD;H7'*./1+6/)@7$FG'6!/8;:GBE;#C)655/"HH10H#4-.,2DE6/"8A9%$E#351E-C7B=F;F?B.05)G&$;6&/5(=,A<=2)-51?F-3&H)*$/'&) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A5C93C0T69 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2254 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31059 42 106M = 30936 -229 TTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACNC )H"=179,*.H/<93*=,64.0*E:&D/.)A7F+'9.:@:+2!0E:&*=*=,8,/(5!%@';!?")-F%%'(4);F083?0<<"&C#/B%8C*/-*-?7@&,.)!' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2254 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30936 42 42M = 31059 229 GTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCG /A,$1$0*6!;"+:>#!$3&/$%?3C26B+G4C1 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:7^T15A21A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2255 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17490 42 111M = 17675 231 CGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAATCCGGGCGGTAAATGCGTGGGG =;4/8(@F1E:,5"3HH@#E-"@5&+'G2:1">C6;:G(4'/H*&3=(3"=39'=9E!6;(?FB4/70$%AG<35D?6D$C,,/16-=-D-.&H8DG4F@1?/#/E(%?8% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G22 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2256 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22628 42 88M = 22245 -471 TGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCANAGTGTTTACATCACCGCC 0&%DAFE%16A5)3B:E4C?96$(8(4F#A==D';?EG&.&(#F,+6FBF/91/(GA$=7$4"E@!-(2D&6&F?06H?0-2E@E=.' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69T18 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2256 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22245 42 383M = 22628 471 GCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGNANAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCTGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGANGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATNTTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCGGCAGAAACGTTGTATGAAATAANGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGC "9C3"86B&5%)'/.+#FC#BA1F#E$BC?&H6465B$D0*>E3"4HGA1:448G=%2:<(555<9D"-)'6:;?!5G3G'A4>;).GFC>+,021H'?09''%7<2.%D)5?GB;.@*B+!3>37F&DC<@3<;72B:816<+0G:("EF.EC%#&(?2@56&*=;:D//,F/C*EG(8(G"E>;CA/;)@>F@E"B<>D"$0>C8#%;,+"*!0F#7(1#$>5@5!63D'!+<:@+($9HD17"&+=7-+=0)?3&"56!>;$*3F+*;$.;0(HD'2,=3+8571A';69$%0H8:50-881D"-F; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T88A1A22G59T105A48C22C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2257 77 * 0 0 * * 0 0 TCNNGAAGCAGCCGCGCTGGCTGAACTGATACCGGGGTTG #!""!**+*"+*%)$!""+#*$$**"&")%$++"&$#*"" YT:Z:UP jpayne@0: r2257 141 * 0 0 * * 0 0 AACGGATGTAGTCGCTGCCCATCGCATTCATGATGGCCCGCTGAAAGGGCAGTGTTTCCCAGCGCCCTTCCTGGTATGCGGATTCTTTCGGGAGATAGTAAATTTAGCATCCGCCCATTCAACGGCGGTCTGTGGCTCCGGCCTGAACAGTGAGCGAAGCCCGGCGCGGATAAAATGCCGCAGCCTGTT !/5!'AD95>;.B11F%$H@+CD47E5G+8*6C,CD4;;!2)3%=8;-,.?(*GA)0"698H53H'9?&>A"G)B-*/7H*8A6(C//41;5$&G2+-A&#G@3G#"-B'2@B3)>@H0H4)(7HA@8'BG74GG).*8$"22%-6(*2-&@-)'*6./)#8(6&$<;5A0- YT:Z:UP jpayne@0: r2258 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12968 42 129M = 12857 -240 TAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGN 4H$%C:>"CH5/7H$C%739%6B.8!3+((7!8@:/'>H$7;A!%B;:5$/(2H>*C"$()&&%".=:?,C.)CD+==CF;366@5-+C69.9'/A3?F3F"@+$8?A# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128G0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2258 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12857 42 16M2D93M = 12968 240 CCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACAGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGAT '.$"77!'$@(ADHF#+B<&28<&/$19@)3?DD#F@G<+G=GA"1@@AH,;;'3-CGC?02#@">A?"*-5,G:8GCBE7HA)-"954:!HBB??**:*A* AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:16^TA26C57T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2259 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42986 42 132M = 43170 228 GGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATCCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGGAGTAGCACGCAGACTG /0%851?>G87.5+)?;E?3/$03BH03-C,*!*B%E7EC))/@,"%$.GE9(F+)41.*>@88=8$',@!=8F$<*41C.&5F(1&9/:DA,4B00:),FH%(*B,2C1D6B%-B:DG+*<'006##9@?7 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86G28A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2259 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43170 42 44M = 42986 -228 TGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGG (B$68:=>3@;%+88(0.AD7G)E./,=)H26A69%1E?#$B;C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2260 77 * 0 0 * * 0 0 GGNACAACCCATAACCCTGAAAGATTCTGCAATGCGCTTTGGGCAAAC '+$%(*""**&(*'&'+*%((!*"$#&%%"+"%+$*%&%'$*#!*$!! YT:Z:UP jpayne@0: r2260 141 * 0 0 * * 0 0 GTGTGGTTTAATTTGATGCCCTTTTTCAGGGCTGGAATGTGTAAGAGCGGGGTTGC .="64?F#/?=%61,8&3E/@D$G0$4-3E(13031AE%A%G304D,H/E;9-+A@ YT:Z:UP jpayne@0: r2261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12433 42 61M = 12244 -250 CAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTGTGTCNCNGGT (*%!")!*!!+"'&$#"*&'%&!!!+'#"()$&&##&++)&##$'*(#+$##)%*!#$("( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50A4G1A3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12244 42 45M = 12433 250 AGCAACGGGCAAAANGGGCCGCCATTNATGGGAAAAGCCGGGGGC 00=*&A6>.G$$#)<4F+%;18%9EEBC&)74H;)&$:2BBG6=' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C11G3C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2262 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16912 42 194M = 16790 -316 GGGCTTCGCCATATACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGCCGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGA )0%),@H4+$!+%0;B.&%<6./AC.*G/,45+)7?/;*$B@?GGHD,9@:(<,>")>A1?F1E*!-C%C9'4>*@6)G4%.&06276B=G%H-22+3*'((0AF(>?,%,7@>)7>%2B21A()-?>E1@;C13"?@5:3#=HA23?C(7('!.D2CF/#H?A4>2(7)6',C7EE$(F=@7"CB:'='G+>8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G89A91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2262 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16790 42 69M = 16912 316 ATGNTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTNCCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGA *)5G'$76>!#732%,'+5@F".&D71/:=@H2!3D&A4E<56&H667/A(%5-($32<5$GG%?91>" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T25A39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29502 40 91M = 29667 238 AAACNTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACC @:#H661.(C>=1GD0B:FD?4,"6-)2'-81<@/43CH-AAF5#6GD-/A*H==(E7!!9;%""4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C86 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29667 40 61M3D9M = 29502 -238 TTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATAAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAAC %4369G+:);9C8%D6:(C4#562%4E*:<6=B+3#!B'$@@.0?7D;"D9?@%,%(5(&?&=#4/;:+B AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:32C28^ATA9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2264 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38957 24 87M = 36755 -2289 TAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAA F#?3E84"836%8&HGH4)+="?;H8B!D@<'3BG=H@;(3!FD/4!G'-FD#G2>*'G?%63&/E5)'$C!%2)E!F3HD;(A'G* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-30 YT:Z:DP jpayne@0: r2264 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36755 24 23M7D32M = 38957 2289 GATTAAAAAGTCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGG 7DA0!,8'*5);B/BC*9;=/8%1)*!/1A3)&(C8-(:?4A&:26$90(E==;" AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:9A13^ATGTGGT32 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r2265 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16605 40 83M = 16815 260 GACGTGGACCTATAACTGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACC G=?,"2:)>.:?!6%>:5-=D8745)4'&H4@:#7')(G(5@'&19H3$=DA2E3,&A46:(+.G1?(,F-'<@*,$'DD;($ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C32C33 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2265 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16815 40 50M = 16605 -260 CTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGNACTG *:>@&',F>%?D/E>?94,4;-+(2:,&#H).%%7F*$!%4DA1$@((()==4419@(=$40E359,<%;!*DE?5*:&-;,!9D40FF/!:>3?H60D0*448F%?1:4'>#!6#B6$,'1%43@+/:+AH(1CF?2H@8<5.14F5D7/77$>&7=$.<$77"B>@168=43E#!6$8,,>..3E(3;21;6C=3@,=6)'>7G79B*!:#(=- AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:3G75G78C11A35G10C21 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2267 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5589 42 252M = 5332 -509 CCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGNCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTCGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGTCCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAG A-146?!"DE1FE;7=&??+161.'AFF970D"$3*F$=#A(#1A$68:0@B51;E66G,-45FF**:&*5;4')13H=2G5<%!;("/6*?%5&)1B%>5*4$+&0-1<)B%3A;BC/;EFA24>D0,#:*89!5H!C+$<9+<**&$/;D*+">E2%D*94*=H(/>,.E+E8'H$*C.#2+(81:/F*EF AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:83G45T77A3G40 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2267 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5332 42 257M = 5589 509 AGGAGGGCGAATGACCAAAAAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGTCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGNGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACCGGAACGCGTGCTGGCAGAAANCCCCGGTATGACCGTGAAAACGG ,:)&'3*HG?6*/?1,!9:$=,-F!"##3;7/(==%@*97,=,"2&.%E!71)'F$G>.+:F6?-46@E7F5G?3G5F@(DDFE3EC/'EG0C&9E?4*0*7=3;7F"@=1#8@FB*3%E.*47-*G&"BB880'+G$$.2E'C%,BA>D,'G)6&C26<3>)E44E4?$+B/?&==#"('!6,()+=(!?!430)*7&%HA.+DFD;3*94D73*.)95H.!/+!1?03;9)>#6"#B"HD4D)F!G?B!C75184:FE.)7A%H$-9!B%-><1"G;4="3:>E5#$@5A<0#%)%5:-8;0.1C@"3A*0++C?D*CDAF:&CED)%A72/?8'75?'A8E0:$:<0*B09,E"-=9'*%+78)DC@(5@8,(8F'G2 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:17G77C60T5T138 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8074 42 81M = 8155 382 CTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCA GG#@),/E9B:HADD6:83/E;9%A%=10<&16-H!3C/.5&/),**&6E?20=82*?@H8%>&"+A-+7(EF3%8#@H)! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2269 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31610 42 246M = 31610 0 ATGAAATCCCGGGAGGTAANCGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAAAGCAGGCGGTACGCATACTTTGGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCGCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGG +0!'/@"B!(!;F7#$4//<(H':D/#9<$#;:"8FGHE&96E39?GH7.?BH8F=55D:HF*H;.F9>HG9+>'=:28?8&E7A-2HA@@+@(65**1;@F&70+14>2F=0*HDB$>3#E?';!AFD;4446A'%@,#8!0A$$0*/CG5@"E5C#18/E?5G5-(230)'<;8;2)/B0F4)GB-6?4<%%:>GF.=:3:H+G@#B$?38H,E8%5;08C1G/"B+9!AF33*!0@H53%8H@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19A49G21C87C66 YT:Z:UP jpayne@0: r2269 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31610 0 * = 31610 0 NNNANGNNTAAGAGNNGNCCTNANNNCGNNNTNATAANAACAANACGNNNNNNNNTANNNANGANCANGANATNAAGGNNTTGNNANNAAAAGGNCANNCNN #"#!!!$!$$!$!"$"$""!$!#"$!#"""$$$#!$#"""$#!$"$####$!!!$$$##$#"#$!$"!#$!$!$"!"####"$#!$!"!$"!##"##$!##$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2270 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43659 42 88M = 43659 0 GAANACGAGAGTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCNGGCACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAG )''#++%#&""(%'+('*')%*!%"!**+$++)&)('#"'%")+")$)"#"&!%+!#'#("&&(+!($+#+)%*)')*)%*"(*)#*& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T5T0T31T2A42 YT:Z:UP jpayne@0: r2270 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43659 0 * = 43659 0 ATTGCGNCNNTNATCCCNGGNTNNGANNNNNNNNCAGCAGCCGAGNNNNTTGNATNTNCGNGAGTNTANGGNNNTTTTNGCGNGTNNNNTCTNGNNNCGNNCTCTANCAGCNAGNNNNNNANNNATNGAAATTANNNTATGNTCNNNTTANTCAGTNCGNTGCGNNGNNANNNGTCGCAANNGNGCTNGCGAACTNNTNGNNTTCCTNCGGTNTCGANNGNCNANAGGNGAACCCGCNNGCNCNNGNNANTN $#!$"#$"!"##$""!$$$##!"!#$!"$$$"""#"#"""#"#"#!"!!!$$""!#$!$#!!#!$$!"!#$!#$#$#$#$"$"$#"$$!#!$#!#$#$!"!"!$$$"#"!#"$!#"""!#!####$"###"$"$!##$$#$#$"#""$#"!$"$#"#$"!#"$$!!#"!$"#!#$#!!$$!!!$#"#"##!##$##!!"$"$"#$#$""$#$!$"$#""#!#!$##$!##!$""!#""#$$$"!#$""$!#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2271 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16895 42 151M = 16895 0 TCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCACGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGNCGCTCGACCGTGAAATCACGGTNTC *"&"$!)&#*("$+)#+#)'!"!"))#*%+*#!"+#+)%%!&)%#)+$(#!#&%"))$*#!'&!)(&(%*&(&(!'&')*!'!!$'+*%$'#(#$*!$'*+)'(!(%#$**+'&+*"&*)$$+*(!(###!$)++&#"%*'#+*+'&(%)% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28T96A20C1G0C1 YT:Z:UP jpayne@0: r2271 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16895 0 * = 16895 0 ATNGCGGGGNANGGTCNNNGNNTTANNAATANGGANNCNTNNTNCTGAAGCG !$$$"#!$"$""!#$#""#!"#""$##"$!"#$"$#"$$"##!!$$#!#$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26970 42 84M = 26732 -322 ACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTAT =@+?,%:7+F5H'2+17(6;2',A##!EE+A-"@C88A50)":%5AF(9,@8C>$((.CA)%=#6<,&&))"8$,F@?6+29E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2272 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26732 42 129M = 26970 322 ATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGA 2<:<*D,GH0E>1&-":;<+691"&$AF/6/)-:?637H#''/B&<6!"#@@H-#7"=1$77>4?/;>8(&BE87(2A//61F4@;0'8$8==,?=C074@!!&?E8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2274 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23356 42 143M = 23255 -244 ATTGGNATGTNTANTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGTCCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGT *C.*-76=(,67&.+3A71F>$,>3B++/DCA.05EGD2#!H7:&;=A9!?;2(A99#;+#8?'.3$$8)2*7>;2B9E(GCE46C./+).>,,96G@B.E@(D>'*D28!%&E+?56-=9/+;E>C<466/9#EB.<$C-D8*50,@A/$G6-$/H%"6B<",*5=H.4"EB!C5@B?"/-"F/8G'!4F3< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61G19T9A18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2275 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36881 42 59M = 37086 315 AATATCTTCANGTNAAGCATTNGAGCGATTTATCTTCAGAACCAGACTCTTGTCATTTG %&$'('())*!!&'$'&)&&"$+)*'$""(+)"(%+"*)*%*!()+%*##(%%!&(($* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:10A0C1G4T2A15T21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41811 42 131M = 41685 -257 CGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCCGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGN 002-%/G-2,,9<.,F1?$+@#%%-:H914#D5C+@.1@)A%$<>$8)%D87)3).#:'-GF-D%#@),GF5#:>$9'!=;*5!##'#=E#A!60/';+6"/<) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20C23A8C5C4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2277 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31895 42 185M1I24M = 32104 266 CGGGGTNTTGCTATCACGTTGTGAACNTCTGAAGCGNTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGNTAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGATTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCT #+%%""%+'#'#$&"%+()&!*#%+*"#$($#!'!%!##*$%+#'!$)++#%$!#$%%)$(%'#!&!$)+!(%)"%+##'!#&$(#"(+"%+(#"("*+)("$()'$)#&#(($)*+)''*&)*%$'$&&*+*"*+'*$*$())+!"(%)#''!%+#%&!)%*&'%%%&&)"#)'%)!)'('$"&#*$"$&"$&%"%"##+$#+&!!#$& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:6T19T9G80A38C34T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2277 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32104 42 57M = 31895 -266 GACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCA B<&:10B&7=8((#5"%5()<@?;DB3718%846#C%#::)73>')9D#$)4/$C%; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39660 42 133M = 39865 253 TACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGANATCCGTCGCCAGTGGG .907&<&*-5G-192H-"AGC46A$-E=%%#&D1$D7@+@.7?6:,?;8+D>H;,&)8;HF6D@"(";!66>*A)'-G&4*%B=#;C!1+;)"B@4EH8':2E(4?E,F59F:E%'1$;8=5&9< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39865 42 48M = 39660 -253 AGAATCGACCATTTCTGCCATCACCTGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCC H8&54"C57,4=A/:1(38'(&3<<)!=$?&4&EA&")#%42;(#!94 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2279 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38371 40 60M = 38238 -193 AAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCT 49@4)94)&!'6,;%@A(6!G2%/1,C$49>?'>6>?=+&(G((;<BBA>5*FG-(?D,;5'6;0599:..54!7"@'&9>:37-.*B*3E;;"!.AF&6A!*G4/=()1.:9E6%9=%17@ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:32T27C19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2280 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6101 42 108M = 5961 -248 GCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACNACCGCCCAACTGCTGGNGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCG !5(%:>.B?>/95*8<>6<9%,#B":;-;/G:65C;& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A16C42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2280 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5961 42 140M = 6101 248 GGCTGACGNTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCANCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAG )62%#"%?,C)D;=56"-E+452%%/>,+6A;HE0&612%B$7$"%.>4H&()B27G!D;"+3+9D3=)2+"8$;A3,=B2BA5255<9>70H2&/F%+6>/$'-.F!?A"+A&D>&'=8G:%FGE7;F&EHE.(=H",& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C7T54G76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2281 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2427 42 47M = 2538 204 AGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACT 1=82D)1?$,.34! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2281 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2538 42 93M = 2427 -204 AGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGAT 3#FA!3&7B0F$+#<).$<2;#.'7A$52D"A,07(25'@69B)("?C43B(7>0!4?'AD!)@.(2&;.$B5.$G#9%9A;:*/CE$<,D:5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45221 42 48M = 45269 365 CATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGC @8%70"C59;=??9",9A.:!,>3?(&&@C$?,D@H5!BC24&082#' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45269 42 317M = 45221 -365 AATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCAT H16*.".'F!!-G24+,??2F8,3<;!+FE*?C955:($+<=95EF-F$7:."44&<18"=-=60EF1-.(';-9%$<"(9%6C4+5A'#3#$#B*1)A8>C"6:6<:5818,@!$=B-4">,#F!6'1=EH-!;&&8#4)=-5A8H/1AG+,&G5=*-;!$:<2=7H()/,':?-F4=C7'D>.F+D7?E/82('5E"-9)G,F9!:G>49869-=#/-(#B)E&>):/%59G&.9C).*9.3/A/-D4B?>'9E(6:G?FB0()2E5*1$..:>8?.*E;?1"B,F)7#DF*5HC1?19 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:317 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2283 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48284 42 45M = 38831 -9498 GTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGC ''+%+$&!*#*(+##$$"+'$!&)!'%)&$%+)))'&+'"))+$# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r2283 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38831 42 53M = 48284 9498 AGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCCGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCA 2<2,@">/H(@2>)9G16/@A:H/D25%@46&FD>"7ED((,6+'C7%*@18* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T28 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r2284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9765 42 68M = 9879 258 TNACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTNGCCCNGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTC !!&=/2+.%99>6$$B;,31B$:E*=-?C"@+8E:)H?H-+3>?-'H#2.5G.B4,DD$!#3?)$3>* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0A30C4T30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9879 42 144M = 9765 -258 GCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATNGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTG 6>:;6$&2;-G3F+D//8>H2@!+8=&?7:(*:40:*7;4G%7CC%=5(01>!:@6,C,4B&47&9"C=D/CE0>1"E$.D,26=?2G;@6<4'@9>GCE)B9"8#4.%-D@-B'181"CF$=808< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83T60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2285 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6480 42 122M = 6309 -293 ATGCGTGACAAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGTTGCAGGCAGTTTCTGCCNTGCTTAAGGGCAAATNCACCATGACCGGTGAAGCCTTCGANCCGGTTGAGGTGGCTNGGNGCCN #+$!!"!#)+!!!*%%+*)+*(&+)"&#+((%&$($)!&#$!%$!)*(%))*'!$#)!%)!"'!#*+''+")%$)"($!##!!$"&))'('#+'&&#()#')*'*##&$#+)+#)$*!#)(" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:9G29A17G15A24T13A1A0T1G3G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2285 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6309 42 100M = 6480 293 TCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTC B;B4&;E-86CC.8ACB3B:F,4A2&(0G-98E;=;:6")!D-:!@4=;!B,7@@8><+A@=G//@;A&!!':F(;D8#1$=+$2C04)9BC)F.$&"C78EA'B)E)*+$:B/;F6+*#BEBF'+64D&5=(9&H:H68#*@/6".!1*HC+63&GED80,;1/D1E-5?2)#%4.,(97,250.4;4,07#577$>D8-1%:!*;&%3&:H#,F2!%D8AF=D+E6%!51$H!'CC.*0H!E7(,HA24%G>%$"D26%5#;.B-C$EB/H#!H4%!@?1$AHEHA%2=@-/& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:14G36T94C7G22A154G13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7736 42 57M = 7390 -403 TTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCT F'06&809?"1*326/F4$<9@F/38%16A"&&=+=.F9A5D11EE=<6EH2#'887 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2287 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30289 42 59M = 30406 210 ATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTNCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCAT %*)%#%*#+*')&(%&(#("(!#!&*+$+%&(*$"&)$")$!#(#(('&*%*)*&)*#' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2287 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30406 42 93M = 30289 -210 TCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCNGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTGCGTTCATCTATCNGATCGC "(+87?96!DH7/&?DD90B44$*0$%5+4-:@F?/>:)*(4@6$;4%*'".''@4GB0='=+A34DC5&%,"8BF5-A,$7EB2@:EE<26, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T43T12G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2288 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5876 42 51M = 5667 -260 AGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGC 7/6$2@<$2GH96!"0<>!(&/H@/!&:F3"7007EEC$$;=('*35*-926/3=173(2D/:!:D:*4DE?./B:>'2?6+'??,9BH;,!"!,"BF,2!6-6#@-F;/7,A?0$$0-( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2289 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2095 42 48M = 2165 182 TCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCTCACCATTGTGTATGAACTCT +?/!(!7?$5-#12+)DBC;#2F/8A!DFA';$/6H;.%=,E+0$637 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C0G16G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2289 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2165 42 112M = 2095 -182 GGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGTAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAA E($EGD"$/>/!-5$C2?>=-;&B9H6EE+=99@D2)F#A17,9/"23+C51#-9A+.0;9+F)F>G$#C408'=#(5/"/5E#/D->E#,%2:FE+%:-8%6G:C1!A26< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G79 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2290 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11034 42 103M = 10830 -307 GATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAACGCGGGGGTAAGCGGTG 52+78253/'(%7:0;)?+A$(H?:,.CG3>F"/=<%A(9.-D0"<%7>?C1278;1@79(-"@F%B#!E@&6G/-GGF@A+2C@)B3HEG23$?9727:@AADB-5FA<&2(>).33(5<(%)%)1+-F7D=@6B-/10C)D%CB*637&,A'E3D**EC) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G19C23C76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2291 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27244 42 95M = 27450 316 CTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATNGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCNCAT :)1@?#*.D(EE4A-=/+;B*67(H'>*$39,%A:5!.&B+BE,%(H)%1%6*#2!H79.8%:C$4D>H-9'%*-FC%C8<05A(#3-H.'!6B, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A54T3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2291 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27450 42 110M = 27244 -316 GTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGNTTTGCACTGGAGTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGCGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACN $))&!+*!'#"%'""%'!#!)#)"*'%&!*$'$$*$#&#&(+((!)()$%'')+$$)+%**&"$(((*#)!#%&$+!$+'+)#$(&$!*'!$$&&'%%!&$"'+$)"+*& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32C11T23A40A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2292 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26825 40 223M = 26593 -455 TCGCATTTTTCANNATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACATAGGATCTCTCTTTTAAGTTNCA &''#(*++(+#*!)"**$%+"'&#")"!$('!+)"#!%!"&&'&+)"%%(""$$&&('#!'*)#!(('+"*&&#"'%%$!*(""%"+##$&&#"++"()%()+$(%'$(%&$"+++'*$)&!+#*'+'(#"%"!+#*'&"*"!!+&"!%"&()+))+$)*$*%+'$'%#'#%)$"*)&#()#%(!(%&'+(&&((%##(#+&&%&$!#+'+++*+"&'+#!)" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12C0C186C19A1T0 YS:i:-60 YT:Z:CP jpayne@0: r2292 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26593 40 94M13I138M = 26825 455 GCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTCAATAGCTTTAAGAANGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTNAATGCTTTCACCTANGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATNTNTTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTNGACCTACAAAACCCATTTTAACATTTCCGATA D<0-BH>FA960B/+<#)4A3(2(-'0=$E"2#')B-2?05-@#7<.=(.F0H?"/2?*3?'CH=33EE%:-!=;E-1$<(7:,/G=32CD$@2*;1704:9':@,)9E*>D+85%,B?>7#"GE;3#D71B>EA,#&AD4,-#+7,&B+!)H6!5G3E+B:6$9<+"9@G6FGG$<*FF5&33%A8?8%%!0"/H7G9(96,*2E;19F1C8%"*@68+EG9F*:H/>DF->CED1:<# AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:21 MD:Z:50G14G47C14A38C1A29T13A18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2293 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4945 42 225M = 4835 -335 CCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTAGGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCNGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCTTCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTC C8@G/2*.;=0BHC),"?/5D1<9-D75<)$FF1(@#+,>98+!6@574FC.:A5$3%<85G-B/6:+-!CEE($704@.#:?/:$5(%5>)"2.)H-9$H;<%9?%E:,>197F',6G-,"@G9@C0&!,$<764<:07+%%<62*?0=7%'C+G:0,!C%4'*-2E.B2D4><>A49@-,$'F$:!-;GD=(,;#;=9<.1*<5-/))2F=1-+?/D#43#+1,(H)H4*B.#G8?<9".!A<.8*3:07&1DFA283.#')//%BCFD(''A*4.=!B397C:.!B7;!+3*9,#:@>%%;6#2*$,<%H!<*AF+G12%@%CH&2E>"=*26;7:!(1B3H.)C@->0G$764A/>@5"=FA@C44D%D9>=2D'D<08+)$&$<*F-?C0G7%#C:#>5"#6*8?(C',C#?*$#=G+(-0/-8(8E%5=)<$0"$?9F>332&19:)>>*!=8+#%,AG;12++:847$<21@;/;9*G%;)E9%83*$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87T8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2297 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16734 42 73M = 16471 -336 GGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGATGATGGAN )))"+&(&+#+$%*"&!%#&#*("'!'++%'&%!!$&!)$#+$$%+&!&($&'&)!'!$)*+**'*(%)()%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65A6T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46345 42 71M = 46183 -233 ATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTNGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAG #?CC7C#3-!/H8-E$B91727$8++<:/@@3B#.0*+FE/+25-)-%#*8=4%*99C'2>7>(:0.H(7- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G27 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2298 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46183 42 101M = 46345 233 CTGNTTCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCGGGTNGCCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTNTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACC %*)%$+&$$+*!+#*&(%!%#)$#)$"(%#*#"!+!$"(&)+)!)%$((&"%&*+(%*#'+&#+$#*+**%("#$#**$!'!*)")%(+)#&#(##!&(## AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3A1G40T3C1T1G23G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2299 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29786 42 112M = 29548 -350 CGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGAGGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTC <9;'5'#>&<+B>$=&"!"&4H$FA7+E/:DGE3?>:B2=&:,/G96(H<>53!$9E!@5&;)0H>,"+66%C==C/>"+,4;(/+0%-4AD0&1C,)9A$>3:5/9(B:6E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75T29G6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29548 42 82M = 29786 350 ATNTANCTNTANNCCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACNCCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGC "#!)%%$$!#'(#+%++++#($"#!!)")$"(+($'*+&!#'&++$)%)'!+%&#)%#'+''!**&(#((&$('$%%+#%&! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2C2C0A1A0A1C0A29A39 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18719 42 56M = 18866 239 CGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGAAATGCCAGCGGGNCGG >96-7E.20"5,=6(%-<>&&3-(0$H%#F4$&-BDGB0A4G$1,4"36><:F&A( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C11T3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18866 42 92M = 18719 -239 TGATTANGAAACAGCCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTNTTATAAAACAGTGAGAG H=$/37+A24%A2%@E(92!<;,#/@<>-/(AA*!1$2)EG15H3)6H?52"$"9/%8=5/1(*@B:+,DA;;!5'6';B?+-'<@&H#-4C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A7G59A17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2301 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 735 42 86M2I198M = 1019 571 AACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATNCGCATACCAGGAAGGGCGCCGGGAAANACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGAGTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTAT 0AE'1DHD.!1:.B%#+:2-0+/A&?('01.=64=/,!A%.*5@7@76&/>G.$G3288E)!:6D%9+@7%7/<+@",*"<$2H0&8+%A9E?3G@="7*=&@B#0(;>:2FH;'>*82<0+&%4!#(5B41'7?;?BHH:,351BF#(+6CG2A1'5@D,625@-D+201'=/G!78(31-,74HC-,'@?=!6F+#>)?DF;BA7&3@%&G8'"D=E2BH"8)?5.+(G&=5@!@@"+('EF#);&3:F:G=!+<#(!1.7)+B73C$G+10$1H?C+2"-E(:G>97E4849&7F$/#)0(?=">@H+#-89(>;?%6@<0)G9'(%'?70=&.0C8%9'3%C.DG+3"=>6-G>"AD31&CC9@=HF(?F@)>:,'H18>3:9C@'DE-,/?7,A(;9H;(HD6%9!=?;107-$8$F.783-)- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:44A15T126A36A17A44 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2302 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5857 42 150M = 6021 244 GCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGNTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTAACCAGACTAGCACCACGCTGATGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCT &&+#'&!*)%(#"%+!!%#'"+)&$!*&##%+!(&$%+%!*$')+$)!%")$%$*+!*$(+*#+#*%))%#%$!(*$())$!++"$)))!'#%*"*'%+""!#("(&*$%&#"+&%*%)&'"+&+*(*"(*(&*&+'%+%")#($$#""& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:65T22G7C13C39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2302 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6021 42 80M = 5857 -244 CCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAANCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAG ()EH!-*"%#1?:>!+&791C6:,9,2*'%*"G'>7)B!/,1?A2DB%)C<,(:;C?B>"??).7(6H+?6-!G:&7.F. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2451 42 72M = 2262 -261 AAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCAC F)%$87CD&GF86<740+$HF!$3?**0!?;(:D3E'!/<(B2<(@!%1::BF!G5&0+.-G%:$>>63F'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2262 42 43M = 2451 261 ACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGA D;<90:="!DA"%)H(6FF$8;'2H9<>",D(93F(/"G?G-H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2304 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37774 42 70M = 37637 -207 NTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGG 0<,;66E/.+489(EH"F"8.3/()9#63+7?AB@7A;@%8-5C"=?8E4-C$<-5@D#>1G-H.C;,GFDG9&@0)"&7-F"%#=;*G7>B*'8*4!&%G+?3/'-??9%4>!?D)BC@&8.1>+B<29*0-($)&G#)D-73<1%.>9:7B#E%/%/)-<)C$F?C774=3&;=CA:2B%C6%G=D$.@:&8GG+77E<%A%#>''BE2>;5H)5,F2<69@D!5A0+7G:!"'/<#:=:&E4$C63;H8/-&6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:90^C17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2306 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36418 42 42M = 36619 335 GATAATGNTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCC -/8D4=$)G<2H)$?/CFE524"=+-F@&1=7H(&!)'?2!: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2306 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36619 42 134M = 36418 -335 ATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATNAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTC ,G8!$H-&+&C4>H"#$8;G;"=B%/./6?A0+6;.%,H$(&39G.*+7.-17&G+A,$031B,4<1H6(E<:4HG68AB+(*);G)=@++72 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85C48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45800 42 84M2I68M4D45M = 46001 352 GCNCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTNGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGNACGGTCAGATNGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGT )+$!)%!$*"%&&+)&&())(''%#*"+%!"##'"&(+#$*!++!%$*!(!$"$**&+'&%#+!')%*(""(+$'(*)"+%"'*#+"'!+&(%(&!&#!#)$'*+'#"+'''++$&$(+)*#+*+(!%$'&(&($)"!))#+*+)&'+#+$)&(&)!$'*+'*&()+%*)#&!!%(#'""(!(*'!&'"$!&""+***+ AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:2G94C47A6^AGAG4T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2307 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46001 42 151M = 45800 -352 TATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCT @$,$,5C))C>96=4(!"!F$(;9",;7?HF!74#+,;1)E"0E'@-'E7$2**#>@01*,G=--.9'="@;&4C90&!F.F(A/!H?%E0+:04=.6G3#$.FB=&<0F$B:#8#;<$3)#3FA%F06@9=G@>&#?"FC;C-'0-#3(H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r2308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14379 42 227M = 14275 -331 GGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACNATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAG "6DG*AD!>'9,+@%6&B=D,8'<+H),29382&6'9%1;6;A30H:C!DE,81&48*H#8<'A)C214F'AG$;2!3C+7.:'8:()08-FG0*716:3":+A(AB?+25H6+D*(?50?93#90#=50#/#HA5)'H>G=9A+5D*+#,**B,85/5>,89?52>#3C;-+H'7.F+;6/7+>E:%132@8:!="%.H:-/7GC+8?H"?$&<8=83&8?%7/%# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G177 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2308 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14275 42 44M = 14379 331 TNTAGNNCCNNAAGGCCGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGA %'(#"*"'(!%)'&!*!#+!##*'&!($)!"$(%+$'"&!$$)" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1A1G0T0C0G2G0G3A1T27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2309 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47788 42 42M = 47830 229 AAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGA >G<>F)*00A1@:"&-7%H96G3+49'56=3C#$?C4=*#*7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2309 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47830 42 187M = 47788 -229 TGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGANCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGA /C:8&=?!8A=6C#5@+33$F=("*$G+80:732#@.8F/C9*?@0-H(=<-@'!;$;$CEE,C5?8>E356!4F+52<1!CH$.0>+,(7A*B)F?-.0(#:"?5##B,D&&C"H;9B%5H=-*205,6$0=:73254;FGB%!;&"9"2-H-,&;4?A7;"3")A==)F@'=)C?$"EG/%-/>, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G13G123 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2310 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41117 42 56M1D191M = 41056 -309 TCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGAGGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGNAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTGGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTAT :=55'2%<':AD<;585&2775-88A)2?A&;F9F#H6-'4"&?#A1&B#+6(>H-!HB:-H6ED"971C4"2A$)%G6B;3!%-$8(.:CF16H0*&A/7-3>*E!08C5!/5F94*2-5>*$5<5;#HE+,>!A<#1"$*#%B?7/9+402.(3?G2$"-65(E@;D64H;@BB4(9!A<8102=GD/D.*GEA5F?C3/*AG$4B';BE;!2%3+%&&C25'=6/HC< AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:50C5^T63A34T92 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2310 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41056 42 61M = 41117 309 AAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTANTTTNTCCGGTGGCAGGACG CG6=A#H<.B=E$$E'=A8;C22%7432347A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G3C15 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2311 77 * 0 0 * * 0 0 CCCTTAATTTTNTGGCGTCCACTGCATGTTCTGCCGCGTTCGCCAGGCNTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCCTGCGCTCAATACATTGAAGGCTGCTTTCA "F"0'0A4$!/+#9=/%BH76!8,44D"4'1E,*'B;2'%=H4;=7D(:(F'D.6=@H:D1>$7),(/@00$*E=10:(B##*@*!BG%91<>905EB/&@+ YT:Z:UP jpayne@0: r2311 141 * 0 0 * * 0 0 GCGCANANAANTTNGCTNGNTGGAAAGCAGCAAATCCCCTGTTGGTTGGGGTAAGCGCAAAACCAGTTAACCGCCCTATTCTCTCGCTGAATCGCAAACCGAAATCACGAGTAGAAAGCGCACTAAATCNG )&#$(!'!(&)!!#(!!!'%&&+(!(""(')+*!"%'&('')*(($&(%%()"()%%!*"$!$#+%+&'*%"()+')$$(!'%$")"$)&$&&!+"$(&$$)&%&(%(%(%$'$&%$(*)&%%)'"!)*"# YT:Z:UP jpayne@0: r2312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21169 42 167M = 21336 252 TGATATTCTGGCANAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTNATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAAC !>@.DC+-2>(77-/#1F#*E&>!-/@!D1+/4@.;*';%,?,>&9G7+!899-1<"F.-+G%07*0748%B59>?+*HA.:D:)@$H83F/B>=6A/41.?"A+D9F#&0B?G.&.F?H&&FFH1ECBD9>;96'";=+B7*,-<6E=0E297 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35578 42 192M = 35487 -283 CTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGNGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCANCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTGTCAATAAATACAATTG 0(?.5/G.&2(!@.'*7%-:!255!7C,:<747D?A(''9#G8,730>H*40.>HH9:0A./&>=,=;-,?,$E'?82.*1C,&3<-@=F68*<"8+%*90A-(#:<+:%,7*4E@8E#88F-)8>749#"<*.,*!65%>5);7E)&""H7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2314 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11169 42 77M = 11336 252 GCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGANAAGGTCGCTGAAGCCTNCGGGAAGCTGACCACAGACCCGAC -.D19+9+74&A%+/34)-(7("F')86<&?57:!%9.6)2H9H.%)74.'!4(2#A1#)8#:;-<3,4.7!D'>:: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35C16T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2315 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2095 42 61M = 2268 232 TCTGCTGGNATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGNAAAAACATGG H,6+/-1'*G49B731+)?'*G.)>H+,6,C3384>94/)D4??<=+B)!''40=B78;$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G19G21A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2315 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2268 42 59M = 2095 -232 ACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCT --H417H!F2-H-"".2>4-0F8-?H2A$G03673,B/-#9$#:. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32548 42 57M = 32358 -247 TCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTNTGC 0,B%/.-;B6:B9-!G=,03)(?;!2%'H5.,C3E!6ADE3!067*!H#(D27&$H( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32358 42 48M = 32548 247 TAACATCCGTTGGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATNTCTCTGCC %;5*36/D"4/A6&+$'##B"*;*8G07C>?/&6C/"54=3*?H!>2! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T27T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2317 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8889 42 137M1D95M = 8721 -401 ATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACNGCTGAGTCCTATGA 5E3@<0F%+GF"<./7$F*2.(+"/!>3%3DG%1#F;1G"#,>#/#(>4!))(G8&AG=6&".CC2!@6F;F?3BE=H*/C**ABFF5(HG7FF<,.3*;8/=72H&07H759H"980+=8*+'/(&9=AG)#)1!C"3C5!%8(2C$"=E%2D$%%@C:>2:)01*>$8)78./E@31"(6=%%=4:/:%F89C,5/2'7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:137^T80C14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2317 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8721 42 168M = 8889 401 NCTGGCAGGCGGAGNTGCATNTCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCCCTGNCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACG !+>+.G5D1B*>ADB'$-C0+7:(7.$@!*=%0$3.B<451.8@9D!3.$&6E8EGE!G'F0&1H.5D'3->16=5!;;10H9?(6$*A1H<2!D+1%B5+!@BGG8*.;F-.7$HG5G*<,?#7.)!@=60EGE)0#H$E)H6#/E'));%@+#&<>A&3%40@%2! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C13C5A91A3T51 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2318 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7930 42 46M = 8014 188 NNGGACGGACCGCCTGCNGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATG %!&$!*&$+&$!(+(#"!'"'#&(('!'"+#(!)$((&#$!*%#$% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0G2G2T9C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8014 42 104M = 7930 -188 TCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTNGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAG 2.7A8&1*9@='!)+&5.+BF@9')E0'DD-/('A4G+<-AGA-*-96=0'59BH+#FD*&.'>,++<%/D9+#/$=>&,4&38;!'$.=@<@34C6;>,:E('%>%D$G-5<8C6(C/@!01.)-(-(+?";H8G=3%4:BD&D.?BB..:>5%-'/-5A5D);%(E&=/<.3+-$(:?A=HA@=BB34B%F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86G29C3T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2320 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7897 42 101M = 8084 316 AATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTNACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGNTGTATGGCGATAAAAGGTCTTGAG 5($?GE76,9(.$51HA08C.49FE)">105"!#10$E'=8$9)G.;FHAC=-*@"447$#+*B).#F=??;&&1%50D'!&1>:?4%'1-C'9G!%0*B6:.G(*5$@EHB3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20A2T22C13G63G4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2321 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14875 42 60M = 14711 -224 AAAACNGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACANAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAA .D2233/A0"2>G<%/21%3-?5H26,F5,('=0G+G>,D<9H)5"0H!C<&2!<.?--G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G30C23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2321 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14711 42 164M = 14875 224 GACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTNAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACNGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTG 4/GH?3-)<9:@9'<2D,G4C4,C5$#65#7<-;'A&1!:)1&,$?76"6)%26"1,7FA;39G.>GB-#(%A1%482/3'642C$%?H<<"==%&--;F(>977C89H?F!D!E&7*B1HA7&3$"#F,4'*@<=D(C=#:1>@:56,G.HFB!;'#CGC;/( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G68C67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19428 42 157M = 19169 -416 GGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCANGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCGTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTG !5E2/7G$=-(1!B.E>D#*+HH2A<33E"829$&**#F7A367=1@$=?CEHF*0$,7F$9$AD7F(->B)94F&,A(9G>!5B5?31))(6%BD@=C)2%.)0!E=6?8&"G:0C!;08C85>H36,B='H"%.#%*G9=D@H5=BD7& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41G2G43T68 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2322 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19169 42 259M = 19428 416 AGTGTGGGGGNGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCNTGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGNTCAGGCAGTACAATGGATTACCGTAGGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCA :!+@0*>1)431'+963!*6!0:A2+#:)$./D#=*;DC1@D8%635CB9@&@*,G:,.?/$7/!G*1(2A6%9:&D%-&)).E'9!:@!04B)()5;+H,.8C+;?.CF,1:D1*CGECF>5B*H!?300@+&036;F=,#G44@AC6H6'<8D9E(.*92+GH(A-4.3H4?*;46'8-90@>"==0",)F%!1/5/$E!&=A0$"'!;5>A@B74.3H00@A,GD>>G&FA:F+*0GF AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8406 42 95M = 8215 -286 CGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGNGAACGTCTNCC )!*'D$6#,1#E,2005CHG%=@F+E;6.(644B/,$3C-%"E2>90F/(G=@A&;1F>4!=%-D$31A%&@>H2'B$,=A*%7=$B=?#4<$4' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83T8T2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8215 42 76M = 8406 286 TNCCCGTACTCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTNGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATC ,*0D?.0+'3:(?*,>&8C84A,H89;:*@H>@>7FD62@1:5FD6%*@*E+A$,4A4=/.%%'%.?EE!6+9><. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G6A22T44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2325 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47509 42 105M = 47325 -289 TTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGNTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTCAATNGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCT ;>A;'*2=2(76""D;&7BE3>/4$"5*A+C*(6-)H3*9<2A.!>=)?1622"(%7=EG::<0)E>>C):,+5.*9423?@D;,8BE:8$;B'&D"7G(3":%G AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T36T3A32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2325 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47325 42 107M = 47509 289 TTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTT %87>@=*G*3D/'D$,>E95-;7="%1;HA$1?B$6D@;@2//;*@??.09=-%BG)F-41H?=/'%&1+7.*0+(#10C49;6E9:B)#!;-.//0'3/83!'E(1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2326 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38003 40 241M5I68M = 37952 -360 GGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGNGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGAACTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGNCCGAANGATTTTTTCNACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATNCGGAANAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAANAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTNTTACACATTCNAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACANCTGNNGNGTATNCA $!#()*#+%$+&'%"!'!#+%(!%'#!"'*%!#'&(&''"$!#&%"'$+"!!&)'&$+'*'*%*"*%"$)(!!%"+(+)((%$%)$+%%)'!)(#"%"'+&'#'&#$+((+&*!"%)!+$)*$(!'+$%!+)+)($!'%&("&'+)"('()#("!&'&!('&+*#'#&+()(''*&&#"(*'#(#!)$"++*"'++&))%#%%%"*")&$()!+!'('+)!!"#%&&%'%$!'!)"&*%%)&!!"&*$!)!*&"*!%")#*#!+*!$*"*$#("'''+%'#&%#&+""')$$'*)*!&+#))*"*)$"('#$'$ AS:i:-49 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:26 MD:Z:0C0T0G1C26A71T43G5A8T0A27G5G25A26C10C32C2A0T0G1T4G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2326 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37952 40 53M = 38003 360 ATCACCGCAAGGGATAAATCTCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCT ,%@F32'6:$<42;1'.15/%99/,(%,B*=H1;51H/77$D0*C&&G>($73 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A33 YS:i:-49 YT:Z:CP jpayne@0: r2327 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13208 42 113M = 13208 0 CTGAATNCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCATTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAAAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGAC &/##=@3)1$A#:,1H?,%3H:&?'3-$<#/:DD6+>75)>=:$=H*=-8'?C503"F'%&,7?$?-B3G9%!(+>(1"4)(@(?33%H=F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G27T46G31 YT:Z:UP jpayne@0: r2327 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13208 0 * = 13208 0 AGGTGAACGGNNNACGCTCTNCNCNGCAANNTCNAACANGNNANNNATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAGAGGTG '&)*"%(&'"*#'&')("*#"%!$!#!(%"!%!'&(%)%!!")'##*+%'!)%##'*'(+!)'#$&'(*#*(#!**)" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2328 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8943 42 83M1D21M = 9082 241 TGTGAGGNNGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCNGTGAAAGGTGCCGCGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGCATCCGCTT #*)*)%%"!)#+'!$"+)#&"'&+($))$&$$!$$&$)!')%%$%'!&&')$$)%*$"%'%&"(""*!#++%")$$%!'%"!+)#!'%)'%)*"*+$)&*%++& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:7A0C29G13G30^T12A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2328 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9082 42 102M = 8943 -241 AAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTG @(436)H8:(EB.7<"A/04;7!G%?DG()7>0:*.A$,16F11%6F%8.$)E=45C8%*%.-&D/'#4G)><"FG6D!8H>E@=4<#3GD+31"D,G''74 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93A8 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2329 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20408 42 47M = 20172 -283 NTCATCAAGTGCCGTTCGTGCAGCTTCCTCNGCAACGGCGGCNNAAA *$+'$!##%&$"*'*!"!*&(%$)!")&#&#+)$#$*#'$%+$%()$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A13G15G11A0G3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2329 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20172 42 164M = 20408 283 GCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGACACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGC A2F($52?E>CG(#A'DDD?=EC>>A$48$066?F>H5)$(,B?,4,@6<>3AG-?4(BB#@?&+.?*)@4+B#3!BC37,9C:3&G6'EH@(FD+2C6=:7+F!,=%F(""!>93E<7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117T46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2330 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26686 42 348M = 27034 404 ACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACNTTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATNTAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTC @4*74#'@G9<6"3C"+.01FC/G>D:A@<=F8,:&F:<-21,,28>A22#"2H'5@(6B+!BB!-G%@>2;G1=)8,E"0A3H5C5E1CH=B$A&%8;++8/*/-#;DB-,A05!$75F5%)%#+&7/'.@D?AH7,)#587(,@*$0)1F302'F2<(=D,@3G-C)=9%A-'( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G180A106A59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27034 42 56M = 26686 -404 TCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGA =412?2@GE'H552G/C:HC2+>G$&F,39&)8A%*5%,H!'1F!)*2+CH3H)-.<;-,6G?0%F:EHDFH*!),5&07(85%'2*-'F-4&(=&8.A(2#*#),%)>5.%-1E"D6F23B61+!9@>@+(D=0F=F/9(C8EC/F+9D0?(0*"9'C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65G96A33 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2331 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2183 42 89M = 2272 285 GGCATCCGTCTACGGAAAGCCGTTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTNACCTTACCGAAATCGGTANGGATACCG 0"<5##7/41)?AE1G0.&)7.@-/=>&'(#*#<%"3!%@9$F/8*38.?;'="4+3&.E9!?D:3!F+.,=C!AC3.$*$BCDC($?@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G38T18C8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2332 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13870 42 107M3D26M = 14034 270 GCCTACTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAAT =(;GA<%CH*%<1A'"AH)73//G&'2C=2%BE28#FB2A&:A2;=851,=&9+#G9'5?#G6A.>*3F$40@A:>'<(8/1@:9E*((%.0!2@0!9-3$%HD$,/;%%!&&(6&2@=3B<&*:),53/%C# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:4C102^TTA26 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2332 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14034 42 106M = 13870 -270 GGATAAATGCNGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTATCGCAGTAAATCCCNTNANNC '#'&+*+'&+&&$'*(#"!)!+"$"#))+()%+!%)$)"+#)""(&!)'!##($++&+++(+&+*(%))*'''()'*#$+$+'!"!(%+))$$%+)!+*(&#(!$% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:10A73T14A1G1C0A1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2333 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43217 42 423M = 43640 496 GAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATACAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCA B0>2%E)7/3&/#65E&,<87#8C3+90*'3)'+&#*"#@',,97DC-F34>,&;#B"':43G0)-0(:E165,&=A(G<;(?7?>:=@'9")*9#-C*#D(&"8!9F,#0=8><><$D7-1(D/"#%0,'HCC+,(H('$A@=?:H(<$7(EA-!4FG@;G9B>'H9BA09#94"?>/8!CB%,#<+?G?B&&/G6H#(>,,25!G"?/((&1H.,$.2B8/0B5&*>B#7B9/B?*0BB1H7/9E#F5<5DB<%C?;>#5,3F721!HG1>?)-(G*D#4@F,?2HF9H&::G,60(;HH4!CAA(B*'$89?:F%,BC"1*%H="+4-?*DF@H'?(80;G-A+5!FAF$,@G0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:89T269A63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2333 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43640 42 73M = 43217 -496 CGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGNCAGTTGATCANCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAA %&;<905F-$'A4DB;>.=7D!C7,69H!002:9'3(8G%1H9.7@8;!99ACA6-;6$EG&6@76/#=28,7)H582D=92!9?;F*,:?F*-64;'@A2<2%,24E*+4,BC>/, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T104 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8632 42 72M = 8803 212 CCNCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGA 0D<*'33";3*G><<8?1=>+8"(E!H-G+?&)#!7,8+*3-5B!(%?01/$.=8'A"E60B900*4)F4;G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C69 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2335 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8803 42 41M = 8632 -212 GATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCAGCACTGTCAGNTT :E#%%)&22*@@89+E.0&2A%9BE/B8"@>64,'++*$'# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G10A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25570 42 176M = 25771 258 CTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGNACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGAAAGTCGC "6:1%)6;F'-*'<2#06BD0.>17#>H+8):9/&:4H3%7)'-8.:2';A.860!H1F,/B=8/A+)B#1FE'%3&H8&:CBBH0."-!"9A79!%9>&'>'9:89($&FD594'<++'E=7&-7&;:>1=E#!0G=/8/9>%)63$=@)6E%/:41!?5<83D-)DD-0?DB;E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47G120T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2336 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25771 42 57M = 25570 -258 CAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCC F@8$)>>96#.HG"==DC/4=:1"CE-EF51#D%D#4H.<=73/=8;/&5>C:B5%< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2337 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27930 42 81M = 28080 247 TAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCG 3B$@/AB7,F(EE1HG>&29=D:3@G@6,2HB"4),;%G(9%'=0-&9,>%.8F;..@.8G$3264G*>%FF8&F)00)'@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2337 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28080 42 97M = 27930 -247 CCGCCAAGAANCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTNTTGGGATGGCAATNTTTACGCCTG %B$!HE?3;.#,G!!864+>#:0#61D37B4E:D>;877*$0>+G0)0F:%/C3;-!+3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T61G13T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2338 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36171 42 54M = 36171 0 ATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAANGCGTACGATAACGTAAGGAATTATT DC@0+*&$>**->A?>10?8-<4H<2BB7@6"7,779+;6=$5&;:0?'.<8;< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T2T22 YT:Z:UP jpayne@0: r2338 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36171 0 * = 36171 0 TGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCC GD%G$)52(5:+E09;68C?@5E:-.B"4%%29H>?,>/89D:/=*,;F4-!DB("H4E83')46*7$:>9G((&;)79G=??24A!#3526566 YT:Z:UP jpayne@0: r2339 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12193 42 74M = 12267 356 ANCAGGAGCNCCTGAACGCGCNGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCC ,?$F1(E81D46E;F93:#/75B1#6!%F;=7@-B39AE$C@"">BC.@;0%%*)-6AB9%(!8=>--7+=6;! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T7G11T52 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2339 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12267 42 282M = 12193 -356 ATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCNCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGNCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGACGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGNGCAGCCACGGAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGGTG =G$D'H,*;92:H,-C8$DA69A9>,*<6=E27G:>0'A3(-=H@>A@C!0E"@H+'5@?%6/$?3*+@D&C"6A:?+60H?!!15*!1**?9(7:B$!G1D$6;72+><;)3)1->&05=-AD(0;1*!.$"'<*'$$%#%-4#4B+-,0"?34A"0E#'DB26F/6A;')*&=#2?-.98B+1;7?HE%#+<2B==6&H745):-C$4 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:61G107G27A35T9C35A2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2340 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12237 42 120M = 12429 305 NCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGGCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGNACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCG $+%%("*)$"('%&(&##$"&$)"#'(!)+##++''*)&+)&#"%%($*!&!*#*)+#((&)%!&($(!)&(+!')$#+$(*'$*#+$(''!"!"#%$'*+(++)*'%(#"%*$!!&+'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G43C25A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2340 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12429 42 113M = 12237 -305 ATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGANCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGC H+@+2$ACF465&DA0/94:D>1"@>4,9,BD=)EC##CAHD'*)A6G9"(@'./&?8*E/54?"??/2*"A!>(@#?+A.<*.#"8:@C$7+C%C=9=$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2341 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25965 42 68M = 26229 311 TTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTNCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTT ("+*)'"&)&%#"'&*+'%"'''!&#'#&#$)')$$%&##"!&'#!"$#"''*(''%!)$+")!$(!+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G38C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2342 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24041 42 90M = 24041 0 ACCATATANTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTNTCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGC .1E;HC-0772.B$2'5"HBD**9=0<.6>?&H*9,)$-#)2=+CA:;F;%/9885(E-12B&H/G&@%F/"&?9>$;#DD9+;G(>3.* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G37A43 YT:Z:UP jpayne@0: r2342 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24041 0 * = 24041 0 NCNTGNGNGAANNGAGNCNTNNNGCNGGTANTNNAACATNGNTTCNATNTNNNANCATANTANNNCNNNNCCAANTNCGNNNNACGNTNGNNTGTTTAATGCATGNNNNTANNNTGNNCANNNCAGNNNGANNNNTTCNNNNGAATTTANNNGAGNTNGNGCGGNGNAGTNCAAGTNNNANANNNTNTNNTNNNNTNTAGNNNTGNNTGNNNGNGNANTNNNNNNNNNCTNNNCCNCNNGATNAGCTNAGNNNNANANTNNNNCTCNTGNTNNGNAGCNTCNAAGNNGNTGAAATNTANTNGNTGGGAGCNAANNNACNANATAANTNNCGANGTNNNNCAGTCAGATTNNTCTNNNNANNCTNGNACGTCNATN ####$$#""$#!$!"#!!!#!"!##"!!$"""!"$"$#"$#""!#"!$!$$"!$!!#"$$$"#$$""$"##"$$##$#$#!!!!"#!#!!#!$$!##!!##$!"!"!!!#$#!$!#!#$!#$"$##!""!!!"#"$$$""!####$$#$""!$$$#""#!$#$!$"!!"!!#"!#$!!$$!$$#""$$!"$#$!$"#!!""!"!#!$!#$"#!#""$"$#!!###!!"!#""!#"$!!"$$""!#!#$"!###""##"#!#""!"""$$!!!!!#"$"#!#!!!#!!$$$#"!###!!!$!$!!$""$#"!"!""##$$"!$$$$"$"!"!#!!$#!"#$#!$$#!!#$!#"$$"#!"#$!$!$!""#!$!"!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10839 42 155M = 11027 255 NNNAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAA "$!6E8274DD9HF0BFF>.72:C>D86)A3#B#<"1#"42B+<#;+;#7=4(79BA?,G"+&08-.CB)/H;+&/B>998 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2344 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45428 42 253M = 45380 -301 CATCGGTACTCACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCGTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAANATGGTAGAAANCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTNAAATCAACAGG =HA.,"@D45@+=1.4(@4!(-'"?*7@#.>$B,$#50@#)GH2;4"<,9G,$;7-$1>&,;:7H=E>7+2DD?F#/5H3'&$7.DD,D$DD>-)!+)<3/HF2"DB*G@%.#!=EG,&E7%23>A26(E?B"@3:77H06",0@01EA>'*8#DB:7A-4:$)":7>.A#ED%0EGHG&1,12H60GF38A"C1?H/A/+*6;F7D)(.5#=7*9%ACD86HC0(6%3):,5!7F3A2/:<)34>A;0;8A6*;+25) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2345 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15153 42 65M = 15418 317 GGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCG +//D<$!<$@3$7(46C0%+F7B-BA%C:35?<*EB>%=C'B99B*H?'"A)7E=?'?<)(,A/H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2345 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15418 42 52M = 15153 -317 GGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAANCGC DE=C3@;1+)9;?/$$7,;(/:A=!,(58B;5G50=04?G8!G3AC0D!?77 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2346 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9491 42 162M = 9350 -303 CACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTANCCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGG G@7EE<.G7%-'G1C0.?H!5/C,)5B2B<$H1#++A<&2H5'=%7H5&26?,#%1,/H&=/$%3F"EE*8"05/2;%?>:;+3'49?B3%7(;(%0-'HE@+:81&F,/?6?>*2C0*31"AA1?8D"&E&;&2!"!B8<6H(67D03!20=@2F?C5H!9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A127 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r2346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9350 42 35M5D101M = 9491 303 GGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCTGAAGATCGNAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCAC BC-$H#9=AH>9;"9$@11:;@(C(#!!(B>>(2854!"E'0?<)"=+=013,94?@C4A8F5?AH3B,)D"#;,#-""3:)352<*&0?52:,.D42A3514.,>%@& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2348 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32723 42 206M = 32445 -484 GAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGTCAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTACCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTGCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAA 7/&D+>@C-'C-%$.%2E:"D?+2<-9/%AG3F#,3$97@(@D98939<>3"=/D9="#%EHBE$FB3% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26A31C98T48 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2348 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32445 42 278M = 32723 484 CCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCNATGCCATCAAACTGCTGGTTTGCATTGATGATGCGGGACCNGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGACATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAATTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAA 5@37A+<7!*9!G@0-8C%@0A?2&2C;=))1?9,7$";6&$=$A0,'4E)&=BC0##$HE@630=$,1,/5.7/+B9.#%2!%"/%"E68;23C196':?@;G#=)=3'%1@,E2.8H,-C;.GED3@==AFA%-GBD/>7H2;60<2D5(9&:.5$%D@'3558FA%B95-#H6$/-)D?15BBE6@=%010-.GF/G>$A!E"3G%32*1C?.5E.6?;(+635C<41,5C2 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:81C21T18A28C85C40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2349 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24355 23 52M = 24355 0 AAACGTANTACTANGTGCATGGCTATGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTG &*)&$($%$%$&(%)'')$*)#*!'''+&''("%")%%)%($&&+&+"+*!% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:6C0C1T2C0G7C1A0C27 YT:Z:UP jpayne@0: r2349 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24355 0 * = 24355 0 CNNNNNGATCAGGGNNTNNAGNCGANCTNTNTNTNNTAGTNCGCANNAAANNCNGANGATTTTNNTGNNNGCNGCNATNNCAANNNGNNAG #$#"!""$!#$"!!$#!"#!"!!#$#!!"$##""!###$#""#!!!!$!"#"###$"#$##"$#"$""""$#"!$##""$!$###!#!!"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2350 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46096 42 51M = 46199 160 TNNAGCTGGCGAACGCGGTAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATG '#$+'#+!(*$'"%'$&*#&(#+!"$'!+*#&"(&#%%"&!"+!)'*&!"$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0A15C32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2350 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46199 42 57M = 46096 -160 AAATGATGCTCTGCGTGATGANGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGC #G6*8"4BD#!'A/-'E.E;9"9A"1#5>15<4:2%1)A6,%B/=#.;4D-(0&-B/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T16G18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2351 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8432 42 107M = 8596 288 CCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATAAACTGAGGA B%>($@'%6#+5@:>#81.%&+!'9>!#B'@GD*'GFGA0C-&21&17.A=01$=?@"$?FD)B2%)+=,F7"8E01.1F=>4=),::=&,9D9==(8(?8($2:!C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2351 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8596 42 124M = 8432 -288 GAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATNGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTNCCGGCAGTTGCCGTTTAGCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCCAN (&1+A8#"-EE?B*%7.7;5'G)H8+#(53?/'*&5)A0AE02>"$=/'&B)'"!&?)!-$H"2&@>F@9)?=D&!24@H84E=695E@E76)0+()BG8?F5DB461 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31G31T17T39G1T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2352 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1179 42 97M = 1360 225 TGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAAC (G/".-A-C+!C80;#7@)=$DG!F4+&>$5&H4/6<3A95=F;:<16H5B5$E>!="C>;40-B">";,";,CB%-=937944529#E1*!G=4F& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2352 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1360 42 44M = 1179 -225 TGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCC A3(*CH'6-#5G4+$=>D%?F6+%=;-?-86=-.?)62-(HD"+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2353 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43429 42 153M = 43582 272 TCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAANCGTTAATCANTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAG G*,';$)-.45#?,A)FH29F-12EA?0E9-'#7:$.=@D#7=3(7>!8:C7B>1&!4CE>@;F;B6A+$+'<:4=<%.;'0A<(5B)F'0@$@HC$0&>2H9)67A14!8$$-C5#?*?%'<0',4A:)::#GF+(3:G*8A:H!#!(5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60A9C82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2353 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43582 42 119M = 43429 -272 ATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATC @E900.3'8/,'+FFH;$9&>%C*'8?8A)A3A<,E(86C@9E4/=$8;%F==2;!;1>F29&$,+F<5!2=&;;F>%.611%G%33;97/,,:5@6CH"&$3)!*2,222!/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2354 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 608 42 108M = 372 -344 TTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGCACTGATACCGGGGTTGCTGANTNAA '*("$(+&*&*!'#&!$'+!*'&+#+$%%!"$%*""%#$%+)))'&!&!!$%$%*(+*(')%#$"'!%$&%!***!)+(+$()&(!%#!(*#%#"*+##%+##))!'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:82A20G1G2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 372 42 236M = 608 344 AGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTANTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCAGCGT ?->@)C=(14@G8&3D(#$=D#B2'?G%;<*>+="#G0&')!*4BD&;H!*CF),H,"2";%$9DE.G0#@3:6>2@''3.0EG=>H8@-(!F=-7)3HA)#>4-0+*F&(0@(8E(B>6.F9@F=4H,;0'%-5$9EH6D1(;>-B18&0(CH%#E.;?$92EA0$@5#E?21 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G169T29G4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2355 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23312 42 95M = 23102 -305 CAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTNTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTG 'E0HA.45%A6#C+A"1/CG0%1>0&(7!=GH>H<.#9'>$G&D))*E@$3."F#8.1E+?/A)H;@DBB?4.-489#H$(;32(/9'93!3'D' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50T3T40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2355 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23102 42 54M = 23312 305 AACCGTCCTTTTAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACT -?%=@C)&#D"%F/#C<58H)FAA%F:;(-6B('7@6%.%'E7$5)7CEA&&@& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2356 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 199 42 111M = 199 0 CAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGNNNT !$"%+$(($&$%%!)%'$%%#!)%"%+$'("(&*#'"#%*('+*$&)!)))'%"$*""'#%+***!&''$%(#$$&"%&%'*+)&*'"+(*'*)$!+#&()$$*)++"+($ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:107T0G0C1 YT:Z:UP jpayne@0: r2356 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 199 0 * = 199 0 CATCCNGATATTAAACGGGCGCGGCGGCAGGTTACCCATCACCACCGAGGCCAGATACTGCGAGGTGGTTTTGCCCTTAATGGTGATGTCTTTTTCCGTCACCCAGCCACCGTTACGTTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCANAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCCTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGT 3FAB+(#9C:7!CD+.$@E7370D?"(5?A8D";E#GHG(EE,=@?)0&B8%4%40/H?H8>CF-0F3'8EB8"2=+=3&72+7:BB,%B:5#6$-:5C4*A1:17;+E'G=B0)0D446$.?F".$=02AF6HB?8!-.$7$3>(*@:*F!D!.5=3F6.:E/?-4"$=44>!?.B3:#4:?8B(/2%6/F&G2#@'/*<'/E770>F5-"*0C>@59/7D9$99*F,81*:*!+0%?@GG@AC>G3'"><1&);F%0-A?B'?#D"09-GDC=>1+E@90:*;>"' YT:Z:UP jpayne@0: r2357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41349 42 64M = 41175 -238 TTCTGAAGCCATTTATCGANATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTG @)#*)(:8);1>3: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T44 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2357 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41175 42 174M = 41349 238 NCGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGATCTGGGATATACCGCTCACCGTATTACAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGAGAACCAAAGGATATTCAGACGCAAATGCCTG ,H*790D9G,*C%?A1#FB=7)H55C"<0E85':?;;%%"@=!CC>CD(94+>=A71273:"+'5,#8.-0H)(+.(@*?);7&,*/<@(=*1/2%,$C?427EA<79G5AFC$2F6H'H*";&F5%/,6@#E6F/3@"/$'7$+3$*.<$F+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A64T25G50G22G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2358 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13306 42 45M = 13070 -281 ATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGN ++!$"!"+%'*''$$+'%"&'&%&+%!&#(!$%)"'!&+$))*+# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2358 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13070 42 104M = 13306 281 TNATGGTGGCNTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGTTGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTT ($+##""*#!)''#'$*"+'$!'+&"*)&+$&')+%$&(%$!!(+)%!()#"!+&)%!'*#'&*!$'$%'&#!!%&*%+$!+$)$)#+'"!&"$(""$&"'#"$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G8C56A36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2359 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15154 42 255M = 15409 300 GNANCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTNCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGTAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAA )!4"'!)-@>H92+9@6F5<&;.G2"8(F%G8)8#F:98C4+?FF,-@*%0HE059"@>C"9F#.B-0D+H02%F3'-G8821F%<28*#B87)=#F4'B,D&#$*33-2:!F9D9<:,C1FB(?)>;?8)&>,1@<=C=@4)-5,8<'E6A#-=&'8<9?31GGAG->&1A'-")%#?5)B2A722"@+9%GDA87+0&"EAH(H0->E2"E&#C=+AG.:;A(E8+19(!&0'2;G")+9*4F<(&14DB#).7A/;6+B8D&@="%(A@,<5D%1:'=755+A%H1%46GH/:&D&AD>>#0$7AG;1#+-'B8C9%B#(>+D%A6(2G)A*&"B:@EG($F7F85;2+-*%EG4+*5*/-(78@!.5<>-A':F''G.C7?%"A:E=*-;-9G("@*()BH9.>41E2'2=!;H0E7A#H6=:.@CC3!6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53G6G19A1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2361 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45982 42 202M = 46184 284 AGATTATCTCCGCTCTGGTTATCNGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTNATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATANACGAAGGCGTTAGC !D4"1&?!3!:8D9;13*>9!/3@#"-6340@-"%A.:C7$*E&0?1=D21:F%1+>5)?"1F4A6)D15C5EG+!$6GF$C#*26H./5+71#01C=B"9@8'1B-;H?2"@-3,*?A"F;#?%)("?;;1D+-20BEHE?@H:>%G>?9G:0"><%)(52@!6F84F74-1;)3+4/1E0!:@@+86CE=7&009&>+;F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C22T137G25C7A6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2362 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20617 42 58M = 20447 -228 CATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAA @1<-68>6F#:C<$8C"("?57(6H=D3:++))8F)481E94B%="E>=GF6CE/8.$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2362 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20447 42 71M = 20617 228 GGCAGAAAATTCNGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACANCAGCGGAAC =A91),A(*97D)078(E&A*!1B0:!';(;;0%FH%@<')%HE>GF&%2>$+*!159>7:$:,8F8:EG1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T48G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2363 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37172 42 49M = 37312 244 TGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCT +(*%+$"((()(&#)+($!&*!)+!++"&&(&#")$*!%$'%(%))'&* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2363 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37312 42 104M = 37172 -244 TGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGACGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTC -?-.C6"::8#=E&4AD(,F2=3<216H1@391*"7++!%;E9/40>$48@+9$"3C)/::4$E;G?#$,;>>@H=D7,428!C54)*3E@0!C886),7&+*1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2364 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12440 42 284M = 12724 470 GAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTTCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTG .><18:6).1%684<5;.3#;H7D7;D>@*17?67+"?AF#.<:!F+=70/-/$$+/0AH/;>>;&(!$F4%7D"94B;EA#F>9;9?:+<69$+)!7:D;(F.C+.3/#622"A496.=;5$#6HE78,4,$><)8A.B#2:80.&:1:.?!4@#H7!,<,.2-G!5069?9!-4# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:177G99G6 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r2364 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12724 42 91M4D54M2D35M = 12440 -470 CGGCGAAATTCNATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCNGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCNACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCA >2)E>(;+6;($3!;44A);6+994#/*#-;=-G7;',#AC+.#C&+:<9;)DF56-B@,>@G?#G&*242%?/@;<75$0H#6<.=CF):%:-F$+1;;#'$712(*)96>?C>5B$4D,(3C!"2D15>3H964A=-80D"%,D$#.-79'8&+#*!!>79->E=A:18G<4FF9)+)G89G15=+B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C60 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24770 42 34M1I32M = 24623 -213 AAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGANAGCGGC #&&&*%$'!'""*!%+'$()&'*#$)!(&$&*%#+$%$)'%()#(()'&!!%!+$&+(*+'')$'!" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:59T3A0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2368 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37321 42 96M = 37518 237 AGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGNTATGCAGAAATCACCTNGCTCA .2"38GBC;=?A9$*#=#BE=.3B+H/G26<4!#'>B).=AB)8?CAA(("71<0G7C0,%1-)1E%@C>5>6CAG"*H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73C16G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2368 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37518 42 40M = 37321 -237 TGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTC 7&.C'7&,:2,4?*H;:%3F2:5>4GHBF&>@(76()6;4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2369 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7419 42 92M = 7686 351 ATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGCGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCT 6$$(*)4D>8--5=E&/%4EC;:>=5.=D4%)*,D;:,7)$:65+70=/3A/!'%7=@:=C3"8E+-A*-8!F7'5C!E=))=7-80,F>?9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T52 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7686 42 84M = 7419 -351 GTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAANCANTNTGCTATNNCGG $%)$#%"'+$$%*$*#'%*'%("!&"+'*)'!'"%'"*%")*(%!!()')(!'"&"$%&)'"&(+&(!'#))!%&&**$&!*'( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:67A0A0T0A1C0A5G0C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2370 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28624 42 42M = 28424 -242 GGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGG @579#%,$3;H,D:0?19"">*069H77@-D'!?<'+60+D> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2370 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28424 42 127M = 28624 242 CTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGC -D02':&C,6.88"-$#8H2;B'!@F=4$H?(5?=+)+$<9$A7%7G%)0-4/";/+,G+2%2F5/:2+0(078E6$B0<6$@,>B@D7$'(5AE6:'&9,H!-),->8A:*92G%@2)$BGF"6)8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21354 42 65M = 21591 300 NGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCGGCGGTCGTGCTGTA *2@%*/0C#4D$.6+"G9(?<=?(E/8G?=26#,54?'@'7E0%!"75FD(@C4543(=.&4&!: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C49A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21591 42 63M = 21354 -300 GCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTG H$5;(;CB+HBBB,+>#@A!F.&C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2372 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18754 42 153M = 18603 -304 GTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCANCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTG 8.C497&&><9$>>49A&,1.4:-40'=A>G530DH8"@,D95@D@;+4AD2(!@95*F(2>#'3.!;9)4?:8A1B(BB@,+F)08A?F$7"$6+0F8,/!4.6?.;%1=##H1(?!>'>:@&=0";&/(5/B@C;FG=07D&DF#%-#4HH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2372 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18603 42 66M = 18754 304 GATAGTGGTGCTTCCGCTGACGATTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTC =$!F,2'2@'5/+%+)'+5;5D"+AA$=C+6=:AGF3,>B&9=5.=8<*>C8.,787/-**B9G8& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34725 42 49M = 34272 -502 TATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAG :<(0'?D46-+4;,3**D>*+"'=<9.'G6#5-9"!*@2:)*F+7(5,+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34272 42 441M2D10M = 34725 502 CAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATGTCANCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTNNTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGNTGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGNATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTANCAGCTATTCAGCGCCAGA GGD?:/5&9>F$E%C:-7#&=F;.4:2C$;,C-$<,?A?"B>5*)-E57>5(726%F>>'6E#8)!3HH,9319,26523AB,;5BF/442D./',.&/<&FE9$9==*#C:D'8=;5.&8&17/"(4H-/(#5$!#81/FH8!H>/)@@0&&C2H6?8A6FCE+'DCE3-=:3++;E$A.4,;916)B!.#%98F.>D/?C!D!/3(-66#D>+.8&1AF"=:66GA:3=/.6C>/04F4,,82!+!6)FD0+&.>59((73<.HE-:G0H(46G*!$>?=H2;))2-6*658E%)561)8.=G6,()!"3!;$F.=7=B<%CGF"*$B**6D4G5,(*+ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:88A3C5A55G0G57A164C53T8^GC10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2374 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4680 42 72M = 4854 274 CCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCG 4.;B=5.0,6B,BB*B?=(25F5BC>0%;==/<"2CHE0+)1&;:4;5-C0=@,!76)74%##'0>$C4C6- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2374 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4854 42 100M = 4680 -274 TCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGCTATNGGCNNTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCATTGCCGCNTCCCANCGTCT (#"%)!+#%"&!(()"#%$&&(*#+$%*!$!*)((&'%%)%&)()%""**+('%#*+$%(+#&""#%$"$'$&)$%'")!+!%')"%)"#"')!"))$)) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:29G3G3G0C42G6C4G0G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2375 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45640 42 45M = 45432 -253 CGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCC ,'"-7G/@%HDF(E?""=@<+.-=86&@1H$=<0C>1+H,2G)!/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2375 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45432 42 70M = 45640 253 GATACTNACNCGNTTGTTTCGCTTATCNNACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTCGAAGATGGTAGAA )"&&##&#*!*)!)')#'()(*%)'&*""+#+&)!$$'!&!#+*)+(###'(+")")"((&&)*+&*&"# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G4G2T2A3G10A0A27A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2376 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5924 42 45M = 6130 271 NGCATTCTTGCGGTGGCTGCTGACCAGACCAGCACCNCGCTGACG !++&=2#G73/F3E"H&.@=%)2(!%;CF.D$!5,6;'?C8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2377 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27120 42 197M = 27317 251 ATATTTAGCTTTCTGCTTCCCTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATAGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTNCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTG 0*@-&0*AFB+#37.@=(D.&AB6@??7*)#/@G;8-8!.#(-&+6G$?6-&D%;%-/A,62(D(?3<;%GG0E/BF/&?+A+0?/5'"H?.3=26?-<@20%E=((!.7#>G0,()!&/C,@9C#ABE;<(,"H+@'5$"-B<23&A/.(5$)91CA?.=#6<&-G+$(+8$E5@+ABG"03))4;+H4")/#D1# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T31G73T70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2378 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45698 42 43M = 45467 -274 TTCTTTCNCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCT !#E=?=",2GHCG%'D1$;;=$&$C5D*922A>(FG9*D/:B/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2378 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45467 42 70M = 45698 274 CGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCT 6-*'>**5!"5(<1C-A)G7H;9(3.H")CC$B/A,B/#+BEC*4-#CB/:>5<.309H!3<8:-&?<$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2379 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7888 42 165M = 7665 -388 GTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGANCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGNTGCCTGGTGCCGCCG H!7&&AC!'01E@C;@F=E=H(47;)1<0HF%G;8'G$%+!?'44H)HD9!/$&=11:@2/.DH>B2-09,5/28H$7F%31%E3@$?H#D:>05&CH3)EG@&1,#,&?.8B32-F=>%DA3.<1>>A18GF+1:C(F59GEC>A9<,<%?0!51*<1=G97)6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G99G39G15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2379 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7665 42 223M = 7888 388 GATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGNTGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGG .65/%==A>:A:'&C)@-B.<8$DF6&-)D"+""&/C+("F#9E*F2BA$G=H@/4';@1&B@36?5>*/E2B?C3(6FA.C&6E%"AD8=7*4C674"!G=>!D1=96#':G<&5.5383A)=)&+1;&/D&F#!H94H*/&B+6(.D@B4>;&<3. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77A145 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2380 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32757 42 235M = 32642 -350 CATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGNATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGNATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATNAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACANGTGCT (8E'FH>?@#3$*A&0;*04A0F4/(-A)"1+2++'7<$D=0B+39:0&C"=F41<2<@,6(:31'!@;G1C3?2@;#*/3H:0/)4A'$@.$: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:70A45G40C71G5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2380 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32642 42 115M = 32757 350 NAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCAGCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATC +&)!&$&%#$*+&)!('!*'%%"%"!"$(*)%&(*++'(*+'&!!+$**')#&)$+')!$(%"!)'%('''"#+)*"(!&#"*)"!#)'$*'*"('$'&&+!$$%$+"!!!(&$( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T58C55 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2381 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28799 42 121M = 29021 285 GTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGNTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCG +#'+'+'+#%((+)!+"%++"!'*%$!)&)&#'$**%")!$&&+!!&+)+&))#'$$'&)$&*"$("'#&%+!(#%#'))%!#+##*&!#"!%&$(%)!!*+$**+$)"$')&)'$!"#*' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G81 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2381 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29021 42 63M = 28799 -285 TTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGGNA 7;3+78B&D+B6/9DD85.6A>6+/8CG0F=6D+,";'21$>'BB.A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2383 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47088 42 123M1D10M = 47300 376 AGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAGATAGGACG ;04?5(7!%H#6$62AFC4AG'<;2)5!4)'C7G3-.#554D&6&82&-D3&)2/:@0,&+@'%#+HB2,7-C!5$!5A:.@5@BA7:':@5.#G-/78,B1=<>;!=7>+>.,4>E"=008>#>:,$ AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:123^A1C0C2T0C1T0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2383 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47300 42 164M = 47088 -376 ATCGTTTTCTAACACGTTGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCT :5;"$$'7!5$+7!01@")!8@&@"E2?D5':4;:!G-H+1--490E72*F?$G:3;4(=75G:*$*&93;CC?7!"(8%.8B3$A3"2EC;C-)@;0@A.7#@<3$>HF0E@'#!8)F7#<7*7C(?6&%&+83!G754;.2"B'E.D,C#/'.(B"!!4G;6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A147 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r2384 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32862 42 97M = 33092 326 ACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGCAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCA /(;@#)G#6!EFC:>1=0-;2F8D1@;E5/>G9"7E>H5%",//4H?"7+G+*5;=16!5'D26H'%9*+H5($B@&0.1!2F@;C.%:/G,B3A#! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2384 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33092 42 96M = 32862 -326 CTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGNACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGT .>/H:0(?.(8DA.(==?G'>8(/"D/.9A87.3D/.;?5ED#&$/4B87CG/@=*?=EB'<-'?"AA,1!A&;6<$>6E/#="4>-*HA%4*)=31))&A)E-H>AD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2386 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12759 23 56M4D54M2D39M = 13040 321 NGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGGTTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACNGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGGATGGC ">G++$C&FD5B)#"!4D9/%H*(<.D((18:?FG!F!%G+>@E.2&-=12,BAC@B93>5!)BBH1#DD.60*B56+/(=3E-+.)%'F7;1F+2%$6GEG&)CD,=-A*B5@A)@3H.G#77;-(#*AH.#:3'>961C.;B@77C- AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:11 MD:Z:0G29A5C19^CACG39C14^TA33C5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2386 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13040 23 40M = 12759 -321 TGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGCC >@=3D0C%92E;0:E4A*-?+;=/,=;0#* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G1 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r2387 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36069 42 128M = 15783 -20414 GGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCA '&CHEE82,@!+A3=*.CGH9E88FH!-;>*8%1(>*=$3F,?'")$..GADC=8.F-/!%B+!<=(,@>EGA+,=%GB75&!/3-3:(%6&7=(8+:"DE2%G&"'8* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A127 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r2387 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15783 42 58M = 36069 20414 AGTGAANTATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTG 3&+A+0;@%:8(?G8$E(1+5".$1"4'&+!;%'22)HG/(2;(5<,G1=4E43;1EG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A51 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r2388 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26094 42 110M = 25811 -393 ATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGN D@/>FB)?E)H@>5E&&/"@<3H?9DE&?,!<4%C*@D%44$-D9>E.3$<8D8%2D3!5,?*-2,=*H7=);=6@=%>:B''F%%@04(.">+08"0G3?5/.H(B33' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109T0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2388 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25811 42 283M = 26094 393 ANTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATNTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTTGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCNTCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTNTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATNAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTNGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATTTAACCAATAA )$0%CH*)!5*7#!1+E7/;-&?6'+>=-"%,4&"!/241.6'$8@0&F(?/C9HC+H%@?8+F"22*>)FC/DD<1E9A'F8!:'0-<1'0@A/,$4:,>"+:>>($*,H*)58;-2B80$"'5>8@?3"<%C0E6?'&:.C6>*))06"?4*,'*$(@18G"E)'7-752"#>?HB$7=@>H!.H8-#8CF491";9 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C31C57G33A37C24G40T42A0C9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43721 42 127M = 43908 253 CAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGCAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATGTCGATACCGGCGCAGTGTTCTGC +=(%;85%6-9;&80H4,+5)9-4?7@-0$=F/#%$& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73A29A23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43908 42 66M = 43721 -253 AATTTCATTCGCCAAAAAGTCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGNTTCTGACTCTCTTT -50G.4<>64715/%4@.4A-.@+*:%@H*:A7,:7<1!E0'$95A6B@%4@602C:39);2$G/+C/)@D;*.;2.D,(<:9@789-BB?%A7D90B#1;H#+-7,E4$/>;$13/)05?-.4#?)&(@@8G(D4*:@5+123:&.62G05=H:F8F5"/,%8'E9*&&,'4?6)26%E;2+6$(%"9!&8:3<@@$0F1A)F#"@=DG."5#D&!D;?FF#/-6;C)E@82#E3/7<+7$!H"F19$36='D(H//66*,#.&(&).D= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G128 YT:Z:UP jpayne@0: r2391 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39674 0 * = 39674 0 GNCAGCCNGTNNNTNNATGANNNNTCNNAGNNANTGACNNTTNGNGCTGNACNCGAGCNACNNGNNAACGNNNNANGANNGCTANNANNGNGGNGATNTGGNTG #""$""$$$"#$!!!!#$#$#!!!!##!#$$###$"$$#"#""$$!"$#"#$"#$#!#!#$"#$!!!#$""#$#!"!""!"!$!##"#!$$#!"#$"#"!$!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11655 42 203M = 11858 279 AAGAAGGCNGAGCNGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCNCTGAAANACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCT +"@#"'$+#>21880'<;@#7)8!:4!+4F5D%.*!'#$E??$?#,9E9D2/@$;25'6E!>=;()3DG!:H501>)>(-.++E$D?C?FHC"'9D$%'4/&(9A7$$$1+(;4*>7,,65%?.$,F7$3/HGE")*5>7<"G1@8$G'B7.&D0'39F(H"/$H-4#>:G):;G=G&?*5A9E&.-1&5(2%!&?02*A5%6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8T4A147A6G34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2392 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11858 42 76M = 11655 -279 GATGGCAGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAANGTGTCTGCGGGC @#$4$.;+F*-,+<=G6**"9/6.E),7EH8;:5)C/",4*D%;/481+@.*FG*4%F<,#F0;@2C%C0A9#!7! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G56G12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2393 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33246 42 50M = 33399 252 CGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTG 9*>">?/6!(A1B!2604"%E<<3B"4<#D$B")"F5%:,F!18;:5:-@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2393 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33399 42 99M = 33246 -252 ATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATNCATAACNAAAAACGC *8A@.8(.*;=7?,-+9$GG&!>C725*CB9D57BA17*HH!4GD3&;).G8(4+(=2E.8--BH1%"#.,*G8'0<$?B8D6%:A,##;>3:/#=-HB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83A6G8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2394 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15928 23 73M = 1 -16000 CAANGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCT &>?=821,7=B''7(D<(6A9'>"4:0(9/#(52C)H9%?*DBFC?;&'9+%*/01:8+9-2<'F#4:?&#F8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C69 YS:i:-39 YT:Z:DP jpayne@0: r2394 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 23 4M8I75M = 15928 16000 CGATGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTNAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTT 6#%1/*/47):5$$E%1B124&6@12@BA=>3H1E-%?!!6E?!9&E,H*=G68.F/51%$884A.(-81DC9"02?A7"A1#*718 AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:12 MD:Z:0G1G0C43T31 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r2395 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19611 42 180M = 19871 325 NAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCANAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACANGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGG #@C%G=F2:0(/5).&0!99"/=2.DG$88>!>5H)8#49'!:@H"-&)2F'@'"256HH>@>8&48/-*0B95?/!&.D:/@A;14$39F*#:$G1C)0@BEH(G(/(@-1@-0'3F3'(C-+'E@DD96'%C3&-,23C$/=''+4,A>0,*.:!*!'>H#D;5*,(#.7G4#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C75C71C31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2395 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19871 42 65M = 19611 -325 CATNACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATNTTCTCTGTGCCATGACGGAGG E$#8A6:+6/$$@/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C39T21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2396 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10216 42 62M = 10014 -264 CGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGATGGATATGCACTTTT &(*%'!!""+$)%'%***'"("#!((&'&)'**$*()%*%'"#'##(+"(##)*&!&"'#*+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C15 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2396 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10014 42 50M = 10216 264 AACGTNNTNNATCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGC #"**!("#$#&!%&+*#*'")&!!!&!+"'"#)&(**#%*$!%*!#$*#" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5G0G1G0T1C38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27253 42 190M = 27183 -260 AAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATNGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTNGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGNAGTNAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTT C:#H@7:":0>!)&=*'+7B"76&9;A$?9#572=.$?/H#+B%62+;7$#0.?B>?G.'GD'>%C:;>(E&4&C<;(0+)/+@#9!#0/#'$.8D>&;-'-A@1.57:=9E=(+/((&-A!8>7C3(?8D%5!=9>"=H6<<=3FA>+=>"@B82=7:&67B/7>@&1;G"E8BH2/3G=6)2"?:*?6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27A106G20A3C30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2397 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27183 42 70M = 27253 260 TATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTTTGAAG %)G%'%2?.+D(?,*0"%:6"F+1>FEA+6>E4D,(4>">>7#.:@::5*<$B!= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2398 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33942 42 70M = 34012 202 CTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAANCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTC )2@2(29)6=;,HB>@@<1E8CBBE0A4,7FBH52A)32!#>8?8&.F;4%)C:!1E5(>$-GA=CB(*- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2398 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34012 42 132M = 33942 -202 CGTGTATTCACTCGTTGGAATGATTACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCG ).&A4H=>):889,2!>0)$)D5G=8#("(&AE)/'.4B)?;;(:(?-<&%37!?-$:48!2C<%!#A.*"$.@875H>>$:!#1!->BC)52++!EFC/H11B,@,G-)/(D=D'%':D=G6?D545C#>5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A108 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2399 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45285 42 149M = 45450 337 GGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGG E&82*59/B.G=B7@>/=:!%&@@4BE(@A*.>:C28%EH8G2B<,>#=#8'8,9&/7"'HA3.!D:EAG?#;:<7"8$;:AEE9$D*=09///"7(/A4F+7A926=/H89+6:)4>3,D9;D'8*(.H?<<'+E:3#251!EH#F-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:149 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2399 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45450 42 172M = 45285 -337 TCGCTTATCANACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGGTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACT >@!,"43//EH-@?%C"#+0/(2>HF49/<$*C40+;:*;;->+7G/<7A-:>C98B4)C(3(-6EDA4,&1)#:CA?9=<%&4C"*=*G.*:A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37G24G38G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2401 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21008 42 97M = 21212 249 GATCCAGATTTTGCTTCCACCATGACTAACGNGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAA 56)812B!=EG7D*.G..6;><$7#A-?E0AG3'#4F&DFA4(;/:)#)@("+:8'6+=*F@C:C:G:)#+'46#(H()BC3-&-7':H)E@/=E9C AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A15C65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21212 42 45M = 21008 -249 CTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGNTGCGCCGATN ":%2@?>#EA%*D4<./<;8!'$G9B,-;42!G.#+.>"G##:@% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G9C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2402 77 * 0 0 * * 0 0 TTGTATTTNTGCAGTGTGAACATCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGG )""('%'&'##+'#"+$!)"("&"(#*#*)#'")!%+&$*"*(*"" YT:Z:UP jpayne@0: r2402 141 * 0 0 * * 0 0 NNTCTGCTCAATTTTGACAGCCCACATGGCATTCCACTTATCACTGGCATCCTTC #".GF3D!H$.'8BG8:%@CA;E>;C<3&.'1+,5;3C.1(EAG;,F1">D+#-# YT:Z:UP jpayne@0: r2403 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2301 42 328M = 2249 -380 CTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGNAGGTCGANAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCNTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGG ,24:5*%;H,-H9;D+/.F+6B(D;6-?B'=5G5)3A'70#'&<+-B!+,&,,4G73B30!A6;**B&,+1?0*30!="619A=%#5/:F;:);()A=7.!G/988&+G3H,;.,@$HH#7:&8F5-89/=21"*EG;%,B,&8&97CB763EAH-8C0*G2"%H5!3C>@/@:+?-A&:1'*C:5*."1+4)!7=48)::':@F1G%2((+>%G472H<>A4A40=,:=C@45C<6G8@?:<",4;<09?#A)C:"3,H=5<7/4H7G/$2;C+2(:!,./%'4@..'-H*#,*?7E;42>B*,?G)1H) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:102C7A69T147 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2403 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2249 42 52M = 2301 380 TACNGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACA 83(E<:,8'@+6F<=4>1:4,5+(%;)*=@9@>3:A1?3#>!7<,7-:1(:+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2404 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9436 42 109M = 9269 -276 CAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCNCGGTGGTGAAAGGGCNGAGCACCACGCTGACCGAGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGC >5!!72,DH'6G0@&''$?C0D/EH197;6D5+>@D&%.4<,3<$6<-8,$9; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32T15A17T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2404 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9269 42 75M = 9436 276 CCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTNTCGGTAAGGC 38@(;685&$F(@H9G+!GD=2-$-&)DDA%F-5.**&A;#G;#8D?)GH#)4C88&2!/@9C=@-C)C$D(2/A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2405 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42804 42 82M = 42655 -231 CAACTCCGATTTAATGAACNCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATC F%61:@H@A*%1D&.!,,?&(*5<'81$<50-1<00!,!3BHA,-+76,*?658!?.#(-'C+1A:2F!2D;6$3*<'<<-- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2405 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42655 42 41M = 42804 231 AGCCCCGCAGTTACTGGATTAAAAAAGCCCAACAAGCCGTA *0H&-A#?F@"3!H1&*2C).(7A:/:91E0,$H4;-2;B$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2406 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31181 42 115M = 31338 293 NAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCNGCCANCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTA %E1/@B"&-$>G57*H1=>&4E;B08G+334D!HD+GDF@0;B:';@8G;)2%!(@$:23/F)C2/:!A?H2>4"F$:#AD*5A20CE6A'FE= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A44A4G64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2406 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31338 42 136M = 31181 -293 TGAGGATGCGTCATCGCCATTCCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATA B!/=B>BGF*.."@*G"519:)6<-=#-2&06A0?:;>'''12/15*B2@371@@E:B04:2"F*"C,)('*7&,:?C;8<.6*685$?H5.(?>5G/&@4D31642656@@-)5.:=CG@"<@<#73.")H)5;?(1,@B2<@B"D8)CF:F=FB&(17/=!'(*;:5$5BC:G)*<*.F95?8;B<>=38$D!GA""8)G)CD0E@+A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18A35C11A59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2409 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28216 42 42M = 28370 228 CAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGG 103G.A?C.:F82?&5/4A5;C"4B"5-)81+8;#C47492H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2409 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28370 42 74M = 28216 -228 TGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTNTATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCTCNCA "$%""&*$(*+#*$$&+%*(%'%!+)&$"#(&!!)'&+&#!&%+$!!(&!!'&%%&"*&($*$*$*+++"*#)" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34A34G1T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2410 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29880 42 167M = 29751 -296 CATCATATGCACATACNCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATNGNGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCNGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGAT '4#>36++6#8G9G*+33!%22?F4>*(&'"F%)*#%)48D?40+C0-58#55>(%F:B6BE=&"64FAF63755=@+G)5A&)3""5HGG AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11G4T39A1C53A54 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2410 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29751 42 129M = 29880 296 GNACGNTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGANGACGANGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGA $'&#)!$*'&+'+$#(*!#%$)'#'%+('*"%$"#('"'*&+&$*($**'%'%)!)+&+&!&$(!!($&#'!*)*"*$"!%++*!'(%)"$$$%"($#)+**#!)#!*(#+#*"*&&#*)''+("'*') AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T3G37A5C79 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2411 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15487 42 66M = 15621 203 ATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAANGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGAC EA%"":B.H-*$E#C,5>()8D"G1:3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15621 42 69M = 15487 -203 NCATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACNNATC $'+$+)%*$"%"#!$%+((%)%'*'%($*%#"(#"+*'')'()())'#)$")#)+&%+$+(&$$*'&*# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G62A0T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2412 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12423 42 64M = 12220 -267 AACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGT ;:-!"2,>+"/041H>47G$'C%=?-!C,?E-'D'0,;$!%:2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2412 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12220 42 203M = 12423 267 GGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGNTGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACNGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCNGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGG $)5<6@&*-8+B=:,13B+B?C:8F:H<&<9"/7)(??93=7$=(H1<='2-CF>14-*2=6:%8C1C6&EA47>>"(+-;-2?%C56(?,!&,87D;>G9+E)<"/7*9?#64A3CF-&,5)C,9=;.E0"#,!1("!G/+F"E=6*%.*:21F@1@C%!92H)AF@&=2(00!7%D45*:4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A50A25C57C67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2413 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30642 42 203M2D30M = 30543 -334 ATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATACAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCGG 2+6@83;@0C/>/)<"<5*:1;(>;E7@EH9'%$&02$:8@3?5.C!&1G:/..>79AH#.47E2*63$(!=5/;C@1".,*7:D.*9:A7:%5:̈C%B9+>9#<4&:FA-=*=%5D8%F;D@/<-*4#H=75433DE"'6(6F1F>C1(1C9,+=H.@3H1HF,H/2)>F3$(:&(=8",>4>!=#3%7.>-E(&C!,41&B7EHB(&6*#3"<&=A$AD1>G*:H!77+H.@D6>B)1F18E"=H8"0*E.;?>&E&<$?1'D9E1+B8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C25A44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2414 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3142 42 105M = 3349 280 NNANCNCGTGCCTTTTCCCNCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGNCTGCTGNTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATG #$&"*!&$(#"($#$#*%&++&!%'++()"))$'%''*'(*!"+*!+$!%(')#*$"+'&*"($)&'%((!#"&(+*$&(""('$*'$)(#!''*+*'"#+$+)) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G0A1G1C13G38A6C39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2415 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21047 42 47M = 20796 -298 GGTAAACAACCGAAGANTGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTC @%(1>127+C$6/.$@"B87E$2AE2?@FBA&'D;#:;HHGB=&F18 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2415 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20796 42 58M = 21047 298 GCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACT ?,8B!%-.#/G!?%32E4DH2@7#D567E8,/=H<")68D%D,;22'H:?=-EE2?>9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2416 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42928 42 63M = 42735 -256 AAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAN @+?4E".;=85A$.738"/D,&/"E&8($@7-8!%B::G=98(,E$G9"(H'?BB.$&.D.2$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2416 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42735 42 99M = 42928 256 ATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTNCGATTTAATGAACGCAATATTCAC G;(&+#+".@:$96$G1D,6*29?-$9BE-?F"C12<&3+!#!5!+/))=*1:38,F=C(A?61.0+4!4:2/"/'/'C*5%E3+6H;C'"B;C89E:C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2417 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2567 42 123M = 2771 311 GGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACA 31+6(:)=9;+:"FC7D=G)E!(')3B0H&"2FB0'0%+-7,G7F308'E0?'-:19)9B*1))6/51!6@:8H;)?,".='&$<'0.,+-H9-58HG;A-G6';&A><*&5E&B:C0+)9>2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2417 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2771 42 107M = 2567 -311 ATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCNGCAGGATNTTATGTATGAAAACGCCCANCNANCCNNNCCNTATNGGGCCAGNNGGN %+!!")($(!#*&%'!#'"!$+#"$)%+$*$')%"!(*("'#!%!+&'"#)!)$&##!%&$"##$**&'"&*'''+*)"&%$!($!*!%%)$'(!$*%*#%)'#)&! AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:50T7T19C1A0T0T2C0A0C2T1C1G5G1A0C2C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2348 42 97M = 2473 219 GAATAACCCGGATATTTATGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGNATGGCAGGAAATAAATACTGTGG +6F%=9?+5C1?.$G84,C584:1",/+#$(B3H;;,9>!'0B",.7EF.F2,>+&=$;8>)!>(F/'GD%?/D7>AG$*=F)-("B!?3@;EH==*;+'-A9487152GE6C?7,=E*F@FCH.1C>"?C<>29A665,08;0;.7=+,CH)ED<8'!*-6$7C+6&$89EDD-?%%D#,7,7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:84T5A3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2419 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45138 42 175M = 45138 0 ACCTTATTNCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGNGGTGCGTTTACAA 0E.8C&2(A<9<(+$#>-87!23>@B()B9-C,:-4@$8>=>D"5GBA/4")%$3!76C=GC):@6A>6C(A,=.:3A>8D33&B;@#D/&+C/'#409:H70*+4=3G*7(&>A*$+;@,6*#"*2.)6@E+.:C*!9$B)+8+(5?>3&9AH==<&@:>FA'(B/-((8D.?4;$*&!/#@3B>:C/8=>"B5$1#C=!@FG>.17-6+5)/A(8%'&85$>"H73F(!6@221H?,/6+6?/?-(5"$C%+-?5D1/4D9;F6:;"4A#3* AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:96^CAGG36G60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40633 40 46M = 40722 286 NGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGC #<8;$)=:D?F65'>#-!A%'6A?)4,7<;HH'",$?1&48F/3E. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A45 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r2421 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47725 42 470M = 47648 -547 ATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGAGGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTAGATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCTAGGCTGAGA /)>4!!>$*C>'A160)(F=%4"0C<>)?&<8HEGD693..0A+&:BAD6B3$@-4)%.04'.5!!;B'&+$5&E<.9,*2=/>%82//3E84AA;1*'D2">*/:&6-)+82785$1)8G!""@',9$5)D-@6+1D(#)B>:)83:C<4>A'+?F$7H-:BG)9C*;9*#70>%9GF5?0CCDD58#;@"?"0--'.F#>95:BB.:;$CB!&);+;*=9G!#&72:ACCB241?$!'(D(!EA:89&!*,FH207/=F?A=G,>D6/17$7@4-$"%HC9F/1%%$%9C./658(.%<2@#9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G71A11A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2422 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24420 42 107M = 24284 -243 TACCGGATTTTGTAAAAACAGNCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAA 3$@H622,+0AH(%0$B,5D35$'@&C:$241FH8(#:0.A9B:7H-2&H*170"E5$5D;.B.(5#F9"+*06-G3CD)25:5%+)2E5(65 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2423 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4892 42 249M = 5141 329 CTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCNCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTACTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGANATCACGCTGATTTACAGCGGNAGCCATAAGGTGGATGGCANCCCCTACAGCCNTCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCA :?#-2?4"F>?)9BFE>$0;,(B."#"<.14*<;:A5CDF@.4+#);F(&C+?E6(;94')F=#938<651BG?%BEF2CBGD:8H0C)9CB8+'/6:E6;=""*6H77331."/)E('4A-%9E?H>B4#449+F*6G8/F/39:=3C$:&".A+?#%#2/$%C%(C3)"@;(9)FB.FG<;;-C--F&H1DH?/@C6;9<@!/82<>F*%!&>?3)?6<4DA@??(1?H;#2,.;$<20$&?*8<6% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:77C7G37G25A20C19A11A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5141 42 80M = 4892 -329 ACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGT A+8;''1?HDF#'>*/*>B0>+!E1/'0-$*",)6F>'#'#';*2F"#+392#30%H/".":A>2CD#$BB)4*;4#?=C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2424 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39609 42 103M = 39407 -305 AACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGT E8$%('?HD*?>:<1E"4%$9H!!-A>*A+9$G=,E(?8*"?G1"2$6H9"(7G,5AE8('>6@:(&*C2<*<&*@0/E++#?%;E759,#>4'':/5590>E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39407 42 53M = 39609 305 TGTTCCGCTGGTCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCG *(9-B#86C.@1(16C+-5<3?9+*%C3+"*./7,82%/>#D88"/B=94E"A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17530 42 72M = 17336 -266 ACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGG #>G&EF*+6;#4";B7*%2C?1A,B8G.7,&/%&=//%?'8?=%7@'E8.$?A94+)AGBA*:4(G78&%48 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17336 42 42M = 17530 266 GCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGA 7,H:2?:!F>,#9$3"E*1,5(GE3A+3C/H8=%?G:/#B&6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2426 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4424 42 52M = 4234 -242 GCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGC 1H,;=H+)92D(@&=B(.E,!(;4?<83B9>B?=''(*B0?$+#%C+*(,6& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2426 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4234 42 137M = 4424 242 CTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGNGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAANTTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAANCCGCCCGCCTGGGCGGC 0GG67D00/E$0-?+3EF?@50**BH'$./6.24@#'$=78*G0%(@A,87&@3@/?+"6B1%#:0<4*<4>3/"%*E$3A-$514 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34A31A52A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2427 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7719 40 108M = 7864 204 NGCGGTGATNCNTNNNNTTTTTGATGNCCCTGNAAAGATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCNTTGAAGGCTCCNGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGT &$**)%&))!'"&&$(!("(%&&'(&%&()"'%$%(%++#%$!'**$&)$)%%$+"'(##$'""#(+'*%"&+"($$**+"&#$(*+'&%#*+**'&($&+!!')"(( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0T8A1G1G0G0T0G9A5A3T27G11A31 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2427 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7864 40 59M = 7719 -204 GAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGNATGATGGCGGAAGTTNTCNACANTG "))+%'!*+'(()("#%*(##)*$+"#%%%(("#!!(*+($"%&"&#+&%&$+!(%"#' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33G15G2A0T1T0C2 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40485 42 54M = 40270 -269 AGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAAC 4+"D/01?G-./E*A2';3-D9C1"<6#G;)@65(E;79E>F&<#*E+$*0??< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2428 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40270 42 67M = 40485 269 GAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCG (@/C07B>B:)2"->E@($&0=.C-=!),C$:DA)(29H40!4)AG&7=>#3C"/AC47?D&)/8F# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44191 42 95M = 44045 -241 CGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATNTTGCCAAAGCAG %($$#&%(+%"%*"('(%+#%$+"&+%%%#**%!!!'$)#'+$$***!!*(+"*#+$)(!"#(*'#%(+)*+&&)$)+'*%&%)%)%*)%"$($) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82A8A3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2429 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44045 42 146M = 44191 241 GGTAAGCACGAACTCAGCCAGCACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGNAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTCCAAGTGCTCGCAACATT EE29>5,!9#;>#1-B0E449BCB.'<@%6-)D#A%A.)&47/A09EED>"&8'05,75/E-%?EG!9=?:,FE8(7G5FE3(@>7,3B/"-B7>'::;CH>%(G02<.20#5.D/==;':C;$B0.*-*,.(H?HG/24E7!$)3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A32C73G17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2430 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15469 42 68M = 15601 270 ACTGCTGNCANTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCC #)&'')&!&$%+"&!(%"+)+)+#$'!*()'(#&()!%'#+'*##$***!%!($+'"+'()*$#'+"( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C4G1G1G0G57 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2430 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15601 42 138M = 15469 -270 GGGCCNATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAACAAGCGTGGTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTNCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCG C,F"0@!*GG*3@6<$!)*1;")E"!C;&(B/;-24:2H/1/?),!7:-(@6H"!F)<=;;2B:?:#%H="H@E+3EH@)4F0@1$#(:1%=,$<&;;<>7#.5'7<:")!D@:1D$%"ECE;;+>>?=C;-@;%?=3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5G25A7C67C30 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2431 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12536 42 93M = 12536 0 TATGGCGGCGATGCTGACCGNCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGC 8'77>3!=/>B@"F=@5/E0#/<5:#,<2H%/,4D6F>E++-1F8#<"!>)*1&D#B>+, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G72 YT:Z:UP jpayne@0: r2431 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12536 0 * = 12536 0 GNAGNGNCAGCNNCGNNNCCNNGNGANNNNNNNCTNNAAGNNCGNNNNGANNNAGTNNCNNNNGACNGANNCNCACCNTNTNTNGCCGT !$#"#$!$#$$!!#"#$!$!$$!$#$!!#$#$#$"!#$"#$!$$"""!#"##!$"$$""#!$"#""!$!"!#!!###!$$#"#"##!$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2432 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43194 42 131M = 43084 -241 TCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAANGAGNTGCGCTATTACGAAAAAATTGATNGCAGNAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCGACTCNNACCNNATGAACNGNCTGGACGN #*+*"#+()'&!$'((!$'%&&&)+!#&*(**$!&(+"$%(#&*'&#!#%)&$*+)()!*"*#&*+)"*)))%))$$("$*#&$+"*&"&&*)"&'#+#*"""&%!&("(''#!*%)*&$#&&%(%%'$#! AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:26A3A23G4C42T2A1G0A3T0G6A0A0A5T0A0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2432 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43084 42 110M = 43194 241 ATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTC >0&>"?5GD346FG=G*(//;B%%@.B==B8=G3;(9@35-+@A*?&F&FD6*B.9C&-&0".B9=6%$+< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31992 42 65M = 31799 -258 NGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCT G&"F@+6-F(>!:E-EG90#>$F&E7G;82HHG"01E@!H%%>3.(0:F;H)1%BD<."65<6*> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2433 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31799 42 193M = 31992 258 GCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACAT H8%!://&&07>B?1:!7)3?.A?5*E5&05!%3A.!!@0F?0,!2$#11F%")%F-%)'"*=DA&,A(H.'@>4.$")//D81CE3C(.1&8/3+8B,4.)'6%8-"8352!A2$8G<0-,$):E/7!?58!7#""%6)-".<3;9+H1+@AB)"/H.?3$#GG(0(;*&13);B'F@C$4#-FG3(?#62. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:193 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2434 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35332 42 121M = 35625 365 CGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCG E%+3/A)@3"FAD19@/*6//!-0';1=CHH);#B<114H-(E.)3%F36(D'"E$(3,85=HAD*%!1D/7(#+G=(CA$856=H?-C8+-CG8/0@E==;73*)( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2434 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35625 42 72M = 35332 -365 AGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATT H):%F)=030"#C58A#G6=!1@BG5802/H/C-0E?E%%80)&3&G%*-,)##G97#GH."2,A<(A*;(/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2435 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34938 42 106M = 35184 299 CATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTNAGTAACTAGATA ?#9G;#F?GEH,*G*<8:B0-H7-89H+GE%)50A1@C;G725C2:4-#/8>E?"&=;$#'G4?77+%*9C>A'=486C=)4:*/=4-G,3F?CH02"'F0F39E) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2435 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35184 42 53M = 34938 -299 CACTGTAAGGTCTATCGGANTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCNGTTTGC #'+()$*)*!)+&*+$#!&%()&%+!*(&)#$!$%*((%!#"')!$+*#$(%' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T26G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2436 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46754 42 133M = 46887 301 GNTTTCCTCACGATGCNTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGT %"(*#%!*(+$#)#"+'(!'%"&"*)%&!')#")&!(&!+$*&$"('+!&)'#"$"*'#&)!'''))"%##*)&'*!#!!$(!"%(&"&$*$*'*"&"&'!**)$"$$%!$)*+&#()*")*#)%!(*++!"" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T0G2A0T2C6T116 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2436 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46887 42 168M = 46754 -301 ATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTNCACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAG 3E#%9B*FD'+>8&:"/A60A5!+&!#'@"?7A9:4)"@41F?D@?&+$G8,/;.G6)$!$6).H-@@B+<+!6E0CB4D+631?'<5:A,!'@.<+&4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95A72 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2437 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25884 42 224M = 25802 -306 TTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCNTAACTCTTCTTATTTAGAAATGAGGTTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAAT !""+'&++&+&(#+%+(&*&+"(#"'*((($!'(%&#&(&'!#!)'+'!!#!*%&'#!%!'#!+#!!#)#*!)#*$$*'##*"'+*)'"&#%+"!+*$#*!'"+'%%+*(*%")+'%!+*$)++&&)%'&"+"""%#($$(+"$(!+#'$*'$(((#&**)$")'+#*)&+)+$'!(#%)&*&*#!'+!")+"$+$+()%++%+$#"))!(*(!$"+&*+%+$& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84T9A15C113 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2437 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25802 42 49M = 25884 306 TCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGA ,'>F0.-$<#=2B<-->G:,:4H;E<4><2G596..<=F+5,DC5,H06 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2438 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43443 42 100M = 43341 -202 GGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACG @?CH40/''DF7(E?GG,$:*1/H#FH<>@*%:?;=&FHG"<:GG0%+$4(>&?D51&2>'6@638#F.!;+7-;5?%C!EE-$28'-)@-1;5'"&H-C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2438 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43341 42 55M = 43443 202 AAAAAAGACCTTCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACG :32E*442DG&,(+/$9F.@EA2!@3C9779-.&:)07.'(1!19?6+1=H60=@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2439 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46029 42 75M = 45866 -238 GCTGTTAATCATNACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCNCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTG ',.,.!-CF&BA,H04)18/&HD#!8:4F$FB'3*.G7)?-%(8+2%)/:;3*H.4D;561.B&6G<1.*?'E'2,F:?6.73-CGH$20!.6"8B,G6'6H!H2821/FG=4-GD6#C3))(=;8-8C30512+E,!@3,%G=!A$C/>44C;23%B)!77!8:##&@*+$1B=*5> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39G57C29G30T1 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r2441 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11349 42 173M = 11212 -310 CAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGNGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGNGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAANTCCATGTGGGATNCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACNGCGCAGGAGATGCTGATTAA ($=HA"#**79A7:.(<1/6C+&(G41<)5:DH>;=%3A8AA*':B,:H/?#H6$-/>4@,1=2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28G47A33A12G28C20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2441 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11212 42 137M = 11349 310 CTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGANGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCNAGTTCCNTAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCNGCGATGAAGCCGGGGCATTG ;$558>BB3)CE>H!)E:52#FA6<496EF7B46*!"@B:#@;,5'<'31&A8=0A1.EB31<1=8496;0C$%67H>)E64%E)H-46C*$#?5B8A?E%C/%22?73FC978B#++0)F503*718?2?AB-?4% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C25C6A49G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2442 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21155 40 43M = 21318 212 ACACAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAG 2"%*E'0-E"#.'!931(639#C1)!B;A3>6E)'?>6-0:B'*.!A'A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C49 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r2444 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25238 42 98M = 25170 -166 TAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATANTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGNGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCA H,D57,.BEB8B72CFB18!>0(+82EG;/$@/?)+1*?;>C*G&*>,7D7:%D)F(DE>2-A#31$05(F+E9%+..&4G,*1D82& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T25G41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2444 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25170 42 54M = 25238 166 TTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCNAGAGGGTGTGTC )%.181>A,F&78&D?-?4!22$>&#,,9774DH1)?=#4?"?'<3%?-@?6F9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2445 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48087 42 78M = 47890 -275 CGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATNCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCC *:%HG)H+@9(D4-&"D&7D@*/%=%2,;?!B8(>FB?-3E#7777FG?B$%3A@7#&/-8>8=3(=9#-8-#$?80& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2445 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47890 42 132M = 48087 275 AGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTG H;3E"&!1;1)37B@,B%"AG'A+.-(*,4'2.:(0A6H(D5!+8D6?B0D6$5E=E(B&-+%$412DD)&.&-65,2::GB'A:A:/+;6=B?A2"&/B9-@+GA9)H>;:$'0C%!)#!G%#.*58&"1' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G128 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8804 42 110M = 8978 247 CTTTTTCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGAGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTNCAGC )+!+*)&!#+!*(+""($"!$'%!#'#+(%&"(*("**((#+&%'$'$&("#*$)#'(#'!$!)")%#)+)+!&+&""()"*$&#))%*(&%+%""!($*!)&!#+(!(% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A3A75C24T4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8978 42 48M1D24M = 8804 -247 GCCGNTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGNAGCGGGACCCNTACGCGAATCCGCTTTCA ;/4"*438-18*B)#1@6+H12-"<)29!;).!:>507!4?"/A;;,>2,'B!3F')31E5$/(4+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:4G37G5^T5T18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2447 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 148 42 42M = 148 0 CCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGANTGAAC 4-:4&;=:C2)B065.!<3=H?;<#!/(++657"?#CB"&3) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A5 YT:Z:UP jpayne@0: r2447 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 148 0 * = 148 0 CCAGCCACCGTTACGTTGNATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTA 1&9G',G1)E@A+/5*;H-HE.E#%=6.);47*42C"(9$F?B;,;.!2B?"D#8D!':#(+F03CE.$#?=<2(,$4F6$ YT:Z:UP jpayne@0: r2448 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2453 42 128M = 2306 -275 AAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGNGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAT 115>3!&38#>0=,?E#>#F(3$G5*3!#222B="?H8)849G@"--(8$8F),/A3!DD-3&F8;+9"E1!2<26>1E/#<(+//AD@"3"4F%5!#(;79;"?;.$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98C28A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2306 42 147M = 2453 275 GCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTNTGGGACAGCAA &G#>;,:2"6GB5+3=<&BF>@>"903!-G+?(!F4FA'22$#0*2HH)/7>>-45#C=.7-'>+(@8#0$7(-"7@1H/AE,<@B>48G8?7E0D+906;5)&(7D&02)H!26#A"6EA%4<>F1&C8C?=:9.D46!6->)'")"=E)GH/F/D44B.624=8(D)E!"G:0:-!C1G(!2(E-9F<:8F='H;$D:.'(;A61D>>%+:02*04=/8'*HB8?/F('9,/H<3,4?."/:!39=2-&H7)+-F+2>9H3-25&? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59C18G129 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2449 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6552 42 60M = 6612 268 TACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAG @"H--A1'E?1:)").((H9?@6)173"@B2C(9B40$#G>"&2(53D-+.G-."H1/34 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2450 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39265 42 43M = 39134 -174 GACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTA A,-#A2-DCF&)<,'206&A6)"'#556<#B"C.@:9-H(475 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2450 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39134 42 41M3I32M = 39265 174 TTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCT .G=73/DH<:*,8&9G>,-4D>G$/F8!:*'E;" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2451 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36556 42 116M = 36556 0 NCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTACGATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGNCGATGAAATGCATA #+,E0E4&)940/&3B',?H;7HG+4(B"4H'4>C<@CF2A@(80'39,CD:6:/BHC(*G%%++&/.18B$(DD'0DDFFF+4G&A*3F<8G9@&+*@&F11/;?H64%48:4*8 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C50A0T48C14 YT:Z:UP jpayne@0: r2451 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36556 0 * = 36556 0 TGCACCATTCGGAGATGTTTTTATTTGGTCCAAACATGNCGCCTTGCTGCTTGATAATATTCATTCAGACGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGTGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAATGTCATTAAGCAGTGGAGAGCGCGTTCAGATAGAGCCACTGATGAGGGGAACCACCAAAGACGATGTTATGCA ;>;5(E2:$G:E=%3;2%0C-1<3@)E976>=0;5:5C=:H7;B,&@A>8;G5=8/%#4$G9*(E2&"2$63'!H40A8%3E#"-F;*#;:6&.B2#=7"G6;7H+-30>F!?>.)09+28$=&!3::H@6)'6@9&1'')4>*>D"-F&.!79?>>8?/";F!$"-+E:)%(/F=%AA9'0/%*H?H@8!:F%0'A/+2 YT:Z:UP jpayne@0: r2452 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 992 42 126M = 1138 276 ACAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTNATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTA &!+8@/&)%?,:;H57EC+0BE1$<9("5*/<-,G"6B=(A21=:67F>(:?4-F5#3>/6;A#43>+F"F=(!$'8F8;D.8(*!:6+C0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G85T3G34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2452 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1138 42 130M = 992 -276 ACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGTTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGA !;+E2EDG./=$*8E'9)B"!?!30,,)?C*,=)%3/A,(>67+'#=>4:<7-G%6E16&G$H7*9DF@"84A*6G#0,"F,B&5+)+(2+3=A=1D;/.<>43+,B51+H>"6<3H;?E.C)B8;H7*( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2453 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 201 42 72M = 390 248 NCAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGC 2!=!2=B39'E74526=7/:3(D)AE/;-#"E'FG,HB>#=<*$*4!!*;E*9&?3?$*D7*!"689%<#* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13G34A9C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2454 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17151 42 318M = 17469 435 TCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTANGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGNAAAGGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCNCTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCG F+6.EG=,23G.1&F:$E)-%E-?C?-:.2C8!.%&=&4@0)='125!9=6B+/E17*9%$/A;=7>$>>+%@>)9".)#0.(/''@H$>D2BCH6/17A,B379F12.$<00!C17&@@G!=@,FH6F9"7;6&,".#256'GE!H$.56A14E<01$(74A6"/)&B)7$E2G8E-:"H&+=DB<7,%!!4-7)E7+7=!.-+5;,$5?1F8.$0+&H&!9,74@%A<69@H9*1%H@C0+)F.82'@'-!#@<>;;B3E<+:;(:.1&:552<$8DH?# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A1C89C20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2455 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13382 42 84M = 13253 -213 ATGCTGCGTGTNGAGTTCAGCACAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCA 2#+D3;%D89*#278=;3>4.6<-7?),??@.@!!43.*9/29=;EE=,>8*%7'.>C/"()!8:<'"G$*"?H24E8+2?3'; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T9G62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2455 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13253 42 114M = 13382 213 NGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGG *9F46E7A-&,AA:$B!1&3>'78(3$82,A+B1<6G+@0+B/)2F5$F('16#C@22A$=2.!@&4619'E*43&<'7#%80=G9?@0*B*37.6.0)'(*;':CE)A->A9: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C113 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2456 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19179 42 60M = 19239 312 GGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGG $0FE"DG6193H7#-0!2#72)%2?D>GH%D#7$9)>/(*A*5* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2456 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19239 42 252M = 19179 -312 ATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGG @C:H7/,$C#";$C=D353=<&."$E3C"D8=?7.00$,#B#C?FF12:C*F,,@&%59$0A:B2$91.F%;<$<3+8>-H-(F;,53>$#//65!7@;*%H:3*@,2(2#9'FA6;G<0C4C-">D57:1!0'A'@):E'"D(E)4B7.#9+)4?G8;$3D/:>'&@!D'CA$,(,D%AF*)*B>9$&G9B:B1!>0';D-6*0?1'030D6E:E69G(2'-@A+"?E5=1G.C<0,$F=.+C@9--683B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:230G21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2457 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12342 42 42M = 12558 265 TATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAG &>+3@)5-.3E+,H,=8@$+@=>&F8<8538:=25+'3/!77 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2457 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12558 42 49M = 12342 -265 AGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGA '.'$79!22>(+D!C>DG'=673"/&?B9E%,H)F"G,"),/A(B6E2HC;F=(C6D))"+G+:10;>"98&F?-0*@1>!'@.-8/F7H$A9@$H$:3BE"-;$8"9'C*04<+4E-;C4"$8B52*,;H#9?;&3)>B@)&0@GH?B7>;C#G!DE*,(B=',:*:<:.&A3EG4?4;9FG1H-*'H#0"@3*%(9?4F9'="!&,D<"639(=!70B5&FB6?E+9'2)"B/><3B%2'819930D/C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:185 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2459 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47669 42 70M = 47739 620 TCTNCATACAGAAAGATNTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGNGACAAAA ,*1F=?&AGA/E(?@6:0-CB AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T13T44C7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2459 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47739 42 550M = 47669 -620 TGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCNGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGTTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCT =%'D:=6F$EBG3),1/)=5'+F2*-E"$'/E?$'C15&0'5/1*;8.3G,GC?>H1=;D===*.?,"52&*0/B!+$5#C"#*&-HF&C=!6"<7DE-?'.AF7;H#!<2-+)8B+B03G6&?F7200A$H0<#(*A2F6&!#<,F=C!2/4B/,@H479G#*2E%(+$,;#0CHE"E#?,-3773?-+3+D:@4:29B,/&6B57*F630A0&,G7C;!>4%E/,@-GDF9'%!E*E5;("'9C#G.":?%0<2*E(2#8=1H?3802&5+"-H0G<&?8''+&745/F.'%(*C9#!,07;G"@.:>'3331(=,.C6@:=+F(>4<62D(,+64?-+5+C46+625@94&'$#'$)F*6"*=8*$$&A$,-A85,51<2=H'$2==8H4;A,E*/>D(3.&B1?9+>HC:!,8?="(%+0C?/1*:922. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:154G37T209C147 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2460 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4114 42 83M = 4289 253 TTACCTTCAAAAGCGCGCTTNAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGNGACTGGACAGGCTCCGGTCGTATGGC ;:G!).HD<'8$*;(&8://2H0/.:*,%,D42HHEG=7?6'3.3H9.1@=:20#8C@)#2/67%#6:*+%0@C'$H#%:D2?0%8E-:9C37!8#B#(-)F6B,.H2"0CA<& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YT:Z:UP jpayne@0: r2461 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18894 0 * = 18894 0 NNNNNGCNNNNCGNNNCCTNNANTTNNGCNNAACAGCCAANACANNGCCNCAGNTNTNAGNTNNNANTGTCNTNNNGNNNANNTNTCATGNGNGNCNTCCNNNACNNNCNGGNNGAN "!##!#$#$!!"!!"!""!$$$"$!!"!#!!#"$$!$#"$#!#"$$$"$!#!"##!$"#!!""!!"#"$"$$!#"$$#$#$#$""$$"#!!#!$#$!##$$"!"!$!!$"""!$$$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46787 42 58M = 46996 285 ATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTT ,!>AD4?D:+7#G1&BG&CF;?@!57?.%,3G>/?)=1$'=-!4H9%1!D205B>#/! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2462 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46996 42 76M = 46787 -285 ATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCNTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG $+-3;GC@;8.*C#*2'!B%H5"A4D6"2;F6'.&GD/,'$F$*A18>>D!%F(H.6=$F$33.%!2#)@=H:8E&7:8*08?+0/4;8.G7B99<1)&%ABH<9DF0**=/C0"#-:%2(!E$B=+:6)'-,>($'F8988$((*F<,;D$E%);.9G'+2A,?/&FF?05E7+F*&;-=.&H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T69G79A12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2464 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36290 42 105M = 36395 293 GCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATNCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGC *DD9B5E=!<=H1EF(F;60?4?6#F==#?+%:!1H"*F,,F$2.A>*$"D:&24(>DD;"*%"#,F*':06%C!/4%7F0?7D94;6%!-$=(/1(C&6=-*** AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2465 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 78 42 82M = 15938 15965 TTANTGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCNTCTGTCGTTT C:1B)FB65&F7<)B%+(6*H2;92#/?<*&<,F$,)0)3&C(A'C+*F29G-66238!9"*B?7<<3:F/,#"!A-@**G1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A67C10 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r2465 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15938 42 105M = 78 -15965 GTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGCTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCC ?HD6:(!6G9;=#1)D."7*(28%='*;>#"F%=),(123@?386$%'')$5F@4G.17-C.D"D<4G*E&B%)D($$A"$/@615,7="H+609A7=9,64@E/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75G29 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r2466 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45984 42 119M = 45810 -293 ATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACNGAAGCT 6A>!3#=F!1@:882'FG!642%(-/)B-);40&FHC2HHG?G"(AE.)4,F9HGD$0<2C;902D)F6/G-946D, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112T6 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2466 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45810 42 74M2I52M = 45984 293 TATGATTGATCGTGGTGACATCCGTCAGGCNATCGACCGTTGCAGCANTATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGAAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGA D%$9:2;E$.@<'+4>36$*-;8"70%CC4E#=36.2!5EB,31+? AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:18T11A16A78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2467 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28729 42 98M = 28579 -248 TGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTT !A?95"2#)AF4?C9(!!'D7&G9;+D&6+*;2.%23*>E35=1%.B%)+=9@9))$*/>6"(8+%B>@$C2";?,;E%90,G#;DH-;'".0--A:, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2467 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28579 42 122M = 28729 248 TCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTG &'C@FF,'!&(!!<+7-:B/9B8B54;.6)@)*62HHA8@F5'6,4:1@;7G,,4C$-=1;"!G6$0'B3F=+%9"(5GE(+8CF+EF3G,!+$+4)>1@=;)&,H;!"%E%4H=$!42"A2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33964 42 50M = 33785 -229 ANTAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCG (H--8."#@(!0,/(?&E;EFC*5(4$A'?,AEF;-+&?2DH7=%0E=/A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33785 42 96M = 33964 229 GTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAAT 7%311)44:>$%(222C11().C#BHE$.,4E"$1@)385,:A370H%0$%@'"11D/91H5AH(-/(2D4'EF-'1>0.E&;)B)=24B@$(*:> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2469 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43526 42 89M = 43257 -358 CTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCA 9-35A*+2@/!;@-(B*H!7@-+01D#?6/**77/9B#8E@7CA'B7E"?*.?<>3>EC5='5"?+D#,;%+'5$,#>A%5)$<73))9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2469 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43257 42 269M = 43526 358 TACTGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACNAACTGGATACNATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCANAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCAGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCNGAGNGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTT '("'$)+$"!'#$("#%!+!%)%'$*"%#$#!(!!)(%+)&%*$($&%'$&"%%(*(%)#'#!!+#+"#')&%!!)""()+(%*$'))%*%##"&*#''&*"#$'("!*)')%#('&($*!+"#&*'#&##)$%)&""*)!(*+!&*'!$+($""#(%+*!))%"()%*$'##(!#"#+*#%%$%+&"'&(*!"$!$!+*)%$&)+$("%(&"$#'(!&($&'%$"!(("('#%&#'%!(""$*($#+%&&"&+%$'($"#&$&)("%& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3C45T7A10G63G46T41A3C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43762 42 136M = 43576 -322 ACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAA %@/<*BE1(/,;,A0BH*3G:'-5*<;HH,,+#6EF@3">%?0;2>)H/.2%%>B$0A;=*<2<=BB2=>,B+)D-(F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43576 42 186M = 43762 322 AAGCAGATGAACTTCCGTCAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCNATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCNAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGG E##"C'B:4$1*6>$D'7-;C'-"3D>,?ED*F3>4!7FE68-"H;8F.!05:&&3&H!82;A1':38+%+F65A"@%5A30(/,A&C>$!;4"D'.'->4(-*;-D3=;1.>EE#0<>-E7:=#H=1(2C$/:(H*$**H;;@&G:/HE3>9%=GG=E+':5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T49G33C83 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2471 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23387 42 195M = 23623 282 TACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATNTAATAATTCGTAACCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACT %@*E)@'F<>BG+?6D?(:08D>6H<$>$7D+%>E(11E*.GBF26'>547"+"DAH'5)".@54*B#&AH?B'8:F0/(61!8!&0)8.2?=5CEB7B@H89*,:B+&!;=CAC$8)/#.3$1A=-9&05%E#;?+%7,=64>/:D3%';;;D34&2-%&=.-12G1<9)C?)(DHF,%/!30F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42G13T138 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2471 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23623 42 46M = 23387 -282 TTTGCCTCGCTNTACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTAT *%5&E.5;GG9HD-%D4,06A<='6+#8:$FB:@739BB*7$?*C-!/?*G;;B.>4:9&$E,1C>-"6=!<:,;&B# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:62T10 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2472 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1750 42 293M = 2043 366 AAGGGGNTACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCNCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGAATGGGGATGGGGGCGGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCANGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCC )@<.)G*&>09*:>0+#'C=AC('HG+)#8D5=5!CD.FB+;E?EBH*1*A$<,B<"#08/D'3FGB.0(;E(A-5)823CH(C49)./F)83C5C"5D#B<&?$<-)A$@7!+2E>,#=D:)0AAA>?:&3+4#=:,--)0H;%,3A9B70H=G:0B2A1:;'+#G7&!47EA&2E759+5DD459-@<@=<:8*F?H>*80/#47$8(FG9;B#%+5%852+C*0(2D:<<(DB%<49%"=43=4,/&+3;=D/*=6#-F+!,50086,>E,B& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6A47G111C25T14C48C36 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2473 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7049 42 129M = 6963 -215 GAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTNAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGC =+H"5)"48?/".C6*066CB)@B>6=9#*>6?%4:.4'(G:!HD#F@E#-?CF4?5$D0,!C7BH;"(97;#B/*:&B@5F(6G;9;5!((1><929EC&!D*=;2F!4$=>E%;C8$:/,%-!9&D( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2473 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6963 42 47M = 7049 215 ACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGA 7%<;$H'5?)?$:*@G/4=)95C?(,+/-:(2(8CC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2474 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18848 42 158M = 19006 724 GCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACT 7!G#.4.<'BH"',&8$**A61'H!+AB#:=<$#F:?*@8>E8?G85/2G5"<0G8:!'B&!;;H&EB.!*9?2--E%CB:+54+5=5E4FB+&5@G;2#02+;?5%2117"C,0,1-*,96!(B??'2G7<4+/5-%*=.)6"!%5=9CD,'?&1D* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:158 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r2474 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19006 42 566M = 18848 -724 TGCGGGGACAGTNACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACNGGGTACATTGCCGTCGTTGTCAGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGNAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGAGTCGAAAAAGAGCAGNACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGTCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGNGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCATCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCNACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGAGCAN )&)$)'"(!$$%!(&##%$&")#%!+%!!#+"%$"#$'!+!)*($)%&"%')%##('#"$%("''!)#((*"$+%&'%)$+&"')(+"&!!"#&%!!$"!*#*+(('"$(%&%)'*++#'"*#%((+$&##$#!"*+%$$&#&'()+$%#$#((!"#(((#"+"!!"!)"#'**""'#$"*+(&!*%$&'&)+%'("$!)&)+*&$!+!""+'!*#&#)$+)&)$%%"(+##+#'&*#)+&"***$"+#%#$%$&+")%++%!!&$%++#!#"$)*(#("$'#'!$'(#'#$)(*(!&)$%"+%*%'%+!+!!+&#)'')"***')&(*'#'($)+*)+)+("$%$&**$"!!%"!+*#$*$%$+"*(*))#')&"+)%%*&%)*"*+$"&)$$'$)'&)$)%#&%%!(&&+()'+(!)!)*$)"+#++++!%+))$'")(*%!#$*#&*()+*#&"!'"$)%#%!'*%*'&)*)("!*$!$'+&&"%+%&)*(+!!&)$"%!"!#&&*+")+$%"!!"("(&&"('''#'&&!'$'(')%!%'**$$"%!)(+!(!#+$*$(!#% AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:5T6C61C21G27A72C15C66G171T10G29G38G28G1T0C0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2475 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25182 42 100M = 24955 -327 AGGTTACNAACTACTAAGGTTGTNGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCTAGCTTAATATTCTATATTGTTGCNNTGTCG +"!%)!&("!$!$$+*)#)**($!)!'*%((%$)!*#%$!$*($'$+#)&#"&*#%(&&$##('*(&%$%*'##+(!*%#&%*(%'#*#$+&!""$"(&% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:7C15A45G22T0T0C1T2T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2475 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24955 42 131M = 25182 327 CCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAANTTCATGATAATGTGTAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCA *,;5)F8F%22+'*H&=%439!)2H!"'+F>F*"BD-H(B08((&!-"G'9,H?#D1E((-!>G7/3+((*C%'D((@B&C# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51A4G9C64 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2476 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15962 42 61M = 96 -15927 TCACCATTAAGGGCACAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCN D6C"1<<3$723D;8%,B21/49BED$+",&E>"&1?G2G36>'%"7#89#(47!FD$"+2.9.35)$*6(F+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2477 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25039 42 96M = 24925 -210 CTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTNGCGGGTTTGTNTT D78A?7/@/,&A$#(87*;?*76;5-1=#4"=2>=C#E@))74;E0:*.")G$(&5>/9.?#$C2/'0G%0.02=8A+D!:?;D1E(+-G.0;#F@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82A10T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42239 42 99M = 42338 294 CTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAANGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGT *@.E>G>E>:BA:-=*1:9;%8+#27$$BF@8*'/"?2B!F43E)1A%.8A0@6;E(B6;4"9@)B#5&G-)#+*E(?"@B11=@$>2(?#<88+/C-H07?+,7G"'4?/H&;D;8G3$6,6'!C4*/C<0:G2"@F$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2480 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39240 42 84M = 39402 222 CGGCGGNGATTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCNGCCAG &$&*''"")%%(&+#'#)&#%!***#(##%##!%$#%(%!$)'"+&)#'%'*%(!#')(')'%#%('!#%%$$%+!"!(($&$+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4A1C0A1G68A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2481 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38377 42 113M = 38204 -286 ACGCAACGAGGCTCNACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAANCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGA !#4,18C$9D30%=EA5?9C*<:<.8=;40-473(G!<;>!-G>&&!CG*-7'85.1ECC'>9G4G)5+B<2=11>C($":BH2'=F5<=@:B>8";'.9@4D6(-%.,4E(A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T29T68 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r2481 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38204 42 40M5I133M = 38377 286 TANAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCNTCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATACGGTTCGTGCAAACAA ;G"*('D@EHCD2%,!,45C=B=D2H48D,/0/,$G.$F=+H?3FB-B'56''H':(E167)><=%86H""'".@@/=)04A6-G@27;4?).H6E*07G+2-)+?:7A:E49.)<(,1/F*<9C40BC5#C',0/B924<+*!'9G!+D07D%,5,>%!&=C80!--"-"5)($3E*B:B%%!31+<67$-/G8@&C&@)#%%1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2483 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34520 42 64M = 34665 232 ACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTT 3C;'?13+>';G(/74D@*%$(5D4D5)H64,G+9&B)+E#::*3)0A..))8",:E'9C5)(D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2483 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34665 42 48M2D37M = 34520 -232 GCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATNTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGC $"&("&$"&&*+(&($&(((*$$"&!(#*'#'+%)+()$+)#&&!!)$)$"+"%$#*!&''#+##$&##!)'$"''&**(%)+&) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:27G20^GC37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36256 42 190M = 36168 -278 GCATAATTACTCCTGATANTTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTANCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGNTGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCGCCGGC )BF+.="**2?H,?@6B!.6F1+<)>+"!6F.+1'HG7!3D((E+8,..4*=;29>A4?H.+?/?#F328''6?:#9'>=2F?0!60BB-CH3905!G.(;&G.9-))D2*AH>>-/G4!";3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A89T36A38T5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2484 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36168 42 88M = 36256 278 GNAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGCATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCC $'*+)%##+&!)&)"!!(&)!$+&#$+$(+'%%**%#(!&')+*%+#**($%")&"*()')(+&!)#!*'&%$%)!+)*(&*#!&)#% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G48A37 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2485 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17972 42 71M = 17972 0 CCGAATACCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGANTGGAG ,A*38-@27!32(A8C9A7@>5F$;-9E8),?D?,8AB#%'D"<+A-#B=@DE#$C64H&!;(+3G8(=1( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C58C5 YT:Z:UP jpayne@0: r2485 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17972 0 * = 17972 0 NNNNNNTTTTGCGNGGNCTAANNATGNNTNNNAANTATTGGCNAANCGTNGNNTNCNCANTNNGNNTCCCGC #!!#!##$#!$"#"##!###"###""!""##$!"!""!!##$!$$!"$#!!!#!##!"$"!$##"""!"#$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2486 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44326 42 63M = 44076 -313 CAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAAT ,E!8'!2"1>3?D1554/0E..A%-.A!?52"7.9B<7C:7@(77E3+A1-;0,'(8%679(@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2486 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44076 42 115M = 44326 313 AAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAATGTACTGCAATTGCTCGCAACATT 8=$1;&.73'.")H43,BHE?2"D@:H6+2,H>G/$;-6.4/..E"=:;*6++C!*89*C>B8A6+-9"/2B?#H.33-.*#1)>(>D*E1<0?;H;6,$&2G""91&;=,>8/< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91G9G13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2487 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35435 42 185M = 35620 507 ACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTTCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTACGAGCGTCACCNTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACA (0E9(F-*<+)(E/7.$F3#'C+)5",:/*22"'*=?F.B9))=D8?9$/C@-E"$.$H<#F2,G-580'@"$G#9FDB1:-/@HH'/8B/79E!-/%A$@&?+<2%5-C./792,3%9!B3+:&<;G9.)5?D''42'#1&;)D->!#9D*H)=C'929H+092C6"(01'1F54!>H(67/E# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84G24A10T64 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2487 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35620 42 322M = 35435 -507 CCGCCAGAGATANTTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGNTNGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTAAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGANAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCATAGGCAATGCCGATGGCTATAGTGGGTATCNCGTNGANNTTTGTGGNAGA !"##%(")$*+)"#+!"!*)*%*!*!&+%!%&&)%#("&%*#""$"*&$%(%)!%!*%")&$&#"#&%&*'*$)"*$')"*&**"%'(*'($#$&)!$)+")(#)&"+(++)#((%%)"!$+#&)"*!""&!'+#(()*$*#"&(+"$'%*(!!(!!'&((*)&'!#(*(&*+$'")*"&%)+&&*)"+(*'*#*$'((#$+&"'%'%"#$$)+')'&%#&!%&'+#%"''#&*&$!*#""$!)'"!$#$"+(()*!$*+$&%"#)(*'("+#'+)')$*&$)!'("%"+**$#&!%"'+)%'"))!'%!!&(""!!'&$&) AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:12A69G1A25T73A87G16G12A0T2A1C0C0G0C2A2C0T0G2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2488 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11104 42 55M = 11196 203 TCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATNGCGTCCATCAG 8)E*D!@A$)*/%)&<3&;&//(G-:B@/@/>&?"609&.49,:$A=7$F";"9" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11196 42 111M = 11104 -203 GAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTAT 1D;F@.!E4>2-&%B87%.3@AD,&97#F@EB19);5#?9"A3@#<;+9=9H=?G6F'H;23H+7>%8,4(#:=:!E=H!@!9=#*/9!=A=;6#?@,:F92 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2489 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28431 42 134M = 28683 373 AATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTAT (>85(F(2?<=5F";HC$!@8A?-D,'1G105,+$(;&$,"$969&).F9'<-F.'8)<+C/"7+.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2489 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28683 42 121M = 28431 -373 CTCGCTGTNAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACNCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCCATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCC G2C6='392E%9'5B)*-".H/2!A1G3):-D.(-1@':0;?-,85<1C9B)%A:$D%H:%=;DCE&$9;">1A"'"#F>B#56;=F#;)&D5>HEA,'+A%>4/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2490 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4715 42 254M = 4612 -357 CCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTNGACGGCATTCTGCTCGNTATGCACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGNCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACCCAGCCCGG +()%*$%'&%*")&+*"%!*#&(#*+)&(+()#&($%"()$'&&)%"+&%'++)"'$*&''%"(''%&*#+$'&+)$**%(#)%!'#*+&#+")'"###+"&(%$+)$$#!&%$***+*"$!*#&)*+$%$!#'$!($)"#%)$%"%##!'%!((%)()*(#&!%"''*###&&$$**&#"(&&((#%!)+!&)'!+&)!*(&$!&)*$+%"+#&#&%$+$*++"!)#)!#'#%))&''!"'+)$")$$$(')& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:71G16A4G87C63G3A3C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2491 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20604 42 86M = 20342 -348 AGTGCGGTNTCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATAT F'5$F68.='F769B1@%G0A1C&E/935>:7$=2.$#.7*G-,'5:@2<('/@%FG3=9,:E127>1:3@G?+D79<,.B"5D2A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2491 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20342 42 46M = 20604 348 GGCCGCCACTTCAGCTCGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCA B'4@'.?#.060)7/&@HF1B2E&,!!*+A2G%(AB)2EE;FD#%- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2492 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38488 42 137M = 38661 223 NAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCNATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGC "/-8GHGEDD;3?:38AD8:/!!?0*05/9=2>9G"%3H<&(G%!?5(8:F"A+%(7F4DA@DEC1F;18H4:(;>#F%@1H7+03E)3#6)#55+!#%*#:+)%4H@F?D:>"&G1#6H)7093F,*B66.D9&%92.&D39-11H@7.AC'0H-0F,!%EB$/!E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26001 42 129M = 26259 311 GTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCNAAGCGGAGATCGCCTAGTG %2?>-@'=HF-#19GG5)'/F4<'>.!E6((*?0'D:%?1<8+,.$E;/;8@:)#*7/*2(H46:3/:30>*C?=1AF-6,>8#C>8H74B=8!C=H'#>9-9+3@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2494 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26820 40 41M = 26562 -299 CGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGA 8;,%+(,&H#)$G?DB"8'0A++3&/*-H$:<+%#$3!+5C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-50 YT:Z:CP jpayne@0: r2494 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26562 40 125M13I133M = 26820 299 TTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGANTAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCNATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGCAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTC @A377?&D+D&*,83;&"+:"5+$;62G1.0C#%,8G@EE%?/?:1;1;>(&=-/1+!/B+@8.D827:&6,2%07<72G;,*@&A(!1+C0B,":+?$,"+"3$0$C3EBC4#(4&6D)CF?H/24H267H+.,&2#%6:"="$&!9/0+@$64H;BG9G,(CE:7%A#8E/?;*3-;:6<6D0&$7B4)+,/"#2FB?#AF>4*H91:?#C)95D.CB.,+$)"49=''<52+<9A%/<@.(360.&C;?)5=<<(1"%4.2*FG5+B(+>/1?,@!F-"11G?:#9);:%)0D7G36/B*!H.AAB1GG3.B6>##=F<*GD<5A,(".6E//&H=<$H(4#%B.H+E#'B6B01?B=$F.984'<,$268D$+A&$?1B")9#)@1%GB/@!:=&4((60;0;01A(6&F00G7(7@>='G(4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14051 42 78M = 14194 247 NCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAA "C#.G3@5"3A9!:(+-172#*&5-9=#2D>)*."9F,:)6/(!H)62#.?@1,*"'4(?*80##4%"'%7(:#88*/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14194 42 104M = 14051 -247 GCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGC BB"<-4*,??2F;@7"@0!F%+H*=!:C;DD/);)(3<$#92E%BC'/B='G.(HE8(<"6*$2?&0B>+#%%A(!$5&>?#+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T46A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2498 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 882 42 162M = 1075 256 CGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCC A9EAA.1,03-:>@-48+"/:%CC':3%GC(+F%C"46D,C)'!7.5&@0H'+1:<26@9>2+F+%F"/?9;?*"E5/CHA")21$'GG-6C:&:0&5;('5D,#(/?@!3<-A>GB)*+*68"!(8E/)0$=42E6GC;$B@/=*!C/%89"?%<-365@4/#?5*4#1GG-B8,&$G*&C%3G-F.@:D$0.+:*7F>AC:-1AH1?,)*-',-?%266+"-?'0.E<6"1-$:&C17;-B/9-46FF0E6.(':+E2' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C91 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2501 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18031 42 92M = 18031 0 AGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGG 832#7("958,07*E)69E"B&(0H/@<35."0BE0+B8<<4/9"H#H)BB'+=-2',-$8G.6%=(:A"6$+$23#H!#6)*#*'F<#;H= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YT:Z:UP jpayne@0: r2501 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18031 0 * = 18031 0 CCNNNTNNGTANACAGNAGGGANATNTNCACANGTNNNGNTAGTNGNTNG ###!$#"$#$$"$$"$"!$#"""##"!$$#!!"!##""$""##$!#!"#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2502 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48353 42 132M = 48211 -274 TTTACGTTAAGTTGATGCNGATCAATTAATACGANACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCNG C<'$2661;G&!82C3@>D>9$E,?;#4=;%=C,@)"<;G<4=',14$#4A,)46/1<(>8+C:8B112@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A15T92T2C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2502 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48211 42 95M = 48353 274 TTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGA %"/:'5%F8<5?,/@93D>!98--9"D'6B348&;ED0*:D4":B.<3/$5(,>:E'6)68:5C5-88&"8G1='%)!79<8;6-&+=*7&D;!' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2503 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41732 42 47M = 41594 -185 GGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGCAAACGCCAAAGGAGATTAT )/A@(F)-%B+>7&>AD)88F?.89-<'-)=-<("DH(,,C=A?D,) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2503 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41594 42 137M = 41732 185 AAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGANGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCAC ?@*E1%A,':G0*-F;??/#(?6$A"2+(A922:(($E&*A9BG*D<<%+C0>#>.><+9,""A%)"A$4DF7(9838+%?;,!-73D.,1C)+<+*3960D9DC&0',D@;7<->.0G/&-4!E8-A.<9$CA;05 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98T38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2504 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3435 42 69M = 3616 232 GGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCNGCAGAAATGGACATGGATACC 7=7(3(=(&.3#>7&0H(HD0.)'5D9@-+>)+G)5;B.4>9$B-CC+DDE@(B7"=(1C+8F>8(E,.,)(<: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A35T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31683 42 122M = 31854 266 AGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGANGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTA .D7(2%26''>*/4"@40#@/F:%0?6'@2&8$A0$./(%320<7)$4&C9C&E6-8%@21&8+9GA=$HE#5A,>3$!$9?90@/)C,!1>&%'819-H@'%<%>#3A&=0(, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31854 42 95M = 31683 -266 GGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTNCTGAAGCGGTGATGANGCCGAGCCGT '9&%8C@E0$=2@%7E35A?18=C-CE'""/CD9GB.>(H!24-0C6'CG<-*6"F94+":-&7:>??,=//CAB5&:9A4(G@BE%#)&)#:H'!,01<+B0.A,FB/H56?75((7C+051C:=>"88'#%B/".)?E>(/*';D<6A63'G5;H$"F"67H'09B)1/*F:4FD&&>' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G28 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2508 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29785 42 74M = 30108 398 ACGCTGTGAAGACGACGCGAANTTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCNTTTACAAANCCGATCTCACTCTCCTTT %4)&E)30!5$"327-!(?.23>6%6-(!;.20#CF?&$#++<2A,.7GB4*5B14"#-#$C7$=%;H@7/,F9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T20A24T8A18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2508 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30108 42 75M = 29785 -398 ANGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAG #2@$42=*')7@>#E@8+9?)5A0A;E+@/7108$A?&E)48-@@69=3;99E:))1D!61(FD304G0H>>6G- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C73 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2509 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37802 42 149M = 37758 -193 CTGACNGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTNTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCAAACGNNNANTN #!(!)%'!')('&)+$%**(&$#%"&)($(&&#'%"$$!$+'#'#'')"(%(+'"!"#&"#*!"*)&%+$$##($+'$!$!**%&'%*&'#&&#+)(*#''&$$('"#!*+#"&%++("*(&&*$&')"%%+)$#($*$#''#()""(' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5T57T74T3T0T0A1A1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2509 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37758 42 44M = 37802 193 GTAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGC &9=E7G@@!/16#162*@)DE&*5%6A37:6:171H)#3),9(2(?$4=BG+61.",&F!=$%%%:?&<5:,+;;B2--8#B5:?'3>%D/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G71C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34401 42 97M = 34214 -284 GTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATNAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAA D9:26;CF!*!+)<5/%6"292!6(H>F&F6",#.2293(C=9-(:7'=!:H?F3=620AA(?E%!9GG0(6B7H=E9("4))G15D63?-G0*(-+:46:48A"&@>:"G#A35'5;*BF1C&* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12G38A21C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31903 42 54M = 31715 -242 TGCTATCACGTTGTGAACTGCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTG %+3)D+:()3/3CA1BG8DAA)A8-DB21+:@24%-;@E?.*+E53?G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31715 42 186M = 31903 242 ATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGT $G+:.*0'>#F.&8A=&'G@(.9(9%6A@D8D%9@3%#&7(@.@B>D-;G+1?%C2!)=<1@D:>,D6+0..518%?5/';:@!76C,#:(A#.+%/GD'>G9.2*8;E/E%)'B*F81,B8!!"G*&.3H,6/0?C/(<.C<(:$G0)?6A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:186 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21986 42 142M = 22128 462 TGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATANTCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACNGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGC 2)7%G:G/:=0AAE4:B.@13G/9+';;<.B(17.$"#C#6#9+>()6)"&&>-*6874"2;' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A60C47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22128 42 320M = 21986 -462 TGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGG +@66E,,:?5,F=7E4HE:E%2%B70E3"4E#!793C(/-E7#.-<.$0G72=+F(<4--$$##6&=0-,CG+().63G);A:7!$7"&7&,%+F#)$(0E!$=;-,)'7(?>'+/+B*+-G.D//BC=A8)/A7A1>/A%.*1'!CAGD*$;C/(AG',1&A/E46C"957'%B12;);7'4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:320 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2515 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36552 42 174M = 38922 2418 ATATCCGATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATNTCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCNTCAGTGGCTNTATCTGAACGCGC 1$#F2"7F.3-:@7$3*>D0AD;83$7G7CB*';>7-+-")=#F6@/!7"/C=EGDC9/8B-#*CC>1$=!+/';B8!<;?;<;#*7F:656*-*EF>C8C.D%EB8$1A5&F.#46FD@D9"$F;<3;%30);C!#@6%$EH%+C!C7H*>7:%.371#%$34?A71E)<=H,5&9=:4<56"2=0DH,!8.;(>-@3CH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:DP jpayne@0: r2516 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8276 42 24M1I44M = 8516 283 GGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCG 18*AG)7?/66*,/.G&>AHG%CA1F+>,C!E4'B1(5,,(C!.0(-; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2516 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8516 42 43M = 8276 -283 TGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAANC 2&8?%"7@*!B:88G?227-6!2,9$@<5..&,-$?E#,A/$* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2517 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40708 24 27M3I37M = 40493 -279 AGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAGCATGCAATCGTAGTATCCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTT 3"!BB6:;:48$7/DG8,"<73.*A:A.4+62)2FA>@%+7+A.63@G$F"!4(?,!*:,B"65DF$ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:25A12A25 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2517 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40493 24 70M3I31M = 40708 279 NCGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATA !H;.;4!9A83D>&A#:D68*6$A5@A3/71A(!=3%%A#,-A;F-3$D33@+H8:.73+$;=2F!4;,EAA(>=75=D:B1539G4A)-&;29548>0%1:))4!==5$.=GF(@6=?00(*;>@E09;*7=>?'+*C3$()(.8)HB42:'<33E98;"F!!G)B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2518 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35461 42 63M = 35650 287 CTTACGGCCAATGCNTCGTTTCGNATCACAGACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCT 0B4(/&(/#,19#H*;B0$>#=C@9!$B1<2$HE AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T8T6C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2519 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46016 40 107M = 45878 -245 CTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTGCCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTG 64;%-"#.;E-?E+,!!.,H+E5D#93,#D>G#!?==8B&C'@D6+#72$#4D78;<4A4C=D)>GBF$>'#!3AH;;C-9309H84359(&""800$A=8/=G"37 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A63 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r2519 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45878 40 74M4D34M = 46016 245 GCTGTAGTTANGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATC H#3C)$$<57,B17$%BDEFH!-17BG<.%&-'1#27)#3@-!@"91:E1F=/'?/H6$7$,F,30#?8/)D<09#.B3::$C$=FB.*D:=DBDG+0;)H34 AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:2G0C1G4T63^AGAG34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2520 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26627 8 60M13I11M = 26714 134 CATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAAC (C)'-"!9:=$&70@8(,=<%@"@!G'%8&4.1G#E#""4-A<;)#-%D/)3; AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2520 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26714 8 47M = 26627 -134 TCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATC 2(;BA3DH#>13(51@*2G$9="8%*C+C!/A$:=13#E%G=(-.$; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r2521 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20548 40 97M = 20645 239 CAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGAGGTANCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGC E)B5&';7D%0B0%4778'? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60C4T31 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r2521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20645 40 52M7I90M = 20548 -239 GGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGNAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGAGGTAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCN 33F"2$)FF*@$)7-6D8>134/5;>?;0('4&$8B-E0$'E!78!E;;,$G+?A7<1D)GCA(!3>47C@;')*<8#CH)!@35CD$>>#F0E?H?)F/$"-?G8!11/#95<2B;A*339*??-3EG%0!8C3)6,,:<9=?$F@@' AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:35C53G1A49A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2522 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36130 42 57M = 15723 -20464 CCCCAAGACCATCTCTATNAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAA #17!EB<==@4?E-:'"D-*F5,F/H'!GF"'>D6&FG413C?-9?+(9E)2-H1!F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G38 YS:i:-4 YT:Z:DP jpayne@0: r2522 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15723 42 101M = 36130 20464 GGAGCAGAGTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTG G:+?!(..9.2!<@'G%=A=-2HC,!%9:9$B,)1HED@5)-?C545(?C4%,A"B39;?=(7/17#B@;@,4/5'B2?E+6F;8&<(:&GG9<)B92-%< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C92 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r2523 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17086 42 93M = 16934 -245 GGCAATCCGGTCAGCNTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTA '((43@1E2G/.&@$!">D-&E%4#&6H4E*C"@F72&C,<%A9)=:/@703"2-=HD>.B8+5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2523 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16934 42 45M = 17086 245 ATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCG <1A(9A+C""F:80-5446E'D=?)-G(1@9D6C#8><*$+4-%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2524 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17241 42 63M = 17033 -271 CGACGACGGCACGTATGCCANCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGTCATCGTNGA >9=<,.)2A#!&82;@?;).B@66)H&?3(C@;/<).<(6D>!,'$%01#9>!?60"$CG2)$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T32C6G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2524 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17033 42 78M = 17241 271 AAATAACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGANAAGCCTGGTTGANGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTC 68E44;#A7FB!A5)0!##F!#%%E.86G2A2<<0*/6,+0&+B14!#)0D:21)$74);,0@8(7B&=!(8$01=>9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C28T12C31 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8765 42 261M1D34M = 8660 -401 GTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGNACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACT 52#+DCAEEF&7C8&"3@000)H@$C%0E$2D6'<4)28$;;BG2E(1)*#@6(?7*;#3FA=F'%.H92,7<+$A1!;!-@;E/?:<.1.?B&472?:=E&::?5/?C;<#BG!4&.832/@,B;$/85@--**+C8)E7BF-"!9,C8$'/1G34,95B8H63&;1D-H%==--'9E:6"A5@*9D*A*+GG=C)%/'HAB2>C60D-C)5&5F$=%BF,909>*$D8=45!/0!.;(D1A!5&&'B%'3H@45%=CF1'BE1A2(83*C.66B6?+1-34>-H-.):;AA(9 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:261^T0G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8660 42 105M = 8765 401 CCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAG BE1AH2H-5"33'B2<,-E2/%BGDF-EE,>!(!'&&:9A3"FA$2&"'83%4??'7?'CF0>D$;G.=7)@<'E'"C48B;,6?";G@96$EFH7A?1B(.H,7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2526 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35446 42 86M = 35596 276 TAATCCGGAATCGCACNTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCCCACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGG (+)""%')%"!#(++##)&#"+%##"'#$+"%*(%!!!&$#((%#"(((#'+*"(+&'"!'%))(%%&%!#$+"!%(!+)"$#*## AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T25A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2526 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35596 42 126M = 35446 -276 CCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATT =!&=2#9-!;#:66A>),$7C5>E50<+C$B*96?7CHG6H?09&AA=?G@(50$!<.HED%0*?8395,BH671;?9$)D75H%,.-'>A08?!9F%>H76!F#3!#HG5C(%3DD%4538/D@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2527 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27515 42 103M = 27618 375 TGGAGTGCGACAGGTNTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGAT 1A.2-1)E72F,6!!:7B@42,'3)(>E$5C=G-$,8!9)65E"!9==!@/8HB72*)#E%00*H5F?B$=+:H,F.;+B@D<$&A17>-G(?6.1;D'"C.1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2527 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27618 42 272M = 27515 -375 TCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATNGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCC 6H:(&/*(@3?69A-G83*2;FDH<@3-*2H90@5:-!(.,C8"FB+@05C*#$'C7C83C8&7;*9&&<<926H0.E=?3%-2%5F4@C,@20$:"5.#&!:*"@(=%-(-$.G51E<@:"F7C,E(0?FE/&7=H55H,,?CA!:!,>3D(*&:,&"7!E9/%99!@3.?=4)+D,<9%/20DF+:3"> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74T97A99 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2528 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35262 42 79M = 35262 0 AACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACANGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGN ':C/6&C4A+0$9A2%,A5+H52-"25A0($1-*>B7+&#A,:/)5CHH0C@*9,4$B+&4-6E;"58;',@A*1,.%: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29G48G0 YT:Z:UP jpayne@0: r2528 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35262 0 * = 35262 0 AGAGTNGCNNNNNNCTGNCCNTNCNCGTNTANNGANGNGTGNNNGACCANGACAATNATAACNACACACNNCCNGAGTN !$!!#"""#$!"$##"$##"!####$"$"##$!#!$"$$!!$!#$$!$!"$#!""!"#"#"##"$#"##!!#!"!#""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2529 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2046 42 45M5I164M = 1915 -340 AATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCACGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACNCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCNCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTNGCCAGCATGCCACGTNAGCGAAANAAAAACGGGGTTTACCTTACCGA #E+G@4H"$1%,>,1HG7/400,CA(BG-:=HH"0/*9%08.H!;,)61E-C#-!7@0F&2"=A(&=F9'&HH!&!A>;0=53C=A29G6<,BG:(=C.9,,*"B5*H8B>"*%@)==!8<>;%@-+E)@:E65C0G"1,.*$+9$C<'/1@,AD*#44&/6 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:11 MD:Z:75C1G49C33G15A7C23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2529 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1915 42 131M = 2046 340 CCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCACATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATC 52;&E56<1%;'#@<7HF/6F($">7747)=B(451F(5*@F@+9'(.?,#?3&5G#8$,?>72D::&D55@@GE%.3F++#>1#E:*#>,+38G>7/27!E$-@:31#&15C-$)%!,G*0;:.GC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73G57 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2530 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31128 40 67M = 31326 238 TCCAATTTGAGCAACGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGAGC &-9B-6C+C!(#*7DB4GH=4.;+:&/5?B(&"72B'!6."BE)&.C-(F*D?HA@E(4@?#C'+H/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G49T2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2530 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31326 40 40M = 31128 -238 CGGATGTTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCACCCC G7C=!#A343?19!007BB&F$(&>/D/HF;.6-E3.+51 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A29T4 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2531 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30442 42 123M2D13M = 30442 0 TTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTT F25/$%:;"C3E4(F4*:5%.-B@>#?D<&?>$.%03'D#(/:>-">40$;H""$2:D5,04;;((#!@DE3"F3#74 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:123^TG13 YT:Z:UP jpayne@0: r2531 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30442 0 * = 30442 0 TNCNCTNNCGCTTNNCNCGNTGCNNGANAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTA %'$##'(""**$'""'&"#"''#!#(+)!#()'&))*$"$(+%))#+(''&"$(&+&+"+$% YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2532 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8451 42 154M = 8178 -427 ACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTNTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGA =85?H-4,0#C0@1G-HD%*%.)/(1==F'C/;@HBB6(E@$E"?$2.;:71!&6#()G322F,<:3:,C0)4"?;!(&3-?@,-$7(+#')9BC,D@"8"@%2-.>!4!;!G/4+/(3B;1#.//6.#.BA++!'8#"#,,/9&7%/1FH+,F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C108 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2532 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8178 42 122M1I151M = 8451 427 AATCCGCAGGCCAGAAGCAAAGTTANCCGGGGNGATTTGCCCTTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTACTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCGGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGAGNAAANCCCGATGGCGGTGCCGCTG (?='C8;-;0!':2B+8#&&1AB@:"&#-5"=*2:H'=5520F@,6G'241")%CAE2;,5*4'B4F/1$27DG8#H941((72A@,#-@7%+?="%;$9HG#1'56*#/;>!7>>$9;23C,A.G6(A6")HA,)""2A AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:16T8A6G9G129T35A38T1A3T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2533 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9292 42 93M5D69M = 9056 -403 CGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCANGGTAATAGCGGCAACCGGCATGACCGTGAGGCCT .D@0E*99:&&5#H<#$72$076/2-9<8-;?'*>@568;6?4H0E7C423-2(>5G;5#58E(<9;H5-+;#%8=/==D=DG2AG3-"#AF**0#!:@0.-60C3&!6)/59?$=)")'?//GH,2B/B*;E)""%#5=>+!?(2F AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:93^CCAAT34C5C23C4 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2533 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9056 42 236M = 9292 403 TGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGNTGATGAAGANGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGANACCAGCTTCACNCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATNAAGGCGNTACCNGTGCCTATAAAATCCGNTTCC +#&&)&%%''&#$#'"%"*!"#*("*"(**+&)&&'%&)$)!"!*'#'*)+%'(!(*'('*#"%"$+&%&$++)'+#(%("+#$&"%$+%*"#*!%(+"#)'!*"%()&!('!(&&'"'#&#(&*+"%+""%('&!)**!&(#"&+"*$#*"%%)#&*+&*#')()%&&$$$!'$+$")$'#)$%))(%!#++$(#))&"!!'!+''+"&#()*"&"$("+"+"%$%%+%&!$"%$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:80A9T28A15T11G54G6A4C16C4 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r2534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27283 42 306M = 27243 -346 TAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTTCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCCGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTNGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTAN )/4#6(@'E#*=":+CAG0*9-5H/8B7-GDG<$HF$.B!*./7A"'<430&7A85C8E*7$41C)HG;25A7*0"B7$-$;'>D$<%E5D<#9!A!#@!"*0BHB%"E?@0.B8*+#3254@G4D;:>CHH*3:5HD1.C?3@?A&B'"257H!<$@;G;>4"%C>82;D9)9A90D7C-!+G+**5H89B=/D>EC;3F+<8%),C%?A;36C#6:3H($8G+6'8D.HC-45)#$21@$7+3,5FE@2;+B+/'HC9,H!8(E0H5/7704/46@C@0F.GC27F!0894A2*%.$B<"9=+('6F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73G15T13T62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2535 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46672 42 79M = 46751 245 TTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTC ,1*/>*C042!,3,')>D7!6>>.B4'7++/H>47H3'*=%D0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2536 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41388 42 167M = 41555 327 CTNCNTACNTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAANCTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGANGAACCGAAGCGGCTAAAGCAAAAGCCNGGAATCAGATATCTTGCTGAA *$%*"$&&!+&)(%#""#'!$#)&*%&#"(*#)+(##"(%)%"#+!#'((**&#$))+#"+'#&+*#"'#++"#&&+*&+%+)&&&**!*+*'"(+$$!("%)+&$!+$"%+"%)+!$($#)'&))*%*$%+)(&$*($+%)%&($!!%"($$$%(%$%$+!"!(+) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C1A3G31A77T19C6T21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2536 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41555 42 160M = 41388 -327 CTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCTATTTGCAAATACCGGNACATCNCGGAAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTT 'B=>7F96(9'+&83"H44H,&$+E+F3BHC@EG:H'"+B(EG=C852)A.E@4&;;*7=.:!5!?A:3.,GF%E&':($<=%H$8C3-HH%(4(-798*?(#1)3=C$.-B?,)$5#?#%H35"A:828;F)!@D%/)EC0)E*1%C@*/D+1HG,>)? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:54G15A5T3T79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2537 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26433 42 103M = 26320 -216 TCACCTCAAAAGGNATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCNGACNNNTCTGGGNGNCNNTTTACCAGACGNGN ($$&!$!*$*!"*+))&&')&%*#&%+)"&+)!'+!)"'*+**%#*$"&(!*+*%"+#$*'()+(++''(+*$$""$(%*#%!#'"$'!*)#*")*&)%#%'# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:13T56T3A0A0T5C0A0A0A1C0A4A2C3T1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2537 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26320 42 78M = 26433 216 ATTGTTTTCTGGGTTGGTGNTTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAA .!=?<5B7A*%D7+*15.-6G544*A/:%"$82C/$C6@?3B%E79*5DF8,DA*=(G0&1F8B<7**5H%00'%.F% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A58 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2538 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24611 42 182M = 24523 -270 TGGTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTGCAAGCGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAANGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCT 1A!/4()*>.70"2(''<-&7.21D*'@!F;>83F4@!@)"-C;G/7;$69B9%F#3.%++$6&'--:)27(/@8)4/>.02H5@1F2,B2:3/3>5C"B%F20B+4"=A<=6"E?:4,8F&!BF95,29H(+8*,;D%?:&?9"H,4GA8@ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2C113C3A34G1T24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2538 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24523 42 88M = 24611 270 AAAAATCTTCCGAGTTTGNTNGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAAACTATAATAGGTTTCAGATT :.0F/88+=@>+*!<7#C+9G,DC:7(8H!;7#%D%=*7;.78$H5B4$5855D9%1!$&@G34?=$)E$+5D%C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18C1A47T19 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2539 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13683 42 59M = 13794 265 CGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCC /+>99#-1@9.,*,6+,2564D==;EH$5?%:-GG!"4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:154 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2540 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21066 42 73M = 21205 226 CGAGTNTGACGGCNCNGGNNNGGCNTNNCACGGCGAAAAATAAAGNACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGC ##$%%"%$)(*)#)("%#!"")*&&#!+%)#)+')(("&&')&!)%!#%'''""'"%"!&%(*))"##&&%*+ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:3C0A0C7G1T2C0A0G3T1T0C16T0T27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2540 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21205 42 87M = 21066 -226 TGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGT FA>A-9AE.9&.&F<.F)F%$0B;7(A00F-$@#+?D1&C/F1-@HE4E;>H,=&7?&G$1;.8?.E6%96&C!3!/9$& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2541 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28280 42 54M = 28087 -247 AAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTC 8BD+>0)$7037H)HD*2A583"..)3*/+-C+!%%>:#(,B0'6@F.EH.4"H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2541 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28087 42 70M = 28280 247 GAATCTCTTTGCATTTANCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTCTTGG ''*"-"5=C6+1<025?E5$)G;'9,G*%?3.41&G9)=//!9>6>.F392A'$@A@.:E5)#%>@99$A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T47G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17898 42 332M = 17803 -427 GGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGANGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCANTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGNAGGACACGGAGGANGGNAAACTNANNNANNNTCNNGNTNCCNNCNATCNTNTCANNCTNANNGCNNCNGCAA %+)&+)%'#()""')&(+!&&&!)$!*%)')#(#"$#%+**%!%#)((*%*#+$%%!$!%!+&&%')!&$)(&+#*#(&##%)($*"%+*&#"$'!$%$("(+*)+$*((+)&'&!%)*"+'&)*!*'""!!"()"+'&(##!!+&#'(''+#("&")%%$&'))&#*")'($#"*+)$""!$!$++)(($))'!*&%'&((%*"""))*!&##'!%(!''$+)'%$$*"**!+%#"")+()*)&!!$)#"()!+*#$#+#*$$&#)"$#&#+++''#)(*$"$"#")!'&$*#%*!)#*%##*!$)$*&)((""$!)!%&(%""%*#$)'' AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:32 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:32 MD:Z:42A130G85G13A2C5G1G0C0C1G0T0T2T0G1T1G2G0C1A3G1A2G0C0A0T1T1T0T1A0C0C1G4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17803 42 95M = 17898 427 GGTACGGCGCTGTACTAGATAGCCGCCAGTATCAATAGCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATC C%;*A%.AH(AD8@>5";D97++(HE6@7A,2%/1C)>A%/#15)##-@E(!&22?:0;'9?<&F.F$)90%$CA&E04@A*?D1HD!5#*AB<5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G20T57 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r2543 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19429 42 224M = 19273 -380 GGACGAAAGTGCAATGCGGCANACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATG >B>.>069:4679F*28!5C/::<01545#;#:=HB?>A&)2;46-H*(8*)0BG9!$-01;*/*(-D*$CH)'77+:1+3;.8B2*+A#@7"55@0+E$H5;4@5.=1$D<&'/@(E.7*!-;,',!%9=?794*A0.$'&,G,.4D@A;="213+"48&+DG,"*#*-1/.F;&?C$7"1;7C-HE&56"8F2"14 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T18G183 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2543 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19273 42 156M = 19429 380 TGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAANCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAG G+=%8B1A!'<3F2>>7C6&;?@55%C)HC3(=&;@$H>E%8823!H1EG2,?':2,E*B8F?:>5%;#?CG'4=-06HE*1!:,.72!&3+D;9)44AGE#/#,H4BF:+:6)'"(F@<1)%4;8,5C/+:D/=(3E=-*0D.)0AB>F:>(,C? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:119T36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2544 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47606 42 71M = 47452 -225 GTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATA 4:'F;FEH+.GA$97E4!(#5GB$+80+=57&#!:'FB;F@"?BHC5/5#+?9G26$,:C5@H*#H77E.F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47452 42 50M = 47606 225 TTGGTAAAACNTTCCATGTGATACGNGGGCGCGTATTTTGCATTATCGTT .'@$$ED<3#>4+5$#?8HC=+/8-$-3/%;68.7A%7)8B!0*01;E$+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C14A9G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16773 42 58M = 16991 302 CGCNCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGG "("$('+%"%+)%#++)($%%'&)+*$*#$)$)(%*)!!""*&%)&$(%)&"!$$"++ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2C54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16991 42 84M = 16773 -302 TGGCGGTNAACAGNCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGG 3:<6)?7.;G6/0#6++F+=?F#0!#,G+7CC/=H=2;-B+!BFE56C4AF4G)37@%=GB=;0+$/D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G5C70 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2546 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33060 42 93M = 33282 280 TGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGA 3=;)E%#EA<3!-:492(>91/(AB2-E=)60,)'-&-A&;5<((!;'H8D:36;AC4.%D&A<)*<9==7HD1?/=)#HE;,+56=G(,GD< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2546 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33282 42 58M = 33060 -280 AAGTGGCGATAGTGAATTNAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGA C14E*??@'+=*"09-:@*46:*8?=A$'3%2/;5FF%$:)8($*&2,++:==>E6D% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2547 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47137 24 76M6D9M = 46968 -260 TTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTGCTCTTGATTTCAAATAGGACGT %(!4,'ED,E*(:'C0HE<#<46=:HH>6?/DC=4':6%"G>G3E#'!(4*B"!@)=3&+':A;/H9)$'D/@>G$E0)H)+/4H AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:62T13^CCTATC9 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2547 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46968 24 118M = 47137 260 AGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTCGACAGATTTGTGTAGTATTCTGAATGCTCTCAGTAA GBE*7.0+65(17#:C6H>'&G@?%'-'/55E"7E&B$#<;8<%2)23>+8%-61H=9,2"7B0$=.-G(83AH:"48!836,%C(G!"-E0)?$(+0#A4%++2G90?7B;<7%:.-.-)+"=&,"6+6#9+);G1-24&#<+23FF"'=188D5@#@98!F?1@,&D"2B73" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:23C96T24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2549 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14418 42 113M = 14631 360 GCCGGAGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCCCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCAGGGATGCTTATCGTCTGGCGGGG 8D(5#9D,%H/HC=!H8*3+C5/)-%5.61-E(->98'9)*3F!8@@-+%C$'4.!+?;:5%8.<-@F-('>A#H@=%7,0FF++''*58!: AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5G45G37C12A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14631 42 147M = 14418 -360 TGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTNCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGC /D'C)C%3?0'25FH6,GACH6B2ABG%2%?'->%#D@2D.3&"/D092E#DEC2<.=<0',840F?2?,H'*92D+H( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G113 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17155 42 158M = 17313 212 GACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCCACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGC 8B>7;==C*+0;+5AG?$"0C?D./:0)8)C7)/A2;968&?#FG?F*-+A#"5A5&F%*)$1?3+?A#+:(,GF#6H>G-G#+@$>+- AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19G2C17T3T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2551 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25406 42 71M = 25224 -253 TTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATNTGACCATTATA H-/!"'%@91G'7@"C);E:68')5;!2;552.6;5#B3+H%!"%<7EA,E"#4H&%/@CB1FB=&@&G4= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2552 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10093 42 46M = 9785 -354 CAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTT !/)'.8A2D5'3;G?)*)#$.>?>'DD;':(?5/-F-H?><4H384 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9785 42 308M = 10093 354 NATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGNCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGGCCCTGTGGCATAANCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCG %A$4"?ED"H+2F9@9B&/:E(D%F,=(315=700D$?.34;AHF.D)6..<#0,=1"2#?,71F=*%H.3-8$6%C6-H'+%!-G08(!-E7G-3,38!%6:590B:F-=F?B$#G7%3D5F,6#!;1!*"'&<@E1133;'8,D&<@@D-3$B0*.=#B:/(D0';%8CF';C&<8!<:(A!;0($D6G5==))-+F&(C%D/=-:0>C#;:A4';,"90+@1D.%7(:49>?>66;1E,";%("78E">B("22#',4:!>2CC(G5+AA14H=%B;!B!A/*DBF.62:<>DC%2FE AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C79C31T13C181 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2553 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36084 42 189M = 15782 -20491 GCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGAGCATCTCTATGANCTGAAAAAGAAACACCAGGAANGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTTAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGNTNCGCATAATTACTCCTGAT "&?B#,+G$%<80F:D5!0EC@'8/EB%EC&?&&#=:0*@E=<4/*F516?G=2(G+&$F7&AE>3<%(E@!&&/-A*$(D@BA&"6'"(=9-#>%@&(9D&7H)C83!&;8+>%B>=.B3-H(7#1'G)@=(=!3;+/-2C2&/A"!6B.2@3;?( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54C11G21T41A37T1C18 YS:i:-20 YT:Z:DP jpayne@0: r2553 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15782 42 126M = 36084 20491 AANTGAAATATGACACGCCGATCAGCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGNCA *"(**)%%*++&"#!#))$'"!**!#'%((##!(%+'%+!((*%'("&')#&'&)"&$"$)'**!$%%$"!%!!*!"!%&$"&"$(!%!"$#+*"$'#%#$$(+$&)$)!+%*$'*#'$&#!)&)" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:2G21C90T1C0G0T0C0G1A0A0G0 YS:i:-8 YT:Z:DP jpayne@0: r2554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22295 42 119M = 22149 -265 AGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTT 4G?3.(77)C@*'-?F!5'+7F2CB=8@193?;F==HBC#.F..%;(H)5GEE-3E$=!C2,*9*BF+"AD);H5=)0:=%-B>)$=(G%8B=?(=B3(@F"D3,#7+3.?>-AH*4A* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2554 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22149 42 90M = 22295 265 CAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACNGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTNCTGA <64(%*C<*-1@7CGBA*#8"4A&43C.+#<9:"&,F=AA6.(D#$>:259*17%:G"5&;B?73;+/H%?.9.056$.#1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C36T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33608 42 54M = 33771 246 NNCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTC !'G2/H"*H#=H7701@;*35*"2,'%*$<$6H'76B5/%$#).::?.)4%,+B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0T52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33771 42 83M = 33608 -246 AGTCGGTATTCAGAGTCTGNCCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTC /@8F'705BG.$5.1D91$0A1!/A%9C)D=$@G0'D*5EC8@$8<7$9*0-(?8G0-?>C;+@>";(=F<';61*'3#:FD/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2556 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7573 42 47M = 7573 0 AGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGA '+87?D?(@>)H!&A684,"*>7A?3;?D6-89'%>56)"7'-,;8= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YT:Z:UP jpayne@0: r2556 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7573 0 * = 7573 0 TNAGNNCNGCGAANATNTNNTTNNTGGCNATGANNNNANNGTANCNNCAGNAGANT "!!"!###$"#$#!$$"!$!$$!#!"$$$$##$!!"$$"!##""!"""$#!"!#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2557 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17175 42 55M = 17017 -213 CGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGT *9HEB**-,:/C2-)>=$(7B%+.=*2D#=A=269%A+6,*;#5D'F@/;.E;'A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2557 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17017 42 57M = 17175 213 CTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTG $06>B@D!>@,),'#)%,AH@=7-(>C-76A7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5726 42 230M = 5672 -284 ACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGAGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATACTTGCCGTTGCTGCTGACCAGACCAG >#&@A7;9E"@"4E6CC2:5<'@!:*H"D1*"GAG'D07A6;A5);&=$/,:*#"DH)H=E-(/G2(9G++.')G6;$@?1=59;:5='"2)<;6()4:$(@97D81(F4?;%69?*8'0",11%%?3%+5D)%>;+"%DE'H>77H0'6=7F7:)?//6)E3AH+/#47/F/=BA9;)51=1E:)B)/#>(114?..7;A6)?#<(94FD5-G>3D5&A)2+"?%6H3F AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:74G40C87T5G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2558 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5672 42 54M = 5726 284 GCACCGCNGGCTGCAGGTAACCTGGCATCTGATGCCGTTAACGAGTTGCTGAAC *@&E+6>##>H4;?H#(D/*E3!:#'::'7(8?49-7B%%*H,.(%&=838EA+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T14C21T9 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2559 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19970 42 108M = 20120 287 NNTNNTGNTNGNAGTNCTGCCNCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGATATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGC $%)#!")!*!("&($'!)!!&!+#&%')$***'$%&!*!"'"%")(##()#$#&&(+''(+%*#"%!'+('()*)$*!(&')*'%#*'#(!(*#&$!(*($##+!#(& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0A0C1G0A2G1G1A2A0G0G2G1G43A42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2559 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20120 42 137M = 19970 -287 GTCCGCCGGACAGGCTGCATCNTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGAGGCCACCAGTGNNGTTN )('++'$!%'%$()**%+#(*&'!!'!+#+*)"#%#*("'#'!$'*)(('&""&#($#)%&#(%')"&*'##!!)+%#$"'%#+"!))("#+%")%)#"(#((%$"'&)*#+)$!%)$!)*)+()!"&*"+!&'&%! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:21G97C11C0C1G1G0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2560 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5095 42 97M = 5356 321 TCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCNTG '9-$'@,5:!*?#2?&F3?%3/E%%&D!#3A=C.8A?+>?#DB$".%'17<H4.3&@G>8GEG$@;8*%2%:# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2560 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5356 42 60M = 5095 -321 TCANTCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTTCTGACGTGGTGCCNGC "69?99$689(;-(0/(13F<9(!8"B5*9F:2C=+,51,(<2H/CH482G8;)#33/,> AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A39A13A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2561 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18004 42 272M = 17894 -382 AAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATANN 'D!.C:6=96*.@)?#"B4!$7&27+4?"80##E(#*70=;8?<'%#9>H?;$%(G-+A0!G#?7$A4=%D-544(;F:,9*C1**7H;6HDGB''%#%H@*(14F5B/F/-BB4@5'.@"D7+G6!<5.2G>2:3G,<6<"?-CE*0/--E?)%E,F-D;%E*HC!DD>*@3:4H%#+'D(+H7,"61!-!62#'*CD'E39*23'4B8E89&5&>!:%3$5'2//40'G4EC:6A(>)>77??G<4/9E9(5%2(#0D5.1$(:@H&)$* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:270T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2561 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2563 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20791 42 56M = 20571 -276 CAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTC $*)19,3''B#:""?2$'6'.?E1:5$A:"70669H.81=+98)C'.4?H>::58A?!6) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2565 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3164 42 167M = 3075 -256 AGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTNAGCGAAAACGCACGTTNACCATGATGATTCGGGAANGTGTAGCCATGCACGCCTTTAACGGTGGACTGTTCGTTTAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTC 8B+3-A8$?#.%.#%>"@?".:**5>+0G1#'A1F7"'%,)H(,@22#4$?=; AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:56G16T18G4G22A10C35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2565 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3075 42 89M = 3164 256 TATCGTCGGGTNTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCG @%&D5:.*&AH2"H;4"EH1&1B>"=GE7H82,39D->6#+<>.(25'D+>-+@@4B<> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C77 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2566 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30155 42 166M = 30321 286 CGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCNTCGTTCTCCTGNTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTC "+'))*%!'#)++)%*#)'(!$$((&!()'*'&)+)))'&!+'&+)'!$+&%))!$#&')!!#$#)!&*%+"+(*$'+%&((#('##(*)'+++''$&#"&'##!$))&'**"#"#'!(!%'&$"')#"'&#*!*#&%&)''&"**(")"$&(*+)%*$&#*%%)" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64C11G89 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2566 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30321 42 120M = 30155 -286 TGCGTCAAATCCCCAGTCGTCCTGCATTGCCTGCTCTNCCGCTTCACTCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTNACTGATAAGTTCCAGANCNTCCTNGCAN &*()*')!)")&*#*$)!"%)!&*($(!"+#"*(("''"+#('*#*!++*"&!+)&'%"$(*(&"(&#!&%'%&!"'+"+#"%'+()!$#&#&&(%%+)'#%#$(&+)#%!*)%%!)&)# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:21A15G9G43T16T1C4G3A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2567 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19635 42 67M = 19446 -256 TTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATNTCAGGAGTCCTGAAAGACGNCACAGTAGNACCNNTAN +$#)&!)$'(*%%+#"&&+"&*'#&&#%#)(#(*$"')!"*(*!!$*+"+*!)'*'+!$(*)"%'&' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:29T19G5G1A0A3G0G2C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2567 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19446 42 189M = 19635 256 GGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTT C5A-3,CF7'@16*;,$6;9/4E,1%FA3GG2!6@D+7B>1#E6*1H='07!A1%@C?)G#G&<.3<>4C803>/=D9*6:.884@F!;#4:>9G45:"=?4>+8#$HF?;?$3/13-)9=H+&9<5DG=1?'7""5>5>"<$0"H)$7+;A>C.'()<3$'A9-@::?@4<&/+#=> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G165 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2568 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44079 42 172M = 44251 356 AGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCA 8(@CAF""+*&$H$(G:4>&&/?*)?7=:?*@E;6H#,:A"H9"3>H>C!>7B$FC9+9C*5C@?1H#H9)*CA/;92E'?#:C(4-%+509%>F!?.*1#5C3.)2C@?D&-/8#!E9"$/20*/%*7&,0AD/F"G@B,?EA%@'+)"(F%9-B0(;=61EC2A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2568 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44251 42 184M = 44079 -356 TGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGANAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTANTCCCAAACCTTACCCAACGCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTG 5*.@&@)?//*9G:51!,9G('.,FE&A&7:,4+)>)/2+D2.+AA'DF(9=!7>B.-@1-6>D#H*==1-+*$";F&D;G6'B.79&E*9F7$)0:"6&A":F/%8+-B9F@6:<@H0,-D8#-?D@"6D(9&6%8<3?A%6!EE+,0B&!,*:FG8?(9+#/07-*D-9;&C:73%C')4.$,D3@-=7#/#92EH;.:)>#?$,%3=79'(=B516#6'<=;>%B7G-=%E(F"*@/H'B74G"<;F$C(1A9()'C=B6E,0"!4/'0?A?. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2570 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14120 42 49M = 14286 215 TGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCC "/"05'>C2(6D5/E%F&'>=:F1:H6+?#F!*+=C$,=H&9'G&B:E< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2570 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14286 42 49M = 14120 -215 AAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATNGTGGAGCTGNTNTA ##+&(&'!!((%!#!")%!**!'$'*'#')+)&'")%%(%"&&#$)!(# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34T4C4G1C0C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31577 42 273M = 31496 -354 TTTATGGCCTCGAAACCACCGAGNCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACCGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCACGATAGATGATCGGGGATCCAGTAACATTCACGCCGGNAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGAGCTTTAGCGTTAACTTCAGGAGCCACACCNGTGCAAACCTCAGCAAGCAGG -B2:4#2D%/%6<>3C%4&8-;A,'D7E=5"99=#=@*A/C+5;D%#CB@'C+%&*>E:1".F9"E82'">B80H*(5)F%G6",=:0=,/0#FE5?8F'*<&;-*2:65.981/#%&?(5H@)'2>)!H5<'0E)0"<::D)$/@06"F%3082&';BE1!?7DH9B)40&::,#!0381,&9*0&3/3#(;'B#9A8G6D+:>4@$D*9DF8G6*1?D>+3=;H-334)%$4()(5H!FFB6$088G;;@75&,+*G2@ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:23C61T42G18T18A54T17C11G21 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31496 42 44M3I37M = 31577 354 CGCGGGTCATAGTTGGNAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGAC <&B!G$=2:B&C0;E5$(?$*<#2;=D2,E<&501E!;8C10:)@>?1F>B3&G*6@E;%-FD',5;127B/F AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:16C38A25 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r2572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 574 42 94M = 668 220 TCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGNGTTTTCCGGAACTGGAAAAGCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATG *;3(%5:4'%>.,"'!4>E:A)E',)23(:2$@F+,(8E'8-0=56B3"5G)&44'-H48<3-+,6$!*!">"#8E8%&+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C19C42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 668 42 126M = 574 -220 AACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGNGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACA =H4+,'B79=$684>8=@B="<*(@9(7#;>2C>;?;'>/1;D/E8=+?3A+'>,:'%.A)&9<)(1F'C.1%BAB'3;")2?:B-5'4)./H<)*");@7,, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76C8G40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14075 42 64M = 14149 184 NTAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACA "4/B3/C)>/H=C+=.->##+%A+%8)&C!-6)?=;B975.0;#3D+B1""3$8&A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14149 42 110M = 14075 -184 CAGCGATTCTGGCGTACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAT :-25)E@F1F'99A(5'H(4D/--;;"@@-(<*=$5B@;09H6G@=DH2B)17E47;<.;17H4D+=?:?+68!E(?$<2A+@(@@..)G9%FC*%H5$8,)"(/G6E?- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C94G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2574 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38887 40 59M = 39045 293 AGGACCANTNGNNATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCAGTCAAACGGTGCAA #!$*'()$$#'')(+$#+%"'**#'$"&&$'#$!'$%#"#*+(!!%!#!($(*)$&&+) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0G0A0C1G0A1T0C0A0C0C0G31T14 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2574 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39045 40 135M = 38887 -293 CGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAAGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGACTTCTNTANA %!(*(*!*"'($(*#%")'*#$)!'!*!($'%%!!&##)'$#(*&#!#'#*%+!'!)#"&*""$$'!$%("+)#(&*()"+*%(&+&'$"*)!''$)$!(#'*)#')&#'"$!&##%'!#+'!&+!$($&((%)! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:23G101A4G0G0C0G1 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2575 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25942 42 216M = 25841 -317 CACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTNACATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTT *'C*:@C*7?2$E8,6%&5#$9CD5):DFHG*>&#/5;1$E.%=%H!08504>4-B>A!17+B8(G-9'E?8G."$"">%(2&+DG*&C30,E>05?-("C:E+B28();:'8<12G*=7D.7$*G>,>;?@5.8G+/*$H4?"CH./6AGEA!+?E#1?><7EA00B7').9G7.4"%BD@&;9*3E1!@7C4(=B6*;."C%;<1G=),4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:136C0T78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2575 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25841 42 101M = 25942 317 AATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGNAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTC 2;9!4@0,$(0F3C5.*)D*(%,7C9'"(%%<)$AB*&+68>,6:$#<";$+7E93!G)##='/"6%7/(<#@>+-2#C%D!76%7)'E":8'D0*D!<&1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2576 77 * 0 0 * * 0 0 CCGCTNNCCNNTGCNTGGTATCGGGGCAACTCAACCNTGTCCGA $&*###")%"!)&#()'+'$#$!!%#&(!$))#%*#$(!%+%+! YT:Z:UP jpayne@0: r2576 141 * 0 0 * * 0 0 NNCCACCTCCACGCCGGATGCAGAGGAGAAACGCGCCACACTCTGGCTGATGGACG "%''+&'"&)&)'$%%$&*&(%##%'((+!*"+$(%&))""##'&%"$("+#%'$# YT:Z:UP jpayne@0: r2577 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34185 42 40M = 34225 363 GAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAG +(+'"(%'"%*'+"#*)#($%&'$)!!#'$""!%"*(%%% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2577 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34225 42 323M = 34185 -363 CTTACATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAACCTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCTGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAG $5=)!>;0!1#.@@%"6H0"7@!$**9$2?83C;)D#)E$%(3=#2/4.(8+2%2;?A*2F6<#"G>FA/$B5:GE"+*(7%F4'C'7=G;&-).1#45H&4.8-F=;/?0!9?&A"#2?$395*B=@124BF&#GD=%>?<8?/%,A>F,,B6%,-GB@76!&%)1>'#24@9?H,AE-%-&.&!??#.43)<.995B1.>$H$H$H':%5@.%1"&5.B&B'+-C?B9/:A:.75$:6>5/5B,&B%H:',A0@*C#)'1AGC?E848!7#5B!/;42,9-E%'EG'%,4>:+$*8D#),=7:-(8H+/9E2-H',-6G># AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G141A91A55G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2578 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33471 42 52M = 33302 -221 TCCTTATTTATACATAACGAAAAANGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTNTGC 9@-A5*@C+.?EE8FH,H;,2=/F/E=6*:B3:B77CG00<.8=E(.AAA#' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C23A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33302 42 64M = 33471 221 GTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATA /<'51=,'9%$:#GF"(G:*0-3H?'.-$:E'/9-&/4C7G1@+"C>&7?C"A3+2=83"+$:! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2579 77 * 0 0 * * 0 0 TCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCCGTAAAGTGATA 14A&;3'C;<4D+,E;DB"'B"C7/H>6$B)(@0-%$#&=>->8&G YT:Z:UP jpayne@0: r2579 141 * 0 0 * * 0 0 CNTNTTGGCTCNNGGGCNANGTTNNCNTNTTCANTCATNTGGTTANGAAGGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACNATATCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACATTNTGATATNTAGATGATAATCAT (&&""&!)#%%"'&(!&"&!($(!%%#(!##'("*($*#$)**#)#+%'%(!)"(*')(*!%&+)*$)'*#+%&+#'#+&#&&+('+%(*)"!'&'*!"+&!#)$"&$#((&(&$#*!*))!&)'#$%!#+#&&#%(!"$'$*++&*#)((+')(+++')&*)"##$*''+$&*&&#)()+"%)"$*$!+++(+!&)"%"&(((''*($"&###*$"')$))()+%%*%(%+!#&((&*"$!&'(!')'&!()(!" YT:Z:UP jpayne@0: r2580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38335 42 133M = 38176 -292 TTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTACTTAACAAAATCGCAATGCCTGGAACTGAGAAGACAGCGCAAGCTGTNGGCGTTGAT +(3CH)@98!1)2#D5FE;3,5,)3/,31D%83=B+/30+,%+'=1$*/G;$*:?F;@E;6$11!04DH=13.6FE$E4=8"E)8B7%)&%%&+''F2.B#6$(7.67DB:C(8%/G.B AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:75G19T19G7G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2580 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38176 42 63M = 38335 292 GCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACNAAAAAAGAACAGCA -.B?93)CG7>;DB&(=5E/444*+04=<2%+F'&)!!-(&/(%$B5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A6C7 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2581 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36551 40 85M = 36735 233 TNTATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATNGCCAANTACAGGTAGCTTGGCT '&;8)*%,&A71?'.H=7#C+<1),?;C:>16C3G0%"2"%>@E" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A60C5A16 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2581 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36735 40 49M = 36551 -233 CTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCC @E>:;";('3HFH56A)F<:1%/$>C-.E'G9@? AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:43A0T1T0G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2582 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46531 42 49M = 46818 342 TACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACNACATTTTCTGCGCCGCCA 0%4H@@7/9*D1E'>9E1$B<(65/C3%33/9*>C31G0(;A($:D&@A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2582 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46818 42 55M = 46531 -342 AACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGA 3F:>6'-=81)EH92=,)@>B0+&3"+)H'#9+'>1">A+,?>&./CG;3?8+)= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2583 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20410 42 88M = 20541 254 CATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGCCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTC F:%A526/*$B(AHF7("1F&B;0<>'>'<1F3(?+C6$<;1)=;D-62>"@9D+3F..075F%;:F%:7!="7?? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2583 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20541 42 123M = 20410 -254 GCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATAAGTGCAAAA D3$@E>ABF+5)+=:5'H!0(%/33@3.*50/#8'87E6CC6.?-;154%7#$":;4!%*$5G6.)F3>4&99&H570B7F"=?C2/F0>24;C,E22EA@+0)(21(H/B$#"(-F:-AH28 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114C8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2584 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45602 42 63M = 45400 -265 TAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAA 052!!F#/0/;;1D<9%1:!>6,(++G<*+-B'E'EC*DE%1H3<8A/'*":,"3''=$'>': AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2584 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45400 42 101M = 45602 265 CTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGA @@(7-E2A*3A>.:9+<,89+@=@18!F6,(7E!EC(+)D8!$DH$E>%("#3(AD>B'1;$A@7+A*3%B$()6@.$E8,6F=-+G=B-A!8=B(98-D& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2585 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25215 42 68M = 25215 0 NTGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTA )%+((*('!!$&&'&%!))+!(*#('%!&)%)+%")&"'&#"*%!(&!$"))"*!)'%'"++##%)(& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0G65G0 YT:Z:UP jpayne@0: r2585 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25215 0 * = 25215 0 NNCANTNNTGGANNNCANNACTTATTATCGCAGTCCGTTGATTCAGAGCTTTCTTAT &&&&#)'!'&&)"#!(%!!+!(*+$&)#))*)&$*$%!%)+(*"$!"*(!%*%'!'+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1593 42 115M = 1708 229 TGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGNGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGT "**)+'%+)&"+(#+$#+$$*%)($(+$&#&*(*)&$('!')%(#""#($)**+#&!&($")(%#*%#'!+&$$#"'(&##+"$%"%)!+)+"*(#$$%#&$)*(&%'+))+&$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A47 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2586 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1708 42 114M = 1593 -229 TCACCACCTGGATGCAGATTGTCGAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGAGAGACGTCGGAGCCNAAANTNNNNG ""*)($%$!&!%)&$*%!#!!*!'(*"&!!()!%#+*&'#'*$(#%((&"$''+&)*&+(*"'(#&("*(%'%$%)&(*#$*"(#%(%()$")'$'#$"''"+$$**$'!"!!% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:11G11A64T7G4G1G3A1T0G0G0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2587 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10434 42 40M = 10637 255 GCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGT A/B4$F8(.?2%>!%$2%%B&87(8'52&;HD@')+1@85 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2587 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10637 42 52M = 10434 -255 TACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGNCNCTNNGA $"+*(%*%'+'&&!##&'$)$#'*($("$$&&#'*(("('!++$$"'#"#'( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:43T1G2G0A1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2588 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34068 42 93M = 33949 -212 CCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGA BE$%5$HC)335E6HH=F#3?(*51"5%15&.0<)G"03-G<9-BA?=*'=('1*C++E.BH'D+<.-BFH)'37%:,E00";9-=@2E'F59 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2588 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33949 42 119M = 34068 212 GCAAAGAAGATTTCCAATAANCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCAGTTATTTATG CF#B2.@00,#B4B.&37B446$/9:(;2:FGF7"GC5! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T87T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43360 42 77M = 43537 279 CGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCT ?-D;-.!-9;,/(B6D6@)0B<"0?D'!?*3@.C"6B>GC3)*&&=)(93%,AB:2;G@/3*':H7:@#6E/G=0(* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2589 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43537 42 102M = 43360 -279 ATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTAATCTGCC :/,:3+##>E<5,%!%!9),0A0?%=$/>@)BA//:79D9$2E-=8+D/@4.:0%6CAA'D=8$33E.=F4.:.7EE)0!G5+G:1=6;BA4)!>.,8<69(8#@70>)7@B@D.7"0#C$.?63*%A"=+/E#%40=2EC/?.@-0)0338128%9)0!;78H/:>/:-%=<-!'"'.,4*.$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C15 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2592 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30539 42 26M2D30M = 30666 288 CAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAA $/2:&/#'3C?-2&$>'A);$@H(0&66&(H'4/G:%,@9>BA#-2"?EC(04$CF AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:26^TG30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2592 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30666 42 161M = 30539 -288 AATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCGTCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCNCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATG ('<$6+.-A+-(ABA$%;39$*A8#:<>3-=63/#?2556!'A)?)($(7:C-?E,:<>'%4=?*#'A/B-E)2(79D"24,>*1*/>$/*<,('$HB0;-1C)=-1+H?8D)D?4#50,>@H'72)3%(%-E4#E.!F#:>44#+0;E#/171/(?!&/E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A81G30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2593 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42778 42 59M = 42837 352 NTTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAG $(1;8.>;6;>/67F:$8;*%8F.6$@102F>)%E&,&F;EE*>E&H77%! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2593 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42837 42 293M = 42778 -352 CAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTTGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGANACTCAAAGACCTGCGGAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGC )F)C,&&9H=H6@55:&;!!)#7*F&6?6<197,90<4+5<*,/#H('.B@.<:/AH;:9#8=$-&;.3AA0F,"=,$!#$*-A+C38:(!#&#$8=?DHA3#5)5>G.C"&,-BH'?3)?85"D7.0$#-F)+D!-0DD)?@37*1G-AH>$,3;84+"G#(B2.!2+5(E>==%F,.?D662""A7?#7"-)*'<6#7&;+?3&8";:2-1441$EE<"FH>'@@&47)8"A!A2CC%$4!,C#B/@6:#(07=?,G(%G7-7-#/='CC$(H0)H)*1.9AB2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53C112A15A110 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2594 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31261 42 99M = 31383 191 NAGGGNAGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTNATCGCCATTT )&&*"!"+%)')"#$("$'!!!#'(%%+&%&+)$#%(+*#'(*$!&$%*$**$$!(%*&!$&"&"")$$((#")))!&)%!$&$##+)!$&")$)!(%# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C2A0A0A0G81C9G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2594 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31383 42 69M = 31261 -191 CAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTT +&!'&!%#%#+"((*"&&))")%!""++++)%"#%%$$!#))"#")(!)%+"#$$('#%(&)%*$))%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2595 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3326 42 215M = 3183 -358 TTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCNAAGCGCATCAGCAACCCGNACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGNCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAANGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCNAACNTNCAT #"+()$)""))''"%')'$%"'$''))"&&!+%$))#+)*)*$%!#"#'&%#%+()')!!%&#!"#(+(!")&*)**()(%*%)*!#)!!"!!#)"+*"$)#+$+'"&#+""*+%(!%"##&!$#%)+($)&*%'+&&+)(#($%!)&+"#""*#$($(#*%'((&!$"!**(#!)&!'*$#)%#))&%)#*+'$%)$"$#('(++$!%"&()*" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:25C5G18A25C87T40G0T0T1A1T2C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2595 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3183 42 143M = 3326 358 AGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCNTGATGATTCGGGAANGTNTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGC 1,E$HEB+.>6GC<%!-G1%+&+$!+=$.3:4BC(0:@&CE$8>-#..H5D,$?/>9!5DB(@C!+$3G&-"#!1<6B4CD%F"#0#2+H+(G61&FB1.'0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58A14G2G66 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2596 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 785 42 36M2I42M = 985 251 GGAGCCACAGNCCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTG .8:#7:&A-$75#!*A0$E@H@28G"171?:!ED('./B6-!+%6:4A+:C%,$)#:@"(*"@49,&:9H;,.-?H+%"@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:10A67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2596 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 985 42 51M = 785 -251 ACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATG !A,H."(1?*#"5+<"&D&!G,3&?FF89#',G,9$,H6+%&@FG8.&1C7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2597 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26496 42 186M = 26670 297 GGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTNTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTA @HE#-&E@E1<%!1H/2?"!H3@'4&H39/&""5B3'90D(?C>D=G)0F6&D&.?/-60?@4,>+$!>((-=='$;7=%GG0)/A6$?H$-4!F!:%,%3?#)E04:<.C$B?/!DF,D:?(-//@GC-337$H95E)&!@/!FE+2?839#+/)7"8$?FG$:"E18<.(:&#:&%F9.@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106T79 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r2597 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26670 42 12M1I111M = 26496 -297 ATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTGTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGANTAAGTGCTTACTTCTTCTTTTT %()&$#"#+(((#%%*(#(%+%#&&"!+')*"$$(*%"#%!!&&()*(##"%&'!'()&(##%$#!$+(+'$'*"%*'##''+#)"+%+*+'!#"#&(**)#"#'!$!+%"+!$&%&#)*#+)+ AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:13 MD:Z:1A0C0C0A2G1T0T3T0T0G26T56A22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2598 77 * 0 0 * * 0 0 NTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTAATTCTCCTG !>/6%@H*F7/86)H*.4#HC&+*%5,F-,GH5$B44%0+& YT:Z:UP jpayne@0: r2598 141 * 0 0 * * 0 0 ATTAAATCAGAAAGACGNTGGGTCGCTAATACGCTAAAAGATTACGAATTAATACATGCCTTAGCTATAATCTATGGCAGAATGTATAACTGCTGTAACTCTCTTGGCATACAAATAAACATTCCAATGGGTGN 7-/%+?22;@716*GB6%(,:C(#GC*);H2%<24#.4838!/GC1,&9, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10118 42 102M = 10321 244 CTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGNATGCCGAC %H/2;>C:4B.,4%.@1<*99&!A9(8;<>=-HA:$B1@6#:75=@GB273+/13$:?6,E1?!(.D;=G'.C3*)68@.=1'2H+0:0.,2.'=C;6-7,29?74!AD+;<& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37A13G15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2602 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46395 42 252M = 46647 319 ACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCNGTTTTAACAATATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCNAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGG 5A)?2B;6?5##*4-&!!FD)5.'$E:8CEG"H#*3>A2#)%/03)'=7&$D'%+1>GE&93@FA'!+->1BB=>ADB;42!E,'F=/3$5<(H:BED$EGF*>!58FC91<-'B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:157T10C56C26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2603 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38703 42 128M = 38600 -231 AATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGAC -!6C>EC09H6%(DBBC$#!>8?'FG+G:$,2:%9/-G&%,(6%9<6D/66-93,&>9%4FB6&(;ED=F3F.*=1$-$*3D'>/&:9F$> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2603 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38600 42 103M = 38703 231 AAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAA -16!:5@+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2604 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10995 42 99M = 10718 -376 ACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTACAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACC )=;D,*152=/6B373C!='1'<6%$,6%7:'A=*()2':2(+C?:1<-'?320F;B13H"H">@?1("@>=?;A+A+7F@&HE,-7-/,.?#>'20A)$;6F?E39D!DD4BFB4*G-H>"7?8%G5">C.0<$17#A6*%=0772E7$B!G(*3GB7&+4="$9#"H%"<1+8#).64*3#G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20A55G67G35C11G84 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2605 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48096 42 143M = 47946 -293 GAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTNTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCA H-(28(,!%&(-;7;-A=E<",E'G"6::01//,*"<:)"&?"-0#C.CB?1!8&/7*/9FB@:BA=G";+*$<:"A$GG511)D>*!@>A5--2!'E/9*D3%9@->,(9:F$>>(3&"*H&43EF$#40=@A87B$BA*<) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T113 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2605 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47946 42 118M = 48096 293 CGCCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACNGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCANCTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAG (#+*'*("**+!!&*'$+)'"#%%(++#%&*)$&&+'%('''"!!%$%%%+'#'%*)()#)+(#")*)("%!'*+(#'+)$)&+))()**!%$#+$!)+')#+!$"+$$%#$$&%$%& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A38A46A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2606 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41319 42 195M = 41207 -307 AACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGANTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGACATCAGAGCTGATGAACCGA 9$AF+4@/$A&-@)8+#A@+33(5&2/5*1+G>4D>$G>E";??5!>7:G>/0/+6%E3.BC>:"?HH.462/.;8(E/)B,(B',,%.3"+1>''?,'/32&&324*H#-47G:%0D<$+5':%0-H-G),=HD<.1)&88%:':0!D5<<@HB30=2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104T69G20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2606 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41207 42 112M = 41319 307 ATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGNGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTNGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGG +E2D:2@>F%5,'*.C&+!.F1>)=0:&$(-0+2E+,14<+/FF@%%'A:-0;.79-B)DE"7,B+F%#$*8:6+0@5$6B+E;G">9"46-F)02:)'/B'H':3;6,6(7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T54T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2607 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24720 42 40M = 24843 185 CCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAANAGCT B1"H>E.?8>$8HA/BG7/@>CA0A:B141$=)C53)%EH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2607 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24843 42 62M = 24720 -185 CCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGG 52/$1::1:!60)!>&@#&+@A.!-+@:F7CG'?5*&-*-!,+:3$F51'/CF2#F(/=1D+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2608 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20693 42 51M = 20499 -245 AAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCA ('2GCF="*(4=%6D9:&B@2;&3(;;8%-$H5&<,C3#D4*=490/H7'> AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0T0C0A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2608 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20499 42 57M = 20693 245 TCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCG :;=(G+8!.#+('&(G*EHB%G"=.)(=*49D.<'):%4@"F@AC6=9/(C'D54*" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2609 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47215 42 129M = 47093 -251 TCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTANCGTTTNCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGANAGN )%$)&'("%$#+*)""%$##')'"(%'%#+($*#&!&%)#')*))%&'*'#&'$"+&)$($$"#!+"""*'*+&+&+$"*#%"('))!$*!#"$'#$"+'*)%'**$*#("#!%()))(&++''$#&)& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A0T0C82T5T32T2T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2609 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47093 42 42M = 47215 251 TGNTTTATCAAAGGTATAGTAATANCTTTTATGTTCATGGAT )'#$31!A4.8$.HEA4A@)G"A,..(!-*=#/%H1!%@"*@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A0A20T17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2610 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20764 40 42M = 20913 210 GCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGG =;@,96@(0H<8:<18H3*01<3*+0,8.%G02#'A"AF?@' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20913 40 34M4D23M = 20764 -210 ACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAA 76H"?2!'%>4)ED>7(F9E9@!$%CH%$A/2!'5!)&D$!:7?B AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:34^TATC23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46817 42 279M = 47096 393 AAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTTTATTCCNGGATTAACNATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGNANTAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACGCGTATTGCATTATGCCANCGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGA #39#5*0:BC*&=$C-:>@FE@,277--(5-(/*0-E%E75@G$$D5#&8G>8D==;3F7BG.-HF,'7G(8+;B<30E2/A"#5,D+B7FH$,@;<8+7/&0:H(382&.#-G$16&DA)<=C)>498,G' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:68G6C8T44G1A35A17A93 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2611 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47096 42 114M = 46817 -393 ATTATCAAAGGTATAGTAATATTTTTTATGTTCATGGTTATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTANCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTT !A-49!E.:$2F)1-BH!($B(A3%F-'H'27>-/GC91.H!H>@90>?6H'F&?:48AB,,$-B4D+;F%<7&,-82,H.'(?4B)24E:556HDH;.7+(C@H17F886-A% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22C14A32G43 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2612 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38427 42 67M = 38494 364 TGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCCTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAG -4&*EBA!%.0""*H7)1154*/2021E*E7DE!C&&'-D(92$26#%+.1)B4=+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G31 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2612 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38494 42 297M = 38427 -364 GGACNGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAANGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTCTCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCNACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGANCGTAATGTGGCAGATCTCGANGATGGTTACGCCAGACTATCAAATNNG &'%($(#")$%%'$+!+'*'+)'&%(#)"+$!*)!#'#&*#!&"$)"$&$!(&"('&()+%%*$(%*'%+($$*$'%'!(*#%+'&!&))%"#(%'$#)(%&*("&'#%"*&((#%++("'&*%'))*($*#)!)!"!!(&"&$()$#*&+#)&!&(+!&&'!)!*#&&!)'#$&*##*+*'#!''!&!("')#*'*+%!!#%&"#&*''%&((($"+#(*!%'&($('+)##!"*(*)*)*+**)+"'!+")'&*%+++!'$&'$+&#'+$&)"%%)'"*++%$%'##+"*"($"& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4T107C63A39A31G20T24A0T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2613 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16455 42 54M = 16584 198 CGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGC 8F&&!+/.F'0?*48C!+F3*>$D-35$39GDF>+%*:.%A,.."&!*E//>?C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2613 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16584 42 69M = 16455 -198 GCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGC ,??6"F@!.#G!!&%EG5+/24B6:>9E9D.% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2614 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17650 42 32M1D36M = 17482 -237 GCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTAT ,/18.36'!AF=E6E$G*4<@B&32/)))827"A;#,>1"2AF=8>AC=B&.%!9&'5H;;7H.!A36 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:32^T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2615 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2432 42 176M = 2355 -253 AAAAATACTGTGGGACAGCGAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCCGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACN 5.CBFH%A.E.(!2!=:*!#!C"E/F-)=,C9#*"#E89?-303:D9,8B>5."37B9<,& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A71T83G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2615 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2355 42 77M = 2432 253 CCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAA B+.?H3/&&=!2>;27/,7H3C:2!H<9&%?+=6F1((" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2616 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44062 42 113M = 44277 273 CCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGANGGAGATACTAAGGCAAAGGTACTGC ,=3:8*:*>%2(*,>=-(/H17@BF98>&'(&)C<21@F->15?;&=>:3&+@#'G>)2=5DD9CE"0%31@EF#8H>$,C+(4CB.;##!8.H-4C%,%-(1*8CAD;=6*+/+F+4*(/3.6#:"5FH&+E7CE6:%*F:9(*,6(4;3BE,AG'C)%->>4",'02:;3>)AC=/.("'=2%'?B0*3:-%?8+;(21'3BB;>-%H7E?'#@A&"5&0'722-)?@5('E@5&2.95?E>*E-?G6G)A.819BHD,;93"06/-.78D/B?@&87&?*(?)AA9B.;A:2)4<%E1DE&(61(E;:9F:F(!37+A,&2.,H!7C:"3!&D?G,?38E9&?G>9""(*$>A.3)'8!-"-88)&!94=9,1C=585G6!C"4:+5"!0"(+4C>89AEA,B7<27:&)5G;D5<>,/@6@0F$2,$?24(E9H3!'-,F?6>72>37+,>0/%1=C%F%+DC91%GA#A-H"9A1E+'F>374.+*>H)/>&"A*2$2:.H="& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2619 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26259 42 136M = 26395 256 GAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGAT 3H97G;AF/6@D;"(A&?6#H6/%?#:AB;=06;F'@46A#AEF1'6;4G';@H8:5<.';&+3/+1/;45>0'((/%83-@)3:'";!81DCH@G@0F!.,%'$DH:D2=E,H5$;4&)##0=<84>51,:BE;&BA?#0),(&!/F/D">('/ABC:8(>71=1,BA'H95699.13C67/:&5#9!)FAH>7&0=+##;'9+E>5>H('<6=54%+1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57C50A22G4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2621 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9901 42 123M = 9765 -259 TGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGNCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGAAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGG 6E%A$"C7.;8*B1B9(,H*.18+$>B@<63@+B*5G:$(69-(36'/.6#)"97;#F)>=&@C3<6B&+*9!@,;%8)'!,.1&,('.9E7>480$CE-(HC$<7(03HA4)#B% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C35G53T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2622 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25043 42 156M = 25043 0 ATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAANCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAA C,@D6F7B09<%?)G((!C.B(@25*@(C4(;0#,F:)2F=8EE11$C8,2GF,@4-#/?3C6AD04,)=8=@7(.2H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116G39 YT:Z:UP jpayne@0: r2622 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25043 0 * = 25043 0 NNNNGGCNNNTGGNNCGGACNGNNANTGGANAGNGACAGNNAANNGNCANGGAGCACGNTNANCCANNNGTGANNATANNNNTNGTNNACNANANAGANNNTCCNTGNNGNTCAGNNGNNNAANANCNNNGTNNNCCCNANANNNCNCNTNNNCNGANNNNCTTTNGNTNANNACCNAGNANCNNNTNTNTGGNNCTCNAAAATNNTGNATNANNNNAACNNNTNNNGNNNGNNCAGNANGNTGTAAATNCGCTNT "######!#$#!#"$#"$##!#!#!!#"#$!$!"!"!$"$"$!#!"!$"""$"#$!#"#$$""$!#!$#!$#!!"##$#!"!"$$!!"$$$"!"!"##!"!$##"$#!$"$$#!""!$"!"$#"#"#!#!!!!""$##!$!!!"#!##!!""$"!#!$$!""""""!"!!#"$"!#!!$#$"#"""#!"!"$#$#"$!!#$#"#$!!"!""!#$$##"$!!!$"!#"#""#$"##$!#""$"!#!$!#"""#!$#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2623 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37794 42 44M = 37872 261 ACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATT .H>+:5GG'7!AH-3@,:,49#G=H6$C(-$.;&2#98HD&(8' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2623 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37872 42 136M2I47M = 37794 -261 ATAAATTGCNTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTANATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCAN #7.&97F8)2E!/FH$8D07&*5*4,>*=<47BCD?7%."!-E#"!,,"5(332+@04$9#D4%:@.&"<7*<6C#17.!77*'#B.F-994=>4(-6:$A$*G45032F'@'@E85B&F'A!)4#C/&)46(CG$E506$6E(07>('+809,D6C-9047-B13+E0!D"!*2()56H8.5E! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:9T65A106T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2624 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4168 42 93M = 4261 241 TGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTAC CH?#'/G@B>!:&C>""%6$>,10H**FG-651)#;*)-D@=#H!:C7-CCA06#+0=2/!H#?#"%.+.-5(%=6BA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2624 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4261 42 148M = 4168 -241 GAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCNGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGG )2;1C$3,$A3=,6/GG"G#191-:@4#!6#5&B1,'3$#C4*FH8=)+76*FACGDE#+&G.D4,G#66/G7/$0D5="C3%-;?*$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:113A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2625 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44792 42 108M = 45031 358 GAGGTANTANCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCNTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGNATACCGGNAGCAGAACCGGATCAC )*$*#$%!&!(($%+!&)#)++!('#%($$()%*'%((#++"%*)"*(%(+%$('&)*&)%&&$!$!)*%""+%!#!'&+%+$"#!!()#"#$'"++"**)((#*($* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C5A0G1G33C39A7A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2625 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45031 42 119M = 44792 -358 GGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTA 9D+!?*B$B>1E=9%/*#'%8<-(3(=*'+8<+<($D)"H,?!'A6D9?(;B<+74;5;D?2D1)=#1,$7(H&7C20DD).23?*0/*0D.-3@>5;0F(%!0/;GF-2*794:561G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2626 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18861 42 241M = 19102 342 TATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTNGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTC /+047G:5>'1%;)-C7&#:?3%,."3H0F6)3/A9$C?/H,5@!&6>'&8C%-)24AF-<2((9E(%)!=C4D9@!0A)H8=@;29B/8'CAG.8/0((<268.*8?5B5B69:$52DGD6>)7&71%=,E2A@-D$AA$D@H98(61,A#8:<+FEDB=2.'H;)D$.A?4$<#>9B:A6#%*3$=<(..!'H>@<$"&= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:179G61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2626 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19102 42 101M = 18861 -342 GGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCNTTATGAGCTGACGGACAGTNTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTNGCCG ''/+$3"+G@84-9&<&+D(<5(C#(/<%A9(?*9*9@D"CAB,!-AB7-,>>CC>G()433F@?69;4F@43%G+;)4)%;=C)-88C@B;/'-;EB98% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50G19G25C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2627 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6791 42 95M = 6652 -234 TACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGNGATGTATGGCGATGTGGCCATCG BD"98/>(AF#,57=E'&.11@9+"4$!&0:!.B9D=$*;H4/1?B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A37G23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2627 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6652 42 59M = 6791 234 CNGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCGACNCGCTGAACGCCAGC %*+#*$$($)(#''((&%&+"#+)+))%('!+'*(*!+%"$##"%$%!#'&&*""%&&! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0T39T2G14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31339 42 40M = 31182 -197 GAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCA :81>@4+B*B7%F6;1$$+5>??'C$-:101(8:,7(A&' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31182 42 51M = 31339 197 AGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGC 5":*D$E'3,"1+175">'9+"B.#G6)'E.C5-?2%(!?."+D'!/!;F& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20713 40 189M = 20658 -244 ATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTANTGGATGAAACGAACAGAAAAGANCACTCGACAGTCCGGCACTGACCGGAANGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATAC 6049":'$C>="#G4<<1!F">#"'86H$;.66.=3?6#:#.07HH*+#&7-#0%081F9C1(>+A)&@?A@8(.#5A?5+*8,=9(*%+<=-4(8B9G(:!C"8#,C=2'B/:(!+"G2A AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:55 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2630 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24050 42 45M = 23850 -245 TAATTTAGTTACACGGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCN *0'7<1&"3.@G78*;G1*H(02%!8=8572CD/)5C7*((H88$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A10A29A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2630 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23850 42 153M = 24050 245 TGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACNGCTTAACTGTCAATGTAA ;+5$8<,!?0$;CAF6(G))#;)82.BH0:/;-A&:+2*D.:%+&91G>5'0=-%6%/9>19'%7C+4*$73191=+;C"-+C&!<./?5(?!',5?(GGD*1?,$->)%8&3#;$)1&42' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:134T18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2631 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37454 42 30M1D130M = 37615 320 CAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGNTGGNGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGATTGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTNCCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACA =#&6&=7)DDG/+=<+G=6E4H1!D588*5))2,(7AB'!)DF2+<8%2&3'.?1D5$<@C/=&&5::<=;!D8'8,3'A+;HC@<@A?C9HC5"+3.G1A;G729>D,,!$+47%1#*8,H!A&>5!8F.0$H"0-.-5";4*,#HC6+A)6*D30?DB$BB@-G%:'=$E@4;%C/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:159 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2632 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1874 42 65M = 1701 -238 CGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCTCAGCTGGACCGCTACGAAATGC 6HH>$G%B%",+/;#2GF.9>@#1'*7/D0@6';=1F&E-H=-*(%=B>=%&B*-1HH%"+;&+( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1701 42 52M = 1874 238 AGCCCGTTCNCCACCTGNGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACTAAAG ?H>B#C2&D(F'.G/7$:+*,-;@F9*?1::*'82G5!.D#5<,*-!-+2,H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A7G29G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2633 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7286 40 97M = 7495 261 GNCNGGACNCNCNGTNTNNCAGATTTNAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCTGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATNTGCTGA $"$*$*%'$'!'$"&""%")*'%"!**++%("*$!(#*!&!'""($%((%"++((!($*(!"$&+!$(%%%$!*%%'*''+*!%'(!"'#"*)*%"' AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:1A0A0C0T1G1G1T1C2G1G0G4G0C1G33G29G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2633 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7495 40 52M = 7286 -261 CACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTC =59895$#9#'6!(/FC%CE&"4D/=D,4B68!?!$'@.022',$9GGD7D; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2634 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21451 42 91M = 21542 319 CACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGAT A,-264..<:/'5,FG%3:8)(3A5>9H=7>ACC+!?<(>3A,BC9B55%8$#/D(G%&/+21CG3&E6);,%)#.:*9CEE031&,,7&8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2634 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21542 42 228M = 21451 -319 TANGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGNCTCATGCTCACAGTGTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCAN C3C/96H2>F@16#0"H!;9A@=/.:)6!@(7E'6>4"#'=;:<*)8@:06E=1.(G1+86613EG"GF@=,/+#1!84:;GF/-'2;-4G9?7*-$&,$2"G#4:0*27?8G'G765B133?)BF97=D@0+#$!,"'GC:71$2%.(-'C?)F?/<>9C,9"7G%5+!1D/D>-6*3'#?@A!HHEE'31=CG;8)E8H-@B;2"$72B?3>&F1D&'0H62-0F!)588!E7=E,=68'4B#=GB.$144)61 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102G1T8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2635 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7528 42 160M = 7688 273 GGCAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCAATGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGT )6>9@.DB50@5:8-B:'.DG05/87?-4+%*)7F6A7.&2959:10D>;&H$=2H&:??*C9>:B>,36&H>75.;1D+$2B&#)@#5<,D-4-H:D-#A<@=F.A<;1?1C9@!/ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G115T41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2636 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32242 42 72M = 32390 228 GGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCA 44=FHFGE(86?975?14?(#%31?1*AH##/;<$?-ABF&AC=9$C/(1A-8-2?;D25*/2321G<'&:? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32390 42 80M = 32242 -228 CCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCGATCCATTCGGTAACGCAGANCNGATGA )'%'*$%#''%+)'*(")+$"&(**!"+"!&%*%%$"(!"")+$'$%++(%!$$&$'!+%%+*!*")""+%&!#$#))"* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52C19T1G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2637 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18170 42 119M = 18170 0 AAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTG A:)?=DGG!!3)BH+36D#G=>',3$*0+.:$3$3.E@.;:B%71#6:+C@D,2>ED)>AHE(A@"B$53(B"H+$#3#>*)@0@>08G$)B0HB*%@A"E9++.E8:.'.8#C@!A-+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YT:Z:UP jpayne@0: r2637 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18170 0 * = 18170 0 NCNGGCNTTNGATGNTTNGNNNNNTGNGTANNGANNNNGGAGTTANGNNATTTGNNANNNTGNATGNNACANNTGANNNNCNGGATNANAANAANNNNNA $"#$$"!!#"$#"$#$#""""###"$#!!"#$$##!"$$$"$#"#"#!!!#$$#$"#!#!#$"$#$#$""$"!#"#"##""##!#!#$""!!"!$!#!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2638 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20005 42 119M = 20124 270 TGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCC =84#4=?8+>2-4A!/)%G3EF6"55.3-D1-%=)+!:=3'>F$/3B1,@AD$1:?B+,(<:';7/)G)+7A0H7-"0>B4?B=#;E(21A.*.F"-(8-9#!#12)68=H,$F6%E2B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94C24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2638 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20124 42 151M = 20005 -270 GCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCACAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAA %0*.95=,D;!0&?G(A5;.D(G&FH!%2$&)7$.5:&1H8119>=3%(1D%8@A9H:838ED0C8*:($$F$)?$%H'4.)+()A';:@>G&3;>1?9#2'A3(:;52D(F5"-/)?078B%*'?E$)+!45H/G3#:;(%&!0+4G7C' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96G54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2639 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5045 42 139M = 4916 -268 ACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCAATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCATTCCCGGATAGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCC $B@=!>C"-2':$;&1*C9B/*66+0B$7"#C9:3H98"'B,4::70G1<;>G@-+/D+&H=.C)B%)C#DD-+B6&!3$,-H6#B*(:#8&(B)"E8.!8,E(*.HH/7E)E*/14H>>C=GAB>)8D1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48C31G8G49 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2639 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4916 42 129M = 5045 268 GCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACNGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCTCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATC /?=$5A8-D("A1<:;CC.$+A(,?>66%.31<=,14$>82?=F.95//74$HC8H"#-G>C1=--D$0#&F*=161C(H#4?96$55(5;H&53'#=F%E!80-!7!*9"2,"/'4&*HB0$H%7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59A1G42G24 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2640 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15632 42 130M = 15632 0 AAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTC 34)DD$%7&6=6942:-&A0=E"!D@DF$C>B#;=22CD17BHB-CD(H*+HA@FD*C5!A0@906%A?2#14?E279!)6D16FF?''H.AD',!)FAE=;3H5-)1@+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:130 YT:Z:UP jpayne@0: r2640 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15632 0 * = 15632 0 GNCANAGTNTCNNAANGCNGAAACCNNGNNNTNNCNNNTNAGAG !!##$""!$"#$$#$!"$$#"#$#"#"##!!##$#"#$""$#"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2641 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13352 42 153M = 13193 -312 ACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTAAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACANTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAA G,/(:85F%EGEGHEE%(CFB%D4:A0>!<>H%=.EC"AHC(7.B1<7'5">446)23%@D?458#50F%,H'%&/01202DGG<11!1F"-:5#-)?C!0"-5E2B*B<+))F;(039A0.-4;E6?;1>#:@1($'F89(%,<5)4211FC AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C53C51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2641 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13193 42 159M = 13352 312 CGAGCGCCTGCCGGGCTGANTGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTNGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTG 9H>E0GF+")0;4,'-;BC$F$+;6(F3:6#68@(1*H7'19):?G+*)'5H6!%=4/8#$@.H3A,02F&%>3!!4&"EAF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A89G49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2642 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26237 42 184M = 26000 -421 AACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCA DF&H>(!'*/""*"69.##E1)40)53DD=H8@H/G-64(13:?(54DH0?9!8:3(D++!E--H"&1+.$&8)3%G0*=(C%!)7)G3D*>#77"-E!6'1HE>/E(2/G)6$-:,A=#:$;2'!&/CB9*7G'-&340C5.9)-?>&*7@15.0(=.1>3E%.4@4FG#)#,-!C<*5=1:. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:184 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2642 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26000 42 237M = 26237 421 AGTTCAATATTTGNAAAGTNTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATGCAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTA ?&B4/DA9E/,0%;0@!3<')*EC6C/CC'@4;B@"1,C?"H,%4D*8**5:71&1*H72)6"!@.'4#9+"9?'CH'"'/$>?53!.:C/C=>'/6,*C1;'@),B,AG);7<<<4(1<2%G$5;GC082D*$9F@(5%8<7H%0!7D AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5C7A5T63A153 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2643 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40387 42 55M = 40387 0 CNCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGCTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGA #%%<4.(2;<5C@G,;A&0D'G-46=&),"H)'4<"*,0.)G*G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G29G23 YT:Z:UP jpayne@0: r2643 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40387 0 * = 40387 0 TAGCTCTCNCNNAAAAGGCCTGCTACGGCTGATTACCAGCAGGCCTGTTATTAGCTCAGTAATGTAGATGGTCATCTTTATTTAA )$$&%)*)&)'%+*#*"*%+""$$(!(+%%(+$##!$!'!"*&+(!+!$$%"")%)'$&'#&'"*()&(!%'"'&''&"*"*)!( YT:Z:UP jpayne@0: r2644 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42038 42 113M = 42151 298 ATGAANTAGCACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACANAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAA !%)&!"!$+!!*&+$('*&)%$&"#''"*"%"()!"&)('%'+')!(($$&(#("$*$&#&%)(')&#!$#*('$)**%+*+"'"(#'($'#$((*!$**)((""%%+)%"$+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G4A0G1A74T29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2644 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42151 42 185M = 42038 -298 CGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGANTCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACAAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCG "+/,;+,*/$@*.?D>F>G4&0BBFC6&55B,3BC7$#=D7==11='/2(731'2*4"BC'CG'H,=4G)-7%E0E>%=3*7"=?=63"*/7:==>?.267;*9G7C?"&BB"78@.3,2A"#B#2:G:6C)=4F%<$C/E0(@!H)C3( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2646 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6308 42 116M2I11M = 6601 364 TNCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCANCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGACGAAGCATGNAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGATGACATCCGCAGAAT &':,'7/%&&+3)E.&B70(3$1,&0:"(+-$6@A<0&(4H+E+585"??F8,@A1@9&%8E9)7EC6/6(8C'.(?%5,94:(/168.G='/'A!B--A?$#B)H1,@<-#&4+"D5+-+,":8C4@" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:1T33C28C9A39A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2647 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28139 42 132M = 28271 212 AATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCNCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACNGCCAG 7<@B0F2>F3*2;, )05:!C'E'(''?:!619?B*E,$EE1F8G;;,,7,#663&-.?:?A226:2&)E/$:)07D5E8*GB3)(3@!AG'=*@##26@5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:93G32A5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2647 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28271 42 80M = 28139 -212 TTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCNGCTNNATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAAGCNAN '(&%"'(++!$%%)*'+()#'"*)$)+(#&'$!$*&&*&+!$!'$"'#++))%(()*"+!$!+)%)+%''#+)'")&$%% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:39T3T0G29G0T1T0T0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2648 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 824 42 68M = 970 194 NTCTCTCCCGAAAGAATCCGCATANCAGGAAGNGNGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCA #($+"$!#$!)!')'$%#$#'&*#%%!%()%$*+**#'&*(&*&%$%(#&$%(*+)($"&")!*(!#' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C1A21C7G1C33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2648 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 970 42 48M = 824 -194 TGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTA &+2*B+;*D=/.0$/D4=?%'?1&51(>68".:*5#'0F20.//5"+C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23916 42 83M = 23737 -262 CATAAAACTCTCCGTTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTNGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAAA <-F1&E.?H<&B('7(#(525133=?H??5;%%21BB%;696#24G?"/=C??/4;HGGC!3G0H&28%4#6>DGB8?H15?( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A36A31T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23737 42 73M = 23916 262 NAGATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTNTGGAGGA #()!*"+*)!+&)"'%%+%&#%#*($!+%&!*)''&($!*+!#!"*&((*%##&&+$)"%!)(*$*!#!(##) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C1A62T7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2650 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28024 42 134M = 28207 256 TTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATGTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGG 5-=C#;')8-H/A2F"<&CA7>D&!5F,H';2'@'=0-!)$3F)5-+-!&'8F*0:H2D!7&A95H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2650 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28207 42 73M = 28024 -256 CTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAAAAACAGCCAGTTCCATTGC */C?22;CF/D#$2&H<6!C%(7*.:$3>>#%4EC>"CD2+(#0A(3&&>E1F)#=A8($*"*,A8.@3.H2%B;=F&45'.+''-C9>H@2/;&'@153=+@.)<#9H8C!#H;(3%-7(?:2H:!>8)=G=#)3A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C88A26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9622 42 62M = 9777 259 AGGTNAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTC 0DAE+60)(E@)*B6G::;>@=,*"B06E&2<5&<"H5E8+?7#/%-3;":.:H#(0G55=20E"(2BG"B2-A"'2*+F@0';EG35-#;?2.49041/)H84&#,)#&AG",.2!70.;>H5C<:>#.DF%E;.B6!:65,=@9% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41A29G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2653 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47363 42 65M = 47479 243 GTGANGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTT E(G;1!9)%6-$H"H,:<@6*/(F7685F5G.4>$F3B.(A$1:9C%.B))1FC:G3".*/GA*A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C60 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2653 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47479 42 127M = 47363 -243 GGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTNATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGANNGTNNTGACTNAATNGTATTANATGNGTAACNAAGCGNG %"#)#$%(&+!#*!#!$!%()"!!#!$"+$+++%&'!)$+('%"(#+(%$$+#"%!%'$!+)%$"''$*#"$&*"#*%!%*+!%"*+"!'*#*((#*$&''*!*$&()!"&$""%*&%$#%"&&'"* AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:25T61A0T2T0T1C3T3A5G0G0T2C5A3T1C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2654 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16922 42 143M = 17140 319 ATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCNATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTG D:BA+!2(@>C)1?1+A%%%ED--H,3-E,F'H)(51$6/&?=1+$%,(#B?>3,11H33;"-)4!(!-:%%B<1%D>-G0?59D'&&2)=3.D@1>@7-/B"H'//2<11)+3)(8EH/;?C33+A>*F"#H-D/,0$=86F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G113 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2654 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17140 42 101M = 16922 -319 GTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGNTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAA 13/@*%==8,?"!)>%EB'E;=@/D.;+93D1=+7#)!#G.#'B5B@=>#%#F4F.7./&-.?30'>;7BG5?#3$D1)CE97@!BG;=75(2'$G89E37 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2655 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15206 42 110M = 15080 -236 GTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGANGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAAC /G6G+22+E:+A5"-@+84!%$=-&0961):#)G=0011;?:E=,($3/033*53+(F>'07,A27B0';)#.3>;C)D'AADG1901:'70,A'">?:=(=3?3;798F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T82 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2655 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15080 42 98M = 15206 236 TCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACAGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATG F>>@=9AGFDH,.B8A!&/E%D9A/6FE!&A921/?1$-%#";) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2656 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40558 40 5M3I32M = 40341 -254 AGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAA /#%-0;;7!0A8'E AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:37 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r2656 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40341 40 217M = 40558 254 NCNTNAAAACNCTANNAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCCGGCCGCGGCTAAAATGGNACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGNACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGNAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATCGGCGGTANATGG ##)*!%'""%&((&)"$+%('&&)#%"*"!$+)!'#)#"%#)+!+++(+%$++!"(%'&%*#$%%$'%('+"#&$+$%'#)+!()+*$)"(+%&'"'+"'$#*###&"&))'$&'&!(%&$*)**)'"$#'$&+#+&#*$($!)#$")#*)'*!)+"')%!#$("(''*'#*&!*&)+#$(+%'"'#(%'!#%)$'+"##&)))"$!)**()%*$'* AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:0A1G1T0G0C0C0G1G3A0C26A17C39A15T21A65T7T4 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2657 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29468 42 195M = 29468 0 TTGCNGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTNCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAA E>'@G;#9)'+=/3C7BH"4G>?%!)0#+:C&*BFF0E;,<"67*:E/#);6D+1&:F!4G&%&(C=2&;19&BE'C"'B,<;D"6H$!932A"21E/5'=.;=E;>=>D.5.@!&-D'7G$.=0&:(4.#2366(?B>!%4.3?<.,!,:B-#,@25;94G&H!*"A(?*6-H:=*@A"08$0$>4&'2&*(42$,F2)+@?,&-$3*=.7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17A57C18T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2659 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42553 42 76M = 42422 -207 GAAGTAAAGAACGCGAGAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAA B0*8C1'E).(H$C/0=H**=8$97&6B$AD$1@73@BH-;#>;4D:?(2"?;+-<.BH(&7E9;(C+G;>A??>' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A59 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2660 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35032 42 13M1D28M = 34828 -246 AGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGG 7-C'958!..F%+/A=#G?*G5&+9F:6C:,8EC*'-E!2'$H"-).3ACD//*0?46#,FBG7F(,! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A7 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27377 42 113M = 27243 -247 TGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCANGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCAC :7./:;-;7;G0G"''/*.+88@0434@HF%34@D.08!B#&'8>@+28$F?%@#7$%3-BC=*-$8@-81!(&EG?!0;(;"B96G6*=38?,%F6=@C-."HB(C7D&?/B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81G31 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27243 42 134M = 27377 247 NCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCNCTCCTCGCGCATAACAGACATTCACTACAGTTATGACGGAAAGGTATGCA $.DG-A;5-$#"F0<(+):0GEA>.$(;>)#'@/!2=($@41D:B92)E2@@'>?E;8D9@5/E,083-:E0=!)@+.=&0G@33?>H@>G3+88+;H!-275+<75$.8++@B$,!)%@7:03C3-G1.0B!' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G82G8T26G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2662 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12306 42 99M = 12405 357 GAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCT 5E3)'D'2<%3*C472>,4;!-0-*:>2.)37:$-)23"?02#6=");34>*@02"(?G9/"E?0@H0D:5@,.B5;1/$C:922,(4*""E@4F8#<1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2662 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12405 42 258M = 12306 -357 GAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCNCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGNCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCC ,D1H;)62##)./F0/F-':1491<.0/&&C1#!'BD<@D@"#:4>E$*'H,0<2%'$6;,';2@H7.+0/?566#D9=(#C>*5G$F)H@6(D/2--C--E$-B2+<2+2>/&4G":C<+&?7H+09*B2,1=546'$D-%@B#F2$E?&9.4+8',A/3F'E-988=8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83G108T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2663 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17858 24 46M = 17669 -235 ATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATT %4:%GC6A6@+(($3>A2(@.6"*E=B5?;$6*;A=$>+:EDD-1@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2663 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17669 24 13M1D40M = 17858 235 TGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGG :4$%5:+,7E)0-(HD:HGG:%D7F?B?8*,'D70B(5%57%:@9'!*1-?HH5+00#5%)07$/C4G(7:.C>@:56.71B#<*-B%+"" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T130G45G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2665 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3225 42 392M = 3086 -531 AAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGC ?'@-E%"92E#+;&-:(E)1(03:$*4-;-1)B1050"4>*9E'!@3#)-9@422:/2@>!51G-3&3(7<5$4$88136'G6)>!'/2"*A@A=D2(@7C3"+2;+6G)B'4C744!DH>-=*@&/C2"(9/G4#*$"@65?%7%1=6B+,-#0=966&573!BG5-.2@,=",&:)(H=>';4"A+@C%:4G)1C@E0D63.6.H)-C07,),9,!DAC4B())>*29002(G$9G/F1:"#0*#:$/B:?-!6;.:&#'0>.0#F3B#(+*E''%8A%*F"23BG,+HA&F+9%00)-@,3??C"7=*!:A@>10H/C:8F>8+,;85126B+.H30+73-4;%7;%40,CD*F%*)@@4>'H6GE4#?32.F&AA(>FD9'E&+?!;B(9*0)C4$*5.A-@@21G@'8"F*DA@&7F=!?=;?$$C41$H#@?1"E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2666 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12782 40 33M4D32M = 12983 272 AGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAA (,0@-)@<)%@24@-/.(/'9=3E)6AG,+4.G/BC1H#@(%4$<"+-F@8.'&9/?=845C*8. AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:13C19^CACG32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2667 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2500 42 129M = 2337 -292 CGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGAGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGTANACACTGGCAGATTCCTGCCNTGNCNTATCCGNGGGGG )(##(%(+"*##&!+)$"""&!'$"$$&)(*)$%'&"$*%*"$*$+")$#')!#&&&#%#!#$'!&)%%$%!#*+&"%"((%"%&#"!+&"!!*#)&!#(")"*)$+$!'&"$*&('*%'&&(!)'#() AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:51C37A1A13A1G0C2G2C1T6G0A1A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2667 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2337 42 163M = 2500 292 GTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGG (G=<$:#C1$D6C!*4,0F&21#;@D6=E!)-:$.=2'G@958+&"1+%'AG4;)4/6#)9880?9#H.*5#,A(0!72"(*$><>.,CD/=7'&%;2.!D6H$G;GB5>1!)8"459'A@7D1<*;-D)D7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:163 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41242 42 133M = 41375 416 CTGGGATATCCCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAANCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGCACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTNCTGAAGCCATTTATCGATATGGTA +%$*#&&$(''()"*#&$!)%'&%*')'+!)+&$#+#+%#&&#("))'$!($&!!&#'$'&%$&!%+#!)'&"#!)"'(*%%%+!&'#*!+&")('&)*(%!+#)&""%$%$*)*#+*"&%&)!!'*!&!)(& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9A29C37A30T24 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2668 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41375 42 283M = 41242 -416 AAGAAATATGGCACTCCATGCGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGNCAGATTAAAACTCGTNCNCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAANCAACAACCNTTCGATTTGCAAATAGCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAANN '*'(&+&%(!#)#*$!*+'%%$("((!(##(+)"++))#'%#'!$(%*+(""#'%$#')$%$*(#+"&'"%(+#"($!)*')!%(&!$$(!#)($**()+'$#*)&%)#*('#*)+#"&(*("#+*%+$"$)*)#'**'('#%*+((*"*&&$!'!&+'%!%)+&''*#+#$+&('!)#!"!+'"$*(!+"'&$#'*&('&%)#)%&$(#$""%+'+$%(!)&(%%#%+*(&#*!+*"+!%"!"#&$'!+)((")('+")*+('*!(%$*+%*&("*%&)+#" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:19A23A15T1C159G8A15C34A0A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2669 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 863 40 236M = 1099 281 ANCAACACTGNGCTTNNANGANGCCNNCATGAATNCANTCGGCAGCGACTACATCCGTGNGGTGAATGTGGNGNAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCNACGGATGGTGATGCCGATAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGNGATATTCCGTCGCTGC !"$%()&$'%($%)&("*&""')(($"&$")$)%&#!%(""#'&+*##*#!)%$+$%(+"!*')*"+('+(*#+#!)#)%+$%(+!&&&$")"!)(&"$**!#%&!'!&"+$!#+$"$'*+++%&%$"%%'*("(&"'"*)'(**'$"!%()+%#(*+(!)&!&(%$"***)"!'(!*)&"++"(&'+$)++*')#"()""'&&"&))*'"&#+*(#'++%+'(%$($&%''"!!+ AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:24 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:24 MD:Z:0G0G0A7C0C3T0C1G0C0G0G3A0T7G1G0A1G19A11T1A91G17G32T2T16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1099 40 45M = 863 -281 TGGCGCTGGCCCNGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATNACACGC .2(E,-'*2(C@!@$@%D.E@-!"<>,/(*C"G$61D7:;A+/@G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C25A6 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r2670 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7127 42 91M = 6979 -239 CCCTTATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCNTTGTTTCTCTGTNGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAAC %##!#))#+(!*)+$%#'%(&*#+()"'($"%(+'%&"(!&!*$*)+'$$$&%&+'"&()("'$!*+&(*(*!%($""%(!$!!+$+!&$+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G47A12G25 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2670 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6979 42 66M = 7127 239 GNCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTT #"'@7A&(G%2';">A)/:>$1:3(FB=7E;!$845"1C;.CE$:.>+*CFE#BF"7'D<.$74"1$71<+'92C;=>AF1(?%7,":&/6=+'=&>G&/D'0-H,)-.(""A:E@3@2D6*>'6/C#<82+>D4;H=?3"6A>F>,-AG->!*H?) "5-@F&&*2*6@*C7!,3F4:'@1E:H")60+257(-C6%!6G:D*F(%2&!*3;H(:;5!,4&4+%B.*.9?=>:F*HB$8%$;?+A"9@2>C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:117T73C19C30A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2671 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34375 42 42M = 34128 -289 GGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATC >>4#:,C25"A138D<,%A7>E/!82C=A0+#),!9H42>*3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2672 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17302 42 61M = 17302 0 GGTAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGNGTCACGCCGCCAG '#'&#$*%+!$*!+**))!'")((%&+(!!("+&))(#%))%%$"(!!%$#)(*+$#)*#( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A45T13 YT:Z:UP jpayne@0: r2672 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17302 0 * = 17302 0 TGTNGNTCTTNANNNGNNGNAGNNNNATNCNGNNTGNGNCNTCGG !#$#"!$$"!"$""!$"$!"!##"$"$!!#!$#$$###$!"$"!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2673 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39638 42 75M = 39723 129 CGCCAACAACATGCCGGAACNGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTT G?$=G..%&79H3,&'96*/-,5,?C60#(,+97217=0H*@611.%/"C(-@+?C.";?='-%D1',>CC+ED3%(.B&,/F'*&/-)=2+4:?A79>0746*2.>%-EF!.!5=13/D+;:E.)(.,5'*6.E@!''$3G"&D@+E2!8/1.$.B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:185 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2675 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33437 42 131M = 33568 381 AGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAAT (A"7!9D?;-?'?H8AB@E6&E,4A5,"=H-GH@+46,7:GB(!$$1050=@/'!+?H6C&6$D'#/65)*2')=<*743G;9C.,*&.&%6.#>H+B79>",:)!/73&=5!E89#!:,;"&608;74!" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2675 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33568 42 250M = 33437 -381 CAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATATGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTT :*D5E'>D9'<0HB61@!F94'='AC$+A:(BCF61),&192$9>722?87?+62!<)?:$3$:)?6B<#+=#1>%?%.0?4.3C%H>$043A=AD*C:9"1#$'1$&"-'#6&@.7#H2"2,<#&!@CC5-A,!@B2)&7,*=2)+-,$3+HA;831#F.#@B!5*!G7/E+()5E2'E<(-&%D0-#H.0'3"C=EE.8+1C<;1.@:@-/4AF35C.H AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T119A106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5131 42 207M = 5065 -273 GATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCNTGCAGGTNGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGG )8&!B&!!/+H3#1E)($:6;2&4,@8>":F$4;2"/<18'4H?,&,.#D198HF;G29>";"+A8-.=)-G07-;(!*HE<(B#+.9!CD'>:7$F=>$@0D?;F3$8-$=<%"3;3"1$E49618':.(:&3:B"4=>.9@$)3=0%%%!A!0,#/)H152B+.(H9$1''*=3DE<6+&=(?"4+HBCHA#D);,H990(+>1; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58G7T140 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5065 42 62M = 5131 273 CCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGT D3GG6G/%99:!1A4(;@B%%>F@><@=5>DD"B/+*=GG>4F-,)*$03@G<.A*A06;%F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2677 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42635 42 67M = 42702 354 GACTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCC 5+=---0GD"8#7G:!* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2677 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42702 42 287M = 42635 -354 TTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCNTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGANGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGTCGATCAAGGC 5@=F0C3".2B3,./20$.F7B<.(3,#7*!*1D@/HF!@+3.0((1-72?1/A1EG.:=:GB-HG/05-0"B<36=7*+3&,0(4=FD'6&GGF'D#B+B+3>=D!3#4B2;>8+?C#7B?&DH18)-EE"<61BE5E<4,#7.5DE-G8?5=:>A?5<"3@8"-A&?"50A,C>DG3>7&'70A!%.E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34344 42 41M = 34453 263 AATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGT ;6,<$%(EE7!.?=2>BB1=**0.,?C%A"3/11)*HE>/0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34453 42 154M = 34344 -263 ATCGGATAAACTATTACAACCCCTACANTTTGATGNGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGNTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTG !B9-+0&8:?2%,%G7EB"<>>>EDC-.8>,$.-0BEA,?,+*#/C#8F*+A>68>GD-D%,7:(-=>"8''G)E'.=6CE75)D/.9G<9$.E2?943GCA0!:8B'.3E#"(#)!0**:H&=!296H2)4#EB*&:;<("24'6'>#-!82*F?>/? AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:10^GC28A5C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2682 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31524 42 16M3I66M = 31157 -449 CATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCNCCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAA +-A,9@1$.6A,7+>#+#5.+E#!<,'>!2?>C*$F"/A;D$=A!%$?,3#*-7!?!$9%6!1B:C:@G:DG=+/?';('!:E3:3D#F#+125E>2@>%F;E=2@4.B/&+C5?"$$"03+1&54:(E>77/.&CA$EB&;8=2;.&842>=%"@%A=C9G13>;5ED0'=7"@8.D/(F-H$/5C@48,/CE0'3$5!4?%#$>=+@:,$:0>"%:/5>4=22%3%=83H-">&4%C4=%:( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2685 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43209 42 135M = 43098 -246 GATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTANTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAA "EB!,G'7&C:'(01/C;>!;'<(4G-"9H$#=7A:*!,03=8@>.2E2'07>B/.,C/827D&#G7=5G47,H&@BH*-;77<:F7-27?0(.HC%@#605H&40BG$4$97'"F/)$BE9'+D59=4=)+H<"9<8'#G:95#8H18#3E')>*#25A7*/C=3;1>*=F-H+3-&=!?B2$;?:/'B-854B<""+>D" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C110 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2686 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27435 42 49M = 27551 195 GNTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCT $2)A3B*$7%3$>6C-#BH;,,'=D'1C0!/$4F,+-0:)0@.=?-1G0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2686 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27551 42 79M = 27435 -195 AAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTG !D&55/0(2A;,.#*%398#E@#<(>,2$=.6"!D<2&DB>60E"E$E5:56>3>2),E36=6&+)>7>.A8HG/,$#@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2687 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37054 42 263M = 36990 -327 TTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCNTAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATNCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCNATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGG G>+6(DFH)2B*6.&F,5/G"?.9C3,F>AH50)C4-5+-+.)4>$#H'=#B@.><)!2$>GA0!)%3&:=<#?'/#,?)2F8=A9H>H=3+F7'<+%38";G>@B43B/>#0=;.85*&$->;$2"+A?;(=+"7*(#.8D4'5@&&>3?-/'(;D<;C/G"?%1/-:D9BF$4DAF8CF84F226A?C517=A0"*##C'08!,D>%*=&0::2&B:%DD.!4%7A,45%F@-3)BDH"(!/)4@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:43A81T28G16G91 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2687 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36990 42 64M = 37054 327 ATGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAANCAGACAGGTTTA &-1/!E,&*!G2.$52%39C9B>>0?2=+FBA+"@%-$%C(6E(/HF&):0:1HC%752"AC/! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T50A12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2688 77 * 0 0 * * 0 0 TATAGTTGAAAAAATCTTTCGGCCTGCATCAATGGCCTTGTTGATCGCGG +!0""@!+0>B9G9)C5?$H;*!=*CE:D+1D>@>09B=GG&%,@1D%*& YT:Z:UP jpayne@0: r2688 141 * 0 0 * * 0 0 GCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTNTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAAC ;HH?FB3G58E&@53:5)%1,,5F,9$$;9C@E?'A'E?)5H%DB>-C>'@A55*%B4:$.&)1-(3<%-?6F2!'@/2%G$19>G.@-$F<@)*HD&>D#-/'&>6G2H YT:Z:UP jpayne@0: r2689 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12261 42 290M = 12194 -357 GCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTANGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCCTGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCT 5/$"=;A*F5.88:AB1@6C-$26<)$(<6#5.1BH=*$:0?B45E?,/B<$D017521&!*056>-0!0#-G$#8;8<6&;.+D5,G4%;=2/HG,05F+(:(()@GFHB07)65&A*E'1<0&?0=7<'*1>33*,*?DFE?#=5C;B.<(GHD9/)!H#@=-+(/7#B6@#)#-0FB>+.):142G3?D)(88,(4"2A+9HE,=,0+/2/7!"6* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83T30A175 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2689 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12194 42 67M = 12261 357 TTAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGNAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGG %"**'&%#%+)&!()*"(("'((")%)&!%!"*&+!*&$)'+&#()"$%(+!)'%$"+!$%)%$"(( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C26C38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12236 42 78M = 12016 -298 CGCACAGCAGCAACGGGCAANACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGA 13HGD5F)&H!:"E'DA=->962:BAE&EG="")-05,3!A&?#<-"0*?-@7'6H;@'9'&<>6-$;?=&D-"5FAC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12016 42 42M = 12236 298 ATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGG B+6@D)FB4@*D;>:2"8:A"ACA($-'G>GD=3FAA?&%4H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2691 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1266 42 70M = 1525 316 NATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCNTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGT "#F$?E:;8<4,0+.-'!="#26>+,%0+7.D#B-!E@-9!-0/7D8#.)2@G">2212G@5H"-8!'E- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G29C39 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2691 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1525 42 57M = 1266 -316 ATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCCAGAGCTGGACTTTACTGATG +744)>,G%G3)2/251*959C5@FE-8/<@<.5(.8/9;B";7)3FEHH0?9"":: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15A20A0G19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2692 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24328 42 141M = 24213 -256 ACTGCTATGNGCCGGAGCGGACATTACACACGTCCTTCTCNGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATNGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCN 799"#>D41H7@(F3$3E!#,'!0+H:6.$#1$A@1;A=0*43).()H+G4/CB/:)-?FEH1F?92%7/;1760A:G'1;&980H%<9/*G/H(/*&<(C#$6CEE.=8=#6A549$HE(?%FF*)03+/>?"?<$+97" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9T18A11G36T62A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2692 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24213 42 97M = 24328 256 GTTAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTG +'*=,8A!2-,,=2H?7#>9F/C?5)A'<;!2/4'?F&E)$()-6$(!.-(!!A8,#G,D--;268='F;,?!8-.2!,D.8#(('<%,!9@# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A95 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2693 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46378 42 40M = 46195 -223 AAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCA 7A'!?&246!2>5#8&*<>E?A0'#9!A*C./$.B%'-/! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2693 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46195 42 49M = 46378 223 CTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTT FH<15G$02D3+*6G-=6BG55<.";%!+3B6&8"7.@",@&=/: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29234 42 70M = 29109 -195 TAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCNATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCAANNCCAGAANGC *'$+)$%+('$+'%#+!#'(+$%(!$&")%+)*#"$#!')")$'##'#*+'#'*)(*+!%$$))!((""% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:26C31T0C0T3T2A0A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29109 42 58M = 29234 195 AAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCGGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACG ()E(@7?(@7-EG#'@-F--5(-"1B"H0FA-7B00.?.9?)2<(.C&$D97E*/$?; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A26 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2695 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18047 42 76M = 18286 291 NTTCGAAAGAGTGGAAGGATGGCAGTGATAAGTNGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGG $>1H,F#'F,>%F(-+%/!#;5F9,8!186"=<&5#$?&>,*/7G!=BF!)$?F">4#7=;1/C7)3,%A)7-,.$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T20C11G42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2695 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18286 42 52M = 18047 -291 GTNTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTC /+=FHE)%"9@'-BE1:3=8>/(E&D688EB=35;G!*.(=@$%#CFH6=8>9!HE-"3;.D148H##7028/C4?)HG=17@73"@@?1$(.)C$8=C),8,9.,H+=4A-50F>C:;E@5-BB&0@-DA:FC0E1#1F/.-G+E15E/"%42F94B++"'-EB"11=*4&.*?4$'H-$E%=@2>8.1),#!?F(--AD((FE%32<@G88#!;:(762"234;FGG??"#"5.-+'7$($F.2>A!B#*E1572EF!.G8&1%--A8#1B.>;!$:2HH;)$E<6A78)3:%!8'H)79=CH/);(%D;$?&&#E)$7'=39B/>!%.&-B=.>;)97$$0-833!&(=?;07DC5B+"7)%"$';H63#7@#&6/8):@83G''+6'"#G51:/@E1#4;6=15%@$499<41G:6"FH">/656C)29#:!-0?>!E302 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39G60C138G184G37 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2697 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27261 42 73M = 27406 260 CAAGTACTANTAANCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCG /*8C32*B!E*8+=4(0<7$#:)&C,A3"9$C'5:;';>="F(4(;68%A0!,@=./*F+2CHB,;$;?GD/E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A3G59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2697 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27406 42 115M = 27261 -260 AGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGT C0/%/=>F2:".C8,AH#74D'5#(H.6C)@;@,0(25A7G.75A4DD",?7AA>$)6FA'1-E=H@1)8A28HA%7>*<=' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2698 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37561 42 53M = 37793 326 GCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAAC F/(=$;#,5H-/'E+1F?&<#&G22-9!<.'28>@'6@!B65<#-#E<=1=-@D)2;!B<&21*-;7<* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2699 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36416 42 40M = 36626 262 TAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTT '".H)DD3$32/A<04*,A*3<(D>BA7:G!"H7-;@-D$' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2700 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37839 42 169M2I7M = 38015 233 CTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTNTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATA C<+9A56+8!&%D(/"1+6$B4$(=&D,4$&'876$E5E@B!':(01A6:/'%'@F%A6#(-">/+7B9A0,&/!D*38ECB&3;+;+;1BH#="5&%5CA"B'(8C(!8AD&==52$20F.EA*C=HD3>=#+GGE/'B(;?'%A0F<3!$$C#H;/.*+=3D@3'.7C4@D12#4.;!:D&@)A;./,5%; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A11C14 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2701 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10817 40 49M = 10817 0 TNCGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGNGATGATC !)+#%&+)%'#'$%%+$**()*$&+#&&)%'*(+("$)(%)$#$!(!++ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C0C0T38G7 YT:Z:UP jpayne@0: r2701 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10817 0 * = 10817 0 NNCNNCGGNGNNNACNNGTANGCTNNGTNNNNCTAGNNCG $#"!"!"$$"!!"#$$$##$!#$"$!!$!"!##$$#!"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2702 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11353 42 113M = 11206 -260 CGGNGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCTAATCCATG -$?CD?72-7087H1#C:5>B:'GHA+57:B35?#:-:*50@(?CCE--=@.H92DG;?.<-<+EEG!,'*172@@06F9*4A47G+C9!4)#)E,H>(4>+2<& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C100A8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2702 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11206 42 91M = 11353 260 AGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACATGTCGGCGGAGCA @;H,9*0E55)5156!AF=;?9&.@0D4/?<3'(<#E>(19??A:!$8+6258>")'= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2703 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16283 42 77M = 16107 -253 GGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACNACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGCCCCATCCGCGCTAC 3D77#"1C#52*?>-B<,5!,1+++,H8$+?4.9'E49DE:2B99D0-3C?<038<7:)*E!074B.!A0@*A**@) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A29A14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2703 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16107 42 145M = 16283 253 ANACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCNAACANGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGTGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTAT $!+*)!)$*+#&('*'#"+(+%%(&($(!"'+)')(!")%"$*$%$)*"(+(")+!)&&&&**%)!)+%%('&&#$#(($%"&"%!)+*(#"()*'+%'*("#'+'!)%"!)$""(''&(*)*"&('*)$#"+$)$$%'%)&##) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T34G4C52A50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2704 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20662 24 38M1D8M = 20818 197 AAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTG GD.@>*>5@<#*;8D+A/$!G%!7H>H0H2AH')CF*C'/G.#/@% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:36C1^G0T0C1C3T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2704 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20818 24 41M = 20662 -197 AAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCG H6*;-*$,.F**16517?,8):&>69/@C'5+:,5$:,55B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2705 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17497 40 79M = 17578 275 GAGCGGCTGGTCAGCACGGNCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGA +''(%!#*!$'$%'')*)$!(!$$"+%+''*')*&!((+#)#$#!'!&'+("()#'&##$))'%*(!%&%$&$$*!!#( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C59 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r2705 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17578 40 104M1D37M6D46M = 17497 -275 GTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGNCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATAT ?A,//+5(<;B--0B):80?<9+D.2,%"4+?8<.-H3:E++'<%B;)>&;(?+2-2%/&%"FCH7,$::C"A=,0H=)+9!895#G>C-%5?23D+3H)23%H>-G$>"H"H%->?99@;1=4!-.(2G.7F#?C>=)%;4*B50.>=*,>05=#E3,>A%E0G'(='G%>FFB+6&$>$1?)0@5FF3G"3<;0D6E,C+1",H;42HA"1*6#9.3=0>&;1C+"7'+:#F:<5?/H*G0$;?90B#2+E#3-EA'.0E.1D10>EBDG<05HH6==65EG&?4.)B&;+D7)8.+9HA<70:5/15B=?B* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T0G104T53T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19645 42 54M = 19454 -245 TGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGG +=@8'6@%:011EDH"-.'C&%*G9/G/<8?2?3@F3;(9)4+@HA)@=-G'0> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2707 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47202 42 11M6D76M = 47295 253 CTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACG 249F,2=F5C-,F835F)#*>%'HD<$('-?E(#=<,5:7;A0D%1H>*?&A>!,9!H#ABF&8#;0/9F-?!5 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:11^CCTATC76 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2707 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47295 42 160M = 47202 -253 GTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATANTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTG ;G163?4G?G?)/=83/DFA&E*>*D==$AFE&(F"ADB3,G/8,+<;?>'-83(5:3*F3;HH4B"!E:C4-$<<4(#E>1+?7E-H$5%E$A#FEA;%"48>8F5)26G93@.A/@1*$$@8)9/>G)6*;D'D:3AFFF,)15D)- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T129 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2708 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38051 42 182M = 37890 -343 GCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCNTCCCGAGTAACAAAAAAACA -640*.-&//)!)0+/B45E>?F(0,3!)*?G5"1=+A**#48>6H,*2/C9>5$&11&7/$(&9>1A'E11DC4)%.,!/@;#%<&',#.'3-*!5B612;F-5)7@<0=7)EC4%B/&:/0D?FC?!5A(#7;"<@F1A0C=:*EA!D;$:HA;6D137!=G'9%:'(G.B+2%&+/5B/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:114T46T20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2708 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37890 42 118M2I43M = 38051 343 ACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAAC :@@<1;;2EG>#2?6AE-&@>(2E6)8*F.0"/#87>/"C5H1@#0;0GH9GB3/$/=6'5921@%:5<$(FC="<."#>.8D*"H:C'!6E)01.9'@;<2#5-AD:B+:F*=F?5>;51=@.!<,,"..7""!>@E"*..-8//3C3214.3 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:161 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2709 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36153 42 485M = 36638 581 GAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATNTAAGCACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTANTGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTC (364'1@;96./,'A>D60B>./+>H0=5C*0>5F12(!3=CD7"8*3#H'D.-'B(0,@HE1(?-:5.%&0<9:$E).56!3F=$A%.3%23*6G2E47F&+HED#%6$$,89998(6/.FE6D"E-8=89+&%0F#(<=,:4.;B,2,CF8F+?1*,@/:;5<$?)F>HE$C/>4,5D52HH='.;,82@/-8HE7!17H"4)337=D.'>'$/**+;%EFG9.8A>16*:D1';-'!CA#>>"07@F.')+D171C.H@5+>*.&=4;A:20D?""&$=,9'&/5E9$2H@H:,180GC<6'D6<+93%92!3()2E"E4?"!E/7++1D04E-H9$=?$G59!C$&DB-&:@%+800AG?7:1)G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48G19 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2711 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43847 42 56M = 43598 -305 CGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGT A?#+,$+:,H512$>/"461.#?;.**2%".)!1$C>&;25$<=%00&0"-3:C?4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2711 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43598 42 60M = 43847 305 CATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGA 98)=+:5@,9-4<25G7E+4H"*F1GA>0: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2712 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24457 42 203M = 24357 -303 AGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTATGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATNCAAATCTNTAATAGGTTTNAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAANCGTTGCGGTTGAACTA 6B20C%F&=CF332GDA,,B%?>E+5G0G-',D:0:F?-+=@A5,8&-#!/2'C+%BG:=%9H!>?5,7<$;#"/6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:81T47T7A10C37A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24357 42 63M = 24457 303 NCGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTAC */&'(B"&>B794@D=!@45>:%?H3$HB349/BH#8.>41@#!!E*$''<>5%3*F<:H((9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A62 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39819 42 50M = 39869 340 ACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAA 97!."?*H"2;DG0:8"DD"<*E$@CB.B*H!=E&0C7#E5>A&G<.<:' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39869 42 239M4D47M = 39819 -340 TCGANCATTTCTGCCATCNCCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGNTGATATGGTTTACGAGTTTTGCCGGAAGCGAGGCCNGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATNCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGAAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTG @)#B1E(@-/!D@#('3#@;07?%H;:6DB$@,(36>5"=7@7;0E$=&:@C:=HD66"4!9B14B;C$'!?#A43(5!F3>.@A?-@CF;...+#9666+'3#9E94=(A>#04($.3($B,:CDC+@78;9>$5-24=E$G=-=D-1B5#0(@+/D"2A;3#H4,(0B!3HC7.-1!!(?CB#7%20+--9(8F")+H?#EB&46F-.51>):%;2,9H8"7-#F0919&C@:,0-B22>-=254H=H1-28B>&&2F89!!:!B AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:4C13A73T17A17T75G34^GTAA5C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1805 42 203M = 2008 278 GGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACTTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACG 6CD./3(C/13-656B"59(@H;$01HF#6?'DD:F!C*6:5E+C8'@@.F1.5G1&D>GFD,;-A7,D=6'*1@C@/&39.,<52:63G<347D:-0".*$8F8;7,!H>=>7'"7.0@C"64$=278E."98%/3!67:=!&63)207"DC*,'!'G!87A2GDD1:6<("45@A.25E-?'()?DF==86+)92<( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91C111 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2008 42 75M = 1805 -278 ACGATGAACAGACGCTGCTGGGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAANGNTNCGGANATGN )(!*+''%*+'*($"!&"))%")+&#"'$&)&$('#%+%""!!&))*'+&(#("!'$(+(%'*!#$($$"!**'" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20C40T1G1G1A2A3T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33351 42 101M = 33576 289 TTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTTGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAAT =B0,B;C<"9.0DA,"-*6?-FGG'=8D-HE'6*8D,A$766E)=8:A4A$;1+D,?47@,HE;,@@7:?"''AB+)+';&4**@+DG"5;%==C'C<(0-0F(3+G>G; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T55T78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2716 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44118 42 41M = 43911 -248 CGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACT 90GB1<7;;2H&(C:69!#7@0./&:8#C5HA589+@B7-E,8;>57/4826<>$"A(?D*(7=?E/9B$;;5-F$H=)+;.6*6$%D9:G>" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G139C15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2717 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33791 42 84M = 33875 265 CCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTNCTCTGTCATTACGTCATGGNCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTA 7A2:%)#CB"#$B727&!-!FD,CG5''D(F:?<@(7(DH.-!//&F9+G&FD/04-7E:#04#7<2=1$9.4%$8%=F*=GC< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C19T34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2718 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45882 42 70M4D48M = 46004 426 TAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAANGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATNATCTCCGCTCTGGTTAT (6:C0:9+=-E+84.1B<=7CHA?+*H-.<;3D@79<)2?*,4,&$5D="2<4G;C:"@'&%3("D7(@@!<+3".4C)%>.@H!<@(:H1D*$FG"6F(4H=%'%%2"%4,?C016" AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:1G22G45^AGAG30T17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2718 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46004 42 304M = 45882 -426 CTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTAACTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGNACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCA )!/&1=99.G<%!#):$%#=9;5'2'>",<=%EA<#88/8()*5A7:9-6$/*,*F;4'1%+?41<3)#.@G:':C>BC,<(:7/3H*H!=:%*2#"450,@-DC:=A0-9.:G8CE#-6#4+9<3E4*/4>03-+<:0'3E?/;<$';D=>14>;H?55A5D!-B&"8B6>5B(:GF-29:#4*8%?+>C>"?+7=:&;:+2;5/B%%C*D@A)5C9/E(4G43795$*7!AA?=#-.;65*DE#B%*%)--?=5.=F6/#*5#B$*=9..+0D47<+?!!=?3@?;"0(AD>/BD2)H;4A* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56C176G7C62 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2719 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26220 42 145M = 26015 -350 NAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAANATATTCATTGTCTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAAT 6;1H.&A+&3HBC:-:.;HG8)G6,C9-*:C&F(6BB1A066*4;:(ECE0<'.8=H!$$+&AAC@E,0A>%A!*#$>1=G;GD1C$8#>7;+CC(8"0/%.E9$,H-#72$/038A!--B$C4*$?GHF2=3(G:=#0+1H9,8>&853(%*5,3)2:/,@88+;4)HG+7+'?%7-F9&AD(/%>4,6A*C1@*8*0HF./=.-BG(!"H60%;-4G;&>AD=7,:9D=/!B%10+2:7$73/$DA5AF@,3>45">G%;#!5H"1>BC:23$?2=41;!4-6D)D3#.C77.$*;($768&476%8;>:!;HD,C?&$0C7>+65?@-8@+3!B.%2/0@".2$'0561)/*=?$?A;4CF),6;7A55EE#D).!>?<# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74A67A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2720 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46175 42 77M = 45977 -275 GGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCN F=4!;;.<)'H),#<(E,:*E63=3=G!C.B0A0#BFD)3+/5C'C$7(>9C&"-#@+A)A;! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G13A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2721 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9484 42 62M = 9206 -340 AGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTANCCGACAAGAGCTTTCGTGCG C5DB#,=<5*<@&,,1HF#"21DD.?*G.8*!4"-:>%F=!*)-37A(;@3;H*81"@.:4E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A20 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r2721 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9206 42 179M5D72M = 9484 340 GGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTNTAAAATCCGCTTCCCNAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCNATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTNACGCCTGCC -'4%*HC7)=6,/"!*HH.D3$:!:#"7)4#F#C>!7FB2<=D,)A1G)+=5#=68B.A;+*.#H&420B+@.@&,9B8:8F=(8>F'%-5786G"AA;G'H44+!$&B+.2"70"4:H!'$+4'&E)#)"&7%85%A#=05.BB/6)CB?3(8B0!4D=3A-*$5&,B8GH,D3(.)H'%:93:54<<:=;5"$)'(A=2%?-(46F#.*& AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:71A15G91^CCAAT14G47G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2722 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9384 40 57M = 9139 -302 AAGTAAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACT H>-0/7<,A=GB=:-!;57#7(%8/,?7)$2!)82E3D9#4$CB64B+CF+D;5D/% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0C0A1T50C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2722 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9139 40 93M = 9384 302 NNNAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGC "!*&82/;'027:F8-'9:EB++>9,F?!G@7H)C*G/@!&>*+72*4531D90(/);:F>',*-?%C,9$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2723 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4373 40 68M = 4230 -211 CAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGATNAGNGACAGNNCANNTGGNTACNCN ")%!"'%(&"'!)'+*""!"*&'#%"(*)&*(%(!#%%&$+)%!&#!*%)&$!*#($%*(#%%%$!&! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:42A0G2T5C0A0G1G0C2C0G2A0T1T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2724 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21357 42 117M = 21474 271 GTGTGCTTCGTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTNTATTGNCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCG ?10"B0/'1":,''.E((5EA"*#?E'F)-F88)99FE2.CF.E@H?0,EF"#B0H:(>8E.,:160;7$;GCG"0!&$#A8-@6(26;(;;G?$2+B&"7<0*F;8?/*@/0#24) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C49G5T51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2724 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21474 42 154M = 21357 -271 GNACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAATNAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACAC 8B*<26>&25D?"G=)696>@5+G6?@B/74E)='<2"./1*F&.=*!-5$3#:9197";C%/:09A')B6*".(?GF$4"F2!A954>20A;#!B01F@9-)?@$'1-A,CBA%:BE(6:%*6F@B!AC9F*07?9$0<.913 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2725 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9132 42 54M = 9265 181 CTCGATGATGAAGATNCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCC 1>!;8-/'*-03BG!4(1780,%2&D1A*?1$9;5&&&&!2+=CGBE:G0F"A5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G27A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2726 77 * 0 0 * * 0 0 AATCAACTCACTAATGTANGGGAATTGTTTTGATGTANCCACATACTTCCTGCCTTCATTA !;!7=5-H.!,D/;G'$59**F2)G8+5A2*%>0+29*-60%1AH,7::CFGH!7".4=-# YT:Z:UP jpayne@0: r2726 141 * 0 0 * * 0 0 GCNANTGNNAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATNTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGC #!&((%&'!)+"%"())!""('*$($!((%#"*#*$(*+'&()&+#)$$($**+"*%"")%+()'++* YT:Z:UP jpayne@0: r2727 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26790 42 58M = 26857 214 TTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATC ?-#-,,-G!A@;<+E*#@,%33?31=2*68@+F1)!7C17C(:FC8'2C7G"FE:,(/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2727 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26857 42 147M = 26790 -214 AAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTNATNCCAACCATCTGCTCGTAGGAANGCCTTATTTTTNTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTNAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACC &!+'*"%)"+!!&"!+"'*$#%$(&$&+"%&$)($$)!***(&'!#!('"(#(%&("&'%"&!)*!+()"!)('#"##+#!(*&&)&!*$'$'"#!&&(#")#*&!)%%"&")($"#(#!)&$%&(%*'#%!%#%%(''$%+!'$+& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29C2T21T11T38A41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2728 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9906 42 64M = 9970 216 CATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCGATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGG &+1(98D$%'%17#G,0C,,52C-,@:E/&!C('/F@4>4*;$?>G>0G$G)&:7034:;.",$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C31 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2728 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9970 42 152M = 9906 -216 AAGTGCGTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTCNGGTAAAGTGTACN +"&)')($+)**!'('"&!!+%('#''))'!(""+%)*'&"*&*!#&'"*)&(+!$!(*!(('+&$$"%&&"$$%'&%'&%$"(*$!(*&')&""(!%#(*+*+"&"#"+)+*!#%'$*!((#!"')"&)&#'&&'#+!)%!$%$'&)##*! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6T130G0C2G7T1G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2729 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31381 42 91M = 31173 -299 TTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACA DG8/*81<&$&@*7!&1582A0B-&8)5#5>*$*GF,1>:C/39623$=#$F:64D>5&2&6-:*$F.9A5C9#<);&2&/@GC;53D/99 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2729 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31173 42 44M = 31381 299 CTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCNCCTCGTTTATTATT E5H'B5#)@.05F7:')DG(.3C-&:)58A*,7*B'-C8B6=6> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2730 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33601 42 108M = 33257 -452 TTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTA ''(#)/<:9>'34=6-!-C,GC(";=!(D2@/?/CDA@>/,.)H>':8GB!B17"G">F/)%D@&8=C)G%2%G?A"80&D5145B91G@CG51F,)G9&6HB@D',C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2730 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33257 42 344M = 33601 452 CGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGNTAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCANCCGTCACGTAATTTACGGGTGATACGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGNCAGCCAGCAACAGGCCACCCTTCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGNTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTC 28@/8-#A+"+#=90H47$D8@37H6*)%00)G+.212$6*1)$7B.-C463"$CD$#DB>HC,BA3"<3+CD"C'E"8(G!#;99?:7?F2B6/<1,<5,7186C(08HD?G!#@@6D(F&4E,-7GA,8*.1)=,)9(C4329/5563;,#@>,/.BB&6*::F<0*5=%"*>8#1!F0"/;6(D8B47+;=8@*>(H@C#C;F)$D1.257"*)/&H3853<.8@,12G:1;2-/ED0;50&'+-14/1-F,(9.?#43G2->;@8>F:%/H7AF-9*-;*,/5#C=C?BA>#03$H AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:51A68T23T23G21G69G73T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11945 42 68M = 11756 -257 AGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAN 9$B%';-8!(3.+E$!58 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2732 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33573 42 275M = 33848 635 ATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACANAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTNATNGTCGATTTC *8;:GD)H$0;()BG8120A>GD@3H@+41"1D#).H%#*C$&B#G"('/-#G%;$9=@C,)8.3,H@>2B(/+G2447-D=:"=.=;83106BD(5>4C.(E3H;4EB9/--.H(-&86@C-!D*=#>"%H9E8F@A>>'>,D%>#.#AH*E2G"6A'"6.1'G8B5A,1..G!=D)5,02>4"E)+H<*;5=331B4H'24G)*H?6=G8B22!D&A6-/2=#C2%->7,'-;C02!)E"<", AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18T81C161C2G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2732 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33848 42 360M = 33573 -635 AATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTGACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTNTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACC ;>34,EHB,+;6%/&H!B3(>510=%(((G/29"?53:6F-<;%=8!D/"149>3C*98FEA8B<2G#$/48HD,;7H37G49&A%*:F8F?=>'AE0>DF1,0)B!?7&4+H1788:C8"=)!4))+B">5!?!$A0#:7)<&6';42139G!71=1D'8:19+$!D"5#H&9>)(15F2-$/#G'&>2!?6DC"82>%G:'H+:/.D@0F.H,D,#/0!#9?"&D0>>)D0+<3(H#D= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2734 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30931 42 79M = 30770 -240 AACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACACAATATGAAGCCCNCTGCCAGAAAAANGCATTCCGTGGTTGNNNTN !)##&++#'%+%+"#"#*("!+'(*#))"%$&*$)(+"&%"#"+*!)&#)#(+#"(&&()!*"')!**+(*(+)"'!$) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:33G12G12T14T0C0A1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2734 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30770 42 43M = 30931 240 GTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTA $>F$<(38-,;("$F.71,@&?%5A%;0E77C$#;F#?59,"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2735 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44343 42 115M = 44343 0 CAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAANCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATG 67<1>@H.A2:B#.6=4*?1B>'7A?CA6D>)9"A1?9)2,CC!(==++#1,1'.!>0? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G29 YT:Z:UP jpayne@0: r2735 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44343 0 * = 44343 0 CTNNNTGCNCNATGTNAGNNNNTANNNCAANNANTTTTCCNNNAAGTNNNNGNCACCNGGCNNATANCCCNNNTNANNTGNGNA !#!$#$"#$$"$#!#"#$!$"##$$#"$#"!$!""$!""""""$#"$!!"$!#!"!#$!$"$!#"!!$!$!!!"!"""$#!$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2736 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19502 42 84M = 19712 292 GTGGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCCGTTATAAATTCTGA )*#+*(%#+'"#!')*!&)#"&*+*)''%"%%##+"%$'++*'%#&+$#((&)()%$'&&#'+'%+$*$"('+%$&#'(%%')+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T66G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2736 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19712 42 82M = 19502 -292 CATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGT .06=&%&(>ó//%?8&%2$;)7D5"",#"/#3183/2-,4:!E+4A,C72:!?96D#61;-.83815'CF)33AH9D9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2737 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43198 42 43M = 43402 259 GGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAA DB6?:&;="A'1*+D1,?#F2*;:17,E/.*<#10GH$,;"=! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2737 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43402 42 55M = 43198 -259 GCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCANNNCCA $%+#'#%"&(#!((**'*&$"*!$)!'*#%&!&"!%*)#!'$#%!&#!'+"##'% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:49T0G0A0G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2738 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17599 42 83M1D37M6D24M = 17422 -328 GGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGNTTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCT -"81H!=5?$:90/8<&B&G95:=9.>#).A972.1>4>)924.>D72E;$1%"B&-20<4>*=,G!CBE+"BG1=&@9$<8:E8/.>H89"786#);?,0@+?(+'-4,-H+.$:%<,"&@+17C'8:5%9'-5DG#4*(,G8 AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:36A46^T37^ACCCGA24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17422 42 177M = 17599 328 CGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGG #HF4AHA/+!.'2#:CC6H/$C,$02>B:$7"/?C4/?E#-"-$#&A*1=8F9$'DHDB+45,:*E:'6A!G<$#45=H4&F="8C"8"AHF%?+%5=)A+4FBE:?G>(H<,'.5/-$1<-4F"&5?42#&./F!0!H%-(E%G";!2>(FG@/%7<-2?7("AB-@7C-!14'11 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:177 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r2739 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10236 42 49M = 10309 302 GTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCT 05"1#.1+A8.&E59.BD!%-$.9@GF:&=.0'<%*9,A:*8@G6;5&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2739 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10309 42 229M = 10236 -302 TTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGAGGCAGGGCNTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCTGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGNNGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATTGCAGGAGGAGTC D%&%"+?A",%:.G+A-1<5'(1+/A;3646(C<@>>?4;2&!::*+5#@;8202/#;9;'-,C/?15'08C92>4/(1?!%<-2E;1F&?&/754(FB8,7AH94?@)9/<$8=?.>44G7C6E>#,='$1E')<78".95G:C73=8/HG;B/.&88!:/)'"&#!%,B+.G,)=6$4-A&G@+6@A;!*%1+H2:DE36H,BA/#"09-5!<0"(37G9&,7F58D5-?2*?537((H&@!>;>1F1?+"?@>9G>?(0A<,637-=90<=AE-6326(*(9<,3+$;C#)G3E"HC<=H)$$&171>C'0,;,/CHB*3!B$1B!@+'F8*B/;6D<;3=E,)9+2A<7D,+G?9-"/@0("6.10"*:7;*:!!<"F/C82D8/!:3"-@">B;'&E;CC)1AC7D16(1D,.% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21C3T29T106G12C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2742 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42983 42 217M = 42833 -367 CAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCNCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGTTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGG 08*$!B+(G&>,:/2$+'):1)A@3@G6/6A?(+-2+&B!8,;+?*C'F89H$!&(+C8+>3=)*;,**;3-E?.H753F0@(?<=8"$G-.7*:;F9D>1.#C5%4C9)!%?*.':50$1CA,C/&:.<*!)=H-23D-37311F#;7$#/%?;9'F0(A,7F3-HD!(=EC&A?7#@(F/?&'259A8<3?0*A!D>C@2; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T86G63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2742 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42833 42 150M = 42983 367 CAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACNAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGAT 3$)@,,,<0#*1>:)#GC7>%(5=76<")D&.4"%1A!,#>F9;GG24G5%A(F3GB"!<.B&"(8*.$3%<2C,<<>F*9.1(43A-(.!<(1D31'1;/@1HFG93(%CA;6BA,F1<;787G'1"7+%@0-(H)&")F@.E@E32!#>97;)#1)B+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51T72C29G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2744 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13349 42 139M = 13488 373 GTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAG C9>**G5;H4?5/8H/)*<'89"#=;51>(CE!+%2%F'(F!:.&&E>>55=E%)@"/=-.3(HA?56+F79;4E%EA?)@)#HA+0EE&-)462$/.D-F9!481,)B;'?2>C--E?$%.DB1:569)6;ED"!DB- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2745 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48099 42 194M = 47958 -335 CGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATNTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCNGCGGGNNNNGNNN %((''$)##+&(""(($%&*)$"$&"(!(!&(#+'!'("'!"!+'%)(!**&!&$#%*$!'+!))"'"+#)+(($!$!'"'**)&)$'+%&%###*(('"*'(")$)(+%&)(+)!&++#!%)&)*!($*)#+"*!)(%(#)#*$$&#)+!*+'*!($%)!&#*)!)+)#+("(!'("$'+%$"%+)"$!*!#" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:133T46T5T0T0C0T1T0T0C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2745 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47958 42 141M = 48099 335 TAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGNTAAAACTGCAACTCAATTACTGCANTGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACANTATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAA 5H/-(0(42+">-*1B?C)!5*4?G9>71<0H28:=,-#/A>7HF?30-FD80EEA,>D%!"B;'26D&68,"8-26>H1$/E1-<1@A!0:/1)>;#?"3E>59A@.G=<>)'C9(9&+>>H*AAB0!;@.-2/E7;33/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64G24A26A24 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2746 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8008 42 130M = 8152 275 NAAACNTNNGCCCTATCNNNATACNGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTGCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACT !$#'&!*!)*("!%&))(('"#'!"+"+(%""%$(#&&"%(&))(#$"(%*$*&$*#%()'$"%&*'#(!*$)%(%&+++'&'&&*)$+$%+"$#)'*'#'%*!!(*'$"()+')+&#("&)!*)!!(&+ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A4C1C0A3G4A0G0C1A1A0C43T61 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2746 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8152 42 131M = 8008 -275 CCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGNAGGCCAGAATCAAAGTTAACAGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCNG .B>.3F+/#,02"4H?>34H$=AH0?G9<,8@@4<9*6(G@>5(4F<;=2DB.BH?:(EA?F$80AD>&?G:4:;8-#7B73.)AE,@4H$.$"DA-H%EB*=29C'2):A4%)!6)+'H4&2:3(5A:@4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C20C75A1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2747 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6941 42 90M = 6771 -260 CAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAA 8?1/(+@>B.:D&+,H64-0583(1$-()204A*3CE%&:7;HBD0+7@C&:&6"3!:2.+D<'D&?0(294.*5@>"9#=0%#%'4>)G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2747 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6771 42 77M = 6941 260 GCCGTCAATGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGC A..#"*,31@:*%2=7@6:)E!"H4FA2A#$D"GF'#C'4EC&6-'?2(7+>,4E0=-H79@?1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G44A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2748 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42596 42 105M = 42487 -214 ACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGC 2D!>1=:HB,C%03?9'4">A<)#?/40/4=;6.7'>B<32F4:4@F;H7>,F3::6C;(;:))@GHC)9HG'8<&=(E2H;(:7->B<:4%69 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2748 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42487 42 89M = 42596 214 ACCCTGCATTCGCTANTCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCG C43!F1H;6$B.68;AG#>,=5;?F1,F4A9+/5B2%2!4+C-90(5+3:$F/-5++FF3?0=3BF!15#;?$4?:#H,241?$)@$#$'9-7'@"D@??0,0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C63C28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2750 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3444 42 143M = 3324 -263 ATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGNGAGTTACCNGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCNGTGCAAATGTGT (59$D2E/3@/#&>AF+A+62B/$&D%C88.?9(<2)?=0C!4?E/E6%6*1C7D.1)648%"*GF(5(%E,3':=*>$%7*1)G4+#7%!H-A+)'#;7+;A!H.0H10+:.$G>%'/<+*C&,H$#"&.'?>1B,:@/6H> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63T8C57G12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2751 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14644 42 159M = 14803 248 GNCNGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAACNGAGAGAGGNACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCG (#%+$"(*&+&+#""##'##&&%*($%(%)!**('#%)*'&&'$!+))'#%+*$)%"''()(($#%"$(#!"+'##"*'%$#"*&'))(&((!$)")#()+(%''(+"!('%)$'!%#&)'%$+)%)!*%$%%$))%"$$#(+)#'+'(&(&+*$&$++ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C1G104A0C8T40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2751 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14803 42 89M = 14644 -248 TCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCTACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCNNAACC ('*#'")"!*+#%'#$#&+")$("%)*$)*&&+'*&(#(+#%$#&)+**)&'(''"%%!$&"%%*(')(+%#")'+**!'(&$+!(%#& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60G22T0G2G1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33792 42 40M = 33461 -371 CAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTGTTNNTCNGTCATTG !+%$$%#""+*&)$%$+)$+)+)+$#('!")&")$%$%(# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25T2C0C2T6A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2752 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33461 42 89M = 33792 371 CATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGA /5/$DC>;89/B6B7@$H2HHEAH@)=/%)CH!?1!3=@>D-G7-B59&@?,?7003"*2B'&;G.E(+("9BE9/'2#'=5/&D((1; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2753 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5103 42 52M = 5274 281 ATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTT =+3!,)02"DB"E#!?;FF1;1#E:AF2<5-@&$7E52A+*:<1#G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2753 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5274 42 110M = 5103 -281 GCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCTCTGCT .4F*(GH'-/E/)=,*E81'"8GC&B2,+*DD-9/-=$D2"%;2$>;?;62/B<,--2A90C%=E'A>"@C:G52E'."G20*H6<-F'C2BEB4@F5+:$G9D;#3/233FA,=";.<11(1E2+*<.GB3%15F5$AB:1/&"(DAF"3*7'8E;H)@$E6B&3!9;2D<3DF@%#1:?FAD"CA/):(3<-E+@;<,1?1;&=:+#5"$'(7< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2757 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1601 42 86M = 1433 -254 GACCGGGATNTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGGAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACA ?"-(EF;(A('2;&;"('/BC%09B0)EG;8C29!5)$)*>?4>,+&9@#:6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C40A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2757 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1433 42 101M = 1601 254 GCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCG =AEE=:@:3%6H52(3-3E=1""G5>1.'F0(FC?B/#A1G)&6BF1"AH91G@BHFD%'&F'( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2758 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36056 24 8M6I193M = 36257 269 NCCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTNGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAATAAACACCAGGAANGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGTCATGATTCTGTTCCG +;"FB@04C"#8GE,9!&3.9FDD'"E(72*'A+&-*"5#;')3*BFC=2D#=!7+*:%,'H6?'4&2.7.4DCH=9B(5'A(0)#@)7%$%$+>)0F#-"#3E<&=/.9,.""H+78,/,?..AE@H'%FCH3+EA-$$57%1E1@=$;A#!E!79C:"B7G)0%B-G?6E3(&#*7;!$B7'H!(@B&24)%H*D"-'6F<<:(( AS:i:-56 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:18 MD:Z:0T1T0G1T2C2T0T0A58C30G12T68G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2758 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36257 24 68M = 36056 -269 CATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCAC F3=8&F3E/C%1/3?((%&%)40*$2($:D8<=8C!'10-89)+@*';19"HDF#?=/'"9!G$(?8) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-56 YT:Z:CP jpayne@0: r2759 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31351 40 48M = 31483 211 NCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTC ()4$%!G0FAC91B3:#3HCCG!$6&?EC;9:=7D.'21-D(0/-$%$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T47 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r2759 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31483 40 57M3I22M = 31351 -211 TTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGG B$86@?4H<,.&AB.A/10!4")02+>%&A3D9-A9:?(/;5<$;8HC3$0FH;!#(:7A!'02!C-&'A*8@G?@%%G'@( AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:68A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2760 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47722 42 85M = 47871 198 CGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCNTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGC *F>0H?+)F2B')=<)9G&03+E16H,1>F&/%3,$.7GG*3)EC)*?(G+6H0-6?&2804B(7!5?>C4;H13&A?#C%#C=*)E0((#D/!BB6@/BE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2761 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37731 42 202M = 37933 374 GNNNATTTTTGNAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCANAAATAGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTANTTTTT )$%%+&#"**+()'&#(#''%!*"!+*%%'*%+'$'(&+*"!%!!%&!'+$%#$&%!+%"!"!*&)*)'*$%()$%&$&%&+%)"$'*!%($$+*&##%!!''%#&*#$&)%#')!!%"'&"$*$'"''!"!&%'")*"!(##&#&#(&(&"(!"+('&""#'+(%'*(!#''""+()!**!"!%&*+)$#!#&*#%$+'"( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1A0G0A7C130T4T47C0T5 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2761 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37933 42 76M2I96M = 37731 -374 NTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGNGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCNAGANANCTANAG $+'+#*$&!#+''!&!**&'&+!$+"#+%')$("$')&'()$#%!&'*&*&&%($*#!!&()))+)'&&%$"$%*$(#*&+#&!')"(!#*+$+&!(*!$*+%&(%%%'"'*$&+&%((%&&&)+'!#)+"*(#%$'(((""&"%*$!#(+))*&'""#)&+#($(!#(*$!($ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:0G158A3C1G3A2 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2762 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37478 42 6M1D172M = 37386 -271 TTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACANGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGC G/..E4+!<";AH$4D4>!%?D(+/@7HHA<&H+9-%D#42*71=6H11E-7;F:(3@9F>H'2!D- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:6^C142G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2762 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37386 42 64M = 37478 271 AAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATT /0.:/,>A0D4H%!+=>'=D24>1!##=:9A3-A@925D0B;:'>'5+&!,2!#9,.%8HHH4D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2763 77 * 0 0 * * 0 0 TTGTTATNAGCTATGCGCCCACCAGCACACCTTGCCGATCAGCCANACGT -B(3-F4:"BF="$(DEG>1$&'B?,83:-2;.4&20*,;!4*8-G)!)A YT:Z:UP jpayne@0: r2763 141 * 0 0 * * 0 0 TGCATTCTGGCTTGAGGTTGANGNTAATTCCATGACCCACCAACAGGCTC ++'!#))'"!''%)#!($*!!&*!'"'(+*#!%&%%)'#()+&(#"+$)% YT:Z:UP jpayne@0: r2764 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27056 42 79M = 27187 302 NATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTG (>49/!C0!%B(?1?".<7C>6/*2DH-!1DG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C78 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2764 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27187 42 171M = 27056 -302 CCAACGATATAGTCTGTTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATNGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATGNACTANNNA '++"'(*((*'%%#++$"*!""##(%$#!!"%$#&+&""%!*)+$!#!$*("+!+#'%)%($'"&)*)'$()$&")%(*(*$%++(##+&!)$)'**#)+$)++'**#!%%*+%%(##%$(#)+(%"*&$+(!$#(&+())#+)*))$!*#$##))(*++()!)*%"$$#$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:15A77A67T0C4C0A0G0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2765 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29517 42 162M = 29697 246 ATTTGTATGCCGACTCTATANCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATNGATACNCATTTATAAACACCTTGCAAGGTATG ?D,D,"-CC##E<.>!H73H6<4,E22!$7)E':1EF#BG7B4*4FH#,:?6D0"0+.%5%E)=.?"/9(+314%@:+#"29=1(%6=;'"7-$&=,<66$)3CAF8F,#9F/&#(12!-9>9*!1E5*-*H'H@D51 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20T108T5T11T8T5 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2765 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29697 42 31M3D32M = 29517 -246 ATCAGCAATGTTTATNTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCN :"B-:F!&1&DG)6526,,)HF-0HF9>:&/0*'9&&"'*"@?#(88.C*+F/"F@6,D8*7,8GE)+=")7$9(G#4>99A>!;2(D!B"7*F>8)*D'$22+;C1BC8@:*B%CD!2E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18T97C13A26C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2766 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23035 42 73M = 22848 -260 AATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGT H$>5$>$%&D-F5.F>;1&F2H?.,0;&=>C?F)H;0:6+:-:<5*-:%<()%1D0C&+'FB5:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2767 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17245 42 79M = 16980 -344 GACGGCACGTATGCCATCACCGCGGTGCAGCATGTGCGGGAAANAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACG ?05D#B0,6D00$G.@1.)(0"#46@:!E4$+&:B=G"(B,5G9:01:D59C;;1).;>@,/''($:=A:994:"F%#D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C13C5A35 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2767 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16980 42 265M = 17245 344 TGGTCGTGTGCTGGCCGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGCACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTAAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGATGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGAC )(+$)*++'+*(#&&%%')#&!$#!#$()+"+%'*&!+&()'!(#$+&!$(*$&&*&+"%(#*!"$*$&!%&'+#)&()&#$+'$%!&"*$(+&"($&#$+%**$#'!"(*!("&!$#%*&!$)"&#%%$"")'('+!"'"**#++'('$+)%#'*&)$!(+")$"#+)*!$!#%$+)"+&*'+!&'*$''"%#!#%$$**((%#"&*($)++(+%&*#'!%("(+*$!&#$#!(+&+"#+!#+)#)!#)%(*"$*$!*)%%$!! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15G59T41C59C87 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2768 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19629 42 257M = 19886 327 GGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGNAGTCCTGAAAGNCGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACANGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTNTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGA -$G#FD3B#AF/$A:%=5/G.2&@5$640<,(3D8),G!?&H:3G?D43A'"(#"4?)F8%A&&>6C?/9G@:%5@3F2F!0A4C>4(@!.>4++H<-A%!@H(F6*-#;8,#!!3%@5!3944C+B-F5$>$EF5F"4<:) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66G2G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2769 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41208 42 75M = 40919 -364 TGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATANACCGCTCACCGTATTGCAGATTGATATCAACC <=05B5>='.%+2D(-)C?<>46B*1.4(H&$BE?HC+5A=G:A#6?5)#H>8G6>(3,F/D2GEHH;A236ED0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T19G12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2769 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40919 42 84M = 41208 364 GGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGG !''&)%+&&$!*'%)%!#+#+$*#**"&#$)%$'$*"'#*&&#$))'#(*!'$"&'&$!&&#*$'!#(")&(*$*!+))%&%)# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T83 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42298 42 102M = 42123 -277 AGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGA $AE0E!&D>)68)!G#6!@3/96!<4%<<@=0@0A99,<3:-&.#.'0(H-3)G8%=-3"@#1<==,3$7;'7",>G,'<:%=7;C1B>(#3C6H/'.B#29 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2770 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42123 42 57M = 42298 277 ATCTGCGAAAANTGCAAATACCTTCCAACNAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCA 2C1;3@?'>DG3;(0D?,!B:8>"!)4#6"CGDFG!/7E?B*4:C-$F$;"=+A9=3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C17G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2771 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41449 42 149M = 41330 -268 CTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGNCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGC ,*CF)$40/,&,*8&(@,39*@3.F$F/-**G!H-*".1GA7F:/*&?D#.G5&:1/E%-<62?>+)?H'='!B/162'H@"D$?,'-/71(%27+.AD*B?.E-%,E>B8)<+>D<:A4#=:C.-G>62+;> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2771 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41330 42 91M = 41449 268 ATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACA 1.79E!/52BE8660-B>F"6F)&G4B$00(6)6!G%(H74"?(2%?4!6C>72G@CC8CE)>9+1D0B94C%&",88F75*6E&/(?'AA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2772 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1083 42 90M = 1327 303 GATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCNAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGT -<2/+@9A.!AC5;7E/-6&FH?(F/8EB5=*E!0@18>GBC$@"H6/(AG.D*3DA+C4;)C=D36267F)%//H!"#8?B6CAE.0;0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2772 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1327 42 59M = 1083 -303 GGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGT C,:**?C?:D'D7+>.$(3483;+1F@/$(0;-(72@;50"-C@<"'BF36?.)(&":: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2773 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23602 42 199M = 23847 327 TANGNTGAAATNAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAANTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGG &#")$+"$$!"()#("'++!&'#(#"&%$(!%**$(%)&(+%$")#%%'%(*&%!%*!()(&$*%'&*+*#))'+"(''#"$*!"!*!$($*"''(+#$%!&())""'%"!(!!*"#+#+"#""%+##$$#$$)%&)#)%(&&+#+'"!*!#%)&)*)$+"')*&'&&%%'%++")&#(!#*$*&'&###$(!!!+#!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A1A6A63T123 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23847 42 82M = 23602 -327 ATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCC 6,/>(";!F(D6/<#&EF*!@D:@-&.#C!?!87H2$+/#->7-+)/"#,D@5=5CH*#%=H'0E5&?@:F;!!FG1=16A? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2774 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1229 42 116M = 1030 -315 TGTNGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTG ;HE',/@(D:'&/<#7(D7;.D8B9?#9A6($9!,$7$5+%F829@35/,FACH013*>2B<7%$!H*>?3!<;7'.?=,!=D,A&@7B48><>A%D50>.1;%177:(8<8/#C"/538#%6-A/'C7;H='%-/'%(D;19D3*0#'0=='H0$CH%3?@ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:12C5A3T23T2T28C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2775 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29216 42 106M = 29478 314 TGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGGATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAN E*;2(G%3+@F'*,4/&$(@4,E<-<=/?1)&G8'!1!74+9#B;'-32$>*;G;@9>C8<&(=C(F)%<58.H'"?G!G3$H(#8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A75G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2775 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29478 42 52M = 29216 -314 GGGATTTGTCTTCAATAGACTTATAAANCTTCATGGAATATTTGTATGCCGA D89,D';H/C%A/H#&!H!9;E+9=(3HEG1;)*3=&.5H*.C(1/,/@&H- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T12C24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2776 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11379 42 40M = 11569 232 TTAGATCACCCNNCCCGCCGCCTNAAAGAGAACATGGGCA &(#&('"))%&#+*$&'!&+$'**)!+&%!&#*("%!!$* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2T3G3A0G0A10G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2776 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11569 42 42M = 11379 -232 AGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACT @;(2C5:G:.6+C(D-;C$F(';36%D2?$:<+3A(5&H;('493+.5$:F6?,F*.#E?"/A+0%1C.0=B.?#22?$<> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6G3A22G27T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6260 42 55M = 6068 -247 ACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGT '")/9)1;",:F*.61&/"GD1&?8@/)8++G@*E"+:H/4+B,="?=6.)1E,: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2778 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33008 42 60M = 32829 -239 CATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGNCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGC 8?7E'G*G2-'=DGA!)F1&3567+%,8(:1"00*G+6!)G"4;9@+(C-+79B!A+;E@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G22 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2778 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32829 42 179M = 33008 239 TCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAATGCACGGGGAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCANGTCTTTTTC 773$%F3=5>68$4@<@7<(-5&<+9'E356A&7$%>'+0H"-.EH2%H6E42-?58'26/@$0:H<3,$&*+=#=%>DB/2D#18)3-%0B!)#6<@GG/3)0)27$207'F%G$*41#9A;H9FE0>B2>#C.E10*6%9E(7?$>+H,2.#&DE@+G AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:89C7T71G1C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2779 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15522 42 73M = 15158 -437 TAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATC #8H+H$H$EAED$=8?"%(F28"DA8'(?89$/0B@'?9DB1:?+)?,%!/B8/BB*7*61A5!BA;?$",'F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15158 42 364M = 15522 437 CCNTTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGNATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGANAGCCAGAACTCCCCGTATCCNGACAACGGATAACGGTAAGCANAACACCTATTTCTCCTCACNGGATAACATGGNTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTNTACGGNGAAATGCCCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGNTTTATGTGAAACCGCCTACGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAG *+=;,A#2<9/A!C-*=,/;AC/3!4:B"7"5*33/@:6&E!08.=EC.C5265D0GB'"3.)'1!@H*,$($C#B#?,F4+?B<<-7,5)&%$5(@,5:77%+6ACG?,!?5C';G'H54.:H77/"';8(?/B2B1 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:2A46T37A18A1A21G19T11T27G5G7G91T17G49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2780 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15167 42 41M = 15402 290 CCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGT );A"6E)@;G46(DA=(4C<--G/4,&&#.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2780 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15402 42 55M = 15167 -290 AGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTT 3,#,1-+,H";:9-7-,(%?/9#!BFDF:8>CF16AHE"44:($-996-?=>E?? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2781 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15959 42 43M = 107 -15895 ACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCNNN #)*$""$$$%*!"'*#$%#"(+!#$$+$"&&!"+')'($+#"( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40C0T0C0 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r2781 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 107 42 44M = 15959 15895 AAAGAAAGGAAACGACAGGTNCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCT E()A#2#;-+<5;&9;67'16=)4H<%'%A83?#?BF',$HE1+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G23 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r2782 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11225 42 45M = 11225 0 GAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCNCG HF.E?:&'G8/(80*)/F%+9.3%+&-'&40(%#,>D=#A!07(( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T2 YT:Z:UP jpayne@0: r2782 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11225 0 * = 11225 0 NCTNCCNANNNNACNNNTGNNAGNANACNNNCGANGTNTTTTCTNNNCANG "##!"#$$!!"$!#""!""#"!"#$#!$"##$$"$###!$#""##!$##$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29373 42 233M = 29606 311 TTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTTATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACTAGACACCGGATCTGCNCAAC :"%0859H.'+698%>%0F63C)--7?G$-CF:#+7'.CG??2H>E%C3>.4#0-<('9D3<7&(55:(G./$/"=B>21#)(5A2#&9A#*-3@57&D4,1+D#8#;>!E%D@DDG)(9.'*'B4),!E-"7$3%1624+H<9FH:9"$@:7G2(=B)55->8H9E<<141:4H,C=,/&3$C'15(H&AA-*A<1088B""-DG-<2BH!@3)07EB"!/!E1%:%8)71B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:136C75A15A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29606 42 78M = 29373 -311 ATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTT "%%:#E')%*#!%6(<>*!2H;48)2+DB@1+#E,80+)G!@5DA@>4(1H,C(A$A!,F*>5,A/,697G33:?20/;3&355#'C9@H0D-=2F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A79 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2785 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24037 42 52M = 23786 -303 AGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTAT H=@!($)@==A+2@'%C( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2785 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23786 42 234M = 24037 303 TTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCNAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGNTTTTTTAGTCATAAAAATCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACCAGTTGTTTGATCT 1;*7<&!/0,>E;G$9E15)4>&2;-8FD;-57C,=;'A,%8:B7::3>13'>),4>%7->/5EA7E9BE$BE&,0G%'D&;F.'AC+0>%F;;F7;*#A@6)=@D4&%.G3>)68:(E5-B6-7$-!>$F(,7E5$;BH!3,B?:"<33*@B6B-!F6>A60&33:?E&&+;-<=F3($B3E$H2F78@84:' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38A81G16C82A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2786 77 * 0 0 * * 0 0 CGNTGTNGCTGAGTGAATNTATCGANCAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCANTTTATCCG '*##%$!+&$$)+$+(#(%($'"%%"""&#$))'*(&(*((&+(((&)$**$&)&$("( YT:Z:UP jpayne@0: r2786 141 * 0 0 * * 0 0 CATTTTGGAATAACCGACACGGGCAGACTTCACCACATTCACCTCACGGATGTAGTCGCTGCCCATCGCATTCATGATGGCCCGCTGAAAGGGCAGTGTTTCCCAGCGCCCTTCCNGGTATGCGGATTCTTTGGGGAGATAGTA ,%?6?#&(-D">C43=FG#2:&%H2/+=":7$B/CG;FG2FD);>94!4/312B=/9"@6FB19?5H$=79,1/9-%#2;> YT:Z:UP jpayne@0: r2787 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35798 42 169M = 35651 -316 CAAAGAAGACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAGACAAGGATGCATATATGAATGAACTATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGNCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAAC <>$?G80@8433%.?:-<$--<>&4"9%-2#,;,4E,1?*#F13=09H6'G,"0;7$)HC.,>(2092*@D,1+!!(7>D1/(8(+'$4+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7A55A24G41C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2787 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35651 42 53M = 35798 316 TATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGT F/,;5B!&-1D-)%(F1<9H55)19(H4FF,)B461206:F,;)<8@.6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2788 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25883 42 40M = 25656 -267 ATTCGAAGNAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATT 71F'B32%A@@H<=46$H&)'A0#;*&%,020!@>58&@$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2788 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25656 42 49M = 25883 267 TCCACATGCAGGATTTNGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGT :A(&;G<28@$3B05(>G80$23GBHGE92:G.F$%#,50.1=)B9A3B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2789 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45719 40 43M = 45832 202 CCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACNTCTCTCCGAAAAG "<$G"A1.23?(D9?*<9=-.GE9%#?::58#B")><8,AE<7"%"5H%:&6<>?E! AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:44G6G33T2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27809 42 82M = 27953 343 NCTTANNNTGATTTCAATATTGTCCCACTCCCTGCCTCTCTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATNCCCG "*%&)##'*%++*!(!$'*&%'$'#!+*"*%+*&'*&&+''$!(#'$)++#(#"!%!)'%)$%#")"$+*&!&$!')(")(& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T1A1T0A0T0T10T20G37G4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27953 42 199M = 27809 -343 CAACTCGTGAAAGGTAGGCGGNTCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACNTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTNTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCANTATGCAATGCT (FG%,1F95AD!>79A8:H6%0$!1@6B*F(:<:B/?3<**(88#A&75#-!:2F5.$B;?$#:0C:%4+#!C+G693@,?95=%1GDD$H>8,5'F'G5?;540!;4GD2+E:2H5D#8'8$#F6=$@75$&H2&7>/+>$;.!8;G"'%<8D=9#D*-1G(H*E#E.?<:#;'A=26;;7@+"FF=5<&$F, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21A48C69C46A11 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2791 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2493 42 75M = 2205 -363 CTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAG =@6AH,E/*.2HC?B"!#BG8020>6#D)>2:GGA9<7@<#7&G08#G#%#GF(%9<1,@)7C7(/./G8(<3#' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2791 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2205 42 288M = 2493 363 GTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGANTGCTTCGTTTATGCG >'D;C"";7077:97*2071"@>2&:"4"#26#92249=A99<8452>8/*%$%,>&H3+!*F)1>)8"6@;F1)AE'B3%CE>;!ADH61/63$!=?5'0E)E6A0.B7+%&(:>?+ACCG:B7H'D?9938)3/62'52;HHD1#/:%H5286CFG>A"3:+9F'4;:,:+5CAE,C/73&6-&/&08;A/H)82&(;E3F?7#G'.!@H/>HB7D9>@-?),=41H$6$F!HA"6,)."=';D!6G.F1A<(A$H$&)G9?@:8!5>04=!>3;078G*-;?0:=0-".5&=(%1,F7A41%.,9(.78$>E?.39,85%7D,76:22:(7E42-24'5G+6DH?D7>D@G4/)6&/-8=9&%8/8G>1!H(<5)7&+A*)#*/%,7&1+/7'C62(H%@9'C?294#/1A@!2:8F+2&CG:6!<:2>7G"7C>+,3F$*-!3'&F1?B3" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G121C23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2792 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19523 42 77M = 19600 269 GGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACA $8>#&HG+8#7E1A&=7<$=4:B)H/B/>&9+AE0*)8,-+@FA@B)9! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2793 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20802 42 100M = 20902 326 AAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATAC F,B'ECA3$#GD.84!)$B%08=*>.>C4E/)F33?<<-7@GH27*7CD?B,FF%??2D+=.&-+!;%-9&>3$=<-6C5"FH,,G?D"-,5>4B!%;8!9G2)((7<51/6)<7DC,,>(,1D/@2:5)$6F?EA4*=489E"#@!)@--+!.=@B!6F),1-4#3972C5,D?%>-+ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:3G41^TATC0G7A150T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2794 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38906 42 72M = 38984 224 AACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATA G;.E469"A5B=B$*1FH8&$->?*2AH3%GD=*F(3C"D26F2$$F);#?)!/09,,F<%EBDCG,0%./= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2794 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38984 42 146M = 38906 -224 AGCAGCAAGGCGGCATGATTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGCGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCANAACAGGGGGACACAAAAGAN <59)6&&7)5A*"B&E75"'D23@>4?8)749&'1D89'=+7=1/G!1,FAE=7+#B<5>2#!72D(G:>+D/<"" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17T47G59A19C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2795 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38776 42 89M = 48359 9672 AGACNATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAAC #-%/0$B'>8D+/.71G'!5+)@40:3(=D?4-G&C5F!/$4>*-HE#568=>"B>'F:G"697,>("736:C:, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T84 YS:i:-12 YT:Z:DP jpayne@0: r2795 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48359 42 89M = 38776 -9672 TTAAGGTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATGGATTATTTGACGTGGTTTGCTGGCCTCCACGCACGTTGTGATATG '1=@-D&:!.DED>-G<.!*@)D.>(6AEA#5AF!$&3*>-E0;2)ED6+??96H?%$B13>.19H;&F#2#?+"E>='=<>-2-,.D$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T37T19A25 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r2796 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28501 42 80M = 28679 235 GTATNGCANNNATTTCTTTTCTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGNCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTC #"*($)()(%#('+!##")')"(**)')#)&'#")*+#'+*#'!*'&**%$*$+"*!&!(&!!+"&'#%%&"))#)#&!! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1C2T2C0G0C0A9G27G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2796 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28679 42 57M = 28501 -235 GATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTG /0.*#+A:80:/?&99,3675?C>@*<)8$C9>3&G:0DDE!FG>2-=F#@=6@."C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2797 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8778 42 67M = 8975 250 CGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTT %*-#:$D.!%@*:!E+*$#4F&*E,.-64A"@#,(H24.A-DF7)%=(H2&%!,D=$+;#G'7G3/, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A66 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2797 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8975 42 53M = 8778 -250 AATGCCGGTGAAAGGTGCCGNGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGA 2@,1C"(9$;+2AG7B8226:<&-,>4@:D=89:/-&00D:F%G##(#/*203 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G30T0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2798 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11845 42 154M = 11749 -250 ATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCNCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGA -"F0:?:AH7$2B00;,.7(E2EH(7)E:7<&C&%06:HC>F>F#F*>H6-:27:6B0A17=H?36;G)B-%#&F@E(:(9HE!D",:$(0;&G&H,&E"4>E5DG4B"0<#=& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2799 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20319 42 313M = 20632 367 ACCGCGGCCACGAAAGCGTCANAGGCCGCCACATCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCNTCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCNGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGANGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAA ?E1(/G&4C>8G,H8+C#&?.0'%%3(.'/.0$7@F+7):0F/DG6D7"";C.CA>#&>437?FE2&0"DH..<3#5!5&$5.D53C?.GFFH-G2>=C#!:99::'=*?2#14,>"&H5/:06#)AD)9(%.*&-#D!E(&%9=F!H=$)$7<%?@-DC,@C:(<)/"4>A<@1@(68+H+0#;:.%E-;45'C;90$::4+&&F?/*1?*EC*5:H7;)7/%:9G'.C>"48#73'-G6%!/78,(F!4+>F,6H.@?B75! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21G10T146A32C72A27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43449 42 159M = 43608 234 CATGAGNAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTANAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTG A?8:!@:%0'DF>BA8(+&,AD"2F9@.!@7*.HB2HH/.C"4#G0@@$134@!&>!07@#D73H0+)?$F$7;"*8(.DC:,+B/B).&01H87?E)(-;&)5!*628C&9$+.>0;C,?=()!,;DH#=(H258"&.6EEE6CG-A;:2%%/'2*,) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C105A46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43608 42 75M = 43449 -234 GTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTANCCCTTNGACGAATACGAGTTTGGAATGCCAGTT $$&)'+%$$"%%&!)(%+(#$+!#+&$"%'"%"&!!$)!!)("$&)+!("'*'!(+'*!%((!'!)$*$(+)+)+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41T5T19A7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2801 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43805 42 244M = 44049 402 CTTTGCCAACCAAATGTATATCGATNCCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTNGANAGCGTAGCTAAATTTCATNCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTA "E1,C,)""B#$AB5%4E%@"A-G";%52!+3"A1?G-"47;.>5>")?7?-34G/)!+(A&-34'(55$$/@6+G)?&@?@.7$5>&33A-3F&'1&@G":&%="8@(>=$?9*(9F:<9(7EHF';/*?%$&)"%H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G24A63C2A18T132 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2801 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44049 42 158M = 43805 -402 AGCACGAACTCNGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGNTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTAT (F#;'.G/!@:@>6?))$0%E#!%/<:2F7H0$>:H0B#&087B5G>&,@#!?9:5C2>&FDD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A119C26 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2802 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21115 42 125M = 21240 258 ATATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAGAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTC %;(-)';("(6:;#8&@C"B3'/@/HG7*#C#:A&3D<)8!*?'(80/@-+&C;F.96@0+FDC+7&H#48D'(AH52?D**F@F64#*B9+F)DD6HC9:B<9,0+F6%&0*H2EED?25#>1/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G68A55 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2802 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21240 42 133M = 21115 -258 CGGCAGGNGCGCCGATCCCGTGGCCATCGGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAANTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGATCCCNGNNAT #""$$!$"**(%))&*&("%!%#(+()#"&%*(""($##(+""!(!%&$'#*)"*"&()$*)++&*#!#$%%'%#&&$"#++&*&+'("""&*"+((#!&&+&%')$"(&#''""$%*+!+"$#%$&")(*$( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:7T20A66C26C1T2T1A0T2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2803 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16657 40 95M = 16780 286 TGNCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCNATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCT %##)+$(&%))+&(%(&&(%$$*&%%$+)#*(%&+*%)%!+)+)'"%("&$(&"!!%&#($#%+$$'"$"#$$&%&*%)$')'&)(*))!(('$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T0C30C24T36 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2803 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16780 40 78M8D77M = 16657 -286 TACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTG C!D5@5+*H84)($:$>BG!$4$8>81=&00/-3)%<>/ADE8)76.?5?!!0-4==55H(-C1>>5E0/55#7.4>+34'@F=CF',>43*+8+.:,,:5<><2:D/'9-:D0',=G5G)28&.768@HE(<:9$0?7F;8<)3/<4GFB1;EC!5$D8&61&%C22,8C3"5397@/!2>"3C)9*4/DHFA/>" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31T79G33T21A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2804 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46787 42 99M = 46610 -276 ATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTG B9"<>GC8;-*)4%*+<,6*E>)"5./07F!-9,H(B6D<<=6-3C44"55C%"#G7.@,F)A!>?$A.<&H;G/*:1@!93()40:"F,"6<=7>;4A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26805 42 90M = 26905 199 CAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAAC >(;3!C&=D7:7)$";)<9/+)"+>%0G)(%F) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26905 42 99M = 26805 -199 TAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACANTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACC 1C5.<>;(G!C:1257?*>2D,",2/@H?80/#,::1*%.@)"'A';$H$&B5/=2)F670'#=G4+4E<>>.-!$#&;>BF+$);2$+@9!';C##;?=<:03+F:@><'>9.4>E$@"F$02<,65$8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2806 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43564 42 44M = 43321 -287 CTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTG B<-(*?,)9F6H-?D2D;*(H%F)&E&A6-#7'3GG%F+'G";/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16428 42 92M = 16267 -253 CGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGC ;#7(/9D=2<6),0C!$#DB/DFAG?)$#054&>8'D&"8C%C,=B-=-C22%:H9:5H;953/@.*@!;2$8,F;%?>C07&B!>.E(6<> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16267 42 102M = 16428 253 CAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTNTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTNCGGCATGGGG -B81B-@@80C3(@?$?B$,H10";=62+8(C;;@=H?).'>D.>4D4."3B$$1.;6DA,C7"B#"<7B?&;?@>BB!2D>F5:+=!@!D":,E?"EA&,- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65G25A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2808 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31324 42 70M = 31186 -208 CCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAATCCAATTTCAGCCAGTGCC 980@:AEB"A;%06?6/+G*,GE70G,3:F!/=4(!=1?.4)F5((*"E:C4*!26,8-3%?7F,1(.!(81!(>$=B1,CE*;=+*1A@0*=,$B","E%)9/E10#=F;:8?>E* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2809 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24956 42 86M = 25186 273 CNCCTCGNANTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTA )"#$(%)*$'+&#+#&''(+('(%(%('&(*($"*$&#$&%++&"#"!*+)(!)+$$&)#%)!%+$*##(+)"(!++*(**+'&&" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A0T0A1T1C1G76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2809 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25186 42 43M = 24956 -273 TACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTC $C/F:&H7CGD"2C3,4!?-#F)04?D8'E@B'HH:@6//&=H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2810 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39498 42 112M = 39671 225 CCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTA H,,%=H!,)B6!&!--53C=>30$&:;E80./"DB2>!6;BB#C%3:&*G*@7C6/6$6!#6@#:785.>0:90:)5EEF*C!GG9(E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2810 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39671 42 52M = 39498 -225 GCCGCAGGTACAGCAGCTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTA 82==1?74(H868@"%%#-9#:&*"$#6-1(*/"E/&D>)-22#&")C7EF- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1220 40 96M = 1380 204 CACAGAGNATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGANGTTCCTGGGTGACAAGCGNATTGA ")*$%!$)+"%%&)#&'&%+""*'')#'*%'&$*""(&$('"(+$&'!'!$(%*)$++(#&++('"')"'+%$'*(!&$%+)&)($&')'%"!'"$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G0T1G1T1G63C18T5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2811 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1380 40 44M = 1220 -204 GAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCNGNATNTTANGCGTTTNAACGT '%)&*'#%('"!)%""*&)*)+$%&%'%'*(*!")&&'"($"*" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:22C1C2T3T6T0C1T2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24062 42 95M = 23961 -196 ACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGG 486(A<:.(=;F)/H?>*F<$/!9*9@+C(&5AH':G#*5H/-@%93<%'#:CE!3G1:<796$>9H!;,(-3C271:F!-DBA:;BD6?B.&)* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23961 42 101M = 24062 196 ATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTAC 81+,03852?:!2@,1&>G%CCD5DF8D)/D(C943D=7)@@0-8?@)D, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2813 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9792 42 159M = 9951 362 CATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCNGAGTCAGACAGCAACCGNAAGTTTACTGTAGAAGACGCCTTCAGAACCGGNGCGTNTCTGGTGGCGATGTCNCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCC ?&'+0>0$*8@=G3,$;DF8--)*/!(07;.D"!(&>9=9E7=D14(@E?3>!'?E)=%'.B'+@"88.+3&5#/&=E(%G!+"32F$E.0*(::HH)/"9&A;E:#"!4"$".0%$C+00$4:(='>%F2F%-!*:&:)0"*?22+H1A<&53FG:-)G'5/<'CH3-&95.!&E!&&:<795,==?F+#%&H:A3E@EHA>+9+E@7EEB@!E&4=!0"&C*'@&.;!-,;492)9/BC48C+'@9&@@$:-GD*@AG0,+C:@>9$.(4-G)#A(FBB/&9$()BF"14% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A79G55A57 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2814 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21532 42 44M = 21691 348 CAGTNTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTC $*))"$+$+&!*)%%$$%!%*!!$!+)&#"$#%%*)+%(+#$"" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2814 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21691 42 189M = 21532 -348 TTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCAAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCCTCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGG 56,2+1!:15F?='%707$?."!$2'&8H;-9GA8+!E?F!:A9H=$9C;8)DF7##23;8C2469$@=.B1<=65D@.H,?*41+0F;$!&0@#CH-;H6*C55'8./#/'+7;>C),3=2DB++*E,.9/!D<&66'/%:E*$?30+B!73(.3=#=6"(.&2;"FG*4'+->*#''3<= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48G97A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2815 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39415 42 40M = 39415 0 NNGGCNTGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGA #(''&")'%%*+#)")*%"*&)')$'(!*$%(*%$"+$#& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0G3A34 YT:Z:UP jpayne@0: r2815 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39415 0 * = 39415 0 NCNGGGNTGNTTTNNNNCNTNCCNGCNNGNGNTNNACNTTGNTGNTNTNCTCNATCNGNNNTATCNNNNACT $#!"!#!""#!!$$!#!#"###$#$!""$"#!$##!"$$!$!"$#"####""##$"#"!##"$$$!"#!!!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2816 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22770 42 46M = 22384 -432 TGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTNCTTCGTTTTCTCTA E8)4#8G0;D+7<8&7&(?%G$;;((-<#,>9&0H.DC$111A9?) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T14 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2816 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22384 42 386M = 22770 432 CAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGNAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCNGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATNGAGTGGCCTGCTGTACCTGTTATGGAGTAATCGATTTGTGATATGCCNCAGAAACGTTGTATGAAATNACGTTCTGCGGTTAGNTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTNAATTGTTCATAACGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTC $EG/:B71D%&?397."G?"*#9GH.BGC5H>?-"/E6!H39<)G02$A@559@1&5D9B8,>,#.-'%6-9?8>:@G&F>H6?179@;G30/B"&:A&9&,B93GG/):;BA:<8/BC!'<;=05E9'E?380&B&H1+B%*DC'E.,HF,)F6$99'D&<'A6D1::F016FFFG3!%2+*'9B1E0#+C$/@=&$BB:D:?.4.2"F><0*7/83>='D+/=0F33.$8<7D")EF/C9$9/((2<",351?@-)E)>#+961-",1D/H)19.<;#H4B>>"9E!-.@.F3E93$+"F8F0;F7)G.%8/H*=?64&?$3&:8%85DGG(;A<2*A41758A*$3#2>/H-0;+F, AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:64A22T55T14C18T13G19A15T75C11G0T69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2817 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36331 42 89M = 36165 -255 TTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCACCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGA <,-BF8/4$G1$G,B('B$.GC&?A@F$H$9-<($-!&F-5.F18"(@:"<<(!@1B+"#(8:*%4.,3FB:E6?@%9+>18$5C$F4B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G59 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36165 42 143M = 36331 255 CCTGGANTGTTGTNGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTCGCCCACCTGCCTTTTAAA %)$!"$$#(+$'$&$"(#%"!*!***")+%)')(+#)&"+$((!"$+()(&&*!#$"##)&*$''')!)%"*&)+($&&%('+"!*$%%!(%%!)*)%)$''(')"*'++&(%%'($!%#'!*$"*!(#&&$&&"&*)%+(') AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A3A3A2G110T18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2818 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46754 42 148M = 46649 -253 GTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAANTTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAANN &#$#&#'**(+'!"!(*'&+&'+"+'*%+))#%)+*!+%%!!+#!%))!)%('()%+)%#((+)$$&#('!+%"(')#")##**$&$*(!($#'%"%"''+'$&()$'!'##&(%)(%*)!%*&#)&#*$%$%"%(%*+%#$!*+("! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:78A67C0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2818 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46649 42 63M = 46754 253 TCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTA =45G5#B:07$C)?G!1G(!#/8>>1C"G87@7:D72ECBB5%:E7)2,(,?1";7>6+H86D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38986 42 189M3I72M = 39247 316 CAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGNAAATCCNCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATNCAGAGCGGCAGC EE<+=G6A47E00!"/4%8#%2<4>&&E&-861."1;6%/<)B?(="3(!-/5G(BGGFB3>H+:%)A:$89E;&3+=<6&4&).<%:6@!#)9H-'HC9$A3-8-)@18F6B!3?)G"&+1%AH6G:6#67A:,H",$'-%1(A;"*#7?+?,1,@H;H!0)EC6#,7AA()2#((+6")A)92)1&<#)==(=& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:65A6C175T12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39247 42 55M = 38986 -316 AAGTGGGGGACAGCAGAAGAGCTAACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGCGN %'%%"*$*($"'&&%('%"#%#$&)+*+))#"%&$'$!+&)+&)!)""#%(+")" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20C2G28T1A0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r2820 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14595 42 246M = 14845 306 ATAATCTGGAGGNGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTNCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCGCGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGNACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCANACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTT D/2E"%=;@)07)E*&B=CB@3=81A@'893?.>!5>36:&4?>60GH#:CB)58/!#D*+4>H1*G"H(G*(9H?2+F648H3,$:)FEA$HCECE,)-$55+*&'8*(?(6);;G)%AE@@'C2!/@AH8>35A/12"4C0+7'E!&3!'B60+?-(B>"BBD%**5,+0276+$"-!$+CH)AB>&4B0>(%#6D43>,B6<#/,%27<:$4&5'676H8/8*A7'>C9B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12C51G31A47A47C53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2820 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14845 42 56M = 14595 -306 CGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTTAAAACGGGGGCCGAAGCCATCCGGGT (""+*&#)'")($)#''+$#%(("!+!)!&($'')#!(%%+$(*&#')'!*&+%+# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G11T13C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15280 42 100M = 15096 -284 GGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCNCGTAGNGTNANGCGNGG #%'&#")!$!)+*'"**$&%$$")"+''#$!$&))$&&&$**'+&#%'(#!'(+'%&$++(()$&$(($'(+$+&+%+'((&"*%*$*$"%$)$$"(%(* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:82G3G1G2C1C3T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2821 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15096 42 87M = 15280 284 GGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGG H3?@&'/D$>"C$:1.5G:/+/DB&6#6.3<0E$2+GFE?%,A/CFE%AD?8&"6,2B6>E)H!.#>>4D".7?A,FG$>44"79(G0:8#6;:3:F26$H2+77B3@3B("?%FE:2E,>BD* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:4G1^TA64 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2824 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 75 42 169M = 15901 15873 AACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTGCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGNCATTTTCGGTGCGAGTATCCGTAC >*-%14,#!5>;C%:A5>;73'+F$,4F0#G!0+-?>298?#6<(+1=6>D8!;(B(@1<56,+#G6C/*BA@C<'+3E?7E-($F1H&&H(;4H>"(;30#CH8>1&&(:=D0C1?$04!:'/;$;)"-"F'-"E0&F7=+1),E'.1+7'7%:DAF%,;E-;=D:(?)(1<@9A0+6C42 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YT:Z:UP jpayne@0: r2825 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39042 0 * = 39042 0 TGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACNCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGNTTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTNGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCA )";'$!/04)E+-.!<#8?"E+*;4<2BF+G?)7G>0,;1&2C-?0"/9GEDD:*43'H"'5BA5BH4)*)#;HG!!*+B*9F1%03;5$/0=.0A,':AB*,<=5@F!E38)9F=''6-A5$:"#HE.H6.4<&&0!3<%?>2@=G/3*:(D76,.#18(%&>9A!6/>52)B*#3'8@".#G4'D?(5%")72>BC///>HD/!)4,%=$#B6>,=:&9!!G!=7&457! YT:Z:UP jpayne@0: r2826 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13476 42 88M = 13606 297 CCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGNGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAA ";GB2D@A$FB7&-A&7(B'-0HE.6282C,=+"G6!.>-,@%:::E52%#0D2=4B?. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83G81G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2827 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42904 42 47M = 42718 -233 GCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGC %B,8@7D3(<1/-7)6)768%?:H;B<./*2984(/'.1.632&'?C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2827 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42718 42 79M = 42904 233 ACNGCGACTNACCATGTATCTCGTGCGNAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTNCCGGACAACTGCTGC &*(()&+#"'&&*(#$*("'%#*'*%)*'%!+'")%'%('!+'#'#&"$%#$(&%+($!"%*!)#'(""&'$+#'*)() AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C6T17G35A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2828 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16524 42 135M = 16659 335 CGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAANGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTT $06='%9A%9#"#=8)=50;"*?%AC.,'F+F7'8H*>0/?.=>5F@)/'"1##>"@0/D5+1).)?$$<%D)C88/1@/15%D,=$+ABDAAF@./$34!:5D8E4A,(:G!)9/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39C90C4 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2828 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16659 42 200M = 16524 -335 CAGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGNCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGANGATACGCNGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGA E/E$7/?@-@12.7,$1A%B*407+HB49#>B%DFB*.+E%81&';7H!8+/:5.(6"24:<*G5F,.B-8G/F28",;87&<*BB.,)5G>8%2):ED0BG:E77=%;E(?+%.::$&D++'<#$01;!=*1,66,&,(.:$&1?GD;=A%$$F@)-+--F06@?'&11))@.72%7*,;F73A< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C54T14G27A7A92 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46826 42 162M = 46988 409 GTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGCTGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGT 18-.?H$#&C!7D6+$72!DC?@A*,!H7<;'717DH7>$#82>=<7H01>C3CD$?6)3-EA3(CH2B7E7&2A%7.>=++D="D**(5#>7%;5":E*=#>$G8==>;.,*H7<(*(0$08E2F)18,1<"')59E2/:>7C*;0;5D%9C"8$)H@>*8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A115 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46988 42 225M6D16M = 46826 -409 ATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTNCTGAATGCTCTCAGTAANTAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTCACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTNCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATA 6%%C&3.E'10F;9>)07!@H%D1H52H"/B"$$!5B;4'$94.0/?+)D.'E*:B<8-9";@-9,.33*/?22F9&,A+=,)BDB06!#"!@%?!:E??"@'C670.1;%'99$#,%>G<-G*&+$&7)*!)0E1A/7/9:GA+8:C03&4(#1D')18*'755(=(,/%BE4$>(*%ECE&+81/A=$.>""+H*)GD*7H$**=G0>:4034&8?/H)+/52!/:"&<# AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:80T17A54A33T37^CCTATC16 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2830 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13376 42 114M = 13564 253 GTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAANGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCG '1'31AC)='<"#G>.B6H1+$.748*5+C"5#C@.A.4@.=6H4?&CDA(C5=E;)E4(%.(2HB.'/$+&$DAG!"'<->,=G$*5=A6,;/=7.D"):#=:*+":-*H>2E)B7D*::G31A5,7&8*-+9G%$8F+B1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4920 42 286M = 5206 355 GTCAGTTGCTTGCNAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGA 71@>?=C%9@@>=H/(2B=3-/:*C,2.F8&";1"%3$D0BA$,!!C@.&@F+7'4!)"=#C*&?+*A:=B"=(C>35,FG>7?#0-@17:E=DDE-(7G3BD5>"H.H3@2@7B@A5$0:,?GH++30F6D@6,&D!92''?2.1/G%C@#6D!B0A5)<).'':$D39@?/+$95+D=$D>B:FF"&G@!:,/BC235A>=+!C!E*#,0 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8C21G27C4T5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2832 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7013 42 78M = 7101 290 ACNGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCAC '##++$'$+%'#&$(!%''!%*%%*!*$&()&+#$)+)#*%"$'("*'!)%("&*!#!*!(("(''&'!*!##"%""+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2832 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7101 42 202M = 7013 -290 TCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAACCTGACGGGNACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGT 5)/;465E(01D7B:.('#7&EBF?-3"-AE=4D%ED$G&7)3F>%37C4,@*-B+6D2>F24*:D8(@>G36D%58)'2.6+@93,;*-ED>DG?@?D(>)9=.E77.HF0$@2G'(1"8$H.#E-"C%CB%$4/&E@*38=)49#H&DG17*4==:B@E,+:A3*B8">A0"EH.F*4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:165G9G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2833 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21380 42 247M = 21278 -349 AGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATNGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGAACGAAAACAACGGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTNACGCTNACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACA ()+$*$)*+&'"&+&+%+'!')++")%+")"(+))#$)*$&$!*()"$+!+("!*)""+&'*)&!$+%$%*'"$!&'+%$$'')""$)**&#(#"%"+)'"%)&%'*%(*!!)#%!(!$$$&)"&+$""%(+'('&)%()!!&)$!&&%(+$*"**"**&'"#+"+))"&'(%!#!()#+('#'""&(!$#%'&+*%#&''**)##*&%$()'$#$'$*+"(&*!#%(&*&&%"&*'$$))$''+*) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T56G79G11A45C1T3C45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2833 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21278 42 102M = 21380 349 CCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTTCTTCCTGATATGCGAGGC 501@)#(4)@#-2E0#@EF5;72/8(8:$)9!@8(D*4(FE:E36?G>C7F;HE5'"+*:*D6+H$'AB94,)7@A=.?)&66A06!($8:.7/@/;6D$@.$@$E5?!0H274D;4)@%;F=>EF#&4,E,=CC'>'$(GCH@6/!#/6"3FG192!&2::/8DC(5-;,C44- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79A20A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2836 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31470 42 44M = 31229 -285 CATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCA ++34!/39H6>3+.FA1H.;?(0524A!%="DE@;C%E-D#FF4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2837 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10573 42 79M = 10422 -230 ATNTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGC 6!F9F>H3?@HC>$(;7#'E':-8#B.#:C3"#29$2'7A2-CC9A,;$97HH'B/>C$;96"(:H,:E!.1&');"'D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2837 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10422 42 131M = 10573 230 NTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATNAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACC #/7/2A'5B3EF;.@>F:8C>B761$$>";22+,%:G%*5$$!5;"3.%;/,-"G? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G25G104 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2838 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36483 42 54M = 36622 202 GGTGACGGGTTAAAAATAANATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAAT ?>5G05+FB%,#445$H"C8"-<(.;D$D/5-,*F+F(9F&6F-5'F98C271-.:!92+-4@1!A=#83C;#G.BD+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2840 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23569 42 28M1I99M = 23401 -295 TTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATNCATTTCTATATCGCCTTGTTTTTCTNTCGNATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTA "&)')$#%#$&"($'(")$)(*&$$#*!'!''*($'"&+)'%&)*"'$()$#+&%+$+&+#(%+#+#)*)*%&)($(+&&&'*#$'(%))("*)!$#(%''&&*'(+)!")!!$&&"()%'''"+#%+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:67A8A16A3T29 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2840 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23401 42 161M = 23569 295 NNTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATCTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTATGATTTAATANTAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACAT "+"""&'#%&"#&&"%&&*!)$&"))!"*$$'!*+!*$&!)$+!%##%((!%%#+"'*+!*!%"!!!%!+)#$!%"&)$&(!$'($!++##(#*!!&&)$+"&!%$)!$*&'#'++**+%$$''!!&*&#!'$++"'*("'&"&*#)$%+$")+!((!$+% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0T26G44C10A76 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11996 42 64M = 12124 236 NGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAG !C:160+>8+52&6F"B,$19)$,5$9D,%6=?:206::?-$.$='A-3DG0;2H5=#:3C8B3?,4;"+4;?-3;.F!?G&?C&+7:0:)B#-&CCH;&$9!CH2*;.,;#1$('73>/F737/B(>80(/7@,$!,HF&.0EC#?&,3B*-?>3; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2844 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34802 24 58M = 34630 -230 AGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGNCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACA ?,@&4&A1@6*G2C#;*&)A8>>2<(=+)-%#+:B')%57-5!+(;:6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A15C31 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r2844 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34630 24 83M2D34M = 34802 230 TNGGTGNTGNACNCGTGNGGNATANGTTCGTCTTTGCTNTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAA $!*(%!()!##"#!"*$#'&"$'!"&+*%#("(&%)+!'!"$!()+%''$%#!%+!&'+**%*&')*('&("(!+%+&*)!(%$+%%!"+$$%%!*'$%)$"#(*$%+*)$+&$&$( AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:16 MD:Z:1C3A0T1C0C0T1A0T3T2C2G0T0T12C44^GC34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2845 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22757 42 149M = 22664 -242 CATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGGCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATT 5<)2+5(0:88)-%*"$.-./"0A1G65+2$-;6H;B"@/!)AEBB9C?4D/6D%G?55;A$"&)>7#$=-E3+1.E(@'F.$8"978E,017H772/C-E2CB3@&6DD9D@*,!H>FB;B0E*@58HE/+E9@BG;68?"4*9;(=< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118T30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2845 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22664 42 52M = 22757 242 AGAATANTGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACANCACCGCC H+B*2)D-EG@32D0C(&+63)D2@87,-?D+ABED'E)!(#)/&G'%>#-* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A37T7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39793 42 141M = 39934 307 TTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCNGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGNAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCG C/A.%($38'90H:@(9'??"C4;/C.G::(3*(%*"++8A;)0>D093;F$0*B".&D3-F(7)A&50%9*>9D=F%8<6C<3.<+88)@DHFEGG%+-=H>=6!+3)2'2%A7B$3>*,DG3731C"!A@%7(#G$&13 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G31C39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39934 42 166M = 39793 -307 CCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACANGCGGGCCAATGCGCTTACTNNTANGGA %!##&!'*&)'#$&)!'(%"$#$+$#**#&!%)!"&+&*"+($%'$"$$*&"&!*&)+&!)!')+#'!#+$$+++($&')!$%))!*!"%#'$$'%"+)#&'&+)(*#+%!'*$"!*$*&"#&!(+'*#(""#'$(#(!()*!*+(##*)#"$&++#+"!'!(")& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:138T19G0A1G0C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2847 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24762 42 42M1I57M = 24605 -256 AAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGNTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGANTTCCGGAAACGAAATTTGTA 2A!B"+"9/-*>,9-3)E@0EDB023B5%6+.8$+'<)2:"26A%>A!-)D#0?--$EH3;#;.>G0GH'F!6@"( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:4G34T38G18C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2847 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24605 42 95M = 24762 256 CAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAA EA3"C<&C%HH3%-'6+&#+,'$/F:?B5AF>:)3@@HEDC/&/2&9G!05?D7=4/,C"AB'!%A1'<-)!F"EE$*$3;H,+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2848 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13611 42 69M = 13611 0 TCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGANGGTTTCTAACCT ++4=,B=4@10?()3G*+;9:(3784G7F&)47(3#%5@5&GG9,A043*$B6:77;>) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90A21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1129 42 63M = 1272 255 NCCGNGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCG $=6;#CA>;>C"C"G4B5C5/&-'?99HE"#>3-FF%54*0F353.:.>9-=F!G(.D&7=(F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A3G58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2850 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17153 42 194M = 17347 322 CTGACGGTGTTGCTGANTACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCNCCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTTGANAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGCTGAAT 0')A.8HAE)1$/6/)%G2G&FG"7/;44%(==BF!.G&,#*5B%/'6D(F+-F,,GD<(GC2,4GF"0?AE5#(;HD./9.0FE7B8C6D15E@"/6(C;H6("'=G;,:7E+6'72E5$C2B0>4G18F($*4.;<9#(+>.(1,CAG>AE)*@/;($@D#EA)$C%B$!C@+424C-:9*<*?C>E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16A93A37G2T36G5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2850 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17347 42 128M = 17153 -322 GGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACCCCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGAA 58/B!.>=H*3;'G40ED'*,#-5D9=)8:C'9'<2,5"+3D6BE!&&,G'!+#'5"-C*B3$F+!F0D0E7F:+&5<6D4$5@-)-BE3(%!G9(!-A->=,6!>)C,)-+B+B-8')<@G)$=53@C?F'0"4!)!C-3GB3/';7(84"-(("":B)#1+B+66=9&;$*=B('84.' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77G9A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2851 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11103 42 41M = 10830 -314 CTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCA 70>,D.H'AH4&@C?8:D-&A2F+/A>?)'1G'6+/;-F-' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28163 42 66M = 28000 -229 AATTTTTCCGCCTGTTTTGCTTTGCTCGATATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCAT E12F.7(6@HC8!$,24F/F&C.,GD'4%6%8/%G4G251:E;3+6?BH88;C%)-'(ED5A@*9< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A21C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28000 42 86M = 28163 229 CTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCA >&F,4E!G+5)=H6'($64#4)@B"/9"B/F41$1*5%=B$%68&FF5;%"6<%H.HD/F2/A?)"?!<#B.+9/&*+HA(&>*8' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2853 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19911 42 239M = 20150 477 NANCGNCTCNCNGCCANNAANGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCANCGGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCA #&!$%"&&!"!)*'')!"'#!%+%+#$%&&(**)+$+"%+'&'$#($((((!$'"%"+'$'!&#!#+$)%#%("(+(*("**"$!%++*!'%*&#!)#"*#"$&*(&+'%)!$$'()(+"+'''*"''#'%))#&&+"'!#!*(#&**&*'*%($*&"'$*$%$($#%+'!'(&("'++($$#&*&"*+*+#!(*!+#*'""$"(!"&&#%*###'("!'%*#!+&##&+((!*+)$'$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0G1T0T0T0T3T0G0T4T0G1C0G108G1C56C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2853 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20150 42 238M = 19911 -477 GGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGNCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCA 1!.CG-@&..E&E9/A6)B98F@'308%6;/?4(?::1:C3:@D6-37-<+4"0B=9("-B$3"D/$370&@0/G#,=H/#B>(B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:176C61 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r2854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2104 42 57M = 1803 -358 ATACTGGCGGGATTGACCNCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACANGGGCTGT @5G09D-7H@D)D9G0%6:<60-$-?%/>6$-#0%DE=CC!A@0CC%-0>1G:20.8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18C0G29T7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2854 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1803 42 124M = 2104 358 NCGNAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACC ,')H&4A(/+43'F5EEE:8*27<2),=;";91%"!>*E-1$E@64H7H++DEH!CA("C5G2?532CB$#:H9/D-%.)#9.@GB!"F)7&&BG>*+%43F,FB*G!G>0&1$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0G1G120 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2855 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45444 42 121M = 45200 -365 ATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAANCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGNACTGATAACGGA 3C195#!DB52=)C<%(<550>/'%>GH"=H1"6.4/G$E6">4G&"!B-339E.$:#AH>(*#9=DH?#D6CH1$#10C29#")A848F9G>4A*;CF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T41A12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2855 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45200 42 244M = 45444 365 AAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGNGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTACATTCNTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAANGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCG +(+&%)(*'%))%#%')(%#(!(&'%'$*%$%%'*&'&#()+'++)'&&&((%"'(+*&&)*)#*"&"+''+$'$*%#')"&(%(%++)"'(*#*$)!&$#+##)+")$&*"$&()('(')%"'!'&(&+"+"!$"*'#"(&&'&&'*+&(%!$+)$)+)!$$(!#'&#'")&+"&+*#%)++*+*%!#('(&&#+!%+')')*%+&'"+'!#!!"'+()+#"&(%(&!")!%!#$$&)+$(+) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:99C55T5G47C34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2856 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13472 42 97M = 13583 164 CGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGA .:;C+A63<1"2D""&('D6F>(=:;8(082$+%)$'C:("44@84A2/HF,(F6#4$$=.B&D(D-$(-:=,#&5;,5BA:$G62;''$32F,$E+DB8%!-A'0( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11T11C28T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43421 42 54M = 43250 -225 CCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTT )?A*,G*=5<5G.<6+?%+F72@5>0(H+C6.:=-%?"8EH61'DF$.,23G"= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2857 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43250 42 166M = 43421 225 CAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGTCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATC DH'5<-$#%DE<<0=9B#EC,&=E)27&%5,A@"A&,B?46A)D;@>A4=B,>(>F%:&F2D2G$)&+G+8B=)<(,GDD.C9=#3509B@B83.=:":)*@<'01GC1"?D85>8)'&A#6.2F=-9/?G2"5%5*"<9+?H1<.2E3&;*;9@#$5G/#'='++ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29G26T109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2858 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1706 42 120M = 1590 -236 GTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGGTACGGGAAAACGTAACACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACG :=%0D2@9$A690$E)4B:7,F7965)B.@7=:D2"";&'7?@)>30D0(:?&45F#%A-9*H.&2AF@/!)>!<2,9><17D5=>+:4=42(,3F:4"#42(9?1+5E7(CG"A/?%;( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50A15A31G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2858 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1590 42 100M = 1706 236 ATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCT =3=?(D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2859 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41762 42 138M = 41608 -292 ACGCCAANGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCA 1&G(/!=/0*3!$5BA0'$7=$**=&'5F/=8B)=&1)&;C*5,(GF0.#%B5'49F"+(0D9B1;B)=7E.8!&'25)9";91!;/)3C5*7$,35@"A2'1H1("4/#F-?B.HEF(?%8F;?'2)9E>&F:0A,$;F:F)7/!,@#8#3HC()A(96,?/#E@@H$=);F=B8@.9-?>8&,+"$4";,>+8:6?7AF>!/$?+(1C=9C6*&A7+1/"C8=884H(G3DC"%<-:8@22*+8117?)-?"C4B-75)HC6+2B"1;)&27H73/1H4)&.6F!+*&)%F9;8F2!;88$C;!$;9;A6C<' AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:23^GG64T0T45C9A31G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2861 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30721 42 101M = 30822 321 CTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGC 8@A(;5&!)B%A!<<632A>H-#,@'4-,;/(:4G0$91;->"G$3>.0"C5A2HHC61<1A1;4+BC&>4<#@+,)3E+"A5',0C/:?75>@>#&>AD- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37928 42 47M = 37685 -290 TTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCT E;:&7$H,%*@:2'>&+.9A./)7#*=>.>%1:"<;BB%.=F2BG($ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37685 42 200M = 37928 290 AGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATCCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATCCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTNTTCATAAATTGCTTTA A;HC1:<0#H?-F<*A"=,-$)+8)D>G(B<<=)*D"HC40))"#8C*@93#C*4G7:+#@)#1=,9!F"A;"<+."F$(HG5*<#;@3G4=..1*-1#.#4E5!H6D>%99DG6'5=D9#/2'#%7E@D<"', AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22061 42 74M = 22228 210 AATATATTCCGCCTCATACCGGGCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTNT ""#B#6-;&F?)A(G3A5!$>(F,#1'(9.?!62:'<18<@FC&&/<;@-6"0'&FD==38C5$-(E7)+0#C72H>F#2=H'<.G"8*D:&!,F$5.:9=C?AE(6344"3B359+:A"99B<&%!F@)%EF(2;%:),)E"C(-/9%#F,89!B(;@;86H%=7D1.>8-!"5-/-?9*&"76>G,D58C'DD0AHF/=>=C::D3->.)"?.'D:03B<#*)FH?AH=C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80T75A35 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r2866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26649 24 38M13I24M = 26711 254 CTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATG B=0(,0&G%!(4(D1*C(;5B;"8!(!#H,8'4EBH?3.1FE>70))=-@:!4%E83D<@=#+>*(HDCG>79$0 AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2867 77 * 0 0 * * 0 0 CGAATGCCGTGTGGACGTATGCGTNAACGTCAGGATCACGTTTCCCCGA 6D6(53;4$##%G-,(8H+H.D=2@#9>-0+,3!HA-2!@D.27;0E4. YT:Z:UP jpayne@0: r2867 141 * 0 0 * * 0 0 GGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGAAGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAG B"F.(+&83.-A#37!/!C*!=C/$21>$2@"+E/%.*21E!<6-*:6&2%$=,C+'7)67F4,&)B#>E&9(&8&66@41CF!G(5*;#D.D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T1C27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2868 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48116 42 126M = 48052 -190 TCATCACTTTTAATTGATGTATATGNTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATN 'EA$5=3+7;!1>8':;93!G@&0B=6B/%:>+-BF((9G6G9B#$3G,GF$,4.)/;$>4." AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C99C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2869 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43860 42 179M = 44070 273 TTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCA <5>1?1A$#6)4@+52*F<@)8.6C?76*+4<..'$@./;0BG25(>/E)"F7CHH:"13@1)/,5*=7#.H@G&!(%;#>>$"34:C0,-?$#)HG)&'-9HC(/@$G04-3B!(C@+36)"0>!.;%/6$!.7,EC8>5C?4-.51#;>H?)#B5:1CF<' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:179 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2869 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44070 42 63M = 43860 -273 ACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACNGTG &C8>65"F$(643F,H='9E3C?2$4!<@8HD'1/;/&1:CA"."#E:'4FG%#>3"%(BF;G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2870 77 * 0 0 * * 0 0 GGACTNCGTGGCTGCACTTTTTNCCTGCGACATACTGTCCGTGGCGCT #)'))&+#$#$!"&*"(!&&'#*$#$%+!*&'+%)*"!('')(&#*$! YT:Z:UP jpayne@0: r2870 141 * 0 0 * * 0 0 CNTGNNGGANCTGTGTCGNGANAATCCGCTGGCGCTGAATNACGTCATGTCAGAACAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCNGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGA ($*&"#$%(*%()'!)$'('&$*+""'"()"*)'*)!+#)$*&'+'')*)#)&"')!*&+&(%&**#)"+*)"#(%'$*!*%'')+("#!*("+&#((+(*%*+%!)'(&)+'&'&%++((##)#("+*)%!*&# YT:Z:UP jpayne@0: r2871 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20907 42 40M4D65M = 21044 263 TTGCGAACACCGCTTTTGTACTGNCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGANCTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGA -FEB-4(##1<9:D,8+:3-!0&.B1G6/9,4HF7F531D+E18*:9@.:DE<%,E?A1H69#5G7)<#'@=>@(76@)(4#(!.6 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:23G16^TATC35A29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2871 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21044 42 126M = 20907 -263 GCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGNAAG ?#B>6(<&(0&8-9D5E/<-"!')C44:-08-81B!)1)>>-1H3'-F/GC*GD>;F;0>+E%03G@:*#2%.!937)+H%8'B1=-'85%D45B;.H#A'B-"$?@9/+(40!-3G3'FC*&%$# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:66T55C1G1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r2872 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21786 42 88M = 21874 229 CCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTNTTATCGGTGCTCATGCCCATNCTTTCNG 0D?.B3)/@(!9D<>,+>%+8-&82#(BF+=7D>*BEC8=1+9H8//3((?86!+H>G.&0$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59G20T5A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2872 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21874 42 141M = 21786 -229 TATTGGTTCACACGGACACNCCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCCCGGACCATAAAAATT +*"**+(()!((!+&)'()!$*'##&'""+&*')$('$%')"&&*%#$*(*!"##($*$!+&!!*&$!"*!$"!&"#(&('##"*)!$')#&%*("'')&+++%#!&+!!*!$(*+%'!$"**"(#$%(!)$+&&#*"+$+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A105A15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2873 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20235 42 58M = 20235 0 GTNGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCAC *"!.>=63A?@"##F7&2?*6;*9)/C;)*179%<3'2/4,&#!7;$G!B>+A6D/>D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C0G55 YT:Z:UP jpayne@0: r2873 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20235 0 * = 20235 0 NNCGNNGNGGGNGNNNGTNCTNNANCGCTNNCAGNGGNGNCTGCGNGACANNTNGNANNNNNGNNANNC !##$!!""#"!"#"$"$"!###!#"$!!!"$##!$$"!""#$$$!$$##"#"!"#!!#$!#!""$""!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2874 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4431 42 322M = 4753 377 NGCNTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTNATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGGGCGCTTGCAGGCCAGGTTGGGATCAGCAGCCNGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGANGGACCACGGCAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGC "'$$+++(!($'++'+"%+)&!%#(!")&%*"(++('(%%!+$""'*!!!"(%'#$'&*)*'%"$%!$+)#+*+!%&*''+'#)!%!$()*")$'*#%'#+$%#%**+"&!+')!)&")"!+$)&")&$$($&$&)"*%$$%*'#&!%)%""!$'''())#++*)$%%"%&%+!!$&((!+(#%+$'(!*#)#"')&)$(+%(($%$#%(##!&(#!"&)''&!+)%&($)&)+(&!!&&+!&*&#"*)'+)'!##!!&%!!)#'%**+$%!'%#*$*(*&"#"*))))%#*+!*'*(!#%&)&&%#($%('+&"#**(*'" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T2G42G35T15C15T75C8A122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2874 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4753 42 55M = 4431 -377 CCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATG 6=>@*#+F3'=DH#-H87>B(F&*;/"$.%8)&%H#)D11&9!,?//+D-@%2*$3""6H04)G.?:)?4516'+@D%1/6B$-.71?&H:<" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43004 42 86M = 42873 -217 ACTCAAAGNCCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGG 7%@A057/<95C80=:::,%.9F+&0.58F1+A=2.%:7+A;%G?1*D'A>,#,9"98!DCC$3B=@E*,:198(%$D>.0D79G4)=FC>>(,:7$-B0A(H9?2C%G,??<3,B40=8C#>B9"!57A#;&1'438H6DE'8G3#C7E2A=8C1G2(A.=+A@>1,43$-F(!)7F$%-.718!-#:C@79"7G(E?G365#A'8!'06?&&0E*$!?;16('1.- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2880 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24530 42 76M = 24383 -223 TTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTC )/-*.>FG46;9+$"<22%4#DC@'=*.H;BG;8,@%8!><,2-;0+)719AH:;2FH37@;C1E%/5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2880 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24383 42 143M = 24530 223 NGCCAATGACCTGCCTATGAATTGGTTAGCAAGNTACTACCGGATNTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCCTTCACTTCCGATAAGCGNCGTAATTNTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAA $0FA<15>.*(3(3*"G:&(!"27;2/&56%,,**6&C:$=B89:,%F%@@?$:C>C?89E"$0-22>#783A,"A/)1B,+7>C&5%606H@8&%-.3G6"A?AE13!7)>?C/E2(C;"@7<-)";4E31*B6A.*/0F4* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T16G15T11T35G17T7T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2881 77 * 0 0 * * 0 0 GGTAGCGAAGNAATAAGAATTACCGCTATCGATACATCAGGAATATTTGAT :;=G)3A?@H740;2H@26!F#.E+/.98<<,G1$HD2H@(#44&AA"#>H YT:Z:UP jpayne@0: r2881 141 * 0 0 * * 0 0 NTTAGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTA +D(3@6C.+0F;372<*D0B=#'(#2;-#)F2GF(/9<=2*$+$;6)F&3-2+.H(:+*5@036B?!+/#@1(D@&B(-@!)G@&3=29>?%5E7(GF$FH#DE$4&"D16"?76+48@=1'5*B'EC#C!?-)'?H8' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:83T27G1G1T16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2882 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13044 42 142M = 13186 274 CGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCNTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGNTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCNTTGGTGATGGCTA >GB/=4-A,EE,@G+%,:@;">%"2"%AE6))<9-'DE04=6*@?--.=)?;H")F%-!=E35B$@$?F!>+=67@'A,' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36C50G40T13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2883 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2488 42 66M = 2267 -287 ATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGA @*D%F#&01B,15C0GFD0&.=0)80DF+312$112F>?5%"H*&A8$1<$)/(C<#4-'")$&<3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2883 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2267 42 51M = 2488 287 TACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGANGCCGGAAGGGGN 12!''1'5(!/5,?-?'39<),8B24"):BD*,=1H!E97*HH YT:Z:UP jpayne@0: r2884 141 * 0 0 * * 0 0 CNACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACNCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAA %"D@>*&0CD'.=?&65:1'+@)?6,*@9 YT:Z:UP jpayne@0: r2885 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29306 42 67M = 29166 -207 AACCCGCCGTAGCGAGTTCAGNTAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGG *6*>=$,99!-;64AD&23%H4)+$;BC@E(-3)6&?%G("<(C7"8..H@G.CA:,?$;?++@F2E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21A45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2885 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29166 42 76M = 29306 207 GTCTNCAGGTGCTATCTGCGCCCATATCGTCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTG !*$(%**!%+$$&%((#$!*(*#+#)*!)'*"&#%$$$""+*#$$&*#+(%#'*%'((&#%)"&#"$*'$')(")) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G2T20A47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2886 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44516 42 100M = 44729 281 GATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTA 45F.:,EF.C81.@!2+8(=2D;"51(F0520;CD0/?41&->6&0908'-@2>40@955=DC0D='2B?6@F#1G/;;)3D8*$;.00G;/@), AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2886 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44729 42 68M = 44516 -281 AACNGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGT D1(*&H)4;A+3F.>=:0'(>B+-(/0&'46);8B."02'5D#<:1D.5D&4*C@9?@>-67&-.5!2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2887 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6596 42 92M = 6596 0 GGGCCGCAGTGAGGAGAATANCATCACGCAGTCCGGCNGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCG B?F*%(A>8%C51:!A:*)"%1F>#83A>G:'/0<( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A16G54 YT:Z:UP jpayne@0: r2887 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6596 0 * = 6596 0 TNNNCCNCGNNCNAANTACNNCNACGNCGGNCNCNCAGCNNCANCNTGNANGNTTTTNAGNNANNNNNCCGNTTNNAGCNTTTCGGNTCGNNTTNGTNCNTGNACGCAACCNCTNTGGCNNTGANCNCGNNCNNNC !"""$$$##$!#"$#!"##"""!$$$##$$$"$"!$#$#"""""#""$!"!$$##$""$$!$!#""!$$#$!##$$##""#"#"$##$$!!!"!###$"$$#""!$##!#"###$$"###""!#!""!!#!!#""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2888 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35501 42 42M = 35660 275 CCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTT )-H?'-@(#C/@H?47F96?'=9,#H40@H<3&20>08078> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2888 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35660 42 116M = 35501 -275 GTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCNATAAATACAATTGGTTATG >HEE*E@F07A1C8%661$+>=+*$:&A-&FE!&;%@182H3;-(0#A>#?#E"2-&=>8,9)4.:A':)2,9%3;1?C>1"8@(23/C'':$1#?!<;#;EE3$C,5D3H,*!E6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2889 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1251 42 58M = 1309 377 GNTGCTTTTGATGAGGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGC "#$(*'**$"(*&("+'&&'+*+%$)&!*$#+$)**)*#&"!!"*+&!*(#'+%%%&$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C12T43 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2889 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1309 42 319M = 1251 -377 GTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAANAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCNGTATCTTAAATNTGGCGNCAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGANCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGNATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGNTGGGCTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGNAT :9;85?G/>#D**$0>17$=A.*8:%7EB-,,<06(DE%(&)?>&,.:,>!?=".$&?=,3>?0CD3)71&H'/!2>*$7<&7A+'9?48:/-G5?==C-)0@.7-;<*,0<$8<9?&H1AB&%#>*70&HAD#-->D0A84>E-$@6+D/?BE0"A?);C.E"8*@<,C2=BAF3=9'?0,A$!ED/)G/&D!%H81&5*?>$)*;G>H*5GD##>F5=%1790#)2F)%52C5;*9,$E:&<3;"(D490,<@15905A$FAE+C$9#&;(3.5FG6(6+EH%>+#)(!;":'8F!C@!79().61%:C)>(DH7.5 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:48A92A11T5A39C27C3A25C3A54C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2890 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38489 42 118M = 38360 -247 AAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGNCATGGCTCGATTGGCGCGACACGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAAC 1A%&7>5.-=B*)-&?6,6=.2!!*<";F$%(*?",B"%(&-'E.*-(,2""+;6D'B/;/1?53?!9;&G9%=;+C6%3%8A>*DA-0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67A21A28 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2890 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38360 42 129M = 38489 247 NGGTTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGG '"(+$+'+''&$%$)*+&"&")*'$*#%$$'"#+$'&'*+*)%&)$*$!%(!'"(#+&&+''$)%+$*$'!!'$)+)))%+$$"""(+%$"#!%&#$"%$%%+$*#"$*&*"#$)"()!*)$%'%+(** AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0T1G125 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2891 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26423 42 104M = 26423 0 GAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTANTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAA D$H7?9&7/4BE1,6+D,'C9C69&CD+=+9#B+5+=;G*&D@20)$:>1.>?FB$"5? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T43 YT:Z:UP jpayne@0: r2891 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26423 0 * = 26423 0 TACTATGTTAATCTCAGTCTATGTCGGTGACAAATTAAGCGNTGG +AEH1D92(:&C22?.!&1.H.B?,)6A-8<6%+36 YT:Z:UP jpayne@0: r2892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34966 42 79M1D11M = 35126 214 ACTGGACTGANTTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATT ,3-3#C%,3-"B..&+C!!4H6/A.1<=?C79@08B2=AFFD8%9*CF)<7!?>19AF8.4B0.8415A1#%$58FABA4??GBD+A9H7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:10A68^G11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2892 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35126 42 54M = 34966 -214 GATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAG ();7&0H-18!!#"DE$=5C6%'9(@7*?A!G582F=A)&?54%3(4&"'&F>2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C31 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2893 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34163 42 73M = 34404 293 TATTTNCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCAT 94@($%D=5<&,D>0A"?8@A47?0+2&>!@2C$3+1%9%$9"?,&E>/C)3F3-#4D=-7:(-8F-&-+>$< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34404 42 52M = 34163 -293 TTTTAACCACATCAGGCTCGGTNGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGANANC !%*%(""!')!*"'+))+$+'#*!(*+'%$"(++&+%('&*'*!%+%%#(&% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G25A1T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2894 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38435 42 67M = 38210 -292 ACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGA 8?-3H0@'*07A;*H.D-63(,DFA31+H*<%20C0.)?(.>)#5%!158/&7>-1-HHA.D6'"4$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r2894 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38210 42 34M5I178M = 38435 292 CCTTCCCGAGTAAGAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAAT '4?A"6+D1B:E60=&G!*;-1C>16+./B7D4C26:,*'*"E-#/6%8G?GEG5/3@>'*!F04#$8/,D:)97!@-!?3#6E>>B!((',3H??< AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:13C198 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2895 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11382 42 63M = 11201 -244 GATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACT &F?6A-(/,#.$3><@!B+*(,*F>4;%!&;0F)(1)()/H"/6>!2.#F;2?"A"":F/$E# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2895 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11201 42 134M = 11382 244 TGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCNATG *-1;4*E=)B.5/76G/BB>)*#==-87=@,G9F#%F0&%A6"B%#=):&E5E$B=(6'8%#4G=D-;>2#!1?3B;4@C333./D23+%8<"?7?>.'4"8%61&=89>231?A841071:<)/<8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G129G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3184 42 145M = 3329 210 GAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCNGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCNTTAACGGTGAACTGTTNGTTCAGGCCACCTGGGATNCCAGTTCGTCGCGGCTTT $G>%8!"H?)7E4==")'!50&9CF,6#9@B;5;*!?%B?.-816@G*&B,!.,#&B($E;?7FF4E(F$'!-53F%!*%48700!)*?!/?(82F*&75-4(")0?="F;..ADF90>9%"B1%6(B"#D!@8,0E/)4+#F0&90B*>AFB!54A?D#FCC!+='@;':/<;(2@HDC/5*%A!0&#.&0,"H877>":",@!-CF7@#;H+/5+%=2D)A>1!4D?&,9;@4()2A@D/+7;EA.)>)87%,(E66.4019C:'";G&4D==;:B0?F&G:3B;.%AD99.(:1:=%6++DH7BD'EE;"A,D':<:>4""8.D.2H*>&9!"6F AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:113A41A7G0A34G7T100C32G67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2898 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32644 42 94M = 32738 281 AGACNGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGGGAAGAGTGGTGATCAGTT )(!(&:6ED'E'6C%=F28:1+4E,/3;:>A<)4&2=9?1'.*A12-0G4%6?#6?%6+-:=""@;)8A,#/4>.D$!%H;9$=#?%,0,16.189',AG*0>?4(E1B/8C9,C?@(5F/946@$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:32T1A11C23C35T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26185 42 141M = 26340 262 TTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTT %HF+34>%8A3.1A@7!;.@261:"%;$HD,/GB3.*:5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2901 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14037 42 264M = 13866 -435 TAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACNTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGNCGCACGCCCGGCGATGTGCGCNAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGAAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCNCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCNNAAGTCNGNNNACATT $+#+"*$'$#(!&''%&$*%$(')$"%(&(($#%$&%("!"")'#**+((!($$"++'(%"(&#!"+""+&&*%*##&&%*%%%#)&!'&*'*+*&#'&!'(+&*((*('##!+&(!")$*('!")(#&*$!&++"%!&+(!()*'+%*%%!$'%')*!$)+)%!%*($)&+)&)(("%$*"+!')!!!#&!)'+*$+#'!$(+%$$*#$!((#*(""%*+#&()*++()!'#((&)##$+#&!+#)!&))$#""#$!"!)*$# AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:43G79G21C23T29C47G0G3A1T1G0C0T0G2G0G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2901 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13866 42 111M3D57M = 14037 435 GAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATCTGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGA CE5029FG;9%-)A*#A?(%,.B:&::8<))0?A<$&E,<<<5!1C$3)*403=!#B,A(A,.8F?,9@-#3C#GF!%!;//*,$5289#=+G1&0 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:111^TTA26A30 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31094 42 56M = 30829 -321 CNTCTGTNTCTACTGGTATTNGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCANGGCTATGT E',@!E$;;"E+9@C&,B,>&:1@@'$*E446CE@:+4C>%1D10=8.9%+6%58D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G5T12G26A8 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r2902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30829 42 16M2D230M = 31094 321 ATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACANGTCCCATGTCGGNAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTGCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGC C!#*146B,'H)1>.E*:G;H?<@&=>2?5223*H6A=8F&>,!+4@>@.5D&#.*+'9%C%*D4%D),5)9>1H&!?+H3+(?+>*/"=?$F)6;;B3AC1?B4H'.(5?C2$/D/B?)C;A@(94E"4C)4>H8*4+&)D<5B',27796DG/?F4(>-HD1"/=0+1,&!$%)<5CDA.")"4;6F/A&57$%:E686?#3#&7GF$EFF5*!-5*3G*2::B/: AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:16^GG88A12C103C24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2903 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32587 40 109M = 32742 251 AAAACNATGCNAANCNNCTTACCAGGNTATNCGNAGNTTTCGTNNGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGAAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGG (!*()!*)(('*""$!!%#%&!#$)('#(!!')"$#$$)(&"&("$"+%((#!&')$+(+"$("!$++"!+#**%**#$#'("(%&'+*(#(&**"&(&+$'++#$*(& AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:20 MD:Z:0G0G3G4C1T0T1T0G4T4A0A1G0G2T1A0A4T1T0C38T25 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2903 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32742 40 96M = 32587 -251 TGGGTCGACAGAATCCATGCCGACANGTTCAGCCAGCTTCCNAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACGCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCA %%")%!%!"(+)#)))&#)"+$**+%$&!%%#(#+%!(!"*')(+"$%%()++%!'&#"!&)"*)*!'(!)')!(%+"))($%"%#'&$%+$*"+* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C15C23T30 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2904 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13522 42 160M = 13373 -309 GGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTAACCTGGCAGGGNCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGT &*B=D=:C(BA1HC;C2"<(01FF8-+=>;:%7D/E.92(.53$1(H1#:>7G2@&%D%AA3@D$B&;.D4H+,52-7E;A+;*F5><1*,0C;76A(D,EF/D981<4+0D-C-B%;:#C'9"23GBF)-F9/.*;>1/5"-%?/53#-79?#< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G42G35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2905 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5723 40 46M = 5877 234 AACNGGNNTGNTNAAGCCATCTTTANGACGAGCAAAGAAACCTTTA )((!&&")#*"$&**)!")(%)&)($'+!+("++$&)*'')+($!% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:3A0C0A0C0C0A1T0G0T3G0G2G4T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2905 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5877 40 80M = 5723 -234 GCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGC 09,!%"763F1B#B&)6*(/<3F"9-A!!7D//2!6H9;((H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r2906 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8537 42 79M = 8537 0 GATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGA B9>+6%3*HA7(3G8?C",%:(+%7.6/3D1@?:?<4B&0="(?%G0*#9,28@51FD6A;4!>3')A4C3+B:<:8E# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YT:Z:UP jpayne@0: r2906 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8537 0 * = 8537 0 CNCTNGTNGGNGGGNNNCANNGNTNTTNTNNTNGGTANGNGTNCNANTCCCNGNGNGTTTATTNAGCTACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATT ()"'"$$!$#)%))%&$%!#'*%!#)%'(&()!()%%*##%!%)#$"&*%(#($&!(%+##&$(+*"%%'+*"'$((%+"$!*'&++&*"!$&*"#'"!)!*#$#!)(#)#((("$#"!"!!%%'%(&! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2907 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12296 42 93M = 12112 -277 CCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAA ,4:&1@%$3&6#0)5C6"4>&=6#AD?9)&&2>C<($#;)?76&7.&/(#G&+#-A&"89#.?"=-C4=>-01#?&55($/CH&$)H?3'-9@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2907 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12112 42 109M = 12296 277 AGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCNGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATAAGGAGCGCCTGAACGCACTGGNGCA 58,?!&3/.E9/6#B+0<797=BE237FC7F'9;#@=(G>83.G(A'5.+(E"*$A":-'G5<(=C&D0$@,<53>EBC@3+E,:?!#*A"E*(+#)=):/5"!7FC=0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:51A31C16G4C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2908 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25611 42 41M = 25792 224 TATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGG 3@ED+H-@06/1E!;4HA#87G.$F<8)BG@5(9&##/-@5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25792 42 43M = 25611 -224 CTCTGGTTCATCGAAAAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACA /13#8E0B1$>G?H)'2,&:;FA"?1G-F8F-C257'C#%%1% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2909 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33351 42 90M = 33351 0 TTANGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGANTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGNC "=F8(D&,G+8=@#(.?8;&97G*"+32<#H6>4%HA7.FD?,;:80.66A=-,0<@;@1)A"='B/9:=H*F9)8#!.6!";0B+2)&; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A61T22G1 YT:Z:UP jpayne@0: r2909 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33351 0 * = 33351 0 ANANANTNNANNGCCANNNNNCNNNCTGANNNGNANGNCNGNAANNNNGGTCNGTGGTNNCNNTTGCANNNNCCGANTATGANTNNNNNNAGTNNNNGNTCNTANNNN $#$!"!$!##!$"""#$$!#!$"#####$!"!#""!"!$#$##$$!$!$"$!##"#"$$"#$!$$$"!$#$!##!$$#"""$$$!#!""!$"""$!"!"!#$$#!!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2910 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26546 42 143M = 26789 314 TGAATTTCTGAAAGNGNTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTNAAGANGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTC ;846,=$+!D'$E%E5C39F:32-H'9C.5#-477*>F%::&;77,3:(%<%8%;).5F*"!90>H,@C'4;*&F1&4,61D/GG- AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:14A1T89T4A29C0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2910 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26789 42 71M = 26546 -314 TTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCNCATCAAAGACAGTAAG *CCCE<:">#*=@:7+'%0D*BB+830/:DD+!';*2+#1=4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T16 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2911 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16785 40 73M8D104M = 16988 248 TCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTA B!*!B!&H"F)3.?')F@E/7+G>@,23;7)3//'H'*;'@=D7A#126?,1(,(5"G1$-7+.E6B":0G49*5@@)5F89E%*-D6F0G@6G(A'0'9+-)1-;$83'!:9;C''#=%+/&-D-;@(BD,EB8.'E#A'3#26/;=2G?EG@6-7FDF,1@>%+,=,"H968%G* AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:8 MD:Z:73^ATTAAAAC104 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2911 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16988 40 45M = 16785 -248 TGCTGGCGGTGAACAGCCAGAACCGGACGCTGACGCTCGACCNGG !(%'!$()"()"*%)(#%''+#*($$(&"%(#!")'+++(*&$"# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21C20G0T1 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r2912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41225 42 86M = 40977 -334 AGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCNCACCGTATTGCNGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATNG ?:5!6@"4H:7")-BE2C'+3((AA%C22BF/=G3>&//19DF&3!E1!94@8/#!:E"E"<,(B6<*,*7'5"897(BE9B0>)$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31T11A40A0C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2912 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40977 42 199M = 41225 334 CTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATAC HGH@7$).!3B'=H::<+,"AF:*+-.(C$D.<<8%%4(E?=8+5F234F&E1+&>-H/06=,;%:,?!:!7#HC3:DG62G#9!C17?G4,@:$'D%("$E%H)+(84C50FC59;FA5/C5'GAC/9(<<(F@42F#,D0B0./=C(:'&F%C;FD10<<*@H+?8"5:2,'=,D AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:197T0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2913 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28964 42 195M = 28799 -360 TTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATNGCAANGTCTCCGCAATTACACGCNAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATAT )>"?E>@$)G95":%:$&.=!.(0;9";&E8@#/:("D,34"D!8=D1@/5#2?$8'9&$?=F(E'!E91E+)1E3C9?)3B/,./0/?E?*?+?36F8"'B=2-./E>/E0?(?(+)")F>+::?@>*B9,G&32::GH24$:G18,$>25%:*<98$?56H<*H,&>@A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:115C4A18A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2913 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28799 42 165M = 28964 360 GNACCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTC 8%!9C2D82:5".2-A-?-G$18B;22+(*&5':.'HDD/E.D!@3*F*,8F94.8>./7<0H5"=7+C9&H&AF;1GH;&$<&7>43:9%1@'E03;EE(%EHF65C;%5642D!+;%&9:G;B6+@H4/*1:)0?(4*G7@#).75HF)'6*@";A"AG('7, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T0C162 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2914 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1431 42 79M = 1683 296 CCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACC 7?<8<3C/9#87B%,9%#3+E%2",3$'*14@%;,:=@-%D#*7/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2914 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1683 42 44M = 1431 -296 CACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACNACCTGGGTGCAGAT *0-5"'H1);CD+>473<@EF>(#CD>HD@'9$D'A05A-;,'D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2915 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18522 42 209M = 18731 324 NTGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTTACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGNTGAACGGTNCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGG &$?D9D@(?EC)9@84#5*93?#H!5!=,D@'+85D?C&D',-)1C5,G1$D'8A(GCD3*<6,BH(8.@E6>6@H:;0G$2/D0D6@5?,1-G/1':E$;3H2'(7'-2+;2DEB%4%8;.%6(- AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0C74C22G69A8G30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2915 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18731 42 115M = 18522 -324 CGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCNGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGC D>5.A*HB/C<,8'%A-/*,5'"0+(B03"&%HC#=$E;<7EH/36'(!3,#B0:D7G>%9393)!A'>&7/D+:7=::4BD3'D-#@=#3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A80 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37939 42 69M2I77M = 37890 -195 ATACGTTAAATCTATNACCGCNAGGGATAAATATCTAACNCCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTNAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGG ;<3BB&;F?/$HD?)%G(-6-21.4')GF!&7,;)A@E#&A157D9=B&4<)>G*4A!0!*C85-A6*;-*'.+*F+(&*5.CE6C%<8;)=8%&-FG657?'D92(&5$1D2>@.D'/?B+:'7103"#G"4/!C!#<+?@'19#;0 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:15C5A17A51A54 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37890 42 49M = 37939 195 ACGTGCGTCCTCAAGCTGCTTTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTC EA'E(&9#3&.=!F,$!C*-6&6$!41:H'G1F$"="):(3(#&,'&6( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C28 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23719 42 43M = 23522 -240 ATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGT >./@,$.D9/'"?G<1!841$;$*&.?A:;02208.!9F:0=F&6''+<+5"!3'G&=G+/A)4:*C*10"-A-F&5.2+(GE,5&' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:28A9A7A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2918 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13536 42 104M = 13411 -229 TTTTTNCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCAGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCA (0A#41F/@@)+150B#%-=%DEF(#$(25CF"/<;&..,:H(C4H&6)<"/CE.6)G!2:/4"#E2?%/>).3802,<&56.+,5EG.2?(H.DDE7"$:-2G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T29C68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2918 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13411 42 41M = 13536 229 TGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAAC 1'92(F!@1$;/+!9!F*=!;/#+9,*<#4B.,(&/*#57? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2919 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33324 42 196M = 33520 271 GNTCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGAAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTA &%#+)$#+"&*#(%!")*#*)+!%)"*%#)""!(!)&(!+$)%"%#%%$("'*&($+!$&($)"(+*%*'*#+(%(+('!)%+&$&&%!!"!+"%$"&)''+!'#&")+%"'*%'##!##!)"!$(*$$*+'!))&&))"*($!""%$")''$*"&('*""*!*&#+*&"&'++%))'!('(%#++%$&&$''(** AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A94G99 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2919 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33520 42 75M = 33324 -271 TGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGG @A'#@1<+1&HF02%&$?-6B9GC'G55@5E/#(F3$3A7CD"-09BB@1!1#=B2+'E22>*-F3/EGA@6.>6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2920 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44477 42 122M = 44412 -187 GCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACNGCATGATATTGNCTTATTGAATAAAATTGGGTAAACTTGACTCAACGATGGGTTA 73('-5D&1&<@F06&CA*";5A$,?$-D'4CG'1*7E"FHGAA)*$%+3;+58F38'>98=5$8>F?.5A,!-.?7-1+?%E###'#,.1((B>3#7<9)+)!?B+73B0@F!1D@22-A7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:66G11A23T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2920 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44412 42 40M = 44477 187 GGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGT 511,);&'A*9124/(!:.B97A&ED6+&D=G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2921 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35755 42 110M = 35870 177 CNATATATACAATAGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGNAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACA &$+##%**)'&&*$$$##&"+'*)'*"!+''%(#($)+!&'%+((&(!#))+%!#&&$"$(&*$*$(#$$!$%%)%%)#!*#'$))+"!"%*&&'&*$!%!+")*')#%' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A3A7T34A61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35870 42 62M = 35755 -177 GCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGC *49=&)%#?3-%/3$$):3C-$"G!/%*H3(EE=D)'1'D&2F><*8>:@:#4@&>#8A)8+D9!9?13!1>+16/E*@;B4D,6?8#>9D=+%&91/6'8+#1C5B8.1'52E9FE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G37T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2922 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10462 42 95M = 10567 202 TNNCCCGGATGTGGCGGACATGACGNAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAATCCGGTATGGCTGAACCGGTA &#!:FH7CE,9692(&.*%-0E?!8#1G7827'=#0#<5:0(FF75+H?5%H92/!6E9939H!8?"1;19E?&0"508=;5/+AA$E*9@3&!C<57'>@(86.,A3"G%/0.'+4<549D?+D.)&7)2@E<+25&6'"1$@$$8??*(!*,@0:1'G*G)+F&3E*3% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T6C11G17A24A11G88A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2923 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34472 42 110M = 34308 -274 CCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTNGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGAC <(C84'E844*A!+!;2F18@B#/:!5%'/1$1<#!,B::#%>!!>3='(E.C=6A(<49=D'6E?38"H62>F6B)B?!*B.00!4-?7?!%#($,@FH";:844)>:0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72G37 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34907 42 80M = 35081 237 GAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCA E61>:B<=0;D4/079.7,<@B;5E9)3FF.)@$A,4$&H*HH))7HE01+*)F"'+.18.$+7):->/1=?F=&!8FBD AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35081 42 63M = 34907 -237 TGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATAC 99219=$&$F@5.9E&9568!'66G/12//9/%5C&85*C/48>F7>C0C3,B6"!:94,$G2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17593 42 89M1D37M6D171M = 17897 383 NCGTGGAGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGNTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTNTTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAAT #A-,AE31$?/!7A-665-1FH!>CA?@#--3G*.#+(F#*7/+F4G@07-5,)A)/C'5A81'F/>H,+#*605':10HB5#54*&G?<>?D9#F?>G@3/G@%A>97-C682!G,-52<0.3&E."35A@4G;63%,942.%<04*>E@A:<0D/6)=4HB1B3:.6?;46/+(+%GE/%3"B)F5=@.:3;B/"(0>53'C;DB#*5.'B7B&57-38!6?<(;2,5H43563.;,HH/FE2FD#6A*8G;*@,!F'5><875!?$&*B>A:((%H&CD:B=88+EB/@%@3,1 AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:0G5G82^T37^ACCCGA8T123A38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17897 42 79M = 17593 -383 CGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTNTTTCAAAGGCAAGATAACCGA #3G"&<8F%8!A?*HGF,C#'BE$>,FC&A?1EAF:2#,."0>*B%=DE62+7;A"H$;5?>.F:3*4<$@@5')2!8, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T21 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r2926 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7598 42 119M = 7859 305 TAACGGGAGGNGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTNTTCGATGCTGCCATTGCCCNCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCA E%A2;'1A-D)0G?&3G(&*%**.9-!ADF5((.E=386=;#-1>E0(3BF;1%.:=C*907F2A5.71%C,-6$4'G9-%@,F.4(F<8*"*B9D#C3,27,-CC?46(HF6!#=<"$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C23G19G64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2926 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7859 42 44M = 7598 -305 TCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGAT 9?+.9#20E$3@($?=1*>@CD"6+B?$,B$=+&,C8?B:B28( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2927 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2140 42 50M = 1927 -263 GCTCGAAAATACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCC A@'$9$*E&39$4(+6/<111A==69H@:E;?G0-DH,"89A:@;5GE1; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1927 42 42M = 2140 263 GCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAA .5%55>#6&3);(E($"E$'/;7$/#)(>8050/?,2,7>$> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2928 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30256 42 51M = 30307 331 TTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAAT 45$.2?6:H2:0-H@5'(391,/FB@E3!;F&-)0!3D"%*56F?<@!(>,!-&' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0C0C0G63 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2929 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16627 42 139M = 16551 -215 AATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGGCCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGC B8B%$.;H%').&"C:%7&88%;?7%7DB;A@)@=>D%2.>/BG!?A1$-4;51:72D84)G"01(>C/FD.G&D'5;F68'12(F'09$@@'*1G=C;/7)7G(:%G/F1(6F!5E($+%?%D/,0##2A1%B0>D06 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C30A29T50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2930 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25290 42 147M = 25437 284 NTNGNGGAGTGAGTNANGAAANTATTTCTAACATTTATCTGCATTATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGCTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATCATCATCGCTT %$"(#'#)##%'''#(!+)*%&#$%*%('+'!%#&)##)+"!)"(!*)+*#*)"#'!)#++!!*+$#'&+*($#'!(($*"(!#(+)&)**!$"$""#'##+()%##)"%+'!"&*'"&&$!#')$##(*&$!$'$)'&#&(!$$"# AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0G1G1G1A7A1T4T22C37T53T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2930 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25437 42 137M = 25290 -284 TTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCNCA %$*!+(+(*'!'!'+&!(*$*)!(&#$**+!*'(%%+(*$(("$%'$(!$")%#')!"#$'#*#)'#!%#$#+%(#)"'+*!#*%*"+!#!!$+#'$!&%#&#!##**"!"&)%%$"#&&)(!*)#+%&#$!&++$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:134T2 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2931 77 * 0 0 * * 0 0 TTCTTTACCATATNGATAAATGGCTTCAGAACAGGCANTCGCGTCT 896.?)!+,2%#1E+0"@%BA#=3H?++$71#H(;$C4"D,&5C76.(";5DH2=710CB81+179=.D?=:E4D'CC+760B96'#'<( YT:Z:UP jpayne@0: r2932 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40694 42 41M = 40915 293 TATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAAC 8/G/C;5)"(:C?,0&!%:=5$@*6+C')#-%), AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40915 42 72M = 40694 -293 GGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAGTTTGCGGAGCTNTTAAANC *+()++($!*&"+))#&!#&+&"'%##*""')+%)$!%#&+($"'%$%$!%*#!%'+&'&&+'$#&)(!%)( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52A11A3G1G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2933 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20406 42 46M = 20544 260 GCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAG ..+:G8??<1)B38$F/55;5-8)8;FCG),2H2>7"/$D%%C.*0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2933 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20544 42 122M = 20406 -260 AAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGNTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAA G<,'(6"C.;C$.===."D*C9G"+*9&4*@F.;C0;!(6$('B*<5$D.+$6."F)6DC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52C69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2934 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13776 42 201M3D57M = 14037 372 GAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGNATTGAGCAGTGCAGCGCACTGAGCGCGGTTAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGNACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATANCACGAAGGA 0=%A8<8+2!'*>;.B3?EB;.:?6,/-H17&BG>2#)99+34&C2:-7HABBC?+E4F7?8C!-%@$.D-7G+DFC<:?A-%7%D23",'+='%/A3"A@""?<+B78('3;<>;6HAF>-H1FB$8.C3!>'#A,#"66@;H,D<,0,G7#/-9>4)*+!+'1D%-H3A$A*3>GE0"@8/!,4C)8=&4G9*"*$%>*'C64/9$85<.8?5G/98$@F94+5C-(A5@H?.)>2%G@+3#76'C%E.#;+-&".A$037H-F:GC.&.54(2.&1G/4B AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:20A2C32G21G67T1A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 822 42 118M = 675 -265 TANTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGNATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATNTGGTGAAGT ?))&;*E(0&<8CD(F%?:?9#0:"AEADC0CB;BH/,#-.4+G.0>G24<.6G;>992%HG/))=6.2:<77;?#06F,6:"5+&(&.9-B1;%)>?A,H36>)-4>=D=( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C69A35G9 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2936 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24229 42 134M = 23943 -420 AATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCC =!-=A,F3(A#<>8D8!4+310&:)('C9'@=5/G-4'63,>@9<8D)$.:))!58--/B5@>C)$-)0=3=A,$CE.1/3('2.%C!/0HH=-4$.G:-:3F8>,3-#,?G,G@1(:6E,;-?'F$)C?>'#; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90G43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2936 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23943 42 286M = 24229 420 CATGCTAGATNCTGATATGTTTTAGNGGTGATNAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATNATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGNTATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTG :4+%-.,+'7E+0GB3:3F#=H%)C:F@%$;93F0C@AE#)66GB9-C;/BF8277-.D%<#16%4#8/"%>6!(114,%C;"F(3@,3B-16HE+5.A8%19(/E&)*%#F,D#8813BBG@FB;#8GF#:9$+E)>G3$8F*=)<&'4-A<#1F,01'/2"H)78E2.#G?,E-$%C#D-"&@//?(459F+"-+">$3H*/EB48?9/:EA?$@A!/H?&/3,HA@.7'C*.-2B(7=4A0!=:EB9'$8/=<4+AHC1F090FF-#)6;(*3$E547,:=0*$$0D''"0+:C)F:>'78F!G.D=,/)9($# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2937 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8751 42 74M = 8578 -247 TCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGAATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGANGAGCGAC #&(!*'"*)$')&)&(#*+*##!(+'#)*)*'#$++&*+%#*)))(#(!#%"&)))"()#"!)+(!&*#+%%$! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32G33T6T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2938 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 102 42 40M = 15935 15949 TCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCT *,"@B/==/%96&/;A$@%6'?#F?>;!4=10*683# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-8 YT:Z:DP jpayne@0: r2938 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15935 42 116M = 102 -15949 ACGGTGGCTGGGTGACGGAATAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGGGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGC <97?E)'A:!)@/CB*1-9A;;3>&A5',6''!C:G8*7,9@>,8*D:+$?E@;8=H,6GGD0@A0(,B%A/#0.HD9F86EA<6$*;;%>H+202C;7- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A51T43 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r2939 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3214 42 108M = 3051 -271 GACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGANGATTCAGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCT $4A+';GD/#,B/%=D+$&F)D+$D;<+0=@4=,-4,5,'<-F;!G#44>@D-:*#6,<:$F)+B-/5>0;+H;-(F-")(76-/B<3*5@D-/1>D25*GD('B&1$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T5G69G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2939 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3051 42 87M = 3214 271 CGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTATCCGGCTGAGTCATCGCCCAANCTGGCGCNATCTGGGCATCGGGGA 0*F?:%(#B=8D&3%;><#&E1?$D%((+F-DEE!";:63(8/.C.&-$*6F;22B9A*:44:B@76$B+#6>D=?./$=*4=%-F# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:40T7C13G7T16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2940 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7701 42 326M = 7634 -393 ATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGNCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGACAACCTCAACCGTATCAG 2,4-35HCD$D=&<9C.1:6F2F,!(F("EB@+?7+F!48&=#%:8-<0.-(":E6-;!7;.7G+#@7C$@&51<.2+4"<9$!#7&A?8H;&)>/<+4@+(8*"H4D@*>H$6/B7:E;F;7<0:1!A3'07)+?9%$"FE+FC<0'>C(&2D?->C8">H&B<,784*?$#3G,AB;;',9F+9/*3B,/=@C=G:7G."6)56;?D'F:;+*43?;@?E5(A//B'9%'9=*B(&21;3H'-?2+D;>&4A+;+!&B*6,0/G'09+')668*D,CE%3&0'<$''8+2+H0E*E27?7)2@B9@&>0;/H($F9!AF0*'$C AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:74G121G111A7G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2940 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7634 42 67M = 7701 393 TCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTNCATGGGAACGTCAGCCACCATTAC C70.(F!EAE4,HC1)A12C>;510>:9;,**1*:8,.4'1G020GB)6-+<<:*@>=(037$'C7+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A24 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2941 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44659 42 65M = 44844 297 TGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAAT >&;A-?G9@"=$":3%#H(#C&446;<1<@.'6A0;.G'&H(&G2F$% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2941 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44844 42 112M = 44659 -297 CAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGT G;G78468A@+$'B2AH:"G2+EH-E<+<19!F/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2942 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25681 42 154M = 25498 -337 TTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCGGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACN (&"("%(&)$&!+''$'+"#*#+#+*)'(#%"("%%"'$)+!"(&+'&!'!$)*')(#%&!%+#*)$!%)$$%$##)%+($*!%)!%!##$"+"!!'!&)*#('++)+!!&)#$"**!*')&!%)($'"')")!*$!'("*)!%%!%$"+!%+% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103A49A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2942 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25498 42 99M = 25681 337 AGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATGTGTCNCTTCAAGTAAAAACNCCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTC 52.A%?=H&+D(04(&D;(#H@#*G5#@G$(*H94GF#&=>+4$8=)8!E3#F2/AF?#$2?*A6##ABE%9:3$DH!27'%?/B/1=4$*FCF19(/")'@6@+;(5)<)4*)D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28770 42 102M = 28630 -242 CCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTANGTNGNNANTCCCGGCGCCCAGGNCTTNNC *#&&&)&$&$$!&!'$)$!'%'&!+$+$+&+"()+*%!!%#"$'&#'&#'+'"")&"&('$$(*&&$$#&(+#(&)#'%*#()(&#'''$('$"*(#(&$') AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:72G1G0G1T0A1A9T2T1A3C0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2944 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11415 42 52M = 11590 301 GGCACGCTGGAGACCTGGGCAGANAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCACGT 6@H4/3+C,%)B$*6;'<9-.<0:DGC)B)$!?#8E#6,*-0.67H0>6E-' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C25T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2944 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11590 42 126M = 11415 -301 ATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAANAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGNTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGANG !"&"#$!$"*))"#+&'')("()$#('')&#($%'"+#&!!%"*#"#&*((*)!!$+!(#!'()$))')'&!!#+&)(+&"#)(*!($#*+()%*)#!$+#'!*'!&+%$')*#+'")#%&&$"+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35A36C51A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2945 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28915 42 101M = 28738 -278 GGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGANTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACG 1+?%5939<-E4565%"#,G#,00,:9=/,@H12G<-,2=7$:'#$>/*305896:F<.9!BC4=%BA>H3-6=*H2@0D2*A4?GD?*<7?/A-D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2945 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28738 42 91M = 28915 278 TAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTNCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCAATGTTTCT #E/D7%3,G><61=(+.$63;;+?"?/4,#E!A%6.,<4;A(&H:D:9(CB8%'3'?2@4'(D+,ED0&#<-,65B:?F!/,=!;=E(#&1$1D$.E110#H&%2/:)!,1'=03@!2=-6!/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2946 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8556 42 43M = 8680 237 AGCATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAA #(3$G8&1=#:>*H0HA,41+*$657$)99:.)/4H,G<4/85 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2947 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12087 42 47M = 12340 314 GCGCAACGTCGCCANCTGTCTGCACAAGANAAATCCCTGCTGGCGCA ?H.*;D=532B):/3/C03(:E/*+8646B;GA+;/)B!)-0<@2/G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G11G2G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2947 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12340 42 61M = 12087 -314 AGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGC '(>,#;;9/0@"/#=17A+'$?';.94/@:%.3/FGB=H0!),#7&(C.-HBF;% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2948 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22211 42 101M = 21930 -382 CTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCC +>,&49&3+@3'>?731E78"8DF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2948 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21930 42 281M = 22211 382 CCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTNAACAACCTCGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGG 67'D(?:A8@91B#'5>=F8<(E?%=,:727H7'4>#338D!8'@<5=C3/$1G(H=4)@%.$(*>C*(2/&B*("988E$/*,%F;&,A@:4F/'>))/G115>B7A<-$8'8;123)CB7:(H?7<*EB=$C59*EHE#E19=2+H'A3:9*4';#"!94D%B!'#'C5-9*>-CD(628:(1+4("!'76B#=B/5)*;>CB',;%*%92*.GAF-D7)..9)67DA(.BF>"H&> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G7A211 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2949 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11826 42 154M = 11980 267 GGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGG .B34"E4==5H,!:4+=>1A5"&B6?C(>%68%4<$.DC4CFH=313(&A"'A4*4<%8,,;H7("'<"D1"68%2GH.!=3#+C0<.:(D70FF>$A20)4080"%%$<"49G;(06#1!<;B(D'-B.3,0;=0-8.1?F$@$A%(D0&63? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:154 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2949 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11980 42 113M = 11826 -267 CAGAACTCCNGANGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCACTTCGCAGTACTGGAGGAGGCGGCGCAA ,A%?3'>E5@#0=#-$5@!884;3H-*DF-GH8/,0!#*+"2?GD7)1;!.#?B83<+)D21EG*E352F-C(?B,$C@5CDEF.F@H,D-95<%5)1/HCDC)6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9G2C72G5G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2950 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43191 42 177M = 43082 -286 TTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTANTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGNGC )?1ACH>3546AA<9+97>C<(E5DD;&@:?BD0EG",E0.(2C>=@969->*F+#)8F75<6<(B"!87DB,?,HE?BD/@+F3AC*5;9:2213B0;;<)A"!/4F;"7+9,9&<2"61&4'%)!)!4G811F9#0'=B#,2;-A$0CE9@24'F$$6?4F!G=/=3%*C11211 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41T73T58G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2950 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43082 42 46M = 43191 286 GCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTC @'=+74-+7;(/.BFC7ABA33F&*-;%'615?-/)7./+@$6/:, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2951 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44073 42 118M = 44268 257 NACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTNGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATT ,E$8E)'F!*36,@0(=%0/*$9F7)%6=%)>:HFF*<:EG*,)='E/%9%>H.21E*(",A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A63G53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44268 42 62M = 44073 -257 TTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAA 9=6H:)'/A92-,7#4.F%5E2$85580#@0--,&?G(@(+)!?$67F@?1("4&4G,%;3$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1799 42 180M = 1751 -228 GACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGNCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATTGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTNGCTNNT )%%%&%$**(!$!(#'"#%#+*($)+'#)*$'!))*+""%)$*'()&*'%&+#+(#&*(+)*&&&)%("*#(%&)()'$$+*$(&*'&"&*!"**(*('+"*(!'("("'&'(&!!'%++"!)!*&'!#)+#))'((*++)"'$!%%$!'%"("!*(($%)'&&&'!$(+)#&#'$$'&$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5G67C37C61G3G0A1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1751 42 48M = 1799 228 NGGGTATACGGGAAAACGTAAAACCTNCGTAAACACCACGCTCGGTGA %1@%C+'2>)<"!(?"4.&-96GA5$=+,-$".'5D2".+B313A1@H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A3G21T21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r2953 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11533 42 58M = 11689 256 CGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGA ,F<=!'8#;.2GA%3C#$860103#1.>@'F98@&E?<0A(0>H'"#BBG(G9F?1A1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2953 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11689 42 100M = 11533 -256 ATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACNAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATAC $!"&"&$$"++&(&(()+*'"*%+#%()**&&*!+("'#)(+%$!'))'+'*%%"*$!)#%!##&#+*)##)(+&&+*&("&'$'#$)"!%'#'%*&&(+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2954 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42119 42 154M = 42012 -261 CATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGGCGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGA )*BC74*"H;6HABCB1!A)3'H9#,#))A'093+9%$)4H6B((&=25??>!:#1*$+04)@;(2F&+B/B/6>::%F;1@$#<1,%7548E.?>)'2:$640+(&21B%G;:GC2?@4BG7E,;4&*;&D+D!"-H:?816;&2+/650+A. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:129A24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2954 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42012 42 107M = 42119 261 TAACTGGCATCGNTGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAANGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGA *$"&*$'!$')&+((+"+!+(&!$)++*)"))%'$%%("*)#$(%)%&()'*+&%)"!*#(*#(!*%)#$$)*)!#(%""+&$"'(&(!*#'')(++""*'**+'*) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T5A4A56G37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2955 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11133 42 135M = 10952 -316 GGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGANGCTGANCACAGACCCGAGGTCGGGGCTGACGGCGATGGCT ,*5H'BFC?/35"4,=%*-G(22:7$7B.?/<3-6%1<8",9EB=!()4C!'598%B:7)9.7D/8G*F>?!G59(CH->#&'D'@)#,5+!!4=0E=''= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:94A5C11C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2955 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10952 42 181M = 11133 316 TGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGNCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCCGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGC ?+(!HF7!D.+F?'/7-HG>(&H055.*>6;A=6,=C0>"#@;>2FD2H85B6@07D3!A$#4A@<*195C@C6%,3@;8/3>88:8*:"/$$7(;+!%(;3G>;%.*C52$5F#7%<54;+DG(%/6A?,H$CE2!%,/3>!$>0>43*497B6EA'8?+>4-?4!#&'7F,$@,$.8*C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:111G25A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2956 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43726 42 200M = 43685 -241 CACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGANACCNCTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCNGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAA )/92'?*@;&&&4F)-;#&=3&.G&37BC@-4:1&'GG,GA%.?"=1;H#D'CGG9EB;A90@63>02)"A;7F9';"&>A;B;#&G>*8:>C%1&.16/.C<<1./???!?BH%3=B=>)-=58#8H'-<4;EA24352<;@"-2"::7"FCE=?C##+F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69A3A45T80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2956 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43685 42 41M = 43726 241 TCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACT D4/4<>&ADA,@,0BE<3/>#E/F6FC$'&++/6+89;;#% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2957 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45714 42 170M2I68M4D116M = 46072 446 GGATGCCTANCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGNTTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACCGTCAGATTGAGGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCNGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCNTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCC A9E@+-C0@$C!'="3GH$B;H9).DG#G81&H6$>=A/FE@G!8D2@-41:.<.#"-?43*E&DE=3'"5,="('<)?=E50G.,/>F*B15>:!?)H&-#H*&3'%80E-18#19)=2&"4/G.<$(85!=B>/756HF"+D#C2&?6.,86#F(7A/&9-.B!3B%B4<2='=AD17B7+:040BC#65#:D$-=C;)G83.",$8?C!?&80&$$B9%57=(5(%'(#"5,<@A@*2?B?<6((.C&*"7/%H#D59FE;5H=*+$99:",H;5"#9>'-?C>@G7:A9:"6+(9G@2@ AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:12 MD:Z:9C195A28G3^AGAG7T53T27G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2957 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46072 42 88M = 45714 -446 AGCGCGACAAAAATGCCAGAGAANTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGA +0+G8."-8EA$G/GCH"?($1-)+C6-.:8!=0+4F8=F,A$*@A23''?0<*)G6,FA8G,H5%" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C64 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r2958 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4185 42 64M = 4185 0 CGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGA /3+=7)99$G2%@CC+,(D'>C>5:!7!-D,BC=)50/D.44>;4(C0..0*F/$C*4H="3,B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YT:Z:UP jpayne@0: r2958 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4185 0 * = 4185 0 ANTGNNNNCNCTNGNATGTNNCNCNNTTNANTNNNCTCGNNTGCNNCNNGNNTCCTANNNCGNCNANGNGNTANNTTTANNTCGTNCNNNN !!#"$"!$#"!"$$""$""!$$"$!"#"""$"!$"!"#$!!"$!!!"!##""!$"!"!"!$"$$##$$!"#$##$"#!##$$$!#"$##!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2959 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46790 40 72M = 46892 179 NNNTNTNTANAAANTGACNCAANNCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTAT %%!"%#('*('*)")!%!#*'%!!+)#%'#!("%$&("+'&+!(&%%$'%#%%&)%&(!++*&'##'((%&% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0G0T0A1G1G2G3A1T1A0A3A0C48 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r2959 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46892 40 77M = 46790 -179 CGGATTAACTATGNCCACAGCCCTGACGGTGAACTTCTCTGNGGGAGTGTCCGGGAATCCTTAAAACGATGCACACA 543.='5>"#C'+-9.=39FBG/48G-5D$C1(=&,40$87?$7.E<(.046@2D-;"#+?(!#G=87;;'3FB;=% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13T15G11C16A0A17 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2960 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12404 42 149M = 12668 317 NGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAANGTGCAGCCACGCAGANCNTTGATNGTATTGCACAGCATATGGCGGCGATGCTGA #B/A."D:9/9<6:A1?F'11&766.-(F#58*HC@%);'CC$B+39&:H885<.?3/)39>C#!*C0F)0BF=<115F'6C%99%A:A0AA@C.D9E31"G>7),:9??8'?#A>/)36>#8?4)@$D9@!2$?./A/->=*D=,7'6.EC7BH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2961 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45967 42 139M = 46106 243 TGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTACATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGANAACTGAAGCTGGC /!BG78F+(!)A/F,=C5AC#;,-=--7(,E9H*4<<;B.??$>@2CC,;?*8@-2G%@/%!@",(@AB.73"?$#-GD/+H#C4B1%9=%<+0FBD,1E2&14H/.:=/6'"H+;+C;8@HG7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T40 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18296 42 59M = 18398 221 NGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACA "6D0$0GGHH+=6%,4-C04+:6D;49.'=F8.+2CDDC,#,F60-!F0,H@*45+5B> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18398 42 119M = 18296 -221 GTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCN &E&9$'H'C8.#E%!=$)$1.A)82HCF+=2=37+@3,34ECGD<0:E1:F%B/;"=BC07A6,F.D,-(0-&;!@;**&"H4'A?3B"43C%" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23864 42 45M = 23732 -177 ATTTGAGCAAGTGCGANAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTT ,GD#E-GC,$'/*GG;%.&@402/!7$01;*=(+0<5-B$;BG;% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T28 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23732 42 59M = 23864 177 TATACCCACGGTCATATCCTATNATATGGTTTTTGTTTTTTTGAATAANAAATGTTACT $&'#*#%)!$&*'+*()&+!$%()'%&((!$!%(#+%")"'("#$*#*"((!)%#(*+& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6A1A0T12A2C22T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2965 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41323 42 95M = 41467 339 AAAGTATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATAGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTG F.8(DF"=E%@G1/E;D<#/H<3@;+G'1F+$!?57*%DGD=/)GBB*G:H1$'?=:"*7H)153:*9@A!DD2A4"@0)F6$8?6(/95,=<<. AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G43G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2965 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41467 42 195M = 41323 -339 GCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACNATTCGATTTNCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATAGTCTGCATTAAAAAATC ,7C1>@3@9-A.,.):(H**?/%:2;<5,:6.908)7HG1!(E%%1-#-5(8@<&("$=:824)C<'"?C;%/#E"6E-78(B4<41B6BG&@E551=E:A!>EE5C/1(?$()A5:,HC:BHB10"E%=*,>?(,C$D?70FE7F'238*<;8BB>?>C*31'=)4EHHG"H.!2=".30C9((0@H3G?<.'B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:137C9G30T16 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2966 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13518 42 121M = 13328 -311 GGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGNCGGTCACCTGGCAGGGGCGACANTATCAGCCGTAGCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGN +4F7DBH4E@021A&DC=("#1#(/*%%F386;7%72!)9'9:A073'<%?/);.='$'#+,=14/C(:6:+A54AB/++$8FE$;B'=0%E(##+&045#43C;*/>/600.44C6.A,! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:52C22G11T32C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r2966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13328 42 190M = 13518 311 TATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTNGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTNGAACAGGTGGTGAACNGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCNTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGA 5007/#',9(FCC!'9D(B5,?65//%8FD5H@,1=7.60!@A@,A&(/)%.#C8+=5H8DA/=+B686+#"1'(!+B0D.695BD85H7.AHE?C33B);890*"/2!GH50C0,9C665<3E*/AF"96.+'%-/2?A(*"-AG294&DB-:B1%1$8*,FA0:F2@81+3&"?$697&)3"=DD6/* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:43C39T15T61G28 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2967 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1640 42 166M = 1806 381 NNATTTNGGGGAACAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCG "!!*)!"&%!&*#$$+%*)!'**#$(&+("*!!#)'&$'#(*!$#"+(*++*&+%*&#(*'$')+("*&*%'(##%$#'+$+&%!"+$!*(!!!%'+"($+%(&+#"(*#*+(!)#$')#)%!!'"$!$(%#''$%)+%!)+'*+&)"$!(*&$''!$))#%%%#& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0G0T0C0A1C0C2T3G150G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2967 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1806 42 215M = 1640 -381 GAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGNTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGANGAACAGAC A=F'#0<-,E;;E2>1H?AD0-(2>*);8E1E';2!*A3&=A1,,9@!+9D;E:30*5,@H;G:@<9@9/D0%CA91C%A0>5,,%!-AD492,6/@@F78EF2D.HF++,20>FH;8#?(E)#"D.#4>-/01)C3H7>AG0.&H$/A)+#1(*+G680&/.HD&@9D:4F,@5'#86%/@G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:154G51T8 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r2968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16149 42 195M = 15988 -356 GGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGTTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCT 2B)8B3*4(?)A2?CAG/"7B+:F,&29:@#-3*C$,*29>,/@3B$>B/*=F2%47D3G=)@#,!-(66*(?0*C>!96&A>"%)*>,0(/#FHB1.2GB-%-<0,-E;6@(A<)>(/-F/?5FDB@,#3=$-*).B=?.:=-?;@66B##!,EC0+"E0;=F,2:53G*6#'.1&)'%(D"@+*D!%H9268?H#.G0;A;B$7#%386@#0>?AD#&5"0=,(?9:6H=:2":%94574A40!G%/;,A/@=@G5(8AHBD%7-6.7$E<-::(@B0@*1@,7,4F&G#:4#/H0:&!C1&7$$983$>EC8-5#*B?,5636,=F5G68.6)'7#@B8?4@C6.78&,-8A+;!0E9#C,F#2'0&.@6)3;&9(B+H-F';=*2B,=%?/1!<#GB!*< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12C0G29A141G149G11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2970 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10321 42 63M = 10432 215 GGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGA HC15G18E)$=C.3(B"7>9A-A-+2:!5<87#64/G#7HCA2=:CC:?F-D2DH21"->056 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2970 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10432 42 104M = 10321 -215 TGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCAGANGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGCAGGGATCGCAGGAGGAG 2.0"?,09@,*5"$F6>3>A8C!/1069$F,)5(9"B:"E">G6A$8C-C15?29HD"$"!797/5"G"'G(1"@<5%5C-1H06C)0>40&7>(82FBEHB9G?HB24=#;FH1?%+-3'3(H>,2H68<1BG/-?%80>5@@?(4-G<:2C%/C<5!8#;%$(?(GE9##5ED]@GC4G$;?!'91-59>,?"D*3@5 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7C8G38T43C21 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2971 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10669 42 112M = 10817 269 TCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGNAGGATAAAGCCGCCATGTGCATGNTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGC 1;5-HE66:(=G64'"&6%*:5G5#C!0)FA,+/0A?$'HF%"!-==7+DF3+@)6(BCE>'94&D+>GC)+#H7B97@*0((5;0&%#8-==6GA*CH'<3D$A25';=:: AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:62C2T14C1T3C25 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2972 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43938 42 134M = 43857 -215 GCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATNCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGAC +35)%-E-H8F2>C,??#*39?)?@)#E(CCE*&C=G1%5""3!'.68&E>;7@+:6G5&3E;F&(GB*-/+#?2;7/&*'">D';+A5)2(!!$>;%@0%6;6G&-9;$.2<"2.<=?-7.!)>05+A"D$B; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87T46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2972 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43857 42 81M = 43938 215 ACANTGATTCTGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGA (($#')&*$)(+$!*$$"!+'*+&&)(+$'&((+%"'!#"($)+$(*"&&#)!'#$#*&+&$'+"')%%***+"'!!!&#% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T6A70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2973 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28251 42 88M = 28085 -254 TGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGNAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGNNATNCGTCNA &)&%$!#"(#*!!!#%"+$+%%$#'#(!()'()*)))+%&)())*'$"'')))$)+)'+(+%%*$&$!%!)%(#+'&"'$*!(#**#% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:28C48G0T2T4A0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2973 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28085 42 62M = 28251 254 ANGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAACATGCA $'!+'"+!**"(+(++&+*%*(#)$$!#$$&+%+($*$!!#&(%&"&)+*))*%&&!#&($( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A54T5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2974 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28112 42 137M = 28372 358 TTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTAATTTCGCATAAATCACCAACTC 0'49(G$?.C*''6<-9!@:5*!=)<7F$D67:/'5"25D9+2)(F+9)B.=6?,(/8E4#E)1.11&FBCF%..')#ED$1$H"6B#."%$4A2:!"H!38%"A44-=0E?BD3F<=?""8,,BCA>(01D?4B3591<;9??D2G"G!)F!)/9HEG*7E2)0%1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T36C27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2975 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44310 42 49M = 44310 0 AGGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAG +38%'H=//!B)%-F-:91<.D%C><69#C3(G2>1/F>=#.FH4!&7- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A47 YT:Z:UP jpayne@0: r2975 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44310 0 * = 44310 0 NGGAATTACATCANAANNNATNGNGNNNNGTNCNTNGANTNNCNTNNNCTCNATCCTCTNCANATGNCNNNATCCNGTGNGTACNCCGNNCNTNTNNNAGAGNNNATTAGAGANNNNCTGGANCTNCGCNTNGGGNAANGTGNANGGNCTGCNAANGNNCNNNAGNNGNGNTTCAGANTGGNNANCTNNAGNTGNGNNCGNNNANTGNNCGAA "#""#"""!""$"#$#!#"$"""!#""$$"#$##$!$"!#"$!!#!$"$###"""!$!#"$!"$"#"!$!"$$$#!$$!"!$$#$$"$!"$$#!!"!!!$!!"!$$""$"!#"$$"!"#$$"#$"!"#$"!$$#$"#$#"#"$#"$"""$##$$!#$"$!"##!"#$$$#!!$$#""""$##!$#$#!###$$$$$!#""!#$$!$$!!!"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2976 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31691 42 215M = 31629 -277 CGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGAGAATTTAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTGGGANATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCNGGGTTTCGN +&%+&#"!(*&$!+)&"%!(!+))++'*%$'")'*%'#&"#()+#)'*')'%$&##%)$)##&($*$+*%++!!&$*!#*'()(!)$$"$%($'!"&()'#%#&"'!!+(&##($*""))(&*%%'&%+%'(*#')$$+#"&!'&+#&+$#&&%($'")&%&%($#%+$*$$"*!)+($&'#)&+%%$#$#($#)!(*+'"%)"*##!+%**))* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:55T5C107A3C31G6T1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2976 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31629 42 45M = 31691 277 ACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTNGCCGTCACTGCATAAACCAN :51-2,B::*$6%FB!A88@07)D@5.2%6E,"1545&6.?!;?G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T19T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r2977 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2540 42 103M = 2746 260 TGCNCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAANAGGATGGTGCAGCAGCCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGAC ?,/0G$&FGC$&"/&,H/8'1H7$GE?$&:8?5-E7#@05H"<5!6GD1-!!8@5+5=:@G0EEF%>9E*.-*?6F00'ACB) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G21G14A62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2977 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2746 42 54M = 2540 -260 TTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCAT %+8+77B05=)(DH-5;).'>H##3B*0E-=C,GD=3B7=/D>H0>C(<<":A* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2978 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44570 42 49M = 44353 -266 TCGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTG 8F)&D-*,.H$#9)8.#>$*38"-6@H54)+GG+0(=647;#%83-;%> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2978 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44353 42 52M = 44570 266 AGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAA E&;4!*,$*1(B1*D@+?#G!B!)D='(G0F)G7+'2#&C2,28B=?!"H-% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2979 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 321 42 56M = 321 0 CCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTG 03B"++7D9"97;#+F(?60>26A>&'5B7661>FA)1@".H!17-:$).)E-13, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YT:Z:UP jpayne@0: r2979 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 321 0 * = 321 0 NANTACGANGNNGNTNGANAGNNCNNCNNGNNGTNNGNANCNNNNCACNNGNGGNANTGNNCNCC $##$#$$"!!!"$!!$#$"$"$!$##"#$"!##""!"!###$!"#"##!#"###$"!$$$$#!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2980 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25103 42 44M = 24891 -256 GTNATCGTNATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGAT C74:H%A47=.HE5?":%;%/(D2>0,/C8&6'(?#D!1GAC'B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C5A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2980 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24891 42 60M = 25103 256 TTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTC *7!'8G=H(D@$,6&&C&;&!/H)>2:#=*+;6:98@>.<1-"+CH?@(<#=@:"!/6<' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2981 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1943 42 101M = 1662 -382 ATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGNAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCA G9$/(!?/!@F9">':8&5#*=::61/+%,,#E))55=C():%,'G+$%.459(;<92/1./AB"66*AA,F-:%H'266"5/"1,@#7H<&>2#8-=!C) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G78 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2981 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1662 42 281M = 1943 382 CCACCTGACAGTNTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTNGNAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATNGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGNCTCCCAGCTGGACCGCTNCGAAATGCGCGT 2);)5:A(*01C3B,G(3/*7>#E;%>9&E5B'DD5#58*#6#>,?$5>0/15."3)92%G'@?25-@B.>69%67$0=0B("/!<-##6:95?6<411-@006H4$F#E>E:"E"A8D$=@/"0B?+)912/2%5*,7'9=:>,+%<<=;$'3%-A1;72,A+(#G71$/-+-$-0/<+1@)69E.C?$$8DA,B0!)=<5"%,&$*AF<";D:"-795(24GB('0)3,=),30323?+-<;)CC-0C6%9-$$>2*8H$:F!@82:*),%&/:E%G=' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:12G103C1T23G39G67A17A12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2982 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38906 24 48M = 36683 -2271 AACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCA *G'19D&(F04"F5.22C5!<#5@H6@"9D>+$DG5F<)'GC0,#G;; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-36 YT:Z:DP jpayne@0: r2982 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36683 24 95M7D12M = 38906 2271 GTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCNACTGCTTGATGACATTCCTTTCCCGATTATAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAAC 5=1E'4!*#?8GC<#5B;"G.1D!>D8?5$:D29*=83@67G@4+-7B-B>#G84"';;!B#*G="DEE<%>$C$#5A0%G732-<'(A,3D0?1''1$ AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:47C7A21A17^ATGTGGT12 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r2983 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28061 42 79M = 27896 -244 AGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCA A?H079)4:38*&-4)">4-/FH:3EC.%2/"$7F0+9.03A$F:H@*(C9+":F:C!G;-&H<.=&&H=&D$*D35'18B>'813DED'0)9?'9/+:"?,87/D'$?;GFD:&:(&',D52;%H*A4-'486(#81G=G'FC0!3'G/5<@,?0<6!>2@/A(HG*6?,!8(>>=('4%;,!72<&A&>9' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G19G94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2984 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3059 42 50M = 3109 487 AGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGC .GA-D-&&+-%2,ECGCG/B(5$2"+/=1F4A'*$7=A%8C7*#;11,!6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r2984 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3109 42 437M = 3059 -487 CCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGNGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCTTTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTNAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGNCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGNCATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTT "!/<(:6)>)>/;0B)-)>.8+'3+6G4A-"?7%-8A/.)>+!>'H90&5!94$'?-2,:H)<:15-C'1!**@)+=F+;&5=CBC6(,#$1:%'#H:+7:G4!@@25"?@(6A9DF-=CBG!8-E?5,;/B+8,6C/#;(=6$,E8)&*;&H8.,?+91'14E##?8<#(+,:-/C5+/A?D$.9/C7(AG0B)A:G.4G);0@?"0%H&!>4:1,($G34,%A;)%05D,:!5"-1,7A6B,3-@%5?;A0>H<2D0F"B02&"G9AGC$9G#E2=21&A9507/.!820!/EB;9(>1#&+AE30@+3#?D?$//A;/B,%#+8!<.-G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:26G75A71G67C55C85A52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2985 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3253 42 132M = 2992 -393 GAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACC +'"%**((*#'*#!!%(&#$('%*')$$$)!#+%#%!(+'%"+$!")%'"$#!("&+$#"&)!#''''$%!')#$$)%!)"+$++&&$+"(''((!")%%&"!'')"%!++*+#"(#(++&!#"%$)'#)$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98C33 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r2985 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2992 42 261M = 3253 393 TTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAANCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGAGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGG @7;6$/+?%(:)=D*+)<.,-3?>E45/8'-*.0'0G321FA4:3C.G)*DD"!/?+%D=7@/",+E$1?;GE4;-!,5H%"G)2%:(CA.<9)%/HG#%?H!-4?D%,+#93B+G%D+F.>B/(54=E+?!G"28HF?%=,<0'F<-)B-&7G/8+$4G4*0A07H@G$H34E7+<.+:4C('*,,)03#+.&= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:153G77C29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2986 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26945 42 147M = 26813 -279 CCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAANTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTAGCCGGCAACACNGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAAC )+#("&!!+#+$%*%%'""(*%'#*#+&*"()""*#%($'%(!"&*%&!!!($*&+!%(%+%(!)$"&'!!*!%!&$)#*)$#*+%*&$'%++#(#!'*'(&*&#%&+)#($*#"#$%'($&)&"&)"*##"**%'%*#%'&'!$'+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:43T25T1G9A65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2986 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26813 42 132M = 26945 279 ACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCG 5+$%#A",&+2!?.$=+!;E>?1H!=.9<8C,?C4H)!$(06@9@0C+',3-62AC.#1E'""D0#CC6"3-?.($;?*3/4C+<26082'$4D224.6&-#.%8@:!)##)'+4<>.'%C,='?A,E?A=$#(;AE+@'0HC-C-)<0',8-9H,;C#.7@*8"5#@7(.,87A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2989 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35110 42 55M = 35179 202 CTGTAACATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCT -F7EF7104;:%#;>=@!(5&1026C5/.=-<:+G!5'%%@=$G/AF3;4$%3$6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C32C16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r2989 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35179 42 133M = 35110 -202 GCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCCTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTGNNNTT '*&)(%&)&'*++%$"$'$"'"'+)''**"'(!&%*!()+&&#')!*$!'$!"&((*#&'#&##"(%#$&!*$+""'#"#&*(#%**)+$&$")#!)!&"+&"+(&"+*&!!!%)*++&$*"!)!!+'#!!(' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:43G83T0C0C0A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r2990 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22188 42 56M = 22015 -229 GGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCG ,B?#>-9.#,=-!)FA*9-.0<1)D-:.-@:6GC)H-B.7;?.0>+C*7EG5H'(0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2990 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22015 42 48M = 22188 229 TATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCA 9>D6!$9530:/>?*>=4,6%&CB;=66&*#6';70A.H-&"!D>H:9B=4/G06GG.1!159F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r2991 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15906 42 95M = 16132 286 AGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAANGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAANCACCTCGCAGTATCTGGCCT B;FD.-820@)DG>?DG'C<4735F#;@(+$*.?$-+=59:B91#7?H&)=>'E323/BB2A#D&A54=%/C40BH$,;+7&<$B%0#6:"2<:51@AD6;F&.?=!.4<%C78;:%&2)D%"FH>>%?HD0'F9E05)?32778D3% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r2992 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22908 42 96M1D22M = 23112 270 ATTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTTTCAGCTGCATAACGCNAAAAATATATTTATCTGCTT +!((&#$+&+)$&%&*$&!'#%*$%+)#"*&+(!"%&("&#('#'"#"&$(%)%&'+#'!!$'#!+('&!'*(&&*%!"#'&(%+)'&&(!%'$"*'$*#$%(+()$!!+"#)$'+%& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0T80G14^C1A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2993 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36849 42 336M = 37185 411 ACCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAAAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCNTAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTGTGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGC #.0"#)(GED@EC17*=*'4!8:E(:G!,)!:=*:F7!8=1%<4#:C5&F7+:.A<8D.626%:81H@(B$3GBD=2.&B,H69$@*);76-')!)(=.)*246-@?G(9G*5C?%4$.$"BFG/$!>&%6,87:+!4$2."=/$4-"F>3+;9$=G8??*9#FG2+5$@=.+FDC2@%3/(##.G==/6)8EFG.2.H88$D)&+F3.1H25@C.3>7(G2-3/"8.!,.5,1,(*3C;7%,.D;+3/@8.=GH'#7H?+DF!19? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C53G193A39A47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2993 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37185 42 75M = 36849 -411 TCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGC @(73B&C855@@D0?"+B909#(,$D.%D>!*);F#;3%A/%7&D>B5GA>*E@3"%5/.C70*#;:2H%DD:A4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G51 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r2994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31042 42 69M = 31259 278 AGNATNATNTNCNGNTTNNGTGAAAGGGATGCGGCTANCGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGT (#"($&*("($'"!"(*!*$+!()%'**$&+*(&$$%))&$)*+%!%)#&&$&!!%#$%$('!!&$"'% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1C0C2C2T1C1A1C2T0T18A31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r2994 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31259 42 61M = 31042 -278 AACAGAAAGGCCGGGAAATACCCNGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCG 13F.HFB;=.GH89#$;H(74,/D'C,8=54,(>!/*%@C(G"/84#,&;#%/;4?7##&!G=>D78=5F>@'+%A:)D,+7B08B1"4A')>)55!32C@&1>,FD%,=B8@+B1*F-!)+")$/!81/:@&11@B8&8!#0GE-E8)-"H0#;"8+D;0>+*A8:! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23T64G3A28G69 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r2997 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47029 42 129M = 47029 0 CGGACNTTATGATNTAGCGTGAAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATNAATTATCANAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTC )'($((+!%&***)*+%""#('$&'$(!)*%%&#%#)!&%$#!"(+('$%#$$&)!+#'+%)$#&%&'+*&#$#+(%%+"()!(()$#)"&*'"(')$&&(&*$#'""(!(%"$'#''+*)+'$&%!$) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5G7T7G43G8A54 YT:Z:UP jpayne@0: r2997 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47029 0 * = 47029 0 NTCNANANCNGAATNCNNNANCAANCGCGNTNGANCNCNANNNGNGNNTAGNCATTNANGNANCCNNCACANTNACCNTTGTANNCNTCANGNNCCCNNAGGATATNATNNANANGTCNTNNNTGNNNNNNNGNN !#$"$$"#!!$#!#""$"#"!!!$!$$##!$#"!#$!"##"$"!""!"#!!$#$$"#$!$!"#"!!"!#!#!#"!#!""$#$!"!#"$#!!#$!"!!#""#!!#!"!$$"""#$""!$!$!#$$$#!"#!!##$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r2998 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18000 42 424M = 17919 -505 GGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGNCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCGAACTGACCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGANCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGNAACCAGATATTCATGAACGANCTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCNCCCACCATTATCAGCGGCGGCAATCNTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTC )21(G*?H6/7;$/DH",,$(-03"%:;<:)8+$3E037A#!=1?'52;7@'?+@8/3CD=H:'H"@1F1H/;A%CHE7GC#);*3>F>:CA6"?EH&;5:9+BE3D40C&5CFA&5803??1%2$@EH(E(",&5:CFH!3B?A)*>2)HC0@B3?/#G:H*AADG5;7=,@&"+,06:"A77#D+/">G09&A;D@=?E430F@%G":>=%1-%30?H%-.CBC>:E!!!8)=F98F>:"+$<3%8-BF9@-F1C>:9ECGG(9DH!<0;$.?6>%3+3$,?0EGC>4*2>:.FA),/+>C#=64"E>H%>%1<4F4?E=8!C$;/F*A11-7=3@=5 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:98T76A6G39C41C20C0G22C10C14C88 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r2998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17919 42 81M = 18000 505 NNGNGNGCAGGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCT ""'&#!#"!#%+&''"'"(!+$)&("")$#)%%+""**%%"$!)!%$%$+%+)$''*$(*#&$*+%+!&#(('*)&%+!#% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T0C1G1C1A0G0C71 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r2999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41404 42 209M = 41628 274 AGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCANAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAATCNTTCGATT -,)C@&;.8"7-6#!3"3"$(B3'GB,'*.D*6%/8%+2A@$#;G!:3&'@(1G?!4:G/D-;%F8'=C*=>F#%#A&"33:$-2!A4<:E9@*0BE"4)F=;9&(B)F61A,<8'/6D8EAF>127EE"D:>88269D;BB.356,7G!F+!'E*8C,#/>HH;/D!*"/>'1+BC@."3!041@@A%;$,<92&%--G-),>-,)C4 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C94G103C1A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r2999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41628 42 50M = 41404 -274 ATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGA H,'"2DDDB@'?"@$#&G>9CB$B4A*=48F()9"4D!,'9$"B=)A1+C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3000 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34398 42 75M = 34647 302 CCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAAC ,*!!28*)HB+EG"HC'><8AH7%23@%13>6)%87%9!04/@BG$9?%1>D;CD2'2:'%"'A&A"A=8$<@D8H3%B3;19#*'A=F9H<4&8)..CE./1EFDB;(,;&H-7&52$'!-3 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:50C17T6T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3002 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31872 42 139M = 32011 217 TCTCACNCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGNCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAG ##((%&!*+$&+*&+"*#+'%)')%(&!#$%&$&+"*"")*'*+&&&&*($!'$!*"'"!*!#$('+++++&))'!*("&+*$$%*""($&%(%+""+#+()!+'#*(!#'!+*)&(+(#%$$%#+%"$&')'")+(*& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G3G0G66C65 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3003 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5039 42 43M = 4825 -257 GAAATCANGCTGATTTACAGCNGCAGCCATAAGGTGGATGGTN ''%")!$(*"$+&%')**$(!++)&(%)!"%)(&#$*##(+!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7C13G19C0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3003 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4825 42 45M = 5039 257 GGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGNTGACATCATCGCCCGTGTGCG .H.&>.'CDG#%0-)6)++>15#>/H9"0<;-;5-H57E&&=;0B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24976 42 147M = 24879 -244 ATGGAACTAAANTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAANCAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAG ,.$<9;E=<&F=A'9<%>)-1H@&2!CC*$'!#4=D+.D37)'A/71G?(D"A+$%':/;>3C'<4>+*G;3=7=(9#8;9A9BE0,@/'(,%,CE8E>98-$)>/VE?<.B+0(#<29?&+4<9=H0:>E)281'.E!185&' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T107A27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24879 42 97M = 24976 244 AAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTNGGTGTACCTCATCTTCTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACG 7?B16.H).!4&>$G;@%2(,(3,=HD3B$:$&3B$#B#!8HF=06'/.F.B!E8F&4HC$>&EE'G8.@8F5@;97BB"9:+-,A9)+401>*$=4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T14A45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7829 42 83M = 7912 572 GGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGT ()A/H>465$#B5!//)08'@DD/1H,+%C?#;:808306@/6G0<.554%'CF5E<7*&6B!"H%&#F+=E62@:(:'%GB@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G14 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7912 42 388M1I101M = 7829 -572 TGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGGGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGCCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTNCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTNGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGA ."FC4;8,H/;)5@@?C;2?!?;F3C4)&-"%-214!?*FD:C%A&&01C4F>>?CEG7G)&@.!&HEG)+-)7$()8CD+GH,H'$/BH/).6:2*-634.9C*4>0.--<9#F)$.,7->?"8>G)>D=+2#&G3=*)&:3>H04EGG0B99&$#8+FC/=?!C-H!$7$E18B+9"=GB-6C$&7:*5$65+=?$.!2299G@.00+6+8*192C8/,H,GB5#E5?;9FG+!B2&%A:4;D9$:D4+A"B:-/1DAE1#F&6!&7/$$:?A5%3A4B&==HD)91G?7HE@H.D@EFE+!@+*()?;;197FEF(<-$;/G6C6B,/7#E%)BF-+1=&B"=+%G934;=D0-66'6.33#D33?*%*48DDBB4DC%#-0$G3,"3*->+$D"&""H%45C0- AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:84A103T115G157G26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3006 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 861 42 184M = 1100 280 AGGGAAACACTGNCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCG 'B<$?CB9;<-;$4@(?@*G(*!13E?+G("/$<2@D6%=)/6:=!7#'E#0+B(C*8'G*A"!A;(0:A7>2B..?>A$%97"HAF3F@D159,.#?+E=B6>/;C9*21??:B0()=?(2FD4$;;0GDA%6+:&-)D6@!-/=65&5';",)FHF+07>%+1)2<'.$2+616B7(5;*A@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T11C171 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3006 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1100 42 41M = 861 -280 GGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAACAAGCACCGGGATAACA 4#04>*;>H-;D$&4;63.+/2C140>@+8/+E5;2"?*,6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3007 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8244 42 56M1I223M = 8107 -416 GTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACNAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTG ),41%+?G/,0//=<$;3(BG1.FC#"B8*2*?4.38E?/'A-/286?!%/;/+3*HH&$95.9(/48%8A;)(FC9>#-#-'(A:,:A*;H5=8?'2=@;!)<'0++)ED1:>@5;.2<0(=3C='7)2C;6-?.#0491:$7?62$&4$>,&AG*E?B'6BE#'<*%D3?35*6+/+/D7C@))99G>D+*G>*,#HB4('9'>A5>157&BCE1&5+)HGH*52A(DF+.+?>;.H.H0C06B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:223A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3007 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8107 42 137M = 8244 416 TTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCNGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGG 7=*#+?6.6@4C+)F,)=E;5!4?B,CBC0C080(*FEAH05%<+6+(!:3G*$/4(G443<,CC>6+,!/D*D('&>!HG?:3'E+9$D=,'8CB'6+:G#F0G+0)'%(.386,)&;$10D'#;5.:%@<#,29# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C61 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7786 42 73M = 7575 -284 GAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACNA /CDD4>.'C*D(<097;#;>0.#8>C*?C)*'057+6?()#(*#B1E@1";9A=5B$HH)-4$6A4#-#H,*" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3008 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7575 42 134M = 7786 284 GGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTG #4,9/6%.'&03$"7.E@A1.!2+5!=1*1HC<#1C'E%:-1'@G-6%G=.4*$/*>%!C:<#80"$=8)=$$:"/5E0)6H(,ED@=(&3+3<=481FC@B1=?*!=7/:62(.-"&(FC2D3;>7)>96%#1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A133 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3009 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26742 42 71M = 27019 323 GTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTA E@296E8@=!)'FA=A8=:H!5#;/?B4*"68&(7E<>?$;"*>;58-5#%(B"F."HB)4H@E;;F'DGG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3009 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27019 42 46M = 26742 -323 GCAACACAGGATNTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACNTNT #'#$+*%+*("***$$%&#("'#(%*'+$&("!**))#%!"+"))* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C29G1T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3010 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30355 42 49M = 30404 236 TCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACC 3:A!A2*20:#A:)68(-H3)<=B)?<<)*.'*6!3>)F$A-/;H,6H" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3010 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30404 42 161M2D24M = 30355 -236 NCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGNACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTNTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGAT @.?1'8FDH50D%G+#,%3991;H-;@,@,#GCB-+@-,@5:4G3&EDG9,'=>%;E:!G@C(76C%#1%9F'4&)@8(D#/)-1"1H1411F&=E/;;2'&=6#*91&!7!'25./-497.C+6??<)H,$7"28<"#=<$B4F'@>>:%"D97G+!@5C!B>0?:9,H;*F3G=A?($,%48@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G73 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3011 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8404 42 72M = 8167 -309 ACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAANATTTTG $!&"($#*!$$(')#("'!("%*$$+%$+$(%!!+!+#+&+!&")#%+"*$'*&*)$!*%!'$&+"#)##!$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65A2A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3012 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27089 42 125M = 26837 -377 AANTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTNTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTNTTAATGCATAT A,;E%5"B6E=F@4%7",!D>"2+$*$$?=!;6<+=12./>%6#.4?+;ED?G&+-.E00-'/00>),!B450A!<49<163#<;B+4"F5'>>*(9B12-5?(+&&E?6:D8(#+E)#8AF#;@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C24T85A11 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3012 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26837 42 252M = 27089 377 CCATGNTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATANCCGTCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTNTTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTG 6GB3#>3E%5+'7-'>8>GE5&*-)32C$,6H5C<8&)84)8HD96,5=H'7)",8=4F@+F"(30.8'A4'@%).H",?%4&3;9."3A.$#8"3+!A$1%!%;3+!!,+4(8#/599EE!"2&04AD1+2)H+$59AG/8,H+$@G)#";F6=(F5(;BGH8%#&= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5C98C3C46A96 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3013 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28823 42 94M = 28755 -162 GTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAATTCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCNCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGG 9$-6"##2:>3A'50<(E0(9"!1<>=A6(5B*@2(-GHH#E16B(34HHB%A&E@73'A(.0+G77.7:G*A0":,D?G"##A7G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A41T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3013 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28755 42 42M = 28823 162 ATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTT :-,A%#)%*E@3;,C<;*,/;0D"'=E*:%5B'HB8):#69: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3014 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8629 42 41M = 8420 -250 TCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTG 9@/D(>F..(<'A4C#;/*C64&1(?H??:=?)2)4E$BH2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3014 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8420 42 172M = 8629 250 TGTGGTGAANATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCAC H;HH$19G9%4F)1'28H*D2)=&C&=-C76--)7B*(@&=').5D"-/-<<"@/?/$D&&(<>A%!9CD21B&/94%3-90D7:B+8*9<3*B*'/8=@9A&@#.E<C.6,;"$%3-,G<;%0C@H(+C*G01?:0&C$>';*)12!+E2"+5-' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9A162 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3015 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21028 42 52M = 21080 111 CATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACGCTGACGGCG E*(+1'2HAD0"H),;'#A,00H=5,$:%A3EC8G%A<$85@97. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3015 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21080 42 59M = 21028 -111 CNGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGC 4.ACHF/3/@D65C91$-@9F/9=90"B)':0298!*,8&=F:GC=)'216+4D;>)D21D17F(.E@(.F'!,B%2"/8D62G76>FD:&2H-@"->!,!?2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3017 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39969 42 139M4D20M = 40132 507 GTTTACGAGTATTGCCGGACGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATNCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCC ,'687*0(,":1"E>8<2&?D?/44/D1:-4B5,?A6=1,H0H9(&+52?&(9>5/)F6!=E)'H?469*"4,CD"E"+=$=/H3H$;,:-8##0B'%/,)38B$/"G8-,9'!C2E@-<<-58:HB8+4:(=$&@<3D%#=32&C<"<;42F21"%G% AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:19A94G24^GTAA20 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r3017 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40132 42 344M = 39969 -507 ATATGACTGCGAGAANTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTCCCTCTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGGGGCAATTATTCATTACCTGGGCACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCTCAACAGTAACCATCATAAATCAGGCCGCGGCTAAATTGGCACGGGCAGNTCTTCTGNTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATNACCGGCTTGCTACCAGGGAAGANC "%1+-(6.;,E%F3H+(<>;851&*B>>(.0$)$!(F5.@C/$"90=),,E'B9/.A8D7B*BG24>@5-6*B28##-H),703F<3,$/(B@0<4AA@7G'H;<%F99GEA!E4H21*"9'$EE42*9C7FH?-G7<9)E8>H//6C3?19?48#,>,8C7%7@'*61.<"%),5H#!4A!A72.=%*+$/:5!--'7+%-$-1-HD;*:9<4&-4"@=H.1';A**:)C.;'D3#3+A,2&5A23G6"/*:$0--1=5::&508B+-9F*7*3"/@$)6+/DG-23))EE),"!@3B(@EC7.*4F.!>8:*A2.!@@B6D0:#E:-;D!D*63<+0 AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:15T39T3G101A21G45G12G22A12G7G32T5T16A1 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r3018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42073 42 60M = 41915 -218 CAGGAAAAGGGGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACANAATCTGCGAAA E+35-2FG@*&''7@@71+8'>%>7&=4G#3B/*64=0(G@1+<$):3GG!?7A+8%9(5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A37T11 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41915 42 53M = 42073 218 NGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGNGATGTTATCTA $2E;7C*:"7<,=?'&.%!06&1-8;E>0CH3*;<.=G3"<8$""5A8=*H=< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G40C9G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3019 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22925 42 79M1D50M = 22878 -177 TTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATNTCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTATGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATNAANTN "*"))()%$+#('#'"%+'(!('&!($!'(*+%"'!*&(!%''#)*#$'"$*)"&$$%'%($!%+&($"*('#*(')&*+!#$"'##+!$#)*!'$'%+"(!)$)"!)#$("%&%#+$''&"!$!+&)" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:26A35C16^C44T2A1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3019 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22878 42 47M = 22925 177 TTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGC (679+>7A!.7&,90$8!'??.0)/&94'?E%,*2.<(6A)-F:B.# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3020 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40061 42 47M4D47M = 40233 259 GTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTG 9"9CH25!)C"!.-*#!8<&=?BE>&><'C*31?>@:@(<'-DHCF?64601(8C($'&=HE4!G!$?@:C;%''<@/?G!> AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:47^GTAA47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3020 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40233 42 87M = 40061 -259 AAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTCCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGC )#C*866;-=C0.?5'#87C.?#-:=>3?!,F,GA";(/:HCH<&'D5CD$,HF7A!H="(,= AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0A3G0G53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3021 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40320 40 101M = 40623 363 NTAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTNGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAANGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTT &+*%&")*#()&")&'('+"!%$#&+)%%)%#)!)#*'"++#*"(#""*)&**'(''%)#"*&&""("**''#&)$)"#!#)#%*)$+(!%$#(!#**%*" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A24T52T22 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3022 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4491 42 40M = 4676 271 CCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCT G$$:(F(B?"1E;4,H41E:"C76%D;/6:68073A=/?5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3022 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4676 42 86M = 4491 -271 GTGTCCGGCACGCTTGTCAGCCGGNCGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCN ?>0$6E6DA&1HH:>>524-?(AHB8>6);2>!=!05?2E5E<6*&%1<@*2B77-(GCG>!A0.C>3:7FH!6D8GC65/<@?6/"#/6)/>F,32A!#-75,A;;8#$A.):A'6.*)-.=D9." AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3023 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21118 42 162M = 21280 256 TTTTGCGGAAAATNATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCANGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCC >G.B;?6!+&=(9257E9!C'G81+"8"@&33*)*5C88*&B=6,6,EH7!.&*-C)>;(1B/360AB14.CB./B+#11,%=D6723>*FF..2#=C+B9'*)H1".4(A47!(!)2/CAE) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G113G34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3024 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34236 42 243M = 34479 323 NGCNTNGCTTGANTTGGCCGCACCATTGATTGTTANTNCGAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTNGGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTAC $('&'!)&&*$(!))!&((!'$(&*')"()(*)($!$!&"&%')!+)&()'+((&*%)#((++!(!!&+#!'&%")+)&'&+"("&)##'%"*&!)$(%$'()(&$++'*'"%%)#)''"%&*"!$$)'*()((!$('"$)'&#(#$()&'("#("(%$$"'&)'$)%'+&&$'%&"#'!**'"%**'+($&&"*#!$$""%*#'#!+)('&$+'*"(%+*#"$&%)$'('(+#**))(%!"* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0T2A1C6A3T2A11T3T0C0A0A0T45G0A47A108 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3024 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34479 42 80M = 34236 -323 AGTTTGANGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGNTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCAAGTA ')$%#&"%!+!+"$$'&'%)&&&"#+!(&)+('!&$**&$)&*(!')(+"%#+!($&')((%)"&!")#%%(+++!*+%( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T40T27T3 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r3025 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20219 42 108M = 20112 -215 AGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCNGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGC 7$.=FD!*G.E+=BDCC05$GA4(<7#/>"C>4?";+%"2=*+/"&;GD)%(.7C1<%F';B"7&:?5)!4'-4C;!76,7/D50A(?CAD4"B$3-*A&F44!1++#>1?B.-52?<.-*A87ED"C2G,%59$%.B*"66(A7/16(#6!"3-.54G,F#,<34">C/A9.8<>&H<564:&2*;C;-.B2$')G3$B.)&G9EA"1&F!*.=FF/D"39&-F+<+=*,=%*;2>$768 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A60C5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3027 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17948 42 68M = 17860 -156 TGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTN D*;/!@?>0:B1$A0;G,*?1#D.''&&>?:,+B.2.3?.">/;#DG30:)#?9!&4+D%?(GH#*9$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3027 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17860 42 88M = 17948 156 TACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACC 7+<9D("9-92A.!,*$"+!+GH*C1!=ED@A-0+7G!E)#C962?4.C)="B#22;AG!8*?A'B5%G.C3(,&B@F>'(6@GA"%>(7H1(<1>6;,>?+%.(H0$":"D:%%.9&>=@F6HE/?3&?7%3DF8-345,E=F9CGH3C*#E8/5#=."2"/<+1/4D$4'(;;>DB2D?>2555@;0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3029 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41198 42 178M = 41125 -251 GAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGATTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAA #>(/*;0C40G9%3..1"+!"9#!''@5-4C0%3G/AC(((<$AC@"@:)?@F188;B'/GGH"<=6@1EAA+#*+04BG*8?DD>$6=3%4?:+,35$"#1F2&!%9:>BC)693:6C%D3<'$=8/8E3H*+8,%821A0>=%A"B$EB;%,HF++-5>)=(/@92H*<-G;A:(= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90C87 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3029 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41125 42 51M = 41198 251 TNTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGAAGTGCATAC ("&+*!%!*&)')+'"#'%+&!*%$($*()%!!*)%))+#&'%&""&+()( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T40C6T0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3030 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39962 42 92M = 40165 246 TGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTA 3)9--7B(A4HB3$G>@6-03H3A0?E#5H'59>E.!8910#8H>>+8=3.%$3?8A==.-$&0@?+)7E@<4@5C="-.)/%)?42;;AG6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3030 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40165 42 43M = 39962 -246 TCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACC (292090A&?3!-@,C5/"..6#@%G>FG6A/99EF57:B6#86%&+DCA1BBF/4#$"=7G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37773 42 45M = 38020 293 ATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCC ..!4-1.131,B+A=2F/$@C2"927))7?)>'2'")/75(/C?2'03#D:EF!3-8"2"A@3324##6H6H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3033 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31966 42 55M = 31792 -229 ATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCAATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCC E@:0%,EA@=H382/D,AE>#D.%5<4;%+1=F(<'G%@,F1(50)G3=4;>466 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3034 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36604 42 56M = 36377 -283 TCAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTACNGNCN #"%(!$($$+"&##'")%)*$($"'##)"&)!#($&*%*%(%&))&+++($"#$$" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T47T1G1C1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3034 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36377 42 68M = 36604 283 GACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCNG )2+0H(,8983B26&4,$4!<280&0064*7:;8E95;.&C2<%<<-=.15.$,*;0-;54;8')171)-+/):@(! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3035 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18500 42 51M = 18267 -284 AGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGG <@H;@/1'>@6HGBD0!E&24%)5;.?,.,7->1-F9C4#:9F.#'2-$,% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3036 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48232 42 129M = 48033 -328 TTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGCTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTT C"H5.-@28:#(?C.)#2<#!&5>&%,3FB"E$5(6!=9(=B%+>8?@C(F@7BADGG8A";$72CA!<$034B<>+!7H2GD=@;1; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58T70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3036 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48033 42 60M = 48232 328 ACTCAATTACTGCAATGNCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTNGGAGG @(##%2C'/4>C0@',-A4>*!,62+7<#F?"? AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:34C3^GTAA0G27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3037 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39777 42 293M = 40070 363 ATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCANGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGACTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAA >*@C7/:!).40*=,$.C&&F#,>>G9=1D>$8B3='$'B@0-%(:(+?A%&4$)($(;&4"/(16#FC/9=D?(C*5A$*E41928"/2/GF68(2);,*.0"69)08'!<)1#*F'5G"1!!.=$C1.8#FH,*A?'!A@4?.(,BF.3?-89D.6%0B1C3H*>%'+(2@");CG*&7/C88;F@<1BF1-5>9'"-'6B8@%05<264<'*D;)7A.9B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46C190T55 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3038 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43457 42 134M = 43363 -228 AATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTATAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCNNATNAGCTTC #")"'!)$))$'"*%#&++!)+$(!&*&+%#)'*(!#(&*$%$%$!**&+%%'&**+'$#!"+"")&!!((&'*)$(*")$*))#+'*$*"))'*!((+&)"'%))&"*!%%*"#!)!)+*('$&")'*$'(*& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:71T51A0G2G1A4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3038 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43363 42 89M = 43457 228 TGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGANCGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGNACGTGGAAACCAT -HA=&?<&AE!-=5@'51*=%4&F)86/.2#6E8++%<2FFC?>6?0'A5A.0D0-+)!4$"?9&HGD&:7%5&8A4-#7!A%E@"*<6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A44T13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3039 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20148 42 61M = 19962 -247 CAGGAAGCNTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAANTN *#%*!!(%&"!)+&&$$("!$#$+*!""&('((""#"""+$'*'+%%%##+!&)"*++'*( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G49G1G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3039 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19962 42 124M = 20148 247 CCTNNCGCTCNNATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGA %"&!!$)"!*"$*++"!*%+""*#$!&+'!##')%!)$%&*!'(#!"*"%''#()+'*'!"!$($)')!*+('$%"%*(+!+(%*)(#!'(&&*#%(*(%&%)+"(&$+!$($$'(&#($)*") AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G1C0T0T1A0A1T0G112 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3040 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5848 42 136M = 5848 0 AATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCNCCACCGACGGTGCAGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGC ,38HH1,6+H/:+3?<-73@B916+C&-2#7(H2!47.")>2#??&'#$$14?#C-+'471>!>((?+=;(+%F/*E$:*=-B7@%*.)A(H,%D79<#%734-#)D!">*B!E='35)'-)6<6@>37E2H9C(-B%;+$B; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:158 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3041 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47562 42 87M = 47649 245 AGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGNAGGGAAATACAACCGACAGATGTAT 54!0+%,D4.=$!.0!=60,81$(0G?7!*0G!C,+7:62)",,,5$/+@,#1)9%"H;D)H75%H"!H79<$8'4'%6$?%;$$H04<-5(/+%/#6AEE<+C++7865+*+'?>/3.?4=E68BC=$G(@H7"1,(2.BD>8H31?-7($G>641/86-<2"4(6,)%2.%56#/!9.%$;B:46,7/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:180G20T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3042 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48089 42 46M = 48135 276 GAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTNCNTCACTTNTAATTGATG ++#<2.F%.&-@2$1!8:?923(%0F,B22!*&=25)994+)5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3043 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48382 42 65M = 38732 -9715 TACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATAT (EF0')-A-13E'1''$1E<:917+B6$.;F/2)6+;6H&!>,F:"+5$2?@3BHB8-?6618/# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3044 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40897 42 276M1D157M = 41331 597 TTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGGCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGANCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGTGAAGTTGTGAAGCTCTGGGATATACNGCTCACCGTATTGCAGGTTGNTATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATA @D"?&>F5BF&=974!().--0%C*;"%%=F#@&<=B&B?:;6<+:683@59C0>1H6*294-(#0?*>B285'?4-@9?.D#119%8;/E+)2$DBB67*@D>0@D%6(&77>'"0HA8C*C-%>FD'718@(D78#;+B:,+%-.86>?EH;FD.(?1G.$#8-"A) AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:44T34G196^T53G12T12C20A56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3044 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41331 42 163M = 40897 -597 TTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCNGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGG HGC$"@='-1*9?B?7A+;.@*A#:59A+"H728"7+5?;8077;==8%E;8:#--D9H2(!0*!B/.!?*6!9-H899-B&EH(D33%7,A:#6B/;H=<(!$*-D!(>;.*0H;"3.%:DA@4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T82 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3045 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40076 40 32M4D75M = 40203 207 GGCCAATGCNCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGTGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACT BHB$)(A5@:AH-8=2G6C%"<$?.,/7005#*!81E.$@0F4?")A>3+';-"8F+>C23$C6B-#+>@2:='.$0@@E&DH5,:!HD'+"F!!7<-4,=C7D>,D AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:9G22^GTAA31A43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3045 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40203 40 80M = 40076 -207 AGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGCTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATG =(<;(1.@,E9."6=3H2336E,$'EF.2(8/B;29C=8:9#<&17+?;<8),C7BB@0#";A,D00GA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T25 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3046 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25253 42 98M = 25438 284 CNTTAATATTCTATATTGTTGTTNTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGNGTAATGAAATTATNTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCAGT !")++)&'&"#(#"!'"#(+#*+&''')#%"(%!'##$'*('&$&!)#($#!$&!"!!('*'*$%!!))$*$"*&(*"+*"*)##(('&+)#&(%"'& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0C21C24A13T33T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3046 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25438 42 99M = 25253 -284 TAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTNTCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAANGGACTGCGATAATAAGTGGTG -;3+(&7%8DF!C"B(4##!1->@";;C*C2=$-%)!628A5";.57 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A51C21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3047 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30768 42 77M2D72M = 31041 323 TTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATNTCAGAATTAGCCTGACGGACAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCT #H#5B1$C(@$30?0?@-.1:'%1%)$+"/2-HG4))@/F$3%)9<27D6':#C"35:88-=+/C3A/C9); AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:0G76^GG25T18G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3047 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31041 42 50M = 30768 -323 CACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATT *$+GD@E/&#!BAF);+/H5<;&:#+)(97-7=&9#72A*.*&'A!/35@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3048 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23490 42 107M1I47M = 23665 321 TCTNNCAGTCAAATATGNAGGNAGAGTCTTTNGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATNCCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTNTGCCTCGCTATACATTTCT ))##&#%'&!')%")$*!**)#*'*&(%$'(#+("'"**$$)(!(%&%*)+*')+)'(%*%$#%"#(*%%(*")&$$$)(+"+%#$)#)#&$+!*$&(%%%%&!#'&!&&!#"$"%*+&"&'&&$$)$*$"!%%#$'#)#($'+($(&*!()$$) AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:14 MD:Z:1G0A0T0T4T7A3T1A0T0T5T25A76T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3048 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23665 42 146M = 23490 -321 GTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAN ;%&'@4D:@2E"'-=6";B+>!G4.+E>4:,E;#D&!F(!2A&3.67*4&2?"C+.7#%@24<775"0B'6.E0#=1?-G?1,/H,E?A&37:F3>:E:'H37.2;H)D.!F?)&'FH!80=D9')BD&.3*-/B6!F(C62<:>$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:145A0 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r3049 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23526 40 71M1I8M = 23699 264 NNGTCTGACTAACTTATTTATTCCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATANACTCAATGTCATTGTCTTGCAATGTAA %1H<5<<0(6H:D!?FGH>*">%$=@B#)7C(#5G276+"%&3E>&5./,7H$+EDE=+508CC=5+:#.0'F1$",G,@ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:0A0A13T5A30A13T12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3049 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23699 40 91M = 23526 -264 GATCATTTTTCCATTTTTCAATAACGTTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAAGCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTAN '@;ED)92C%24'#,@GC?F&;+;=$9'>76.+:9-73<>"42F3*C:>;665#5BF$;)F2")2"/>*:<;CD+!%%0,9+H04:04(;! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25A31T32C0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r3050 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9025 42 65M = 9025 0 GGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTG E,7)&0)4,1!8,G(#$%?4((3HFGGE8H2'):)&D:/3D8%897GC%6G#1>*%3-G:A-:;. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T63 YT:Z:UP jpayne@0: r3050 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9025 0 * = 9025 0 CTTCCNTCCCCGTNACCNCCNNTCCNNTANTNCTGACCCCGNNCCGAAATCCATCNACCGTGCCGTTCGGGAAGCGG )'&""")!%(&*$#**$&$(##!)&"!(*("$*#$''"(($!)*()%%&%"%!)%'+$)!!)%%%$+$'*"('*)+! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3051 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37065 42 96M = 37161 451 TCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTC =B+&-$+A.)''2G5C>+*76%G"E(45=)+D@%?D"::09!B2BC261;.7D1/")(HF)<2@>3AF48::6F.'$5;%G"6*D+HH2>-B,$7= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3051 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37161 42 323M1D31M = 37065 -451 CCCTAATTCGATGTAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTANTGGTTGTAAAAACACNTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAG 4&.4D6(1F5<3E477.H#;=H4#/!=5!-*E;G%@*2:%*73;$,0F01E?0B;>F*3+GA%:6*HE8$%@6E#5*A>-H>8GFC3DA+0.*"-H6G&(%'!))(A+?'$)@350#2?D0'#H&9-)5,9!,&BG)=@::$529403FE'7'H)D)**1'E6*A=?2B.,9"CD"3%C;;@$#,"(444$@=5-%F06(5!7A5997@F8-8"80G@0C*6'/*E)?24>A*%1@<:$3=$5;4*83&)%%;A&*)*;?#/+@C2>..#A>;'BD:$@EE;7/G:421>&4?G&,!D&*C.+"BAE?65!1*H'*57,#5=8B,8:BG&4(20.44//&4E.25B290)7:5$?@FD694>B2+7,@0?3,72.F+$,"H/-;;7")5%B%8<71#2:05,9!;53+-8:C(%,=:C#6HC9!=%05!,9BC6;0?)=,B"F;EFF:C#$734-1;()C9=.@*B<'! AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:11^TTA39G21T9G53C11T21C10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3052 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14150 40 78M = 13966 -262 AGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTCCGGNTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAN 1E@BFH>!$0*3B,H/+GE65,"??3;(?387+!>:/%/5(+0$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G3C28G0 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r3053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48274 42 68M = 48445 216 TNGTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGNCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGT *"(F,4/,1!A,0<8'GB$BCA+3=3E!!+"(==@AF?"-82.=;284;3@";3459.F/70@$8.@=C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3054 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12566 42 159M = 12725 389 GAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGNTGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATNGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCNTCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGC 6C==4,#@8.&@C'!@8B/G+$B(;:-E.@37AD'BH-8.%H!"*15FGF.206"GA5AB2(*5%F3$H:"2$A.8%3<=C2(73@3!>5.4*HG@@C8+GC<@8+8A(B>,D>32&>-7':!A;*7)"<@@#7?,-3D#1;2(/1"(,GHC6-$!E410@"HC0-B/@1,B0#*,1)'#(B8%G(/.AGG@*DG<"9@)H18-CB.<>?'5&CEHB1"%'44@C34 AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:11A58C19^CACG54^TA80 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3055 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11844 42 45M = 11889 266 NATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGANGCG %<%+$,3$')56>C,2325!?G!3@1GCH>#F&!!-:H#1*CE51 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G40A3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3055 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11889 42 221M = 11844 -266 ACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGNAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCNCCGGGATTTGTGGAAGGCNGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGGGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGC ?F?;8.42C)(5G7(6>75:#?<#F(>E;=312"/&EG7A*'2+C(C&(DG/<6AB5,*E4)8H79GF0$)G4;G'8#+8%E-H&7?/CC(:=$19:(;7,+:&?549:D#B>#H'<*<'(&640*<*#6CD1E2G;BF7F6A,6?8.FA.?8H*:?-)21"1D7%F;(836%H+D,%'?9&(@74@(=C%=GH=1A'(D.E4D*F>DC=@+>"A54E9*G AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:124C23G18G28C24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3056 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3067 42 41M = 2791 -317 CAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCGGGCTCAGTCATCG )B4%8%B,<->+$,E&8EF#D"("7;G9?*B8C)E!H,<2' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3056 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2791 42 126M = 3067 317 GNCCGGCATGACANAGCGANGCAGGGGACNTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGNCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGN '#+"$*#()#)+&%&!&$++#')(%#((&&%"!(+**%&!)*%+')+")(+*$!+*(&#$&(%*'#)'!'((%$"**$('"&')+#'&&'(!((#*$(+""(*)$#!%()##$++('("$)$"&'+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A11C5C9C47G47T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3057 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14014 42 43M = 13835 -222 CCAACGTCCGATNTCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGA ):-*$9154--073*%(B&%39+-!"H"&%?8:3/4C4E:(!> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3057 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13835 42 100M = 14014 222 GCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCT AGCFA;$85;;E),-)A#2D>/%;>3"H>57@+*7E44%0#>A1(A$F10A"6H40?D%:H8*&G:*.H2&1&1+?@07H527673&"CBF:A?:(<;=H;+>9GA&3.8%A>7A'#1'B@01:#$;*!'=11>9HH195,E>94F27A9CH)%3BG13:<9)=.4FC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3060 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8297 42 54M = 8143 -208 GGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTAT ,-@EDD0EC76+*A,;+B%)6B:4>-;96$>7D4%2G1=:$$.&5'0,0E8><% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A1G51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3061 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 580 42 241M2I14M = 835 341 CGGGNTCCCCCTGTCGGTGNAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGATACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATCTATCGAACAGTCAGGTTNACAGGCTGCGGCATTTTANCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACNGCCGTTGAATGGGNGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGA #;0&'G8(76=(*/2H/(!+@"-:F5-*<#/%.5>.*-7F#&!59-45,*"!8H5EC0#9E;%$E(H<$858:(53!"'!9,&0BB,9B@:.#$9F'C4DHE9-?)09#0AE0B4C"G&3(A&G=!,3/-*,5:1("<&*C5.EFC=52:%*$%!(#&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r3062 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31292 42 111M = 31173 -230 TGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTNAGCCAGTGCCTCGTCCATT @D4?@H+=; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3063 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28860 42 240M = 28725 -375 TCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACA 0-1D"?-:2<>+45/,'*5:/:9?/76?:#$;1,56H$F(",*":0G=8.(<2B;3!5>+FA?C<,30&0>(+"(5+$<3A:92"5087;B2'"D?,&G!#4B1!"FD4-40D&.;/8;$4')@/AH""6>$:#-;9D9/@*.@0"26(#&.)5%"=1/6$-*ED-H?D?&>8<1@-"&B!>=B"G>3'G3,F"@H&232)?BD$48/+3A0$B550;#>'DBD+"=6!3"H80< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:240 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3063 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28725 42 135M = 28860 375 ATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGC 49*0@911<+@%+%9&C9,?7/F5&1?.+9"FA09$';),1A-;D==G$>)@'$H7@>G3$!3C%(,H9%A.."6/E8;2B9@7,+&;H*2&5G4>):2:EC$!:1'$7!#/"@E1#=)B&%,.@#9$*A*GG#< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4501 42 67M = 4301 -267 GGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTNCNGCNNC $''!+%)#$$%&$"#$)$"(+'#&%#'&*$&)'))&+!'!(&'(&'(#('%"!$"&)&+&'$%&#!( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59C1G2G0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4301 42 74M = 4501 267 TTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCA >!!""?B6%("%1%C(+'D#$8D!>)4H5+#@>087C:13((?!46A9C69?%;FA*"F36,%$+$=+'&@!'1;:043B2EH9,2;.'E66B& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3066 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11361 42 180M = 11560 246 GAGGCCGCAANGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGTCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCANGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAG FAGD75A;8$?6*3/4B01G57$:'+5(49'/28/9?D?!,72DF74H=8A;*(?4/8D(/$>-8?0G&D'B1/#=,ACCGBC8/1<-@=8E$(HB570$?97*%DHDA+=%4+"@#7518D?B;0#5+9A*H9"/#G1($%-B:.7.>2/C.?7#5A;3#3*7F)B787:6D=@DH16/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C61G73G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3067 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34199 42 107M = 34065 -241 GGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATT C#0>8B1$$62="581F33#:;06D.(7!+(&9.11$?@>4GG#9->+EC&'@4*)'3,4G6F-?+C08'=@3A9(C%?!B'>E0&!EC>%;32E6#B?9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3067 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34065 42 110M = 34199 241 CTGCCAAAAATAAAGGCCACTATCCGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCT $/,1.C/=5(!6=!!@#)02&E1)=+;/)=+!1DD)CD*,$A%)%4>D>'-?7FB#97%='@0'>?4B,C,&-.+=*?0E=!$!9'FE/G-E?0@%%%8,4*7400E&(, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A23A85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3068 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35797 42 137M = 35663 -271 GCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTTTTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAANGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCTCTT H7:097C@,':G8E(GGG01"$26#FD-5.>/$B.83<@//7$B3);G),A&A+@240G*-CD4%<3(5,&1<6+1E!A>0D,$?H:&--DH$2@@:+4/D3'?G,-:+E/B:49,CH%01+)#2D/%B5@7-:,;; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30A57C44G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3068 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35663 42 47M = 35797 271 TTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGA -E-4/12G-B:;BE$!5G,G1<+01E$%A;41-A)?!/5/5H@AFB- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3069 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31231 42 61M = 31344 225 ACCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTT #?#5D5!"C0GE+60-81&F;6*=82,D!&)A6"9'C>97D/<18F*-<-)C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3069 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31344 42 112M = 31231 -225 TGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACNCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATC !5+14&,6&2@;H?%5,A0:,(B(*2.0B'+$(?,"4H@@B,?G0$&DH0:>*1HE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71T40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3070 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30111 42 59M = 30170 508 CTTACTCCCATCCGAGATAACANCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATT *B=5>;@">"'4:%+";CE3@&!DEDH"+CG)F203(F7:F)?8>E/:H?$'0$FC:H66F8BC)?D3/(8-.5;%+,::6/3:!*4-#%B&;>6B8G$;()5%($A5F+G'(!;C$HEFG/*16&CH!/@1%F,C&2E27:;&&-16#)/&16A+)310F%=);D#@?,.44'<;,8#B-+G1#C!B0+*?>4,@("4;,B,+15.C$#"$C0-B4C.F-;8=;-.?E%+(G;F@A?91?A-CF'//$2A*=?/B98E7F)(+#B<$C'282-2-D(.-=5C%0D=GFC?'6FHE!E3F>-'#4@E2@&6+G4G1*%$'CA/39-%D/H;-7C8+8FB*07A3F(B#/=0G1B$;H8C"2',*='%$5@/7?5G5/'&6GEB24(FH('EC:@)8 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:87T15C91C75C99G3G19^TG42G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 261 42 232M = 96 -397 AACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAANTTGAGAACGAAAAGCTGTGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAA ,3!5;">4@43)6->!$@B/:0=(0$3=83A.@1/-B=.H&1B<"<2"H9<':2&<<<*.07E2=05HG$1E/59/'B,A;'>(-.E9=!5&/%*36B%*B;#?;BE=C*B4//63*.&8!'A0>.<9,)$@!#):1A&F:08);2?*%>F""*H'/HA(,$!"4477A1%").&CD"A><'9$8!)C%@H<9B2E:7C!>%0G,;9!CF$F')$4,1GDBC;1<27/"53* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:98A17C25G89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3071 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 96 42 165M = 261 397 ATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGG '"H-"5<%D)G.$+E#6<<%"+)<@.4E44='3A*9@8*;>&96<0?10>=BF7;77??H;!/B8E7B'B%!<$2'H<9A33AF$H8?&?7:5&/*<-4#@6;**(ADDE*#?..(.&6+4AG"30;G#EC<)!BG2$77"1#"83)"?*@)D6+BH>6''$BF>;0@F;C!(G'+,5"(0F78"4!"DG./.,D;?9,8>;6++9?/#,-772/F="=6235FHD$F%@+>EDF, YT:Z:UP jpayne@0: r3073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39281 40 43M = 39324 247 AGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAG %E&&0C&6+=723D:-A!:2%-)(%.*+84764261E=>C:/$B%/B&H6H>D2'5;!6BG+6D?;H@5*""E@)8@3A41B3.DC=1@3-2/<=>,)<$?$'$!99D-)8;F$@B/>")4:@9/;?&6B?%>FB%+/=.G427*+;/!4%55A.+A$=E#(&7(3A!<'A7EHDG5E9EAHDBGA1.<@;"?*##)*;"8EB@'9)',!););":$()6D8"8?0+ AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:5C20A24T100A6C1A6A0A4C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3074 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9045 42 52M = 9257 301 CTTTNAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGCTAAAGACCTGACGCCCG (*&(!+)+*'!(!!")$*$#'$$!'!'+#%)%#%%&&#"&$&$*"(%%#*(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C29T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3074 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9257 42 89M = 9045 -301 TGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGNGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGG ;$;B4*2D=*>A*B!+6!=/"8820<@3D6,$B0@H.47AFHC0F2.F896F$$,*7/?:-;&D?F9A09E5)+26%77B'=)*90 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3075 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45065 42 104M = 45169 519 TGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTNGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCC :A3HE-(5=-/H$6C$5G#*',*E*>+D#*B8#/E)@:/'&.9+@)E&/:5,;A/#*0D39.6"%5D0/>B-58*,&=)%F7&=,8$=)7$"?##'?C$(%+/- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3075 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45169 42 415M = 45065 -519 CTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCNGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGNCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTNGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCNACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCANAAATC 68..(!12C?$5.&?.1!=76*1/5A/1)G?F8>>>29(0>$;$!*1?C3"F,$G*:C3"AC%<,1(2*.)&A,A:1:5&5-<"4=>)+F9/DB5B=),.F/)/!8.="1$F-=C9DGD';$A<+&(B>!-=FAC)4$3B7;D/>$A8F+%G!A92E2+?<6A:C/&8B95(7<:7?GB%&B#%4:$97<F#:6$&7;%9H:29'6>;1.=E'"A.C,=17/DG7<!.-4';'H=@'+-6<>&'4+DAB/8:=G/61+)81/-H'@FF064$@H@<>@&!C,(<6&>40:C*0>##.B+%)72DA6*)(#*FE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:61G118C101C60A65G5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3076 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30311 42 78M = 30081 -308 GGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATNT C(E&HA.8&$6<#9D->0:AE5G!2-&>,>389$'B=#@;&!6CE-0+%5:/G5<978H")$@5'<:97EDF*)14') AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3076 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30081 42 44M = 30311 308 GACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCG =@%FBEHED-&@G;')#9D(H7%0D@%71<,6D) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3077 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24309 42 282M = 24591 369 GTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAA 95D(8H&2>*96@;7?@33:3=D3-#:B9<+3E>6%C:.)*0*4,>'FA;56(F'="6'D5B@74*,CF4=F(*2.%(=GF%:82>".6)5A#4H6G'DB!6D'-+.2G:.4$0F(BCE3+GAB=!G<+:B9//>%&5:%9!:;%:!:;B5,3>&=:B9FE.3(.G5(68,?7:*/?"<<)": AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C102 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3079 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27884 42 69M = 28026 286 ATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCG F7-5+0&0.3C"?=**C31GGCDH@F%FF.>1);&.)"2)3(%,*/,2/G.)>6?E&7!0,+:3@A1&-HF:H"6$.8EH3,4/=:A4'5:1?8H+;+:F@-A<+.AD+'E8-".GB,>9>)A&8,E?'G9FF(#,,A; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3080 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26800 40 111M = 26631 -280 AAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAA >5"@#';'F0:;8+4939#F>E'B,%-'5F=2.2>,<>19EC*1-7=-7#93%3(*=5>.C.?(G6:-04H/@683/D3H9%0<:&A;FE@%827F&"==%1(2H,)8360 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r3080 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26631 40 56M13I113M = 26800 280 CTACTAAATCCTGAATAGNTTTAAGAAGGTTATGTTTAANACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGNGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTAC ,3(."2D(D$H9/@D'/G<($=;F'7F6!B)!7@>$F6+"&',!E=9;:1-H/97G!!9<4<&&??H:FF9$%C@5-BAB$E$D3=,,<83D0$39DC06+:@);"*"0AF(D6G<'?*,!1$;&!64A/!'**A1@!F9.-C5('A&>5,9AH)%&!$D2- AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:16 MD:Z:18C20A104T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3081 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20575 42 69M = 20703 243 CATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGNGGTATCNGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAG :F1"-"!.94&#!.+;H<6-D%C=7F86,D-./>2*/:E&&F>/-4=!"HB$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C6A28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3081 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20703 42 115M = 20575 -243 GCGCTTGAGGATGCGGACCCAACGAGAAAGGNGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATG 'G*G&#%!"(8(D7>*50%%:30HD';,4$/6/*H:DFH?5.1+:E:$(@($7?+/6:8:H<,*E1A.:F9: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A12G83 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3082 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10757 42 95M = 10852 213 GCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCT 7&6**0E!$1%!E7&A-H+)1'6*2:((8?!0C)CD:=B#%C"'))*'@?('9",H8F<@+71$<=%0#G.0'6-)(=,$"*)"3*A16"3?=H6B2&5D"H3%+6"78GG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3083 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48187 42 116M = 47859 -444 GGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCNCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGCTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACN G$,DH(G:%'$5F=(2"@7<@G!E+57C2A$5+3?C->'H!9,4FG#3E4)H&@1?9:%E';:>=;G$;'B6D(%F4D3&+"3"-4"?H*?A@B.(;2,/C>8*C:2+8A%H2*E(G,?9'H;=8%8852@C>26*%:054978>,)"!B82<57@(C/E@44<9@1B6;7<&62BAE04G0!D0><;@!GF5!!87D>?F25$7G/9+,GDB2((,&3>;=/-#:??7>,@1&)-?D AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:34G21A143T39C17C29T39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3084 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2896 42 58M = 2769 -185 TATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACC 09'!*2=@3C5>,9156533-B7-/;&B%*(5H$=!F0?#/8.3616:-?9GDA?51G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3084 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2769 42 90M = 2896 185 ATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGTGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCNTTCCCAC 4$D47A9*(?7!:;'>$-=2-G(@5+*>4%&*$=E*)F6B7C!<>E!3F;8'&)&((+H+2@*0>*/<,FF+5H2279>E,D1>1C?,#@0E&E=/2-&/,GCG@B<6!H36H.)$"994H?%011DEF1=5@D$15//!<9$-,'0F?AAE:B<8B;8<-G3G)@4@%*2>0#C@/:"&+,*..2C!'>'F"(078-"3B,#9:''4/.6?F!0C2)'6/<$?#030&%=4A>/$72 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C9G15C11A123 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3085 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10631 42 74M = 10440 -265 TTCTGGTACGGAAAGTGATGCNAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTNAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTG -F:;>'5)0A/.(9(>++6D@-D&@!4A'-<HHE!G@*2"(*G6+7AH(2?.)=;1'77B47,E.4"A063>!,1:%-(/9,,7G@.2+*B610.2G53+C/+"!%G=*%(&('>BH;CG+9+73.G0+C.H).3D%2?%@)76,&,)1,92/AD5@;;'(-,/6!&3"&+F"").265F-B*7G/3?D;,&0?! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57C27G27T32 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3087 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43080 42 44M = 43152 213 NCNCATACGGANATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGT %(#)+(*"(%("'($&"'%+)*))!'($%+$)%!#+%%*)!($* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A0G8A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3087 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43152 42 141M = 43080 -213 ATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTNAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGA %=%:5<32*>;-/0B/D"C?=<0==D1.89>H,@40(#?;:914.G,8&B1C*=>.7,%2C;A,,=4)0?FE;)&%7<68B?)<@"9.6%+F&;EE>1BG>8HHB/2$86BC?/BFC!D.-#FE=)(=9%" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3088 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24958 42 50M = 24783 -225 TATTGNAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAAT -49%%)$?4/2.47;*@*./,FGF:C)*7;D(-!"=67.&>"#;BG;=)H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C44 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3088 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24783 42 21M1I25M = 24958 225 TTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCANTCAACATAAAAACTGA *E8$-2.1*C4FA2."HC!-D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G44 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3090 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38147 42 91M = 38359 260 CAGGCCGNAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGC ?;8:&.6:,;4%0#:+=9#9"/;%C*#E..;'7($.6)%264>2D*2""";0,.4D.-F73/GEB:5=#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A29 YT:Z:UP jpayne@0: r3092 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8043 0 * = 8043 0 CNNANNNCCTNCGCNNGCATNCNGCCACCCANCTNCCANGCNNGC "#&"'"$%&%!('$!'()*!&#%&#&#$*!$$(*$"*(!$("%)" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3093 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5869 42 101M = 5644 -326 CACCTCCAGNCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATNCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGT =9AH0=#"B8E-0%&64-F5'E-5FG>F9217:G:?:9@/C!;+%>!.F08;6:/#H%)0A/;:8E3F4/&;A"C,7%D3<4,3$*%B<.7A3-D:,.A>%/,C5:F5(=;H3%-.%;-#E"/)/-&:&=;AD#2242$(!#'/9?DF.'=/8A=<&91-.>,".901*C;/0.*$FFE,5GAA%2(1*E',$<- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17A107C11C18G21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30447 42 118M2D56M = 30623 745 CAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGNTCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTNATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTA BF893<">7?67,&G2D<5->=<$'H0D.4358>5E+.<,D62);)+..!+12E79/D''"4.2A#&))?=E>C.3.F9A&*7#A"7274=HEH"E>7F',9C($C'92($G:;C#;=AC9)'<78FB&1863/,*@!D-#5!@0G,B:.;6F16+/4$3+4@=G5CF8B4.%+-:1!3D=&.2354=A9,6=,14"#F14#)3)44-F3C.>E.F4?C7A):#;A7,&>*5@D!>53-D7B43C1B=0++A$%-/E5B5#!6?9)=*2%..'C@$E.11<5;;%-;?-/F>B7< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3096 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44254 42 98M = 44377 274 NACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGC %=5E2H3)00C#)H37:)?>?/D408H39)&-*"5.%%/*B67-#6?/(2$<7(>#F(A;=$>)>6-477C?9:2A#>/)A(7.71 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3097 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42960 42 133M = 43184 276 ACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAANCTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAA 1$"G!*,:5BF-&3:>B$%$!E-+)7?255%/0,:4F6<5(*>B'#F=//#G%;/C,G6B)E1<2A-3?3?B;7,8C=3@DDG0+DC$#G$25A#4A):GG2A2EFG98;2E2%8>%4:$9@E3?'D7/ED:! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3097 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43184 42 52M = 42960 -276 AACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTAC &29E;!=#7!=7:>4"0@926'4D@-.,@"66@:&;&!H91;F(!>'A=)1& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3098 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17589 42 45M = 17341 -293 AAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCG *+?3?C-1.)8+,B061(C4>?>HD)=D9"(B61H09H7%/E:14 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17341 42 87M = 17589 293 GTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTCCAGAACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGG 1BH-F=E:@46D+!G3+C0(4C'53@29@#00*@"509=0D03!>@#(-;2;$;).G19CGH,B2#@%=&$"0+4H;#G&FBC;'<2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26G3C56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3099 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4170 42 178M = 4066 -282 CGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCACGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGT 1G&5@C)#F2E&)D<+CG1=63,,*A1:@26G0@=4!#C;55(",H@E:8"7GF!4G0%"*#)G,">7!7/7+36E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G126 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3099 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4066 42 87M = 4170 282 ATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGC (35-B0A?3E'82*;H0,D&7#$74&4/4**/,F&,F@D&E&+9,0(F+2+FHG$(F.1+;6,(B;>0&3@#0.C&F>,@@H+#2!F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3100 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11757 42 165M = 11972 348 GAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGNCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGNCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAG 1-G.0)#ED19!1"68.!(HC6/1F,0B-=0#*FDE9$E$?.8*!."4'%<-B)7)1#"=G*F1)@/E4.,75+0=+4B:(?..'"B04E?!,*&(H>H3%3"@A:6,82.)5*109E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C73G56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11972 42 133M = 11757 -348 GCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTG 87&;+,DFAAFA5(9<3C'6H3GA=26@9#!)":7!B%#(%%5?:%?.BC'*7B.4.;<;5=0<9&0H.?&"83G71DH+D4FH?$#9@066%-%C(/5D;%0=(@?A)7%:2;)5.<.:$B;/2##49.<8< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3101 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30705 42 140M2D19M = 30444 -422 TTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTNTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTT "9'E.E/-4+8<7C<'"F-$?89/318FD/0G0F#9H%$>(,+@97:%;-(,#65H@.H>&9&=6,BE016:GD5-)7(AB#FD.!=2D+@H(!B4:++G)HE<%,7?AF7870&F1B/!F>#4*C0"F'A82%%?C*@8=H#)8@&E;3F88>H;D?4<4;$G/69$7#-?=@;%?.1,125H!82C>GE")E*C'8&H!*=E*C&?A@<9-?6-'5D;>&B<""CH=6(=!G-35.;,3#47%*FE4)0+B2DA9,->219*;/!!H$*= AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:121^TG52A4T30T49 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3102 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33440 42 104M = 33245 -299 CCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGNTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGG F9(F/F&A2#;H67.B=4"E$!;&0F)0"'$A/42"05:'+@6@):B@G>5H<38:1#G=+/*#04B!,&@A$D&=#76,=*);*='C*-08!9>=)*(D%013 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3102 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33245 42 69M = 33440 299 TCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCC ,00:*($>>",'<"%%?B%2;1!%)=(B-1$0/909HF',/B.;,CD#"*0*85-@0(#?.-(24G51% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33973 42 169M = 33872 -270 AACAAGTCGGCTCCTNTTTAGTTACGAGCGACATTGNTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTNTTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTNGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTT HE',-,3=F#;8,=6#A+2*/H:HF4D,.%-")9E5/5;.,-4/8!'D<$#*!?2&6#*H':+D<6,4?'30+972A@=@B8"*%A!FH<+8.>)7#!%G8%5B2%C','8E*:F"31!@.G/*C"A#;5F'B2?9&4*."<1#53H7A-.#08.#2=.CH(>+) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15G20C43A47T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33872 42 85M = 33973 270 GTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAA &1'A8F8735%6C*H-=+*3,,%$>?)3)%92#06A@)B;-,76&A/9!>9/CEB0E@3?9*;!)-*"-2466+<1"?:'E;4HD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8831 42 87M = 8686 -232 GCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTANCGGCGCGACGATGANGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGAT :G-&)B.D&*@G-G)&>E%C2?48=='DB+/$9)8(#1D)#B;4#190@3GGGA0BC%,/*35/&@531H??'7G+B"'+&(77*=) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C14T24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3104 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8686 42 55M = 8831 232 CGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACCGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCAT E9&<+D++/:A+%880DC>?8<%C@//!@"6876FDA674?A8;@0<)FB$,7>? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45236 42 59M = 45024 -271 GGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATA 6'9/A<#8(7F<3*%5HD6?-#B'E#&C>4BEF"&2(7(1:;4":?#,*!1HBE7-!69 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45024 42 44M = 45236 271 AGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGC C?/8456$'C'F)&&;=54..1=**!3-"@=33BD1.4-9?C<: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3106 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12473 42 115M = 12317 -271 CACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACNCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGNTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGT >4:!8G/G:8=F*FE6A6)?C%9!),BC73AH@+@5)3%8D,(.078C?C;B+)5!0)6/=6CA=>:3'D.78&)879'05HG:,2E@,>,-4'EG04@=#E,D@<)%*@$)14G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G39C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3106 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12317 42 79M = 12473 271 CACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACC 8AGD)8B(48:'4=@8..?#=75..9(G6F#<#5@A0';A'-92=A(/D'.@7"/222/>14091GDG-F)A7?;"F>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3107 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17573 42 49M = 17426 -196 TGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTC 6/4!D>AH)>!=.5GC*C(77;183G$-)(BC,:9#8.&'2G##.'B=< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3107 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17426 42 46M = 17573 196 GGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCT 3=$?&:)?4.3$#0E&0G&F"!;9;770">=@@2&:'F24%C+@B@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3108 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29423 42 75M = 29304 -194 TACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGAC ;%2ADH@9<=:705/!?;7?D"G/B<;&%=-88):?H9?(;/2?G-?-?')075;240+H!(,9+52,;&>,?H6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29304 42 77M = 29423 194 AAANCNNTNCGTAGCGAGTTCAGATAAAATNAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCA )('$!$%$*)(*$('&(+"#!#&%"''"*)&+(#$#&$&$$#"%!(!'%#)*%*'%""+)"$*'&$$"*))#%"*%) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3A1C0C0G0C21A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3109 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14742 42 186M = 14928 288 AACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGAATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCG E&%=(.9$4B&0B1D":87)EH"9%%2*>%=H!$=:4'01&D&81@);E3=@3D9<6%!C8D'7B;#<"8C:D589@+?=#84@%;C2+:E2D@>!H5:>FF6DFD4D/;+%B:C!0,(:60A04%G5!<;#A?&B:?1>"C?8B$G#3/E%0)"/:89*@,:7*%14-7-H.G18D7*.)%G!*3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78C107 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3109 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14928 42 102M = 14742 -288 TCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGCATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTANCGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGC B1=6$#9F/*6CC0/&H;!D!);G(/%42=(6++4H*2(6?FG+1)18;!HD(2EE'$3-',*CC%#A!8B&.+'09@A&-("@A:.>5!1*@*.<)5>1G1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33G33A34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3110 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 787 42 34M2I122M = 943 308 AGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACNGCCCTTTCAGCNGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTG 591@&52CFC%702*GG>7:7!+&=$,5$0-B625?#=>A%&G=(4!''-/%0+>234>.<=<('9%6*7H4,";!//3,#E%*-A>';0F3777A'3BGAC+&@'?##AA%>=:+$*"D-G<;!2GG5/!-9A&(.3-'-<.2D$6;)2FD/4F12#22#G?5-5:).H&=$%'HC5)2(5AD">--'23)9/=F10=0H"EB,='!5$;HA='3#F@9H@0.!3"%HC9HA+* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27T33G39G34T15 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3111 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35995 0 4M2I44M4I6M3I15M3I6M3I234M = 15761 -20543 CACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCCTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTNCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGAGAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATNACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTNACTTTGCCCACCTGCCTTT 5C.09,/G+.A*:>;59/'0'*DD2:-;@*?F4%&+)$!362.8!#?>!.5&6+0D:+#71<;&:=B;/#.1$%9<;G/;10A=469(4"@&+%'&8.@C.=;!#DC4FC*9AE#H?&??/*@=#-F**?$3%1,:G%#B3"6<84$),;GG6;$1,4@/%!+$/D:DE2;%12G:4);FHH/:#A(5C$.8)#<*=2@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-187 YT:Z:DP jpayne@0: r3112 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15165 42 104M = 15362 280 GGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTTGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGATCTCCCCGTATACAGA 5F=/)FH?H>2!F660DH1&CE*:C0E!>-!%?,34@5'9.4-. AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C36A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3112 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15362 42 83M = 15165 -280 GCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGA %309.GHC@%!0B8@<@(FH01>9;C&&*D:&3*-G'7)G$+A:)46/*7&39'-7-=DG:2!%&+0"A1ECE.'(H:9*"CE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3113 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12486 42 82M = 12304 -264 TCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCNGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGNTGA *#!*!#&("((%(+*!*$!"%%$%(%&+%'*'*)!'*)*#")%(%&#!()*)&%%')!"*"+'+#+"%*$'(&%""!+!!"" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25A52C0A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3113 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12304 42 110M = 12486 264 CAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAANAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAG ?')&@CF),<">.;*+!H84*@&'&/;A9F4%:)44$G26G4)H%);#'5%.=A)6*<:B;D0:H./;:)35#E34*,B?'!/.-3D>&;),+%A5A#(HG7F(+AB!"+'(D<71<# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G32A37C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3114 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37183 42 129M = 37329 233 GCTCAATTGTTATTAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATNGCATGGGATCATTGGGTAC ,(G7H(&',?E*$D55@DB/+?@6!%G.=74A0DG+(9-F))(&HEA@(9E163-8*;$>5164F,-CF+!-..:95./!E1CG+9F?9=B4(5=;2"$516D2@>6A1)H5G5#EG3D;1D/0GEC=:"A<%;@+&<4*!> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3116 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19279 42 104M = 19487 277 CGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGNCAGTACANTGGATTAACGTG %"+1#@-3.&B'3F.F66078@5F.>E:@G+?1C$:=D#C*:5@943E(:-%488AA:)E>&=-(4>$'*>?A1=+/3;8A71E6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:83G7A7C3A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19487 42 69M = 19279 -277 CCGGCAGCGTCNGTCATTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGACAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGA .<$:",$1G2E%>B0-:;1+,#H3"4/'F8+=7);H56H<4($00:HH=-B1<<&,&6).4:=#D#4D! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11C3G27G25 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3117 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4748 24 41M = 4954 251 TTGGCCCGNATGCACNGNGCTGCCANCGATCCNATGGTGGA #%"&#&('!!$*)'#!!!(+*&%#!*"%')"!$*$&"+&(* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A1C5T0C4A0C0A0G7G6G8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3117 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4954 24 45M = 4748 -251 GGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGC >/HH<>*)+A/4:CD7&,51**$@B276)/.C43(F?;"@=?-.D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G21 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47803 42 117M = 47521 -399 TAGCACCATTTCTATGAGTTCCCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAA *E8<&A50"0>)'2E=H)>,766"@7&C6)<9;@D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A69G26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47521 42 282M = 47803 399 CTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGNGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAA B;"(4D2#-$C.F#C"=,%".'H2#8E63GE>H5?-!:-768,B986?3C6&;;<@8D-4/)-!59:=>84/6;A3138@?6("<"2'74=6<3!9HG!(=:*5#G?D>8E'$"**.,B=>"<*%B6E>:(1=@CE,77=%&'G>:%=56>+2)<&1?*2G,.+@94.F+D-9=0(F=@$!F.<>53<82G%D=B.AG8D<68B71(H;&16<8< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50A116A6A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3120 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42735 42 103M = 42911 249 ATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGC ?991G0&%%//?C5!7,%>B08'F%2G@!+'3#'80H2H'.("9B,95(>!8:4DB=(%--,/+:13?FD.=C'8?!00?D)A%:().F!236(/;7%.B,@(55C8!!@<( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3121 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43130 42 141M = 42896 -375 GGTACGGTCAGAAAAAACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGNCAGCAAATACCGAAATATTTA 6,-H;,-/EGA8A>@>D3(HCB%D=>@/>>H$/&43GEG==4!@));)=%D79*-+FH/+,);+$?3H,8>4F$A//0.9@DF+0,5C=)355,)CA!,G2F,C7.3(@;0!<&@+8>=CB&1$8:F;-<;4$+$*(&>3% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T103G20G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3121 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42896 42 234M = 43130 375 GATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGNAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTTGTCGC <$($B(G<1":;'439>FC9@3!;F/A1'60,6'>/7?#5+"4>"6?:%,)B/GBB&;8D,288@,0$+)"60:!>9ECA(G2&?E@/CEE(A8'FC)"<=4089$D2AB"%27+$F#!E"'7#E&(=H9-5+2*544D?.FFH)&4*&&:$$-D-0,+7+!-=60C)BBGD%H8375&A@&=-.0>E>98EG%&)1>,*=0(%E%9C#-<1%:.H7+8'(=..1!@H76#&F+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:132A95A5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3122 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1385 42 42M = 1588 277 TGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTANGCGTTTTCATGTTGC =#H:HE??'*-5,;8G=()51>1>#0!8$(3FC"$6+?02$H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3122 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1588 42 74M = 1385 -277 ATATCCGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCNTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGANTGAG ";C.$&<++<"9@;"-C8H0=&21B4?<,A*28(+5*GE',,)EF*)8E3@$6!H!B1%4B?"G--#"36*D7( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T24G38T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3123 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15680 42 199M = 36065 20478 CNAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCNAACATCGNCCGTCTGCGCTTTNCCTTCGGTGTACAGGCACTNGTGGAAACCAC +.$@5%*D'F$2&0H+42-!66.&:!900G8%!47B**.FH>G%#B:0';@?58F74)G'0"(B0@6@<*;8,,%F+'E!/(;7!<%'!5@2(-G+2!-?C9/,5<)3GCD.-;)D$#,-(73+?$C*E3"+E1E760=/8?H#FBB.AB4(!->:%)B'+8B)1(10E04B!=7E9@*H/"3/3,>-:#98DC%96$% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C143A7A13A19G11 YS:i:-15 YT:Z:DP jpayne@0: r3123 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36065 42 93M = 15680 -20478 GACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCTTATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAG %-61:+'(01:34$*1199:4$*3)+(9)0?A%%!A22GH"30,2;*'"*568+C%4@;()("$/6"F+(.?39DCH25H./D5/")=H%'6$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2T0T0A43A43A0 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r3124 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23326 42 68M = 23113 -281 AANGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCA #(2,'2.6G2C!"CH)7D3"C4HDC:G2!HF2D*AAE;><3B!0#?%7C3!9CE/5"=A/,.$>D(#* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T33T31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3124 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23113 42 105M = 23326 281 NAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTCTCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCA !E#C!!->H5+7>3/>7F%7-9<53$2#<<9251<(:C%=3'@F?D01$/>;ACGF0&=*FE%H0)3'93#A>$D'='(@")+5C?>%6.2%0;+@&/,C<*"4>?8!?870*0--+**B9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3125 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46392 42 240M = 46351 -281 GGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACTCACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTNATAAAACCGNGCAATCCATTTACGANTGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACANTTTGCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGA &G-8D,B/0G,H>#2F/A1,(+4-=F%)!9F9+,!&&>+/'$A+$@.A0@1H@+9D-$+,;@*<8F*$H-6C7)5H9408#@5*B"9.G+@7/@*#0!B-A#('A?C+:D3D.1!@'%%(.+)E46E#B,);10&07!C*.EF'8(C8$3,22&H:46(,+43-$0(/;-:C/5,-D78=%+4BA0C90FD$05ED")F&=743,/*0#A'&4H93*%&!%5!((+'H?.%1B9./17#. AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:83A34A9A15A64G3T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16061 42 166M = 16227 215 CGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCNGGCG ?53)..>:>$)5<0:B/0#!-=':-.%<:2)94.G(*5+3D&#B;):4@E-$A%6HHH5/03):'2&0+.H8/B!'B=1A9;3829/(G6A("+7/CG00F@#DE%1-@;+%2AB0F83;%'9C&::H#?G:++B33?@2B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:161G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16227 42 49M = 16061 -215 TATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGC !2!1@&HDC*<5G(7'7?C!F((%=(3.B#&5((3;::%%6B7@8<8#3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3127 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29041 42 100M = 28960 -181 CGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCA 9%%4%=A?)GE:,5>*B0%8181,BC<>D<4/)70)3*2!AG'3,%*+&14H"2"E9(;8A#+0.*=245-67C-81"$;E7<7-?>B$*BF=5*1*4,/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3127 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28960 42 81M = 29041 181 TCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCANCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGN 0C7'>DC<,)!38;8"?>HD,7,0A2)A93'7(>;"BB,(FDC0$6:#87@$F5".>H0?8,B;B2+)B$! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50T29T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3128 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14655 42 99M = 14902 292 TGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAAC 61;1/<'E:3>+C,/<#0=-*@7$3@+4E*5CC2>#7A@%!1@$4=1)40>)!0)H/'AF(A"<64>E:=?'%F=939H6>:'>C%*,.)3FB=A=G!5>8$;3")<9$#,)E)8&-2D:?6B.85!;$9,2B4&9BA504-#*E?B907EE@5E1>B)B4+(<;;)3;@E2$"&H+%G'74G*%:5%,1.=/,9E+?-*,.%6A:>E%6>=DD@>/+CE-1,A?C*$* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YT:Z:UP jpayne@0: r3130 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25156 0 * = 25156 0 TNGTANNTATANCNAGAAAATGGNCTTTNTNCACCTGATGA &!#))'")(*"#(!%%#%&$'((!*')%$&)!(%(()+*'' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3131 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30871 42 122M = 30993 269 TTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGC *985-$A:"=/3:2%:'B*/C0(=1A"+$H656HCG18%=C8&.D!>(#>G9-*=;H5/F%@.4%9(AD>03'',E/0F303-)E>A"3,(0HF"D149',9*0?$HD1FA;4AA82243%9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3131 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30993 42 147M = 30871 -269 ATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTNAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTNATTCCAATTTGAGC DAG6,>H96F"%E;=434&EF"+*!>520,&E%!6.5'@A!0B.FG58;1B%/HD):#G7EC$#(058.9;20:.D3+2D0E.+3<#&.C1%4-&HGC<59*185#*D$<2/2#3+:+12--+2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70G61G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48222 42 119M = 48076 -265 CGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTTATNNNTAGTG '!&)$&$&$$+(%*"&!"'&("'(+*%)#"%'%'%&!*%*#)"#(!"#')#$"(%'&)))"!')#(#)%"&%')&)&"#*%+""#!#!%')++%(#")'%$)%#)#!'%++%#%*)!#% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:108G2T0T0G2T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48076 42 112M = 48222 265 ATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAG C*B$@5,<:-6&5ED3<>;H3$2=&9D)"#09''2::288F@2=6)#?!36$;0E%&E"4@-)%,D=1??8(!+#0;+F/"",]-2!%A?6,6,%C'>@,<(7/*.:C7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5171 42 163M = 4895 -439 GCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCANTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCNCAG H7,C4$FA@C*.C?<0$";!A&$'<,3:$"9,,@E2+H'=@+>C:=2;'=*A'3$A*/**68;>)$0$B%'D#!H!3'($8B./>?F#F*D:..?;A/1:8D>%#F7-*:A*3&>CFD*!?.EB/B):DH5C0>D."!H9%.C5,F6"C1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70T88T3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3133 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4895 42 276M = 5171 439 GCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTACTTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCNAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCG B9&6D&99G#<'C55$>+5FC@3A1@?.EE&*A@!5B7G%7BE$!E8("'E//0AB(<:6<%6(:#%<-D5.<&3$D=A=E@-G0:D30)DH87<--.4/)D%C8?H"..2B<&4<3*(@'45<>+E/;3/C8929)"!#;139,0!*6,%9B:&"0<+42G7!C1DG=93F#;,A7$4(C,H#2-A&F819)&4'8H/,:D7E+"$C3/-GG-:'"")9 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:82G29A139C23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3134 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32294 42 52M = 32079 -267 CCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCAT 8?"39,"4>,A6#H9:GA0=5=::316E->%B!;-.7@03&9",F"@)-004.A63(;4/#2! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T5T0T96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3135 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28612 42 113M = 28725 265 CTNNGATGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAANGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCA *%)'&!+''&!'!'*!%')(""&+"*'($$(%'"%*$$&*!*"&$!'())!!+!$#*!*"!)$#)!")+!#)#(&'$(&++"'%!(**%&+(#("'$$"&&%&+$($(&%#$% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C0T1C45C61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3135 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28725 42 152M = 28612 -265 ATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCT 4D9C&;7A6;GH-C(%FG0.)=&*&,!*,,0E>/$1#);8&'GC=.042<1!+4$B-353+*827428+H@1718C*H)039-AF>8$0)+5:3>A8B),C8A8$=))D&1!H54@;+&!%1H98H:6(),90-.(*(C(6F)$976(%)99 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3136 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16240 42 120M = 16425 277 CCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAANAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGNTAC G289F=,C*F&%4621.48AC>;,3B8#?2EFG9(?>%G@&@'(@8+,.H?2?C4CD@1-5$0!6)('F09A#>+DG/)='><0@+%G-;=GDB$=&H-B(5F4$<6<&,-:3?!,!G1)=H-?GE*'4!F>C7H%H0<6!=D5<;!F47D8=1(@.-/GAD=F?:!B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3137 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29265 42 42M = 29453 233 TNCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATNTCCANAAAACAAA &@F("8>G1>(?:9-B&G$#(-+>?.,>"F:?(?;,$?#:"B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C26C4T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3137 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29453 42 45M = 29265 -233 GTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGNATTTGTCTTCATTAGAC 0E)$8752">7-D<7F/B>D<:#3'+ADFG3%6DD%EE!0!2B&) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3138 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46063 42 47M = 45873 -237 ACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAAC G<5&)%;#3E0:+?%7;>*;->4C@@&:8"FC'<""%&<+4F:G?H)D%5:8*9<7(<,7>4#?#6$B;>-=>?35@-'')3:,77(H83-?>)2BE+>!?9A;<5&A?=<99?0E$0>EE86(%E#0BC@-8=465+'01C6)36*>0%F.CG'8;4@HB= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37064 42 56M = 37239 279 ATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTC G@-7>2A>0EHB;34-#H22E=C=@!'G5)2-/(3<;:C"H4G*-A3B-8+,!">2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3141 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12755 40 60M4D54M2D8M = 12643 -240 TACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTNTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCG 72C8HA*3!+-'0#";&*#='04/)%G8?@E1#@H:7'F+>:7D3599-'&*3B,843/2('27.!",51>:94-9$>9A%GD40A'4D1F9$-D%!)$2D!:5"B$$&*('D/E.#0'&34 AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:40C12T6^CACG54^TA8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12643 40 68M = 12755 240 TCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCC +:;#:/@C9(81BC+6..B035)7-$&05065!G1G5B4!G@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r3142 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17102 42 70M = 17331 283 TGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATA :.89=1+"H+"598$.<5B:=/!EFF897>/7H)DE%H.#>$G)E$%;,!:H>=6A!?D0EG5@0B2B0C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3142 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17331 42 54M = 17102 -283 GAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCACCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGN /<+'/::*;&#ADBF;E:2.E:-H%!/B'$1H@),=;3/1$:9&=6#6* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G25A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3143 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42030 42 209M = 42239 299 TCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGNGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCG 3@GA6?=8;'G'?>,8F&3+6>>EA#6.G$,93B?7:@2H?,/D59%(FF"%E:A6?.;!%<>.6&$>/CE3=$=,-?+:6%31)10%9F?ED47""3>?C83G(9C?)@75$20AE2B7==5?EBA.'<8<':075'4C#0<9:2/10?'596&-@8.*:C&H38CCH@3&?9%?>3%00.?,B:=22D'G+003-<+) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A155 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3143 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42239 42 90M = 42030 -299 GTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGNNCACGANACAGTNAGGCGATCTTNTAGGNGCNNT %&!((%&&"&()!)!$+$+!)'##!!"+'"*")($*+(%'&(*+)!$+"!&&+&*%#(#&%(!%!"#&&#$(%%("*&*!#)""""%(&% AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:55A0A2A2A1G0C2C0G0A4G3T0A1C1T2G0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3144 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3286 42 85M = 3371 281 CTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCA )3-29&BC&;0HG&+$$-"F/*-!/F44.:*2,0/&48$$!3#?6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65C19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3144 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3371 42 196M = 3286 -281 ANCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGNGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCA $'.;-&FF#/F<+B8G)B-9*H7$B+$<0+8"B1E,*96D"CG;8;D/#D&G/4G=+,%,7?!/#A.$,$A%G'8>.?5@0C+'A2G+?@34-FDB#F@&-.<(.5&'';$@&#-:+G/) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C91G102 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3145 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4742 42 116M = 4858 191 GGCATTATCGCCCGTATGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCAT 3"9/C;.#2%"-H"G$'((=AE$/902:001C.E$B2,6&+,35!%G7@/)F(2"9;H%FB29,CB7H:8E5*)$#GFE!.6*!/#>CE:(EEH,/H011B7(%&7'FEHB705+$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C100 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3145 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4858 42 75M = 4742 -191 CGCCCGTGTGCGTGACATAAAANCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACCTGAACTGCNTTNGNGGNCNGTTCTNAGC $(()**%#)!*+&#+&%"()'(#*&$)&!"+++*+*!$(%"$!!$)'#&!%+*)'#!)$"!)&&%$(!&!$'"") AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:22C23A8A0G1G0C0A2T1A3G0C0T0T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11524 42 87M = 11368 -243 CAGAGGCTGCGTATAAGAAAGNAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACT B@->./A!F-)'6.3G!4'!);1<&'E0249(G$=8C@=<$.5!)<74)?@3@38B49'70CE8"665-'4+==&"CH#CBE$B:(4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11368 42 43M = 11524 243 CAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAA 8.,$HC;<+-;4$BB#,50)F7$E-0-1?H1>'9F;6*&F-0A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3147 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24443 42 117M = 24623 275 CTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAAC #>8757-A9!=<@9F**F=!9)HD*3/%7>A!65%BD/-$'@66@!*3C8-#:32""31(46+3/7B"32,B!)?=7=9A:-E?/B<)'-$'9$0H#>"#') AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3147 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24623 42 95M = 24443 -275 TTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTANATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCT <#=19H74*:6="HF+@?/99:0-3>=A+DH!9(2*+!->3(6E!&2+#$B>+*7&69*-!)BE5/E709)/,287%",$>:,60;H0#&<(H-6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3148 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25171 42 294M = 25045 -420 TAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAAGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGNGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTAT $#3C<82-:1?6?97(?C-,69?!#=4@"=9*=D#&-?<<*E6:B=@G8G%0&3>0)8@*025B"A!2'E*&="*64@#1C9$?3?(8C7#@=64&FH,F#.3D=C>3!;)=/,9E-D5D22)1<;.F<6G5&/(:;)D03-B5'!6>?/A?//(=;/$:F?3,46B!>D8E9'4:45*>7)"(*9'5!:FG,CA%/C=B0"=3B@:#@@0H:F5E(H/AG2H-9A'#BC3#E<07G@!:!"(H&3$.6(B"*%6/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G99T165 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3148 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25045 42 126M = 25171 420 TTTTTGTCTGTNCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATANGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATT ,$A$B13&02<(B.#3;-77#F>=.B"(G;$8.5CA;:@2;"?3?5.=5&F':28G06*!!.*717)A2D+$&G>A=9*881G?36(A/-*<-H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C58T55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3149 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18235 42 132M = 18463 278 NATNCNAAGNCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACNACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCCNCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTCACACCGGACGGAAAG %*#$&!)!)+%&*$#!#&"$"#!!')))!(!$)"&+*($)&&&'%%()$%)"$!%!&*!)(%'")(#('%%%$)&+'#!'#%))&%*(&)')"*!+"%"*$(*&'$*!+!%*'"$+&$#*%)+))##+'+"* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0A2G0A0A1C1C38G44G0G21G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3149 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18463 42 50M = 18235 -278 ACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGC )&1240$&2$'H"A%0%("57C+/H8(//6H25!09&8D#C#-3@'+!.5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3150 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43799 42 90M = 43648 -241 ACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATNGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGANAAGNCGCATG 8.@@&"B:G/1A'>,>#1*(%H-C.H?B<8:5&E-=+.7:*24=2))9E'30E(2$+,C<,=?4/'?%-:ED,<,?+"E150)"?*?C%'02+B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A79C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3151 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40114 42 79M = 40193 248 NCGGAGATGAGCTTGTCCATACGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGNGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGT '%&"*(+*%"*$("'"%"$%#!&+!'"'&&+)&!&*)#""&$"*+*%+#"')))+&))'''%*%)*(!&*#%+&"$+!! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C2C17T23A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40193 42 169M = 40114 -248 CATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCG "1)<(82B$4">9D9#F@@7@:.5C):B*;D&/9:3,>@>)A*G#1:@/B+#?,883C6$6501&/7:8D(?)@1?#+:8C$@H<5E>@5)!"";;>E20,/67D/B$83A!!C<;:7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:169 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3152 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6739 42 62M = 6982 310 CGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATANCCGTCGT -@>7GCCD&5H4/:-,9%A(A2A8@D>63?=,)B72C$!$H,;4"+2)9>@FH2?,*:F!B& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3152 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6982 42 67M = 6739 -310 GCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCC ?8>A;?A*%9'3!F)'9*.09.F;(F?>94DCE:%A$HBDE4!!?AD05H9H0.'$*3#&/%-/,A9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27961 42 103M = 27760 -304 GAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGA $(-/.>= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3154 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21100 42 75M = 21296 279 GAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGANCCGACTCAGGTTGGCAGGGATAT -%(>!;@5F221A8GF7!&F5D>E@5&=$-5$*%;!G827C/1#).2G>%7%DF-;98*F>0HC#H=HG)B>#1/ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T40A1T21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3154 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21296 42 83M = 21100 -279 ATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTNCCCAAAACTTGNTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGG "%??9:H*=6%FDGE4B3D,5B"9=-,-)A;&E!H/DF8FG"->3+13BF>;EB@&FB2>@G:*76@735 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A11C39 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3155 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46136 42 79M = 45913 -302 TCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGT !9%?:F$=51)6G5@4+(C'2E1";!A06$<'F!-A'.:C7&@E<)?<%2>-D+:D=:G<#?:H5A=+,F)@9G130+C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3155 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45913 42 39M4D72M = 46136 302 ANCCTGATTGCAANATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATNTGCATCATCGTCTGCCTGTCATG *"+*"+'"&!*&))&"")&&"+)$$!$&$#*+#)#"&!+#(#+##&(($'(#*)++))*!+''$%(#))$!!&+%#+)'%&%$%)&!'##&!"#+#+)*+#"!$!!#*"#+ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:1G11A25^AGAG48C23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3156 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 70 42 44M = 257 293 GTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAA +))&($$''&+'%)#%+%)('&(!$'+&+%!#+#"#($+#()!' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3156 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 257 42 106M = 70 -293 CAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTG A3)7#AC&9G30/2)D-;C?BF2#?6?2-"H65=C1A0GH1.DG4=16%G?)E-.?G$)/+>>7@01.C*/:?--%A9E.8875!F1&0)#*+@D#2#67&>B+<2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3157 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24538 42 101M = 24538 0 TTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAANNTANTNTGNCTGTANCNNC ++(+%)*#+$+&)%%#+''$)")(&$!('*"''%"%)+#$$!!&%&+*%%!&"$+$&%*!&'*'+&$'(")$!$"##&#+'"!$&)("*(#&(&&)"*(%) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:81T0A0A1T1C2A5G1T0G1 YT:Z:UP jpayne@0: r3157 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24538 0 * = 24538 0 CGTANAGGNCNNACATNGNTCTNANNNTGTNNTNTTTNNNTANNNTTTTGANNCCGNTNGNNCGNNCNCCNGNGN #"$""#""""!$#"""$""$#!!#!!!!!!"$$$$"##"""!!#$"!"!$#!"#$"!"##!!!"$!!#!$$$!#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3158 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28490 42 118M = 28626 263 GTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTG 32'C.);A:GH="AFB7F<'-$G-?'>2AHE)F82$09*"9!328*1,DF6E2#@9:4$*!,)@.6E&(9'7+?1(5>&$5-F!5$3#<)3#H?F-*;H12:B9;")&9AB>4%('+B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3158 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28626 42 127M = 28490 -263 ATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTG =&&58H+@%=":;4%!)!*@;H%=*;G6%*&=8"#.B:7$B5+-,H1CA3<<1&-7*H%"'H7$'6C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3159 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25780 42 41M = 26016 304 NTGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACT #836E'>;$+1&:,$6D#=0-16*'975%;/06B:'*?H.< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3159 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26016 42 68M = 25780 -304 AGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATA /=H=.&-?:!4>#$)603>5%&@0D=#2'0# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3160 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32949 42 60M = 32728 -281 TGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCNAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCC !3G)B1"=%#=(''@D*"B@-DG$#.9<&CDB/@+6=-?7)G%D&0>G*28D=?4(*2:5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A18C8 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3160 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32728 42 73M = 32949 281 TNCATCAGTTCCTCTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTG !#''/$H)*653<5*;<+D(F1BGC94E%!A+C6A:+FG/6A=2F0;H-+022/.,H)&7*FAG4;")"5.BH1-00B5B0?"F>C;D(3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10658 42 68M = 10431 -295 AACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGNATNTCCC '((!#$')#+&"%&+')#$&!'!'#!+%#**!%&##%$(+(($!&*''+'$)%+)'%"#*!(+!&&)# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60G2T3G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3162 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18873 42 170M = 18750 -293 GAAACAGGCCCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGNTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCGNNCTCGTGCGNTNNGTNGN (%(&+!+"%")()))+&+'#!'%#"'%'*%&#$$'$!(&")%+("+)()$&'&+')(""++&((*'#(%(%$+$!$((#)*"##(&%"$!*")$%)+$#+("'%!&")++#%&('+)'#(+%#&")!*++#(#'*&!")#)!%+")"%+*%""&*"%&%*%'%(%*(!%' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:9G26T113C0G0G1C6G0A0A0G2G1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3162 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18750 42 112M = 18873 293 TATTGTTGACATGCNAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTT 4(?07AH1F=C<3F4=CA?82&9"'=$CD>&6=39(+':!.G;H-"$@56*?&+, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C97 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3163 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30730 42 62M = 30792 325 GCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCG /3E;?'=017#;(20,,?'=A@)14,*0GC>FH?:G;"7*11HE8A<62=8%/6$AH-G+3" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r3163 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30792 42 53M2D208M = 30730 -325 TTTCGCGGTGCTTCTTNAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTNTTTTGATTTCAGGATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATACCGTTGTTGTCATACCTCGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCNCCATCATTTCCA :4-9<1'G'558$1-F-)>@2/=9<(.004!#?<%@,##?86#-1HC;;5F"%:0F/)+>:1"*&?:H5E=3>H%0?7@E<+CA'>7-'=+@"BD$!E#>;>E73$CF'8F;C':<+6C=&>*73=A7$+-3'&0-5D.$2'!0CA7(.!?,@531?'0635.BEGA&5)CH&+>3'+6A?G&;,5:A"3+3(#1A7)3*9D:/C'=,?06@B<18&676C;@A=@<:70G7<8,%=0$GE$A7&)0-#-E5@EC!H-D?* AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:16C36^GG17T12A117T4G12G28A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3164 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9327 40 58M5D64M = 9327 0 AGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCNTGA 6)5/!$F5C=DFG:C,>57.=H3-'6'?&0#A*@'A313<-*?;5*<),)>9054)-"36:*EA,@%C?1.!GD/1=+=/=FA#H-!*(,7&H+=68*&BCE/C9AH!>@15)4FD#(;%>. AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:58^CCAAT60G3 YT:Z:UP jpayne@0: r3164 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9327 0 * = 9327 0 GNANCTCNGCNGGAGATACNNGCTTCNCGCNNGGGTNGATGCGCGGAGAG $!$##'$"#&#'$#$"$!($$(*)*)#'"$!'*)&&"*(+!'()"+%!+* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3165 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35399 42 76M = 35178 -297 AGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGC ,;26=675%:;F98,').!'C.1<>)!BB"'@E#":9!><-)4<:,,6B;0-/@9H6-;8+)=$%;/&*%FDD.-A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3165 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35178 42 63M = 35399 297 AGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATT 5E(5?.67?7$4DG";9@3/+(@B'$F!2,49@0/3,$A7CB#20;-G59B)0A%'@+56"D8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3166 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32683 42 82M = 32489 -276 TGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGT "!2;=;9:%H9D%F/C=6G90=<(0=.'*0#?24)D("A'.4=#%.F#3;9;1=F3G-A:2&:08$)=1B%H&=C-%--=!%%A2B:*&;:G>E@>2;'-3CG%#(>H)32;B%03B(4!3#/7<,%D@5H/$F0C0>C='%.!9-G+:,@)2(&?FE>F3*2>2B(;H@BA<,/=1C"H5:%&)AE5!.7&.@/<4'-8=>&%C0'A7A-:31+%F6-1@B;6=2C"4=7EBG<0,8)>!:(DBD/B&$42:29H@4$*@$6-,?<8D&-#0/?A:'20)H6!DEFE7 YT:Z:UP jpayne@0: r3168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12700 42 115M4D36M = 12287 -568 GCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTNGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTN 39)=!7+-&A/H:F:#0=#-*E8+!$0%6%5;=$,,1&$9:).8+,&:=H17EH$HF5326-&6:B=.3>-='6+>$8//",;49(6/&78/2,0"0,',D*":4',3<.7+5**#F48D''>B9,C4CH2A6D?B-G/#.9#6?C06-G% AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:17G77C13T5^CACG35T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12287 42 413M = 12700 568 GCTGACTGACCNGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAANAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGNTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAG #)/0(D/A-:B(@1!:D=319HEF5=-?($FE"!@!=>/'ACA=0)1'((?#"H<.)&8%E5B+!9/G56,-06G.//"&9B;2B8+1H?G-&@074FG<#32*1;;>?64-50H9,"8:%;.76><)'534BH;)%)-2.6*92D0*G+7?/>=78B3@E347&<"8'-G,=,E&1"F%;F!2*'"A%>60D23CG?$9+H=2,A-*EH(@21.54F/(24FG56F6)(,5AH.'HG""+.C/*3E-)5.5<>A;'C7CE3'<)@FG&H6G5@(&AE%83:D8-@*)>$#-&D"C8DEC&@<4"H83--(;A:,97"!:6)$E:7-AC#%4%.4*BB;5E/*E?,AA-;1-<>)H/==4G<<@28!1'&$2.E*C5/+/?*0;FA7&'3"=)8+)61< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G91A58C250 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r3169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32097 42 226M = 32323 295 CAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGNTTTCANCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAG D/*?3B4B4'B:HD*2;9-7B397.!8&=)!6-?90)7,C1.%&<80H"C:-,C(A="!'#G9!+F:$'AD0#3%6,25!5<%B49FH0>%+BDH-#,?5G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112G5T107 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32323 42 69M = 32097 -295 GCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTGATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGNCCCC 1!3E78<&,'29.CC<='FC'64)3;<3D'>(C,B5)"A$)77,@6#;(**,-#)%08F81E$;/;&+: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T35G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3170 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3027 42 43M = 2754 -316 ACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAG (4?DG60FG:;,G,D8#>HGD@%C2?+6/:E3<.*B/?.&<*E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3170 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2754 42 79M = 3027 316 CNNACCNGGANNAATNTNTTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTA ("%(%%!)*&'!)%&"!$+###)!'$+*#+))##+##%'#')$$)'"+$'+'%%)'"+!+'%*#)'$%&&&"%)"""*! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1T0G3T1A1A0A3A1A61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3171 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12677 42 72M = 12485 -264 TGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGG %/<("'*!8DDA&H>B8E.#F:$*=5)(05$#HD3=-:--(20+4&!G'!38&0.1"+8-%A..!,&+071= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3171 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12485 42 109M = 12677 264 NTCNCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTG &;"14G>'17D/,3;"19<9&3@C0<-1(*G7"E!99D6!%-2E!EC%*)#*537<">9'#F-& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G2G105 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3172 77 * 0 0 * * 0 0 GGCCTGCTGGTAATCAGCGGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAG 5$B57;*4C7"/=F-+.)/$&*"85F1!3%428>*'98H!(8 YT:Z:UP jpayne@0: r3172 141 * 0 0 * * 0 0 CTGGTTGACTGGCCTATTACCACAAAGCCATTCCCGGCAAGGTTAGGAACAACATCCTGCTGCTTTAATGCTGCGGTAAACACACACTTCCAGCTTTCTGCATCCAGCCAGCGACCATGCCATTCAAACGAGAGACGTCACCTAAGCNGGCCCATAGCTTCCTGTTTTGGTCTAAGCTGCGGTTGCGTTCCTGAATGGTTACTACGATTGCATGTTTGGNTGGGTCTGGAAGGATTTGCTGTACTGCGTGAATAGCGTTTTGCTGATGTGCTGGAGATCGAATTTCAAAGGTTAGTTTTTTCATGACTTCC @1C)%,$/A;;+B9%1GH)1(H;*69(",)%=#'1A-!<;2%5!)0$2'1@#,+44!E2F?=G;+30&35E<0&<<"HF#$6C*<>?4-6?E>%=83;H3('(24B3/D?H5B5F.)<86*.1%#F4=A!(2&"(C+G70H18(>#?>-$-!?!C(!EEH1&1EG3<,="G(""/162'1A(>:?;;)#@>.$@=!="6>:-A.7.0:$EEDG(1)G=*C56,,(.2:9+7<:?$?G"A)/334.0#+H8A/2B6G6FH9)F!E#*D@1*0,D-;CA*4=$C6(&15>95,)1-4#;4)!GC=G(4#5.6DA!5B(;''G7%5@-E++2'29)F@DA3A(8;0/4--2;*A#@H2E.>A+$F%8.-;&.''*BA<$>:FC#D>.#-(E6@2HG+644@?*/6<#?/*.B,;. AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:65C21C65A5A19C28G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3173 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43539 42 211M = 43750 420 TACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCNCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCANGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAANACGGGATCGTGAAAGAAA 11;)=88CDC&$3!.9%B6):B%.H'31CD#5@)$>5*='G21!C,/B*(9/@$:3@..7C0;6G&'2>.%C'042C4+6(.2:&;$97&%CEC:-C0>8AG:C(+B*F=B4#2;<>@<%!=A!+.D5!5&"!%4A)AEDACCG(-&D$$#;D,49>H205+)486EC$22 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26T74C90A18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3174 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16390 42 79M = 16241 -228 GTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGC 1B+.2=/2B(.6.7;,&)9@CG5)'A/9+>,"D,"4)'*A-,0G31'"B8+12*29A5C'H;&@.6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3175 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43492 42 64M = 43722 276 GTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCT "?-)$6.G4(HE:(F'.G&#,?@:E1=73!(,/@$G8)==3%7H7*23D%%D)2/)'"EE4";# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3175 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43722 42 46M = 43492 -276 AACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGT '&"!$*)#*$$#&(""'""&"'*++(+$)$+#''!+(+)$(&+&+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10241 42 235M = 10476 295 CATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATAAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGG 2?A8;G.*7#'D=;.A%5/C,+:E@H:G4A31"8(4$'H2D?:+H1)31873&$%2E);4F!3'&$E6(+=2EH&.F;(*40E2BH/;3!,?39+88!/2.7F,>*#%)D(3>%;30=D:348G/=DD,0>(1@#3'53>E!'-.??;.G5,=5C;&?>GC5=51+?3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C70 YS:i:-40 YT:Z:CP jpayne@0: r3178 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41569 42 40M = 41677 216 GAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTC &4=2;&B5400D<$E=$&?53@.+)B9:(0-&1"2G1!59 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3178 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41677 42 108M = 41569 -216 ACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGNAAACGCCAAAGGAGCTTCNGTACCG &*(#($)*)$'(+#&*&&&&%'!#&&(++'%!&"*&#&!"##!+*$#)!!&)*('$(!$#((!#++*!)!*#$(&+("!$!(+"'%#')!"(++"&)#*)(#*&$%*& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:82G14A2A0T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3179 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10966 42 43M = 11136 262 GCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTC 8./@D)4?:C6* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3180 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38483 42 220M = 38370 -333 AGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAA 0C0GF@G7@()-3-)?450!9?#-7B2:(&&D9GGA%H=$$%B#D!6>,B1GB!M/*;6.H76)@"->%6+<+*>#"4*5E,BFFA=C2%>3@3$60?*%DF<-D.17)>:B%9"$H1<"A@E45=*9.)62#@5C!+*-1,:809D<3/G'(F=/@07)%78*8'?1G!B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:220 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3180 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38370 42 113M = 38483 333 CAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAANTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATGAGC E/$;8*D%)*%0A>*(;)<95;3#'A1??'7,;9=D-@"G-G<"<;,8>53=:9:@3?*E<"!H?1+*<23>G7?-4<62>B!4-E9):4=*144(,=E$6@.*@A("*0,/" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66C42C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35300 42 76M = 35162 -214 CNGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTN 3#/!'/<=E$B2.6;@6$,7<7$AE+BB,%+2*A.88/CC%3A7!F=F,$/,5.:H9)<8?6#F/5B>7?.AA/9! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T73C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3181 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35162 42 96M = 35300 214 TCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGC .?55!1A(E67(B;>*=1*B3G)/@=**%+DFG>G.B)@+GC@(H'D4012G8% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3182 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23942 40 106M = 24112 259 GCATGCTACATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTNACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGNTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGNAACCATAT B6)5A="+H#32=!3C"%D"2,G4&%@*3C*45.3*H1C+-EH/99+*$%A8$A'D&+*G?+?13*&..:($$$,./D9C9=;F#"+&(0)8?DA!*@<$A3&CEA AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G30A27T29A8 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3182 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24112 40 89M = 23942 -259 AGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGNGATATGGTAGAGCCGCAGACACGNANTATNCTNGAANGNNCNNCGGTTCGT #*(&+#*$"&$%+$"$(&'&(($+*'")"%$(&%!'$)+(#%&%#')$(&+#+%'(+#%%%!(!)''")"!#(&!)!'%%!%'%!'*(" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:37A23T0C0G3G1A0G3C1T0G1T0G3C1G1C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37041 42 116M = 37157 269 ACNGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAA &H8FE$=%<,-.B8&'>=#F!%$5<-+7F20A*=+(BA=3#?BC(=8.84"-)E.F&7+(B8A+5HE/4H5#3+D,+A+6,G=2(.4:50$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0C10C55T0 YT:Z:UP jpayne@0: r3184 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20949 0 * = 20949 0 NCCANAANTNTACANAGNNCNGTTNNNNNNAANCANCANNANAANCCAGNNTCNNNGCTGTANNAGCCNNGNTTNCCNAAA !$$""$"$$$#"$$!$#!#!#"!"$$#!"#$!!"$!"$"!"!#"!$#$$"$!$"!"!""$!#!#!$$""!$!$""#$$$!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3185 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14484 40 64M = 14683 266 TGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTT 5B.+'A97,=H>99(G50;CFB)'/:-8$"6B?A"&';15<1@#B("0&F6?*C@$7:'$A!+) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3185 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14683 40 67M = 14484 -266 GCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCTGCNACGGCGAGCNGCTGCACCNNATTNGNGANCNTCNNCGC '"(!+""#++(#$')%'+&%*')%+&$#$%$"%)+(!#'+()!'*'*""'''%&$&'&*$#)$#%&* AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:25G2G9T8A0T3C0C0T2A1A0A1T0G0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3186 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39107 42 56M = 39107 0 CAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTNG >69'-G190!B..2@!,,#2+,'+@+EE3G2*GEB9!4G!9'%:6#!/>"E1::'# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C1 YT:Z:UP jpayne@0: r3186 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39107 0 * = 39107 0 TTTCCCGATTAAAAAATNTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTT ./1!0"3@4).C=B!D:5.!6*-!2$H<6A#9.;:+2@B<"/#,# YT:Z:UP jpayne@0: r3187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42940 42 49M = 42989 163 ACCATNACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGC .8,+A.73H8,!#B$;;//&>5C,$(?8-%E5'( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42989 42 114M = 42940 -163 AGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATNCGGAAATCAGACAGAA <#H3;6C73G1-(=F1G%B1!,4'+$)0C"@908>,*'>41$<@E-)#"EEA21'"25?92D;+%)'A0.:5F#D10*!-,-$?=2.ED)G095#1!!!AH),FB"-72*1DC6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3188 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27671 42 60M = 27671 0 GCAAAATCTAATTTAATATNTTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTT E>07!@C;+C792=%+8$5!BE('+G94H><5$7D$),3CH=/2$",>@<+7'>22=(=2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A40 YT:Z:UP jpayne@0: r3188 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27671 0 * = 27671 0 TAGTTTTNNGGNGTGNATTGCNANNATGNNCNNTNNTTGAGN $"$"$#""!$$"""##"!#$!"!!!$#"$#"!"!#!$$"!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18815 42 61M = 19048 291 ATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAA $1.<>A=DG?C$+#$6;D!4.)..==564CD%8&@%+;%;,F=5?(C7%97G=H/E/'-/5-+#9%H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3190 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16012 42 85M = 16012 0 GGTAACCTGCAGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGGCGGACAGCACCACAGACCAGNTGCAGAACAAAACGC &EB'#+H<4%<7(>$EFH4%1-A0#8(;6HEH).(7?GA AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C37C20C15 YT:Z:UP jpayne@0: r3190 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16012 0 * = 16012 0 GTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGT 4&!#F$-!:9.16=E.4D=7*G#+G<"421.9/$@:))++/4*?($B.=)3/%#$@)"FF%BC7*;D04D-2-;.88(/ YT:Z:UP jpayne@0: r3191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10997 42 203M = 11200 437 GCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGCCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGG =,',7)9(??+H"<+!9A*=+F-A?DEG952.FA9%DG1?0B6288/',.$1-2$AE0>B7!,?,;:;79+.>$2.6,6=;%!$;0(%2-A0;/F?>,#9)8A/@9+)AA><$0C,01<$9D(@-'#7-)0A:##F?9+7D>+,/#9A+D*:5/)441G*B#;;=92-&98C)"8?,H;$%H<@G&E:95?"ED.,2:&.1?*/.-9#7;=D,@&7101;HB,"(;D8'A8,(/'G#*/$>'CB7F8.,F"B$6*E'2#4@AH1!$(:E!.4$@,"0;,;*3F(-8&*#;95&-?9F.A)9<)/FG#8@/DA=D=@0+F#5CE)>29-4462=)3&B$HA3@>:G<;44A2,1.4+:9?64%($,1? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88G141T3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44685 42 60M = 44745 215 CTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAA -*7,8=8D2.03<./7-@8D,*.4?+E>9)2DE(C28(-50'.EC$!07#-,4+'#8EB/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44745 42 155M = 44685 -215 TAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGNATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCAC &$B4"@97+'9($)8B(C+(#..4!#9GE71&;!-@%#8F6169C8A1!.?!8%/E:BAC)257#?)E@CA18>G@E&G,$3'A-"C161,"":BF/F8)E=(G:;!!9-E2E7*1=-*=GA/1$G+-'3;G'G#!F>*$&,AEE&9;@C3@/;8#@F8@G>3FG);G-/<=3:%A-8/"/714@89%%)B?!('(G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3193 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3299 42 120M = 3155 -264 CCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACTATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCNTGCCNGTGTCCANA )%!#('(%&!%"(+'*&&"$')%))(("(*#&"$+"*"#)'!'"+%'*)+*(!#!%"('%)%%!)*'"$+'+'+'()**"&&)'#"#**$)'"#)&!&#%&(%+&#'("'#$)()!*$*! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:52C27A24G4G4G2G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2350 42 103M = 2184 -269 ATAACCCGGATATNTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGNACAGCAN ,+3B<<@/=A)DC9>@%/7%F.EB8(=61F=3$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T81G6A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2184 42 166M = 2350 269 NCANCNGNCTNCGGAAAGCCGGTNGCCAGCATGCCACGNAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGNTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGA '()"&$!&)'!+&"!(($)'"!!+"$)!'"!#+!!!')'$+"%!$'+%!+''"$)&)****''!&"%(%&!#%*+*&!)'))!!*)%(&*'!!'!"*'*"&#*"+&!**!+&#$%!&!)$''#)&&!%)&!(*%*+%#&#$!%"&!"'"%$($%+')"+#&&"%&' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G2T1C1T2A12G14T71C55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44376 42 65M = 44176 -265 TGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGAC 5#E-(.62=A6H3D*$&-55<6(@/%(2FA(A.1..!=,$63'@4CG,00!/6"-*:E#E58**1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44176 42 94M = 44376 265 AGTGCTCCCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGNCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTT $12&)$F?9GA$E"5+)$'9D2!-CF/-A/,'74'"C)D+<:E88>$=,6%1-1C'55&:0-#$;8-(5$*=+#.$.:8)+)HFCC3BF@0@3$:GH$"3+4F#2!;/7*D>36%<4)?$2;E@,#:D..?9;%?)/HD$:+'0+-"4+)A&<%9B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A20G43 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r3196 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47175 42 38M6D409M = 47091 -537 TCCCTGTATTGCTGNAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGNGTTATCGTTTTCTAACACTATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCNACCTGAGCCATTGGTAAAATCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAANTATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGG 5D;,=/$@;>$#=<6D)=';7=!9#G,?2'77+'+'?+%*!>G*:45.%)%-64*-6-=,*8'+0!H0D@-;4#/&CD+,(?;5,009D71.;)H46&&/-'F.C<98?838!24FC2F7EE77@/?87",9&BDBF:%@8<.F2*@:93*3D.6;E#0/FH((0#:C"B33H">C@'&%)DE>2=)B-#5(@=DE*89+)(5(;4/12@-2.*#;!6D"3.#03+>45%8,9%6@$A-/G"*!2.-B&3G:"-/B#GB>*$EF.9A@8-6>'2..?*2<2 AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:12 MD:Z:14A23^CCTATC77T18G125A19C95A70 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3197 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5192 42 269M = 5076 -385 CAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTNTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACNGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGNGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCANGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGC $(+)+'"&'")"")+&*(++!"*&'*'&%'*(#"!++&"$%&(#&'++#$&%$+#*)!)"&"'&$($&"!&)'&)"'"$#%%(&$'))$(($'%!)%()!(%&(('*$%+('**%)*"+($(""*')"&%&#!$%))*)#!!"#'**"$+"'!"!"*%"%"%*!'+"+*##*%"$'+)&++!#)#'+#&"'$%#'!+%+##(%*!+"%%%'))('%$!%+&))#++*)%!#+"#+'+(*%*()##$#(%$&*&")%'&+"#'#$"%)%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:29G51A63G51G71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3197 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5076 42 116M = 5192 385 ATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTG :$?*;==*,"G-4C'3!('.>#DA%G'<19F4")")+8CHF$F%*1#;$C>:+3+54+D1$+&<,%F(+=0'"#E)67A%:)1#9/6=,#+/9$BB%AF&70?D)H"<10=C+;D5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3198 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15812 42 76M = 36064 20536 CCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGG 1*.$8!C8&-:0?.,=+0;2"=3<3:(2;.?F$'94.C>#:A;@2/@;&,1@0,;07)*552E-@1)"EE<#7+;, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-25 YT:Z:DP jpayne@0: r3198 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36064 42 284M = 15812 -20536 TGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCNTCTCTATGAGCTGAAAAGGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATATCGTAAGGANTTATTACTATGTAAACNCCANGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCACAGTANTNT "$+'+'("#)%'"(+"+&++#")&($)"(%)'%%!!*(&(*&#*#%#$"&)"!$$&((%%+%!+(#(!(")('%)#$'&%(%#!*)!!(''&+%&*"))(%%"!''))+!++(!%($(*$(!*%*%*%*()*+"&%(*#&)%%%%"(+((!!)"#+*$+*!%&""*&!'(&$)(+"%&#%!()!)'!&)'+(#$()$&"#'+"#+(++')'%(+)%'"+#'*!)#)$)+$%(&!%&!")!%!)("$$))$!)#$#!!)(#)"$("*'+&%&)"+'"$&&&&"## AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0C2T0T0A70A17A51A8A16A3G97G0T2C1A1A1 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3199 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16148 42 86M = 16355 289 CGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTTGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTG ,=+F2/&5+@F8":/$@)9=$-)!+$B@%A":/"@@/57#)5&?23DD/>DCB8+=20G&$0$68?3=F(#8&))C!(;!//F>3A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3199 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16355 42 82M = 16148 -289 GCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGNGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTCCGACCAGTC DH#!=,55B?F1=-,HACC>9!"1.)'0C:G&G6A=#4@'-<%43/#%'B:18B$!08(/1?B30*/?B$C"@1!#>)?77? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G25G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3200 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19128 42 79M = 18938 -269 TGAAAGGGATTAACGTGANGTACCGTTATGAGCTGACGGAAAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTC @A4+);,0')3*B@:""F"G!,40../(F/DG(!,"77/,C'5!6:5(,-AH31;(4A>F#1DB@/3)89&F)E>)@+& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A21C38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3200 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18938 42 108M = 19128 269 TGGTTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTNCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACAT %$!*+($!$""&"#&#)$$(*'#(!**"(*&"$%+%"$!($(+#$$!')!)+&'%"')##!"+!("$#**%'&#&+)#+!+&+!+++$)"!!)+())'(($!&"*%(& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T0A66G38 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3201 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7842 42 52M = 7697 -197 TGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCG /;!<568G4:B-:3>F!!%=)@B,>9)@:!G,#>"6?((+6A!8;9,-EH10 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3201 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7697 42 45M = 7842 197 TTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTG ?E%%===B?@5+6&5(/&2C2'0E7AHCF=;+G6%!C%@FC!,0B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3202 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2257 42 87M = 2344 249 TCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGNGCCGTTCACT 76*34,12B5DD+,+,1#7#HC>F'F@:%A>7-#G9@&66$H5FC7,)(1!!>>*4%D7,E-98+2D5#+HH-F'=!"?=2'@.89: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76T10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3202 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2344 42 162M = 2257 -249 TCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATAGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGC 74H*%%9(C4$+B%!>#DB3D?3-.7!5;-#%,C":',F-C70!)F7+(+B+)$9F"(%E()C+<1=<=3*B&#;!&2@@)4?26:@#:!?HCE$#)=#EC8HA:!3D<:;$3(>"/@&@,,5.158@)F862A$=-9'=;<,21;G-.940BCAH%0>+=- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72G89 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42381 42 712M = 42286 -807 GCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCNACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCANTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAANCNAGATAGCACTCGANCGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGAGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGNAGAAANAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCNGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGANATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACNATCGNAGAGTGCAANGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCNTNCNGATA "!*((%'$&+$((%*&'&)"%(&#'"*%*+!'#*+(&"')!+'**)#($()+&'$")!"#+##()&$'$!+"*$&"!'*&!)'$(+*$*%(##$$+)(')&)")&'#'%)%#!!$$$&!(&$%$*!+#$#"%*)'&$(()&&($!*%$)'''+%%)+'$*''%%*$&!#)$'("!*%&!%$%!(%(!&+)#*"!*$#%+&!$#')$#%"!!&(#'+')'+)!&'$&+&"&#*%%)')("((#$##*#*!("##$%"+&")(#"+)'#+"#%%&"!#'#(+#)!)+#'&'!%!+)!)%)'$+%!!'&!%&%$%(#"&"%$('$*$!)(%*("))&(#&$"!$)("%#+"&!###)"$'+)'#)&#%")&&#*+"!('#+"!&'+)!&%(%&'"(#*)!!)#+$#"!((#!()%"+%+%&#"#*"$'"!&"+!!&(##!!+"'+&)!%"**'#%"(#+!*!+$*%#$"%(''#$+!*%%'(#*!"($$&++($"+##%(+('#+$!%#'!$&!"+$'%"'"#($$)%(('"*#)!$$+&!!$"(%!!&&*#+$"**+*#%)$!%&(&"(!!%%'%"*+"*$)%&*%'""))'#)*&$(&"&&!"*(%)!)!(%(+#*$(&""**$"!!()%%'$*!#&$*%!'&'%$&$(%'('(&%&!)#)"%$%(!!!&("(%&(&#)&*$*#)!*#!#()%(#%($++'%%+(#$*!)$*) AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:56T1A66G25C1A13A25C37C5C165G85A91T4A9G106A1A1G2A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3203 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42286 42 95M = 42381 807 AAGTTANGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCAGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCT D**&E.,C"<'.G+64'BC#?G/.E:=7%C&F8A%''F;A1;'FE4#+?6B2F..@$7$'(;8+@*7+4(E*/8E%?%=@&;<:7>0'?$(G'7#H/=%G-@0//*8-'37)?D?%)'4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G1A34G16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3205 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18319 42 62M = 18084 -297 ACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAA #+!"%+*&#+''&)%$(""'**#(!*$'+(*!*$!!(('&!!#$+*()%+(!)"$&!+'(%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3205 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18084 42 61M = 18319 297 TGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCGAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATT @#):F$7BG/E>;6+E(*36&)+B'G1A2;+64&9E0G0&463?'?6907./*H"C:>(&3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3206 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33242 42 55M = 33032 -265 GCGTCGANGGCTTAACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGN &('!#")++#!#+$*'&+!(!+%#"!$#"*##)%)#"&'"(!+(*!')("%)%*+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C5C40A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3206 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33032 42 50M = 33242 265 TNTCNCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCT (")&+)$($')&%")($$(!%*!+"####''$+**&(()%%!)&'*%*'+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T2T45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3207 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42601 42 108M = 42709 238 NACGACAGGAGCAGAAACATAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCTCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCA $E&$!.=C(*#EAD5+%82=(*<.&<:;>2'*;?46<#4#/8=+*,!"+9=29*5#>"3D&..D#8!GCC!,G"4'%/)*3;"6-@-<5=C&9B,;1'7CE>%D'*C1 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G4G13G27G60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3207 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42709 42 130M = 42601 -238 GAGAAAGAGTCCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCNCCTCAACTNCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCA 36F@+14B*"%/!%9:4=*!.-8'-(8&50"13'BA;95*%3)D7(%36.6%@/'EE4+6?H5C393#&*C%/'-DG-?".*00(/7G,6**6EF7#6/48F5>3,><0'FC#>2@=.,C>HCA2C>E5$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A81A8C29 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3208 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15709 42 129M = 15709 0 NNGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGT #+H%33,*9#-#-)CFEH@A&4<.72E54A67%'EG?!GH!A,.#0*:0C0E<+;C3$#24CH%E%=9;F=.02'/,0B9<@/+36FA1+.=@)';HD+5!?EAH,29<>%.8BA>4FH)9%"*.'*(& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C0G127 YT:Z:UP jpayne@0: r3208 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15709 0 * = 15709 0 TTGCTGCCTTGACGTNTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGT ??E0);GA3C:=;E>?H2&8H0AE(D06!A!64.3A3),EA*?060).376#4&>.0%&H>5C+* YT:Z:UP jpayne@0: r3209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40216 42 71M = 40367 299 GTGCACACGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGG B5C0$&!#,4B12&C8H,;33879@"1?#!*.6CG!44.$09.6+64!H<, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G63 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3209 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40367 42 148M = 40216 -299 GTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGANCGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAACAANGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGATT +7E!FB@1$""9?)082"F)=2:.H4G1-90!7#?(7.>!><<787?$+/:F"*8F6HB:,#%@2BHAE.28=7>8/=,@&+<2&EE<20?;5H1B8@:3-2AD%/(B>($4@($) AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:75A14T14G2C37G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3210 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80C91 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3212 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21608 42 174M = 21782 346 GCGGGTGCTCANGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCNGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTACTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGT :(D9<;<,G&0:'>5+#C,>?,-)F$"):$(7#32.6"4DED+H-92+*0FC&)"FE("D7>,F.<9#!=0-+,A+51B5.HG:(D@+G9EEE<9-'('AE,'@<'5-#DHC"/&!%*+;;!"(H1"-.::4!2H@/@!(H"6*',A'GC/GH4A=E$&7"1E$H9AG6!,:"!$2"-/:B?7!!!48%,2D2=C*GG"('F&-51.-0+A#=)*8%2D-;?GC%6D5G9"%H'%6:,*H<;)(C%5,%0D:FH8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A51G61C48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3214 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16753 42 68M = 16540 -281 GTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGNCTTTGGCTGTAC 276"#/!/F!=*7?(=(F5D4*>3'%&;8%?8>6*-?.,8DG+3-"G1/8&.">B0F)=9A,=%E8@1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4058 42 94M = 3837 -315 CGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTNGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCG 2+8=/G#&9:&"!@D.GD04(4A+E2A-&2(C:>:%@;F(B5%7?7%*"513@+/2<3&1B6F(52"&$><$>(2!);<"*E07:(=!B07G62 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3215 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3837 42 221M = 4058 315 GCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGNTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGG ("7;-H63<9D$%5*)('E+"41A4@?1$'.1E2D&1:(2FC<@"=0*?9C-25:.<-,?3"%G$(4)&6/C>781$2D.$,'B)G5!A,=1A9?>H(&0:8#H49<76;=:E"3%*,A852=)6(/!C1>#*B*?6F7=&!.D:F/"6&-?H'D@5'29#D2=H;'15$6=9>&+G8$#/@# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G77 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3216 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47971 42 187M = 47892 -266 TATTTAGTCTGTGANAGAGCCAACACGCNGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCNACTCAATTACTGCNATGCCNTCGTAATTAAGTAAATTTACNATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTGCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATAGGCTCTCTTTTCTGACGTN )#)#"")+(*'%)+%'"*&)!(*$!+&"$'"#!)+&"#"%'!"'%++&)%*!%'&(+*'$*(((')+(*'%*'&)&!#$+$#'$(%"*%$"&'%$#'!%&)#%&!++()'(#)'+!"%%&&"*&#&('#$(!+#!!*!'*%%"$($(#+'(!"#"!"')"!%#'$(++((#"&&+*($#$$*$%$+" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:14C13A32A13A5C12G7A35T29T17T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3217 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23285 42 48M = 23081 -252 TTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCNTCAAATAAAGAGTCGAATGATG ;7H@5.:#@-645)6E@B#$*$6E#:;9-,7%0EF4!5@+04%?*:?/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3217 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23081 42 49M = 23285 252 NAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCNTTAAAAAAGTCGTTTCTGC !F5@EA(=9/#?F%00"&!'"5'+,$5!+(?+B,!<9.3D(5587&<,$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A28T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3218 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12083 42 161M = 12244 247 GGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGNCGCATANAGATGAGACGCTGGAGTATAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGC +&'+(#)'"%%$"*%$**"%%($!!!**%(%"!!&')%%""#")+%$!(''''%#'&(!$$"#"$$')$)&#$"!$&(+'($(''%'*(#$$!(*("#&$*'"+%")&**$(#%&'(+)$*$+"%!("%!)&$((*)""!$'%'%*(#&&&"+&")*"+%) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46G6A18C88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3218 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12244 42 86M = 12083 -247 AGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGC -C$6'*E0.+*63G-:298*;*$*="2G'.>776(E86)A?B=-(?,B4<9E&&6&&7=5,@$+8+#$CE0.AB$8GH)73.E!@7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27559 42 45M = 27771 299 AAAAANCACCTNGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCA +@./6=>$B?F!D-%?=.09'(@,C,;79/G;,1EH6?)&>!:A1>&(4GCH$'#*%+(,&45H?$"")6B>'H'E*C656(%#"(51*D,%$/051D1)DF6,!&AC92AG#(>9'2!=!;1*0>BB#,!)98EF;%B<<;BF5E-D?E,@&>4?%@?7!A1'0E,$F#-+!C9)8?,119'3F%DH*BG@E(.0$=+.3==4+!%D-'E3'5=3'8.&=1:!>0&'G:A=%<3;F&"!)8-?3C#GC0&?>?-1;B$/33"5:,7-D7%7,.CH)B$47 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:49G17C45T38T24T37A85A53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3220 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 851 42 51M = 902 406 GGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGAT 2#(F>=+.B2/@E28/-;67A23@9',09)2'1*8A%+E'?:42B(HED9G!2FA<;>G+C%*-)-$F9,%8DF>.@H%&%C:'>#,A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:125A20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3223 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 252 42 51M = 121 -182 ACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATG 4>:5'+."C(!/+DE#?@:376?-0/DG?)5>?@5G&5'.6;E?G$55(/= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3223 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 121 42 61M = 252 182 ACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTNGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTG 2C@15D4&9=HG0H<5/$#+E)+A:B*#A.2$G8A92-@+7"5F'F(>2-70H;'==C8F.90D7(D"6&?6/9&7H*A%0B>1(B(2AF3#@A%!)F0%.(80H=!&0@>F$4/4H3%-32>,./A,9ECC2C%D>00/E#,<,'9-/'A-$7&=.E98),H/+(;&/>A40%>G,415?@)&@+@0H047%!/>/529A;70-4">G((48C090A@>!;F?1##69 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A45A35A8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47466 42 64M = 47263 -267 CATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCC 2?"+7%5H$@6BB.?=;*H%A@AHEC)9.7=H!F'/&4";!H;#',:A0"?H.;#/!-'$2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21116 42 147M = 21263 204 TATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCNAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGNCCCGATCCCGTGG 5DBF2G+'$-CG=F6H/:)=;9A5H"#.B-;0)&7):/39',"H-?:'.FAF41,%BFF"(AA=02%(A?+FA5D"7EB9C)6D6.A1+0#?=###.E.(26+D!$'%=!9*HE!':E8%@F64C031EAEC2-0!7HD0%BC!>FF AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65A67C0G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3227 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13228 42 69M = 13418 300 GTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGG &'+#!$!*+)+&(("+%$%"+$)+)#%&+#"#'**)$)#*"$+!'!!$%&!&*'))%#&'%*+')"+&' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3227 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13418 42 110M = 13228 -300 GTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATNAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCCTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACANAGGTCGGTGGA :/!)(+C4CC2.G5G-1:FC/>E$BB@B)CF<;8&2.,*A("-.%AGH(/H)$;(/E9E77>;?F8:?25'3:*<"HE0!)#=,7A4(G!D75<)+0046672-8=1:/0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41G29G26G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3228 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20018 42 151M = 20169 474 TACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCCGNGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACCCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCA .$@#2,@#DG1>4'4"D&9#'>G)7(',F//E;=3/;9'F+%$4#2>,*A'4896E1E";+&7DAA<34%;1+,DC#CA*D#/)$,@A%D@.@,8FC)-")!=6#F:%=A51$3+1@;7&E%B)4.*((-B9-9EF$:"*/;#')-%-<"0 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25G1C53C7G61 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3228 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20169 42 323M = 20018 -474 GAAGCGGCATCAGCAAAGGNCACTGAAGCGGAAAANAGNGCCGCAGCCGCAGANTCCTCNAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAAGGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTNCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCTGTCGTGCAGCTTCCACGGCAACGGCGGCAGAAAATTCNGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGC #"D&5/-&9):-DD'A.:5!162BF:=:#9;"))E9085+9:9.375D-#@#29&:7$3,BG&(E5G;#'A4%,;*#9'&>?@6!)6(F#':)??):#57HD98(D"6BF<#/EA"'7%>/.EF@A+'@!&<=841D,D;/A.A=7H7>'8C;*@1E/#)??8#;,H!:1/B*@*3-3!&86#0@@=249+3!&+A27%=%6->1%;G*(!062G@5B:F?,9GB,C)G:3:'09%<%1F+2"799%7!/0,.2&;=&H',E(9:? AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:19C15A2T14G5A37C85T68G14T22T32 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3229 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20163 42 105M = 20268 442 GGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACG 6+3+@=/C67=F90!4D@>#/"/H6>4,-/C!70E1CDC*.-?>>-514H<5.%(=B7#'=;+)&-%!$F<2;AD>F@%&@64)B?.-9:%)@:%/!:G6G4!=) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r3229 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20268 42 337M = 20163 -442 TCAGAAACGAAGGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGACAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGNCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATNTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGTCTCTGCNGCGGCAGACGCAAAAANTGNNGNGGNNGNGAGTGNGACGACGGCNTNCACNNAGGCNACAGAGGCTGCGGNAG *"#%&%*)"++"($+"()*!#"'!!&+$(&+%(!$((!+)$!%&##$&##(($*&+(!'*'"((#'%%!%+($!&'$+')()&$+'''%)')##(#((%$%$#""%!"+$&+'##$(++)&#!#++'+"(%*!**)"*()(!)&(&'*'&&#')$'#!%!(!+"%$$+&'(!&))%+#(&'($**$(*)(!&!+(&"*%&+!!+%'()(#*$%+++%#+)!*&++"&+'&$"))!"$'(++#*)*$$)$**"%&%%"**&"*&"&+**)+(&"%%*#&#)"!("#&%%(#$#)$)$(#$%!%!)#'"(!%""#)%!&()'%$&*)%)*&&'$)'"#! AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:24 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:24 MD:Z:11T52A37G129C23C6C16C0A1C0G1C2C0G1G5C1T1A5A1C3G0A4G13G1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3230 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37679 42 41M = 37679 0 TCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCA 1@?FH;.@4F"=19%==#B269#*5:;&1B1:160;-5!AB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YT:Z:UP jpayne@0: r3230 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37679 0 * = 37679 0 NANTCNACNCGCACGGTGCTAGGTATTCATACNTTGNTGTCANAGANTNAANGTANNANCAGNNNAAAGAAACC %)$&(#$)$($*&)*)%**!*)!*#$(('(!&""(%'!)(#$'*$"%'!&%&)#(!!())$#'"#%++(#"!&+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3231 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7290 24 53M = 7607 362 TGNCGGTCCGAGTTNCAGANNTGAATGANGAACTTGTANACACGGATGAAACT "'#(*'&$(#%")!#%*'('&#*&'#''!"'%&***#!"+'+#''+$+*(%'! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:2G2C4T2G0G4G0C4A2G2G4A0T0G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3231 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7607 24 45M = 7290 -362 GCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCNATTGCCC !,0.0*CB0DH7'?%#72&$<:E/3.+*B4:@%A:86FHD?)(5A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C7 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3232 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19525 42 52M = 19711 281 CTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTAT +''$"&'%&(#(&)+)$&#)$$!)'*)('$'+'"&)*!'$'#+#!!+'($&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3232 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19711 42 95M = 19525 -281 CCATTCAGCTGAAAGCCGGACGTAACAGNACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGAT ?"05G:2=C4G%H(>'."-C+8<430,-!C;A<)@@>6@.EBCD5H;0E/=@,&21=27.C.F;F<1<:6EH='E/,@*"E15;FA%,#&ECC(( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A10C66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3233 77 * 0 0 * * 0 0 AAAACATCCCTCAAATTGGGGNATTGCTATCCCTCAAAACAAGGGGACACAAAAGACACTATTACAAA +=F$6/E7!)"H'3&"81<#0'7G:;BB5#.@59+991<.8-?=)64"0>!&2<1&:$/8#B$:)1@:H>*+"1&E9@1B#E YT:Z:UP jpayne@0: r3234 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20952 42 55M = 21148 261 ACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAA =@,A6D7+F'<80>E:@(,#' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3234 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21148 42 65M = 20952 -261 TGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATANTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACC -6C%0@+5-,::,:B/B*02@<:#329-3-."$/?)?-(G;.F8//-003'.5B$:2)=HB"?A3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3235 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29952 42 155M = 29857 -250 GTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGNCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAA >7D%B+$!:1,0&;A.A&>%6'';3>HE+A#09#:C+$?C"=B-GG-6/-F(26*EH6".39,7-:$6F@A1>@>@!H1?>:G$4(H8=DE=;)%??54%)2',.&A,(+;.0.:H*0,$*,>>)<.?)@'@:!+F*9667@;D@!+,D9G-+?B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:121T33 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3235 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29857 42 44M = 29952 250 TTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACNTACTCACC )<'+DAA..+15)AAA#4>$2F2=1"7936#B!#@H'2"D1!#< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G0A8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3236 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4199 42 144M = 4343 351 TCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACNACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAG ,>"H0B)9$:44H+5@EAC)(=)")+;$/%16H<;3+&>F"//CG=:6=$G06!,4'H6=?E4E*'*DA90&=@-*-1A1!%"%>$A3!D76&!CCB;*#0.+4;9F, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89G54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3236 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4343 42 207M = 4199 -351 CCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCNTGGGATCANCAGCCTGACG 467+-(="8++HF(&A+.,E7*F0!$3&G-"!-)-#63D#E8G&;,8"=@%$:8.D*'G918G?.85B#,8-A6D31;;660,=)!G/6@@:#C-58'F$)=C@'2C+D73&F0'>!>92$#<873-0C@#E4):%9CA/%#=B<)+,;;.<.&>82 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:187T8G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3237 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6784 42 153M2I112M = 7049 439 AGNNGGATACNCGTCNTGGCTCTAATTCCGAGCTGGANACCGCGGTGNAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGGCANCGTCGTGTATTCCGGACNGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCANGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATNAACGCCTCTGCCCGTTACCC %*($+#)!#"%((&++')&"$('''!'%*(&")%"+#*'+!%#&#%))'!+!!+(&!*'*$'#($#+*%#&&+"#'*+"!&*'+!&!(('#&+*+*&&*)*)"'"'+%*+"+#)+&"!((#)'!'+*#!)!#!#*)%*++"'#++'')**"$('*#%"*!"+$*$#%&($#*!!("%"&'++("+$#"&**)#(""!"&$%')(*$)'+'$'&*+%&$'($%%"&+)'''$")#&+)*%+$)%#("(!($##$!$'+"#$%!(()(& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:14 MD:Z:2C0T6C4G21G2A6A48C2T17A99G26T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3237 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7049 42 174M = 6784 -439 GAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTNAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATT 97GF33>/7<5<+:?920G4"=F*>;FG,C5?.-D:G#(!=?'5.01/,**E9,027@;;&!B25,E)-/<.FA0'+GFC5B=F<2B#45$!<+%51F<*.'"5$6>5"E.G92;D7<"@-9D4C'G1?""G,8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49C124 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r3238 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31926 42 59M = 32103 220 AAGCNGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCT 0?"G:-4/96<%B@>A/*F.)-:2B";A@,>:&25'2*H?*2E"B41.D2B7/%$5*A- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3238 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32103 42 43M = 31926 -220 TGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGC C!+)79E.+(@0DE/-)@B>*H1+:0B5:$*:H9#/*; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3239 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10131 42 208M = 9971 -368 TGAGTTTTGCCCTCAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGNTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTNTGCCGACTGGCACCGCTTTTACAATACCCATTNTTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGNGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGANCCGGATATGCATCAGCNGGA *#'(!#$'"(#))#+*+())#$"!'"(%"#("(+"(&!'))(&)"*+!(*%#'($#*'*%+*"()%&#*$)$'&(&*&($'"+)'()!(&)))"('*"(&#!(*(%#!''*#!*()&"+()$%*%'(!##)'"')'!'%*)#(!#!(*$+%)&()+"%+!*"##&&+)&%+*+$+#'()!")+&!%"+)$&$$(&%+)#'+#')!&%( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:13G42C24A23G8A35G36T13C2T3 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3239 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9971 42 160M = 10131 368 ANTACTNNCNTCNNGGCCCACGGAGNCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGNATGNGTTTGTGGTGAATNATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGC )"($*)!%(&%%!$)+!&%++#%*+&&)&+)$+!$%)()"&%!'+&$)'$*!"##)((#%)*!"&$&(!&"#'#*!")&#(*#$!%##"&#!+(#(+#$#+)%&!&$(%'#&(&%+"'())#!%$$"""#'')%'$&'%#&()!+(%(%$#!)&!+#+!$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1G1G2T0A1C0A1C0T11G44T3A13A71 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3240 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42103 40 47M = 42290 227 TNCGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCA "$)-DG&7/-BBC)"=';%.;#(@=&(!F-2$&$&"%#C''093>C0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0A45 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3240 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42290 40 40M = 42103 -227 TACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTGAACGTCCNNNN *("++"+%#%+((&&'")*!$+!*#!+$"&&"$"&(!"%% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:28T5G1G0C0T0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3241 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34378 42 110M = 34229 -259 TTGCGGTAGGAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAANTCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATT $"**')')($$'"(%"#+*+'$'**$%'"&*%""&**!#"$"%#*+**"!)!%)("#)$)**$"%"&"')%&*%()")(#"%+"((#''#(##)%&&(*%(%*$*&+(!% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T65A33G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3241 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34229 42 148M = 34378 259 CATCCANTGCCTCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAANAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCNTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGG *6BA,*7B.GB5C'+GG,!5;%$+B;CG@A5?/G='E:BH(@FF/#FA'-C!!0E<@%G:.=;"%0/+D/@)@!E-A#!&7#>$64*-2?0A-E>490;=/)#!H2:0181+E=?"09",!G#AE0!392!73E-=)- AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6T3A35T55T38A6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3242 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10597 42 55M = 10414 -238 TTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGC +65C>6'*01(.7&7A:$DCH+%7*>"5<&8@+@1&D1@E/7,B?2+!;E,+FE+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3242 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10414 42 48M = 10597 238 TGCCGGAGGTGTCCGCTTNGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGC ()9(3;D,D,(4$8",><#D8G13<'/G.)EFBEC3/*/.AC34!9$7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3243 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30149 42 133M = 29906 -376 GCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACANGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTNATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTC (681";9E#)H""?4<0#6&<8&@7!8,3A8'!(/*'C6A;=,??4=/#)07<')215F-.!-AD=B07D*E%>E+-$:E;:5+D672<8!"C/0.-H?1*.9/$4=+BAD,$@7;-DA1=418=E"==95$G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C52G38 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3243 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29906 42 243M = 30149 376 CNTGTACCCNTTGNCNTCNAACNCNGNNAGAGNGNNNNNTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCAATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCAC *!"*'&&'*#(&(#"%'#!'((#(%#!$(*)()%!$"!$)'+"""++*)+%!&&!&%*)##(*&!)*)!((&!)&$)!'"#)$)(#$&&!(%&(!#&"(%%)%*&(()%!')%'$&"(+#(&"##+""%##$%%%)'#'&$+#+)&*(&"+%'(%$(())(%"$%%+%"$!'&$)%$&)&$$!#!()'&()#)+(#($)#%"+#"(!''#!+&#+#+*)*!($(!$&)#+"$%*!!+#&(%!+ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:1C2A4A3A1C2C3C1C1T0A1T2C1A0T0G0C0G34G169 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22729 42 57M = 22838 258 NCTCGACNNGTGANATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGNTGTTGATATTTCT $*'!$(##%$))&&+)&%#)((!+**%)('$$!+)'$++($%$'*&*)'&#%%'))' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A2G0A2G0C0A3A29C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22838 42 149M = 22729 -258 TTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACNTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCT ((9?"2):1@6)2C??B%C0&AB"!4;%/$EF0E@8A-FA*'"6<#51%%9();EF>8C;#*1>(A$?5!/3#H"762&GG=F32G:"D2-9*0'B6$#*?&0A;"<&=/.!,)G)=%C.+;/&*C;1780C(.77GD<4((9#2#"G6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C117 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21929 42 43M = 21754 -218 ACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCAT (FA;8239$B#A7@D"4<9"6GE5)#+64(>?7>D$?49!?./ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21754 42 51M = 21929 218 GGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACANCCGTGAGTGCCGGNGCACA @<)-/*/5375F0,F9$2-HH0@,F!37,!911H+,?)H)G=:F'D>$D9. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G13T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3246 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48163 42 239M = 48402 289 CCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAAT 3).;:DB1;:#.C'14'=H7D<'?BG7.8DG2F.8$%1D?+H7"?G&!&+35#CHC66#1:;"7'16"CH2H3*>=@$?D$)E<22A#6D.?F+""?"::%:>$!1<<<2"A@@?@A$=4,,-E;07/4;'#$0766>@1$>?(1;#,EA:.%-C+$>+FG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:239 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3246 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48402 42 50M = 48163 -289 TGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGA .E?/F@:.!2:*?=0G6-@F(EB5C2&;)2*@*%;G<)175/%,F:573A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3247 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11892 42 113M = 11819 -186 CTGAAAAAGCCGAATCAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCA 5$4D+A@>5!0G"D"G;62FC0253D2C9D'4>5-")E'@%&>!4D!'"6A=@7> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3247 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11819 42 43M = 11892 186 GAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAANACGCTGATG ?,9/:C>)$<>)%.#%!7H5<$.7C;%C!:&C784D*$99(=4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3248 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5792 42 325M = 5593 -524 AGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGNGAAAGCGCCTGCAANGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGNAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTNGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCANGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTT F:D+DF"H/B@#63#H!+%*%*4:1E8FD%F;:19/A5C5F39<;?>*A->E$5.$)G*6!&2500G".0!#?'B$(*5+=?054H$<*72#0$2H!$!#312:;B"B$9B;50#!=-C'-E#15C(7B'<:2.D,,F6FH&8HC4>E3);230%'&;<+00:9@:68H"@";H<;85$+?3?/A$)7&3%57032@0E;67-?("8B58("-.@,+/$)D#$'001+AD3(4,?=(()3#$%!/967C41GG5.)*>H93/)A!F:C>'!(G/AF/-9%"3;@-0D+%4:64!(+?$$$A!97 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8G34C14T30T41T37C155 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3248 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5593 42 199M = 5792 524 CCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTNATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAAC .=3!";?@$56;01/C>00D+C=,D$B@C%C/0"H)$?:.F95"$$,&$B.;27D*&&(E,.-<;*-*:33>A2!$3$GE,-1C3F;",4BA%*,(D/8$?&@-BF5%7EG@2E'23+96%(1B!)@H863(2B?G!#4#!5#7(%0E??@'*&8(<#A9>="GC*086517'*2#D?>".9&AE6<$8A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G126 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3249 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13108 42 89M = 12964 -233 CTTCCGCTGCAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTNAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTANTCTNANNGAG ()'"'$+&"$"(!+)#&)+')"$&"*"")!""('$#'!(*$)$'$!)+)"!&+$*!+!)$+*('*(('$"($!++&"&(%')*($!#%% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9G41A26T3C1G0C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3250 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41708 42 62M = 41399 -371 NGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAA A!62=;DH5>;@G$@7>H:7(0,1D:$>@(&A'B)@1A/;BBA@A3?;GF*6/F1+'/A*<. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3250 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41399 42 309M = 41708 371 GGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATNTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAG .D-/9D31-:4=$G7&4E7!,$2B0)D?%.5(19*7!C+=%2.3>#?=@!35.F@=EAFG,02*+."%05:-3;')?:73(76!0$48$E(B$E339B,$)4F?:=%$4!2/'%$%+G46&6+2?4?5.0%/,8+;G&&&/'E0*)F6)@=%-1!:E6*H%)018>:#E$+698-">#:"B#'74C-/-4%5F9$>1HH;D(-?2G,?&E*70D7B@<,<"C80*18B?'>2@.@6.%A*C!=86>3,3?4#/:(%1:/-99E#("(7/4)8;@$63C>C8<4!/G&F21)3:,C+9;1E63D2<1)'E'1H36<#F5B(*##F0?G*,CC@D1::+:73'>'9D-F&,B0E@GA&:4%??)7.&2/$!874&5D<%2*@H7=6/9C8" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A78C90 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3251 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38595 42 68M = 38413 -250 CCAATAAAAAACGCCNGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAANAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTAC $"!!+()#(+%&$(('"+"+"(#%*'#''($"*#$)**$%"")"+*)&()#"'!&$('+""#*!$+$( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C22C29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3252 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8712 42 83M = 8808 186 ANAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCANAGCTGGATGCGTGGATG )*9C""*-8"%/@3A-8E*)B6>F>@$,@?4&E.E,";3C@D#=/D,2$.54C954!-)1/7(>:%,+91):#,5(*>68C+G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C63G17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3252 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8808 42 90M = 8712 -186 ATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCANATTTGATCACCAGCATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGG G!'B*098=1C8'-'#,A:H##$,/GB&"/>B,:)7;%6-*E0(=(7"G&GG"),"&D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3253 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14082 42 45M = 13842 -285 CGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGGAGTA '8="'56E%0D6@()*:-CF(3"B@$CEHBD-C?#+$";:!3703 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3254 77 * 0 0 * * 0 0 ANCTGGCAGACGACATGGAAAAAGANCTGCCCCAGCACCTGTTTGAATCGCTNTGCATCGATCATTTGCAA ++&*%"'&!+&*))"*%"+**('#$(!!(!#$++$"()+%(!)%&%+(!)"*$)%#%"+%$'&"&$+%!"* YT:Z:UP jpayne@0: r3254 141 * 0 0 * * 0 0 GGTCGACAGAATCCATGCCNACACGTTAAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGT ;HEF/5&1?>G%/>2H032H)!=<3951(<3*0);C6/B##A7B#-B-D&H&&-?3 YT:Z:UP jpayne@0: r3255 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33263 42 141M = 33440 241 AGCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGATTTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGNATGTCGATAAGGNGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCG *'+#(+%$"(*(!&%!%#"&&)*)+!+(')(&&#$)%$"$&(&)'#*+#"*()*#!#'")*!$$$#!!$&%($%'*&++)'#)$%+##+(&#'!%%)""+)'"+&#*)$$$*"')*"(*&)!&#%$$)!#''(%(#)$&+( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T32A58T12C34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3255 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33440 42 64M = 33263 -241 CCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGNGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAN ?:&1,=%#;7E2$*.B@F?:*/.$47BG5;'?%#1(C)&%&5/%21;8#*';CB*/3+G,CCG! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T36G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3256 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27269 42 81M = 27128 -222 AATNAGCCGATAGATAGCNACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTNNCGNTCNCCTCCTCGCNNCTATCAGACACNN "%+'&!%%'#)%$%$**$!+#+$&!#+%(+$((#'+'$*!+#+(%)+))""!&!(()(***(%'*$##&&&!#%$(!$!&" AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:3A14C30T0A0A0C0T2C0G8T0C0A2A6T0T0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3256 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27128 42 119M = 27269 222 CTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCANGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTT C)>%<6A8%C;+F%A=E@3+6,:'*D%C24.GB#/8+>4#,%&#=F25:#*A7G69+@1#>:G8D.70>/F-)%!41+<3A'4$3)+>B/9)*F5B)9*@#;H6CA54"5<+5+4;2&8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T82 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3257 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40036 42 43M = 40036 0 CGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATTAGAACATGCGGGC $.HA;0%5C?67?<40A/F7*(8'HB.HEB/D%A@+%F+E,DD10+'8"&9"3#;?'($'1?'(9!18*%/80A!%=+$*HF9F67@)H!%:5E==4. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C13C45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3258 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19885 42 191M = 20076 274 AAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGNTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGNGGCGAGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCG +4BE4;&.="*D(664.#&2-:4"G=3)=D.7-@*3#3(9C&H80=5,96%7F<0?09G:ED24A4("EH$?D>/=D<.:)3D$7$%.:B=''=E7E")DG$;8B;-+!:9*FGE$32?99(*=F76"!4$-3?:D="*&3B24:BEF<0)/)F34=50@?>3+B<97G%0/+-0953;31> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71C30T4C83 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3259 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25097 42 54M = 25240 236 AAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATT .+<+37*+<3@+5)F*%H*&=-E-!044<90F;F&65CA2C580BF="2*;:E-A*5)((G5C/03*B6@,G:0*6<58-#E<37(3!@7#*"6'')!G:426'4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3260 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7510 42 179M = 7343 -346 TGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGANACGCGGGTACATGGGAACGTC 8%59"'"18C@G/-06@D'2"F'F20*+"+!1&E$@&;-HF,/E#?0BAF#/:#:-"H0#'#7&-3G,+3:A38"/'.A'*!BF9:1>)=?=7C/*;@=0D+$>'26)FD,9.65!BE@@%@1H?664*!E4)<80(:A4&=2;ECC&A@4$@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157T21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40350 42 41M = 40173 -218 CGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAANCAGGCCGCG ;9G/-H92).GG'B$CDG>!G99C*?6##:( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40173 42 141M = 40350 218 CCAGTAAAACANCTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATAGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGG -<@%"%,#.0,HB7C5FF@F:&F-H#E=70HF:7@?EGF'227(*+G&+6+3;-,?B;),6#3F&9*1)G4F7@H?B.70%:$!C1""F$+G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A53C75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3262 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2619 42 53M = 2755 198 TCCGGAGAGGATGANTGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCA ;DF$D0864<,/=7!:.04E;G"!"4AC,*,.7E$%-,(D,B5-#+;70$/2A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3262 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2755 42 62M = 2619 -198 TGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGG 3+F;'$&2&E!&)*3!3..<:$+.7+D%"&&3.+$E&AAH%85"<730$6?F-1#/0);>),?E8GEG!-D%FA;'&>C;C>+A=0DB!0-&7F(H=/0>;H,1?#;**0:.("%G'42F4*<8H>3=9!72<5,F3@99&2,@0.*0((";5B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96C85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3263 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8468 42 101M = 8601 315 AAATATTGAGCGGATACGGCNTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACT "@$AC*;D<&!C&(G9,<6H3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3264 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32197 42 71M = 32001 -267 ATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTNCNGCAGTGTATGCAGT G0HE:=!!DH"@@39(4#F6E-E0D4:A0)4?HH7H::G&$*'021C"((9!7;=GC@*.C-B9'53(*$2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54T1T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3264 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32001 42 44M = 32197 267 NACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGNTGCCACCTTCTGCT ';0170&A'.2?19&;$/C?771(B@HA:E!@@$.C>,F(F8"B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T28C14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3265 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21381 42 47M = 21171 -257 GGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTNTCAG #2$/FF19,0>=4#1?*&8:H?>9!/3<+<&B5;2F%7H,@9/E?,0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3265 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21171 42 66M = 21381 257 ATATTCTGGCAANAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCT *?F<2#)?<(!.4@>43-D07DD(7*//7; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3266 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22000 42 147M = 21746 -401 CGGACCATAGAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTNCCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTC 8=,BG:*.-71,+7&8,=-/1D,H-//)!6%)).1"%E50>&*AD(61&98H@46:8/,"3=3HEE)&E=%=H'9)+&0@0:<)-3>:!;8F%C0,&7,#9;:0;B08$7*9'+(;D,+0#8--D2F=,>>A!=C6CDG84'D/CB>A)#1%#2H+:-!7&-!(GBE"?.?>'1:&8$+/@'&7-.A.")07-*?7?3!!),!#91<*859>H%!=46"25!)9!B62<77E?#;A:.15/+BED0E<"03'!0,:FD+F4851CE9B7./,4A:18+$/>7%*@@D%68G8:(1D+1E(5!?#B@("F8,'&$E)A"1HG#+*9A8H&@6$=AH@C?6 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G96T7G126A21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3267 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38773 42 70M = 38627 -216 GCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATNTGACCAAGCGACAGTTTAATGTGN &()&*%'&#'!"+!*!*)&*#!*##%*!'$&*)**$#++)(*$!#)'$)(((#'"&)*++(&*$+#)))" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45C19A3C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3267 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38627 42 69M = 38773 216 TCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATA =$&8(+"0+$0F4A4>)?G0"%4:FD3B:)B';>,;E0..*@!,F7$H)$=9-/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3268 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42388 42 51M = 42146 -293 ACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGNTGGCTA D<247(,1BDD,>*E2"8/)D=+4*%.,-*101& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42146 42 86M = 42388 293 TCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAAGCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGG 58=6#CC37%".)8,G6HFF<561=:4)E>C*G-A5+3"6D&=;<(&@=.7$9@#F)*"$"DG!)*C;!@3&(A?=BB1"'(A*C9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3269 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11883 42 92M = 11672 -303 GAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCNGACGCN ")$#*!$#'*('&+&%(((("'!+$&#$(%$"$'+)+&$&'+')'!$"#%#&'&(!"$+&+)$#+"!$(#*#*")%"("#&!)"))+!)+"$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85T5T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3269 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11672 42 200M = 11883 303 GACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGAAAAATCCTGCAGGCGGATNACAACACGCTGATGGCGCCGGCGA %DE%%57+9(.7E/'$7>03&0),+<3D&2,(E&=0=98."/(=$E.//&'G4B0$A%BGH%>%)C70+E"B0);1'&-F48ED)?.),D;%9/&<8E+$>;5.2),@;$/%0"#A.H!7?)4;@!7!F:,-'0;67703G)+(22H6E;35H-04="@700'<=D8#@F?&*%?->,A%=&>45G=H@$C,8#$8;CBD AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:156G18T17G6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3270 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44081 42 258M = 44339 377 GCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGACATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGANGCAAAGGCGTCGGC >"504/%(=2%,$A)9$8?*(7GA7G(5$$.H:05<,6>4AE"(;$D!@>:=C7H74>4;910=C,.G/04BB3(!>2(H5#%1E(@.;5??@"2"G7$?EC?&G@+'#BB$$/#/:0>.+9@23H>'!GA':/AAAH9,%:!,/B2%<'!>!7A'>0/&ADB1D><02?A.=/4--98-;-1(0$"B-#/@!!"??DE(%'305;DC'DG0G9&<1FH32:'G,G,>A=1-"HG;,H2,'!"''@%?DAE(2/:2B$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:162G80T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3270 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44339 42 119M = 44081 -377 TTTTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATG %$"*(*+*&'(!'$&$(%&+&$"!*')+#+"$$)#$%#'#)''#("(('!%$%($'#('&"$(!*&"*$**#%!"'*%'*%''!($++"!&%)$$)"('+)(()$&"$*$*(+**($+* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A117 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3271 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28286 42 122M = 28118 -290 GAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGNAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCNGCGACATGGTTTGTTGTTATAN C#*;3?$..3!.5<%;C!%$G149A+)B,#.$"B77B?=!AE>+)2#B(*F0F(D=@C,:;H8/*H=+9H>7D;$20H19!<+2827?GA?%72*>#;C71DE5AC(3>5H9E39(C=04=* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56T42A21T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3271 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28118 42 70M = 28286 290 CATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTANGCCTGTTTTTCTTTGC 7#+5.!14H)63!5;;4H+H)AB.)'E/:59@@1$"D#9%#GB<5GH9EC;GBD/.DB(#>#$=<3D@<- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C9G6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29256 42 78M = 28987 -347 ATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAGACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAAT =1C6'"8-@/)F7;C,<<9@-?$75".?@!/:9'G0"=B$C0().-GF88##)75E%0,)$FCH10(=F10E$H0E*+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3272 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28987 42 269M = 29256 347 NATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGNTCCACTCCNGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCC '60H1F1A3(7<,-1>.F:?#H+G5#>+D/1&82&=A@,G7."HB@AF2.12D"@6*/)AA/67?#/B'9'@=#$>',74"%!7?;AB")/-)0=8,#?;A*E6)''4?$5!?+>A-,'C4@:D(G2%,)4C52/4=??H.1768!#=024F3751':08&3A:/)=#)GB5GA0H63-1A,7E%@)(7,9#!;=$-5A.82/CC%.5E3C3,"D9"(9@$@HG9A;8!"#"0<;6B22,"#8C>.<<&-3&6"1%* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A65T8T193 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3273 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27723 42 92M = 27400 -415 AGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGGACAGNTCCCAANCCGTCNAAANAAAATCNTGA *()"+#!('&(#**&)%*#)$"#&'(!##&'&+*%(&#()%'(((#+"%#'#(#&#$+%)'')*")%''&"%%"'%(!%)'!#(&'*"(%&( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:59A4G2A1T1T1A3A3T6A1T1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3273 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27400 42 323M = 27723 415 AAGAAAAGANGTCAGCTGCGTCGTTTGANATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGNGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGAAAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGNAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATANCATTTTACGTTTCTCGTTC @"?,62CE--*',/:G53'=::%?$//.H%"H;+=F1/7G@(),'/22,0890@:@H")?%10.3+)'5<2&%9'?$7&?#)9GBE3H&@F'B3$1A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9A18C37T70C72T92T19 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3274 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23598 42 290M = 23888 419 NATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTNGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTT %H06ED@!7>';G,91+F(4&"BB'65)(+/-7+D0'3@=0-.!DCHA%1G$!-9)2,!-+$39*(@G'(4+7)"9="->53GG#8CGA??#6%F3A@A?#,0(74&3$*=:G<6//(H?.0")*:9H2!!'.;HE1!8!)82C);7A@:+6+*H'$.,+&,?8,+G7&3(C33@H9D4FF5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A204T84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3274 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23888 42 129M = 23598 -419 TAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTNAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGA 1@>4"3)!%?;1H$;5C!7G9C-6=G4+A0>.:&?3&"+":+/+'30G"&&D%8-G&<5;8>6D#E#4$1#2F>!C=$0A#FE510G!!&7$5'F4H)//D$25+3@,:=23'F53)#B@;5C/E*(&<@F#3-E!$#:*5#=#8:>A@":E->F&&E%@>?."5$:"19F.##5/!::FAD>1/A3(4.?)8DC;,2186$6>5<=+H>+72F==5(.'@@2GG<5&E#)5E'-60>CG>%/A1B%=)A9#3/:5-$E!4>F@H2C88CC"07C>G&F6,D-F%3;D6#0?7'/:5A:A$%7E6!=0@:E.A.H;3D1/, AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:9A8T15T106 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3276 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39262 42 108M = 39054 -316 GAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCNCCTGATGCGT &(=%.:EA4?A""6@&!?:5;3->?)+"?$%)59$&.+1=>:-A5:+)G33:*8-C"(0:BH+2A!'HD*?<++9#:$)$/(8E;6@CA*/:(6.AG1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T16T9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3277 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11478 42 69M = 11345 -202 CTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATNAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGNA "#$#+*"("!)+%'%$!$"*""+(#$$("%*'#"%"#%"($$*(+**$&*%)$"%%"()"+$!))*+$& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41T25C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20511 24 54M = 20692 252 GCTGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGT BA*71G-&EG8%@=#;?2%C:!?H#8,&8;.F+0%A,5?(7?9,*&;3'E*'2E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G51 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r3278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20692 24 5M7I66M = 20511 -252 CTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAAC -,54%.3-1@>>E(<1$E#9*+:52A#=4$D==!05;&%/-3+6=:'C"*#C4-##F8$(;,172"2.#&H$1D$FA< AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3279 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41369 42 108M = 41272 -205 ATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTCCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAAT ;=(%-)3:C(+G@&+D*;@G$1>*<;8D?*$,0'@A'*<96!F*%H5'@4>F71$9G7"C+0/BF>#2/4/#??&(C+H2?B:*C%$-!;,&3)D)%:80(259GD%3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3279 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41272 42 97M = 41369 205 TGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCANATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGAT ?@6.7"<.$03%+5?!-#-*)9;8'=F35!=0AD.6)"9<>'3BF,D-A;28,0&GC,;!C)<)C69-+9A,8;B3AD--F8=81:B7!)B79E8>= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3280 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28071 42 150M = 28312 344 ATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTNTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTATGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGAC 2F=G%$?=;B;F+6C)9<93G+*;;);/B8)%,#$,;(?8$H)A13A<)@F0D>9-6>B,/1F5E;15%0H2%G="+0H,*0F&4A?E1'69'1FD+!(9H:BCH")91&.A@$(8"!>".5D>B.1>+3@?CG<2%($*+0%;$/502E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T75C49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3280 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28312 42 103M = 28071 -344 CTTGATAAATTTNCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCANCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTC ;3;9D2G>+1'57$+H-FH48B8BD085%1?8!,:,:&<@4@"?G5.''<(19(FD58'2/'96!?"38&#'5+H+D39-<>?/A72EE2EBH25<4F?6A8' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T61G28 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3281 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38139 42 105M5I113M = 38357 263 CATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCNGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCNTTAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACNTTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTA #'*)%&++'&!!(&*'&#'%&)+'#)))(&%$'(*&%'*!$$))%(&&(#!"%"$%'%!*%#(+'#)$)"%#)!&+)#$##$*%(%#"+#*#'$#"+**+%(%%#*+')#'')'%!*%*!%##")'#&$*&#'$%!+'*&(!'+(+)*"'!&'!+#!)'$*#!!+%%!*))+#!*(!!'#!+$$&!"%%%!!&$!+'%&!%$+*))'(#(*"*++"')%"&#+ AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:26T30G84A1C41A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3281 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38357 42 45M = 38139 -263 CATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAG '4@<5:0-DG1?(,>#:&=3H;0>G!7!G=A1@H$B8)6FF9B6/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r3282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5209 42 135M = 5432 288 CGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGNAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAAT 346>.:"',=*C@=H$(4%E36&&#<.6-&"%)?26'+G&C@2!C:%%,,!-/&*.BD3?!=<5+><*AG7(3#$#'*;8;7::6/>86@8--&0<3;&:D?/)0;7;="??+G9EC6($570/A46(464FB8C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108T26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5432 42 65M = 5209 -288 GCCAGCGCNGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCG 'FE3;97$/#9B!0<04+%06:*#GE?,&&:"76,;BDCC)*39E#<:7>92)(H@D-.8B4/E< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G41G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3283 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11459 42 140M = 11335 -264 ATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATCGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATNCTGATTAAGGCAGNGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGACTCTCCGNAANGATGNCTATTNTNNTNCCGANGANNNGC %$!("%!#!!&%+%&'$(*&%))")()*"+''+#$#"'&&#$+'"+$#!$!+*##)*&'$#"*&#&+)%!!()#&#')(#$+'%#*'#$)(%+$))*(()%&&#&!$&$"###"('!!(")%"'!&'%(%&)!*$%(()( AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:27T26G13A32A3G2C2G4A0T4T1G0T1A0A3T2A0G0C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3283 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11335 42 83M = 11459 264 NAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGC &>/"++9@/!C18G@?C7?!?C):5605'9-0B;6+:2=8');!4GB@)@>+=+A$$,EC&@38=7AH/3>H)9/43'8=4:E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A82 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r3284 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35352 42 181M = 35288 -245 TGCATCCATCGGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGG B*'?H.:,0'0,.EHCA@6<.23A>*8@'1E734#>@>9B/)C-=6)E-$#E*G%16*'+E=5-*B-G,!3;24DEE#6*')#,1&=4F?-!3C:+$8'/49:@.E2:EF7/A$F3>2*G:",5*8)6:-6G99,D#>'E4G@".=E,#'$;)#!).E,B9(=A>.@%6":+2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T170 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3284 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35288 42 64M = 35352 245 ACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTG /("D#37+H.D.!"!A0/&D+GH+0>.3E0=8#%4AD8/G4.6?04/BAF)00($377..3,4( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1272 42 59M = 1415 216 GANCAGGNNGGCCCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCNCGGTCTGGCC %##&%*#&!&%)&+&+&(##+)!((#'+'%'($+'%"$%$&*'&#*%("'#)(%&&#(+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A4A0A3T35T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3285 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1415 42 73M = 1272 -216 TTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGC 8-G6(;BE&+!&=>)'-F;8E7/FAG/$B)1DAA@1;C"6,GE<0.+7*"'#:5<+'D)8A;G--351/4#4G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3286 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29587 42 108M = 29695 291 GACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGNTCAGACTCTCACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGACGTTTCAGCTAAACG )?<=$%):'$"06EC>)!-69$A#&#%C-;96$5/3')%(""333)*5/CG*@EC)7(%!//#,?&3/-4>)1,(>"0D,/(75,.&DB;.6-46/2-C&C%(@E$26 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42C9A39T15 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29695 42 33M3D147M = 29587 -291 GTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTGCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCA E224E2/B4@*>#,#-H%4)D!;,H!*)5<<7563%/50%.!AE3F@/+),E>@-3(6&=6-;317)350&8=)B"?895HHD4$!B.;7>1)>H.BD4B1B%-:;4=4%G1A,D)2:7=+,4#9")A(B)+= AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:33^ATA123C23 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3287 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36084 42 60M = 15646 -20498 GCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCN E$G=6>(/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T0 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3287 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15646 42 45M = 36084 20498 AACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCC 5'>"'**'+$52!E2)EF8&1B'):".A+9)6'F*A:CG4?DHC( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r3288 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4623 42 158M = 4785 270 GACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTANTCGGGGATGACCGGTTACAACGGGATTATCGCCCGTCTGCAACNGGCTGCCNGCGATACG ,CD2AF".ECD6.1E,D*9&'G+<+B9@&0CG."EC(%>'.=>@:0*1!2.%6&/!):3B=3&8)12A/C9*'E'-7!2H.=):68,42/*'$'*/8G/#B&"BG$'E;+=2E<0"5-5E:G&?##A",AB4"#&H@>E$C*1E8EF0;1@8AD;=C( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:97C23C19A7A5C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3288 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4785 42 108M = 4623 -270 TGGACGGCATTCTGCTCGATATGNACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGC (24&1G?>,G&DD@ACE?,62<'%*D:A!<&??EC>,5F>B1?G.=AA'/C*E*<=B,:H+/!F&%583;#/28%5@88,9)-=(@7#(5-C)E295#58@18AD74= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G84 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3289 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28014 42 57M = 28159 239 ATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATT H)8B'A;G)566*+!BF6A+//*84,?.@$?6H,;$+17.4&2G/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A13T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3290 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1912 42 166M = 1629 -449 ACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGTAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGA *D8-F1F&!-/@C&<0)*704-B0H)&<4!8D@*9;?).98(@>'D6,E@8D=#,)E&2>'9?&A73HDG)$C18=A5?(8?5803C!72B(3-55+$/,C3,"(>>=&"?()0CD49:>))GC9*;*4=101A,)=48DA>A0BH'.F0B!">=;A:?",G0$;5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A111 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3290 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1629 42 283M = 1912 449 CTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGCATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACATCCGGATGCTNAAGTGATGGCAGGGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCGGACCGCCGGTATCG 2/5-F5AC8))4H34?%B#.*@H;8*29#89+#'6$B7G2+*0;2D>A&/G0>$&6*4*$/.F&&+B,5..6.4,E&DF2F$"B,<#H01-;B0'9*B?2/%DHE1EH#'5572"")6@B%$F@-CD,C68:8CA$'#<;+;#/#;B(8!"'.7)/#BB1/';31H:=?4>327<+>441E@2)!%=927H*D)*GG56,+356*#6 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:110G64G20G10G12A47T14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3291 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29258 42 468M = 29170 -556 TCCATTCTCCTNTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCACCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGAATTGTCTTCATTAGACTTATANACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCNATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTA (**(*'/?$?B)A0."1%4,,6'FF$EF8GGF5.(+B/9.0?)3E+'H/++E0B..@"4D2A)G&@*)4C@';%F,/<$+:(:<:=-)D82??981=2$.%,".%9&3G!';9<)40/BF9B#4++(A1?$G29CG"0E6@5,H'/,8*22>33B&$F<514?.#13?"ED@CC)?65:3A7A$7DG/98.>31?-<01%&%+H+H/9:.C,(4@;#5#36F$=#(&#@8:C0;&A,>#:A>+77H!;%5"/>@G>;.'*:+44(:G%0@;37*'='1C/7?E!7)/"B(134%$2?:(B8!"D$54E6>?F:"E3./'H&=!7<*8A1+D0F?HEG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:62T13G29A21 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2295 42 177M = 2472 243 TTNACACNNACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCCAATAACCCGGATATTTTTGNTCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGNAAAAAGCGACGCAATGAGGCA $&!)$)$"#)+'!"*!(&$'(("&()"(&&(!'*$)+$('+''!%+'')&$''!"+)*##*#")(!"&!%&+$$"&&%$$(#'!!&)&$'&"(!$&#''+)%$(#+!'(*)(+%(!(')")#+%$$+'&)&+"&%$"()!$#"($)+!!&*&'%"(%*##&*%$'*+%*%*(!(!)( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C4T0G44G19A81C21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3293 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2472 42 66M = 2295 -243 CTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCACTGGCAGCTGGATCTC .9D'0!A*+;+&*FH')/-BGE'!-7CD*?3FF170G-D0:G;G-&3:G;9*''9*EC0.F27%11 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3294 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37096 42 116M = 37366 353 CATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATNTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTNTGCGCCCACC 0"B2,H>4.-,'$-:BC6%&F'HF3!"<1@8%D2B1$./+5E%?-!E/@G>4.8G;<<*-A!4AG;.6FC3+)!C-0%+;?4?B#'GC*!G*@D<41,H$4)489'*)BA)D+<@++H<$($#1@B-'7/F&!0/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3295 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43672 42 92M = 43519 -245 GAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAANCGCGAACGANTCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGAN 85B+F:;;H:!7-#18.F9++$:6D%/B!<%7/B$=/"(=8C14$?@.CHECB?A0+:F(6+.021HD&D"(*>"+)'2"%7,', AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34C9A46C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3295 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43519 42 102M = 43672 245 GCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGANAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATA 5E-H+%FC8B@F=B1=EEF./*>AFF(-9@7/*AF9:B?*7*+G1-!A"@*?"!D7DE61,73,.(<3#)&3;2068A&>=)5;0+@6@%5.@(/#(!34.A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3296 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34461 42 239M = 34700 282 AACNATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCNTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTNTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGCGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTGATGTGCATCG @-E4B!6>6%8>=%A<-)<:D@.9;+"%%D%.5!$C)'@D8<*2@.AH=C%><#!>H8$83?"-*:%-0<3E&'DG%)4>8G?3B-EH2%.>)C39E"&8*F3:" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:13^GC12T14A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3297 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10761 42 122M = 10883 251 GCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGTTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCT A16??>@4G<-<"??44G<D/&+G2'D#+A$(7=;*,!"0%0@!,6'40&C.?*=0:3C6<&:8;4;6'.982(9/'')@E21H(@.;C&&/H%#- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78G43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3297 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10883 42 129M = 10761 -251 TGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTNTCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCNGG 7'#CH;G+8:A@:'F(.+8;41<#$D('9=3&1!-F$:(/9,$!,!-G!5D-'@+B0+57)3::6'<2<@:*43-8B+?80)=6G3:>=F72,!?#EHCH4,+H&B02**AA:'/.F*6-1,#?'12%F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77A48C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38070 42 119M = 37942 -247 TGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGNGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCG ',4H&5D+E).<2H:GHA=?$;>HA@@C.;-!!3"*FB'20+68/?FA@"1:=G8+17B8!*D&)5+725;52>E1+=(0=.6A4)$:4)FF-@8$**%?%54&3B+;;&)B:=%+&'E7/2.32)B&HF@:(79009+D7$8<0D8;D&<%-&C;:A?!#1+9!&@=3:8!D-*F8C%4$*D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32642 42 74M = 32850 283 TANGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTC %%!+&'!)##%)*+(%#&*)'#$%"!)"%%!('+&(+#"!('"("#"+%*++#$#%#(#+'''%(++!#**()& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2574 42 156M = 2730 248 GCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCANATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGG .46G*>2'=+3/3F@+F)CH26<%%H--EDC("E+"H:22'GF/0DGA.04<7HB%)EA:?$<%&'$&D>(E&FC:H;)0.+E5@F5(A/2E+8(19F7A$75"9>E2A*-:B;2/:.?7@A>""+60?>%G=+E*.,/$*H(+<6,9;39H=%(5.?AH8AE)$2E2FF6HF1=5%F;B'>)EF$1>B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3301 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8093 42 68M = 8162 180 GTCGGCGNCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGA +'))&&$%$'($+$(+(%%(++##&'"(("%$#*!*(%$$)*&!)#&**"#%%)"*"*&(')#%+%)* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3302 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46042 42 58M = 46042 0 ACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCTAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAA >::/E?DA)!0*0HBH>7;E835":;*2=0DHE#B":"61'6-<.H=%(,/1:HE)-F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C28 YT:Z:UP jpayne@0: r3302 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46042 0 * = 46042 0 GGCGGTNCANTACNNCCNCNGNCTGNNGNANCGANNAGTTCNNGNNTCNNGTTG !"#!$$!"!!!$$!####$!#!#"$""""##!#$!"$$###$""!""#$!"#"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12092 42 100M = 12011 -181 ACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGACATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTNGCG #)$"#)$)&$$&&#!*'#($""!"))*'!&"%%!$$'"&"!*'&(*(+*"$$$$+$)&"**)&"*)!'"&'%""&)!+)(%")+&$'+(()$!$%+'$*# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26A69T0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12011 42 72M = 12092 181 AGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGA *$+)&""&#%""))&""+!()+&*+*%%*'"!%*"&+"!'##'(&)!!$&"*)%*+*"$(&*#"&")*&$** AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3304 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25990 42 101M = 25819 -272 GAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTATCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAA <$!7;!+'3:+,"&D:@*7/,E#G>>3!D(5./D.D%+-;7.#G@1("7*3;@+&++A*(F?(F4"&;"H;33)8/"8(066*GHF AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T70 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3304 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25819 42 171M = 25990 272 CTTTTNGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAAGAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCAATACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAAT -GC":>8'+(49$HF91*,C3CD#E<<&@(,$3#?:>F$==1B'+E%0(5-01C)(.C-!F?@59@97G+E,@1*F%B958(7 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C93C42T28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3305 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29259 42 85M = 29493 299 NCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATNAATCCCCGC /:=/6;:5%<"48)(!'G+B%(A%'&&F@H9'"#;A(#D&"0H=7E%AF#H?"%%7'12;%/"F77E.98;=;-)$)66+!'!(( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C74A9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3305 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29493 42 65M = 29259 -299 TAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTCTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAN @184/F1,>30BFC'2?F4>?+E3-C&D88C(-<;64B899EA/#(#@%.6'(1>5*:+3:<75# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G35A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3306 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40300 42 53M = 40146 -207 TATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCNGGAAGTNGCNGCGT !")''$*%#+#'&$&"$+(!%($)!('%"+!'#$+$(*#)(&!%&!&&'*#*# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:38C3C2T2C3C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3306 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40146 42 154M = 40300 207 ATTAACCGTTGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAGTCAAAGCNAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGNCAAT 5"DH#')=,?*=#@66E8#9";&1;=DF282###5*+&"H%?8+:1C;-%6'?88>D10AA+&/-GF=*5A;./#@*#5/+B(F09&9%;&C#D(/,*BGCA7"D@H.=:;$=6?@7-8'5F!9E87-"<1A%<2?%.?7'4H*G<4;G0':+? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9G89A7T41G4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25029 42 192M = 25221 258 GGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCAGAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTATCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGT &G)DH),G;0&+B,8+>@H.;8+;,1*DB8!E@C$-<)@5&59-(7B*57D-80!:DD)%!8F8<5><70?'54403%%@3.A6&&D!%!7AB@21$6/7D;1H;-(8!;(5?%7:D":.5%(*=%54#$9<$F,1.C='!(25%33=,>E7&F)-B&8H=+$1!(?B,.!$!=*:/0*A"?+9F?4+> AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A38C53G98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3307 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25221 42 66M = 25029 -258 GTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTNTGCAAA B?E//53?/EGE5/E,97,;:,4&-,.!4&D>:#*?)-@HH<+#A'59?/7>5F2=$"@E$72H$1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 925 42 85M = 768 -242 TGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTNATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAA ?49.C.*H$/5G3(C*HF.0D#%%D'=04-DA:G+6GA7@C!?-BE:<:+:>*2.;-,2@/A9/5G&,@/2C5FA8()BEC;62>") AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3309 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45536 42 46M = 45624 185 TGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAA H8'E.=4&=;?H+59$!<84D!/,":C)8"H'E&H5),)"G&5;?H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3309 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45624 42 97M = 45536 -185 TTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCC @;%A?@B1:!-58BB"3"@9FA@//$??!HB*%G1&%B)$<+-F=6C'4&&907---=FE=1+:?D(-)/."3$$<6$248A.8<)H%2?(/#*'/(*B*"H%725.:62*);D-H,3A4+43@+05>"%&#+-?97D#:/"D<+EC0)%0?D:B? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T66T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3310 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25024 42 53M = 25148 277 TAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGA *=06%6724$G?/G5&(93,$A%@29GB38C=!%'9C""3,7341(;5B4->6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3311 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17780 42 71M = 17603 -248 TTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGC 1"B1!1)(,:-AD?;%;.F:D+HGF4#00=:?5'!(<(2-&0)8/@";F@2CBD(<70%#-,8F9$09!?7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3311 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17603 42 79M1D31M = 17780 248 AGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCG B/-(9/#;0@35@>8$G6+5G7;6-<$6"(B"0&-14B"4*+=-&$F/6G-7-$;1?(-9D+#7E4*98E2D=7*2+*)C@C98*+3G+GG9.1H*E;F-!&<=81AH5- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:79^T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40319 40 101M = 40562 297 CANANTAGCTTCTGTCCGCCGGACGTTGCCGCGNTAACAGGCGCAACAGTAACNAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAANGGCACGGGCAGGTCTTCTGGT %(#)+#%++**!$')(%)%%$&+$))!'#")*!#+%+$&!%!&+$")%)+("%'")$+''!)(*)%!)+"#*#"(#('*%($%#%+%&#")!'+!)*$"%* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2T1A10G17C19C25T21 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3312 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40562 40 50M1I4M = 40319 -297 TAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCG #'+6?,2:*",?,8-3:27D;5/5(H'8,1.&"%$)/;')-6(?E@;B67A8$HHGH#)&8D"=A"6BE*(H,BH=+EF:/2.,A(**6-)1D+H>A3@@(.!/@0#3F14'B/GC.#,%2#D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YT:Z:UP jpayne@0: r3314 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15729 0 * = 15729 0 TACGTTATCGTAAGCATTTGCTATCTCCTTTTCCGCCACNACATTCCTGGTGTTTCTTTTTNAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAG 7E*6%-1*9C7F=<1/15*D=(<3"68:.FFA2-F?A.E"BG-D6%?A7HA,$EE-;;G#=03D*7!F@<2*5//@0+8?;=2HE9=@7H#E5-74B3&#D)5;DE@<3$-6C/1+"%0'%%4+.$)/F=0!"?D%G3?&#B6)&-89HH&76"4"C.=1@DG?1)D64@)32DD>F*7;9B"0A44">?=@080>8(1B8 YT:Z:UP jpayne@0: r3315 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21968 42 81M = 22125 227 GNTTAATGGCATTCAGAATGAGTGANCAACCACGGACCATAAAAATTTACAATCTGCTGGCCGAAACTAATGAATTTATTG #!+#$%&'$"&#&'"&'"++%*+#'&&()*+#"+%+***+''%+&+#&!'!!!"$)')$#&%'**('#&&(*'!%+#"+(# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0A22A23T13G17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3315 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22125 42 70M = 21968 -227 GGCTGGCTTTGTGGCTGATTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAA $(&,'339A)#2A1E-%$*+B.$%EE)5("/4084$!8.!>6:<@C8A)'&76(1B4)#C5:"!.7=2'G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T52 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8424 42 72M = 8278 -218 GTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAANTATTGAGCGGANACGGCGTGAACGN )/&7*;<6(>5=3F,=1&6.H1-.<$DD>F@C=,72&"<)(D9%1&4?%4A;'=1138(9@D6>043>"7$! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A11T12T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8278 42 22M1I37M = 8424 218 GGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATT G48?GCD1<5.),BD%4D2'$B>.0$H0+13@DD52H)@=3>8*#G<>D3106AH,8.10 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3317 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31237 42 47M = 30897 -387 GTGNTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAG D$9(/&4>A%25/(9-8.;"D$;%(3/3(,4*:3?(3C$@GB&.#7, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3317 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30897 42 340M = 31237 387 CTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTNAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGNTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATNATTTACCTCCTCAGCCAGCCGCT GC9A>;#'-G'5CH*<>,0?$+!-*F.9'D.A.!#C?8EAD00"1&#/!!40%%=/#(H#B(-C(+2HF023+<&$A3C>:54'+9-#%(A!H9(#%$;4:A5-.85(#>!%>+;HC3'GGC/?0)<7?*1'5*4BG6!.-C-527"1C67!6+(?$5&6@EB?;8D"H3(99<8GD4>FD(=(@(!"-6"0>,6=FHG.$"3,'.*0!"..(*$-C8&:)(A3"<4;%/!9C>(<7B2BE+0:'$@H0%F;C/D%BA9E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:166G123C25T5T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3318 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35612 42 121M = 35453 -280 TGTCAACACCGCCAGAGATAATNTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTNGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAG !>A8*>0==?+;!5+H:58>EF/17?"??;"?G*<3C+8#B?9/%00F'))0-??>,H$&1:$0A'9+028&0(3A>A1F"FG*3;4+@1)')"):/3G@>4A8!4'''$"D.A++H393, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T65T32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3318 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35453 42 47M = 35612 280 GAATCGNACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACAAACCCCAAA :6"41@H+/D$GC::6A#+C"+;5;8C=(4-98$GB2$)+D9-1-'. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C31C8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3319 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35308 42 89M = 35308 0 CATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCCGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTGAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTG *-">C*F8E@3E/*!=D2,2?/<%0(.<0-)*F3=!5/G-5"82 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G35C21 YT:Z:UP jpayne@0: r3319 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35308 0 * = 35308 0 ANCCCNCANTNNGTNNGNAGAANTNNTANNGNTGANNNNACNNGGTNANTGNNNATGAAACNNNGANNTATATTNANATNNCNGTCNAANGANTTTNNGCATGNTCANNNGCNCCNANAANANNNNCACCNGNTNGNNGNTNTNACNNNNNNCGCNGCANCNNCGGTGGNCANANNCNCAGNNCNNCTTNCAATGTNNCNNNGNNNAGGNGNCTNNGCNTAAANCTGNNTTTGC #"#!"$$"##$$###!!!#$"$!"!$!$"!$!!$!$$$"$#"!!#!####"!!!$""#"!$##"""!$###!$""$$!#"!$##$!$"$"#!!#$$!$$$#$"$#!#$!!#$"!$"$!###!!$!!##!!!$"$"!!$$!##$##"!!"!#!$###$#$"!$"#!$$#!!#"##"##!#"$#!"#!$$!!$#!$$$#!"$"#!$"$!!$!$"""!"#####!!$!$!!!$"#$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3320 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13912 42 65M3D106M = 14086 259 NTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGNAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGC #D&83(HCH%AH).FG!+3%F5()AE$2A*CB3&".5-(1!9F!=0":B"B&=B,9%";)@B6;0;*2D:.13/?29D?DB1%>!(07&H0:H"9"2&%D."%A8$G1"*1/8@ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:0G64^TTA0T105 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3320 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14086 42 85M = 13912 -259 AACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAANTCCCATGACACAGACNGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCG ?$70$)3,..<&G)!&2'+/BH28)+:89E037,GBD.@72!-!957>D3'';-EE!-01C;,9-B6FH2)F*5!<"9$)CE;$2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A15A26 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3321 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5696 42 369M = 5696 0 NCCAGTTNTNCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGCCACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCNCCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCNGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCA ##"##)&$(+!$'"!&%%*'*$+"$*(###)(&+$+$&&"!!*%&&'"$##+&'$$##!&$$&#''$#+&&"$!&*#%%&&%(**&+)#*)'%+++!'*&((*!'%()%!!#!"%%+!)"(!!'*)$+#)'++%'!!&&#')#)(%%!&&'(%()&*%(%++""#&**$*+&+*#*($%$"%+""%$(!#'!)#''+'*)#&$(*!(+'$'#!$)()!%*&#(#$"!%&'"&%+&")*)*""("()$+)##('(($!#'+'*%*$+"#%))*))(+&#)"%)"'$')'()%(((()*"(##"!%***!%+*+"%&)%'!!*&+(#*$$%""#**)!"$!*$'%'#(%&$!*&+%+$(!&+!++&%'+## AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G1A0T0C1G0A1G94G67A34A104T56 YT:Z:UP jpayne@0: r3321 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5696 0 * = 5696 0 GTTTNNTCATTAGATNNNAANNNNTNNNNAAAANNNNGNCGATNNGNCNTCNTNTATTTATNNTNNATNANNTGNTAGNNGNCNTAC $$#""!#!"!"!$$!"!!##"#!!"!!"!!!"#!#$#""!##"!$#!!$#!!$!#$"##$"#!"$!!!#"!$$"$!$""$!!"$!$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25058 42 247M = 24978 -327 TATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGNGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGNN #$!%''$)#()"('#&!$*%!++!)))'$&%(!%#"#+(*)%!%$*#'*'&(#!%"+!)('+(%*"%"+(&(**#'"%$'&*%!%)$#!)()*'"$&(*!#+++""(*$&%)($$""*$+($#"(($'*"&#+$($!*&'%$($)"%($+%%#($"*$)*$%#$!"(%""$(*+&'+%##%*+#+$$))!&*##*!&!$##(!+'+%""(%"&%%(*!!#*"*%(!(')!+%$&"(('"#"'"+#!" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:156A88T0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3322 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24978 42 80M = 25058 327 GGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATNTATATTTTTTGTCTGTCC (%-=+%A0:H%=&H/352"$F4?1,?30#$B'G391H"4".2EG<9F13F0?CGEH>4@)6%>')"=D,93:783*H?6G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61C18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3323 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43884 42 163M = 44047 458 GCAAGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCANGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGNGG #.!?-H=/!>6"D'!70@4,16A%9(>+7@F"F0(!G$%266454?%8<@.H8B&3*2+0$#/2A@%+"3&DA@?B$& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T68C87C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3323 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44047 42 295M = 43884 -458 TAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTNTCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAACGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTAT &A>#'C4<7G4*5$(1=B58%DH!6;@"@F5DF5C0:B4H9+F&D3ED"*9"<'&3.4<:@==G!621%3*)B<.57#<0==H+3>&9--3E"!1*D0*&-:?B9(5'6)/B)=BB%%F$69!HD#(D2&*$8&D>.H$2@'9H;$8>G!8&C7.#*/3/H6A#1?>BH71C.7",&H"F:+>!"2G$&GE149?AFB?-:"F:($:>45:C@"9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69A44G180 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7890 42 78M = 7753 -215 TTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCANCTCCGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAA (E/$1;=9;>0?B,;"#0/#?='0F=E5,/98H"?=3$'H;5<-'!<>A.9,&)09@C8F$)F*1"3!5+'HED&1'G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G19T3T46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7753 42 99M = 7890 215 NATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTNGAAGGCTTCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACG "@4'23$#+#':?B$A.AH8E<+)$?H.8,"?+3$FG'93.@@((/4>110 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A31T7C58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3325 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16765 42 93M8D82M = 16948 349 CAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGNTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACAACGCGCCGGGNTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTNATTGAAATC '()&<=4)>;@1$-C(<;()F*-.0E(+)*043BB20C#D+C8>#=">+&6,->?,E"!+>D8A0+4(7D#/3"&&-;33=9D>G'**("&/>D*9H$)8$0(32.F;A$6 AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:12 MD:Z:28T45C9C8^ATTAAAAC72T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16948 42 166M = 16765 -349 TGCCATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGNCCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTNCAGT D1&.@3**A3B&''-1,==F=#"GDB/GHG=E&A5:B%%D$7)DFB9/@/:#338A(7)?(-/96*;DB-)+F>8.)!=1C!;!@':6!*<7,)A=6F#F1C!#>:<-',B=@4>A.G',:3A8*-":++3/&"B06"69-:16&(!(E=A8H*3=B@0G148G8+!F.,E=*3E$:@=G AS:i:-71 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:19 NM:i:23 MD:Z:0G32A37C75C6 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3326 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15915 24 134M = 1 -16048 GCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGC AA+A%>&0H6(H2F85!2:>>%-"@=%(<2=+9DE;E!,31H9('-33>98)C'(62E=E.F$7<=!H*6B9")=::;%D%*.+-C7;G1D--C"*45G2.)F$7-=(&"$9><4-#:'&&"0"9A!)3$29>!B3& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91C20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3327 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12240 42 314M = 12128 -426 CAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGACCAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCTTGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGAC E@H%606?;6797*:8=0E'$6&&&:#%=5D#),?5+H'F/++"4/6&-,'A.+'5/2:*=54&B1)E-6B+#7&:;##'GA@GF.CFG/&847H%*<.*66*=326)>8#422D+?CB6*@*4#:5H>'.7H-3F.G:?6A?ADF&75<=1'>/E<2%>=#'5&,H4)'B9G<:AF*-0>CD5>?<',(@7F1$C8F?#G")!$12F/F!""HD6<9GD/((/:C$D9EC:AF>H:3#D?72-&@!@H=#E7,7&B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98A36A178 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3328 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14753 42 69M = 14527 -295 CGAGAGATGTACACCGACAAATGGCNGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGNGNT "(%&+#*(#%(+%"*$((!!#(*$&')#'&+#$+)#&++$&*!''#++(+"()&%&"!*&&"#!+%%(& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7G17A39C1C0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3328 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14527 42 43M = 14753 295 GGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGG )'+&$+'#("**)**'*$%$)**"+*%#*)#+*($(&%"$&'" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3329 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1935 40 151M5I87M = 1863 -310 NTGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGNNGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGANGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTNCTCN %&&)'$+#+$'*#!*""'&#'%+)+#"'")!*'""!#+++!*)))(!$+*""&#!)%$$('$(*)$+)!*!&#+!#++$+%&""$&*+"*#'!!)"*$&$%+'"*'($&$)"%)#*'$"**)+"')""'%(#!$+*'"!+'"+&"$!!('**)!%#(("''"!'!)"%%'*$"$(&'++'+)$&)!&#$$%"%&!)'"%&!)&'$'#&+'!$$&"*!%(!&!&$$'!%!)#$""$+)(&'$$" AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:13 MD:Z:0A27A0G74G83G44G0A2C0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3329 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1863 40 72M = 1935 310 TATTCAGCGCCCGTACCTGNCCGAGTGGCTTNCCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAA +9D522D>#G@7:FF%$60+CB17,H=?-G4=%4A9706.%)&6,+4E,)"$5(!#2F62(>$64'=#A;B> AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T4A3T7A40 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r3330 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14955 42 113M = 15068 424 NGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCNTATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGT -14'&7E@B<@0&&7%!--!,620+#@C*9@3/C&#F)"",)'(5F/.HC*A*$+BDF3/)&::9B$'0$@D!;23!#3&?'7=7*##!$"":A3C=DH8ED1#:@FB<:;:$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G82A29 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15068 42 311M = 14955 -424 CAGGTGGCGTATTCCAGATTGACCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCNCCGGAGCCACCCTTGCANCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATCACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCNGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTNACGCTCG $"#&)#*&$!(($()#!(##%$"#)%*&+'*&#*&!"&$"%!(+&+%!*""#&"%$+#))#$+!$!%%(!#"#!(("'%%()!#"+#+!""+)'"!)+*"*)()(!$#$&'"$#&&()+)!'"!!!($$$")(&$$(*%"%*!!+*+$%""$"&+")(&(($*)&)&&"%")#$&"'#+'*#+$'"'()"#&*&%%*#$"!$#'+"*($)#%'"+%!"+$%#%&%&*+)!")&(("!("&&(+$'#%%$$*)$(+&*%%(&!(*#)'!++%$)""&#)%+'!%++(##!'$&&*)"$*#%""++#'!*+#$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:21T37G17G131A60T32C4G0T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3331 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15139 42 57M = 14963 -233 CTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCT $42?*D?<,06;:7/1@%F%%(;&7$1H3/-F*'77)A/,D352*.!+$)$0%%1&+C4(D8C6*/GG5C?-@"=50$8"1F1<5G16!5<+7-'E)=+9)=&';A)A1)*;?9$%=7D$D@.$':=79)*G,F0#9*BG>(,"/B4A=-<:H0/E@2$+<>1#;C%?-?0.*'/<6#B=BH,6?'>7A2<<'F'3-@*?!0'C5(A#3;+><80:(323$*&=<.%HG27?BC#"/,)":+-=91@G%8'=<16:9/5-+!7"+D5&%0)GEE*F9'&F$A1++F'!,+.GGG"8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61G78 YT:Z:UP jpayne@0: r3335 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15668 0 * = 15668 0 GGNATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCG '!0E>B?F.=D='H-9%0&G+9960<@&/;+C29;(3B!'+*)A$5$3GF,;.'4BDCBD-,"7D3? YT:Z:UP jpayne@0: r3336 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39911 42 200M = 39783 -328 CCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTNTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGNGGAGTCTTNTCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTNACTGATGCGGAATTACGCCGGN 2?8*<9,G46B$4F2.3>EC"!$.7(24E*C1=G+(;?/"7.16,&45*CA21?+&;2'5"(D:+;$64H.2B!EC9B5<-ACF+4(1)0:@%C,E8#&5G&)*8.<#A6?'?/#'<)@.@-1C%FF$>$A(@HG1(?#88G"A+;("$6#1?A5EG9@5&;!>6#"*E*+A4$*751@7?17H<12G>/FD9-2:#C@# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:60T37C8A69T20T0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3336 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39783 42 128M = 39911 328 CGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATGGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTG CH"@$#5#60FAD):%C!F9;?7G(A,B+BD51;?%B.0GDD&47#3+2)H2$$"F9*?@H+8;)8#;.52G6<,0;8!@-6,9D5AG+EC7B(6/)6-<)8=-*<.8#48!)%;7,/0@=045@/==GB*DA!ABF,8BEG/,$6-<=C39&GA4B(,D<7%DG0H67+)9,<=/!-*-AH2:G;%('?;#/7353'4),;.)952*(H+3'>A4H0;$#F6641/7>32.9:E7=% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G24 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3338 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6543 42 218M = 6458 -303 AAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATTGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGCTGTGGTGAATCTCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCG %.<8-'H@*ED3;-B<'H(D:;'(7:->1)=624F4D/8C=*%274@:3+'.)>C0C.=3162+*:C;10E7G58*)>>G6BB,G7?5H.E1?:F=1B5,"#.HF8$/EF3H5FF<.CB#$$):'3@HEA<+D,A(-#1%+@.G>C!;D-F8!6:@7,2)1&F.B3D(898#E*2,=>&%H6@)44B):*B3BA0+@C<%:,%2.D4=C51.;A*7-; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53G115G10A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3339 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25842 42 166M = 26008 212 ATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCAT =&&%B*3+#F%/5/E$>8H!9$%6"H!)A4*<@'#,#!'3+.?9>/;,/&8D:8*C%'":;&.&,;4B/4@2CD+E?!B99;-&?$H8"@+&2E4A6&C+!1')D?<><<4E%C0E2,A1'#.')C8+)8*>.=7"5B9$#>(!)H8#6?>4-#A<(<@54$0@7??G,0*7:CE=8?2/8"H)9&!D-/).?GG$@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T18A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3340 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37910 42 76M = 38119 298 CTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCG &*)+$'*$*''"&+)"*&#("$!(!'!!('*$'&))%**%'!%$(#$$%*!$(!((+&(*%#!!$&*+*$!+!'&) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3341 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20726 42 219M = 20949 543 GAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCGCGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAACAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGAT <:&1?%=(F+F=68!+="$$<78G5/&0&<684>3*7=,?!$G::'#AD86A$(43!'/,)AAH136@@-FAB!'$:"4(H*H!0#4AD*9$C6F1'9%==".@3*@"3#*);>5G=(!AE8+106-D7%G"G'-6/D8/#HA3H$>08H:90ABF-E:=2HF@"%(%9G#?G/=@:3$FG4"$;G-1"C,)0'B#C3C"B!A: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A63A114 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3341 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20949 42 320M = 20726 -543 GTGACGCGTCTCCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGNAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACTGTATTTTGCGGAAAATGNTGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCACCA ";%*41!,1!BEE3+#.+1B3;5@+1.:1,E$@:$EA82>B,#*9,4E&;F.-EA$&>A9F"3'D9.5??F2,12-70.F($(H65-E*"+F-A4.'/'?;'18CC14$$3'=$D/!;8.%#4EA)32.'3=.FF9A;3>;)7'.%.<"H+18-&!1@6#1&FH7$'/<+-#$$(2%?026F;.$0A/B=52>%2< AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T0C8A99A50T3C17A133T2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3342 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14544 42 88M = 14303 -329 ACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGNGCTGTATCAGGTGCCGTT ?%%E;=5>58"D?54<*4"3D2=D,E8;@(535,!-7#.-5GE#!0-%D<0".H45E2/0D4340."-(!F2F(0B,*?C>52515(3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3342 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14303 42 241M = 14544 329 GAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGG @%80A*$&A&>,9@;2.B998,8.#=@4.E)D>,0G61F+'-2.4?6;)AD%1$&(F(#"+G?7&4!;(08G(. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:241 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3343 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43353 42 213M = 43266 -300 ATCATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGGTGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTAGGACAAAGAAATTCTGGATNAAGCT #'#'!+)&#$"&*!&&")$#&*%"+&$%*&'("&)"'#$+$$#+%'%+$*#!!+"%#&!$$#*"%'*$'!(+"$))))%+%)&"%$"$!&&!!(''*!!(%'$("%('$$+'"*$"*$#(+)+)'!!%#*$+$##(%''$&)%!*(#%))$#$$*!+&)'*&$#($+$)*$&'&%#)%+*#'%+$%!"'$#!)%#$!')*'(*!"+*$*%'*# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C1T112A72C16C1A5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3343 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43266 42 87M = 43353 300 ATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCANGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTG 8,*.-ADA(:?2&4$&/94-..H*3*&1,6;2'&@!G$,)DDAG?"8,7=(-B#.1C--+8:/7G+;7%0&'>H"0#A5(HF=A)D< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C16T46 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3344 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 818 42 72M = 958 298 AATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCAT 2E1/&)E=(6>2-1E8D*5B*'!1".-/#A&6E1C03$C=>/>H;@2HD,E$07G?#0$-)<<(/B3E6;?E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T1A69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3344 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 958 42 158M = 818 -298 CCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGG C4/D<=*C7C7F2B?68+54*<6=AHD:!-@(2E9F7>>,EB-F4.?G37+":@&E1GC@4'*0+@/(HF7*A%5FA$*H%&?;?E)8G2)BGG61C69C$(7D0G11>)37HCD)>&D$.:'*-"3DC/?*&?372&5<"-$56<$F$/#???%H3= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:121T36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3345 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34328 42 75M = 34475 239 TNNNTNGNAATCTTNAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGT &!$%$"#''$"&')$%)%&((+*)&!*$#+$)&**$!(+*&'"*%!%")(%(*#'%'+'$"()&(#$+($$*"(# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0T0C0T1C1A1C4C27A32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3345 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34475 42 92M = 34328 -239 CTACAGTTTGATGAGTNTAGAACTNGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACNTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCG F%:C*C:DF=#E6!0#'*9(BE/@=!.*%82*%!<&('->(=*GD@.1")7/6A%=$.**B#:HH=!;A*55B?7'<@E08#319>)A/@.&FAD23@+D4+F4G:FD<:77$D@8C-0!,4DD;(=1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T6G8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37245 42 53M = 37345 162 AGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGTACAACTCTCATTGCATG .17:'+C:B;:/!5=!;B7-,$C.=&71'/D%1,F'F='#!D*.=-5)CC?#" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3347 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34754 42 170M = 34925 248 GAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAAACTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTCCCCC 16>.#+D2BD:3*G:A-1?#)'D/)F73%9A2;0/C@D>*582%=6=6&@-3B;D#9E2%!(B;&$+=B"F?5A2,7=>5*7B3#$-?,.15+#":1F*=9-=A((B"/>*71'1'5%'1&#)?G,-.A75+0C AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T38C18A106T0T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3347 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34925 42 77M = 34754 -248 ATGGAATGGAAAGCANATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATA )-02!"9#""=-,+BACA59C7:F"#E$',D($0+7&1!:+&(@D932(7-;H<:!G@A@'<3$(<8E?'68.::&:ACG!"4E99--=$+G.5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3348 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39560 42 341M = 39513 -388 ACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGANAAACATCGCCGCACAGANGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTACGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGACTGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTG '*)?$.%-/-086-,)/.$;E%A63%,2F;F-*-:<"1A1><&@2/,6CC&%%HBB(D1G*1*D(1#?E/%>068B,,D+$45=?:@,G6@9>;017%C.E(BH1:&>B;=7;0#>>>38E,D?6-+,E!@'!/0%/(%6??%-?<7B95'=04;706>E"=)!8>9>7F'@)B!;'0+?+('0G,C>45;A)(.2<6**.;16H,3:;':;F-7C/?8G48>23$FAG:4:E.H"#?"#?!AG$G3@72#98@4#:+$+<,#=/G%1!%48C'?@/&=3*&"A$)=(G+:E)(0ECF-E+:"2>A&(9(<=A? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26A17T198T42A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3349 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7401 42 105M = 7598 247 TGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGNGATTCTGGATACGTCAGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATG 3$$H@=+")/A=+/1$%;A4&5(>)#3$*(3=%?';!GG>5"7-.%C-E.5=?;$32,B7?2):&AD(=/35 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T15T64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3349 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7598 42 50M = 7401 -247 TNACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATT @;*6-5G%5+G,0:<%.,-*A0/$@.($!#/-6<@@9C#DCGF?H)=G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3350 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21747 42 60M = 21603 -204 ACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTACGGTANAGCCGTNAGTGCCGGTGCACATG &?9@G&DG(E/@C#'5'9!>2:74:G8#C/>75AH#B-!!A0&;E&<*:7C39H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3352 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19006 42 61M = 19162 220 NGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGNAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTAT "B"&>#+HBG+)$$:HGG$7$%E#4>@+01@G54+G"#,$-H4-13D)=7A?&#==&FC-% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T27G32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3353 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25806 42 71M = 25574 -303 ATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCA >H<#69!!/E+B9%2-3*<(D&#C/8<0-BB'$EF&,<20G%B3*418*B:1H091/DA#;:,,:85B@4> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3353 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25574 42 232M = 25806 303 CGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGANAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTATTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACANCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTTGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGA A%C8D-?-"@1$0DD=5%#EE5D;F(%5;2B9D0!3:9%:%?@"2E"+3H--:C@E,:%1D8CB:1,H2E4DC2$(=A9:(?A?"D.?&?*47),.#>0%BBH19@<&0CA)%4,1".9($4!1E@#8G75$93)=HH)<&GE0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:49T68C28C56G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3354 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3460 42 106M = 3335 -231 GACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGNGGAGGACGGGC H4EF/9C>"(@)4:+879"-"H5>.:F$/$.;='=+FH*?F31)?,322@>9(1F9A<>&&)$7'BBF:6703,9=>5FF?5-7B8G>$&BC)3.)&337&"/=/B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T11 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3335 42 53M = 3460 231 CACAGTTCCCGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGC ?=E:66;@HB96:?6>B&<(*7%1?&+02)BFGB&>0G?89&3:>@D"&;7&2 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G6C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3355 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38992 42 50M = 38992 0 GGCGGCATGTTTNGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCA (+>-@5;535!)6=D15"<';(%?--463A?>,:%F@D7$C:6.0& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G37 YT:Z:UP jpayne@0: r3355 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38992 0 * = 38992 0 CCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAACCCAATGGTGATNCCCAACTTAGCGAGATTACAAAGCTACCTGTCAAACGGTGCNACGAA ?53*">%90E43E=E9=C<.<;GE/GG.%'04A9CAA3?/H0C&H8'/;1EF4*$G@-%6EA.6C.!+?8G/G1/E'B3B%5):B;+B:"&H,"+'FE673/1/3C)@5)6:"8- YT:Z:UP jpayne@0: r3356 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26826 42 165M = 26991 377 CNCATTTTTCACCATGCGCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTNTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTT *0-&)8F%(7'#=,7-F4A-H!8")(B*%&'A=<=E#+9A0(2=<62;?CD7(8+*B21458(<"/H4783(%+'11-)!FH:!>4$?$#*F&9+H)%?HB''A>>>8>D&!6$;(HG#"+,#GG40?(.:3?C?%,@59*)#F/0'D#5#@:??CFC=='0F"+/8;.!#C=@+9H-/E;E:;+H2B=;3>:C/C$#9B>6G5,7!32H.@0>684B<0!!'%0'+/1(6="18%%8AD$6"<>,F#+G%;71@; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T16 YS:i:-26 YT:Z:DP jpayne@0: r3357 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38404 42 501M = 48449 10093 TGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCTGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTGAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACNGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGNCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGNTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAAC >0*H&6?A-627B+-BH<84-,B+C#*)&68%7'2<)'$A4EA<(70&B<902E%;,,H#'"'4F*&D+>9F5E"4-1+-,0@2"<:)5-*%'+.5!8%0-),:4"'8:C'6@,-D0&9F5H1BB##4336G=C(6=*=!$,>#12CH&:>C%.,F-"GG2"FDE"3!8?<3C2,.C99CEB:*3<#8-./-CC61B8=8FE.'F-<%(=,36E&1-:0?>&0#H?.'C811:=697"2H2'31G@C)1(:H*D;"7HCH'<858G,A'3)/&?#1/C$#:43,&02!A+38FDC73õ=&GG,"C<+=#HCCA&=1)0!&&9371G,.)/4B2==:!$3%0!G3;!H,10A%.F2+>E!!>F78G< AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:76A33C105C96G50G131A1T0C0T0 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r3358 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48293 42 44M = 38860 -9477 TTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGT EA)="4G*#',0.88#."09>CEB(0H:(H*CE432A=9;D,3' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-8 YT:Z:DP jpayne@0: r3358 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38860 42 44M = 48293 9477 ANAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCANCGGTAA '!+$&"$%+)'##'$")%)%!!)!$&(!+*#(#$"*!'+*(#%( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1A35C2A1T0C0 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3359 77 * 0 0 * * 0 0 GGANNAGNGGNTACNCNNNGTANCNNCANTNTGNNNANNNGNCNNNNGTATNCANNGNNCTGTNNANGNCTNNNNNAGGNNANTNTTTCCGNCNTCANGNTNNATGNNTNNCGGCNGNTNGTACNGNNGGTANNGTANAGNNNCTNCAAANCGNGNCNNCNATGNNNNNCNCNNNNCGTGNNNNGTNA $##!#!#""$#"!#!$!"!"""##"!$"#$"!""!$###!"#$$!""$$!$!""!"""$""!""#!$#"!$$!!"!!#"!#"!"#"$#$$!$!!$$"!"!!#!!!$"!###$#"$#"!$!##$$!!""""$"!!"$!"$$!""$$"#$#!"!""#!###"#!#!$!!"!!!"#!""##"#!"!!!!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3359 141 * 0 0 * * 0 0 NGNCNCNNNNGGNNTNNNNNGGANNNANNNTGGTNCNNNTNNNGCCCGGGTNCNTGNNTCACTANNNATGGNCANNNGCNNGTNNGGTANCNNNNNATNNNNANNGNANCCAACTCNGGNNTNANNNNGCNNNTTNNTNNNNNCTNTAGCTNTNANNNNCNTNNGNCAATNNNNCCGCGCNNTNNNCNCNNNNNCNNGACGGNTNNTNNGGCCTNAGGATNGNCGGCANNNNNTGCGNNGNNAGNNNNNNNCCGCCNTATANNNCAA !""##""$"!"!!""#$"!#"#$###!!!"$#!##"#!!!$#!#"$$#$#!##!$"$$"$!!#"$#""!!!"##""!!!"#"""#$$!#!"#!!!!$#!"$!!!$#!#"##"######"!!!!!""!"#""#$$$#!"!!!"#$#$$""#!!$$$#"!"!!"!#$##$"!"#"!""$$"$!!#""!$"#!#"#!"""$!$!#"!"$$"##!"$#!!"$$$!#""$$$$$"#$#"#$$!$""!#$!!!$$$#$##!$$$!#$!!"#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3360 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40969 42 81M = 40829 -221 TTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTTCAGAGCGTGGCGTTAAGTGNTCAGACGAAGCGAGACTGGCTNTGT AC$?#F'.&<00@(%=';!7.)C(%"G.D=%#%FD63%0<6*B!@D9)5@;**3'61BF5$3>4-B'$H?(%HB@=@@G*1'F:.5%8'"F'HAC/13&&?5'1C(FG=.6>0)":?8#.!E*;EE5!F$=%;>."D8>+$6?E57(#A,B3D4$E"B2D'#$9>F9?;34%8+0D==BH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:140 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3361 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8169 42 108M = 8277 235 ACGGTCAAAAATCCGCATGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAG .-C6,B?A6,8$<%86B;-(#9@=@,6,EB',790/D((C.32:#755%7*=21E@-?B4.6H<%(78!0%!?-=-BG.1!.F/FE4+?*=7B+=1F2&-*;4/6C95+545 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:13C11G49C51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3362 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30672 42 112M = 30784 308 AAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTGCTTAAAGNCGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAG 4ED);'97:'052E"?BAG"D37!$3')93C(?03E+!8/->)-2B$$B@*3%<,8<''B,$.=4"690'($%F&!35BF:=$+#-AC>A5@??D'6<>3G4!C/H+81-;: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C7A55 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3362 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30784 42 61M2D133M = 30672 -308 CGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGNCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATNTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCT 1>C'+%.0126&A!:#"/41!)+C"C8&4#'$G#:4''$"&>)15D)CB,;(2$")/.H#"1G>43,7/034+A::*/:4718B)F,#FH*&.'798.8#9$')>DE<*F(3&4$?B%%%(?(/AAD/E*GDA)6'C40>&AH8BA,B((&&)-12'@)*&E6$$9/2$*D(9E,0#GF>>722$G.$>4!-B.@!89.@"84(7C-<=,&*CF-;"&3('))4&G)/9#(%013%52 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3364 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33765 42 42M = 33565 -242 TTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAGTC -/&>4/99G*.F="9D3,.C1'&!#(;-1?))H4"?D7**'; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3364 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33565 42 132M = 33765 242 AATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGC 6/4<*)22FF<:'@62-,H9#*=49E9)8H#$*C91B32*2=>@H*99*0?/#H7B1?C!8@4$/%!EGE)B.*."-=,)*+$F"*'/">A$<+!;17@)'2@(,'C;45!A7F9$+:B: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24T21C47A24 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r3365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17684 24 36M6D34M = 17846 281 NCCANATAACCGCNACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTANAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAANGCA !&*)%)++!&)$"#%++)(%(&($*%&()&'("%!#&)$%%"+!%%%!'*!&('$!&)(!(()+$$#!'* AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:12 MD:Z:0T0T2G8C22^ACCCGA5C24A3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3366 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36675 42 88M = 36541 -222 ATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGAGGCTCTACCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAA .75D<5'C!%70"*(F4E'E<8'E-?:20?00)!->3/A/7?;"*4@G;?+E=?D!:$.1/09E9"9%?,E"8.972*,;3""59'G( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T7T47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3366 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36541 42 63M = 36675 222 GCTTAATTACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCT +10009(+EDH>#.=2/(:E'7G!'#:)3&+$DAC-"*,)$!&,=A..%74,8E@8G"0:;+6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G55 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3367 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16337 42 58M = 16554 266 ATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGA 1=(FC)=GH!"D8H=-.>24#E"5-)7-:10AE90%@DH:*9:#?";+4G79??>=;# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16554 42 49M = 16337 -266 GGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGAT 3F-D6HF)'C1FB6&(D/!7A-9*H!:?=E(9;;6B;4E*)*%.GBD&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3368 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38041 42 145M = 37870 -316 ATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAA .(C1=()1H?E4*:+9+/HBG!E/'0->=-=)<093):1#EA&>F=+"/A:,,-GC/+2/#*:/>,'7%'!H$.*H72/"A+@,B*1!-CB7G'=C.=E<8D543G0*10=. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3368 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37870 42 47M = 38041 316 NCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGT !+("#+%%*%*)!"%&**!#**!)#(#$%('"'("$!$"#%+#**"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3369 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35774 42 56M = 35943 214 TGCGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAAGCCGGGTTATT ')%'*++!*"((*&(+%$""$#*&+&+$$&+('++"+#$%&"(*!+&$)"($+(&+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T41G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35943 42 45M = 35774 -214 AGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAA !7:3-CHA.?*BAE;:8%D3E7;)@>866,"A7-5EF2*)'8H0@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3370 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40728 40 7M3I83M4D152M = 40728 0 ACNAAACATGCANTCGTAGTAACCATTCAGNAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGNGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCANCCGGATGTTGTNCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCG 0G);6>D$.3!4G(.@2F?1;C$!0.07!$9:9&767/F4/-9(%F0F/"(1&'H.:CB!>1!9E46,$7#2F8:>D+H>#C7%)A3%#"+7F$@G5-'2>D!C)B#.(,?4)/-(&&GE*D#C2FBC9@/E8=&D!(;8$%A.<;?66$F: AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:14 MD:Z:2C6A17G62^CAGG43T23G1A9T72 YT:Z:UP jpayne@0: r3370 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40728 0 * = 40728 0 GAGNANNNTNACANNNNCANNNNNNCNTAAAAANNGANACCNTNNGTANNNNCNNAACCCNANTCNANCCNTACTGCNGGTNCTNNNANNGNGN $$##!!"!$"!"#!$!!""$!$!$####"$#$!$!#""!$"""""$$"#"!$"!#"$"#$$$!"$#$$$""#"!"#$$$#!"#$!"!"!#"!#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40943 42 79M = 41114 218 AACCAGCAGGATGNGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAG B"*26,G;$/;,2FB&*.<<;<"A;'4A4$;$*H4"A1/(6,)54+,%'(4./?73D&@&H9C#BB*5*C!&;@#8+C> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C65 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41114 42 47M = 40943 -218 ACGTCAGCATATTNGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGNCGGGCAGT D4$,"5'.)6>=590G=D5<444D81"G490+(:F5D&6*;&+<21# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T24A7G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3372 77 * 0 0 * * 0 0 AAATGTCAGCCAGCTGCTTTNTGTTGACTTCCATTGTTCATTCCAGGGACAAAAACAGAGAANGGAAACGACNGAGGCCAAAAAGCCTCG E1/=?0#(2H);3.)5!:7)A$.C1+HD.)*D0D33@3,F/'<>-$>.3=E54>?<--:&13(>A:<6:*'0E2F71G+=@"@94H.@7B=%.-A4/C<31G,/4BH=97,=CD36B<9#4*+7,.$(?6(C9=/%$).C7-=C>$C! YT:Z:UP jpayne@0: r3373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35319 42 154M = 35201 -272 TTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCANTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAAT E,E*?2-'2531D$@GA?5#-A?/E(.:B@'&>A'5?:5;48795G?56HDFE#*%A3)4-A=H:.BC@)5#AH+*DA)!=!A<,?8582/$=DD3E',60&!-F4.H&F.'CEB73=0G+)+>48?32#6138#C/:B,.GE%*44D&$0FEF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81G72 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35201 42 52M = 35319 272 GATTGAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGTTTTGCGATTCAGCGAGAGAAT 2:'%,;:?2&6;@1=@,40(-(6=3;.4A7+&C;,$/';#1A3'++AH<(>G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T25G21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3374 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40954 42 86M = 40849 -191 TGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGA 1BD?B"?##,B65<2=2BFB14;AH$6'0&,)80)1#GC2F0AB%;3=0E;6(1%)8+5+27AA>?33=D#F?$C&C.5:"*?,F6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3374 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40849 42 104M = 40954 191 CAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACTTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGG +GCH,*=0"%0@9G+H=A/!#'%9%@*4#*(DG!-9$#94FE&(/H&27>42=G/GB&;!)D.AGH(60!",B?' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3375 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11758 42 226M = 11681 -303 AACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGACAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGNTTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGNTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGA 06@2'E:9=AC&164G)5!)2#,2+6C.11AA:A""?"=@":2+F40:/%748)?#+(1>,)="8+BC,)&7.@&6#0.8C+59H*C3@D61;>1"E<0F5)'C@&=:;"$A8(F+,-)5.>3242+>-G3&11(=:%1395F6*$2)F&+?%!<=5!-9?(21;(/3F8(+A=30B1(6G17>)F99804:9,H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37T82A43G61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3375 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11681 42 77M = 11758 303 GGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACG 7,A1(3%?*+-.!HAF0!B=5!?%;?.*#D,C635)D#"F90'1E'##7F9;HF&D6?D+HA@;;*?E?+'*=4BB#G&,<$D('C$*<+'-#D%;F-1F,0>687355H4);$=#>#A($6D4'-..+H(@95<*-E:$)H;@601A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3377 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30135 42 292M = 30085 -342 TTCGTAATACTCACACTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGAGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCCGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATNCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCA )H)BDH1"9;,4E?-A3H#AD@6$#3+B)D+>?&!H>*:@'?>F4+/&<4!AD97$>+/DG5D8G@C&BE#/>F37(*$@:%DC=6D-CB$0'$?7A5'(:$3B$A*17%,5!CE5D/,+/-?D<;@0>F5@#!9D67"/GAE>"+.5)<,4B5"G!B6&7(@0=46"3+A/,29B0D)C$A"#CC/CD*H&D&E8#82;79)<,)F<37='3+3 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14G88C35A56C95 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3377 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30085 42 50M = 30135 342 TANTTTCNGNNCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACC '!(*$!(&&"!#'+&(+"%&$)++!+))'#**)("*$"""!++!!*!+)) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C0G2G1T0T0T0C39 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3378 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37556 42 186M = 37355 -387 TCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGANAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGNCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAANTTTTG 1/0@DF:!&>B-157C3%CE8%2F(*A7#GFH6):#-4;1ED=HH9CE%*9!!*$!#D'GH0EA0!FAA0!E;>-*,'D7,>1-G#EHG:;C."%A3>E<3+,63=<7:F)#-!@/H# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:45A77T5^C71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3379 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12876 42 192M = 12801 -267 GCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGTAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGNCCGGGACGTTTGAGCAGAANAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGNTGCCCGTGATGAANTTCAGACACAGATG H<#HHG(%0'&)70#014/&AG7,F2BC#;5?,4*'H$*3=6#A/#:CA4AD9G<; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:29C27T19T5T79G13A14 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3379 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12801 42 14M4D30M = 12876 267 GGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGG 719-/!<.1&>3**%*8)+'=(?1&!9+C;C?&A4>+/4-/.H! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:14^CACG30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3380 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9621 42 56M = 9445 -232 AAGGTCAACATTCCGGTTGTATNCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAAT &)F4'+(8.D@0*64/3%BHEG&A$1="%>$847,*/@?8E=",/E9&8":.*?$, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3380 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9445 42 176M = 9621 232 TGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACANAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGC ?/3)"C;8*/;60>#DC:7,!E1.!D@?/4F10>G!!07H37?0';837E*.<,.G&D&HF@4-"D9=#&0G3>9($BA8?F9.;78#."B@E<3+@A*;BG2$B.*GB(FH51 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3381 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18647 42 58M = 18469 -236 TCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGT 9,!EF!%9H8B9&94H+-%G#>?""%*4"EAF-B7:;C58)G>H2H:#!>9>?,#81@9&G>(A7B.@2.-A+!-:?5C> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3383 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44650 42 403M = 44602 -451 CCGCCTTGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGAATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCATACAGGCGTCATCGCCGCCNAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAAC 5')7$.CA6?8,#E1B5?@+51C##G=33%!*4D68=23#F&0GG@%;E(#"9(6:E'1H$)5#B##7&(2EE;F=&@50;5:%42&3<,:=+76D+:!+689:@4-E7?+=,,>4:'A.5D95G-BG0<-9A&@.H:<65+:'DB$#G">D*(='<5G-795-(28"D@"HCA7"7+C'H"$';E#2#5-9C;/0$H#029#."'7(??",$#A9>C/%+9F#+@!"FAF4.AA74,?:6FD,?'9-/"#'#>#H0E24).?:*9.*=?DE9/H0<68.)"<0'7==GE:.+G7$!HG,+>>%8?A;>-E=8@>46$:@299C18F!->*=:>E($@>$1DF5-FB0G AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A145C104G19C125 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3383 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44602 42 48M = 44650 451 NNCTCGTTGTGGTAGTGANATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATT "#+)$)+)!$*%$&#'%(!'&#$$*$!"""$%()()*'$()+$#+*!' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C0G16G29 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3384 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11874 42 55M = 12177 349 AAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTNAAGGTGTCTG 0C$0(*B-9008?B/4)#.3(EB-(<5;.0<>%$H(F>1=G>%<7.#83F!0<+& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3384 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12177 42 46M = 11874 -349 GGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGC /0&?>D+7#A:D8:F94.4HHH=$5>5=%G'03&6984@-"=<&(> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3385 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41608 42 42M = 41752 259 CGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTG A@B,?!#.H/E9A*0837D8:@-B5@6,C#+:>,?>6'!'55 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3385 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41752 42 115M = 41608 -259 ACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCT =C7;F,;,.-3CG&4@?#67154:.+%;"./@+A/30$0=;7:G+:2;$41+71:"/4-AD$?9#)'!2*7?9-7A20>=.#.$4,!5/>@-D-&,@C:G$BC'.(D".&#B/$#%/FF#5E+=(FB":/D:((+C83:70#$9&)4#*A+#E+05.D>F,.9149E+.9!(C(:;F/-D&/=31*&4F;-9E:<+$%7A+$#,(%H"!F'2,)6,H*>,D6C?7-$C-(8=);1.F1$'!!.%/F/B3="- AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:39G29A22T26G3A19T138 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9643 42 110M = 9476 -277 CCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTANCGTCACCGCNAGTTAATCCGGAGNGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACC &<6-5%?F0B#G0<=D16(5877;D?E#A6)@"1E+8972"9!C$#/3..)0G=09<#.-)D>*E58E6;0F.6B8@5D(H2"=(6A22H;):F2A>@4BF2'%=%C.F* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36C9C13A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9476 42 167M = 9643 277 GAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGNGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTAT 2(1',>,"1-?>+"26:06$-G-,24'*+55D*F>'5:?$7B0G:;!/48?7*3/D)33/=$3<0/.+329?/*A!(6;"86<6/655@#542.F,F(*E3==D.<5&&C4;9,8%B0:=!?8)6%/A*CB5=,:!8+?B,$@%.%/(H@)*##&D>0"G1D3&F,3,&E;"/H"!AG#+@H$>A*62C'HG=/60!?.E+@->H7-"(0<%3-"'*2-:@3441$H4DE8!'"'"CF.%$0>9A,CH,+(=D1*4C"3;7"- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:194 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3389 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21294 42 66M = 21170 -190 TGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTN '&,?9G,2EE9,*';(:#15&#;-A>(->FB,(*%;'#9F)AD95*@5BC*E+3:E9:H!:3=7F! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3389 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21170 42 124M = 21294 190 GATATTCAGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGTATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGACATCGTTCCGCCTGGCTACGTCC ?1;F<0=%03)$H@1+&"/7;:%!==),;B29F39.@#5%1*=59=9CC$:=+6?C57414(-2&0!C6H!@0%/%;8" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7T29A63T9T12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3390 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26835 42 199M = 26764 -270 CACCATGCTNATNAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTC +(#$*'*(!()$$%&#)%(!*((*%*'+*'#+*)!&##*)'$'*)'))#!&$##&)*+$"+&(%+!!%$'+'"")%"&*'+#*$&!(!+("*%')!(&*$%%"&$"+$(#(%")*)$&+"&)&++%(&%%$"%&*%"(#!"'$++%'(&('*)*&(#$#'+$*'$%&&*+)()#'%''&%#*&+!)')!'*&'+!$$$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C2C186 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3390 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26764 42 71M = 26835 270 NAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTT )?"*=5>(7@5+6.!?37F4F'0;H5*7&A/F*9!??7(2=A:9=9&3A5C=,47'.>B<+D>$H'#07F: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3391 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28011 42 140M = 28011 0 CGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATNCAATGC ,E::3*E9<9<25EA8B*E,G2<24DC=G>+,(*%8.F2,'DDD4"0#6BB'0&)%$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133G6 YT:Z:UP jpayne@0: r3391 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28011 0 * = 28011 0 NGNNTNTNATGNTNCANNCNNNTNNNCATNTTNNNCCGNNGNNNCANNGNNNNNNGNTGTTTTTNCCGNN !"$!#!$$!"#"$$$$""$#$$#"!!"##!##"!!"#$!"!!!"$#$#!!$"$!$!"##$$$$"#$##!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25827 42 104M = 26052 309 CAACGNCATCTACTAATCTTNTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAAT +)*'"!!!(")!!)$$%")!$$)$"'"&##**(%$&&&(+"$$*)*#'(&"(*#+"$)+!"+!*)*"%#+"&())(!*+'"%$&(++#+!*(!!+%#"*%')%) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A14G83 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3392 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26052 42 84M = 25827 -309 GCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTN :,(*>E-&=4H2%"FB(=*B5/&51*&(;?3<#)/;1;+1@,!"F1F,C$'C+2(6*G>@H7*0,4H"2A89@0.=H&'A./<. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 964 40 49M = 797 -216 TGCTGCTGGGTGTNTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAC .@)+4@1%E0*"?C(@HE#D##6B(>#.0>,"@#91%<5H+8=&@F#(,*?27"88'<-:C+7;#FH2?7>:-E&B4GGG46BGA$7@"",-E6C@(B&+-E"=H(>4!>%B9<))94)E6@=3-4,5B;7&?893!G2()D8(06#A+B*5F$3)7,F"%#*+3:<9;%G<)D-,'0>!.3/<#8CH#3,#6BH)E/0-F'15+!72'"18!H*B(*.H6A5G(3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34C14C95G77G24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3394 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18859 42 92M = 18951 340 GTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTGTATTATAAAACA B@@3F8$167/7$@D3GH:"!A>$"-?)2*$@HC1)0#,DB>*!49)(,2!'$C2!'C6+GGF)+:?20A)A/B"DD6# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79T12 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3395 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44199 42 84M = 44089 -194 CGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACNGGCCGTGNGGTTGANNNTNNCNAAN &')#)'#%$!&"#('+)!&"#!&)!!$)$)*(**&'*&$!")*)&'++%&))*&$'%$+!$#$#&"())$'+*!$"'""')&'( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:58A7C6T0A0T1G0C1A2A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3395 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44089 42 103M = 44199 194 CTATCTGATNCAATTTGCACACAAGGNATCGGGGAAATAACGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTC *1+4512$GG84!'!)(0(39$BHDG9'2,(;G),(,/AE7#6,.2-45:$"-BA=4,@$)'D76D&4/70C4&(1!/B6D8B:/..D& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G16T12C63 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3396 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14834 42 113M = 14947 194 GGGATTTACAACGATTTGGNCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGNGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCNCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGC 6A5G#C,*!&46-6C31C!/%03.929F,2C6!&+B03="<8!$F42H:,)(?5:!=F&6&&%%('&+'#!1"!;<)G0C9:75"D*"E>AG8* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T27G33T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3396 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14947 42 81M = 14834 -194 TGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGC ,+9??"A2G:>/%6='.<1"&E-/7H-$@*-45@;.:EH69/2%94A')'7112F#!B0G918*D&H)>1C8D=<,E1*?- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28391 42 374M = 28270 -495 ATGGTTTGTAGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTATCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGCTCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTNCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGNAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGANTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTNACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTNCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGT *>D*.E,-.9D25&@+%C8;;"#D0/%!4+"<>->EH=6(4-$;469HA05F=9G7>0:A#A%2E%":,'>9D7H7;>GG(1,6D=:68./D$01>(>;1:DAB'>!$';6@'++B(.!A1@,43")8&2'BD+0H&E7@-"@'3>=-!'7A.-@+5E)#@))#A7;?7.>>H.H7*;%G"H104$1253H-;DD#!<*)8?;DC25-1=$*%87!B9$1<4>H*>5+:+*'5D.%D'?D9:.?!85&D65*;3+D0!$@2209+G&3)G(*6/>0$(765"!C&4'(>7%.:,8,<<0"6662GE68;5%D8,'=G$5%@C#H859(/=E0$/E5G'*=15"*0B6$+E#"1@G<(4-+8# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T35A71 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3398 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15788 0 109M1D5M2D39M = 15689 -255 AATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATAT 4*!"323?E>9%.>)HB*74A7D"*13,1B#1=:C4<:EB)A,>(3?:GBE"F"-7C"6D!?B=-9B?73.#.*8#B=(+43("-,6?0G"0D>E<1<@F+.A;3'FH*'!%F?'F%(6@H(!3E55B#99870#5243 AS:i:-92 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:2 XG:i:3 NM:i:25 MD:Z:109^T0C4^GG3T1C2C0T0G1T2T1C0A0G1T0A2A0C2A0A1G1T0G0G0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3398 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15689 0 41M = 15788 255 CCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGNGCAGGAGCAG $0*B/+:.;(14D?$0D@EAB:H1&D2,3+11889.:+#+? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A10 YS:i:-92 YT:Z:CP jpayne@0: r3399 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32809 42 63M = 32580 -292 ATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACC &(HGF+#E5C?5">5608#!>*G11!'$<5=?:5;*G9C*A497D#.?46>505-1/@-D,A)5)?,B+%.*":87<-C/#"$7A-)%F*)(FE("4-"-?,A"BE:/-32@58H+D"/6G;/.9BH$2918$2@2?,3C(H7#7F-H:=:&HC,?,3?<0<&<:H9)!$E"2!4+=$>4'9F*,C:! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:83T8T10C103C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3400 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31798 42 196M = 31994 404 TGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTNTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTNGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCG C64<>=%$?AG72$@/##G#.$81BF0A"@&(+HB<#;!BD=4CD'B"8-.E//3"',9@*BFG$-$%-5EF*+A(>!@F,;H%!=@>=,C!1D4&4*-+-$G49!D95="H!(@6$,=.8F@.5!61C#/@1DG1*1$B?AB"CF%HE!,7+&?!$4A%(F-@*'$E%@.4<>@F066$C:8>0%,5&'%2C7;% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103T51T40 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3401 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19147 42 106M = 19279 206 GTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTAT B$81"8,2*$83#/$B:>8?=1&,.06#*,::;/&<%8=>!B=2?33D03-?&")1H-GA:@.@/&;,%%9#8"+13>35E6-?F'(,4,%/*./4@01&/A48:% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19279 42 74M = 19147 -206 CGTGATGCCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTC H!)80>906/A0>2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3402 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34904 42 93M = 35114 293 NTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCC #>3AF&=!A4<<8'H23-:0'<*":9>%"0+G.FH;D:*D+0A0(8A+:>340'1(6#<=2;HHE9,&845<@;(&09EF=H6CDEH9)>D4H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G15T76 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3402 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35114 42 83M = 34904 -293 ACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGNTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGATTA !+)%#**)&&")(%"'"'#)"'$*!!**%+(!!##$+"+)&"+(!%(+!##'*+#'$*&(%&$%$!#+)*((')&)&#+$#%! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34C6C37G1C0T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3403 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17888 42 59M = 18033 316 TTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCNATGATGCGGNAGGTTAC 69*,@*)7/330)*5*A@)80G'H@&&78'38D,06+,#3D5F7)/*E;C7D(2<&))!-<4$.HHB2$>5.E6'H*A*0@B;,/,%C1=(."&-1GC3&D!%06C8.:G%,1+:@#C=$86F-*)957E?"#'/%B&)470,:)/8-H(G+59H8E>:&E$30&+.;+&5().@HH6&"/6C!- AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:7G28C48G24T18C5G27G7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3404 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5883 42 71M = 5999 276 AGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACC 1.E#+1B5#(*,!:)9<62!'"%AF6:E8#F6.?0:;.C9$GFH!16B>@?1GDD7E$&*50-/BH>!>1/)EFFF!&>6> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3405 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39383 42 89M = 39522 189 GTAACCACCGCGACATGTGNGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTANTGAGCCCGGCCAAACTCCGC 5>),;'FH8+04?7.+4%(3=%,6>61-E.B<404HH<=69<<,)16>/=H%$"9H:"=/&*"2(:0*09&<3CE/*D%*47D-24-&"E5B5C>C?'#9>#9'9FD'F7?1:;F,)A*C5**51@!H:>#(":F7=6<-5)#1D?$D/(B51F#;#'&;6D)=E,<AA*/.D55-A,))@!H&C#'*1;:727-6F#?5-9(@34@C@EF5$?:B@"7G"#/2:G@G99%..CFC5:1.':2&D"+9#C: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:200 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3407 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46886 42 77M = 47083 238 TATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCAGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATG %%+#%!($#&%!%*"')*+'!$)&&$'(%(+(#!&!!$*")&!'+*"(&#'#''*"!*&(+"$'%&%&(+(#%(((( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3407 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47083 42 41M = 46886 -238 TAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTA H#(7FA!= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3408 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39992 42 94M = 40172 272 AGGCCTGTATCCGAATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCNCACTACTNGCTGGCTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGNCAATGCG +D-6,0@>&;(?D-B=71*1>67H4<:(?)$#6/;<(?,%"G<.07<0F?'.,5*C6.0:H, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13G31G7G5T26C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3408 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40172 42 92M = 39992 -272 ACCAGTANAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGAN G2!C+<-1"0G/#*C391D8&00.#=7;<1&'@(,7':(0;F)E""72#%%1"2.&7*3ED-,D$:GA58.0)0@9::8@F?,/!3#$%FB-"#G3EF52F2.6$%.2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3410 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47131 42 82M6D28M = 47247 286 GGATATTTGTAACCCATNGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTT 3(+@3(+9,D!,!34#$'93-1,(7==(*7=%69E!36,+'*01>F5DD(0:385$.$75=27!D#'A25>"1C18#.)&"2';9518+!F$37-<.$>%*5!/AE).) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C57 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32815 42 126M = 32694 -247 TNTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATATGTTCTGCCATGCNCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGC FF@8G6B"<-H9,:F)%,0C/3&8:#0"=+)#,;!&9->@)+#10"1CD?;B@G#5F?F=/A7&GE0D-5-6=7:D#6*A"D91-;G6%-&?3""#,>?3G9"=:7#!:+;38#7C:,@?&(EA2; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T59G13G50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3412 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30985 42 278M = 30769 -494 AAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCGGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTNCTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACA %A$>03+02)&5*#0F0&F?96411%%-?@-6F-+14",B.A#$96/;=B9@;D/?@!C%46-+7=96(A5H751"=')1%:@0$BE,$)#/-G(-&+F@<="8"5:@4-06!24>)&EA4G05G-+#60A%6!,.(;0=&:=$6:$&7E0?EF9:5(E9:%!3::#=%6:,5<<%)3C&$=:B'?+4D6*>>/F7.,@'+-64FH06?%4H/D+,0H&;@A%"A.0!"3"7%6)&!")!2:0480*+6G0@"GDA2CD4$>345#D-3)G6E+&%>>/E?'>%D">,8D=812+9)AD&&+?D/1<')=(>E/@$41)1#1H,.!@7B29"A#2DA/)?C*)(BC+A-F>*@,D*(A-2=/3D$!?B8-4/=E@+ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:47T11C16^GG31A105G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3413 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5704 42 45M = 5704 0 TGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACGAGTGTAAGGGATGTTTAT '*!6B7:-318749('3.0)$,G88#@0$5,,=,2'>H0D3!0688C/'92+?$2;95.3D56#57=#3-C<53(6(..!$>F<(4-A"*)D("7#.:?6D2&>C9>83+/AD"D(-7!B#;G-;: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T23T45 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3415 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39719 42 99M = 39818 250 GTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCNGGCTTTTCGGGAAAACGGGAT ,G$B98/364'-2G(HH@13'":/"-(@43HH66!B"6"8,'?640?0D1!:05'4A(6B:9:*'?HE<&/@BA'GB(7*=3#;:;*A9+,>G,;&BE+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3415 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39818 42 151M = 39719 -250 CACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATG 70!+8?#7.;5F215.3F.>%#*C,7<=58+)#9'8,7!@G$%%F&CB70"-/H6"#&'52=!HD;+2"%77=$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3416 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20413 42 65M = 20242 -236 CAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACG A(B.*7<4&;G3;*H:&50@4>5:('5>:0<31-DE/&"#9H@)*?:()>;-+G687F5,3GD8= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3416 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20242 42 132M = 20413 236 TCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCGGCACGAGATGCGGTGNCCT ""*++')##+"'(($$&"+#"#$")$$)!*&($++)*()$'$%(()*)%%$$)%#%)&&!+)&$"#*'%($#"&+)!*)&&%#+*%"'&&!$*+"!$!*+!$**&"%%")!))**%%$$'!&$)'((!!&)" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C111A15G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 764 40 57M2I41M = 522 -340 GCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGNTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCTAAAGANTCCGCATACCAGGAAGGGCGCT :,1%:2!D77:AE8BE5B9"B16CGB=3936.((@.9#65$EA9&2E?*1/<>3A)F9@0).."?&D$?*-&&AGACB,+) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C24 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3418 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29642 42 66M = 29546 -162 TCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAANGT :A3$&&7%E1#549@7601@&4*4C7H?B&5H-!/C,0H*65#B@/(.03*('A->1-)-)#A1%H7'$:BD1G=H)5/("@A2E)H2D8G'C6:0,969#C=&)B,@4%#F*F#BB/%"!:;-6-'9.1%":3'HC.5@.F6G5>?;F/FB)D2'#G9;+$C53480H$?4.4(&E!A,1"9.1H@>/D?'1A2;;>G&F&-0,0#=26*8H!?$4H:<*@=,2*("=0E)D67A%F48-+'!8.:@HA4<;(;?.28$;=.*/$08#!1D/-<424':*>78#.9+61458F&7::%;&1+5#463&B+/.< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11T41G88T125 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3420 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14271 42 92M = 14099 -264 TCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTG AAB'<8A1(>;)*&+59/ED!1D!-B-G"8)#1)G/@/*-.31:8=:618B@E&4="A3F4>.9FHCH46?/1,)#9>&H(!H0';"GH486 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14099 42 52M = 14271 264 TCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCA )?/F+1&04E+2#11$GGA?E$BB'%D78G3$->C<(2&)H:AG""##,-43 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3421 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36138 42 64M = 15759 -20443 CCATCTCTATGAGCTGAAAAAGANACACCAGGAATGTAGTGTCGGAAAAGGAGATAGCAAATGC 7:,#D6@-/8097&=(H67)0/<6E8'+>C6'B4+H&>4,10>:%3@-0'=B!>=*(#==/26" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A17G22 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3421 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15759 42 47M = 36138 20443 CTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCA (/80A5%34&8H5:4&1.;E#:(@):BG2# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-4 YT:Z:DP jpayne@0: r3422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39933 42 54M = 39747 -240 GCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATNGTTTACNAGTATTGCCGN **%)"#$*(%)!'(#'$!'%#((&)*'"%#)!*%!!+*($$*%$%%!)$')&*% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G6G10G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39747 42 60M = 39933 240 GCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCNGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGG +#()8:;>7(7-:HF.%%-D*."-5B*:#&,#/)H.(/6B$+'*3=*#D3/=5F61#.D* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3423 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24706 40 103M = 24574 -235 CACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATACTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCG /@FD@(0&:5;)#!'@*&/>"=34&HH2HC04-#?>()"<#*$:&&!668?H*$.%#HA%3'4<46-7'89A;2G=,<8&*??8,4=4&'41<*&2*E3$:G@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:44T15G38C1G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3423 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24574 40 59M = 24706 235 GGGCGNAGTCATTNAAAACNATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGT !)#"'((*#)*(&!#%&!*"'(+'&)))*##&&$!&&#+$!#%%!&%!(#+()"&%+"# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T2G1A7C3T1T39 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3424 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44480 42 126M = 44706 273 GACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGNGTTAATTCGCT <>:.>#(*&9"$C20BH-?5,1B#;15F316DF)736/"B$-D$&%0"1@HE-6B'@(7<,5C'!5:4.5-4(/DF(5,@3>57(A51H7-,)"A?!=BCBE=;=!(7F:=(F);9<+$'@G>G9$-HA5&'AB!?*=5>F-29E1$10&B(7'@+'#A4+7+#C<:!1.;@300%5./H'46+#(G"6,H$E2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3426 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37930 42 78M2I32M = 38080 261 TTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATNGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG A%//G)!4*-D719:"ADE=G+5< AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:87G22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3426 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38080 42 111M = 37930 -261 TTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTT F1F#)>7*E=H'><'E$'=E6H%<+4$)'##.<"GC*2:@F6'4D34#AG@:@88G+91)8(AC7(/E(%""B8F6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G28C33 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32165 42 100M = 32072 -193 ATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGC 8C@5%:1<=C/'#.=&0-(*#C8?()7F!D&B0E,B%<4=;0D7'B9!0&HD<0%&3B&350A'H='0@G(:21/"=)H2,2'83@B,E,/$,0D#C/**!4D3?$<+1)=,+!.<%F7*4(*,7"?%2F$=0%$E((60A$#1F97?*B'4*=D)*>&*=*:5*37.&'$@4+>0<9B:$HB&":(%?G27'C94, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YT:Z:UP jpayne@0: r3429 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38910 0 * = 38910 0 TTNTNNTNTATNTNTNNAAAGNGTGTCTTGTGTGTCCCCC "&!%#!*"))*))*)$(*&%'#&'$*)*("'#)+'$"$+) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21636 42 86M = 21146 -576 TAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAG ?)G.6>FF9?5192#78*=94,.:)"B3)G@(!G)F8,3):>B+F;H,;,9H3D=*D#@*FB!8!(@;'D=*6*363H08E=>/!.D8,74"5A1?5:39@".E=2G6D8D$C+4(&FH4#A)'?"EB@>,.0E(%-*3?A9&4E9,56;C@6/*A3"5(1#5,:>%6AF(;3$:4#H9:09A,H.H#FHA7-$C4.:6A*7H+&F=;(D-&>F'.F%$D,G2#D= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:119T70 YT:Z:UP jpayne@0: r3431 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23963 0 * = 23963 0 NANCNGTNAAGNTNCANNNCGTCNGTNNNNTNNGTNNTTNGNCTNNAACCTCGCNATTNNGACGNGNNCCNTTCNANANAANNANATNN #$!!"####$!!#$!$"!""##""#$"$!!!#"$$!!"!#"$!!""#$"$#$!$##$"""$$!""$$#"#"$!"!###!$!#!"!#$#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3432 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45743 40 141M2I16M = 45900 251 AAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGGTTAAGGAGNGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGA G'3<4&$.,+'C+*+;*0G$)'$+G40+1F679B61?;0?CE,,(7#?""'01<"25D6D#!=.G"';-G7*F37 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:44A8C103 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3432 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45900 40 52M4D38M = 45743 -251 GCATAAGGCTGNCAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCG .D&@9"7=/A/(C-:%F0-@=6?H2/-H82=4/<>'"H/17&#.+8,@$)B(1F,1"7%41?!#(%>-<1-4.2EF<*@6:;2E"C@2C= AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:11A40^AGAG38 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3433 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12453 42 99M = 12649 246 AGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTG :;18=+.00,C7=C,/B/6+(#?56#0+4-H14,0&"?+$.F6*#$=+H:D4C:","3$AA=9BB673'?34!(D"A&"HH,4,64H)1<*!?#@:CA.*D>"@3"04;!5?C8GF$68D@&0% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:53^T16C75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3434 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41014 42 84M = 41120 252 GCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAG G.B&%5=)33)&HH.8A-6&8B#G=&#./)8(+"DA55E4,%6H6!@H,$:"'/@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3435 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29063 42 53M = 28816 -300 GAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGC $('!*)'$"#(#!#)(##+##)&$*'*'#!+*+%*!'%)"!#"#&'("!'&(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3435 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28816 42 42M = 29063 300 ATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGC 3G'H:+C&E2C:";9(2-4%;#E?'79&<.$<2G#7;H,>>/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3436 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1549 42 59M = 1724 226 TCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCGCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGG 0CG67)25(=%E3#;5%"*1DC:'F>)0>61$D@?##E8G:8331')#C+/F-1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3436 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1724 42 51M = 1549 -226 GATTGTCAAAGACTGGATGNAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTTAAAC 73E9-9,B1=H:9<1/1,C((:($*A6GC@B+;%B,,$+D2(C=;3A=7BF AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A26A4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3437 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2656 42 115M = 2494 -277 CGCTGCCCGNGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGANAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACNTGAAAAAATAT 192040A9/A%37=<6<31;!D9.H3;3H5295A23<(1<5=>=B,09%205%=)&@C5+:A?.1EF5*C%85/>AH=2=*:5E:B.:CH*734,H(D$.>:@4F2)A$;-)B#8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T49A43C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3437 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2494 42 105M = 2656 277 TGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGG 37<;$=;FBA97D,?9",,=D93;CEB.8$&&=+FB@)"/;0B.%:,.&4!74'2F9868.5/8#"D+1A92?C+,?05D>)'<:42E?:C4@2*9@'<:F%:># AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3438 77 * 0 0 * * 0 0 GGNACCTNNANAAAGACAACTCTGGCTTNAAGCTATCAAAAAACTAAGT #'!%##)"$""*+%+#(##%(%'&''*%!$!&%&#"++(%(+*()(%*( YT:Z:UP jpayne@0: r3438 141 * 0 0 * * 0 0 GACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAANTGCATGTCCAGAGCTGATTCGAACCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTT /22'@E(+H*#>+C#5*5#B+@4HD$.'(FGF9H#*&#;$<*@AA@AA;;64+52+482=G-.+B0-A4@A9-&/B4%=*7-! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G41C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3439 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23886 42 81M = 24087 280 TTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTA >:>/A"/(55>+,)!*'"<$?/-)@+D?&;0=/A2".!+A=FB/#4'8&F-@<0>'#)F3ACB>17@#FF&"%4B@CDE&. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3440 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23713 42 120M = 23648 -185 TTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGCTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTNGGAGGAATTGATTCAAATTCCAGCGAAAT (FC5+)5)3-5"$(932#*#=&43.$$=6'03FB0*B+=3*4.&''6&H>-=:C8,0/BH??2@D9>9-9'44=8G"!*1*=.$+EFB;8%#;$?B:/4-%<'8(=)/'(CHB2='7D0* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48T41T20A8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3440 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23648 42 65M = 23713 185 AGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTGATGGATCATTTTTCCAT !:GF#)12E-HC,4+A+-&0)!!$'B<5,9-.3B2:8D<=>D5E73A/+03."$;0,96>E$,($ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C46A17 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3441 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30966 42 154M = 30819 -301 ATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCNCTCATNTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCGACTGGTATTGGCACA @!GH.32H#7@3'21;B.,71?=!('>;!9/2+@1$('6AB<%(!BB'#$>;,3>D;()=5-B*D)9&+@7A<(0(3%948#H5F(-?+F5=='78,F*4/C%4"7"HHA+*@/D(D15A0E*2%E&=G$#3)H%39#A=B"(76FE?+2G3*& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53T5C78T15 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3441 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30819 42 26M2D119M = 30966 301 GGNAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAANCTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCAGACAGA AG5:1+A64(4$*8".6-B%%C0DF+/5?-#)+?@#7='!&"42=59,!,(,49B7(-C2,<*&,./;#-G"&1(63D!6BG9$B1146H3EG0)9.9E9:/).?,5C7=7#E+D6>8$%@)!A5#E(<,E<@8A<2B0E%#GDH AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:2C23^GG2A110C5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3442 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 532 42 45M = 589 201 TACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCT 3F"36&A%H#/7FF@.0"!<,@*0<;30$!F&6&8$:+B1?23./ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3442 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 589 42 144M = 532 -201 CCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGANCTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATAAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCNGAGTGAATATATCGAACAGTCAGG =4";EE8!E:%F/<3A&"92.5,,B9'D.?(#8+7HAC3E/(H)!7!;%5">:8133!"15D/#>-4#H6=%(#"&-7+F2+43<&-(!)31:D;((9A)4F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27A50G40T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3443 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34687 40 26M2D15M = 34889 255 TTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAA ?3D!C#A4C=)*0#E32?+*B1)#6;94H+0+6<:53=A+D AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:26^GC15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3443 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34889 40 53M = 34687 -255 GATTGAGCNTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATA "'8?,C?H5D3CCG*.(((BEE>?8+7,$"3.>@G6@'*7*52>+E::84*0) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T22T21 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3444 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43356 42 92M = 43610 339 ATCTNGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTCGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAA *5C<'E87?8$-"0C/)-+20B"-4).1:..8,*9,,CE--<>@C(G5.;=54;'G>-2711(60=)D'63@-<'.0)6206<<:2#G.&6/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C22G64 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3444 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43610 42 85M = 43356 -339 GAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTTTCCCTCTGACGAATACGAGTTTGNAAAGCCAGTTGATCATCAGCAG .:;>BG?714$EC>??:E<7(@10'5;G30H,1'.F2#;A%2C"(<3;:+!";+&<8+937,8,'80D44""!7$DBD;'G(>00 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38A5T17G22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26638 40 49M3I9M = 26748 260 NTCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGG #C,#!1)2D67"8#BG4*#3D0%FGE&H#92B/.:4H)E?4!G%?;(?%EC-.D6/8&#@& AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:0A49T2G2T0A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26748 40 150M = 26638 -260 TGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATATCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGNTAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTNCNNCCAN *$"'*%!'%#)(*!(+%$!%*#('+%"&(&&*(*"!+$##$#&*#+*$!%"#*+%&&%)&++%&'&''+#')"&"&$&$)'&+$'%#+$*$)*))#(&''!)&!$%++(+*"!*'#+%$%')%'%$"%&)#+('&$+'()%)+*&"*!"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:69T42A29C1A0A3T0 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r3446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5599 42 164M = 5763 278 TCTGGCCGCGGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTAATCGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAA -B?)"4=/G2B!F;FH>0<9C4*:0(70$.$*/@77;5>=DBB0(#F$8/?$',-7*0)+C<;D2'(0/C"+79!G/1/9.24?/;$%ED@!5%%H4+8(!3D@FG8H.&.+=1F1B2=E.67 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A101T1A50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5763 42 114M = 5599 -278 CCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGNCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATNCTGGACACCTCCA %;<(/;4"42=33D<>8,@?;B(#A1,1"@$G&HH@F>?'&(93D)><&#E.3<&?GF+;D(?+.9$*/H2+-2#G6=*,!+:<+765A0H<1;#/@:F>$/10(.>8",:+98 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37G18C43G13 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5431 42 93M = 5578 204 CGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACCGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGA ?FD&H)>+>FEEDGD,#$#E03F0"90%!#4=/;B:B1?/"9#6$-;+5C&#-=C1B(/F,=#DA1:1@.5)0#))99=<8@:%,)35;A*9= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51G9A23T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5578 42 57M = 5431 -204 CGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGNGCGCAG .!/1@"&#&+D?$6HF*?HB#-?"4C'54:+*70/?&A'!)0@!:: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C6 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3448 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12471 42 62M = 12306 -227 GCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAGGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACA <'0.9;,1)(/.4.>B1B6'5&E4A25@++,E"9&)&2&&35%!C9?F'4>&D2+#)672@4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12306 42 165M = 12471 227 GAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATACTCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGNATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGC EE/;:>C'%:+3:D1!A!-6"(!-C@33-E::(719D%G&8*#C&2B=#191-940:7GB(G<07F&!0$('>5".=&2G7536&ED7*)0>$0880CD7(=F-@7.!D$")>#H#(-;>8::,8G#59!-4G5%A8)':3F(%;790"C!C.-A+F729528.7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46A75G42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3449 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3806 42 95M = 3649 -252 GGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAG 8?3C2B8-;!+#6*#1F-&E5*7?A$/F&#G=9/;5$1*;$>2%D'/"4!*H(9,2'#3:%!47.&%)/0>*EE-784F.)39<$<=9.+G4G:D>H767""7'?0B*CE0+,E>-3>3+C(F0(*4D.5D?<1?*F<+H'F=)$'C2@52?!:G$6&.E,8%,5.@0!,)(,912;9+-DFD'.E.2>'4A;"@.=G)!64((E1.83=6""+A=717'4"27'DE1@/4,:'$6$F(=+G(*87B+,CB(%7&#)/(D6)H7#&$=$!45'0!H'>G+C$D7!8*8HH0,!76.4!,<(AG@0#%C)GD"?$FH(*807<$4&;D* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3451 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22787 42 62M = 22560 -289 AAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTA )+E,;C"6E7*7&FGFG,$38G,31,0AE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3452 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23948 42 104M = 23747 -305 TAGATGCTGATANATTTTAGAGGTGATAAAATTNACTGCTTAACTGNCAATGTAAAACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTA *+.H@6.G>.0E.ED2'+>"A=5538A:(,/71(90(&)530$6D6F"8?%:1;6(DDA7HDG45;@>63':79(@5CFDE3&>F=C#5B#9?8:'+-?43(GG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T20A12T8T48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3452 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23747 42 201M = 23948 305 ATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGNTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGC <)B(6?-D6/:4F$-1%*7A7)/$#:&DBF:+;:/;?71>=F@7,5+$F/47&15(+&0"2A?2"<3+4F<3B?A'C.01E(?5%F19)*(4#*0F)=>)7@=F3$41'AA/A6);+<8@'6B)A1/>AC5:!2&9!-;3=24,G.E@0B4"5'2HC!D&@(.5%6H?65?E+F2< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T56A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3453 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26326 42 123M = 26186 -263 TTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAANAGGTAT =+.H34?'-6<(?!8F!;15+-D#<-/27?,A9.<$/2%':15**+&;$<<69:*=2<.H#;@E1.*-H64=2>$,(;:>CD89H)1(C,.?@5!E1-71&)>H0)$76CEGA1+$$$?!;-3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:116A6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3454 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38328 42 80M = 38594 322 CAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGANTGCG ::>+"9AD1-9)=1#@BH!B%*F-2D)'2>F4.'1!&#)$A5,1)8%##->&%!3."'C(86&D=.=D!C7H6>&=';-*@6)(A)F?"?=5(BA='5@8>0E:&?+-(C.3<#8C/;7!3#; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3455 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44813 42 134M = 44653 -294 TCATCGTGAAGAGTCGGCGNGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAA +"*$4*%,+D?253=$AH%$/2)-%C(C@&&.F>/94:0/>?/#B<.-=9*-5G&.A-/?CC2.-?F*5'5>;)55>,-E+9*+H6D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A17A114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3455 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44653 42 54M = 44813 294 CCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCNACCATCGCAGGCAGAGA :?&0.+)/(0#E5?A$D,(>+&/6%AH-39+/B$?G0.5!+"#F.1EGBD8";3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3456 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41420 42 114M = 41203 -331 AGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCT ,40-$,4:"&-B+2,8D5@%4!6*A1BD54?FFG93*)?BC5)84H.<643: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3456 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41203 42 217M = 41420 331 TCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATTCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGNCGGCGGCGCGTTCTGCACTGAC A"E%DEE2&>)68=:5A6H*602?6$F'91"(668E7('0.!)/"2(9;FE@@&D?66A6@99H,"!CFD96$*>4=F83*$,;!874$0*<./?2-?;)8,2:=F$).2F6&'+7)DC4!<=-:D/2A67437796>)1,)F&E.=F7"D%/7,H0--7";E(G7=45@E?DD?!#;@>(!5",.$EA=!C/)9.B*#&2=,8<1E2F<;2$=@D:>?*(*;+)><5"EA7!?G#0>CD<2AA?2)&A$%8)%C9B"7>&'2H,D"F"B,HG5%(+,+=D81/FE!2@<65$G6H@1!E&355F2@"'B(#!#85-==8.;+7?*$F+>G>A6(&2"'5)(?:A-'3B7)*E96.>0D/A+)3B2%! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:69C5A63G1T40C0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3460 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6496 42 63M = 6496 0 TGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCA 37A0B'!>4+3;-H*$DB8FC4%'+F5@C%F2,=F49$4-%2B0<.&'E-G9B;$*G;3$>-491@%9>(>443;'.>A7=.$7:!9/2B'+;.2F866:-525(F6<:H*();6#?"E"F270/2'%)60/C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47G65G10A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3461 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10840 42 101M = 10701 -240 TGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCNACCGGT )>",+B8(?1'@21C#0G#9BE@GE6DE&('9(;EB7;>&?D155(+B;GBEE.-H-*;!(C<%&6&8EG%3+A$B>B>:7%992H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15047 42 121M = 15168 251 CCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTTCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCTACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGC AH&9HG30-)@GHH&<&$2<>9;&F05C46&9&G"%/1A'C:7-7G+D@6:C>46@58-$@.$<40CD/)4#'"3;30;=D@@!?5A.7-*+4E++:?G""%0<$,/8:81H,4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G34C32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3462 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15168 42 130M = 15047 -251 CGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGCTGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTAT 6!6F>!(614:9=89.8<%$"1+#C$!"CG;FCAG=#,)0*$*"DA:.A-"$D7%8F,+*'()0(A#27/8/E+$H('D'8!5@GE3&-1?.B(-2E8%(H$=B;$;-2;/5&0,B+&DEE3DA%(EEFE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A65 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3463 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23473 42 64M = 23155 -382 TCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTGATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTA $.A7702<::-(&/5%D&5167A1D'G.C@"0E@9-4<)<1>;8H&AH5>8>%-")+(6E+!H$95-83.3<;()E6969H+/%)E04;+!26$15$+EA:'$0G8B53C;4>B66H,8!=9&.@',-)*@,'6/$D(A63#31?(A!*&;9$?F++F'#0!2(>''$!*54,$"!A2E%.=-7,B2*+E$%'H+-E#>18>:E"/9:C/3B>C$9=(;A6+BF%C#',2F+71>5C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T90A110T110 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3464 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 378 42 73M = 202 -249 GCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCA 7(6$?$*5:9BB2HC?("*3H@+1'AB7.5B12-).'01GEA#'F!)=GG-1()E!/G52E7+%4-9;E'F*9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3464 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 202 42 128M = 378 249 CAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCANGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCA <%'*&EA9&,;#,9"50%"!,71$G..*..7)1$47%/36;'%%=>G<#H65A*0;+A)/CE#@(6/>E5'F$48,H*G*F%(:04%@4EC3A<;1):4E4: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92A35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3465 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16069 42 58M = 16288 285 ACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATG E)E9B4-)@=:0*(A!(F$6:H(1,1@>"2'$"?4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3465 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16288 42 66M = 16069 -285 GGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTNGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCG "%($&"%%%&'#)&'!)&$!&$)('(#)!"+%%!%&$)!*#'(($'(!+%+*%(+!+&&$+%%+$( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3466 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47831 42 47M = 47878 314 GGGNNAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAG )%!!$+'!"#''+(!***'))''+&&'!'*+(#&&!($"$%*&)%)( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T0T0G0T42 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47878 42 267M = 47831 -314 AGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAANTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACNCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGANTATGCCCT *'&#$(+%%%&$$*#*%"''%&'#$)''#&'")$&%')+(%"+$%#($)*(##$&+$!$)'#$***(+%(!#(*+'*%%$&+'+%')%+!$"!%$*'%!""$%"!&$$('&%&#$%&+*$!&$!(!+)'#!"&()%'('%'!&)%&)*+%%%!)!&$&')%"*$'('+"'$)%(!%*''")+%"#(($"$'&+%"+(#"#*&&&'&#$)#%($'%")!+%+'&"#$"*&*$*'')"'&+*%#&#*)%&(!''*#!'%($*)"++'"+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:15G165T40G34T0A5T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3467 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41390 42 153M = 41543 260 CCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCANAGCCTGGAATCAGA ;/F4+$;F)69:";?5:+D@/8DH@!;H(E3?498A011;:.#.,7,+.01*<($21&%<%6"7BE@+A=H*D*F$67;"30""-;2#'E50/*CC6"8+F)>(75"%4/G$G(:"0(H@9/'#.;06E*<;-57C2-4GB%AB-(-,8@+/( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:138A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3467 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41543 42 107M = 41390 -260 TATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGANTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTN )D/1=/$('7!#8=.&'(?C'4E"B7B489'8-E94!+<-9*%?%836+,5?6@49A?/G)=/A.$$,"@!-%D9.'F!82F+>GB+5:0&BEE$,D:<)2FE+C&/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T37G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22669 42 62M = 22445 -286 AATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGAC D?=>D@>5,7B3B<8.G%&66#;.G6%&FH:3*9.8?4D'CC4=+?;;:B@A,.?+;?AA6% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22445 42 172M = 22669 286 AGGAAGAAACCTCGNTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTNTCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGNTATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATNGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTA 11$"-8+$#!00CE.8)B',87G/3;88!"2+-='5;#!4'3F'B1:B"*:FB=AGGE@59E?D,H4!-FFC""6$<70<3+CE1!)3AD744(4/B>F/6%;&%++7A7D2*:"448#"/##"%.%C*.'+G"+$;%="*-1;:?')/2%%73!521*-D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T21A41A35C57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3469 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33524 42 127M = 33287 -364 GTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAACCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCA DF&=DF"%?>5",B:'%2,2CF810C-)*5&82>E(1#+-<93#(9$ED?"+96'"F2',&2(4(1B4)E8=/968B*9+/HG$79D6;-F766H9%;?'(8A*<4GE,"AB,"%#$%,?,A-2#$9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43T23T59 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3469 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33287 42 237M = 33524 364 NCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCANGTAATTTNCGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGNGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCAGATTGCTTGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGANAAACGCCTCGAGTGAAGCGCTATTGGNATGCG ":@B4*30'157+<@!96A"H*&-4"?%#"E51FH(GD93G)C1>8454?H1<%$64!#A">8AH'6A;(BH&"">-@+F@A:#4*A/2=+-)H+,;$$0!H")F&?5%,$3+G<9;>4**C83<:C%H/?):H*>5G=!&H47B59&*G,'#/?<;&>2E/44:/+=47(317?B=!C8@+<$G&..FF:8?=&A7##-20&@-B!/6!9<2(G=+',"C9=072-= AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0G96C7A31G31T5A28A19T6T5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28757 42 363M = 28712 -408 TCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCNGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATC 3@"1%A+>G0;9C659AH=)/2'<5GE"FC$7-8,4-;CB70A*>#B!8(:2%>=/BE9!;-+GC6(E+5,*+F.*5H107<$'=27!C4"<")*##:6;-;A(-BH9GDH42!7*"((B5/'$G&E<@*!.;D+&9(><;8A)1D1);D8-=DH6BG4@3G@,?46?<+B=C:3-:&(C7@F3/-1H3G%(G+7-5:F).?91E!8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:287T75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28712 42 45M = 28757 408 AGAAAATAACTCAATGTTGCCCTGTATAGCTTCAGTNATTGCGAT !&*+#+'%")%**)&"$"+*#&*$*")$*+*&$%'#+%*"!("*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T18G16G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3471 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4405 42 41M = 4209 -237 GAGGAGGAGANGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGC =1$%5D-9<7)%7DG7C'CAD:E.2H-($C=+#!"481C40 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3471 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4209 42 71M = 4405 237 GAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCNGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAAC DC#?3-/$2$"FFDE21?&5CH#(@2F24/$;D-<2#1>6,=E1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3472 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25996 42 80M = 25838 -238 GATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTA ?#'F9(FAHF'>2!+/;D37*2$C<&20(A0+B!!+@&./#F?7&/.09+806$>#H:7$3H3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3472 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25838 42 158M = 25996 238 ACTAATCTTNTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCTACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCT $'"#'%)**!%+(!&!&)#$+(&$%"!(*("$#*"(!%(++$)!)%+!%&(#+()%#!%)'&"&(&&*(""*(&)(+!)*)%!%))()(+$))"'+"$&'&%*##"!#*!#&''&)$("&&!%'&***""#'+!+!**'')'$%##&"'$)%#$%**" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G94C53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3473 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1132 42 61M = 1132 0 GGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCNG CHDC6D32'9,?(9/<#518>246/GFD#>+)$2AD"/.<@A(4CF(,&7;'+;$;<2.#* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G1 YT:Z:UP jpayne@0: r3473 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1132 0 * = 1132 0 TNGGNNGACNTTGTNNNGGNNANGCNAATNNNNNNANGTTTGNNNGNCNTNGNTNGTNTNGNAANANTNNGNGAGNTTANNGCNATTNN #$$$"!"!"!$#$"!!!##!!$!#""##"!#!$#!$$"#$""!$!$!!!!#"!"$#!#!""!$!!#!!"##!$#"$$#"!!""$"!##$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3474 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44834 42 41M = 44725 -150 CCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAACG #G8H:#-!BE38255E=4.4)/"7F>EH>D<3A=$(1-+:: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3474 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44725 42 75M = 44834 150 CCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGNTTTTTTATATCTGCAGAACAGGTAAG E&6(;&'+E,(#)/3?F%C85+:8*'0*F3"=:+$%'/@1%%5-@(?6!"?0%C",D>5)G3A+?EEA7?G303& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A15C10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3475 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2078 42 6M1D174M = 1987 -272 GATATCCTATCCCGTATCTGCTGNGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACANGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAANGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATC =@G8D#=:@*"C!$"=/266#.1@%<6*CC&;G<(GFEG9#03.EG&(D31GE/B)DB%8#@*0.>B??'!'=D/84.D,E3.'2$*(F+7G)4=*?D4?8>?G!!3-(<)%B;-2=@21;7#, AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:0A2G2^G0A16G20G29T27G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3475 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1987 42 83M = 2078 272 AGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAAT .010D'&.!4)-+H),$-)-+'*?5HGD:,/;--=AA:5"A0@D$&G%8,"4,E6<"(>237H#;0?)7??3D<@D&73,)H$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r3476 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13729 42 248M3D11M = 13649 -342 GGAACGGTGGTCCGGNGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATNAGCCGCTGGNGCATTGAGCAGTGCAGCNAACTGAGCGCGGAGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGATGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGG '2>!G$)F@/=H&$C9%AHE45=0F>H82,$2#1%.1&C"DH1G9+&(0.9395--B!30.0*&H-<',/F,!*>G1H8$)44;0#$&$B*&7(=8$#70.&E(/%.C0E+6#C53>2+7>*7.(.&-=')A7$H2E$=,6G,,=F;/*@):E%2<-/;=&D'5#68.:$/3(#(0B)A;48-D=!0A>6#H=,G'.?@D05?=:2*0"CC'15&!2E(@+%*37.9E!6,:=2:01)'+D!,"A AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:15C79C9C17G12T98G12^TTA11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3476 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13649 42 49M = 13729 342 GTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACNTGTACGGTATGGTCNCCGG +#%!!'("(+('$')$()'(!!+++!)*"(&*+!'"!**(*!%!*&+"& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C14A4 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3477 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9463 42 106M = 9275 -294 GCACNTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACGGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGC :"%"BGG4-(!<;85<+#+-3=,&=+?4:G-6G5,?252F1=$3:?2*EBF$GD"*0*$H9,-'>2G!$E89G"/;>*G@38AF.4E47A81&6G:E)A+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C59C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3477 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9275 42 104M = 9463 294 CTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGA 9*F(,H('7GD0HG,";''92/)0F:@,*$)42(?>F:5-.C>3*.02=29/89#/%@:@/#-96/A;'"&938<8/?8;.EH>C0,>?8@>0@$)&<1C18:: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3478 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21934 42 40M = 21696 -278 CAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAA 4>&;%4B1.E#%1D.*B(BG;+G*9=0#B*18$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3478 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21696 42 73M = 21934 278 CCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGNACAGTNANGGCAGCCACAGTCA !+,&7*713B1,9/18!2+GH<6:*90E-C0%"#8%C/C,"-(,6%7812B?965>C7--';1"H+; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50G5C1G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3479 77 * 0 0 * * 0 0 CAGCTNNATGCGCCAGCGGCTGNTCACCTCCTGCTCCGGATCGGCGTA "!#((%+$&!)+&''+!%'$+"+((#$'$%)+*$"#)((%*#)&&")$ YT:Z:UP jpayne@0: r3479 141 * 0 0 * * 0 0 ATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACNGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGNCGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTAC /B!),"1B%C,2:%!>?D0G.B&?>#G#5"*5;9H!"##*C.B0.89?'E6333?F),<;F=%"<>@1!9'9C5/";;,G8%.:+55%?67H?63&093/7AF4%B)3)26A8A*$2"/<5:!>;6>"&=0H1#7;82:&&9!/'=,5A@?3C.?A7(6!*4%9)+7@="#9DH>G<"%G!E=:)BHE8EA7!) YT:Z:UP jpayne@0: r3480 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28727 42 65M = 28546 -246 GTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCG )&$#'$)#)"(%$%&''%)!)$#&($"$#(*$*'(($$&%"*'!!+"**%"+(""&(%"++)%+) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3480 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28546 42 78M = 28727 246 CAGGCAGACCCCTCCTTATTNCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTNGCCA @'4,@D#B"/2&7+:**.,(B@B3%A0./G=+E1$139?;!5;3?.>#<8/F@@G.A.$)/@$9G=:;;&"$H5&A?# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G52G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3481 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2322 42 87M = 2186 -223 CCGCTTCCCTGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTC 63?#4>A')$)(*C62"2/F#8C7"6B*GG)3E&=7$8#*G*(,2*;!'0A'2A(<%6#>?.#5$+9>:7EB$2A".=(.11,(;-5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G77 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3481 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2186 42 136M = 2322 223 NTCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAA !&A#*4&#HGB"81+59+@%.>=3A8%H#9*46.,9*"!6$1/*63-B?=9,@G+=*!:@A>/9-.",200!%D!1+,,=(76#6/H=(4B$!;$!2D!'$&594;/2,"8"BC30>G;,=7C$@$*>;0*' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3482 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22489 42 161M = 22669 254 TTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCCGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGA >>=94<(1@;E(E:>),0<(;"/,7G9+;>/!#1-B"!GB2:4>%?87G?@"38"%3)%<.0EB1/4>:8C/:+%@?@!8'D#4$*2E4-6E5+GEH<&&5?%%(&&-"8$;'C/"0)@B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T110 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3483 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26802 42 154M = 26721 -235 AACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTNCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAAN ;79$"946D3&)D+,4-C#(A%H>*(>1F#;("'H:$!B0A!#,-8A6AG9:G6@-'#H:%1;A!...4C$?A57$*$@!/"*%/2F2! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98G54T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3483 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26721 42 71M = 26802 235 AGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAANTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTT ,F"3.A31,$-*.(1,>A#54#F&-$BB!)(%?D"6&GD7"&51!/C943H.84.<%%'"!#$>.'H16$@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12154 42 218M = 12022 -350 ACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGNCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAAC .&=CC$C?,B5;A*;,A6-EGG/(C!7&25++$-.),$AB4!/*0>A,E:>(/!A*'0>-=(ADH0%'GA,/9?(=F/:84;GE:;BBBEC79>,'0#$2?AC51"7;@@G&!8!@)-44:1!946:/E):9"69%<03@'.#H>5F"F.<4C:C@?2@'-B$*>G/#4C.>(6>?4A7!AC;:-$B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:162C55 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3484 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12022 42 132M = 12154 350 CAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCTCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCTCATAAAGATGAGACGCTGGAGT !1C?2@7$'7H*'=E331321@DE((9@(@,#3)4>#'.7(*"147(06H8=6-.0CGDB,?%%4=.BC4AG);&@#B"61%A$F:"A$%$)?C9$!CD7>/3D3B"+%/H2C9#:H#+$17EA6+=,-B&G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A66G41G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3485 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24297 40 50M = 24400 210 CCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCG (*$+*$&)#')+&###%*$)*'*$()"!$(&+%"''+#!("')*$++*)( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G27 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3485 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24400 40 107M = 24297 -210 GGAATTGGTTAGCAAGTTANTACCGGATTTTGTAAANACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCNGNTNAGCCTCNAACCNCTCCATCNTTCGTCATA !+&+!&%!*+)'*!!'('%%**+##(%%*&*!+)%)%!'!*+*++!&!%*%+##*(*)'+()%##+)')!&*+"**)%*)(!(#!$*('!!((#&*("(%%#(#'%$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:19C16A36C1A1A3G2G0T1A0T0T0T2T3T3A5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3486 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21458 42 51M = 21637 222 AGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTT 12)@*1A'=F12==00'.'92HG;(03?65D;=01H(>1%4F0//2"@@>% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3486 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21637 42 43M = 21458 -222 AAGGAGGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACC ?!H"H(%>H(>B7&C9/<(%F2&26A'G'A<512)#(?:H?+8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32826 42 86M = 32651 -261 GAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACACCGTC &,G9A?E,5H,@!G13/+B.31E144<&0$7C-G:C&0,D84@3&:!/B&3C#!$:;#G.37#(C+93GG$;)=#G@. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3487 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32651 42 115M = 32826 261 ACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCNATGCCGAC *8,<$!$)24)'1%&:@%3&*=C@H4A7+)!4/:C7/7D#H'%5"E"-0()8)#%'GG>+./!6?<'-8'@5H12/&GAG2F70<'@'?H9$##7C+CC-9=B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106C8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3488 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6692 42 67M = 6912 270 CTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTC 5!>5*7;/2G,<.)DH+E;&)A/B4;$3@;$50)/5AG?+="3F>$36A=&%AD;=<':$'G<2;-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6912 42 25M2I25M = 6692 -270 AACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGNGAA <98A'..('A46"";:$>?G,3G0?&-B@,?#?HH3'B7C* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:46G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3489 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22445 42 194M = 22165 -474 AGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGGAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGT **B>!'565"0B?34&=823,A"",47",+42+67((A!G528F@?'#&.7$+-%@@/+=%3CG49->#$D&A?+0"*94A&A<)ECF(8+8H/'07;E56-)D!C2(G8:<7E-<"B+=43AAA6./7C>BEA@=E96"-G6FD,:0&70>*$:5G>D1/E!./>&C,!;)!*>F<8(&63;"A.8+@1''(/376BBGH'D).+ADGG@?+"<(3:.:%7!!;))/AG40&:%3.8%2,+-(89$3)'-""5EHA.=A#*5AHEAB&%)/09D;2/D;&?48D=,E.B'4#:5>-31*$A1A$161% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:146C21G86G0C23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3490 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43141 42 68M = 42894 -315 AAAATACGTTGATGANAAAGACGGGAAAATGCAGGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCG )7229+!#F8:04??:5+A.,"C6&289%<338;866.-9C!B3@,D:=78:DF8/?F7>/&36+!&E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T17C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3490 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42894 42 102M = 43141 315 NAAATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTAC ($)42*1:3'H+,;9(#:85'E/>EE&@)%G:>9:<%B*@A+?FE78*9B%&#D,E!6;G=08B76'G5.>$:F4A5@&G=6%-!H>H("@-@.-,:B$#)276'CA,.&&A5;21*>-F8.,25-&/).63&3:!10/(:77-CGD12=0.-*H$9D6F%AC9A8-9@5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G56G1G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3491 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7135 42 55M = 7333 280 AGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCT >8".EDC>"3B)-"@>>H.58;'4B:>&.8*'!C6#?:5-)B7>/8?$,0A&E+; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3492 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13182 42 66M = 13289 156 GCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGNGAAGCTTTCTG A?+5>,!9?-346&H4C+??)'E&3H&2<=+.2:*H"=!(9+3"%&=5D@$%H$;&3"B6A)-#8! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54T2C8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3492 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13289 42 49M = 13182 -156 GAGCACGGGGGCTGGGAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGC >-';!9/%99$<,'F/6)AG(EG@!5<(%D=-#BG!09)135 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3493 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17197 42 118M = 17007 -308 ACGCTGCGCCAGCGCCTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACCACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCTTGGATAACGGGGCGC 582';A?GH8;H#1'&6H-F3'"@5AC'62-5B.A2=<;@,F/88--!@1*=D>#3("-0=A!@>)'!AC&43&*)&F/:!A@4A(-4(A>-%(,>)$>!4+99B'"1H%5&=8#+', AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A30G56G15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17007 42 92M = 17197 308 GACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTCAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCA ?%!81*-4!A#E0B),(<43!"-0@4%.AEG2(>?5:,?8H)CD9!&2#;D/.9%'-/) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G66 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3494 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1805 42 76M = 2018 266 GGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCT 7DE.1?".26/,,&>&(0#/)1;H71*,,#5CD0#B@B(A@&5D'=+<$><<$H8!+H(;1<%C!@G@:?#+HB>= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3494 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2018 42 53M = 1805 -266 GACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATG A4.A>>H#-<%71G3>'/3(C=35;:0H<6B;HG)'%B(9D'3-#.#!#B!C< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3495 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23945 42 46M = 23991 317 TGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAA "E+0'F@>1F@G@@(%$)((D4(E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3495 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23991 42 271M = 23945 -317 CTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTANTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGNCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATT 8GE&!C'3=)(A=+?ABD$%?'F4,(8/BG3<5(5EC1A10?)7=94&CF:B8%E*@*"4E:%G1F9?H72595H3?62/;(%=(C9*08>DB>?>+D12D86=G+$!?(BD8=-B86!5FG@'>#%F?&(3=D7"->!*14)G./=:E$&4039B?C(C8-3"4!@D@94/B*#-D#(2*6G*"!$DE%=AA562$$86"7E+D!==;-00@+E?'G4&CA#/9/'%'3$'-+.G?+3>$-@2C-E9F;?8:C0-2)3;AA<&B. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:111T21G137 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3496 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23911 42 43M = 23747 -207 TTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATG :?'00:#;F/!G/F&/1,/@9*B(!*D)5>EG/81(&(8'HG( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23747 42 51M = 23911 207 ATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTNTTGAATAATAAATNTTACTGTTCTTG D":&9(7<@0&(:+*&H="".>@HCH5+,H@(C)<=D%"-.'H;4#8?#&B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T13G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43717 42 88M = 43892 289 TCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAA /G&5&"EF<%A.41=>E,H3+;E12;/B%.G!&E4".!1D168H>$;?B)7//19G60;(6<3B>%&5G0(#A0"'<7>E'E>DED%'C1<2?081,#3;F+F9&-D*C0(=;(-"-537E!"&<:H!1'6$G)19!6%). AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3498 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4018 42 128M = 4169 201 TNCNTNTTNGNGCGGAGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGTCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGANGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGA &!)!)!!*'"#&$*"!*+"*"*+$)%#($&")*'&)'%*")*(#'#+$)+!%!'#'*!*'&$&!+!#('"*"'%*"!((%#)%!*%"(!%!)+!'*%!"%+!)**+"*%%'$&)%+&*!&'"($"$#+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1A1T1T0A1G1G4C23G28A59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3498 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4169 42 50M = 4018 -201 GCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTT '4))G6<#4&33,1?02&+@G8?/B)#"//D+:8;(7BH&9-B2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3499 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6091 42 62M = 6091 0 ATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACC ?H7D2BG*-%69)B(4)&6-3/92#D;#)((HB?.B-D+3.0".%,8-2=EC8HAE!,"0-5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YT:Z:UP jpayne@0: r3499 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6091 0 * = 6091 0 CGNGNNNNTGAATANNNNANNNNTTCCCAGNCNAAGANGT "$#!!#"!$##""#""!$""$!!"##$$$$"!#$"$$!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3500 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41834 42 65M = 42019 314 TATCAAGCCCTGTATCNGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTC <<;&CBB)2%99.A"1&)1CC'/D,<34G8E5?*)A5CB0>5/8(D(.")F2("657:@/>C1?) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3500 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42019 42 129M = 41834 -314 AATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCNCCGACATNATCTGCGNNANGTGCAAATNCNTNG ()'++%#*+%(#!+)+!&'%$)$)+(%&#$#&)&$$*!!#*#"%'+((("#)*'"**"'($%*($+"**"+"*#%'!%'+)'#+&#*)"&#+"(+$$**'(+&#!*$&%*&$"#!!)')))($!'!$(! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:95A7A7A0A1A0C7A1C1T0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3501 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11009 42 79M = 10832 -256 CGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAAC ";%+!8?7&C6.B+9B4-5G@.,"#&G8)H.'E(111E0-B?.$A=%%E?--FD@'6%4E+G"F28H6-!?H=)!4#;* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3501 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10832 42 177M = 11009 256 GGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCNGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCAGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTC A3?4@AHAE##72E6-=D3$=1!$BC8%%3@):C##5@&03:"5B@2@D!E2H@39,?$0+78G#8C6$1,*0?%H(*1@G7'@//%@:DA%0(<3$A?>#C"(!;'>9@>)2+,;<%9C<7-,101<@F5,,CF#++!.@&&>7$AH&C=&6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G120T30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3502 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 223 42 138M = 361 257 GTTNCNTNGCCGTCTCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTNTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGGGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAAT !)$"#!#%($&)*!%$''+!%"&(%(#+$"(*!"'&#"#!*!!%#"++"')$*&&$&&)+(+(#+$$#(%%+*!*&"!%")**)&'"(#++$#*'*)!"#++"+*!#'(&'#%+!&$!*!'')'#'("!"&'&'#!$$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T2C0G0G1G0C0G0A2A41C27T54 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3502 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 361 42 119M = 223 -257 TGAGAACGAAAAGNTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTGTTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCNGGCCGACGCAC /02<0"9.;7A#4:))#+22D):)!1%?E=)H&'!2709A+1B)/1!;+!517+#("5+:"BCEG<,(2@)5<;$948F.BG/3<0F/#D812!*."7(,'?)?.?E*7;D. AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13C28G30A33A11 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3503 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28141 42 85M = 27980 -246 TATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTNTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTT 39584E1+'C<)(?*D340=50:1(+,#D#575/H(!@E/"4*&#;%H;%&2(4'0.&8#7:&7A9F"*..DCC"A%.5DC&"1B:"<3-BD?%FG!;+<5?D?%$)D3#,'7#+1#=>:(4+=D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:129 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3504 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 254 42 175M = 429 259 TNGNAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCNGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGNGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGGAGATCTCCAGCCAG 7E<@B-"-75B&?599>:3+"H'1-61)F5%4$F'21A&/2!>4.@8HH7;%389=*,/0;0(/D1C.++>&!E$8.%-$@.C3A%=(%72"9?1,!105 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1C67C23G53G10C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3504 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 429 42 84M = 254 -259 GAACTATTGAGTCCGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTNAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAN *"#%"#(&)()*)"&"'!%&)(%)$)+!*&++'&('#*)$)+'+&!'#%"'"!%+$"#*+%(&"(!)!(*$#$%)&&'((#+&# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12A45G24G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29090 42 70M = 29277 371 CGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATT GB',()#$-GA)$ED8*>$1G);679C$H&1?&&<%4B?$HA$/.5>?FHE<9.8!5=0738',.7:.(0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29277 42 184M = 29090 -371 GAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCNCCGTAGCGAGTTCAGTTAAAATAAATCCCNGCGACTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCNATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTACACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTT $:)='<@0G%(/?CA.&4-7:1&8C99@),6?"'#*2"#-9%EG!#,))1?8,&ECG?*2*CG6:!#+2-F?H3.>#..(>E%#H;3,+)(H=1?+:H"4B<*03:2&3<3?H$26*9%@D&=8D5:=#8,.:&5',4@$5!&G=>,:;&/C*/5 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:34G15A13C4G36T33C42C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35691 42 62M = 35941 309 NGCATTGTTTGGTAGGTGAGANATCTGAATTNCTATGTTTAGTGAGTTGTGTCTATTTATTT #5@B="F."A>)D/:GF8116A/@1?&:>/2:D7*5>G#0,6/*&1F7E";<&45 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G20G9G18A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35941 42 59M = 35691 -309 AAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAG @:7&*E)89&.091?$@:10+C5#C:&A@B=>/?!'2H(@4')0-9:&5-:FH<7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48155 42 70M = 48010 -215 GTTAGTCTCCGACGCCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGA C)'F0?,#(:1,?+31D+43-*-4@B"2F9=%)/;E*4+"06:-?C78*38&90),9&49*=/C0'C,79 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48010 42 93M = 48155 215 GTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCG ,4)'?!,1,+5>5&3EFEA()*$A=90B/GC&-1>,.#>6:<)AH-//:+B&%;7C>H10&*'*%,@<8G65 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T1T21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3509 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20901 42 46M4D222M = 20861 -312 CCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGAT 60B-6H0G&!&?)4=6)$/0E%HA&>4(+A071#D.0:4C1=CGF8$F&96C+%AE'$9=$/04*=>026&2BD*#F?<9)/?(/',;,B-!798*-89*#C!3'FD4C,%?/$,DD&',>030?40-$E#32'D.C8.6-F)D+5-!>7A"+G?$4)%G59)0G@E::5)8+-<58176C$C,'4(4.1+;#BEE/+.>*14 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:46^TATC159T62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3509 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20861 42 40M = 20901 312 ACGCGAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATA (&($+"$($')#&#!'%((!$$!*%*&%$")"++*"$##+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C35 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3510 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28108 42 57M = 27925 -240 GTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAA G$'!@8G&C@D/D4$.AD72!E$+<6)?96"=#:;1;*/1:85 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3510 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27925 42 54M = 28108 240 TCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCC =&G5#H!H8'8B7EA4&3)-35-;'=6?H#6*F)4(&G=43G41687)6!$C/3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3511 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7123 42 70M = 7123 0 CTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTG &9>(:.8'G.HG681,#="54;"-@546%<%'-%6(G?"H>*A4;4<:+/-,5*).=D&FD%ACG->.E9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UP jpayne@0: r3511 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7123 0 * = 7123 0 NCATTCAGACANGNGGCANGNGCNCCTNTGGANTNNTTCAGGATG !&$&***%!*(!$!'$""#'"')!)'%(*(()""!!(+!()$#%# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3512 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19049 42 90M = 19251 304 ACNTNTGCGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACNTTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGTAAGGGATT *%!##)%++"+!#"(+"&+!+&&*%&*+*!+)$'(%$+++$($&(+((#(+#))!(')"+"&$*)%)$'&!'$$!*+&+%)%#%"%+$'+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G1T1A31A42A8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3512 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19251 42 102M = 19049 -304 ATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGCGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACTCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTC A!'6!A@=-*BFE!6>8$7HH):8<78)-@/2*C5:H'<55.6>=:=)1/$'E%;<<-A#%5G(6/>8'-6$; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T46G24 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15498 42 66M = 15334 -230 GTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTC $2F"DD3"@A7'4771*)5418:;(6&1=0E1"7*.01.4%4F>DGA>&+G-8%(:=8C5&-@C4' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15334 42 61M = 15498 230 NNTNTGTCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCA !%!#(''$"+%&$!#%#*#!+$%+*+!+&""'+#('%'#+!&'&+#+'##$)'!("#%'"! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0T1C2C54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25275 42 72M = 25481 285 TCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTGTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAG 92$D2H<=>C&D@G>%/H76"&*D0D28$>:57!854#"1E8?+03B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25481 42 79M = 25275 -285 TTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGGTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAA A63-$.F-#&$>C1E+6F#92"/G,&4?5D,D1-(E46AE!7"0:,G$D203)6(H)(F*7;:&B)3-A+40,><( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3515 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16641 42 79M = 16461 -259 GGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGGAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTNNC )+%()$*+('&(%'&'#%!)!))'%#)+%$)*%(&+&")'%%*"#'("&+*%(++$%$&#!%"($(&+!(*'"(#+"#) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13C26A33T1G0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3515 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16461 42 110M = 16641 259 GGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGA 923>2#D*6=$<@)BH)=850E!B.,B2:>=*/26:8@/=;26(7G)?%BB,):4<#'407#H50@)-F,=*.E&28;>)C)7%*+,C9'$BGC>H$&82*=*7B#=*%A>46*/';+;08#2!>1.G#-C(9E9,+,,DECCH=/@>&CA/G5";AF1;E56%:)3&$:74@#>,0%+274+E?G0"4+&@E,E.C1?>)&E)3,=''A?+A59:54532%2&H7$24,$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T115A16G10G31G8T10 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3516 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13867 42 110M3D176M = 13671 -485 AGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCNGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGAT *:+C5&'&'3+$D1!,(/BC'C(7(FD$7"D,=0:0$+/.%@)"0"/;)0'7*D@>/,1FG60*47?0G4B,9(!$;F"?*D$?,9"&4;('04244+8$<33)5=?4+C+H&F*A=(19=%*"CGCH,9+&@106(=10?B-5%&%B6?AH0+DE))A!1+'.)+;;B;>94?*<,G75+HA,1H0%":4%);:&&4E&=?3$:H1E(H'(E"BH@4A68D8-G%62/,.%7F$,57>00%*4CD5+E> AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:53G56^TTA176 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3517 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40517 23 46M3I49M7I13M5D47M = 40713 286 CGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCA F7?@*GH?'1-$,<"8-*<.''8>B3D8FG9-@?0)287)2/B4<>C?@,&-12!&52!8GG(4*GC*&E7+2>B1!!2E7=FH74G%0EE)5%4?,*F6A&7"9&!*$<=#:4#3*G.C.3+-=F21#-5,*2F"412>7AHH#):; AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:15 MD:Z:108^TTTGG47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3517 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40713 23 22M3I68M = 40517 -286 ATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTA 93GF18<)A+05F-BC5<:80"F(&"H@:=*>,)@6/DF80:@$3A>696-?H72%:/&'*C7E4(?C98.*5EA6/+)@&-(.!?9+2CH<6 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:90 YS:i:-60 YT:Z:CP jpayne@0: r3518 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27919 42 95M = 28094 226 TCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGC )&$+$&$"*)"!$%)+!('&"%%"%(!+(+##)%'&$"%'*&&""$#(#+&$'#)*)%'"#))#+"()$)*+&!*"+%"&+%%+#')'!**(%*) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3518 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28094 42 51M = 27919 -226 TTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATG %&=.#-,625-+C=:EE16$$4E.811<3+'+=:785'%7%:F<:,,F)$4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3519 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10860 42 80M = 10684 -256 ATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGG #44B..@5A!7=2,>146"8#>F><,1&-9H%1?;D>3C@A#C5"-65863?&>@D(+D,+$6#:4B,124=?E.1H,4) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3519 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10684 42 126M = 10860 256 TGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTACATCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGT #/EGF+E7'-(%<>,49A(+'-378>11G#5(/-!-<&'%?"G73CC:,&F89;GH<7#@5+-!E,?)0G*(9"H1A!=2H'>F<5&A=A@BB%H*C5A+!5,";9<3)4G))7!?99&#>3$;+@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:84T2C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3520 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19778 42 114M = 19936 217 GGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCANTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCNTCGCACGCCGGGACCATCANCGTGTATGAAGATTC 1*!%+1BE!-#?"619A!-9&(?.8'"&<5D)B/16D"0B3@2"D7.%)%#520.*3+@D)<1'91?8('$*3/@2B(1*&4!#G0B82-3%B>CE:7AB(F0=?9;B+?)$=)G$6@$<*->>/)$#-3023*C/+H78;.&>#AC6$H2,A5*HG9:3,D(#G0*D<.,B2:3-D0%,&%H<-=9'.(=9'?G5?FB#(H<%F.0.>7E'H4&137+;*-0'F@6$>+.'7"3-H1"3F+=E9E!HC93)+F"H1+<(/'<;&@#56 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G46G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3522 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26362 42 46M = 26408 305 AATTGTTGTTTTACCACACCCATNCCGCCCGNTAAAAGCATGAATG A*(;3G2)1C7BGBG?%','H1464"=32"9$8@-A46$6A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T7A14 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3522 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26408 42 259M = 26362 -305 TTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCNTCACCTCTAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAANTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCNTGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTCATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGNAGGNNANGNT +(*$)!#(#%&#%')%"&+'%%%$%'#'%(()*&!+&)&"&&("#(%&$'!&(%)!)"&($#%'+)"((&$)#!#'#(!*+*+!%')($+$$")!#'+'%*'()"%*+"'%)%"&((*(****+($&%'!%"&((&)'#%$$)%'+"&"%)(#%#+!%*%($&&%$%((($$#'***&&%'&"'##&))%)##!'(&!!!&)'*!#&++*%'*"#$$&#(!'(('"$*'$*%%'"!*&%$$&'#(!$+($$&!((#('% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:24G7A68T35A69A40A3T0T1T1T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3523 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20150 42 210M = 20360 350 GGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCNAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCATTTCAGCACG 8.%#823"=0?:#9#?'0"C:*H/G$>"+=EC&+DEE>'??0443.98F,-3/5/3%8124(#9:3'8-:+%BG,D;+73<8/(&G74;6GA00C??5E-?(65$##-0?14E#(!3;&"-1,C7#*?;2&F+!)2)?,+!@"D#9;@0-B(1(3*F;43D&;+A"+6F!1E'?!,(%5+)(!HA54(+7@"(4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A166C9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3523 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20360 42 140M = 20150 -350 AGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTNCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACNANTGCCAGGTCAT 1&A4&>;>?F6+3)H<84.;6@1#&B>HA"1BC3+,.>G!F7A:=7,#'99&6*'"3,./02,"C:$2?/%F0B'5&C64?<<@2??-A0FA3(+B"%!:A4'E=(,(EC/-:>>;9>(#E%%@/0@=-C18GG1BG8H2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73T52G1A11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3524 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12208 42 76M = 12284 419 ACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCG B3=8A9GDBD"H?G9&:27+G'$)<6.!@@G!H6+B/51B3>$B.>CB%1C?'&>2D4239(99.E(G4*D0%,>% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3524 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12284 42 343M = 12208 -419 GNGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGANCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCNTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTNAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTNCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAG ,7/;D.6C0,4#8*A(;$5B4#,$":=E26*93B#4'$;*$:<4*@'2@!(?G'9.#>)4,#?/CD=,,3*D-A+#*#%:AE!1!"E7D'#7EC%5!!=*+>E+B74F5$3B7>+GDFEC%F8HF:0$9$>!:'D#<45@C=-@(.79C-*.+/*FC/=:C*4:*%3G!EB!*BE2=G1).)895"@D0;D$@?/,$A1/%'EE&@>!)"226)873B2F8H.8':?==+""E&'=%A6763C;<08 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G97G31T40G44G125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3525 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27659 42 73M = 27803 264 ANTGTNTTTTATCNAATACNTCATACAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTT $!&*#**)&*'(#&('#'!!'%*'&!+#"$%+'('&)%)(#$+'%*!)'&(&%&$++!#)##!(#((+*!**& AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T0C3T6G0C2A1T0C1A2T0T47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3525 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27803 42 120M = 27659 -264 ATAAAATCATTATTTGATTTGAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTG F?@=/))9'8&FG3>'%>;H38/BE.*A;%56?5&74E#6%51"'HDB&;&5$1#@%<6$)112#20=GH>%A#&.H3*!33CE,?/C5"3?3+=@H:F*>;AC4(/@(*.#!/7'A!,= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C99 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3526 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45263 42 92M = 45104 -251 GTTTGCAATGGCGTACCTTCGCTGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGT E2B"GGADD4.1,8+4#3.D;F?5@!;)G6,D<'6F<";#-*C/"(/(=0<3;EE9!6$5#08:+'A967,,EC6D=/""')7%3G9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3526 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45104 42 129M = 45263 251 ACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTANGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGC BA%G"@$$>8"!(EF1!,'HF;$,?2<$:4#"6"2C<:89,CH&F<10)AF*H@@$4D%<>: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78A50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3527 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7070 42 430M = 7001 -499 CGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATAGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTGTCAGCCGGGAAAAGGTGCTGACCGGGCATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGNGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGC @5'CD@/*-'CB5G((+./=1AG:4H+<:#@2%H?G17F9%8/@80;67A1D&F*:@)%+96'*35@%40B-3$#69%$#BE0A(^.!"5DF$-9%<+82D5GB*#2D.!'')<&0A5:=A;((2)*#4=5-5>0$D4EG2A$')5<+655<13.-+23>'DD%-C@3"2>!:8:+E$,9,9*@#5A+C)2@$6,)!5@47$95>E07;*0HC.;H02!A4)"B&=4;?%7&!8G:.C8F'@<(?B0(GG3,(E!%;C$)>2=%G%33=/.,%7!GB#D.3.7:8.G"*D!?:+9*)(/D<"%6AF-:=.+34!$E;.;E/:-:*@-4?$='"&D8,?H6F$E&E#3@>5.2,9<6; AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:95G195C13T11A79T32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7001 42 69M = 7070 499 NGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGG #G>%7CC+;;+5,$8>F8C1?&:C/=%#073D(E,/5')!.:**"G1H=06*-.2(:=G=E'G%)'D;$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G68 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3528 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46200 40 42M = 46200 0 AATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGNCATCGG A8:B"6%!#:&A&80")(+*(F;2"<&=G27016&<4G7A68 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35T1G4 YT:Z:UP jpayne@0: r3528 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46200 0 * = 46200 0 TGNCNNNNGANANCNTCAAACCNNGCNGNACNNNNNANNNANNNNNNANTNGGNNTNNCNNNANGNGTNCTNNANANNTCTCAGACGNNCNTNGCNNCTNNGGNANTGNGGT #$!$$!!#$"!#"#!#"##"$""#"####!$#!"$!$$$#!##!!#"!!$"$$$"#""!"#!"##$!#"$"$"$"#"#!"$$#$"$"!###"#!$#""""$$!!"!"#!$## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3529 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39336 42 158M = 39336 0 TGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATACGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGG >/?7&8!!6>D?B..4.:)BDE51<1+"9)%;GC;D:5H"'AG&@F?+9F.00"AD:21G%G##,24"/.))=,*C$5/*%0@@5:./;:;DD:C&H$-.56:;!=15&"C;7#=(;905%=%.>-;F"2!/(E%F#>G?,11G,E6161&E$71 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:30G118A6A0A0 YT:Z:UP jpayne@0: r3529 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39336 0 * = 39336 0 NCTNGCNTAGCGTNGNNGNNTNGNANNGNNANATTNCGNNANNNNAANC "$#$$$!!!#$$#!#!#$!!$!$"$!!"!!"!#!!!##!!$$#!!$!$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3530 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3273 42 124M = 3105 -292 CTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGG +:>E;55(>G*/1'DG+&<"GC@!0;(+4<=@(GA4,3BBB965%%DD-=?,6A>))HH&!='-%2$73&;(B%!0#$?)"HGE,"1"=5.4*>:59%#*A>;DH38 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78C45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3530 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3105 42 168M = 3273 292 TCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGC C@<9,:5;23!F3&&.1?H46/0/2"E+H4,:@'$<$,C2$C.DA#:F?03>89-%=;?><+;!0.A3992H(0,$7!&/.30A?=&.*=64$)",D3-$HD@%0!"-6;63D@A(:6D0#;5$8-A6%%#%4%H+#9?G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3531 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15870 23 119M = 16048 272 AGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGC C%.#D+#/A?D;GG4?<7!<(&>1=33+>:ECF*4;:/3,%EB$D7B86!<2.3@!H45!,A*>4EC=:6C1!+C%<>>E,GF'&?!H= AS:i:-56 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0G1A0A1C0C3T0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3531 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16048 23 94M = 15870 -272 CGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACANTNCTAAC %#+**!($"'!#++!%)+&+'!**!!++%+%$$$+%&%(!&!"!+!%)&(((%$++!%!+%!)+&$*$+)+*("((#!!(+''&+%#'#*)##$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86G1G3C1 YS:i:-56 YT:Z:CP jpayne@0: r3532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39727 42 128M = 39855 348 CAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTNACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTA ,*>'7"'3"<>C+*.."2C,26:CB0GB)F5?2/*@(,/E6/G.GG*8%2F"'F?),2C($,6@0&! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G20T26C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24068 42 60M = 24221 224 AATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGTGTTGTGGCTTGGCTC FA1>:)C<300$>GG/2.2(B7"':-#!69B>"*<;>3)4B%'@=;3>!++B!!(E./2; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A15 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3535 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7790 42 128M = 7994 274 GCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTCCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCNTCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCAT ="E3;.E:8>#E>084%A'B;!B6H%&(3%(4?/6.B2*;83.&)E"H"HH%8G'::;HD"#)0)+"2$+5<#;*-7D#9);%)04B( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37G30A38G20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3535 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7994 42 70M = 7790 -274 TGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATT A9?3-'G-;$(A),#@,3$7@B9=$G<3.@;>))'E+?,,-<446!D6B#*4&00;$G/&B(.7!C>(D< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3536 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13658 42 160M = 13848 349 CCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGA 9*>H1H>>:(CG*F35"!1/G>1FA2,8%F/6724F)-E="(F4B@"9;;.<%E(<*:)+H8E-2:A5(H$6#(8-==D+%(06>C29")E3-:;F8%/A'/7,"";-2H+@;.H!7#G:)0'7DC>76:42H"-A?3794B/C<./G!;D;2%8;)09< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:160 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3536 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13848 42 129M3D27M = 13658 -349 CAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACANCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATA .0;28C?32/>?E/:A=4.F2+0?'4:%")2!5<95#:"3H4E'-;G.+DD7&4?/#00)@"0?+B-5DB/!@+,H'D&E":/9DH3A<3,8$43B/!(;=G@C5+9&>!0,>2H'-@80%4%!8E!=E==%6*>>?487-EA:'3!2F>5(+572 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:95C33^TTA27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3537 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27038 42 128M = 27230 232 TTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGNACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATG C/HH94!D.F80$4F#8<4F)8!!@12C6%+FA*8('G$,6:7!@)7>/8?4(:(65*2%#CD+89.>0.1?,.!?395=.>C/!%9:7A$#=2#(("3?;!H!F!>E7H*36F#$9,'E;B=%&$1$.%3*4A= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7C19G4A5T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3538 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6283 42 135M = 6138 -280 TGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGG 8B(/5(=$,"#$<$+*#G825B5><$,=!<)9H%%BH"/4!H@:%DD#95)>C7!/77H!8A*CE;4081:%@"8*(F$(61F3/#;2?$-6GE'9(6;1F1)%3#'*GCH7-9@49."?C251(6D#-,E19H-%6&8/<.?1;G$;G1"+C4B-5(/5?A81?@,@#'"4.)()8?(<.9#,02C9)/:C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3541 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 616 42 43M = 426 -233 ACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATC 7%"9#%1F2<#';<,63.65/#17#)D(G%')!/E=E1:>&:C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3541 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 426 42 41M = 616 233 CAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCG C3+"3@3@C2"1DC0:)*%/E'967#=40,5%"7%"+GD-* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28146 42 122M = 28060 -208 AATGCTGTTGGGATGGCAATTTTNACGNCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGC "&5'8C'.)(1)6AF+'$;0%0(CH#"+(5=((9)9E.7!0=9()(?#.*D>95>?A?:';"9%HD/#C4.757/3,.0;0,/6#(*E%DA4::+!E=+A<"9F1#616?C;(F.CD+-75# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T3C94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28060 42 83M = 28146 208 TAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGNGCATCAATA DC'6E5)0#BG./2$)C=)(,H;=-G='&"F'!$/3:1'%2B707$6EF:%)9-+64E)35&#G<:"7*1&@>'017D8>(4+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3543 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31803 42 133M = 31936 190 TAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGAT )7-#BF<"E'-9=/#6(6)$9G'+G1F28.DA+6#E0;6+"#90+*F;G9,G*'-3.@H"#/8:0%B5)52!E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3543 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31936 42 57M = 31803 -190 GACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATNCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATC @%,G97CHF/369D8'@7AF")9+14BF)#<62@%,5<;9!HG3.?9E9%=%87@;7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3544 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18748 42 179M = 18680 -247 CGTATTGTTGACATGCTAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCNTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTNACAGAGGTTCGTCCGG F(/E)"F1$)7C1%7>7!:.'%/<'6>3=30-'A"9291'>1A/4HC-GB22>-F*D+HF<"&(6HF%9%F'*:+7!-)#CB"$1E1CE&DG&%=A?6G?G'D+$-!H<)"$+*6=7,&*9B&0+#;247)C3=G1.@F7*.>"2=-B4#%.H!&;21A+A/G4*(2.#:E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C69G75T16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18680 42 68M = 18748 247 TGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATCGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCC -",=#-GF,@(-'D@368/:$?6!82H/6B=1<+2")%" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28093 42 119M = 28287 237 CTTTGCANTTATCAAGTGTATCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACG <%D?G.&F,=.0!C55:)03#90;G))%57EA#55'972.D9DD1@+B:'!&E-@E1!E+F>(?"H(*55093;*0H;2C'14+%9;=)A9180=5,&0.$FF06=3!<.3)F32)68 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3546 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37837 42 107M = 37724 -220 TCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTNCTTTTTTGTGCTCATACG B!C-*@&:.#-*'488F494;'1#D%%C9/H!1%)+,F>>,0C.B5'=CB&A?#0'+H%: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88T18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3547 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10725 42 42M = 10495 -272 NTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAG !8?;5,(@;++(693!9:3&9C4G!7H+$9!"85?%H$.1$<&B9$F&;B-@DB:F'A8%BB!9%HE<+8A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3548 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31972 42 90M = 32176 292 CTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTNC #5+3G09*0"H#:C($+B7"G"'F>%<>"9=-#1$)=..3;+-7D2A&$=12G)?*8>D*5B=0@<:5D3:F:5C,.(/39G46DG1F3! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3549 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21046 42 364M = 21410 422 GGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTNACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTGGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGANAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGT *'(#!*'+*'(&&*#%!+"%#+))'!)!'+((+%!&$'*!$(')!!+*+%+&!"$+$")!$"*"')'(#%")!%&#*!(%$&'(('$*"$*$$&)#$+"'*&#%&!)#$!"#(&))&''%*"&)&'+$!#''*#*''"%''&'&%$#(%&"&&)!'+&&*)!+"%((%'&*))'')"*(&&"!)"(*&#($+&%&'%$$+$"!*"+#+#+)#(&!%#$$'#'!"%+%'+!')*+$*"!%)$'(')(*%'$&&#&%*'#!)!(*+*%#()'#*$))"++&&#(&)+"+'#"&)$&$+(%(&+*("#"$"'%()#%+!*%)$)&'*%*'!!&'!(+#(*)%!!)"))*%*%$%(!%++#%!)(+#& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T43G76C84C93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21410 42 58M = 21046 -422 CGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTG E6<866#A+=@'&=G271&E)?@GD0$2D>*11;.G@59"B/HB3" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42717 42 48M = 42805 246 GACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAG >;4%%#@;"-1:#="(019H+3*#0%C4C%!B:5;6EG9(0$);&+7/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42805 42 158M = 42717 -246 AACTCCGATTTAATGANCGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCAGGNNT '+'&#%#!!(!(&""**+#!($")&(%!)$(""*'('$$$%+&#*%!'(&))!*')*"&+%)+&)*)#+'+*!!())#+()*%$&%)!))%#+('!)*"*%+%%*)$+%*)!("**$)+)'"%'#)+%!&')!#*$+!(&*'**))(&)!*+!'$&"% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16A135T2A0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3551 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4950 42 64M = 4673 -341 GTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGG +A=(!94H39B=G=DG!.6/<09EE4#")06$G21!>!@& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3551 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4673 42 58M = 4950 341 CCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGA 36-6:72<,0=!?#E.:)(21F91*77E2%4%07-D6C;ED2/(4()=C=3?6?4?A.&6C!)$*,&%<;E+D2)'9C0CG;5%4-=.DC4BD$1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3553 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26238 42 234M = 26472 328 ACNAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAANANTATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGNATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAG 1"-<8('*?!-8*(;H($*(A90>#A$GDE#+'A167D$E+-=%9E**79=B;%5=+;24D@-<7?/;G1D.#7'5F&5;?B+);0@D3@/*5:;.5+4(:C+D+(D27#4&G/=B0.1"D%B;F)/.0+47G./"24E!GEG1.%<#75@'!",%,BA%0>"69!<9!A9E@/&:"E+:%D"?,,%DC")C7$B2G.0?C6"&:84/<)25*94-?6C#(@B.!,A+?'7C5=@2:68$&D,>%/E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30798 42 47M2D196M = 30674 -369 GGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAANAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAGATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTGCGCCA 24$08!,?B?&0A$"/0.0,3?B6?/-8!:")F21/#=DD)C,F5-E78)"A"2+49,"=@=$<9/5!:(!"=$#B@+AG/3?&H09">(A59>>+EF".:05=-:&4G?9!'/<9?4,?:'0>BD/&")$6@F36"$?G:0/-&2">+)E0);%"#F32*,(@/9!<=>%5//B:4"2&CH83->/2.>/!/030E2 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:47^GG86C54A48T5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3554 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30674 42 124M = 30798 369 AAGAGCTTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCNGTTNAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGC )!+!!%&'*'%'*%"+&"$&!*+#&(*(%&()("'+)"$+$#(#'!)(!!($$(+&"+&!'$!)")&&+"%#*&")+#*#*'&&$("&&#+#"*$%")!&*#*#&&"$%""'$++%!$$()$"* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G4C51C3T61 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33874 42 67M = 34012 192 NATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCAC $2-*B3"H&.E(.(C2"A9!FDA4.,%@8%3>-4+#;*!=%F#*H19C./;#611;9@2F4);&3$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34012 42 54M = 33874 -192 CGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTNATTCTGTTATTTA #04%1-H:%3E",>8-',G!GC#G(F,&3->#+'9"=)9->:>/+84.C7G!6< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3556 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26299 42 90M = 26389 223 CTTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTATACCACACCCATTCCG #DCG!72#)A!9A$+C.)9-#1=15C>"?$A-1D+(AG>59H(:'/C?",(C-/D1''+.?==?(<*<4@/'&D#2FB69C-4G.71"$? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A72T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3556 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26389 42 133M = 26299 -223 CCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCA )%/HA")"0-18"B>A0E/(('!7G@%@+#=;D"C86$&.(:&/4E'$:/=3A:C%/:,2#2<2H>(28&D/9@##(1#3B-B+4F/EF,C9B"G58,;=+3(?%!/.,AA(>H)14A$*&$108BGA"(@(@1=?HB##H7<;D(73@?=F'-&A4!07)=G4=8/$?!3CB*&,F>.8&:6A:$"*>D&6CG);A3=87&F)%=$EA%)E3:>@?'#3-&D5;;$*,F%0#+>.9C4H&2?=G*25E2D!-?*/%D>/'=71D8A7-.91,<7B'4<5%6>%F7'+H;.'%&B3@B:B0&1@5'(E'/C2-AGA%<#!(0F>)H)<$:66,3*#FG:9;984GA>F=#6),D@4!;9&$?.-7*$@==;*?1$*C>0HH%B:D'9&A&"6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:101G58C92A23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3557 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11358 42 201M = 11559 478 ANCGANGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGG )$$+)#*$"$&+#&'$!(!$$"$)$"$%!+###&**$#!*$*($+##!$'&!%#'%"##*(*%%#+*%&&#(%"+)"#%!!"($'"%!)##$!*&&%#((+("("*#'+'"#')$('%(&$)!'&!(*%#)"+!)(!!$$%"(('")''$&+#)!'#)()&!$&(&!+%+(&+%')$#+%"&'*'%'((!#$++%('%$() AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A3G195 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39391 42 67M = 39230 -228 CGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCC (0%H$)-#?!72BD!*A+!C-G!,=HE>$1<59=%@?;17E64613/G:/'E6.7CD&"?*E.,.1. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3558 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39230 42 75M = 39391 228 CAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGNCCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGA ++*)&('%#&%)*($+(()%)%"((&#++!$!+!+)+)$"#"+#$!%(&#)%)!!##''+$()#%!$$!*')!(" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3559 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4996 42 278M = 4896 -378 GGNTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGANATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCNCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGNCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTTAGN %)$""*%+$'+#%***'"&')+'$##+%)*%(!"))*%&)$)+%"$$$*)**%%#*!%"&*"%'"*(#+"($'*+''))%%"*&%!$"%(#'$'#++"#)*(*%+$'%'+"&)!%)""$$%$&+*+!#%%%%&"$!%!$)(%$')'"+*!&*'")+"+")&$"$++'*+'&("+%+%'#!(#!)*$**$!'##)+'(*&$#&#""*!**%(!&#(((%!#*$#++)"+%'*$##(+'*$%$%!'%+*)++")#)+!*+&("(!&+%&$!'&*%+!%*& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C42A86C53C87A1C0A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3559 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4896 42 100M = 4996 378 CCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTNAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACNCCATNGGCGTCATGAT &,*&&9(%8D-B@57(%)=->H):'AB5!%1#DH'G);"B4230;6*/.;83GA'8=5>%!BC+9$HG=@!,7/8F2%$)G1!8&-@&#&C9;,E&/4=$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26C54G1T4C11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3560 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23922 42 73M = 23715 -280 ACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGNTAAAATTAACTGCTTAACNNT '""!'&()')!(')(($'()###+'+"'*+!*+(""+)$$#!("+#'(#%#"#'(&('("""#+%"*$&+&$* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51A18T0G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3560 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23715 42 181M = 23922 280 TTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAANCTTTAAGTCTT B2>@;9:"*/27&1!1DC5G7HB@637"B2:-3.:.E34;C(&!&8G3B@@-+9HC?H?8>)(+:;'70)-6"1$$?H0'?A!!D&=..+8F*#@B8#+0D77C7%B21&)F&,=/=(2@:=ACE@>83>G!991@.&!)#A0G(4,*",:!8&/F@*F++'=A-@B'"F*)2EC2$; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:169T11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3561 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31632 42 49M = 31632 0 GGNATTTCAGTTNAAGGCCGTTNCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGA ()'#+#+'%'+''$+'&"!$)%+%$$!$+!($'#+%!'%%)*$*$+++' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C9C9G26 YT:Z:UP jpayne@0: r3561 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31632 0 * = 31632 0 CANNACTCGCNATGNACGTTTNCNCCTGCTNNATCACNACATAATGCAGGNCTTCACGCTT ))%&(*&))(*')"%*&'%&%!"'%(&'$&*+&")*&$$$()%(*"+"#%%+$)%%#"""' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3562 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11905 42 283M = 12188 457 AACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGNTTTGTGGAAGCCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAANTCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGT 1+,.)1?!,H!EC/?D1AE60+83,:&6?#&#.543@5F&3'6>*G-A5:..E',)@.)$-A+>G>?G.-=#H77*.?%C501885'5/D6-GE(?=E>;9#";/)9C%CG0D3<1!*.1&:@>H:'D-/@<"0&*9:-@$+7)9G<19)C&,%=$06E*0'2A09@5><(AD/E362>H*A7%E#:66EC@49 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:138A10G64A68 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3562 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12188 42 174M = 11905 -457 TACGTATCAGGAGCGCTTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGANTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGC 7;:*?05$&#$!<=!F"D3$4=<=&@.GB-@E&0!&.@*75DHBE<5510=5#%0*;H;>?C$D!/D3A%FEA$=%51G1H@')B:?/-=<8:11:$E=02B/+*E4G7!@5&B>)G8,:&*'#HC0+E5D9:+/-D=.&42E&D@DE.#0;(AE5G/3'%;'+2A,?2@<9!( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C87C69 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3563 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31165 40 115M = 30985 -295 GTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTAATATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCNTCCAGTGGANGNCCGANAACNNAAAGGGTNNTCTTTNC "''"&'*+#(*(+)&+"+(+'$$*&(!+)))+%#"%"!*%&!'%$)''*+'*+!*#*%'**'%*&$!+"%$+$&+"#%#***#$#)#&&$#')$&"%&$$'*)##*&$""#!*!* AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:47T28T1T7T0T0T1G2T3A0G5C0C0G0G0G0A0A0A1A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3563 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30985 40 102M = 31165 295 AGAAATGCATTCCATGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCANTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGA )!&+*!%#)"")'+")$(+")(%')%$(($&**&!$)%*##*"(*+$%$&(&&'*')'+++$(%)%"+"+"$('''#""+%*'%$()&+%)#++%**'$#%' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A11G50T37 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r3564 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42706 42 108M = 42833 208 TCAGNGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGNCTGCTCAGTGNGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCACAACTCCGAT 80$-+?$0(*(C;.F<4D/144=B%+*-$G.2ED5'."C2C1%=(+2$A>>B+.E?,F>$>0-,!$!',8)'B(("H$-:,18B&5E!!- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A45T10G35T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3564 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42833 42 81M = 42706 -208 CAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCA <2G7G?C1':'@>A)+62C%?<'E+H>B*52)*@<8BC0?A&EG'5"7*?C!?D*;<8GFH--3?$A1"E(3F(2%:$2A;>?G.2(==),)81C(09(@-F02.C;#FE:&6&A)47/#@!E)->/3$)A7>/-3-47=$CC0!B@D*>B93-')DG@F?#=$67D9)%0=!!7*:DB<16+"*G&1586%/$.F5D%%'5,"/DF$4")'.C2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G61A18 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3566 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5376 42 151M = 5527 257 CCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACAGACGTNGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAANACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGC A3**G5*0?B-C80"!&F8011$,$*/",B/(96;34'2D-59!4/,'6*(.%1G+(*6-7)#25*,C*"+;6$25@D:>69'#!96&9@"5D;=&00/6E4?;#?:$1C86&?A06#)B%$F7:635.:B%/2&3CAF00B''*G8+961 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25T5G74G6A26T10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3567 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28745 42 243M = 28701 -287 AGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCTTGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGA "@%(*'7E:BEB7DD9-.@7G)F8!%G;D:$/'&7(-<#<8,$1E4G),(C>G1C2,92",D>%GH4/8(-<6A$F>3::=A:C=">2A1++02*/1G86C0D/H4-B=)4A04*-'A-,!:>2B&/+9!595&?&.B..%.@A%;F!C*##G&H530-*!)<3?,,3$"'6+)7C,G);C-B"5F$(!0,7$B4,H2B-:0!E*6BF!*(=@-;9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117A125 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3567 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28701 42 44M = 28745 287 TGTTTGTGTCCNGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTC .B&$!#(G"G26",%@"3DG!&A-(31':$4@!HC/C';!%%") AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3568 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36295 42 57M = 36403 218 CCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCNA C7+;1H1.G?(19GD'4G;?ACB23!E9CE40,D8+>B!'E@B9@.>)!?@"@3C'G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3568 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36403 42 110M = 36295 -218 GGCCTTTTNCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATNTCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATATTATCCTTGGCA /0;B,EF=D8=8%",%?A-BG',0"@5)=DH)'.0<&%7.%<4B8+?&&(??5H7'@E92B&G)3*91:9B)%;B-+'-#)')E";!5@>@HH7;*.A=5!7,(A-60C39E4;5&#E-2!>.;B68"'F%@@C.%,&;'89)$(H$11&497>D?80DH%@0*,=F"H9==E5D(/H"$;:'>@-/>07<*2B.&!=F*51@<4=C))?>$+' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C9C62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16896 42 100M = 17058 224 CAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGACG 597C>',A)C7.;:-%-/A0=(*B98/%G&$;*1-5$5E3C(2FE@F#B,B9E3G*-0#,H1#( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17058 42 62M = 16896 -224 CGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCA ""4,"189'E&>17"<0'GG*?!G0:;:6)8@7/<6%/B))@?HC&9D9,B*8F-(#:A1)B<'B">:8H&"'6.+8".3/%B#654#D<1C0G"E%>62%AH7!B%2=(AB@,;860/,$H@-80;C9G1(27B'.)F'-C&#>3:!-AA575+3A$$&878H:B"-">$2?&:)?:>*9G.!):->DG@&F186"-4&'=-D;#A.$D#83&;3=8$1 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:64G38T8T53C45C60 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3574 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10699 42 71M = 10770 344 TGTCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCNGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTC DH!;E.)-08'22'B#1">8DA-4=-D59?:F=6B"$FE2+6$6?"7:B@2H7&<33;H= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G26G41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3575 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 0 3M26I126M = 1 0 AACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCT (',?*/.?-%57D*=H'!E-3FA**3,2$$=$B5'1>'@",4+0C/-'HE3@?G=E!46$/6A9(A99A=>!.03E0FE'7?;'"E*)4;<6AH>((H2A@F%=)B!E'E,+;:@#B( AS:i:-90 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:26 NM:i:29 MD:Z:0G0G0G126 YT:Z:UP jpayne@0: r3575 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 0 * = 1 0 GCGGCANNATNCNNANNAGGAANNTNGTANGNNNATNCTNAN $$##$""!$$!!""#!"#$$#$"##"#$$$!$#"#$!#"""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3576 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46500 42 158M = 46432 -226 TGCCTAAAGTAATAAAACAGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTNGT @,9H)$46EF@36E7%5:*0?#E3?H:89&+(0;84A@@F&?35:E0+,;(0-:"(FC=!3'/FF6?A2(8$'/E7-1C/0+.<9*#?8F0&!@D3F)F2%@D+>@C!E#/*B8>=>4DD,:48"%%#2)@%+2-G"85!F:67D1>7?!#>$B$"#* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18C136G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3576 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46432 42 68M = 46500 226 GCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAA *='#(1$#*CE06$#9&+-7';1$=GD/DA<@33<#5@+@A:F#<.69,'7>7D5?D8#F3*CG+;4' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3577 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 133 42 108M = 15922 15851 AGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTACTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGTAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCN %#+#9#=+9:8.'"G<0<=@G/D<6*-9=47$AAB5"65#-56?+$?;;E/;74(H!"&<*0)A.9DF'--=)96#9F/8%070"(.2+>7=@4;BFA#(6)H0<7:2 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C21G57G0 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3577 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15922 42 62M = 133 -15851 CAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCAC $18-D!9+)@84HA3=E"!5-+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-10 YT:Z:DP jpayne@0: r3578 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42288 42 40M = 42035 -293 GTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGNTGGN "+'%"!&))%+*(&##!+#()*'&!((%)*!+#'*+"!*" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35T0G0C1C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42035 42 60M = 42288 293 NGTGTNNAAAAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGC !)&'"!##$#+%(%%&'')!"*%)%*##))!%$*"$&'+!")(%)!&))'!**(%!#"%" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G4G0A2G50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3579 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39396 42 57M = 39185 -268 CATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGNCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCT #13,-24.!>&7:>".0>>EG'$C2'<";E4-;)"?@1B?(%&E8@A*B6B1"5.(? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3579 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39185 42 86M = 39396 268 CTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCNGCAGCAAGTGGGGGACAGCANAAGACCTG DCG&!&!>0($-;?=46 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56G20G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3580 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42015 42 264M = 42279 415 CTGGANTCGATGGTGTCTCCGGTNTGAAAGAACACCAACAGGGTTGTTACCACTACCGCAGGTAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGNAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACC F9B';G"9E=A$?GE5".C0;,./H.".4E1!H3@C%)06#2#-3A5H.!%:!>A,H7FD44&+!254$45'4-1GE7(71=GHH@?9F+@FC1CD$1=1#;/E(!H"B"@A%@-G6#;,E>5.6-:F3G"=:;*!,0-(<9+'E13+DB>E69,G'5"1'3*,(B((+>-0%/8H.6C#7&7!9(-C-+-B&/7&21BF$AC?.C1)$+&&3H2$E>#0%.&!BF-6A":$;(9$56D$0:H/%.C.G@:8(+@!#B,=3BG; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3582 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21793 42 144M = 21602 -335 TGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGNACCACCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAA $?G+'&%H-(G6-E:&&2'BD&G6*A!7%A/&40'.B!6=)D1F.D;0#'G!+5G8%299)3'E2"F59&+7"?F+!E@91H6<8'*D25=&+#(.FH227>;G,950G@?H&74G>31+&#G*-2;?!8.3!/:)>A44%EH6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C4G101 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3582 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21602 42 191M = 21793 335 GGGGCCGCGGGTGCTCACGNCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTNCAGGAAGTTTAGCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCNACAGTCAATCATTGTCCGGTACAGCCGTGAG +%!*&#+#&')+%%)$'&%""*#&&'&%#)*%+&'"'#!'&()#&')%%%($+&%%''(!&+!'&*$+%!+&+)+$(!'!&)%''*("&!(!))$!&")&#$'"$$%#"("%!)*!*"&*#'(*"+*)+*'$+%)%!(&'!%*$"(**"*%""%%+*)($!!"!#!(!')'%$##$&#*+(*$+&!+!%+# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:17T1C61A11T65C7C23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3583 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11431 42 64M = 11431 0 GGGCAGACAGGACTGCGNGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGNCN 98$E"*:&)*+@A64%7+=6<9+(;(+HEE#>(!+3,C;9==GB1.%4A85H*@2@A5A)9)-= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17C43T1C0 YT:Z:UP jpayne@0: r3583 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11431 0 * = 11431 0 NNTCNANNCAATCGNTCTGCTNCTGCGCATTTTTGTCCNGTT !&#$"#(#$***&%"+*)"**((*))$)+)+&*))(!$##'& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1690 42 70M = 1863 230 GGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCACATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATAC C>0D9*90H&=:"A83+33D.0(:6>:#=(8.?B<-BBA2G#-@F+:/0:"(%)!>>G-6?>DBD&,.+C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3584 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1863 42 57M = 1690 -230 TATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGACTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCTG ,D/.*C)1A:D2E<(5;8EHEB,,&G@(">)C8-G0BE6%FA$+,1E8F$GF>(H%B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G27A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3585 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10756 42 125M = 10641 -240 TGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGTAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGG A="%-D?*7'-!B8!!<@45!9,;-5;;%8'C2,:,5-(:A+/)>7?CH9H%1#H:GB6)C"*>74-B;;C#53B-48H:(:&&+H*??8";G)('-65?)!.F:@)GE9?8G*;;'A+&'7GB+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86A38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3585 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10641 42 65M = 10756 240 GATAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGC EF0,.&=4'(?FFC3A*E&;E380=!<9*($C.($,5C?3>"940(4D6-F/%@0;/G*41<;F7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21730 42 161M = 21901 242 TTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGAC 87AG89'9.85(=;A-&8:B0(<4H"+6@%271E0:'(0)1G6-A/=)("*=1"!>317F$&7&9".,/6+"'H+*A+3,96>(274?"GH3$A'F3@A?98@CH@@0$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:161 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3586 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21901 42 71M = 21730 -242 CGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTNCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCAN F<78A3#.+/C456/%0?6.;:.0B970++>C3-0#E30A,"-=<8H9$0A@%1GE#";9A2,)%?17@>2.&+%;!'A'/#>64>D68,9",G3#DE6!>D@)0A2279 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27127 42 101M = 27347 319 GCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAA 5DA/#D!0-;2+3B--6'B)1-C>2B8'0C6>957HD93,F,(509E>G5A&>H$:B88/!0*9E#04#'(?54>6!CH*??5.3D?'$%)8+C*!C(D;F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3588 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18123 42 360M = 18072 -411 CAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCNGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGCAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCNGACGGAAAGCTGACCNCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGNGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTNATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGNTACGCTGAGGGCGGAAAAAAT ."D)GG94'=0(F50*A0"7.%E,"-6&:78D.!#=3/2B842#B8%)?;>".,!H4+%#-$/*?0613=@66".CA2=@*="%(,6"C&/CE('4"4?D@9'>441F"<@BGAE&H-H="8&-H*?525'?3"D=B'-."%@=%4/$F>)#*08-*F.F8<7=*7(4G"/#1**#00A54<859@"FE>C+0+>2:E3>9DG<$2'=/42F*9("%H6F7'.G>5C;"C@.()*"93(F1!(*2'B7(5H21*5==%F6/F29/-$E.1G09CDB7E.(/26/HACH!,-9'2*'"?;D2BH):8B'2"?8:?*6%7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:68T103A61G15G25T27A33G21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3588 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18072 42 51M = 18123 411 TGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAANATTGAGCAGACCAAAGACGG 2?8!0-%AA27,6<4E*=&"<37FE3-1*&6"@$)8=>97B"B@$(7F%%+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7238 42 76M = 7349 210 CTGGGTGAACAACTGAACNGTGATGTCAGCAANACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGA 0G=6<()7%)4$/%EDA*?D+$2=B@BC7%AC-"&3C@&>=;-(C"9=H!6)1;D9):>:@.6F"%5(6" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76T21G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3590 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33749 42 246M = 33655 -340 TAATACAGAGCCGTNTTTATTCAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTNTCCTCTGNCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTNGATGTTTGACATCTGTTCATATCNTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGCAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTAGGCTCCTGTTTAGN ,7.!)7*1E!D.:87'6&H$=*1:"C"9%//73D7>20B::"-$4/26?!(0@#2G'$ACF8"F,1-B2!4D2#7+!C//?/4FE>'!A(/F@;*B1,:5*.9?2F!".:E755;02"$?'/4$-#H=-!E'*7)7C/"'(D$:BF&7.76?-94C6&C4!8(..5):?! AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:14G6G47T7T65T23C28G34C13T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3590 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33655 42 94M = 33749 340 TCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATT $D:.))7=#E%D6(A3?1,E#4.)'&64%92(26.,*-/%"H2=9B=,/6,41)$18>G='""42 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3591 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16198 42 205M = 16069 -334 GTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTGTTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGGACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGG C758!!B+#60+<:#$9<8E>$"B-;H4!8,,*A73<6"#?3<'0E2DC6#)*0&C(D&E8C%EB@,7((;"8'#+<-6-C@4"2,'=/)&'6B%C0.86:#'H/5HBA%(9*""6;0+D$#>)7F!/@B.%F%?+)G&D2G@!/G,6/= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A61A112 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3591 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16069 42 129M = 16198 334 NNCACAGCCCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTAGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTNCCNGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTNGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAG "#%+#&($+*+&"(&&%(%&&'$*'+!#'&$'!"%$$%+!!&!"!%%&%)!$#%)))(##%(!&))%*(("'!!+&#!$%+#)&*%))&$+%&#*!)"%)'#)!()%!)%"'$#%!&#*+")#"$%+*$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A0C5A26C35A2C27G27 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3592 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13102 42 112M = 12958 -256 GAAGACCTTCCGCTGGAANGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAANGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGANT (*$)*$"'"!((#(#*!(%%*%+'*)()&*#++'*(&)'&(&$!#%""$%&')%#"()($$$&$$''!&+$"#!(%))#$''+)+%'"'(($%"+*&"*%)'$)'(%&(+"" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18A43A47A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3592 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12958 42 47M = 13102 256 AGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCNGCT =C1@#&5!2@=1(5>;$?8BB$.<-( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3593 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18339 42 87M = 18488 247 GGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTNAATGCGAACTCCGGGACGCTCAG ;("-(@&;;;/<%8D'6D?-5B6>)?&@5:2//H'"?GB3>9$A(%4/!=+@"21)285B009FH/7):&)+,:,$&8=!2-EH-:@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3594 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35326 42 173M = 35530 250 NGGNGCCGTTGGNCGCGGCGNGTTTGTGCATCCATCNGGATTCTCCTGTCGGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCNCTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAA ""$"#(*(*'!%!!*+'#!!*)")++#*&!(+($%)*))&%)+'($#$##+%'&&"%#&$$)!""%#(*!"')!+$%)##'")!*'*"+"$*"")%)#"%(*&&"(&''(+*"$#(&!&+#'"$#&(*)&()$#"+)&'!("((("$(+%)'!)'))(+$*''"+"&%(($%$ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G0C1C1A4C1C0G6T15T13A83A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3594 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35530 42 46M = 35326 -250 GGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCC ;#+9A0D3?5-&C02G;45D1(4@8*E22*H#F.B"=/':C/+$%FF8"<0,F!=9?8*0E(=/3E,!8@08221+4@+1D,/DE+%)4@C6E)%C,>">/+=?;4<0,#&(*39%CE'(D1:)&011&4'@?$29&*;<>(G122;12D"C.C4B?7G2DC9B14EE AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33G34T23A20T14G26 YT:Z:UP jpayne@0: r3595 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26456 0 * = 26456 0 TAGGTCAAAGCATTGACTACTATGTTAATCTCAGTCCATGTCGGTGACAAATTAAGCGANGGTTTTAAACATAA ?;2B<&!:3*8=/-4>6/GG3EB:@%:,(/4H$AH.4#?:8H,F#@ YT:Z:UP jpayne@0: r3596 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20181 42 76M = 20299 214 GCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTG GGF%95&$:"+#/:705*4'!=:.2"G+?-0'"E4;()))B#2D07.$G?@48=#B.5*"H;E=4((('278,1(# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3596 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20299 42 96M = 20181 -214 CNGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCTCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCAT /%FHH03<:,9;?*H.$!-958%-AA31&1,.B+"A14<12B(*$F%!GC#C&8B4;9"9<27G>B#1/$5+EG+C>#)1?>E8"A1&:4@=7.*0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A45G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3597 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40497 40 66M3I22M = 40497 0 ACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGNTAAATAAAGATGACCATCTACATTACT AE/G)+C'&3=&+<(3?F8%>5=$$!)9D8.0-02$1:0D7(! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85A12A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3598 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42490 42 94M = 42612 221 CTNCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATNGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGC B9"/2<8*7=ED/01/'?,G+34>EF+"2$8'6H,D4:#D''E26B">==,?E#*";8E#,8G<3?0G%5:A7===E<."2%:8":B&6H=F$4=C:1?#BE0:7*--2<-)2>;7<>+HB)#%1H&.G?0=:822B/#?2!H1,A;E;D+F3D.2+!54)*F)+A*7G?';+?.,G.;4F"#!A0::2(.,=5!1! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:43C51G4A60T42 YT:Z:UP jpayne@0: r3599 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6368 0 * = 6368 0 TNTCTNCNCTCTNNGNTNANTANCAACCTCAACCGGATCGAAG $!*)&!)&)$'%##('#("&$%"*#%((*+!"(+!"$+'&$'& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3600 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43441 42 248M = 43689 300 GTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCCGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAANCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAANAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCAT '+%%"+$%+"''++%"'$)!"!!"+$)#+!(''*&&)%)$&(!$#"'+'%'"'&'&+"*$(*"$!%"&%**##&(%&"$)*'"$*%%*%#+"%##*%%"))+'"!'(&!&&**('%!#+&"++$")&#$'$#*!!!"#*)$!$)%#%"#+#&+"$%!$$&'+%"!!#(!))*$#%%(%"##%(''')&#&*$&%+$)&!#("#)$%&#*'&$%$%'#"'&#&$#++'(%$'(+"*#"+"+("#$(($" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:74G47G58A66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3600 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43689 42 52M = 43441 -300 NAGCAGGTAATCTGGAACAGCGAACGNATCAGCAACTCACAAAACGNGATCG 7#&8F:8"D4EC,G5E*'"9?#:!?/64(43.7"F16 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C17C7A19G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39850 42 126M = 39976 398 GCGTAGCCCGTCGGCAGAATNGACCATATCNGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACG '"+*('&%"$)*"!!+&''*&+("#"*$)(')")*'$$##'"(&(%$"#%%(+(+!''+)'+$&&&")%%'*"'')%%+$'*&$"+*%#!##+%%($!*&$&+"$*("()&""&*%)(+%'$&#&% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20C6T2T95 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3601 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39976 42 132M4D136M = 39850 -398 AGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGNGAGGCGATCCCTGAACCAGNAAAACAACTTCCTNTCAAGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATC G0B<57"46D?383G$!0$<:+F)#)752*+1,<813("6,A'142/2)<+*:';FC/2=B00H-#853@4#B,2G!5,&6#*-4:$7;C:;4?2>/H$<%)8CB?0&$C'.6&$&!BE(:9G;@#>?A/1*@051:G@=?#F6H*AB*H*3C9A*>/A7?17A2!;=:13>F=D%6<&7+%>5,:H&1.&*DD8.",*D5#8FHB$6F@,#$%G"$611A0C4$;,.DGD>2(%4HD AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:132^GTAA45T19T13G3T52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3602 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22517 42 50M = 22346 -221 CACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGN 70(3,GH$(+38/>-8)$++0!G."399AC4-FH!=2,?EB;+A<8'(4/(G7<>+9B8"%!,?G4;FGA2>CH/2?)@7)0H8&!2#*5(4-$1'27&$0;?@+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A79A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3603 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14862 42 75M = 14862 0 CGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACT (CB3!?C=<=.3+4?$C.!15@>,3=(8:B42H09*:8G"285!-"E6/3<#8%;;>);'E,11A$3?F#B&G)) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YT:Z:UP jpayne@0: r3603 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14862 0 * = 14862 0 TNGCTANNAGCNNTNNCNNTGCGNNANCGCNGNCCNNNNGGACNNNCNNANCAAAANACNNNNNNNTCAN $!#!####!!#"##!"!##!#$"!!!!#"!!$!!$!$$$#!$$##"$#!!##!$"#$#$$$$!!!$!#"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3604 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37928 42 46M = 37743 -231 TTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATC 47,'@D?$=4:D"4(E19?$CCD#.6=0:@E$%H*(892F.@1.4C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3604 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37743 42 53M = 37928 231 NCGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCAC ''>#E-29HG;11/,;C"#"7*C6-9@+C1(0)%%A%"&="31F86"=(1?6$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0A51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3605 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23038 42 55M = 23223 229 GTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTT 7A!4H#1(/)1!:C="'?:HF5F7*'D6"1D"9+F*025#."%978D*19()%7-.:2E(#A2"B0? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6C45T1G12T40G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3606 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16439 42 209M = 16648 323 TGCCGGACGGCTTTGGCGCCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGNGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGAT #++#(()*#$+#"$"&(&+(%*)!(+(%#''(''(($(("!*'$%$((%%'#"$"'"'(#$*+($%'&#%+!))))#&!%##*!*!"$&(+)$*#+(#*#!##"#%$"#'%$%($!!)))$("!!!&("($!&&('''#('**!'*+(+)#*'&&%'$&$&')')+'##*$"*"&()!&"&'&#%$)%!&)%&*&$!)*)%#&)(#%"( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G151T38 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3607 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28915 42 50M = 29062 242 GGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGANTCGTGGAACAGATACTCTCT 817$7@BH$2?%28H>'@&E8?#&*"&F"%&DG?5*";A019! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3607 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29062 42 95M = 28915 -242 TGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAAT C7BF.<#903*$A%)>%&<(8<2?,;F>G&&>1/2(#)0.H$?;%=&='=H'8)+6,>A/9)HD!68DH"H=!11AB*E1,2*!;H+D&H00#4?BH@)G4(0!!.$(((6&D210G!89&0 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:15C16^C61 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25299 42 92M = 25608 357 TGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCNTCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAG 74F9!1$F9D(#2*"@%,$B0-8:*/8-:C&6-)"G)H2BA/"#!->&="B:6E.;!-2@.8-G3D8?-$2%3(6E<*7#4"3754+&H2"22/G=2(@9+:36>#0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40438 42 62M = 40148 -352 GCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGANCACGANCN $&$&!(+#*!(#&*$#$&$($'#')%*"$(%)%**%(+*()*%$+*$&"("&&%$++"#&$% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19T33G5A1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3611 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23928 42 56M = 23724 -260 CATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTNGAGGTGATAAAATTAAC 7&D"6HB,DE9"(/%#5'>'GE%31,-=&6'0%!87A!/"C>5,D98+BE>->@/, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3611 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23724 42 51M = 23928 260 ATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTNTTTTG 6208:BH/"(?C20B1G1D!=.0%10,6744#",18A'!(FD6"0=<6<-0+9G>%3,6)D'H5-26F0/+!<2A1>(?E;:8,F+-H8!*%9H"'>,"G*9FE%)91=<+C,$>>);678E3$?"?"?8>5$!/#&+<&3CG&74C+920;,HFD&6(7:/G8C.DG1//)B8G;=;57!HD4FB&:G!F=!C=C/!@%F5F=7,7/!(,G!=$":)F5A@H3-$HD61G$?H1@>F)+$?C'G,G&":!&,8C-!$-(86),G6'+/F+3=2!%53=ECC<.$('-H7$1!3E$?)+!F*+E<+EFA:.%6:70D/,G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:155A46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3614 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33549 42 209M = 33347 -411 ATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTANCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCAGCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATCNACCACAGA %#'!$#"")")*")$%+%+#%+(&%%(%*&$(%"&+*$*!"'(+()&%(*$'()'("*#!)&%((&#)!("(+%%*%))(("#'!(%)'&'"')(&''&##"&"$!+'#%*(%+()(+&%%+)+(+")$*$)&*$)*%!))&)%"!*()'!)'"(!"'))*)#'&+$*&!%(*$''#%&+'"!"&+))"*(+(!%$&!)+$*&!(&$*& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:36T5T59T96T0T1A0T5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3615 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3417 42 128M = 3545 319 GATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTT H;,-96:%%;B#3BGG6,$>*)0%&:F<:"@H0!56?6D72?9-=B'<*>2F659'/=BCGH2:H)<::C/>F0?F?%,!DF)$<:#:"$>=4-6F4'"F&D))$#&1C&0'31 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3615 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3545 42 191M = 3417 -319 TTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTCCAAATNTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTNTATTCTGGGCGNNCGNTGT %!$()#'%&$(!!+')$%)+'$!"%"+*%&'!$'*!#(&*(%%&"$%#+(+$'!'%#"))!#!#$($$%#$+("*'!)(+!%"&*!'"$$!+)($($)"'*+)%$)!!)#'$#'$+'*)"!*!&'#*$$)*%""!+!&!*!(%'*!!++*$*%+')&$+)*#'+!!'+&&&&"$$'#)#&&)#+"&'!"'% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:32G5G72T59T11C0G0A0A0C0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3616 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21183 42 131M = 21414 272 AATNTTCAGTTGCAGNTGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTT "*%"**#%+$#+%%*%"+'*+#'+!*+&*$"+*#*"&&!'!"**!#()%'#!("'"*&**!*$+*#"'$('#)%&!*%%(*#+#%%$)+*%+'*#'+'*+#%&(#)#()"*%)('%$((%+"+"($%("!) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A0A3C7A115 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3616 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21414 42 41M = 21183 -272 CTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACC 85?A0#20/=#FGHB+?1.='1G:0<4'8D<,$8A;&'7H* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38136 40 108M5I87M = 38038 -293 GGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACNCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACATATTCCAGCCCTGAAAAAGGCCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAA 2<>0<:(E>@CC2.-:C(?C*?1AH..-51+G0A#+G89@=7'2)5(F96E;1/5D!0;$/!1E%B@BD/80$#E%=C09'+36B'F6)D24?44H,%H?-$E&--.9/"1G!@=)'2-'630G499:$E9'.%-+2=67%FG-7H.=0=D-41!#"'(;)575!6(8AHD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3618 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34145 42 101M = 33909 -337 ATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCNTCAGGCTTAAACATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGNTT 5);&1G6<8EH3@@"0G==?->(#;DC381@F1#D:@8>1>-F>.5!$?&7(;74C8!<00,0F5$=+/-1/89E&CC)96BB,F6-15$D09>9="1F6' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50T10C36C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3619 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26650 40 37M3I8M = 26785 298 TTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTAGTCACCGACATG :'*469F)7&B%D;/20@"D2<$==.*HA)<->)-()?06H'$H;-%G AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:35T2T2G2T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26785 40 163M = 26650 -298 TTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCT 9BG98!EH6(*C0E+%D)13;HFEH+)>=1H?!E%)'+E';/!"BF9DCEG33G4C2%1@>"GE?AC4#%=="/A6F'//#<*=0,9!9@+#;$6A<;-2?E>@8";EG9&!*!*!B#%)'7+HC<46?>(-,8..>'FH98;#+%=,+D@AB&/"DG.#?>' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:163 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r3620 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21650 42 104M = 21778 198 NCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCA !H13%,$0(461B.E?!2'3/'C2=77/:E-G6B@$")A?2BDC'>7+2!>GA<56+?'2,>)G= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3620 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21778 42 70M = 21650 -198 CGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCANCCGGTTGTT :?@')>((;=(#,/;:+82'F4+);0C0><59503:A6G&=C)F9#*,='70>3.#09+#'8A24A17D: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3621 77 * 0 0 * * 0 0 TACCNAAAAGCCAGAACCCACTGTCGACGGATTTCGTTCACTTCGTTCTGG 2;B'+&=B%>F?4+20B9@8=.1,E;;B)?HC/5!6.:?H,H./@6$@+D2 YT:Z:UP jpayne@0: r3621 141 * 0 0 * * 0 0 GCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACNCAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCGACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCCGGTAGCGGAGATCATCAACGGNGTGTT 2(=847#;3H38=8-%)7"6=.)))DDB-4E6*C:H5!,>%2E*+<,13H0#E?0$G?862!A;>GB6.:/0E'A3'EBF8<*,!!,0&'==';$1=AE<55;0(.+&A:'0%4#@#,,-3ED#>0:+!)A?04G'DFE6?A<>7-'F@!#C8/5678>F,%F@"2<8&++C%@<;6CG%@C@G46$/"F1*2*= YT:Z:UP jpayne@0: r3622 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27252 42 61M = 26999 -314 GAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATA +$(!'%*"'#&"+)#'"&')")'%$*&(%(!%#!&!#!'&#*#%+'(!#)!&#%&*&')+( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3622 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26999 42 102M = 27252 314 TAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACANACGTTTTCCATCTAAAAATNAGTAGTATTGAACTTAACGGGG 5>:6>5ABB=*%C5E3,7:3*-4/$#-.=1A#/,3$,6,15;>C'067HH-BE,>3#&7>F$',))9*!H$;=->(!)3<2H(79!'*1>0F6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59T19T22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3623 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3102 42 45M = 2869 -278 TCATCGCCCATGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGC (37(C/8"134H("F2(:H)G7E<,(#")4&&".3)B.481-6D1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A34 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3623 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2869 42 217M = 3102 278 CCTGAGGNCCTNNTNTCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGNCCTGTTGCCCAAGTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGT )""#!&*%)(%"$*'%(&++"++""'*"'+'(!!"+&!(")!)+)%')#!$!)(&++$%)(')$!$%'(#('+$+*+&+%'%")!*&+)&)("'&+#!$#%*$$'!"+!&'!%$!*(#$+)&!)$#)$%%((!%&!($"$%)$%#+*&))+!%)"')'!)!+%+$#(**&*'+&$)&*%$*)%"!")##+#+'*(')')++'&&((#+&*++%))!* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:2G2C1G1A1G0A0C0A94C12C94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3624 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2600 42 66M = 2600 0 AGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCNT ))'!!!*$$"*&'(*&")$&'*+'+!*(%#%*)(%*$&+#&$(%&"*+)#($$*!$*#%&)+&%(' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64G1 YT:Z:UP jpayne@0: r3624 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2600 0 * = 2600 0 NNGGTNNNTCANCTNNNAGCNNANTGANANNCNANANGGNATCGTCGNTCNTNGNCCNGNGNCNNNNCGCNNANGNNTGNNNNGTNNNNNGCNNNNGCGTNNNCCNGANNNGNTANGCCTGAANCAAANGGANNNNCCANCNANCNANANN !#"$$"$""#$#""!$!##$#$#!!#$"##!$!$!"$#!#""$!!"!"#!"#$!#$$$"#$!$"!!!"$$"!#""!!#!!!###"!"#!!!$$"!"!###"#!"$#!$""#$!#!!"$##"#$!$!##!$"#"!"""$#!"$$"##$""#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3625 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48318 24 180M14I4M = 38788 -9714 TTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGNCATAANTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCC B,=GC49<)'%/(1+2H)$/@:A#C!03+-AFB",7'G9F+?F((D?B09C!&+C8;4#2:<(;H6:D&'(>.$?D;0<;'/:"<3#*$,$8"&+&3#<3@#/F,?;%!"H90 AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:14 NM:i:19 MD:Z:77T5T78T17T1A1 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r3625 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38788 24 98M = 48318 9714 ATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTANAACCTATGGGTGGAATAAACCAAT ,/A>G;2.A=>9.)2)48$->$B(87,=8=E%""FFH64AG248C+*>>*84+"D5>#@2<@"EGE'FB1<'E.D9+&D0DG/>E(1B/"H9/$/AEH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A24 YS:i:-60 YT:Z:DP jpayne@0: r3626 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13216 42 346M = 13052 -510 CAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCACAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGANGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACNTNACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAA 191%?+$8=(0->8ADD#E65&@>+661,'A&F7)5/-)593=@8,G#$?1#0*5.*3@&'DE88!.,3)@(A/2$45B0DD@+-1*DB'G7=,1#G11$@3F8#EH'7(;+8B5FH/H&%#H=H3$*=(B7@.;F5G>*4?G8-43-+-64E48B"(4(F1742F>#374@4>6@?71/*,,1649)#*4>#1'C)(H))46%32;!48--:;D?1?&9G!)1AD3FC:26C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:142G71T79C1G49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3626 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13052 42 164M = 13216 510 AATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGC BG@F(9'@>$D!?*@6*)=E@7*<$;5-@')%.7/AC1)4@FC=;>%#D?#$")'2B:FD$"%56)*;B1!;8(1F!&/"?&5*F9@F$$*3?+!%C?662E,#-;"@/&736+E$(55(0"E+5,4;D14*2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:164 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3627 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16316 42 164M = 16243 -237 ACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGNTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGANCAGTCAGTGCCGGACNGCTTTCGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGT 5D0-A#H03>1>>*57:HHA+E85:)7+/8(<7B;@975%D7D0'!%+38FFB!;.=,8/18DHCGDH#-&7'(.+H$/EE0+'%4B5)'7?HE<5,@/?=E"'01<0C3C%+H---@=G3F811 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:63G51C15G5G26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3627 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16243 42 73M = 16316 237 TCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTGAAACCGGCNTACAGCAACA D78AEC.>,0@3,/3(A:&E+,"6G-%DF-!2<2:*;9=C46-4.6ECH.7D.$:9*C-1+6GE2D3)/B#B: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T8A10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30920 42 55M = 30728 -247 AGGTGTCATTGAACAAGTTCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGC !0C;4";+F&,12(#;@>&E<.>+8@G.-%0/*3!;!%"2#:-,3'?1c!5E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C36 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30728 42 117M2D23M = 30920 247 ACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTNCCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTG )B3B%<"7)D-A2H=#%+>*5?E$.:1!8?#EGA.@"+$5)-"(+!#%6@5*)5>$>):6A"GD.2$0/86+/-8:2!(B-:>."F<(6+90,5+93#DD/>00B&(/%G9<3A AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:60A56^GG23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3629 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33358 42 47M = 33534 308 TGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGT D(::88&2%;>?18$'F*D?=*>:/FA<%C3.3(AD684'9703?/$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3629 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33534 42 132M = 33358 -308 ACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGNATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCAACATTCCAGTCGAAC ,3$456?DDB.!08&>"=?);-2=?=B:.0A-B?/)9$50:?'!4%(6<5)6&#"&H5269F!%/3%&971+89'&%E1<7$*!5"6#)8(H'(&3=.F>-$D:?%34?,FF@3?*:4G(@?A--@AE4A@E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T7T59T14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3630 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9536 42 103M = 9663 229 CTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAAGAAAAGCCACCGTGTNGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCNTTGNTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTT +H!%>1*CC@!"98>=C9A'>B!&"CGD03E%F6E0G"$GCG7F..#3F,C*#4D-GG8=-FC4A*7(C3(D%90C1:&(&/8B,:2:H2()E):HA&HA>E, AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26C14C31G3C25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3630 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9663 42 102M = 9536 -229 GCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGTAAACCGAATCATTTGAACANAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCT 2+3BE:D(:-9D03HE96F4;&;6::6>+=4F+!2#>$-"2@-08"*+,5D@$H1%FD"2"?@>-06H>HH'8!7C)'967<:1>.0C-C8H:AEG"3=G"- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57A19T24 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3631 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20771 42 176M4D53M = 21004 297 TGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGACCAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGNGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCNGCGCTCGG A?7D#CE4+*!B5%+-E0EF@777F66@61>>6'(=F(&&""$D$#84="A%=0;7:1(ACE)/H7D0+,AF%(=H(8%1/2A2,@%5(-6#$;,@/-(=5,,$;4C>5+=C&@#D-:F=2B/B?#E#9;H7,(@-1')#-5HE2*)*+?/9,.C$'89"E@A7G AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:53A62G59^TATC44A8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3631 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21004 42 64M = 20771 -297 GAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAANGCGNTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCG '3<*&>46/0>=;C*=&;!-A:C'58$&6#"C;=+9=>DG*:)<5?<:FD%3&52?,1@528A1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C3C26 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3632 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20457 42 54M = 20262 -249 TCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCA %"$)*!*!!(#$&$%(%%"!!$%+)*'+((($")"$&&'#)$!*&$++&)'*)) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20262 42 148M = 20457 249 AAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCAT 9@.?>*(-$.-("@H/9+3:$(?/+*989H*'>A!;2C:(@4@65F0)E3789127.4'0+04%,54//F$?/=!6#6)%6G*=)%F98?=+-B#;?1$2H+,'&C#9'+-">3H,%@6=E'B"1!3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3633 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11493 42 102M = 11595 275 CCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAA @6379F6/#&0%-8<#"<%'6)B">?=#$.&"?$))G0!)27E/5F&F9$H:5@59?@-D@-G1/980)'/H?'005F5=F$#(+)*:;)<=,=9()20"DB#B89-()"))8#.1";=?'G)'2*B)*)<&:A"7C(8G>F?9:23+.,$+?(G@*1*>-H;'=D8?)3?5! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:74G33A47G15A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44694 42 41M = 44477 -258 TCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGT ?$.<8H4@>-@7(2+!?$=.;&GCB0#4$*)<.&3'6C(.G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44477 42 61M = 44694 258 GCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCANGGATGGCAACATA 5E)>,,2.2"G8#&$8$)7A1A@9(07H7$&2,;F'&B=(&8B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3635 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18770 42 144M = 18640 -274 GTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCTTTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTNGTCTGAGTGTGTTACA &&%#&&'"$+&")'++)*#'+**$!('("+"#(#)#!#(!(!*(##&$+&$!")&')&)#&)%")#('#%"%%((#!##*"!()")+%+&)#(!*'$$'+)+')#(#'"'$%#%#$("&!')&&+#)'&!###&(**!(*!*+( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45A81G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3635 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18640 42 91M = 18770 274 CGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGG &>E-$"!@*0,G1$H$$C+1C5E+:(82="38?>,.('A'.95(BA7!5A@B$>3:$3#/#"'+D<5!,D/D24%:;6H;&25:&/$3<.8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3636 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6238 42 14M1I92M = 6344 379 CCACGGAGAAAGTCTTAACTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCTGTTCCCGTGGCGGCTCCAC 7F+BG.9-(F"'!.;3AG7.C(,5(B;2"0C$2#$31)!;*2))+8,36D;$9G%A:?%)23=)=5?DGF5+$.D2D(38,+C=-69?E?5F.3E"&,E4< AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:16T69C19 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r3636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6344 42 82M2I191M = 6238 -379 CTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGANGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCNCCTGCCGGATGAAGATANCCGGAGAATCTGGCGGACCCNGCTTACCGCCGCCGTCGCATCANCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCNTCCTTAAGGGCAAATACACCATGNCCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAN 5)+A;!%5>-0'?5-)3<643)-H!A8)2B'"8FC79!&'0A9<6)A+CD$2%#%5/D/;-3"4#81?"'!G=-&/72'8@!%#H)3H+:>"51@H8FC"5&>D"#A8<1E838"7/?G1*6455;#76;#F.?B19CC@C/-F(7C)F/,56++3':F70&3-,!/-95)*&*2H$)H:DB",#F,H"$H0DF&BB;6;:"E*7"/5':("' AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:11 MD:Z:39A25G19C16G22T67G1G21A54A0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3637 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33450 42 80M = 33616 260 ATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAA +9880E>82@+"6G6D?EGB!#:+?)9/,C(/78%2:H(8AB?'8G(B3G.//E,E8:%$;/="4?C"&BA+B+81<:EE+*#"-.5$*F>E:60%,H5?CB34'=AGG/-*GH%B+(8G<3H"$+;6;-"!2/E+1?G*36>!?+;' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3638 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23328 42 72M = 23158 -242 TGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGCNTGTTTATTTGTATGCCAAGAGNGTTACATCAGTTANA *!"+")(#!!*)#+)+(!$+'&+)#+&*!!!$$*!)$!#'+'+$!!%+%''%#)$&&$)*'%+&'(+"%#&" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33A0T21A6G6T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3639 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38747 42 42M = 38747 0 ATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATA 4*(:+/1*#FF>7B:C!0-%#@2E:CE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YT:Z:UP jpayne@0: r3639 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38747 0 * = 38747 0 ACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGTTTATTCCACCCATAGGTTTTACGCAGAATGGCAAGCAGCACTTTAAACTGTCGCTTGNTCAGATCTGCGCCCGAATAAGCCTCAAGCAGCA EB!72C@6A?<<<'FE:('=B7=.E@)7G::/E5'9#-C#2/@(B'=E0"67*GD@*.)AF<,@4::G$2?;2"A.'+E=32">=;ED#2BE*+F8;(%A"$+8'*(DE9H61.F'<6!>80*%:7'>-H=,#@46=(;)@B%*HH?C$/4?6�@,<#F*?9&&-()F(=B/"H:. YT:Z:UP jpayne@0: r3640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20611 24 86M7I21M = 20482 -236 TATCAGCATCGCAGAGAAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGANATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCNCGCTTGAGGATGCG #(&#$(*)$'%'#%"%!*$*$!%'&("+$&*$(!+)%!!#"+!*!!)!+$%#&)('&+'##%+"$#('$)%!#''%$%++%"*++%+$!+!)%(*#+&*#")*#)))*"(*!(+ AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:16C59T15G14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3640 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20482 24 58M = 20611 236 AGACNAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGNAGCGCCTCTGCCGCGGCAGA *-,A)<.4@$(,/&D6DC!-;2D'<<9'>8)F-HB,EC:F%0B?900/5""@F*;,7, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G32G20 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r3641 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12180 42 101M = 12350 217 GACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAG 1H31"(7G,D74(+!>$%!'+!)'--#(?1@-E6?';#*.*E*0G0!%;A>",HE0@76=-"3##4<#F>7E>#@F;1'=*FE7(;B0>3>.+1?-4@))E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3641 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12350 42 47M = 12180 -217 TAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGAGNC A*-0@:@;#C3>=6=?D,&0(*):03)3E/:+3CA7/7)E*!! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44C0C0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3642 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27106 42 63M = 27307 291 TATTGTAGTTTTCCATATTNAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGCTAACCCACTGTTATTCATGTTG #:7,B"F(?:;E,=G.05(',C;@=945H4=6;2*!&:4-$7E0>@G@@:2%E?D$%'*+..9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T20A22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3642 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27307 42 90M = 27106 -291 TTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTCGGGAAGTCG #'2:F?$5,/C>*"45*8!6)8?-B-516@,5=HB-!#"*B%*:#H)D<1$G4C40,5%B@6$C9*&AF) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3643 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10402 42 349M = 10751 483 AGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGANGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCNGTATAAAGCCGCCATGCG ==>6#D9%4F=0"AG>7"()?1FH>>B;A+,!7A';6$>=E9.=//24')/DAF8)4D>*D;5.@875E=3>5BE8"2#B7!9D3H0<084(G>?H$4.95,=-8"&C:D3F@$CH(=>,75G-8G./)C58G)938+H/#($#&A-(E!(2-7BC/7&7=7F4A5AA:HB5H;H!?E(840,F>.7A21;CC(>E".BE54<#0=G9&1;(%-4&!0DB&'$:63CG=$H*,>E>70&8045H;DF:CF&"/&:&(GE'>#!B??'BE)D@&4DBA%9/==:0&6"2=/"'@D;=/,=H10$84FB"F)HGC"+F"-G-;='*&7B@B"F<#'@<3E"+">%E3H#>: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:207T122A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10751 42 134M = 10402 -483 TATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTG =:)GD:B+3+$H:/.,@2B(1@%6203F#A&&&!7<&>=%-!#D)!=0H8;&*;(-4E/!7&$7"&<#,*50F0-%6,7D6B:;<+93:!;CCE<"03 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15604 42 207M = 15438 -373 CCGATTGAAGGTCCGGTGGNTGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGC "H2"4.F@$:7H35/$,:'@3;8&4;2;)/";6@#(&BF:&C@:?3B1#D?GAG5!?A1!0FH@3#57G!)"&-1E-C**,:;(>;44;!&;(::H/'7/7%E/-25+<3)#$#HF6*#9/ED-#)6CHF1)A"39+)!G$G.')1H7<,;(*">??>!94?9=,C3/A!3$=#6&FB=8:"C;)+&)&@-A3"((CG81-F5))+->)@'/)G=A"#22+)A"36&%)!-?A(F!55*%0.<>'<6(?!E:;/F"8/./=()':59((=+1D?&5()3"#12HB9+):09.5- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:122A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3645 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26049 42 122M = 25983 -188 CAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCNACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGANCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCANCNTNCTNNANTNCAAGATAA ($)''*+!")+$()(+)**)*&+!&&!&*&"**&"*(#%+"("$$('($(*"##*!!##*)!$''$%)"+(!**%%+#("'$!+(&)")!!"%!%""")(+!#!!'%((%(!*&#)($)($% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:25T45T29G1A1T2T0G1G1C3T4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3645 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25983 42 66M = 26049 188 TAGAGNNGAGGCTGANGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGNTTTTTGATAGCTT '%#')&$+*'()%"!*$&!*!")#"&!&&%"+(#"+&*#!+%)(*#''()#+!++&((++%#(%+' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4A0A0T8T36T13 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3646 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37981 24 27M2I85M = 38211 268 GTGCGTGTTGACTATTTTANCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGAAATGCGCTTTGGGCAAACCA CH<"1C6@.!DC.4%0F+$$8!/H;#7B:#;<*9+:"B3%0E"*<-'=:/(%#FB(0%F'8&C.=G57-0#06-?/"/06A@3?*H AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:19C71C20 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3646 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38211 24 33M5I5M = 37981 -268 CTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCC 8+:,=D1;<+')A&86C22C9)#.!!G$A>B18<5HDD-'D5G AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:38 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3647 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14331 42 91M = 14181 -241 TCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCG /%(:?$10**B1@&-8>:3#+/<3B#2!F#+?35,%$0597>@/)@8=A2*1&A"&H+EA.!+"C4!(&6C.=''E1630%4"B6,(?5HA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3647 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14181 42 56M = 14331 241 CNAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCC "%.?D(C:!@>!/C"%$''C0H;#*70EA,'0*.9?F8;!@/&"=>37-5/1@47) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3648 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37309 42 175M1D43M = 37528 326 TACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTNGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGANATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGNGAATTAACATTGCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTNNAGCCAGAATNCAGAATCA 'D7F.?@E:74$0H-&7GA/)%!ABC)*"=;/C(8*(2"9-!*!8(2*!27D222G5FF20G=$#*<1&"AF"51=A527@7$55#+2)88,C<##6,0G?@;>A/;+#'4@"-.=$.<:C9-/C&5*FE@6468-?E'B#4'>2#'-"&)D-0$6;(1;79*DD,G7H7619@-:.$7@'A)"=/F1D/D%#8C8#7.?''/167;))!-;D#17>'F&#A=G&D!( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60T10C21A11T1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29890 42 251M = 29834 -307 ACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGNCTTCCCAGGATGGCGANCAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCANGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTA 54;-CAD@C=?(5>2G<7&7063)0@$H6,9B-:6;0H4/(?1%>C*3H?-1/F44B;A/DHF/&C**"50>3C:+$>-#"BA444+3/A+:(E+0;2%4?/7!-*+B91:,"H?)+6,(8>:G,D#)/5F6)5H#D;!6<:74G5$G8H&"?4.3AE.@D!61%9(G56@##71 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G143T16A26C61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29834 42 56M = 29890 307 TACAAAACCGATCTCNCTCTCCTTTNATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGC *FC/5$%"#=889("71=4FE$?*EA<,EFF*.=-+22@%>/*!<,7.>A,F351+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A9G30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3650 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43017 42 41M = 43017 0 CGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAA ?-."-H5:)7D',>7FB<8?(-.)9B;D&'8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YT:Z:UP jpayne@0: r3650 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43017 0 * = 43017 0 NNGNNNCNTCNGGANACNNGGNNGNNGAANNTAACNGNACANTTNNNGNG $!#$"#$#$#!"$!"$"#$$#!!"!$$$$#!#!"$"#$""#"####$$!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3651 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32546 42 54M = 32749 268 TNNGANTGANGATGCGGGACCANCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCAT $($#*!*(%*)")+%'&$**$%'#)((%!*%&+(+&$*(!(*+%"$&$('"!"! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T0T0C1T3T12G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3651 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32749 42 65M = 32546 -268 ACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCG >>7&FG'"=804H"##5@0B!@F,(:C/@/DB!=<%5!=>1F'-%180#<-?.&FAA+F2F:)99 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8341 42 198M = 8539 265 GCGCGTTTATTCNGCAACNGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGA ".2HE2570+5#@@B1D;,<>5?(<380&+F=A"6B,"D5"!7*=+29<5,->(H<":D;>;0-"A:/5=,58:+(#:=72A<0D0!E#/,2%H4,FE=-7)1E(1F)?E,H47E8;@5<1(.@4&2C=8G;88F(@0+89D=(33"8+#'64:)#:=>)02)$E!=F8>=$!((7#1&GD89!3=>)?7:G59='$= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A5T179 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3652 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8539 42 67M = 8341 -265 TGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGNGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGAC .F8E/?-+!-?33G9C23D,<@5.#.7F(('#+#"0"529'#!@@&D,A2!)%E0'#4E,<)-:*0@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3653 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29090 42 174M = 28988 -276 CGCAATTACACGCAAGAANAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGNATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTGTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGNCNNNCNTTNCATA '$$*+$*(*#'!&"$+&$#$''$'&)("%#"&$$+""($**)')#+)$(*#*(&(!')(!)#"!(%+)&*$%%'"*)!!+("&)%(!*'!%(#"&+$(&$!("%#$#*+%%'"++$%#!()(%)$###*#!#"!*)"'(($!!&$#*!*(")''#&#!$*+!&##&'))(*'!" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:18A45A68C26C0T0C0T0C1A2C3T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3653 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28988 42 102M = 29090 276 ATATCCTGCATTCCCGAACCCAGCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTC ;2):#F"(F%%,<."!F"@'H8.<%@#01%27B3A:/65E7@G@"<1.FHF$"!=>#BE'H-ABD.DHF055@'*6B1DGB=B?37!$4!;/F',E/1FA,0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T79 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3654 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18754 42 70M = 18588 -236 GTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAG E3"*@"G0&E/5*!/&;#8416G5'"31@08=37!86F1%H3>%.36;,A,8DD3#FCA:@/8<8?%@:E6(=##E/":.:7&0G>6";3!H)3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C21T25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3655 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34586 42 127M2D49M = 34484 -280 GCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATNGGTGTTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAN %BGG(85,-943?"4,A!=$>H)10G+F?!/;57:>D#H>=;D)&,<>-&@8;7F*#/%2C+!#,E$9EA,305.:-<#G%,##$6%#)=?%.:(1H=6$H+.=)30"*2/5.,1?=5-0135.:8/0)&(G./#AGHE5:A9(1&17B%FH4)-2#%,%&=+#?(368E6! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:45C3A77^GC48A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3655 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34484 42 53M = 34586 280 GATGAGTACAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATG $D(7-+A:?33.%6-:1B6D/B,$)7">.%@/C!=+CF)"EH?<1()H"%(G* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T44 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3656 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45516 42 58M = 45308 -266 TAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAA @C;952?;"*46>:5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3656 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45308 42 58M = 45516 266 TACAAANACAGTAATCGACGCAACNATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGAC &%)(()*+'!!%#$$"#'#%&'#%($#)#"'+($++)%&#'*+*'$()$((&('$'%& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A17G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3657 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32345 42 68M = 32190 -223 TGGCTTTATGACGTAACATCCGTGTGGGANGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTNCCNNCCNGA $%%)&&&!"*!+)%#%!+&("*"$*'('%#!'#+'+$$#%"(*!#%()$(%#$(&*+#%%'!!'&&&* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:23T5T28G2T0T1G0C2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3657 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32190 42 128M = 32345 223 AGTGTTAATCTCCGGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCCCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCANCCTTGTCATAGATACCAGNAAATC (1;C82.H$/#9<:45D;40''1C"%.E6(8#8G$**=.$8)(?2';3)1@A.&"BA'#$'#?$.!8C+<'1E+@*+C*C3>?26+E1=9"BA/F?E=5?BA0=:=7E,3G#.7.)%3?2'!+BBH6A AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13T31G57T18C5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3658 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5280 42 173M = 5215 -238 ATNCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGTTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGAC 9(=B2"BBH:0)&5H"@))>+:6GG8HHG/F4C,CFC1,%?',G&))3(''@72(?$D:;@9B<*D1@B94B>9'$&0,E0DD(-/.E24F'A'9@$GG80F=:1-D!44""@=4@:#+G>:92;:%9%-%>/6*,)$%2E15*C8.$/4F.<,-1E#+1A97<3+,66>2;; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G99C70 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3658 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5215 42 65M = 5280 238 TGNAGNGNTCTGCGNTGAGNNGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCG ''&$)&*#%&')%%($"&"""+)#+&'')&%)&+"($"%!'*#%")'"%+%"&+!*$#!#)$#*% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2C2T1T0A1A3G1C2G0A44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3659 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13339 42 44M = 13383 341 GCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTA )8.4)F%?>;?%>690@G1F0?-2B6$BH&8.8$>C&B:?*C$. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3659 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13383 42 297M = 13339 -341 TGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGANCGTNATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGNATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCT "D'%D4B*4&#.>F3(!E;$13+B,5#?;@D=8,9HG$=.!0F(E16CG$;E:68)"$H>>&:AD.#:%=.2G(30H&)<+>5B)G?D.3#5=BA23#53H3B71+A=.A:5.#$7/=3*>B88.1D9A#;D3*4?)1(,&;66;<*65$()D'#,*:D.((683%<;&"%5=%?#5E496&/?09"%>&D*%=A'>6.%-)*A23H!2:%D8HHE#A45E)*@'1:>$.0:>85&2"#$G(.$B&5<;)38C=@(2!D3C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:147A3T59T85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3660 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25013 42 71M = 25102 157 ATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTT 36>H.=A;HH=#4*=!?*A6)?C,9.7?'(:"(21.!-FC24904-%>%50E:C@"2&<,1EB62%"A&D- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3660 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25102 42 68M = 25013 -157 TGTCANCGTAATATGTTCTAGCGGGTTNGTTTTTATCTCTGAGANTATTTTCATAAAGCTTTTCTAGT (5&5;-8G7(ACH==?"-#C80E-:0%<47&B)%F&(H%D#.0:/47!!593+.>F8D1HHEA2D:!) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T21T11G4T21A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42784 42 102M = 42570 -316 GGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAANAGCGGAAATCTCGTTCCGTATC F;'96+@$.:D>H,@<=0)>>$7,5&=G6F;;3?B%D<6DA'>8:52/=&3513?A907B<5=+-!-)-*58*:4("E,)70HED@.3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79A22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42570 42 214M = 42784 316 AAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAANATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGNCTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACC E*3F*#DE725A3G.#5H5-&H38H0,&"!$=0G2H/-79!H.,">3".*'&+!=)A'-7<$5/+$%#6>7!3?$+=G$4:74E?$2D@"9=A!;'.F)ABBCA?B96+&<>$/@?:F-%16'<>&3BD(.%'5&0-14G.##-E5#543#A0$'%A:*2'#-%%2?"0%/."E1-35+22$@2=/#HB.#)%4?D&H72* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65G88A59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3662 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5507 42 223M = 5753 314 ATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGATGAACACAC 8=+D8*.F8@0*1?>-@&>2777H#&6'G1/:1*=)G4':.F1<31#?3+?E<',E$=<0#)0&:E3C9"*8.+E+'5%A#,@'."-@G@;>=>'.%'@+9H<90$3;>53,/H#G6)#G,76+&<1/2(:()H54,.=9EGD+D!(?8$:A8*&=)AH%)!"B8;D?.+6A/%?+1<1C41)2F#66:F>#C0?B1D<4&.C)?*.*"?A,#,?!0A>4CDD1/;-9(9;'A6(;>9@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A28 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3663 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37676 42 117M = 37585 -208 ACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAATCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAG 1"<1/D'EAC,37-&D6"@;D5,/<.",8H(D'4F"H;<40=44&:?EF&7>;+>*&./*"-E50G9?$7C#6!!7-@87)49*416A..CD%.)ED+5,?!0!,"F:$1809"&'A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69G47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3664 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18068 42 265M = 18068 0 CCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGNCACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAA ?!)7#"$E3+4F,255,9,(-%B?"C*'5A="0'G-27440,<:3.=<7-@$12>&)FF1A@*DEE*4GD55E,DH1)16(6ED,#'G&91:F:4&)F#655$?&=/D>34H!()AG!?6,&)*7D?A4)'&'H&''%-E<*A',?9F3<,++(6-EF2#"F$6D;B**$$C;D4$!3C4)HG$C7/$(#" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93A171 YT:Z:UP jpayne@0: r3664 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18068 0 * = 18068 0 GCNNNATCNNNNGCAGNNGNAGGAGNANNCNAGGNGNCNNCANNNNTTTTCANANGANGANTGGGGTA !"!"$$##!!$"#"!"$$$"#$!"!#$$$#"####$#$!!#!!"$$$#!$"###!#"!"##""##"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3665 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26631 42 47M = 26813 311 CTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCG 4!H9=8)C304*<9/1$52G25:E=@=HA2E18G51@!",;&)2!9/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3665 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26813 42 129M = 26631 -311 ACATTTCCGATATNGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATAC 8#EH,E-E:!52!*3(86;?AGF),!=+%999,?/;&,<=/<(%75F96D>8H=?0+76AC#<>!A48H2@*C!(77//A0*&(8"*,"C")%!:$3.*F4,94"+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C115 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3666 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2153 42 131M = 2324 280 TGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGNGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACCTAAGCGAAACAAAAACGNGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGA 3+$**A<3*$*?+@6"4)-<(,9217!*?.<:0-*"FF94B,,!/H<2H(@?*"E-E6#"-AF*AD4$A9<:;>83-#"3B:#)#+E!7)4>4$3;8A"$?,?C?*5;2+)/%E";'659$.20)@&F6/7 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G37G17G44 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3666 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2324 42 109M = 2153 -280 GCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGNAGAGCAGGTCGAAAAATGGTTGGATGGCANGNGN +*!%')')+"!+"+''$%#*')*)%('&#!*(+%&+"%#('+*#%&!+*&+*&++"&'+)'!"*#+'()&##'*'&'&(%&(%(%)!#)&*'*+!$((&'+()+%''#" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:74A19G9G1A0A0A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3667 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17878 42 211M = 18089 291 GTGAACANCGNNGTCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGCCGAGCAATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTNCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGNGGATAACGGCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCNAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCA "$'($$&%((!*(!++!!&%(#$)$)''$"""%*%!&+)+%#$$)!$+$&%'#&((%++(%(+!(*&+%((&+')(%&&%#(#)#''!'&(+#*)#''""%*)&"""$+*(#"*"+*)*)'!*!(!$(!&(#"#*(()*$!+''##)**($(&((()*('&##('%'%#%'++#&$$$&%#&#(!$$$$(('%##!&!$!!$(+!+%"$)" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:7C2T0T1G31G5G67G22A8C21G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3667 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18089 42 80M = 17878 -291 TGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAG ./3G%C#C0%1G<;-/!.>+-)A7'+H%/$5(G27B:C8$?4G8719/+7)'#-6$"-0=*<9G,(6=99B532*F>F%+=GE4D2!*H%,*84##8;,);-,!-,.!/9=8,>&6;@A0-(,&,F%A7&.A*/39DC*$8."2E(%2F"A";-%"-41D&!/6/7L>FD$%;DD$;FB'2DA04!2$%4D:1$$GA&10.C>31,<7*%(&07)5<9DG!0G!#G5G$DB4G5(D3@,<))23'(H3*6G5#8.B3&#FEC:01:/*=9D(@>"&!B;F6=C-(5=/;F7DF?.HD9:B89@,'4>'@?!!*7;(22$@(!'"'D3%@ AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:12 MD:Z:0C12G50A47A14T14G12A73G12C34 YS:i:-46 YT:Z:CP jpayne@0: r3669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40607 24 5M7I13M5D88M = 40330 -388 TAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCT H-=1<=FB52"D#@/>*?G/=(=')@:9F8*5;E"!?EH'5>?47"/&.?6-8@03F087.A2!E<)+>D/B03%2E#>4)H&$49!@/2C+7#5G84526298%BB-!)E%4 AS:i:-46 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:12 NM:i:12 MD:Z:18^TTTGG88 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r3670 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27996 42 276M = 28272 566 GATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTNGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGT 87:,?90#<$0D#!F<%-<<1?.<00*!4CEB-/E6?*'26E2D!9G$:F6.A"=;*=+@$,:D(#*)@*=F6"&D%'4$=-/C'<7&,>9<$G69)=%8.5B#'A9:!4:H*;AHE63137'D:#%E0C&8&2-B:C+&C"0/#07>C!%/,#,DE)-#<#3B>*;+7=CE(C*1"'2.=?3(8(-EA/6/0:=4&"1$:9+F5=@E=6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A210 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3670 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28272 42 290M = 27996 -566 TCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTNTATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCT <8.-!:.'34)#*=;--6?DGFC@;<,&G=%1@;%((,,5.?=70(0C965(G)88**/CA3B:4,.7,(-G@$%%@$$A:%5D>=":"?!E",;.D8'-(/=!,4("9EC3*4FB+'-(H9,&''7(H!GFD%'<5,C=GBCB%,,"H,!&!2H#;C@H#9&%<,G2+;+"&,>:/@FF4A)!!G.2<1$38H,>'B774!)(*99#$G-.&8(+@,$@,+1!F8'2EG-#)FD43D>2A.-82-%,?'#9D-$&BF/>'C$&/:D8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132A157 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3671 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5026 42 68M = 4841 -253 GAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACATCGNCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCC 55?5A*)7D#=3/+70@7CEDF&EG(7)6F19)"6#?3%1#<%8. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G2G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3671 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4841 42 41M = 5026 253 GACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGNGCGTGACATAAAACC 4$'(#"311HB4).<'BA+/"C!79=/E$G0C5?)+G8A7+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3672 77 * 0 0 * * 0 0 ANNGATTTAGANTGTGAATTGTTTTATTCNGAACNAAAACGTCACAACGTCTCANAT )&)*+&#!'*#$!%("%$&*%+)($#+")&#%%*!"))%+(#(%)$$*(#'"&&+'' YT:Z:UP jpayne@0: r3672 141 * 0 0 * * 0 0 AGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTT =)C%%9'38C&?C927<1#,$(&9>*2522+%2-)20E:F-CG.746$;B*HBF+ YT:Z:UP jpayne@0: r3673 77 * 0 0 * * 0 0 GATNGAANACGTATGTAATAGAGAGTAACTTNAAAGAGAGATCCTGTGTTGCC @;*E8;=-=0A<(E89367D&0$"7"A*!"(;:E,/A->52=D11!.;/6$0C YT:Z:UP jpayne@0: r3673 141 * 0 0 * * 0 0 CAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATNGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATCCCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTTATTTTATTAAAATA /*H;#0H':"40<.+>/.C$="$,;6)017E%)F2"B#E0-*D:/,0#G&$3A9'8@;0G:8160C:+:"-C+742;6?1G=).6:EGE2$CB#.C,-B3FE0@>1'./3H(3@3!"D5'A-6$+:==&,G-+6/*)'.'&HDB,*><&/C?#%4?1>?9(/* YT:Z:UP jpayne@0: r3674 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24710 40 101M = 24810 194 CAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGANNCCTGTTAGCAATTTTTAATAGCTTGAAGTAATGNAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGN D69>8&@C'0FA&9&%A)$<:$F%=62&&28$C-'&G;/F;&H=('@'%*(G/F6!/>#(F/!2//+)83DE64,#/*728,!0;'9:;6B"/C'"C6H5H AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:25T0A12A14A1G3A34C1G2C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3674 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24810 40 94M = 24710 -194 CATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACNAAATTTNCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGG ?B0;:&?0714;D79>#3CD:0."72-2E(F>4%CHH!)C-A5##&%1EH18@*#2)3F%'>)8*?&G+A649D*@<7-@G@*+*(4G1=4:'5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G6G45 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3675 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32955 42 121M = 33085 244 TGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCNTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCT <29;8DA0@>#AE&2$6*.''=H.9<77:3A,!G#<##-;*G"04E%;-C19,A9?A5'9=3=D7%%)F$#:@@(#.:A0C('8E('5E.H.%D7*F=5'C=72FF6&'<;G&D?67"G4- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45C31T43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3675 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33085 42 114M = 32955 -244 GACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACNCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGNNTGCN %&%+%##*!)(((!"$$&)&%%%%*(+#(()$#'"$(*&+&)%+'+''(&'*)#+!)'"!%!&)*"$('(&#(*+(*#%#"#)&"!%#*(($+)!(*!%$#%'%++"%%*((*% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:36T71A0A3T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1551 40 156M = 1450 -257 ATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTAATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGANCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTCNNNNCCG &#+!)&#!#(#'#&!*#(#%*"#*#(#+%*%$&"("()$#*!%%$!!+"&'$+"!")#")%*&"(#'&!"!*""))"+!(*$*'$')'*!#(#+#*!#)+)*'!)"*"#+!!$#%#(!%!+"!'#&((&$')%'&%+")$*"%(%)#+""$%%*&* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:36T73G37A0C0A0G0C3 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1450 40 101M = 1551 257 AGNNCNTTNNACTTGGCGACNNTGNGGAGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTNNCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTC &%'"'%*)"$$"'''$%*')("*#$*'!+'++&")+""*"!&'%"&&!#!*)$$)%%&+%$&"'+%*%'$!"!+(*&+$%*%$(+#)!#)%'+)**+)+"+ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:2T0A0T0C2A0A1T8A0A0A1A1A0C47A0T13A10 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3677 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2941 42 62M = 3019 268 CGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGG H+/AA+H'C.4)HE;?&-+#A8)/HF*'>405./BB<4+!,#5)%7.*4512+D$)A77.4( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3677 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3019 42 190M = 2941 -268 GATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCT E8FC)-/3&=+E2?6!(C*(1+-%8%=%=412#!%BG)CF8?8''1CFAC'F7/%.1>HF'*09GF@7?&B?4.B'E.>0*+68>A8&D93C,'(:4FH96DF!H.BD/%)3.&E1-(0)&$GF$@#B5@B)&2,.1%800D%A)!'8/1#&'H,7:E*06%#;/#%)7%)3H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:190 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42798 42 158M = 42685 -271 GCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGNACTGATTNGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCG -B86"76%=/!CF02H>8D5&!@5(@D66-+BG424=7:4.:#5=@@)'B'@&*&9+FH22<*,A44&9DH($711?)1!D=19AF7FA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:94A7A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42685 42 40M = 42798 271 AACAANCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGA ->@/#*:C1,8B%E=F9EA7A#(-'8(%F/!56;48B7CF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3679 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25163 42 118M = 25308 222 TTCGAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTNTGTCCTGTCGTAGGTAAATANCTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTC ?D+,24'0*7'7)7F;$:;.3-E?C.($H'D/2(+;(6$*:257*!#28@AGDG<($?CC9B$$319%33@0@/%EG?>F;-&#HC0H=*'9=7#*@*H*F@@G#6/0"3F53G58.9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T52G20A40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3679 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25308 42 77M = 25163 -222 AAATTATTTCTAACATTTATCTNCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGANAN (+(%#$$!##!'#%"!)("#&!+++'""&+%(%!(()%""$$'%%+*'%'$&+%)*%!#$(#(!$#&"#('+%%$'& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22G50G0A1G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8032 42 269M1I50M = 8351 385 CGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGNTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTNATGCGCNGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGANAGGTNGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTAT 0"<:+.9*%B+?%@.$$(H1#B2)EA;-)?HF9(5/56'H6*A>0!-!D<:0*.'@%*)%,/1H"?,:%AD=AE>;F/-C3<5GG*)(-,9(2D.G'*/7A#0%F?E=46+$)98,>H7A@76!?8H9%(#=D(C@#>9,!634D"%,+-C1!,33*>&'#7+$)DB+(3C02'C0?D78ADC$+5.)">04DB)#4)HH(&)C58@!:8;+<&F=8<("E*$H%06,2:G)&=7*A3:"EC))G5"0/7HH*-.;@?54DH)*!EB#FE!/53,34(F2380-!6?AF'91(=):AD>ED+">3#FF.H'1G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:92G110A6G53A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8351 42 66M = 8032 -385 TCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCAT ,),=%A>$68.FE9BE!:HE92(39?&E@.,;"B5+E5>?00F'D&HGE"$"#=(2;:?&2EE)"F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3681 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15578 42 56M = 15379 -255 GTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGANGGNTCANNA $*("#("&()!$$&""%''&('&)&%&''*%&&**+("'+&"+!$+(##$%#("!) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:46T2C1T1A0A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3681 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15379 42 48M = 15578 255 GTTTCTCAGGNNATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTT ,$;:(&0).'%?FG*(6=+5?>@)>3$@$#3H9<0)''H#,CF3*.),FHB+)/0*9/EH:##F860EA7&DH2GGEF/*.7?#+!;B1,(60.0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C33G8 YT:Z:UP jpayne@0: r3683 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17450 0 * = 17450 0 GANNANNNNGNGGCANGNAGAATCGNGTNNGNGAGNANNNGGNGAANCCCCNCAGNNGNTAAGNNANTNCANNCANTANGGANNGTNTNATGCNCT #"!$#!!""#""#!$!"##$#$"!#"""""$!!"#"!$"!#"#$#$#"!$"#!"!""!$"$##$"#$"!"#"$"""$!$"$$"#"$!"!!$##!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3684 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42834 42 102M = 42460 -476 AAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAC :'(1@2>AFG:):2+*?@2ABHF!0A,2@B,06'%AA"H2%F:#A>1A+:161?@3%D0@$)$"C%G'&*@?GH51A)85+<$@=+C#6(;4C&F@#8A>'$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3684 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42460 42 374M = 42834 476 AAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGNGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTNGCCNTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCNGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCAC B2)C,650!:'0H44-!=/-?<."7=.;G?>'B:31*?7#&;ED#;9<'H1&C9&G'D$B?H37C6,3(E3D8/;&.::.8%)&5'F;<8H%,&,G;$-;!1":F87;0.B49#('?.<&*$-860."/H7'?9??0CB@>)B/E6:@"@&+%$AG-;#;8":G8&D$8A;,.B-H)"7%"@",?(7#!36:&/=**HD*-.H8AF.3<4874,F<%(5!,E2):=GH:"D,*<65D=%@'(7)&E@+"53GD-)C9D,C'$6+!?BH?; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:65T121C3T40C141 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3685 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45022 42 44M = 44839 -227 AAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGNTTT ?)C<4*5)E>H<=G>?=!E:7F5:>67E!E=(52*FH$5G:)C5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3685 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44839 42 49M = 45022 227 TTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCA >$F-)9?4$;93@H'"'CG=,66%C+#@&HH()A"<8>8*00G',D0H?=?9A5!+FC&44C2(G@*?D0&9'@5?<944&6<@6A5";:H(9'./1,+22B?>-:G/&D2@+#>F/%9/!H$:350#81G5/02H7>E$?F&299B393)41,@D";!;%;3%< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43C152A0G35 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3686 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19899 42 246M = 20145 479 GGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGAAGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCA /53;6?1>8BDD@+02)$H!%1:>@$AHAG?/>="-G>,A%1"+F4><":-AGH:;DB@+8?*-8<8?"B"&@,6+!>=+B566D37G&<%)9/<'F<-6@&6H1,(;;7.=CHGE0G-+%.>6G=.B7$018(-DD:/?1%-$(,G#@D*+831!%C/>A#@7-@1$@%-H6#!457'2;9006#6GG$G1&,G*5;@7B0/:#:G(2B?718'AEAH8962.9,&2HH-)$8H(*/>@:3855&*:D9-2$#2,&&7=;2&-@C9B19,9$0'9$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C31A0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3687 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42389 42 331M = 42720 417 CTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATNCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGANGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGTGGAGCAGAAACAGNAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGAC ="&14@"DF+>3H"#(*@D7,>$C!/>47A@%%81>,?"=!'H/392=D47=;F574H<::EEA8-12&FG?"?"!5740&?-%9"4#@,7-%HH<41*!4H5(5/-CHC*"282D0B8B*F&)#<72H$5%3--HA7;?'A8=C0B@D27D;7(A4>%.5@,"A1B!=A@6*>@-@7-9%6#D$F4/=/,8HF=GC5E;*8D9$!:+G?#%CA&A=D(14C+C>%2#)A+)&$C/BF-6F?45E-D6C<4>"><4*53 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:26G23A115A51A13A98 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3688 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7696 42 98M = 7535 -259 ATTACATCCGGAGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGANGACCCTGAAAATATCNGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAAGCTC .6).252H0<64)=B<105C(B0&*H..!6)@@9<0 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11T35T15A29G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3688 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7535 42 82M = 7696 259 GCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCACCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGC @H3H!.*1FHE$)?H@2**"$A;A&DF!4D001#,>*"-"3!/5;!+B2-%A::AD%)8)#'D%8(?B;8=*2=*F-GA1*$A:5:$790::C"D=%,=*D)?34'$G(@7'(716?'8*G9-.7'/B6"*6B&0)ED#.(BC@?BE/?5G741"*1!(=FB"8B<:D+H'"1&72HC@,A'2*?)*+DF!(;:?$&$1/;8(9-H)B:D<>!A/)0H0!+06/($99B:+*2GA+&>87#/2;5?-9"/19>/C3>?/#2/'HF:0/>)$C'C,4=<%"&G4=5+BG<.C'16E/DG61<89+F"'!&B AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A40G2G166T5A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40136 42 48M = 39698 -486 GACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAANNAGTACNNNC +!()()%!(+'#'#*"+)+"(*+!+&%#'+)++'(''#%$$)"!#"&# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:37C0C4A0A0A0C0A0 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r3690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39698 42 410M4D24M = 40136 486 CATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGNAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGNGACCAGAACGAAGTGAAGGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTCACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTNGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATACGGNATTACGCCGGCNGCAGNTGAGCTTGTCCATAT @F?1";&5.G'91-DE-$2=8,+>7'9D!C==5(H3,>..H*<&6&*1>="C.BGC4E?*8H9.1%/).(C.?6B&A+)(6*<:"36%C='<-+;/B!30:3B(%6&?,A@#/CF97($!)/@1"C#'E9'B*D..9';6,H?5-!-(<@-@/&@F%"E3?%.'70A8A213#$81$"7>'#@4+?EE/$HEA!!D=15$%(%*%$F>=;4;4GH5)!;2H"";GDBD#$')5@=1A*!HDB9=-4-;'#29"H'%4F+71;8(8%6=E0-;C8:48E?:1685GE+B@:*E/H03"+"-&+2-&%;$%<5#.9)#7H)2'$&=,,@==3'*@0(A1BHG*.,#72GD(C%<'.634*..G4@#9,(%"H?E:,)GF.5+8&2'88AD/'>(A+7F4'5"EF*/8E<-<33,C AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:13 MD:Z:29C27T17C63A186G70G3A8^GTAA3C4A15 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3691 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32914 42 125M = 32862 -177 CAAACGCACGGGTNATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCT 2)57C$*:-DC)1?"!!D%72(#%>=0$C2('AE=+%G8:*F*"0::F<4D7$6,7*"=9:#>&(%50E9%3*>EB<>#EE9>:8;-6).=D>)(9&@/-G27C><1$F-8$A"*'*/!$H=2,H)C/8*->(65F@'9$7%BA"D4.&/9=?"(,'-)0,=1&,CB+#2'$A!*9?+H5!+,&E>=?.2;+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4991 42 45M = 5122 263 ATGATGGCTCACAGTCATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGT G06.1="+<*=E'>8>A+'@$-!'.8(GC5;>*<"6<@3#24=@H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5122 42 132M = 4991 -263 GCAGTCCCGGATGGACGCNACCCGCNAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCNGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACT *%&!!$#$%(&'*#))!&&+!#'!"%('$#!)'*!'#")')$+'&$!!#&'"!!#)$$)+#"+%&#'#*%"#&$"+#'))#*)%+#&)''&%(++)'!%%%'&''!(*!$"&)#+'#&"%$'+#&+&+*'+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18A6C67T38 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3694 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41023 40 150M1D19M = 41023 0 GGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCCGGAGTGGAAAGCGNGATGGGGAGAGAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGGAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAG C)/C/B$H):;,'-D6>/!=!GE#G*'97)"""9=@85D/-7+E)6H!'@.?H/=:#6)EC:0H5=-28;2G)-:D+G.F3$G-H306%:.$E?+88G/F8*52!*8#9E2: AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:24T13A10C84C15^T19 YT:Z:UP jpayne@0: r3694 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41023 0 * = 41023 0 GNNGCAGGNTGNTNNTNCTNACCTTGCCGGGAATGGCTTTGT )"#'$))##")#%'!)"((&&(+)#$%+#!+'$""'%'&)!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3695 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28062 40 90M = 28062 0 GATGCAATTATGGTTTCTCCGCCNAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCGTCATTGATATTCCGAGAGCATCAGTCTGCNATNGN )!%'&*'++)&'"*&'"($'&*)("'#!$())'"$&#'$)("&)(((+#"!%#$!()%))$&*##+%((##)&)+&$+")"#$&"&'$%' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:23A30T23A1A3A2G0C0T0 YT:Z:UP jpayne@0: r3695 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28062 0 * = 28062 0 TGNNNTGNANNNNNANGANAGATNNGCCCNNGTTNGTCATGNGNATANCAAANCCNNTNAAGNTNGTAANAGNNCATAGNNNTCANNNNNCNNANNTGGGNNAGGNNTNNACNNTGNCCNNCNNNCGNTAGAGNNGNNNNNNGNNGNANNCCTNTNNAAGNTNCGNNCGNTCTNGCGNNTNNTGNNAGTANGTNNCNNGNN #""$!"#!"#!"!"!!"!!"""$"!!#$#"$$!$#$#$!##$$"$!###!$"#""!"##!!!"$!###"#$"#$"#""##!"#!$$!"#""#"#$#$"$##!##$!""!!"##"$!"$$"!$!"!#$!!##$""!$!""$!!!!$#"$!$!#$#$#!#$$"#"!!#"!!$#!!"$""#"##!##$#!!"!#$$"#$$"$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3696 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38511 40 128M = 38639 254 TATCNGNGNAACTCANTGNNCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATNGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAANACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATC !%$&")&&!"#**"*))*)#+*+)%&#!#%'*"+*$#)*!&'+'"%%%%#*$"*"%*+++')')&*%()"$(*%#!!)"*!(%$#)$'"!"%$))'*&*+!#"))%$!')(($'*!+$#&$)++!$*" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:1C2A0A0T1C0T0G2T0G0C2T0T29G43A34 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3696 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38639 40 126M = 38511 -254 CAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTNTCAACAGGNGTCANTATGACAAATACAGCANAAATACTCAACTTCGGAAGAGATAACTTTGCCGGACAGGACCGTAATGTGGCAGATCNNNNTN *$##(')(!!(*""%!"$#"'+(&*%%)!*(!)")('#'"%$$!*!"++)&'$#!)!%+$*'!#)+*(&&$%++$""'"'$!*(")!*(!!'#'!(!*+#%*)*%$!&%$%!$#'&"'(%+")%&# AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:31A8A4T16A16C4G18G16T0C0G0A1G0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3697 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15994 42 84M = 22 -16056 CTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGAC "))"$%%#)("))!!(+!+(%%+''%'$(+%!&((!%""$&+*+(+**!&(#**"&%#$$!'(&"%'"#"++%%%$+!&$("$+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r3697 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22 42 54M = 15994 16056 TCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAANGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATA #A6)-$(B.69??,GB#0)$0F:=6?(4,;G!;8#C;*:7'CA9FAF@6+2*6A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G24 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3698 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12603 42 182M = 12524 -261 ATGACAGAAATTNTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCNGCGCCATTGTCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCANTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGC ;+013!0?90->H0#*",G!//>3-B0C2D8,4440%&A3DDE".F=>&%(E?@?"90&#&(.$CFH2$%>232),!GF;8%10?+,.80'12F?!()E,6GF3AAE:5B,*F)/04=*#7><*4FE.793/:!F%.!42F8#A:;<(D"B4.*;"D6(,=F8%BF=E>2HB.+F AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:16 NM:i:21 MD:Z:0G2C14T52C38A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 290 8 48M = 1 -337 GGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATNG -.!.!C&>(("("3E./;3<-)"2%?,6E#-=6'26*%'E0D,$(>(' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G1 YS:i:-60 YT:Z:CP jpayne@0: r3700 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39291 42 208M = 39498 297 TGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCNGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGNAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGNAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACTCCACTCGAGGTACAA @/5!B$!C4+,.AGDF"C6A4D2=(H)-.C2&5)39B*?6#8B,8BH8;&F/92H%';"GA@"0$/3H.(.2,-#8$#(4F7D?#D?G>H+:;4'ED(G&&#*H*0H.DH9+:6/''E'@E<(%=EF':@*(-= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3701 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31103 42 155M = 31296 289 CTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCNTCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGA ;G$(#%8E3=F8<,$;6-'A*45?4)(F.H?$<4@7*("=$1.;<%9&E.?B$!9AF.&3*?G2:C$GCE:G*>H+%1$C.($3#E5CF&'@9&A8874,!:$/!)20!8.51GFA<9&F'A:F@C&+%=G!-B,0F-B7FF>*'%-(#**;-6'B#).H9,'3-E'/+4G;BB7AC5??68*7%5-D3DC(2+>F8/E.31##8+-E=$;784)A(8("0=@"!+*/#H!4E:+@89.CA"$A%'2GD%C&=G6D9!9AH@:5!5;B>.8"B4B16$82C&>GD5C."').1&AH7E(0-'?4B#'1%-9%(E5/@D<$A329@E1586=D+*.GC!<*-/;2C+78!:E,:==2)&'72,,>+CC00<*,4*!?07:C(.58"+CADBA/3)E4$B)%"6C;(*>&8.,CHD*)BH&3;!/4'E>4,%,3AG7"44#6>E*&618A/#<)4H623,!*91D096'E5A$9(&>=-!9#5B,!F2:%>D'&32"G9%F.FH$$';.<85+F0?; AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:21T42^GC3C93A33A8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3704 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21232 42 377M = 21609 464 GGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTNCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGANACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGNTTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCGCATGCTCAGAGTCTGAGCGGTTCAACAGGCGCCG E*5>;,@/&=:-+H/2%+75=/+$$.,/(@*@,G$4(7$=3)/'F-%8.6@E!$0/D2&C7D83&.H49HB34F1$B"-@-*B0;50--HGD"2<,B(6E?+7<9<42<2>(9D6=+>!/6:40A?/,=7#'52B&62+#B:3H=&(&:+/2))@,D:1(F$%>)4$DG+3%F)A:@4;@HH4$"1D%%F7>4)&><7%90%E2F7=*5$")"@)1#F0G(8#+%@7&4&5-B+!5&C41-80:(7&%6'9%)0"$G0-(*DD+:'@3)1C46'C:*;37B$;::6==!(%#AB);H3%G')%G"&3!>(!E8#1<(<0*;1!3<8,F;,079<"BE!3GB6*A.B-2 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:132T31A113A63T8C20G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3704 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21609 42 87M = 21232 -464 CGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACATGAAGTTTAT "(D#B3'8GA96H+$D&&&>:H5#+!0'%$4AHE8HBA'3,1;>8-H>2D%;=B-G%C&7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G9 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3705 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 173 42 120M = 173 0 TTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACAATTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGC +"#!*&$!"'**#%$*''(#$%#'&($!!+#*'**$+$!'++*'#"+##!*!$((**)#$)%#!&"'*%)&+&))*%"$$)$)"'&*()&$"*#$%#'%))%)%'()*!%"#+'&))!+& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T70 YT:Z:UP jpayne@0: r3705 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 173 0 * = 173 0 CAGCCACCGTTACGTTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAGAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTT -@5/0B1C<62:)#!7F<;>"(&2GC/2/3:*8<<3,#EA:GC>)H0<@(>'%82=3(0%5H+,#D"E')EA";@C+82D/%%A3!,"?$>?=#82F,CG%$<:3,)A#)12C!*98:>)H@.-HH":'!?6G-+',(9AH<'93>.+!07%HB,,"0=>BEAH#%1'H5%C3(6D(6% YT:Z:UP jpayne@0: r3706 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43495 42 94M = 43652 248 ATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTTTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACT 4$G8B76/"",,;&A8,3)$47;0H1.*77*H7?#G',6)D,?3&? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C62 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43652 42 91M = 43495 -248 CTTTGACGAANNCGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCGGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTG <((@8H%3+((#D:@<%5%?$.(5A20:*=7,6(6#BE97/)86#F.+/4-1:;CH+3F!:5-,3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T0A26A52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3707 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21666 42 51M = 21717 225 NNNGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCA "!#+#$$""++"#'"*%%+$$(*"'('('+&&"!&$!+#&"#(+'$('%!" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0T0G48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3707 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21717 42 174M = 21666 -225 CACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCNCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGAAC =&C2/E4;0;46<4'79G?*,"H,"C#*+F%6#GG#-!4"6C./,BC(.6!"'E=,1?A68=!@6?/:4F,37:"@>+6E=3<,46.3'>*.<.@7%-$%)B0!:H0@A'7FA6=!H%&3.G+)*("*2F#=C97A:2;C1@+39C.'?F#D9F3%7,#7DA$,9#4;1@F;E4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91G79G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3708 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8273 42 27M1I14M = 8015 -299 AAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGC D):;-8C*HFEB!!FG'3A@"8C>%H?1(8?15E<2?!-B>/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3708 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8015 42 153M = 8273 299 CAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGC 05">%&*/#$448'%!F6>$G4+)4-F:4'+D966B)B&4"AH>/(6')F9;!)+C,H&'D8<7/.)1&.74A-"$5=*B%&65%8C3"=!8554/@,E2G&45:D;(*E5$>9&*#AE-;:E61@D;*?%)/0E4G#&7:4C-/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3709 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42062 42 122M = 42062 0 TACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCANGCCAATCC .D)5@%8;3'F;:#*;692&?$/429*28&3>%55H4DG-,59?E'=*<<)8((@>/&/A5-D+,)FE?(A$.6G6:1-$7!H(4*)>>%,&"4)>!4"/&=D=!%ED+9& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:113A8 YT:Z:UP jpayne@0: r3709 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42062 0 * = 42062 0 CNCNNNCATGNNANNGNNTAGCANANNCNNAGNNNGTNCGTANNGACAGNNCATTAANGATNCNNTNCCCNTNTC #"#!!#$#$"#!$!!$"!###$"!$#"$!"!!"#"$$""$"##"!#$$$!!"$$#$#$$$$$#!##"!"#$#!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3710 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40043 42 65M4D133M = 39842 -403 CTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTNCTGNTGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTNCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGAGCGCAGAA 4"#$%:?0&A$'7E.70;?34A3@&">)'+=6224@$'>>B?#*?2H0;#*H.B(E*:3-/&/$51H-&3/(-71>*&B0&'G32%'#"6;E$:B8-D$@@GBCFDBE/-D>2)%""#)>)%%5.0D?/8*>0928<0$5AG7(+C- AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:46A3A14^GTAA75T49T7 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3710 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39842 42 201M = 40043 403 AGGCAAGGGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCANACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGATTCTTATCCNTGGAAATCAAACGCGCACTN *'%(#!$"%+'"$'#)**"+)+')""&(")!+%*"!#+!'*%)&)#')!##"+&#&'(+#!&('$%()+))!"(&$!!*"(&!!%+"&"!#+%++%+)&+#'&)'*'$(""&))"'#$*!#)''$+%+!$(!$'!'+'%&*%(*'%%&%%#')+%"$&&()*)+++(()'!***$#))+")&'"#+(!**%$+$$(%)"!$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3A1T1C95A67G8G19A0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r3711 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17800 42 75M = 17594 -281 CTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCNC B0'C<233%&+*2A,64/256H5E9%1<99'580A*.)/E5"6398*'&7*"3!;G?*D*/279BA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3711 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17594 42 44M = 17800 281 NGNTGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATT !'#(*#%##&+#&%'++(*)*)!)!"#****%(#*"#)**#(&$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C1T0G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3712 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24840 42 44M = 24650 -234 GTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAA &GB@?7;E9F#H?9,3"#5#+(81CB9:AC>C.,C%%6(7<':H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24650 42 98M = 24840 234 NGTNGCNACTTCTTTCCTTATAACTTTTACCAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCGCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAA '%'##!#""!'"*+(('#**+*+#'%$#(&)""%+"$""))!"+%$!&%!)&&!&%'!)*'"+)%'!!#""("+*#*#)(!*'!!%*&#$*!#++&%& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0G2T1A0A0C0T0A1A18G39C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7758 42 92M = 7961 251 AAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGNTGCAGCAGCTGCGGCGTGGAGACA ":-F>>E/0<%".5G4<&>;@#HFF80"F=E@0%+HC"3.715>>*-,>50&H.C=&.DB?2=3B6(-==B9*'"$-F0#/0E7#2*B'C6) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C66G3G20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7961 42 48M = 7758 -251 GCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGA D(#'&@!2#*20$@*4+8C/(1,16F1&F%)*:%0"3E:?5-A/92"DH/0'H,:@G8=94C5E+.A$(6<(.5921-2;=H2.2;D3C#&4#H.?9;)61""A&!+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:122T5T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3714 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30580 42 51M = 30708 257 CTATTTCTGATGCTGAANCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGA @;-&*8&!FA/6-3B=#7?2$#08E@@EAG%',B/:18<:/B&DE>.">BC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23228 42 103M = 23415 283 TATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCATATAAAGAGTCGAATGA &.<"8?5>,9<*(5+70!=4:<-&HB?6+9CC?D6)1!+!$857:GG!/0<-;*(54(=/C>*'/+(FEG/%*/).5'F.,+2>8H=)6G0!*,4:5;0*#C% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3715 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23415 42 96M = 23228 -283 TATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTNCTGATTTAATAATAGATGATTNAGTTAAATATGAAGG <(?2C9A%@A;8='$B:93=66/)D;7%%-07,2#&+!D*2/=F>>!/0C+;.+G-,8C0)F9*<:BH: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3716 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42239 42 70M = 42058 -251 GTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGANTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCG 1/G623G6F$!4<''@!DF"%15G0F1=6)@)562832.?AE;>:!A-@3@!@%9'5@C+G#?5)B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3717 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32435 42 41M = 32645 273 ATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGG B*=;1:;"H!9=<7:9GF+,/27*:?6A?@#>3824E"H:! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3717 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32645 42 63M = 32435 -273 GGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAA =BG9&AC%/(F3H$&-!29=(5BG$(/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3718 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23430 42 41M = 23430 0 TNATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGNC )"+)$*&++%!+&&+%(($)"""$%%$##(+"&***!*"&" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A37T1 YT:Z:UP jpayne@0: r3718 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23430 0 * = 23430 0 CNATNATTNNATNTTGCNNTGCAAGAAAANGACATTGAGTTTAT #!!&$)"("!"#(&#)*("&"+"%'+"%)%)&('))+$'$+#'+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3719 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15067 42 96M = 15163 296 TCAGGNGACNNNTGNCNTATTGTCCTGGGGGCTGNGGNCATTGCCGGATNATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATT )("('!)!"'#"*"&#!*#*+'#"'"""()"$*+&&$("&!'*)'#+$("&(&%)&("$+$+')"#))#)$&#'$)'")!!("!'"&!(*"#!%)* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:5T1G1G0T0A1T0C1A0G16C0C1C11C46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3719 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15163 42 200M = 15067 -296 GGGGNCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTCTACAGACAACGGATAANGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTCGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCG 'C)H9E3@3--*+*57"3/=C9+0;:/"FEAE'4$91@5@+@C7;*8)#,/A#3!%>2CA@604A2:B.8FB-'&31!@'(;2H/7F)()F%##;E$2DC1.9G461E%F&G63%$;/B63>@/>:%:;+G*62=/?=@>F($@D!)8B),G;D8>A*4==@1'2?HE(D5,!B"!+)64(-C>)#'#)F<3),C=56?? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4C94A16C29G53 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17153 42 241M = 17108 -286 CTGACGGTGCTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGCCTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAAGGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGAACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTTCAGCNCCNGNGNGCAGNNGCCACTAC +*&&'!"&!'%!')"#$&(!&)*%$!&!'$('()###&)*$''!((%##'%$"&('!'*#%%%''"+"'#$+##"**+(%$*)$(#%!*!*+%%()$$)*%'##')#'#)&$#($+#+"'*%+!"%&)(!($)&$*+!*!+'$'"*&)!#+%&(%(#'++!$*)#+!#%""!($%#"%$%*)!*)&&"&!#!$+"*#%+*)#%+'+""!)()+(!%(%&$)($$#!#)&(*!!)"*)**"' AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:9T48A29C72C52G4A2T1A0C0C4A0A1T4G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3720 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17108 42 45M = 17153 286 TTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTC 89A'/)C"9A;0?/H.4>298.>(>'?@26<2C=)((-$7&+:E, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3721 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3490 42 78M = 3302 -266 TGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCNTTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAG H=H"(=B'%CC7A$%%@:#:?9,??1%#;+#88#.B?)BH*DC!>5.<.'G719A8@<*)+/,,)53*%E28F,%%81 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A32 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3721 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3302 42 188M = 3490 266 CCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAACGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAA @"8#!@G8+1/:BC)$8='-#B!2D,,A6+/!3=*D4,F3+1H>68;)=!G-/67/H3,0F%5:-AA",;27,H%#3H?9"!'3->:8&FF5.E@=21*"%B=(0;0)7,%7A*/5!9D8'6 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49C8G129 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3722 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44146 42 204M = 44350 561 NAAAGGAAANACNAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGNGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAACGAGTGCGGAAGAAGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGAT #))&"#)*%)((!+"%%&$'$+("$$"(&*%'$"$#'+'&!&+&+*'+"!*#)#("%!%(($($!#%"%$#&)('"*)'&&"('')%+$'*!'$!$$+&#*%&!*"!!)!+!(%#'%)&+#"#()+*+%#"%+"')%+!($&"!")!%*&#$*%#"%%'!(+"&"*+'($#!!$*$!)%!!&*'%&**)&()+#+$("&++!"* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T0G7T2T71G80A12T25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3722 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44350 42 357M = 44146 -561 GCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCNTGATTGCCACGGATGGCAACATATTNACGGCATGATATTGACTTANTGAATAAAATTGGGTAANTTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGN FDC*?-'#:-H:)=GG*7)"A01%;93=8,3HD2>H5/FE4F$3!1/@50+"E<2A+(%A-B:29=$5)##88/G)@H)5$+;%'=*88$&+7'1'289)-$<)B$521/%4F";(6-A?!?G04**F-",$#4:FBH+3@#$.AACFH!?&E&DCG3:?2))6B*8?4F!2C<*C/2,&)%58&1%04+&E@99G,25%8(-=!&&G>!!4'7@F?"8.2)6:1C'%?C5:;GA%7#07;F;:-3GGH23-*A596-E'8+DA<=,C+42#5+@E?-%('!>"#969! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:164A25A19T17A127A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3723 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45149 42 53M = 44728 -474 AATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCNAGAAA C1C5C5=H-52$)F585=#E:'B;F10@-=.;"=6!351/.46'#$G.')'3E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3723 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44728 42 421M = 45149 474 AAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTNTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCT >:"2<70!421'64(9?(0%$>*4;*(%&#%)"D-D4203&BF8-*/HA04HG-@+(BG0G>#5;)&'$4?9-<(>(**>.-;!.165$G+*2A3=#.++-B?H/HC+F'9G-F#80A@3H*&A*&9.B+'G=>7'!C$4@2+/+'%C788G:H&,1F"5204-3-3+>1'$<5@EF<<;9$F*;%>:'8/*DG)F#1083>13&H+HH;AD/9-(!>)A2.6/FH6&18$9/?:..-/,$<4@(C'68C#E/>*6$?/D0G3(F0*$(H#B-E&4A*<+99C>/)96?6/-)>-, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:275T145 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3724 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4480 42 100M = 4585 295 GCTTGAACCCGCCAATGCGCGGGTTTTCTTTTGTNCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACNGCC &='B5#GF8(F>G&-H,H-,H<@D'!(8+33&:29-";89'875*9%+85')$",77CG@(!,(H5/$FC=@D(4%;:A@&,0,A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T20G61T3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3724 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4585 42 190M = 4480 -295 GGCACTCGCGACGCTGGCATTNTCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCANGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCNGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGNCTGCGACAGGCTGCCAGC G=/*)2%7%F'7)#'*(0-.6#+B*B)HFEC%7"GF+(A%9='#*>9"&(B+/?D2;>A81%17;;0/$$EBB$$H%%9*!F66-&0&*4-#-*9D@361D895"GA4>%"25.HA)-D:/@<2C%/<-=F=/7+7E167>96("""=D#;%!!8E%*<@<5>!F5;G;7B!27E4.C66B!%587!,,,'C!0::<&".-::G@+%#?/:-1=#3200 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3725 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41350 42 65M = 41091 -324 TCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCA G"-GG5F6"GE/"!.:,-G&F@DC72>&9.7741.;=H2!%42"),D.9%*69@@-F48H,.;:, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22206 42 67M = 22455 352 CGTGGCTTCCNGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTA C7(/.EDF*.A9GC,'5--1B(F8F46B/BC-GB?04@'?F&4=:7.G74D,?@G".2)89-31?!"+$.8F=83"$=,@?E2@240GFB-/E- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75G11C15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3727 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27038 42 54M = 26854 -238 TTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAANAATTAGTAGTATTGAAC E0H-0)E/.%>H)H(=@9%-E-A/99(/FG*&;:GD1H,**7= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3727 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26854 42 136M = 27038 238 AGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATT '/-C6";9+B!;)#?2@C(:<()-48E#"AC'3@8>#07?$8+7HF=$<<5H6B1-%>DC+2>>>G$.-.EDB34A&:F+85DB:A*&!5+A&D%$+8'==!1;H94/78>/5@E,5%&A"(%(E;?&&80/),?B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3728 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43754 42 81M = 43558 -277 AGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACTAAATGTATATCGATACGGT '1G92-9=499832$+>),/.F0?-9#E<@8&A%1?>3@<*,D5A%-%-)@7H6&:&*$C"F$5<8:;;E.HA*#!#5!*% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61C16C1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3728 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43558 42 92M = 43754 277 CTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGNTAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTAT 7&C'<-2&G)@.#7-">035DDE1@=:>:&<,B6*390;&GF(3E;(-%=4B-A0.E0<('&8%9!$:8&+"0#7/"B0DE%13#906#>536?>>E3/)+?E'67;?@7B&=*8*5C1<(G"G84?"1)CF&$&C";;9:$4#ED?8"7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3730 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1633 42 130M = 1508 -255 GGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAANACGAAAGGGGATACGGN &&('#%!)!!#!*+'!('$'*'*"*)+%)'(**(%%$*"""#)#*"+')'#**##)&"#)#'*"')%&*&$+"%"""!$$!!#((!&'%)$+(!)&')&((!!'$(##"$"*&$'&"&!*$$!##++&+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112A16G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3730 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1508 42 87M = 1633 255 CCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATGGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTG ,".1"D%=;>C/,'')B";%%G*%1*5+##<1"H36GA-B/944!6)>)*GC)5/0)D,)/68(C;3,)BA21B88="'<>17*.5# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A0A54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2792 42 241M = 2722 -311 ACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTCGATGCAGCCCTGTTGCCCNACTTTACCCGTGGCAATGACCGCGCAGACGATCNGGTNNNCAA %'(!#)+*!&(#*'""#"&#*'$"+!"!!)&(%#'(*!)*(*&%&%*+*+"#&'$%!$)$++*'((")'&##$')*$+)#%"&#(&$((*'%&))%*$#(#"+!!%*'%"+##)*(+"(#++"+&++"!*!(%%#$')$(#"(")#!())&#!((("'(*%&$#'"#%(")#'$(#%!)!(!$($(!('%%")$(%+"$'!(!*%$'"%!+*#"&%%!*'!(#"&%#"*+*!)('#$%*$) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:178G18A18C14T3A0C0G3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3731 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2722 42 62M = 2792 311 ACGAAGGTTGGAGTTTACGACCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGG +*'(!+*%)#'&%'%!+!%("+'$##(#'()'(()''+"%%*)!#)%*%(+#)(#*')+$#+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G11G42 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3732 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37927 42 69M = 38021 220 TTTTTTGTNCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTAT 4?88B=9"%'4&E>.")/5@?/EG?;@?"1066@61H*AH@E73=94D(,/:D-!%8&ACE/<>58A(& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3732 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38021 42 126M = 37927 -220 GCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATG *9F#"+:$(-4/9%1&&3&6C=<'2%(E6A:H(A9=6F$#>-D2F8)-=-%@9&6;7H14?6/C1CHF0G97*5&6D"36$3G588":6B5)(4$0?9H!*#G+,6(8:B('&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10881 42 47M = 10668 -260 CTTGACGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGC )0#2%:HD7*C(F=@A,:6H&H:'=6?-BE!4"<4E'H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10668 42 105M = 10881 260 GTCGTTGAACAGTNGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACC *1@CF$=B89'((&.56++9(@A./1C>($A%8?H=E->&5-0#?D>/AD@;,CC(H7D5#C$'#H,&4::B=1BF;:57A5==4D>/CEFB%C#&>'A!<:'70 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28427 42 63M = 28615 230 TCGGAATGCATCGNTCAGTGTTGATCNGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTAT -<79/@2E#/=05;H1:?8403"8&*C-G5;G$@81@%/*BC+#79C.D:.7=-?HF:@(2C) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C12T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3734 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28615 42 42M = 28427 -230 TGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTA +*H'F:*;8B4GH?>)@=?G32)='AC/)480$?'G=D0(5E96-D,1F&!="D!0'72#4./A%3F&97-!>0>GDF7G!;@8#"!F4D&?H)F'-748 AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:12 NM:i:13 MD:Z:47^TTTGG31T5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3735 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40454 3 60M = 40578 213 NGGCTTGGTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAG $&8)A,>@'8#5E388A4F'7.E9@5A&G)E@8B/E5,B:%3=A1@:.;,1#:#%G:&>! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C2T3C52 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r3736 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26083 42 58M = 26141 622 ACAACCAATANATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTA 1BA6F?G$;4E$&$@G5122*>'B*+A#5HA2/+.8?H/?(<-!DD"??90@F+%3"; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A47 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r3736 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26141 42 546M3I18M = 26083 -622 TTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTANCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAANGATCAAATGCNCTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTCCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAANATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATNCGGGAGCACTTTTTCTNTTAAATGAAAAGTCGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTNATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGNGNTT !+!#$)$%##*&($&)!&"!)$$$)!!*#!%)*)+&#"#'!!+$)!"("$+%)(+%$!#""!(&'$!$'""*'"()((!$'"*''#'((++*&!(!%!$!*'*&+!*(*!**!)"*))!'+")(*(+##'%*!)'##'("+'#!)!*'!&(*'+*+#$"*#&()'+!#&)()#!)%&(*(&$%#'$#$!*)'+&!')'""&+(')((""%#*#($)+)&+%!##'**&&)'&'*'%%+$(&#!+''$)#'#"''")!&!*%&)%$**("!&#(!'"$%$$$'!($+#$#+%&**%'$#"!("(*#(#+*"+*%$+"&&)*"!%!"++!'#&('))'"%#+'%$+)#$*#!*!!"+(#("!'++)''"""&$'$$#)"(#+#)*)!!%)&&)(!)&$)%"&)&!"*!!)!&'##%$#!!(%%+$"'#((#+#&'##$(($$*)!%$%%'+**+&'$))*&&$*(*#))#($#%"(!*!(&%"'#%+!+*)$!'$&#*#)#%*%'""'+#%")'#""((+""'$"!)(#&!(#(&#$$$')!)++($$"(*!%'(%!%&)!!++#(!&& AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:22 MD:Z:42C38G10A69T58A102C16A13G101C89T2G2T0A2A0T0A1T0A0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3737 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13640 42 110M = 13514 -236 AAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATANGCAGAGTCTGGTCGGCGGNACGGTGGTCCGGCNTNAN ($&%%#('#*)!'#%*'*'""#!$("'*%#++)*(*%''*&%!()"$!+!(+%))!&&()#!&&(&&+$'()#&(*)+('(()+**%+'&"(%$*++*!"$#**%+%$&" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:72T18A13G1A1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3737 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13514 42 81M = 13640 236 NAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGT !&F>(?-5(+=F4*9D=7.?;G<@*3(?H";!.3.-!2%,?!&<:H#F$!EH<7;()152<.87,"0<&9?9<6=>384.) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C80 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3738 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27630 42 138M = 27475 -293 CATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATNATAAAAAAGCATGACGTATC +"%!'*+**''*)&%('&)&&"$$!!"*')&+!+%*(+$($))))#(#+%(%'&&)!")$"***%*#$%&#++!&**+%(&&)+!!$$%%(%&"&&$"&()*($$++$%"()*!&"'''(+'''&"$)+'$%))(((' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:117T12T0G1T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27475 42 47M = 27630 293 CACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTG .7?<71B4BE)-+<=69>(..%3/($1% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3739 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23158 42 88M = 22959 -287 TATGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTNGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCCTATTGTANCA !%!++&!'"$*))$#*#"#*"%)*)"!!)(#'$&"%'''*)$$+(&!#%#+$#$%"!%)#$*)%'$+%()!+!(#&!#%)!)+&+")) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C37A37A7T2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3739 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22959 42 45M1D54M = 23158 287 GAAGCCATAGGCATTTGTNATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATT 9;0?(38>A(F9E+BF:!!62=.EG@7#5:FCH7!%FG744%CA97<4AH$9;8>F>CA$2FGA5E6F8='&-#D,1H?!7FF$+"2=2&.A(G$/BF39072='G*G(?$&/#A:+1< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G24 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3740 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47614 42 103M = 47854 304 GGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATAGAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACTGNTAGATGAAGA F0/#04<%&A7#*#9H>;H86D!**9?3691)@B%D+&H AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63C26C1C10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3741 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31931 40 65M = 32037 223 GTGNNGNCGCCNAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCANATCGAT ()%(!)'&'$""+$'"$'*"&+*!$$*'+&($$"!+!$"*"&$+!%($+*$)$*'+#)$##+$&! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3A0T1A4G46C6 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r3741 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32037 40 43M1I74M = 31931 -223 CTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCNAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCNGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGTGGCANTAA 31=?"&(;0!+D!GE17*0823.3H<%%E&18-E,"02&D4E)G.BF.H=:%"!0!/73C2=1%)A(,G%>,086+A<>-)H1D43193/AFH0:H0(05""92;%=%F'$3&:!&'$ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:32C16T16T41C4A3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3742 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48084 42 50M = 47873 -261 GTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGAT *'+!#(#!(&&*("'!!*!()!%+#()#$(#&&('*"!+$'"&(+"$#!+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3742 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47873 42 67M = 48084 261 TTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTG /.(0"&EG,$?%14)8::23=5,H8/G4BH724507G-2B$58'<:2,7B"H"G24"7"!75"6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3743 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14312 42 189M = 14529 268 GGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTNTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACA 1.?B"%A!:??6+7F&."@:1?"+B-C*1G#5;;@"((?BB>?D"G9'7655+'4(1@E6H43,6*.73&&AH*/)D$+9C-%4)(-2F"06$G:("F)@2F!?'76;*'H0-@)A'-5HF(51%BF7,6-H62F1/)4=89C2/5D*B%)0#4%7:D?"G#/@;>)H2#75"D;)3@+788$A3(;%G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:160T28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3743 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14529 42 51M = 14312 -268 GGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGTCC '<1.>9B"(@2%+!%D+05("&9!/93@&+( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3744 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7542 42 112M = 7732 237 GTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGC +C@E8:;=/=%"$#'H$H#/=#DF'%+:8%G>/6,7&*1>@B?><>;>C8$A402*>@0F&%3>1%6:E&F"2<%,2*?7A6<>3G<2?!G-,@-D!,*(;:/?H$4'>.'AH.&>E&E#&G7>,#<1;+@=F#'@5/!B6#21@5$)=B,%3#';-,/H:@0(GD&A.;1B.:F/>)45H>=A%$5E8%H;/A<##88E7*E=CG"2-5:;?*>+BE-5489=$. AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:20T61^T18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3746 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14094 42 129M = 14094 0 CGGNTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAGTCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGG %2,&4B-8A:$/6%6DF'")5+@4%G894;E%5C/#(D#-/>9D'?-+DG4D1'E!8"=1F41>AHF(!"8B"A@,?2BB-873$E>+5#H*->0-969D43$=C/673E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C30A94 YT:Z:UP jpayne@0: r3746 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14094 0 * = 14094 0 GTCNGNNANCANGNNNGATACANGNGGCACANGNCNGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTC )&&"$&$&')*#'$&"*%%"#"!#!#'&*$*'(!*+!"*)++!$(%+!)**&!++&+!$%$*!+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3747 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13760 42 78M = 13592 -246 GTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGNAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCAGANGCN &$#%!%%*$%##%"+"')+)%)(&($%(+('#'&!*"*(#'+''('(#$!'*$)!(%+)!!%%*(&'(+")!$#!*'! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31A39T1G0C2A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3747 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13592 42 168M = 13760 246 AGTATCAGCCGTATCCCATTCANGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCC ".H>C-+B,;E($AGH%;,?0/&;!)7'"84?+29C*0-D=!3@8/G4*D1.F:/%'-C$;EH'@'F0D%)1@1#%4C)6H&DGGG616<0#-&A49!E3#@H"24-G3(3&D2<6F.0$@G:G#,AC(EG)!&@)+$7/H%B24-=!)E8:H(6#-%58249"1(:, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G145 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3748 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3194 42 182M = 3015 -361 AGGATGACTGCTGCTNCATTGANGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCG 24#>@@B=BBG,*#B7?6'%!50"/3?#09H'H-.2*89%30>E;9=B()D*-"G.":';9;G,5'?1%)$!C#,=H5,2E*;/>=@$6(60B2?513)>!3C343841$9CB"@C;;.36(@67$2'5B)"6BG>#F>"2--2E.ED"+H"*>+2<*-,;00:(%$<1<$'2/&C.&<6>$6"$<8/%!8"#F9G34"=F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94C132 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3749 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1222 42 75M = 1297 302 CGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCC *FA8;::1*5C.#$@44<*(*B)!38A2(%71:GF.F(D47DG'5*.;3.8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7088 42 213M = 6802 -499 CACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAGCTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGNTGTCAGCCTGACGGTGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGT *!EE$(?59:6%A<4F7@;G'/:HC3D')=?=;.+)>5<5@!'?845:61.;G(8%3B(@!>2/':$&<89!H#5%H>,>'>F!<)B,2+4C%-/>$$-44@8H'..GA28%!%2F*G$"/'&&,C%E$7.0-/1EBB+">3D>4'7.+0;B&$9D<"/2D15B$4G"CFGD;F=5-466"$--9*EE("0+$H=4G&+7#'+) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:128A43A14G25 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r3750 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6802 42 135M2I151M = 7088 499 NCCCTATTTCCGAGCTGGAGACCGCNGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATANGGGGATGTANGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACATCACGATGGTGCTGGGGAACACNCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGNTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCNATCCGGCGCGTGAGTT "*"*+$$!!#&%&"%*+()&$+"""(()(&'#%'#'&"%$++"#))"")"%$+%*!")!"#(#!('!''!)#'&+##(*%$"$)!)!!%*%*'$#!!**#"#%$+*!'##+"(!&((%%&+&%'%!!$&'+*&%+)*()""!&+*&&)'+$%(%&)#$&*'!###(!+"'!"+*(&$&!"(&%"*'**+"#%%+))$)$)'$"""+%)(&"*)!'&+'%"#+$%#"$"&&%'%*+%%#&&*%#&%(&!'('*%!'""("%#%&&'!#''))#''#$!!(+&%+"*!!& AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:13 MD:Z:0G1T3A15A2G31A9T73A21T77T27G16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3751 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43706 42 54M = 43460 -300 CCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGANAGANATCAAAGGCGC !,G<$,,%&F71"/!9,F607<)20;(C8@F.H0'4A5(F?H!#203';2G!-)>6",*0CF5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3752 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18264 42 144M = 18408 316 CAACCAGATATTCATNAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCNGTGTGAATGC 6>:CAD(0@!&"9H9H&F0?A52<?@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G117A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3752 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18408 42 172M = 18264 -316 GAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACC H+6>)BA1)3=5#3/DFF:;:D*A5$(?622?&"0*C)3*D/.;*B5470!$&%,=7"EH*4$.A#)A570@-?@/7:(C'4.9=+04=B'-C/+@.:-39B.<+BG<0H,E&69+H/?0),:6=H)E+A"1?,@6;*)3"(-GAG@@($C?42,#@1,$#8*1%2GB0!:8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3753 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46691 42 52M = 46864 216 GTNTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCGGCGCAGTAGCGTGTAGCA +!+*"#$'$#$**)"%!#$)!*()$'$!*&%())$)%#%''##'!'"+!&++ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C30A11A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3753 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46864 42 43M = 46691 -216 CAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTC $+#))*%#''($)"())$&*#!#("!*(!!(%+&$!$##+*+# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3754 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6798 42 73M = 6798 0 CGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGAGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATN @(:<;!)5-0$:9/.'*<6B:GA".F0C=#0@)A9<0C)F307$3<2C8DC87G>F3CA-==&95)@%B&?/3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26A15G29G0 YT:Z:UP jpayne@0: r3754 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6798 0 * = 6798 0 NCTTNNCCNNAANNNNNTANTTNCNNCGNNNNCNAANTGCCNNTNNNTTNCGNTCNANNTTCGNNTANTNCNTANNNNTTTNTNNNTGNANNGNNCNCNTNCCACANNCTCNCNNGNGNNNNCTCTGANAGNNNAANNGC "!"!$#$#!"$"!$#""!$""#""$!$#!#$##""!$$##"#!"!""$$$$$##"!$!#""$"##!"!$#$##"###$"#"""!!$#$##!#""!##$!$!#$##!$"$$##!!!!#!"!#$$$""#"$"$$!$##!!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3755 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19264 42 95M = 19052 -307 TGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGT (H!DA,9GA&&(D?80"G5/:F<>"1#C(>4&)8=.9A7!0(/:848;$875H2H"&C?-#$01@@!*?.,D=$DB>1E8;7@&!GB01;F<)H4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3755 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19052 42 212M = 19264 307 TTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCNGACGNACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCG *H:-H,61D1H>=:26=;9E$)1>=1#'$&"8?#E31E<72:B;A%=,E""(>'*"$=5E"5)CDH"&28"E?115,.;7!5082&3=@#=2=F:3$CB5;62@!HEC:)A?/6&8"4CA20!B('!)")&*2!*3":@+"C.4$D&%&0-C&4A@89#-/C??>6<$@05025$.)24-C4#?$6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109T4G97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3756 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42692 42 71M = 42799 194 CGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACNGCGACTTNCCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTC :'?+CA'+'-!+A6E;$69.32&H)2F>B@7!3;B3@"'8.$"99,&FB)>1>0$$29,5"H74:HH3E+' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C7A34 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3756 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42799 42 87M = 42692 -194 CANCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAAAGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTANG 439BB%78-4/$&&."!EB#!A@3!69=.)(/3(2#36"C/$0@=>#AG+27)F@5A"!7,#@B/#!%23?1/'G$2G,?+!" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C38T43T0C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3757 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39662 42 107M = 39439 -330 CGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAANTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAG @=7G%'3H7>/D*)?2;.)&'.@3B,D#*EB.,;3$>B;9=+'A1*!B%/)3*43,<>1AG43(#3HG#,)3.!%<)B&#+.*4>.H*#<2A!#738B,4D)<#9>8*54'$E4?*3>2/H9@=?HB'?E-%9$A)>7(0(H4BG2B"??$E1H'1<*5-',2:@)GCE/?A0<%9#A-,9(FD+5':!!3A?"C>C2%H-?H/6&;+H=-/(#B/0,!F"H!'#8+9/G.D50%6%@98DC=-4C)6#?H<:$B?.5-/5'94#$@7.(=&A8!;'3'>G!; AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:1C39G4A6A0A15A84G14A28C23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3758 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30345 42 144M = 30540 276 CATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCNCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCT -:)6%D"4.;B/6";'E(28&!3@64B-:EB="@D!(07#D%A*=8,B:$E1.D!?2>8BB'"9737:59/*$4;,&;*A&>H,797#5-2%(91(/6!E+52"(>,%11>6).DB"E4'F+-GC3*EE.DF.@6-;,"-H@B= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T96 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3758 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30540 42 25M2D54M = 30345 -276 AGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCAT 46)3C!<#9;A3#<5"+@04B2,<%-1H+2*9>49"9<14!>/!@*8@1!1*-!#$76"F,%9!H1.%B5$4+,9,01< AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:25^TG54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3759 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14063 42 65M = 13864 -264 GNAAGTTCCGCAANAACGTCGGCAANTTTGGCGNCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAA 9C,H/:/802!&53,8H8+;F=5;5H9B4,/5G/%@$.<6C1#9:&!.*4#);FG.'B8A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T11T11C7G31 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3759 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13864 42 113M3D29M = 14063 264 GTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATG 4#:3"=?="4:,##B47,?4$&E=1"3:G62*!+DBB.<#+(5%?9(HA9$/,>&4/1H!>:9A:,+3G>D.3&-)."$A@D0%56F)0F+#$*B+32<=F#0#*"H#2$"77B8931*<@D1@$*1%;9;(E4 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:113^TTA29 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3760 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14484 42 150M = 14634 262 GGAGGGNGTGTTANACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGANGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCNGGTGCCGTTGT (!*$%&""(&**&%"(%+$)')+)&)"))!'#+)'&(*!(((!'!('"%#%$*&(*#%)(&(!')'#!()'$((!)'"*'!'%$!)$#%##&&&++('"!"$$#'&")+#%(%+*'%#+%#$*"+)&*)&#+'"#%#'*(&%!+&)(#!" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T2C2A0C5C40T83A11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3760 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14634 42 112M = 14484 -262 CAGCGGCACAGCCGGGCGATGAGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCNGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACN :*B!.<",D42>"3D1G.&@C0A<*G#6-@(,%>0<@+??)%BF10!)H39E99)A!A7.!(%=0+HA<.C@DC-$@3F65A>'C?78!A!,$#%+*8.>'+B,&*4%%+@& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21T29C59T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3761 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21660 42 122M = 21496 -286 GTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTANCCACAGTTAAAGTAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGT +??#;,F>C)F$CH6D!BG.:!'(GE1,8@01>C:&=411.90!4<1$D59276G'05-GHH5$-6"EF'BD$'D'A>%0D:6*A>+6B!'.E$8";>/+,4"3E*/#H'D549)$>!:/(< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35T12G73 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3761 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21496 42 144M = 21660 286 CACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTGGTGCTCACAGTNTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGNTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAG +)19=5>9*+73C9%>/32E@"/B2'G./1@19F#<%:=<@H%&,&,11<4#A0BF028!9+"4$639.&+2#,"B8<&&3:FG#/!D(/;DA9*8:0HB9707;*@5G6A%.57!%H290(=*'<0;"2+3A;;@@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:79C0A10C27C24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3762 77 * 0 0 * * 0 0 GAAAGAAAGGAAANGACAGGTGCTGNAAGCGGGGCTTTTTG ((?,3'5+4>-:;(%ABA:G)8$74*?9F=D%(?!GE/!,+ YT:Z:UP jpayne@0: r3762 141 * 0 0 * * 0 0 TGATNCNNCTCTANTTCNGCATCCCTTTCGGCATACCATTTTATGACGGCGGNAGAGTCATAAAG '"!*""*#)((")#)''!&'')$+"$!)*'"#*#)#"#++('*")#+#'#)&)"$*!()*)!+&# YT:Z:UP jpayne@0: r3763 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13659 42 128M = 13429 -358 CACGCTGACGGTTTCTAACCAGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATNCGGTGAACTTCGTCA E4DFG@%<5E+#38(,."GDG#B.3/)GG17@G4H2"H& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T91G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3763 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13429 42 95M = 13659 358 ATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGG H??$$!C;F'40;@)1@D97)6@E"#!?(7$(#CG1+&&=#'E>&396-(FC:.H3B"+F,CD$B?1?/E?E0C,)0:=F,A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3764 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27241 42 177M = 27517 316 AGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTG >7;E-$.E85/+;->:D7:(#!ED'7%C9340?H6?10,38B.-(B.):1G*4!H&'E;@3(3*HHA6H:$'B+%"B7."&<*2D'H@!2,HB8A:9#BHE::66.(GB)?G,B-B)C&.;AD3"2;=GE-($>$)+@?4-7/'=="2DH<1*(7<7;0*,G/"70#!%?B@-2%C; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:177 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3764 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27517 42 40M = 27241 -316 GAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAGN >$$EA=C*;7BC&:B82GC(1=/'&B?F8+)(E0A6G2!! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38A0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3765 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41805 42 157M4I28M = 41990 340 NNATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGANTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGNGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATA ##+!$#$#"*(!#($)'&&)+&")**+$))#""&)%'!#+((%'+*'%!*$(+(")&!((+&(+"!*($!+('!('%!**"&$&'#+%%&*$&&"&)$)!+"%*$%#(%)$)*#)#(!#*&"**($!")!'"(#)$(&%*"($+*&")'+$"+()+++*("%+)((#&$(+!"!"+"'$!$(+%*(%'$ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:0G0T89G59C33 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3765 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41990 42 155M = 41805 -340 ACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGAAGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCGACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTNGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACC -?A/5&0#?8BG(?."B=.E<0-;--;+E@4-E610:!6>#:H>F<6,H48!"G"#$8<9B5/-@=67%:2!6/!6.+%((*+'9:63#D>3/=F?,:/EG%$2;%-"%H#@#6$)3*+59C,E&.4FA9;-4"70>+43@&130DGF#0&B-:@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T25A40G52 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11475 42 47M = 10986 -536 GTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAA 2?&G@(@;"/#73G.>/H422H$H:0,9=4/27>E'*C4+B(G9'76 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10986 42 489M = 11475 536 ATCAACAAAACGCTGTTCCTTTCCGGCAATNAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCNGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTNCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGNACAAGGTCGCTGAAGNCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGNCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTNAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAACCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCTGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCG !@C"F56&G%/D8';D.1DE77&@+#C8HA0=;'#'>6E%&EG=:"-5127A0+B95@1D$F;-1$E'7E-+F=5%;-1'17/5+C387/!A1!2D<)G&A6-+#DB:+D%A,>#&9D&!0@C0."9,""EC#-$G1C?+$#B0/<4&E6%12>*#8)DGG0:5+?EE1-2,&/:=@#/3A@0-)E*!D4#"#,B/@807/C$!<7/H59)(2/%=)*1&.G-9<+D530B$AD@81@#-;B-$FG:'&$&+D5>6(+=5.3C0?$"A5,!5;/10.:(0.=?6HG>7A'>*!G,3B'"E:H+F@232-?%8%,#7CD<&&4BA.;78CE0-4?;3->0H%@HC*74(,DF*/H1?=.54.:6-(@./-!9-G+H&G));!"+7'+"=0.4GE?)=H=E?4!G09=&);?;4;+F'&<9=4%,10%8"H!>#(*A:%="/BH'D>+D"E02%=4.$#4E*86>0<#5+'"")?8*G<0'0C>&'F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G16T47C16 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3767 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3737 40 54M = 3611 -180 AGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAANTTGNGNTGTCANNAN !)(!*&&)"'(""()%%()**!&))*+!((+%&)+())'*(($"#"%)('!!'" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:38A3C0C0G0C2A0T0T0A0C0G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3768 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32569 42 76M = 32569 0 GCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAA +E>0<)A,>+A%7E+)B)E*&5C%F+)3A.@'FG#G//A/G1-7H!B47$0%;:*(D#$C'2,$+787"8<(B+6B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C75 YT:Z:UP jpayne@0: r3768 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32569 0 * = 32569 0 ACATNCNGTANCTGGTNCGAGANANNNCNCANCACCNNNTAGANANNANTT $"$#!#"$#$#!""$$$"$!$#!""#$"###$$##"!#$!!"$!"!!"!$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3769 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4502 42 293M = 4454 -341 GTTTTCTTTTNTGCGCTNGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACNGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCNGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCGGTTATCAGGTNATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCAT .&/16&7;8&906CD!+,(?58"@2(:=$A61.A*-=+31(.<.,++.HA3:)GD!7C"++,G2=B5C+*&D8"83A22=$/A=7C6"%90%)"+#)%-#?'>4?#;,@!,:208:D6?EF0!B!0>64#)FH&D$0>!?E%@!>.(<<.%3'<"/.3+?<%4H!B@C!91=,,06E,5,1+G*=AB.(A+%:%!G;;<>>AE+"A*>'?$:;+"@)90@D9*-38'A22>@(,"/27F:E@H)%"'+1(/-;:GF43&@!!.2;G+0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:10G6T29G59C30A10C143 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3769 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4454 42 48M = 4502 341 AGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTNGAACCCGCCTATGCGCGG +>,F3+;5#9F,%:6&FA>;85C!@*)@D&6=E0(2C-29H500EF?- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14743 42 94M = 14552 -285 ACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGG 6?,A4'7)!!4HB,@5HF"H=A-C;&2%6&%3&5FG6.=7>8*>F)6/7?2#)(:7.,"*=>9@0/B:5/$:308!8&D*H.(.5=62#)$GE4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3770 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14552 42 176M = 14743 285 CGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTNGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGNTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGNGGCGACGGCGAGCTGCTGCA +'*6"87?!;!%+/=B%(##F/&:2?,&:=+G1E593A7-@9?02/'2-2!G!95G,D-.?"&%H$#G3)&4E;F'E..3=@);&4<#(EF9/F,CA.3"7(C/<3+@;%'D9;%68>B0,?().>5-A-+,7:'8-27+;0$.,+3D.))C++,/8-"@4E.A44!?4)H/7/%/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41G30G82C20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3771 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41446 42 110M = 41324 -232 ATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAACTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAAN >2C@$F)*)".5=2D$;@,5%59<>"'"33.*<)+F4%0.8H<6E4D<;2FG6'F%#&A&;1D-F04+(+B>"66-/2,6#2A" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G53C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3771 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41324 42 59M = 41446 232 AAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTNTGAAGCCATTTATCGATANGGTAAAGAAATA =.2E#>98&>&#(?B%)A!0.-G90,F380$:+:<#2C!.F2);)/C8)F&D':<-?19 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C18T12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3772 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33738 42 40M = 33562 -216 AATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGNCGGT *E!?4H"5&G$B>;:BG<;10*%#?98.)%(D?9*;AAH4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3772 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33562 42 60M = 33738 216 CTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAANTCTTATTCCTTCGCTACCATCCA #+'!$"%+)!+*(*%((%'!%&#&*'#'("((('(+*%)'))#%''+)!*+"$"&((($* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T6T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3773 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16446 42 68M = 16635 296 AGGCTTTNGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGG *A$6G$D!&2)3(584--GH;@!*96F;5<"H?)'85+%#.90(//G;)@E+B+-$%A)GE&.A0$B, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C6G60 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16635 42 107M = 16446 -296 GATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGATACGA *!!)($($!!'&+'(#%##'##'+'%&#'($)""+)'&$#*+$%%)!*!+'#"!!%(+%"*'+)!%+!$%#!&%#*)''+%##*%&&%&&+$)#''*(!!+**('*$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19C60T21G3G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3774 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6156 42 67M1I29M1I172M2I38M = 6462 450 CAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGNGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACCAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGT 8CHC.CE,=)%*=0.CC-&/;71..EHG7(5"9)=>=9?AD!A32$A8:+.7=&*A4!+7A9FH692+0/0A#!<*C%#'3'B*2./D.E(-2897.FBB+@E8,/1AG).9$F-@C!C/$A5?2;,+16E'/%%-$4DB*5:G#HD!-D+*+.!+2:CG;6GFE@=DA42B-)6+0$+G:C,B@C(;$53'&G.FH$G.A,@';)<5!0H*1H41>/<:A,5;:A.E$9(=*'9,,9FHC$$'46@>-2@($8D.1-D6-'?B@4'),,%7F+72 AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:3 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:51C54A199 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3774 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6462 42 144M = 6156 -450 CGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCNGGCCATTGCTCAGGTCGAAGNGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGT 7'"GH9-G&F=@E1+<87+8<92.##=)"&G?A:A59BAC5.-D/F**-<.F+C!.D=B7!=541('D?2$7/FF5 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:44T41G0T0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3775 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45682 42 88M = 45798 205 NCCGGACGCTACCAGCTTNTTTCCCGTTGGNGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTNCNAAAAGTCAGGACG (+$&')*%+%*"!%!#()%#%%%(*++(((+(!$')+!&!+"(('$#&%!+($'+#%(#&(%#&&$"$+&+)#%'"++#$)%!"(')" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G17C11T41C1G13 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3776 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5897 42 114M = 6042 238 GATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGG //3C-6;8-C$(H8B?:2)8D((-,&>?$<.*%'=%AD7,!A1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3776 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6042 42 93M = 5897 -238 GGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTT 1A;@#/B8?5G#6!3D@G$CG2.F$.?1"@F?E+(:1*C3&D3%H2!.DE<"D24"3!D0;D.C74!)<,4+$&17H+?&651B=(516/4=, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3777 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13327 42 57M = 13136 -248 TTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCNGGTCAGTAT 53!=+22?C+B///H=5@2+C-A=>D;@DD0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3777 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13136 42 62M = 13327 248 GATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAACAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGC ?,;&/96<3:676'9";'=+H!2=A8>#9#':3"CA/6?5?/C$G!,FF"0G.8%5%.2A34 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3778 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32731 42 148M = 32966 326 ATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTG @5>'9*+?H=<1)+<5,G-%?@!,+--/C4D1E1'B-:?(C1:2).A("-4D06BG&),(>6F3)&?*E7AHG1A+4!.;')(E=E,:#DB+(,()).A"-!%51)+41767?!9A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3778 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32966 42 91M = 32731 -326 GATGCATAGCGATTCAAACCGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGG #06-D0"=.5>?7A;;>A;2>E?=%<321,D.*<"6@C!4!C?3:D&#%*A@:68CAGC7.D)*%.E)",(4DD-'G. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A14C56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3779 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45742 40 83M = 45862 161 AAAGACTTCTCTCCNAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGG E1?2H/)(BH09459#&,A1C319'<5-':#7#8!D<8317AE>''$.GH6490B-1@$$1++,D5%8%)2H3:&E#04%$,@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G68 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3779 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45862 40 22M2I19M = 45742 -161 TGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTNCGAGGA +&)+*+'!"!+#'##"%#$)$$#&'!'(')**)!*"+$%%#+$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:34T4C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3780 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10382 42 130M = 9952 -560 GATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAC =7*>";&6:;17<',;H)?,<4908'6")H6!4(3(!B$"9A;AE*/"0/?C-!@2/3B.&2($(#4ECBF5B%=43H6DH=-(17""+,FAD$H.!;=($968G9G=C>+43&+G;&G3H5=(86-:/& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:129G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3780 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9952 42 430M = 10382 560 TTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGGTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAANGCCCCGGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACANCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTNAA ?&3"/E!CGE;)*:;/$06'81;E7'G/0A)@%/&00,,?"*:.?@=@F("7D6/26B44&+<;FA4H0+46/?($E%>&E'8;(B;&0D#/<'"@*!@H=9652(H=47FBCG?%<))!B6EE#9;&-@5(,+$''+9/?G+,)',"H=!!A<(,>GA:+.;635@4><8E1014!A!A:2$E7H9@-(:<@?D!&$>>7'#9#-5*G15"?64:7%=G*A*B<)H7+A.,2A4F#82823>(2@497076$@+7+5H8C)D<,%8>C>"5%076!A3?*0(8'7='$/?$6G'5+!C&-.0=G*@A@E+&D!87D'#59<# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23C85T5T225C85G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3781 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31137 42 79M = 31000 -216 AGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTAT @57:"8=$-7.=D$44A!EA%*'0>-1EG%864&E4A".<@FD;>E5.7H#D43@*673BD7-C6=/(=C3<7,!?0*BH686(A@>7:55DAB4%DF);'>(838ADD#360D+;5#>1$=&7)9(#D;*9=2#83C(8/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3782 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32476 42 96M = 32648 287 TCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCNTCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCA &+-D-B#+$(4*HH$8.)!DB+93E6CA.38AG&7%H37%*4@,D()*F8/31A!&7)$4;1*6$&&G-1$-G=)&*E"?%(('+47H0G7H;1); AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A39 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3782 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32648 42 115M = 32476 -287 CGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTNGTAATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCN *"*!"%$$&*++$"&$)*("($&&)!)*%#%(%%#%!'#$%$!"##%+&#!'$$+#$+$)&*!$)%%"+&&)%!+"#()#***+&('$(#*($#*"#*!+$($$++(+$)+$++# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:79G2G31C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16420 42 219M = 16639 291 TAGTACNGCGACCAGCCAGTGCCGGAGGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACCCAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTAGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATG #":(-E.?51C<;9E;F49+9BE(H-141C<,-#66:/@8-A)F=(GE5AB6;AE,%B@>!2C'#-5G&H!>3?4,F6&A(/1B'A4)<-#$*3(+;$7A#C'H39!2.,H@3(5 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C5T8T10C50A112G28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16639 42 72M = 16420 -291 CCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAAC ?A:+H(0B@2$'->7,@C"<>?=7G)'(F?:0CGH<%)C32*D%A3FG1>@B+G>4(31#F;2%/24-?*,; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C56 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3784 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15331 42 121M = 15452 262 AATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTAACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAA '&D&;!+D!8;80/*3,/0;GE)C(036:<8'@8;&+D?)"3F8A*>!96/>6+'9BD$774D>F-&;5'*80*:4CE!!8H176%A!04E"@3=D2*)E7AE!@F5*!6#8G--.7"?=< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C80 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3784 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15452 42 141M = 15331 -262 TGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGGGAGGAAAGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCAGGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCNN $64;0/12E.73>8>'@4..3>2C3/4"'=.C)%* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:47T6T59C24C0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3785 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38917 42 192M = 38917 0 ATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGATTATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCNCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCA 6H-C+:,0+?G#43>8#-0H58+C==/<;B9A60&(4A3@/'#-,1+411!@7>'@.G/3#5%=*3130A?$FD10;&!:2,-/62#++H?.22$"E4F+F1GDGG-6#!6A>0<%*6.?9.AAAEB64:,#((:-#%-;F6,5$2!+G18<2()'F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A46T86 YT:Z:UP jpayne@0: r3785 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38917 0 * = 38917 0 NCTANNNTCCTNANANNTTNAGGGNAACAAGNNGCNNANGACNANCNGTTCNGTATAACANCCGGCCNNTATATNCAACNGGTTTTNGNACGGTNTCGGNNANNANTGNTNNTNNGNGGACGANNTGANTNNNCAANNNNTCGGNNNTNANCNNCNCNCTNNTCNCNNNNTATGACNGACCNNGTTNTCCANCCCNNNATGANNTGATNCCCNNNANTNNNGTATCTNNAAAANNGNGATTNNGNNNANNNANCCGNGAAATCCNNANNTAATNNNNAACCNNGCTAC $#$!"##!"$"$####"$#!"#$"#$"!"!"!!!#!$$!""!#""$!!#$"!##$$$$$$"$#$$#$$"$$$""!"!$!$$"#$!!$#!"!$$"#$$"!"#$"##!!""$!"#!"""!##"$#!""$""$$##""!#$#!$#"!#$$#$!""$#"!$!#$$""$!#!!""$#!#"#"$$$""!$""$$#"#$"#$"!!"$#!$!$$$#!""$$"###""!!!!""#$"""#!$"$$!!!!$!"$"#!#$!!""$""$!"$$#$!#"$!!$$!$$!$#$"$!""$$$$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3786 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15278 42 103M = 15012 -369 ACGGTAAGCAGAACACCTATTNCTCCTCACTGGATAATATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGT 9B#3&8,3A6E&.>G9'9?+;A@/''(+:@G>5H+)*0D49?-)(>7B@4BH/+2%=DHE(,C'@+H04*"3).+GHA4*1#)9@<6-E44+"2%&="=GH?6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T15C65 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3786 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15012 42 266M = 15278 369 GACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGCCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCANCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTACACAGACAACGGATA ,&?4(!9=-.7%$/8*<229<;9C5B.79'3H=D:#0/9FEC'),)F=H&*+%7$4G(!43/?-7AD8&$*#-1-*,85,;"-,'HC"!;!!>88=64-A,E:H&8H&*@C9C2+%A0C8 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:98A4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3787 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31300 42 153M = 31453 256 AGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCNTCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTNAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTC 4!G0CE;)/A3(1+!4;4'.6!>=%9=F0;//CC72?37+,548G-F"-H0$%9(F:EB:*%8C)B<";331H?+)*(E<+)78B3%B5(4%"DF&*G=G1F"- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3789 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28288 42 171M = 28184 -275 GCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGANAAATTTTCAGGTATTCGTNAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGAGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTA 9G62B98F';G0F>,=-$>274<@1E(2&$/DE54%FBEA)/E"!.F7$"?<;)&7,/?(-&90C$4-%08GC1E:&*-%*5-?C4$27=&*?49C+#C>5.D5GF4#'!0,0<1"!!5'-E.34;415)76%.:#&+"5B0$<=)*D4(H=FF@6@A"0F!#3F.G?+4D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T18C44T77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3789 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28184 42 81M = 28288 275 TTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAAC %5DG86?FG@E-D:-.G4&@E2,G8#/--#*'+(E-)79=8A8-+.;D*<;9"#+/;/=A<+743!B=0=$0):-2E%;H< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3790 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38168 42 76M5I216M = 38079 -381 CTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGNAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACTAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATNAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGNAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTNG "($*#''#))#""*!&)#&&"&&*%+(#*')%$!!")+*+"%%*&*!"#*+##')%!)()$*(&*+!'"(%'!((!(+'#&&%!)#%"%)"!'%(+')**((%*)+'%+&&#!*)($"!*!'!)"""%$$()!("+%'$&)+"(&'!)*!&&%!)$)'+*)'"'"+#$$"&&)))"*'"*(&!)!+*#%+#%)*)#&*&&''#"$+#(*!$'$"#&%"(!'(+)!!'#$+&)*(#()+!+)""+*'('"&$(%!(&$$%+""+$'#)#%%$#&"$")("""#"+)&'%*&'$(++!$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:29G26A63T59A109G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3790 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38079 42 89M = 38168 381 CTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAA $3?%)!+H-=(7'3E:CD=#$8-><=D"!9/616.$!B(75(1E.8>F$C!AG$?0?$B1%.*;64$1<&@A813'B2A.:B")/6"C: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86T2 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r3791 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42990 42 98M = 43170 224 TAGTACCAACAGAAANTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCANACATGCTCGTTGAAGCATAC &G8'6ABFB;3G4<14'53-HE$5C='A3BB4)<9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G14C61G20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3791 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43170 42 44M = 42990 -224 TGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGG 9+'F,#-%CHC$)',B53+$CD"#*,2'&6+B7F&7=,2%3.*.)64%*972F$#;#/<8'$<%H=G.>7&=*C9:%?>D"+0A6,8G%(5HDG45:<-7%8A4B*$*9D21!#'%A4(74:BGB/2A#.6,(E$H-(5!8DB<..,EC;59!2?:%#4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7569 42 81M = 7370 -280 TGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGNTCGATGCTGCCANNGT )!(!%%('#+($%#%()!$"&*%"'"(#(%*!%&$#!$'+*%'#+)%*%!#'+&+'%+*'&)&*#*$%''%)"+#))!!"" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T12T0T1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7370 42 44M = 7569 280 GAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCA 8>278G?1=(,))-=.6=$G1%+H7-#!?3E'#H;BB7#E12)C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3795 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31728 42 82M = 31880 251 TAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGGT F45#36-3'-%$)DC81(:>B<&448F*7"4@**=B=561B"8C!'CH::.>9%H69=@%>*+-FF?7'$616$,-+F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3795 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31880 42 99M = 31728 -251 CACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCG G=7/$C'2/B,>$A1C,.#4-$=")H9?3F*B/-;B>70*;?<(7#H=FBF*88643H1BADAB7A8="2&#.).6)(,'?F>F>18E0(>$:',B*F5@0H=9(F/6-+)04D9D1:<95?.HDB93F8/180)'*3,41$*2%8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C59 YT:Z:UP jpayne@0: r3796 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36577 0 * = 36577 0 AACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAA &955>H:+3G*3$-9+/.7#7143%#/).A#0;/AAAH(&>=.G%+.G$0+<*:1CF'0E>:.:C:?)C1:3?-C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3797 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13505 42 52M = 13646 193 TCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGNGCAGAA (FD#77)-E#DE!%/--4<+BG<1@-4/$05,81BB2)45@%F7$2A'2H4$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3798 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38992 40 43M = 39143 208 GGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCA 9D?'>#?24H$+(0G%A)&+75=?D=(/#@F&B)',+?/.#=+G8$10("C92G/-+1-73,.0175(8%,0-+=6/.DC9HF%45>CD!"C4H9""(<(B=6-2-B'C8$'CE##F*C:&/;*B=50<*:?4(%$9!%*%$40%1/''?'08'&3B?A0-#FH>)?.3:-B8(,C,:70H'B5#CG.5D7,,,H7&7,!CA1$"#!F&H0)E*@2%'@/.2&D>$/54H2A1",:A,7+E#,*6BE/"$8$=F%7,9?2*,9@B.FA9H*"E*CF53=<*A,%&1@;<=4/$":=1HG884#=)6F5+,6AD2/4?09$(?151HD&8+2#;3F01*79(8H=!0<=;!1=9C5D?,/'>0*@+? AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:4C0A27T68T79C145 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3800 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7885 42 138M = 8023 466 NGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACNTCAGCCGTA #B',>27?A?>7.:A4H?10((,+/D(09F"3F6-;-G-G7/()1$E+0>9//)<DC?0&&*9E42C.-;B4(C)GG%7;)''?",::84"&D?:?$/HDHA62$7:H9.-$G85AG'+E1B9F-' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C11G115C9 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3801 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5016 42 51M = 5067 241 CTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCC 1EF')%D4$/%"4F8$:&0,!D7-0>,6;G$@DD1(F>@'2(.:-62+B0" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3801 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5067 42 190M = 5016 -241 ATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGATTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGC 0:3DH-F;;AC$?&(7'2F-!#$(#5D=BH#,+F45@GB@%9G%:-587*,9;.9""02)+>C+@!E3HC(9;'FBG4E"56/H+?)@C814%'&)9&B6"B%=#074/++(!!%HE$$3%+?)"1HECF.0>DG58<>2+AC1:,1/*B3/H&;.H:A62+D&1%(4D?+9;8@H')8'4$D9>5$2!/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128G61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3802 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44368 42 123M = 44491 282 NCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACNCACCTGGTCACGCACTGCTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTT *53#?H/92E;<67+8"!"2:G=!2#.GH%=)+C.G8/(090,7#<0>/7>A*/F4:%(3:;G;)+),D8)1FF#'02'8$0A)AD5;?2=->*B.B?6&.E>%*+D!%H/;-D!D(/7H%5) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T37C17T66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3802 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44491 42 159M = 44368 -282 GAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTGAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTANCGATT A<52<6)>*?+F;*8C*+95D50!#->%"E(AC7D=+!#@3;#*8*<1#.4<*!@,?>=3*!?HC5+H0C(7<&6:0/:4$&#H4-A9'.:*E4G18&=:*1E/=''%>F=2@!<&D'D1H:F='DB?A=B-!,()5C2+;.C@&C"!@0)4&CF;$(8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95C57C5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3803 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11594 42 188M = 11459 -323 AGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTNGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATANCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCNCTGGAGA 1:524=#*3-453E*)9G./9+A3A=@+A<#+!FA2945F:6)H2H=#*2>27?8%<'.$+61H9E("6/!$%/H/1,;):/2H'43:C9#D9*A)>=*;HE-5C!=:GAE5B48-=(AF),;H$'?1)A6H"*3F2*:A@)3CD><33E()69,B'"3<$7&$7<'*=6)F3&3<&>4@(>"H0<"H76G>F<$B0G?0;/9D?(5BF<+0C!56G-H=&4A/<#/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3804 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11395 42 75M = 11113 -357 GCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTNNG *($+%'!%+(''('(&*+"&'!!$)!&')('*)!)%&%+%!(&""(%(""("&%&((&'(#+$')#"'%$+#"$$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72G0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3804 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11113 42 65M = 11395 357 TGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTC E/A/>*>5-*F/!$3:1$B',=#*C:GG@8@+BAG8HE46:G$*(4A>35%87E6+$HD$>F&2H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45245 42 210M = 45455 281 CATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATNATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATTGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTNGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTAAATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCT G)CB4>18FE&*G2(.=6%5.$@E-7>(<3:$%'00$;.)40E:C$$4($4D/A5B7H@-E2$;G@0;A$&D26=$$B#"38->*,CE""D16*,?59;$@C+:1E AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:49A28C28G75C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45455 42 71M = 45245 -281 TATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTC <'?):505;&4)7#)%<1.2E9/6"92(&:?60C3;#!A)4)8G:AE4=?@CD'"AB6H7@';0644 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3806 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10884 42 257M = 10730 -411 GCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCNCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGNCNTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGC $5!%4%(G#%B#.*-+@,E,A!7/.8HH8*=!:"<2F5H=4=&!>66499*=:'!>@*&+>+09+1?5;0=7)G@H@74<'4AG'%+F/)%9$+';F,*:A(A.<$89F-(5(BHF# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11C7C95G38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5568 42 264M = 5524 -308 CCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCNTTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGNGCTGGATCGTCTGATGCCGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTACTGAACACACCAGTGTAAGNGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACNAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCNCATACCGCAACNGCGCCCGGCGGATTGN 7BC!B*.,0@&F-B)#4AB$2B)H2?*/4A-(4+*>#(4-+'=,$E0E.EA@!8.=;75D0)B14)D64*/"8G5"G"#GH$B@45<5*)9B;/%,;>+EA69'#?!E$6-C'F3.2H5"9$781=8G3<7)1-#15-,/).!C?1!)E$,<$CH<.#D1E<<+4D&9&H1'+C><-$5F<=*((?GE/!2A<$;%C>#.48<650D:1+% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:29A45C17A57G19G37C22G2T11C15A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5524 42 44M = 5568 308 GNCCNATGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCC %&"%%%$*+!"#$&#&!+!'&+*!'*"+)!!+"%((!&)")')+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1T0C1C37 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19415 42 57M = 19615 277 ACNACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTAGCGTGGAGTTCA ()"+*''&*&$$"#&&"('%"$&*())%$!*!#"#*(!+*$(#))'!$+##$&*(+( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G41G9G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3808 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19615 42 77M = 19415 -277 CCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGTGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGA 59=#2+*/:1.G##%+&H%$+'<4#-.3120(#E")#<'&8?(4B0+<#"@.1=(/1&F,2>2068(>2-D@$7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3809 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2465 42 125M = 2266 -324 TGAGGCTCTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCCCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGGGCCTGCAGGAAGAGGANGGTGCAGCAACCAACNAGA <>>H9.0<'1(/**!G1)E0D?=;2F9#G/<>6F@C@>D6(2<$(+>/#(=B,1BH>$&+1;EB#E8.8B8;:43#>+/';;04/(*HH#C>E7!?#46>38);93*GDA@+0'=!:B:,7";%5 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6A34G46A16T15A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3810 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42911 42 88M = 43056 234 GCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAANCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAA 8B;/?,'9#63&&-(>,GB45>)%8#8<%.@@HA")B!C(4*;3+8255=$F94A&=-*3>70G#23">+3;8' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3810 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43056 42 89M = 42911 -234 AAACCATTCCAGACATGCTCGTNGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAA ,+%',.2,(!,'HA63?A).F"'6A(9?9'F0-1D6,A2#"B$*3AD5"A7$5A3'G<6C-C%/FD:5* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16511 42 109M = 16731 352 GGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCNCGGNGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAA **+(()%"*"#(()#%$$!!''&*'+(&$'*%''!+&*#!)#(!"!"%"!&'%+%$!#$##*%'*"%)'+&!'#)"'&&&!!$$#(*$!++#!*+'!'$'"%$(+!$$% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T3C81 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3811 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16731 42 132M = 16511 -352 CTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGNAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAAC @F4C5D%17.7A,!HCDFA;&>61),9)=15AA<*D3A$()DG80=F0/)",3*EC.,/+!5+"A?8"G27(F19*=#A)5$B*73H4C4@0'?C&/0(,8D,-DG<2DC7*;=97;:(59<6CCB,C.562 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:57T70T0T1A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 203 42 172M = 129 -246 AAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGGACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGNAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATNCCGAAAGGGATGCTGAATTTGAGAACGAAAAGC FBG&5/9G+,4DHG/*G(B;#@@&*1*..5)<&E&=-G*7FAE4D43616"54@A+FB!@*78(6'<+9H(?>7#';G0;08")E$./)-!@65=4)B!)">C(0974:8+FG),9),=G%"95$28::-!""6(&,(.2":22(G'58F"@"#AF-65!6=@$4A#<7>(7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48A46T42G17A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 129 42 58M = 203 246 TGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATG (9:G"E!6%>4F668B2/'#;=;@2+*84E'GA1:'<8,;1B8B2@658:H'+-/989< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C36A40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3814 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3470 42 100M = 3570 218 CTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGAC />5H8'5>H3E$:38?6G%:@-%4%0H-:'?=1A7/B:*AB?"&840@->F4%@C.A'0AD&29!)$,'$&>-%7?#=0?@3>=,7;C(?=),>'*1!4. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3814 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3570 42 118M = 3470 -218 TCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGT =%B)E1B:19E#,7C/>/#"!AAD48';4;(%->(?/B:&8>+6=)@"(H3D'+"#'E68@%)?2,4A2:%/@"/@.95&03)".387#&;"%2/>(:A(7".(*)8A773@"AA"24 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3815 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34320 42 41M = 34133 -228 TGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATA ?@'(D>9<0?65A$*+#7GD$4$$/=G,%?@C(6;C*H>@9-0%9&'2:4(FF%!+3!C?>,9' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3816 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9954 42 169M = 9863 -260 AAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGA 6F,E+2CD33C;F*;C+/*(4B>E#(?9"($0$#D:;.9591C'7.D%,D@25-!<*>?F=E)G<41035,@1,;)0H!/)C#F5%68":1#:"CG!-C7)-/?BD61)08;:8618GB#089#$*9H///@>.9(3$!3";+'&5$4,%4AGBB@25/,?/>)1/A>2#6>H'G%6%'"6;/.'07" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C21C13C17G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3817 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14558 42 396M = 13969 -985 GATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGAATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGNCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAACAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGTCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAANCTGAGCGACGGCTGGTATC 4:6+%*-F%CH=2-*"<0(:$$%+E&A2-.%=*"40?6F3!1%0G5*=((C:,54$*')D15!+!2CH=.38>:%>%?C=9>B8=7*73A5*,%B$11",-?@FB43(H7B,:(/%%*.*$!46/CF;=#*2$<+,-0@8A1/(08*<2>DA#=E@B%G(/#C&8'("F)HAB9<$$:@6=D-';5.(!7H+,'#+.564C22EA&+2@(<<>#<.EB(CD9C?,(16#AG*H/B@F7+!?B(H$<:H7+0+@,?=''12%/(':,3196AF=,0%A8H*<8093;F/5=4H$/42*0*08B$>$+H#7*:#%:B(*?67)*GCA>!03G25HD:8??$5,70-,3!3#, AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:60T65C63G27G157A19 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r3817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13969 42 8M3D578M = 14558 985 GAGTGCGGTAGCGGTNCGGCTTTCGCGGATGAATATGACCAGNTAACGTCCGATATCACGAAGNATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTNGCGCACGCCTGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGNCTTCGTGGTAAGCACGCCGGANGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGNCTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGNGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTNACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAG ++>A@*.,<*.<2'+5:F"8H3G$#(+(D#&7=FC.09&!%0G1&?(&.A5%EEC/<(+/=+;&>7A:4%&.F,%:1,*::@&0EC9G*)1/@>D%C3<'4C6B!$$3>7<>/0EE20A.$=/'+99?:?9@.%3G(B5?E6!6G7A8/H7:::B@E:2/"=56*&?=GA4@D-8247"289;*G35";G%.)3??2$=37?2@+%>?:"(@/:$*8B1(?8990=7('B"C%-)8$?5(C;;#;?7+1?F5?&#;$H/B9%E3)(A;825;@=!#>>'%@9;3'%D.C!*&)/B$;.$!-*4E:6/=*D>+<'5,02E4;,C7=7!#7*->9(17(3C433(#'%/F9-+:<%;.GCC+BE8-EF!$=*+%!B(H@*!8+&(4F+A3)8'5+9*HG?F%E0&3@@@AF+.4;'>>AB:11>>/A1-">>293G!5)(9EE(A(-3&D.1/-@5(5?68:")E;&)*>5E#&<7;"&02$H=A>ADA@2C)+,<+=E:9'%#6763A$4=.A@9< AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:15 MD:Z:8^TTA7C5G20C0C19G123G9C27G21G69A173G31T62 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3818 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33828 42 98M = 34007 319 ATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTNCATATCCTCACAGATN 62'2DG-GA,'-/!:6&%).6.-?C-8)/%F0D<"%-.A;F,)G,/,C-'",-=F/.F7'=BG@5A<';D;?>F"+:;,0F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81T15A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3818 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34007 42 140M = 33828 -319 TGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGNCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTAT *:D-8*E$$$F'2862*DB'=!5D,#0'@&&($F-&+E804*6$-=@,1B:<$>50+-'6?1<8#=8G29,;8D=508B,998D=*==2$@-7-@-';E<'+8E47"'"-GGH-.(!'"C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37482 42 87M = 37707 271 GNTGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGNATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACC )*%+!(*(%&#*'%&'*()"!+$'$%#+)*!)'+!!#"'"#)#)#&(*%*&)$#)'+&$$&#!#!(#))"&%##'+$*))*+)#&!% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0G0C31A52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37707 42 46M = 37482 -271 GCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCG $4!)8/#4(6:A>9G8H82+4*.<;B+7,:%F7!<;H":'.481#9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3820 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21478 42 98M = 21693 312 NGATTTGGGGACGAAAACNACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTC +"'""'**&#'((+"+$("!)*"$&()%'(&(($%+!))&+&##%*(""+&%"'!*")%(*&)+")"%*'$*+#(+)+($'"&#%*%("*+&((+&!( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G17C79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3820 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21693 42 97M = 21478 -312 TATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGT H-B+5:/FG7<;=EF)+@6:/2.1F5@/>,F951$327?201>:4F%@D,,;A"(E>,-?/1"&'=#:6.229.%H&448-B!% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3821 77 * 0 0 * * 0 0 CGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTNTGAGTTCTGGTTCTCGG ;>">?1.2G-7:7="C/'@6&!,E!*/$&B++" YT:Z:UP jpayne@0: r3821 141 * 0 0 * * 0 0 GGTAANCNTGCGCATCATCGCTCGCCCGACCGACGGCCTCCA (*')%$%$&+%#$"('*$$""+"++)'&#(+)"('%)&+$"" YT:Z:UP jpayne@0: r3822 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25907 42 120M = 26028 287 TTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATNGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCA +(!'!+$*++)()*%#!')*$$((!()'*#)%%++(&"&*'$*+#*$*#%($%'")'))!(!#"*!**$'#"(##$!('$*&%)%#((*)"#'(**'($!('++#(&+*"%&(#&"(%&$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C88 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3822 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26028 42 166M = 25907 -287 TAGTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGANTTGTCTTTTTCTATCGACTCTCATACAACCAATAAATNCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGG B3*'A4A0(*8<<=@*!6/17/$=$48-*?,H9A!@4,,*A>-C@5.3+#2>94".ED&9F:@->@575%H2!:.7<<2/4364.2&E#$1$3<=*?9E82?=A.,#A2F?=('!81&?=+&:'/;<1/;D=')947A2;$&%-#G+-1H'(8>$,1/(8"7.C&,-1*'76D-F.(."=F%B5DH<+31FF9?>4:.7=@?%0('=2339>",--86->$&:C8756$D#;35'+;6+9(%H$(!4)/1@)098B-/7-(.//A'"4HA<73!(7;CB=?1>672'F$0A%$;+)F@-68!AG32.+A8.@C?@<;B937D'@>&7-:F':50-)6@8/GF3@%292D7.%%.E.!!%8:&"*"*'5#+);(57/.1, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C107A173 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3823 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32842 42 70M = 32535 -377 GGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTGCTGAAACTCAACATCGTC #&(&+"&)+!+!*(++%+'))*%)+#)"'#))"**$#"*!!&+*&&%&$$%((#$&$)$"*'(%$*!)+) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3824 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28552 42 54M = 28364 -242 GACCCCTCCTNATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCNNNT 0$5B6+&A,>>E:5G/#!1C-*&D02G*/E.?80$5/941#372G5"7+9%%!* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10T39T0G0C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3824 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28364 42 54M = 28552 242 GAATTTTGCTGCGNGAGTGGCAGCGACATGGTNTGTTGTTATATGGCCTTCAGC %++%!#+'%!*+$'+($#'"!"#+$*&$"*$(&*)$"+%!&)+"&*)+'#!#(# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0G11C18T21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6428 42 65M = 6604 278 GCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAG &F*F*)E#,5/F;A(5<=14G@G*3H#DBBE<,H;1+4;5!G$F$<5!%"1$/7A%G9C8> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3825 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6604 42 102M = 6428 -278 GTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACG .&-),C@D0/H9<'HB47*C25554C)394EHG0*F8AA:22("-4B3#/;'GF=H*(7/A>C8#?77>"+8'3.D=0++?<:04+#/D?FC;32+$'+)'G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3826 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2955 42 119M = 3074 294 ACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAANTTTACCCGNGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATC (:7-*,/?#9+EA(D79(@@',;-D+/@$ADG6C+C0GA;B4E.&8D!#!*FE@'D"E1,+97"=<-04D,/E?@4>AG.@+>)32$*:A5>%)D)@G<24C!%3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C8T73 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r3826 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3074 42 175M = 2955 -294 ATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGNTCAGTCATCGCCCAAGCNGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCGTTTCCCGGGAGGNTGAAGCGGCATGGANAGAGTTTCCCGAGGATGACTGCTNCTGCATTGACGTTGAGCTAANAANCNANTNTANNNNGATGNA (!*#%+$*"$'&)$%*&$$+%++&'"*("#)+#('*%!!)!!##"+(#)*"(+#!#"+%%*"(#))+!(&"!$)&#*#*#&"+"$#*$(!)+#!'##(*)*#'"*#*$!+*(%**"+!(++*'#'&+"!$!$$++$%*"$!(!&''%%&#(+#$*$!#$!###(*$"!!*")*'! AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:22 MD:Z:23C17T38T7C4T14A7G15G17G2A1C0G1A0C0G1T2C0C0A0T4A0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3827 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42231 42 193M = 42431 244 NANATCCGTTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCNTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGNACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGA %&#)#($"!#%"++!"'$()*'$)""&&#'$**$"%)!'!+*+'('$'!)'()&!#'*#*)')")$(%&)#")!*'++%!!++#"('$%'**'%"*%'"$*)#(%#!$'$%!+**(##(+*"!#*''$$*$*)#$&$+$(&$&)""#(+)*"*$+"+$"&!!"%*&)&"%%+&!+*"&"!""'+)!&&"!##) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G1T5G76T57C49 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3827 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42431 42 44M = 42231 -244 GATGGCTACACCAGCGCGAGGACGATGTAAAAACGATGAATGCC 481,>F9CA(D+/H5A/&CA:%7'FF7%/+125'>5E-$;CF*2 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A10A24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3828 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41361 42 65M = 41473 202 TTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCNGCNCTGACAGATTA )F<)2.*$&G#C;<&'G2'71$/;DB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50T2A11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3828 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41473 42 90M = 41361 -202 GAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCGGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGA H5<%+B2+*9B$827#2@HD(!H959*E"H&7F!FDC6$B<"$7/G'H%40/, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C32G12G41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3829 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11737 42 82M = 11928 284 AAGAGGCGCAGNAGNCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTNAACAAGGCACT F!;?'-.E.4=%G"G(?6/22A)%*C080=!3B(.50,,998<8=3'-=+=1.D@:$A7'B!2-$.D2'#@.D89/%3'8(: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11A2G55G11 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3830 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5417 42 86M = 5609 265 ACGGAGGGCGAGAATGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTAT F!<(!,$7'D.H?%'3<"9=(D7'-1998EDA7H,B)2(.6?*6E"-#3B5()B=8DC8@9%2!A1G!@;4E9*?#B0=0@+#/*# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C50G20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3830 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5609 42 73M = 5417 -265 GCACCACAGAGTGCACNGGCGCNCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGG +?@'@9E:(D8-%?$H#GD$1%:+.:(*G>5=A)H$,*+8F#%D@6:FE!-65+D2*9<7FCH4C4FD'EF&F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A5G50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3831 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1654 42 50M = 1482 -222 AGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGNCAGCGTACAGC 2F!&8A(:B'<*(8&!D%483.$++,:B!/%$8*+6*)=>*E@A<(0@1" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3831 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1482 42 56M = 1654 222 NTTGGCATCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCA )B#E(2(#"1$D,DH(6.>8C6'%,8/8593:B8@.H;+.0A/,DD4,+98>C-D= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T5C49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3832 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20083 42 86M = 20344 339 TGACNGATGCAACTGNTTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCGGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCA 16.A=2*F,-H@@"''95&<:-E"B0&>@H4,-(06C(,1?1.E9&<)27D&2)67;,;9FG<54%,#3?#018!70(,0*5/"B8 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T10A0C26C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3832 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20344 42 78M = 20083 -339 CCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCG D0??2.3-&2758D9-403B8HA.?2G/@=:>#=H!(#52&5E6EE1/4B#+7(-2C":?:5(D;<#C;H<-5@#1$/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3833 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2319 42 101M = 2420 447 GAACCGCTTNCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGANATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGT 801:?$;1!?#G5H)9'E""8(E-&8&+.&(-/G:5,$3EC1/!'!1&E-%22$C(/.HD(9+D(=/C/2$,*",5AA'BA78.00%)(//->8GA<,:?- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C31T59 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3833 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2420 42 346M = 2319 -447 GGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGAAGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGNGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGTATGANGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAA "F'3(5)3?)!H%B9,.2+$3B)C:'.50714*$7CB#F7339EB>:++F'+(?61=3:6)<(2/?D'*&'87DG#:>=8,?;9A4>4>2".+B,9+)=5;.C!@A>-%E!'=G=="3)#9C@:.G>2/)D:9D+3*&'H6$920+C$$#:?"3#:FF?,::=&@"!@:&??F/:0.?'29H7@-9H$B5FH=%*G'/A)/$7HH-EH799.:(@3$:-89F(5"9(?:!31C89/'%A'0G.*%0=9;6#,"4@$53:78)0%#2G8+9.-5E><1E&+3:$CF.???#<1479,4:#.63E/0:B!%4F??D8&AF2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:40C92A78A4C128 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3834 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33482 42 55M = 33273 -264 ACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACC .;'A57/.3A974B'!'/5$*0(<,'7>8%*1=68>%:*6@>;2$$%131G70C& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3834 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33273 42 50M = 33482 264 CGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTT *?DC/B!:FH+5=3">45;$G0<@40H9EE$8>1=2,*2%5&?*!1B:,A,/!%C4:DG1"%+8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G62 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3836 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16739 24 119M8D83M = 16949 261 CNGNGANAGNGCCTGTTANAGATCCGNNNNNCATNGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCNATGTTATTGAAATCT $%(!%*%(%*'((*'**#$#*"&!$'&$$$))&'"+"'%'+)"#'#%+)'(*"*$!+#!*#$*+#"!%'!*%!#&#$#'#''+!)*#!+&&+#)+)!#(!(#&!)(((!%#+$'$(++#"%$%*+)'*)#))(&(($(*''#(*(&!%)%%""%&)$"%*$(#())!'*%(!)!*(#(*+!$%*)*)&)+#!&$*)!$%'(& AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:23 MD:Z:1G1C2C2A2T4G0A4A2C0A0G0G0C3T84^ATTAAAAC67G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3836 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16949 24 51M = 16739 -261 GCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGA G;4DD;D%2A8C*6!"(!'F8DF%7#%'570"#G59*GAHF$!F64-8)5H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r3837 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24755 42 49M1I95M = 24927 212 NAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCNCGAAAAAAAATGTCCTTGTCGAT #%C;""?6,'C(:!)?DHBA480#,9E,'2H@=@*!AB$;)B9/()E3%2A(*@152<$7&849;AEB(611.DB9>.>,4E,2@>@9B406-:(2/7'+57F&(;E3EC5<)532>#,E+*H0/@(!B8,=8HDB->5 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0T10G108A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3837 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24927 42 40M = 24755 -212 TCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGT "*+&'*%!()$$&*&&)##"#)!+'!%"&)%!$&$!$+*) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3838 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38752 42 102M = 48369 9676 GCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGNTGCTTGCCATT ?6*:/42-A$5B?EC/B%A$5C$<3>#@HC?.C,C2+,'?;32!?1#?8/?;;==97GCD66"4+"%B*+4B;=+,+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90C11 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3838 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48369 42 59M = 38752 -9676 GCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCC /#+'1!HDG@+78E=)""H@",1*#@&0H%9(C&0<5=9A#',()439@H4H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r3839 77 * 0 0 * * 0 0 TCGGGAGGGAAGCTGCAGGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGACGATAACCGCTTCCGACCAAATCAAC 5.1#)0GHF/:+$=8F990%+,=#'$H-?H&+$71;BD;/,&?E.>-E96<7E;?87)G!.*;#==+BD@.&2(H%06!G, YT:Z:UP jpayne@0: r3839 141 * 0 0 * * 0 0 GGATTGGCTTGGGTTTATTTCTGGTGCGTTTCGGTGGAAGTTATTTGCAGT +#+#*&"*++&+*++"$&!"(#(!*')((''%!+(&#)'$+#+*(&+'+&" YT:Z:UP jpayne@0: r3840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13127 42 64M = 13303 252 CCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTC A",22$>8@3'+<;E*/4E-E%@7'>44'2"CB';7>=,@$&%<@8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13303 42 76M = 13127 -252 GAAATCCTTTCTGTGGTCGCCGCCTTATGAGTGGCGGNAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTNGTCGCNNGTC *(#$(!($%%('(")"'$"%#)$$$"#!*&*!!%))$$&&)+&+)"#+#)'&&"(*#*(%&#)&*+*)%&#(%()% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16A20C27C5G0G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36056 40 108M = 36164 379 TCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCANGATTGCAATCATGGNTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAAC /22E2<:H$)%17-/)(5.&+?H9?%,>5.=8HBFH@+H436)7H30%8=(//76#>#41C-((!65,'8.;B@23?E5779=G5<79,)AG56?A&5=.:+CC@1@# AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:2T0G0C0T0T0C0C2T0T0A21G14T57 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3841 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36164 40 271M = 36056 -379 ACCAGGNATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAGTTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGNGAGATGGCNTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAA F*->398&!C82H%#A6D<.B46"3*3-&(FB'1>FGCH"83;20)>G2BGDE*E4"@,+*-4B2!1!5#(;=8(8%15/08";H+='A955>50E1C@22#6<=9-2DBC+D!E7)%;+3@7B4&2>C8722H,7H&,-C$$A"'=$*BE?9F0(29H:F&9@%HG.$2?H<00"7=GG:G$%E;0<&:-G4=$G01CE'F419H-5'&53#(CD0>"4,H*G&"GHAG43G"C6=7$C*A/1?5=6@3B;H!<5@)1====@"A4,3B#-B=;5)2CD)%DCB1D2%!%BB.15>$(/>=/?H/@F6D1DEH(A9>A=+6>C@8AC*G7E2)%'"4(82AB@F3CH#C%'75/-6E-!40,!F+HFF.>CG8F0/E?<$#6D5<7!%3#.;,'/6#+472;?E:>'>E14C0B1'E*= AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:46C153G22^ATGTGGT34T0C0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9831 42 117M = 9539 -409 TCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAANCATCCGCAGAAGACGCAGAAGCCGTCCATGAATGGA &!(+'#&'%""+&$#"(*&&#$$$!*"%'+%'(!+%"(#$#")'!%%###+)'+%&$$+(!$+)&#!+%*%'+#&+")*#&+"'*!%$)&"#+%!)(*""+#*#&&&#((&''((') AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80C19T14A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3843 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9539 42 292M = 9831 409 TCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTGTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAG 4@'@D=:#@>514:$&*#.9E1811$.,5;5)*HA;;=H$*/?(4)+,!+!1-!:@)9E#:8<8G;00G(7-2/*9F"1+-$>,G4$>B#%AA.&$-$?1-C4=F2F#?CE@0'4%AC7(%6!1.H7:@$@@20*88H,;+FA0%H970.<)"D/ACG(.D0H$95>8&@<4%,)1.2/@$3B3G!3)+!94#;CD;38B*'<;8:E"G3+/<@4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:222T69 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3844 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1543 42 173M = 1716 309 CCTGCGTCATCNGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTNATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGNAGAGCCCGTTCACCACC 6;$8A2737'(4!C5A1/8A$A$0:'2:*!;"&*?"74<44#28?4)A7=/4>B.3@'1+@1',8#(5AF4@<&&;G5<=*G&01@7F'07>D'/'033@0CG!AB*D5:CC).$4=>4;?)F# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11C23G119T1C15 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3844 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1716 42 136M = 1543 -309 TGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACNTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCAGGATGCTGNAGTGATGGCAGAAC :?5F,0(C;#.7@-F3:9EH/=1=0D@&-@@>$*-6G@(36G:"*7-+*1.H((!BC!-3H$#1*,G;33B.G=;%?,,;$-G2*5;E;=3071(1-&;'"!B*'-7&>"(#4?A"$4?90?')D+0!%2$@61.3<:!E+B(+=1D; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3845 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16722 42 89M = 16530 -281 GAACAACGGGTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCT #'8A9C6$2HFA&'>)=','-4,7+=B-D'@A/52(6;):9-*&0/"!E;'&9""655=G3($3G.$BCF4"D;6%.),7E/FFFF.?@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3846 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33394 42 107M = 33247 -254 GGGNGATTCNTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTC +DE72#1;6.3.G'"!D$#G87,G3!"&("$93;%&4*D;./>/$G@*CC$"":.9F$:!8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50C15A5 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r3847 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32571 42 143M = 32400 -314 ATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACGGCGCATCGCTGTCANGAGCTNTANATGCGT (#!*!)'#*'#'))(%!)&*"%%!$'+%!#)'$&&*$!&$'+"!##''(+%##$&%%&"&"!%$))($%)%(*)%$&$$%"#&#+)+($(+#)+#'(#%+'&$!)&*%*'(!&'"'+#$+'%*$$**$'%"*"!)&!"'((#& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:112T11G2T0C1C2T2A4C0G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3848 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37433 42 51M1D152M = 37247 -390 CAACGAGAATTAANATTCCGTCAGGAAAGCTGGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCANGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAANAAACAGGGTACTCAT +!'+%()!%*#(!**&'%&)+'%$%*+'&%!""(##)%"(%(+#+*$((*)$"('($*$)*%"'")))%"%"!&*'&"!+$'%!$+#"+)&$&#!(((&*#!++'+&*%'%*&(%&+%*!'#*)(#)#&)+'%*(&+"')()%#)*#!##!*%'%!#"+("$("%#$!%'%'*$'*&''%&*#'+$&**')'$'%)*&*%+#+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:13C17T19^C106G29A15 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3848 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37247 42 186M = 37433 390 GTCACTGANTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGNTTTAGTGGTTGTAAAANCACCTGACCGCTATCCNTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGANATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGT %+'"'&%!"(&!!$%#&(!!$*!'&**"!#'("*&%!"))*!"($*)+!*($*&$++&'"()'#+!'!'&'"!#('+$()!+""$!)))!#&)'$!+!&+)&$(!#((%*#!(!(((#*#+)")!#(#$!%$#!*'!**#&$#$'")(&)"%!%"%##&#""%#)#!%'+$"&&$)*%)"!#*%$' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C6C61G16A16C51A29 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32466 42 123M = 32226 -363 ATGATTACGGTCCTTGNGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATNGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGG (5&7D<-"9-5@E+14,?B@(8=>;HA:>6FC@6B16(7HF(26&D0-320'B23.'2;E.'">&7B8451!/>:9B+%3H%53/*/">5?8%0<35/D3$""$4?"='4+%E*3*=<5"543 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C27T78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32226 42 240M = 32466 363 AGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCNCACNGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGG 2',C3!65H!1/1,E.2)2*9!5'E%067E;3(E&E@/EA:,846&14/GH@"E#;F3&#;!,@/-ED"-9,@%@A4;29&BD68FH+6.8.@-C*6HG?B4>??H=)?=2GB6#-:?8:=3C>0#%4F.?,4,>HF:9!"@*@$!%*AE?-0-BA!7>>72E(8%G4F-G3G!E?:$,E%<)4=<.=.#='6A+8. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3851 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9779 42 95M = 9963 302 GCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATGAGAA ',H;"/.(HAE/--1=C&6AB,&.()E47@EG")76C(?A9FC2%4;$61,>6B9!4&.':>5'-0"'2;3359 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3851 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9963 42 118M = 9779 -302 GAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACANACAGAGG <")"0=$14";8D-+'H6+#E2F&'H,EG:7/3BG4'C#!/(15+)/B+1(C@5H."@C<#H+99+4"'$(.A!EBG2$A#1>7G0(&=!5974+D8F3$.#4A$7?!7G334399?1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110G7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3852 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31445 40 95M3I39M = 31598 205 NACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGCTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTT #?5%>//2?H>6#<.E%<#4"@H7*A(*9'DC5$'@.C5E=?5&!6F.>7;#"4G,)65#;0AE7*/7C-45G&:55>'$;A/E7(!,=#HCF/7-/!B'.+"C@.1#G@./,!F#8D1+.:.A*-%9B6A;$) AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:0T55G49A27 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3852 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31598 40 52M = 31445 -205 AGCCGGAACTTNATGAAATCCNGGGAGGTAAACGGGCTTTNCNANTCAAGNN !*)"+&)"!)%%*%%))")"*"%)!!++&%#$)$+*'!"(!'")!#$#&)!# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:11C9C15A2T1A0G0T5G0C0 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r3853 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37401 42 55M = 37149 -307 GAAATCNCCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCNNNA +"%+!!%%)*(")%)'('&"+((!"**)%*()#((**)$#!$+*+'(*(+(#)&) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A44G0T0C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3853 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37149 42 81M = 37401 307 GAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCA C$E9F@C;4$+*@<:G1AE3:/D@-B)AF'8C>6F86E9"=@#!!/15;43?3&C:2C8?)8,&2**#FC..5E=.>@.+1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27801 42 105M = 27617 -289 AAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCA ,<&*.A)==@8GE7?"'B-#$4&E*6*#"!4.0$=4"@2B4'D/1C*-F(*B5+)'!-F/#7>=?,)2'!E2@>E"*.;H);;B6."6F3#'C#/#==/026?;/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3854 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27617 42 88M = 27801 289 TTCATAGNGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATC '=.@94E#!<%+!+D2429<,"/9*7;5!68,C/"93B".E(EADE46''E-)@C.:/DH8$C>E0="(-4(D?#&F0!.;)';)E1" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3855 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38463 42 118M = 38463 0 TTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGT /:?HH7%E#77FD"=!@';(%2D-/37ED0.G3A@<8GD!9CF)(?;D%A0=11(/!(9GBD8$=>./%#=%?*?+!*47?0?/+&4<&)7#77D"H8GE=??H3?6>/<%4/'+)8G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YT:Z:UP jpayne@0: r3855 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38463 0 * = 38463 0 NNGNANNNACCGGNTNNNNANNNNANACNCANGNNANNNCGGANNNTTCCNTNNANANAGCTNNNNANGNTGNNNNTNAGTCCNGCGACTANTTTGNGGNNGGNTNNNNNNNT !!"##!$#$"""#"!""#!!$#!!#"$"!##"!#!"#!"$#""!#!"$##"""$!"!!!!#!$"!"#!$"$##!!!#!$$###"#!"""#!""##$!"$$"!##!!$#!$!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3856 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35619 42 58M = 35619 0 ACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTANGTTTTNTATATGAATTT ::'DF$;1+:F&';;D/A$-FHHG>#=A*-"G21(,87?."#*G,312/-&&:4E)E% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T5T11 YT:Z:UP jpayne@0: r3856 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35619 0 * = 35619 0 TGTTNNTTNNNTGNNTANTTTGACCAGAGAACAAGAATAA &''#&!)$!!%(!!%"$"'+$($)"%)&+')+'**(%%)" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3857 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28822 42 76M = 28898 221 TGTTTCTTATATAAAGGNTAGGGGGTAAATCCCGGCGCNCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCNTCTTCA :-;B'3"3B!/8)*.@:H.$8$&@+'FE461D&1B(*H%/F2B2175%G7#C=3CE>0=@#E&:+E/555%+-)%/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T20T30C6 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3857 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28898 42 145M = 28822 -221 AAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGNCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTNACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCNAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACNACT ($*&!)(&*")'*%$+("))'#""&(*!"&+()*+%$)!#(%#'$"!*#%+("+&(*)&*#!&$!'!!'('#"&&*$%*+&(&&+**&%)+!%)#%&%#!&%&&%"&'""$!$*&%**##$%&!)'+&%%%#"'!$$%$(+$(*" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:29T46A28G35G0T1G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37540 42 151M = 37700 216 NTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTTAACNTGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCNTAGATTT #($+$'('!'!$!+*$$+"++&!#!+&($$&+$"#*&*&*")(#%$'"+%!*$&&$+'!+'%!#+"'*'')''(")+('#"(*&###"+'$&)*)%&*%"()&&#!$!!!!'))$&'#*)&"$#'(&('$&$%('"&$$!&*#%&&($##$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G69G3A68G7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37700 42 56M = 37540 -216 TTGAAGGGCTANATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAANTTTTGCAAGCAATGCGGCG ?.2C9HD(!43C="8/>G2>B'%&720H18+$#>F;F;);8!FFA"-'B01;B'(? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A24T19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3859 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38867 24 21M2I119M = 39007 356 GNGNCCNGAATACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGA *#*'&)#))%+)!$&())*%&&'*+*)"#$$$!#()(!!!"("%+!+++"&(!''''+'!+"#"*&*!$!)$!!**+$#(*%)%###+#)!'*$#+%++)!&'%+"%&(+)($*#'!"+)$!!*)&%)"$$(')!#%)()$$ AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:21 MD:Z:0A0T1G0G0T0G5A1C0C0A0A4C1G0A1T0C0A0C0C108 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r3859 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39007 24 168M3I48M = 38867 -356 CCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGTATAAAACATCCCACAAATTGGGNGATTGCTATCCCTCAANACAGGGGGNCACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTNTCCGGNGTNANACCG )%**(&!)+(%'#)#)+#(""$'#&(#$%&*$&%"!)#'%)!*%&($*$+$(&$&!#*"&$)"!()"+)(#%*(()#&()*!$!$*&"*()&"&#%"+"%&*"+$)!+!'#$$++)$$$)+*!)$&)&#!+&"*!'*''&!"#)&$*!+**#%)$)!!*$#!''%)%#)&&$((")+)*%*#)'")*')+$'!)(#$&+!%"*#*$!*'!)&#(&'%)' AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:14 MD:Z:63G12T9G16A8A87T2T1T0G2G1A4 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r3860 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 835 42 70M = 936 194 AGNAGNANGCATACCAGNAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGG (!$%$""!+')"'"$%%))"+($*#&!%+&%"+#))!"+%("$)'#$)))'$(+(!'!))"&(!&"##!& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A0G1A0T0C0C9G52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3860 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 936 42 93M = 835 -194 AAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCGGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCG @+=#2.5'.,B=?F,#)3>?>8/&?;78),,!&!F>&!1#0"7$;.#"0E5H4=#=4%+6E>HD8H5E'>C!C,1%*$(DAHHH:D&2> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A25 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3861 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36554 42 100M = 36554 0 ATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTACTACCTTCACCGTTGTT $&H@8G:1H2"0/.?6".!?6H&H.))+;%A864&&",?&:99%9>0+6H4556&CBAC%>0,,2*1GF/.E74(5!+->@=':6@GGB'+<,$(5; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82T17 YT:Z:UP jpayne@0: r3861 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36554 0 * = 36554 0 NNTTGCGCCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCACAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTT %()%'%"*+(&)"*"&%$(%###$"("&!#+(#)+%*"*((%"!"!*#+()#"+'))+&!+('($!'%*%$&'!%&'##$%*"$"+!'$$&$(#&)!)& YT:Z:UP jpayne@0: r3862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37369 42 115M1D22M = 37272 -235 GTAAACTCATCACCCCNAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAANAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACN 8?C75;G?.G#-+*,H#>#==<)9*5H77'+DG93&#)?2(C>2'H,+2()%7B3C(2&-D6;-0!>6!E4:;!$5'4HB!<0+3FHG58+>$$(D.?':29->?*<7"!$2C38?#<)6?B;,+-0?G%<%9=.?" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:16C32C65^C21C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37272 42 65M = 37369 235 CACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTANTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAANACA /FB*1-,DGC0D13&B382H025&AF.$G#BE>3C8$2*'822D*=.0D?:B-+A)'?3G=-*8567(2D!,;C4(->D@4/$0G18D*"(*6DH@;<7BA-4!0D%32D#F%??(044)F@9/773B1:F74$:$;;/"!==G4$E+B='/0-!$8?>(#%B-)< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T165 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3863 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43963 42 302M = 44265 478 TGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGANCTCAGCCAGAACGACNAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCNTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGCAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATAATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTAGAGGCCGTG 79''FA@#98#:89E.,#H==2%/*=20C2ED2(4F7=5A#+4@?;38B#$#7EBF.F9-(!*C=',@00@.GA7&2F1C$;.->>=3'+".)4F+9E"6'B?8GD+)'+AA"C2<=A2;BEH*H<.#01*?8D:'C?;!;1#?F')%<9FE,,#$$3-F:8$@.@3=4/#=."(2EF-E*!A#99(5$6!BA3"/"%E.+;-++&=;;3$=B1-1/?(B94:)%47A-9E,@G*<"%?E':CE0)C2+54.;13:&=:GD'HA%32"%8D4/<1.-7'>5%:77=%"5!;7>75*&:D+#G AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:93A15A57G20G52T51C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3864 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23038 42 129M = 22893 -274 GTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGNTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAC #*:6G:+<7#:'?F.$&C%74AC1@:9*=#/4FG9%4E427G39.+"++40"DE)*C98GAA/!%0B>>F?0+1,A)521G8:7?:HCGCC4F4?.&F!. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T95A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22893 42 52M = 23038 274 CATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGC D5-8><=6:037H1?<5,7(6H"(+&D/&868";@*).AH?%;056B-A48A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3865 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11036 42 101M = 10926 -211 TCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCACGCGGCANGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCGCTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTG 6E/92E=1,:>''@<$7D,#"2%H2>!B"3-"D2'77%1*D4-+6D4-?6E&0-G-.>>56FED?C*,#9C1!2C5-B:!,*.8E%F5++&?#!E(4)D<( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G6G37A25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3865 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10926 42 110M = 11036 211 GCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGA B">(')4@)$>&;!1%'=+;#4A8=4#,.>9<-)D"+/(.,C?D$("4%$36!!#B45>+E=D!,%.0:,AG#0F7B6H)2,G@3<07'$1;5D;-5%0677?.BH1(9B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18837 42 199M = 18729 -307 TACGTTTGCCANCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGNGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACANTNACTCCGGCCCGTGCGGA ('+$+'!(*&"$*+"*"""++(&(%(&+'%&+(!*$*+*$&(#'))+%(%)%&'))!'*"!##!((%#*+****"!!'+!#""+$"))"#+"+$+*$&&!$)%)")+*#(*$+)"(")$**!(+&!"'&&))+)*%(*!$#)'$""+!+%!&%%*+*)&%()#+(!&"&"'"(%#$++("**)(%$(&#"()#()(%$+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11G85C81G1C17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18729 42 108M = 18837 307 GGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTA BBB8A%$((CC":4!DE39"?$0!@4-7->45C05>@!:$&#;$36-A5-C!+)5),+?*,=0,AFG#5D:,.(@3)0./3CD% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3867 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 536 42 80M = 349 -267 TTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGA C?BB"$=54#B=6/!!$B9D#F)62?-%.#DCD(2#1#%$=:&$+(H(441)94%$,&,$582"3'G5"FAA<5!"%9<2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3867 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 349 42 65M = 536 267 NNATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGG %$3?B25C8 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0G52G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3868 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26519 42 49M = 26519 0 CCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCC A"8@(0!!1D;E"1(*D,'7-.>0()=-,9*)G!1!,&-A=+FD?79?F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YT:Z:UP jpayne@0: r3868 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26519 0 * = 26519 0 NTTAGGANGTNANGANGANNNCCANGTTCNACTNGNNNNACGTGGNTGNNNNATTAANNCAANNNGNTGNN #"!#$"!!!$"!"!"#!$""$$"#$"$#""$$$!!"$#!$#$#$""""$!#!$"$#"!"!$!$$$#"$!#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3869 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20957 42 84M = 20834 -207 TCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATNAACTGGCCNCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCG ),E123!,:A-70/G)6/D3-=0*F$C=%:C6@D*=;104#(2"8/-?,G&+D0@.*;/44#ED:4*#&%70FC#'(+*59 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3870 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5979 42 127M = 5841 -265 CCGGCACGTTCCGTGATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGNACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGC 8E43,)=%A#4=;,F+5E8AE-5*F746CE:>.0("2@@,+,6E."2)GE,A869H?39!!@?70&B;9&+%0'H#8E&F@FAE'2+E5*-G,"1GF-0;/;%D#E&'<'")8D''D36/(.-6+(4-/(A.FC/A4A85%.#C7)$0+3()G03*(8#/=A-G&$E2H)&+3C?B! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76T27G33 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3871 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35373 42 102M = 35557 228 GTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGC -GF>&.C8+3H'&9.EHC"<#E/8-6D-/+;F7%>7D8'$%=.G',,+;F#&76(=6$',:H851<%#=/B63(:9B+E5CD57C+)F852>&*7#8H*<3$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3871 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35557 42 44M = 35373 -228 CATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCC #DC898A0#,+'#7;186$H*:$*A$'!<0A(;#"029#8;4/+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3872 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14674 42 165M = 14563 -276 TTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACNGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGANCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACANTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGAT C!9&2<5"-G5A=%8<.792G$4>E%>1C/;H9&0H@,32!>)6$A:%G0;0%8373-,H+;;1D'$'>F7?7;-<1G.3+F+HB/F%-")C-1HDG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40G33G42C47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3872 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14563 42 97M = 14674 276 CTGGTGGCGTAACGGCCAGAANCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTG -*DD">B3!=(*%;?$4C$0)8F::-:6$+195A&4D6-/!-;5=6,D3=FF'104*E/'5=H)5++==#&18*'8D2@0B7'8!=B)H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3873 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47119 42 91M = 47409 353 TNTTNNGCTCATGATTATTTGTNACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGANATGTGATTTCTCTTGATTT !!((%(%!'*)('"(&*'+"(*$"&#)(%$&&#'&*$+!$%&+!')'+'$%%+#!(&$##)'%"%%$&!+")!'"!)')()''*"&%%*$) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1T2A0T1T5G0A7A48A19 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3873 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47409 42 63M = 47119 -353 CGCACTTGATCGAATATTTCTTTNAAAATGGCAACCTGAGCCACTGGTAAAACCTTCCATGTG ?;D3+$E@<;::8$;>7@:*(436"274$EGD-04>:)-C&+BBE-G>8A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A19T19 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3874 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18079 42 73M = 18325 303 TGGAATNCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCANAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTNTTGGCCTCA :DD/7F'%2+;%+-5&)6%=G0;??#:"($*%8CB*+:#F9HFBGC#H-%4<4>.;24G<,DB8;4-1EE-?A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G30A25A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3874 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18325 42 57M = 18079 -303 GGCNGCAATCCTCCCGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAAT 8;$#;'A*8%>17?'#)?<(,)'+,8%49E"/>">:/C.EH"<56A8;D6/%>)FA9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G10G42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3584 42 95M = 3710 280 TGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCNGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACC G10%1",G3=5=7306+DB'-D-H+:)'#409;)2%22?0/6E+DC:$9G1$>444CE('1>=0.):0*9;.7(C+&F8#/D(0';;''G9)C:F;6'8D(51.3E!%(?%%A9?854CC8&#AE:!?FF&CE$,3B4+(0#BD,,>1.*94'>+/D;HC2A>9"E<=6!1;E4"(;'9:5@H/"07G)@9GA9C&$65.'55B3)'E>*+D7&>0,-F!;?;AH"&(+2B;;)<:8?#:BC3<&@#?)/$G>1$<*)7E2<<@='E)>A1'6934@9044D"ED:H;FC;;H)3GA(*A4>%',8G9#0E265.G0(8H23?>/GC'#0D*&H)D6!*'E,6D6"G<29+7H?AH( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:44T3C135G15A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3877 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47650 42 59M = 47709 260 TAAGGCCANCGTGCTCAAATCNTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTA +:=9&/%15"@E+(&'GB#19:3@+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A12T37 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3878 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23214 42 67M = 23436 275 TTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTT +!"('&)#"+!'+!)++!+!+)'%*$'$$%*#)%%)$"#"!'!$'!'&'#+###&#!("!#!+*#!$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3878 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23436 42 53M = 23214 -275 TTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAG E%=H8D;E(=%::'9%GC9A?6,.9&'*CF+9<&6*#<>5,6D5;3*!B9'%H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3879 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47990 42 49M = 48039 312 CCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAA /A%7B@.7-HH/4(8":2;:$+"#8?@=?.4+/')C!G'9/@$//.A>C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3879 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48039 42 263M = 47990 -312 TTACTGCAATGCCTTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGTGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGAC @3.5$)5,*C%D8&GF>>7$+&6*%7?@!1):4H*9E4+$51+">15F6>8/2"!0B)2?#8)E+:8-80;0!4,@>G%)$5D*BE::.3?!,.'314"F$55&3,<."G!(G'$&53==!$EF2/0712+42(1<4<4G*E@#8'CH!@*(,=#2&28,A2H3@@9>89736&D$=@>>*69:@'',G6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C39G209 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3880 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33084 42 87M = 33171 176 AGACGATCCTGANTGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGG GA((*=AG21).A24<-914*@*/->-70'3G)-=(:GC5.A+4/:!%"GB?5-A!4.9C#H.HA->-%C#G-E#-"/.'5"%8%0* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3880 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33171 42 89M = 33084 -176 AAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGA >.1C?1,>1506:(5GA7$60B5-@<0@:?)H!D"&!!$!D/E6*:,.)/7:E8!$"B&D@G:5*G-4"-25E#.=D+0DD!2.A#;@%FF+H4A81+F/2@1?$9E;/(0;A"%$3%=*C5AE<'3@E?*)C4-AH-79#3%+'@037#3:.#(5,(;/G%;;%1#''3G.D..##68C3),0$#G/!'"$&E+HCB5E9&97)@.FEC<*C0;*20F?!$<.1E&.&8@)?:6%9H*7=F!;AD"?,C""2F.7&"B.;0-+.B$90;*;(>5#:;?(12?703F/-E+>'9-!%'H'105&EA>AC/@&':@-@.G:33A)*5"22@?FD:"9> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C106G74G6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3882 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25462 42 180M = 25642 250 TATCTGACAATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGNTAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTNACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCT <#7''76+:H127G'"'7?)<;A.*&3D9#'2D?%6A.:AFA@0%C"/G4*=$-9:;GC#-AGE$9%6=''1+#<'%,)5C&7766@C3EG,$*!>>D0?03?,1!?$721#AD3.$7C$2GA$)+,,BG,7A;F(+;C#?C/'7H7D=F$A&;$BE3B!D-9B55,F(';E:D;<;)G/'?>)@9*0C33/',C#65"8F9:D$F(%0G6+8;9$D6+*@B$'-1366%=@@>;9(@0E2$2")=&HF13@H')"C4E<0@?@&+#@HH+>;6C'7$2E56%E*"3)!1H-&1'??6*)#/&C@1?$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A39 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12914 42 310M = 12874 -350 AGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCNCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTNCCGGGCTGAATGCCAACCTAA H>267>!G$=!&8&F+9)G":,%C?69;7G8E)!-14<(1#E>H?6(077-):4-30A5<@BAFF!)%8E)+A*61;;$=9#+%9,22?6&A#&:-*)A/%C'H"&&-)-@/(;)$!,;C0($33H#19:'@6"5'(6D9D;9:A$5G<<1BCG9$>(16',$6!AG00@?/A%F0<&%;/B$$:!19((F#8@HHC*1E#C"03D5B!DB9,?;"48*0.B>6<$B&8*-H'33-*F2')!B>/0E+@A0!.2):?48?'"7/8A+A&%$8<*9DE7A+4)4-"&H?A?CH.:&D:7G+-9G(3(+=&4D7?./F,60$G&/DD;H>;@<'B3AH)4'+555(=.D/?)B5$H&5F#A'6!<8">9(531BC')(9'*!:(F(G9@/(3//&F!0'A16&6C<(7;=$.@'.$4( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:116C5A23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3887 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22743 42 71M = 22595 -219 ATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTTTC (*&)"+#(")&*%*"+%$$""#()+%*)(%)$)*(&#(!*&*%!"(*+*'*&(*'(###&''#'$&+("*% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19469 42 64M = 19252 -281 TCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCNGCA ;%.=+:16)$'?,*,;@8H5GB?HD<0F07(F4#?>C8E829-0?.:B@1,);42!41,+5))* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G59G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19252 42 47M = 19469 281 TGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTT 0*H58"AB8.':G2E/C+.!$$>482%1,AE%+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T2A8C24A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3889 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11190 42 40M = 11410 270 AGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGC "71(<2&1=#:*D?6,E$>)H32E?#*0'?1";CE@24?A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3890 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6555 42 102M = 6385 -272 ACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCNGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGAC @.C8D;8G=?2%;$,+H;F"!9.H5/+8D!3:H19:6!#,(4+-=D+0C%9CE?;>?/=:('/ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:0T10A51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3891 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40004 42 104M4D68M = 39910 -270 GGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCNATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAA ,+9(6C2@*E,2HA<3<,;:'35.3F0,?!(&A1/C8,<2E?*@?B.G?A;:7F,,0"EFG*70)5/?194"1G8@A(-/@3@<2-.>@7:-'-A/5.9B*'!2&C@CC,B>E0(%=2?59?H".)+%#6)F#E1$;7,G&B*!C(#.-3A7E1!&3B?!1+&HD%D375*= AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:104^GTAA19C48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3891 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39910 42 94M = 40004 270 GCCGGGAAGAAGCATCCATTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGANGCCTGTATCC .(HA9:<<*&/E+H0B0/-#7:-C*=,,6+A6(3DC,5*(&66F?!)6E5C@A5%E:=33>#:6:B6!,::8?@@&EC>D8,A-4&2->&.1!3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17G65G10 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r3892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28872 42 63M = 28953 215 CTTCNTCCNATTTGTNATNCTCNTCAAAAGNNCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTT )$%)()"%"($"$#*%)$'%"*('&(''#("!&+(!+&$*'#**)#%%*!($+$+'#)+"%+# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4T3C4C1G2C3T7G0C31 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3892 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28953 42 134M = 28872 -215 CAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCNGAGATGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTGTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAATN :E-E4$E.F*A$)-*-"C5FDD0#AH.>8A2B0(=70>96/14C+G61&A1#<+&7=@)"EC1(HD'(H.6/E7/=3%-;+?1H-C'?>F2<>=>7;H7;4%.;89>/3+>=/>C>DE0+++# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25G3G39T62G0T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3893 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43776 42 46M = 43562 -260 GGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTNCCAACCAAATGT A*DA*.#EB()/1@6+=1*()7(D=8/DC/$%0;.!@"G0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3893 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43562 42 73M = 43776 260 AGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATC 5,B=BA'56#7;5=<<#"!C*<&B64-2108"(:G#5.D38CH*'D0B4/0%>9!2C"6A4.=A6)8*5*:'! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3894 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33181 42 41M = 33269 232 AGGGGGTTAGTGAATGNTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTA :27"%&."+-<++<&"5;D.9=:*6"9,%@&?-?5A>2&&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3894 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33269 42 144M = 33181 -232 TCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATGCGTTCAAGTAN ?&5(=BB+32";-:7/"?$,<=F5DC;&>70AD(%(-'@C0(&,F9;@;G;5<<"&=A#G0*+"$GB:%=/#-6?:5!8"*+BH8#D6$+@5B5BH(C,$$=,*.(B21B@5A+@D-+,*+FH141B@F*,D)+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27T10A54G0 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r3895 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3744 42 41M2I167M = 3952 302 NCGNGNNAGCNTNNCNTGCTGGANTGGTTAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCNGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAG %(*!'!#)$#!'(&"""%*'*))"&'$'#+"%#%%(*$')*#%(+"$*!'*'&(+*'")#(#'#)))&$$%+('(*(+'$%!$$"!#)'"'+(%*$*!'$(#"&&"(&!$$%+($(*#&#+(%#"('%'+$+($#'$'!&)!+)+$#&$'()$'+*'%%!)&+"+&%*'$&+*$*$(*)'$+'!'!)*(*(&&%+$%%))%+$#*(!""# AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:15 MD:Z:0G2G1A0A2G0C1G0A1C0G6T4G129A49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26061 42 318M = 26379 437 GTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATNGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTTACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTNTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCAC 0.?B+>!(*<:->A4,>#!%.*9+8(.3CC(4($GFH7A+'.B.%2HG$)/+G-&!<@(DH*@8>06#E14?>#C-#<"'&??*8,'#47A)+2B%"5G841'>G<*<(5G>0*@*#E!BC!C(?-,.$D@6E&E#466B=&;(H-"/'4#(7G!CD7=DG&7&!!8AC98)F6(1!@(65%7'0"6)2.76:3&=$&!*DHE!,6C7A9;G:; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60C160G42T53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3896 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26379 42 119M = 26061 -437 ACCCATTCNGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGG $803:5:=742&$*">$1%787')$53=4(.2EA+*+.>(:/A@0$!=7GE9H5!;-C'F98*&(B<2EC> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C110 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3897 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42575 42 48M = 42487 -136 GGAAAAGGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCTGAAACAGAN *4):,07<8%<+8-<&5G,-C&"E!;1;DA3H9G9F)4HH@"*%5,<( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A31A8A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3897 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42487 42 43M = 42575 136 ACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGG 3&D".'<253%*F@H,>5$?=<4"H(HB/-D/,!",7<=)3=9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3898 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15914 42 124M = 49 -15989 TGNTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGNGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGAAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCTGTTCN %'(''((%$'%!)&%#+#&()&'&#&*%+$$$))*$++$+)*(++&#)$&)&%)")'&&&'!#(#**#)!$+"!%*(+&*#)$&&+!##')'$!*%'*$$!!+"'+('&!(#*$$"((+%%'#! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C30T27C56G0T2A0A0 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r3898 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 49 42 64M = 15914 15989 AAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAA %%0F#2.A.G0'5EF8%7D%:G6#F(6'"0=#B/%50)%=G22,<%!81/=)+-(+48%B+.6D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-12 YT:Z:DP jpayne@0: r3899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16740 42 121M = 16580 -281 GGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGA DE<9':62)+7C*&-H6B<:;"&-<%(/$HH%=/B=F+--@"3=:2'!!BB85H+?-H:<-*!#>7:*19=,!>@71'F>!+8'87D7'7>?&!7+B6;+%C9=1)A45G/?3.#H6<3)2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:119T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16580 42 41M = 16740 281 TCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAAC A1A.)<&0="62C0/92?/-?*2;5HB:/:77,FH8*D"A@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3900 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25780 42 122M = 25929 231 ATGCANATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAATTAATGACNTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGAGATAGTAAATAAAACAATTGCATGNCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATNTTTCT %&*+$%#)#(*$$!&(("((%")%(#)!$#&%&$(*!'*$!#*"(++&""'"%)!(*%())#"+$'$*#+()&!%#(*&&#")+&%)#()&!&!%'#+!%""'$)!#+##$)(!&)))#%'$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5G26C7T27T24T22A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3900 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25929 42 82M = 25780 -231 ATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATN F#'$>0(7%%CH!?A10/&@%1+-@0,-31#7(9/D?3>,>32)20D1&14HB>H&3F*6$6/&1=<8-:)*").C6-5=AE>.3F",F0)&*$6/H?/36:/-$; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17970 42 135M = 18138 225 AACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGGGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAAT $+(!%!&(!*$#$)"()&"''))#'*')"(!"$(!#&+*'(*"$$(*((+)'$!)((%"')+(***"$&*)(!'&#)#!$("*!*$#'+&'"+$'%%+($"%#(*#(*((%%'+#++))!!$$%%(+%*#'"(#& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3903 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13713 42 147M = 13613 -247 GCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGATTACACCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACNGTTACGCCGATCCGGAGCAGGNNGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTTCAGCGAAANGNG )(&+"+""##$#&&!(*)#$'#%#"!&)($())('**+%%(($%+*!"*$&)(#))"+*"$)#*)()#*#!*""$'+")%*#$(*'""%$$%!(%+#&**!)")%$''$$$!'*+'%+!(+*%!&%"%('!&%#)%*(''(+"&&!) AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:38T4G38A21A0G28G7C0T1A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13613 42 40M = 13713 247 AGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTAC 87H&2B/#H?H-GFC,&@943C@/D-23G&?:1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3904 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29274 42 174M = 29448 312 CCGGAAGTGCATTTATCATCTNCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGTAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGG !77>H2A0"B8$!!*)4E1DE./->:@(?+@/;$#@,GA6"0!+%%57G'-HC224!"A7-53H@+@$?21&$364@H-&A,A#"!B2D@./>9&B9(,?;(@0H62>;?A3F8%&H"#3;/92(85!*%<>/=(#9$.H*8"%.>;2)"DC($'8,6.A=<6>3< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T20C109C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3904 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29448 42 138M = 29274 -312 TATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACA 7?39.<%<7%88A4/-=%5:151G!.)-GC@0.G?,!F?>9*,?!821+<-+?AH%4>/=#-'"F)7,'F4-??FC.8EGH-*F?"GE$!E->>>;(5?89!)45/&<+,+BBF!<).F?@2D,/E::A&6"7(#9)) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3905 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11069 42 57M = 11325 324 GGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGG 26@/DDEA&BE*':,9+H2*7/%E/9'A.5>9"692)+<@@932AG?@6+*G9%.>! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3905 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11325 42 68M = 11069 -324 TCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCNAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGAC 19!#H33%.9:@=93?HF=CEHF'34&H.$?DF6E):003/B=0)4.-G@69&9'?%9#7::AA:E;$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3906 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1357 42 58M = 1151 -264 AAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCG /F9!/?7E5@$$;97E5!#H)9:$3(D>),E;+(G>%$C!-FA*HC+5,G3)2CE;"47A?4"CAB4&A/*=!,A-G+0:*G"&#,>3%FB%$:5$D%%G,#G0+D;3G=1)#"!'7+%,=*@G=+!/!/)9H2/GG%+7G+<53*416E"38,<<3:<<.&:3H%4$8/##@#B49C'2$#2A:"F=AHF+1AF!@(75C&A8>)DB(@;)EG:=%:E"!@;1F*%#9/+H-7(C&<-3510?80; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3909 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7277 42 158M = 7530 316 ACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGGAAGAGGCGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGA 58?+-*@2?G)7F:*F:?>;=?*B>7-E9C6?@C,G4<>8$C1.!&1(7*!67+6!DH224*4;GA%;5A=0-6:B9C,<6A#=%-H<0G&(E1,GA142H==A8D@!, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A6A114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3909 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7530 42 63M = 7277 -316 GAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAN "."DF/.+H576(<8B$>)C'.=5'AE#";?C0-0/!.<09'/>8:'$H6E.68,0G1@#F3;+C*&H0274/D5G8>61#-"=?C;C9$$4$G)B93)E8"50*7%;)4.;3%=(!+8+(:9*6/+""+8D=!C6&EE9+?$&=H2H>E%)5<=(<8G&?F5-%9;AC((9D4+DC@!58(?&B%B&0?$:;+73>)/EG"4,31 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A110 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r3910 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32030 42 50M1I130M = 31870 -340 CTGCCACCTTCTGCTCTGNGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGACCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGG 3H!9(;+!$$->'0A#-.7+$@C'FEF7((@81&&!%7*)?!1'G'B!50!$;:056'3?&/D7.9E@$-2G+2)?;>!'C/=%*4$'8",H6-(%9<,'41(GC-,>2D#<:.7HB%H=#;")>F5."@,)1$BA@)3<=F?A:.G<&)(2;G@+*2 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:18C25G11T123 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3911 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18377 42 187M = 18564 281 AANANGNNNNTNGCAGTGGCTGCGTAAATGCAAACTCAGGGACNCNCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGNACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGNAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCG )%#)!)%!!#(*&)*")(*&"(*&(!)**&%"%&&"(!()('#!&"+'+$#*&*)+)&')')#%$'*)(#('%$&!&)#"+')*%%$(!))%'$#**%"!)('&'"(*#(*&)('*'+!!)*$+*&"!)(&&#"(!$%&+%'(+)!%#'#$""(&)*$*"()#'$&(!!'$*$%$"#&"#%#+*!#* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:2A1T1C0G0G0A1A0T7A1T2G5G5C5G1T39T74C26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3911 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18564 42 94M = 18377 -281 TACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCANATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGN #+'!%!($'*!%)(#*$%!*)!%$)!++#"$!($%""("*#+'$&%('*"!&(++(+&*$%)+#()!("$$"%)!()#'"*)+*))*(**+$*! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34C4G53G0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r3912 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43499 42 63M = 43499 0 CTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTNGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAA G>F1'B-'=%'#G!97D%H<92!28C%//2=!8,D0<3B!"+7!15@71970"'#""5(G4G4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C26 YT:Z:UP jpayne@0: r3912 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43499 0 * = 43499 0 CNTNTTNTGAGTANCNNCNNNGGTCGNGGTACCAAATTACCTG $*(!%'"$"'&*"%*#"#"$(#!'%'%&(++!#$"&!'%*""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3913 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26152 42 56M = 26236 245 ATTCTTNAGTCCAATATAAAAGTATTGAGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTT "#*'$*"$(*#'+)"!!+#$("'+%&"+')!#"$#*&&*))*$("('+($!&#**% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G20T28 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3913 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26236 42 161M = 26152 -245 AAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCANAGAAAAGATATTCATTGTTTTATGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACNCATTCCGCCCGATAN @8)BC&&8B=+B8>,0<'=A960-@?2E)'1032AC&=557=?#;$-(<9=2@*./9(=).9=>+"5;'5(B%D";19-+=G=+)*9H(1(H0@2.;./#)<7F8@AC=;92(2G!,&A+4F9(%?.?0>6$#7D+?!-<%G!1*(1;8,;&:EH<4" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:70G6A14C52C14A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3914 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20847 42 49M = 20913 221 CGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAA +6"6>)HA;E:*=G1:E0F''9#2H8;ED AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r3914 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20913 42 34M4D117M = 20847 -221 ACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAAGCGAAGANTGCG *#(%)$$'("*'*"#$$$!!("#'!*&"')!')"('!)'$$)$*(!"#%'$')')!%&%++)+#+#"%!!!+$*'"#("&%+)&*!*(!&#&%*$#)(++$+)%'"+$&$++!#()*((())+$''#'"&$+""+#!"$%((""#+!(&)) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:34^TATC105C6A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3915 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11912 40 109M = 11801 -220 CAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACNCACNNNNCNAGNGAAGCANGACNGNGNANATNAG )*%)$!!++#"'!+&')##)(#*$$%"&%'#!(!#"#!(""**'"%++'*"!#)("'$*$&&+%'(*+%!+)+#")'"%!!%(!#*%'(&#(!"%#)*$'%!&$%"#(# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:74T1C0G0G0A0C0G1T0G1A6T1C1G1A1C1A2G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3915 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11801 40 42M = 11912 220 AGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGC B=E4D$4="(H*H.>5)+:%4,B8;,B)#F81)75A8:C*+4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r3916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30796 42 42M = 30502 -336 GCGGTGCTTCTTNAGTACGCTACGGCAAATGNCATCGACGTT -1G6C@,'89$"*$$,,'8$"=1AAC1.<@;:A,@&)3E?!2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C18T10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30502 42 48M = 30796 336 ACTCACAACAATGAGTGGAAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCA D82=A%:"0.+>C&C8:9;E412)?",H%-(GB"%1,33&+(84B8.% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3917 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1909 23 49M = 1909 0 TCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATCCGCTTATANAGATGGGNTCA ""&*%(""#)&%%+$**)$(!%%!+(#+(&&$"))$!!"*"($#$'&$' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:28G3G3G0G0G6G0G1C0 YT:Z:UP jpayne@0: r3917 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1909 0 * = 1909 0 NCCNGCNAGTGNANGCTNTNTNTANNAGANANCTTNCATCCCNTNNCCNNNCNGTGTNCANATTGAGTAANACTAGTNGGNNTCNNANGANNANACGGGGGAANCTNAANCCNGTNNNTANAGCNNNNNCCCTGACANGNNCGTCNCNNNNNGANCCGANTNNNCNGNNNNNNANNTNCANNGNNANCAGNNCTNGNAGNNNCCANNNCCCGNNCNTNACCGNNAGNNNNACNAGATNNTNNNNN #$$!$!""$#$#!!"!#$"!!#"$!"$#""#"#!#$"$#$$$!"!"!"!!$$""$$"##"#"$!#!"#"$##"$!$"!"$!"!#"$$"$!!!##""$$""$##$""#"$!$#""!""$"$#"!#"#!"$!!!$$$#!!$!$$#!!!#!!!!#"!""###"#"""$!$##$!$"$#$"!!#$##$!#"!!#!!#$$"###"""#!$#"#$#"$!##!"#$""$!"$#"""#$###"#!!"!#$### YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3918 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41316 42 55M = 41371 338 GGGTACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTGCTGAAGCCATTTATCGAAAT :'72>@,0"B<1('".&.<2@-(6@==:=.B4?"6@2<;F)(+)%?C$B!?29;+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A30T17T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3918 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41371 42 283M = 41316 -338 GGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCNTT 43)=AG49BA=G+E?."&3;3<)!19!,)%#)(;2+,@>G?1,#.!B*/,6;/--!';G@BE>7+6:#C"'@@8:-+:5=;%")FC9;@!1?AA10;E7EF;&4F$/52E3"/6:C2!38CD"-5A?)A;'1*16*#H*CH+%('9B$D3''0&,#B60)><2HH?F&'G$#<6;5!@5$1BG8)@DH0?*12=';D%*#H;C;&2.->+?3(42#DB;'.9B(%+DGE.!26&@*>-1432(&=?7/4!%.7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:280A2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3919 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1396 40 149M = 1314 -231 AAACCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCNGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGGGACGCCTTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCC !$((+("(++'%$#%"&#('"#$($!"!''+"!"*)#*"#**+)!"!%#%$)($%"%*+)%())!!**#*'#)"&!$*(((*$!*"!"")'#*&"%$+)&'*%%$)+#')!))($%"##%!&$*!*&'#($"!!+(#)#%!#*"#""+& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2T51A23A6G58A4 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3919 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1314 40 82M = 1396 231 CAGGGCTCGGNNNCGCNTGNNTCCATCCGTGGCTNCACGCNAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCNTGCAGCCAGTG "*!&%)(*#!*(#!('!$$$%*)#%##&'(("!&!+%"'&&%#!$)')'*%"&'+'#"(%+*(#!*'$&%)+$!$$'"+$*% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0G1A7T0C0T0G2C0A0A0A0G13C5C29G11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3920 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7072 40 60M = 6919 -213 ATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTAATGGTTGTNGATCACCCTG "!!%'&!*#)(&+)""##)$!+*!%#(#++()%*&)%)#+%'*$$#)!&!*!'"$"%&'* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:40G3C1G0C1G1C1G6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3920 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6919 40 18M2I64M = 7072 213 NCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCA !H$522@H02FF-*7DH6>>;));AF/1?8E/?4?0C20D?E!3!?B8 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:0T81 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3921 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43429 42 189M = 43619 255 TCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCNGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAG (#62H@+D*0FA7!D/=>#A6689,7E@()C2"4)GB5"4D4+BA12+D<+:!3<.%#0-%(;;;0)&3.-''C;8>.7(/;!+B*=%F,C5C;G1)%:(D1),FC+0F<3C+73#G=393$-,-2@6=4@BAEC8)*.=25C&5'+=!E!@A8??/#4H/+/4@,D-?682)$%H4%;1%AH6!-39; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G102 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43619 42 65M = 43429 -255 TAAAAAATATGTCATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATNCGAGTTTGGAAANNTNGNTG *)&%(*&+"#+(#$'&"$#&*$)&"#)&'''#&)'!&+'")$"%&*'*%%#)#*')'+*!!'*&# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:12T31A12G0C0C0A1T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3922 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28421 42 130M = 28421 0 TGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTTTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCNTCTATGTATCCATTTAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGNTGTCTTGAAGTGGAGCATCAGGC +$'%"')"!)'!#!%%#%&!+''*"#&)!+))&$%#&+*$*%)&"("&)#)#)$&)*)%$+&'*$*$")&+)#&&$('&!$&#!(##'*'&'(*$!$$#+""+''!$"(&'&+)$%#!&&*(*!!%*"#* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25G37G14G27A6C16 YT:Z:UP jpayne@0: r3922 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28421 0 * = 28421 0 TNNNNANANNCNCNTTAATTTGCGTTNNAGNCTNANTNCCNNTTAANCNATCCNANNNAANNGNNNNNGNANCCCNNNATCNCGNAAAAANNGCCNTNNACNNANTGNCNNAACANNNTGGATCNT """!!#!"$!!"$"$#$#"$#!#!$""!!!#$$#!$"#!#$$!$$$"#!"##$#$$!$$#"$$$!!#"#$$##$$!#$!$!"$"##!$$#!!!$"$""$!"!!"!"!$"!$"$#$$!"!#!"""$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3923 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18278 42 102M = 18433 244 TGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTANCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACNGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAA *B7"*G(..'.::2$+??>(@7.(!0H:%C:=G+=,;&<*6D@*&748&'F6>C4D29A*%F89!C9(H@!2*3$&&3H?(&,4F3%HB,CB/G05:B7BED AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42C35C23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3923 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18433 42 89M = 18278 -244 ACGATAGCTGAAAACNGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGTGNCATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCC -5>%%C,33,)*;'H.:-HG$$#$B*,G#,,G(?&+-C(-;@:)71=*73GB/GG;A!/85:'32=A+2@>6H9=+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T40G1A30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17922 42 93M = 18118 249 GGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGNATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTNGTAAACGTCGAGCT ;83(6>>9;G%=-5;'=501B1!2!.1=)F>(37G$$<+0-:!A?>&G/%.D=;*@(!F1,2?H>;C%;:$,.42)&9&*>:14'6(B@B%30 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28G49G1A3A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18118 42 53M = 17922 -249 GACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGA 'B)33-C$4:%FF+%,/08,CD+7522.+@G.DG7($#G%+),-FH>$$9:&H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15522 42 84M = 15606 313 TAAGGGGCATACCCCGCGCNAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCC 6C1--714285?'/?C0$=$%E71,*#=!@)56%=C%D4+,CD>+6E@01C-!4>:.9+0>B1&9C=*2/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15606 42 229M = 15522 -313 GATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATTCGGTGTCACGGTGNTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGAC 4:'-,6C8B1*,#(!75D(;5,&7G:>-7H>%%?*A6G*4G%;3C>,+%>83;F3CEG'303):!(362:?0?'52584!FEACD2%$E;&80&,4/G(C(G,B-C3/&:<2*-C?-$G#=/DA*7@>4./5.)% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83C13G131 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3926 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21590 42 94M = 21743 260 AGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTA ;A/7!!HE'CE*;6#C7+A>/'?C2C!'#B#+++)A4@+1$/A"*);(A.!*AG#,:B;6+:*@-D>.@C0)74)HG9$'F<*#.51>D=" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3926 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21743 42 107M = 21590 -260 AGGCNCAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTAT 7$)E4G"@3.=@=19ED(#6*:4+'/#'CF@=##7/:-/DEE>"")C7.?9F1B/$1()EB($%+4=%#3"<@*+188,)7?1:-$>A39-!>3B7,*)<@3"F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C1G0A102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3927 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23685 42 94M = 23942 317 CNAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTANTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATA %#8@12"=B?*6><<+*7$$%#@!D+$<@#C,'2'&9*,&,3A131?>89378#*$G:*$E%D)29- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3928 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46984 42 63M = 47084 237 ACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGC $6:.9'##$AD:B&.3B#E1H-76G?)/7:3=#CE6C+:#)C.(8HF/*8:#HA)A21$-9BE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r3928 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47084 42 129M1D7M = 46984 -237 AAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGAN G3/9+D-(649B>"H*<%'C)$0"-)$E5#"$"5D3/56.41.F=5!+A'!!F&F&*@5:A7;C.(286E1*%("$>&0B3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3929 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13429 42 111M = 13622 240 ATGCAGGATATCCGGCAGAAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGCAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTT B5"(((!.9=)49.*3"8,4>07-*!>E"?$,3>48F7(B7;)2A-E(*.0C97:9D1)"%&6!;(.,'=.:;E/H$CEC$*-$;*;(.1G.$@">/34:7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C77 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3931 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30317 42 106M = 30470 255 NGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTNATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGT #D.$;:G(!F*E5&+=1#95.C?75D,!='#1D4';6AB:%F,G5;00HB,F>-EE.2$F>-5,4@?%7C+=$-7AC4H#?#,(,$BH"#9@,&>?5("1$)@+B, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G66A38 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3931 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30470 42 95M2D5M = 30317 -255 CNGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTNTTGCTGTGTCGCTG C;GH)-B259%G+F(F4$>-68$E8,'.#!1F#:$=3)%%8%>!47'&+CD+,=0C;D,,//%A8&;@3>*7;=G7E)B5=4/(<;9)3#)#$)"-DA?D AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:1A83A9^TG5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3932 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31550 42 46M = 31331 -265 TGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCAC A@#4@D425CB>,&F6FG"E@FE%/%$0;-20,!'!5>>GH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3932 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31331 42 58M = 31550 265 ATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCCAATACAAAACCAATTTCAGCCA 011-E<,(E:21#0-*3H$6G'#8:G;7/E/C*B3-0')7-!+6(>8E7GD7#=<+D5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3933 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13807 42 170M1D5M = 14049 302 CCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCG 323@+%4G&%8+<"23/H)5?+22)"+."*92D!;8:'!8*.:-<@6,:!57?#2;%.F71B"G/.1C/";&,=+(CC"E*(+7%.*79B?D-,A6$-F%>/2$'5?8=,18"%E6.')58**E AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:170^T2T0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3933 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14049 42 60M = 13807 -302 ATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCAT /HB(6)4,&;5G3#'&2;+*1+H;750F&GD,A:%*+"D88*HE:&777?FD:B,;;G>+$?$/2CD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:89C9G18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3934 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4549 42 103M = 4681 250 AGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGNACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATTACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTC "68/GG1GED%-+0.;;=3"B:@%<+D7*<,6387D#!(BB7/#/$5)HGA4<*1A8!3%D0>DB-)EE:H#86.0*'<& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G37C31G32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3935 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7863 42 124M = 7987 234 TNNGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCNTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAA %!!('+&%'!&)'&%*+#'))$+'!"$+&+'"+!!+'%'%)'(+$($+"%+!&+"!)*&%+*+(($'"*(&&+(&*(+)'%**"*)%+'!+($+)"*&!%"*'$""$&#&!&$#!%))&)(+!" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G0A31G27T61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7987 42 110M = 7863 -234 AAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCNCAGTCG !)'(**#"%'*&#%+&#!+'")!#')'&"'#+#(%!&&&#*'$'(+$#$%&#+(*%"%'%##((#(&+)+#&#*"")('++!"*#"&!&")%%!%+&)"(('")'+#+$+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103G6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3936 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7270 42 372M = 7642 431 GAGGGGGACGAAAGAANAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGNCGNGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATTCCGTNATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCT &%%'$+!$!'(!&*#%)('$%$*'"(%')+#%!!#'#""'+*)!&#$*)$)%%+!+'"'&"#!!))'!"&'+#*'))&$"+#+#"("")&!$#&%)&+%'%(*+#"*!"$#&'%'")))*'&")'+!&"'#%&'%*!!!$#*!(%&&+*!#''+)"#)+&('""'"&!#'*((""$&++!!($*%+'+*!)*+"*#%$&&!#+')'))*"$&$)+*+$("%&&'!)!)"##%*&!'+*%!$#%(&'"!&"'#*&%*('#"*%%+$'+!$#$(#%*$%(*#"''"$#'!)+#)&(($"&%!*"*)$%#"$#'(&!#%$)$$)$%&!&+%"$$%%))%()(%(&')(()%!*&)(%)&*""$"!$!'+*%)&() AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C13G79C2G51A4G215 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3936 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7642 42 59M = 7270 -431 GCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCNCCATTAC :8A#8(5.<$9@;-#H*:@F#+60G5*=-H@=401*BE-18'47&"D?!::4537/F<6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A7 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r3937 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38121 42 76M = 38295 258 AAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCG D83$<(-GF+861/,&/)=0(#2?$&%<4$>"C#%%%/=.'@*'0#%3/@6--C%>75%#10ADE((>@H,B0,/: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3937 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38295 42 84M = 38121 -258 CACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAAC H94>:0?A80."$A4G..B!HF7B'?=+=F3:@8-$@D?G!9.2@!31&747G71E;C?7.2H0;*'DA$5,$34'5-29$.+9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3938 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48423 42 56M = 48219 -260 TGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTNAGGTNNC $)++'#*'***%*"&)('&)(&('"&#"*!*+*&!+''+')!&!%&')+!$(%%&& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:48A0C2G0T0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3938 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48219 42 86M = 48423 260 GAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATG F21-78AHCF+B(48CG'@6'0G5B@+9A&82:&%F06=.8=E7/79B#&$C98+,1-?>0F/8&G5$*%-$9?H!5E89;-&8E2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3939 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16203 42 44M = 16247 338 CCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGA <>"/!$G-G.).40!=7;7-7+&*A63B$>,D$=!-'8)='$*7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3939 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16247 42 294M = 16203 -338 ACTANAACCCGCAGACCCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGNTATGNTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTANTGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTNAGCGATTTCTGCTCGGCGA C"ADG08D?"=8F='/7B9!6%.;/:;*'!EH>/7%,4)$>=;)D=6E">-!7:;3.%'%E#H?*GA(.?7=E!9<;/2?&D+C%-?)F20?C(#35'/C"5<4/"&%,8H+D@1>G;;%E4@/+E=HF-1H$0E'A$B:B,(!((76B)47;-D'C*'7B6H?+(.@,!H:-+4D?;:7"(<>030H5F(,29*';*0)<*#G65;&6!E?#/AF&71!@)AD>9+,+F+A.H!G;.'*G$C23!D*,1G-$A635D=;$%>+):8%H-,&6B:?':$"!79+/'*-FCG+,,>#'88EH24$?H?/ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21G26A16T52C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3941 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33253 42 50M = 33400 255 TTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATATNAGTGGCGATAGTGAATTTAG )/18=47=>5:A$5!3+,&H&#.#'A"@G3";F2;+"F1-BG%G9"><5' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A0A20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3941 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33400 42 108M = 33253 -255 TTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACNGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAA @055/:E#'F7G9*?@8;<45#2>,H%=HG,=,$:@;"C+@#5HA0H)>.;F0"!"4+<6@:D'2GC$26;@.);+*2"9>8$CFF,?5C,='76BF'.*$=(%4BC' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A70 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3942 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31989 42 91M1I77M = 31919 -238 CATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGNATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAGCAGAGCGGCAATAAGTC 69@*C./A7868!/;==1(<'DH$?4(A')9$""6<63'-A(%'*BAC>B?F2@'-?<>,4=C+;@;>.5H#%!A68:+B'A)7%2<#D.&8&;1D7*G&@B93%88<2;$>-;C=/@,31,.>$@6>B;,H<*4+B-A-0,9%8@1@$3;,6 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:97T28A23A17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3942 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31919 42 70M = 31989 238 ACTTCTGTAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCA A6G>5A@'')EAEF)70H%E=C*E2$.=7)#5;!72.C%0../-&?A4$!"1"<6GE"@9*5!+2."5:% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A62 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42944 42 172M = 43116 247 TAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGTAAGGCGATCAAGGCAGAGTCCCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGAC %,?&'!(=*B%;*/@#HC#E*39*3?D+C!F049-GC$08,D(D-%3DA(H<9&A+:(3)0:A+4C'D951F*/@$>==)0!CB6584(81.'FD9?@?=@52*!9%&+++-?F35G%$2+H5;8:?0@1!/',3=37;6H86:F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C19A121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43116 42 75M = 42944 -247 TGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACG 8(FFC$8-&?**D27::H.;0"4!830HF',)&F+!&@!$1HC:4/2.F5G+E6E8&#(%C8;70B22E>3=#GB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3944 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23880 42 61M = 23880 0 TAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCANGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGT G0A2/%H6+#2#E"4=7<4H#05>-6;'1/!<'>A7&3!9'/+G$-?!+6-,!.E)=>#>( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T36 YT:Z:UP jpayne@0: r3944 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23880 0 * = 23880 0 ACNGNCNNNCCTNNACCCTTNGNTTNTTANATNAGNNTCNATNATNANAN $$"""#""$#$$""""!#!$"$!$#!"$$#""!$$!#!"$"#""#!#!#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3945 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42310 42 83M = 42310 0 NCNAGATTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTNCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGA #&$&!(++*"%)$((++#)*)%*%!"('"*!#$("$"%$+'#'+#$&''%$(('$+##%!%"+%##""("'#'(#)#!++'%! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1G2C36G40 YT:Z:UP jpayne@0: r3945 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42310 0 * = 42310 0 NNANGNNCNNGNCNTNCNTNCTNGCTNANNTNTNATCGNTAATNNGCANNCNTNNANNNNACGCGCG !!!"""!!!!""$#$!"!#$""#"$$!!"!"!#"!#"#$#"#"!"$!"!#$"$!!""#$$$#$$!"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3946 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25302 42 263M = 25565 394 CTANCGCGTATATTTCTAACATTTATCNGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCACCGCTTTTAAAACGGTTCNACCTTCTAATCCTATCTGAACATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTGTCCAGAATTTGTCACTTCAAGTANA #"(#&)#!#*+((+!#%&*)"+$)"+"'!&)*($#%%++'&%%'&$'$&)**#""%*%%)#")"&#&"*!('&!+$&!!*&!#(%#&'$#*%))++*$$!&)$#+(#+&$*+'&$%#'++$'+!'$##'*"!'$%!+)!!!%(""*&!!!"(%+"$%#*+&&'&)!*&$%!#")$)"()++!*('+*('$**'!$#*#&$*(%+#'&!+'!#"()+*(&"'&%##")'%$*'+($(+#(+!*))%'+'"#"''"*"$&+($&" AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G2A0T1A0A0A0T17T101T17G19C69A23A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3946 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25565 42 131M = 25302 -394 AACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGG #F%27H(&)1FFG.(!-G=!B91'8+6/>B0?G,F(7=,6(B$D>*HC.D:=@<.(H*+DAH,!!#;:DAH->,'@<46/%F2?@2G0$;(@E&"'C!E,@,HB+43D$-!+>;A31@:E:#6;H361B;9'=':B-"39-"B'(+=E;4$$'"(.&;&G"1!?+>GF AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A9T78G9 YT:Z:UP jpayne@0: r3947 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45464 0 * = 45464 0 GNTCATNNGCGGNAGATATANNGNCNNTGGGTTTNCAAGA $#"#"*$"%%&'!(*)%(&&!!'$)!"*)$&%$%%&))"& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3948 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20006 42 75M = 20145 202 GGTGGCACAGAGTACGGCAGTCGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCT '#+)++%%)+%&'%'#**#$%!$)"*((+'#&'(("+((++(&(#%((#$!$$+$'$)+')&$+*&"%#"'!%&) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20145 42 63M = 20006 -202 GCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGT =<*E.,B.)A87)(A6!1+!<"G+&B*/F8(D>))@9"?;:5A-'(C@)"%/=5+;;F9G8)C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3949 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43127 42 174M = 43057 -244 CGCGGTACGGTTAGAAAATACGTTGAAGATAAAGACGGGAAAATGCACGCNATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAAAACCGAAAAATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACAC &"!%%!*%"*)'$!)*&*)$'(%&"*(++*"&$)"*$'#)""**$%!%#"$"++&%$$*#$*#%'#%$#)%)&"(%$"$")&+%))'(#*!"#(*)*%*%()%+!%+!"($("*)'#""!%$)$'*()#))$)#+%'(*&**!"!+#'%+$"'(*#+"*(!'!'*)"*!*++(% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11C14T23C79T7T35 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3949 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43057 42 70M = 43127 244 CNCCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGCAAATCAGACTGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGT "(E+'>?4:-EA#5)>F25C".3-5=25.&F*&>2'873)?%F%2&(7B81).B):H!D=<#$''448$- AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A30G9A27 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r3950 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30677 42 110M = 30439 -348 AGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCNT ($"%$"()(%(!*))%!+"**%)&&+)$%)"")%*!*(%""*##&%#&$*)((%'#)%*$)$(")*'"#"##''"%%+!#)%&#%%!"*++'&%"%"'$!&'&##"+""& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108G1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3950 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30439 42 126M2D110M = 30677 348 AACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGG G&F$,:0(:/#A<+#C87<'FAG<>%AC?"$1?:GB?9B2>FE637<2*78"C5A=F5H%:C$)H>HAG>%C:/0BB81/(7=D5:9'G&*<2,!1*0)F3&8A&$C'*7B9!5-8?D6.;8@9%490!-90*8C2?,1D@(2G>(+14?;3F7< AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:126^TG110 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3951 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11024 42 113M = 10900 -237 ACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCCGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCNCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTG )5@6(,G+")@';AF*!A#F$->$E'!9>G9FGF.#77%07>7*B/A<)A=/)3/*2#(AD>C-23/@B*:4?>.@832$FF4AF78AF@(E;:2#-( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3986 42 169M = 3846 -309 CGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTGGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAANATTCGTCGCATCCCGTCAGGCTAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCNCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAG '%**'"'(&#+))"*'"!#"!$+*%#!!"+$*)#))!&$&#('!!""$('')"('(+##'#%"$(%%!%'*#+$%$'*!*!$)++(+$)&(+''+&$"&$(%&"'%*+)$*&)!++)&($&(#&$##!$*(&%)&()"%%'()%+(''"#!'')+()'(!+#+%%!$+) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24C26A21G40G54 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3846 42 140M = 3986 309 CTCGTTGCACCNGNAGANGNCNCNGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCA ))(#"*(#&$%!*"'*))"#)$%&*(+($"+(#"&()+"&"!'++")$*)")&)+$%&#(%())"!"()"#''!!"%!&*#%"!(((*$"(!"*)'!)*%&*%&$++#($")#)'""&+)'(%#""&'!!'%)&("*+%) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3A0C2A3T1C3C1G1T1A116 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3953 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8206 42 77M = 7993 -290 GGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAG (*+?(2,":(F=(C5$A/'7E"A3)/*4C3)0;H:,F&1@"F?+$B.;5H1>95!B,"+B<*.1*9*3=>+$D1$"H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7993 42 116M = 8206 290 TTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCNAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCNTCCGCGATATCGCAGNCGGCGTCACAGGTT 7)@'%.'7*5266!2)CD/*%05&A96A:(;)&FG8:H!%33&0<+3"%*7>,(+1+4G"#7)7*>0+>%<''-A:6A7;24"">=5G"5;+E>7-0%0>0-5<4>3%D4%$0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35A49A15T14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3954 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1271 42 40M = 1033 -278 NGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGT #>%/3'@=&F/H&:&.:>D9*D5@.:?3?.);2B0;;!$= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3954 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1033 42 46M = 1271 278 ACGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCTACTAT #+$'(+%*)!#)!*&$#""%"*$*+##()!+($$#%"%!*%$!!&) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T38G5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3955 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40395 42 100M = 40243 -252 AAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACCGGAAGGAAAGATGAGCAC >=1B4->2@CDG5"D./FE5@:''08GH4+?0<:*BA(%&/A'.!*@(C,"&C.:?&AF:;D!#=4B&!)3:.47=8%?*@,D(('#"?-E'E>!.DG+9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T18G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3955 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40243 42 70M = 40395 252 AAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTG 9<8CE#>0E)@A.58:!)!(24+!5412H'FF)A,-ED.2$4--813*8?4C<65C>1>+D;3D2- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3956 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20296 42 66M = 20131 -231 ANTCAGCCGCCNCGTATGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAG 'FECFA&-HC'5,224$*#$"2@0GF%G73/A)48G..EB$#;($@DB4">+-.8".8B)'#F:1E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A9A3C50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3956 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20131 42 72M = 20296 231 NGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGGCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAA %5*A82))8D=9.;:BD'58B/0/;BC0FD>"=5:.6!FD1/2D.8-,)7D'8+*!B>>D!#,:*!6B/>$> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A25T45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3957 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43036 42 183M = 43036 0 CCGCATGACGCTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATANAGACGGGAAAATGAACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGC 4/5/F#7236;(!&4'%6-,C<.<%4/HD;!(%G%:DD9+-(-6E@,"G9:1D<$$8A'H$6,/E<412AAC,-"2:@':/G!HG>!@"-$H5<#'$D78=AA9:%A->//;'0/B:GB@-G@)7@9H42AH+-$3B)C*FD&F,88+5,H89=!#F#,6&:+" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10T111A13C45A0 YT:Z:UP jpayne@0: r3957 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43036 0 * = 43036 0 NNNGACNNNANANNTATCNNGNCCNNNNCNANTTNNNNAGCGTANNGGNANNNNGNNNCNTNCNGGNNCACAGCNGNNNNAAATCTNNGTNNNTATNNNNNTCNNGNANNTNANNAGAANTNCNNANTNGGNATNNNGNANAGGGGCGNNATNTTNGNGNNNTGTGGNACNNGGTNNNCNNNCTNNNNNNTGCNNTANGNNGTNAACGGANNNGTANNAANNCCTAAGGNNNAGCNNNGNGANNTCNNAGAATANNGCGTGCNNAAGAANGANTAGCNANANCAACTNNCNNNCGTGNNTNNNNNCNGNNNNNNGT $""$#$$##"$$!"$###"!#"##"#!"!""#$"#!!!!#$!!$#!""!##!#!#!!!$!$##!$$$#"$#$$##$!!!$$!"$$#!!"!!!!#"$#!$""##$!$!!!#$##!"$$"$!$!$"##$$##$""$!$$""$!#"!!#$$#$#"$!#"$$"!$"$!##$#!#$!#$##$$!"##$!"!!!!"!"$""$###!"$$"#$#!!#!"!#$$$#$$""$!"##!!$$#"$$!"#!$#$"#"$#"$$#!#!"""!$"#!!!"#$#!!#$!#$###$!$##""!#$#"$##$"$$!"""#$"#"!$"$"##"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3958 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29046 42 59M = 28820 -285 GCGTGCGTTCNACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTNCNCGCAA ?*/H+FH7,>?""31@),C5:24B:D.&2,7A;#+8;7F8,<:;-.92+;7?4!?'D5;741;;100?%.D3) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3959 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16469 42 67M = 16298 -238 GCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCNTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTC !!9:1H-*#$$?;0!44.=C!9'.)%H7F($01F@4$A&8=AA;55'95/#7%>6C?0@!0D"(E/,F"-H&A,8CC.C=?&A9+*A>32C(3E63A=6@=#B#EF<6-3>+#4E""A@'6A9*B=0/">=1=8A9=*)G!H-;?@/**@'E?D"!"F41*8'AAF5$"94+%3)A6-(E%2'C"9415-5-!,50#"@H-3683C?E/(G3E$";6D37("DEB>"3A<4>-543'-G>5)-."7;8$<3D-A(@70A):#E7@+0* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:39A32T108C8A1A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3960 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27297 42 72M = 27369 285 GTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAA F*496#2"*#(@=1,0*@5$3?!!'>C%.@F%9-!A%;6*-:5%5C%>&@3:#**6=:@(63A98,65:/!6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3961 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41182 42 83M = 41182 0 NATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTAT !/@1E67;2<:2C>,@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C82 YT:Z:UP jpayne@0: r3961 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41182 0 * = 41182 0 GGNNCGGNNGNGNCNANACCTNCCNANNCTCNANAANCGNCNNANNCANGTNNAGNCATNNNTNNNNACTNT $"#!"#$$"!!$!"!"$#!!$"#"""!##"!!$!"#""#!#!$""!!$!$#$!"##$$$"!!##$"#$#"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r3962 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10231 42 55M = 10286 211 TTACAGTACCCATTAATTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTG <-3>C%0<(E0).+-C-FC(2'9'>$()C,;D(H7(G<283#50$8";%)6B4@- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3962 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10286 42 156M = 10231 -211 ACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGNGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGAN ;H/9)&F%A<,+1,5H.3:E#615B5"@,$0*H+E>(#36H=G4*0)7#8CE&!,0*"(C+:?-?:H6-C=,%+3!?H5:%*.0(=97A87D=6-7=$G%&-99+$$-B4!0B'@.'-1H11&*8'*H$1<(6#?$D!"7+H,.&@1FFD%H6.53 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:118C36C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31408 42 58M = 31599 282 GATGAACNCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATC 6?,/"F58'/8F&>FA-=FE/'2)B$=#'&)572H!A+9:#1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31599 42 91M = 31408 -282 GCCNGNACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTNAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGTAGGCGGT 2B065?&+#&+(@5?C4;;#+46:.8G$9F<*#<.H=%5#H-.#*7?11"0H,*>BF&'5B="@44;&#"%6GA-,*9D<)/H/7D*4:", AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G1A39C37C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6098 42 91M = 5865 -324 AAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTNTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAANTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAG ,?5?G?<334?-",7128.!181C>AD)7H$F.(54C,%??%G7@=64*6H(':9H93%.$4F:3#;;.D"H:158$5D'#H2$6"(H*3A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T39C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5865 42 66M = 6098 324 TGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACNACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTC AE?=7H>5:;=51:=4&,)-2%!,2=*6:,FC4#=G?''AG!/AF&<#%7C<@):3;:;$'2E8)1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3965 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2551 42 329M = 2880 431 CGAGCCTGCNGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCNCTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTNCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCAT *B/D170+0;&;(12F*D(?C0.-C6$#9$/@C7G(C-AG@<'*%H+0:!#8!0:7)@F!8D+A5'.5:2+D#<5+>,@9'03)3/*6%F(7*&650,'F;@>0;+545:$0>@#)'182H0:G$*2@B=01D#62%1!)D*6%5A(0!-@.H5%#DD.$""2:2&8A!7)/:6C5!4.8>B!:"D'09$B/:6H@0D<;F13H7'78%1/0%%/7:CF"'D=8>?40@26-8456$=/>F=9.(#(?#D'A0G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A110A75T132 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3965 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2880 42 102M = 2551 -431 GACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGNCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCT F40.!,;5'G0/22B,2/1=+(*.%0"-$"32%/4;6D(A<$<+8&45#3:@3C-E2H%7,>5=1E1+E-0=1E;&+,'D$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A53C108G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4517 42 136M = 4653 302 CTTGCAGGCCANCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGNTGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCA 0#';F<;C7B,H6)D7(;"7F32:#=3C/<":7?CF"0:"1AE83<'9$/%./9#9?1&H!!@+3+.4@F,;7#+<0<08&<+"+4+=3B"&=0<9#$*#:>89E3)-<09?);#B;361?"4?<,3)178!89CH AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11G88A35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12422 42 63M = 12198 -287 GAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGTGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTAT (1+@CEF>8,;3?#9=9;!58'#B@599F3"2/)!9@2-#)>(?D1DHE&9$5-3GABB9:3+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A31 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3967 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12198 42 137M = 12422 287 NNANAANTCANCGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAA !!%!'!$#$(!#+*"(+'+'"&)(%!')$!$+&#"&(&%+!+++!!(+()&&)"(+)%))#"#((*)&'$$'(#%')(*$!'&$%*#(+*)!%%$*)+*+)(#("$"*!'($"###""#%+%%($+)!**(+()')! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0G0A0G0C0G0C0C1G1A126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26205 42 75M = 26075 -205 CTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGACCGAANATATCCCTTTGGGATTC 3.99@,8:3@-C0.70+)!73C%4',:EE%6>=(%87C."A!B/'H7433%:-B660!:4!3GHB=9H8!&.6E( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52T4A17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26075 42 130M = 26205 205 ACNCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATNAAAGTATTNTGTACNTTTTGCTGGGTCAGGTTGTT *'#$++%**#)%('+""$%$!"%+(*&*&*)"(!!#'!%#%(&(!)#")()$)$&)*!()*$'#'*)%*$!'$&&!"%$")+&!%!(#$"")'#'&*'&(('*%$($')&#*$#)*#*"&!*'((&")'+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T91A8G5C20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3969 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7034 42 119M = 6906 -247 CTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAAC #"%6.2<;A2)B-!4;H99,*":GG%%+0<:;;8H5E7F+0@;<>$4?+C?(*,>>('->"4+A,/4?)3#@%3:A AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:0G102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3970 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39919 42 189M4D68M = 39847 -333 AAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCNAACGTCAGCGAGCTGCTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCANTGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGNGGCGATCCCTGAACCAGTAA *.=++;99(=!;E.@B<;C'7?-:G;(!;-0H$)8B1$*'>/::#:!8/70!>FD$0@-?">.42?/F"@(<9G5.:(CE&:!HG,8;(H-E3D(-390"54+(758#&,-A4'HG(E,0<'3A&#*'*A;$9-;%E'HE$39H6CF;$/'#594&?#A,1F&G?":.0)=35>+@F7C;+39.6*D@(5"#2%//.*60 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:25A15G120A26^GTAA47A20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3970 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39847 42 72M = 39919 333 NGCGCGTNNCCACTCTGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTAGCATGGTGCCGGGAAG #(%#$'$!"*$!"&+"!$!*!!(*!%%""(")&'$!&$%")%'(#''')&"(&($%!%"")"*)+#*)#+$+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T6A0G2C0G2G39T16 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r3971 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15089 42 112M = 14951 -250 TCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTTGTATGACNGGCATCCTGTTTTCTCTCGG !,-#.@2C,%%9H@=6GAD&!7'>1;:=&)>!A/&<>$!,7*=--&?D?F-?3704B>:+=H3%:0D3=BE)-(?3D:,#9@93(#"!'2?D5.F9%*0#%?.H1>E3B5-D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83G7C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3971 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14951 42 121M = 15089 250 ATCNGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGG *=9)6!$&/.2@FF*%!1FG/1@:%F;9/F)B-1(>8+;,F0E+.&=.26;!C@$A4@4+4.!>4)&34*BHD0>")2B*&33)3.1F/0-$=G:-/5E!5&-0D8F=G60/@D>8(?=2% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A117 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3972 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6838 42 50M = 6954 228 TGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTC 1*%DD!:8+$:5+&E=;9?3&59>H8"E@!"E)$%*ED&5%?*7!;=5!? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3972 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6954 42 112M = 6838 -228 CTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGNCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCA =/$*A(#6C6,8A4D2<2%)E&?;@1<(/F?*.'F>.."$=F3D.+A+'-/:,#D(H"):$86D<6F+<954?:!;,86/%G'5D"*(#?EF(&./6EFD&6?6<* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3973 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47541 42 110M = 47682 248 TGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGT AB+-/,HH=55E&<6:G77F+@B$472.0+E3H=2;4"*8)*CE"GHD3B;/B(=9B>8!+"""3$4.,*,+=0%G:>&.1B;&$,B<#73F(0.0*!*+?@8G2,8+F0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3974 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18893 42 72M = 18965 340 GCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACG ??-$+$0"1D80591!$0'1B>H1)':5@$G'FA9!3>&E7D.+"!F/3B97748281')!64,C+=#C.(" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r3974 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18965 42 268M = 18893 -340 ATGTGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGNCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGNGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTCATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACATTGATGACCG !:.!A209H*9;.>49*2G"%28*1.9*0,*#E!F";!4-B,+*,;.!"DC119*5"0H:6E13.0(=(*6-0.@&F68;<$*8&D28C)H<'?16'$??9$*B1B+1*DD)<'/?1/$72+?F4&'%!2C94>#58=8$G7>7A3282FG%=5"-:9F41C1266(@532>4H;7=5F&@-/B7H-*&>6)"7A>8?5$9D)+1)&,?+$"F)F.54>#/D!#03BG+,189=)<%42G12-*!3A1&"*H)@,/<4D0GF@B=?G( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3C48T99T62G42G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3975 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42 42 87M = 251 314 CCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGNCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGANANGAAACGACAGGTGC FA?,;HF>$C1B8'H=BD#90B#7=$'= )-14:H6>%.E-:3C$$27%2<2"E:+G$;)#2?8/G@808!/$D)6!'#1#"C2/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T40A1G14 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r3975 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 251 42 105M = 42 -314 AACTGGCAGGAACAGGGAATNCCCGTTCTGCNAGGCGGTGGCAAGGGTAATGTGGTGCTTTATGACTCTGCCTCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCT 4(08;!-7+(E3<'BD+&$90):8C*C?@>/+5!"/2F?G.+@//@$"4>>!(34@'47)8+:CD4EE,+F26+77>2368<447+H"'A7G10F-++ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20G10G20A19G32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3976 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26811 42 61M = 27012 276 TAACATTTCCNATATCGCATTTTTCACCATGNTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGT 9"0#$&>,1)A3)2;**=0AE>9"'1D#,*B14:<=-79,)0F8C9BG6,)8))6-.7E@2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G20C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3976 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27012 42 75M = 26811 -276 TTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTAT !H!$#G4;)F!9.(H!-#/,C=-766;-8+D(%5//:A()G':;-E8'=8*((2-EC'#:H:+$6&3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3977 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4655 42 81M = 4808 203 GNCGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGGTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGT %!+&##!)#$$!+!+$+"**)&(("*(!"!&+')&$%#&!"%%*(#(!))++#&*$'#%!)#%''+)+('!&*&%"&&*'% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0A31C47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3977 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4808 42 50M = 4655 -203 GACACNCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCAG %#*!$)+*('+&%')**#$$$&&)$'&!&&&&"#&$)+(%%$&""+!)+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G43T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3978 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15317 42 83M = 15437 168 TGGTTGCCCAGGGCAATGNTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCANGAGATNAGCACG 20!B-F5C?+3!HGAH3B&@3@!(-8*7.%(0&60,4CA#E'-%9+(?8%:&/F.3A41/"@1?E$A=-"&(-46!(2::A-8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T51G5C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3978 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15437 42 48M = 15317 -168 GTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTG :6A>5-1C33=:G$@''4#'!F6$9"5A<7):*-9=8'/':5)/C?@70+B?&G0E!0(<"B!34G9/!):%=:7&2D8(81"0;?(0*1;E28'+0%<3;B)&:%A)C:7(A0B;:(=8D%>-+;%);.C%H(15H&+!%A>#@;>HB% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G25A109 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3979 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32753 42 75M = 32609 -219 AATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGANTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGN 0!B60./D3B5?5%;E8AD%!2*D310>;CGA0*%.(9B"AG$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G28A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47795 42 142M = 47937 235 ATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTTTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATACTAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGG @9#8)%*-,*(GD1,:-@*6H#8*-A=902G8D@G+B60,"0@H7G1F-%=+&@)'0+8'H!74&$=,:,6$77.1>.29E,@&C$"/@:,::0E>:!F?4=4/H>*>?1A''!,2($':*5("#=20F*),4*=<.8+E?C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69C28G16A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3980 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47937 42 93M = 47795 -235 TTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACT ;*>;:)0#C--!(6.5:7,:H(01*(!C<:D7/B%E2EGD$E@2-#/+DDA-)@C*5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3981 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25974 42 101M = 26075 290 CTNCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTTCATATCTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGNTAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCT '#&+#)'#'%))$#!'+")#*&(*+')$&'!%$'#!*'**'%+(!!#!*!"&"*'"($)%()$#'#"$$'%$''$!(&+%%#"*($))*%()!)$!%!%*% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T27C5T31A32 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r3981 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26075 42 189M = 25974 -290 ACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAGAAGGATCAAATGCACTANANGCAACTGAAACAAGCGATCGAAAA ,.6?0-A'$7F,;C-D#6;(:D505%D6#=A,1$7&)'5EB@6<8G60:;6<8/'4)CED<(5A51)?%+,&$BD?(A8A!C4E;$1>'09:'@8%�#8:7G;=/,.F@,C-.=?;%%%?!A(/;H4.9?;(5G%!#&2(4**:?4A;!-).4?.3&B>7%G-:AF2.2= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:144A17A1C1A22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3982 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46208 42 242M = 46092 -358 TCTGCGTGATGATGTTGCNGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAANGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGAGTATTTCACCCGCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAAAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATANAGTTGCCCATATCGATGGGCAA :%.>3$<'1FB572GB340G#H24/(>4G43FA5=D-+-=(3-@.!2,=8$=CB:%@*C$%=6$F6<:'9(/+73AB<&$&>>=+4:@D(973$@*($1)):9%/;GF.".F%&/A?0G?F'H-F;%:;D;,7-.17=E(28=%'*1/!:D>@;05F/+?6G?19BA#/9)!8==8,>%G9%#6=;?B)7#FG=:@.3B),*BE@+&%&#?2G.$2G/3:&$189#D=35/G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3984 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33262 42 261M = 33202 -321 CATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGC '0)G4@5)9A7&G0G*;%:.F.;1,G5=%.83)#C62.7>%5&G?0+/(:9;-F+:5A/2F(/#)"H=&">E=$?"'B@F;B4G9?),86+4(5+8(>&,78+23G6!1+48#%/BA!0.;(23">-F>@E1$AA.34(59;%.&A%-,?A@C)%A/A<<5?"?B;(%H=340,9(F'"G131E;7=6EG'21$450+-9#HA/%/D&#(02%D"2;F77670)770;F%%6;=?F9!=);$CE$F/'*36=0DF:<6D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45A32C7T22A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3985 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22483 42 124M = 22636 265 GGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATANTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTNATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGG !(?5%AB.4C6AA./$)=>."'+?&C*DE!DA;16)(+@&<&F*)52E(80BG)+5+*3=139+G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C42T21T58 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3986 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34105 42 64M = 33952 -217 CTGTTTNCCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATNTN +*""+&(!*)!'%!*!((*'&$+&%('')!+"+$+%!"!)#!$%+&"#)!)#$+$+(+!)(#&! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A54T1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3986 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33952 42 54M = 34105 217 AAGAAGATTTNCAATAATCANAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACA *#)$)'**$*"&(+$+)*%+('")&#%!%$++#!$)%'&#"'%+*+'(&%!#"$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C9G33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3987 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10518 42 291M = 10809 376 ANGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTNTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCANCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCG +(!'"!+&(+)'+)&*(($*()&#$&#*'*(%%&"((#'#)##(#$&'(*)"$+')'#$##(#*&''+$*()'&!#!$%**'"')!'+$$$)++*$!"+&(++$!!*+$(&(%&#+"+%(%!%%+!!(*%")+")$*(!##%+#%&($$'"&)"#(#%'#)"(*&())''!&')+"!++(&*(#+$))'(#%%*%+&&'+!)!#*+'(*'%"*$!")""((%&(%'"&*)(+*(!)#"&#*$$))**'!!)(+$&&*'$*)()$*(+(&*!))!'(#!#)'+$*((*+""! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A61C205G21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r3987 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10809 42 85M = 10518 -376 TGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGCGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGA 1+)%"A+:+?(/5BAD-;>C2CHH9:B98EC!C./,-<".!5D%B:'E&7B,?C/>@4F;0=$3"B)F7:&>4H!621;:';#$2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3988 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25983 42 168M = 26191 287 TNGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTNTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTNAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAG '%$+"!'"%!!!))+#%%))#**+*++%''&"*'%&)#")#$"$$""%#!#$&)+)%!#%++$!'+#*&+!((!($&!'#+&+"*(+&%""*+#*!"($*$%!*"+%%'**')%$&%!&'&!$&*('&#%)**'(!++"'')(*"%+#)**$'&()+"&($+'+"%+' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A54T71A39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3988 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26191 42 79M = 25983 -287 TGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCGAATGCACTAAACGANACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCC @G-D3$-7>*G4=&4%EA<)5!?!:C)B1.>99$9(6GD8#454A%@8E5+,@52.@)C2H:!53H2(<7>C)+<2C9; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A14A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3989 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32147 42 56M = 32208 294 ACAATAAGTCGTCATCCCATGNTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCC !0FF$BE/8)2$!-*7HA/0@,!=658!1AE-*3<,5&>)H1$72B5H86$G2=8B85(&B5E5670/0C-(A40.4./8@1E.6D!%0&7+'37(,/8@FE1/;>C+?#:&9$-(=%7"668#5! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:233 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r3990 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32670 42 59M = 32474 -255 TAATGCGATGAACTGCGCATNGCTAGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGNNG "#*&"$"!+%)!'&"+'($#$!+#!%')')!$(*+*+#!!''(**($(#!#$'#!+'$" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20C3G31T0G1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3990 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32474 42 173M = 32670 255 GGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCGATTCNGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGG D-552@.$:&-<,A>##+G?5;=:,-#F56>(4.H.6>'#G#5C)-A89-"247;2*D$B$#%71,FB34<(A!?C3E?0+H/3**40@31?;?,"7.+"B?22B'<49"$#+1$?%(:4;C#=5%2D)%+?6#)18E(F$-0!(?30'$!9;FB>&33!B#=)G!5B%;>5& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:123C4T44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3991 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32182 42 44M = 31944 -282 ATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTTATCGTTAACCGG 1'B:5-?8B"(>C0"9+!?:<0>(=,5!-2:D*$7=!H*"!:$> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r3991 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31944 42 70M = 32182 282 GCTGNNNTNTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGAT $'###!!*"(&%%+$((&%%$&&$)""*+'#&#!%%(%+#!#%!'!))($)*)%&!"*%$!)""#*((#' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2C1T0A0A1T61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3992 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15516 42 315M = 15516 0 AAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCNGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCTTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACAT 20A"+(4..@CCA+-,7'1**&45E9/2**,)>C*2!%D%8%/C08$7>%,$F'7DA&D"@A;'D2!88%G00@E%$:'6".A2+<@8?*%,8.FFA*,FG5E!E%7!&)*!H,F<'>8/:?''AGBA':!C02:,3/G'/F5GE(3A6B',).7.4/F#9391)02?E.5<+29D6/3AG63F,A2$CA9*@63/3+%73)"2/9B4C'C2@H>+6=3'-:B,73*ECE98>*;%!6-&$=HH&F-=42;6"2A%-+G/-)G-H=/!7:3(6(; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53A183C77 YT:Z:UP jpayne@0: r3992 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15516 0 * = 15516 0 TTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATNGTCATCATATGCAGGAACCNTGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAGACGGTCG D5(9HH>@G095B+$8G3&&.1+(A4*<7E15?1=/!@HB'3223&2,=)-?E72@&;.E5;8E.2!7.?-:6#&0#5'C@2.C.?&3,,G/?<*#4)D1D2H&H:>C5'5($-458G>=?21$?/>'BEC$GF'G"438%4AEHACG0('59F*'8F10/8&4E8E88:254;1!=C"AA?EE;$F.(!"ADG++H8%=G;%*1C4E:!C?7#'G+7'7<2$C6.)+4?*#4E=)1*2+:<-?F3"-C#D>(#$@28=$F8,? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50T65C79 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3994 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 522 42 57M = 262 -317 CCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCG =.=),$33#AD4=B?*#C&!A60<--6,?"F2-47=D$'$G)F@3B$#(-DE)E945 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r3994 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 262 42 260M = 522 317 ACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATNGAGAACNAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGANCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCNNTCNACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGNANAGGAACTGAAGAATGCCAGNGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAA @);+-CG(6!1#?$0-FG,3H*+!?@3HD;:D?5(":/3/$)AEH+;.;F$=)<3?0G*BA,E:/"B$8!"4<91&5A&G4B!5>@0$HAH#?)38B2-F@>)9F&.!2<(-1@!*GHD1>3$D(4=-!H4AHF)#D6H*C5-3-3806@<5'4=52E%':6E.FDD@0%"D8)B$<-9)4/<0-FA%""','(3@3HD+>+#7:545EH#A AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:99T6G34G14T30C0A2G23C1C19A22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r3995 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15304 42 56M = 15452 234 GNNNTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAAT !!)$%+'(&'&'++$'+*("&!$'*!(*%"*)"$"$!&)!&$+"%$(#&#$')#'( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0C0A0C52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3995 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15452 42 86M = 15304 -234 TGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCANTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCG 37=!#H;;:5*EE:?6=9+/G+0B(,3H41"?CG8'BA)";FE0-1H((5E845/:4$--!*:3@<,<="67D6@!:BBH;1G@$B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r3996 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38122 40 121M5I50M = 38293 364 AGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTGTGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAAACATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAAC ;#)7?->+$&<9G#"=(0>*:1EEE-D3EB.3%@07'2?>>9G(=!@*0''-A?*BG=,-DF#@-=&A::7G,D,("-A$3#6;FF*A?-?//)-%?)AE0'E6@4174F'$4=D.*>F(@H:?.7.3?==<+<&70<497!=9@?G3F#)8+:E0;1>30?03G4(CG7A.?HE>!?+C+3E-FG1!G-)G$A)%&5;2%,. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:137C3C17 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r3997 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10555 42 199M = 10754 358 TAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGANTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTAAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGNTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATNCGTAT @3"4>(+C1"B)35=*(8(HFD.?F=54G?*<@@58HB"H#D6+>/4"/:>;+H(D62@3')4-$141#F1G>02%-(.@2/4$"B$($("<)-C9D8>DF=!!F%;E;!+D76/!/D/H,#9:9/?CC3;$(0D4./*$6$;*;D=;%%2%4G+(9F9!3G%1-4!:-HB-'H(9+-"C=2(* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41T77G27C45G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r3998 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45736 42 148M2I29M = 45682 -231 GGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTANCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGANCATAAGGNTGAC F;4A#"-',?4!!3&E(5?7#>/G89"987=E=*64AGB6;(BD!$&,'HDED#*3*E!'2?/B,5&#@-8%44&&CG:@B@4-.1*1--C()&C*-269/.35$#=$1!B,!5*;7">;@7?4H&?#*9:.*27./:4/E:%!;A5F$=C28-.-7:.#%(64<$149D1C,88#4+$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:72C91G7C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r3998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45682 42 54M = 45736 231 GCCGGACGCNACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTT 02G8%8#:?E!D?CB8);#$A=D/*75:1*B7'2/'B6#%82'7.@2F8@'.E( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T44 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r3999 77 * 0 0 * * 0 0 TACTTCTTCTTTTTNACCTACAAAACCAATTTTCACATTTCCGATAT *-=4HD8?.(=8F63:3'2-)A<1:#'&!"G>6D'#4,)B96CF,!9 YT:Z:UP jpayne@0: r3999 141 * 0 0 * * 0 0 GTTGCCGCCAAATAAATTGCGGTTATTTTAATAAAATTAAGGGTTACTATATGTTGGAGTTTAGTGTTATTGAAAGAGNCCGGTATATTCCTGCAGTAGAAAAAAATAAGGCATTCCTACGNGCAGATGGTTGGAATGACTATTNCTTTGTTACAATGTTTTATCTTACTGTCTTTGATGAGCATGGTGAAAAATGCG E$(+G*CHB:E,&@??'=;8%5+?E)@&&<;/.57=="F$D8C!%&HBD"".#)$'&"*4?3;+)'"EF1$G=B7/34&73F>GC8C17/4>#("85@<7)D44CF="7DC,30>B!9F>EDCH5$7(#?(>"#>;HE YT:Z:UP jpayne@0: r4000 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4012 42 90M = 4012 0 TGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCNCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGC 7-/.&=9&-H4.@")2?)/(.2<'6@H=."@9*D.&&?!5#@<)B9E?CGA9%*",6#@1(+-E"4-1$F,8$$-/F?;-.*4)C*3#F= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G56 YT:Z:UP jpayne@0: r4000 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4012 0 * = 4012 0 GGNCNNTNNNAGTATCACCGCTTCCTGAACTTNTTTCAGACCNTCGATGG '$&""#)!&$%(*+'+$!#%++'&")'#+!(#'')#)')++'&&)&$!$% YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4001 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3569 42 61M = 3755 266 CTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACNGCGAGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCA A!@;#*;C1(!72A=;:!.0%HG/.$-./43;-+$13(#4*4.4"6!:8*7DG!$=/; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A3T33 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4001 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3755 42 30M2I50M = 3569 -266 TGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTN %;?$75-$:>4<6+A*'H2/H!$<>+63!%0AE):7=:F/.9EC::%<>=<$:5/:F85ABD7<,"*9&&/#$?)#@1-"7+;8:7&1B)C2+D0:7=.E>7-.C#1: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C13T16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4004 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11927 42 58M = 12141 261 TGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAA ,41"*#.@GF;*69C&;/@.;89%0&H!A$(=:$,$7D*D/G5/?A;;4E.C;B--DB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4004 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12141 42 47M = 11927 -261 GAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGT 043)G.29GG,?8#@GC'*D18:G'.)D3<%&&GE5G*";#5D1%-+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23721 42 133M = 23951 283 AACNTTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTA /GFAGD;/43".!7G6GA3EF60"&BGDG1.40=4@,6'78B"4A<0?@4:*E6"4,3HG?@HE5%7!#@*--"4H-./(-##*-02?H"1EE0(D=#G".9GF;3@8C:6>>/,HE/?4H2-8&60>72-!& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A129 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23951 42 53M = 23721 -283 ATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGNCAATNTANT $+)!$&**(&#)'%&)*((!#&+("#$&)*#$&*)!(%&%#)"#+($(#'&!& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43T4G2A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4006 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39890 42 80M = 39371 -599 CGGGCAGTTTGTNGCATNGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGANNTNG '#++('+($(%&#)#%'#&+%&'%''("*$'(("+!!('(#*#&+%'#'&#'()+!#+*'&(%!#!'!'#"(!%"+"*## AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12T4G57T0A1G1 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r4006 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39371 42 124M1I395M = 39890 599 AACGTGACGGACGTAACCACCNCGACATGTGAGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACNGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGANCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTAATGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGNTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGNTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCACCACC ,<;5!!E$6+%2C,F6;2"'0#7+=!:=-)$A))#(0>,H#&3*&@?&'E9A/=@84G&B+;#2%1%#%=$5E'?*3>;5.4B,E:;%@13G,HD%(*8;/A,C*>A,BC-.>@6!";HA,B<::9???A,*1$!,;)3FB9?D4?%<0B25$=98:?@3@0:3/(EBH'C(/32>%B76.@/G@87E71H,E>),),;*>&)*=2@>7/3;4<)D?BH1;@EC.-1"E''2EG+=B*1/4?&H2,(:@'F0E AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:21G9T82A6A0A5C46C176C69T41T49T4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4007 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20319 42 56M = 20493 235 ACCGCAGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTC B%;)5;/9.3":1#)1/+E29:&C%C:$5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4007 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20493 42 61M = 20319 -235 AGGTCCTCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGANGCAAAAACAGCNT A@G>D&!5*7$2;';D8G3H0(04;(9=@H4E>+6=;&4;.4'735%0?F,+#>>FG88#' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5A41C11G0G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38279 40 164M = 38187 -256 GCATCAAATTAAACCAAACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCCATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCNATGNTTGGAACTGAGAA >>GBBEA:2,%78%!'-B&B+3=2=CAH!$%,+>%(%)@56D;/F(G*.1(77E",*?+/4-$F=A7.2*:#!@?GH3HB,/57>6A=G$/'?A7D:F%$H5%#7,8,9%1<0;H'E%&,;+5G!<6,.0#$5 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16C33A95A3C13 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4008 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38187 40 65M = 38279 256 CGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAAC .C@D$5+C"#6A+E/0EE@F@DE&(6$4,HA6%.HE2%=>2+%>H.)/**&B*6&AF??#E22F( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:57A1C0C1C0G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4009 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16181 42 58M = 15955 -284 AGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGN B@A/G0=(A@@)-2$4FF65!94+E;,$53(/'=-15550;)!E',B$?D3,.(#H;" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4009 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15955 42 41M = 16181 284 AAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGNATCT 9$2*G'HB9GGB(#BE>:&072!,&+'?9(@)*F,40-*@< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4010 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40365 42 129M = 40365 0 GNGGAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTNAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCA &!!$/++"A20:#(,E.-#$;24!>DC&;?2D+>94=8=B<2H/7!@=+/!"$8+F"F/?@&-;G/$D2'CHE8A&<$?8==?)C=DA(>=>D*+F.C&G#!%'.8(>.4$B-=$%83%<,<:H4?/4= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0A1T25A62T36 YT:Z:UP jpayne@0: r4010 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40365 0 * = 40365 0 AAAAAGGCCTGNTACGGCTGATTACCAGCAGGCCTGTTATTAG ?DC'$%3.A<):&<=HE.E,%(0)%)G?-4G)F;/4F-,"@;: YT:Z:UP jpayne@0: r4011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 381 42 90M = 220 -251 GGGAGGTTGAAGAACTGCGGAAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGTGTACNNNNGCNNGNGACTNGCGCNNGNGCNNC ))'')&(#%%#+#&#(!!!#!&&+#'"$(($$!(!#((!)*$#(#")%!!''##)%+!%'"*)""$*%##$%#&'%"#*$%!!*$))*#" AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:20C1G34A4G0A0A0C2C0A0T0C4T0A3G0T1C2A0G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4011 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 220 42 161M = 381 251 CATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGATGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGNGAACGAAAAGCTGCGCC *1.9BC>.:)0C7))$G?@H3E!@@>=(%7-AA(%8$"'!!H.H1D!#=8=,0ABG0,D,502B.GG$7(063%.1">>AF5"A4811"1D0D9F*,)4)GC#)0% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4012 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24641 42 82M = 24473 -250 AAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCT %,(+6-$C+44/$CD!0F(?>8":EFD6"#-;C?7="BF!$G+)#?/$D/<6:9H9$(4104%+8H&?6)<&@!@E*H1$0? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4013 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36108 42 44M = 36225 280 NGTACNNATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGC &"(")&'%*%+)#"+!+'#'!"#!+$&%"$%#*"(%&*+%$!++ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0C1G1A0T37 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4013 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36225 42 163M = 36108 -280 ACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGTACAATTACTCCTGATAATTAATCCNTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCA %$C=;<'$2A0F0DB3!%CA&89*C8!9G.$H>9:1BA'4F=H@6F&>'A00:D&.DC9,B2B%:9%=<9)?1:&>)829D)+0A!&:$D!!1-?0=*/2':F2>.D+;,&E#6$$*#?"H3$:-#4#E2$<""7$8'66'B>'2?"EH4?%3;4G=*@.?5C3<=C1"G8;%A=9'G6C2:G"?8:3'?(*3<0>CD1E)2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11C16C22G21T9C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4015 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45730 42 154M2I68M4D63M = 46019 368 CAGCTTGGCCTGAANGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGGATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATNGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCATAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTG 46D-2023,&ACF!F(C""9E(4#G*+?3D0/+9D=-@A*6G57!/@:9'/2-?)/%4C!6%760*0>2:,+F(12=((26%F5CA/C%&0)E86%5$D13:%B0D//!":9>)!E,!!B>=223:6G?9E.,253F0/'1D6)1-%HH(',0:1F9H!G$:'/F+C*)D4<>?0'4A3">'@/>.'4C<.#*C?!@8;C9<8H:.!-$!?(=C&8:$F.(=AC!883:0&?&'28A4/'?D6?4173?D%.-*/-/$6DF19D>+%*?A4H/F7<@+:H##$AEC? AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:14A31C43C111A19^AGAG63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4015 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46019 42 79M = 45730 -368 CCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGANCTG 2B326-@H;96$+;71)+$F3;!:EG0F%;CC(@+*.<1.$<=:';851GGFB=5"%?@B#"H",+.#-(:D3!<<"4, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75A3 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r4016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24150 42 129M = 23993 -286 GATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCNACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATN ?H/5C/>;*1H(<;7),'&!'B+',B>9G,'9#:#7-E-.%E6#/.$=62$/+03&B$4D:$*GD7A"&#&B<#.D;!E&3=9-F069"%:5/.*4'>'4#2#66!8:E3:9;% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95T32T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4016 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23993 42 129M = 24150 286 NTCAATGTAATACAAGNTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGNAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTAGTATTATCATTCTTTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCT !0.A0FB?A.-05)2:=2;!(1&=+F*68=3:':F/G?@=0!'7%?)&-!'8%3:%2%8?*72-7@5<)$=@3<>$3.29A(="H-7!DG?8-%'5$(D4B(<8'F8GC%8A?G>%@)C:B$%9>3E18 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G15T40T31T11A27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4017 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8880 42 86M = 9109 352 GGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCNGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACC 0G+/-==+==2.8(=!16/HD0.B5*?<#@F*H(?D-2*H4((8>$..#:#518BG8<5"$>+.C1'3+E(01-8A>?5B'31#)' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C51 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4017 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9109 42 123M = 8880 -352 CTGAGTCCTATGACGACAGCTNTCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATATCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGNGAGCAGGGGC GBF3$/0>(5*27"=<*D&@+B)5+,A5"D-(F.#(2H2#$!&:+(B$&'0G67),0@E4CF#D"1:!6"%1<@06;FD>0-92)5:=/'GC6''D:$8-@2E-6-/@4#=)=H*D AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21A44A17C27A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21133 40 130M = 20963 -300 TGCCGCCAGCCTGACTGAACNGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCGGTTGCAGATGTTCTTAAATACCTTGGGGCCGGGACNANTTNGAGCTCNCCGGNANGNGCNCANNTCCANTNG "&+*'(*(&#%%&#!$$'&*$+%%+&)&&+%$$+)'(*""%*'$((%*+"%+#!%$"!)"&&)!())$+$&*'('+()#$!+!##*%*+*)!#"""*(%)#")'!!**'($$$#$'(!#""(#)('!(!* AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:23 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:23 MD:Z:20T36C15G16T0G0A0G1A2C1G0C2T0T4C1G1T2G1C0G0A3C0G1G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20963 40 170M = 21133 300 GCCGNNCTNAATACGCTGAATGAANTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGNTCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGA $"(!#((*"#))')&)())(*&*%))'+)"'*&'*'#!'"%((!''&#)!*%*'!)&&*%$+'**!!%)+%##%!)'*'($("")"&)+%"'$+*+&!%#&%+%'%!&&#&*"'*$+)"'$*"'*&&%%'*%)*%(#&"!)#("%&!!%&+(*'$*#!&"&&("(!'#$" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A2C0A2G15C21A100T22 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r4019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29095 42 93M = 29188 175 NTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGNTTGGTGTTCTTTCANTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCC &3$52%?3C2GA=7+%GD644#?0&$FH)-(%3BD7,=11F=2"7B)-"C!*(=/(GG0;:;)@8)@! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T30C14G46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29188 42 82M = 29095 -175 CATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTNTCNGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTNCATNCCATTCTCCTG !:*9:(--&4"$0!>C2+9#E3/'(><>$($7H43GH613C6<88.+:<@#&D'72H=??>)G)>B?H9(:=3+-G-'.+); AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35C2C27C3T11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4020 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8213 42 81M = 8017 -277 TTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAANGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCT 21%C2<(FE%?3%4..'.*?!*5EB9/659<#('9"..;=E%+G;-."1=C)/.60H:E31BE+;?) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4020 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8017 42 57M = 8213 277 GCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTG ."-5!1AD>B<)2'-;*A7;=<,@>CEG,8A1'-5B""-G1E'48'&@>(;7*DE!? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4021 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25584 42 68M = 25409 -243 CACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGG /:0#G*#<5*!#/86)(71-,@>3+F739B:*+"?*)/5&-+5B:D#G(&+,!'G74%.C;A7(4($2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4021 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25409 42 95M = 25584 243 CCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAG 6'*,7&4!<5;>F"&@'D4/6% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4022 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28144 42 49M = 27934 -259 GCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGAC "1>"%<#'BH;".&H+!.3G.?(FE,0<+C3F7D/@.%C",E3H=6A5=.C,>>G!*$1&@4F379.8/7B0BH4F'D9!3>-7"FC2-4@#*)#*&+)4C70=&D7&A1/A.'D8FA8'FBA%!<4)-;F29.*.+&GB0H!F"2)@)C096+(C6A2(=:D)$=3 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:10^CAGG13T4G122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4023 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41032 42 68M = 40808 -292 AAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTT .5CA;+-3->+*!ADEDGFE@<=0#%;'"=2<4($E(072:5B4,<:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4024 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 511 42 74M = 403 -182 AGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGNAGGTTAAATTGCCAGTATTCTCGACGGNC 2E%)-=F813'%F6A9$1E>43.%;4H+(E:$!&04#=HF3**=4*6.7.G!78//8./;2'&.5.4($44?!) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44C4G22G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4024 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 403 42 61M = 511 182 AGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGT ,28BGBGC@*%C"48!C3$;6<7*1#*F(.CD%:$(0'F2?!B114%8>#0E5"5#9)C30 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4025 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15947 42 118M = 16065 237 TGACGGAAAAAGACATCACCANTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGNCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGA ?H45G%11!+7CGF(5'<3+6$'16?%*AD2@>-=>449E!5C=!=G?&-)*D620='3/9G(1F:=1G!B069#+9#%-21)5A&@@2-0?.61FC6+?-38*/C$H/'%%&>CE@?'BB?7G2@A%13&" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28A5T83T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4026 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12484 42 312M = 12381 -415 TGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATNGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCNGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTT F>>8.**8477!?7.(!!88:C@3E:(#G*A&G'!+9-@$*ED!55;>1E,D<2,0(,E3,+12/A<>C%879@3-E1/1E@4&)!'5501A)FA4?5?(29>&E>H1H/G%=A13-@D*41F;.,>/F).--@#*4.B!6,=4?@":*"EB&C@#($?9B(?@>;))#:4%#:C<(>)HA=H=/8B&C!"'&ED;=GC0B00F3'0@('+-<$<&9F?!E"4HC6B#FDD84$$H(-0-<<1B.5F5<'009,247%0D5.4%1#48,F!C;:5#CG=< AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:55G36A140G77C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4026 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12381 42 103M = 12484 415 GANNATAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGNACAGTA *$%#&%()')+*'%*'%##(&%))!+'(!!&**)&'+)*"%&*)%"&%%))$!*!&$'+&()##"!)+$''+"$+$%$%)!+!#&$*+!+$#()#&*&&&*&+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G0C1G90G6 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4027 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19902 42 75M = 19902 0 CNGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATG #28=/./B@.-.*$?4:>G?8CC02@3H1E/7%;)"1?>?8)(B>G%.B%=B8(;120;41%>4!#(G;"F<>*< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0C73 YT:Z:UP jpayne@0: r4027 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19902 0 * = 19902 0 ATNNCGCTNCTNNAGNTGACGATGCAGCCTGTCNGGCGGACGTGC ##"#'('$#&(!*$'"+%($$#$!')$#+('+&!)+('!"+!#&( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4028 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8906 42 120M1D53M = 9080 302 ANTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCATACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGTCAAAAGT &"@!D#21'E0E;>!=1.#-=C<4.)/#3D1D-FHC;@9B1?&6DE+A.&??2)4:8#C(8,1<7"H&!<"!()0+CE=-"$>7.(+(;012088-*&0.D$E%)HFE64H(%H37$)2.H:6?6$-"6AEAA+33&)/H4'B&"1&/F*1G,//E5$796FFG49<5F!<:E0#F4-<3D/H$+1&>!,!&./;7>;'+,H"F*6&9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46A48A32 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4029 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21855 42 52M = 21690 -217 CTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAA C7!,55"?2"!@D<((!=E=?33)4//,"=''11)E='3;(,!%+(;@0#";(G/&%<4?52<1-/3.$=BB2? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4030 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15680 42 184M = 15625 -239 CCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGA +-@7A=#+:*+G&%(.2+.<@50*.110*,=,$#"/CE4FF@A+:1!+.".:))AA;:F*G;":%$"FG-;G.-$4:(D6%F?#)/0(02//*<<#CH#,:1)0H:<2::0$<&8"'F';7/;*/>5)*%*66HF;9CH1-!5$H8,%4/G3BAB4-),3D;D(5&@B5,91AE)++:,A?:%D32H.'6)+G.;()D2<&6,:2='HF? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4032 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7030 42 85M = 7204 220 ACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACNACCGGCGATCCGGCNCGTGAGTTCACCATGANTCAGTCAGCACCGCTGAT 5H0(1,)/*/>9D0B&4):,E&@9;+?!%$(&$:>)8)G3-611'5G69>0"'*64%AH-)C9#/6#C.!/$:HH-0(#>A*.,D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34C14G16T18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4032 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7204 42 46M = 7030 -220 GACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAA (*B4G:'0D!)9#@3.(?"$C1)'>D?716%1GFE*"?4H7A$*8:$8>.C%>;H>DBCG087+*E.FF9.!#G/*!5'!B828"/$@C*.%'346(&C(;6A; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4034 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11865 42 68M = 12074 274 GCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAANGTGTCTGCGGG &3::H6&B35+37%1B3"$9E=$@CG*%0"?&#$,')HG94A?9>F$F>%1G91+449F4;4GE/81= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4034 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12074 42 65M = 11865 -274 ACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCAGAGGAGANATCCCTGCTGGCGCATAAAG DE:.?1G3H6.2"!86&=A1AF*%)@#.*8+-(/0?E1(?C$35@&8H'8&:& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C6A20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4035 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20766 42 84M = 20766 0 ACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGG .21=H#+F;BG9-D='*6(6;46E)F!3,??=5G!*E?GEA-=987:(*#0B(#*1B9F0<4ABF5"'H)*%(B-'%)$?F'-- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YT:Z:UP jpayne@0: r4035 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20766 0 * = 20766 0 NNCNTCTTTNNTTCCGNANTNNNGNGTNNNTNANNCACAANCGCNTCNATCNTANAGNCATCANNNTTCTNNNNANCCNNGANNAATNNNNNNANCNNCANNANNGTATNANGNNNCT $!$"#"$"$$##!#$"!"##!!!!"$!"""##"!$$"$$$$#"#!$!!!#"##"$$$#"""$!!$#$$#$$!"!"!!""$###!$!$$#$"!##$##"#!!#$""$###"$!#"!#!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4036 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47231 42 114M = 47104 -241 TATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTNAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTNTCTGTGGCTAGATAGTG 9!:?H5$5(;&6EA0/"45"6$<)87$B(,424=E-0B6#2(-&2>D5039-H@6E5-99?9'6D+!;87$D4+7,#)C-5GEE2<8F%92.=1/-H,4*>&=D!=C&G!)8E" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26T69A16A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4036 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47104 42 48M = 47231 241 AGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGA 07?4;0*;+E.!68G&$:.GHD710E,D3(-1'1<,. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4037 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19426 42 126M = 19312 -240 CAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATANCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGNCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTAGCGTACTGA @1B"0?4,+=%G=671F$A()<@!/=:-:=!G48?0"'@9+F3FF-9?*'<9&&C#C%@#FF9D8&2C/"4<@:>'@'-H:5 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26C16G20G51G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4038 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40449 42 50M = 40269 -230 ATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAAC )BH;5=#7+&F=351G"$B>21C6AE(';3.">>&(@>7"9)',%2+H!6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4038 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40269 42 118M = 40449 230 GGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGACGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGC 1>*D;-DE+?E"FA2=;35HH&59'*>..5#?CD9)'D1G$-"AG(D6$%&)8(#%BBB804#."+,5$GHC;*,?+$6:&7G346=%>9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4039 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12581 42 59M = 12581 0 CACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGA B@89?F7&-(1!8@=)='9G".**1:>-85;H":H%!6;/H87C09&DH5*6G*(E8:G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YT:Z:UP jpayne@0: r4039 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12581 0 * = 12581 0 AANNTNGNCANTAAGAGNNNTANTCCGCNGGNGNGNANNCANGNCNNTGCAGANCNNNTGNNGANNNNTGCGCTTACTNNCCNGCNNCNGGGNTNCCCNTNNGCCGNCNNNAN "!"""$$$!"$$"#!#$##"$$!#$$$"$$#!##"#!!#$$!"#$!#!!$$!#!"!$"""!$!$!!"!!""#!$$!$"!##$$$"!"#"$#$!#$$"!##"$!""#$!!!$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4040 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39298 42 107M = 39110 -295 GTGAAGACTATCGCANCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGANATGTGTGT +&C&&030(?&E48@'("-@D"3%(>6C09&'F:0.(6@%:;;FC3)0=,+&6'*!4:(;G4+&8059-!F(0(0!;<0;6B7G#(+#D+"3AB$+"9;.& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4041 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12063 42 59M = 12159 209 CAGTTCGGGGTACTGGAGGAGGCGGCNCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATC 7'.E/96GE&)?@##6@037A7D7!(6-(FE-!&E3',..58D*7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C18G32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4041 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12159 42 113M = 12063 -209 CGCCAGCTGGCTGCACTTGGAGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCNGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGA ?A:1+/#;G"3-&0:517:B+%:'%.@A&/;*-F)1$H5)C4#(#9";*E/:(?HC4)7DC4G$$"G?G9(:6-/BB-"= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C25T66 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4042 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42691 42 45M = 42873 264 CCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTA C,6@33DB%!1B69@2$-!)*&G.24(%0"E3(!@=<<%"G'A.G)!++6!0C:)'>&*965DG&:0%H8B;H,( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39C25A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4043 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13442 42 76M = 13230 -288 GGCAGGAAACACTGAATGAATGCANCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGCTGCTCTGGGNAATNGACCTGACAGA @="FAHE.@;9'1#&4(=D=':BE%30"H1%',";3#A:%*EF.1<1G=G,D"3/82((8/&69)E*F@G:$C':* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24C25G9A3C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4043 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13230 42 148M = 13442 288 ACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGT C:;EH$!.:#5C4.D)1@"=(:E)*7H+835+H.>F"37@-5+:'46)$2%*1%:!91*>:+B4)(3"!!'2;9>'<1@:(>%>E=:/4/D.>9#0"*E<3/F!2#+56#);&#%501="!=/-'>D=C,.,;.DF+(;-C#;1"H?$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4044 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44047 42 98M = 43879 -266 TAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGC ?=AD%C$E;!>9'2,?!'2>6&H#/:-;G!>6(?@BF-HFF#&.=;1-)8&3+&2>%C514D&2>2G,?%-122A3CC?>*!9.B1"@6E()H,?&$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4044 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43879 42 162M = 44047 266 AAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATT A1+*8)%<;,"/68?/3>>,+;'C*);<20D'#=?>B):B6*<"+A.*?3#9HE.5G4F@@E86'((+>DG,4*=36!C4?4*H2E$5@'@+9%5H,E+5#G#2<-)-E;/.A2DF;"D$.)<+DB4G3'2H2;A,$3::3=E?D<#84 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:162 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4045 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4313 42 184M = 4580 330 AGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACACGCCTATG 5DF#+&%)%;G!=*<=1,+$-4?3'F@B4%-)*7@!5,G8->D.0A('88+?=.C4+?%=)5,A37(1.->.HC..39A+%$,$"+C?5143G@0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4046 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39206 42 56M = 39366 200 TGNCTGTGGCNAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCNGCAGCAAGTGGGGGACAGCA )"!&#*(%("'**%++)'+(+!+*%!!%'$')$($#'&((!%'()'&'$#+$#''( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T0T6T0G24G20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4047 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40551 23 14M3I41M = 40618 188 TAAATGGAGTTAAATACAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATNACAGGCCTGCTG &+#&$)!%%)&&$!+(*&'+&)*&!!&)+&%*%#+""*!)#(((*+"&)+)&('#$"" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:2T39A12 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r4047 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40618 23 121M = 40551 -188 CAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAANTCATGAAAAAACTAACCTTNGAAATACGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTNCAGNNCNAANCNTACANGC (!'(&&%$$+%'%)*)(#&&&%%*#&+*&$'&'#%!#!+!'#%!()''*%"+*(+)+)(%!$)%&((&%*''"(+(%()(#%'+)"#%&"&#%$*++!"+!*+)*""'#))$'&!&((*** AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:22 MD:Z:1T0T0T0T0T0A3G0G11G19T5T51C3A0C1C2C1A0A2C0A0A0T0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4048 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3805 42 69M = 3590 -284 CGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGAT 0@<(;8?>;<<;B,AH9C3%/?FEH?'?!HB*6/*A):878H;.<72*.,=?42D-'%*%%?D==D:96 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4048 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3590 42 94M = 3805 284 ANAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGNGCGCCATTGGGAAGGNGATGTATGCCGCCACCATTGA $!=B=7?8'EH?0:;G<=);,+:+,+-4*=40<6.E$505G+6E?"*$@<5H9<'=*/'90+233+;57'.*>,2+9/:<1"E=&<0)*'&HE5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C54A9T5C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4049 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13856 42 121M3D113M = 13812 -281 TGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGAGCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCNACTTTG -78:?"%'2D&.(;.;'1>+.-7955,(8-'!H5A',D;3:?3B*/;&#*#F"334899H=1,DFFF:#6G?"@3(4.20?5E:**A57&*0G:&,A)"?8B=2@)?;-E28!<=>*5B74>;8>+"F/8E#6.6C0@?E><:E/'7B@1>C"")9&;4!8H7!&@%;6,B!.!*:;"!-%(A35A?=C72,G6E=+(/62A*)/65#,G/)H&(DF@,(-!H&-CE&H>1/(2 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:121^TTA30C75A6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4049 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13812 42 44M = 13856 281 GCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCNAAC <"1E-DE-5%D.F80;)=*,.,+78)-G6;-'0+&7+.%AG45,A-:2("6,$&@:&GB*H7("AF.D*DD:=7EC;;B19C@''4#*002$=>D+)61(9-2&G''+"1&$>"&)52D8#G$"&7F0/"!4&*;!>!<6H0./<('2H(B<$F4H&')AB-;=7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102A31T27 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4052 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48005 42 58M = 48161 236 TCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAA 23?)0295,;F2F'58#40**9@%B+$!)*(A2FC#50?'9627&97CF*&C;F;#)0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4052 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48161 42 80M = 48005 -236 CTCCGACGGCAGGCTTCAAGGACCCAGGCNGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAAT F;A#F56?/76G=6#=30.*D4AF8:C!.E@#%15,00-D8C7G4F(E0:97FC=H>=,7,G?G">7!@2/F&)3/(>8< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T9T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42522 42 76M = 42673 204 GAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAANC ;D8DB<%C'!.5=>%@A00<61B1;7C-H3'!14H;F0'?HD4'9ED,%#BH1-FCC'0,H=A.%:%5+A!(6A@E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4053 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42673 42 53M = 42522 -204 TTAAACAAGCNCAACAAGNCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAANAGACCGCGAC *04'6.&:!3+F&:>-2C3A)@<&0"9+783#$A03!,)'9+-%?H02"BH!; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C7C23G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2456 42 118M = 2352 -222 GCGACGCAATGAGGCACTNGACTNCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTNTTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGNCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGT >@3$5.#,0GD54E,B6;:#91%38660/)=3GAAD&'B&,%.>!(:+>229EDC:72&%$7&17$B'>6*FG.+,#!3AB)"($8A?-6@7,@-8@2+4#9*CE/#"A7<46+E9D5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18C4G34A35G23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2352 42 71M = 2456 222 AACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGA <+5+<;>+?AH361F2!C7C455="E+593(26+.3.,8"B%0?+7A% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4055 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24645 42 164M = 24488 -321 GTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGNCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTNAATAGCTTGAANTAATGAAGAGCACTGTGTTGGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCGG &+C:E!$0D7,*$)!9<1094*3$216E":E,$1(+4),';&-=&F;2D/(C<-DA2H=&A@73"2E6!;(8->;<;!9#;31;!3BD/9-A7;H8H6E/2B96<133:?,*0@F$99))?E4$,,(@*!.F2+F"HH0B4E7G,)CHB":;71,%?2+9: AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:79C27T11A1G9T7T20C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4055 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24488 42 112M = 24645 321 TNTTCTATCTTNCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATA ,((:$!G&F:(%0#4,(-3?3:=)'6+??6.-3!=>)@60'-A&++EC-2G5&+D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T9T100 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4056 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16581 42 269M = 16858 681 NGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGNACCTATAACCGCAGTAATCTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGNGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGAAGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAANGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGC $&(-E:8,."0(?:?(0?96-BHB4)4..B+-(E%0*C%""(71$#0/%'!0@:0-;7!0G8'%34E*C'>E@71?5>*BB#@9D/6>/2E$EG->,5"+C:F78DH)H!.!B::>',>?B'E6000;@%)'2E*F+?$F$FG'16>3E2?(@F>A=;6/?8E:@?:+&&-F(.'C7.?5,HB944'@/>9?9,:B"7-(91B5'GGCE?2"+F1B,E-7)89*!9:'2$CAA9.%39F19>,?#F-<@+F(3)EH9#>4!+FC9.525;@?<,6?D)GFF?C;4.9"E-)@A*;F3D4>B.H>$, AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A0T1A0A0A0A0C20C339G35 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4057 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5520 42 167M = 5383 -304 AGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGANACCCCCGGTATGACCGTGAAANCGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGACTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCA .E;7=$,<#!@8E&4E+H$-5@EAH<'@44$C81+)5G=$6B6B0?!@G0,+$$3H258:1,,;:"H4,/0C@@*#G)@-;;20D?,3DBCB&!1-B/3;2"*,9%*5<&+=9*2;BF%$(A6*DG*(676/./+D# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43A21A67T33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4057 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5383 42 79M = 5520 304 TTCTCNGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCG '*$"&)+($%%&$%"'(#)(#)(%((&)%%#&#$*+#"!!#"+%%!!'$'%!$(")()*&+'%(!$""#+'#++"*+(' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G1A73 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4058 77 * 0 0 * * 0 0 CACTGTGTATTCACTCCAACGAGTGAATACACGAAGCAATGTCGCT *G5-2(!4<15!#4A)/.:":=<>+A,F-!H;>F8<-6.+#>,!-2 YT:Z:UP jpayne@0: r4058 141 * 0 0 * * 0 0 NCNCCNTTNATGNANGNTTNGGCANGGACNTNCNNNCTAGGNATTNNTANTCNGANGACNTNTGTNCNAGNNGCNNACNANNCGGNCAATNTNANNNACGNTNAANGCAAACCAGNNTNANNNNANTANCNATGNGTNCNTGTTNNANNTATNTTNNTATACNCNTNGCNANCA #$#!!!$"!""$!"!$"!#!$#""##!$!$"#$!!$#!$$"$#$#$#$"!#"!""!$$!!$#"##$$""!!!##!""$"!!"$#"#$"$"!""#""$!!!"$"$$"$"##!$$""!#""""#$"$$!$!!!#$#!"""!#$""$!!$###$$!$"#!##$!"!$!#!$!!!!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4059 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29071 42 43M = 28792 -322 AAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACC ",-,*4)"9C5!!D8&1+(-!D#(:'?47"@AE"9?+.77;G8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4059 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28792 42 121M = 29071 322 GNCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATGCGTTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATGCCGGCCCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTATGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTA %"$+(%"$%%'"+($*##*+"!"#*(&)')%+(*$#++)(!#$!+"&%$)!$(&"#('&##%+'""')%&!"%))!%+++('+#!()###$&$)(!)$!+$!))$%$*%&(!%"#$*+*&# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T0C24C1A31C5G26C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4060 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40767 24 51M4D131M = 40568 -385 AGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGNTTAGGTGACGTCTGTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGG %%&*&#%+&'!(")%$"&!&!$)')))%)#(')"*)"*+)&(*'+&+)!"#$'%$$)#'$+'"!!"*$"()%)'!&'%'%$'%*(#)(""$(())(++*#$!))+%''$#+#'%$#'+"+*("#'%'($&%(#+%!)(#))%$")*"%!'"!%$*"'&()*%&!*")&*%'"&'+*%%#'"+ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:32C13C4^CAGG131 YS:i:-70 YT:Z:CP jpayne@0: r4060 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40568 24 44M7I13M5D105M3I32M = 40767 385 TGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCANCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGNTCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACTCAACCAAACATGCAATGGTAGTAACCATTCGGGAACGCAACCGC <9)=,")5'6?BA$G+?%2$;?723$9%@4G/77E)0&9"2@$5F1-?:4?*-">7$'+='0D@@-9>";+3=)=C)*<=2;H12>G?$.E8"'D-C6>"2.81$/!.@5E<6&)B57+"-'67*">*(/F2$3+/B=8AA673">B&-+)63D?>&!&"1 AS:i:-70 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:19 MD:Z:57^TTTGG40A54C13C13A13 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4061 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43528 42 162M = 43690 361 TTAATCNCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATC 4D"5::/?+0@/&>8."BAE3E>&H-0&(:@/)!G<&C2EF3A'A*>)1A++<6D5C=D8FB+8H+BC/812:9.9'@=&5>#9;2819!3E?2>@B6/>@'7&&9)B:="4:C!5C:)H2>518*1;7")<6:;)A*>&H<-H$49G"%D@G=3>9'*4)*8;!8*D<7FD#6D*%8=G1H-FG!F!%61".$-#*#!/*2FC- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4063 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27030 42 82M = 27262 276 TCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTNTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTATCGGGGCATCGTATTGT ,/-@8.(6%H>,$*,.08>C<2%<4;=+!=+#28=45)$"1(4F8'$!+C6)@*6.("0H2(@#%'(7$)0(/G*7(22$=0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T31A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45896 42 56M4D257M = 45753 -460 TCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGNAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATNATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGNGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATNACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGC (,B7D/+B!"EC@:%F$4@0?+*2.,.A+BG#+F$=6GC6D@926..578;>/6E%,.BE;H8?7?0"<(>:GC(8F9&/C.24!,6!2>4H:5?>7(>C&*3G?2@5'?<;F:>9#7B63%AB/9#A#B*/B75%>.-FD#>1-!'=F0;5:CA4(/.>C:G>5!)%#H9%0-FA,C*+"4)317<0G+E>%((55EE;E@="1.E7)<8$#=8F>9#3B0E0F;GH<;'DB0>22:9.22,6=@#5$:?F*C0H(D--$3=D0!:?,!61$F.-7+CD56C04B.(4:2:?&(%$$G*=B5;:G!::&?+-,D5%0G1,C*&*6>G#1%31/5#1;6$%A68?FE@+,=+,&>+-;)GAB1@3:)&)80D-8=5:98"/?+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28G22T5T8C6T49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4065 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35680 42 236M = 35557 -359 TTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAACGCCGATGGCGATAGTG @&;(*HB*A1/0,""$GG*""C@,6/!5'D3-9308.18,@'A>5>'G-45H+9#*4)%=9(9F..''),.",78(%<96.6,)@E-D1'"F6#(1>#2482>0)1(B3"=4371@(?D.&#E,-4%79-8BD.9C091:!+9G%A5B((9&C>3%)1:G$FB@!87B@E0)3,0F<2&/80$54!G$!>8#3BEF5$+>&,"+05488C0$9%-EF9H9FB3?BH8>>/DH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:219T16 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4066 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35083 42 133M = 35304 270 CATGGTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTCTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGNCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTT &$&&&)$+*+%%#%+""*()&*$$'+*#+*'&"%(!$'$+(&)(&*+*$+)()##*(*%&&$!&"("#+"$%+!(%&%&%#'&")#"+%&%+*&%)*$""$#&"$#!!%*$"##*'+%'(')"(&'$&$&%&+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T60C8T22C35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4066 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35304 42 49M = 35083 -270 TTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGNCGTGTTTGT *#)"=91D,*D%42+819')+@'&23'/H*+46E#$-#897/.=&1C2>FFF%7A*;!15GA>(8@H)H'61(1>(.-10!"!B757:'-?0">?C1F;@@(*:!*.)-&0'D./(5>:'24!F&?GC;(6,G<3&EGE#H(8/%0)#"*1= AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:89A55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4068 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31271 42 191M = 31462 336 GGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACNCGCCATGTACTTTTCANCCCGCTC 2B-3?/?F9"E32!0E:C7G0$.9,58B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4070 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17690 40 30M6D114M = 17840 264 AAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTCTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGNGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATA '1A5=!<628*(;((9;;D81AC@=,/1"4=>+)$9=DA:5:@$D.$9-A?D'#:*#7#'&@1*A&F&E9!#H?G5<*'<%(/!?=8-/D3972'>&."@-4-1AB*'E+))@//3# AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:0T29^ACCCGA9T29C74 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4070 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17840 40 114M = 17690 -264 TCAAACCGGGCNATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGAGNAAGGATACCTGGATT #E$HA6@49@69%?14EE$/2G%":-C*?588.!3+<8C7!(H)-,)=:.)E-2:$:%!:.55(.7=.>,75(*.G:G)7!A'D755<91E1A8*6>@D(%G1C8CF&:2<;=1&'HA4G4&'=$*!%":HF&3<5C=*<&=HH1G-6#251B@,29(B:>&*#,$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A122 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4071 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33344 42 106M = 33218 -232 TGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCNATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCA /C-(%:G.;06.4')#"5-GF6B(9)$0+5D'"=9%-*6>;2=EC36%:8>%GH%15>(%1-2A07!>B=6$1,=$&8:A"+H)#GF<(3>4/=&H?1-)8F/.@+?$8-3'!386::@E1/4H'G%B?FH+A7)E*G:9):*;:.C551" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T78A52T24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4072 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32631 42 74M = 32705 235 CGTCCACGGNTTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAANTGCGCATCGCTGGCATCACCTN C;B+$BA9>D%#07*39%?=0>3* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A41C21T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6132 42 41M = 6349 261 TTTATGTNGNTGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAA -B-+'0C#:D$(.#"@%BD5)$?+F4)"EGD9F@F=H429' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C1A31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4073 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6349 42 44M = 6132 -261 AATTTACNCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCG 0;E.%G7!0=444C+E,G=,B(?A&3E5@,'E(-!3?$?8(%), AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G36 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4074 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17027 42 153M = 16767 -413 ACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTNGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTNCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTAT +4"!H+3#.0117.(C*8%6+#B#/78**A3DD(DGG*'?4>#9,<):F"+B>("556=?*AC1<*39D4&00,62,8'99$)57@+#?G:C/?!0@7+B5%C7/G-1/()A@@*/7$C!#>3.3C>)(*?529-2E"+D53D*B=D0@7CG6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59G22T70 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r4074 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16767 42 91M8D161M = 17027 413 GGCCATTGCCCNTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGANGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCG H'DE.?(!@>6."?<>92,8D13!4(.G!'F'245,/G",6+FC"";./,5"HAFD5+4D)!E9E"D<&'B4.*@B%0/AAC>/B!58H!AA;:9' AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:10 MD:Z:11G79^ATTAAAAC69T91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4075 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16030 42 105M = 16316 347 CCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGATACAT ;97G'B)"0&(%#64'&3H,(-G1F78("$!<&+#">=3/D-5G&&':674-+&+B)'F0*12<4"?=&++7F?%%<@02:2)*?-68.5*+(#9*!E3-'1/#6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:100A3G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4075 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16316 42 61M = 16030 -347 ACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCT !B$+'/$%:51'73151'A)%':6.*C6$4(CE8/D%,=0*?:%4))$8&C58,D>F184D''/@0934!,;F7*=(G>6:%.A?F-G=#C=AC4$D==/*+>+9'G-D#78F21/-/A/9*.A&+7()#$!B%<@8/#&$H89$8555F3F4$F948#FA6$F'%$,"$$<#3$-0(0/8"@D4E-B*/A-3F3@D1H@2 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:74A6A0A13G21A3A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4077 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39287 40 48M = 39411 251 TGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATT E+'('8F#E(20>$%/>*C@4(;$+.D1B$% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4078 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32445 42 232M = 32677 369 CCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATNTCTTTCGTCCACGAATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCG F15,9!>C/&+??E'1/.<@7@33%+B:C=;,5!">+/!A6@6029.%:'#*$E9;=.*"%4B/H8H,4!3":H01.D?7%0+"BC*1$B%??D!4A;6B>78-!-&"HH:%9/,"69%7<5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G47 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4079 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42295 42 285M = 42219 -361 ACAAGAATGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGANGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAA /"',-40G9/3#*A9F.D;>5C2>90:D&9G5D)5?:A"3!@E!69&D/&:-EB?059%0DB9G-GB.:/<%.:0"BD8FA!6/5E#D3'1%53,6DE%!++8G253>G#A<7D*C8:E@H#)4%(%E@B8'+4'(*DB06)0'./".2,.HF-DH!C<)!2,H@?@,0?-6?;#:4---C@.7CF-$G"1?',G@/E=0E9?;%1GGFE'&/*8"-,=G2A.@.!;)C/@*9D*G2+)76@1.D)C*=;2=+052B.*()DA+=>);:?38--3B; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A124A11A140 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4080 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34767 42 49M = 34767 0 GATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGG C'E,*#FFEE=$4B:487C:1;#0,=1$E#/& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A3 YT:Z:UP jpayne@0: r4080 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34767 0 * = 34767 0 CAGNCNNNNCCNNNNANNNTATNTNCCTTACCAGNAACAGNAGN !"!#$"""!#!!""""!""""##$!$"""##$"!$!$!"$!"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4081 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18970 42 66M = 18800 -236 TAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCACACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGA 9+C(,3$82B#1F2%0BF-4+<"'@,>1C?>&%G(1'D&F-,#=D7?9%(H1CC4G$*.2"<;H=< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G34 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4081 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18800 42 67M = 18970 236 TTACGTNCNAACNGCATTGGGCAGATATTCCGCCGTGTANNTTTGCAAGCGATGTGCAGGTTATGGT '%%&#()*!!$'%&&++"&('&%*!!%&$$*"""!+'#+#$'"*"))'+&#!+(()&$"'&!(*+#( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:6C1A0C2G5C17A2C0G5C20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4082 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8126 42 143M = 8269 278 NCTCNGGANACNGNNNACGGANANGGCCANCNTNAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCANAATNAAAGTTAACCGGGGNGATTTNCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGNTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTC &%!$!)'))((""&&!*''(*%)%'('"'#%)*))*%&*(+!()('!$"*$%)&'%+#$+!)%*&!!")%))!!%'*))'&)$!"#'&$'%!+!&'$!'"'%""&+&!+##*+'&"%#'("#)"*')($"!$+*!'+#$+&#* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:20 MD:Z:0A1G1C3A2T1G0T0A1A3A1G5G0G0C1G31G3C14G5G27G24 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4082 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8269 42 31M1I104M = 8126 -278 GTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCNTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAA -7,;@,>06%=84&%,5>5&7$+47"**E7>+,4.B9F"9A:83A;7''72:D8*48(%B'E/'>GC5H;C)*;7$3=G:A,-.F(). AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:60G74 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4083 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11858 42 165M = 12054 268 GATNGCGGCGGCGAAAANGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAA 7"1(#>H?&3A(7;#';F?#4A/6C*+*;"E.-=@=6FC<=.)(.&(+:FC'8C@%/3G:9C?C07826D-+G4$$F3&?1()+$1?+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G13A147 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4083 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12054 42 72M = 11858 -268 GCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTG 1F'A$!2"6H(1/18'4*B:D!0*'(3H!3..D*%'=HA+;0F$&./9H;6;=3?98:"?;6C/H9$($)@/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4084 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 667 42 92M = 563 -196 GAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTANCAGGCTGCGGCATTTTATCCGC ("%*)'+"'+'*$!)!#$+!$#')()&"$$&!&)&+$$"$'"#&+%(($&+&+&+""&))""!(##!'*$)+#+&%$'!!*++"*+%#(*+) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69A16G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4084 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 563 42 65M = 667 196 ATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCG 7-9A<)**,,%#>=A-B2*>:&>A=3-#65?GE('D**.*"8'.7-8'F9:0E>>?2A@@23A5% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4085 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34125 42 97M = 34222 358 CNATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTG &"+#&!!!"&($'%%(*)"+*%"$)$$#$("'+$)'+$%))"'!"('+'(+#+$"+#)#')+%"'#+("#*&&+%)+)"%%+))#+'!$++&$'"+% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A95 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4085 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34222 42 261M = 34125 -358 CNGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATNCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAATCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAANCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTN C=%*B'"*;-=@2"$"0"=5GB%-4&&$EB;H##-B8H:&)9B":198&@"D.#.<=:E/E6CC!>=/"4DG(!&75!B@7%:%<852#0F<6-4-E0>&H&2$C"H,G/+.4?0/!;.0(D9%2*!%!B%?/2:;$?&*;#=3FABABA!-:0D%!HE6.($051CE,H-:/-D9)9$?%9F$=(""FGE+$(:#A' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A94C51A39C43T27T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4086 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30589 42 93M = 30731 228 ATGCTGAANCAACGATGTCTGCCATCTTTCATTNATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCT (95$GA%>9>G<6H7.&=?).4B*';-(38*D=$:?(4''C*.#:35D7@-.3'%70@3/-1<=+?;'8>'H3"EE=5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T3T20A59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4086 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30731 42 86M = 30589 -228 CCGTTTAACATGCCGNTTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCT C7D78B%%A/",7@=H66#*/C"+E@>$=6&E-!A*1905,=:+57G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4087 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11577 42 278M = 11499 -356 TATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTNCAACNC "7"-@%-AC6DB;>#&@)/?3**%&""%>4=56>%=#D0;99=&4.3*CH?#795@(/C=9"<%0?9;6H1C2/!#/*@&C33<+EH346A)@(*A"5'24F.:5D0/,;9;/5/%#'%%'9#C"3)F?.9$0%%!0?#&&5B;E7)A+#+0"!%DH"0#8<)9.<@>7,,2=%<5&"%+91-HF0:>@G+/D3.G#9,;6/,328(B57!':4447G!B2.G!::-(4B/(:,E>B$,=47#@&") AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:271A4A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4087 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123C375 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4089 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 179 42 74M = 15912 15802 GTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGNA %=)3>5+>C8(74+30@H8(:9,DHG@.BD4$+$/>4D#0"/.4E7!B,'+2;#EB*!<3!6,;1$GA8*4(#% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72A1 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r4089 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15912 42 69M = 179 -15802 CCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAANAC 0*3#*B@9&+9=?3'#A,B?(5G.649E8!6C2@.?:9(1:"@7%39:&5+H5B?/.9+4B>$!D"46' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A2 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r4090 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44502 42 108M = 44339 -271 CACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAGTAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTT 28/.;:%E))&>9FC8,(7B..:.!:"&?92/:C6(8&;*A&*(/)!5::(6@$,C%(E-6B):G<(#1&9399/9E/=G(E6792H1*?.)D=9!4$"G;.B6!:)' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62A45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4090 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44339 42 115M = 44502 271 AATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGNATGAGGCTCTGGTGATGC (3*!G,#;@<(.1F'9?4>BG1+#?%<57'(-#G2;EA*0.F@H4:;/;H9?D2%"C@CF9$+:%$5,"<1>"EG%:=>2/!,=33-<$'"%"?40.:F8G+$1(4CE2$A3?":;*E.++H@>>%CE*(226<05+$@#'@!G!+(87+#9'39-40-92G#%?$9E**0G>0:'D,$1"1<7G=9.5.).?0&(%6DG07=.8$!2C*@$(>"5'<&.AA!<412D6@B@G=A;!0@2E)E8B@8/E0H;=:*G;,%AGH5?:710A57(4?<-+,/(9*:*/0:;H&1--)HG$#H<*/3G3,)!/C,(1D/>-0/775>B$850GD>A9"FA7@.B3E-FFCFC" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8234 42 66M1I36M = 8373 230 TAANGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTTTGGTGGGTAACCGTCGTNT ?9:*@?/A18EH4335(<8#:C?:D%G4:0E0)"0@18%$$=;":"B7296961F@HD8D3*A4393H2*&74:%GB:?:A)==C.A6'*<-+B*H>'+AA1E AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:3T78G17A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8373 42 91M = 8234 -230 TGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCANGGCGTTTA ?F&.5>#HD*//6A+#%4E*/$>(@A<#62-+9;B%>*13+*$.2@'-HF'2>#EFE1B$2%994,!49HD<*H!1#@"3*!$HF!6H)": AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82C8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13184 40 103M = 13443 319 TATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGNGTGACGCTTTCTGTCCCCCNTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCNGG $,6;"725"*54@B@9*$%3.6D*=!?&-5:2)6%<7E=**@)7(H%65*2.@><7!%1EB9%B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50C19G29T2 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4094 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13443 40 60M = 13184 -319 GCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCNTNTGTAGCCGTCTTNNAGATTNGTGCTCTGGGA )*'""*!$())')#*!#&#&#!'!+*#(%!)"'%)!'$(#$($&)"#&$*%'#*$'("&# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:26G1G0C1G3A3G0G0C0C2C0G1G11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4095 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45706 42 178M2I54M = 45938 454 CGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGAATAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGANCGTTGCAGCAATATCTGGNCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGNTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTNAAAGAAG EE/5-1F84D=C):=,;;-D7:)H7D":)!==>(590;"H>H.0'.1A-,+@)AEA=-3.3E=E:FG.+A8)-37E/6E8:6*&%B*C4B4D(#8#?;+-"06D$E35D1:A>CB3EH%H;1C68#=G6?&:35..-6/H$">:4.@(E06&H#GDAD*9=CG=72,0,C8-1%41(4>E'@,6!)5GH#F2;"AE'F:C)2+3#ED,2'!H:HE'2B%A7<88*4524?E+2.(,<0GFAE@=$95+=)'"2?6211-:8.(4F6C-=3,%8?B)3+DF38,?+E*-G%2AAD(E>G'0B+$F9C$7@=E.3H>*C?A?DHF&6H'8,@G1B*,/=@D=F8DE/>7"C*$,'::57=&%;$E?2E2#563;9;!8E)1?<&($#C@5HE2@B0*#(',A-;@6'!#B7&;9@!*(:,F2C,EA(1/DE@H(E?D!9&?'@"+?DHB9G82?D88-;>@#E8/348%>%">#DAH'@<&=@*FBC7=+2"%:.9)4A/GC=9*25B@1@;./;#+/$?>"@F.58%31>/8*2+E/!&4&!';$(BB:7F9&%?'#18;F.1$'@'$EFG$D/,B">?D:B'7)-4@.E->(8/:/.E500&0HE;:"=B9;+!$H*57;%BH,=.B!##A1%'#?);2'6H!G@0-0E"G(5%D!;:=B"$1*">;/0"<7%5+CF-7=H3HF$+,2/37(F%C<$H&>3%.@CH>G$:,/E4'6./7G?":*<(C1(#0++5D(:61E!:%31"D=0=$GDB>)%(=@17G68/>HB?*&G,-F:!&,4F9":"53>0("9,&GEE#47C9(:@495EHD8##!1(>E7>)*F=%(4AA9" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6G172A57G117C100C56C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44726 42 197M = 44923 711 CGAAACAGNTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACANGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCANATGCGTACAGGCGTCATCGC ;7D&,H!?C(75!C/07#?(8!8:!+>0/DF.?&/73)F!;6F;;2<<29=?@86%&-0.F@+(:=<;?E83;3@*8*4#&C*;D9/;54B*88*/G2*0"#$<>9>0:G';8C6*)519A(1@A2:FH3=.@0''1D0CF602HE"E6/03)=)E"C52C+%HE8#7#B7*G><&A5G'A/(=,6'<,5"EH247H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T59G107A20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4099 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7428 42 68M = 7496 211 TTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTNAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCC EE-F#FB:!.=%2B.?03?7.@4D:A$3,?"%"B,"1#<89?:27F3>)$3/BB@@B<.9A)1>3:.! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4099 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7496 42 143M = 7428 -211 ACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGAT A!G19E4:%7;-A.8DH1'BDAG!51;)+!6?=E@#C/>->.%H9((.,@+B1H69*8%7B!?7G1;.@4D)F("&?(/&6$?=,E64/CH1237D(8C64/>+32(GH&,">1/A7592',%%(.8H:.:DD="1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:143 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4100 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11049 42 63M = 11049 0 CTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCGGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCA 3%C1#F61#<3?))D@;3132(B71A:!.14<*?$2-(0G)0<8.?2@)%,'6'<@#!/>>;. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A39 YT:Z:UP jpayne@0: r4100 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11049 0 * = 11049 0 CGNNGTGANNANGCCNACGTTNAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCAC **$&$('#"$("#&"$')(+'!($)(+%++*&#'%*%!($!'!$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21828 42 58M = 22064 293 NGCACCAGCATCCGGTTGATATCGGTGCTCCTGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACA !5%=9B!8G7$8?3.2!%+8.5C#)/+#31*-DAD9@B*"99261(9G+5*GE"(;%) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C17T11A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22064 42 57M = 21828 -293 ATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGGTATTGCACCGNCAGATA &%)'"!*$'*+%$"$'&+"&+#(&#%&!$%"$*')%*"%%+$##)!**"$"+')!*+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A10C6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4102 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26304 42 66M = 26078 -292 CAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGANTGCACCAATCATTCCNTTCAAAATTGNTG !%#*""+++!&"'%&#((#&%!!&)"(&+%%+#(+%&&')($#%#%$%(*%#$*&)'"%%')(+*# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36T15A10T2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4102 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26078 42 146M = 26304 292 CTCATACAACNAATAAATGCGGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAANTATNGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGG 0@4,@$@D2?-6;:6=,2AH@8><1B12!?>&E6<.?@)@G:5&339C'D5-@#F.AB4ECGE9HC6&%G(#80"B<((0(@'+'-F*ED&9#,,'(6=BC#E&$9!-@H=2 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C9T74G3T46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48346 42 125M = 48213 -258 AGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGNACGTTGTGATATGTAGATGNTAATCATTATCACTTT C?*;C5=%6*4-,B:8(6+(4$+G02(!B(D7$E0.%+@C@@CH.B!9"DD&5"FF>3=;G%+#)!($*(:(4/!%,"7%9@(FB.)(/6)D+.<"D%CG"@?.<.6%@-@">50#0#AD5E$:= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88C19A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48213 42 58M = 48346 258 GCTCAAGAGNGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGT )-&8;4<5-??1':D:35H8H:7?%F(;7H)&8B;9A)A88(G"!*(>A>@C/'(#&? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29300 42 193M = 29186 -307 AAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATATTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCAT ?37##)GA(,3?/7>:<46G6,'<#C6$+5+?2&8E$F("%$?"5"B.'7D)%/+=$93D"EB-0'6914@G$.>2.:"E,!%6&+8E1C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G104 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4104 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29186 42 114M = 29300 307 CCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTNCATA &GC7H3(0>7:0H328&C8E#-F;34B&E-A%-(C/13%BGC556)/#D8C=:3G&A=G@-8'5!'75'&,F5F7'?2A!0-F?8"$:@:%:.;$36E89&//:4(B'2??(9: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15473 42 97M = 15317 -253 CGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGNATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCT 6F1#!'GB?;F"7&?.64B:7#3D63:!FGB,G+).:/66;!?)@CCD1<#<3%&5C("F/3B1<87-;>#@+87H06D"4#=4=7;2D)C.)A/7# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56C39A0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15317 42 101M = 15473 253 TGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTNTACGAGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGTCGAAGGGGACGTN >*+''=3;3@)6E9=?BE'728?((F7#H302;71%5&4(/4>&?.E:3,:*D:227'1?A'!A!4;2><18)*'5$D.*.(2,;4)HC&?-.DD??.DC) AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31G4G50A11G0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4106 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2385 42 205M = 2338 -252 CAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACANGA @5<;1B';E.0H)$+G?3(F#"4>1>.%CC%2HF*H$:*054643.!.D*B0-91:4)AA:!.?5:6!DA&-!-7)D<%D:=&5!'&)8HB8+:@#9-A)FC;F$30!?=9'.;)).C/.!/)?4G&+;5D":B7#0.+DH*F)96,,3"<%!?C/1<*A50'5/G15A?%@C+0<%DE@(EB/1#E6+&,7=0/#1>.':C%2E&:<<>&1H8/6@+!A9'GA- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G7T14G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4107 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13762 42 57M = 13916 194 TTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAG 7E4;%F#A2*F&#D(:?BE.**H'8*/$E->$FA703G6"-.1!;B1D0#(,:7F+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13916 42 40M = 13762 -194 TTCCGGGACGTATCATGCTGNCCAACACCTGCACCTGGAC 54F)84?<3DDEGD8403F6,9,!)AA=E84.;&4/&C=8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4108 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15898 42 128M = 16026 216 CCGTCGCAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCC #>)F-!.GD#1!74>9<),99A":#*2:+G.2C7#'G,H-))%95)&A."1<'G3B)G'8;!27749',><'=<@*"5975?5$<%9=%))'D;7B6H01+>&F0$9HB@;@+E%CC!:2#-0#>$%? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G121 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4108 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16026 42 88M = 15898 -216 GCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGTCGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAANAAAACGCTCTGGTCGTCATACACT B-"8'C+8"GE%;95=29#GF,#.3@B)4!0&/**/!!H6F&C3#0A<+G/GD,EE-)>'#!2?7?+A7?4G5!:>1.);#(+E%$,* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A31C24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4109 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10791 42 72M = 10964 224 GCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGANCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATG D/=#A-24$E#(E?>H!F<.=1A;E?1,5D:=."HCF>9"/F3,);3D4BG"9E?;$D%@@0);D+52;;!E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T46 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4109 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10964 42 51M = 10791 -224 GGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGTTNNTTTCCCTCTA *+&'(#%('!"*%+$!!&!("'#"$"$")+"(#+%%+#&!#)*#$)#$$&& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:37G1C0C5G0G1A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4110 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9124 42 96M = 9052 -168 ACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCNGCCGGAGATACCAGNTTCACNNTGNCGNNGATGCCCG *($')%&(&(&'#%%($)(+#'++*%(!($(#"+$#$!(&)(%))'$!$&$*&$')&)&'"!#%%"'')'"#''"+*#+!!*("(#(%)%*%''"' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:51A6T14C5G0C2G2T0G8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4110 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9052 42 72M = 9124 168 ACGNTGACAGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAATCCTATGACG 5A;6!%=2>"<6(?!'+15+*,-")B'G)&!82("AC%(#65:5(CA#7.";3%%-.%>?'1BA7$DHH+06 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T4T52G10 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4111 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29365 42 54M = 29549 262 ATATTGGGTTTAATNATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCC 24!@%)&8(A(B'9=$789)B8-0+!9D1B&3;84*@"#4C1?,"'@B/C:B4% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4111 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29549 42 78M = 29365 -262 TCTACATAAAAACCTTCGTGATGTCTNCATGGNGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAACCTTTT "''"+&*+#)###&$"*!+&)&)'%(!+!)$%#*%"%!($!"*)##)$')!"!&%((%&!#)"&)'$&&&'$%&!"#+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C15G5A39T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4112 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4255 42 100M = 4526 330 CTCTACGACAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGNAAATTTTAGCCCAGCAGTTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAANC #(%+(())%%'+("$*')+(+$%$&'"*$*+&(*%(*$)((*)!+)&*+""*#"(&+)&)*+!%&&&%!**)+'#%*'($"+*!))+"&!"##%'$$!%' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A0C6G33G7T9G37A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4112 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4526 42 59M = 4255 -330 CAGCTNGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCNGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGA 2,<:8)<=@28<89#@752<1%(C/';$)23#,+*(2H>;=6(1-6.<0+C?H/-FDD) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T23G29 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4113 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4474 42 151M = 4664 241 NCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCCGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGCTGATNACGGA 0!3/3<>">(=8/='$!7(B1@@C/&&/:58DC'>>H(/#"G5@%8DE56>*&#/?'"H0G'E*E3:E+"5>6EFB>=72&+#CE02ECG#86$/8H(9H?=% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G80G58A4G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4664 42 51M = 4474 -241 GCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGNGNCAG %%*%')+%)!!+')(+%#(&!"&*"+"*&+)++(&'%$(#*$'&+&'%!*( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45C0T0G3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4114 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27422 42 309M = 27731 477 GTTTGACATCACTGCTATCTNCTTACTGGTTATGCAGGTCGNAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCCGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATTATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTNT 7FC'8E)H51;E%"'F9(0-9459E;15+(*-<=E-&5HB6-H>8D1#,FE#B-H9)02!6-%&D/6'7>CA6!7:$,H77*;.@>48%G8#-4*24.4#F64:>12!EHEFC9!"@(-4/6"A&"C'=577GF*B.83?E17EA73.+-F:E(1>9..C$/(,)2)%$#"<%)C9.!B<&"%C39FD6?02>B?:50./:E$,%<>=#'>9=##$D%":2H;5!:)D2G$8?"9?3;(7)77!E=$C4)'7+@GGG0"2(*''E3/%;(E,'A0/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20T20T119T120C24T1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4114 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27731 42 168M = 27422 -477 TATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCNAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATNACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTACGCCCGAGAAGATG 6B?4):.>%B84;66"2,*$6&*G?<-F?(536;E<<'@7EE,A!!DABAA=D22AA(-@7,@3@D%3?&&+7.5-61$"4+!#A<=B)A?$):1.;B+,G56.%#H2&>A'? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59A9A52C31T13 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4115 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20013 42 54M = 19807 -260 CAGAGTACGGCANACNCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCT ?"31A,C=D,D.8)7;00EB"4(B'@?&627B,%.(64/6&&8:!':7=15F@, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G2G38 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4115 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19807 42 43M = 20013 260 TGGANNNCNGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTT &*')&!!$!(+%'+!#%*'&(&+%!**+'*&$#%"%#+#'!!' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G0T0A1G34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4116 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17548 24 136M = 17685 338 NNGNNCGCGCTTCAGANCTNCANGNTGACATTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGNAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGAACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATT !%#"%!%&&')!$!$)!&$*%%#+#&%*+'*%$&(+%+%#$%%"*!+$%("**+#'&**%"&&*%+('#++*#(!!)#&#""%'$"*$*"&)%(#)$#(!+)&!**!*+"*+'+)++*!%$*%!)'*+"+"(*((( AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0C0A0A0C0T0G5G0G0G2A2A2G1C5G26C45C32 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r4116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17685 24 35M6D160M = 17548 -338 TCAGATNNCCGCCACGCCGCATCTTGCCGTCTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATNTCAAACCGGGCCATGATNATNANTNATNNNNCCNNANTGAGNNCAN $)(+")$+")'!*)'%)'!%'++(%+'##*+*(+*!*""#)*!($()))'&"+++""'*"()&!+"#%%)$$&#*$#("+"**"%))+')!%+!#'+&#(+*(%%**%%$!+*%&#"&)%$#)'+#'!'%%*!&$+)'(+#!"%(()!+&$%+**&$%%+*)%%&$(&*&$'&"#&$#"#'&"$'##)"($")') AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:26 MD:Z:6A0A22T4^ACCCGA113A17T2T1C1T0T1A0T0A0T2G0C1G2T1A0A2C0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4117 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27950 42 57M = 27785 -222 GCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGANCTGATGCTTTTCG +%A&9@5C?:"*$!+(-+!B(-7#(+@("EH1*A7*C'23%'/&,*$:A*(H)G.A3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4117 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27785 42 51M = 27950 222 AGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTNTGTCCCA +1'G,'5G2BH,B>:>(D?7@)>/D*%*<:EC,1&>:D(EBF)!.1?0477 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A37T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19740 42 75M = 19475 -340 ACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTAC ?5&;=E1BG(;&@1,<2)@@7>F7@#"<*ED3D'E(#0=%09&%G*2/$*-D;.A7='C&.,'"5-%<5F<7G!9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19475 42 77M = 19740 340 ATANACATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGNTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGA %%)(&%*)&**$'**+""(!+"&(('$$&%*$''%$#"$#$&'#++'"+)**(%)#&%#%+'#&%""#*"')&))&* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C1G34C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4119 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29777 42 106M = 29777 0 CTCNGGCATCGCTGTGAAGACGACNCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCNAGCGTCAGACAT G0B?;&50:/.&C.:8>E@27%6>D86'DE?)BD&F$1#!0,&5H.!;%%&.E7'>.@B-,@!F;8$5F",@"4:7.A6*EA;A7!%:4/86C>(8&->7#(/0HE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T20G68C12 YT:Z:UP jpayne@0: r4119 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29777 0 * = 29777 0 TGTANNTNATTGATNNTCNTTNNTAGNATCCTTNCANTGTAT *%('%&&$(&')##"$)"!*&"%)&#!$%$$%'&()))&"'& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12383 42 77M = 12210 -250 GCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGT 4?6+7F-/";0209784$G1=4<7+&9%'4+'GD1'")42D1,,A@"05>!&"&,.=.$7+B7@!5(A,@4")24F< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4120 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12210 42 98M = 12383 250 GCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGA +#!*!(#!#%&)(*#$#('(()$$!"()$**%)$+""%)("%'"')*+%"#**)'&$"!%'#"*$*!$"!!%+#+$#$+&*%!#*(!!(()%*)(*%) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4121 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42846 42 64M = 43055 254 GTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCG 3%2#:F"=A*9"!>2'&'/,D/D*;.1#7+5CH///+)C6=-/>25A1'428+B/CCB(F5#%9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4121 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43055 42 45M = 42846 -254 AAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACA %#)%!&"+$+#$#%"&"*'##$$#&"!!"(&+"(&$!%!"#()"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4122 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19990 42 52M = 20042 359 CGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGC .3'2('8BAC9&()*=-;@-:/.%B806/28)1.@1)29.12+0-F10:.88 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4122 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20042 42 307M = 19990 -359 CGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGNCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTNCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCAACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAANGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCN :5$A(;G6%57!'?*,(8):;./A=H%.AC*8$F.;=F'@C@A=C+#+,!-DE,85+>@43GG;H#B#*%@>")1()A'=9$!,$,&D)<1')B?E"1=+#0)!E1C7?%$36'%??+<6+*01'C-,2%)8'D#5#%$9)>7;?9&-D;!G,"/"*(&.E)2@-08F+!E@FAH95%7%67/#*;6$'))6@8B!3#'<*8G1>02),--H!16!9-'A?%(&.$2EH677%" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:57C21T36C84C22C81C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4123 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27123 42 73M = 26957 -239 TTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATA AG'%CA%;/6.(5E,:(2/&)*%,)19".86$(9?*7:/'F0H+5-F"'/(B<;,$$='"&(D17A3B#=5#1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26957 42 114M = 27123 239 ACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTACAATAAGCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTNATTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATC *;&&8;:)G;6&?E$"'$@8&#$>B>/0;A">F$00.0E!D3B6GH%E*51=+87-19(AA;0/H*2):D2A4*;8@8/G#2<4:G)B&4C''H"E&9F738)':ADE4;2+A9 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39A5C37A1G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4124 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29981 42 89M = 30179 245 TTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTT *9,$,BB5&,A<1:!3=>?:H0,GB3123H>>H3!*CDG+587:9EA.7,H,+5C6#C*0(H=5.BE93-$.=!H!@BE*$AH!8C,%4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4124 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30179 42 47M = 29981 -245 CAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTC '+"%)$")&*')(#'$+#)+')"$')'$*!)+!&""$*)"+##%%"% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4125 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9399 42 70M = 9252 -217 CCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCT ;'."/?%B1FD9F.D0>/A1D)>6E6AE"C!*1>*<@C6D-*&/B"$.+(#36?8GG#<$FB*3.),1:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9252 42 76M = 9399 217 TTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTNTAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCA +;6+=0F#7?*B>5:-F?.&HH5;;!:?/$E)/9$3A+H:D7EF"D#<+@:)*#%$3%;=/1A(;8,2$)+D=&.3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5055 42 73M = 5261 246 ACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTC BC/@)6<8)!'1=84@8#BD#,=1/,:"(?9HC"&029-(2;,2F08$8!/+!=G%9?#!DEH"G3GHG!@.+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5261 42 40M = 5055 -246 GAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCNTG 4!!C9:C2/=AA2G#.:4&2>F(2*(7'>#1.5?;<1!'" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4127 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13195 42 78M = 13273 311 GNCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACT ##+%+&)#)*(%%"#&)#$+&!$(&&*"("&&'&('%!&"'$!*'&&"$$&"!)(%('"&%*'("&&(&)!")$)!&) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0G76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4127 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13273 42 233M = 13195 -311 GGAGTCGTTTCTGGAAGANCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCCGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAAT H;/;9%(F$%BE=+@?5"*G>8@'<81BDC8&5B4-G7;27,?2H$C12.=0D0,!%FD>A<#F&<3/3%/-6.A,>'D@92A*@3>/A#+@-F-4DG"*(8?6>!9&.!;=E>"GB@A8<,G8/GF?>9@A0<7DED8<15-"=3+53AF+.D/3/AGGD%)7A-HG2@>?>33$%/H,H+#35"27,6)G5(""G&>*5:#2F:C57B'=(@+A')E1!.>=7.3;?<-0E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G87A126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5489 42 56M = 5396 -149 AACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGATGCTCACGGACGCGAAGAACA F8/"5'$34-D815A"?8DDGC!8)F3?/A*/5*9?9A=*>-'H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4129 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19635 42 207M = 19893 318 TTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGNCGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGNATCCNGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTT ,)7)#+H!%HA:8%9"4'CD68$)A>D@&%?A=/,"/6?H4ECFCD5%$$92<$,A.(!1%D#-7-)*B@-D*H&"71::%,+1&F%$,4.D1#=.;+=1&=H'(:@)"68!?<9&C29AB200787;382EE%;+4?9?&("7;#7@49#8!!GE.*(B=&04=?<>*D&H$@G,6'1&9-4&0C67=$5)'@(G@9%-)CA=$H5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A91A4G63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4129 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19893 42 60M = 19635 -318 CAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATTNTGCCCGGCCGGAG =$H/"BD:"#*>*3%%*":6>5*4&(:?%917-CGF"/=7?)%&;-+=83"+E??;D82E>!%$!?A!$!A.5(9$+G<3'8+48BF(4H20;2+##)'@C;-0GF@?F$:12$C5/..7)@"=G?7##!#&!6%84;@/>18;*'0!*G8.C86C"$9"+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A36T81A19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 42 211M = 8127 366 ATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTNGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTNGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCNTCATCCGCGANATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTA +/;$46%D.5B,0G<$D.D5(,%*)A1CH"1*87,+68$($<=#;;2@%=-5G.C:/<2()1?C-.D)=4/9)5#23-@8*:=7;:3D9-&%B/;-,&.C$?6HA@'9=#7C%E4"<4F2,(/.*C,(("@7:&%=271$&8,0/,%*F0,;/'4+,!$:6(A?D5:$"5+*"");5B-H79.64'54$6E4$2F<24!7D";@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:78T48G31T10T40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26053 42 83M = 25902 -234 CCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCNCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTCGTGATNNTA '*%'+&#%""!'##**&**&($&%#'+'"#)#"&&+!%#'%)#$'$!*+)('$%)&'&!+*!#&")!+%&**#"$'%+&)'$# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26T46A5T0T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25902 42 108M = 26053 234 GGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTANCTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATAT 8G)#:.4'+@4>7116;&7B=2-A&D7H"G"C/:5;);E//>H7>FG!88<'7=:86&>/G'&+2&'#/C;84!"=/*55*DG?3+&:/@G@25F@( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69A38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23375 42 78M = 23129 -324 TGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACNTTCTGCCATAGNTTATANCTAAGGCATGTAATAATTCCTAATGNTNAAGCC ((%$+)!(+)&*(#+&'"*(%)+"%!"*!%()$$%!%!%)$)!#$#$))*%*#*$%&%&+('')!%#%)!(#&$&'$' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:26A11A5G19G4C0T1T0T3G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4133 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23129 42 40M = 23375 324 CAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGT .%%C89*(@:.?#*;!(BE%,B"B655C#.7;0H.2F3@E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4134 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9928 42 78M = 10060 238 AGATGCCGTCCATGAATGNAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTC '@"90)=!(.(44%E4@79@H18"2;+/6E)GD#6!15D975F)G!2G-<+H><'@BC<%;43"44*4&=:5C94?)! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10060 42 106M = 9928 -238 ATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGCN 7<6>G(D.5F@1'!DCFC.;7+<'/7F..$4)HA>5;892=*7'9G!+.-3:)+1D@&"C6"?$(?G)@>5;2';"0,B11DD9.D;"5(<>/FE:2.#2<93#&$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104G0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4135 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5807 42 52M = 5936 240 ACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCNATGACCCCGC 8+D2>&;5?0E>?>EF-+1'/&14DC=,--B,@9AHD-/D,%>?4;AC0807 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A10 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4135 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5936 42 111M = 5807 -240 GTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTNCCAGCGACGAGACGAAANTTCTGNNC #''+#%#$+""$'&(%**#"**&!+!)"#&!('"(!""*!*(!+%&)#%#!*"$)!*'#+#)*$+&%)"%&$"(%'"&&%%"&!(*%"$'+)!+%!"%%!+)%*&%#)"!* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:84G17A0A0A1G1A0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4136 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15328 42 56M = 15066 -318 GGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTC E.(F%;:F4EC1D8+!H;%$B(8#":#-6&=D%946A,**9)E>"$("2D$;/.C> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4136 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15066 42 94M = 15328 318 GTCAGGTGGCGTATTCCANATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCC F7FE;0#"*G381F(9B"&@39E?(A0660)(D!2D:+!/,&2CB+>C+7++5&/E*28=@.@23@73,0$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4137 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1574 42 120M = 1718 241 TACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCANCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGAC BD"E,&>$=-)D$+,H:3%F&*G=!@C75F<7;:&6725=%4+-8#/3B&.#H@G-9'(+HF7,'F50*3A-)$(F+!6#G3H%;+5*2-AA*0"7@>.,02CA,(=H$67%,F#DA*;> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4137 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1718 42 97M = 1574 -241 GGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACNGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAA "9%><4.1#=%3B%F(4%&*7(2;?(=(3E.6<1"+?9B%(>H3=7+2-C(""#GB'G7@/7*F:<&-'/+<748-!F<3$2(D-.6AAHB'0*./: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42G43G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4138 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7399 42 52M = 7206 -245 GGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTC 8C)+>*B:EA1F1.9;BF-,6@5!")<+A4!.-/?D8ED>::8$-0%<:'=F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4138 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7206 42 75M = 7399 245 CGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGA >&-24()$G"*"0$??F'-C$5,<%%8!'F)2$E0G*H6"<:D?6-&46G9;;#3C=*:0!/G?$'64$*$%':+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4139 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13070 42 73M = 13250 287 GGGTGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGG %)"")"(*($(+&$'*)!'!+("#&(')('#%#''(+(""#+!""+('&&(*&+&)%%'"$#!$%#"")%%%' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T1A70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4139 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13250 42 107M = 13070 -287 CCCCGTGAGGAGGCCACCGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGANCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCAG *)'%"))#'+!%''*%'##)"'+%*+)+&*#+$*&"&*%!*("()&%!!)$&$+)*)+*$)&#)+)(&+!&*"!)&*"")*)'#"!'"$+%$#*)#(#*(""&#+#* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G23G63T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4140 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 922 42 188M = 836 -274 AGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGGAGTGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGGCNCTGCTGGCGCTGGCC EA:4DG1";42G2(-9$0>5$*'.3F,=F4F36,0#G342'-5F2#>A=B0!*0&"0B%7G9:!($,(E6@F,4CE1(:27A582"9)*1$H-,84*D@@;GD1'B-@3(845,1)107'H'"8#>!?D2*9B@"&*@-7$%(G%E@,4@-&@GB7C AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:80C2C73T12T1G15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 836 42 86M = 922 274 AGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGNTGGGCAGCGACTACATCCGTG --$;3F''@8*2>AG&41@#/03)$3.DA7;AD!;H,2.EE#?<8E403"=.$=>-)<<<5;6E9','(3@G5+?*=98%3>H-5$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A21 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4141 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10821 42 61M = 11029 257 CTGCAACAGGGGGGNCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGC <,+'EE);@<3447;F--D")*?(<#@0C!*=*-;9)6=1>/*-<;>A8$==F"-?(B92, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4141 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11029 42 49M = 10821 -257 CGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCANGCNGNAGTGCT +'$!)&$'&"&)###''''((&%$)&(%!&++*'''+!#'")%'$)&*) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37G2G1C2G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4142 77 * 0 0 * * 0 0 NTCGTCTCGTCGCTGGCAGCCTCNGGCCAGAGCACATCCCCATAACGGAACGTGCC !!+"$*&&!'&%)+$)"#"$'+#'))!)"'""'($%+&&%$%'('#'&%))&#((" YT:Z:UP jpayne@0: r4142 141 * 0 0 * * 0 0 NATCNAGNNNATNCANCNNCNNCNNGNCNTNNANGGGNNGANNNTCTNCGAANNNNACCTNNGGTNNTNNNGGANACCNNNANANNTTCTGNNNNNGNNTGGGNTNNGATCANNNANNGNGTGGNCGTNGNNNTTCANGTNGTCGGTGNNGATNAGCNNNNCTCNAAGCNCNNGNACNNNNAG "#!$$#$!"##$"#""$!"$#!$!!!!#!!"##"##!!$!$$!"""##$!"$$!!!$!"!""#!#""#"!"#!$!$!"!#!#"""!!"!$!!!!#!$#!$#$"##$"#$!#$$"!"!"#$$"!#!"$"""!!""##"!$"#$$##!$$""#$""$$"!"#!"$$"#!$#$!"$#""$!!$"$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4143 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43270 42 43M = 43374 192 GGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAA 6:H-"89+0FE@>?,'F5'$B$B1)*F)#-BA4;B,8G4(C-( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4143 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43374 42 88M = 43270 -192 GTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGA "7HE:G(+*A*.+C@%HF-?CF7<.F1!.2A.+B1.6&:*"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4144 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 711 42 92M = 851 244 GTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGT 3/E;EB2'2A7%F*DD*297D++!@40*CF3:*!EA$>C):*'"@1&?""(;,;1.8:.'4>!D!22FE8(4(-;?.9((9HCH5GF&/9DE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G49 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4144 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 851 42 104M = 711 -244 GGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCCTGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAANTCTGCCCGTGTCGGTT 0#B,4-(1>=+:!DB-<2GE&(7G"74?(;27B!;?,*1H@+$$)==G)?=E:6.7#+@9E6@")0"8"%,*D5=@'C9A=3@7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A46G16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4145 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6116 42 62M = 6300 281 TTTTTTACGGNATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGC G83D+?F;A=86@1%;.EB/%9E:5<-C>D$73H=-/*%,)2!$C1;@H;: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4145 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6300 42 97M = 6116 -281 CCGATTGTTTCCGGTGAGGTTNTCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCANC %GH2;-%C#2(,@#@=G#G)55A,0$71A0'40?)8(AAFD?:,!,H(8&5$)H-:FA7'-!8$1?B,,=5@?66CH'B<"F!8@@/6'DG9##7!! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A73G0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14519 42 247M = 14239 -527 CATCTGGCGGGGNTTGAGATCCCGGACTTTCTTCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCANAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCNGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCNGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACA 9230#D(C(<;25$A;/@*F29>F';//690,C,H+#!)1G!+/(-$?B)H5>?&"D!2*B'@&:24F9*>#'G?)D$EEC+4G)9C4&D2=G=+@3$.F)$#A49G6)%2@"/(3FD<.2@C"D+92FE)243$H$"AEH$-:E*8!+FA?E>5E33&"1($&G"+>#C*/?G9CA'<&<*:BGE'G-G2BA8#*C:/,::(; AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:12A7G10A30G65G73T44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14239 42 280M = 14519 527 GCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGANTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATANGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTNAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTAT -04??'G&A9<,33484/A!342=GG$(2'8%,5DA;;8)%7>!"*&@45<(9)G&@:A)5<@@HA45$H@HC&F0*4F)0!%7!(2=*E03-H!)>G(?;09+A5-)+0,&CE$$F$!*?-9=%C8--1?!?C024/E$-=<":G'&+D:D6%.>9F(:<(F478G0E%/&D3-A%;>1+78?-,EFG'8-,=:%B/""./*:#3.:(."@E103B2457@:8$/;D@5?)5E%)>2+9E>E-<+'EH)%-2@10<( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51C145A37G44 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4147 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5235 42 97M = 5033 -299 AGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTC E/*=$25E%A>H4./(."&-4%)"G6<7>'1/.4G<(&;7'+1A=<08)E=A'5!"-G;4EC>A3.<3':77C346&";)CA"5:D,'9.F;?0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4147 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5033 42 202M = 5235 299 GGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGG CEFA7:)?F6-5H/=G1/+((!99"/-+#H84<4A7;A=9*1F?;F<$AG34,F@C,(E):5@H5():/4D=FC('%!-%C:F<0+.GB=2;0A#EH00;&@A<9;&4')E-/>.0F2%(#%/69-A-49?,8'H?%E,)86%#1"'/D(D!A<%9:4;><;>2E*/AC@F$@>EG!BG!@5/1$%5$.#@B'@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:202 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4148 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27966 42 66M = 28165 263 GTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACT -BC>:E/;1!,'#3,:/%+$E$=.F1&?B:C:.!.A@,1-H".E&"A'F3";E)>G%C21*50F;< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4148 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28165 42 64M = 27966 -263 TTTTTACGCCTGTTTTGNTTTGCTCGACATAAAGATATTCATCTACGATATNAGACCNCCCTCN %&+"#$"%))#!##!+"$)!+$#$!*&*$)$"'($$#)+%(*&)"(($"')$(()+$))!%#'* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:17C20C12C5A1T0T0C0A0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40999 42 72M = 40803 -268 TCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAG /FG/=!B/3A-E1+1$)5#7&+>GB8D<9B26#.;&HH;=?%:GB*2%/(3+=&'0(G!/-$,H+/((E;FC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4149 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40803 42 15M4D177M = 40999 268 NGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTNTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCAT !C/7%>6)(/+&C2.13!(15@<+/('&17%=6'3H(:B=(92C795*:/"%)6/$+/5=&DAB=(12<>;':-?305.F0(HBCB*('C@+)9'600?D""4/)!C?++&#"4E++G:;:?1/5?&@G46H,-#H!%7*))D17&/?(%#84?EEE/51'156'D-G("C95&DCH;/;D?AB>B-0=/-% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:0G14^CAGG104G72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4150 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4127 42 123M = 4010 -240 CGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGAC @9G(=716=#HAF9;GD;<@;><&:7!-7/.-@;32+@A/HA9D-@F)%5"63)>/,%&D>(5!-$C2>85/=8A)5#).FG3C7+"<>F'B)-7G?#8#-;)//H-?#)975%"49:99$16<3= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C40C40C4T8T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4151 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9457 42 131M = 9309 -279 CTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGT !2-4)'/CDH3,(2H8.@(2#;@@0';@6F$H%&+4;D;C/)%9/=70%B'EB997;#:'9H=.4'GA/=!/G,,:E@#=A,)29F4C08;,F88B3=&"$/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r4151 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9309 42 76M5D14M = 9457 279 GTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGNGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGNCCGTC :'C6&F17B3)6@C%?=*D/FC1F AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:34C41^CCAAT8T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4152 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8148 42 42M = 7909 -281 AGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCANAAATCCGAAGGCC ED56&E;E6(03+>!+?G'4GC/==7*8%-?>C#;8(65H.8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A7C5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4152 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7909 42 88M = 8148 281 ANANGNCATNTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGNTGTATGGCCATAAAAGGTCTTGA ')&!)'(%*$*#+&"&*#+%""#'$)&!)#*)%*'*("!*((&#)&)#"")%+&&%!('')*!!#!&)#$#*)!+##&#!)#+'$)"+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G0T0T1T3C54A23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25845 42 62M = 25644 -263 TTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGNCANATCTNNNNA )*!)%("'(('$!#"#($"(($#(!*$'+#!#'$*"*&(!!)+!$"%#+#*'%"$%)!#$#% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:49A0T1T0T3G0G0A0T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25644 42 61M = 25845 263 ACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGT 8/)5H*F527CE>6%,*)<5<*,,1/636<198@!5F!,4F7*1.#2H3'>3HD*?>7%// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4154 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44586 42 49M = 44420 -215 CAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGG $1HA@>>.:@B?)8E&548$#E+.+'#=F;(!*/;2BGC,!>+4H94=6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4154 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44420 42 97M = 44586 215 ACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATG '<09%D:''H$+6'C)&$+-&=E=&&+;!?*C&)-,HA@1&H>G=FA>0?$F9-B<8B0A6')80++-77-H-AF5+&'.>5G5$B,,)1F*2@!=8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4155 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1222 42 163M = 1393 233 CGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTTCTGCTTTTGATGATGATATTNAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGNCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCTCGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCG 1/+$B86#43F1!(,,8'3D08<:8H"6#E5(2721-1-#;?'DE6H,B250'5%1E"?F#H+>4:'664+'DC'$AF0(7<"0<*F-+-@'HG+;9A)A#!$:?3%6*E;GF;-(@,%!3<-,E/C4G7/(H?7+@DH<@#2'CH2E3;=86*D:7+2,(0E:3!,A&=%A!%C$B;1E4*B#1BE*!@,A=% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37434 42 50M1D68M = 37591 251 AACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATNACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCC CG,#<<-4=.HFGH@0$'#16@6,H0,06*<#>'00HH:$2<9,GBB-346*/3#):A?0B4G+FF,/##B1F5'HGCE$&D9"8D7:8,(E?4,#?7/EF@!.@->4E**6EF(-.& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:50^C41C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4157 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37591 42 94M = 37434 -251 GGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGT H9D?+5>5!,#1<0:H<$9=6'*;&;$%?&)$C;>'-/0$=#3E*&*$>GGHDGG:+)77/?%/*-HC.)ED%+@!:6)2H,H79:27;0/C9E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4158 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7341 42 310M = 7235 -416 CTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATTAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTNATTCNGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCNGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGNC 1B3%.DFEHEA4&*!80@9'(=93))*@&%&($.DE87G=+F@C=#>!&G!@.ADF8$0!+0!;BD=2,1ED"C+#&">%&A!@2$%#A:)@B)1':6$/,7%?E0$"C=9>'H0(6@-43:.;B1.-%168,&HEAC'+&CE*4&9>#$)3CH-0*/4)71"&0=#6,,/E='G-E*D*#D"/;&-5'=DE3#:-7&'2%,<;7-0C2&00H)+<;%3*=96>F*/#18-CB5D&00.E6'E%/3A5%<%6*E=+C#"'EAB&60<.-,963+;"* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:50G34G4T152T64C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4158 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7235 42 106M = 7341 416 TCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCNCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGCGGAGCTTGATGACACGGATGAAA &(+((*()(+!#)')%!+#$*$)#"%%'$*&&#+%'"+!"*%%#"&($(**#$"+&*(&!)&#*!'$%&(**'++("+$"&'*+'%$"$#+!#)%+("$'("$##+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61T20A23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 178 42 166M = 74 -270 CGTGGAATGAANAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATACC EBEC9,!>'=$18*:#0A8G(A$8#;%,;A0(@(4A#FE?B)$/G-4=H>67*5*$"E,70G(EH4&4C<7.3C2FF)<#E#7F7*C5B09H%8B66"8#%'&/<##G#4,;$&@,)%1;3=?#,04?/=>G83*6"7G934>&4*2D#= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C151G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 74 42 53M = 178 270 NNACNNAANGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGT '"%(!%'"&%+&!)"+!&$!$+&%'++"%(""#$'!"%'&(&"#%(*%%*)%& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T0A2T0T2T44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4160 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45353 42 42M = 45353 0 GTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCTA ..B?C!"&EE&@!0%,!A&.#."!/A-62G=HG8B-A0<""! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A1 YT:Z:UP jpayne@0: r4160 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45353 0 * = 45353 0 ACNNCCGGNCGTTTTNCNCGTGNANANNGGNCANGAGCGANTCTGATT )$($*)#)!''#$&)!'&'&(#*&#*"&)(!*&)$(!&%$"'+#"*)' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 665 42 156M2I172M = 993 383 ATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTNCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCANAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAANGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCNGGGTGTTTATGCCTACTTTATA &:)=*;,0'="?279(A>3#7/66>FE$A;E&-)&429-=;G2H($?&)5A6,4"(&D)+5?8CF'=*C'3-&90)B1<1*===87)@;"<-!A@5EF!.:12?;&!?7-AAFC.H&>5<7+00FC:#A?1G>+7#@%.#&@-,-B(#2442H=CFB'%15:E1&$#$<.-?918C"G2<$#E(.DG7:2/G@&AA8918C#'<7E=7"/($@G4..?<2:)A5G!B.8+$4AA)=>?;;FEF#>3-*7&(*"@>21D935H!4? AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:41G46G38C43A133T22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 993 42 55M = 665 -383 GAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGA &2;)H7,(9#<9;6-?:0108!D,0-@,$E"E!FH-@F&&B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4162 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48303 42 173M = 48303 0 TGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGG G*?9@E2E?6!9#,A;5(D7-"4E3&)B.7%0>5#&2<7;%=E39H?>C014!73:)6>1:5$7:)?@4BD';=+"D3%(D;*)-G9%!8/=.G7AH%<96G7C3;/2$%G@G4''95,F(H>7H40+(-"$=;:/';&=0F#(4>91?5=@7&4H?+#E6:GA#B0-+DAF@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YT:Z:UP jpayne@0: r4162 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48303 0 * = 48303 0 GCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGA 3G*F6)B&("F6@D(9--@286.41-$-'1E+)F);884@D(%0&C*,.+@@!(.$0'%E? YT:Z:UP jpayne@0: r4163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19562 42 88M = 19423 -227 GTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAAT :'"F.72E#',-@9;#&C#3(?ED>E:27C@@330"2(AB'*:<7:,&"@E%):.:/C+HH905=-(3927".'E,+.4!4D+021C@4C4-9/,A.B2,F!1>;0#+/&)F&;)(5@. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4164 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46447 42 40M = 46571 194 CAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCC =E?;.2.&?&>66D=/@$-8/'35,H;'+2?&1G:6(G=7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37489 42 115M = 37604 350 ATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATNCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTNGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCC $$#+#"(&%%+$%$!+%'+%((!$#!'(+%(++%+#+!("!""%)#+(&%(*&$$('%!*(%"$*!)!+$!!#(!*'&"(%!(#+$+$&$"+'$')%(!*%&*"(+#"!+!$$!& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G51T32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37604 42 235M = 37489 -350 CTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAGTAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACANATTC #()+"'("$'!#)'++'%*)(()%%")+"(()%&"'$"+"+''!%%$'!&)#!'##$)((+&*'+&'#')##&")#'+"""&%(*''*&+!'("'+***'+#"#(!!++#"))%!!'!!)#&"$)&!(%"*"+#*'%#*!)()!("'('+(*#$+$$(&(+"+!&"$&%#*&"&$)")**+"$!'&'+%!""'%%++!($+))$&')+&!*&$!#&%!%'(+*)*%*'+)$('(' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:183A46G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4166 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44533 42 55M = 44679 224 ACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCA )+))"*(*!$'#("(%((''##*)#(&$#'*%")+%"*"$#+%!%)&)!+%*$!! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4166 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44679 42 78M = 44533 -224 CTGGAANTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTACGCAGGTAATAGTTAGAGCCT 0,8'%%E.6@#E>-F,-H&.$B1G;5A!EH3HG:A>GD!>G6"C8?%3=6515'+.D6-HB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C49T21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4167 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30497 42 61M = 30497 0 GCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATT ?&*/!A'89.H!>H*AF'!.@/H(/F<2;)5+D4GC8/C">&GH1)!*"G/(:B/3;(6*+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YT:Z:UP jpayne@0: r4167 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30497 0 * = 30497 0 NNTGANNNCGNNTNTTAANNNNTNNGCAGNCGGCNNNNCNANCTNNGTGGANCANNTNCAAAGNANNTNACANGCAANNTNATCNTGTNGATCN ""$"#$$#"$#!$$!$$!!!"###"!#$"""###"$!!"$$!$"!!$#!!!#$$"!$!$#"!#""!!$#""$!#""#"#$!""$$$#!"#"$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45782 42 59M = 45540 -301 AGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCA ):@@";3'B7$.2HH'8?1G@,:+8)2*HBC?)1,AC)7"'1.%4D?8394;F=FG=B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45540 42 68M = 45782 301 GAGATCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGNTTATGACGTCATTGTAGGCG '!'')*)+)&)!'"$!(#'&+""*$'&!"%&$%$%*&#)"%+!&&++*#(#)'+&"&*("(#!(!#%% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T1G43G20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8094 42 61M = 8328 309 TCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCA .2-#+?C)-"%%&0B;FF/0@,E=)B>3861.,4$/.BE.F!+C42#'*E),H5B7:,<"/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8328 42 75M = 8094 -309 CGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAA +:E1BC1"G8+47H$&GE+E3311"!H;?9$G+G!D'?'*,G)"FE'1"'.>9)706':<.=(-6>5H"%6D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4170 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24264 42 82M = 24084 -262 TTGCATGAGNGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGC >@:!34@B>%0@F,1-"2)1(=;=.%$0GC1?-F6HA8&B)5?=8B#8$?B9A:/'7AED+/37;H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A45G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4170 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24084 42 75M = 24264 262 ATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTA 4'G9:E>/G5/:HH;'G6E2%7B&1",C76F#>7)%);8'$7+7?:30F/0,/!&E+)6=$D<&(6?H):HG4AG#;7,6$(8E?H(AA=48D* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42C11G17A7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4172 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32357 42 115M = 32285 -187 GTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACNGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATNCGGTAACGCAGNTCGGATGATA E<&",.EE6HHE?F<;,!7(=,BC<#83.C,!*"G=&1A3A8/D+00!.6>%#B-.'-G!-//,87CH**0<8,/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27153 42 65M = 27375 277 ACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATTCATATATAG +'$(&'#*'$!$+)&'*)(%$(#*#'"&))$+#&&)!%!+&+(**#%+*%&%''+"!+"&(*)&! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27375 42 55M = 27153 -277 CATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAACTCAGCTGCGTCGTTTGACA &'(&&*$"*&)##+')+$'!*!%()"%!&%)'+#'$"!"#!**($+'+($+'%#+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4174 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8356 42 72M = 8145 -283 AACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTNGTGA *'!()"!!""&&!$$)%&&$*$)%)''(*)$)#&")('"+%*(#+""#$!()+$(%%"(*&'""("+#%%%( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4174 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8145 42 91M = 8356 283 GAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGNCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTA 6)FF53!G%!3#*70A6-:$<>A2%?"@%FBBB#?1??F86&53&):C1:#16&.,66383$=2CB'?@91/6%@4.= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4175 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4977 42 115M = 5092 303 ACTCNATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAANCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAG G!'3A:B'4+!*7*=!4EG((2G;G%DDG(%%2+G@"=!;H&$')/)E8/;G&**/.:=CHH8A/6F86#=2*2';8DH"G!($.G9=+3:9H;9,-C%=H)4)%,+3<9FDF#3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G3C61T48 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4175 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5092 42 188M = 4977 -303 CCATCTTCCGAATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATNGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGNGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTNAGGAGGCCATGGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCG F,"4+'/"/@!=*C9H*)C)AE=9A";H8;0!E:H&<;>5)HF!>=5,D*#*<')5/.487!==6,8E:.#$5"E%3G&.1?2A,5G/H)@>.(+52E"A2A<-6H)(HG.#-*H/:/:8A)3(6:E"B-@GA21E*(!E38/3-%C7B1;-&&98!*",60"./-7F2F6<"DE"!)$E%2*=>-D% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10G31G55T40C10T37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2146 42 155M = 2301 260 AAANACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCAATTAAAGGGGAATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTNATAACCGCTTCACA $03A.5##2CG.F"FC,89,(=BH3FE%!B47GE1,F)/(,@7)/DA9!F7BG7:*5,FC%#4F?88>@?>"B"8<(">8G+G3#/><-8F2%/G6G?&C(>>7,#B65/%"+E@&B7AC3G8B"E5> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A24C10C100T14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2301 42 105M = 2146 -260 CTGACGCCGGAAGGGGATGAACCACTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCNGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAG @DA3:!1+ADC.$+#,9DDFE7H.))#?D#9A0)@/H'$)+%#53=B)<6*>.,<$,!*2'(.0=>8)39'<<5:;>39#94?3#7(;E5/'A+> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G22C58 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4177 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30314 42 49M = 30029 -334 AAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGC !&&!'#)(++$+*#*$!*!(*!!'*")$''#&(+')(!&")+#!%%!+( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4177 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30029 42 140M = 30314 334 CAGGAGTCTTCCCAAGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGAT 85&%3&..18&,#39,F&%AA&@)G>(($4F:=36"-/5)E%)*%H**32(4G8196)4:2(-#:4%*4>'5>9#C-7@9:*!C<,F2%?.$*04#"8&9E-'%8*5/F= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G29C11 YT:Z:UP jpayne@0: r4178 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18558 0 * = 18558 0 TANTACNNGANCATNNNNNNANNGACNGANANCTGAAGANTNTCCNNNANAAGGNAGNCNGCGNGNNNANNAA !$!!!$$!$!"#$"!!!$#$"!!!!!"!!"#"$$$$""#$!"$##!"#"!!"#"""#!"##!#!$"$!"!#$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4179 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36432 42 203M = 36635 303 AAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTCAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGC F?&,84)B*+7'8>B7,?@3?7/E*!,15+;>&.25E$:/=2<1>7(-?&(6078?$/25;&;E3';%"6">+5(FA/6@/'&B:5??4,:(#';"E90:,F".8GH73-84='7//F6$,*/%3)*D+6,@83.,:+&D57<3=2H+:=@)1!C:E<20#*:*1?@$!95E!A1:D)5801;G97")7;H9>4G<-"6#&4: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:173T29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4179 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36635 42 100M = 36432 -303 TTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTNGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTNTCTGAACGCGGTNNNCNCTG (&)('"")%'!%##('**&$+#'%%#*'+((($#'"*)'$&*&*%%*+*+&!$+#$*"!%)&+"()*!$)&"#!++"#)""()"&('"+#'%(!&)#&$) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:57G21A10C1C0T0C1A3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4180 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29806 42 71M = 29969 226 ATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTC %ACBC!@72,G>@95;@G@+2A*2F2'C&C%3B<1=;452/GA4<.-?48:#7D=;@+$!?C'$)0/"+8< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4180 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29969 42 63M = 29806 -226 GGTCTTTTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAG %A?B.'D*:")6!+*9974"&.390:2?'9D92C#097>79:19HD!4,2F:?:#::%:-80= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4181 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39195 42 50M = 39351 234 NGAANACNATNGATCTNNGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCA %#%)$'"&)!'("%)"%#(+%+!*&!($)''$%+&&#(("$*$&#'&)## AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A3A2G1C0C0T0T3G0T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4181 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39351 42 78M = 39195 -234 CGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGA G@9=7H33@E@?,6/":G6/)%&DF!)A5A-+;0)EH&F*'D*9/&%.14+7>@9C1-'+"$7257)&EDA66"3)// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4182 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15362 42 280M = 15642 377 NCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAANGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTTCT "C#4@6"@)B#7=G@#;#;4G/BC=)#"9C'@B6"GA2A!F4$77>?B"<1D5E!%$2??264H7+.D$)-;:@E5(A!+A<2#$EG377$(4.&?B69(7(-B&:#92>"9?(?<>)D''BG%7H09B%'HAB!='52A:5'&.-)>"@.$B@5?(!9!F*>'9C4@0),F9@?4-FE'B&;'?+25,*:4(#!B=>E)+4;1EC7:G:!A<";F,:95 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G89T186G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4182 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15642 42 97M = 15362 -377 GCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAANACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGNGTTCCGGGNTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCG ?<-&7G60E1%7>>G./22/03G%E4B&7F$>!<)4$C%/F/&%%>D7&=,BH(?2$).+6;?*1;+H?):9%H1(1!((95@B1/G5F*A8:).#1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36T25T8C25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4183 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2031 42 62M = 1787 -306 GTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATANCCGCCGGAATGGTNCAGAAATGTCGATATCCTA @.?BA'F!;CB->@G(C+A&F@)5E"!$5?)=,F)=*#6AE@>3!E=-$<=0F?.%:(!+E( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28C13G17C0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4183 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1787 42 47M = 2031 306 CACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATG *=-6#;!'"*B<&A:$337-;2,*277AF?5=4*@.4'%<<4D=3DG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4184 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1484 42 183M = 1395 -272 TGGCCACAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCNAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACC "9%#)3.28384#)/8=B"1$.5#65=A/(2,8$7:G6@3$>>GB#,.+%$>768%*2+"&3%7&@(%;:36$'6)'@5A:G7B?G.(F-?,<<02D-%B<'.4?'<@4102!:@2=;B7E3)9>23>,,!?95#@8G;4@B'08(2A9&2)4*0<$>5,G!A,"H6CE(841*F937&A-=$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T50A16C109 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4184 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1395 42 89M = 1484 272 TNATCNCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGNAGTATCTTAAATTTGGCGACAAANAGACGCCGTT #!'&)!%+##%&(##(##'(+)"&+#%)'#)(&!)*&+$")'+#*!"""*##***$++%*##+%'&%*#($*""*%()+$&!!(*##"! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0A3C48C23G10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4185 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37147 42 72M = 37032 -187 GGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACAC 'B.1G9.C.,:?#<>&;#,86/358$G9!6+C2C54(2=(=";*C50B@,4D"-@&#E"<$D>%F?9))*BB432":42;-HC,"! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4186 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28957 42 120M = 28739 -338 TACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTAC >+2F3%&.==*&(<6?FE,/252B?3&,D"!)A5F.,/2A<.4""0'2CGEB2BD%B,<$4-)+>G=F8,B-=7?-).3/5!B9A(6*4D8/#&+CBAB:B<%(>(EE,A%+18;H?E24 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4187 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8635 42 70M = 8494 -211 CGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAN "F::/870B>B:?10'$A>6A&E:,@":!'''?=76.B9>/G*G:8@?BA-+@1(3H=.B/=;!1*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4187 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8494 42 72M = 8635 211 GTCTTCCGAANGAGCTGGGGTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGGTGAAACATACTGA 7(:*3+8!B@$B/.B3:C@A;<:G%%=$-D7EH#;"8%-F7/- AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A8C38A13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7095 42 179M = 7274 308 ATTGNGTCAGCACNGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACG +4)0FD6*&,$:-4>+&:-2D2,?%E$!?A-.0%;7+,#'=?&#F8:H9!C:)*'4.49!:F3$-@#!6-7B+>B)27=H+':G$5:"&3@1?.')!G6>G?%D5!D"G(C2<&75.%#&@$.@,"71,>H+H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C0A8C165 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7274 42 129M = 7095 -308 GGGACGAAAGAAGAACTGGCGNTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTG 28%GB0-2<"!C1$D+&%66<-!H#:22'?H"2"%"8>)E>8=14-'A?1!HB1>5#=77"2*+A9:!BE/5F10$#4-E,,BF18A,&3H@&2=2.5'!/72)E59/(;<+.8+!,AG%;DD/?-,<7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C107 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24895 42 64M = 25004 241 CGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCAT )68"/H!&GH'$.(24!F.(F"?,@&FAD3'5*">/?::.9H*7$1824H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4189 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25004 42 132M = 24895 -241 AAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCGGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTT ,0D:32;@"3-3.,#6-GEE#G8;73#,;42)6)9&&.*6@1>$.9=<+AEB74F.G=:453F%4/3<*=@1>B53C*-=,36#G$=/-1->,E;CDD/+54#,"G,48(1D@'()54B$!:C!;7*:C>2; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4190 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8809 42 189M = 8998 304 TCCGGNGATGAGCGATATCCCGGCACTGTNAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCNTATGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTANGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGA 93/FE31?<)2?+D6313.@)4?)&("AA/=<6&)8.@HB;0%D*BG4'B2<$0<517$0.=/'H,=+$"'45E#34=+EBE27=GE-?*,HA@B0(2?%E-D!?,03A5752<2!%=(>;+(=*0F1;6>C,&%A/B36B#61'.9F4.#(43&0/?02$+.+D4#H4,8@AG&?C24(&C$A!"C%? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T23C61T1G53T41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4190 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8998 42 28M1D86M = 8809 -304 CCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGA *AB?<:!%"6*8+H6>+<$.,:<(*H+1()<&F1BG3!13,,+4>%66D9<++/A=FF7!/$6E'0D5'8*023%!3#BBH0),.+5?/(16<6E%9-,3'H>;B#43/7$"#A AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:28^T86 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 85 42 156M = 261 253 TTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTNCTTTCTCTGATTTTGTCCGTGGAATCAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGGGCGAGTATCCG +#!)"*(*$)&++)$&+()%(%%#&'('$'%*)"$%(***!*$"(%*')#(**(+"!'"($%)#"*$$*&#)!$'+(&%'"$**#('($$#)((#%%"#!()*"()&'*!$%(''*)(!(*(%*!#*(+$**!&!")")*%!"*('!%*"!&+)'$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:75C9T15G42T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4191 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 261 42 77M = 85 -253 AACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGG C37%3B=F1"5><%/!<1>A"9"<3G%1B9+>$!;)"70B8$,*8.;%G7!/?4E)-15&*?#;.#H&BE=/#CF"'C>;,GC;"8B&A$';:B)8(("@;"?#(:F<12D9F3*;/-%E&6.@G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4192 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23947 42 113M = 24128 284 CTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAANTTAACTGCTTAACTGTNAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTT '+("'*%$!$$"''"'(!%&!$#)#)"#!""*"%&')&$)*%%+##*&$'"&*&"!#)'!#'#$'#&%#"&"#+*)&(#&%)"%'%*)""!'+*'*&"&"+**!$&$'##!($ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A16C64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4193 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27537 42 192M = 27729 427 CAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTNTGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTT G.(H8DD3'-&67$)$!2>06F)6?7!G%+&D?&E$=+<,87;E$3E81!@("79.))A+7>"7#B/;)3;:=$9$)&+<$C0$806.H8B4&.@=$:5,@(5!/&@A1>0?=A/D&(,'>7=&-2:><#/--';!F-BC>7.=4&=G,&82A;EE,0%?!$?+:=))29>GGC>>D79ECD>.**)1022= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132A59 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4193 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27729 42 235M = 27537 -427 TTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACNGGTCCCTATCAGTCAACATAANATCATTATTTGATATCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAA !#)'!!#!(#'**!+%$$'+#%&&"')!###*&++'%###($'&&#%"'")")"('$$)$#$)(*#$$("&*%")!')+"!()*'*"%+!)+$)("#('"$"")+#!#%($#*!"#%!'!(#$#+"$*+"""!&*&)&$#&)+""*$%$#(+#!"(&%(#$%*#'$"!&#%&)!'#)!$"+&!"()!(*((#+$!)+&)(!"!$'&##(%)("")*(&*'+#(*$##$%)#+'($ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:56A4A11A4A13T142 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4194 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30416 42 142M = 30558 376 NATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTNTCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATT $#(*+"%+!(+#!'+##%!!"$*'!!&*&#")*$!#!'('+)&&$$%'(!+%#!$$''#&+!'#&+&!++**+'+!&"*$%$#$!%%(!)($!*+)!)$+(+"'#*#"+%#)"#'*$+'#!*+"#!'+("%#'$#+)*!*#" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G72A68 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4194 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30558 42 7M2D225M = 30416 -376 GCTGTGTCGCTGTAATTCTTGTATTTCTNATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTCAACTGTNGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGNAGCCTGTAGCTCCNTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACNCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGANTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCG GB#!%DB<7%+$/.3!$%%@;;/7(GAC!G4=46'@1E<>3D,.H=3#A2+1/;?,;>-&:.$E1,#+F?;:92;9C+C,57-=28@!:02GCGB1B%(9$4@<<2'#5")#E8>.(B%?">&**E-C!$<:@+DE3>2AA-B*.G+3+**?7%E?9AA=64-H45*0DH=;$60.0*#,BE?*:;02H5;-C(>E0+4:E:*#164!"#2A34,!&H,=++<85? AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:7^TG13C7G40G6T39G13C39G33G27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1217 42 126M = 1089 -254 AAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGANGTTCCTGGGTGACANGCGTANTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCG :2$=>G96!C7"$@)!5$=/4D8B-;$0=+&'>;0.6">1@F@04;+=&0+&D2E2>!,&(>2/-40A>&H1%17F75#D204E=!03.1E/B)?,H(1:,#@?'/)26&,+&>H8(%AA4",E$6%&8.''>5)$+?31!B#;596=2D8+377?=<&1-F$E<&E,!"!39#3B-GA>$BC;""$(=2404B7%7A$=?,9@G)0.3@<3A39+=;-H"&4#711('@?%B(&;D*+."@B82&2956/33+!C:BF+, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4197 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31192 42 41M = 31414 303 TGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGC ,<6G?EC;1@-=:C$(C#'@*-EAFA5?.2>!&.1-#&4F* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31414 42 81M = 31192 -303 CTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCNATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCAT 27%1.B7?2"D#.@"D'>G.B47,B$D;E$-F+&@F&(:40$@>.?1+.+C(*H$-A-E'+:3-D@$F9'4*""5)H7F;3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4198 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8848 24 50M = 9088 288 TTCCAGTATNNTGAACNNTNGCTATNACTNCCGGCGCGACGATGATGCGG ($$)($&(#!"*#))'%(!")'&'##"$(&&#+"&#!$#$''&$)%$*&# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C0A7G0G2G0C1A0G0C0G5G3A20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4198 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9088 24 48M = 8848 -288 TGACGCCCGGCGCACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCG "B!/?<(97-65C;#F=)F+*BGE@C%&?2?1";D:!:9AH:=* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C74 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4199 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27262 42 360M = 27187 -435 ANNTACTAATAAGCCGATAGATAGCCANGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTNCGCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACNTCACTGCNATCTTCTTACTTGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACTCAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGNCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATNAGCTCGAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCAT $)$*!%$*#*##&+('*$'$#("%+&$!*&)%++$&)#"#""+'!+'""#%!$"'"**""'*&+*#$!+#'%#"+#'*#%$"&!"!#$'#"#+*%!#*!'"+#*'$#*"!!(($''#)%'#+&%%!+*+))!*)!%'')'+)*(')"+*#!&#"))&%%%(*(++$&%)(!#'"+%!"$$$$))!$%"(&$"""%(*"#(&&%!#(%$%*$'(#!(*"&"(!%$&&"%"&"%#*'!*$'%'+)#+(&+*!+"&)$*&)%!*+!*!)%!+((&&)#$&*%(&*(*+!$%%%%+*)%#"%((%&$$%#)&'*#*$(!!$'!(**(!#&'+#+'%%&$'!#*!"!%!*##$+!*")#''+')# AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1A0G24C39C1T97A7T11G26A24G43T3G1A70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4200 77 * 0 0 * * 0 0 GTTCCNCATAATTACTCCTGCTAATTAATCCTTAACTTTG A=$G6")=@(,8;%8'C*&,39=A/8C9,!-(,!7<76:5 YT:Z:UP jpayne@0: r4200 141 * 0 0 * * 0 0 NACATCATTATCTATCAGAAAAAGGCCATCTCTCAGCGCCTCT $$$%$+"$+)&$**!%'$)#$%#)$(#!&"#'"*&*&$(((#% YT:Z:UP jpayne@0: r4201 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31770 42 125M = 31957 289 AGTTNNCNTACTGANNTNNNCGGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCNAACCTCAGCAAGCAGGGTGNGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAG "&)'""'#*&)()"%&%%!$*$+!)((%(&&'"*"*+''!'"$+"((##%%&&++#*&*!#%&)#(*$$!++)%*%*'!"()(*+#$!+(''%!(%(%#&#))(%'!$"&(!'*%+&$'""$"'( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0C3C0T1G5T0T0T1C0C0C1A41A19T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4201 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31957 42 102M = 31770 -289 CCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGT D285'@-B/%&,3&;842=F6>05>.C'G.->$',&467&9&',F%@9"/+E.97/.:!4F2)F**=*A2,&2/(:!%@&1.1(=46?'A*D,&()=3$8%9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4202 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2657 42 187M = 2484 -360 GCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAAC B'D609!F!H*82:$5+/H&5*9B?A#A8"!%B'9!:=-*BH/8E@+.A1'HE.?7%#:=0:?:26=7H7'(BG7?3A@'%49D=@!?-A.-D;:C4*&9G:F*408E?=8.EE?!:'<.)B<9A4>*//A'.68>9!GH+/7C"4H57&60%1C&'5DD8"/>F)G("&9/94.;D-+HB&"=4E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:187 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4202 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2484 42 173M = 2657 360 GTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTNCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACACGACAGGAAGAACTTGCC 2"9*1/6+%7!>.#>"/E0@E)G8<0$C*,@'H46C7E670(:=)!(?8855)A(C+,6=>*G#'*6B('%C#*!52!:!;(%)0*$6;9F3!85"/07!G2H3(;$/#HA:>>D8".7&8#?;,,;&C(/()16'E#*./0A,5+FBF-;2-7((9;(%+:/*0*>?3#002 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G91G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4203 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9589 42 186M = 9775 342 TGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCANGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAACCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAG 484-,?D3>?"97/65)AE;!9G&@A.(!A2@5?(3B=>7%&067+G*C9,:7@"0+*/CE4#"<.E/<*A!DD,A5:4%7G&G1*!1&(*2<14D.&*%D.&E$!@8#*=08>E6@(H=C<5)10G:;!3?=B=<>8H$$?*D98:=3+5?7#")7@.->!%%,25(652.A=C0)*9"1!5+4D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A73T78 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4203 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9775 42 156M = 9589 -342 CCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGGACTGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCAGAACCATCCGCAGAAGACGCAGA -.:70&E$"1754F)/F(:+.AF:#$61'..8H1.81&6D)4&*E9+;=#=4GBFG9+H8,D/3!<#E!4-2&.&(+F''+7H'$<@$;-2<)64<+*99*>+.",!$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:0A89 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4204 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40913 42 98M = 40689 -322 CGGGAATGGCTTTGTAGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGC H:G"A(=8)CDC6G!6+2B/#+0'(/!1C@863DF>,'G;1H;3->(7$H)2B:;0*148!97&03*C+E<',85,C5/*"6=B&&*%$FB5GHFC/0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G82 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30456 42 104M = 30604 210 CAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGN /%9G-CCF<-%,/4)>>=!#1!17B+?.;'F?F2FC(%E#5G3&6A@#-0,&?<4E,FCG@GC)B9?AEC5ED3&C."9&'E3A=$;DB"B#;C,06$A63*4C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30604 42 62M = 30456 -210 TGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAAT *<12DF'0D9D+(H=EC8+'4%')7*?>$07%5$29'E-$4@(=4?4/&:4"G-2'.7*($G@$C%?2>;(E-(C*?8-<!%",07)BG!F!,62'>&,:141?;CC!=/B:5$@5%C/H%7111D@-">F# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G118T6A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4206 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5829 42 90M = 5919 231 TGAGTGCGAAAGCGCCTGCCATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTG CD(BFGA/EDE7$G%>@#?7:5*B=36/4.@":*-&/+.%-G0)>',:?5'98-/&+9)!GFF5-1-/F(/(1(,D122=$3D+%''*>B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4207 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35808 42 43M = 35654 -197 CCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTAT 3><6'A>%:1%9!(2+8H(GG)/7'=F45"92<0#5?3#/9@) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4207 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35654 42 54M = 35808 197 CTGTATGTTTTTTATATGAATTTANTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGT @06-9$DF83@2%@0$6!*:%8F=7=$)05HB;C7//DFHE7(&*F'3!5A8;*6C4@1H1:=$.!#@1<7837> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4208 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10019 42 182M = 10201 236 GGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACANAGGACGACGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTC >G66%.)>D&9$@>(D4%G;05=>)0H5:)>("1(-'>;.4,>5?17C%9)=.+2F!9'@(;E4"C-+6-&?273EGCBC?4#!96HD32.)C<*:@.,D;A)?9B(F?G'35<-'1(?1C?EG;)2H31E07%C6G'7G66-E:DA%*E-%*@BD1#74*D;4#7!9!9;+)C1AD/C7>E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58G6C116 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4209 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37622 42 86M = 37373 -335 AAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATANATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGG 853@H!03+=45F?D)$@1G#A9C$0:=-A7#>H,<6G6$4D"7E*,D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C30 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4209 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37373 42 111M1D137M = 37622 335 ACNCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCANAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGNTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGAANCACCNTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGNCTGAACATGAGAAA '*!+!!+$*(#"+$$&%%*)*&"%#'%"("!$$*+"'$*!($&"'%%%#)+$"#')*$#*&+&"#$*)%()(!#"*&"#("*("+"!)$#%)")%$$&%"*!#'"*!#('"$"(&)+'(!"$"%(!&+*)++%*!#"*)$+$'&*++$&)'$(#(!(*(+(!##&%&(!+'(&""!$"&%&(#'!'&())&'"!!$"!&'*&*)()'*&'(#***+%"')'$#!(%$%*%"#*"("+$')($'((')( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:2T25G82^C47C29C1T4T37C14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43447 42 101M = 43248 -300 ACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCNTTAATCTCGATTACGACAAA BHC.@5C2!6'F)<<.45#-&$$D.0:A6*'<>"4@=:27='>1A/;1=08HHH*6:.:6DB?1/-9&39C;-<)5?%!!*G.;#D"+>/-&/&.H3',?' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T20 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43248 42 175M = 43447 300 GGCAGAAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGCTGCNACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCNACTACAAAAAAGACCTGCTTATCTCNGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGNCTGGAATTAATCACATTCC :H,D.*<1$14HC131!3.'"9)F%#6D@">'G>-H;!642%!5/7D0.#*!6,2/!$!@"4E*F:D(D"7E>B+@!!:7&1"&+7"=%804':0$@>13H@>1B%FG!->44>&;&41#>:B%@B'$B54CD/:#52",D?/(%EC.$*EC,;25-B3&;2$%)@09'@533(,E#B@.2)'"3%5";/>$;0B;.::(?&/-9HH@1-#DB&;C0G&@92A&H7>D$<&@3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:78T91G52C87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4213 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9897 42 113M = 9757 -253 TCCCTGTCGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACATGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGC :9@C)'96F@=?G-?H9F.&A>H&%03*B=#8)#7@H@!&#!3G+>=21$<&A=61(+.+!?3:FE67;/F@><%=FD6+1EH7F*+F&H&5D4+@78188/8*=)7A@*;AD AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G78C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9757 42 44M = 9897 253 CGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCC <1/,HAC$>H34BF$#4A%G,6+9(<!2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4214 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15399 42 88M = 15260 -227 GGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTC 6->$A:#<0A,E@9E/:>!F()E?C'C8.!0)1?E)H6-<74/E,&F!H=2"E'&<>!*C208"8(1E;)/<&2'-'$9(0D?H@::C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4214 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15260 42 109M = 15399 227 GTATACAGACAACGGATAACGNTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGNATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGG H70+2#5>)3,(0<&B/F;>''(AF'%+<=8>-9D#//,AEB>A)A9"0C8D>@?(2#BC+F@5D-0"9.E>4"0)=7;$B'&?!0#6=&5)#':45C9.'!&*A<;"8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G28G58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44210 42 64M = 44036 -238 CGTCGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATA <2H4A;G9E@/>+GH(D&91:(#.&?.B45E-1'C:)&3,9EA8%D'2$%4"C-D1>;4>($@> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4215 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44036 42 100M = 44210 238 GCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTG 64DG:..;"9A45./@@3++E"";:F3'@F%'9#A(E(H763H5?71/;0;;**<35#.,GGB'FG3!!?><5!37-+>!2'."0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4216 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5429 42 56M = 5252 -233 AACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGC 1B->EH=70;F&D,?8>C9-A93&GCDG+/08%6D/'E!7E,7+@-,2B:8H.:!= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4216 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5252 42 101M = 5429 233 CTGGCTGATGAAATTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGAATGCACGTAANTCCCGTCTCTCAGGAGGGCTAATGACCAAAGA ;&5F;GG/)(2F+>.:EE4,14:->C*!#2=892H/"@H0@55-3>=$7="'&<1'C&'8>:3//G"#E?D-+.&:?6HE6C'F7?$,H=B0<>&!9-+C71G*C;FGDH@8$-;10"9B0!2,2.G9&;?:!,-,#!#73,?B=)6),344HGE2-51'H>+D@<4>D&AA31*.&/E**C!AA?1?<(+1;+)+!36.1A0**F@?C>+>;C8<654BH+'AC"#C5"0"#)*:/#C$&>6;8<"7.0%0%<#:"7<78F,1D?74$HA0@1@ADE'!@&B)99D)8@>5!%H,4.5!.D1<:B2!:3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:58A97C56G11T38G46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4217 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10093 42 95M = 9782 -406 CAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGC *#6DH-->#3F#('E.9F0@>@'H8F)'#H*<6+1@*#E;=G7'7,8&9;9*+4@$9+A5$!3+%9G#="'0?=D/9/,9/E0,#3"@0+F+$#/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4218 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23426 42 89M = 23177 -338 CATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCNTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAAT B:!(0-'*5G<)+2F/<"'15:,-%%>,AA#-,(7A,.@2,?)+1B+F$20HB8=1.-"#8+)",C9(6D0G!7@'*("@ACBE2<40F<"G#(@$$DH#?6D0//-331;$@)=%A<-#4+>"%;?%2A0=C@F$:$+)8=G61250@'$H-#G",=45?,3(<>,5@$7>);!54;$'?1@@/CF)E3-;C0??!0<3G,330;CA!%+>"?A@)@7+3$=%C7')&H3FA:?#@#5&9$+D712!!1GG1C4(/)F?-,2,E&C$/E;#DE)H.98E43)>% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4220 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40203 42 46M = 39978 -271 AGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCA 7>CD"GG(E=+0*C%G-C94*1")<#@?@0B6F#&E-G+*@+#&F& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4221 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34777 42 66M = 34959 289 AATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTNTGGTTTTGTGCNCAGCCCTTAATGAAGGCA "<1.E%(55;&*D66%16'9(0(H,:CB9,F4.+E5E5F98-)@8""?-1-B$3=*E518D?BA0< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G34A11G18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4221 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34959 42 86M1D20M = 34777 -289 GATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAA ""72:0&E"2C1=7"/36=?2A>B**=)G>D'52&C/(.=E8C5>#AF(.'(2)E7,,;)!&A'&-8-7!C+-H45=":-+..B@E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:86^G20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4222 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6726 42 62M = 6555 -233 NTCGTGTTCGATCCGAAAGGNTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCATGNNGAANCT !$((*"&((&()&+*+#'""!*'&(%&%+&)'#+##**&'$&)'+&()(&(+!!#"))*")$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A19C31A1G0A3G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4222 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6555 42 53M = 6726 233 NCCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCNGTTGAGNTGGATATGGGCCGCAGTGA &9G7-+.:!#$G).(7@D(>6@.;!:1(91@4!H(+.($D2>$B?+ED/G5@3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A25G6G19 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4223 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2430 42 284M = 2348 -366 AAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCCCNGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTNGATCTCAGNGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAGACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCNGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTANAG "%!!+)$$(&+!(+")&"$(*+%$*%+!!&!(!+!'%"$"%(*#&)&#!"$!*$&#$(%)*"")%+#&)$"$(&#**"**$'*$'(('!)+(!#%(!#*"##$%*+&""(*(+"$"$($+%#"!('#'%($!*))+!$%+%"'*("$+$"!"*+(#%#"'+)#'($%!)#('(!%!!+)(#*'#&)+%#&(%&*&#+#$&"'"()(*''&#'"+&""#+$)#+!!%()"++")("$%'&$(*'"+&""!+$"%!%(("#)(!+""#&)"('$*)$%$!()$"+' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:71G1T27G8T50A29C89C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4223 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2348 42 82M = 2430 366 GAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGG H2E4"*5(.+9<90%>H0EH3$5F0BH?BH%53!EF*-0CA@6*""$/D+F/F/5C"G<6997A,(,16*4!)?$HA-!$?% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4224 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14910 42 110M = 14746 -274 ACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGANTCTTC +!)#%(&*(!!&+%'"'&*'"(#(&)(%'+"!+!%)+)+&!$!!&)$%%*("$!'#*'#'%!!)(!)!"'(&))"'&)*!$)%$)$+!$"*+"$'!()%#$%*+)*'&)) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104C3G1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4224 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14746 42 76M = 14910 274 GAGCAAACGAGAGTGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACTGGGCATGGCGCGCA $<;=3F2:0F(!A4(H=F5(B5#EE17!-D2%+-11H-#;>1C#3*CD/0@#)>!G6+E>!<&96!#+)5&<#'9@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A47C14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27026 42 121M = 26855 -292 AGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGA &@H+D2<9*3@",6"5-!%##=9&9C!:$DFCB"&*><%>+541,>6$)8AC+:D.3$#"#&3)H;4&#G!7D2)8C2/>:$63E,D3CA"0)E>='7*=8F%3/CA=F6<3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4225 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26855 42 84M = 27026 292 GTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATA ,?H3E=67.7;A:$$5+@;B3%:0(*0G(!&*9<9*48'/79BG1G2E1-'C1FF?4@B'$.7AB3F@A/G/5,.487C$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6991 42 82M = 6866 -207 GCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGNGNNCTCNGTCNA ))'*!)(&&%*%+'*"(++!)"%')'#!)*)*$"&*'#)'$"$$"*#&'"%(+%"#&#&$*''&(+($'!##$&"'#&%&%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:69T1A0C1A1C1G1G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6866 42 48M = 6991 207 GTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAA 7)B8:/F7*2A/C&B"/C;<"/:#"4"H/&/%3-.661:23G79&8., AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4227 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10646 42 142M = 10499 -289 TGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGCCAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAG /+5%C(D0=.H9-?.'E"@+C;(;-$0@G;G6;6>D!..5@&!:&>>GG4)>&.5)$&/=E?BH<#!-FB8')6%+;=&8::C,-7+:G<18)C!!ED8DB+"=A$?6E2C.:1,>4,23.D*?,,F<@%7*?@)<91!G&< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4227 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10499 42 117M = 10646 289 ATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAG $*/++"9F?0A0G:>2!($<'A;G9,22:'A'F673'-"?!0(76C(D;>6;(1$(F14<:6A/.?!7566>=0844+3F>3(,*,AD('D"2;<4B!E.@<%6&<-/@&3A#$1BD4G"&+=:-,$.?.47CH4/<=0!,2'2G0<,#>;$-FD)6;9&,?'8BGD/'5"C$2$.EH? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47G15C27C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4228 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4100 42 62M = 3895 -267 GCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGTAGCCCGCAGTGCCTGG "''*!)$##$+*+*#)&(+!$")%"+***'"*$*!)%)+'(+'""!#"*($*#"$&&$)"+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A16 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4229 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20848 40 95M = 20651 -292 GGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATCGCAN '($$'+(%(('#!)&++!)&')"+(!)*)*)%+'+#*%&)(&&')(*'&$%#"&!$##%(&*+#)(#&)#*'*&&#&'*(#%)%!#+%%%"%#)# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:90T3G0 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r4229 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20651 40 46M7I151M = 20848 292 AATACGTGCANANAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATNGCTTCANATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGGTAGTGCAGCTCAGCANTGCAACCAACAGCACGTCTGAAANGNTTGCTGCNACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCTCACTGGACAGTCC D"7#$.#$!$6$FE"$E3=;E?;7H'8%4:+?74"4@0!3(!$543H1$(#<*7184$/B66%3A5')D/-HE3,-!&1/"%9%+)GBD3&&&.0*42E>FH0.;B+:G)#H.C0+DBA2A,!/,DB@&$0((:H0<>'CE?+(,E21')(:'D7@$&'9(,8=3F7G(5)1,:1$$.>G)#/*$B<9E55 AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:16 MD:Z:10A1A26A45A15G23C1C7A47C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4230 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28758 42 43M = 28965 248 GGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGT %G21G"&"7:F=49.47??)B2H8F7.)*6%=!4C;.B+G3$2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4230 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28965 42 41M = 28758 -248 TCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAA 9=2.'+D-GG<6=?H!(C&@/;!(3=,#E1C&@%3/66G$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4231 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10485 42 59M = 10485 0 CGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTAT &+*$"++'*")!%+))!$"+$*+#)#%*)$'!)(%"&!!!")""'#*!!%)$!*++%)+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YT:Z:UP jpayne@0: r4231 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10485 0 * = 10485 0 TAANACCNNNNNTCTGGNNNGNNANCNCCGGNCAGNNCANCNNCGGNNNNNCAANTGTNTC "!$$!#$"!!#""$!#"#!!$$!"##$$#"$"$!$"#$#"#!#"""!"!"$#!$!#!"$!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29596 42 79M = 29275 -400 TCTGCACAACATTGNTAACGCCCACTCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGNTACTCATTTATAAACTCCTTGCANNG ')!+*+"'!)(##***!&$#')$&)')&#))*$"+(&!!'*+&)##$$")#$+&$(&+!()%#+)"&+%%'$$"%+"&( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14A9A27A23A0T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29275 42 51M = 29596 400 CGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCA %96GGGA5;"D!C""G*!&7F-++3!$H34+7+(D9?B-3F.$8+56E$:#)?-159-4HC)?.+H<%%@!GE=(D="HE">)+#),#G)A%>#H=A>@$HA7A,(("+D0!<>'46 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G25G67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4235 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24311 42 217M = 24255 -273 AGGCCACTTTCCCTAGGACTGCTANGTGCCGGAGNGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCNCATATAAAAAGTATTCGTTCANTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAANGA ('#*"%+)('!""+)#$))$&+#'&*"$(+'$))$##')%##+((#"#&%#%'*!)'&)!'+$%)%$#(")"!&()!&($+'""(*(''+#)$$"!!%+'+*"&")('&&(!!"'$'('$$(")"&#"#$!+"'&+$*&)!!*#!""")*"'!+$%'%')&!#+%+()+"(!''(&%+!+!&*'#)'($+$$)*(*&!'!$$&#)"*")!!(!+$!' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1C6G15T9C101T21C55A0A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4235 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24255 42 56M = 24311 273 ACTTNTTNTANGNNTGAGAGAATTTGTACCNCCTCCCACNGACCATCTATGACTGT #*!&%&&%'#%%!%(%+*+$!%)$!+)$)(('$"*("&&%)&$&#(%!)+"%)))' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2A1A2T1T0T1C0A16A8C16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4236 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12606 42 209M4D54M2D162M = 12555 -482 ACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTCGCGGCGCATCCGCGNCAGGCGGTACNGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAA DG$A1E2$+CAD75F+6H<)2"A+>(;3C4F&@'1G9<5B60A,='=:E93!!1;*;;#!3>(2&C'=@,4'H:D=+G-73:)FFH,?70AF=;+.+785-1>8@0G1B5*//!C1%-46<1&F!3/.E4F-/@CH&G(%H5!$(!G8A>:7'?#81*?E'*@>:C+=00+F+(@$=7'/=0H(,&E<(=&0428!'#$.#93?>"8":@%*H!-D%<*@90.8?>;0,>-@)F+;/5.5!3BB?&*B?+64'1E58B(4"B5?.8$;"?4B)+*=="#!776?,54B;!.G32970H-7&5BB);('HA4EH,B#7E:F'/.5=HE8+/2>("?5<9C4#0%@7"EH2,&,G<4%(<9$1F?7=-#CB)+E#GC:B<2;D-!H!8EE0'D/+0G52/&&B39:H78!";&&6!6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YT:Z:UP jpayne@0: r4238 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7447 0 * = 7447 0 NNNNANTNTNCNNNGCNCNGGANGGAATNTNNNATAGCNTNNGTCTGGANNTNNNNATNGCTTTNTNNTCNAGGNNTANNANANNNNNTNTNANNTTANNGACAACAGTCNTCNCNANCCCTTATNNAGCANNANGNCCGNGNANNCGNCNNNCCNNTCNTTNTNNACATNNGNAGTNNCNNNAAANGNCGGTCCCNACANCNT "!#!#"#!#"$#""$$!#"##$"$#$$#!#$$$!$"!$#$#!$#!$$!$"!"#"!!$$"$$#$!!$""$!$"###"$$#$#$##!""!#"$"!#!#"##!$#$$!!"$$$!"!##"$#"###"!"#$!!$"!!#$!!##!""#!!""#"$""!!$$#$"$!!!#!$""!#!!"!"$""!#!""$"$!#"#$$#$!##$$###$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4239 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36345 42 45M = 36178 -212 TATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGA ??7?02C3-6C*+E/)!B+>(&*)%)<4BA(38-"%9$363<;"E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4239 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36178 42 40M = 36345 212 GGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGG GE,.=%:8"8",6B+0E#)8";B6,<18=@7>ADA53H?H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4240 77 * 0 0 * * 0 0 NTAACGGCGCAGTTACATGAGANTCTGCCTGATGGCGCTGAAATTCATATTGTTCCCAGAATC (64(9$35:1G;H4/=!FH@':3-,;4+B,(.$3-;'D4(2G=)9G+!>#=B(8:C0A(B%C( YT:Z:UP jpayne@0: r4240 141 * 0 0 * * 0 0 CCAGTGAGGAGAAATAGGTGTTCTGCTTAACGTTATCCGTTGTCTGTATACGGGGAGTTCTGGCTTTNGGTGCC #(+!"*%"$%"!+(%+)!'"%+##')$)&&%'(&+#'+'!%*$)+"%%$+%$%%##)*)*##%)$$'+$!+)#$ YT:Z:UP jpayne@0: r4241 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13650 42 140M = 13478 -312 TACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGGTGCGGTGAACTTCGTCAACG @D".7C2=?%G&B0B?4F)9>%(&>>#B18.(.6E.1G?2.E;6G4D%B67"H'2B0+B22@,(H2=,-+*/::;D-A!1.$1>G(@/*@F&D.?-2DG&*"9-E+%!,4-/D+:8=CG/%18+8*F40%CG"9F528:$$?H&-C7B=#2"425H+.A6041B1B8'=3,-D:; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G23T80 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4242 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48095 42 98M = 47916 -277 AGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGA >34,1:E@.6B+"E@;@GB'#0AH""-<>!@6"7+"2&3B6:9#HG7:BEH%/.4GB@*%<0;+7F7.A5-3HC;7B+=8'#$B>H'42+7>(5A5,51-#&8'#+?%C1@-*0)2039',;E&;!%$G0,653%$)5DE-(@=B6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 167 42 57M = 263 187 NTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATT #@+G-3+--G2B4CHF8C07?4=+(#?*$E+9.0"5D'@,""5/,H137/,#(2&.< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 263 42 91M = 167 -187 CAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTNTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATN C0B9>4/%'?8DE#F<8.+?D;F,E*#9.4>E<.'5)7?@8=#,>?6H&%"F6*A@@';--C:@&&:+'2?@!C0;B1E,.45+D3-1+/- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55C34G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40393 42 153M = 40260 -286 TAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACNGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATT ;;"C@%*>BE#40@'9%+=!F?C41-(A&5G16)GA!:$>*6*%A,+!-"@8D$>?7,HC=+@5.-%6$BBE;D;=9D&4!D94C<&A&&7!9>&(1E@%0"6.@7@/-4%8;5.D!+=,"F251*?+C19.F%:>/&"63/>D/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64T18G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40260 42 45M = 40393 286 GGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTC <&0A*!4?F<+7>D.6<(%3-E'6"=AHCA(">A'"5D(<'=)'& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45415 42 79M = 45298 -196 TGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGA '&.3D',*:DC';###5)4"'1."#2D>(-480FA9$DG+43/55*!34&6:B2#9@$1#23#:@2=-(G,4)&A0!>F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4246 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45298 42 117M = 45415 196 TCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGNTGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCACGCTTATATAACGAGCG -76F>>%G2($7#3-A6-:'9,6E2)'DD?3F@@2B*)@;=;D)@60CC"(9FF?B4)%("2F01A#1C/A,7"G!C"6D<:2,)4(">3?:0<;3:%%8:2"0H@C*@2+C:G!9: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G34A63T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4247 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33369 42 75M = 33496 286 CGTTTCCATCCGTCACGTAATTTNCGGGTGATTCCTTCAAGTAAAGATTTGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCAC ?%C2C@4G7G,+!.9#+A@3AC;%7(3*D,57A8$)8H<;+'%3:A;"$.*=*4+4$CEG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A10G14C25 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4247 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33496 42 159M = 33369 -286 GCCTNGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTNATGNATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCAATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCAT 9"?%,":E#A0%G=(2/:+9B%4A,&/4%.,"HC0B@9=0+:FA-!:<(2GH!))BB>*D'G24..F%:% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4C78G3T7T28C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4248 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43689 42 74M = 43559 -204 CAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGN +(5':$2$3@)A?#@++(;2(.H(;3-.%?B(+C6G&&?0&.H)/<6+=?)F"$<6(D'*2.3%&53:56@";+,G.HF6#C#5%6,D=0H)48.&%EAH8*"'(+:E6?!$'.F?"*-9H8,4+,-"## AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43C75A1T0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4250 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33123 42 183M = 33123 0 CTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTGGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGACTTTAGTCT 54-,78,$#3H.H:#H$A@2'';$(=&F@**)E01<)@;7#9?20H/:A>)5//-7,('>2#<)14(18>*9"%""#F937>=&/A;:9AHA,:&)*E:#?<('3-93#<&9*31@<7,-1:CF>:+-+81H9$3,"972(H,0#(7BC()*++F/49"-664*4' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45A128A8 YT:Z:UP jpayne@0: r4250 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33123 0 * = 33123 0 NTCNNNTCNNCGNGTTNTGCNTNATTTTCTTCNCGGNANAGCTNCTNGTATTGNCGNGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATNGCTGA ''#&"!)''&%!&"&%#%$*!'!$(#!)!)''$&$&#!"#(#*"*%'($*!$"#!)$*(+)'"*)#$**$!#*)(*%%((*)#$"'#'!("!)&!#)#)%&)&'+''*'& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4251 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18970 42 83M = 19217 294 TGANNTNTNTATTACCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGT )%('!'"*!$(*'+!%(*)&$++"&%##!*(&&#'"&"(%!"'$('$&)%*%+)+*"*%%"&*#!'&'&!%"(%()!"!#%"! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A1T0G1G1G4G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4251 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19217 42 47M = 18970 -294 AGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCG 5&.77==G99?*1!88"%!/!B!,(2"*D@B!;8='C.5%&83G-)' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4252 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39865 42 128M = 39993 187 AGAATCGACCATTTCAGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGA 7/+1?(%BC'1BF<33')<#8*@1)0:=/.$+F%8-/;(:.(A7(C;9*D>-CE8&+(H+2):EC<2%A'6%/-)-05F<649)<7150E>'+-)482H-,D>&2C5@9.%(39!7H257=G$#@"C4+4*D6;$;5C9-2;918+:2C1)!C&A:@B@&H:83H.,-A,-6GF-;&0:!H!>F1AC/57H#*D.?2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T1C75C13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4254 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19290 42 82M = 19290 0 GACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACANT 3+3,-&!G$!H<@%'5%6D*A9:E&>>1"EC")"$CG2/$"78#D%H@/&>2)1A9&74B'GG/,DH6>5.8DC.,D/9?E@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80A1 YT:Z:UP jpayne@0: r4254 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19290 0 * = 19290 0 NTNANAGATTNATNAGNNNTAATCTNCGGCNCCANNGNNTNNTCNNTNCGNNNNNNNNTANTGNCNCNAGNNGNNTGCATNNGANNTACNNGNNANNANGNNCNCCACNGNNATANNTNNTNGACCNNANTNNNANTGCGCANA !$#"!!$!"#!#$$!"$!"$$$##!!$$!"$#"$"##!"""$$##"$"!""$!!!!$!$"!$!"!!#$!#!!#"!#!$#"#!$!#""!"!"!##$$"#"$$"#"##!$#"!$!$#"!####"$$$$!"#!!!$$!#$###$##" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4255 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22757 42 247M1D68M = 22704 -369 CATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTATATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTT D27"8D6B?713)%GD,%$;;BB@B.$A#C3$5!8?%#F>6&8"F3/,A<<9825"!-<9'9)38-.D9C=8#E."*)FH8&#=H8F=%=$0)*EA@9=D=.7;0*-!"(B@EE5H-G604!GH.B(7$,90>H+'(E5#A?2>?$*&B,-2($.=+.>')8G,(,'@+B+3":?(>?:@?:,FEB+70"BE4:G9H;""BB"?G#,"=6+#/#:7H+7+5(%(AH0"*<)#%6)H AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:247^C36G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4255 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22704 42 53M = 22757 369 TACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGT C,9-2.F4+D"21&7!0?293?G+D0$)#8G<@6$09*><2?8E+F-?#9E&A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4256 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3685 42 49M = 3871 228 AGTGANCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACA B0'8H;)6+-HE08D27A@-*H@?>!"0!938:EG'3H$B$/1,=49<#(2916)&!A&1;7C?G'$&=9B#25>GB.=6;(*/>!:,6'%2#1"34>4>8H=*&-$B=$;/;=>=(%B7/@'4H*E><-!%,2D'5C/9H%H59A"C597!7#*@!!98<1)?G?;-19/&@:$8$E/ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:47A4T101G5A0G0A0T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40247 42 57M = 40405 324 CAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATT $;**CD%4-9EGC97$!0"-H79-.:?@!A,%(4F6<"<0E7=%*+FCA!26151@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4258 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11210 42 154M = 11121 -243 CGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAC !EE61@DD2F=@(<:,G#<,54<120BGF#@>+2!D'D?<.3H>?+B5?@;6.-=)0%*F*F>7>99=#CDG/9F"$-"BDD<;$@D*BGH7+!==45409.7-%#&<(&.$:-.$F!6G&./A$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:153G0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4258 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11121 42 89M = 11210 243 NCGGNTGTNGGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCNCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGT "&$%%#&%#+!&&'#!$+#%($(""!'%)#$"$%$"!)!*%!)%$&#'+"%!"&%)(+(%#*('%+"&!'()&$+%%)"#(*)%++'$$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G3G0G2A0A40G38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4259 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20580 40 41M = 20631 245 ACGAAGGCGACAGAGGCTGAGGGAAGTGCGGTATCAGCATC +)%!(*)'))$*'&%)$%#(&($(!(+%+%%#'!+""()*$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C21 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r4259 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20631 40 66M7I128M = 20580 -245 AGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACNTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACCCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAA 7,G6"2E+/+A).,5"GG"E0/"#-:#<&G#!A@@5H)*4;*2A.&*,G"(#-F9)A*H7%8)C!'A28A&9*=65!G>H8!:DFC05EA991@)!DECC4'$=G7%F. AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:46G99G47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4260 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41882 42 80M4I18M = 41980 393 GGCTCTTGTTNTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGNCTTCGGGAGGGAAGCCGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGC 5>(B61%9:'6E*E'8320G4-6-C96"&<15"<5.>60&E'-#3E24)2"G:)CE7:F>FAD?0(D8@B.8F61+&"--<9'@@0F?9='F6/6=B)&/36 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:10C38A15T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4260 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41980 42 295M = 41882 -393 AAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATT 99?!%HF/&-??(/!B'$619EDD8E%?$84D96169*-*H"8"+0$C0"E199/9G;/E>+789;'?,GD,D2(DEG?:46(1C>;+(0<9'/G'1@1@"2D@7D((.B;6#0#%E$D?#'844&3@*'B?".!5.#D@/%84D+!#5'#35<-E4(&DH)'HB0)5.&G6-+="7A/>(AD#14,5"',&'+<6'*8&7B:$F,-4C,?C.AA!?G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:295 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45079 42 86M = 44973 -192 GGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTNTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAA ;2-#%:@A73D6B@BH=C,1:?+.G%3/6,%361.51$C1$6:1D&&-,@/+4DHGH2%>#($?E89"EAC<-1*2# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44973 42 53M = 45079 192 AATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAG ,)3A!&.<6@;'H*G59''D27*.DDE19&1)85#>49B4)E(6F!46A,E3E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4262 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39224 42 194M = 39224 0 NTGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATNTCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTNTGTGCTGTTCCNCTGG -A=3)09!01&C/5/5':%B(F>,G0@6AHF)-@.??D#8$$4';'$2E/+-A)2)F!-H>GH?G1D(H9H>B)/H,'<4$>.CE'9%0H:@E/?$E"4.B;'<9$38)(53<+A(;F6;',!-C5-E#9*"1?,H-FG@@!,>F$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11093 42 216M = 11049 -260 CAGCGAGTCACTCAGCGCNCTGGTTAAGGCGGGGGTAGGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGT 5<";+D.*2G0+.4BGH1)>E1''.3C-*=0ED*#!$>G)?:881!HBAG48+,,A&-:"%>29+#)0?7CC*02<%=.-9C-5=#,:$%4@F39F3G*82+>066/(A?;HD<+%41>>/0B.;75-=B@B=$-4G19-"5/E<7?F>$+/!9+-5/"481/D8*;GAF11-'"H0B1*@>,BF0H38'A-"<0DD->64@..>;&"7-F))6$* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A18A178 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4264 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43912 42 168M = 43829 -251 TCATTCGCCAACAAGCCCGNTGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCANCGAGAACNGNANACAANA "$%&'(''')+#&"#"&+$+"#!&)$($&*((%$#+!!$"'+%%%$!+$%'$&+"%+++")%$!'*$++)(!'+++$$(#")*!%&$*$'""'&!(*#!$+#"&&($#$#+%!'!'))'&*"*#!*#"()$#*+&)*&&"%$*''$'&+!""")(*"%"%'$&%*&*( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:11A7A129G1C5G0A0C1A4A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4264 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43829 42 83M = 43912 251 TACCGTCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGNTTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAANTT '++(%*(*)+"!*$"")")!+!&%#')"#'$())%)&#"*#'%(#%'*)!()!%*%&!#)("#*"$&)'%*('$'"$"$(*%& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G28A45A2 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4265 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32602 42 96M = 32741 231 NGCTTATCAAGNNAGCCGNAAATTTCTTNCGTACACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCA "*&&!%&''"%"')*!)(!+(##$&%'##%'$')(((%%%()!##'&+)'!%%)("!%$"()&"!+$&&(+&$$)+'!%!&'##%#"$)'"'$+'( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T8G1A0A2G2T9T3C63 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4265 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32741 42 92M = 32602 -231 GTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCANCCAGCGTTGCGAGTGTAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAT '(&&))(+#*$*!)*++$*((($%)%&$')$$$!%!(#)#%#"+&#+&*)"$&*+&%)!%"$#!!)&"!&%*''#%+!*'+)$(&!"**&!+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G15C30A0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4266 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15075 42 78M = 14820 -333 CGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGNATGGGG 3;A<8@AC:4F$3$.@09G133!&?AB"2E=ED%9C9992)4A71/F:-)>,2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C6 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4266 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14820 42 255M = 15075 333 CATCNGCCTTTACGGGGATTTACNACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGNCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGNTGGTATNAGNTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCNGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATNAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGG %%*+&!($'%&$&+!("$"+'%))!%(%#$(#+*&%(%&+!)"'+*+'*!)+$)'#")(#(#%$+!(*#%"(*#)!!+"'%'*)'*+*#'"+%%"$$(*)&''#$+'"%!+++!*$#$+")$$)!&#"$+)+($+*'#)#+$(#&+(+'+%*)("&)&++'"$&%('"')%$$+)()*"("!()'!%(&)*"('(+**%')&&$'(+')$((&*'#*(#+'+)+(+(("$$#!'#++$'#%*&+((%)!)#!$)& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4T18A62C39C6C2G23A29G64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4267 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8364 42 136M = 8500 240 NATGGCCGGTGGCATGTCATGNAGCGTGTGGCTGNGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGNGAAAATCCCNATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAANCAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTC !2$,1@:-<<'DHB7HBA(H+=+3@$$>)C&?>-;4:-09@6,E>6'*@=<>6*'@5C);"!.,5()A5**-$50&5'.=80:7,&-:CA-1=:$G#%94$$><&B"->*E4D2CGG.?@<$$H=)?/!>/CF87< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A20C12G26T9G29A34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4267 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8500 42 104M = 8364 -240 CGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCNTG ($!++$'$'$!(*!+*#&!$#"##(''!!!&+!*+'&%!'(+++!&)'(&*+&!)%#"'!!(%(#*(*!*((&!'')!"&#+!)"+&#'")(%&&#+))**!*" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4268 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24558 42 246M1I23M = 24827 336 ACTCTTTTCCAATAATTGGAGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATNTGCTTCAATAAANTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATACCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACT ?,%/CE/06:/"A?,@0",8#/<>2C9)2+0:B%4C"&E:DB2D/#-/E=#*G#:-8!2'5E2>#=7?7B"+108>-A1CB=:8(9C.32)4E7#-1>0AEH089HG!&)#90F??HH57;*,;01=$*>2G?!(H;F+*EHH"&;?%HH0/B(';>"BA:G@5&+=>*466G%73(G37--/,0&B/,)6-1#,'=F!9D9','(+4*8H@7#(?&HD"!#,"4$@#430186D"7C'$<,B./6;1$77*2H,2A#<19D?)#' AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:19G32T12T133G8G60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4268 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24827 42 67M = 24558 -336 GATAGCACCCGGAGTTCCGGANACGAANTTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTG =3.)C-##>5$D%81A08@7F=&*, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4269 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20209 42 58M = 20081 -186 CCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAAC (7*38DAB"=".',079@*93FFH548-#2)DC9#&+C&+95.G1B+>?!4'70+):- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4270 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13691 42 40M = 13470 -261 TCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGG 4";@AFB-8485$B2,*'<;:@-F#!19./,+0>H2E1;0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4270 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13470 42 103M = 13691 261 TGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCG C)E'1@DA1F"@+=DD)!(@@1;5;D-2*'/=9?>;%)"+?-0/D!AD()G,CB#*5.@H*.+96:?6>4!!).)+(F40B=B%>89&(81FA)?D;+-(!"5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4271 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44191 42 101M = 44336 210 CGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCTTGGTACAGGCCGTNCGGTTGATATTGCCAAAACAGGGATGT +'*+'"'*'%$!)&#$!"%&#'!$'&%&+$##(*(!&'%$&)(*+"+!!#(!"+%"!&'$*"%)+)#")+(+$$!#*+)"'!#*&)"""'%("'%%$)%%' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59A13G21A1C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4271 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44336 42 65M = 44191 -210 GGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCNGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTAC A2C2,-5,0-,-:8/@;%/C1A>B3?="BD(*'&&.2D,,5>3&H1=+,?,''78%(3=405B-# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A38 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4272 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25827 42 68M = 25895 224 CANCAANTTCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGA %(&!!$"&)+''+#"&%+$&$'%%*+%!))('%!*%$"#+!(&$!#)'%'#'(%+')")&+'!$+$'! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A1G1C0A60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4272 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25895 42 156M = 25827 -224 TATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTNAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATNTGAAAAGTTTTCATCACTANTTAGTTTTTTGATAGCTTCN :E*8+;7776&5#!%C"18)B&:!*"'7A=1,:%$#6HFA9$D-4,A'/!H/%,4<9)!A;EB.*H(7$D5+(89;':?7A+#$"--#B,);C@84'!-4'*C#>DCD*,G4/C.7;E*'(?-<1,A*5B'E,=$-8941>5:4;,7(->*4-=?% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:88T26T19C19A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4273 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4396 42 95M = 4331 -160 CAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCG ?0"!,G*"EHC7*@EH48)9F>+:6$1',93E7!,%(B/BHH?E*5"5+9$&>H75(.%<)&G1,9B2C%1+.;A>G6?00E30?6)%=$)=?),;96)$8>&4@<'2H07@#"54%,;CAG'(G5</>6$&><1.7#9,(+G-B+H,A2F@+H*>3A>D$9.68,>$5H&"24$D41-H$A1BF3A4&6A:+@=-9('!50,?=?$4!A;4-%+'3&%%->ED':9*>&6(.7> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G46A36 YT:Z:UP jpayne@0: r4274 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7018 0 * = 7018 0 GGANCGNCANGTCNTNNTTCGTNANCNNCGGGCTGACATCACGGTTCA (*(#$&#)"'#(*##)#%'##*&%(%#"*%+()*&$%*)#+((#$'(# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4275 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4587 42 112M = 4699 273 CACNNGAGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACANGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCG "#%!%((+&)+(#%"##%*(**&*!(&""'!"&"%'+#%)+(#+())!&&'%$%#(&$+$%&)$#$())"'+$'#)++&!*('+&)++$%"%*'#('#&&$%&%#)*&$+!& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3T0C1C39G65 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4275 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4699 42 161M = 4587 -273 GACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCAGTCTGCAACNGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGTGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCG <')':!#/8.,B7D!4'<6$'59,B*GAHFA?BA=/;20A/1E37 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55C9A68G26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5214 42 112M = 5026 -300 CTGCAGTGTACAGCGGTNAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCG C=0'EF'G3!D55A-">F32<@$"8, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4276 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5026 42 70M = 5214 300 GTAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCAT #!!++())&&*#"&"%))&+"')&!'#"&+&+'(#)#!###!((+*(+$')%+$$#+!%*$+%*#"%*&# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4277 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5691 42 150M = 5612 -229 ACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCANTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAG 7-2E2E=FCD*@$-59,!:,'>$G<6(-7A##H/-78;-E6"+(/::*D;;.8:',<$*/#/45-HDF,$0G8'G3<5*)>!3).'F?2H;-E0&;&@>9D98,:!7G"31#6%%9&0B4!0>20?3H%**!;035%H$C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82T26G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5612 42 52M = 5691 229 CCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGNTGCAGG @G;;;:A$"/*?(=@@/:EFCE=.,B3A>1(>.(#&<,H#GB.H(>+;,3@/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 964 42 80M = 1060 202 TGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCC =-,220.D'0G'D*35E,:1B";./:$9C2'H9>&G%?,>*&2&5/)<-0="4,5+;7>@C$(H%,F&/;+'0(+H?&.B*:A&A0*($76* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80A12A24T54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4279 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26729 42 74M = 26803 247 TACATTTCAGGGAGNTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAA #"*++#&)(#"*'%&!&)++%%+")!')#!&(*"%'$""!*!'##!)!&$*&"++#)("'!*&$#*)'*$&"+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A13T59 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4280 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9978 42 525M = 10503 620 ACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCNCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCTGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATGTGCATCCGCTGGATTACAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCNGGATGTGGCNGACATGACGGAGGATGACGTAATGC .:'8A)4=G+5?4*$(+@459F:#>(,6G#*>*6,8'27<1<:='%3?+,)1-:F7G6#8=H:4'C->#4"(=)(8-:@F3C-"&"0'&457,-"5)E@B#0F>**'6,FBH>+"$E=D469C2:1/<.B0H3%!0C:'ED39*-<+DA#-0)C$B*:%,3*%C4743+D%"@D3$<<0/#/F7.9)5C5,H46'G7B-=*:*;47A:7%B+?FE1:5/!D)+*68E<2/D?4+@=;<:!:=E2H=6<.4H.0$8(%?FG6,;=)=+!75H315$#<56#66D:0%@?/#/"A391'.$16H(+)G6)*F2-@$1'G-$BDB468D>)!:37><3=H;#<"-?D"!7'!3')3G'+H8<31$.'@*,C8(!*-;9HD'"<<.0(';"-<)H1AE.-9!768.":"C41#!!%0;F!2+8@CF?62F>@-9>>@=4G@:7$.,/,4(4,F+6+&=-@!3AH(,F2?G,FA=7%E=FB!5@10,8<443 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:114G208A23A15T125C9G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4280 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10503 42 95M = 9978 -620 TGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATT 5E!1.&71?/BDEG@=E8-0$=98?(&!.1B4+?>2A=/G.):(EA67<9=??2*:9;?:08;,!9!*%C&<%=2#<H/5,@25;?+2F$B&EAE=26!*#DFE1,2@A37$==@:2F:!.5/*$A8%,C19799$GAC,2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4283 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3141 42 68M = 3361 294 NGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGNCATGGTAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCT !?E+2-*<@5.,./H4F) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A33G5A27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7132 42 146M = 7278 420 ATGANTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGA 9,$E23?6&&;32?CE4.G#&-1-2/?@,9D3);%?%4#.F*@27.!8/0.40A%)C780)''5G0C(9%DFDH=;+G5D#H!"138F5'2D="50)0;73@(B">'!24$;?$A"47",>4E#59!D/D3620DA3,&"2DG55? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G141 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7278 42 274M = 7132 -420 CGAAAGAAGAACNGGCGCTCCGTGTGGCNGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCTGNNGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATAGCGTGATTCTGGATACNTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCGCTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTNCGTGTCTNTGA )+!)%"*#(("!+"$)#*#"'%**)#$%$$#''*)(!!$('$"*'+)#**!#*#+)#'&%%*+((*+(!''$#+(%%%&''("!$))!)(!+'')$((+#%)"(!))")(%#!*"*$&'*$)(%"*))$'(%%$+!#&"))'%+"!#&"$&'+%%++))'#%$#%(!#%!*)!#$#'&#'$#'(#$'#'&!(&$!(")$'((&!#%))%#*!#*#+*($)$+&*'"'#($!**)$#$&)#$*$($*#(#%!%'#!%+%!$"*)(*+)&(%!)#& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:12T15A57A1C0C54C15G47A53T7C2C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26463 24 54M = 26615 287 ATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATAAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCA <<#8=3389%"'49+06!.GB45296"*0#)01;1C!+>#$='A@C72HC8%8H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G27 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r4285 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26615 24 72M13I63M = 26463 -287 AATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTG #:+98,*@AD'+)=*:G-5;0041G6?=8.@A,<2473=H7:04DF:%C;5?*")/&@16(DG;.-@;7((;,GF77C">A7#?4@,4;G?E4B-0%+D1D0#:G'(?6$:!9+/5)%@15<278!>'87(9->C#8)&1*,D@#A<4 AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:135 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4286 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23246 42 61M = 23036 -271 TGNTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGT **#%%*!!"))&!)%(!+%%#*&$++%+"&)*""&&#%&(#+"+$+)#%!!#""(++(#)$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C57C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4286 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23036 42 128M = 23246 271 ATGTTGTATTGATTAANTNAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTCTCTNCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTC ;147GB;)300%?1:,F'H?7E7B?2&:#$D,1?,=$<(&;DC'>%*74D5,(BA$,.=@A%;6&4%=8;D)G?C74:#$<#:#5(/'*?""BC-?4),*$/&$0(&")@*G&#)A8<,'G83G"C/$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16A1C69T3G35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4287 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1213 42 139M = 1352 358 GTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGCTCCTGGGTGACNAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGNCCATCCGTGGCTCCAC )5-?95,'4.-:''"71.1CA!6%,)9;(@*DC7#D/(6@:2"61&/=#3?3@D9&(#B#1'&2G2'E70<9*$"6,(EH355%!*9GB/)0&<3!))+E,D!F77,E)G8(%>9$@5>%*F*6?.96''5G(25#8FH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80T11A29T16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4287 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1352 42 219M = 1213 -358 GCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGTACGCCGGATGACCCCTCCNGCGTGTTTTATCTGTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGA A!%!>FH7#8&A88H=..H7>?G&+?HC0$@H/+B"+60B7FH8*5D/<&2"#H=&BC'$%2CEB$345D2071$12D8?@?'G7"'")@-1BDFG*7C;/=!5)&E"#+::3!2/A7&,5BHA3%><81+5C7?==?6;C,0>>*":)9-;";&E'$+=0>EF37!$);-9F6>(>=&3H%((1C4($18GG4()-B33%%H,?;!'!5:/6D'!=4- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:144G18A13C10A30 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4288 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12052 42 88M = 11962 -178 AGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGA !53CA/88D'/.)6+0(1"A)%+8,+;E:=">5H@:@-2F:/A9@(A14+>%$!0C2D@0595G*>A;CF+9CC?)4C4%&)>=+A7.%5))0+?<>1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4291 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3880 42 78M = 3958 311 AACGACTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATNAGCAGCTTTCC *''($(*+"'$&+)"$'*%$%$%()+""&)#%+&%*+++&+()$"'$$%(+%!&*(#)(*'""'&"''#!'(!*$(!' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G61G11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4291 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3958 42 233M = 3880 -311 CGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCANGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAANATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGTAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAANAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGNGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCG )B47-!ABF$0*(+(#0,C();205FG=%1(8-19AGC"'),3BF9/&%63"/(%A5$/CA34$@FA8%7C/H*EBE$035":&,E57$0:440:*#./H4'2H**A.543.=0"+,9A3F-);>!!$C=%-G>*=C&<#!;9@!B"3;H*'55A*63=C-7,2/>.1)AH#)@=* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28C50A47A38A36G29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4292 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10119 42 74M = 10373 329 TCGACGCTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCC /296/4+8D(5E!?H?#6"C3H.C3#D.,''>-%G-D?G0A65B5C.44AE@+B@G%*B?+@12D-+=+*$=A/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4292 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10373 42 75M = 10119 -329 GAGCCTGAAGATNATGTNCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAAT ("&+*%)')$)(')&&&')%&!"%%'$*+(%*&"(""%&*$#+%*!)!&#%*&)')%"!#!%)#&(+)"*"*+)' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G4G57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29320 42 158M = 29542 278 AGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCANGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATG C&D<@?=!#?G!HH'&&3G/>+0'.C8,)@B1%@009/$;%%#AF/$771B;(F:G!(:&48.6+HA*@17DD$.C>61'8-@04"D!':E8#DG#'D;6BH84>C2%3;3H0G5F7'.3#11!@*;72@A/,-E-++;)>= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:125C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4293 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29542 42 56M = 29320 -278 ACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATC +&*A4CG>)<7$6@H>1.A+-22#DF(.+%>,@C*BC)BF!AED;/8+8BE'DEB* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4294 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29993 42 67M = 29826 -234 GAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAG B$16*+B7A@#!4=$.+"!=5B0G(G%G!#9&*8E9)/0)B=>4.-!)A6>C=/A0;;;.<#+C+5, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4294 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29826 42 71M = 29993 234 TTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACT 54,)4H,:D1+H;8=(0&2)B1*F(;"B&$8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4295 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6529 42 190M = 6775 292 TTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAANCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGNGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGT @";3,$?8A#,=#+D?3(H&(&>=<0071(75&D@31&5+7A#*>6"BC?HE*6=7%&,;><9$A$=6+$:&6++)@0/$-&A'.;@%=?7"8C!<+5+;?;/=:+-!G,$B2F,;#@",?2+&!"4G.'2=F!26%#E!>=1@%A#G,%/-)3!$<-!&"&.2C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G39A108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4295 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6775 42 46M = 6529 -292 TCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGA $2G8C*.2"/5G&G$9G.=?%=B.4";./?%(15@,D8&4<@A3$6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4296 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11993 42 163M = 11890 -266 GCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGANAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTAC D!/(;G(=35=:G*7#=0<.3/1645;$,30,&H/#21,E"F''?-BAA%4'0&26/&0D<,#?D,B">1C@0@6$$-4$D*0FA$G2(1F+5$?,:2)#:+3%GB5)3&2)'B;%,H&*6-#=7"E2/&A7%(;?;!C>2D0-%E";E8F&1F+=1!.#..- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29A133 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4296 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11890 42 79M = 11993 266 CGCTGAAAAAGCCGAAACAGNCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGNAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCT #6$"G4//D0&CD"''#F,"7C/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T32G25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4297 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13641 42 202M = 13589 -254 AGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGNTCCGGAGCAGGAGGGGATCAGCCGCTGGCGCATTGAN )AD3D>GE/E;4;9F9H7E371)560B2H=4GF#+-:(20?A-19(1E76G@03@/F((2CG##9.E25C79,C$C):D;A5F5"2G25:3"851"A@.E3:%5.2@E8<9.-$"@5"!BC/%F1%')9;3!21312!*(*;0<0C"E=+>A=45C=7E:B";>!9-74-B9:1%51A>5'>6,0% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:164A14T21G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4297 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13589 42 52M = 13641 254 GACANTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAA 1;-13E,=G!*#/8>/$;(87+)(>E.7-(,?#+)0!1G==<;C48;&/F*( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31575 42 87M = 31409 -253 ACTTTATGGCCNCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGNTCAAGGCCGTNGNCNTCNN )*##&$*&$+!(%#&&&%*)'(")%'$''*)#*'+*'!&%*(&("))!*"++*)$'&'&#"%'$!!)*$'($##+((&#*!!&$)%$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:11T55T10T1C1G2A0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4298 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31409 42 51M = 31575 253 ATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGC '3G&1A"8<:9C+%@7=29)0(<5( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4299 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42399 42 43M = 42179 -263 ATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAGGAAGATGATGGCTACAC >:?'0$%EC&99;<7D%6.!47%<5-77-G"!EB3AF>*!!-5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A14A2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42179 42 125M = 42399 263 AATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATAGCCGATGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAG F'C)&3=0&!%!<,0+@CD*<5EA840'3/DC#0E"5H*D9;<"+BA&$,,1-@,8F-0%1085(.814:, AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56T3G64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20013 40 42M = 20201 278 NAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGT !,C81B&2F63&>9C/8G5%B#<"F>.E30.B1?G"?H7A$C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C41 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20201 40 90M = 20013 -278 AAAAAGTGCCGCAGCCGCNGAGTAGTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGNCGAAAACGTCAGAAACCAACNTNCCAGNNTC )#$$!%*)&###$)*$*$+&$'%&%$)*'%!((#(""+')(***(*"!%%%!+"*!)##$%!"+(%%*!(+$!#&+&*$"#"""'()"&# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:18A4C0C33G16G2T0G0C0T0G3C0G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4301 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39405 42 75M = 39190 -290 GCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTG 2=$0;)BB,62771180CF*;:H1.%+!?6)@.!+)=8E(-#(>*#'>D2F=@3%/=4F52%B8>.3:B(=; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4301 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39190 42 59M = 39405 290 NAGCCAGANAACGACCTTNCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAA %+'#'!&*!(&!%$$'&%!&"%%*"&()&'!&'"%$$+!$$(!+$+*#(&+%%)&#+!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C7A9T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4302 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10985 42 82M = 11067 273 TTTCAACAAAACGCTGGTCNTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGNAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAG @+-F=;3D1D83.B9:3)',$G:(;:!%2&#>F>1-F9F;?;:6DA>6/B>G86@5E7/6/*-38#!-:B0%7F-%34%+$)83'.-D-AC..H6@-.'.+<&20A2;@/)C*A3;E=FA#C!&)/9!4H(D'+6!11!5B< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G120 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4303 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24031 42 43M = 23841 -233 CTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTT ?%"C:)%61@6==E$,(%F"G5&3+?+*61@$=656$,G*D.1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4304 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31092 42 138M = 31230 294 TTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCNACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCC +.7(.A-8.#FAGH8H+:5$/)6553:4D#&@.4,D;A(%26"G(2A0@A"?/5H9G'(1!.'480F.>97<';B2H-*E%1&+<4'>E'/7E&,(!1+#-4-@DA8E3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84A53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4304 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31230 42 156M = 31092 -294 AGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTTAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAN &-E0.>-@!<:+>,6$)573E>1.D2A'>@1=:2'B;D@.9%%>C"93>55E>4;,DF"=!*C07,3$EGEC4%1<4?%27643#CFG)C'?%-,91D,6::+6#G+?CF/>-*1(9EC+;!&$1G#"@+3#0A+2:+F(C:0(@(11>G<,)4.# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109G45G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4305 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10718 42 122M = 10840 327 GATTTCCGTCGGNCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTGGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGNAGG ;0;=3F;4%@:#(1@!2+29D(';213-66=B729'/178;#C0$5$34FC)1/5,62@(<,.4:7!>3A>52#+BE15?EB")(5:FD+D/A?/-5?<:H8-@)& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4306 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9248 42 66M = 9078 -236 GTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTT /#H7"5*$)!H%:2(<51'*$<%@3E*.E-1?5?!6<"./E8E:/.94%7.,,:;*%.GE-/EG.: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6866 42 49M = 6915 264 NGNTGGCGNTGCGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAAC "$#)'%(*&+!"!"%")#%$&!'+#)!"**)*((&+!$%'%+"'(')$( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0T0A5A2T37 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4307 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6915 42 22M2I193M = 6866 -264 GGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGAAGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAANGNATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGNGATCCGGCGCGTGATTTCNCCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTNCTGGCTGACCC .35-08)#%476#/$1)1'?6G%//C.$9&;)"&:@209@B)'#97.7<0,F64/+D6#'2;*AGG,+>*!(E59=2*E-FF%2=%5GE=C2;3'93!#D0%-+,'$A6/H>DC7:C4+2F9.1*/@/9F-037"7030'974">D;E)<->>#D-:1HF&H3=&$><($$E"+4.?,F4'8@!EG%7B+*/D2/"8$F'&:7%14F*7===+)>7D AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:34T73G1C44C14G3A28G11 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16146 42 78M = 15885 -339 CACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGG CG6$388?HB67.G(43AA)HF7>4#&0F=D$(0#$?=E1<")/.$:=.CG?:E=EH=4;8("@%'1.G.6A4HGE-< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4308 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15885 42 125M = 16146 339 GGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACNGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGA 3B!!E2B:(7@EA3*&/;E;/HC1E!-E+'>B334:?C;$E8.H57)813);?3=(,A,5$>#;,E0=#3G/%7*)90&*"9/>!F4A3C/+%+4=:;972 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4310 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35255 42 126M = 35092 -289 GGCGGTTAACTGGTNTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTA 75H(F.9,@AF8@2%%2>+8<'>2?@<%9.6+0H%<8=F3D:*:'AA3%+8@.**B81#4()=-',>08(:G"/$B?/+/06>0/2$, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T111 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4310 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35092 42 43M = 35255 289 ACGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGC !.1@HF!46?#"#D(4<.,H!69?5C+-2*42%H3*?1#9$B5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4311 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47934 42 63M = 48168 281 TNNNNNANNGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTANTCTGTGACAGAGCCAACAC )"'!%!*!!+!#&""#%&'")(*'#*#(%&%"#+'+'+*&!#"%('&!"$#)+"&*)!$(&(+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G0G0T0T0G1C0T34G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4311 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48168 42 47M = 47934 -281 GGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGC D&/F%@6>=F.*-CH>?F46A".B?D5=EA#94-@0H!2.(734G*=@8:HA<-B-0!:/52,A)-9,HG!<+AG,5,B1-A(,':5?E103C2',92FC,3H25DAF,#?=;?4%=9+.@<2C7&9F.,8!C0)F%B?8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4312 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14197 42 150M = 14347 272 GCTTNGTAGTAAGCNCANCNNANTNGCAANGTTANTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGNGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGAAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGGAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCAGAGCCACCCCGG %%((##'#)&)!*%&(#('$#&#%'&(((#$!**!+&!')))(+"$*$")+(!")%%+*!"(##*#!&(%+*'+'*"('))"&"+&!&$('%*#'+(#+')'*%+$"+)#"#+&+'!+*"!+$("+*+(+))&$&*"&$)(+(('+#%%( AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:4C2G6A1G0C1G0G1G0G0G1G2A1A2T23T29G23C25C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18915 42 101M = 18748 -268 AGGTTCGTCCGGAAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACA "GEH:<%&E&'*/-8H,."8!)37@,.!80A?+6G8+65/H8!B:C/)!A-4@+EF3.BDA)<168*+B514$?C+0#G:'=C-/?:'A6/;1'H"7/9!4>1C2='F*+.+F:90!2!/>?">B?%+D%A3;=%F5"CF-74:E))&@4C2&DD&.<09"C&8%;241B/H:C*-1?52A1G3C41)C7CE=% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4314 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20279 42 288M = 20567 349 TGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGTACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCNGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGGAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGC %D#@(&"=??E?=)E(,*<1/'9:B#9#&4<5%<'8#1G12488E&"+%,#&*BB5?>CC*/$2FE3,$,#*=EEH).?4#H">01&''8A'#E?/2H.=(0'8(%@)49/49-+E8/@11'5>H5%8'*4$1A'-FC7&9-523.1H#.28$(<7*7!?7B,='43EC+$<7$@A,+58F9*32!9'*A4'1'=G".$@$<+/=E9&1=!8!":.7%1'DE.E6G:B82A&/+!':-!3A)/0:A! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:77C106A72C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4315 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16227 42 109M = 16095 -241 TATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGNCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTTN GF:0B%A"&(08&51CB)554'4C?;,30F&%362#)@!2A"8C/=771BE"90351(' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:76G30G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4315 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16095 42 132M = 16227 241 GCTCTGGTNGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAANAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTANTTATCATCTGCGCGGGCG 53B6CF(H*&"G?'G;9@9)'/5+)9*H'6,=D)&,<06AHF5DD%"/:*$"#,?09%))#:8!F#,/@3+8'65DCD;F;BF=G;%/:/C/<7+=+H@%=H1$+B/CCF/DABCC$->D!'6=80?00(D&-+18AB9D(;8(E@?BFD9H"0@G'11B<%=029B>=E6)8%/-BE<'-7@4B05?H"8B2G;C9!+2$;!G.+1!A')#%)B1?%-F855G?C$76HF78(&<375,'3%,,69'4=C6*4(3"H:/.A.&$G/B8;F!'$9B$;(G2&?2%<.@H;;73,A1=C*@"D/F'".:F0)+6E,<%"#2&$:0F)>&413@566B:3F*CF,$<#&H:-C,)6>)6:'"F4-%E3H>B>@(-"?3'8H5-!*,3"@+C>3#:/,>)?#E@A;0!=1B"'BH,H1%D> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:192T43T4G31A21G64 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32870 42 173M = 33043 533 CCGGATGTGTTCTGCCATGNGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCNGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCAC -=0450$:G8+4E"E*C+E&;*"E))%G(9!$3"/B,,(?B;=$GA090A@=*(,7,&A'41<$@<,A*?26+!0#$'@!HFG!(.@)'/D:"".0)!7$HCE9!G8>/>G<&E&13A81<+40=5:1H-%C9$>%$;4)67F6''#F!5%@,"8?2.3!6$?'>,.:,(<+- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C51T58C42 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4317 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46258 42 194M = 46452 262 TCTGTCNGTCAGTCCCTGAATCCACCACCGCCACCGGCGTGGATAATGCAGCCTACCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAANGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCCAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCANTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACT *)*($'#*$$)&%#)&%($$'+)%++(&%&)%)#"+&&%)!(""(!%$++")%!!"*$&%'*+""$*%#&!"*&$#)("$+"#!)%%")+*$(()'!'%#"'(*('#)##'%'"!')#+"("!!()*&!))!!"#&))"%#%##$(*("(+$*$+*#)*))#$+"*"!)&('((**)!&)$'#%##%+*#$("% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:6A6G1G4G11T21C25C39A39G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4317 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46452 42 68M = 46258 -262 CATGCAATTANTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCG &G"9%6&%/:H+9'%->@#%@.!4@!+!7-$9!#EG95'#.*:$3F6/#$4!D=75F-,4A5:F6+:8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T57 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4318 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3874 42 54M = 4082 302 ACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCC <>&9'$574",+1%22682/7B?6D35.">;;8":B#H6;/18<=12CB!!<(6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4082 42 94M = 3874 -302 TGGAAGAGGCCATCGNTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTG *#H354;8H421#F7;9:;?D2G+;=H9#B%9$8D'9+()1*%.:-1.$@&;>;C3DHH6(6->*2#:+G++=!8?CC3BF37HE*AA(&@(:; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4319 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36641 42 51M = 36641 0 CTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGT A.;7'GF/("?@!7::,!DG#51AH'55C.!A,D,9&EFB6@0$-FHE86! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YT:Z:UP jpayne@0: r4319 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36641 0 * = 36641 0 GGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCA 1$$B3@8.?E81%".47&HD@>C&!#-:+8=$66.*6-**-&@5&81G YT:Z:UP jpayne@0: r4320 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43932 42 72M = 44004 256 TGATGAGNGACTCACCACGGGCCCCGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGA 7=.2/7(HDD036%D6(E,72"H5-78%6/630A0;03+%*>#HE633'4#-4"H"/+>0C,6E7$F35/!0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C15A48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4320 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44004 42 184M = 43932 -256 TGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACCCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTNATGCAATTTGCACACAAGNTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAAC =2*1)3!%(HA4BB0$3!+525*C(<$>;G%H9D#B';,8;.++A';1!?!;@95%1-4H'02(=/"&4"9#F,$D,*DF23,!%#'/4-082*H>C56/B:%"(A>#?:.:H54C/'-/=!7&2:34;>'0@&@=!.5(!=8)A6B!?<) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4321 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31403 42 128M = 31284 -247 ATTTCGATGANCTCCGGCATGATCTCGTCAAAACTCGCCCTGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCANATGCGNGTCANNGTTTNNAAACTACTAGGCATTTTT %#($"+++"*$#"'##+!#)*"$#&&%)")+')$$&"%&%+&'$$+!'$%&#$%&'!&$%(%%$&##+'&&&"%'!$%*$*&&%+'%#)%+$'#)*'%)''$)&#%&&$$&*#!#())%('%'"&")' AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0T9A8C19A51T1C3G4T0A3G0G0C3G3C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4322 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9769 42 69M = 9848 231 TGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTTGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGNGTCAGACA 1%E/(!--7:F3!D8-=()D$/H6GF=%D-#;*'1(#"7#D,E=CEFE@,)-8B0*E77+646:>>0%FA'F(07D@:)&@;;?=!>H"#*@B:9"&?78/80G"0#)+3F*#/F-75=!#)3$3%?2+62:4&(2$$DH&!D?A-B;BB#-7&&B@&-1#%0%(-"@:-2B@/0'/D5' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84G67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4323 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22763 40 48M = 22987 276 AANAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTT !&"*+&$)!%"+'"!!)&(*)'#$$')')+%*&&+!(#)!)!(#&##$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0T0G45 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4323 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22987 40 16M1D35M = 22763 -276 CTGTCAGCTNCATAACNCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAANTG G(0#H+C22;F2G6/HF),&/<7@D+550.1,>#H(4"C58=,/*4CB(&: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:9G6^G0C31A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4324 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10581 42 198M = 10779 510 CNGGNTGCGNCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGTCGACAGGCGCTGGCTGCACAGNAAGCGGGGANTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACGGACGTG #"()#%+"'$)!"%""'!)#'#$'+(+'%"!+%"!&*'$$*(")($&!*"%")#))*)&!")(#!'!('"!&")%+&&("+)$&#$%%*&$*'#*$!))&%"$+$+($$!!#(%!((%'!'*+&"*!$'$)("**("+*&$#&!%*)*(#)""&!'%+)##**!&)#($+("#")+%!(#)#+((*#*$('!!')++& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T2A4G97C21A9T51C6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4324 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10779 42 312M = 10581 -510 GCCACGCAGCTTGNAGGCGGGCAAAGTCCGTNGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGNTGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTNTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGNGCAGGCGGCCGGGCTGACGTTTAACCAG #;$'B7$&)":=$1!2;3><#9AB&><:5'?66C!>EFF%10(:/*B:)5+(GH(?6':3:"8D:#;@"<:;'D12;-H#%G#=,=(**57C'2*?+)DDF!@/&?/40?3+H&!B9)5H.)E+(D(!>/92'5B3!!68?$>%.<0F,3406#45226;22%?9:)*/;=EE"A0$6*.B#<07*05&D=)/16D((D,/35,C=!8<*C<,/71(/>.+;>=17E7'&4F*,2B41E&BC+4#1=@8'3';5*&>H0,$2F9(CG-'>BFG&E-$CH#.)B;=EB??'A.*F9H62E,@1<*!+*B&9-D AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13C17G94A100T55G9A18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4325 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12300 42 225M = 12525 288 CAGGCAGAACNGGAAGCCACGGAACAGCNCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCGGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCTCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGT %@A"?D"42C#<@-G/;/;#D=9:4A(A9G:5#3=62!D()-&H+E@;18)@==EACAAG/#%:8D49,4D5H)B;DD.3-FBG$H=,*:/$7)G))H@6E;5&(,&HE*E>$<"7@19?D(C&BBA>B5-1"G57':39$6<89.C;6%*F=%H3FE,04;'?D7(4//'#F94(@856&<*-H0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10G17G105A53G36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12525 42 63M = 12300 -288 ATTGCACAGAATATGGCGGCGANGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGNGCAGCTTCACCCGN B/(%G>,#68G",04!(*@D'@8B4*E#15%%*60D3%!?%?E$:9@/#E<8E4$;G#-=D># AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22T25C13T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38421 42 114M = 38570 319 TCGCAATNCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTGCTTG 7+<"7$;EB;8*$3-"/($C<&E785A9'5!=53?$(73=E74(C1%(A=#0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G101T4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4326 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38570 42 170M = 38421 -319 GCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCNGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGNANCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGGAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAG ))&$$&#*%'%*)"''*)('))'"$&%!$(#*!%)+%('$!&!&&+$#'')(&)!!!$#!%'&&&"&!$('+$%%#)"+(!#$(&&#(!##&&')+)%)(##&(%!#'+!+%&!&*$!()+$&&"%!+$&+"#(!*$&))(%#(#++"''!&#!"'(*"))%&(%*(%+% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59T35G1T31C40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4327 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 650 42 76M = 827 316 NATATCATCANAGCCATGAACAAAGCAGCCACGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAAC #+&&!H@,3'!A%"'>4G=.B5?BCC"-*?7BHH#56B$;D";3/:+(E7"#%*%./6"0?.E,:"=6<%-A(D:? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G9A19G45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4327 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 827 42 139M = 650 -316 TCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCANGAATGCGATGGGCAGCGACTANATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATC D1'C(B/#B+")1ADAE?HA>0;BD,!1GHD*5#,6*C%-4,5/G??'9E253G68#E$@G&&,.!:#>46)6H=C.9;88'<5'(C-;E>')3D732)(C233*H5!'BH&ED-4)=*B6%1F)6!H;GB.33%)&.$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65T21C50G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4328 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17417 42 69M = 17604 231 TGGCGCGANGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGG '4$.=7G3E1%E)1$G$)6=#/6)5#?20851C$?",7D+2=."% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4328 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17604 42 44M = 17417 -231 GCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGG >>E"5(=+..&!=9;))$2G<"4%C#;@D(3$$.&)'C##&B9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4329 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44452 42 146M = 44615 219 GCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATNTTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTT C2$.+3'!H!/4,2(+&E./)A=E&<5@@6*?263">C2+);A<9C=1.!/'!:AA.>H5H,%'<2''0*7#E,/43+)9H.=5:2@.4",.-0B6967;.<<+?;DD6&''BH#(4'$3A-:%DG$:0B5412*C381:+<$,C5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4329 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44615 42 56M = 44452 -219 AGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGA H!F@G3<,.E8@#*BB$/)=%$7C6@>%,G?7?:=>HC@&#'<78#+:5G>5;G6C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4330 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32497 40 64M = 32366 -195 GTACAGGNTTCATTGTCCTGCTCAAAGTCGCTGNNATCAAACCNCCGGTTTTNATNGGTNAGGN #+!$)(*$(#)*&%#"#'&*!+%&#+%(+""#("!*$&&(%(#")!)&*!)'!%#%*(%$*(%# AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:7A21C0A2C0C7T0G1T6C2T1A1G1T1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4330 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32366 40 84M = 32497 195 GTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAANGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATT '31A-!14?(@=E!7*!-F:<,'6.;H0B2(,#6!("56)F4@E8H2$'F/@($"+=H!&&'>5D##/@&9?=D4.$7' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T28 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4331 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19769 42 49M = 19912 303 CGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGT !1>=!.*01=DEH251E"-+)G908#'#2G!;G:6=*#!&>)/+"#(B4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4331 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19912 42 160M = 19769 -303 ATTTTCTCTGTGCCATGAGGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTNGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGT <0A.(/$3-1/%9D5?)+>!"-E(AA>4EGB<61$??!B*.@="D'."26B$;8GB!&92$3.C20&9C*8@?D/992->D'H-,,+(-DH==H.;@8CE=;36'AD)A%D9,<33:"(4'G$GE*,)*6?&'%-;A@E;*:&,4-%+&"6F/6E%G/;12H9@FHGA=3(;/4)(A-<1G6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r4332 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38770 42 41M = 48396 9686 TACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGG >3A:C?681G"E27D:;08:;G64>9@(F'H4,)44;G<$CD8!D/E?3D3;>:E/<=?/.@06!HAB6"E'/;FG>-!#C3?;C/"(,$(>E7>"D/;(6E+?)*?&97"887+DD=?D*'F1:4BHE:D6DF+F!&#)@E,((#/)2G=G=0@HA.1+FF%*C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T204 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4333 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 968 42 62M = 1076 316 GCTGGGNGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTANCTGGTTGCCGA 0#$+,31>>B@B>,1)F.7)+"!A4>C/&'F%-<*2#/E4.E@(#29B557G%:A"%%B:5= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T43T11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4334 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31536 42 4M3I82M = 31677 228 TCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTNACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGG 9*/>&G+2CFH2'3%&D83,*F1G5"#4H'8/6,6E=7#9@8.@)*1B?&2:H?-8>,4G@;-0G/D4E5#!B@F4+?(;F14-6#"-C AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:15A22G47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4334 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31677 42 87M = 31536 -228 GAGAGCAGGCGGTACNCNTACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTC ##3'<<66@C?!8B:0$FABC(:3H+G5+B>()?,@//&F=>C5,H+#-:6BF$$:51D7&4;3/E*(,-'&D2DEE+#>#'!:6*. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G1A69 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39441 40 54M1I16M = 39635 264 CGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGNACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAA 9&)'$;8,+)."36C/9BA2F&0$H/())."@E2?9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C54 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4338 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33251 42 200M = 33142 -309 GCTTCACGAAATATCTTTTCATCGCCAANAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGACATAACTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGANAAGGCGTTTCCATCCGTCANGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCNAGCAACAGGCCACCCTGCAA /;$DD+,,5;F/G&+.G'6<,B.4:H3B1;%<*%9DDG?>0E>*@E"9516#D8@')&;)H>)%;$011#FAGH"//<7C<8@2&1$2>'!HH4@$''C$&D"'C(9H0>-.A:/1:'90EGF!+$-4;#$94!/:F!-$<5*;.4%1>C?:-(*53$.E21$'H@9H'!"=!3"'-FE0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:11C16T32C5G45T19C45C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4339 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22654 42 124M = 22538 -240 TATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCNTAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTG %.7:,G-6G4'A.!<1<(!63DFH,/F.E'+=0!7*9$E3&G144<(G,B*G"8;1GC=DG#2)A$,"#1)8C1)&'@(BH(@F*G-F%(F@+@?=3;B?!+AH4(4'+.+$;>38D4;" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A81 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4339 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22538 42 91M = 22654 240 CTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGNAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAATGCT @GE)%E4241<)1D(A02HB/2)D41G6-!EHH+9$>(*& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A31A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4340 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40004 42 65M = 40207 272 GGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGA 3.'=7$:0-4=/?4(+-%;8F##;EG2%;/82/&<6&H8@@4/:50%03A1+/:'F27G>G6(&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4341 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2358 42 114M = 2204 -268 GATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGANCAGGTCGAAAAATNGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAGAAAGCGACGCAATGAGGCA BG'DG*+'BC2+5>BBD&D&;3@$C=E,'G&&-5';33&)+38&H1,44"<;?1)?$>9<=G!74B'4:)4*D"=+,$%1B04<21G1.C@@H4CD.+1G3@$=3()@F09.3# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G13G35A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4341 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2204 42 54M = 2358 268 GGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAAT HE(A.BFC*6(9559+".1;.6A5:#7B@6B>=:=(??"@@.4:=.'5AG3D@' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4342 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14623 42 112M = 14812 237 GGTGCCGTTGTCAGCGGCACANCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTCGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATT #E<2+>-02F7-/=%2'3A;F%*.<)4),,=<(%">7*'-!G:F-/C;/=4;2/B1H4"FEEA1.:DAF8%>.D6)9E<>*!!")A3".'>13E-FE!)-'=;&">H,09'F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G27G62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4342 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14812 42 48M = 14623 -237 ATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGC A$$7!&6A<:*/+&1,D4A689=;4H')%-!5G0=@!8*E.8?#!;?) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23290 42 122M = 23412 248 TAAGTNATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTGGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATA @*8'DE7)8%'(*F9A815@,1%%8<;10+EF2C1!&-",78F,$/(!.5@1;G>&DA*>&0)&>F?*5D67B,8*<+(<0'7>6CB1<-/G)F;G>9=!AH$!*@#11ADFF0D"3;->>*/6/H,%52!-+E2((34AB0#6A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44T17C63 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4344 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23055 42 42M = 23229 279 AATTGGATAGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAAT *8%2:H=4+?8,6"F,%0>F,E=$(#7&*:(CG@?8--+(7< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4344 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23229 42 105M = 23055 -279 ATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGT F!+84(:7967$8E,6?9;'A+A797"81?FF3C96D"$)E*D3!=$#B84+1&H+$62A7%)).HC9D/ADH@)&)G3(7.@'E-'D.@F,6/.);)#<*B/:B<.;.E4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4345 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5180 42 294M = 5099 -375 GGCCTGTCCGTGCAGGTTCTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTNATGNCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATNACCGTCATGCGTGATGCACTNNATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCANGCTGACGTTACTGACGTGGTGNCAGCGACGGNGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCN =&@DH-3%<CB7-.D0/H-)?##?/>$.(<(5E@9++4>-/+:.)+<(=H-BD$75?.BAH2D/G=#HH/5,0-7@1:8%<-B-6$**G6/:C.&C1?*?D!&#'A*6)6.B4*&.6$'856@@E*"!=.H<2CGA;",>;*:9C/H9H+?BH(.%.96526!;$%B6"#3D&+6.-D(#3E@@&A.BB6:/:@5-&&#.&18AA+-+% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:18G44G3C39C20G0G79G21C9A51A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4346 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2570 42 47M = 2395 -222 TGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGGTTACGCCCGTGCCN B.?%,9?22G#AG>8!6>;)G=6G@66=HG-0'95GE-H>9;FE:)( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A13T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2395 42 83M = 2570 222 CTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGAC B*F.G,A5FF?B0'+-,%>2)6-EGC2<35+3*1>!)>9'E0#.!-=#A9<#-:1073+%D,+""3,$/@1;=<+7*E>,B4< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4347 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11480 42 169M = 11306 -343 GGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAANAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCNGGCGCGATACTGGGATGATCGTGAAAACGCCCGTCTTGCGCTTGNNGNT (')%#%#)**+')+%$%#)%'+%+*!#!)+'*("""(%*%'%)!)!"'*$%"!*)))+!*"""$&*!&""()*$''&!"(!*(#'(#$*+!((*$$)$##&*%)+++$'!$(!*#!)''&!&%"$#"($!%!*%('#&$#*%"&(#$'&&%%(!%+%"%(+$&*"#'%" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:60G58G6T20G16A0A1C0C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4347 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11306 42 174M = 11480 343 TGTTGCTCAGTTGCGGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCNGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCT &2A0AH<@''B+C#2.F.!,),:(6;.4'B#F)C%";B3)3=F1*0'(6H80&(),9)!*H/=&6%?/%3'G$7D/'&.BHB4*@93473'$(.:$@%4>'#A7;+:G!E#%:&7CA(<<3G;C04<8;6@:B&<>F/:)@=F=B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A114A44 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4348 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9157 42 53M = 9292 192 NTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCG !*!%++!++&)*$!*%(#$%(('*!'!#*()+&$!(%''(!+$&(()*&(#!" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C17A34 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4348 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9292 42 57M = 9157 -192 CGAACGGCACGGTAGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGA )'F)--78F&C3F>*D.2!D5":?-#6#500BB<0%#@;+1:5"A?=B!9#$'$/"/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4349 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40866 24 65M = 40584 -347 GTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGT ,"08@39;<8/5'-$<9D!@48G$"F1<:%$*5+F6FFE1,2HG/(D&,H0E!#F#+9'D.8@'. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-79 YT:Z:CP jpayne@0: r4349 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40584 24 28M7I13M5D105M3I83M4D44M = 40866 347 TGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGANGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTANGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGT >>/8-B4GDA'9"FE6H"D<=*0$E0;+(>$>=).+*F:/+#%>(A47.D;?GG5FF&!0$@4581##'.3*=+D&&D):4'%B>45#%<+;,90&7!5/8G7CD8@D!*<'@1D>=H$=E(:*6<&*HE.=$<605+7A496D>:E8530;=A딨C!-G"A&$3*(*3%F2$+71*/A+6=2G2>B*#=&=0%)>"2)0828>H@./&8*85;F5G-5 AS:i:-79 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:4 XG:i:19 NM:i:21 MD:Z:41^TTTGG6G154T26^CAGG44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4350 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4011 42 69M = 3826 -254 GTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTG ?089-D)H:,<+72:3G?=8"A;80("A3$6-;)&7'0$;>@3/H?GF'&1#D#6:8$4#.A:48A>-E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4350 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3826 42 61M = 4011 254 CCGCACCTGANGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCT 4>:&5*(H6!")(5(*!',#(,5@C&A2$=$,*+#<2')&!)"AH3/G0(&;?@=#@95!H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4351 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6639 42 60M = 6851 258 GAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTANGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCG ):!&?AC/F>E890<#=F7H;;5!>-/0,#D34&5)3BA&BFGH0H3#)47$*>;85&2+5F(98=4, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T45 YT:Z:UP jpayne@0: r4352 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7003 0 * = 7003 0 CATCTNTCGTCNTGNNCTCNTCCNNAGAGNAANANTGGCCCCGAAGGGCCATG **')&"!("#%!*%!!%(&!)%%!"*&#%"$&!$"((%%+%#$*+&&)%)!+$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4353 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22781 42 223M1D50M = 23085 356 TTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGNTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAANCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTNGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCNCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATC <&3-C1(+B4C5+,%;#3EF)&%F54>0C9@2-/$F4.G6;5(==0<>5$,/B/$:=+3?6"9FG@4=6D49E;/F&BA&$(>4&!5:!6>@2%'A9FA6C37"!D8FC%@5!(&E<5?";G'@98D;%G.3:A,D+@/<$GH&G5,DC4-G"F;0B;5@G+@>>-$F$/: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14866 42 162M = 15157 357 CTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCANCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGTCGCAGTTACATGAGACTTTGCCTGATGGC #+(!'*&&#'(**#"%&%!($&!*#$!"&***&("''!*#*&!+(%))#+"'$!"*+'+&%+$!$#&&'!$+(')!*)!!"!(+'(&'#"+*#)&)(#!(+"*("**!*!!!*%*"$&)'%"%+"&*+)*&$)+)$++&!')"'#!"#''+$(!))))!(%" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28T103G17C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4355 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1830 42 47M = 1656 -221 GATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGT ;DC&771B!,$(&D"8/=*E.@D8F(?"5"(#7G"&=E'@?4.><(< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4355 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1656 42 103M = 1830 221 NTNGAGCCACCTGAGAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTCCAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCANAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATA '#'+#((#+(&%*)&'")!*&"&"(+"%+%"!#%'('+#+)*+%#%!!)&'#%(%**#("*%*!$(#%!+!%!#+!)%")$$"$"(&!#&''%"*')())++$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1T11C28A32A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4356 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34688 42 25M2D139M = 34854 390 TAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGNGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTG .!.2#E'!@F2+,7>>".)(99"9#,8=9?#,''C7$/7A?E47814*2/2*>G!':-3,,A$64>(>;-"(F:)=!;)D=A<&0<"#>0'*&<2,A(=<=+F$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:25^GC97A10C30 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4356 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34854 42 191M1D32M = 34688 -390 GTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGNTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCTATTTTCCCTAAATTTTCTGGCGTC @E+C$>92"2B:'"0:'7-6A/D>>:E;//8,2+5'+3B>7=;55?"61,D3.EB@.9B?0C!)DE(F%0&'4&%0#@F1&3#:'(4=DB281,0#0<=?'&0.6<"20@!A>(?7;&?D6C@+!*0)4#1:D+34-B,B>('(,$@B=%E AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:66T67C56^G7G9T14 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47271 42 61M = 47093 -239 TTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTNAATATTATCTG "E8!;0B@H">H8G/D'.1H=*=8":>F(#C).F/37)G6%*.G85;%-*$,H7!6%3E/>,!,5=4'7F7'*AE,G6&<'C$C(5B/7=+F(!:D9"26*+73@F5-!;,.0-+%4=$*(,@.*1=9&6A9;7)D-*DF*;E'A7((*"%8"<:/<$$7<8#&F#'<"G4- YT:Z:UP jpayne@0: r4360 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39276 42 106M = 39098 -284 CGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTTGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGA &A4/2A?"!G.,-,E!6=GA2+G5>G):HF?3-F(;G5<*+'BG7%$F!)9>;2@G(?E="'4@=:848!$3H)2)("E$#"0G0@:%748-<@6>'@"+/5.E0- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G37 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4360 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39098 42 77M3I18M = 39276 284 NCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATNCTCTAGGCGAATCCTNTGACCAG !E*@!*)3A(E%+(.H&,B=='5G+C!26;#0;/831669/ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:0G73T12C7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4361 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24473 42 90M = 24273 -290 CGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTNGATCCCTCTGAANAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGNACTGATACATAACTCT ,'B:G75$.$G"B30'3)+$@C(20A26:.5=,@?EC+$61031.='G!:0B:/66!8#4,@CB.7D)D#1;/'2,."83,,$%0&0E?%/9."@+HF#,+:E4>34?C';2DE")*@+*>@.&-B60F21/,"3A;1H!+,B*.=&,.$CH8)8>>;568*&46?0&B))0&8G'(0:-0#9C;0$)D&9;)>B+2.#E@&86(>D1/H-=A04*229%54""G&)50G:?312;=#$6G7( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C31G117A35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4362 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45831 40 53M2I68M4D185M = 45831 0 CCNTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGGTCGAGCATAAGGCTGNCAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACNGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATNATCGTCTGGCTGTCATNGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAANGCGGCAATTACTGACANNNAGNGNCCNCAGC *'('$"++&$(*+("(+!#$!$$&++!'"$#&+!*()#"&%#)'%$")(&!#%+*'*")())$'#)&#)!*(&'&")("#)#+#")&!)"(+))+#$&&"""('*%&$%&$%&&*)*)+)&)((#(('&+$$$&%*""#'*&!&&'$(+('*"'(&"*(+(*+!!'")##"*((&#(!!$&"&(&)()%++'*#%#%!)+!*(!**"'(!"+)##"(%'&)%&*"!''(&)%**"#'+!'))!'(#%(*+$)%*#*"(!+#'!!'%*+$++"*$#&)#'%%("'$'%+#+)'!+"!')("!#!!#$## AS:i:-48 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:22 MD:Z:2G61T15A36G3^AGAG54C8C7G81C16T0G0C2A0T0G1G0T4 YT:Z:UP jpayne@0: r4362 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45831 0 * = 45831 0 NNCAANGGTGCNGGNNACNNNNANNACCTCTANNGTNNNNTCGAAATGNTNTNCNGNTCNNNNCGNNCTGATACTGNATCNCGGAAANAANATAGCTNNNGNNNNCTCGTNANNGNGGCCCNTNNGCNANTGNTNGCATANNNCTAANNACCGNTNNTANNANNNATNCTNNACNCCCATNTCNNNNCNNNACGNNNCTGTCNGNNNNNANNNTNTTNGNGTNGTTGANTNACNTNCNNCTANNATATNNTCNTGTNANNCTNCTCNCCNANNNNGTAGNATGNACTNGNNNNNNANCNGCTTNNNGNGNGAGNNGCNTNANCNTGGANNTTTNCCNGTNNNNT !!!#"!"!$##"$!##!"!"!!"$#""$!!!$!#!"#!"!"#$"#$$$$##"$##$!"$#####"!###$"##""$!$!!$!!"$"$$!!!$!"!!!!""$$!""!""$#$$$""!""!$$!$!$""#$!""""#$"$"#!$"$!#"#$"$$$!#""""$#"!!!"!$$#!$$#!#!!$#"!""!#$$!""#!"#!######!!"#"#"##"$!!!$!!!#$$$!"$!!####!$""$#$""!!##"$""##"##!!!#""##""#"$#"#$!!#"#$$!$######!"!##$#!$!"!##""!$##!#"#""!!$"!$####$#!!""!#!$#!!$$$#!#$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4363 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37006 42 89M = 36825 -270 GNTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACNGGTTTNTTGAGCACTTATCTTTCCCTTCATTTTTGCTGCGGTAAGTC %%"9@'H,-8CEH)4%(DGF=.-E,>G!!B$>%)GA+.$-*4D7+!-G"&?)69(($-9F,<$D3#%!&:-+G+#A%:GA$<.0!4/G7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G39A5A6G14T19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4363 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36825 42 44M = 37006 270 NCANCAAACAAAAAAGATGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGC "'*"#++$!*%!$"#"&(!"#%!))"#%%))+%)#*&&%"$&!( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2A40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4364 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11194 42 80M = 11194 0 TGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACNGCGATGGCNNCNCAG "#!$")&+(%)%*!*$&%+")++)#)&"(++))+"%#&(")")#"&'#*"*('#(*"!+!")"($$&*($+#'!%"*%%$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:64G8T0C0G0C3 YT:Z:UP jpayne@0: r4364 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11194 0 * = 11194 0 TGGTCNNCTCCANAGNCGGTCAGNNGGNNGGGCNGACGTTCAACCAGACCAGCGAGTCA &!*#%("!%%&#!*'$*&)$$)(%"**$&('%)%)")**!+$)"*++&!(%!%+&)*#( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4365 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5450 42 173M = 5623 297 NACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGNAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGC &/:#09+4:H8C:)$''?<2.%8.#19$+%D2+9C,H(>)1G*26'#"',H9B%65?/;./#F=%F:-&7($C>-5@>,4=55&,G&A8)'$G7=A!7(0D8<&70+*D0@':B>97/'2>0>BA9!,>!>&@=;7;3$7-29/713@C;>!??9/8GD@=-'6,%3,,#G'! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G30C0G33T106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4365 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5623 42 124M = 5450 -297 ACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTT C/,F/632#15=F&@32>?C?%EGG=0"?;0G,B+300CEC-,G,B98'5D93>@B*88-D@!!H/$$!,2?.8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4366 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9255 42 132M = 9134 -253 AATNAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGT -2D?AF5&44#BC,#9=H3#%@5!B?-GF,.3A&;9+A$(C5@=,9?).!F"@C#B'BG>2"5#47EC/B/BC@'@E>4';)&?&H,=/)3*-#>H*@#6;=/>"&71B;1(9%EE<@4?.C'9'@E3,&7; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G126C0C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4366 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9134 42 121M = 9255 253 NGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCNGCCGGAGATACCAGCTNCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGNGGTTT %22!%H&+,G!24>;<&38@/8EBE6='H/A#)'5&.'.5A&4,8CE#$$!E4%E.*F.B(?&&,$$@:&.",&2/*A$AD;B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C40A6T16T49T5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4367 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32424 42 176M = 32600 435 TTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCANACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCANCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCAT F,8$41*?:89"138-&4-%!470>=8*7D'5=B,>:2*(8C3"*"5E$0A#H#*6)&.AH!7G1>G'>3A:G:CA*(FC4D&@+A/D#<;F-2HC48DG5&0$=;D4&67'G>5+.C-5"% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112A35T27 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32600 42 259M = 32424 -435 TCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATNCCGTCTGGCGAAGAGTNGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCAACACGTTCAGCGAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTT *H9>*/70,H130-G(-./5D(:E6A!8>*9;+E8.+##5$H<.32/4@#.$?5BE+-:<$8CD6/G2(.>/=1EA AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:110G16G35G11C83 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4368 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43163 42 60M = 43267 324 GGGACNCTNCTAGCNATCGTCNACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGA $&!%$"!*"%!"*$!'(+)+*(&(%%&&!#'%'#)'*#&+"#)&"#%+&+*$*)&)*+"' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4A0A0A1G1A0C2C6A38 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4368 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43267 42 220M = 43163 -324 TTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACNCGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGANAACAAAAAAGACCTGCTTATCNCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCGGAGAACCTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTNTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGG ,%7CD7:E2FEC#B'+:>(3)')9+89D8A5*>F.+!7E$'(9<%+;<8<-41@*>B)2">/%E&3H/(H8:$BA4G!C"9>0,83A64"*.%@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:32A6T30C21T28A6G41G49 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4369 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28769 42 76M = 28565 -280 GCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGG ).*#,&75).$&>/*5$,D0&$+&+)..)!:A'>(&@+-!C=GF(11*0>E@?.3=@G41E18!33FD4H%#B53F"=2.+)9:=E<2B?B#AG!/.:7G>%(8!%F39'@3&%G8F(5/E$C)'B$>/G+)E$(B$$CB184D42/)": AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G25A39G18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4371 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15643 42 68M = 15787 243 ATGAGNNGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGNGTGACGGTGGTGTTCCG "%*)"&"$'$+)&($$$('()(%&()*"!"$&%+)$*$"*)(+"*$$!#!&$%)(!+*+&"$$%!!$! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C3A0C0A43T2C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4372 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26163 42 56M = 26381 318 CAATATAATAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTA '?@4FA7F)/&;0.*=:1D-/#48%G53?$63"%2HED0%"3!/GBD:'1A4.<>C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4372 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26381 42 100M = 26163 -318 CCATTCCGCCCGATANAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAANGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTC H7%<9CA,<=EAC,79C02/A4H6;*>$GGH==<@:A;B7?4D<;0B(C0"17/7;3GE:;!7@C6HC<%F8<-0BB<+H'1%)13#7>( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A47G36 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4373 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26428 40 44M = 26532 269 AANNGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAG %($*'+&)*&&"(+))##$'%$#)(+'!$*!++)%%"(!$%#+' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C0C40 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r4373 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26532 40 155M3I10M = 26428 -269 GTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCNATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTGAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGA 636F59F)45D*%&)-'66716,<.<:A7D>$'!1"?BF'5,;(G:2"12C7.A0.(+H)3C8'&@3C!A)*5*?#5/#%#=)5)3=8B2-5;*5+'#926#%;=D7-G,:HEC48+7D9=;1%B6/CE().&$-/H59*,CF#&);068D.(,AB3*)/(E1.@.H< AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:95C25A34T2G2T0A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4374 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10626 42 59M = 10860 315 CANCTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCT )&%"+)"+"!!)""(%($$'!&&#*+")*'*$*)(*))%)**'+%!)!%"'+&%)#'"# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T0T55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4374 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10860 42 81M = 10626 -315 ANGATCCCCATCTTCANGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGT A1D."6>$2>",A>7507,-!&9!"474D(E8.G/:8=;%10+E9!!/8G>3+>"*64A%3B=:;;,:@$%!7)FG%$C>, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T9G4G64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4375 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19645 42 46M = 19831 286 TGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGG 6@@))H:8;:,-H0(*,0%H@0&#%?!:10(E30">.1A@4!2,6E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19831 42 100M = 19645 -286 TCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTNTGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGAC 9$H4+.(#-8-#%+!?B2H51)>828,;><;>.17)=9;"?B@&C,-9*?($-1@,,@!>@A$7/6).=2%@G1F>0-.8;!.DG2-%>F('$;;$'FFD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4376 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29140 42 240M = 29380 302 ANTTCTTCAATCCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATC C@$12)=/'?+E$B4CA:&=%8;+$20:,%1&$H1)0BH;59F!4F.%$5B.6,,$GA8B3*"4%ED6(GH75F9/0*DA"#81!2+'+.//'(,5.13F>%-&04F<(;"'A#D"H;-E0G!+H&"=:#*:<:-=")+%;B3A0:+&3A*6<*DH"H7G<@!&>C.88B9+7F'/<=6GA# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G9T228 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4376 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29380 42 62M = 29140 -302 ATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCCAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATANTTTT &+3H=B?88$G)GA5E,-*',*+67@GD-&.:;:<#B1G?.C5B0%((#,=BE/GDA?F.D8*''*:>?%B&3F><0FC%28@"?C<2<:A>/475>,.:;-F("69&!GE%7)415GGG71C(,&,,B5F>80%$;B3>,$8-1-'B(,'@:.>&(&98>B="7,+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A31T104 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4377 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40559 42 50M = 40420 -189 AAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTN G)-,G0D.#7D<0<0=:-A>=>8@&-1#$%'BC&-#$('&9!B65(38A' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0T0T0A45A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4378 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8469 42 202M = 8671 346 AATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGTTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGNTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGC /$BB/C1DF:&1&/4;BF:?G(5317A8HCH"#%2="9.!16<4$H$2$%##*1#>H@2.'9$F"!E)"5>644F3A-$HHD*18$/515"=@8'95B=(:DD*E52+!4,+%C#63H69*.B=/;/*C1"F(5/(:G3F5'HB?:+!9&H2HF@3.1E4HGGF*#;*F09//#E91:,)>0G)7B!*5G&,"-B) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C119T30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4378 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8671 42 144M = 8469 -346 CGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATNCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCGGGATTTATCCGGT 3(??E.H26!.-=E,H'%A=7.*42,""*(?+B9?.0<;AB/F@)8#C0.@==@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103T26C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4379 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23626 42 60M = 23444 -242 GCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCC EF.%"C@BG.%*7+?.0.3"3)27$!).7;"+'%%>;.+0@140$);(?9% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4379 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23444 42 153M1I11M = 23626 242 NTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGACGATTCAGTTAAATATGANGGTAATTTCTTTTGTNCAANTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCANTGTCATTTTCTTGCAATGTAAGAT "?$/H%C:5%2F=H/:,6)?*=9!@)&2+%.F,<<7-"BD>?;E>-./!@)=%!)5C%;/2E/F,/D!#?7<19@?E%E)1G03B&(66B>9<8,-,8'>F+'A.;6+?/7';,''C1G0#3*!27G/44B(GH!D:DDBF8+6,>75<3@F:$&F;.G)!;#.$ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:0C45T17A15G3G55A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4380 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24328 42 209M = 24214 -323 ACTGCTATGTGCCGGAGCGNNCATTACAAACGTCCTTCNCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTNGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTGTCATCATATTCTAGATCCGTCTGAAAAAATCTTCCGAG ;?2;8"5A*6'<;)(<27*C1H60%C9,@EBF.(6"A&/:/)=G'6GF,=C<<"=>D$G43,4D"E<)9%%1=4;HH3-/29$@/<'3C!G04%,&%!:+8;!,=:H%-'98B=-93?)*8#.&;2"G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19G0A17T39G91T18C19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4380 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24214 42 94M = 24328 323 ATAGTGCGGGTGTTGAATGTTTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGAC 69C("A."<1=(;*,?>"-D$,3B%&&89?&D2D;CB.,'*-HD4.D3H/3(8%G%1)&D#D%(-."70:(%%G4/>8CA8(GCDD0*04A6H5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A74 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4381 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8116 42 117M = 8233 328 ATACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGNCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTAGCCCGTAATCAAGCTGG ##(::1)C-*$9D=/&A,86$$C@4D#1F*@B)AA(?$(:?9!4A=5?42H:F:GDA!"A#3/(7D>"56;<#;A>&@H$B!5>AD+>/.HB29)&,70"=#AG19E$'&C&)-&!88!,@.55A+%.3>G?A.4:*1F>#A>4F!B!:.8"2*;650F197:85B0F9;6?$E'8A73/:)$, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:48C19T50A27T25C5C41 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r4382 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45949 42 358M = 46307 579 AACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGGGTCACCGCGATTATCGCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGNCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGAGGATAATGC %GA)D*?%';HH15G:F@=(3%(,&F(A=3!5(!!!F-61500#,C$??.2DC&=.5#F)%-,/9C4(0;358*%'H+G;&AC&>7<=(1,C)+2/**5&!58?$9(.-@&46%%5)$>,"#7>78$!H?")2%@(*"8'A%/6G<2->.%4=0"-945H-:=E"BE?/#$2!HG5+F!,&4-'0@&"$%@!'A>=2-A;53%&,3-?%G$,18=2(%!1)48-,<'/8)?+.2H*2*?3684>20DF=(?0#"9"(*$@'GB!B%/(@>DC775A(;(:&GC-/B1"0@"3B+@.3GE'*6F0'*/."0H1/?9%@;HA-,84A4?"!:+:7*G@>*#CF"(8*C==4B>"<5>;C@+C9"4/23=1H8;?)4'" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4384 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27636 42 284M = 27920 335 TTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATNTTTATATAATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGNTGGCATTATAAAAAAGCATTNCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATNCTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCNAACTTATCGCTTAT ;H90C!6CF:#'96%%5:0D/6&!.!9+453>$=0!7?D86./3:!F8-,H,7"F8("H!'>)!1(;0FB".(9-=C==&@--<0(94:A7EE)/?D8.D8-AE.%<;8=:."G(2"26=!:>8E%:>F-(7%)DA;&6-F1+%/)$'604EHEE;BC@73G4H?266(C5##CH=:)H07,&?)>D(!65:B0!06:,B!$9,$(*0/+%00:D!0&62/80,!:<@7(DG0,,F@C/9>-9DAF*+6F7/-G- AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:60A7C35T20G28A68A45A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4384 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27920 42 51M = 27636 -335 CTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTNAAAGGTAGG /9)95(C58F$29D)3;2G3"1@'0G7!:++AG)58DE2H7#E#;H=&D4* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G9 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4385 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18733 42 164M = 18636 -261 GTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTNCGTCCNCACTGCATTCGGCAGATATTCTGCCGTATACGTTTGCAAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGT &&(+,.C!*<:*9G*&A:!!<0-HH''*))&DH;%3,&!CC+5@08*5F5F?G7-="&7C9DC-?,H,D:F-F(5B1+A+)B79)(G320084G>?D4G'$:177$/C))$=;1"!?D;$1<&!+?4$%$"%$596C:6##G&.(<3D"'5'<"%9D,5% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:69A5A3G17C15C50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18636 42 97M = 18733 261 TAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCG +!#+%""%+&*+&&&)&)#))#)$#!$)'#'%(&''(&"+'"%$*#")"%'&"+%%+(%&(#&)('(*$%))&)$!%#%$$"!+$))'%"+!#+)*& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4386 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8171 42 41M = 7986 -226 GGTCAAAAATCCGGAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGG 8F5C&:)%9?5FBC9%,5&7(15A+#04,0&85/6#6>&D( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4386 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7986 42 67M = 8171 226 AAAGGTCTTGAGCAGGGCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCG )7"(9?@A'>97B4.*=B21.6<=8+?1.A.,B7'>"D(B@'$0!0F&#E/9%'@H4(DF;>25?95 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27021 42 196M = 26768 -449 AACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAANTTAACGGGGCATCGTANTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATA <(()+,&1>>0<:G/"8:D)1?C+6D855H7;GDC&+0+@%$E&B)B?+$*E%$-G;#EF(=<2.&2,;:B*653:.24.CD:53$+59'#(E%.-'EA9>>1(2+!H%)2.FH+#6E:4@F#.E9,4BB/5*6CB6!H5+C6?(>.5G4;B&"$&F"1-D-G=*FB10@HE/'CC.%.>D2?=C58-;!G!&*CB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70C16T108 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26768 42 253M = 27021 449 GAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATNAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGC )(3$=/3=#)G+A$F-#("D*)@$$!-B'=G8<33%#,)6,D5?'0/93;#E.A?.A#1080>FD:))'F+*@/(H6"193!%A7)(.7:$0,E30,0'G2G>-$97?:=4:*:+G'6E9'1@(=(,;D5$&..)&60&1>6-A;6?HHGD8,:!C)36;73=G%6=($G?22>%0)1?46B+3==(8:9"GHD+;"A;7:@1@??=>?>+6<*,%&"%=G@G;$5#BC@78'7DEG>A#&9+ECFC<-<6!1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:226T26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4388 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14731 42 464M = 15195 687 CATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCNTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGNCACNCAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGNGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTATAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTNAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCGGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGNCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGNCGGTGGTATGACTGGCATCCTGTTTTC +<4#8-7&&@.<#49%9)BA>-2=%<(C%4/6,91A+.?,0&;54#,5&2!/6D619B)>"DF&BBG4:/(/3FA'1$A1=B>#E8H0/:,AG&4A1H9E#-%C5&*$30>(&-3.F1B*($CF,C71$&%?1#)'15C>(C.8?#47%:H7?($:9&6&0>6(&G1F2=F&49-72(?A2,@7!/E:7"9$!*19"+%'4#/;F"D6'5B:%6&-!A"-*!*3*D'9,H71.'/0>;,/H%:#>)/%2$-DDB<96'C7<(@A*-8DB=.3263HA-'-*#%)(+,D.!3G'/(!@1G(6(=),8+4D7A,572C@FE5465(#>*,&93D$48B/=CG( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T70G103C3A60C59G36C23T35C38C12C14 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r4388 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15195 42 223M = 14731 -687 TCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTNTCCTCACTGGATAACATGGTTGCNCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACNGNGAAANGGTCCNGGGNTCANGCNTGGATACTNAGGAGGTTAGCNNGNTANACNAANNNGACGGN *!)&&()"*'+#&*'"+%!&++#)''&'$"*!%$'!**%"+(#*!%'!#)!+)!)$)*(!)$%&%""**$*'(#"#*!#!))*")#)&%*!%'+#+#(++)&%!'$!%*$#%!('+*%!*%"!"'%+''+"#!(($+!#(&*#"!)"*"&&$$%%*++*"(*$*#"%$(&**)("'#%)%*($%$#(")'))$)('%)('&)!'%&)#'$(!$)##$(&'"*% AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:27 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:27 MD:Z:105C23C27G1G4T1C0G1G0T3G3C2G3T1T2C5A1C3A0C1G0C1G2G2G0G0G5T0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13319 42 241M = 13560 387 ACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGTACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGNAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGA ,CB0753G0/<&$.!7>2"'9*.7;CH2%0>+-C"*CE3H+>/4.&9&A*:9+"#G/7;%EB/H!$4G<*'H.>;3'70C-:$+/%#"DH:=7BG%@:9*C",!4H;@B!H*$H@3//*8:5B$&A(<0GBE:3E.4C43B5/HH;.'?,H9!6*)(F)@=+)H7(31?8G8@CC!*@4&2=<+GH#&@8+*;"<='($7(E6H1C@5G.+0)4+3*F.@@496@5-%6()G<,<#-5#=8-957,%0!-(B/)D/:0??:D-AE*8'3++$7"<,?2.56G&<9=(@)A93$2F%3@2F@FG>2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53A9T82 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3724 42 61M2I26M = 3811 298 GGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGANAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGNCGGTCCGGCTG +3.&HC556057/1=8C-5/&<(B+1)AD)5A3?6&@:/23,C4:3.EC(*.94):+E8)E9.D6-,GE:)4C!9+E:'7@;H;%*C=- AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:26A48C11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3811 42 211M = 3724 -298 GGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCTCTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGNGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACT ;C$!+;"(="D037?D7%>*G*97!)!<+/$#:>?<3H,B.!4+@-+B0#:,947%<,F,?>::(:4)=D=1)*B*+;!$)=5'%##?C"?#:>9D97G%!7D.68;9F27E8/B8F:(&)((#)"@/B-1AH<605@G=#+:-73H*<><<;+HD;&2.A5H5*G*>5,G.9<@);=C!),!92&".A8EH/!$-@44?G>9+4C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38A84G87 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4391 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2151 40 50M = 1953 -248 CATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCNATTAAAGGGGCNTCNNNTCACNCTAN (*#+#$*+)&*(%$*)$&&##*&+&"""#+%"%)+")$%""##&#&!!#" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:23C11A2C0G0T0C0T2G0G0A1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4391 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1953 40 69M = 2151 248 GNGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACG )!*2>7*><7+-)>?--;E;4(,2G%G*&A&A4$)%".:9:A78/G53%$E(8H" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G67 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24828 42 204M = 25032 405 ATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTCGTCGATATAGGGATGAATCGCTTTGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAANA (@566H:#0)!4"(1-7<+F&%8(;69C94>&+&4797!F)557!$+">3>E168B63/:$A@=6?=1!7+;F$:$4$C"?!(A')-G6">CA"%=*@C,-.+*,BC0-8/@=0)DA;E327&+8,A<3F'44(11#8:3@5&H2>C!#)"%34=?72!)7.$/5D5/(D:A+G29!=B9++< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64T23G113G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4392 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25032 42 201M = 24828 -405 AAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAG !#A"+<18D4&93FCDG29"1-3(##E)=(!988@94@E8792.)-,),D/79(B(1*'&6!(@#6%0:4#=B.((:?.139%5B0)@9&&,HDC@C(B1,FC>G3!CA(/-1#6A7//8:1/F3:&71B+7+3,6(:E+G:CB;1%:95'7F2>*:F3H.C0BB78'-H,#5&++/7C=0C0>A/(--957%D"$F#;93 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:201 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13292 42 56M = 13054 -294 CACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGNCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAA 3;!-GH8E95/F>E#7;?/8:/38'5-47DH5F0<7!EA!,E;>%<>=*;,8D?3< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4393 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13054 42 98M = 13292 294 TTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCCTCNGTCC :G.!.B3D2?<*A!E?E+FA+4+"-3A0CC)//2.76%A(,-+74-'2E-8:3/,EF1D7,H(-1+5@59A1H%,2A7.=01:9#4)>'!6#5A*<47 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:90T2G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4394 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34202 42 268M = 34470 308 NNACCCNCGCNTTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACTGTTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCANACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACNATTAC &!&&*'"$'(#%+$&((%*(&!!%+#&!!+!%)'!('($)!#!*%!+&$%!(')$$$'"%'++!#''+)!&+%*+'*('!&!*)!+%(#$)!""!#$+!&&"+&)"$)+$$*'%$))#*%!")"%+%!+($+&&$$$"%(+'#(%%)'#&*)&(!#$+'*!&&)&%&%&&*%"(!+&&$"))&!'&#"'&'+*!%+!"!+"%")&(&(&#&)))")%+"'$"%+%#!'%&#(&")+*#"!!)$$$#"'"%')!#&)!%'(('*"&&+( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T0T1A2A0T2A46C0A26T82A93T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4394 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34470 42 40M = 34202 -308 AACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCG .4:0":?+!-::#)+*A-ACBF.C/'0.1D"?4/@EH5##-?10C5<);)=DF@21 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4396 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48003 42 82M = 48003 0 TGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAACGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTG @EE@@%=G3%A75/D#("C5@5,5%CB#=F-3%:%%<1EEH#@8'$77<2'EE=,$:+)C#81=44FC%552C3$$&B"%?F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T36 YT:Z:UP jpayne@0: r4396 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48003 0 * = 48003 0 NANTNCNCANGACAANAACTCGCAANANCCGCTTTCCTACCCAAAT &%$"$$!$&$%%%$'$*)%*')(*("#!+#"(!'&%%%)"$++"(! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18043 42 56M = 17864 -235 GAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAANGCCNTCTGGGNTGN %&%*%$'!#"""'!)"&')&&+)(()&$$&++'$(%+"'&($%"(%+!')&&&(*# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:41T3A1G4C2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4397 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17864 42 129M = 18043 235 TTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTNGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGG 833#.!+A8F9$.C*3#*D;$3DEG=):5!53-6!C$B.!2D#,B7=%8"+GF+:+@>!>%"G@DB).DG+/#*"/@E%-.H6@=C9@.?0B&2?@&*88+9."A8==)@.@C.4- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C88 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4398 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40498 23 65M3I49M7I13M5D105M3I33M = 40451 -317 CCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCAGATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCNAATCCTTCCAGNCCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGNAACCGCA 9AG$A7">5>4%FB1!0D.1:3-5!%+'F.64?,>2,:85+>?*;,/;"4'%E%#/47%G?%1<1B$(3':%C+?,02"10>/,<1;=:>5,F26D$/G#14"A)2G1(!.>C;?.04:%3()D+D9./965$1'3HHB!EE%+04">D6E.7+$5E>.;,?04=' AS:i:-80 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:4 XG:i:18 NM:i:22 MD:Z:127^TTTGG50C30A11A36C7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4398 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40451 23 47M = 40498 317 TACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGNA 8/.7A):>&H!*G>;>HA0./6HG)9++410/:F)'?2.-<#9&=%! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T38A1 YS:i:-80 YT:Z:CP jpayne@0: r4399 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22942 42 62M1D185M = 23190 295 ACCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGNTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAANATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTNAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATNTTTAGGCTTATCTAC *((*+&**&+#')$%""%&%'+%'(&'$($**%$"##+""#)#&+$)!*!!!*!#(!*")$$$&$%&%(#'!$#&*""*')**#&)++('#+)$($(#&$!#")!*"+%"##!%%(+"(#'&!!(*(%$"!'###"("("&#+**!+'!*#*##)$)*%'(&$!#*"&!%#+!"$$&!&"&)++#)!(%)+))"'(!&+'#+#'+!$"%*+""&&"#*!&"%)*$%)&(!!#(&)*+#%+'!&#(+" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:1G41C18^C77A29T61T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4399 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23190 42 47M = 22942 -295 CAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCAT *E>$+)1:.".;1&-5.HAF'<'3H9B@A24=";$&/#1*.7!>,*B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1730 42 144M = 1874 331 CAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTNGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCC 69"G?#?#A=G@74<243+@0&+..$!.2E+41';$-59992(E8>9(-3.&9"=#?"AD;20(G!@,.7(3<#<0(?ED=9!6-0E1&FGA646GG>9G#A2)',)5/6;!G=@;67-=:<$(&GEA#G&88E,,6>"(@+!8#?,05&0D,(9%51@@7$1>*#*F=+=&D#=,;=%.$<("++>:F-(-AH(!D4)!1EHD>>!>H+1:3$+$!8H%93D/>H<5#:;(HCF7E0:&2D,5,/"+E4AA AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23C6G20T21C165 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4402 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39966 42 142M4D69M = 39966 0 ATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAANTACGCCCGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAA C36/(B,G42(E-F?5*,.87/&7+559@G,*.=;CF4;,*%.'7:9FC"/'#':)+@=:;58;)9B)8D2..@.-85,$G6&C/F"+,$8:4'&;24$D>B)A>:4/B.<0#%G?7-FH.3,?%A0'!4H@+0E$A&()DE4.$+4:=#2E(/G:<'(C,.E-*'C$'?H>+%5A/F:&="&*D6<8+H80,01E9&:.($.25,0?0=# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:135T6^GTAA0G68 YT:Z:UP jpayne@0: r4402 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39966 0 * = 39966 0 NACCNACTGNCNNNCANNCNCCNNAGNATGTNNNNTNNANNTNTGNCCTNNTCTCAAGTGNTTCAGNANGATGTNANNGANGACCTCNNANGTNNGTATNNAGT !!$!$#$$!""#"$#!$##$$"$##$#!!!#$"$$#"##"!$!$#"""#####$$"#$"$"!##!#"$#"$$$#!#!!""!"#"!!!""!!##$!$"#!#!"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4403 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36206 42 172M = 36107 -271 GATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTNATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTNTTAAAACATTCCAGTATATCACTNTTCATTCGTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTANNTCAGCATTGNTG %$*"+!&$(*%*(*'%&$&&&$*&"#+'"'!&&())(#$'#&+))*#%(*"+'$'$&#+&&)'"#+()%'#+*#+))#$%"&"*#%(()+)!%#+**(%%+&&%')(#&%!)%"'+%)"(#"$#'+""&&"'%%))%(&)#()$+#'&*)#!$#*%+!$+#+#+#%(+)$)' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:71A24T23T7T29T0C9G2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4403 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36107 42 99M = 36206 271 TCCTGCATATGATGACAATGTNGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCATGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTAC @*"'3)&F";..;;1*"($09.9E!1:D$6&>#D!#*@(?3?45#85D*C;=D<'!5/7#C>=&# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C39G37 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4404 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37353 42 131M1D15M = 37192 -308 GATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCNATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCGTGCGCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTNGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAAATNNC )+(#'!*"($+*&')&("&*$+$!*$)!"#+$%)+#"$!#"'!*)"*$'(!'())*+'*!#"%$$))($("&$!%""(&$!&"*'!+!*')$""'!%'+!+$"'"!)")+'#&%&(%(&%)")*&#+*$$((+#)$$%)'+!&!'* AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:42T26C3T42T14^C10T1A0C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4404 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37192 42 48M = 37353 308 TTANCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTC (#$!+%&*+)))"*###**&!#!+!"!(!+++&)&+$$'%('*(%(&' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T12G31 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4405 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33973 40 81M = 33973 0 CANGNGTCTGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGCATACACAGTGCAGTGTTTA #(!)!)**&$'"++"%')'*&$&##"!#!*)"%+"*'%!('*)#$$#*%!+(+%$#%#(&#$(+!"&+%("!!$))*!"+* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A1C0A0A3G52A19 YT:Z:UP jpayne@0: r4405 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33973 0 * = 33973 0 TTNATNNGGNGNNANNGANTNATGTAGNNGNTNNNGNGNNNNATNNNNANNNANGNGNNNNNNGANNNNNANNAATNGNTCCTAGAGANCGTGNCTN $#"!#"###""#"$!$$$#$$!$$#"$!#$$"$!$$$"!!!!##"!#"$!""$$#!$##$##$$$!"!"!"""$""$"##$!!$#$$#!$""#"!"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4406 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39940 42 40M = 40062 318 TGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTA C@/?(?4)'2.(-AE2:)5=65?=47"1A8@)GA6AG5&H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4406 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40062 42 46M4D146M = 39940 -318 TATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGNGCTTGTCNATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGT *(041*9;$(<9#>@1.)E1F#-C7"<*4:@BH,"$5H20)*?$'>!*9A3#9B9?/#.B)&"5DC:-5E@(B86:)40A#8,%,H<68:/**2+E(,)F;/+H&:2FH3=(<-$B-E#?G6('&?,=B1*B8B2)6B)(C<<%E:,,@2 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:48 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4408 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18257 42 96M = 17994 -359 CGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCNCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTACCTGN %*+**!%))+*&#$!*!%%$"&)"%"(#"+%!")&+#"+)(%*#%"$#!&)'$&+')++&(+"$"!#(+''##$!$&&'!$''+*%!)")%''%(+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52C37C4A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4408 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17994 42 263M = 18257 359 GCTGCTGGAAAAAGNCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGNCTGTNAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATNAAACGCCNATGTTTGTGG D,??@/83<'4.!5&'$67=DB5",G;A;GB'3>:?@/D7A3/2E3B''@/B6$%0G8*(-@83)H&'*AF:$?=A%G,'%"$(;076*0&A30!G6C>%(A90,D)C>8,233"08+B0.BE-EA*.@-0+56!3,5A&.$BH*D@FF($.<525?A>:FA6&7@.5>@%%%;9%+!#-4C='>3(8-$<($?2(!H=+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14T85G4C138G7G10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4409 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12563 40 252M4D54M2D26M = 12522 -379 GCAGAACTGGCNCAGCTTCACCCGTTCCGNGCTGTCCATGATGACAGAAATTCGGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTATCGGGAGCATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCNCTGCGGCGAAATTCCATNTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGNGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCNGGATTGGNGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGNGAGGTNGGTGCAN "&"$'#+%)$)%*"%#$(&*)+!(*'%""&!"!!'"'")!)!"+*%!$!"('#%""$"'!%'&!&+"'#$)(+#*&')#''!!+$&"&&((''+%$+++')%!#+$'+'&$%!+&#!)(%+"+"*&"+"#$&+)#*$)+($#&$#")$$'*)(%)!&(&"'%)$*+'!$&"!'%'$'+"()&&!%%!)"!*#)##%#+%$!!$#$$&'&#$)*%$*)&"(+$++!&"))"%')#&"+)$)%++*("!&*#'"''*)()&($#*"$!+%$())*+()!$&)(('**'&&%$*"%')'#(*&#"'$!)+&%'&+$*#&+')%$##)$'&&!'%! AS:i:-54 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:24 MD:Z:11G17T23T25G7T66G2G17T56C4T14^CACG15C7C30^TA12T0T1T2C3A2C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4409 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12522 40 41M = 12563 379 GGTATTGCATAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGA #>#4>/H'BCG,9B>%20@9GH:&C*E/B8AC98E*:47=G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C31 YS:i:-54 YT:Z:CP jpayne@0: r4410 77 * 0 0 * * 0 0 CCATCAGCGTGTTTTAATCCGCCTGCAGGATTTTCCCGTCTTTNAGTGCCTTGTTCAGTTCTT ?**5@EE3@+<@9#,.B0#G@D,=??=)!2<<8E:A.53'(DF,(01?>?$<)8&.:/"<:?+ YT:Z:UP jpayne@0: r4410 141 * 0 0 * * 0 0 TGNCNGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGNAGCAGACTCAACAGGACAA %#%&"#+%("++'#$%#*"***")))++&%$(#%#+"%#$%'**&' YT:Z:UP jpayne@0: r4411 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6459 42 76M = 6284 -251 CGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCAAAGAGATGCNGGCAGTTTCTG H.9*9=2&630"9F,6 :6B#'<(6!D1F?@;#E('9:8.)=/5;(='/(3:;D<)G#,C6G/A60HB3")"=1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54G9A11 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4411 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6284 42 138M = 6459 251 GGCGCTANACGGTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCGTGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGA (*'*&'(!#($&+!)$$%*&)$**"+*+%%))##$!'#$%&!#*$&$!!$"+$((!&($*!&+!(*)##"!"(!')+&#(##*+!!%(!$#$!+'#(("")#''+##*&**"&*)'!&!'#)!#"&')*#'+"%(("( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6G0T3T83A42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4412 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2765 42 117M = 2604 -278 AAATATATTGCAGAGCTGGAATTGCAGACCGGCANGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTTTGGGGCCGGACGGCATGA +16:8G'E!4G?!'%G5C:,62#%%F"8@""9=*,#CG?0*DADG)F+#!>&7#-33(B%-'2&?=F#)#4F1B/A"'D0H&@CCG*G&(=1942<2+GB,.%+88+@!F01$@:/$,%<>#'9&D<;%6D&BG8C$@5?,/5%BF2:8!#-"C/A#2,D7#$C.>:>EC'64C@33)="H;>1C813)??, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A88A1C0G9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4413 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45599 42 62M = 45439 -222 TTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAAC >-7$G*"5.3(71&F>2/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4414 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23360 42 161M = 23289 -232 GAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTT G->"#?4!;7E2C+6C<1;0:7>*';C426HC09,"F89<'=&H44?=A3319#,#*9H2B>62'/<,02'23(C$#-:0,>3C97740(6G'FC%:D47$G,%H<1H:H?<:C.8E:,/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T158 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4414 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23289 42 71M = 23360 232 ATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATNG /11$?'H2/@30C<(/67"A;G"E%82'1".:H23D/4D*8H/@A?'@)&'#,@:A>8'(.D?CBD5<3FCH/%B%$4+6E&<<;FEAC"."7/H35=6,*FC,#6B)*-.!=:2#'*%&:>5F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4415 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15820 42 55M = 15553 -322 TCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAA <.1DGB+E@A+>H21"G%9@%)ED!-@7B(DHH!1/4D*A?0-"=6-0=:""'HDF&9D%B,=$;8-?:%C:!.'*"B3?E$-;&;8-48*.6.:=&8A&2H-(DC+$H"$4G&9!.>98G611,$,/;D2'806<,8)*0)E,7 YT:Z:UP jpayne@0: r4418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2064 40 22M5I104M = 2200 270 CGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCC /,F;D/)$2!1:E/$1F$G.H$:1)5E1A%"A(!8-6%3>.+<1)%4:>6?@/CA@325'3"716A(-::BF4-%5-#$"$B"6CG3!;@<>)"9>+<#()6B'?70'G,<847?#F9"/!G.48:6.=GG AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:59G66 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4418 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2200 40 134M = 2064 -270 AGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACTGCGAAAGAGCAGATTTATAACTGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGG >9A#320'!,)+/3+B8C#D6;"B5&,&"$F8D0322$G,8")@@:90F@G/H#B23=%B65**C0+E>/);!EAG'52>'<92-=C+;" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:70C21C40T0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r4419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23439 42 159M = 23597 255 GTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCCTTCTGATTTAATAATNGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTTATNTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTG '@8"6/+)90!#F!$E1;6(!GDB4;!1EH@B?4!3>;3:6.7(2!!FH*EH'G5H+G+5":G0(D5DA8/(@/9?&> AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:32T15A79C2T26C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23597 42 97M = 23439 -255 CAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATAGATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTNTTAGCCCAAGCCAT 98+>$45F2@$*<+D.0>#92@@(G')5= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44878 42 52M = 45093 275 ACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAG H56,>)@=<'+6$("78&0#AH)%=)EDGG<4#2*1B#5(D!7-"@<@(#+; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4423 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1250 42 93M = 1446 292 TGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCG F,?>$08::#+E1,,F3?.'$0?=4*$D4#F!-9@(+990H$%55(.1E#E% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1446 42 96M = 1250 -292 GAGCAGTANCTTAAATTNGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGT !)*!$$**(%!''#*+!)#'+&&&'')"*$'#!)"&!""#%!*+"()%'&*#(%(#+$"$%+#&*(#*'*+$%)")&(%")!#**+***'"!!"#+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T8T76A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4424 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15203 42 187M = 15203 0 CCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAANACCTATTTCTCCTCACTNGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGA H8"H6(=0@<6',9@:B)=<64#8"':'F01("2C&)3B>?!B,=@!G8%E,B53/+3./9+2?C<.H0E00&*$-"/+1&;(4(#ED+-'<3D4'"?D=(!/B(?$%B!3"3C-17(!E,4HD09;#:>@D;%+;$G947$<(C4F1?8>048A'5&.G&!?7!<@)G?<6$0=)?1C@?E-(?)!"*' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81G22A3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4426 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19682 42 114M = 19534 -262 CGGCACAGGAAAACCGTTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGANAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTA 'DGB-7C!E-/+;#0+&(5=B$3,+0-,39<'A?;6@4<,"-:;(<9B7H13/,/,E@4#-'&AG!)+;A95'<#9B53@3/F@A&1+'D;*H;5A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G73G23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4426 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19534 42 138M = 19682 262 TGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTTACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATCTCAGGAG G8-'36C'H6D.#HA,-DG@&FH$C&4$F'A5&9%>$6'(?5*"H@)-!C.,DA3>24$-#(;F1&)'14A>4.@4*.H?==>@'=+&)C9%=760/;D!D):A?E0<.(5$F5-;!CC>E7.69C(;="'=G++9!* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A67T7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4427 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21015 42 41M = 21056 439 TTTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAA #3@@6>4-!!//"8GE<-2%4%B?5GE$)=7#+?6C6!,9= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A40 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4427 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21056 42 398M = 21015 -439 CCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAANTAAAGTACCGTATTTTGTGNATAATGATGCCGCCAGCCTAACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGNCGGTGAGAANTCGGCCTTTCCNGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAANACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCNGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCANGNACAGGNTGGAATNANNGNNCACNC '&($#!&)*%$$''%$&$!!+)!*)*"!*"$&""$))#%)!*+#($%#('*)#&*$$%(")"$%$)"%"%#*''"!%)')!($+!"%#'#&*)'#!(*$**#"*&+"*)*'(%(*%!+)())#+$)$$$''#(+*%$%(+"!'"*'"((*+#''$(###)&+"(!)(!*%%'(('$"'*#*+"*)))$*%*&+*!((&*'('(**&)(+!"+(*#))%(!%'*$(())#")#(&&'*"*&($'!$%&')$'*$**##!%*&()!%(!$$%$%%"+*)+!&')$$''&#%()$)*&')&#$$#)(#&*+')&"%'(#"$+!"(!!"#)')(('##&((%#('*%+%**"+&!&&!$%#&$#&&+""#$$##+")!%$"(%$#"&*"""*&*')"!$)"$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:21 MD:Z:49A4T12C1G1A17G73C9T11G91A33T59G1A5A6T1A0G0T0C0G3A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17069 42 118M = 16888 -299 GCCTGGTTAACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCT /,98F?2!%09H;B#&<)2*D@%.<#%G#(2.1#E?DEF029C6,#8A4+(0"1&;C3G07/6FE'4"8*4E.*87;9%D8@+F*C;.%#"6B@<>B7!8&508"A,1H;1G4"A+C. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G109 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4428 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16888 42 44M = 17069 299 GTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGN '1A=37348G%@,C8=-=B2>CECH-$7-*#A&&B#!7C9/;F, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38289 42 394M = 38219 -464 AAACCACANCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATNTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAANCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACGGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGNAGGGGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCCTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGGATC *#%()"#*+"""+"&'$)"#'"$**!%"*)(($&%"))$$!"&&'&"$+%(#')&$(''&'+%&)+(!'$()+(!!""")"((!#!"(!$%))%##(*%##%**!+$*%+)*'%!%%#+(%(!#"+(&%!*'!*$*&"(%$$$$)!(%'$)%+$#(*!+$")#&'"%'&+#+$''*&+"!*+&"&'%#&)'&$"#&#%(')%(!%*%+'(*%$$("&+(!"$"$'!(#$*+(++(&'"(%!$##+*#%#$*#($"$!#"#"'')#''+*#&##(*%(*!))!"&!!**))%!#"&))%!'+$!&#!+#+#%'&)'"$))#*'%!#+#%(#$&)+'+!'#%("&)*!*"(+#"%$)'%('#%&%)&#%''"$'&!#(*)*&+"%(+++(*(+!## AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:8C44C54T48A35C3T45T146A0G2 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4429 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38219 42 25M5I45M = 38289 464 GTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTTTTACACATTCCAGCCCTGAAANAGGGCATCAAATT A:)A:A!)7./00)'%'2"H?*45$BA%06<.0(A07'FE&B+)&;+A08@GC@0:F>$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:34C21A13 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4731 42 240M = 4629 -342 CCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCNACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCNGCCTCCCGGCGTCTNGTCACGCNGACCAANC +$*()&)+&)&&!#'#)'%(#""!+&!'*)')&&(#%'$%"%"!#)*'("#(#'%+*#()$#*&$!%%#+(*%+%!(#)$'%""('%!&(!#!*")*!"'*&!$!!!)"')'$#*!#')'#'+'*'*(!%'+#")((&$#!"&#$$%&%)%'(+##!##(")$)'"%%+)()+&(($)+)$&)!)!)%+*+((&%"%*$(#!'"#+#"*+!!')(!$$&')%&!('""''+"''$##!!* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:167A40C14G7A4G0C0C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4430 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4629 42 102M = 4731 342 GANAGGCCCGCAGTTATCAGGTTATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGA %&!+#"(&'!+)""!+#!&*%#"*#(((+$(*!"))""%+'!&)*&%)%#)'+%"##($()$%$$(+#(*&'(()'$*')($&+*"#%#%("$+!*$&$#&) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C19C79 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4431 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47490 42 134M = 47231 -393 TGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTTTTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCNGCTGGCANTCNGN )#&&'$(*)$*%+("%()$!&(&#)!$++%%"+'*!#*)(&)))+!%#''("'!(&()#!$$$*$*)**($+!)$')(#*#'&%%$")")$'!+)'#&&(%)''$!"))($#$""#!)!"))&"&+)(!%%!(" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:94A25T7T2T1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4431 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47231 42 259M = 47490 393 TATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACANGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTT H6@F@(#@4#%93'-D)5#'(,8)1D6=2"-'.7<3BFC4%7>4(%&;0/)1BH9*(?DG>))>=&,460.'0?171A&<*=/(;@7-;C2?+'E;?;;&+(,>:20>,>F$C,-@"BG''-12D7."5(.1-&-=*.#F+/BCA=?(BH#E9DF0:#8@D>*A%$#>7,338(.3,3BH>.3G#7D-B-'"4EE.0=&5$#+61?+0>>*$&;*-<2(3;:#+'-;),,>"1?D"?1G?.%/%E!-:C&=;&<&%='G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62C196 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4432 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24772 42 32M1I23M = 24988 267 GAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACT G9*3"6!3(12-E'?80H;E<>&G:8(1&!/$%:+2<:8%*#@<>.B?D7."3929 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4432 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24988 42 51M = 24772 -267 TAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGAT %>$':'C%"59@E>?@(A@0F*7#D5&B:E29G7F38;8"7(>H>,93B@1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9336 40 49M5D12M = 9150 -252 GGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACANTGAAAGTCAGTGGGACGTCCG EF1B,$)48A=5%04CB6D$A&7*1@HEA0=.--.!3+*E4=*?5#):8+>=/.%81C(B. AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:38G0G9^CCAAT12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4433 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9150 40 126M = 9336 252 GACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGANACCCGTGCC ;"),?<5!EH;H(DH)).@-=C.GF0'F51,A0."8+6B":31"7:02)@F!H/7F!=%BE*"62@A/12*.04"1-0"@1C-G*!!FFC4>.H8*H%<"?9)<+8%"?B&$1,&404#( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A90T9 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4434 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24070 42 77M = 23814 -333 TTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATA ;:.!C@(G(E55#/>A$4?/%2"B!:-"7&@;"FG%",G06G4+#1CHG4'H,":35"&=8>4&!,'2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4434 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23814 42 42M = 24070 333 ATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATC C9:EA/?A4>CGB(#A!AAA/F1A$A,3F-/571.!H,:6C@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4435 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35591 42 78M = 35761 253 NATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTAT 'G9;GAG,E8#2)8EEC6/11D'9BB0/%'E442',="::B:@'0;'9%4.HD1F<)+%=#:=@5-D7B!*;-G-C8#+$#0AFA==;3+H#A@;E4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22T2C4A58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4437 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11482 42 114M = 11616 228 ATATTGGTCGTCCTGATACNGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGNAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTNTGTTAACGATGAAG .:A%"8A>1!;(2BH2.A?)/4;:*-7"B@AH<@D>"(2&:E'-+0+C:!,?!$.)*"CB!#;$++E6CB895?149%>$--#9H#A%75G02D?:/C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C39A39T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4437 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11616 42 94M = 11482 -228 GATCGTGAAAAGGCCCGNCTTGCGCTTGAAGCCNCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGNTC #+)!*'%'+""!!)$'*$))+"&%"$)(!!#$&+")'*#$$&$(%%!#%!$&'%!(%'*#"!*)"(&)"+!%+&"+*$*&$#%+!(+%'%)%*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17T15G57A1A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4438 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31536 42 88M = 31403 -221 CCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGA 1,A!D>G7'*3/":0!F:8?C!/*@F:@:G1".G.H9H3F2=A$,3H+@!-?6-G19#4&1+9*@,38-8A<'*.EF/25$"==92#6 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T1A0C11A72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4438 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31403 42 101M = 31536 221 TNTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATNCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTC )1%%)""1?7*=!EGB:,/',%/7*80)D>%#;0%-3B'9B;6E,256A0098:2H*)H6##E5%+8:BD+6A8C#$D!A1;:D9'/EG.FF=G5.=0*,4=>CCD5!)!@*B>3&:>/!"72 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4439 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10843 42 200M = 11043 292 AGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATNACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGNGGGANTGACGGCAGATCGTATG D=.>%G(#3-@8:(%;/B)H1-61'@-,6==B5>8H+$)16B(3'59&9?$.(A!':9,HH0/D-%3-G;2&!31,F7A$*<;AE7+3889<6F6%57FB74#5.+*8F#C1'>13#C6=B;51'60G:5*A-G(:5FD#,.,,++:#$/$,,D(;2'; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T55C18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4440 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19402 42 228M = 19630 318 GTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTGTGAAGGCTCCGGCAGTGGCGANTGGCGTACTGACGGATTCANCNTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTG *&'+$"+(''''##*$#++#*)#%#"+("+)%+(***&%&'+&'#'+&+"!(*+%*%%$&"+&")(+(%&%"#")*%%$+'!&"*%&*!!$#"!!#'"%#+%&!&#%(+'*''(#()!!"*$$$#'+$)*)#%)!$%#(*+(&"%(+*&$!&))"!"$&%)%&'&#&(&()#)&'%'!*'"+'(+**"'))(&%%&!!+('+$+""+!#$#++&(%#)"*&")&&$+$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:67G48A21C19T1G67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4441 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48400 42 40M = 48152 -288 ATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCNNGCACGAT +#"'%+!(++)+&$$$)*%"#(+&*)%$"%+!(*)(#)(% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A0C5T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4441 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48152 42 158M = 48400 288 GACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGNCATGAGGTT (<*)>@H>;<+A>!H.)<-%",84>03@C6@"3A/3@);*('6B*@/8=7@>3,7/G!$+6$CCA=>52C)#%C'=CAB>4CD;7H:(7A@="/5=E9*1,40GH.A04'.4+',.>%9+?&2,!3>9?59+@$A"!.):6C0,,>7?;&74G)+!G>!+'H&&&3/E-"'/6**)0&905<%9*3=,/="63GC)DH4.,=*(,6:>FHF'>@%H8#2.!&@AC20=5B@$52&,94*32G"(#4(&G:&G7.9%.$>-;D;G-9(;#!3%4DG8'@,2=@B-C>&A@E-(E.;;E35F4.5-/?-$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T74G140T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4442 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47697 42 199M = 47896 434 NTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATT "87G6;GE!A8(+?1E*6!%)&&EHEHF!)B2/F5HBF'%8!;*'=C3E2,:C99-0-?$E+/&55$>8/F$)>%E4$835<:B(=797CCB0>@@*@B5BA728B)D+'+&-:<(&97+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T195G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4443 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10833 42 127M = 10960 231 GGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCNCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCNGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTAGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGT +!*(!&)&!%+++$!&)+*)'"#&%*)*$+(#%))#"+"(!$'(++%(!$$(#"**)#"!'(&()'%(*%!&##')$!""'"(!+'*('%*!$#()#"!!!*+))$(!&(+&*"%()&+!$)'!)&* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34C32T30G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4443 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10960 42 104M = 10833 -231 ATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTNCNTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGG B?9'225A0B!=FC?:9HC,/.<205E1?<)"(G,G#!0:9684&/57,#&E5..D$2$::9-'B0H765@)4'-?FG*329"<>H4%61F#@1>6"1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43C1T58 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4444 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19981 42 105M = 20173 274 AAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGA #/B:1=E0%:$E(,=*;#5;<9+.(;88GB24>D+.*6F+HA6'D)G*7;+*:&H$"'->A=&0*E&F4?'$A1)+8<933;G#D@71@D2.*+-H17@0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4444 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20173 42 82M = 19981 -274 CGGCATCAGCAAAGGCCACNGAAGCGGAAAAAAGTNCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGT 'E2@F<1.8:=%99-?35-6"B%69F;,,#A8+,?H(>,A=D"080%)E!G&13' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T15G45G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4445 77 * 0 0 * * 0 0 AGNACNTGCTCCGNCTGNANATNCANTNAGTCACCCGGCATCAGGTGCGGTACTCTTGCGCCTCCCAG #!)*'!&"""%)')&"%""'&%!')!*$*('+&&#&($*(*"(%*((#(!##*")""#$$""+)*&*( YT:Z:UP jpayne@0: r4445 141 * 0 0 * * 0 0 NCGCNGCAGANTACGCAGCTGCANAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCA !%)$"$'&'%""+!'&")!(&)"%#(&(%)+"##$(#)#"&*+'$**$#$&$*#!(+*$"$+!$&$&%#$+"!++&!')*&+(! YT:Z:UP jpayne@0: r4446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46781 42 56M = 46839 280 CGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTC E!">,)13F6B0CH<6F?B--&$%*"C(@:5B9#0@;HC282FA>.17"B',02D' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46839 42 222M = 46781 -280 ATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTTCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGCTTTAGCGTGGAAAGATTTGT 32>>03,CH42C+#A."+!;84AH*98@24;5(3*+)6(>'B#3)E<2<4",2=(GA1"9@E-B>-/?1CFCD;C;>H+="6-&:*=&CGG*,:,'&(B);5'/0H3+)??61+/9*"F!GH!HG/-6H8#B'=6&6G38D+!9D).B;(/@3$B)F%5!.9"8B;A$CH4GE8AF5"&AB>$.=,(?4<"#?%?*.$&&924 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:173G27A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2775 42 141M = 2985 282 CAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGG ;D12.2#BGD>@3!%D'2G?BC/;;;F/B@7F@."8",/?):HE-C1D,,5+9?@?2?BA&;CFB&D3@D%#&FEG7<)-0EGH<7G7B=!F+42%#")2C5&H$"#'8"D5E)-7#8:@&).0'5>&(*=+&8-65CD.( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:141 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2985 42 72M = 2775 -282 GCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGGCGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCAT (F?E/AG&#:A>+/F:HB,G)&AGDA9&'!?9$<9FD$(DA9D5:H.>BA7H)GB#$3!8BA5:,%*;2(7- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4448 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43595 42 165M = 43760 213 ATTGANCNAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTCATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGNAATCANAGGCGC )%&!##*+*#+#+$+&$**+""(%+*"$*'')#%'!#!#!'*(*$(##&&)&&!!'%*!)$+(&*"'"!*$*#)!+!(++$""!*)##!&(""!!+*$$!*%!#$"$#(!)*(!%&#'&%%)#(%&!'"'$+!%#("$%"$'(#*"%$("&'$(!()%*'%+"$( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A1C1T1G28T115A5A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4448 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43760 42 48M = 43595 -213 GGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTT ,7%"/!1%HCG290A6';A,0B9+;-E:EH=#;5#7<652!>4!-.C<-49>3$C0<52&'21:=35/:8/?2'66 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T9T1C29 YT:Z:UP jpayne@0: r4449 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25233 0 * = 25233 0 TTNNCNANAATTNAGNNTNATGNGCNNTAGGAAGNATNTGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTTTATCACCA )!!!%!($(%'("('#*%&#')!&))""%)$*'&#$*'++#$&$$)&%(&#&*+$"*!%"!)$)!'#%!!) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4450 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37260 42 206M = 37466 340 GATAACTTTCCCNACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGNTTGTAAAAANACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTG C,+F>>-$!8?81E/:"E.A."00$4&:2'G"/C'FB$!!/-0#F/.!CC%H6-9%1*0C><4C;$%&H.2'G$F*=,*1)0)2*=$&5B(C.<-D"=&4,B&186887E<<%?%=32 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C52G9C130 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4450 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37466 42 18M1D115M = 37260 -340 GCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAAC #*(9F5AG)@A0'%5>$C$:?2#53"':2".(!="83E83*B#/0E/$BF'?/+HH5>B78E.!>F>5=:05@0H?B@1A$2)F7FDF+$164":@%1H!7',#(F359=B2##FC7@@,B$+F&8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:18^C115 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4451 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3114 42 65M = 3289 240 CTGGCGCTATCTGGGAATCGGGGAGGAGGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCAT 8H#6-?/8>>=:;,:=%)B842/.8+"01=>9<7324AF#$3(=DA,3;E2#+/C,6C*$0;=+4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C11A37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4451 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3289 42 65M = 3114 -240 TTCGNTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCNTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAG #31F27)0B86@$*H:@>984A*,/%E.GE>CA>(C*G+@3:H,4D,C8,:=-0$G1/A8+%%$: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T24G32C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4452 77 * 0 0 * * 0 0 GCAACCGGAGNATTTACGGGAACCGGCGGCNAATATGAGCCACCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGA :<+@;5BD@:+8<9A2)9'H"F::@1>3<4C/+$#FE!6D2+@=,=&6"9A)$>?6C57>:"2#FF=181+(%32%@)6737%#=!7"*D22?6<(G%0;/1C=&AA. YT:Z:UP jpayne@0: r4453 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16234 42 93M = 16098 -229 CAGGNGCCGTCGAACTNTAACCCGNAGACGCGGCAATANAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGG !&!"))*)#!$"!(%'%*%($'!&%)#%#*)'**%&!$"'&!#*($*'%&$*%'%*%*'"$%)''*)+(*!&"+*%"'%"''+"#)(+&&("' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T11A7C13C54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4453 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16098 42 109M = 16234 229 NNGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGT !)?G%?21-*"@4G8,-#:E).G4?=F")8G7F'-EF>)!,A#2HF!;.8B2C.(,.(B2.B05'C)4D132B73->="*DE09$*1AE<8B,2A#D"92$:?8.2$)/$804H5>0=8AB;!(>B&/:.G%+&1%AF;E;?9)H)<+"541(8*)&(8&+B8%$'8"(=F781#479:D9?=F#1'D#4'7$*F)D;D*AD%"(4?'?%1!C)0$7&;D3'GE"&D;CF'/&E3--.*7.%3$$7!/$?.,&B*:7&$#5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A99T98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4454 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15483 42 120M = 15284 -319 TGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGG 4:+:C4='>CB2$G#,D84#*8/37(,@-:=(#&6+""1(8C"G,>>D&>.,G))+0.F-3(>3>BFC=2,?%9:A/>3: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4455 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47559 42 67M = 47419 -207 ATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCGTGCTGGNANTCTNGAG %"!"+)++$&&!"*%+#&!&$'*#(&!(+%%'&'*+#+(+*'*'*&!&(#+#$+')&&#$)&"$''( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:50C6C1T3G3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4455 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47419 42 42M = 47559 207 CNAATATTTCTTTAAAAATNGCAACCTGAGCCATTGGTAAAA *#+)$)%!"+"(+&&**'"#'(+$#**#!*(%")&+')&%'# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G17G22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4456 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7979 42 98M = 7799 -278 GGCCATAANAGGTCTTGAGCAGGCCGTTNAAANCCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGNTGCNT C!&+A$6(9?).4H)>B*/3#8#$E=0"*/:D?H68F5H1B&.501:()G)(7@-1-)%4'G>%=G>771!3;)?*1;#+$$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8A19G3A59T3T1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4456 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7799 42 156M = 7979 278 CGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCTGCAGCTGCGGCGTGGNGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACC 2+2C(&'.G,F&+2F/<26"/<%;1;;G58F')$37(FE%294*#C&F.&4B%+H*,).:4-,H(H#?H0%7F./H/AD5/>:5% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G15A51G57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4457 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22092 42 62M = 22263 254 AAACAGTACCGANATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTG 1#!@D09>F,AC>"?9?0,):1D*B970/6H65(5AF#B916'33F1("?.4G0$(E#G;<'G+**+40=)B0&30:122;.97;D2<=9;2>*1BE/6;'7$.*1F#)&=<2B:*,"8E)1<=2);=4<%#.44H;D@:D/:!668B/##'"$&!#9$$:@,.G:@=0)3'*AC>5A"E8-A.=GE+- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4460 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27877 42 43M = 27702 -218 CCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTAT B@F=11/)=%62+#,EEB8;(H:<+0,:!BA-%B'+-#E/F'H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4461 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46576 42 95M = 46808 274 GCNACANACTNTNGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGNTTTCCTTTNGNGCTACTGCTGCAG )*!%$$"#!'%#'%+&'$)(%!*%+()+$#&%#'$"%!%")&"(&'!%'%*'&&+%$("#&()!&!*'")&()#)!!#%&"%''&#*#+(*'+*) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2C3A1T1T1G57G8G1T11C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4461 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46808 42 42M = 46576 -274 ACAAACCCTAAACNATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATAG #')"'*&+%&+*#*$)%'*))"(!+!"!"&"(&"+&(""(+! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A27T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42943 42 155M = 43098 322 ATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGA -#;!9/C-8A)#.EDF>"EGG$E#DD'(>G8E/&/9D=@2&'9.CA94F9&24%C8C55#8''H=#*C"E=1%57G1& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:155 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4462 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43098 42 167M = 42943 -322 CAGAAGTAGCACGCAGANTGNAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCGTCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGNTGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGNAGCAAATACCNAAN &''%++&%&'+!'')%!%(&&&%++"'!$)'"$)#"'#*!&*&($(&+%"%&!#($$&$%!!)%&!)+&(&+!$$#''+'$%'$!#(!)'!'"%+)((*!'(($*+)"'&%$'#(+!'#)#*"+$)")+((*'"(&'+%+"*$')#""#%+'($'*(!$(%+)&**" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:17C2A59A31A39C10G2A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4463 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46595 42 109M = 46595 0 TCGACAGTTTTNTTCAGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCNTTTNGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCAC 234#?:BG3$H0:@'=1;&GC&7)!4B$!:&0(--@7DB6;*:<>E>.==:8DF5:0238F'7'#?=H?-&)$8%-D3:B((8*0B(@A?#?!.-/D;#692&1!%C-%E6,+:"430BC*>B2,+7&//0('5%%AG AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G59T80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4464 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5118 42 60M = 4974 -204 CACTGCAGTCCCGGATGAACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATA ./"/F#;#$@!!&AF+=0E;:+C*!@2&D%43=F.!**$,F!HF;"/(;!B65.D0*:(C49>,G:>>9;3=?'2"GG5//G817;FGCA8A,;10<6:+F5+6-@0#2A;)'.H#;#$22@6G842:=;C>?8B673%1(G174?19EA332A AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T49G13A1T58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4465 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47554 42 147M = 47417 -284 CAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCNTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCANATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTNT 7!0:1,D1!(;+(%81'.->C(D4.:499.&!$H=G%8+/9?"-<=$?.)D#1:>*5#>*98=@-3.D;036CB5*!(D'2=+43&08%EC>H+-@<&%-A=CB>3%C7"@9$2F'AH?'D!/<'2H@"H;'F21.(4E%:(05?A7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55C57A31T1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4466 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6830 42 107M2I138M = 6656 -419 GAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGNATTCCGGACAGTANGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCANGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATC %D$.+8.7-.!"<9"80,F;)C)FG2/,1=3H"!B+7HHD#:6#?/.%?@BD?3/C:2#..6/;(8$:3C#=;<(!'881;B:>5!26A0+GC2$%>"DB5F1'-0"G)#=0>!8H4',>7>1>0>0@&/?/'G;G,!&D'CHF"%16&:H'AG)5)2,027FB/=>H9<76/=7=+%"?(4E=%>86.7(A7A4 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:61T13C62G106 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4466 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6656 42 174M = 6830 419 CAAGTACACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGCGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCGCTAATTCCGAGCTGGAGANCGCGGT 5339*649='6#9!F(7<:6E2>E9?%(C,%"*>1#AC%%#BC/"$50A="HE5A!9H"<@D.<$,>#+G--1E0)/:G$A=BCEG!3>#,@3'F3,H;1%-8!<%!80@2#.5G58='7>43B:D5"-E9E;",(%#A./;;00&+D>:->-C9-,('1*F3")"25/1943$ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C53T88T18C0A5 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4467 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2814 42 49M = 2558 -305 GNGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCNTTCNCACCCTT +$)%%'")$%#+!!+(%)#("$!$#++""!%"#&##+'%'*'&*!&%%& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G35A3C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4467 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2558 42 97M = 2814 305 GCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGNCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACANGAAGAACTTG D37(=F08E->A/*=;#9;E%3-8$'.?,8G?9/.;:$4-2>F,A%+H,$-B&+@-F)H/+$3F'@";>=3-&(,F+(CFD"=E2=$G=-&.@G*@/H,:9&22C;D/;88D35&739+;'2*3GB)6@> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4469 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14614 42 41M = 14428 -227 GCTGTATNAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATG ?5.H/AE@G'/"790.(>75*2>C!B,GD!/=3+*E7.%2@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4469 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14428 42 59M = 14614 227 GATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGA H0%)8C-<<@5@+422-,#$<)"E(+@/3:+D7F86?;=3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 385 42 82M = 212 -255 GCTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCGGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTCCG A$5"C&/.&B3+BF5$7E-7<2A>/971/+,44""=9642C5*+#=;>>6A46E>60AFH-;C2EG>@%)2%(F&/"8D)(' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G16G23A36G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 212 42 71M = 385 255 CTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACNATTCAGAACTGGCANGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCG 8@C:1@?1.'9;=!#H>&A-H>B5D+4+)-3"B&:(1(!2-E29H%-:';&/&)*GBF?:<59+:=&D?<' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32C14G23 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4471 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38947 42 71M = 36666 -2352 GAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAATA E-H""$0'9"<')?&(E)??.+?ACB@$>:F6H9B4F-11B!%A;BE!(2E8C;BE96E=.B+%)'0.C.FH&B2,/?'&3H:@0*B".*+&E%,(H>&$%:1->5; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T40 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r4472 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 516 42 305M2I32M = 430 -423 NGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGNATCGCAGGTGANANTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAATGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGNATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAANAATCCGCANACCAGG !?F??$>6;#E,-E6/#%E*D)H#D"3?#0>@)#.+>,(:E(!F$,>,#C;)F9'&1>A0-<%%4A+G$=$=<.<6;2+)*6;'!$E6"+F65F):DC,A<+$%B*;<85F1?3:*'=@#3:.:/!@(:,0E'74>7"H%$<9D#A)836A;@(+2('0++(E%1.1B5+FD&(+832"9?)!,?* AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:11 MD:Z:0T33G11A1T96A52A38G83G8T6 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4472 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 430 42 86M = 516 423 TTCNNTTNANTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCATGCCGACGCANAGGAACTAAAGAATGCCAGNGANTCCGCTGAAGTGG "($%#(*)*$('+&)+#+#+'!'*&'()*"#*(!())"!)!")$&+*"&(*)*$&*!&##)!))*%($+!#*'!#+!'$)!%$*$! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0A0A1T0A2G1G29G9C7G11A2C13 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4473 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8508 42 82M = 8437 -153 CTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGC $5&+41F@E8/(7=35!7+E';>*<'4A56H/$'.4!H-28=A#.F4B?%G8.=%+1DA-.87!?C0GH6&;-'A)64%D0>#-B$H:E<>8&-,+A<+%3"<6<<186B&-2F;A9F8,;0G;=%!>,'>/F:40?=*@7942/)B024> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4475 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13663 42 114M = 13528 -249 CTGACGGTTNCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTG %HC&G>A/&9BD*;'0H,56H,%"F%>>3AD%34?773;B$.)F.)E=+5%0,;@:+49?5,5?*D&,DB:,E"=HF9&C-/2+G-3DGE9=F1"&='01.@2(4.3&F4&*/*4-@!3>& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4476 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38568 24 332M2I4M7I22M = 48403 9899 TGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAANAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACANGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCNAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGNTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCCGTAAAG 6%5G&9/+AA4(4E?#-,188?:&'%=-'9)=4F-3,@9?)F274,8+D$&H"A<.A*H>*=E27H<,?,-D>7EB57?1!HDD$"$$G?,&/,8+E#F*1C/C4ADD)"D9G361@D;.*>FH#69D2!-@%4G>#-&H&76(?F-F57,"';$?>C@*9),;"C>G#?H,BH0EF'=CH#2?27="@<4@G*0#GB"0/'3A'',@(;6.D3;;.24/.G&*8(/+!1!"6=>HAF38)HAD2FB0,>2?"9F5&G:(8E:8+A9.-(;1@+/'%%9'(!=8H3?9,+598@2GF?(C*D&*!4)3*1@E6FH3E+%%=42"@5"**B3)(#:#>084<:H,2.A'/$1*2,,1=&4=AB-C AS:i:-80 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:2 XG:i:9 NM:i:27 MD:Z:34A74G97C69C55T0T4A1T0T1G0C1A0G0A0T0T0A0C4 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r4476 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48403 24 64M = 38568 -9899 GATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCA H01'>"A16>ED*.H6E)/'//6/%;=C)HG/&*,C7?77/H::%>2G:)(E426HE#2HGA5& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-80 YT:Z:DP jpayne@0: r4477 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6739 40 80M = 6898 200 CTACAGGCGGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGNATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTG "!("*%&&&)(+$)&''"$!*!#&(#((#*$&&''&*%!)!&"#'#'$+($"*''"%%"*#!"))$$+!+%&)'("$&(! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1A4T41G29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4477 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6898 40 41M = 6739 -200 GACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTA "0ECCE?8GDC=:A:#<'65DF--4)E"-61"<4=G/8G8E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39C0G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13588 42 156M = 13787 262 CGNCANTANCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTNAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTNCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGG ()(%#%*$#+(&&*%!"*#&)($)#(&$((#&#$!#%"!+'+'*%$!!()*!+&'"')'*%&*%(!+$&%)*#"+)$)++*"(*"''$%#'#())##%'$"#%*(&'!)*')"(&+&*%''#!%!%#'!#!$+%"%!*#!)&#$)*(%)%+(&&(# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A2G2T35G39T71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4478 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13787 42 63M = 13588 -262 ACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCA 6G#5(<$A-/;)):?7339G8H8*/8#<0C;6"0(??(18D$A75,;E."EB;H'3E#CA@"0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4479 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2504 42 184M = 2688 255 GCGCATCAGTATTTCCCGCTGGNAGCTGGATCTCAGTGCGNTGCTGGCNAGCCTNCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACNCTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTNCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGA %@-G5";2)@DA*C+7+E=4>4,2,?.'?6E>A>=(C.4+8**F"C03;):AC3D8&;6@3H<,<"E?H643/$D&9@F:+$C$1A:!,D$,H77H+@H+9C=E0)57::>&94;81;-D(@=""E)69<$>%G;>>4>!D!E.*%A#;8$*E!!!@D!B35)(A+H!B#G,7A-0'@6,('F2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:22C17C7G5G35A59G33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4479 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2688 42 71M = 2504 -255 CAGGTNAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTNGAGTTTACGGCCACTTCCGTNTCTGAC $"")%!*)#%&*!)$(*##%#!"(')'+)!)$($%*$$)&"("%(+"&*!'"!($%&(*#)%+*)"(&$'' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A37G20G6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4480 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24850 42 147M = 25001 224 NGAANNNTNCNGATACNCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTNGATATAGGGATGAATNGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTNATAGGCA #)%%!!'&$)"**$*""'+!*&((+!)"%#+"$('&&)****%'((!%$"!''+((%$(%**&%#)!''#*'(%#(%)%"%*&()%+#))"'$'!*#%(+!)"+&"#$%*"+')!*%(&(+%+$*"&#)!+($%&$+&+(!(!"$%$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C3A0T0T1G1A0T4C28C15C77A7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4480 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25001 42 73M = 24850 -224 CGAAAATTCAGGATAATGTGCACTAGGAAGAAAATGATCTATATTTNTTGTCTGTCCTNTATCANCACANAAT '&"""++""'"$'))#*#)*')$#"%$*$$+#'!$#!#&(#*$('++#')*)&*)+#(#)*('&*$$$)()*( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:22A23T11A5C4A3 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4481 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7356 42 386M = 7742 467 CCCCTCTCACCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATNAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCANCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTG B!,AF4==D5G@@@$H"65=1DG8@3-0>"5#.B.E/<%+5-BH6>C'*'$/&33='<#-B";F1@!%<4#F(/4A+0;$<&.,;BF5B(95<>;#5%+%E$6#(*=!7--0?:.0?B37?3?,E:5=BD<<:$8!DD(%('DE%.,@,8BC)@06/%"@@*C#A,!"=8!0?->)&8;/B7".$C=CA,?<.4FG25>A)9;F.0!HD2D+-3AE(5H1E#AH<-@#:C<3A5(G327,-4#F#.D"!*9$C3!,/*/6E*-/<:CA$8$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G41C282G51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4481 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7742 42 81M = 7356 -467 ATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGNGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATG )106+:C-)/-3&)($<77%26&1@>G">;<%==%2+C+#D->.:(&>5+>4&G+//2?B+9:%23;+1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4482 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35173 42 67M = 35384 253 TATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGAT /7'0-.H41E.A%H+?4H%;G:G=C+>4%H"+5+')96!E&%!-3*B1(A9A4G$2)'9.E#*%,;" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4483 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30412 42 57M = 30117 -352 TACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGN 01?C59',(=$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4483 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30117 42 198M = 30412 352 CCCATCCGNGNTNAAACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATNTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCNTGGAA *'*%&)%##)#(!*!+($'+"&$'&%%+)*#&&**"+*%#!()&(&*+&*+!)$)!*#'+*(!*%'&!#&*!+)#**%!*'")'!*&#%#&+&$!"(*)*%&'#&'('&'"("&!+("+$$%("'++&"%!$"#&&&)*+(("%!)&%'**)+''"&%!(%$($$$*#$#)*+'#(+#'$''%"!+%%)!(*')$+*# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8A1A1A1C37T139A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42585 42 174M = 42531 -228 GCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTNCCATGTATCTCGTGCNGAACGCTCACGTCT 27*"GF$"37@1.3!.0?):".4F3;<6,2'9>,1.%&,%1GC978@F<6%G-/)(G91G*"6DA-@.:2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:143A15G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4484 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42531 42 54M = 42585 228 ACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCA &-%3A5540:C!3,<7A4H4),1(&'=C<@*8A61;G;+=,-;=AD&!7599.D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4485 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22540 42 69M = 22400 -209 GTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTN 6'B<>G>7!>%#/2';!8"74)#114A8-9-'*<63(0B9!2:9++(9B:24.?.>&.$5,F0!1-00% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4485 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22400 42 49M = 22540 209 ATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTNCAGATCTGGAAATCGCAACGAAGGA 61=D>/!F2=!()=!G9)455D(./H1@A800<&?<@4A!=5<,B:9H8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G13T11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4486 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19546 42 47M = 19732 251 TACTTACNGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCA *(%"$#+##((%&'*&"$#*#*&+'#"$#($"(%+)'"&'$)&)'$! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G2G39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4486 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19732 42 65M = 19546 -251 GTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACCCGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTAN &'#)')+'!'#''#("'$$$*&**!!(((&!!)&(('+($!)($++$$$##"$#'(**++%#&+# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A37C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22204 42 414M = 22144 -474 GACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTNCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTATGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTAT @,<.1E".D#+5,@?;%B5!=()D&.8='%?,-B"7#1:B257=-;!HF7C1,9*+<%EAA5*8+2D:7$$)2.$*&5F0EH)@()(,(,2='B?>)D(G%?8>CB/*.':##%.)GB$,<098@-E%13.:7#"%/@,@:B2'2!%@1?%2$)..&8?F!!+B<2C#D3?EE.??4:FF:70?785HD)2&37:B*78G@/#66%0AEG95A3D40F%<+=EH5:;&D?%9!%9!<;6!/3@&0.(9066E-@')@%AFH&;:G,;-3F(0?HG4'G/;C17-/)AD17&E209.(#4G7$3B-A"FA&@:H832(FD+,72C>"<1,G3+H?%. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:312G46T54 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4487 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22144 42 60M = 22204 474 CTCNACAGTGATGAGGCNTCGTGGCATCTCGNTGCAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTAT +*F008/"&G4+"#(.<&7;)'F!*7,#E0'*H&F3G"B"8!8=3.(,1B#=,703!>,- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T2A13A13T2A25 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4488 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8823 42 40M = 8565 -298 ACATCCCGGCACTGACAGATTTGATCACCAGTANNTNGGC #)(&+!&)#*!"('!%&()+##*))*+'($&!+!!'(('% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T12T18T0G0G0T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4488 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8565 42 87M = 8823 298 AACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGG 72.(G=569-597=0!"'*4?5EA028?+FH(%;=1E#+$"3(9B;":%+@*68.B6E9)*&/E1!<04=$0?7":2%D;/8>"7.1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4489 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35639 42 380M = 35558 -461 ACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGANATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTANATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTNGGTATCATNTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACAATAACTATCGATGTCA #43:"4;E)#8:7@97,7$*?H:)4H,@.-7%D&#!6(3C!5''*@#13(-:.;9$:35+$HB?0,#1"B"??:EH;3'#!G6-7@-+6>*D,+@7.2F43'7"B7;1(8A/1//.(45>4#)%1.>857#1D,(@H61?B<()"G%<1DA/=9-F6-HH8/%80)%H:72B.1#,//3@B1?A@#BA6>22.48"D0-47%+%=/7$E&?:9&<0CC9>2..G13>=$A5-6/!!9DC1D7(<..#($2>0>A8)4D;9,% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:73G137T64G8G85C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4489 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35558 42 81M = 35639 461 ATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATC ..',(0/94:61B)*<,-D4$7+)58=1>3F!04B'=56<5AF7-":=:BF14&8::G=0.E*-1)1-C?:/*#52G/?@* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4490 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47962 42 43M = 48030 154 CATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTG #4B5+/,DH09E&"0433$,B6<=?-;#/>5<50>)=(+&C:% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4490 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48030 42 86M = 47962 -154 GCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCNTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCT C7'+'&5D?B'+DA+660$BCE=D*1*GC#(4!;"496+'E6+%DA0E:=,)B*):/10&%'%)+-E,A/+139%.CA&FC'#;@:@>'GE&GH*,E@2/>,$-&@&-+95."#56;B/$83$8GCF:G:4/1%G1<;A-!G<>"%<$/F102C-1H52'!DC*1)>+985++7B%C'#E&A7!%(>DG!!H=>!;+<&=:)BB+>388E%,)G@)5H7?D802-85??$5$45' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T149 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4493 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40008 42 74M = 39796 -286 GCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAA *=GEG3'A;*=(-@8!C)B?E08<=:1/G:G%#6$0!E7D>:!785"4A:9EB&?=G%H:2H#D77&-;+D;C' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39796 42 164M = 40008 286 TGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGNACAGGTTANCGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGNTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTG 8A)="5HH3607&$<056$:0/%,5B%HFA9'<6A:#6!:&$"#+)'(9"%1&E@B#:$2(:(!6HD,.F@:59$EH4331GF#H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33A8A62T58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4494 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48225 42 73M = 48225 0 TGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTGAGGAAAGNGGATGTTGCGGGTNGTTGTTCTGNGGGTTCTGTTCTTCGT DC61-(*><.'C0;5D#.D1=71FB,:HF:-0E'FEE?AF5E2-B-EH)12+BD@6@78/:A4$9E+2324A4>=1<&D724,<=:9H&D;7G%+./"/8A7G5'-D3/'6,(3,>0-?(3(5C+=$,&(B"*!H42;H".@7!&(10'AC'4/0?0+&+;$)/*=9?>1,!4'3BBFA0,D:*6,#G6>$:7-EA"$>9 YT:Z:UP jpayne@0: r4495 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36688 42 94M = 36459 -323 TGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGC (:CHGB4#C+AF*1'>#FE'@G49.F-C,)-2&.&:*4B,3<46".4$CG#!E=,3332*%4&,3+@>C AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:90A0T1T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4495 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36459 42 217M = 36688 323 TGCATGCTAATGTCTGAAAATTGAGGNGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTNATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTANCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCA !'&"!+')'(%*$#&#)+!$!)')&$!)"')#"%++*+)(((!(#!&$"&%)%*"&''%*)'%#)+))($&)(+!%&)')'"&*$$&!$(*'%+!)+**&)*&'*((*%!!)+!()$&($*($$&$(%(&")&$!%'&"'*)%&!&)*%)($++*'*'&$)*(#$!'('$)%$'&$%)++((*(+&(+)%*##'+#+)#"%!&($))$'(("$)%$& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C3G21T35T106G47 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4496 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46624 42 350M = 46506 -468 AACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAANCCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAANCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGNCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGNGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTT /==)4=)G4'8+=*)G9?8&CCH273;*/F7&E$#+1F&-2"$9!D9.29/C=<6&E'9.&.H0AE=%==!"2(003,BH,))D!-CD+;6H399860))0<6#!B";(E33A49/G?(A*)3+C5?GFG8<:,63,-*"7))-A8H7=>"FAC34AF31:"B%6?#+%53;/*HD*$$A1.&G,&8!<'F:C008A3C?5?"F=*%51';<&,*D#>96>2%*-':F*(D=(.6DC-5,?:;8>-508B("7",="$/?4$F"F<2B8F/F&'%61&"$%-/!8)60-G15+E6D,B+CE$54E-H!+3@-G@:?C.GB5#1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:188A64T34C22G38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46506 42 118M = 46624 468 AAGTAATAAAACCGANCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTANNAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGA 8'G%D#9!?E@@?@71?=;)C>@E(C7B18DH8*?680(:-:E'+2A3G3431+"G34;G4F#7H5:GDD#2/=):?740BH'?>2>4D"#!>07CB+G"@%$G"7,;-62CC/@B:& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G37A0C63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9904 42 185M = 10089 264 GGCATAACCATCCGCAGAAGACNCNGATGCCGTCCATGAANGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGNCAATTTCTCATGCNGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATACCCCTGAACAGACAGNGGACGCCGGG 0%B"EE"B*>."431"@+?):4%?<.5-2@G'5:+0!H(45.==$@B,G,G/!G@EE?C/181-04?%&$<1#CA1D/>$#6F3,/4==5#%==&(;(":D'6.GEF5@=-&5.;09.#4,AF-HAG83BA%0:".3E'+=!:=CHGA(3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:22G1A15T51G13T51G15A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10089 42 79M = 9904 -264 CCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCN F+:!<*0=19+/&HB-5$4$3@>?%F!,"*5$C=/D=2+*+!0"27&.;EGC78#46,54$BC)?C/,2BG#:E!2$7/83-30089H"48C)9>F9G/1::&CGD AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4498 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40355 42 167M = 40292 -230 ACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCNGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCA >!.E3$H?CEAA022=(>(.CA@AA>&G0/.55%7.#=E&>)G'9:0H58%*D4&1-)=B:*-$:(+>%.?:F/&(:(D#.#8;'+)H&4>E8?><./.;)<50?:%,&8!#27+33&0ED&19#BD@-($B/D&G#>,-H#1D*C/8-FG0>@0C'-*C.##5@-,1/@C-;,>C<5BG"@11,/@*@D3*B3!+2#/>3/&6"BG(E'37/G4FH)E8$0>>=>8' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C52 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4500 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20686 24 11M7I28M = 20825 223 ATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAA #@C7,H85(&=(?);293B=3H5'4.(."H!!7;2-H!22:7"7$& AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4501 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1191 42 168M = 1110 -249 TGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTNGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCNCTCCGACGTTNCTGGGAGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCNAAAA 63))=!,H0,6->3-3#17F1B.A(D;2G4$!5++F=(=,'=E+<&0)8*0%,=9-G(432H=+=,>/)1+H8?#'&'=:0 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G30C61T10C5T52C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4501 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1110 42 58M = 1191 249 CCGTGGTATGGCAAAANGCACCGGGATANCACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATG (E6=.HF$A9)2+BD"5$>+?(F>>2#=.FDC-0)7&3"A?6!*B@*HF897E(-*', AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A11A29 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4502 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14413 42 126M = 14539 323 GGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGAT 5B=-=4C#*H)90CE4;,)5E)GD7&<:>F//2G+!754&C70'F&7F>!5E#>8D)A;2"1"$AHC??9&E&8"")G-!+247)G?,(FH-7@B51%5E. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4502 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14539 42 197M = 14413 -323 GCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCNTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGNTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCNACGGCGAGCTGCTGCACCATATTC 8:&,H97=-5(3&2!4B$E5F..C3>AC#'6+A??G;*350B1@0#(E-%?FB/2019@.9'43'2?6*!;A22")C+84&A12&@:.&;(6%@,FE72G2B.B/4F5>0?)09@?>!5?=F$:,&%7=8-@4+A%)0(,+20='+!++30F@5:*&7+9(,/:?!A..HC5: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32G93C45G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4503 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18438 42 180M = 18618 233 AGNTNAANACTGTACGATAAACGGTANGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGNGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCC *&$$!+##%%+'+#+'&%*"+$+)"(+$++'*+#&&&'#("("!()(%"!$!#!(!%&#)++&'%!("#!**$+&)!"$!!)"'+)*'#'&()(!%!)*+$'*&())&(!&%"$(+#!''$+*)'(#)*#!(!#&#!%*&"$$*#%%*!')($+#'(#%"(&(#!%#%)#$!+!$()(+& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C1G2A18C41C91C19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4503 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18618 42 53M = 18438 -233 GCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCATGACAACGTATTCGA ($&'$!##$(+!+%"$+'&#"##$')%*%!$'%#))+)+)+)*'!$*+**#'( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4504 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27513 42 95M = 27608 209 TCTGGAGTGCGACAGGTTAGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTA H::B?%&8*$"2+C#94F8-,F4&,C#?-(')38>'<@#A+")/83C.#;7$%728#B;@<-ACA,!23@:H)+1&C81,:-<0=800+;,:G@" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T76 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4504 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27608 42 114M = 27513 -209 AGTAGTTGAATCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTCATATATTGATATTTATATCATGTNCCGTNGCTNGTN %%&$(&%)!"#$#"""$!$+)*+((*(&*')#!&!""*!"$#))*#&+*"$%*!('&#*##()&'!!!")#*$!$%'""%'#"#%+"''!($!')"+"+!'&"*(("'&'%%*$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:9T67A21T1T0A3T0T2C2T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22044 42 72M = 22156 220 TATTNNTGAAGGTGACGCATATATTCNGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCC "))'$#*+")&#))"$!((!)$*"*$*"%#')%)($&"!'!$)*'!()'#%&*)+("&+%%*'#%'*#+'## AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G0G20C45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22156 42 108M = 22044 -220 GTGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCNGAAGTTTTT &"#""+&&$("&"*%!"(&($&&$$#&"&'"*(#!$+*!"!%#$"%"")(%&$#%+'"##*#+(#'$'$(+(+))+$%*%+*#')*%&$!(%+$!#)++)*(&)((&* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A96G3A0A4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2733 42 313M = 3046 365 AGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGNCCGGCATGACCCAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCNTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTAAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCA <&?<;GH.$?0E-2(&2;$9,)(:;<56FCEG&BE(4,!?;.B((C35#H'B+"5<5H."&3;;A,!7987%#>:DA;)80F->64B(F1D48C14/,#E%=4,8,489G"BA'B0$*D==FG1;5%55:E"+D!;//D'&..)5E-EH-%#G*CA=.G0:E)A+G)$,F+,5#5,&H0A9@:.()-)>@C"=*:E&/C&3(CA:EE.*E&-)6<2:906G@;G#.8488: AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:59A10A56C101G82C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3046 42 52M = 2733 -365 GCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGC 0;7@'A+7B")<2DA!&5A-6.1"47-?@;>-DB#C1(C2G9$E1H))!?=2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12313 42 110M = 12203 -220 AAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGNCTGAAGACCAGCTTCGCGGG 3(>5=)@)82!*6:5,3==>2)118%;G2H>-/'A-2#'(*.?3$A5;!/@,>!$7#.;.2G$'&2G@?68* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89G20 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12203 42 108M = 12313 220 CCTCAACGCGNGGGCTCANGNTGCNGTTAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACG %%(%&(*)&&#'*&"$'*!#"")#%&"+#'*!)+#!%%))#)&#$+)*"$$"$)&$%!)+"*$'*%%#'%'#$*'$&!("+*%$$&&++%$&*$(&%$&!&&"++()) AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:3G6C0T3G2G0C0A0G2G1A81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4508 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43120 42 231M = 43005 -346 ATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGGTGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGNGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGNTCTGCACGGATGCTACAGGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACC B1(2*.GD,F#5"#7=.">9C3&A:"!G0(+?40BG5<=&4"%/G8*#F4'EFH%D8)F$-$'EG,)>G";"C-00F'2:30F!3G$2:86*".10@.CG!;0?";%!C&,&??D4*%8<@H"C*3E:A:6G*:#*(30?;@'#EH'=#&;&7D9:-E$G"6:.''?1F?,8@$5";-A",?#4@%@B=GE=(,+F.,EG;/5+C%94??<10"A?"B*&9%0?$#??5163!=E7/F677D#%&&59';0(#1G3=")")5-?',@;'=,F=261,(B0.#%'$,67A1%@2C;8927%)>*/(?H<+$,3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83C28T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4509 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10719 42 62M = 10887 309 ATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGC +(;&D'=/0%)$.=G7B&.!;:?@3&%>+$!857+*H(=>''/220*-G('?(G;3"B78*B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4510 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 292 42 329M = 621 398 CAAGGGNAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCNCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGG 3F-1,7=(24'/8$6.7;0H)3,$;(0"1H;6F@9/#)8-96(%8>@76-0C1$31),'G2#1H:'-(%F(/B"48;;47)@:B!??<@&EF:@80E5$8BF:&6:B2!09-H3F=69?90"=$G,A4).4<-5/,!B<;"=1:D:=0@'%7273,:667<&9E@*A=2$>(!DE)<#BH4G12D2,#>E$(7=C9?C)G$%(A2EAD4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T104G102G114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 621 42 69M = 292 -398 AAAACCGACATGTTGATTTCCNGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATG E&-91@:H+C#F)HEHC#7C6@E?(/;H>:)9=#D$?(=D%FA&>#G>-51)2$*F3=*62@-E79G?. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4511 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38962 42 48M = 39175 257 CTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCA =HA(5)F5'4'@3!?"";&8"2'8/<;"#/1B#%:&$%E0&HE2H2+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4511 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39175 42 44M = 38962 -257 GGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGNNNNN '''*%*&%&)!)'*#)('$&#*+!+*%$'+&()%')%&+!$!$) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:39G0T0G0A0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4512 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42407 42 114M = 42230 -291 AGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCNGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGNCGGGAATGGTTTCACCATGCATTCGCTAATTAGTGGNGGTGCTCTCC ((#")('+$*$#$)''*&+#)$%%%&&!%"')%"$()%&%*!(#"#*)$'(#+""#"!%))!')&$&'##+)#$+!")"&%$*'*)#))*$#!*%"&#)$%))&%('$+((#'+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:32A3A29C16C13C5T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42230 42 117M = 42407 291 GGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTG %==#&3=3C;C2EE>:C'1G8%#;@827=D$"A"?DF@.?()(-<74B%$);2;=!<-,6H<87-/"151&"A04FG%A;H,/*3"AE9@E")00((">/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48078 42 134M = 47920 -292 CGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGANATTCCCGGACCCTTTT 1%6322C&=B1=H:.5G!3:.E+$<&A0.B"E4FBD#3&!>*#$=0"'&)3#,5/3*DC">:04=192AC"9".=6#0,-#0*HG@62=8)/H5@H4@$G<&GF6@+*2-$/973*(09%1'?+3A)D>E.:H< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117A16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47920 42 158M = 48078 292 GGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAANGTGGTAAAACTGCAACTCAATNACTGCAATGCCCTCGTAATNAAGTGAATTTACAATAT '':53A)>;HA3<=9,30F:'859@,"B"5'C2>C+#?D21%2F?)(,.*A*FC02#59%FAB6@:"-,'C$A:)5-1:!"%7B+$+B,F2?A#F+B=%1&4(!BD-"GEH',25#&*F(:1#;>@$'6"(&).D#4C:++C=6H*8!$;#51D*D!9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:98A21T19T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2316 42 57M = 2400 264 GNTGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTG (!)5E#59'23(+A13=>B4,4G/(A<<;<4@8GF&<.!<9-D5?05)AA$,?2E,= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2400 42 180M = 2316 -264 GAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCTANGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCNGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCA -4,BG$"6#.=>B'@8"A!@'H;!0!<1(?.>F@F0<-BA4/*+=#(84&@C(C38)-A&1B%G2::9:4B-*6))=?@71;$>C91.&)9,AB$&G@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63A1T64T49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4515 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24820 40 101M = 24724 -197 AAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCANATACCCATTGCTCACGAAAAAAATTGTCCTTGTCGATATAGGGTTGNANCNCNTTGNGT %#*+%+&)#*"(&"*"*##')!'$"$*+)*)$!)(!&(&'$!%#(%%*'+"(!$''+&!"+&))('#%$"&)&""%**+*)'+&&"$*")!*"$"*"$&$) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:41T23A19A2A1T1G1T1G1T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4515 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24724 40 45M = 24820 197 CANCCNAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAAT %#%$(!*+%'((&("''"(&%!"+#(&))%''&&%#%*%$(*"$+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C0T2A36G2 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4516 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46639 42 159M = 46463 -335 GGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGT F:+E7@6EDD9)!5@.@F!=#7/!7:*>B$7!;:16<:H59#C!3,!>1+$@H.:#641#>0;2!0.>7&;/+-A)"EE4!:,2DA,9@D,F'%F%',$-G2$H;.1=1#.&=A/E-?7"!!F/"?+'7*:$$*H,@D5*7:,"@&7,:6?7=(E-&%:2?!CC(+-D*0:H*/:<%<5$.-C%=37?C4/8:&=6": AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A55A25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4517 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23011 42 125M = 23136 266 ATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTT G7E%#78";HA9&%E:/F,H+*<=D-&1>#$E",(F,2A",H3-:/8A$46C;"-D)9%,9(?;FH$4";'<85-G,4;0ABB>A4/"6@-;">;"6G4AD-25/'D9'6G;55:G#8$98D70( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4517 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23136 42 141M = 23011 -266 GGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATC A3$+(7A2A6++<,.>71)F+-B+''70"4"7'"EEEH$B&H'(97#'-7$.H6C:AA$$EH=6/A('21F=.E%G5H#$2A!'$5:6>>;'A(23/4G4HHG*-"+6.0%91E("+<";!(&;0630,@#2A18*A"@:7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:141 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4518 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8168 42 136M = 8007 -297 CACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTGATCAAGCTGGGTAACGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCNGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGC +'"*""*#+*"#(*$***&(!()'("&"%'$+$'%(*!&)"!#!$""*)($"'!&*$)&'$+"*%!'+)')*#(#)%"&!$)#)#$*'!!)#&'$**!&&&**)"#$"#))&)+!'$'%)'+*')'*#(%"+&((! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:54A14T21C41G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4518 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8007 42 161M = 8168 297 GAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGNCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGC /<'(%0F039D!<(%G?#%E2,AE;,D3G&"'=;#?<69"63)FG:3D&.7%#D/4GF:7:./+>+(F,1!D'<(D&<)39)%.*$6AH&$>/)/+$@A)6;7,"6GA!A*E!%8<'+(&,:F',29)>G!1?=@%D9*&3"!.&,5C8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93T67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4519 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30143 42 316M = 30068 -391 ACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGCTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAA 74=D6<0<27-$1=01(?E9<%&$F06?C&5*92H@&B+>!H<(926$8D(3!7C/"?D>)+,(-@@40.>+'0#$+G<;-87(0)>H@--D?(-9!.BG;7?A328--7!8@$78A205"'+==$))10*/B&AE(ACDGC/%%25?G-E?-2"5A;(08AC.8@:'(?0/G#<$15,A&9#,C:';@8..D7.4,#H)*"0.%5CG-(8F38#G9H2/6#-.!4;-3#'.9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:156T159 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4519 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30068 42 75M = 30143 391 TTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTNCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAAT ,A2475!02::1-$C."0@#4"&>G,"*%%B<)$F2GF,?466*"G2(+45;0D!<6(3&$6=1,BE,0D/<8#H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4520 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28616 42 145M = 28498 -263 GCTGGCCAGGATNTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTNGC %+"%(*%&%(+'"+(*%!")%!)*&(+##%'!"+)+#+!!)#*#(*(%"*%+("*#&$&#$""")$$))"(%!!##"+&%!#$*!)!"))%(''*!$+(&$%**'*!*(%+*$(&'**)%+'*&#'*&%%)(!%%)+"&)$+"&" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T129C2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4520 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28498 42 73M = 28616 263 TNAGCATTGCCGCAACTTNTTTTGTGGTGATGTTCTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTT +3?5B!%'0.(>E&9=0#60>#"H3D$$DC&HA/;-97 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G13T2C14C0T38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4521 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35039 40 40M = 35188 249 NNGGTTACGGAATCGATTATCCCTTAATTTTCTGGCGTCC ''$'&!(+''''()#+)+&(%"+&#&*!*'#"('*#(&"# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A0G0A0T0A0A0G0A10T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35188 40 100M = 35039 -249 GTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCNTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCA E6*%?-62"!.B#D83=63><2.+$'-5%BC<,-2<(#!4D@E661:.D)9?"?;H2:2G6D#*0%,>.)3*0'C&D6)".%(+#B="E<*(=&9*AD5A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G65 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4522 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12322 42 267M = 12589 308 AACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGGCTGAAGTCCGGCTAGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTNTTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCGGCACTGGCGCAGCTTCACCCGTT @8#3,7E,7*#5#;E6#7#:&G>GE+0"!>B=E23<).14*9*<&>6(2A;1,D0,32"90D8DA(3A/,%F7-?G'9"25$'883#-!148),+2831E06*G4(4+/*5$AC.7FF/%4$H32:6>#D)<5"?&/-/DD/&1(-%128.%B&)9$>%A*GF1@@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:115C13G73A39A1A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4522 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12589 42 41M = 12322 -308 CCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCA :7:!==F-*!@C<6$/430&??-A"/*>H)&GH5H):6;-F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4523 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9610 42 96M = 9477 -229 TTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGN 9F=C12%6'A?H5*(#:8!+!>D4'>*!4E$.GC;3GE(?.FA3=3,,'-;27;9)-:C$/&'C><#0$$5BDG-&# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4523 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9477 42 42M = 9610 229 AAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAG -&;11GB.98GA7BG+=B(F@0HH4.26:!5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4524 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8267 42 33M1I50M = 8487 297 TCGTTAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTA ;2ED"+-=H+&/49(%<"9##*-=BF,?G6;&0C-9-2:!=(D4>7.;?D8.B1-G0;2?(B%!"C1+?,F7&62)0=71!354 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:4A78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4524 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8487 42 77M = 8267 -297 CGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACT B74=%5#31;;'0HC733/F%@>?*>-CG%E:*7E="2!+B#2."9.$4!H(D?@!,7'7G!B+(@%,B>G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1224 42 143M = 1034 -333 GTGGATGTGGCGGGTTCTGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACANGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGN 5(=3%$6/*+F38'!13)2,H?)36F6/B"5==1'<$7+29"62C:7*8:H*B3>)$2+-D0#?BF9E0:09!39+),9),.:?H4E#D%//<*,F5-79&5>()A%G@D+HA2(C!'FD! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A36G88G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1034 42 78M = 1224 333 TGGTGATGCNGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCNGGGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCC (+)($'"'**$&)$!*"(''+))%(%+)+%+'%$+*'"*(%'('%(()%+#%&##$")($)*$%$*&&#''"+#'""# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C35T0C1T29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4526 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9972 42 179M = 9754 -397 GTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGNCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTG 9,!:6&FF$(F"1)?)3$64FE&;C/A11H;?DED.778G"F75/G2B)<%!"&/742>"F2<7"D&"C>F&3%-4;-&*!0F#A<32H,H5!4?$8;)B+%HB@<+1G<@'+**$;7<3(?'!:EHG%3D&$05>!>H2#&$",-8H@B&?092%D".F)919.76%C%($H.@2'A/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:126C52 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4526 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9754 42 218M = 9972 397 TCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGGAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCANAACCGGCGCGTTNCTGGTGGCGATGNCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGNCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAA -5&4%;;0H;01>=>"CDH-5/""(%0BF;.&.(;C)"D+!?/5-2;DC+((B42G(7#H'-?,04*D3)1++!:E')@#&0&=E!&H*@'&(7"2(>*1D81(:F;7(:HB:;&*A1"(892(;FG)<;/3G">H1(<>4!3@D9?$A+00@&'(G6FF2CA>86125A)E2D271.?(98-2%4.F!+#'G@ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:53A63G12T12T35C38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4527 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30768 42 77M2D141M = 30528 -460 GTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACTCTACGGCAAATGTCATCGANGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAANGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGNAA $GD=E6#;13/7:%>+8">F324>0>1&5=BE,<-@)2,B.D$H(60-1#%7"AB!'?+68@F''E25$F=>G!$H5*"A-==*.C?&H:>/.1),78?@,?946H"'@*(>&+<@/!2).)=)F.3,)D"<%;%&2$G&GAC?A0# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:46G19C10^GG57G80A2 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30528 42 37M2D201M = 30768 460 GCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGNTTGCCAGGCTCAAATGAGTCG 4%1&?:6.:6+>B1,>.'@3*=E0>AH1BD8CB;7,">F.)37#./::49$.=D4>9B2(@):'@9%-"76#8;%,%&'DA$G.'C,@&)67,(!$@9FH%E1+7<00&:)12;;1D31$*A=-,(8.!H?2*>6"/&B!19B$F.?")*@?G2,82&!:.C'446%A-7"G/;#*%B4A!A>5778/7%C6(4G>-B+-=7/$#26//=HG6>;E@#<*H7'2/2G:/5E9;?+6-! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:37^TG179A10T10 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4528 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41637 42 124M = 41843 299 TATGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGNCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGA .#$$B:@0A=>8$@3&*5)'=@30,G'-'6!8AB9>E0)GF:?-.<;2-*7@#F?&!4/7'@3(HA.59)?EF* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0C85T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4528 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41843 42 93M = 41637 -299 CTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTC *#F;;=4.H8A08%-$5,1!4=93B66'AG!6$&7@<4,)%E+D&*C4G544=!+B2F23=8!';.831H?/G,;6F8#A48 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4529 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6912 42 25M2I108M = 6745 -300 AACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCANTCANGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCNGTGCCNNTG ')'#%)()($"&*$!!(!)'&((*))'+&&&*(!("(#()%'&(##!"&&"%#&&$+*"%$'!+!+("!$)(!+'$)#!'%("+!(&**%)%$%+$%"$%$)%)'+'+'&"*"+)""%'$)))%+!())*)%($) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:85T3G33T0C4C0G1T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4529 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6745 42 71M = 6912 300 GCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAG 1B3.F1#DA3"763D>5/EH8'&27"('6(8(5&H"(G74!7'361D!%8E.9@/.+*-#<3E"#GH(6%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4530 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40242 42 40M = 40338 196 NAAATCTAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTAT $<.6)4A?;2.0"<7-:*=@E*?C2G3.""716*(&>:$' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G5A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4530 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40338 42 100M = 40242 -196 CGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTNTTCTGGTTNTCGAAGGTAAGGTCNG !!$"%$"'$'()*#+&+()$#)"+#!$+'%)"'))*#"%$%+$)&!+)'+%%&!'$)$+#++'##')%!!"$$#+*!"(&$!)'$+*))'**#&&+(#') AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:74C8A14T1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4531 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26742 42 50M = 26549 -243 GTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTT B0+32-39H$.E=H3F%C&51D6@4=#E50%F/7C#B7A(@-E;>+'@#E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4531 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26549 42 64M = 26742 243 ATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGG >,?<'/?/*.%G&5$A.=H,F+7#1$1,85)19)$!?((H"DH2"-;4":)=A1E,/86@D1A, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23845 42 44M = 23987 202 AAATATGTATCAATGCAGCNTTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTT 5#)3A:0((G-GF!B@9A&91,#",(@?4()+1>/A/$:B+2C?%' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4533 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1248 42 86M = 1107 -227 CTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAA '*##"""+$%%&)%$!&!"%*$+'*%++''%'&&+%"%('&#)&'%%))#***&""!$))%#&"+*&*)()&)%&!*!+)''&+%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4533 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1107 42 88M = 1248 227 GCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGNTCACCATTAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTA =37F1,D5CH0=DF!",(%C6=7(;>%=4!+F;!(D?17/;&+)H62G"99.D9>"9175FB$H&$HAF.)?);:+!H.+H%+<%*5! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C7G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18718 42 80M = 18542 -256 GCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCAC H3"<;0#>:G/=%F,9B,*2C#C&%@;++'3DB?%&@6&8?9B8+)?#B%6E7H3+':-@:"(&*H#;"51+)*#.)3"% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18542 42 108M = 18718 256 TGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCA 8$022&%""BDG2',<9(E@C@!8$#%=%.?BH6>35<=A7563:34H9.$$%/D$/-&*8D/2=CACA7AAG3@=*!/:">7F$*D>G:3?B,%BG#/"0E1H:278 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4535 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18983 42 140M = 19183 281 CCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTCAAACCGGGTACATTGCCGTNGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAG 428D@B,D/::2AB1$$@0/8#/F0"8C/B0G%!$9H>A:'$H'9120@#C./,9G>C=)B+)=$C'9@=95C0/5;$,8A"48901/+:H;!F@@E2!?$A3-GH1$%$+C8"&F?9'=9HG27;0.7. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G91G19C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4535 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19183 42 81M = 18983 -281 GGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGNGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCG &==1'.C'.'58B!HH2"%.F'B%D;>G>(9>B-G0.'C*@#A?73C?.=9$F*8!3G28:+E'*1D-/3F84,F<>0:0, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G29 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30588 42 257M2D9M = 30468 -388 GATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTNCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTG BC3%B::5012H-("',&(2'(@!2D(:5!/C>74A$DG-=#>3#3'D:D@!-0..!A>0>(AG;+2G4&2+647"9,=<'0(;()H?=,4>H&.(!*:&;1/'<708A88>::#A/(:*=A;%.;)F"/>G#&):5E.H=,,(&E21##390?)H-=/7><2?3?=&G7G=%*5;#><2*>7')&%;#)C,*91@AH0:B"*8A*"7#-9:@077>7,(B":$7/8.)"239B&E.F!;-$5&6=0=/B?90+#2@->B'''B<-33)$7-A-<#4D3?6@-6@6??B;8;4/#:- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87G4A5 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1546 42 238M = 1448 -336 GCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGNACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGNAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCNTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGNTATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGNAAA 2E59$3$4E-&(F')B6:!%1*'->9C0C@01(CH@@E+<+)3.C862.,DD&?#6>A1<44<54--D=='C1CD/"2*=03DD$2/HB45<421E08F":>1/1:.(5/)/>&1EDDGFG/A63FE&/<460.=?BB=1CB0@6$G8/=1!"0GF%:4D:3-2;/4DB":14FC:'5@<"81!G&3,,+7;*%#.%&-!E#>.F(.<2G.9"3+% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:67G37A45G56G0G24T3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4538 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26441 42 103M = 26441 0 AAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACTATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCNAACTGTC ;6*#;D@HDD8=:2,!=>-'(F@4B;B1<;!;.D&A#)2>+D?E,D763%'96E'$=?*,<)G$HD"&$;$G:/&4+=G9'B'6=6$,4+G:0/8H2+D373> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66A28G7 YT:Z:UP jpayne@0: r4538 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26441 0 * = 26441 0 AAAGNNNTGANNACANTGNNNATNNNANNNNANGTTGGNGNCAAAGNCNNNGNTNNNNNNNNATANNTNNTGTANTAANNNGNCNAGGAGGNNGGNNANGNNCNNNGAGGCTCNNNNNTCCNATNANNTTANANCCGNCNNAAAGCNNNNTTNCNNAGAGNNGNNTCNCCTTNCGNAANNNATN #$!$!##$$!"#$#!##"!#$#$!"##$"!""!#$"$!!#!$##!""$!"#"!#"#$##"$#!"""!"!"$!!!!"$!!##$"$!#!"#$$#!#!""$!!!!#!$""$#"!#""#"#$#"!!!#"$!$$##$#"##!"$"!#"$"#!$"""$!"!"$"""#""#$$$!#$#$!!"""$!!#$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4539 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30749 42 92M = 30635 -206 GCCAGGCTTAAATGAGNCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTT A.'":;B@@H714)(2=&E/H$)3$(-CD55,:3"2>57D,#$-:>@E&0H1=4F@@B01:83'C>'D>E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4539 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30635 42 49M = 30749 206 TTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAANAATAAAAAAGGAGCCTGT H'82F&//"/$0F27--A=B3E$=%/,,1&6H11*BH1CE&6.0$&5)G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4540 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17369 42 52M = 17593 282 AGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGC -9D!D?>,;.4FFFC6(1>22)19/(A$?BH;?)24>.?5,E549@#G000E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4540 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17593 42 58M = 17369 -282 GCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCNGCNG (=@E)EF&:96C@@H1)?B%)&E)'<@B=*!#8:3%*:#;@F(1HG?.:?11%E4A*: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G2A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4541 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40114 42 43M = 40246 193 CCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGG *)>C1,-,+682E*5/">=@=>+8E'66*%>:>G02A/;?#;8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4541 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40246 42 61M = 40114 -193 TCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCAT %D(84D(GA.'&+(!EG@8C;,4+.C,F''G&*B<8F%=?1;/G->#0>D4+1&A0B""*- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4542 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32168 42 48M = 32290 212 TTTTATCNAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCAT BC(+@16%$&@>B+7<"+!E0!$C699./?4'%=7#B/$*4%.DCG10 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4542 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32290 42 90M = 32168 -212 TCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACANTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGAC >BF&9*-/70E%?D+.<3?D3H3"3:9$+%>:DB9(5-<,/E@.3>,=-!9"43)3+0#.+:(=<*'1@0E1E,A-G7F7F7->G,9$B,#3#D!$74>+0&D#.$?!/:63+=&72?>(*7G5G';94?$-% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:105T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4543 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22373 42 107M = 22592 326 AAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAAATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAG /?7E.398A%B&%8"&;/A-&6E#&38-=(*0H>65*&9#02DG)D,F&17!<&!28>5B+(E@-+7/4(4@4-!&(?78D1.;??2.?=2B;0#)"8-?&&!!+6/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4544 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8587 42 81M = 8786 248 TGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGT =#GEBA7BCB:D"3:E"0D"(:!,6"*"/AB4+(E%)+73.*1.'@=$()?,@3-A3<=9;!6(GD+<*$A"0'()G!0<5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4544 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8786 42 49M = 8587 -248 GCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCAC 1$*4A#:H0H3$:4<+,--9<5-"D6'CE%"G*C/7!+..?E*>>A262 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39938 42 67M = 40010 237 CNTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCG "$+"'#'#)++'(%)&("+$('&%$#++"'!*"#$$$$"#'(&"&++*$))"++")*'!#&(*&&&! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0C65 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40010 42 98M4D63M = 39938 -237 GGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACC *%=*;F+*9*=/)<&,=.1:FF+25:',1"=F:3F>70<+4!01H?8E6";ED.A/@2F+!-B8H-.733H-%;%*'0/#'= AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:98^GTAA63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4546 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15984 42 179M = 16163 428 NTCGCANTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCCTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTTGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCG 3"DA4;4?%1FH83(D:7GC5*B93$6/A<5@36/:E/4+,C>C+$AE?@E**40+9>3>">;%0:&/+1!3*/5E;/AE39G!61?7>#?171>+8,B>D%9)?:(9-=,9/B-A*4'/$<$5: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C5G41G67G62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4546 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16163 42 249M = 15984 -428 TGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATG H?&(59-?@/"/6E.?/HD-=79%>/101C/!,?@)D@'+.59HF?/"3'??<9845"@#(6*==(#:@'B7'4";$C22%E%#A8/:@H0%8<-E;?B*6HA8*C,9AD-1."9)7+'.BDFE<+<$<(*@?F+0/%H($8/C0CE0<2!&>%9D%+F+:C974.A:3(;5-7<9+%#%H=H*16*/#;5/6A4(#E0*C919H,F13C8@46+"@3A91"4*E/1C/-.03)1D:/5'/::,5"3/:E)434!12%**"2((2'"=7'C@'(3A9CH:-2G5*$E:G(/.=+.#&)G#21'$801>E=8?+>9H$=<=(%/>5<<:!>&".DG<*62.5<1#GBF973BC#B4C@A:).(:(+AH25C1+,.3/0#83%'"$DE8-230G35(E:82?;/>@:HECE,G=;=)/)4B+A&))3,5 AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:36C7^T19C17^ACCCGA5C76 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r4548 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17818 24 91M = 17638 -271 TGGATAGCCGCCAGTATCAATNTCAAACCGGGCCATGNTTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGTACAAACTCNGTTTTTGN !)#*$&&')&&"%*&*'$%)+)!)%()#)$!!!#!('%++"$+%""")%)%")'#+'"#*!+((''%%"))*+#!!")%&#)!#'#&$*'# AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:21A15A35G0C0A2T1G0G0C0A2C0G2G0 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r4549 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16901 42 73M = 17035 253 TCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGCTGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAG 7BH@48='!?>F,1454)=0H1A6>8(*097%/E0A0,5(,9AC/23@&!=7(1<.!>8,5>:-*%3,G,"1! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17035 42 119M = 16901 -253 ATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCC &>B='H!>;HC22?,9A4:H.0:$-G%)8%4;6*&<0C%>)1F*"H,C(2#47?).1=="%A9&.G-.5/,@2EA0E>6%4:6(?/C=DE#7BD<%2G1!;=E?H$/%3G*(5E"07H43,F.0:&$ABF($"57F)?+<-3(.70E828//)8@>)>#2?3#'/H4?B4)?35+$*'!!?F0'F,5449?.7;G>9+- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60T21G71T79 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4551 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36521 42 78M = 36599 196 TATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAA 2",,%H77*%"@?$5EB#>"D/G3E78$,6$$"'">>)&A4/9<>5H9G$F1;)<(8D4=*"A4&E!,,GF"B!%)G> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4551 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36599 42 118M = 36521 -196 GACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATC '#'!!*!'#)("($+#"%!)&'%$(($$'!$$*!&+()&&$%!"%*)!)+!!(('#!$!+(&%)"#"#'()+(+#%"&"(&$&*#!+$+$+)#)$!"+!&++#+'#*'$("&$#!%&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4552 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42278 42 98M = 42471 274 CAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTTACGTGTGTGAGCA 2+A?010>E>'A?-7/++,9E(;"5)-'.'/)G>'<3B,,>-!++>/8%#-;(F")E&FAH!.-:#G?D9D9<'F+/9*7(CF5):B( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84C13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4552 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42471 42 81M = 42278 -274 TGCCGGNAATGGTTNCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGA 57G3:!>&14@>E6**=!'B2*1)H50%8'=CC?B8)#%GF,4G(+$+)AB"@-)&&15B1H/F-D(D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T0T40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4553 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29087 42 69M = 29267 240 CTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGNTGTTCTTTCAGTTCTNCAATTCGAA +"+'%)"!*+'$%"+!$%*$+)("**)(+#++("'"##&%"#%!""!!#!(%$(%!#%&'#!(*!"#!+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G15T9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3945 42 65M = 3706 -304 TGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATAAGCTACTCCACGGCACGNGCCAGTGCGAACGAGT %(!=1E>%B-31GH+C@$B=<:2.+A!:--!0:9@=9,7F01%!C:)(GF1/>2'#?,$?:"/D=/C.+)*!#8,3$H%D. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G12T40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18914 42 66M = 19057 218 GAGGTTCGNCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGT G,7=6,2&6(;%G;%?>>9F5H=9H7D#7?@&D&?:406GG&6/9;CB3.>&A@976A67//2"4*29=B&8'H!:B6?+A&7'-'H',A&5*"(+/#9,$:7%<"(=20H"6A.$*:7=*%<)!=C&2/D%4.(3B>@+D39'C4E:; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4556 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29300 42 46M = 29451 209 AAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGA @A&<:/'A$1,C3"(3>$'>A3:7!.";#8'4B!.?D)C4$6#&,; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4557 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4736 42 56M = 4944 249 NACAACGACATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCNATCCGATGGTGGACGG "*+%&$*%!*)%("%%#''((&&)("%(($&#!+(*$!+"""'*(%"%)#(+*$*& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T6G31G16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4557 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4944 42 41M = 4736 -249 CCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCTCGGACAGACTCCATC #9EH+4.@+9-.B$!!'(&,9D.D-:HGA/H!,-@',>2F5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C7G7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35970 42 51M = 35724 -297 GCTCGAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACAATAACTATCGATGTCATA --E75??E#3<8.;9D6*;2#E+9BD:<'".C(@69>1;;3;@EC866<:+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C35C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4558 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35724 42 105M = 35970 297 TATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTAT '9/H6(3%(F/D9/'C%A#A4#0=;?F/3#F@892>>?$#@+FB./;GH7,4=:00&G$6/?CH1&9#D*$8G")-F:B8,#;->4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4559 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46772 40 53M = 46955 226 TTTNAANTNNCGGCAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATG '$)"%'&%"#&$!#(&*+"($+#"*$!*+**)++(#)%"(+&'#&'&!&"!)& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3G2G1T0C0G0C0A0G39 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4559 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46955 40 43M = 46772 -226 AAACGATCCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTAT 3@-@$:.7;G%A9,>8,#(>.)#);/:#@%0,B,7:($;3<4D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G35 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4560 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25121 42 132M = 24938 -315 AGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCNA %A=+7,GB6&"0$&3GA!836<"47-E#44B&:F>.23CD1%(6*/C&0:1/'H(;'E!#609?C'/0*.1>7@!76-F>";$345=F4=A$*DF12;5?@#*.1,?.AE'+#<(;'6#:#$.25.6)8/!$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:130G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4560 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24938 42 183M = 25121 315 AACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATNATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATANTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCT 1<6.1<1!>8":(0$/&';B$1">4(9=H$,H@H&&D,A0:=FF2=)?H%*5H;:+=D!:0'BF:"?7DE;05/$)D"655#2:?E-@6'H!H=;G@3!773#%1<=!@#% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C60T17 YT:Z:UP jpayne@0: r4561 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16637 0 * = 16637 0 TCCAGCAGTTCTCANCCACATCCCGGCGCGGTGTGCCTGCCCC @!0D5B?,E'F/5A2FCH8GFC&GH40,.(12300+@!?'<+A YT:Z:UP jpayne@0: r4562 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3851 42 44M = 4107 336 TGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTG 9?"0D.C/5)%$E>B6.5AF:G&B=#?4.B/C-C4+/"8FD<9"*B$C087FHDE;@0C*-"7B"$B<)$C9D8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4563 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33395 42 107M = 33568 224 GGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGNCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCNATGGCATATTGCATGGTGTGCTNCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCG &.C2#>)+.3!#/0+E!678.F,,2:=CG8#%A@<91&&GAA$=F@%E+>C("E&8!G<()2-FB"4B<0'&(.?"9G(BF9AH* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G23A22C29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4563 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33568 42 51M = 33395 -224 CAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTNTTCCTTTNCTACNAN )+(&*+*+%$+)"'!)&&"($&%"'"&##'($!+'"$*)")%&"*$'"'$" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:23T11A6C0G4C1T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4564 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17864 42 137M = 17707 -294 TTTANATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTC +G!1(.>F?#)$<2HBAB,.0D*:?./@H(F,*F)A=*1,-!*!07=*=)!:4H(+.,002G%5+,.=5;F!&("6?;4<5?1'2#84?1#::'//$,'$/&0:.G=>F6C+)70&&G(/4A@3D'''&3.4:<+H.'?1DCC=6+)'*+=+?DE&-#E$5E%FA1E40;%EH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4565 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29230 42 41M = 29416 247 TCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGT 87BB,;3G"?C5D<$2%.(00*)27E6-6:.)&.!/@D81/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4566 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15840 24 60M1I7M = 15683 -224 GCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTGAAGGCN 3"9)-,++"/45-%'BD1<9%4H$FG"G-8C.B4/A,E<;6GD!646@%!>==67+(2!(5?"9'F($ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:57T1C1T0C2A0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4566 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15683 24 52M = 15840 224 AAATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCC 83G"09<3/18=4;5AG8*+!$9(17-B!A)HC;-F%)63#<5"A:<,)%&7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C50 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r4567 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29921 42 101M = 29768 -254 CTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCTATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGC 4482A2?0)E.4;@")3%%C:.0>(@H/F9* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4567 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29768 42 62M = 29921 254 CACTACAGACTCTGGCATCTCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTNTCACAATCGTTAT ?%G!09-?D.6%9&@!BFF=:DC*.;F2#==)@;#A:#%<<#,2H$58H@#$C=2B#!G%7* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G28T6G6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4568 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22214 40 46M = 22075 -185 CCGGCGACGCGTTTTTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTNCCGGAAAG !0++#63GG(@;(76'81//?E,+;,=*##,'0.,+?=-3;BA6B& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A23A7A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4568 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22075 40 63M = 22214 185 CNTTNGAGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTG *$*!&!+!!#'$%!%%'%$#%$'(&"+#'#&*$&!*"!&"%!#%#)+#'&+#"&!&''$)$*" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1A1A0C0C0G56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4569 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45777 42 108M = 45894 167 ATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGT >=3#%F6B<#+;-7F8%B1)7:/0/&30@CDH:2@3&$'/,=1.3??4-F.&,AG>5@<4,3GG;A84"60-1G,>G8*52/:"&F)G+E@%,'&4"A3-C*7E+A8C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4569 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45894 42 50M = 45777 -167 GTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCG &"7?C.A#1$$@*C/C;D.G,=4!>?5%C$7>9:C*#:#$.=6;$B+)3& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4570 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39767 42 163M = 39930 405 AGTGAACGAANTCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTNGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGNAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGNCGGGAAGAAGCATCCGTT :9:1H.-CE;%"2+44<8&6?G@8&-9A47BG=$)4'=36A(6A1;*5#F+79;?E568.3#=F,'"6002A>8'+@:31#?.ECFH41-%897)-2F8=C#7",D!/4.<#554A<"21=),+B;0%H18.9<;0+-A;98CC$:E+/*DC!->,3)>G?HH AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10A26C36C69C18 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r4570 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39930 42 178M4D60M = 39767 -405 ANCGACGGNCTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTANCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGANGCGATCCCTGA )&3997?<:*,6.<80E1$+:0"#GHE:#9*5'6/%1#7,---$"#5)!!587+07!2G+.5CDHG1D::#-<'3478H;,*5$47!9>%20B,,'0E@CD9"H!A#!9-%.$E8"1,A$?=399!14!6:F(&?2"G0'22$!')C""&? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27A9A3C43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4571 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18626 42 52M = 18471 -207 TTCGCGNAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTN ?21<1=CC8;H>A$F"1!)D75@5BG'!!0/'+$HE".556&<1GE#=/B3$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G44A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6281 42 105M = 6532 331 CATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCNGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGT G;HA>4F6B(+!B%+A/A(&($0B5(&?&'?7B"6CE6(H.2'=)-0)*4#>@:.&#(G"E8D1#D,,!(*C.&8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6532 42 80M = 6281 -331 CTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACGCCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAG /4:DH,6B6?0.3/C-!+-47.7$<;:0(4.:G(6$B!8>,-/F>$"69+<)G%50E9BH5G'B=#;"D.B%2/7%,7/B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39133 42 42M3I126M = 39301 310 ATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGACTCCTCTGACCAGCCCGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCGGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTG )7:==<20%H#(D+E&5F=#C8:5>H".EC9BB#6C;45(C",D#C1D1#@8GE%4).120F!?'"ED0+4<70+(??-F#'B08:BB&-GH57EE= AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:47A14A40A64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39301 42 142M = 39133 -310 AAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGANTTTTGCTGGGTGGGCTAACNATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCG %52CD6DH7H(3??8A+*)69(94!7A.'1-@($8H7@(1&>2BF(<,;:3E8@#).,!97:3"G%/<&02*5C<2#%:B.1F!*1'39G"-?==6-04)E:B;)C*87E#?"##.$G"86*'*5"+,>:4)?!#3E+EA5= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A19G90 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4574 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48438 42 60M1I5M = 48271 -232 TTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTANCG F0#.22E>=CD-$#(:'(=H4G>++B01C",@B1%!5!+3>..A,1;45)>7%F.:,.!%2@!>4>2?"-("F<+8:D!.CA?:>/68>3B%=H6+59"$H*"*3; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69T37 YT:Z:UP jpayne@0: r4575 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47295 0 * = 47295 0 NANCNTGNCANNNNNTNNTGCGTNTNNTCNNCGAACTNNANNNGANTNNNNNNNTANGTCNNNGNCANATGGCNCNNTTNTTTNANCNGNNNGNNTATGNNGAATCTANAANNTNCAGNCNNCNNCAGTGGNNATATGAGCC "!$#"$!!!$"#$"!#"!$!###"#!#$#$#$"$!#$"!"!#$$"$!#"$""!!#$!###!$!"$"!!#$$$#!$"!"#!!#""#!$!#""!"!"!!!!!$$#$#$$$#"#"$#"##!$#!!"!#"$#""!#"""##!$!#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4576 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22961 40 43M1D61M = 22797 -269 AGCCANAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTNANGCAANTGGAANGN %&#"+&+&$#+*'%*+!&$)"&($$#*+#!*$+#!'&"+$""'"*'($&"%%%+"')$**$$&''!#&&*)#$$##!*$#%++)*($+)'&%'$(%)(%)$")$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:5T37^C45A1A0T3T4T0G1A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4576 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22797 40 65M = 22961 269 TTTTTCTTCGTTTTCGCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGNTTATTATTTGAATCAATTC @#C!=()17H'2+0:D15D.$+6:87C64=0H899C%5C3(9'#<#+294.E,'4+0F@,)%(;( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T29A19 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4577 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8280 42 20M1I168M = 8468 232 CCGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGGGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGCTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACA ,65:4,BD"632%)-.6#1),)<@"(!E?(H%>&5:)!?(=A>(F'40-#$?96"9(1D;7),?E34'8AD#$&99&*9BCH&6>>-E-H&:E&9'.2D$;@%(@)2=:+1;3>03A$=/AEE*5+:'D: AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:1A38T121G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4577 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8468 42 44M = 8280 -232 AAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGG */0**1!5;B>H&?;G"CC/03*>#9D'(0E@8()#)-F-E(>C,EA:?$8;/3-5$,A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C10G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12514 42 55M = 12703 245 CCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAA 2GG-'H5+A$A8/'-&B'+""=;BD#2>E+0:9)AEB4%E(G9(1C;7E=9&+95 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4579 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18157 42 125M = 18002 -280 GAGGACACGGAGGAAGGCAAACGGAGCCNGTTGCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCNACCAGATATTCATGAN /2/7C8%B+";H8@31F(78D*(;$G3A.=&.HE:,C8&'8*3B33"3#%%CC*;,13!2H=A0:0;9H8(@C+-.&>$3&2,H"5!E*;D#49B;H!>2-;574B-!50&+2:*>/$8%0&2(# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:22T5A3T75A15A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4579 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18002 42 155M = 18157 280 AAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCNGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGANGGCAAACNTTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATG 0,E=%4.+6:#7=&@F6.77!2/-A;/H"@;"$!$>1B:*7"7BC&,036($(G8"36*"3G;E'2HHD<8/>B%!5!-$$D:8>*;CF5B$-#/E89E68:1E5DB$@!66FH,4#?=.*/%(H0<5@A3<714023)$=)&<*:-0-> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A88C7A28 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40751 23 42M = 40498 -295 TCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATG A)-0.6:.EH,'B=A<:/G-BF:749238;(-F328%"$(,, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-77 YT:Z:CP jpayne@0: r4580 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40498 23 65M3I49M7I13M5D105M3I16M = 40751 295 CCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTNTTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACNAAACATGCAATCGTAGTAANCAT -:9/%6/;H7)0&6)&A$1G:C!>!C6$?&A76%:.&.73610.-6@:3"A#1B$+;6(D#@12&*(A=F=.",#!A5'!2"3%);6-AG=3..$,#C:63-*?/>,61-F<'1)H$-;B0(C8/2-H=E$.BA59/G31D$/#8%'$*3"6@-<1"F2.!-$'=2G:$#13CC#G3:52D&/EG#"$%1D(@48;36/"9:+A=4=9*?F2B/.@)$6& AS:i:-77 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:4 XG:i:18 NM:i:21 MD:Z:45A81^TTTGG100C16C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4581 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12781 24 34M4D54M2D52M = 12658 -269 CAGCGGGGATTGTTTACCGTNGTGAGNTTGTCNTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCNGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCG 2%G:?'%"2F"=E<'*=68A"GE24G$C(963,D-H:68#&=@)70?HB@H=,:,F.6+C"(C8(&DH#H*F61@,DE9)(.<33FA?=$F>C:&@$.1-C3,=>%='2C:>'!GC;84?5761727D.H/G4F$47*<@G483E?H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101T42 YS:i:-53 YT:Z:CP jpayne@0: r4582 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12705 40 110M4D54M2D94M = 12969 408 ACAGCCATTCNGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTNCAACCGGAGGATTNACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGNCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGAANCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGNAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGNAGAATAACCAGGTGGTGATT 0F6#+(2D1=#$E792G53/-47C.D1.0318%H)9"+7%:/>=;;/3%""H#2-6509(!,E5.4H4#C:D;4/64,="&648!@A!G(@6+*0@:E8@@!GA/:0016;712'':)C(.3F,9<(:=B8<:39;"8'C-C1>G:F)?2.*:8/6:2 AS:i:-53 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:17 MD:Z:10A1G23G13T39C15T3^CACG46T0G6^TA38C34C10T9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4583 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38248 42 61M = 38474 288 CNNNNCNNNCTCACTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTAT )*#'!*!)"'('%'+*'#'((()**)()"#!)!%!)*+*!))#"*"#)#!#**+&%+)*)" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C0G0C0T1T0T0A1A2T47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4583 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38474 42 62M = 38248 -288 CAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTCA -GEC5=50*1,-C'*6B2.%$?1$5#D"):+!89*$( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4584 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47938 42 122M = 47767 -293 TGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAAT -1A#/4/>*E376?3!6(/++;%B8DE62.0B!/1$5$A7%!>,+A@$AE: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4584 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47767 42 79M = 47938 293 GNCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATNCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGT #$&+!$*#)#'"%(!+&+++'&(**$*'(#%!()*+#'$"%*"*!&$&''*!&!(&%"')$+!)!!)*(*#$""($+'$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C0T28G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4585 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37411 42 60M = 37492 239 GGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACNTTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTG (7>:*-CE9*3!/#8AHB#1$H2B;;%C,E).E#B:.!;F-C"-G2G@A$F!%%A/"59> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4585 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37492 42 158M = 37411 -239 GAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAG 68+?(D*@.*$:6GG-42%)AF:/%76 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:158 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4586 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 320 42 52M = 130 -242 GCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGATAACGAAA 5)9G*)5-B,.64#5/05),$*#(.1=B!"0@EA>'"$8#3&29!627'6EC?0B)E-=7()) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15137 40 126M = 15022 -241 NCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCNGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCANACCTCCCCGTA 4!8-A10%C@/:1G"0G33@=)@$$03F--><:1A'/6>*3;)'45&$D47*-=1/-4:64FD%:$(/B-#,H#3D$/D9E$F%%?",(!9>,)G%.+05 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C30C82G1A9 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15022 40 93M = 15137 241 NATNGCGCCGTNTTTCNTATGGNNCNANGGNTCGNCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGA !$)!'''!'%*$"'##")%(!)!&*"!$*&"''&#)*+!+(&*+'!"*)'*%'""'**!$&%&*)##'#&*&($#!)&!*&#'!#"+)!'%!% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0G2G4T2A0A3A3T1T0T1C0C0A1A0G3C58 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4588 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8894 42 78M = 8972 317 GNNGGCTTGTGGAGTGCAGCCGATCTGCCTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTTCCANATCC *!!&+'+%$*((#*(#+!!&*!*+&#'+('!)+!#+(&)(""%%'*)!"''&&&!$%()$*#&"'!+&!+%'!#%)'! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C0G12T11A41A3A4 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4588 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8972 42 54M1D184M = 8894 -317 TACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGGTGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGT "$97@A:G:(1=.-.5(5,&&H3+F*3&8%7"#BCA#0,-=#0+F>D8:*47+/0H9%8""!<@':#3)+2+%&4D-,&3.&&+H=$!,&H8@1$+2$2,73H#)$0H;.1@.(""19(;%0.<&7BH.3=73?++!H6":.>@$/ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:54^T118A29A35 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4589 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8355 42 63M = 8125 -293 CAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTTTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATT 3<"B."6*&*//CH0F/---.>E*+B-#4G2?,B2FD$E=/:H&"5)E4FF,EGE= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G26 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4589 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8125 42 175M1I38M = 8355 293 NACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATNCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGCTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTC "&$+&#$(+''#%$'#%"$+)(*&#!$#)&(*$'(%'*$)+!*#"&(#)'+(*+*"$#+**#%!"!#!*%''*%&+'&!+##%#'$$)""'$&&+%#$*#()($'&'&*"%*'+(*&!%+%'$"#!"*!$)#*'$"%+'*'**++#%(""'*(")&&*+)""+(((+'!""(*)*)%(&$#$*&'""'%)*)+$(&(!%(&"''!##"(#+*(+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0T55C62G93 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4590 77 * 0 0 * * 0 0 AGGTTTGTGCCAATACCNGTAGAANCAGACGAAGAATTTCATACGTTAGCCGCCTCCCTTTCAC @H%2"-';0"//A<,/D)@?)>!66=4B,%E%@<$A6'38:*&).74H.7!CF'69'#1GG="7 YT:Z:UP jpayne@0: r4590 141 * 0 0 * * 0 0 TCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTNCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGNATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTT =3'"/6?(EFAC9'#+C?ECDBH@F:C*3()4.:8>!-HF4B39C-%3H6F)?G,C;+;E2;7(%64B;)/)?F'&-2(E2A=?*,+2;0'9!$G&;F+44D4B8FHAGH#0"#-;FC)+1>4)4@F8H#/:"7",4#$%)H/(;5,-5#99"'-(!)984<1CBCF.?76=(>8"78/6;8,?)D';26$2=<*(F+>269A49G*"<.+A7*B"2#B166H"5<&D1E7H(3(*'4?:9:-CE762%?'!2- YT:Z:UP jpayne@0: r4591 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38681 40 90M = 38793 227 TCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGNACAGGAGCGTAATGTGCCAGATCTCGATGATGGTT 7=F15G-&7G<8":B)19#>59<.2;F0>;B9GHF+0296/3"8%$DD"(0$:9;05@G@5>03 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54G16G18 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r4591 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38793 40 109M4I6M = 38681 -227 GCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAANCACCGGTAACCTGTCGG 4+66;"E@H4!.?/B.<0/B?4B2)=/DE85$.-BC4=>2:F7#('D0*//=>,.(4@9/C=2/-:ED.0!G:!5/8;?,2%G'DBC-:B8F6@B;&F229?-9-5"*,7?#6D!9>0D AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:101T5A2C2A0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4592 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10122 42 75M = 9937 -260 ACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGANCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGNA G72279-:2/E79+2/2&F;HE>8E&.3,5=(C.-B/!'+6<,@*-G%C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C25G1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4592 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9937 42 80M = 10122 260 CCATGAATGAAGTCGTTAAANACATTGAGCAGGAAGTGCTNACCACCTGGCCCANGGAGGTAATTTTTCATGCTGAAAAC (+=+?%1+!"+2/2E*C)1:G*H&/*E.4?-*@G-H+D,87%2&A>B9F$%G#H&AH'-:A3' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4593 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45702 42 89M = 45589 -202 TTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCCGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTA F7'8FC#(,G!F2-B4FD.+36AFE=E>H85'HF*=;E?D!G2=7;?"7)F.G*-21'B88:6G6+(DA1(GB5334)"0!>*9,':>*5:9G=%F!=,E,;+,DE7=B5+)2>A0<-5$8C9!+1$FB5G+#?2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4595 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34583 42 127M = 34478 -232 TCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAANATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCN (C4!@990:A3*=?1D=':@F.-$,E,#.8H3<5A%1051:6*/'"AG"FG/-6#B2HC19*'D$H@E-G4!B&13-B'"!+B*&G"@:D8C+?91FBE:59C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T26 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4596 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25023 42 79M = 25102 170 ATAGGAAGAAAATGATATATATTTTTTGTCTGTCCTATATNACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGACGAAACAAGCA 1$9"/8;)!B=C?>F3D9%D8$<>:>":3'5703!,"0E4A%F5=.)0&@5!4:1(=:!*A)!=&;5EF AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C23C27T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4597 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27408 42 70M = 27251 -227 AAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACAC H7D;6E4;2+?8C'B=DH9@!B.G7"/12(-)@*6$,=:A4-5G"('G$<"0/!9:C%-,1-3G+>%HH?90%A9&<-C>&>$%%;!.H&34@DBH;C@>1C%/4E5-4;/.-+3@BF7") AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:153A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4598 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34052 42 69M = 34197 288 TATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCT :4&'.&/11$7C*<;:D(;<+@(?AC=>3*?!D>),%6&47+1+3/A?"C1>)F>5$0<"H<,E0.%;5+666A4@&/-/!4.2E&?A-0-.5%12GDB!G67,GB?!'/BC!3G-E:,<$B3.7'+#*#>>=0F40350=6A9$(D6B%H0+,;F@H7:1=>&:,!#; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T45G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4599 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30609 42 203M = 30476 -336 GCCATCTTTCATNAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAACAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCNGATTGCCAGGCTTGAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTNTTCAGT &#!"&!''"(*'$+'&%!&))"!&+'+%&*$($*'!$!)*$$%*%#"+'#$'++(""%)"&+()"*%#"!&)(*'&"""$#*#"*$)'#*&*&*&%'#$*%*!'#)'"+#*$*!*(&($'(*##))$*'!((%*&%)#''('$!)(")#(!)'#*'#+'$&**&)%#'&'&$("#(**$&()!&$*%+$#$#&!%++$&)*+% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12T49A72C13A46C6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4599 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30476 42 89M2D18M = 30609 336 TCNTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATT (&)=5>+!-F=17E7:.-D4@0*4/+$01A$3$:(-7,.4+0@&+,;=DA+*/">'>;B#7(9#%$?B90'0-9FG="*%+)@(G>=F&E6EE'1/!93C'D+3/;!,@:2#:<860&656;#,3.7,7>2((D+E=',B-)&/<%,#!>F/"4/+02&E+.6"F%;5DB5%)G?$1/*>@;6<- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4600 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40314 42 204M = 40214 -304 GGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTANCAGGCGCAACAGTAANCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTC #CB.$'"@*49=B"%@*CA(E7.9%)#$C8/G!)FH-06>++/!5.''22H;6AA+22)3>F$54-A'22A*&E82 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41A15C85T60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4601 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21842 42 77M = 21842 0 GTTGTTATCGGTGCTCATGCCNATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAA .2;(*#E+DC9C>;EH%-0-)@:"(6D3H>(CF==0/"!>E:D9'!C.4!3*H;"!*D$98F&3'F>+H10>3F2?#&$81;D:,%B;>E45D,H#1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G6 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4602 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41022 42 151M1D124M = 41298 325 TGGTCAGACNAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGNAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGNTAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGNCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAAGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGNACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGNGTTATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATAGCAACCCGGAGCTTGGACAGC :="0(.(.D@D@C1;('=:<5$#B.:$B?)8):6H,";,?.*E<#;C:C3#@"(*0E#*?7A@BE4G'6->&C&/1;GH8>G&7F=E/GB-4B283:003G?#EC($$CG>E(4)6.7:G.<$B/4):9E1(C46D:8'?B4-(+CE2H%C,A&;G%%C%2C?7<#2>,9B:7".F?:B;6B7;H%#>4#5"* AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:9G23A28A24G49G13^T25A45G1A29T20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4603 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25380 42 106M = 25279 -207 GGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCNCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGNTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAN 1&77!'A/4CF1$?!A+5'+.5<20)9)+G!(9.AF',A7>@/;"#669C92&+<;&!5C:*;9<9*+D$-G>A,,63(9(D32FB)AE+/*!80!5886288AA&7HCD.*E;$;+%G8)';2B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4604 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42818 42 210M = 43028 262 TGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAG 2(42F%AF+)+G>7+$&976#$".GC$(*<@3'8.DC99*/?419$G40#'>!BC2!=(?F%&C2%&7#'=(A$*=D)7C2>13"H!*F*H:/HA)2A1A68;2"1GC&@#F7;7,94A9!5E%1C1:3,52#),:@&*$B9AH20$@G4+##"##),&#<+=1;3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:210 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4605 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2286 42 95M = 2117 -264 TATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGC E6A0F>+,!,D<<4"B-/6-*-158)EA=90:!F-;A,F:G@>E>H!,C!HDG"89'D:B61/'?0-CF*0#6C1(62;;@-.%71)010/$97&<37 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C30A54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4606 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1595 42 218M = 1508 -305 CGAAAAGATCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTNAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGA (>&1=5,!"D9**-2@*)=GHHF+4)8'AD@79B+:69>(>*C"%?;-?:';C/7AD#G&124$,.%?".:12)/)2-%%,"E%B17:0-90:?724&%!#DC>&;-!0;9:A/;-9G:;#1-*';&. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8C177A22G8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4607 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45572 42 68M = 45423 -217 AAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGANTACTCCGATCACCCT E;)*7'ED:0?!&A9'&$E;63:$D=-91:)C;E#<78-?=),8-66*712G2F'AF5?$ECE<.7GB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T15 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4607 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45423 42 117M = 45572 217 NNCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTNGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAAAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGC '#3=.$!,:($F/.,37!$.#0%1H-'+*6,=-42!$1D!/:>9"*H>:@3>(HF-:E4":@!CD;)/%B+02:3$C##7+&9@FG)*6$*BA9H!A),$F99H(.#3B(4?G&2A1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G42C31G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4608 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44560 42 41M = 44308 -293 TTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTANT 1>)">@9H,)7C10,E-C/@,HF36.'9/=:GH@:0F8:$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4608 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44308 42 72M = 44560 293 GAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGAC 0)B2CD:#!6B>,?37&8CH@'CC%D$$!9/;>/4-)A/.?<>F249#8(+@A16'A0=8(8E20C-&.BH: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22382 42 261M = 22644 332 TGCAGGTAGCCAGTGAACATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCNACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTCGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTNATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGNTATCCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTAT :"31++E'-%$C!F9/9!&E!4(!H?:A5.'<*1E<::&')@#?)9.&D$>$8?;<-?G//%36B+!1"E8>!H1D385;7@;8F1H&AF?'0F*D?28@(?+6+>3C-CE/!.3E1"#;;=$15"-:%3H,8;-2"&HH35;0A-8H>A:G!1/=!6"&+F?-82'?"*;'"D:*#7>H*99- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:16G41A49T31G45A3G70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4609 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22644 42 70M = 22382 -332 TGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCG DH?3$D%@98&E/+>*?E:&<:2B(+,.H/),$FA%6"?D=>6AE-/G#&DD>HD-54'+=5D#-+%H+2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4610 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9514 42 134M = 9703 230 NGNCGGNCGNAACCGACAAGAGCTATCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTNAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCNGGTTGTATCNGGT *"$"'(")(!(&&+$$$)+#"#)+!(+%(!+$*!$((%$$'#'(!!!!%$(%'!&'!*)")))"%)%$)&')(!$($*+""#&)!*!)+!!(''#"($(+(*!*'#%)*!+(#&$%")$"$'%*"!)'&%$))) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C1G0A2G2T14T63G31C9C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9703 42 41M = 9514 -230 AGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGGATCATTTGAACATAAC B1#5@3DE7F/07'B-DH+6'/E53<8$F@@FF??E:7:=; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4611 77 * 0 0 * * 0 0 NACCNANTNCTCACGAAANAAAATGTCCTTGTCGATATAGAG "%()$%%%*+*(%+!$$#*)"""(#$$%*)#"&#*(#&('&) YT:Z:UP jpayne@0: r4611 141 * 0 0 * * 0 0 NGCANATNTTACGATGACATGCTTGTTTCATCAGGTGAAAAATGTCCATTTTGTGGTGA $)!'$*%'++#())("')$&$$%%$!*$"#(#$%)&&)''&+!"#"$+$#$!''%+$)% YT:Z:UP jpayne@0: r4612 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19114 42 90M = 19254 202 CGGTGTGAGTCATCTGAAAGNGATTAACNTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGC H<'AEB7@;?5?H/&(%?5'H-!7$44@3=#%%##@-:-+;D+5?ED35',=CG@D"%7/<):8?:#9A&B>$5=G$DC',!/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G7G61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4612 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19254 42 62M = 19114 -202 AGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAG );+.52;3""".0>GA>.%?-?!B*@-E!,*?70D2:EA1+!%E;A6:9#5C/7,?B")4>, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4613 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3615 42 41M = 3749 257 GCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGTAGAGCGCCATTG ;6?0E:1D!+'<-!./F3%<57A"/.+);$C(%C4<94(6/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C12 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4613 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3749 42 36M2I87M = 3615 -257 AAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCNGG C9;(-:51';#8"&>2/;!AF=1DD:-6(G6(;H!F(#!"DF%9D@2H!.>?+&88"6*C/<;),>?>=815&);1@(.%G/<&.D-H=8?D/H;';7$3.$,=*!E$,@3D*/F#*.0@# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:120A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4614 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40000 42 99M = 40099 251 ATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACGGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGG "&*((++)%&#+$)%+)*('*#$('&$!!+%#'%!%'))&((*&&#!)(*$&"$&#(*+(#&$"$))(%($*(*$*)"(+&*")*%!&!#&$"+()&+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T54 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r4614 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40099 42 9M4D139M = 40000 -251 AATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGNAAAACAACTTCCTGTCATGGTCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGTAGATCGCAGAAATCAAA 8F:4H'A!A%.F;'=:*3(F%&()AC=-<(1'0(9E9'(/GA!4@6,=CDC!@=:?-F@F72#E;D>7F-#%4*+57/.D/$()4A>A1.""( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T1A21G19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4616 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21012 40 55M = 20768 -299 CAGATTTTGCTACCACCATGACAAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGANANC $"$$((!"+(%'!$%!$$%(###**)*+)"("*!'(#)$)&##+#+%*&%%!##" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T28A0T0G1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4616 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20768 40 59M = 21012 299 GTCGGANANGTTTGCAGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAANCGAACA &''$''")('+%&%#(#)"%$()!")%(&&"+*(''(('('!+%"("))%#")#'&*&* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3T2A1C1C4T36A6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20234 42 193M = 20160 -267 CGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGC (;(3=B17"*7E41B8/@$D9((F@@4)995,<&&;C&/C;D?C'24H6+00(*@91/A7>3--@'/F5,H;5'3G5>%&!&'A9(54<<1F@)3>7C9#D=("82:E@H!&'/+;B*;,6:1G6=9"$<@<>% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:192T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4617 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20160 42 74M = 20234 267 TCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAANA F1-1!67(/5);2:BA74?DHG..G8>=)&B1%%+A,4$H2GG23,08912%;B-3*?21?CH:B5G-9>:F77 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4618 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32447 42 71M = 32270 -248 ATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCNTGC 0-(8;585A<7B1==EC78C7/CCC%/%4%:<9(AEF<-$@'65C+%G.;DBH.1'+2,H)536*F7,:5B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4618 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32270 42 82M = 32447 248 TTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGNACACTNAATCATGGCTTT /H+7E436:1C)B!'+@H?8""!)//23AC7&+-*>4'9=H2G,96F,D30:*D@21.97/5CG",>*0B@*.F'5,96*!G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C5G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4619 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10074 42 138M = 10214 242 ACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACNGTGAGCTGAGTTNTGCCCTGAAACTGGCGCGTGNGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCANGGAGT $+''%$'#$$!$*!%($'%'(("'**'#%%(&)+&(&$)(&"&$)$'$&(!$%&*$&$)&!%#%!"*+)!)!'#'#)$+$+&+')!($)'%)*$#$!)))*&!"%)(%#%#*!*&%"%*#((#()#!%%()(#!)(*+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:50G12T20A47C5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10214 42 102M = 10074 -242 GCCGACTNGCACCGCTTNTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTAGACCGTGCTCAGCCTGTNTTTCNGC &'0/-8E.D!<:7?+%.F*>AH;$FG>/50()59-;"4F>CC=E"&%=E->?>5DF9==A5>&%(4-?G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7G9T59C16T4A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4620 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39749 42 41M = 39868 277 TANCCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCNACGCCAGT "+"!*$+!&%%*'''(*$!+'+"'&$$++!)!#(&()$'+$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A29G0T7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4620 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39868 42 158M = 39749 -277 ATCGACCATTTCTGCNATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGCAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGG H2?<0@3A3*)(2);H-09*7=8@>*2H/6"HA@!:D2.>B.FA2@D?HB.;F-/9C)2,0(%(?>5>A,'/8AG?F:9-8?E@6))H)%8@"';3%EE:145):'&;= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15C102G39 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4621 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44811 42 92M = 45066 324 NATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTNAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGNACCGGATCACCAA $*$#+*!"*")+'+#''')"%"+'*$***%$)$!)#"%''""!*"*++%&"%&&%&&&)&''!!%&")#(**)&#"+!!("!!#$")#"("$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G28T48A13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4621 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45066 42 69M = 44811 -324 GCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCNGTAA 4=9)$//EE!+AF6$'--<266&?>D0D+B$&+H-&E==;?% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4622 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23820 42 64M = 23616 -268 ATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAA -;6F,>&C8C"3@$,133:)@/9,HFB+8H6?0'CD+>F*!9%>54EEA&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4622 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23616 42 46M = 23820 268 AGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCT F#%.>&!)H-<12'4D>B?288H3;F@0?5;<$5$%";)AA"4!)# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4623 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17180 42 49M = 16980 -249 GGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAG :B0?31%1:*>C).:1.3=>&(66H5>/D8A>E!F'<#@7A)"D)A+3B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4623 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16980 42 73M = 17180 249 TGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACNGTGAAATTACGCTGCCATCCTCC ?:@9<-(03G-F$:C/1!;,.=2@H,CB72,@&%'G;=!@-#) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49C7C15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4624 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2552 42 123M = 2418 -257 GAGCCTGCAGGAAGAGGATGGNGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAAATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTG <>00-!>#*/F*H/DG>;FG.BH!(A8A)@*((*2-2C*1EB4@7;=*"'&6CBD.C>7C+8?6>H>?-0,G!#)."-9=/+B$E64$'#>1&@#>='B7(2@8$*$>0A;F&:2<-EC&56+58>G)?51'%&*%9G32>5D3C/'E7&B='HD*<&84*>0F*.+8>$:#.32#B&>F4#C.,$E@*3.2(H@E#G1=F$5%B1+5?&E5+@"+'(@@"((4&91=0E*G>(7;@.!//G3<"+"A8;D1=-'FH'@!8?!=+!HC"FA=>!D8>7#;64#/)/2>.?#F/,&'2=E?H?AE(9CAF.?H+&G"*C51*:'C?&,!"5!C(H6.1&:?:>A6<)41%FB"846E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4626 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14562 42 86M = 14420 -228 ACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGNTGTATCAGGNGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCG E:?+CB(8E*;@D,!+1A&%/!''2FG*4D6=8%1;<"F'7"F&.,'>"%8AH-$4-(+1E=0%!%1E$E3A8F,<-D6-((!@@= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C9T22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4627 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13291 42 122M = 13413 457 TCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGGAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCTGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTG %1/445?"1@$EEC,>8(H6)B)'%-+5/1D(4)GE$-:HC'3+"F?492-/)-$#'?DBE$8<2"*;);:> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G48C33G38 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4627 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13413 42 335M = 13291 -457 AACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCNTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGNCAGAGGTCGGTNGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATACAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGGGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTA ,E&9=G*'G=$FC"-#95:$6C5*3()8=G,?1@"+4%+'(5)C;"G%)9*1E9(@CG8*H#85>53F?".6D:>)4)@C(#3/%'14+<9(F"=./'5/8.@304=FFB:@#,?..A;G(C0::H08D#@)(#!,?:(G6702.+9/5#D,1+-%8%5745'HC+?;%%'7DD..>D)C=$=-1F,*?"41<7.-E732*G0410C((1=- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0A65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4628 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15343 42 77M = 15276 -144 GTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGG C%!H.:-1/4G:9';<)7)>$::'A$8094C@;+,*,A7E:A+=H?8%@,@975%)!/8964D><-0>*?:=8!>34 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40295 42 62M = 40026 -331 GCAATTAGTCATTACCTGGGGAAGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAAC 5A226>B+&(,'DFC6.<#C$H5"50/7#1&$H05$8;>6A50B!*EB16.#4B81E,39%5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T14C39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4629 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40026 42 55M = 40295 331 AACTCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGNCA ')!D#+H3.*/>>8A1=C!7)?=698?EB)919E0:<1*;B6G0)#9)-::9F=, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A49C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4630 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34265 42 40M = 34316 191 TTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTAT !H%(@03G*%9'3$AD7";9/BFDB.;ABF?@6$1=E1-& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4630 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34316 42 140M = 34265 -191 ATCCTGAGGATGCTCTTNGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATTTATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTNCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATC +,?=@.,4%>,<0F#D/F%->AF)GE*7@*!/;$075#!=?49+D,%*D81F@3;D/(!*E;+1)<;D!"2>6/&:"&F"*70CE)#5C&GGA1'%B>';#6;.;(%-.*<(74+4C%5F51!:F19+H?F(,B6911, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T67T17C15C12G0C24 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4631 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21450 42 108M = 21223 -335 ACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGNCAGNNTTGCTTACGNNNCCNAGGCGA ""#))*$"('*#%""+#+*#)&+"#"!)$")*+%'#)$'+!*##(($&'$)*"'$)#'%*#$++'(*'%'$++))$+%+*!'*$+!#)#%)&('$$#"!*("*($)%% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:81G3T0T1C1A5G0C0A2A1A0T3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4632 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4274 42 60M = 4082 -252 CAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGGAGGTCCNTGAAACGATGGAGC =,B'B!3!16%6C3G08(6&518!0<.7*5F*B98'/93"&H)EH'5"1,3/5D9))84: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C6G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4082 42 111M = 4274 252 NGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTA %&(E$77D*).4"&%F4$B:2CG)!!F6=(&1'94/=/?4H99>7B0,(!>"26,+?@#.&HF28H(<@E?5'#$!DG28-:1CC1A% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T110 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4633 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1945 40 146M5I31M = 2200 317 GGGGATGGGGGNCGGGTGAGGAAAGCTGACTGATTGACCGGCAGATTATTATNGGCCGCCACGACGATCAACAGACGCTGCTTCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCTCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACC 'AG**!*=1E&).+';*B)'1759#'+"9*E2:8?<>FD;-G89!C:;/:0/D7,1EC:?-*$.E:@6B;,-05DF%B!+#62*8!.@6=0+5$"@1B&!!B<%!%53(HH:$84)53&,!>$(2#5<56,A?><-/A8<">-/0C";5@H-%EB<3D?-*46/% AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:11C16G23G15G13G94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4633 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2200 40 62M = 1945 -317 AGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAGACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGT *+&&&(()'!$*%#)''!*$$("+%&&#'$%#&&))"'#$+$")'"""'+!''&'(&(%(+* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A26 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r4634 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1879 40 60M = 2028 271 CTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGC -B9%HEC&$..6D=>$:+><'@<106*=8,H%3@=B$/>?.-!(9=!"",-DE>%7F)@' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r4634 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2028 40 58M5I64M = 1879 -271 CGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGNCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATAATGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAA )($&#("%'(($*$#%'"''+(*"*))*+)"+)$&"*'#(*((*+(+%(&!)+)#&&%*""+*+&##")&*+)%&*&)&(&+)(&$!('&*%")!&)*'#!($)##'%+*($(%#!!')&)#(#+(( AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:35C43C15G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4635 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12217 42 122M = 12093 -246 CGCNGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAA 9%*6;'G2D:7=07*%AE(38?.$:/.@.6E/3+:1:0F$6*G<%.;">.$G1F=8*,%>,:,?)/540;,,064@/%*@?FH0@1+5%@+21@B<%&,2""(#-G(+364$#3E((G),)= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4635 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12093 42 124M = 12217 246 CGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACNCGCTGG 9+%7:05244)#;'*/%1(@;E9@-,B$9@:9&9,0'43D*BBF2.>,<)F6"/B=E<$9&C'"-',0H/=?&!F#,0@!*48ED%2A>)(*E=;2>#&$("F)79H(911!!?,2$3D79:D77&03(=<@1C32:D#6!G1'3#$(*2+9%%:H9H'3-CE&148G$H8D:/3C7#H;'H/>/:!>($4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A104 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4637 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22227 42 131M = 22407 231 ATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTATCGGAAAATTTTACCTGGNTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGG ?/5#=@0H>1-G2E?7@'75*,6(C$DG9>/$+,()456?!9B:%!?8C#70$"<&B:?&;6F3#@*$!5&9CC/)!H16DB&B+?,;'EDD5G4,7.0H6*;B,:3:=#$(!37+5%' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C17T87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4637 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22407 42 51M = 22227 -231 GCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTN (*$&+(*+))#''%#'"+((++(*$*"&"$($&$#%%#**('*($%$!'+# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4638 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14367 42 50M = 14151 -266 AGGCCGACCGGCGGCTGCAGCTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTC F1H3:(1E=77-+*.E/&B:42$HGB0"-,F4B1B;&*":!07*B6B,0( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4638 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14151 42 69M = 14367 266 GCGCATCTGGCGCACGCCCGGCNATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAG 4(-#E290#;?*(G!H:F&88('0*,=0-;2("=0F>,7)8*?,>2:C,&@04E,!0;?C;$!@'&&)% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A0T17G46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4639 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40173 42 70M = 39978 -265 CCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGNCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAG "9B0")*+5"A'43#*3HGGCC0>(#A-FA#@4>GCD+B@/:5FG5=>&9!";+48/1(==(G@2?:#/G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4639 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39978 42 51M = 40173 265 NNTTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAA !*=2(=B';4&=&8$+(*2B+*10&:."0.)2-3>9(HE:!*/,D35F*2' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38199 40 45M5I59M = 38092 -211 AGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCNTGAAAAAGGGCATCANATTAAACCACACCTATN ,F"8+&$2>9"@$?F',HC2&1*B*3>>3;"B!?@<68(3;)AF-0-3?!,D*"B&!;!!8!(-7;+,><"%)E>6=''A*(-@#&)D(:EAAGG5&/@D.(0'#&)6. AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:70C15A16G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4640 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38092 40 40M = 38199 211 AAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGANCA /53G1++&<:A32=,9=307G*0*B0&5,GH,)5-C3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T2 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4641 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32559 42 108M = 32687 184 GCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGAT @;D##'14E741B$=(++6050/F)9/>D1+-GH5390)*)"'9AE*3?HBHG*8)*4',.+<#?2.28#"2"(<6$?.H>(=)+7FH@:=31-+B;-,E:A)'),H) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4641 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32687 42 56M = 32559 -184 CATCGCTNGNATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTNCCTGT >=6F"(8-%AG0?0#A"&6H4=3)<3%5A/0,=2)@;*<:&E&-GG5@#;>$86G1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G1C40T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4642 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45886 42 44M = 45886 0 TATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTNCAAAATT 2;,<7/7<"=,.53?8EG.%-@/!$0>6?)8-"-,7-C$0CH9# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G7 YT:Z:UP jpayne@0: r4642 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45886 0 * = 45886 0 NNNTNNACNNNANNCTANTNGATANNGGAGCCNNCNACTACNNNCNTNNN "$!!"!"$$!##!!$$#!!"#$"$"$$"!$#$"$""!$$#!""!$$#""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4643 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11131 42 54M = 11131 0 GCGGTGAGGCTCAGNTTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTG >55"2@;,0G8;8B@/?<<5.;&>3#<#5&6/HC57$$G>(>B"C,+,6-,"F@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A39 YT:Z:UP jpayne@0: r4643 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11131 0 * = 11131 0 GNCCCCCGNNNNNTNAGACNCTTTNATGGCTNNGTGNNANCNNGNCTGCAANNNNNCNGCTTCNTCNTCNCNNNGCANAAACCNNNNCCCTTCCNNNATTNNNNCNCCGGTNNNGTNGNGNTANTTGCNTACNNTCNNGNNANNCNCTGTGNNNGGNAGTNTGGTCANNNTCTGNNAAGNNNGNGCNACNTCNNCNACCNNNCNGCAGCANN #!"!$$!#$!$$!""#""$#"#"$!"$"$"!##"$$#!!$$!"$!$$$$$$$"!"!!!#$$#!$#$!""!"!#""$!!$$$$"$!##"!$#$$#!"$#"#"!""$$#$#!"!!$"#$$!"""###"$$""##$"$"!!!$$!"#$$#$#!!###$$#"#!!$$#$"$"#!!"$#"!$"$!#!#"$$"$!"""!"$"###"!##"$##$##!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9129 42 77M = 8953 -253 TATCTCGATGATGAAGATGCNGACNGGACTGCGACCGGNCAGGGGCGGAANTCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCT -/2B.3?+:&3-C??G$)7'@85?H#0>%2C,G:B"1@HF!F=;>H(@<%0/!,>>FBG>(735?57(:F';1C0-D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20A3T13G7A3A26 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4644 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8953 42 73M1D102M = 9129 253 CTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACNCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATAACGACAGC F:#A5,A@3'G#(6("9.+G-E3@9A%F:6DF>,#D<366!/;$-25$FH$="-8*4%&7*D&#;C!F9#5:@=9842*,?1CB@90%1,%4A6--%+'@2A@DB#23CH;<2-'G1=E08C-3$$0=@0/"#?E#64"!#+!'3@'%E85'=1=0+13!.:&@=0*-&=('G3- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:73^T9G83G8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4645 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42809 42 112M = 42921 316 CCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCA 94%8<<"<<$D8#.49*&60+/!AH:A((%&?&EH"<*8#8)96.$H7:E0:7'/6>%7DF)H28,".F>H<0"7$CD0';*E.2<>HG:(+:%)*H2?5208@+'3:97+3G>@AH@23+C&@21@<=,- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A2A19 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4647 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26336 42 224M = 26273 -287 GTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTGTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCGCCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAG FCB5.F<5>2D+*5E>-###,G2,&7$:E&5-G;2E>6,.4>9*@*#;01=F..B"C;&$1AA$';*0'1F5<=5",5(=G4$;?7;5A;?.)#DE"&B2GEGC&,<69A45)*=G(C8&)A$0-H8F?&0D@6B*)E@%AG:BE%H+E8))H;E"*':<%>?ECG1;C<>D6,A;(:+/?(G'$75A29$24C:/-GE63'$'%3&1))' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T35 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4648 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23054 42 104M = 22903 -255 CAATTGGATGTAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAGGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCA B:BE?>-8#):<./5.8'>H#),%25GG=7F4%*?0+0/2)<0>=>74%<#+6$+.-1:H&:0:.2$%#8%5(7;$,*8&.GD*H8=0F6?@:::%#0;!%1%" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G53A38T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21169 24 41M = 20936 -274 GGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAAT 7!,<6,=@H"DA+8>A1*--A.5@0;F&25(8=;87;$A3$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20936 24 11M4D51M = 21169 274 ATTGCAGATGTGACGCGTCACCTNACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCNC ,650?E>#!(HB@:)&C:(9AE5EDAG+H=#0',8*$>GB>0>7C7%*">><9.H-C%)3H$ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:11^TATC12G36T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7411 42 181M = 7314 -278 GCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGA 2*=*0#(4!0&*7-B0??0B8=86B<.6C-%@=(A<)2)2#2B)5C@6G6$*DCDA,7D?/33E!'0$5:B4''@G!1*8%.#$.&=$C5<."2$,6?%, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:181 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4650 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7314 42 97M = 7411 278 AAGNGNNGCTTNTNGNNANNGATGAAACTGCCNGTCAGGANACCCNTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGNCATGAAAATGAGNTGGGATCAGC ##&))&"$)*"%!'#$%*!"')*)$+%&!'"+#($(#!*)"&%$(!&+%((&')!(#!"!&($*"%!"')!%"&!")$'%)*%*&%"""+"$%#$#& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:3A1G0A4G0A0T1A0C1C0G12G7C4C27A12G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4651 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 583 42 238M2I87M = 908 472 GCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGANCTGGAAAACCGACATGTTGATNTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTNCGGCATTTTANCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAANCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAANACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAG 'D;-285@/+E%")@;E;DG&+!67'!"8B9H8(0?5*;/1'B9"A05-!1#6?@2>/'@(<:.GEB-F4/7;=+G&A".*4')D9,AH1@1G:8./78D=29*DE5?3A?2-FG*2A,#?4?,"70/%+#?"3:C2H;G073$F";5B,EDG#F7.C.A&6"'+53,B"#,%-+$)"(!@<,;)*FBE8;:2FAB&")B3)674;#-;@;8C,G719*1HH7E3:G-105<;03D<*A.C>%)4(F2%-H9A04AB!='%;5H>70'!9+'D034GA5%C4#1$9FBF&EC@+,E8?;$;/0A:AC$@8773C<$61&1=-=C87< AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:33A21T104G9G0T85T27C39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4651 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 908 42 147M = 583 -472 CGACTACATCCGTGAGGNGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGNACTTTAT D4@&1#<>>+?/H88654H*$7:8?:D#/F)B0E:AE$*4C'>G-&<""$GG8<94+,&6HD1-=9-4=18=A3."%!'<>1A'71">.3?5C0#;A#9+3A!/6E'=7,*&DF<$D43-)@("2"@-.B'*H.;#?B0H:=7,;<6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T121A7 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4652 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27264 42 43M = 27107 -200 GTACTANTAANCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTT +='%;=#-BE*1+(:*?.8C:B'*70G!&).25=,B@#+'A;F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A3G32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4652 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27107 42 84M = 27264 200 ATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCAGGGTGCACTGTNTATACCAA +:0C4)++D'7&F$:+,>A$"'/@G7;C=%18E6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64T10T8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4653 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23932 42 143M = 23844 -231 TTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTT E%BH**7=!6(.1&(7+!;7.""%!++8F!F&A4/G(%-(?<3D.6#&*34*=*2&!"?;%27!?B?A'4,?%B/5F67.>60BFB:28)@B0&B:3*D*)!!92<<5GB''*C4:>#@$C10DE!1F3AD7-0F>A05A+FF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:143 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4653 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23844 42 63M = 23932 231 AAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGG =7-ACD&:@)4>5F971%:(2!0,7B9,#//32C%H"1"B7D.H:D<;F+C7+ABA")"F$83 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4654 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25202 42 125M = 25202 0 TGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTA FC9B)0;A5H9?C/'#H))F/C%''6G+1G)H-(4!7)CF#?(<9&1F"&!6!510H6,"*?"D"B+"+?+*@$9(F/70,(D.3A4'=2E94"G)1B,=>6B7E.44-E)@?44/<DHD>!-5'C3H9,5G-E094B.+,*FC<7!&4F6HG8#9B&6EDB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G41C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4657 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34783 40 53M = 35004 274 TAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTNTGTGCGCAGACCTTAAT -%"CC;3'B/2*2/5(=B193F$HB%2E2627EA-"=>>%A!5FC"0%.;!-( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A5T9C7 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4657 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35004 40 41M1D11M = 34783 -274 ATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATN A4#@13#$!C'.*7<)-67D.C&)D,CFB!*+!1G=0:&7937521(&4F%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:41^G10T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4658 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1193 42 81M = 1013 -261 TAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTCCTGCTTTTGATGATGATATTGA +E4#+"@0CGB+F1):*.F>0H+8A:!B@3F)F6"+0C2H)1@*.#(:7,DB/("?/1*;0+,-9"%E1*9,(=)54*DA* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4658 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1013 42 58M = 1193 261 CCTTATCTGGTTGCNGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAG <%C=GFA(A.;"C4E.<@"6)+E63G>?"+&+0@8%CA2A:#0H9.+.@"=3>*@+?/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4659 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10527 42 183M = 10334 -376 CAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAANCAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAG BD?B86/!196>'/7/6,>D3A46$D&G328*@&5#%+)F--$671695>/)0&>A;%6)#0F4!"%2'&8A)#3>6+/B>#1(;5-G?@6E!8%"(.C@BC3&6$%&?);9:A&1:/5#64:5=G98>8F4F56".@,%A,*25-)%%6$4,;>:2998()/!#1)3.D1*-A.)7"&">;C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132A50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4659 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10334 42 193M = 10527 376 CTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTNAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGNAGGGATCG .*HD!)E).0<8?9?&G+9):@F/F=$,7E3)3(+$-@,9&8.),:,$B$<%,%F=(27H(G>8)=B7<:;6>GD/E8AA=&FF43%$)0,'8B7=',9*1&F8*.32*8''6@HH1<%#46A80;9F4;4'(A.4*D;'.F.'F:!.H2.;G13/E*/((F%?$5(-#2+-,"77>/7)E#"H=EG%#A+*/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G138A8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4660 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27630 42 80M = 27737 204 CATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTNATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTT 0!)3",C@E=":!?==(<490B4!+>5$G$"(@C--8!6F8>:0CFAG2/D:E,1/@"(E!2'AC727((.H=@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4660 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27737 42 97M = 27630 -204 AAGTTGGCATTATAANAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATNAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCC H3>5#(:>+.H+C6.427C!A$.$=*>)'A"H&?$=',H>'65,2=!21'!"C=H*12E'.H.HG-*#H.G*#*H28<2D9&5=H497=H:5AA2A5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15A37A4C38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4661 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34781 42 43M = 34914 190 AGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGC 6#.-)5',G>,:(-E6+#,A=!+H'!(#B*F7;2;#?,,(C./ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4661 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34914 42 57M = 34781 -190 ACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGG .:4=&(F/-C=8H1"H#:609'4BE?9ADH28?1=94E<)20*#04C/)2*E*6D#A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4662 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24378 42 76M = 24507 229 ACTGTTGCCANTGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCNTCCTCATATA @3@>&H:F;>.C>H#.4$HE2+'CH!38#C;3@140./A.D6&-F!B%)+0&%:9/+F2A9H)8;.-C*E-?D@31 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A54C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4662 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24507 42 100M = 24378 -229 TTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCA 8?"+(B%6(%3("%;.G?29!(5HA6$#;H?:6F=-:>H5+;@8CH0E7C!H&'6132'$4BF#'6/E9D>B'*7$< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4663 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45233 42 323M = 45556 458 AAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTAGNGACCTTCTCGACTTCGCCNGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCNTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAANCGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGNGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACT 5&DEB?)74.F9GA3;H/"A'3!8D67CA)5D.=6>!4-F07=/B'?-<1<8'8>/2+&$7<$@D&;F-0!F/!,=;H6&=*@1A%G78+91E$&61@3(15+E5C$9@GHB(=ED-62$<6D/)?'C%<=3:4-0?2@E4GE3GA-H'"0:+?;3;G8C/8+.?813@A,"5"F?EC+;H>,3>+,3!87$483':()69+D-(A,+<+%B0312F5G.4.&<('DD@@*,HE27%C,76'-*$+H'8@<$G&9(12#!A6(163+,(*#8@5/3#A%)B(3%2+3$"+-$C0.1-B=/.%)F/%/'#6*@9!!4<4(-A-> AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:127C1T18G32G46A59C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4663 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45556 42 135M = 45233 -458 GATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAANCAACAGGCGCCGGACGC )F1F259"!=*"72H"73G,**=6,,/13/F=;27)>95/=#C4+HFB5)H/:EG132%%%G-74%""%H;AG#/3B=G,"FC.98EA<%4D*4%<*&/H- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117T17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4664 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4794 42 149M = 4943 403 NTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGNGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACTTAAAACCGGTATGGGCGCTTGTCACCGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCC #+"'"+!'($!#"+"+*+##)'%'*$*!%!&$%&''%"*!+('$+(+*%$%'(*$)%"*)*+"*)*'(#+$"")#'(!%#!"'"!%!%(($*+*$)!#)&#$&"('%&!&*$&&#&+++!+&*#"&!#('!)*+($)"*&)"'%&''#! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T51C27A21C2A43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4664 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4943 42 254M = 4794 -403 TCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGTTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGGATGT !"+)%+$(#!#$!*&(%#))%"%(&+&''!!))'#%!"#**%!*&#!"*(!)(**(!"#&%)'#!+)')!*"(#"%*''$(*%#!()#$#)&&%&!$*&*(#"#(!"+*(#'"")$"##"**%'&'+*)')&&)*%&'"%%$($$("(*%#**+()#"+))$('%)"'+)$+%'(!%%()'#'#&+$+'$!%"+(*($"#'+*)!&)'#'#("$'$)+%$(!(#&*')$'&(")''#(*)*"*&(&+#(!$($) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34G20C193C1G2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4665 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7040 42 343M = 7383 442 CCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCAGCGATCCGGCTCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCGTGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGANCAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGANGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTNCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGA ;,@?$%$9%:>F07A.H?#10D9)'1!"FD"A3,A'5;"C2$&6;0!0A/!/05=/A71C;853+)G;&-A/,*60*';.4"2EG1<#%.A/E<$&/:@#4H!2(*+>E/-#?.-D6$AD&A6C-+<-83:*<.3(/,C/D'G#6$C*H'&D./;;C5BCE%8)@<+90>)!@-A>!+")-6F$9%FE+-E(CG(!??8E;$8/-"8D>/24D#G>5FF(A,=;5."6.*7*6&==B>"!1C>=&;H=.<0"#>-,/@!60D==1'=%A?29EGF&>%1G2=7)F@!53&:5*=<96/H.$@&.C0C<#)##/B$!4@F(720@@E=!0<1;H#4E!)5.+@-2F$$25#370%&7$'&H8A3@4H!(?>;1??4"/?HG#5?$H>86!HD'0'/%'?!6#/$B70,"?A9>F;(B*,")@.*6@*:"&,/90B?D@GF7D288("D07+,D$)-"D>)4*?A@9:?DG<.GC&?./"4=E=7:42E1>,0C+A$?>/4:2:4-@25H:-&1E;B6C86<:#E;/!268!&B?)?=?E AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:15C15^G65T11G24C17T39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4666 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34913 42 56M = 35014 293 AACTNCTCCCCGNTGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACT )(**%++)*$*&)&$"'$"'&)&$#%%'%#%%!""+)"$$&"!(((*!%!*!"($+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T0T1T4A43 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4667 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 755 42 49M = 755 0 CCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTT F$&;5-7"30:#2A'537,>09)FCE%811%&@3&%&F!&%EF1(*"79 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YT:Z:UP jpayne@0: r4667 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 755 0 * = 755 0 TNNCNTGCGNNANANNTNCNCTCTGTTNNTNNNANNGGNGNNGGGNNNTCNNAANTATNCTTTCNNGNNATCTGNNNCNATNAGCGNCAGNNGCGANNCGCCNNNCCNGNATGCNNNNGTNNTANCTAGACATNNNGNNTNTGNTNNNNNNGNNATNNNANGGACTGTGNNCNCCNNT $!"#$#$#""!"#"!!"!!!!"$#!"#!#!"#!""!#$$$$!"$!""$#"!"!#!#!$#"##$#!##$"$!!"$!""$""$#""#$$$$$"##$!"!""#""!#!###"!###"!!$"!$$!#!!!$#!!$$!!#$"!#$!!##!""""$!$$$"!#!"$!!$#""$"$!"$$##!$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14922 42 49M = 15030 207 GTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGG *>-)741*@$":<-@"87-)A>+-E83>!?B'5->A.<=48/!4--;=F>>14C5::,G3*785.+F8+D=33;D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4670 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29497 42 107M = 29606 191 CTTATAAACCTTCATGGAATATTTGNANGCNGACTCTATATCTATACCTCCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACA 6%C0!1E1=:BG>10D7G':35,2"0GC>=G="<.(@6->;F,%'F5*(>HFA3*30?/:;=#G/?GA+9%2A,H0;D;(&A0F!*#@;H%HH(*&=*'D3!+=;>&8GE@,327) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T49 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4672 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37164 42 207M = 37058 -313 TAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTAAAGGT F?8@%3$!(;&BG0&AE!#<7D1.+->6D96%2A6!"*C5+H(!E>'C?C4@*6GG"E!$B;>",;%H1ACC*,1<<-&@>A;:A"'"C8F!(./#*"&3?D7FDC#40'6*,"(AD6190.,@7.?>BC:+$#*3:)D!?:'3#977D(()EG#H0FFHD8"2#2BH@40<)6?&%;"96@@<6BA AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G156G5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4673 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9855 42 58M = 9913 346 GTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACC +'*")#$#&)()'*+&$')&)!%+)+!+'&#$*'"%)#$"'*"+)'!+#*'*#)#(%' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4673 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9913 42 288M = 9855 -346 ATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGNAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGCANGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACANAAGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGGTGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATNCTTGCCGGGATGTC <"<20+0>H/84-$<$,+A#C'@&8=CG,4:)55B9,1<550/%07)$*F20*:&DG59C&8CE=@G5-1080#G222$/'*:E@>9D#5+@88HB-),.01$":.2<-4A576C*:2F0@E3*0@!$3!F';7G/=(7@@634-!=!:GA?%2E=86'6@@%@>HGB$A*5#"BA@@*G,;F-:$,>:#:#"/9BB'DEE-;>=(#@2H?*7 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:99A28T1T33G1G80A25G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4674 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22030 42 56M = 22268 281 GGNACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCT 5E"/(%FB>.F?;F9?*&=6&A/A*()D>7!<==@5*+$'!'6?+"!H1)@85H"7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4674 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22268 42 43M = 22030 -281 GGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGT :%8E35:;$'<7>';962)$$<20ACC-!(+9:33%9=+3#<$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4675 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 408 42 68M = 160 -316 GCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGAN 6%G;55.*B7/;)-08/42$.C/0!*E*&+:G7)E4C/$G/,/8$G+E(7/,A;.+34F88H<>%=H" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4675 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 160 42 248M = 408 316 CCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACANTGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCCTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCANGCCA 9D.A(+%.%4)06E>&/&.;#4#*3+;3-:>!8@>!95E*2?D(!/2=0>4-(B/E&*'3,6A7*@;0F975#DE>(#"8"<)D!#A7?=/921%7EA!)C,*6?=C2A=A*#$)?&5!2$@&,**A.+@1=4*29B*+9-9:118<>>8E&F.>FF%E@9#G46G&E:D( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A83G127G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27323 42 138M = 27185 -276 TCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGT 914;3.&:#4$$:'H@!@%+E5*D'"3G:DD<>$*?#$*!3ABG7*5E8BA%=;/E?E?7-BD:<>!5CD8C1.@198ACD8:>$%=-&CB3)DF6)>@C(A!1C"+%41H&4-=H:G?@)/HAD*C4'((C%8$@#3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27185 42 138M = 27323 276 TACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTANCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACT <5-@-E'3%#)$())-(H,;E7+9.GH'H*.)&%;>"H;"B:13E34,:%@8<+7B=7(%+&8D)>322;!((0#*218&:95?$D:E"43<"@$:%-*;,4./F294!3#F9(*::5?,+,=%/<5?+H3*=,D&>* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4677 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9856 42 79M = 9989 267 TGGAAGACGCNATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATANCCNTCCGCAGAAGACGCAGATGCC 0DEGB%03%7H3($0,@1%5E7'13G5D<#.#'2/*A=A8(!'6:$/F"4@9.()=;E/E25$,-FAF=E&4-.&87;/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C43A2A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4677 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9989 42 134M = 9856 -267 CACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGA 7'9/EG;136H*A+5H6.8.$?EF3EEF-4@&A#7:=G+$9BHGC68BF%4A<(3C'?9%/+#%;%8,G:9!20%"&(>=D+H:#.=/$83$#<(#AFE-*D)#@)1G!F:3(6>"HB/%@0/1(%?!-C;64" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39180 42 79M = 39030 -229 ATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGGGGCAGCAAGTGGGGGACA H3",A!=F"7D48CC&<<5F7'?5F*9D96C>5%=9A3;=-9G79+0:;?/2=%"&<$>1HF AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C11G34A37 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4679 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13892 42 85M3D149M = 13807 -322 CGACGGAAACGGATGGCGCTGNTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAANGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCTCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCGTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAG +H+:#/+=4B.B)"5HF;%#AG:G(A6)A+)$F%@'>+GDGE,;(=-@1=DF:B0+9&;6=.."&G01&GF3-?5:EG8+>,6@.1F0C5#@2C8B-:>!:CE+3635H)8B7B>.6!F@*/FD40?.A*A+$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:21T63^TTA54G37G25T29A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4680 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5473 42 40M = 5311 -202 AGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTC 1%1=B2@5-"GG*78=:/0&98*F@A!")#!F9+F/F(D3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4680 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5311 42 74M = 5473 202 TGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTT $A2?4/)AA#B?>EG17;/;!G-&'9-A%+'CC,@<5'69@(>,327,60-/?>)4A%!")AC=E&"?)-18F( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4681 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23675 42 92M = 23675 0 AATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTG C5)/2.B948<"'$,E+1;:=),0F1@DFCHE/E%3?==:5>9)(=1.!9$>6&G@D-(2D585B'>)E7D5=C7$/H5-A71B@A-%.9,3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YT:Z:UP jpayne@0: r4681 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23675 0 * = 23675 0 GNNANNGNCCNATNNCTNNANGCTNNCNNCNNNAACGNCNNGAGNAAGGANTTNCNTCNNNCNGCNCTCANNGTNANNACNNTCNNTNNNNNNNA "!"!#!#"!!!$"!$!""!"!###!#!!$#!"#!##"#"!""#"!"$#"$!"!#"!""""##!$$##!#"!$#!!$"!#""#$#!"$!!!$!"!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4682 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46991 42 83M = 47145 218 GCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAA A*)#($*,3$=?3A,%$-0,0(CF1#04=@FDE-H33;B>H>-8;6#=@,:79@#$:2B$6/F0?8/#'":E$(,:1";"@8)F;1.&!<+EH%1%8BC8177B5#EA*#"!;A,CD=3;(7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4683 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29019 42 136M = 29168 286 TGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCNAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTNTTCAATTCGA C&H=-#92G91;D/.4(C8,&,2''@4C-%E,D1>H>/==/:,E4+48&)7@+H"H2D;5B";B*1*C*10$$$?+%@H'31;'8-@G3)27696@8-=&98@'4E0929!7!/1>>@"D2+D8*H532<;!2+.F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52A72C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4683 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29168 42 137M = 29019 -286 CTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGGAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGNTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACA 99?HB,AE"%1DFC",&D5D)A(H8'+5'0#=B<:5"##?;BH/!A>E#+&40+?-:E0A'5>42=/>=7018B#A7/'%++21B8.(%#1?%;89;HEGA/2*B'%#@,*A+$A!>8.&8$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38T43C54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4684 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38116 40 85M = 38204 179 TATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAG 3B5;2233G'@42-/.&%1@:H67#;%"'<'=&(%2C>+=F34"%4,&?56&/.(B<)#4/852,)/.*AA)3)0A(G2%1,;;2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T35 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4684 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38204 40 40M5I51M = 38116 -179 TAAAGCCCTTCCCGAGTAACATAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCNAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAANCNN #"$)$+"##"'$%%*&""!)'#)'#+)')(%"'$$!!"&'&*#($+")+(*+#$**"*+"&!!((+'(+*(*%$+'&"%*+"+$$!&$!&+#&'!$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:21A38C26A1C0A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4685 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31183 42 168M = 31044 -307 GATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACTGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACNAAAGTGATTGCGCCTACCCGGANATTATCGTGAGGATGCGTNA "!#*')"''$!'!*)&#*%*!(%#%+*"'+!*"($%'&)()*(+#&&*&"%+#')+!!$$"++*+*$''"(#$'(#$%'"#*')+)'*$'"*$(*'+*++(+"!*'%!%+(&(%((!+##$!'!!%&)!%"##+')((!"(%&!#**("+**!'$*%#)"'!+((*"( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:79A44G22T18C1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4685 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31044 42 55M = 31183 307 CATCATTTCCCGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTCACGTATTAAATTCTTCGTCT 09!3D:49*9=DG76/94,ED'<*-8C07.;?(F*EG5,)87:@H7%H>!)<5.* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A23A6G13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4686 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18441 42 161M = 18602 364 TGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCC <0>'CB&>$E8B$,G,'<522$5H?BD"05)<.4!E0,:(0CHE=2"D,H$&F-%%E<.7=9!'7+F&FA)45+5!G!:'81/.<:5?E+/8=!40338B'.!7:)@')G0C2&A+4;,$*A3.7H:%E%5G0E<"7#(=,;C9:34,8=2,0ED"#)A=! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4686 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18602 42 203M = 18441 -364 AGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACNTTCACGCTTACG D:9?:B$5-(D-H<..$G;:,4%:.;,-#-9::$:8)F"2&7-)=/D,:88FHH7E230313'&";AD'+*?).3!>6*6'4$;:)26G(E+8:C';%+2B%DA!8E1@:74H9E&H3;2D7/A3%-D@6%5B1@4."+,0%6C!=,3/='G#&F4%�!=,.'*3(E4E$:#"7G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:190G12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4687 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44591 42 56M = 44276 -371 ATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCG =6#4/46?4*5@(>?G<(';;6C*&DA&*"A'9(E8,CF4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4687 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44276 42 315M = 44591 371 GCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGNCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAANTTGGGTAAATTTGACTCAACG H3HA:/#8",=%()%%*%1=<2/;&C?H+G70,.+*5!$(+G)-5(3.*"6';F>&F-,'!+=C'.=!:!E:?(F,@69-%0%)G<.6%F;((3-&01',2=5#@!F/EH:&$>G9F7),G*;C&D'E$6/=52*G(G@<=0-<).D!)+C36/+G:-F44C!-+#!A.@F2?9,)+'6HE(F$48)='010)),>C7)<*A4>2!)-93*F#///!45A>*?H7A)5$4:$!C?@A4&31>(&*G;,A3=AC==7529:H2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T264A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4688 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7894 42 48M = 7942 332 CCGAATGATCGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCG 5B8-4.71@%H8*(#4%9=1H9-:=;0=9$!8<)H4FH7>38F/G+'= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G5G38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4688 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7942 42 284M = 7894 -332 CCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGAGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACNGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAANAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATC 1-=%-),:%*:/:0-=-B)E5*;5/89FE<(70D:@>B2*DHB/@67E0"G%3>DG.,%61%*5';A)2G'2-6&14'!'>B(F?CGD,"7+C-:/$*1,,B<*<">(B6H!',!5H7$'GH&&1&D;!?E'(>0BB0G(FF!>G#788BA$D199E$=!%@.BBG!-E'?%&-"-*"+C$B*=8;#C0//7($A-/.$4"!?@87C7D&,:C.0*2+#%=7?&,:8)<-1?%$)5( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G61G143A48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4689 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36665 42 69M = 36472 -262 ATGCATATGCATANCATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTNTANCCA (+"$%%%*%&(!%"+(!+&%$$'&$#$*%$+'"#!%+''$*+$"!##'$(&)&$%+$(&($%+&!##$$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13A48C1C0C0A1T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4689 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36472 42 87M = 36665 262 CTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATNCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCA F30A>8"F(68B-?;+*8A$/8:?#?%E<"<%(=-)H!7=C;F@=DB"9*-2.=!>A+(H@C#7$87&F*"/!#+.DF2F?@$H6*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C32 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3771 42 14M2I56M = 3644 -197 TGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCG 15H=.;,?;",?(),.%'1!(;D47/:FEH484(%#,"GA;D56-!+)&)7>71F"C/;2H/E732+G:-5- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3644 42 94M = 3771 197 AGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCA .$./!D=61F%,)0:D&@1,8>%5C'6D2$,H-+),?3HF$&(@*$/#87!.7*:?+0=1H0B;#9CA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T81 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4691 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24564 42 70M = 24394 -240 TTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTA -?;))*!#:)B.$?,6&H!)$1*)8&D>&*,7:FA5E;1(##!7..*<.G8+>C7"!!.5A7D!B.G96:-7"):?$--#21CC6(223F@&@=(66G7)1B%04H)$0>5,A%*?0B&7?B50"%!.AD'+96'95C6("1!%/@35F9:@1>5?)D-.:%B#"'2/51&!%.%+9#/6;7489%*&.EA/.G2?F2&;;6B-,'99!083*@/),A+:2C%,/+&5)=DD'B(*>98$C@/%E9F>G"&52C-@(!C.@>/68-:7F@2#.*G(=G8D9$9/")4-,%C..!<'#%.H;66,'A.5,D7&-9"- AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:14 MD:Z:42C115G12G8^T34A2^ACCCGA29A23G99T4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4692 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17884 42 348M = 17502 -730 ACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATCCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAAC H40;)(=#'G#78!B)+G;<6/=2#6>3G1:>$,D)5F?-8%#""2D32C0'',7=,,$)(4='6,;5FD&9CC:36&>(C5,75!1+C2&1!:+C96B#-FH.'B:;21G!'-(??185;2-8&?.49$08C6&1"*-H35#>/*&G?'17=&/B'185>A2:>"#(F8C=-#-<<(5+4+H5E$-H#"C:,DF40A7:@$#(<(-9"-!G3&!4!B7.-E+<#-9,!C(0?9<46--/!&));3?#2)%-/=::-=)"*:=<181.!H'+39"@(F=*!GE4D+"0'#C)%H&.'GH AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G296 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r4693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13742 42 235M3D23M = 14003 316 GGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGNCGCTGGCGCATTGANCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACNGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATG 4$G<,,A<$:F3F<5*)?$;BE>+E4)1+-.3BD)/:CHH(#93DF@A<$$;%A4%1G5;>"0HG1E<;@-=?D>H/@25;6<:@27=:4G6D6?##F6F#!0%4#0.CG#*>).15H-1/4AA:>G&(?:2>=:H2:=;20=1+/G5-%+(C8GF*&FD6;'26C1#8716-C';>:@);<1-7'+4E'3/G+.-$7?CEG,810*,=":FF0>C-6F/F,F#92-04G9(88-,-*7/*C='8"'"@ECE&/F!>=7=<<"-!)@&9(1C*"8;86H%GA-@)6HG:2#/&='(&FB4<%D#H=684@B&B*HB!&D6(*?/9/<$HE!6F<'>!)DF.@A<;0'@&0;:0-&368?E>#>&'BHF;+D0<5G=5% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102G25C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4695 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14582 42 146M = 14363 -365 AATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCNGCTGCA H3H=';??;;D):#=-57+-*/5@%&83((C:D@/8&F%7':#/@,+A/G)<)6H@75:6"#B:45G0C;+,5#=C.$:B(H:$=*E=5DE8<(46E?=G3A&714"'@10C4?E5%#"5538B0A!!.F4;BF?H(@5=,<4!*1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:139T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4695 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14363 42 219M = 14582 365 AGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGNTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAG 9@!D-!'4<./=@@6-$G<5&?#)#=./+>+C4@H9/FD*/<,1-)E%4%B@(,>!2&=E%6,02;-2%('>4FGD"&-*./@C36;'(A5&=+-1H>"-%2:%*%F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T143 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4696 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44835 42 64M = 44956 199 CNGGTTAGGCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAANCAGAACCGGATCA '&2-E429D*>7&0A.G#?5*!9F.5)<87%8&D+:'$D9DH!(A;$0F>==771E'+3GC#%@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C11A52 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4697 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17290 42 42M = 17186 -146 GAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAG *2/DE%8C,4B719)E1(=8/%&9@001B7B:.3B@EG(:>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4697 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17186 42 41M = 17290 146 TGAAGCNGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTG 8<',&45&?)E))3+<$<*AG0A=)*8G%31<:&3"B3;2& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4698 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27530 42 320M = 27334 -516 TTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCNCTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATNGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTANGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTANCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGACTTCAACTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGT :#2G'F74C=8/055)<'3.,;/=+43.:=9>!3-:?,#-*H(,7.)8'=!,@'.!5H46G%!$+,!1$"A?,3?=CF0C4>:&,BD539*=B&06&6/AB%>@*/54@@';/F;*>5(4F/5,9=EEH+!7C&0=#?!@)"6'"%E@@?B2&8;;=8+4+G+G<+@,/)H&4+@3G;33%B4C4,9="6%&=)!"#,1),.#,6("G6%2$H39.>>7EF17"+6A'$?A,3>=./<%6>34G!9(>,<3$?!.D5;*142)#EEC/:78?<>3#B';DG>-%B:1(DC!*9C=#(0G5>=GA%38+H5G7!&,&A!D&?E/58!!'1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A61A11T25T87 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4699 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28031 42 137M = 28267 287 TGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTNCATTGATATTCCGAGAGCNTCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTT :=?C+)<:)H79;6C#!EHB+>=9<+6+2B,A?F322F=0>4#A<<6/A)<6-5%4;+;$(2,-:H-B$;F"E".D:A-C6.'"2F-&6F!4=@?:'5?-$%8>9D956:9C'CH%807(G>#"2G#/5G<.D38<. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86T18A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28267 42 51M = 28031 -287 CCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGAT .&5@!:6+A;8%8'2=75&HB=8*?F=A3?H<6%4&%3/C,G2)4&@@1)= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4700 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23109 42 266M = 23375 362 CTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTNGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTCATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTNGCTNCATNAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTA B5-%/%>+*>#,;0$,5:H&:"*740=?.D'/5A$=83FB72>(@7617F;A:'5<$;943C8+F5G4?>;D5A-C8$E/9(27?)#<'89@&.@77+5>00F2))3%-$F!$#&)&69-10B"8$C7)8D:C=$1,GE%,H./B7F)'48D#H"+;=8#32;E:2+/4AG@0=):H@,<*&(H9!<*"4G0:4@7(C:+6D4:0*".954*8G950@F'#%,6D&)=-H)C=:06);:G?FFAB:G'C;D:"?:3<"4?5*7:95 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:27G32G134G3T3C49T12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4700 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23375 42 96M = 23109 -362 TGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACTTTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTC $($'+("!&*&%&$##+(!&%%"'&*&&$$#*!)*#&)&*"$"!*(($'!$+)*$%$!$#*#)(#%&*)+!)$)$#%+!$$)+!'*('+++)+)#+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A69 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4701 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19696 42 108M = 19887 233 CGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGATAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGNTACAGCATGN @G(.H@HA#GE:5%1%B.6GA>9+GA>'(%.!5!4!-88-3D->/;%/A8>7-+#92H0$BA#7<0D.*EE69G(6.5.51(B@:2*!>9+252/:$8?&8?FG/-4- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27A69T9G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4701 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19887 42 42M = 19696 -233 GATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATG ,=;6DD0F,(F!%@,'F887:E?0@="@=>#;>&B$4%C4,( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4702 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8525 42 60M = 8661 199 NCATCAACTGAGGATGNTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTG *+"&*'!"$'%'*#$"%&#*"&"(*"*$*+'()!)'*!&()'+##(%!+)&+*$*)!($% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G15G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4702 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8661 42 63M = 8525 -199 CGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCT *1='H<7#5?F:2;<45*@7?*?+/4/?.)B6&:@60B&0,B5(%<0-%$7%7:E%-,D1H?A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4703 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 290 42 152M = 473 223 GGNAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTA #)!<=**@1@77!.7:!!-A8&,!+<9&D.D13G*>#;1FD8:->#""D?527567#E=)+#84AA0'"/!C68B@7"'-<-:B=/@1/:F6.E-,>573 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C110G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4703 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 473 42 40M = 290 -223 GACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAG H0B8C(AB8@.>!*+E80"E-$?5$;48+&H(D<0@@64= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4704 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33230 42 176M = 33406 549 CATTTTTTATAAGCGTCGANGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGNATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTAGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTT 230)9515>4&*A5F#?$224?./A(%G?3?83H9>6$HEB:@?-%7=FH'DH.2"@D$!3=!E,*<225E()E?F2$H9$3)'D8F:!5@C)!-A3HE@#GD%$/,!6;@)AD.!)A#;,'0@7<5':-C$G&E@/A6E"H@E"($7&H&3,<=.14555*H;9G59 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C46A39G69 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4704 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33406 42 373M = 33230 -549 CAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCNCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGNATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGGN )=+H*1FE/!E#+//+*-@<7BB2/5;#B)F#53!94!D@$F?15!A.>5)8%)+5AC7A;B2#(;/:?0)+,0E8;2"0>B3'<)$&D4,>-?.3$/)@9631;,H",4:'D>.)=$?):7DE%*=BEH(D%0!8CG-#6':%H?":;B&%+?B910D-CB7%%>=:E"-)84:%A'G0:8D&?4HB)7.;E>&-HA1499'E=C5F+-C+='5G9:,;#86+-%0-,A(.4;-62')1565,"4#0.<+DH?>+:.:"5E1BE9F494<52>:AG((H*2*-&D=5H@#?>AEH?7"91;$=@"22!/=+"B,/?@#6C## AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:185T19G119C45T0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18783 42 67M = 18570 -280 GATCCTGACGTTCACGCTTACGNCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGCTTGCCAGC ?'+=&99F65?+"43-,9;9/:CH+A4@$((A>8?47%$5B*)/%CB<'FC-.8+AA*?,8>-D/50 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T35T8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4705 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18570 42 116M = 18783 280 CACCGTGACCGATGACCATNCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGNAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAG E?6$5:%C"/3C,;!95%6CE:-.5G76>"ADC!!/.E-24E=F?;-<,*G"&F3#*<4=D.?A".='+).:$D**?2!#;<>#CFB>"99:-$1(G+F*?+6AF.G76,.3=!-C8:;9DGC47#??()25<(0<#CC>1=HHCG**D/;<5F6,==FB>D4?=F7-1"D)38!>A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9559 42 119M = 9414 -264 AAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATT %:H.4#/,&!9"&@5A9F7#H!E;<:,$).88*&++50?+7(9C7C257CE+8:'%><5/)*21,F?<<+202@1@+!*1&A.0,'3%9)@EEB<':CHB08$@<4+=+/40=H<%)0C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39940 42 60M = 39732 -268 TGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGT :@@@+$5D5B>F3$E#%-)C2=1)&$&;F,7):)B$E<%1(-)6>%+BC$6%B$@&H:C( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4707 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39732 42 94M = 39940 268 TTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGANCACCACGA &2C@?<=5/H30#<3)3H2!4&*#E(EE-F1!-=7214*26>,77&D/,*C!1HEBE@7#D3##<>$A>%C+:,B1%0HD6DD,-*)$(0G.BC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4708 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30752 42 54M = 30854 273 ANGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTC '&+""#"(&&$&*)*)%$+*&%%"+($*++"(*$"'%"*+$""'(*!&+)%)!% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G52 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4708 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30854 42 171M = 30752 -273 TGTCTGGCTTTGTTTGATTTCNGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATACGCACTCAGAATATGAAGCCNGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTNGTCATACCTGGTTTCTCTCAT 9-75<#&).(27F2!&047C"1>F/B!8F/GH-B1(->'1A"?3:,'B07@/;5C!:%-21:H:FGE5F3D>G5(7DD6''>1*$6HF(:(,.4?",(1A35A(0.4-4<'2C31FD(0%DC?%A!">0-/0&0#0,'G21,8$/',F+51>*F3-$F>+:E,/0G#EFF5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11T9A80A4A14C26T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4709 77 * 0 0 * * 0 0 GTTGTCCNTTCGCGCCGCAGGCNTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCC 1"+6FH0%0?F&*%=(G7H;%6:D:"FE*EH*F3=1!=$3?8!F%E<;" YT:Z:UP jpayne@0: r4709 141 * 0 0 * * 0 0 ACGTTCACGCCGTATCCGCTCAATANTTTGTTTAAACGCCGTGGTCAGCGGCACCGCCATCGGGATTTTTACCACATCAATGGGGTAACGGTTTTTCCCAGCCACACGCTGCATGACATGCCACCGGCCATTTTTCAGTAGCTGAATAAACNCGCNGGGAATACGACGGTTACCCACCNCAAGCACGCTGCCGCCAACCTTTCA @/8%4B&!;E4G0":3B@EH9E@#D<7C7&=@3.G#$#D&!#"=G+!(2=/C+-,9FEG+A:448H)*/)F8!+GB2@:EC*;60<15>!&&!:5)0&@H65G-,*#:B%!:G8E(/1G$,#<;2@#(0?')3&:D%D,+/$&=3+;6;"!GA23*)%EGC8C'4$*!+=B,=?,A%:+B/<; YT:Z:UP jpayne@0: r4710 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10910 42 153M = 10846 -217 GGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTNCTTTCCGGCAATNAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGG 86EDGH&6(1%92$63#0=E$6(@95?0$?71>,/!,"A#C18&%B8!."2>9@BA2G'-9'8$.3F)E-G)C2&5(H+65AH%EA06?A.D%4(/D&>/;776."=D?F18EF.@*?C(A0>.?D@--'-E=/4< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T25G19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4711 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7292 42 153M = 7198 -247 GCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGNAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAA /E>0%'"C3,FC$2#B#1'28+&&BA$,7F":7&%"44$D6$5&EHF3-.%.*?<10+=0.6!+E81G>=2%5B&9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21A131 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4711 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7198 42 67M = 7292 247 GTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCNTCTCCGCTCGCNGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTC .'=)G="8)562%;2C!B.<$0F69G17(?B%77>H%?#D*$76==+)"/&(C>FB+EH,'1#;:!5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29G11T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4712 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17320 42 65M = 17385 270 GACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGC :$<38BH:8/F@E$29!ECH3(!C;-*CEB3D3;1*%(H/6**))($2&9!HD?#AG4+/"('?H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4712 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17385 42 205M = 17320 -270 AGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACNACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTA 8+6*$?3E0BF#5G7G7@46CD*&E9;%4B%00CF(-20$=3@,AF,9H2(!)A!."/67)D8:&4(4&ECG6376$;+$<65(,)'E,9EF<)H$BB9>B'*G'(=+D*4"F5+0C9=FD*")%A(AH(;67B2@B$3;7.FA;%5,%C>094G&6C8&'A')#+4$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:147C57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10420 42 89M = 10571 234 AGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTCTCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGA 7;!5H"-0HGF.116:>/2<(=@>*92.;532;8@>+)A?E<@(B(989*D/#':"!%91'7G2!"H.:E%34-2'<5;-2<565<7$7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10571 42 83M = 10420 -234 TGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGANGNGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTNGTACGGAAAGTGATGGGG *'**%()'%$*'*#+')#*&&"'!$)''!%)*"&&(+#%#%%&'+&!*($!%(*#*(#(*+'')$(#'($("!%$(*+'+!*% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:30C1A31G15C1A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25768 42 231M = 25999 302 GAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGNATCTGNGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGAT E$F*'G+C;)$?B&2!H6,@"@$A$1$H(.4.&F'+39$F19H0HD/H+#!$>?E7(&1+0@*1>;?*B">.D>&%4*95"(H.8;DDG&589/12%9-*'6;C1;B&=;0$9!E1=A$=):02??9A9E9>1&1G4B;1/-'2FE%96F8:-3@7E*>)$=:G.F!<;%?"<),3" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:180A5T44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25999 42 71M = 25768 -302 GAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTC 8=GE4(:#?%)(D7??*:8;/;%#-A,AF&.=2)0(9.442@?(9)8.%5*0'$B91)1C6%="''-<"3? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8219 42 81M1I9M = 8404 265 CGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAG 7<%95%#"F61#=DE:,H-C-B'F:70F8*"%4-41)H,.(>):3G(EC174>=(35F>;9#=0-@8.5!3:)%%C2H0A)$*(!9-G---$.+0>H#<$=;@*(0B.1H@#7:;&+E5!?--%B'8A:E7A(7(E;3$=A7?E+2@8#2&:*C2H=F:+!? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8G56G5C14T35A40 YT:Z:UP jpayne@0: r4716 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23934 0 * = 23934 0 NNNTNNANNAGNCTACNANNNCGNNGTTTTTNNNNAGNNAANCNNNNN !!$$!"$"!"$"$""$$!!!!"!!!##$#""$#!$#"##$$"#!""#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4717 77 * 0 0 * * 0 0 CGGCATAGCNGATATTTTCGGGGTCATCAAAAACACCACGT (&*)+&!&)!%+')!)##*%&#*'$))%'*+!(!#!%%$&+ YT:Z:UP jpayne@0: r4717 141 * 0 0 * * 0 0 CTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTNCCATTGCCCGCNCCGATGAAACGATACGCGGTTACATGGGAACGTCAG 4E=*AD9?-1*,>C/D0>65F3:=!8?--6#3'H3**G2=(('&5=D"'59D@B:"'$9/!"'/9:E?9);==#D*:AF246+B@)!=!?:8&56=:&;9/6D1.:!1(-+A.H-*E$**;%!:6 YT:Z:UP jpayne@0: r4718 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39072 42 58M = 38901 -229 TAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGAC 1:".990*3,0C;)#.H#!',48(&D/2(E#:<3+ YT:Z:UP jpayne@0: r4720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17302 42 83M = 17135 -250 GATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCANCTGACCNCNCA %()&*&&"$%)"&#*'(*"***"')!+##%($*!*")'!!'$*"%+*+&$(!$(!!!*'$*%)"""*#'"#)!$*$+*%'!$* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:71C6G1A0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4720 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17135 42 97M = 17302 250 TAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTAT DG15?-.C7,&D.3CG?6&(($C3-/C)('C9=?.)7B)C"#5@F*@99D.:@E+0>@?E+!E.?/"DB(192$".;E)8/2<>-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4721 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37026 42 187M = 37213 268 AGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCA B3#6'(*=@2BF+"07<*'.?'6=B!C-#&;9)%'3;5*>D>A1(2C'HC.1GFH*4/43-"G6@?$+%&?G,!H$$#+64G;$!E*B$"G4CGF6:'32(*(GB",F'@AE28+A8>7%E;;@-(:@5AC"495865/>5BFF=.FBD+;D<.7G7CFD8!/A''7,;*" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:182G4 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4721 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37213 42 81M = 37026 -268 GAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTATCTTCAGGCCACTGACTATCNAAAACTTTCCCCACANCGGAACAACNNNNATTN )!%((!"+*+*#")'!"%+$&'&$#('&'""%!*!"&$+"!)*(#)&""+*!##"%#"!#)'&*)&")()()+%%%%"(&& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:26C18G1G1T13A9T0C0T0C3G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4722 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34263 42 145M = 34079 -329 GATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGTTGCTCTTAGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGTGGTATTAAAGATTGTGCCTGTCTTTN .G&A02>2#@(2B.=$G;':37B=A&-,0-D9(C<%5+.1%96E@H<24177<;&!G6>4147"F(+09G#C?6CE(D:71A"E.%G/)+*1>"!7:/F"19'D)22)4=%E*+DE<@72*@" AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:62A7C36A10C4G20T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4722 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34079 42 60M = 34263 329 GGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTC 2?9):B,0B'G'>0$0#C%4E#BH?+#;<'@>(0&>,."8$)?*-,=;2'0-42")H+=; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4723 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1012 42 41M = 1118 284 CCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTT A?.@E'4DA:2=#DAG=HHGB/*C+4"=8@=&!/-#*F)>: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4723 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1118 42 178M = 1012 -284 TGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTC !2>/0:AD41)<61F&;(%+7-"2@??103A@1E!.4?$*>-AE!7247.9@.A?7;D5>G1?(9>*;+?A"!#-%7<-88.#5+'+?@9:'BABB15B:4"98%A,)6F?=B7)/7)9>A+E3G%#%.;;-/;6'&@=G*D:(/!7.?2B)8F3/5>G0,,.%628.A%"C>C46(* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:178 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4724 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30257 42 43M = 30104 -196 TTCNTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCANCACAATCGANGGTGT D=F>4>)3E,23/)(;+G/*:@D)=<>@*065"B,+H/:.>"A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T23G9T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4724 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30104 42 78M = 30257 196 CAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGANTTTGCTGTTTCAA $30EG3;)D.-;>.3H5/C6C"18*1;D8-H-8"5-9DF/5= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4725 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 500 42 84M = 668 269 GACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGG H9(E+-*="'DC6C;6$-C5C7!HH.*(":<*:==;+A$335/&:$> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4725 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 668 42 101M = 500 -269 AACNAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTC E!%%5=52%%.?:25'8>)8;&BH&A46>24"'=0*43A;A:>!%B$5;0@>4C>?<1F0GAD"0&-5/)0C,"3*%A8<%#//&&4&F5$"@$#92"B!? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A81G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33548 42 200M = 33748 312 GATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTANCGATAGCGGTAATTCTTATCCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCGTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCAT 1=H?2,>A!D=,!;4=&FE:1=?$-,8E*"2H@4$2+B3E&34,7D$F7+"6+C(6DH%3)+3/&FF5?:F"%(G!)%$BF;:>AD("$"%3<%ED#>%G-8G?:&:D+H2'>E+:B-!C<98F38?*BD041$)3,>BC#EH&9G@DG<8%C+>9(B"HH*+(F+,0=!,,+=-,*<<:/HBC2$@F;5(7"?7C;'HG AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37T5T13T28C113 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4726 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33748 42 112M = 33548 -312 TTAATACAGAGCCATGTTTATTGAGTCGGTATTNAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGA %$(**!+&$)("'!$('($"%*%!(($&&"%$*!*$$($#()$)!$)"&(&**+))(*('&%*!"($""(')*!"&*&"'%*+)"%$$*#*&+)('%*)&""!'()%&+*(" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G19C78 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4727 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8891 42 63M = 8708 -246 GATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGC C>#89*-@-!,198@"573C++&8#2)!;.><;?%-/6!"&;!.*(00:/"?#<1$?@&E>HG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4727 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8708 42 90M = 8891 246 CTGGCCAGNNNTNCNTGGCGGGNGGACGTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAG %('(##''""*$'%$%*%&$(&(%%*!'*)+*$('*"#+""'&'&#!#!%&"*)#'&$%'*!)&+#&(*)*#)'"!+#%"'"(#%!%'() AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:4A3C0G0A1A1C4A2C3G0C62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4728 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14745 42 96M = 14599 -242 TGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATNT C%(=B.E>,'D964#13CG;&@D5;8#.&",2E-@A>1?A-0/B#;'.2499,$,17;@:#%'CGC-$"06> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4728 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14599 42 95M = 14745 242 TCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGAGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACG 7=3"%=@+98E05.%'"&@?932BH$;!F6;6A>44#HD%7"250=E42G)H4$B5=:A<'=65H@,''5?H',3;3EEC&C('2"/6?*-3B79 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4729 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7542 42 206M = 7484 -264 GTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAANCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACC H$3&.&'+D*")@2090B!7:.#F=9%9")#8D=H<+3;&2,-G+8GC+E1(#?C=G!7%)',+=2+F.$20-EEG-;)19,?0183%5>(=5';<+6G2>"/HF$">(07=>8>.B3:"0(+$2F;H2C/>6262/@G%"#E)+',6A8&01A.">24)>'+D#+:<'AA?%E/H':.H=):--?9(-3%?D:!:5'=? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4730 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47749 40 40M = 47894 199 ANANTTNNATGNTTATCCCTCCGNGGATCTGATTCGTGTA $"#"&"""(%(%%$)'**"+#)!!('"&+(%)((!"*"%) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C1A1C0T0G0C2A1G9T16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4730 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47894 40 54M = 47749 -199 TTGGTGAAGCACGATAATAATATGANGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCA G93(')284@8,<)*1/$#$"1:=(:+9+)G;F#4DB/5)*".40?8?/C>.A: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A28 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4731 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11537 42 169M = 11706 340 TAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTNCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGC )E3+9@(!A$:F/,D);"D42'B$:(@#D3-E%(.G68('9;H8'$/)94""H!'*H%98?;9B+238D4!B//<"&%*E*9%4%-)"-0?3G11&';*;08&>(!/G'.' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G141 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4731 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11706 42 171M = 11537 -340 GATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTTATGGCGGCGGCGAAAAAT &>(=C"@DC"$&+F.@?9&**D+,!=7"8&1)G=)4),@?-C73CA)AA:@43G+6>-/#@?=5D6-48HG:"14#G00&80(%/7G+EA)C/(/$#/'-*;E&'&+'1;7FAH>8?#76>.&>!@)D@/4<2-G(6>F19F'F46"G0E#?!"C0(9#+"@B$! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:152G17G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4732 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1878 42 100M = 1685 -293 CCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGNGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGNCTGA ,ECD&@9DH$618,3(,$H&CG6H+*$!&>&?:,&C$EBG)*G,D4>3:>CB(@'@F8#!,+>0;#4/EG4*#4D1<#5F-<7@13*;5.F0.>1-=.38=.$*H5.$$$#,7%4+E>>"-03> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G214 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4735 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41647 42 163M = 41565 -245 CTGCATTAAAAAANCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGNAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCNCGGGATGCCATGAGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCGAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATC /(6-2<;?8&E'G/@87H&4>+G-!<(;/D5;(9<"%*/<=,).E-=F,!2>;74*G27-6&2(.'/&B@4#>)"9A7!(F54#C,E31H<,5'3-D?+@6H"=6D>7!3#>G(#H>4.3AC):2&0$A5G<*B421#&EG9?E+C'3H.-F*.)%/2=E(:* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13T44C23A6C5T24A42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4735 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41565 42 82M = 41647 245 TTGAGAANGAAGATATCNTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGNTAACTGCTTATT *:7CED4:+:<*G"01H->5C=?5#,+A'$-,6EB%?G65<#21-G6H>DFH>#(H%#FE4H;::.*2)+,?"G@F?6&E+$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7G9C51G7A4 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4736 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33673 42 189M = 33526 -336 CAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAGTTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAAAACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGAAG A'A:<2F?'A"H6=-=HEF+0.G:81C:++526 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A49T107T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4736 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33526 42 147M = 33673 336 AAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCNTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACA G4/.4<2#+D+(D/-1>);%EB$;.4$<82.6!43%&A+%6#:&5+$F;/8,+&"&,D5A0&G/5*/;/%(D2"8'19=1)2/78-'?FE9B#*@.2=563A@A&5C@H%.5@-"*CC,A6;?FAAD(G+@26H;&BF/HDC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4737 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5824 42 45M = 6042 262 CGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTNCAATGACCCCGCTGATGCTGGA /5.35;/#-02?%D=/$>B:(1G!9=#:F5=43B7F?6#;1E05E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4738 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46134 42 47M = 46332 277 CGTNNGCGTAANGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTT &%%%"'*'$$'"+"")!*+*+**$$!%&%)%''#$)&#+&('"*$!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C0A4G1T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4738 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46332 42 79M = 46134 -277 GCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTA C@"65.*3?3CA;>11/?.&&*122A/#+(>%$#1"BC.32+2083&:C?CHG'?-EF?)+'?! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4739 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42417 42 100M = 42544 199 TCGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCT !+)*"$"$$"$*#$*"'&##+#"&*%$($#')%+&%)'#%($"%*+"+*)*&'"%!+#)$!)''"*!#(&**((!#&&&*(!'&*&))$#)*'%')&&$+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A21A77 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4739 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42544 42 72M = 42417 -199 TCGNACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGA !21,F7'<=&((!FA/30+.''9/*DF+>!G/'="!3!*??B)4/6-G/?HD.6A!B%3-6&,/>E)E3D<4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4740 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19142 42 196M = 19345 277 GTNAANGNCCGTTATGAGCTGACGGNCAGTGTGGGGGTGCTGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCG )%%))$!"+*%)+&'*&'!&"!&%#'%))$*!#$+(*)'!##*##%+%)+)!'##$%#'$!$!&''("%)!%")+++#!##*!%(&)%##)$"$"$*+'#'"$#$%")$#++*'$+#"+##'+!!*%'##"#!($(%'!'%((%+""*(!!##*%&*('"*#$!'%"&+$'$*!+%&$$'%#(!!&"&)&!#$'%+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G2G0T0A17A13A156 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4740 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19345 42 74M = 19142 -277 TCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGN >FC4F4A#(@.:9;2B/FCC/C"F4F#B**'7@&-+->@B/"6"97@! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4741 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33184 42 64M = 33294 205 GGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCG @0+/A$7@'3.!G#:.).G@&1B%".F!;0B1(4D/C>91$F'-B*84*0?C9B1)8=)*"*&3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4741 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33294 42 95M = 33184 -205 TGAATTNAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAANTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAA @*A>*!1=09),:1?$"!*,A.!$5:02..?D,<0F**4G99@H1A&+12382B=123*3&:,>67B;>13B6!C# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T54G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4742 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22264 42 183M = 22447 246 ACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAANAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAG 7E2?E3;0"B".B.>7+8@-E$60<>!0(3@FG<0,B=@:!5AC>,+56@,#A5G+7@*.<>A(/;98!=G":45A.<)-:.-647C:##$F4&=G,$!>)'"-2AC?+#8;%:74>=8/>'BG">FC2(+<"0400HG&-E'&4=E$FF6>!.;&7==*>!$>8"+3)/70+E"DA'+:28< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103C79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4742 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22447 42 63M = 22264 -246 GAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACA 3*+5?6*0-2C+B+).:<*)$6-.'"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4743 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7171 42 122M = 7293 300 TCGGGGCCATTGTTTCTCNGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCCGGGTGAACAACTGAACCGTNATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGG $()+("""'$&!)!)%!+&+&"(#'"*%*++!&($))#&+&#&'&$&+$*%&'%$*%'$)++"'!*+#%*'$*!!(')&!+%"&*%"$#"%$(+%))+"*$!&)#)&+&*##$(!"$!)(!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T49T19G33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4743 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7293 42 178M = 7171 -300 CGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGNCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCANTGGNGAA 9)5A@"A',G1+1-'1F%"%4<%+7&&7'(=#D18E)4'%&9="GE1!238((@1>C?@BE">$@G91(")+H0?;?8&A>*@C&"8;FA99"4!"2:A65D(/9$#A0GBE.>D>D"BE1(,(F"%@* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4744 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41684 42 122M = 41524 -282 TGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCNTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGCGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGG &'%*##('$%#$%!$(#$+%)(!!#&#))"&)!!&*#'!$+#)#!)"*$)%)'$)''!**!'#&)'"$($"%'"#'%('#+)&!%(!#)%$%%&$)%"%$"$(($!&*%('+)"($("(*(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G62A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4745 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2690 42 68M = 2881 279 GGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACAGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGA 3+5C+A%1/!5-59D5%F593.9(4@,/;809;5C*,6@*,EA2+C"=CFF?-A'DG:94A;.#64E%@@49.,">$6?&;.?),489 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4746 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8269 42 31M1I42M = 8105 -237 GTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGNGTAACCGTCGTATTCCCGG #+"5/'(0:D8?,&FE#374-A!3>+)<* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T32 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4747 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18169 42 88M = 17948 -309 GAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGG 9.0/C?:HD!%E.+$?:A->,FEB-24&58;&(1-,@*.#'0)!,?5#*=6F(@6F'35546A>!+=20//@HE&*)<+!4C%%14"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4747 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17948 42 96M = 18169 309 NGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGG (')++#*%*$(#*'&+''%&&%*!#$&*''&#)'$"!*!'(!&""*'(#!&$*$#&#%)#*)$$!%%)&+)'%'**$&)&#$!(!)'%++"(!#)# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4748 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30290 42 47M = 30413 238 TCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAANGGTCTGCGTCAAATCCCCAG +"&''!")%%++''$#!("*+*+%*+%(&%"'))%'"+&(!&$&'!) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4748 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30413 42 115M = 30290 -238 ACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACTNGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATA #9G#B!5E>#0%).3((D7007>G7)EGF@-E<1/,(C+&+.11F'<8')$,#E@@*7=52E27!-C4$$4CGB@51+'>C#C.6-.*<&:8CF:=!+8"AFD:6G2,>8?>6*: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A0A78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4749 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3368 42 42M = 3529 321 NCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCG "-465,?%0G?0),=#.)+6@36GB8B2.H,BF8,*F##&F1FD%F835%$?*GGF(;*H5AF'+1365H2<.?/:6&5.F&%,5@53G%D--270:&7%#9)EAC2H:/F&C>"F1<-5<')1A)$!4.!;7CH<.0;+9)D<)%/!*H::*5H%!D-#.&A0;HG1?'3#)3@&$D%;,1"1DF;(=BB,@3,-2F,6%F:@+?A'=>F8GG(7;D5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37T34G45A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4751 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37598 42 91M = 37441 -248 ACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGAT 8..C:&?4!#>3$3$951@G!)!;8BD!*CG?4-$'*D60".F3+,2)?E14+"'&#F:'3*:"=+:G/;36@*8397#E!52D%90#).A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4751 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37441 42 43M1D7M = 37598 248 ATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATG $/(48(&8,8-2<@+')8/F8?'AHFB*/B#9E!'GB%C$7D8.%B<<0/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:43^C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31388 42 95M = 31266 -217 AGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCC .4G<$,H)*C!/$;3$A*-8<(/+(1+F4'$>B<>6#86HD12'B&6&/!'A@*F(4H7"@A?,B'9,135.6&BE20G0F="/A=8$>=8!',; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4752 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31266 42 61M = 31388 217 AGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCC 11.'4*6@E6=?9)(&&52!=D3'#8#1$$.*)<105--+%D4?=5!:'@,D$D>/6(#-H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4753 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34467 42 126M = 34295 -298 TACAACCCCTACNGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGGATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTT =,8:;.E'/=%4,1G5C->=?#!+-!D:?1-->0$6D-$@/'.H))2F4=B><&E=2D'.6CCF?'%=-7&+>68F&9#63'/0*,F/7((:A;80A=(331'B@6=0G0(3.8'8(7"!#F15/6/#;DE9*,16(@1".9E38;(A+=02/9H94F#;@*&5$BF:!&96D.4'$"F/6'%4==E4>)>9934;.FGH01?,#,*+0F-=!9E(DH9"?8(*<@.=0!?E)/>A/66 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75A96 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4754 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11592 42 77M = 11381 -288 GTAGCGCGGGCGCGTTACTGNGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCC $9:(9:1#1<$8*6BA//(?2@,AAD4!<&&8'<<>0<0D>'HE"D*-2%)GG2'1'C6+<#D&$29",$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A18G55A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4754 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11381 42 211M = 11592 288 TGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATANTGGNCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGAT G+1EE?)7)0F6BDB08+=3:/>.@%404EGG+=(23/$3&6#?,2"84DE@)$260"C!@C"+-<$'$F-"?A1->04,"&C41/);:$$:3E$!4?CA2&&G= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104T3T102 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4755 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6237 42 15M1I127M = 6133 -246 ACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGNGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGANNN ##!!(!%(&"#!%($&+''*")$&)"'&)$!*&+"(+"'(##%+*$%'"!)("!&!"'%#&"$"!#!+&&$)'!*''!%(%!&$!((*(*+&+#)$$+)!#$*!%!*%)*&&$&#$&(%#"!&!)%"#'+"+)!$(")+'!'# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:98C40A0G0C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4755 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6133 42 90M1I14M = 6237 246 TTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGNAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCAGTGTAGAGCTATCCCTTC '))(#+%(**%#$)+*+(*+#%""!#'#%*"$($''#"&)')"*")!%!)($$%%+"!"#*&&&)&'"&%#*)%#*$!#&%$&!'#+&%"%&$)$+%"'!#)*+( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:47A38C17 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4756 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31312 42 48M = 31074 -286 TGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTG @5@0$A3?!EC1#7*B@,?H-(/8"@;<73DB7%+/4@@11:(B-0?)=5@A#H!2E:&$F";;,&>8,*./339""&#A6'-!#/.):"(6E3G.C/<,")4*:,#936H0@<#E#;6/B%/)5<4;.:D8"7ECE>9=7-.!#(//30);9G*! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33G72C8A9 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r4758 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20326 40 113M = 20181 -258 CGACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTGCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCNTCNCCCGNNNGNGTAGATNCNTCG $")!$)*+!%)($#*)(%")$*$"%"##+!&)&%"**(&$(&"###%$"))'*+!$)%("%)(&%$"+%*))#)'))*#'"#)%(+&*&""$%)*'!$#)"'#*$!"$(!%&$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:1C24T61A0A0G0T0G3G0T0C1T1C2C1T1C3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4759 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7888 42 99M = 8041 213 GTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGNCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAA :GFA:=C9:(344DB-@AE,F*F@21%B65:?&0675;##HD;>89'2F?)8&A.$E>E9C>>HAA<39%C'89>3<*=;;>+#-86/('A2&(8*#G5F0,4"&!*/CB@.+.D"8'%56#&@AH*=:-(AA/6-"#6-&9E'-"0,F+*FH+<5,H?,3%2F7(F9:FA/!,5A'C#<32:6-B"2>2F8$@/==<:#+H09$)>-,,;@4%#"4##B.;$:E&@@67<3"=;+EED@).1=4<.6;,5C8F)A!C#B?&H!)&!7'?%!1/.A#;=*;9?=$<;:,6537"(H,/&6D>>G6&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:297 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4760 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11376 42 126M = 11502 423 GGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACC <<<@F,BB;-.*'FD!2<2$<#@<=::CH4+"98H/+@0#(;*G&H4<06>.)16*,@!9.!;+0AA90/D!DD:+:?@8C,*#'0?<>4-D->#8'=&+@%>DF0B*)2@EA#/?G0+D')@>)C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4761 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 757 42 64M2I159M = 653 -327 GCGCCCGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGNGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTA $FE$=FCAH!9$BE*B>@D/F*,,FA*,#9$<='!$1.?2D)!D2E5=2ED45=;!+>;"#B"&H*C('A2$?%H,?.509<8/50(B@G=+:8CC(3D!)&7 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:5G119C97 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4761 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 653 42 104M = 757 327 ATNATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTTTCC ))!+$+#"'*$"!!&*$&&)&)($$#$"+'"#%+%""++"$$+%+)$((!+$#&%)+!''*'*$"""'"#"!*+*(+!"(#*"+#&*!'&!+&%#!)+'"("!+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C97G3 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4762 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1001 42 51M = 1001 0 GCAGNGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTT /)*B4%11E)-;8@1$2+G4=:'.4>%'GF( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58T8A0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4764 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34609 42 104M2D18M = 34862 321 CTGAATATGTTAATGCGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCG -0;;:%1.*H-&H=+86!@*D@D/A"7B35D+1@F;@!0?>#"#$&89>!G"?'#2C8GB6EA0B&+.D9,'"<2>A:4%*&/=1#A9D+A&H6*$7B(1?/(',:F&A.9DH/B9:H*0?4 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:15A88^GC18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4765 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47637 42 137M = 47544 -230 CGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGNN D,)F;@6:B72@((;!E='<,AE'G>3'H=8#54)A.'9:=?G*"(?4G:-27>'D.0?;";G/=8H!++G$4C#6=-?6(H90"D4$;;"?)%;'/-*%64+852!D9)A(F$@%! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:135T0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4765 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47544 42 93M = 47637 230 TGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAAC H/AA'!#1D?7H-'0-$$"F&@128&0AFH>GD782:4:EC!&( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39721 42 387M4D16M = 39675 -453 TACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGNCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCATCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGGAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGNGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCNGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTANTGGCAGGTTACCAACCTGTATCAGAANATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTT 9?$#&9?H+2FG:E=69=/;&E!;'E$'CC$B5/,H1*A7/05:3((F1,+=+5+27,*.DE$8"3/FH>?EA32,'5!%9;B+B70FD04<+-#,%%CA@#48@!$*!B4G%>@2F?'=;A2E5(955.29#"0>3(?31-88>!847>2:5$0<(&!-2.%!?)@@H5(*-53/HH02?''544)CDA2/DG"!=4),0=C5"3=-A%11(%*8'E+;D1.(&(06"2&='2B-2(?(#1<,*,;!$-/@7!GE,).8$F-:C,E)?E>)):0/"+;/+:7HBB#D)9&6)+,*("?(-0?0$E$1+:@))28/):6BE>262C,H0$6#BG#4('3&2!%;DA/2,%G20E'=4FF)/"D!&#(2H0-:!EB#$6 AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:12 MD:Z:61T37C95A59A27G38C4T21C37^GTAA16 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39675 42 46M = 39721 453 CNTGTNCAGCGGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGT &&"%&!&(!&*%+''"&"*(&&)('+)'(%*%(!##(#&#%')"$) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A0G2A4A35 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r4767 77 * 0 0 * * 0 0 CGGAGAGTCAGTTCGCGGTNCTGGAGGAGNCGGCGCAACGTCGCCAGNT .2:53<+&?0*>G*>8F"0.1(1#.>@"'7',#7<#%14G/&9!E:BF2 YT:Z:UP jpayne@0: r4767 141 * 0 0 * * 0 0 NCNCTNANCCCCCNGCTTTTCGCATCAATGGCGGCCCGTTTTGCCCG !%!(('')#%''&!+!$#&+&)+$"('!##"!(&)+&+*+(%($')% YT:Z:UP jpayne@0: r4768 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39798 42 40M = 39972 216 GCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTA .,;34D3&-5@=G,C6CE>GCA<$#4'D:((79"GDFE4& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4768 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39972 42 42M = 39798 -216 TACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAC !"'?163<3,A(%E*DG-E$2),)67)!G99H*9FB?0:=7( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4769 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46252 42 55M = 46421 218 AACCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTNCGGCGTGGATAATGC $(+)%%#%'!'"#*%*(#'(&'%!)"#%"**+"(*!#!#!'$!&)*+&#'!%+$! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G36C15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46421 42 49M = 46252 -218 CAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGNCAACTCATGCAATTATTGTGAGC H;1H5!;,)>7-9)CC2>92+=6&*)$=@%&-,8-::4E3847@:*/3' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4770 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4117 42 184M = 4334 267 CCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGAAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATANAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAA %#??,@>';73BG>0"7.2'H=#,)%B<5=#-F#)-:#"31EA!4:G('D6-A*;B7-9F06--;G0%A@0-EG7(7?-?7@#2!!"$7?1#3/?&(.A.-G4!%4!9>C4;F"4(8E%3*.:::@:6-"E%H6*?E>F89H8%8-GG4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YT:Z:UP jpayne@0: r4771 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31076 0 * = 31076 0 CNGNNGNNNGNNNNANNCNCNNTNCTCGTNTNNNCAANNNNA $#$!!""##"!$##"$#"$$!!""#!$"$#$!!"#$"!!!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4772 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30326 42 117M = 30525 296 CAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTNTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACT BG:GE(B58'!-%6H5FA2E=,24:63DF*=0&>*72D%7,##B>E+3+2@(D9%@<(<;=4"#>A&6HB"$>/?;'F6>5"+=2+<#;*.F#53C1:6&@#/&0* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85T31 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4772 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30525 42 40M2D55M = 30326 -296 ATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCAGN #-.>!,5=FA((57!6E$#+71&C4B)2"$#>D:2:>$58GC!>9CA>+-=2"9)/;+>#?<58)*CA2:-67-.<;"/B)?;,0*-3<&+:D?585@G-B.7@#@:1'.:@(@H+E>62@1A4D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50C38 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10209 42 168M = 10035 -342 AGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTAGAGTACCCATTANTTTCATGATGTTCTGCTGGATNTGCACTTTTCCGGGCTGACGANCACCATGCTCANCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGNATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACNNNCGCGGNNCGGNANAAGAGA %)&+$#+%$&#+%&((%*$&!+$+$(%""+&*&"&+(%#**")%')&((&!!+''+&+!"$!$'#$"+#&"*"!(#(*#'+%%"&'$"&*!*(+$%*&(&)(*$#%*##&%"%+$+(%%(!#&%&(*&()+*%'"$*+&$+++&'"$!'*'(("!!("&$#!&*)('! AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:25C11T21A20T0A4G6G25C26C0G0G4A0G0G1T1A0C0G5C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4774 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13300 42 56M = 13105 -251 CTGGAAATCCTTTCTGTGGGCGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCT 6<0H3@?(!*156&3F!$3&F+<#':C&=<;+F),C4?&EH5D+0+(G"34(F$54 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4774 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13105 42 66M = 13300 251 GACCTTCCGCTGGANAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTNAGAAAAGTGCG "+(((+((((&%'#%!+%&+*&((+$##(("!&$"'!*!&)"%)"+(*"+*%%$&%*&$""%$$#) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A39A5G5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4775 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33223 42 115M = 32986 -352 TAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGT 6F4,;#/@>@55%5!%=!@';A"9E54&4"??:%#%"?A+C/D0,-EC.!&#E4F//2<")8,075>707&&:*1='A+2/+6#-<-F50!%*AF4=9@#-1:##6=GE.23 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4775 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32986 42 237M = 33223 352 GNNANNGGAGCAGGTCNTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCNCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCCAGACGATCCTGAATGTANTAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCNCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTAT (&%$"'(#!+%+%"(&+*#%%$"%%!!"))+"#$"&!!&"&&"+$%&#"$*((#)"&&')#!*%%""(!'++'&((%"$(*)!%)!+&'$$%)'(&##$%#(++$$')$(+%!&+*$"!!#'#"(+$)+)++!!"+&!)*!+!*!(%&(#'+*&'$$+('$#$#%")')(%&!''!$(+&(''+)%"'#%$#$"('"!+())()'')(!+'#$&$'!)&*"+(#')!%!&%*%&!%) AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1G0T0G0C0T2G5C1T33T46A17A43G77 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4776 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4408 42 128M = 4314 -222 GAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTCATGCTNGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGA +>%!#?7C28F92=C13G(!3?78+..%#%.G'>=F5'GC)!A%3A=4(*)(E/<,/!7-2:-*2)$41/"5-0#B+1C9!#6-&8)'''=&F:8/);.F+9**7B.!H@462#(!7#$H%>H):;@3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G5T52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4776 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4314 42 55M = 4408 222 GGTNCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCG C:&6;'=2&F!HCF2@<8G(37B+82E&AB8'86##9+6=':"3*+!H<-0B+D1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4777 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17196 42 88M = 17345 273 TANGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCG #)$3/(81H5):G"B!:963&-A=:>$,C0+=?D.4%5A,2'11!&9B;&%;)>-6-)G7F?'1?&>FG#B(4;+&H/)6%CE<%!@2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G1C85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17345 42 124M = 17196 -273 ATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCG D,,6="$&A/8>4,BE2."%->@1DB299H?-())H%C./H="8G05<4$(1G/?$G!3C3+E>C.;,;.&F9+/A$3&>H=E%&+*-!:1$/-4E;2*<9,44*5B:/9(5,GC181F/3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4778 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3832 42 263M = 3730 -365 CTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGNAGACGGCTCNGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGNTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGNACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCAT 0304=CE="')6A.5@=H7;#$E=B#5(=;BG@E.0---5/3?'C632?C/H(%C6H(#E<%.,2<-+.3B8&E>17.9?BAD$31&9D;B;.4.56#(,C&8#%8@//;90")@$*!B507;2%G6"/+9A%;'1!*80&*:6/C@6192=&@D@7*2A69"53,5D,25B!)<>6%(<>D(?38;*H+-D9D=B:18>H"8$;0!=0AH=+@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27C9A25T93C105 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4778 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3730 42 55M2I47M = 3832 365 AACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCAC 9$4%6@5*E4:8.A$/?:;4%!H$C1+08>9/&.A1%0*"12)D))6#3&2:$16!;<*(/-/(;".*.33#)"G./F?#$*"B?B8)H#!",1'8@A.<91EG AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:102 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4779 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38671 42 71M = 38472 -270 TCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGA B'%8<),)5?-8)6+<6:9369$))2++.$653-#.>%-"C5#40);>!2#('!G*H"3"%5,&&-(-&,> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38472 42 62M = 38671 270 CGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGCACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTT *956-;&8C'4>"G9A4,4?,?*#G!".%F@'D;;-@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4780 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22895 42 109M1D104M = 23109 346 TTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAANAAATATATTTATCTGGTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATNAATTGNAAGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGGATGTGATAACCGTC D,55>+5,/=;6+-F591>)3&19/@C2'=F)=)G>:C184EGD%9/#7.C:C!/0F&+D*G41.8D'@E/&,H!;8%&<-#;<(,5:<&8C?AG2#"CE+>D3<40-.+B4%77,0CBF?H>&FHE1C&2#*'32E4H=9?B()$D$$:B3A87-CD#C"A%"CD@;=97E'(6H.B!?F$'*"<)/8H!.'!%HB(&1A;+9"E5!A@D1@ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:109^C3A15C29C5G1T31A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4780 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23109 42 132M = 22895 -346 CTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCNTATTG ,:D@3(2B">"(*9%FF++1959-EE<*81@H-1+)!$H79&67;&61%24E=4"92F4.2(:2@3)>08#D<9&4$669?E=7&D3&639><6C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:126A5 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4781 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26810 24 72M = 26619 -263 TTAACCTTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAA 5H67,0D2,!(?@D(?(!; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A66 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r4781 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26619 24 68M13I112M = 26810 263 GATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTA =-;$HD:&A*8A."-A.C1@',++/*@?=<%6F!E'B18#(B#2H?F&+C636!,$01B-F#)@F1<0-CHB5?,"(=2*!BC<%"1#88+:5'?G298EA.)$9#D6B@6/36F8#C9H8!971F*.)''==%&28,+72,+D,798G+=!1H59+E&!@AD%4G3G#H=9?&F9(7F-/25@G>%=2(4/) AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:180 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4782 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43236 42 102M = 43018 -320 GAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGAC 94,7&<7(9+02--//6CF82(62$?H*"3&'E1""!D=4G?@C'5:FDFGBG9/C22218,?1@<-!7?C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4782 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43018 42 218M = 43236 320 GAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCNCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGNTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGNGATGCGCTATTAC 099G'C%4D!359E+;4@$&ABE#-0=E**C82'F+1))@!/)2(A/:+.=H,%!1)A*(+.&66@E1A!G1$$A@7(@B$2E93)5>8C%",>C1EC(6%?#E2'%A8/G9(.?9F7#;-"54/D81-#/0C7>$7&5#8117:==&D>?60DFC;H*B;=B@=<:'488/.G7##(%!D!'A@C//A!#AE8>;!5#6<"*+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T149G22A13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41974 42 50M = 42058 226 GAATGCAAAGAAAATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCG @8$:*2G*43;=&H-3G0/!+734A-C&!H>>C.0=*>F)EH;/24-,.; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G37 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42058 42 142M = 41974 -226 GTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCNGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTNCAGT "+'($"+*%*("$$+&*"*$+'*)!)'(*'$"'%**+*")+)')%)"&$"*&$#""&)!+)%'+#+'+!#)$!*+*!%'&#($#&%!%$+$"$"())"+*&!$''*)#+!('#&!*"+!'%''"%&*%&+*%&''#$+#%'' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:104A32G0A0C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4784 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28975 42 82M = 29197 270 ACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCGGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCC 5A8B4#F@<*?#;#G=@9-6'>-!4)$C1B!$(1@EFD=:*1123B&5*$.<$8289-G(3='8F)1,&+??E&B'F%<$A%A.H9DE1+.#--78'0$H&62E,B:$"?2'?9?51E% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r4785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1937 40 149M5I43M = 1818 -311 GCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACACTACTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTGTACCCGCCGNAATNGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTNGGATACTGGCGGGATTGTCCCCACANA *&'&*%""*+()!')$**&*%!!+"*+)!+'$+%')(##)%*&%$+)#))*$""*!''+''!+#+*"+)"!($')(%'*"!!+%"%%%*#'!)+%!"&*"$#(!+)$)%!#'$&"&$&)"+&'!+&&*+!"$+!"!*%*#&+&'$+&#)#)&&+&)&$(&$'!'&%"&*"%'%$#)+"&(#&%'%(+%&(%&""#"' AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:16 MD:Z:84G2G31A9G3G30G17A3G2C0A0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4786 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22619 42 57M = 22464 -212 TTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTTTTATCTTCAGGAGAATAATGGAA =EG=3G)%@D&09$8;3F-FF414;A9-:G&)/*%,C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4786 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22464 42 60M = 22619 212 GGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCNACTGCACCTGA GG"5*EAC7H24&3C04$<##!'*H#,6#<0(C(,(6G"06HB!4+',+D6*8C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4787 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4553 40 57M = 4358 -252 GCGGTGTCCGGCGACACCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCNANGNTNATANCGACC #("+($+%'(#%$!!+%'!"*+'')(%'%#')"((&((!+*"#"'"&!"!(!$#%)( AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:16G24G1C1C1G0G0C1T0T0A0T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4787 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4358 40 48M = 4553 252 CCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAG CB3.(-A:.&8G=F6(.$5&+.$G9*)&7)/50>":A&/2.)08'E;3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4788 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12098 42 72M = 12198 250 CCAGCTGTCTGNACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCNTAAAGATGAGACGCTCGAGNACAAACGGCAGCTGGC )"C8!-$$A:F2/EGF-?6'&!&:%9D+BE=$F.6-#)7$%C&C/6<@":68-EH78F@?:*+?7$-FF6%F AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11C23A15G3T7C8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4788 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12198 42 150M = 12098 -250 GAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGTAGGAANTGGATGNC '#%$&*)%+'(""'(#))+)(#&$&))&+*'$"))'%*$'&(%&'+&'(+%%++)++%+"&*"&)')'!#%!!%"$*&"*'$&)'!)&'#)&%$&'$*%$#&(&*(#%#$%&&+)"'&##(&"%+)+%%*%&!+$"'**'*"''*%*&!) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:135A5C0A1T3G1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r4789 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40822 42 138M = 40960 445 TTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTG 91(*#-4;0BG5-%0>8;'6#8$4H"2;48H8%&>(;#7141,4;@A+B7#G4&-)C!D>4.?@F3B,A,/1&#$*(*!:%D:=B6G6)!#>$,C;)!=#B(8(C11CD>!(D*1*993B9*B4' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4789 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40960 42 213M1D93M = 40822 -445 TAGGCGAATTGGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGNGTTAAGTGGTCANACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATNGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTTGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTANTGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTACTG @DB)82E4;&+::;B2A?-4DE8!$84">-.1G3;&DE2&)0G6<"&(57%5%9>-<,+!H2/D*!D%A&%#7!>+(*$E:C9,?.'2)@A"C42"GHB,;2D-;"98#&142+&>+)*47#E8'42.DE<6#?,0@+>B"2$%C<%*<2.2.9"7'#4#;&C2A@BA()GA:>GF.A+'83:-1/)7:6F6>*+&.<:+2;/D!C4%4'(H?.4D0@*50+,$%9A,C5E5+&5:+F?34@B+$?%1&A340+:&(*F2/G>10E0(:<.E:BE;60"*) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:10T44C12G36G30A41A34^T90T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4790 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42471 42 153M = 42353 -271 TGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAA 746#B!$+%16.6=))$4-C9&;/,0FH?%65$1=;46F0;368<.27BB6*B339#(%1A7,;3>2-.';16(=C2'>!;:<1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4790 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42353 42 101M = 42471 271 CNGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGAC '+'&%!&+'&!'+()*+!))!+)$+!+!&&##')&*#$!'!!$*$!$#&)#$"')"%!+)&!$*'++!*%#%+*'#"#%#(+"%&$*$#!!)&+!(&&!&+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T84A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4791 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 473 42 222M = 369 -326 GACGCACNGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACNGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGANNTAGTG (%!"(')#&+))!')!)&)'(%!+$$#+!#%%(%*"$!($+%'+"!"%(*)"''%'*')'&*#')&+!)$*'&)"#%($'#)!(+"'"!(#"!$"+&*#$*%##%%(""(!+(%!+&)'()#'%%"&"+&$)$"($&""!#&+$"*&$+!&#'$$'!&$)*($%+$'*"&%*&$%*!$**"'(*%!(%$&"#)&"##&)&(#'*)%**!(%++%$&""'!%& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7A167G39T0G0A1C2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4791 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 369 42 104M = 473 326 AAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCC AF)'7F.:$":/*;.&)%0%A;$GCE08,),0&G>'*5$#=B/&@<.5,="3-!5,";)86&D17%6'#@;@>?/..8%#-2#0&2(":F@EF(E,-45@/@-; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G69 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4792 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39553 42 90M = 39374 -269 AACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCA G4?36))F7G<:&9DH745G&"+4HE*D54$62#/)D)>)A*5;"#,!/6DC-29D1=);B=-%2@)3*.F)6&@+(E;"/C0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4792 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39374 42 42M = 39553 269 ATGNCGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCT $'&"+&#)$)*"**&%'$+#"'"(%"*'!*!"+&"&((!"(! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G2A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4793 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13239 42 96M = 13143 -192 CGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGT C0H0>B.GGC06&C)F4H9?2*76DB&.HF4"4H?)>C%%E2%$BD39(:9,6;@2F2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4793 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13143 42 96M = 13239 192 CTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGA /<*:#/7&=A2H)(,2:53G):8'6'6"#=:2'99=7"B@3>-84G$.4'+A,<#0+#8=B1?:B;))":!;7.8G3=4,7'5;B2!,&'?1A8?/E2(=E7,*-D@<-+36#@/1=DBEE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A0T63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33349 42 77M = 33558 306 GATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGG ")()%#+'*)%)$"('("$#'#+()&#$#!!'*$$'!(("+!(!&&"+"'%)*'&++'#$(!*&++)#"&&&!$$*# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4795 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42044 42 50M = 41871 -223 GAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCANGAAAAGGAGGACGTGTGG ="D9390%'+!5)%"C>#7$(.&(56/>$"2A-E+F@55;B6* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61G15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4796 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12553 42 120M = 12390 -283 CCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGGAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGG 864F?+E#/*8,1AF"5!54F7<6!,6A.!#+509@'$B$:=>9,;((8'58&!:9":8"@E2C53G-3;,.&2?BB;+C8,)+$@H/3;E.7.$#>H8#?A?888=&.%AE#6'-"F<6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4797 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28919 42 271M = 28795 -395 GATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCNCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGNTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCA B$&/*!<*%>6@:8D"0DBG6(G<2(?G2,3)/-4#F=!629BBF&@#>(E*/4'3.9>;,.=134341DB+D9@942H&E+-9*&?/5!9#6*H7(20>&!"@.8=/'32E'7FG2,D8&67'!!A,44:H=7-F@'A)*60H>$1C>H#3G#@34-!C+=+<(A'#/3+%*25F(2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82C27C160 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4797 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28795 42 124M = 28919 395 TTGGGTCCCTNTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGNCGCTCATGANTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTC +78B@+-CD@G5%4D'4:,3+FE.E*#<>90G6.E1?1#1D##+=!9.5*+F:H?.5>,(:%9GHH8=@&3(HG,+B$*7.$%8@?G!/%-E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G50G9C52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4798 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35019 42 26M1D16M = 35072 217 AGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCC 051/E%8(8EFHH!-#<<7435".#(4$*#-2/;-HB$($E93!9)?-=B%$<(F8+G*>C;$!26$/-E$8)='5:+C1>?--G>7E50&<4A)?#7(-"<4C>@=(/0#!:791?%!?/-(0A42)@=2D@"*493!/04HD*4*@'F+B21(#'(E)E5FGB) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76C44G42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4799 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12056 42 187M = 11962 -281 GGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCNGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCNGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAG DG;,4F6!?7(#@!@641H55=F:&F3(%63+8@*GA,6B;CB+44(G;49C/4:C1;"28F/>'1+*4,,4+>@=;HGC,-D%+<0)E/:F856%C0GB61- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G76A79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4799 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11962 42 94M = 12056 281 CCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAANATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGC ,,H/1+.4$@A';,3+?473*8C7:0"HH;1(:8#:#DE+"A@9:B4E-.>7*@6C2:$705-"&79E70>C8'0B&6%%B4E@D&#*CG?E.H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24354 42 258M = 24612 302 CAANGTACCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGNCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTT &($)$!($'+!!)+&*)%&+'&%%)"*%')+"+*(*'#"#%!"**(#(*)$%'))"#!%#$%%#!('$#((++"*#()$'+&(#%'!(%')$)#)"%)!&&('$*%"$&)!#$*$)+%#"#(%!"%(#&+%%$*)+*"%!(+#"'&#$&$!%&+%"!'$($"$'*&&")"$(*#"$#*!!($)'"!!+(&)$(+(&+('!!!")"+#&"'+"%*&#"'"%*+)$!'&"$**+$+""'"!(%#''(+)'$"!&**##+) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3A0C0G0T121T129 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24612 42 44M = 24354 -302 GCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGA *@/'9&CCDAE!B+A)4@FHE*=F013:*$98GC,"A07:78E1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4801 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39587 42 40M = 39395 -232 AAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAG 0$!3'+#+:7(GA/:,D)6/6>!;,4H8.,5F=3AF6?FE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4801 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39395 42 100M1I92M = 39587 232 ACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGAGAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAA =.H7>%:+7:".?7(GG-9G#;G(>1(GH&:)%(A95-&36>754-%2A+5(C>3;G"3E=!-<)A8@2<$D5<&F45*#%?&A;.D%F)AD>0.H$=?9&3;:E-)>%BE;C&=G&(;9$BB6B>?6579%$$65')CFB!4B':GD?#1H.#716B?=F@@'@E/D8G0"&$>H:%2"4'=%%,-$'1+86?+9E>,<,)+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G37 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4802 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37490 42 66M = 37621 177 TNGCNTTACCTTCAACTTCAAGCCAGAATGCAGAAGCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTNCCCATC !#*&))&+*%*!+$'#&!&+)!+#+''"#'&(!(*&*((!)$+&&#''++++*&'+($%#$!!%($ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1A0A11C18T23A6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4803 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15778 3 119M1D5M2D25M = 15778 0 ACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCA %G)(9'>5E,&/7"G1%!'.B0G03"%4B-F#%8;7+%*F?&)G$+,=2;))<2FEB$2E+@.7B(@)*,BG'=9CG5C:-)7?9:#;F2#)&$<+DB04AG29,B1(1(6-0%/F,!(E/)AC%&&0!8,$C76#)8F++/5H AS:i:-61 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:2 XG:i:3 NM:i:16 MD:Z:119^T0C4^GG3T1C2C0T0G1T2T1C0A0G1T0A2 YT:Z:UP jpayne@0: r4803 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15778 0 * = 15778 0 NCNGTGANNANGANGAGANCANGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGG '%$$((&$!$"%&!""()!"+*&())$)*$""&'+*"'*!)$')!+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4804 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11357 42 196M = 11553 302 GAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGNACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGAGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGGAGACGAC E<64%56=);/6HA&6<(1"=>0.G8),@8)@&%*EE=D2G-1,'+!">(.<'5@?D@/0)H2//&7+",BG&$8-6-.=)*685=?G,6"&5F>0/*6'@G:2B-/5!HF;49+B>E%1-'1D6>9D$F7"7/->>02@&+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60C50G76C7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4804 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11553 42 106M = 11357 -302 ATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTANTGGGATGNTCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGANAGA *935B%=C:1'*H=4E!E"6.A)"0%B)3758AG6F?@);<5<0"->G"$)%B.%&)%1-H(F("B?2H#-%F-DD)?69=B?D48%D86*HB4.096>=C0#786 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56C7A37A3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8217 42 83M1I131M = 8431 406 NCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTGCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGACATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAA *?;8'#31!/@0F,4+D!A0<'BE/C78&/C'8*9"(+2D6226:*7%A&%$G&)-4%3E+!%1)!2:::C+'99D.#8%!8=F:/:'GH<=<&!@D2!C85FE0!FAA(1$"D$<81%BA1E-4A&,G40$GB;&>H2<"'!<3<:A:A*<>G8733%98(=0?3.3-"9=!;B7>?EC!-@/5/4=;5HE+1*;79+@-7A!"'5B9'*F&1G!=4<4!@,+.G6,BF!&7!8"?:8*0$*,7A?C,$@0*.#7@172<)?*?"&/%B7G=2+";G-2,#?)H5=83FA19B!<>2752@>39<:70-:'A5,:;F90B;6%"1A1%90"96&#*-$1#1"+4=-'%/;01)%B)2&6)4A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11G34G95G14G34 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4806 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16629 42 82M = 16890 307 NNTTGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATACTGCCGTTGAGGTGAAC #!&$+"))'*($('&%($("$'!!!($&(%"&&"#($$!+(&##")&!&#+"#++())(&+$#"%##)'!*(%!!!(*#+(" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T0G1G21C39A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4806 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16890 42 46M = 16629 -307 GGATTTCAGCNTCGGCGCAGAAGGNCTTCGCCATGTACCGGGCGAT ,7DA-19@-%H(@0BC*EG9@C41++D+(;/B$-H"D!ADEF&(1" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G13G21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42443 42 200M = 42294 -349 AGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTANTCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTNTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGGGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGTA *'%(*%!&+&%+&(#!(+#%%))##&"*)*#!*+&&$(#&(')("$!#!!#'#('++#""%+$('*!(("$%&#'!"++&%*#!!')#'($#'!#&+)!&)%++$(!&)!)!!#$)*%++%(+&#"'+"!((##)*)(*'%%$)''*+("('$'&+$')#+*$'&&%*%'"#(%**()+()%*%$&#%*(*#'!+)+*!& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59A23G83A30A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42294 42 149M = 42443 349 AACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGNTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACC =B.4.<8/!3B#6$8%G(3??9+1B'DE$2H+/3'D=,>"7160*(4FG4+;;6EH;"B.=-AF3A-3++)G+0!7*-7=&D<:C869F4-.72<@1/&(7'FH4&4>*>*F.FE.8*43(:9(34G=48C:C>HA?D4@H&;83A.C1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50C94A3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4808 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47250 42 110M = 47118 -242 GAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTNATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGAC C@B(@'CDF%)BG9;$4*B=,/D27E(-)HG&B<>"=HF-%&"H:7BC0> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4808 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47118 42 88M = 47250 242 TTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTG (1:+$#+$)1D,$G69GG*A0562/..E0>%+62B?'=?5-6+09:>G33>0A>HE$@G2++9(7#9(25H7.ED10D*#E"<56447 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4809 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25504 42 197M = 25701 305 CTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCNGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCNTGCAGTACTACTGGGGAAT >,F():H$:+4E$7'%-7E=;C48>'B*=.E-D%7&B<9/H;1.%D:*2&$;7B&F:=0C96>#B"G(0$%?A1">*,-,)*B':C:++:C'E4"0C598H4"$6;'0F*+=@0G.1$1&.2/0B%0:.%"'(E6E1%'.5<9%&E1?*G-!H=!,'5?F:%355@#"&5/085(:'0.:5B. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112G64T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4809 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25701 42 108M = 25504 -305 GAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATA $'"'<"(=E(?3')/0."-&C-&.%=?(B55*;):?8,"3:&6;=8C,56C"&#*$1DB4*G3.?"$5H7GDD(>7)@HBG:7+?D,#D!29A:)7BH%4D,G'>C.2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4810 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33890 42 59M = 34090 273 TTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGG ,-?GC%BF?&)+;?*(1='.5-*#;(0AA&!B+-1C6%D56;E=F(=ED##%8B'#H-E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4810 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34090 42 73M = 33890 -273 GGCAGCTTTGTTGTTCTGNTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACA G=G8,+1#G<07@B!D187C>A#+3*<-AF4EH4$;-@3":$$!C/6<5!?:*?0,%-/E9#-BDB$D%;(-; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5861 42 197M = 6058 264 ATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCNACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGATGCTGCCAGCGNCGAGACGGAAAAACGGAACGCGTTTGCCGG E"%41#9B6(E6,G6F02';G,?$/74*1DF'&(,;10*&B(,E,E-H9/-"4<47DA@,7@3!;@*C&6+%;+$(/8-A,.)HB5,A;F3<%"7-&'8;="&8#;C'<$9E*%;3?"/F&B('D>>9,A:/C7!AC*#C!%3 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:48G106G10A7A9C12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4811 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6058 42 67M = 5861 -264 AACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTNTGNGGCTTTTTTTACG 2(5BC#H)C11;>$=-B/"<7#899F:8:6%BG2#F;B!%).HH13B/08*',3+-:@G-D+C8E?'?)$#;B6)5*$$B5&/03#)@&"0C207=5GED+&G616 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T50C5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8425 42 293M = 8718 368 TGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGNGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTNTATCTCACCCGCGCCGAATACACGGGCGAAGAGCNGGACAGCG :)EBEH.%H@;?/B9:!)@5)B%B9D43A:?%H%7+DFC3G$.82*GF984?:*E/@+E(@=11)<4/8+B@(FH5C$GB5@&=36H=#5=D:%H$6>"2)H+?6D>5<14CC"?>B":8D,!&GE0%!&+.7+DFC@7342C9#%")?-"@*8C5A2%(!9%D(/H")(=-H&(2+7*-B3=D&(&.$>;/4G>5!91!)",A4)0(/#.8<%97+%(#; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33C215T9G4T19T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4813 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20818 42 129M4D357M = 21308 700 AAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACNGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCACTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCNCGGCGAAAAATAAAGCCCCGTATTTTGCGGAAAATNATGNCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGANGTTCTTGAATACCNTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAG ,1$E/20D?6HF)G!H';+;14D.G,/EB1@H8!4+A2"(D8G7+B)8;!BB4#2%:./-4(4G".)*/6$D'>:A(G+G,%5'$3/2B/#-H%*82*;D6/72#=/340(:43!5:$>&A34?DHD/:'=<9C4%0+F!/2=F@D3/E*04-?6:1(H#EE47511(C=<4&("@=E@%3<2"@?/63#;D0:1,D3G/)2$&0;EDD)HA&E/9,9%,0C3/8+&HE3F-8":G)44&B&DB?136A$;E;'(?/H,E:@2-D;%DC:E+H;2?;-6A6C$20& AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:14 MD:Z:39C60G28^TATC144A14T0T0A18G3C63T13T94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4813 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21308 42 210M = 20818 -700 GCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACANTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGG "+,5./-E795$:;'8%+*/A)?;>*5&EB.-#+07#)?:/=2C(A+9F2A&$DD'H'1!B94&&E7!<.$,0%D2,'H-A'G8+9B39=F@H(6).->!38G*!8%=?.G!?E8B?-./= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151G58 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r4814 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17681 42 40M = 17951 322 TATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGC (:5<4,$:%?8D)>0&FA(#3"9(C";B"&!<<;A71+<5 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0T37A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4814 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17951 42 52M = 17681 -322 ATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGA 0'?0:+H@>@E0(/$*4H2&5F>=%14$!95D90F"=''2D$%G:642'*.= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4815 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32915 42 106M = 33113 246 AAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGCTTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCC E'%=!-46*C(3(6!>$1B!7!@?9-9DE20:E&70-8F):#2F8?FE)3=(@,;@2#'C!(#.@;<$5,"$.5(/59G13;.+'=1B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A22C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4815 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33113 42 48M = 32915 -246 GGCTGAACTCCTGNAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGG -/46@0!/D4H(4$?1:G$0=7:)3$&E,/5"0:-$A'1''$D,#;@F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4816 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42159 42 169M = 42369 266 ACCAGNAATAAACCCAAGCCAATCCCAAGAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTNCGTACAAGAAAGCGTCGAGNGAGCNTTAACGTGCGC >E?HA&&4&1!E7FA'4969E*7$H%/(A6-,0*C)B$6A8C>-<1/;H,9'H*-96/<6$=EH*,!A%11:!7.!4')29+7%&!@5<7+"8.0@D-=1HD<%2<#F)??6#B&7=&9%4,G!6$-A7>?3#+*G:==<,95=.4.>:&.B)21#4*,=7?A":?&%C AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5A22A103A2A16C4T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4816 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42369 42 56M = 42159 -266 GTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAA 4''<5<;/DA4.4!C:C",?%<+1(%@56%76=82;602;FC2;38&%32F'1'.C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4817 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13090 42 132M = 12985 -237 GAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCNCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCT FF?(@.'E*B(HG)!C4;?<1($78=B#;4-=&G:8;./-:4/?/)807'6B#7F"=%D>5ADBHF=&.3BF$: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99T32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12985 42 100M = 13090 237 ACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCACGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTT E#12015B;/*C&E!$FA4"7?5=:<30/?.05/D#;4?#3E.AD AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C54A22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4818 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46441 42 72M = 46583 243 TAAGGNCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACNCACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTANAGTAAT "*%'#'%($#%'%&"+($(##)%&*$#!+*%(!&(+"(&*$'%($!(%!"("*!)%#&!+%+&##&$%'##" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G1T2G28A30A6 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17831 42 143M = 18001 215 GTATCAANATCAAACCNGGCCATGATTATTACTTTTATATCCACAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATNTTTTCAAAGGCAAGATAACC 1;387@(H9$0'?B4A5@7;D?/5:6C&'1)>7:A)">*FE)#'>DH8CF*?5F;ED7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4820 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34056 42 235M = 34291 326 CTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCNTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACNATGCATTCCGATTGCANCTTGCATCCGTTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACG ?0&@69)94+>FC>#-G:6B+.?G/>5"0+5G*<..C$*H@*?'0D,0&/5C)'C&#?38@!B(C*+&%F$?C57+(8C<,;5A;*=6%*=6B1H>!.<*6>3+%&G834:D'.F(B4G=H27*%*E;B)/86H>4-BC39?>F73C>H@+=%A7"/(,*;180,-B=3D14$,$;<$.1C%54"6B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:80G70C16G9A56 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4820 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34291 42 91M = 34056 -326 GATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACACCCTGAGGATGCTCTTCGAATTCTTCAAATNCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTNGATTGC /D25=F3?3:9/@@0.B(<3DG;(B%?5#6+(>F"17DF%,$C>HA6F(,H&##88$":(6&%#=%$!@95*#7-D=5A55D="3=37F(E AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:26T19C9T22A4G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10785 42 112M = 10644 -253 CAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCNGNTCCTGCTGCNACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCA B4A;$)(:!@+#39*4F*D:8+'%>D*2E.4+A(4G,3)4D1C#(D+EEF1"0)>:;:7)"E>-+E7A/+B'#"$-++A2*<'(0%F6A09$&;B(#:"AF,3*8F/G8.?5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28T1A9A71 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4821 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10644 42 72M = 10785 253 AGTGATGCGAAAAAAACNGCGGCAGACGTTGAACAGTCGNTGANCCGACAGGCNCTGGCTGCACAGAAAGCG '%&0:8.5.??1A)D%-'8#<7>=$:%"8DG@D5E(+*<&@B=9!AG1"FH:0!E=1A60&E'7=";41":D;<;!37.=?(AC#9.>.A32-->*=:#E&4EG.-4D2&;2!A-G@1,A:765,(2@0B2FF/"D!1#./?4?,7;07E;$2,40D108H+,A?CH=2'"GBGGF?",$HB#$. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41T88G0G61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4822 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8298 42 53M = 8355 250 GTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTAT ,-!)!D2'!5$(;H1(-G1(4&8(!;@9'C$;3/&C#'4E@5A!!-;:E+-)8G(H*=,$C-E5!,))GA.9#:C=0CF!%@:'BD';22C0:,E&#C6+H!39/H!H>D-0@?=7"9)0'#1%< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:175 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4824 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47260 42 164M = 47486 277 CATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTNTTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAAT >G,&7@@&&"07?04D@,:?23#,(C>&CC(?%04G@6F:(+,>%-/A95F5E&F#22>'7G<,;B3@!+-G+8E?<:'*77;B=85(*/!B!F+=;@89:E/E>$?DC!HH28$FEH"%0&D=!<@?"997E,DD&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4825 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31409 40 131M3I15M = 31238 -317 ATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCANGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTGATAGTTGGCAAAGTACCNGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTG 99/3>*)50-G1,A<"-&="D)#63*.$&)#%6%7="9;EEA=:@09&:2?$5@<2;'8!4HA"EE;$)1EA4!'4E%,,B:$E+59)#B6C4.+C,299"AH@?;(($H(<: AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:34T59C17A29A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4826 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37531 42 43M = 37230 -344 GCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGG :?(?D3$26)="3-))&.D=3=$C6;)-'(&A,DC<77,@6F; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4826 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37230 42 203M = 37531 344 GCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAANTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGT 9+>)0E8;)?7F+7-%(D>(0!*F;6#*?#=H*-,5;C.D:@&@.#'/15G+8";F5B4B--6H*!?>4CC.HA*E!'25)=D-!/"@"D3?/E2::$86:4-G5B&=-H+&>>&F52G'BC?77!C82*6;'B#A801-D3&B%=&"<,'3D'08"4+HE3>A.%68G17!3)(.0*9>9<0""&(A18@)?F4&5285G+. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C147 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4827 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16012 42 75M = 2 -16085 GGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACTGACCAGCTGCAG 40G&?-244HA97D;#GH$1(G!/E.GGE#'&;74$652*,3-+9H,/.>BHDG"4+?39!/'42;9:<'1$3"8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62A12 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r4827 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2 42 57M = 16012 16085 GGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTN E;(G8H-/-="D&").?$2:?38.+AC%?95(9@)G4H*7%CH5+>G78"1#>DB6#($FHG/6)09%C%.*D:F'4>:?A35,5;1/,5HD/-$":=+-21#';0=)3AB+*41/9-3;49&%82BDG3,:515H3+D;B%9-G0$''20G28014E$9+%?/C9,;=C#+) AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A51T5C32A50G1T60G120 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4828 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48077 42 66M = 47751 -392 NCGTCCTGTTCGGAGGGACGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCT BG@#$<#!'?=.4."BH=C9-)&@44>*;7%DAF@02'-:=9'2@.F0A7B-?+C1E7+,D!9@$5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T17A47 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4165 42 215M = 4380 338 AACTGCGACTGGAAAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGAAGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATT -7+3#-C43B79B)#H>(*F)5>%*;>AA0"CHB2FH@GFC=B>*#$2&G40F79#%+9<"*:F?1H50D))+5-A5=F9381AE?D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T53T147 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4380 42 123M = 4165 -338 TGAATCCGGGCTGCGACAATCAACANAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTNTGCGCGGG A;9-B@#<$"(;97B0>189#:-;A6,D5B!>@H70B,=!"(CD?C6>-D;$%G&%$6&57'G?0$/F62&*/:=).<:4>-@67:-9"?-0?5*!+,?=(0.06E.&BA*.'HG!H2;6!-0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G88A8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4830 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15312 42 75M = 15567 348 NGACATGGTTGCCCAGGGCANTGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCA #$=?;'AB6G@.-)2/1(4#"B8"5.'&=!D#"?"8/55?E.,;')'26%#!8B'+!(7!#1C.<*C:?"6,5$4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0A18A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4830 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15567 42 93M = 15312 -348 GCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGT ;'!@6@F,B*C,10%H;8?21A;5+958:?#G,(5(+7C";+=1H)!!B93D9#<9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21228 42 73M = 21345 251 ATTCGGCCTATCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGCTATCGTTCCGTGTGGCTACGTCCTGATGCA -.7&-32%?;@&0+!B=91!FB=813E!3+,E%&%*#(6:(.',%5(+DG6?"1H++'-4:HC@42:HA0@A6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T32A11C18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4831 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21345 42 134M = 21228 -251 CGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTTTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCNCAGTGCCAGTGCATCCGGTACG =B3.+%*4A7D/!,%5G;$322'5CD,"5/E'213"F'>E&)9)*>61?/1B'*BDBF-,>'?1":7@A**>#1=0*7&A(@&2@'2-3*G9-7.F)%3/%))1>?9(6$7@,.6=%49$F3)3D;1+',45(1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:71G39A22 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4832 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12465 42 141M = 12296 -310 GAGAGGGCCACGGACAGTATGTCGCAGGAAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCTNCCGTNCNATTCNANCCANGATG "$#+))+#+&$("&#"#'!(#)#+#)&*()#$!*+'&!!#!($$#)%*!)++(#"$'*''#++#%($&"$%%($"!%+!%%%#)&(+!)("('("((!"'$(*#*&*&!$&(*++)+!#*()*"$!"'($!$!*&)%''(# AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:5C22T88A0C4T1C0G1G1T0G0T3T4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4832 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12296 42 169M = 12465 310 CCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCCATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAA A@!2!(D(A/!D(32=30=5+78+H2D;AF.F7&9!$/9;1:1'+&H1EC3'%&;)8C?=0*2!/3=,?A%H9-8"*@80FB2G8/5;(?"7(B!.FEHE5%E9!0B*>C9260> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G116 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4833 77 * 0 0 * * 0 0 CTTTCACTCCATCCNCGATGAACNATGAGAACGTCGTTGACGATGGCGT -;G1H7+"H+4,-E.8/5A0B9*"(<3!#9C*F>:4B:8(B3)>-;3?C-E.$D-$6#(&F86.50.H56E#F7,* .=D;?5?2AGHF49,C?#(#GG?BH%0.D6?.153?1('$>2!:? YT:Z:UP jpayne@0: r4834 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37468 42 16M1D78M = 37699 277 TTGGAGCCTGTTGNTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCCCCGC C+(@H+=%;,%&C=0*2!,,4E4.4/=$0G);D=6&B<1E0>,D($F+$/>A8?G77+53G&/FBB+.BA'%@4/G6.ABF:8!'AH5*>53EE AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:13G2^C73T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4834 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37699 42 46M = 37468 -277 ATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAA 2G&B9G,%=+=:B,4-G1)"@./&"6+C,8:#//4@48(.=C!)B@)BFD:F@87&AE+"FC)((5B,D=GE)!9("D$D;!%,C35C:0<3/8#2%.!H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C61G53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4835 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40965 42 154M = 40836 -283 GAATTTGCGNAGCTNTTAGANCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATCATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTC >&C!190!!5;&1('#0-8E'3*=59:1>>5*"(=%H3:#!4:C'G&D-?4G+E(AH5&"(E;95!B6!@$@86FB"&C3A07G',F<;@%+F8*CCHH6$'$G>,B*A!.2.8BF056&:F!48/5FH?)%)(4/?B2=,;#5..'D#H%!$0'%"=@.1%8%A0E<()F1$7&#>62$!=#D%B7'E'0?;9:'2*?E&,'4$39*7&&;HD*A4"@>*=@"(,?'%DEG!+7C,<;E& YT:Z:UP jpayne@0: r4837 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39117 42 58M3I164M = 39340 281 GGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAANCCGAATTTTGC /,'.,@12;.6(*/F&)CD>#!.(!;*/F0GBB((/D+;%F%#;.:"$4/*'H8,:8,:*3-13E+6$0BD#,E"4%:E0H4()$-E89".?E0&2.E"G##&<.23#$BHC'92F8%D/3?.>AE:#6)&-2C$*B&@D+;>2H30$05)E&4!3@<*C$)17>6*8+)"9=241C5BD%.4G5,>:EA*1E%<(6(.-FD"&A10?ECA3G7" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:210A11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4837 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39340 42 58M = 39117 -281 GGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGATGGACGTAACCACCGCGACA :16E)<9=FC?;D51@%6)B:8/,.2<+%0%(%F1>$/":"4?DGFA=52#.0>%%C.+%?9.$#;CBGA*$/+"()EC05- YT:Z:UP jpayne@0: r4839 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45843 24 41M2I33M = 45947 200 CGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCC (/07*,.9,56#)EE,2@G912.F+7<9H:@B0?:8%1+(1!+>5>H,7".@><()@32#,%C*"6B;F)CB@98" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:74 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4839 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45947 24 96M = 45843 -200 GGAACGGTCAGATTGATGTATGCGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCGGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTANTNGTNA (!(!&%&#$*$"'(%#%'*&"&"%*)*#)*#%%'(%!(##*"#)$!!(&$"!*%((!$$"+'!&%))!!$*'!)&*()%+#!#*&+('$&&!(('' AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C1G0T1A1A0G13A35T30A1C0A1T1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47505 42 75M = 47580 319 ATCGTTTTAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTTGGAATGTTTTCACGTAA *#((8@=1=)7(!#-*:6&'53;"DE7*0+"F<:@D+7=;/>G?!BF4<,;8H3)288/!E!!$'@1;+<-7C$$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C49A13T3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47580 42 244M = 47505 -319 TAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACANATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTTCGTGGATCTGATTCGTGTAAAANATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGANTNA #'$"+$#'&&!#+)(%*$**''+&&%&%*)$)%%'!!+#))*'$#)')&!&*'#+&)&)!!%&#+)(+)$%#&%')*#((%$&!&*$)#"+'"#$+#!$*($"$$$$%!'(#"(+&"%$'*)"!*&++'+*$(*'))%&#+$+&%+#$)+)*$!$*"$(#+#&!'%'(*(*"*+'#%"$#+&+*$#&%('#%&!*)%&$%#!*)'()%*!)$!+%&!((#*%"(++$($*)#)'*)*%(+#$"' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:62G126C22A27G1T1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39321 42 47M = 39512 278 CAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGC @1E8*H6"@!'(/(*9"/29'9*!?%48#/*3B0B0@!"!/.)-!'& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4841 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39512 42 87M = 39321 -278 AGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAANCACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAANATCGCCGC 8-;=@.<>B7$+C-:9,132#86-$$$/3/-B016?FG?E7@#BB#A6#4;B,2E($4"6C71":#=>:20$?BD:+(GFA;F8FCDE75 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4843 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39267 42 228M1I17M = 39512 348 CCTGACCGCNGCAGACTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCANGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAANCAAC 5./A/':9'#%%2-01.'"+=C**4H?@=2&H(7@)B-8*?,(%-6;!.-@G30/(($1"!)&+%9@GD-;,!6=,+BD3718,&DG.&+BF/0'2)CFB&)C5C"C0&5DBH:>9B=!!;1BF"*;@3&)%6&0*F<=%B8+50!*('!F:?9(GGC8,GD$'49(A%3&733=.?.(*8*G@=)H-@(;'EB.E<6%BF$.=2E55-0B!+;A!!C4!( AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:9C5G138T63A6A0A13G4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4843 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39512 42 103M = 39267 -348 AGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACNTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTNNCCTC $'#"'%#'##+%(%$!'%")$&)&(*#"&)&%(%)&!$!$$+'"'#$%)&'$"+%')'+#')"#+''#+%$(%$'$+$*''%*!$#%+(!"+(*+'(''*!(! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:35C61A0A1T1T0 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4844 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38441 42 49M = 38304 -186 AAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGA 3"H(@H##3.($H*@@'H,C25,F&>$<'"3?D()/8E.#F/"BA0@=D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4844 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38304 42 65M = 38441 186 TGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATAATTACATATGGTTCGT )2B5(.,5663,&AF>*!1=CB*.@1#%<83'H-<@CEDB4F;#5FH&3:;0?6',E@>"A-@C6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49C15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4845 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43382 42 60M = 43214 -228 TGGTGCAGACAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCNGAGCTGTACG #?8,6##!G63&1>1%*.4$%H,B.$A+&*,5&A'5<>('0?$CBC)4@( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G39A10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4845 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43214 42 129M = 43382 228 NGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAA ".C!5H,1E7A8HCE25(8A0#H+B;?B<3-,(5GG/;)$670(?@C4D#E-(F##.56+HB.%.+(&"'>DH3!DB+G=/)3),%@*AE8B,%:#D$&#D?G,;H>4)->!B>3)(2#6,)H/1#3%< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A91T36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9514 42 63M = 9635 202 CGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTNCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGT F;"-*7?><<&DB+**-/8"-4<@"?:'0F5"6/B=,2B+C4@0>?2(7>1@.@/H87D9=51 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9635 42 81M = 9514 -202 GGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGACACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTT 3851FC/9$D<7DF79!*1/B>4$-/@+&B#%=<::@96>4A54E--G,)9G/4(3*=;2$&@*E67. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4847 77 * 0 0 * * 0 0 GACANANGGCCNNNATNAAGGGCTGCGCACAAAACCAGAGATTGCT &(#!(!!#*#$!%!$)+")'("%%(#"+$&)((*%)"#%*')""*# YT:Z:UP jpayne@0: r4847 141 * 0 0 * * 0 0 GACTTCTGCTTTTAAGCCCGGATAACTNGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAA ,,GB8$/+1>698$?+GB-0320+6,A=ACD:=H?)===(1)=;3#4-*4"37G&9&-6%C.!4/E)5B)73<;7!)'A9'4$.F9@<&E)8'AG&@=G#-3>F(!7&4;0G,38:>,@?E)7/>%**<&C82<23+F%=2"$?")+'0=860H,F(@ YT:Z:UP jpayne@0: r4848 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45448 42 131M = 45290 -289 GTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACAAG $$!#&$#*&"&$+)#*#!!#+("$'&&'*)%"##%%**%++($(+*%#'(''(*#'&(#!#+&+*$#$%*'"%'))+"#'&#((*))"#(()#!)'+"#+'%'')$&"+%*"!'++&"+$!%#)$)'+(*) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4848 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45290 42 149M = 45448 289 ATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACNTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTG 38,B6$"6FA9$F1&%*G2@G>)(6.:+-':/3@)8?31@=F<693,%7$HFF!$4HE,16'01#7/=E3%4#G7'#EF+!/)%'BA)0%4;'B2)55E+&A+%&6*7EHA8(3AA3::!:&3!;,)0-'CHF*.+!"(2:AEC.3#52 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 838 42 128M = 666 -300 AATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATACGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATG 2D*:)/3="#,F!#(>F7@-H!/0+38.#,@:#=>;5BH1:<-)G>/E:+!H8D4:%7=H/=B:(7,/<'?2@C*#B9)?81'65)B/=,?8:>(4%/A,=(,9'H5,%8BC46E/!DG/+?'42?)H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G68 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r4849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 666 42 155M2I17M = 838 300 ANNACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATAACGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGNTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAG #!#.*(1(.AE$!B9%-34(@E:"(G"?+F1HC$.CC8@+"HH+0,DF/3+"4.,37-G3!;-%1?%:"9@:H+<'<-,@3->F5B?+E',95*B-;0&E+*+5,7('+C@8-,C;C(6#-?.6E4)/#5"66!;93E&1'EG)G&20EG;/&'7<@6'6E5/B7(06)'>7*5 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:0T0G0A29C54G16C67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4850 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24089 42 186M = 23786 -489 CATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATTTGGTGGAGCCNCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGTTGAACTTCCGATNGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAG B@=C11-#6A1B;A)/A$6&)B5%82CA6;9-)"G0/(?4"!1(#:25+G99'8-9EE24$1B$>,!CEF44C<%">249;,%#>F8G!E#.2.3)AFD@$,D&)/',&+BD.,=)0H8.H+&5E)=&8B#B6,2FGFC:'?3DG9*8CF))<8!B9.>4G3(,D.3#8/.A(+;E83"#*3&!5& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:64A4A5G38G12A58 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4850 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23786 42 303M = 24089 489 TTACTGTTCTNGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGNTGATATATTTTNGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCNATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTAT 13!/&,9H%7=*!48D1/:=#+=;#&A+4-1:&*:,FFB,;).517B9.!4/);=.8->&.!6+52<%+>E2?H'!7-#=!B%+(*E8F!(?G>#EC+BA'!3,:&C97$.96$&*+03:D0AF9@<;?#FH94>958E#<>F4!H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10T157C11A29A92 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4851 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16484 42 114M = 16598 276 CGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGT D1DC<'C;G$"9'<$=0"=*9&*FH6852=;-,<6@F,*6&2$*)A23"GA+;-=#3E"&=(>4;C,<(:4F,="%1;%>'5B3*+?,D#$5B:&G%ED=1+;42)CB,GE.B'&&99:@(#B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C39C60T44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32790 42 60M = 32641 -209 CGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGA AC4BF*+'42F"*&5-C,'$@!1(H0,3%E2$"%E#,2&/'ED!>A/)4F/8E2@H3?(5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32641 42 72M = 32790 209 TTAAGGTCGTACTGGTTGGCAACGCTCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCNTTAAATGCC &+()&"*#!#("!&*+)$*(+*"!*")")%$"(+(*)("+&#+$%)*#"%#)&()&(#"+$*'*&"&!'!&+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C17A37T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4853 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40516 23 41M = 40557 359 GCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATG !++?&)*4/>52;04EC;<&:81G60=+A,HAE//=-999C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T40 YS:i:-103 YT:Z:CP jpayne@0: r4853 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40557 23 6M3I49M7I13M5D105M3I83M4D53M = 40516 -359 GAGTTAAATAAAGATGAGCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGANGGAAGTCATGAAAANACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACNATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACGGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACC 9+%4E.)(:EF)9+:?'AH2*@C!<:D.4G8,(7H+$=+H-D1$$0-@;&8".>?386E$6F##010BD6H@#H)-,8*)'G+@4;*7%B::$+"%&?;GF6B2('#)$AH)C&;F>&+&>@-,4G%5-@2A7-%!%/2()48-=):"A?F7281A@@(=@5D&E<6;<*2"*)GFF1#.:-;0E.5!24B&!CG66);5,9(?))!>DE+H>&7.838%0%2B195E/2)!%DG;$@>4C%BB$>D%+@>$9C)D(ED'+$,9#*/1)!!D<178H!?=;#5)H*G#-D8!HF"3=,.&1 AS:i:-103 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:5 XG:i:22 NM:i:27 MD:Z:14C53^TTTGG6G14A96C33A35^CAGG53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45291 42 255M = 45241 -305 TATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGNAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTC *-'%0G./G'&*.E.;)*3;F%5-&!!+)!4H#.!CD;+#."(%2'-=('>91)2:;@)>'F)?'>4E3,"#!60?":/-3*""15GC/:@>BH?6@:-@"D<2()6>+>F#E+/!6<+D@&8B.=)&,$D?&GG,=H)4@9AD43GF'>6<"=B907E1>&91/$@9H3D,0"0'5?4,!A<9"&2:$(%3*!(F73>F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4855 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42881 42 104M = 42999 184 GTATCGCGTCGNACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCA ,4%,31?3E4H( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4855 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42999 42 66M = 42881 -184 CAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTC %+/C"E23C*:0.29,A@18#>$+"(%F(<5!%7--&/#,4*B);;0"GC52?;?$4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4856 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18342 42 44M = 18167 -219 CTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGG @0F32;9-&7;$,5>"B3=+*A54=C?+32;5,/8(==F;##(5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4856 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18167 42 140M = 18342 219 CGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACG $-C0A6*>+.06:(0)=2!1GH,G010(G@82"(($C!H(DB)*;H4-+1.,2%!;8%6F$;B,6:C2A%B/1!?&0(@/+0A*&0-%"@#56;0/69*(8@=%$=!64<3,+"*1DG=.EF-:;'-!E,HE4(DF)3', AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A139 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16303 42 216M = 16185 -334 GCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGNGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGNATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTG DC$@9&#-+19:)D(>;/G-@*!7+&"&GA1-*88<2,+8+?GFG?7C3<:##.,2"*%@<*1,3G#A).H*2!#EEG+:A8*&EA)@7808"-1G>3/+$>.(2<5)7$0<2>($9+F8(!)*@)7"5D9*8A85$.(!8.4&110G5F&<%& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C32G131 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4857 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16185 42 118M = 16303 334 CGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCG H%:>?B&75>A0138/7*7F7<4,32G9E7&&>/<*,7E:D@%&'G4?B?G;&>9$.B=!81!;,'?1E5.@<;$-1E4-;#+H$505&:"*7:52A,.<#77:23.%!?=>)3"!4" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4858 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15631 42 51M = 36069 20508 CNAAGCGTNCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACC (+D49,>2>>G,>07F'15"$B>$+?4*23)0.%'395B<4#B>(*031+6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0A6G42 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r4858 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36069 42 70M = 15631 -20508 GGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGAC ";@)B(>2F%72=&'B7180/<=99>=/2(.;%#89$F(G)D9+%9D1"HGBG82)'70F@G@41'G(.E;"D.H2B;.<94A+D9'0FA2'A&E'61<'@285B?C2$$63HH6(+221/F):D@B*0%06-%*5/!A6AF6D?,G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109T78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4860 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26734 42 77M = 26916 269 TTCAGGGAGTTGNCTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTAGTTCTTCTTTTTGACCTAGAAAACCANTTT +)!'&$+'%!&#$%)*%"")$!*+"''!&$+*(*#)#+(!$&'(%'&&##%'"%))")&!$"%*)#'&(+&)')%!& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12A34C17C7A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4860 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26916 42 87M = 26734 -269 TATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCNTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAAC %%-A,0)G25=>@@#2"792)3>6@DEEC'0#-)/=.F8#.A6+H7,-7,""9B)+(@8:/':6=(*1-H?=$'%?%2@*D03,0", AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4861 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24001 42 61M = 24062 282 AATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTAC 9(9E$"2E>(54(.'E#09D7$3;A9@&+;-;72#16G22@*8@4)B))%'.51%#(% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4861 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24062 42 221M = 24001 -282 ACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAATTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGNCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCNACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTA F3C3*.!5C!))3+.*@2;2<"F0!5!H!)F3)E='C>C?64!$'(&4!:85HD-9DA4$4,2##3%0.,1&$15>26,-AC2!+1><1:))CC0-7/E-*>H7!1B9=@@FEGH$*!(AG>@:-!$0>/@>A."A$E=&B2D8E=2C&!2="+*&F.0FC!DF4D*>B1,7AG:2+A2DF;%E,B?7H5C'8'2+<&8EH4F9;2?,:0,,=4BG-D.(/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51G85G45T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4862 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2140 42 78M = 2339 253 GCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGC H90B?/4,!*54+(:+.;=1<56F1$/E4@$C*F27;E9"7!& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4862 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2339 42 54M = 2140 -253 TCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGAC .1)!2#(=;%=/@6C>4.F8&D(3AAG0+44"$CF*A+/*'FC:#:'/H#< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4863 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33658 42 250M = 33908 358 AGTCGAACTCACACACAACACCATATGCANTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGNTTATTGAGTCGGTNTTCANAGTCTGACGAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGTTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACAACTG &)*+!!!($"&)!$)!#%#((())**$()&$!!%$+%"+&&'("'"*#$&$&$*$)((")$++"$!&%("'&'+()!+#+!%$(((("')*'+&')!#*#!#!#)+)$#*&%"&()$+++&*#'#*)#%'&'$#*+$)'"+(#+(%%%"(('"!(#"#((%"!+&#+$*!#*&!*(((&*)!#'($))+%#!&!)))#*&!)""*"(*(!#+!&(!'$%&**#'%)'$)!&+*#%#!+*)'!)%)%$#*& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:29T76T13A4G8C69C41T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4863 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33908 42 108M = 33658 -358 TTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTN G&"B,83"+0DG.;;"8C9-A8(6-()09=:A.>&69)5A3/&"*HF7(B-D)E=GE+6*90<%7%/G@F42+.2F'C*0=;%!:3$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4864 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22994 42 10M1D140M = 23145 261 CTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATNTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATA -6(-!:@1B:$&!/G8@"/66!"G;H4//1$#?<%!:"<,,3#5"!&,;*B1!60*5C@>(EBF?9)*?:=9/<$!HH3FH*CE5?*F&=8G0)!.H15FD%*7)1/BF)&C=HB8&2<9#!+@2?DH5-)7"*$06F9.!F?5G-13?" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:10^C25C114 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4864 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23145 42 110M = 22994 -261 NTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTNTTGTCATATTGTATCATGCTNNCTG %)!+'"#!*+!)*#"%$(*"+'&&)""%%'#!*#(($%"*(*!++%'&!(%)"&'+"$($&"))!&+'#*)*"#!$+%''!"#""&$$"+&!'''+#)&%#+)%&)&!#" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G83A20A0A0A2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4865 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6393 42 31M2I131M = 6555 469 CAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCAGANGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAAGAC &3<0*7H-7).1"*>4-C&@;!/C>%@5H.+#>6@89,:2,(979G(G7=E%9!2;&072G4C%$9#9$6!4E9<(FE8$9*G1,)!.(-2#24263:/A0 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:23G2T132T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r4865 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6555 42 307M = 6393 -469 ACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGNGTGGTGAATATNATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCNAGGAGAAGCTGGATACCCGACGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCGNNNAGT +%&'&("'#*"$$+**"#)""'$$'+')'*&'")"()("&!"(*")("+##&!#&#)+!+++&(!*%!"'()+%!$$%$*"%"&*!+&!')!)%&'%%'&$!)*%%#*&*+$"'&('&)$'+!))*%&))%#&*####&$!(&++*+#))$&+!%)+)")(($''($*!%$+#'%'%+$())"*+'%*"($+%")(&%##!&&+)'&!*&%%*"(")'+"#"%)!&&&#%+#'+($*+!)&'+%"(#!+$#'#*%&'+!&(#*!'#%+##"%&!)#+'&)&!""!'!+&))*$'%'#($'%"!#(($ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:158T11C51A19T26A30T0A0T0A2G0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r4866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41970 42 76M = 41776 -270 CGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGT "&7-0H6H$E/6@=B"/-6'E,904+@8(>"%FH0E=#3.38?1C!(,C(+E6!/)53#:?F!,1C-#5GE@/!A# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41776 42 60M = 41970 270 GATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTA +$"$"&)(&#+*'#*#(*#**"(#*(++(*&+#+*'!'!'(()()#'(#')($*+##*+$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4867 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41879 40 94M = 41879 0 ACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAANTNTTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAGGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGT ''(!##(%+#""%)#"+%%%)""*!!(&*+)"++&)&%+!*)!(&'*"+&+*#%$)'!))(!%+'$**%"!!+%#*(&$$"+!!"#&'""+')' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:27A1A35A21G0G1G0C1G0 YT:Z:UP jpayne@0: r4867 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41879 0 * = 41879 0 NNGNATNNTCTANAANNANNCNTNNNNNTTNCANNGTNGNTNTAATNNNTNTATCANTNGNTNCNNTNTANGNAANGANAATNNGGANNGNN "!$"$"!!"$!!!$"!!$#!""$#!#!"#"!$#""$$"##$#$"#"!""!!!$##$!#"$"#$$$""!$#!#"$#!##!"#$!!!"!"!"#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4868 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28844 42 262M = 28694 -412 GGGTNAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTGGATTTAAGTCAACNTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGCCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAG AC7'%B;/75CH+A>;E,7171+"F"!9:*+88A9&@;:08$5=2!,(#659@604)F@:'!9@6"/00.*$G-2'G65'-G%B6A:A!02)GD.+B/1E*;9CG:!%)3AH<*-C6D-%:&!'HE0+F.GC)&6>$6*)*DB4,986?4&E8!:4C+-+.9:.=HC);BH3E18CE?4)H"%D)8(!@.E&9//3,2@C6?C@)#&-6:)%:4)/):;>3.6+9-ED/E<4G3#%%FA(G1>H"C#!H2*1-D.6"3"5AA AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A69C13C113G59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4868 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28694 42 150M = 28844 412 AGGCTTGTNTTTGTGTCCCGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGACCTTGGGTCCCTGNAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGG 0489*E;C&E)+BH>'1D$6%>,7'B=+)%(+A3/-:7,',!A=)=#DDCD4-DC'H"GD'A8/F:#B'3%9B>(D7)HH%D)/<5(%B0H4/.0":-)E!-0'7C#&E02?<$=5B5%52!B5'#2A18+#4!3?D:'/9)0H92464@-1$#!7ED%3=E:!#,,BD4G#%)8. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4869 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45324 42 152M = 45516 233 GACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATCACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATNGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTNCTAA ?0#/H%E4986@7*G1-@4D#!%FF'9B**0*G%97B0*(&*1"=&7A9E8C*'9C-/*=(FD?.#%E38*&).=3-F@3/H"8H-.?79H)F7C>)&("0+@<)%6@.>3;39@B98EH:F5#9$B.(E7E:*3D.63F2A%-4(/7/,/: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:83A38T24G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4870 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31420 42 121M = 31246 -295 CACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCNGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACT @2@3&/+E"G?6%E1+<(:<$,2AF*/)=115?&!E@(7&C9"H$6E)FB=%'235+GD5)&B" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A61C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4870 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31246 42 125M = 31420 295 ANGTATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGNCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATA !!#";;7F>BAG!9GDF@.>163(4H%D)!%E!)5*C@1'B:5E;&BC7!:F9!F#D='8%+!*;G/?+AA-#>=42%>#"%:D>5A6=1=(+/2+&:*?FD"$%?= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0T1G34C86 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4871 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38116 40 94M = 38210 333 TATCAAAGCGCGATCAACAAGGNCATTCATGCAGGCCGAAAGATNTTTTCAACTATAAACGCTGTTGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGC ;"%4<;%-4;!:,/$'+8.#CB:69(EG6#,5:";34",8#->+'=*1(*,;;!5-";B4',;0/79)@8))C;2#6E;-E(A.<1%,E<>A4/A3AA2=-4-7<2;H6,BC590FD.(:/*!8@:,,"2>/=H7)5-?B33&"?8'?1'?&8.FHD>=51.&;B9>F32B';?*D)?*GE*<1>&A#7A+0('B7=.DC1,$,H7A3(>53E6 AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:28A156A7G30A14 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4872 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3943 42 40M = 4114 226 CATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACT (320G&=#'"C(;!$6<)"2FG%7C&2#0G3.+$%8@0H+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T39 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4872 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4114 42 55M = 3943 -226 TTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTGTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACT =5.:?:"8E-4=')8/%@+5CF5<69.>E&H+-'492!C:8A>4+A(+H?1;..*9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4874 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23856 42 279M = 24135 360 NATGCAGCATTTGAGCAATTGCGATAAATCTTNAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATCCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAAC "@)/1"#;2.7=4C5';E=*,=*B-@!>'?4$=>D$8'7-D1B;*?=0-F!?>%AA0/:?;'3'=?@$2#EGD<)9!H6D&>#--EF(0+(H-@1D1,BC01GF@-0F%!GC3%*BH;F@"72>9;D56E%7>BD-3".H)37B.*@2E'@-D@-D412$3#C*4)'C"A$!$6+-(C<;%H0+%92H>G@0>B:!!-!;1+AD,@0)F$A23!%7%*A"E('ED"H:G2C>@G&&3@3:99'.=AF6*H:"A39(6;:$;G@!C2@-9='99 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A17G13T203T42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4874 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24135 42 81M = 23856 -360 ACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGAA H+*2)>.F($"8;8%:4<4&'!.;23DG7*%<'?BB;;529%H67?%=3! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29123 42 77M = 29275 260 CGGCTTGGTGTTCTTTCAGNTCTTCANTTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAG @>(&3=8$.#&)2;+%=B&3;0)8*9=49#!5$)(8G42&H!*#G*0?C!*5>($+!/ABC'H4'E'5/-H/52*CF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T6A50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4875 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29275 42 108M = 29123 -260 CGGAAGTGCATTTATCATCTCNATAAAACAAATCCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATC /E02FE72&D7,64<*F4#@)H+B!E)G=76=,H+'+>6(*HG2@/1F<0:=.FC(!@D"CC38F4#().3E?6A*@,C,!H,72.:$(/5HC65998$C4>:@48$< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C10A75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28406 42 77M = 28248 -235 ATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCT 48884E*-7#&-F8+1<*!0",*125=1H258$H)'*E68HA8:94GD,?D#=.>)G$>$=G)'557<$7=D+-))B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28248 42 158M = 28406 235 CGTTGCCCGATAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCANGTATTCGTCACCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACANGGTTTGTTGTTAT #+)#&*!*&"#*"$*"!$)*#!#'****%#+#*%(()&!#%**)+&*+((!'*('!*&'!&$'$&($$%'*&)**$&"&'("((*'!!#!)%*+(&!%&&$(*$#&''++'*))#$("!%#+)*$*'+'!")&"'*!%)()&&&("*%""($#*&!#) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9G69G10G53T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4877 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21850 42 123M = 21587 -386 CGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATA ?;!77)C0*&<,>B!@,'>68<.'7B/4*E5DC@H/!=1362C'<7F,':<"$-E=$*C>>%1C>EE#E@0'/".F:81F2B0*GDF.'?49(/F'CH,37*7;7.:4(C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4877 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21587 42 263M = 21850 386 CTGAGCGGTTCAACAGGGNCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTATGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTNATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTAT 3.(F5&DB#),E2:.9/G@37/,68<0G1A-!=$*)<%25=FDGE*"0&;);>@"=#+7C<-FE8.DA%2.DH&-*,.7*C%#$3DC!(&F<(6;F>3!F<%$.<9D-D<(7A>92=(?FG;9&B2$848#'B%@:5,&)=28!$E*-!"DD;6:??1)31&<=3>0"-%2?>(?D4=?%'&6@'0*H?C(F/&B"?9.8+%DCF2G>D:#@<5":0&/#E>:0&(0B(&H&=?9B0(H%HA!EG8/.$/G8*F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18G45C83T114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4878 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12824 42 49M2D27M = 12688 -214 GGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGNCNGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACC 8B9G>21:-C<.78&&'GEE&,D,6:"*8&4GF!.:C,9?;)'%A(.:-=*9,)0)0'FA%'/A252!+HCH311; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:47G1^TA0T26 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4878 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12688 42 115M = 12824 214 CATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGNAATTCCATTNTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGG 8:#A?";2(HC*+GD,29,H><-EC!E%>*.<)'(6E6"/%B&?89=$)%7%! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:29G11A9T55C7 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4879 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22594 42 67M = 22449 -212 TAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAATGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTC A9-H=3/0./H,'#@&6%;.HB*@1F,@.+-=#8)(>(7+H+>$,@<66E68(2CBE@/BD>(!<"F@381GBA."!*1>9G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G112 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4880 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13820 42 142M = 13685 -277 TGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGGAGCNAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTNTCCACGCCGACGGNAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACGTGNACCTNNACNTNTCG #'$$(+'%"+"&%(#**'%%$"'$%%##+#'"#!&%#!)+*!($')%!$+"#%$$"#)!'&))""+*&!)$*&))#'"!'!+(*"'#*%*&&*)((+)#&%$*"'*)%)'$'(*$&')$(+#++"()#)&(&%(('!%%'*( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:28C3G31G13A45C2C4G0G2C1A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4880 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13685 42 135M = 13820 277 GTATGGTCACCGGGATGGNGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGG (58-0A*5;:4D:/.AC)9'2#20:2A'00D!=E8?=F#'5'0C"DG$(E%"CG4#/@9,6"GCB;F>%>8F30"B3#&#,8C9?="38*"89'#0A:%H$?3:/HF9?";=%$CD0"CB2#E--6-38-1?21" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C116 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4881 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4319 42 145M = 4464 224 GTGAAACGATGGNGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGCCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGANAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCT 77A5)E*6A&B%AH:7:;-?4-2H&>C$8HC$)91:"9?!)08BD((#.G0E(@D1G&+*'9@A%BF9HC3:-=,$4B781!GF5+%B?C.#+*(>7:"24*>%F;573D99GE:-:47/!0=GG01&B)64>+7H#76)F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12A34G55C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4881 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4464 42 79M = 4319 -224 TTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAG *1.?%?G5HB8&7,;61@AE@&'75.%@=!2D8//C"22!:)H8E7%G8+,."1&297)=>H'CD8!?*H2)H5(F--7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4882 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33719 42 164M = 33719 0 ATGTTGCGNCGGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTGATNTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAAGNAATGA ::,H"+3H03B45=2/8;?8%2C'>">(7(/@>@C/2(:4.:9/&F?'$-)450.-F6!BF"8//D3'D,%>+F>/:&>$'.4*6(,!$2,4:92CD9$<.=#.')%,568*+017-.0H8:"<7%A3)D,H%)6<01-/,7,(C4AE!F>;8?'<3= AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8C1A73A2C69T0C5 YT:Z:UP jpayne@0: r4882 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33719 0 * = 33719 0 NNNNTAGNNTGTNNNNNNGCGNNGCTANANANCGNTNTCNGCAGGAA #""!#$"$!"#$""!!"#!$#"$$"$$!##"!"$##$$"!$$#$#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4883 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24202 42 153M = 24202 0 GGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCNTGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATNCATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTAC E73B=*A4CB,B&)#<($)9=FD)F8EG-'2=H/*>?=.'.?20"'33>A,2$='#78>&4<6:!)000+$?4277$.24,B$24C=01)*B0DF(D-B<;A.+(!>@&.-<>H*:)7?895%,$7H(./!1;#B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21A43T79C13T35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4885 77 * 0 0 * * 0 0 CTTGCCATTCTGCGTGAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGNCAGAATCACCGG +-ECDH-C>H,"D$/G58A@F1/#54;+,G#0.%/3%, YT:Z:UP jpayne@0: r4885 141 * 0 0 * * 0 0 TCGNGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGNCGTGGNTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTA #$#)$+*($#+)%%$#+'$+($*%&)&&(*!&!+)#!!$&)$%"&#'(+%#$''#'+#$(+!)+('%+#&('%&$%("*%""("&"&!$!#!!!+)&&)'#%&)#*)('')(')*)"%"'&"$"#)$'$#"&+"#&&))(%'+*)%#$*!+%(%'"")(%""+#(#"(("%**++!&(%"&"'$*(*)((%%%')*#("!%'&(%#**$'(+(%'"!$(!' YT:Z:UP jpayne@0: r4886 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39584 42 188M = 39772 374 GAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTANCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAANGAAGTGA H)CE%+2B,?93?.)%#-AB@3G#,:E*5/F.20D3;2&1*<";5C(@%2,*$'6--/'A!83G"FC&?A9>>F>B7@)%>0B0=E=1*46,2.D0<@95(BC)1>!3!&12)*1-'43<4>3&'8=:G%?=4D%'/99%4#=,1B464&CD26@1G*8DB/50C/A<")9AG'3"8?7:&!)228&- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:106G73C7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4886 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39772 42 186M = 39584 -374 ACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCAACCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCGAAACGTCAGCGAGC 1%#>!<456")9-EG;D#D,6!8!CA=%)@9E@!;@"CA(7?"(+4H.;1$9+A&"AH/F;3:0(;57;6/&,D1H.1H9!,)).*5E#C"64-2.,+BG?1E!)D?#G637'#/+D:5,&=GA@0:G!+H@4:H&;3.+H)+@B?+: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4887 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8915 42 72M = 8767 -220 GATCTNACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAA )!E&9=G4,5DGB*H0HAB%/8C#(A=)0'&%"HD?4$E#609;)"*F),G""'GC8.9:>(&!-=/5=& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4889 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2732 42 176M = 2929 256 GNGNTTNCGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTNTGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATCACAGCGCTGCGCGAATATGCCGGTTAT )(&$%(#+!#*($"!)%%*''))!$")%!*$)*&+%&!()#&*)$&!%+)%#+'*$"$"+'+$#&&'&%())'%"!*+!%)'(("##&'&**&'+($'%")($+$#)!$"*&"+(#"$)*&*$*'!'#+&#)#$#*()$'+)#+)*+$$$+(&)&")""#!&*($(%*%'#%+#+" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A1T2A93A47G3T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4889 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2929 42 59M = 2732 -256 GGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCC )3(C9@%+CA(5B:+1?A=F>':=-/+"A#)?D7(+A5/86%@<0E<<1>=/0.1;F-% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4890 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22788 40 56M = 23018 272 TGTCGNNNTNTTTNCAACCTNATCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGAT !*'!)"')&!*)'#&!"&"&#*+)'!*#%#+%(+(#)&'#%&''!&)&""%&*+"' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0A4G0T0T1T3T1T0T1G1T0T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4890 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23018 40 42M = 22788 -272 TATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATNAAATCAATTG 6-(=%B/2H0*.0B/0B2(<&/470D018$?G-5/$<)(4%E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T10 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4891 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30913 42 127M = 31215 348 CCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCNGCTGCCANAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCG (#+&&%"%+)"#(+#)&''*&'#*%!)+%"'%+()$!($)$!)!#'"#"#'$('*)()'"$''$&*+#+)+!($!*+%$!$+&*#"*(!)+(#!#(&%+$&(!*#*)+%$)#%(*#(!!$)!+('($ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C7G55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4891 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31215 42 46M = 30913 -348 TTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAA (B82H!3;*05/D.';6D)D:1D"3;0FA&*2F45F#G;"/&:9.C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4892 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12728 42 78M = 12659 -147 GAAATTCCATNTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGA 5:-.2%G-%*1FD(F4H&8G+E@3%/2DD&?1,8/9)$E6:97/&4A11'?8)81=$4:?A/-/H"D97(CA395C5- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T56C10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4892 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12659 42 48M = 12728 147 CGCCATTGGCGGGGCNGTNGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTAC DE.+:(:!G'5;HG'87B!'9)%.9A0=F4,+):;9DA#)3<::9=.> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T2T29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4893 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 352 42 125M = 159 -318 TGCTGNAATTGAGAACGAAAAGCTGNGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACG A;=&5$'?9"C:*F-1&:C%%7"'B':$(1:/CE%%5CH97FAD3+,;3+<)*/=E. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A19C25G73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4893 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 159 42 193M = 352 318 TCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGNTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGA G0/-08-+&-;-C18#8!1-8)$3<)21>++52E9.!8;%(F8;(@(12!*<(90587.F57!/<5-#1/$+?'+9,,2BH5B)D",@&EC'8>*>D)1#8F(==!)-=H4;9<03%0/0<&G0,19)%8D.09E3)19!(7=##5>CD8C-H''<(8,"8"9F);9)#$2H2*(!%/9H;)DC;:C(GD::4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:146G46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4894 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34637 42 76M2D160M = 34448 -427 TCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGGGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCA >2;C404"@<$B*!7,8:#72E*1@D8""8.0#7,.06F?60#'E/:;0,'>&(-,B&=-4G8+&.?>>+5*E6)*FB$0;83.+/<3G;6"-7=B2'9<1"22;9@7)30$?41HF#=>1E>'4&-GC.D7"&>)'/:E:43B%8@;H3?B@+0>B8B"?C66;7%&H8F(D(8GD&).A!%79"H0:F8A%,:41)$G91:*>8%H),G3F1269/7)C1/G AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:76^GC59T37A62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4894 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34448 42 189M = 34637 427 GAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCNACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTAT 08=*>03168!3;0+8?%@"#1,(288,3-;77A),>&G@E21E>/FB;$?C,)C*1:E#?%@2HEED%&H!G):6B6&FA96)!$B9F-$4H/D)FH@1'5954D*'"D25-1,**&+92174D+)HC'-<8:%%,C'*,B*=+&,4*-2&98(5257@+:8>2/05$+&5E473.:89B0B)8B'17+=C,FF.GFGG/0F7DG;EE70)=9&F'$)%#D'CH.H?$B(?#*7%<72:!@>#*=%?"%"8/("D?F1GG!24-BC.;D-4<9C3E5.":E!()*9<03.!/B4'8F5.E.+"0#/#H.=B+0&@G92!$<=F).=2A":;$H;@24&% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:170 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38473 42 103M = 38576 186 TCTNAACAGTAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCNA %))$)$&'"'%+"!##!$"$))&(**&!+&''*''#"(!'%'%#)*)*''!""+)"#$("#"&&+*&'#+)*&(!!)''"#!!$++'&+##"'*"''+$($%) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G1A0G1T3C91G1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4896 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38576 42 83M = 38473 -186 CAAGTTGCTGCGATTCTCANCAATAANAAACGCCCGGCGACAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCA )*;$!>E!7#%:E8(4(><*H*7"!%!D&674D$3DA%9>A(,BA5/0):D,9;E19)46/<5G-2A*BEB)!1&+7!"C@$9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C6A12G43 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4897 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25642 42 88M = 25503 -227 TGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACNACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCACTNNGT !#$$%*"&(#&'"($%%%%!'$"*&(()!'$**+$$)*')$'$)#$'&#'!$))($%"(!!'(()&'+*(+((*+!$#("#+!%!%%( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48T33T1G0C2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4897 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25503 42 69M = 25642 227 GNNNTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCNAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCT '"$#+&*$(!&%")#!"%'!"!+'+(&*)%%#)()""%(#!)!")'$*'%+#*$+*%&#+*"#"%'!*% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C0T0C35C29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4898 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46195 42 69M = 46195 0 CTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTC HH@:68G%9,E"-<#8;,*B?::A3C=8';'?3<=18?(?+;/$8H(/*9.D@=G3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G26 YT:Z:UP jpayne@0: r4898 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46195 0 * = 46195 0 NCTCNTANANNNANANANTGNCCNTNNGCGGAGNCTNCCANTCGGGGGGAGGCTGCATTATCCA "&('!%)!#!!#(%*!($##$""!)"'*&&%$*#&(!&)+!"%#'+"*'!(**)#*&&)!$&$) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20336 42 274M = 20187 -423 GTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGNCAGCAAAATCATCAGAAACGAANGCATNATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCAACAGAGGCTGCGGGAAGTGNG 81C1.05#?E8"AD5(D&;.0H()FA?381.E"HD2D7+66(B643DF,8",G:"A@):D!<(H5?!1&9/8?@D-)*!*4.**2+--=/BH+#A5(6),&1($;F42:$")ABECDA,='68)-='421?A0,0#4$"D2"GFG"DG&DA"/'6/9-D20<@4*+C$#FH?@&7-9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:46G22C4C177G19C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20187 42 149M = 20336 423 GCCACTGAAGCTGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGC ,*$=,'#+*!,(:$'F'72*:*'%'-2.>54D36*@'A7G(476G7E02$5E9G659B7CD*,)2"3&E'.&>H;B8!,<81@B&!#H/"75$1=%>?:H>6/>/6H-((++?.*2'&DD-=A>7:#A8#B*AB,1):3$B*FG)!(>9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G137 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4900 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28245 42 61M = 27988 -318 ACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCNACATGGTGATGATT -1D#'#-70H,.6&.DHC'<4#?:G;/5-$-2-!3+E@.=7BG7&=(5:@>5A62+!0H:8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4900 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27988 42 96M = 28245 318 AAANACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCNGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCCC D>(922()D):!!2:4/3)G9<.(<,.B:(>1*D;<--.=6+%*HC@=2#)/@G1B>9*;C7:EF+GE9,E9D8>D4*9HC0'9:;$!-CC-(1C< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G55G34G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4901 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41614 42 141M = 41755 219 GCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCCTATTCTGCNTTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGNGNCGGACA 6/G=#:H&D5FC>1#%8F"@*GH,?8GE':%0)%*&.GC*+DB)E?.4B%<-('D369+4@5<#$B'826)5"8=H4%!?F&/*1+69FC/(7:&@C*$>=8539 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28A8A94T1A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4901 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41755 42 78M = 41614 -219 TCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGA %;#)9.H-F2".&5!?"%'2:=,A72>;G#>$$2FD42=(E0EH',:HC@D')?1EFF@9A/337@#)7F)/9.-.(G4%()E$BH%)1"27>;#,H=HBHC<(69!="@B#<(?*&)#'!6'$E$<-/)E%("@1:-F1&:?#4&,;>3,,1-!G8'>038,4G*>%@E6A*7:/3)>$E1461$C1F%*',DB-*2%8:B%;CB=,7<$=B:4@F9?#0H%(/+H!25;2BE?B27F&782%)CB)A:?H7'8BH%%"'*;:@H-1<&A-&C@3>D4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78T49A176 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27536 42 126M = 27662 431 ACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCNAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCT BF<+/!=H74=9764?@)1=8/&A81%01,F&:G:3)A*&0)F:!)796>F76(A$?'#9#'H&H@A*A%D,C,7H+E@AE:2'B*5(6-/6H.28'!!C:F/597C9#%:3=*D649.>2>)F#$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T55 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4903 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36266 23 74M = 36046 -294 TCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGT $3$3CF7!:GEG;@#7;!)$42=)21A2E;$@FF9H+09FC:+FHA)<'58&3.8!8';*7F&8/"(1+38/@6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-65 YT:Z:CP jpayne@0: r4903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36046 23 147M = 36266 294 TGAAACCACCTCAAANGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAAAACCAGGAATGTAGTGGCGGNAAAGGAGAT ,/C,?A/>#1.':);?,"!H,>>$D6)."7E/>"FB)//%80#)/;H,%850*/(<*B9"*:2D'!G9*8:21:0@;%GCD!G80>8=.,@3&:#B(1;3FC%.?"'3*');;7=;&1#%FDE1.=#0&#H9A$+9-&5,C):($#@H7)&H*E940!3';1,#@43;!&92C' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G49T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4904 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10215 42 127M = 10342 250 CCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTT C'1:>"'E.#=E=5#(%83:%-GD?"C!5*%>*A-HDC.+>B*9&564;(FE%>8B<0GD0$;64?'+!(39$H9!"E7+D2=1)5:&>@,1.**?)8-%4226#B#):+/9A//41>925AG+82. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4905 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31495 42 45M3I97M = 31637 245 GCGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTTACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCAT %3"1&H@:)H2=3:.2$*E&$D@7/BH5B+2!H&F>):E$2#!+:2$8A6273B8:'F"A79'C;;'93,$5>)*D& AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:0A55A22G62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4905 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31637 42 103M = 31495 -245 TTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCNATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTNACGC &!%&!&"%*%!&+"+%$$''&&*&(+#**#"()*(+$#%"($+*'!%&*'(###+'%%*!('"+%#*+$$$"!(%'%+$*')%'(!'"#)'&#)"+'+%()*) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70G27C4 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r4906 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45314 42 136M = 45192 -258 AACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGCACTAAGNAGCAATCGCACTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTTGA &(%(%+($!*("#$%&(!($!*)*&+(%!*!)'%"'#+"'$&"$'&)&"#%#)#!)($!("'+)"(#%%#"!$"(%!("'$$"'!&()#+*)%(&*'$#""**&%!'($($)'("!%%'+"*&!#&&')%(&+%)! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:68G6T7T1G47G1T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4906 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45192 42 56M = 45314 258 NTGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAGAGGAACAAGGCAT #?$6*>H*+C&%BHE&83F-?,>=.6;/3*+"($/DA51!E@$*,A?"0=,;>4+' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A41A13 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4907 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17422 42 66M = 17422 0 CGATGGGACANACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGAC -5682'0-0?B"(;)F..C2-A)>@*8@55/0:+F#B,&B=5FBEC;#4B2@244,F#G"6,%3A< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C55 YT:Z:UP jpayne@0: r4907 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17422 0 * = 17422 0 NCNCNNNANNNCACNNANNGNCNNACNNGCNCNGNCGGTAACTNNAANTNNTNNGGNGCNNGNNGNCCNNNNNNCNATNNNGCCGNNTCNGNANNNNNCNACNNNANNNNNTCNNGANNCNNNTNNNNCNTNNNAGCNTANACCGNNNNATNNNTCNGGGGNCTNNGNTNCNNNNCNATNTNCGNNNANNGGNANGTNCNNNTNACCGNCCNGGACNNNANGNCNCTCCNGNCAAGGCNNCN #$#$!$!"#!!#"!"$###"""$"$$"""#$#"#"##"$$#!#"$#$$##"!!!$$$$!!"$!!""!#"#""#"$#!"!!!$####!$"#"!#"""!$"!"#"#!"$!"!"$#""#$$!!$!"#"!""#$##!"!$$"#!##""$"#"#$"$#!##""""!"!#!!"$#$""#!!###!!"#"!""$#""$"#$"$!!"!"#"$!$$"!##$"!$##""$#$!!"!!#$#!"""$!$#!!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4908 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1915 42 139M = 2127 286 CCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAAC 45&&*A(!$.(7;$A4(3!,BG?%@#8?A7&+35-3+(#"!@/FH&$<45>-E3==:9H*G&-D7&';$B'H7>;+*D@.-:H7=2;$C>)0.%:3(D+5D&'G81%)8:-;!C+'C=8'E,;& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2127 42 74M = 1915 -286 ATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCANCCGTCTACNGNNA "("$&$$$&+$!"#!"'###%#)!&"'&*$("('"!+&'!'$##"#+&'%+)(&(#$)%$#&)*&*#++")$#( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60T8G1A0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5116 42 55M = 4858 -313 GACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGAGGTTTGCGCAGAAGGTGTCG /%(C5?%01/E&!42'$,#/+.@,<#=/:A*EGE)/F)'<*HG#C$?C,66.)G$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4858 42 46M = 5116 313 CGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGAC D>&GCB?/(/F?(-6:.3G%C:>70-."43/0@?> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4910 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7436 40 52M = 7202 -286 ACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGNGNANNGGGGNCN !!+$(++(#+)("(')('")%"#%"""+$$*'$#++$"+'$$%&*%%#(#(( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:39C0A0T1C0T1A0T1C0A0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4910 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7202 40 41M = 7436 286 NTGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGG !B<.41D#'-'.&B5C.>58?,6A?>'(1!09E*2:;00?, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A40 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4911 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20194 42 52M = 20290 253 AAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCAC *E6.:-;?(D26.D88B&;=#'7=72F"+<#A);6$G@77,H;$(CH&B;GA+!38ABD8@*D=#F&7B"3.G=(*9"*CEF$06;#<4)B2)9-F%38<*"<);!3$50E6><$8D'E:/,>85%C0G16B,6BF08A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:157 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46208 42 68M = 46008 -268 TCTGCGTGATGATGTTGCNGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCTTC !'$!*"&&!&#%!+'$"!"*%$!&++%+!!!"$#+$#(#*&%()!"((+)(#)*!&(%")(+#**&$) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18C10G35G1G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4912 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46008 42 181M = 46208 268 ATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATG AH2(04-#$D."'DC3)&0E!GA@7C9&58,C/E":!D77<=%F1F>GF*#8H53.@4*+%0;/83;7A9<>HCB-D"D/&**G-7"G5*,,(F'%G91"(H!&$GE*BG8(+:2C>!&=4E>.E+<,0:9F.!AA.)72 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:181 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4913 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32987 42 220M = 32876 -331 GTGCTGGGGCAGGTCTTTTGCCATGTCGTCTGCCAGNTCTGCCTCTTTATCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCCGCTCTGAGCCTCAAGACGANCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGNCTGATTAGGAANANAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTG :11.6@5&7"/;<(578EE:?06A,E%&"A?>5:*0G&*;/26,&=>>B.1H<)!H"CCB"AG>!'&590)"D@0*49>>"67G(A%4=B2,?2#>@+(3/82?@9$2F%,2D!@&%7*!DD,'3@"434>'D)%=;<@:+56EA$4',.331G4*"5) AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:13C5T16T11C34A19T70G11A1C31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4913 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32876 42 58M = 32987 331 GTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACAACGTCATCAAACGCACGGGTAATGGAT 8B<,G0%G39$3B1>;#,,66+:H5,7@&H51A7/%3A#C0E6+92@F!!/643)/)= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T26 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r4914 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45355 42 60M = 45453 294 TCATTCGTGAACTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCNCGCTTATATAACGAGCG F32H3"8,%?"E/,>0+6?#E@90:8#(;C=D<(85=?E%)&C-44(40=?"B+%,."5#!:?7(;*6?D'F*:1'555,2$(9*0@)D0!7B7?-)F*'="#8G;>DACA(:)!FAB#;,.0H5&,94?H569"=6;. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T32C58C41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4915 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19896 42 121M = 20017 304 CCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCANGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGNTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCGCAGA <7G>"1/BBB&)C'*:2$0E6>$+>B9#%@(G;41A@&/5%5%H=82@,&):.+/4;+8-9&4?C3'GE*H-3;G15F&D6G@:*E$ACA>">+D*$.CF?,B=0#C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43429 42 97M = 43558 232 NCCNANGTGNNCGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTT #)*(%("%&$#+)#$#!'*+!&%))%(*&!*$!))%+$!*%#*!'+!"()!%&)'#'!%'$+()"&!##&$"+))#&#''(("'!+!'"$#()%)(# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T1A0G1G0C2T0A86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31206 42 55M = 30936 -325 CGTTTATTATTTATCTCCNCAGCCAGCCGNTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAA 1@H.7C:E1A=A';0H:0.!7)&HE#0,)',,;(:@)>("!!;2G;C?,>G#H,@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T10C25 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4917 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30936 42 158M = 31206 325 GTCCCATGTCGGNAAGCATAAGCACACATAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGTGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTT 3--)-$%9A-)=7&@G>.6:'2;%;HC30%GB%"@!++G7-"*G=#+%+%4%2F!G**87EDBDF"?AHC'A!H17#5>B=>-&-C62>*?A:(:)G"1(BG:4"ABC-2!=%=G%6!9+;>$4@D46='#B-00G*22'*D9,53A*?2=>F8-3*, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C15G103G25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4918 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1278 42 228M = 1133 -373 GAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGNCTCCACGCCAAAAGNGAGAGGCACCTGTCAGATTNAGCGTGCAGCCAGNGNATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGAT -)3D!=E@=.25=F)B+=+8<+=@)C@+>B7>%0CB#6(D204C@D8-F93%C'.2?-:F#3;A;G)$E0!-583,0+>&7#*@DEE0",/0/=3;EE>>++&7%F/%03"14/>(.6<2%9742-5?=68<9/:#+:!?GA>4@:;(8!#'(<&+%B-+&<+F$C!99>5,.6,D(3">0B=0D>5@G.5"?#(4*AABGCC'%<=!'8*!4($$0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85A45A13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4919 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39133 42 42M3I118M = 39330 264 ATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGTAGAGTGGATGTTTG >D6<58"E&96C&'(*..BD8*6232->D?C4@>';D%C>%#,.9+*;F5+>A;.G<1F144=2BGG,B*;;?!8&4+&&@C$!7,,!9>===4"2(!?<1$&<%=@C>?3&%.3*/9:?1$83$2(E?B@??$H(9)B3:D#A@/3D#=@6&*)(0&H=AG1 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:145C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4919 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39330 42 67M = 39133 -264 GAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGAC ,,C64#;G$G-$,3B#?&307292E5;*631;3:5-&2-DH9=C"4.27D-(;+:5@<@DA9H3E$+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4920 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19375 42 125M = 19500 263 TTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGNAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCG ;;25:110973B2#D,+#;-=*B78%06$-'2%%C/'+H<.1%D.84!CA*:-G'&F#20><4-36.*"$5==%@$;(4?C6.:2>A#2G4%?H8*B6/('E/#41% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59A34G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4920 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19500 42 138M = 19375 -263 TCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGNCTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTAGAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTT (,@822!8)D-9;77BBA2-(;57;7-G-!*<<9AF!'!!0AEA&!$$463.)'G54>+E"!+=8-;:=&)HG("<2"F+#>!6/=C?,?"72#@7@D/H91D6@;/*532A.C4)DE!#?%*?C7!'#0A+@+2"(D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A36T61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4921 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41959 40 3M4I85M = 41742 -305 TGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAA BB'?9">*B!?#D#:9?'6:62.AF.;;2&E.)<$$G"#H. AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:88 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4921 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41742 40 53M = 41959 305 NGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGNAGATTATGTACCGAGGAAGAATG #9%;1,%23.'9;'/H,?>"C7+0<%E4!("$G,B*268D)%7+)15DD++4F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T28G23 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4922 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3511 42 116M = 3511 0 TTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCC +"#%(%+)!'($((($&&#*)#"'$"%#%*!"#'&#')'")!#**&#(!+*"*)+%&+$*#"%'#*"+#$*$"$%*)+"*$$)$)'&(())%*"*'+(("#!*"%&!"#!'**("% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:115T0 YT:Z:UP jpayne@0: r4922 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3511 0 * = 3511 0 NGNTNNTNNNGACTGTTCGNGCNCANNATNATNNGCNTNGCTNCNAGCCTCACNTNCNANGNC "#"$#!!#$!$"!""$$$"#"$$#"#"$$"#""!!"!"$!#$"!####"$#"##""$$"$!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4923 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37604 42 307M = 37503 -408 CTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACNTCTAAGTGACGGCTGCATCCTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATANATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTC *@0*E;!68B6?+=4?H>">F""0>=!)946-58?-5=6F?0ACGG!"C,>-8CH4G5/>EGF3F+1*.'BG649HB!?<8@:;98H&!2@9>6*G7$!87;05A!*/,HBD+9.8H53=6!D.2=:';D1'*0*0.$B#+$5">D*$F6'(/AEB@E?/))!2%%!G*=0"A)DGB(/4A=%$+&F3#-#';"1%!C"3#8A)>A5$3/4,;>'7C?!2@&9/E8'28++4))G7:+)+9;(65:&.G:-1>+AD!.+14'>1%<:;1-'696-68 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39T18A212A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4923 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37503 42 101M = 37604 408 AACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCC E:EH0B0,111.AE?#DA58#:-?6)0G=./E$B:8+C1("<(B38D-H3D%@;8':+%B3:*>9B=/1!B/"D:H',1H/3A'*G0(8@-162A5#$*83 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6620 42 122M = 6847 269 NACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTNACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGA $&H,?<8974448";/57;"(+,%76061G4(4@/7(F'!9>B7105'9$"14.7A(16!1?$%H>+A*'"/9A&*D:9H=%CG-CB<&0(&FCG:*%GE"#"3;30&B%5C-;3%!E62#0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C33G87 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6847 42 42M = 6620 -269 CGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTAGCCATCGTCG @9$5;#@#/:125'#GF$+12&B*%0B>1?AD.&$2D?&/9F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4925 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1087 42 42M = 895 -234 TTCCGTCGCTGGTGGCGCTGNCCCCGTGGTATGGCAAAAAGC 1;=@97A()@!),EF152!-%,>@+?HA?FG15H?..%!B<, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C8G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4925 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 895 42 51M = 1087 234 ATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCC 1+5-G,;B./'#+7CGH5;2,-4?!+1$-6?$?:.'#613=D)A4DF?G>% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4926 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21679 42 142M = 21435 -386 CATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCNCACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATNGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGT #D/9A3119326:;=+;D/'&#%*E.E6?7*GE0E08/B"&+#3%#A:6667=A(6;:!$09(D*"=F#G"/$.A(,.)F-6-C)65H7C*4-484,1AB&66&:F87>"B-;'C%A1@@DD%!*4FH%+8@>6E88..,2)6;9:*:A4D/1-BC4/@""#6ADEB+"E(>9E&@8&4G.@4F00$AECB75,263;>7%-!/?6H5<9F))C->3$<3$.C;='E!+@$F%!@G9#26;''&)9%70@178(&,G2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:213G14A15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4927 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36395 42 62M = 36199 -258 TGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTG @+4;B/$+77,"6D)!>-2DF6D==?D.0;H"(.%/6&%E%6:GG:;&?%%#64$'E$*-EF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36199 42 40M = 36395 258 TGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACC G;D!;5DC"CEB"=#?%E23.+?136?:,,521D9GB:0GC11<'6&5-9<.&/!%2/ AG;4$,3CF485G1G,(&4B+5+:=H(*-:**3E4>4'1E+!%=3).42?3DF"=:,(-/%/57(95,*F>D'?5,41G<6;"C!)6:*2H@0H,9/4>G@.+$?$">B3GC)?/76/)D@7(+=B3@*&.41&$=$7)8-A,B(8<)=,G1=G>8=8$G03F)2'.-#88GG##E!H6G/=A1*$AD=(%4D=.)&:B7*"%/"7*0;94H$B+9.D'@15C0"9%@A3955'&,7!<))>7*E'6HD&4G8'65,F@81F%?#D:.28H./$/93++'C?#E9$*!E9*?,3!7=8'%6B7EE)12-5(:3=,4":C%AG*7<,E<36 AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:148^AGAG27G24 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r4929 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23231 42 49M = 23023 -257 TGTCATATTGTANCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTT A)3113&9=;B)0H8D237#1/"0&4B93>>F"$AC:7*.E@C<)?*,0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4929 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23023 42 52M = 23231 257 NCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTAT "+$*''&+**%""$$+"&%%&)"*+)!)'$(&)"("'+&("*!&'%)!#%() AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4930 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34922 42 123M1D259M = 35305 500 CCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATANAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGNACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGNCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTNCGCTTTATACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAANCAACAGGGGATTTGCTGCT D/1"CD-"'!')"&-#$&DH3DH1E68,38AE?#&-F+;C"++H4.,!8D7G0-!$2(?!@C<%#78**'7%A!B,GC6H1*H0;42$#/?6="<9E*'B;C.E?B9%DB75,(#DH)-8?&9%(#8;DG(>A).7)=*A$?#*:F'*G@BG2"-D5E/.57D;(2*G;+9BH+3A38%.=C=A1B3@9;H%$*B-=70=H9<2G*)*'$'>'.>B7'7><+F4$;.);/F7459D8!*G9G%%'@1",8E1(<)$<$86&'D#"H18+C'+*..3%,;")>-0">.GEC6(G!?C,1D>3?@,2DG.0478=;-C*"F%H,8BF64-@G#A43&3BEE:/&2GG(#9BE"/$A'&74>-$2#8F7H:G0+7.F". AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:78T44^G67T34C31C28G6C68C19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4930 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35305 42 117M = 34922 -500 TTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTNGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAANC D04F69H:$'&?".?GCD$8H>>73&<@%,'G3F;:@@$*C*E!H+/>G621$5575.0"H>%+1+6!1&%#7D:B;&9!F;0!3)+=)( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:84G30C1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r4931 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9630 42 187M = 9817 256 ATTCCGGTTGTNTCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGANCTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGG ACC!%4C@-F!%9?,D@?)E&//3!?F4$&D3G(41=(76-@=);2"B44$E?)/..?/?7@9/)(E;-4GC8#&"=,8=2@=976)H936)BG"?8!!E=%&0'*;0B("&$9":01&G1&$>30:HH5"9*34E.H:B/2*&%A@#''9C%&9AH'%(;"E(/354++'-<$@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A125A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4931 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9817 42 69M = 9630 -256 CAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTNGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTC C(%0/4,E+->>#>F)%2"A13CB;2',,!!<&+$.&&)$#+/>#1H6<28C8G4F0D?4=5<=5(?E0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4932 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31227 42 84M = 31064 -247 GCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAA ='5@F")!E.F%F+-C"-=>".2C>$;.D;7.$#6'?;=>4G!H<1A25!>!$9+GG+C.&;F4)11H&=3.B.6):"G$H%5D8F,)#0#"G.*5*E#-!B.@>!;9*1=";-0E>8G)#H8"2<,E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C47 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r4934 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45198 42 60M = 45301 227 NNNNAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATC !!!#+%+*#)&(!'*&+$#&!)!"&$+"&)!(%"*))&+"#&+%'$%#&+)!)('#'&") AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0A0A0A56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4934 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45301 42 124M = 45198 -227 GNGCGTTTACAAAAACAGTANTCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACNAGCGTGTTTATCGG D>B0#F.>>=DC06()B>?<$9F"16G1?2$3-=9/4C9%C(9!<$.*@>9->=+3345&$>*B@H/&%&A6%(=@#0AC?,7EG?/2=-)-D$G&@44#1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C43T46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14897 42 221M = 14743 -375 GGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGNGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCA ?8CBHH@6'-!3D%GC.>00EG'E0D@/"%+!&.'E%#02>:=D*>(@#=@.&'*/,B3:G9/.&#@D%;A)?.3!5>5:'%5+D5%>B,H;B1)E%);2D/GH=)?AC(6,'!8"+D#@02B4$A?+67+F,7.-3@9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C177 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4936 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 614 42 54M = 463 -205 GAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGTCANG &(("#)*'!"+'#!'"$"+''))()*%(+'($))%%&'*)&)!'&+(%(#)!'$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49C2T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4936 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 463 42 79M = 614 205 TGCGCANGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTNGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTG ;.HGF7'$2-,14F7?A/-*#8!1#/)D&-6#:H<%%9D$C:;4*?@'27;<@,5==?-@23?B;=>=!=7CG0A?;H+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G47G24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4937 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47660 42 107M = 47491 -276 GTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGANGAAGAGCNAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGANGATCC ."C!%G*D82:;/=CB*C$#"!,08EA?":6:G#(,D7CD4.2?%?%CE<;74642=$B>/1=5'63EB2D!7+8E8:--;=3:=4A%>*:*487>:-<'D+'H1D<<&4?E0+)0$>@"(4>(CC:2A2"<1%!F:?6F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4938 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33267 42 169M = 33436 276 TTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGANCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGGGATTCGTTCAAGCAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAA D1D;@7@6A>B*<84:97-'2:!2%#,,*8?=9,1$.$F*00D*A"%*E0,%G:/A%F-66C?0/4.C(D*&@3#7H-3/20?D;D47G=*8&5!F-H%0=F2AG/)(<4;.(&2<292#=&:!-#1/)/*+7/?8D<)'CEHFA6*:GG&+#;!)":&D6$) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59T70T12T25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33436 42 107M = 33267 -276 CAGGCCACCCTGCAATGGCANATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTNAAACCGCACTCAGGCG (22A+3&7=9=1"H6E9/E;*B$5.C%8C?C8<-C7F!;+4='$<,:HG3A?+&>%'4$80A@DC/H:"6<*54<&?& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T69A16 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4939 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10632 42 114M = 10798 296 TCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTNTAAAGCCGCC :'$5H-1-2'E,#/H5<38H.9!.@9&)+2D=5(#)$>:842,>D*&-8/1=;<371.D,8G>&>'2)2>A3*>6/AH8+55:$.H?)774)%EC)6$.%FDA;;#41917A)7+$<4!+39B*(-166*BE-E,@*"2.05'D&/A282+:4"7>:GB%'AH@>6((*4)97?!CF?."8> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:130 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4940 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27873 42 133M = 28006 371 GTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATNCTTTTC :?)B#?.C-F=*$-9.2&2@C-!"B%,(;4E$A%>H(0)H4C-2>BE?*5FC0-:H>)"CH)H"1*4F$$H#&*.BB=-+6:B(.0'D2:/68=/!$4)<@E%%$+%11>ECH!:)-#@,+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:126G6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4940 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28006 42 238M = 27873 -371 GTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGGTGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATCTTTACGCCTGTTTTGCTNTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCATTTCATTNCGCATAAATCACC =D&0#1"'%C%4!8F!=3F6E"2017G=0<#78'.G>HCH%8$>7/*4HG'-5072+:B9A4+D#0(/H>!'>.)1?57<6"C"%0#B$2..8A. AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:57A102T17T38C6T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4941 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41816 42 128M = 41721 -223 ANGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACNAGCTAAAAGACTCGATACCGGCTCTTGTNCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGCCTTCGGGAGGGA H$>$!/.*%*GGH3:,-G?"!FB@,>A(*(95+!$%.&&,?-3E7)3&)$"E:*"E&32((?.,@#B:"#=.:;>A@+-'EC;-:.,F%5='@=E:A<".F+9+!G"6":F0A98!3F5'>'"DC*)E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T44G10T17T39A12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4941 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41721 42 95M = 41816 223 AGGTCATCACGGGATCCCATGNGCGTGACNGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCNAAA @!@/7:<%?B/=82,=>.074A%7*4:"?>)44"E59?B6+#.<.,=/GFC@9F@/2#;@E5"AGCG@0A;G.*3@++-'A<2'5<740$)%+G< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21T7G61G3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4942 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20390 42 86M = 20271 -205 ATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTCCAGNTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGAANANN !$''%"&(*&+"$&!*!")'!(('$"!"%++!*"%++*&%+"!'+("'!#'$&*''+*!+""*##*++()('&&'!)!'"+%&#%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:37G3C38C1A1A0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4942 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20271 42 58M = 20390 205 GAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCNCCGCGGCCA H5554%!40*7#>37%;8$/'<@B.9DFH7;/"A:.6BC':G8GEF$D';*C=-'/8# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4943 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46249 42 41M = 45974 -316 TCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCAACACCGCC 0-B8)9>:#12G@B>&"?0*=:@0(7,;G<0556:(5/3#? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4943 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45974 42 143M = 46249 316 NGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCTTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAA %21'A)D1?606FEH7G30H$:0)@=-C;,"@@4C;875A'F>64>%:@7@*1(798;(5>#BFEB,*CG6$"@,>01;A)8F6H>@9:5E,>,!*#7:7F3;>?5=*D*"3<5$=D'%6C=@H36:B&!B.H.&(C::-++%"BA30@1F%:=FB5#8,;';$2@H%2(;60?=GB-F422 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4945 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34192 42 68M = 34021 -239 TTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTNCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACC FF%98-D&8*/?@0&BBD.<862,6<3C;GB#2:'/$4@C6/:!6E1G..A"=(&>@9,F*27-(1:@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4945 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34021 42 78M = 34192 239 ACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTT F08=E%&A-'=BB)=4)C2!8*>4;6>@#>7'#G0+F3-)1F*;DH$E2C<7(->,.D!&G*0#0$)-:'"&/)=%7! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4946 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6133 42 90M1I29M1I153M = 6042 -363 TTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCANCACGGAGNAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCAGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGCATTTACGCCGGNATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTG A>@&-5C64D88G$#='@'=+30(='/)$D>H3>E($3G1F1/71+3<;1/(/?6!@BE8E#:G>529F>%!7)7:2$5?<,!DB@#9+.<7D51:+&3>"A)2,A2? AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:105C7A54C47A11G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4946 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6042 42 91M = 6133 363 GGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTT #DA$&-=,5-B7%:77:+?H$@#G,:0C!C50&);19GFC-1>7:);@1,4$*?#&<53-F1;83>+!.5:F3";;(A23.%2="*.93!; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r4947 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22904 42 101M = 22724 -281 TTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTNTTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGN 17'%?(/)$A#FB5*&$(41,F*!)07:0GG%+38%&D4#G,,<)?8)>*FH9'2G0"0C=3"('+7:#@/31A#5/0)8A$956;AA=D#D8+H&)"25% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74A25C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4947 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22724 42 76M = 22904 281 TTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTT F,B';1;1"3.5,5%4;>A*<0@+?6:=;:@HC!55!G<@>2."568337#0!6E>6054A7$='&(=%F'3@BCA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4948 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3005 42 55M = 3237 276 ATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCA 49/!01D>-"81/.%8%53C!":!(G%B(D&5&<%?G-&:+E40*G>G/*G$)1F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3237 42 44M = 3005 -276 TACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACN +"!%&'%#!*('!!%")*"##'#%'&"%)!#++%**$%(%+*$) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4949 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33643 42 48M = 33691 651 CNTTTCCATCATTNCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTG )('(&$++&+*$%(!!)&))($*'$"$((")(+($$"("'#*#)$$%+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A11C33A0 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r4949 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33691 42 603M = 33643 -651 AGTCGCTNGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGNCATGGTCCATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGNTCATANCCTCNCAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAACAAGATTTCCAATAATCGGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGTAGTGTTTATTCTGTNATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAANCATTTCTTCAGGCTTAACCATGCNTTCCGNTTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCGATAGTCGTAGTCATACGGAT >@0;D'7AE,7A;-C,0F06;"A@0GGC1D=;+$8A-1GE2D3.4*24D%H.*-):@94<2A.-)>?54.:(&"E@G*624B&",'(8343&0CCEG;*1;B'?5B:1+-+6=D%:&/:*.0*!,,B>C)DG91A6&!"EFEAG=&"<:2E-G-"!)9.((8$F-9F)G*5B+8+1;9H>*B8/)F=))<5;"A:EA'0/.->0.<+7AE745:(41E-9H;G01F&6<6'?$H'(/DA6?2B(@+F03825!,$709)8'/!,7<*65>D+&FD'%>HB1%,E9(@5/$-E9B3,;@(5G!/;2!:+<#G'G$CF09-$070-?.9@*8?8G*4+#"*;B8#;H8&9EFG*#/)=D%D8?(?12A@!/)8=E"1&%7+B9%E?869>$,B+'CEC5:<@A%D8.*"=HC2)-+0G:1G3F'76(#*)7C.0%"43#%H3.A#C7-C1?!D7D)=7GA3E;9*/@6<"-18@C:#CF9G>*FC@"&!'E2-9725G4'99G:0<#A""9D*7@D5?9:%+=/*8-1A03E#+>=/(ED<$%/=;;@!<*<4"#A96:3933:H-;9?"F/-;@#1(/6,'"4=%4=*;8.3+"(@$06 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:7T135T7G65T5T4A34G16A73C14T127A23A5A54A20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4950 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36406 42 59M = 36229 -236 CTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGNNNN "!*%+!$!$$!%(()'$#"*%)((+'+*&+%(&)())''&!*%+%*&"'"'&"!+$&!# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:55C0A0G0G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4950 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36229 42 92M = 36406 236 TNNATATACCAGGCATGATTCTGTTCCGCAAAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATA ('")#)'%++!$!!#*()&'##%"$%*)#")&+&(+(***+"#')$(*$%"*""$"%""++#)'#("')##'(!##("%)'$(&%'$(")(( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G0T1A1C23T61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4951 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28545 42 72M = 28766 270 TNNGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCANGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTCATTCCTCNG *%"")&%%+)!())"&##%'##*(#&!$'$!&%)(%*%"'&)$&*(!+(*%%'#*#!"#'))%)%&(#!(!' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C0A34T24G7T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28766 42 49M = 28545 -270 TCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCNGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAA 4?>35?.;H,#@-)@)?2'2+-=C#:*B"@/4(',E-%')=&C27%)8: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10859 42 111M = 10688 -282 GATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTNGCCGGTGCGGTCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTANGNTTGNTATCANGACAG ''(+'+%$$+&!!"$&+#*##!+**'&)$)+#%+&(!)&"&!+'#$$*&$$"#&**'*#)*&(%(%!(#'")+("+'*+!!%)*%+!"*+##++(!#%%(#''($"*((%" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:24T9A58T1C0C2G5G1G2A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10688 42 108M = 10859 282 CCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGG 296A?G(419GH/-+?"A)FG5E2)9-'36-1%!!7$AB%0-7)-E8D3.>?/)"D9F37?/!$!4*@00G!1&!9C#8!E%@F#:0?HE/B( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4953 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2150 42 258M = 2408 490 ACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATNCCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGNAGGT /;>-CA))45D+,.9==807G1,(<5D538*>2'@5$;F.!"4$0D#*0D96:FF+4G!;69650.!504?;5G?#C2E-H5-E@=<*9H,40(;'>!/F)*;3?E9'H!$9A<37BC/=E/H<,:DB:G4!"8$2/! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:118A134C4 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4953 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2408 42 232M = 2150 -490 CGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAACCGACGNAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGCAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGC %2GD1+"!H(>,AE-76A@*6$@+<&0,(F;7>87C@37H&%1F.2.?D&29+A5EF$B39,1&-0*5'0@.. AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48G5C99G77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4954 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6527 42 94M = 6705 236 AGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACAATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAAAATAANATC (+!"('()"!!'$')#$&%'(%'')#!%%(*'!)*"*#(+#+'#$"$(!(++#*!++#!#*$'%$&)!$+$"''+%!+&"**(!%!(('*&(!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30C53G5C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4954 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6705 42 58M = 6527 -236 GCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTT 9>B8EH3!DD4->"=><#F<;>5?(+H9316":#;#<'7-8;>1!:#?-;-*,H12*; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4955 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15545 42 141M = 15686 285 CGAAGGACAACCTGAATTCCACGCAGTTNCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGNCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACNCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACA )+'(%(#""%)+)+"#%!'(&(%$+)"&&*%#+)!!)*()&$"!&))&$"+&+")$($##%)&""+$&(%)(("&)"'!)*'!("###%!))!)*$#"#$***#'#!*#'&$"%"((((#&(+(&)!!&(*!""&!$$%$% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16G11G41T38G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4955 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15686 42 144M = 15545 -285 TATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACA 1,0/;C82&3,+#E=G(:#809E*('F++5>++%75-0C(09=*HBD!9=;5:&$.29+B=5-,D2-G4'B&,A/BH?)7%+"/#:@48%30-D=E1?9(78(5/3/.'27F,?37>*G3<9%%F$%9%HE+#"#%-=G<+;*A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4956 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42438 42 79M = 42120 -397 ACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCNGGGAATGGTTTCNCCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCT 4,=#-A%*2E=-!8!,;%/A##=+>-@5,(%0!H:$00*E26;<8A-:B'A"3G1@%/"+HE8$):8A)9E99G@5/.'58154%$C6/A&(B%1A@1-2#=8B240=HG!5D6"E10&-0,41<17&:>A<(9&,-'>><("+D'H($'?4F?!"?/-E4:#);)"77G5FCF*G*"8(<8G/2($C10,5EC<5/>@+E5@?7*6!=(/:"&"61)/)$2,&%B<93G+G&*0?.+'?1'H2A%=6<%A9,/!A24-3"6)'<@=982&0@'<8.8%'2<5?+'==%7'%3/E(3E5?9>'"#%=082#2>275A")D:H)6ED#1.:%)'%=!:?,.9F?9.5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A34A211A24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4957 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4366 42 175M = 4541 217 AAGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCNCTTGCAGGCCAGCTNNGGANCAGC !+&)#$#%$)&+')$$*)*)#%&(*$%!)(**"(''#%*'')(*$%+)+%($!#)"#%%&"*)#"'%(!#)&(*%%%"(%'((+"(*$&)%()"!)!*$%*%&&$'('&%!%+)%$#"#&**#&"!$**"**)'')&%'""+'')'&)*%+"*+$))$&!&'*("$%&'++)*)" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0C148G14T0G3T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4957 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4541 42 42M = 4366 -217 ANCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAG )0!5(0.E,'/7A'2F")"5">*@0"#."E:&E/D=G).",2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r4958 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27861 42 138M = 27740 -259 TGTGATGCCATGGTGTCCGACTTAGGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCACACTAACTGCGCAACTCGTNAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGAT !G@F/%/(=.+/&G'+5E+!A41"G&C<94:4@2)4-6"29!0+.$'*,>E!"=132(?"=#7(HE.)#&&>+C*6C8898.=66;4'!B!C,=3?:)?.E-FA.H$21H/, AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24T56G2A15G37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4958 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27740 42 121M = 27861 259 TTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCANTTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATAC D8@!95".@=;3&C238&!*+()'/;6A7,58&<25B?:&,;=94:8@$E,D',G==0,0E7E0*B/748B0@HF/"HB%43D<8H?3@!>"31&#$H0#B$@2"7CA).D5*59.9)4"C-16,#?(6#;B%A37@3(=+)$7HE'ED3B=38$H6-H:)H$;@@.(HF/!&*+82:9G-8B:2/GH$55-:1&9)+A3)7:5:45@8)7920)'+6B3@>37>1+%H<1G& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14T34T30T38T125 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r4960 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43447 42 83M = 43611 213 ANCNTNAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTT '&(!(+#)*$&*'%'!)%%$+'(!)!(()#!"**$+&)"("$!"$!#&)+')&('&"'%#*'("$*"(($*&)*(&*$*%&!( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C1A1G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4960 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43611 42 49M = 43447 -213 AGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACG G7G,?3/CC>C%6HB<1?&6!0CH7C(>,B'5->E4H?,::,"0:/977 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4961 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22572 42 162M = 22734 275 GCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGA H%4%?@<51G:=%;#)/2&F(&G8/+%)C%#F>14178/&;C"2*+E=D=0<%27FG17?$:33*"?.H?*C4*FE*7/?,8A:;#=,*%('$<&5;;%E;"$>4%@E:?AAD($H=6=>$"(A!.HD'B9&'7(D?@4H:?DH1%+.*2()$-3:9*14C/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:162 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r4961 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22734 42 113M = 22572 -275 ACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGNCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGANATANATTTTTGATTNT =F?C))";0@<@CC'B,"8/:-H.37#D,(F#.*A4B+1D"((/D6)$/C%*>7##>*<&@$(C6B-.=4'.0H+D#@H3&"D$58$F:0-8*2B0%:>A'/E#$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34T61A3C10A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4962 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45379 42 180M = 45281 -278 CCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGNGTGGTCGGAGGGAACTGAT $F2<8,%$C@&9F;EE2=A-5,A:>HBA<$B216:9)#<=3H#)CC03B?0!A!DD02#F;*C,!+G#6%GD!%G@%0)8(#>A>-+DG*%+.959&.>G<#B=;?<.A(0H$1#3@C*?1;@<,&6E/&@15-'0'%G7?C"52%(<>E+7$'.8/*$B7"G:H720>&>'<=36CE?8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:160C19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4962 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45281 42 98M = 45379 278 TCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAGCAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGNCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCG E&0==<=4$"0@)+D-57H)>+;&&);AC!H5<978,F'%4190."D9.D).?E&$818%@C3-';)!6F;$!159D0+"1!)A0%.B4EC%*0H0DG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A33C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4963 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45963 42 233M = 45963 0 TGTATGAGCAGAGTCACCGCGNTTATCTCNGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCANTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTAGATGCAAAATACACGNAGGAGTTAGCNGNTGCTAAAGC &8$BDB61@<#44H7G;1@%!$)F!>685BF8H28,*4/D87&D>1,1!@F&"(5<'8?>FFA?)H7#$F.".44#>?5H917C.1!HF@!372F$0F15/*E9"A/8("@FDF3DH+!+,*06-F8$2HBA()7/':2"/;8D!H&6G!)/0(A7?=$)FF8EHBA3G?335>61?H-8,8@#26<)98:7GCG7.5B!).)'4? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21A7C64T99C15A10T1A9 YT:Z:UP jpayne@0: r4963 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45963 0 * = 45963 0 AGTTNNANNNCCNANNGCNCTTCNNNNGGNNNANNAGGNCNTNATCNGGACAACATNNTNGNNTANATNAGNGAAGNATNNGGNTCGGTCGTNTNNN ###"!!$!$"$$!"$!"!#!$!#"!#!"#"#"#"$!"#$$!#"""!$$$#$$$$!""##!$#!###!#!$!!#""$#!$!#"!!""$#$#"!!#$!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4964 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-20 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:35G123T5A131A38G14C69C75A57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4966 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28503 42 43M = 28717 268 ATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCAT ('&#$$+#"%'*)#''##""*(++!"$%"!%+$+'(#'&%%&# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4966 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28717 42 54M = 28503 -268 ATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCNTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGN &%>>!('C*91'=,F1&7(%8?"(79BH2%@3-0B4=7GD(# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25T27C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4967 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23078 24 92M = 23078 0 TCNAACCTANNGNNTGNCTGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCNTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTG $)"&#"!%(%"&!!##!(&'#+!&(!*$!%!$!)%!&'!!#!+')#')&)!!)*#'#*%!#$)*)#(&'$"*!(#&(%('*#!$+*!&(+&# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A0A0A2A0T2A0T1T0T2A0A26G47 YT:Z:UP jpayne@0: r4967 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23078 0 * = 23078 0 AACTTCNTGNNNNTCTNNANTNGGNGNANNCAGNGTNNNNAANNANNTNNNATNCAGN $$#"#""$"#!!$!$$!!"#"#!!#!##""$!$!#"#$$$#!"#$#"$!"##$""""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37759 42 65M = 37577 -247 TAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTT ,757H,8!F.$=;@*C'*7%%(6+$83G,3(9A'C1:-HF3:#;3>G+B.%"#.7@BBD)4$;(: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37577 42 56M = 37759 247 CGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGNACATGAGAAAAAACAGGGTAC "+#%!*%($''")#(%+"($$($*'%$)""!*"$)#+('+'((#'%!*$+(!'&'$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A33A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4969 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19261 42 54M = 19023 -292 GCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCA ,D1AD,DD858-1.G)B!@B'68C56*'2&A*&.",3*(#:""-*;;!1B: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4969 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19023 42 86M = 19261 292 CGGCCCGTGCGGAAGNTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGG +4BB!+.D'$5*$2@"*=0+A+9C#!'*.;7-?;"%3B;,3?AE?4E2)"0.E)20&*@HC.BF'+B'78G.FH0&$)<20%H0@2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4970 77 * 0 0 * * 0 0 CTCGTCGCGAACCNCTTTCATCCGGCACAGTNTCAAGGTATTTTATG ,.9=&#=--C92F25/(&'E'6,$C73'38*6D#>(45=%#;>50<: YT:Z:UP jpayne@0: r4970 141 * 0 0 * * 0 0 NGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTT =%+.3+03C)+$@901;G":C(CG7)6BF=E*5++/@E&6/*F=#!E$4>G&;DB#(@-C-H*3!/56E@51?,-/;%1; YT:Z:UP jpayne@0: r4971 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13588 42 129M = 13429 -288 CAACAGTATCAGCCGTATCCCCTTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAAGGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGCTGGCGGAAGATATGCAG 08/>+G3,1H$-*76:/"A:-/,>D>D-85<,*-CB&6C?CG%(HA@<8B3:$$*@0>+'BD7;3GAHA=H'-3(7B#3G;GA-C%!:,%!FD;(/-'1<3&?H@)2"/;GF<9F;!?*!E4:C(!;A+ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G19A25T63A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4971 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13429 42 92M = 13588 288 NTGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGT !+")&*$!%))##%##)"!+&($*('"*''*#"($(!)*'+*$*"%!&()!'+&$&!#)&'!)((%"(%((!)((%$#*#'%%*(#)*&&)) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A91 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4972 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31605 42 42M = 31378 -269 ACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAA =2"/6A/,7=,4+E4=58H&F7D2)0?5=,&:>@,F<32#9G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4972 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31378 42 40M = 31605 269 AATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCC .#?2E-5$F)GE8$F65-6,DAHEA1!0-35??"!F/+/< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4973 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15797 8 48M = 36033 20563 CGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACNGTCTGCGCT 226/HDF&=!7:22C#8%"$4C0"@&E%"1G-!)*8GG:58:!-4@&H.D6D?!,9&;,!,GC<$FC:4@+G0F0;2=$:D4,?5*$HE1=3'!?@5B+5H<&,?AG&16E%!EC+<$4"<=$><4'?*9,G8@)G?-0<4+B6,*B0#92:*3!4B,!12=.&9#H9'8D0?$H,/9:")!4+@3;9526B%:E&:-ABG1"E6#<$/!F'>:*C8H9A;:6374115%9/,@A;3#:28:0C7F"B AS:i:-122 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:3 XG:i:12 NM:i:34 MD:Z:0C2A0T0C1T2C0C0A0G0T0C3G3T1T0G1T2C2T0T0A74C15A199 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r4974 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12903 42 81M = 13127 300 GGCAGCATGGNAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACG 1&9,2=7:*5(E*-F"%.H'@AA54$"A33DG1!4;(5,(+C9AD&8)HHF&2G6@D(&-#9G9)@D6@$B=F.6*3-8$* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C45T24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4974 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13127 42 76M = 12903 -300 CCCGGTATGGATGTGGCTNCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTG 2?H%/%@:%E?>5<#,2:$3*6A&1$?)=H:%B%A90D6=*F1D)5+/7F0,+C+448"DCB.=0C=,;-9<%08?0F'!A0H4F?"02F8),?1:#307(2#D0*?*$8A(;@@@@A0@.#,!<4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4976 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24567 42 124M = 24453 -238 CAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAAGAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTAGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTC /-49?%="-FE%'8,&3+A8%?B6E+2&=9*4FB.5"56),.0/F$<6,+G0CB@@8CC$!'"@)!=16+FD=1$2).$(F-)G"9@-5>9C%.>A.B9'A-';"!/E:E!3>=!(;"47/8G5 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52T27T43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4977 77 * 0 0 * * 0 0 NNNNGCANNGGAANCTATTACGGCGATCCGGAGCAGGANGTGATCAGC !"!"(&($"!%(&""!&+(""''!*%%+'#$"!!**+(&'#!#%'"!) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4977 141 * 0 0 * * 0 0 TTANAACCNCNTAGNCNTTTNCTGCATTTATCCTTCGTGAT %*%"%%')!(!"'&"&()"$%&*++$$)&(((#$$+#")+) YT:Z:UP jpayne@0: r4978 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2069 42 17M5I57M = 1486 -657 TGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCT ,!,!00A9EB>FD;?/?$!'?D/2!,/#5:#>"C67 AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:54G19 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r4978 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1486 42 583M = 2069 657 NCCTCAAATGGACGCCGGATGANCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCNTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATNTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCNTTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCNTTCACANCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCNCCANCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACNGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGANGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACNAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTNTACCCGCCGGAA $+*(&##"*%)!'%#(##%"#!)(#%$+++'&+)%($&"('%$)+'("!)'$)&(%+*!%+($"%)%$)++"&)'*)%'$###&#+""%%$%#%)#)!&&%%#%'#&'(#*$#"%&'$$&)((*())%%!*'!&*'))")!)&(+#%"))#'#"&$"%(('*&)%$*!()"$&+*)&'!+%$&&$&%$($%"%%%+(()*"+$&"'((!($*&$)"!"&'"%%($+()%!'+'%(#**(&&*!""&"$$'(&*(#$")*#*)"+!'''%"$*(*)+"%*('!&+!%!#%+*())(#$%#)%)(+%'#'*%"""+(%+$+*'#%+!$!)'*$!*&*&$%#$'$+)'*%&)"%'&$'&""&&#"*!'#!*&%(&!#!!!%#*!)#(#!#"*'$*'$&*&+&#+*#'"+#())$(!+'"!*'"+!+(+)"*('"'#$+'%('++'!''#'+*$'##'+*'&#('"*+"&#+'('")$'%"+*&%!$'!!&'&%)!'")&#%$$"#"("))!"+#+($+%'"!#!***&")$#((%)$&'$*(""++&!(($((%*!#*#($#!'$&"(+&"!&$$+()&!'&+$"+ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0G21C31A3C47C33A53T6T22A3C22T66G33A93G123A12 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r4979 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6112 42 58M = 6291 301 GGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGC =0/@*7704A'+H)0/:D):-75:F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4979 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6291 42 122M = 6112 -301 TACGTTTCGCCGATTGTTTCCGNTNAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGACGGGATATGTCAANCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCT $=B#&,)F<"4='-09(,HE@E<;B*.%6:,1'+2?9!=F4#E"8.F3'*B>@$207=+)%4%;$$DB*;(1+65*+9@.<*G.=&7E*/-=0!AG?667A80*-)6D$58&$.G/..AB>5 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22G1G41C13G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4200 42 83M = 4333 304 CGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGANAGAAGCCGGTCNGNGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCG &6G.)B>>01$10 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38T9A1T1A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4980 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4333 42 171M = 4200 -304 CGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCNTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGT A=!%%%5",,>C":#6'&G!A7)C8"BE)5%:>?(#,.7H="5837/0812A1?3E(,"8/;?8$!"&*5*&GEC/!7#:&,'$@&=+87'=B=G8-BD,C6@/9D4#0;G+8:#42.%G(>@.&473=8'440-;?.:=@88!/D3F;#!&7E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:129C41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4981 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41839 42 57M = 41642 -254 AGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTTTTGTTCTGA %2H(+=%@/.)('-!#16;C882/C9E10@/%-"2:,-)EA6:9E=-$E>4<:1*)G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4981 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41642 42 48M = 41839 254 ATATTCNGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAA 6@).B!=A%D:)#?@@'?(E;,(,=!5*GC&(C64-0<@6*005'A$G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4982 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28256 42 78M = 28468 346 GGTAACAACAGCCAGTTCCATTNCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGAGTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTC 74$)#B+A,*"2;C&7)B<-@0H/*>(.0(81<*=C+70&E05.5@:$$F5-,#F5'6C89%2"339=56+H=&8';5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G25T29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4982 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28468 42 134M = 28256 -346 ACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTC >+4A;(140?19..C9=)D%58F6%94*H*%4D,"H,7F'":::>@:D)@>8!*@91H:"1B::7&$2BH2=.57<"..:"%=1)"4-9+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4983 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21523 42 102M = 21639 225 AACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCANGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCA /2C(<"H7&C"F!;"$3%,68?5'G,D(:$+/+8B,H(<=*H54=)@F<=<(:>.-)D6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4983 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21639 42 109M = 21523 -225 GGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACATAGGGTATNGCTTATTTATCGAAAACGGA ?3)690.<>B,%C?5&'7()*;/,;74@,#042')'CGC*H+/*)(.7*8(&F0,38**6(+<4@<"C#D*.C$FH6!4#5*+: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80C7T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4984 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31222 42 61M = 30988 -295 CCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGNCCGGGAAATACCCN "@?C+0#C%)*>F0"='9"((;?1:7+.4&6D'>C-9F1$2$5(891,6C5*7;B7-A.-" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G13A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4984 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30988 42 111M = 31222 295 NCTGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCT #"@$$'D*9B5D%9*GF+':C$.853:>0>&B1&,6H$EH&!/.583.5A!<%%74"0!%,9B0"0(+A"4/$@8>:''>)$97F46'*7#%=##@F17 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0A109 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4985 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33786 42 85M = 33786 0 TCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGN "'$('$"(!'%)""!'*(*%#%)$!#!%(%*'!&&*#$&&(*+'%"!'&(#()+%*!'&&&&+!+$''(&%)()$$%"'#)(+&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84T0 YT:Z:UP jpayne@0: r4985 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33786 0 * = 33786 0 NAATNNNGNCNTTNNGCNCTGTNNCNNNNNANNNNGCNTAGNCNNNNCCATNCNGTCAACTNNTGNNAANCNCG "!$$""#$#"!$"!#"#"$"###"$""$"!$!!#""$#!$#!$!$$"#"#$!$"##"$$!$#!$#!#$$"!!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r4986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45772 40 112M2I9M = 45893 239 GTGGCATTGCAGCAGAATAAGGAGCGTGGCNCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTC 087AG)"+:F/D,)4G:'4.-?%*?2;),15)G(=B6/!;5#F>(*2(473AAHA10%:;$;9&=E'H2=#4<2<*G9(7%<(-:5#H/<"+A%:-4G4+9#F,&,: AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:16T13G90 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r4986 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45893 40 59M4D55M = 45772 -239 AGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATC ::5@%:D(7B;=,*!;#BDF4$1D52<9A+($2AD#=DB47?<+)(-?9:<#H0,0H$A";,*;&F9(!2B=,C85",7.H&9&89$37E4G/!H'A.A5:57,,&8&A36$/9 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:59^AGAG55 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r4987 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40606 23 6M4I13M5D91M = 40721 282 ATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCC /F-='@+,.:$06'3>)-:!,:9+""A+3-@934*065D5DF428:8*!13))8&0(:@$1(A,5AB.&?+;E''?:*<'74=''>>%7%%F";B@)@?)3F+F?+70985+E' AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:9 NM:i:12 MD:Z:0G1A1T14^TTTGG91 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r4987 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40721 23 14M3I83M4D66M = 40606 -282 AGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGNAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTAGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGC �A:1-*,:/C75*G918;.-!H65651;3E)#!3?,&2(7$$B:!GA+<3.H+9"#B@D25(7E86,=G5FE;2E(03,6(6$4/H)3":C49&F$(@462.=&84(%$"!>#B7!7*8E8D6(9!569.:E?'F>3*68F0"%'&D%&A;574.C94)(9.0"21>"ACD3<8/),0$'945 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r4988 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15881 24 115M = 16090 254 GCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGNTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCT $-B&@BB9=DA+C,EB"9,2#220#&,&E5%=9.+3=2F>"7$3=D>8<+)D,&4G&10G3:;A$16%."!80G"<12#:-+/+'+&0$" AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A42G57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4989 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16338 42 85M = 16423 274 NATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAG *F#C0E!0=(1-+2F-ED/"+C8DD#H>)HF2$!??HF7'(1@4(@=C37F0@$.)<(!E=B3#+D/?$0.';&)F)H%.=<>>7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T84 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r4989 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16423 42 189M = 16338 -274 TACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGACGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGG (H1B#-:G=4?749,8DF<=1+?*#9$0/.+@593;G"7?(;.A$92($@)2-59*!.EE59D,GF'>4.%-B5+F)8,"='>E=D5))D.D):=+)*/;<+43>&E($.!16A1>DH1C1#!"(5*53;3"1>02><4+?5;8-!2FA<,'#H/!)39?=DC?F?4*!,8$CE?"*,0B"G/;/$..# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92T96 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r4990 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16562 42 155M = 16717 245 ACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGT >!1;1#:+.74<5H%/*?1!6-9B1*.A//57.?35A=-$&>='=>$<#C3!8!948B.#?(F'@6):0%0EH?1F@:A8(!FF)#H??#4"CF97)&E639A6D&B0@68=,A25F*:4,7()""EB))&/(A5%%F$H1?"8)$'3>3=7.36 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:92C60T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4990 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16717 42 90M = 16562 -245 GACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGAT >).7H9,:=0*;D5B'3)7HC+2!G/77))@>?@HB?A5*H4(B"1&:&F68',78125/.,E1*5%/..H%'1?93",%/.?=7?)G91 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4991 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30760 42 85M2D103M = 30950 266 ATGAGTCGGTGTGAATCCNATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTNAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGANGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCA EE28@$&6!C/@A')3A4.5!4=0?<.'+(6-=D)3>%'6987!;:#HBA1340#$?)A5:@?C/2=BA$0F%H/&F7?61/=7!$70F;")&3?9'B/@#93B>'+>AF<-:D5!-(A608!F&:4><<'7$&,!.8)*4299;(;(/&DDD=2$?3! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r4992 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29483 42 176M = 29659 238 TTGTCTTCANTNGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTNTACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCANGGAGACAAGACACCGGATCTGNACAACATTGATAACGCCNAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTA 5-!G8/!AG0*GB'*B:7'=E$1<(@D$!*+'1%8!520EE5#*$BF%0%E9*?<.5))<1,.05"0+.$DF6)B#5BF&&).;&G%#,2$211%GAA$3GE"<6F#(B2#-&C0H-1!+'24(18GG3:=?.A54*@!*(?A>8)#%%GGHG!; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9T1A45A37T21C17C40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4992 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29659 42 62M = 29483 -238 TAAACTCCTTNCAATGTANGTCGTTTCAGCTAAACGGTATNAGCAATGTTTATGTAAAGAAA FGFDE&ED;&4<(CH&&D0B21/,%3%>"0?';3=,2;5::#*H(H;+4(2//AFAD->&0+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G7T21C21 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4993 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4309 42 94M = 4050 -353 CAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCTACAATCAA B*D-1+28'G0@&B67'477.33#+:H7.&57%/H832%/8G@3B#2G>@"/'8HB20@AH7E+,8(71!.(EA0@,B$E%6F!(B&-CBD%&; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r4993 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4050 42 259M = 4309 353 CCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTAGCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGNAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGAATGGCCATCGATGGTCTGAAANAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAANTTTTTGCC -73=(2608"6#?7!6507*)BB&?D$H=F*'@;@?E*/G+@1C1&=(+".+5""9(#7>4E-;,C;?G1/70):;<1677"03002GG%EA;1+.'-66+95@#!8.A-90;;3@#--*-/>6(H-B.$3/9+4,?F.H63D%'.%;C7=09!77;&0!=3-(-02#$*?>F*D7?*(,@A+9/CC13+71&;C+0D(&;'BF%)(D6%@%+&:A//D>F.4!C#9=C+D#!.!G! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:67C27A45T21G86A8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r4994 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47592 42 65M = 47444 -213 CGTAANAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATNTATGNNAGACC +(%&&%$#*%#$&#)##%!%$!!+"')%%#()"#&+)'+*"%"#%!%""$+)*&"*+)##&)!$* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C47G4T0A2G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4994 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47444 42 91M = 47592 213 CTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTG H%01;,+.9H-A6'2(G.D6E!-F*A7E!$+48-&2& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4995 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15789 42 76M = 15658 -207 ATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCA *(A%9$C;H*1+#;;!H447(&(;4-5:*2$F'?7.A?@2$9H*CA'5B?5+5F-;/A75&/@9.D)+'8%6$-:E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4995 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15658 42 131M = 15789 207 GTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTAAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTNCTGGGTACGGAAGTGAA <;*/2!-#/=(>-FE!63HC7&"8!GE,%7%)%:*BH41%-B.5#-7D=/!H'A@H/$9>+41H%8:1+?H0"24+=9B-93H,!$C5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60G52G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r4996 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25002 42 116M = 25118 249 GAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAANTGATCTACATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGT 3'B1AA&8HG!9E?&&C0769.++-$=&=#&;D"=+EE78-5>')DG;,5"0E229F.B@-'3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r4998 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44385 42 219M = 44008 -596 TAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATCATAATGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCG >./7'B994B/"7CC674C(;4*0A,1:D">6-D?;&GA#B7E7/(!/FE<>H(@;E)!*("37#4"2+G)CG#,$8="#HED:'-,)A<:G=<;((@E.>74!6;71*381-@;A0D2/36:66074E"+8=A2-7)!!<6335*4!(0E82#74AA+/3A#44BBB.09*E%,;#D$A;,>@;.@<;0/#F!4!$G/6*F1>5#>$!%7;=7 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:163G3T51 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r4998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44008 42 377M = 44385 596 GCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCANACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTNAGGTAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCNGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGNAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGC B9H405?E<6&#A)G/"1(45'7A+?$!/G4<);7$"3293?&19=9&9D-*()">;$G,F:&?DAA159B/"0/FG,3%D$>DG#2<-B*?9(;(21)%;C$=6,;4"2+%?DH-6=A6F""#7&(-3FEH'0+#8&;8>/9#'0H7E19++:#D@;@=(.(9=>#BC20=HG-.30:&:*52C!D8CF//%!G%+-&<-1D06<>6?3-#"@+1/>3794:,2('-".HF$:=*3'0+GGD@4$G-,-@.9=-2*B(B8'9@+&*###CH%,(33'!=).1/71-;4""A@DFH7**.E%!D&#<09>&1;6/())BC&9>H7.6!+(@D&A"G=?=:"9"HA62 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:100C50A3C46C144C29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r4999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19987 42 41M = 20085 144 TGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGAACAGAGTACGGCAGAC 8<0C*:6F?7/D"!)+$+(A/85D=2<566!9G;26+*#E7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r4999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20085 42 46M = 19987 -144 ACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGAC 7"?68*48"@-D15+)5F71"*>:&;?),*/+!+1B*!*"E*-;5* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5000 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21766 42 52M = 21602 -216 TCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTT 72A9/2H252=."6+/:)4B<5-'@F43CB:#"4;&"*8$3:F/8B&F(&,9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5000 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21602 42 78M = 21766 216 GGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACC A6983#5*::HA+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5001 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8942 42 84M1D43M = 9070 322 ATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATATGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTC /&@',FH6B1$D,C&<958)70)%.-A6<=H-CHF;7E+B#6H45$2/&6;*+29:<>0"D<*H;D<8F5G9!$#()G'#!?94D0&"G<)C0@2FF!657+'+,+0"9'&:<%8+*,''/(G+=%( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:74A9^T43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5001 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9070 42 194M = 8942 -322 TGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGGCCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATANCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGC )6C!<"FE$36+;G(0B=C"3@6%:<7=BB/*29)5*7$9+@B<*4+"'1C=#9B678@&%9@(&:(83;1??>3A1H@#F2:"!3C,F.*A05D8=+.+,+$.F-F>55.32:?4349*-$GH34G<2'(,BE5@:B:0>=E!.F81&;A;'H&$36#7,7'%=G!4EA5"*8B!4:F43H#!FB AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:92A12A17C70 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5002 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46082 42 78M = 46160 283 AAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGA 3#%%5;C,H"D,"4@.)*;3*3B)$:$H:-0978"!1DHG@4*!7?5"<:'*3.<<=#-5$2#0+1;97"G1$#$7F1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5002 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46160 42 205M = 46082 -283 TGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCANTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGNCACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGG 78*?),3HB(#H:=D1&(0@=$2H&9-48)6>;6&3$92"E.!@"9C($"B>&$++1?37*7'=+&A=5@;3%76547>3>+$/=?9/)>)"96H)9A%<,ECH&(HF/!;C)B/B5<+:!0-7G+.(AF#'992!;/#/,5*;:9&B@F$0F(!/:)/3F85/%&5#D-+H!91>>0D:5::-)'H>+-;>5;-+(+,.3>;+3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:77G31G57A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5003 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12760 40 55M4D54M2D124M = 12692 -307 GAACNGGCGGCAAATATGAGCCANCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGTATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGNGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCANGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCTTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGT >:#A2,DD*)338:,6A%3'#$+7#"!/,!062;%H@;G$E:4902,4+'6E5(-5?,=!-"4C#'F-1*##:2F*)6@$@+9HB#%1B*!A@FC+++-4;0CE%/6E<(3+482>-#1"6F-=#):)$=7/54"G,/%F532A+9+?4;G+$347!&'?<,4HD2&4A72E;((:$CC9'%1:@@DF5+A5%,<<:1;<(+7@6C=2G"9H>C<97C65=5!9)6C23>65& AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:14 MD:Z:4C18G11C19^CACG30A23^TA9C25T21G26T39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5003 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12692 40 68M = 12760 307 CGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAANCGGAGGATTTACGG C=#4#<1=F+4@<*"?F>;D=!2=;A89&(&=B:#2A;A:C0(65>2A+)?H%.'=63G",(:@/E'7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G27C14 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r5004 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15225 42 64M = 15322 157 GCNGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACTGATAACGGTAAGNAG +D9("(F>C=7!-@%$,$:/H#'?B-C;73&75!=#C%<'&(-<#4735G-)#:857*)H#&6) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G0C45G12C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5004 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15322 42 60M = 15225 -157 NCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCCTGGTT /.G").5D+@E!3?*84+34$/%C48<"""GB(, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G53G5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16514 42 50M = 16757 283 ATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAAC EB5GE2%9<*@F1H&!A%)$>0.+?-CD"2/9$1(6%(:@C4BG+EF':% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16757 42 40M = 16514 -283 AAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTAC 3,59@'16D-77/55A"(<@)*C%<>-/&005@&0ACD((07+4-B*DC;A)D);E0C1B'%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YT:Z:UP jpayne@0: r5006 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40910 0 * = 40910 0 NGCNAGGNNNNNNNNGCATTNCCCNNCTTANGGNNNNTCTNTN "!$"#$!""!"!"##$!$"!##""!#$###!#"$""!$$#$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5007 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21617 42 76M = 21466 -227 CATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTT +7E.)&A=.E:+A.#;?.:8E)+.B(@6#F4H1F:$%>!-@D&2@8=6%1F(+1&2-=%*7AA)6!A9"**23/4> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5007 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21466 42 76M = 21617 227 TGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGNTTGATTACGGGACGAAAACAANAGGCAGTTTCGAT H$&GA1&E(.+$!<%";);D9!5:.#<3B19(2B.F:7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T21C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16371 42 172M = 16248 -295 ACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTNTGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATN -)C)7*9*$!G0HE?F0'+255(16")4EC?4!3/.6*F6>09"4H*)H%!<<.H6$A5?%!"069C-5?(4D!-5E-,B:C'.)?0(<690$=3G# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38A132G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5008 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16248 42 123M = 16371 295 CTATAACTCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAA .7&"A>5:/CH$(C!0*9=&DH+"0>3"=646H7):/C!8=&.3?54%3CA/('<7D+=;$#&+$<#99#"8;.4&H3=A865.@;*/9+@E*0=#1(3*--#C1/5G:<8-<;*.*5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C115 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5009 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16327 42 98M = 16150 -275 TGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGAGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTA >6>,+)/&+,G0C771998H;F!48==F13.-4=B#7C@=;E($EH:>$*@3=/#A=3."('-'4+:G:B&"2.4(71'#9$3E/73G%='*62 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5009 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16150 42 44M = 16327 275 GCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCA @&E-F5G3?G8@"C,E=6.:/606:"80<72,,-:.G'23525& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5010 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5403 42 91M = 5403 0 ACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGACNTNAN +("**+*#)!%$"'&+&%*!'*#!&)#((!"%"#%*$%'#(&%)'"'&*#"#(*%%&(!'&"#+&)"#*&%+&"&%+)%+*(+#*'%"%'' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:79G5A0A0A0C1G0 YT:Z:UP jpayne@0: r5010 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5403 0 * = 5403 0 ATACANTGGNTGCACNTANANCGCNTNNNNCNGGANGGGCANTGACCAAAGAGACTCAATC %#$*)(%&)#(($))$((")!*'(!$!#$%"!&!*$'$&!$"+!#)#+)%($'(*!*!(*$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35414 42 51M = 35131 -334 CGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTA 271>,@,2CE%#A/!>/GH$5B8+2,>0!(9;B%.8-A%"D1&%1&A<.#C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5011 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35131 42 283M = 35414 334 NTGCCCACAATACGTNTANGTATGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGNCTGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTNAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTNTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCNACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTNTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGGAGTCCTGAA ('*(#'""$%*$$%('#'((#"+!''%()&*"(!&%)&)!#(#"+*+#"'+((!%!)#*'+""($&!&$''(+*!(!""(&##)'&(+()*++#**++*%$!$')''!$+($!#*'%"%%$%"#!(##)+")!'*)+)++#+*((#+%"$#+'*$&(%'&&&*#)"$($"&%*''!%*%()%&**$++*!)*%%)$!!+$++'&$+'#$"&%%!'##')$"$%"%)'#*'*$%)+(#""%$%$**%$''##!(("+#&+++("")&!((#%'#))&$&(!%&+ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0T3G1T8T0G0C0A1G0T27C1A58C27T60G42G30T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5012 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11039 42 68M = 11107 349 TATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCA G4"C4,+:+D!=%GA?9:54!(.?(C+D2!@8&3&=80#22'69A1"<86==E0B$>+D/;;C>98>E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5012 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11107 42 281M = 11039 -349 GCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCNTCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTNGCCAGTTCCATAACGTGTCGTCGGAGCAGATTGCGTATGNTGCTCAGTTGCAGCGNTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGCGTTTGATGAC &)'+!)'*'"((!"&&()*)%)!$"("!*#"(!#!'*"'*'"*!'($"$&%%%*((+!!*%)%$*("!&"'!*($&%%+!%'%(!#%+#&#)+#$#''%)++!#%("+)(%#""&+)$%!*%!"+!+&'+)!)+*!'!(+!(*$)&("*+'+(!#*+!"!"(!)%+&##$%#!(+(+%+)+(+++!""'*(&*+()*$(++"+'!)#+!&$&%&*%*%(**#"$*!')+%%*$$"(*)$*%*#*))'%(%$'!(+"$(!+!'$*$+!*%+*#(('*%&#"+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:79A81C20G18T15T52G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5013 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14809 42 111M = 14676 -244 GGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCG H5AE;,?++&;1H-FA;'4C278&!#,152(.CC?.CC<"G7D-1"?55G#D7=-A*???416#E0$4D>%+"-E:/A!5+744+%*&9F#AF#D,@(2/AD/224*79E)A4/@3<))H5B:5HG1+<4=-!$F,%88-H-B)#-858'"?56<'!3=87?& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5014 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39686 42 126M = 39547 -265 GGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAA (12"%0:;'8+94$$CED=#8?93-@E61405$>6;='DA/H;CE0138*/>BE&/)AB-<:B6;/).4H)%93>/.E,$.1H9)57F6'?@:*3.%B@@"%$0'1B5:(F2F@(=60G-H-D06( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5015 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25090 42 43M = 24863 -270 ATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTT '+$&1&H0;)&"4;@A-/GE'>*D.6#A5HD;7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5015 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24863 42 82M = 25090 270 GNCCCATNGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGA "$H5E'EA*D30:)">;3'HAG03HG2&.$$)6'$9>G)@/DC<)"/$-9G=;999582'$-(%;9%*F=+8)@5>D02=(3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0A5T74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23251 42 127M = 23199 -179 AATGACAATTTGCTTTTGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCANTGGAATGTTTATTTGTATGC 92(1.@187/0;C<:7H*>>(F-4>17@AA=:#.,,&G$'23F1G-.8:'HA,";A25F+F0?-",8',D$-956=:$A>C,);5DA5*"0C;$6;<="H13"#1-%>CD8B@,&+53C8'2%/2,G$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5017 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12388 42 114M = 12332 -170 AAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGNGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTG )-)F!BH#A3*+#1#:&)"0E:(#H7!$>><56$,51/A"=D9=C>?9%19:511+!3;>A4!G:-B8D2!#1D;B-0(.$%9,CD=BG(2$93;.=F=/124&"G?;2"#*54 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5017 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12332 42 56M = 12388 170 GAAGGAACAGTATTGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGA /A=.5=%D&:%?F7*2"=7DG4!B*,$8."F8"FA%?"#,&$&F&4+"72;@-HCC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33960 42 80M = 33758 -282 TTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACA "(#)"&(()#'%%()%*!*#!$"&$!*#'$("#''!+"&"!'&"&#'!'!#!!!+*(!&(%&)#+#&*$*'&+"!*(&+$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33758 42 202M = 33960 282 GCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATNAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCANGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTNACATCTGTNCATATCCTCACAGATAAAAANTCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGAT '?9F+-$&=C!%=5E!6=(B"(D8,+*H771/3*7=<:)E%>,8'@E+$@$<6/,/&$@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:44T34T62G8T20A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8484 42 60M = 8650 238 CGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTA >*-'44=#%7CF,+&%950.F=:CD:6>DE20E>#D6E>(CGF<<.4*9HD=5E&1<'(" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8650 42 72M = 8484 -238 GGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGANAGCGTNAN )*"+!%+&&'%)+'%'!$$$'"(*()#(+&&+)&)"#!)*%"(+!(%#+*!+("+*$((%+%+$#'*$!!#$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:63C4A0T1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5020 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11809 42 160M = 11653 -316 ACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGNCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCNCATGCGGCCCTGCN )(!+')*""!&&(+$*%!$"(#'%*"("%$"'**&)""$*"!++!!'+"%#+!()$"!!$$(#"*$(#&&!#""$*$%%+&%)#*$#&'*"#*+(&(&'*&%()'(+'!!+$&"%"''$%)$(""%$"!+#$#%'%&&$!+'(*+&##+&+#$#*((&#( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:92C52T5T7T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5020 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11653 42 99M = 11809 316 GAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCANGGCTGAAATATTCCGAAGAGGCGCAGATGG G5.E%B/8H=@8E=2+7)='>F>H&=5F3E(.*DH6?+1E03B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68C11A15A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5021 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20890 42 57M4D222M = 20821 -352 AACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTGGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAANTAAAGTACCGTATTTGGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGANGTAAGGTNT +%$!%%$"$%"))$#(**&"!##)""'!%'('&$$*"#$%*%'("%*'"+$'$)#*""**((('*$$$"$"(&*(+%+"&%'!+"+%++'&#&)#$%"")'')+$&*!'"!!!#)'%+%"'(%&!$$!!++%""!")%$!+&&*&!%(+*')"$"#%*!&$!)($"''(*($')("%#(")!##)*'*#(&%&!!*#%+!%)$!)#!&*(""('"#'$&#$!#%$%'")'(('*("$+$!$$'(&$()!%+*(!!&(#$(")$%#%+)(!"#')#*$$) AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:14 MD:Z:57^TATC50C103A4T10T40T0T1G0C3G0A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5021 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20821 42 69M = 20890 352 CGAACAGAAAANCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGG ,DE$($62'"B370'BH8AA?3("3A86FD23,:9D->G?2(',4+7A(''G5C,<*FA!7,%+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G57 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r5022 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30905 42 47M = 31063 296 GGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCNAG ;6+)&?!!?9(+@%4!@=;(%C,2<6=C342C/&60&9CF(E?1'=3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5022 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31063 42 138M = 30905 -296 GAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGGAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAG ,#EHF10>%-.?"&,(.9E)*&%@20.!+B*:<55>"&!#!10"DEH%3-D!9*5#2*>A4%5/<7+9:D;$;D"86594.C;D"652!/:!.))F1/A:2==1)GB#?1F8!('C+'+>+3FG"87";--%160/:% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5023 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17361 42 234M = 17306 -289 AGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGNGNGTGAGTTTCCTNCTCCGTCTGACCGTAACTGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATNC 6(2/$'.)G!<2DEH%*""34&>@!,=#?5#(C92'+3!3B614!*+@&E7#1,"#8=,,%1E6B5$9DH32.@#F!219%1B6:)B-A#G!+:1'.(B(6!>?HB+#+E+#+%+3G55&G)+$=.#-H?/85&)72C-@-$*='E,+0)$'D'2;G(E:5&?*C!4C3;'>?4+9'.@@;&!08H&53'+.!3*A89%D;*:)22'7#=5$#<,08*C-<8@A#9)!%'G*-:'?!-'76@;# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G24T57G0 YT:Z:UP jpayne@0: r5024 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 137 0 * = 137 0 CACTGTTTCACATCGATGATCNCAGTGTATGACGACCAGAGCGTTTTGTTCTGCAGCTGGTCTGTGGTGCTGTCCGGCGTCANCCTGCGCATCCGGATATTAAACGGGCGCGGCGGCAGGTTACCCATNACCACCGAGGCCAGATACTNCGAGGTGATTTTGCCCTTAATGGTGATGACTTTTTCCGTTACCCAGCCACCGTTACGNTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTANTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCG :+#H**,H?FAE.@*GE./>.2+(59&>/27:9/'7=;)1&2-1$:4D@B20-#=85::=51<2BGG@C//;A1509&-@6"A!D9$/B@"&H9"/EADA:=22E1@.9AD51-??1=+,)H",8#*1DE-AGE*$H=A7><,,$E=.0<280<@'4(#;3B2>$'F=$9A(%.E2&=513:*@/*@3FC+0/G>4,@1,%;#/!30*5&'"&+2(6H9<<:B.)."H)1.@8+8G/*D&@2@2#%)&-=C>(H(A8@FCB,2@$&96:G96%!4:/$6!GF&=./2(184#-,/4"G>@7/"*,D%@>EE*('7/0%/$ YT:Z:UP jpayne@0: r5025 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28528 42 49M = 28679 229 TGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTT 3D"$8/*(8B+0G,<(%;0#/-E!1+2&GC4(GG)4(5H<;$;.<5C2@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5025 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:62T24G226A22C1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5027 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4737 42 72M = 4809 226 ANATCGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGG *((!&+)(")*+#'%*)&%++&""+)&'""(!%)"*!!#("%(**&"'*""#)'*"%&('#+!'"'++'($" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C1A68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5027 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4809 42 154M = 4737 -226 ACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGGCATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCA 5@39C!60$8-'FG8HA-%'.#:C1"CB.!<.8>&8@:2-#88/G5H&47E>&/::<()6'&245='1D">6!%:*@-AB5AF)/55"8.G=9;=754A4;EE$1ED:A<:B:$5#H8%,0!2+#)EA!,9#>;:4H<"D?7<@7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A111 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5028 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1855 42 205M = 1806 -254 AANAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCNCTACGAAATGCGCNTATGGGGATGGAGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCAGCCACGACGATGAACAGACNCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCATTAAAACCTATAC $@1CH1*)@DBA>H1&*5+0#&H+8?9&H1E&CC//E1&2+:%+;*/8?=,.+*79&9@$%!&9/F8.=)0-%5@=+<%-:9@.71'>H6!!>*%&,D*1-(DE<.>:9CD$:GA56.*8"0#.3/#@EDD7+$CB2H2%"259"HF'A.A7(%#97!?H)(?6@9B883&:4?;6/0)8G-9@!F&;7%()>B0H$G5.1,9($0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5029 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35054 42 79M = 35152 203 NTTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGGTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTT $6F.$"/.#"@DC3>18-?006.6C2,4=2$+D4)8H!7C85;2F0B)3&G0H?492&FH-19%14##!?;;1G,6.FD AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A32T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5029 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35152 42 105M = 35054 -203 TTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGG =67;4&H9,>)%:+$3)$4402B!:50%*HE!C=DE<@+G-;FHCF8G58.57:"$;81&;C@'795>C7"85/(94@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5030 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5296 42 242M = 5296 0 GGGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCNCGTCTCTCAGGAGNGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGNTTGCAGCAGAAAATAGCCGCATTATGAGGATCCTCAACAGTNAGGAGGCTCACGGACGCG 2:@/?F,&2/F(40"+.(C&7%)1&'-&-EGFC.;6DC)65D5&%/H-,AF/:4#@'*E9530(7!,1F+(GD-'3%.33=<#.3F18+E35E8D=!.7AH-'-:3#+,(26-D@9,-,,##6>9<2!)6D'E>"9-75<';:?2*8D AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C25C13G139G4G8C12G11T2G18 YT:Z:UP jpayne@0: r5030 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5296 0 * = 5296 0 GTNANNNTCCTNNNTGGANTANNNNNTNNNGNNACANNNGCGGTCACCNTCGN "#"$!""!!$!#"$$#""#"""$#$""$"""!"!""!#!$###$#$$!"##!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5031 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15817 42 52M = 15613 -256 ACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGG #53!:;4#<3<4?.!9B@&/3B=%8@-H1'A(-2%--!1> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15613 42 61M = 15817 256 GGCCNANTGGNNGGCNCGAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGG $)&&"##*$)%#%(#!#**'+%))*+(#%&'')&%(!%$!('%*$%)&)($$!$$*)"")% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2T1C0G0G3A0T3T0T0A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5032 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42545 42 95M = 42338 -302 CGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTC &CC)97-82H-/5<$<$@<<$"&H>5C"&A(GA5A>='F0C23'?CB@&5E(((<7.C>GGG39)?)<5%B5@3E76BE!%=;*)H5@0B9)C09 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5032 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42338 42 207M = 42545 302 CAGATGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCNCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACT !A94C>F#H424"D7DAF#,1A%6B.2G0714/E/DB'2,)7'G#!8D4G+$7BBD*;HH,-A<6-*.E.+$4,*9.),25CB>C&&FB=#40F.@<;0/9B2C:..D)924F%@1?'$2B<;>3G;@#23"(BE:;6909+D%!.@"B8=7-?*-(:31DD!#C$E--9::=/D@"5H(*$!*3)=-4AC68,,=5!EB$1-()B; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A96A78T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5033 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13935 40 42M3D55M = 13821 -214 GGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCATCCAACGTCCGATATCACGNAN !17C;9>F?D;%%?*01?(/.=F-A%C""A0#%?D-97+@<$-;;&F7,)'E1>FG80'00<=#,>:E$HAB-!6#%?23;B5G!(,*3G>C<3200>'-+:F;;&9%7&,72%*36-)@FD;$6%E6<2*!0(*@#A!&6G)*(;:D"#5D3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47C22C8C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5034 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21782 42 42M = 21576 -248 ACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATG "8+@!A)04?1#*H)7:?3%6;9,)"399%@5&D8E35G,;" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5035 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11757 42 63M = 11757 0 GAACGGCTGCAGACGCNGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAANTGAACAAGGCACTG D8C:*A=D9D7)@=<(A(D)+80"")>;H6#A"?00(D1-@%A:DFB70F;=/)#!/# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16C31C14 YT:Z:UP jpayne@0: r5035 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11757 0 * = 11757 0 ANCNAGNNCCNNGANCNGANGNTCCGCCNTNCACAAATCCCGGCGC )"(''&!''#""&*$$!**#'!%*)**%!&"&+#'&$%&(%)!'&" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5036 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31352 40 75M = 31536 225 CNTCANNGCTNCCCAAATACAAANCCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATC &%!$(!"&'#((+(#%%$"&+&*'"!!'$'%""+(+'"'"%')'#%##"'&!%(%&!"#!%*!&$#")$)#!+!* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G0C2T0T3C12A51 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5036 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31536 40 4M1I37M = 31352 -225 ACNCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCNATGTAAGCTGAC &;=+42C75*/(8BD.#/E*D1'H(./8$=$:@A@=A0;9,: AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:0T1A12A12C12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5037 77 * 0 0 * * 0 0 AGGTACACANTACTTTTATATTGGACTNAAGAATGCTGCCAGCAATAGTTTA @BG-9'#E,,("::B2.:2"(@5A"-E53!D-HA+46)H1+D#'; YT:Z:UP jpayne@0: r5037 141 * 0 0 * * 0 0 AAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAANTCTTCATNT *7)'!!&"@+:E:@4B)H*CH+-@9)+;?A4@=&/E+?@%,AE,,.C%F'!>,+9%1=B:=BA712:% YT:Z:UP jpayne@0: r5038 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11680 42 47M = 11455 -272 AGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTG ";7G!B,&4-?1(3)<+85+1B,B&++3F8H24D**+@>%GA4C41' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5038 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11455 42 150M = 11680 272 TCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGNTATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGC /'7;.)!6<+7,?-4)-H>&8*-%;H7)-*)=?!0B70-$$?*$?5;E0;3:D-A8@H/�+)0<0-@::%4#@>EE+7&76"/D!'CE.C%C4+C;AD6),@%,3/E)AF(40/6CB!?9:D,9)E&"5B59D7;0B.(EB$D"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5039 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19779 42 53M = 19854 243 GATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCAT :BG4$=9ECG3.G<(3:@7+7<9@?BA.;H?.734;/"A97$/A3@5FB1DD@7"G,831?@%8)CH1BG-#=<2E!37$#%(+FH<8/:=-E5B=>7<:+=&#F+H$,H>* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5040 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27347 42 290M = 27306 -331 TTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGNTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCNCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCAGAGTGACTGCATATGT 3?'<%)'$8.>E(;D1,A#/*#((%=;024F6H0DB$4"2/#*E&1G0#+FF&C92/"#HD4896B'"0!#;D2G$7G3B$3*G0*B<<@2(0>859<&+:!&A,9%6.+5@%;26.,@!B?@E>H*)"+??8<(#G3)AD(F68AE-73C<8H18<.52;)129B0D#&5CD=%0+)90FD$:#F/$,<,$A9H.1/=&2(.#&!->.)6D@"F9/FGA+C-0G6H@+2+?HA5!%@/';/#&+"H6+@;A37?E2(B%<-F+5G=&37B55<+$$,6=*3"+0/:8"A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:122G79G71T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5040 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27306 42 41M = 27347 331 TTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACA &H<#1-$$+;!,5'":E@A.21$3H&!.1/+/'!7=6")?7FA-EF1=E;)+:E3#38+'@00'*#&&34G0@=$H,:,!-#6$:)7'81:!:)!BD,!(7?/G79%(11);(*38-+7%(45+*<1!7:&&@:9#>D#%0:$C,832#=@3*5+))E9/9;.>C89AG$*G95$"B-5>/4&2/CB<;9--;C)14EF9<<+%C:?58.A& AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:32A138A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5041 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31806 42 59M = 31519 -346 CGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGAC 9/#>(/>#G,(3!#1"2?<11*9A7;;>+A6"4?CB">&16F2E*$1A7"=#*+C?6EF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5042 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14662 42 65M = 14848 281 GTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGC :&,)H4)-+FA=3!G=!9=$40"3A5E%D083F#A23).097#6CBA:!D1B"$=@%(B0*&-<29"-.-F<>B=5F>-(F;$A3-#(&+D-;6GB#BE:>F=)F:"21$9F80<889G-:;C,D349DB9=/)D9@*?E;>B@4D4CH,E=EG AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G38A26 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r5043 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20624 42 73M7I117M = 20814 301 GAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATG 7$H:9:?'(>>"=:.)>"@;7)D/)"EEH?>C8,0@HF":E&-<%:9@?0>#7/G.A@5.1;$1'9F1"/3AD*+G"),/H?/)?+>G&*0:.?-G"3";H@:A9$C0'<7D>-)6="02G&1@:1&,>?$7;H/;;.<"-.CB4!.D3@?3F1@-DG(8=$>&'D7FE;"=$A*/*;D9>',#/%0*$: AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:190 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5044 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3470 42 134M = 3314 -290 CTGGCTGGATGCCGCAGNAATGGACATGGATNCCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAACGTGTTTNACAGCGTGATGGAN ("")$)&!&#()&$+!&*"!+("**&$&$*%!"'#)"$#!!)"($$)!*$$&!*#(+$&%!#&%#$)''$#!$(!%*&)"$(#()""$('$"%%+)+&)$+))$"+&#+%"#+$"$&!"'$$*+*!#(*&&()! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:17A13A80T6T13G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5044 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3314 42 156M = 3470 290 GTTCGTCGCGGCTTTTCNGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTNCGTCAGCGAGGACGGGTATC 5D845>F-GBH+(?(53(8,D1#(G/1>?/+EA!#.;(C8,!!5G'+;@-52;=C?<7/;F@129)#%@)*.1*)77B=?E'>1%@CG"+B=AC8:1%$9B<$A,'@C3+5+6BF"4A;D=H60! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17C19C97A20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5045 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44882 42 56M = 44938 191 CAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCA #15!*B;;,B$$'#@-(DE"AEH2/)6"&&)/6*/!H+8"")**0E*8.":=GC=-1,"9E25%9/")!85C19C%#0(<+7A<.,?&1352)"2A#=#9@.8.AFHF5HD*6.2A>E--8(-/*2G4BGA(/0B1#G1AA AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T11C36A17C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5046 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29498 42 46M = 29590 224 TTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATCC E-4"0CD$,""*6>""G"420$51/&:G##HDF.G##@F8.662@" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5046 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29590 42 132M = 29498 -224 ACCGGATCTGCACAACATTGATNACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCNTTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAAC '$%$)!)&)%+)!(&%&"*+$!!*)*##!#)!#!!"*$)%(()'!&$('&'*#+"%!'+*%$$"!&("()'!$$")%&'*#*")#&"$+(#+%'()&*""!'!#+)#!'+*!'+$'!#"*("('$"(&+("& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A41A67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5047 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26778 42 238M = 27016 556 TTACTGCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAANTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATNCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTNCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTG )D/76(-0.=A57)'E/(H7EE#!D-+A,@1*,$,*F.1:CB0)E,.:78"5*68.FHF##(221EB")>:/1*-(A6,'F(EA>?B"2/B@<=-:+<+E$$C'G'E*@.6:DDD!#7"@%'=!G(A*>$47(;B6A.GH0"%2(58.C.C=73$@6,+CFC3%H+2#<3$==7+,$C!02G-,G6,2%9A1A,=%1==1,CFF,#>FH5G271=B7G6H$"D4053%,DC:;40+(87>!@84()9:,D+62"E(D=FD:%5)$H0+@?@F:H/9106-.;=435#C;A*)&F@(1(9049.?2(8?.;?)#"2AD7%0-$",)B=@D<+53!D1>?*6&B4..8&GD0E+?9AA(B#3?D1+!00!-G'"&>**A32*5B0&::DFE(#/%!E.(G)GD*AGH11909G9""G<9/$2-?=';:3(%*(C+3.BD/:%?C+6'/D8/6;#&6G&.*/.*,E8(';4,4!5C!A,6(;%0#:6+&D!(88=(,",/*#C*@0$D:+D="5.A,.37'A0"##%8(.FB%@!(>=3-B=2A,87G8B:8=-,F('7=-,DB%3:3?+EF,D5/=$$<.=C7;B,:0A"HA#F'D0G5(@#323"B:<&)<(:<%=.#,4EB+FG?1(-1'&EH#&*0=&,A=:2BCE%E3=D?<'BD$,?,."&-EH0/1E>F06>4F)(%A=87$&$26@7$/1'>85(C&)(#D89%FF84H'5>0-G"/&"#?H%)G%A,C0-AD,'(G0E,8#G$60(/"C) AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:4G61C165T171A38T36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5048 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7853 42 40M = 7893 520 TGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTN &H,))%5'6"1+G8!6:1E"6*91&:#-+,$"/042+%*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5049 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3983 42 226M = 3941 -268 CCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCNTCGTTCGGCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCT ,H2.:+21@+G3+/;',/%%@H?86#-FB78>/A5:.0)*8F4E=%4-.G):;./'@:(-!(G,?F:@&@;C>!/=3-??>+(8?0#E4DH#E;4>0**@4-%D;'*!9<%G(8?%-;A00*21*0;*@F'"H?%3C"?)?51H!@#B#H7@(G(@4D%&@-2*.)G><;@,12E3;)+4=BC5)4##)66.(&5/?6*?.+?4&)$@08E*$1:889+AF<9#8<)A1<)DH,<$#9(8="&;#.3-7:8A<$H1$"<09!"&@"+4E+.8*+2/0,1/1+B5HF*@"5=8C+*8!>7H"=#)7G..$1+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:33G25T66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5050 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24859 42 253M = 24733 -379 CATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTACACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTA ,62A3.0<6-#G/*1*B4G>47!/1B?5'?G9+F"4$4>1?+!2<=;"@2=1'4/9D;#"G4=)=#8,"A"2"B$1$5E2F$A.:'48:B9:;.$:/9:<#H60#0"&5G$:9%$+..D6%E<:(>/04!0FG?B''-)4G&"$C>->*7@9%%/)=$+F8&*.7&/9A?@DH//@%8G14E>=<=*=25G"0#,G0-433,5(*%%.=D3+HB-A353'>-&%6!(<<-..&9$-B3G,8"@;C*8FD!$>4C%G9BF(%5'7<9/:&H20<;"B;*G9B>!>(A2*;5@+-*/#:=&:(# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5051 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12024 42 42M = 11820 -246 NTCAGCCAGCAGCGCCGTGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAG '*++"!$($)#'*)!+$!+('"%*)+''%'#!$%&+&+++$( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A16G24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5052 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22716 42 107M = 23001 346 AATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTNGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTT G%&;>06!(CDC0)!4',E<-:%.B1FHGE(EEC32E(G.'B;+5)",@78;1#A9D4#C."+)9F'3!>DE"8?'<./>))0E5D/CF7HH4$,'3F:4?0.!8$+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C68 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5052 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23001 42 61M = 22716 -346 AACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTATNTCNTNNNNN *(#)!)(*#(*+($$#'")'(*#!$+)$%$$)!&!!*(!!(""*%&#)(++!#&!&#&"!( AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1C0G0C46A0A2A0A0T0T0G0G0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32033 42 47M1I124M = 32204 320 CCACCTTCTGCTCTGCCGCTTTCTGTNTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCNTCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCT >+B=1*44+*B">@%B!#6,C;17,(4GG&@%"*1AC:?6773E,%C)6:AF>46D;A%%)-EA("#+%6<96D1A%?&;@&H;B2.'@5/)=HF,9-0C#%>!>,1.-#B',?2&0C.$F+8A68&=+BGD#*CCE:*!./F:@=' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:16G9T26T73A43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5053 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32204 42 149M = 32033 -320 GCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCANTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATNGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTA 8&3<6+;E7C4BG?="!'')3@;C=(5(.G:6)%:6(B<.=1*-<3"!CA-"?9'2%F1:?!2GE5='&,(G"1-%56)B#%6009*C7*7:,&=D/!+?(>A$?!C,*6=.<@.57'G,/:.;#H$1D/1)*7*'299>D.BH1DA$/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G45A49 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17500 42 175M = 17392 -283 CGGNTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGATACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCCTCGAGGATTGAGCTGACGN )$$'%!**'+#$$(&&(*)'#&&'$&*(*+(%$##$!#*"")+&&&$*#'&!&%$!)(!"%#*+&')%+))("*'!%#&$(+((+*)($*)*))+!##&"($&&"$+"+)!'!)'&!$++'(&()'$*"'+"$&&&#'%+)"!'("'++)"#$&"!&(!#"'()&))#++'#+%" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C25A125G18C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17392 42 108M = 17500 283 GCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTNTGACNGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAG 8*@5G,D6'C;7!8':D-+.49&(=@BA&&>;-#6>0FG,%B&C#HF1;@:B@%3$7C)@!1&D53&)2"E1#".667*FC:*>"&"3!D9*"7>/">*)! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78C4C24 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5055 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6552 42 107M = 6281 -378 TACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAA /72/('0<&@.56=B:"@C,)CA07>%/<6&EB3!*(/E":H&/?F2,#"#C'/@.,C(;4%D;"G>37+.)B6@+:DE43!'(-FA+9D.<">,E0.3DA')=+C&;(HGB'+A9'++/.5G-9E169,7-,=")<;!581?+73(3D6,!&H3+F@A=>F1'!<:"831E@")77#CH=H:-:2H64.48'H>2-A?75&!-23C9-"38G<-)(D.=+?!:3:5.#)+C!9#5D0*3&1#95&G#(%-#<#<(0G"$A.1*"E7=((?#&,D;< AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:1A16G20T40G104T79G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5056 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4330 42 66M = 4132 -264 GAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGA "+1,/749@F%2D@91AC5(>1,!)F4>+%B6D+(8.&1@2=!*BG,:=6'6#C63,A$'!;9=6H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5056 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4132 42 94M = 4330 264 TTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAG 40G1&4-"&9#/91.)4&&?9(@CH8F,<7F=&FE*=8C;8+$85&@/0;=:>H!3)F7.#65G32;&5=%';H(882/<.A0,B$8&%-H*24 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5057 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9449 42 113M = 9615 218 CGNGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGNGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCAGCGGATAAAN $)!+(!#*#$"+*%))+"#((#+"#''%$+"!*!*+(#"$##"$'!')"+*#++!%$&()*++"$"*)$*#%%#&+#&%#!'*%*+&""+$!""(+%*''+(***$)*++$'* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T23T75T9A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5057 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9615 42 52M = 9449 -218 GCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGG &("&'$!!'*!")%$"*"+"'!%(+&""!#%&!+)#"#(&)#(*'#)()$(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5058 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20587 42 104M = 20446 -245 TGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTAACAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATA 2!10;.=G5'+&E3>2:0F&$(G@?>4B9-&85&8H3%5(%"A!<;*E)#";D-,6C1'#**/$&0**=?(=>;DH9,G9E<8FD03=&6):7;5).$.?4*96 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C25T77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5058 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20446 42 64M = 20587 245 CGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGC ;4042C.'?DH*#3#-5$.62:467G&6.73=,6,:@;/E;4#B6%&..>AB;>1D>,G8EEBG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5059 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13929 42 48M3D23M = 13757 -246 CATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATT ==#D/!78,.E*21@E?1!H."3BF8H78-F=$4%1825,E,+'1AE'/5&$?>#?=:9/&E058-2<84% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:48^TTA22G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5059 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13757 42 72M = 13929 246 CCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCC $A8?!2#>&C*,@D%75'%G6.0-F#C;,>6':%(A<'1<8#D=&0$14.A/7E3?@;H('B%%A,75:2(2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5060 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48338 42 65M = 48170 -233 TTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATT B<#-2>#8>)FE7.!39=(*/&5B*5G8-"6+?98@G41=-F3;A"?+=GHE?5B>@9)8'G'?B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5060 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48170 42 168M = 48338 233 CNNGCGTCACTNACNCCGTNTGAGAANTTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGACTTGTA )!"&#''!'#&&)"&'%$!"'%'+*##*("!%)*)+(&!&+)'*+&#$)$(!#'**&%!&+"+!##"&%*#"'#('$'&&&&&*%#!)'#))+++'("#"(("'*#&)&++(#$"!)(()&##"+'+'+&$+)(!"#!('&&!'''%'+)&*"+$%'$(&*!'"(%#$ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1A0G2T3A1G2C1A1G0C6A135T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5061 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47990 42 57M = 48192 255 NCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCA +)@98*&%&C<$#G:G&DB>=0&7"%5A#!307AC81B':A'D<,2<8=A-61$>DF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5061 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48192 42 53M = 47990 -255 AGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATT *++*!&*+&)%$#%(!!(&)%$*)&'+*#!*%"#+)%%'+"#!$'#%"%#*++ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5062 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46044 24 64M = 45915 -193 CGTGATAACGCCATTACCTACAANGCCCAGCNCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGA ,=E4,C+=+7#5C?/CHD-.#C*E!F'(!A92(96D%4A*>G""D:3>8:$F5-+=2A@@$501 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A7G32 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5062 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45915 24 37M4D14M = 46044 193 CTTTATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGA )!6*(#C15?(*;%($1B.:2"*>;9)"71/E2#8<&?"+*2*#5@:%+$H AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:1C1G33^AGAG14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5063 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31257 42 71M = 31090 -238 ATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCG 2+'/,H3("65@%$8EFF',5>.5-AH$/6+D;)5)4-4;@:@'0H?E:!A5B@<,@.95#G;@%-*EG1A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5063 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31090 42 106M = 31257 238 TCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCANCAGAAGATGCTTTGTGCA A*%G2G1)D55.1/G;0>H=H':G;1>9+80E3-BGB)5$G&1'9(#F=?HC:C)3*0:9=E!$5/EBG-D*:4:#943636'/B/7+D7+F(D--224%#5>4)2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42865 42 46M = 42683 -228 GCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCNN *!"#*&+*%!++))(&$'($'#)''$(+(#%#!!*+)'%&$&$+*! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G0G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42683 42 173M = 42865 228 CCAACAAGCCGTNAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGGGGAACGCTCACGTCTGCTCNGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGTAATGCGTGGTGTGCAACC 1'$*8!E+7(AF?E9*@D+-,=,$!?4?@4%B%*FF3&9;+398-;.:G'6@A-A)4:F.ACE#9000=13:$?;;EB%9A1-C!*E.3"':B*)6@2).5AE@"/35=G%8F6-//)8@9/%5F7%*!7=!@*6*0;$4$*(=C9$48,?36HG7F/!@#6&0-9#?H>-#G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12A47C19A73C18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5065 77 * 0 0 * * 0 0 ANCACNTTTTNNNTTNAANGANAAGTGGAAATCTGACAAT )!!#)"$'**"%"*!!("%"*!$'#+%"+*#'"*"'&!** YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5065 141 * 0 0 * * 0 0 NGANNNGNANGTCNNNNGNGCTNNNNNAGNTTGCAANTNNNNCAAANAGNCCNTTAGANCAGTANTANAGACNNNAATNNNNNNANCAANGGNAN !!!$!!""$#$"##!!!$#"#"$#!$#"!#!!#$"!$$"!!!!#$#$"$$!$#$"#!""!#$!$$#!!$##"$$""!#!"$$#$!"##$!!!!#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5066 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37562 42 75M = 37765 261 CATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGNAAAAACAGGGTACTCAT F>DC>0($!%$?5!:@52G+>A#0&0+1)+1F4%=>"345)C+)@785+9=)?9!'./;)E+<#&,/?3G&*)6? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5066 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37765 42 58M = 37562 -261 TTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCT &:6AB.0@:D08+%;G&?+*@2% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5067 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34513 42 142M = 34437 -218 TTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATGTGATCGTTAGCTGGGTTAGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGT 70+B065@#'$!2D#;1'#7%%;A(?'B%0:/+%6C"7C,G8A,'C"2%B>$EHC.8D(C%?#?C1F3,%$A@=/H+'5(4!>(+H46$2),;;'@F!=A+'?/E=C(90 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0C9G3A57 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5068 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19117 42 95M = 19212 225 TGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTNATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAA B*&524,$''#"AH=B94H(%?*D<1>/06C$:-,:%*5)(5<520.)5>4/+H;5.2B@+9GC=,%*?3<"(?9*<=+16&36) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61G5 YT:Z:UP jpayne@0: r5069 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10046 0 * = 10046 0 CNGTACGTGNAGAATTCNGCGNNTNGNGTNNANGNNNTTNNANNCNNNANNNTCCNTAGANCANATGTNNGNCACCCTNAN "#"#"$!$"!$$##""!#!"#!"$!#!$"!"$!$!!!""#!####!!!#!#$$$#"$$"$##$#$!!#"$#$"!"$"$!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5070 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32849 42 102M = 32710 -241 AGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTG @'=E5B@-FE=C.+/'@&%EB*'=D0-:,H/#&527=*A7-;?*0);$4/D0/1D;E$113$-*908784%6"0><%0(&+65G)A@0.@(2'<&%;9?5A* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5070 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32710 42 139M = 32849 241 GCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTG /(21%,;GA&74(?,.**FAG&7C.))#?B-H9'"<8&&@EHE%F@@?D'83=?>+2E?,A,DH<;:D)#-@@680;".6??(;(?=033B:!FC66#2?*22H59:H'DH?05%*0.<=6B(*+D'3*E#F)D(/!.4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35758 42 221M = 35664 -315 TAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAATCCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAANACAAANCTCCAAGC G-./7A+6@216(H@H6HC..*640@4C5)G,23!9$9,+A9+(.%19*%5,"?%"CBC"!B+%/G0CCG&"8??7!"HH*"F?&&E716=4=<-D!D#GF8FAF-2=8;1H8!B83>@2"33BAF=&A*7:-7A(EF/@C-"-;7H?%6?/:2=5('#",$G,:5>;=@((%/"$$=)$7+1!H0@$'8G?/>50B%EH!C9>@?4.=+33)67FA1F"(EC7=@.?AH7>6;*)(% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T25G67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5072 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3911 42 92M = 3696 -307 TGCGGTATATCGCNGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGTTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCA !2??79?B"1F501F@*C>C4#6E3D#;0&D((8(A4=54-FD8':FF)&C;A$188$;5%&>C1FF' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T27C49G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5072 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3696 42 44M = 3911 307 TACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGG )3=G,:':#"/56&?7C$#2E@"!%31?84DA9=5/D0A!*/"5%<#73B0$C;<&/FA26#+4#4E3@'*?#=* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C18T60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5074 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16598 42 84M = 16395 -287 CGGATAAGACGTGGACNTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACNGCTTCAGCGCCCTGA F*:6<+/8#8!/"00G#.GD3E;5?BCF/+1./;B>87,32#:$:EG8G*6'$>?H065A%1(:7D!>25D?)"5;D300'010 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C39C11A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5074 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16395 42 64M = 16598 287 TAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGC F*7E0&:F?B;F1(-'5>3.3B&*/:2>$B66HD5?-<$3H1B,'EA*'FG*(C2$@.<4!!9C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5075 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34935 40 42M = 35108 236 AAACATATATNATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAA *%"''*++!)'##(*&*)"!#("$$#+')'"'$&&)()%!(* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G7T31 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5075 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35108 40 63M = 34935 -236 TGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGNTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAANCGCCNNGT )$''$!()++!&+!*+%$!**+!!)+(((#('&%$"%"%'(%%*+'("!'*&&+!$#&%!#%' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:28C11C13T1T0G0T0T0T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5076 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36304 42 75M = 36448 265 GAANGCATTCCAGTNTATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGA !''$'+&!+!!&'"(&!%)+!%'$+)%+(+!(*)!$')#!#)$($#)%'*'%""))!''")%+(&%#!'+++*() AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T2A0A9A60 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5076 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36448 42 121M = 36304 -265 CATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTNGGCAACCTTTTTTATATCCATTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAA >9-8GA9(B)9D4&242A453C*A@$6!:'>-335?.)!)!C.%&A<'9C2FA(*/F*-F?+#7(&,860"@C@2E$*,+";>.//"/C:D,0,&+0458G+;<;6(93G3,5;)$E6/7/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60T19C40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5077 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26123 42 159M = 26008 -274 CCTAGTGATTTTAAACTCNTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCNAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCGTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTT "AGC94+HAH/57.>FA:)1($2(5!1&!-+>!21:59G$H49",>B-2,+:(?GE:1GE13GE<6>%1$4"7G5@.)FGG(;<"DCB.9'(?HH)7+9A/G?'#<0)D:-9F#-%(*++@:B)03,22B:%B<#E9C.!)8%:D/(:>H$7B?3E2,*8<>=&$>*$?8;C7-%;.0=,:D-$>F:*<3BH*>3'G/3($F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G0C109 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5078 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1116 42 126M = 880 -362 TATCGCAAAAAGCACCGGNATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGNGCGTGGCTTCTGTTGACTGGGCGGTAAAGCGNCANAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTAT "(#('##%!&&)((%+$'*#!++$&'""'&+*($#&#+)*'+($%$'&('*+$(&#(($')'+('&(+"(+')'#!+"(!+#+!'+$+%)*$)'$#!($*$#)((!(#!('+#%!+*")"%+"#)+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3G14G33G12G2C15G2A38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5079 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34190 42 43M = 34340 232 ATTTCTTCAGGCTTTACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATC *)"+*)+)+&!$&''(%)(%+!#%&(*")("'!'%#&%#!"!# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A28 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5079 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34340 42 82M = 34190 -232 TTCAAATTCNTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCANNNT "+#&(#''")%*#")#+#$$#$)#"**$*%"*(((*)%($&"$"&&$+"'*&)+*))+($+(%%&"&)"*+%!)"(*+"$"# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9T20A47G0G0C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5080 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33308 42 356M = 33252 -412 ATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGCCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCANCAGGCCACCCTGCAATGNCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGA D7"0+:-38!2A;=*$5.)23C1@&2"@,+6+8(;/-GG(8=?>0H41$@18'+&8$)AC#*"2.A5;0#,-?7<'G$D(=$+:<1567B;052;@"5)-A-$<1E,3&-0*"7!/D:-).1?@*6F<9>8,8,(H*,%7>)A:GA/F<>>(=,66.&'0=0*=G$8-'#3%)7&%>'<#*B8H9DD<3>"A$#)5&+.8=F471E4<3EE6H*D9&;!DH)D=#:F$9AF>=.>%B,+$!#;=BC#4%*&.94EE)3>,/%='6@#&F:G<'6C!3>$2-*0F&HG=%32$-!,+-,C7'"#*,''@#7+);F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73T53A17G137T72 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5080 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33252 42 56M = 33308 412 CNTCNANAAACATNTTTTCATCGCCANTAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGG $($#$!#&+*""*#"&%*!*''#''&$)"))+#%'!$)%!#&(')%#%**"!%&!) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T2A0C0G6C12A29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5081 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28179 42 53M = 27866 -366 TTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCAANGATATCAGACCACTTCATTTC !#")'/*>6"FH23+4)=&@@"<4;:),1#790G46*;H-4$,&:04B6#%85 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T1C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5081 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27866 42 79M = 28179 366 TGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGAC 4%9FG29F3==,6?'"*4&-8E85"*9*$F0C)4D1HH+-.#6@38&"#D+<<;C3=3G07(<<9>>C,:)56(G!<3B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5082 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3542 42 124M = 3782 281 TTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCANCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGAT H/5B<6592?)9&-E#5-F4;*%*,>%2,@<(5#@?(:(8H"<*?2B1@44":)4#!!0D6.).:9;C56H2GB)'?&"F>%>AE-D>(!HE8E.H9@+,3FGD1/""BD#&6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:97G16T9 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5082 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3782 42 41M = 3542 -281 TCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGNGGCGCAAAA 72@)HF(B/4>2BE.:D)B5-F;/=3$>F:C':@?'.EE/36<&?!-;(G91B;EF!.71 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G5G58 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5084 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5617 42 101M = 5475 -243 GAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGCGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGACN 5&8*83#$)B%><+-,C$D>&"*@.),0>>$H<$!6%5*3<:@H@E/":47E)9F3)EB#?>F+5/!!$:@1,$=5EB7!>,(%C"F(A:%9E"7,:1;)" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48G50T0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5084 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5475 42 82M = 5617 243 CGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCANGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCT +%'%'+'*)$'&**""#"%*%%))'!%%(&$&+!$')*)&)"'*""(#('+(*#%*")'$$%)#)&(&#)'*(**!!#*"+) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G33T13C26 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5085 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32060 42 20M1I36M = 32177 201 NCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACCATGCACGA &?H?#1A$)F6=DF.!/G=3!E&3039+F+<0)$+4@6/:F3/?*(&"F!!DC% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0T25T20G8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5085 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32177 42 84M = 32060 -201 GGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGT @6,:H0D9,2H."*$93&?6-EE>7C'0.,.0,;;+&4(:E7"@F/-A;A74@18%77-6-,-?G#6?.&5;B4*C>#H2*.97 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5086 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29095 42 164M = 29259 359 TTACACGCAAGAAAAAACCGCNATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACATCTGCATNTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTNAATGGCTCTCCATT A!-4"B8;@G0.@BHF=2+#)F..07A/).1.#"7"/'66-=9;0*=D@2!F@0!//E5@E2&&7:'.+%!;"HG"-/!F%,8,1,;9)7'+A2G"*99.+G3F):96CF*9A4*'%"2#5$9>*1?&;>A?B:74@'A(53F@@GD(:G0A7=-+46B)F5*= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21C49G7G69G14 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5086 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29259 42 195M = 29095 -359 CCATTCNCCTGTNACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAANATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCTACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAG B6!%>!0H%*G'@G9+!+$>#D>(;+908!=D**A4#-88>GGE:?2$,C"'(3E)0*4:"'6"(88$95G@-$@,F>-!A@$-'3@'08&4C0)"B;+!D+.4E/=F+5(?ABC'-/&004@+60<$G&?CF!$;=5;)(H&$>@A,A;2,.+0!H=8*E"1?:?3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T5G94T51C35 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5087 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29380 42 55M = 29446 194 ATCTATATGTTTTGTACAGNGAGGGAAAGTANCGTTTCCACCGTACTCGTGATAA 7D6!!!2@;*G!BFE-'66*75-5<3)2C>A,H135)5B@%G&-F+A???+2@*) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A5C5T23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5087 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29446 42 128M = 29380 -194 GGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCNTCATCTACATAAACACCTTCGTGANGTC +0,HH*"G7'2"/37+GE)B>#:',-';)279C//#9#1*380#DF&=90(%G3+A<9@0??6$;CG/("43*5+<&6,F2!HE!;!.A;%>):2,$-*9GH1H128&D)?5>G>14?FBB9E8/;GB7/H*-;8=%G3'?%:*.;1&2(@!'A">*)))1(7!@B9@:<"A7$,7@6%H*BA&8D5:74&.8+>'!22H8#.74.<3#A''09"2>#%/"?#D6GA<%:*,E8<8<6$,?%*F+'C51AH/20%#.*-G+CD+0A=5GGG:0=@@H'EAD@&0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:26T4G10G58G54T44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5088 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47284 42 154M = 47438 355 TNATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACANGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAGATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAAT %!>9@=9:=6:F&?(5G3$:59)5/#/1">GA=H3B-.+H7-DE3E*62193@+&:,((B>*E4F!++258.G'16G!*+3!>=$2;.B5+7%<;%2E0.7A&5"3=A(-!H=/(//391H93>F$&+2#650:6$E=,B3@833%%-7(;DE# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T28C86A36 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5089 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46177 42 80M = 46257 251 CNNTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCA "!!+'+$("&("()''"*&!##$(&'*#'*#$&('#%#'$'&$&(+#!($)$$"!'*$'%*!"!)+#%##($%#%&"##! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0G0T57G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5089 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46257 42 171M = 46177 -251 GTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAANGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAG -D2;)@G"BB/*G=*>%-8D5-$:HH#/"+E9D>9./&:-6<:G#5,=:>>%#4D.!>)7?6;"13@"H)8G7+6#9,1,CG'7HGA1$%;.4"' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T123 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5090 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8283 42 17M1I344M = 8644 425 CGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTNACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGNAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACCCCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTT <0@-;>B0-55E4*4=0$*F.&$AC1>)E85*)%9-FC/7&28F5*A?=:;("6/=7.';@8>,3"0D:+=0""CH2231EGDB@/5CG3.E#D.,BBEC'(E;73?69=>0"E@2+E5-&@@=#/B1606F$C@8"B<26+6-"<74)B)#-9@%9&0?6/0H74E4E'H&?(/'/D*606?1D%D$@:4(%:(!*D4G+6.B%D&5%:6#H)@2$$B'"-0#276*"'#;&D)@,4+%8A,$/(%B0GF=C%3A6H#H($.6@"671*314-A.%2*F2H"*!;(::GB=*.57B,8:'H@5@&H(6G/$G,;("-E7@28=152$0*F5- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G7 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5091 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21741 42 320M = 22061 417 AAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACANCTGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGTATTTATTGGTGAAGGTGACG >F)6F!855A'F'&:1".:,852!@GHF$19;8E"7#0BD.69.7'G%9:A>*D07*:0#=+8&D=*=)0<6A9D?#%E)>89!HE>'5H=E,:G2=B$A71:-3+(C(5-8*(C)F64&#+?$H6D/(&:G0<,&CB+H$0CA
H1;7FGEB'5%';D<4H?8DHG0A),9A&4:.F*0&*6--C/%!9,,> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C77 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5092 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47423 42 105M = 47228 -300 TATTTCTTTAAANATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAANCTAGTCCGACNT !+&"+#*)"&%(#'#))!%&*!*)'*""(%"(+$!+*%+$#"$%&'((#!*(*&#(+###)&#%)"*'&#+')'%))+&&($'*"$#"+$+'&""%&)&%#&*%$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12A79T2G3T3C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5092 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47228 42 193M = 47423 300 TTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCG 8E&D?>?;/49DD!=!:/!&?(6AG#:-2%H-,.=B4'%5)A%4@2-3*/$-*+B>#D&>7!6;?37;,D"34G*//+>A!E)EE&'B=8-EH%C#H-<,?8EAA'F/$>%8A%3B).(H%C98A3CE':"-1B*7?D@$<;-$F>;E36@8!9':!/4H;('E)/>?EF%+(%=H(1H>H.;:>31B%.#'3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:193 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5093 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44138 42 208M = 44075 -271 GCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACCCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAANACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGNAAGAGTGCGGAAGATGCAAANGCGTCGGCTATTCAA E=DG+)#6@>.&,2$"+'B'71-B5;AB9)"H=9(G@.!G%2"!67-(93'69%%>$C:)#'97%((7/!!0(<5,##./$$.,?,.G@D#A.#,%.3-:>A2";)6.73";6/;:9/E)1:3( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:86G56A27A20G15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5093 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44075 42 63M = 44138 271 NNAAAGGNTATCAACTATCNGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTG &$*1(?6%3E5)"F7&>$>::HE//#($9:<-BD'49?F"B*E6!)1%4BG*G$=BB6,C775D5B4-4*()?.)G07*/$H;?/C$-;D,$)#2A<-F2:9/BF24>"8<<)D.>0?,G":3/"=7+G'0:4H438?H,73)91-6@$=6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5095 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40349 42 167M = 40185 -331 GCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAANCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGNACGGGAANGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTG +"0E$>:3B>04/4BD1.;E=C-BD%1@&$5)70'F#8<,47BE/H:)#0A4%=F!&:,5&!G%54E*-'40E+A&@3D"?"E!:D/F?(A'/.=(6DF(*6",H/(%5:0>=3C-/=;==!779@9>F.E"@(/A:H//>?G/?*G9%;:0$67&+'CG*&*#6CBD-@'00.C;4@+3F@&E4,H+D(/F.#)/8G@0<7#796D:F862>.11FD,C"6-4%?)F/+B4'**20FG,".!:7 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C4T129G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5097 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33374 42 238M = 33137 -475 CCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGGATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTNTGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCCAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCN *&*"#$!)&#)#)"'"$#'&&&&"'%%%%"!!#!)*&+*)*($)))!#(!"&")*##)'$(**!+()!*!))!&("%*'&%+($"#+"%))$(#%(&#&!"+"("(())%('&*!*!))#()*+)"&$(#+"!&$'&!!)$$)(#!$$&)!$"(*%('**&#%"*(&!+$$+%&!+**("!""&!)+#+)'$&'++##+)"!!&$#(+'!'*%)((")'#+'%!(&!&$(#"%$""+" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:80C64A49A21T19G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5097 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33137 42 237M = 33374 475 GAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTNAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTGATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTT #2ACD(-A=!>:E+1(=G220/:(:!6G;F(9):'*+*DA;&!4&-.<0-=3;6/!%C+8G7*GF'B@E.45;<,7;1,92B,9."+=C84C2.4@B9:CF@>).?5="D!8B',%4=CB?%$D@E=='!H$$?*5'1(?%;57/,>A(D@=DB191-0)!@E0,#>0=">+6G,C&E=>"7G779@5+,C1.C5%B!0HA*+5/?3/%!C=/2B98840F30.#4A0&<":;7"+,G051+,/)%G.B+D#E3(B9C':)D3:7DC*:0C>E'F$E0H)CE#(-.#6$+<9C&'4D&5)&?F1!=&-E9F9E+?4*D)8B&#:.G"&>#3$1628!1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58G62C43 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r5098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6493 42 444M2I6M = 6943 615 AGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGNGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGNATACCGGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGTCCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGTCGATGTGTCCATCGTCGTGTATTNCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACA ;5-+3#%(B%-3:?9<%#H@:6>A:FB%5=77."E&HA;<795@=5?#BCFD*H5)):9):1%&1+A%690.$@6>%GEG&/$4C%>2+.8<:&F$)0#=#)<(9EG,%'(20/E:4=;791$'-0?G.*.!&96+#DH+$E@11&B*?,0=2#-6?)-=B2*)-$EC!C3;)<;#A($>*%57C32F341A.$-&%->(4C-%5)+HEGF<2=A;#8>45:>=-4#D)94?98/G$'=#$1:7-,.#B@CA:*6*26A<(?/9+912FBB<94'BA0-H/#5/-;+2%F8"G!F/.-".@'($/6-D68&/FF<5==43(C78>9*>$,4A)F'A*G?6B+,1HA8H2,%8(>%8)AF&!7)@!G6F?2(/*2(*E/,69H;,;":G8*4< AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:24A271G5C26A1A46G7G15C47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5099 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43767 42 128M = 43624 -271 TTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTC 0C7)/$/H4)G1:#2F.7#!@F)4:.'!"6G<;>6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4330 42 126M = 4221 -235 GAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAG A!/3A&&-9;4%;A-9.)C6$?+.*A*-6'2!H:#E#6//6:)/5"4EE#.H$'"<*,D&EC;6%=9>=E0+<8(*?-F.4@!;"9*&@0#&D.6F=9C:"'B");.7$2*;!!9D1=4*G#(,H4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5101 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19109 42 91M = 19109 0 GATACCGGTGTGAGTCANCTGAAAGGGANTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGNTGGCTTCCCTGGGGTTCG D!#:F1G;7>576&4E@:91'4F&,GD>.*@0+>*BH-$;64>(H?G#G%?/97AGB?@G5/B#F"<2=042$,F/.#H8=91:<5*51)+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T10T43A18 YT:Z:UP jpayne@0: r5101 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19109 0 * = 19109 0 NNNTNCCNGCGNNNNCNNCNANCANGNCGCNGAANNGNNAANGTNANNNNNNCG ""#!""$"###"!"#$!$$###""#$$$!#$"""$#!$!##!$"$!#!#!#"#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5102 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11696 42 53M = 11831 247 GCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGA A$17/A+#-"=2%#;$04$5#%C.@06/<7HG2=BC"G7+':;!.*A3@!*;4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5102 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11831 42 112M = 11696 -247 AATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCCGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGAGCGTCAG '1CG!G?7DB$3/&<-HG">(':+*1G5%0-E#9G=(A/#*1;B>,9,.4)48*%?#E3?>?8C<7!&;D;GA3H9A198H(3&F9:+1D8+!A1*/G5'H.?0D8+B9('E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T42T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20236 42 65M = 20079 -222 CGGCGGCCACCNGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTGACAACAATCA $)*(+&(+%(%"#"'"**'*'(!+&*$+"&)%$&+'!'#+"(+%#)!%"#$(+$*&%'%*!&#+' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A42C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20079 42 50M = 20236 222 CTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGG *1!8&@::B#:)B85''4'9:30'%=?7G@0&9F@8,=7#8ABD1"0.*& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26274 42 49M = 25968 -355 GGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAANTAATCANT 18><3G+1-+*.)$9B)@?0?24C%5@(#';4+#E%;25;#+BE087#$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40A2T3T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5104 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25968 42 60M = 26274 355 TTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTNCATCAC 1:*+E29)6!(9<;C'&;H8',(;&#$)-(5=08=/4C#,0051+!%@3F.:<7+B:4*? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5105 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12961 42 81M = 13118 325 TGGTNATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTG D%C-%HG4"'/*-549)&5.2!78&C=:%45'FH9&'".DDD&%>G)AA!+/.G;/?4";E'+;;8%/*8. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5105 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13118 42 168M = 12961 -325 AAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGNTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTANAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTG /D+4CEB6&!!-C?@+@(*4:*"D#>G1B7?3+*3!(9A*-+B&6AG-9.,*F0"%-3).:;#3#D9#9"51,@005'#0A&%$@DE6(@("<9H(A+50@,1--8A)C2@!G@<7.G;%=)F"$-&-BA+';9,,DG+A4> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65C47C54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5106 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22935 42 69M1D11M = 23134 261 GAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATA 8D8H1@,-+9GD"E5CB6"8D&-6&.C!31.%G'E=(839);<=7"F=D(C'07.&D9DH4(>D5:?+""C5B:,E/>%( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:69^C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23134 42 62M = 22935 -261 TTGGNTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTT '=D@"?#"DD,#.+)2)!EF=/?!&@3B,-3@G@@;=;1$H7DEC8248 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C57 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5107 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6260 42 154M = 6414 231 ACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGTCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTNCGGTGAGGTTATCCGNTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATNTGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCNTCGCCTG 05=AGF76"8&"F4?5#3'.ED2-#-E7"<&*,E/"E$!-A>A"A#?5'F##">;"C2BG**-%G/!5@-,(!+?=CB09235&5<7G;#,&B>)#1*(3(E@/===+D!&79$D6@9/G9=#5);;9!GC(=?9B:("1<.@-,!'9)2;:,9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25G24C15T37A41G7 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6414 42 10M2I67M = 6260 -231 CCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGANCATGCGTGACGA $%16@+'0((0,)8!D27<0$=AGA"+CC78+@<&H0>:21G+2G9#=1@>=->;4@68&:"8@4?)&5E#!2/0?>+@3#1F$/2%G0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5109 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3420 42 50M = 3589 226 TAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATGACGTCAGCGAGGACGGGTATC :FE$/+<.G!B*B(,H-85>!;"E(/7+!54-F<>+"+A$&C&C@&%(.E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5109 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3589 42 57M = 3420 -226 TACAGCGTGATGGAGCAGATGACGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGNAG 7>*E54;"%3%?18"3B>C*7!6<+''2EDA.6(>F,-?8,>G=:=,).;3(EH/@4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A31C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5110 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6195 40 28M1I29M1I43M = 6425 299 CCGCTGTTNCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACTTGGNGCTGTACG 6B?*'+:0&,@H$+6D+?$70?4C$G<-==@84./ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:8T78A3C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5110 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6425 40 69M = 6195 -299 TCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGA 3-C22*!9(G#CE8@-,;EEH'$,'%CH-/'E&/(1@!-0;5>!2<72%&?#>*@?(6$D.4&5/5&"7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5111 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45447 42 98M = 45545 193 GGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCNACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGT 83E68C&:C.9B8,5)8:&=5<"0:90821'+#A;1?A(!>.1D#&H4(@0E5D=4*CD'@$+/4D1G2???C>G3(@9@>?2=;B*%:,=,H$/A?C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5111 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45545 42 95M = 45447 -193 CGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCANGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCT 2+7660C.7"294&>-730=!+82E:/'C#&:;61"$AGE5$A*H8.;+#'15CH(>4B+!39;"#?"-#C8D;F$DA9C22G3:;B=>@?,CE3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5112 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40178 42 177M = 40178 0 AAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCNA *!%!"!+"%$)%#+#(+(*"'")#&!+&'))"($)&)""!"$*""(++(##*%)(+%)"")!#&(#"!%#(%((+#$+!*!)!()"!)(&'%+&$"#&*'&&))+)+'+&)&$&"('"))++(**#&'#)&"$+%*++%'%%&'#+"'+!$)$*$*!*''!##"+$&&+"%+'**## AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:175T1 YT:Z:UP jpayne@0: r5112 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40178 0 * = 40178 0 TTNGNTCANCTNGTTNGATCACTATNGNNCGNCNGANAAAATTNCCCNGGNTCACTNNNANNNNANGNANTTNNNCACTTCCTNTNNCTTGCGNNANTNCAGANTAGNNNNNCCANCNCANTNGNTGN "!!$"$"!"$"!""$"!$#$$#!#$"!!!!"""!!#"!##"$$"#""!!"!$!"""!#"$!""###$$#"#$$!#"$"$$$###$!$#!#"$$##$!#$!$#!$#"$!$"#"#!""""$$#!!!!##! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5113 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43623 42 110M = 43733 179 AAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTNATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAA <)8?3@?"=(83#63@>$"#"+(F/>?A&1EEAGC511=)G5::51E!"@*28-<:<(:4FEA+>,9:/E!C@D3,,"/(!2G7.>8=H0<."/C#8C:,.HE06)*%'8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43733 42 69M = 43623 -179 CGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACA 8>=2+/%F#(2?(2<5-)CGEF2G7)#="1B7G*>C"GG6?C*C@.B):$/0-C160-&-,("F-)9." AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5114 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34473 40 82M = 34671 324 CCTNNCNGTNTNATNNNNNGAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCA &)"%$*&$)!$!%&'!!)$$&&($+*#%&#$%&"*"&(*(#!(%%#&#&$#&!!"#%!*!*))&%!)$%!**#*%++()"%' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:2C0T0A1A2T1G2G0A0G0T0A0T62 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5114 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34671 40 42M2D82M = 34473 -324 GCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGNGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTT ,A2&:D$A@7,@)4>,32G65A1:!(5&'F239C;<#*F;,!;:=5;4>?"40#+#70?4H,;-G/B0#)03#%.EG0%#037A$0B#,@0C5&@1<75=+-?CB29+F95.E-+/H%5(-4CB?4.G<#8*!",:3F",2F/%)/<;&E.F2@6H!9G&6#0#:H"4D@+FFD91491/@-?'!G:6)%GC,,$2,B.,>CD"?-)1&B"!210:CB6?*>F,7.:$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A187T5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5115 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28330 42 73M = 28134 -269 GTTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTNCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGT !+%7F5C:@6ED/,.@D+7;&(*B18H5.32>B3?%>.! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T51G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5116 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4040 42 280M = 4320 333 TCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAAGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCG )+B7%)-B4->**C5);"/:#')6-(G*9%70C@216%$&'7G3<379-D!6?=76+6:=7&33>8B!-)&AH3E"<@9F:AH668/5*%<".'"#245#'&"088<0":+&)#,32;"&,)%60''/G1G"D:>!,/*D/43!B")=%!!78D6?D!BF*G':/843'0?*"HG!D?+4G>G6!8=9E7=$02-21C2E;,;+?/5A9%?:E(4!(1A,-=$.<:.(0B:BA#@,<%<@;;D);)))#!@'9&A#*2. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G230 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5117 77 * 0 0 * * 0 0 ATAGANTACATGAATCNTCAACAAAACACAAGGAGGTCAGACGAGATTGAAAAGATAAAAACGATA )')$#""*#$$#*")%!+!"'((&')$($**"+$!"!")'!%((&$+()$#&*$*+)'%%%!&'!& YT:Z:UP jpayne@0: r5117 141 * 0 0 * * 0 0 GAATAAAACANTTCACCGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAANTGGCAACCTGCGCCATNGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGC )+)"#+!(!)'*#+"#%'&%&##&$'+(&!#+"(%("+''!)(%##('*!!")'$!)!(*+!(%#!$%#!$)$+'!'))#+)+)$'))#$')%)!*&%!""&!*&'&!%)*)%* YT:Z:UP jpayne@0: r5118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35061 42 244M = 34931 -374 CTTAATTTTCTGGCGTACACTGCATGTNATGNCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCACCCAGCACTGNAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCGACTNGTGATTTNGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGNNTNGNNGNN $*$%%!)$!'+&"(#"#**$!'$%&)(&'$'"*&+%%!)!('$&*#*(&)&!*$&(&!)+"!'($+(!$#%!&$)()+*(%)*)((%+*+'#'!))+&&&$*)'(!#+##&*%)''$#%)$!&)&+&!"#)*)!#++)*'$*$($&++*&)#))+$+("#!*(!"%'$#*%+*&''*!$#(*)'&)+'($+((!*)%)%"!%#(*(#)$%"(%**%&#*'"%"+$+%"%&&'(+!$$!%'"*"! AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:16C10T3C55C30G9T27T3C7C65A0T1T1C0T1C0T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34931 42 114M1D15M = 35061 374 TNNAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATNAAGCCAAGGCCAANATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCC #)")+*&"&+*$("(&()'%)$$)''%&+)$"*+'"!!"%')!'!+'**$*+!+%"'*"+!*&&'+$!&&$#*&&("(+'!+)&&*&(&$$"!*()#!')+(+'&*$'&%)&*(!!$)#"$#+%'*&$' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:1G0G78A13T18^G15 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5119 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17297 42 47M = 17353 211 TCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTG -F*0+05CB0CD=H//!31H.EH7-9A1'C/72@:"-:H#=4.B2&- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5119 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17353 42 155M = 17297 -211 ACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTNTCCTGCTCCGTCTGACAGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGT $!@0*77(9#(5'5($9=*A8/5"D58C2G1D02001'6D("%!>(A.0B@/."7&5$;@9H(HH@'(?H9'6=?B>#73%)@?':#.54,,>954#(-7(80D)7('3=;+0G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:105T16C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5120 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12929 42 47M = 12976 276 GGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACG 0/:;-,:EE,(%.H&9B@12*0"#+#8E(05@A;$(%>=3")C+@*$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T16 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5120 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12976 42 229M = 12929 -276 ACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGANANTCAGACACAGATGAGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGAACTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCC 6?:"H57B27:;C/)+&/H(8/"-36>.+-9$,"EE0CG3$#41G9#(6;"A7"8.9%&C!G;1&510.%"#'><&5,*6/(C8C:%DG<4."#*#:+16+A0&6G3+8,=/-D2 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76A1T13C38C97 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5121 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7784 42 40M = 7549 -275 TTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGA 0<2C.G&A+A<*.9+=D@/)F0<5**517?5"(&,:E>!; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5121 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7549 42 84M = 7784 275 NANCGGTGTGGCAGCCGANATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTG "%"'(++)*)'#"***+$)%#%&)"+%+)+'&"*+"'#%($#+(!%))+#)'"%("$)&#)"#(%#$)*&$)"(""+&&)!$%$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0G0C15A65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5122 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5966 42 87M = 5806 -247 ACGTTCTACAAGTCCGGCACGNTCCGTTAGGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGANCGCGTTT .A4/7)/$)*;C':(5883%?A0'C"E3$-+,3?7GH!.."-*(*9H&(6!%2138/05E#/)6$=%>:3(<3++ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21T7T49C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5122 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5806 42 59M = 5966 247 TACCGCAACCGCGACCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGC 5$@,(5)?.)4E>*C:?F=10E697%?E*"47A!>8)!$@/*4($*H%B90G(=?.(.8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5123 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39788 42 320M4D261M = 39715 -658 GTGGGTTCTGGCTTTTCGGGANAACGGGATCACCACGATGNAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCANAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTAGTNCCGGAATCGNGGCCTGTATCCGGGTGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCANTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTTCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGANCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCGCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATNACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAGCC #%!')#(%)!*"(+!%(+(%#!&%+#'!+"!#)$$!)%"'%$()($"(+#)%()&+$&!+%!!$!'"!&&!%%!+%+$$#*%"(%(''!*%*&")+!*("*$"(&#!!$&+$#$&$"')&##"$$##'*%"!*('%+'*''+!"&+&&)+#'!%#&$))"!*'%&!)!+##%+&&*+#"!"('+'+#$#+!(*'$(#")%'&$!&)#%*!&$*%""""*$$)#+#&'&%#'$)*!**!)!("%"")%'#%$('$#'#+)"#"*'##(*'(!*(%'')%*$($%'+*&(%&%!%*+&)'!%+"(*"%))$!%'(&'&*$'$#$#%$$&#+"#&$!+*$'#!*!&'!%%'(+"**"$*)#&*%%)**'($+"!'$+%&)&*(%%+%**!((%"&'"#*!&&##&''**)')&**'#)&"'$)!#&"##*$%+#'*&$#'&+$&*(%%!)$$$"##$'&"*'##&"'#"(""('+"+!+("(*&"(%$%')$+!#)&$&$"!'$$"&%'"*)&$!+*"*&%(("+%%'+&&'%')+))&!##"))()$&*(*#"'#*&$)%**''&!'"%$&)!('"&"&+'(* AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:18 MD:Z:21A18G37G113T1G6G2A13A33C67^GTAA28G24T42T73G87A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39715 42 73M = 39788 658 GCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCA 3:6.!G&G/00,@*1G@65D-H?"2$==/+$);0>%:&9((+3G5=1#EG/@9#FF72-G$F!,:@8-2)2@% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r5124 77 * 0 0 * * 0 0 GNCAGCGACGCNCANAGGNCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGTGCATCTGCCTTTACGGGGATTTCCAACGATTTGGTCGNCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCNATCCGGGA *"'$#)#$!&'#)#&"%#%'+#*($#+#&*'$**!%!#)##"&#)*$##!)**%%$!!$&*)#%!"*#(%'*''%'&")%#$!+$)')%$%'&$('*+*)')*(%+!(+)%#*$&!!%*'(%%++* YT:Z:UP jpayne@0: r5124 141 * 0 0 * * 0 0 GGCGCCACACCACCGAGCACCATACTGGCANCGAGAGAAAACAGGATGCCGGTCATACCACCGGCCCCAATGGCTGCCCCCCATGCTGCAAGGGTGGCTCCGGCGGTAAAGAATGATCCGGCAATGGCGGCAGCCCCCAGGACAATCTGGAATACGCCACCTGACTTGGCCCCGGCGACTCTGGGAACAATATGAANTACAGCGCCATTAGGCAGAGTCTCATGTAACTGCGCCGTTAACCCGGACGTGCTGACGTCCCGCCCGGCAATCCGTATCTGATACCAGCCGTCGCTCAGTTTCTGACGAAACGCCGGGAGTTGTGTGGCCAGT $+?H-=+149+A8:D*G?>A9375":!@A.!'1!32F*>.6&5G,!+21?EH18H,G4($((F."%B?9?4>9G))'?"+"8$%B,,$3(&8-BC8",&5(**CC!G/@!6&D-DG*;H:=/5-$$7)0605:,A,BD>)6G?"E&EB54."9,:E:<.#3A,G!&.+1;95'-'71+01>/$/1!A?3AA$93522)BC20"!'E5C$(:D">#*B.:700G"'1GF"-GB@1GAC48@DA#:G:0%,C/;;':&#'($2>#C!0-034?;&3A-)AGBF1:?--:*E%*G$(#/*>HC9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A73G103 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44051 42 70M = 44121 280 TACGAAGTCAGCCAGAACGNCAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGG %16E,4!9D$%>/+7*D-"0;D;>#'BF64F6FD0#1A#>D!5+=6$ED/4($&)9@@;2C2C666<=#14:451F.>D+*@8%6.84/*B#A'75!-7A*2B$$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5127 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32501 42 238M = 32383 -356 AGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGNCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATNAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGNTGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTC %$0%),+;;07=&7>!/F("8/A!F?<#&F>D(29?D#=A8"*!B:D-)/*GBH+B@A=3-A*6>4>-?8$D@A!!<8&C7<@2&+8@*=(B79*DB<4*D%D,%#$'.7=;+$02'$"A0:#D*.**4',44*.=,F2%.E29AAG?E0>>EC1@H2F3(!/$93E3*2'+)264+1702AD66B1H?)E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23T84C67A61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5127 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32383 42 118M = 32501 356 TACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTAC '.*693H,-!#:%D:@":+;"-2+H<2D#G'-1.7D&8/(-448*#6'6D%&%B9A73A*>>1D=.6-96:)@E:H+=)4::>.F.9B9,606H%?902H+A5&5/@5&,<0-&5'D4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C117 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5128 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39006 42 60M = 39006 0 ACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGANGGAAAATCCCCTAAAAC D"$9,>-C;AH@E/2%G(B+7*&9F&.93%-=G<0-'0A!@:7'E/)'F8@%:B",&%G" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G17 YT:Z:UP jpayne@0: r5128 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39006 0 * = 39006 0 GCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGGTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCNGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAGAACCAATGGAGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGNGGCATGTTTGG DG-E@HD.:8":9D>@&1*:34-+*9F.='?D.?D85)B%-7&@<9)5AD?/@,44C)5.C%E0'7?+EH$<8)."249&8DA9"1:8E;9&;8@;#H9HAHD@#A3F@*:=B'!H.1*E>?-);"D&;BH+H;('=#".*.E?9&*>:.+*=G&?1&C(0@%(B(2'%#>G@;'21>%<2<%F1*F,7?4$(A.70G(C;;@=,:$"B#9H&<"C!6HB9(F;1B!&%0(1*>F8A"&*C:-:. YT:Z:UP jpayne@0: r5129 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3781 42 41M = 3578 -244 GTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAA 3:C$%"0.F(&;DB8BD,7BD-&.*66"7'7G+9?=*8'G8&H)94,;;4:2(AB-1037,8D<@&/E!$@BH0%?2!D($=?8AF%C+);'*FG2#F5:"G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78T71 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5130 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35452 42 144M = 35283 -313 GGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCA #-*1#6H7'04AF*+B7622-%&>+/C<)=>-2!$E+B0@D6%5H,=!4C63%93F4=07&&G,6A&<'<5&!80#EHE$HBB,7F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5130 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35283 42 55M = 35452 313 AACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATNGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTNCG ;D9&F!9B83+>?.59;E15/);,)F!0-&)#<71+)=)?%=96; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T23T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5131 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11839 42 138M = 11688 -289 AGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGNAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTC #3!2:/H+4CC"=&3'"*=/B&4&19&"=/D+.0-A6+A+9F$+DHG8$?:$)!>6"/&;1(3:73%3,BA)#3"@E/=&F*;B8%4+"#2-CE:1C$@,26.&%;A0F168:9$BG*&"G@=(CC58H.A+E&+?7: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A105 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5131 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11688 42 73M = 11839 289 AATCNGCAGCAGCAGAGNGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATAGACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAAN !%%!&)+#*((&+++"")&"#')#*$*(#)#&****("+)$)"&&)%!#++&&+++$(''))#*#*)$!(!$' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3G0C12C26T27C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5132 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4503 42 245M = 4503 0 TTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGGCGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGNCGCTGGCATTATCCGGTGANGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCNGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATT 1+8:@"56--D9;"$>0;B.")0:363/.F%!,./>H->@;19&H*1.$3AA'5BG8GE1$+)162="3C<%*>!-F#;)?72;F-#8G)4FG;A-..6+D@*)+G+$%B97&@.0-&#D+0%5D4+*0/8@A-4"F"-9>$4,$.F5<@!&9)+3+6598.(7(,.H;,5)8%(3')F#9G+=02DFC!.C;*0$'-!3)->C;*(5'% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:44A47A19T88G43 YT:Z:UP jpayne@0: r5132 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4503 0 * = 4503 0 AGCCNNNTNATTACNGAGNAGNANNNCTTCCNNGNTTGNATTTGTNNNCGTCNATNNTCGNNANCTTCN "$!"!#"$!$#$#!""$"#$##"$#""#$$#"##"#!""$$"!"!"#"$$#$!!$$$!""$!$"""!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10201 42 216M = 9909 -508 ATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTACATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGANGNAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGC '$##$)''!#(($)#("+!+"&))"*&'!(#'+(('"%!!!)$$#"'+#(+#)+!((&+&+$+")!*"+$(+$#)&!+&(##+'"&!)!($)!&(+$+*!#'*&+)%&"((*+#$++)+!$&$&#"+#*#!)+$#'++!+$"%%**+$%('$)+$&)!%&"+$'))&$&)%!'##!%$)!$%+("$"(%$'!%"#**&+(#')&#$$&&!&&%)'+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48T119C1A45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5133 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9909 42 292M = 10201 508 AACCNNCCGCAGAAGACGCAGATGCCGNCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTNTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGNGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTC ''%&&%+($#((*$$#&"'*(+(%")'$'%#**)%(&"(""%&'"%+&$%(!+%*$*!#($!%()$&'+)&$#)&&+#%+*!!!+*$+*$"!*%+%!$*+*'(*'#+**!((&&('++'$$%($'"('*!#)&"*%!("!(&!"&)!"&%"(*"*!%&(*&(###))!)("%%#*(#%&"('!(+&+"#*++)&$*&$%"+#($!!!"(!!")+$+*%*&*+(#'#+')&+#$)%!""%(%*!#&($#("+!+*#)$))+("%(#($&+#!&(#+&%'"$*$"$*!%#&%#" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4A0T21T168C58G36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5134 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43635 42 185M = 43888 315 TGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAAT &--.09%<$@H'!67>%4)-(#@)4/'*"C81<+38+D4@?4%)>B5>H$";(F)6F/FBB;85+A%.7%3G/84@CG8DB!!)>-+'+-C4.,H:74#?7**%,2:+*!(E:<@$8G!BB&GH=;0$B!;+:5FC3!2(6B--B-6!B*0?+=4E>%A4-"3B-B1*C6EH9G6@?!& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:185 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43888 42 62M = 43635 -315 GAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAGAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCAC 38;:*,)A9-&H:;(E0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5135 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31032 42 349M = 31381 480 TNCTTTCNNCNCCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATNAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCNTTTTTTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTNTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAANGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTNATTGCGCCTACCCGGATATTATCNTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAAT &##*&%!%!'$*++$%*&*$!%*%(##%&&%*&'()&'&((''"!"#'(%&%'#!&+!"$+*%'#+$%&$+'%&($%$%"$+$"!$$+("&&+'$##'()')'!$)()%***&$#**(#)+$)'&%#++!$#&"'%$)%("%)!!()&(%#"&&'*$)%+(&%""+(!%')(+(%$"++)*(''*(%*)'"!"$##&$($+%((&(#%!%'+!)#"&"$*$&)$$!'$+&)"%*#"+%")&%$#+)&)!%"&'("*""%%&"*&''#+"#$("(**!+*$(++"&%+%+&""!$%&#*)$&*&'$&"%$('")!'!'())#%%"+'&%(&)%%$!'#"%*"*&+%'"!( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1G5G0C1A42G121G3A25G29G45G23G43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5135 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31381 42 131M = 31032 -480 TTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGAACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGG '.C3,H;0F@*@8$=))@4=9+:C;$74%+&7G+"0A%#1!3E5GA,@"0.'3/%>=:- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T66 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5136 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29779 42 58M = 29779 0 CTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAANTCAGCATTTTCNCAAGCGTTATCTTTTAC 6?7?6'05*.!#9BB((!H."8(:1>A8(A'D!!$:7A5:43<%$AB0EB1-;2H,96 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T11A17 YT:Z:UP jpayne@0: r5136 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29779 0 * = 29779 0 NNANNCCNNCTGTAGNNANNNNCNNTCTTTANNCNNGNTGGGCAAGGANNNANAGNNTCTNNANNNCNNANNNGNNGNCCATTGTNTNTGNTNANNNNCNNANGANNTGGNAGNNATNNANNNAG "$$$!"#!#"#$"$!##$!$#!$$"$$$$#"!!$!""""""$#$$$##!$!""$$!$###"$!"$$#!$!#$"$$!#!###$!"#!$"$$""#$#!"$$"!$!"###""!!##"!$###""!"$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5137 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20848 42 75M = 20963 244 GGCACTGACCTGAACGNCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATNGCGAACACCGCTTT (&16/(0#C:1?,)H:,/.$E"@1C#4#H&:+15:;??%&<1>B:(-7D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G5C43T14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5137 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20963 42 129M = 20848 -244 GACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTTACGCGCTTGCGGGTTAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTT +)8";-F00=,/G:55F7,G!#99'.C%:'4/&*-$1$>693+926A?<(,6:FF3)C*9A2;5GFE.%*BF=>))DA#?03%2/4G"@#/&88 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72A14A41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5138 77 * 0 0 * * 0 0 CAACAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTANCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTNTGGAGTTCAGC (&%%$+((+)*!)''%!*'!+&&(+&'"+&!"("*+!"+'(")+(()!+*$++%(&'+#"#)$)!# YT:Z:UP jpayne@0: r5138 141 * 0 0 * * 0 0 ANCTTCATCATCGAGATAGCTGTCGGCATAGGACTCAGCGGTCAGTTCGCCGGGCGTCAGGTCTTTAACTTTTGNCAGACGCGACCAGTCAACGTCTGAAAGCGGATTCGCGTAAGGGTCCCGCTCCCCTTATAAACCCACAGGGTGGTCCCGGCACCTTTCACCGGCATTGTAGG '()*)*%+)+#*+*&+)#!!'+()$*$"!*%#&%"&*!$$)"$*+)!((%#!##!$+*+"!!)%"%))"*)%++)*#"++%$#")"'+&'!&+*&!"&*)%!&#"*("$+"&'&')*"*%'"+$(**")"+&)$'"&'*'(%$$%*'+)%*$#$+!$#(($'&&#)(!*%*)"&!! YT:Z:UP jpayne@0: r5139 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21839 42 103M = 21621 -321 CCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGNACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCNAAAACA .*D#8>)6-9.3,&%*6G('-B9%!)/$<*FG52+#3@5A63&#(A%:5#8.0>.+5.1!-$+##ADH9*6).F$-#9-E23GG=,@%0+!?,)0%AF3A,75 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G46A6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5139 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21621 42 54M = 21839 321 CCCACACAAGTGGTTTANGGATGAACAGTNCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAG 78')8"5("46""E&+$:'*HF:09A=B?24,A66C1,%CA-EC3EB=.4%&=&@G=F$"#"48B19$A*"7)<"(?>?-$6:,/$*$26-@F9,('*3==+2/8??-4=;F%0%5A*-6>)3'#@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T82G49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3015 42 140M = 3166 306 AGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCNAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTCCCT G?.<*+%"#EDDF9@2+/%C71.8GA"-7!?/#F'E-@C>69GB%*86=E5.F,83G0#7;.#>,4@-HBH,!3!03E'61;(<3-E+F94=9C90=):*!H<54E3/FG2>CG*/8A!+;560C;'5FD55"2'6!(;C-/;2H$.)51;,@3DA=$E--D*8G$(=+52);4)2+*A&B>'72<:DHC*E14$:H3A#-2>G<.-8!:)9!+(#3:/,+66/("3A(92*B AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:56C39C29G22G13A0A3G20 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5141 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5874 42 58M = 5674 -258 CCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGTTGGCACCACGGNCGGTGCTGCCGTTGTCATNNT *)"(#!)""$()&$!*("#&+'#$#%'$)%%%%+#&'&#&$+*")"(+")*$#"&#&* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:24A9C1A14G3T0C1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30403 42 76M = 30304 -175 CTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCT +"&'#+#!**"$*+')'$#$&'*%'#+&**'%)&'#(%!"#'+&'')$')+#++!((*!##!&$+(+'")+"!#+" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5142 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30304 42 99M = 30403 175 AATTCATGGAAAAGGTCTGCGTTAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGGAC (8$B!.<9B?.%B:B!(HDC@H6-@2AE"@,,@&>/41*%*E9F!:7??;%?%37.HA=C7*5/)H!C##(?8592@1+D@AF%#H@..(G8$#<(;:6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C73A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5143 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19001 42 122M = 19218 260 GCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAG :GE:&//,@%$H6)3.H.8%E(6#"#<.9*E4.5!0F0CHBH5,G7(*13"',0)22A(?1?G!A5F,BA2%>D>%5D/D-;7EH1D,8HB!@?9;$&E<&EH5/F0)8/H,%,%84B+BBHAE8D'1@@1@.22+6-,;7;.=@D2(2D824("32.2D2><8FD<*B$2E49HE?3?1EF2?2& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A81G38C23 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5144 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6396 42 28M2I76M = 6500 257 NTGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTANCGCCGCCGTCGCATCATCANGCAGAACATGCGNGACGAAGAGCTGGC !#%++)"%&%%&+$#*&*%"($(&##%*$+)"*()%+"++(("!'#+'&%*#+'&'!"%$##))+*"!&"!))%*"*%%&+*+"%+(("#&&'%+'$*""#)+'&$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0A55C19T12T14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5145 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17504 23 77M = 17702 269 TNGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTC &%++'*#'+$!(%"*!&%+"!'+(&#*"+#"%&)++"!**%&+)*("!)+&!("+*"*+#''"#$%++"&#$&$&!+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G75 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r5145 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17702 23 18M6D47M = 17504 -269 CGCATCNTGCCGTTTATGTGGTACNGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATGNCNANTATN "'!")*)"%'$+*(&')+!$!'&"&$'"%&$"&+)''#"')+$+#%"*#!%!#"%+!("!!("%! AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:15 MD:Z:6T11^ACCCGA0C5A30T0G1G0G0A3C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5146 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39288 42 207M = 39525 293 NNTAGGNCTNGTNAAGACTATCGCACCATCAGCCAGGAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATANCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAACCTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGT !$("'#($*$'*!+(!)'#!%'!&(''+++)+%*)"+(#+$($)%(*!&*"#('!)+)&'&((('(&'&&+"%#%+%%%)+(+&!#+''+)+)&(%%'(!&*#**%#"$))+$"&#&)(")'&!"&$&*"!#&%)%+#+)&*++$"&&"$&#(!)&#$&$#*#%'("$'!'#%&*'"#!&((%%)()#""$*%&+%!**"'$#*)') AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0G0T1T1A0C0A1G2G23A31T108A19A6A0A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5146 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39525 42 56M = 39288 -293 AGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTANGGGGTNGATA +("!"!'(+&(&%!$(**%($&!+((!"(($(+)#*&$$$"#&)+!$&*'"!%)*" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45C5G3C0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r5147 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46853 42 107M = 46638 -322 TTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAANTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACG E"C.!H>$G7-$4A9--8+#)C.:@.1)87.,658-D3.=!<.:+60",$>98 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5147 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46638 42 109M = 46853 322 GGGNGATGNTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATATGCAGGGCCAGCGCAGAAGCGAGTAGCATTTT )$"'%))(!&+(#!)'))#*&**'$((''*'!$%(!)#!%"+&#!&$%*!"*"$"&#('*#%'&&'!)*!!*'%%((*"&&!*)&)$!&)++"#%")+'#&#!!%!"#% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3T4G68A15T15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5148 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41916 42 46M4I158M = 42120 411 NGAAGATTGATTTCTACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGANGCGATGTTATCTATCGGNGCGGTGAATGCAAAGAAGATAAGCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTNGAANCGATGGTGTCTCCGGTGTNAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGANAGCGACGAAGTATCACCGAC $$(&(+#($(#*#&#$)#+)&*(*)#)$(!$*!((((%&#"*&)!'#$'&!'(!&((%''"$*"!%"#)$)#'!$*#"&*(!#("!&%")!%+)+$(++"'%)'*'%&#$*((+)+&*#!+(%&()""%*$$(!"##(+&#%&'!+)!+'&'%)$'+($)$%*!*'&++"*#(")"%&(%!*'(%"**&&!%*!)+$"#*#%()+#(& AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:15 MD:Z:0G1C2C8G23T13T22C25G3T18G58C20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5148 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42120 42 207M = 41916 -411 ATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACATAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCGGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCG *#G"-'<089#*"0"3.?-9A>.8G#$(;D#:?&*?F.0(?#*B*@:+&2=/!H3<:/+#4#?#(C20=3"G!B#CG7$0&2(+$8&;0=;&)'>E!#)9*D#GAC(>.&'+'5F)!F/H!C:1H#ABB8:&-<(,&B*%#+/9:F4*<-:72GH67*/"C.%G#%A&D4G195EB"@6(&H,@(%F,726= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78G27T100 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r5149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35854 42 93M = 35733 -214 GTTGGACAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAA !4E.;E0-(&E#A.:(7#,AB8B@7%*;-#F;F&1:B/0>D+3+5-)41H98+@+D+'5AD:E2-HC&7E/'E%;A/HD<'%,H/=>'G'4#= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A86 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5149 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35733 42 121M = 35854 214 TNNGNTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATA ')('*'$#'#+(+#%%%!)'&#*'($!$%'%'$+&)*#)&!!&%!*!+)("'!%%)&')$*##&*%)*+'$)"$&'$'&($%"+*"!!)&+%'"$"'(#+&+%'*)"&#$#)%&!(#*)"+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0A1T116 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23111 42 46M = 23343 309 TTAAAAAANTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTC 1117#'=B"0)356#1?'&6.)*7#46)F+:0B$B4>A)C$+:4>2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5150 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23343 42 77M = 23111 -309 CACATCGTCACCCATTGGAANGTTTATTTGTATGCGAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAG ?8C9AF",6CBD09#923#&>;FD0?=&@)-H=?9:()8G0#:3'&D+5@'E;.:'(0C5AG=4A>D(<9AE*- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T0T14C41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5151 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37927 42 81M2I22M = 37773 -257 TTTNTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTNGNGGGGTGATAATGGNTGCATGTACT D.D!5!.5;&&EEB8H3!>/+8;7DE70'0:0&:D%=%C1@,C>F?!27GH(:66@B$97%.682#("(;D@E AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:3T74G1C11T10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5151 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37773 42 154M = 37927 257 ATTNATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGANTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTC +%),9H')9194'=CF78;'9,4B;>E1%065CE5%0(0(+3G=&;B,G1)>=(->"9GH$E"4?9-43,%8#E@9E$E31E=*$"#/B5%,,F,6HE-7E@#D,#C8!@;C'*5>A)(@?>&5H+&@*2)54!>7EH&(,G)>**A+4G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G59T90 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5152 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12272 42 47M = 12067 -252 TNCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCNA $'"!(()%#))*$&(++%%"&*(*%&!*')'($$+*!!'$!)!!+"% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G43C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5152 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12067 42 93M = 12272 252 TCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAANTCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAAC CB@*24(@.)&=;E@20&("G"&$G-#*)2G1<$;?&1;:6+$=FD1?)B(&>C!D#*<6AGB'&6(H7+1F.%<>79$41/@%'@82&C90' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22726 42 224M = 22633 -317 AAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTNCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGTGCCATAGCTCTGA ('0C6;E5,"">/%<5G)+5B$D(<=,=<:'+7)4G#4)5$"="#6?1$+)2#(-7#H$-7,;*H8'06:>(#09(-*7<-.%9#/35BG1E6B%?7421676*3*H21)D&'G&B=EAGEG#7*)$).C<<3;"G*=6C96)5)":"677!.9&/D8G@)E@>"GG+#)(/A-#!E&)>#?@,B/72.:(G4#A*'B';B0E!A)B">9A,01DE):0A+?D% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G164A13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22633 42 93M = 22726 317 NTTGGTNNNTTCGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTT &"&#$'&($&#%+)(*"#!$"+*(&%%('+$(#+%#*$*'%+&!!)''%&'"!)%#$$)&'($$))%%'")%%&())&$#())+)*!*+""!! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A5T0T0A2T81 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5154 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22306 42 127M = 22232 -201 ACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGNAGGCGGAAGAAACAAANAAAAGCCTGATGCACGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTNG 0,E0E.EB+5,#0H$<6GAHF+G-'D2E?0!B,-:9CEH!4!!?A@1+3*9#5D1@=+%F,%3G+F,))")71EBA.7F.'1"HF3>DA3=#A;A!G0&::)1.=9C3!C?),H6)9@B/>-8=>!& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48G16A14G44G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5154 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22232 42 67M = 22306 201 TTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTG 7?0&,BD,8'0*);#?!/(?A+*/8(AE609,*$-=DH1)68??&9#.4:A6,$)G0@;="(%74&83;6BD?> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T1T54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5155 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6031 42 47M = 5733 -345 GACGAAAAAACGGNCCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGCNC +(%'*#")(!!)+#'%$#&##)'"$')&)("+&+'$(*&)'("*+"! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13A30T0T0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5156 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48279 42 95M = 48279 0 TGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGNATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGA 'E.G.-$5!5G&04+3?#4+8(:55);+!:.:&'=#55%(76E273&"=3&.3/H85;%C?"$=97&,%(/.'B@";8+)+/<8?%C;10G@B8/@@3(!230#=2/85(@',!E?$A@:9-><#/BA>#&/?H"%;00&*AAH9,%#$?@/#HD=+)%; YT:Z:UP jpayne@0: r5157 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1906 42 143M = 1906 0 GTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGGTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAAT C#!5@=B/')#B.8H>92"':A'5-DE9+G!-H#4,:,)GF;@/+1,>6)5<"7&!F/A+1=$<754>>45$(,%:4*!5;1)F)B($+305*62G1B:"$9D=6D;=3G0C4%0D8H*8CG87=8!5+?(+1/38#D="C=B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C78 YT:Z:UP jpayne@0: r5157 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1906 0 * = 1906 0 ATNNACCNNNAANNAGNANNGNGNNGTCANCNTTNGCANTGANNCNTNCANTNGANANTNTGANNNNNNNNATGNTGNNNNNTNNTANACCTNNANAGNNNTANNTGGGNNNGACAGNNGNTNNNATNNTGGNGNNATCTNNTNCTNANCNNACNTNNNNANGNCNANANGNGNAAAGNNCATANACACCNCNNGNGNAGAGNCTTNGNNANNGNAAAAATNCTNTCTTNNGNNNNNAGNNGNGANGNCAAAGNGANCNNANNANGNTNCCGANANNNNNTNNGNNNGTGTGGNTNGNNNGGCNNNNC "!""#$#!#!#"#$#$!"!##!"!!$$$#$$"#!!#"#"#$!#"$!$!$$"$$$!#"#!!""$#!!!#"#!!#"##$!#$#####"#"$"#$!!"#!$"#"#"!!"""$#"!"""!$$#$!"$"#$!!"!"!"#!"#!$""$"!!"#"#""#$#$""!!$#$$!!!"#"$$!#$"$!"!"$!#""$#""$##""#$#""$#$"#$$"#!"!!!#!$$$##"##!$!#""##"!!""$"$$"#!$"!#!#"#$#"""!#!!$$#!!!"#""$###""#"!""$!"$!!""""$$"!!#!#!!#$#$#"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5158 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44394 42 158M = 44260 -292 ACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCNACAAAGAAGAGCCAATCGCAGACNACATTTTGAATNCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGACN ,F=;(6,24*.F@&E>0D>7:-@E+%;AB$343E(CC8=,/0*50"AD,>';!?3&:(/CF"AG"%F>:'?F=+#H0>0A41&@D3/#@-?.C>A,AE/'%B7";H*:@C&%@HF*C@.6"6F*:AH@9D$' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:65C11T11A11G54T0A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5158 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44260 42 78M = 44394 292 CCNTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGTTNTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAANGCGTCGG 0?)>':<9@29+;!)/*%'7DE/?9&:<=D53)8CA1B+1A=D@9E0&B7>)D&HC'H'<>D;E!-6=!18@(B@A9H(!'C;',AC7EC#B(8';*!)/*+?+94C8'-6'F<<=8?HGHE,==%2?,/&;).3?:D-8;5#&<,%%1ED2-79:7H/A>1,C'G3)9<>(@-"C0@C=6=6+A6D>!B55G/B<1@&/C+1+( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A3G2T96T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5160 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1124 42 170M = 1294 286 AAAGCNCCGTGATAACACGCNCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTNAACAGGAAGGCTCTCCGACGT *+D,=@+2-BH7)72G.E#=*;5C'BH2#.DG4?68?B@?B/4">G&C<85)'>"/7#<"<5>""9*8BD2?=$+8!"8"7>/$*%+!F949"E#B<>'>D/067.EC""!83+1+!+>#F#;?$A"!:<%<%F&!/-2$,(#0A@$)%;*C;%"@5D;0A0&0> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5A3G10T127G21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29339 42 72M = 29508 257 CCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTTTATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTA ;":-7%8A#%22,"(2@;E";B4;D&7#.+7E=2F%D1:$@?)#!F?0#H+-D!1-+1$D,.)#1G3",2-!",#.%FD<4,0A(094)2%1:;38,-#G.HA>DA+&(9+;0D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G9T5A68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47839 42 109M = 47666 -282 TGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATACCCTGGTGGTTGACTGATCA >D$<$#/8+8,!05?:"D(55$4E"74<)(A)=8D*;*?;4:0!&3F.E$H82*)!9$)?A,9'B:@!0?&.:#=*/,4,1$?);1.E5$D,:G4%(,G/H)HG>4>:E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54G33T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5163 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47666 42 72M = 47839 282 AAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGNCAAA *>/&,*HH!=GA;51F!(H()3G+5>?64;86H1%13G!/E&A8"&BD;+A#@(+5'&$4..",0)93#4?B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5164 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14235 42 64M = 14437 277 CCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGNAAGACTGGCNGCA #+(("*"!'*()#)#!##)&+$'!'%(%%+!(&'$'#''#%!"&+$(()&)!$$#!*!)&+)&& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50G9T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5164 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14437 42 75M = 14235 -277 GTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGA &4$9$<(89+A'93,1,'()=5H1%%%621(%26E,'75BF?0-!+H/%>CH/:A2*"G%=+;'11930+#= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46476 42 45M = 46582 231 CACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCNA G(&.,2A0:/3*F#!9G%,+<>B(&H;E&@&1H:=0'-9C:73+1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46582 42 125M = 46476 -231 AATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATC -4EA9==4'(+==67(-3G')-?.$GH:%-4+<&/7)?:34&&-GAA)B>70C08158C,C4A9(#!4(G.#A'F6H7)G3F73@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5166 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31828 42 142M = 31697 -273 GGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGNGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTCATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCC D>?<@3))0@7*4*47E*$!;.-3)G)D@&>4,+1&FE39DG+1)/"0%-?!.-+@";*9?.?7+E'<22 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65A39G36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5167 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9887 42 41M = 9992 242 GGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGC +'.;&&1F?G592F4>F$0@61$?F149+F#+D&:7(,3&19:@CH"C-+C35@?AC@1AA<91,1%/(H4E;%F.'.92!$:F/;C725$1*/H>/=+0(#6>,!&F::651%C3$1.07:1.1=#AF135*%BH&2".H.D8F! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74C61A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 425 42 76M = 286 -215 CCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAG 9>>6.6)"G+.DF*(#)?0%/9/F#>E..#,7').G95&+G@?%)<(1G).)+56)>2)0E5@CG?B12"+G(=29 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 286 42 46M = 425 215 CGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATA "#A"(;%8C0$H+43!7=G#D*,(6,>=.)'@F),E1&@,,/@.4B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43913 42 87M = 44049 233 CATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTNTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATG @')*A8,?,!-,(C8->!&%.F=581GB.E4>EB,HB;2$6C9>=H("=95H(?CC7-+-E@<;E0*E88?>&3'.*,4)5'=3;>B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44049 42 97M = 43913 -233 AGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTANCTGATGCAATTTGCACACAANGTNTCGGGGAAATACCGTGGTGNGGCAAAGCT H+!/":/#>9CHC'5!F@@9"H"9HB78D!;GCD<2AA?=0<62-5=%HC),#(H,#&'GF<2B<D*C7FE4!HC4@@*B905E=7*5A0;*,@%05#713.&2>027>8>&#-6"9,-!1.6+#.=,@<0D9&,%@:9/.+G(#/C?ABG/;4HE4H4=5#?!7>9<3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5170 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1460 42 86M = 1312 -234 ATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGGCT %:@FE=?363'H#E6A@);.2C/3,()+$4:F:>HB1&+395,C/?(C>!./F!=<;'7,C"6;1@;3: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80A2C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5171 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30988 42 156M = 30913 -231 AATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTNTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTNTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGG #--D(>?HG!9">#6E)&3HD;*-*0*)<@"9F!)&A!:&0F%&,F9)<##:%F6.9"#F4;:F2==/-%;:$F"=7C@F=@#,@>(71G?2F?634#6;A60'$&.?@,/C-#7>>3!0/A$.*#1G(74/?;A'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70T32C52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5171 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30913 42 75M = 30988 231 CCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAA 89+1)F*2B00"CD*@G<,)365=,+!B9B!D0=<)E,-*02&#""- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5172 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4937 42 51M = 5056 185 NCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGC 'B%F3'AH+78C@5&"+$7DH:E93'4!>4$(<)?2*<1C'/'H%)6!.&+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G39G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9609 42 47M = 9683 187 GNTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGA '&'+)&$%)*'$(&*)#+!*)&'&%)$"*"$!#+)#+++()#$&(*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9683 42 113M = 9609 -187 CACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCANGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATG @/DB5C>D.A?%B!3&?C9-FF@F@,3=;4E,53-<8@)?4$/'&F8FHAH()7:9'@HF??D@%:,&?(9G!""A)(-3D++E,+C<,/C4EG1=5?1=1?.>4-/BF!3(! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74C37C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5174 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38539 42 88M = 38706 207 TNGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGT ((/.$328*-E@)(#49;F4+:;@BE;4@*#G$3,D9"&1H"#!D28(C7>9.=<>D&&AD7+49,B03(F%':008B;$?:>'D5=' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38706 42 40M = 38539 -207 ACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGNCAGGAGCGT 8=4(!<9+13$!)5(D)+=0//%,EC4(H"$-<+&'G5C@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5175 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19647 42 120M = 19549 -218 AATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGC F1E87F/9D>A<$;87%D0#84.7/&G:&?B8<=F3,&>.B<(GFA/,;+8B@"G(*=E'A><0#F2&@,>A+@:-$G)D.D2:,;A9<:/@%:/4$.#6,/3-1.C('3A5&A:/'G$, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5175 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19549 42 63M = 19647 218 TGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATNAGCCAGGTAACACAGTGTTATGAC B=@9-')65+)A8.*51F%CD+H/F194;D$FH6><6'C9:1!",&:%<(+*=2B7D@3C(#H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5176 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11691 42 77M = 11459 -309 GCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCA /=>#2!3GF!3)>F4,G?()7HF30:$8'&$1135HF*4%#7@@'>A?"1.H4@D?;24D+6/.H)-8"1/>%F#96 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5176 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11459 42 232M = 11691 309 NTCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTACGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCGGGAATCTGCGCAAGGATTATTATNTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGAGGATCGTGAAAAGGCCNGTCTTGCTCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCANCAGACTCAACAGGACAAAAAT $?*351"9E1=,;(8E!09#B()7;/@75-/?-E8=<%&4GD6*)80HB8!.G/:5<=/>@!-&'@F*,,D.64$>@5@9%;@39+0;A?#H'9*A(?>@7-!;C!*/>4848%>:39(D,@06E>$:?DC.68(;C3(,,:11E&&:+17E%@/9:9*+HB$G2/-F680=6=')E8<*=4F4D4HDB)="5)*:6E):"B*?E AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A61A34T17G5T34T15C7G29G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5177 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38506 42 43M = 38332 -217 AAAGTTCTNAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTT *)4@$>+5!'/.#DA+>9#&<9-0)#7:"1?0#>*6<*;H4@G6;@$EB$1?-F,0$H6?36#;8GF0&>,,.'(144.0> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5178 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12450 42 114M = 12586 217 TGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAG /(H/G=6)/==%=:7B79*H":*?%,D?GA,B&@/F"H#4>@#>/%2-3&)*)AG:/A#HGC<>A6A22&=.,E+2)73BC&(&6&A.F<#5&23F?@1'50371=;'BE26<, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5179 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5042 42 86M = 5042 0 ATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACANTGCAGTC '>%,GH5*(740&:23."9*5%&=A;.C.-?009 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78C7 YT:Z:UP jpayne@0: r5179 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5042 0 * = 5042 0 GACNNTTCNTNNTACNGTNTNCGNATGGATGNTNTACANNCAGGNNTATCGNAATNCAGANNNNCGNATNNNNNGNGNCGNNTCNCNNNNNNCGNTA ####$$!#"##$##$"!#!"!#$"##!##""##!!"!"$#!!##"#!!###!"!!##$###"#$!#!!"!#!"!$#$"!""!$$##$$#"!!"#!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5180 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30480 42 66M = 30546 521 CNTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGANTGGCAGATATAGCCTGGNGGTTCAGGCGG &#(+$)+!$*)"$$%%)#!+#!')+*&(**)%&++$!#"'#%"#+)!)$+%"!("$+'(%'#*##$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G34G17T11 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r5180 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30546 42 19M2D278M2D154M = 30480 -521 CGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATNATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCATGAANTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCNTGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCNGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATANGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGTNNACCNNT )*$(")'"$&!$)#%$%')%!&(+"(!'*&**&%&!%"#**"*'")%&()+))*$)"'('(*''$(&'%$+)%)&!$'!(!&($%')%#!+#+)*)%#&*&&'!$+&!&!%(&&))($#)+*&'!(#'%'$!%)'$))((*'(&"*&##"+!+%&$&!'*)"&&$!+$*+!$+'*'%(*)#$"#&'!!*%$*+%!'#)"$&%)&'(!'**!#"&))$)""*%")"(+*$"+)(&&)('#($##&%#$&*'*)$'$$$%+"#++%"!$"+"'%+((($*"&#&&$#)%)+'*!"#(#$$*&*#'#+$+#+(#*!(&$*##%"*$(!#&+)'!&+%#*%&&))(()'!&!(*'**)#$%%%$#(%$(+&"#!!%#)()*$(($(%!$%('"*%+($"%)!')(*#"))(""(*$+(#")'*+"+*')&$$))"&$"'#%'*+)&!$"&(#"#& AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:2 XG:i:4 NM:i:17 MD:Z:19^TG35G24C4C75A136^GG11T97A35C0A0T0T2G0T0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5181 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 132 42 66M = 230 229 AANNGTNGCTGTNTGTNTTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAG ()"&##"(%)!''#(!!"+++!")$!#&'#$&#!%"((%+!%%(#*+##''##%%))&'%!()(+# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2G0C1A0G3T1T2G0C0C48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5181 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 230 42 131M = 132 -229 GCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGNATGCCGAAAGGGATGCTGANAC ./8.C?74DH.<&(8F@=&<>;=$!$767!2><8B.6$/?,G?(6$0,.E.;":;)H(+98C<$<+G&85;;B)G#<8!:G21H)4.=2,)C(34D?/7'-C3"!@H0)>(4+(#;:?E<&!'" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:108T19A1T0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5182 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31157 42 243M = 31157 0 CGATCCTCGTTCTTAANTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCNCTGTNCTTTCAGTGGATTTCNGNTAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCC '*$&&+!"'$)%'!&%()++!!(!+*)+!&()+)%!!"%'*%+!)))(!('(&+#'"%$(+)#%!&($$))&(*$)&"+%*('#$'(*(&)($+"+"*+)))&&!!#&(%*)#"$$+)!$(&'#"''#$!%(+#$%++))%#!*+""!'!%(!%"%&+%"$%($*&'()+"*%)!$#"%"(&+&!'*+(#++'!++)*!$)""!"+$(!(#())$%+'"*"("%*))!)#&*&'**+')++!$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4A11C60G4G15G1A142 YT:Z:UP jpayne@0: r5182 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31157 0 * = 31157 0 CANNNNGNGNACNCCNCNNGNGNCNCGTTANTCATCNGTNCNGGCGTNNNTTTTATTNANNNANNCGNCACNTATNTCNNAGNANNNTTGNATANNNCCTNNNTTGCNNGTGGNCTATGNANNNTNNGCAANNATCTGNNACTNATATTCANTTTNNTGNNCGCGGANTANGNNNNNTNNTNGCTNNATTCNNTGTCTGNCGAAAAGNNACNNNCNNNNGTAANGNGNCNNCNNNNTNGNTGGNAGGNACCNCNNANANNGCNNTGNGAAATGCTCAGNTNTNNTNTNCTNAANNTGCNTNAAGNNCTGCANCATNNTTTGNTTNNNNTCGATGCNAAGACCCNNGGTGNTGNNGNNNACANTGTGNNANNNTACNTCNTNATNAT "!#!#!"!!$#$$$#"""#$!#$$!!#"##!#$"##$"#"#!#$$"$!"!!##"$#""#!"!#!"!$####!#$"#"#$##$!$##!!##!$"$##""##"$!"$!!#!$#"#"$$#"$##"!!$!!##""!!$$$#$$"#$#$$""#!#$$$$$#!$""##!"$$$#$"#"#!$"!$#"#$"$#!!#$!!##$!#$!#!#$$$$#$!!#!$#!"!""!$"!!""!!""$#$"!"!!$###$#!!"$$$$$"#"$!"##!"""$#$$#$"""!#"##$"$"$#!$!"##$""$#"#""!$!$!$$$#$$$""$$$##$!###$$!""#""!$$!$##"$"#$!##""##$"#$!#"$!#!!$$$"#""$"!$"!$#$!$!##!!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10638 42 44M = 10936 338 ACGGAAAGTGATGGGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTC 7HG1C4:';.4:7()..5,!G/<.A;$A$4,1GGF628H0:;94 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5183 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10936 42 40M = 10638 -338 CCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTCTCAGGGCAACTCAAC '#FF234E3*F75!AEC;$"B@;8=9%.,CC5E0CCD09? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35477 42 120M = 35597 306 CGTTTCGTATCACACNCCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCAC @?>4$%;-B&C7AE;BDB.(+F(>$<CEF80@"1F734!)::"!.E?A2:"-4+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A104 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5184 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35597 42 186M = 35477 -306 CGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTNTGTTTAGTGAGTCGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTG =G09A2672,>G<3!0F6;:8:B,D#,)532150.>@/;$/@EF@,>5E*9,&A&+$:%B8.!*>$?A2D@%5?"3-D,9):%76&>)53?%*%%7"4C!C64 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:128A12T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5185 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9138 42 204M = 9342 371 GATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATGTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCCGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCNGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAG $D$?DDD(=47/0H,;33GA@9!D<<)1CA(=H&%8A8$*6-DECC<&5""0=B540=3C'0H"?C;4,=C+!0:;'E!8H>::#;#7!##<=C0>&19"<5AA#+@70E2FC2/.@A*H$&6)!C+!'0:7-/-2(-FD@)GH=#@3/36B2G)G@*DAE@.-!99D#7#BE.&:D!6C;(.BH=8$*H?7@A%9A.F2#!!.:5)',H).);::(?979,9C.A@*E"C AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:43^CCAAT65G53 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5186 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12270 42 115M = 12089 -296 GATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGC &@5-:G;/:3BF7G+-.#'>:!.H*$;&1H6=1BG'(9C+*>!8G!)%%D@"&,C$00&*9-A=.2>HB@=;':>%1)/#:C=="0-CDB!1( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5186 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12089 42 79M = 12270 296 GCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTG 8.;-C3('7:+A@.;))@'33;.,""@1A*)>1FG68$*H&,?1CC*F10!<%,*#+"8?6%#(%;,BA4*D71=B:>@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5187 77 * 0 0 * * 0 0 TNTTTACATCGTCTTCGCGCTGGTGTAGCCATCATCTTCTTCCTC C%'"4&75F>%&')B#(%#%2D.4:-E7/?>FH33.6AB322#?@ YT:Z:UP jpayne@0: r5187 141 * 0 0 * * 0 0 TCTGCGAAAACTGCAAATAGCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGANTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCAC 86HA"2G8!3B<"DDE':*"+4.4561**.8=D=0"(H/+:#92:41>C9;)(;*2F&<3'A<>==54'?8)A<5A7-?)?)*(8("7<=>=-GA>&!A=:FB41H7?B>"7HA/0-6!/;4D5*H=H)%7)37?+6;6@15=46G!0G2#;)+"A*'E)1B6.6('FF6G=B5##.CAFD9"A.@/;796DD0@6#+<,7BB4+C@3<@F@A72+<)FD4?A06+3&?)H,.?"!"3&FB6.#H42"37'HB4+9&:/DC86(B(:=@,"(G<7@+?H:"6G!?<0:*(?,%+G9C&>70)0DC?**=E(9"0%0DF'4C7*G"AD6;5+>#&7;(8"B92C0D$!(+E+AF>-5:)B,@8-AE(-#81?'11='2GH63+3,"G31//D>H:C2@-';!";,<;.G7/8B"-0**# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:186A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40635 42 100M3I44M = 40779 538 AGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTNCCAGANCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAA @95<>'*;)/E-E,"%:*C'=D>:>+FF4.750-)A-@4CD84)?4@FH<<$)5%6"F'.32=:<91*/>:#E*3<-1#0+G2G#,C.,%9FHG9=-,# AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:83T5C54 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r5189 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40779 42 39M4D351M = 40635 -538 AACAGGATGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGNAGGATTTTGTGCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTNTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAANCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGCTGAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCNCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGNGNA %**'&#()+&%+$*%+!%$"!!+!##"'("%$+'$+'('"&)#)&"!'&#($'")'%$$%#"++(*%$)('+$)#**(%+)$(+&'&$&()+#)'"!"*'&'+(%+''$&*&*"'#$")%"'#""++)'*'(($$+&#)$!)$$$&#&"%)$"%"&&(&&%**&"&*()&(#%"(#%!$+&"#!&*!$#+$*#""&!%)'"$!*%"(+&$)$)#'#"&%&"&(("!**'%$'&)(+*+"'#!$(#($+))'#((*%*#&*+#"+&%*'&&"('!#%'*+*"'")&"($'')"""(*&($%$*+%()*'%#'(+*((*##"**"%!)#$'!'("'&$#$"&&()!!'+&''+*&&*(((%*&!(!+#+)$!'!*)*""&!"*&+*)*')$) AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:15 MD:Z:7A31^CAGG68C5G4T22T109G49A1A43T38T1C1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5190 77 * 0 0 * * 0 0 GCCTGANAACGGCCNCGGTCAANAATCCGCAGGCCAGATTCAAAGTTAACCGGGGGNATTTGCCC $&(**(#')#&)'&"*$''&%$#+!'+#'&($()("%$+&$!'*&*&'**+$$%'%!)++(*+"+ YT:Z:UP jpayne@0: r5190 141 * 0 0 * * 0 0 GTNTTCACCACATCAATGGGGTAACGGTNTTTCCCAGCCACACGCTGCATGNCATG %(0A4&5!B5E0CH9%=/9*C)BA;?%G;:1=52&F%G5D&,1"6D2G+BC!*#&% YT:Z:UP jpayne@0: r5191 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10152 42 74M = 9920 -306 CGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCAC #$>CH*AAA255D0,>A;+>4HE)14C$$FBH=!(B'2!@)>))324"59$E!)D8<%1">)C*@A5>+H5A;> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5191 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9920 42 163M = 10152 306 NANANCGNAGATNCNGCCCATCAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTNGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGNTGTCTGGTATGTNTGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGANCAGACAGAGGAC ('$%!"*"(&))!#!($'(&*!+&)))"+!++)%+')'$'#)&"'*)'!+)))#*$+$&*&+%"+(%$$'+"+&"&!&$$%(*(&&!#$)&$)"&(&#(#!*&))$$*"+)**'')+"'"*"#*)#$+++)*&')((!*($+($&!+*"++&!!"*+'#!$&' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G1A0G0A2C4G1C1T4G43G43C12A27A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4429 42 106M = 4583 201 GCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTCCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGG 766,=3G8:.<7/1C(BH1HC<5"+#B)-?$HB?G454@A?3(&#:**#65.!C&330@.<#6+.1.6=&8';F'D34G;/0*H+!6%7-(88&;"0#DAG* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4583 42 47M = 4429 -201 GAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACG $*7)$2DHD7%<'G#%"19,@'7>-H>0C4A.*?37G>-,?-B*:#* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5193 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9931 42 53M = 10086 262 NNGCGTCCATGAATGAAGCCGTTANACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACC #"')((%(#+!$*+)!&))+!!$&&*!'$&(*))')%%#""++)%#)!#)&'+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0G0C21A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5193 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10086 42 107M = 9931 -262 GGGCCCGCNGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCC 106'4D$7:0DE+A/DA(?,>0$1"H&95">('0&,'+D:;7/?!9+6*06*FG8+$)A43CH4'24,2:E7!.43%@CF.%>5#.5=-+05<=0E1B2".1@$*/9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A98 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48026 42 159M = 47855 -330 AACTGCAACTCAANTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTNCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCNACGGCAGGCTTCAATGACC HF,.4?9$E@7"6)?,-E;##+!2"6-95;*7$B=$6)C,/3@=.30/-?0+,(+:6!AA>EE3;G"&&%855=;#.>24B/F28'=57G8291(FG#?,/*D25';!,('A+D%!+C!-#7;'52A%!B'H,#:?/19&3($;4-,<(!C7GG8<6H6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T69T55G19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47855 42 171M = 48026 330 AAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAANCTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAA 3'-H72,@F;$F*269D=GD#G71;+!!F(25HFE3;D1F4,#F(6*<>-?(F1&0032'F!%.723,H,?,2++3..#/(+$).<#0=8&(?.>'C;5*=5',,90%'$F<2*-6(E!:6*(>@&:#F8D.!GF@:D+C0;-19$3%6>H$HH$.6)>C!3=&C(48%A* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G75A56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5195 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39812 42 86M = 39898 356 NGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGT %(3+/;@GD'.C.55++?671?+@F$9/@;>A'A49C&>,:.&"!6!!!G91:=H"38@1#5@"1:;<;@8E?G3E,F5@$3<.4* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C85 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5195 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39898 42 210M4D56M = 39812 -356 TTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCNTCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCNGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATNCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGNAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGNGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCC B%(,1015D?$C((4FA/:81?;9".&$!C@"*&,'B&&.AG-'%,7HB;C%A.:(+EG;65#'*12$,H(C?A"D,#;&%F;?9=D@B#BF144D21008"(?C%B1G>5(=9-C62H=/.%6!2A8,-#A2+9*==D<=H(.>&C5'*%*B&G AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:25A61G87G34^GTAA5C25A24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5196 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35344 42 114M = 35172 -286 CGTGTTTGTGCATCCATCTGGANTNTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAANGAANACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATC BD/=9(*1(7896$3!"C22"75A,@/5?.6';(0.B!3E5$@8!(6&>1(&7D2/7:8-3A>H-<')H<903-!;%C1C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T1C45C3A39 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5196 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35172 42 75M = 35344 286 CTATNCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGN "%&""+'*#$#&#$('%)"$&%$+)*!)'&'"&*)!"%+"##'+&+$#%!$&""$)!)&''%+%%#!%"(&+!'" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G3T69A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5197 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45479 42 87M = 45601 251 AGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGAC 3'A%.<18@$#"A,:3#G)B/'+-3D=H#A3C#=@&<$F+1$'4.8+$,5@?4DB0"#;>;2E;#$#4G5F@@4(H3!67$"!@&A2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45601 42 129M = 45479 -251 GTAGGCNGAGAGCTATNTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCANGCTAAACCCAAAACTCANATCAACAGGTGCCGGACGCTACCAGCATCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAN (%"!%((""'((('$')#'*#'*&'&#%)'"$"'&++*('&&**++'+!!'#'&'')#+$#%#*%)#"'+'*('&))&&(#'(%(")!&#&&("*%#'+!%##"$*""'+$')"+)"#$"'+!&!+&)& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:6G9T35C17A9C16T30G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5198 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37398 42 70M = 37518 250 GCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCNGTCAGGAAAGCTTGGC C$1;-@"6"(=8,H901#B0>FBGB&H31@$6/0DG+'1&5F4@.'6+(G=H:6$-1$>C$%0+0@H,*= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C16 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5198 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37518 42 130M = 37398 -250 TGCAGAATCACTGGCTTATTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGCAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTA :/@!*$.<5H1,C.>D/60+*)H")&?4BB!6*B4-*157711;8-B@=G,/H6C25?3E00=A=E)#9(&(+#>B-15%G=C"?E;@-625DGH#;:,5;G=)2$9G*(G1)8> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G3 YT:Z:UP jpayne@0: r5199 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3025 0 * = 3025 0 GACNNNGGGGNNAANNCNCGANNNGNCTNNNNNANCCNTTNCAGCTANGTNNNN $""!"$#$""##$!"#"$!"$#"!#!"$!"$#!$"##!!$!$##$""!"$#"#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11780 42 151M = 11931 207 GAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCG @$/6$H@44#H<)@2BG40"(67?*(C8!2?4;5"/71%:+?(F5#68"C:G<$,#D"F#%''#D"H?!+DCDD)-(7;$<6408G)8)';-F61F$?.A#,5(D=?#'&!;"85A)%5FH';H4(1$F873C2?@G$$=<+-"B$*(D@' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11931 42 56M = 11780 -207 GGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACN .:37,FG%?,G;D7-29.BEAA0@><52#7G6B9$#A-D4F4(93G0A56A,F:>' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5201 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12718 42 87M = 12983 324 CCNCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGNTTTNCGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGCGGTG G3:?%7(F8B(3+4%:;2FH;,E9C23*(&31/D*49CC:A3!/7*.+*29'F6/;25G5:>01-(!5+H'+?@DD=A>92#73306 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G31A3A38C4T4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5201 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12983 42 59M = 12718 -324 GAACGGGNAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGNCCGCAAGGGTA @3;&,*7?4?:3FD#1G*=7%(3;D" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C39C10G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5202 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32843 42 161M = 32789 -215 GTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTT 8)>%(,70.2*#+>*##;$#?&3A5D*8,5B++.A"=4-.9/662++:@=9F.>317'C1.)-0(0+:7*96:A8":!7FC=9,">(4!F4)B737=@/E(*3##>C"D!")A2:23*$7/'85:?,E/+$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5202 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32789 42 54M = 32843 215 GCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTG .0;1D4<9*"C?$A4GH=HH.$F%9%)EG,&-);8>&(@F)?)2G6,C:/;$8H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35659 42 48M = 35463 -244 TGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGG F.)E8>,!'/!0%E9F$/?$)0B78C>6.5-&.!,2;%<@15+9!!%H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5203 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35463 42 50M = 35659 244 CACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTG $'+#(($(%$##"#("%"""(&!(!(!"%+"$*"#&&&$'%*+&%*+)(" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9127 42 206M = 9033 -300 GCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCTATGNGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGA B2C.C%.2,/!B.%+18A-H89*;A/!4)(*'"E8/8BA3(?%AE'F-@C1H*G/=B4(#"15F"E!G/#F!6>6E'?HH<:B4.H/65.&98$A+B9/!#=&+%/58<6*41$7G(4?4#954!#$)=B8D9#G5!'3;4C?,;/:6,6E.43B=>6817C*278D$E3<7)C$GH!.2#.92G?;+2&*)C0E;%H$F7BA*B$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48A130G3T21T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9033 42 94M = 9127 300 TACGCTATNCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGNCA (%#($$"!&*)&+&)*&&%%$++##')##'%+$(#)"#"((#&$((&#"$)$!&#"#!"('*!+&$#$!(($+%'*+("!*(%"*$&$%)##!+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5G1A0T82A2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24206 42 104M = 24310 370 ANCTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTNTGACTG &$+!%%*("$#*"))!($!&$#+(''"&)$$')(+)!'""#())+$$&$$")!&)""()("'$"))%*+&)'!'"##+$%%&'$(*"*%()"!''!!&((*+%# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A95A6 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24310 42 266M = 24206 -370 TACGNCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGACCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGGACTGATACATAACTCTTTTCCNAAANGNG %+)"($&%&$$#**)&!%+"&%*&$*""'#!#"+!#$%#'&%(%)"***')$%""$$%)#*&&(&"&"$%)))!%%!&))*'+'!(*!%*&*))%+*")'&+*!'(%&$!('$!+!)*!*(+'!!#&(!&$!%$#'"&"'!""!('"%$*"+*!&%"&+&%!*()!)((%$*!*%&$"'$!$)&!$%(%!!"()%'*!)(!()%++'"!'**)#!+)$'+%!$%(&)!!%!)*&&!)$+(&%$%'!!'#*'"+*#(%+!*###"$& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:4C4G121C104C21A1T1A0T0T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5206 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19455 42 51M = 19664 297 CAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGNTG 1/::C#1E=!F>CG10;CE7+7(-++'9G(77+8H9,:!B/+0H5-"6$+" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G33T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5206 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19664 42 88M = 19455 -297 TTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTN ?3,#<'(1:9"E=;3,+$2+$&%$C4/C%DD-"FA9##*)-8"9E"%-.+.D"67$3%$$%A%95+D+E'$7)*! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5207 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11985 42 120M = 12198 277 CTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAACAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCAGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTG 6AF+@C!B*/%,F7*3/40(8!=95EG6,F"-2%44($";!0!A@)6#3"CE!C6=?7.)=0-+#-999112'./:=15G.2";5/'7+G-*2&3#*?+?.95.1*>/FF=1F"37/@.H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G58G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5207 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12198 42 64M = 11985 -277 GAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGG !492.'@%=.#%C:/H/9.$#%(+,1;'H$51.4./)0;DD35)),$7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5208 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4127 42 154M = 4281 325 CGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATNGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATACTGATAGNAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACG -55F#@H2D17"=4"$-&(A9DHGC?"5H&%>D8*'@182#8:3=CAE/G$*?B9D7B!:@1!25!$#C/*'*H76.1DG=5:-E)?7%4GC@/6F$/@(D&>>/1B+'= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52A53G7A39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5208 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4281 42 171M = 4127 -325 CGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTG @0-G(9G+3!*.$%D-;>')*DG(!6:',':(9.!B"?@+-5:3+%1/,C->CH0FE49DB4A1@DGE&>A=?G=39EHB7+%B'F&H2,7-&474)9($@,(:,B:='.1FAG94>1E;'@C1("4,AB7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:171 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5209 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42286 42 393M = 42203 -476 AAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGNACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGNGGTGCTNTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAANAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACNGAAAGATAAACTTAAGATTCGAANACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAAC ?1:)/*3:C)'2DE"%?G2A?.:D5:H+#2*,GH,,/.58)!,3.DB,-B5!2,(5#*2H4(,G-,*B@24%G;7)7>+'8>;A15=%.9"$"@112A"ED@F4A2!;*'"!5&@=:>53=9&$7-5F3GE(0D=-5?:@9G7=C")52G74)>)#?**2>2/F0$H")5?;=?.C:"=7F#;$>,95)GFA=0''0),H."G5FF2D';0%/@%&16;F)06#5@D*##HC*&$'254!,4<@?7'-7D>F&.G-)#$E:(&@6"G&DBA+G@$0'!846.%>-6&!85:'2A8;(*FE,3F;!0,.4"<-:F&>;27.9 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:101A51A70T6C75G25A23A35 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5209 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42203 42 83M = 42286 476 AACCNTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAANATCG #(%!")+&+#"%(!%!"(!#'))&)%)"("#$($*+%("(+!!(&!!"$$%%"+*+)+&%$$##(&*#"%()#$)(#)%*%&# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T73A4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5210 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31715 42 250M = 31965 381 ATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGAGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCAT 7,)5>-:,2!>68H<@)A@!3&!2$/-;'$:=F,FG))0>)5,E/9#=E0F!>0C=0007'0!53/4<2F(A/?6+;2<0F+D)14ACG@:C2,)733=.;59,-+%A.E59&)>2(A*3$C%B,D?C1-12./&H=075+D%:CBE,9!>134$:/&2?C>)#%1"EA1#?'E/H84,'("7"C&,%23 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:201T48 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5210 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31965 42 115M1I16M = 31715 -381 CATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCANGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTG ;?-7C,@10<95-H%F(D:(-("H5'%3>/&>.E3/@!D,=!*C*8=H7HF@?63CA?&&<;,0D2>.(88D/E8'E?C/>@%4DD,8;;6-<6C?<#AA+*/(1C AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:45G75T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5211 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2635 42 54M = 2405 -284 GACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGAC 4HFCE8?C4F/HC#7')625",6E6/4!-A3&/!-A$2-E=8F',DF"1,)1#< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5211 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2405 42 223M = 2635 284 GGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTNAGTACGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAG D8"=#G;39>F,:73#*;$AD?!;F92F761GF.H*1$&19&'97';<8'"8G+A?/?$9";5''C3D7+?G/%G:')B%@86&.D3B*CG50@>F5:>ED9F<).EG4,-:#>09<0FF#HB74.;((-@@A!4'$D-E% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:132C3G86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5212 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41524 42 77M = 41683 244 GCCAAAGCCTGGAATCAGANATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAAC %#+"$)+)+%*(+&$+!"!+&+&#$*+)*()"!#&#&#&+&"&)''%+$*+$%$*!$()+&*&#)!(%*"*'')!+! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5212 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41683 42 85M = 41524 -244 CTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTATTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCA *544!'4B4"0/B9G)BHA&FG<>27CA3B=(/#>ABA(4>"B<$>8C48$&A,.&@);@E?4-FC=>003!;BHA(BB-+1//* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5213 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33825 42 236M = 34061 289 ATNATNACGNNNNGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCTAGTCGTAATCAATAATGTATTTTTTNATGTTTGNCATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATNGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGATTGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGNT !'&(*!()"$#!&'(+%*&"#!(!"%")%))!#"#&!(*&#"$'$#(!!+&()'$++"")'"&(&$"!%"&%)('*#())#*(')#)#')'&$%&")*'$!**'"*+&%'($!%"*+%*)%+!!+((''+$+!#)&(!&&*##!)#!('$*$#***'+&"%(%%++&%#%$((')!&"!!!"$"+"#&&""&&'+$(%!&"((*)#!&"$)%#&$(+&'&!!%**(&&"%(&$(!' AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0G1C2T3T0C0A0T29C13G11G7A30C98A27T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5213 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34061 42 53M = 33825 -289 ATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACC 7$;FGA0:#@8/E+-!.B?"5.D#+<%0)C'E7;/F?:?2"A(F#)>5*?:+D8A)(B294;/+B?9%(%*9:D2.2*":.4+28B4DC>E+%9'A6DA."#-.+"87<;' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5216 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5019 42 42M = 5177 260 GGTTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCG "$)*+*(!*+'($)*&)(+%#&+)&**+!&$(%&!%&&$$+* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C1C39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5217 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24635 42 169M1I226M = 24403 -627 CTGCTGAAACGTTGCGGTTNAAATATNTTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTANCAATATTGAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGAGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACNCGGAGTTCCNGAAACGAAATTTGCATATACCCATTNCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAA ";!,9:6.';E74;C?6/2:)$6&8)2'6&5D>%2:""@/&3BG1.1&"%4:>+86:*D/$)&9,?F0F-56?6>'@/1C-EA,36=F;;G2%$#H.,6+B-E+AH)48?>(@*..E&5/)37!@H0%&-4:&7"G&B)>1<$9%!.66)G4138A",6D)&8'97#C*7!&=,467'3;B7.,,<0EH+(AEB&-G+7#66":;%+97D49=!!<>,5;-*&%+>/,&;)<@(!67A2++.@>@+9H.HBG.6$#.4H@7C@A)1=89D@$1:G0H7#4G!$5*-,(B5HDFD*-/;@-0F>2;.4?6G3F.D:&?*:?74D$14-/*8B#!?#7B*<"E=*74G@!+D@(C=)C="G9066"6-=@F)0!==0'*'6"!9*#A@F$.=+FG(@>1H85D;2)14A)0':)(5(!B.7$?(2-+A%C%D((%>E!/3#C*2D;00*6>.5:(5;%.&<,5'-)!E1B'/=/2:HH,EFE!??,"G04.C7)90.H0)3&)4-4(C.&84,!267?+,07&0D'%F1+:;H:A//3H==6<$>G,B7*A,*H1#F1232D'HB- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G59 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34232 42 138M = 34483 334 CCATTGCATCGCCTGAATTGTCNACACCATTGATTTTTATCATTAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTGTTCCATAAATCACCTTAA 1/?<"*2+=>1,2*G3+?("37,936&0C&5G=;/E;?*-E+5B36<5$$12.F'6H?>%?!-9C0-$C@!/3>'@$;;(.+#H1*5*3;*1."A4.-E3" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12T9C19A76C7T10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5219 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34483 42 83M = 34232 -334 TGATGAGTATGGAAATGGATCCACNCGTTATTCTCGGACGAGTGTTNAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATC <)?%H6%5.7:?D;0:HH-=2G),7H9)BBC6#(5".%D$?E*//G;!%7B$3";,7+:"/',690?&"+%('0804#?3B8D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A13T21C36 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5220 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19830 42 148M = 19978 283 CTCCTGCAGGTTGACGGNTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGG !=;.""4BE>F3!)DG'%5H"+2A$63H<;!$./<'"1:G:=/(H>F!#CA*"2'%%DA(;CA>AA,%>*EE/FGA&(,2.118D0&H$#D&)4<"EF>56"5C%82,?6#/6D;&$B,0B4:5D(@BAE4C?A=*F-;&G%G$>9D$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A16T130 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5220 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19978 42 135M = 19830 -283 TGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCNCTTGTGACTGANGCAACTGATTCAGCACGCGCCG ,(&(2=39%1AD-(-$7-B1,!:G&G+/425@,"EC8B!0B;;;A?#@=8C1.+F!;!53244AG$);C)>G<-)/7<"-60B+)B;A>!$DE*;>$";$7(-8EGC2@?F''?0F&2?GG>8,3A=*0-:<)=F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:100C11T8C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5221 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25153 42 52M = 25205 320 CATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGT D.&D)4C*F=!',@2/1<#F(?<6$412=!3.G&4%2,!//7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5221 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25205 42 268M = 25153 -320 AGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTNTATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCAT )9<69,4GC(@83%"./F1"9E1>#&5:;/432=686256)>;09AA.:8:&"$=-E95)CH?C'E$#*,AGCC$6B?'(B<2%9+8%@<*E%CCA.$$F3'"3-7:GAE,,3.?664H$%,HE&!48B*&-CG=G*2/-C#:7F"??",@)!42C4:(;(6#!>(;<26A1<@=/)C@9&E6@A7@3"10D4;6*?;%2;CG%:>2'$0((,2H,'/>@@:G&B=&2G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60A207 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5222 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16237 42 188M = 16425 302 GTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCNGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCNGTATGTCATCGGCCAGTA /91"8")H847(&*6"&8"$(6!2&)>D5)961@3=-8#(+6:->+>:H@"CF*4>E63&#$<*EE+C34G):C08F5G#98C+2@'94*%26GE)'<$8D4?H%&&)653G?(;?('C0+0).EHD:<*(?C+00!:DG)::;@12H8<=CGE7H1@*(9-!?)<(:"1-'G73%(!7,2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65G103T18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5222 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16425 42 114M = 16237 -302 CTNCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTNCCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGT 08.C*1H@$6H+:61H>"#!%*.H$>E'E#G!279!F:+32D!4@.(.<*=@*E%&+:%0B@G/,6'9#1CFD'3D<4G?-1F"0,.)9'4&BC;)(7%=1C!'$B!&,D7%F! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G59A50C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5223 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 306 42 61M = 193 -174 TGCTTTTTGACTCTGCCGCCGTCATANAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAA 8"&9#+BHE*%7G.-A+2729(6+;:2#488386-2A+6"**@7*!C/!1*0G)6($#4C: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A19A34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5223 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 193 42 89M = 306 174 GGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACANTTTCGGTGNGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGC ?D(A.?,,731F!B'2EC#18G;?F?8?%F,=B(+@*1A7H#:2-$.FA&49'9D.3G'$B9,%%"!8B<,&))3"46-1=1,%5* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T8C50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5224 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44517 42 91M = 44608 311 ATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCG .E+&:()<)9/(:GH+4.G+87=$;'#!)72/H;6-BH0;,?61EC&!(E5G-(!9,CDF;"5B0C950AG(#@":A:1E*/A*D>B1)E7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5224 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44608 42 220M = 44517 -311 TTGTGGTNGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATNGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGNTAGAGCCNGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTACACAACAGGCAAGAGCATTGAGTCGATCNTCGTGAAGACNN )'%&%'($%'"&&"&*$'###*(!*'"#%"')''$#)$%%*(!)*("&&+*#&%"#+%"*#)*%*'+&)*'+#&'!""+$'+'&$%%))%&('+)'$&(%#)"&)&(%#""'#(!(%#(%)*%!&$$#'!*%(!''#$))$&"$)($'##!%%(%"("%%#*+((*(!"$'&!+%%#%$+#$$"!*#!++(!!)!+)!(!*$#"*&(%"%$!$&#"+%!! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:7A60C71T7T29G9T17A0A9G0T0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44409 42 183M = 44307 -285 CCTGGTCACGCACTGTGAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGANTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCNGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGACTAAAATTGGGTAAATTCGACTCAACGA /*8;%7(5=8A0007$:A')8A&4H.F(E)084D>1*=<486*0""C&0@"E($<(3BD!D:BB6=H"@9H5H31;7$C78(=/328C@F,3&>E);?$%,A=0*5(BB9.7@.'F&5-8AE0%G:@;.E'=:.!)!/H+07@1??B>)*=,+@/DD AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16T44G40A52A16T10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5225 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44307 42 102M = 44409 285 AGAAAGAGTGCGGAANNTGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAAGCCCAAACCTTACCCAACCCA ==",5@D$(ED-:,7&0>"G46F5+-E<,+,H'8+G6G"/(:#9<+">$31<(6G7;H7C$';$9*$D9.-$8'*$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G0A64T20 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5294 42 67M = 5138 -223 ATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAAT &+'?(8'G/0*E=,818A"6CH.(HE!->:*+1G+&D9FB#;C/@2"/.:D5*1*D3-'A#C@6C:2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5138 42 68M = 5294 223 GCAACCCGCCAGATGTTTGCGCANAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGA 906$;3*(&>E":.3%+2?69!/%:?E6167E/=517D=)4D&BD1&"#7)/?56 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5227 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23651 42 70M = 23804 293 CTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTNAGCCCAAGCCCTTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAAT :EA#5A2+49+F9'.-H.!!B-89?B)(#9(9H14(@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T10A28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5227 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23804 42 140M = 23651 -293 GGAGGAATTNATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGC '6!>H2%F0>"%-1:*=:E;5-DG!>"<21"%&*/7A3GG!?>#49%#6H&5<6H-@)?A;$@664/=,E%0A7>-"$1F$A27D1=E?>.>+%F0&2H;$/F3$8=*=C2*38(4B')H8"1@&6"F8=%+:37'0*@D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G130 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5228 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20491 42 206M7I248M = 20949 504 CCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCNGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGNGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGNAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAANGCGGTTNAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAANAAACAATACCCAGATTGCGAACACTGCTTTTGTACTGGCCGCGNTTGCAGAT ;2;99+F#<&'=#%ACG40CG277#<+<-05,;%6)D,&B>:.4G)>E&/8CCDA&G,E3+8F*$-73$C$-4?6A75%DAH9H%F=4046.836@(C1F:F!?G*E1.&C+:@9=E.?6@*.DE@+E=%)#@$;9('1==(!F()82+&629(E()24)A,623/DA?;A);*<#((761+2"-7GG'94$#%+,?2;;C(E)-)8?=D7'04:<"B03>(9'5.*E@/4/(A'++B:%"$?24F5'*A/'F/>#;;7C@-88$#<#&$>#'D.@@*.?&9=);40/:3<3D@3:3*8"D$H6.DH";#F@F")=:<%7D::24B"H<5@5%'#4F1F3!E8 AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:14 MD:Z:118G145C39G6A89C24C18A8 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5228 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20949 42 46M = 20491 -504 GTGACGCGTCANCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACNGNCNNC &#*'$'&'#'$'&"(##'($#)"$+)(#&&!$"&$##"*"+$$##$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T0C9C27T1G1C0G1 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r5229 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45206 42 169M = 45375 224 GGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGAC !C?7>:/-'$9$BA!?A6>C7@A-))/$"F90!0)0#?++B/5F7H%DE?3$GEH"B,.%??.C/GG;:F+C'E+'3#D2,EA*!$;,3!3.,;*')E&<;/;1; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T168 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5229 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45375 42 55M = 45206 -224 TTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACA >092/!%F'AB+9#/B5$9H2(()=0;EA=@E,:01)*D(;!".F=2$>A(A+43--:**.A9";)'%6G1!&7,GG6-:-%$:9=D3A&"/EB#$/*#5&7*G6;6A(""9&AE5"29C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G4C35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5231 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4590 42 137M = 4813 267 TCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGG 6-E9(/00@E;AAA%(C&2F'G/=(5!F02A="A+B/@5-C155,/0:@4'%4'&+FCA:26'A,*H"'6;E.))C2*=4;E@0B0!<2$GF'BF1$G)51-:/+/0>$"9>&748AB@/.HD:FD!&E2*7@."H4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5231 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4813 42 44M = 4590 -267 GCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATNTGACTGCGCTGACCTCA E#/<5+..HB(8C<@B&0,:D<&+-.*+3.A);,@=G11D'CA6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T13A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5232 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41043 42 60M = 41152 236 GCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCT .A:**2;F;$-D9"CF!EA!$,;/",?2G5%4#;/:)/!$"73-<&1H@<*3%8>5%E(8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5232 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41152 42 21M1D105M = 41043 -236 ACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCNTGGATACAGGNTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATC 0,D%()&=B8:2;52-)..E?11(#:<1=*FFH(2G%1EHHC;4@+<;8G*.59<"8,GG/>#F&F'*29.1)=$?:'7?'(B&H*6$C2%*7'24#C#4*+8%D%D.;3FA$4#4,8)+;$FBBB AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:21^T9A10T84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5233 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48336 42 55M = 48118 -273 TATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACC #2/9'A"C8>.-43E4&0(A%$9-B%<(.6:=B?@"%"AH'8@$F-;?:-;7"A: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5233 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48118 42 131M = 48336 273 GNCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCACTGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTNGCTCCAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGN !!G>2>9E@:G',,5758A5-69C9>$/'&CA$933-H5".$";#D/13&A*88H<2&5$"B()";'B$>6=%(3A4%)7)5$5H0$';**0;B6D'.<@'#B%CD->?3EDD2D?@F8F'%-D)4C-%-2 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0T59A32T4A30T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5234 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8749 42 63M = 8586 -226 TTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCC 4'1?-6;(C1(?48$@+/9$3A0":57/?B%G5D83F4#)&;-24+C,$2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5234 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8586 42 50M = 8749 226 ATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGATCGCCCC F>D?-"87;E8?@/%<>'G6&2).!3AF=@.?G&? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5235 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12474 42 60M = 12719 294 ACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAG &#%8E@<71#3A<:BA?HB.)(8$6.#91$8$.<14<-19%,+6B),0,(B#0#8<+'*H+/2.F+"5FG@#;?7D75$+E17CGG:9>&)3F'->84BE-+H)GE.9#.$-,?0$488#!9%2!>?1.1F).D'8*3@.(3=,&-*(>A3&C*6+#3*6B;A7;6'%>#+&'#(B"3"F%HA++*5;)!)8-?C'7A(%*4*3/-(4*(46-)0).GC06G&D4(:?)D?(>(C,A.?>*D-@=#='83!,HEFD-2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107G34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5237 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32550 42 149M = 32439 -260 ATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGNACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAANTTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCAT F+H%#5/*!*.'8)9<@-")0;1>6)C'F&/A0E5,$0;G>*.97%CCEB#@%157;1%4;;/A<(5+0EBC&?>.)*B/;>)#D;++1&<&5):(69EF2"%-6;1)?*F(%F47"+-.E<>,."*12/-@+:D4.;,2H&4>4$&5H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A33A75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5237 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32439 42 43M = 32550 260 ATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTG 9:+4F:4;5*!<*",)"H&8!%;>$G#9(.,1>;@44%*FD05 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5238 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16914 42 206M = 17181 325 GCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTTCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTNGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTNCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCA 61G5A'FF7>),A"+BC6'.G@(,!++&D?2";B-#0-8(=$97C$F/82,<2B7#BB9$E(:7E'D3?%-*?04A6*7E<:A25?75H?7#4"DG;3("0+DA-$0=CAF$53!1"=,6%+7*B83;0?;DE&%;0>2B.*@:7272(8?:H=GD=$9>52=@6,?85*H9!B$EA@&8&:.0)59EBD0F5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G31G69C68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5238 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17181 42 58M = 16914 -325 GGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAG DH(&>HB#=>"/&24EG9%)0E-?3#>-">(.D94DD?=+A<.HEHF0&=+=G(H5$E,'4.6+598.&--8EA(3%7(;&,/AB>8(7E,:E0.9AB"2/#-.:327 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58A23 YT:Z:UP jpayne@0: r5240 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42020 0 * = 42020 0 TNNTGGGNCGANCNTTGNAGNCTGCNCCNNNANCGGNNGTNNNTNNNATGTCGCGCCNGCCACTNGANNTAGTNNAGNNNNGNGGNNCCNNAGTAGGNTNTGNCNNCANANTATNNNGNNAAATNTNNGTNTGGNTGTNTNATGACTNNCNNNANG $$!#"#"!#$#$"$""!""#!!"##!!"$$!$!$!!#!"$$##$#!#"###$$##!#!$$""$"!$$"!#"!"!!!#"#$"#"!"!"!$$!""$#$#"$$"#!"!!#$!#!#!"!!"$!#!$!"!##!#$#!!!$#!""$$"!#$#$!$$#$"$"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5241 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22316 42 81M = 22217 -180 TGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGGAACAAAAAAAAGCCTGATGNNNGTANCCACTG $&(%#$$#$())+**)&$$$"'''%'%$(*$+'"*"($!#&'$"$&')!(&#"$"$+*+$%+&%'+#$#'#(')%)(*!%( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:48A19C0A0G3G3G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5241 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22217 42 82M = 22316 180 GCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTC C2"=F7&&$3A+B/F4-9%.#*(4'A.BAA7EG?5A'!;!<6:+A+0")-)#,#E-*G@2.BH8A)0H$(,>&7FE67DE&@'B+4@*2HC484-E9" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72A0 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r5242 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26630 23 57M13I44M = 26811 254 ACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTANAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAA .7?HG:5.?3H0$HD&7@D:FF&8(#B6-@*#"5?8B-F'!!8G$22;8+;028C460%A04/G"DB4#EA&2F'5/8'102C-#,%68F)*HA19,99 AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:14 MD:Z:39A61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5243 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28052 42 135M = 28283 282 NCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATCGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTANGCCTGTTTTGCTTTG &)+*!#+'#&++%"$''+#+"&)*#$$##!!()+")#&$*$(('"%*)"(((&&'"&+))$!$$*#*&&$%*"'%'!#$!##'!!#!#(!+$%'+#!"$*)%+*)&%*))$&%"*!$+(()")&*!#!&"%"%'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G68T49C15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5243 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28283 42 51M = 28052 -282 TCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGNATTC !?7;!69<#,<9)B>C-C9)GC456!C!-0'9G@.GF:+H0BF)076B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5244 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15886 42 9M1I152M = 49 -15998 GGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGNAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGNAT 0-87)C*A)/"<+(G.>26;)%5'#?3C$68&**5%(F19/;+G@*)5)BH'>26#84(4;BH)(=*,$4+*$?0,H0<9?$5>H%#E.5B?:<'%DEB7=,9&<'.66C AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:3G0A1A1G0A56G91G2 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r5244 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 49 42 60M = 15886 15998 AAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAA E+24.0!:)/3%=1DF583?'(5G<>B,*B>&B4#--22;A0"54@%=14,B:BH3,4?9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-22 YT:Z:DP jpayne@0: r5245 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25891 42 164M = 26055 353 TAGATGTNTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGCGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTNGATAGCTTCAAGCC !*)(*!++!++(*&"%)%*)&&(&%#&%$$$"##%'$()##"#%"#+'%+*$&+'#+(+$%*"$)%%*'%!$""%%*$#'#$&&%*)!**#*+%*(*&'+*)"+#&&%("%"(!''%+)#*!#"''%)&"$$$$""+#)*)'*%$&("(+!"'#)')+))!&*# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C4A1T55T85T14 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5245 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26055 42 189M = 25891 -353 AGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGNCANGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAATGGNTCATTTCCNNNNAACAAAA #*"("))##)'!"&"+)%$#%)(#&#&($(*))+$'*#&##%&!'&#&((&)*)+#")#+"&#()$'%%*$%$'!)&(#&)$"%$""!+*+$!$#"'$!&%"%"$"%$#)+&+!#+!$($*"+(#!($#)%"+&%!&)&"#)(+$$'"!"+%)*+*#(('&&'%'+*''!&()"$(!)#$"!)&(!(&% AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:140T2G22A2A3A0A1G1A0C0T0A3G3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5246 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33771 42 193M = 33771 0 AGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTNCGTCATGGTCGATTTCAATTTCGATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCC :8;D1+;$,.@06B'$@CG0'"H'.35H4+<:+G'H8%F&@(.<'E*"&4/3<5!5@=+6)!A11G/'2<#0'HC:5?#3G"&/'C-76,":EE(C:9$51)+.2+3@*";",#9%H,':=>@*'G!E1H(";G!.@'?4=.$:E' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60A22T109 YT:Z:UP jpayne@0: r5246 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33771 0 * = 33771 0 NNNTGCGNCNCGANANNCCAANTCNNNCACNACNACNNNTNTANNCNNGNNGGTGTAAGTTNNNNGANTNNNNAGNNNTNGTGTNNNGTTNNNNNCNNNAGAANTNGATACNNTCNCGTTGTTCNTN $###!!!"$$!"#!$#"$"$##!#"$"##""$"$$""#!$#""""##!$!$$!$!!$$"$$#$"$!""#"!!$""!""#$$!$#$!"#""""#"!$!""#$#$!#$""""##"##$$$#!"#"#!$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5247 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11760 42 82M = 11905 205 CGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGG ,/70EF!:)*'1$>*?=&H>,>=H#F")9G<1E?G+.+%08:+(6B07>506.+?'>"8=1'@/D23/@=$)9'.2,B1''2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5247 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11905 42 60M = 11760 -205 AACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCC 7<86G+38'>E+8/'A!=H>B(/=25,>!648G$D!C88*B:6*H409:.7/-*52@0/, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5248 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40609 24 16M5D48M = 40416 -262 GTAGCAGGCCTTTTTAGGTAGAGGGAAGTCATGAAAAAACNAACCTTTGAAATTCGATCTCCAG :<39E>792B?H=8!8+)C9)+.!+!B#>'@<9!5;((?E>;FG9F!G,618EH(:$5.-*2#5 AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:0A1C13^TTTGG2G21T23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5248 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40416 24 100M = 40609 262 TGGTTATCGAAGGNAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTG BD(#$<7()&D,8(.E*&.5H>?C@BA-/0AA@61B-9-H=A%0CC*9D$CA7"'3@<0'D72D(8,88B?D@*A*)3D#?06)$3&*92(DE,<&2'E. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T27T58 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r5249 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23990 42 154M = 23948 -196 ACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTNATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCNAACACGTTGCTC #-2F!8)#7BF0&C@108DA2=72%;A'4'*3E'&D!%'@*$2:.';,?E=:'/3.?3#&8.:AEE34"35*A!8%=28(FG7#8#$3GE@1'&>(>%5,BG$#('3#2:G3614&B62)5*%?(!C1;5;4.4=-$=?-?'17;%H1C7%:8D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103C37T12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5249 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23948 42 42M = 23990 196 ANGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTA "!E(:'F+@!!(#>H@&C,)75'?+,!F965%5D9?C$140% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0A40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5250 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28439 42 96M = 28535 224 GCTCAGTGTTGACCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCTTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGNGGTGATGTCTTC F.>?D#'+H"!#$?G"6$C.1"!B?D'+$<#(8++9!9'*A*3)@B>C1?G1!560"'%?6=0#=8#-7EE?/.)+-@14$5E#2+H+6D2-C43@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12T23C46T12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5250 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28535 42 128M = 28439 -224 AAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTNC =F$CAC4?"B;%@0<@G"A+"8<<;9!8%*&5;6;08E#+,7,3+":=F$"1)=)*#@,'1@064:5C,/8/74*8!2C'>!1@?9BDA5D(!.@6,7')=AH1<9*&.EF'"-.-4/'@64EF8'%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:126A0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5251 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36210 40 58M = 36210 0 ANGNAAGGAATTATTACTATGANAACACCATGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTC 4H;%*3B>A551AF53/(BH*#.-.6?1#H#?C6-(G1:F7>H>(=$=+8-0!/A=)' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C1T17T0A7G27 YT:Z:UP jpayne@0: r5251 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36210 0 * = 36210 0 GCGCTTTACCTTCGGTGTACAGCCACTGGTGCAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCNATCAGGATTGNAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCACGACCATCTCTATGAGCTGAAAAA 5F'.9)B(G;><9>BH5*9;=6H2=>28"+/'&D0<*.+?4%"%4/:E&?A,AB3-F'A.F?D?*0C1/>+"(C9%B1H:=:B595!A>=12&B'ED,=:!#GGB"/;%,%8;+=2/2G!<@%A*)=0"8/8%B.76/)"G$(E>+-3-;H78)@-#?443@'H+1AG.G/=)G+;C+>E!A&1!H!9!.@0,,G*C%7(1*G2&2(F"$@-BC,+C#(<6./%-H.%$CA(6B!2-@;B.:CFF33-H5!!4A/&C0H'A2:%@B%.5D!@:"CG)/E200#,6E6&GD2*'1B8EFCA3G2=B0;D+E@$"+1<,,4#5>$&$#D.)%G)7EA;3.$A79H0.>=0=#%@A6H0=2"AFA@#2?<9@+4@F.6&9!=2E:7-AE.AC@,86#1-97.%&#+D1&6H5A!*!=4:(/<,B?(7:(<:GFC#H-H.B?8F:-)A!":/&2>#@'/-#AF"/F2E@;;2%&C68.-,'=H-6;=&D2A(;:;,"=B!:72CA(>*/)$/2#)CA/'4H#&*F?G>(24>.A50!+E"=$/H@AE2#:B:A=!>##9: AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:91C8G41^AGAG74C5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5254 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46036 42 186M = 45810 -412 ATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTAAAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGNAGANGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGANGCAAAATACGCGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGNAAATGATGCTCTGCGTGATGATG ,=DCH;1/F9BG/;&D%!&$G4'5,)+23F04%/'A#H>/9?)!5$#5!3$"982%C=!)1;+D!0"++4H-G-$,=A/--E<(500"@"26 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:28C63C3T27T9A27A23 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r5255 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11269 42 179M = 10969 -479 GCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGNAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTNTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGNACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGANANCN !*%#*+'+**!$+'*!$!%$))"(*"''+(!#'#!($+*&'&$"*)"%("#&!%('("&)#$*&+'%"!+)%&'"''$!($!*$$!+(+$%'*''+!)#(*(&(*!*!+&"*'&#!*!#&"$*&(&'"#%+)#"$'&**%#*)!%&("'%%#&#'#"&(%#($%*$"!"!%)+$%$$(" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:50C60T28A33C0T0G1G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5255 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10969 42 300M = 11269 479 ACTCAACCCTGTCCGATTTCAANAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGNCCTGTCCAGAGCCGGGCGGGCGGCAGGGCTGNCGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTC #-4'+@:D852C3#,E?,>'9C69!FE=1D)56HG'1<@6(H;(.E6079)%<=C,6DB=;0/E2/)/+:7=55A-.962G*H-@FA$)&;4&1@%!'G:HC4@'7**(0G06"#H/,?")1(8#)2B18:@E?5!H%9+H=63%7,'))2F7#!B#E@87-8$0$6?#0H!297<,D7/0&+*:;(4*=A.7576%&969&2&2%781$)>:BD<@/6B6>2AA&?<=:A,*.B)@<0+@"-H%#$3&:"6C##F<=(9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A81T45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5256 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1668 42 107M = 1525 -250 GACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCANATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAAC !&-!.9F*,4=+--F?#E=(GF+??,>'<5*C)0?4%%'&52'1G1%DG&A;8-<*.3$1G4>0'-89H84@E4@G6GE8<8.G> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5257 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4708 42 90M = 4560 -238 GCTGCAGCCATACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATNGTGGACGGCATTCN :B,,H.',3/28*D)>8+/;2%0E15GE,&(G(77GEC,//0@6:!;=3%G%;$1B8><;-16G#>$E$35.C,10!BE0B7+$,/2.@) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G65G13T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4560 42 124M = 4708 238 CCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGG H?%B91D173'D",.3>*7#.H%BGG#F?961'0:ADA$$=55&:=:BB0;83="=@1?AD8GD!7B9:6BG@C@6'<>D->.F$0C()#"--24=62;6=A@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5258 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31325 42 93M = 31480 235 CCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCC #8;->'!.+D3494FB>HG0E72,0=G,,6HBBB#2F1,+E?!AGA:A7%+3;2%37<'973B?7#'4-F/G;'.H=<+.G5.@>)518.,%2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5258 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31480 42 60M3I20M = 31325 -235 GCCTTCANGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACNT #6'!@7>G3#"+"92-/F&$&C:!/6&B70F.(8.2(4?#H>C*D2+"1A,2)(?779=7H%HF5F7D!&;1*,@:.,'+A/:7!)8>6=;H8F.5!%9+:=/C8@B&+%C@9'"(6C"#3(!,14$()#;6E(&:E(80+,*F(#<>@$,7G8;.#?!6C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C30T35 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5260 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43994 42 135M = 44166 235 GNTGTTGGNATGACNNNATCACNAGCCGGATTCGGTATGGATGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGNTATCAACTATCTGATGCAATTTGAACACAAGGTATCGGGGAAATAC '%%"*"&)&'#%%""'#'*'&*!#")(+#)+$#")$('$!#%'*%($)!+$&&"&)$#%"*)!)%'+#&#'#"&"#"$!!%$+#$*%)&#$*"$+#%(+#&$+'*+($"!%%*"(%+&&("$!#!++)%*'+""! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1C1A1G2G3G1G0C0A5A17C47C23C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5260 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44166 42 63M = 43994 -235 AGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCNGTAGTGCCGCGACGCCGG '@?:/@B2=F0B:A$>"CGH:1"!H7DF>*9E21CFB>G2.B*?)+:B+(;<'?.E'(2"<1< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C18 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5261 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2941 42 40M = 3141 306 NGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCC !12*6G",%<&8E%;="&EHHAHGE@3E)-8$GEF30%)0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5261 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3141 42 106M = 2941 -306 AGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATN %-6D:.<"!6&=G.#AA&@AG"=$.?H9G+)G"*#+H9(?05@%$$2-H+GD)C9*F)GG86;F%!)B! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:105G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5262 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17907 42 72M = 18065 211 GGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATC /+/:$BF>>54<(27+-*<,A84$4.."$7A9'CG3B7(."+BG4+,!HF0$F"<"8F817#/5$,39$-0H,,<*&BB?9C6<1H*H,/D-%"1"/-.%7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5636 42 186M = 5822 251 GACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGNAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCC 9#(!C"$3:2+'=DD"/5/5C?2<;D4+C2*G!/(D+$BD:,5,6#0.("&7<'C0%-52$G-B&8$7);-3#)6%:)C#@3=!2'C+#920GA!=''-@1C7%5:$7*;'))>"3GG%GHB50)61E2$!!6.*F/@G3((C#(!.7@0B542$)+(**B!5F-==$2@368<50D;?<8@9+>F39G(6G'3@6.B,9+75)F%E! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A38 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5265 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37318 42 166M1D18M = 37228 -275 TTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTA H$6$AH'D3;4>+%/2*$!7E;&@.4H?4%"<1C92;"*D#7,845:93BG>C;F3+9:5&5/92:225)!A8A?8E1:EA8@8?B(35=FDA(A$=69F68&-A($1?8B=15(#6G#<&<<0/@*=@GA0&$@7/$*E=H+2"(0/4&C5>$;DA,E<6.??,D+-F"';?$FF">+G257$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:166^C17C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5266 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43648 42 50M = 43533 -165 ATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTA A-=)4A"1#)4C&5>("1+F@)"'$9C=EH&979/&.6&D57#4H=2ED' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5266 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43533 42 110M = 43648 165 CTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGANCTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGC ?=(7F77E)F<%)..@54#1;1*)*':=),:3#G"'-9A&2"E,D''9.3@,E5D50./02,7.=9/7$5-C70F/5F:<")0:$3?)6'=99C-1/6?D&(2&996B=! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5267 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27895 42 52M = 27693 -254 GATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAA :2./+@84/?B>??,7/#9$/&G>CD(H-C-7)59F=*97-HB?$$4,6E,C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5267 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27693 42 94M = 27895 254 GATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAG @;B?/94").C%>68F>:&:?'-93H?(EB264DD>2DB;)$-(?&2D*,9!4G:C2*A=G&@&/(!0=8E,;G45B3C*)#8?5@6'0F6&CC,C%;'9/1FA!"=;<7'GD"A.*:#&60;B(>%6?.;E56H5C2#*!8!H74!=G150(#C7D55 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A35C31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14903 42 140M = 15139 309 TGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATT >53"=!)/?6>38433$B@@)?>%G+9E:29=#!@05?!5G*8>B272@G/,;E.8F34EBH<>7D4::7B&:B)57B#F@91';,4@DABC7);24=H6A$)G9#D'.0#5"8D&"B6/"3-H-A251'F;:.#57#DC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:140 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5269 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41746 42 216M4I62M = 41632 -392 TGACGGACATCGGGANACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAGGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGACGNCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCG 200488E="88C%1=F4<#8!C+<>*$-#@)A,E@C*9((2!7*/=6G.G*<">C;AB1#+%)B7,&)&=!?97#:B,C"CE7A+7"0?H+.%F*7-2G#@D4-<(5-C9;5:)$E.4.%"'&70"2E+77=A'6C:;68*:=.7"08@94$*'H*4,H/CB!G-5>64*>"D8?GC3%+$H18#8*"+G@,382==9C<$.(%61!A6!.AGE1E08*(7>3(H#/E"F;FEF8=?,../(:67C<+!*1'&/%= AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:15A77A75G1G106 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5269 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41632 42 114M = 41746 392 CGNTAACTGCATATTCTGCAATAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGANTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGAGCG 0AG#;536>E$*9!:+)5?C0E++(8C2,#F;5E0(<5*;9*(=72039(@'"HH?%?=C3:-*2&%70>)F9/.*?&H-+'?+"?:1G,,,HE'0?D$2$G>'3)<%. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29G15G5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5270 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20974 42 179M = 21188 265 TACGCTGAATTAACTGGCCGCANCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTNACGGCGCTGGCAGGGCTTNCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAAC D":?F$3#763AH-H9!CDE+)G"=?*:C:0;@4>1-3#/,3?@/)D0F.F0/09=?&!$B6)>)D0D.5@*4'G)F'+86),/"2.>2E/%'#/@)@=B0.H0(HF!71(<>!6>&);EED3C%;4@29H?H"0CC/C)=7;.#1.2ED-&>"D>0&G361F#6/+A< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:132 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5271 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47534 42 175M = 47402 -307 GTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCNACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTA F6.)*C04FD#'G>/D8-D,7H3#H55(?/831<)8>'<41#!*F@4)@<&*#E"H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104G70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5272 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20483 42 91M = 20587 187 GTCNCGTGCCNGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACG &$(%$!("*'+$**)&))%''$*$%&#%'(&%(+''&()%!(%$$%&+*(%#'#"(&##*++'("'))!$+$+(+%'!)%&((*)#'&%() AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1A1G0A0A4A80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5272 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20587 42 83M = 20483 -187 CGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCG H=*333;/-';F@$#1&C*""*"#BCC>9+6;C<=*7H+H+HD%=$.E18(?@:E83"#873,+$+.,:$E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5274 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20859 42 88M4D92M = 20753 -290 GAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCNTGACTAACGCGCC &'63D&610:1/%05!#;D!/9=,:1$*&G@AB#+9A!B(;=$G#/B'!#%00=(!>+?>A6,"F!.*<1A"<)=C8G#,#0@*9@.F)!B/7G02G6G2%!@+&1;F3/G"G?028#?2>$&-:#665%20CD)=A-(6-2%"2(1+5-"DA*"#.%0%E#7#"8%8@@&)/9$"#23C1! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G47 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5275 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16328 42 104M = 16224 -208 GTCTGTGGGATANGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTGGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGAC .A"(:1$&%78'C.D:B!@@$,E:9$F+A087&+*D=16-'4;E(01C1FE)>7',#@('>@D@-+*E25+/(0+68,;.<#($;8'2F3,757+;=3@F537: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T36T54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5275 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16224 42 55M = 16328 208 TCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGT "6B*$@1/."3%1''@2>H-E4.8BF/%8@E2?),$)EF-(/"=6>!.B;>4!!' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37902 42 106M2I236M5I22M = 37823 -443 AAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTNTCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCA A;=7)80A;$0273?C2?C%<-,'(#-13&;4:')0!/<==%@92';G-@($#!+@#)*B!6;5%'<>)5$%*/!DG,(CD8=?=(/A4-D8(;G!"(,33!?H?2(9?">C9=+G-7*55B.3@4.:?'#<".A=:1B6->51B,<&'0@6!>424D.!,:4>)!%1CADG7(>'1;3>7'7)H+=+3.0?)$%-5/"7;!90'A?3#:*;.1!?5'$=G7$H,6G3<8$!C++803EE&AH(2<&6&$%=6$)G-G"H1G3"C!<*:B%F$8@(60!+:#+C8=F1)*::A:0H2C9A=<%<4+196B90/3?#4H"";?=9E32@*!B$<7@$B:43.&>*"H'5?5D4G4"D809)C#($2.@>7C4 AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:50A212T100 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5276 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37823 42 79M = 37902 443 TGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTC (')=:!4G?*<@$D#1C+G.DG08)<2/B&>?,0?$-+,+H63)<8(0:5CHGE%2G5@7&'<,=")F/4'AEC@-,0*F-DC!F?E2'FB6CD/,0>,&<7>A>B84%E+%3 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G36C19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3110 42 177M = 3287 261 CAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAAC 3$#@3#6!.2D()"B5%5B8":$5-!'&<"=27E,/552GG).;53?,"0=/E'&==,H,#08'=AG;4>8(H'"!C22A3H)@/6@FA#;#('F=-#)?8'#5E&E8'007>$H(96-:',?A*+%(1=(>(C@4EH.!<*2*<:%A?*"%C"!0B@( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:177 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43966 42 40M = 44102 201 CTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATG 9&"3@"-23(H*6'/*A+-"AG6B&2?D<)&,55>,--)1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44102 42 65M = 43966 -201 TTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACAAAGGNAAA $$!&*$$+$!('#!("**&'%"*""++)"#$)!&)(+($%)$'("*++$))+#$+&(**$*!*(( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56T4C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5279 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18784 42 87M = 18991 248 NNANTGACNTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATN !!$#(!'*'+))(&%))%!'%#$"%*&#)$))!&%*+"#'"!#&%)(*(&"%'(!%++"!*%"&(*("#$*'*)'+)'""(*+$"(+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0T0C0C4G77T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5279 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18991 42 41M = 18784 -248 TGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTG 2$=1@?(A$D;'(F$)6>G%14>!H-B6%;.E4=BC%(#+D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5280 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14805 42 169M = 15024 301 ACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATNGACCTTCGTGTGAAAACNGGGGCTGAAGCCNTCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACNGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGG @,>"1!04%-H6**7,E>'G)>E=0'0D1C+,@9)B$."/4$84G17,*=C/E,33-.*+#C,<=28!D9:91*-DF@&9>3-2:&9:@28;CHC*?0-""98'F%58$'HA&/2B;@+HG=#;!9%#H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:57C17G12A50G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5280 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15024 42 82M = 14805 -301 TGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCC +&!:5;&05F#=F::!@B#E@8>:(43!@/4$5/5:";>92H5D;H2G&!3?94/36B*,(@D<;:..A;3)"C*=A+%F/3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5281 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43095 42 85M = 42894 -286 AGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCAT :+:&=3>&;?E'GG7C7/*4-"0@'?<(:B6>:)%D!!D7")!8@)'G=>>DD/8%9@2F,5G8D1/7@9EA(=;8*)HD7C-6. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5281 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42894 42 88M = 43095 286 CTAACTAGCCGCATNGGGNAGAAAGCAGNAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGA **%'#%$+*!%$$**"!)**#*&*"!($*&&(""'$$%*+()#+%+&!&(%&)%*$*+'*"+#&+*$"%%##()""&)**#")$*'&* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G1T9C3C2G6T59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19930 42 100M = 20030 616 CGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCNTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTNGTGGCACAGAGTACGGCAGACGC 0B9A<"(,5A/@A/;*;=F08%2)*5B<=D$<(*=>-52(CE(#?&@-'$$!))-(#D>D#03H%!6*)# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G45G23 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20030 42 516M = 19930 -616 GAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCANCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCTTCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAA 4$G)"1$$D'%4-$#&>6B-&D96E?$EA@?&0:6'C@DB&!?B)6%A;E&'2@;E:GB640"86>$&+95':%#G8">98;D&<,H>/=$5C95E%:2+>$5(HCB(2(,)?&,0H"*CA&A5D(9)-1/,4):?)*46,1=B,9=#9$:(D0;-(,0%$5443#$GB1,=.G9'*E+.-7?:62*,,8DA%'#HA>7275FCA+.*4*-C3=*#=='51+-;C'?/B7'!4B)@=>-"(<-43(C+>9B@C*62<9D0H,7/7/8E300=*2'EB-9*;0#?/E:/B("))1*0E5@;==+G*;/+4*;-==7)>0>9=#G/+32$53G).DDA(+)"4)6=97'/6#*.=F484A'8B.F/&H+6D)9*FB(H#:D),:7-%?;C#87@,E4%B.*DE.#;10-9))2#5;1@?.@%#E8$*+<&7)7;'@#+5)2D#6?G)($+B?BHF7FE!"!GB3%.,'F!!#5?"9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69C220C87A137 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5283 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33443 42 281M = 33724 521 CCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTNGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTT /G<5/%B852F+2D%$<5?52#>0:29C.:!=3'*62879'9:9):)/;=37A@=#"2::4&&9'7D',?E'*C?'D"H5$;$+6G'D:?H24H!,:6==H3-3;0<%06+>6G731;1=ACD=-;@>$D?!B3'96.79B50(5A96,,<#!79G;2.9-1E1=D(>,!$#6;%-7.#1#"$9E1("/;D2**H<%$!;+*@CF1B@B68#$087///CC>($G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:201A38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 340 42 65M = 405 316 TGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAG 7%B1E5?>/-3<-3;=-1.-&>9'>*9!7?&#.F7@E>&E-26,=G+"2?)+@<7+"-=$HFEB= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 405 42 251M = 340 -316 CCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCNGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGANCTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGNACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCNACATGTTGATTTCCTGAAACGGNNNATN '"'(''!(+##)#)$'#&+'#%*"%("&$'')$'#()%#&*')%)(&$%()(%($"+('%(&(+#''"*+&#+($'&#*$%&'$&&)*$!%*#)"(!('++)%&))#%!'&'"*$+*&&'!#)($+!*'"###!*)%!)())$)+)"!(+%!()(&*$(!!$*%*$%!*#()++*()"+"#)()!++!+)"")(&$))#*(+&+%$!#)!&%$#))&''##)*$!+((()*++#"!+(#'*'$)+!("&&$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:22A56A47T94G22G0A0T2C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5285 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33267 42 137M = 33200 -204 TTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCG +*189-,#D8&7.0H@62!5:D"+GA>"9"+H>1G:=>6'?393/(8*9,:H3@9!;9*;CD%A-*&F5#77156FDAC*)*BH?*/?0(;..!736$/1A6=2H%/&<4DF10./&=%.@,<",A/:G,3;;E.,# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5285 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33200 42 53M = 33267 204 TTGCTTGATGTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGC 5C%;H/,B=8;2&%D369#8->08A6>5-<4F2&!8G",,C%2GFA,34A$!B0G%&1EF5#*942$-=D.$D+#+>32*C5H$>DD@;>!2%:<%D6F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21454 42 54M = 21181 -327 CCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACCAAAACCACATCGTCGTT "&)'!""'&((++$&&($')!%)")%)%%*(&(+*+("!*'$)+)%)*"%%#&& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5287 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1093 42 59M = 1093 0 CGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATG %:D%)*GG-32'+1:;"9H!B#%2"0;'&)*:!@)E;+>G9B1%>?6(5G%;2+(CA9< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YT:Z:UP jpayne@0: r5287 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1093 0 * = 1093 0 NCTNGAAAANANTNCNNGTNCNNCCGGACNGTANNAANNTNANN !#"#$!#$$#$!$$"!!!!!$#$!!"$!#"#"$#"#$!!$"$$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5288 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24088 42 157M = 23947 -298 TCATTCATTATGTANTAAAATTAGANTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGNTGC A1C%@<''0HE2&:"':.B''F;&F67=)/0*24$#B9&9<";H#98BF'?6.%027#@3A>!,A5>E@H7!A*F&2%D;+)%?2.>*/9B4%HE7@98+5H"B363E02;@=&5+C1$63B4864*$HC49@?6E@(.>C"922,;=&9)!1//=< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T10G127T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5288 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23947 42 141M = 24088 298 CTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTCTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTA H/-H8%(=1,:?<'G,G;/=;#F<((GA&)@"'!?:2",>;2?*78>65*A-*&EE!!%&&'2/H5$D0E"3;:$4;%-'4$>##%@?@55B"AD>50#6)$'B5!2@7"E-)GG&.%8-C)(#31E8/"+/BH;?.&'9/;*=F#-<%C."0E2>#<,6E#7;,/+E@"F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:143 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5290 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30547 42 18M2D65M = 30651 247 NCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATNAATCCCTGAA &+&+"$"#*%#*&))&(!*(!"!"*&**''%'!+'*(%'('#)*"%#&%)*#*$!!)')%"+'!"%)!$%$'%*))"!#"!+' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:0G17^TG54T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5291 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17287 42 128M = 17415 292 AAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCTCTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGGGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCANACAGCGGGGAATATCAGGT D*)<.+C,?*G*17BFC=<4)A)*?*#4!B0D<@)8=3=D45+C;15;&5*-5EE=8-1>!-F$@6-+3CG#8"*609,$8D2C,2H'?*6$D0>%;CE(?('60"&$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28A47C31G19 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5291 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17415 42 164M = 17287 -292 GCTGGCGCGATGGGACACACCNAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTNTGACCGTAACAGCGGACGACGGNAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCTGGACGACGGAANCCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAG 8!=0B$-*85G55/7(5B>$H*'/ADD0$B6:>!..1$A)6E1F9/E=G9(+@2"G*3H#?"=-$8/3H>-0H'D"%+44:!B9*/FE1=(1F;?*8,D+:#C<0)4&:..'G@E!D2:*?4C(:!?B)2#!G%8"F=?3C178G?315?B=3%),2?D9A&%1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21G33C22C24C11A48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5292 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33249 42 147M = 33084 -312 CGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGNCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTAAGG /&!7)A9!(C0%29+D7%?+!7:03>(0.!G07#F*,%.*B8<>/-2(=FC.G=>5*<=C3$F"9$*0A234$C!C5)!,60,5!0A:!020,$)30&D/A3'#7(H->'-@*3<6B'D'/*9G)F+007"./4'A;*76"#0EC-E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G105C2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5292 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33084 42 165M = 33249 312 ATACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGCGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGA %#'+"'""+&&"!"&%'!$+%&*(*'''%*$+!$!*$''''*%+)'!%%&'%!'&)#$(#!(&%!+#+!%(()*&(&(#&+&&&$"&)#$+%)#&&)##"$+!('""!((+"**%'!!'"#+&+!+*$$*"('++($#"+$'")%)"&$$(#+)&"+($*(($%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G74G88 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29688 42 40M3D85M = 29816 543 CTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGNCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATT :-9$"6B(7F41CH5);9@*BA+<;5&?9-(0E;),832.1A@FD;E(F:7A,23;4"?A(B><+E##0(:;G?@=C)+-?&5.#)F"1C962AE!HD$0#+5(;9>8!;B8,$%$*F$&+9+A6 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:40^ATA51G33 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5293 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29816 42 415M = 29688 -543 TTCACAAGCGTTATCTTTTACANAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCNCCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCTAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTANCGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATNGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGGCNTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAACTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTG >.@!3,/E?2D%E+%;/H7#;B>=+.)D$3#2'6&*&*:;-#2!<2+C;',519)>H2!F7HA:-618AF">&6>*6+#=A9))0"4)6/>-<72?%F%?;3#666.,48C1AG4CB3H%G1E#/.(5F<#</<@$F!$/#:F*>/&?&C<1='1)4@8A%'E+">F?*!:4"6001+2#%>B';G.3/*=!$9#H*8#)$(3@A9*#6-')C%!?CA@F#B;G*EH89"G?5405C/#13AE,E.*38."C7H!BG>?4-:(*B%B,"&7H.*8:1B;=9,*:$B#G81+*+28<+7'?B01:C#8G5E<')B:./3?B9A8$H::8:A7H?D10@H8-5("#'=,@0@#@22'E97!=E5$*DA<8!4=#BH()E%DB,%>1 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:22A52G6A25C41A80G34A1T97G48 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5294 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36642 42 150M = 36507 -285 TTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCNCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAG !%)*"*!"%(++!'(!(*#$(!'"%%'+)''&$+#%)*("*%())'*&!'$**()&'")&"')'++()$&+*%*!)%(*!!%$*&!#()#%%)(!&#&!&&'*$'$((*#(*&('##"$"%%$'&'!)%%&(*'!'+%%"""''#"%&+& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:111C24A0T1T0G0G0T0C0G0G0C1C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5294 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36507 42 111M = 36642 285 TTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCN D*.3E89"$HFF#:0+%H80-3/%$3@6//>0@. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5296 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33875 42 46M = 34083 248 ATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCAC 'H'8$#H63E-!$BG-+>%8<)9756?1'!9D$$1*GH!7H)!/)&%H8)<&<32 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T60 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5297 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11452 42 125M = 11577 200 CATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATGTGCGCAAGGATGAT %+$,.!7G9/+=66"<-,15.9=0DCE%@A1=@'&D+"-&+).'84C!C'$+8D/,GH24A46!)<0"!-H<.(24+-(-H!D<."4)B8/<23!/D2"@8+#%.8:?E'@)6A@.&D5.4/G:4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110C14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39774 42 86M = 39543 -317 GAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGNNNCNGGCTNAGCNNG &"%(!'%''&+"*)%&)!$&*+%(!$+"('&)&"&#!'('"$!(++)$&*&'"'#)"()$+)+"#()+*((&"#!(%(!"("&#"( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:70G0A0A0T0G0C2G0T3C0C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5298 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39543 42 78M = 39774 317 NGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGANCNT &+")%!%"'(&"!*'"(+'#%*%"$+"%!'('"*!(!(*%$#&"&&'$'&)&()(++*"($*+*(!$!*"(%""**$+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C73C1G1 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5299 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19604 42 332M = 19512 -424 GTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGGGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCNCAGGAAAACCGGTACAGAATTGCACCATTCANCTGGAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATTAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGCNTGACGGTTTTCCATCNTCGCACGCCGGGACCATTACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGNATGATTTNCTCAATGCCATGACGGACG 1D0A+91(A&364C,F8=E/(6*F):2D3+F%+2(%@G#/8>#7:>-427AB"3B>#8.&&;#2*06*'@*1)-:C%;="/706)'?-"@D8'/9E6:#&DF:;3=4;,;.C64B8(04E-A%/6H7-?$,(A*,37D#!$ AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:24T57A19C11G3A59G56G0T13C1A17C33A7T3T0G12G1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19512 42 92M = 19604 424 TTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGATGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTNATTAGCCAGGTAACACAGT H&;#19F-=19;(D=&%75F!-/<.7$=&;B.;!;)HA'B='FA'"D";<0=6A-G2+:0)23G7%,47)E->' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C31G19 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r5300 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 89 42 80M = 15889 15916 ATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTNCTCT (("2@E79G.#5/'"".=!F#&;1=A'A8-)!+-2992$!&@7:C$>F*)@:9"<14C96.A08323 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T4 YS:i:-19 YT:Z:DP jpayne@0: r5300 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15889 42 116M = 89 -15916 GCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCGGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCNCCTCGCAGTATCTGGCCTCGGT $DA-$*#G>D=@F*B()-/;44!F19#GAF>*&!,!4+#!C'E6G:".F=6E((7'8&9FA%7)'801/*;$**.$&;D0E-F*<.35D(F2@.A@%1;.6A$:EG66!4C+4H1D AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A1A0G0G0A18T67A22 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r5301 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7653 40 92M = 7465 -280 CGCCGATGAAACGATACGCGGGTACCTGGGAACGTCAGCCACCANTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTNNTGATN '*"&%$$$)%!!!")$&&+)$$(+%&(!#'("$%!)''+*"&!**)'!+')"(#!+'!%+*%%($$#)!')#'%$+%%##*&"#++!')$&* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25A18T40T0T4G0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5301 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7465 40 49M = 7653 280 GGTGAAGCTTCATACTGNGGAATTTNNCNNNNCGCGGGATGAACCTGTG ('&$'*"%*&**&*)*"#!)#!"*&$#)!!"&#%**#*+$'&)'(")+$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:9G7A0T1C1C2C0A1G0C0C0A17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5302 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8927 40 55M = 8718 -264 GTCATTACCTNTGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAANTCCTACAATGCCG F:F)CB9#?'6@68:D8D40ACD;+>2?>&FC>A&D2E)>2/$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A30A13 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5302 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8718 40 119M = 8927 264 NTNCNNGGCAGNGGTNGCGNCACAACNAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGNTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCATGGATCGAGTCCCGGATTTATCCGGTGNTGAGCTATATCCCGGCACTG !''*"))#%")$##!%((*"*'"$!%&+$'*#+$++)!!$+$+!%"''!&$##&$#)(!*+*"!)*#&+"$%'+&%)!%%$$$(!'+!%'!&'*"##!+!(%)$+)(+)$%$%"'**(" AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:0A1A1C0T5G0C1G0A2T0G2T1T1G20G22G5G21A5G14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46014 42 42M = 45735 -321 GTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCC D/FA65<&9--40$H4)=:1/1!.;94%60?@E6$)/*5>5. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45735 42 67M = 46014 321 TGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAANAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTATGGAGCGTGGC 0>3CF2>G4501"HG/?.A;83/.#9GF<63&8A;*G(05@8-8)8&A5=@<1/>1+,=*08%-"$) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A31A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5304 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1701 42 168M = 1557 -312 AGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTANACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAANGAGCATTATTCG @==?F(4)>@563E')(,?,#'"&4F)8E65G2&<7>;&6;:?61;0*<39#7>>@'F1(2#C0/+,6B!,F@1ED50B$#19#$;5,B$=8.C%B%4#.7BG2'@,:?"7%9(@.3?E)F+B!-1B$!E9$2;$---B><;B>5=*%3<#$33+<3#/! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:81A21G51A11A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5304 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1557 42 107M = 1701 312 CAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCTTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCC 7+&3&G!,E-/0:17(,,;'5=!)(,',DH"B%:2D#-38E?/FG0D":%A2*9(E7@D/%-.57/H!@&,20=-/G>>4)3H<">B/4%E4GD14";4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G23 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5305 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20727 40 97M = 20908 246 NNNAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCNACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGANACGA !!+!&!#*(&("!+"+*+"&%%"(+**!)'&!#%(("%&)#&%#)&'++'$+$'+&"'')&""&''&''%(''*+#*#)*#(%!)#!"+!#&(+%*% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0G0A56A32A4 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5305 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20908 40 39M4D22M = 20727 -246 TGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGANGNACTGN %$+)"&'#$*$&('"%%(%%(+#''!)+')#&$!&)*#(+!"(#(*)%+))&(!)"#$%)" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:39^TATC14C1C4A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5306 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1335 42 91M = 1428 212 TCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTG @167G29C,H24.<$B&EH#E25'H059G/01<&3A3%:B$453006CF>H#>#!+2./-:B8#9(5G156;/>7.=#$-3A6=05@62-/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5306 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1428 42 119M = 1335 -212 TGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTANATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCNCAAATGGACGCCGGANGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTG CC3*=-.H>C46*"+DF:2C/%2E!!(<9B54*C=#!6-??@9%'C36A'%C!*)D:%<')(9)E'674;-#E5"09+(#&DE$A&3>/83/+5HF%C!-7@&)6;,>5E/,'.(?:'5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31A29T15T34A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5307 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14126 42 84M = 13961 -249 AAATCCCATGACNCAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGNGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCATCGTGGTAAG GC%/,)$D&0"?AG+-12A@)04BE=D-,:*C,3;B!1+.3"@.218%=,1'8;49,F!"C+E7/3GH-/4+G7'=,%4":$A',=::F5/2E?/"5+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5308 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25106 42 57M = 25299 277 ATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTT *BD>(>BD9DH//6>FCHF-56>@6C6H);3$;(?8&$#1>?".'=/8$709@&"=D+/CE9$B58%GB<,*%*4";A@&;AC?,8:D(<1AC/>,&G0,2=?!F4<2=99%E2.4D+4.5-3H=?+C=-'&>4#1$8!?@*F#E$)'F&:79"=*4(?,HC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5310 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22643 42 112M = 22765 217 TTGGCGATCATTATCTTCANGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTC 3.+$=$/D"59E$/>9D*3%7<=%!?B3*,-@-DD7BC(!(/G3??$ED@-!57;5A'D?8>?=1E4,)EA$#+1&B!5A7##%4)%>?-+:5@=<6A'-*3&;!=@))"$0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T10G92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5310 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22765 42 95M = 22643 -217 GAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAGTACATTTTTGATTATTATTTGAATCAAT 6H*A49G2#.5,""F;F+.FG*')1/+:>#B?E-E,CC*%H;@9H-0H.B:3.!81EAA<+#C*3&1C=3AD#;8@:+&F-84(@:5238G9;:3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5311 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27459 42 80M = 27561 144 GTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCGCTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTNTGATGACA 5=6B20,(<*&+@'C,&!H,G1C4C9<6&C&80D/!<)+$/9'(DG25><9H.&&3D;"8=/E)::3($/24>8?0/9G< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A41T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5311 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27561 42 42M = 27459 -144 AAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTAACAGGTCACTNATNCC &!%(&''!$(%(!"#*$%"+%*#)*"$$'"%'#+#(#&)"$* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T10A2A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5312 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26243 42 104M = 26117 -230 ACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGNAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACC 4G>$9./&/C!77 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5312 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26117 42 86M = 26243 230 ACANCGCNNNGTNATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTG $'%%*%%"##%+$%$%++###+''*$'!&*%!!&)"+$+$&+%+&%(($%+*'%&!$!#%&'&!!'&)+$++#&(*#*!#%#(&!* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1T3C0T0A2G73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5313 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33447 42 80M = 33634 246 GCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTA )G%BD6;0BF:A/:<&?/>6("F6"/7,>"63@EG/!<+6*"F<@<%F4:$3.1),EH-=,95'H634A"A(DD+1:293 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5313 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33634 42 59M = 33447 -246 CTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAG 3440&6-28-(:E=44'&4D!1*)"/5E>)B3D-H'<05"-3B564/.3(1&+'-$."A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5314 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17997 42 102M = 17929 -170 GCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGGNGAGAGCANNNCCNTGGGGNCTGT +&)$*''*##'&*''(!)$)%#($!&*%$%&&!$&((+#'$+))!#*+%!(*(%&###("#%$$(&(%')$!++++'"'%($!&#(!"!*#!'%(')&)*() AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:77A0T0A2T1G1A0T0G2A2T2G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5314 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17929 42 49M = 17997 170 GATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAAT )-+@#%=@A>=HC@-A3>GB-5-$<$&!H5:7&=B.H247*3F.%&!*>CH,*@A:"#@;>D336$(HD*,'#-<%41-C5<>GHF.H%6E:F40)9C3;,?G7::4D,4<"F9%A*!*C(21D!!?"/)>E.<0&!504G5?4BEE;$'5C,-GB;$2<2?9$CH@<8.&*@*'=;'*.1/C(EH;0,G",$?19@4E/7H9<+*@.,)6=?-B;H>*+>3B),;< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G232G71 YT:Z:UP jpayne@0: r5316 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7191 0 * = 7191 0 ACAANANGGNANTNCTCACNCANNNNNCNGGNGTNNCTTNGTCNC !!"!""#!"!!!#!!"##!!$"!"#$!!!""!""#!#"$#"#$$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5317 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38990 42 110M = 38990 0 AAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAANATCNCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCACTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGC 9.:-+DG/4;,*#=#F9H'H)<4/3:7E0"'7G3#5FA-#/<%177@,-G*4C5,E$5.,8>%.@2)(/5+89HGDC2!3>0*C5*F.(6?E0'") AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28C3T35C41 YT:Z:UP jpayne@0: r5317 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38990 0 * = 38990 0 NTNANATNGTNTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCNAGTTANAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGC #$#%%&%"")(+)*!%"")(!&&*&'#$)+(#$(%$*%%$$$$#+&)%"&!)*+)&!#*&&&!)'#+"#'$"(&*(%"(##+'!*!&+()!"&!*#%!+#*)(%('$!+#%')**%(#&'&#%%#)!*(&%")"*'"%#$#%+(%%%(((!$"#)#'**'&$!$'''&**$'+$!)%+"+!")%%*(&!#&!%('&##""#+&)&*"#"#!&&#()&()!"*+)%"* YT:Z:UP jpayne@0: r5318 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45378 42 154M = 45532 217 GCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGNTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAANATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCNAT F,'9%""&0@;1DF5/81EBE@F1./,'6H'726=60+61*#(B)(&1/5?<>.>H4A&$92#D3'F?6H*#?@A;!G0E!*30EH)3(2C(8CF/*D<--%-&,#+10.AH/B4(HA,8-#" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:70G43G36G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45532 42 63M = 45378 -217 ATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGAN &+62E.75F>:7+GG8:H2=<2>*CA1@*@(:"-$-H90=-H/179"<1@*3+9897@*/"!+40FF%?1.('GE*5H04=B2A$+A-0&=&8))(DAB!9.6;.(6>%*?:6(!"@=7((E97$=":5/9?'=!C90A,?D>&9<@FB+0(D;>,H;3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:188 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5319 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14966 42 57M = 15033 255 CCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTG G'&=(51:C)>8B.#:?11A'.?//F,E6EEA6.)5+';?..*A2@3(91DF>C5!- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5320 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16563 40 214M = 16514 -263 CGGGCAGACGCTGACGNTCNTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGNGCGGCGTTCCGCTACAGGTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTCGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGACCNANNTGAAGTTCNGCAGGCCATTNNC !&")**)*+'!)"*)*"&(%&#%'+%+!**''%&((+%&%*#"$*%##%$%*')(+(++(+*'#!$!''"('"*($)"')+("!((''(($*!)"(#%%+%)!*+!%$(!*%+*&)$%"$"#*($$*"!"%%&&)$"*)%*(%(*!+%$')!'&*'#)&++%$"$&+#%*'%(($())"&)!'$&&+"$("!"%($(#!"$#*&&'&%)')#$) AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:16T2G67C3C13C43G2T33G1T0T0G0T5A1A0C10G0C1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5320 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16514 40 49M = 16563 263 ATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCAGCGATGCGCNGTATGCCGGTATGNAA :H3@@=)>)C9"#H/8?9,-G)-HE19: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G9T13G2 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r5321 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44054 42 40M = 43840 -254 GAACTNAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATC 9=;-7#6(B*B0;%HG3D!H,C2EC2*$5%++C>=&E#C; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C34 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5321 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43840 42 196M = 44054 254 TGTTCTGCGGAAACCTANCATTGATTCAGGNACAGNGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAATGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCT A50')H'@(%.@3H:2;$H$.)!C=DH&E*-1=)#D"!@.;,!)=2"45FE,<5C#388A1$4;+(B*++DG72;1"30/3@- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17A12T4G49A110 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4152 42 47M = 3904 -295 CAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCA E;54A&-C(@3@.@$GC:EH?81B46!C$AEFH?*)-AD/''F5!B, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5322 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3904 42 248M = 4152 295 TCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTNCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTNTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCG C4F#EB?DF1<&.?B/"@#DB10?=%7EH:'/G@E;@C%=1%@+6#/7=E9557>/'";FG506'<#0C<*%B7>!*==5=$/#'<4,:+)-4>-?C=A!D/&@4C6(A"!-=BF*+C+;94C*7*E-+E?)G:1,8;3@0*+'!/:@A$#C)H0;((.'@@>=56414)*(0<,.G!./!:1%<866E+(7D!/'F#=EC/572#-=#8';F5*74%.BB."?BG AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96G69T81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5323 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20655 42 42M7I251M = 20595 -353 CGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTCCAGAAGTTATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAANGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCANCCAACCGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGNTGAANCGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTG ()'&+$'+'))#+&(+$('&(!%%)'&'**"*%&%)$(!')$*&&&)*(+&*%&*#%"+*#&!'#*%#"+%"+(!!)(+#'#+$'''&)+!)$&#("$!$#*%)(*)$'(!!%#$#++#"#*+%(!'+!(#)&!&)")*(%(!"!)))*'+''%%!(**&'#%'#'%'(*+!"&$&!*"#+&$&%(#+")($(+"()"#!%'(%(%+$%!*'&$&%"#(#!")$'*)%(%%"()%"$)!*%+'%)!&&$"%%(*))#'$+"!*)'$(+)#$)&*''$$#$!$#)"*##&&%*&++!'(+( AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:15 MD:Z:24G6A44A25A5A51A4A126T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5323 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20595 42 45M = 20655 353 GCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCA /$'<>3>+287!F/1&1"+6??,A3%1F@A,7$-AC.$<+F@@CF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r5324 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10119 42 93M = 10212 211 TCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGNCGTNCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGT 70E//H1H:.-#&>'@D97HA.#)"B?&E?G'HC)2)H!-,1?3$;G4B,&!)H==5E'1;,/&1C")G.G?4%B=8FD@13.26(*9#4HA'*%!<559H+#4/#?E?&G@E?=/G7F.74)%E%@5F?A,?3@D.D5HA;-(.@0? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11T22T13C103G5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21367 42 112M = 21203 -276 TGATATGCGANGCTGGACNATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCATTGCATCCGGTACN 53C8,59'0D%A$A<8H#C9(5)/,/G(:$G1CC*G1!;+58?*<&=57G<%/#,G<6H%2)2AH-7@AGD=G;F%0;102&%(&,$;$?H726/=E-1&EH.;)BF5G&F" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10G7A79G12G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11653 42 168M = 11899 293 GAAAGAAGGCTGAGNAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGNAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGA $,$!"94'A?,+%3=9B3@<2"%;-?=6%!!+29B16/3#.14&-;4/.;0.888;209:HA9-)G=A,"EB>'4*E$6@&6%=+-"B2;F5!B#8,'>('*)20.65.H/0##&81815562A4%:4:>E:7E>3*E;33HED#09<"AF!.7C+D0<%@AF/H(6, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C26C126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5326 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11899 42 47M = 11653 -293 AGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGNC %+)%!)(&#)%+()+&#&(!"%)+$+#'*!***!(&"+)('$$+'%# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45A0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5327 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37658 42 43M = 37479 -222 GCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGAC !+(%*)%!")%&*+%'%'+)'$!$"&%"!&"(&("'#*$!+($ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5327 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37479 42 85M = 37658 222 NTGNNGNGTCANGNAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGANTCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCA #()&*($&'*("**!"+*#%(#%(&*"*##))%")""$)&*$%*$!"$+)*)+)$+%(+)$'$!*%"%"'&##)%%*"%++'+!( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T0G1T0G0C0G4T1G31A39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5328 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27823 42 57M = 28011 234 CAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTNTGATGCCATGGTGTCCG 6=EF.E$F4,>+6++G-EB71-1!/<1%9"F?5?37.<"H#C,=D5%.27)C.6.D6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5328 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28011 42 46M = 27823 -234 CGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAACGGTTCGCGAC -*850#9@F6B:-C+D@"D,5,/@$?=0E;@=>=&6E6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5329 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46737 42 59M = 46908 259 GNAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTCAAGTTCGCAGAATCGTATGT $+*##*%(*))(#*)!%&*"$&*'")++"!'&"')'*(&%$$+*$(*!%*$'#"''!'' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T36G20 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5329 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46908 42 88M = 46737 -259 ACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGAAGCACACAGGGTTTAGCGNGTGNACGTATNCNAGN '()"*#%)&$*(%$)!"'#'!+"%!**!#*%'$+*&")(+'###&$#)&((!+&'(((+$&&#+&+%!)!%"+*'"#()&*()""%%# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:53T17C2A0C6T0G0C1T0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5330 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32820 42 112M = 33007 239 NCCTNTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGG "%%&+#)"%$*&)#*'!*#*(+"""&!#!%)%%'#"$$!%('+((")&*#%(()("+'#)&(%&"!$+#+&&)"&$$#'+)%'*!#&#$'$+&'&*""%"#"##'%)+++)$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A3C107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33007 42 52M = 32820 -239 CCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTA 5==,'-<()#C?;5?"D;0F:E@@)308.B%?F?";F)#&BEF#>,<:6G24 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5331 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43478 42 166M = 43478 0 AGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAANAAATTCTCGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTNATCATGGAACTGCTGAGCAAAGANAAAAAATATGTTATCTGCCACGCC ++++!&&%(("+$+%!*("&+)!!%+$*+)#*'&'*('%"%$)"#&#')("(!'+!**%))$'$&""!+#+#$$$+*'(!%$('%%"(#"$#!)$#(#(*!''!*(&(&+%!%+)&'#)&)%)')$#+"&(+(+'!($"+"$&"%+)*+"#!*+##*'*"+(""'% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:70G7G38A5C6G10T24 YT:Z:UP jpayne@0: r5331 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43478 0 * = 43478 0 CNNNCNNNGCNNCNNATNCGNGGNNGANGGTGNNNTGNNTTNCNNTNCTNCNNT "$!#$!"""""$!""#$"$#""#!!##$#$#!$!$$#"$$#"$#$#"$$!!"#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5332 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23347 42 83M = 23159 -271 TCGTCACCCATTGGAANGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATG 0$7DF.7E6$B@9?D-2=.7/6=().@2;%%/>@B6+0)8"59>5:9D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T0T66 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5332 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23159 42 97M = 23347 271 CNGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGNCGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTNATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGA B1(C&&87=/H!B*40#%)'1@52)!$5/1.);?(,$7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T38A28T27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5333 77 * 0 0 * * 0 0 TTANTGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTNTGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATNATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAG "#&#*%()+!'+++%&**"+'%&+)$#&&$)(*'(&##"()&'+$)!**!#&&(&+$*#'!$(%!)*"+$"+$()+&'"+(#* YT:Z:UP jpayne@0: r5333 141 * 0 0 * * 0 0 ATGTATGCAAATAAATGCATACACCATAGGTGTGGTTTAATTTGATGCCCTTTTTCAGGGCTGGAATGTGTAAGAGCGGGGTTGCATGATTTATGCTGTTGTTTTTTNGTTACTCGGGAAGGGCTTTACCTCT 7:'E<=$,;.7-!%>47&-F+0=GB':9"G;59-4,4:"6GB7<.BG@.-(!1195B)'#C,&0,";F/1-98+@,)"8G,'8(C75:H>!;=;CE.-,A"-:A!!(<<11:-(;$8##CD15-;F0;75@3G YT:Z:UP jpayne@0: r5334 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33337 42 134M = 33199 -272 GGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCAGCCGTTACGTGATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGC +4BG;4;2H,B-.<(B6#,=H=#=>3!=+%+6'F&#)>85'!D8E*$486:9@C@.:0D>>/*B.8HB/G>46H&#:,8G6-A$3D#*FG'D!),-A.*41,6D"3/+6F0/"4=@&??,)#4?(>C=,0F=/B$:4>/5&E1D1:*@8:9')2'9=>+)<++);DHA811H=GC86-H3";3)89!A"H6=0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T137 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23819 42 64M = 24088 316 AATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCANCATTTGAGCAAGTGCGATAA 5/@,HA&3GB0'.5$287%=1@@G0%0@=GAA7:G3-/=@F-6H('7.$,"G:C)F+99790(= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5335 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24088 42 47M = 23819 -316 ACATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTTTGGCTTGGCTCTGCTAAC $"&32A**?=,B7!&"0<-B9/"+A%0@+22#'=EGC#2@B96&>>D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T27G18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16862 42 100M = 16962 249 GCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACNGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTA 7&>>&D'*!)23*:6B59-5%/52?:6:F+54!1*26C10-'@#04AG@-(/")/="G.*F*!A:;6C: AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0A0A0C21C74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5336 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16962 42 149M = 16862 -249 TGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCNCGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCANTCCGGTCAGCGTGGAGGTTC (C*7%'('D=//#')F?H'#;#H&-DB%/;#,!+8!F11&6A.;#9B$@>A5(78@'%>F;D:7:20H!-C*2?/75E9);1&DA7#E@&E<,#7%*C+)0G0',;+E>7!%,-!69%GB;5"D64<;!F,(>,#B('DG.969"B,0F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76A51A20 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5337 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18395 42 89M = 18185 -299 GCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATC (>2B(/D3$6&8B41;F3E=*&>@=2D*7D0!D+#6=:D6F5"92GE5,?@H3<%#G?!921/%D((C@C42+0?E=!@@8$C#E7H9& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5337 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18185 42 91M = 18395 299 AGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACNGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATT .-$?F>9?7C5E"@0>58$"/*E?A1,7!($@3ED=GHC356G;4B6HB*"&?13F2!2+28%A.2'$::@507@GD#4"D>:1.$)4+6+,C-1+3H/!3H9/49/6$8,52FF/G=5@%@< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5338 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37234 42 48M = 37417 246 AACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAA 64@A)8>E"9.7@"8&-2%9/.@@6:D3"8'0D<%,48&74@>D(%,5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5339 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26678 40 9M13I54M = 26741 370 CTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGG H+5')04*H#),":G%+1<>BH@H3H1.$')%*G"@'FF=(,@-H=#E/=4<<$)A9='93G4AHB%H"E$&.*AE AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:13 MD:Z:63 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5339 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26741 40 307M = 26678 -370 AGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGANATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTNATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGANNCT !')!%)'"(#)#$&*$(%#"#!#("&(""%$!%#!+$+)%&&''"#'*$+#++($'%#$)#)"#$+((!%*("$%%"!%)')&"+#"$*'&*'%*$&%(%"&$''!+&#+'+#'%"*)("#(##+%'*+'$$(&&'+('*!%)&'!%*$%$&!"'+(#+%+'*!&""("$)#!%&#"&$!%'"'+##"(+!'""()""(!'&)&)"(&%+!#$&+&)'*!)'"#!!+%*$"(&&'%%+*'"!&&'*''(#&#!)!*(#++'($$)##("(&!!"$&'*%&)"#&$*$(&'%#%*!%"+)(*%&&&)' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:82T186T32T0T0A2 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r5340 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23383 42 63M = 23280 -166 GAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATGATTCGTAATCT 1H:4./;,BG("9*"GC=G9>3830!8",',A<&(11?0;C>E/5%!/:-B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5341 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25194 42 117M = 25056 -255 ACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAN D&'5F&F7.A(D>EH'%3(BG<4>3!3)+=E+F9H=*4=/=1$'%C#>@-G5$A9&=B,FE/A*/$DG;H3H!<,3205,(+-0,G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A4C32 YT:Z:UP jpayne@0: r5342 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 231 0 * = 231 0 ATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGNGACCTCGCGGGTTTTCG B!-24F5/D!*&/?&A"H)6D789/$C:(:742F3-0=HC!',AH<&$@9"?"-< YT:Z:UP jpayne@0: r5343 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 177 24 153M = 1 -329 CCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCCGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGAAATGCCCNTTCTGNGAGGCGGTGGCAAGGGTAATCAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCA %+:B+/CA43ED!!:#6'>=,(*=*<8@?CH7>.B&:?/26"5:F?E<+$890";=&??+0.0F>"D9)4>!)9G4F9:%9)E"3);+)5+"56: AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:40T49G7G5C20G27 YS:i:-64 YT:Z:CP jpayne@0: r5343 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 24 4M13I172M = 177 329 ACTTCCGACGGATGGGCGGCNACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTANGAACATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAANCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGT D2'$9B6,/.1&31=4-13/E4'%()62=DE26;-*-(C'>659@,0=>>8@5:=2$HC1-1/;%@(158&B:#5BD<%/890?+22*E8%%&%3$C9337?)-&ED9B4;)F27B13(E$G6H-&@D;6$4:#="&0C&F&0+2&00&*6;9@):GD9:',,=$ AS:i:-64 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:21 MD:Z:0G0G0G0C3G23T3A97G42 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5344 77 * 0 0 * * 0 0 NAGNNCACCGCTTTGCCCAGGTNTTTCCCCGCGGTCTCCA ")&$#+$*#)*))"%"(+!#%&!+&$'#!%&*$#($'*&' YT:Z:UP jpayne@0: r5344 141 * 0 0 * * 0 0 GTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGNCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGNCAAGTCCACGTATGACCCGACC $(*+*$(%((!**"#"*$+'(&!!#!!#!'#((%++$'$!"+&+&#&&$&)%!+"%!()%!'*&*%++$!)')+'&('("!$'(%""&$$()&"#((%%&()&$!*"'!''*) YT:Z:UP jpayne@0: r5345 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16110 42 150M = 16005 -255 CACTGAAATCATNGATGTGAAANANTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCA 5<199<6B@/C4HA72D7*14+0.$E6B;0)#8%D5F*9(3?B,8DC;66B*7B;-B>/+7>#7-=+(-5-$E@GE3!42)?5-):B+D*)'%>5$*=>8"!:;&57G12-'-8F0+*,)C-%C9*G.=6/0$*>6,-1G%,@=5F=$$C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C9C1G125 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5345 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16005 42 105M = 16110 255 GCTAATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCNCCACAGACCAGCTGCNGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATA !!()'*&#*+('(&")##$"'+$"#*"#"%)#''"%'$"*$!&!)'+"(##%)*!$'$!*(%#!"%'*$*'&+($$$")!'()"%('+#*#&*$(+%+')&&%%' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1G60A15A24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5346 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47279 42 41M = 47014 -306 TCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACAGTANGT &)$$!**&#+**#!&%%"(%")(%$#)!'"#!''+%%#")) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35C0G1T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47014 42 75M = 47279 306 TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTNAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCNCAGTAAATA -A414-<:05<*505?5%-02&!+='H%G9!32?/4%/%!)">;)0$5'$<&6=0*H-75>D/A9"G/"BBBC"# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T35T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5347 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22289 42 52M = 22009 -332 ATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACT E0@.4CCE?DH/7/B;E'&7'..2209GB--079&=##7':;3H7@F22>,'C7' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5349 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38212 40 42M = 38343 180 NTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCC )+&'&!&)(*''''#$'#'&%('"$(#"#)'*'(&"$&!#)) AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T31A1C0C1C0G1T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5350 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37721 42 74M = 37587 -208 CGCTAACTTTGAGAANTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCA G335+H7740:;01-/2G/#H*(7GH6"6C;F"$)=/:!?3!B.%@2G9><89/=91H)>"$'F:C5D:?H/81 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5350 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37587 42 44M = 37721 208 CTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGT 9%=!C4**"FH<)<0-F)#4=3+#:2#:"*H"/-+!.4;92?.*'+<3?H0H($<;3+)>DGB2D+9EB:B<3G#;04-060B&:'6-5%0G-!;#: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T18 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5352 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 767 42 54M2I117M = 1039 327 TCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGANAGAATCCGCATACCAGGTAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGTCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACANCCGTGAGGTGAATGTGGTGAA 239'963G>F:'"@H*-<8(C.(0!@87='#')GE5/C"H;9A85,1(EG>9<+8=3*).$@#8.%7">)EA$1D1)6)#;6*2C/:/>*7!%*1CC7:BD@)"/GAA6,6D7$<4D>7;:=,CD%+;':'/;H"@+/H'4#05"$E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24A7C7T1G12 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r5353 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19908 42 55M = 20104 256 AATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGNTGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTC G3>*-"9=$*%F;7>1&)""H>9GC@-1".8-?8(>'/#+DH#-(82#G1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5354 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41454 42 63M = 41566 155 ATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGC 9@,'A2!0A51E-=7%./>68('--D*#+1?*H:6$>42>1A!19*%-+&!,75"@@%@(578 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5354 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41566 42 43M = 41454 -155 TGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAGGCNACAACCATTC 8*6759(?D3,450$,:+'494H5)*(BB5"48C*2)7%0@<' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A2A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5355 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45127 42 121M = 45035 -213 ATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAACTCCCCTTATTGGGGGTANGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCNCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCAT ;2$'/*-%-$)B>5.*6)&4.@.;.$E)9+6&$8>D4**&%!<6:8'-836H%AA=(7C:"92D47CE?56,EGH9#8;3C).=2)!"<-G.?+E.@3!DG6#.7:"H.B%'+00= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5356 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45983 42 56M = 46173 288 GATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCAACGTCTGACTGTCATGGGCTGTTAATC *D*8"$HAE('3=00?68&..-?2*"";4B:G5270*?9>,8C52"&),4EF$=;: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T6C19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5356 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46173 42 98M = 45983 -288 AAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGCCAGT EH#&;C*=-.75#B#.4%*<$:8<90*@;:=<188&3"$8D)B;,96/!95:&<4'"G<=*/4)'1++5*G@@B*H.E75*#:,3*02&41+1-$;/; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64G28T4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1317 42 167M = 1207 -277 GGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGTTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGNT )+$%$&'##&**)#)+('!"&*##!$+#$)$&)#)$)+$++!#!&&#)*$%#)*!$**##%"%"$())%+#)'(+)"%''((&"""))"$'!(+"('(#&%(#&**&!$%)$&*"!"*!+$+$#(&'!(($*!+'$"#'*!*&'!!(&!&+&&#%#''$"(!($+(* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C135T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5357 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1207 42 110M = 1317 277 ACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAA >6"*-*+2.01,3"$=0AF5D33B+/!?1;:#!D61>/$"6/@"$.<,4"(H&HDDA&/E91;D$6+31A1A50H)B4."D4"!?9! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5358 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4886 42 186M = 4821 -251 TGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTNATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAN -*%!);3G@B#7+A38,(5.*#7B'1HGB(DC"5@DCB=,0#<+.=*+G%%<(-2HD;*712E'",5G!$E>-G::@87!:.%-/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:91G12C80G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5358 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4821 42 65M = 4886 251 CGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTA +HF=2,8%.8&06A#9@>94)?(,-<945,E#/B#H)FA,(,AH.+AD8*),631'1EF#&=-C5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5359 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23248 42 86M = 23398 219 CTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGT $8@-BBG>+"412F=#+@1EH1@4"7;"+,5G+!CD?:7H!, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5359 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23398 42 69M = 23248 -219 TACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCAN 6208+,'7(@>GF@H:.D/-1#-:=:"?!3298&E;5:(&95,5DA&:/2F2" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5360 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28370 42 51M = 28436 252 TGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTNTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTAT :?==&;*E>+>0G2-;2!.7H*F:296+$>+""!B=E9#D/*C98&5*!5* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T24 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5360 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28436 42 186M = 28370 -252 ATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTNTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGTAGACCCCTCCTTATTGCTTTAANTTTGCTCATGTAATTTATGANNGTCTTCTGCTTGATTCCTTTNGCGGC !+&**%$#*"+("+*"$''"%"'+!#$"'!%"#(!'"*##&')!!"*!$'*(+'#"#*(%&*#$**"**!(+!%+%'+!($)%+"*#*#"*%'!+*%(*)(#("!+&(#$)&)&+$&"""%+$$#&%)("&"#"%')&)($+&)*#)($'#$'%"+&+%%++#!+&(!&'+&*$"+')%'!*"'"' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:80C33C22T20G0T18C1G0C0T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5361 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 495 42 174M = 324 -345 CCAGAGACTCCGCTGAAGTNGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGN ,H3;17%?5<1F0+4GA@=!820)F>1"88G%?BG?69CB0F"GE<6!4'3!+!&<>06?/;CF&(4?"=#H3#2&/+EF4F"9.--2G:F(2HF*C$705D565&1>H#+C.*9E!1!#@<)*=)'&,4E$'++1=)+'<&!),E'$&F.-B6EH8;"%;0"B6+(@#A3AG& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G153A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5361 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 324 42 136M = 495 345 CCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCNGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGNCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTAC )219*37;%/!;E;>/8.!G2EH!<>$&!%1:(A:1<7200CCB(A8E0!GG95.)18'?F0!((>5503$7?G6);B#D6/B18;B$E&CA(+EG1=1/?"$$B36CH3@(*!G1G,5346=FD88A*A#<3C.="'F":<0D7;6;!>*1-1;?E>2%19;;!H/6@,;AG&A7#F,0.,C-);?+#:2C"G%$;8&-=@@.6)8/9A<-?6,)B?#-;7@31'3G.B59!.;52,0.F?1,!5(/*3E(4('&+G#!BB9#*@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:91C8A32C32 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5363 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23021 42 169M = 22963 -227 CTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAANATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTAC 2%/D/&:3B-E4&3?97B)!H$FA'52><(C!#2C$G*G:#-G.6$2">-15<6%@(,H;?G@'2;G?3D%H?>:.0)E>G,=>H87:2,##(-3$/;GAB:E,4#G->H67*0""'/&+)G.C8)$!6.9788&$#6$67C3-1D;-H>)8<0-4(76A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A107 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5363 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22963 42 41M1D16M = 23021 227 CCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTAT E&=?4E5*!>5;(4#%7#:F4@>76(2%$F%D$3*?@#GDDE9.,G?)"5<&'#!%C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:41^C16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5364 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33379 42 136M = 33515 211 CGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTAT 80E'1/"C?H0=%*,&$$D4G+2:D+>$3:/CG'?'3%5?H(>0!H<9=33:7')4+70:0=8636(/=7:8)!E/=)&:/DC/G<'<7)C>7FE>,5-!,61)%H48:A$1#=+!;9,&:?;3!? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41560 42 99M = 41410 -249 AGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACNGCATATTCTGCATTAAATC !&!+'$&*)(#)&'()!+)#%!(*+')*#%')+!'#&*!%)$!'#!+!!"$"%)!')%!+*$&%**(&!$'(!%($''%$)*$(&'$"!#$#(++"*"% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:79T17A0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41410 42 129M = 41560 249 CTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCTAAGCCTGGAAT 3?2G:2F-DACC"*>4+D?C5F*-;><47F6"07H(2?A8FF%$B(F=#=*G76%85);&@A7C"E:1E7C37);.:/',*"@)B8D&;C!E-D,B>9>*+D'9(A!029174+@>BD57/EH(2'0$9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117A11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5366 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6014 42 60M = 6182 242 NNGGCTGCCAGCGACGAGANGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATC )""$+()'"$'&!!'&*!$"*"++##$+)+)#'(%)'$#'(%*%#%"#'$$+!%&!#'*' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0A17C40 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5366 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6182 42 41M1I33M = 6014 -242 ATTTAANTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTNNN F-=(<870-+!4+1)7457A7C8>%5G65&FBF3##19$+:,$3$(9.(@2&34B>7/<-!4?=38!C=&$A#'( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:6G64A0T0C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5367 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22056 40 52M = 22320 305 TGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATT H66#=))?$9'8>E'CFHD#662',<$D5($DAAC:2@B",-A(';.ED=%< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22320 40 41M = 22056 -305 GGATACGGAAGCAGAAAAACTNTTCCGNANNCGNGCGTNAG ("((+')*%+(+(#+)*%&*"+*!+$+$(#(&'"&#'#&"" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:21G5G1T0C2G1A1G0C0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5368 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20914 42 33M4D208M = 20857 -302 CACCGCTTTTGTACTNGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCNCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGNCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTC @5'E9<7+*F'E"C#&!.7C2.3EH%7+;@+D$2<;B-?C5A5;D;-,B0(533D:H*<4E!'",-<)-2:@5B%:C7+/(8$H):(3>&956E;"?896#*>6G"768G"H;35H<,!&9*"#<8@C(;)4@E!;:G,8@AH'!3?(F1@<%E%@5:5.G/'@ AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:15G17^TATC42G83G32T48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5368 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20857 42 57M = 20914 302 CGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACATTACCCAGATTGCGAA 1$%'"=>B"F3#&2&B*=CHBB7D9):3.G((6,FD+4/3H:8'!8DAFF%F->.?! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A15 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5369 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4095 24 71M = 4376 327 NNTTTGATGTNTGGTNACTNGACNTTNNNAAGCGCGNTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGA "!%)!%''(##$"&%$#*!##()((("#%+$"&%!)$%"+#&)&$%$))!+!'##!&*%$!#&$*(&)(## AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0C0G2C1C0C1C0G4G2G0T0T2C2C0A0A7C34 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4376 24 46M = 4095 -327 CATTNGAATCCGGGCTNCGACAATCAACAGAGGAGGAGAATAGTGA ;*?82D<*"C+$>;&?>*A%F9971FG18#)%8$3+8)@C$:5;1* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T11G23G5 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5370 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27802 42 57M = 27859 270 AATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTNCCACTCCCTGCCTCTGTTATCACGAT (++!)#$""+)%(*#$(++*%*%%)'(+%(!'"%%)**)*'()'#"))"(!(%!$'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C17C8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5370 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27859 42 213M = 27802 -270 ACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTNGTGAAAGGTAGGCGGNTCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTA )#,7)F%D.4AD(01=EB*8=>+C'C0>-."3>?.*66978F(*CE/1=D6A:E&19H!=H71#*%)B++&.1$'183@+8"5"2AHF-5'!HH4=+4A/<6E@D78GH;4@@5>CA3(H3GB<"G#*C?6D@G4>D#BG33(9);&8=H9A%==BG%%C?)H'6+*50'?3"#()2=BE51%&22:CB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:99C15A97 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16109 42 370M = 16479 434 ANNCNNAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACNGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGNGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGANCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAANAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGCGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGATCAGTCAGTGCCGGACNGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTG %$!!'&$*%$'*++#$)(&"%+%'!&(%)'&)*'!+$")#$%(&*+$$$)++')"%&*(+$%!'()*&%+($!++"!#$&('$%*!$+)&&*+"+*&&)!&)&(+!'(!+%+")!'"$"#$&#&$)+&&&+*'$%"&)&$($%++'$#!)%'!!*$"%)##&"$#'"$+($+)$%"*'+!#+)#"%)*$+*#%!+!!!%$'&!*#+$$*)*'#+&)**$(#)%!&#"#(*$))&%#!)))+#'(($"*&!+**#'($&%'!+!$+"'+%$&$+*"("&$$!&+*"*&%$!$(*!""&&*('*#%+##&)!$$'"%'*&*&"%$)!('&#++"*&*%#&!%!(!#"+$&#+$("&&"!!$+!)*!+$!%$+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1C0A1T0G39T23A23G111C86G29C15G31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16479 42 64M = 16109 -434 TNATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATG ):..40-3;C/&0A?+)-@;&GD<*B8<6>35#,9+@%2+:"A!9:E(:0!@"= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A62 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5372 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13163 42 127M = 13293 299 AAGGCGCACNTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAANCTGAAAACGTACAGCNTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAG *))(!&)*)$%*!"(+&&&#%#*'++()!"''$$&&*'$'"#$#&%$++"!$)&%)%#!*$+&#)+%*")(*+!*%$))&#++!&(&%$!%%"&*"&+$)&##()*(*)$%#''!)*%'(%'!$)*+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T2G1T46C15G54 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5372 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13293 42 169M = 13163 -299 ACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGCTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCACAGTTTGANCNGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAATNACNTANNGAN $#*#+$$#%+'$$)%#'$!+(&*(##%)&+)('!$!!*!'!$$$+!'"&)!&+"&$)$!)&'(#)**&*!++&"(&)(&"#+%"))%%"&*!#!%)$'+!$()'+#%$$$!!&!!!'++&$%!#*&##"'!"%"!"&%+"$$)&&""+*)&*)%!%+%#)(#)'!!$%! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:73G39G7A1A33A0C2T0G1A0T2A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20825 42 78M = 20697 -206 CAGAAAAGCCCACTGNACAGTCCGGNANTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGTACAAACAATACG >0:@+&CF,.4(HH$.F,.6GF<<7"@!$9!=3013B5=E<4)46.%'"EEC/78#5<=:+#:<+*5C6;<202-'/" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15G9C1C37A11C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20697 42 56M = 20825 206 GNANTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATTGTGCAGCTCAGCAG *&""+*'(+"!+&&!!"$("*()"'$&)**+&$+(!'('")(!!#*'*%&"##$)* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C0T0G37A14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5374 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9229 42 44M = 9433 276 GGNAGCANGNGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGT *&*(#)(")'*)+*+%+)$"'"#!**#&""'('!(!%+%"*#(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C4G1C34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5374 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9433 42 72M = 9229 -276 CGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGG ,C;(@=#&<.>F<217;(?#"#&<@A86#$4D64.:??+#>-(.@$-%*F-())/,C/D894!96,D!2E/2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5375 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47670 40 76M = 47842 229 AAACNTACAGAAAGATTTNAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGNGCATGGAGCGACAAAATNAATAA "%'&!++*"+!+++%!##*)('("$)%"+)*+")+!((&*'(#+*")'*!"!!!)("%&+'(#''##&*($&%%"# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C0T0T1A13G33C17G5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47842 40 57M = 47670 -229 ATGAATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGTAGNATTGGT <&!CH(,AC3H,(6*%A)H,-)*"4F,6A-HC*(D8.D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YT:Z:UP jpayne@0: r5376 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13625 0 * = 13625 0 NNNCGGGGNGNGCANNNCNGAGGNNGCANTNANNGCNCTNAGNNCGCNAANNTNCTAGATCNNNNNGNGGCNNNTNNCCNNTNNANCCGGNNNNGCGNAANTCT ""#"!"!$$"!##!"!!$"#$""#"##""$#$""##!$$$$#$"$"#!$#"$$!$"""$##!$!!!$##$$""!##!$"$!!#$!!#!$#$"#""#$$"$"#"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5377 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43680 42 246M = 43504 -422 GTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCANGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAA 1#+><9'A80'6*%%+#(F+*3,!(.CA,52G=/$%=08%%?GH+$6@AD"G!78C60B&*#->5#G!&1!=)@D#*(8$&&A1GE28>4AA@*820)A;A%<<2+>7HC:G3<"<2*>#H1:8@=*5CF'$30&;4:6BA">CF(7B.29,@?%;(@.4#3G/88((?"*=&')(*+8$.34/,H'??'F2B"0&,G@.--G)8!**;/9%E'!-+CFB>,?5.D,%9;&1+H*8$3&1C3*4:04:=2$;-(+*)G031&1A14:B,.,'7#,H'!":'D/;@<)3B!$D30A?"?50A0+$"=>0F'(*+725"0A<:-!=7B09='+*&@'#<,%9,7H-4/$#3H9AAH+B+5:#':D+B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A124G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5378 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21120 42 75M = 20962 -233 TTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAATANNNTCCGTNG %&#$+"'"!")**'&*%#&!')&*$+'#!#+'*%$)!)(*"&+"!%(""'""+(!&$*%+*))#)$!$&%$'()* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:63A1A0A0T5T1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5378 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20962 42 158M = 21120 233 TGACGCACTGAATACGNTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGNGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCNCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATT .>%3)&7DG)5:$D&G9)&?B@43929%%+3=-F5A1A+",32:2:&@+@#B=76*'.">7!7:$.2B0;/&!!(+:,;>"3.65G2'5;:0("%!G;2+/%6F32@5B;FG2C;@/,-<-%#3)(D1,2/$@BF/DD=/8%F<.B+;A$B>"< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5379 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34320 42 106M = 34226 -200 TGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCGTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGT '=C8=!8;!B?3D24H-)7A/).-E"7H?2)6C)3/%:,=+84G=-(14,/)/1:D5+(>#D:,:5EF2HAH<*;3<",C'3&*2$;FE),&G%;#$:+H8+@:D> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50A28C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5380 77 * 0 0 * * 0 0 NAGGCATTCGCGTCTGAATATNCTTTGGTTCCCATACCGTAT *H=.AEF==#3(07=B.1B!"=.9F,"'G8>#?E#2'(!"&/ YT:Z:UP jpayne@0: r5380 141 * 0 0 * * 0 0 NGTANAGANTNTAATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAAC "*(*#$&%!%$&!)+(#)+*&!")#&"$"$(+!!''(!"()( YT:Z:UP jpayne@0: r5381 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1087 42 297M = 1384 356 TTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCANCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGNCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTNTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGC 2!/$/,C<)$-,@.(:7%?0':G347(.@"7A=A%*/0++;@';A-)&)DC!E3#@CC9D>$'93E+@33H<98F*<3"*6""AF-"6!B1.:A8G,/'?+/5122?"+<;DG71#C#!H?!1?&+6G=7:0&;=?$@3:"A%>%='2BF*D&E;"!H;#9&2F,*/3;)#?@.G,5/DB8+!7H4%C,6!E1EF/2'.*$%&2-681,F%@'1F(>/$-H)4:*=*?%!.!4*(21.)4BG;&6H9!2B.*-$-!>H.60=-)24;+$08B?&*;!'3C=1@G'6-(3-F11D,=/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43C90T35T126 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5381 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1384 42 59M = 1087 -356 GTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCANTGCNNG !#''*!$#%#%("&*&+'')!)"$'&$"'$&'%&#+("#)'*%%)+#+!$+%+*)'$") AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52T3G0G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5382 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9770 42 149M = 9632 -287 GTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGC &!B<(>!"1;E@.3+37.;:$?!D?6EC%D=8%>;7:4&?2'#B8,';+B;($-&@3H5/+,9;E(G7"GF#&H?04A:AE<8=>C?*C:07';;4@$D:%$&@*&1(7?<-/EBD>H8000'C&$8CEH/-=*=F326>AE476.<>, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:149 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5382 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9632 42 97M = 9770 287 TCCGGTTNTATCCTGTAATGGTGAGNTTGCTGCGGNTGCAGAAATTANCGTCACCGCCAGATAATCAGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAA 5-9+4&<<8FC%2(E!H37B>0)@@-F/@>A.(9')D"%%286"@?8E"5(F!!*8!F?DA#D2*#C+%+>;1$'F,-@H'B*3F0"C@8G;4AB)B AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:7G5G11T9T11C12T5C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5383 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30490 42 75M2D42M = 30715 274 TCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGANGTCT G"@9F>&E34$2.?13G-,98"5<10*:9*%%CC$#<9:0"C@.@-AE+$'=,+/79"1*7&?.+GCG$F>)4A0H,(,49/%H&46(2=1(! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T39A0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5384 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23021 42 85M = 23126 170 CTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACC <$B&1C23A*?H5$+*@60"F;+E7@0!2'BH+C4*!BH*"2;,%*F7027*44>8EG89F,?8%'$!$0/3$/<>:!@15B!H/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5384 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23126 42 65M = 23021 -170 CTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACC H9A"*.::2(:E<-?'>619@?B%/-5+.3:.AG57+<-E/;0()3BFF"5%A8.@G$<4()D7% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5385 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46151 42 56M = 45988 -219 TGCGCTCGATGCAAAATACACGAACGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATG #H<6=/8<50);#1;+C7>&)12%'D#-D7E?1!!"$4">(>3=;#D56=G14!(+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45988 42 72M = 46151 219 NCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGNTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTA *+#&'*&%)%*&**!&%')!$+$#+#*!"$*(*#*"%("&%+!%##(*")#)(#&$(#))$&*'$*!"((+% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T41C29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5386 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32145 42 230M = 32375 333 CGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGNTCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATNTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGNTACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACNTCCGTTTGGGAT $E'&7)?&'HH=>0%BGB.!'4;84"D>%"!9HG3@#>=#>&BB2)2<&(<%7+?;G2*;;/@0D&75.FF8$.F<7-3/F:'9G6,+-3+E&GG0)7;D>=DD$"":7;0>&75*F*/8)-460BH=:."G<8'2&=4:!,8AE4!//?CEG&6(8!D:5=&=B926=&//B@'670=E'.(;#)#&)"C'C?."6*";:'(EBF!9B:8$4EF($9.D!8+C/(8B?1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37A49G72A56A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5386 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32375 42 103M = 32145 -333 GCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTC F&5H,;>>106:G35G;1/7($"DBC4B2E:9A:)?#-$HA:9/54("!1'!AG(98'B.C=.%>':52/3($58*5>C=C?@"2?FD2;H',<&=<4:;!>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20862 42 85M4D126M = 20763 -314 CGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAAGACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCNCCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCNCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCAGGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATCCGACANTGGGN &#"&!%"&&)*)'&&)'%+)"&+#'$%!(#'"!!)($*#&%(#+$"+((##!#($#("*+()#+$(#(""')++!)%&!+!#%!$*&*')&#$*(%*%(*(%!("&$%!'$&+&$&(&&('!!*$$!%"!%++)%#%%('%%'**')')*&##)"#+'()"'$($($%$"'$!$#!()+($'$&"%*$#'%)!'"!*''+")&%#&**&)" AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:13 MD:Z:37T47^TATC8A38G31T34G5C2A0C0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20763 42 99M = 20862 314 AGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAA 4!C16DD6$*>)@=<5GF%-)(8=/>AG8CG1:(D**E>-5:&C=%;CC0,H@:D?&8&"6,E27G+A0A4/34!$=2,)3+*!# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r5388 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37052 42 192M = 36869 -375 TATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGAATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTANGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATNGTTNTCAGCTATGCGNCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCNANNCGTCNCTT $''&%))#+%)(&+"&)+"#+#*#(*!"&!)&*%#&$$#(#&+)"%)!''#*#&(#&$$*(!"%!'+#'#%('&#&'"&"$%%#%*#!!"++&(#%*%'%)$'(#+($&#+'&$"&$$$*"&)#%*"%+')#$*%&!"%!"!!$#%("'*$&$%)$"&!'"#+'$+$)$!'%%&!'#+#+%*&%#)"*)''% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:44C41T51T3A11C1G23C1A0A4T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5388 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36869 42 183M = 37052 375 GAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTTTGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTT @$7<8)1,D@+#8#=:9*BD71H(EA1-".$F#2*F$%@9:/$55@&:"+4>E=HB'B?%40!-7.5.(*="/)0//6):9$:C,%56;<4"0<-G#"HA2-.#+,*&$B#$;:/8/$"&0%")H"*A7+,&1*630((43E$!AD1?E:E6)55(+&F6C-$A13@(15",%4:(%$;5-&+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:105A77 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12153 42 89M = 12250 280 TACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACA G&HDG=C:$(0G>(@CG+$8***? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12250 42 183M = 12153 -280 GGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACNGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCANGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGN 2F6!-$!&#EE?B17<8%>;!F">A-:#*@1C'&/*65:'$7@3#+"<)#1/$CEDE;#?36#1@7#F,='%3=>B:@8H48)3(&D/+-E3#;,99.(/G3:@:?C#?HB*8?@867CB:$('6!+.*%&32">%$=4":9F(8;5+3"<,--B::D8!8%@G2:'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43T25C112G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44937 42 100M = 45037 344 ACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTNGTGAAAGCGGGTGGCAGG @+,G'A%=>#-4#A1%!4BH7A:69E472A!*&+664C1C!,0?*&@@$1>:DA/?5D4G)5-'H/B*6E.C%5EE+1;!*,C1*/C6D@%E)#0H#H'D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45037 42 244M = 44937 -344 AGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGNTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAANCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATNAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCT ;E?H/1:&&0?>20>/-H@C30<=(9$25&'A<#D).&D-F86'$%CC?D4:/8H'?9<=5+D.A7.5;9=1FA%=G9:"#2'?))F2,%<@-G($)A+H5/2G#2G9=.GEA);H:H-%C584$"?C+?EGHF);%G8,26.1/6;(%H!3/6(576:,59,2,,F!$CB4B'A46$593A0$1G*&;-#G=365D7"*D+.><9"DG4<>=1+;1+7@,7##*+#F7185'@*,6=G@:F)C,35;'7!9F03@2H>/'F16HH=&*C"(F&2=412H!:8A!8!07H7=:&?"336/D"-E2F9GH'4>:66F07D)5F0G1""%@54&3D9%'7H#$.B7;(7.!'&4<&2*=&-3=>'AFE?-8-D:!:"E4F!H$HHA<<.@(5=!A<$9E95*6G*#@":@"H3()(3A2>D&B6-@@7)*&G!;$,ED8 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58G27A73A49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47307 42 51M = 47444 226 TCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAG #;&BF('$9+@:H3(?>$+E:&6%5$+'G.:HA+3''-G%)=#3<.(5;.< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5392 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47444 42 89M = 47307 -226 CTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTNGTCTGACCTCCTTG EF/A)EFF5B@@#15:'?07:,9(@1EF:CBF2=@/)%=,%/64)97&EE4+%>?B!5/:(BB$B9%<,0.8"D:;<@="F6+BF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5738 42 141M = 5615 -264 GGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGNTTGAGTGCGAAAGCGCCTGCNATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGC 9&H:*G6?(1%4,9>6A>)%HD:))%3*B?@.8'02C"!67=DD12&4";&#ABD?'++/!,.$:?E4C-,*':=43%#(8;9=HH!*4F7211,@#>>!3-829;D0'1C&;2C$=AB;087F!'.6D@<#2?7)FE0%& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:62G26A20A30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5393 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5615 42 120M = 5738 264 CAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTG (A1F>6#"H@6)5%@766001=9=(<$0HH/.9'56(3G.##>HG#9'FF"&9GE;-9/!4,AF4E4*-),C;FC<+,H#2E/$:->?/B5/&:E47'4-6$9-#%&(*8>+C40!#0@7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5394 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18995 42 193M = 18808 -380 TTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCGGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGNGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTT DB(C+!@@>1!%0"3:%:1F9>4?*)14@&;,.1?B4B0CBB368+1/;$F?'%8?$/A5""66*)9'(8A"-B:0H=%7!EEF1@.:4"#*32:='0;<422#,+>)0B;!8:8C"!*GFCD AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C84G79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5394 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18808 42 187M = 18995 380 ACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGTCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTC B*;,3G8&!#"/5$#4!&('$5;EA6&A87CB-%0=)83/B/E'6$/7,7*9F59C0AE>@C8'?!'.(B)-1>F&C9*6EBE2E@:B49,779"8@,49:A%A25H5"-.39-445*)A:3>DA11;=>8F$=<9>8HGD>&4(;3)@-<"!9"D-2=/H2)HA*;0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C149 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5395 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45882 42 70M4D83M = 45759 -280 TAGTTATNGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCTAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGNCAGATTGATGTNTGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATN #'!&#%&(%"#+)$)'"*$))*!&*()"!'##&(&&&*&&*(&+)"#$$!#*(#!!%*$&!*+#(%*!!$$)#'#+'+(*")"#'%&#*$!")%('()+(!'(#%&+"+(%++)%!"*!+()"!)"&*))$'!$%!+''*)"%)'"$&'+$"& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:10 MD:Z:1G5G34A25T1^AGAG10A71C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5395 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45759 42 125M = 45882 280 AAGTCAGGACGCTGTGGCATNGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCNCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTG )+)'"!&+(+!+"$*%'$&#%&!(%*(+)')#%&"&)$'!%(%!$+'"#)(%+%""&($"$#&+"#%$#""(''#+)#+*"%%!+#&%&*&'"#%!'"$"&)#$%""*!"(*!#$%*+!)%#)$" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T22G81 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5396 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13582 42 238M = 13525 -295 CAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGNCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTNAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGNGG %%$)$$"!&(*+#*(+!%$+(&(*#$%+(+)!!))'*&&'"$"$"&'+%!&*"((%%)#+"(!("'!!*)'%&$"+)(!#)($%$$+#!$%!+('*!'%+%&)()''#(+*+%'*&*&'!$))$$*++'$%+#))*#((!)()(%+%'$+$#%$($("%+&)+!++!$+$(*+(+*&%$&%"%)"%'"+)&'+&"&&$"+)$*(%()#%$('*!'$&+&%!$!*"(*++%!*$"+!(& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61G103A69A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5396 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13525 42 57M = 13582 295 GGNGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGG &5!*<&F-C2)@39)&A;&A5100A5&,>08C(3D1534@@<1C$5"#3)1)A)/$F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5397 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42041 42 88M = 42255 286 AAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATNACCGACATAATCTGC D98/&6H,-F@0>00G!B>#9C>%2);C#"$#!"/EE9A'E)):?<;B%3!G"FBDH@DA#F:04(.",,A)82'/1!8D))HB@"A( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72C15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5397 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42255 42 72M = 42041 -286 GCGAGGAAAACANGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGANCAANAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCG )>+=1G'E;C:?"3#21D.G$?&2$AG&@@)110#5C$:G0DF,6G$*8%GHFG2#1:A3BF'3H;9,F+'65.G:+&F=>)E=68'F2D58<7*,"/H70C4G=+@5=*,>C=,-8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A55A80G2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5399 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 798 42 23M2I56M = 615 -262 GCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCT 6)5H=<6+*GH%EB&$'=556C:$&%'C?GC.>G'4-3/(**+4=&!.5.0#)-!AA%&0"(@;"!#>3'E('6E!5'E09 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:79 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27297 42 62M = 27519 288 GTATNAATTTTTCATAANTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTAATAACAGACATTCACTACAGTT ((&#"$)#$&**'&$"*!+!"&+$&)*")()$*#'&$%")++*''%!)#($)+'+*"((!*% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3G0C0C11G21C22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5400 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27519 42 66M = 27297 -288 GTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAGGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTG 9.8=@G>C13"';.0&G;,A7''0!%H8/">.67B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5401 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27099 42 41M = 27173 240 GGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCC 8G5*:6,E:7)')D8)8C4$6,5:F4";3/0H1$?8.FC(- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27173 42 166M = 27099 -240 GTGCACTGTTTATACNAACGATATAGTCTATTAATGCATAGATAGTATCGCCGAANGATTAGCTCTTCANGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAACCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCAT &)(&((%++*(#)#"(!'+!('&*)"*!)*#"$&#*(%*#!"'*&#&(%'""#!$&"))()'#*'*$%&"$)!+&%%)"+!#*&#'%*'+))#!+&$*%(%+*($+'(%%$'#("&&+!"+"$#*(!"#$'%+!)()(*)'*!!*#!&)*!#""%&((&%+%)($$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15C24T14C13G31G64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5402 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46737 42 198M = 46648 -287 GTAGCATTTNTTTCATGGTGTTATTCCCGACGCTTTTTGANGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTAATAATCTATGTCAGGTGCGNTGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCG (%"=4,D5/0>(?EAEC/%C,1E8$$/6*)),<%0;=E9FC(!."'"<>;$2;)/4#>A>G!$3+"-./)*856;9F:.11'+6CD2#043>(4+*)@1/*.*<)8EB$&+F)(E4%0<753H8##4'3%E9%AA AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9T20T9A75T4G13A62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5402 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46648 42 89M = 46737 287 TTCCNTTGGTGCTACTGCTGNCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGAACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGA D?#7)-'H:G)"'@'"++&0+B@%(?D,G!?%!<(D>D"D3))>?%/4D1C*8>(2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T15C32C35 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5403 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32328 42 96M = 32244 -180 ACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGTTGCGACTGCCACGGCCCCTTGATTTCTCTGCCTTCGCNAGTTTTGAATGG &&"%#%++*(*"*)+%#)!$#')'&!(+'&!"$"!$%*''(!&(%"&!%"*&&$%("%$$)*")%%!%&+$'*)(*(+(#%+!$&'$))%$&+'*( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45A18G18G12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5403 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32244 42 84M = 32328 180 CTNACGTTGTGNAGTGTATGCAGTATTTTNGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGACATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAG "#$*%)%(&%&$%(+$#%'(*()''"!%)!+&""+)#)%'*$$$&&"**(!*"*(&&+!$*%!'&)+&""!#*"#'$"$&((*" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G5C2C17C25T28 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5404 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46975 40 44M = 47073 260 AGCGCGTACACGTATTGCNNTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACA F*782123,5*"HB9-'A)1EF2D5)D4*A"7&"5F:('4!;11 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A0T24 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r5404 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47073 40 140M6D16M = 46975 -260 ATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAGGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGANATTTGTAACCCATCGGAAAACNCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATA )-E44H($9($B-*G#')2H,#'-6$G.A$EE!.@;:7,E68@)(0F.@E70,-GB=D?8#'(",CCF(:A9-.190?B4G0F@@:*0%":>=?>&3B)$94:FG8A>778>"B*8F%69E"=;9?8)<##D&(D?G):$F::3H5.> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A28G25C39 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5406 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12919 42 68M = 13051 229 GCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGNTGATAAACAACGACGGCACGAAC G'53A==/H.<+7H/(7)B4C=)+7)$549'9#E4.#2B)7<&*%8@3AGEA6($')-)HC6>/D;/, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40T3G4T18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5407 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7811 42 86M = 7589 -308 TCCGGANTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTNACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGNCG %*&(&#*(#("#&&'))+&++"*)*$)*"++%+(!%&+&*#)"&&!%''!"**(#$'+))*$!&!%&""%!&"'!#$$+'!+'#"% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C36G39C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5407 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7589 42 80M = 7811 308 GGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATA "3;/(:61+4:!+7#D8E3?16.,*2-9C2E>:1379><;D@#9"(2A>8E-BA!/7:5F/,&?8:"7GA9?'C#*<,!'<*E04!11&'988-4/4(%;403.<'EHE>:"1("8'3!ECF=! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5409 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25118 42 113M = 24952 -279 TCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGT 7-;D:44E+@-628.*<77E(E%G0633:)92"176&(;;:A&398F+78'(.B.;A:1;0#2-/.!D:%=77;GB@3A*@)6D#1,DD,3&!HDGD108G-7@H@0(8EDC% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:113 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5410 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16441 42 41M = 16645 279 CCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAN +,13>1H)8.5"=H7B9;97:C#8!14?F350!9%!C(87= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5410 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16645 42 75M = 16441 -279 GATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGAC /"E1A9=F?E&5#!6>)61-7B7$*$('.+5#5/3<)>#>(G= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C60T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5411 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44373 42 101M = 44474 421 CTGTGACGATGCTAATCCCAAANCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACANAGAAGAGTCA <6,>:4)B5FH)B0<#.("49:=>E2C.9AG5;C>//9HFH*.;&,/@/;CAE%>;(@C9)445!7/).(/3"'.E4@95!F.86#,(,(:!8%<;@#)6@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C67A10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44474 42 320M = 44373 -421 ATCGCAGCCAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACACAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCNAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACA *4:0$@C9<::C9B16F6%C2CC4/B+++<0<&;=<7C!6(E=>2(8F=1&;'%/(6C(55B=0327%:@H+D:G)F7%'(;CDB/A&%48=$1@=="F5$'$"#.-2.A<,!BEGGC*=??G,-;6$D.*5+'#1@"A<2,<&(&,(;+.'?,-E!-E>%95#8E*>@5-->#+5("#8*C:<8H;4,@$F&59)-%3/46?*:?@':D1*25-D8?G?654*-@!EE3;65=3B%4(.'"4B74.BF&5;+7F7BE;'?/1+:$;3@9='2;<:AH0>;+<2/*20?:/E,>*FH@-+"=>55#$'=-66$)$8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A103T128A79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5412 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21721 42 69M = 21933 287 GNGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGT ($2B:><-'7A&%:,>G$/.:*9.E7;-2H!+=6*3E>.?,!=9>*5&'D1/5,)!B+;:FHE?.'19( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5412 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21933 42 75M = 21721 -287 TCAAAAACATTGCNTTTAACTATATTGTGAGGGTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAATAACCACGGACCAT C53,H37D0,G(@*E*C./")F;+F#F./&B4("24@2/+*8,H(HA*6?-FA6A&*+/@;#G9-D8),G?.".- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A18C28C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5413 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9196 42 56M = 8942 -310 GCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGG C,0(%AAB(?1C40'2-4@/42@#--'GE/)'E>!?:F%.7)F5027/%=*(>75B+F&&1%5'AD'+/#>;!!?5#>3DH197-BHD:;,BD8>+>ED!G(.=->>4D*E&4D35)8@H,%>,-*5EF&F999)7,-DG:CF52/>/<<7;C$38":/2!A')!E7*D-H9?3FC2--=,%A,&-+,1?B%:D.E;,=16!:/;1F=):/*+DF@20?)*(8B1D5FG.,DG@50F@BE)HB'40$,0GAF=2C7((%A=!0#'?+A57*2*!*G5B&+H9-:B=7G4:':).7*2;@7#*.A(5)3:H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r5417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11855 42 94M = 11693 -256 GCTGATGNCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGANGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGNGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGAC 1A.(AA#-20,(0#2!(#4-,?F@4$E)G@B#E<0%='%7)5#>E'H$33(7)8=G2(,=7@$?EB>0?2B2$<6*78'5<50:47,=,E/G3G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G27C26T31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5417 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11693 42 124M = 11855 256 GCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATNCCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCA )D):(!$;-*+8?!,0>F<27<698.C+*<6G&;)(00-=5*1/,4$=46?0027/$@2@:0,4H:*8E14)H&"?G4B4B-';C="+78/>9316EAF-H1B3E%?/<@++=A">@3HFF=4% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94A29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31396 42 129M = 31525 275 GTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTNTTCATCCCGCTCNATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGC 82;>;ABB9BHF8+,#>*;:+E+4D-D38.?=-&A/:(E!:;+F);3:A1=5<::/*/?$11)B5%6?2?=@.,HD%@&/E9?@!2->B'/=&8B9"1;+.@*(#=55@"<;F6H-@C26E%%)C#7D2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T12A62 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5418 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31525 42 15M3I131M = 31396 -275 ANTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTAATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAANTCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAAC %0A@:A2:7=9(.DHD83(AA.'6<2@%+49/9EBFC:C>(:A*/5>A)=F>('40&'AB;:/-3';'0$;3A<3+G(@!A?(/#/&"2#BCC.;&=?,33-"/A&E"3'5:94>BB9C:6C$@G+>,7EF,7(*.E#-6HH+(./?&@ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:1T24A27T35A55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5419 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28669 42 58M = 28471 -256 TATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAAT 6;#H.!>6?"7+HDFA-("61:!):D(#-&"A(03'*!%:%=@H%@$*$E"#%5=94/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5419 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28471 42 66M = 28669 256 CCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGGGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAA 84E+&#H0HB%AD-)"&=*>7-24=60&420,:GC.8&(3@D0GB,:5.&C6D36*5H37GE$A?A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5420 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6764 42 111M = 6618 -257 CTTCAAAGCCGTCAAGGANAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGA $7.;)$1E%.4(!65@&:E8B0>,BC,03C?-;(B7*9B:@0&*A=9>)%??5E#@/@9%H<#D/<;$57!%4A@BEA*.E8$G$=(GD<=0()+* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G41A50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6618 42 45M = 6764 257 ANCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCC B*!>7+8+'-.-:B$B9C,$%FD51/./?8>AH2F$2/B<1(%=*1CD@6)E"4@:*!*3+0%;!03&BB40?.'FC?A2;;2)/811<&3BD<;8??8-7;F&G'/DDB=@)AD7@HH.:0=.2(6$4%FH?2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25A17A75T34A12 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33502 42 44M = 33250 -296 AGTGAAGCGTTATTGGTATNCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCC '..G$:/F>+8-:1A;1*(D5;5;%C"+);(A:+5AD?@)#45, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33250 42 116M = 33502 296 GGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATA >195:04+)0)#?8(%97(/3<@8?8;+#)0,F)EB@G1%HFG;/;@%H99'8@"?B%"7?:&&.E0>&5H?$?9%'56$&83=894),DB#B<2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YT:Z:UP jpayne@0: r5423 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16088 0 * = 16088 0 CNNTGGGNGAANNTNCNNNGNCANNGNNANTAGNNNTNGGNAAANANCNTNNTGNNGNNNTNNANNNCCTCATCCNATNANNTNNCNCCGGNGNTNNCNGGTTNGNNGNNNGTNCNTNCAGNCAGGATNGNANNNCGCTGCNNGAGAC #!"!!#""!"$""$""!!!$!!$!!$#!"!$!"$"#"!"$!$$"!!!#!#!$!!!##"!#"##$"#"$$!$!$$!!$"!##!$"#"$!""#$""#$!"!!$#"!!"#$!###!###!""""!"#"#"##"""!"#$##$!#!!#""!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5424 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32315 42 63M = 32569 303 ATCCGNAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCG 5?2(=4)6%B'DG/&6'E1=+A'&<"(+9>>@2#,EF5(9<)+*)F'87$)->(0>A,>A:-7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5424 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32569 42 49M = 32315 -303 CCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGACATTCTGCTTATCAGGTNAGN &#**!%*)'$'&'(*(('!!'*#+$+!((+%#&%!))""+$&)$&#(*# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27C16A0A2G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9932 42 59M = 9739 -252 GCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCNA $=&'-0"+B@3.?>!F!<7@A(9<3*C3H@>5B>5%B4(30A6&!#2AA;4G&-(;A@/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9739 42 193M = 9932 252 NNANCGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCNCGCCCTGATNAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGAT '%#)+&+"!)#!$!&!"%(#"!#)%("()!%*!"%!))(*+$&#%!)+&$"(*%(&*#+!(&)+*$'"+!$'#$)#'+*((*%!**!'+()#")!&+!%&'$!!$++$&**"+$!#(&%(+$)$"&*$!!")!)%"$$'+")&('&&)'$('*+%"$)"))#*"+'#&*'+$$!!(&)"$"$&(*("$$*)(+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0T1A53T9G125 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5426 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17051 42 465M = 17010 -506 CCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAANCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGCATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGNCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGG >3,(A4E8#-9!*>0AAH)%8+3.F+4>/'4DH7.7!+?>=/#DE481E32&)@A?5GCG$;,GG(53%>&'<-;7$9&2G"(A5?=>1%2+@G1A54:$/+#,BGE@A/(*E4%#B@-<."&"&D."'<#56=E(;)')+!3@&:FE'@B?C(C4'+"6$D:E8H.G694/EA.*)$)+D*H6"/+H'8*-"..>"D):C513%1?,!@)56H7;G/CB,21*HC$.6C5&@C9)1B/@;=)!:7!1A8,69)DD#72@@-D@4F"D47 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5427 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44113 42 63M = 44347 314 GGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCN @E028746#&&8E;?4?90.0G9?F4!7'?4.0"1961-9,-2)#61*$5,@E&;+F0C2$DE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5427 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44347 42 80M = 44113 -314 GATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTA *.6,1$&0,4'@:06*A?+B/F3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45077 42 217M = 45032 -262 TCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATNCTCGCGGCAAAGGAACAAGGNATNGGGGCAATGCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGNNANTAN )#"!+!*&%+&$)$&$#*%+#(&!(!"!+&&()$$)"+$)'#*!+$!!&(!"')&%()#)&'&"!+!+&+"'$$)$#%!&"'"(+#!%#!'$+&"*#"*&"(''*+&(+'!&%#&!)&(%'"&()%+&))(')"&++'#(&#)+))$(&+*!!+&!#$!!$'*##!$%!%)&+$'$%)&&+))$"&"%*'$"+$&$!$$!+#%%)!*'&+%!"&)&! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:147T20C2C8C29C0A0G0A2T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5428 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45032 42 45M = 45077 262 GCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATA 1D<@#68);!?&3EFF+;A7F>-A$A*,"(G-4#F+'(;&@DC%F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27221 42 51M = 26997 -275 CGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAAT 2'6*+)&%C<%->>9*=!:.D:5>":,#CFGD5B7AG"2'8=4:1C%"6>3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5429 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26997 42 224M = 27221 275 AATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTAAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTATATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTAT 8?+=:<3'C"'@HB##66)3;B$&)!6B!&E=1#>$=/B8&FC@E=G8G7>1@,+3(?'7?1%C82>/C'-<,&5G:>252(/2EA+<*<5?")G$3)"22-B$:24=0%B?422,7C$G:+A?0%&,/::4H'+,(.>+,+*=-DH%;HGA8%04%F:DG0B:;'4.A:"23#=21!'DC-@(7C:$+$-E6BH4E92B@ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91G93T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5430 77 * 0 0 * * 0 0 TACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCNACACTGACGGCGCTGGCAGGG (641&7'/8F$199,?-,*FA,2/1)C$366#)<)176!0H!6"/=<&- YT:Z:UP jpayne@0: r5430 141 * 0 0 * * 0 0 ATGGCCACGGGATCGGCGCACCTGCCGGAAAGGCCGAATTCTCACCGGCCCCAAGGTATTCAAGAACATCTGCANCGGAANTTTTTGCCAGAATATCCCTGCCAACCTGAGTCAGTTCAGTCAGGCTGGCGGCATCATTTTCCGCAAAAT 1%GG?!$<+E41F?95?),="G:,>?4-F<#.G6C"2!A:H2:#BF%D)!*<+2<=-+H3@.H#,7!#F@2!-/48))C3?%+/.'3;?E/4BF$=HC#%-))1@/H&$E6G",$,<'#&0"B*D-#;D4D1;=*,D;#,50/25(4')' YT:Z:UP jpayne@0: r5431 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17925 24 59M = 17708 -276 CAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCNCATC 5%A*'>G9,;E1%(""6A)AE/B3;5B*H@8(+#(FE>=C:-;G6?67-89B0,E).,# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G53C4 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5431 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17708 24 12M6D54M = 17925 276 NTGCCGTTTATGCGGTACAGNTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGG &'07/,+H/=1.4,1+%8$>C*E!D> AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:0T11^ACCCGA8T45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5432 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33233 42 48M = 33233 0 TGTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCCCCAATA &!?7-<2)C'7%8#3D*D/8+G,@/1,7:0+@.($)!2-1?'2>C82= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T39G6 YT:Z:UP jpayne@0: r5432 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33233 0 * = 33233 0 NGANNANGNNGNCCGNNTATTANGCNNGCGNNNGGNCGNGTN "!"""!"$!"!"##""#$!!$"!"$"!!"""!!$$#$$"!$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32924 42 71M = 32743 -252 GGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGT /2;A*.,4?21<:C.2H"?<$;:99;86+.,:!;)-F8,A5B+D;1>D1!B<;G,-?,C=>3'-)HG1+!- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5433 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32743 42 141M = 32924 252 GGGTCGACAGANTCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCNAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTG +&(*$%"*%*$!#'$)')%'"+!)%+)$'#**("'+**+'$()(&%+&!#&+!#*+**&"%!!+##!'$""#)'!!#'%#+#'%)')(+))##%&''&!(!)%#&!!'%#$#''#!*#%"%"&"$(!()%*&$+%&)+&)$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A28C100 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5434 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34772 42 172M = 34772 0 AGTGCGATCAGTAATTCANAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCNCCGATGGAATGGAAAGCATATA )')+!$*'()"$(%*&!!""(%*$&!#)(&)"#%%(')#$+#"++"(+*#(!)!%#"')&'+!$+!!"**)"&"&!$+$*'$%+"(*''#&#%#%%#('$%&"*"'!)!%(+!+("()!)!)*!"+%'%"%$"&+)&!$))'*!$')$(+"%($++*!##$#'%$%)(+(+! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A21A107T0C22 YT:Z:UP jpayne@0: r5434 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34772 0 * = 34772 0 TNNAAGNANCATAGCNTGNNNCTNANNNANTACACNNNGCAGNNCCAGAGNGNANNAN !"!$!$#$"$#"#$#$$"!!!##"$"!"####$$!#!!!$#"#$!#$"#$#"!$"#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5435 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7548 42 61M = 7548 0 CTGCCGGTGTGGCAGGCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGC 38DB&B'&5B!C=HD=;F9%,#@BE9G&(4=,4=(H036G)1&HG*$0@A1-*%$;8&4:> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C45 YT:Z:UP jpayne@0: r5435 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7548 0 * = 7548 0 ACNNNNANGNNCNNNNNCGNATNNCNTGNNATNNATTNGNCNNCCNNANACATNNNNNNNCT $!"!#"!!#"!$$$!"$$$!#"#""#$$"$#$"!!$!!#!""#"$$$$!$##!!"##!""$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5436 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29642 42 86M3D73M = 29582 -222 TCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAANAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTANGGTCATCATCTGNCACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCG GFF@BD(=!*,E:-)HE7F&$0;&A=(AB$&,0>:;=!'D/E'&:-0<)',"7!&"%(%;!.3FA%?E#F*E$?.7C&F/&::EF6.%/(@D$)#B27E%H(-6"'@F1%721+91%$A&.8<>)0'-G'H0-9BCH7)> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5437 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32862 42 87M = 33068 297 ACNATTNAACGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCG &##%$$#*'+!"+$($%&"+#"!!&+*+%'*$$'!)"%+)""&)#*)()+((*'!*#)*#"("(*(%**#"(#)+(!*%+%!"()%* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C2G0T1C78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5437 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33068 42 91M = 32862 -297 CCAGCTCTGAGCCTCANGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAATTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCC $&$!&+%&((!"&*)##$%#+&$"*!('$&(')(+(***+$$'#&!&%*(%#'!$!*%&"+""#$'#+)$"!'$$%++$'%!*%)&%""#+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A35C38 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5438 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35392 42 44M = 35474 222 GTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCA ;1;17D53G$-E4(-!<9%0.."H8114&&$9!!'H(H,A#5:: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5438 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35474 42 140M = 35392 -222 CTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATG &BF?,G"4("5*C&).&$'8(-**D='42FFA9G&78A;0*..;(?=")B;(6)/8B<$D(C2?()"'BF;#:#/#?79)&7,@%/?&B?,..184.2CEH'(5-"?5?>9!<@-;&55<*=317?:@#1AHE7C4=?;; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:140 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5439 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36612 40 166M7D22M = 36548 -259 TCGCCGAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCGCCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTNCTTTCCCGACTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCA =(B"3-3==HA-3(?&EG*'G7D1:!0$5C11A46B<,9+G41,H6">@6.#%-2G-#D?=??-3<(,?6*<&/#<8D%3=B14B-F4FH)%2&GEGE:)&;H5,=?14H6-)3"A(!>2<6H1CDD5)#%!7*4709: AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:5A27A101C9T20^ATGTGGT22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5439 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36548 40 43M = 36612 259 GACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTT <53,=0A9$6<%8+!?"#$.0/.#EB-1.D14#):1,4* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5440 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42587 42 92M = 42779 253 AGAGNATCAACGANGNCGAGAGGAGCAGAANCAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAAC %)$*!)##'***&#'!%+#"&)*'$($")%#$!""$#"""$%)'!&"'!'&!*'*'!"(!'*%%)"*"*$(*+!!##$($!*"(+!)+*%(+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4A1G0A5C1A14A61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5441 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16726 24 132M8D18M = 16652 -232 AACGGCTNGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGANGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCNTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGNCTGTACCANCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCA 1/#!8&11-((F>H63588<2%&(<#DE*:'@$-,GB1D&92?>;:2)"A*>G**#;3B7-0$.36DB+?G*993C+7%D##"8!CHH?#D,@0B87'2@='+B@%>,H7177E$A,8)*H?7@-4$+@:(=9/41D0./F8"2/@?1C2 AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:13 MD:Z:7G24A28G26G8G34^ATTAAAAC18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5441 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16652 24 55M = 16726 232 CGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGT D5+,5!;!&%4HC@#6;6/"E#./,(54+9:7A+&(E;@54::.1:&"A.),&8: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C52 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r5442 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29778 42 299M = 29642 -435 TCTGGCATCGNGGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCNGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAAGGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACNCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCNAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTT :@72&C<4'&C*3..@45D!?5$#(3C1;&@C1-7;,"0DH2*D7!D-)>#6.=-G<>4-17H57AA79-$&7>'3+3;:7/?&617D(/9@F7:FADCD/&;6$-!)14D2!1C66-;0@+@)<:&88(&;*&7;,<<4F37.1?$H=DA%<=7@-B&!==;D=,0C)9B-6&&*&#$1<+6-@C47-&*9E0H&'':H#C$:*7>$*4?A#G*=+BA//.">1A+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10C0T87A13G75C30T42C35 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5442 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29642 42 86M3D47M = 29778 435 NCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACANAC !-$C.EC@.9,+"9>>H#$)(9H3,7#)8AG*B7<),25:4!E8!EG!8D*8530B"$9@C/,A33)-%-"=3!33-%,+@#F!*F#H8$+C<<83'448:H1>2&E$,/D4,F*;C41/=6;9'!$1>'/<< AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:0T85^ATA44G2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5443 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47106 42 82M = 47000 -188 GTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGANTTTCCCTGTATTGAT 1:10##.!?-=.4@H,,>@5,9-"B.G(<.%7D$)**54B3#D("5*2.,?A"'2'8HBH(C/9&E1:?DG*),7(3&$/"= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T13C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5443 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47000 42 52M = 47106 188 CAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGA @5C4E/"!B$5E"590B>#'"B/)>!35="F2:;8@!>%0=()*B"@?,="* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5444 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26380 42 307M13I161M = 26270 -578 CCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGNATGTTCGTGCTGGGCATANAATTAANCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGANCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGANTTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATC 1'B$-(6((@:4G#E,;8"<4"5DF#+.+&@!5'"20#9)@<8-?>9"C'/#,F3F6H97=<<2;1%)@,)&*"C/;?DB24*;@,:&7.39(<902,9G,8#--8%''DB;C,7D0=%.?A..A,F6+C'28"C+B>B38=3,>?A,",?%6F&(.DE<-?G$,?>H!"#!,4<*#2F"HFF63*5?2G;!>>;6G=?!/"0-!&&)()#9/)@?..E#?>B>-$-(E9%?&@A70*HH.))%<0!B3+3;.&/'#AC24EF49((*19A30?-&'$H>,/C$!=-?1>C'C5&%#%0E7)*?B-*1:F?#/;,1=&"&6"A)<%;%=%G48@.,0@7-HC-D46E'9C*A,):A4FG!%A#>C03;&6&:%G>7H%1B$#;(GE84:<0@-,,>#3=6 AS:i:-49 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:18 MD:Z:24A18G6C40G77A298 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5444 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26270 42 110M = 26380 578 TTTGGGATTCTTNACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCNTTCAAAATTGTTGTTTTACCACA '5B*,4:;6/7$,(.&##0/F':@,)"D$%-8*2-.3%A&C5G">13%3B618>?#'?<53)218G**+!;/G,&"!$3;+F06/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G73A23 YS:i:-49 YT:Z:CP jpayne@0: r5445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41116 42 57M1D134M = 41308 460 GTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAANGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCNAAATGGTTA //56!-?&?D*9;%)6G4FF6>"98"B?-(#"%B$=/511=,$!=)F:6+77#?,==@4B:;DG0HA6B-"#4.+D*83B,G8A2"#-!A,!(8,%?7$F-0E7@;"#F9)'6C+G:2;3&3@!8?G#D))&"++-+<.9?.G9HD AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:57^T34T89C9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41308 42 268M = 41116 -460 TACGGTATGGNAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTNCATACGTCGGCGGCNCGTTCTGCACTGCCAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAANNAA @9E34++<0B),B:7D43?-)H8)30E7?#1D&-DA?D(,F5:CC6G6"&2,3E+),!*.#2!<)97)"0.*124+0F#$2(.4).=+'?4!99FD;G'*<3)-5C3"(6B,?$9:D%:D9+9/"8!1)!"A$D=(0F?<7'-E9B?;7F)#3!68(3G2>,30E=GBDE!B2#"3819"E197/G8(B*ECD>H%,/3).63$89=#?>G.57@!-A1$E?!#78BE.)0GAA,EEF9)';;%7A&F!F7;E)>G"8E<%#:AC@1>'5D#+1!A8>/8%="G969$F;!+C7?D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A34 YT:Z:UP jpayne@0: r5446 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15767 0 * = 15767 0 GCCACTACATTCCTGGTGTTTCTTTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACANTGTCATCATATGCAGAAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACNTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAG <--D-/F++%A6,82,2G-6!4>2>')(EGD;-F!0E4+%"0>(:E32$#2$A(0D4*#0*+@3@B9-%:C#12.?9@6#,%18BB1?+!DE5-/BF:CD(;H#&B*C19>AA0*0D*3=@8H>:3!F)F;D47?A$<84.(&/9,!2%.,D2(.CC"&.$:1)C(9 YT:Z:UP jpayne@0: r5447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15612 42 62M = 15833 291 AGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGG 2BC'-!46?()>*9*B2(0%5>HDB##?5-DE?3FC283=3(DF".;*.C4/C*7&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15833 42 64M1D5M = 15612 -291 ACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTNGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTC %#&/0&C*@@.4/4-F*>G+D;!/'8BC47%5$$/:(F)7,:$,'C"7%>=6G0(<#D62@+3G'92%7 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:34G29^T0C4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5448 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3371 42 353M = 3724 444 ACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGNAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATNCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATNTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACANGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGANCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCNGCGATGGATTGTATTCTG DA/C(&*(.DED9$1*$>$5":%D'%0"7%<="B:&0;H5B-=,#DEF;1:2&E#D)#+-9):12HC9=&>A6(A-034F@+!!;088>&.:H-A6:"C!A=.B.GCE!?*?(#199+1>=$'G6<0FF-:DG#=)'.%/=!5"12.+#%4&$4-+,74B+,B9"-1:3=8;>F)-BD@+#5%>'();$)$,D"H7:@-+@1>G$+,#3508"6.:2G%@?=3.!65)G%G<$'9+C/$;,'=1(",'<.$67H1,073<>&E,2#0-)-127F7$)9:*C#.@@,D'?%&A%(>.':*:B;&$D35A@1<>H*F-4)F22*CD!4<4,=#F:*7&)3*,2? AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:116A49T45G39C23G8T48A10T7 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5448 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3724 42 61M2I30M = 3371 -444 GGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAG 'A.1%@@7#&8?0+!4(/-G-:'5?=>'HG&19>C2$&G,)6:9#5/12(/:(-%BH&?BFB37E$B+D.6()#21G.;$49>67G&+@1CC; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:91 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5449 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28261 42 129M = 28441 260 NNACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCANGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCNCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGTGTGGCAGCGA %(27HC-4A#39/A-32("!(CG4*>6%0593D$3<5<85*28!-%0.#04+'30=4@;!0G.><@!,!<.$1?6F5=4&5E-3D5+86**"35$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0A64G26T24A10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5449 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28441 42 80M = 28261 -260 TCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTC ($&!+)$&"%%&%*!!#+)"$#&'%"($$##'&(*"$)$$&"%$'!!!+)"())(&&#+%(&)'#!)'*(&!(&#+%'+' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5450 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32913 42 64M = 32697 -280 TCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTNGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCG >1E5+*<.4?C;7>8)7!"C0G4!014/B@.!?D.+7$0E-:#H72GCA0*8:A7<*3-/45C.92"*;;GF,?(*8%,6B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5451 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27511 42 76M = 27640 225 NCNCTNGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATNACCTTGCGCTAATGCTCTGTT "'%)%+#($)*!&*!%&'&+%!"#*)$"'''$*#"%(""'))*%$*+#+!($*%*#"*%$*!'&''##!$')&!#) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T1T2G48C21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5451 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27640 42 96M = 27511 -225 GTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAANCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCNTTTTNATNC +*&'#"+&$%+*$!+#*")"+$()##*#*%"&+$%$")(#)%$%+#**%&)$"(+#%)"*#!#%+##"*""%*%#)+$&+#'+#(()*&*(!'("& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37T48T4T2A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5452 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20244 42 61M = 20407 234 NNCAGTNCCGGTGCGGCNAAAACGTCAGANACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCG !")$*&"(+)"'$$+'$*+(&$($'&#"$')&*(**###$!#&"&!'$")&$%&!!("+(* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0C4G10G11A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5452 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20407 42 71M = 20244 -234 CATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACG 3E,09*B3HFD&6C);5'19C$$::43A:0*4HC>4:*67.,*H"3,4?>2H3A4: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5453 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46556 42 126M = 46842 332 NTNATAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAANTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCNGGTTTGTTTTGA %()$(&!#'*+#%$&%'#%('+(%%'"")#(*"+"!(*%"")+$$%$*%&%+&())!(#%##)&$#*(+#!'''%*+(#!$*"$%+!%'%(+%#'*$""+++*"*"&*#+'('+*(!%!#+"%"+& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T1A1C56T51C12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5453 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46842 42 46M = 46556 -332 NTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTA 1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5454 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9543 40 46M = 9319 -270 GCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCANCGTGTCGGTCAGTGGTA 5A*64B5'BE1@&:8"8$=.=,(;%56 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C17 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r5454 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9319 40 66M5D105M = 9543 270 GCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGAGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGACAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGGCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACG B%&&FF$;44H:C,AC<<5+4=A>GDB0H3#D;;&'?20G*$=*"9"FA1=;/*4=1>1>*&47+?2)=:.?)B/#1$,H1A?:#1E(9A$B%6('"96?D1(H1A!?0$(%DBA@*/&<;-F/A?-+C8.#2<=&2..C AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:57T8^CCAAT18G51C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5455 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7115 42 175M = 6991 -299 GCTGCTGGCTGACCCNGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTAAACAACTGAACCGGGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAAC 3E#A59B?8>,!."A.3BG4>C2#'1F>70'A8=B@*/&9C43'67#A9:(C1+3#('=.&D9-."?&0+H=&B$/F41&G)(<552'82%H-;;&>8'9666";")5839?04C6-641H?'=E(<-B,/D@F:7E$!=GCF$.*>?!A+-3<>73=@&&/)F8 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T113G13T31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5455 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6991 42 41M = 7115 299 GCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGACATTAAC +/HF$=G,#DC.H3ED./%F"43/2CA$6+=FH/A8%#/"G*&6760=DC.1G!523)5'H72'$?.A%0G&2:2C$;"= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5457 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24781 42 23M1I115M = 24919 233 GTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGT %.+=1$*ED(?D5>+A!/&#%H.3>E:2;2:D-@3)726G2C>06A"$!-;+>/34>"F-=,9B'80,E'7/-DHE:E-41!>"832G6'<656;%3'H)84#EEHF-2GH1*-; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:138 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5457 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24919 42 95M = 24781 -233 GTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTNCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGNCATCACCGAAAATTCAGGA $6)6%+B,2E7/C-,)@;BE1"629<:-!&=<.C1?6;@H#*=.4F7;:,-&@.,"'!$1H%EF%8%/C@60E>%-.F";4?'-1B5FE2*,/#@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35C39G19 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5458 77 * 0 0 * * 0 0 AGTGCCGNGATGANACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGA 502<90=%HA'/%F>):24)(#3>/4%:FE1G?:"8>(%),0;+F0%>89#/>;#.(11;4.)C'/A YT:Z:UP jpayne@0: r5458 141 * 0 0 * * 0 0 CCTGAATGGTTACTACGATTGCATGTTTGGTTGGGTCTGGAAGGATTTGCTGTACTGCGTGAATAGCGTTTTGCTGATGTGCTGGAGATCNAATTTCAAAGGTTAGTTTTTTCATGACTTCCCTCTCCCTAAAAAGGCCTGCTACGGCTGATTACCAGCAGGCCTGTTATTAGC 32,0$<&$)FA@'?%,"8!,:A?3=<*HH##')5>F85>D2$(>(22)4/@#?B3"B.>E%,8=#.!&67>71).78A/A!:3(+&(F4(4!C#4/>"?3*7*"F+4&;85/G)11099%B,G&11E97;2(,C!+5/;,;/45-?D>"%+7'(E+A.-3;.$9#2=1() YT:Z:UP jpayne@0: r5459 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26185 42 150M = 26335 296 TTTTGCTGGGNCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCANATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTT (9D;7)&(C?+--B.26D&A7FB%6+=03">(?5924?=G=,A9/7!G@41*"G*"%41CHB'0/BC1;C2=71:/%557A9%.2;42:,+"G'"50*B7;&=#8F6?0>#G7;"1"71&&)=.F0+5D!F"G6@'F( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T32A106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5459 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26335 42 146M = 26185 -296 GGTGATTGCACCAATCATTCCATTCANAATTGTTGTTTTACCANACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTC %>)>5@C020.4E+>@;(7B5@>'F2:;/,-%B$:1,/C9;4C;&25/D,2.*?EDBG#992.+HC%C*)9$?6B;8>F@#$%D146+225=(E8&B:+:7/*'0#,%=GC+-!%(C#AH9E/6) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A16C102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5460 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6167 42 49M = 5995 -221 GGCAAATGAGAAGAAATTTAAGTTTGATCCGCNGTTTCTNCGTCACTTT 3EC?"=6EG,8AD?*5.2<"--B7$/."A)%;@A6",C+F71%/:@(7E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C21T6G4T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5460 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5995 42 67M = 6167 221 TGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACG 3-'>A/'-H4A!=#*0B6B>C75-(@5/-=+05AB3)&18-=.G3?87G93.2$D!G&0#0'7*>0& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5461 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21717 42 155M = 21482 -390 CACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCNTTC *<')%+)1E&76B?63)-)#G1@6+,H1!)A2'BE1'3.-+7><1?AH('(GBCG#3027*9H%6%?=C-%A!*;982AB#$+A=0?(1;54C=?A(-G;?D*1A$"@?"$74%D?A@;GG'0"'-*.,A*!<>0H2.8+E!-;/0A/<34E,@+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5461 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21482 42 69M = 21717 390 TTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACC C*#F3,F.?F><3=?A*-E@'GC%H9=638(A*)5'/(/&1#?<)BC@,E@@,5%9<;1G$A=0@?.1<6.@+H=D#!GC=$/#.>++:E<$%$2H;)3!@:79,4'C.*)+#2(-D%0E:%A.9&9<*.>#;;E*G,>4BB'C#?0/$?HH!32F,GE@43@FF@B$FE AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46G20G44G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5464 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46973 42 77M = 47158 240 CTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCNGACGTTATGATTTNGCGTG '!+''($!+*'"++)'(*"+&'%%'!++*%&!&'*)*$%(+'$(+!$")%(%$)$(''&%&#(#'!'!+)!$&&!!( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T56G13A5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5464 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47158 42 55M = 46973 -240 CTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTNTNTCNANNTCNA +%*+)#*"%+&)%%!+#%(+&(+&+#(#)#+)$"+!+)"#*%"+$)($*"%&(&$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:42C1C1T0G1T0T2A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5465 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33011 42 42M = 33165 306 GNCGTCTGCCAGTACTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTG A44'?3=F?3EH=C$8+@544-:+$@8%*'&"=CAC",+,9B3>C$1)7C47>EC+DC7'<2C1+9FD6G#6(#@!DG=$,:&<01'DGG$3A*.C:.!/=D8D7$'FF0>$AH&8/=92C3C&/:"<$07G+6:41616&4$H(>G$! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65C31C52T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5466 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23817 42 234M = 24051 433 CAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCNANGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTACCATGGTTTTTTCGTCATTAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTCTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCNTATCAGAAACCATACAGT *0G"H!$'2=,7C"E.72'.4?6#48/>&.!DH<#=2BE)*G4-/+H723F54HG;!F>/-8-!A.?!:6/0#@>4'H2'29#/(+D?6,><6=$'!!#.):2"06>)H+F%84A!58"285:((.4G9)4;#$(0FFG5$1=':E:$>%@9-(<;%>!(AG@A!=F)%?C*#6@*=&2&(-!*+(22->G$+DE9<3FH%,,&:0H3"4)$-?7,E93.*F@,",>1B580"& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:39A1T41C12A5A44T67T14T3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24051 42 199M = 23817 -433 AAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTTTTAAAATTAGAGTTGTGNCTTGGCTCTGCTAACACNTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCG 17@781+:*.)'-(/=GB*32..9;3F*278B,=,;B@@20=;+;<;H,D$%H30/H90%AC63#:*/->2&'!!1@"1D/'$EC?AG5G:.@'05-1C;D0-3B+$H+)A(.!0>;E0AD6-.-$6'ADD AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50A17G17G112 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5467 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1507 42 100M = 1356 -251 ACTCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGG %G4;=(GG&!>72;(B2$/.F54E*3-6A)!)'#.E;G$;B="&71-GACDE=>5.2=7=8D.=4';'8.?7?:@!A@%H0&/65:3>=F-'#D8*1"2% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C30A66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5467 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1356 42 126M = 1507 251 AAAGTGAGAGGCACCTNTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAANCCCCGCATTTTATGCGNTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAANGAGANGCCG 2:F!BCBF..*C4'HG6E=/-3C80!&0"5BD63%;=G66EA<)4!%G?-0;""5+F4(.AB.B0/7@0"(22 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16G25T16T56A4C4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7338 42 76M = 7181 -233 AAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGNGAAAATGTGCNGANCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCA !+*'#*!')!$*'!)$'%)+*)+##*$+&&$"$")(('#)!$$'$#!$(!)%$(#!#!&&$((%%%%$)'$("'+# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G10T2C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7181 42 70M = 7338 233 TGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAAC 9*B/C#E:A&A<;.>76A$&GA&1A./F1"(7?$F<6.";2)FDHA&&E!9!!2@E4&4&":4E<7>AC9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5469 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9634 42 43M = 9506 -171 CGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAAA &E29,15>0,A#"H7*?&0BAA@77/H)/>8*C<"G"/-)'0! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5469 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9506 42 101M = 9634 171 CNGCCAGCCGGAGGGCGTANCCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCNCCGTGANCG &#(*%&((++*'('%!!(#%&+(+($#&(('"$())('&%)*+)))#'"$)*%)+'$())+)#"+!)%$#$!%+'"*)*!"%$(((&!'"%&$&(%'+$!$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T0T16A71A6A2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5470 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11365 42 160M = 11525 273 CCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAACGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGC H9:6GAFH9?923#'?#,@77"("6-B,G)4AA8H1#"H.AH5(H04+0.2.$-%DB,G*28AD+?*#)>>@H2.?+0B#6@D09&!-.BB00#68$71;',C03F=<5!B4B91>?&D'%:')>=7'!2=)G#=*0>&3AG69#BFA&61$H?G%"G/6CAH0-;$.EBA/*4<;#?HA338'8D2%$H.8B3A2+<;81,:'='0GB'454$83#0?<.;!EF.")?/35,A%9"92 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A39T56 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5471 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20808 40 139M4D97M = 20724 -324 GTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAAGAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACATGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCANATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGG 7(*4-?D4&6E*>%48AD*B60C7,3!/>4,CG6FB&D5BD(#.G701>C22A(5A?C(*?7#0G&$A32B0!1A?4>2/;&!5G%FC/@/4589;##H,H"%A/H@-:1 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:60C78^TATC10C52G33 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5471 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20724 40 77M = 20808 324 NCTNGANTNGGNAGNGTGCCGGTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTNCTGCAACGCCAAAGGCGGT %$%!'&"!!"%!$(##$&%$&$"$$+"*$"%%!&('$!&%%(+$%+(&(%*!'')'$(#'!(#$%)'')&!!)''+* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A1G0A2A0A0G2G1T0A4A1C35G19 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5472 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31486 40 54M3I16M = 31664 260 ACGCTTCATACGCGGGTCACAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGC @,D=(B2+H8&"$1)=F9?%9=E;3;-4?B((;F02$#)?:5>7!;A&%6:C*<;<"!8,632??62%93*/( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:19T45A4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5472 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31664 40 82M = 31486 -260 CAGAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACNCCGGAAT #*$$#"$!#!'(+&**'++#)+'+%*'##!%''+'"'*!"!)#&""$!)#(&'+"'!#!%*!")"(&&#'+"#+%(($#+$$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T71G6G0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5473 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27101 42 112M = 27293 237 NATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTGATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATA %6869(F-&:&G&4G3#:>8C)84->>@#3)?D#(B6""5/C-5("#!"/@)A1=40A:2>#)C:@B8#/8"=."*8C;,&6/6D<7;C,BBA#0DE&6H.0)%0"***EG""/D74%)70B%1=7@>E=E=H%=,#8)/*99?BG0.(%+@(<:-9+<=?9C0/8<4CA;?/#0A?#?)&19.F!@F"/A; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A92C22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5475 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40325 24 238M3I49M7I13M5D17M = 40325 0 AGCTTCTGTGNGCCGGACGTTGCCGCGCTAACNGGCGCAACAGTAACCAGCATAAANCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGNAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCNGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACGGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATG <%D!G9#%.''8:-A=+5?3**G$#5>F'%8.+-@E,.()A##(1(61A710)G4#'>-7C<$1$)"4)A*48:D/G*,-:-":(&!#20'2@H;AED:(#G18:64<0.>;*1*1,DB!:*,?6B46,,+%@931"HDA=%<63"&(42G="@A+-1"&>-13$(-%&7C'7+&8GH00!/7%14+C!/=4H6>G?F&>*C3H63-A5>A=E0%%7(+5G>CF-E%C-!5?%5$;H*+B:@7:'+&DB4/2:-F%'E?)#B,68*40>99C#7<**05F)8#.H4+!4*=5"**3("?$H88>3D@#C,8B'<3: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5476 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2729 42 42M = 2510 -261 GTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATAT 2D#8%FD#>,82;F>3D4$/+=233<+A44:@&837HD(8B>/2G3.1!B4-9E29!36==6(0B6$-**A0H-)6,%<;;",=.B9)'0.9A- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5477 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43075 42 271M = 43003 -343 CGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGNAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGANGCTAAACGAACCGGATNAACAAACTGGATCNCANTGGGTCCCACNACGANAN '%$$$#+'%%$''!'!$!'"*"'!+*)$&*$+%#+#+)&!*$#'#+&#(*#!!+"#*"%%"#%)"%'+)"!'+)!!((%&&(##((("$%%!)%*&*!"&%!&&$($##'$%"#)$"(!")'""("$%"*(#&$'+!(#!)!%#%!)#(+&*"%"%)&"!##%!!'(%!)+"#+')"+(&#$'$*(''!$"'!%&*'(!&&')*%&'(+'*+)$$(%)#+(#&%*#!$%&$(*)!*!+"'%*"*$$+#!"!#&&*#"$$)*#)&)#"&"'* AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:178C39T4C7T3G12A0C0G1T3A1T1G2A2A1A1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 94 42 88M = 225 227 TAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTG $25<.19@E-@.13C:=/'$>D5/8""+2&()F=)H*B4@.!8;E4=F6"GECCD#*.;6/.B&)98F64FA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5478 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 225 42 96M = 94 -227 TCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTG A44/A3E+HA6F*?68E??C=@7A8;"8338:@0%-4A,C@0/09%-2.;G1!$A20.&"+.;GBDA3&,*294/8%3B,24<794=$/"*>.487 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5479 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24741 42 67M = 24505 -303 ATAGCAATATTTAATAGCTTNAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGNNCGNCC *&*'&*%&*%*(+"&(&'!)*#%'((+#%'*$)*)"!"%("$"$'&*+*+$%!)(***++%!'*"%( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T19G4G34T0T2C1G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5479 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24505 42 76M = 24741 303 TAGTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACACTTTTCCAATAATTGGGGAA 6A;16C1()(#!-?4;F2)79&8=<'!H<))37,.38B6;1*+;-)+B65)<3:,!93E&3,G7888-E,*8&FB& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T52T20 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5480 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12243 42 135M = 12378 339 CAGCAACNGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATG >E-737B$"4>&-F9B;F5BE'.2A0C5$6G5'D/@C5G!A=E4"8G8'?3F*G?0!E-0(#H(C435A.D-&D*',-"@:BFE"65BEF2'(>8E<5D<8H7B!@!7&);1;,H+=1)F- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G127 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5480 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12378 42 204M = 12243 -339 TCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCNGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTNGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTC !E;D+.+F@/33@@-=0,9!%*<$0!/63!6D;E!@4H534.C,?*"$G/C=E;H;4:6-(1:'"#3+%D88<4D')&4--@=)'?')D:89:A1)61CGA#GF2:!E%"2'(1AE#,=;#0G.E'&"H#D*A5!)F60$8'>?&;E6:6#0D=7=7?>B##5#<51='96;@$H+FD-(F9&"4.&:$D)?>/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T22G154 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5481 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18986 42 91M = 19077 350 GNTGCNGTNTTTGCCNNACTNGCNACNACNGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGA &#'*)"(&!"%(&)$!$&$$!%("$##(*$"*"*+!)"#&#+*+)+())"#!)#&!"'*"$+&&%&#'$!"#+*'&!#+(*((%#!*'*&! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1T3T2C6G0C3T2G0G0T0G2A61 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5481 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19077 42 259M = 18986 -350 AACNGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCGGAAAGGGATTAACNTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGNCCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCNTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGC :>D58:.3<.5%3.."17*04#&,#>7""@H!62.9"<(-20$9';"%/B<"G.G1(1$F%CG.EC,B)0&'!E;1GH$)A&!#@6/C#%#<570!7.';H:C#/(??$72+;)*3!7%.F(-3@=":@5A691#&E!#=@H&39"B9H3'75=6&.'"!,)?%=$>%$>:!4?#B4>;@AC07C+G:&0.3D179=0H"62!-!D2#"!%.?$F:G/H9;###%A8!H'2-9>?C4!&,/<'>'"%E.?4G%&?CF%6=E29"?7FEF=&%E9*./.0))>#3D>="->26:$)BHD-F?1DD!-(%96/3*84/#1':%%'D;-D%)064@A6D1GA#&D>E4B2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33G23T138 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5482 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35712 42 109M = 35516 -305 GATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGC 4D$:2B#:E)G1+&?8G1&6@!..G/DFE#EC!1/B,DCF2'15"83.(F(9=!@8-H.F$<(.':7D6E*8?;%0-7$%46!1?%#5&0;8/E*3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5483 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23362 42 59M = 23362 0 ATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGC >6$9;'H-@3&="F2$G-(:5&":@03E:%.3B80*60)4@H''6F8B@+&C:'"%7A) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T58 YT:Z:UP jpayne@0: r5483 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23362 0 * = 23362 0 TANANTGNGNCANANACNACCCNNNTTTCATNNTNCANNGCAAGAAAATTAGATTNATNNAATTACAAATGAAAGTATGTTAAACANTGGTAGAAAAAAGTTA &)&)""(!'!')!*!!'&($$)!#!(%'%#*##(%**$%&%#*'#'%))#(!'$%&)!$"!"(+"$#&!)##(%!#'(("(($(%%")'"'+#)+!!'*+$)# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8454 42 113M = 8240 -327 ACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGAGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGAGATGAAACATACTGAA 6=?4165#$9HD,F&CH:7C&:B/(')&!.'153A!#2A-<54>%+G4)#;>8(B&"@.&B8$F$$%D<7==&7"29B;"*H-@9458$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C62C16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5484 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8240 42 60M1I154M = 8454 327 GCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTNAAAATCCCGATGGCGGTGCCGATGACC "21;C6@:6$ED5.+E">#A7*?F3$#624$,4$:GF+8>H@7E&C7)?$>%4=%048"?,4+:874@0=">7.5H87+*++"=EG=9.3F413>#5&B."8&$;9+!*$69FH7;C$C'4169:<61C7-,1C$G1<9DG9%CB$E#0A:F#C:?)!/H.' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:186G21C5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5485 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20777 42 48M = 20948 254 GCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAA H5>8EB5,498FH'%>7;"'/9'EL%2/<'*+@E15&,AC2:,'8.;%8&010"#?"6+AF7#"";G1;.=$$A9#64*/,H7C*!"B0?<;%"H5;$,*0,B)#%;3.2;(.B>EB00810H<<#%;CG"55 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:4A9G12^TTA27T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5489 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13860 40 57M = 13950 171 CGCNGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTT 0)9&H0>4BF((95%041?,,-;=!<+1G(CE00,F4+'(5A,#&HF183@#B2+H@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G53 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r5490 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 737 42 78M = 597 -218 CAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCNGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCNCAGACCGCCGTTGAATGGGCGGA "A,F905$8=H+7/5AC1-)!BF8)/>CF=!$6%<5<.!'0G*.ED>.4*,CE-5>?$E,BBH.GBF1%*6<)1@E$>/F--"69%,,:":'*2+146C+9*5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5491 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20185 42 166M = 20016 -335 AGGCCACTGAAGCGGAAANAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGNGGCNGCCNC $'"&%()$&)+)&)*)&*)%'$$'&%)##%(#(%*&&&!!((#'&!(&$*%(("!%'+#!'&%$+!'&%&'%("))$&"#(%("$+))#)%$*!("(&&!*')&(&""*"+"&!&#')(($++%#&+%$)"('(+#)!$#&""%"##"%$!#!$!#+)(%**%(&% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A137A3C3A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25967 42 94M = 25736 -325 CTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGCTGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTT 03+?8B$&(0:6!:)+"C"0!$.;A'F./(C"(5/C$'HD!E-F'96!(6'!::*B586F155,+.1G%7E1("$F4?74;,./"+,F&7E41% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A63 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25736 42 100M = 25967 325 NTTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGNTCATCGNATAAANCTAATGACTTTTCGCCAACGACAT #$+HF#')'1:B:&1?>4!*#9$=<)G&8..01*15/>B#HH+37-*/$D!$06)-+@70,-)/1*4D<6'6H=+!#=*#,9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0G60T6A5A24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5493 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7043 42 89M = 6915 -217 TTACCCGAANAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTN &#%!#'"(%''%!%##!'$*(*+'"&$&)*%$!*+"&%%&)'*(+%+%$!('(&'#"*$#)''+$*%'+"$&(&&'"++#*#)'$$+'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A78G0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6915 42 22M2I66M = 7043 217 GGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTAAGGCTGCATTCAGG @;D543(20G?+2/G3FAH%=1-6)1)136*B?$6>5FC,9C3$>(-!@'6B$F;4D1A*#=88-FH$+:(07;)=.95+6"A+;)=A6< AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:74T13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5494 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2683 42 213M = 2576 -320 GATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGANAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAA >:CH>B*G6;/**"C#2?,>8!9::+9HG9'!&%<3(*<95!=)1@";+,,AD%)0A7&F=7:5$/.=.806+84 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A180 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5494 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2576 42 107M = 2683 320 CGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCT #<$3'=F.2!);?6DB.=C09534)&"!H65H459'54G-;9.D,7)/E20>EEC6A559(%8A)F?,;0:&A##&3=>;> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A106 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5495 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34699 42 14M2D29M = 34821 235 GATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAA G/6350%(2*>#B>(FA/!(,%D7)8#@0>CE*:6=%.D@F5% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:14^GC29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5495 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34821 42 113M = 34699 -235 TGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGG 7D"?!&;%9%=6.!E94G,=9-!+D9;3#'HH7&1D*'+"?:9A'*#F/:#/GA>5166$0;H+>!8?&?:E4HECA;#:5:5$%+255C7.C?5B1<4H'"G3D6*9>5HE#F"*:D,5,<+:H;E!!E905B46D?-86#5BD7*0,3FC79+*!52.&!),5+8$9,*(1)F31-)#%#,"1#4-A+,/2="#A23:4@@'67)+=&.2-!B2+<&4D<9D#0G+2!G1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:130C62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34319 42 116M = 34435 309 CTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTNTCGT A$+C<$"$-1&.3-,?@1;A>">F1/#2"!!62:>F:)2)?4-'F2F@.;+,&4!=:H09!<9GH5=A6$C1%CDG'&"0':.>)97522&EB:C9G/)'D*%A<,6%D" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51A59C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15411 42 52M = 15597 298 GGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTG H-@)*@E!(EH3C-3$2=,C,H6"G"/GFD>5!C*@&//%F,::-E/1&-H5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15597 42 112M = 15411 -298 CGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTC 6DH/1=-C"F.>"7F(.*.:/:+(6:D-.@@<+)*B?.&C"0=5).(('>"++'?CF@26"G-?'23DB6$4/3=#)G%E6-17A4:=FF6H2)F+H%:)';,(E.+&,77H#)F3B2'<9>41-GBA-1<3%;%GC*:CC,#H.G,;1!CD+'"B6'B8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5498 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10986 42 58M = 11153 242 TTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGC .4)C,"0?7#EG"3317(!=F+?C;8A722/:4F=3A,DF4(+A'/F<5E"A3D@82= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5499 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35886 42 87M = 35491 -482 GATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCT H2#6=B:.2$,:>"HB%>A%7-.7"-1'+6"#3B0/@01-B0+-&A-HD&E.5B5.H0A0?F;@%*9)!9(3H2B$58*.?#!3)9% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35491 42 395M = 35886 482 CACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATCTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATNGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAAC 2+,<-)69*#4*49;2"?5@G7?G)D.9FDB7?$!2AG()9/243*7$C*.=,H;EF%F$B(1E(?703<,*(@D'"=*6-22/C163.@G?/F*EG>D+!0E(,<&;60.>@$:#;H0@+,#:E++H%AAH:A=3=E,<+G9G.?;%86?F%"0#34,%$.>.33&?@H@+FC>CG';(E>D%)(+05/>;3,H-54C/EF!G'4/F/>B59D5'.!9E>A;47#;=#>$G7)(4=!>7';'?;2?-C*8D2:8#$&B+*0&;/0A6D)D/+"%(&B45@!>A17&F=7!)E,7)0-E)D++;359G3.>%@HB;#>73?.&CE5!>*&*'%#+D'D.$+?>*4$$)EH<>%-EA&4>!*'+4-1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:92G112T189 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5500 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13108 40 58M = 13279 225 NTNNCCCTCNAAAGTNAGACCCGNTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAG #*!!'!%"&))*'*%(&!')(%&"#+()+&"!$(*+))*%''**&)**!)$#*+!"*! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C1T0C1G2G0G5G1A5G34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5500 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13279 40 54M = 13108 -225 GTTTCTGGAAGAGCACGGGGNCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTCTGA 9>#&EF*,..8'"GB74%261*+02("!47B=($=?=(H5!;2%%30(4G@/-5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G29A3 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5501 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4884 42 94M = 4884 0 TATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGNNGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGA :2$H45=#846B;(*#F@7427%"7%>D!3:;03G@9;)1&'()@>%;D)>5*GHG#'102E1.3+G!,#"7$#=-0:02G(A3B4E0:(="D9,.:4C-68(@?115?G$!;=3!@+B>?,?BAA'+/%&HD!$(E;),F(?@(/#!;,)4&65G"H%-7,H)+EB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:140T63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5502 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32525 42 94M = 32619 298 CCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGTACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGC E,7@E5@"0'::4/=,FG4F&&7!*>&,82(E8-=C$83.+E88?0588B0165@,FA4:4H7<@-D6.@F(11A05!,# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5503 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45312 42 93M = 45087 -318 AAAACAGTAATCGACGCAACGATNTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTANACATCANNCNCAT #"!+%"%!!%"%"#$#(#!('!)'"!#!%+*'"&)(*!)!$+%%$#&*'"%(#$#()$+&!%(!)#)&"%(%(#(!*"+!$&*'($%(&"!#( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:23G55G0C0A3T0C0G1T0T2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5503 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45087 42 223M = 45312 318 ACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAAAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGNATTGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTA 0-G7=?-BA0F1<)%EC%<)&/54.'#./:>G7B1:.72:=AB%<(@%44<24$-$#98+.?>=%+;#?''C#,?0E(0A7*7;<,&>80@#G)8@,34!4><0/>()7=:-6DD!1;";*D8>,8-D?H-=!D,?!.D0@2H0'?:C'8E;::8!871,1..,,.,"%'.=B/)F(9;4'CF*#"%.(%%7>@"BB960#>-=8+.)3'')"4;,14893A/9#;ECE%#,CFB1!('?4+"G0!BG!?"DH=%,>;B'>C-0>E,%-,:>@?E=GD/$61>,E=/41@62+#)G AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:50^T37^A1C0C0G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5504 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17794 40 55M = 17632 -217 CGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCANTATCAAACCGG %#"!H:F!6'<.!8@!9;4"B7)0"*1A5$!5=>H-=D6652,@GH65/$4/6H6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A11 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15471 42 97M = 15568 371 TGCGGGCGGTTCTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCNCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACG &)E9EH<00;"$2C)CH-88&>A<+2/=13'.%&*==H9&$=1DC:#D:C2'B.A'%+=F'&#>@+'B1*8-.%BG7>B3D&2C@%"!6'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T56G28 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15568 42 274M = 15471 -371 CAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAATGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTNCGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGNATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGANGGTGCTGGGTACGGCAGTGNAATATGANACGCGGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGC 6&=&/F%..1#$*?H!7)E%AA-:A%#9<:5%#(;%!9>B75C>B2@)@27&D/0"'?('H52'/"4=05?$79'!B:<;2E#?#4<0$@0.)>'""3:&?>2&$+$D85.B#!*2=H,2'9/%$&1&>94$4D.A316.-9''>*"#+"!8B@H95>37:<5+,"8D5'#20AH<%*FFE&>(D">>A-(/?#9(&EDG4-4>:)+)-%8>=)G4A3.#6?-9'B,61+;G5;=G!#+=#D?<7*1@(41+6)7F,=E@6.A('"GG55C-$E AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:45G38A23A90C14A4A7C4C41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5506 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39538 42 57M = 39360 -235 AAACTCGACCTGACAAACACAGNCTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCG 4+<*;"(..'.$>4<@-2@,%).>.*&G(CB)%91'@$=2$,#:H@B<"0G+)/?,G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5506 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39360 42 88M = 39538 235 CCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTACTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAAC B-6*7!?G,97)"6.5'C#D47?$3%&G(;"@D<.9880&450<,CGA*?"$D(-7$7/'%$5/;2;.;-#,;>55GE9&!H5E!!$7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5507 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31024 42 290M = 31314 386 TCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCNGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTG 3@-D<3>@H0G6$3>4AH*:'H<5?;2.)-5%CC(!H,#=/*DB!6;?CHBBE<2;%.:FA&66;@3&6"1@=:&75"$><526:?"9/H!,@,3**>3%=CB)2.'0,E>'CH%'H+3>:74$;8/<94E1':(7G141A,G6F257'6>C5+140(%*A'1>4'GHA=BA9G4>C&E#9<43<8%;"<">-8#A'26&6F:+2>H/..'D$8#F7AFD;32>?C'%>%1./*7D&587)'1A*(D,F2A&,G'B>/G)++C3F'-1;'D0>5F5?37?C$*#(%(:"H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:212T77 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5507 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31314 42 96M = 31024 -386 ATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATNGCNATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTNTAACNA ("+%')+%$#(((""+'&$+''!!+*$%"!#+#!#()&*%+""((!*##(+'+$+)%'++)%&)&&&*'+)#+!*%!!!&+(##*(")+#*$&*%( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:38C2C47T1T0T1G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5508 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47373 42 62M = 47599 291 AGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTANATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAA .3;0E26!-8=G'&5+'E,&=1/5$43'+&64&)3'68<3G=0-$B#,50C9:: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5508 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47599 42 65M = 47373 -291 AAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTNC .4&11D=.*1(H74!7H8E74#,<1-&6'C03+E';+;G;HF=F6!8!)8.8,.!F'D%D+H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5509 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20436 40 101M = 20208 -329 TCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGACATCNGAAANAGNAGTGGAACGGANNNCNNNTNCNGCGGT $'%"*&$#"&"'!)'+$+$!(("#%!+'%++"+&&$("(%%(+)*&(!$)"+*!%(+&)#+##+'*$(%%!#%##*#&"((**$&'%#*%#'*%)"$&&*# AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:60T4T4C2C2C8G0C0G1C0T0C1G1C4C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5509 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20208 40 47M = 20436 329 GCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGG >*-?3-A+#!7(A60,C7++CE1//#"E&@-&D83+BG#EE.=<&C96H6A!#E>C;5A(%)%.+<$-,0;H$B-.GF:$.(1A+A09"),41+56!1D,'B;%<'*5D;;#>58=">3>F!=C#F!!&=:<11":7=4D436?C&F# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7T104G6G6A129 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46381 42 118M = 46125 -374 AACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGTNTATAA ''(*"+')(##*!'*+$#&)+'##!%"*#**&'&%"!*)$&!"$)&#$'*#&!("!""!%*#')$)'$(+$$$#&&(*)''*#(#!'&&)"'+!#$"('%#")#%!)$$)+##**"%) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:111A0G5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5511 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16005 42 42M = 16005 0 GGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTGAATATCCGGAT ')$%&$%'&&)&)$&$%$#*($(!$#"$&*(!#!+%#"!+(& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T11 YT:Z:UP jpayne@0: r5511 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16005 0 * = 16005 0 TAAATAAAAACATTAAGTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCAGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACANCGTAACGGTGGCTGGGTGACNGAAAAAGACANCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCNGTATCTGGCCTCGNT ,6@%35;'-(<%&?EAH/#;8A.)0?64/G4H%>A)"B9>"6#-><&A89%>7;;4,>(A$*87#!EC47>:114A.74E<4>2"#E:7!F79+)8;D-"05:.&A#625'<-?5"1'CF5B$)0<%D36)0A>2,27:A$3<($/(?("A9:"+$+%?D1(E09*6>G6181<%:1*@'%D(;('@#F<@');5*0+%$)8&,*$:823$21-HE/G?: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1261 42 112M = 1541 350 ATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTG -7-=.1&*<)BC?@&(@?1$E"=3>/D44+"C339+9+C4><:GA7G+8G'?GA5*.,<=$,H5/;?4)++6-0(,H$D'8)/6(A4(@"8%-E'!&&%BH/1E4H@&;73"1#E/'::AFD)/62'&/DDH8."C@;.H;2A=2+8'F><"'(-G=H85>!:%&H2/"#<0CBF$7A2F8#%76F/A=.%$C.+E!:H80-+4A0590F@F"@2?#)!7:-(8%!/0+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C101G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42073 42 178M = 42251 331 CAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGNCTAAGACG AF-H%)C)3H1''&"6!7"-6#0;=F)'D29$=(71D7.@$D4:'.#E1(#0@B$?G&+D9.3/!1G".'D$1:HC+>FF4;(55("E=E17C1/E<=,*+/.DHDFD+G+!F9(@.@D6H8$2'C+5HD53D"$E1)61#0!C*"@5:5A:F?./'9)#34A=5*,5-4CC#8(96, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:169G8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42345 42 268M = 42613 352 CGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGGAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGC #<7103!!H57)#5D+AH/*>*8&&DB+;&+;37%%/,%==;1(81-$>#";A72)A.-CD'=F>;&8A@)=8)=1'G9FH'GC=%FE$HA(D-C:/C'''5G57%CDHA(=+?85:39#,'99'G48D9"<):F*)6&B&E5)#7E!-:A,5%#AF@'?941?;*0GB)-2#)9G(*7C+4?1&BF$B"--(6;>9F&+8<(F:>5$F4C$;'1EB3"&49'"?-A.9>1A:-B,+,.;(H'A,E(4EE(03F:9G2',G''&$!G2=?164A$"B&-2CG-&E21=#<.3D(/9#:')7>F;C'(/C=5BF>1%+<;-E)>GCD>1,D'=0>E3B+@+G&!@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T6G11 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5516 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24829 42 114M = 24740 -203 TAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTT $9;:B+(8.?D.H'2"/*1G>...(B!&38(@-*6*2"@1?@3'F??;."B'9,F59G-?/3B?@B1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5516 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24740 42 64M1I25M = 24829 203 GTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAACGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTNA >AB?E*"&B@:+;0#-D*1G%'?60,2##&91069><:D(G1F&7?G:G3'.G-:!34>*-6!93%):,C5'7F("865A!@!>D#AH3%4,FF-H=AE.2FC+@(.*"(A4GGB;$A:0!;C'>&51(?H6>'3#("FH-AG?>-,A,8>'05C;'!04+C2C.A:DA)%A5+5762B*H-);15*:4,6#";. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5518 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41986 42 63M = 42064 225 GATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACA :H3;CG.&+;$(,HE-9B"!D/1FG$B0.('AD'B+F""+2!!7'B;0H3#!*$;,' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T18G31 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5519 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15194 42 169M = 15042 -321 CTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGNCGCAGATGCTGGCACCGAANGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGACTGTTCTGTACGGGGAAATGCG )"7"(1'A@4E,5"&.0#(2.;=(?-&0<>D(F<",<;G2)%25F2$<1!%D%-H!9#4+-<4B3&5=#$2:>F>'#*'((CDC,(D?0$G=>G(=)F&4#HE<7?9,,+2=,A$3A8@D/)$:$?&,0&E8?(@<=@"$=H4!DE@(*9D+=G/;&<1/.:2$9%!$= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32G19A93C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5520 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47461 42 83M = 47276 -268 CCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTNA (2:#8(F./+F>&9B'8+*!48$+#8)GD%FCBDA!>-C;=F)=>):;59.6&B'=(7;;7!.F*;/+7A"#8?G7:7&@1=*;@7?%%47=.2=H/12%9!68(G)+-G?:7B16F*"E2-+"CE%!GD81"DH!8)*)2"C.C(023C@5>F6)D.7;;(7F&9< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:146C11G47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4813 42 67M = 4607 -273 GCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACCGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAA 2G,$B4,1ED6C##*?'7+D@0%1>&-%9A,D3+8#+G<0;/CGB#G:D6H)H9#;?A93:-)D"!1-@=#E+FH#.3%#DC$G=8E6/D;)17'2HA@-3%128962245(0AE=9-(?5:'#&@*,,2<)#G&E3,D1%#E5GFFCD;4C62/F>=0=-@(?#=@"-(;4E'%@$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T75T54C4G0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5523 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13393 42 175M = 13568 234 TGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGGGGTCGGTGGNGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTG 4E@''F+:/1/>9A><<&A-<3,3D$9&8;8A3:71/9C.@9:'C+;;;1;;@C0G&'=,.+/A?@")83@0.-%+>""0=9#D%@-FB,"+$?('C:2!'0498;);7>>!2:11,E"',F%)=CA09>-.B;$F3.G=)D;*(!/4?* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:124A9A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5523 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13568 42 59M = 13393 -234 AGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTT C)1&74!<3E,FDC?%(087&.,:C-F=1@A)6/=?8-.;;/6A?02"18 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5524 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27772 42 56M = 27545 -283 TGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATT '*=G=F-:FHC-43EA>0;0.%A)D5-B9+*AA.A7=125H/HB;-5$,?;@FD(= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20810 42 140M = 20759 -191 AATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGTGATTGCAGATGTGCC 3#->"06/3"+!#G3=G!2!2?E<5H*2)"*,B%"A8/<1-8?.0:!0106D9A-!)0,B%;+-E>@<>.+A;7G#B.'<&=A61FB0;>6==/!#6-$',;4#'H5(3("8-591,D74:8=01G*A63&1?:=:'"2- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:124C12T0A0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20759 42 51M = 20810 191 CAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGT 7:,E<,!=2*<8$+0H06%3=???+H:.G;:,)A9#!D)86"",1@!02,( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5526 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34265 42 44M = 34380 177 NCNNTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTT !!&"(++'!((())"(*%%'+'"!$""'"(($)*+&&&!(('"( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0T0T0T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5526 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34380 42 62M = 34265 -177 GCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCC -F:0'#,C,""CH'13%#1C5.72D#B(/E)6)<@!$&'(A?E:$02?'$7=+G3E=B)H$> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5527 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30969 42 40M = 31064 253 TGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATNCCGTGGTTGTCAT )+%("%+#)+%%$$*"#*&"()#&*'#'#%*'*(#*!!&' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5527 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31064 42 158M = 30969 -253 AAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCT D/E>!47D;D3.8G?155&=@(64!#@'(&%&9G/C,:=@'"1G8#4%)4(D+2B4<;<;F>GDGC>A746@HD".=:C.6'DE-C<>-B,89=6%;/198#7#D700@B"*+("*&/+=&*(7<(308:<;+"8$$#)8(>C3D&1BD+6;>078"*F!*=$*#82")A8")(ADF8F3?%8,,!G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C73 YT:Z:UP jpayne@0: r5529 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16429 0 * = 16429 0 CCGTCNGTNGGTTGNGNNANNNGGNCNCNNTTGAANNNCANNNTNACNANGCGNGNNGGNGNNAAANNGGTTGNGNANNTNNGNNAATTNANTCANNACANTCTNNANACTGTGGGA ##$!$!$$$$$$$$!"#"!#$!!##$#$""!##$##!#"$"$""#"$!$!!$!"$$#$$!#$!"#$!!"$##$"#!#!"$"#$!"!#$$!##"#!"!#$!$$#!!$"""##!"$""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5530 77 * 0 0 * * 0 0 NTTTCAGCATGAGAAATGGCCTCCGTGGNCCAGGTGGTAAGCACTTCCTGCTCA !.$%/,3#15&3#"#*/;40;))8?2D0-/F==F&>(2:/#,+F33GDA8#B9) YT:Z:UP jpayne@0: r5530 141 * 0 0 * * 0 0 CTNTCTGAACTGTNAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGA %%$&+")$*(%"$("&!("#%+$&)"+)$&')(&(#+)#(#'&)*""+" YT:Z:UP jpayne@0: r5531 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13778 42 63M = 13541 -300 ACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTN %+&*&+(!&%'$&"!'$!(*)((#$)%))&(%%%()'*+'&')"(&$##$'("!!&)$&++)& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5531 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13541 42 144M = 13778 300 TCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGNCGACAGTATCAGCCGTNTCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATTGCAAAGGCACCACTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACG &")%$#+"+%%#$+#!&%*))+*$+!$&#(+&+(!'+%'%#"+#%$)'+!*!!)'%&%!*!+'!'%&(+))%'&%)&)&$(+%%!"+&"#%((#%'%$%%*#"*+%%')$)&&+*$!+)*'%"#+'""("*%#&!)'('#)+!" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46G16A31G12G35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32158 42 53M = 32343 241 TCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATGAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGT 07>/A.#A>B$)4G0B%+=4/?A'(F+?2!;1?23B,1B;-;5-=$=0$0(3% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5532 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32343 42 56M = 32158 -241 CATGGCTTTATGACGTATCATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTNATTT )""+'$!#'%*+%&'('*+)+$&##$+''++(**"$$"+"*!'"#+%%!(+%(%$) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A33G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5533 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21304 42 146M = 21230 -220 GCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAANAGGATGGAATTAAGTCGC "G692!,,&"")7C,B86#&F;'/70&/!>F5%71/:G/&'>81GD.$6*D2$271F%5!A4$@,<94:3$E?'>:)3*.:+1A>*:6:&*,DE458"F1H6$-)8";B"!)4!H#2>%4,=2#,15)/04F)':2H6$1;334/; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127C18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5533 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21230 42 74M = 21304 220 TCGGCGTTTCGGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGG #%)(&#%$('%+)(!*'*'$(!+"$%)+#("''!+)&&'&")+%"$"!("""**&&(#)(&)*'$#%)()'((* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C4C63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13645 42 88M = 13454 -279 ACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAA ,+2;#=1H$$G7F9;GB)*9$$,.?9*/(H>1GC1GF.G)6H1,?99#B%H;,@D;"9$>#D"-5/:2=@G2,%BH(%;73/9699GF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13454 42 191M = 13645 279 NGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGGAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTCTCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGC ((-09!*$D,H2/D>AF6:0B'/0+7'"@0>9?4#6'C;>!@;,,3&#(B63G-&#!*")863+F:<-8%'49B6@9C"3C7%:.8'3-173(BG9/1=0727*?#+6H;%F7;BG,GB$8.DDG=E-4?1=G*';G3#;3&(F%5:%4/9E?=E#(*4AH$&3>:H&C*8>$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T90T49A49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5535 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44427 42 136M = 44563 266 NGCCGCTGTATGNCGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTG &>&5&3+E9*3D+.#"F:'=%92!-2C**;3B'GEH!2E6+3))15!,-4.(7$F>./DF?5564B,G9:G-,"4:A=&6C/!17*+2&2H@D@;?:,!D:9/5;GH@>518480.#7.7D:#,'><*G+C-=%21==<6H$A70B5:2&?/6E:+$E&H8'92;$2FF+C!B@@'-F6;'BE+@8)1G9D"EGEG=#:(BC6,59.,6.+2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A108C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40335 42 82M = 39986 -431 CGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACNGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAANTNACACGGGCNGGTNTTNT %&')&#&$)()(&"$$)#*&*'"**#%*!!!++)$!!+(&#'!'+&%*#$)$&!*$%++!'%+(!'(*'$&)&!$&*'')!' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:31A30A1G0G7A3C2C1 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5536 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39986 42 122M4D223M = 40335 431 GAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAANTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATNCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGANCTCTANATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTG 0(#*"G/87,+H8-$9=)5HB7>*/&50-!;"5&>1'1'>4/?0+-BC=6CCE')FC."00A,$.*!#H/,;G9.,;",5?@&13AC*465@3+H8/7<#?G'G6-(#-2FA6#9&!@$?4"FG;A588++2B,$:?=H&1-4#D8-B5%+C==(9>6&*#3&(,10=%(E4%"$(G:'1'=>7%+'621A>'CF9H*3='C<6B()E"72$+A".'E36>$(+50D$# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:115T6^GTAA54C39C5A122 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5537 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45367 42 52M = 45577 300 TTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTT >G21C!&5)HE(@(,H;94,GE8H0E3*/(1@*(H=3>7>DD==?F'%-F?5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45577 42 90M = 45367 -300 AGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAA 8)CF6$34!:#2"08H;;5&;+FH/+H#.E27#.87,+(3#9()B$'9/791G)E5&;?;,&4;<*)GC=$-9-'=AE)-A=,,25%&&0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5538 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41706 40 92M = 41840 283 AGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGAGATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCG 5@-''A><@1$H85:-B1GF5H&,8F;18H0'%1H9:H(82251&4DD'7*FHB8EF"!4/0'6"9B%G8)16*-4@;#.)5"'0&*H4>.6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C44 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r5538 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41840 40 122M4I27M = 41706 -283 GCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATAATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCTNANCANAC #$)"!)'$!""$"(#+)""!'&")"*%"*")&&#&#!#&#)&&"%('))*#!(#'$+($#&#$*)"(!%(*++'#"(%&+%!('&+*%)'"'!'($+!+!%*)()*")#+!$#"'+)+!$)")&((*$!+%)*''()%)(!+($"!&'"&)*# AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:112G27A0A1G0A1G1T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5539 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39596 42 82M = 39678 407 CGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGANCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAG ?9(-,A="33765C#'$(C$/<'639&;>B@+/*E7BFF=E45E;'D-"6BC>E6@D61!;GD<%#@5EH@=5;0D/1H/6* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T40 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5539 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39678 42 325M = 39596 -407 GTACANCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGNCCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCNGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGNTGGTTGANATGGTTTACGAGTATTGCGGGAAGCGAGGCCTGNATC )#")$!"+*(&%!*"$%$%+(!$%'''*'$*)+!"*)#!&#%)(')%"'&#+&!&+'#$!%#*+&'*+$&+!&+'!(#)!%*)!!))*(!"&)""'!'#((*$$$())'*$'(!+(&+()')!#$(&(%&')#))%$+"+##'%((%*'&!#*('*&$$"+%*&++%"'%)!(!+&((+!($&%!%&++!!$"$+++!)!+#+(!")'"!*$#+()&#+($+'!%!&)%)"$'!)&%!"'&$&*$''#*+$+())(*+(%(*##+)+&#&&'##)*$()"+"($($%"%)"&$!"(*+'$$+*$#!)&!!''&)"#*!(*+!%*$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5G73A47G151C7T18C14T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5540 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33021 42 182M = 32902 -301 AGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTNAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTG 2C#G%91!<<''B*11%&,A$0826H@97GGE6,;.!*:DE,EG:"<-E1AH.E+/.8;&!8&#D+5<6*3*B=H;F7A7+(,6()(#2&%??F(,C>A"..A)-42;)@#'!=0E6"..6.#7#A%3;$@=':/%$8"8#22EF,(1D)6+8AC/9."GA2B%41=2C@.:$01$D7CA/& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104G77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5540 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32902 42 119M = 33021 301 CAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTNCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCC 7#'9-B@A8B,H-B-?"=?)7:#0:5%)(>F7G>#,D1@34=:#/:;>/D@+D;E7$$7.-+%%EG$12*935.'&:*@11,B0!(CC$%$GC21>H,(52F#7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87G10C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5541 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10143 42 127M = 10373 301 TGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCNACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATAT 6)B:"<56:?=$C909,3G(648.4CB#"+:-H3/EH-,C.;A0$<74."==2$4(C)0$(4ED$:6+E10H+D:;*;C%(,6;BD!9>#6*:2-+E**-6+#HG@2"@"2>>>@0C<2+$47B3>1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5541 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10373 42 71M = 10143 -301 GAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGACTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGG 45;+7%=E.6@%)!?,>.H2F15A,/4B#/%)!;?.7%#H'EA4F@@&A/'9F8D!29.*:1F//4&((&4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42654 42 43M = 42524 -173 AAGCCCCGCAGTTACTGAATNAAACAAGCCCAACAAGCCGTAN .8=0-?G9$$EG9$+"+2H53-@(2A4E34$-%0.)B5<630' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G2T21A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42524 42 130M = 42654 173 CTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTA $B*AF,0/>:%.$9C"!74-7?9"D4D4/9>@0?"/3?HB6F(A,*'45'B)79-);<0(75E$<3H9GC!50?C104B$@8**:'1:4$F=!+G&./)#+'8!89!7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G129 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5543 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11240 42 75M = 11048 -267 CCCGACGTCGGGNCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGCAGCAGATTGCGTATGTTGCTCA ,!,*@9;7<&>D/:0/A+D'B=%1E,=G2#6@E/8E,+E?F+68*!;5"?230)3.C4<>$&D(F) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G39G22 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5543 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11048 42 68M = 11240 267 CCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGAGGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGG =';+8*:?>7="1%3<6&)-1AD),8.'>:$@B4C>'#+4.12>EH!6F769A48B"(*G/D.EH0"3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5544 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2524 42 40M = 2524 0 GGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGA AC2:&&+<'C6<,B7)@5E*E1,7'4;DD$:'F':@A&F' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YT:Z:UP jpayne@0: r5544 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2524 0 * = 2524 0 ANCANACGCNTNNCNGTGNCGTNCACNTCCCGAATAACNCGGATANTTTTGATCTGACCGAAGCGCA #"$$"!)*#"(!%$%*'(%#)"##""&#)&*+#&)*$"!''+!+*&)!#*'#"!*"&&**&$(#$!) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12608 40 170M = 12778 443 AGGAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTAACGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATG 4;91>&*4;)C/@&@+&1)?8B4'2G+&9DA&,$&33<"?)A=*6E2?2C@+D8F2/,,',$&2'.%*+@9C>5*)A3?19:+%C@1/:%.A8?=:;)%/;53>(D=2;:0&>3>!G,83&!HH7&>,(('A@@135/#2<%F56$;98=/;D0869<+9:' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A41T64G60 YS:i:-48 YT:Z:CP jpayne@0: r5545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12778 40 37M4D54M2D176M = 12608 -443 AGCCAGCNGGGATTGTNTACCGTGGTGAGTTTATCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACANCGGGCAGCATGGCAGACNGCCGGTCGCAGGCGTCNGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGNTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCTGTGATG =EDH=43<1#0)B2E=)C!-2435H%1A<&&#<:70FBG(F;0C##?-(&/27@@F1A'D/$-?9?E681#>##:B(D3>4-#H8:2A>4HEB@@9DE325H01-=?@$'<;->F$@08AG838=6>90%,00*>E)33*B68(+;"D7A)#(,:"!><%G,9H8;B@+9G>@/'H2'=A)G>!$;.(?BF,?',:B#&"?'@=ED21==31: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5547 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42879 42 136M = 43015 246 CCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGNGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCNAAGACC ?C-'82#D5G>4<"#>HC.<%2C812;FB.AA(%'9;;0,6?)#=,*-;+"+?6F#$2/G'6=)F,F.G;EB(2#.-C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91A37A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5548 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44386 42 55M = 44452 167 AATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGAC .629-92>/6;96<=%2CE2#>/.=7A72(BB:!/$#"4#"8*G%G6$!AH(*;$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5548 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44452 42 101M = 44386 -167 GCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGNCAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACCTATTAACGGCATGATAT 5#>28-A5<:#99*@1*(A7,(2E3GG7EC$6?%/?G*9.$<<(8(<7;+?%:'*G"17.6#+(?82=5'!="C"@2?)&*-8*0;#*6BH;&)/'$#0#A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A53A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5549 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12681 40 65M = 12746 266 GGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAAC 4*'E1%<)%C#9:9!D#C3@6=<6:,?(83+'11#-(',<%():F2$!G!C&=15F8386(="2B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G28 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r5549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12746 40 69M4D54M2D72M = 12681 -266 CNGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTANCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCGTGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGA !*E+G',##+17)+,%@5--)F7*.%7#.4E@735)CG2@8!;8A.1B<'F5:D4-.!GBAB4$.-B%A,1B"@F$*3%/6HCD3;F(:0E2@71!2C!GH6E-,DEB)(>08-=4DA66;F(BE/%;.>G!EE:*40F*D>.3F'#"A&1<27&"?:8&0FCH8,HE.<5<=6%F2+GAF4D8:CA2E">:%H>):6/*E:HD8+9@D;>7=-E5D,->:83,CB:=A66@,<4?2>9*"C>#(H>3#=)4(&36D)F#-1G9?)6>"&0"'"H/C!5E3/8H<6:5#4=4"!E0H"'=CAE,8&,G;?#46!1"B*)'("*-4@%D2+/"H=33;0G(-!;DF54'-$&G2;44,/3A1*)!A)=6>6+61: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:116C60T54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5551 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43701 42 89M = 43573 -217 TGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATTGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGC (<.95B-2@>?;6!>+#&+-=F=,A?&CE=.-28*H%!9:D-2(0AF6FE/6GG832-'H&/A=E9,!F4$&,.3153>C/12&>$9$G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5551 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43573 42 95M = 43701 217 ATAAAGCAGATGGACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAG EB%4C*:1!C4+8,3C(8018#D:*FE8>6>->8G04B.'>##"'&E4.&65#"+1'!@0"&(=$32;?/-,;6?81.,"707.-*H$&"H-9BC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5552 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27296 42 105M = 27453 219 CGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTAAA E;>:@@7>F9A;EE*<8"*40:(33(48.-#8#%"&/B"+4>G21!7>7$,3:C14A:>,45G(C(,%912(;)2,9-$62 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5552 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27453 42 62M = 27296 -219 ATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTC #:6(2?299<7E6>.7:,9"7!@';GF+09#/<9)>;F2)3$;E1)AG=;3DGC4G25.('B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5553 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47459 42 89M = 47217 -331 AACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGAT *%=.8%54;'AB#3(5H.C'%'D'.C0#9>"A4@/9A5'<*!$"!A>!D>&FE/9A41C2$$7;1A.&*5&D9/;-B8BA:)A"/5:7@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5553 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47217 42 134M = 47459 331 AAATAGGACGTTTTTATAAGATGCNTGTTTCTTGAGAATTNAACATTTACAACCNTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGNATATTATCTGTGGCTNGATAGTAAATATA 1>!"8E@'07'7%,E!"5(!;AF"12&1)A>$C#;G3;5)?19$--;,%9""1EB95)"A6$H%5G*%37G=FD=G"BEE7! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5554 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1170 42 84M = 1302 214 CGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAANGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCT <=C#&G6$16.A3=?%#1*@??+<:,G>*',88B+=7"*?.0&"0#@@5+%8:@"2(6C&%;4CEG--28A: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19170 42 156M = 19337 212 GTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGT 9?,B/,G$5;@6%+:14B(A%<#9)'?4B>)0?=-.4$%5*26;?"16@7,-3.&H,!D%19$49:-">,(7;7!#4::.>A>D@5!@"@->@9#156D3"121'A++6:.(/DC7.58A*E)B2"9174BD;D96C*>3.1$'A8#-,FDH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5556 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2149 42 81M = 2287 285 AACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAANGGGGCNTACGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAA 5%G)A&80H)7;?).9E08F1!*;#>=$H/<6#*3!D7&!&7$F$<.3H67(#A/56%;;B9586?BA9-/3AC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A5A1C41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5556 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2287 42 147M = 2149 -285 ATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATANTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAACAGGTCGAANAATGGGTGGATGGCAGGAAAA %B692<2DD2E.8'2A>$*097D#4D&>+878G;CH2(D-6.4G4EFHGB"8#&D4&6.%35A,*(3!55?1/2E1+$3&#?96+D-%;H9).D4/-F>;>5G;$0#,8>EE*,@/6)<93789#9;B33C$:>239/#!6F1D7=* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:75T39G9A21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5557 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48057 42 88M = 47753 -392 AATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATNCATTTNNATNGATGTTTANGATCN $%#$&($('(&!)"&+"&(*+(*%%((%(')'$(%%(+&'*&'*'*#%"!+#"#&!"##%%+*$"$'#&#%&$$$&&$)"&("*!(&$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:63C0A0C3T0A2T5A2T1C2T0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5557 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47753 42 304M = 48057 392 NCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTAATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCANTTCTATGAGTTACCCTGATNTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAANCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGNATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGNCNCTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGT !,00*FDC(*C'(-'GG#,&:=$=.0B"D***%;"18AE'FBB;367!>%3(-$E1&C?G5'0CD@D5D6C79@'.!/'+;.+3++)$+$6()15A,BA:'G80&8EA+F97+F,=@)3:#)<'G;+;"D'1E7D2"9(D>0>3-?/?$?H3$3)39%A-9<""$1.>#>,>&8)"-'@FB%=&HE2;1AG//E=8?#&1"&D*/$#:57G5+?A4@%,3)&*8:.)-&97AEBF6>F?39BG' AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T25G31T19G38G22G27G83T1A49 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13751 42 93M = 13625 -219 TTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGC --0@;69:#&H/6?*&E?C61&"F1;E%:A,/*C+9H(G,F')B752H"%!8H%%@4=3<8,EH,*>6539>>A13,? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5558 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13625 42 74M = 13751 219 TTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGG >+,%E927*'=9D-@",>C%&5%E5?-BF026*"D77!=F=<;,H>1>4%-&$E/:*.:%(E0(%;?<;!;A9? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5559 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48124 42 103M = 48338 280 TTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTNCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATG D;";D&:893225F21@%931'5=HC>=6GBF;C#(2F?69<5FBH'>1>>+CEG,=,09*#>BE1H!;6&/2B%*(65>"/6:.CC7&?+,"9,$<"?6):/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5559 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48338 42 66M = 48124 -280 TTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTTATACGATACCTGCGTCATAATTG ).62('$4.>G>>AH),A3?@54&2E27//<>H)21A$>(#D:H.E'=>6.!1&*4(;E@2BD?EC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5560 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3946 42 353M = 4299 450 GAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGTGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAACGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGNACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTNCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGA 9<"$9E6:<<;7/CB4B-F72!8?"A%H-H*1!@@+/;<-D;4<%F,)AD.A!'*G>G.?8B<(C40'#$B*"3*5FE%$3=/E1D-$0)/7CC+F6A>,#.8*/&?)*?%E:1H0&FD(!@.FB4-61F*D$@C&(G-6H9:%C=4'9.0D/3.D@FE*":<38)@3D(*#6$=1A0:<8@:B#;@16'@);/:FF);)H+?#(H(=7&<9"0+;1%.=.8.?BEE%+5;&%#E6F!4=+.%$498E$8$%E>:267=D(0,1%/,#6A0C75CC=8"5*4!%3F=#=@%0H+8!"/!FE!3*863BH:!!"'>+B#$DG<%$G=ACC3%:;C/C$/*$B.B769(;G?+B=EA<@A$#D6&$>ECA;/@5=)!20<6HH6<,4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A44 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5561 77 * 0 0 * * 0 0 GCTCTGTGTTTGTNTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTC -%3$"1:-12E/F<4<"D)(1*#%4C3'H<)&*,%"*655G, YT:Z:UP jpayne@0: r5561 141 * 0 0 * * 0 0 CACATTANCCTGAATTTTCGGTGATGCCTATTANTTTAGTTCCATCGTGCCGCGACTGCAATATGGGAGAGAAAGGTCAAGTTTTCGCAGTAGATGAGGTACACCAAGCGATTCAT 6+#.3-4C@*-9A2,&C!H"B2+?3@:9<:A!/F"C?"&!H1AB@?*B2B(-%.9HGE*365%-"5B:7.%>8#0C@7F)1FH6 YT:Z:UP jpayne@0: r5562 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26763 40 112M = 26666 -209 TTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCNCCATGCTCATTAAAGACAGTAAGANAAAACATTGTAAC "8*664"26D+(#B)/025.?."-6)=#A>?*+B*$.?:+,"7EG=-+0?>!<11C%?>&,H-<363F:&3D&;("D'-E=F/2A48)$'HF)6'8+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:73A10C13T13 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5562 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26666 40 97M = 26763 209 TTANTCTGNNNCNNCCATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTA &&*!&#)$(!"'&*"+#%&'"#'*()%"+%*#+(#")%%&"'&$%)!"#%(&(*#!(%($#)+&+$%(+$'(&*(&##$$)%'#&"!&%'$*)$!+' AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:3A0A0A0C0C0A0T0C0G0C0T0T0A2T0T0G76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5563 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27185 42 125M = 27310 277 TACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTC HDH/.%48.(=B4!1("6.0'>F*EAB(/D.$76+&&1$/-)2=+#(!?9?*61<-H3=/*3G?<8@E*->.82!E88@?+'6FC*(%3:F>B=6C)%36@2;-$C2@-H%5=9/@?GC6.!%$$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5563 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27310 42 152M = 27185 -277 ATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTC 0(G%&*59'@9(EH+FA$$F0B2H?BA/F8&(<>:A-"BD-F*A+E*4!58&G!H@HG-H/'#&G?%E-@@>/GDC,,?%AFDF972+<3$+4%2C;;1D9#<3&';,#B=9&3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5564 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34511 42 46M = 34190 -367 TATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTNGAGAGAACCATG /3E?AGG(A662@",@6C<->/.,G%+C3;5""B2:G#%/#8#D99 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5564 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34190 42 108M = 34511 367 ATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATACCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGTATAGTC (=1',E3CF'442./7!E'=G8:D%6",-#8!,+73%9D0D3C2E$*:;E=77H*@.A*)(7+=CF('#/H5'!E&=!%<=:F5!C,2F'82C,?=06'+D?%%G+D( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T76G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5565 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45992 42 180M = 45992 0 CGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGGTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGGACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCNTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACAC AB$>9<08:G+D>$C?F/6-A.(7,A@2$<;D=G%=*DD)8CACF4G%1**-+;;41<@GD!1.H9&E#3!.%A=73=5#A<4D14&3%-7#5/(?;F(::/%'>D=,9#C;HD5"D2=/B?'%7!&&*;HCE/#4D*-9E,4@'<'@$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41T59A47G30 YT:Z:UP jpayne@0: r5565 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45992 0 * = 45992 0 GNTNCTGCANTNCTAGTGNCNNCGTAGTTNNNGCTGNNATCANNANGGCTANANNNANTGANNANGNTANNANCGCCANNATAANAAATGAGCANANTNNNNNNGATNGNCNC """!"$#"$"$"!#!#!!$#!#"$$"##$"!"$!$$##$#$$###"##$###"!"!"$$$$$"!#$""!$!#!!$!""!#$$#!$!!!####"$$#!$!#""!!$$#"$!$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5566 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35818 42 57M = 35883 241 GGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATA $<**,@(F84CB@$4&*2;:(<<.(/G<<>D6,,(=#!;"#:0")7"!H!8D-,03. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5566 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35883 42 176M = 35818 -241 AACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCGCTNATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAATGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACAATAACTATCGATGTCATATACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCNGCGCGTTCT @,9:C>?"E!5-9+G618F)4.C&0E/."&>+@#*7$8%.&+AA!F&C:@:);840;G6-#45!%#6>'=2:HD>"C29181(">H6C.&:H2/",H7-F)-.A$:>#;A??9C*D.-.>)::G@=.4$76+C:28H$>$>"29<)29*@%07$?20(#)/2*.0&-,31HFH,>5 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:50T35A40C38G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5567 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25309 42 292M = 25601 513 AATTATTTCTAACATTTATCTGCATNATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCNATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCG -/37!;H(/2/6!:&(H-G(,@,-G==+.C/9/2&..3@,6675<".-<&,D'@,A:@B%0D2@')*6@(3<,E,A-*:#+#H5*%=<,,E3(.+2(GGC9=+0=6&.BC-=990/:6:48;(H%B::'=G7+&!=%E'@-A6D8H!5-B,@>,F9&FDBC21F-7E*'=@);-#-1)AB"A!8>66H?+@B% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C127T138 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25601 42 221M = 25309 -513 AATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTGATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTT :&:@63D>"?61%#"1DF2%FC'#4B++@%)+A:13381"32B&H8=B-<+.50;(2&,-2!&2@!'*"<0D2A3+)D,DBF$-A=3#$(89'2G<.>G&+5EH&F$B-B2/'G?6<,9&HA/<2AA@G@B&';B-57:8'=623&2&4D??&2$D$?56,(!A#DEHD5D79-,<3,?;.:''+*D6":20D%9!06E55'FF9#5C:.02=6B-'$.G7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T191 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5568 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27841 42 84M = 27925 318 TGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCN 64;+?4BF2D.F??$%E86*641?@?&>9/,#?,4=/$19:8C%172D758B@B?H6G+1(5G&A#+//6-'?*C&(5A20?D0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5568 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27925 42 234M = 27841 -318 TCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCNTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTNNTCAAGTGTTTCCATCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGN ,7")':4'2B!'#E77B0#$$A)#D@0$5.DED@',77:<'?,#&1A-(*=,$.%>%'<3$)A"%&"E=FE8!<<8'18(4612'G0D:<0;A"6)F&FC6@#%C/68,@3"7C$;F*598$@A-:>(C$1%:=3C85/,"!4:7;'05+"F;;>@4'.GF'/=/C*6E'..H&!$+-8*B;HG$A$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:81G95T0A12T41A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5569 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34049 42 107M = 33878 -278 GTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTNGTATTGCCCATAA )+'+"*%*+'(!&)'%&+%'')**%)&!&*&!+'*$")""(&(#'&!%!''"'"%!*((!$("*(($#*)(*%*!('"&&+'&"++$(!(#*#%'+(#')+)+%$%$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:93C11T0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5569 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33878 42 108M = 34049 278 AATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCATAACAAGTCGGCTC E*"49(A>2!$18<.AB0:,(:4E3AG9%/=46D/(+:D,"1).+:0?B,.6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5570 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5685 42 49M = 5874 261 CAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGT 5,+A2.*7"29-C;B/564:?:<$/59,):(%8G*$"D0,:<1>-<=4B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5570 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5874 42 72M = 5685 -261 CCAGCCGTAAGCTGGTTGCGNGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTG >F"(A2BA2;@&F$+9B=B335#G";,8.G0#/=#!($D$=7&C19"528*H;$,#@$7FF9>@C+G)2@E, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46163 42 138M = 46013 -288 AAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGANAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCNCCACCGCCTCCGGCGTGGA =47@H%"CC/ED+,%DF',8C008A728AGH:C1H+%%./:&=C=)-!FH+F+,"&;2%@A/58F<+=04*B<.0/?53$E!C&.5&:"- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36A37G43A19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46013 42 54M = 46163 288 CGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCNTGATAACGCCATTACCTACAA A"+'17?30:97*(F5H&C,)F%!4A1-F!#3/<9%+0,/*?%%3@:,C$"#=3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16281 42 80M = 16361 248 CTGTGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACG -C-4G;+>,*63B%A+/!=#/)7D!E6/:D0'#;GFH1=7D&))76.;+1;1><,3&;2#D7GA?@;'E9A#@)'27&%B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G76 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16361 42 168M = 16281 -248 GCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCCGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCTCCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCCANN &$'!%*)+**#'(("((($)%!$*("(&*$()%)&+(++&&+&))'%*'$("$!*)!!$(*%(*"'+#%!!+*$'(&#+*$#"$'"'+%%!$"!!(%*(+)&#&)()(#+)%'*%'$##&&+$%+)'"##'&$*"+#*+&&"&$(%(#(*&'!')')'%$+%+)%)!! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:45T67A50G1T0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37385 42 50M = 37687 344 CAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCA @A.:=;>7.$417B"1*.:#*A+@'"3$F%F%80.#3&$!93%07)56=04$0+E9'0:3;2$/761:@&#*=$;C@<$#=-7B&4-(-''HDF&<37'.#-9"+#3:*'%+'77<04*%;2C82CA7G:##>'D&!4073F5+3,)((70A-14=:D4E#,+$&*@05HH3>'AH@'-/)3G>$00--<# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26T57T11G68A0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5574 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3721 42 64M2I309M = 4094 539 CTGGGCGCNAACAGTCAGGAGCAGCGGGANAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGNAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCNCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAANGAGTCGTGGGCGTACTTTACGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCA G*7D"CCG3$0#C+AE$!+@0'87)1BCA)")AC-#(4*9D&G19,G$>?0./9A,2,&;5/9-D&.34F9=+5240?.;;:G>=A(A0"DB!B:-/2)&"18@<+!%F5=3D@?'G*(('894B@1HB)?*8<9234:4"<'$0;C0:?8:#DG!(79!*9-'C@;'F"&B'G8:=A9!H7)B+@/!&0*)"'=?E*%@GG6:HA25F$HAH&G#H@F(>@'5-#>/=#E6(*A-3*"DA8..?!-'!(,;$.43#2<5<'@G<$B+D8$H1!9/+505?/<,7*'%(/(D7>%/9;?=/G:*=A&>/+0#287<-#(#.93B180-"F*'A#-1'+/7=4!E7!:">93D-904=)&7;%,!"<:>.#8!7?99(H15?,2F0F0C:#'!67(1.5H!: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:187A52 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5575 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35184 42 166M = 35350 406 CACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTNGCGATTCACCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGTGGCGGCGTGTT =&/.0<"949#4#FG=4;2GH-$E'D3@*1F&6%+B!"E'H0E=?);CCH=!;++":DC)0B)-?/)9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50T8G94C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5576 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17936 42 88M = 17824 -200 CGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCACCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGA DB*.0679*@8>,4E;G=G"*59+9C)=#G=@!!;DC+CC4-'3BF6A+H+4*+89$B0A38-6$$),8%3/"0;1B/E&03;-8F=8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5576 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17824 42 112M = 17936 200 NCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATG "B-7C.%:'D36"<9,H@<>D2-=8(GH;@GDCEH@(=)AC4H'/.&C+#/<(:C"8/0('/F8A.-?1A!748*2/?'0=*;$<<29>;/0!EH<%&2>1==-%/66%%$5CG0E-6<14)#$>E<*"F:.=9C?298*)A$C@8B(1"!6!9DF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A5A100 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5577 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32422 42 229M = 32283 -368 GGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCNGGTTATCATTGATGATGCGNGACCAGCCATCAACGCCCANCACCGGAACGATGCCATTCGGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTNCACGGATGCAGGNCGT *%'(+*&+%$&%&++(&&%'*#'(##(!'$)(%&$)'*&#"%(')"+)*$&%$+%$!+'"((*%$+#!&!''))*+%#+*!')'*+)&$($$!!)+)&+**''&')'&&'(#+$))""'#(+%$*'+&*%)*+*&%+("!*+#$((*%*(+!(#%(%+#&&$!#(#*!(($)%!#*+'*%"))("!"+'*+$!+!)(&'"#'$*&+&**"'&&*'*$&'+"!'&("&&% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:120T4T14G19C19T31C7T0A3C3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5578 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25961 42 61M = 25753 -269 TTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTNT ,D1#.8%(+E?:.@40H)1:=.CDA.)6D'+(7D/<.7C2"!3'2:G'*B041#%;7F!?E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25753 42 115M = 25961 269 TCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATNGTAAATAAAACAATT 8B"B2""9>E@>"H8G,5D"&A4-$,C0)/=>:2'@5*C:@4%DA3'C.4=C%!,-)21.-@+EG!8&-94E)#*6=4>-F5)?#9;61112/D<3;5H$9@C5;?B4C1##98+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99A15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5579 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16078 42 151M = 16229 467 CAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGNCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTA (>637&=G,,H-2A-#6GB-=$B"-5=A-A4',H7<<$=!$/D;#.3*/8<,H;5;F!-7;AE);/"7&3?H7A9>-8(G%:2-@<:F3;C,=;>8"!92E<,* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:125C25 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5579 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16229 42 316M = 16078 -467 TTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACATCATGGCCTAGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGTTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGNGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCG @*-"(6H)+%*)C@;1G3%13D9F2;>=@%748!=2/%GC5-<4G-&H*21#7>7&$4@00>-;B;%%&E90,FE:H%!)"2@GB$1:=+!'&5,!H!$D!B@0=-!'*/6(55$%=BC:D'1%,71GB56'>GFD=%F#FG4#;GE#(G*3*!49(=A(0CCB<6&65:2$50"C%%AC?3!H.*=.:?C:)?G,$!.C*)3.G68ECF:=F*6F?8%C'<-?!)#855.>=G-2?G(61HDH--"#?B8+7C3#0(&H"8@H6:/<+#*732!>E@A1(:)-8#4!&9+;;1()#!8+!?3*'&B<7$6)G-1D AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:87A8G53G128C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10867 42 145M = 10752 -260 CCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCANCAAAACGCTGGTCCTTTCCGG .?"3)")F).-?F6**.5'CC!6:="#=8&);F#:*+F>&A::64,-BE%&DE4:6!93>75.+%'-8(HCHA6=%=;&,>G?">!!)1!$@2A,C6GE8,"+A/'? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5581 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 328 42 105M = 485 217 CATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCNGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAAC :;?,60@*=)8/C!/E#"F/9C'F;"9=88<6*##-@&E-"1;5G$E*36*-:),5?&3'+E0D;D.G1/%.-(4B4CF@<+@?;$&"4<#!?*F9>-"<5(A10 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75G3A25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5582 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17902 42 75M = 18031 240 TTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGNAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAA 6$6>,.1&F.,,F-C$0#*?G)1C#6-!4(1$G*@0&5";7((/3B4+,4AB4!'BH#B&%71D1!8>25FG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5582 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18031 42 111M = 17902 -240 AGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGT :?0"*CC3BEH--=5'B6"0H'D?9-+?%!5:/*E&E2!F!1*)-6==@:C94BH=F2D"=.)D;11,53>+A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5583 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34873 42 127M = 34750 -250 CATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTNAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATA 9(3A$G17.>#3+6EE))@A8.:;'6'"6=@<6GH(/8';?38%,?'%A4#0;6<-(!@8EC+GE%C&3.,0/+&-<)1*H.1/EBE$46G;0C,"484,6#@)-<4;@E++(C''/:?=,:.9%0, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47T35G43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5583 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34750 42 123M = 34873 250 GCATNAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCNTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCC (2;3E9.!?9&@DD2."<&3(&+>045+1CB1G#=D1;(%,-B*$)*0(#7A9#,!G+-&':F03(%0.6##3C+6F5H#'/$$3;@!%3!&:/B&;E!$B4BE>+2!&>$8,%@F9>H%5F# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T40T16A60 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22163 42 56M = 22310 264 CGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGC =A6>@3C0;E348><<.#CC--51-.01;7 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G65C19T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5585 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28154 42 158M = 28024 -288 TGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTG :=.'B>79.B(@5,D#8H@"(1!8(HB81$=$54#,1@/-=5!:*"D:71%C?3;*=82628)@D(>/,F,&,"A>=#)1HHE@4$$%H/#)@H8F.52*95DF$1:"C+(F:07%2)((4(&*8!:102G#!(G-"/)6F7-(361)&-'D%"D<0- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:158 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5585 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28024 42 82M = 28154 288 TTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATC 3,-83:@$#$,/>9>!+"#0D.&)==FED-./E8+0>@9>A:>./.@'B3>8@3$88)691,AGB,"!>6)+1*'<-C3+CG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10735 42 70M = 10805 224 ATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTAACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAG 12@("?.H;A$;:>>9+3/5.)%+E"@G1(1B#F)A''/0*A.@$ED53.@<@"AHE'+.+33;*,:6",D!40;!0:&//1.+(=$1CD60:D@$97E/$%F!")3/>#61(/G#FF7F*':86.H'B40E10;9,)8#4?>1E)GBE0GE$/62#>3@=80G8+D%2:G'*,-E<8*,".=61$*D;'#6.<5G=65!G)-9?,5G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33G118G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16238 42 243M = 16054 -427 TGCCGTCGAACTATANCCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTNGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCATTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTA H4.BC''$B=1*@EE'8HC>0)#%:?G3-<19$;0ABDF8%+"9-!8=;,!7(C>&3'-3G?>87A3+=)(%F3C4:/7$E?-G:;CH%0C@4!+!)G*?*+6&+.'?($C(#FF0@"$%48(?B>F%0/,<%:;*B,!F,0$!'&:/+"*3<=<9GE#,-%/":@:9+FF388;=/E*>942;6=#3;@*%#;")4.?07A*:';?FDE5:-G5C>-%8=7!0/:<>BH9/+=!>C2HA6CF AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15A123T44G58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16054 42 184M = 16238 427 ATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTAATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGG 4/H558D-39:%%39=-F(0DDB3<,0+/;9)1!7":(2'(:GG9"+D*/)FE*53"2,@8.8F5G"/,D./44ED,28FD%.=<9=#C1)C$#;)$D.BHH7G+G%-'4%A?"9B7EGF0+745/+CEEH$E0<4)7'9-2=&*H%0'=?5&D3<55?4G"7-&@+F$AF<1E-'D9,@!6?2"G(H7C(=<.+C)E9!92A+,=%;C?(9)99?F#4==0H6;+&&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5588 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29126 42 259M = 28990 -395 CTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCAATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTA F,.,$7/">,)G)*0&",3(D&%:H!(=)!75&2$D@FAE$58$F>-0<+HE<@(9G=C3D,922B/4=F;5-+!D?2C:;9#%E010EB0*>-7&/#&@H!"9;#A;E0+&.68*E?:5?DC,%@$C*<(!5*,9(7$.A--B;E(,,0#D&;';G2$8-EE,9450"$<+290'!DE91B.+&##$6+D.8D#H#D"B.2F/$%#3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62C196 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5589 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16522 42 54M = 16346 -230 AGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGAAGACGCTG 6,8+6<(8,<<355A?@3=:=.@,%'A#FHFH'43?A+(7(DC58HF>'H)--D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5589 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16346 42 88M = 16522 230 CNNATNNGCNCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGNTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCA %%$#)(!*+%'*')#(!''&+()*&$))'"+&+!+%#$#"*%$"'%!!)"$"*"+$'%!*)*)*!$")*(+&$#&%&&(!$&!##$)! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C0C2C0C2G23G54 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5590 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18921 42 117M = 19038 268 TTCCGNGNACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGNGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTNTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAG "0+-1A542CC"(5*B1!/!+(;C:,1;C'5E;EEGAF=@&9<0(4CD%%F2BH/A";7@<).+A!40G/A==ECA7C)(9+-A%.(A&?C-$A' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G4G1A25A23G59 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5590 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19038 42 151M = 18921 -268 GTGGACATGCTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGAGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGNGATGGCTTC 4HAA:+9$&B"F!&;7/-6A'*B:<3D%#&5+E-H#=CG9-&(*3042$+(%<:)+!EA+<81"'E?/(1!B*$'D(4<=!)G.EC<*!;D3*=6C$-(<.'FC>C4$*D?@.-!0D,'0@1F7/(F+%*8G//'<1"1F+0*4;5<&#)&&>) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C30 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5591 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18185 42 394M = 18579 444 AGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACNAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGANGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCNTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGAAGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCNCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGAC CACB!$G+AE%?)+"""H>A<54@0/>+9'?0)1)C:E)0/>#*0<#7&):"H-7'=F2DF'EE9B6**-)C=3A.3A,*0,,E,;1F'/DF-+2)+&<96)1E(=.$#7E/8>87C+>',9H-(AE!&AD?-:%%G2"G=B7)&4:6D?*C;&'C80'A5,;%!CB8B>+)3&50G@,#A$.$;,0*$"6E+EF,,?680DBB6(2,%GA,F7@50784$E67($;=8"?&3GB2305"?018@2F$2(-4(!2<5@68DE(AF?%/H&A=)4?:#AD>(4/)!=316&-14EE"<:-!=/?@9A.F7(:A"D6E1' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:83C36C29C24C161G56 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5592 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18991 42 122M = 18991 0 TGTCTTTGCCGCACTTNCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGNNGGGCGGGGATA 6/;!$C'-+$4/:B)/8?G5A4%2GD:18BE6.:4=#H)#9H*F!E).8>@;;2<59!9&46&(C$$?5A!"&<*4)2D*3(@"B5AFF@A0!2;14:8E5>?"1* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16G92T0C11 YT:Z:UP jpayne@0: r5592 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18991 0 * = 18991 0 GNGGNGGGGATCATCANNATGAGANTGNGNNTNNNATNCNNGTNNNANGNNTGNAGTNNANAGAN !#"!$$#$$$####$#!##$!!$$$#$"$""$"!""!$!##$"!$#$"!!$$$#"#$!!"""!$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5593 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28252 40 40M = 28078 -214 GCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCANTGCAAGTCTGAGCCA 8(78(-'CF--17:=+-;=13A"'5ADH,":#!2)%+3/, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T15 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5593 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28078 40 40M = 28252 214 GTCAACNNANNNTNTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTT !*(()%$$(#$!*!!+&)+$(&'#$#()%""*%*"*")(# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C2C0G1C0A1G0A0A1C26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5594 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2324 40 94M = 2540 261 GCTTCCCGNTGCNNTTNNNNTCNCNNATAGCNCGNCTATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGNTCGAAAAATGG '&%'"&)*('*(#'**%$'#*'"%!$$*'!)!))!$+%&%#)'!##"#''+(%*#()*(')$%'%&'#$(%"+##("!&(&&&!&+!"))!("" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:8G3C0G2C0A0C0T2C1G0A3A1C2G0A46G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5594 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2540 40 45M = 2324 -261 TGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCNA (+1>#E.E?+%-(17-7+?./<@70;'(/G-#/2H).1;&(3H5C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A1 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5595 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29602 42 126M3D273M = 30004 466 CAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATCTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTNACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTACC >D2E:-$E>C+7!1#"!6-"98'C)B3,=6)@:$,!:&.('E)6/.E@>/E=/@$38)'857)3BHH!G&,;8-.-A9:2=.C.C)6$($#6@$A6)C%CE4);/!+2.G5-6-)1*#*'-H,9#/6A"'<8G$B(G0";*.G*!''+0@:E(H8H);@69>0#/(F>>;;22:B:-)48B0&2%(@$@@=C%)G;(2<,5(GB4'=:EA498= AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:76G49^ATA160G73A35T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5595 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30004 42 64M = 29602 -466 AGGTCACCAGTGCAGTCCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGT C+*B<4-<#CF)A-2@24&H0'$!@5*$,-@-66/E/3";<"-#-1A8&%*4F(+93)C4E8.< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G47 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r5596 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27604 42 96M = 27733 188 TCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTT .84*96/B$4-2?@D*H3>:)=.2$@.E0:)$*!.4-9@"(@DG85'!>'*";=F&.@8=*$*8*1BA0>(($8E6=/0/7B)#,"=/!FGG@#,9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5596 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27733 42 59M = 27604 -188 TACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCC 9;'F99?1>9&!CF(:6&%=9B@#3=&$178D-20GA=23G8$E;2E.)5?>;%;9<0G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5597 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8189 42 111M1I73M = 8418 319 CAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGG H&=@D*3@%&5)8&/$(6E$8@A&;0-=$3&%>"+0-04D+969?<*.25GB,94775?77D:AH.18"8!)5%8.&?C3$&."#(9DB:/"3?G9>5$A0&B$C$A.<,/6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:184 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5597 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8418 42 90M = 8189 -319 GATGTGGTGAAAATCCCCATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAANCAAAATATTGAGCGGATACGGTGTGGACGGCTTNAGTAAGNG "+("'%!%*&%"$)()")+'")(&%'"%#*(%+"*(*%'**&"%)#%!$+#%'#*!#!'"(%+%$)%#&&!++%))&#()&"#(*)#''' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:17G29A21C3A3T3C0C1A3A1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5598 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31129 42 65M = 31059 -135 CCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTANCTCAACAGAAGATGCTTTGTG 1'D=!(%,H>H*:E!*#:B"*/+6(=0*A:.BC95"3%,E:+.1$F/(4A3(-)5ED.<-E#:.7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5598 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31059 42 70M = 31129 135 TTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCNGTTTCTACGGGTATTGGCACAAACCTGATT 05!7B2F7&D3@%C-%>="/'/B9,$H@@<.8H/B4BBG/;F9"!C$5(3=!;%-@,/0/93H=@H<#6( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39T8T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5599 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5814 42 85M = 6029 286 CCGCGCCCGGCGGATTGAGTNCGAAANCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGNTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGA 0.$4700-+("/24--4H(7/1%*+6><&5B,F3;?6/*C&!CF>B>+1E;(@G+F&>3)CD&013'%*$<*==:2;.;"#*&D' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G5G23C34 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5599 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6029 42 71M = 5814 -286 GAGACNANAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCNTCGTTTAACTTTACCCATGATNAGNANA %)#"+$!#$$!&!+#&)+#'**'(*+$!+&&'"*&"$"!$)%"*"("%#"*!))$"*(++'#)%"&'"$!* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:5G1A34A16T1C2C1C0T1A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5600 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17098 42 54M = 17169 253 TGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTT $EG)>%EH1HHF";;E%$$FC?H-8G58H8>)A/8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5600 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17169 42 182M = 17098 -253 ATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGNCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCANCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATAGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACANAGTGGCACGGTGAATGGTG 66E9"<-G7?EG#,%86D(-%?+C:+F"@+65B4<1"AB(B'0GF7888&-9'&%8::D.&*9.=@$>-AG)&8C99)F'4#86%AC"-,9)DB56D#+"!2:B/21E0:,9;A>.)%,%$))>502'4#7@>FB7H*2G&503<)1A3G?-,7,(!<'@6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:36C55T36C32G19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5601 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2092 42 45M = 1855 -282 GTATCTGCTGGGATACTGGCGGGNTTGACCCCACCATTGTGTATG &#"!#(#'"")*'$!%#$#+&!'$#!#'&%#(%'"!)!+%')%+) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A7G13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5601 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1855 42 56M = 2092 282 AAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGNGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATC @GHH-44AF,C62<$ECGD9!@65A-9$E*GG+D2!'$$,+4A;$(&E=22,GC)A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5602 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8894 42 101M = 9042 282 GCGGGTNNGNGGAGTTCGGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCG ##(!'#)"+$(%'#''#*)$"*&$"&!#')&*"'+!##(&&'*"&#+&)*#*%&*%"&+'+!'++!+"*'!("(''"$&'"!+((!(+)!%#)("!*!*#& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C0T0T1T7A83 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5602 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9042 42 134M = 8894 -282 CCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGCACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCG BD$)/+F7;A!B'+;?;<276.1!@/,E"03401"74'DAD)$85)3).F"%9-*-@=)6>FB;A095+F0&B'23<*B854(E9)F3;*B8301?,"'A;??=")9=F89 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A74A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5603 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46779 42 143M = 46690 -232 TTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTNAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTACCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGG $"%&;,H0HD12&/"+<+'*3&@0&<7!"*G9@12+:A=C*)?2#9F@"(%=@(!2#"D18G+,+H<*CB4H(?>89&GC-.;D>B4B?2&@&H+<:)9:<7:C24*HD>:-8%4B!A$-%(:4&<,B;1AFBG4'5/$"@G, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65T45C31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5603 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46690 42 78M = 46779 232 CGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGANTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGAT 895?F"G'&27"8%:'-!%DH7,=+!/0'"5F/;F>/)/76*&33.A!G.<&/.*=#28G'6>")C=G1/(74@!@(8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5604 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24762 24 42M1I38M = 24762 0 AAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGGCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGT FDB)/'"DB)<;!;66':<8",C9B+G$?FB:G=...#,,B%16@@%@!=#7C(*,!10E&D@D5.5B%?&F%)9=8&><1 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:4G19T55 YT:Z:UP jpayne@0: r5604 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24762 0 * = 24762 0 ATCAANTCTNNNANNGGNNANNGTNTTNNNNCNATNNNTNNTGTNNNNAGCANCTGNCACANNNNANNNGNCCGTTNCNNCNNAATNANGTCNACG $$#"$"#$$!#$$$$$#"!"#!""!$$"##"#!##!!$$$!$$$###"$$"#!##$##!$$$##!!!""$""#!!$$!"!$!$#$$#!"$$""#"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5605 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48331 42 166M = 48331 0 ATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGNAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGNCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGNTAATCATTANCACTTTACGNGTCCTATCCGGTGATCCGACAG @/D5?#9$%,1)1.1';!(1-%@DC-BH/&-#@E=@B.G&ACG%.:;2)"GFF&.?54!.@0D&B0C+2=<<4+.E!,F.3-"1?F809)G2-6*%C7'B!0?"/+>D<$!962(7C?>53/*3%,H"*#2#0E+%9F7C*7!D:;6":B;6B2CED@E.<@D#CD:>F#6G+&G*8$6/##'&*-5%%=E!0?DB!?"/6/1:#8F=+)'06,';AFGB8(&?$H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:93T3G43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5607 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 416 42 41M = 250 -207 GATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACT "&!%*"+*!%$$+'"%"$%%+%'##!&$$**))*#))*#(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5607 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 250 42 74M = 416 207 GAACTGGCAGNAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCG @H40($:>?CA.*7.&"$E7"#,&DG*B/9(&99+E1,*2EEG5)GA$<6(D.?;H)H=4*&"9H;=.;4"&/9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5608 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14938 42 242M = 14888 -292 AGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGNGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGNGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTCTGAC A&'(%?0F:1(2*>75:5+8,(HHCF(H4)&=D?B&D=77,+C,8&/=1<3B;@7D,#"(48':)<0#)#H!(?<3A:::,5F#AGA4?)/<0$=:/=487/B?#9:*3E?+9F>&+D76/8)&4,.39=&8+#74+54+,E.>&&A)6%!G257"E94D%B*'4;$793H:+@2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:113A23C99A4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5608 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14888 42 50M = 14938 292 AAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGCCAGAAACTG '"&+%""&%)$+'($$'!')'('$&$#'*%'&(#"(%%#%#""+*)(&#) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T9 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15994 42 58M = 16189 238 CTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCA 8&$!$."18)?"%633+GH'4A3*#,4E'DG#F@@+4!HB8#(324:1&&<@-2./7' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5609 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16189 42 43M = 15994 -238 AGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTC 0@>5.,)C,?'4A-E"E?C.!2+4'< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5610 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42947 42 63M = 43010 373 CCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGTAGAGTACCAACAGAAACTCAA 6)2GBH7H7C@'B1::8)#C(@0>(H8$)9/H@A<-1C.1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43010 42 310M = 42947 -373 AGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGNTGCTACACGAACCGGATGAACAAACTG HF-,;B?*F@?"5C;,GF9!-GC>67$($HHF(="B2#:*38@E#;0'7,+H?H2%8CG/".H@5=AG&5>9#C>B+"=F4/%9<<$18F<(.A&(:842.;7A;-FF+>:55=E7/HGH6%04$F;"8=2!F%$#0/5F!E?!(>E!E9B9@<;)4=!/1G0$8038HFB?1&.#E7H539/.'#1%3G"6(*%&$F!9$@).@= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:282A13T13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31989 42 91M1I238M = 32318 394 CATCGATCCCGGTTCCCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTNTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATC 33%B:)EDA9",08@G6@G(%66?G6&/-,<0+DD"C.'1@'3E.H5C#"-%$0*/"HF-*A%G87=#2B1;?>2)1(=@52+"F!E.E@;:(3E;B:0#&3)<*3EGG>G3F>C!-A7%163./-1+#:B&$EB.*HG3;8,8'3*>-?1'CH;4>/E!@*-0!!.AB1A1@:+),&506H!4)@D;&EA*0+6!*>><=1=#'#4*)&+/=B6=E1.D/<54;?B?D#D$A&%2G6!@?3E#B=>3#H+:"G;F39G%9'1>(,B/!%<4BHD6E)2H0C"-4!!?)/B8 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:13A1G52G28T231 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5611 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32318 42 65M = 31989 -394 CGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGC 6.F8A9(#5'%F:A5F7A782'#7,3F!-#=D0&4/53<>@A?/=(=(2$++&)#&)-G!0;5/< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5612 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46158 42 123M = 46300 248 GATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCC 9+$:H+&G)$#:/8%'35)1F92#.EB9G.0*D+EDG7:0@4F,B'9:0&F*B&29;%&3>.>BEFG!89;F$-DC+B5C$DGE*<.A:'-!"$0.)8AC5(C6$">2;'@BH>&H(!@"!+0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5612 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46300 42 106M = 46158 -248 ATNATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACGGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGANCACTATGCAAAAACAACTNGAAGGAACCCAGAAGTA %6!$',@'-ED'.)!&A0G8(/+C>,'!:G#F?*0@2A9">D)F/<;)%D,2G=02.CBF=FE:09609*-788E,F'C>25&041#85@$.6@5(4F7:#("$G( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A28C37T18G17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5613 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4945 42 117M = 5107 247 CCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCAACGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGG >267;9A*=,?3-D*/.4#*"=$>F)>93<0=+5)#3A*:/CA6F&;&H4.%C7)73,F$!?&HA!@2+7")F@C-H73!=)4%G<*+2$@;6G305-%.9C3E0H<@&80"7@/;; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G5T78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5613 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5107 42 85M = 4945 -247 CGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTG :G<<2"%'8&3=9@6!!$.1'C@)6C+AG"7.27.0$"*"?-!*1;;*E99'.22&E""(A!;5+<<'+)-?&1>$A@5)$!83' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5614 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32254 42 79M = 32407 205 GCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGG 27B,GF*272'&GE&G%=0,<<1&$70>H4&,C6*02%H//36F9..5F;7)97 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5615 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42837 42 42M = 42664 -215 CAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAANACTCANT (%"''%**+%%%&"#&+##$&*%&%#!$$%&#+'"#$#*$#( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34A0T3G0T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5615 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42664 42 173M = 42837 215 GTTACTGGATTAAACACGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGCCATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAG %7@-B:8!7;-GG$$/&;49815/B)D4465@!'A)4$+::B!-&%*/E;)(3%954'=9C4&+,9@E*!/E,F&05H(E#8'/*/*)&C*24;8)@G-;$4E&2'0&D87,,;A%)-:>G&66"4E!G#C4(/0H9=79)6A'='5!&(.+@;+!8A(/"(";AA4+)'C6B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A95A60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5616 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13486 42 56M = 13668 233 NGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTT "*)&+)!(!+")$*&)*&("")%')$%#*+$#%&#'%"(*'*'))*)#)"*+)'!" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5616 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13668 42 51M = 13486 -233 GGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAG 12;=G4DC"<%1/;/.HH&526'G"5&584&)4'-45,8!;-4;:;4,71D5)D6D*5B3>;;'G,*-@+#!?&84#A54%?=ECG824@05,8,HC;C.&)!7= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YT:Z:UP jpayne@0: r5618 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36177 0 * = 36177 0 TNNNGTCAGTNNTGNCAACNNNCTCATANCGNGAAANGNGANNNNNAGAACGCAATNAGANTGANAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCTCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTG )#""%%'*$%#$#("$''$'$"*'%)$&"#$!*#*$!&$%%!#"%%#%#&!)'('%$(($""!!#+%"*&''((+*)##!&"!+#**")#&*'$'+%%&#'+&%$%!#&%*)*$*%!)#'( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5619 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15312 42 64M = 15511 255 TAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGC )<'H2(5<"0BF2A8F$>&6@5"EHE19).91'@#0%;C0<9,CE0*-$&;E0A>A.3D6512+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15511 42 56M = 15312 -255 AAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGANGTATAC "*%*&&(*'#)$$'%+(!&*+(%*&+*)%$)&$$($!+*"#$'$)$)+"!*)!%$* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49A2C0C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5620 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21542 42 207M = 21749 274 TACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGNGTCAGTATGGAACAGCAACCATTCCNGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGAC @E/;H9>3#2@-*@2)*AA:)A!8-=#@<4A1G2'#H6':'7CEH?<-!.BG$G/@:96A2FC>/H<8CCA#?HA$H92E65@+H>BG&H-'4+,1"5&<*+$%!;+6F7*6E,#-=/:*A4A?F."(9#62,;*H%%#!"3!C!4&;'+$$H3A',%)7H5-02A1902? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:117A23A1A63 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5620 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21749 42 67M = 21542 -274 AGTCCGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAG <;?*B6:@9%E5F8E9,H-2@=+-@!#*<+/>7!45H!+:D69-E9H9(#/E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5621 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15125 42 108M = 15359 320 CCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCNGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGA GE>B)1.%'6B0*(F:,3&+"0>')-)"+:D!4*):E67F!G2"&C&=>:C#8=@H#?0&C@2.B;C1G#D.$@:?A/(3+5C+AB')D8E7)) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63T44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5622 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26058 42 43M = 25904 -197 GTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCAGC "))*$$*"'+'#"$#*$'"''+)!+&)*"'+*)***)+(%)'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5622 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25904 42 63M = 26058 197 ATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGT AEC=66AD'@##0B3E+5,57:@#450'&,):==>1/2D!4%*E9<6>.@123)GG@A@4+.7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5623 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14810 42 75M = 14632 -253 GCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGN *7?4;!3GD)H>+:"=3*0%+H.#:/)#2<&($12;672(39(!@A"&*46@3E:@-8@;@6/;C&B>B&&'0A# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5623 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14632 42 45M = 14810 253 GTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTNTGGTTC 6@;G2G8:8&7?/B"8B01;E.H%8?/<0>7C--&AE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5624 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12422 42 108M = 12422 0 GAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTNCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTNTGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGNNCATGC !%&#(!)()()')+'+&%#&#"%!#(%*'*$'"!$"'*#((##'(('"'!#!)+&$$'&+*&+")&%#)%#!$!+##)'*+&&(&('##)&"'##***$%+("$$*&* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:23C37A39G0T0A0T3 YT:Z:UP jpayne@0: r5624 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12422 0 * = 12422 0 AGGNGNNANCNNTCANACCNNCTNNNNGNANNGTANCNCNTANAACANNNNGNNANAGNNGNGNGNTNCGAGCCNNNGNNNGCCCGANTANTNNNCNTGNCCTNTNANAAANANNAANGGGCNGCACTNNGCCAGNNNCNNCN $#$!$$!""$"!!"#$"#!"!$"#!!!"""!"$#"##!#!#""$$$""#""#!##!##$!#!$"!!!!!$#!#"!$"#!!""#"#!"!"!!$$""$$#"!#""$!!$$$#$$$""#"!#"#!!##$"!!"#!$$"$!$$!"#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5625 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32092 42 185M = 31983 -294 TGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAAAAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGCTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGAN 7/G$9@AB:EE%=D)"&E!<7#,BH)9/3D2F+B@$%5:!<.H*3HD"7C(*50)%:!(?2D<;:2H%FD+H-24<4<0(440.=B-;H#?G@>=2/>$#7E:2G>D285?.0:8;+7<<"G0?E AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:5A97T5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5626 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29036 42 275M = 29311 498 GACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGAAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATNAGGCGGCTTGNTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCNTTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACATAACCC +<:;EE;<+!(#.;;#D5(D07)<*"+A3D?*+5&=2@0=4EB44=8#&6!?C*"5D-',B*);+.;"$3+60'-587=H,+G8$'3/>;4F4*/H=0(66E4,-5F1-"&=B9743C8C1*2&@"#7F";D)'?:@$A.-#(!%E"'@!02$;4@32%$:?.55,3#,C8?77=E)D0530/9H#D4;:*8*<4;<,#E=5!HC>!39D46,!9F4'E.5B=??FD/9C&A,A&A.:F)$'>+#A?:??<:#3*+E5+G?/G5A)G?/<$$E/,?&A+9%-@.%G,"$1B5*@?$,!),%'HD5$+;G=8.!B&ED> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5627 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31193 42 94M = 31092 -195 GCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCT ##D.;@E$+(5AH#87,8D.2/-H/9"9D:6>/8?!2E5-(7@E1>3D=4.F6$6D44!#61,-C'!,7?!%/7$%50:H<4?">:,=9>F69C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38239 40 5M1I115M = 38084 -275 TCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGNCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACA F>8G0E2A!&@5*C:>93668;E406.0>#??E3.12$-A$.-!331;8+1"<454H>D6&@9'/@BG,@CG.G6-'!2B126%+9&?$C4,A#>7%D-3C/H@(/ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:1A1A0T23C91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38084 40 49M = 38239 275 GGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAA 5#G+A.+D"A@,G,D#"$76)5,&0$!56&6)#A3'"80.5,$A+C8!D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37086 42 398M1D73M = 36999 -559 CGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCGCAACGGAACAACTCTCATTNCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCGTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTANGCAGAAATCACCTAGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATNCCGTCAGGAAAGCTNGGCTNGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCACGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTNTTGGTTGTGCTTACCCATCTC ,D*G/F.7"2GC)3.C24#1H/@@5;'&1:3%F0AB-+1#4.E4=72+5E",E:0&F116C>/"0"B3C2C",@%H=/1D#F#?B(EE19@2&)/?EC(-E'-4$:.=+E-D;*:;B46)"F>1E//3+)5D$9C#;&F:427!5E+!>AG)6&?<=C":%H3(D"D,G)*,??.48%2.:)C43G(2+=!6-/5"(=1E1-'>7-4'.)CH9FDD;:H"-*':*-A'C?:03=!8A39AB+D42@H$(7GA61G?16609##0#=.->"@46FHAE(,'>E.!3:'4.H,.81;%!''"<)9%=4%0*1(?:)E8H#>H:4.DH/+-;):(E?&="73<:A6G4CFC$5?>/8A@%3F5(13$#AD*&%>E0D9-57-F=:(*'2E&51EE#66'*"?/?$8D*)'B:5G9"*(A@D+D9)(0'>G*='0CCF*+7 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:122G64A19G69T33T13G37T14T4T14^C25A25T21 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5629 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36999 42 87M = 37086 559 ACCTGCAGGTGATGCTTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCACTTTATTTTTGCTG HC-1'#9H8A5<"26=0<4$A4$F*'$!G%B8)#!!!6!B)>'0@!,*,$":9';AH+10F@-:CE6%762+!H'C,?E9B$DH5:/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A57C14 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r5630 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13050 42 87M = 12849 -288 GAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGN "+#)%*)&'**"*'#$("*'%+'(+'%)%!(&#*$("($'!+#'*#"%%*%*&!("&()*#'+")+&#*!))()(!&(%'%"%+"*% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5630 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12849 42 24M2D69M = 13050 288 AATNTTTACCNGCTGATGCGCGGCTGCCACNGGCGGTTATGTNGGTACACCGGGCAGCATGGCAAACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTT $%!+%$+%)!!&)+%$*%&++*(+*$%$!%)"%+&"((&%*!+(%#"*%'"$"!!'''")&)#*)#!*++"*#%"%!+$*#&*')&*+&++"% AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:3C6G13^TA6C11C21G28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5631 77 * 0 0 * * 0 0 AGCAGACTCAACAGGACAANAATGCGCTGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCA /1*>=42B93H;FF5A045#>&<= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G16 YT:Z:UP jpayne@0: r5632 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27593 0 * = 27593 0 NNCANCNNACATTNAGNNCANNNNGGGCNGANATNNNTGNNNNGNNNGTGNANGCNNNNNNNAANNANANACTANNCGNNAGNGNCTNTCNNNGNNTGATATATNTTCNTGTTNNGCATNNGNNTANCACTTTNTCNNANACGGNNNNTCCANGNNNCNTGNGTCNNNCTGTCNNNCTNNNGNGNNCNAGAAATTTNANNANGNACNANAANGNAATNNNCTNNNNCAGCCACNNACNNGACTGTNNCNACNNAGTN !#$#$!!$$$$#$""!!#$$!$!!"$##!"$!$!#$!$""!!"$!"!"$$#!!$$!!##""!""!!!$$"##$#!"#"!"!"$"!$"!$"!#!#$$#"#"##$$"$$""#"$"!!!!##$#"!!#""!$$$!"!"$""#"##"$#!"##""$#$"$"#$$$$#"!!##"#"##$!"$$"#$#$$!""!$!$""$!"$#"#$$!#!#$$""$!!"!$!$#$"!#""$$###!!#!"!#$!!!"$#"!!"!"#$#"!!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5633 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2208 42 145M = 2118 -235 GCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTNNCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATA 6#'<6D3'HDE!<#717>1?)''+-H8-:73@=BD1,-E19+@25&6F&D')&H)=%*"BA(8>1F&$EC72E#*8#-.BD%D0AH:44:4!5@:"D#7D2:(1*#4-..@G&$+H68&04/.3.!7% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:120C0C23 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5633 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2118 42 87M = 2208 235 NACCCCACGATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATACGTCTACGGAAAGNCG ")&+)+&#$+"(*)+"))+'&*#(%&(%((!(#%(+&)#'+))"!!"%*+)')*$&)#!&$&('$&*&'!#(!*&'!+''")#*!)& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G4G2C61C13C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41104 42 43M = 40980 -167 CGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAA DC?;+*>"75==%0&+>0GG:,?0=EE8*?ABF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40980 42 55M = 41104 167 NTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAG #<$.AF>'@GCA+8C3H:=+;(%,2';G*$:B,,C3+&;@H1&293GE1?'CAB- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5635 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40681 24 64M = 40970 331 TGCGNCNAAANGCTATTCACGCAGTNCAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGT !$&"%(%')+%'!#+)*')&++!)+'')$(+)*!()((*"++#*+**(*%$"%!!))%&&+'%' AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0A0T1A0G1A3C14A28C0A0A0T0C0G1A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5635 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40970 24 42M = 40681 -331 TGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCN H15G<:*;4HH9;(++A3/!-(<'9/,926.D0,-#C*==54HH*>06CB:))/.?,E?C1D,#/(0HE;3*C8'=-'+F)D)&2142$DC/3EF>HB#)"3'"78.24G53*AD;,C:/1&G:(G1$A!98D2D.9?2==-6"3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104T64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5636 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18999 42 70M = 19082 252 NCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTT #?3AAA8;B:>-(@+,F%G<'HB<5A(3,H?6'1.4$2).GG>43)$?(0/>6:$+-5"##%1+F,-+5H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36658 42 46M = 36451 -253 CGATGAAATGCAAATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCAT CG8)AF-0!$7'3246AAAD(0#>"9B@H=@5D(!"F/18F@3?7@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36451 42 124M = 36658 253 NTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTNTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTNTATCCAATGAGTCAAAAAGCTC !A:?D8;'7/*/:DA+#&->:?1$,-@A<=!0*D&%.AGA7(@:<#=<6487*+3B4.D$4AD(@!*4'"8G$?7$H:G8:/7$=G*#:&?B9C%E6/D&4%F2216,F4B(28 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C65T34A22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5638 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17405 40 41M = 17607 296 AATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTG F5BC;=GD-/++$%.8D$;=77. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r5638 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17607 40 75M1D18M = 17405 -296 GGGCGATCCGGCGTCGGTANCGTTCCGGAATGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAANNGCNNGA ""&&*)&$(!!&#!+%$#&%$)"$&!'+&&!)'%#%('('"$+()'"#""&&"'&!(#()'$'$'!)#&!&'#%**%*#($(%%+*!"""#!! AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:19T9T45^T10C0C2C0A0C0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5639 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 603 42 45M = 671 255 GGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATGTCCTGAAAC ?5>"+($D>*!"E6F9?.H"(:DD21'B7CB+;G*C4<%A3F:=7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T9 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r5639 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 671 42 150M2I37M = 603 -255 AAAGCAGCCGCGNTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATNTCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGANCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATCCCAGGAAGGG GG)/;FB@89H+.,(C=1<0),#-&*&2*-D*-@A,$1?HB%*,'=2*AD<)$),#=49A&1>0*GA*7D92><$4C&D6C"#(HA8E0E7<7?#"(F>&+G(?2FG>64(0*A=74#49<"GB,113@<=G363$F7,(3H25-C"$+="+-",6/%4CH>'*H!G'&>+BG/4ED+,-&'/@%A<6( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:12C35A33G34G58A10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42716 42 113M = 42531 -298 AGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTAGGATGCCGGACATTACCGGACAACNGCTGCGGAACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATA (.",6#(;4'923$.206.745$D-=A124%1@:7'3/@*%,29%.#$2&H4F."#*.D3=/6+5F:/01G""@H'C/?:6&D#?%&3&'$<71H*D@;$F/)7,?C0G@7*A AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50G24T7C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5640 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42531 42 43M = 42716 298 ACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACNCGAAAAAG D)G16@)4,3)>8?CG#30D>)5"1.GBBA0:"*C/84<.@B+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5641 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31822 42 81M = 31701 -202 CACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTT 5="7"B6<+#B#?@#C/&&+0>?$+>?A?:*#&/7(>//"71B'?H/(!F6.F+BD8(=,;&1-7(D539*(H@**#H/?5E*7!+87.02#G+$26/850G6(08DE1)2)/#>;% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5642 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9185 42 111M = 9419 277 CGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGGGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAA =#A6;!>$H1>GE+!G&1E@?9)'8>,=5!.33'918F.?@CCG7$#.<.-'5>3'1C&+&B*&<>!$'(G"$EH)=72";?*C*8%)-?&0!!'67)0,"G*&F&)&6,( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5642 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9419 42 43M = 9185 -277 CAGCACGGTAACAGCGGCAACCGCCATGACCGTGACGCCTGCC !#")*$(#$'"&'((+!%'+#%&#%#&(&&*%#$+'+!&""(+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5643 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47962 42 107M = 47777 -292 CATTCAAAGTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCCGGAAAGTGGTAAAACTGCANCTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAANTAAGTGNGT %""!)'"(""%*''**'('')"&#)*!+&$)%"(+#(%$(!**#(&&%*&#"#%*$*#)&#+))**$&)&$%)#$!*+&&&%(*!)&%'#('"*+*$*'&$(+("!' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8C42A19A25T6A0A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5643 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47777 42 185M = 47962 292 CTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGNTTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAAT &:65&4%;,0/?61A"2>5/#0F#*&/5/E:=@'$D3C5,G7&$(9)=3'3;+-0D>06/:?+FC6@+<<#*2>EH%7%,/&DG#FG#=D9@B$7()%11D#=D9&!2D&D8;?DG#:67#HF!HC*=%%2A55F*$DH3FC&4E?%>7":4"%/84?;$'/(2<2HG-2#)&"G&5#A*?6<)7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:116G28A39 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37566 42 84M = 37405 -245 ACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAG ?D/A??7H@'@*5?%5F-#0A;<>6'4#"$#*1-/%:35G!+7#5-/@;15+C'*G5(,?65">"F+.!7<77A&GE(#)+59% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5644 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37405 42 45M = 37566 245 NCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATT +H>36$G,;H,;H66)B%BB5HH%)+H"=@/);*E860?''0.%? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5645 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34275 42 41M = 34090 -226 TAGNCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCNATCAC 5!<:!G.6;#5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T31C5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5645 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34090 42 73M = 34275 226 GGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCCTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACA -=D,@4",FD7/D&425(!#="6F;5=E&&/->)'C"&%+E/&)HE>4)%FE:C9$($8@2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5646 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 696 42 125M2I6M = 827 281 ANCCNGGGATNNTGNGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCTGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTA %')()(!#()!%)'!&&+&$(&+"+'#&##&*&(&#)(%**#"#+%'&)"!&+&#"$$%%+%')(+)&)"#**&!*%!(&)%'$"'&&$+&)!""%)(++#()#*(+&&'!**(($)+!*$*'%*'$!%")+' AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:11 MD:Z:0T0A2G3T1G0C2A42G30C42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5646 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 827 42 150M = 696 -281 TCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTGCATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCNAAAATGCTGCTGGGTGT 1B0%48H-9,D;*F<+89%>!:227)$*8:-0$$@(E#D;+23*;>>8-#EG#<'?=<8-A*?C?%/=>C6A("(<1-D#/F+9,&5%B11G:&>A/!?@24;:4#8==#H*6"-4*#.3*50G2-!G4,1/@0(8D>&D/3(E9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86A45C17 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5647 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26594 24 93M13I45M = 26732 247 TTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGANTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAAN !./GCD?=#=#1><>-(1ED07(#7H+'2=<1D1.G41$9*99,!,$4-5/!H(6+-G+=6+/4C."G7%..G<@C1;.,:7*:+?H5-1*&(>;++*1;/1)4"H,3B<79F?-B@4$C$2&<78(,E6$451*>42B4D'*!@)*$DA6 AS:i:-48 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:16 MD:Z:0C98T37C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5647 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26732 24 109M = 26594 -247 ATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTCCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCAT GB5@*$,-E?-=7:D9!(.E"%8E6F6,:H@8;/-G62(351/DA1F5*/)AH!@3@/(,@%!'!"/C8@>%&>:/?+'<*2*096?17'!'=B.B#0'4)"A)1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G64 YS:i:-48 YT:Z:CP jpayne@0: r5648 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29827 42 126M = 29591 -362 TATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCANCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCTAACCCCGTAATAGNGNTGCNANGTGGTG !#"$%*+$!'&#$#&)%#"+&!*#(&#!!((%'&($"%!*$*)')*#"&())(+!&#!*'#'$'$'''+$(#)%(%&))+**#!")"+$%&")(+('$%(+#'##$*#"*+$%!&&*((!$*#"$% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:45G18G32C13C1A3G0T0A0A2A2 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5648 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29591 42 137M3D96M = 29827 362 CCGGTTNTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTNGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGNATCAGCAATGTTTATGTNAAGAAACAGTAAGNTACTCAACCCGATGTTTGAGTNCGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAANACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCTT #&!(!($*'#+"""&'%(+$'+'"+*#*'%'*%))*$%""("'"#*+%*"&(&%%)""*+)""&'!")!*+$)'%%$(!%%$"!)!$"$+($#!(%$%$('*&)$*#*'!(+%)*')#*"#*"(+*++(+"%&')#+%($#(#$"$'!###)+&(#&!'"%)&$+$)+'&!*()#'")(*"$)%+%((&!%("#!&"*)()&($"&**#"%%+%##%+**($($%"&!&'(*# AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:12 MD:Z:4A1C70T27T17A13^ATA0A21A41G29G1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34288 42 71M = 34157 -202 ACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTNTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTGCATN 18(;(&>F+6?A8=1A1A4*3$&0(FDC)):/F3;?::.(#.(2.111=,CDH07! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42C23C3A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34157 42 131M = 34288 202 TCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCAT @G$;-#G2?%HF3H&;#!"A+&34;,6B7D*98@6C/G@=;C3+%,&?GC"13H"A7B$091A#:8-/;8,72B#4BB+F'B#:=-87C"8:A;378.#GD=B&%;H/"-BH"$A"E.%9%":7#&0),?) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42773 42 144M = 42576 -341 CGGACATTACCGGACAACTGCTGTGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCNCAAGCAATGCGTGGTGTGCAACTAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGA *$&AB,5,D7#73&%>@4.'&;.83E2D15*$7D(+3F=GA.3+8*!*%451:(1F!9&B8A8+;!.E$%&;!5H026"9'720;B'/(@DD,89CF7,/"",3>8;-(!? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C35A22C61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5650 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42576 42 197M = 42773 341 GAANAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAANCTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGC &E4<#$;B7A5.+H24G--,5:"G9H=..A!,:3=.*(<:A7C-"3<+.%,)#/HDB$=%@9/:1",E5;2AH$4F+*!>C(@$=;,,?>&,:@>AG47(&%9<#-<#&.'::,+HH568D0A:%F6<3*08,1%H!.:H$2@**$<'%:=35!7,>EC1,4<=<0246**/D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A49A143 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5651 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1715 42 92M = 1715 0 CTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGANAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGG 5<#D8+@,D%6,'1E#%.9>2%34=7E;%=@(!F,3%.,1@E7"2<>2F>$!:%=,G%6::/FGF0B=F09BE?@6:3=F"H$8)5++F&(1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A53G2 YT:Z:UP jpayne@0: r5651 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1715 0 * = 1715 0 NANGGATNGCNCNTCCANNGGNANTTNANNATNNGNNCANNGCNNGTNATCANTNNNNN $####$"!!####""#""!$$!##$$!"!!"#$#!"!$#""$!!#"$#$"#"#"!"##" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 63 42 135M = 198 247 CTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACNGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGNCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAG ::A:!>?=$>B,??@4#0#!&)E7(<,=D'@:D&C/&@)$A?3;BE9;@,B"FAE%H:<*$FB,87G.059=2;@BDB,C#E'!:(=(-<>,B)(8+<>!/89;741&9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G23T31T21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5653 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4612 42 74M = 4407 -279 TGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCNGGCG ;)A9+2"1F*&3(=E4(,9!D/:6+/44H$FBH4D5@0(3?+%;4'>A"+3(@4C'%/BH3.#'#504F>"#8.$?"<;$': AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:71G9A6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5657 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36666 42 112M7D12M = 36457 -340 TGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTGCCGATTAAAAAATCTGTCNGATCGGCGGCCCGAAAAC 9$1<&##A;ED%5>133BH?:*B."%#F0F$H?C-=+4,-3%<)=&2%+(,?+<89.!G2DG'G'52F+8DC$.%B*6B#)@&G>.H3)8@C0(GE$'B!E6+/&$,:=*<%H:93?&D+"<); AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:86C18A6^ATGTGGT12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5657 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36457 42 209M = 36666 340 CCCGCCGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCNTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAGTATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTNCACCNTTGTTCGGCCGATGAAA "''&)&+(+"&$#"&%**+*&#%$$'"&'&%'"+(%!%"!'*&+('*"!&+"#++&$)')#"+%"*"&"(+")##&*%"+'(&*#+"$$"&*+#("#"($'+"*+'(#)+$%))"+*'("&$"*!"%*"#**&$*&$"%%'()'+""&!(+)$)$"(%%"+"*#%$&&#**))!%*"$*'#!(*#$#($!)+)%))$&+(*$##)('+# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5A66T52A60T4G17 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r5658 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16193 42 178M = 16132 -239 AGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTNAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAN +!>='%%$05*<>?435#H9%:&0.!;6DB5G?/'0D@8)31:4+$F7DA6-.F#,&F@?#G77FF55,@;/;!>6G%;?F0(D*>5F2,&"%"<.<,/D73-"5(>6DFCD?;:%D;";:&)EC:46,'FA6.?F$12#,:E)@F16GG>(%"(G<## AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104A72A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5658 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16132 42 61M = 16193 239 CAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACGCGGAGCAGTTCGGCAGCC 14;$:&5D)/;/+4-)-0)*B!-H7#64H::=%G1+$6-##(/3=)*",13,(" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5659 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4313 42 180M = 4062 -431 AGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGNGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAAGCCGCC ")0)98,3."=,1?G6E7H0E72-1G/;7D7A-*G2>+?/(C9GH:4#7)2@!$3!(0"9BC0B-'<.&=$=-6C37.%+G4$F"E,C&BD8A/=)=<68;?>);1&GEF!;14*',4&"%C39+&D=B#9F3:"<8:#+GF!@H;0#,1E9-+.:.AC.;1!,:,AFG7+F(85""F+,5-;GD73676!4E,?/0E?;0)'H,!:H@9E@*F+.!4B1,GE39"0&!550+? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G31T21A58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5661 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1478 42 96M = 1574 267 GCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCNTCCGCCAGCAGGAGCTNGACTT B:!6;C17>9-#9;&D87(/"G*:!E4G9E&&,)F(83AF!D'*32!&(E87))6%)(4G/"046-A8)>FA8@)=)-H"32:47:,,&D',B5+1:3D+E+ED%-!H+&#.E"=H=6.(D!:3F0H";=C7)FE"5',1#:2HA<8!#= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G77C48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5662 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27470 42 42M = 27189 -323 TGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATNGCGAGGCTTTGTGCTT ?@8B"(<>A4?!?+//1H<.A(E%90G#8,=#),E16E;DC1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5662 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27189 42 43M = 27470 323 AACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGAT 5(0.-,$E:$2#>.1&>"'(1=?-$&C-*3G4;:GE:$9E%?* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5663 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36255 42 135M = 36109 -281 CGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACANTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCNGN 3-+,0%D5E1F'!+=@H"96G;:$/'*'-+*%&!5;<.5>#A8DCB;,.,+00G9E%>B3:=:H?A.0@:@D7)@-( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56T75A1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5663 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36109 42 45M = 36255 281 CTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTG &+!#%&)&$($&#'#)+!*'"+%%%'))!'$%$)""*'!$$!(+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5664 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26162 42 143M = 26305 321 CNANTNAAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGNACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGGCTCGATAAGTCTATTATTTTC *')&"#(+*"$$'*('%'#&%)$$"&*!")#!&'*'!*#'$()'#'!!!"##)$)*''!!')'"*%!%&#!))$'+'!*!"&#!!$'$#&+%!&+)*'&)#$!(&('*"""%!)%"#"$#%)&"#+((($+)#$+%%#('+(& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C1A1A0T63C50A21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5664 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26305 42 178M = 26162 -321 AGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGNTGGGCATAGAATTGACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTA 5C+6%H&@">H4'!)=794H-C.">D+0*E!.7>;9*5<<&%:2$C!-<)!DH-7964@!:;086;!2;*27G"9+8//@B5E;=.B?)*!(>7**@G?+>,0:-626$3-6$4:$$#*91(E/HD++8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A16C6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5665 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5597 42 101M = 5801 264 NTTCTGGCCNCAGCANCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGC %#++*+#&&!%$"%)"))%)&""*''"#)%%)$#"!'##)'$'$+)&$")+%%'&#''+%*)*)'%'(%#+'#&+*%+#&(&(&%#)("&"%!"))%!*"" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A8G5C85 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5666 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10729 42 63M = 10421 -371 GGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCCCCGACGTGGCCACGCAGCTTG :=G92GEC%64*DG8&/&$"D*-$'-'!(+5">E-)<)@)9B&=!"*>43FG65)6,3=F,0F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5666 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10421 42 92M = 10729 371 GGTGTCNGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGAGATGACGGAGGATGANGTAATGCTGATGACAGT E!E74E@,;>$#@3-'42-$/G;@54E-E(1E4-*)5>40AD/A0%:E=4&8'/*&*>D-+G&../*+%G=#7=7G8&A..H6B=(8AC%"2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C52C14C17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5667 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2989 42 50M = 2779 -260 AACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGG :&52&@?G=3>(HE7&6)HE6.",(+%9+:%#7D'0",+($%9C7/=!4. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5667 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2779 42 210M = 2989 260 GCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGANAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGACGTGGAACCNACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCC '$+'*%#!'*!!%+)**!!!"'%$%'")*+*#))'&%$)+&*&*#"&*#+&"#)#(*)+)($(+&!%&#+)$#**+#'("*((%!*()!)(*!"+&"'$$*#+'*')$$(%%%($(%(+++'"*(!%)%"($(%+)+*'*+&(!'&#(*%"(%"$(#+$*!$+)$#'((&%"*#+()'')%"#!&%#!'(#"++%+)!&+(&%*)(!#'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61A103T9C34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3650 42 124M = 3837 232 CCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGA @'F;(0C)=:C=/&8D#669;971"0$(%&9'E)G"<1F)AA+CF#).C%854>.&5849))4?:>$)07#+/$H@;CA5.)(7$"&0H2=,"$36FG=7";A?6E0!,8!B-EFBG$F0F>1G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T117 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5668 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3837 42 45M = 3650 -232 NCCGGGTGACTCACTNAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAC !'500# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G14G28A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5669 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38636 42 55M = 38453 -238 ATCNAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTACCGACAGTNGTCATTATGAC $##)'#''*'+&!*#$%$!*($$)!$"")"#$%$+%"$))''#"%(')&'!%)*# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3C31T1A4G0A11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5669 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38453 42 64M = 38636 238 GCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGATCTCAA &H&4D6,8:(A(/<-.*-.5-.CH@8>FABG3H7/*1<'.#64829&25'1/1$%FF-,&6$=E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T6 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5670 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29817 40 146M = 29718 -245 TCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACANCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCNATTGACCTCCAACCCCGTAAAANCGNTNCNTANNGCNNTCGANANATA $!&!'"+"&"&%$#!")*"%"****+#$&$$!%+%%!##$"&%!%!!!$")($*%$$%(+#'*!)!$$!*%+!)"!'))%#!%+)$'&#$$!%&)$$'+$"#"%"($%+"&&*"*(%$+%"&&&)!'%#)&")&!)((#('%!*'' AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:65T8G22C20T1G2A1G1G2A0T1A0T0G4T1G0T2 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5670 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29718 40 10M3D49M = 29817 245 AAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTC 9$3!(G?,"(.64/2%/)#4E.),E8/5>%7#=>B*"! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:10^ATA49 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r5671 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44205 42 120M = 44043 -282 ATTGCCGTAGTGCCGCGACTCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGAT D/.%4">6(DF9:##@@G&):!CE'B09./#!H!-G,AE(H:C)FA#7:>8C-B0*(2!'4;+C.BD75+8:$@; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G100 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5671 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44043 42 43M = 44205 282 GCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTAT >8C7243<#%D-GF#C?#*F#C<8<'G-$9$422C9-?B.-,7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5672 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42883 42 70M = 43041 219 ATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCA 71%H39>&-GG%<6#;-D!BH/8<<)"06@G%H"?0&74H1!863'$!%G'E@>DC23D<&G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5672 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43041 42 61M = 42883 -219 TGACGTTCTCAGTCAAAACCATTCCAGACNTGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGN ,<7CF3@8'A:3(<41)3%>7;G?=5H7":.=2$.)-&AH41H'6+@D:>F;*C,2AA:F% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A15A30A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5673 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25317 42 64M = 25104 -277 CTAACATTTATCTGTATCATANCNTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCNATAAGTTCTCGCTG $'%%*%$)!($)"#*$$%&$'$)$!!"'$&)%%('%#$%'&)(+"+'*'#")$%&'+&*'$"+$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14C6C1T25T14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5673 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25104 42 110M = 25317 277 TCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCNAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAG 060(#!%"*>@6485D3:='#22>-B'0:27B+H3<4G*;&A$)-H+#-,1?6F34$@:@()!%C7FH1F'#A<$A;$A67'((G@+1C*B;9;B0,1:9.)GH,5@G>H1AH7"";36)%"!GE/'*.H(D8&/H>(DA4#<45FG:64,35,8(8B5+8FD!:':DGCE:-*"-9@30!$A.8F:1(0$66F/,D>48*B.7#35,4@56"1)6""1*--F*<%59A(G&-H YT:Z:UP jpayne@0: r5676 141 * 0 0 * * 0 0 AGTGTGAGTTCGACTGGAATGATGGAAATGNTCAGGAAGGATGGCCTCCAATGGATGCTAGCGAAGGAATAAGAATTACCGCTATCGATACATCAGGAATATTTGATTCAGATGATATGACTATCAAGGCCGCCTGAGTGCGGTTTTACCGCATACCAATAACGCTTCACTCGAGGCGTTTTTCGTTATGTATAAATAAGGAGCACACCATGCAATATGCCATTGCAGGGTGGCCTGTTGCTG "?>61=28<3&@45A0A+1+)BB10H*3@?/344D@?4@A%8@+<5(D'!?=3"6H/81F>1:1D5G+=(E;!>$'EA?&-#A$=>A#12:1/@?&A1;*G"H%%A4>6EA4,EEH,1B%.,HD1DH1/&;:@5"2"E@CF!"'.D.5E:90""9<+?.:4(8,D%4A0.$*42<4+.-D5!2)C@$:$=*$-2A=8;>7*"4?+@DH52#>%:DDHH@.8*<3/'<,70!%88 YT:Z:UP jpayne@0: r5677 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1796 42 87M = 1608 -275 TGAGACGTCGGAGGCGAAAANTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAANAGCATTATTCAGCGCNCGTTCCTGA #E8.#A?;F6<5D==-%,-?,HD%"*@28'F58D@<@/(B8/3:ADH".6C7F-%2C,2>/<>AH+*F"&59"?;3+#E/#0=?3+E+(8)! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T60 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35734 42 86M = 35530 -290 GAGNTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGG D>,"!0BE?E:<<"F!>G)-A#"0(@$'&%G7B.D9C'71<'@17",B(C==/8,5CD9/=#C0A<&0936!<:.6GB4@0$0->0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T82 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35530 42 85M = 35734 290 GGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTNNTGT +GE);7/"'7%A1:20*F5"E,9D!;7,66)$/<6#&%&H1E94?(%5?<.&1G%/GD;4.">$C,%-!CA1G8A5+49!C.;@E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80T0A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5679 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20640 42 57M7I52M = 20515 -234 GAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCA 5.98+%DE<0-2*B*42E.F"G0,-#>@8799D?6)F,51%-D"C16!DG&A0?'*&%#>A'4)C4E0=9H>'353+*:0:+158-4B>.%#*-'$:/)#B%02@E0D<7<#1.3<7'=4%:=32.'/="(-A"$(#(D*3+D&&B+&,GB#$)C))5=.@8*?H!E"=A6;/';6!?(@AD94,@%"#3+#,B,6%!B0'@D>+,.918,E=-A/BH$#F1B;6G>( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r5680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8423 42 64M = 8579 246 GGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGG 7('#1'.9#:C/@1,>?#*(+*)"8%"7@$+='E'.7F:>F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8579 42 90M = 8423 -246 GTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGANGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGNCAGNT 3&D%9-><4F'%C$(B?F+8?H/>/G=8&(*#8*#.-EE,9B.1++@87!9"E>(C+G!1'C!(H+D$) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37C46G3T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5681 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18496 42 325M = 18821 479 GTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCNGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATNTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTGTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGG )665#D:(72"G%FE*"#2A*93!/!'6EBA3#72FH((':4'=,7>?0<4!=G#<;'6,6-C0H'3#5&HA#%><#A=2@6:?H76B0;E%CC%<-76HB1F.,922&>=8=E,(0<8.498?72#C-#.1G!EG,)H03-)%?(C>$E?F91A(&>?HG(F)48A!"'8?@6/.B@H/$(E%C#?##-2F3925$<://F6HB9AA4>0+)>&C7/@5?;*%BH%?/H065H@(E+!EEB4F-G)1.2%@+B.@'+47=(=.*%'G%?0@*+8!;/"@@##G;C/$2#@B(D:2GG:4!"B8.8.D4;3 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:66C35C73G71C76 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5681 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18821 42 154M = 18496 -479 CAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCANGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTNNNNCANGNGTAATN *++*"!&""&!((('+$!*'%"&#"%(#*%+)""%$$)%*&)&!+&#)++%&$!&!'#*$)'&%)(#"$)+%!**&%!'+*'+&'#"%')+*%!+%!*%%"'&#)&$('&"%!'%(!$)&%(!%"+""(#&"*&+%**$!$"&!&!$!#&'((# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:37G101G0A0A0C0G1T1C5G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5682 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32745 42 132M = 32992 306 GTCGACTGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATG :98?=''AH(>?90,AC;%2"(+B';*F!-,59,'142A$"E*::<<&0=$$(:/:#9"0()0"5G?4G<26.@?69>,52(60;;E@"1C5)D#A=.:B1F"&5'"!:0'-1<-G#;;=,$"2!().+=,4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A125 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5682 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32992 42 59M = 32745 -306 GGGGCAGGTCTTTTTCNATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTNTCTTNACGGGCGAGC C%$';2=FE%+%(/-/!)#:/!'+13%'B,$;#1G-CH/94>#B#>)!'6F&(D%FE#< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8C7C26C4C10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5683 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44184 42 91M = 44088 -187 CAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTNCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATAT $,/>74G):1@7"?'6,C5F6:G1./,@B@0(E,A1&/B.'1$B,<$-;7(=7?#*%+7GE+E6D@E(DC232G40$E"!4'7"AED'95=69/$!?00?3)$?99=*G-A?G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5684 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1430 42 170M = 1223 -377 CCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGGCAAAGAGACTCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGANNCCCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCNAGCAGGAGCNGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAA $30BD>>H?7EDE@)')-"<",H9E#$A!778/90*!C9;-,F3B#G7?*?F&.'/0&:><4;F4A:<"(:7=+#!< AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:38A9G26T0G0A32A16C9T32 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5684 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1223 42 207M = 1430 377 GGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCNTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCNCTCCGACGTTCCTGGGAGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTG 873H5C#F!E'C&!96&+H1&BB'H7=>6:40<<,#E=:E6<;F?55B($?">D;7G>"1.6H:3?7$*6#-4!!1"2A65,3E;>C68G*G%2:#19&67F9$$1-,,@(;->4?E3D3!$BH549+*BC87-C./B".,H8!$3F&32>#<-!$*GE5&>B2@.=#,@*7H,*%78##A:=)75=GC9?$E#1>2D'A>'@C55: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33T27T16T128 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5685 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13140 42 141M = 13281 408 TGGNTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGT ';$,92.35G5B$E5F;'"0:=.*C48#"18.A2+A5C3*6;?-0>AG,,4C2):?"#=(.318?C"<7#G$D77:B.;@CDC&.$6%>B(G31-BE//=GD@$=,$+6HC34!6-B,;@1CA:8:&"*"+3"75-)$=6';#++?5%8>.H667%)(@;%&7!/:F-7(:@=2=<;-2HFF46FG<-.D,8!/*(>"?7D@.:9("">!:3!%&5C?;@4GADC7,20-CG":BD/260C48#E14D/&G&C(1)E'2&4F*6C",3F57'=+$1:*.29E!=-!#D>8EH+&&7+<&>& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:267 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5686 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41672 42 61M = 41672 0 ATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGG 2!+C.<-GB/07"0(14%8*<6<(9H;-5771*=7:./;'!+H7(@H/%H068'!A(E/):>"$++!-6CDCC4HG2"1)8--5,3;"%3G+-04*=3>&G+99'"%.;&',CE>->$C.!/$!10"4(:D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5688 77 * 0 0 * * 0 0 CAGTATGCAGCCGTNACTTAGAAGTGAGTATGAGNACCCTGTTTTTTCTCATGTTCTGGC !+++!('"#+(#*+&&!*%&"*('$)!%")$"&!)())%%%%("%!)(*&)"$*)+&#$! YT:Z:UP jpayne@0: r5688 141 * 0 0 * * 0 0 AGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTT (2F@%8GC;'%>&-+9/.A5BB#;,7G7$8*(D3'361??/=3#%'4"F0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C60 YT:Z:UP jpayne@0: r5689 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41294 0 * = 41294 0 NATCNNATNGTCNGNNAAGNNNNCAANNTNTGGGANNTNGNGGCCCNCGCANTGNNNNNGCANATCNNNCNGGAGCCGNGN !#"$!!#$"$#"!$$!#$"#"""#$##!##"$#$#!#####$!!"!$$$#"!"#"#$!"##$#$$"!!!$#!$#$!""!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14719 42 149M = 14624 -244 GCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCT 1"1%6AC@%&49:/&860*A:-1DC>'5<51?07)75660",31E%"0=C0:H>,*C@D%(;G)D*(55D:3-9)3?C/,9F6BB9%B?5<#"@5H"9"AD9$6> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:149 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14624 42 95M = 14719 244 TTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGNCGCAATTCACTGCGGCGACCGCGA %$:E;7F84'28A#?4"1/5,$+4@(-*C<3C:')*-@8@/@2H3HA<2:5%+(%;D#(/.F(17)<>4"4EE5;CDH0D0%&DB;E@.ADC081?0,+.:?C0##$B$F;G6C11 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84T18 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r5692 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13422 42 374M = 13796 477 NNAACTNATGCNNGANGTNNGGTANGNAACNCTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCNACCTGACAGAGGNCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCANCCGTATCCCATTCAGNGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCNAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGNTGCGGCGAACTTCGTCAACGGAAACA !(**($%"(*'!%%()!&!"'$"&##$$%%'(+%$&&)&'!"##&+''*'"+$$%!$''**"(""#&##)('()&#*!(*"!#("%$!(%&+')%(#%%"!")#%"$!!&'*'$&$+'!&&+"*#*)**""))$*%&+#((&#"+$(!*#%*+(%'!"%"+$$("+*"*!%&$%!*))*!$($#!&(#"'!$*$+"((("$$)%+!#)*#$#$(+'+$("'*#$%$'+(#&**+%''#!#!$#*)"($+)!%)*+#&!(%*)$''#)"('*+"'%#+$(!#$&$'$')!%")*(#$+&(#)+)'"'")**#"&+!#)+'!"$(+$#&&!)+#%"()&(#&'*$*+'("#+$(('#'&+&+*&"!++&!"+#'$) AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:20 MD:Z:0T0G4G4A0G2T0A1C0C2C1G1A3A54G12T78G15G58T94A5T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5693 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5747 42 55M = 5535 -267 ATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAG -EH!6>*2-/B"-;2<)H>2"G42>"&#A1@<;8#*9<9H)$"6?A&#&?8'087 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5693 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5535 42 42M = 5747 267 NCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGA .B=,$:G;B*2!7:2C<+0=".*D9%39+)5CF%(4&4!6E8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6337 42 80M = 6156 -261 GCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCG :H>;'!'"3?:C;6;.BB/C8'20-!<;/+3)F:D9$'8B.)&*6C"3!&,E24%+: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r5694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6156 42 67M1I29M1I53M = 6337 261 CAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATGCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGNGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTNTTATCTCTCACANATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGAT +08<@(0?@C-,16FBG4?4';:$&DGA/.-DC=5DA%/DC.B*08F.E"0>6&0597=/<':@;3F.(&>F7<@E?2&AD2+C?3C;,3<&"(=66)39/,)!#B+=8$GG3D05%@='!-;6(80DEEG9/40(B7B=)/%=%G?:=1: AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:39C25T29C11A41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5695 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22706 42 103M = 22899 290 CATCACCGCCAATTGCTTTTANGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTNTTTTCTTCGTC ,AE+3/1'F1@)9D*@?;#:G#D48'5"&"8/53<#5=F;)6F-2!BD<$2;B;80/$)CD+2=D$@,"!.-B.F35+23.)$/D$:66&7(<"/,-+'/16A0C/"5G"B3.#;4B0#/;#<>:<=+8<1F2>730 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5697 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36552 42 102M = 36398 -256 ATANCCAATGAGTCAANAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTT ,*4/*A'(004?84#!+D!C)(F4!"#>HB9)+%5/C<91#'&39+G>62AF8(/)8:3?)/C;AH+C<("E@$>7=/;D31/&8:42=A(/-G6F@5D0(2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T12A85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5697 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36398 42 104M = 36552 256 GAGATGGCCATTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTNAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAA *0C"9&-%4/+6902-/(/*@!6A(;EG$#?C6!<HA5;,,.::8-C2"";)498,D:29:(,)E&6)'G#<007*F22G302F!EGD&H!>#1&>-#=70'F>&@3<>C*%HH*?'E=DG&/A-"@"G>C@D!?CG*;/6F"20:86532(B)4/A:&HD?-;?0)AH AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:64^C55G49T46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5698 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22613 42 327M = 22940 544 AGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTNCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCNCTAACTATTNTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAANCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCAATGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGANGCTTGCTTTTCTGAGCC 71-;4>((:FC9D0=D0/+E3C4C03'$,47'!?!64AG8=A>G)&*#+%40A*D%A"':AB7;8B/&11:0?DF.F&0-"(!EE;=A@CH7':?=7=HB+CH8)C?,H0,3+8>>@&0/%!.&A8=-7'D&@42#8&03!7<,*$#9,=6BE697C=17G5.(-:$$%0;3=H,E@$.5.87!::1DC<#.=2G1%732$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:65T133T9T32T39T26T17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5699 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44287 42 88M = 44426 283 GCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATNGCGCT *0-2$-E$:43+3+:$%(F#E(@.)%@'@+.2!CA98,E55/$>*B0-39$7D>4&-&,,=@?)4+;&/D);+>"=15F#4">1:7(? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82C5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44426 42 144M = 44287 -283 AAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAANGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTGACGGCATNATATTGACTTATTGAATAAGA /9);32."28E1H>=C9:/'2F3#C&*61&)?HE/HC)FE4=#(!#6!>("*C1E/=)?/F8&&5?GD?#D8)&//?>9&F76-)'5*F'<);*B:!FCF0&$:E==5?!")#0>21=!6$"E<99DCH>+A?#"?"A9E4@!# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38A75A7G19A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5700 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33662 42 271M = 33392 -541 GAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGNTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATC 40-"##*$7,D/CGH6/G7=H'A))"B:2&*34:C**AACEB@&5.6+!0<-'2D6"&?!9%0ECB9D!D.8=!AA@(&.;3#%;8/4>?%#GGD",7D;+<78H2AEF#)90#:<5H!5%*?FG(&/9$-&":.A;+*H2/C!?3/$:&BGF2F,,8A'%8(H#!3,'42G--11;.+3@GA3,8;08<5H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:235T35 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5700 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33392 42 270M = 33662 541 ACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGNCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCACATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCNGACCATTTNCATCATTCCAGTC $GBAD!2/*@F:0D+A>6/47!?&)EC0@*4H%,2$GC.6)?(/22:*6F<,!")@)=;-%:3E&GH&!68.B'%-';C#E5/'--.C11*E!AED<;%-4)E2G0G1)F)G4<=4?C+;>F,&$%*!<>B."=2)=7A((%7=772*.&E$>7/(?%D.-&/?@H'D=:E"+6BGBA7EG29*GB-5#:93/+6*#80=):/-@GFA)9.+)0%C9-"">7F)D5BGD!CHG4GA80"F:=:4+0/90?=G%%D(#:H>H>$-/(+DF" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33G144A20T47T8C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5701 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34783 42 262M1D10M = 34671 -385 TAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGNGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTANTGAGTTCATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTNTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGCAACTAGATAAAGGAATCGAT $&!(G53D,@C';"%4=5+)!2'*)D2FG)<(35#&!.*#%5.@A62-+,B>$4E38F48GE50C'@"'**,&=2*0)-D7*%$D>!:4',2;H$G>!,)2<4"$F58/:4F%%4!#/DB/#8/B3&!F48=3DH3-B/"C?=)7/<1EF/2>28+6F,A*E@'"3$9%&6B$(8-#=!./=$DD@#=:(424(5=F+<97*H./*(H&'4H<.9C2=>(4FE#3?C"H6%@'B?=25#HB:00%0D93=('2& AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:29A8T60G6G27T2T113T10^G10 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5701 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34671 42 42M2D68M = 34783 385 GCATTTTCGCTAGCAATTAATTTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGNTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAG +&&)((*!*+'*#(*"&'""'$$)))!"%+)&("+(!$'%"!'!)!&*)'!#!#%%#$+(*"$*##%$#$!+(**+)##&'+%*!"(%+%$++++)&&*%)$!%$()&#! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:21G20^GC25C42 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5702 77 * 0 0 * * 0 0 GNATANNCTCAGCATGGCCTTTAATGANCCGCTGATGCTTGAACCCGC )!*)*'!&#+$'!)(*'")')!%#++(&+&'*&(*'#&##&%"$&()# YT:Z:UP jpayne@0: r5702 141 * 0 0 * * 0 0 AGACACCGGCAGCACGGCGGTGCCGTTCATGACCTGATAACTGCGGGCCTGTCGTGGTCCGCCATCATCACCGGATANTGCCAGCGTC $)$&+'+%"*%('&)%'(')%+%&"'&)*&*)+$(%&)*)($'&('&'*%+")"((((#!$%$')%(#%#"%%'%%'+*+")(+"+*" YT:Z:UP jpayne@0: r5703 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30217 42 66M = 30413 260 TCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCC >?9%F0+4'&$"8H!E8:*28AF90/4>/E"/&:%H(1:9<:G52.D;*6D&,,F>1.B(==-@-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5703 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30413 42 64M = 30217 -260 ACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACATCCCTGAACGACCAGGCGT F.9*8F%(;#7>DE,E8+@7C=$"/2ED*5+#&##G62>C?<4#;)H@%9'-*@G!514AB77) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5704 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15636 42 73M = 15709 241 CGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTC 98B0,3#8)9#::>)B@?CA':43.61*;=8G-/F%=%6H9::91E/+*(+DD"-A*3=+G,&!A&/B"=-#> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5704 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15709 42 168M = 15636 -241 CGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACC @,C$@AFBH!;:B"B<(F%//AA#<-4E@0(;DG(HF8//,H@9AB?,2//?1!$17)4.6/+,+@*>;7:",@>557?)?#,146H95:<&-6,:<'8D-**5A)7?(5;,?D!>);(/-2E@*9.79D"?6+(2HHF31;>@?H>5G=H#D;;0*('"$A.EF#'< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44250 42 43M = 44004 -289 ATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTACCAAAACAGAGCTGTG 2D=3-#%-A:1<6/-)#<5.$1*9!/&",C< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5705 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44004 42 64M = 44250 289 TNGCGCATTCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAA (&$)+)*!*$"+#)+(*##!*!#!'%+&#!)"#%*)"($)#"&#(#%"&*+(%*(#"%*&(*)* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G5A56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5706 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2104 40 137M = 2055 -186 ATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGG =B@FG>56/C(B6'#D:3&G1=9<4(B2?E%4;=9#!B'3)>2<."%*##B%>'2=(2/:#89@6*41;7=@(*;$+9D27)?8E%?4;2B&'%A2!03.AABCH:2@-2+G$<+!%C1)")#7((;-H!D??90<= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G117 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5706 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2055 40 31M5I18M = 2104 186 TATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGG G//4C0/!""0H<8F40'(!/H::/GGG,7'#10F>06(A3<$6:5F?"3%A)= AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43247 42 74M = 43048 -273 TGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGG 4E&";4A(.;'+'388!.$"8<3E9?A/A.0H34:B"F7&E"10/6/D%)1-9B=9*:"8&'+6B*':9F-9!F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5707 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43048 42 199M = 43247 273 CTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACCCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGA B8!8881B(+$2E/6AD5$F@53@@*82";?'F@D'-,:6!<00*=16$$@#AF8!#**9AE&52/?@7F+0"8<5:;<@<'!G61(3.HB5"'?D(?++:D1546A8E=!0/2235<3.A?9D!F4C5EHD$+3#G:.<@H%#/@*F7"5#H<5B5F-7,,8/';!==-AHC7.(7=)=256D/E),1>3A69;A?$, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127G71 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5708 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41291 42 134M = 41425 232 GGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGNTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAANGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATT 30-';,?&93;<004?E7@30>A?11'-E:+F!2)A:E(!.3)9EDB'G)HD4H7?;<<'(8G2@>!DCBA;$@=&8,=E:5%-5H*A>G(<$*A))?32<"5+B!1@?@#@;3:EH-D5+)A$'HC"9< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58T26A48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5708 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41425 42 98M = 41291 -232 AAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGANCATTTCGGGCGAGGGAANTACACCACGTGGATTGGTATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAA 12BD#..1.E=!4/-#;27923>H+8?CB)>E8061C!B:!($E!(?&&1E!.F2&"08E843D80C.6@<@@1BBF2CH$HG0.)EG6!(>6.1C<; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33C17T17C28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5709 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2347 42 80M = 2486 199 CGAATAACCCGGATATTTTTGATCTNACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGNGTGGATGGC ?8!.>4!9F.CH!8F-H>3""9722%H@48"?GB%=,.50FD*=496G78&%42"@G78H7'F7(:?B2&<>6@;AB<61,0%301@>E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C38T8G6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5710 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31171 42 164M = 31336 229 TACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTNCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATNGCGCCTACNCGGATATTA !92576F+H0,@H(AC1-"C;5!)D+H"D/<=::-"3-H8$6-;-,(BD(6F9(!-G"6:"2.2$80DDB=,7/2-+"?!'7$).=07;&7@@4@*F,@,:9!D$D$HH&,/+!7(72/-F&.1;-@!1,,F,7C"'$8'9-@/:>1.@9B@)-H%/.D7(6%$.E6%8FC)@(HB$F54#@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5711 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38530 42 70M = 38677 234 TCGNNANNGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAAT ('"%'*)+%($"%)*+)&)#)*!(+%("%+*+*$*#&$#!$"&!%'+)&'!+%*!#%$!!%""!$#"+$& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2T0T0G1A0T62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5711 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38677 42 87M = 38530 -234 GGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGAT ,?9>3(A'F)@&?;G29-.EA.55#@!@4B3$4!2&#()CB?&B'<*8$0A0E?&,$*1:,#=$4G1@;C(-0C02E/#10:79CG24')>''G.=5*$%-CC9569G0+H.0@.*(G+/=.-0#6$=+?<'3978;($65=-:(F7#6B#/!8<565:C0-77&A"#DCC"<:2*D17*,9)F1$8#%HB@>3)&E&#'2=AA%;A93!+/7/+@F42?@7-H*:&$C<)"=E2CA3969:!=#(GDFA;7C<3>=$,')(@5)G4&- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81T48C236 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5712 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47614 42 95M = 47247 -462 GGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGNGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCACCA +%!(($$%+&!%)%(%(&!%&*&!+%%$*%*!!&"!$(&"%*%(&"+%($$$!&)+#"#$*"'+)$+&+*#$+$"*)'&*#%&()#+$'*+"&!& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47T43G1T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5713 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35420 42 136M = 35248 -308 CCCCCCGCGATTNGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCNTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGNTTAATTTTTAAGAGCGTCACCT =-/2(GA98!/6>.'01+?5#+<4A:BA,FD*$65-9*H4.-+<5;"E"#!@GD7),7GG!):?E!><41HG?=0.'&4:F(F+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12G76T23C22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5713 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35248 42 63M = 35420 308 NNAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGACTTGCTGCTTTCCAT 0#!0C'G!./)609)?/,G/'4/E-,6?,$;B7*(E#2:9&2C5=C%DG(91*8;*($H*"(%8&H%7<*"-5'5(<2,(##;3?81$6@88+?/)5,B?;E!+/0G"5F"C+4"0-C1$.>B%#425/*,+E%%&A3)(1=A$($:'/#DE50=26E,4E')(8<%-:)(F)3#C6B:E0*&583H0#&/BH9/0952=+5$/4GAB;H;(,>%'7AB!9.C2GAH/<(D"%.*+/$"H"$7E:3;%85.35B5,*33&(929$8??2*3=HH6!/>),0412<(;28<"3%G:E+3/2F4.0H!>#/1(5=+!6.@&&A+C?2CF+/6GC$+5%/A&4*7E=%5;"*@*(9(D:E:C752:7F0@,,=D$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:167T14A94T8T4A58G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5715 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36325 42 59M = 36384 410 TTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTAAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTG +$)&#!$"#*!"'&"''!+#&#"+!+)***$$&)&&!$%))&$'"+$"!#'*"%$"!*! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5716 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21686 42 185M = 21871 320 GGTAGNTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCANCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTT @!3:EH0-;$0G?,.#;04-;25=851+%.&;";@%%$1>:'=+8D-9>#D@&3G5F4,:$&.A5:<6:*(#4>;#0982*!(1A,BF+5/@/-$>>%71/G#<&<4F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A2T140C38 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5716 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21871 42 135M = 21686 -320 CAGTATTGGTTCACACGGNCACACCATCACCGTTAACGCTNCGGGTNACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCTTACTGGCNNNNAGAANGAATGANNTANCNCGGACN $+*#*+(++')"*)!&"%#'(''+)))$)#+%'&$+#($&!)!(%*!$!(**"$!$%%*!#&$))(!"%$!+)"#%!+!)$"!&!#&#*(%%'(*#*)'+*#$*#%*!$"#$"'$"'!*#')!"$'#%"))*%*! AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:18A21G5A52A2A4A0T0T0C4T2G3A0C0A1C1A5C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5717 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4858 42 134M = 4765 -227 CGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCNTGCCANTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCNGACCGCACACACANACTGNATCGGCGNNA '$"%!&**!+(*"'+#!%*)+!)$#$#)+'))!!"$(#$$)%%!"$$**%%")"("$&!!)$#)""&+())$&!#&%*)"%!%(#'!!)()!!!!)+(**))#(&))"$$*''%#*'(#*(*##*)(#'&'$(' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:71T5G26A6C1G0G3G0G2C0C7T0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5717 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4765 42 51M = 4858 227 GGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCC 2F1)63H'."%.$&5#=@;=-0AF.4"H8:6<4:A7.84%GF8H5$:H93) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5718 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28855 42 172M = 29027 249 GGCGCTNATGACTTCGCCTTCTTCTCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTNCAA ;6E@-0C9<>0?EF,!26:0<9(*.#E,7+0;6@$4=A*%G)79"E(*7"$G3+.9:*&D0#8%G:HHE-3*.:0/C972DFF@=+148#)1FCB0DA8%8FH!%9#"+2,4B?7-5+%9>#B*D?#HH/AEC#$"C+"(0H(#@,A7(1-?'0/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C17C143T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5718 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29027 42 77M = 28855 -249 GGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCCAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCA )D"75C!3=;C2>=E*.&;(5?4!<$0@+0CD'(AD;9*&E9A--B9*#6(&.8*E<=5;,=>+B8H)34(/A+)D; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5719 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32055 42 25M1I28M = 31869 -239 CTGTTTCAGGANTCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAATTCTGACG ".GD0)3:B:!G/99=66(D8"()!.(=:ECH8#DF;$$)&D4%69BG;0(>A#.,(*#H:8F0E8.#!)$29(+%+94B8117A9%ADA;0,(%:,7"20 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5720 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12813 24 60M2D80M = 13046 301 TGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGNCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATA **,6:8/?6&$HE$,6F*E3@CF!5)CB;(-(@!)&'%9.)FE5#G',53:H%&##%=<9056=G"G:2?,;*':/%4.B>>#42%:C,.?D/#9C:CD&%&-/32;,1#G:D@B#FB'0<1=06'.B#"1.E/%&= AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:1T0C0A0C0G52G1^TA80 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5720 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13046 24 68M = 12813 -301 TGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGGCTGTTCTCCGGAGGTGGACCATGAAGAGCGACCG %$$#'!!$$&('#&!(+$$*'#$&+#+(()+'#!((%!!(#))%#+)+$***+!*)"&*()!)!#*"# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33C19G7C1T0T3 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r5721 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5871 42 66M = 5694 -243 CCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGG <=2%7A81>)9@7H9&CE1B<674GB$"5=*1;=@59?GC)<5DB.!<9-E$'$%B(.#0>.D.*4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5721 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5694 42 112M = 5871 243 CGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCNGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACNAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCA 8@6>,$*DEA%?B5ABB-<''078A**H:>.%+)81%C@D>;@BHFG&!&C!EH6&+:'?'CC2CG")0D3H0<<;,6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27T30G47G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5722 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40244 42 69M = 40035 -278 AATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAANGAGGCAATTATTCATTACCTG 83E$5=BD0E2A+5(@3>G;//-).,-A,=!G33-54/"4A&GG2966$"5)0$7")<#<4/H5C3>2-,H':F2*C)0:7E#'#$2::%H!+B.10(!2%$>!H;G14A!)C1D'*=#%!;>=%6C=6D$E$&;27?C$=##634A';?$+FA5('>+H,6H#&9*@2 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:63G9^GTAA36T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5723 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16566 42 52M = 16674 254 NCAGACGCTGACGTTCGTGCATGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTAT #+#)$&"*+#+"+)%"!#!"#+'#'##!'#%'$+*("%%%(#'$!"#!!"%( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G20G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5723 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16674 42 146M = 16566 -254 CGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTNAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGNTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTA 1&24.+E"F3-%*(1H#%?EF$2&D."AD,<,(4,&8;'BG!?C;2G=4)%<4&;HG--A"A>H@,&(8('#327):2&*?&BB=?FF.));;H-9:4H> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33G7T34C69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5724 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13079 42 48M = 12875 -252 CCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAA C/.0#*&/*6B3D(@*.!H=G!"!A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5724 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12875 42 44M = 13079 252 TGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCNGCATGGCATACA '%*++%"+(*#+*)*)$"###""()*#+#)(&!%!#&!#(&%)* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A8G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5725 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 925 42 80M = 1069 199 TGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGNTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAG /%-"E=-&4-E!E6"!.*)?/9#E=-@7+'F06-8!:2D$*F)5"$@B1/=+"<3E5(/#?H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5725 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1069 42 55M = 925 -199 AGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGNGGTATGGCTA "%$'(!#&&!#*+"$#"*%*"#*!)&"%)"#(*"&$$(*$)&#!'**"&#%%+$* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T33T8A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28331 42 182M = 28530 268 TTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTNTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATAAGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCNCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAA '/90D<(77A'8G"92*<9:A:C*FH2+,60#=.B,F78=EBG377:490C46-)'>04.!B8@<9A1)2(:F6FE-F4!G-%'67$%5=9937>).D1!!G)>B,'(2/&07E.;%!$:=<44"(D!H.'7,:$2%3,D8>B*4@2=H(5C!&8='-AC%=7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C43T65G39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5726 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28530 42 69M = 28331 -268 TCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTNNC "%&#%%#*#)$!+"+!!+##"*"&++*"%'$#+$*"&)("*!+%+(*$$$"#!!#%$$)'+(&"+)'"' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66G0T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5727 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15608 42 103M = 15608 0 TTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGANTACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCG B"4#>+@F7/&33*:,%'.-7D,D502'17A$8$@C.%'8>ECC-0)H.8=A4DE71)H;0!A@,:.70@=?EA%GE7#AGB10C()7A5.';#29&G?665/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69A33 YT:Z:UP jpayne@0: r5727 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15608 0 * = 15608 0 CAAAGTTAAGGATTAATTATCAGGAGTAATTATGCGGAACAGAATCATGCCTGGTGTTTACATAGTAATAATTCCTTACGTTATCGTAAGCATTTGCNATCTCCTTTTCCGCCACTACATTCCTGGTGTTTCTTTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGNAGGAACCANGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAGACGGTCGATGTTTGCAGACGTAATGGNGCGGGTGATCGNCGTGTCATATTTCACTTCCGTACCCAGCACCGTCTCGGAGCCGGAGNATTCANATCCCTCCGGCGGAGTCTGCTCCTGCTCACCAGCC ?0>4)E2#2*5%$@"?(F9/,,48%EF/F/+&AH6)'8)8C+2?!#:$<'C>G%"55&/)38<(B7@&@%*&,&F@@D;.*?H;$0.>8-+'3*)B-86(A8,E%:%5=.!C%2H$H2(3*&02EB2./G0;D'49:5)=.,?:'8'=91!;BHA!?9(G73#F=?HH&9-E21+-3=A%6:@2+D,(,8$3=D78D:(=;B1).","+/E2=E63@8.*8+3332$8E3/9**!9$7$D:,9>E!GE.#+4-"8$7< YT:Z:UP jpayne@0: r5728 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24988 42 70M = 25192 271 TAATAGGCATCACCGAATATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCC B$?BFE3:9311C+0D7/E$E&=.)6':#&C2&.'*7(;E@4/@!$?$-1H6"BC;:D5EH;)/61B(&?@<00H$5: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5729 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7405 42 144M = 7549 289 ATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGATCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACNTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTC +)%'(()&(#!"**#$&!##('*)*&#'&'*'%&%!'#!**&)'"((''((*'"$$*'%$&)"#$'#&$*#&"''")%$#())(+%"%($&%!)*(+$))$)+*"!$"(+%&"%%#""+"&%$&$&*')")(#'$$#+!+**#* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G39T60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5729 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7549 42 145M = 7405 -289 TGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATACAATAACGGGAGGCGNTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCNGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCA )+@1<3:C209"9-H-&.7,<&(+=-06"A&)3D5,>?F-$E)&@*%'A0//"@F%B;D8:/+5G!6@-&9AG2%5D%6(<*A*&7#=':*A'26A3+F$-H2C;;:1'9H/(46?*(<*(C1E?2:"0('!-/96-049F%:6, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45G15C45C37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5730 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19581 42 122M = 19407 -296 TCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACA B';6C"*FHCCCC<15="')!D.F*<4C2;(:3=DD958;HHH$-.)$49#&)#"#G0'4-F0/77D@G'<70/AH6D8@0:*8D9#./,,419A>7C27B>>=,+-)$. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5730 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19407 42 70M = 19581 296 TGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATAGCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTAT "1"H'1%<1'<&C/9GDG($G$**;:H'F'?H7:&416/"03!H1>'H+0,:,%0->G&!BD>A7;.=::@(G:@G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5731 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13443 42 51M = 13243 -251 GCAGNAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGT "=FFB?>F09*C4$34G&+A3'#A9F04<;&;#;,&;10(C@;*>,;H&<3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5732 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39185 42 100M = 39069 -216 CTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGNACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTG 2",(B9H6AF2*25)1!H76,/B!.!G7*8F,$B529:;*6;13?D"4&"<(+B4H77,9$0+<545D(G:FD4&B%9.C?2D"'5$3% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G29 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5732 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39069 42 106M3I10M = 39185 216 GGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAANAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGNATCCT 14G+@71+)=F1G$,B+A$3%4H;-@5G5/;D=8-H4*@A=7=!%+H2$!<::,E"9?!)#@/&=1!*;92#-/D45.4$4#.C-:2%*D!DH#<@8A3F9..2/,52BCF(56,*583 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:80G29A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9923 42 147M = 9814 -256 GACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTANACAGATTGAGCAGGNAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGA 0=8!=<0G=>?7@)3CGA!%EC.5<*?1%5;3)1!)H'30D'$H:*(G*0GGC*C>C#(=G=7&>H>@B4?*G5!E1&+338F!9(9$-13#+>)2F+%,0G=8*5#7E@GB?AF&(AA&4/(D#2-3&@8/4$=>) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A14A99 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9814 42 109M = 9923 256 AGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCCGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAA 3>#3'8#!</#('"%"$*><,,>F?8GAG5E(.">A0@,8'H5"3("?%HBF)F%4A#83 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26922 42 143M = 27105 237 TTTCTACTGCAGGAATATACCCGNCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCACTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTT ;6/.>#4;F'>($H2>&-&H:43;?6&&.G2%H2$"+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C86T32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5734 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27105 42 54M = 26922 -237 GTATTGTAGTTTTNCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATNACCCACTGTT )C11D2.5(2=A7A7,=,/:)0?C35DHFA%-GA#;14:=*$%%1(+D3-#6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C33G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5736 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34019 42 124M = 34221 243 NCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTCTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTC '-G81&;HACAE0'6G78,!"8/CG!;'4-$74('!-?-G:H:.-1A7>*->36$)>C96G#30$+D'8-F3';::005%AA44:A!99GAC400H>(4#=8/*9/'6<1C*93H1"DH<=9.> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T79G43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5736 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34221 42 41M = 34019 -243 GCAGCTTGCATCCNTTGCNTCGCTTGAATCGTCCAAACCTT %'(($*'%"!""+#*)%*&'%*$$#**(%"$'(&$!%$"$* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13A4A10T5C3A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5737 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29295 42 183M = 29478 335 CCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATNCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATNATNTATATGTTTTGTACAGAGTGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATG &6C"8(-!F)*'&D$'=CDA*5:61@$,<<*,.A%@0?!9D#!<2=$F"*((5!"@!6:&B10<@03@'2<<9$,@<5-3,/4G2'-*'?&2H'>CF:8,%,1?(37C6;5D@::(;C5$A>>B($7-@E,)4;H"B9&*!1F::5,-3;-956(-'1BDDB<6A14H+:8"+1,E08EC)H( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:43C40C2C18A76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5737 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29478 42 152M = 29295 -335 GGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTNGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATNGATAACGCCCAATCTNTTTAC ")*''$#+&'((%$+*##&'%)##"%""$+'$)((*#%+)&&!+%"++!#**(')"++&#%#''*"%+)*&*%($%"*(*$$"!'""*'&&(&*'(#%+#+#&*#)(+('*$*%+$"&'+$)$!$"("!)"!"$+#(#)&+(&%&!(*&+*$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:87C42T15T3G1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5738 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31956 42 124M1I106M = 31856 -330 GCCACGCATCATCCCCNTGTTCGACAGCTCNCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGNCATCCCATNTTTTATCCAGGGCGATCA '(%+"$*&$%$')"$$+(+$%+"!!*!((*(((##%$%+%#"##()*((*+%)++(&&$')!('%!+#$"(*%'%+**#*+(%%(&"$#$#+)#$&)+#*$&"*%$'($!'&"()')$(#))+%(#&$%&!+*++#!**%)&)&)($&#$#'#'&+##(%'"!+#%'$&))++%(++())#%%'&!)'!(!+*#'+(+'#)$'&*(%"'+)((*!'#$!***+*"**(*+) AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:16C13T99T71T8G18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31856 42 52M = 31956 330 AANTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTA 35.H4B.(0H",B@!HC'@7AB)H?,?0HF/=/>(1#,,=@?0?*F?'3E<' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G49 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5739 77 * 0 0 * * 0 0 TNCNTTAANGGNTTGCGCTAAAAATTCTCNCAATACGATAGAAA *!(%)#))(&)$%*)"++*'%&$!'&%$!"))%%!))+"&(#)$ YT:Z:UP jpayne@0: r5739 141 * 0 0 * * 0 0 ATGAAGGTAATTTCTTTTGTCCAAGTNTGACTAACTTTTTTATACCAATGTT 38'$B3D!8=>#">=HF&7H#?@/AA7"C:)<(D4CG+9$7E=;@F%-18'; YT:Z:UP jpayne@0: r5740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48284 42 156M = 48224 -216 GTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTT %D,"G.A?.70B=035!%-<(7H)#6-%6:4#%/.C'73;+B>8CEBG5<#D>"A=;G$G(3E,=-9C?3-BE!9=*8AH42?G51*.-2&&G1G,;'<4;/* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:156 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5740 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48224 42 60M = 48284 216 GNGTTANGCTNTNNAATCATTTGGTTAGGAANGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGG )&%*(((*&&#%!"+#$#&$%'!#)&#("!")!!(#(+#$"'!"$&*+*!$##&!"$#(" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A0T4A0T0T1G1T0C17A28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5741 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12827 42 46M2D47M = 13086 310 AACCNGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGNCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCNTNGCAGACAGCC 22GG@($;B(A'2+F,,/921=(H5(@8-?BD,'@AC?72*0D.&0G6?G"D--.<+B2,DB)$HH$:>?>8@>C127/..&9$!01$=,1!( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:4A41^TA8G25A1G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5741 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13086 42 51M = 12827 -310 TCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGG H7>>#"''(,+*7$+):E/@B!F6.',$91@?B2'#&4H)0F6AG!#=71G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5742 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36202 42 92M = 36294 299 TTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGAATCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCNTTAACTTTGCCC -!$)A!=7C,!:&.770378"?/*06B#+",)->2F33F728&+#$=35?2:B1CG=-5E+;AE6A@:<,9;+4:%=A:C<*6%'5)#1#C1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45T33C12 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5742 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36294 42 207M = 36202 -299 ACCTGCATTTTAAAACATTCCGGTATATCACNTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGNTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCNGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATA G;-+!./(.&*$?8+;00;<'6B&ED7(<(DF229H:DC=%.,)F:BB:-;)*-GH,1D>9FHF)!2@=+-HD"9H05>#&DG?0-@?8>@%C<'6F:&1'D67E3(@HF,6>A0'%=>7.7;5+HD,,0?$5:1D4F8B92E2:"E?.)6.*B>*H.B+&*3B+(D>:#5A(-7(7:>%&=G341D=+5/H:"1=%?42$60EBC, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6C14A9T49G67G57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17010 40 91M = 16831 -270 CCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCANG FA3;9E#/,@=D6A973B9.+/"C$)-C(.&"&A.;#.H.'G,8)@,C@0!9B#101A1>4?49&E'<,4+%% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:89G0C0 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r5743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16831 40 27M8D144M = 17010 270 CAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAANTGCTGGAAACGCAGACCGTGNATTTCAGCGTCGGCGCAGAANGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGAC #HA.;%"0<':+;9EH,<=;0@B393'!-9A3#:=&@3F@#%E20B8H9H6%>%EA)H;@0'A73<37/"A"@(;6773/.!%>A=GA&E8&>):(7=%+D' AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:27^ATTAAAAC4C20G20G97 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5744 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39924 42 89M = 39756 -257 TCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGA @/*$8C%61H0,5(15H=($F.%?C9?1'&;+>95(H:&03&E2=/247$EG;)G38F('AFD+B%:/6@>5H1>@;B">+8):&3*GB7CF?(#;#%F6D6>A1@-"6.+><@7.$BC483&!#H&$09/;#,1-!/&%"B$DD35B)D42)5?DC7EH*2B"'#F'@5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77T9A32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5745 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11334 42 46M = 11454 240 NAAGCCGGNGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGT #*+>!;9).,"@).(&/9>:..'$>E"B,3:"HA2F,,8B)7(*/9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G7G37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5746 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29033 42 155M = 29188 368 TTGGACGTCGCTGGCGTGCGTNCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAANCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCC 8:=:@;!2!<:2?#"402D0GB9C1E>24<((69425C:29*)2-3;)D#=3,<('9@//417G6#:/+-<@$0=%&20C<,;@5A2).<@#:8("9/+&&&*%02CA;;%<+ADD8:=#2<#-EF"0!5">!3E.=H.<@/)+)-3<(>1B(F! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T57C75 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5746 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29188 42 213M = 29033 -368 CATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTNCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCTGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAG <;F*-/)2!"+@"5B'&=-;4B.%%%?/"&H4E,$3!H02"A/A976*(2.-6B,&*G*G#;7<2(<7"1&,3'%'@1(=)=070$.$=C4?G'415!B:.6=23+3@:0!-3C%'H+#1>B'&(G/6*-C##,G:B;848!:'-FB68F>&;7"8>'97D&=0DF AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T9A35A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5747 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9969 42 101M = 9794 -276 GAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTATCGGCTGTCTGGNATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGA 5#8>0+$D/@#6H032G"A#&8D:?2/;,%3<=<7@":7FG,D%<4?99&A0!!7A%H:!+/GDBD13/G4H:59-A=*(FF01=..#0%CE!1981>3)3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56C11T32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5748 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23444 42 150M = 23593 255 CTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTNTTGTNCAAGTCNGNCTAACTTNTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTT 6*-C9H#0):A5)/+GB-5<-+(&E"41!GH2?E9A9*F2&/AE-;"9*0.%,;-(>-B@@<.%;31&83-A@EH-*+5H5?3)49D,@G@62+H(<;=66D&2(&HD10!(4A$9D+/"B+&=A"(+87C6,/>2)872<.H!?&!4B.1C8>%@))G!(, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C59 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r5749 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38382 42 169M = 38579 261 GCTCGGCTCTAGGANNCGANAGTGCGTNCCNTAACAATATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGNCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCATTGCTGNTTGCTGTTCTTGAATGNGGGGTCGTTGA !)#"'"%*(*)()("#(%(#&(')$')"!*)+'$($+)'#+'$%)$!*#'$'#*&((%$%$'&*$"))$("!+*+*''&$")$+!(+#$+&+%****"$!'*+*#(("'%#&*$!+#+!''&!!#*")%*))$+#')'($)++%!"+#(*"!!*!+!"$#!'++$()!& AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0A1G0A7C2A0T3G7T0G1T6A40G55A5C16G11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21607 40 77M = 21384 -300 CGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCTNNNNATA $(%+%*+'"("%&&")#*$&&+%*$'%$+)##+')"!))"+$"*("%&)"$)!*%*(#$!)'&*()+&'%$$#"")# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:69A0A0C0C0A0T2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5750 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21384 40 40M = 21607 300 CAATCNCCGATAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTC &%')'&*""%!'+$$#*"+$&%!)'$$!#%&%!#!(*+%$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5A0A0G1G0G29 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5751 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34101 42 85M = 34208 203 GGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGG $0+0&4@34;01>2#4'-9,0+06D60C7*3#/&$?@.=;%0<-&???@"H2=: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G60A21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48136 42 117M = 47947 -306 ATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTNATTTGTTCAATCATTTGGTTAGN 87+$G&$HD/%)#1-.HD6:D$<;*$,;/-:8G5,$/A04?,-0%G*&,8:-9&21:$#?.?F#;*H2E67C/';E8:11#+E90D+4<)G?$@G+#47H)98?$(++;C&:FA"H;1298#!2E5C*,;8/#A3<225+D0>!987BE<>$."/@E%4+@HH;C=<1H,(<1)H-&2#G+<%,',7DD<<=D,%GD#E=0>H+>F)H-#3, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5755 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10579 42 72M = 10651 367 NTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATG "9"@F)07#:*$="2D6<B67*-.A&3F=1?9>(-5%%,4(B%B>F!#0E*;9100D..9"*3/2!AA,1.D8/=EA-@G==0:<=@=639$(2E>+B(98)085)":1A+)&?2.<=;>F*&D02$?;5)<;0,1CD=6#B2!?B5>'9"BH=CF>(7G4&,>G%,<0GB$.62%4C+;=&CB%&,@&8E0F$/4036)8);50$-A,55"D>(://A!!3AACE,=+658G/:."9EFE)1&G#G$&G6.>C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C279 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5756 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45381 42 286M = 45667 330 GGACTAAGTAGCAANCTCGCTTATATAACGAGNGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTANAAGTTGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTAATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGNGCTATATACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAA 012B,@F+D%:(2DD,?<35@)+'$48@3;EFH!D3-(9/G$F: :%6*4()(;)4@>8+=H(0:!,$#+BF-$6906*/*;::&@8F5-4:1'2<-6/9@1+@3.BH;HH=@2=/7B5"!2&>"-B*2CHE8H'H669'A:6@))&?C.76;&&!@C.A!4F>.79"2E7("6C='B($,@"''2)C&25A4+),G:/CB:;:>=@0/4B!DA7>,%20)C$,8B8%B'C/%8A)A)/BHE@GGD2(=53D((6$E;$.="%@5(6:C$4,(C77D AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:14T17C75G3A62G54A5T49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5756 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45667 42 44M = 45381 -330 CTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTG $+$&()")(*+)%%$#"+'""(++)*'#!%$)%"!%#$"(+*&) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5757 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43521 42 95M = 43429 -187 TGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATANAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCNN +2>06:")H*@$2+<5D336)2.?#F2;H?HB3->41>0GC<;1$#1&@B/)&770?E0)A&E6'992F(2)/;D.DG+?/"F!!&!;$38C"H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5758 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37096 42 98M = 36970 -224 CATAAAAACCATTCTTNATAATTCAATCCATTTACNATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTNTTNATTTGTN )+'$!+)&!+#$&(%&+(+"%&(%$#'%$#$%+(#$'%+*!*("')*(&)+"*)$#+*(#*&#)$(!!'(%+#('(#')!&)+)'&+!"*!*"$&*($ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:16C18T51G0C1C1A4T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5758 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36970 42 75M = 37096 224 TTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAG F!#&F%@/408,D?B*H86'$'0E<9%;@:/9&6%8>#F:0A7!7G"+HDH8='.(;?,/=$6*<>C6/# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5759 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12689 40 47M = 12736 263 ATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCC %3),=+0@>(#8,'2G6;+3"H(?=>DC.@E,&!-";8C%A14;(B4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G18 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r5759 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12736 40 79M4D54M2D77M = 12689 -263 ATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGTATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGA "H*8!%BD&44/G3+B"1,HG("9''0CE8&"@-#=)G%$%.H"'-*-C./5,=9D$48'><9&3"7D3>H@,HH3)G-F)/$)5H),AG@;454H)EG4+C8BF>2,7(()*@#77G89!@=70*4'(>=1-H"=.$H<@1FC)7(,B@?/A/E423ABDB, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5760 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31771 42 206M = 31977 251 GTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTCGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCNTCCCCCTGTT )DG=-"4%7D#1+F9H.*6(8+71!/;D6&!6),3D5,+?$=?**0<*";0:/"&&$,*H;%/6;@=>G15F5,31)<'!8%#B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:143T51A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5761 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36701 42 77M = 36460 -318 CATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGG 195*,)2-;8.5ED%F>H2/FAFF34#.9%)H:H<4'.":5'#&09,B1(5A=%2?3"?;!>4BE@)@CG'%:$2<- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5761 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36460 42 241M = 36701 318 GCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGATTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCNTGTCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATNCATAACNTCGTCTTTGGTGGTTCCCCT :F=+@,,6G%!20!@$H5++A:@<6@H&86-16G,?=)-2C39%&D%H@=7A>3/H3+%#EF3<-;=/(6E!FDC+C*-2(#,5:EA>!H/<#+-D()##2&<1717E,';9'<.4<,!8%.:7@;<(2FA<9A;#9(@,%$$9D>9>.!,+>%=B);)1!5BC#&DH%)$C+&G&(A'0D7#'):H)?%;H:64#+&&'!-C@D?088#G<)'$4:"='D;D0?$> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:90C79T2G39G6A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5762 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28822 42 232M = 29054 289 TGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACATTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGT EGA/+&B1,'?"B0-@#;9120((%8#.#/G4@)4@.>9E514@"=%)F191A44,7G>;C(?91:+$%D=(3'-=9);A:=">:5"6G1A,(A*?/C0)9!0,#$B&%6:C"(+DCC#E20%.*!!='2:>A1@5/%:#'6A$/)-%B4!*;"+E7A"":12&GCED@<'.<%8B9&0H5)C-;,.)F(?(6#B),71&"+D?%1> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110C121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5762 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29054 42 57M = 28822 -289 TCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAA +!"!$&**%%#%+)$#$%+)%%*+"'#)(+%%($'$('+$"#*&$("$%++$(**)% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5763 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38768 42 77M = 38675 -170 GTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGAGNTANNTTNNNNTNNTN &*%*+&(&"&*+"%+&(##+"(##"#$#%!")))(($#$'$(+!+!%'!)""*+%(+*"!##'#"&*#")#!*(&)$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:59C1A0C1G0T2A0A0A0G1G0C1G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5763 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38675 42 66M = 38768 170 CAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGNCAGAGGTAACTTTGCCGGANAGG E,,?40?)%FBB#39426:2=?=H9-G>6F#*$)'>$.D5.3B6),%'()G(EH!1<*-=/4.7=!D8C+?4D!5&;@"#*(4D*D124$)+#<>'72@36;9&?GE4F14=3!)90-/)G&15>83.*%'9!?+2G/E6**;G5:%7)95"?2@F@D8A,0=;A?F$+/:('=7DG%)+>F;;3"6A':":?5@D'":H5F+4BG65F$B/2H2%-!6"!3.)=,$?&6H692F:.=/4<=;F$8:2@C.8AE;$'"F($$=%1HB'<=C):'+0B;(56/)-.==F%F>C"+(HG247;6EE%A#ED>+;6&4,DE5/D1#@34=>%GD*@%AB#>6? AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:16A48C24C15G185C3C15A1G0A16C13 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5765 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21516 42 157M = 21673 503 TGAAGANAATNCCAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAAC !)##&#)$#"%!+!!#%%($")$&)!+&%%&!*&%*)&+**"(**'+)&"&"*+$%&)!)'"'#!*!(++!%%$%%)!&#%+*#$'('(*)')($"!!!&'$$(##%+&&$#()*!')'#""!+&#'('"!'$)##"!)(&(%+'$)!($)'*%(&$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G2C2A2C0A0A145 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19898 42 148M = 19716 -330 GGGGACGCNGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGCCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGAGAAGAAATCAGCCGGC 2(F25H0G9F!A+=<$83&<">/B..&@'=&9A$3*1/:&H+=B$+638%&(*5H54*#5C7:F-CB%E?GDGB67<+6,!=@4?:)..93=.9*",&(-)H<*E/%D*2<>;5+238EE:*,* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T82G39C16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19716 42 75M = 19898 330 CAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGG .8F2*5,,H2CA=1;'>6+#?&.$='F9;/=8#8-&5/<=*F!;+D=2<@1(.%>6!/@-46)$=9?C7%*C2;6+-$6F:F)<...2BG")9;*!C)*+%E%DH#8-5)?!4>:=#F57C/H1>%2A;85/*;"12&H06'B1%97>F68()G0%A.=B;E"1'C17E;3'!F#2%:9!+*E8?'D>H479$4G8B&& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:121G65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5768 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32204 42 137M = 32376 227 ANAAGGTTTCNTCGTTAACCGGAGTGNTGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGA !(:*'09(A)>6.*?D#>21)404.@CF%)422-'C5F4E,39197F+.61&&E5/FE$3E'*);B$=D;+1+-@)0*0-3:0G'F-9811'%6*$6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0C1T6A15A110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5768 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32376 42 55M = 32204 -227 CGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGG 9;#=22.C<&<=!7#!A9/6/E&+7;!2'@H4*>9'!::?3DAEC-+*/H;9@=E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5769 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9464 42 358M = 9822 544 AACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGNGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGAGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCNGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCNTTTGAACATATCGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAA &H,,4)@(94H6>,3&$9EEG>%E*-4@,'!>G#$""*3:*F5D2EF9!;"10'C/B&'B4&-$*?"*&?"!,E?+'5::97-#5'+02&$F<)8/88$#!G+>D4!2@!)(!#2EE2F*9DB2#4D.906*A9:*:E$D8#A-88@/8!46*!/842<#(10G@C3@57.9#F-;E1A#!%BA9:;'//+(%!!C?8.9!@@56=2BH@7$3)-#/;==3#46.)6,%80HD%-#HE7*/234.*@?3?<$0H-+9(-*"<"7?A<#8=<@B?*?E$=,))3)$2<1%7"=1=>7.&E:DDF$9:@"!D'1(%.4D')A,4H;B5+'5F AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C69A39T87T68A10A79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9822 42 186M = 9464 -544 CAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCANCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAANAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCAT ,!:150C#;HG2F@?C8+<@B%F%9<+?9):C?E1(=:2*A%9DB.!8$#=34--$+.":*>5H-7."<9$%4-.H6##G6&H?F(.2+",6.B308E-*6C=#G=5+&3B6?(@9+5'(9=F3)"'C?DD-=%)193E$:FH?94#7C.(C4A+6&B?/H)"D,"3+0.*(&G<1&.#4<$'1?7B":614*?="4G;$,<'F,71@,F#>E;E$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21G15T5A59T18A0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5771 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38149 42 47M = 37922 -274 GGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGC *&$+*"#%&&)(%*'*$+#'+!")(%&!&$+(#+!%+'(*&*))!)+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T30 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5771 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37922 42 86M2I63M = 38149 274 GTTTCTTTTTTGTGNTCATACNTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTAT 0*,,9"//@86A*+7%!31E1+9:1=/F)-/(:("D#>CB374C1"!2E;-00A-=:2-E3%3AC'&722/7C9(AA<+E$6.#:$CEE7/':!89;E!=7(9,=<<(%;80.>&:!HC?$H52&F*.DH-1;'3C.:-BH)$9@30&"77.(;G62D=2*@F>26++G<'=/C#"?D1)E=*F,:6E AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:62A17G43C29T5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5773 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30209 42 63M = 30331 196 GCGCAATATCCTCGTTCTNCNGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCAT 4C9F''3$9-B$6$14B6333D@G@<>,:;78=6%4.?#+@-53F5>&@47.&*#C>0:-/2"B;3BA1&5!!DA,E#444>H;0#.8;+6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C35C37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5774 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16009 42 71M = 16009 0 ATGGGTAACCTGCCGCCNCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCA -D8:=,7=1B885!1'!.@6!".'G:7;<@))=A-2)(91E?E>%B;(?&"0.?-5>@0(!(#,/>C>F6A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G53 YT:Z:UP jpayne@0: r5774 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16009 0 * = 16009 0 TAGNTNGNCGNCNANTNNACNCNANNCNNGCGCNNANNANNTCNAAAGCACNNCNNTCCGTGNCNNNANTNTGCGGNCTCTNCCTGTANNCCGNNCNCTNNGNNN $!"!#$#!$""$#$!#!"#$!"!$!$$##"""$!"""#$#!!"#$#$"##$"##$!"#!#"#$$!!"$###$!$#""!$$##$#$#!#"!$$""$$!"$$#$"$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5775 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29556 42 162M = 29718 235 AAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACNACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAG /!"<>-?76&!);?#9,FA)6?(F7.8.+GA:#5<>ABA4,H!"!B9-2<$%GD=A(:#7C/E=*5C!@574*3E#&+,?DDF8#.823,"E3H-F,6@66""(;+@%&&:9,*38&FEB5AB2E2,,8!84:C%(&2+%/GD/$0(4G( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A114 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5775 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29718 42 10M3D60M = 29556 -235 AAACAGTAAGATACTCAACCCGATGNTTGAGTACNGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTG $G=F#G4E7(@2CG(6HA/&CH!8E6=1>;2*9."E+#)E47,8.3FC1C972&;#=5'.B/-)"2FB80 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:10^ATA15T8G35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5776 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24244 42 58M = 23944 -358 CTACCGATTTTACATATTTTTNGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATC 4'3!794%!09:2D"'11(=#-E0$DC;/"G!H;&3A10(',.-+!98G:='">2<73 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5776 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23944 42 57M = 24244 358 ATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGNGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGT +&!+'%!!"($!+++**'%"$"*)"')&*$"'"#"'%+!)+++%#+*&(!'""*+)$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5777 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39107 42 50M = 39157 362 CAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGAT >"DEF-8&%>E!.:$7F,)5'H22D7:%@<>2,:EB%&.H(AD"B,"A7@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r5777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39157 42 18M3I294M = 39107 -362 TAGTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCTAGAAANCGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGTCAGCAGAAGACCTGACCGCAGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGANGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACNTGACGGACGTAACCACCGCNACATGTGTGTGCNGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTN $'"*!'#"&('&!(###!#"!!$*"+*$(+!#'&++'"'#(#$%)+%)"+"&*!%('+)*#*#'""'#!((&##&"("+))#$&(*$'((##$)+!'('&)*$&!(')*##+*%+#$'(&'"%%!"#*'')"(#((%%$'((+#(&%#$+$*+(#(&("!&)''!&#+'%+*+%**%%!%'%!+%(($&''##!#))&+$*!$)!*(+*+$&'*!*!!(#!$#+'*('(!*)%($!!'$+(%$$#)&!!!$#$"('*!'+"%%*+$$%&&('%+')!()&#**$)%(!#(%(*(!+"(#+"($$"%$&%#++%%! AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:13 MD:Z:2T34C5A55A19C25A71G19G12T60C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5778 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27298 42 107M = 27168 -237 TAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAA E9FF:A<+!340,89BF;@C;$07.,;=#>7A",-F,8&4/;@;BH5.-8>?';>%D7>/=!::"D%D"<,;51.**5+-/-GEC>)G,)0B8,>??3G#2%'G-C2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5778 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27168 42 130M = 27298 237 ACNTGGTGCACTGTTTATGCCAACGATATAGTCTATCAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGCTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCG %)&*'+")%$!(+%$+$'$''!)'$*(&('$)!"!"(*+!#+"$#&'#**++$#($$%*+!(##+&)&(%))%'&#("*"!$!$!%%+&($'%($())$#+*&)("$)+)!*')!)%!#(!%(!)*&&#$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G1A15A17T53T39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5779 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46177 42 141M = 46023 -295 AGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTNCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCNCCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCC >5CC7$"*#(&29A*(HH4>#GC;F>&%>H'(19!++/76C/(%=3#<#/$>>@,C*)%%*/"&0>.==D/1?F86$CG%@3F,@:*71?:??3"'3G/E=10=08.9DG134-*:+&"%4D4/)#6/07%+.. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34G25G46A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46023 42 104M = 46177 295 TCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTANCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACAT ,4-A&*9@D1C3F-3C242%+5;9G#8;%7+"%4*FA?E#.E!G.!5@915!81AG3)>#?-<&.>,'@24'+#>+D@"FE#?!56&F7'2;@CF7>=?E6,*# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C66 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5780 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1325 42 44M = 1369 321 CTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCA F73G28"D;B2;>>&36:/CD#&>1$9,..F=5A3-BD":7E&= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5780 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1369 42 277M = 1325 -321 CCTGTCAGATTGAGCGTGCAGNCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCAATGCGGGGAGGAGCAGTATCNTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATC 2=5360.;@*H&G@B.%G5'E,>3/:-C;--569F<'2#3?;2(0/*?=!>*$E*2(7@FB2+/B"+(:C?16,05+2C!=E!(.AG#$C6A<9;A;)6>B8?7>A.-1*5:+96"*,=H)<39!&)G%3%CGE/AG$91D16@:0-D.*(A#)?7H(AH#&=F01=1(%9<1<9"(5;2)@B%/)%EH"&%A046!9H=/4&62$$/.$1"B"@4078*>!A(6#+5;G/@<").4)7D- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:141 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14503 42 43M = 14600 269 GTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGAC @/!*+$*7<*'=$A@1(.D,.G%."<6*$?*/$$C=65410/C+A731@.7%07;/F6*;EG(E3'8-> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103A68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5784 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7860 42 333M = 7793 -400 CGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCNGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGGAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGNCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGA E<9@DD/F%E5/;,"BE7B40%&?51.6-!'(7H=E2&&6)2:'A?43@!#8.15G*B@,&4/>'&.&.;6A@F27*):95-;+2#3#4G6$@6CF9#!4.2?F?:?:5C0!&@'9HED%/A)974+96/B,C8G%06;=/,)::!!:G#G3*:@#AG18%"1$F?<'C4(6D&+&F/;H!4FF&A@7/(@*%3$51C%1$$>8/143%9D;&1C>6:'F.>/@&4+D;''9BAF2?5@!:,:?:G?3GF397E$#E=6D.#:AH302'B!,+7H6G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37G62C47A38C145 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5784 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7793 42 67M = 7860 400 NCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGNGGCGTGGAGACACGCTGACCAT %+)$!*)*+!")(()#$###$%&+#!"+'*+#)'&*#&#*'"+#''*()++#*&"&)#+)#!%"&#) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C43C22 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 383 42 70M = 612 274 GNGNTNGAAAAACTGCGGCNAGNCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTANTGAGTACGAACGCCATC )$%$'%#'&+%*!$")+!!')+#(&%'(&+)!)%%('##%(#+*%#*'**+!)&+#&("(+&)+#'%)'' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1A1G1T3G9A0G1C29T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 612 42 45M = 383 -274 CGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCA ,*GAC*@!25C"*G6&1-20DH5(!0"B0,%7)@-;D0@G+$7C3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5786 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14920 42 73M = 14713 -280 GCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGT "F3()6'"F*"=)('1*!12"',$:+@6D8.&6GGFA2B'+(6<;":/(#GD1B8#(C%4A8,5-50H.!8262A>:#0:@177)F?+.G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T17A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5787 77 * 0 0 * * 0 0 NCCTTGAGTNNTGNAGGGTNAAGTTAAACGATGCTGATNGCCGTTCCGGCAAACGC $("'"$)))%)*'""*!''($*'+$'*!("+!%)%+#*(*&#*&*&)$%(#)+!*' YT:Z:UP jpayne@0: r5787 141 * 0 0 * * 0 0 NGNNGCCGGNGNNNNACTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAG %#"#(&')#"#$!#!((%$++$')$!)%+"#%)'""($*%#) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5788 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27639 42 53M = 27467 -225 TGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATNTAN 4%"0>+*?A<*,HBF0-,!4*2(<'#71'='!?$A/2/9-+--/!E4@#<%1( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49A2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5788 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27467 42 61M = 27639 225 GGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCNTCTCTGGAGTGCGACAG F&A?F+$$FB@B%$&:#EE-C7G;HH6=)@FHH-H2=E.>$F54%*>*2?0952+,F-0A/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5789 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22300 42 259M = 22254 -305 AACGGCANAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAANCTGTTCCGGATCCGGGAGNCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGNAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGAGATTGAGTGGCCTNCTNTCNTTGTTATANNGTAAN !$$"%(&!())"+*%&$'%()$$*%*+"'%$''&&(%''#)&"+*(!"'#(!#(#*)'%+)#($((%&)"#!&##&+('&%#+!+)'")$&)$+'$++$$)%')(!&')((&'(%)$!&&+$#*#+(%#$&*$(*!*&%+"'$&+&$%(*+#&!)&)'$'#%&!$&!()*%%$$))+(&'*$%%''&!+'!*(#*''$%)"")'$"+"&%%()'''+$*$&)*%&$$#&+)&)'!+)!&!$$"%#'%*))("*!)%*'! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:7C30A18G75A90T12G2G2C0C6G0G0A4T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5789 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22254 42 46M = 22300 305 GGAAANTTTTACCTGGNTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGG 7:'=D%"'94?(C78EAAB@8>B:*F(DG@(F;G.@(2;?%+.+*A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A10T29 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26502 40 98M = 26600 194 CTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCA 4F.:"E0F*(!EF4/@%.3#95G4:44)E+6?4+-;HHE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26600 40 87M3I9M = 26502 -194 TTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGNTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACANNG %'63$;91:100.992'3.8++F/?+!45:(1419+C#=($*5(C"6@"H!)!A(:(,1094C"@,&& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:49C38T2G1T0T0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5791 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25612 42 77M = 25612 0 ATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTA FE075D@?!G(>1;#*/BA?%-,'7>?>G.1-=!>1:9<=;0H?'=+244+A,$#:HF=*B;24&/#C4"&@'>0H> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YT:Z:UP jpayne@0: r5791 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25612 0 * = 25612 0 AGTGTATTTNNCTTTCGTCTCANTTTANCNNCNGNGCTTT ($&&$%'&%%)$!&&)'&(($"'$)#*$*'!)!!&++")' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5792 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8753 42 190M = 8605 -338 CTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAN **'$&&)#!))##)&)*!(+"(&(!#'**++)"&*&)!#'+(!&&+))%")''!'#(!!*)"#)**(&$"+$+++(!(!+"+%!&%%$"'+*))(!%''$($$)+#&#%)!)+"$#%#!(%'*$!$"#(*$*$)"%)!)$!)&)('*%$$+'%'+"*)$+%$+(#(+%+!*))!+!$!')$(&%**'+'! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:189A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5792 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8605 42 148M = 8753 338 CACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGCAGCTGCATATCGAAGTTTTC ?9A!,A7$A)5)'?,?BG&;A3C2(&*+:+.43F>&D*<@96F809D2)!AB)=;9?',2?345#A0"17:.&%H,D'1)./H:D#,D1-&+4/HBF=EC%<46/7'C2)%?(#4(C9'117AC8@"*"DA2.-7;4EH+>%) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127G20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5793 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14571 42 149M = 14738 261 GTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCNATGTGCTGCTGTGNTGTTTTGNTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAG )5/B(/;%'&(3C$52.?F=:C+*D35#!#G%.4:7,1#*/#"(%(?+?,'4DFF%25/,0,?@@?A8*-**=<#4>>:B56$E@=)%/H1BC/;/+)<=:A#FF@$F"C9%G-0B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:80G13C7G46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5793 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14738 42 94M = 14571 -261 GAACAACTGAGCAAATGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCNATA 8";6D1#8&!4/4(&.>H2)?#1G"%(0,.H,<7H8$8+;E54+H#72=!"/2@E#G#7.,A2+58!.3+9/$.HBCC1.2H5G56?31'E//C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15C74T0T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31955 42 47M = 31773 -229 TGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCACTCACATCGATCCCGGT H1$<.;185=B+2!61*(%%67?F!)/50='%=1)=DB?'*@28)/G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31773 42 112M = 31955 229 TCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTT F!2H-A#@*'%AB0;0"!D2?=*96"-D4?<<$%9,9;?6/G/?2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5795 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27783 42 68M = 27633 -218 ACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTC +,CH2GG#B+&?4)%@+!@:$2$F@1/G2)4!G1DGDCD7C+-2"=*.F)*1"2&B5&/!/1(51(11 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5795 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27633 42 56M = 27783 218 ATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATA H?H2C)?#1BH"#&05C.#/@=/9",4)+B5->E1E3&6@1%%&0D4>18%*9&33 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5796 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37345 42 139M1D39M = 37259 -265 CTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACGCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGA D!H3+4())AB#F/5?B7"92"4$/"G$;A+9GF"%C!10/%))3?E4;5%-9"0H#2:/)8G$B*!C>0*)#@#&8-((38'1,8).GDG'C46&53;9@$.42D&%G$B/DD/(#52G3H;/&B20A3+'#&B<:6'%0((,3-%7&@0=/?;)#D0($!D(?>$A0.A.('-8F/ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:30T108^C39 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5796 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37259 42 49M = 37345 265 CGATAACTTTCCCCACAACGGAAAAACTCTCATTGTATGGGATNATTGG +31>+*986''&3@<,$>9:2H52+(-)G-5<)<1E#&-)E:3=4B(8. AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C11C7C5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5797 77 * 0 0 * * 0 0 TCAGCTATNCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAAGGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGA +$&%"$*!!!'#%$$#$#*$&$($'*)""+()"'#%!%#+'*("#++($'!$%&**)%)#!$!$'$% YT:Z:UP jpayne@0: r5797 141 * 0 0 * * 0 0 ANANGAGNCNGGCCCANCTTGCNNGACNGNNNGTTCNNNTNTCNANNCNGANNTCAATNTGNNGNGANNTGTNATNNATGNATCGNCAGNCNTNGNTGNNNNGATGNTNGGTNNCGAANNCTCNCNACNNNTAGANANCNNGTGNNTGTNTGTNGNNTNTGCANANNNNNGANNANGATGCNCNCCNCTNACCGNAATNCTGNNGTNGNNNCNACNC ##"!#!$!##!$#$"$#$#$"##!$$!!""!"$$"!!!"!#!##"""$$!"$$#"$!###$!"""$$!!"$#!$#!#!##"$"#$$""!#""!$##"$"!!!$"#""!$#!$!"###$!""""#!##"#"""$$"###$#!####"!!$""!#!""#$"!!$##"!#$!##$""$"$#$!$!#$"$$"#!"!!"##!#"$!#$!$$!$!!""$#!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5798 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1695 42 58M = 1695 0 GCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGNCAAAGACTGGATGAAAACGGANG 2F4%C-&87H-4,D%7@&5"1'5B:@>?9:++'8/?>+.$C5#!;%)>)?7>$.'-AFD)3786==#/D+@4B=55H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T13C20G46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5799 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9840 42 103M = 9960 215 AACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACNCCATCAGAACCGGCGCGTTTNTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGA 7'*@?>8-4@%>3.4?*.=)>/*4&9'3941@>C-!CG6C760;BD<3:1B!:5(12:;?'FF:0,27G)AD0:+*E:5?1' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G5A5 YT:Z:UP jpayne@0: r5800 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5436 0 * = 5436 0 CTGNNNTTNTTGAANGNNNNTAAGNNGACNNGNCCNGCNCTNTNNNANNTNGGGNTNGNCNANCNCGNNNNGNNNNNCGGNGNNTANCGNNNGNNCNNNANTANNCNNCTNNTCAAGANTNTGGTTNGCNTNCACTCNNTNCTGNCGTNGANNCNTCNNTNANNNNCGNNANTGAGN !$#!"#$#!$$!#$#!"!"!!$#$!#$$!!!"$##""!#$""$""$#!"$#!"#$!#$"""####"#!"#!$"#"!!!!#""!!##"$!!#"##"#"!$$!#$$""!!$"#$$"$$"!$!"##"#$#$"#""!"""$###!$$"!#$#$"!"$#"$$$""!""$#!"$""##$#!"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5801 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47885 42 114M = 48055 211 GAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGC 9#,!8,/E499+$>+2E?;*:E+=;-@%E4&*?85"!!3>(%A)4*-B!!'035H'"#56"'$;,C&.)("B7%B@@;/;&H!F=?ED>(5(3BH36=$A.A=2GG)$-83=H. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5801 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48055 42 41M = 47885 -211 GTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGNAA .,:($>33?9ECA@5?,+52($(AD.F!.(&E.<,:1&E>: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5802 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9494 42 72M = 9271 -295 GCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAA 1<85DF!';/+F4G:G43>$D)693=-D$EE0>:1;.D'=19F.$&)6)E.*F#&A$/&3GEAF)H:E7;&G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5802 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9271 42 114M5D17M = 9494 295 GTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGAT E'B:%)%@+E7A?B@G6C?5C!,&.99*:7.5-E0E!06C+E2:H6'0684">E"8#E*;2B+!H@*G1&&:7=#<&H1?;D.E'H"B:'+=C!=5.4<&%D@F>6-E;:$%.57?#9+>.G.$!4#G125 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:114^CCAAT17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5803 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36124 42 47M = 15737 -20434 ATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGA 8;.A9'/-!.E1:F(HF-$+-B9-D68DH<'C58&D=)2H;1<&@./+7+4-@)1)5&26@@>B(@;5&62.007-@"#D!CGHB AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G68C7 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r5804 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35855 42 126M = 35855 0 TTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGANGCAATGCCGATGGCGCTAGTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTNGAAAGAAGCAATAACCCGCAGCAAAACAAAGCTCCAAGCTC =#(39H>E8DD'A0'6G+5!)D=:"(:C?G%7%,)D2BB7@(.0!0A'5G)0.8*=,618.+9:919C.BG$*("E).*$!*<"G?=CC04)H?E#"06@70.&FCF)G$C9/3>!C-G5H<)DB? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39G15A28G21A19 YT:Z:UP jpayne@0: r5804 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35855 0 * = 35855 0 TNNANGNNNCANNTGTTNNGANNCTTGTGNTNGNTCNNTATNCAANGCNNNNTATGNGNTNNGTCNNTGNTNTTCGTNT $#"#!""$"##!$!$$$"#$"!#!$$!"$!##$!"!##$$!"#$$!$!!"""!#"$!!##!!$!#!$"""#$$""$$!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5805 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40739 42 78M = 40739 0 CGTAGTANCCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTNCTTAGGTGACGTCTCTCG (%))'*&"&+'"!%'!%!'$)(')%+&)'"$*'"%&#"))%$#%'!"%%$"&!$*+(%!+##'***)(((')#$%(+* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A51G18 YT:Z:UP jpayne@0: r5805 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40739 0 * = 40739 0 CNNGCCTGCTGGTAATCAGCTGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGA )!%)F<>5.4>28+H-&>?E8%9;DH!96'&8G$8C0'15/&,?,@@H'6!FC&8+:#84D5#F;G-0A$8($9?%8DH@F9):CH!"G)F-("'">204<9H2/=459=<0A-2E0+A4G+!0FB30%26H>$,?8E$GH/%&)BDE.H),@=F$B6CG!8&>':6D>7(G+-0'75F#,78%"F;+4/,1$0)68B85@#F%7,DE3?),H+<2,.+0A?*$E*AEH&6#,?6&(G8+F9.*F.EFE"150/%->?&=-D2=*0H5%-=*/>!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86C94C0C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5808 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11156 42 69M = 10978 -247 CAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCNTTGGG H567"<":<-F%HH@$*3/&*5#B+,/%>45C<)DA'F6E4"G;G,3G/#%'>'$-H'!--HBB!>(&& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C2C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5808 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10978 42 46M = 11156 247 TNNNCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGG #"!&'#&"%+)((%($&'%$*)#+)#+#()!(')!##+"*!#$%'+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0T0C42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5809 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30019 42 42M = 29780 -281 TGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGA 22$";'E6+9517A,&!<=D9DA55+G>,8(:0.1'82$/(ACF"(H(;'-<57'C9#$08%$.F%6<2"54:$AG$9F4(3<*AF57!>630C4*%)%?@/,$$2;F6%484C&7%#B<*,HD;1E66A-/5H(0;-6%,74'>7.#A#.46E*7$DA)-1=AA.?9.E8.&?H*EC%C('2!E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A67C179 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5810 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34015 42 42M = 33750 -307 GTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTC 5+08C$?%6CD35F-1G4F+F,;6G&%*=C#E.6,C9?G$-C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1771 42 297M = 2068 390 AAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGNACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCNGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGANCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGA ,#":>0(C%$8!%&*"5:9C,)CAE+1A;!*5D8*,46;838<=-:.7$&4($5)>=;*6"@F'F,&<<'D#=0;)"%FD,?.@*6$%?"71'9A#6EE>-*4G.H+4')#EE?<1'>./>??GG?#"*HC"'(E0%9%/61"!2!-+B,,DC$775%;)<<"F;,1:%F4<2(.+F;?/#5.&;0((4E'943/6%F4!)F<=D+5!3HB)1/@;$=%&'C0!:%CFF9,CF1B689@?!F*=)=2#:+DABF.>CG6,)=2BD3%FD86(&D);*!)@98+E./08**H#<3G72*#D'>89=GC'0$E7*&"*()A.3/G52,&,9,@,G<=;&HH.3;B:916.5&FBDE)>E% AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:55G37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5812 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34323 42 79M = 34515 272 GGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCNATATATCACCTTAAGTANTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTG 2("F:HH?65'?%5$=*/2>,*2/"CDA8'3)6-EC8;)95,==9)A(%7+4"+,C=H&/9%G&+?:@1>5;-9H2H=H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C14A2G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5812 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34515 42 80M = 34323 -272 CTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTAATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAG G,AC+3.G>F+;A5'*/1;994G;5BGG=.B,,31)B3"/3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5813 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32563 42 40M = 32283 -320 GACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCT E=##3.%@:((9D56C'"6A*H2"9%';-2G;%B>7,G:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5813 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32283 42 78M = 32563 320 CTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATNCCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTNTATGACGTAA %028HB9&*)G-D,;'&*)@%?116@2&6.$#.@+5*FG(%B;%A3H3F(66=4FE,H0!C23HB3-#=%FF)A6E"7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A42T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5814 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41798 42 90M = 41888 192 NTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAANCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCT !8=!A(5%>"5;60>A!D4&#$A@E8'!3!))A2;=40%A%ACHA2/3;6'(%.:->6+36!2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C41G47 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5814 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41888 42 78M4I24M = 41798 -192 TGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATNGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATA .4,!/(D.5B3GH93?'4.@(D117@.9,7*'+8@-.<*/((8.D)3D;>:&:FA>+#D/ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5815 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36159 42 76M = 36159 0 GAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAA A=7/9!:8%=;).<'=,D2)BEDH>,"F&97&:$17'9<@%&G+#D%F66!#4.G&.G4'G,$'5-/68&HAD;+/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YT:Z:UP jpayne@0: r5815 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36159 0 * = 36159 0 ACANCNACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAANGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCTGGATTGCAATCGTGGTTCCTGCATATGATGACAATGTNGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAA "&#(&!+)*)#*(()"**"!&&)'#&$&$$"%+#*)!%%('&#(***&$#%%)#*%('(+$'((!$$+)'&%'''$*%')&)%+$$)&'+(!%+''!$(!$**$!!&+!+#&&%&)''"%*$))&#!$*)&#'$&%#%"&("((+$%!!!(((((% YT:Z:UP jpayne@0: r5816 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19024 42 71M = 19104 209 GGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACNTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATNGCCGT +B(6?@<>.49%":C71./"+D9A%5>%98&@@B='3#8<5,E?:=AGA11!/E?)4#)G2>&;!-7+/+>C*57H+:((>#'51<.6&*"@&!$F#;3%/A?GC=(&.%->30!+9'+?00#A8$H<7/%38D,4$C;&G)#98$>":6.D0/279%'.01,6$>D.73#8CD%<29 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34455 42 72M = 34638 254 CGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTG H2A#C@"#4@8G'0!#;5-,$1?$08.(A!1)/:,!<9E"%?;(*+.<:H+?4;)8B3"'261=6>A?-?!4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5818 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29737 42 81M = 29926 257 AACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACNGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTT 85.AE3+1%0/2H'A"C*2%4A+/B%1A%<'.@:!?&7(*,');8C02HD01#D7F0&!/.;&E%3."AC2'<%28?9!)" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5818 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29926 42 68M = 29737 -257 ACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTNCTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCAGCAG !*1#,318*$E@5@*.A$D48%>'9C"&$).?(1*'F@-.,>CC:-8=3F708*0E*'1C9%<"@25( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A26C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41362 42 123M = 41516 265 TATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGGGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCAC FB+1"+ADFA'1D8:2"/:')65"A=?G"';F)1,-*8"1*9A*=),H7G#6G/-'1-A&/,;*14EB251%*FG$%G++*($7=FG6)/BD@'>!-(C*)&0G9&;/*9'2B7/H3"@!6D* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41516 42 111M = 41362 -265 CGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGNAGGAAGNTATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACNGGAA 34"1,&9$-#,E&;84"E!.>/+=93*?5BF;H+#A9=<::4=9A"HCB?A;393(%5!4;/80%9=3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54A6A44C4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5820 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22753 42 196M = 22695 -254 TCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTG (8HA+G&45;'$?("!*2-!'A4:A/F"@A74,G4D,:B&>19,59+ADD+517DE68-+:2C0,8"644'0')7"+;&?C-G)"%*E*.F<&-&&-9((E4(-D0"#,'>FB&",+)83F&">< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:196 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5820 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22695 42 57M = 22753 254 CATAGTGTTTACATCACGGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTT +A$55BF-B>7H,<"D$G;E"39..2-0,/F)8/=*964%23DE,5*,*"!!.;29# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30341 42 102M = 30103 -340 CATGCATTGCCTGCTCTGCCNCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTNNCGGNNGCN (#'%(!$')(#$'"$%&+$$*!)!%*!+*+%((*$('#!#+''+"*'$(&&&!()!$*'+!$$(*)"*(&(#++++#)$()!'"#&*#&!$+"!!&($#*$! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:20G71C0C0T2C0A0A1T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5821 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30103 42 89M = 30341 340 GCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTNGCTGTTTCAAGCTNAACACG %)G1D:14<+$'.G0"D!=?+.,"*HHD11/G0,D,'#.+52,?4.,G@#?@#G*5!7015(@(*F+23&:&H;BF):!:+..'"/@.' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T13C6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5822 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9249 42 122M = 9154 -217 TGGCTTAANGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCN 8G,$=C/(+B*C&'E%:,E5D!$--!F5=$?H(8@4D%@#,&:C=4/,#3F4.C72@!/(G*+,1=1&/E."@7%;"8(E:BC7/G1/E$':8+A*<6+61?*>*$7))29@/-/"?)5%+39H*7;6>#6511:>)3D$EH2.+<5,@>80:6*$)0B6!A09%2D-=?E?/3BC-)81B.B7!8E;5F/3G+4.7-F$6-E4?7%+G5.7"AC3E8./>2E2"@')"(60*7D$@"9<1):C0"C4%*=$22 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:154T28A66 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5823 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23666 42 128M = 23416 -378 TATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCANTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCNTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATANATGTTNCCGCT +&""+(%&#*%)$*!$&%&&+*&)+)&$*&+"'$'$"#$($#&%"$)(%&$%&"'%+##'''$)!!'*))+&#')&&%)%&+)!#!&#$!!))$++&!+"(&'%)!)""+&&&''%"'++%+"("*#( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:38T45C31A5A1T1T1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5824 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24697 42 107M1I77M = 24892 240 TAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGNAA =#E"D?+#02$?(@FAHHB>0.H2HD;<*5/6'4?"@/>6177#/*-.:=:D8)4F!*D/7,@=>,!?;.:)#62GG3:H+<747>DH*5(!#'19$;%F:6>?>;'7):!%!57;,04:2/4+@=$1H>@7<)'-<&3$1?>+==">;.A!.*-?:+#2!H82H)&*9(H61)1H*-&*&/G/! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:69G111A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5824 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24892 42 45M = 24697 -240 TGTCGATATAGGGATGAATNGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGA ;*DA?(H/E3#>'H=>>0F2;($#G,;AF"8=ACD-A9;-#3:E3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C25 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9433 42 193M = 9626 328 CGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTNGGTGGNGAAAGNGCAGAGCACCCCGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCANCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGT :,,)$,!H3DG*ACHC%06>'?A=.4FD+7>0G$:.*%=*82/A)&#@18!FH(C<14!,3).*>#.58:0/$+>&+;E:*$;E:*86F.;+!"8;"7)C)C791=2-%%$0;;!5%A7#5+,()(%-C&EF?&!)$,-/>%(GGG.92>0"@.'<=!&$:,F<&H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:36C5T5G10A78C54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5825 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9626 42 135M = 9433 -328 CAACATTCCGGTTGTATCCGGTATTGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAACCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCN G+!)?&?C(@?:+@#)76;*,0!D:+!93A?&*-8C/;%#(%>-9>;01@>EE#5#5:/+%!&/@)#=3)G$C9E!6D%9HA3@3;>>BF:"6.A+(;G',1&;H='H$A>@EG(6C>?77,:H%D%<521/"D$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A79T30T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5826 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12452 42 140M = 12329 -263 GAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATACGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCG 54*"-9@/,0-@3%(E@A.8.1&!78>2-9H,-!6(H8(,>!D+9A";;B;".$F#3!G,?H5.+6%?B#'42A#;C0.@$/$9.<508:F9D;+E#0*6HG44/.4>2+>+&1/7;>8<%68GG,GGE$A4&37,@:CB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86T53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5826 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12329 42 59M = 12452 263 NCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGNCATGTCAGAGCAGA %,?);EB=<>9H(712@.04'9%!(,>AD1/%H6D*15?G68?!2C5685+C?C7<88* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C43T14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5827 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42230 42 202M = 42432 254 GGNTATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCNAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGATGATG FH2A27(.4A$:4,952#'9&@10E.;:%?*9!B:"?8D-#$(*E+/>?'E1@C;E3@A90.;.*H"(<*$73&:3H1/,F#0:1*!C&?:AH,1E0'':H)4&?32AC;7>#@96A%/6@2?7+64..)CC<34-GA&*)*$G47%.H;F"70 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A31T12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5828 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33338 42 161M = 33499 332 NACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACNCTGCAATGGCAGATTGCATGGTGTGCTCCNTATTTATACATAACGANAAACGCC $ABF9;G/37')>#8F63D70$D);))5$B@*A'#C#(=04#F1E!>/?C:"(+71HF(;:9*#&)A(5<84H>7F@C/D%6EB),AG"!"!9&)A0B446$+EC1C@68C''%AG"9@4%2$==C(D06H>!(#%>>0A39$D-.&"-25&8".>$6%+#:?;1<6.HD,#%'71)5.FF!3C+.-//-<5+=,7.;4?/B%,-FH3DH,G<-#*,/'++C/74,03?0A%=.;F1=1;10-6;")&<9CFAE+04"/?=E: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:92T73C4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42088 42 40M = 42252 245 GTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCNCCGACATAATCTG *1%4:+='DD$><.0#A:C/$6H*=/E(/HC,=.?#!0#H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42252 42 81M = 42088 -245 CGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACT +6H&2!7.DF%(/6'6B68,#<>*C=-&"02+&2F="5*$F25.(4F%0:=&''@1'+1=;62"A8G;F$66=2-"HCE>;,:*4C9*<()84"03121&+->.5G4!'0&(/*%A"B..,%/1431"-/2,B5#;2#D(GG(6*HB6%,2BG=6;A/)*D>61A.3<1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:34^T80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5831 77 * 0 0 * * 0 0 NGGTACTTCACGTTAATCCCTTTCAGATGACTNACACCGGTATCCCCGCCCGAC !"21@3$2-34D?7:0+(BF/DA,'DAE$A2)>&=#'"*:DE&H#H+(0,(++5 YT:Z:UP jpayne@0: r5831 141 * 0 0 * * 0 0 GNTACCGTGATTAAGAAACAGGCGCTGNGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACNGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTG $$&$#$++"(%&+**"&%!&&+!&("#"'%#!%#%%)!'&)+&!"&%!#&*!$!&(!(#'&'%)*!&%#%+(!&')!"!&)#*(!#!#(#!*"#%""%+(**#+*+#!!*+()($!+**!#&'&!)+)$&*&!+!"&"&) YT:Z:UP jpayne@0: r5832 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26520 40 167M13I23M = 26710 334 CATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTNAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAAT .:+-HF.(=?<-F>3?8#!#,6"$5AH+4;,+D%E9-@$$!!+&2"+9!(8A<:CE%C"(00A$H$+:"H%&!2:C0'+&H>9D*%7H0#;(1;!<.5=8>6**E?8>"2.<7@%!.D"C>@?;+D,&>%1@'(8(!0A'>&FE>)@7H"2(?6E$;4(9.184?AG:H=%D"#9!81@)>""G(B9)'('+59H&.&6&%%F AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:14 MD:Z:35G154 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5832 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26710 40 144M = 26520 -334 GCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTNATGAANAAGTGGTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGAC 8,%:02B7,'C,"+A.8.+H@9*7:C?$4%(6=;/>79)=/A+,$:;65.8*"(E91?0E13+F9+%+F/!*$5&<>.208,%5#-FG(H?3*!%*/!.&E=.'B*642=;C=A"6G#G'21<):8B@/,<9-61/&A)1"6/< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55A5T5C76 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r5833 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26219 42 78M = 26354 215 AAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCNAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTA ="%%%4H40/+F%.<(%08')=4&=&>G:)9::A3+3+%*C96;"<)&!::;(/@@G"&/C/GAH->'$B7G@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G37 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5833 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26354 42 80M = 26219 -215 CCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGTTAAAAGCATGANTGTTCGTGCTGGGCACNNANGCCANCGC !%!+#$'))(+%('"&('*%$%*#%!")"%)!#!)("'()(++#*$)$'!+*+"($")(+*'%'**(#!"'##)")"#)$ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:39A11A15T0A0G1A0T0T0A1C2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5834 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6442 42 50M = 6246 -246 ACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGAAGAACATGCGTNACGAA **)!$+%%##**$*$"+"&"*'())*#$%#'+)(')!"&$)'&)+)'+#& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32C11G5 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5834 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6246 42 6M1I71M = 6442 246 NAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTAT "'03&B2.CE::1)/B:3G8G4(>G39->2HE!(G4-$?+.D!,F5@-G,9C!6.)A;6;106>43*!<;B#/C%8;+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:0A76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5835 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43677 42 77M = 43458 -296 CCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCATCTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAA DC*1E0>B!:.05(B@+/@1//0:-+4C/+?7<3+=BCB+5079-GA+8)40/.H8$2'!@<+!(%@*@!!>>>8EG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A30 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5835 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43458 42 57M = 43677 296 ANNAGNGTCGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCNGCTTAATGGC &&*&##!)#+$!(**"%(#+!&(*"))'#('#+$&%*$()%+"$'%+!$"+*%"+!& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T0G1T0G0A1T37T10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5836 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1913 42 177M = 1834 -256 CTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAANAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATC DG,81)/)*(46$/>*):.21+-6='G5F,'*=?0B.E45"<&$5A0E+%'!1!%0-=;/4)D.H=D'!8EF143/E&6H=#E=!+9+?2:*<6F8+@GGAB-/8-<**(@("+?,/%B)-43+.#?3%(!6H)>34,65'076"!&-:5B$E!'GA@2@!&=$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C61 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5837 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2968 42 98M = 3132 226 CTGGANGCAGCCCNGTTGCCCAACTNTACCCNTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCA $)!H-2?,&=4BC..&54C3:<, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G4T7T11T5G66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5838 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21743 42 104M = 21743 0 ACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGNACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGT *:=2;!;===(1>C-8>*:11*&0)BE68B2#$E5=FB7/5>6)%1((5B3B<"7,*."E$DA6A*,E0#'-)F1!,'.5-B4#;%<8E7'>BGH%E%. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C45 YT:Z:UP jpayne@0: r5838 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21743 0 * = 21743 0 GGGGGNCGNNGCTNCCNGNCTGANNGNNTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACAC (*)&(!#!&!%(()')&*#&()%(!#'#'+(#*"+))$$#$%!$#'#*)$!##%''"!+! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5839 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41289 42 42M = 41385 176 TTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATA $+&&+)''(+)$*#$$+)!)!##+#)*"+#&*+))'$*"'"$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5839 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41385 42 80M = 41289 -176 GCACTCCATACGTCNGCGGCGCGTTCTGNACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTC ,?;BF:03F+/(9;8''70A*@CC*F5),:/C='<42$BA!@23-&78=GHD8C6FB'/A0#?7@4,&"<#H$@2&G)*9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G13C51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5840 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 713 42 56M = 514 -255 GAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTC #FADH.C-7;>G<"29AFF'1%/>E!@0A4";@8(B4E%:&'DD5E2)-*08!18( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5840 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 514 42 69M = 713 255 GNTGGAANCCNCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGAAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGG ($'(()*!#$&%$(&++"+&$+(%&!)%*##('+%$"'$'!#"&&!)*'*#+!)&&%'+!*(%'&"'"" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G5A2G30C27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5841 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8966 42 60M1D29M = 8804 -252 AAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACTCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACNT *,=A32#/8:8-;#A(2))-85/HH=/G$%8GB+C%;%6@=*4/B@?;1;H43*?E)@8')-F0@;7E'147'/GE0/C>@A,6;F29!?B56*E=BH74>!335!2#<*9@>%0#&141%E3"(>>G3:9:A:A<3>;4EH3@C>9DC>8+*6@72C;15::!2+5<334B5G.715G8EEE*"F"G8:E1*+;$.F$(65!2?>D=/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95A131T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2077 42 9M5I203M = 1878 -411 AAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGNGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCANCCGTCTACNGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGNAGATTTAT 4E/0F8)C:;<#-:3@>?=H>6?=2$8F5B'E'8F9&".2?%(%2"H'945GB%9)H#'A,40G$?>3<&96&88H).##:-&%#)0F>48!..?A0!C;!)5!E(:4H,DD#F9-+"@;4(F4:D07#*CA#C)3#E>/)(6+),8FE2; AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:25G20G63T8G83C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5843 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1878 42 199M = 2077 411 CCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGNCGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAG C!E'?8AD8&%$:-7:>%!$5;++9$*2)E5"4C<;%/0A""C@3BH?/;B$"800*A4'H!0$<7+-+4'>8=?)*-4;1A0'<+#6?+&9;'-CA5G)5<@$G(@BHDG1% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:141A57 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r5844 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4427 42 184M = 4611 233 NAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCG #9A)',8?B"*>$$D4D"#A?";8)<4590A/4E"/)#AGCF;"D8@)B?;@<+'+4,;9GF=>.BED(1E*;E%*1C9.)?-&H<%?/&#A.E>$'D!+*)=&=."3H)HC$D1(&7$100(,++6-1H#9:A=(;4??B7G*-EF4"/2*G=8(G7'9%'G+:/H< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G183 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5844 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4611 42 49M = 4427 -233 GTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGG 97:"5?6G.<7'015'!%ABC;/2-?./..+-7(?,./8&5D)6A274< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5845 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41401 42 216M = 41617 382 CGGCGCGTTCTGNACTGACAGATTAAAACTCGTTCCNTTCACCAAATACTGTNATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAANTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCACATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCA &+("#$+"%+%%)*(!&$#&!'")%#)&*#&()(&%#)')$!))&)*')+*"&#%+&'"**++"+(#+")##!()"$#)!$(*&&!(($+*&!(&'"'"("))+'&"(''+(#++)*!&#((')"&&)(''+(%)*#*(%'*'#$)(($&&*&$&!##+*"$%"(+$+*&'&+())'&#(%$$+%&$)*#!(%)%*#%*'#&%**!%'%&***+(# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12C23C15G101C29G31 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5845 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41617 42 166M = 41401 -382 AATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGNAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGACGTCATCATGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTAC #4&..#->?3.&%E,41;&",B/'/5-FCC)6DE$#7,96@8'E0BD?@40C:D;1/CG.(*(0C$%B38).8/?>E+DF48+!2?>$.@&H;(G+<A'5(18#*(80=16:;8&B8>#7(9C.#!FAA2&;.++-.3'H8)!.1'G>=,1><3'%/& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:79G25G7C52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7808 42 54M = 8058 290 TTGTCCGGACTGANGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCG B4;0*+0=B+B.B<*C@+9$%>E/B#,@%*$#%4G@7$?B3>E+74E4D,&(!, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8058 42 40M = 7808 -290 GCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGACGG 8A,>8%7#>:;3#&E83)$8>-.!',';&56CD"1-7H,% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5847 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46096 42 377M = 46473 417 TGAAGCTGGCGAACGNGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATCCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATANTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAAT //:)G1@6F8'57"E98.7)(363:/1G*:>A5!,3("6,A666>7$B:5$)G:/B48'>3=0H?-F+CB+A!/#C(;BH'<4+-5-$A5C3,8!??B$G&0-F0)37=5B3$:DC*>3@D?H')B0@>F+3F<1G08H*=8=2<4A#;/1-7A9FG,'?%@=*+?;8?>$C0A5*.8,D;0F%#)?H>H*,2;A(.)5%0>.>8G27*.(#1AF=7>';"0$-HF=7)!BF@G81"0)6;/H)?=>>%EG=5/D5=!'7%##DGH& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15C49G75G170T64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5847 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46473 42 40M = 46096 -417 ACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAAT H?-9F=G9"2!,2= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5848 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24099 42 107M = 24281 227 GTATTAAAATTAGAGTTGTAGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCGTAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGATGGTG ,-"-(=5)21+!!#)'2;1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G25A55C5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5849 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29528 42 80M = 29622 180 GACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATCTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACAT :':631;8$7*F>G/6?#$+H:1+8F848C868&G'.G9,314?*-9(E#'A1'B6GA*=,C'$'>2B1!85G76D?"<* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G36 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5849 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29622 42 86M = 29528 -180 CTTTTTGCTCNGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCANCTAACCGGNATNANAAANGN ")((((+"*"'*'&!*!"+"+!%(+$)#%#&+'"'!+((%(*+*##$))$($#"!('!%*)$+''#($%&"'%*&(&')"#))!"% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:10A54G4A3T2C1G0C2T1T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5850 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 213 42 42M = 342 256 TNGCTGACATTNTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACT *):#?7;3"3D?4C7,H,:;<;D3?4?>?8D(G-;2A,>5GD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G9T30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5850 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 342 42 127M = 213 -256 CCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATNGAGTACGATCGCCATCGACTTGCCCGTNCNCA (&#$#%$%!*"+"(!$"$!%+%#%*#%+'%"*+*('++%!)'%+)"!&("")'#&)"**&#%!(%'%#$($+&*&%($#"')#)$*'!'%"&)(%$*!)&"'#&%!)$)'"*+(%+$"')*&!'#** AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:61G32T8A12A1G3G1G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5851 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14722 42 102M = 14638 -186 GCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATC H->$@54,;G$.A'0<;8>!@?GH;,5D$#A<0=66@E;F3#9E).71H,1@%++B166295'7?&19<.:6C#:?-@;9%16!*#FG192E("A?G$6895 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5851 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14638 42 47M = 14722 186 NTCACAGCCCGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGC $!%'+%*&&+&!!!!+)"%*+#'$(*!(%"!+#"!"&''*'**!+$& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0G7G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34690 42 23M2D154M = 34455 -414 ATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGNATGTGGTTACATCAAAACAA (#G)<72"<@<4=.B:(E>BC5(9;H0EG>(AEH)5%:&2-@#8"/C/>@:;>3-6682&0B#8<9#/#;=84"+=H88H703&?*9=D AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:23^GC97A35T20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34455 42 235M = 34690 414 CGGATAAACTATTACAACCCCTACNGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTNTCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAANNTGTTAATGAGAGAATCGGTNTTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGNATTTTCGCTAGCAANTA D%%".2HHC-*H"25,9$'@-2;,.3C94(#D<%A/>$#&G6&-H66C<;:F93:99:/>0@87@5$3#29>+5H5##2(FC$0C').22:G=H;"8#A2;C&>!C(B>@G=.##2?8<"5>E%#7&-B,GC,21%A)0/=&GG'EG$5$';E.%<8E(*)#GC7"A8%<)>(?=(:0CA;;+2!)$9+0+)HA!.=@18@8+57*4<8;C4>E!&F$!6#:5;+2:D@FB1/4: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:24A89A44T0A19A36C14T2 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5853 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26089 42 50M = 25907 -232 AATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGTGATCGCCTAGTGATTTTAAAC )&0H8$&;'&4B0$F#H%71H?6=.G4#@;7'),B4%H39<7?9G8@G<6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A21 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5853 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25907 42 109M = 26089 232 TAGTCACCNAAAAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCNGATGAGTTCCATCTTTGAAA (!')("&$&)&$+#!%"'%"##+$!#$&"$$"**$*#(#)+($)!)*+''("$))&((#"*%"("%$)$&$*$)!#%('"&!$(!&(*%%*(!!#!$$($(!"+&'#$" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T4T0A0A2C76T12A7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5854 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34913 40 132M1D121M = 35167 319 AACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGNACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGANAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGNATGTTATGCNGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTGTTGCGCTCAATACGNTGAAGGTTGCTTTCAATCTGT 75H11.46+71A69%$;2:HE=*.B/68;+*7!H%*06(";H:%(5FH>#)6;G0;'643')2#G!5BB87FB'G(1)'FH)&A!()2:5-:0"=A3-,4"9&9CH439-4@73(+G-1,1"!)H!,,;C>0B:++)E-#)#9BB/6!D/64CH5E17;4D:8$5##H/39(%BE:C/E%$.5=A:%E0+39!!?7H AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:7T49G71T2^G37C9C36C14T2C18 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5854 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35167 40 65M = 34913 -319 TTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTGCTNAGGNNCG ("+$%!%$'(*""()"(*$++)&("('+"!#)%)"+%)!"(")'&"&$))$#'+"%''#%%"'"( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:54C0G1G1T0T0T0C0G1 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5855 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47131 42 82M6D175M = 47081 -313 GGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCNGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGANGCGTGTTTCTTGANAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTNA )%''!%(!#"(&((!"$"+)*"+')(#*)'(!%%+!)'&'"*$$+""*&&))!$*'$$+*&'+%)+"!%'#''$"+')*!&*$+&)!&+*"&%("%)"&('"#(+(+"&#&'***)&))&)((!!&+'')**%%''!*&"%'%$!'*&%'##&%'**"#*#*%"#"'('*(&*!'($)(*"%()*"+!##&%!*"%#*'+!#(&$'%$')'"')*$%((#)""&+*#$++**%('#"%))(($'(+'%%!'"(%"+) AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:56T25^CCTATC19T13G139C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5855 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47081 42 50M = 47131 313 AGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCAT C63=F4&$00*(!G;@*15H9":2/6?+C%=.HF3'H3B,);,,6H7#2B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r5856 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4171 42 100M = 4171 0 GACTNGANAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGAAGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGT 4-!1#22;/7&&30;8E&A#<(!C7%4G;(?;<.F4);.>2.(!-@*6A06/G*8:$!*H>1-5=/92).F"1&75D.6A=06&3!;'*/@=3*(;6*5* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G2T53T38 YT:Z:UP jpayne@0: r5856 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4171 0 * = 4171 0 GNTCTGNGNTNGCTNTANTANGCNATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACC !#$&!'$#"*"(&#"&'!"'"%'")$+)'#)*)*)'#"+"'"*&)$%!*$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27024 42 52M = 26789 -287 ACAGGATCTCTCTTTNAAGTTACTCTCTATTNCATACGTTTTCCATCTAAAA %>:!FHG'C><*3DD,#,!&?$0670-;>H:+:(B94>*H/%=H70*;DE83 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T15A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5857 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26789 42 161M = 27024 287 TTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCT G>9?.8%2A@C%*B<'2:7DA3H!.4E2B1!B4,@!40?*319=8.!+,79A0.+E:61>@*4')C:>F*!?@0&.7G&&F.B>D"D'/.82G9"4>.*390,=E,03.'E>. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:161 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12434 42 321M = 12755 462 AGGCCTGAAGTCCNGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCANGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGNAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCNCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGANT 684A>-B%@*2&--&.((19:"1(!+="4BG929%G&*&0+$8+.(2>:DFE:)=:F5=-E1<,!<93F0F;83+;(8>7+5,36,(A#%9H//)%D'E#A8;>G-6>8@D#0*)38H?<'GG%0B+57+E)E9?>$/6$A7+.905!?=5!)"EA-A"$03#)9,7/=GH&)A+291">E1<.!?6@EA5G7B8-!6H2CBD?B(27?D9??+C@/.H#6*DD27"&;!760?&2+!4F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13G27C34C176G29G35T1 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r5858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12755 42 60M4D54M2D21M = 12434 -462 TAGGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAAGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGNTGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGG +$%'*+!*++)&+$!((%!"!"!!$$+&!$#!(#(((**""+*!"!&!'(#!'&!"&)#"))%"%&(%)((!!&!(*!*%"!+'&%*+)(%*&'*#+$)+*(*)"(%&++$!(#&*!("%&'%%"%"+()(*(%+ AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:2C37C19^CACG5G39A8^TA21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5859 77 * 0 0 * * 0 0 ACCCGTCCTTGGGNCCCTGTAGCAGTAATATCCATNGTTNCTTNTATAAAGGTTAGGGG -(?2A3',0,&&+:>>%4>FD1?D2)9-)*EB%)$0=7,>#!?$. YT:Z:UP jpayne@0: r5859 141 * 0 0 * * 0 0 GAATGGAGAGCCATTCAACAGAGTTATCGAAGCGGAGAACATCAACGACTGCTACGACCACTGGATGATATGGGCGCAGATAGCACATGCAGACGTAACCAATATTCGAATTGAAGAACTGAAAGAACACCAAGCCGCCTGATGGCGGTTTTTTCTTGNGTGTAATTGCGGAGACTTTTCGATGTACTTGACACTTCAGGAGTGGAACGCACGCCAGCGACGTCCAAGAAGCCTTGAAACAGTTCGTCGATGNGTTCGGGAATGCAGGATATTCCCACCTCCGGTTAAGGATGGAAGAGAGTATCTGTTCCACGAATCAGCGGTAAAGGTTGACTTAAATCGACCAGTAACAGGTGGCCTTTTGAAGAGGATCAGAAATGGGAAGAAGNCGAAGTCATGAGCGCCGGGATTTAC F#F:2#+<>@&E2*;?:%4?>/>B#D-*%!C.(;E61>0=%-;(&!*'7#*A#?2!#::+=.!A0;#$/6*;)G/#HGG=D1.=1511"$$H$$BD&!<,9F>#$'D')#>FH)+/'51(9.9'48DFB6%G*&F:F6/038$H50G!"!G62>:@DA8*A86=#*/5#&C-*#5@2A&G!9*;199+%7(<&6A-(*2%%=9F!7''>F67:$0,A.)<-;C?(64">FF4%&H!C+9H"$CF!C:..E3?4D$4%-'.3():878<#%/*3:,7;H,E:'-%#-EDD??+#1;/):.=2B$"G?H6B/9@6=&-$/:G#7?"H9,=,&-/7;#9;:/ YT:Z:UP jpayne@0: r5860 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9759 42 97M = 9651 -205 CTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTG $'?C6*H<%H2(.H1):#5+&3*(4#<@E29-,2+2671F"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5861 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26081 42 47M = 25891 -237 ATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAG 8./(#45/549.&$!=B2,+7..@.%6EF&)A<>=*#2>D.-@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5861 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25891 42 58M = 26081 237 CAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGA .595*.<.G=('6E/9:0F%@!758+1,+186'#"C2>,3H) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18254 42 43M = 18014 -283 TGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAA 8#-8,+!=EB"."*E)F1E"E#@/+#:A?!:=7//":,&EF.> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18014 42 150M = 18254 283 TGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATNCCAGTGAGAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGACGACA @!/-E:@0/5,:-(.AE9&/2D!?(31&E&-2C6-AC@F@!:=AG2AG1'$A##%GFHHAA9,94@'E# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53G7T83G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5863 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34459 42 116M = 34199 -376 TAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGG *3.5'#(C*GHD!H%AD'41D@):9';!2GC%209%4(*$FH0B6(+8)(DC.'4;&;04+F:<31<D411!:(E&A"&8@B(%$D%-A**%:AG6!$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5863 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34199 42 260M = 34459 376 NGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCNGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGA #8>&H%;/B*+B!6(4.*G9++,H.!?C7H3-#H(7&B'>#)&H/4>"(G=1*/DF<.5,C/3*6G.61,?G*H=3=1@8)2<7F115;&!,H:FA'1?(8GG.'-?2*%>!1&.57(89D70/+4%+E5A&.7'?!*92)"C37=46#6>4$($5&4?.A(H#)0=51 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5865 77 * 0 0 * * 0 0 TTCCANGCCAGNANGAAGCTGGTATCTCCGGCAGATTTCCGCCCCTGCCCGNTCGCAGTCCAGTCTGCATCTT **)$*'%&**(%"#)(+&%%((+$$*!"&$)'+!(!*&!*!&)*#"+((&%%($"'+!"%+)"+($%&#%"(! YT:Z:UP jpayne@0: r5865 141 * 0 0 * * 0 0 ATGTCNTTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGNCTGNACCAAATCCTA .;F?!,FEGG@$?*%?"7*A66-.(:$F=/7'>(3HA(1)+CFC''&// YT:Z:UP jpayne@0: r5866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7142 42 55M = 6881 -316 GTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGG <:-78*1/'.%))&1B/2&(9#BF'%/-E/;)?B4CH4&B.,=!,(02/$>3(F* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6881 42 56M2I73M = 7142 316 CATCGTCGTGTATTNCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGA G:3,$#!1%8)9,69153*95'AD)5(61"=<77>@HA*&D%57F)GA/#C:!5!5854F,)(0'<$8&=.=61;%$22?637,71->B'B$6@"*H98%79%'8AF$$@/3<>?9;1!,>1;*B?81"4+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:14C114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5867 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17658 24 24M1D37M6D45M = 17838 270 GAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGCTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATA 4E/3-12D?2C0.9%5HE4H8)B"':+H$E/??5,0949##B$;90G'#&.,"#$?(%H1%@A):%B.5/"%B$,'1*;;.-GC!81A%8.?%2&!?>9(4>>4?8 AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:24^T31T5^ACCCGA45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5867 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17838 24 90M = 17658 -270 TATCANACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTAGGTCGGGCGAA %"+#$&+"!!&)'+#)+)!&$'!+*%*!+##&(&*$'(")(%%"%+"%$$)!"!(+)*!"&!"!!!%*!+''$"%#(+!&'"*"#%$)'! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A72C10G0 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r5868 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12590 42 70M = 12407 -253 CGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGC A/G403@6CDH,'F(.91;;:;'>/1%.2*'4"*B&(!)-5&G4?4&#F((G:.+;'8@2-4"#D2'62. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5868 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12407 42 165M = 12590 253 AGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTG 3.:'.8C<%6?<(,"4EB'7,$-26'E83G'.*799>-'2)9<">@!$?$,//,7A%?<1B&D'-<"B19C40<%!EE@CD2&!1)"8%:($#<*!G'A6HB=$0>4!6:+%EA..C83CC/$?"4#3#9.<%'%7A"B:-!C9747'))-467=H784C!!&H? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:165 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5869 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3037 42 51M = 2865 -223 GGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCT <@E1D#H,7A'6!86=(G:@=2.6@6,?/.)*8AF3H0?*4%%>;"*;3)= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5869 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2865 42 118M = 3037 223 GGNTCCGGACNCCANGACATNTCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTG ')&$($(('$&$"%!%*%()!!))+(+)*$)'#*'+&&)%+!+)%"!$+'('#!")++(!'+&)+&%&(!%!"!**&$+#&+)&%!)')'!'%%'++"!+("!#((!"*#")*'+(&& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G0G6G0G2T5C0G96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5870 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31639 42 53M = 31692 252 CAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTAC %&B:A5'/G4C4<84<&5D$D;*@C0A$';G>#HEC*/!%F1,.1"54F.%"D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5870 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31692 42 199M = 31639 -252 GCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGNAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCC G;$(+A7*A?5DF8@B)?3=9)/A7F5*B<6*E9:<*,58.BD?1B#='%*.'#>(8-#;3$@/-A"$&H5A&7696%:F?1F"-!86*&<>68ED-HD:<7&7"@:431C&: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:150C48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5871 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6140 42 83M = 5918 -305 GATGTAGACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTC 53>5AG)"-26EC/F48G7'@&4"7FG@,DAAA>&3/H&E<'+;72E0EH+:58/9H)9$C@++H?."/'$B+'47!-$1":! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C75G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5871 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5918 42 86M = 6140 305 GCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTNACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGT 94+@="-*3F1=?46#*(HG.8)5&5*)$?=1*('<2:.2;$#(D9;"-!!(*>DB>*!/<8-5E/D&$"1;H-7>?*;6%E65&-/56*9C(1,=-!" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G6C118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5873 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 232 42 236M = 232 0 GAGTATCCGTACCCTTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAATCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGAGC #ED1#*32,FD##<"G&>'>4=:29:;(!6=/"AF=.5-,)B3$B0F+3,!87=38:*>">6'"9;D)/?2D,"<8:2(33C(%G:00($&A;:FB2&6HD.C.>%77#E?.@,%BF$:E'GD/>(#C:(),+.9/6$-+=>7)CAE8,H)#@!*5;0$/;7?C)3-74,E8H6(@3C,>D)C$/( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13A157G0G60C2 YT:Z:UP jpayne@0: r5873 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 232 0 * = 232 0 TCACCCAGCCACCGTTACGTTGTATCTGAACCAGCAGGNGGACTTCCGACGGATGGNCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCNTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGANGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTNAACAAAAAGCAGCTGNCTGACATTTTCGGTGC #*0BH8F(:;.H6$:!;(HH#3(503/*>G/4&#%;0;E>F$:@&%)+>3C/D9'$-'2,1+=?+?C49*E/G+;+,)$EF+H,7=FF>)*9E0*118#62$%0&,86,)2GB,+C82=7D(.;A.*+%3@F)-6:9B+<04$##7$9=*@-?G'*3;:02-"F(#,&#')FD#"BD(7(E+ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0A37G7T10T10 YT:Z:UP jpayne@0: r5874 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2084 0 * = 2084 0 GGTNAANCNGNNNGANATCCGCNAAGGNGGATGCTTCACNACTNNNGAGNGCNCGCTCNNNGNNCNNNNNTNTAATNANTCNCGNCCNNNNNNTNGNNACANGTTNATGCTTNNGGNNGA "##"##!#!#!##$!!#"""""""#!"!##"$#!$"""$##!##!###""$!!$$#$!""####$#$#"#$!"!""!$!!!#"##$#"##!!####!"$"##""#$$#$""$!$!#!#$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5875 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43100 42 68M = 42868 -300 GAAGTAGCACGGAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAA A&(#?,52/#C+7:'7EC9C7(>8@B8F-%8=13.0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5875 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42868 42 232M = 43100 300 GAAATCTGNTTCGGTNTCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGNCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACNTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACA $)#&*($#$"(%$%#'++*)#%$+&"+#!*(#+'"#""%+#+)%%%%)"%++!(+*+&&!'$&(#)%)!)&#"%*"*"""%(#+&"!%'(&!!'&(+$#)($$()+'$++$#()"&(!)"#'$)"+%+$$&'&'!#$+')$'&(($&"%*$#+'"'"&%')+'###+!+%%)$%&'&''"*"!!%"+*(+*!$!!($(+*&#%!%#$"""$&*)%(*#+"&*$*"+%&*)%# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7C0G3C2A66C63C85 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27096 42 102M = 27003 -195 CGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCNTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATA F+8/:4"(/811%6>+3$):A>/A"DE"4DAB#+*#6@H&DD<$0E=1"%90)>&C;#1G.-6D(:.)5.!AA9?,1>24'(?B/A42'D(AF49!@'A48. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27003 42 66M = 27096 195 CGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCA G,!$>65/7FB=138(88!%8:E2DF=25CBF.DCF(H@FB<#>B8;G'H?!%+,4@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8148 42 113M = 8367 271 ANGGCCAGGCTGAAATGGGCCACGGTCNAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCNCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTNCTTTCGCGCCG ($++&&"+!!)&'&("+$%"(+&(%+"'$+!!(#!""'#)('"'"&(%$"*#!!%%+!&**''#%+*%+#"!&&++*")"#$#+('%%')"$")()*#&&$$++&)+%$&+$% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G13A11A42C30C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8367 42 52M = 8148 -271 GGCCGGTGGCNTGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTG $)%'9:"7GEB3+,!'#$@;.$";=/"H&928B9;+CE"9B7@;/91;G7-C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5878 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30551 42 13M2D163M = 30479 -250 TTTNATTGCTGTGGCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTNAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCNGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGA +G=7!$H5<8?%C%;F9!;F$%?916:;?!-:!5-45;$-6H?'<1:98-<:8!+@;"4-9=*#>;E>D?!.4D**#1?#-33681%=F:9##BF'4D04=*.C8BF&GF&25-$D'/5-%,;4922* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:3T9^TT74T40T47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5878 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30479 42 67M = 30551 250 NCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGG !1%!G*B4C(+F%#4(*=*?B-7C#<4CB*C=&+(..A&"F?#@$;)89$5*B"*H-@D.>3&'D87 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T66 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5879 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31632 42 226M = 31858 300 NGGNTTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCANTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCNGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTNTGGCGCCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAA !#&(+)'))(+$%*&)"(%"#+##+$%$&+&+'%$!'"#'!%$$((')#+%"$)*$"$+&%)!+&('(*"*!'+$%(")(#(''#$%!#%%###"(*"*&&)*!$+)!*"%()$"%$+#&*'"'#!("&'&)+"&%%%+"!&"&'%&)$&&#!**!)(+'*"*"!$)&''%&&)")"&)'*!)&!#'$$*!%()!*!+%"#$%*)'$'+*"%+!"#$!"%$!%#*$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G1C0A25C64A36C5T88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5879 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31858 42 74M = 31632 -300 GTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGG DC4/'==<=;1B#7"'8)3H8G@='!5F<7?G,%27:3882G"+H-6G5F/%"$<,:C-08?&@-/F143)2CH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5880 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2717 42 40M = 2522 -235 GACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTC 8&,%C;:<67F3("&@8*-(HB+3C,6GA:;E>47:(GC! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5880 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2522 42 156M = 2717 235 CTGGCAGCTGGATCTCAGTNCGCTGCTNGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACANTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACNGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCAT "E$&E$F:H)9,)*C"BD5,4B+@;#,,*4*-C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19G7G45C47A34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5881 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37578 42 81M = 37659 242 GGTTCTAAGCTCANGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTG @A!'G6"6"7$>#+(-@;@"%B=.2BC$(./9A7@'31:#)0FE%6H.(EC(DB#/G?.1D)7%E12>"50(.8)#E<-B+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13G67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5881 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37659 42 161M = 37578 -242 CATACCAACCGCTTCATACNTCTCGTAGATTTCTCNGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCA 2'63/AD*"@!;EA7)>D;G/H*G049+$F/H:5#0.G'%>)F-#F=814&8D9%0%EG6;@C>HGDGFE&11091#.5E&E216>/E$32,8012GHA89>9%-:77BF>%27B13@A7 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T13A15T125 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5882 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36658 40 120M7D21M = 36538 -268 CGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGT ;(=-.#?=--/#-(45)8B((C3"+D7$-3A>@6&+(2626E:/E<)D%G3?+1B.$;E;):44D&+;26.-*A:??%GF;"-5"+=2B,*$'"/*EG,F;'%E3#!*!;2F4$B655(?2H<5)%$F,@<5!&82%!D/! AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:120^ATGTGGT20C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5882 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36538 40 41M = 36658 268 TTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCT 83,+/FH=/:3AH1!(-A&G/0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r5883 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16261 42 106M = 16384 257 ACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGG C"/;:3$/*=,!<:F=,+'3GH'D5>$BF-3<5+:!43C!-89-6$6@.4FE)%5@&645"F?C-&A'#A>&1B%53$53,BH("4B62@0=:=5.'&:)266-9E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5883 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16384 42 134M = 16261 -257 GCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACNAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGN ,FD#4C9-A,)AF1:@(/=*4:/@G,!-,(EC:F=!-5;&*F8'%<3;4)CC?12/*G3=$-2"*4:42.:=<2F21DE3>=>8G"2;G&H?%>/C=7>*.>!E%C;")F2*+#&6(BD703*56?&$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C84T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5884 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33255 42 103M = 33064 -294 CACGAAACATCTTTTCATCGCCAANAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTT 5.2>7<'5E1#'H8FF=C$&H$/#$*?F+(C(2=A7*0"+&F<>6E>G&61E(C!E<?4D=!8702.H''1#(C<,, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5885 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46174 42 274M = 46448 612 NAGAGTTAGCTGATGCTAAAGTTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGC %!6"DF4@@4!,$8"+/*??5A=DBF=6D!6B%7<$48*@+)+8+A:#A*%6=0C3B%4))/E&"7G5<2>(#GC'?G;)'.:(9AB1;?C=72"/7G%-@1,<;@(F+C#:70*,32*".<$AB8&-D;,$9$.E@@(1.G7%&G>,FGE>71,?)�F3B:(6<+',&C>%/>B)1)?:/+5C''049H:CB8<4A+7FD1!+-%.$@G1A@E0*?D9<%8)>-:7$A4GA=?7HH AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0G19C41G210 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46448 42 338M = 46174 -612 AACTCATGCAATTATTGTGATCAATACACACGCGCTTNCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTNTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGGGATGGTTTCCTTTNGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCACTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAG 5:C(E$2B+8F&24'"09FE>?-*'FF!&2#0A9<'1A)C=56?6%+'0%E:=>-%-'HC)/%07'"7BE%3-#913F!=>&0F#0)%2%=2FD*!/$88,C1+)<##C*:'+*E9)7,.9CA:H.1-."AE09E#-";,9+>8'A9/7D-70+F88+>+>,E1E%>H6'/:>2@)*$@=C8$@0(55<2-:;D98>";>(>0D*5%'H,,-)B5*)2,*@E)/=*():$315*($3&7*&0$)5%&*?:)HG-06H*=B65):1A!4H#>A?9F?07'#@4DH*=0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:20G16C67G87T13G74G55 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5886 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41143 42 29M1D78M = 41251 319 GCANAAGCGNCGGGCAGGTAAAGACGTGCNTACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATAT &*&%!#+(!+*"*))'*+")!%$$&'#*!&%#+$(*'*!+&%!+#!#'+))'!!&!&)"&*(&$#!)!+)%)')#)(*'$)$!%*'%$*'%%(%&$###*#&+*!'& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:3A5A19^A0T77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5886 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41251 42 211M = 41143 -319 ACCGCTCACCNTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTNTGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCNCTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCNCCAAATACTGTGATGACCAT E6=H#H!?"4*+?12:=!"7-D)<@>AB929;:BA7:G#GH4FG1*$!&+99DD@8@??654*0FB>1:16*49;E#C5!9E+8G8H50))*41<88F54C(>?8&B?7,-A#7@.3>(#5+='%*A&9'(6-!#/+/6.DG>/1E-.**42;8H6<;0!E)?*5@H$>GB$(.(+:>++?C%@3C@BG!29C6)(<,*GG30 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10G52A72A53A20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5887 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34923 42 122M1D80M = 34828 -298 CGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCT :/B%!/?$6(&;E(8DG+&F'!F.&"5)D->4988E$*<-7!.<>$-1DF/4/-0'&7'-+)%"EC7?>+/HC2*E;8F@:#:27DG.>@=?GF8-/)0DD1>8D?>@,C.#?(1.="F1GD7%C;<+G@CBH=4!A-21A<2BBD(6=(G(1D0;<#=%5F' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29905 42 87M = 30129 279 TCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTATTGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGC F<;8!8&':1G))CG>GB6=7A3$2?(D3)5.*!7)A*.?()03,H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5889 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5194 42 79M = 5056 -217 GGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAAC +::>)$74%G92=9@D$83*FH7;?3D<1>.55F<3)55/;;539;=)E"G5+#D0G,)>+F8-!9#%G!<%29.DA@2>;4H1+7="0*!9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5890 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6205 42 18M1I32M = 6299 199 TGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTA 8B,(/)46!D*"/B&G$6+%,*B&,6&F"(C-5$8A+7=:7GA7FF99@02#A11@5+'7&-8D/@&.E$;EC15)HC AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102G15T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 243 42 151M = 449 246 ACGTTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGNGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTNCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTTAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGA &2?>B0GFA8>C*-H)5>A96%H!"(9'+6-.'5D&*F6H.H$1:$9GA!&14&,("C111/-,>G.9@A,-D5987+-(F6A&,2/C3(4@;7C/.'9H+#9%++8A*C%.<5A*9-%.=49=#>')306(/%G:8/GCA%,:B+F#,E@ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C1A50G23G35G37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5892 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 449 42 40M = 243 -246 CATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGN $@+A<)$8FE>#/)&H:?#$!/2,2H*:&%,95&A@$#/" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5893 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30911 42 55M = 31086 215 TTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGA $-7*B..9+,5>:E0'@"-'$%0$3("G3+:17.<5..1F$F4>G:);G04&@F>0G";%24;926(9/80)6.'$=EEC3)@0D29C.,4A.5,.90-4@'4,GG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G139A47A32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5895 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28085 42 102M = 27864 -323 AAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTG +GH5"367:/D3F-5<*!F@/>0F'>*5'GFA1.DD086A@0AF<&1B6+55&19+D-14'A(7'HG0HA--F)<;2A/EH@,#*=0@6).:9G<"&8353& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5895 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27864 42 47M = 28085 323 GATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGANCAAACTT 4G*8G!9$%))(,;B$*!3G64"&120,1*+%;*(&?7!)B-E!1!G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5896 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22615 42 125M = 22496 -244 TATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTANGACTGAACGCAT !")!*""!)"*$!!#&%"*#$"()%*!#)!(("!+%($&!"#%&'&)!**'("")""*&&#$(+"+()+%'&$'"#%&+!"*$***&"%%'#$%)$)!!+$*+%*#'&&!*#+))+$+#'"#$+# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112A12 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5896 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22496 42 119M = 22615 244 ATTNTGNCNANNTNTCAACTGCACCTGATANTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAANTAACGTTCTGCGGTTAGTTAG *!""&*%"%'#!#)+'"$*#'$&('$%%#&!&*)+('(&%"'!%%"!))"**(!)*+(*&*((*&+%"%)!%#*(!(*)#'%&(!)'"%&)&)$)#$"++###'#&&+"(#%"%'&"(( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1C0C0G2T0T0G1T0A0C0A16T66A21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5897 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45866 40 18M2I68M4D49M = 45752 -253 CTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATC /!D"&."/(;E?>*B;3+0'(&<27E:G2<(A0*++;2*)#9%5,'H5*(<#@-=)E*=H$;0''.!*16;F'B>@<(744D$C"=6E?G0@7-1%C@B2:CF346A.'><&$.6%'?4,1:H@0"@ AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:86^AGAG49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5897 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45752 40 114M = 45866 253 CTCCGAAAAGTCANGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGNGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGNCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGG F/?')C1EC%4?=-5%*@+2:C$5((0+@">7)+4;8!/'%$<%7#9'8>?=<>7$#?1*8/*==,21&0E4?7,9(#-E)*&H(!!F<(,)#%)*'1!19!."9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13G30C41G27 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r5898 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5796 42 148M = 5982 286 ACCCAGCTCATAACGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGC F'5"&2.7:6;?@;>,C%0(";=%'-4D>;/%=A,5-66F3H&-+')3(5'@E""#A*40E>DAEE("#2/8HD5%-73,<(E:3B% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G7C135 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5898 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5982 42 100M = 5796 -286 GCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACT .8;-6+D0!-5H=8:,0-)"*(20B-&984":DE/BE!8==E=7G+4C*E?*HH;?;?58=(D5FH?=>G")*E48@>@E(.2750B!A7DD'3"C)#!: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5899 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29416 42 82M = 29498 334 TCCACCGTNCTCGTGATAATAATTTTGCACGNTATCTGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGAC %F*72+):0F@B70D24/H9C>&:A&2A)G@)(:GH!':3/.5A?E5,D%G,#;HE?@5G*1)'<$+B!?"6"A+D$&#%;* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A22G4A45 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r5899 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29498 42 230M3D19M = 29416 -334 TTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACNTTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTNTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTG >69%!(0!,*-$/&G"(FA+G1&/2),4?G8D,69':DHA#>1<'$98D=#.<"/A?%F6B8)23:9/$/+:@$F.5/@'8,!+@/8>$;8-2*=(?C!/E63F63'"6%=;%7<%:B=:@23"-0&!.H=?5@>$'D)G/'?D"(:H/-><&!;!*.B,"E(9,=$";A3:.+;7G0#+,>">1692$B5:,GA*@0/752>&1!.,9/A9."25-2/B-%$9=-(59HD3/DDA#>9+"A19@/@CB AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:108A76T44^ATA19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5900 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9952 42 59M = 10029 254 TTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCT 7"@%!,5D6?".4@;0(6+>)A%0=A$$82+01D;*G9G$2,>A==D,((83):29A%- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5900 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10029 42 177M = 9952 -254 CTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGANCAGACAGAGGACNCCGGGCCCGCAGNGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGANTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCA #.:8+<+0*77G=:2=,$%8"$C%HGA,%1;?$B7'(FC6$='6&;7,"3)E6/CEB8)**19$@85/%F,*1==H0%@$E#&0"(H>8G&B$/#E4=%!G/?$9>H0&8, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41A12G12A37G71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5901 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1277 42 325M = 1124 -478 GGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGNATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGNACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGANCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAG :5;46>1.80?;?20<0)114<=$/+91:.-%<@:3")E5#>"7;8G00B84F&B7!C4++G+3'8>8#:>$2@9%&9CG"'E9C7,.D>;@3036%3FE.#;%(@-B7<5:.255HFDF*1:'*C$4='6BA24H"-1A1?F%)$F,DG4!+HD;($D3(74:C;$G>,&3';%"1"/8C68:>$,B(/DD2+AH7<0,#F#%)13*$C!':D."(G%=0+"?".?!1?A.93=?C%0B)@'70".=9E-B:!D1!@!@=G"(;.6'@1<":5!/?FF4:7ED)#(+!6@@E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33T56C167G4A61 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5901 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1124 42 153M = 1277 478 AAAACCCNNTGATGNCACGCTCACCATGAAGNGTTTCCCTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACA '$#$)!$!)%)*)!+%+'+$''&$%"(*$('(#%*$'""(+#"$'#'($")!"'(((*&'&*(()!"*"()'$%$%&))&!%%$)$#%+!#+'"!#&'!*$(((!!!''%+&%%#'%*%'&*#*(&$('&%'!(%'&%%!(+&%#*%++(&$( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G1A1C0G0G3A0A16C5A115 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42416 42 74M = 42219 -271 CACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACC B(%1GBG%3,A64!2E8=9$(>C<1)#1A;=E6C&F4@;5(=;B0@&3BC!94'6&F$84H.1%%5-,)7G=/= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A50 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42219 42 197M = 42416 271 TCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTTCTGCGCAGAACTGATGAGCGANCCGAATAGCTCGATG %>/#@?*3:1$6/>$&+=8%H(&!35=#+/%6>FGAE.3>E4,%@GF$18A;2"*1$--,;7",1:!A)(,+7'.=(&9+-)#?H:"%6%@/!@161>BB:!C09EE'222G7@%/.&>-G1#?;1-?%>&#AC5/,()3D/H+D.4'*56-+-55,+@7,E@D(*,0@4CB.4@GB!HA*D5C2B2+;)7-&53"2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G158G21T15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5903 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25434 42 91M = 25670 332 CTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAGGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGA (++'')&""+")+!"+%*!++')+%("%$+$+!+%%#*+)$'((&"!$)'#%%$)'+($&("'%'!&))!*'%&"$&'("+$&)(%%+"!% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5903 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25670 42 96M = 25434 -332 TTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCATAAAAAAGCA $F8H!@!'<*5(&8B:28%*87!3A<2869'!3@,069'-6.!19-.!875"2G1@1$25@;-$,3#'D:E6/E087$&1($,E#$"0<(1B77,,!?,54+AC-09E*>/ED9(C03)' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5905 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4242 42 49M = 4046 -245 AGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGAC 0%')5/(D/"8(5DE*6+&GF?+%/!+4!4%601C=5D=0F>'+:.3'F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5906 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24002 42 123M = 24125 322 ATACAAGTTGNTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGG :9%C$.;+(AE,8H*B0524=*.%.<)*!"!C)."/5'D:*+6*.(!BDB1A>.6+3E78(+!B1*&?#GC>27,<51(=?D"*+01A3744;.H3D(3H#7D2:0D7);(527F/'@,9%58(;6,B0,0AG$>=3*H-.=%3;+8!A=>(""34%)<>0&F%C':9B2,,!@'&+HE4>$80G,C(4G.$G,;-8F52=@CD@(4<-9.A?(D8A6A0.@7:5*",H>8?%%#( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23G49G3G113A2G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5907 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46645 42 84M = 46496 -233 GGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGNTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGC #.FD-,3=9())(8'F/$8!&489?,FD#5!=,<,1':*>0H(A:,,'+E%1;<=HD0'$<-/-7?&A83&B+$E1##E!+"$, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5907 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46496 42 149M = 46645 233 TAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTNTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGAT &82483490@&E.97AB=15D48D4HE!=CA7:0B'8+<,+@*>:@/@&C>F*%+308=%D&>D78AA7B449365*5'3"4,)*>C)C"BH$21;G&=#&;#?F'/(D03'HB5?942&HA0.@41+58'=AD6B9B1"B,C*?00.F56).(C.-612D/HDAFG1$-9/,1$'"(9;< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A2A97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22463 42 122M = 22340 -245 TGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGT )*())#%%&$$)$%%#"&'*$%'+(('!+*+$#)(*!#%#!"(')'%$+')$"'++##%%'++)#!&"'#%!#!+&%%+"(++"+$"!"%$"&%&%$)$%+$+)+&'$'!#*"&'+#****& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9537 42 57M = 9402 -192 TTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACC >3#2$:8=F1619&4B:@D@2=>/>?$&CE+2*%217!=A//+6A@D:9>BA(7.-F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9402 42 69M = 9537 192 GCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCNACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCG $G@/'&?"*)6A<0';H5308*G1$D$D0E01=6.?%#HB2B*&55?(/B%?25A6*G!GG$(E7F",$3;B.&%"6%!!'AG2F>,+1#,!C(/,:9"?-.*)C>?<=G#5:3+#!4@A.%HG965F7E9%+)C+%B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5910 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18102 42 40M = 17874 -268 AATTGAGCCGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGT '(#:$$"5""H)&**%:;@=*6F5D4$G(8E6G/>*6.E0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5911 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36462 42 154M = 36358 -258 AGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCATTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAANATNTCNT *!"$!$'''+)('$)(")((!*!*"*'"*"!&#'+("'$)%!(*('+#**+)&#(%"&&&#!)%*)$'$!)%'&#%(%%++#()#(##&$+&#+'*$)&(%''#*+'#"$"&%+)*(&&+))('$$+#)!"&*#$)'"#"#*(!#(#&#+"'&# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:44C101T2A2G0C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5911 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36358 42 104M = 36462 258 CAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTNCTGTTNAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGC 2(F.6#;@,<1"F$B751!;%,E#8.7C.=>?A;-3(,7'7.6'8.H."H+=/!C$;86$=&?/9)&,D*,=9H;?"1@8:*2"6933$+#9(7-D5AC-#3FF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T5A29 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28229 42 43M = 27998 -274 TTCNCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGT =E;E;;"9;A>F&E<:=&%B7@>:="/@'*HHH,+>0B+=:FB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G39 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5912 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27998 42 231M = 28229 274 AGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATNCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGACTCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTNACGCCTGNTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCNGACCACTTCAT #33,:$BF798BG#90'6H/(@HE-9$'"$-;)BF:?A!?;.3)=4$>#,71%73E8"#CD-*1D1HG=53%#D5@+950"17+H'D8%-C<20*;3=$="24C2?2=6F14==78!GHD@F%-HH82,15E4"!!E60!C6CA1.(%;*.&,;3#@31D/F#E+7GF#1EF!/%#6-4"F(@G=/C%@7,5;1./=%57&?==!+E*4H93;5>$380:>D*EC073=7+-2.>;&,2?- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5914 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42598 42 406M = 43004 505 GACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGAGCGCGACTTACCCTGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTNCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCTTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAA 987?$GF"'44>&2E?"66A3/781$&#HA(!21,+;"/+).C8D#8G7*%D5F=5%@A:322F601C>$8,GE>%'AED/C#+48E53BG4C;HE<4>@((%<'B")7;2@-=F;G(=%#C#45!)=0G%,7G?'(0EH!%1B/%B'#A63C%A:D!%CBF:4/,0<8HF!)#9(H4BG>+D8?>%,728:0<;<#&C6491='9BG#F;DCC8+03GECB@%2")G=G/?)@D9">GE(,*'/+=%?=A942?+='93:&G302E:$@4=EB=$D&,=='B4>H+;6<49%+/F9G0F9D,BD8:@:*D9&HFD46/DH!7-*7DD%>..&854'>:G(!='1!0#<3&#'.$+DC9+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:121C11A63G47G160 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5914 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43004 42 99M = 42598 -505 ACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAC >.>:8AH*G$?;.)(+'C23FB99B1/%?)<7&5H*5E&,A1)*4)*9/3/8017H6%$5&E64@6B1--#>;$<$=G7&@+#8! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98A0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r5915 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48361 42 137M = 48184 -314 AAGTTGATNCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCGTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGC B>;G+-<+9&5-?(A(5/HG=-8/#+'&&<%4.34:>+<735?H(8*>+0-(?A=@91AG/E$.+E-/2E;E$;94--->!.2C<+3E4C5H(@G8:<#$9+0(.;!:6H62H+:7!033'@(CF&C=9-%G.HH?# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G57C52T16G0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5915 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48184 42 177M = 48361 314 NCNCGCNNACATANTCCNCGACGCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATNTNTTCNATCATTTGGTTAGGACAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGNCATGAGGTTGCCCCGTCTTCAGTGTCGCTGATTNGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTT !#""*$#%$#!&*!&()!"&!)%++&**''"+$#!+*$('$&$+(#*%%$!'"!#!&'$)"$%&)(%'#)&*&!&"#))$))#"&+##+)$)%"!#%$*+(*')"#$))%')++*(!**%"&"""'!&)**+$##))$"$+*#+&"))(*)$)*#)&)"&%+#$*&$$%)()%&$(% AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:0C1A0G2T0G1G1A1T3C0G3C25T1G3A15A45A16A16T26 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r5916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13436 42 107M = 13332 -211 ATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTC 815&.6$)DD6%B!+($F8&%:34CF!G72$/*,74)=:3)>&*FFAAG1.0A1*;6)%!H6$7E>)"-;&*,=)??B/%@30(@'HGB#"@"B!8#81B+>)=26E)F#1%)CBD=<%!C<4%@9DF AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3413 42 372M2I6M = 3288 -503 TGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTNACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACG +A61"E-.!0=*D/C:A@00HA'3':1>!H.0;*/+G!.>,++6>(;AF;&(&'.3'$9*3?*>@84;*:2D29%?D:+77A!D,(E2%)03=>-(8FG$/2(8/(C0@-";3.H1;'-D44B8,4>8+8;0FFA+7/,F-C&9:!#!'*)=.H3#*6%-@G5?0.'(6>D'"#'5!E7$E.::/#?05A-*=&+D->'%136/;B0FBA'*!?12'A>4;!$G3E"D)>+> AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:243T99G34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5917 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3288 42 125M = 3413 503 GATCGTTCAGGCCACCTGGGANACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTG $!+(*)"%()(**+!(!$*!("&!"!$#!##!!(+&)!*++#%"&%**+&$&#(&(%!#+&$)$'*!&$%''!&!(&'#))&*(*&*%&'&$(+!)"*(*"##'"(*"'"'&&#"%%&&&%+%!+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T19T41C61 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5918 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32696 42 41M = 32737 253 CATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGT =!3F;:7G/@*A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5918 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32737 42 212M = 32696 -253 TCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCNTTTTATACCTCNGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGANACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCNCG 8?4.':(DG-))??F%7D18F'8%=&*D*>&)@0H#@-*FAEAG#8,#99%/C(#-"H8&%&"9@3(/;D&DCH5;!1.:=614@<,$:9%6FD618@HF&F?&&!!=2%/E'5G(+:(EF")<(?&,.C&1E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:164 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5919 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4160 42 245M = 3996 -409 GGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGANTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCNGCGACAATCAACA %4)>D3(19H-&:=,+*6*8;%&$4#+B$-C-&4*D>&(B1)(F%A>GD.2(.2C+B/<&C!%C/+47?'%:>+E12H&(G2*/"6F-(E0,1?@>+&@1@20*2,:D9!)AA*-C!176F/7E6C#1DCH3:08#A6#6&H&8A@2+%.CHD:$C/)(''1&<%-9771$%E?#E;H8-.DG.>%;;H/-$#(=5%BD!;:@-!-CD/D0&G9>*9"D/;H8'20H%6?&)9.#:'5&A1E8A);!,6F*3&';8D(=,(AE*D/*'@-4#*5>>06-<&'7=C=:-1%8,B@A?&=412H3&)B7-+;==-A@>)C;0DF!5".C>-G=#D<%*H$E:G+'7B&<$07EH-9(&BA7B<,F/'?E7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73G79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5920 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45045 42 52M = 45103 211 CTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGG 2.B3H.&'FC%-83&8+/)<4@F<0=6'69&4;G?>*F$-5:BC-67A;1:G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5921 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39902 40 122M = 40024 238 TGCATGGTGCCGGGNAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTAGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGNATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGT :,:B2"?56B5!@%*(B:29!7,-HE+.!/E;=):;!7G+$0(G(7#&(*387>D"*FH+;/24#!8E0%<>D2577-!?,C8HE*!)+E.)>.!,6>/BG74#4!E(.)-E4C7,@6'9B$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A45T36T24 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40024 40 84M4D28M = 39902 -238 GGAAATCAAACGCGCACNACTGGCTGGTTACCNACCTNTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCTGATGAGCTTGTCCATATGACT A'08H)H;;0F:9F1;'60B:1,)4.&C<1$)EE1#D?0D4/HF&F<@C4'E%42><)9@H?;BG0E22<#A8!-7>)>85=1?)B7D7#EF5&"3.9A9?G=6E@?2H@-& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:17T14A4G46^GTAA6A21 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5922 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19338 42 116M = 19578 303 GAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACC B:$1E>=&/;E#+C:8687"(@845!G)26%6&;&1,=)>$5@:$08>:8#,'?+-3/>,"$82/240EB!77;80((3;6GDA2F%B$-;*/&(5+1H;.-1&4E8+A;G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5923 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29993 42 128M = 29787 -334 GAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGNCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAANACGCTTACTCCCA 4,'8,=D8=,"#4-@6=E;$?0>+=-E@7AFE:209.2B;#@D"-71=!9H@9-E535?B#?F@)27*+)2-%4FC)7E/E!(2-GG+GE456);D.!G007%7'@/;=7C/"18#E,F.?F@.:<.G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80T33T13 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5923 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29787 42 206M = 29993 334 GCTNNGAATANGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTNTACAANACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATNCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTGACTGCCGCA $&(#")"&#&$+$&*#+'#"'*(!"(*%!%)))$"!#(($'+*#***#*+#+(#!#+)"%#+(*&%!&%$"$$)"(*!*'%!(")+%&'#!#')#!+*)%*$%&$)+""%%*"'"+$!+)"($))*!'%''('#%++++'+$"*#"((!"%('$&%$&*#**!+'&&#)+&#("&&%)&$%'#**#*(%'+&)(%+#((!'$*&&$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G0T3G1C35T5A28G22G91A9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5924 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39470 8 25M1I36M = 39470 0 GCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAG /04#=,+31?*,-=3H%2E012@+6EC6F*1-!>;,?*#+37)>'@@55?-:/*(&,?>=C1 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:15A6A0A37 YT:Z:UP jpayne@0: r5924 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39470 0 * = 39470 0 CGNATTGTGCTNGGTNCNNNANNGNTNACCGNNTNNTGCGTGAAC )'$$%&$#(%*$*('$$&!&"""'!)*#&#)#!&$!!'++)!(&+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 892 42 149M = 1041 319 TGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAANACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGAT 5+9<"GDF*AE+%!/""&DC1)!D352%+-*G%"2,EF4C>13E8*:?#;;#H)&.!E@9F<;@;)"61=04ED>9&!(9GGH7=)'F99-'<;-D;56B5#6&:*C724.9D3=:"A:+0*7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118C30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1041 42 170M = 892 -319 GCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTNAGCCGACTATCCGTGATANTCCGTNGCTGCTGGNGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTACTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTA >5)DD-3*?02?&/1.:7':1E(%>8,2=%*1C%G*@1(!"0D:E298*);+"!")3BG=#C.A;"D;!F(:GD01/=$'2$-++*/5.):8F.38C>B?&*2A'3*#G"=99;@C!2HC-D##696561;H4B0@CDBB2>3C4C0"<*;A,8%>"H#D=,8D75"'BA2#%#:8F>$&C<61:C33AG#6-A)H6+>G(A;:25)94#;:1$(>G/?6!,&B(:)*"C;::3D*27D:+=6G:F:DFG=.B1/7A>3/F;9! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58T85G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10250 42 48M = 10395 290 CATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTG 9F-=@0C+2D"4AH$*+$*H5D9*,.3)H9B0?:8#C(?&)6D.2517 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5928 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45494 42 70M = 45338 -226 TGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTTNTAACGA '&$$*#$++&!$"+!()+!)*((#'++)&+*)#"&*("")&"+$&!"#%&%+))+(*('++)(!%((##' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:62G0A5G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5928 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45338 42 119M = 45494 226 CGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTA %'/"FH.B4.%=3>;C69"C9*,7G<:E>#$&@>A4F'#660=7$':FE)GD*B($7(%.!%67/3"0"F'F0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5929 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40273 42 70M = 40104 -239 CAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCANTTATTCATTACCTGGGNACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGAC 7E710=C&"42E)1?<@'?+A"2-;>F@&:;,F"75H,'F'BB.56C.E@B%",93@46-$?.27?/1(E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A16G27 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5929 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40104 42 144M = 40273 239 ATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTNAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATC (+')*)'"!((*%("*!+)(#+#$)*)#+#(#*!())"")*'*"&+%)!!")!($'()'(!'"*!)!$$&#!+!'(!*$*"($)#"'+#(*$+'#"&!$&&'!%'(*&%$##$&'"%(%+&&!#"&")'(%&&**"&)+*+$$) AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0G0C0C0G0T0A0A66A69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5930 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22920 42 84M1D185M = 22833 -357 GATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGNCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCANAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAANAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTAN D-H;E9185=6-,*D:?<5D>@90D&G($B563B35+&$6H,D"A3-'0%'B7$(5+*&".D@<7:9FFFAE5BGE;D#<-&@:A<(?H7"0?<9FF/%=E=1+5G=:<0(F'+:=.,C)7D+)6(8@"1HBA3%-#$H@6F0(D/%+'+?==%6>F/>!1>!88=+'&4H@>1(7E80A"!A1A8'/@CD%;=+$<.")7773'! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:64G19^C72T39A71C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5930 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22833 42 87M = 22920 357 ANATNTNGGNTTNTNATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTNCATCTATAATTGGCATTGTATGTNTTGGTTTATTGGAGTA #!&)$*&#&$)&"$$%('*""+&*((+$!&#*$+('!)+&*%!)&&$*#"!(#*+&%)+!%)$("%+'#+"('%$!&(*"!*)!+"$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C2T1T0T1A2A1T31T23A16 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5931 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8602 42 417M = 9019 567 TGACACCGGGGCGACATTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGNATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCAACGATGACGNGGGCTTGTGGAGTTCATCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAANG 5-?>.(=#>C!D;4H"7<8=G=22)1*-B64..'7$'3D-#CDE#8,8A%>1CD,,B27A*6%BE*6##6GA%E&0.!&737;H:(776""B)2(8-5#("2<4=G@D=D$')%:GB,26CC;!7FC)*+*-1H51B*&(F"C(6&*"'&,BF&.21GFF0#?4%B+(32-;,-@:A"6,?0&=;)8%*"&@?E8:<84+G7AF@957D9?!;E@97,C>2:2"4';8!?+(5$8BE3A3!C52+@$&:8/>,DF$*,9%?/6+#(*9"34)'G9!AB4/*A*046;?FCGD8".&6>@F,9C323/<3A;@!2(&<1>(5*"<;D>0)G2*E;E?=-159#)@8C/:/7A7/%'#4>$*'.FC:5B0@'<510C,)3:E>0A/G>$;#3.2/'47C.!?E?F$0!?:!1C0<%0.!C@F:G.&D8--=*53"!0*2$)FDG#E,&&%H+3%?3#6*!+#22/C<;9A$HG@)6-11>6"G,("0!5E84+<%A#3"<';2G.#7!@-D@)1=8?"5':+*0/061F#$HH"B'C=+G0G;CG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r5932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41074 42 99M1D60M = 40943 -291 GGGCTGCATGATAAATGTCGTGAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGGCAGCATATTTGCTCTGGCTAAAGGANCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGATCATCCAANGACATATCGGTTTGTCANGGAAGTG 6$@'&1D4%8%5%.'1;"3526B)?.+:#;'*:(;9HA,7G=0()1B+@>7!/-84*>#+$00&%5:;")/6F>=6+)!3*'+>$.*@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T29G21 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r5933 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12795 24 20M4D54M2D35M = 12951 216 TACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCA 7F0#93FG:"&!,,:-*,!+#*'%?=E44#(+),03%*'H1:FE/,DB-(!4G1HE:.5B5*+?-=F.>C6B;+,/7E';.% AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:0C19^CACG54^TA35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5934 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1902 42 98M = 1771 -229 GCCGGTATCGACTTCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGG 1F#1B,G?%)E?-0G25D236'!:H0/%(%.A"*+2'5>4E72(00&7.BD779684"<%02BA%%$!AD&,H8%.&/3C>>=@:*@C6B9,(B%7!: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C84 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5934 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1771 42 67M = 1902 229 CAACCCTNGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGANAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGA "&((*#)%$+$*($(&'!%!+*!&(*!($'++($+))"*$$#(#(*"&+$'&*%&%#*&%#&&+&*% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A4T1C25G8A24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5935 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26535 42 135M = 26185 -485 CGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAANTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCANTGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAACGTTAAGAAGGTTATGTTTAA <%"/:E@G?0?6@=C=C">">EGB@(24;1C=?0E$9FG,%?.4@15/A/29B'%BD?+)%*"-+01D.>FF)'AGG!;5+>=-7A=*=&#)B98=-8+H948GH?+1%+"<7=G=6,!71F&2=*.:$@#F%@08*%;?:/$,HFD.F1'A3>841@6%>=)@5432H4="&EC0&/<2)G37+3$EE0B2@6/#;H4$=);0$(>2??;28"'CG)!)'808<9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5936 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2943 42 163M = 2816 -290 GTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCAN !>%A<52,+<(%*8A023-<1#:@2C@26G'$?!)%5A*6F8=,G4H@/-;A)C4,=34F-C#3D@D,(2AH8E-!%=E*)9">85?9(A?/>;-:D#8E5;#95.;-&$,977,F4'A,0!33F=+?>*<&-1H+5D;8D1'-9$+50,;''-A:D/<-",-@4D)<.><<0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C6T70A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5937 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21425 42 40M = 21626 282 CAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCA (8+H+<$>A9;/B?G#%GA49.C1<8&2;'A#08"8H:5! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5938 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6409 40 15M2I65M = 6589 287 GCCTGCCGNATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGAC 1%17,-(F:&4*#-1H6A:2:'B&>E*".9D4,72B4/$"/+$0$#1%C$G(395C%F7E#;:5E%>-(A=.4HAA!!,5;) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:8G71 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r5938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6589 40 107M = 6409 -287 TGGATATGGGCCGCANTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACTGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGCATGACCCGANCGGCGATACCGCAGATNTC (*)!'&$!$*$)(*$'#)%'+$+""("+)#)'!)##"$(!%($*)!")*"'+&&''(%$))+)%)&"+$)$&%#)&'$$*%+'!#!+#**)$#"((*'(!"%#!%#( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:15G33G27T9C2A5T2A2C0C0T0A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r5939 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5275 42 58M = 5434 220 CANCGACGCGATCACCNTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAANCCCGTCTCTCA *%$)$+%$%!"('*("'&($"#&&+$#'*)*#!*+$'#'&)!"(+)'))+'&+($"#! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C3T9G29T11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5939 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5434 42 61M = 5275 -220 CAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGC +A32?GE((5%)?E7>2(A"=;>1.+/:6BH!E2;*2/&89%224)-1H.,>:6%'26H>" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48G12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5940 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10075 42 41M = 10384 360 CAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGANAG ;:'$99';<.&>)E90'8?-@63/12>FA+AB21=F>!2*9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5940 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10384 42 51M = 10075 -360 TGATGTGCTGATGCAGANAGCGGCAGGGCTTGGCGGAGGTGTCCGCTTNGT ##&%'+)#+$*&*%$#%(!"+!!%($'$*!%!%%(#)+*"!%+#"++(&## AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17A14C15T1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5941 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5496 42 253M = 5283 -466 GCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATNACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTNGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTAT 1-.1A)0D(0%@"'E8%.:0';/;>D?:,F.D1;5F*5&>2B4C1H7!E/(',D8)6CD8,-$0,-$,98G?+4A:)G*#(')<;BDA-8.BH0+,H,.*>870E:FB$-89<=H8(8,7/F0B;F+G48-$H-(2:8!<<&A$5?;;@A;"G%,"FE)@6=%.%+H>#:H?E5(:HD7%5H.EC6./>/(/F#!)#'6>1??B$7:;C;%:++>3-9E#-2@H9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T58G104G68 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r5941 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5283 42 213M = 5496 466 GGANNACNGTNATGCGTGAAGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTGGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGACAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCCCGGCGCAGCCGNACGTGAACGCGNAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCC %*)#!)*(&&!)+++&$)$)&)#+'$'#''&%*!#)(%'$*%%&!&'"*$&)$&+%!''&+*)''"%!")"!!&))#(%&$'!!&%%(+!#(!*"%&$'()"!%)!(#$$"**+!*)&"#""$*!(("#+))*))(!""$$*"(%)%+*#%+'*+&#)&%+&&%%(**('*)#!!(&+#&%$')!"#+%!(($'%#&%'#(+#%#$!)*)%%" AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C2T0C2C2C8T82C25C26G11G11C19G13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5942 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10783 42 209M = 10720 -272 CGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATNATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAAC $E?B&3!*-3%4B!C5@-E#-7-A09H>:247&2+'-0/5&"8E@9,68;<+HFDE!E)<4F!#6BC?8FE/+:<956@&H64(530&53HF87E!@4('6D--EC/0,;3*A-404>,014B*3+7CE7-0:9,30-5G%%%53"@/81+?5((=4A)-:="+GB#.#.AHC+H2:-CBD9?4; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G129 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5942 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10720 42 63M = 10783 272 TTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCA .09++C:'H1,D1(EF!F%D4-8)?1&17831$*B3+"C$"!)4%37($<5=&1DA='8?)-9$.@6#4?(.((G@2:C-:!=3H!)GA4"9##/<39$"3%20H7' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5943 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15095 42 44M = 15321 303 GGCCTGNNNCCATTGCNGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACC #")&*"%#'##"%'#%"+(('*&*$"%+$$*&+#!+!'*$"($+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G3C0C0G7C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5944 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2901 42 45M = 2677 -269 CGGTTATCACGGCGGTGGCANCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTC ?8:%9G.)1B-*$74%#9(0+:6#EC!B:?G2(H7A,GB#8)3D< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5944 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2677 42 131M = 2901 269 TGACCTGATGNCAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGC 1,H#61B6'+6)@C'3FC=&>718:=04E8"CE$,5E#:BF5$')'9$(!95CBF9"D5D0(95733D$CA@47.==9AC('G#$4>;)+@E5:0EC'9E&.5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A120 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5945 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28829 42 82M = 28911 288 TATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGT )>E95D'"%/F;>'A)+:5$>0>#$/76?-0!6)678(&.$B58.BBD>B%5F(1D6/@8$F>6>51<0"4!HD1D'/";"C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5945 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28911 42 206M = 28829 -288 TACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGCANCAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGATGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGAGGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGNAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCCATTACACGCAAGAAAAAACCGCC 66B=;%.3>?*@89'36/GH*'*&,'#3B(7C,D=*%@*.3A8#=.$>;.93-G4ABD"F//42C?72.B3$9>6@2(74@,(&'*?//*A(:,/")79D4?7'2F.;?*:$'/B*+:77DD5F5.GH#%><*+'$,@.0"G(C&>!&,=1>@?,;#-9#0<03:DD6>F7D92F;2BA7-$?:1<%3+():0!5#3&1$+2AG!0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:39G1A29G31C49A28A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5946 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25092 42 203M = 25295 383 GAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCNGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTANTTTAACCTTTGTCNGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGG D265(<#?!8,;(:7580D=%-A>*B,#A'D@8F$AA0$2!C0EDC0&(CA;!#0*A'04#9%9%"1$@7%/0'.$4D?=*?@.5(&>0G0,+A.09$B-21D=,?.AF$+("E*41/A:<+/5+C7!35(8C;F+9"94C)#(CFF$6(C6EG8!>CG(@'+=5>)6=64F?2B0@+9D$5;(F*24,'.3HC)'46?>:1>!><01)#H>2@97?2(#1E@8%@5A=,)40F/$%7H2@41;&#%?>=<<9-:7<#-!"?/G)7A2!>.#++36BH#1FC$37<(GC*=A@B+")><5F.5!/9CF%A6:BD@D9,*4,-5'H+#5,7AG(??14!=!@8--B""AE%<0=35H&A=/"%+3?$C=718>,G&09,!%'E.=8H6A&A&"?:H?B+EF)="/&'/D.AD)(;>%,1C5!B@)8G=CA6=>@947*!03D.H/$-8<8DF/,)B2=.)+="0:,C00/A*-!D"1-3/?A)>?E#HF'A5B9+E'G) YT:Z:UP jpayne@0: r5949 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3417 42 75M = 3492 295 GATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCANCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATG +G(F=B/7+E1,!A"8'D3@<;-H@$.D,G9"'CH(5&FFH0!1,"%.5-@;1$7$C%)=$*.4:A*(-B<'%57AD+0#&;1:!4114(,2$C(#0B8+?BA,.,DHD!GG#E&*DC1,18?ADAG1A?(?;-*,58/-1*=//'+C6:)%9H@@C-:CF99)2"66#%G>'27C2!' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:49G5G5G23G71G6T53T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5950 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19222 42 106M = 19416 281 AGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTAC 9<9)?E><,GD@G.!BBB"=&E*;>"!6*%=6!(/D!&4*9!>%82D7&C:1,$8AA8??@&4:"3:1%/$..C#A!1@*(+5&$6094% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5950 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19416 42 87M = 19222 -281 CGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCG 2:E;3H3=<'E.=?*:##B@&-G".87E"&*%?27@94E4!!%@"EA,#+9'2-*5:+-C(3%;57G<*/8$08!%;4&4%/?<:8) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5951 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29881 42 156M = 29782 -255 ATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTC :&@(.H:0++=+889?G--G#5,8H*0E);<;72B7:,'.&7>#+",#@"6F%:(A#!E=#>*A2>C3D#0C@"!HA1'%-";D08F>:,.3>&0'5D?#6-H*DBB/0=GGB?&A;-0"?2)6.6/50#,(:B8B+>,6680%&D%3((@761E+&%4:4!/BH*91/@4404#<*G;2G5BFH99-,A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23A16A14A15T27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5952 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38741 42 81M = 38741 0 ANCGTAATGTGGCAGATCTCGATGNTGGTTACCCCAGACTATCAAATANGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGA ("<"D:EB!H(>#=G5%1+>A@/7C$)/4C>6BC,DB6@#)B%8:)"!?BE?."G3@E3#19G)-<.@8&0?$>,3C!A>D AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G22A7G15T32 YT:Z:UP jpayne@0: r5952 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38741 0 * = 38741 0 AGAGTNNTTGTTCTGCGGGNTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTGGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCAATGGTTTATTCCACCCATAGGTTTNACGCAGAATGGCAAGCAGCACTTTAAACTGTCGCTTGG $*%"&!&)+#!)*&!'''+%*$&"'#+#%($!$(*+$$!!$'$%#!$!))#*$%"&#+&!%++!$'%(*!)!+(%)"'"+#!&(%'$*%*!$++)+%&!+#&)$+&$$(+*"+*+!&+**!!&"*&)&$(+*(!!&*#&($'#(!)"!("%%!"'%'*!))+)&!$&'$#+%$*"&##!""!'$*++%#&!)#$&%($$$+"%)(%))#"%"((*)#&'+'!+!)!#+(&*#'&!)"%"!)%!*''"('(*"!!"&""%++*((!"#"#(!*)')%%)%*()"'$"$+%&*!'()""'+#'#$#!+"&*+%"** YT:Z:UP jpayne@0: r5953 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30509 42 56M2D59M = 30146 -480 ACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGNGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCANCTTTCATTAATC *#*..#6,B#>=#*E/5/FE">F:>2G5%D(F'96-BCC!?'.4H0;67'?FHC+9,B8*"G"33E.?C/0&(;<6*)?B8%,B;<@"E#42*5A(<'FA-D-94$A3<"9$<6? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:53T2^TG46T12 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30146 42 363M = 30509 480 CACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGNTTCCCTANTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGNTCGCGGCNTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCNTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTTATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACA &D0.G,#568-.#BH<,66;C09!>A*73?14!+:BCB?F5(:+6)50A2BG>DE;$H.E9@8-$*.10,-8,,(H.84.('%,36<,'/":<<"#=3&D,8F,39HF0&H8"4@")-'77?$7/@D&H4/109)@8:4+@71=$F=EA+*,56@!'*4404&7H/C(,'5";)#C*@1#77CG,2!H'%>2=@8*6+(8,H'F$<8);;33/"4H=A2GG=5=.,8CH82,3/7>%6/"-.98H<;6&<>C#?:E!656*ED(D2?29.G,'=+4.%>%74,@/54"A@5/6C$@G5)+7A5;G:A(.?6=G0:F+!54>8H?;?21,62$&7#)AD&04",6C03*?'2%05*G)3*F"". AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:49T7C27G7G111C64G92 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5954 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39528 42 75M = 39420 -183 CAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAG &.A!-,C6,1"H3"6);$34BD$+%H(-!6!F&)F!41:'"H:44@,<72C4$B&3,+#6%@C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80A3A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5956 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15320 42 62M = 15320 0 TTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTT 5@'E$EA<6!A4/<%,0*+H;%*4.<#F2%;<,=7$E#8BBC#,8!H#B!GH/:0582;1C@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YT:Z:UP jpayne@0: r5956 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15320 0 * = 15320 0 TCCNNCGGTNTNTNNNNCGNCCCTTCGCTGATGGCATCGATCAC '$$*&"('&%&$&!!"!*$'%+%")**#&))!)%+*(#('+(!+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5957 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15908 42 86M = 16088 246 TCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACNTAACGGTGGCTGGGTNACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTAT $?4::&G&/#;;-0;#"G5D$$;"F+-..-G-3B9E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5958 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34492 42 63M = 34278 -277 TAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCA H)BA1B"7$D-&E(E8.F)A<0<%.6DG?7G:F:>;?B46?A6A,*?B)@06.>362./&A88 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5959 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 528 42 56M = 407 -177 TCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGG AD7C&=)4F8&#:48B8,*-B%&6'D5+1%+9@*'3CF=*H(1?7!4*21 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5959 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 407 42 40M = 528 177 AGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAAC 8G9E$@$&AH0A:.AG*;&4)$0@;6'<<"((-E9$B3F5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5960 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4607 42 47M = 4806 334 TCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCAT H65@%0>#$)E@";75/(C??+9D6)(?0H:8:@AE1>*1((/+F+) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5960 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4806 42 135M = 4607 -334 TGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGNCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCG #A&<$;;4C/@CF@D5AH.E51)&.@&5B&(!6(3'/(A(@9>FBF%1?7-":2+:;-3H.'<96G=$G=#;@'AB)>%)7F!#/3"0E(-A!C4!FH"=6?9'4HH#><3!"!B?9C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5961 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36952 42 120M = 36842 -230 GAAAAGTTTTTCCATCGATTTTNTGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATCATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTCTCC !#(&&+$!*+"#'++)&!"((!$(&&('"!"!%*!+)&*$)!'&"&!$'((&+!&&"#'*#)&#&+)(#!!+%*%!"!"*$(!('**('+*&"!+*$''!'#('*#!)%"(&*$+)"'#+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22A37G55T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5961 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36842 42 61M = 36952 230 TGGGAATCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTA G#(1D0/;,03G4,003 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5962 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43314 42 83M = 43146 -251 AAACTGGATACGATTGGATTCGACAACNAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGT #$()#'!)#((#&&#+#*#$"%%((!+'(#!(*##%*&'#%!&"#&*$!!&!)%(#'(!)(***"#!!('+#+%)!#)""$$+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5962 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43146 42 78M = 43314 251 ACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAG -B>./'5FF?F<%D1"+#*!13!%"!9*+F48G=66F2)C5:=7*FE&2$'"!=EA$%-F@=!0:/4/#51$*8F89E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14893 42 70M = 15106 306 ATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGA *9&@B>>'B.F)84H9B',=8E<;.5)8'&4B1F7F@!'A@BF,G:C!(F,,8+1)&+D?4=""-.B8;F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15106 42 93M = 14893 -306 ATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGNNTGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACNAGGNTCANNTNTNNNCNC )''!'"+"(+#%'"*%!%'#%#!*(&)*)"!(&**#)&$!!%%$'+"'!*##&&'()'*"($*#$#"%#&&'+#+!#&"*&!!**(&##!%#* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:40C0A32C0G1C0A2C0T0G1T1T0C0T1T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5964 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21085 42 157M = 21242 333 AGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCANCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAANTCGGCCTTTCCG &=&+,!/%*;#BA%F<"3B.8(#G04E56DDG89?8&B'-9>#@;E)*+&A$#!?C,C+'G,D2/9%")G985=$+%092%5#0/*&*DA"CD,A/''&&E;8@.7%$&1)4CA4>1D8CB!'39,"(@?4"DF,F5A(G:-&7H/51A:#AA:?49,5D48*$61(:,H,1.%/A:*H7$:H6@HA+C2/#7")$F8%>*,;4,+<>6AH!HE7C,+G9*'B;+#55C&2,@!D(E=1D@G-7)H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:94T70G10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5965 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45675 42 100M = 45483 -292 AACAGGCGCGGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTG $&)"*()")%**#"*%!")$*'*%'%%!$%"(%+))#!+%&*%)&&(*%$*%(#""*"!+'(!(""!$#*('*&"!%('"%(&$!'&&%"$#!*"++*&) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C90 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5965 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45483 42 90M = 45675 292 CGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAA #B9#"=3=H+12;8HEDB/?9"A9./%/1>?H9'8'957-";&C'>1?AG>7D1D4-8@A:@9?*)/$.7H/H2'08DEB<&>;A*HH%9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G89 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5966 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21770 42 104M = 21599 -275 TCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAG &A2DF,;54000/%)$#A(+>G)77934H$?AD,1F/34!.$-::/E'69&&%1<2'F!*E./;D'=<$! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C6T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5967 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25434 42 81M = 25538 166 CTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGCATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAA 30&7.>36@-8:#?B/>9DE@&':0.3=*"8"G>258'+>7F/2CG?HG>==-"(:/17+>147H2"BF;D6@)AA7#0,E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5967 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25538 42 62M = 25434 -166 TATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACC F;A-*>(C=5,,>F5'>9D2'&!(%E8(E,*#9:3C7C&./A@H?3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33065 42 44M = 32847 -262 CGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGG A,6?2AH7A4?*1?*',FH?;97<:?B*7-C*)H63&3"3'DG" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32847 42 51M = 33065 262 TGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGA G)19$F4/(.6-%CC$-!==)&)H"8F%670G>>1DH1'5B/!&A23C&B/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5969 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11725 42 43M = 11488 -280 TGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGNACGGCTGCA 9$C$(:AE9'D#3+3A9DHFBD)2A&<"D1#0:'4=%08E!6@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r5969 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11488 42 113M = 11725 280 CANNNCNTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGGCGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGG '#%&!*$+*)')'#$($('%#'$+%"%#%$(("+*))("($$+&++!*!))$'''++&)((!''!(#((!!'&!$)%#%"+*'$%'"%(&"+(+!!"'+#!'%)'(*+(+%$( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G0T0C0G0T1C53A52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5970 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30028 42 55M = 30207 272 ACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGA %0C=9+54#*:A:F(1G#60%7:!-(2&44C5F:0**BC44"#$,*==#0&9EH" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5970 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30207 42 93M = 30028 -272 TAGCGCATTATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCNTTCCCGTTCATCCAGCAGTCCCAGCACAATCGATGGTGT B8.@E"<))31&$/;C%!E/+(637H>:F/"5HC)5)"0E$C19H8.C/EC?*;15'2)6D70-6+8&->?'E7C8=%CH#4B#,>#4+8'%5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A45T19T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5971 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9513 42 44M = 9715 281 NCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGA #906:C%A*!+H+2"61.5.H->F(3!2!H4>"=E)0&&?""@. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5971 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9715 42 79M = 9513 -281 TCCTGANAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCA 48%90D;;E5*2E90.=0@BB"'+-?-3DF!&.?3!C?4=(B/'3/C'>0$!,;B0+3#D1;AE3/58,;6$='E''(D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5972 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42427 42 317M = 42744 402 AGATNAAGGGTCCACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTANTCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGCACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGACAAAGCAGCAGAGANGAAACGACGACGCGAGGAGCANAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCNTGTATCTCGTGC $#()'(#(("#"+$'%**#$'+&&%)!(+#$#&$#(!)&#)('*&#"'$(+'*#)(%$')$%%)+#!*%*+#($)&$%#&)$(*%$%)%+!#*#))*+'+&%")+!$"''*+*%"$$(!)&'&**&&*)('+&*((%"+(#%(+#'%&#!'*!'*!"$*+)&"*)&!%)"%!!++)+!$&#)"()#)+%%(&#'$%&+%&*$!(%"#$'')*&)"%""!#&$#)'"%%)''$*$!**$$#**%""!$#$(+"!+&&+!&%&)#*$*#'"'&+')&'$()&(*&(&!+)+(###&')"'%'#$#(+&%$'($+&$(&* AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:4G1T2C1A0A62A27A47A13A12A8G116A12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5972 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42744 42 85M = 42427 -402 GGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGNCATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTTAACTCCGATTTNATGAACGCAATA !FD*7%='6*".;-042&$12+CH7("G,&GE93HH/D=?E!*D73C$9<->C>D+HF<1=##+5"7%&B=>?05:#E4<=C>H< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32A27C11A12 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r5973 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39734 42 110M = 39875 212 CCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACTAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAG %665D?F51&'B="@:H!)7:7C4BA-H"#).B'9>0A<1#:/A0B.4+(.)(*>'?;$(&F<@<;D-?4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5973 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39875 42 71M = 39734 -212 ATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAA $8#@!>A:-H;/)=$?5=;620@5!7$@7!1';*?;A2)&#DF$@+76H47C/?):H'!98#?!=!#A>D9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5974 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28559 42 274M = 28437 -396 CCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCTTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCCCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAACTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGNCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCNTTGTTTCTTATA &35!&0=@&'+)2&H-7?DF&!&$:3+A:C#-G+6B&GBC2/A0,4A"006!//6(!3*),2+*D)**7=>+!0(+F4:A(*2)"&DE)91&$)5:,G%8;65H7F7<(B4*)3+G/GF.)F+H>@3;*3#/;CED$<=)*?>$3)"/#(D(?5H+&63/(=C+C?&*#G/(A-BF6#96..7:/C/&*G3)/.200FG(:GFA:FC-: AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:75G49T55G23T55A12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5974 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28437 42 122M = 28559 396 TCGCTNAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATNCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCT F8*!#99/4D*<6'B=HD9D292A!2&=0"3!B=$65-3*GA)H9'A"BEAD=<6=1.9>,0#E<<;57HGDC4F7C(!'@02B$AAE@B//G6+#"(51B6&+$5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C51C64 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5975 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38057 42 187M5I161M = 38405 703 CCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCNAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTNTTCAACTATAAACGCTGATGNAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAANTCATGCANCCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCTTACATTNAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGT 88>C3'@(--A#5C6.5>4")G5BF-F5$D97"")$4H>:C'(;92(F#(02>&>?7G807(HB96'!;51+D54$30B0G2589+96F""1F@%4HF!BH>=%$(#&"-/'()G/.'?0>=A6""='>F%,"9:9=77$F=->*99.$34A?%"#-4<9D?A)"),H;'CD=>C"F/!5#746$5$,D7,-H0>C:@A*)$B>GG64.1232+(*C:(3&&=-)/#:;=H89,C&47"C(E"5'GD3#:+@'/H$G/<0+$&G:$)7"EG2#7$@8<$#+9*33>*(5:9)B<-*F#*!=+E&$,%F&'0$F?A<0CGB%G&4(F7/0+H5DH?8E1>2:C;7)!7 AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:13 MD:Z:43T61T2T17G58A2A75A6C76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5975 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38405 42 355M = 38057 -703 GCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGNGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGNCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTANTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCT &;H!53-6+*8D.*&GG:&3?/+%1>D!*(:H,>D9">@5:824G*0*+)&A('/%2+A!'A"H0?G'33(88B.57#736;,+D)5-+<++G"%&-D'H(3!0&3G'6:>:33'1=D!%(FF;0$'"@C*1'3>%A/CE/26?"EF0+8%!B(#<)4?&!<'1>(?7#-1D@+5!!#9AB8$$C!FH&DE.EC6'G5<5,#'B3;,85$"5B,!/5C7,DCD4$,2;6)C775G30#=+C/1'2'6A0A7>3;,#@D#&+4/;E4)3:3. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:87A68G100C97 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r5976 77 * 0 0 * * 0 0 GCGANCCNAATGGNNGTTGCTTCCACCATGCGAGGATATCT ('!%&#'"*)*)&%$&&+%+*+&'#!+"'!'''!#'**&#( YT:Z:UP jpayne@0: r5976 141 * 0 0 * * 0 0 TTCNGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCNGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAA $&*"+#'!&"%&(%#"!)")'%')+'&*%%#"'('$)""'**!')#'*"%"*%#&#!+&$)'*%)$(#%#$"'$)*)$$%%&(!% YT:Z:UP jpayne@0: r5977 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47487 24 58M = 47322 -223 GTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTNAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGATNTGTTGAT $"))%&+"#++)(*%!')(!()&!%(&#(&!'%+!&%(%)$+#"%"&#+!''$$%(&% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C22T1T7 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r5977 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47322 24 56M = 47487 223 ATATNATCCGNNNNTGGANCGTATATCTNATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTC (%*%##)*$)#!##*!'%$$('($'%!$&+$($*+'"+"$")&+'+'"""&%+"'+ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:4T3T1T0G0G0C1A2T0A3A2A1A27 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5978 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23431 42 72M = 23652 314 AATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAAAAATAGATGATTCANTTATA ;@$7FG&,H?B2)'@#E++%D"<&H<58)6D"(>5B0$&=%G)/+2,'<9;1!1H%E6+*2DC&<-<7(D5* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52T13G3A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5978 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23652 42 93M = 23431 -314 TTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCANTTTTCCANTTTTCANTAACATTATTGTTATACCAAATGTC ?03;:3B9B=277:=*F1;,7E1#2%(,+#$:@8&D3;EBGH=:5@:E)3*#(CB&9-;!7=G85?.?D:$7!D#;H$+?; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52T7T6A25 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5979 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3754 42 31M2I87M = 3872 183 CTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGG >B7=7D:.*$$4A/0/G;6:)18*C.*H4".==C85)7/&7@@>B%0H6/0D-/=E=01.2.@%&,A5=)*4D0:)6,H->;2B2$9"+C>/":%)9$G&5)C"@>)C0(C#?AA#+EG; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5979 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3872 42 65M = 3754 -183 ATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGN =7E@($38G9)D/"9/.5&$92:7.7'"+A5.&;3!*)0D(",<0(B,#&FE<3=..%8$*"!0% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11909 42 76M = 12159 337 GTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGNCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAA 8%C$"$F==?275#&(4%7A;4;">'D!,D3D&5+,4.6B;1;4BH;.0C@>$>"(#D$.%#5BD6G0-&3H@&!% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53C22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5980 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12159 42 87M = 11909 -337 CGCCAGCTAGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGNTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGTAA ("(%!%%'*'(($*)%"&$)%+!+#')&+%'$#++"#(+)''(!+&+*)(+&&((''&%$"$#!'%#&$*#&$)(#*()'*%++%*! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G45C29C1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5981 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43528 42 40M = 43568 216 TTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCT >F.5+F8!+<+C9!'C':&34*9/2-*HD9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5981 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43568 42 176M = 43528 -216 TGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTNTGGAAAGCCAGTTGATCNTCAGCAGGTNATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGA "?;:7@50&@@HH*AG(630=:?B*A56&('6,/6(8C,6>+$'3*.#;8F5?*G(E:;0"&A-!41='3:?C3)7+=%)C-47)H.2A..6<#)4@3:**56%3:F(:!-C&G3"+D7>$*=)3D=5->5<4D!/F866>-G(=@"$&7?+%%0<)"/F>H/11 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:101T17A9A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5982 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1653 42 46M = 1447 -252 GAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGT )>9%#HG)>@26E3$;D2=-7!G#$#*,E3'2&@-8,6=AD7-3E@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5982 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1447 42 85M = 1653 252 NGCAGTATCTTAANTNTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTG !1!!&>:*2%DB'041?#7G<;&1;@.'AAF)7,3A+;F4:-'?FFH*2"#7A.E'$A'#;+.7E(8C//A5>@(=%!4;!?/%7-8,688G@>+1C)6="A5<@6+8D$"?!=9D9$;G+0:8%;5A2=-%,+5H,>@(.4)-4F>;44B(;)2C6"60B/=#A$%*2*4:73 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0C0G26A18C81C2T25C17G35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r5983 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33083 42 170M = 32871 -382 AAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAANAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCCTCGACGGC G".6=>C>?B55"9,5)*G<$'7/86.+,"2%"/,-@(10D.*'.&D'E>G"95,,0<'A1%18">91BH59G3%)8)B3-"13&<<;@A;B-2A*+;3#:=CE3F'%0DE=27/9A6CE85"'?)FAH.H8C;30=B#+F@0$H($71,;<,,B#!0.@##1ECH$E*H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T114G8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r5984 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12834 42 39M2D61M = 12432 -504 CGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGNCACNGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCC *.$42=>9;8':2$=6",4+.>;E=F+5"(+%3'=5@:*-;F9FED5>0.C@.5%0.34C83!H3ED;H;19(*/:)?91)'CC*21'7C2$:7@14!-7 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:39^TA2C3C54 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r5984 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12432 42 383M4D15M = 12834 504 GCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACNCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATNGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTNCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGC @9B&'=:A.?=0:7<";D;4G:F,$%G,#,F5&,7+C(+51#;!1G-GCH@&!/"7?+/*:69-$93782;'B6!4@;<3G(//?.);%#*=>2+"C:(A$;+657?-G/@FA?:>=2*C.#3C1%C4>,":9;0'F89%.)5%'@$79,/!!6F9:3H5(;0@$7674A5?0:A5!/(DD3DF4@F$5.)*CHG,69H(//$@A26-/F-4>)G1F2/(#8.;4A:3E)&*550++"(C,7C9>3D?.G>1875GA*@&5BE9%)39D->*-4FB:-!);."HF7-63+97/% AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:77G155T51G23G53C19^CACG15 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r5985 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7840 42 183M = 7840 0 CGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCNGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGANCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTA @D'&(8($*#7535*H'C39B=;0/F%/$,2D3>+3??A3B),%;)7:27&<(=E.?"9FCG3+8A80.GE@F-7,H90D5+%-&FD4:0E"0<-$HEG#C!F*.H40:"E$(..'+;"1092!.'0@=#9E$H24(,C*6#0$!-$9+@6572F9>B5'-B(G<'%(<*!<2$*486G)AB" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57G49C49G25 YT:Z:UP jpayne@0: r5985 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7840 0 * = 7840 0 NNCANNNCNTNNNCCNGGNNNNCTNNNCCCTNNNNCCCANNNNNNTNNTATGNGNANGNNNNNAATATTGTN #!$"!!""!$"!#$!"$!$$#!!#!!"""#$!"""!!"$"""$#!$#"#$##!!!"""!!!##"!##"#"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r5986 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2742 42 57M = 2500 -299 CCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTNGAAGTGCAGACCGGCN )#)$#%&%%!'*))"%%+!"%'$+#)&!!#!%&)!(%$'&('$(!'&"&'("(+$*$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40G15A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r5986 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2500 42 98M = 2742 299 CTCTGCGCATCAGTATTTCCAGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTG )!)%(&+$(%!++$+'#*)"")&%!+&%"*++')!#&#)+&!"'%(&!*$)%*'&'#)#*$&!$+&+*&&"")&+#'+$"%'&!+()''!'#())")) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G18C77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5987 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38910 42 48M = 36629 -2329 TAGGGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTT C(-$#B?,0G:,"AEEC;5%%H@>;FC"D?:#:5>B$&>/9EG'.(G? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C44 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r5987 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36629 42 71M = 38910 2329 CTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAANGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCC 5:,03D@=H9+>A>.#8=2+E("C-.B35H#D/#C;;@$"%'4G-ED80BH2C5;+A=42?+FFC'0H+0& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T33 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r5988 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7689 42 54M = 7828 266 NGCCANAANTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGA '&')&!%'%''#%'*"+$#$&"&#!$)"")$!*)!+*!%(%!'#*'(+(')*$* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A4C0C1T45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5988 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7828 42 127M = 7689 -266 CGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGACATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACC 72#(F:)E%C"2B2-:-97,,9B3(2?F"3#3$+%A:E4)3"/>9EF7G@&'!:'=.1?B(9%4-H!;;#E*"(G)@A0=-'AH/0-6:6%3,E/$F?@@?#44D7:/A'(C*)@;G'*8!+AD.$3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G16T40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r5989 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34762 42 129M = 35017 298 AAAACGATCAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGA 2<*-D$):F=.;!%/9.7>A'#8C=;0:*B::B!)E/34H+#6',<%6;H;5F<=#+1@-!D26.9,)-:=8481;=$9C67.D&-*E%H1$):E>EG/=0'47;16'>0==;":+0%7=@.:8-".// AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A41A78 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r5989 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35017 42 28M1D14M = 34762 -298 CAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTC @)'!3"*5G!F*8.+1G1D*+$A909?@1=!?C"*,2-/8)G8G9CF)E&;1>4B:%@8H5+!+-CA*-==?A9D>)B3&F"!,)14)24@-E*+3@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16G31G73T69G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5992 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9651 42 63M = 9846 245 GGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGANATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATG 6'03''(F+!4"A):!,+"$C=HD;%F;2(1'A!10",>%,!9E::.!=#>'9B@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5992 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9846 42 50M = 9651 -245 AAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGAT :8D&F$+4).+#".G(3#0B'854&9.HCH73"))F7.8#.$CF)9%=2-?.F//G672%40?H671B5;)64;24.E(7$/:GE&'4<,.>;6,++*F/H*3:)??0+<7A6(HED"D$.5>=&3'6E4*F)"6%2&;#F(*@*6&@3B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r5994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40849 42 54M = 40903 288 CAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTC .A,E$(D#F"*0GDA)*.!<7),*@8=86/H)(="1.?'%9@>=.+*(87?H'6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5994 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40903 42 234M = 40849 -288 CTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCANGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTTGTCAGACGAAGCNAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGNACGTCAGCATATTTGCTCNGGCN '%'&$'(#%*'+%)(#'#$*()*%$))%*#'%*#+'%$"('"+#&'&+)(+"++#!+&($+%+"'++"&#%*)""!#$(&()+&$$#!#!&+'&)!+!&*(#%$&+&*+('"&+)*"'+%)&"&!!'")%&"+!'"&")+!#$'%&&&###*)!+'%%*%'%&$""%%'%&!'"*'"#'%$"&++(%(&'"#("!&+(&'#!+#%#'!&#+(+$%*!&(+&'*&%+(&%$*%)' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:48G71G12G76G18T3T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5995 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46450 42 321M = 46771 403 NTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCGAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACACCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCT "/$"=7"/32!H%0H!8F$82"8>AB"A='9*7C@:$!&<,-8G8'@E*H(H*BB0B2;H6(3::5/#$<:!"2$+0$*(H;@83F)2-1;:=5)$!?+9B=E'>>)H+5#&'@A<,A:->=;"2@(==@*:5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C35C218T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r5995 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46771 42 82M = 46450 -403 TTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTA H&DB-?4@'18-4)5-2)@F*29A?45?E=.5&:>F/"917EEH/>6%:@A"E*7D8C:B$6CH;%*A6@>9;69*.1<+-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r5996 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32886 42 141M = 32655 -372 ATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCNAATGATCGATGCATAGCGATTCANACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTGNGCCACTACT ()&$"#&#(#!)!&$'#(('$'$"&*')!$$($#*$&!'"$$"%)###&$!$"*!%"%*!*&'&!&("(**$#+##'#$&+#&*%)(*#")%+"!*#*(*##%+%"&&&*&)(*(!''+%"&#(#(%'*+$%($))#*$'# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:72A23A17C15C0T4G1T2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32655 42 231M = 32886 372 GTTNNCAACGATNNNTAATGCGANGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTNAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGANCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCACGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTANCGGATGTGTTCTGCC $)&$%$$#&*'("$#+!*)&+%(&$+&"*"#"(&%+)*!))'%(+*"$"!#!('"&)')!""!+)%!'(")!*#((#*#*#"%')*"**()!%*'++**&&((!(('$!'!%)%")$##)')&$*+#&!+)#"''#*$%(%)"!("'$!!'"%!+&!!'!()"$(+"&$)"*)"!#'$*''&"()")+*'&$*)!!$(('#'))(('%$()'*+'%!*%#()%+&"!+()( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:3G0G7C0A0G8T26T26T26T110C15 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r5997 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47355 42 75M = 46885 -545 GAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCN A/'?%2=D%D;$1&.2%"&=A->9<@H:=$(,)@1?G;&/&'0,8672H"#%=>C>3" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74T0 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r5997 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46885 42 328M6D136M = 47355 545 GTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGNGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATATTAATGAATTATCAAAGGTANAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTNTAACCCATCGGAAAACTACTGCTTTAGCAAGATTTACCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTANAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATCTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTNATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGNTAGATAGTAAANATAATGT ;'$).F0B9()2?<,)4C+;7&0!7>"!;1-,!8G=$)F7G7(D#DEE38$-#7E<,%*A0")>:)3#CCGF)&*@#$):((-=3E%('H#H+%9?ED621;.H+!??#>BF"+A+,)"!?<3%:%:7"&):/790G31:180):&ED,G%D?2#':F&@H+&D/G&'D2'!"(>#/"+-8C:C$D/"#%!:8;%3:.3!:#H@G#?&"84'077&:G7'(G3@'8>55H-G1%7E/$=9<#96=:-8B8556170&&"8"4?=#)'%88G4%!28A4H%2#5!D6+B.41(?&#.<$B;;;2(G49/<8.<;H)#B?71)-/(<"4:1@A(A.2$-<@?-4*,+E*:CG@A8C72&,!@C7B@-=H4B3(F=*#/H=%1D!65=C?G$?G?DG-A:%B/4E23E?/*&1=5(03)2H%1%H2H?9C$A&=7@DH%G,6'(H$-%'8CG6'(!7B<=GBFD@6A AS:i:-44 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:17 MD:Z:48C155G19T29G17C17T37^CCTATC14T29T35T35C11T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r5998 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36232 42 60M = 36353 203 NAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCCTAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGC %(@012A*E*G%7&.D$?5F>48:,!-G67%#:BDG&%F0,11E+(=5"7*B8F,!/3=B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A25A33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r5998 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36353 42 82M = 36232 -203 CTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGGCCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAA G8G*4-4C-&D3/%4C78B6@;(A('!>B@<$>#5>.>F%(>>-804C82(96:B:6?,"28-*1;CH**/A(AD?E.12E$C19&:>B?(4<=H/D=(EA?G):=,F"+D".H,(1&5@&7#7=F@C=)!:1;@,7F47,11>0(DBH-4F)!',%?)#;2@#,.D-G',-'8"='9H/-CC'C777*";A(!&E74+,*(2)"#<=(C%3:+D-F?;D3#2($">>!$A*'3(*.94%#C4"H2H';*1#.8DDAF:B&,A!9?C)B.7*;D,5:C%DB"D3394(;)46,B220:+8D(/=?!?.8&=@;H>:?F? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:67T37T191T1T6G26G9T31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6000 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30905 42 90M = 30995 465 GGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGNCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATTTGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCAT '>4.77&D>%"'%,:96B.)*$,/B-64A47G913(?/?,;.05AG#-G*FF8"*-6F2271;=%GC&D$9HF<,24)940--63!!03& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T30A26 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6001 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41554 42 76M = 41421 -209 ACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCNCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACAT 7+E@;D%75>'-2@B5)63*7?7>79930D)?:-'%"3G#<).<2;H%0@%)H)18",+)3,!$;,E+C6/-H0G< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6001 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41421 42 41M = 41554 209 GATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCAT FH+81765B>/=#F@0:1C,%1#6#9()H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6002 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39156 24 19M3I52M = 39156 0 TTATTCGNCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATN %(&)&&'#$+&+%&$$(%)#+)*($$!*%+&%'")#+)*)%$&%+!+%$(#$!%#!%''%&&#!""*+!$(+&! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:7T62G0 YT:Z:UP jpayne@0: r6002 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39156 0 * = 39156 0 NANCGNCAAGCAANNANCTGCCNNNNCTGTTNGNNNTNAGANTNNCNCNGNNTGGNGGANNTNTNGNGANGNGGGAGNNGTNACTAAANNGAGGAANNANNTANN ""$"!!#"$"#!#""""!"$$!"""!#"!!!!!##"#!#"#!#$"#"#!""!$$"!#$$"""!$""$#$$$""$"$"!"!$!!$#"#"#!$#$"!$$"$"!!##" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6003 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32717 42 40M = 32460 -297 GGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATC :?:8(@7!B?2#)C9*D%%"-%H7783>*&E+*G'F@B2>E<=/4C9:..,<78A@D<3%:8GB>!1&);;8HFG+&.H2&(3;6,.?;7A+<;+??<3A&HDD1-.&3.#+&$2#; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C53A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33774 42 72M = 33586 -260 CGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATT 32.H,1696DA/$.6:=:">&:19E;1920=%@#C&5)!60&$323"%:-GHA?D-)!6,?7;%(7A6?A/' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33586 42 120M = 33774 260 CGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACAGAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTG 8$$-D5B?)H'.%$5B!G0.;.3E,H5=:)GF0/"%D4/;98A1)%$2H?E<71).,&73!"* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T81C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41010 42 146M = 41222 255 CGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTNGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCNTATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGG >0$&12+C1E0#5=@.(B1(1.,A=FB)H:,2;2!";C+=>&1D2EG!6++?=F>!3>9=2C$:0A*;+9H!:>%?9*H.-+9)845':)G9;G%&>!FF4*"G2633-0A(&2HE;'**>=+")3AD$5<$,G39F$D94=G,H+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G79A33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41222 42 43M = 41010 -255 GTCAGGGAAGTTGTGAAGNTCTGGGATATACCGCTCNCCGTAT 95FAD5E)8>F<'&CH)'5B(*"938557)B3"A*CFF;%B;; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T17A6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6006 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31865 42 119M = 31865 0 ATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGT #-2$"9+$&:B;*/@1B('=/%('?A.6F$=F>(1*@+=-=/04%208G6:%96&%7(F1A%-.C."#$1E#''+'92B!3.$FFF&'C-,8*>?1(<(18$%),$72,G)7(19A/A" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118C0 YT:Z:UP jpayne@0: r6006 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31865 0 * = 31865 0 ANGGNTNNNNCNNNNNNCTNGNANAAATANNGCGNNANNGGNNCTTTANCGNANAANTNNNANNCTGCNCANTTGGNNTGTACAGNNNGGNNG $"$"!#"#!$#!#$!!#"$!##"$!!!###"!#$!!!"!$#!#$##"#"$$!$"#$#$"$$$!!$!!##$##!$$$!"#""#!#$#!$$"!"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6007 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37267 42 217M1D55M = 37207 -333 TTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTTCNTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAACTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTG 6,'63F"F78+/4*%%-*GC!-0&;*<%7*0DE+4>H='(H>7GFF'(D7$.+")9-8<5-,F)<54H,B*88?DBC??E,=:*=-&GA)!HE)0$20""FE:A=),!?*!?+<2?E;H&6B.F59!"E;A%<=;.1F:52!G#>0+5F:2$F3.--.'5?.-<-ED/+0&$61/&?<9>.(9A,$H9$-+GGA!@').E+&%331.+546B5(#.AD"+6+:8FDD:;!;7C)897&@'(3+?!09E)4(9GF951!?BB2"&G0*7:473 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:183C1G31^C10T44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6007 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37207 42 60M = 37267 333 CCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACT D=5@(F-":A&%0?/'D,,>>1H,A%!$)7,8-7'<;0EB"$*8;F147-64286-H#1, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G58 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1891 42 195M5I188M = 1805 -469 CTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCNACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTNGATGAGGCCATCAATAACACCTATANCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATNTCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTNAGGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTCCGGATACCGCG =%AD.,1F=HC=8-?35)9A39*&74>4346@01$--E30D$C$,>=#5-9B,=)@#;==849,)2>56D36D-(H33734(";.%.862>16CD!G4%%3>@1.!C@:D>211D:984';--)/,2!6D'EE9(9&? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r6009 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3550 42 97M = 3425 -222 CCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGA ,59C<,"!3,G.$8"3@1C,B/E4&/9-#E<:7!"*-&A7&);4&#?8E>$D0A>/>9B%AG.!/1C%FCG45+'G>E"+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6009 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3425 42 64M = 3550 222 ACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAA 43&/$3,%08DB'BG@9A4C&3-=AH80AF'5D&&7G:*76/,)>"?"FG8GAD4DCHDG#+>A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6010 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14543 40 65M = 14731 288 GACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGC @+$+G#>.F0D%,0&5G348"-83DA/=;E1*64F1%&';+-E$)4FBH57AEC$DGD9G;H+&- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6010 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14731 40 100M = 14543 -288 TATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACNCTCCCTCNGGNGNCGNCGNGCNCGACNAACNNNTGTCTTT ($)('&**)%+)("#!+$'"$%&)#*'&+"(%(*$"&**)&))(%(&!"(&)'(+&+*#$*($$$$$!(("#'*!$()!'%&#%$)!!(*!!"%)!(&(# AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:59A7T2C1T1A0C2G2A0T1G1G0C0G1A0T0C2C4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6011 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28395 42 102M = 28497 166 TTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCA C0AE+;"C%+6;$:E0(/">0@&27EA*?'7&=@?"G30$#7"">A7!G9@+853.BAD$@;&,=(?4712)#27;!:$.#HHE%?*D':+,-6A"9'#?>D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6011 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28497 42 64M = 28395 -166 TTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCC #=>E>#'=*#@727=-($H0<;0A&1B).+2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6012 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46455 42 110M = 46241 -324 GCAATTNTTGTGTGCAATACACACNCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACA 67;6:'1-6>EG:A4.B+,"#:7CG#DB&"F(AE-2=2<"97HFG3)>8H&-7@#=;B3#AB8*A>AG?.>/+F.7@+)><5:-&+B(GD,.A/$1/C(/@C/>GC21=, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A5A11G85 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6012 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46241 42 214M = 46455 324 GANTCANNTCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGNCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAANGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGANGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGCGCAACTCAT (&('$(&*#$+&'#%#&*!""((%$%)&*!&"!$))$$"%!$$"%!+&%"'"$$*(""+%'"&+(++'"!&$')!#)")(")*)*$&#"+$!&+)($)+#*&*)!!&%##$%!(*!&%'#$!"##+)%%)*$""'#*%%&(#"('*&#"""+"((!"+!*&&!&*!%+!#"!!)#('*'%#%+!'+)()"#"%*$")'*$)')((*"#)$#!)+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T0T0G2C0A45G43C63A42G9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6013 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46562 42 48M = 46610 542 NCATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTC &)8;623=%?(-826!&+G:<@$-$>198!>23@?D#F'<-<"6H??&"3$<=66&$8?;-:=;5GE?3+9@1G?48E/CFG,"196&@=9?";8,7EE6,B0*@E(/$F.1.7!7H.%;1=3)?:H<0=>53?4>!)/#9:6*>$9H.H3C$)5F7)#7*G..3H83@0/,75D3&763F2ED9@.(8*-)1!8,3-07*@2F.33@H,1,?(F8#;B'F%BF52@(G;%B/01-33*4$;/!'45.%?1;/H;.A(@)*-FH?0FA5#>B?"?D#?=71C)C6H'D-2??0/23<3$5(;=$A2=A@&+8(D43&$H%>'F=?1B6E+>BA><%D"+,FC.>1"F/.&>&4*=:,A96#H>G=%(/H'0F(;>D<.<.84479?B@)G31>64%A;<@(,F$?$*54C/@,+"9:CH=73AE7)-'"3;*B<>#'#0%,D5; AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:37T87G37T6T20A25T83G51C140 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6014 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40191 42 49M = 40310 254 GTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCG +&"@.(=#+:;,"A356$=!GG=';F63>2?:;1EBF7D)3-"*A?F2$H0*B>0B:"D2>1B,4H9G=H+,+4&9)A282<@>!6AC%HF*0-$%6C<**HB#*9*@;28B'.&$H8.G!GA9/2)0;>1C/%"H/F:6-/:/5<%#;70G@7A)?.GB$6%>G=,#9A'6:H'4E2!'5="A"%C/-%1@#+A;1;21E:@G4?!&)/42";7*= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:161T62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6015 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3431 42 51M = 3495 288 GTGCNGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGC 2@7860=5EH:2F2)A:G*107(@;%/='F#>E%-F8EF;C)?4(9> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18721 42 57M = 18513 -265 GCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGA ->'67+$;H%?;C,)(@#,4%,A@3C(+C#HE5@9?!<<#2$1-9D'!39'<7'2??B8+/2&%0"8@A"G350EDA0.5??%0"*3!((*6#**G;B9"46E"50+DC"5!(?H/6%@'<9"'=CBD!!9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13C42T28C58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6017 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42229 42 108M = 42337 201 GGGATANCCGGTGGCTAAGNCGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCATAATCGAANTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTNCGCTAACTGCGG 0-#G47*'-;3:&E?CE./;;)9.),80(H>24)(1'B0!,E73<9F5,/$?@=/$%#=?,8(=#9%,9=>#@9604 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6T12A31A7G35G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6017 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42337 42 93M = 42229 -201 TCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGNAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGA 339BE4&#*.7A)&.E=>7:"(.F<$B3?$62DA=<+*%B@:+GFFE,7!4-+!5=::;*5F*4*!D$AG93"#(!3/./A57E354,?&)%+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C45 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32459 42 150M = 32179 -430 AGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAANCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATGAAANTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTAT +H7FA0B+"%D/?B*"!5)4<4EH96F1?*>+C2D2&8D2CEC1+.AH&'9$.07:&1F6H",D)4>FF;&G:@)@A(,4:158CC#803/G=3E)/+@36EG'"1'7B!1@';/&9C3>+D-3+>&'E8),#>E03*E1.D*>@=7<8; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30T44C3C70 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32179 42 280M = 32459 430 GCGATCAGCNGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCNCGTGATTTCNCTGCCTTCGCGAGNTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGC 6?B##4!$@=0.H7/(&+.D3-),#HA*)5@F7F/H"E"*??//*3$=?=01<%=.(28$"'6*1.78G$+;=02@?-()23,26:76E4,:F4;)C/*&EE1H5+$95@3+F9488"0E23(D%#:D,'/6"&D+@@69,B96%)-G/!'"A@A';,7?G/63?!BBAG,D@C5(,#8(9A!==&;.-/#198E$)!:($+*/01::69"-8B(;$&D0+G/H70(A*&B!,DH&))(+)*EH2B"9)+("9:8ED6E3:/G)G.<3.3FGD7F-()7&GA98<.36FD9$@2@(*E'02$G=1G/1F;.4B+#5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13073 42 128M = 12993 -208 TGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGNGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCC G-F-BF0B"74B'1#F&=1/G(!"<823$@H-A$#2#'E7&FE(3/<8F/4.&;;@;--@5A3'75522;(F/;6H,/))+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6021 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5377 42 55M = 5259 -173 CACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGNCGGAGGGCGAGAAG ?&F0F!#*/&'40!E(*D+1!6EE?G0.# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A13C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6022 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46074 42 47M = 46333 352 CCCNACACAAATGCCAGAGAACNGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTAC $&&!$$("(!!)*+!%*(("*#')"$**'%'+'#+#&&$)&#*#"*( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1G3A14T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6022 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46333 42 93M = 46074 -352 CTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGAT ;=.'&4,%<0H?49'AA1)+//&-D=5+:"HD8,,+FE"A?1D1F0!;58)7C7CD"3H"H5*.8G'/!8<+>6#2;6-5,;(0#"=G<;5)< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6023 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33871 42 65M = 33948 240 CGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCC FH,(99;G%A=,@B&<8(>3.1,C,>(&<:??H8/5+8"B<6:?2633/(H@+!":1<.E0<=%#:E#DA.HA<7/8,4)+<1215#?&EF<%69$6<%7G&03E?A*CF-36B'<3:*(2%6;662A""4*71G"*"HE03.**C6BE'2?DF=7D(7(E;F678H<;''52$2,)#=H92H6@!1%DE?5E@C4&'=#!>*AD('6++:58DGA;A7%#"1@HG+6.:*??>0<&+0:3/+E!D20(68:.F=)1*1A>!?%1C(A02)D(ED8F.:C4(3$2,0!470)&CA#+);95.B<67",.1C..F<>10180-0+-?.7*5?&G@HHA* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G3G150 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6025 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17228 42 315M = 17035 -508 GTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGTGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGTAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCNCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCT H7F7(#)F,-4.;)D/(1>;+A1G4:2.H2/C***:3>+(6!3AD$,B=6A%AE?#.E07*@-$+H;/(-D?="%4**2H$?'=A*??)9#(*-F(,=/7%>A'G0C?8F@D&AG='&D92"'C?#2D0G%$*>7*/.9*C&*:@=C-DE-7G44*($F?5(*9G<$@A):C2.>)21)H=EG,>A+7?D.0!7!E"1$")$'"E#478#60%;'+>:3HD1!=*=F=5HE;@=47F2>50@7%"0:G27B*&4,EH&8E+319@:96/."H;A8$%8F98D<45$7<3BF.9*/GD"+43.1#A%*&)>GFEH92 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6026 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6760 42 63M = 6576 -247 GTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGA #"*!!'"))#'#$%&!#$""(&!$&+)##+()'+&#)'#(%!)!'$+#'#'!+!%")'+&++( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6027 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39584 42 70M = 39776 249 GAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCG /'$B@B7E,720"#-E<<4B.$3$A..21)+2E"'=&;?H*0,-!*'B-!$%E0$9,>)@/(%!:,#69; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6027 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39776 42 57M = 39584 -249 AATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACG =?<'@;#B2213,==1+E8*11?F-@>?!6=4<2;-5A*C0;#F#,68%7/EC%7F! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6028 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45954 42 210M = 45840 -324 TCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCTTGATAACGCCATTNCCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACNCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTNAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCA @A0D&$4:0D*/=4:7;6'B?-B?3/F2-=C8!>-B**-?-$0FH=G0'%!"!F"*,/':@@F29AE?*DA>/'@C=-"&/6D>$:/+A*(6"1*3!B%8C$&5F47%73 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0G89G13A50G26C26 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6028 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45840 42 44M2I57M = 45954 324 AATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGNTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGG 1-:/45H+;:%7D5>)#21':(@$*311"!@(,F>2==8:@%8<&3G-2./(A$)H6EB.DG@?13-#&/A0%?5;C8B!&20847:-:9#FA3<=(/)%2'C-$/F@.12'$)3)8#%7<#"E@3AE:AC7>6#;H5=0,>>"H"*,1FCC&7@!%/50AC9#@()5"G595#!)CB@"%G45DHCA.%)D8GH1,G!H'#'1<,H"F$1"/;$=6#7#C'31$?)G$C4.)5+=3&B;8>('"==0 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4G58T24G81A9A198 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6029 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5595 42 201M = 5796 580 GCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGNGCTGNATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTG 2+,)3>A#8$?6=%68%2/.<+0C60.3!;3"$.,2>H<.0E:82-BDG8/6&64H801EE"=1095H!BD7!$'9F2D4C?<509!=-?9H*E?)";@3'B.6H-/?108&-7-0?;&%$82>>144#'%08(/&-$C)3*G/:0.9H)3*1$;<6.8C1A>69?*(&B%*A$*><:018=A@F2#%1A< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48C4G147 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6030 77 * 0 0 * * 0 0 CNGGTCAGCAGCAACNGCAAGAATGCCNACGGCAGCACCGTCGGTGGNGCCATCCCACGCAACCAGCTT *!#)+'+$+"#))*$'$(*#+!!*$$%$$&&)("+%&"#"&$&)%+*)#"'+&($*$!$+$&%'#'')* YT:Z:UP jpayne@0: r6030 141 * 0 0 * * 0 0 TGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGTCGAGCAAAGAANCCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAG :>40(*#19E(?E'41@1&7&.82B+;CH39::2(,;$C=:7*1"A7E&%HE?/+71:678H;%!)&)*=5=61@# YT:Z:UP jpayne@0: r6031 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23617 42 48M = 23857 321 GTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATC >,:&'-FF43<7A&7);:-$@'&4C6*9**B-4+G=0&F7(<)7>7'' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6031 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23857 42 81M = 23617 -321 ATGCAGCATTNGAGCAAGTGCTATAGATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTAATA 8369.2-9;.(,'',#?/1<.(,A/)4(?9'(1&<=$4D'-1.8E7BCG8#4%9*)%)-5@:5*-B:'4A1&.(3F/!+F? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10T10G3A51G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6032 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26091 42 81M = 26306 264 TAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTNTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAA ,:44A?04309B!@'H=5GG4GBF1<3":=H<4E9H-+!"'=7.;E4H7)&:?)(DB/<'2A4()E;7@.4CD!D>$"9>: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6032 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26306 42 49M = 26091 -264 GAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTN 7?#?,:<4;@"193=HG%)87&8@8FHF=;(;<#3619!='5(.C.HC% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6033 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40376 42 187M3I42M = 40155 -450 ATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTNCCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCT :4F"9(C%-AED:4?GE01F#2)-$4GH#',23+E9'$!+HH-(@)D.0C&-(!%!#&%74D5%,"87*>#1/:G#);4!02<.:)(#HH0'&9$:D0%)13=$35!G=.,9A,D&+'6<%6$)#"A2?4A%2=6D)#+D/2*=/#F2*'!7G,H49<$<,H>;.=C.%:;$>$:0,4-#4* AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:76A4T147 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6033 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40155 42 221M = 40376 450 GGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGNAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGC )G@:"?#7)$6"FC'20#&,A1-,/C9"*8$E=E'D,+)3H@#+:"A-F"5C6(8B&?9#8A53;65""(!;-9$1=GEE*(%%6:B$4#.38?;%H3#8.C6H0937#H+!.=F#&"24($D?<#B>.98!57C:%='DD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:111A109 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6034 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27152 42 85M = 26962 -275 CACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGGTTAGNT *&&!*&*+*(")$$+%+!)(+*!++'(%'*'#$$%%(&!&*+&"++#)!'"*#%#+)+"'($#%)&())%%)'++&$'&(($'() AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78A4C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6034 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26962 42 41M = 27152 275 AAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAAC /G&GBD7-64B78E+5/?)?AH!$="%.$?,-::(G4+0=1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6035 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4770 42 203M = 4973 374 CCTGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGNCACGCNCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGNCCGTGTACATGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCANGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGCTCACGCAGACCGCCCGG '&#(+&+##($#"%+*)$++$&)&$"&&%("*'+'$$%&*('!&$%')**&&')!$*$)++#()!+'**"'%&%&*)#&!)'&(+%+&($$*%()))%+&(*!%&#(($'**)"(*"!"+*$&*%(%)'("%"'%(#)&)!$#+((&("&#*##!!"''$+)%'!*&!*"%&+&#+#&+%(!%')(#()"!)&"&+&)+'!$# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2A36A5C44C6G1G49G35G17 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6035 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4973 42 171M = 4770 -374 ACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGNTGTGGAAATCACGCNGATTTACAGCGGCAGCCNTAAGGTGGATGGCNACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACC %60:H&4@(8G"=#.&>)'EFB41153/#2F2";;:?=48$;6F!G0=C*H:-%G%?(&6@;=A,A%"-4'!H4@F+A9%A@$>F:>;A->D%26F;@*2$!)/&*'E9#8/#40;"$5!/(#B7H4!E%F.%99,,B?A->F%%"6)>FB"1$7H(/C)1B3"6,-%;5) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4G56G14T17A13A62 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6036 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44912 42 58M = 45067 231 GGCGTCATCGCCGCCCAGNAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTC '8:?-6=A6'8F:8&#D3'(C7<>.8DD<:8@F;5@?/&E/?#2$%5@"E73!6G>/D68+DG2(5;6H:D%1C5$8$0:@C(0@:812 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T33A30 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6037 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29535 42 159M = 29409 -285 TATCTATCCCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCCCAANATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCNNGNC +(++"%"%+!!#(%&'&+!!$%$*)!')&"*"'%*!$##+$#+(+$!$'"%("+%'!)(()$(+"#%$"$!!'!%$'!$&+#!(##$*+#(#'!%"$!$$+)+))+*$#"*$$&!++)%%())+!&!)$(&+'!&'"&+&&($)$$%+("#+'($"!$* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:7A58A3C83T0A0A0A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6038 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40470 42 71M = 40673 248 AAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCCCGATGAAACGG 3'/G4H?!C*1()$HH+H:4G94@DH-6,:=! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6038 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40673 42 45M = 40470 -248 TCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCT A+GG/#5857;)9*2H>2-H+<1::3?AB>9$%4DED02:5:E*,9DEC/(4G,EB.?02B!0&.%FG:G:AD.8C5=,1;'('A.>42A262%?3/;5E'(8A:5'796=$3">778+(4BC5;(%? AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:67^CCAAT30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6040 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19839 42 106M = 19839 0 GTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGACTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATACCC =?.,!0:B09$FGH@!7.(EH'D%0CDD@C=;1H6G%!9E(80F-)B;2H;.(HE><2FC!-'>9:0DB(#5DCA%--C*E)"!0;?/,;0DD%*'5DGE$7>7;= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50T51G3 YT:Z:UP jpayne@0: r6040 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19839 0 * = 19839 0 ANNTGAACNGCNGANGNGNTNTTTTCGCNGANNNNTAACTNNGCNNNGNGCNGCGANNGNNNCAACNNCGTNNCC #"$$$"!"$#""##""##!#"!"$#$$###"!$#"#!"$#"#"$!$!!!""!!"##!!$"""!$##!$"##$"$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6041 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22086 42 58M = 22181 231 NNNTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTT !"'-A/6#<)35.B:8F!C!(HH>F)"2.F2G8%;!3&/'G,,*+!A(7.*@%H2;A+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0C0C55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6041 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22181 42 136M = 22086 -231 ACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGT 2BDF>$39$="3;76.<>'1-BA7).AA??$./E*&)$F.D632.D5=7-4H0">2,!%3&8$#=%;&46;.;0>9))B808C1E9G:0$37>3%H;@83'('05-8&:4,:F>2C$CB.C"7**(8*8$+,80-?#2E*-7)&/%"0281!?64GG10166G30G&(G*"!=@">%<2@"9"4.*' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25G54A70A12C12A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6042 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27455 42 41M = 27496 219 GCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATT .(5#9!9A*57B8#(BEGB191#F+=:1;<8AA&<0B+2", AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6043 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11381 42 86M = 11266 -201 TGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGT AE!3B.#H.7.#'6=-#F?5AA"+13FB,H5$9;086;E?!A)0C!7,E?!-D@)<&:B(2,F*"4.>$>F"-$1)*/%@/()$/) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6043 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11266 42 53M = 11381 201 CTCGCCAGTTCNATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATNTTGCTCAGTTG ,E9#C(3-15<*?A5?H*6D4!!GH(-'7>8)<877**!.5A;!G@/C/6*=* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C29G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6044 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25046 42 41M = 25087 200 TTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCAC @>14<,.4938A5>/8CB5;H'0)/E3!7<()A)1H#((C& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6044 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25087 42 159M = 25046 -200 CTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCNTGTCGTAGGTAAATAACTGAC /*4;*:A6$G=(@F4*<&0:;91*:'!'&@F)8C!"B'5;'$E$<7+#;G6G>&".&6H76?9F-:")#4,@63?G--B.$2&%%21371$0;45=->"'!@='9F/;0%?-(H5>1!"G/.F=849FBB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:137C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6045 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26072 42 126M = 25908 -290 TCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATGGCTGGCAGCATTCNTGAGTCCAANATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCA ?=B;)53,",84@>->*';'!%%83C?,/3")"B?2%/E4-4>!E-=:836&@&;;!,BG:'5>D?%*%7?CB@C+<'4,C"".!%(.$=+/+<7#>>9,70H&?&&E/*#@E4H2-82B-!F1&>EH2F+8-H=(07,=*+4+$,FF;.7?;E@4+:,G3"1D%5&6'&2CE9,EDB3.>>6F@.86FAG%@<5/.H!7,F69?9'C@!9H07@5>@"D;8"G%?:?+-A;H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:189 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6046 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11045 42 102M = 11147 291 GGTCCTGNCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGNTGAGGCTCAGAT ?379-)2G:>D.B:F@$7>#CH%/;.:3>/%5;/&C&G"8<#=E&%@4&*@/D&"94>"FH(%/#-&0=9:B(#.>>!E1HE&0."D2=6!(%B;!;F;&+" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T81G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6047 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38381 40 57M = 38088 -350 AACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACT 6%4?,1>!2D.C51(0"?,9;,A,++&77>G910%3=H?#7BF?@)7$%/')/2D*4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6047 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38088 40 79M = 38381 350 NAACAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATAAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCAAGCAGGCCGAAAGATTTTTTCA !)$1<*#0&8D*-%<5(@!C3F>6F*+E8,.B$*$>&FE#*-(*%(83D:.+(:6>?G"5&%1$)(25"2>415$:*D6 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1C28C25T19T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6048 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32862 42 229M = 33091 504 ACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGAT .F+6>*!$9.GB,%;?!#$&619G6:-()B#23">-9C2-B@BB=9=/&(BA**3='>E'$A;0>,>H*()CF3+-H52.-/;$=EG5$7*-,##9"BA545,2D(9H0A<%,BAG:%#&?.@H.?GF3<3C:1"&/E&9<-5=771&24A4#;/:#69E0H6+$0>/-0F6;+*!"&!0;'++B?0),+9CB!,"-91!B9#@@FE$$"6#:072GAC6=?2%)5)47 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:138C90 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6048 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33091 42 275M = 32862 -504 CCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTTAAATAGCTGNGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATACCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATANCCATAAGTGATTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATNAAGTNNGGNGATA ##'!###%"'""!(&$"'))(+)%%"+&)+!*&+!)&$+(+("*"%")$+!!))$&$&#+"()*"+%&#&"%#*#*!*''*"++)(*(*'$(*"!$+'+'$)(*+)#$*#%+*'%!"%%+#*#+%')!+$'+!!"%!!)!!$'+)&($%!'&!#*#!*+$)$)!)(+"$('!&"!((')"#%$(&+&+%!+)**!$'''&)*+%&"%&#&(($%)#'%#!+'(''"')%'#('%%*++'"+%!&!'*$*)&*%%$!(+*'%#((&)%"'!())&$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:34G9T92T82G9T30T4A0T1T0C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6049 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13847 42 45M = 14044 257 GCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGC B&?,A&!/0%* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28A3A6A11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6050 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27054 42 84M = 26968 -170 TACATACGTTTTCCATCTAAAAATTACTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTT E:@1AC6":2'#>;#2@HC=B!H6?C4,4*=H#91<>=9B'E=G<99C1+B'#H-4167>>+C@.=>99?%06*B32D!!4..+5918)F3;6&5"&+,01E&/+=;"A4#.?-?/>?H&D8FB+>@310.(C"2%E%0C/8?&/.8H8F/*B1F-,(4<G7-2.$):)?/D7=6018,,-!>@B+:3,>C48.:8$A#;;1?)>D5'&;D:1%HCD>F4*!*6+D9'5 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A12C25C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13259 42 166M = 13425 238 GAGGCCACGGTACTGNAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGA -@F3B@#?,;$C'8AG&,HE,A-%!B.D9?">*@%@627CH+"A?A5*=$G)B1$E7B@D$:&-?0G5@A8/?#C0,1+;C-2AE.33@$=.52;"4'4C5!C1;17?8H4))3'/F=D!)#F?#G&6F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G150 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6055 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22976 42 28M1D53M = 23074 228 TTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAAT *'H!"%09(":H!A?B?6">6"C>/E&(52+B+>@&>&7.;.:=3%H!<'7(0GF-#<'@8/*-';'>#=,H('7D(=&E' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:28^C53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6055 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23074 42 130M = 22976 -228 TCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCNTTTAAAAANGTCGTNTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATNTTNAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCT -63G/=9%"C+15E(,!F,<+8G!A81#99'&*F;6"C+5.$E@&+4.(:=1DA(A"+%;6H,::)>.07.7D+/53%E83E>542F:-@,/3H@36+&7.-9?8,2@&9;.%.3@#:("<=F;AHF+D,G,B#(61+@%=GD=)$/H2%7./7%A>;5, AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:33G29T69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6056 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24619 42 66M = 24733 247 TAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAG .GF202,.9/2+?1FF7)7!9G9$6D,G%3*@!4/<>.5)#%):*1B;!E6H('A??9.%5,A8)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6057 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8410 42 42M = 8150 -302 ACCCCATTGATGTGGTGAAANTCCCGATGGCGGTGCCGCTGA +0F,@+E*7G;$%$G(3#(4'7@/,$,04B#7241DG!<>2@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6057 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8150 42 68M = 8410 302 GGCCAGGCTGAAAAGGGCCAGGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGC *?H!$06??C.!5)D<.=&;40,/->FBF#=F7=D9'&!$650;D<(.)+%2*!.2CH%5(&=F348,<@H>>%%<3BE<5$'=*.!G$GH"0:;B+;/;+"1/';=;609../'<**=A'/G8E",F0@+&##+E&'=%1.6<63443%=80$%??0%,G&+=:!3$(F;=$1/*5?@=@D1@;H@%/<073/'1$A/AF1#(071'92+<,=73$+/.0#E288H:$+5C2+?%>64?A!><9>D-H-88$->5$7/;%($,B2E&A6.)AH59>6$43>,5=<5<"+1(8+17%4D?H0G+<4/-,C>$7@11#GC-(/=9)*,H(;B1?1&E<=@C?>6+5.-H=2 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22C0A70C40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6059 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10676 42 118M = 10805 264 ACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACANAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCA B3=?!B>;$A36A972@"D7"G/*8+1=0H$7')!@&)=$=@",$2-A+'E0!)2(:>628!?8/$&-6>9%46=$//-7FD$H1?*6%2G8;F/4'3:25&F'A=F/=6=@$C0&3G3D."+H8"77'F8*'4(+))94. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6060 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23886 42 240M = 24126 298 TTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTNCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGC 3=H'4+35>8H#2:AE(HE>.8',;)0>'4H=0;D>%>-1%91H78"B<<2($?+CD2(61'!/316,#$,2"2:A+66H,722?*G'"BG:>D5#G$8#-C8+,:HDA%F>B59.3>+9$$;AG?A8-6@&)D/D-D(/;,.=*G;3*,+&@+3$'"!5%=/'-;'(>E=;2B13=F(@(($(/,C=2@800:&@(*<1=>06."01B:7>-7"A.B-*09+-C*3A)2('#01",!,) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99G140 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6061 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15872 24 4M6I131M = 31 -15976 AAATAGCGAANACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAANGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATGAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGG 8;6,?65*9=.$45&$�!46=0EH1*7"D0>D#0,!9@$-H74D4?:<3,7G6GE;0><9***D>G@.-HD/-"?9/3A<@BD0&C=+B$-?>>C".#>$5#;9GA!!A7B2+D+'?!:AE"8E>*F%*-652*9/$7*,AA;DB.1==)>/!D64E"*F-.+#21G3CF3.6*%E:&!$$?H2#$94%#E7-;@3,A-3H'65"8!1!!.%A&+'.3%65>#??@%0'BE%#H?<6(0;9,"C;46A.%,<-"2H6,>G2:+(C$3/+;:0!983E?*E=3?@5E'*(EG=1A+-2!@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A115G53 YS:i:-62 YT:Z:DP jpayne@0: r6062 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39942 42 94M = 40134 268 NCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGATTATTGCCGGAAGCGAGGCTTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACG "G<=B&C940510G,."#04!F15DA83H*2/4=%C*',2!):,/?-F))&:#$.?.98593A*?>78>'/:)9* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C34G18C39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6062 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40134 42 76M = 39942 -268 ACGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAANTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTC 5#"/"5@:%$>!>4E&+.306>1A<133;=61A#$:3:->>0>(>.C%C--*=!(:?5*,?;/"FF$GAF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T49C24 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6063 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32203 42 182M = 32452 328 TGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTTGANAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCA 2E!<4#+@"+B,)/.C:G5>13G12D.-#903'E9C.83H.89>6%**/2;'!'8'>0=8('H2D,...-;>"9$70<-!:0#G4<0-A(46:F2&!977DF31CD7>3<@>& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70C2C108 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6063 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32452 42 79M = 32203 -328 GTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGGGGTANATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGC 48@/=,(AD9>54$4#$F4,14!74>G46(B75?3$@<1G%.'7C1>5&%>>"%/&3=2E7E,7H>A%HG=39D:%F;5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C4A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43703 42 127M = 43493 -337 GAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAANAAATCAAAGGCGCGGACACGTCCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAANCCACTNAAGTTTGCCAACCAAATGNATATCGAT #H39>$DE;@/E3?$F/9C8&&";-A)%D!6D%#,/BBB(/1FD).*&3:4+.;@)==F5BBBF+&8&68?0'=!C5%E@+3:2G(AC.$+16(/"/H8#6:FA9,#'5&-1C434F&FA+%1B-0' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:43G21T27A5C18T8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43493 42 118M = 43703 337 TAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAGGCTCTTGCCCATAAAGCNGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTG ;,:?21GE%@/!62AE6D5<.G;2&3*,3!'8G0;+1H50A?7A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69A17A30 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6065 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23928 42 56M = 23984 269 CATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATTTATTTTAGAGGTGATAAAATTAAC +"#"?'E!*H0+F;6#3F.G<)*>6A>1/D:-H3$*>$@0B'++;;9.8=D8"C-G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A24 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6065 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23984 42 213M = 23928 -269 TGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAATCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAANTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAAATATGGTAGAGCCGCAGACANNTCGTATGCAGNATCGCGCCGCNGC +*&%#%&'""'#"##%#*#+*%$+!)%+(&(+))%**'$&)'#*)&%+#!'$"&#'$((%'+(!)*'$$!'+"$&#!%+*))&*(#*%(%%&)+)'!#&%"**!+#$+#'*&)"%$+'&$&*!%%'**#'#'&)#!(!'$)'!%)))$*(+&!""*%("*($!+$!#!$)+&%)!"#')$%(!&$#'+%')!()**"&$&'#$&'#"!))")$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:58C65T41G20C0G10G1A2T2T2G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6066 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36242 42 41M = 36242 0 CATGATTCTGTTCCGCATAATTNCTCCTGATAATTAATCCT ;.'44G)#;>)5;;D@82D)/6"<=G#)82DC35=-<1G56 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A18 YT:Z:UP jpayne@0: r6066 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36242 0 * = 36242 0 AGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATC G%?'!%7<*8>5*=B;6%-,G*F%>*&"H/.48:%=G6HD03B9C:E'?E4*A!*A02&=5=#F<' YT:Z:UP jpayne@0: r6067 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28622 42 97M = 28759 192 CAGGATTTTTACGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAAT %+"+)&#+**)$+!"&+!'#!!"'#&*(#)&#*()&)+*)#)$($)"")+!(((+'+!$$+)(")$""!#**!#(%$'+!(!(%())*$''$)!)$# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T86 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6067 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28759 42 55M = 28622 -192 GCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCGGTA "#&'+!#++$)($($+&*%!*$)%*$+!&+##%'#*$)*%*#$'+$"*)+*%(#% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6068 77 * 0 0 * * 0 0 CACCACGGTGGTGGTTANCACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATNAAGCCG +&&(#((#'*!&#*"+!'+$("%%+$'#+$+'+#'%#(!'#(&&)%%")) YT:Z:UP jpayne@0: r6068 141 * 0 0 * * 0 0 GTGCCACCACGGACGCGTTACGCGCCACCTCTTCCACNATCAGTTCANGACGACGCAGCACCTCCGGCC +)*)&(%%*&&"#+&**%*#$%$#'+'!%(&%&)#!##&%'&%)'*'*(!!&%(!$#)!"(+()!&))' YT:Z:UP jpayne@0: r6069 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18984 42 105M = 18775 -314 CCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTAGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACAT F#C"7>A7!==?,2,10?E#2G9.>+4,"23<8G0*/C/H1B,!0$'E+:%#?AH&1'C1&>9265&-3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T82 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6069 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18775 42 65M = 18984 314 ANANANGTGATCCTGACGTTCACGCTTNCGTCCACACGGCATTNGGCAGATATTCCGCCGNATAA %#%"*$+!'*+%&'""*%$!*)!$+!$*!!!%')&)'+"*$+&&'*'+%+)*+&+(($'&)(+"! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0G1A1C21A15C16T3C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6070 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19484 42 43M = 19527 229 CATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCT !+1%,!:3D-91($H"/8DG"0D#$;7G67"((+&!-+H*"#E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6070 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19527 42 186M = 19484 -229 CCGGCAGTGGCGNCTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTANCACAGTGTTNTGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACN ?A7BE:;>G%E."?1?*?."8+E!32:*!+,6:;9@71:E4"G1/:='G8+:0$>?G!8/'C,8@-E@H,$E'26>:B)A&)C4AH;7G18;8619),3,&''?2H!1?E%7*!7H*H"D-+BB?E?*18<;) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12A57A9A104C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27095 42 92M = 26990 -197 ACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTATCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATN )&)$"((*($"!*')&"%*')+$**##++%&+$$"&%)&+#%#)"&($+'$%)!'("%#%#"#+)'!("$"###%"&)**!#$&'*&*'+(& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G58A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6071 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26990 42 99M = 27095 197 TTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTG C%62=AA6&)18C(&417:F0$B/*>@+-853!C1GB2.0-F+677&3/)(EF,6=*>(!E*-E5?'1>87-DEH6)1G;%<93:82@52-)+%;<#B5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6072 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42013 42 82M = 42148 312 TACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCTACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGC G,E$/:(*!!=.HC7!<=.?A*.%B5@B$566.):73,&,G+C13'E/82>64&3$456:@C80*6!A*&DH7@047A$*,5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A43 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6072 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42148 42 177M = 42013 -312 CAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGGAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCCGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGCAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTG $5F=*,C-=@;:.G?.DC36%E-"96(1531E+('DF:C*D,/(E#8"$A=7C'1)+)+=(+#5>+F<1/D+$8C+C-45=;E3?GA)746A?!H79E-@$>6CDD!:5)3908(#(9A?*45B;8+B2)/27!+==?DC<7!H(3(>F5F%)<.?G-2-+0<8/32),9 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51T26T33G64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5907 42 67M = 5998 231 CCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTA FF)!*9(?9?.38*5&*4>@(6/1*786H!#""+(*E!G%.*+1H-/0??)<)C#?$<6$:;;0=34 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6073 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5998 42 140M = 5907 -231 GGATGTGCTCTGNCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATG 1'9E8!@G2&12#FB1$@H/1''5+#9-1),42*45&29H=(D%%,&<;D6A<12H@$$43:*=+2:'CH=(75F,?)?B=&G%=(2)G!E!"1=!(#?H;&4BCB<)@=G9(&/@G<(209G2C'9:>3<5,F+#&:,9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6074 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13459 42 185M = 13340 -304 GAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGNGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGANNNNGG &'#!'!#(!*$%+'#+*#)&&''()**&)(''""&)!(""(%)!+)#$*"$"!!**$%(+(**'""$*+)"%!+!'*!%!'$'""%%"%)"*'&)&"!!()'!%%+#+(!%%)***(%+&(+#)!+%*$#+$(!("%*#&)#"+#!!"'%%"+!#"$*"+('!$&!%#$%$*&"+'++'"#$%*# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:127G50G0C0A0A0A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6074 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13340 42 119M = 13459 304 CAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATNCGGCAGGAAACACTGAAT )@/6$F-HF(,.$B)F$E-*'$;39&<1G'AB4+A5'A75A0/$*&%9-F&G"&D1;%<6H=H,%7"+0;3%=15G6E1+8+1#H%:"7,<8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100C18 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6075 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44356 42 123M = 44286 -193 AAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGC !(+A(=%#!&2&1>>.+4>;G:"&5;!D*0$3"?=.+0A5@)/:181,H5/<(@25?=0$.6H##+497G)G'E>8>+?:23G"=;5=0H?1%471;F,25+.45;:?E2--98<6H6FB4,F2<158H:?926B6%8!%'#B'F5/5;$BG8(>:;B';%=&99@/CB&>/G8,H#7B0G5;"G3485-6'EH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T48 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r6076 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16704 42 154M8D66M = 16932 331 GGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGGCGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGG >-)4B;5?+9%7''86#9$G-6A#BF:(H7>*?&-=?A02/=&)-)4HC"C39D@214F-:9(B$B)/=7C,@3:%.CA"F",41(.88HF8D)&7+'8==%,1B5;@1*>$!<4'+&#>8A&6FHG6;FCG;@8<963D836%D-;'(HBH"*+9DA-(0);75:3A">=;9-8/036A)+&0)@?!&'D9:DCE#C4H?A78 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6078 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6874 42 68M = 6998 268 NNGCGGNCNTCNTCNTNTATNCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGG "%%%#$"'&%%"&(((!'*'#+(%()*(##&$)"*)&&+!'*+$(*!#'!$'+*&#*%#"($+"%"") AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0A0T1T2C1A2G2G1G3T42C0G0G0A0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6078 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6998 42 144M = 6874 -268 TCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGT #*#')'$%"&(&'!#!%#!$+"*&$*)%+%%&)!)$**!($)!*#*+*$%$#!"#""&&!'""%&*)"*#))!%$&*#&&'!!!$'%#+$$)$%(&$&)"!#)'(!++'"#'%)+'&"$!!*!!$(#!(%)")!$!")"%"'+# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6079 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23064 42 47M = 22844 -267 GAANTGTTTATCATAAAAAATTAATGTNTGAATGTGATAAGTGTCCN $&%"''$#!+(!)$*&%*&+%$"(+))(&'!'#%(*)%+'!%*%*(% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T23T12C0C4T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6079 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22844 42 42M = 23064 267 TATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTA H;@HB!>"4%&8D&:H)49#F%9#(5E>6%>F,;H!F!0$:G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6080 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39491 42 49M = 39680 319 GGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAA (-F1E,?/-7#@6?*<,$?=&'"3/"=HG>*>A#D-&;H;(*<@BB+)- AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A0A0T45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6080 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39680 42 130M = 39491 -319 ACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAANGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGTN !D;/"5:<+/?&?1,BC)43C57:-D.4!!(-)*G6?/3+9A4165-,0.+D+3:#2,/%?@$&E&E@(C;1'@#"60="3H$@)1!?#6$?7)9=-(@93!(>8:";3,,28D9>:%+D9%9/CC&C%' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24C103A0A0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6081 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6398 42 26M2I34M = 6142 -316 GACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCG &&A:<08EF(;"*1::$!5"EG-G7F@1%5,A.7D'=%:FC.H8*0;-HDAD><3'!48/<. AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:60 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r6081 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6142 42 81M1I29M1I146M = 6398 316 TGTACACANCCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTNAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAAAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTANCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACNTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGAT )+)F=/<2<("(5A2+3*)7!'@&!#C0H!)/F#/F:&*6/(01/E4/3?E>G/%1)+??3HB:,5.H<3H*A48;E!":H2+G-8:'A?+H-&G=54G7C"G+=,,7*?>,&3"90)**,G73H(-+;81F5G<,/24#17&&34@=/;6(2,=EF$*29552#68E';C5G('$D5E%)E/;;<$?!!8F)=>@:9&A'+H3#>)>*.:76;/#3C?+=A:(HF07BB6')G;'0"+7+614&D,F">3@A&&6'2 AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:8A35A37G29T39G103 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6082 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32020 42 44M = 31811 -253 CGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAG C.-H,HG7'A42,F7FF)?2A0@GH=8':*A+D&+BD79.;8,5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6082 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31811 42 48M = 32020 253 NCTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAG $2<=4;3/?6D!(,'BD:)"0!05?9A961'A9=>%27;6)''7.A!./,%F83)00E!6'(!7#+AB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A18 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r6083 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31896 42 184M1I38M = 31825 -293 GGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGANGCGGTGATGACGCCGAGACGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCNCTGTTCGACAGCTCTNACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAANGTNCGGTGTCATGCTNCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTNTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGCCCTGTGTCANTTCTGACGATGCACGAAT "1H*C?#A?6&6"?)5&.FG7#=EFD8.@;-?B+-"*'59=D$!BE0=9H6.%9?31G!'2?,?-<+BG.7;>-90>'(29%G2F')7@/C?92EF<<.G8:AH(*+01!#!7&!"-F+2;6A(G3-,+68=+=F+68G97&%""&013,,##6F47<5&!=%->+?D52+53%+69G475=2(72"80AB;<>84;*!60G,GA+27)3,%%C=32A74;E$ AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:31A17C25C15C28T2C12G26T26T2G9G18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6084 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22214 42 211M = 22160 -265 CCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCTGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGANGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGNTGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGC /5/"+:7D.1G))/43E9#F@35FC'-*9<$.E?'<:H)5/6C='&1")$4@:07&':1!5,#=G-/9-A,E3),6<(H+,3BC..8%3$&,3('>1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33C34G98A43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6084 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22160 42 54M = 22214 265 CTTCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTANAANCGTCTATGACGTGGCTT $'2EC$D%B!D:B3<1E=1()#732?%H0,H5(-,B63<-HB/B785A*6&A2(:',00 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6085 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45772 42 63M = 45621 -214 GTGGCATTGCAGNAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTGACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGT >@8(2-=FHH8$0GC3,3"4DC-6$2GB&CG7;$)D':A)>C9F,'%$0A44(88?/!$4>F< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C21T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6086 77 * 0 0 * * 0 0 ATGAAACGGGTNTTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATC )#+&*%&"'!"$$)%(+'*(+$*')")#+)##&%#(!&*#$(#%"!& YT:Z:UP jpayne@0: r6086 141 * 0 0 * * 0 0 NGCCCATAGCTTCCTGTTTTGGTCTAANCTGCGGTTGCGTTCCTGAATGGTTACTACGATTGCATGTTTGGTTGGGTCTGGAAGGATTTGCTGTACTGCGTGAATAGCGTTTTGCTGATGTGCTGGAGATCGAATTTCAAAGGTTAGTTTTTTCATGACTTCCCTCTCCCTNAAAAGGCCTGCTACGGCTGATTACCAGCAGGCCTGTTATTAGC "=:2@EE/6@:&E-H=+64<):'B$%E=;5'H.G)"8#;BB))#;B%7F*A;1*C$/F*>C#E'1,'%45*,E3.4/1(CF)%2#!?'E2'($<(H=3"GF"%;!G930AC4!?DD!6&A*A2A''/>AH..0'H"05-"".B8E?:*'3!82A.<1B%:1B,,E:#@&>2:#AA*6F?;1"$%?/*F+($=$$D=1;@3?$:A)2AB/3+2;=* YT:Z:UP jpayne@0: r6087 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38042 42 109M = 37954 -197 TGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCNTTCATGCAGG !'&$')*!###$&)'*%"+#*+#*'*##)+$''(!%)#*#"#"*#&)+#)%$"+((#"!$%(%'&$"$*&)!("+()$+'&($'###'%'$&$!##"#!!)''#&#*+) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98A10 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6087 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37954 42 54M2I16M = 38042 197 CACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTNGCA ''>72'>2C%!7?,.(4;)1.D.BA?>HH<($%2)-37B3*3*"%5>0$F),;1E;2937.5B87-<9/-#G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:66T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6088 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45830 40 54M2I68M4D18M = 45974 308 TCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATGCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGAAG ,'9525%-6G>H25&8,>::",0A3(*5#?2;3#(4DHB2(;'&0-A=C,6!5.:65?%@)+G,;!6,+")30/5&,.9>G8)(@''H?2()34F'2//2>,BE&$-?6F60582);E-GG''G.;27C0"'5>?-E.3G+< AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:99T22^AGAG15C2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6088 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45974 40 164M = 45830 -308 AGTCACCGCAATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAANATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCTATTACTGACATGCAGATGCGTC D>)&--((2E"8=ED@2#%H!@'/A>D)-@A602%*"8=C:9%."E2-/E;2B%'1.,#(8.H%>@*>301>@2(!,'3:A%1F8B32B73F,=3*,+1;$0,$1;A%FC7276HB08-7C):5=061-"B-.'EG%)<<>H/A:A!&=HGB++C%#&9::3-E AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G99A31A22 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r6089 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6825 42 112M2I51M = 6714 -274 GCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCT 2;73;62#*GAE4G49CDE==D715)A>#6?>*-."-E>7B94?F+1*6(HC-!/+F)%#-$*84@#A=3)>$,HG0H5;:.2'/DB!9"?)=?-@!F-E"?6&C/+5%7/)@*<;=+419"93FE3$CC2G99!4EAAH9B&=?,3FHH&H3(C5;:?$5;,E)#)3$&,A2!/%88)-.&=C&6BE><5FB!G7E"7:D>8B=?GE&E,-)F*=4>"$8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T65A42A0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6090 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9687 42 218M = 9608 -297 GCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTCAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTNACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGNTGGCGNNGANTCTGTC ("##&%$!#%"!'""#+*)+(*"%""'#%#%*('%$!('"(#+"!$*&!#"*+*'(%"))(#+)&'#'&*&$**$')((#"*!!)%&'%!'($($(!&"$'(($")+$""#%(+$%)'+'')"*()&)*$+!$*)&$%!!'#!"'$"%")#'$!#('""$'#&%'$(!#'%!%')*#&&*$#%!%'&%#%%+'+!%)%(+#$('(((#!*""!*&'*" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:32G29G138G5A0T1T0C0C4G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6090 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9608 42 44M = 9687 297 CGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATG ?-;2G=C-)5)817>FCFA12:@:78/&-"H-5?8$3-98@%5# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6091 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4181 42 203M = 4384 349 GCTCCNGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAA 37%)C,%$H-'H@3"1G-9EC'7"F4+4$=F,,5.:B(7;0AGA#*''7#CG3"('$E*4@'GA::/97$BH+*:*C1D.1E%?E9/<"6&',+B.899!%=B*A,'E3199&<3=//%@?)-"D7-"BF=C@#="%(>"08204"?F$8B$#6'6,E)!C-BA&$/-&HH*-"AA8%<)7:2'53**579=;$+.(%)5,-:0.;A52 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A14T37A22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6093 77 * 0 0 * * 0 0 CCCGGCATTCATCGTNTTTACATCGTCTTCGCGCTGNTGTTGCCA D6/5%2/1C1E?G,.H=5H.%;81F(F2%<(<$92$24>:+.279 YT:Z:UP jpayne@0: r6093 141 * 0 0 * * 0 0 GCGAGGAAAACATGNTGATTGNCCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAANGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTNCACGTGTGTGAGCNCTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCC "A,)2;%6+61E":H6G'*'F!*!D39$D'$3%51&:H)$$6?5<.H.$#+0-%6?,"F$"B&EH.5B4A(#B$&-:,,05H?)93&#:(''G4$'D'=?8B6,52>E4E(-(!7E3G:*7,.3>'H-.>#6<%'-< YT:Z:UP jpayne@0: r6094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38132 40 112M5I31M = 38335 266 ACAAGGCCATTCATGCANGCCGAAAGATTTTTTCAACTNTAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAANAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAA -@#A+!+3@>=2F,=>B2E1??+"@5=?D2(=AG9'F;7;*4@E42%@6$G!"/<3110C(4%B='$*@61:D&4-"0H6;:4/#6(67$997>B:'6+$%%F>=5< AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:17G15T4A55A48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6094 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38335 40 63M = 38132 -266 TTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAGA A(;F#A&8=B@65=0:=25D;A?H/,A3;#+C@C@%CB4&((2D-+2D4'0,<'""2A*6-*# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61A0T0 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r6095 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15680 42 101M = 36077 20476 GCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCNGCCGGAGGGATATGAATCCTCCGGCTNCGAGACGGTGCTGGGTACG *#''*+&(!$)#&)"+)*+''%**'!%***%*"*!$&$%'$"('$$#($#'$(%%&+**'!!*'#*$'('(")!&(("*)%#$&$!*'(!#!)#%)$)("* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C53C11T14C19 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r6095 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36077 42 79M = 15680 -20476 CAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAA !&%.(?@?34D/,2$,#HEHD":B.;,#$=>6A-1-9)B!.7?'5&D5>3*84;030#,5;$+D"BGF)31!C$6<4#1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r6096 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13148 42 75M = 12991 -232 GTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGNTNTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTG 5+DH#)?47$"%!>/$CHC%3G.8"!%F5/5#&?=A@(?AAG?F@45/)4$&>70?2B+@/"6A7B0?!$/0@&5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C1T49 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6096 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12991 42 134M = 13148 232 AGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGGGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATNAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGA 2E@GD,=%=B9<%9/&"0!,)D8'.2>92B5CADB)F@")D,B#B4AGFCH%857A@!8"BD)+=+;-92+(;96B!#HA47GF-6'))#/:#7-782E..7--,H@7G"*H2371>*)$22?F3;1A9&&B.@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49T61G22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6097 77 * 0 0 * * 0 0 NTCGCTCGNNTGCTGAGTANTTCAGGAATATGGTGCAGNAGCTCGCCGTCGCCGCAGTAAA #$(*#!$#$$)*##%'''""(+"!$)"+*+(*)("+"+&'#$+%!)"&$)%(*")'("+%* YT:Z:UP jpayne@0: r6097 141 * 0 0 * * 0 0 CCCGNTNTNGCNGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCNTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCATTNTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTCTGC )!*&$%$""%&%)'$'*+")$(%++'*&#+'#+#$**%)'"$#!$+)'!*)*%!"""!'!$)!"+%$%!#"'%*%%#&*&$''!&&$+)*%%+%%%(((!%+)!*)#)!('#%'$*!$%&#"*'("!$&!'#&(*)&%"*&!$&(')#+'$)%*#'*'"%'#")+#('$)%&#"%)"*#&#!+#&!%(! YT:Z:UP jpayne@0: r6098 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48052 42 134M = 48186 252 CTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGGCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCNCCGACGGCAGGCTTCAATGACCC 0=))3("@A'B82646,2!'G/1&C@6+E"3?49.HCD+.G2"-'?B-0$"*9"F27*.B*35G92#B3(D$)):D?=?4C(@F#/,%9?G;67"?4#.#).!3";A&HCG;4B">C9="2$B#*1B-6.'>'% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T81T23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6098 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48186 42 118M = 48052 -252 AGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCNAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCNGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACAT HH,;)&A+(')GA=19,/C>@=B)FB95*@29G38:%-@38(BFH"+%&;76733,G8=869(:6F7B%:@1=E+?9!:D<;:G<%2)A5-5#5=A'(3*!0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A49G36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6099 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30917 42 165M = 30838 -244 CTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAANTGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGACACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACG #4A1-=:.D/=A;33=);"-E?5A=32G429&2/H64?)FC"-@,6E0@H"DB#?">#GFA535C-GGG<<&59144#AC66(,@+<9+/'AA,#<7-,C2704;5F:>E@+@33G)%$;7H91:/;%:4218#?7HD.&30!&-F"4;56E35E'E(=/C/.%/9$'6$(>?C&%.H)2."35'F@2D=DD1*6//&$*(:(> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C15A25 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6102 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32595 42 174M = 32595 0 GCCTTNCTGNTCANCNGNAAGGGNGNAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCNGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGAGTCGACAGAATCCATGCCGACACG )*#!(!('"$)%%!($%!!((##$''"&+$*)*)!*&)!(("$&"*&!)%)"%+(*$$*''"+%&")(+'("$)&))(*#"&!&&'++!'+)"()(&""$#()))#*)'&+)*!&(&+!+'(%)#+$"+'$"+"!$*&&!!!*+)#+")(("%%$'(+#)$(&""#"!(('$)& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:3A1T3C1T1T1A1G2A2C1T95T27G24 YT:Z:UP jpayne@0: r6102 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32595 0 * = 32595 0 NNNNTACACNNNGNTGNTNATNNTCGGNGGNTNTNCTNGNACTGANGNNTCCGNCANTCGCTATCGNNATNACGNNGGAGNNNTNT #"#""$$""!!#$!!#$###$!!"#""!#"!!""!!""$"$""""!$"$$##!$#!$$#$#!#$"#!""!!$!$#!##!$#!##!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4140 42 189M = 4073 -256 TCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGANAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGAT ':)D6<>A/=#3#"HDA*!4':H-H2DH@(6$:.*?56=ED8='%1.*-)$:-8@D>"723><:6*%4',.#-H)/)B/$=:0=4B"&7E2F>;$D)==2#E,;%&!=9'F2A:,*? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T35T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6104 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7096 42 144M = 7012 -228 TTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTTCAACTGGCGTANTCATGGCNCTGCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCT "3/>,:&0E?(E(5HE/717)B'6G#8?;#0B+!.FD!4&9*9FFH6:=3/0*>*'/1:/(GA4E:;.);?7;6G*D!!-H)E!?$57<2>><&356.#G8<%E#-98F#A.&A:<;/-6@:?+42F:FG2<#D;53-4"6%+9(*B4(/B?(%4D)6;>FF=0F?-7#"27::++;!0,H><%B+#+&-D<&5#5(3!$*HE?4:4F5)=-1.9;7A;C&(A<0;>CB!;5-8=*%,#"D&)F8$08!?8#C#/+%/-+86"?#=<:.?2+F>@*-!:A2:&;E:-(=<+7:.*"#,?*><2>*!77B11$2.,6$6$DGC4,=,/BG$7#?#'%49'A)',H2$$-9A.95)G-AB;A>E&+@$A$4<*/9>+#" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:183G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6107 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7830 42 54M = 7642 -242 GCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGA 26:84'=7D*;*7:;6//8(+5!+(/1,$;;?"HB1#6H6%1@2.E&&>AA#32/#&E#.D2"('%''"A>5'F1CF9$:!HA+-.971G5%);5'-606A/0%H((8-FG!"%8##5&!9C.-/1"0=G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71A31 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26267 42 162M = 26429 265 CGCNTTGTGATGCNTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTA &$&#%*)$"#!(*""++)""'(#)("&)&&!#+%")+"%(*$#&'$+""+*)&$)$)++"#!))''(*%&!)$((*&#!"+"#!&*++")%%&#$"'!'''(!&&('(&#''#+&$+#'#$*'(&#"(%+!&")$$*')$(!")*'"$(%(+*&&%&!&"*' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C1T3G3T1T148 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6109 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26795 42 137M = 26940 225 CCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTNACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTACTTTTTTCTACTGC 7'$%.@-1=<0FF!/#+6H)(/8HB1+5&+:B)+26(:+E:H:8**F'8&)0E"!2'=07++:02=9D*8#;@E-+$A#:F+)29'CD:?!&(03=C"!$E&:AA2E9F56%%%*6E@A1/84D=E-,59D>)A?&+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C82T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6109 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26940 42 80M = 26795 -225 ACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTANTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGG $D5D45D)#)*BA7-B0"G)3=)D732/*147B&%@CDA#'1$)8)%*D208.G41',39?AG5".2.$H0=>C(1::058."5>->)(66AG>$=:31.9A(# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6111 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45231 42 102M = 45132 -201 GCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACG A>#67$:H5/32"E1!)4C"!$&A?:$06A<&A!6--;'73A!A(->1DE7958F"@)5/-3%;'0?=:EF4+#:G& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6112 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13195 42 133M = 13043 -285 AGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAATAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACNCCGCCT 239/3C5B'BH5E! A01(,E#>1(F/9%786DC>:5$F4'$G!FH3?C84&!B2=H12G72?<7H78"9%.0H;H?5-58*E483)*H+29'D3':H<7HAC>A09D'&:@>$#&07<$H@@>4&2-#7> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:94G31G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6112 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13043 42 152M = 13195 285 CCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTNTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCG $=E,'HC5,#C@(>HH9@FGD/11(<4$"/A*(/8&/0$H5#.'B,#5"5-4H$>2?'*8'F0659C!87=(@+C%.G$4%.H)E;E%+:C6&G1)G4;*99E@8"!')=99!9:'+D<6,7(*?:H$3D;:E!;?,9:2/(.20:::)F,; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C109 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6113 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14819 42 51M = 14870 342 GCATCTGCCTTTACNGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTC =3@4%1%@('=GB+-G*-F<,64B*=0:6,*0.E/40>G?6:F#27.'*0) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G36 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14870 42 291M = 14819 -342 GTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACCGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGANACTNTGCCTGATGGCGCTGTAANTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATNCCAGATTGTCCTGGGGGNTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTNTACNGCCGGAGCCACCCNTGCAGCATGGGGGGCAGCNA &'!!""+&&#"#)%'"+"#$$*#&"(!##%!)"'%%()!!$'$!!"+""'''+"++#!'!(#'+*&%)'$&*#&*%$"!!'$&)'")*()(("!$%!$#%%$"%)*'&")#''#'(+&!)&"$+)+#%!("(!"%!!$'%#%"+%$+'%)$(&*$!"*"%"$&!$'+#$%$!""%&")(&+'*$*)+#(+')))'$'%#%&*!%')*&'"#%"#))&##(#$%$!'()##"&#"#(!#+$*+)(&$))'$+)*(!($+)%++#"$''&+++'"%*&#"*!)+#"%)*+"!) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:74G67G3C18T44T17C23T3C13T18C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6114 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6993 42 287M = 7280 333 TGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACG 52/<&64(%79.A4+%B00FC."E&.3280.(".,H(>B2A?/#F;,0+?AB91H92>CD'G=;#93H9A3B:G68@*B.>&6@(:;=&08B>>(6,EBF4E9&BE3>,-5957>3.%D94G>(*"6&;1((#3FH(>.)C(5DH.=4"?DCD+98C#->?@H9A#A&<4?34$,%#;E"+"A=*HB176?973!>&-7EC3)#0/5-,!F$69*>%0-G$,0"E8GFD1#9E$C9?#0,!1#%:)2$,B#=40:861F(1;G(9<0G(+"E*.B5!@2FA3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:287 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6114 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7280 42 46M = 6993 -333 AAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGANANAGGAGCTTG ?H"0+.1&0A8B3%1C?-"BB9/?H5.9:@1#20F,A!>?.>G811 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A1G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6115 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 515 42 101M = 616 190 ATGGAAACCGCATTCTGTACATTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGGTTTCCGGA "':*99"(H+D5,&61E$>,7!):>5&4E<"'C#C:<.3GCF5$.26>7">D)+6(@-D*GE8+><5/,*!D#3+;(*)E6.01,93:6269.,)7H1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A44A13 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6116 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25444 42 53M = 25599 257 GGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCAT *)*<''-642>*'.@)*0CE0C"H2:!?7)1$%*0"/A@F-$;!(F(<-7<:' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25599 42 102M = 25444 -257 CGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAAT .53.08H3EDFG"@;CD3!3."GD@#-)A,!99,:'$(FFH#A=A"(+9EH?F+9@AD2B&-A37G15-=6/#?F$0">E&./5)9&/3:<.#@:+(*?!F/GFD8,E+?@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31G11A6A36A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6118 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32876 42 47M = 32942 239 GTGTTCTGCCATGCGCTCCTGANACTCAACATCGTCATCAAACGCAC %C2/9;/8F1=)AF7(131";0.+B$"D<2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A24 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6118 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32942 42 173M = 32876 -239 GGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCANAGCGATTCAANCAGCTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAACCTGNTTTN $#%$$)&""!)+*($!!+!%&#$')'"##&)$*)&("!+)%(++")"$#$*#*'*$*#"&&((#%$#'%""*$*$&!#!+*)!"%($#!+"*+++!#%%)&&$"*'#&*+#(!)))"#""&$#(%#*+!"#'+""!%'+#+$+"++$&'!!"*%%!$%)"#"+&*#(#&"&*" AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:30T10A3G12C104G1G1T0C0A1G0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6119 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30642 42 40M = 30487 -195 ATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGNAGCCT ,G2-.A24?25:&-D9/9H.4$3'<+!?A?<=;F(>46$H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6119 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30487 42 78M2D75M = 30642 195 CTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATANCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTNAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTA 28/5>3=9?B-BB%**72?;&;#6F>'76:G0AF?;(:0;-D+359>0HDB$*+EBC->A+A*"6H>&'5"?;&9!!1$.%(E%8!#(#"0.?H.,78':.=3A@$)+.0.%4*(;:.?$G;&5>;CGG2E$#.909DGF6,.,'./2/E3>) AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:41G36^TG27G47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42734 42 319M = 42638 -415 TATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGNAGCANTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGNAGAGTGNAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAG 9>-#'+>@<21!*"/9?4%5D"1.C8?=+2+,%.3(ECC,D;32G7@>>0,)@.0%61;:B1F/2(D,D#6B8!&0=';+)@#<,5E&C0/68=:G90:8$90D22D@7G<"1.B(G&!:!8@!E".'C8>H3@*>E2D6#-DG/4&4#!+!/,A@0@5E@>B)7.1,=A$29F:7C4;(#H$0A/9??(E1B&G%G2.(3*"+$")%(>0C'":B,3':8=9B@-DEB>&*=<6(%%>$A-A6+#8#GA5-4)-/@=D"G'A81 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G16 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6121 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34437 42 49M = 34250 -236 ACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGA ,6B'6CA-%&4E?#*%>5-192/":0E;@#D!/D-7))A6F=7$=+',A'8<*)=BG7>'+F1):9/B-5H9@$/98-3:.)EGH62H"5,!"%*:43A/7&#,G*/:7.,>&D%1*93' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6122 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8557 42 94M = 8557 0 ACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCACGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAG EH;&'40AB("D5;:*#2/C?D/CF(#B#G4=$C6$D$6;&'H7H< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T48 YT:Z:UP jpayne@0: r6122 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8557 0 * = 8557 0 ANNNGCANCTNANACTNCNACNTTNNNNNNNTNANCCNAGCNNGNAGNAAANANTCNNTANNN ""$$!#$$#!$$#$!$!!$##$#$$"#!"#$$$#""$#$$""!$"""#$$!""!$$$!""""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6123 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33899 42 180M = 34079 358 TGACATCTNTTCATATNCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTCTATTCTGTTATTTATGCCTAAAATAAA ;,*'%.:8HA"=2%'>*?!?%6E6B7*'-B=EC12D>C<:?;GAC/*+EG; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G7C135T18A8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6123 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34079 42 178M = 33899 -358 GGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTNCATCCATTGCATCGCTTGATTTGTCCAC 7>1+'9D$5DC5?85,B,/006/7"E6,@E8G?DE!F#?=+:5EH:%4A)A"F+3C8G14&EG"@A8"!?*8BH);%7/:.H&H(,#'53B:*4DF8E7%-A-#(.6E/3H(!$84 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:149G19A8 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6124 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18274 42 84M = 18165 -193 TTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGATGGCCCCCACCNTTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCG .6.4$1H,)!?#1>:50G<.;2=/'/5-FA AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C10A41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6124 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18165 42 109M = 18274 193 GNAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATNGNCCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCAATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATA ("'+')**$%$&)**&***$'%&!")('#&&$')$+"!""*$"(""**#(!()&!+&)##$"%$$#+($"($!%&"')#!'#%$+""+'%'#)+'(&*"'&%()'"(!( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G52T1A24G27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6125 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9182 42 76M = 9258 205 TGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCNGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAAT .=;<&4=#,8%F84,H=>B(B-<4$',.0E.1:?!@"4<,57<2<%9*A$-D51%B<+81>4!"2"H;;5"B(D:# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6125 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9258 42 129M = 9182 -205 GAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTNCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGGCAGN )*'!"''**#)**$#%%*$($*'"+***#"$#*&$(("+)&$+('+#)#'"$*+&$$#()!%)#+%'"+#%#!()$&!%%&%*$+)$!!!"%')*)#"#%*)+'*&!)#%&)&"+#(*+'*'"+#'*%" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32C91T2C0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15003 42 75M = 15078 264 GTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGT D56F0&"*3+(>'<'$2H25"D"2??A4F82.0B"$@:*01.B=D0;E$0=%387=36?6+/<'=EF*67"@.B+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15078 42 189M = 15003 -264 ATTCCAGATTGTCCTGNGGGCTGCCGCCATNGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACN 2'A&,26F)EHG><+$'D"36F)0**C>A@=C%(+8B+%%>@9?/!>3D:&D%-35&.9%F,)@"!E/-/894)+H?93'$%C1%.AC-26+C;1FBE2A! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16G13T157A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6127 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8589 42 150M = 8743 228 CACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGC (G9)"-$9&=D9:(>8C7H=/5BD8&HHD%:/H;+:8))-B6C/435$#GGA@(49=C.#AC'?&$!BB;&GD%!0(.$F$1!.:G-G>=/3@G$'B"'#'6)3'-.38%H7C0ED/8'4844=/2-,&40>5@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6127 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8743 42 74M = 8589 -228 CGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGNTGA 3C?@($7).!=E%*3G?7=.;B39B*;%7*?=<:3!234+BD7>&@;'D,F"@*B0.3.-/C//&A/A7>C94!$G944,%6*.>+&0@7#.50,()),4;E%B& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YT:Z:UP jpayne@0: r6128 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42523 0 * = 42523 0 NNTTNNAANNNTTANAACATCACNTNTNTAGNNNATGTNNCCNANCNTTGTNGANCGGNGTNANNGCCACGTNGTNAGCNNGAANNGNTNTTNGNTACCNNNGCNNNANNANCNNATNAANNTGANGNNNNANNGNNNNGNNNNCATCNTGNAGGGNGTANCCCGTGNNNNTCNNGAGNNG !$###"##!!#!!$!!!""#"$$"""$"#""##!$$"!!!"""#!$#"#"!##$!##"!##"#"#!$#"$!!$!#$"#"$#!$!#"#$$#$$!##""$!!!""$"#""#!$$$!#!$#"$#"!!#""$!#!##"$""!!"$$!!$#$$!##!#!"!!$##"""!#"#!#!!$$#!!!!"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6129 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17843 42 88M = 17646 -285 AACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACNCCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGN ,F$E*!C>/>5H&C1055%4)&;)@)D"*('#-2HF%BH.?(8:F(="&6&*)?#&;E#@08H:&2#+A.8&1.#E8H=?06<6B(7% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41A45A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6129 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17646 42 36M1D29M = 17843 285 GGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGANAACCGNCACGCCGCATCTTGC 6'F";E7AA$&8@8E5!&$D3FF#::;A3-#->'')F/!9!9G:90<2,<:(=F"H%FCC:<176:#"E==D2CA2,A)#282>2%@5<162;4(@EG(;D+B2?;G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6130 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29438 42 136M = 29314 -260 TTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTC ?6*?1%.'B'8FB'A<9(2&F23=B6H+)$@3H7&02"=>1$H'#-HC1;0C=B9%95-@"-/2EGD5-8!5E'C3"89*'13@G4.C<"E%#E2C'4'<1&.(,25G@0$+DH.0+!;> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6131 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2392 42 196M = 2588 333 CTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATNCTNTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGNGCAGCAACCAACAA *D%4E@"A0C4"@$B@+#1,EA;8(%F/8B-+5??$%DB=?9/$5C:D04@("B9=F2EH@1"C&3-0=+3G5H.905E$,D-%">@G6D,#*!FD!@13&0%H%H2*=91!&@#/525E#+095?2&.;*6)$0-1?4!FHD8H1#+;<-':C%HB-B/%,C42>#68:$8D)D.A&<(E@.,=4#;&(H,1BE/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A2G131T14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6131 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2588 42 137M = 2392 -333 GAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGCCCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACG ':>;&=0:,14.9)*H&8C-%,.(%;:@=B97*33(!G6,;B32F.>$+*C;-165G6B%%&(E6;9'#@0B**;@#)8?%;D3.GB(#!$=$AA+.4)"0((3!-12A:-H9760H-E7995B:>*%AG)!>,+.+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91A45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7597 42 125M = 7403 -319 ATAACGGGNGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATCGGAACGTCAGCCACCATNACATCCGGTGANCAGTCAGGTGC %!%#"*%(')%"!!(!*!$%*'#(%)#"$'!"#)#'&+#%**$""+"$"$))!"+!!'(!($&)*'*+&(''(**(!'+#&+$(+*&!!%&#(+))$*'+&*()+%!&')%&%%'%)$%)*"!#+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A74G17T11G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7403 42 194M = 7597 319 GGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGNCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCA @2H$&"("E13A4%F324+G,%?$4+6%?B(B7&DA%?,$-@)=02BD555E4(:&@%4#@FA0;'9C*2=&@D&/'C(D0==60:3F)6?:*&-*3492%<+"!ED73D$?;#$-1"(7:'#'>#C,=34"A5#+@0((<-HE<#%H6=+@)&2C!F155$/2//*"#H73%$4H-(!#>+'/5F'H4#$H1? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:111G82 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6133 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27457 42 52M = 27509 231 AGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGNCTTTGTG 92F.&3)H=:,+,7(/+"',B?0!".>>27,/7-F?BF3BC56($$G3,1?% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6133 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27509 42 179M = 27457 -231 CTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGANGACAAAAATNACCTTGCGCTAATGCTCTGTTNCAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAAT 14+0EF/5?(2.F7,=F"E"?5&B0AD!:FD$CD9&FB"9C>'FDCH3!4D%:81$F3>�$H#<,B).;F454#8-B'.5F/=?CF<(/5+6=F3,A:;2>,D%4B'%H=37:"07-!:'=0&/!+/EF$A0A))=(4F--D,$H>+B'%73F6*=E:7E0#$E@20E-/66E1*G< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A9C21A100 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6134 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45769 42 74M = 45569 -274 GCTGTGGCATTGNAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAAT *?8F8*:*)#'%#6;0BG.38A54;1A9$%1:C6"#&.=4#DD)*-.+%"'+80*>A?5#*-!0@'=G5B?4/2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6134 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45569 42 72M = 45769 274 AGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTANGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTC BH(2D=#%1G0%=H.;85EA$2?A3H.G5G=7B8;D(#$EC579(*"&,$DB#*'6A,-H23-?A@9(0-$"F"(%:1=4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G13C5C22T31 YT:Z:UP jpayne@0: r6135 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27814 0 * = 27814 0 NTNATTNGCGCANANNNGTTNCNANNANNNACCNNTAGCNNANCNCNTTCNTNNTGNGCNG "#!$###$#$!"##!!$""#!"$##!#$$$"#!!##!$##"#$!!$#""$!$#$"$!"#!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6136 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34810 42 76M = 34886 221 CTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACNTTAGTGA H?)AG?9-99>!>@";5=>$@:@C0H<@,0E9C?@!$98+:C$@EC4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A65A7 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6136 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34886 42 145M = 34810 -221 GTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGAAAAGCCTATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGANCCANATAATATNGAGATAAAGCCAAGGCCNATATCT ;!B!#'&G=".?(E5/D%%>G8<3.D"5B&C;H4B6-"#:$)G%E-424G:*1-"=E(10)D:,4"G1#7%;"+/>:,H!!*'1=G)CH;"#9-":,-BCD9<=1G<'23D99D=G"#?B9-=1,?@F*7!F9<;CD9.H?81%) AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:34T12G5A54T3T7T17A6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6137 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22814 42 70M = 22639 -245 TAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTANCTGAAGTCTTTCATC %H39262(.!)9/(<1(F%@>#=@&0;924;;9?$;4@:;(=&EA,!"F<4G,>2":@,3G"A=F)-$+? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6137 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22639 42 76M = 22814 245 TTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGNAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACNGC +.2)*D6)E%4:80AD+E4/:2=8/45@(3;?$B9(04E2)/6:1$8)A*8E7+E,!*2'!:.',B)> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:129 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6139 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27134 42 64M = 27288 277 GCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATA :+@6;@;5!,(%F&D=&2%BGD1/'/$%:;#,3)01/2@:5:6+3,F@<"/!6(F7-;&4E>2? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6139 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27288 42 123M = 27134 -277 ACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAG +?&=56H/>6#CE7#)D7B3,7'(-?>B7AH6#&H.:>664&:'7(3D-!;GD?F)@C/>=,%,B?%(0H$GC)!.D&72C#5,+-<*E7)53)A#G8)&HG0/0?=>*%;7!.C!*:<3AA::G%-/4:3>#$$,*!$:G=%))F8#9FE;4AA?344H+"#A;89;CB<%!H4F4>%C'6@6+H70%:7C,:C< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:141 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24786 42 18M1I29M = 24904 259 TCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAANAACTGATAGC A;.5A%G7309#"H!'!:2%!C+B:+?8/;=*H"08D8,GH/8(HD3< AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:36A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6141 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9648 42 127M = 9460 -315 AATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAG #$06B1%#F98*"50,#6B"%:DFE7GA"5=%$G2HB1&2(0#C7HB-40B7'=4$@G+/@@,!%@"0D+7-;,38C"G!4=-C?,88B*5:=61@AH8,(/<0;G'502((B*F2!5':@6D)5?3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9460 42 188M = 9648 315 CCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTNGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGT 821,G:%#>..8;-*011*42)60&=>*:B3-;@H-"G42:C7?+,+*5-*+!H%&=!A>;//77&?4!.4CAF5*@%"'>.087:G.1#/77=-,$&+8D&+?!(5573$2?F*@0G47,&F;'$B0?$?G9ADF/.##2<-5>45(?HE1'*H.5D=&(3<1F&4: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151T36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6142 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 64 42 110M = 273 253 TTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGNAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCGGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTT 0?E(D20,@C,?*@)C&-"02?H,3H@%BH6.'286B?425@6'$7C"46756F+"2.3E&9&2@!3+'F;&6=?0")=7(8E5D"?G9D1"B'A7:+9%99D?2>@:A9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52A35T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6142 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 273 42 44M = 64 -253 CCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGAN ,%137"!/&)D$*+*&EB"758(/+H,572E&)G=1(*2=1,A" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6143 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22028 42 48M = 21809 -267 CCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATNCCGCCTC =>.+F!$G3$>A+G%*G$;#C8F@7;;GE-FD-/8"@(=@9#!,>&2) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6143 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21809 42 50M = 22028 267 CATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCANCCGGTTGTTATCGGTGCTCA '/25=9+4@2C>16#,4A->8@B6?HG:;,$7%5*" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6144 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37341 42 66M = 37099 -308 ACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATC FAE#'15!@99"0#>09*9D%7+3+=#$0/@$CH0.&6<#F#"#"A#DD896.*/H#63@@5%..-+,!?2?2,B<$@$+-*(BEE39/@,'?40/.60D)>B4><:3!"BB&;?2C+E/0*H;>G7G) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14484 42 47M = 14269 -262 TGNCGGACTGTTACACACTGTTCNGGGATGCTTATCATCTGGCGGGG 7,)E%*>(25&'D4$;!".'C*&AG,H9H/)D1./HD=15#A)(.$D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A20C23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14269 42 80M = 14484 262 TTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATGGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTG 6)"A)=-*-7$1($D$?=<-1@C0H,@28H,/E,")2%-<4<7!*:8>B'3F:B45E#E=%$HC3,@'&203%=$;7AE, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6147 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41792 42 102M = 41894 323 NTGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAANGATAATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCT #-#-:.#G9/245-GF6!>G8E91"?9%;,G*F&A5E7="$<8=)(,/1?A)%#/.2+;=@D)>7=;@H/C#;02>+076)54-,..BF"19B?&2(#7$&G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A37T3T59 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6147 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41894 42 68M4I153M = 41792 -323 GAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCA 9(E49<)69;C5G.01#)2%G#,-8E#9+6(4<%8.<+6.5;0D6@!**+HA)#F2&7>"!:!&%)H!0;)F%A.>"FB9"&!.'1B7-7%;!"?E3@.>D"FF-"19C=+124%A$%F<;76?F3<'7#92'90'.+C:<)AH>H%!F!0(1E%,71H>&7H?"H"A<'.GE(003"=> AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:221 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6148 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10573 42 137M = 10464 -246 ATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCTCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAG *C4'.1?B-%CH(+G!926%;)!(FG&4(5"<(!'80'41!5+E,)4?;7B5@GA2G90EB=5$;9"'5&E!22'$/%<'*E''>,35*)G1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G37C57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6149 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8203 42 97M1I133M = 8433 315 ACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGNGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAANAACCGTTACTCCANTGATGTGGTGAAAATC 2=+7;3409?>7&;H,/?.0!>"D$E3AFD;0<(:"19<,#E=%=365357?;,%C65:.H(;3-9'>(C4CB27G15;4(F=.+/%'8?#4%8>2G3!;2@8+;9<+*1('8HE:%8@)$=-F';+&-'7B:-//(-F-!C#/;F333=4!-@(#?5(D;H4'#2*,DG)EC0 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:117T81A9C3T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6149 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8433 42 85M = 8203 -315 CCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATG "$?/B65C7)!F52(C$2B(D8=98-*%,=9%1;!60>C1;D/66A(333E74?/E"H%,(:5"4A!@/G'C4E(+;(02!%F.( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23947 42 191M = 24138 280 CTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTNCTTAACTGTCNATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTTTGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTNGGCTCTGCTTACACG "<&C*3",%B/H106@5*@026"1B780%36C,?H:&E4F*DG)'65A16$>FF)G69G69'85/#6'(0):E!<-A)<;;9/)*16?!=6"6>/E0876%@H6D<5!C?9.D0F0BE#="/,66H?F!0AG8*2)7),?"2E/E(0AE:@38BE-1D3!.0*0*5&=BC%<>;0H>8&G6(B@34&G;7. AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:38G10A100A24T9A5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6150 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24138 42 89M = 23947 -280 TTGCTCATNGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGNGNGT (""#*+%'#*)*#'%(***(%)'*"&'*"#)$"++(())(#%&#!'*(*!)#&+!)#$!$#)"'(*'&''*)++#$*%$*$$(+"'"$" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A75G1T2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6151 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40666 40 42M = 40708 250 TTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTAC )H&8/?2+))-%')4)A8*0B;B%++9;4413+,=(?=H1G. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r6151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40708 40 27M3I83M4D94M = 40666 -250 AGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGG 7&2:/'/9#6#6CH6;H=4*$B(CG('1.:&'&,/D<4A(9DAA>8-@=8*/4"##$&GD@5A?2$4(&3"%H#2(H64($&BF/59)<0&/<=EF/1<;F>+-D"A#)=:G-F4B62%A.!6;55(<;F$FE#F2+'73.41D$<"6@=G9!33.F"6=@9=5C<<%3&2<.0'5398;CE<*3@-9DFF@43?&2@1B:&<5!78 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:110^CAGG94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6152 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18899 42 50M = 18744 -205 TCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAN @6$?#3(24$7.(91)=2&@,:'G23FD+C%*<.<7BA!,>0+CG6';D! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6152 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18744 42 72M = 18899 205 CTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACNCTTACGTCCACACGGCA FC:8F=%0/1E=7/?'&$H;.":8EE;+B=671A(5/&FG*A.?&B*72F37G<((D$9*A3!5AC<&7.>- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6153 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14938 42 46M = 14708 -276 AGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCA ';G7EC50"?78C+D=/A'+<*>EC$2?/A484A'8=2;/(3!:$G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14708 42 50M = 14938 276 GGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGA @HF2DBA3)9$"@97:D(F/'+6'C(0<;#=.E:$!@-F/-B1+!2G?-$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6154 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4602 42 226M = 4828 383 NATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGTTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGNCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGT &B=@0=@/B%*>)+F"?%75.1%$G-8&@2+E,*>$".4+4?,6+:A3/?@F.8'86!43'F"721(!=&,=64-B11024,D052#C#<0-12E5:E'897=?)B3')HA!69E!24>,+':.1H'GA87#G9GC7@3;,))@EDG7<;A>,()1H!"3+23$$A;1F3B?CH(,$$@4*<&H8*030;;)D'.A<'E'E1-+1054,3"(B2$%+64<&$D3+? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C85C77G61 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6154 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4828 42 157M = 4602 -383 GGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATACAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACCCAGACCGCCNGGACAGACTCCATC D18E:B2$C4-,@(:(@7E<57$1.)7'/,#-);@#5=A>!6#./-G3C=*<8B>!3/>B;28C=B46:B7H/1G0H+1@$G#(F#+7="405@'3G'3';*,6/HBCB19;E-#%@!/63&,"3:00=6('F7>5'>)0&&151C8 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:49A82G9C6G7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6155 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35242 42 378M = 35160 -460 AGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTNTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTNGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGNGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACGTTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTTTCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGNTATTTATGTCAACA ,B;9C?&!#0#DFBC><0.#"4<4FAH(0?)#B*'#&1G4B-2*B6ACG6"G.2.G2>3:#*001"EF@3-(B7B@6D!09BB3&:#E8"%F8=>E.@C@7&>>?660.62098A+G-#=B'E;>36!E?A45H+!43"B<;&*?'$+0:57E(++A877#HHD,,5"DA-109H%$7)=E=9!;47=6.B7G.F6@@90A>*-5A/5A6F5*G3$E!2+D'&$*F'?@#"+7A6DB!=A=304B!E83##;!,4>9&=:7*$48H4/0"9*>;&,5;6**:5.+#91#56+*<1,=C1D5A;:EA88:61*9(E&,(&>2D/.$9D>,.?!=G$/H3 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:63T57G27T45A47A119G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6155 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35160 42 82M = 35242 460 AATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTC .GE;A,7FF5&";>B*++38F?1D(8>-'*>2$'60<91/9G#GC.$0G*C&261;0?C!?'>F143A(124'$1H/C"!9% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6156 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32830 42 51M = 33046 256 CAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATNTACCGGATGTGTT +'+*")%*)"$*##(""+$*$!%+++%!#)'!$'+'$*(%')%%&%$++#& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6156 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33046 42 40M = 32830 -256 CGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAG #5@)H+312;4DHB6=&(G,075+?FF'784 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39466 42 29M1I114M = 39609 268 CTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTANAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACCCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGNATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTT &-%E3$59:?D0#?H#F0#,5?F4G>2+&,":E.21.@('7CF%-&'7056#+'1*00.CBE=-H=&,>B,/-&83EH2986:H;.7(/7!@)24,'=@20;%)#%/F!%<9/;1292BDA=0:1=30E AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:19A6A0A1C46T34G31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6157 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39609 42 125M = 39466 -268 AACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAATTACTGGTAACTCT %%('+++&"&$$'(#(!'$%%+'+*)$*)""+*+)+!)!$%!"%+"*+#**%$%*$!%#"%"(''&&*'*&*)'!+"'$('+!##())(($%%""&&(&**$(**##&)+&)&(**&%$&)*"'$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110G7C4T1 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6158 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14956 42 84M = 14848 -192 GTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCNN #/&(C-:G5;1%(F7D;6/:CGB",:2!%+F56B!&CB95+E&H)+%C7'=5%41)F-7:''$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G10T1C17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5447 42 111M = 5256 -302 CCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGGAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTG 9"!BCD65#9=4<@$>9;;=7-3$3%4-:0*-)&4H,-$";"5%B=> AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G4A28T41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5256 42 60M = 5447 302 CGNNTGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCAC )&"#+)&*+($$#$%*#&'&!!*)**'!$*%+#)&+))%($+*!"+$!'!&)#)*&!#"& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T0G0A56 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6160 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13150 42 60M = 12997 -213 CCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGCTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCT 9H?E2#8B6$+%B!F)+;""BE8@;C?291%7%><7*&!-C*#@H)0*&635(7:!.$4$#6,G<4A3FC=*>B>3-61HH4@&=-;2.G6.DE7=<)..D3>:4($?%5C&A;HCD&.6E8#%G/5:31(<4/B.;&&6GC%"B!(;19;97D6;@@"70?,7,<=259F.*:5*D4:+%,+G7;;@5+-(:5:*!E3=/C-D!G,5)AB/E(',;=(G0#,@9;A//%,:1/B!C>A'"151A#)"#C AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:78G0C63T29T45C37G20 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11055 42 57M = 10777 -335 AGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCANTCNGNCCA "*#""$+&"(*%)%%((#$$%)+(#%)%*)&(#&)#!&(*&"#&+)!!+*&$%$%&( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48C2A1C0G2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6162 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12897 42 72M = 12722 -247 ACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATT (15"!,>"9<>F?&+>25+89/;:F-7!8G=&7B":>'3GH!#15"2>.=8!)06'%2@(+7&C+;A-3>EA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62T9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6162 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12722 42 70M = 12897 247 TNCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGNATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATT )%25?=&!;,B60B#G6A8>E+2*-!C49(5>;!1BC>1)@3&2.9*>$/B'=E>'&C!;,-8"F(H:!6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G27G40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13090 42 143M = 12988 -245 GAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAANGTACA F"'$F9%G)E>69H-8.?8?0.73;2*&1D!CF30:;6-B9>G7:$B"6=>81)=.F?B./CH3B"A,;BH0(E"6:"3C@?BD?E:D<9E!45)<*"4>?19<@1%7@;8?(-*#'F=)B$)=>G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:137C5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6163 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12988 42 73M = 13090 245 NGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCNGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGAC '$H207**(="@8+#8-82?"0#0G*3HD*9A$"C-+*)H%)4'64'A@.?F;+19.#&*-;:B,:1.)&):! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G27G44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6164 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47229 42 91M = 47411 240 TCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTNCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGT +87(F('1:*&((236-)@B"="HD.@D(GD5/3&C/1$@.:/G'G#BGB#;F,BA$H=)"/*(-#049?4)2%!HH+5=&G='"<<8E2' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6164 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47411 42 58M = 47229 -240 CACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCAN H<;5:;#),!(&'4$55*(&0.):7/F;D+><(1!,%3?'9:B5*-)1E=3:16#2D" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13998 42 76M = 14074 316 GGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGC 0G/..8.3<);B4-20G@5*1%C&(5C,50CC4F;5E7'"FF4!7-<"/B6?: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14074 42 240M = 13998 -316 AATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTCTAGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCNGGCAGAAATGCAGGG /(%2*HC4239=8B9B6C'#?7G%4!!!"69:$="#$)4<-;"*:F.2&0F9$"79.5G>4!."%CG%&-4":=7$(>'A>%*$;)''<5!>H8$41"C"8B/F!FH&'=1/86&&$4+="F7C%"0%*?5:>A3A58&!1D%7E$E+G4DC%*A"9"77.:0G-8B'5/7=")4"0C4=%2%=:(.F14)>%>200$(4A&H;%+'<$>0"#6B*0)-FB-H<=2#0+G6;!%#G,817 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44T1C177A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6166 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22523 42 64M = 22523 0 ATANTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTN ('&!(%+%")&*#%((+**'%("%$#"+()"+!#$'#(($%*+"%'"%!"+%$)&'!%&&"($* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T59G0 YT:Z:UP jpayne@0: r6166 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22523 0 * = 22523 0 GANNCNACCNGNAGNATNNCNGCGGCCTNNNNNGNAATGCNCATNANACNANATTTNATAANNNNGGNNNNTNNNNCNNNANN !$"$#!"#$!!!"!"$$$$$"!""""$""!!!!!!##!#"!#"$!#!$##$$$!#""#$"""!!#!$#!!!"!$!!$"""""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6167 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8575 40 102M = 8575 0 AGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAANCGGAATTGCCGGCAGNTNNCANTTT &'#+$(""%+(*$&!*$"!*+"*(*++&(('%&&('""+*%$!!!"&(+''&'##%!'*')&('*!'(#(*'+#&'('&(""'#((&'&)%'#&#!(!#'&" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:75G0G4T2T7T1G0C1G0T2A0 YT:Z:UP jpayne@0: r6167 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8575 0 * = 8575 0 NTANAGTGTNTTGNNAGGNATGNGGNTTNNCNNNNNNNNNAGGTTANGNNCNNNAANNNANTGNCNNGGGNNNNTNNNNCTNNNANTNNNATNGANNNGANNNGNCNGGNACNCNNNNNGGNCGAGNNGNNCGNGGNNANCCAGTNNNAACNGNNNATNGNANNNNANNNANGANNNGTANCNAANTCCNNNN "!!"$##"!##"$!"#$$$#!$!"$"##!"$!!"!"!""!"$$"!$!!""$!"#$#$###"#$!$!#!#!""##!"#"$!$"!!"!!!#!$"!#$"#$$#!!!"$"!"!##$$$#!!"""!#!#$##$"#$""!"##$!$"!!$"""#"#$""$!""#!$""#!""$#$"$#$$#!!""#"!"$$"$"#!$$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6168 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14015 42 194M = 13901 -308 CAACGTCCGNTATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGNTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCNTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAA 2#90F%9D9!/%B1":#=(;G4/'*D(!A%C9D8F*;(A0+&A@+&7E-8)."%6."H/(=)%D+(-=$')4>HCADF;.;!/2#(*B6F*=6(DA7*#)F,"FDDD93?&H=":4,E<95=#E-7(%0(40'E')EDH)B/DC>CE3E,CEGF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A35G41T106 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6168 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13901 42 76M3D22M = 14015 308 CGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGAT >-20;55>F#0(DF<%/94C%?$E'$#D36"'19*<2+>9*8-H6E&,H$5D$/#$G1*$$5;C.#+((=E$*9002C:9(($+,%?A),C5)&$1,2 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:76^TTA22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6169 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12028 42 41M = 11814 -255 GCCAGCAGCGCCGGGATTTNTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTN 2)!*2/&4;H'3D;/)H"H>:2?4E3ED+$36AG&7BC9F. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G20C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6169 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11814 42 44M = 12028 255 NCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCT #8#%2.8$;1A1-!8G2GB8E7'=4AF"B*8DD;9$F8!("7FF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6170 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41981 42 42M = 42263 340 NAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTNGAATC "F80*/<'46G:)8,0$6*/52"23,*&%*G)G((!H)!)$* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A35G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6170 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42263 42 58M = 41981 -340 AACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCATTAA A%AA3<*-!;)B2*#*4)27C6)-D4(=.1179&CAD)=0-==H"=B$H'#*68;6)) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6171 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43251 42 60M = 43410 270 AGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATG %3"1,8=?G>+6H8F8#FB4E4>*.2B)C)+,,<%5"?*>*(D8=!B=3+?=/H#G)CB% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6171 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43410 42 111M = 43251 -270 TTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCANGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATNACTGGCTGCTTNATGNCGGTGGC .:9,%>5-G>6?/74'&G;94G73.$GC<5#55;D"9-2B&!!9.7@8(3-=(-,/(AG!+00+=1,8BD9132",*6G2.:.50('=6:*@78@)!8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41T45C11A3G7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6172 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47522 42 43M = 47255 -310 TGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATCTTAGG F3$ADE.!"4"6=&>F?=1C)C)C:4E/3)%).!7HF/035!- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A5 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6172 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47255 42 239M = 47522 310 TTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGANGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTACATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGNCAAACTGAGCCATTGNTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCA EB&0?.#57@7=%&293$$*21@+"D>*5'*H?E9&/=(=D/';>@F+;!,#?*7$26E!:@"F'6"4EA)651*F!!#G81@D=4GH/'BC9!('A&1/EB)6@!G%AF-?3C"DH;B!!F@3*@9>:'@0B1#(FC*2+@-#5:B9D<8E%'+1<"6=2/*%46$6$81>H/B3>9,7%G-%E?.56=9C25C9C)06;*.7 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:104C41A37G3C11G38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20861 42 65M = 21074 296 ACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGT <%<&0>F#%C!)FB101B$7,8$-"EA"3$7F9+4653!$,+3#2@F,G?/B@*28 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G12T46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6174 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34415 42 47M = 34203 -259 TCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTANANNNAGAAATNGGATAA "&'$&((&")!!!#'#&!)*++#'&"")+%*!"&$)'#'(#&*((&# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29C1G0C0G6C6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6174 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34203 42 183M = 34415 259 TAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCNTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTA G1?(+:1@68$;>G8@#447@/C1G<4!#78::)A1=H1"31>7>+%AA,-H6E=>C4:*:/(2D&7-&"7/309/7/34<1#9"46(9E)=>6-,.,=8'C$)6"4?#G%;*DF0"B136*01'>=06)';%9*C(5&D/*C(=2?!H6<8AE8#*>5:6)B987A-=64@#-"95.EC@G' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:137T29A15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6175 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10601 42 110M = 10762 282 CTAGCAGATGGCCCNNGTNAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGNCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGAGAGGCGCTGNCTGCACAGA (*'&++*(++)#'!*++"&%&&'&!&)"&'("%)#&$(#'&$%'#!**%#&")%"*#'+!))*+%")''$#"$++'%($+(!&+!*$"(*#"&&$'&*+%&'$))'"'"( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G11A0G0A2C45G26C8G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6175 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10762 42 121M = 10601 -282 CACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGCGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCT 9,CE*!A;'>@=?A+%%7(@)3>BDG@HA,7:5(H5A/';0>846=&E/,@+7;HDCE0A#ED2D",D>9'')3)$0E$?7='G(#&;*F?94;FD!<,;+#F()!/,5@$E>!!>:<>(C@8&55=#70@C5<,E" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r6176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20577 40 120M7I22M = 20410 -309 TCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATNGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGC ,F=C+E:)#()14<064.(@;=@7=.8)#B2'H(H22>&4)=&-6,3=A$/)0!:A6@A:9>":E:0A3#2:E8@?0FH'81-%F8$$"#6-GE)'*?#.F3;:0D6>@'!D:(2+,"4(=HBA+7**"H:;:, AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:113A27G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6177 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3464 42 48M = 3690 266 GNTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGT *"*5.E!/%745>F7?8=!".?5"//F<331@,$5E64$$*=//1.<.%%,D-=6>8#=E+A*B)@$@/%=7;4-30(BF8=6'2A0?&<04 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128C8 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6178 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6871 42 66M2I87M = 7024 290 GGNATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAGGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGNTNGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAG ()('+&#(+$+)&&&)+%%$"!%!*)!(**&#!*+%)%&)$!##!%&&*&#'%$#+&$'$(%)%(&"*%+*#!!(++#&'!!')+#$"!*"!*(+++*!)!&*#!*)*&+()%'$&)!!#&'''*%+$&**&')"%(')&$#*)!%#(!)")#'! AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:1C0G51A28C1G67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6179 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23684 42 337M = 24021 419 CCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTNCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTNTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTNCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTT AH$"<&F''0*&('5)=0B66*$$)&:::E27B.$/"8>H=B*015D61HE<18)'30:G#3$E640DFF94'366)';B/7="7(%7*EF2>3GG69/@C&A.$3670:/A%)79+7%'H;><3:!)$2(4F%D?.@8&6;.B@;.@?:/*#%$!%%B?7-$;)(G1(9'5!>2C.&)1$43&F/9993*$)A=686F&#F@/0H'''D11D:8<%=532303-13F/*;"8=7"8G:@8('&8?;%!%4(-E#/'5/=/=>8*:8!<@#%<#*)H&(F35&E+%=73.,;):(,B/8@67-.5#@:0?*F< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6180 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44098 42 214M = 44312 333 GCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGNTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTNTGCGNATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGNCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAA D+9/*11<./.:C4!68+C800>D!5'!."@D(?!@;7&A'"(<'8%,36D"<,/0;81?"(CG?57E+54/%?5)C'*5#925(AD'.F&6D">G#!(A;(9+1A?/>&DE"$?;H##H>+2/:14">E$>A&%8E'7&/)C&E9;6DB8H>G:*1#EF6'."9CB:5D&?G9C7F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46C51A4G57G52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6180 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44312 42 119M = 44098 -333 GANTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCNAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACNTGGTCACGCACTGTTAAGCN +'()"))'*%%%)'#*%&")+(%*#$&!%"*+*#*+++)")%*("#%!*$+#$!$$)&%%'*%&(")!#$"'')&'&('&&!)%"")'!$!&*&*(!)%%'++$(!$)&$%""*#+)+$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G41A53C19C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7531 42 103M = 7406 -228 AACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACTGAGCGCGGCCTGGNCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGT 1:G3.=0/726.6+*B5;%4;.;:<&%+1=+/0=4E?")H6B"*3@2:9/&7H*F*=7-HF8/;-F%6C//H2:!*4;HG4.>6@:3.6D;#>-# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A13C46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6181 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7406 42 95M = 7531 228 TCAGNACGNCGGGGTACNGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCAATTCACGCCACGCG '&"('$')!#&(+#%)#*%+()$%(%$'&"+"*''!$(#&!$&(+&#&)&$+$'(&')$*%$"('%%&&!"%"(*&'*#+&*'!#&!+(+*$'"& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4C0G1A0G1C2A3C63C13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6182 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4977 42 160M = 4826 -311 ACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTCGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGA .DG50D1G/%%E,3.?"7=E4GG-:(3:%EB#7:>8=)8@F,5G%E3588>#:C+;@&'@%6F1*/61%:30-*,&.,4;$'*B4"5-+BF3"((+,137,:.$<"?0-1D;(,C".4DC->8@G%4+)F2$,!(0D.)C/>&/>#%,BC"=,*=2!/.' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G96G62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6182 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4826 42 151M = 4977 311 NTNTCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCANCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAG !)(&(*(+&"('*$*")%*!+*%"*%"""'+*)!"!+$!%"*$)%"$#'$*!&!%#"(+"%!)%)'**)'%*()#)&%%(%*$+)'+&'&)&%')"&"&&#(&$$#'!!+'**%%)*!((&#"!"%"%+('"&(#+%'((&$$*)++!#(% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1G0G27T119 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6183 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45832 42 52M2I31M = 45674 -241 CGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAA 0.EF$H>E%9!#2FA&A5)@=.B;<+4:<8"B=$'#=-;C@CF38G<%"98#3=*6>::*ED(A.%:AHD/=)/=/)@;#/;+H$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:82G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6183 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45674 42 158M = 45832 241 CAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACGGCAAGCGGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATC (*#<,=F+,045-,$CG>HE84<,!.'3107:4-$-<>.!$39?<"5C74)?GB#H+.8!AAAB74-+, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50C6A100 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21915 42 75M = 22047 201 GTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAG =DB5#/$/=!%B6G#928,B%.DED?D*A:#)5--,++723%G'$+8B'C#*C1@92G2:5F"843+;:-@.EE.-6;H6,D.FC4+$+,2"55"!<>BD'B;F'19.)@)&1!A!983FGE/D'97 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6185 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40208 42 137M = 40345 315 TCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGGAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAANTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTNTTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGT F(?;0"$;*53+DB<3214HF2.?4?9-!,9)0H@9?/59HG9-6D704(:!"G$!FC-3A4C".(B<#0);=&H!'>A5;(@-.7"?"D()=-%*(4E%E/5<'/*,@@9*?>H<"-#2.<0EFE=.->),%37-7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C35G24A43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6185 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40345 42 178M = 40208 -315 TGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGNCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGANGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTNAAGGAGTGTCGNCAG B,,4)E"5-4..D#5*85>F$='.&%1@4=D*>0BD+H39CF4%?*+(7-@3.A,G@;-.&!3?8A1%%E)F)#9+;#>>$8%%,E5BE"DB#;GF/2)&;C742/;2H>32>@,=!#&2=D*1*8E"@'-6..:>@5AH'CG,(1<'+;/!/%3@3,&-177>8".D;G>A)#=3>%)H$#1@*8204==<7>H-/.:@?8,#G!28A+A"84354&&5)32A8H256@;&@%3E/??C1=2"46D0#F0$=%=0F6-C32(+@&&)'.6H+3'H$;),7%0G4$9#'.*&%6:5&!D),G%55--?/(&*?-=;6D0 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:13G141T3^ATGTGGT6G11G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6186 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36536 40 83M = 36619 272 TTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTANTATATCGCCAA *:<3&>E49:%@03.A>6#6!?;GGH1B48H#G4H?:'?->F+6HGF+8FC6*2$%@?,D&/?E2G*:A?06CCEG,FG6(BE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71A11 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r6187 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8484 42 164M = 8395 -253 CGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTNAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGNTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGAT C/>#@.7!/D1#ED/E:H@&9$%1+#*.6.C3"!80!/@6-3.!FB>/"A*A3EG'G$?8D):E'//@(;3DE")DF@;#,FD/F4?8C":055HD8"GB$E04G4-'>%%(E%!5.@56879/0DF#H4.3&;AC?:H@@.4""6F884B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50G83T29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6187 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8395 42 45M = 8484 253 CTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATNCCGATGG ,>%H.#0:2H:47'H'56'!3-%/9?(8/)G2%<'CB?)<"E>4> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18067 42 202M = 18269 369 GCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAANTTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACNTTATGTCGCGGGTATTGGCCTNAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGNCAATCGTATCGCATTTATTGACCNGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGACGGAGGGCAACC ?))EB,!A(.;-+#=-.#B:&A?,/B#59!@;'F#)7,+F>01=C)G&.7&'3:0.@B@7(%G?6G$<<9=!<=?=23=.>'7!/("E*/'-=02(76,2D:5.5H$6A!0+&=GE'A: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:36A24A21C49C23C31G2C9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18269 42 167M = 18067 -369 AGATATTCATGANCGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGNAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACG 3,A$'7$959#$&6EA4G8F;9=8&2DAB8#&GBE9'.!C)44)>8<%#)%5.3+?'2>+/<%5';H"7)!%::.8?85G5)B8%E+,B,F45$:,:F=$EF':>DH;&71H6:;BD4F$0GEAE-3C-=:--G;3D8G.0:%&)83"!A54DF#3>6,.H((,+;,04-,?>./'A+&$D#+,792#D1BC>C,7D30C=G0:5;#2:3;"H'1#D#"2BA/:<*.EA9)*6F@)8'88;%.F:-!E:H<%5+EBH;2B?=74A%B+F7#>*"DH))+;=H!98>F5?0H:BB:>"=,>3**%C9A7-=26G1-4-40+3,#C3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:101A62T79 YS:i:-21 YT:Z:DP jpayne@0: r6189 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15891 42 125M = 6 -16010 CGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTNACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGNGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTC %>H9=9E<0BGG1G.)F&%&'<+<""F(G%,%,+HD/:'*2!CE"8-"0@@-G@G;,H&H;"'>E(;)<.*!<;HH<;D#<"(!+>"A4&<7)*7B0@6?:+D:?-="E:18D*5;&3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G49 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6190 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22346 42 57M = 22495 237 NGATTNCTGAGGCGNAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGNGCATA !#&*&"#!*%()%%&+"!#$'"+)%*&$(!&)"()!($')""%(%%!&"(&&(%)&) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G3C0C0G0G6G36A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6191 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10893 42 67M = 10700 -260 ATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGT A-EE3."9,$4".20G5EED7//G+2"&/?"@,C=?09510E&)5/%@6&&<**$20(+E=A>D:9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6191 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10700 42 72M = 10893 260 GGCTNCACAGAAAGCGGGGATTNCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGNATGCTGCCTGCACAGTTCAC D%H:'E#0F+"+0-FFBE$#/B.F03CC6F!=?6<23E==#%<2G3<##>=%;4H;7?!(77)#F=5FF+37 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G17T28T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6192 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40116 42 44M = 39987 -173 NCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGANAATTAACNGTGGTGA DC#3;.15.!@/>-0*)+/D>F4!$5B8%#->*0GF=;2,+?>+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G27G7C7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6192 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39987 42 97M = 40116 173 AAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGACATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACNAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATG EH>@F1427.5,C(+#EE!')7905?;'9<8.@'CDH:9BABD3FEA"6<,CE;;51"0B=24-!2565FH35%@6-(F<0?38+2.G&);/4$7,+=3:=5+>+58$&0=,<<1A&)&)*(6E.('6A>!&7!,4D$'3@;9C.1:A(9C&";2B))G<4&29?:&;0."33%#*=8:H/BG#G*:"%?2*,!<"1,70,1>"B)''D!/9BHE>@A>HC7:,*>D$07$9.$4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A115 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19668 42 72M = 19449 -291 GGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGC 4&$)):9+=7<%$=4'2>09A/:2<>:7"@=,'%7;/?;1.!:%+3/2>H+@1#A6<0(..F%!,<,898*? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19449 42 219M = 19668 291 ATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCA <=B5!C+$B#"D'?=:@('GG$/=4%=GF=/-14C;-%6=8$D.:@1(DE.;AE)"A"8FC,G*"6!1&C"28?7C'H-:*H<"54;/5B@0C?&82D(CH*HB+H'68#(+DA-?:7'+)E9:3%?2>#'".8B"1G1&A):,*!&0A55G078AF$EH29;GBE*A96"&+27)7.812,FBG)8B@!+B2)"9F-?42$)(E+*>6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G198 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6196 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33060 42 86M = 32891 -255 TGACGCGCCCAGCNCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGAAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCG =12<#;(:@C)8-F'/,B>F92$.!!43,>,*F=;5(4C6>9#.((-;E((FA=#2A+@GCF/@H>0?&),)7"12@'B1=),>)1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T25T46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6196 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32891 42 65M = 33060 255 NNCNTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTTCTGGCCCCGTGGCATT !*'!"'+%*$+(('%)+&*''#(!%!)$$'&%$+&))*')(*$(&!'!#&+&'&)&#!!$+#!+* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0T1C44G13G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6197 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31327 42 136M = 31219 -244 GGATATTATCGTAAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGACCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCANAACTCGCCATGTACTCTTCATCCCGCTCA *%")$**"%$%++*)+(*&$(#'*'""$*'&$(+$#%'*#$*%%""&"#(!$)(%!!")'%!(#!(++%%%(&&(#!+$&#(!*&#"##'')$#*(+!"()&%")%""#$&+%!*#$%**(')&&(')*&%!$+)$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12G57T35A15T13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6197 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31219 42 106M = 31327 244 TCTCCTCAGCCGGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTAC 6%3@:G..%8F#)3%'<*@4-;<=1D&8*3/5ED(@4*-#H8> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A94 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6198 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17004 40 94M = 16816 -282 CCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTC #&2<>5:2!=7&5=76,,9:=63&4"/@9$*D0?G.>BG9)20G=)=41$E%@.<->?!*+-)5/2"+8).(*F!8"FA1F.5$1;#F?7E*4E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6198 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16816 40 52M = 17004 282 TNTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTG 5D20>E>C+#(;0-<%('&4;#?E8GA(:8;#%@07?,D7H7)82+?6CE94 AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G41T0T1A0A0A1A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6199 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20334 42 123M = 20228 -229 GCGTCAGAGGCCNCCACTTNAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCTGAAACGAACNCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAGT !,98=;B+)GD8*1<$;6%9#+$=A.E7;97,DADD06.@9545G!*1"G1H20")G=8G:.'F)+F;B&>#B6F#@2B(5">)+.F4"DHE;<;'"B+%$>3"38<;/34#787H&)81;!) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12G6C42A9G48A1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6199 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20228 42 106M = 20334 229 NAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCCGCCTCCACCGCGGCCACCAAA !-.6D?7"B0B2'0+:*B%G(&"<($F/<&64/<,#<1A-D7*=!G><,( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A83T17G3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17550 42 132M = 17683 321 ACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGNGGATTGAGCTGACGCCGGGCTA /91B*C6#>A8A@>*C'H#A#"9@4&,E$H>3/6(<9E$.6!+38"FB.F5*6!$!E47E*BB=59A3#A?C&-(E$+F3G(@48B1?/C2)#$6>1&(;":5552C720'F= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109A22 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r6200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17683 42 37M6D145M = 17550 -321 TTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATNT FC'&%3?*6&D2=089'0E+D"@-%+631$'05?%@#!"&'DD&?;,@,:&?@.#$D$@C,"2>AH&<1;B,9.<#=#3C;?;@4G6,B!E:6F,+?&4GA2%-8%(A!4FD*EH#33,H3))G/8.HH4$H,3F!3?%/;$3/%+&?475212F?$!7&8:"%3+B<-HC!) AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:37^ACCCGA143A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6201 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13954 42 23M3D67M = 13811 -236 ACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGANTATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGC D=3'=C8$'+0)B1C=3,?A0>(DE9/E$1$9,HE1.A3/:D%=&0D.;C6/"9*7)3+<'(B$6$7&#C%-F=!6#!25A>&F8H#57G AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:23^TTA24A42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6201 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13811 42 87M = 13954 236 AGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTCCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACNG 9+@84"1:C;#!:,>>/%6G.>FH@.B'+7H5).&=-*$*4A<&@8)B"D0&H+#&&*@(*C"4<"?2*4D83E.>,*803($>$.# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59G25G1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6202 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8229 42 40M = 8052 -217 CTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCNCCGCANGNGCN !"&%)*%*++++$'"'$%*'$"(($%(+($('*(#'$'(# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28G5G1C1T0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6202 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8052 42 51M = 8229 217 GCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCA G!GD."%HF,%,?BD*#3')@.."HB1.#*""@??7%;A=2A)4G+#71D/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23261 42 88M = 23048 -301 TGCTTATGGAGTANTCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATC ;'6*5)31%!!6%,@H.0#5,$5E69**>E'4HA)C%:C(;#2?0%7"#29:$%'=0!FD=G2C9BCF=>%>H$-''.&;H8#,33)D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6203 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23048 42 41M = 23261 301 TTAAATCNATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTANT "2%47&>%FB>!HB7)H>B$H$BFF?.=+%@D.>4A+>"A@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A31A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34941 40 64M = 34682 -323 ATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATA D*9>./A4@H*0"*#CC.'#BBH#80D:B40&1F'F+=.D19')1>.,F:);/ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:10G20^GC1A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9404 40 45M = 9629 269 GANGGCAGAAGAACGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGAC &(#$))%++$(!'&$&!+"#+!%!&#+&#!)+!(')*(&$"%*!& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T9T32 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9629 40 44M = 9404 -269 CATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTNCTCTTTCGN !**#)(%!'!#"+*(*##"&&%%"!+(")!(+")!$%####*%" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:34G1G0G2G1A0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6206 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32858 42 127M = 32768 -217 TTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAAC ;.-$,4*"G24@/AE*#!5*B'+62#4+9HDAH@+8C6%F>!+?01D1G*":.#7#6,5A%;8"+-"D3/$#B!@D4GD(,0*B&2:''G#4>/-161?3$>*;,=@BF$4A?)#+!1'5!HDE%?C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6206 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32768 42 63M = 32858 217 GTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATC &/:&$=$BE440@.<.;@5H>+(&*CF9%5(+(F4,:B=F$=(+3?=#=FE"-FA198A(B>A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6207 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41117 42 56M1D73M = 41327 277 GCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTNTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGG ).#1>1#F8B(3*4-).@D@;,=9*"D1? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:0T55^T48G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6207 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41327 42 67M = 41117 -277 GATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCAT 3E18!7)C,2>6-17A,DC.DG087-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6208 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6780 40 78M = 6586 -272 GAGAAGCTGGATNCCCGTCGTGGCTCTGATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGNNAAGGGNTNTCCGTT '%(&&"&*"+&*"*%'+)"(!&#$+'#"*%&+!#&%!&")"$'$+""#"((#'+%%%(#'(++!)(*#'!&''#%##' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:12A14A16A17C0A3C1G1G3T0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27366 42 51M = 27521 247 AAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCT 08+F8$FA.88#;))GF'37>%>>F>5=$!-86/-=,E&9?+H.&(-B&3: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6209 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27521 42 92M = 27366 -247 GCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAG 5!75**94H-0=3$":F6$F>=*7=%7D=:(?G7;*,9":E-GA"2.@2D?D,?F1-5@1A9"!&,.4)8://021245(==D!*#7D"*@,C"44:/.=E%;B;7"2'A-7($''%6G2C/"B&B9?:047/D5'60:#7! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54T21T7C0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6211 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13456 42 124M = 13580 420 AATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCNGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTNTCTGTAATGAGCAGAACGANAAAGGTGAGCCGGTCACCT 0*2D-F#)!HGE)D.3F!5AE:A,@>A6.*C:6(9.;0E)DE'<>3C1"E1C?#(F%,-4"4.,6"!/'AH,@HD"<"A&:'+:7D-H#H*=7H><"B+@8G&4A+08%)HHD(),>@'F"8=@<*D3C$=%0.$+#)G41#":#(#@%EB13@-3F,1E#9D$;<=3*7!6(H4<=*1*CADE/%1!*#C-A5DHEC=@41.,EC21?!13D;/D($,5DBH30F86)-6F&=0F>B9'8'?1&(B7E*EFB@7,.H>.E=#9.6,.#FF@4/*8%>4+59CA;?E-E'E#*&DB$77-C8,&;H=3*1-)*64C-),! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23T43C71T133A21C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6212 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10111 42 111M = 10222 296 GAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAANTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTG %01=5B/'3E*,&6(G,&*GH-?25!@55'>*<<5,E)((E?26/*21/@#E9*&E;&6(%,5H$9H')=(=B>?5)6?5*95,/)(*@E718AB4G@H9)+*CC?+"3A< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C73 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6212 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10222 42 185M = 10111 -296 GCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCNGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGANGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGT !8F/?<**!(G#F*23:(75(5H40"H*D..64C<6H1!!&$$5"56B:$0-6!5=,,$&+C=A0(2/>86/F97B8GA"82AG(-03@+;->&F'/0DH+,G($<0-D0>! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41T99G42G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6213 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31872 42 93M = 31614 -351 TNTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCAT H1A.)5AB:8@'.CH!2:'$>A?,+G!++?;HE..9F51)-$7C?4.9E%B"1;1H0*F2#=:D%@D?'G8:6+!D,#H%'$D8E$F8;FA&G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G91 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31614 42 258M = 31872 351 ANTCCCGGGAGNTANACGGGTATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCNTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAANCTNAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCA '#1-G.(9A3H+)*A0/*%@>97*C6.=8=)=84H!4$H"&;H;!9&C.G+,///:G5=99BE232,506<3%8$$%E=2%%'?0++:?;;50<,!;:5H5&%@D;!9 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A9G2A5C133G67C2C32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6214 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30325 42 86M = 30239 -172 TCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGT 9C9-/"G33G39"'(-;;4;8:>);A6%6%D:*78HD44?2F,9B%2">7%@2892)'+,%<$1(D!DB<<:E):)3!'$G?!DH- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6214 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30239 42 86M = 30325 172 TTTTGATGTATTGCTAGTNTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCG #)+%)($$)%&(&%%+*'%*)!#*"*'!'*%%"$*#"!+%#"*'$"(&$)#%$"')")#$#%#)!#&+'*($+$%+&'%(*#$#)# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G14G2T67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45233 42 41M = 44986 -288 AAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGG /,G$D<-1H@!)#,BA&$+4=##8210F9@"@:D1D-(8/; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6215 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44986 42 111M = 45233 288 TAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGA 3;>"ABDF/+*.3@D'G.&0@7/5E5F18B<)''5G2&?-$*;??>>)CG5"7"4+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6216 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17362 42 105M = 17497 262 GCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTC "3022/:$8@05/B0E/(.!G(-F/9-"?1!B;)+#)3=/GH*9C,8"55;@D=9'@5!0D,-#>B!F&D3B=H/',;6;6H*B.GE66.9!.-10 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:39 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6218 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7241 42 120M = 7468 317 GGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCT 4:B=67+&)!.0,"1,:-6#F2)=4/0A<>1*@;+!AD&>AF5+/0?8:7!AFA,,'5@&@2G->6:=D09FG)2C)78473G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6218 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7468 42 90M = 7241 -317 GAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGANGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGT 3.$&A%3G8/,#."H*%"H?)>4H94<2**/?*33-#88A@D*A2C7D,2+@2(<7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41063 42 91M = 41154 270 ATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGAC 6A3411#/$&'*+;.+,>>(!0>7&409"C>,,CH"#@?9>.-=-'7(H$*H;8:22&8495D9A$% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6219 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41154 42 19M1D159M = 41063 -270 GGGCAGGTAANGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATT -8"?4+D&8-0>)&B;=67%)//%67(H?;5.@(+8#.)+*3@*E?,/*=+72!36'BHD6#6*D&-0@$9@G:E5$D0-<9/7'A/#8#7=G3@0D70919/99@*@$'0$*:E-!&:- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:10A8^T159 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6220 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2973 42 98M = 2744 -327 TGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGG F*3;465A)DF5*57$<.-4+';#78<(5;<5%8?G:'?>9=$6=?/. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6220 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2744 42 81M = 2973 327 ANTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCA &$+$+(!&!'+"'*&$+$%')"#$!"+!*()+*$#$#*%(()))%+(+"'#%$%$&*+)+$&"*(*+'*+)'%#"%(&%$" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6221 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 673 42 101M = 841 246 AGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCA A=?D8?;2B5+B+F"=2'(94+0(71+?-.+H"%;GF1%@1AD,CC:+1=6C$7)E6%9DA,5%:*G>?GE+2'&C@?D<$CD.3"H.+!BH8*/H@(+(4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80G20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6221 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 841 42 78M = 673 -246 CCGCATACCAGGAAGGGCGNTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCC '9?B3>DEE?F5F.:F.3+-4(F&9":-@!9667>A/C'F=@B:+="%H*'AFE2H1-#731G7(EF8751>.D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6222 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30178 42 81M = 30367 240 TCAAGCGCAACATGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCCGGNTT D=?(8)=,=?>=!(!0*+HA(#D.!+')"07!(?D+83(;!-9)53B'B#HF8-$'>1:8;&),")%+(!;E/6#?+-)?( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T5C62T2T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6223 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44614 42 116M = 44730 193 TAGTGAGATGAAACGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTNGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAA ,//&**9'-GFG!'60C#H&1H*E873"@9CF//#F.1;,#0F-+75F*$(@E-.F6#!/#D;416&055C4//"=;H>B"A/#HH<&&*;3-H>9)D"1$C/(E8(#7:!B!7E, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A28A73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6223 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44730 42 77M = 44614 -193 ACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTG F!(9=*(AF,E9.C)-/!,/E5;E4E%-(,>;0%;#4--!:8/(D9<-4G<-@55##@/+)4H4BH8(G&5'1F&BC15H30@/2%61%4*H=%./CB?'(";A@,H6&"+#%GA>62-/ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:4^TA79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6226 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12971 42 213M = 12869 -315 CAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGNTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGACGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCACTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGC !)%+#)&*('"+%(+#)#*+**+%)%#'((%+"!'#$++)%&(#$!)&'!+*#)$*(%%*$!#+""+"!*)*#%(#&(*%'$!'!!'#'#")(#+%+)*)*"''#(#%"'($()#!!$%(&%++!%%$'')$+#%*"!"+!&$"+&#'*)#*)%*%'+*+$*"+*$#!$!)(+&)+'#*(+"&)*)'#"!'$!*'&"")'((#&(('""+*%$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46G55T39G70 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6227 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 661 42 142M = 556 -247 AGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGANCAGTCAGGTTAACAGGCTGNGGCATTTTATCCNCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGT 00).5#8'>C>)$7,BA;8-%E1?.,E1-B7C(6G3'&5&?<2HC22/'++11(%GG@9'=74?B;/"3*=0GB26AFH0B?);6<(#BD4H5BABH82%6?'=/1=F7"3*HA*%C#5:!>4.C8861F+/$D$/&3H3'4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:63A19C8G3G45 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6227 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 556 42 105M = 661 247 NCGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGGCGGTGCAGCGGCGTTTTNCGGAACTGGAAAACCGTCATGTTGATTTCCTGAAAAGGGATATCATCAA $!+*+(!!!)('*&+"*"%#$$+*$"+&#+'!&!+&$!%$'+'&")&"&*(#)&&'%'%+)&$))+*!!*(((%)!$$"'&+&'*!%"%"''+%&'#*'**&$#* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0G35T17C16A18C13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6228 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41192 42 106M = 41192 0 GGTTGTCAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGAGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCNCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGC 0,?:$DC0'D?(D4F@D,&,G&)3H=E,-"+67A9%G<&.6C4.*F/)7H."D0778/#(E@:G#;,(8=2@A1,+#0=%5H<4@=H&4-4%(<);3H7-D5 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G28G28T41 YT:Z:UP jpayne@0: r6228 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41192 0 * = 41192 0 ATGGGTCAGCNANGTANTTAGAGAANGGAACGANTTTGAANCATTNAGTNGAGNACNTN %!"(('"%&&"#$(&!#'*"%!*)"!"%*&%&*#%(#()$#&!)(&$)#!)&%$%&&"( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6229 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19458 42 58M = 19226 -290 TGGCGTGGAGTTCAGGTATACANATTANTCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGC F;,8%+=+5@!:E(>5290483/F3$@)195%;9@B?@A68$?B5&@4$=@*'HH>-6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G10G4A30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6229 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19226 42 42M = 19458 290 ATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGTGAGCCTGCGTGGA #"+)&*("&*)*#+*$!%$"%#$$&&'&)#("()$$%!'+*) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6230 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31158 42 55M = 30955 -258 GATACTCGTTCTTAACTCNACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTNT #H1:D//H-1FH"2;1$)!?%D'5&%99!2G@<;-D33&=%43B+6H'<<1=%40 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A34A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6230 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30955 42 121M = 31158 258 NAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGG #F-!98,',-*&=0*:%H7DCC5@9?!=#)"A1D005+?%@=604-)"=88.:=*02.&A$@>>A/3.11F. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A120 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6231 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24622 42 79M = 24542 -159 ATTCGGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAANTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAAT <"41G+$4;*F-6C6B05+<%+1F:#4D;!7<4B2'D,:(7.=1%&-47:*1#!B??C-@.-AE:68D&26-E$'D)*; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T46C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6231 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24542 42 56M = 24622 159 TAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGNGAAGTCATTCAAATCTATAA .,9@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23428 42 108M = 23253 -283 TGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACT $C164CE3+A,.E(C)<+.5;:C*,3%??&!4B?=EB.%&6@2;4";GC!')E$B<;(930F-0&-70B/>!:4C&>"#!?2B3867C>:B3@):*6?:#8*B;7?5C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23253 42 99M = 23428 283 TGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGAC 0.D8@"2>;E@!B03)42),A/.*!3.B1-2-A*"45-%:10A78<7,<3%(4GBCA42"DG.)<:/4%?H'C1,7-2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17A22C30A20 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6233 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 732 42 89M2I125M = 946 306 GTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATANCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTNCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATNGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCC )++"*)&("'+%*&*%)!'&+*#"!#"'''+$!&))#&())++"(%")+#+("()&(&&(')#!&!"#&%""%(%%"($&#+%%+)$"&%)&++#+)%)"")'((!(!%%($)(!*&")"'&('%'#%("&$+%&'+&)'!*+&%!!!"!$"#")!#+*(&**#$!%)##"'+('**&&%((#*%%(%'$)*+$+%'%()(&)"&#%%+(+'#'&& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:21G94C23G29G43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6234 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 340 42 156M = 507 224 TGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGC 7C0>(9@;$$#75<7:>-AA"EG$$""H@63C#5G,B)D/D0B5GE4C*%H@;H=G6,/0?21?:3-A')<9B.=.)&3-0320A4F(C8195!7!:BG77=ACG#&41C%?2BA-1#/@63*>+9BB66>1&"-?.;.%@%D)/!C*8//9&HA. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6234 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 507 42 57M = 340 -224 CTGAAGTGGTGNAAACCGCNTTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGNTGAAA 9A,'!9BF%!A$G'=%$/<'#:*#H"/4>1?51,5'659=>->5#'F!FE@'1A'7@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G7A31G5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6235 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12804 40 11M4D54M2D15M = 13027 320 GAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTNGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTA B!E(.@GE1#A*?"C4-70-(6?D%7"7F3GG3;&C,E'B$%(97.#0$<@G AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:11^CACG26G27^TA15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6235 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13027 40 97M = 12804 -320 TGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTN F&>5E?EF-"<=)&>?*3;3/>&8362*0"A&3H&:28;E<1'7(+/3.A0)$:GE4GB...C%0B049G-'3:(1!?!,+C91E0<2>-6172+<7$95>C07 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6236 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37118 42 151M = 37293 254 TCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTT 28.>:E0+!<4*0?;HD90?'G&:"E2*+,%!$.32&+)1B(@@>6:9'G,0-8""$/4:,7@'25>"<'*A3F0%)':+:?G7;,)#8:&C! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90G60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6237 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17030 42 88M = 17227 268 GTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGT /541':BD2,38@0@/9#5<3)%G50A$/*);B;>!>70H8!;2":$$!!7-0).>8+:C"E<-B@><;3F'H-#DF:5*H!+G3;%- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6237 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17227 42 71M = 17030 -268 AGTATCCGTAAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGNCAT "$'(!#()(&+(%&%$%+(+("+)'!$)*+$(#)'&&!+'%!)))+"#((%&+!$)'+"('&'(&!++%)* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G57C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6238 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20123 42 110M = 19956 -277 CGCCGGACAGCCTGCATCGTNAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGNCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAA B=$@)GEH2#9?095"/:8E"3A!;A$<2&&0-<:$H*BG+027:'!?;@!(98'6H?$!@A*.@H<*2,1)1'4<7/H>4$*/01@:BF@@**@$3"4?$3)4H>,6F/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G9C31G57 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6238 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19956 42 167M = 20123 277 CNANGTCGCNTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCNGCTCAGGTCGCGGACCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCNCCGCCAGCACGTC &'#%**%"$$+&++$"!!"+)$+##!**$'*"&!)())'#&'*+"*+$$**%$)('(!)')!*)"&$&&*##'%!*)!)+&)$%'&*+)$&()#))(*+*"$(+')(('"#&")&+%"''*!'($+**)*)$''%(+*"##(*)"#"&*)&&+**)*+&$&#*#'!& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T0G0C4T0C97T13C21C9G13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6239 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34597 42 78M = 34808 258 NAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCAT ++!#%#('%((!&#(%$+'&&'!&%"#!%"$")+$(#)%%'$*#&+#!%))!+''+$)+(""+$!%%"%#+*!'"%"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C77 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6239 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34808 42 47M = 34597 -258 ANCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGG FB-8G&94B<=#."3.#9.1>2#&##+E*;C'F>G"+? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T2A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6240 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3152 42 185M = 3337 326 NNTTNTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCANGCCTTTANCGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACA #&&*$+%#'%($&(#+%%'''&)*&+&')")!+$+%%%)''$"!#&+'##(!'!&#+%(&('!*&"*$*'&$*'!)*))#&*)(!*!!&#$(*'$%+!$#$%!')'%*"&"!)#($(*'))$$'!++*+%'%$&"%"#+$$'&!+'(&%(%(*(**)%+##!))')%((#&&#%$)*&$*%)($" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0C2T113C7A58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6240 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3337 42 141M = 3152 -326 CAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTNTGCAGATTAATGANAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGG "B6EA>+B#+!'8F11'*12<<0(,'%>'"":(%$2==1>7)86(>D$+;=0HB6,12CB2%6&!!4H#6/*0%:#5=6H0>72B6"0(+AE4)9$)3(2#/>A3#)091=2/*"AAF2%&(-D)<54CB+-.&G/;G+>7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C60G13C51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6241 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12112 42 63M = 11925 -250 AGGAGAAATCCCTGCTGGNGCATAAAGANGAGACGCTGGAGTACAAACNCAAGCTGGCTGCAC 4(&#!F.27=1%H>*"$$?,(*#H=$D$5>C0-!<='>?$8450G?'=9+5/AD*+8F3<:#4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18C9T19G1C12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6241 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11925 42 40M = 12112 250 TCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCC *7*5E))/=$;"(<;&%*D1=3"B92%G,::+")&@#4=; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6242 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37300 42 71M = 37536 304 CNNATGNGGTACTGTGGGNTGAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGT $$("(#!+"(*%*(*)#$("*)))$&)##(*'""%'$!)#(#+%+'*)+(""+#*%(#($((&$!)&''#( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A0T0C2T0G11T1T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6242 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37536 42 68M = 37300 -304 TTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCC //%/!8C'7G2;2)6F>#3+*<75(,'1F09;F%F5!B*&;!=)8*/,F9'% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6243 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20060 42 134M = 20249 247 ANCNACCCAGNTCGNNGNCGAGGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTG &###"(#&''%$')#%)"%"!!+)+&)*)(+('*+)+''+&%)*)(!)*%)"'*&&!'(+"'+%$+#)'$#")'"'&**#'+(%(**)"(+'%(!##$$&&!#$)"$%)$#("!*'#!#"*&(+&!(++&)(") AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1G1T0G1T3G3C0G1C1C0T0T17C94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6243 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20249 42 58M = 20060 -247 TGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCC )'#96C>8)9(A/+(&1F9&?:E&@E*"!+GH#-?1728#CE"*!+.8+E':+,F$*F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30181 42 107M = 30455 338 AGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATANCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGNTGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCAC :<54(-#@:C11D+##<1/#=4>(0'$B.:+.%@A7+9B63/)5>!564)G#C"7+1CC%0=5B$D5@5@6H2-6(0?;G<2*#7D>%215E5?<)$"!/5>D4#>@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T26A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30455 42 64M = 30181 -338 ACAAACCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCNATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTG 2?F=67;(809A)=5&E$(7(F;(6EC7=E;4<2>:4"8:EB("C$(.D'BA*!=5AB)B)2;CE,<-5*&#&4F!H-"&34+2(18&30H-C/94)3B-8>$0!$;8*;GG3DA%3$,,6/!+"#@4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G76T10 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6245 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34942 42 105M = 34843 -204 TATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATANTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAG 9$)*C5%*!E=(;5(;A:C1(<:"?BFF4?%4<28D>E3"-1.41+"*.."205E1EEE9?:1+94,C.&D@#8+/8'7!#5(,%EB>F)"A(!G$/+6&7"HFE AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63T39G0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1853 42 96M = 1702 -247 GAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCATGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGG $AA4#E=G11/2=&=9C0F*1B"-;"=#H:A$?++A/@6/90E6,H%93('1F4=B62F8H;D./%<@31-@54.584BH9?=98$1D"FE?<-/@F<*C>D!>%GC2E-)FG632B%0?6,/;>0,3,4:3/78=GA@4>A2'-' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:90T11G3G6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6247 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12667 24 138M = 12809 245 GCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCAGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTG BFF'?90A+H126G&H+D->1.7>'"8<<6FF>)E+B9.%170HCADG2=&;-'G23(:,3#%!?,2!0/'/,(1B:'4)9:F7#!G=C8),$!$180:;GF0B96@1?&3F>A!+E3C59!&GF;8=?=+CF";;.. AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50G1C75C9 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r6247 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12809 24 64M2D37M = 12667 -245 AGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCNGATGNGCGGCTGCCNCCGGTGNNTATGNNGNTNNNCCGGTCAGCCTA !##&'!)+)&()+$+#(+&!*!('#$##""%#('))&&"(**(%$)"#"*"+"(!(%%()(+("!"(%%!"$+($$"#%'!*!&)(*#"'!$$'%#')$*$ AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:24 MD:Z:0T2C1T0C0A0C0G43T4C5^TA4A4C1G0T4T0C1G1A0C0A4G4A1G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30001 42 80M = 30081 216 TCCANGTCACCAGTGCAGTGNTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACG ;7H75*."E69 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G15C59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6248 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30081 42 136M = 30001 -216 GACTTCGTTGCCTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACANGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATN #1H!%F&,A<55(>/BAF":'<46(/<,C2%-?C&*47D6".D,(3.2!7?)%E=D>'6.-:8:*@&2-('D1GC6:#;,F:#C(=GG$01+(>8-$!7CCG7)%7-@($ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11T97C25A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6249 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31901 42 69M = 32093 247 TTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCC 7G@%F4@CE@7HE#FD%8*:#52C))8"0@7=3F3#C>%68F/A>/*+'HE.CB93/5$,CHDG!)"'( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6249 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32093 42 55M = 31901 -247 GTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGC 9=>3/@&%%@''10-#?/#+D"(@B2E?%4(.C%12#=&?F82,3484B)!$$21/@0&"$/?8B!!/0D59,02$>"01@,4-H!,(($5-(C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23G8T20G13A67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6250 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2580 42 108M = 2738 293 ACNAANAATAAAACACTGGCAGATNACGCCCNTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGA (&!%'!*(#+#($&(&$"(!+(&$"*(%$'&+%")#*")%'!'(!$$)$$%+$+!$$)'&&&!(%&&#''"#*')"!)#"("(%$&&&$"%'$+)('()($$("'*)* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2C2C2G15T6G76 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6251 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20797 40 101M = 20642 -256 CGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACA B9@,;.E8!4!&4*;5E(@AE33:50D*1,+B?">*/-$H7E9E/>+11AE2+C1)(8+"##'7"HC4!,%:@G@":+#1(0#%:/%1(23.H,C$!F:>( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6251 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20642 40 55M7I10M = 20797 256 AGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGC ?.$0H,6<1!41H%B&>$6-&!8D-HBH23(5C-;H))%?2F*$?E6'DF>0-/#(*.A:.?*AA*8*DE1,0D<=C@!$EA(2;1?3;8F6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A34 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6252 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39791 42 223M = 40014 283 NGTTCTGGNTTTGCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGGAGTTTGTTGCATGGNGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCANACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGAATCCGGATGCGGAG &%"("+!#*()!&()!#('$))!')#%''$+)(&'*%#'&%%!&%"!$#++"'+)!&$!$'$%!++%*$'*%+'$%%*#)!&$&!$*$&$)*)""%!%!+))+"$+"$")$!#!&$&$)"!!(++++"+#(&((($#'*+(!$*!&*(*#+*%&%$"*#!+)$'%(++)#(+#!("&+)(#%)*"()$"!')+#%&"(%'$)$%%($!!'"))'))%&##"&# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G7C3T90C14T35A53T14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6253 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45849 40 35M2I68M4D82M = 46038 269 TTGCAGCAATATCTGGGTTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAAT +CE9,7,<"*G@<1#F+?F-E(!E6!7/.AA93A,A,.#G,)8+)/BA;%@,*=:!D;;+>(4G3+;D:)C4?35'46>?FCA60>CG"+5+2#;524BF"8.+A+1$*'C:*:E35A"'F#"=BE"?!F>2<57C,29B-'*2+0=:G/3C'/2A@%(0%G!%/*59/CF-B@6 AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:17C85^AGAG82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6253 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46038 40 80M = 45849 -269 CATGACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGNACGCGGCAAT ?&G1:)3"D-3.!94&5-%#<=:(.2=%("5G-G-''",6!5%:<.8H-1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T65A10 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r6254 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21927 42 68M = 21754 -241 ACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAAC A*<:4%2$)(2G*B1/>@3/@.H?"@%A3E4C'A'0'1A+$EF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6254 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21754 42 55M = 21927 241 GGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCG B7+58!!@GE&G'#33G319GBE'HD=73B:7D:F@<*#+,)9$5-*$5%58-*6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6255 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24322 42 70M = 24392 202 CCTNGGCCNGCTATTTGNNGGNGCGGACATTACAAACGTCCNTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGA $)'"(&#%%!$*#)#(*"""&!*)+(%"!"(&(#$$'+!&('&+)++*#%)''!$%!+(#(%"!$+*+*" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3A2A1T5G2C0C2A19T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6255 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24392 42 132M = 24322 -202 CCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCNGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAA A,.@1.#59,9,&5.(=GG+:4/AFA#2*)?!6:8D@%*.0A;66&$E->9%0,83;<)B9%=!7'HC32;?EE$BBBH%#'8:)%4,.#F3,1%06.16%?:%B4:E7&2C$=?CA?<=%<8:&6229>82 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C50 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6256 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2637 42 156M = 2513 -280 CGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCNGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGNCANTTCCGTGTCTGACGTGAAAAAATANATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGA ,?@@)*0A=%%$DCA4%FCBD&C4,+GGF33F$#''93)+"-$<1/#.5>4A584+&%1229#67)-8D'!%7$7B;F&=-">&-3+<=2,?B/=88F29&/H'5G*DH#4&<*4'3+5+;*52B)/1.2&1>:-/C8-E-=?GD3$.A*0:1*,*C?8<%:C7;$=F&!>91+@258=%E&H0@!?2?,6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6257 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31228 42 48M = 31001 -275 CCAGCCNCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAA +:H$2H0%6/8&B#A'.A'<%E&:5,1+.4FE!?7$C2$843,+.$47 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31001 42 40M = 31228 275 GTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGC F2<$'0)'#'1465G&1<0=A3@C62E2)))4E'+EEH+F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6258 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34539 42 148M = 34379 -308 CCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCNGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAA 925")"91H=?+5-=1CEB;EAG)1;?<,;@!>?=-41:D:#G*G:C0!384'%H&4$1-;CE=:0A")7+;082-H-*0?(+*="$;3-&D*(*!7>,C$G6F"A1F*?D:)'6?/@=;*E1@0.AB55-@"B<0:@3=4>*D36)E3#<,86?9-C>--BF<'1%?4(44"-8HF(49(2(H2(!).H*%A12D>,".?2'&;$1&+F@9:2.,;(.$B>,?CG;.('*.7260'7B&!H,&7%?H"FACG0./A)-6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T19C28A93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6259 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9621 42 197M = 9566 -252 AAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAANGGTGANTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACNGCAGGC %GB=H*E.H+H/24A/C1:>!B&8!;G35=;>A$89>A/<82BEH"<7&E;#-$?@;(-=H";G!6G'3$?.C+@=)20?6&E'=C/.4"!#&9<0/62H:$<6;8=)C*%H#"+G'7B92,G)*-3F":(C5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T5G154G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6259 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9566 42 55M = 9621 252 AGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGC 9;=(.6#5/*3>9G8AF>)6HH!)CC=3*.;.+%#D,C6#.4?/:=1E&.5(#&: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6260 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18808 42 88M = 18953 343 ACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCG /)A2D9,/+:?:(&8D)>>?8EBB-!0&%+AFC9=/*66(+$,6?-&H91#/!@,$G$-57!8+%#0G-!)1&EE".+/.6"5/:G5A8H+/$<22(*AE=)$9?8.$E4"5B$@63"@)2#(8#+?2B;A724C$(F(<&%)%692-;3'+F/!#/3!E8/"E"H8:'@=*&&5&?<(20A6+3!)+#20F5:@.G*962 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:106T27A63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32331 42 50M = 32126 -255 GGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTCGNATGCGACN #%*&#'"%#(#%(%"**$!''+%&"!&$(%"!("*$'#+$%#)#$()*'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39G1G7T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32126 42 56M = 32331 255 GTAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGNGCG '"DD4CA!7F>87<@65A:7%9.-&-5G4%4+D;?=07B/3.?+(#1@E16=BGA3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A50G3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6262 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20351 42 262M = 20274 -339 TTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCNTCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACATCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTA "!+F/3E?:A#6;EF"46-A9;G(>%6,4@8,>E:-538B8A$!5H!75")8%B8%@3D4,)'$>E0,A&#/!5'/C.G>+&0,3&35D+,!)C%FD14E>2C49H7E5DF5;A("A";E(FC1!F>,447"A>(C;>B2GA9)@9B#%4#;#AB5<)3CB+-(-&/B?<+E96A,8/*>&!-H79D(2*@#6@'3F0E%54"'G*B-B366@:31;G("?&>>9;,44:GE?<*3&6;,93@:1E*",9,)@85:$/B("',DE5B$>C124+G17 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A4T33G37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37914 40 94M2I6M = 38073 269 TGTTAATGGTTTCCTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGAT &#-;0456F%()&=.;D1)9.?3GE<2<@0C)B75'1H0!(:@5C?F$B5(.F(B5<-:#94"*=9:>12%$$?F8/(D2:+103-2D/E1;5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:13T86 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38073 40 110M = 37914 -269 AATGCGCTTTGTGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGACCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGNTAAAG )&+!%("")''!"'"'+!"%&($!"!++&*$#&'$("!&$**!"#!+('"#!"$*#!$(#'*&!$)()$"'&%#'+&($#%+*!'"$'+$%!#++%%+)+#(*)+$"("& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11G65G14T11C1G1T1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6264 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11237 42 237M = 11474 282 AGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCGGATTGCGTATGTTGCTCAGTNGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGGAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGNCCCGNCGCCTGAAAGAGAACACGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGC +)''$'((*)"!$$")'#*"$#&'+$!!!!+'()*(&%#$)+*($+'!*'$)#"%#)+!)#))'%$$%%)*"%+)&$(!+'#$*''*!#$*"!&+(#*+*'$*&#$+%'*!$*)''%)$"'!(!&$("')%!!(&$#($%+)""!!"'%()%$!!*'#)!!$+$+%%%%"#&$%%)!)!##*(!(")"#(#)**"!"('%*%#(*%)%"')('%('+"#%('#%)$+!($*"!$)*' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:59A20T31C41A4C16T60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6264 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11474 42 45M = 11237 -282 GGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGGT A,"+48$-3BF#>8*C!@$<+9"4F;)85'8@(?7=%B3B-/=/E+FG;*1(6+(D?3F&)E!!#($ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6265 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39311 42 93M = 39129 -275 CACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGANCGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTG BE4C%BF?8HA$8CA;9:"F=9)5D/*7E789&8'@80'F$(!>8G30B"'45G8%BC*%7<(*"F"8<29-6-<;4'E.3/1+9&6,0,-'5@3'51-);&H112E=-:$F*=,%("38HB@"?!C(9*75EGB3#@9/19B0."330B6B(5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C49C10G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6267 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30022 42 93M = 29821 -294 TTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTA 44,E*B(+5.D7&9A826+4?#6FE&0$;%F(F*H(C53!H3&4)#A&:27B7"AE:@G5F%618E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6268 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22027 42 234M = 21896 -365 GCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGAGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTNCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAAT 776A.4>DB4+%G.@.F#A'.">?@6:))5H.3"3H5=8H#*#$E?914,<<#!3;<7B9162!@C-().4(4,5(1B)'3!>;B$(:0*7!=#4&/-<'."D7+449>#91/"@$$C,67#>-:#,1&,14&<=3H"1)&,.6"A7DF?5-4H:C;=-?1"%D@D6E9B2:;-(7#D#'*:;*@97B=27@599<(<66,*?34+=:. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:162G23T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21896 42 131M = 22027 365 ATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTG )8+@+8E)/23&6#1@@2?H8#C8F*&B2A*H2'F5A;)(;/%/A*?F@FD;E60'.9C51@,6.9G0*$15).@/#7F&/%=*'&9*+0&$9961@>EF88%%#:8(923@/(*,75$D)3A#8!B")F$-;(?D$F5F(3045D1;+#?(=)"4<-F5!3#,"@(9G.$//=&D.E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6269 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19609 42 270M = 19520 -359 GACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGCCGTAACAGCACCATGGTGGTNGTGAACANGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTATGGTCAGTACAGTGTCAGCCTGCAGGTNGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCG -%C'D2F#H%B%%,&.H/8+D@3>=1<16>7+>H3!H66>*8>B8-58%99@E67!+%):=0:<'G<1*56#==>63,69;+B9;48);%C*A)=<4"CE,C:!(,+"E8B+,=6A",@5$5<&A2>5+7/D1.FC?:A:F.3D=+$:61#@A'C(@7=-A5%$-/@EC4:8,81E;+.>C00'8;(@2F1H4>(BD34<838.!5G=<4?3G59$C!!F%?6,$F4#=-/7"4D.;C5."5%%-(/(?*(":,B2CAHH?B AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:121A13C6G7C54C16T9T37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6270 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3967 42 44M = 4179 292 GCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTC =CDG,!.G&5FH/($@#F+-'@41A0*"#:51:;$C&'-H8+;7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6270 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4179 42 80M = 3967 -292 AGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATCGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCT (DA:(+.;%*;4=&E@.,8#4.?'@39,<($>F":%*4,:-<;4#;(80AG6G'+0=47!-&23+!5<@+0D+&.-)650G-.C/'"?GA>"F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6271 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44608 42 92M = 44434 -266 TTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATNCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCNAACCATCGCAG &#.:H)51><(@4875C$37-8!1GF6<$6'15!@?6E:'(()A@#C&F:G"6A46-=(A&/+!D2;?:>34==DF"-D,8#!E/H@4&CFD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41T38C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17519 42 106M = 17352 -273 GGACGACGGAAACCACATCCCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGTCAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGANNGT !+$+'(""$%+)&$&'!+'+!'"&'%*!#)+$+#!%&%&')(&(*"$"!$"+$+"))'$'()!!$$!#%$$!))")+(''"**'*$#!$'"$&#"'!(&%'+#$'( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:18A37A44T0C0G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6272 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17352 42 167M = 17519 273 CACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCC =B<81$>G#EC1!.$5:4AC;5(A$?>-9">.G!>6@*9H>>9*3;==%*6()!DDC?F0C)?#2&&8>5%5E<=*E/=)>4(FA'3.!BF2;43.E$-0C%5*'G90EEBC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:167 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6273 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7953 42 268M = 8221 351 CCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGANTCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCG 31&(9%1)4&GG04+<")71&F66+B@'=#40B?,BC%1=#")?7@&)$G"/DE=/=1??G;271@C?>%27*C"":%AH'A'>/1*5.#7!&G@$%/=1%B!*;5!D=8,74?!H*".%?@8G#E2B8?):-G,H/5":5F8<(!.=$H8#GG9F@H(@!>"F16C(,?-$<")13C+C&72/"?/.+,;2)FFFG1@G.FC2#4D4,(+8.1<*!2+721F AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:69C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6274 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4213 42 121M = 4369 233 GAAGTTCAGGAAGCGGNGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTTAAACGATGGAGC &,)H(C<0B:*$82),1+F@**;5-C557@9FF/"'1%G15<=A'%%$>C1<1H0')>.:+0B><&'9>7>A7>.5EH"*='G)):%8B/+=0B,#>G'**)C-$;G7."*#C$8F<#4!) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T91G12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6274 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4369 42 77M = 4213 -233 GCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCCC 30!0@<&@%?'E>!,F>B='H5+*=1#0%.7/=$@C*D#790+/!H96@#B;)&A99@3-D3D'D0.DHD'38? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6275 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1423 42 81M = 1525 280 TTGCCTGCCCGCANTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGCCAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGG 5DG"73B7!>7>B($(A" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T31A35 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6275 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1525 42 178M = 1423 -280 ANCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGANATGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAG /)?,2$D<;)$'B<,?1%:3<)9:!";+(7!$11.%3G)8@A(68E&0.FC(:"%B6B&(;BG=7$3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T13A57A1A102 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6276 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19143 42 174M = 19317 283 TCANGTANCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGATCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGG (!')(&+'*'%(!%!"+$))'#('(&+!%($'$&"*!"*'**#(!&!(')#%")$!$!*&+($**%%"(&*#*+#++*#$"!&+!%#&''('())"%++#+&(*+#+!*"+(&!*))!$)*#$%!"(&!)*$$*$$(*&+#+()&*#&+$)$('+'%''(($%)*"&($!')!! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1A3C141C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6276 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19317 42 109M = 19143 -283 TCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGC 2?=H:6A&(%=;'*/+#*#9';G#?>D"',%+;0H-FB"'#!'@(?<4GGF)CFHC//.-- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6277 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18978 42 119M = 18822 -275 GTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCG 0(4<<.-.:.,4*E?-1,+.%.6@&<73/'5B#EHBB7@%8(8G=/4%*?*?;)!$)&!7/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18822 42 46M = 18978 275 AGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTG 1H,C"+$4E3?'.(8C:;)8ED&/+'!8FC4@8/EB!E0.$')#25 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6278 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24753 42 51M1I287M = 24629 -462 AATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCNCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGNACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGN *#*"%))%$$)(+!'&+"!&(%("+"*!%&%+'*+$"+"*"#*'+"!)!%!(+(#'*%)"$)+'&*$%*+("&)+")#($$#()+&+"(+#+'("(*'+!##'(!(#&!+('+'#+#)!!%+'!!&)($!$+(*%*)(("+%"$$!#$")!!"$*"!"$&'($*()%*$+&"#"$*(&!"#!!**%#'!++$(!)#(&"+)+**!$))"")'#$((%!!+#$"%"%&+(%*()#'''++"*'*!"*"'%)+)")#%%'*$*)%%%'!+(!&+(&#)(!'$#'#(#)((*$)+$'()##'(#%)*%**+%**$+&*&"+$"#$#+##)*"(+''*#(+&% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:13G106T106A109A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6278 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24629 42 124M = 24753 462 CTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTNTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTT ()EEF):1#%<<':0:)@0991A-H9,6<.B&=:GH7E< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6279 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7674 40 98M = 7513 -259 GTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACTTGGTGTTTCTGATGACCCTGAAAACACNNNGNNGNCCGGGC !$"#"'(+#%%!%")#$#'$''+%$(#($****%#+()%""%#)&$")#))+#+")!)*(*&(("#)$&#*'+&+(%'$&*))%%(%"%'"'($!'!' AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:56G8T15T1T0C0A0G0C0T0A0T0G4A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6280 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34261 42 153M = 34071 -343 TTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTATTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCAC 2!/42!B-C?01=?((7',@*H);$,=CA3-3E>C?)D&$);.E),0%0+/9@-F>%-F5.B0@-0+A0$A%=4)F4"9?!(H,:$4"BGD&&C"1!1'F0AD$F:%F/:CDH74?6D?$<9D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T38 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6281 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30672 42 58M = 30733 315 AGAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTNGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGAC !$6#/E8EA4/;E67.D8-+&3B'/#D-A/-+AD".?G%")7;2#*.#&22H)7$2)6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A26T29 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6281 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30733 42 112M2D140M = 30672 -315 GTTTAACATGNCGATTGCCNGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGNTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTNGCCTTACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGNGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACAAAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAA 91)#')8H&2,=CC72&/%2708=G3.1=H!2*4C+0(F(564@'&"#C1$*(+;=;7HH5+:-#'E0*4!804$1B&G;;%84F05BG6%7G+(FDC)&)=9)B5&9C/("$-0:E2!=")')((CB=0-+@8A-A75;<*D8/'%2?&6!A8#:; AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:10C8A39T52^GG34A4G33A41C24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6282 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31242 42 47M = 31018 -271 TTCAGNGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGNAAATACCCAGCCTCG :"+C##F'!HF58.A9$9F?">C&4>60&5,D=@1)#-2%FFG)G'B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T25G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6282 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31018 42 64M = 31242 271 CTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACG A?$H0>,D-5>.)($66%/BB'9<*77;:*;1E"H57<#F6*'<<1C;=7'F#+CDG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6283 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8544 42 57M = 8328 -273 ATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGC 0!7.6D15F)BG.;%2=3/62!3D"'$2$%$$3>$1>"436)8G%.=.?*/A7"?"G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6283 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8328 42 216M = 8544 273 CGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCANCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAANGTTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCCAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTA ?#0E7,D$$1+9F**F)-E3+=586=%+;D:&7.A/?!2##@?0E2,.8*;=B2!":/3*;!;:6F'F%$%3=B"/;".>7C&@D?.?(C-<8BF;4%4:,3,8$'E*=+=EC59*0!!3F*9CF$5=+C&9(985<10E;03/C83/!3=?%7'*3"DH%>&<&+;%&@-@94 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:59G83T0A28G42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6284 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15871 0 6M1D4M1D88M = 15871 0 GAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCNGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGATGGAAAAAGACATCACCATTA DH7?+7:;5G>9.A;.:H!(=5%-.'"37,,F$606%49-12/**D<%?>#7">>38>'2A;/*G644?9/)7DD*+1/-D9+5F(;A(:$:=3?:"9#F;#3E3!>/&F(+-(1F:@.H6,5#925$,+6"9?:!@#F?%%CE4)'%$23$'#++2:9%%/59/'=E3GA/FE2+G9C(5>40A(90$:0=F@*.9166'?+@*4?A=4=@4C/04/9.@;;#"-53;9"8,HA9B.:C>E#F2=(H08*=&#"#'A1B# AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:27^T37^ACCCGA11G125T14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6286 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25529 40 43M = 25335 -237 AAGTAGTGGTATCCAGACTTTGTNACTTCAAGTAAAAACACCT +E,+4%#%#:9(0E6!DA<29D0F;&:*+@15(=:9D1;:*;7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G12A5C19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6286 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25335 40 61M = 25529 237 ATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGATGAGGTAGTTTTT 43>1B1HG(D:@H$)'")582#F'0:G>"0)C&/?46+6;+9>$@+67?39/4BE%&,FF% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A12 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6287 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13171 42 271M = 13071 -371 CATTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGANAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCNGGGGACGCCGCNTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGNGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGNTGGTGAACTGATGCAGGATGTCN %*%$!*%!)&#(*'%!"*(((!"%%($"$)"!&""%+&(!+'')%*"$!#"*")$$+#')'!('+*!+((+*%!#$+*"&$&(%(*(&&%*#!&'+#+"%%*)*)+"""!$&"!"''$*'%''&')'!%#$'!+*++""'!(("+'(!)!&(++&'#%*&$)(##'$*!$!'*!'(%(#&!*#''"(%%&&#$%&"%#$"!*)$*#'!)'++#&$("%++$&(%!)&$+%()!&!()####'%%"%"#($(#"(&*$'+$*!#$%%+("%" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T51A89T1T9C68A22G19A2C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6287 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13071 42 100M = 13171 371 GATNNTGGCATGNTCTCCGANGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTANGAAAGGTGCG &&(!&*'(#&*)%#"*((%!+((+#%$+$+**$#&#))"'#'$%")"*'')(#"#+#&')")")$(%+!*)"#$)##!%)+!)+&%"+('""+%'%)'(( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3G0G4C2T6G0A68A10 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6288 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29419 42 164M = 29583 329 ACCGTACTNGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAG D,1B&801'E5!F*+802/($2@$#!@:;@'GG;=#2)-#50'(*C@%C:3(315((%/=11H07'!&=:13@32/#"D(.>D;@';/3%"6>#H7'487"/2=?#9#/?H(90@=9G6>G,&85A1%H")C5*'G2=9E&F.0G.>/'!F%# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C155 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6288 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29583 42 145M3D17M = 29419 -329 ACAAGACACCGGATCTGNACAACATTGATAACNCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACACCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGNAAAGAAACAGTAAGATNCTCAACCCGATGTT !%*1C6-$C0-"<=-DG44(%G)D3#0;,=1,B9E;H05=7A!E=!93F6$!!DG@3B+++@HF:;5GE) AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:17C14G48T48T14^ATA2A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6289 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40206 42 75M = 40373 252 CCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGANATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTA C9%3D4,B"7C,7G#<,76076:2%E!+A9B&=BA+370:D%?(DG6?$:A6:'C2<2<62.#H!")8??0//43 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6289 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40373 42 85M = 40206 -252 AGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGC ;D1D?G/7@)!?@(3(CC37=&<"1*%26;?2:4-?E;@4;(025/8@0:;23-2?:G='(#?-2(#!!G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6290 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6388 42 36M2I48M = 6526 201 ATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCNGTCGCATCATCA $'.9G3-?E('!%>,97?;F2!5$.=!"'B,3"(66!(E13$!%92&.)AEA<$B*=3>!-"5;54')H8"%*HH05E/>G40%1< AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:71C12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6290 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6526 42 63M = 6388 -201 CAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTNAGG A-9#<1H(??")2&@,!.+<0=53AD>8"F;H865C6*)E9GC'#2;72=.C#&%?()A4'>1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G3 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6291 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36212 42 294M = 36212 0 GTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCNTAATTACTCNTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGTTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCNCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTACAAATGATATN &**!*#'!!%('%&)"''#!!$%**$&#!!%(&(%'"!'$%+()!&(#'*(!&$+$%($)&*(($'))%(&+'&##''#$)&#!+#!%**%#%*!'!&""&(&'!!(+%+'%(!+'+&(('+#'+#)"+#%+#*%$)*($""+)+"%'*&&+#+*!'%#"!!$*'#&"*!"$''&!#!$!($(*+&##)')$+*+(*%+$#&+$%!'(+$*$(+#"&!$%'#&&&&)!#!'%%#!*$*""!!&$"!#%%(%%"%$#&#'($&'&("$%*)%&&&&&*)&+&)!%%&&"!*#'(& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:46A9C125C65G34A4A4C0 YT:Z:UP jpayne@0: r6291 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36212 0 * = 36212 0 GNNTGTGGTTTNGGNAANNGNGATAGCAAATGCTTACGATAAC %#!'**&'*%#%**%$$!%)$+)#+"+%!*')#'%%**$)'%( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6292 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39346 42 127M = 39473 264 GCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGNGACATGTGTGTGCNGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCG 7F$BB:50H?'D3%>%&C5-1B.&7D#>4E(;C5$!=B37/#,+@).+;;89#:DH.."(.9,G:0.571=)60:+.!2;%$!D5+6!8A(:,81#7DH"+(&350C5%&%CC/&G$B2#G,;(,CF AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C13T65 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6292 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39473 42 22M1I115M = 39346 -264 ATAANTGGACCCCACTCGAGGTGCAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCNACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGNCGCACAGATGGTTG 43HF:/1>+"'*3F>':?'=F!BE!(#23%H2A"34#;%9$,>'*E,C1&F:F482C*!-.>&;@*#9%AA2F,>=5!.#C?%;!!2=.04>!=848*,!<4B$H!)$&EBA6*B>)@AH, AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:4G7A6A0A50G50C13A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30745 42 65M = 30810 288 CATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTNA #*G);F9,#:'-&+<3.;-20/F1>>4G>D'358,.$9$32#-2EF7@:-*B(=@,0,*C.53D7+1G#5DA43H/87#$;$3;9!$C&E%."(B77?,)%:7<67!2>+$B#8.6,(<"@C7E59%E#3$-=)C?CDB2C00'(C6%3%,.6;H$;&B48<;>-6E*.FAB975'"*F(2EB&%?7-=D=+,+D>#37.=?!!:-BG"B==%F6%*G;AA*@+(#A>::;++-!=@1>6:D<*=&;3(F+>&="'E4&FF1=5D#=9(1E(!E0A6-?3/-'B0D)$886+('77 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G6T29T85A127 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6295 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29385 42 93M = 29516 181 TATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATNGTTTCCACCGTNCTCGTGATAATAATTNTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGANTG ?((C3<26;A?*+(0!-33)B1+4=CG%(C<'B8=<7*'3!CCEHA!=:<(4?--#<4&A'?!?)),A@H=B$B*/6D./E$DB@8'!A$@11 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27C11A15T34A2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6295 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29516 42 50M = 29385 -181 TATTTGTAGGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTC $A3CF2GA/".,$&<2961E)2"?-&AA#;D'B!2G7HC5C#7):,-2<5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6296 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35665 42 243M = 35908 353 TTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATNTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGNTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAAGGANCGATGCAGAGGCAATGCCGATGG C-334$D#)'-.7>;@6?/3GB3D+-<+/-C3(!0D9?*@>/FAB!,0801/17B:)?(?D?:-*04=,*2+)=%B6-A/!>"4B5#;74B-7D+.(!&C/2*0<-2?=#@B6,$,=<&E&DD>!?D#1EE84>">#(#G*&8=%,-$;%$3F+38?#"*@$@=B665CE;G&79/G=5#&8(<@C69+?+>9)F103.A'>(?3C)&7&FF6:$*3A8%DH(&3D.( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28A39A8T8T62 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6298 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27314 42 78M = 27392 331 GTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACGGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGA .8-%7>;4G"-@CC&',5G"3&:$60?0?")B;--140><(*')7-)80?/H&?B%;G8,10*B+#6#=G3<;,:1:/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6298 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27392 42 253M = 27314 -331 AGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACAGCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTT 93>'@8#D+#(4#/GCE(A2*F31,)+!2BG@4/?8=(H@%B)?!;G#-7'B)@8C<60&,1E!H%E49H66#B80(+C)>%8*3#"6FH;4#?>7@#%'"%E2"6?;*37F9F'>'4.2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T214 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6299 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30168 42 73M = 30374 246 TTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGT D%3A(DF/3"--34H$3#"@9A>GC5)<5+CB3?-GEBGF$7""=A8&;05=7=<$3<'5-@069A:(E)":9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6299 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30374 42 40M = 30168 -246 CCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTA 899C7H3$=993A.5=&A#01B@.'!>5/B8'79'DG<1) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6300 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13838 42 108M = 13695 -251 TTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCT G*DHFD%%)/D8C=!>."2!G;0F)$*F0<853E$974B&9G'EFEDA?D+-."$>@-=4-'E">F.7*@HC-1158?9@"#"(<-#0&?G71@80807E8E9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6300 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13695 42 143M = 13838 251 CGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCTGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCA D2E";"%)2G?D:229+(G>2+608(-79B:1:.%G.D:#G$@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:114G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6301 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41824 42 79M = 41617 -286 AGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGC 5C3%@25G,:-B*/(@B57B2D9E.,?AE(<$54%=>#2!A>9,E:B2C*>:?20+2@#4+(<"*B#6)#&@1!=4*%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6301 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41617 42 154M = 41824 286 AATACCAGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATNTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAG E>!#<:22-D!48$(,50:,8'53>6;"0F5E;*,+6;.%'4H#!-1,B8B-F"56'?<0:<04%G$&B49B7'BA#"H;=F+:)6<$1(?@G:>/'B5=1#D#4%=6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G117G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6302 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10081 42 157M = 10238 256 NCGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGTAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCCACCCGACNGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGT 0?>28?0.*)27#'/H257/"A%>*B42D-G,*>(G="012E-:"6<+HB8EF?2;A:)+5/?1@"B)!<"2+%?.@:%);<8E%3>(&!&9#G>#-B)0!7D,(B+*16BH*54E"+#77.B1%'/0:CC&A):.A/=8B#7$E;,-60F;0D3G'F$$0&0C%6'#;B/H7?%9.9)>A.F'E(9G'9%HA8-2%'18A#AG*';G*=AA"8E@/A1)A>8@(9>(%&.0581+5)6'AG('&A:;//A(H-+D32$68"1-G6/?)H1/'45',?G90- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79C29T25 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12317 42 187M = 12504 322 CACGGAACAGCGGCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGNCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGGGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCA ?)9",B*9*;B6A0GDH0.0&C;!%B$;-;.:;1/F0(=&BH-7*,*5-(D36D>>'C"23F:<=!5C$'!,E5**3)>1D'E'?H,$2#"0H!F$G,F*+:=A+*@.$2"EF#+/234#'"&!"H$3$?38D@'&*#B0C);?5*"F+*19):((#:B&H5"5A15;063%-FD;%&&CC?F(-#? AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C114T25C33 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6304 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37456 42 28M1D96M = 37581 306 GGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGT ,B+;!!()EH;%B=;/E*#4&-<4.>@0@&4+-&E",B5B)$?D!99;*12<7:&">/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:28^C96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6304 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37581 42 181M = 37456 -306 TCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAA D6?)'#8$H@4$E.='+*8:1>>$B6*E&8.-%%3@>G=.)@E&/E1ADC;1-20069>?%#C;%G.#=@3*D$:?';6;6;@;>H9.<("/6D.8@0G9.B)2B(-8$F&("::HHCF.+)2E$"./(!$8:*6=D2$,E0!'7+64/2*28$!%4(B%?B)7C:1(!=H!-E54A3?1H,@*=6DFG1H%D-*/83//E-=+C5C@++H$& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6305 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30578 42 170M = 30461 -287 TTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGAC /D!.*?E"(CB#0E&/&DE-F>=HF0,?*%AC2'<##1*-<,1)8G";H$G39:@,0+E%3CG+B'C#42;#(H&.7.:!)"FH2>/-,H/+3'9<'$!<>+?%*.# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:169T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6306 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3618 42 48M = 3734 264 CGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGAT )(<,=2;AC"@(;!A0$%G!<65635.H@81A5<843-86#"('9(DE AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6306 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3734 42 51M2I97M = 3618 -264 GTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAA &'%0A,!,HG+E&CH+'8C%04(E,"58H2)F731G)+,!A$(5F+H@0(E=63%)4=@D:B@"+?C,&##B+31-%/;E(@/!/#,.119?D>"@%#6-";")7(1A=6->4?"#B07<8C@!1<-&HHC1B<)==#3@<1BB*G.&C6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:148 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 384 42 46M = 498 281 AGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGG <0!>2*E)5&!9+(#D("D?G8':G""D)E:F<-*%C7F?,5E)F& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G26 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6307 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 498 42 167M = 384 -281 GAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCNCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACCTGNTGATTTGCNGAAACGGGNTNTNACNAAANNC %*#+'#$+(!$((!!((*)"'+(%+(!#&'$$(+*&+(*"(+$"+"&'!+&#"(&$*#*!$#*()##+"*&')++"'+&%"''&&"+'**!*!)")!(("!$#!*('$*+(!%'+!++$%")()#"!#'*++!*((%!(%()"#%))('#($*%("$(%'&'))#!' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:89C42A2T6C1T8A1A1C1T0C3G0C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8545 42 108M = 8106 -547 TAAAGCGATGAANCATACTGNACTCCGTGCAGCCGTACTGGANGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGA ;+FB$BB,F4<5+1F$(=:',#F9HB%7005CGG+#)A1/2C1@@<56-C*04B: AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:39G35C24G0A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6310 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16393 42 248M = 16641 408 GATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTNCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTANGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCC 7&E8:B'?8:@3@6B-G-/'#";B68.:6+5A7H969@D$0&5&>@3BC8#H3*H51$G$AF<#472H3D1+C/&)=H8A9#C)#6ACG*27"G-75>G@B*4CC7B>B&3#9$)15@60C*?<(3/2C1;ED<77AD;5EG3##/B&);H;3!$-:."D0$8B6C91<6E,!A**59H,HE=E:D07-&-=C9B=)2@!:3=F153&G9;('1>G+>;'5H*D2AHH/:*B9HG9'H'"6C=E'E=#:F$"-9@#=,E)>10H',A3%7D*FF<688$#83*:+5)!.A"%3=2++20>/"C0-+#E&"$*GG;;)@$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T12T48 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6311 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35403 40 66M = 35224 -245 GTAGTCCTGAACGAAAACCACCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTANTNCGGNCTCGCNNTTCCGGC !!''$#"!'"$"*%%+*'"$!+"$#&#)"%'!!"'"*()++#&($$('$"'"#$$#'(%$'((''' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:19C25A1C3A0A4A0C2A4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37347 42 112M = 37511 271 ANNCCNGATCAGTTTCTTGAAGGTANACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCGGCTCAGGGTCAACGNGAATTAACATTCCGTCAGGA ($#&(!(+$#+%(%%#$(%'(%!'$#&+$"''%'"$%#)%&"'!&"!*"!!&%&(+%'$&&$$%*+))*)(*#%($)**$"##&)""%"!&'%)'!&'%!"&*+"$")"!*) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T0C2T19A50T14A20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6312 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37511 42 107M = 37347 -271 GCCAGAATGNAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATGACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGA &4,C>-%,>D-9#4>:/4$G3&'F3,:;+H?%H1/!-1@.=*A3#98;61$+$F*/,53%9F&"<)C"1=87"D<;#1G/;#31.@5A43A71@3!<773!#HA2GD AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C44C52 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42170 42 107M = 42058 -219 ACCCAAGCCATNCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTNGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGA /*5F84G,'>/%1B?#1*31H.8C#&4+GH!=<7))@6"9";&G=E"1E+E/.<3>9031)8,7#-@F-*A);!G:-B?G-+%7=G9!?D$F0"3+)-);)A/!18; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A0T70C24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6313 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42058 42 112M = 42170 219 GTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACNAAACGCACCAGAAATAA G9AF2>-600$3G"?E.?))E#*#A2'3,<)H5&ED36E@<4#&@?>/:A?=,=&B?@,'-63&*F;5H%H1/A*21"H27+E&HF1=$1=(,A!=$,HBC76HG8! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94G17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6314 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39725 40 70M = 39463 -332 GGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTT =<>8#6CE!:5=FG'>B8'/0)8%,'=5G8EF8F@<1*"+&G7!-?6."F$).,$AD@3#3G"<@E:9A@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6314 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39463 40 32M1I50M = 39725 332 AAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACANCCAGCAAACCAAAACTCG ;4%AFGG0*G49:*&'71?..%&$4"$@">26E?E('AEF>A*B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6316 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39312 42 96M = 39491 253 ACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCNGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCT /@1B!B.451.)%4,18'H.0:E5&-21#:/0E33/E::38*@0%)3H6>";@7'3<--<%7D11H=+>:#5E3F88G=E"0>F9C($F;.'8468 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T68 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6316 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39491 42 74M = 39312 -253 GGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACNGG %$%+'+')##&!'&*$(&")$#"+)$'"(%%#&(&)!*&('$#+!&#$())%+$+"%%*)*$'+)*)#!+&%%) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0A0A0T67T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6317 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24628 42 125M = 24473 -280 ACTGCAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAANCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCNAAACGATACCTGTTAGCAATATTT )+>9(/7:/)0E(-B,6F&8,C8A=0';<++.89:F:&'0?#4-=E>"B,,3@(4.9,+$D5>'!FE'G.BE84>,2E7+*):>#9#(F7"B,6BG4G'49-,#E0"$3E$1?%@+BE.,#,8=< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T67T27C24 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6317 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24473 42 155M = 24628 280 CGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATNATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATNATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTG HB.+6915.3?'829;91*%$,)9/:DHB!<(,$G+8:%%FHE;59@C30D+@."A":.8D,G!50&%*$4,C6E?125.$7H-!"BH,5*C.5G2F:%E5G<$HC=3H?(/;2)0$=9<.?%6,!).* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98A24A31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6318 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12717 42 59M = 12490 -286 CCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGNAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAANTA *"%(**)&"$&'&"$+)$&"%&+'*(''*&!$(!""%'$'""(%#%+**&'!&)*+#)& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G24C30A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6318 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12490 42 64M = 12717 286 AGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGAC )B74&+/.3#B"(6-F?5*6$H"%5!"%">"(>87A!F%0;93;'83EE'1C;<>(?4&F)-'9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6319 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13665 42 75M = 13810 222 GACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGT -0.B#!89:E?F/*=1-24'=%GFH"?( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6319 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13810 42 77M = 13665 -222 GAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTC D97-#B1;DH-1*0.5("72$35G$*4'2;@98#7<=''<--0A(.4+B""4G#4&@D2/2%1#9*(*5,:->-&#G9'@C'@$#E+1F4CH*,(=?"!A&5!@4G#@!&C;1-$46.!8.7="5@C5=$%1#E0=4B9+G%>E.B5'HD."5%-/A&9:H:1/:F",&-!3& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C132 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6321 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15529 42 69M = 15598 206 CATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGC HC%(+#F#9DDGA"?+@-D%>?4-?"@+!$5A;&7E@43'7#)/G-@/3&'F2+:?C(46E-65)/8$E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6321 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15598 42 137M = 15529 -206 GAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGCATGGCTTAAATAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCTACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCC 0;%@(>4*G,2$'+-16*,%$A.4,1+9H@E"!*98F$DH3*$'2(.DB@0!."/,4#+'?77&+?'?*:1%*B-2#,;#*=#>85(.+C1)F=C,6CG2%F<5D"B'9..)AG6.2F%"');>.G)>B%5*9?-01 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24G10A48A52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6322 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47049 42 122M = 47171 313 TGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAG "4+#8$87<.?D,)+H.-<9%-(2/2=55:9C84,=9. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G121 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r6322 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47171 42 42M6D143M = 47049 -313 ATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTNATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGACAGTAAATATAATGTGAGACGT 5?*CF"9=@>=.'$@2%!8'1BC*F:()$0.",4H;H;-)2*-.=69B#F*43(.F@57-946<5@C.8!#%H&;"$9:":*6<=B10"E>')-32$&E%#?=!%AB"$%3-8>/1C1@7#7')?8DH7"-'466F%C$G0,3+5%,.5&076*:&8'D-3 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:42^CCTATC66T54T21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6323 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45313 42 56M = 45369 250 AAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTT 9)F<,?F=/+G&D?E?.1F+'+C6B@/8:H/&1!-7/H7*%6"4A.D/B**AC5G4#;-01&D)6*1'A?29760%9<,#?G$,G"?9=$G3B0+/H3:C=9#B*7ABCHH7)04!:$5*%&<26;$+08:""#6F57-9'A2%-'CH-8?H$4="C>'+64!'<)E-<++0H@/"4'.:28G%42%2/H=(FG;$F!%6E1DAE(,?6/E.&?D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25A52G99G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39974 42 134M4D215M = 39891 -436 CGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCANNACCTGGGNNNGNATAANAA !))*)(&'%"&"&(*)"#*'#*##*&+&&$")")++(*#*#(("''&%!'$(**!)''"'#"!*#"'+$#)*'(!*"%!#$+'*$%$&!"$&(")###((%+'"%+#"$$((&%+&'+#&!&))*&"!)##"(('*%'"%')"+$)!)*!($)%!(!*+'#"!&%"))%!#&!$(%)$'+*+*)#$*"!"%%"%)(*&$&##&&$!$+"$&&&&%%$%"($+&))+'&*#*"'%+")#"+&%!&&!'*"('+$!&"(#%*!)&(&(+%'%))'''%#&''"$#%(((*$%%"")$'(*%%)))%+(*''(#$&&#!!)))*)#+)"'"!!*''#&(*$$!)$$$"($&$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:12 MD:Z:134^GTAA194T0T7G0A0C1C4T1G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39891 42 83M = 39974 436 GGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTA ;=,H#,%,C(H9"6)9)"5D,F@#=-94#31B-GF>,2%+C.*$F$:;$-B*0E';"G4E'+C6.<&#E%@9$;-:C8CB444#)3)D2$&!=(5A0H!/(1<#,@0H174"'E-=8CD/4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22737 42 106M = 22595 -248 CATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGA -:$!$*H33(=62$'@20/2*F!A'&?#$$%/45)!>//"C0*:H!#*'*A.7):?8D;866F>031G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42715 42 124M = 42839 293 GAGACCGCNACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCATCTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCA -<@CE5B=2'E(**3G1D.BH16D<,=9?.$7F4G8&5*8H$$49&$"E,E8->+:,83?G=5E?+2#6%%>D,H&-BA>'/5$'@9*,G5/D#6-F64->GGHE,,/6EE?GD(2G4=71!59%FFDC=A3=FA,><6%-H6.A&2F7)$/*F2=1HF2<57).B2-A@70#2FB.A3?&'35!7?#36C$6H11& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A97C53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6327 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13564 42 80M = 13765 289 GNTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGG *%)++*+)'#&)+*(($+%+%%!$#!$(()&*+&++'(!%+(((+''('&!*$'%"(!$#"#&($%'#!'((+(&%+%%" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G78 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6327 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13765 42 88M = 13564 -289 CTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCCCATTGAGCAGTGCAGCT #6C6?#61)&26=)C=#10A=&=@8',EAAH,!/<;,0!38CBA?-52F&*'@5E+)&*9%(.?!0+$@$,:F(+(B<# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70G16G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6328 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39919 42 53M = 39765 -207 AAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGNGCTGGTTGATATGGTT ((+!.+(FADG?-1GH*B-4B9H.<8=:F(94570BC-6E0(=(?#<8:03G: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6328 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39765 42 114M = 39919 207 GAAGTGAACGAAATCCGNCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATNT 7*+9%0C3C98@>:83++G9G9.F.0D3$EAA''.)8D1>D**+767,0:1##;#!+E6143>*$GC$&*&H*75<.'#/FE?/5!!;.*@0$A&/5?H9)<4'=A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T94T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6329 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23181 42 55M = 23019 -217 CTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCA $)E")6@:1,.(&A8,)D'4FE?#"@$0=F#.-??07E1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6331 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13730 42 48M = 13572 -206 GAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGA 2=(/G?:&7B(&AC4=0&0HF.?C>C,727'4AA-0&42,GHF#6.&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6331 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13572 42 158M = 13730 206 GGTCACCTGGCAGGGGCGACAGNATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGNACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTGACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGNCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCG "+#$%+)*&"+++%#$$+&#+))")+$&)*"($'*#)#+(*$!)))("$'&$+$'&"$"($('!%)'(!'%""'!&%*'""$$+(!(+$((%)#'+&"!"("&%()*+*'""'(*&"()#&"$+!"&#&()(#'$&%*$%$+(&+&)+"#((&#%*&) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T49C30A26G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6332 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38375 42 131M = 38216 -290 AAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGNTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGANAAGACAGCGGAAGCTTTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGNTGGAAGAGGGACTGGATTCC '#!!+%#+##'##"!$%#*(%#$%"%&(*%(+'+$"(("$&(+$$#%&%!)*!!++(#&''!&$$(#**+"+(+)'$!#&"&%)!(*$!("(+%'+(%+")!)#(##+$(')(+")''*''+$#+%'%$+& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33T31G15G28G20 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6332 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38216 42 28M5I131M = 38375 290 CGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAGAC B721H(>F3B&3>"'=63#99!1*2+,9)H=-A#!#?#.>7.!1+(80HH;!(GD(?#>F856:6&;H:B%:8@9D@?:?+C15515"4H9 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:156A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6333 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41014 42 109M = 41179 247 NCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCA !/0G8$9G#+,A('F$='01AHE@=#0D+'/77="&C$F:1"27CA#="'96*!F#D=E=>A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G108 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6333 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41179 42 82M = 41014 -247 TTTCATGGANACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGNTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACC +9!7#!*H*4G/0E-A)#+*)<#>+8<7"+H89)@D4:2F58":4%HF462)2:B5,-D"@0DB%:A'H@)8F&H2(#1.%3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T30T41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6334 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17377 42 69M = 17559 250 ACCGCAGAATTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACNCACCNAAGGTGGTG )<@(%'-!C*!5"<,';F+B&(851C7%>//GC?+C"&E@(;+@/%2B132(-73?@('9+6$DE3096 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G44A4G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6334 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17559 42 68M = 17377 -250 GGGGAACTACAGGCNGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTAT /$:D*2"30=<>6#A&$,78(;1=+B1F'D1,"AE2-!#.5CC=6;,&F#3B=;<@818*B,#H/43* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T53 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6335 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 396 42 178M = 294 -280 TGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGNCTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTAT .#;)*1C2F.1?#5$"-:/B"6!;";.7;.7E'3%<.E%E8G:8A;)GF;4;E..9DG"(F!2E<:':;$F:+20?%.-.)2)61!*##HH<"&(D6*=F;94G3(F.$"=3+F<,71>:0(:)-B$G>4'F%!-('HE48B$49=93"3.B#H21*-E+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G50A119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6335 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 294 42 69M = 396 280 AGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTG *(',G?A,5&094ED!-G!!E+)8'?/-G'=<'#/)=53-H.C2B5;D'>5#>#@:8<*@DB8-E7018 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32830 42 154M = 32991 280 CAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCNGAAANTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGANCGATGCATGGCGATTCAAA 0C,="744@)6(?FG,"'=73E?*G4*5-:/;%>!2!49G)%A)18(*"97+2AH>E:!5+'#"!2-/.G$(() AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:65T4C63T8A10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6336 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32991 42 119M = 32830 -280 TGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTT +'51E;A9C@8'<88$#$/C"F4;4#="6#5H!,A4AHE84E)*''03:;2/A7,$+*>#**41;+!!*6$B'82-(5%8H%7ADH2F)CDH7#C&31?7=EF(7;2)+B@-%-3?48' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C109 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6337 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1626 42 91M = 1725 156 ATTCTCTGGTTTTCGNCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCT #5/7CH%:9)+#!+G=>.G4<00?A;(GB:%,H=,C!C>*"7?)=C/G@!!1=4&,!.96E=DH/6,A/&(F?%,"GE$/@G5)*0?H/7C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6337 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1725 42 57M = 1626 -156 ATTGTCAAAGACTGGATGAAANCGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTA 433"(=?G':!%D,F4-)!,F-/B;5D'$)34&;1/?&C/1$?-;8"1'.#2@3!E*7*E63='/5CB=F87)D@0F811@#=+E=BHC!9D>&$A:?3:!%#HAB96!+%#/0-G08,@0/GF#1<88+533%DD646<:H@.9#0("3)" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:12G80T30 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6339 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35729 42 76M = 35551 -254 TTAGTGCGTTGTATCTATTTNTTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAA #$6E"<@/?61E#1->/9=7)B-B"'6C+@<6=#272$/+FB;9H%0"855,%#?2B2A+@)C96+CD>$E&B>+6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A13A55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6339 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35551 42 164M = 35729 254 CACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGAGGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGAT H$:'5?"*D'77',*>;@E579?7A"A)3(5<.?>G7%1$9F,;A*1#"!"A,@8573/C:9+1F:4/5$,="G+7"0??..:'-/98B@(1:4A2-0/&A0BG8-EC:&8)HH.=H9<#/AGD;7("8D-&3/9'0(0:@'>:G)G8+5D'CG7#1!=' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T132 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6340 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18404 42 109M = 18614 261 ANGGGAACTCCNGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAANCGGTACGCTNAGGGCGGAAAAAATCNTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGC &"##+%+$&)%)#*('+!)%"(&*#"&%*("!&!(!)$)$&+%%!$$&"$%%#'"**&'')(+$)!*%*(($%(&#!##%#$#(+($%($$"'$!%"*'+##$&%+(!+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T1C7G42A9G15G28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6340 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18614 42 51M = 18404 -261 TTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGNAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGG D&3:@H9><(EAF,"E.;#2(?1,7@*7!/470&GE*4D(GDA1!(94D6! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T27T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6341 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23637 42 103M = 23843 266 CANTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTAATGTTATACCAA +%'!*""%))&*$*'$*$$%"#$&'+!"!"*#(%"&#&)*%&+)($!*!#(")#%*!$(%+%!!#!#$*!($"%&&((&+&%%!++!''+$"&#!")'))("' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T88T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6341 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23843 42 60M = 23637 -266 CAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCC 7C(7+-(<+1*$+$!G=@H.8"4!;D!)D=/@#D%5BE=!)CA#"7#DE&2-D(F:/4%- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6342 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13622 42 59M = 13622 0 GTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCNCNACGCTGACGATTTCTAACCTG E)C8(:GB@@/0-H9#7#+F9)3HC%><2D!4''>2@<*5)A0A*/$9A<58A2.(=&? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35C1C9G11 YT:Z:UP jpayne@0: r6342 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13622 0 * = 13622 0 NTANNNNNTNGNNNGNNGNGNTCGACNGACGAATNGCTCNAAGANATN !!$!"$$$!#$"!"!$!$##!$#""##$!#$!##$""$$!#$$"!#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14175 42 86M = 14309 280 TGTGCGCCAGCGGACTCGTGCGGCTTCGNGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGANTATCTCCGGTGAGCC '603@-C*0+322)C'75?;6A/B7!2+:$(-03,3565(4D$DA'B9!DBA"0*'!#H&E>,3)":&5,2"&5C>B#.*%A"FHAA/B-09G56)22+%:($%0/"4>.((E"2H9::<=78$+,E*&+GE=$"#7@! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:133G0C10A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6344 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40031 42 77M4D199M = 39974 -337 AAACGCGCACTNCGGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGNGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACANTTTCCTGTCATGGGCNGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACC 5":%=H>&.((;666C,8*3<8>%=&#)D'@1,5>6#1=DH;EEG)B.'9C$!2E0;<+,('=8.?=)"AF-E9C%C,)G0.1=AD,3#+(?05<%H/$4H(D0.D)"9,.$$?:D2-**"--*9+FC@D/!.5:#C2)4&53,<#!F*%D:010)G"=A==/':*;;@C>,09+1>;#491!7&8*0F%%0<,#<%$@&(333F)F!7"?$&/#3?%:"E<03'94?91487H2@)HAF@:?&="A#G2@1)+43?0*?,$>$&=?@F7!(-A%98"G53&6>%GH22G'./('B:<0120/'1%@"0:7>+6;+5D1B")@""4+,?H'2092:51:;)/D+HC,+$*@-3::=B".FA6$+8;)E*2),2E4>+:E;97:4A@'"#'0F'5.=?; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78C119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6345 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27149 42 55M = 27246 295 ACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTAT 4#&4F0F1"!,"2,EAF-;/>;>==>3-$F',1A;4C2('D>?B!71;!/5?H;= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6346 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28251 42 40M = 28336 246 GGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCC !E4&@H@<<+>429<@@$7$/?H;39*G;@&?E4#%586C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6346 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28336 42 161M = 28251 -246 CAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTNTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCA @C&(>+8$8E$:!7-&B6:*C(>BGF<3=)##&1A.34'G=-+#><$8-2;;:%-(HF-=3?->?3:C@7<"@8$"%87*+G'$$AC2.@9,4G"#1?FB@,BD4#5#BC#G//+?@DG=&)0!1D08G#A&*=G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110G50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6347 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5260 42 121M = 5093 -288 TGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACT GGE2E6);$E.@-G#!.-E4$1>&1#@*.C*,DE2F-'@$%;0>C%&&2;@&;5G0#=+%FC&0E!D=>.'',3$%(22FH/8/0/-7/<"09F#E(91G44E8-6>$1.%@3+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6348 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21782 42 102M = 21223 -661 ACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCNCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTTTTTCAGTATTNGTTCA *!47'<."+-!&<==A000C!DC*0;&$$0$D'7;;CE.19)D&+2/*<3(.?):"$!2%F'G&>>E@5C"+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26G58C10G5 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6348 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21223 42 559M = 21782 661 TGAGAANTCNGCCTTTNCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGNACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGNAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACANCAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTNANAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTAGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGCTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGT ;F<2H*28=6@5G?/<4;&H&6*;1@):/21/>6*;,.G<+>5,#+25FA-F.'4)H-"5(>@D;H+<3>6FE&%;3)=+&,0+"EE/3?-HHDF33*3.;6@H/9+@;8CD*H1*&C%C12,"$?5@8,GF'=>>#-(->)4;)(1.7:F6#<7:3F;D.*208!!%72<@9:%D?E,2&19G?3><1;';#106$*D;45<>"92?&)?:5')->C03<%@617"2!?GF&/'C$A5H%>>@&G*;G9>G%>>(E#,D@>7-A.(D="&(4-F*,HG(5"7FD0)?7F38-+H*'5GBF%/E>)F**:>+2!.A8&+'28(-98A;;(,>3G8%.6H*<=+4!1-)7G"<2-#,(A3&6'&E2'=?/37+'AF:!8C)9:%/+*EB+2A&"7.?%6':/C>- AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:6T2G6C142G108A35A53C1C69G69G58 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6349 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 384 42 94M = 250 -228 AGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCNTGCGCAGGCCGACGC -HAC"#=DE*!!7-;HA-FG/@/A$=2AF..;D>8$:B3!,D!-=-"9"..>,B/,+&>'(=H2-<%(<3562'9'?#(!HCFE1H4>/DA+G7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G58G15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6349 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 250 42 95M = 384 228 GAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCG H)/#@&0*7,3F1-'/>(->)G/87DGE5,B!B;EF1@<4F:D:<)(/:,CHE''B853" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6350 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7483 42 76M = 7645 204 TGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTG 81(*$"H)"((1!9,(&.6+8F+<=%H4,'6>E-5.=G3?!E;.9#&,'9GDH8$15$/1)D5A"B8@*D-*+@(3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6350 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7645 42 42M = 7483 -204 ATTGCCCGCGCCGATGANACGATACGCGGGTACATGGGAACG H)8E36(1$=!<,(E*0)2'F'A";.G&C07+-F.+)"",<> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6351 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3729 42 56M2I83M = 3960 288 GAACAGNCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCT >0F&",0=)5.0,"F81(&C*5#",2F%C<9E99,(-$AF"3''<.6<.>A?DFH:HFG,+",?4:4#=)?C!CF(2FC-F<%0B?,5/*=<'G7G-<,&:#1F.!?&-=,B++FG+*"9"64$7)4"<3*;2G6%C(C<: AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:6T132 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6351 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3960 42 57M = 3729 -288 GAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGC $-E(2A::?1F7@#1#+=1;0>C1"H5EGGG##)-+E!HA?+)11$.GHF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6352 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15589 42 141M = 15730 214 GCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTTGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAG *)*C049+*5)F(A+86B7D6/"E2GG?7>.%>%,%7*G!/##97-%A:&G)9+D;7!?>>*:2>!%=4H5!65:4.305>8%2'G$><6'66(CG6256;;;G:>C-A"7D@>772-#:':G2,?7(#8(.'%?<:E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G108 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6352 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15730 42 73M = 15589 -214 ACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGNGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATAAGNCACGCNGA ?A3H-"0--:6$H!DE.(D$97;H"%7:*6!8!$.GG9@2F/)F002@GH!+"G&!A@??EH>A74?)G#:); AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34A27T1A5C2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6353 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32916 42 50M = 32744 -222 AACGCACGNGTAATGGATTTTTTGCTNNCCCCGTGGCGTTGCAAATGATC &;%)925G.@-G#=2,7D4!(F"!H?3@#&739*?>AA0#(!$F4A$!B0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G17G0G22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6353 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32744 42 100M = 32916 222 GGTCGACAGAATCNATGCCGTCACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGG %+"*4F1*#&H37',0':->($8;)1H7G:#!G5'7%'/C'+C&F;"HE!9?#H3)3D5,+%=12%&'A"->@!D"4377'9B2$%<3>G,"$:.$F;8>1(9=)*43C;6?2AA4-G?'+,6&6;#20"*==?:22"3@+($$$+3+>2&H050;>F9/7.H21:G3>=&A!54FA?CF---,/C/=9)#/?.8+<>860"52D7A:E/=;%1DF'"C(;/H1:A:62$(;& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:63T50T6G5A35C1C33G10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6354 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34288 42 41M = 34078 -251 ACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACGGCCTGNNGATGN !$!)()%*+#('#!#$$+%(#%&&+!+&"))%)&!)(%((! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28A0T4A0G4C0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6355 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6935 24 54M = 6935 0 TACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCANGCACGCGGTCTGCGCACCTA 9A"E!2H*47H8@49(*F>*,!)(EH9;;0-'8F=4?CFH):+)#E@6$==!*H AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G0C31G20 YT:Z:UP jpayne@0: r6355 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6935 0 * = 6935 0 GNCNAATATCNCCGNGCACNGNCNGAANTNNTGANCGCNGTTCCGTTCCTACA (%#&(''('#!#)*"&%#(!%"$$*$*%%$$)(!%(&)"+#+$!'+"*#!()) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6356 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24511 42 168M = 24679 298 AGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGNTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTA G"AC":5AHE%;.'"906:51G/'4@(#1+*3<$4HC6G2%;E5:F(;@=!010A?#B!3C=2%=:H$EG",DFB$2A(H):3C5).*@49866A+9-!8/6/FA3D0D89E@8-30!*F("6?E@!/:8C AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:87G38C1G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30116 42 71M = 29955 -232 TCCCATCNGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCA -'00!C&@!@::+$=38%>.G1=8$>5-+3-5"8)E5;6E9G=8?&&GE4$0#(>;&1$=,B2F6:G+)1@2!) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6358 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8834 42 87M = 8834 0 CTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGANTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTNGTGGAGTTCAGCCGATCTG 5)H0"G$32&/&50<'F, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C25T19 YT:Z:UP jpayne@0: r6358 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8834 0 * = 8834 0 CNGNTGTNGTNNTNNCNNNCNGNNGCCTNTNCACCNAGNGNNNGNCNNGTNACNCTNCCAANTNGNGNNATNNCACCNTCNGNAAGNGNATTCNNNCAACNNTCTTCANCGCCANATNCGNANATNGNNANNTCNNGNNTCGNNTNNNGAATTNNNNNNGANTGNGGTNNTNANANNCNNACTNTCCNATCATCGTNNATGNCACAANT $!"$$##"$$!#$"!"#$!$"$$"$$#""$!"$$#!"$!$!""$""###$$$!"##$#$#$"#!$!"#$#!#!#$#$"#$"#!""$!"#$#"$!#!""##"$$"$#$"$"!####!!$"#"""#""!!"!"$!#!!#!$!$"#!"$!"!!"$!$"$!"$$##$!!!!!"""!!#$!!#$!$"$!!$"!##"$$$$#!$$$#"#"!#"!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6359 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47509 42 200M = 47427 -282 TTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTNTNTTTTGTTGNTGATTTATGTCAAATATTNGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTNCTTCTATAATANTNTGATGAAATATTNTAANCNNAN +"+'&&%(&)$*((*#*'%*)#**+)'+)'&$)*%%$)'$&)'()+'#'##!*!'*$'#!*!!'*#)%&%+'$(*#)*$'&(!%'&!)'$&(**"#+*"#'%)(%"&$+)!*$"*)""*#*"'!+$+!++!$!*$*#*"*&*"$(!*#$!&"$!"+")'*+*&#&!*#&*!$&!(%)''!'"!$*%#'$#)$**$)#""" AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:21 MD:Z:23G1G8A18A109T1A1A0C1G2A0G0A1T3A1T6T3C1G0C0T0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6359 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47427 42 82M = 47509 282 TCTTTAAAANTGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCG )%*+(*$$("%)!)!"**#&$%%%#&)*!!)#%&'*""#!"%(*+((%'&!"%&')#!)#(#$(%(#"*!&")*#$&*&*$$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9A72 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r6360 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33992 42 91M = 33992 0 AGTNANGAGCGACATTNCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTAGTCTGTTATTTATGNCAAAAATAAAGGCC %))")""+%")"*"&*%"#++!))+%+)$%#%+#&++("!!"'"%*'!+$$'(%*&)*)#(*#!*)%!#+!)$)*'%(+#(#)"*+"$'!) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T1C10G45T13C14 YT:Z:UP jpayne@0: r6360 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33992 0 * = 33992 0 NNCNGTNNNGNTNANCNTNNNNNANNGGATTATANGGCCNGAGCANANAANNTGNANATNNTNACATCNACNAGNANTGCNCGAGAANANGGTGAGCAGANCNANNGANNTGCNNGGNNGT #!$!"$!"!!"!##""!"$!"!!#"#"$$!$"$$!#!$$$$#$#!"##!!#"""#""#"""!"""!!"!##!$!"!""$$$#$#$$#$""$#!"#!"##$"$"#"$#$#!#$#$#"!!$#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6361 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24376 42 57M = 24613 355 CCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTNGCAAGTTACNACCGGATTTTGT >EA#120.1@?;GB(9@0%$E9F*(*9;#74F5B$5:3/2%&D*.B;,&?C76F..G%?#-;6;B/,)E3?C!/#0=B==:)3#40 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T84 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6362 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34285 24 84M = 34151 -218 CATACGGATAGTCCTGGTATTNTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTGAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTA '#70C7;.?':,?6G@?CE"GD:<:/'1:272(@7068:'7*C;@E):/FD#E$?>6(6-:A/*#%A;E"9<).E0/F"/&E@.@(6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6365 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16315 42 52M = 16128 -239 AACATNGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGG 7=7CC#1?D!D7?2GG1&$2*D?:69$*F.1>>CF?!G.$!):!&"+56274 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6366 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27234 42 143M = 27078 -299 GCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGNACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCA =&G,,29#+C1/CD##&G701DA+E39:$@E>36C.=3&>?C=#(/0@=G+.#/?A.AH?;.FB?A<*73;/H. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57G85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6366 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27078 42 130M = 27234 299 TAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTNTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAAT HC-9:06E'(D3HD+0,C;3>)E4ED-8*C.,9,$&8"F99C$<7FA,D$=>5>;(!"2#(;5.E6>).$F!%+3!51B*"7C+D4>2D#507-4=-;?(9.C655(/A#<-!67"C0##GB#'!079'9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G97 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6367 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13481 42 68M = 13481 0 CGGCCAGCGTGGTGCTCTGGAAAATCGACCTGANAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAAT D,D+(/#);0783(6A>,8.98@!.5F?#'!!3,:,<6?#%E$1>AH276*F2A7!4A+?F!5$GB*F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G12C34 YT:Z:UP jpayne@0: r6367 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13481 0 * = 13481 0 TNNTTCNNNACNNNCNNNCTGNNTGNNGTCCTTAACNNNNNGNCGNGGNNGAGNNNTGNCN !"#$$$#!##$##$#"!"$##!!$"$!!$$!!"#$!!!"!$#"##!"!"!#$""#"$$"$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6368 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42299 42 110M = 42409 216 GAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGNGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAG C,(/@1A#.()(<#C%7=$6F"*<-)#(.@F;A"+='%F84@;#1=/'H/7)/F14/??=2B/2@#+;A9>2969*( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6368 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42409 42 106M = 42299 -216 CTCGNTGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTG 2C.F6(8/?,'"?G4>1#*!(36F?=+?&#$(??4=7H3E0FA>-.49>FDE:7DG6&+'.7$@%DG(9).!CF;55 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A25A75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6369 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47979 42 52M = 48203 276 CTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTG H#B3"8:8)/".6591&@G/69@#03HE=E'%?-3C<$&1F%9'+F&:!!72 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48203 42 52M = 47979 -276 GACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAT >?DC66503=%G:)'D8(F2AF7"!!;2A+4+G#>1--A)0.#:+;32;H:# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6370 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12468 42 99M = 12468 0 AGCGCCACGGACATTATGTCGCAGNTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAG 048#/&=41(.9!88EF11?:7#+>C!1(@H;24-GC@-@@&">&C0@;G&5(2')+;*;,A>D"<)1A#=C-C41?,3A#,'7>(!4B9:GDB8#G#$D78B3'@:1A%H$2(?%A+E9/GC-75+7/A)&):8#?D/) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6371 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39739 42 161M = 39979 332 TGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTT "<-%/5@=1'EFB%*$9186/*@'F$-A0GA=(=008#+$:!*/B!.90$/=@92GH&3#8/FCE#35:E&E"7/2>>2H43.46.5;+5,CH-F?1)/'5=D+.%G?)'4+@'58B&G?;:)BE@6!0-@>EG)22(=?>7%,B/<"F*4'#!@H=B2C= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C160 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6372 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13190 42 373M = 13563 604 CAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCNNCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATNGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAA <8EH"#!HH4)=4<=9*G/#1*&4H9CB'6:@:9B$=(%2#=?:E;5'1+H81DA.&B(01>#,<=#G9-%/95-&!(HB.!,=*3604/)3G>#.C;&6!A-7/!8/49#+6$-7@FA7&?C$H,@?(:3E)!,E8#$@;B:,(?AG"6+FG!@F,C,#?$")-07B6+1FDC9D@2;2(-42-%17788H7,%>5G,*?7>%&0.9&H<9%2;!+C3%0C$B+AEE!'=#--@+",@@'7B>(F@@=#B$0*/A?#42F(A),!3B3/*?>$47&,GE9B-&+<@@=FFCCC)*30$%9$0@2C7,>BB$9DE)60DC.A1*$#CC->9-ED+>8%636.*-,%26)A5E'-+6%='+31*/?%)B6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:89C73G55C11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9688 42 55M = 9520 -223 CCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATNTGAANATCN "&#&(')!""#&#&'!('('!#')#*)"+)+'!!+$#'(+!*+&)!$#"$((&'" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45T4C2A0A0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9520 42 161M = 9688 223 GNCTAGCCGANAAGAGCTTTCGTNCNNNCTCTNCGGATNAAANAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGCCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATNACC (!#")!*#&#"'#(%%$$%#%%))&!$$%))')((**%%$!)"&+"(#$$*++!&*)"*''#&&$*&$#&('#($+$&%"&"$#+$&+*')'%%*+')*!)(""$+)%*()"(&*)*"&*)&()''+""$)'('"$'++!+)*)+(')""#&%+'++&##+ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:1C0G2A4C12G1G0G0T0G3G5A3C56G57T3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6374 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46255 42 40M = 46165 -130 CAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGG FD2+6&)>EDD<*@"@9FD118,C@E#D:B38.";425E0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6374 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46165 42 54M = 46255 130 ANTACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATG *$C.B%/.0+*!/,7>42"0!%/$=8"G#D.G-75E-).;E9=F43$: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6375 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17606 40 76M1D16M = 17498 -201 AGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTNGAGGATTGAGCTGNCGCCGGGCTATTTCAGAAAGCCGCCA B3.G/)&6,=+"F''<;,'300F/'6-;!B*%("@&@BC@2=C3;/H*)B2,/7#G"3&9:>.-5=>.7E#&B>90>7(@D'HF10)#C4?% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:51C13A10^T7T1A6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6375 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17498 40 90M = 17606 201 AGCGGCNGGTCAGCACNGCCCGGACGACGGAAACCACACACCGCTTCACGCAACTGGCGCNGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGG <$+>AA:GEF&!F=4;AC1(@D69*)E(!5/3$D4A+7.H'9G#=+"B=D$3.5:311(G'>A0!6,(D6+(2)@:@2D8)#6E8&30"% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T9G21T21T29 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6376 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5661 42 69M = 5509 -221 AGGGGGCACNGGCACCGCTGGCTGCAGGTTACCCGNCNTCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACAC $-B5$B9G>!+H:6D)%82!=%7/06(8/&&<=F+=.$4@!54B9:3*'+.HE6-(4D@+4-13;@EB6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C19A5G1A31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6376 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5509 42 56M = 5661 221 CGTCAACAGTGAGGAGGNTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAA &&1,=?$!1&6?;A'HD!7"(2D53>,:A"6/76'9'(=-;FH.+.&>7<)H1BA9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C5T9C38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6377 77 * 0 0 * * 0 0 ACCGTGCTGCGNTCTTCTGCCATCGACGGACGTCCCACTGAC ,A9-7/'0H2C9'H?=.<)*864)FA&G17+/!60%:;@:?A YT:Z:UP jpayne@0: r6377 141 * 0 0 * * 0 0 TGGACTGCGACCGGGCAGGGNCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTC 'EF9<""#6!C$49!!&9):E+E?@3F:*>4)%(!=A1%C3?"1.C@; YT:Z:UP jpayne@0: r6378 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3334 42 75M = 3162 -247 ACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTNNC %"&'+"+*&#'+&**+)&!'*'%''&%$')$%$('*$%")*!$$'+*""&$$('*+$#"%*##())()$#+""%# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17C54G0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6378 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3162 42 40M = 3334 247 CGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGAC EE/+.)*9/'C0F'C,.>3//3=(!6(;,5%-<1*5.243 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6379 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17295 24 95M = 17458 213 AANCGAGGCTNTCGGNGAGCCNTNTTACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTNACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCA *($%)!#(#((#&*#*)!!!)"$#(+(%%"!+$+'+")*%#)*"$&++"'((#"$"+$*+)*'""(+#)"+'(#"'&+$!+%&!!)%(%&#*&(' AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0C1T2T2A1A0A3G1C2A0C1T1G31C37 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6379 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17458 24 50M = 17295 -213 TTCCTGCTCCTTCTNANCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGT +>CA$"'A*A8D&E92;;/6?%A"$C)=BG9F<53=,H4%.AA4>:F%&<.@)+6,3@<(C7.1%D+!H':6G)6@$,D=)@;@5D?#E5CA%#&'."4/*@!6-4<(%BB54!,;..&4'?(7'$?"A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28A46T28C37A86 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6380 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1741 42 89M = 1512 -318 TGAAAACGAAAGGGGATANGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGNGAANATCCG %%*&!$+#"')+&"+"&+#&'")&'+$+)+"'%&&)#!*%%&&%*(!"&!+*'("*)'&%+*(%(*+&'%"$#!'(!)'+')#')#)') AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:18C44G15C3C0G4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6381 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28621 42 122M = 28434 -309 CCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTGGTGTTTGNGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGNT >A&G%F4DFC99"22!(263)1;'#*7&-A@,&?*H6;:)+-3/'='CA80&)/C<.*7BB18>"1@>,$2@E,H@#6+CH29!*;,<1!>/;&71?<3GH(#79D'=9'H&;*G2CG81<"6(9;..@7<"6:/E7;!HE>93@6'1$%>6F3C*:0'>)1*E@-:3B#!.,--<*'D>?E.EDH:G*D#F:7&,5(.G=F8A9)15')!HH&5$)A0EE!CCC0*HB)7?=/D2G-<*F$60EC AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:104T29T15T36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6382 77 * 0 0 * * 0 0 GCGNTGCACGCCTTTAACGGTGCACTGTTCGTTCAGGCCACCTGG )#"!((*+(((&+!%%&'&)'%+#*$&!$($&!$'*&%'(&)(*& YT:Z:UP jpayne@0: r6382 141 * 0 0 * * 0 0 NGAATGAACGAGGCGCGCCCGCCGGGTAACTCACGGGGTATCCATGTCCATTTCTGCGGCATCCAGCCAGGATACCCGNCCTCGCTGACGTAATATACCAGCGCC $+(4+?,H>63<<0;%0>$(@#)CG&*0-A+7&%F,)A4$><<#9CF8"D/.<;@E*G.H.*0*<3F!>/>36.AG?7",&82<3H1B81?=-H-$6G+ YT:Z:UP jpayne@0: r6383 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37913 42 95M2I17M = 37803 -222 GTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCAT E;H*)+.#CF$1&F$6&(;H??'&*$>7FH!@<783,F2,4H@4+13H?/;.20,@>#>%--$;:49B)A:<&-D6;24%#H!9G'<5/,F2=E%"(51H8?E8:.61#?-)0G AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:112 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6383 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37803 42 106M = 37913 222 TGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGNCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGC ;B+))&BG7C43@&33)*-6F.?15*=!(H,%.E<&3),*.4<%50#BA,G!/>)F1A:.?:>B0209H,,-,%G8D7C2,>>734"/0#$*2$-$*;=6 YT:Z:UP jpayne@0: r6385 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7172 42 123M = 7020 -275 CGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGNGACGAAAGAAGAACTGGCG 35&'0&8G+3.>/"E4AF(;*8C/9-$7:=#&0ED<=E'>2=0)&2;'E6#A8H$7%*<<0D5<##'>>B0!?0+C:F76*.1!(?:@A>23+/:33:1=%5HA*8F0E9FH=9%(A"8.D5/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103G19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7020 42 87M = 7172 275 NAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCNGCA )(+%+*(%&*%))**$$%++)!()#!)'*))+#)#!"*$+'*))"%#%(#(&%+#$'!&***$%+!!("'))(('+(+"$$%)&$'' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G82A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6386 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26599 24 88M3I12M = 26708 165 ATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACT F?E,.%;3>;.69!0H<>8C:20$G:H0A,00*#D<<)#?0'*5,G-3 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:89T2G2T0A2A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6386 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26708 24 56M = 26599 -165 ATGCTTTCACCTAAGGAAATAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTNTCTNN "#&$"$)(#!+%$'"+)()&%)%!")+)%#$#(("$&$+&)+%#++*'"+$)*$!! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19A30A3A0T0 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r6387 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24737 42 52M = 25015 349 CCTGTTAGCAATATTTAATAGTTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCT .5H@A%8,6=5;<##*5;1"A*?:+63$'E7$H92:H-@C+D3F1G1<$)<'=5)E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13054 42 136M = 12915 -275 TTCAGACACANATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGANGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCA C":7*0-3($1$65;A7+6#(H%$A/@2>/&2G<"G!)A5<4(0C38#.&0+7@,<1D348,&#?&+H5!7.H3H/#,/>!=16?=+@G*,,9+-(1''<'%'G'170;&/72>#1&'A:(>!@$==)8001A5:! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G36T87T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 639 42 119M = 792 260 TCCTGAAACGGGATATCATCAATGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCG 21F((!%CH9@+..:C>D!-B7H:G>2FE#1'=66?D;5?,6;C%6E"079H+A%,92*#@C2@%35F1,?4#'6G/*C!6GDG9,A4?!@@;B9,>0:D#,.?)HH7!8'*+/<&+E< AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A91G4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 792 42 29M2I78M = 639 -260 CAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGC ##<4-.EF/3G5,3(&/6E!1"A*!(=!;+.@8%C&+D2A8('62"";%+E1+3:8"7<4)8&9H#0!2?>+&>!HDD3;E@D0#4(BC66#-"HE<9$G30)508*&E)F*+"0>H0A$8E#4G33=*+769-)@H32A;?(H5C#.DB#G2?'(6B5)8"-;C!&-$!B&3CB;$@'B0>;"@"2E=."!HGG59+@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:49T17G110 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6391 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24562 42 64M = 24699 315 TTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCNGATTTGCTTCAATAAATTC 0<)EC44-6-7F>?7A%)>&%708+B7=7'4%/78,$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62G1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42826 42 233M = 42756 -303 ATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATNGAAGAGTGCAAGGCNATCAAGGCAGAGTACCAACAGANACTCAAAGACCTGCGCAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAN <=,>2;*)#D"C"=7>$#E;">)/9@2#@,.A,-G?'G11<"/.!?4=$AC5=FFE2E4)7=83G4-3B-.!*=D1#09";8C-5H94,%#H$@(!"3(7>;,E4+8G;4)D,C#<@6@';6:+@B5;EB.+HG<%;'#;.$!.&0,1/@!?5"(!?"(&49/3": AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G15 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6395 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16965 42 220M = 16899 -286 CGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCNGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTNCGGTACCGCGCTGNTAAGCCNGGTTGACGNAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGTAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGNGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTNCTGAACACAGCGTATNTNAN )($$&(&#(!()%*&**%($$'&'&#)(#'$#('"!!+"'%$!'$'*"$($#!"#)"#+(((+'#'#%(**+#$*(&"$!$&*+&()"!&"$%%++!$$"'!)#&$(($!&'"(%)!&)(%$)+*!)'+("'%#+&+('))"%*"*!+$$(#'##!"!&(++$%""*')+)"!#")&%"(#"%%))%*%!&*&#*!&"#*)(+(!!$"&*"%$%+"!&)! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:53T32C13A6T8G22G24T34G5T9G0G0G1G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6396 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32611 42 128M = 32818 260 GGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTNGCGAAGAGTGGTGATCAGTTC GBHC"=&%4!G("%'=.E2(.:G9!B)7<=?*52=%$$F1$=&-$<%7$*1>E83:,>H1@/'6+B;+)*"5'/!6!3/35A0!*/%;$EG;@"H'FDE-5=.-F4=6H),=."&-$2%:<1E?#.93 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106G21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6396 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32818 42 53M = 32611 -260 ATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTNN @#9@B$'G#0.?F?9@+$%$'/.5%5+CF'(9#E@($,79H16H-A?C234#" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51A0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8052 42 91M = 7924 -219 GCNATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGCCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGNAACTGGTAA &6A7<3GF7E0$=207880A3D<3@C5EHE)!,7!47+9(F,E&.B.H1!4!-@/#?::$D8$3-=3+;27:#.4D6$%82:H@7D3+7!< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A45T32A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6397 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7924 42 128M = 8052 219 CTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGCCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCNAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCC DAC1<8,+7&,!>-?@36F684"8#2)F76?F-0.!C$*!HA=)1;7:%%$/-F6&+0/B4HF0<,2>8G&157A!3#.5;-;3F/!:08"HD!@:*8< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77G26A23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6398 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19890 42 155M = 20087 264 TCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGG <:(FB4E$7?0/5'=?/!&-7?5FF"-*890D$;(+9'$'/5B92+CH?9;76%0E#E;D'4>6DF-%*'/&!4)./@D7$@H;9)+<:8@2EAD"C;++;@=G&)?0EB",,4**>G-0<)?4<EFA:#59, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:155 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6398 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20087 42 67M = 19890 -264 TNATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAA FE>@2'1"-"&9=$0@=!-!=G&4A'A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G10C54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6399 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27076 42 50M = 26915 -211 ATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTNTNCCANGTTT $$$)"'#&#*"#!(')()$*"!("+*!+*%#*!#)!'!#+#!'&"!')%* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:39T1T3T0A3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6399 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26915 42 94M = 27076 211 NTNTTTTTTTNNACGGCNGGAATATACCCGCATCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAANAACCGCAAT )'!'(((**'("*%&$('+!("!*+!&%$#+))!$*%#++%'%'!%(+($$(%$"%'"*$'''++&)("!%!!)$)!')+(*!*""*)++#(%) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T1A7C0T2T2A13C52T9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6400 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47173 42 40M6D213M = 47111 -321 TTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGANGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATNTTTTCGCACTTGATCGANTATTTCTTT A#=!3A.4<;F$>'E#6FG-1=3=H=G0!3+=H;#9@$2..;5F&C5(<#(+$B.#04,0%=$6*:D>5,4@*=3<$(6>"7=7E4;*>(HAGHC(,+).=?9%/F-9,(<>=D9B2;9""@,0=:.*3+!.>G@12$-*/?/-8@'$A;9-5#&"")1.$F(9$;4B6)-0!4"$'G&F:9D6:#8+B'?#B)B:H#?6$'H/9:#&5>8?90&8'EAC5-7)--H<#414,;.>.G:0<(/'C AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:40^CCTATC98T86C17A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6400 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47111 42 62M = 47173 321 GTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGAT CBD:,2E075)'7;B(-!B;/3)8=(8:@;G9,F5)>D8E/#3G/9)@H*)*.C5-;D-3@- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6401 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 722 42 99M2I105M = 926 327 GAACAGTCAGNTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCANCGANTACATCCGTGAGGT <@3;>?@@$13)>!5??2(F#6>$25*=/C0(0@/!B9=G;36-E$02+?&:2"49B*3+:@>D;->;;C(/E)5G%'#&"A8/3@F&+D*;=H#G9/>9//.&0*."-#!;:&@:3(-=#*8+7)/9=%%=.##;G'<,#A>#+0<'C&96/15&+31A% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:10G20G153G3C14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 926 42 123M = 722 -327 GAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTNCTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGNTGGTGATGCCGAGAN @G4#(3('1@-*G9E27(#/C%-"=D9+"7?8GF7$"-"$==@#9#.D*(),>+?-<@"D=3'B;!8>>G=3B(&C4"(;@65%8;+$;4)8B@<+B-(6,<(=FFH/2=#4D''H"/>5@:# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59A47A14A0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6402 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46450 42 356M = 46806 464 CTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGATTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAGGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAGCAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCANGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTATAAAATT ,5-*$9B".7:F9>1<7H#"D5?A)85D*@18G*.2-#64'>'6)0??!/F9E3%@?>D.25!;"='-;38E$354?)5;)5=G2$,3C7;:/,4-'1=.3DB1$49H*38)#%,H')6=!63*3.=HE:')CA=)C(C;#6;8CC>8&/,A>BAH(%!%G36975D?*-(=)-3@9EBA>/A6?D?'+88DC=@!4/84:,8*>/*.1&678;;)(C7EF'!H'9:H8C1:706D$=D*=21,8E5'--"@=7=)*'+8#A%%2E$&>$<*2+D/B%?;B=G89!$(?GH%)2EF/F&-#C#2H7*+.2%;0=+BBF)C@8=))@(!BF.>;37;=)B*7-)6!**;?5C;9"?233&*!CG.*075)0$.?D8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C23T75 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6403 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46411 42 245M = 46656 412 ATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCNATNATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGNGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGNTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCNCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTG 0.F/&"2>7"%7;C):H5=$/;488*(B'.6+H+C;F!7.::H9;>%*66)6@77;9F*4G59!;,CA6.'%@!#'A9B5>D)=+DCG",72)8624E%>6-9.4#A;,$%#E/%@#)1$0(!/H1@260074#=7+#*$+'B7"(9#3C%E+5(82$G0*<*23DD9:FG0"F,>B8$A,D7,=09H14;3@..EDG7%)A8%$=D%&12.*0$7>-CAC$!&=.H@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:46A2T28C53C29G82 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6403 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46656 42 167M = 46411 -412 GTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGAGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAA :2'G3E2?.$?>$#BB@9$8F/97?77F3-,>B<'>C-79G,F(E9;?2:1A8$H<9;&#&&C"&4!3>G=)F3H7F::?#G3>"G:6+#-1&1B&;;!DBGH!HD*;*-1+GE#<;#F;!5.F""E(->!4:(A(8AB/-44@?34G9*F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64G102 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6404 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12562 23 87M = 12779 274 AGNAGAANNGNGNCAGGNTCACCGGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGA ('%*&!*$%)$"'($$$&)+#)&$'($"+!$&)"+#*(!&)('&'"$"%!"*'+%!%!)#'(%$&+')'*'"!#(((%*(+%!$&*$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2C4C0T1G0C0G3C0T5C63 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r6404 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12779 23 36M4D17M = 12562 -274 GCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGGNG D;FC3$=BE?&?7$2$$/$"!?*F>=4E>+64(:),5-7>6C<29.-;E/$"& AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:16C19^CACG14C0C1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6405 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35545 42 45M = 35351 -239 CAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTNANNTTCNCT ")##'$&"))!!*#***!"'+**'#"'%"")*'+($&($&&$*%" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G34G1T0G1G1T1A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6405 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35351 42 110M = 35545 239 GTGCATCCATCTTGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCA )+******#&!$+&*")"*&+##!)"++$!!##&+++!#%')'+&#%%'$*%)&&()'"&"+*%#'##((%&(+!+)!!(("'#&'+')($'*''#(%"&)$$+&+!'#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G97 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6406 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32644 42 44M = 32421 -267 AGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACNGCGC C-($B0E?:/A&E-<-9"E@"%'38> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6406 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32421 42 61M = 32644 267 TGGTTGGAGGNGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTG **%)"&&#'(+*%'&$*))'$+&&(*#%*)*"(&$#)#('&&)+!+#)#(#%+$'**+&"% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C1C2C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6407 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39279 42 216M1I34M = 39529 303 GGAGTGGATNTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATNTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTATCCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGNAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAANTGGACCCCACTCGAGGTACGACCGTAACAAGCAACAGGCANGCGTGACAGCC "($&&))&$%++$++#+'$((!!&$%!)"(#$$+)*!'($*(()""#$%**$&$%*"#%$'*%+"'&#)&*+"*)&#(%##!)"!'$+++!)*%#)")&(%$'(*"#$#*!**&#"*!!&$'!#$+*&##++"''+!*+&&+"'*#$!$%(#$+"!$!+($%"&%!'%)$*%)$'*%$)'$&#%"%$'!!%#''*))"&!("')+#$')'&")'$%'$!**$*$&)*$$)%+*'$($(&+$"#(&&*$+)! AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:0A8G45T51A57T32G7A6A0A2A20G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6407 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39529 42 53M = 39279 -303 AGCAAACNAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCT ,A(2"*;1$*B2*!9(AG/6>02%C##834$0&/8>F<3""G==EG5&>4<.C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C45 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r6408 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34049 42 91M = 33975 -165 GTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTNGCAATCATTGCCGTCG 23%5H,>B@9&!$,6%G>A;++/B%$0HHH8:7!:BFG*+"*ED?!;4,<,-,=5<@AD0C6E#FE@C&6+0"(5.>-%&87ADC(G*%80 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6408 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33975 42 56M = 34049 165 CAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGA =:;"2@G6B>"F.@:$?AH@6CC:2B#3#99%$;@>;<.DFE2$DF!G+E2*7=F*H,2*+,B-$:1<.. AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7C14T12G5A5T3C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6409 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37388 42 88M = 37173 -303 GTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCC 3@*91AB:*:*"+%D,1G6$A+".$"+95:@9@53E$B>@?+,H.?E$C211/270(B$=H3'9@(,H16E$$43F?&>8!7:E%:1;#*-AC"?@-2"++B&&C">%.><"FG6',B7F3'BE#.-;A.%=@4E%/4*HCD9G937;/,B(,AF AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:182T0 YT:Z:UP jpayne@0: r6410 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15684 0 * = 15684 0 CGACATTGTCATCATATGCNGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACC 530+1.$@4)1-=#')+B9:A9C4.#,!D6#C>9/B=G/.D45E6=?.52438C8&!GC781'HF&&'07*G6:.&@:B):,2>7?26=G1)+HDF&.4+D8C5&'7">0A;?,5->;1H<7%2=+/7D.""H+@@>1C96AF9F1FB.D/:<=+8B:'9?<+;:/-'/@#*;9BG/3<@$H;C< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-49 YT:Z:CP jpayne@0: r6414 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8519 42 53M = 8647 243 GCTGTTGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCG $*&$"!++(+&)(&""*%)(%%&))("(&(&(*#'"+'!$##*%#+*'+!**# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C0A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6414 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8647 42 115M = 8519 -243 TGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCT 08*3G>/734046223!#44)3.6:!*)@+H>>26)31)(>5D4=B;4*54(4?DD3,).44!@EG'+)F$?2A59G.7BB$B#<%4:&$/E(?9:-8860D6'B*,/;,A',// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6415 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43311 42 51M = 43452 248 AGCAAACTGGACACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCG +!!)++("#"+*"&%(+!'!$#(###)&'*#!&+()&()#%))!""&$%*$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A9T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6415 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43452 42 107M = 43311 -248 GAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGTAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGC ?79*=C1)G-5*38;<2=7F?A&5C@*68&:@A8@=E1&FFG:-75<-179*;1+A?('G3/=;H2;?H37&-=G"8*7"E"3!6*H'A<+H8;F'>6)->2))3@A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6416 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41847 42 115M4I21M = 41689 -294 ATCAGGACATGGTACGAGCTANAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGAGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGANTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGANTN !!+%#$("+&#%%'%+!&%'+!#%")"!()%"(*+%"&+#!+")&("'%&)'#""#&+#"+")%$)"+(*+*%'+$$#&"++%"')!#&%*+)('#+$%#%&)+"+$#$#'$'#"*)'%!+)(*)$&'&(&!%$+)!#"" AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:21A33C29C46C0A0A0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6416 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41689 42 158M = 41847 294 ANATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTNATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTNTGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGT (&F;B2+".9)$2F1-2B:"'B>)4A:&B5643(8/@BB:=%HD281(E:?G/;$A)'C";/.<4*4@5!0;2/>325H6!?G<"?7A%41"42#<6;"7HG*EB!<'!D0&>>2B6B<32%5E?#-*@,$2!-+#!"H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G26A59A69 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r6417 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17768 42 217M = 17985 320 ATATCAGACAGGTNGAAACCAGCACGTGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATNGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACNTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCNCATAT ?D"HC$(>91+))$B&4+*$9&*1'(H>A@&$&9#2?-24'&:=:>%5=-:GC'.C/2*036!!&;&G$G(;F91G88@EGE;7D'B)+G)F+(;1A8;:0%3:++1!)4'=.!E5<$3:#".2/'>?(E8%*6H>)/(1F1=<@-4.4@E7&1H<;/?778%!75:597A>EFC;(A//E)&08$*<#<'>*( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:13T12C28A39T115C3C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6417 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17985 42 103M = 17768 -320 CGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCC /))$?D4;E+46$$C%#"$45"@B8D-=',2$0;5.B8!A?7)F0(;%%"%+2=,12*)H?-B"C2#,AG-2+).E104-GA8&;&C?G=EF-)-,>$0&?"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43462 42 74M = 43536 336 TGATTGATGGCTTANCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTC !)"+?C@$G7D'D<>"AA.+C27F-A;!0B;/85%=4)))/9;)'E+,9#-C0G35#94@?%$:81B!3!'/H? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6418 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43536 42 262M = 43462 -336 GATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAANTCAAAGGCGCGGAAACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAAC B6B$G;0$06,28A":5B6DG-5E/EE'9.-#!>38:%60%,0>H.HFE+*!"('BB9&.G+?+-"D$*%&H'<1>6A97C&-'E9=*H090,*5:+7;G<999B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:213A13C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47464 42 61M = 47525 353 TCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGA A%B(D&@!.HAD$E18'H*#)D04"-7B3:-3B$!DF9"%93&8A5F2);@<)+!+B+C8? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47525 42 292M = 47464 -353 CCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGNANAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATNCTTAATAGCACCATTTCTN C)1,D$/!&%H6HDC*<3)D"02FG+:"5A&E'=5?5#1.?!<;!7?A!5%:2#F@"554E73/&#'B3&E!3(C-?204=5/?,+/!C)8?G&(:85,@"*1=GAA.<7541>.9%7+@==/6H6A3'+<71?;5G4:A07"HE=A$(-;)<2;0H))F=G$!#,9#5.0#51+$=D@/H.F,:+,(703-/+""&"H1=D=9):<"&/$2!$3$'6382)()3(,:'&.B6.5>E2G?&F.*"$:$61';".>=*EF>?=4" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:188A1G81G18A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6420 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4125 42 53M = 4184 319 AGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGA ,*+%B!D+!,BG./-(<,H@/:1*3"%A+'5/)$7#G"$"!)8+;BEGA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6420 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4184 42 260M = 4125 -319 CCGGTCGTATGGCCATCGCTGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGNCGGACGGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAATCGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGTAGGTCCGTGNAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAANCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCC ++'!)#&!(&$$+"!")%%#%"(#("+'#+*"!"'$&%##()$)#("!"%$(()*+)"+#'*%#!')#**+'!'*&+%("'*+*'&%%(#)#(!$'#%**%'%&&&&*')!+%'+#+'(&(#+&#()###"$'(%")!&+*"!+#'#%(*"'*(%)"#&$")$"$$")*+')!&($"*!'+*''""+$%$)+%*&#!&&($"&$$(*)*(!'#++(!%%'$&++($!&!(*(!&"+!+%(#('+**%$!'!)#*#'"$++ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:18A41C5T27A33C9A31C89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6421 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33186 42 43M = 33324 217 GTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATAT 2",2>(?&+*!@-.C@A2!1<:A:;C79=5"B//B+;6/'8C' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6421 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33324 42 79M = 33186 -217 GATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTC >96%=0>5>=-,'7620+6"9.F9*3A:B-%0<:5<3803"'2?$>BA2@%H3C?!.;E2C,(%?5%"G,)D?D7@;6> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9285 42 43M = 8991 -337 CGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCA &%E-<((7$8!6A6=#.59#,$8B=B/!3#5FG.5+=@!.,2? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8991 42 35M1D258M = 9285 337 GCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCCTTCAGACGTTGACTGGTNGCGTCTGGCANAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATC 6-<'=7.3"0@-";83#&0)H-'-/G2D*A&(=D671C+09&C;92F&5C2+B-C36*;3.9##%<"H3:-;4*.,AH*==1!";/,9*(!5-6+0#>->!E.$-(8E?H2CF),%&,@@?#=)+C));GD(%(69-'G5*"05G7E*1.=*$E?3$3*B5E5*=#/D*%28&/@;6$?;%?911>/*;+>()E(9!"#0+F0?+7@1+?BG@,0A'31*7#$D9?&B?3A+>@5(6&9'C348982-35+%H=)A!94F*'/ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:35^T19T17C10A99A109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6423 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12445 42 109M = 12554 376 CCGGCTGGAGTGANTNGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCNGAC +(#!))&*("!&%++#!!&'"(#$'&!)!!$#&$#"!$%&!&*#'")('+*&&"'"$('"#*(&$"+(+(+''!*"'*+$"*!)"*'*)&$#+"*%!#$""+$*&*#*& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13G1G89T3 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12554 42 267M = 12445 -376 CGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAACCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAG )D"(H18,!A"C>A8<3(>,6F/5G84+@80<%9C9<"(/6C;DFBD2/"86%D76H%33GCB%%9DF3!(5F;"G(.(*1=67"&+/H+&'EHE1?&(A9;@+(5D:&?<=)&CF?BG1'/+:H;HC;+-%@9E?F%=((6G:#8GB:;;!H&,+)!-$'5>2/?4>;8)6%;DG'G':3?.F*)A64)8#35#B8+*#G"!!7*F7&(.*8)+5A3":11(5(?)G3!B)"FG<2B-G$8$!H1A2C4&)B= AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:69G93G77C19C1C2A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6424 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17626 40 41M = 17705 243 TCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGA +@/$G9?9$F("#BH;-%*G;&&0%.95!<70=:<,,C4;1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6424 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17705 40 15M6D143M = 17626 -243 ATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGACTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTNTTAT =E$>-!3*9.&@,CFB2%?BG?G51')F;6#5*%$'-$24?0(H897/%!-*<'G'!&94FGG*C;&F-(!)!@""/$D=+#<=3A?:)68-);&2@0;8'-3(55,$>H.@H-F4G&8A1+AGE)*-BEF2E1:>!B6F9EHG98-,02H+3,976- AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:15^ACCCGA36T101T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10880 42 58M = 10714 -224 GCTTGCCGGTGCGATCACACTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACC ,B,.>A=90A+,#"C*"+/!-,4(=E82;>2)@A./*,=;&,BF!2.D+@A+/'-&:6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10714 42 40M = 10880 224 CGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTAT =3CB;-$H#15&&@23#EC&/9:*$34&/%<91+D!=:,$*>!8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A3 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6427 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33573 42 183M = 33305 -451 ATTCCTGTTGTATCGATAGCGGNAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCAACCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACA +9##6HG.&=:7D+@EEF4:%=C,@&&)=C*+"G>3+H2=0>!+&2-H(8*2E/'E)(9,?:4-(H73;EAD<"->.<6-73?$%!-<)="CC/?>G#>=:*"@4G#:02H=?%)1*6G+C%0$9)"&=4%;=H&@34-F;"0=$E18.C,,)5.B.+:EH,D(07D(@'D8 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7A10T3T36T123 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6427 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33305 42 268M = 33573 451 TGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTNGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACNTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCNTGGTGTGCTCCTTATTTATACGTAGCNAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAAT :?-(8#B870$%+43-'/3$0B:1=.(29:3..C,67/'E(9*-F.3?.=7=.)%,'8C-,=!2<"H)03DF467?E/:%H!)<7A78--4!$EAG*6)9@F=2GC@49%<59AH>+&*':&,:#4=EHD-52B$?=5'!8G-F6!89BH=80G?.92D=.48(>A(B0FG+**1=7:$..%FA)+F0A2';5?$<;B#@0!>=52;C&>)B$H#/"0A17F17=",!20+.)F*!G;#- AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:56C23G76A21A2A1G83 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30300 42 244M = 30247 -297 TACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGC A-&!C2.D@28G)9.AH6&'H20F$&/A3'G590@FB@//3H5->B'&/%G#>A1>!4#E8C6;EH81!E9"3(!2:%)*&$G6:@$/?0",)271A7H:+-FD8%!4;F"):/7F)/B.?FE(CGEAH:('G2$&!&:4/#$A<43,5D"H/.".9+>7!E@#'6$A>CC:H;-"G@&"#6,H0@1.* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:244 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6428 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30247 42 53M = 30300 297 TATTGCTGGGTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGNTCCAGCACAATCGATGGTGT 76F4G/?:(F.#G#4+#FF**8=305=E0>G(F'E-0+FG548#D96< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T22T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17035 40 48M = 16760 -323 ATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGN !=)(F0D#(4!0$$9)H>#2&!"@>&>&4G'07!(6>>=<-8":H$=! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A0 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r6429 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16760 40 98M8D169M = 17035 323 ATNNGCAGGCNNTNTGCCNTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGNACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGCTTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATTACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGNACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAA &)&$%#$**#$"#%&%$+%")"#('*(()"*#&'*)+##%("('(*!'#$(&+&("%&'"*$$%+'$&"")##""$+""*!!**#+#)'%"'&&%)$'!#(&#!!))"!%'#&((%%("$'(!*))(+%(((*$"("!($)#'*&+%%+(*(&*$+'"%($!'$#**!$)$'&+(+(#!)+!&+'#+#%&'%)'%("+)"))!$!&$&")(#!+$*'!+''(*!""(*"#!$+")(+!(%()('$*$+*((#+)#$')&%!)$#&"! AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:20 MD:Z:2A0C6C0A1T0G0C2G79^ATTAAAAC2A23A64G41A35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22394 42 142M = 22338 -198 GTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTATTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCC *==B=F75&+EAFGAB%%40B=9)/%(C:E+"*=7<#/2@A?*>$"359?=CH8=72:!=+#=7>82H<<--+&;247DB+86<7%,!FB+%&1$D9*'>=4&F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6431 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29103 42 68M = 28917 -254 AGGAAAAANCCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTN +*#("""$#$)%#)!*("(''(&*%!"$(%&''##$)))&+'%#(##'#'()!*$++!")'")()$+$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A6A58G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6431 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28917 42 72M = 29103 254 TCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAA %)21A!7H3A%;7%,G?2E+":H6#;*+F<%B#6;@3G0:1%%9)EG4.%$/-;/>"6E%8*'2ADF-5%%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6432 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14338 42 104M = 14225 -217 CCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGTAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCC 5-H#+?%73#-8+344-G*B&6&D'E*2FBB>,);7!252!1.&/6*38H>,B)/A"#/*G-'"?403'+);F-=A*9',4F#A(8H"&D7:,B(7=%".D'59 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6432 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14225 42 57M = 14338 217 NTGATATTTCNCNTGCGTGAATNTCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCG &!"$(%&$&*($!"$((*!'#*$+&$'$)*&*#*!&#&%&#(%)$!%))+#*+"#)% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0A8C1C9A34 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6433 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41248 42 52M = 41325 203 TATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCA 0#'!B/9.C,B$05.8>>5:<2&E*A1%+)4-&FH&C@8,#B-"19+E:$@F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6433 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41325 42 126M = 41248 -203 AGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATNGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACT &G"$6(2E27'4%;#F70"(2('(C(!@30;*"601!<@A(A1<0*)%=F51G;.G.>)2(.H7?(A2C7"@,(&D1D/,/2H?)6HAD?A6#5,-8#=DA;5:7H066*%D5H@F++@<"$HG5E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6434 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43299 42 41M = 43071 -269 ACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAA ?$!%+A!GAC.1'G&E@9,*!HGB-"<#&32G(";8(&'9) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6434 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43071 42 89M = 43299 269 TGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAA HC%H4-*(#EGB.F/)4!B?,&-?1D>'8)C"87>'B)=;'=&6*@3F=5FCEC)1!((..;CG(-+E+AHHG0.%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6435 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1145 42 104M = 1329 228 AANCANAAANCGNTTNNNTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGNCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAAC ")!*$""*'&'(&$'"$$+''"'$"'(!!$)())+(&%)%''(*&'#'+#+(('!++")%$'*#""$%#$($'*%#!++)&+*##'!$*(&(+"(&!&+))$*' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0C1C2T0G2G2T2C0A0C58T27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6435 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1329 42 44M = 1145 -228 CCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTG G+0C!*217$%9ADE>7@&-H1(%*+D.+.#6=!-)/D':G##D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6436 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36918 42 47M = 37078 218 TGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCA ')7H-0HC=0#;6?C)F8>=,=HE1;/=?B)+,2;;=F@?1>:.*-H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6436 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37078 42 58M = 36918 -218 TTTTGCTNNGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGT C3-)%7?6B?H3A1D@7(D#+A/248>+& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G0C49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6437 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7579 42 122M = 7378 -323 CGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCAANNC $$&%'##(#++*!#"!**!&!!"&)&)%)'$'!)*#%"")(%"+'*+'+)(%&%'$!&#(()##$%)()$*!!***!$'+*)&$)%*('#!&#%&!)*%&"&"!!&"&+!'%$!%%+'!%$* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:118T0T0A1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6437 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7378 42 201M = 7579 323 GCTGACTGGACATGAAAATGAGGTGGGATCGGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGANCGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCG 0)%0B-&3/6.+(79*'EG?>7?4<.3>)678$G&'$?1'29+?5D?D9)/F?4#4$+!,;B;;-0:;-30(+91&/E9H!C.F><-0=+7CF7>%H@):C&C">$&)A%9.B4&!.C:?6A?;":H2%249@H67&*%=1F4C&!",3?7B<*9BE@#1.7F28=D$?&E"9<6+;*A;2:'!,,8'%48/ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C23A123A46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6438 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7896 42 224M = 7616 -504 GAATGATGGCGNAAGTTGTCATCTCTGGCATGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCTTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACATCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCNTGAGAC !#*#%!*"%%+''$)"#*$(%%!!#+*)&(!$#!&$)&!#!)"')*#!%'$&*%*#$+*()%+&'&($+(&(&')"*%(&"''!+'&$"%)'#$)!"#')%'))*(!+!'+%+)%#&*&$!*)$%""#)!'"$"**+++#&%$+(#""*)#)+%"(($!#&*('!)&!)!)&+)*)))#*(#"#$(%$))")%'"*)#"&&"('$'"&#!$""()$+!(%#'"# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G9G17T29G57C99G6 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6438 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7616 42 280M = 7896 504 CTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCNGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTANATGGGAAAGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACANGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCNCGTCCCTGTTTGACCGGACTGATGAGGTGCGGCNGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCC +!'$%(&)#'+%#"#'$'(+)&#+*!%!+$$$$'*++!)*$&(&#+($&&%$!#)*%$!!+)+(#'+$(+*#+"!'!%(('$"+$)+(&%&'#!!"#%()(()!"%*#(+%++!#+"))+)*!&"&+"(!(&&+$"&+"*)&*(%%+*"**'!)(%*$"#!+!%'&)"%)!&&#)(%"((#'$++($*+##'+'$&!**"(!!%!!*#("+&&$!#"$&!)*!*()*&'%(&%))*'""+!%!)(*++#+(&%*%%("*(!%&%&++!")&!!%%+''(& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:25T35C7C87G24C12T20A63 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6439 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22 42 218M = 22 0 TCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTNTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCNGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCC :+.C"G>!*0#:C%8=3:C=7$'#+EBC*+$09+:H84,4=>@"E>)EF,/=A)27#,4;G'$!2/6G5B9?<"AD'EG:A=)6')968?9)D7?-B)61=&'@BC/!!'89*1<.9/DG2'5&5-+;=D9D7F!F??!,C1A=:'7C,D!-4-='<6933ABH)B:,@GD6, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:136T51A29 YT:Z:UP jpayne@0: r6439 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22 0 * = 22 0 AACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTT /.+.4809!/,:C%#8B7:%H4B+&;8+@#!!:+0!!A80/>7CF.@ YT:Z:UP jpayne@0: r6440 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28042 42 41M = 27799 -284 AAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCG E0?!%$''D"C,4/H-;=:&A%*;F8*'3E$0+A17=F->+2)F0%)$0;479-D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6441 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21772 42 79M = 21934 242 ATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCNGTTGTTANC AA9@B1-2A5E=)C$"*CF;+DF=HA/>/G(4.>>7''(:H+6?*F=H@:/$3(;!;3.*8A<.@$?E+:?B:HC*2,; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G7T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6442 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44821 42 43M = 44872 278 AAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGC 692,2:'3@%C#2<70*.#"'C"!B#&5F*A&;!:9.GH7"421/C0)C&5D3/9AA9A>A>)@($=6<7*+29*(-68)?+.F',$72&39!@6<5%(=,,'D AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21G18G178A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6443 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19686 42 260M = 19686 0 ACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGNTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGANGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATTGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGNAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCANGACGGAGGATGATGCCCG ,'5>;A3959%#7/E;C;A,)<@G@478+)-%9/34,&2#0@>@;5"$D1,%,2,+%-=&<,';1&B,-B"*-+C7.?E":6.;0-3(+#5>F:3D;&HGB?2./;"HE>%7=A-:95D28+%G"#(8$FF;7@<.#0"7$/B=!=49=#56B;'5B+B)0A@$.7&C>@G%@8'"D7<;!.%@7$E&,9%C8EE,.AG6255;/25"?"8B64$-2/9 AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:14 MD:Z:87A97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6444 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26864 40 137M = 26679 -322 AACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCNGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAANATA +AG2?7%>7;$%@/86:<=&8'ABG:*956,?<-(<592B!#'CD##G37&8',;>G3:*&#$($0>H>'69'H+G@7G14,A+<:=A0,0C#0*':D8H@,+3AC!6,*A2B,,/&'%(.;1,1*?%FGG,*$+)7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35T97A3 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r6445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37666 42 120M = 37786 296 ACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTA 4A*!5?&6=*"D311<+2@$<4#>/F*1='C9$8:A.8%1E;@?13"@=!-#)2H>=#0"-F*8"@+*+<0>'@6-!C)AA/(#=1&G$8)%5(F660G=7EG5(@B2*:($=/.>2<>3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37786 42 176M = 37666 -296 AATAAAGCACCAACGCCTGACNGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCNTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAG #(52;':#%8)!93:)(0"D)'*%HG);@-6+653B(3,?A-<;C#+1"G;521.'7)7-+5,<6.-E%AF>'A,>'>;E18!E/A0%*5>:$5!,$)3C42-3+>9(E>.@;52!#*A8$ADEE!FE=-0@?'->DBAC1;6'B$;E9EA-!G"EB'5'+! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21T88G64A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6446 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37823 42 140M = 37996 219 TGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTNTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAG )-*&%&44,:@BG.1<79)G&BA&>5(4#!EF33FF#7E46&?A80!A7E>4FB3%1C!"(0>"GG)09#HG,/%!':5@3*(@G8;5F.9?/H8;E3-B15(#&)=F;@$?)>;(:>G+9,6<:(?A=A=1",-E*1CH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T101 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6446 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37996 42 12M2I34M = 37823 -219 TTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGNACTAAGGAGGTNGGN "))%)!*#&!$+%)*%)'*!#!($")+$+"++%(*''%'))+#%!#%! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:30T11T1T0A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27049 42 56M = 27128 204 TCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATC F(&<0:+7(EH#C'C#C6D;-;@&A-?:'2#!E+$F!?*4;57=.2)%F:&F,17- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6447 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27128 42 125M = 27049 -204 CTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAG 0$=!B'7(BH/*'2H*?/@5F:)#D:;5G#/)DF9!C5%/<@,#*G;6<,=0+:981C*9)3$E6;3+"6!("):*.=*$6@*!&HG=$(-(>.0,-*"3,>@-1:;="9,. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44542 42 241M = 44783 311 CGGCATGATATTGTCTTATTCAATAAAATTGGNTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAGAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATA H/0;<3D3BA?1/B08%2-+340@!"'27*$D=#2?@+0>1700FGDA)DCB=/%F1-,F;$739%CC<",/#GHE3)H>B:%#?:27C0$.&B@";+)0-4FFGE"35%:6+-#97+2EG?'C(";.*782G7E@H*<"*!3%F"-(0?9!+9.7A.D"!!AF/*>*(5(8$)!@(-?'4 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13A6G11G51A156 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6449 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 55 42 59M = 55 0 TTTCCGTACTTCTTCCTCATAACTTAANGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAA 3."(H&+"D!>A%9<41.H&45.B"'0".%D8"*>;0HG*-0=@:7-$78#"2%72*HA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T7G11T31 YT:Z:UP jpayne@0: r6449 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 55 0 * = 55 0 NGTNNNCNNGTNGGANGNNTANACNTCCNNNANTCCNGNGNNNNAANANNNGAGCNTTGGNNNNTTACGNTNTTGTNTGNNNNNNNNNGNCNTNAGNTNGNNNNNCGNGNTNNTAAANGNANGNTNNGNCNTNTTNCGTTNNACNTNNCNGGNCAGGNACCGCNAGNNGCTNTTNNNCATANNGNTNANGNCTTANCCCGNNATCNNNCNACCNNNACNTNGCNTAGGNNCNNGNANNNCGGCNNCNNNNNNACCNNTTCCGCNCNGNNNGNTGTTCNGNNTCTNTNNANTNTNNCNGGNTNCNGNNG "$#"##"$!"$##!"$"#$#$!!$$$"""!!$!$!$"$!$#!!#$###"$#$$"!$###!"""!#!!$$#!!!#!"#$#!#!"!#!!""!$!#""""!$"#"!$#""#$!#"$"####$!!!#"$#$#"#$#!""!"#!"""$$$#!!#!$##"#$!!""!#$!#"!$#$$!#!$$$$""$##$$"#"$$"$#$!!!$"$"""##!##$"##!!!"##"!!#!$$""$"!$!#$"$""#!#!"!!$!#""$##!"!!!!$##"#$$##!#$"$$#"""!""#!!!!!!"!"#!$"$#""!"!#"$!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6450 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31704 42 280M = 31561 -423 CGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTNAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCNCCAGGCCAGTGTTTTAGCGNTAACTNCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGNAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGNACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGA 9/7BHG=1!$#,;(+H21=EB!)GB8)*(!;"+!"G'$&106A$+>##($240??:$&%EC.<&".B.@-=:#G&5G-25A3?+-5,1/6,(90/8)A0".-.+)B56%+$))-!#,D?@:6C'"85"HC:.$;*$E9-F34D*B;E?G@9#84)F#>DDH571($0%408/3B1-%6)':$18%H15)D1B&+(#.CD&)@3::%1-DB7B2!"DH@'*=,-1&==;"D,0//!?%)C<54"6"1:169H(015D.)B"CC:,B$'!(6%@D=!CA((+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:48C35C11C7T5T77G25A64C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6450 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31561 42 143M = 31704 423 GNACATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTNCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGT %%!''*+!!'%&&*!)&%("(*(*((!'%*+$&'&+$)'""#!#()"!+$+*&##'+#&%&#))(*!')!'$*&*&+!+$&+'++#"'(%++%)'#$"$&$)(#+&(&)%*'"'+#!'(""+*#"(%##$#'"&!**%"*)+! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0C74T65 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6451 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12366 42 169M = 12535 276 NNTAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACNGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGANAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACNCAGACCTTTGATNGTATTGCACAGA "!)'(#&%+%$!(($$("'&%('"+&(#%!('%(!#&&*!'('!"$&!%)+*!##*+#'*!)!#!!#)"$('!*!(*)'%&#+&)!'$%"#("#(%'"+$*))&&)!(#)#$&*))(*$&$*+#+!'()%%%$&%&#'()&"$""$%%(')**%'#(%&!%$*#!(#$' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0A58T40G41G12G12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6451 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12535 42 107M = 12366 -276 ATATGGCGGNGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTNGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAANTTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATT %)BD/%@%><)%+.":D%(6(2B22-3B*>-@<&8(4F:F;FA=E<#4#'0$C+':1C2@C>9BE94.EG$-B-:1<&-;?*8)G+7+"*#!?C#9!'0/,?;+?8E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C26G40A29 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6452 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25895 42 69M = 26048 221 TATTCCTNGATATNGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTA *!$)!)%!%&()"+*("#+"+)$$$+&)$'$*(+)*)')')+%#!(()'+!)+!")!*"""%'"$'!%' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T2G5T55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6452 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26048 42 68M = 25895 -221 TCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCG 95325E'CD$+HE#17%(;6)@>$,)EBD?9B)F#%$+5*.:B$@42104!,?<(A%+A?68**7.=-)2CF1%8+GC&&>640,(.-@G"0('0:?G$:)<89;>;@/AE-(4+14-,.2!*#C:0H>!H&<".86 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G20A39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6454 77 * 0 0 * * 0 0 GCTGAAAGCGAGACGTAACAGCACCACNGTGGTGGTGAACACGGTGGG "D=6,+!E#E$+?;4FD!>=159-)E'9,4E;41;!<;,8F;1<@'#5 YT:Z:UP jpayne@0: r6454 141 * 0 0 * * 0 0 CGCGCCACCTCTTCCACCATCAGTTCAAGACGACGCAGCACCTCCGGCCGGGNATCATCCTCCGTCATGGCACAGAGAAAATCATTCAGCGTCCCCGGTTGTGAATCTTCNTACACGGTGATGGTCCCGGCGTGCGATGGTGG FE=%'05CA)8B?,=;?H6!52C!+%B@:H@:+6D)A@F7$FGAH9C+5+E)$9!F.&!,)8$E3)8-@22#/9B3F)%F=3#?8/4'+1HF01.?,.A?*1,/AA9%955@-3F)/@:17<##969?#?#8C=!6H/B#&"* YT:Z:UP jpayne@0: r6455 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16633 42 174M = 16807 228 GTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCNTCAGCGCCCTGANGGACCGCCATNATGCCGTTGAGGTGAANTGGAGTGACCCGAACANCGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGAT #+('***&$%%&(!$)(#"((*')%$%!""")%&)%$"%($#"*$""$&#*&)**#$(!!$$#"#$$#%&(*'!&*))$(!!++()(%"+)'!"'+$(!)$!#++')%)*!!#+$#')%+"%!('"&&$+)+!&*(")##'#&$+!)$&*+#!"%+&$+!#")*'%(%*)+'!* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21C14T12A10A16C4T11A79 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6455 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16807 42 54M = 16633 -228 GCCTTTGGCTGTACCAGNCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCCGTGGCTGAGA :$06!&CABD@=C-$)"D35H:0*@06&98;!06,64G;@+!8;)99>;/;3B; AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17C25T8T0T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6456 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17203 42 77M = 17203 0 AGCCNGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGANGGCACGTATGCCATCACCGCCGTNCAGCATGT '55$<,.F53=!.0AB),@C2!!?*);70&7#HG"1?=A&8!>D5:?B(4(;4:C"D2$*;%C9+=45D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C3A39C23G8 YT:Z:UP jpayne@0: r6456 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17203 0 * = 17203 0 NNNNCAGNNNTNNNNNNCACCNCNCNNCNGGNTNCCGNCTTNNCNTNCCNNNNGTTNNNGNNGCGGACNNNGTGCNCNT "$#"#!#!$!$##!$"$###"!"#$#"$"#$!!$#$#!"#$"!$""!$""$#!#$!!$"!"!"#!!$#!"!##""!""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6457 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4367 42 65M = 4572 314 CGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCT 99)<4.D#8$5275,#FBE&-%F?G02,9F=A0C>#D8%9E&:>((*AC-1>1-7:03HE9?"3< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6457 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4572 42 109M = 4367 -314 TGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGNCGGTGTN $;E;;*!1!722&7#F:*A/):"2-'$+:&-GG977GG91EH=,,A%=<$A#>B."E& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:101C6C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6458 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20744 42 120M = 20935 284 GCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACG .>$?%=D7")'HF&-163)E#>//5#H0#:GD*C0#/1:=54(8C;+E9(D-C?!:D26A-B9338(>!55BF1"E+/$<3/&C"8&.DF"/006B):(AAE56 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6458 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20935 42 12M4D77M = 20744 -284 GATTGCNGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCAC ;=+'H+?%9BED*E.95("#9?&!.%@%.>=C6!3"">5>'@)&EG6::*9,,.2?$B)8-!7@89=3C-3-#>>6$3'@1$<:-3+-; AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:6A5^TATC77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6459 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8885 42 141M1D30M = 9103 264 GACGATGNTCCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGATTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTT %E9F'/9.928(?70?E:2=++).-3(D7*!6<,1H9+3:8(5<7%(2FC@.)<6A(21,8*-?62:/5DE8$G0H%,EC<=01C)%192'3=/(A!&1)462929?':D6H2D0D'&/E<6$0HBA4=&::#G9'<>+6%=(,C=3E$+4F(13?9A;//H3EDH5; AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:7A1G115T15^T30 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6459 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9103 42 46M = 8885 -264 TGACCGCTTAGNCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATCC =A@(;$(1=6$@@6+&)#)D'0E7F1>C2((#.)*E)/BH->9D1G1#E&B)#(=D?278-2A0E7,@C3:,4=%";1*HE80#;#)C8H8C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G18C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6460 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10727 42 74M = 10565 -236 CGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGC $"00(>!E"?/3/#7;4/=H2$2B<=-&$(6H$$+H8:BE?BE-"=!:E$F8#&G&2//@-/!/C!>58"&?.& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6461 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24941 40 61M = 25103 237 NGGNCCTCTNTCTCCCGNANTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACC &"$#'*'")*))*!')"'''+!)#'&!&(%%#+(!$*'&(''#*)#$!)"$)$$'$$()*' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T0T1A3T1C6A0T1T41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6461 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25103 40 75M = 24941 -237 GTCATCGNAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTNATTCNACGTN %+')+%(&*$$%&'+*!&%%!$&$*$&&&)(%"*#!+#&$+&'"$!%)!&$+!"%)!$"&%(+*%#&)"")$!() AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7T56A3T0A2C1T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6462 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16489 42 158M = 16386 -261 CTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTNCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGA &%&5""E#A"0,BC"&*39&A67BA,*:G+-+*,&<=E1"#.3"1;*"6&,&3<3&6&2+/5:5?#,%9G,''*07H5DA=A7%6&6?H5EGD$;<$(GG%>C!(@G?+33+633D#"#;>5G,+C/<0$"(>H$!%@9D< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6462 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16386 42 103M = 16489 261 GGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTNGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCNGTAATGCGTAC ,+?>34HD<.F:+=4!@?@3#A83HF'A/,8A47-17H/B=&D20.CC0#(+)=&C8BA&F58)1>5)E2A)#8(A=+A-7G2%CD4?EC/+#;?:B>;9=,< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67G23T11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6463 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26238 42 71M = 26079 -230 ACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAG +%?%G::75F%::,31/8(D)<%A9$.D%C>E-?30=0&?F%A9)0(6DD#*DD;%=2+@F%3891=H77( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6463 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26079 42 89M = 26238 230 TTATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATA *+#%&%('#"#)"('#(!'&##&#(*!'(!$))*$$'*#+&!'%)!'*$&%+*"%!()!'&!'#)#$%$&"%&%$'$""%")##!$(#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6464 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44164 42 82M = 44390 281 AAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGAT 8!G;)F13(:H)8,0,-CCB&(BGE>1&=/B6760DE@H?)<)GB=@D,%!F.-0,="6)57=C::E4C:9-*!=17H&>F# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6464 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44390 42 55M = 44164 -281 CCAAACCTTACCCAACCCACCTGNTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACNNTC !&*'+$'"!%'*&+++!"*%()'*'&()%+&&#"'$'!!*!'+&)+&*+)+()(! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G27G0C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6465 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10849 42 49M = 10616 -282 CCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCAC #'+)F>6=7)%'E@-,E/F<,6!8@58"E7%!%$3>/F5"$DA)5@*G> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6465 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10616 42 101M = 10849 282 AGTCAGGCGTCATTTTNCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGG /(?4&'E.6>(,#92E-76C,A/49;7*H*D%E;9)?H-*@&"1+48)$8!)C8(3&6)(2,8)2-'3H=,:7=(A$E94?B6):B28+>? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6466 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41268 42 46M = 41314 307 AGNTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATNGATATACGGT (%+$''+&)$*#)!"$(*&)*$!&"*"''&%&+%+$(&)#"+"(!) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G32G1T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41314 42 261M = 41268 -307 ATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGN 23"@0@$(3C9A(D)#06,8F@4:&"E3D3(B==.6"77*/9@5>6>! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:260A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6467 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39286 40 96M = 39135 -247 ATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGA ?&:ED72-2-'4!?1/<:1>A/-,H?>6=.865&/60EH()?,(-**11*764G-===GE,E1>&5BE#G$0+C(-78*?3E=?4?1G05'G*--4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6467 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39135 40 40M3I8M = 39286 247 NNCAACAGAAAAACGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATC !&&)"!***&(#$!)+"+""$*')!*%+*$)"'&")*'**"'$%*"!**)" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:0T0A3A7A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6468 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5722 40 107M = 5722 0 GAACACACCATTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACTGCGCCCGGCGGAT 87")<0,D2;5&D$/:7HDE?:?='4013)18<4+!<@)D.C(@(/;?)F4D=@:5@E.53549F<8C.)4&2>:B389(/19.00;?A6:#,D?+&/E?2<8#26? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G67G14C13 YT:Z:UP jpayne@0: r6468 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5722 0 * = 5722 0 NCNNNNACAATCCNGNGNNNNACNGACNNTNNGTNTNGTNNNCANAGCTNGNNGNNANNCCCGNTNACNTCACNNTNNCGNNCNNNCGTNNANNNNCCNNANNNCCNNNGGCNNAANTGNCGAGNNGNGTTNTTNNANGGGNACCNANGATNNTNGGTGNANNGGTANGNNNANCTNCCNGNNGNNNNNCNTNGNATNCCGTTACCNCNANTGT "!"#!!!#"#$#$!$!$$##"#"#$#$"#!!##$"#"$"$##$!$#$!"!$!#$!!#!"#$##"$"#"$$!"""#""!$""!$"#$#$#"!!"""$#"!#$#"#$#!!!$!"#!$#"!$!$$"$!""##!""!#!"""!$##!#!!!$$#"!!"!#!!$"#$$#""$$#"#!!##""$!!$"#"!$$!"##$!#"#"#$$$"!#"$"$!"!#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6469 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44775 42 100M = 44950 256 TTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATNATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCG @*%)*D%7;C@F904E?9240C8--"9.&,-3,@DH757$$G+&C,6)E/@6*)@0))$$<1DA61DF51:7<6D#<$$*D"D?;&"G.#9-3C)F5@!2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A60 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6469 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44950 42 81M = 44775 -256 AGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCATGAAANCGGGT 6*!(($G54(56-&-/*B5)=2*C=B98-$:?F/(9E/D($+312C/*A4=??0@+::=3D)!/4.A=7'*'B*'">$2=* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G5G5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42526 42 124M = 42386 -264 GTGGAACCAAGCTAGCACTCGAACGACGAAGTAAANAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAATGACGACGAGAGGAGCAGAANCAGAAAGATAAACNTAAGATTCGAAAACTCNC +(*'!$)''$('%"&)*#+)#$&&*$*')##)!+&#"()$%*&"$&!+#(*+$($)'!(+&(##++*%"$'(!'!&"'%)!)"#!$'%$!)#"+%##+%'!%'"&)&"%!##$*!'"((&)(+( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:11A23G35C19A13T16G1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42386 42 117M = 42526 264 GAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAA ').5E@,@#'G#'0-8:--%!G,*:3>E;$?0*GC8G!&#HA2B@+1)8H')AD1'2/1!D1GB8"/E.A59$?5,D7#%CC0+E<,?8DAD4,#%617$"3"87A-G59$77%??> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A63 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6471 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25603 42 67M = 25416 -254 TGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCANGAT FE3B"@3!98$7(4,0*>/93$D+1#H1EDB5C,-G.G8%57A8$9+$/G>4=HE5';*F$(3+#>. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6471 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25416 42 140M = 25603 254 CTCTGTNCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCAGTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACT G/&=/4C9-E'A?H,.*B,#-=3*$FH7F5C:22-D;H3(=@$B2;65)6!:G#87#&8:'=1?'/&!#F!D.=*!.&**7%3938?;,2:B90#0+@,BC64(@&=;D#E:6BB<*6'9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T49T83 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6472 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39110 42 57M = 38954 -213 AACAGGGGGACACAATAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAG 04AD-*9FD?A1)A.#7;(F$D=80?@7>+90;5($(A.4C6;?:A-(<7'4%%E,5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6472 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38954 42 110M = 39110 213 TGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAANAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCNTAAA '''&$+")(*"+$&!!"'(*"%")*!*$!($"#&!+!$%(''"$)"('''&)+)!#%$$!!%#+*)()"*'%)#)"&'$&()("$!*&#!%&(#!#+*++()(!'%+)(# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A60A43C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6473 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42228 42 61M = 42228 0 TGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGGGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAG ?88?8?A"@-F',/AE8-$D1$;;G6(B3D9D:?3;/9:34:6,0.4><*>8H!/=H@!D' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A30 YT:Z:UP jpayne@0: r6473 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42228 0 * = 42228 0 NCACNTTNNNTCACGNGTNNNNTNNNNNNNTNNANTCNNATCAGNNGNGANCAGATANGGNCAACNACNNTCATTTN ""$!$$#!#!!"$!##!$#!!#!#""!!"!"$#"$"###$!$#$!$"$$!$##"$"!###$#"#""##"$!!!"$$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6474 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9306 42 65M = 9389 261 GATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCG C/!/9'*>8/+'@8)<=),,H3@G&?B$3H17?)(-&?/87=##;'%999>C4(D:;"-!'<&19 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6474 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9389 42 178M = 9306 -261 AGTGGGACGTCCGTNGATGGCAGAAGATCGCATCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACNACGCTGACCGTGGCCTTCCANCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTACGGTNTCTGCGGATAAAACAAAN 9!B;>G(@<<@/>+?HFGBE%D-A5=8!;,?!E/HCCFDADAF8F0A?!049'$!22&&*H+GB!G.&1-5+B'F>7<+=%/0)6(7,H50# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T13C17G69C20G30G4G17A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6475 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7452 42 64M = 7516 271 CGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGC A;A(:-.0<0:"6&6)+E(;1):HB#%.=/'BH(+H=360F?6,8$>*@H8.!35A"3*&+"7.99!42;1B5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:47C17G25G67T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6476 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18830 42 197M = 18763 -264 CGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGNGACAGTCACTCCGGC 3G?2@=C'1++B6:+;FG8A6!B3+&C'D=@'#(>7%C#)BB%;$(<6G"-;8'0&F-*=,ADAB4D1H.!:A317'@%BB2?6<C7>G6)!-D.A%*#=-5B;)-8E'A4%4FD8(E98B+36)C,F5<.'&$5)979A*9=7=>'%?A>1C@*5G9"@H@%8"!/E9;>$G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:181T15 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6476 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18763 42 67M = 18830 264 TGAGCGNCTTGGAGNANCGTGANNNTGATGTTCACGCTTACGTCCANACGGCATTCGGCAGATATTC )$'$!&!"(%'(&)%%!"(&'""'"&&)"+%"#"$(%(!+&$))*+)$)&&$#"$$!*#!%!+&"++ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0C0C4G0G1C2G1A1A5T0C0C3C17C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6477 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9077 42 55M = 9328 303 AGTTNAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTAT :B?'3;6<.5'$A9;.C$A$A4FE0&66-H!%&)C*8D4<'2#.4")0!=)2B3< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6477 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9328 42 52M = 9077 -303 GCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAA EFG<0862F)$/*(4E?&?5"36(!<4*>?F90+B:<+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27246 42 44M = 27290 307 TCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCAC ')+$%$"#"*%'&)"+*!)(#*$%$"&&&$+*(&++#""!&&&$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6478 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27290 42 263M = 27246 -307 GGACTTCGTAGCCATTTTTCATGAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAA 6!H-+)'.@)2(35/>/1G>-(++B<=FB"0)#+?=5E<3)9D97@":$.@;HA$8/B>*E4%2**>&HH#5B>C;%7%)>07;8!4!*A()0&"H#@*!21!4;(8=AH-42=9#-A$.-%29@HH1E+"G-"2"G3*"(>$4!#'7,?:@9:#%1B$#92,#(.F3="D,(*/4F!'<$$*H%C1G&*-4C)B?4B#6%1++'H?@EBBD:9H**+/+1)'?=D.6"(G26;2")<#4A7=!-&#FC AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A240 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6479 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32823 42 126M = 33029 281 TCTGAATCAATATCAACCTAGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATCCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCG 7:/#B(B!-AGA>:>(-4H,?B?,;8BH<%>5A6!>+A,%/8*5;"=6%>-2F7))5>&*!.A.;A2G.;D8#B@=;=+=3.&7DA1);7$$:F0=$8E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G45G60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6479 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33029 42 75M = 32823 -281 CTCTTTCTGTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATA 365!0%'47'53#H/'-#'/9B?)>=5@G?29!#;6%5.:$#"2@B'*#?=D:+:*)G70&DE'!F>93%1/:!G&%D?B/%:D/BE3"G>B'58<(B+#!HG&<"+$0%*$8*370%GB2.%1*= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G33 YT:Z:UP jpayne@0: r6480 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5284 0 * = 5284 0 NNANTCNCTGAGNCNCGNTNANGNNTTGNNCNGANNNNCNTTTANACGGAAGGTTNGNNCANANNCTGNNANAANAGNNCNNNTTGTNTTGGGTGCNGNNGCNNNNNTGCNNGGCNNNCNNGGTCAGNATACTTNNNNNCCNNCTCNNGNCCNGNNNANTNNGA !!$"$#"#"$!"$"#$!!""$$!!!$!#""#!$#!"$$$$"$$!#!$$##$$!""#!"#$$"$""$!$#$"""!$#$##$"$!$!$$#$$$"#"#$"""$###"#$""$!#!$$"!"$##!!#$$$#$#$!!"$#$$!"$$!!"#!""$"$#$$!#!$!$#""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6481 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16083 42 119M = 16303 276 GCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTNGACTCGGAGGAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGA A;7F9?A8@+31(A2B;(+($BE!,9G57(9D0=E)*EG:27<'0/B1>5F(4*):=#D1F=?/@HC=>=A3>9=(G23#EH"2>7'73;"2G(3.88)G--D7,"-5(?/D/41=!H2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87G9C21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6481 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16303 42 56M = 16083 -276 GCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTAACCCATCCGCGCTA 0**D/?CA4F,$:*B.E932#F:9C?'6/2B!'-0'/3%H66$E+$1883*6)2&4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6482 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41069 42 73M = 41183 242 AGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGG E;0%*=.0/71==:(D(H4&"7;;"?+:=E@,>1#9>:@&-C*@CFHHG'?5!<@HA'=+74B#057>7-+(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6482 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41183 42 128M = 41069 -242 ATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCANGTTGATATCAACCCGNAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATAC '=B+.:A(<=!7HH-#&5. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86G15G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6483 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11443 42 188M = 11339 -292 CTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGATGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGAGATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGGGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCC D?C+4..0F#:EF1,'5G5.F(.4$F"<%1HA=')8!@;14160HA79ABAF:2@&-D%7+%,7C2#1<+C12B>/:/07A)!?0CG$9@@6E4<">5+E%!)+4.AG!2=6-E,/8@0/'(--+%9C?@(?%%99B@E,0:$?,-A'B5G/2E'.5'71+5/HA& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71C37C45C32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6483 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11339 42 104M = 11443 292 CGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGNGCAGACAGGA --(++$D13(@)A&4H):#B@/D;$=+6DFA486@C.>(??<>)F.6.B21,-H))D;?A?)+1>D/)*+<)'DD=@"+H,A*6, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93G10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6484 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22606 42 147M = 22606 0 GTTNGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTCTT ?29/('+C/;CH$.*1')<#8!+A>*@944GC;3'7*/B))>CA2$>;8F/E/@6=#-9=?D?=-BA-D@,+(=$H3104*;H/24F"6'8**$))/;?&-0?B;E$E9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76A31 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6485 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6071 42 147M = 5939 -279 ATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACANCCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCNGNTTNGNCGTCNCTNTNT '&&%*!%$*#*(%')#)*(#)"&*&#%)!")'$!')*#)$%)*(+&!$&*+(%+#"(&(%'$##!'&$!%#'#!*)"'+&*)'')&##%*%)"'&##")&*&&(%"#!"&"*)&""''!$+)&*'(%'"(!(&""()#(((&)#*"& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:79A48T1T2C0T0G4T2T1T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6486 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45451 42 66M = 45273 -244 CGCTTATCAAACGNTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGT 5.D?9.)/:>:F(+=E#,%>,H-@A'/;&?E+<;41>=595:"?5F.:6):F@G,;C698A1"6'; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C52 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6486 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45273 42 163M = 45451 244 GCGTACCTTCGTGGCNGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCNCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACCTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTA 22%$2/(1-;4:%9=#B0-%/?>7)$77H,G@,?/BG#+(GB/'A;GA#;H;<5++2&7182$',4)$/!7D86$,?2+5'#,;H682>)8=*%E?A=%,B?4/8AGF3-#"$$,:-:2G=,?-31A->E8+&0@41-E%/&H@*".:)>=>:&;D>,H>FB= AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11C3A59G26T60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41172 42 99M = 41044 -227 CATACGTTTTCATGGATACAGGTTGNGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGNAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTNNTNCANG $#(&+%+)"%#&''+%('(')(%&!'&#$((*""%&#&)"%'"%(!(%&%#&(((#)**&%%#$#%("+(%&)!$**+#!$+(#)*'&+#*"")!%*)% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0T23T31A33A0T1G2G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6487 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41044 42 127M = 41172 227 CTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCANGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACNGGCAGNTAAAGACGTG E;66&G2!7*<#,C@*;/H)-12*?0;DAD.*5/7%:*#F"7=*8(@E=%8?5)!#DBA69)@HE=>B.?&?G?($<)+6>**BDD8B>>(42*+'A:,D"435=+!8=94;&4+#-;.?H#4&/-" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68G41G5G10 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6488 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44083 42 115M = 43893 -305 TATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTAT 4;8046&B#*66,.<%3.*EE/+BFA4;897*<+E<3FD&4/>00&5*)+F!DHA3C/EEA<%@->&1.79)1/5D@@?,6G$>-E?+4"2F?!7<6>E"!3=F%61".=2&;., AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6488 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43893 42 190M = 44083 305 TCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCATCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGAAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGC F$:GF9#6'GG/G$&*#0?(7D($;:,79G*A97>+76%CH;F7=,)7.E6'%-6,49@&$6E!G&2,H04#"520==H,B.'CA(!69!2$(<2(#A<&.8-8+?;HA1!A#6:/8:EG'$?#$>>:;6$HFA=9HHA!A:<#20&.%-@,F<(&";%&=D"A>90;);;E!0H5$0!#C">$!=%0<#D.*#.@<,B!E=4$=C/.*++6(8AA,.G!AA+CB)&+3,66:14,@-"!(<679!6A!4.$64!+:?8D6)-32F62/6(B#-G5%E:!5"=#(.569&DFF AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:106A14G9G38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6489 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1318 42 47M = 1434 286 GCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGT H4;65*=!H-%@-:'1=3**::#7+%)'48)E)?">-1;?<'>#>$" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6490 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14295 42 73M = 14486 236 TGCTGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCNCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGA '%'#&)*++$%*%##*'&!*+#$%)%(%%&'&!$"*$&'"((#&*&%+'#*+&(+'*'$&$*!)$"'%#+$++ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A44C24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6490 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14486 42 45M = 14295 -236 ACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGNGTGN $+*'$%$"'$)"")#%$*!(&""#(!%#&$"#!&&%#+++!&$)& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40C1G1G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6491 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40313 42 60M = 40313 0 GGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACC CB*!?E1?1,H<;+<5=:"702'6#+"@$H'C1*($,8(?-,-1F,5D@60*F<.673*$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YT:Z:UP jpayne@0: r6491 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40313 0 * = 40313 0 TCTCCCTAAAAAGGCCTGCTACGGCTGATTACCAGCAGGCCTGTTATTAGCTCAGTAATG ;FAE>9>373(#,;03A#;#8-2E89&>E&.9E74;@8C!6);!F$)"E=D12DDB YT:Z:UP jpayne@0: r6492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27703 42 81M = 27423 -361 TCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAA !*&'"!&'+""%%++)#"'+("'*""&*($"%!$#&'"*+**(!%&&()*"+$(+$$"*%(*%"(&&(**!!)!+&*#$%+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r6492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27423 42 280M = 27703 361 TCTGAAATNGNTGTNATCNNTTNTCTGANTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCNCTGGAGTGCGANAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCNAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGNTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATTTATTGATATTTATA !!*)'$%#$%!*(!"'*#"$)$'$(%*$'+"%$#)'#$()$$#&'&%&#!!'%$+"+$$)$+)$&)"&)#*%#"+$#'"*)+!$+%(%'#'$(!"($+'"+%+&))#!)%*$!)"%!!&+()&!"$+)!!)&$$%$+$(*$&+'$$&#'""(+*'*+!'%)*"$*'("%$%$'"!%$&&)))#'(++'*#'&#)#!%##*%'*&&(*(+'*+*%&$'(+$(*"()*)*'+(&*"!"!$"+&*!"!(!&!"#$)&(%'%)+!$"&#+'""!#'$"&%''"# AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:1T3C2C0A0C2C0T3T0T0C1T0A3G0T61T11C49T65T46A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6493 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6633 42 63M = 6696 329 GGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACCAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTAC D7%?A,8DB:#H1=;-:%EH5@0D)6H21G*($HA0>4(:D@H1A)77=3E4C&<�)G>&F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A38 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6493 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6696 42 241M2I25M = 6633 -329 NCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGNCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCCAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGNTGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTNGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGNA "*+)"'(+'(*&)!$()#&'*+#+(*"#'))##+"!*'&+!()#($$+&!*+'#+%%#%%*$($+!'('$"*(!&#*!#+#%%&''+"$*#"!&*"+'!#+$$'"++'$($)!'!+"#%$("+$$!('%"+''!""#'++"$&')"#*+)"!)%*)'+#'(("*$&!+$%$&)!#&*!(&*"#"#'&(##!+$$#()+!(%#!!"*)$**"(+&))+"!!*++$!#'%'#'##+&'!)$+%+)&*$!#"(%$$*!"#*(#)#%((+)" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:0G75C51A18A30A33G51A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6494 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15642 42 167M = 15562 -247 GCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCC ;BD6H<)>C@1.82-%74@:2:D8<@=1!(A8>$)#->B5BD/@>7)7!=#BDF6F8*C9%4$@9*9@1$?/+#?9'91/'$?96#182-=.0/H#;0/9?B+@4-=A>!:';=D:#4;A(:BB.11?(G,/C*@?@)5=$501(0+.-*E?>!.FC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:167 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6494 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15562 42 80M = 15642 247 TCCACGCAGTTGCTGAGTGNGATCGATGCCATCAGCGGAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCT +!)!!+&%#!&*#)$&#"%!#&%(#%"!)'(+$%'#+*!!&*$'$!%%(")'"(!$*%!')*!%!)("#%!!#'$('&'% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T17A42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6495 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13571 42 212M = 13446 -337 CGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCNGNTTTGAACGGAANGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCNNGCTGACGGTTTCTAANCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTGCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTC 2C$E;1&D*.A12@-+%F<-)BF$-!.1?;$&)8@C4>E9=D&:E47B7<5<""!8D/C66A-D.7$2+0,,!;3D@9H.H,71EF'!:?:,$"H@ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:50G1T7T3T24A0C15C62C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6495 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13446 42 125M = 13571 337 GGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACANAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGC 2A;$;7<-$G,*6==@02)0;-@B0&&4;$5B%=981;+0BB$-/+&D4@1-4F*-0:-@H10(;>7"%"-?;D56;@34&,*GC,;C;4E,G@,-@5=8&H5%AE+&6<>;**23= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G54 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6496 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9462 42 61M = 9697 298 AGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCG /=!;!A,G4#:AA721D')$/85,8'!3C?H$"#/F-;90%03/@"1EB3&>:.)),>5': AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6496 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9697 42 63M = 9462 -298 CCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGC 81!)%B)-(62A$;H*//*EDG',.3:G61&F&)B83A?45#$;E?/=5C,FD5>7'9D)!$? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22379 42 42M = 22622 285 TGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATG 9+:8#H%7:E)#:-C7'HA>9!E1+$:.$$7@.9:@>?$(,H;#64(6&A9:@=8.2?+*5$@B;43)$7'D/25:':#83!2G=F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:86A14G25G11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6498 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1616 42 71M = 1454 -233 ACGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACN 0%B5B,GE93->%48<:EH-#9BD7=)>CA*HDA6!D15,+?95C3*DEG0%?;1<;6':)!D*'?:+=8' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C69A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6499 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30454 42 65M = 30328 -191 GACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCANAACAANGAGTG .#8:+>H@,F:?1;H7(G9#+<#C#4:'EB)+C8?$1:)13/F14>03>(7):&C5#5G>G$>-9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C5T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30328 42 87M = 30454 191 AATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTAC 5)+6.90CFB5:4>"-*>.4*/H'#H-G='-$<8-4<+)G17*&41-063-!#:6@(54>C'+83"'D5*(FE8!@+4.A8!0H>==6G(1;C+61-;40:6A;'C.0:H<5+#9=#F2&"65)GH.@>6D&(2)99!+*BGC,7C19@12$8( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G1C5T21 YS:i:-44 YT:Z:CP jpayne@0: r6501 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1302 42 118M = 1191 -229 GACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTC ?6H8'*%?)"B#)!B."@;B;,!G899!GF?/,&%-?A8H*E'6A%/")2:9$5;.@,&+#?+5'8?7(#G;C&&@C66'31!F6=-),,F"G1>?F?)F4%@#=.D-*1.$,0";@) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6501 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1191 42 97M = 1302 229 GGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGNGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTC 1*G4D"9?+@448D(!+!:GE'D:+<16>B'C2B/6)!?/9-4-0-)44$53AH%)(D92.AH6GD!1B249.3;*"E,@/*1F%HH1-!3!=8.7; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6502 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29732 42 109M = 29841 211 TACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAA ')(+#*)&'%))+%+!+%#$"+**%!('$('*&('*#)%%&!$%%)&$#$%"*+(&"+&+("+(*+#))!$"!*&*'$*+"+)!"'!"*)($)$(&&!)&++#"+(()+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6502 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29841 42 102M = 29732 -211 CCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCNNANTANCGACG %%!$*'*##"#&'$$$$%+$%'#(&)))%)*'#))*!"+*#%)("!*')($)#&*#"%*'!$&')&##*'++)&"")+*#)!%#$*+(+'!!)#))&*#(#* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:50G39G0T1A2G3T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6503 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12722 42 89M = 12851 209 TGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTG =&6,B7#531G;''67>9'64"92EC@FA@@;#(5BH+G8200G-#@#/)@H42?/3HEA/4=(CB.9,.!=48H-62)$*66.8$=), AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73C15 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6503 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12851 42 22M2D56M = 12722 -209 TCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGG -;(&&"07#0G303/>%.4@A2/8C;%7#03(+F%-'9 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:22^TA56 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6504 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41111 42 45M = 40957 -199 AGGACGTCAGCGTATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGG 2HHGF?2-,((;&@H/'HC1DE=,2*>+&CB?2,-2";=20AB<@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6504 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40957 42 73M = 41111 199 GTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGA A5.6%*<06DD*3&=422((*#.3@B++,+;5C5@F%4H$&C3).+-6*;+-1',F-5##!-<+G:8(4GG16 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9705 42 43M = 9857 222 TCAGCGATGTCCCTGAAANCCGAATCATTTGAACATAACGGTG E280=7A-:<'!>)BG%=$(8<@#'%@6B=5'1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T7A24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9857 42 70M = 9705 -222 GGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGATG -<$%,DF1'A<;<&-*DGC<3+ED#::&C<3<)?413;3@2&>$A3.0!2E"30>!)%3C)H5<.-0F7? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6506 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25582 42 120M = 25442 -260 AACACCTAAGTTCTCACCGAATNTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCGCNTGCAGTACTACTGGGGAATG +*%!%!)!"#%+(&#("&!#'&+()$'"$++$+$(#'**!+$#%"+"*"('#&")!%"&%&*&%$+!)))$&#)+*$%*"%%&+"()%+*%+"'%$&)(!+"#&%%%!'+'#%#"%+&') AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G74T1T20 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6506 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25442 42 140M = 25582 260 ACGNTTNNACNGCCNAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATCAGAAAGCNCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAA )&#"#)""''"'#(+#&("'"&%(#")&!**&%+*!'&)')##%&'$%#""!("#"(!#'!'#$$*)*"!+$#'"*!!''')&"#&'&"&&&*(+$''+"#"!*'!)'*"*#!"&'(""((!*))#$'"'+*%'$!'$%" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G2C0G2C0T0T1T40A7T76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44944 42 101M = 44834 -211 AAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCG ?95,/3?*=%?8E%,H%F'$%G"BG37/5!=@0!727;.'$H@%C-)91*1<0F0:1!;2#A>1%"D5"'$?=;<7+)"$%H3: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44834 42 49M = 44944 211 NCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGG $+.G369#E%=D=&-AC;B0-0(FF8,$@143-4<2+0#A&0+&,*H/= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6508 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41528 42 209M = 41737 291 AAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGNTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATC &.!0@AG(E-,-B;E#.E3%$A2+!6/2&9AB%;(5?;9#2D47+"##&GG/+/FF?D+;$&36"C!*3/FG80A2G=HA58?'+/)1%2%6.G>2>;#H$F1FF&+G+E2>.>:=9?>9%6.8?-:/93CH':3BE><:EHC?%8D56?C09H3.,/.?03D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G146 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6508 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41737 42 82M = 41528 -291 GCATGTGCGTGACGGANATCGGNAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATG %+.91@59305/A?%%#B(;,3!DB,4D&*$%1:>8A!@FGD:1<.GCCCF&:<*4&!21#/-:!:C4.*B91-'( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C15C5G59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6509 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16457 42 51M = 16675 313 GCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCNTAAGG ?=7+%)+!&;63@<-5?&$EG+;6B@7A)A.7'85!'63.$D.#/"=4EDE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45G5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6509 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16675 42 95M = 16457 -313 GCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACNGANCTTGTTGAAGATACGCAGGC #,#"1+2>D'B32G3?*H5-HG..D,$+?5.9?E.5)G9C,&C?E6'C/3:=+H#33&8C7%H(,50/%;+F@1:8>",%>6.60!D-B**C/;< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40T30A2G20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6510 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44341 42 61M = 44464 197 NTCAAGGATGCCAGCANGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACC %/)3=)$1G>)%"<;0AC1=!E3C/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T15A44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44464 42 74M = 44341 -197 AGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATCCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATA 0B@;%905DB<+1.H14<7"(-(1C3,/"/*%?24+E.@?E5'/9>5#=2#?+B6?@!3A;8E*9GC'%?)?"4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6511 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38609 24 84M = 38763 305 CGGCNGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGGCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAA )!*'!#+'"*+!++"+*!$*!*'(%!%'%+(*+)'#)""'"#!!*'&*!'!!*$$!(%*'%+&$#!&'"()+(""&"'#"!&)) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C1G0C42T36 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r6511 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38763 24 139M4I12M = 38609 -305 TGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACC *G?&(6)10E*BFEFEF!#":;=@-*--:90408?A'?")*/.=DH"4#/=&'FG;<5D12*AC4698&6;HED(!7.@B2<'D$G2E4-F) AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:137A2C2A0A0C1T1G1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6512 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30979 42 79M = 31058 204 TGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCT *228?B)!=H(3C4?+F-!!1,&(F%D;=@+%7+8%2#!6=7?.)@E#63>,"0E:1.;E&#?6+H3!.".:3#-0;$9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6512 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31058 42 125M = 30979 -204 TTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGGATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAA *=+)3?7@:#'FC=>F)F;H%>(:,(>5"3HD@%@D1A9)G8:+;*=)41GA2/1(&3-9,*16.=5$>#-(,(45H:'7)%,+'5"@6!(>A!7C&:&/BAG5;59;7?&5B=&8@$&?>H.EH$-?*7HE;4+;C&")A$C4*1.G-,@B#<(D),+'84H93(A.A7$:D,3$"&&6.B0DH?'G?*3?A>(1#H%==;7C#DD/)'5,6!C>BF1H%%"7BE:%F1(-HG&*)8"4@*51.H$G)7H67)=)>?<*7,61>+06?:D/G;A!&E/$/>"C;=A4.$;)<:>E@D276CB6,=7;:++"18>*:8A/".!8=#/874!HHBG&/"!A:A>H4HF)9:H$(,"@.!76.D8/7H#0..<2D$79D.97338!"A-18#3B%>8)*:986'"/,EA'5#?B$4%3:.=0/EHG"8#-6!!D?+-@B*1*"B17@64$6AA@1:%<5C2",?A>1*0-?37-@213>:==F!.*3E7'FFDC53F;(;/<(:%-H8@,C3B3;4&;"G4@!'EC34AB%32:+=;.<@1>B:C?-/'$95%(##'0<2!4>0+/C7;F99E=7C$E833>B( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:84G71 YT:Z:UP jpayne@0: r6515 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24682 0 * = 24682 0 CNCACNCNAGGGNNNNTNNNANNTCNTNGNCNCAANNTCGNACNNTNNNNTNGANATCNTTNAAAAGNCTCNNNGNTTCNNCANTNAGNTCANNNNGTNGNAGNTGANACGNTCNNNNTNNATTGANGTNNNTTAAAACNANTNCNN !$$$$"##$$!!$#$!!#"#"#!!$$$!"!$"#"$#!!!"#!#$""####$"!$"###""$!$####!"#$!$"!$##$$"#$##!"$$$$"!!!$!######!##$!#$$$#"!#!#$$"$!$!"!$$$!$!""$$$$!"$$!$$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6516 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44326 42 104M = 44202 -228 CAAAGGCGTCGGCNATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCNGNGNTACGN &&"'%))*+*'&*")!%+&#'+)&)$+#')+**(*!$+*!""&+"%$+*#+$)$%!"%#$$'"($!*($%(+)+$#$"$'$%!&)"(&*'%*+""#&)$&'%*% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:13T80A0C0T1T2A1C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6516 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44202 42 51M = 44326 228 ATTATNGNCCTNGNGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATG ##()('*!*%*&)#(**(*''+&##)+*')'("+%#%*"!&%*'+(++#(& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T1C1G1A1T37 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6517 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29511 42 130M = 29390 -251 TGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTNTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATANCGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAA AH./$G"@9F,&-6-6591ED(-78-;"$(C%7+-%3"2:5GEFB,505@,B:>/0F<)(=@00%;AA2%391!/-?)8#G4-B8%)9"?7A"F%%C@B-0DA78'>-.%,/A)0-'85(,62G$:B(@C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62C39A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6517 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29390 42 43M = 29511 251 ATTGTACAGANAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGAT (9;$4'"38&+-!9!;!61@B-/;:473+C((6"@C%B9*0,8#!:D-2?=("841*9:/?(/0D8.D&#"$!!08)D2A4#34$4>B)>67B/CH959HE28<42@-C"'H+52#66%?"'3-"3BF=@5,A+EH)?GF1/528G+$A,;#$/:!/;5A29<$F1*A=>E6EF3(A#>3?7"0$1852A"0F!30?:*,1E3(E3'"8?(::A)<9HC755E50F%C8#0F71,#*:,8HF;$C=D&00GHB9(?A)@+6,BD<*1B&, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:202G39G108 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6518 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21085 42 107M = 21192 458 AGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTNTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGATCTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCG 477>..D0A$?=7BC%D&*=15:80.G;$)F5?#$>?<@+=/0C=/(G?=,8!E)C2+"86H3<-<6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T9T30A40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6519 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18340 42 84M = 18540 289 GNCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTC *$H5;D>B?@@(@%;6B+1H<5E02".-C;10,$%D6-F9F8:57#7=!51,$8!,G!E@,(B8;DD+D:87&<2:B'1>H4E4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6519 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18540 42 89M = 18340 -289 TGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTC <'+15'8=;29)0GG7%66><@4GHE-.#A'/H8*9%/G=2-0*/@@9<-)55((D6;91A,H,"0)E?;?B6:F@4#,,$2DF#D1ADE$+C11C<1<(>8;+BA9.B$(,7CED*3@B62:$A,=?1$GE1*."4C1#D#G?G>B0"#+3'!(8HF1A:$>@>$3#7H$=?6=+-<@80=D249!BD;0/"+*5,+E9"5%0&$11)2&+$##!$/"&H298F!2!A8$A3B(+:-A:?%H/*>,6"'$;&3=+0.+")=D!)!;'G2;0"(<+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T424 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16387 42 46M = 15930 -503 GATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACC :?@$86;8!.6?>CA3<+'(3E265%$0=8E.<@(!3%4(-=)7F- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6522 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43934 42 178M = 43838 -274 ATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATNTGCACACA 0/:1><1>4H%&-5.;%C(H3+H#?9-B7>,+7=5=2-#H;6>>&9?B&=#$59:7."&GAB?&H:"!':8B:7EG+=$%:B$*A#3''!'E:6C+-*GA@3H(?//C??3GG>8F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:169T8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6522 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43838 42 96M = 43934 274 AGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAAAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATG )8?:(8(:"4GEG)6?/AE*,&<8E45DEHB1%3>4F,,G!!<'H:!%<>.B#H:6>%H2354+&C50%741(C$3-=*=##!/F2'A.!(/6!1" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6523 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38919 42 123M = 39042 353 TTCAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGNCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCA %&AH:3,%A"A9')AH14=+9,A'8'65A7$4D">"&%;/;:A++@B##:D?.B>))#?/9!%HC@?/90@*F$@"F-,GC3&)(*B($.1'CD#D, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A75G45 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r6523 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39042 42 133M3I97M = 38919 -353 AAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGAGAAAACATCCCTCAAATNGGGGGATTGCTANCCCTCAAAACAGGGGGANACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGNGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGA "-;7&9&=67&7F:"/1..-G=*-6DA!&=21.:)1,80<5(=%DH8(C4D8F2,.5!>H:(GC$;E2.59#)+C&CG%4;;-'6->"61ABF>2A-)#>(%"**/A7+G4B'.4+0?@'?&3A#0)($E*F870&>-C614+GC4'B/0,6)*3?4@5@#<'G@#?3@+AH."58*6=6;7!*$0)8%4D,E#3,AE'&DF,.AD8GA@4#0%5H/-""90DH//7>(/< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:21G5C60G52C55A20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6524 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 600 42 68M = 382 -286 AGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTNATTTCCTGAAACGGNATATCATCAAAGCCATG 7%C%9=;C#8(G;*?';B++@=GA:7+AA8,")H@0,+E4H29A#%91>'@+5,CF:4=:9>G/#-<+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G14G17 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6525 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7509 42 79M = 7670 223 CTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGNC .D&:C9<<'9"4&/@(4D#%'/#:!AA>?>C,9/"DA88;EG>.-5"@0"?<@%H(*2D@(1-B92(+F- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6526 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39159 42 16M3I29M = 39204 217 TTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGA $BB?9B+..-CCE"B93DC11E#03G2D)1D.H,32@1:!'*9( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6526 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39204 42 172M = 39159 -217 CCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGNAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGNTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCNCCTGCNGCGTNAANNT )(%'!"()!+('+$)*)"!##+*((%"!##$%$!'%'#%$'$&%*'!""%*#*"%+&#("%+*"&!"#'&*!$*++$"$*(!+('$''!(%*#'&%"!(('&+&(#"!&)&%(!*)'"""""*'!"*%'+%$#')!$+!$*(+!+'**++$(*(#%$'&)"!%%)'(()$"( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:39C54G60G4A0T4G2C0G1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6527 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34908 42 56M = 34649 -315 AACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATTTATTATTCCCTNTCGNAGNNNT !!*#'&"&%&("$%++)(&(!$*#*+%!'*$&+()$)##)#''++!($%%"'""#& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:12T20A11A1T1A0G1A0T0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34649 42 59M = 34908 315 GCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAG -3'H#'3".?0E(F9(-:.E+E$C&F;H-&%,/8:>FAC"B5*E*-AD1,:08B?0D:6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6528 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10955 42 69M = 10955 0 CTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGG 55E-/E;!,+E@E&6!79&@1,7D.):7,?C)1EH=GF/).%+-/!=1+B@&95'*B#0+*0A+'8D7/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YT:Z:UP jpayne@0: r6528 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10955 0 * = 10955 0 NNATNNGNTNCTAGCNGNNTNNNNTAATTTNGTTCACNCCNTGNNNCAGNNNTGNGNANNAACNCGNCNCANNANGNCNTGN ""$$"$"#$!$!$$!"$"!!"!##"""#"$!"#!#!#!!$""""!"!!!!$"$$#$!!$!""$!"##"""#"#!"#!#!""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6529 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45242 42 96M = 45408 301 AGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTCCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTG /35>C2%)FA$H:2-"C6@1+8BBG'"5$'77,-A#1.H%):FG>8A2=$6">6/7!F-'A2>-6H2D=$$@>3:A44A"9*6(@+54B(,=@C&G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6529 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45408 42 135M = 45242 -301 ACGAGCGTGTTTATNGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTG %+1;:B6HBG'DG'95#.24#$,4;%*9?3"<";0CG@%:<194/4F8+GF*$":BEEB#,7+*2B)+=!E%"A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6530 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32218 42 214M = 32432 268 TTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGC /C0##/:!=*GF4,B;-52:G+/;-A=C+?E479$,D4283%)B+;DF9=)C6.!D>1*D#E)=;:*(8.@5G/<4-+:%$%4<3)(?5.:@$19-:A(9!H<('40GH2359-9D//*%)-@(>2*2A0+>(9GC)B'C,"C9@@%/"4G10$%@)@0>B455"A/(>HD%2)&=D12)6D8A9.?/E$*&H79191,)"1#-*A&0B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:214 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6531 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38993 42 150M = 38993 0 GCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAANNAGGGATNAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAG 08BH!1!+=)D$:(%'*DE*$HF1%=/65H'?)>C/(8(C*G?$3>01C!%*>2;!*B#=&'E96G-6-.8>5#$"7(A/HD.GE#6E27!02:C%8:&:.539"#<$73;=C3%FB;H6% YT:Z:UP jpayne@0: r6532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21994 42 89M = 22196 243 CAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGNTGNAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGG ((+A,3<81#51!$6(6&+<@965:.7C*A@A3@?EBG6;8,,@<.#?014G3'-)"=E)*"!B??79650D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6533 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45456 42 146M = 45344 -258 ATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGNTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTG -,3<+D4-E$DB-5AA'?5:787?G0"4#=!=/6@":/CEA:*90-C7#89)A=6(H9':3,H0;:&:+")1)"D6/0H7!B37'<==)9"=!G>)4-@?*9=)E@2-&H"F&&7')<:B!-,&&A-"10:(2:/2:&DG#2#E$8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6533 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45344 42 112M = 45456 258 NATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCNGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTT !*3C=CH?%81%"!G43)+A;)?5:8@;,;4:@4)H0??'.0@'!;""B8-!B)1':!G*4(6,%<#E0D)D>:6;GHB%C59EF*0(D4:@70;AC&488G$H*29=E'#4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T36G74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46775 42 128M = 46640 -263 GAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAANTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTA @F!+=7./C3A.B:10H65)$FF/4H1*9.0*9AH&31F;'D-$""&@0@D>5(,,95B@,G9=6;080B=24%>H3141>(3A!;,0>0*:2GC:)F(=.0<*B4A+<50<0#:3F"*:B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58T69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46640 42 135M = 46775 263 GTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGNAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTN DE#0.FEB=96/C30"!F3A$!660B8<1D@(%<'@#+BC$#-A&=(H@8?(:%."1@@9-)>D$9B*>+&/)%6G7+*%C%?9F;GFD!"CD9F<@39;6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88C45T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6535 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23786 42 85M = 23672 -199 TTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAAATCATGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAG )?#"+FFH,85)<;E:2(G+9C4.B"9F+)A8"GHC6HH"1D%+&B7E#BE$=#F&+F1<+)>!(C:D57>"15#G2(5)"E2HC AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49T3G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6535 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23672 42 50M = 23786 199 GAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATA />7;/260#=&>1=B"4C?3/BD!&/:AG5.1C>1B0;%,;6>%A0A+,= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8812 42 105M = 8649 -268 GGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGA EHB:("$8;E-#6AF4##*6F&E87H@&3?3:;?G60H.@4@%F)$7EF55&)F8-3!=4*1C(AH"H4@D%GD>/)<:@*6&E@61A@CB05%> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6536 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8649 42 137M = 8812 268 AGGCGGATTTTCCGGCAGTTNCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGATCAGGTGCCGGATTCAGTGCTGGAT -B,26?3+1@D30%;<)7/36D)+9%H:9C898.=!=5-.40"A,C/"1>A.?6-@'!?2+?E&99,8)-7!"&G&"A*8*%B11C(?&!B@'A&<8H1;F>>E!6)"5C.G&G15BA%7?',%8,."9#146),=$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G90C17A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6537 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11946 42 118M = 11793 -271 GACAGTGCTCATGCTGCCCTGTTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCNGCAGCGCCGNGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTN ,+B3BED5+E#(A#;9"C,?E5H@6%F5,/2+$B,!G*HD@)3(H-=>$A2EGCC..B7,F;%'GF59##!/@F7A)06!C4-@=7=>.4/+-D)?951G5H7@"33:1FC$$7% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21C63A9G21C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6537 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11793 42 49M = 11946 271 CGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGG .?5?.5.(F.80G;&!/'2=9$'6;4?H68&C@G%>)=*C5*(25EB:7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6538 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29694 42 34M3D200M = 29603 -328 GGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGANGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATTTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGNATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCC F"782AH=-0/*H?=#*F5)?(=C;0373CHF.3H1;@G8-3:.%!D(DF5DF<2A/GBF>?3)>+;!,&)GB:B60(84'B=6$1G+>7!;D&=+3=<3A&34>$!&=H7%'9&=*B0#A2"%)#*-)%1)+A3@&GAH2==C@C(04G9@''/+3;115%G-0:;6D&1@83F!11=9+&41:6>*0,,/!&21 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:34^ATA13T85C60G11C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6538 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29603 42 70M = 29694 328 AACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAA -F7DG!D35C)48G75/@,#&E72;7!&'F>+DB7+DA%6#$G!06GA+/7@'A!2,HDF")3#>2E4F<#%>;0D;(*,=;A9%A&-+(4*&$*2;&36.D2E#0?.D77"(3-,+F4??0=#3&92G-*329/.'DAEAG-+94#8%H6B-,?$C'7H)"HFFD5##H7&5F1-8/)%@/7G%)G+CDC*#!<38C7)*0/)H%5%HF9#;'G3#%!)#?6BC:HD/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T10C58 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6540 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20993 42 47M = 21200 306 GNAGAGCACGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGC ($''"%$%+#$'"%*'%+*#%#$&")+')'!*("(""%)%%!&(#+( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C2C2T39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6541 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1642 42 93M = 1534 -201 CATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACNACCTGGGTGCAGATTGTCAAAG *9D-*+-E)%9=%+<=/<1%1*F2E#/1D3:1;E(/$?2&'$(493H='96'8B&A'*;#H&'937$$+B61'-(/D,>0*8E6C;HFB.;-: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C22 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6541 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1534 42 44M = 1642 201 AGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACT 0>&7)%9B9D+1GGCD,?-@C92+A6<>9F@0"$=1F->>3,B! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45578 42 58M = 45384 -252 GAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCA ;:>8(&F#$$9;$/*!6H@DA>@''3/D:$?2*#8A##:2.H';:!9+:2)'A?=)1> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45384 42 81M = 45578 252 CTAAGTAGCAATCTCGCTTATATANCGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTNGATTGGTTCGCTTATCAAACGC !57@E+4:1"F"CA.<9&9".#0>3;1B3+FG+*/5-0-79$C!C2;EBA)BC9@."E:/':@'3,%EF'$FC?<,G)$=$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A33C22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6543 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38343 42 106M = 38243 -206 TAAGGAAANACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCNACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGC !4;1:.,F<:)3;H6!(B4"98EB2&71,<:*D-70>:B/93,F4@#FB#F,,($%D8#)<52;6F&,/7@52G,CDG(F/@C"00=%(?BE(A+"B40C@3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13318 42 56M = 13392 171 GACNCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATNAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGC ?@9:%:G504'*:+,30&#,)'3B>H;+DA;8063AH.'375&?#9A%353E2ACC AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G23A28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5152 42 354M = 5506 616 NTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGNCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTCACAGCACCGNTGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCNGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCNACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGNACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGNG ",75)8D@6A+8,26$1D-'30<5+#:4.H)"7G3@8)0"C>=,A4"'2>E@C14'D;;%$%5A,)G8&2:#G&EH-!&G?(52E8AC6-#6&?,45#--A5/5+*$?+;>88BD$+37C1G3GB9%8$-C,FH9??/&H35@#11A55$)>,51C!,:(%-(E070H2+2BE%")#24F#3>B=<-)91).D.:?"!3,:>4>?.B#,18,F:4/F$D/;G'$=7198:'?:-D+A>D35>4'#CCEC/)F;7,'5B?'5&@"&116E=5:4D0*,E$A5,.G%)!#:7E(F+3:' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C37 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6546 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2835 42 216M = 3051 256 CNTGNAAGCGCTGNGCTTTCACACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGCTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAANGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAA #!"$""&($&&!%#"%"*(*!)&*++$$!&%!#((#&(&(++&")'#%*'$&%+%#(!"$+''$&%%"#+&&&&**+#%!"$"!(!*"*#!**$%%$%'$!(#!$#*&*(")&$'"'%()&+$!&#+&&)'%"*)"%#*!(&&'!#!%#*$")&%&%(#%$!&"("+(**+%&!$'($+*""$'+'(+'*#')&'*!%&!'('""'!+#*&+)(#$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0T0A2A2A3C0C0A0C1A3C47G102T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6547 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28587 42 72M = 28732 227 TTTATGAGTGTCTTGTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAAC $A04/;F6A7A9&BH*3169CB:+C08-=<$'F.=='8-7+B-@$:AAD37F8C3D40%$C<'7%3F&'.8C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6547 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28732 42 82M = 28587 -227 CCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTA )&+"$!&)$**%%#"%!(#+%+*!+('$$)+()&+&(&'*$&(*&+&+&+))&(*+++()*)"%&*'"(!**%)(&'*%+*$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6548 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42496 42 144M = 42333 -307 TCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAACTAAAGAACGCNAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGANAGATAAACTTAAGATTC .%1%-C**:-84,>6#5?<,6595+>.!$?>"?-3(:*'6)2;/H@@7EH'..+%+2>3:7.A7+8!&?345FA0(;*4+'>-81<7A=:='%47;EB99(?9%8;,&B0.:10E,+,@:7>C.C+9BH)*56))7,'(/2G(5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60G10G54A17 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6548 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42333 42 163M = 42496 307 NCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGAGGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATNCCGGGAATGGTTTCACCCTGCAT &4'='!E6#;"CH1=D"2E)6@D@$,4F)/>,A1/3#$,B,E@#&(E-/G+>)%>?0E")99&8'(/46&1=?H**C;D@E%)%H"1:E%837*A6<<@=(E9$G7.,* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16658 42 80M = 16529 -209 TCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAG HB,BE=:F+*0'(=CC#*DGG4>0@(D'1D,.-/.(+7E/4,D(/#180/,4'//562%=,@&$4>5/?C"36$H341'?1@4$2=*'#H<1*; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:54A28G36C8G1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8338 42 51M = 8172 -217 CCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCANC ?6@6#96,GF7F'?B:(5D%*3++5/7)&B,?&':#G21449@-C>*8H") AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6551 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45300 42 167M = 45116 -351 GGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTANGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTGCTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTT F#-F*9,4=%H4,-0$%DG,D&C""A4E&(4B-&/(-;DC2#.'8G@#+(1-3"-.=8#<%/*,H6$9$B,CG8G#147;?,/>><9*8@9#$&.9;A&&H#BHG0E/!37!>81."10*B;%GB-'+%E>;E,!6B,3%F6*:H&21)D?A7.027!88AH!@B;#?E:3@,?4>/D<,@2#G16A;2>G9H)F?#5&,A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42G127G13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6552 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43871 42 83M = 43706 -248 ACAGTGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGC 5=9;*953D70?:C,-1=<):;>+.51H722,E;(':!?8>;B9F,9=008D#'=#0!H5H3B7;(CE8B,"".$<@A98+>< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43706 42 85M = 43871 248 CCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCA '&B*0/!.3;!8998&6<(<".04!7CB#99C2GB7;?@(0D987F+:80@'%085"H-627F082:2+5+"6H73?0-=@#-7& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6553 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2946 42 110M = 3113 271 ATNGAACCCACCTAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCA "$%+#*"!*)#+&+(*!*)(&+)#*"$%&'')!%%&"%)'+#!"!$$$&($)&!$'+'#**#+++(&"!!#%&&("!!$*((+##"##"%&%!*#)%$#'("&%#"'&'" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G1G9G97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6553 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3113 42 104M = 2946 -271 GCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGAC '$4("62(+4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6554 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34119 42 77M = 34277 287 CTCNNCCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCT *$#'"%+'((#'&#&)+&++#*!&+"'$+!&'+($+%)$&!")$!#&#((+*$$)'"%*!!)!$"$**+##+&!*+% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T0G0G71 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6554 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34277 42 129M = 34119 -287 GTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTATTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAANTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTT 3<"F*AA*E:/%7!G6+1;$H'1(:!BD)1GD4+A88">(",;5?0!-"!-="G92(A*#1$5+?DF@>/1-?,D3*,-:9)5=A!&8@B52)$'#2",H$:>-A6G#.H';HC0$H4**DE>3:9.(' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G39T23A35 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28700 42 228M = 28947 302 GTGTTTGTGTCNTGAAAATAACTCAAGGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACCGGTCGATTTAAGT ,5(1((B9225-&*4E(2G>>(5&D:&55'F8%8+/-'H#B((=3=B-'"(&50.4(:(?=B8>E2B40?B*G)-$C0$-/7+;54*F.7B13281&73(D%CB.;#<;:&D:6./C:;9"*2+;G./;CE<4-HBF7=B* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11C14T187T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28947 42 55M = 28700 -302 GTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCC 7>'(/();-#?279/4$!;HC2:>67?B#$34D()#@'BAEGB*E*C?%EC74B,=12)6CA&37BD4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6556 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8152 42 59M = 8310 255 CCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTANCCGGGGG 2$B39EB"&*:4D<4E(>*7CE-H%D-<&3)<+FHF!D%C/+9(F;6F<94F')?@282 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6557 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14542 42 55M = 14773 276 GGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGAT F,C*!?+5)9D?%5>6*E<8>G+1E=&C3,-H$:+:"D4'0'8:;8/-0$%:E#3:/,D7A(AA7CF/$+:--5E+%D*/':;>"(*B(=C:D:;$0'<*:#C#;C,#"@DB9H'8(2)D/A&".:?6->2@EA5:9176G$H82#1(%,21"*H--"!H&?"%H2F-F@<#&A?,9; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G100C59T22 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6558 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19529 42 197M = 19726 409 GGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGANTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAACCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCTGGAACCGGTGGNCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGNAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAG 3'/+?H5D-=;/1CC#-&!9H6F/;>+8AG3',;23-C"+/.*(3@%<9C1,5<<:C:HH<55-G>G'5DC%?F9"@<@:6;H%.2>='B$*&E&2%0'.HED?DB8G(EG.H0/7'#C-F1E8(BE3G-@!4;#-%5>@C55<@;>D85: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:27T32G29C11G45A48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6559 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46741 42 103M = 46593 -251 CATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAANCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGT 53H&CFHD=E>#085,#DB64$'>!.!,%@3-.,35<."5?E9A%C@C2#7B3)*6H, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6559 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46593 42 146M = 46741 251 CATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGT ).C#G.!./@B.>?-''H*@F@&+6(9&(@B"0H(>D00:?F85&@$9D4#:>H3-)+@1:*1D.@28;3-8/C/%HBG,46/6;<>1.-/$.714&8!(<+?7($97<<2'-8#2=@52$0E;A42E4A8=:3+%EG:B#D9G(''@H$?>?:##7B%& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6561 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33672 42 45M = 33751 236 ACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGA B*&&'A=-"89C.3+*.4H#=1CD%GH(@,A-@!.GH,00;C3); AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6561 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33751 42 157M = 33672 -236 ATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAANTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGAAATCCT ..<&-?G(@/HA%7ACCG#-0,E>(HD"BED$D<4+-##&&?H.+E'50G&.?(E2(%52H81%9#*9#"!?<;,=H)C@:EF&$-3@+.@(2GB@(20*$,$*@E1<3!4G)1:%H+4@-.9#/;9++'%4#'%G+CA:0A2;E?47)30@)7!HF09(,D!2F&<'*A9@0-5'B)(G.#,*>AD47B3DF/'&()BGF+/,&&52>'+*+1(F.;4'".2A+=HD;3#H6+:/592H%48/F:.'%E63#?HA4AB,.G,0D?>=B06)D5/+:4)H?@D-<8,G&1::F@(/-A<63,$E0,' AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0A38G50G19C18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6563 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 409 42 177M = 586 263 CGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGANTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCAAGAGACTCCGCTGAAGTGGTTGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCT 3'C=43G2&%16,242A?"5CH@=:634"3?G#$F'3'">))!>@A*HA3%-B5&A,06-,'@7H9"3*G+&6"4+'#0#@:88=8D+&D&F)!2)GD;G/A*5G--4:%#,9B6/AEG83-/68=356":42",#@C37:1*!."2(A04>+1#*H&-,01H%B%,!0&:'#D&/5=-=9$8&BBC$5F27-EGC!">;.G05!@.!5;C63%23D0(E5A0/;8D**B,;-/A<+)H1+B0B8(+E//("65 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:63C24G6A12T4G57C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6565 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29719 42 9M3D150M = 29567 -314 AACAGTAAGATACTCAACCCGATGTGTGAGTNCGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAGATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCNCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGAC HFH.&@;G)47B(D"2"!1$+)-(F1.AA&D9?3E?21:.7:6#9E<%/&5'C:0$@%H$%'#3G6?)#, AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:9^ATA16T5A51A41T33 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6565 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29567 42 152M = 29719 314 NGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACGCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTATATGTAAAGA "<23&+B&8F:<(/DD&:C60+-;='(2F48,2('E=B42)>3D""C8*@4,$-@1@2H149-&"@C:41%C"6G.>F;!3*5("GF=HE+A'FB#;/D?9"B<(8/DH8<5'#->$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T84T55T10 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r6566 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8560 42 215M = 8481 -294 TACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGNCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATT 8E8)9*/C-57$6;,/*5A7F2-$B7?!+0B7"*(;2,E#56241=FC/)H3<.&;4.=C'3D:8=>C4;94;<6%-06DA+-+"?!#3>6"12/4+#F/92!708"3:FA1+6(!C,%?'>2F+9+E$.(("!(E;12&&7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6567 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9232 40 103M = 9377 242 ATCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTNCGTGGCTGGGTCAGCAGTAT &#G"31#,'15=C0%:6/?@0,C'":GD"+"!B2.12#D(9.08350>@- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G80C20 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r6567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9377 40 8M5D84M = 9232 -242 GAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGNAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTG 2/EH$,5!:/7+F:(%FCD;?=D*F45?0+02HGCC,2=%+(CA>@9".>FBFC!"$$57%$>/H5)C+A,7EF*5<7@.&"E0@75/8<82 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:8^CCAAT29C54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6568 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23832 42 97M = 23683 -246 TAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTGCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCC "DDB9E$<4"E&!46'*-?>E'/%%:&G59$5:=,+:;!3$&,)%B9=FH>98(3G"(316C!:$982)15$:+90&*/8?A*:(')9!*90*(62+A!,@"D">++BCCDFB1E4)2++<$*3.H)GF&<17-D'%*,5??BF>7F%=.$CE0&'/-.C('0(H9G"A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6569 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29337 42 127M = 29198 -266 TCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTNCACGGTATCAGTCATTTCTCG !)0>-+A$C4AE$>:.4:=/*@<='.F(=!;@$<>=6+<2;47?=3",*$6:3&,&11C;9>:+%F*/G=8D8G@AA36934H6G724H?7$DC?@E*C-%(%)DH$0<#-%C>*6F@=)!'D&/,C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:105G21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6570 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9818 42 99M = 9709 -208 AGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCAACA E8$5((/!8*1+=7B>2>D@0C#F3G'=4=A"11!DE!&C=0:9=@!0AHAG8,@DBG/);,"::6);%47*,/62-F@7C-%* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96T1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6570 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9709 42 59M = 9818 208 CGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGANCATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAA 3!E612+9#8=07-?6;%.(.HC1.00/$;7:<#(/9?=B*%4@2*$/..4#/""H>C? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A30 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23786 42 66M = 23601 -251 TTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGNTTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATANN /F'G%6.BH%E5G3.;#3)/AB.0>#/45*&E=HF5C-$D@>$/:739/C*8H&<";<5##290%$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28A35T0G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23601 42 95M = 23786 251 GTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATATATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCNATCGTATNGCGAGAATTTTTAGCNCAAGCCATTA :3"$G06&$#F"'@<-'8=11";,;H.0>.8-34&:::E:%4<&4-C;//#6706+>&.H#G;+;6?C" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24661 42 45M = 24461 -245 ATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTT 8473E>GH3*"*8-%/B4A!@AF&&"H?&C:($5'G?B%*)G7)/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19859 42 183M = 20042 267 GCANNNCGGGACCNTCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTNGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGTCAGACGCGAAGAAATCAGC %)"!""+#)#"$%%**&&$+'*%+(!+!$)##'%+)+(&"*%"$+"'("*(&+%*$"!)$(+"!)#+()!&&*)+%##*%%!!($(#"('%#)'*&()!!%"')#)!%($'!%!*"$%#**+*+&'()&++!#&&(&&#'*)%#'#)(&$$*%($)%*$#""'*++*+##'&#%"!!$'(#%+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3C0G0C7A89C59G19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20042 42 84M = 19859 -267 CGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCNCGCGCCGCCAGCACGTCCGC -H'F3;$-!*3H"<"5"<2=19(/(#8>/E$006F8*73C;&#$9??9;%C238+"">!-@379>3!6=9$3?6#5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6574 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9663 42 59M = 9461 -261 GCGNTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAA !#0=F555A6<;92/C=E9<*6,4#>!"*7D-G>?6%E/+$E5>G:11')/E$BFF"G@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6575 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3030 42 87M = 3262 299 CAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTG :,5):EC.1'=!H3@#9F2G&A@=B%9>48C87DE#@2.4@0A"-%/!?D'"F4A/3@2B-*.:?9FB,"G7C@?>=2#&.DG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6575 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3262 42 67M = 3030 -299 GCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCNCGGCTTT %@/:9!!=C1'.H->88+8A?!$;2HA&A%1?$3GF.@5(B,8$*1%58@B.;!.-!H%(+F4B)2A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6576 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47332 42 125M = 47332 0 TGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGAGCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGTCATTGGT E/);/.?7H!$4),93CD9A,5,7(G'E#'<8:@<*4F/=B)=/"7EC,0?1A1;F2/-46.D-9G31:4@G;E;F>8G2*C9H9A+B11")='CA0B*5D*,3(>/*$H(D/!D!E@=(;2;@D AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86T30C7 YT:Z:UP jpayne@0: r6576 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47332 0 * = 47332 0 ANNNCGNGNGNCNGNNANATANNNNCNGNNNTNNTANNNNTCGGNTNCTNNANNTCGCNNNNATGNNCNNNNTCTNA #!$"#!!""$"!!#!##$$!$"$!""#$"!"#"#!"!#!$#$$!!!!#$!#!!"#$!$""$"#"""""##!"#$#!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6577 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48284 42 81M = 48284 0 NTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGT 259%%,>"-&2*D:=><2$,6B9>B>;923'A39<(21,,&&%H0/57'-@A#(5D9(>>=4HC,.?.%0"?,(!2,G=,* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G80 YT:Z:UP jpayne@0: r6577 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48284 0 * = 48284 0 TGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCC 786=@#&"1"E&!#,!:'53/4*!+)C#0)A66A,/*>69H:G;#&$*E;B'+>.7DF746B<'$;E,57E-*!/8D)#37H688-228&0>&=?B%,!5-"8'4?;"G?",-E,,27<732(F<48(9C&/=3'>851>2F)72F)!!&2=A8)CBG.?C,?F,8>A%-!5B:5-%C*4.)#5.BACG")A?%B0")0!4HD/EA!7&+0#="<)0-E*5;!0:79A,3))BF.%&*EC9,3/<'GE%F)DH8$=46@7+H?/+2).::?'-CH;3G4&0!(&@?;?;),G'(2,C<5.(+H(&:+<20447A2;?@*DF!0$1D9)&@C.6 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:19A3G31A263 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3605 42 106M = 3711 425 AGNTGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGANTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGAT %(%%&)+)$$)!!++&#!"'$*('(%*+*!(#)"!$*&%&&%&!"*&$'()+)%(%!+((()(*'#%&&+*%(%$!'!%!#'+%$$*())*)'!!'"")&)))##$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A48T29G24 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6579 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33727 42 91M = 33818 214 ACAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTANTCTGGTGAAGTTT *=2*E#<#E:>5=#D4G?@;#;#-D6:C@@6-=*G$"C4*@3DA9/>'1><)D=>1@C(H%;>&% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C76A13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6579 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33818 42 123M = 33727 -214 TTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAACAAATCGCCCTCAN D><3C*5'@FGBG&?D4*<0<*%A@!0CBEG<"?#F$3@D4D;,>:-?(?4.?"2GE<)G)BBEG;-:F5G(.-F"7-G3D<='A(4)08FG479/5*C1:B%A5":,*#"??H7#,9-+B>& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109A12C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21331 42 394M = 21106 -619 AAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTANGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGNGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTNTCCACAGTTANAGGNACCAGCACACAGGGT H=#;E?+,:8=>=F"?<*4B9353.=1%GC:7687,+@H=->'(5/((B4,'D>!,2F-GH@H$0<0=9?>)=,;?CB)#0*"18$;/1)++$EC>%<1$;4,(303;2#3!H%;09HB;6>7(2(GA'>%(79340:38-1"7@CD32;G+-;/?!>-#+>0?2+3)?)C&$/883CE2A3@@9/4;9-)3="F(650&.2346*D:;$.4.AE*/E!<$738B:?%=$+*/1?C.0%D,G#@8'+1F%AH3?$++6)44#)70'=$/G:@7;3*H:6C%$,F-99A/=+)+@B2$B+'&!6/F'49/?F2;3@HF/178/&2.;$HA,679!E'5GH)*740:F(G!#BFB&FF)0..@F2@E@':=+++E: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:113A71G177A10A3A15 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6580 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21106 42 225M = 21331 619 TAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCANAAAATTCCGTTGCAGNTGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCNTGGCCNTCAGATANCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCC @)+0-798=4?37@2B$'0)58=@56,G6#:;D>?"+##28?'EB#G"274FG&4/F5?6H'AA3F&=6,.FD*B/C6!);!6+/:.&"0C<)*):<49)7D0(3.H3$@9;7A2#;E38,4?/135,'#%";82*5)@-.==+@>$;-HG<@G78B'.8=-%,4 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4T71A15A60G5A7T57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6581 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12076 42 192M = 11967 -301 TGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCA %+5'5('/)-!%CF0EH=''7(6(=-%F+17)9>"9?<2379=-:-,/$$6+4@(#&;?GG#C)#(4'0-!8#+9HB91D@-C,!%)<%:&:(#31"B(G>:!9)?0@A5('96C(";%2;?0!2F;8@9:H!1F3?EB#>61#D01FG;$")&$E@@C2-'F%+36'G8A:$90+;!$.(9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:192 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6581 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11967 42 109M = 12076 301 NTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCGAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTAC %,A4AD5-0AA=0)('-27FH/B5AG"G/75,39$2!>-5@11+D-#*ADE'(-G?0@B#>9%&18A-(,,1(8#+=+,?A=H#(9,:'>F95&4;*B:=$:0C986&< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C46A61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6582 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15004 42 106M = 14889 -221 TTACATGAGACTCTGCCTGATCGCGCTGTAATTCANATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGTGCTGCCGCCATTG C97+G7DF':2(23(-,3G&;&C32(8+GE@C;79AA8>&%/"02:B;%;>@:7?@/*&H1&!,"F:817C-=(;"%038:0G-(H%9B63,5A*7=0H0*1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21G13T56G13 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6582 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14889 42 115M = 15004 221 ANCANTNNGGGCACNGGCNATNCAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGATTAACGGCGCAG )!'*#%'"($)$")"''#**'#&&+&''$&%*)'+$)#'#+"+''$#)&)$&'!!*(+%%#!$$+%*%")!*)#)!*'*()$")&%)*#""%'"%&*%%+#''!+$%&(#$%('# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1G1C0A1C0C6T3C1C0A80G12 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6583 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15624 42 56M = 15836 259 TGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATA G'**9?H=2<-91:,E5*+726(::3:&*=09='#"F2$4F1,,?4?4'.(88(3F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6584 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13288 42 142M = 13068 -362 AGAGCACGGGGGCTGAAAANCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGNTAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACANGTGGTGAACTGA <<9C.+6#(C:#8FE!D%?8D#718$"D*1;)&*9%2<8?503G@A95-)=?!/8=DE':7,'9!4&*94#=#@7"/.C/3>@-=$DE'*'-H$-+(2@"(9)5E;%C9B!5'A;52H4,,5($G/#;#F:*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15G3T35A73G12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6584 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13068 42 220M = 13288 362 CGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCANCCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCAACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGA G&(4<$C7!'FD74)5$"%@$4/722"<2685,ED2%'*2%$#-1B$?D2E%7(H?C"2531.0,1<+E4H",A3B()5/F"9":AFD?CE?8?5(<5?@1E).42&82,/&B$>D:!<%%"35+-.!@A10B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:150A45C23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6585 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23768 42 96M = 23951 254 TTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAAAAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGC 40"@.2A7A@AB0%8)!:%&1&,="-G741+.$.C;%1!/A&+)9&F+C19?&8(?%94&5)6>*::1H'B&:!/B#H=)@/>E'!-GF!78- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6585 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23951 42 71M = 23768 -254 ATGCTGANATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAANTTGTTTGATCTTT ACB'0519=D.&C(%>&%#+)8.7495*3(>G>G@F9:BF7!7*=>8<6=/)!"2(@;5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T49G13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6586 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38167 42 41M = 37913 -295 ACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTANA DBF!=+>DA73GD8A+$.A@')&9DF!0?@;C@.6(<#H%& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6586 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37913 42 95M2I15M = 38167 295 GTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTNACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGC /1071#3-7,!@?='"$H/=@'E4A,*(B!<';65)+F&:>>!+E6G,AB$F)1C>!7'A+8*(/0*,CB>F@;/6/!@.(%=GGG'2@9&F6&4%5$:(D*!6="-*H390&95GDCB,%$:--363"C=CH;,H0!D*'B50-/F+0&5B;G AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75A23C21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6588 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48146 42 91M = 48366 292 TTTTCTGACGGTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTT 1@%#G@=5@/;'F,A#8(C9/4D1>7$3;(3C0??03E8=-BE5'$?:/"7)5=!G8FE3D.+):<";#* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6588 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48366 42 72M = 48146 -292 GATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACG A5">HB"G2+(6.2A(>3=D.7F86$'>:@B;A%9FB86$:@0B8,F3.9#/BC$3=)1$0H?D-(*#$1%, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3395 42 170M = 3565 268 GGAACTGCCGTGCGGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCNGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTNTTGAACCCGTGGAGGACGGG -7&;,DC7*H>(H?,8'(:47@#/$:7%&*()B(0!-@G+>@&C:6/1%+@<9.&@(8=BG4=45H>D!@#0;<2/$AECD.A)E*H(BE5%)!EA@C83A0A:F724&65,2"0>(-F:1>,=D1?.8-DH??:C,/,B9=/>A$6E%'>"@3"'6+?A,79BD2*"9H7><*#+F<$64<+D:=D/194$$70'25#B,C*DD.# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24G83C27C43A8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6592 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1966 42 120M5I168M = 1726 -528 AAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGANCAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAATACCTATACCCGCCGGAATGGTNCAGAAATTTCGATATCCTATCCCGTATCTNCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTNCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATNCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCNACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCG C*.57,375*$">/7=+F1C;>7E-1*10D93?%4=F*A$34*H;#%0"39/!)+C92::E*E85?$5;'?7,FE-$F563804&'$"GH+?(2D*E=E-(+,5HD%3CGD$'-A3%,-@>;D6 AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:14 MD:Z:49A35A21G7G16G24G38C25C29C35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6592 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1726 42 240M = 1966 528 NTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCTGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGG '+*(&"+(*"'+&*+)&$&%#'#*$%")"!$!'(!"&&#!)!*())')*#(*(#$*("!))&(#$*)%)#'!#$$(*"&%))!"#&##%*""*"%$+"%*""'#)++%$#"*+!%!(+)'&)$)*+$&!$&&!%%$$&#+)%&)')('*+!!'"#%#+%!!'($&"*$#!%*"()&(!&*(#))!("*%""""#!+%$&%"%+!$"!*!')+%()+%&#(*!#*''(#!%#(%"%'*##* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T77G0G160 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r6593 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18533 42 118M = 18409 -242 AAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAG *.G/H.#56"E$@'6H)1D6!-A!G/+A*=A,2<;?(HD&1HG/()(60H4=&977ED)-G!0=)6H)5(@4!C--:*&2E@B9&@(!B5A245H>D3#13:3(54A0%1!8D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65C52 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6593 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18409 42 74M = 18533 242 NACGCCAGANCGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAAT #")%&'#$("$++)&)!("%)"'%**$!+)'("%%#)"***!'"%!!'%+!$'&'(%'"(#$+#*&$*&&*"+! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A2T2G1G0A64 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6594 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18367 42 59M = 18220 -206 CTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAG ?$43?!F7-2&/@-(><.G%#"0*5'(G,!=37C$E'FH2=(!GH>F#84>%%*7#E%7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6594 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18220 42 79M = 18367 206 NACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATNCATGAACGACGTGTTCCTGAAGC *(/A98$@4()2?18>$(13-/CB(!2&!#2,$CB+>3+9H9+?@'=:$06B8F6&944#@8#@G0-H9<2@<"9@(H" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G54T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6595 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28306 42 148M = 28229 -225 CTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCNGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCNCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATNGCTCAGTGTTGATCT '?CH.@/@B6!4*.C5)6B*<71"*E>E32:*=>>(<;H35:>E,&=;)3#>):-;1&*4//',<3C3)C=@9-A>/410(!-D-%%:0-955,&%+$7+DE?4G22E840#;G(/<*C@-(CHD@FH2@*54E690)&418@B<+46 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34C35G61C15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6595 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28229 42 42M = 28306 225 TTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAG G31*+>F)6)'&A5H4(H/;B:)0*,!G@.,<%/<+#.3$:1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6596 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30507 42 58M2D39M = 30620 263 CAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATNTTTATTGCTGTGTCGCTGTANTTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATG 6=A=A%#>$"7-FG,7-F5C/49C(.D5DG!E?F,.C1,=73-3)A$1-3?-/6@GF-+G+%(%3(!&E.B?="5%@@ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:44T13^TG7A31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6596 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30620 42 150M = 30507 -263 TTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCGGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCNTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATNAGTCGGT =EHE-<)1;0&4"9"B.$B!$<:(8;1,6>E50:5C=5"3+(8(F)E)*1'/=E70"(C!<#5-0A589$"2F;%(97DB9F80!A#$'(5)?3<+,2$6B'/>G!;EE=?+6,96DE>6?!C*#518!D6")35$B.A45".1B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71T30T39G7 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6597 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18716 42 166M = 18494 -388 GCGCGGCGAACGAGGCGGTACNGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCNCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGC 4:EG@=#'F)"!/FE"/?/(%E($C7"394H0$A5H(6;6"7:>CA+++.A<9-F>6F89'=32G3!<+@;)AG&&:=H&ED<%82!70?<2BD'=-C5"30&7:?7!@0;*G*#=+&,C9@*7&@+C51H(G%?B=<"<&16/@-0%!*C#!F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21A93G50 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6597 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18494 42 222M = 18716 388 TTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTNAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTTTNACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGTTAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGNTTTATGATG *60%@CB:B%9#=6>3-++2/=0;'3-@1D-5#'EEE%@&HG43(!G+4B!<1-;2150%(FA$55"FF-4*2(5BF$19C77@)$0/6+3=;7.:'7H37"G=8#*+-582(G&0C.)9*-:$!$!20EB0C@?:1,/>0G4*.7;B"252/,;(!F61C!$2FA%-5;&="G7.35;G,&93$60;3-5BH##A<8C0+D-E<.:=&#&%;;;-!(&9,;)4174;*=79@G8/(5EEHB AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0T0A187 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6599 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45694 42 90M = 45784 304 CAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAG 293"<5;5,BE'#2H,)F5D>.;76D?#,=4='+!8':D#37"@H/'25)6F9'<%,&H%?("C&C,8>$'&,?H(//%$)#)@6AF*6= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r6599 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45784 42 100M2I68M4D42M = 45694 -304 CAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGANGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCT B.0$61EEH5B@&;9+(CB-HBF8'':0+,11G3<.##@?9&+(B2;3;%(6E'>B=05#+'>B#>1DH0(/)5*!CA<"-A(415='A#7-7==E2:=$67A95D45!=176E%@.,/7+DH:5;+"+2).*E'<*G.F9B6!"(B&G60E)4C"0D!@@07CB8%."#37-8)C&E.*66(A4&@B0<,61&+(H%*F228/)6:0C669 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:152A15^AGAG42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6600 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48275 42 73M = 48275 0 TTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAN "+'$%'"+#*)+(!')!&*%*!%&(*#()!'$)+*(&(#%!$')##+&+((%++#!%$(+"'+&+)"##))'" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G71G0 YT:Z:UP jpayne@0: r6600 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48275 0 * = 48275 0 ACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGTGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATATGACCCGTAAAGTGATAATGATTATCATCTACATATCACAACGTGCGTGGAGGCCATCAAACCACGTCAAATAATCAATTATAACGCAGGTATCGTTTTAATTGATCTGCATCAACTTAACGTAAAAANAA +F@)-(>>"+H'D<'8-:D&13<9%2=4H<"2%*960):?8A0+'GA8G/-:74DF%>>7&2%"=;4H)*%./?B(3';E=#E1#,?078C>9!&A(<";@AC;=G.)(B0=>#>CFG=:3*CB/=4G@);F4H$2D!-"3,:00A?9H$9-D<+/7?2F@G"4<*0.%>$B&%71'B,BD4%76C"5"-7D+.)E;,?&.'=*7#8?A=:-!1EB,22>%&: YT:Z:UP jpayne@0: r6601 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4457 42 40M = 4278 -219 ATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATG @D@>=CD>7<$CC5)!$58%7"C@G#)A*'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6601 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4278 42 45M = 4457 219 ACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGA 6F'!%8:2&6D887/#@(F&B;!7B?;"0)BG'C=6;,-("!=/8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6602 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40959 42 203M = 41162 688 GTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCNGGT C$@-',HH>1,18@1633C<>B3AA1D#:3E=/>BHACA7%"7((3+(4H9DFE1.,%"A+EH9:F);)H;C,EG@*1=B4498<,-4/C87B1$48.5"?0;-FH0>07)%,-/"B.0#1:6G908A!-:;0=,97:C$AD99<9E%D"?0;#D#;!,17((1?&H;3;94+4$*E<<267=A>2)5+&&-%.G&>@':51-$2%34=?#;&8>86%$+//<(,&!117(2@7%+%4%:C.D&'2%*E*#.%D*4/4,00$0/8';8-(01.#:,+.<''''8#'>H1GEB12*,A'C,'E%/1C??D8,@?>*G75#E/:0G!B0B&;1E@+*D6E"H5>E@C.-BG;,7A6?/<5="=91"%EAC8F.4*$">29C.+3H"/:*4G&D>8:,E&8B/(1F$@=='#$FBH)4-DD;;.)#.=8=:E5EFE:$";/=+A$><6F)@C*A('0$:((A5D(*"E9#-""+H<=3!&3"'!G:989#%/706=1AD2;";:*&"$*?AC>E7&GD76!8!)E:B2$+A6"8)*8)+<(A67%$!)$?1,<-:;/A5@<2:'=8#"':/C&/%-5 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:11^T17A108A8A67G165T41G28G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6603 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17264 42 80M = 17070 -274 CCGCCGTGCAGCATGTGCCGGANAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTG >)(88E.&2'<7'>12,/#F,59)&@4F1''>#B<**3@E"F2<''6"/B8$G!/0CA=4"GH;A(61(+2DH#3E9EA6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6603 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17070 42 106M = 17264 274 CCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGC GBD=60-!B#2%G%CA.F$*>=.BC:?A2AA9):4>$"H;1(G0D?=":)"/146""9?=35%72*+"*21,E*-,C+A:'76,).G(2E*2&!=@&H=? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C51C5A19 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6605 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11875 42 52M = 11613 -314 AGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTC 'E%H93=:!6&>-E:-01C01=BD$/9./?0%%-%*!&*/C%A+-#++)+?6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6605 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11613 42 94M = 11875 314 GATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCG D'G7%1&$1*'?7<77@82&D97&%(7/#)+A/,6*>C"*5'52C=CD,0D<00F"/36141-F7H8G-"&,42G"(B-&$!6&:)8:F/:C;D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6606 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15613 42 113M = 15361 -365 GGTCCGGTNGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGTTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGNCTGGTGAGCAGGA '28*C?A&6)D%6C*7"G/$9"CH?H54C-;B3"9'*(%;2)D!"F=F#='<(:"*/92D+6*@-6EG+3,G-,0<+9(;*0FC:"!3(%(,(9F1@32%=".5:@8 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8G21C68G13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6606 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15361 42 252M = 15613 365 CGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAGACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGNAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGANTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAA A,-"*%B,&=B)&%@G4C<"$33(E)G6/?>>!940&#.",??;9E7:>E52#-8/(-;'@&51&()H3B2963&%'H+@>E5ED+19H6E(FD(%&(;D=-,B%D4C166>##?/)H<1'&F-01+H%B9%A!#$/"%:1008,3*!B2A"3!54G/6F!!7!HADD"C<;?0>)%,0=:<754;8B"-/02)(A#&E.8!B1==4%@"&C0:G:5)&! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:103A77A35G34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6607 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48334 42 46M = 48177 -203 TGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTNAAGTTGATGCAGATNANTT +!&$++%$()+"++(&$("(''&'!&'**%(+$$((($++*#$''* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26T14C1A2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6607 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48177 42 117M = 48334 203 CAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAGGCGGATGTTNCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTGCT ;;!2A-)5+<'(%+5<,8F4++#'-0A>39.*7AE7(!-#&>+G*.E:)5&'"E1&06@DG7+,;/+%?EB0GEE?<6+D"?C6C6!F-64%+0E:A)011:(<$6$E&E5H.:GA0 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:78A9G25T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6608 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45183 42 116M = 45299 224 GACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGNAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGG C9#1@FC./!!@"4%:A>181E?(&>G<&B;#9%#*F6=+D!'#A,D"$&C%$&($H%@%627F@H@@,&@/@C'B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49C66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6608 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45299 42 108M = 45183 -224 CGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATCT ""')#%*!*&$'#!&!**"+!#)!'+$*+'"&#()##$))+*%#"%)*!'$!&(*$%'")*+#'#'#(&()!(()(!!+*(%*%%(&!#'(&"$$*"%(+##+#+%!* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35505 42 206M = 35711 298 CTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTANGTGAG H3)C((6*!"-2%=>@>7&)&3H?H$"<*1834!6$2-G$D1$'%@.-'D<5:-(D(*;@?%5*8=>"B=HB6>=/+*/#"9B5"8;9?$=$CB:1$/<9)&7&D%+*!(#4)D80ADB(*!C/%B8A1!.,2@:B+@0>=C!(B":=?6/795)#C@GD20:34!,@2)7":G0-C.H"'&'=.&2G<86!,C1#EHEG*D9E'+(2?D+%1?#6C;#H/@7%,;@0(5(14D6G*G,80;AG-@/2EH@*"%,4D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T33T4A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6610 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21987 42 41M = 21794 -234 GAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTNG +7E=H+,<&$*HHH7:!5)AH@&A3A39?520',*+9'H!$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6610 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21794 42 59M = 21987 234 GCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGG 3E"C=@*;,<-%D(%38/G=/5&-A"F@#F?GB8'C,-4'#G4#A;0&B#'F4HH-(5B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22789 42 58M = 22968 254 GTCGGTTTTNTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACANTTTTGATTAT @81A6@A#65!:(D0:4BFCE805@.<789#&/1$:!<)GE7-A)/-4CH0%1C-(?. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T37T10 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6611 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22968 42 36M1D38M = 22789 -254 GGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGNTGTTCAAATGTNGT )&+*!$$*+)'%%"'!)&(#+"!#')!!&'")$)'&(("$)%##"%('+(&+#+)&%%%+''(%$'+(*)&"%* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:36^C23A1C9T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6612 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4144 42 112M = 4256 244 NAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCNGGAAGCGGTGATGNTGATAGAAGCCGGACTGAGTA 2A/3'#D4H8C$/+)A"/4;D$?=;4HC3@:/$95?*(/'00B#(D=/FB8FHH,A7C9:(F3%7'=("")3D6C>$C@H*;3H00/=/,"#EEE=00$56+/@D-<$88G(C4E@):%84"#3,4:*!H>,!5839>8#;9:E,CA<+*8HG*:8&&4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:132 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6613 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16989 42 74M = 16989 0 GCTGGCGGTGAACACCCAGACCNGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGC E&D;//@H2++D@8+#';H0>$:E8E9=***"=0.9-G1@"C5?5%0+:=)25A92H8'@'4#9E7F#.0--'& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G7C51 YT:Z:UP jpayne@0: r6613 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16989 0 * = 16989 0 TCCNTCACNNNNAAGCCGCNGATNAGNNNGNNNCNNANCNCNNCCNNNNAANTNGACCNTNNNNNNNACGCNGTTTNGNANNCCANGCGAGNTNNNNCTTTNANNCNCNCANANTCAGTTNNNGACCTAANCGCNTCTNGGACNANNNTGCCCNTNANGNNNNCCGGNCNNGNCN $#""!!#$!!!!#!$$!#$$$$"$$#$$!#!!#!!!$##!!!#""!$"!!"#""#"#$$#"$#!!"##!!"##!!"$$$#$#$$!$$"!""##"$"!!##$!"!"#!#"$$!"$$#"#$$""$"###""##$!$!!#"#"$$#"!!!#$"$$!#$""$#"#$$#"!$"$!#!"$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6614 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38402 42 142M = 38284 -260 AGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGCTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGG C75E'-279#H(*?$!6)9*-;2GB>2G-A'&A%.&&)9))6-B'8,/0!)E-.,48$/-=7"B17)++8#D,/E.<<<60"6'31?$@<5;HF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108T33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6614 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38284 42 118M = 38402 260 AAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAG <#5,)EG#6*C(6H<)/3=CA7BC?G"CC7B.79<=G'A1>6%1?9D=@&B+1&2E#7!F70">2;3"9:!,8@B+465/$:424'FC("3)6-@&A.6@F<%0#.'(A:)@D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6615 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11093 42 145M = 11285 241 CAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCGTCTGGATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACA 2/EF&/+!#5$!6-/)1@-:#"B!B!6G2(DG"%0AD-G2.?B+2("G:=#0"68G/C:80E*$>8F!,83%(E2EF;B71===<0-.,8&3548G0:07,%AA+3)B+@"90979=.D AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87C4C52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6615 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11285 42 49M = 11093 -241 GTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGAT "?A)E3%:1#@0@?H;%!3!0)9H92DBFF-0)=E$(*%%H)4?!.;/A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6616 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12212 42 52M = 12146 -118 GCTGGCGCAGCAGGCGGATNAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCC >!A#>$H$E752$=?(3!1##621E"G4#.,9.%*D85=0E?2;9--8,#%$@5.<7@A3,4'<;??71+G-#B?$E:D.3-FDGFE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G18 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6618 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46019 42 165M = 46236 274 NNTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGGGAACTGAAGCTGGCGGACGCGGCAATTACTGACATGCAGATNCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGC !+D/;-2*<7A&",F:@G!GHC'3&75:G)@!0,*@4$*??7(B@/?GE6?45:H2.*$125=;/1EF,$1(H$0/*09)EC19&8GD)66!0;.FF7&*'G"/B,E=7@7<@-'!//5EA2:1$54>D=(A:/E+5BF,DC2$,A/H.0&=H-"0&?H4"5+8- AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0C70A15A25G50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6618 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46236 42 57M = 46019 -274 CATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCNTGAAGCCACCACCGGCTNC $%+%$"*!!!'&$"$&$&+"!##%'+$)*##"'"&!%"*#*!$)!$%&$#+*&(*&) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G35G14C2C1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6619 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45682 42 123M = 45881 268 GCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTNGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTNAGGAGCGTGGCGCT %10>G8?,$>%)?E#98,F/=4,/,"CA18,59AB*AE6B%!B+*9+*37?..0!1D<'7'0*?C+4*0(43EF.:-F2?6'%4?#;,A3B9CBGC+<%@??$A#90C>52.,1G??-"81A( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T54A14 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45881 42 69M = 45682 -268 GTAGTTATGGTCAGTTCGCGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAANAAGCGNGCGGAACGG *%AC4C5G!0&,C&/,B55"2:3$=11"0:)8+9$*"%2#2*>>5+:@A7.%&%G+F$:E)<-?'D3F2 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C1G15A34G5G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6620 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38339 40 45M = 38150 -234 TATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCTAACAAACGCAAC ?898<))F19#78+(4+4>G>'BFH$3-=E6*5EA>?H=C<@24!G'90!-!E!+&7F!5G#%F,#ED7//?,55'0G62/2/2,586%#67))#+$!-&,6*/4F$-/$!'25C!<8.E$&FF8EG>%5/,*+(7 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:15T103 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6621 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47874 42 115M = 47989 344 TCAGANCNCNNGANGCAGNATNGNNNAAGNANGANAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGA (%)(#%&$$$"&#$)')%!((!&"!')')"%&#(#+'(%'(%(!(()'%"*))*'!%*($%"'$+&#+$$()&#'(+(%+&+++#%%#"%+!'!%(&)+%&##+"#))$(''*(' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:5G1A0A0T0T2G4C0G1T1G0T0G3C1C2T80 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6621 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47989 42 229M = 47874 -344 GCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGNCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGTTCC (#%*%$&+&$++'%&!!$$#**"%$)!!++!$+#!'%)*)#*(#"&*$($**#(!")!$%($!(*'%%))!+%&#%$&!!'"'#%#$#($#"()"*%%#'+%$$)+()&$#+&###)+)%$&$'+*%&#+'%%()$*')&%""%+&++*%&#!)"&!('"+!)#$(!'!+(!"%*'*"("!"$&&%&+)%&&)('$)+##!+&#'$#+#%#"&!%$+(%+!%(+#&")$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:180G44C2A0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6622 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44830 42 174M = 44769 -235 CGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTCGTAATAGTTACGCTGCGGCCTT *!*"))'+#)&!(%"++#+)#)%#+**'(*$*'"#&""!*+))""))'"*")$+!("#"$%+$())&)")""+$#!+'*"+%*!!)*(#$'"%)$#!$)#&%)%''#+"!&$(&")%*"&''')"%($'!#&)(""#$!*#+('!(#$"$("+&'*)%"#*!*)+*%!#&((+$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151A22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6622 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44769 42 48M = 44830 235 CGGGATTTTTTANANCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAAT '()'+*&*+&(#*!!%!""#"%+*#"'%+&*&"$+*"!%$$$(+!!&" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T1T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6623 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15550 42 163M = 15362 -351 GACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGG ?C@2F8(E%ABC:E<0-E<>2/B,"0($H&@&C.$?$F/,1G+F/;+293F(;*8;&&H5-$,*'G-570H.DE:&B&;#F49"E7GB1#.+/&7=6>)*"?9%$683?=?H9.)#E=!D#*H,0("*,;98!2<29@005#D#D7+<>"FC(?@C2:=:B;( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:163 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6623 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15362 42 188M = 15550 351 GCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGACGCAAAATGTTTTNTGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTNTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCANTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAG ,%:A!5'83:9A+36%>=>F*AF1;/C<8#4F>54+:4D665.-?3$.;07!57;95#GD%5@)<#(E%*1,;3B)5->/6A5&33&H;)+-(7"1F/G7,9F))?@9?91F3?-1?6G6HG5;:=.#2C3@)=<9=ECF&>;3,AH*.=81E,BD3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G0 YT:Z:UP jpayne@0: r6624 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10606 0 * = 10606 0 TNANTCAGNAGAGGGCNCANCTNNNANGCCCNGCNTNGTGCAACACGANAATANNTNGNCTNNNACCNNCNCNCAGCNGCGTNGNNCTNTCNANNNNNGCNATNGNCNGNANNNNNCNGGNNGCTNTNNNNANCCNNCCTNANANCNNGGNNNTGCGCNNAGNCTTNNCCTNNGNGCTNCNNGCTNGNACNNNGNTNNNCNGNNNTNGTNTANNAN ##!"###$!"###$"#!#"!!"#"!$$"""""###!#$$$$$$"$#$$"!$!!#!"!$!$$#$##$$#"""!##$$$!$$##!##!#"!!#$#!!!"##!!#!$#"$#$"$#!!""$"""#$$$##$""!$""#$!!"$"$$#"$##$!#$!#!$!#"!##$$!###$##$$#!""!#"!$"#!$###!$"#!""!$!!$$!!#$$$!$!#$!"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6625 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23535 42 62M1I9M = 23391 -215 TAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCANTGTCATTTTCTTGCAATGTAAG D-5!GH;B'"@!$?0(9%D9A;)1(&;*CH?@8G/#H(!>H:6+838*'5.A.,/#%-F9(C$'!:,/9,F,5=?9+<%:1>CA8',.?8?6:HD48-CD)!8966/!490F+@,)0'F,9A:2BE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60C1T13 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6626 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41994 42 58M = 41842 -210 CTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCA ()%$+)+$(%&+('&"!*$!')))*!"(!('(+"!#($*"+%&"&&')!&*'!!(*(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6626 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41842 42 120M4I32M = 41994 210 CCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGANTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCG ),/%;B7>2*=#,*%#A=?,-#4?-A:>FG,*<@?')3.34@%>@8;0,/?BC#&H(HB8"D%/>?6G$,-665"9E(3@@4&,E#==8+!,6'1D:D570,0@,"9F7)@'386&>(.#)ED!:5&&H8,,6#1<5"<<,-4:,-2C>7+./G9: AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:90C61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6627 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21286 42 54M = 21566 355 NTTCGNCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTNC ")&%#%+%%)#&%!%*!&$)+')((%&'&"#)'&%"&$)$*+%(#++!#$$&)& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C1A2T46G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6627 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21566 42 75M = 21286 -355 ACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGG >8'/HA&$)"=0-!?D/*B&F?8!29%9*0-(!'3643E;(F7/6H=+#:A0D8$D:GF+<'3G02$4<+.%%): AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6628 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24107 42 128M = 24235 195 ATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGAT =0F;!C/00C#>9?/?1H58#/*<7D/#4'C3;B+=:/9-H*7-6'5,G;3,='BD@2EB>H%F$96&@@F0,A0?0A#F,76#=;AG6A&@.2)(>.".FC"G27CF,F,$/&A?%AEE4.G"E'-/-:4#9@;*2D+%F->*!1C26;,8A4'1GG/7=37$78H*C'A&%'@!% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118C1 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r6629 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15922 42 150M = 47 -16025 CAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGANGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGTGCAGGATNANGCCGGACAGCACN 01!3B*/7>&'=+D&28!>94@'3HF/=.$'E-)5*#>7:9+,>C+91D*4;$%F/;C=9EF!6+9"!026HF?-"FAA*.3G1&74:"84%/1;&84*38:F9@A9FD-=)F@=;BH*4F!<>>,F!;80/)0# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:28C97C7G1C12C0 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r6630 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45289 42 67M = 45458 235 GATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTT ;*#B8%56:6=F87!A28<"22H?9>C?#2@$-AEB%,(F5"/7D<$G3:#2*.54?,+,>/!94>! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6630 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45458 42 66M = 45289 -235 CAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCGACGTAAGGCGT C2/?B,)5F5AC=4!=:G(H3%/&4$AD.@86514B4GH@#:GE,(&,8$!7?67 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6631 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41114 40 59M1D14M = 41327 253 NCGCCNGNNTATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTNCATGGA "'$#"*'&!+)"#'(!)*'))+**%()+(#$+(#"&&#$!)'('(*''%#!)"*")'(+(#!%%&%$)"%&"+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:0A2T1A1C0A50^T7T6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6631 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41327 40 40M = 41114 -253 GATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTAACG '57+)=(($EG$+(/@,?C$F/4':A4GA%94,5%=C/2E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6632 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29953 42 69M = 29797 -225 TCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGC 0"..#F6)((5!;"AB0H%2?F>AA'A6%*G+;<%8323!#.#-@2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29797 42 44M = 29953 225 CGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAA +9BC<9$8C;4--,D/>@"7B>GDG'D>9"'#0$2BCD5,<3H6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6633 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9549 42 61M = 9396 -214 TCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCG =5+=%)A9)+GDGB(36:."10A4G62=E2)-%C/=&614.=F'?-#H4AE>3C:9?5F5E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6633 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9396 42 140M = 9549 214 CGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCNGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGNCGTAACNGACANGAG E>8%3C3A60=G!&F<#7#'FD%+G>G=="#'@E+-;A8A;7#%2>)#6=9"-.!&;E:A96A9@"#@3,:5-+5&"F+BC,7*)224('<"D&9(!, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:66A57G6C4A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17689 24 31M6D30M = 17500 -256 ATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAA 1$=8=(:2"A3'+43"F1HG:*A$?163'BHG3!*!))&F89;/A-$ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:31^ACCCGA30 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17500 24 127M = 17689 256 CGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCACTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGANAGTCCGGNCGCTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCCGCGTCGGTAT D#F4$00$D!6F/%"??+$96907C!A87F"F7)#,65+=A)46E'3C>$,!!-)9@"5.2<*"H":-/5$ADC,()0!F9:/?'+:*&C#@+9@#"+<0A*:""F@&;B56:B/#?+ABC0G>"H58?7H$8874"869>6D:-2272>'+EC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6635 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23292 42 99M = 23391 227 AGTTATTCTCCTNGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACA E$!C(==>2G4CFH8B6'&2A.=DG,'>.0D;+)H6*'$'(2+7!0.C'$GDB7)<03H>=C(1+"H!2.+G+FGAB-E.40F(.!2F.<6,&A=17@49GF@BBG%=#3=B4-1#<&7"%AE,<)5->B#%(?85.(>;(,(*,/'EC:.9-.G3B33;;,7-/4$@G('*E?@97-80?+@@21?&$?>(F:A2:(#<1A&/3) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:115T59 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27097 42 84M = 26922 -259 GGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGNTGCATGGTTNNCCG %)&'#+%*&+!&"("*%'$(#!&'&"!&##!$'"$*#!#'$&"'%*#!!&#+&%*&""&&#&!&!!'+$)"+()'&(#"$%)$% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:69T8G0C0A1T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6637 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14604 42 143M = 14747 293 AGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCGGAACAACTG 9,/1)*?8F=0%"H;!!3>9@=!5G34?&*(#%,7)<2<<;0B62;3(@6HH%1>48,A@&>.5(;C.2&00;%+";<(-F<(2==1);3-=7-><.($B4$9!;2"&D19B2,/&+FFEB!@H;=,/G<,=%"?28+!9@-F;F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T74 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6638 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37951 42 46M = 38059 203 TATCACCGCNAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATT ,;9A$F%3D>@E.*<1H0F+?=E>2-+6@B$G1/>9/%2> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6639 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44366 42 63M = 44216 -213 TATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCACACCTTTCCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAG AA;(2=%.4!CHH08#G";?/(2,F(=>.-G*'2C7,;?,#$(!<0EB9"0.HGBEE8;"0C4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A5A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2989 42 70M = 2852 -207 AACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCNATGCCGCCAACGCCATCC $?B+?">H0H$/&(<$B5%61(=+D'-8D0AH$"'2E,B+H#(>E!/6(HE/)91?4A"(:,1E>503@1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6640 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2852 42 137M = 2989 207 TTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACNGCATGACANCGCTGCGCGAATATGCCGNTTATCACNNCGGTGGCAGCGCATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCC +;-&/!--+'&9#352)18#;0H=-5F?*&7B+-?&5D:;+(7;3#%70>B'-(+FE/;4*8>'$/E894F2.+#;7:?.FF+EH$@C$(AF&FE-'.F'H1#??#5=%!-3B&%+=;3;8+80BD:4%EC'./C&C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:23G8T18G7G0G11G64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6641 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6437 42 94M = 6242 -289 GGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTT )@@%3-8+6FBB=)'7):9'(&D'3:<'%)D.-#(-)#/,H1$$$?H>/=?4!2+G!693*C42B4;+'(G;?0(*$:'''G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6641 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6242 42 10M1I132M = 6437 289 GGAGAAAGTCTTAGCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCTGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGTCTCCACCTCTGAATTTNCGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCACGAA #,=G35$&!ED97G#)4@2F*@5F+?#);4B6?CD8=/6-C=$7"-:05)%!3--4D)/5!1;#6>H/#/8(0C&6)+6%D$%7B)2<-'=>@&1-#>?,3"&G@0,):>8>:"08'<&/C"HB/C<#!(;982B+#:5*2F, AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:12T46C35G16A25T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6642 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16802 42 56M8D211M = 16733 -344 TGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGANTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACATCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTT HA?3*/))-D#-D*$)4G66;81'94/#6H(-!"#E?!)AA%A>3AA1!3=6F:?2-F&;(;*&E++'*F/DH:;""?)C:A7H60B*E72GC34$-/)%'?78=@D!7#=.:<.G$*++/#*4+<8F:+E2,/9)!<)+E(:1"?78G,!+%=CC3C=7B(8&54FE>$>?B$1$BA1HB=#F56!%;5E=9'#)H;&3G2!!*HF9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34707 42 6M2D36M = 34485 -266 GNTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACG +$%;(/E";8+(1&07B;,-9D9-=9;($/;*2+8>'EA*"1 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:1C4^GC36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4378 42 62M = 4271 -169 TTTGAATCNGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAANC 0D,1(7*;!*@#0A=&+.,%*?.@D5*D;22C6H<1(FEA"5FE*-<;.",8.H*1&3#A)* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C51T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6644 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4271 42 45M = 4378 169 GCGCANAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGG .0$3A3B=<;B9E%;+*$BH*3$+":%<:#7F0<3,7;/$E#BH> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6645 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41949 40 8M1D139M = 42157 289 NGCGATGCTTTCTATCGGTGCTGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGANGGTGTCTCCGGTGTGAAAGNACACCAACAGGGGTGTTACCANTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGNCGA !"&)$&$!%#*$+!)$"!*%)!*(#"'++%##$)!(%!#'!$$*%!+"$+")+''#"""("%"#&!"'$))+$#"'!#%&(#'&)"(")$#(+#%!'$&!(%*%$*''(*'&!&$'(!'!&($##*%*+&"%)%)'&(!&$')&!'' AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:0C0A0T5^G0A1G0T9G53T19A21C25G3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6645 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42157 40 81M = 41949 -289 GCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAACAACCTTCAATTCCACGGCTCACCTGTGGGATATCC F%;?7)8(0G0)8E:<6+==H"'E1,0HAB?F)0!,$D"CGE3B1%*(,*;,3,(-"?$7!%0%EH;E3%G2"?FC.36#8 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45A9C1A23 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r6646 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12301 42 63M = 12369 314 AGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGC 8)+E=800.9H!G"H))5/0,@:*66E4!E?7C!4G?7;/<84>!=)(D>#/BDC'/>-<=6>#:#CDGAA/(A;-C',+0(>2:%H*E-F!<.-$9%30:?A27E<->)%(,&5-(;5A*C5?#D3H1H!!$AG9*3D7#BF;-:*0+G2<&-7$)&E84?)2B6)('F<."FE0.;>D5<0D3$*D>B,>"G)>4-3/BC5$A#.F12AB5>1F;6#<"8)#6E=<>7""F:F7+B(24%21/$,&!C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103C92A49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6647 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4641 42 110M = 4434 -317 GTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGTAGCCGTACTCGGGGTTGACCGGTTACACCGGCATTATC BC=&?>&01BH*2D5/1?$3B1*8B!#1.A/%;3AB-4F%G-+37*86A/":D5+F3E<-*;0G"03'$/6)"3:<7;$?/D%)2?,F;%+9?@(%4G>C:A: AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71C14A12A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6647 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4434 42 109M = 4641 317 GTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAG /&!B'F>%3:"0#,:H0"(#B:*@;*=()4;)8B+H=9H-4:2(F,:9<">8@&!9)FGD'!1=7!@5,2E5&&@24.2D91=;"#DH9$:%.!37$/9EF,D*,;A<> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6648 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12136 42 46M = 11891 -291 AAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGA -2F<=$BB:6*EH(8>52)%);8%.A4?C/)*D0G!/5",%9/*-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6648 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11891 42 43M = 12136 291 GCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGC -"-9&+%9;#B,%F>'8!>.,65#C'9"CB8./(1F=22+8F. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6649 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30326 42 155M = 30223 -258 CAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCACTTCACGCAGTGCCTGANAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCATAAGTCCGACAACCCTGAACTANCNGGCGNNTGC *++*&")%'"('#$)*!*'%'))$#"")"+&"!!+#"!$*"#!#'$!%#$+*"'"!*+%!&)+(*$"*$%$)$$)')+&#"#'*%+*$&)!#)"!'!($(#+++$+($'#()("'&"(*'!#*$%++'%+$&#"%+)%+&##('$#*"&*!#)!( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:35G17G67C19G1C1A4T0C1T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6649 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30223 42 74M = 30326 258 TTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGG >#$/-))=G@GE!+F)8B,1:4E=71B($@%+(-%>?58@,? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16951 40 81M = 16757 -275 GATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGT =-(D>E(,/B*%G45;&2.=)DG::(B(D,%$1*":+B+7-D7/2$>E&3(6-/85C"3+!AA5%&GG>?")/;&C87(8D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r6650 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16757 40 101M8D85M = 16951 275 NAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAAATGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTANTGAAATCTGC ##E3F+1<&#GD./?'?<52C&6-F$?(=H4+1D#G)7@)%64-!59G0'&"9BE+?-C$F%@A2++F/*9'*?H#*#<+H1C9<=6A->;=*7B.0*?(F6&$,,#@=%G$1!B<8/.H@-5H,>$@%586G9*4B"@;3,5E,3(<%23CFE*3@>2C'(23'*,+)+<,6/A%80E-'806*! AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:0A100^ATTAAAAC4C69T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6651 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3852 42 171M = 4023 260 GAACCTGCAGACGGCTCAGGATNCGGATAACGGCTANTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCNGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTT 8&(D@-9?28;(3$"/5-@:HA':BE?BD?+B>10?@E@AACD=%7EE2@'(E)(B5=68%*$@3$4B/B%#5/8'8)(.,?2="BA6")9'3$@=<.*"2D63/D)6%3'4=*+4!>>C"C#&4"?'29!="101+8#&./? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22A13C38C95 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6651 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4023 42 89M = 3852 -260 TATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCNCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTNA EEF!D.;";E(9/>"46/G5FG4'C151'=/H=006*$=93+1C49)=9HF/8&)01/,43!'*9?7B*2)*C:;G'$)%A2"-586!( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C59G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6652 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12294 42 237M = 12231 -300 GACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCNGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGTN =B&$A.6FC->6:>F&$H6CF0:$H7=D078F9(D)E/$.6-DB;35'.<51//F("-@47755'C455=0G.9&='7=F1'E>H+G-(G@H3;G'668?"F#2#%<<###.5H)D=1/:;5?(64&50F-0855*D4*"7%(>4:685B/;6'B4=-8+(.*,<;F8<:$:0692G9.03;G;:-+?":?%72;*AA4@2;+0:7>G2?02:=FH)0'#9&# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:145T89C0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6652 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12231 42 49M = 12294 300 AAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAA ;C27&$E%D>0:>)8(4(F+0@(D!'4!DG60B0)B!>G29'4'6:(=. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6653 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18430 42 101M = 18196 -335 GTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGCTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCG G&2&3)*0.5=A!,18'&E=)H=9!/C6@5AH#8CE$;1D=)"0:9=6@GE'!=E:G0%'?D<2!F)H+6H=0#)E*)&*);6EC-+""*1?D:6:!/*49$0E2F#%*)F3<;5A?$-!E##.!$57"5*1&F(/,&+5;'8*#?"+&1(0&DF&9@6F6!++?)D92FDC!H<4"*>1/.3H5HC+"$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C55G13C19 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6655 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41441 42 221M = 41662 315 ACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGNGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATGTGCAANTACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATC 8:77*:D@(/40-"C0-(@4C52H(!,,!F'4D'B:#(7>"0H5D'=>*HH95;*G7500;>'/<9D?>%A9F4"GG=B2!E78HF14:,G>290#=HBH"?5C$%%5)8=!(6<1%)B5+("7!22E")89%@<':;$=4/"(5?H6&;5":475G300*@F1/F);2@C64*G430*@6+.8!.4('4C?H1#1GB127/15;=.=1DA AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G139T5A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6656 77 * 0 0 * * 0 0 AGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCNCCATTGAGA H(*+69(B@#>%,"3%?$!$8&1F"<%85(<*2HD!.=;=EE YT:Z:UP jpayne@0: r6656 141 * 0 0 * * 0 0 GAGNANTTNGTATCANTANCCTGAGCCGTCTGCAGGTTCAGTGAGTCGCCCGGCATCAGGTGCGGTACTTTT (*!"*!!$"('&'*&&)(+(#)&'#%))"&$+*$)!")"++(&#*!&(#$*"%)&&&'("&%#)+)"+)!&( YT:Z:UP jpayne@0: r6657 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20284 42 48M = 20403 269 CAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGA B85F%$>"86/G6,CG8D>D(>H<>%DH@=)1?A+D?F2+76$5$1H@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6657 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20403 42 150M = 20284 -269 AACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGTAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAACG ?6,9,AG4/!1?=0G*6'90=-A7435+1(<%(>C06G3G*';D!>A9$.%+/6)HFA;$7)$#>"$C&-9<8F4$+@:EC"*D0365F&&@'1FF921;%,FE@!00(*@9D44?B35*!!4EGC(6/D3A,5GC,6H77.:*4BG%#E AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C109G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6658 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23418 42 57M = 23519 200 AGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTC ;*"E<0+#%6>5!A+C(-'$GAH/*9<,D&>1>7$2*%=?1;!0535<'/F1=A+>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6658 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23519 42 78M1I21M = 23418 -200 TTTGTGCAAGTCTGACTANCTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCNTGCAATGTAAGATGAAATAAGAG -*?-B453">2F1B7C608CH?-D"6*/H4(#&/2771%G3E)=@=GB/-%.@5FC%;F*+,43+"9"BB?@),HFG*8E6>0HA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C67C17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6659 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14667 42 49M = 14885 335 GTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGG CG6:D)';6;@83%+F-H##-9*1%)CDB&=0?6=)3G4$6<(/9,!;4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6660 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 861 42 98M = 786 -173 TGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATNTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTG 0:74*"5#B'22=6!!F?$E=&1%0*)=6(7@?$D$D##+C4#-487741(/(&65C#!&,/:0@4!29*+.H+8.<@C.:7?"B028E*!2#+5= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6661 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2891 42 125M = 3058 266 GCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCNGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGAGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCA ,73=5(D".;,568@=H(6C-AF@4+HBB,&@%$D029-;384*:89;60H%+A(D'AH.*C5+0;&FA-$#>-696%.-3/.&(37+&;':6B!CEH$,6&$<+7D0?8G@!9D08E0F2078;:3$$$!;G;07+'%#4?%@:/*#<1++7(3)@H725+-@+1,018?*6+0?*08%3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6662 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33547 42 146M = 33395 -298 TGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATNCCTGATGTATCGATAGCGGTNATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAG *3F1E:-.CC6=$31$7('2*@'#0-B7"&=@"F4%+(",%E-%:(E(E3;!+1#"7"5D2+&@@EA=9!F(B6>$=7'30?,#"A-E-%7B;(>2#&"0)>3'0==C3=?E8: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28T15T4A96 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6662 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33395 42 55M = 33547 298 GGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGNCAGCAACAGGCCACCCTGCA G1$G<&@G(!'!A'@DDE&GD@7%:6+/HHCA'GF/'=9?9"+&/@,0EF!'<59"D(DCE=%%&)00D%@-D26 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C4T83 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6664 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21965 42 163M = 21719 -409 CTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACNGCCAGATATTCCGGC ='+71'G<'(C9--27B92E$CG*"#FF+@90F#+EC-H.3@%&HC7G(5?A?$E%8'64CGE-/:#>H:?=EAHBB45"-%(G-@%.92+B8)4=);F5&.,F>-E/B-=:$'-9D!)+&'? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:147C15 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6664 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21719 42 246M = 21965 409 NAGGNTATTGNTTATGTNTANNAAGNNGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCNGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCANACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATNGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGCAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTNACTATATTGTGAGG #(*"!%%)""!##'%!*#&""!&(!$"+&!')&%$!#!#$%*)("#$*&%*%%*$)$**&$&+"''#(++&)#)&(+*#')&&()(%*#!'&"'!*$'&$)(!++!!$(%(((*$&&&+'((&+#(%*'%#$(+$'%+!%&#*(+%&)#$+'#'*&$#+()&+%!&)""&%+)%"!$+"$)%"#+))'+)$*$"'(&()$"#$'$!(##')$&'%"'*&!'+*++"#$)$')()%$$**$+(*)#& AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0C3G5C4T1A1C0G0A2A0C0G33G31T65T45G26A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6665 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17953 42 41M = 17994 282 TTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCANCTCGGCAAGGA B>69!3=!H"F"4?!#EG<+7;%DB8(+3-=8#!>H?#,-6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6665 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17994 42 241M = 17953 -282 GCTGCTGGAAAAAGTCGANCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTNATTGACCCGGCAAACGGG 2D;#!1&&#@/+0(:>.&-B6!1)=7=H#/*>8;2@A.D<3'3/58)0;/:(>>AC5?73A68EE'F?F!;FCEH2-#=B&2FF+B@%&EG6D$<@A:,=/.)?EF5G/<1>E8B"3C+HB#/,23B4&7(>$5G0$F5<8C*/"+@:B,&!>F>=@?(33H%8E1F(D,=@-8@8$)A3(C+26F$>,9)3CHE&A'A<052$6';="EFH;&)?"D?((C@;1='*CG80;8!H4B4D(-;'?#-&F8$>H0H??$&32&G*!:.$A<+97A$=D&%>)G01#">$#;@>:*$7"74:?(%*>H>161/'1H13*716; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42241 42 53M = 42452 255 GGCTAAGACNTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACG +!!&(&%&&$')$(+'*%!+%*#)+%'(*)#*'"(!+++*"&%'*"$&))#%' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6668 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42452 42 44M = 42241 -255 ACGATGTAAAAACGNTGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCAT 71>5BC;<)>-!E&.4"-'"+C-<="?& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6669 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23429 42 47M = 23630 274 GTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCT 4++)3)%45,)18%AH,>AH<,+"*B2?7>4">,?H(&H3,E$">)@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23630 42 73M = 23429 -274 CGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTNCTATCGTATTGTGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATC 4(*;8E+D:<:F&#/=8"5:'$@4-0*))8H0?C$..GD0')35">H AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:30^T18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6670 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41360 42 58M = 41143 -275 TTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTG ;5F7G=(:>!87?(.1??8C2,2AC@05B/+@"6/*?"E<1@G#C.?-H%G=&F4H&& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6671 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38449 42 46M = 38495 244 GGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGG (D,.A/:!G,=/6#2&4A<>?)"'9.605)1@E5D,B12,5FA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6671 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38495 42 198M = 38449 -244 GACTAGATTCCAAAGTTCGCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGAGACGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAANACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAA +/),=(7@(52=<=/<$(=58=(E+H82?.F>2*=:F0*C+@4&3/28'#3G3%GA7)&*+D'.:#*27;0G>D'=(6*C9F714'3:0%+#"7'$4:+&-9-5?$*%5B)9B';;8"?HA=D28;/@&C=H9@E*$6B$-'H*+1)9#3<7AGB1%(/&9$$93HC?7%D6%/2344!*1*'"?B;-';0*#(7#-@!D"/H1<*1)%E<)D?-)/-.4<&E0-;=(4E@2G9%".23)@1H11/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T57 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6673 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13999 42 141M = 14166 274 GATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACAC G9@7/9C#BH2=?EH=-9;,7A/=<$,-+:++G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6675 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9159 42 77M = 9005 -231 GCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGNGCAGGGGCAGCA 6?-EC?$1%,9%-1'>>:@@:14,!2:$2E0A&>(7,#C1=*3?>=C(BF!H!8-)#-#$B7@7&1D8/$5C*?;$4#GB+5/+4:/)/7F-@/7"1D>*5.+'FGF"F#96-<=-?'F=5(86$,)(.974CE7E!,;8F.>*'$,&A4(B"3:++.D9B&&4*39F=69D<>D!5)((C?>:7-1AF(C@4<3.$;;EF43=:'&3!@>>C AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:2G18^T1A43G31G43C5G2C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6676 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11818 42 193M = 12011 522 TGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCNGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTAAGGAAGANAGTGCTCNTGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGG 3&)D<7$A&),3;6G:"6*4'D/B910'6'G/&E?!$,D##!2A1%C7&EC?F-C-'@B1+3'A&:F=F%<+4G+:C.=1%4E8AFA)-DDA&H6GC:E!C3B?7CDC?9,FAE3' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:95A26C7C7A54 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6676 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12011 42 329M = 11818 -522 AGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGGGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCAATTGATGCGAAAAGCTGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGNAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAAC B?1%@"4B+@86HF#+HD@"1C#H--."(A&>:+$2)8)B22')*HC0:*2HGF/<4B1#&%-+.2>)/"#.08:(6&H=2/95<5$2-HE@;43&-0H(3G(9/,.)AFG#;9)>$(C6&B+(6?0"!';H>#?>(@H9:6H88,("AHHBH,C)#)"(9*@+&855(9)&70,)7H)6+8+H3??A8%'B92$,C;F*4:F#<6"3.4.@./>7D&7$5E!8D.E8)*A.#H+)A4=*CD8:B*AE3='C16@/:H3C,.. AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:77C177C15C29G27 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6677 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36561 42 131M = 36327 -365 GAGTCAAAAAGCTCCCCTTCNATATCTGTTGCCCCNAAGACCTTTAANATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTNNNGT ++&$&+&("%*$#)""%*)''#!)!")%&+(!"$+#"'++#&%#!+"#(#&)*&'+$'*"+"*!)*'&$!'+"&&*!('')*!#"#+#&((%"!#""*$&&(!())(%$'('$'$")+!$!"&++%!"$%# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:20A14T11T78T0T0G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6677 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36327 42 59M = 36561 365 TTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTT D)(!%95>1,3:D-57FHH$H;!422H$=G;9B&C%%>;3,5%@38#"D.4/5*/&!E- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33341 42 220M = 33300 -261 TCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCNGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGNTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTNGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATANCN +%(&!)+((!!+*%)#((((+'*"!+''+(%#+&"")(!%)"+)#'*)#"+!%)#)'*%&"&*+$)*)(%!$*#+$'("%+!**"+#&+#+!+&%*#$+)#(&!'$&%)+("!#(*$#$!)"&)#)%+)*%%"&%(("'+%'*)$'(+)*)&%"#+%&#$"+"$(&'&*'&&#%#)&)!&'!!*#'$"(')+$($!*&)')""(!())(!'($#&++'(" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:86A42C45G41T1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33300 42 41M = 33341 261 TAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGAC +%++!)((%+%!&)""'$$*&((%"'**"(+"+&&$%#$(# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6679 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33598 42 41M = 33639 236 TTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCC E><"H&/&B;86$3,G4>;>)>"<<#'6@9(!0D(135F9G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6679 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33639 42 195M = 33598 -236 TGACCANTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCNTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCNGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTAATCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACN H:9D)(EG(3+CG-F=A,&-@@4(+<1:1.&>A#@'=)'9,0:;-3.2C2+*/!9C'$6/).2>4&0,,%;$'A-5%=0*-9)@/%-"G&/!H$!2A#(B3@?:/-8;82,6@##::=#%E/C89%982*&$"7"!7:BB."C?4$(#>.E5C6B268<.DE?68D='6EB)+@2&(B(D77#D,;.E@!.!1%) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6T51T31A49T53G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7424 42 168M = 7592 294 NTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACNGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGA !'07+B>&&=8D7C-GC>8./3A)4&8%*5FH&+#6(EF29D")F6A6"G*>E"))&/#D:4EE!F.6?G!.8C7,?@-:))*'8,"+183.C(1.>D$72D"'*@"AD,-4'6D1"0$#">*6"*%-D,*#*GDG;A>(2)<(!#D$HD1'11*&C*B&#"@(FH:E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G39T127 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7592 42 126M = 7424 -294 ATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGNTGCCATTGCCCGTGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGNAACGTCAGCCACCATTNCATCCGGTGAGCAGTCAG 3H,E""'=:8?7/F9@2-*F!6)(; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48C12C28G16A18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6681 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17560 40 122M1D37M6D25M = 17486 -265 GGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCNGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTC "G?6%1/D?-2!0;2;?:*4G(&%8)6D;(-:A%/+4-!,A+*,?$*AG>/5E*'33F"889>@)&9E8B@4E"*8DG'+&F);88*?5G=,6)(G"/>%=.C7C77AG0'*@AA++3':5A>>88>"?2,:DH"E*5DC"87*"1CE7/4' AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:89A32^T37^ACCCGA25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6681 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17486 40 52M = 17560 265 ACGACGGNAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCACGGACGACGGAAACCACATA /=:-29#$A5HF,>&<=F>.$C74#6@.8,2A&$$B&##G!69A:F<0/6A/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C23C20 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r6682 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1797 42 101M = 1728 -170 GAGACGTCGGAGGCGNAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCNGTTCCTGACCGTGTGGCTTACNT /*C!2/<#=G3*FBGD%981,:C70D!+>)$+(FB.+B9D*%7'7>'!);&0!3G,'7H",7?HB,8F2??3276$-#"?<+E6<80"45*5*-C@?)/3E>:H999" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6683 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39424 42 71M1I135M = 39630 398 CAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAAGTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGNTG GG)6/;=56A?G@*$@)H:>D5A::&'9'D;H@C#64!?(HA=%=&E5,/D!B=*=6=A$F3+7+0>E@>=):35-?E-*D3H/.8=>7DG%D4;'8-";4725)F-H'-+$4$*%31(HC/F;36.!45/H$?F=H-E=7=B@A@*::D50/1D(+01;CE'$F=(!3D8E5?#A-3@@,F0<"4AF<#?E4B%@*- AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:42C18A6A0A133A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6683 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39630 42 192M = 39424 -398 CGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACC !=#,C?"A"H3<#"2EC=>"&;(E8@A!4*0>;B.$G,3:B?A9$GG=/#A97.;55.!348>#7)?!AC76F%D56D<2#%-A$$&7?#8<6=)=3-!=B8F+=CGE@H*'FC@F2H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:192 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r6684 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28168 42 60M = 27934 -294 TTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCA <<1>GC,)G;4B@#;!:'F*(%3,B5&A;;BD&9G>?F5!<"":09/.#?*/5/7:0<"4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6684 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27934 42 50M = 28168 294 GTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCG B%F16)&.!3@*>B3DD"'(2<@F3-!">0+A6>(#7'44/:*+<=/#(A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6685 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36561 42 57M = 36340 -278 GAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATNTGTTGCCCCTAAGNCCTTTAATATATCGCCA :?*.6$A(G$FB7C%E*DF07CEH@F1=>@-0A<*-95!94=;"?1<3A2F(!:+B@..C0B2(2//G&@'';C>7$'C=;A*':F@EG#"?;1E,3A.C:#)#8-:&8)@B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6686 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12239 42 56M = 12042 -253 ACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTG &#D%1E08C4*-BDH0/$=-6'F005FE".B,)*-!83"43>#:*#9%5,A##>66?@C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6687 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36931 42 126M = 37057 279 TGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTG .(?4-.4;E,3<.32)+@".>;'@#84"A=564B.B+*9/#0>D+78$F;7:$;%@3F/?(G#*H):D.-8)8<0'H9?B$;/F4$D6D&,4HH1F;G@.03::!2A=E$361'A36'D?H2(*)6=&@ED!F)2/7H%55!14F4G(HF,1G1>!4)/=(&%38;(H2:-(D@*D?:2,2!;G#+8&:E71 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T58T61T7G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6688 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18635 42 105M = 18635 0 GTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGGCGCGATCGAGGCGGTACAGG .3F,'9"5$51*#1+@2/!"+C/;.)B+A&;DC;!(?,.$3A4%B3,1G9A5*?< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84C0G4A14 YT:Z:UP jpayne@0: r6688 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18635 0 * = 18635 0 NTANNNNNCTGTNNTGNNGNGTNNNNAGNNNCGGNCAGNTGNNCNGTNNTAANCNGTGCCNNCAGNCAC !$!!##$###!!!""$$##!#"#"!!!#$"!!######!#""!"$$#"#!$#$$#!"$!!!!#"#"!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6689 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30998 42 57M = 31055 340 NTGGTTGTCAGACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCA ".!C9E?DHA"?-#+.%+@,)<5<7?.:#!F$")'+.#?58%>#./:3*7'!(B9FH AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G9T46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6689 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31055 42 283M = 30998 -340 GCTTTTGTGAAAGGNATGNGGCTAACGTATGAAATTCTGCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCNTTGTGCATACAGCCACTCGTTTATTATTTATCTCCNCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGNAAATACNCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGNTTGCGCCTACCCGGATATTATCG :)*2'@+78;E'@88=G4(FE&(E8A%45G;<)FF)''>@5H9>&C6G7!70:B!C03-0?EB@B8??"*:-E,2+?3)8*D")C?5D)4:)?<5?@%>5';E;-$-#E8:,:%5=H1%;72H72<(G&A3@;99.< AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:14G3C19T94T14C20T48G6C33A23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6690 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44169 42 50M = 44219 257 TNCTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTNTTGCCGTAGTGCC *!'+&&$!&"&'+*"%'"%$$("#$)*"+*)!"''&+!%&'(#$)*#$+( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A34A13 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6690 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44219 42 207M = 44169 -257 GCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATACTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGNTGNCGAGTAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAANCCACCTGGTCACGCACTGNT &*%#"'&!$%"&&+$**)#*'**'!*"%)""!)+*'&'&)"%)#)'$+((%*)%++*#)*%!!#&&(""*)#*(!)(!&+)%!$$'*$!')%%&#""'+#$)+$+**"+"')$*()+))""'(!')'"&"#*++""!%"(+!'&&*)$%$+"&&)(+%+$"'&"(%*"%$!%*"+$()'')+*%""&$'+'%%&)!%+"&$+)"+'* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:55T26T2T4A95C18T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6691 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45977 42 45M = 46027 210 CACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCGTCGTCTGCCT GF:8!93+!9-)@D@&;5.@$FG80@&(A@285A:9%"(=E+-CA AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6691 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46027 42 160M = 45977 -210 GGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTNCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGA -DC"1?-<52"*@0&&038.+45?*:;776-@B"C:?AG=+A8A*EG/5,5$C9FG((5D'H<0:+F)C$9E+!G3C09>1,00<>/H;0!<5C7G?@&)GC5A$7?H$4>)1FC&"33)059"9D=87E@559H:92?/"0H/3#.H<&%,51,5&A0G4H4':5B$@$E&<*:BD24ED#"9#EF5)HA%(#8+(6,@H-743?/""$74+2.%-**HH0!*1A,%?:D,DD2,C=-D*#-&>3H:.04>0:#@2BE'6?&@#!7#CC-4%(A'3)8/H/.>7;H=9*"H'3%E+&+))?DC6%.?;"A8@?#G045A0%/G$0/C8*2+;+;&B8,G,5B="8#C878-"F8% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:3T118T147C7G95 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6692 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32338 42 132M = 31964 -506 TGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGANGCGACTGCCACGGCCCCGTGATATCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCANTTCGGANGA %***+&$##)%%"'%*'$&#&!&*#++'((")$+$%()'%+!&)$!%%"'*++%*$"%+%%(#)+$"*"""$(%%*"!+))'%"$!#)&")+$))"(!(''+!#+(*)!"$+$$()"#*(+&%#"("(*')& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:36T22T62G0A5T2 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4097 42 46M = 4194 247 TTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCA G<)A91@"<*945B/?=B6&1.!>*==(*%BG<<<.CA)(:;,#12 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4194 42 150M = 4097 -247 GGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTGAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGC 3('#BF9)&.4<<18%&!C02,"7H>"-1#:=3"?3@>:&:'"@45;B!7D@,'24@HEFD?0+%%#*%$H$A297-#/:;H"7E.(4+F8>.&!>>0=E#05#,8$*- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3513 42 59M = 3235 -337 ACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTATTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTC 6#5&3F)7H3"1!9.0AH,$$F?24%*9-(5-*'B>4=FA5:&$>>%CC(?F8#61='( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T28 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3235 42 171M = 3513 337 TTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCNTTAACGGTGCACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGT ;#<">).;D1)$B/;H-4G'>,C<6&((G$5H#<<9,3FD/=5!<#G4=3@=8CE>>H53.@+F)H(3)@#,8+'-A$7;!'FD9@$7A6#?-/,'=H4@A@'+*A*#7@&=(4:CH@0@044.4+*A!0@E'$&'%A&5"8/1F9G7;?"B6=5?'4D/$6"H4G'1)7<'+C-;)1'37%7$C8/6G@)E9-E2*53+#=;H06',5F)6D4B=.&G<98'H6&-$:1B%+@3"'>.;*E:+53#!F!)+$)"B!C9!/-3F!0)0"$%0F/;/98DH0$6&C6=/0+*( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C77C40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6695 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25111 42 98M = 25209 258 AATNTGTTCTAGCGGGTNTGTTTTTATCTCGGAGNTTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGC *&$!+'$&!&!)+!($$*#"("+("#!+#*%)'$*!*)&"*%""+(''())!*&#++')+%(&*#+%!!#*$#*#*#+*&&##&')&)!#)))!$*') AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A13T16A63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6696 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45033 42 47M = 44828 -252 CAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCG &9BEAB!">=:*+';0*3/-4-6BF4;#G'>F907">E'G/5=>33*6:4!;08:-G.A%*;,05&*4-,..&0@%+.2&> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A87 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6697 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17457 42 171M = 17369 -259 TTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGNCGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGNAACTATAGGCTGACAGTCCGGNCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATC >1&E?B'#?,0=93!83>3.(%E45GA+11G5G(&-E/(@+D/6@;+2=E!0'62C-G;:A?((824FA-1<"4A:#;@5:8:HA.C"+1:&CB;HF'DD'2C#"4"%F6:.:CD+E) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:32A72G5C15G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6698 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18976 42 189M = 18976 0 TTNTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGNGAGTCATCTGAAAGGGATTAANGTGNAGTANCGTTATGAGCTGAC '*$*+%$#(!%&#%("%"+")+$&+*'!%%$(&**(&"+)&)*#*++##"%&)#"*(%!*&"&$"&(#$#$$**")$+(&(%*#!#)*)+#(*+"%*!#&+"$*"$!'&(*#*$#("('$#"'%("+)!+!$)+*!(%)$"*++!*)&(#&(($*$*$))'*"$'%#("'"!$()'!&!)"!+*%%*'' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G1G140T21C3A4C14 YT:Z:UP jpayne@0: r6698 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18976 0 * = 18976 0 NGNGNACNNANNGNCCNNNCCNNGGCNNTTTGGGANANNTNCCGGNCNCGGNTNNCANTGTACNANNCANNNNNANNCCCNCTNNNCNNNNNT "#"!!!"!###!$!$$"!"$!!!##$$""##"$"#$#$$$"!#!$!#"#"""!#"$#"$"#!$!"!"$"##!!!!$!$##"!!$!!"!!"$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6699 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20238 42 44M = 20511 321 NCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGC #-6C<2.A3F%A49/';"+1>3G4*?3H'+/DCF%"CA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20511 42 48M = 20238 -321 GCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGNCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCG $8#5#%3/0*G;:?87"(&?4H2;<3,HAB-@H#44BD@++8/A40>A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6700 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7367 42 148M = 7551 270 CGGNAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGATGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGG *)7#"79"F@3.H-D%?.C$4-*D6'DH76/7!"$H$!@0$5D7C8FF#/F?/F2(=)/CE=*D$G#?9E!8<#>)>%?#:8,7HA1A8?C>6C)"E)*@4E?9$#AA5F/+@?F50+B=B:; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G29G114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6700 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7551 42 86M = 7367 -270 CCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCG D#13">F6)/+8")!/,9EH5,+.-(/F=00%CF,@G/#G43)-(6#,(B!G2+'!,E5F%5B129'(?$1.$36-2*7G6(EF7+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6701 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40387 42 128M = 40228 -287 CGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATNTGCANGAACNTGNTTCTGNNNGAGT &++**$"&$&*$&"'*"')+(**&+!(**%%%"')&'$$!!"&(+$#(')#(%%%"!)$$!&!$'+#*""&*)!*$+()*("*%&%%((&&%+%%&##")++$('#'"*&('*$&!**!(''!(%%%$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:70T31G0A3C4C2G2T1T0A0A0G4 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6701 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40228 42 159M = 40387 287 TGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAANTGTATGACGGGCAAAGANGCAATTATTCATTATCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATGAGGC :AA>.?6("<#CBE?+?-22B71G2>2@4G/:4!*+H>#4$),1@@6A7"(6?!A=*C!E&G.F0*>4+C4C!>B6'51")CC58=890#D-A)'%;=13.!4:?B>B!HG-:-7HE=G(8%<:9+>+9*,E6,8+?/0,1 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48G17G14C72C4 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6702 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41952 42 10M4I115M = 41859 -218 GATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGNATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGG B=F1A14@:+':C51?D!@*38)6B:DC.%?F>B?E'6?3D2>7651*2*,A;''B9<9;,">-=DC)3:E1=180?4D<.'0C'"DH'4/C!&27."&6;6<.B,5C8B=$6!G9CD2F(E849@3@. AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:23A101 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6702 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41859 42 82M = 41952 218 TACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGAAG A*,D;>&./:9!*;=>=>2CEC=,6;#47DFC%)';!-3<"'H:;&!2$))D9.G(-*1;G0%+%?5"+$,FB+,6<75$6D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G2 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6703 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42336 42 72M = 42441 203 GNCNGAATCNCCAGGNNNTGGAAGTTCACGNGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATA !!'(()$!*$'""$*%"!%$+*!+#+!&!*)"%%**((*))"#$)"!*!)%&!$*"*(%#""%%#&&'#'+$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1T1A3G1T0G2T1T0G0C12T41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6703 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42441 42 98M = 42336 -203 CCCGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGNN '&'(+$+)$!*$+%&*&&#"()'"*!"#(')&#!&%$!'$*%)%*#)'$"#"&!#*%*#%!!*'!%!+"%!+"*"*%'$(*$*'(#$'$&&$'&$+!& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A93A0T0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6704 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7109 42 70M = 6918 -261 GCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCATTNGGGGCC =D$C?/%-F-%-G2=C;<&/A@8H0A%('FD7-(/:80@.C;2;C522>0&:67>@-7'.=*2-C1HE#("G9"40@9DHA<'5B,D:B952>1+(A82 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:112A14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8149 42 97M = 8042 -204 GGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAANATCCGCAGGCCAGAATNAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGT :9#;>BE@B2!49-2!A'<&&';?..!>H"E6&G(#2!%03!.*-/5'-6'&C2?*%*"5?3G<2$H/88?5/02/:/8/%9(8H,31<&.C@#4>D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A16C50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6705 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8042 42 107M = 8149 204 TGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCNGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGATACAAAGGTANGCCGGAAACTGGTAAAGGAAA ?A:%)B%AC898">7>'+=3.,33<9C6+F)4G):H6E?:99?%'#$F-#!.0(7'.-A&!%G#?:05D@74(4A/F,A)&=)A+8+523F;,<'@G&E(BD=..&3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:50A24G9C21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6706 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 87 42 45M = 195 158 NTANTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGA !$()"+!$#%+&&%"'%"#"!(&+(*!''))""'!(#($(%$!&% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2T41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 195 42 50M = 87 -158 AAGTCAATAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCAGTGCGAGTATCCGTACC !6E+;?6(('%5A<-;G>:+86;,<;E>?B-)$,%93,95@+*$"'0H*6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C24G17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6033 42 186M = 5910 -309 CGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTC &H9A/8;!-A>.:%H21*8/H2@=2=?5:+>,#*&7&DFGE79B,@)=*;6>E2"91#@F.5D/,*E$BH'#88,-G?5;5$7H$7C,6#563:'7$$5;)/=9@5-<,!6>)?!$=A$>6?#=*G#<5:9)#1G,>%.BA12+(A5DD5@F,*FA94"&*F8@:(89-!3;#)2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:186 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6707 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5910 42 98M = 6033 309 ACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCNGACCAGACCAGCACTACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTC 7?80=%7%'$DF';?D:;F,E)>*.F1F>CCF'*DFHG)%+@-&=&12-,;(7G,)0-:77"6C26;FC:3/%?8&73/0:1$=H5E@B8#87 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G33C5 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6710 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46779 42 76M = 46578 -277 TTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTNNTT '')&"()%*%"&$$#+("&#&'!%+#%(%(&+)&**#(%""**$&('+&*+&"+'&)'+*%$#+$)"*&+&#!$"* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72T0A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6710 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46578 42 69M = 46779 277 CACAAANTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGG -,3E&?$"$02(.C:F/0=>+2<$#D%6A0"-H29+"<-"<@&.73E,>5F-5.(>>58.4>09G;#B- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6711 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43480 40 142M = 43691 266 NTCGTGNNNACNTTTATNAACGTCTGNTNAATGGCGGTGGCTGGTTCNTTANNCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAAATAA !$'*))%#"%'"!&!&(!'%!)!$*("#+&+%%()'$"!%+"(+))#%"$*%*&!)$()*&#!%$+(#%*(#!"%)$'!#'%$"!')()&"(*'!&#*)$&!%)#&!+)($()+(&!+(""$+%)%*%%&)%#&**&"))&( AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:0A0G4G0A0A2G2A2C1C0T1G3C1T18T3A0T84G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6711 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43691 40 55M = 43480 -266 GCAGGTAATCTTGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAA HH7*<+8H&353;%D/H16"C+'&G*40@;6E.:A>'AD1!'&9=$H->F.&F>F@=;!E)244*3/(% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32063 42 17M1I213M = 32293 273 AGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCA $;EC*@DE@H#)G$0)+=H;>3B4(&"$'51&8(7*D9%=*H$B/9"D<#@.D"778,F?/2)5*7'=-!4$!#$>G!F3-822,H6&E2:*.7,#>DC+7>ABG=@'#"+E60?/7,B!G#<2:",C;8H%(FH4'2;FE1G9CG#&A28-3E580/8(!(;<6=DA$$007>+)A$<-7>H%:+7B/8+3(?1;?&0",?3*@;6GD9.748 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C27 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38367 42 334M = 38701 433 GTGCAAACAAACGGAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACAGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCGTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCA C,'&.E3/4627-$342HC9-0"?1E#D68@!'!031CD:7(&:$F=)756%"2%<@231**C65A>2&G5AC85*@89B"76*(E0FA!B(F8BB=&8'+!9"77(=/@:.3,G:'-!+50&HB3$&A'%C79(C)=9:@H&44?A8C7-F3-*B@&(>G,8B7=+A!F)'*74+."75=1$)@"/(@:3E187&"2!DGE$*H7,*>;2-,4'1"68A*H+31;$-3CB/17"3/>%A4$&!D'31 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13C117T33T168 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38701 42 99M = 38367 -433 AAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGANGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAN ###+#"%('()%'(%$"""&%)")%%#(#*%#'&'*%"))!(''!')*&#+%'$""!)$+!')$!!!+!&&($#)'+(+"*)#'')$#$(%#!$"++%$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T35G0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42621 42 61M = 42843 282 GAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAG +'+#%(+*)&+''%$#!#"(&+$*&&&(()"*+($&!'%'%*!)%"&$#!+%'&#(!%)%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A60 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6715 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42843 42 60M = 42621 -282 GTGGTGTGNAACCAGCACAAGAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGNCGAACTGCTNAGC +!**+""%'+$"*%&$)+)(&"#%#&&!*#(""+"%%+)%)#&*$!$(#$$!'$*&)+%( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8C11A25T7A1T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6716 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9076 42 63M = 9304 274 AAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATG F3F,,7)D(7+G*;>*:C-BBBE;#34.&,#))"?4+;&(F"'@F*5'FC9(7-"'9:E0+-?482 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6717 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33971 42 144M = 33896 -219 AGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATNCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGGTGTTCTGTTTACCA 3>,:E0-B/8:89,;BE?(;:9?<#=&5>$,(/!8=B*6&31)EA'1B%,6$C=<@>D"H#$A2%':#:?7+H7C"3@/'0#41,.H06=:8)D$-/%5,(52%<<<"388@#5%0G'%)>9#2G1EC<5;-@&&F4(=98F4=7$17%+!C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C103 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6718 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33767 42 159M = 33926 275 ATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTNGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTTACAGATA :@B-7-*#)D8E4C=)=+5.;38H045*.G(E5$A<4(5:)1EFD>9(2-)A/EH6C>4:-D.C*DF-AH=D2C>8,2C+5)&8;'=1>9"CH>"->:42H3#;782?/./+;;5&"7B%E93$$<)2*%=,3C<';..2''F(#E.$!E>HH3-E.,# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104C46C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6719 77 * 0 0 * * 0 0 ANCANAAANCACCNACTCGTTGCCCGGNAACNACAGCCAGTTCCATTGCAAGTC !"%&!&")+!%")#$"+#'$&#"'+#%'%&%+&'&'%)"+"((('+&'%''(#! YT:Z:UP jpayne@0: r6719 141 * 0 0 * * 0 0 ATAGACGAGGGCAAGGCGGCGTCAGCCCAGTTAANCAGANCAACACTGAGCGATGCATTCCGAGAGGCAATAGCTGAAGGCCATATAACAACAAACCATGTCGCTGCCAC AD!G68@%F*D$5?'CC('13>9="G0C-@'8!9;4%(A?6(.$+;H;?D+$>)3.&'6!!$;F0;GDG-.02;#F'A?48-CH"$<1-?-+,A6<0=0'AD3A"A5+9< YT:Z:UP jpayne@0: r6720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11723 42 117M = 11559 -281 GCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCA ,=#'@+$&D,++/:CH9A3$3%6#1+'$!&B*B"/66?=<>H-"04>!,'#G,/3C5!5@D(G/.HHB$C1&$C"9$,!&-*@9HD9G/AC)!=5* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6720 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11559 42 91M = 11723 281 AATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGACCGTCTTGCGCTTGAAGCCG FG?@:CG&)G)")+>.*9A:07D7C6F;#$5F@+D80*?7"H(+0=';D97,CE=',G'9)E:.!,7BEFA-@0$%0HB9#2)4B:(H.1) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6721 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6710 42 147M = 6561 -296 CGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTA 46!'#%*6*0(#<&!CA'@G7:3*%A,C56C;3@F"AD,E-:/;2$8:'!H386%#-=B47$&"1-A#D-C)(EH,)@+#3".0:3<1:+0%$DG9/:3&5C-3$$<0+@G,(!;H'0FADG72?:4<8;126;*2"/G(3%7:?96)=1B,@#C6/$865A9AF<61HF$40>B=@A&>=423E+?B;)<4# YT:Z:UP jpayne@0: r6723 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34026 42 60M = 34212 306 TTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACT H<&)H.D&A<(/" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6723 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34212 42 120M = 34026 -306 ATTCCGATTACAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCNCACCATTGATTTTTATCAANAGTNGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCN %!&($*($(#*("***($*&&"$#!#%#'%*&!*+)(&*'"!$')&&)'!*'+&(&!'+"#())"'!)(''+&)&(!"*#!*#!+*))$&(%'##$+%('(!"%'+!!"+*$&'*+&(+! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9G33A19T3C51T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6724 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14966 42 132M = 14857 -241 CCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGNTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGG (-BD6A1.-"H/>".@&:17;A1"<*4F91!A%-0(*1)/$56'*8,6444'&:,G;E-6<-F*0=H8">!H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6724 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14857 42 109M = 14966 241 CGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTG 3GA/90:@E=-/'>-G'B1215%>&:(A?$-+C';=44;0@#D=,H<2"09E0D66%A1%7-(":566(AEH92GG?DD+933%7#"3=D4@1DC&,@!A#209A1#=@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:109 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6725 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9930 42 115M = 10045 204 ATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATG 39*2CF;:#B"(??$6416CD'(B94G1*2B>:;H73E9D0/1@>+E,)#%!D=G.'1>>E3F:)4,@'+C%>=8($1/8H??<:6G>=?D7$/+(E*D5$67:H'8CD")@#G).?9,560(8E2BA&)3.5(&GD"?+CD0@'E93?AE!4+014.8582H/1E<>7)5?3E*FC@EF5!8BAC9+1+23>G;3D#!!#8'B-@(;04< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T120 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6726 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30928 42 242M = 31170 398 TTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCNCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCAACATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTANCGTATGAAATTTTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCT 5:ECC?57#.+#>G#"?*6,6!?-:0>%5:A+-+6)"2=6!2'--'2?A=A;**,F67<8-+C:4-!?!)A-(3?F2)!4!EG12.3*-;3/#%>+'0-!,$21!$#1F&:7CC#'=$-7%E+#4EFH$*BC;5;;92*G:GG$*0!H+.3+"71FAG9.4$9+0<&,-&%"*9<%&FF7+/.0/977')>30C9/8**H0#%-8*(BE!D:4FDD8%+) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:91T26T32A11C78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6727 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30648 42 62M = 30458 -252 TTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGANCNTNTAGCTCCATGATGATTTTGCTTTTCAA !'!$+*%')!)%$$))%**#&&*%+$++"+#%$)+*&!$#)'(#$(%!%(*$'("*)*&*'+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:30G1C1G7C18T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6727 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30458 42 109M = 30648 252 AANCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGNCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCG *!$;1.A!HG+9F8G#02.((@1.7//E45(@$F-4+;2+=G)&#G&H$<> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6728 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31891 42 60M = 31695 -256 GGAGCGGGGTTTTGCTATAACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAA ,*<4=+?8+>=$5,G%66:'*'83-;"<:%58E#(/+1,E5/4<+BC"=*7*,3ED57H5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6729 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13713 42 264M3D75M = 13627 -428 GCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAACGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTNCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTNCTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTANCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCT ++66@+F?*="GA+=EF:0F&$=8,-0%,B+/"H$@987'A,$5F:F8:%70&=-912BC*@36-4,;=B?#(260<,,/,=.F=:,.:"F%")(*<(3<@'E$+76%13F6(0344:A3B4/:A.+HD8*!9+:D(!)1,,E)7"HF8=7H?:&584H1%C>,-(";?3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r6730 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36569 42 181M = 36569 0 ANGNTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATANCATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATNCCT %!##*+*"!)%'+%'&&$$%#"##'*'"*#++#"#$"$)++'+&'%%)#''!)%+!%!%"(*%%%)'*'%%*#&')%%&+'%#(%&'#()%*#%$)'"%&##*(++"''&&$%+#"'%%%")%%"(!)#&%*''+"'*'"!&%%"&&%))((%+*(!&%++%'*)+##%&#&$"+(+"#&' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A1C105A67T3 YT:Z:UP jpayne@0: r6730 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36569 0 * = 36569 0 CACCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCNCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTNTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAA 0B0"87G7.?D+#:("):,:7>'2A%6"0*?1.H3G<@H<'>%,:;;;32);5F32F7*,EA)7#$>B&&C9?:/)B,6E3&6;H,1>3#B0+BHHH&3,E1D*/ YT:Z:UP jpayne@0: r6731 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23287 42 96M = 23447 205 NANCNNGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGA $&!"!!!+'"()$)%$'!'**#"+'!*$!)+*(+(**&&)%$)')+#$&#)&'%"$##"+$''$"+"#)&$%!$(#"+#')))***)"!$&!)$+! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A1A0T0A0A69T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6731 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23447 42 45M = 23287 -205 TTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATG "18*.(/.*E>?G?6:2H!H:'$&DC!06?&-&@#*@=#$6!4%<'@/D"&">DC/@A>4>#&;0,#%2.<2"*--241<,6$#*'82H3*86<.,CB;"#'6G,G2=3G<*AFH&2F;#H;!< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r6732 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6908 42 29M2I162M = 7099 292 GCAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCGTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGTCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAANGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTC ,-C"#("4&E)(-D$9)3>6.0A=-,D*5/G%-.EDE@!52A8"0:8HG#D92)*+/>30+*&'?!,!?/,.4%;697E0A,BF=.#?C6889*?D7284'?:H2F<-(C6:>CA*+F%H#0?F4*)EGD"5;1?&$@2)'H(54B+0,3-F#H++2D,/="8B-<<./)1088@/<@*.?@&?A7,D54#F? AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:1G23C57G39C67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33162 42 139M = 33002 -299 CTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTT >H18(360G"A#&:(-+#!5(";&>A@0=$H/E@+@:&*E:%?"$=,0>%E?8.$:*$#8<4H,>'$4D>'2,?H03B<24'4=0#'3CC-/(3.#%?D>;)9D%%)/,@!22:>/F#H)1&7BG;8=>,->9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33002 42 160M = 33162 299 TGTTNCCNTNGCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTANTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGATATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGG (!)%!&%!'%%++"%""''&('!%!&#*(("!*&"*%$'$+$(+*(%&$$"(*%*&&%$#)"#+&%%'$#'*&%"+*+''$#()*%#('!"$%&"+!&!$#!(*+"!(*!&'!$&(%)()""$"&!!"*$"+&$+'*'+)$$#('&$"(*)!$*')!'+$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T2T2A1G0T46G67A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5440 42 61M = 5501 196 GGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATT G,E3G%.)"C!>#1>:+2GH$@CA=-0<>H")7-;:<%G!7A/7FG8,&G6C)529C7*73 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6734 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5501 42 135M = 5440 -196 ATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCANAGAGTGCACAGGCGCGCAGN 1G2;:G$-C972='22-)*&A>=6B/0A'F5;0>#@=@9E(13/(9EF,.H>*F1,3F-"3+93E@-A#D9)B!798CA68/.;.D*A5)=/(/+#8=E%=!52.:32&@G@C<&4%#F!@+&-HE-5GB*"#@% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T98C19T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6735 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38945 40 44M = 39154 263 ATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAG F95/.C$7D0+F%/ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6736 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17250 42 207M = 17457 397 CACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATANCGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAG "7B+@/:C0+48$.=;4F3'/=C/?@>;&C$@/)>)5(;86?C3'!@3--0H5+)"B:*>+7%2+9761*8*1E#7!:1?8EF&G<0#"F%#49C$F%G"+53',C6BC*4@(F'E2(&!0H(2>D$A9%@$#E747H3@@#B-0(=!9;.D7+.'DD4FG+H&=C2.?'*';9;<#9#4=%H!87/H";(#3593)D"):=:=B!1-=:/!AA8%%*0#%0.*8,##DH2:!<)(#DG4A+<.A@?-.#D"GAC-G<&E07''>,*,/:B<5*4$)'B1@#?:+5#303+,2!?!/-6>2D"-%667@-'H<,1*3#3!0/2A,!#(29+6#0(0F-..G#4B%9)2(D:B4*"FE#7,E6F< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42G10G53A82 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6737 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3142 42 163M = 2937 -368 GAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGNCGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCN =;<,;G<&'C1'+5=8<%*:2%4$<<@/@3>3D"F#"3.80F38G17/@1"9;(;3+F%CH,H,-%(/&2"'B8C:9=H#C'H<89"C9:8/*&&@-#),2-.B0+7F#G5&79429-#!>391-%4/G0"C,)B6/;FB:"F"?C68*E7:4(122#,G.;& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73A88T0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r6737 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2937 42 205M = 3142 368 TTTGCGGTCGTGGAACCCACCCAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGATGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGNCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTCCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGNGCTATCTGGGCATCGGGGACGAA -=&$>H9%4+4);!=!@65H;A!8%F3G>:G/D#8""=@567)2-#AA4C'+"DCFB66957(+?D.')0=/!*<<5-GE*1B?687".DE92GC'<6H(/!".50*A9!&:@7DC3"E/,6$)5A!0C"0+%G"@5'7=B0('F82@.F&;1":0>9'6#FD<&$GG4?7"59?F+A!A,DF+C2;FA0BD208%89(4:**4>G89)E03! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10247 42 76M = 10437 258 NTTCNTGATGNNCNGCTGGATATGCACTTTTNCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGG !#)#"*)(##'#)&++(+$(#$'#))("(#)#*!(((")!'''+$''#&!)*%#!#(*&&$*+(("$+###*%!$# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T3A5T0T1T17C44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6739 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18319 42 365M = 18258 -426 ACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGNCATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAA H>EFD/A=?<+*''A:=@"C;GBH%$)&&D81;<>>6:G8?=>=3B&.BAF6+G(2%(4>8-+@A-3GF%5E+H+A"0F/#51=+&(;*F)64;CC11&;06,6%<@,H.!H,<3,B%6=E&A$+32AEB/6)<'1=;$/8*0=BF.@9(9*&"B-2F&''=6)'1;%<#D9%!:@,2=C5<#=@.0!<.!-8-C;4,$!3CA2?.2*,%$:ED!H8?>-$<-F=D>-?8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:172A106C85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6739 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18258 42 61M = 18319 426 GCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACNATT B%%30>:&(.E/(G+')&'0"&&%'2@7!CG390&(+5A!6*H:A'1)&=-G@78B7?%#5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8569 42 131M = 8492 -208 CCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCACCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGG E1";@&@64FDBCG=B2)$!FA96@!D'=GH18##FB-3.+H&4*20.6%2%*9&!*F<52D""C&5$2%1&&)?H2@E4'%08!F5?&H/2#@=0.5EEBG<1"G86>"<)>;7C1!.=$=C7';B:>9, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6740 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8492 42 77M = 8569 208 NNGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACT ('=2%1+/F-)H+A+?7#-C&>48>(+A09+2H=*07.*%&8:*$B4"6!BH8F&FC$A>8@%6>E/%3E.2F>;:< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0C75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6741 77 * 0 0 * * 0 0 CGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCNCACGGACGC &854@+C&43($"&'=221,7-F,*/3+A<>H'@;9GD!+%5 YT:Z:UP jpayne@0: r6741 141 * 0 0 * * 0 0 NANNCAGATGCCGGGTTACCTTCAGCCAGCGGTGCCGGTGC "$%&+#+&&'%*#!+*$))#&$$!!#+'*$*)*+&*%%##* YT:Z:UP jpayne@0: r6742 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2055 40 31M5I57M = 1838 -305 TATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATNTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGNACGCT @?1.%3E!<(@9;)F,EE;(;)$#(C:3CF$@*&+;G8:-"#6*&;+<8A,G%:'4B9#$+2H3!5@3@77'6D;>4&)9/4+5)EB7@#!<# AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:41C26G13A5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6742 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1838 40 63M = 2055 305 AGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGAC @=&3$'#CF@BA'))"G6=?*1-5?$$?0,;($2/0<(7E4,!%4#H;E(%?H)'4:/2;!@* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r6743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1661 42 89M = 1517 -233 GCCACCTGACAGTGTGACCTTTCANATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGNCAAAGACTGGATGACAAATN !)++$('))"!'#'#&)!*&""**)!"*%"((*%!"%%#$')(#"((!*+!%)((%&++%!&"+*&!!#!(+#!&%(#)%&*"+#()&' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:24C43T14A2C0G0A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1517 42 79M = 1661 233 CGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGC 0CD',/;99(E32(>E<15&E"F#+,&4-2;FD+B9,'(8B&-%C#8B%)/"&<:A+:*<576C=:5'>=+-!F017D* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A55 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6744 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29491 40 69M = 29704 293 ATTAGACNTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGANTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAAC ?1#<>6@$H0!4DDDD,#-.;C/C:=,;9.B:*#$53@:B'4@"?A'9(*#=G-423A#3#?= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T31C29 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6744 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29704 40 24M3D53M = 29491 -293 ATGTTTANGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGNC F/52/:C+*7=08G>5F8#65*;C;=H@0@:9?119:2,B3+6!(7+B/5+'EE*24.<$?0%'H>@B+<0B,G.%( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:7T16^ATA51G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6745 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36711 23 67M7D23M = 36589 -219 TCTATCTGTACGCGCTCTCCACTGCTTAANGACATTCNTTTNCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCCGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAA :;H65!BE(C3G?D,?CF&:('5B+3/BC562+%,>6;7+84A2,)84A,A:)5?30+)5,&3D8E>=&+A9A*A*#)-,>*B%).8(#& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T48 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r6746 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29738 42 191M = 29738 0 ACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTANAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCGTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGNACATACTCACCTGCATCCTGAACNCATTGACCTCCAACC "/,4$:'D!F+!)-(2G&7?#!C%F$BDF%%!;;*>D/*,0;4:8-BG'A8)+3>>=:;.0'5!%(!)+(8>%BB/D3?;?H:%CF'?A)(C:-4B"A502$+9?)G=.%3AH;FC.=<:H1>"&-?:A)>::>1<45$# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:35C82T32C1G21C15 YT:Z:UP jpayne@0: r6746 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29738 0 * = 29738 0 ACCNTTNGANTNNNGAANNNNNGCAAGATNNGTCNTGANNCNNGNCANCNAACCCTNNANNNTAATGTNTAGGNNAAGNAACTNTGANANNANNN ###"!""$###$!#""$$!$!!$####"#""!"!!"#!$!##$$#$#!#""$"##$!"##"#!!""$$!"#"#$$"##!"""!####!$###!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6747 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18890 42 130M = 18890 0 TCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTNATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCA '#<268>?E-B@8E?.39,<;7BDGF"!5/9)"C(/%/$(&3;%(H@4:;.+'#6EG;(:;+=H:#A9#HD83!;&)C=<*H/%8&7B# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T80 YT:Z:UP jpayne@0: r6747 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18890 0 * = 18890 0 NNTNANGNANNCNTNNGCGNNCGCNNNGNNTNNGNTNGAANANNCTNCAANTTCNTGNGNNCNCNNTNTNCNNAGTNAAAANNNGCGNA !##!#!#"##!$$!!#!$$##$#"!#!"#!!$$#!$"#"$!""!#!!#""$#!$!$$#$"!!!""!#!$!""#""$!!!#!!!"#!"!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6748 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 637 42 47M = 858 270 TTTCCTGAAACGGGATATCTTCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGC -+,G3;;;=A@427*,"<0641<7A7;:41(&)B5GEFA&1D*DEG0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6748 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 858 42 49M = 637 -270 CGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCA !4'.,735:E,E4,H8@,"9F( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6749 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37729 42 51M = 37464 -316 TTGAGAATTTTTGCANGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATG B28$;=G-+!&?33$38F:/$/6%?E55=B.7H'(A=*(2B8/!9A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A35 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6749 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37464 42 20M1D21M = 37729 316 TGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAAC F/>#,7H/+7:A*5<8;4E."FB"C)5.B6$$55-G/C-!6 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:20^C21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14455 42 53M = 14277 -231 TCTCACCGGGCGGCGCTTTTNGCACGGTGTGACGGACTGTTANAGACTNTTCN *(+(*'&!'+)**)+!'*%('&'+'(%+*)'&$#%+#")&(*+&#'&%"*&#! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19G0A21C1C3G3C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6750 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14277 42 54M = 14455 231 TGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCGGG B'C..0F4"(EDF?&9D@F.#-728>=24%(6&9D+A8$'9<$(E/$3#G<002 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6751 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 446 42 142M = 271 -317 CGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCC A?=C&1,;EF(G)%)5/AH14)6-9)'>)H:";)G-H:(6A$@;>/02.FA>C3H)2G/$='.!F8H6=<+G6.44E.69@8;74)<;EE@@"7B1G4<5!7(2-$2>.9(>F*?EG>;(,,D5G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:142 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6751 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 271 42 175M = 446 317 NCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCANGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATNGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACNATTGAGTACGAA $%)+&#""+*!"")('&#"&)+'!%+*#+$&#"&)'$#+%'#&!%)"#+$&((''!'+"&%(%($&%!)$($&)%"+($+!"+))&(+((&#'+'"*")"*$&*$%%%)&!*#+!)*'&!!%*!(!!&)()"*)*)&'#&$**&$$!!"#$!)"+$!)'!'$#'%'#*%(+!#&! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G22A66T41G29T12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6752 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16585 42 110M = 16773 263 CAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGTCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAA (0/4,/;<+6$F);''/!.5'4;'82);(61/A*-2%(A><@30-:AF+5$-"0BH9B+3D=<5;")@/,BC1D&9/<6)83&1!=A?6>;HEF'/6733"%/G0B;&>1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69C40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6752 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16773 42 75M = 16585 -263 TGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGG C86*A.#%BF>+@*HBG:,DE:D?'5D?)$3-E#EB(:>,2%"8A2?!:?*)42G<%2A5<*H/2!8?.55B4HD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6753 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43630 42 186M = 43499 -317 TTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCTTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACN 6EBB&2&72D>8,+/0!E'894G!G$15/:.D,/CB)/"=F9,+38CHA!*##0!>G80&:6<92"/.3.@$D63B91.57CA?2"D27GE+5@H+E$,GD+!$5A"&9>2.55;G0$;&B6&B'$!!&&),<%GE"+9*13" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:110G74C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6753 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43499 42 131M = 43630 317 CTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATG -C<3E$)81FEG.3A*3)F5E$G93C++FH(*H,=H8&=;16"$)!G7,133A,/F78"E#.(H+9'664>$'6:?#9;8:3:'+2F>)31/H*C79*0)7!!,:<9;*G8+3<6!&D6,H6*83#/7!)+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6754 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47669 42 41M = 47806 211 TCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAG %E0>-#F07*./G=#::A2:=$37+B+*3;,G*"60-*.#1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6754 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47806 42 74M = 47669 -211 CACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAG C")>($?G.HG?0B*#;B5-A#'*/:'.H8>+.)+)D(:6'68=G-D4>#D(02HB2&="F%(14")A9#49D? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6755 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40706 24 29M3I83M4D20M = 40864 204 NNNGCTAATCCTTCCAGACCCANCCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTAAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGG %#$*(!$%+&*'(+###('!+""'%%++)+)$&!#()&"(#))##*(*!#($)*!+%$+!%#$$+)+&*!)+)*#'$&#"#")"%&&")+'&&(#%(#'#!+(*"#)''#"('$%+!+&'%!+)'$'#(#$('%$ AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:0A0C0A2A16A23C65^CAGG20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6755 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40864 24 46M = 40706 -204 GTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCN -2E@">?9CA%2.,):&*:0%6>"B*/A1&D9+0.$C5)!1*E?@! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T0 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r6756 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9312 24 73M5D6M = 9106 -290 TTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGN C6<8#*!(.5CDFH0=74#3@0D0A:G;2.&EDG1#E&>G57F?&*#(!>&9;9!84)+@?B84'2F;/F1C8HE5<&! AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:73^CCAAT5A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6756 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9106 24 42M = 9312 290 CAGCTGAGTCCTATGACGACAGCCANCTCGATGATGAAGATG ')?)%2(AH:8E*='<"D9**28A6AB4=#0:2A9.",;/<<+7-B$<%!!D/=9C.A@'E;=1?4,G8>G$,5@:=!=*B;-%D'@#$*3!,%E39$F>:6+13*E?#2G( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6757 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32844 42 86M = 32930 237 TGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAAT 8HA'!EB)?'D/6#7*9'H+D*)F!C$:2&@5.+&&'-9,<8D6@>CB!>:+87FA$5>;C+$.@(>65G@&/;##24'E&3D?-A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6758 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31633 42 89M = 31338 -384 GCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCTATAGATGATCGGGG 68/#D8B.%+1;$<1H&(0+:$7#&8>(3C4E:,=>'!-?(7;4A+;>?/:A")E(<3;7>-C6B;),:>*(,<=:'%?0!@:+#912G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6758 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31338 42 74M = 31633 384 TGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATG .)+F:=&1/%8=.)-$=:3@5968C%@BD?(/(FAH<):;@5".6F> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6759 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 330 42 326M = 213 -443 TAAAATGGTATGCCGAAAGGGATCCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATC 5?==(D,:DFF,EG&5$!>9$.);7-$767'4@7G<(7&-0>.#-G!.*5+>C?9<=&&$@/9;#?#G-8;:90BE=BAD!!4HEF5:/?)5.36@,?3E@A%>96G1=!=+/+4(%>):&4?,4/2E<:1%2::.7)-&)6E8%:2C!<&14;;F7# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T1A50G15 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6760 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32314 42 144M = 32245 -213 NATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTNNGTNNCN !%&&'*%+%(#&%&+$&++("')*'$)$"'''!*)!$*"*("$#$(()*"%''"#()!!$'$)&$%+*'%++!)&#+#!$!+$+")"%(+$%')$&)+!")(*')"*$"%"%!'+%+'!!$&&!$$"!))#+)!&'(!)*%"*% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A135C0G2A0A1G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6761 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5036 42 130M = 4916 -250 GTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCNACCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGNATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGG 6'E39<#>?9C!@&%#BC;B24(-597A$.$'.G/G!DG9,+(91=;C) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6762 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21569 42 81M = 21406 -244 GCGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCNACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGT *)99)CD;"4E:)H9/=G4GG,@49;"3B7)*C-2>.2;6!.#,@,6&"C/H90+AC6!%7<4+>BA=41,*:2*0D6A6' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G52C26 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6762 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21406 42 66M = 21569 244 CGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAACTCGCNCACCCACAGTGCCAGTGCATC 6C"9!'G2A'62+$@90$$44H@,0;D2(C<@C6-E*)>!GBBF59B".>4E#<*C0@/$29<*6; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G4A21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6763 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45814 42 70M2I68M4D47M = 45593 -410 ATTGATCGTGGTAATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACNGCGATTATCTCCGCTCTGGTTA 7<8<;3-9$,?5H(!CA;$1'%DH<2':E$3@?;C!!3D"#G?:48B;:+(0+%GG(3>;B@D?$0B9%=41B.E-4HED*.!98$?/.*59-=*<9@"%G*!9)D"3!78$'(%9?,F9(6@)AG)6%",#?32&E3*="H'(F&3#G AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:12G125^AGAG24C22 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6763 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45593 42 221M = 45814 410 ACGNTATTGTAGGCGGAGAGCTAGTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACGTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAACGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGANGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATG ()#%&&&'((+%*(("(%$+(%+%(&#)"&#'#&"!+&$)"!+&!!#*)&&'&((%#!$*!#$'(*)!)((##!'+"#*&)*)("+#!")($&*%"#(++#'()%%$)%'#'%*)&'(#(!()%$'%*&(+#$&'##'&+&&%*#'!+**$#$%%$"$%#'*)((!*+)%#%(%+&+!%#*$&*"")"!")%*)$"!"&#!"!&"'+*#""#!)!&"""&" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3T0C18T30T96A23C45 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r6764 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47920 42 46M = 48149 287 GGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCNAATCATT 3'!B<+D?&B02;3':7H41$7BGACA"3*%B?>.,''8%6HE7320G.$!*B7(-96)#;")?"9HB*-D/!E53(E#+5341=-4G?89C',AC702>F0'1'>8CC279BAC#*2*!#$H*2=8((5CH='B1A8B9GAEF!6#8/8/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38280 42 86M = 38107 -259 CATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATNTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGANATACTTACATATGGTT /)/4<;01A>A96D)22!.1?:8'24HEE/.&;:B#+?5%$G'59$(D"#9C";)4$4$5F,?@/7>)3:D@&(F%= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T35A16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38107 42 70M = 38280 259 CTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACG E5&D9589(4(2D,*0=.A>5E*&'"/@CA%""?,A3&29>'=GA(!%)6$&31->2=DD;.@&>;((.5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58T11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6767 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17678 40 4M1D37M6D73M = 17542 -257 GCTATTTAAGATAACCGCCACGCCGNATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTA .BF:;@:0"H8(3>!6+!A;5)<3'&>9)B@41>*>E3?D7B=A?*-1H!$"'(52;C6;(G02""HG8EGAB.09,$8/4,D6$);+'.2;()EC&@.@3DG3?4:"3A5E8H AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:4^T3C17C15^ACCCGA73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6767 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17542 40 85M = 17678 257 TTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATNCGGCGTCGGTAT ;1,+8+$?#)./5=@>#(#*D6%(+#A2-%1(9'160"?$D#7">3.@/D$0$(@E?,84-1!E0%4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72C12 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r6768 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10883 42 171M = 11054 214 TGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGNGAAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTC 41(!--7E-A=4'8$92EG1,/96-&/F3$=:%";,!?@02DC/H/GC."(-+H<8$&1<G.#-<-+@D3G.&"'79179-)@&-3-D='A2>4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82G1C86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6768 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11054 42 43M = 10883 -214 CAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGC E5578"7,)$-(8D8H+41A0=@$6!A0-4!7B.(1'?5D324 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6769 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46386 42 41M = 46173 -254 CTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATA &;@-,>7E=(;D5'4CF)1?D?B6&-5?.; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6769 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46173 42 119M = 46386 254 AAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTC '?<=9=(+.@-A:!&!A%A%B,<@DC3G/F:2)%?:D!%A0,5*<).!B"9;&FF!$?G>!=2*G,H<5='.6.$,D4:('"D.%.,7:<9D*.!)FG/H;1EG>487F8>*#7HE65: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64G54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27333 42 46M = 27103 -276 GCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCCTC *%!'#!'!*&"&)"((+%''%"#*!&"+#%*+#$"!+$&**&+"$! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43A1G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6770 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27103 42 49M = 27333 276 TCGTATTGTAGTTTTCTATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACC #F2,$HA/,H1>9<''A=&HF1+4;EH8?7#(>1H;3B-6=,5.=2@C0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6771 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35547 42 176M = 35457 -266 GCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTG '8A>2">085E4A/D&0&-=9H!D%@C8@@B44!<)?BE)=@-8>F'<*,-.+E8/;.+8?(50&5<"C9G?2&9&9/A0A(%.""4*52"-B-EH'EBF8(+.?3C)219+:&/G7'8")*##:A,G>2'+((=<.-#11D.D@#(0FF#H5A/0!"!!=!933G-'A'5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:176 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6771 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35457 42 90M = 35547 266 CGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGA 36510%?#!3F)89@D'8GE$?HE5>6?F68:1-#CDFEH#A1'H86G:*98(7.809?04,9245+*=,/A"9,A13'%6>=3=?%A9+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6772 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39259 42 149M = 39408 228 GCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCNTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCT C%:#4>A3$2>&?(+H!?/@84>B"@45,9C11,;1B2/C*>,$;#,-E%2.("C(/1D;$<)3G#=A1!4A1/;**>3555-'.:B>0C$;B3H5*'@>=4294.>$8C"C"/$;$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109G39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6772 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39408 42 79M = 39259 -228 GTTCCGATGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCA 'DG"69/B;2--)+)0)#G',(,)7B$/6F$A$$G%$@D5@'((<-B*A)"<4=:@.&*@867,4'6C-7C06)<4<5; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C70A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6773 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10872 42 44M = 10525 -391 TTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGG !5:6;E7+"6GA8H,,F4.D""99'(<3-58DH635'/;%F5:! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6773 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10525 42 347M = 10872 391 CGCAGGAGGAGTCCGGTATNGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGTATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATNGNCNGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCANTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCANGTGAAGGACTTCTTCGGCGGGATGATCCCCATG 7(*;,5H;:=6'F6+$$:&H,2;:.&;>,>B=.+D$:3+/@.FC)&7HE<;9D@!8#4/80*=$#/A-><#-2@1E$:-"'E7),F&4*+*<%G**%?1$+*@+@E)$/4>F&/)>/"54F$AD,)&=$"D171588B%?+0@@F(F?#5>#A8D;?6*7@H2,176@/G8DA9@&,52-#-!')D8+&(=:H.)EF8"$D9#GE)1&.#9(+((>?7H*%#=H;GFF743=!6@<$),F-H&8.+199$49'C#BE@5!-?@2,.D0)-@F#,"/BC)1D>70!7/C-0H."!/H0+#,E&62(-0/>00@D(3%./GC(#?7($G8.,+9>FH%6HH9/8$!11( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:19G39G25G1C1A53G169G10C22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6774 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32483 42 385M = 32868 611 GGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTNTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGNCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATG 2"$G6B@9H!+?#G9AA>-$:A"C/+DC;/>&,HB%/7='G@=!!1;+7>/H+*&6;<>1%1-FA%H70C.>4@?B.D4!'">,D!D.(4A:+)(@;3>%(5E,=:<;!4=22>52-B*C5$+!/E?5@G@$1A54%)#DF(='F;<9.3&E50H733-5B6A"8%H2=""&9)%AC(4C;&8H++BA483-$>;G>9(/<.!(@4A7=>FG*/=<($F$B)14A11E37B79:/,=E%-813HA/F5$;G-D/H(2A18+G=(G",E*8GA9.DF47696-84G@>%.4)D%G@6?923#*E6D%B#5292*51G$!D/"H3=(5:'.)A6FF%'&0$?A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:146T156C81 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6774 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32868 42 226M = 32483 -611 TACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCN -'&'(4=+1#,AD/6&'#@"/>A;-$*$&(;-=?''%G/76$)"=#=!=>1D<1#A"&GHD-8>%+7B#A.=6'H4+-+57?<.8D,%==F7E8B*;!6A:3:A=35%9%.88F-)F!+8.3):H)+"9B<+FG8HE,8;(6F3'FB//7D@13EH*:'-G("%B+4!0#);+8HBB7(#.1G8F+-#"3&4@E3H=H/#A$,,E4G,'..A!*C+C69'>-12/%E5/E2F'D.E'3GCB(136>H&F2-F&;&C;E"E,!D8*4824" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C22 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6775 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34748 42 66M = 34614 -200 ACGNATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTANTTCAAAACCTTACAGAAGAGAAATCTCT ?&FB&3&HACA2+D'>:A42%4CD7?./;*/;5H0%4128<-;20:E?908".+*G3/:&'%2BB: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C33A20C5A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6776 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1324 42 75M = 1399 262 TCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGACAGGCACCTGGCNGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAAT 8&7@#'H48;$#<#">?=#1/0&3C=7&(+D&A?1BA/:,%=D.23;>"":FDA=9$@3&F:>*>5C%;&A)7A2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39G9T1A23 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6776 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1399 42 187M = 1324 -262 CCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCNGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATCGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCG 4%7%&A78&/+#3%("'6<#?=A;:)8*3)G(5D?/*68D,3594)(A'$'",!"7:8'+97=#>*."CE),0):#,*E$05G1@F<3EH:"+*<:C8>$!8&/0@6E1A2HF;8&GE$('<'-*F480.:B<7?-#B*;B&/&98/G6#EF)@;:!53:@=6D5G*5&,?8.7!'H>,:>>4FHF1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:102C37A0A45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6777 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7260 42 191M = 7127 -324 ATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCNGAGCTGAAAGAGGAGTTTGATGACACGGATGAAACTGCCNGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCAGGATACGTCTGAACTGGTC ?G:C%/52-!=*8%CF>)1?>0'&)3/4/*>"+5$0#8+=4$=?-=8B4@<1)!(1G<;!$.94+/<68C?"4-FC+/F5F'H$16G7':(%@7>:>GF%-"G'=!F>G/4A=4%7?>@=8F93EH-.5%&$8A*6"9#8,A+F':.(?7B:G>@!-D6044B8!A1;@2>3-H'A>,>8E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46A15C23G84T19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6777 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7127 42 133M = 7260 324 CCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTNTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCATG =*6F:$='-#)82$/"@97"+0>=GC/8+)',H(">!;36$5"E4B9.,"5>:4-F519:H>C*HB#-(.%("GF>.4;F+-;#12H7>$)";);-'0-#)0AD06C:>(+=;6B.8!D>$,BHB"1.1A#AF AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59C70G2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6778 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19436 42 53M = 19578 270 NGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCC $)1E),,(=)A758:5=748$3$0EG(DE:C#2@E&*8B03D@!/28#(4$>; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A32G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6778 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19578 42 128M = 19436 -270 AATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAA 2$F+H='26=0;8DGH/;(CBH/E)FA!;F$)BB(27!:!7?39'#3.$/)D#8EGH;6B(+>)*98?6AE$$8(72B#GH32:EA2C@.&=3F9B5HF"%;'(7$C59+64>F@B:3A@'?'C51(DC?432%>&--;/G9,0='$89!C:E@5G@4&",)890AB$,+<(B(;46*"??83)G:>B=,<9-*"C1#)8?9B>D47EB#'?57>)2?74*-C11C>4@@H#H+3&4;373C*>206@CD8D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C97G17A36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20141 42 51M = 20213 227 GTNAGCTCNGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGNCATCAGCAAAGGCCAC )(#+%'#)**+!(##*$'&+&*$"*!%%#*+#&'!!#'#""&#*+)'')&$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C5A25G16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6780 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26343 42 71M = 26147 -267 CACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTG ;*$"?@<10;G!*&4=++!3&D00E@:;'#EB/?-()/;68;==D?/%2C/.2.GC4.&4E62'>8H(!-4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6780 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26147 42 60M = 26343 267 GCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCT >F,@>D!0,,'-!7,@2H?-':(!?G6A$#@/7D";?-E28&B51(=<>5(5C#'>(FC0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6781 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40918 42 79M = 41045 182 ATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCANCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGC 1),:H&E4A!C#*357+=+C.*G2&-7@2-10-E6=CBC40F=C%1H2!#B45F6+5'E65#?F?+.#"-/1F4+>433 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6781 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41045 42 55M = 40918 -182 TCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTT #8"@(#>G*$7:15%9G&&:D$9,++<1#*4*7>!29'G$!G(#5(?3D.G)F2':9510@9<25;"5<%??88'1;0>3B?%&%?F(0@&5(?$"66$38.)"=6@?+)#91C<'-B9BE1BH!0H?B0B%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6783 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15075 42 111M = 15194 212 CGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATNGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCGGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCAT B0=:$0+G4DC@4,:40:CHE*==.EE7;$A/C'6;H!A+7E7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30697 42 58M = 30889 242 TTTTGCTTTTCATGTACATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGG +"**($'(($)+#))*!!%('$+)!'()$$)&+%&+$'#)%!)!$"$!*($!!#+")! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30889 42 50M = 30697 -242 GGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGNCATTGAACAAGTC +H@0>9D3#04)0!+(')=/1'"(E@&65%+8@46$'7'@/>(;%$HE3, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6786 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30298 42 199M = 30497 345 GTTACNAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGNCGCTTCANGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTNTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATC )=>4%;C>!H15?#E2@(7C@426;@#B5?5C0/(:CG0;41/,:-F7$,!>3%"6$?-0>#$C*='1?##!;(+4C;"3BDA9EB!8%#B()#H:(+D"/=C38=.'9B&=2!A?8@F0E1#.%B';BE#:8;.=21/AB5,'#5D9D/'A?$;*$"7%;$/G4?6):2!7C*@.7078%?-G2<$<8?+,!+D!.)@0?1?&,#=/2.2-?FD5H/=:D2&917:"C6?8.B4"5)A<04:#(<40:4CH7E*D=8-!(%&BB1AB.!F.?$"C9$#">:.=)(4.-! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:31G36^TG20T54A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6787 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11659 42 194M = 11853 273 ANGNTGAGCAGCANACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAANGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAATAACAGAACAAGGCACTGAAAGACGGNAAAATCCTGCAGGCGGATTACAAC #&"%+*&+'!#("$$'""(!*%"#&!#()*'#"*&#$*""%!('+!#'($&(%*"'""+*%+$"$$$!)!$#&+)#$$#$&&))"#&$+&'!%++%%!%')$(($$(()(!#)+"#((+))("*#)$*$$+($!")("$)&*%%#**"'!#++%+&!#+&*)'"($$%"#))(*$#&('%'&$#+"+#"(''() AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G1C9G87C41G3T21G24 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6787 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11853 42 79M = 11659 -273 ACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATNAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAANANGCCNGCGCAAAGNTGTCNGNGG !)&)(+#('#$&"&#**#'&!)%&%'$%+!*&$!')$&(%"#))('"%!%*%!+!$#!)&"'&*""&%*%(**)"'"&' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:30G23C1G0T2A3T0G3G4T1C2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6788 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2285 42 122M = 2483 241 TTATAACCGCTTCACACTGACGCCGNAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCNAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGG .B/:'?G65=2/2/4E61/6&*7&/D!H6(*C3-*9$E)51=&.1&" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G65G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6788 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2483 42 43M = 2285 -241 CGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGG +<5.<'H@+>EC20F'(<#>:C&:?57?-#:&$B($>EB"F2=@@#!#D)1?H/HDG8-;!9EEG)BE">7E7>G8+.!<60="?-,0&*6F(!48C9(4++ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:122C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18707 42 60M = 18899 238 TTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGAGATGCCAG ;H7BB$F9)A7#,==%B)<7$#>%E61B5(>'7+,!.*9990;#07;9:49EB4?3;5," AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18899 42 46M = 18707 -238 TCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTNN $)#&%&)+)%((''$!+(!!($'!('+()#""!%%*&**""%'+"! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44A0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6791 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23977 42 329M = 24306 466 AATTNAATNCATAACTGTCAATGTAANACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTNATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGACGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGGTGAACNTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCNAGTTGCTACCGATTTTNCATATTTTTTGCATGAGAGAATTTNTACCACCTCCCACCGACCATCTCTG )'(()$"&#(#'$+%&"%&$'#$!%'!*"#'$'*+(#&"#%%$+)$!*#'%!%)&++&"#'&!%""+%"#&&(%#)!!'))&*"&%!*&"*+('()#+((+'"!'$"''+**+())#()(&$(%)+))%$%%#('!''"*'$'"&$!(!&$((*#(%!$!&%**#&%'!$")(##)"+#'&*&$%%#+"+'"')!%"#'!"*&"+$##+))+*"(&"%*('**"+"()"#%#%%(+%*$(#))'&'#%%"#$!&&%#+''&!(&#($!)!'!#%$%+(")+*+&("'+#+"'*#$%&)$#'+$(!$&)&+*%!%&)*%#(+"&!(&()* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:4A1C1G1T15T29T128C46T28C16A24G22A2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6791 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24306 42 137M = 23977 -466 ACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCNGAGCGGACATTACAAGCGTCCTTCTCGGTGCATGCCNCTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTNTAAAAACAGCC +GBA7"@A+36#G!:+/B>3E9:##G0$<7&/A.9BA/,23H$)85<9FH%#/%7,D&(=!+#B:2B'?E>)89A;@:4G8#0=#?/&""&8D$&37+$3&G,7G+2>7'280G""C,-A91F74H'*;481"C/0, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13G21G15A20A52G11 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6792 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35029 42 14M1D96M = 34845 -295 CTAAGTAACTAGATANAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCNTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCCTGCGCTCA C0F%5D1#:!D;)D-#>;'D8.DB$+-!-4((<'$.=.9D#.%;2$51G6E8G(<@H7A#%:::@9%.F!#42F&0":668!E$93D9:;<@)1,?<=)C3%#<<7;),H AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:14^A1G29G55T8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6792 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34845 42 40M = 35029 295 AAGTATGTGGTTACATCAAAACAANTCCCATACATAAGTG 2C(*B)5C5<(G"?-D:&4!!E58FC8D#!=;/CH'$(D4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T10T4 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6793 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7240 42 82M = 7340 171 GGATGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAG H@D&3H#>*F+1"552*%D6+4EF?2+5#@7?+=:/B$;,7?3.6%%H.H6")(=3?C&=.$#3!4,6=":0E'6C),.-,* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6793 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7340 42 71M = 7240 -171 ACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGANGTGGGATCAGC ,$H%3&<#HE%<*%E+$"4",8"+2&:#E9/8#D7=;CD*B6,AB$103&>G+"52&*G9%B(/<<33D?E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32613 42 91M = 32390 -314 AAAGGCGTAAATTTCTTTCGTNCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCT H:@C788!H?-=@?-.+&*>7CC<4G>-2<<6B*913),;$G@6+1BA3!4D0A;8B"*9@F.4B1D5E,+!;G:/:%G0?F5-B)D1!@* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C69 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r6794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32390 42 223M = 32613 314 CCGTGATTTCTCTGCCNTCGCGTATTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGANTACGGTCCTTGCGGTNAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTACTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCAACCACCGGAACGATGCCCTTCTGCTTACCAGG ''05-'+>5@@40'1%G5#:)@%DH4<-'3-<196$:-9&-&D:)A+-"$E833!4;1F:(=$0.D.H,=1+H*EG=;65F66"?$3%F<%=)8H=6&6G'2%0H9(@2-&!5@/+B;(4'@'4#ECGB>7>47@2%!"66@#$GG,C+;%4+E:%D5%#!6/C#4%6-"D"3DD?B)F"-7!2/(H==B"58H<>:A':.B AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:16T5A0G56T15A29G63C17A9T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6795 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17041 42 98M = 16762 -377 CTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGNTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAA "($%('%"%*"(#""'&%$#%"*+"*)%"*#%!+&)**+"$('%""'+'*#()"'!$!%$()'+"!+$"(+"(%#*$%")*!+$+*$+*+!#""$%+$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T30 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r6795 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16762 42 96M8D175M = 17041 377 ACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCNCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGAGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGNCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTNAAATCACG >B7&5:?;#!)=;-(%?G*=,A,;D>G2&,.53?8677AB:@*7<>CB.DCB3>*D>&H)FE)52=A$A?2-:!==3#%;@!H/'741:><;&>7*E,7G$+E.A&7!*<;?0;?A,@!'!2FG*A$HB383(8?*AH';@:-D7BCBC2E:$$E8602>,&7>E-A>(4?%H'&$1:069;7(,$=*6D13$/97F%!BFFCHD;G$/AC!D4?/&;-"#%?C/<#<6;'@8,5,%82?>70H><#F21-,'@!,3>6@<7C4=*!G#%@#/$5%%?4%>022>?H<%*=,)HC@71?DB=588H0--A6+5:"@8$E?6+@G1#5F,/;7!'$:$8#3:!C-:=:E.G+?&H)@*AF/A338H4?16=>55G<*5=-5G<,:EA'2C<$:<&8#7F(< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52T71G96C31 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6796 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17371 42 307M = 17118 -560 CACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCNGACGACGNCAGTGAGNGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACAAACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCTGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCCCCGTCGAGGATTGAGCTGACNCCGG &%'&*)%)"(*%(*#*#&'$+##$"*+**%%"*($''$%"(%%'(!$&$%$&("$#)#+*"%*(!!!%)%*&(+#'%"&)%$)*%%'""("%%'(+"$"('#*+(("$#+$$"$)'('%'&&%*!("%#(#+)'#+&+%'+#'(#!&(#&!+)"%*$+)+#*%#(%'+'"%("+)+!'"&+&+(&*&*$(+*$!'+'"&$&)$%$**&&"%#&)'&'(!!(+#!&%$%*!%(%%#+'*!"#*(*&($)%'+$*")!&'#!#%$##)(!(&!$%('+'*%'#*#&(&''"($+*!*$($)%#(*))$+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:113G7G7C35T45G69A20G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6797 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21479 42 217M = 21696 393 NATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGNGGTTTAAGGNTGAACAGTTCTGGCTGGACTCAGTATGGAACAGCAACCACTACAGGAAGTTTAT (%E,D51791D!+<9$)@;?D74)E!35(?G!B68=E!::8=F$81/'&39/AA8'!;H5D<,;6$&AH1E.;3?5'%*@:2"!FAA5C$>ED?88?#2@<:26<-C$7/1"E:&0A,?8$2/$9;)'D-$)@(!"-9D*)3?%?ADE<((F;9&#<3,?549$-:45.!DB:883D-G%,?71G*,;#*"A)%%!G@H:9.A(">>A+>B# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G151T9A18G20T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6797 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21696 42 176M = 21479 -393 CCACAGGTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTC +(&%D0E8G->&H7)%73A2;%B'*4,@"#=+>%$.?8@;@:,9908"!@6:<,<5.>=F668E?A7C,(60;@>*AC7G@CBH&=$:+>>1&.1&:/?B-+C>9E&/*@$=@)E7?93*'1#&*5..%H+1EE/'3D68.%5596@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A73A23C45 YT:Z:UP jpayne@0: r6798 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23842 0 * = 23842 0 AGNATNAANNANANTGTTCTTACNTTNTNNNNGAANGNNTTCTNANTNNAGCGAANNNATTCACGG *(")(&()%#"$"&*'%(*&%!$!!###%)!!"*"!#%&%&(*&%$""!(#)$$$#'!+!'*+%%" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6799 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38803 24 79M = 48368 9699 AATTNGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCNTTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAAC *+(#""!!+((##$"%)%++(%"+$)!%))!'!(!(*%"!##*)'##('))"'$"#"%&(++($)(!&+')%"&#*'(& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T3C43A30 YS:i:-40 YT:Z:DP jpayne@0: r6799 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48368 24 128M7I6M = 38803 -9699 TNCANNTNAANTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATAATTTGACGTGGTTTGATCGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGAC *!'("$!$)#!++!(*("%)+%*$'*(()$)$&"#*#%+%$**#'*$%#'%('*()$((%#%)*($%$$((+(*$!%'$'*!(#&"))'+#(#%##$"'&&'""!"'%*(#%(""+**&&!)()'+*&+)%(*&!#(#&#% AS:i:-40 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:16 MD:Z:1G2G0A1C2T27T17G55T18T2 YS:i:-4 YT:Z:DP jpayne@0: r6800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42990 42 85M = 43136 230 GAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCT *40??.!8;%@HF;>/<*=-(8;=AC&*AF".;@:".&,%;1+?#94:*/).40#="$*.@EAB(2D:!+10D57C%,46(65GF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43136 42 84M = 42990 -230 GTCAGAAAATACGTTGATGATAAANACGGGAAAATGCACNCCATCGTCAACNACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGNGTGAA '%#!#$)#'(%'&+*!()#$)$&*())&&%&+)&*)""&!*##%&'!#'*!(+%")(!$!$))((%&+')!#%'&+!#)#$+#( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24G14G11G26A5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6801 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25716 42 484M = 25658 -542 CTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGNTCATCGAATAAAACTAANGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATNTTTCTGGATATTGTCNTAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGCTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCAGCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTAATACAACCAATAANTGCTGAAATGAATTCTAAGCGNAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCCAG 1@:(-6D,.A/?F7?+5&55:!)'-D7;-25D3:F=8B:4+ACEC-ABF&&0+G70H*3.01H,E!=CF0CE$+96/):G7(9'$;7D(!4968+%4F?H*;.?+D%!@;A=?G63A*&.H2!C+9(23.G!).-B;(@/@F>.=%*%(C6"E:%;?E*4(97966#3%03D50'>-?7&D9A,-HA+=HH%!-?H4G'1!,(D>/>27!H:D)<&&F3G!*0(GH/>:9+0":$%1':H>-9(2&DB1':C31EC+6<7)?7(.+)*!3&HG%H'3C"1!%( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:82T17T79A15A43G67T55C13A21G80A0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6801 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25658 42 58M = 25716 542 CACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTG /3D62E'427@D7C0H*7?:%+(*E==-=A/#159=&/#B(>(9F:;3<=4E1'B7!< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6802 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8493 42 47M = 8754 309 CGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGNGCTGCAGCATCAACTGAGGAT ABBCA;*63+B*41G=<>B66&C$<7C7H@,3HH;<>AD$"4H9+0( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6802 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8754 42 48M = 8493 -309 TGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCC 4%$@,1=C76&+&C;?8=9"-'/(!$FH>39G.=22?B0!9-:+5&'@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6803 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37310 42 140M = 37211 -239 ACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCGGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTNCTCAGGGTCAACGAGAATTAACANT 2%)(9%?GB&43G1*>5@:&0B)G:?E?'0<7;9)DDG+9?(;4C2$8&;51&")45@A"6H0$+9+$#?.A@A),-6:E6<8HD#A<2"-G2F5(((%;0;7>=+1581EG$+CH1ECC.E>(A3*,5D-68G4%1=!' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:81T32G23T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6803 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37211 42 72M = 37310 239 GAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAAC $+)!%$(")!!)&#%%(#($#%"$%+&+&''!#"!+&*')#*'++")"$%&!(&(%&&$%$)'#"&$'"%!! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C71 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6804 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2729 42 318M = 3047 492 GTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACTCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCG <(&6'6+0*H5?0D=)GD+C3&)>(79H=9'7A@C33;*;?98@'18&/(H2#/1B,H0=#FD'0:5@<@/&B/%75C%!G0!74)H%7+#"1=&%,?B14/FH!F(BH1=6.<<0CB9)>FA"1C+9+;(=9E<5.@7<)/1?;B&*7,-("1&C(/D.13!3BFC@&H!C,=@0B"H2%C(&4EG!9D9A?,?7.C"E96A?::7H.:(H>9B58EGF&D#''67=F=#C-*=@GGD.>*, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:224C93 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6804 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3047 42 174M = 2729 -492 CCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGTCGAGGATGACTGCTGCTGCATGGACCTTT +'!)&&%")*+%"#+*"+&%"*%#%++&!''!!+"%$")%+&$!")+&$!"!$'%&"**"+"&&$$'$*#%'!"(")&(!$)!*&(#+#*+&#%%'(*$&'$"!(%#&%'(#!#$($*!"&$%*'!%+'(+!!(**"*$#'$&"("'(("'$#"+$*'&""+#++*$&%$!%'! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:144C21T3G2G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6805 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33468 42 147M = 33468 0 TGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTA +)+#+"(+'#(#&#'"#&"&"*#%$%%("+#%!%"!+%$&)'*)+&+$')"$%#'&#%#*+*(&!+(#&&(#+$"&%"&+%$'#'$!&$")(#+')')((!('!&((*&$#*(%$+!!#+**!'#!#&(&+%()"#%&))'$%&+(# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123T23 YT:Z:UP jpayne@0: r6805 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33468 0 * = 33468 0 TANTTCNTGATNTGNTAANCNNGNTNGNNNNNGANGANCANNNNNNCGTANNTNTGANAAANNNNNATNCNNANANTNGNGTGNNATNNCTCNAATNNNNNGGNGNTANTCNNNNANNANGAGGNANNCCAA $$"###"#$"!$!""$$"!$#!""#!$"!$!$"$#!$$"!$!!!!!!#!$#"$$##$!#"$!!!"$"""$!"#!$!"!$!$""!#$!#"!$##""#!"!!#$"!"""""###!#"!#"$!"###"""!###$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6806 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22835 42 157M = 22992 315 ATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCAGATATCCAAATGAAGCCATAGNCATTTGTTATTTTGGCTCTGTC >F<,%+/>&H/EB<)DAD!&;&%'90C/87B8(:9)))57'AA5/**"";>-@+;#6+HH2'*)$H95E+3:H*8DH@C:A>0+D#(5/H0#@D.'E?*9$<)*2@%9?44&>AB1)6(>C6;#9.+G6A#-=&A&%E'84'9'A+<%A6A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112T21G22 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6806 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22992 42 12M1D145M = 22835 -315 AGCTGCATAACGCAAAAAATACATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCTTAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCACGCTTGGCTGTATAGTGNA !#)'#)#+&&**!)!($$&'%*&*'$++"'*!"(*(($"*+%+(!%*%&("("")%&")'')(#%+*'(&+)+&'#!('!+"!&&+("($)!'!&$'#)$&!#&''"!$%('#(!(#(!"(+!'+(!'(+"+!)&!&"*'+"''*&%%#&$)"&!$( AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:12^C9T61A54A15C0A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3773 42 12M2I171M = 3568 -388 AAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACNGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACCGCTACTCCGTGTTTTAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGNGCTGCNTT *)#&)'#(")%*%$!('&$%(')#%()#&%&'+*&(*+&&"+*'"&)&('))+%%("#!#(**!(++'!('$%*"*+#($""+"*'%%%+)&"$(!&!&*%#+%'+$$$(("%#%+#!''&*&&"$)*)"$)!"#&%(!+)&!'((+')$+%#'$%++!&$++"%(")!"))&(%*!+%%$*"$$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:78T31G14G48A2A2T2 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3568 42 205M = 3773 388 NNTNNCGNNNCAANNGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGNCACGCTGCAGAACNCGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGNAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACANTCAGGAGNAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTG $!#$!((!)$(#*#%**'&((+!!+*($*'('#&*"%!$''&')++#&))&(%'$*)%&+)(##&!!*$#*+'%+"$'&(*#&$'()!"((#+!)'$$+(*!+#+$&"')!(#*!&$+%()&)&##"$'"(!(!&$%$(%##%)*+#+"($*####!&&!"*%("%'#*#"+(#))'*#%*"%'(++#(!#%+*($!%!)((#"& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0A0C1C0G2G0T0G3A0T37A13A21T43C33G7C30 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6251 42 41M = 6360 227 CTATCTCTCACAAATTCCGGTACTGGTAAACATGGCGCTGT )&%))+'$%&%%))!+$**!$!+"$!$)&#%""&%%*+##& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6808 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6360 42 64M2I54M = 6251 -227 GGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGA ?%5(2'/#1FE&+73?A-.E4%F('6AA6*4H+6F9.@6&$$G";D65*F@$#+H7%&AE6>,E/!+'26>51?:&.%<FB;%(:%,A."1HC!>?FCF35>9D&8B4)>GD4%>"= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:118 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6809 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1233 42 89M = 1322 268 GCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTC 4=@==)+81:>2)52)-;G(72**01(17'EHA8.,2G;4,0EH/D"B2G'>H'4G3@EB.$53,&.9D$*)?:G;,$<#B1,C(<5.>;%HB#,G1/G'F7/G#F;G/-%'$H8%=D!9;($6%A"72A%3G'.%'"@)* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G176G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6810 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18836 42 244M = 18706 -374 ATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGANTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGNGTGGTCTGAGTGTGTTACAGNGGTGCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGCACGATGCCTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCNGTGCNGAAGGTGGACATGGTACGTNTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAAC GE!'!.G&/!21#&H)E11!#4(,<8553GC$2A+/;=?.$E3E(5HDH2@+*+-8DA8G)&/?"238=<=/2(GD9CH%9+8+CEBD'G+(H298<;;H6?@.)D%5*8CB4!'1(G75:F!378/=>=1CF)*#0;)@02&A)0+G.%A0&2B7B41)&9'7?#(#8F*&A$2H(;%3>2?=DB!&/5-A8:: AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:33T24C20A3T41A7G58C4G19T26 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6810 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18706 42 130M = 18836 374 NTTTANAANGGCNTGGCGAACNAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTANTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGT !)))%"!&**%'("')%*%"()+'*(($#"(*+"!'(+&$!&!"+"&)'(!('()*+*#+%(#+&#))+!$$#+%+$("%"%%$)**!&$"&+!(+##&(")(****)(&")''""')+#!'+!"&$'&) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A4T0G1T3G0C7G24T83 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21760 42 100M = 21860 317 CCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCAT %<5,&-H865$C-=",<9A"#FD<"!>2?#B.!5A+CA1A'#;$?(<,F,7E1%2$0#8!!6-: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6811 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21860 42 217M = 21760 -317 GCNCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGNATATATTCCGCCNCA /AAB0-;%""?,?';@&0$#+D6+>ABB?A&02-()18;)A(23HC<>A@)H"D26.B6F#%*@C0(B=%%9$AB,.D0ABH5'6)>4%A-)(# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2C198C12T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6812 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6601 42 109M = 6803 248 NCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAG !<2HCA($0'4="G/198%D6C@*,D@>1./-!B%")A"C35%@3C68G&:"&E2.#1DCDF:3346'9(?186:A&0-)@(D@2@.D>*9&<(?1BEHAE7:F+#*D! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G108 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6812 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6803 42 46M = 6601 -248 TTCTTATTNCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCG ?D(22;6'.#;B!)D&8?*,90:,"F$>)3C,.? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C3A3C12A24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6813 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26208 42 74M = 25930 -352 TAGGAGGAGTAAAANGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAANATATCCCTCTGGGATTCTN ::8:!)H:1:C,=9"732":B1=-813=.F"<'F'-'6F1& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14G39A8T9T0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6813 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25930 42 194M = 26208 352 TTTAACATNGTCTACTTGNAACNCTGNGTCAATATGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATNCTAAGCGGAGATCGC )%"'")$$"$(%!)%*'*!%")##()$*%*(&&)!)++)!("++&(*"#&"$$#!"%)($'%+&+%("!%(#(&&'(+*%%"$!$&%++'$!&!+#"$)+*($''$)++(*#(!"'!(+($$%&*!+)(%$"'#$$%&')($(($(())$)"%"#(%+!**'(!"&(&+('%"*$''*)*"*%+%$"'&!'&#& AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:4T3C3C5A1T1T0G2G0T3T2C143T15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6814 77 * 0 0 * * 0 0 NCAGNNCGGCCACCACGGCAAATCACTTTGCACCTGCAGCC "*%$""#"$&'*#&+)(#'+"&%'("'))"$#!$&++!$'( YT:Z:UP jpayne@0: r6814 141 * 0 0 * * 0 0 NNACNGNNGNNGTANAGNCCTNNNCNNNNNNTTNNTAANGCNTNTNNNCNNANNGNTAGGTNCTNGNNN #!"$"#"!$!"!"##$!""!##!!!!!!"$$$!"!$$#"""!$#$#!!$#"!$!"#"!"$"$###$!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6815 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4500 42 130M = 4413 -217 GGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACG ?-):6-.88=4?9)/B8>!H.G2427(0F%,5>8BA*C7!=0<3+C?C'=@4D6%#/8G0&3F-,'0.9"5B"E,E*>8?(?-D+0F>'$BBH-BG%$?@/71C0;7*3AC'<(6H%30&27?%'%; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:130 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6815 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4413 42 87M = 4500 217 GAAGAGTGACAGCAGAGCTCCGTAATCGCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATNCGC E,+?+1B*,+5.'=H$/%)@B6)+=GG*?5.-+%=A8BGA03'C)H+8(<5H1@8;0E;@3:8@$2.917;)G>) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G7T55G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6816 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23159 42 101M = 23159 0 CTNTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTNAGGAATTATTTTATCGTCATATTGTATCATGNTAATTGNCTAT +#%))'&('*)$''$&%!)&)$*"#('(%'+%()'%&"$$*%'+*#()%'&+("'&"&"+)!"#&!'&)$%)(##$"&*(+)#!!)($+!)!+")#)%%&' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G54C14T16C3A2A1A2 YT:Z:UP jpayne@0: r6816 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23159 0 * = 23159 0 NTNNNTNNANNNNGATNNCCCNTNCANTNCNNNNNNAANGNAGNNNCNGANAGNGNGNCNGG "#!#"##""!!!$#!$#!!!"!#!$#""$"$"##!!$$#$!$""!$"$!####"#""!$"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6817 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16883 40 115M = 16752 -246 AGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGGAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGGCGTGTCCTGGCGGT +&%&(*$&%&$'$&)#%#'&"#%%+)))*()"*#('%$!"!&((*'$#(((*(%$*''*(*+')'**")!(!$!)#%#(!&'%"!)"!!"'$+(*!(+)#"###*$%+**"!&+) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24C75T5G8 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r6817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16752 40 106M8D17M = 16883 246 TGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGTACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGC 7',#4$$E)(F(8,?@#?7#B.3/60-'/693AA+(E@4;46CF;AE,1%*(,);1'#C+&'0=(#D<7%+<17;4A'C5/(A#3)?)192:H"$C&BC1D0=,+#% AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:9 MD:Z:83C22^ATTAAAAC17 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6818 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38648 42 57M = 38489 -216 TTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAA 5>G;=.A4C*2C%C7H'G8F9)5*C$<%6G/?;)C6E)*#$A!7123"7'?G13C<9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6818 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38489 42 152M = 38648 216 AAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGNTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGNCATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAANCGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAANTCCA 5(:AACH"1G"5CF,95A&D1-@(0%:@!$!+D''>E3D+-5D0$H<1)7'H*))6''8A9C(/>F2C='A/;E"4"1=D?7$+%4>#EEC;0,<<+F,4,:EB*>C:B+9/E,C9> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C33A48A30A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46170 42 61M = 46306 181 ACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGNCGCTG 5-H20.*H78?7"B!@!*+)A'E!D6C1:=+:@B83)?'E-0&<-91H,<#+H&?C@=>?H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46306 42 45M = 46170 -181 CAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCA 0+F708E"$*=>2@2F-A%&!@C?G-5E05'5+15>,D1./%77! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6820 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9799 42 64M = 9573 -290 CCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACNGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGA E"FAFFG-A401*A$)& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4C13A74G0T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14455 42 68M = 14200 -323 TCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTAATANC +(')('*&%(#()!)#!!%+")+'*)"(($!'#+'#")!(*&*+')&&"!$*+*$*+%$'!(+$!)!$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63T0C1T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6821 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14200 42 197M = 14455 323 TCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGNCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTNCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTG A><*)%80DG"H"H&F/4CD'-D(&F)7;'A5:#D6;-128$'&H4B@('"($;4D&/8-&*66$"'<63@+56!:):.''8#F>73A%7.''$-$35:4%0,@D33 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:124G28G43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6822 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37585 42 153M = 37780 281 NGCTNNGNTNAGNNTGTCCCNGCNTGAGCATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCANCGCTAACTTTGAGAATT !)*(&#&'#!$%$)!$&')$$"+'*#$(+%!$$"(+!+%('""!$)($*&&*&*"!"!++!%(+!**)++($%#")"+&++'($($#)*!%))%(*$*'++#"#""+)#+!#"#()#'"$'"+&&$*&%*!("'((#!#!+'"'#'#+$&($% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0A3C0A1G1G2A0A0C0A4T2C3A107A17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6822 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37780 42 86M = 37585 -281 CCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTNNCTGCGACAGATTCCTGGGATANGCCAAGTTCATTTTTCTT A/AG57F<.+7+0@-@19HB@&:<813(5"%;?*CB0,H,B(76=";91)%)%GE@,7*!'-6G/-FE?,DG&=4"-#=3HD('!0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G0T21A18 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6823 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12910 42 79M = 12710 -279 TGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGG !D=57(@5E3-G@<=1!3)*;>"%:!H7B:$&8G"#32?!=507A)FF:5&89*.F@&8&F%@,%#>$'0$*84>03A4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6823 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12710 42 45M = 12910 279 CACTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCNGAGGATT ('#G*C.!4B+*=?87B'".A&GC$:4/@%!961&%6"4#+H/@93C39D! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6824 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3171 42 43M = 2969 -245 AGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATT 0E.:,(C6=7-(*1BG/=$0=008&/D8'(8<-=A(D,7@3%F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48059 42 71M = 48157 251 NTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAAT !;2H>C/8<=HAG+.:%(;@>#AA>?9,,>261GC@&8)H0-DE($G<.@&;E+#@4()536&G:%6DD:! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6825 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48157 42 153M = 48059 -251 TAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTT 7'$.+);@;CH60%.7=CF!G5%*'/A!D4E,#/*#'0:$1&5G15!!22!??;#( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6826 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40742 23 76M4D22M = 40742 0 AGCAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGNAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCNTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCT 89H>(24C:!A$'H(6;D%88B'#6)2$:'0GA:=?**1EC%3*4'@4780$C"<*D)97;B*F43H431+<-AH'!C(2'(#@):E8*@$*6523!@ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:2T39G31G1^CAGG22 YT:Z:UP jpayne@0: r6826 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40742 0 * = 40742 0 GNNGATAATNGCNNTNNTCNTAANNAANCGTAGNAGGNCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAA %"$$&&&'%""!!"**!)"!(('('%$'#*#"*!+!$")&(#('')$(*&(+$+"+(&++%)"("+$+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6827 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27126 42 64M = 26912 -278 AGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTTATGTTGCATGNTGCACTGTTTATACCA @69?$:@$*4"4&,B>**@B,H,AB+E>:88/GA9H=?49F'6C"--A2=?63F"4A?/0B,FD AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C10G16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6827 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26912 42 214M = 27126 278 GCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTNCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCGAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTT 87#4%0:#4@3!A;6A-'7H!5>5*?6AA?,!836!0::)E8;>522EE:/>/<(&G=@9;(E925C,)@!?.:+D>4>)@E)/F%$"#;#%B""B$.@';CC'A>::6AH(>!7H--,6!>FC710(FA+<@01:)A2?D.H4#7CD(G0&3?(H;#%AED36?F>D=CA#E@(4?6&A>$C-?F#-9!8+2?>F?:%:'6EF*1&$/@,)>GA3<<15$!"BD--%"#D0;5CH<7=14(A8!$*;-BA3?G15617#,"'%?4>4:AF/?4(/>2"<DD;1.+/&B%$&H(HF,#%F5;!(1,?=&-E).$?;1=6C4(!$:!:AH-";#*A$<251E:;-2*:&4--:A@5=H5(D9A$4/HA5."@#4'6" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:8T45C41A45T51A17G23T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6828 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27645 42 188M = 27833 425 ACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCANTGCTTATCAAATTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTC B@#:H87'A8=/872-@4'5()#>8E/,=.46C9-+8A$E-51*(*/)'"0G>B3+EB'0?"$57G?EDF/C11*BDD&!D#8784#?5#D=A/#<:C5&-$0C;C4E(=F*AB9H#.H7C+*0'2A>/++GED46@C3""/AHF>=4HA'"5"!##@(,&<:++9#79+0E*.4B2>)91($3'/(; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:114T10T19A42 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6829 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48082 42 54M = 47857 -279 CTGTTCGGNGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGT E*:'+1FAA='H/1+4EH*B")>F!9).$-(;.%H"2CB+DB<*=;-DB:4D(? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6829 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47857 42 84M = 48082 279 GGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGA &)+D&=A;&37?7)@@/<%+0+=1@)9&7.-89%+.!9;1$75B-303!$?F#%?<>HD:4!%)"('H>D2B?#3ED*$&7E7%,A17.5C&($;9>',$G>G8117:A+$3692(>)70F,0&9$AGB*G2:C11!'!'4.*4/0A7D>2E2:+D5;?>8)<-*>)4(F@:6D;8:5@71!F-09)/$B*C"6:#1/5+%5$0"EB9>*'%,!7**=?H)D9%A87!9,?55$3%DB#GB+.,G$$5DD'C!3#"44D$H'%<%9/=4),"1"+$D29.6:B>?'DB"F('1-B-AE1B;?7$? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42A35G120T38 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9863 40 116M = 10039 223 NCTCATNATANGCGGCTGGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGNCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGACCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTA %#!*))$$"%(&*)*'(!&$%)"%(+*%%(%#*"+&+%&+(*%$)"&!%%&$#!%&!!#*#+!%!+&)##+$&+&+"("'(%%&(#(+$'+'+(&#")"&($'%"()#"*(+*""+ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0C0G0C3C1G1A0C4G0C24G30T42 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6831 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10039 40 47M = 9863 -223 TGTTTGAGTTTGTAGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGCGGACGCC 224)@#1"H(@C@?8'?905&)27/6050:*8G)4+@,F&+#5"H(+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A9G25A7 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6832 77 * 0 0 * * 0 0 TTATAGAAACGTCCTATTTGAAATCAAGAGAAATCNCATTTCAGCA :?(-138?'.B39A%>61+'+<=1853E>-;@#5-@H0>$!(7:+# YT:Z:UP jpayne@0: r6832 141 * 0 0 * * 0 0 ATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGNAAGATTTGTGTAGNGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACT +**&(###)+#""%%%!&)#&(+#$*!!'$"$)(($('!%$%!"%(('&%'&&!(**+)#*(!""($&%$'&$!")#!&"+("%((!&'!'!&!+#*###(!$$$'#(#$*&!")'"$!+(+*!*$")!(!'%!*''(%!("+&*"%$(#('!&*")$#%"%+)+*+)! YT:Z:UP jpayne@0: r6833 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47830 42 141M = 48003 259 TNNGGGANTTNCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAACCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAAC )&"%%*)"%*"+#')$""*&(!+$&#&)$$'###!'*"&!$#+!%$#$&*!!"+!++$#%*+"(#%+%*)&&*)##!))')$&#%*!!"")%'#(()"()+$!+!!!%(!((%#)''&(*)('*&&*)$$*"&"$+)!)!) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G0T0T1T1A2G29G22G77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6833 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48003 42 86M = 47830 -259 TGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCG 1/370:".:B!2$=F%"@!!GFF0#;12#+$<64=3.-A>6,.@G%G4'-*C6;)(20E<36<>G,*@<-C%'E09,<#4&$$D&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6834 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9390 42 101M = 9604 309 GTGNGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCANGANCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCAC (DH1-35#/B;;,*H#&(E3"30HB@&/53!H@1F!G,(,/:12%9&++B44,,7+*)5;,1C8B#%+B0G3B0EE55-5-B8>;"8:G,!;?#;%1+'GA AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G51T2C42 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6834 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9604 42 95M = 9390 -309 ACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGNTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCNGCNNNAGNTAGTCC %*#*&"!&)!#+&#$&%+$$$*"'&)$&#'!*#&*'$)&'#+("+&'!&(%!%('&!*"(&"%+$%*!&(%""&)&&''+!"$%!")$&#)#%&' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:48G31A0C1G0C0C2T2A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6835 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22181 42 52M = 21965 -268 ACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTAT ")5A!5G3;?F12?2:1B/93G"1,7@.38-.!5A/D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6835 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21965 42 140M = 22181 268 CTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGNATATATTCCGCCTCATAACGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGAT 8:%!!:87,G*D-?*-6=0-?9C76$?@1BA17"G&3&'0994;9$&!.-16#$=<$E1475*"@/'!+>7B666&:-'8>@A;,63=9636!BC*EB3'=##1!($//E%<93,7H$;G0*(15@/5;%C5H41C&"4&"(6+&'576%'(2;7D&)5*B7,"7';%>$8:A3#"(:(90F?#B=4(?(3"7.4-1-4H(G=H.(?1#4+%BF'&C"?5C'1*"7#+)F*G7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124G42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6836 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14013 42 59M = 13779 -293 GCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGNNCC &&!*'+)$+%*%#*)%!*)*(%%'!&'#!+('#!*%)*"'*#"$)!'$&"%$*!#+)'* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55T0T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6837 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30823 42 22M2D285M = 31132 396 AATGTCATCGACGTTTTTATCCANACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCNATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCA 7-$H519'G".=?9&-,;3>/*#$0&/!%(:AF5.?@627D6??8:5D:6/365":/./07F1>(@"!&D=G3A>!&3>0#=A,A.5279#1878!G/%-+-4?1F2%'8>*(2"114!)%6D>-5C3)E0>*<:CEFH8=(GH$!*;<9>7C:G!-*%"4HCG?7A=EAC:?-+FEG?5% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:22^GG1A91C191 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6837 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31132 42 87M = 30823 -396 ATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTNA 36D##3'2*.35F*.@8E;HB3?((+-5(H03(1,;*#E!4!><*$0B.(=3<047$<+%.#?,".C1280D4/H>85E&GC-1H39"7>F@G9*D)7A,,D"/C,$@9)0?"!?C%->0<0D+F=#,(CD"0(%7C#9''21"5<4D@):':9)9#&5,F1,&+)$"F()9+:)9$"()@@A!5"2?>>B&<:8D4=#!,'1#3-A>E!%&<9794F1/%9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75G53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6839 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46519 42 188M = 46707 317 GAGCAATCGANTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCATCTGCCCANTTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATC %+#%$##!#**&+''''++%&%!+(+*!$$**!""%%$&%%*(!"%(+%#()$''#%)#('!"''!*&%")''+*()#*$++'"#()#'"+(%&#+)#!#%#!%'(#&*%(&+#""&##"%*%$$"$")#)$(*&$+*%*#(#+$&'#+#$%&&(")!%#'+!+")("&$"*'!&%(#*)$)$+"('% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8C1T77T8A90 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42401 40 73M = 42574 231 CCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCNACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGC G4=43:A2+4:4-BG%#8@+0FA+AH)'/#DA;F#2;>!$)6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T1A34 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42574 40 58M = 42401 -231 CGGAAAAAGCACCAGAGAAGAAACNACGACGAAAGNAGCAGAAACAGAAAGATAAAGT 5!C18*E%C'.7D>>@$A?58#F):G1GF)";/FG;7F/>G6'?<=9AGG!F.%)?H0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11G12G7G2G20C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37802 42 92M = 37961 218 CTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGT C"#9B5;>('?=$FA28$/9'"8;39:*?1<&$8+((,A&<1),?GD.+BG5;1@>?<4-+00'/6G=/H:4=GF0-<4<#H@.333:F/%# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6841 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37961 42 59M = 37802 -218 AGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGNNATAANG (+&*")("'#$(("&'%)&+%*('#&&"()'*""%&&$$)&)%!($)+"*+'")'*(!" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:49T1A0T1A0T0G0G0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14257 42 45M = 13969 -333 AGCCGGAGGCTATTTCCGTANGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGC "%)$#()''$+$()'&%#'(+')(&""$)!+!&#)'#('$("(+$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T24 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6842 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13969 42 8M3D277M = 14257 333 GAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCANCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCNGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTG B&1@=*"'3@:$!B#'@A4A4<>0;4$F7>H&$D.>4*'5;B*C" (D;>%6&!935H?&7EEE>F(F=+6$46)F1)C3%&GC"3(D.*G!&'(G<1=(.*+6F%,.D;F..;C*F..(0%)!D8>)F/>2F8-:=."&;4+"3BA?/G+7'%&E>0A$.4)BD<&B68%0&%$##)=9"(('6C(8-,9('%G* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:8^TTA33G156G86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12651 42 118M = 12484 -285 ATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGNTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTGAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCG @@9!@!"$?"+=(1)9@FH@2!.A-+E7*4/F"3#+0-@?"9=)3:/:!3B3+34-'G*35A":)5G1)'2:G7BA5G5-EBF!F'(0E:>33 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22C40C2G51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6843 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12484 42 95M = 12651 285 TGTCGCAGGTAAAATGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACNGGCGCAGC 3>)G+7&"9ACEA,'7%=DH"@280<9,CC%F4#+6/(@04+)4AH:1C)H"H#+&%574! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A71T8 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6844 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37393 42 58M = 37543 242 GNNATGCNGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTC &!#($*%"($+&"**+&'!+!+&(+*')!!))##$()'%"()"*$"%+&$%$&'!('# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C0T4A50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6844 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37543 42 92M = 37393 -242 GTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCNGCCTGAACACGAGAAAAAACAGGGTACTC G<2*&C!7+530;.)0HEDA:8-E6/)G1!=?E'1(A@3??!2:>;F2=1H('DH1+?2,FC+,643G08.A--)C8#-/%;8#8+?'-:G- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T9T19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6845 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6816 42 121M2I56M = 6993 445 CTTGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGNAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGC G(0;-B5D&5?5:4!58?/D3.?<--C+5*&4%<"+8?<:,$5&64'#*'>1,=?<@((DB3"E?EH5,4:,14:&0(69'!B2H.#!%E)9=;,8@7$DC+%5B28D29.3?8)09?50!=E<<""!#3GA5?"?DA+F!C/1,4D9A(4<"(63C,03F50;8,=#/-''H2*5,?< AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:2G5A17C150 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6845 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6993 42 268M = 6816 -445 TGCANTCAGGATGCGGACGCTCAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACNCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTNATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGNTGAACTGATTGCCCNTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGA @AH(9/)CB'*":H,@%0$$G3,%E=?"G:%CBG+A+D<3B?2GHA3@>,)"=5,3+55+.A183DG$/%4(-5"*41B+F8=G%-/4=F@FH;+6?!."4)"E@D.1467@>-3C2).30(.E7&9G>**/&$F(*)#:1*!5.B06,C.5E8.-$39)A%BE5A8C0:<@-.!9.:)A=)CG.-0:,-(16A"'((%9@-=:.#.!.".7BC2A31>(<$.? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4T15A33C111A52A14G33 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6846 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28445 42 62M = 28127 -380 TGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTNTGTATCCATTGAGCATTG H012:2:-B*->51,%@,3?A+8GG0'F;D6)A+HF?#F><3/%1<6-C*),*>%++B-7B' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6846 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28127 42 318M = 28445 380 TCCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTTTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATAGCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAGCTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTAAG @!)6F*=C4D'EE2*1H766@HG716D6:F>=*1=7B5+E,F"67:54;%?FDH+B$93$!0(C4G';)F@:48;>FC+?&9F3!8<):?,+#+/)3A4#%6D8>&",G>,F4C@,",!%")6#4;$7&:>")0@20=/7(E.<9%" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:28T24C0C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6847 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23360 40 60M = 23574 269 GAAGNTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATNG (&#"#++)"&))'()"&)%"#!%(%$)!%*$&+)+*")!(*++#(&)!"')++#*)!"$& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T0T0G53A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6848 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21951 42 172M = 22123 217 ACNNNATAGTGANGTTTGCATCATGGCATTCAGGATGAGTGNACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTNGTCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATT %#""'')$)%))#)*#**&"*#+"'&$*%+#!+"&%&&+!!&%!!'#&(*%(%"$+!!'*)"!)'""*$#'%(&!)$(+)**#!&&*&++*)%+%+)&(+$+'""$'&')'(!&%&&)%!+)$'&&#%%!*)!$&+!!(*$)*&!!"&+%("+!#*$&%##!%&#*)%"#!' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:2T0A0T2T4G1C6A11A7A33G1C94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6848 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22123 42 45M = 21951 -217 CCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGG -FD7+&#?;D2@;8$)'(<,@-C7?)66C53-E8>!=#.<(/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4705 42 42M = 4528 -219 GGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCAT 67G,?5=5D/2?;09%C1;-13'=B,%HA=H%5;.2"- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4528 42 67M = 4705 219 GGTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGTGGTGNCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCG )"*+$#*)&!##+*()%%"(!'!$"*+%'$("'$")'*$++"'+''"&#&&%&#*&#!**)*!''#' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C24C4T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6850 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33019 42 125M = 32919 -225 CCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTNCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATAT 658>#=7+#E9.(%72>=*8*:A/2603=-%A'@5(#%>5>*4B4GE?46@<4'94491*+2(821;B5'E+8EA&:9'C2GC&=4-C%'6334&@'59"F!>!<3+"964&*')/D;# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6850 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32919 42 80M = 33019 225 GCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTNGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAG =+A*DC3;'2!9HCA&8">-4@21=6%8A9,5G"FE=2H8/C')*=,D89HG:"%982=*D(",;=#C9/-223< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6851 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22586 42 150M = 22736 609 GTATGAAATAACGGTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAAC /BA=H>+0??-33&7A8?C564$:%D137G.(#)*(&/D6%%@*#4G:'%&$7)/-*'>D478:E.86-AA2>(G3?"*H.)<-1AA4$-EB!;AC6D0)E4B8#(6283?D3;&&>27858$+E.0D4?+<+5E&!8H;$*2>"*7B4/>2-0<(E&,.'!;>'$+BFC6>/"1.%9:*3F/,A87C@6)<8:;2D=FE6)7=5:7DF$<;7>*##3'$8!EDF*$D<,82-E7,?D8D1@;DG,'6%H"!+)HF(/FE&4:B.002)$4A0(13-",<>*0!3,$"F=-%F,5>%.2*06;%78"B-D9!$4$?BE;>(%%9E4%C-F41:A">G/1%!&>78H64D1G!H-@.75(5&6D0?@6!<61%(H9D0@.F0A%-1.E>#8.DG,=@C3)B20G%<:"9-'16*GG=8%-A+/'#;D*A50>?D<-77B>D14B44E&/;D/D:B4:')2F>B&F2;0/F,('&*85D:?"1*8"E,2!/9H;D8!!/.3F;7'@C%EHC AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:140C127^C150T39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47982 42 238M = 47877 -343 TGACAGAGCCAACNCGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCNGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAG 25B@=G526)22*1+&/1()>$(E??<*(E;%9A/$#:G/F(,@'%;*D""=;AA(@,$B"&++9>7>))58(A.@.84:92"$F0AE>66-D$E24G&*D?195C4.-":A2/7%&C...DEC?F2.:D(:@@2(8?H+@;H8H;;E&.B>+2,+B-3C72"B85//5-C>C,$/40.9H#-$,#";=$FCE-+#/7::C37-E+?'5??<>:93,&@#EH AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A175A48 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-42 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:15 MD:Z:160C20T181G51T8A49A13A12C103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6854 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47468 42 114M = 47649 240 TGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATA B8$$=!F*#/73)BHA@22.'G/)40#(@'6D?/*4<1E7=6H!./G14-#5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6854 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47649 42 59M = 47468 -240 GTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCT "H=+?D!0-4#1%H:9*"H!B$68$B>8G)E,##;?*@*89H>!#';9+??:7*=4,"8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6855 77 * 0 0 * * 0 0 NGATGGGGCGTCCCGACTGGCGTGCCATGCTTNCCGGGATGTCATCCACGGA "/+A6B&;>=%'>87*#27(=<#3C?&A5;>?>&,#;AB*.<%(&0+8418E YT:Z:UP jpayne@0: r6855 141 * 0 0 * * 0 0 GGACAGCTCCGGCNAGCCCTGCCGCTTTCTGCATCAGCANATCATCTTCAGGCTCTTCGTCAGCCTCGCGCCGGTTCAGCAGACTGAAATCCAGCGGATGCATATCCGGATCGCTGAAAAACAGGCTGANCACGGTGT +#'&+!+)))$!#!)*%+''"%)*($)**!(&'!&$"('#+%)*'))"&&+'+%$#'!&$&$$"&$)"*+#(!!'!)$+%'!#($#"#**!$$)+&$+)*(!+'""&%'#!#(#'%("#&)(&'&!+)+&(++%")') YT:Z:UP jpayne@0: r6856 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27639 42 41M = 27750 238 TGATTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAANTCT '%!#+*%&)'&%$(!)!'&&#%(&+#&*%%(#!&!'##("! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T34A3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6856 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27750 42 127M = 27639 -238 AAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCNACTCCCTTCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGNGT E-9;)(724B+8'+&71.$"&?"7949<056?;;&1%**2+=@@F=-"0C193F#,+<5F=89@7-?F'097?9!6F63.=+0(/7'C+*&!-F8;#6A-*B&:G!7*:6!%D+D'A2+%$1H'8&"(.H:57$BB(-"G!@++25:B/2""54F"!;9,@)#-CB*H=-+3,B3('>$8#"32GF>1:-C35)=)05D13- AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:208T0T30T45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6857 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31595 42 282M = 31877 568 CCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGCCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGACA '<$C<,H87C2(A;@:1B&0HC?8+=.$1=E6:/956*!!=D!0D7+!%4;43#!3""G>.#6?:0'*)@=><),92H3&%$/+%C%<>-/@$,A(#0D..8@/:%;=&4@G/ECGB6H"/;>C=2B(DD"-D3>3)!+H1+*0;>!!A=.3:2?:0?!C)$E5#:D6E;@@)B&.=5)-08H-A@+)"@B#%A>4">@:'F%B'26BG0:9%%2&#G,78/("G1%3>.1-.+DD6F)49#-3(:(;-7D@.6H*B.-1!G+F8*5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G225T2 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2604 42 68M = 2815 260 TACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCA 0=4'=0C-64@?)@=(!:6:C?#3?0*F>;?@"?=?(4+5&22D%G>:7;(76"A)<=E& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:55G13T17G5A21C69 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r6860 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39702 40 61M = 39702 0 NACGGTGTANCCATCCGGTNACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGA **(((')&!)&)'*$'#('&*+*+)%"%##!'#+&")#!*!+%*")##&"$)"*#&+!%'! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A7G0T0T2G2A2T41 YT:Z:UP jpayne@0: r6860 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39702 0 * = 39702 0 NNNNAGTCACGNATACTNNANTCCGNCCNCATNNTNCNTACNGCACNAGNGACNCGAGNNANNTTCGNCNTTGNC "$"""##$$!$!####$"!"#!###$"##$"#!"!"""$$$##!#"##$!##!"$!$###!#!#$$!#""!$"## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6861 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39171 42 4M1I117M = 39292 343 CTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGCATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACANCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTT -374=E73C?(+FA&.#B)?@94B<0?(4C+A.-9+A=F#)8@;2&"4)DED:6/':0&G0?8-5>A3CF7(..@56(3!+/$),614FF#F=H*,D3+$7B0%6CA,C$!H%'&)3F=;B16:G/E3@;/69$)/4G-38=%%'B1#C+39,!01B"H+)")%39"',4'-;,1D?3A4475$72H%+@=C;E@))">#(1/87?5>$6!7.>*0-?:'E4EA"FA=2?%C8 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:63A40C2G85A6A0A20 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r6862 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48313 42 139M = 48313 0 CCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTNAAGTNGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCANGCACGTTGTGATATGTAGA 6)3#%A>+$!)+84-5#6:,A,.A-78703D:)2A?9F,4!EBG!D8!=<$%E!'4C,6F=1;4@57B/802F!5&.)/(-E":#9'"#.'3/3;'%D=:G#":8E*.!32134B!.F;H;'3B));)$443!?#)79."0H;'E0HF2E9#7B,,0856)A/H/%:861&86&1'.2!/B?E%6.*:.B2C:/"-E;;8"D?%%.&#GG3EB!5C#G+2=*6!%:@>9@1(H*"7+8>+&H-/)<4/G9?"4FE'=G AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17A23G11T199C15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6863 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33807 42 143M = 33538 -412 TGGTGAGGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGNATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGNCCTCACACTGGAGGG EBF9G82"BG>'(-B89=,F90>/>%%#:"<+(5G"*'-F.*#4A,>G-?%G%"=4>**'1FG+=E72G)0/>B$(=F8-%/<8%30D*:5816:H,*4)F>/D"/D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A71T48C15 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6864 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33766 42 46M = 33567 -245 TATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTG ?'&+613DGE:-=$@=@"CB0:D#E!56&@G4@HDF+> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33567 42 48M = 33766 245 TCAAATATTCCTGATGTATNGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTA /#;2,9;;(?(%C(73+-*(&42H@)/=5$"121C'%:5'!;&;/110 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19C4T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6865 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4216 42 55M = 4049 -222 GTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCGAGGNGANNGANT &)+*#*)"%*(*)&#"&*%"("&)#!*$#!#'$'**&")#$+!$!&"(*!'*)!$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:42T1C1A2A0A2G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6865 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4049 42 84M = 4216 222 CCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCT -0C4&B*<+-+E-2*8!??.-G$6B-@DAF4$'A@6F#2E"C'0$#5%A(&.,>/.1;*E)1<"4!B++1.38F=)39-A:+"86C,19'!@"=+#6F7?@C@<$&:6<.*;3/C3B,AC9<5=A!'7((@8,E,'>$=3-+)?H?& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G109T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6867 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20190 42 72M = 20311 234 NCNGANACGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCNGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCG '%"%)%+*%"*&&)+!!%)''&&$")!#!*#)&!&+'('%%((%$#$*$%%#!#*'$"&#%!%"#)'%&#!# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1T2A0G40G24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6868 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10888 42 106M = 10888 0 GTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAA %5@F(@.'+$8.=77)'."F*4%7-%FA1FEB21G>3FC3?#890(?$@A#H;/)+8$*DD$=;B(=+C>&-4D#2#@91B%/F4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YT:Z:UP jpayne@0: r6868 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10888 0 * = 10888 0 NNCCNNCNNNNANTGGNNGCNCANAANNNNTNTATNNCCNTCNNGTNNTACNCCNNTGNTAAACGNACGNCNNANGTAGNGCNCANNANNTAGGAGGNGNNNCGNGCNNTTGNGNANNATNTANATCNNNTNNNCNTNCAACAGTGNNTANCGGNNGTNGACNNCNNCNTNGTGNGGATTCTCGTNNNNTNTNNGCNAANNT !$$#!#$##$!"!$$"#!$"!####"$$!!$#!##!#"""#$!!#"!#"#$!!!$"!#!!"!!$"!#$$"##"#""!$!$""!$#!"$#"!!$##!!!$!"#$#"$#$!"#$$###"#""#$$!#"###!###!!"!""#"$#"###$"!""!$!!$#$#"$#"#!###!!#!"#!$##"#!$!$$!"!!$!#""#!"!"!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6869 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43865 42 173M = 43865 0 TCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGC $HG*/4'<>"+(!CB?5E37BB01A#F-;?(*6$/'!E"=AGEE58#2D)6G#H+:&$"41&C<(AG1;02@E%+$-3"94>*&1<"?80/8(.->#FD$G(F/*G<74.GC(?6.F.%29H5+C:.8G0&/-'?)8E!&'1@&3474%CB8,E2G9%H2*(17"%"0$921B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:173 YT:Z:UP jpayne@0: r6869 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43865 0 * = 43865 0 CANNNCANCTTATTTCGCCNATANNGTNTGTNGNACTTNNGCCTGATAGTTGATAGCCT ''!)")"'"$"'%(*(#*(#&)"&"!($&($&$$&"%&!(%&&'+&()'%#)"&)&&*( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6870 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4916 42 67M = 4994 204 GCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCTCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCA ;.%0'55E*3-&$E0%!%F434,-.C>A2$E(C/&H,,8&6,!>#H-%C<:B(8;"G=%H#@.)8D'F=B75%:#A">=!C<7D'-1$/-(87<.AC#@4$))?&&8A<4,FD>$;2=0H2A$,6G>+;$=;G/&:"=0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90C35 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6871 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36960 42 52M = 37148 239 TTTTCANNGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGAT )&)")*!$+''($*+&!+%#+%&""!'(**+"&%+(%"(%**!&$)("#*&! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C2T0C44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6871 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37148 42 51M = 36960 -239 GGAGTNAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTNTNATNGG !"$$()"""))#!&'($++*)%()"#*$+%'$!'"('*+(!%+"*#&$#(( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5G37G1T2C0A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6872 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7877 42 43M = 7699 -221 GGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCT 408&@%('H7>F073#0A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6872 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7699 42 77M = 7877 221 ACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGG A0=#.(!;72!-**=@A0;876.+A-(A3?*E1"97->&1FA1..F?/5''@?>"6/H+$6HGG4CD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6873 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26212 42 44M = 26104 -152 AGGAGTAAAAGGATCACATGCACTAAACGAAACTGAGACAAGCA '.;1(?<)/BA!14>$#00D?'34:6?21B4<*';8=!9;E2B, AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A19A6G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6873 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26104 42 50M = 26212 152 GAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCAT =?(G>$@G$..)>5@5,+3.>8(#//%.&'&H2?6!?AD:%AH>3.$*-" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6874 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32751 42 214M = 32579 -386 AGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGNCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTANAAAANNN ##(+%%"$(*#!$%'!'**!(*'+%#()'%"(!*"+("&!("&)($+#(!#&+(%&#)%)**&##'$#**'&!+!)&(&+)!!(++$("%&)"*)"*$+)*"'&$'!#!('+"'+("*!'!+((%(''$($+%$#!#!%+)&!++)$%&#+&###*$+%%)"(&((%'"+*''#&!&&*'#)%&)+&))!&"("%$+!$#)*$*+"%'*'"#"% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:159T45G0C3T0G0A0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6874 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32579 42 172M = 32751 386 CCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAANGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGAC %/HH?61!7)H;BD)>='-H0=<-)3);>5>&8&%?+&>G=A:&A!,#9!%;)5-D(*$D';;HC6,7(,->:AG39"8;94))571/>-4*8-/H;=&@1C==;G1/6;88A&.4'*+(,G,6?28C*(%92>$0=C$1+0)G+#3D,B$7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T77 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6875 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26194 42 101M = 25963 -332 GTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAANGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGANAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTT #(0G'20'*"3<>*#A/225.#.%4C5;C!5D00(A/-;,-,AB&;!,?15F"%EH:BG8B&@,+=EC7;G8F?$G="3($7G*%;).'+()3!C84,*%+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G38A32C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6875 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25963 42 231M = 26194 332 ACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGG )C!-&3C8A2HB!<0)B6+'#'$!?+79--/0;7F"$D6G)@E=2C1$8=-H1'3E/C:"D,&F0:'5E.0560787&@=.32G4?2.>7,%=>*53"')=48?-@CG:&);"C:F&7->1$443*?$>*.1@1@34.*DF2')%-0.@(C/F"(4?$1&0<$5"6':#E+H*$F("*%*,)&-38@"!4>62'47-$HEB5?''*)A.$%#@E@=B.)=9$:! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:231 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40834 40 131M = 40640 -325 GTCGCTGGCTGGNTGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGC H%#*:3B:-E&2>7=B?<&:@5G:/9=5A75!5:A=AH'!D++CF+.&-@)5&B*$73B7;4)2"B.6/@43H:.,3!D=$'18%9!C0,5;C*E.4>FFC-1DH64+;;6C>'%)!B";5F>D?:&@5/$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A118 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r6876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40640 40 95M3I83M4D12M = 40834 325 AGTNNNGAANANNCTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTNCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTTACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAACCAGGAAGCTATGNGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATG *$)#"#)(&$%"*+''(+#$))&'""*#%'&+!!*+))!+"+'#&$$*%"&$!+)')"(+'($%+")'*&)#&'%%&)"'"(&%$)&'"+)"($!()&!'$$#!&"#&&)!+$)(#(*!('(!!*+$#"#'&+%$'%(#"$&$%!%!$#'&%+"+$$!(%$+(#+&&$(!*+)"#+#+)(&$+$#*(#$!*#& AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:17 MD:Z:3C0A0T3A1A0A65T26A34A12G24^CAGG12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43251 42 44M = 43443 259 AGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATG :(>3"!H48FH,8%,@995C9?9H#DA?"'E&"=(3EA<*G2=E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43443 42 67M = 43251 -259 GGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTA $(CF/:;6E(!7C)4E6GG1F#52$;AH@7?A.F;EA9!%>>!,&H<93>G!7F=(,?(@)F+2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A43 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r6879 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1898 40 187M5I50M = 1854 -281 GACCGCCTGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCGGATTATTATGGGCCGCCACGACGTTGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTACACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCATATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTA @4$"#&81%:#30!=55(D,G:.96HH=F='$26B%5.7$=FA3'4&;E)C+D?;=#+>"@>F2+G1G-<>1?H46<6B$#FG("%%:*)';@*$<()#&&!HH9!5:#:;;D:'G61D86>-"1@,9C=%&8>()$F!7*+:;4D1=?D9?&4H)8$'+.()7GC%,FC)?$=6/*4=H.0"55*2<1@42DB*:G-45.2H*)81!!+(81"3=8&-+*DE<)+-@!D=G01 AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:7G81A23A45T65G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6880 77 * 0 0 * * 0 0 TNNANGGAAAATCGATTCCTTTATCTAGTTACTTAGATATT $"%)"%+((!!#))&()"&!%(*#"$('(!(*&!)!+!&!+ YT:Z:UP jpayne@0: r6880 141 * 0 0 * * 0 0 TNCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGNGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTNCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCC D""$8G+6BH"'=:5B$.,&991&FEBH,9GBC1)E@@454;3>$;?GHA,*&6/%>!*&>H=F.4>*/,".BH5DF80D(G/9>&%41HH;9!+D46A(9!1$7:@.::9")(.3#=$/"$#.':CF5G:893.9(-=E<5/3H0:-=C-8.,B=!<0>2<&GGB0AFD/.;.8C9%E-$;E8@C(2:4 YT:Z:UP jpayne@0: r6881 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31445 42 95M3I166M = 31706 316 TACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCGAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGNAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCG -;H.2%#%F4)E3E,5C'.".F(5/$,1HD,'*E5+)%-A/+/G()D4'*97!)$1'D#F2=&$03!G*5+'E2*"':6#-D%GC;*'"A/.?3.A+@?$#82'#2F?+!5'??BF)7E@D(E)$E87:F>HA0=.BF"*)"5(H$8@&2=,=(6-"8A.>A"+$2A41B'E'@E"+@;)AA#5A(60":*"#;E.,55)D"%H,'A8$GH.-5B60BBEAF3 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:106A93A31G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6881 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31706 42 55M = 31445 -316 CGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGG =1*"($)G34641D0'-''+A6@(>)=*+-$>@;8?<(9D9E0F(4/=B/* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6882 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24853 42 118M = 24705 -266 AATTTGCAAATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTNTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTGGCG 4?"-0E=,"G./!,-3$#8C!/*#C8.E(#(43;>5&:C"=&/C?AD9E";?H!C?*,*(=/C<,4'%4)&C7#;>:# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T57G47C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6882 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24705 42 54M = 24853 266 TCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTTCAAACGATACNTGTTAGCAATATTTAATAGC -BE:8=/G6D(#C!-54E#-,($HC##'6@GA#G#3>?C$(#;6,5(E2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C10C20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6883 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37997 42 11M2I52M = 37884 -176 TTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCC #?8B4)&5'G*2E-=BA;">-<&+((G9;F6&6<%<"H:44&%??9643C9HF+H,$#E0$%-/!4.*.FGG+#)?8D;C'*54:;A3%8/+GF"3D);4,E2=C+A"6+(.$%@=B8$8>$9<4:5C8$3&A6447@?-4AA5-1>'53611/">AB:1-:F%6&%9:F&A<%83*E83:A6:686&;5623C8'8;)?!7%3-($4.AF))' AS:i:-42 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:11 MD:Z:163G77C19^CACG32T21^TA43A40T12 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6884 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12972 42 67M = 12554 -485 AACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTCTGANTAGNNCCTCNAGG '"+&#)#&"(#)()!#&*#)*'))'##&"#%**'#!&)##*!)%*+()'+%"$'"#%(!(*!%!%)* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:49A3C0A0T1G0C2G1A3 YS:i:-42 YT:Z:CP jpayne@0: r6885 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33000 42 89M = 33238 298 NCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCCGCTCTGAGCCTCAAGACG +C?DAH-*0)62E"!995H:B;-4<<842423(&6"*,BD;F--*H#,A=A<9&:6:<@+*.>6@/6"A"F9;H10)B7CE;A"7FGEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C69A18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33238 42 60M = 33000 -298 ATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCNATAAAAGTGGCGATAGTGAA #/H,D:(9;02<3H+)6F%3&D-9:';-@:/"-!;)@="/*F/%@/:E87:0D!-3.=F3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6886 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14299 42 205M = 14194 -310 GGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCNGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCNGCAGGTGCAGAGTGATGTGCCGTGGTGGCTGGTCNGCCGGGGGACGNTTCATANGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTN 18"75F64%"66C;BG84!65D!"4@D$!3D:<8=53!&>,"..H,@C@8B'4>:G*C%D($G(<8D3:A<'B$*"-1F,->27AD"!E?'F0G=4>GAB%.C81#73'")($DB//-F#1&B)G%.=B,:G$G59'5%52-5(' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:45C37T16T17T11A6A66G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6886 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14194 42 105M = 14299 310 GCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTANGTCGCCGGAAGACTGGCTGCA 5D!D%*5.(F13"G33?@+>#6)GE)00*3%6$%E0'93--,!1E5?G-GA*8(!AB22D7D<'+$?39=2H&*'HHE=F0=2A&17;#CH%-EH=#(9<&=/?+;0CHG-(H#A$C%GA<+6C2@#$;>/%H:)-HB#68<2@5<>6C;B/HA++,/'.(%"EG%,;"@B$<-33.!--G=7.4%C.:E2#-'@0)#?'+,6543B( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:100G106G23C7G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6887 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1526 42 71M = 1597 313 CCTCTGCGAGCATAGTGNCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCG #!+*+'!('+#&*$"&&()$+*$!*)!&"%%!+(")+!*#(%**)"+$*'+#!$("&'%)!'$#)!#&+#' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T13A2C53 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11380 42 71M = 11277 -174 TTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACANGACTGCGCCN '&!'!#$"')+$)!+$(#"$$%))'&)$+"%%")+&('"#!%''$%%(!(*'"+$&$!(*'%+($(++%%" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60G8G0G0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11277 42 103M = 11380 174 NNNAACATGNAGGCGGAGCAGATTGCGTATNTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGT ""!')#*($'(+()++)'$)#'+*+'#)&!!!!(&(!**!+&*%('&+&*!%&($!()'($)&%$!#$"##%)#$(&'(!'&#"&"(*("!&((+$")&$*%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C0A0T3G2T0C19G72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6889 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42969 42 92M = 42745 -316 GAGTGCAAGNCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTCAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACC 9"@DD74GE(A+136&3/C?>6"7F%9#"=7>2>,"&'6>,A<28-/*E56#)E%9%B3>"H>(E,?)@/.D70+'18(,<6&8CBD&;!G<92)?8C%/=AB5A!+0=!*D74:%4%'5*C,?=4(3()@)"F'H!08/-(H"$2//?@C9E3,*707=";?=;<=*5H#9)2BE+5)+&"-G/619EF?*?:%2(*6,&)F/<:,7+!>F?D+=C?@H+-&"2H'8(/>=0"1#56=.14,"F4#FE, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:224 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6890 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21341 42 106M = 21150 -297 GTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGT "#+'$+%+*#&**%$""!())%'*)!'*'($+&(#'!!"#"+#''!%%"*$'""+")!*)")(%(!"###'%("*+'('(+#+'%&%#&($&)$&(%#!*+'('(' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6890 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21150 42 87M = 21341 297 AACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTNGGGGCCGGTGNGAATTCGGCCT ')+)))$$#!*++**&*!&#)$''(($&!''%)#))!%'"+)*#(&+''%#*'"+$&#+)*$%+'&*$"!("("$*%&)"'#%)'$! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64T10A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6891 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28895 40 72M = 28750 -217 TCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTT 1"!*%0#!:F/.B$B)F%'4(+<:%.(,+@7H3DC2,E+11=271C4G'2#CB0B;(1H#%<#&5+$2>#3' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6891 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28750 40 55M = 28895 217 NTGANANNCGNCNACGTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTNGGTCCCT &*)!('*!'#"$)""+*+'%*'!#*+*"'&)'$))%"%&!(%#+)*(*)#"$%"" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T2C0G1T0T2C1T0G0T0C31G7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6892 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17169 42 266M = 17435 316 ATACAGCGTATGGGANCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGANAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACNCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACAC #',1$,=;"?8@73&378,G!30.-+G!)#FGC("7D:$+*6-%>"&05-+(-,,EA2C4)G$>$B9))EG-1B.C-8/F"'8<"6>!;#605':"2B;(;)B6'2-#*D?0>E1+G>H@#'>0"EDB70;9<9"CB/.,!48F03?9GC*.A$3C!G2(>7=*618#2C78@2';&::C;G,6-!2G12:((6+.05B))$;= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G101A68G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6892 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17435 42 50M = 17169 -316 CGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCG %)$F3/'?"@:-D,4*-%6,&&B'G078.03:1&-=G),0"63&1-81:B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6893 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37093 42 78M = 37171 259 CNNCATANAAATCATTGTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCG "!%'#")!&!)(%+)!''(%"#!#"'++&+*)$!$%!(+*!*&&++&)&$$#!$$")'"!*&$)%++"*(%)&*'%'# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T0C0G4A3C4C61 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37171 42 181M = 37093 -259 ATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTCCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTNACCGCTATCCC B)")C2F@/ACA>6FC:=/,/%<.>,;F+,+23C1%&51:&?97D5++42(#1A:AE=:9)AG:;'%9*$8E0ED24)4>C6%/">8.F+/476,HE.>33+F$;8H?5.>/"*7G;'*".8A,E,)G*3@8F+#:*0$H1@-2E97A?A%=-;H#<@',8BF5>!53=!%#8D=><,617 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:37G13G117G11 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6894 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26354 40 66M = 26431 183 TTANTCNNGATTGGNNTNTNNCCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGC &#)#%*"!'*$''&!!'#&%"+$++#!'!%++&*+$"(!$(+'*)#"%+'##*!)&&*''*)+!(+ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C0C1T2A0A0A4T0T0G1T1T0A45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6894 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26431 40 106M = 26354 -183 CGTCACCTCAAANGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCNGACAATTCTGGCAAACCATTTNACACACATGNG *+&*'&$#((+#"&*!'*+#'(%#&!"*()&'$%##%'('&"!%$*+&)%&%*((!)')!(!()$%"$)*$'''$%'!!"'#%'(+)$'%%!'!$#"'!+($)!)% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:12A59T21A6G2C1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6895 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6371 42 53M2I62M = 6513 205 GCCGAAGCATTAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGT =+)=F+=:!=%G&8E4)%6-72=+8.7A6"D3A)E"@'78C;413=087.+=G*9#(><85$.)'>%.C>4!C5/65+#H*9DF!02@(5EEA!+BC5/5EH=AB=DH.=8+-7%BE AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:10G104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6895 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6513 42 63M = 6371 -205 GAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTC (HB694!2/:#D.@,?/.00!D'%EGH>H@#,A7$<.;@<,>*-D)$1C'*8"CF.>F--=EF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r6896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17865 42 156M = 18095 286 TTATATCCGCAGTNTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAANGTCGAGCTGACGGA ;53@3$$72978H5.F$8(*%(G0A)!("$)'A8D=B(A%)*ADB)1A8-)&:.6C4?690)@<1E94=<&7+:&?/1(C!;.::5B.E=E'4,)!4B$!#!2G8E'D8*8#4>G8<*0,+1$-#!@1&.##D!<2>=%D+;;- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G127A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6896 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18095 42 56M = 17865 -286 CTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTC A,A-F(*;4)*7A:G)2FF=ECD68>'7CD/$D#H2F0)8:DB5C!@6A9/8;;5.#!;A%.83;E4H4(8)582=6@:)/=+90"4EA<4==))9+"?!;=2E7D1,?.F;)3<,6F39$++8B?;9A('H&3$HF9@8#$1!B5&1"7958+8%G=2!!" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:29A21G67T19T20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6897 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30313 42 46M = 30101 -258 AAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGGATTGCCNGCTCTG H3;)%.>F8D6,=FD?<;4!0-%">F@,-91;*0F:8DC*268$?E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32C6T6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6898 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47138 42 54M = 46949 -243 TGTAACCCATCGGAAAACTCCTGTTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAA =93&9A#"5+=&/8+:?::3(:%;9<,:A:5C1A'8/8;*@'%10&)<>D/.D8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6898 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46949 42 40M = 47138 243 TAATTNAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTA AB;%)%E'1#D<=A:>+'6:<-;FH3,F6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A34 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10684 42 423M = 10586 -521 TGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATNTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGNAGCTTGCNGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCA C!A<%=>$5+(5D92+!2.A@7E)/::,GB@*;:'G3230#>$:695<1#6E$8,=D58G!9A78HF#/9>,48:#7*.)-E73(!G:/%;D@CG-5?6)E50/.%'=/@%)&;=6H+#DH09B$)>4A)%;(1DFBC09/%27/,4C'=?,?E$D5/AD8$:"5%'8=>-3#8BC;3-)==%1$E6,H"?4+*FE=.BHB,7C=C&:2F,1G5+%?B'B.B7-.B)",#=(%B/2B66!!;A.4C7406:C$-4:.!<)"22$@"773E%:,#'4%@A%4G>4.*5C+6G-"BDG2-7C=7.B$%B6D&=4*F)(4.)'E:DGE+B*#FC"E4E(24$D9/@?D(B6F7G.#-(*";FH<5*#;)(C!.((E0$9$,D?7A"!<9,8"430*-<,#FA,F$H&)#4>:+E;97B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T52T34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6900 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32635 42 75M = 32436 -274 CACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGANCTGCGCATCGCTGGCATCATNNTNCNAT *###)(!+)#''%$(!$!*%"'*&&+$#)'$$$$&'**"**!++!*!!&'(+#%)+$$))&(++#)$)!$!%)&) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:46A19C0C0T1T0A0A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6900 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32436 42 55M = 32635 274 TTCATCCATCCATTNGGTAACGCAGATGGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATC B9&C7GG-@6&46+F29%=!)AC>62('<*D0@)8#/&7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C12C27 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6901 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40163 40 148M = 39996 -315 GATCCCTGAACCAGTAAAANAACTTCCNGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAANAGGCAATTNNACNTNANN %*''))(()"(+&*')))*"'+$'$)("")+!%)$'$+&&%%!)+(#+&""'"#+(%(!$*)'#'""&!+&$!')"'($%*+!%*()#""$")%#++)##$("'##$"$%($!!)!("$'*))'$&+)!&*$**)'+!+!))$)'#$' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:19C7T101G8A0T0T1A1T1C0C0 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r6901 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39996 40 112M4D21M = 40163 315 NNGTATNCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGTCCAATACGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCA #&+<"(<&,>:CBA@.4>%A8"G6;-+B@F6*(>:+G"BB*5E/59$7/?9"ABC;!=)>->0-B3<(G%242+5?485)!07-=5/+CG2C9C;;786GDB)28E AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:0C0T4C74G5G24^GTAA21 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1288 42 80M = 1009 -359 CGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGC 8$3-E0(A:77@-CFF5%'5%2((='G3,=14D5*9"?H%@$*7.8:&#=BC<$E>+59D(-2/7,>!.8C<6#44%<+( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1009 42 279M = 1288 359 ACACCGTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCTGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTNGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGTCAAAGAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTC -/&&9C3#,?*0?39C$!#(%?>!-4H5(G-B7,5;,66FF'-")0$9+">&,?H6?;@9D9#F76-4#14"45*B$&G"2.1/8:G"03,?*,$>31H*1,@*378(A/9D4#6>,+95",9+4-:):/*&1G"G!,2%B2A8-/AD.2D=6@?'8D*3B09,%+:+2)/349C"7>-%HCEC-GF+F7>"#9H=@2/<-+.+>A0=C5CE%#BA7).%=F AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5C64T10C23G85G4A82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6903 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22734 42 152M = 22604 -282 ACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTNATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTA +51+0HG"(83*&-BE@3/+A+6%HDB"/G?..58D)@?.(-=67A@,G85=&.8+"#3;':BB&E(/.&)0!--B=.@C)6; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107G44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22604 42 73M = 22734 282 CGGTTAGTTAGTATATTGTNAAGNTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTCCAGGAGAATAATGGAAG 9)+:4EC=$5H:GB52,:H%9DG"D"+8-2$*<8,)+2B+.*C=@::/2<+97/4#;-HE<(C@1-9564#'3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A3C31T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6904 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7322 42 99M = 7530 267 CTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGAT -"*?9)09%!84+G@=A.:6H-$B1F;;"=723C1@HFD:B(F0@,F7;%DG;#;,==%7!)5+"/%>-@;!,@#D#B*607(=+#<"2&G4)D$H152D>7(3A596#(0$7C75096&,";E?1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:100G1A14 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r6906 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30005 42 84M = 29836 -253 GGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCANGATGNCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCNCGGCGGTCGN ##)&(+!$"#*"+*"&+&)"''$$!#"*$+!'$+++'&'*%&"$"'"!&%"'$#)&!&)&"(*)$($(+)+)!"$$""""))!" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:38G4G29A3A0C0T3T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6906 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29836 42 87M = 30005 253 CAAAACCGATCTCANTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAAACCATTGACCT ;;3-2?0D<7>A<=6"=;1H)/,<-/?%:5D=7$/+2*==".5/%"B<>/-H?4><=%@*F1D(!C4H,$B@?EG?19#7#0&'CH; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C40G20C10 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6907 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26976 42 97M = 27115 180 AGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTNTTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATANGTTTTCCATCTA 2!/=#8?&E--)!9%H%E%&/$E,4!GD.2<5#=BD,(H@'1!)04A<@8+$D(<+22G"+4HE5D/-.!';5(&%,4!8""3"F/-"58@@)**#F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A48C12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6907 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27115 42 41M = 26976 -180 TTTGCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGANNANNCACN "#+$!"$(#$'*%%+(!'&"(&#"&+*#+*)%"$**$%((& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3C28T0A1C0C3T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6908 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31804 42 70M = 31687 -187 AGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGNGGAAGTAGGACATTTTCATG F9!2B*B"3?:G5&%@A>4BC$HH6:.GEAE@-*<<@D&!DE;2/BDB60D:G5<@C%,CB&8*#@73%">9>,0&2:D)- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41717 42 59M = 41462 -314 AATGAGGTCATCACGNGATCCCAGGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGAG &'!"(+)($)!%'&#(&#%#'%++!+#(*"+#!#&*$&'%"(%(*)%"("$+#*%*+*# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G7T34T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41462 42 255M = 41717 314 TAANNGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGNACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGANATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCAGGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATNTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTT (""%"(*'''(+*&++('#)$(+!$+&!'#$)(&"+**++!))+%!+)*'*!(()'+""+%!!($'&!&(+&"'!$$("$)+)*''$#)$"!)($"##!%'*("!%*(!$#*!#*%(!)%'%&#&+*#+)$+%*"('!&&$%'!"$)#+(!+!''+)'+!)%&'$"&!##"*&($)#)&#%)!*$"*'))"%%*&(!")'"'$+&"+'"!*"&%%$!)+%'$)#("+!+')!&%%&%$)+%$"!%$*+"++#&(+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1T0C0G0G41A34T44T41C86 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6910 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25331 42 127M = 25458 275 CATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGANGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGATTCGANCTTCTA ;B3DH=D7.,2&"A&=-B;2;B0E-D/C#;5>4(*B:&0C=F$A*36>)>%%H/4"C<*&C&@52EAF-"6?*)#G&'$>(;&:+&$708=HCE2?C6.(CF&3=31A,0/92(C=92+,%(+! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55G58G5C6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6910 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25458 42 148M = 25331 -275 ATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATGCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGT GG'>!2&=C;#=3?B17A@77B1'D=%6$)59G1C(#E)$/D$C3!14237+3*:G@-+-(4**<%#,G/CD?25%:975*)GHG3>;*5&::>0!C@?83>/#+A$H;>H=?>;0E; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6911 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7293 42 75M = 7391 204 CGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTGGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCC @+5!%4!)5G;?ED2G&-GFB$-=F+''*+2>5F/89:D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10272 42 45M = 10111 -206 ACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCG 6A&>'9&.'$(H$5D)DB(C$5&<+>>4+<,/4*85$>-E45.A) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6912 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10111 42 130M = 10272 206 NAAAGTGTTGGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGAAGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACC !"&+"(+&"'&)%%(#(#**+#)$!%''&%#&+)'&'"!#*)())!&$$'("%*)&+!!$"#'"#"))((#)(#%(%"+*$'!")(*%'&")%+'%()#)"#+$"%!$%'""(!*#$&)%!$&"+'((&( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G8C40T79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6913 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16275 42 120M = 16158 -237 CGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGNTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCNTGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGA 1#32:*@,$C;$>&5@D(-:7+:C8*;1F)?,F%=!.-?%EB3/E=*/A>2>#)*%8$<;-#&5A;6+D*<<;$8A=+>D2:)E5A9D(%!%03*-9%34E'46&8AA=4"..:* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51G36A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6913 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16158 42 42M = 16275 237 CGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGT 96-(3<**(D!9-+*$8!&<3:"08+"9256>B@*.A;6>4/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6914 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47138 42 63M = 47005 -196 TGAAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTC 2>"@''FG#=9,,6*>;;5&517:),,&= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6914 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47005 42 133M = 47138 196 NCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGGTTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATNAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATT ,#;/G56:0*()7104#H-733%.",3"5;3.B:*#"*98C&';!.8G%!;>.B6:2"+04<-''6,3/>ADE)DG(-+"40:G?H;8HD%:H$+;:>'49)'67.(?!G<&+CE.< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C49A38G43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6915 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35092 42 107M = 35199 279 CCGCGTTCGCCAGGNTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAANGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTAT &+&"&&&#'**#'"(&*")"#*$%&'#+'*'!&$'!!(!*)%%#'$"#&+*&!(*'(+""""'))('&()%*!(#+*%)$)!)%"+)$*)*#)$+$&"$*(+$$&$% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C41C1G48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6915 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35199 42 172M = 35092 -279 CGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTN <#*?D2+-G85A-*,%!54".@#.E,%'3)0E&;37@#?08H2F2;4+499+7?DGE/3H$+@&2F</1,"+'11G*7E7%>%1*D#<00&'?'@$F#%@$$3&F2B%G0*)!(&<@H<;E<556E0D("!-F'#)+=@!-#@/3,9G4:G! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:171C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28960 42 107M = 28784 -283 TCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGCACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAG E;E"=@3H/89)B*%7G*2<"(79H"(/FD$*">C'=(*E7!:H;3:*!)(4B?40'#'*6,DG0C)(,;'),B*@B?E,'<'-66C3B&"@6A:%;/@?-#""-9; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28784 42 77M = 28960 283 TTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCT D'A99;,13,$2@6/>35;55D&>)!/>E0.*!:=9/'<)!:%/#0#>"/&G$9AA/.HBC=;H6.F8$5A*/%?1. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6917 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2141 42 259M = 2400 302 NTCGAAAGNANANNGNAGGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACTGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAANAACCCGGATATTTTTGATCNGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAA $%%**(&&%%!'"#($!$(+(''$)'"$*%!'++!''''"!&*&+"+!")'(''+(&#$+$!+%%!%#%%))*!%"!%"'*(!*'!)*&"''!#$&'())(#&%%!!$$!+$%&(*(&**'%%+*$#*")*'"%"&(+#*%&'#$")"()#)&*&)&%+')!$#$##$+)#'+')&"%+%&++(+'&$$"*&!'+)(+!#")#*$%"%"++**+$#(*+**(*#$(("%'%%'%++!#&**'#(*+&))'%"#&$&#%# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C6A0A1C1T0G1G0C0T164C27T19T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6917 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2400 42 43M = 2141 -302 GAGCAGGTCGANAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGT ?H-*A2H7$'2?)=6@?$%01"7"F;B=8:(A'E'*+#0D''$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A31 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r6918 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16803 42 55M8D199M = 16616 -449 GGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGTTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGNACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTN 2&5+E"A22!)19!.?BCF)H,,:+,B)-!FH:%%$-6+(;0"=799$089CF/59B2BG*H:&$GA+-'5:"2'!+'0#<#,*/+ED!4B455C@@(/!E#>-$F9%24>#67($;:*;BG0+A-&A24CG()8=(@%"(0?)54$45F8&:#2=.!1#-26+:)F%+>?(4H<+/.@94>DC'E9>)1:F91+G(?BA.:$?DGH'0**!<92$ AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:46C8^ATTAAAAC59T138G0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6918 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16616 42 187M = 16803 449 ATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACNGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAGTGTTACGAAGAT D?>2738G.==C)=D3:)EH6$%(13-)8*!-)GGD+B?.%1/!6BH+(<>;2AH#GAC.&G5?')'@E8.=&"H7=".E='/;)>,@/2*.,4-E:.=6#7H3,'D>2!)-H+C)>?7AH<<('#G1+E%,C./,$.($;&?>?1>2%E'FB%6A569H#0G6?!5G=3;"1'2679#+ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38C56T3T74A12 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r6919 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5663 42 49M = 5663 0 GGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCANGTAACCCGGCATCTGATGCCGTCA 62@C.82@9,)=9$3@?8*4F(0")#63D6!26!@34CF@6B?:@#3$) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24G22T1 YT:Z:UP jpayne@0: r6919 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5663 0 * = 5663 0 NANTGCCCNAGNTATNNACATGNAAACGGCCCGCCGCATT "&!"*&"''$%!$&%#!'$!#+'"*$+%"+$!!""'!#"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6920 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43718 42 211M = 43929 332 CAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGNTACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGTACAGGGAGAAGGCGCATGAGANTCGAAAGCGTAGCTAAANTTCATTCGCCAAAAAGCC 24>=@)';H@)%H.%(B"&=0"32EG(#D.H$<<@F992FH96.1,.7&B"G>;+!C#00*,!2'A&F$9@D>%67G.7;:@HC9D5"+/@+F/?'*EG!'@/-6,B?.4<"+91'@E@E$&'=,+@*/@B.'<675)>:*;#$)A/?.45A?$05G&!:;*;@;' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110A63C17T18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6920 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43929 42 121M = 43718 -332 CGATGATGAGCGACTNACCACGGGCCACGGCTTCNGACTCTCTTTCCGGTNCNGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTNTGGCTGCATTCTGCGGTAA GE4><+F;GG37AE3!A/%:?8D+D?9H16(@527!H=;.#.)$)D>=6.;/ED,(H%)8'/C,3&A9)@>$>E9B$-/#/*57-:>)78DF=5,?56C60/A:29<>'#=$)!&29-(9A".$E%9>=0,H>.*C5)7CD@0A/.G#D?992B<:48/=0<%=D'!7@660-)??A8A38F*1)HF189:;A%1G(%%22#F)-=/E?G70=-">A4D@)("9/!H4?/DHH*#$3;'@->9=F.3@$C3@0'53=9"&+8<2::9A?*E5D8,/(&%;B!2*+8,B,3#+&/7B7G9,*%'.D0EH8E=1<"DD%*7HAH(:(*/C;*/E:6B"/E2"8+-'E*CC%;!?G<#E8F.>9+-G(%:5C/D,$F96?A46E2)"8C&"!/-!/$'6'D?-G>-2A8B':<1(79C,G"0B55.((GG34!9*0#>25:846' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:0A200G20T48A50^T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6922 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10689 42 103M = 10489 -303 CGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCNATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCANCTTG !:6$E=;;;H>:#12BA-<5-7'7&&&"@;-@3:"*54)H;B9A$0AF@H,-%B'4>2C?#"E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56C41G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6922 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10489 42 43M = 10689 303 GGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCATGA '5"A69>?)8&F0=?B69%H4H(C+!@")F?(F3D?2(=+.5! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6923 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9857 42 187M = 9857 0 GGAAGACGCCATCAGAACCGGNGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTAT 0@!BCH3=5(#97CEA-A:,5HBE18"?52CCF,,?2HC:3,*#6")(<-206G=<=<8FG&8@1,3'4&D$;4&,',/#)>A,D1@3>0F(,>4=.F>?B/7H$,,=*;;7#1)/53&!*/*;%6.D0041700:=F=4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C165 YT:Z:UP jpayne@0: r6923 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9857 0 * = 9857 0 ANCNTTGTAAGCNGNCTNNNNNNATANAAGGGNTTNCCGNCNNNATGN #$$#$""$"$##!!$"!$!$"""$"!#""#$!"!$$#$$"$!!!""#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8677 42 66M = 8820 220 TCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGNATAT ;E/B14C6?1=1B$@'!C4>-2@CFH"6GB)HG82.>G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2341 42 160M = 2501 201 ACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCCCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGANAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGGGGC )+(##%+'*)#'&!!")")*('&$))()%"$&%%$+%"+$''""+!$(*&#"'+&"*#"+#'%**!)'"$$%'%%""'**#*()*+!)('%'&)#!)+$$''#()&*#%'!##+$+)%%)))')$)!'*)+))"+**'%&'&!)(#&##)+")"%###'% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40G29A85C3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2501 42 41M = 2341 -201 GCTGCNCATCAGTATTTCNCGCTGGCAGCTGNATCTCAGTG "2>>()CD+F?>@2>648'3?),5/9518!72)C(<;"(*: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G12C12G9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6926 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4516 42 227M = 4743 277 GCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGAGGGATGCGGTGTCCGGCGNCAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCANTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACG D04&B&55A2!F)?6)C/9:BE3*+0+5$?2=1(&B/H&$0!2'&":&)/1!43==2+A,;>2H%%='*'8#E1A'*%B*$+"BF@CC67*>&9?'5*8@:E:A340*"E!59H1&FE'9<*3!'"%"(!6/5HD7E3,',3/6<'3/F9,&("C=%/0)5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C17A37T138 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6926 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4743 42 50M = 4516 -277 GCATTNTCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGGTCCGATGGTGGACGGN &)"**!)($&)*"&$#))"!!*!'!$&(!$##%*""&+*$+%'$%'+($! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A27A15C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6927 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7454 42 121M = 7215 -360 GTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGNNATGACTN ')+*!!$&+*!)$$!'$$%)%$*#$!$+%)")*)##))'%+)(''))%'&%$(+'("(!"*&##+&%+&%#$%!!)!"!*"#+#*(%(#(%%#$*($($*("#()%+(&('&!&#))('"" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:112A0A5A0G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7215 42 239M = 7454 360 AACTGATTGCCCGTCTCCGCTGGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGANGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGNCAGGACACCCCTCTCAGCCGGNAAAATGTNCTGACCGTACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACG 6+B+<"*'$-#$8+5>H*?HE>D!5G=2/EF16?;9<(D@2#(;5&/.)FEA//7,.)50><$'FH@#!"<$?4>71+5'$>;3=/)G=A8A<>+#H10"8::4)?*9;3E>#$G/,<2BE:F;0C3E+,>7-#=27B%10(B@9&-998'6;5"FF<.+%?3*$"7=<.(B;8!+=#"709%5<"?@-E(F%43)$'F:%"1G,B>()H)+%''>6+)-BF$D+>=2:9F5*;"$?CG#B;/%6'!9.G./H>:9=C8"<(C!*@)*%5A..?GB?4-( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6928 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43767 42 112M = 43921 252 TTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAANATTGATTCAGGTACAGGGAG &097/8)"C@D$1!81=;C@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6929 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22660 42 183M = 22843 341 CAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAGATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTATGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTNCTTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGA D&>6>%6::H$*'*-BE448:,H72=/;=1:C&;/+0.0F("1%BB&+-:)7>%3EF8A57$:#B8#:D$+*+D*0(4G,&H<,<(=.).4'?=8=&::.A/:7D-C)B559D$EG!4-,77?6E.)D<*7B84.?0:78/.H%<8"?C+A1@77)#>!=16&%##H! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:82A26C34T1G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6929 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22843 42 158M = 22660 -341 TTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATA $-2/?-*!HEE33G#('4.?;"?:2B>:2'F7-2%77,$&+&D)H($#,%#7A/D+%3H%&-73<32$08$?1H;*1?8))3HE-54-G>#,C:5>2/;!&343<7<0".0BD36!1E418-'"G%C>)$)<1<>,(=3A#>$22$#02&)@F;("*;?>#3402E!)>?;A2F@?9:9,?6&?CFC&$AE1);,E&*C5+*5@,8G7*3#DD$#?44#*2(FG/89*.=4,CE$@.:3028+H@=#)7"&<'EC&".'H78((*3!6$383.(9*H72C4.H6)H5D&B@**@-6 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:39A12A168A13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6932 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2254 42 120M = 2166 -208 AAATCGGTACGGANACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTAACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCNCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTNATCTGN -7#+B?89;%$:4=D!>;D;18,.1'9<+B$!+1>A>%.(&8)+A?+4HB(E>>8A28#@H#/$3,3$9$93-457>:0E.#@<'A%@7:;B2,?=>,(H.'HA-B-27::BB=F@93EB-H72D=4307(E&@#7&&?-H4%.9F!@>,>(+6="-*>=%1@42+7A@6?E1"&5BE$C:,AB=F%)598A:9-CA4<3B>C(:0(F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11G83C56 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6935 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26036 42 94M = 25747 -383 TTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTG $D$#@2?=B"6?4)09D"7F3'7=*B+'(7#/6>!6:-.$"@);35@B.H%=DD'(@9#-:7*D>A,@(<=$9&HH:FF?F4>32;0DH@CGGF%B&E*)7"4C&B?3E037%<<80<)15);BB AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T56G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6936 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11476 42 190M = 11703 299 TGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCNAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGA 4>>,=B/'H;$&'-8"1*$4&C"98*9<#3=27>)1862':;*@=0)%=@<<;FE=G,<4-F7;>&E!5:DF"D"DG:*5F+&;/0G&=.(*);G8-D5)<0>+69F@=+)CH&59+#9/&E.@4&AF!+(G9@-8F$7-1A4$+G.>.8<*-5956A3,#FA8.%'85C24'&%&G"-/$'D<+G6?06 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92A97 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6936 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11703 42 72M = 11476 -299 AGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGNAGANGGCG !+!*"%+#&"+(%')(')!""+&()"!%+'*&&!*)!)'"%"%%&%$)&$!&*)"*&!*"$%$!+'%$'%(* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63C3C1C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6937 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20355 42 47M = 19908 -494 GCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGCGGCAGCAAAATCATCAGAAAC 5G)H/7=12$GG.*0;<*=.D&&3*C580B=<-6.+9!4/F&G)CG* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A21 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6937 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19908 42 447M = 20355 494 AATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGATGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGNGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCA .H&/6?;:@A5G"/74<8$$)!F(:>(BB"2D,>;9#E-="(52-A/HGB70A+!EA(0)F#<#!!16.75EH#>/)D+(08/:'&93';.&7*H=0.<)66&2)G&&<@%%.AH%<$#;2/B8/GD7?B*B>8(5#600#=>$$)C73FE6(-=#EC!1*DHC4H;9E,5<<-%6B2B.G$&808@+D,$A+6C)7#$:8H1;,:/E(-#869583GC&3;"7D65$'1GH41C?:(*")?'F2>#FB4:"=C';8=.4)$3!-4)@<';1;!E0$4@$1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69G121C121A133 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6938 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27452 42 185M = 27452 0 NANGNAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGNGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTANTTGATTCATAGTGACTGCATATGT $'&'%+")&!&%!#$&%&)+'!%+""%$#**"!&%&'"&!*)$#)&'"($'&"'&)")#$+"$&&("*((&$))#*"%##&&*$""%(%)'$''!&+!+&!*)$!#$#!'**%&)&&)&"(!'*#('$*+!)'#$('&)!()'&*+*+**!!+'(*$#)&)+#%*(%'')$$"*%$)&()!#%*( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T1T1C115C39G24 YT:Z:UP jpayne@0: r6938 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27452 0 * = 27452 0 NNCNCNATNNANANNGNNNANTGNGANNTCCTATNCTNNNTATNTTTGCANTNNNNNGNGCCG "#!$#""$!$#!""#""!$#$!!"$$!#"$"!$$$"#!###"####$#$$!#!!!$$$$#$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6939 81 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36102 40 123M = 15826 -20399 ATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAATTGCTTACGATAANGAAANTAATTGCN &(+'*)'+'"$#!(%((&&%'&"*++*%+$('+*#+&!*!"$&"'$'+#(((%$&&$'&#**"#"$'%%!"')"+"'(('!"%+"#*'$*&)+((*'%#'*#(*%#$+#!&)(*%)$''"#"! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:96A12C1T2G0G4A0T0T0 YS:i:-11 YT:Z:DP jpayne@0: r6939 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15826 40 71M1D5M = 36102 20399 AACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTC )+%!!+)$"!"(%*!!)&"*()#**(!)())+$*#%%!!(+$#&'"!'#)"!&&"!)%%&&&)'%+(&**#+#(++ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:71^T0C4 YS:i:-13 YT:Z:DP jpayne@0: r6940 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32809 42 134M = 32702 -241 ATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACNCACGGGTAATGGATTTTTTGCTG #1H/8?C#=+!6<1DEAD0B8';C'875$G>F!7D=*,G;G5/!/(<+"1??E;'HGC/CF(H81H5C9C0/,.F"86)/7%;+*@2;E?EH"9@+:46,1D?2%>=?8!%'>,!&>/&: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110G23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6940 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32702 42 86M = 32809 241 CTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACTGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCC E"=A!7$*&@F1*+6$;>9!*@=*,>;2'/2)@0**/+<4)6EC3HH!4*=30<4#,/':>/$G1+))-H+@CD9@3>E7@3&8=$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6941 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42441 42 46M = 42577 259 CNAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTC '(+%)$+&!&*)*!("'!+&$#'%%!"'+*#'+)(#&!&$*('##$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6941 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42577 42 123M = 42441 -259 AAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACGTAAGATTCGAAAACNCGCCTTAANGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACA E@7@(D/;'A))C(4#+*;-;@G)@))/*44(C%.,:E:&'+'C6%246DB2*#:0E,B>)G.6>CG')9/-$$$@8*3E?%5%D%.EF=(7)<<2B." AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:54T14T8A43G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6942 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18155 42 57M = 18344 251 NGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCG !D)#C/&3G#'G$0;!+9@F6'(H=>-4C"F750840A<-E/AG0-<"1D8*-6":; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6942 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18344 42 62M = 18155 -251 TTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAAT *-D-3;1'D?+0'0)0H+;/!4@=*G/6A"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28253 42 74M = 28434 247 CCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAGTTTTCA B+-#6$G*0?;-)H*3EA(02B@:A5.$-1@D.;&G3B)"C.<1'4**+F348*;"AA12D612A;463A2.49 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28434 42 66M = 28253 -247 GCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTG !E<<4D%8%$'<@:#!&%9657A7:)*C#8":)C1!!>8E:6.#B&+='>=A.$A8F%,?"D"5!+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6944 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13987 42 75M = 14115 218 CCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGT -4!+FG*,H=2-*7@CB*C*0/'-;A"G<&A*799)F)D"'683-B7("6A2C??.!C9E$0(1-1:/C7H@861=.@!7@21G/;4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6945 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24448 42 200M = 24649 263 NATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTNAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTT %.C"-/9H)+D9'&:3G:DC8">A;!,1,)C1F49A6F.28'+8;5$CE,%3"('5"9%#:E.'#'=-+#@23<@.B#+9!HA6>4-F/(H(#7.G9E>4A,8H2041!5(3<*#D+F%>5-6+>+&?'7?D/HD.B-"%%D0A'E%$7&9%C3(-<>"(B.)>F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C167C31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6945 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24649 42 62M = 24448 -263 CGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTC +4;>,=59?:'BD)&*A7"H"D5;!=B'=)10H$/=<9,)4D#!')79.,4)H"C1HHEH.>5:F3-?)(3)&@.=69#$*0H%+1(B/2$63860((@1E)'B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6946 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14479 42 57M = 14319 -217 CGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGA +A36+1!&HD)*H7<94,.0-")GDH/@FB)6G>A=CG469&#*>-5/0:DC+0FH1=2<'.?*H2:()%)>A8!1!.E67E$9="7"%;AC?0%8D"0("5%C'/?G8:7"#$>'#(B97D89GH(=BB5A@*G/?'E<'0;>%8)3.'1#B>"'6@,@!$6)1H5,#D+A<=@HG*G/;7*7*>3904@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:156 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6947 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10775 42 173M = 10619 -329 CGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGGCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCTCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGNCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGG >))@E:=)6!GAD-1#!&5')'8,,.A91F5C-2"5(/F%$:<4$.*1="4*58E%(,B+>;C17G!#-#E<+E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30T61C46G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6948 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20427 42 57M = 20553 199 GCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGNGCGGCAAAAACGTCCGAG H1E)@=.&1-1)D:F!!,2H8%<6+=H'<11F:1:6:B.:#6+C"=>*E0-5.00?G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20553 42 73M = 20427 -199 GCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCNTCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTNCGGTATCAGCATCGCNGA !*##'$&'!$+"''*&!%$+'"%!'(##'!&&!++&&"($((!*+"(%!$''*%"#$#!$%$(+()%*''!"( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A30G15A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6949 77 * 0 0 * * 0 0 CCCAGGACAGGCAGANGATGNTGCAGATAACCAGAGCGGAGATAATCG $+(*#%!!%#!!)(!+"(!)+))"+%&"($#$$)$''#"')#&###'* YT:Z:UP jpayne@0: r6949 141 * 0 0 * * 0 0 TCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGNGGCGCTTCA &<91FC5:&>.>@.E8<1/2@:20-&@+2.>/C61(;@8>):3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6950 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45150 42 186M = 45361 268 ATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGNTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCAGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATG F#':F*-)<(0@505'$!.$('"E!4?07#8=6+#4.8C"0<@;E'&5;-E?,4+69ED*A3%.G4-G/?#8H/BF9E*0'2F*14?;9/+/><.(;GG<&B<32DC>3@A/7<2):(;-=%D:@>(:1C$,D(3B,7?2H*?4F+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29G120G35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6951 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43525 42 131M = 43413 -243 TCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCCTAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTNGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTT ?4)F*5DA.C?&4:D0(0$?!8'7%;97F%$-:HG1%$;2GD(8;19.#!(14#AAB956%2-/1C%9#DG=2@.C?@89GE#A!.A@?,17.0D-6"48'F.,#180E7@A5#==#E<>@D97%3,")3< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A33G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6951 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43413 42 96M = 43525 243 ATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTT ?/!$H!)*$D<+:;H:'4"3D'*D?>:D9.G?%8):;1='#D>;.FF55=&A=B73<9=9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6952 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1364 42 87M = 1581 258 AGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCA =:D#G5C/-0:C+)=!3B&?$;(B'E=%/:,27*23#'!A$5FC6>'GH=63G6BH%*="=:>>;G;?4'A*+&...0$):@5D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6952 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1581 42 41M = 1364 -258 GCCCGTTATATCTGCGAAACGACCGGGATCTGGACCCGTGA $*)+'#)'++"&&%'!#(#)&%$%%#*'#"'($**!'#'*+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6953 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34344 42 79M = 34561 272 AATTCTTCTTCCAGATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGACTC ?&(*/#2+E%$75H)D1A3,$<=F+6%/31E8.,(3&!;$2/##9A#=:A#@H@/#72!;0? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13T12A48G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6953 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34561 42 55M = 34344 -272 TGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATA ;C/G#;2%C%%+*!9F@-*A7=?;/$'!,09F>E9> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6954 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 990 42 241M = 990 0 ACAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGANGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGATNAGCCGACTANCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCNCACCATGAATCGTTTCACTNATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACNGTGAAAAGTCGGTGGATG )##696@,A0E3<<,,:=7#;#+;<")/&=/&CE0%5G:%)A;5B""@18$C$5;/BE)>.02@%"6?G/C0!+'C3>,1G&+,F;>/>F;(/,%CC@F(=)/5#7=22F)3E>'A)38FB6,#D;A&D)*/$3=/1H>BAE921;G*@#%CA=6H+9:B6!BA-;9/*3"-63)&7:?B@;:)5?!D'C-+2=8=5*E#)H4F.@CD'8>+?'D3-G&:5<171F AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1T48T25T1G9T0T64T9G9A47C18 YT:Z:UP jpayne@0: r6954 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 990 0 * = 990 0 TNNGACNNCGGNNNNCCNGCCANNNTCNNTATCTNNNNNGAAANTTGNNNCCTNACGCNNCNCANNNTNGNACGNCNGNNNGCNTNCNNNTNCNACATNANCNGNNNGTNNCTCANNNNCNTGCTAAGNNNCGN "#$!#""$!!"$#$#"!"$$#$!$#"!$$#!""!!#"!"$#!"$"#!#"!#$$##"$$#"!""##"$!$$!$!#"$#""!"#$!##"$#"$!"##"$$!"!#!"!#!!#"$$""#"$""$!$"!$$#!#"!$"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6955 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11889 42 222M = 11784 -327 ACGCTGAAAACGCCGAAANAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCNCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATNAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCA &""')%'"!%$#((%'$!%$+%*'*)((++'#")'!'*&$#+!%!&!!()#''+'%##*#'""#%($#$)!%!%$$(+$+'(""#(+"+))#"'*&$$$&)!+$(!+'$$#'%**+#%+#"'('++')()(+"*"(+!#'"$(**'"*&)#**+$!!&)*"%&%((%'%#!!)$($(%+('$*'+$&'!$(''(!'&#((#'%(+$*(*#!*)#)(&)(+*% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10A7C55C54G92 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6955 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11784 42 105M = 11889 327 TATACCGCCCGTCAGGNAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAGATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCG ::$!+&'-:-?G-:F!&&6)!?F3?)97DC?/-C+/15?HD:9(+FE,"5&,-91-,.;-ACAG%/8D##7(/;,<,8E-7.$6:=H96)!;9:9,)732!#G:D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A30A57 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6956 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6955 42 175M = 7130 305 TNNGNNAANCTNANGCACGGTGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGCTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGNCCC $&'""!("##&!*"#)*'*&)$+*'()(#"+$#++'&&("+()&$*#!$#)%('#)$(!**#'#$)#''%'"#*$$&'*)$))&#("(('+)!$*%!'!#!!#&#'*%**%$%+&'!('(*!""$)+(!!'#++&)#'#(+'*'(&*"*'"##!%"#&%(()%%#(+%()(#!&% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1G0G1G0A1C0A2C1G5C0G83G66A3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6956 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7130 42 130M = 6955 -305 TGATGAGTTNGTGTCCGTACAACTNGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATNGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCAGGGTGAACAACTGNACCGCG ()!&*$%(+'$#(#("+&*&!$**"%**$!")"'!"'%('%$%*&+*")'$)$(&%!'!'**)&!"%%##%)*(+%(!"$"*+%))&+($'&&&#$+)%#*"%!'#)#'#"+!(&+#&!!)+$$'*'*&' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:9C14G26T57T13A4T1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6957 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9113 42 109M = 9008 -214 GTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCNGA ?E'34(G.&13F#--BG-C<>86)1>$C3@+FH<05#%"$;H!5E7G'&#,-1%&=22/H)%C@+F<7;D62B'#$+#8E3;+$7E@.9E.'C%21(0A50D/*GF5&8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A43G2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6957 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9008 42 18M1D60M = 9113 214 GGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGAC ,;*F"ED<$519806:-"4*DF06>(*DD/H33#149A)*F.;;;3-&$=5$!G:<4(<,,,8-&;257%79&3+"8> AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:18^T60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6958 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38341 42 47M = 38048 -340 TCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGG ,C)7H"F/+0BA;D$E?5*);@BD*,&6->AFC4D3961,25));G% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r6958 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38048 42 196M5I97M = 38341 340 CACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAANGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGNCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTA /A)=2C"+19;CE(?:+?#%%AB"26H%%='7!&96<(2@8@1F447?3?".,C=E-$//:'B;"D8H:&;H'7=..7'+<#G3DH@5"D0%)CB(44AC3HA"8A!7<.365*'+ AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:0A26T61G27T175 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6959 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14302 42 102M = 14486 255 AGAAATGNAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGNTTTGCC *E1H2+">&?4D3%6??@C46:36'-7/.)DG*!E2/C4<>H-11?2%'578:4!B)*CC1H..;C3?#*#/('40%5-CC)*0&;G$@)F'G& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C87A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6959 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14486 42 71M = 14302 -255 ACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGA 1>AA#$G#6!D@D9CA9,%C?G728@#604-"-5@FE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A83A6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6960 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34585 42 109M = 34726 234 TGCTTTTAAGCCAAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGNGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGT $F(;$B.;'<.G:->4/8D8F)0?:#D&B"H6-($.8E5,<8>=C4BD-1#B9G-('?G$0&?E;3H:!".:!2/&1?';1;/%AA3>>@")!'F7/,"G31-F5*'2; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C28A67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6961 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29404 42 118M = 29607 281 GCAAGTATCGTTTCCACCGTNCTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTG ('D.265<615?3,@+975E=4)50B0;FC@:6--11+*/,$#G&B2GG,.EH:B4-&9);6E3:.529'3(',>:4##D2E2;*<0&'9H?7!B$E&A8H*<8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A97 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6961 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29607 42 78M = 29404 -281 TTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCNNACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTNATTA $"(!('!$#$+#'"*!%!$"'%#%*)#')%+!+(+*#!$)'+#+()&$)*)(#$$#"#+)+&')")*&!*+++#$%") AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25A0G46C0G2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6962 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22767 42 237M1D35M = 22767 0 GTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAANCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTNATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGNTNGNTNTNNAAANGN *$##!)%$)(&"($)!%*$'###'%"+$!"%%#("!'"(*&$('+$)+#++%"#*'(#")+$"&$#&(**)#)&!'!#'*)#(#+#")'$#*%')'!!%'!'&%!#%""$)(&)#&&&(++*%+#"$#&"($&($('#"("$)*&'*!')!&'++'(+(%#&+$*"!'*!!&+)+!++$(*&'#$'"*!"+!*$$#'%')#)$'!#"('+)(#+*)'(%$'")&+%*(+""+&&%*'+("&&(%""$&&$(+(')#!(#%&&%&*#)('!'# AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:11 MD:Z:88T54T93^C19C1T1A1C1T0C3T1T0 YT:Z:UP jpayne@0: r6962 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22767 0 * = 22767 0 NNNTCNNTNANGTTAGNNTNANGNGNTCNNNNNCNTTTNTTTNNNNTNANACTNGTNNCGAGAGNNNNCTNGNNGAATNTTTNNGNATCAGTNGNTCANNNNCNNNNCCNCNCNGCGAAATCNNTNNANTACTNANNGNTNTAAATTTCGCTNNNATTCNGGNGTCNN ""$$"!""$!"##$$!!##!#"!!!!#!$"$"#$!$$!"$"#"!###!"#$!$##$##$"!!$$!!!"!$##$!#$"$###"#!##$$##!#"###$$$!!"!""$!$!!#"##$$"#$#""!!"#"#!"$$$##""$!"!$$#"$$"""#!"##$#$!$#$#$$#!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r6963 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46801 42 251M = 46759 -293 AAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTNCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATCAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGGGTGNA =-&9"5:)@!0C'G#<;D73*/7#(06*,*C"?!.D47G-$+(C04>:H4?G#C4>2&:*<6+@&"@(B%E6;"5..A=$81;+9-*#2+=-6.2/BH0'@.:":#+>+F61@)6C,%6>?G#D7/94$-DBH09!=?#890;/$A1=="3A#)(8>7@453:B$01"<"&))@;?F4'A-B5/>=D>;)<+9H;5/=C>#!3+:!F-:50>#A8DAA.(E<'!F)34$H)"1:B!F=!3<.4%G, AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34T38G171C3G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6963 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46759 42 42M = 46801 293 NNTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGG $!-'/91(D+:<801/83&E*0&191F<&<:>$#*<4@:E:% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0T39A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14212 42 350M = 14004 -558 CGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATNTCCGGTGAGCCGGAGGCGATTTCCGCATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCACGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCGGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGNGCGGANC !%#)!+!*(*(*%)%$)*''#!#&)#'""))*&&&%%#'#!&*+!#&#""'&%'%+#(&)#&%*)*&$(%+'!%)'(&*'"%$#"%(!*+!%(#%($((#"&%(*!)!")#&*()!((!)(#"!)&$$)"%&)("'(*+*!+$+*%(($$'&'%)&&'%+%**"!#*)%'*$$'+$!&)#'*&&$"+*)#((++)!&$&+"+$)$''#$'!!'#!!###$$"''((()(#!&*+$'%'!!'"&)(%(%+&+&*'('&$**+!!%&((%*)'"!)$#)$#)('%)!+$)'"(*"%"(*)&))'()!'&&%"$)#&$%#!+#)!+%!%)$"#))')%(+%#++%"'"$('(& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:37C17T7T67C97C112T1A3T0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14004 42 208M = 14212 558 ATATGACCAGCCAACGTCCGATANCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCA 3%5/;D;&AD.;@$=(CF%)!#8"4;=/8;(B(&HE!="0;=5'-A0(1,?37/97!@567/#$'D//.;=2,"!A/6>%:?A,H0$&G3D(2-"G*-E)3.(7C.B<&=39)4&,-CA:%&6,G-B7@;/91(734?9?&>138- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T184 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r6965 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23367 42 150M = 23145 -372 TATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCNTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGANGGTAATTT <-5>D;<#>:@#1.)0*?.$H,!7@7"+0$>=./A)C!!#"8HC'"@"/1:/!4>>)/7F1>G;3.945F#904:*H18&F!.4/)!6%A13"=*+$/8CC+1A!37HCE4H88EG=)F=+@860H$D:+7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:104T36A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6965 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23145 42 187M = 23367 372 GTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTNAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTNTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATNCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGAT 8-=5:1@$/7/?B&H6G<2$(!&'G.4%-5%5+@C1+.#@E&+2"D&8;B5*#5%HF8#?:0=><$0,5;>CB5<4:$2&@4'/78DG.(-@900")#!/&2.B!=)+84*@31.A+<,4#BA?'B#G;G6F:D0'1%%-)*3'7D-/<;B6E(C7B0@>.5!B>*;?:>:$9F.?;/HD)!7B: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19966 42 90M = 20126 263 TTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCANTG @6C"GD?E=H3>D879&$+8,E<=4)F&)@#*>%.&?7D).18H<,0D&.5D5"$<:BBHHA00(1A0B?@8440)824&-@F,!B*D;# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6967 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32445 42 315M = 32760 405 CNATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCNGAANAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGNTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCAT (!+%(&$$#))&!+%%"$!!"*+"+##)&()%%&%'$(#+%+%('(&)##&*&$"++!%"****#+(+)%(*)*$&!%&"'!'('!"!!)$)'#!"*'%%$#%($)")+)'*$*((%*&+&*&!#'*$%(&*#"&+"+&("&%(&'*'%!'(!+*"!#+"&('&)+#'"$''$))"*!!()%$++&&"%*!%")'%"&)(!""')+(*&"$+$'#('+&$!*('%*%)!$**"*"*!'#$"++)+#('!+(+'""!$++#$*("*+$+%"%!%!+%%(+%+(()#$(*+!+("*&(*$!*&&$&&&*+&!"!"(* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C163A1G1A77C67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6967 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32760 42 90M = 32445 -405 GNCGACACGTTCGGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGA 4G*#@H>00G$*A+1615()0412%7*?&1E@>;$A=4B1+D(!1G"%&;E;%")E<3=2,>H?462<<&+!0:$;)H656/85=@7D47 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C10A77 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5852 42 82M = 5651 -283 ACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGNGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTG ?0,+GC>7F?)H%7,<@->F,/3>E&1>#=5B2$HD+!7'65;2":2-(3D%A('7AD@+F75#8E0A4H#!C43&%-5)G. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5651 42 95M = 5852 283 AGTCTGATGCAGGGGGCACCCGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTT )*4#?8G?2="59B'D&;?E+?,@&*+A!$9?.+@=$E8A-%35$<#0;8"@&":F$93'19-.?GC':7?C/-A.?#H0A;F!-E>)62"<):- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C19G74 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6969 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26090 42 55M = 25929 -216 ATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGC ,$178B"7,35A+3DH&C(-AG(&35()0'",56E0>%D"*"6?D(?515E#=?8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6969 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25929 42 69M = 26090 216 ATGTANCCTNNTCCACTTGAATCTGAGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATNAGGCTGN '&!)'#%!*$*+%)#*$'+$$!)%%%+&#)#"$'!"#%$#%*$")%!(!)&#*$)($!!!$$+$&"&(" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2T2T1A1C0G14T35G6A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6970 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43177 42 75M = 42972 -280 CATCGTCAACGACGGTCTNATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTNTTACGAAAAAANTGATGGNA +#+%"#$#"#*+)#'%&*$)"((%$)'(*)")(*$""'$)%%!'*$"#'($$"("(*&)#+#*)'!"*+)$$&+( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14T3C35A11T6C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6970 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42972 42 89M = 43177 280 TGCAAGACGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACC F,=G'01,@+(F>"=2';&;,/=94+!(@?/D<.>9E"?0B93"6; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G82 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6971 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19177 42 91M = 18986 -282 GGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCNAGGA %+#*&$)&!$(#"!(%&*'!!+((%+&%$'#""()$&+&!$#)$#$#*()%#")'&$!+##!%*(**!"&#')+"(*+&&)$#+$&"*#** AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86G0T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6971 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18986 42 110M = 19177 282 NTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACACTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTC *)+%*)!!&*"*#&+#!&###((%#%'"#!&!&)#"(%%'+""%%!$"!*!'!$%#+(''*+++"%%%"'$)#*(!!+&$!+'$*'#&!(*%%!)*&#')&"$#+*#('! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G29G79 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6972 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22328 42 121M = 22090 -359 AAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTNAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGA #?=GG*C74.'#>!C4A7F"7A?"7(3+G:6GD9,?!!7.>G%C:.EH?&-.*!6:,5266;<8<(D6C"HC!<:;)GH#H+4G!F.A!)5/43F'F8*&?69H$"5-7E517'&-/(3;>:@%$$-&E5<(@2?27680$3,?)2,02!@'6:D;/C/&>*90)F"DF$?A<8B%;?/H??<=%5&($;3#A9,1=26@:%1-?A>3,2#5&+-**21,/@#??>+1-%3&/-?"7!$A!.)9F46H2/"'483+4<:7$)5:!')@9.;)*9C1#B,-&.0%90B:*"$(6':()+$G:*54:" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T169C53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6973 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4099 42 68M = 3945 -222 CGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAATAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAA (1E=8H;"67'!>296'E!7/)1(EF +4>2B$G%D2+>*1"+)./%BB('AF;&6@"F9AD&2)% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6973 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3945 42 51M = 4099 222 TGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGNCACGGGC GDHD,D?:!@'?&/B#418%&4"9%?>4=-!"27'1;:@6-22)?<+428" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6974 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33877 42 87M = 33995 232 NGTNNATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATCTCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAATAAGATTTCC )"!""'+#&+(&'#%+%$!('#"#)"$&$$##+%*$%"+$&"((*#$*++)!&#$+%&$!)+$#$#+'++)'('"#!*!!*'$!$#% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0C0A0A0T0G31A40G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6974 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33995 42 114M = 33877 -232 TACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTNACTCGTTGGNATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCANTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGT :%8FD?16#G1GHE1>0-4+.G(14"B-'<*!.<(>7C/+F,*/9(:*7$&G&G0->4D69F7//61*G.F)68#:/90$5D0336) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C9A53C24 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6975 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30579 42 51M = 30412 -218 TCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTG #H*"C+&.E&E61#73G.277@BF78',"5=<9D!$.8.9G"A++;%%+$7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6975 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30412 42 60M = 30579 218 TACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCA H"6'4E3B#2,"6@'7:2DA!A/72$6+$147>;DA2H+=.D=$:5.&<(2"<* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6976 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37411 42 75M = 37235 -251 GGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGG (8&:!-.4*"EF%D,/&($"B5&%8E:;6';H8%;B'+@A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73C1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6976 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37235 42 97M = 37411 251 NCGTNGCNTNAGNCCACNGACTAGCGATAACTTTCCCCANAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGTTTTAGTGGTTGTAA '&))*('$*$&#)%*%$%(+$(*(%(*'%!)"("$*&%)!*('*(**(#%&'!)$%($'$+)'"$)*!+#+&**##&&#*"")%!%*!"('"%*#+) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0A3C0T1T1C2G4T21C42G14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6977 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14361 42 209M = 14570 448 TGAGTNAGTNCGACCACNNGNTGCANGNGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGNCNGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGNTTATCATCTGGCGGGGATTNAGATGCCGGACTTCCATCGTGAGGATGACTGNTGG $(!%)&$(#)&%*&#*!$&(!#*(&"&"+!(#"!*!+!'#"'')&###$$%&""'!'***)$(#)*+*'!*&&*'&(#%"!*&(!)!"'"('*!%$$)($+#+'''#*#&*!**%))+")#$%)$%%!!(&#)!$'%&#+((&++(%#(#%%#'$)&+)#+"+&(("$**%$&!&$!$!+("&$&&%(#!%"*+$&"&"#$$*)!'$#$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:5G2G0C5G0G0C0G1C4G1T97A1G25C19G13T17G3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r6977 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14570 42 239M = 14361 -448 CNTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATGATNTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTNCACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGAGTAACNG &#%*!#')**#&)($(*$#(+#%+*$%$(*$(&+'%#'*'('#')!&+&&"+'&+""))*%+'*&%+*!""%#+*"#*$%"+%*!*#"'&*)!#*'$%+()"!+"+&*'!&"*+$")*$'$%#"(("*'%'&!)'(%&&(*$"((+(!)%&$)&!!$&$("#'%*$&+$#)#%($'+(!%&!$(!%')'!$(&%%&%%&''*#!+))&*+(*$$#!(&(%+#+)($%"+++&(*#)*#' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G25A2C162A37C2C2C1 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r6978 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26914 42 95M = 27110 277 CTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCNAT <#,"7:+)6E3B0/9#;505A8)":09;0<3=,>;&/2H4A' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6978 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27110 42 81M = 26914 -277 GTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAA .!4//7A>:&37C246+,E.>5#!73;!=$C8!<%@93%8"<-2&!$@BGE)-8+-H7$"61'9!+(&D5-8?+@$,HH,E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6979 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17905 42 77M = 17732 -250 GTGGGGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCG "!"!%*&&$#'+&'*)*#&'$$$#$!!%'+%"(%)&+*!)'*!!*+&$*(+&%"*)#"!"+%%*%&)$$"(#$"#+% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A71A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6979 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17732 42 63M = 17905 250 AGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGC 'F>+-!#&82?D1H;>#=B+?925:3C/A.#B,/A17<5%+D!3#678;Nj>+/;;';B= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30017 42 80M = 30166 213 AGTNCNTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGGTGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCC )**#))#+("#*!)*)))''"(!&*#(*&*%%!#(+++#*%!*#+%!+('&'*"#+$%#&"!*"($"!#%+!!&"!'$!* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G1T22A51 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r6980 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30166 42 64M = 30017 -213 GATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACNGTTAACGCAATATCCTCGTTCTCCT >5<0;D.=@!:E12CB:A%1-G'B>52,@&B.=@&6A6/5'0*B=7A0*)//H&BB3E:D6?85 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38T4G20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r6981 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39720 42 94M = 39845 232 TTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTNGCTAACCGTGACCAGAACNAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCCGGAAAACC 67>?2'CB,B>!1>#3$/30)DC66:7%=;39>%E)6!-6'338>.0?>2&<+B52+/:)%,D14"/9,3#3@H56;@>045B-)#E%8D!/3/B$25E@0CCB!":3:;#/9<:1+*D9+.-2544%+01,C&.342"EGEG9&(-6"E88?GE%!( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G97C1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6982 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46635 42 54M = 46780 242 GATGGGTGATGGTTTCCTTTGNTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAA AG&=&0>&$.-*0"/;.>!B/5(!0+4D-A!FG1BE/2-!6(1/@9+:%;2-6+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6982 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46780 42 97M = 46635 -242 TCGCNGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAA 1.?"?EDD9*6/:3>*@#2H5&GB(35"<'$6&(+71!*75?%'64;5H)H,"4A:GG42(5#,G54/=!%=+@45;C)2B1BD,#+H085-B6=4F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6983 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31168 42 116M = 31049 -235 CTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACANAAAGGCCGGGAAATACCCAG AD+5',E?F!%G&%&:)4$F@983C1<:F%>+336)$7D@%&?B17=/@(A/-#!-<%<4>D/=)=4&C$0-9(.5%-<%+H5G-%F%(<7%(=@)6743F"$8/#--1'F!E9,; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r6983 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31049 42 112M = 31168 235 CTTCCAGCTTNTGNGTANGGGATGCGGNTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGAT $($*)*'(#'#)"!'$*!+%("$#%*++"!)!*"#+#($*(#''"$$$)"!')!'$#%+('"#*"$+$''"#(!(("(#*%*$%!+#)&''''&*'!!%)'&%"*&"+'*!+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0T9T2T1A1A9C84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6984 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41316 42 107M = 41136 -287 GGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCANTGACAGA 8;+/4%8)9G!!'DF!),A#&=2H+,61(#6D/!C<8HH%/'783)3>'!?8@27:C%!3+9*43)33:760A$0&'FF+3;B6G+"/B;+0$.C/@$;B;*.F$2($>AHDE7'=263>)A7)20+B?9/E6!++9,@G"2."4):?61C"BCA)3FE( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:37^T34T18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6985 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37928 42 80M2I41M = 37814 -235 TTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGNGATAANTATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTANCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACN 70?)/DG&)%41DC93>-122*9?;7H%46*BGB33E)E:8<(<"-BD/C,D!H$=>6"C3/6@$D! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:35G5A30C47A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6985 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37814 42 82M = 37928 235 TCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGC G/@76:-.<$89H35(2#@6'3B!95&?><8;(B2:/$2/+FEH>)/9#0;23((+H%!!8+F/)(:)+#B>>ACHGG=B7+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r6986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29803 42 58M = 29972 212 TCAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGA (!)&2+@+8>5(5.E1-DD)6?*AB!A&3*C9@<0*F%"=+@B"9A>5,G>?"D2$47E9E:H"=>',46C!+/>30G=4;$G&<2.8H9<*G="/43$9@> AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:8 MD:Z:17G105 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r6988 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31353 40 73M = 31534 240 GCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGAT C+A1H+7!3(/%!8=)%G%!A&AC=A,60;G<(44763$@(!-<7E99=&26G-0"#")@/07:6<1C&2E@# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r6988 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31534 40 6M3I53M = 31353 -240 CGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAAC CA18A=%$93(D1-'>>A&$@+6F@-#3)!EG)=--H:<'E3GA8"=8&5.%"31.E6'0-7 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:17A41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6989 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28755 42 185M = 28643 -297 ATTCNCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATACCCATTGTTTCTTATATANAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTNTGATCCTCTTCAAAAGCCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCNTTACNN !#!%)%)%%""%&)((*+!&#(#())!!)%'!)*)%#(&"#(!*"%$'"#+$$)%""++(('##+&&%&!&''+$&')%&*&!%)'!''%*#**+*%$(''(#&!+)"##'!"!''+&"##&%*&%!&"&$$)%#(%&#)!)"%*(*)%'&)*(&((#&#%"!!#))*$!%"$+#&#$!#(*)#' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4G57T17A49C16G30T4C0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6989 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28643 42 112M = 28755 297 NAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCG !<47%@#G/(>/A40H4@:B'D3&>(+AG:E?15(F6'924A>%7?FC%%,.E:%)$',!H73/'F"131C0F6962"9'4=$6:84'@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A18 YT:Z:UP jpayne@0: r6990 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15768 0 * = 15768 0 CTGGTGTTTCTTTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGNAGGTAAAGCGCAGACGGT 8-1-%?8!5B:F"4EF(/0EH43':3;89%D;F,'?D-%*=*'00A*+-D:)2=H@@ADDD=0*CA09!2273F6CGF,8>')0A@8.DED/F"+0F@.%9!-#D=@&5)1-'!B%?:!B!-=><5"$GC(?#,?/"98D0!=A&3EG=AE YT:Z:UP jpayne@0: r6991 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48241 42 60M = 48241 0 CATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGA 9-5',!>'@>D>!"<7.G3,D3/G*H+,8(#E-;?;#D38'#+H&F-A5,<6:.*B47:. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YT:Z:UP jpayne@0: r6991 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48241 0 * = 48241 0 ATAAACCAATGGACAGAATCACCNGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCCGTAAAGTGATAATGATTATCATCTAC A.@C&2H'A(5/989&/45E,?/#B6:72/B/+=C!$#BDF(<&D;*6!,88&.60H3&D.$C'7(+#61C=&-7;3+- YT:Z:UP jpayne@0: r6992 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20249 42 140M = 20423 221 TGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGACAGCAA G%,DC(G<-69$(/!BB9>69#F:>!'/6G;B?:H(9>A),>3"D$(/H7!.?-#D%571-0A,4=72?(),G<)&E1E0-%A-H(4A!$F2@)/75(+,"//:7F#1(C,F$6/H"1-8)HAD521'#F!H(3*A?E-& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133G6 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6992 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20423 42 47M = 20249 -221 TCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGNCNN &$)#"*)$(%'(#*&!!$!$!&!#(%%#%**+&!'+)&(*%&)!#$' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43G1G0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6993 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47622 42 57M = 47797 260 AGAGGGAAATACAACCGACAGATGTCTGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACA #-755H%6<:>.A!G/&9&B-,<$C@B,05)".;5/.6A3FB1'E7#,46(&4507A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G24A31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r6993 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47797 42 85M = 47622 -260 GCTTAATANCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATATGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCA =$8&F);3&F.=55=:0#%H.-@H?A+2'#5)@,D=2,"$'%+8'($DF(!AH;B$:&&:&*=%$!(7@*7.#&#*(%6C-?D:& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G50A25 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r6994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41332 42 46M = 41472 229 TCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAG .=6B#8??<*4?+5/%"<<"!D>9$C?#(@1$>F;!G'8:4A')5'-=<.0+?*4=44<6(8)&$30-F5%=!HC"1!(G@<$D++:1=#B# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86T20 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r6995 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32907 42 149M = 32755 -301 TCNTCATCAAATGCACGGGTAATGGATTTTTTNCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCGTGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTTACNTGCGGTCGTCTG #%)))'*%!('+&&#&*"#*&*%&)!%"$&"$#***+++)$*!%'%"&%$"*$#%!&#%'!)$!(*)(!)'(+"&#%(%#+"!%"&!$!(&*#*!*&'(+##)+%$'!'!%%%'&+"!%$%*%'!(&#!+$((!&)#$$%'#!*&'"(( AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:2G8C20G60C8A30C2G0G3A0G1T0G3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6996 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7028 42 40M = 6885 -183 TAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACN ,0?5%8"08+9)A5508B-9,7HC8)HDB3G*B;">$$G! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r6996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6885 42 52M2I74M = 7028 183 GTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGAC (9,E!E@:+C6?0,AE/'&?91>E"F>4C=7.C28E6->3-$H3)/$/.@3-"64-(;92H82(9B88<<1,:!4C/9#79/@GA+DF:8D==:9;*4&!%D3F3/4BC;<@539DG&/1=G;<; AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:126 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r6997 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26921 42 211M = 26878 -254 TTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATNTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTNGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTT $$!E',)?A1;3'A=DF24!D+B4,357&1B0/#G7%$-#A6-89%?*6'B145/C37.=HD*$7CG%6$<(&#::!E',)'.5)A.98G=/:+0@):7'AA5!B55(BE>4:4GG3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r6998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2631 42 99M = 2985 397 GAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTACACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGG $E046%(7*1<*849E(>#?)F'A+4<$%B6/=B.!/H.8+;E&/E*(@?+E*"=(!/$&2;>&A=15*/?+!#G-A>*8'4D?"?C<7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r6999 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22672 42 94M = 22548 -218 GGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCNATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTG )71%(#()C>:'7?=$A56/!>2+!,67!)=F+2C<=9-9@-F=G%!..'=4C0&&*B$5B>"=6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r6999 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22548 42 109M = 22672 218 NATGGAGTAATCGTTTAGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTAT !9F!54A"%&&5>B6C",@C'F!"61+'H'#:/FFE>'.98173-.4.$@6;E#2='/?3BE(/H;E1(')F&**5#(G!&&:6D02G*=@$#H'&$',$A2/1%.?1, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T15T92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7000 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 346 42 62M = 346 0 ANGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCA >-(9>D*8CE1C.6C3>=C?FED;E5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7001 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39750 42 146M = 39896 239 AACCGCGACCAGAACNAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGAAACAGGTTAACGCAGGAATNCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCA ;8,,8%"C(6GGGD:0D))G3$@.>/40)<(!$9$H"(?G-.G&=3++4+!/H1";=:H+:,#=?+2!E/'CCD77*+A=?+.%!;A&,+F4!@C+9:!A"'G66*1:"E@!<7;<(GD5&D5>5CA5 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5T9G62G19G47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7002 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46065 42 88M = 46156 202 AAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTG 4'.<-".,EG>08H$040#4H?C.!FF):1;+#2?$#6A"8@,(+09H"H",()$'GG79-F)>B&(H5-6@;;9'H!9.A?0*F3D. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7002 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46156 42 111M = 46065 -202 TCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGT :,7@2E;"'D9&'?.&@#6)#/H@=+GG23B*D=H+@:24.C=:/"FA-!1?77GC8#$0&1$HD$A@<")2CF=F"5C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81G29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7003 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22954 42 46M = 22775 -225 CAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCAT @+A&568!F&64D<,D)9.2=9=(&:=>#-#'#:>#(<8=D$B(E9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7003 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22775 42 179M = 22954 225 TTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATC (2BAF.:?;*!2:9/+0#B:-93*BA,-(5$>2?AG"/(?H)@%'E0H4,$(*@@;,383.?$+HC793H67G',GE$$C!F?E%9BDAEA1?%CF$9;?D=?>AG'*4!2$1879G.H!=.&AE5;@66F3@D<43"9B)"!/G?1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:179 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7004 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39939 42 113M = 40185 291 CTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATNCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGN E802@#D""%+?*-(%'32==DD3H6;9+%C,E*+$G,A2"72@C;4B&<':>49&6:=0"*B&3>AA./)$BG4;967F)E%=A2:-99/3*@"<10>=*0&"",*@D7)<( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63C48T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7004 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40185 42 45M = 39939 -291 CTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTG F:8=9/4G$A9E-12H>;%37E+<;;(3E$8$(+7B+A#G+@A*, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7005 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1442 42 169M = 1611 277 GGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGNTGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCAAAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATC (%'+(()'+(&"(&&&%)+##"+($$#+')'$%$*("%"!*"#"%)"!$+"*()*&%)+#(()%"*$&+%&'%!%&')$*($&+)'$"+(&*$))#&(%#$+"$*'%'&#+%!&+)"%+&&+)*)())'$#*!&#+*#($$%$$")$$+&*()(!#+(#%&&#%!%!'! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:62A33T1A70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7005 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1611 42 108M = 1442 -277 TGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGN /386!@'+@6G?6H(BB==C)4;4+?/@'F$!G=./%GC?<&,'91+%8>8)1'2+%&?1*CG"9=!@E4;CBA/4"3=F78'4@*57H.$'%2'D-E4)$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7006 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37698 42 105M = 37826 348 GATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCC B!5:B;EA/8*#0C(H!-3*))E#+0.+1&&2H$'&,*76'4>75B<)4H1G)@-%D&91.1)>-?0.)?C4#'')7&53&//*542C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7006 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37826 42 182M2I38M = 37698 -348 CTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAANGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTANTGNTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGAGTGTGGACTATTTTACCTCTGGNGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGNAGNNNNTATNGN %%++'(!(&+)(%*#*!#("!&'"$&*'+"+"**('"#'$&")"+)#*((&)#$*"+%"))*&#")#%&!!)%+!*&!#&%+#!$$)"$!&#(%*"((&$#&&$"#+*&**((%'"!"*("#)('!+#&*+("&(+*+((&%+(%#"%$'!("#)!!)#%"(($(&!"%+!(&$+!"!'')%#)'%!!&*&(%""+$($("'"%)'*)+'&$$!!"$))!)" AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:15 MD:Z:60G32A2G61C4T17C25G2G0T0T0G3G1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7007 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6940 42 68M = 6730 -278 ACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGNACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCG &:708!G+C5;>3H%,$!)H7/.=H9!B%:6C&+49&'7'7#!55G*!525D<3;4.CB.$E?/1!F6;1:?)E; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T93A14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7008 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42911 42 189M = 42752 -348 GCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACA "&.)3:D:G%6>))B>9<#(%-&9B-C0#(2A+9#(,HH@9E%$.*/A1."3,#DDC2?A:6EGH3:2"C51&1<*2=@2&G>/371/2&HD3'%?%9AE77*+B,%??71>GCH)6;0GC#"56!1@;D0!('90'1684!."1C-<;+#/"<,@=B>"3+/72(@81@8C>@&),H>-6H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7010 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41310 42 141M = 41203 -248 CGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTNCACCAAATACT 0:.?".4'A#2++'4>=0..B#DAF"4?+H%4*B-$F54>.25:B./B>D:E)1C,D"A2#,<2;)A>>G&<3?%F+56888/,4!+!!0..=6>9/F@517C'3>"C/2C<4*818 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:129T11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7010 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41203 42 101M = 41310 248 TCCAATGACATATCNGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTAGGACAGCCAAATG F5?,/&;5A6>2$,E*?&54.;ED7.5<.'C@%'5BA-E89=D)!0DG56>A/A1#B&G6,6FG;H*99D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G72T13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28162 42 172M = 27967 -367 CAATNTTTACGCCTGTTTTACTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACACGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTC G*9"))6DHA8D==804&GD3$4%E%8:A:(**F$:F6,#B/:6D&:*#F:8%9(B$?!)A5H#,G0&@B>!'1A@%24'7,CA,27G/%2D+(FF6"AG'!/--A$(<3/%D8C6"D,ACED;A!(F!*0'$*E@?36,#&*$9=,4.@9F2C)3)5H/8"$/D)#$3#+%1%0;3%CC$HA7'9(DF6.!1A?75D"/F3!&E-*$0/,*3C3&#$+2E;#-, '%>31H;6G&(5#ECF%/!%@#>5-.$3+4214%*&=G@!64-,$'=,57E!C)68=5C%F<"$5C,@#B0*'1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8T31T91A31A3C6A19 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7012 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27256 42 75M = 27372 212 CGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCCCGGACTTCGNAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCC 43>.%#AC+CF'#:F7E>.AC-1;)389:0#?6,F5@$D1?%*B0*!!)E8#-?*E(06/<8!2>=7C?*2$F2H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A9T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7012 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27372 42 96M = 27256 -212 ATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTG #F@2".>/>,2!3-,.'0.+*,'/107,B-F(G#5&2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7013 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40163 42 84M = 40247 306 GATCNCTGAACCAGTAAAACAACTTGCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGACGAAGATCGCAGAAAT ?!$7G2)A0=/1*110=6'/0%E+0,4GG2&F:5FC3A0A?.6=.&8:.>!(2%/#.?F0+!0"BG,4A'548&.<6,9:/ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C20C41G16 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7013 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40247 42 222M = 40163 -306 CAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGNATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTACTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGTCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACNAGG 2)?#!.3E,,EB1?$.)0:5F(9E5,G.0B+/%;G@E5-%:4B?500+B?>D=2#.,*A2? AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:32T49T29G97T7C3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7014 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5819 42 46M = 5819 0 CCCGGCCGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGC 2>'A17E)6$1*#C5$H(,8<:9$*;E4!77G.%)"53-(2=5##$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G39 YT:Z:UP jpayne@0: r7014 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5819 0 * = 5819 0 CNGATNTNTNGTNTNGNCNCNGGCAGCCTCCGGCCAGAGCACATCCTCATAACGGAACG )!(#&$#&%&))&'&*#&&'+&%($!)#'%#$"*$%%*$'&!#$('$##*""()$'$#* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7015 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16055 42 180M = 16235 391 TCACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACANGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGC C@'8.A$;(6.>;<-,3:"1?C,87.-120F?1'%#/$!!8&;?+&%0876:7"1-/4*2*.@%8$+-.A&@)/."1G.GCCF?3='?"A9-+%C'2C2.<"(G*;2#!/G?:3%>6(-.$&C0+6<$@=&C2GH%D7D80=F)%ED.<&7)$*$A33A*DB4D)H-!!G/+;C=&>%/1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G91C86 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7015 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16235 42 211M = 16055 -391 NGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCCGTATCTGNGACGGAACGTTTAAACCGGCATANAGCAACAACATGGCCTGGTGTNTGTNGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAANGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCNACCAGTCAGTGCCGGA ,)C(.8FE0",-5A<-<$0F)0;+65=;7H=38)H+$B;?$!'#B2="!>2-'7#FDH.B8%A'2CGEE8$97H;-1'30'=*G=6C<"/CD<04A31(#*$9$/>!0#>@5-:*?*6@76<3*'3-0'4FB:)(;95/:30#G,:!0$H9:6*/&,*C42>G3*=$8FG?EC%G3G@DA4?"1)"1F>++==:3=#)D+70GCB,,*#*@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A40G7G23C21C3G37C56G16 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7016 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45223 42 241M = 45159 -305 TTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGNTTNCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACG &92-E=:F%-4)6:1<@?;G+.A54BD1$,(062)!0@D+)!;;A#&GA2'01'81-'=$%%)(<@<4%!FD6%>5==4ED$9D5@#C8>"3+/:,77%+&C&@59=,4;.FB(>=>#$E!D7D7;D8G!HD?@9(83+&!@3B6"@-E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41T2G196 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7016 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45159 42 64M = 45223 305 AGNAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCA ;5!+1!<,4.@)7?3A"=H'7#HE';D#C(*"780E%;1GG6=9#06&1/F622C2EHG!'B(< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7017 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40707 40 28M3I83M4D241M = 40611 -452 CAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTNAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGNAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAACCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTNTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGANCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAC *=$.31:CC6((%F7!"!(#"#>6$'5DG%4@C"?*1%56;1DA@'$G,19F+2(/FB?/AGB4F8'HD!)FFH$F2&.?1:?4.G!3##!:G46G>GAEE7.-/G0"?")*=.91+;&AG8,9H$@%8.=%(@)>4@79+;F=026%;(F#6=!>'6'=!;;EH$G45HG2"E>0+>9(H'9(:1(%6E/@"C1%8))2871:4A7$(6->.%A>+%!*'BAA9,#,3@&8<047005.?H=%?D0(B0=H75?53.1=-G,5*9417G-HC5B-DDH-#8.H7=))H1'"7E.:E;;8H**C0F"*$D53@>=E<@DCF;:0>C'33#5" AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:45C65^CAGG38A25G37T51G85G0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7017 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40611 40 14M5D77M = 40707 452 AGCAGGNCNTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTA '78DD."(C0)?,#5#654?'E5HD6HAC"0&4@*+61H1%"!9F$:8A0*6GH*35<=8CA$B)H?:09<8#F<22?E"D1><-!0E4%5 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:0C5C1T5^TTTGG77 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r7018 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15907 42 53M = 176 -15784 GTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGA -'6(;D=<"@8*009)>4,*D3>E<=G4CBD+"#C(%.%65)(G%3#2H&=4C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7018 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 176 42 54M = 15907 15784 TCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGT @:1*%;,6FG0"G1);(A55@%CD$D4A301&$A7"(5CB6@H?'(0F*5"(H$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2141 42 133M = 2274 462 CTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCG ,690(4@FH<(F#=<$2)+4<)'&,2B?:%':+4;EEFB+;*8>,G46)+9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2274 42 329M = 2141 -462 AAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACNCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAANGCGACGCNATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCANCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGA )'?GGG%FD50GH&54G%1>/*+3B7:>8#,5.@DH-)E>!.3E12/*C.3,C3>@"5##:;(#HAC0797!D+D8;%G$>(3#:.B(B,46:==5,""%&7%56*!<>6'=CG!E?@/A=#A$:G-&:5A09E@>D3D00.CBG',!G*'4!8*2G3967!95'=1!>67*/0;01:9:5484C0.'*(=8#BG>;GF@)6B&!H3>#78BC+*!(#A#0;&?CGF#%)89@@G-B="DC=1H@/)C.8*)!04DD?>:">1,/"6F(!+=7H1(0,39%)'C@G@'D<;4),D7H9.:H-"-$E$D$%71@*F=-%0B14<7+?8>!51,.2*36D1!H2"/2#"7A066E#+,61B4G2!C$E@E(31G;."';9%-A80,F6FCD:23<>AB*#%1=-03A2++D4B!B(&C88,,/.A?;B"*@C<45G2B:4EA*@837&A3D?%3@EA%3F%#E&&8A*$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:196A46T0G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7020 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33141 42 62M = 33203 307 TACCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTANGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTG )$'+$)%&+$+#&(!'$%+)(+#%*"&+&&#(!+*(+''$+#'*)"%*!!!(&(+(%+'((+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T25G33 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7021 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35727 42 172M = 35947 285 GTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAA 4"F?!6=&A+(C%/56/+*@8DE>++=49@80!E/*7-:!!38*A$73@.;,H/:5/6D.83&2C:?-(>/"C3H!5$;*2E(>HA$D#5+8?3'(52H,&D,/,(5:0?$$#DCA7H;4$/&+/&?C2@?%?:%#.EB$"7B6:;#GEC/) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7021 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35947 42 65M = 35727 -285 GCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACAATAACTATC !%1'(G;*E1"D'=)#3?<(=@06>GH')26/3#>7>B#-GB8@9'<:)97E;G"'2G4*A7) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A2A43T3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7024 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11625 42 53M = 11439 -239 AAGGCCCGTCTNGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCA >;#B80#>:DG45G)$@0%F,4+:';0>F?=6('$$#)=""!.>&=:DB53&@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7024 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11439 42 186M = 11625 239 AGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAA ."8:;4E*/#1(EH6#9>=&;$C=C9A,&-#(9C>'/2EC;AH7=!0&+C?6?@9,4""F>1,!6",7:H2-=B40GC-C&A%09==(/>?&,D77'G20<$,3D;;"B2E#6#!9F@&0-72D8+0$-3D1.9;G!*1:0BCB?;2A/2B1E0.D&76"D3'&#+6FE6!!/@;7G(AH":2674*)>(98?? AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:30A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7026 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29693 42 35M3D10M = 29523 -218 CGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACC !!FG,@!GE9%B4>+$C4<)%?620E#$639;!:*1?,$A%#A7B AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:35^ATA10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7026 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29523 42 170M = 29693 218 ATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGAATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTCCAGCTAAA B<+G,$+/1G"?4/$=@/!8B*E9"3=C0G#(!&-09C?-H4/E%,7&<(1%BA!BG2'D'D56B:E)(25*5D#A--8;+C3%2>BC)(EG17H0'55>A%'(8!?@F+AF+@/AG8>6+E8481"(#C+53,HF7,3C,$9>20-6A(*$BCAGG??"F44H$)>%99 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C107T8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7027 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31597 42 160M = 31757 394 GNGNTGNGANTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGNTCAAGGNCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAAC "!#&"&!"*"(+!(#$(*(#(+%)"*&(*+$%++(+$*"'+*!&%'!*#*$*)))%'**(+"'!'"(($(('')((##!+%*%#"*!+%%#'#+"*$")#***(!(*%+($"!#+&&*%%'&"*$&!#&**+(()('(#"+#'"'+%(*$$+(+!+)*&" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1A1C0C1G0A1C35T6C107 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7027 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31757 42 234M = 31597 -394 AGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAANTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTANGANATTNTCATGTCAGGCCACCTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATNACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTNATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACA +&*$")+'%$'&(*!'%*($*)*#'%')%#*++$##+*#+)!#&%)(*!($(+)')"!!!)$(%$##!(&'%#!"*#$$!!++%$#*%"*#+"*&+(+*+%*$!%&)&!%")("+"('&$%+%&$&$(!$&+*!**(%%$#&&*(&$('+''&&+#&)(&#'$"))"&$!%#$%"$!&"**%(!!&)(*"&#'""')%((%&"')(#!%!#'&+!*!($"+!(&*"('++*&$$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:55C48G2C3T14T25C23G57 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7028 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43251 42 110M = 43366 284 AGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTC 5>4C1H'.>&9C?=:''G,$BC*.0!H=021)G6*$H)%$:3?/,6D0A/%%G7!?$5H:+&"%B"&A+9,8,#!&*1(,&82&8:&03.%'3%7117&,-'4877:9,D503$"/D(( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YT:Z:UP jpayne@0: r7029 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33979 0 * = 33979 0 ACTAAAGCGANGCAATGTACGCNAACCGNTNNCNNANTNCGTGN ("##&)!*)&$&((!#$#%!$#!#)%$*"#!#)!#)!)!(!!%) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7030 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7163 42 179M = 7418 303 NTGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAAC !H6FH-&/7B"6C!@G*$$;804">7<2E.:/5;4GH''7%2)6!/7"H#:&)7EE$(%14:!.#A+**;-025:'#!D."(.,<037>D73#:>#F$./ YT:Z:UP jpayne@0: r7032 141 * 0 0 * * 0 0 ACATGGCGAAGCCCTTCTGCGCCGACGCTGAAATCCACGGTCTGCGTTTCCAGCAGTTCTCAGCCACAG =,6CF6F;09<-A1,?9&.863D7;2D03CC*A7*&<9/$"A1+5-AB)/E!&(-A57<>G0$AB'67% YT:Z:UP jpayne@0: r7033 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26502 42 60M = 26337 -225 CTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAG 83.!)%9-"A%:<;=6&%!="')++,3,@8G5'&1>/54=--3#%D,86-).@*<#@$FF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7033 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26337 42 110M = 26502 225 NNANTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCANGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGT #"+E77C$*&C6999+$<"3C2-!#D&D&G:!5>A8&#>%B$%%:C)>.B=G*#!=982-'!"D#(.$+G,;8G9BG@B(A6&;D YT:Z:UP jpayne@0: r7035 141 * 0 0 * * 0 0 AATCTGTCAGATCGGCNGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAA ;-CB2C?G&-2.0,1E8A':/"=0#!**D<;;#>A;8,!48%FH5(G62A*AC78'0B&'>F(,?(55/.;A@$:(GHG''#+'&9C8G2)++*-F%4>B(.GA8F+A3**/#>0*,E563=(&$8+F*')?91+!>%7B9,+4F/)#CHC?9*=(';;3")<+07/B+1F'+(07:3:>#'@:*5E6,D$.$:GGA6@49&?F+0<*B'<%7D>4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32A22A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7037 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3093 42 103M = 2995 -201 CCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGNGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAG 7,E;@C>D;@D/D%@7=69<'?G"/".-2$=(E-!%)$2547.6)@9B42:+:C@5".2'6AE!?+40.(+#C;;)CF0:&E##%"GG/-H9EE)>*-:1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7038 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11972 42 43M = 12164 236 GCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCA DF#",+>=$))31G#?446>FG*8G<;B<*2.$6"(4=:93H>,-1FBE@@D,!*G-@>@6-8=DB% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C11A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7039 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42605 42 82M = 42386 -301 AGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACGAGCCCAA ""/2*0?3,!&9*7,>49%@$16!5C6+'0B!G+F@"2=4#+-H'DE8(H3>(E2-?;E3/-,.=GAA&*.+5(5@"D-19/-H<+1G9B#G15'>?C<;1H@2<6(.,$G$;53B@%.=61BC%C>HB7F)#=E$,+F$=<.*##=D>1G(3)$)< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7040 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32818 42 58M = 32876 223 ATCTCTCTGNCNCCNTATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGAT %##%(%%'%#""$""+$&%'&(!"'"%%$+(&)'(*''$*&""*%%#'$'($#''*(# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A0C5A0A0T1A0A43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7040 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32876 42 165M = 32818 -223 GTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAGATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTC 9;+<.7-/*")G7E4;8*(/90:!D38;A=5*482>"FA-/),/.9:D$'>4:+4!>,*18;@59G$)@49-4>!H>F19$F=3'H.>$7FGG0AE9+<"A6916";(F/3;5'2$09A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83A40C40 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7041 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 833 42 162M = 494 -501 GAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACGGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGNGAGGTGAATGTAGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGNTGCTGGGTGTTTATGCCCACTTTAANGA '%%$$$&()*)("!&*%+)"%!*"!%&)$**""$)+(&%(%$"#*!$"'!++$&"+##!&*"('(")('%*+!"'#'(&%)"%'%"+!"&!'"'(()#!!)#*%+$%"$)(+))&'($*"&$"%+(""&!#++&''"&)'"++%(**')#&"$"#+#+%'&' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:38T48T11G33C17T6T0A2 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7041 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 494 42 327M2I12M = 833 501 GCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGNATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCC C-@#!B'F584'D(DBE23G&'BH'(/H.,C/HF@G4E#H>739$620+%(7$5?=;8,1+A<4;D&A73#&9%.B<)F9G1(H+1&99?1F/&-9CHC)!?=A&,B-59&>F7*30GG8C:-?/+BA2*;G"#'CC0;'4;)&,0="@<+F)D.9A7%2$9.6(91.30#GA4B5EB;/E.D$+6&5-3'?C70!G,+<3,-/!;<6%0##1@#0:7)=A> AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:31C227G79 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7042 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22732 42 272M = 22684 -320 GAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTNTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATNGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTNTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACN ?FF=;7"C-7/AB0!/G9E*-=")9(+')5:6.)#6%7CF#1?CA?+7<,GD@4)!8/8F"'98<0!45;A(E1A//!53.!=8HE+?D>=-57,<5?3G!=%>#?'C/%"1GA6:#!!/3=B(@!!5%51@&8;F'&$(#%5B3D@$.%5B6(*%1B22C??4+8)(+!'0$,;+0GH;&EC7F-=E::BACF-& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:107T73T61G27G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7042 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22684 42 48M = 22732 320 ACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAGTTGCTTTTAAGACT 5,A94DG@56A*4%:3G2E2=9*FE<&$:!,3=&($@:9@8"!8B6/= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7043 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22397 42 198M = 22595 282 AGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACTGTGTTGATACATCAACTGCACGTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTGAAGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGGATGAAAT ,<>(!E>!0H0$G5%C<@'#B:"4A32%,1<><-;&&*GE864;(B28<-42@15$62#=8(/%E!"4.++9;=D&GF"645'3>$>*1D:)H&821@?*.1&BF*583$68&D!.>'7.$71$@D;-.@?E=-<.A>1'4C+)6%+B)"E/#B:#CA$+'D'(G-AH,GDD3#@'F>.40F///9./'*(671-)@= AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:101C21C27T1T36T7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7043 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22595 42 84M = 22397 -282 AACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGNCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTT 846@9.52-D:E/*8B'E7"G:'C:@7$5)?E>(('E!B'E3B90,;4?D1C%G)F!@2G5$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G16 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7044 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45322 42 160M = 45282 -200 TCGACGCAACGATGTNCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTNCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGNGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTGCGCNGNTAAGNAGGN "&%&&'$)(+$+)'!%'"('#$%%%+!&!$'%&+%)$%#))"$#'(*'%)&$&'"%%%!)+"(%*!&+$&"($"%%''+(*&#"(#%+)"&"#)%#&)'#(&*)'"#&$*!+"((%*%$&%!((!+$#*))'(+#(*&)!*$"'('!+$*&)*)"#%%'# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:15G38T36C52T3T1C3A0A1A1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7045 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44307 42 66M = 44307 0 TGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCG "+'(*#!$)+&'+$$%##'+(*+#(*))%')#*$+&#%(+#&+&!)'**#*('!#$$!!%%(&+(! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A65 YT:Z:UP jpayne@0: r7045 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44307 0 * = 44307 0 NNANANNANTCANTATCATGCCGTTAATATGTTGCCATCCGTGGCA !!!%(!"*""$'#'')+&!+*)#!+&*$")%%$$'&#!)##!%%"% YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7046 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30825 42 20M2D48M = 30646 -249 TGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAA =;+6<.C",+2=%"9&D*A?:)(/:$6F'42)9">6AHD5":B AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:20^GG48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7046 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30646 42 48M = 30825 249 GCTTGAGGGTGNATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGA $32/EEG7$)3"%%:/0<1@:=$"A0AF<%2C:*CFA5G1%A=?B+H-*8%8)5A;0>+&$D'(2)/6>'90&35!"@G;>95<:56A9%(>8?<=$:1:%?=*H$:;$/C-'708?F:5$F<5.3G(5$'B3"7/2373)11/-.),A'11',#87>B4*(C(A:;.=#-FF,E?88:(2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89C68 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r7047 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12361 40 142M = 12203 -300 CGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAATACCTGGGCGGCTGAAGGCCGGCTTCGCGGGAACTGGANGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGNGTGGATNNTAGGACNGNGNCCCGGTCAGTANGACNTAGNNNANCANATC $**"')*''$&%"#""('#$(''%"%''')*)"$!"*"&#%*%#+%%)#'#*("#&))"$%*")&+$#'!!$!))!)*+%"%$"+)#&+(+"("+"+$&*(#&$*(!*%$*"&#''%$$(**(!(%)##)*&#!&"#"$%%& AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:29 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:29 MD:Z:31G16A2A17T22A3A0G1G0G0G1A2G0A1C1C1A3A5T1T1G0C2G0T0A1A0A1G0T0G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7048 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38474 42 46M = 38276 -244 CAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGANTCCAAAGTTCTCAATGC 5%,!.$&@,)A7H8/1$#@E00:=E-=+=2!3>0G'263*B25+6* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T17 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7048 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38276 42 198M = 38474 244 AGGGCATCAAATTAAACCACACCTNTCGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATAGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAANAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAAATGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCG :%A-3#+011/61$7)94@-0G?12H28@)4HB2.E)H%A=556G,87!5,=<%-';>$::8EG';8B%-":0)E3&=@E=F4;E"44,FDH32*<.F7:2-'E=D9)@@*$*5;1EE)!:!#&0,$@?4>5CF,A'E)A(+:,EA/-FG20>#A(;6EE%!(##D?!5.1:)*%BHDB(69%>;*/6@AE%1%<'87 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:24A1G33T37C61C37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7049 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19277 42 67M = 19080 -264 AGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGG $A!5-A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7049 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19080 42 61M = 19277 264 CGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAA ++!;*,;#>6;(9G+?B8039,<91'!G&;2),G34C21G?'$=C-C$+/F' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A12A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7050 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20780 42 40M = 20502 -318 TGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAA +='05:$")6DD1F6-*6$@*F*++<15!8;050#.*+01 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7051 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12327 42 56M = 12066 -317 CGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGA %C9BGA<9G@D%&4--:G+D=E/$")384H1.<&"<-/+7(CC0A+G,2#7!5G#B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7051 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12066 42 91M = 12327 317 NTCGCGGTANTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATNAAGATGAGACGCTGGANTACA &*+$!+'$('")'"#'*)'*$*+!*)&%)$%#$*&)%"*"'(%++!*'$%'%""*&*("$"&#"*!&&(&"!%#()('&')+$(('""$"' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T8C59A16G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7052 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15062 42 88M = 14839 -311 CCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATG 39)96'8"CF4A!88215+.+2C7B,C3H%%;9=58H$"!D>-+-#;6.$<"@&??30-:(H4-9<2*="=;".21;-!2:FA6@B1< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7052 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14839 42 148M = 15062 311 TTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGGGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCNACACAGCTCNCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGT '(<+;G(?6681>6?-:+:!,2*B$6!!190F5<5!>7):10!)C"05D1*=A?9$6"0%6>9,)1G.6*;4,/9)!A+(A)7D4H1'*'?0)9<;-/$H+=?##GA!#H+:9".>#8",D*29>5C*:0.>&D4!".%()@@9E#CA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32T35C9C69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8969 42 57M1D9M = 9201 282 TCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCNCCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTAC )>90&)/G8A1GB=H54375#;$&F,A192%1?*81C>,C2%*HH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T36 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18045 42 109M = 17994 -160 GTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTNGAATNCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTNTTNGNCNCCGC )'+#)*'$+$&+#)(*%'!&("&")!&'()*!$)('$&&'%*(+%$)'*&#!'"')*%'#)&"!)*"%"!"#"+%+")++#$%*)#$$!+#(+$"$+'!)'&'##$$** AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:35G4G56A2G1C1T1A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17994 42 50M = 18045 160 GCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGG 2(G<-;D4C*&0%$HG?=D-4GD$?DBHB.8+:G=H$2D*B$)-D*(0A/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7055 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15940 42 160M = 15940 0 GGCGGGGTGACGGAAAAAGACATCATCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGNTCT !"'!(#$'(#"%('!$%$)$)(*+"#+()%*'!'&)"'$!'+!!!+'!$!#!'*&(*)!*')(&!%%()*"""($'&+!&'+!#!!+&)$*&)*$'%*(#*%$&'*"&(#)*#"*"'#%($+%)$+&+$&&'#%'('"(#"%%(#"##)*+*)&)*$""# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T21C130C3 YT:Z:UP jpayne@0: r7055 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15940 0 * = 15940 0 AAGTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCGGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGNAGTCCGCCTGCTGGNTCAGATACAACGTAACGG 7-+%=?2A-=A0>0#*;3((8CF;$;2>966>->&4$?(!%.?/G!5:#EE=*#&D'A5G'($;D#E"0D+%!E196147%+?"/,$%H3+/4+,*7CC1,7!<#9H<=45=GF"H(".#?2 YT:Z:UP jpayne@0: r7056 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27136 42 44M = 27291 290 TTCCTGTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACT BE1?GB2-59.@E6!C%:B4;9>!*:78F&$5(?4&!&H+(#5* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7056 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27291 42 135M = 27136 -290 GACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACNGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGANGTCAGCTGCGTCGTTT +2-%HAF.4F()G+'-$869<&'5AA8)7:;09$4,A*<7E'FE58*,E+C&)4F8$;&4?5#/-?:7"++EE8>''7:ED9)'74G05A$'16%""AFH)3)@*);$%9F&5"B,7HG'$CC>4=BA7!/2BA< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64A53A16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7057 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32458 42 42M = 32297 -203 CAGATCGNATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTA ,+C-,/@4:G(2)5F8A''=A@C>F1<;,61;)8-#<$C.5' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7057 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32297 42 157M = 32458 203 TGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGANGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGT H74B4/$4G">*8-5"%-.H4F?E-<.%C&9=H$A%5))'';*E1$0A)7>70@=9A(-:3+9**909145$1;G2895F7%&=#5@<+&26+37H72DC>4.>,;'2/B5.-+6F5A6*97%BE1<8*F11"'50@50)"@56F,:F0G-<3?E.& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7058 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40491 24 72M3I49M7I13M5D105M3I83M4D41M = 40863 457 GCACGAACCTGGTTTTTAAGGANTGTCGCCAGAGTGCCGCGGTGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATNCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACNGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAG >,?)*0916>:AC,-A1'?2*DC=1;/A1#0G-.E$.A."(?H#+A!$BH9D/C)>"%*:/D9#9,*=A7"(4/AB&4?&!:>81B2-3DG,2*/3*D.$A?8==$3&18?F!E='"(C>;,,D2%4@>7(.+=>5@>DFF-/&-7+/,FA7/!07?2.,#3,&9/+G!,3"@;3:216G=318#+>-$:11@"!,9)E7,.;%#$!4<2(+,4'1)>17CD0*(4D&08377:/=9(1CB!5+$@'E:#D8F&/H%E$F)$-6F8D441%)"BG9(3A0F##=(>9$8/C(D92B%6?*G26"A(6&,*1"B*%69.'#%8$07+"=:-,((@.0!$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A43C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7060 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29980 42 80M = 29806 -254 ATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAG '8@);%5DC!*11=H!CHG94./4#)693574%.6%!";GB=)" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:58 YT:Z:UP jpayne@0: r7061 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40683 0 * = 40683 0 TGNNTGCGGCTAGACTGGNNTATTANGNCAAANCCATTCTCNGCNAGGTTAG *#%!"$*#%"'$"''%#('%'*('*&##)"($!%(**((&%&)'!'+*"!#* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7062 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3480 42 110M = 3332 -258 GCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTT %4#!>"0E9=CF*!3.;*>1#4797@84"<.2F4*/D&9.>C0:5/FA*$*.6+G%4>5/B/26(0>(AB92$;G>*F>8+(,.F.&=8E:+3G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7062 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3332 42 63M = 3480 258 GGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCC 75H0?D/.$.:.-2)G-),G=0!>F05E8!,2/$C0+A+#02HG1(-D60E7<=8@A<=#")! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7063 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42983 42 127M = 43208 278 CAAGGCAGAGTANCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCAC H$*?DD%;1!<%,9&=6'46!-,%-)3D(8.@+D/:7?>16DHA::"(3;2$745!E@80)$,($''@F//%*5?FB6.;F3B'&)?=1-!%:)EG#6'E)2G!#/5206E<@;'124,D-12;A06 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C114 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7063 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43208 42 53M = 42983 -278 GGATGGANTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACC 5H-&!!;G06-">$H&H4H9FGC2#6>"560!C'*)E-#=BD-A.+9D394?@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7G45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14359 42 57M = 14199 -217 GCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGNTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGT %:$!19=96GF.)A/5@D,2"@+C:&=F:@?F"3=2"8<3*:BCE=)%0D)&01,C5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14199 42 85M = 14359 217 TTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATNTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCC ?DE3"FC'%'D!A#'1:953?@1"E2$"!7(;F:=%2<,>E+'3.C5D4*<7"/=.9<:)$=?,2//H+=8D=3':,00D95F*H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7065 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6318 42 50M = 6483 256 GTTATCCATTCCCGTGGCGGCNCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGT %E'46?03>(6?4F>-&GA,7)?DF,F%,@54B1<6)9BB(+2@(A?,7& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G13T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7065 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6483 42 91M = 6318 -256 CGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCT '?CF(:2A1B=+>7$&:"@6&,5,@C5/19'<07"'37,%:2?6<>8<.7"6GG1-5#25?89%(2'7@8,G8-B0:<0B/!F55"*GGCH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7066 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1692 42 53M = 1836 222 NCAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAA &$$#+(&%$)&'*"!)!)#&("&#+!)##*)!$$'(*%%'$*)+($(!++&+* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A52 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7066 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1836 42 78M = 1692 -222 GAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCANTATTCAGTGACCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGAATCGAC 5F8%-B%%F37*/:::.($:4<+)!2E.8E:G(*3DE$1A)D7%A,GEBD*%:4E>9DB@*B*B1"$3G!B5@>)B!, AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26T7C1C34T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7067 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38181 42 68M = 38349 212 TGNAAGCGTTTATGCGGAAGAGNTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGC 0&58"00&0@%*$E43<6@7;<;;'E*.)EGE'C)E@>3<-F;7+4@6%5#)13A$HA%09 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G19G40A1C0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7067 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38349 42 44M = 38181 -212 AATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTA '9-(+1="C;A((D*4-/2B.2EH+?%C*2AHGD"54-*F'4G-0>7& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7068 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45668 42 58M = 45460 -266 TCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCG #&?668FAC9#?:D<&8>'-39AHB@E;A2GB/AAA'$F,(E>%0;(E5G&)$F+'0?E0,BAE#:BF1D9@B";CD=3G4-HF5,*F7GA88;9= AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:135C94C33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7070 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40492 24 71M3I49M2I102M = 40409 -305 CACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGNAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTNATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAANGCTATTCACGCAATACCGGAAN +#"%#%%!&('%*$)!!&(+)%'+!*+"&%(#%$'**%!%$$+!*"($&&$!$$'+*("&+"(+'&&'+&+%""&&%#'#"*)!)+'&$(!'&)!$$!(%+(%()"$$*%$""&"#&$'!$)+(+!*"()+##("%#+#'+!*#&"&$#')!"$)&%+$(&+*'(!"*&%&#%!%""*#&&'&$+++#!*)%!$&"!*%&&+('%$)#!%($"#++)#%%!#(%(*! AS:i:-63 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:25 MD:Z:115T4G1A0G0G0C1T0T0T0T0T0A3G0G13C47C12G3A1C2A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7070 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40409 24 83M = 40492 305 GGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAG B40;?8H;;.@B:'28&D!2':.8=2/<1?'A@F15C@4-41E&8>;+*<:03 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48T34 YS:i:-63 YT:Z:CP jpayne@0: r7071 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31517 42 23M3I87M = 31721 283 TACCAGGCANTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGT ):1$5,2(G(7)#%>=3A;&0%>*'!EE?%B6*0."$&F)6=B3D/A'0-@/**5,0?#$-G9'B2&%E) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A55 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7072 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20580 40 117M7I7M = 20704 275 NCGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCATAACGTNCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCG $<-5.1A03F""FB%7#D)"(!."371B#H9&H.0B.;>90"F18=@H$0E6F2%$"6.B(0>,G!/5D>B>:-AG-"?3+4>H;0GGF#2#.68H/$:BG&)G75A;H2:6+%>/A37<); AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:0A92A5G24 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7072 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20704 40 151M = 20580 -275 CGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGNGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCGACAGCNCGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTAGGGNANTG %&+*'&!'!*'+++)"("&)(&#+$!$$!"#$)(')&)()$'$("&)$&*'(++)&"'(%#&(+#$%!$#!")*%%*+*"++++)))"'')*%(()+""'*))%%('&$+!)%)#(%&)"&#$)"'*#($"(!"*#'(+&&+("*&)&$)* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:30G25A5A79C0C2C1C2 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r7073 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30604 42 73M = 30337 -340 TGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGG 81>)ECC$<@5779<+B3F0.,14HH.F3-!=(5/($840!A,A9'H#)%+G?/>.FF+1A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7073 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30337 42 49M = 30604 340 TCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAA 6F;!<7+8=-(>E8.F(=!%"?#8=-:-1'7@2,)(@0@;?H6D4?ED(>F:H=*F2++E$>7F.>A36=B--7H812&01$,!:8G!=?;0D07?>+AC+ABHC8*&@?F5-+9#;=HG3D*>"-05H8/B77,<-;%"?9)%E2"-*#9*/26D.-43)$D,.H;>9>C%56;-#G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:137C12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7074 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22574 42 123M = 22697 273 CGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGANTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTNCA H8#D3@%8+D&.#-+:,7*DC$)4);A?36,5EG8(/4;&=D&EB:D?'A.G4;D&C/)4%*D+!#00<=%-4>E40$"D1;;!-8E3,187;4%H+#-9?(8G-C(=&?,1#7!3%%&)D64 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76T43T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7075 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45325 42 83M = 45093 -315 ACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCGTTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCNANNANGNNTATGTA &+&)"'"&&'"(%&)$&(%)&"!$%'$)%%)!)*+&'#$)#+("%#"((!'#($"*($**!#%*'+)"!*'("$$!&&*($#* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:32A35A1T0C0T0C1C0T3A2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7075 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45093 42 230M = 45325 315 CTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACNTTATTCCTACTTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTNGGGGTAAGACATNAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAAT 9?<;&>)E%H'6'*&:46F"GG&AD@>-8#&;0/07,;90-F%1:G)&+"(BC5/<=;$6@9//*>%8*5&7%CB<<)=+CB=":?9=9H%)8*4:DF(+.$6(&)>27D/5#F82-82%E*,/0,&!H((@&;#()C:D3C9<48H%C;)C'.0H:F?EE$0(G,.5*G@%.,,!;'8,5/==1D!<61+!5A!$@E)(+?$1,,64B<84C@G16GC2!6D/#H&G('5B)#.3B+2:"";<6'"5!D@1BA)*E(.58,EE96:%A)8%/'$G9:>5),6%%-;4=*-&(&$;$=;,<#'&5-31==0=C9@AH&/4FEF5=H=H&2*&*5$1-2& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T4G222 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7077 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41467 42 68M = 41556 278 GCGCGNNANTTGCACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGGTAAAGCCAAAGCCTG **&$))!&('*()+"!(%)($$!!(&")#%!!()$*%$%$+$(+)#$&(#*$&"&(%%'(&)&&'(*& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3A1G0G1A2A40C15 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7077 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41556 42 189M = 41467 -278 TGTCAGACTTTNAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGAAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGTACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGC =F")?/=HFDA8B>*0#&0(;?B/,!B&&,CA)>@C*&A?<(6%,*)F+4?!7.*C7$-=77B<7'87+G=:H=;&$D(1?G214*$'BF-9+#AHH2-777++"@'//$'A5C5H#-3'-,6%;**=1CDH=C6AF61&)58,H(+H$"?(%H:#EB9:?907)71.!:==5+(%>E!5@H+DA=DAB AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G56G51G68 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7078 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47840 42 55M = 47981 222 GCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGNAGCAT 9&B-*H":=HC>A6257"&D8+B/!'<9";;#B;73(//9>,47-==?.&C<-7& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49C3G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7078 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47981 42 81M = 47840 -222 GTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTA 4G8EA:?D8*+4C/BF$>2<#6">32!0!'2@=')21&F90/=,!'.;G$8/"26?' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7080 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36021 40 47M = 36021 0 TACCCATACTCTCTAATCTTGGCCAGTCGNCGCGTTCANNTNCCGNT (+)%#'*!##"#"&!%''$+%+)#)!'$('&(*+#+("!!&%)**"* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:29G7T0G0C1T3A1 YT:Z:UP jpayne@0: r7080 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36021 0 * = 36021 0 GNACCATNNNNNANTCACCNATNNCATNNCNNGNNCNANANGTCNNCGTTN ""$##$$!!"#!!!!"#!!!$$"#""#!!!!"$"!!#$"#$!!"!"##$$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7081 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40658 42 77M3I28M = 40830 234 CTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAA 4:AA@;8!7!H?(.(H)A&@"'F58??>-&GH@53++@,6<&5!-;4D-A.,:*1H>!B=6(8);<%!1-:"4!5/4E$?"A.9"@;#B&-()5CB1>0=D#650@,# AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7081 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40830 42 62M = 40658 -234 CATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCNGCATTAAAGCAGCA B17=(+F/:/@=:(!AD)C5$$A:)6C0$3@F'0#3A3G):$B@)CA;5+A"-#&"+&2"E< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A14 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7082 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40533 24 30M3I49M7I13M5D36M = 40316 -350 TGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGTCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTCTGAAA &).+5,+)GG0'40-0-%E=2* AS:i:-63 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:16 MD:Z:92^TTTGG30T5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7082 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40316 24 217M = 40533 350 ACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGNCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGNAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGA ($'(+(!+)&%'+%)((('**(*)*))'#!#&*")"'''')+)$'!!++!+*)$!!$"!!&!$($%*(($(&&#!%#'&'+"&)$("&$$(+*'#)'))%)(+)&')+&#!('&$#)&*+%"$*$%)'"(#$%(*""&"&$+!&#'!+**)%*'!'*%'#'!#!*+'"!('(($)))"%")#!)+("*##"!")'#!*+!+)"$)*#'%#"#)")$) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:75G65T53G21 YS:i:-63 YT:Z:CP jpayne@0: r7083 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47558 42 71M = 47756 280 TATTAGGAATGTTTTCACTNAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGNGA F(;3;<<'9636%?D)6=!@9(">00/$%;C8F09328<**%E54-0C>)-G+.#/A10?A7E8,,;5@%* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T48G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7083 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47756 42 82M = 47558 -280 GCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAT +9B>>$@#EE)@,#3D4%D5B>C9F&DD:H/BH:8858)958->>@.5=H;#3,C7H26.?8$'0>5)>6H2*H<>AG,>?$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7084 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19453 42 221M = 19370 -304 CTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGNAGCGTCCGTCGTTTTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTAGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTNCAGGAGTC $*;)"%&$5!=5113@<;!0)#AA1,9)?H$!712!<3*4B)?%%G"/)%A&.4:'F-;":+:9@8',F:2),D"E+H3A#%+&7810A%?0FE>A(A130%<%0$?A(BE/+4?:5=8$@,#!"E>1%2;+/+!B'*A84*=$=GHB@8!(6%-,&>E60C(-19?@?%%3.#7>#(:; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16G21C13G29G129T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7084 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19370 42 75M = 19453 304 ATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATG 2.#<8&7C@;D>,%/84B7A#$DF;@0$,H">@>#3/G0*G(H:3C7.0A$'+F#=?F@8!!+;E.$@7A7"'&;#9/0"',B0G&'4G@;<64.-;D8:'38D2<'-%+)9(A(-'!6*F?HH4!E@0(G:<#&+A3E&D%*0'D57(#<5"<55,C=2(1G@+;=53$>1@5&+#.AGA26!'.$H.DDH#4*D>+G2!@'82*4E&?4FF:?0<5"7$52/744&%6C1>>7A6+35 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A53 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7086 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14987 42 111M = 15268 338 CCGGGTNAACGGCGCAGTNACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGNTGGCGTAATCCAGATTGTCCTGGGGA E4$:91/(#>F1G4AD,)4F>GDF19F'-3-F437C(?!B:EA0B*6@G:1<.%,=H,#?'B$841),87$+01B=G3:+62C:#D=FHEB03/-7F/F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:39C6G33T14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7087 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5572 42 150M = 5436 -286 TATGACCGTGANAACGGNCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACNGAGTGCCCAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTNACGATTTGCT -1HB'1<(#G3,B%&4,>/1!8HGB77%:5H5.@,;#(5<<%A+D)<<(><-:4C2C2C+.G6:@C./=B&#B>-):2"(1&3#9F>@8@,:;E>A$*-D-><$.2$6##BA/?G:HG-8#B#+F5(8)=%:;.!5=EBD4='"B.+90D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11A5C26A6A87A10 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7088 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2749 42 108M = 2916 218 CGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCC (/B=6*B$)$EC=.C3=2$,G'<+9+:G803=21.)$@!1%/=B"<5)HCE38:A6<$1>:$FF9+-&;9E7?3@"B5"3>A?8?16!(-2<=B2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7088 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2916 42 51M = 2749 -218 TGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAG >D!-+HB:8FG!$!4#%9-9<96#@*!1?#().FG3,@&E0/3.$A.'54(%<3,3855(5,%/65B!$B4$2,((+C((3E=?@D),9&A.6,%$2%,0D,%:!;#&<,H>@2?88 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52A11T26T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7089 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4653 42 243M = 4551 -345 TGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTNG (;?641';A3:.6&C$(,6?&8@("399?*D.?43G,,+D37(.%9=./"1A2B.=H*C'<*2GGF2?6:DFCH:=?0AA7#"3?$:,#+B'7:&&:-04%+!*/)1!D,+8'&>4#A-'A7#:=:@3!*9!>B#9C(%:,0BGH-=F7(B>/9D18%$:")8=,$H5C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:241T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7090 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8899 42 88M = 8614 -373 CTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACNCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAA "$+9'H/.%/@>'!D1<:4''A5!G=%)4*?>E'B%$6C&85AC9-C7#-!>AF50>6CFCH-FB!)*D?E@A6@)B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G34 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7090 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8614 42 285M = 8899 373 GACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCANTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGNATACACGGGCGANGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGNAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATCCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGG 03"/#.;G5=8:7(*C9=C*DBE60G3>>&=B:3)@>&#<5*EC75F1%<+3DH7GB8%81>G+%(&60C!0?=+H6'<+7C)+:$19.8G914D?"AH#!'((C=C%875%96C3',9F/1#E=-GE:=*41H7::'.'#<@)8>8/D&//-!!(:#/$1#!<1C@=28:0>HG7EE*G/+;)6>#;=:: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:52G24A12A27G41T124 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7091 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16971 42 69M = 17040 423 CAGCACCGGTGGTCNTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCAC ,$,,DA(168>!<<8+*>,>:"7?FAF10''!*.+()0:-347#$+#25F",G+63!G7@1)2(H,6A6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G54 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7091 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17040 42 354M = 16971 -423 GCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCNGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGNTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCNGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCGCTGA ("#&'(&&*')))'%*($$%'%'$%)'!(%%'#$$&'+"+&!""$*#)#(!*)#)&&&+)+#+"++$(*&!!&(&&#+)&)+"+)&&#'*("#'!+%(")!&"$))*"*#))*!+'(***!"'%(*+#!(!"""&"'#)"(!(&'+'#)(!'#$")!*(**#(!#*&'&$(&*!)&&(!#&!)#+&))"%%'$$%$%(&*+#%+*#"(!*&(#)(&%"&%%!"'&$&#"!"+$*$+#)'+'+(""%$&'&%**&(%$$*%%()+)#&*#())'**#!""!$"*'*&()+)+(&&&$(&+&%)+!!!!"%'&*+#!%(%%(*!"'+$'!(*!%*#"!'&&$'#""'&*%+%()%" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:71A50T198A27A3C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7092 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34477 40 42M = 34669 252 ACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCG -#4*>,2-3H=.&8??(CG25F$$'<1,EDF*0G043$B-*8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7092 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34669 40 44M2D14M = 34477 -252 TTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTTAGCGCCAGATATN *!%&%*+++!++!%&*$'("+&%&($$%#%(#'(+"'""$'&&$$(($+#+)&!(+(* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:44^GC0C12A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27543 42 236M = 27779 276 NNTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCNCTAATGNTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTNTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTNGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCA "!,5DC"D#'H7H$-$6$"#35D.F?@HFA3%G6/F50-6#.-$H#"5:3(H8,:.#-':&*'9F46-8!H@$/!"D/??32!"/?/)->01<;2!405G")85((4=+$7..!.%0&4#,A:-*C>;9!:%7D/DB?'03F#6)0:,%)*:-?<@G%9(E5DF;B-:"+08C69BE:D8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0T28G6C85T75G36 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27779 42 40M = 27543 -276 ATGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTG -F:%F2%0=-G03HE;/43G82!!A&*D4H:&3=D?C?@.C?E#*2@%:%=0H?3%3/7D;D!HCG3E4'57$E AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46T3A39G114 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7094 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24260 42 124M = 24384 329 NNNTNNANTNGTGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCAACTATGACTGTACGCCACTTTNCCTAGGACTACTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCNTNCCACTGTT #$&"$!$(!"*%+()&!$"!&&)$(#'!)(*%!'$&'#)%)%(#+"(&+''$&'#"*$#)%%##$*&$"##'+"++++&'$('*'!(%'#))+$&("($&"&$'(!+##+*+"('*')+###+$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0T0T0T1T0T0G0C0A0T1A28T18G1C9G41A1G8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7095 77 * 0 0 * * 0 0 CGATAGAAAAACAAGGCGANTTAGAAATGTATAGCNAGGCAAGGGCTACTCTTA :?"(H?0-:45?ACF090+"F9'<.B/+?@BC"&6& YT:Z:UP jpayne@0: r7096 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26302 42 53M = 26462 281 NCCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTNGTGATTGCACCAATCATTC !$-9?,'+H'.:&E0:;.9#17;7@?4G=D:B+D/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0T31G19 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7096 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26462 42 121M = 26302 -281 AATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAACGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTCCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGG ?(5@=5<:7#.4C(AG%3E=-E%<6:1=7%4,H@9B/2$H.-B@A><.<#2!D4,(?;-!G;0#5:'@80H6,F2H6@E7?0"**#AE58C+E;2)?%@59E./1*;H36;;14!84E)A=11DH<2,.)?A6.#4;;-%0$@:@8?#,(.1'F@)<($?'2EE14(6(;A>"&'EA:8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29C26A41G18 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7097 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 42 153M = 7799 -270 CTCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCAATAACCG '%G>>F7D5=1.F+5;5!1G63H=!B==0"D;2:*-3/2<23$%$79A"@CCB5!-(/3-#G;AA)+'(#>,%BG!@-C54,;12F/>1$9F9:(BF+40!?F3.129<5B?.-3!H2-5B8FG-@)A/(:.,>F2H)@9$3%7F>8349+20 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A145T6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7098 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30039 42 96M = 30135 239 CCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCNTCTTCACGGNCTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACC C;1B**7"AC?<*)#D7+G*@0$="'EB6,A/==(<9"3,)"4&@9-7+"-CEE-=(DGF3:@%@&$<# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33G9A52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7098 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30135 42 143M = 30039 -239 TTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGNTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGNTCATCCAGCA )GF28+<;G)73.G!<+;0=E%2-'H/:'!10FB&">7C:%9<@>48()9#-&DAG4:>12!6H$2AAC(F:!$7"9>/3:7A9<''#E62(H,C;)D?F;G"H5H+#8FA$5(%*;/-00HHGB3!C)H0--2+?H:""@;E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C93T10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7099 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22549 42 153M = 22192 -510 ATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTGAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTG !53D)/6%E,3E@F>':&"3"=91(H:G>H,2@8#%;%H#$783B;4<';5%)(,--9B+3$-!8+1/&4%2&"%27&84H;D,>A(5B')5>?17-;&5':'E8=6H$&:CA#+6;C-9$B=?7)FH'/2@0/H8C56+6$D=888.$8-.% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A78 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7099 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22192 42 357M = 22549 510 AAAACCGTCTATGACGTGNCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATGCGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAANAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCNCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATNCATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTT %+%#*"&"++%'!"$#%(!!*!)$%""**!""$%&#)*%**!!%#'#)&'*$('*)"#(+%*&!&+("+'(++&&#&(%)"!+%("$&#"%*#$*")'!#($'+##'+'')%!!'""("'&+)'%&"$&(&"'!")#!(+"""!"&"$$)&)(%!'!*&$!*##&%('$%#(*#"(")#%$)$##!))+$"$&#$'"*$!'$*++%*"+%$&&"($("#$$#))&%$!('!)$&$(&+&+"&!$#)$'#'&)!"'+'!(!*%&%%&%%$%%$'%*&"))($#*"*%%'$$#*&#(%%$**"(+(("&&!$'&&#!"*)(&&#$&+#!%)+($')%+#*(()&*"$+$%)+)'""%+$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:18G113A38G46G96A41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7100 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21436 42 76M = 21603 238 TGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTGTGAT 7DHG5)1)20'@);(??G!"C)H29;5:3=D8!8,=*3?EF.,"G1-2+?(<75A>%('C0%"0H*19/=1@(E7F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71T4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21603 42 71M = 21436 -238 GGGCCNCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACC 475F,8(<=7&6E;#9C:4<>?,"5!<<0162(>G=?F:H9>:6DF&8)61@$,,.)5)7/)<4&H/C7<24:BD+54<;&2-9@+@>."3$A2*1%/5:=%. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7102 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44715 42 152M = 44867 314 AAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGA G@0*":'GG4!#34C//E!6F5+C"CHD#='%%?73F6:C36@,&"E8@G#6@,4CD()-GD21$1-B>9CA.>%11D:/++@0.%"9,2*7=?D;$'?8A1+!8<:7*2%:>1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7102 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44867 42 162M = 44715 -314 ATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGNATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGG H.!64!'G.:0:24%;#(28',-C%!,:3,D69E5/,A%#0F7+%CE0%D7F76A6E?570-%?%='>#:@?D5!4%&H7:%&!,!"12@H/9D0DG6?43)$43@+!<784(.-AC.(<@3B$=-D53H86H.2*F0783%8"B>=?1;<1@/7>5/):07 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106A55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44237 42 40M = 43952 -325 TGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTG C9E3:A>.%!9?3@D<'@97'A/82*)6)1E,C82FD"9; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43952 42 131M = 44237 325 NCACCNANCTCTGACTCTCTTTGCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTTGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGC "(("'("!(+"#'")"!&!'*'*)"+*('&!#*$!!#'&$+*+$&"'('**$%*++%!*#&(#&*!&)&$*%!$#&+&'()#+!($'"("*%*&(#+#'(($&'"$&"%+#"&"$#%)*&!%%#"'%+&*' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0G1C0A1G0G0C0T13C51C56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7104 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40434 23 129M3I49M7I13M5D67M = 40697 435 TCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGNAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTAT D<'(@1E6)3@)37B8+<<=;A$6.B4&*5F,'.&@1615/2";.7G8<'#DA%/B>C?B>F&4G-)B0C6G4@6#3H&1,E7D,)*D>8?E'1+H,.=0!68B'9AG5B7?H*)/=1*46E'/!2;84*85'/4103<"-%2CH!C<>)B6.4-*)C4@!6+$:#<@&+9<)!7.-)55&47")-% AS:i:-64 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:16 MD:Z:23T167^TTTGG67 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r7104 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40697 23 38M3I83M4D47M = 40434 -435 TCACGCAGTACAGCAAATCCTTNCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACNCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGCCTCTCATTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTG ;8G?E88=@+(B*5,@%."-%%EG?*@F$6C,#+A7+B"?-5./6%B?FF*../(86$136+C:6&1BD;$&04H9BD686(09HA-')&"1=-(F;E.0/@6#A!6>4#9#/E.=AH6-(7D'-@2!H;4G&9!9$8)6*8F)-:*E(!!GH-B'=9!ED0!8<=)567; AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:22C39G50T5G1^CAGG47 YS:i:-64 YT:Z:CP jpayne@0: r7105 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45091 42 147M = 45283 254 ATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTNCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGG &&7DA2EBBC<2?1#07#/F*;:@D88#BD=<7:=@4E-"48H56(E=FE?9).FEE'EH%(/8.-59-GHHH!/AD0'B>)#$$:,/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7106 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28835 42 71M = 29095 302 AAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCA B4*,/03?2CG<**>.;#$:%4)0F:A1%$?1-,$<38'<,;35HC8,"A3(;E2F+6+013((D11A2/D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29095 42 42M = 28835 -302 TTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCT (+B4*AG*?7<%H$+;#A.(%>8H;'B%;D19!BE3$F-,C, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7107 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13112 42 201M = 13050 -263 CGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACNGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGANTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTN #')%#+()&$()*&)+*+#+)*"#%"*#)")"$%($+$'#'$%+)+!'*'")!("$*&!'$()+($)+!('#+&)#+%"!#%''*$!("$$"(&&&$&()$+)$#!"'&!&'!(&!**#("+%&&&#")$!##%%"'*()(!!!&'!++"!)#'##'+$&&+!++$((+&(#'!'(&++)&&"(%*+"*"##+%+)%&*+! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:120A43G35T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7107 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13050 42 62M = 13112 263 GAANNTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGNCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGTAGACCTTC '$&!!$+!(()%#'+!+"+"!'!(+(!#')%()"#'&"&$+!*!+"#%*)%&#'"+!*!*%" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A0T24C23A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7108 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26340 42 68M = 26177 -231 TTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATG &2E:($.B7!-33+.EF#."-F2/)G+72('/5@E&==,8<9+9DD:%%-;%H/5'DC* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26177 42 156M = 26340 231 TGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGNTCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGG 7*A9@,;7,@>0E%'CB57(#G?>78H'A0#52(<9=&5D:G/(9<0>@F%C.$186-;0D>4%%$6;1,&5A&7=23@4FG8+$()?G8G(F#<6)%9-#F2573*>7)/>F:#%531.684G9:,"*7,%/4+B8F:.*!*.B$:?=(E0H0A, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79A76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7109 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33104 42 72M = 32986 -190 AGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTNAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAAC 0/%+/";9>--B!;:1=!%$:H8"%D3=;19!E7G/90>6;#B,D#)/(=E441+;%"H0F7@FAH++FF)6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G39 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7109 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32986 42 106M = 33104 190 NNANCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTNTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATC %#!"+!')"(*'&!!''%)!&+)%($'*&%%"#&#"&%%'%!!*$"$+('($*("(#$$'*)%(#))(+%()#+#()!!$!%(%#)'&!()"*')$$**#!$&""% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0G0T0G10C34C56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7110 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14394 42 132M = 14619 294 GTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGG =004@/.*+9/HG)G*3BB*88AF;)$1?"*/4#D:,)5)E?1;F3%:E%=>5#C20>?4.0<$E!;E6B#A0E/#,"=E"99H37,?ADB23@81=*"*,E$+/F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:132 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7110 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14619 42 69M = 14394 -294 ATCAGGTGCAGTTGTCAGCGGCGCAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCANCAGTNCCGA #+#*$'$!)%#'+('(()#('+!%!*"(%%'%)+%)+'#+"%*"*+&+%(#*!'$%'"!$&'#&+*$$) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C12A36T4G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7111 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4762 42 71M = 4562 -271 ACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGG CAE=9%8:9&1+6G2E@GB932C'6''0:2:#8C""8"3;(D@C(*!5%('C5,=3,B.B=7=F'1CC/G! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7111 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4562 42 62M = 4762 271 GGCGACAGCCTGACTGCNCAGGAGGCACTNGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGG 54@3,'A63:"!D"#=#1.'-;?"G4,=//$A9#%)F#<294D%-4#)88:F>B6.)7*5D3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C11C32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7112 77 * 0 0 * * 0 0 GNGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGA #)<)#CG(7:9$B)GB.HCBB'@#>,#F%#<#8C5'('='HC51G):<3?+G@9.=&,HEDFA0@&?2%(5>+"422GD2E?/1,<-1DH1GE9)F: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3626 42 55M = 3380 -301 TGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCAT C+<=7)09#41.F7-7)E*5"7949-5,,2>,?#6&A-C7G.-2):-:%'!F4>( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7114 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39952 42 98M = 39952 0 NCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCAGAGTCTTATCCGTGGAAATCANACGCGCACTACTGGCTG "&=2$B5%-63.*%B7F#!#F5$A2G2FCC;-(-888>,;80F&,-GC4)9#83)02C1HF,!)(E+.7:C,#B9;2/C,9)-"/+-H416'*=74;?6="6%<0F):?C-2.0.;5'A>2:B?,AA+H&8.>3C(6615#?$?*5?+<1GCH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20413 42 194M = 20353 -254 CAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAANAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACNGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGT *#!$"'($!&$'#*&"!)"&"%%+&&!"$&+)%#)&'($('!!)+$()*&&''#"#%+*$$!)+$#%(*+"&"'()(%#%)%##&)+'(*!'("$"*)*+'&('$#)(("!!!*+()*&'!%+#&""#'))+$+&+&'#*!((*&###&""#+$#&#%#!%*$$((')"#$+%)!&(!($$&+&*#&$!'%)(+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60A44G88 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7117 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4507 42 145M = 4411 -241 CTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTC !%53<,("0-/1,<6*E8B#A=;AD;*63(2H<:@?B!18H0-E6GF$5BE;)A3!"3< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:145 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7117 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4411 42 96M = 4507 241 GAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTT %=E4==98.3/''+6F@2<;8<$1F&A()D*<75;.!D:E92?94:9=9/>&B"6(0@><81;!9!CHAGDHA0:C@1=AH41"-,H8.8)!&5-! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34548 42 49M = 34205 -392 AGAACCATGTATNTGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAGGCC *)*+$*%'&'&&&!())$'"'*(')"%"))($!+*&$))%*(+%(!$%* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A32A3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34205 42 343M = 34548 392 ACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCNTTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCGTACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAANGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAG 8;F%/G&F!.7?7'>1A#G%&DF-:&('AF,(-'($H#E5)?#6%5)&:(""9>".GHF@B#G';5BHD,HH)0+B3="?B!#$E7-1=4D5:H;48=D5F+9"=5@G69&1BH@E#(%>+--EG*023DE8#'/,)A3354<=+#)F&-6$$)9H+9,&D%!BH+&/=@#B?G8926$B'=A79#'C51E#AB7,G'81@9A01E*G-E5'609D@460F)A76+BD<'F++F;D*465;FD%>>,DCD$=F62""$-<5(:?1=<-+F5')93?/'DE':;'@0<#220 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:55A25A83A127T49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7119 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28062 42 55M = 28215 228 GATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCT #B)97*14C1(07'E%4/:?,7!2$'G(-65%:%9@H&8./:C#9)G3A$41E'6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7119 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28215 42 75M = 28062 -228 TCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGC @0-,,26/<0#(.82,,,F88<'=G3<5-0;$'F=#B3,/3,18/:5?C/9*E,7"D2>;HB4#517>.D3157' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7120 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22537 42 72M = 22342 -267 GCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTT &C:%'<&G=;'!'>;?'D&280%@2CAFF&3EH&1&B);ED0#4=!F")EG%'7/6GC*>="H1=;.)1F>, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7120 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22342 42 92M = 22537 267 TNNCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGA %%!2+#:2A);#*"6)/D=?"+'&&*5-3.,#E2'26.1AH>0,@;F,5E4(@%-"6#<>+**-EH:H#E6".''B/)=F1F-B<153(2(77@'G%=/B>1DE'"D+(#,>@''A/?+)/,;G*@23?,;B?0H5A$:( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7121 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40376 42 95M = 40214 -257 ATAAATCNGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTANCGGCTTGCTACCAGGGA <,C1'"=6?#/)B$;4&9(,@)CD2!$DH57!5HGE=#9$0!!$E$FF66'<>!?9?(G#&4H>0*!/A(HD"2$*>=#$(B>0:9$' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7122 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27637 42 43M = 27463 -217 TGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCT D*>7E482/-"#$:%'"B:A@4,B-!!B$A-!F'76E-:7F)2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7123 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32043 40 37M1I58M = 31855 -283 CTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCNAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCCGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGNGGCGAAACATCNGGG +!(()"'!"$#!)+#*)!'*++%*#*'!)!)$+*#*!(+&'&+')#%+(+#!(%#$&#&!$#"))")%#!%""")+&%+(!!)+#+$(")''#))% AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:26C16T5T29C7T3T3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31855 40 77M = 32043 283 TAAGTGGGATANTTTCGTGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGG !"*('!(%)''!'#)$"'()+*+'(%)'"#&$!!*!*+$*"'#**&('&(!!&(#'*)!!#'"+(''&&(&&!'')* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G4A3C1T4A60 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7124 77 * 0 0 * * 0 0 TCCATCAACAGGAGTCATTATTACAAATACAGCAAAAATA )71#E=*$%5C+9G!!G/)>).!8*.3:HB#452(+$+;; YT:Z:UP jpayne@0: r7124 141 * 0 0 * * 0 0 GGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGTNTATTCCANNCATAGGTTTTACGCAGAATGGCA 0AG0@CDH!'39@78/.!3!C3B.3&+AB"=0A,8F75'9A#'64-77:=8E0?/-&%!).6H;:A@&DD*-A&5&A$E+;A+96&C?:93F4.'HD AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67C15 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7125 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36003 42 46M = 35854 -195 ATAACTATCGATGTCATATACCCATACTCTCNAATGTGGGACAGTC $*)*+#&+("(!&))*(+(&)"'*%#*#%)(+'$+()%&*%")$"' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7C23T3C1T2C5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7126 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13829 42 148M3D20M = 13686 -314 GCTGGCGNATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGNGCGGTGAGTGCCTCCTTCGTACTGTCCACGCCGANGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCNACACNTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGG "$$)'#%#)"+'%$!'#%$*+%&&+)!!&(!$#(*)%+))%%&!)*+$*()$%#(*))++(%(+(#($!$&#!$+(+$'%($"+($+''++&**($!&+###)#"(+#$&'"+"#*+!$)+)%""))!&&%*&((+!!!!#%)'$%!&+"+''!*!$&!&$+(*+$&% AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:9 MD:Z:7C23C17T16C43A4C32^TTA20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7126 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13686 42 97M = 13829 314 TATGGTCACCGGGNTGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTNACGNCCGTTTTCTGGATGCGGTGAAATTC 52C89H6#D;E0B4FD>?8!&%1&1(#"05*=$)!-E$C.(,93#0$A,&1866"E&B."C.+(3:!2:1C/,*@F06")H3>!7HB<$:9:E2;@> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13A53T3C21C3 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7127 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13601 42 78M = 13601 0 CGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGATGACGGTTTCNAACC :&(G,H"+8,.?#"-@2?$"+D&.AD$3DE=-E0@4C()>F.3,#3<%?)433B.3=C%&;*1$7D@'A-6:6C.:A7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62C10T4 YT:Z:UP jpayne@0: r7127 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13601 0 * = 13601 0 TGGNNGAGTGNATCNCCTNCACAAACNGNGNNNACNCCTNGCANNNNNCTCNNNTTNCNTCGANCN "$!$""$"$!"#"""$$$#$"#"$##"!!#$##$#!#"$!"###"""!#!$$####$"$$#"$!"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2797 42 55M = 2558 -294 CATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCC +(8@3.$/?;$<:/4'679,<.4+G$,59.?*2G;3,D*//#-3#(*$+5?/%:@5@35'4D-7&-<&3'D.,&F>??;D:HBDB//$36(>'%=#)*6;E'D#<5@/F>.DC17*&'C5$.$5DFB2@!B.@2#>/G9D7-:'&0A?05&;5048GE72@:1?/&%#G&=-!G8G!EG5455H2#*'C//EE(>0H:!6H#'G2F?A':H"9A):1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G7A7A151A94 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7129 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42988 42 47M = 43035 310 CAGAGTNCNAATANTANCNCNCNGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAG )(!'%'!'&*)#%$!*"$"$#!#+$$&""&&*")!$($!#("*%&*' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:6A1C2C1G0A1A1T1A0A0A24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7130 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18480 42 44M = 18671 261 AATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGC 8&2H#*D-2!2/C*<=3A&/G+,*EF.5.,=?E+5D@DD0!E&? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7130 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18671 42 70M = 18480 -261 TGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGT !.2F0$;6(&,B2%#!#E"BC7'?F1*6@$>-#<--47*CD/,;0)13,"'4;*(5GE)"5-C3H7F8EC='#%!.;124G)EAF8EC1(H+#/#>B<4H*1,7)(?A.C>&A7A'D:1%FC(C&E40!+;.842E$3?%C%D77 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85A70 YT:Z:UP jpayne@0: r7131 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26487 0 * = 26487 0 AAGCATTGACTACTATGTTAATCTCAGTCCATGTCGGTGACAAATTAAG ;1"@7-(!A012"*:"8,1@5)?"<)#57/G178EG9*."+2"73)77/ YT:Z:UP jpayne@0: r7132 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28315 42 93M = 28491 294 AATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATAT #H&G8GB2!#(=&72-&9:%HBA/=8<%/1>9#>EA'DG%95/*0;%A61.51!6@>,,#330D&=9?;'CA@'C8#'6*@=06G;EC(%D*/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7132 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28491 42 118M = 28315 -294 TATCCATTGAGCATTGCCGCANTTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCNGCTTNA ?5E<1+%5-6F21%<'$3E05'&4;E(5G4+0-(=((A,=!&$G<)?%$@D2:45;60CAA"+/7EC!/B+B=.);0.:3B-B(@#1-!!$/@:!!58%?5)G)D94-:/;A/*/)(0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A89T4G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7133 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5131 42 58M = 4939 -250 GATGGACGCAACCCGCCAGATGTTNGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCNTGGCC &('('#$(!+##+&+!'%(+")'(((&!(%#!#"'+#%&)&)%($)$+&+%&!"*(%% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24T27C2T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7133 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4939 42 140M = 5131 250 CGCCTCCCGGGGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATG FF/2.7GHF&0?7D=@=D?/E5F-+H!&,)<7#AB-&;.01/H%.C::5C<"$&1.C';C@:8-.!+(F5"-.+D#?#91@,45;A0E85%3.!>C/D:(1>';'BD95'311H=+?-,"4AA?!C-',9@A.!*4=#H$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C27G101 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7134 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37949 40 59M2I16M = 38061 254 CCNATCNNNNNNAGTGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCA !$"$*)"'"!!%'!%$((+"'$%)()(%$("('#(!'+")#&#&*#&")'*)'($+"$%""%($'"*%*"!"(%)+$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:11 MD:Z:0T1T3A0C0C0G0C0A2G60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38061 40 142M = 37949 -254 GAAAGATTATGCAATGNGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATNAAAGCNCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGNCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAG >='0<-GF.);:)+-<:%+:!5A?/F!F%3"CA4G5!+.0A.1/?B)@6:"H,@+693)28H0!<*":)/*,3-(1.3BC!F$6E73AD:<(BG8@,B<(:#-@:6&-,'F#::@:E5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16C41C5G24G14T37 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7135 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5309 42 116M = 5240 -185 GATGCACGTAAATCCCGTNTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACNTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGG A6F(!BH4:?"83>'D'E%F4:/<1.,#9<'"E'!2D$!(-C(332=4$&6GB<5&%,+!&83@;@%63!97(*HE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7136 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1119 40 112M = 961 -270 GGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTGACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATG ("#*(*&""(+#)!&*&"('+%&&#$!&+$)"&($%&#'%$$*'''$($')%!)(&%%%#)&$'+*&!'$%'#(#$!(!()!!)$'%#'%)")$)##$('&!#%)#%+(%&& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C85 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r7136 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 961 40 93M = 1119 270 TNATGCTNTNGTNNCNTNNAGCCTANTNTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCTACGGANGGTGATGCCGAGAACTTTA !""*(&'*!&$&#!"!%"$")'($*")#+&"$)+&#(&%&!#+'"!!($)#"(+)"$*&'$+!%#+'#%*!&+'&"#'*$"!#""'"!#%)'& AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:0A0A5G0C0T1G0G0T0G0T1T0A0T5C1T39G5T19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7137 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6738 42 61M = 6952 277 CCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTC 4::5001>G:+4%#.591.H-/)(G?:526DD6/;?GD--=H.-F%-;6H8#2E!E&,(>' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7137 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6952 42 63M = 6738 -277 TGCTNGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGAACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCAC /<)BA@HF1GH3(!*0A5&61#?0%E+3B,$5*1,(9H#&3AG8H1554.21>!!5*EEGF<= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G26C31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7138 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38341 42 139M = 38527 270 TGNAGGNANATANTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAANCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATC $!!)**!&#**'"+&)%(%$(!++!&++'&*($!($*)!#)%*#$%"!"#+!$)!)%(*!#()&%")(#+$*+$#!"($)#*+"$&+))$)&!%#*!&#*')%$%!'&"%&)""#*'%++!'#'#(*$*"(%&#)#+%% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C0T1A1G1A3C67T58 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7138 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38527 42 84M = 38341 -270 TGTTCTTGAATGGGGGGTCGNTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATCCTCACCAATAAANNACNCNN ''$(()((!%!#%$*&"!(''%%'!!+((+("'&&!'%(+%$"!+)&%&#+#%&++"#%'!'(&+*'%(&$%'+&(%"()(*!$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20T42T12A0A2G1C0C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7139 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19664 42 126M = 19603 -187 TTCAGGAGTCCTNAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGG 5,.G-;H8*CA-0.C+.-?.9#CE1;0)%F<3A5%.:$/650CB62:8"H!!C4F9$)(,167>E!G8>$GFF$&F>*:+$GA.''D/4#,H'7FA;7%&/(C$9;#/-CG?'9-2#64"2%!H/H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G113 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7139 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19603 42 61M = 19664 187 TNNTATGACAGCCCGCCGAAACCGGTGGGCNTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGAT )"!++!+$%&()$)(''%!+*++#+!$&$&*)*+&+$+&*$&'$!)!"+$#"&((!$$#(! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G0T15G11T30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7140 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15004 42 92M = 14766 -330 TTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATCTTGTNCCCAGAGTCGCGGGGGCCAAGTCAGGTGGNGTATTCCAGATTGTCCTGGG &26<8B(.15G0*>/H*EH!>1/7G4/F%2))F<4F=;1F4@,*)'FDA:$%!C$*'C,:60*=63G,%6?>1'(B=&BC%&@A:EE*6/C: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:36A4T11C17C20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14766 42 76M = 15004 330 CCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCTTGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTA CA5*4!!!!&/CH8)7CE=E%)1")@-E;3))H3=HC.;=%!FC-',0F,+D4F4:.*B').9@.?"8(85*$0:2/6'3C$:4>.#<->"H2)/3+=3:;B&%D,%B6+$=88 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44971 42 358M = 45329 400 NGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGNGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGCATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGNAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTNGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGC %8A+E(=#65&*%3E8%89A6#6""6,C*F=8&7@)>A8C/G>+0)7H1,/90-/":-0;"7)A,%H)%2A/:E04F%G-&H8'+F+E8@#<:.()3FG.A*BC.;8-@!D5,-8+&8%%H+D<;38-6/<%!><@;!;@H?"49A.H@"74.*9E.##77.$(396H<<:@B=>EH2'%13B?./",0874"5/+.46725F<2!?"-.88DH94$/,-*A-)G(EBE=A/A.$!7<6:8"#.A3,$1E(#,7-'DE>0;:FA0#45A9,?,"?E5-$9E#5?D::).D4A-9>?./(1.?F4!E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T65A79G81A27C101 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22411 42 77M = 22207 -281 CTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGN +<@E3/;/G7*,D*+6'A-07C/#H(8(5-#BC4/2E*$:#?;3-7(9*#B:?>3F.+%C.=F8+),G43=DE'0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7143 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29580 42 148M3D105M = 29836 349 GAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGNTAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTNGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGANGACGCGANATTCANCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTA 2B19C2!9D?$-7F7(4$*84@8#("6+,#;;#B<&@>/8'5#6243A'7H84?G)89+-H*)%354'+$"5C<=".0!/%*E#,.F/7C'(A%'2B66+2DGF(F"G*+('>F&"8<+#5&?B$6),!.?;3%!"#.'D6C9-6"CG53<>'D/:G.&4 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:30A57T59^ATA66C7A5G24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7143 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29836 42 93M = 29580 -349 CAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCNGAACCCATTGACCNCCAACC >E3-6(<$&*C!9CC.)7AGB$&>>: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55G16T13T6 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7144 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41194 42 57M = 41039 -212 TTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGCANAN )(!+!#*!)!""%"#+(%))(&'%*)%!%)'%&%!$*"))$*$(*")'*#!+**#"" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52G1T1T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7144 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41039 42 91M = 41194 212 ACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGC /5#."1=#9&G"&'4>+9'>)G+4$%;43G,=!$*@H?HCG?G!AFBAC20/67&3/3'3-=.$/,G?F(;C759.&<<1?E;EB3B7'18 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7145 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15911 40 117M = 1 -16027 GCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCNTTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGC %+"-:2$E1&33-9"E>42+)""208"*FG>,:"@"/98)+%--%:@G/?,F6@;A$F?=;&;#2=;D7@7>4%AA4E(0)H%11.3(8%@@**DB%(1:%46.C(&<28"D=?3%7E!;#26:;<=ADH1HA+98'$59(:-/C31;2+>D3*2609*'57?G!,;A'/>-:>:,%+D(/2(;H;2>251#7)>E9>7%B1A!,G!GBDC3+6%#1)9",><;+1#!C7-0+$B/96$64/AG.+0<@'0$+:0.4)#*2!#3*H AS:i:-57 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:15 NM:i:20 MD:Z:2G5A141C13C103A8 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r7146 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41381 42 151M = 41544 297 TATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCNAAGC -;8*BH!28AF=9D5>9;7+'<4=8D(*8!4D10-:C2)H=6A(A$)*77&;A4E;CB###7@4G.C$)EF(E%/$;9/EB<:D5H,?%HG;'ED3,E@?;)'',H?3?)9&9!0H4%@0.("@DGC5F2D:>@@/85(D3H'=7'!)8.%D54;HB5?%8C!5,'@+$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T46T65A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7147 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21038 42 231M = 21269 401 GCACTAGCGNNANNNCANACNAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGANAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTATGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTNCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCNGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCA *$&(*!(*)!)$!&#$(%!#&)$+''+"#%!%+"#%!))%'!'*+)&&+%)'()!&')$)$*"'#&('&(*)#'''""(#%"')"&"!!"$$$&#++(++)*!!'($#*%(##*#$*)$)*$##($$!&)"(''!)#&&"&'+'(+'(+#%($&(%#%"$"*%'"*!+!'%(!*"$%%+$#!"$%))()'(#%$+$%(!(%%"#('(")+*)&$!*#!#!'*)")')&'&) AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:2G2T3G0G0T0A0A0A2A0C1G43A7T65C25T37C28 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7147 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21269 42 170M = 21038 -401 GATATCGTTCCGTCTGGCNACGACCTGATGCAGGGACAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCNAGCGGACGTGCTGTATTGTCTCANGAACAGGATGG 6$7ECG*":0(,A.8H)&180F6'.5,:<>G+$2=!+>8GA)!6,51B!7/4FB#C>C/%F<"G3?3.9G=2H<3&?(&&F!H)><;#E-C4(D<4/=??@!B,7:4.(G?9"D-D* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:18T3T12G98C5T17G11 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7148 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1061 42 62M = 1345 357 CCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCA 5"@!5@?H%=0?&"!#9!D,G:H46?5=@+5%$?A?2=BB;HG;*(A,($5.@'B=4"7E?*1A:77$:%4323'A@H".&-16D1;/&=CH88/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7149 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25629 42 230M = 25460 -399 TTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTNTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGNANGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGGAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGNCTTCTCCCCNANGNTANCTNCTAATNTTGCGNTAGNAANA &*"#(###+#+)!%'*"+"+!%!'!*$*&"**!*$$%"*)&*$*$)&#*%"##%&'($$+"**&%#&(!%'($$&&(#%*"%'**#"++&!$#"#')#)*+""&%%#(+!"*&)'%+"!$)&'+#"&"&&+!)***%"""'!$$!*+%$'$*)&+$"&"++$'$!(*$%+%&)"!)'"+!!&("&++'&!$%''))#&%$$!'!$)"&)%*'#((#)$$$)%$$*"()(& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:26T42A1T70C46A3T2G2A1C1A0C1T2A5C3T1A3T2A0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7149 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25460 42 169M = 25629 399 CCNATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTNCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGNCTCAATATCCGGACGGATAATAT H48G!D+6G9G/?5@$@B>E9+.0"!709.>3/!G!,D?0+;83//7+8,&76?;%3"2"!)='E(,4#>4?H$<1'4)F."?93#)$0?)'/,!'&<8?>?@F89EB>$"=8(-F@6%-B+D*/.@:HFG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T93T48T23 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r7150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3457 42 199M = 3656 283 NAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTG '/5?",9%;"1C#?1B)#?E0=<-3G<'-A/<&9&AB*/::'24>B:91;%6?@#AFB<*+9:39B;%$29/F592D-$(@&;H/)+8#(D63-(8EDE@#!B;%C+?56$:""-+F&7G932'H&;F/9!CA""%"&H:B,'@$D6G/;.4/D%A3#"@5'&<,G;+A,/3=>1'?H!#&")'=H== AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A1G42 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12820 42 53M2D40M = 12682 -233 AGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTANGTACACCGGGCAGCATGGCA 7820*&$23B-9+:E90$-E"46*BG;D=EA6EB8/3A8B6F-#*A#:8+3<'C656FB0*6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7153 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22116 42 56M = 22313 269 AGANANTNCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATC (#'&$)*")#+!)!&%&')"(&'$%$+(((!()$%%%$#$**$+(&#+*!#((&!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T1T1C48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7154 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6295 40 53M = 6207 -141 TTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCNTGGCGGCTCCACCTCT 37'>>04>,)9<35?+:!B@%E?<5!BD8GGF11724:4<+,0H4E<354H76 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G16 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7154 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6207 40 16M1I29M1I20M = 6295 141 CGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGCG .3'(B/7*DG0>36;!,+1C!/$F:<85D&<=8C86%>H>1E009#)&'"<0:G:?2<%>4HA7?>! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:63G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7155 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47037 42 151M = 47188 320 ATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCT G!3'3@+(@2555BF05'(A!1=33*&+"!0$#%0438"+)2(E&7@#)/%*B99GB417H$1%)9,=+=!8.F95F60'7DG6(H/@G884/=1H4-0/8(D?(36=6A7(8D@('"=D,E/@)6:%*DH0-<,G10?94("@#5-*4A; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r7155 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47188 42 25M6D138M = 47037 -320 GAAATGTGATGTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGATAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTNGCTAGATAGTAAATATNATGTGA 1D6/0!FA(%6*=23*05'A@C83>@8C9D2?7D@H6G*B6*@:+:7$5AC-79&>F;!AG627F'?4F5.($;%"(%;2B;;C2'D3/'7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YT:Z:UP jpayne@0: r7156 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26965 0 * = 26965 0 NGNTAATTGNNTNTNNTNTNTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTAC !'"#"(&')$)*#*!#&$)#+#!$"+)$#+$")(*("($)&)""*)*$+&+!)$&+&++ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41418 42 105M = 41523 235 ACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAANTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAA ;BC2?=0$''H8945A6BA'3?&;;C$'EA,D-7>A3*$A>/.#G=+'G+104E#!<-,E195,@8260C$1&=>GH"89$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7158 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46173 42 64M = 46357 236 AAGGAGTTAGCTGATGCTANAGCTGANAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTC :"%''9F+)><.",,0=AD/=&H6*;EE4G,7-&'B4DB-H:D"C:$G++=#4>@'27B/A';B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A6A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7159 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42875 42 204M = 43079 364 CGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCGTAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTT .*,7%6F-9D784HC"6>/;"9;08?$(;C=&!;G!/G8&"C//$3=(.D&&"=<8!3%2C?4B4<>=1#4G/$.4CEC@.CD#?''2!(@EB,BGA>3,B)C6B$#*>&,&)='+G-)'!0HH'F17*+HF&/E!48"DF=)&%'9@%)?A9H$)86F(-E?'HHE<8G8@D3&@(@%#-(8%B!-/@1E16#,3,A!.8-77 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68A135 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7159 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43079 42 160M = 42875 -364 GAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTNCGAA AD6@/8:E";G!B):!D>!C+1/?D16)HF,-F>8@$>(7%#AH'7G9B9!@E>7.1&&F&'02)*.G8.E2!$C>22"AAG-&$7C/E?A*;(3%--@@CD)/H:4!/"<+4:07*"#+*58AH5%:/H=E<&687;BG@;5!:6?&%;-$%;&2F$9C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:155A4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7160 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2560 42 55M = 2429 -186 AGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGC :B*G$G0-=-?H80CH,8*&/&' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7160 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2429 42 51M = 2560 186 GAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCAACTG :,H@=3%"0'1:?-4+A2D-3GH$%$/#C!%36#G@.EC1*4#C1A!9D"; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47135 42 72M = 47329 335 ATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTANTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGA D%-EG#00+9CH3E1&8,&5>9*,3.2&&%&>)?@E5$;732&CE-*FF(4<2!C@4G05E'B@0:&BB0.B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48T23 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47329 42 141M = 47135 -335 CTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAAAAATTCACCGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATG 6!/("?7&<9+:(,7H2(:!1"!@?D%1"408G+!?H9"DAH0?C@9)7.$5%E5>#FC8;DD9>,0+H,@D5E%!)8%5?4@6("+#AC'&!=,"F/;A(F59(*$.@,@.-C;AFA;7D:/@A);>'9%9(.B42'D/./<3E*.%.+B+E,)%3&-68+*+:HB?(;:") AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C15 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31591 42 95M = 31403 -283 ACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGG G113*/!&A!<'+@$,?B!D@$BEC2C-*&!@#@(:,A3C@5:B!+26/B>:/<)"@>(F-G&;FA$9!&3@!$)B89A<20(B/;7$/*.*B3= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7163 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31403 42 92M = 31591 283 TTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAAACACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTNAA ,"/8:'37A#2#-75H-'HA?1,2%,7#!&<&)GA@46.*34 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7167 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5464 42 46M = 5648 306 NATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATC "=?&?-.-77885&>EG+A;D-%D+-4:67A.#@?;1C&$>E67F= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G17G27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7167 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5648 42 122M = 5464 -306 GATCGTCTGATGCAGGNGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGTCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTAC ;5.@"/4+-?A2G/(.+3<6&+C+50A4-*F+50%1B-GE-ECG=AH)@.'%.471&F%=F-7?0>D-#+6B(<7!FDE6;5#$19?H(0.0E025+G@<2E-GB+'A?.B0)F&=->G*H. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G31G73 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7168 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14632 42 85M = 14759 199 GTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGC 5G==.7C-D!>%7FG3A)A&DBF7BBFG'+!&AA27;A;B2"2=;@E!487)86H;/A7G-=H@2:6,/&3)91D4@51!3987= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7168 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14759 42 72M = 14632 -199 AGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTT %$7!;?;+*%1*$"6GC/>"A!?:'(AF;E.6:C1@F!1E4+#?GDB/@B)7D70$=8.@'A*?2>%GC<7, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45879 42 68M = 46057 282 NNGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACANCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAA (!.+@2>F)*$6#!E2H'"H.8':5*<*F(H"/-8/4%6#,F=;**2D:*3%D=!+1:C-5>"E8;&- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0G0C1G30G32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46057 42 104M = 45879 -282 TTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCANAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCNNGAN *')##+**'*%#+*(&$%#'("**%&%)&*!!#$'#$!$!)'$*+*'&(+)*$%%)('&'$$*)#'"*"$+#!&$*$$))#$(!'!"%*"$&#'+('#+($$'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33G65T0C2T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7170 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39475 24 20M1I61M = 39639 275 AAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACNTGACAAAG F$#;C?G!(;#$AF%DAH>@/FC!1D4;%G5D$0.$331,99)*C9#B=A='."ECCCD!&1,>6!(E/.):G:&+1>7.9?)<*>7E2E1&$G/65#C%1429C=7*B*4.#HC0&9"-85,D03/$:)4>57C>-%+86#0&GE@@3H297 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G13A22T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7171 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46111 42 73M = 46218 208 CGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCNCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGC +(#%$'(*)***#$*$"!*!+%!'"*+(&!*(("%+!'&'%"#'%(!$%!++(%%%!#*)&+(+%"%!&*$*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7172 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34773 42 65M = 34838 358 GTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCNCTTAATGA !G..6-G6/*=;AG@C=5C@/?D;&"/9B:F$,:5FA7%60A4?@<3&/6!>#-7!);79=1G:0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39A16C8 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7172 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34838 42 207M1D85M = 34773 -358 AGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCAATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAANCATATATTATTCCATATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATNATATTGATATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTC 3-<+14=3-.2+4G+;$:>*2,(+'1BFC4:;$25G+'260+519>8$!D>#9F<7D'4*4@@A>,-7>"-/AH259$+@+9'@68+"$?8*>.;B5(=9/30#.3C4>C&B#/3:<:19"H)'<4GA&%>4(&!2@0$%3.78@"'A#-!5=0!=BD#$372B1#/E8$9C/6%G="8=:-$.9@00CH57FB#F7,3>?%//9%9$3'(H("5GH$61CD AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:35C46T16G13C49A7G35^G85 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7173 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26608 42 69M = 26695 243 GTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATC 8+FD!3=6659%5"HF@&A2D'80(/AG4&5E,#E+H9?)<$G5E!&=H&"F=+,*@/="9C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26695 42 156M = 26608 -243 AACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGNAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTNTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAA ;8@3/:AD===>'-18A&B.13>-"!>:A#'9$4*.-H+:EG%/*610:-CBE?'C*)!3'4C*4=*$*%!!*76$*6?349:%:0;,C=29AE;&=44B?10(;A<*;;9,.7/6BE,>?7)?$,*=@;B/-71!$8!)AA2G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G86T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7174 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1006 42 153M = 857 -302 GCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGANCNGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTNGTATGGCAAAAAGCACCGNGATAACACGCTCACCATGAAGCGTT F3@6*9.>5B/00)!7"?%/H@?!0H%EEH=:'HD$2A-3+??!7:(>'A(&B$;3H:GCH=.'G"HED$&ECA:31/#!!?<3$9...1C49@"/B;5H8/%5*0F5(;&*,$9'";);"%B37E??5!%@9B)6(5'5A9#>;5''4G!'0 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:64G1C6T34G18G25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7174 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 857 42 121M = 1006 302 GCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACNACATCCGTGAGGTGAATGNGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTT DA#8E):@:8%-@CG@$*;);&:A;"*$)2#1&8=31)H?--/5AGC/!%@A/-*0-F=7@)>'1>E%G$&%>9,)AG$?;4*:D/2CG4)?A)C1@//:4:H784G0B$*G*-&C@D/5($44A9G6&: YT:Z:UP jpayne@0: r7175 141 * 0 0 * * 0 0 NCNGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGC &+(<""2-B<).%;;?7#?,4<>G'#.H5+$'':H:9C7!,9E4)B!#F0'+B&CB/3H5'=$&$>92!=0%D3H.8)BD@F&3$68?7'E)18G YT:Z:UP jpayne@0: r7176 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40985 42 51M = 40985 0 GCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGANGC (!$&('$"('("*))*!)&"%"('(*'$)#$*!&!%'*+*"$(!+#)!+'" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A2 YT:Z:UP jpayne@0: r7176 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40985 0 * = 40985 0 GANTNNNGNNGGNCAGTANCNGNTTANGGTANTAATANCACGTTANNNGAAANNNTNTANNTGTCGGCGAGTNCGNNCGNGTAGNCACNTTNNNNGNNNNTCN !#!$!!"#!##"$""!"#!$!$$!"$"$!"#$!$!"$$#"$####$!"$#$#!##"""$!!"###$$"!!#$#!$!#$##!#"!!$$#"$"$"$""#$!!#!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7177 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44410 42 102M = 44589 220 CTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCA 9,-##.:-%DA@0++$3!'3''598&6;.H&D0/'F&19>A1)188*!)#'G.+@343 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:102 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7177 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44589 42 41M = 44410 -220 CGNTGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGA &;94;">'('00$88=G;*0-E2&A>-BH;0"5*.B72F$@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7178 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9727 42 63M = 9878 227 AATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTG @(FD$;8&A@3C1&D?+H2*24%/*0'(8C%4#41:1765BA$"=&+).$+$<%77#5C%H8.&5BH?7.@*7/8,0G(>#=2*6>,5F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G9T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7179 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13581 42 46M = 13369 -258 GCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGANCGGTTTT %F);87F$#$:#"0$+9"*/)<#H364$#A=874F:/"$B,<#)F* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7179 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13369 42 73M = 13581 258 GTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCC 5,:3(@'"6GD50?%:#F%/*@5=+<-6H<9183&760;)-%%676/-:7@*3#!+=<=H-AD)'A(="52'% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7180 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 693 42 97M = 792 211 TGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGC +1H1EF1%)++0A-,E0&3!5?ED0&FE&%A;4-F1C*;@E()(*0;8DCGD5C9:6B!'/'2-#:?'A69$**H"..C7HF>H@.)>B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G36 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7180 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 792 42 29M2I83M = 693 -211 CAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACAATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGG 8>.7B432B"++'/20D*9E!(*$"G:>1(/>G/H48-1,+C?6C:?((?!:<##"22;-@A@!?F71G.# AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:33T78 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7181 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6918 40 19M2I47M = 7147 276 NTCNAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCNGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGC !=?"1%8@8:-.&&(<&;H%4#59DE#=#H(&H!>.*3&;5:E33G3)E-,0H"196<.?9*DBD,?9 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:0G2A33T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7181 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7147 40 47M = 6918 -276 TACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGN /6>D+8;0.C9$28=@(@)E.+92H5/38A#C/.%D(+06-:%/@1# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7182 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21681 42 181M = 21896 287 TTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGNGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTTATGC *%:H$E*7+"9>EC&E*6"$@&7"6-EF:?@2'#8#16'&H4-BA"1E69<-F=C.*B>-C5=/*D%&0==>%-634*$@%E21G9G?A,'4:<$67D+3.B3)064+>>E+1#'/2F>*9:*$<>D82F:D4+&"@!;0/*E&D:/),4>13B2;=.-1+A."?.!/:>(H>#<8"HCD, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:118T57C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7182 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21896 42 72M = 21681 -287 ATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAANTATATTGTGAGGCTT 7-E/*'5&.:=.)&>8>2DE-)B5/D!59BF<@)""=B@(3,!;=19:=5!57G20A%77-79**8,"83+7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7183 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16494 42 65M = 16277 -282 CACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTAT )7*6C,-.D-&(-3109.1&/%5D8B=$;B)0G;B#DFB=.;7/-/%ABE<7&6)6A:0*E;BC@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7183 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16277 42 90M = 16494 282 GTATCTGGGACGGATCGTTTAAACCGGCATACAGCTACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGG @4:<+"C71)0#?<$6:A15)*;'@?HC;40$A-!/'88+2=5D8:0E.G#+AG9'/9B3:?A5+,:6F? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A20A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7184 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32639 42 175M = 32516 -298 GATTAAGGCCGTACTGGTTGGCANCGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTACTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTACGGGNGCANTNCGNNTTCG *+"+"!*'$'"%#(%'*'*!#*&"$*"*#(+)#"''*&(!$))"&'!)%!$+"&+($&#$!$'$!)+*()&"+$$##"%(!$*"&&)+#!+#!#&#)&**'"(%")!*(#))!&+&#)!"!""(()++$(%!*"('*($*#&#*$%%!&)!%+!+!&&"$!*'#!!'%!)%$!') AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:23A75C55G2A1T3G1A1T0C0A4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7184 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32516 42 81M = 32639 298 GCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCANCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGC G91-0/;DF--36#5G<>3:!2!6F$E=-1C$/-0C,D(1'1H,*/)<51!-<6:&,&0(22>B>.,D!(,0,-/H@#12: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G28 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7185 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38836 40 79M = 48271 9651 NNAANGNTACNCGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATC ""&*%#("##'"%$(%(&**+!+(%((**+')#+!)')()&$+()$(#($*$$!"#$)!")#)!&!#'$&!$&*$(*#% AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:21 MD:Z:0A0A1G0T1C1G1T0T52A1T0C0T1A0A0C0T0T0A0G0C0G0 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r7185 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48271 40 216M = 38836 -9651 TGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGNTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGNTATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGT (@%?CG035;3B/D*2G(*$6B0B*3&32>$#2"B)-5HF+&H2&2G0A#57"+107*2>=D:@H/6#"8HB/0&/-;%!0F)5=9,/#=!3GB,;>""D;+D=+&)+"#4(C@7*?:*8!H+?E6E4%3@7:$C2!$630-F>97)&&0E#6>/'4*9H<3)&G/5G6'&'B@(3&+0,F,F?$C<3;'DE")E*>G!+;1B&<>E-4=?<6E6B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26T145A36T6 YS:i:-37 YT:Z:DP jpayne@0: r7186 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3638 42 147M2I73M = 3638 0 AGCTGCAGAGCGCCATTNGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATNACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGNGACTCACTGAACTT *+)#!&'%"#'!*$#$$+%#!!+!#*+%#"#!&%!"#'()!'(('(((&)*(%"'$$"+$#()%!$#"&''"&(&'"%&&'!""#%+%'')%(%"%$''+!%!('+()'++%#$'*++!!(#&&'$!$)$&(*#'(*+)'+**))($"($%($*%('""*")&*"(+$)!!($!'#"(*'''&'%%##&#!)+*%))&$#!!#!*!%$(#$(&##%%#!"+" AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:17G0T130T55T12C1 YT:Z:UP jpayne@0: r7186 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3638 0 * = 3638 0 GNATATGTTTTNCNCCNNTGNNNNTCNGTAGNNTNNCNACGNAANNNNNTNGNANNNNT #$##!$$$$##!$!$$"$"""!"!#!"#"!$$!"##!!!$##$"$!"!#!""$$#$!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6494 42 65M = 6559 245 GATGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCA *!>DEB,>+5(<.3H.#86&B8<+E4.5B3>;8GH@;<)."E((@':6E>F<-!A:):&E?6>=. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6559 42 180M = 6494 -245 TGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCNGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATC #8H%2C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C109 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17526 40 156M1D37M6D49M = 17775 290 GGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGCCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTNCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGAAATCAG H.1,20:&6?=%'FCA<3?;8G(5:0&C0$#?=,;)C,-&&$+:@!DAH4@<56#<&:?%<'A052%?E@"9B,3/5G3>)(9>G7@;"@B-).(@%%8$5E=:0#239'%,%#B,<33G!3DDC0&F,B$27=#9F*(?7+F19#:&G"<3#%H0-,&#"E!7%.$85>$0G=:(:/D#6E&->52#/8&F;A%:/#B<@)2::B3)4)!GD9?03$*H7<#'#%:>'3H(*>)$H>/++3 AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:152G3^T27G9^ACCCGA43T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17775 40 41M = 17526 -290 ACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGT >4>/;$6EC!(@F;70'(4"24">?.=154AC>%!=4.=:C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r7189 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29448 42 52M = 29448 0 TATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTT *24,86><>FD1/$(61/%=FB"A3:&8$42>!078G/.:@=5*!!#/1H=" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YT:Z:UP jpayne@0: r7189 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29448 0 * = 29448 0 NCAGAANNNCNNGTTGCNNNAGAGGACCGGCTNNCGNTGNNAANGTGNCNTTATNNANACNC !""$$#$#!$#"$$!!#$$!#"!!!"!"$!$#"!"!$$#"#!$"!!$!#"!!#"#!!"!!!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7190 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9180 42 205M5D8M = 9398 328 TCTGCCGGAAATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACG 25(:(8FH=59*5"F=@"A;-0@C3GD%>:!,6,=2-3!5%B=?,@,E(*//6G?7F-23@?:D"(C('/!7H+,B.CF,!$AE;-C!#5)%D#>9+08F.=<-:5A>)*=>>19!)"F*,8C+#;/?#?%=.E3"-@24C*6;#=/<.9C??$. AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:9G195^CCAAT8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7190 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9398 42 110M = 9180 -328 TCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCT A:B//D*==6D6)<-:(2)#B3%%1H9AF';+81>A$1,HBF.&8-%,:"(>-;0!H#':.>48+*$F3C;>=("*$B,34&4CG>,,<*1D6F19A#7*7=-+<:<)4< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7191 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34219 42 76M = 34398 221 TTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGANTTTTATCAATAGTCGTAGTCATANGGATA &/.-#:%2C%5?=&E(EBG+0#65@HC59>GB&.;4G;;CB'21EB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T23C5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7191 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34398 42 42M = 34219 -221 CCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACC =-1;H0;7=D,;/!&&/95)@2+;5-?'*EF*8)*)-F('&; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7192 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30598 42 141M = 30527 -212 CAATGATGTNTGCCATCNTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAA .6#A&/:-05D=A%"(DA;-8''923<;69A9GD,4+/"24>@-".@16DEF&(D?1GC4F2/<%3H)>A=H&4*(76/6'>)';'D!?E:#)!17"%C93+CCE9#,--#-35>0EA=.F>)$.@>E94",3.B>8;6DB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C7T123 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7192 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30527 42 38M2D23M = 30598 212 AGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTNTTCTATTTCTGA 78$7.09?8,:=0G-%>,4F(C"03*/+C*10"%$.69)H.'6G$D/.??G@2ADGBEA6$@*86#5)"D$$,&.<*B504@F5G+A+?6*6>3'H19?;8G2'&F+(#(AC22H"'#"."=&-5:H?:!H:$''BF=/&*+7$H398"G>+-61>1316)&;F)?HA/F-;5<=@!%;%G5?(>!.837G'6!9@"03;=07-0#<:":7+6:A$9 YT:Z:UP jpayne@0: r7195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44913 42 60M = 44692 -281 GCATCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCNGTAGCCACTGTCTAGCCNN )'"*%%!+&++&)#"+"+%')"+(!!%*')"%$%#)!"$%#%*%))##)+%&$*$!&('" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G37C13G0T2T0G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44692 42 221M = 44913 281 NATCANANGCAGANAGGTCTGCAAAATGTAATNCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTANAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTNGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAG #&')*&)%'((&&!)(&+&++#&!%!"+#"+""''#%&%(')%#$&!#%)%"%%"++$'&&))''$*'+'++#)((%*$''%'(')'$+&)*""#*!#$+")&%)"+%)&$'"&%"'"$$)(*!%*#**')*+!')")!%'!"''(&#))!*+'($#(*#+'!)(+*+%'$#%+$#)#+%#%!)$('*%(($%'"&%"%#+$$+"*'%!!%())'(+%$(+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C3G0C1G5G14C3C26G58C102 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7196 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30202 42 79M = 30436 295 ACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCGGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTT *6,CHC@":*C%"-<&G>H*3*#+C6DH,G80D80C2:9D.DAD(!<%"1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7197 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16729 40 129M8D46M = 16912 253 NGCNGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGNATTTCAGCGTCGGCGCAGAA $567@&8:A.A>;(?1',%$CF1"2H50@0)8(69&1CGF&(#)350&-=7H/*/9)?;1C/%;G/"-5CA?.(3FH;F)6D*13D!-4!3A>A?)+EH92<7F'?.&,D7A>@.G%&/.,48!A)28H@D"B2!,-$:?5*H@90/F19;A**'>,4>2:,"984DA6;-)@>& AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:0G2T125^ATTAAAAC25G20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16912 40 70M = 16729 -253 GGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGANTATGCCGGTATCAGCACCNNTG (#"##&*%*)+&))*$+%&"'!!)%%)#%*$(+$'+#+''+$#'*#'*'$)($(()+&(*+$)!&*+"!* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47C18G0G2 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r7198 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30734 40 52M = 30546 -240 TTTAACATGCTGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCA 5*-9<=@9==A?H?-B*'(D0;A!<$#(,C%2=>)"F5-F8&4*8&"E8,<$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C40G0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7198 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30546 40 19M2D85M = 30734 240 CGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATNAATCCCTGCACTGTTNGTTAATACGCTTGA -6BH@<$%1F5;EC2*E#9>';E9C>$81EA0?B#6-E:,1"5=)'H3GC#544#E7)$/%A%'H%=F84";.349@%+13#E*&:A-(0G82=F=9C#%(E8E0!4-&*.E%"#@'!#+1A-1A54;(*";21+-2F'*9+021E:7:$,25;?- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A85A18 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7199 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25577 42 43M = 25835 370 GCTNNNACNCNTAAGNTTTCAGCGAATGTCTCAATATCCGGAC #$(&#$((!(*%"'(#*!"%$#+%+"%!#%%&%&*()*(()#( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T1A0A0A2A1C4T1C3C21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7200 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48349 24 149M14I4M = 48192 -310 TGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCC #H:1))H>H#?H!:"?8B(05!G'7-9<0%+(8F3;5@B3/;=7:013G5!A)=,(B<*$;24G:!D,;33G%E'$$!$4H7-@+:%(/-'8*8=2=-$4".*B?)2&!(#02C/-<,@;#48DH;&3>6E*9%$-D5>5C#3*3?715)A8;:*E1=C!G0D60(7$7GH2/#!$C38*.EB#)/040**46:6)8F05%6<)8.9;$8,#-@$(C?@9DAC=05*4'3&+"E$"6B)$D(D)-1G8<7;65413-1<#1@3<4&#,:"<,:$>11B3#B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A3A20A30T99T0 YS:i:-57 YT:Z:CP jpayne@0: r7201 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9152 42 63M = 8930 -285 CTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGAT 4B-!44D.BA-$(+0("H94B2)$7;2G-909(#4:?<+8*C2:#+5$?-4!&5@7-C&(109(+$E9(F3-D#4#;3B.D;>;E1$4D88C. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15G121G21C71C12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7203 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11303 42 47M = 11059 -291 GTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGC G#43D3+40:%0%(5@D-.68H5!./2F3B;-*66>#G!1&("!1&"17/B<1C4F%:7B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35624 42 160M = 35885 311 CAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGG >C=$DA+8E!44598#AH<;*87F>/><7'AC=2"/9&%$.1H&>-FF)7D)C58C#=5H@@9F'.;/>BB!+-4$=1#0%$;%C6D7@6(E/%0HH7#'!B',@8$!+)(6112G))9,9&<+G)F?3-=;!710?/77=:7?5)H8<1EBG"3H/B?> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:160 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10108 42 41M = 10194 189 CGGGAAAGTGTTCGACGGNGAGCTGAGTTTTGGCCTGAAAC <,B"#$*+D70-# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T13C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7205 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10194 42 103M = 10108 -189 GGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGT E;''5)41G&0<'&.F?;ED(."4F+89D+$A(*$*6>,$&8*)95"6+849:&=30):3?0/><56F<,9B)=A;82//H3-.!(+$?-2:3=6:)/8D"-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7206 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39805 42 131M = 39936 215 GGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCC 5@4>B6:A.,.'A?5-),&&0D1!8G0CAG0"A04*&:H15+>@"DA23&'C:$FAB6. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7206 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39936 42 84M = 39805 -215 GGACTGCCAANCGTCAGCGAGCTNGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTAT >+@2:D")H$59(G?9:34/+H@4%!A4>74AA*F*71&:4:1;15!GH<%-;9!'6B1=(*-AEA)-A@4H*.D("+2B%DFDC@8+0H=1/000-+7=7(.<2<-'*A+@G132-)C+;B6H'EF#C$6895?D?4&#&)H-'7590HF1&0D#0%%%:38-=079%"A2#B$40'3A'A###B"89;8C<933H(894-ADD5B01CA9?D'0-!1+G+!03.E'%<>%@(0B/*,:*-/&.G6E)11E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75G167 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7209 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1473 42 52M = 1230 -295 GAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCAGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTT A'81:&=-D&(CG&6H0";(1>$@.:G@%*=;HAF365C+0"*,D+).>19? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C23 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7209 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1230 42 118M = 1473 295 GTGGCGGGTTATGATGAACNTGCTGCTTTTGATGATGATATTGNACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCNGGNCAAAGTCCATCCGTGGCT 5"E&GG:*?#;*>)(80(=7:9E65DF<'7C/2=A$0?/*1;(4B6<:BD1G##>>H8:?*+2B1*"C3EB0:<(;<9F%6)''>FHG+A?0/6=:8:@FH.F10G#8/,G-$=,3D" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19T23A52T2C18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29755 42 124M = 29615 -264 GGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAANACNACGCGAAATTCAGCATNTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCTATCTCACTCTCCTTTGAAGCGAATGCCAGCGTCAG 8C<->1;)".8:>G98BFG*!)<,A,&.+7!(6*?GD)46!,.#C!)&3(%.#)"5>HCH,(4$;'3>=#%B!.'-#HE$?9,H>"H/6&H><8)0D22"//E/;'E#-"7#B54C#+679;7? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:40G2G16T27G17T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29615 42 64M = 29755 264 GCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTNTAAACTCCTTGCAATGTATG C*+.*DB2?D4?#251>>+A>!*G,&3!':;&"(6-6A&)#2&$G&>*5E>#>>4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A20 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7211 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44336 42 44M = 44471 245 GGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGAC +!+#+#'&%%&%+!%)#"("$)$#&"$+%+)%"'"(+*&$*)$* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7211 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44471 42 110M = 44336 -245 TCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATT -.6/:-E+H@&@9=$0/!D7):0/(E'C"2<7E%/(FG:;(*D'#)2(;>4*"?FD90H-;%=66AH.@&;&5D6EAF-'A"6D:)#&C5H3.&)96/(3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7212 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2761 42 45M = 2530 -276 GAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACG +A"9-5A$9,*FA&$#@G%>8*+E$CE8.@*1!"E;F?.'&+2;" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7212 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2530 42 45M = 2761 276 TGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGAAAGAGGATGGTG 30CHB*-6.B=6-).A#;<8&<1GC>F)BC#B3#*CDE&?2G"E' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G12 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7213 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7197 42 46M = 7366 230 AGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGG C,157E=D6H-A+5C=$/DF@8%$:>C0;3?F(-!%-A=-B1*&-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7213 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7366 42 61M = 7197 -230 CCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAANTGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGGTAGTGNG +%*+"%')+#"(+)*)")$&&!$!$+"&**++''""))*!!!%+'"%+))$)*+)*#(##& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29A23A2C0C1T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7214 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12631 42 60M = 12254 -437 TGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCAN !!&%++%"!"$#"+)"(*)+$*%#"*"!%!"&%&#$$+'"$!(!$)!**'#)+$!)!$(+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7214 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12254 42 377M = 12631 437 GAAACGGGCCGCNATTGATGCGAAANGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATNGCGATANTCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGNACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGNGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAA "@A%-H/5#2$<49?&A984,>(?*6F%HAD"3G'6*%%!9!8;$/,F!9=D#85<:&8C>G26;8/$2*E",)7@H97?6613,#7!"A?@(=7#E3+45"18(4&2.2>7/*+E(A$;'8:(,#+":"B??0A<6:<=!E(:45%%:BD+>=)%:).26<(A25FA?7@7*=6+-A@?"*<&%9/G**1#(7)C&:3#52AD=FH.'+(;'BD<8))**)>!1B9D01)7-<>8;<;0;--5:'3E0!5@<.$68*/BC,-/@%8C89?!+9H5D,!"4F51:5?'>##4/E8F2.;&>7-C-D"* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A11C12A65G6A124G66C86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44778 42 270M = 44716 -332 TTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGNTCTTTCCGTTGGGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTA 84FC-A5@9HD,=HH<86)/3'%,+:@32>+C%9E,40&;!C=62=@!1$0;84GA.@@#'B-H/!D#/+7(-@$@8=49AED''CB&/@96EG-':=6.?=?.!$21D&5&>A979D97;#(!@<6($%?H/&&/!*!?1)G6/*!=0:7B!)"B>2;&+;6GBFC$8@"+#,;7EA"-5?E:0:2EB#B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:71C11T186 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7215 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44716 42 62M = 44778 332 AATGCAATCCCGAAACAGNTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTT <07?H2C2+6%6B.>/@H,3(=H516&='H0!7<#-<$)8;+:8A"0D(4/-4#E.<52C:% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7216 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12641 42 174M4D54M2D57M = 12932 446 TGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTANGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGNGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCANCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGC :3>"/#3(<'$:!D/7A"$;24%=2A*2=13.8E15+'B63=%$<'"A5@"!62@A934?C6:!21-H/D@*+(/3D.(B;B@D'+9%CEB%A(-0#;820F;16C2=;+!G&:9(B@4:%'>G*46D"8F6'49:3$D"++&G1D,$=-"''!#D>:>C#<<9;'@$A8@G&);7*4DB68D;:=)FA0/9B'8AF47C%D+7EE-;D,"C=#&%<"3!'+C,E*0E3<4@#BEB"D4=5:@#'?;#'92!<*@2>',5:0(//,."5>3<,7E/4BH)&<*H)E4-:"-H6H4)E@5$(@6'=)(#A3/+7$9.)(B>@+>$C"9G/2;0.H<5E>1D:,--"3$B'H,H?+1$80)9'0(!F1?9D*E'F+GH;)1C*A;C%H8F.AF?#*$>'+5#7:;9#A<#%9=-41'"4E!"->D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T98G28 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r7217 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29488 40 59M = 29722 283 TTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTT 82'E/*F;E25;*7/*4C@!#! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7217 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29722 40 49M = 29488 -283 AACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACNA )!*C4'1$/*/C*FC6073;3B).)A!5*07??0=0'&''H@D!#"<=6(@>D>5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7218 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28744 42 159M = 28962 277 CAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGG 1#7?6%0/7D5<-)9:0@,=DC6$'E280*$D2"-EB!1:+/>9D@*-#69)F6#(,,0<6:+7@H$1,!.:%&?1#4?>%4AB+#3'E,@10!84$DE4D8**5/16983:0=DG"%8&B14G!C.(8F60:9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:159 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8009 42 73M = 8125 166 AAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCC 4F@%)14G+*?D$"6(C##6)8(8G-@>A&4$D:=5A(15B'!?!FF'F&.227@/%%FE64;%$A:4AF4C@EGF'E>9-G;@A:7%@!-$.6E27B>21' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7220 77 * 0 0 * * 0 0 TGNNANGNTANGAGACNCNGNNNTCGNGGGANTTNNGANANACTNAGATNNNNNGTNNNANNNCNGCNTTCNCCGNCNNNNNGTANNN $!!#""##!#!$!!$#"#$!!$""$!"###$!$"""$$!!#$$"$#!$!#!#!##"!"!$!!$$!!#""##$#"#"$#!!"##$""$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7220 141 * 0 0 * * 0 0 NGTNNTTNAATNAANGCNAGANCCGNNNCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGNCACGGTCGATGTGTTCC !*!)")&#&($&"'&%"$)$$$'$&##!&&+&%*'*'#+')''!)')*$*++#(!#+#$"+*!&"%$#' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7221 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1783 42 152M = 1937 239 ACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGNCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAA H44$>9E$"F,94!(.H3G$6@F5'%'&7&63@6'%6";40864+!-C'.*HA<*)7D#-96*#CE*C-?844G:*A9B?EB7!+!'98"1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G14G115 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7221 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1937 42 85M = 1783 -239 GCGCGTATGGNGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGANCAGCCG (&!*#!!+$((#""$*!++!''%"!#$'$((")''"(#"+(%!+&%$+""$%"%%%$!$*%'(!!$+"$!%))+*))!!+&)%(& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G67A3A2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7222 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6140 42 55M = 6266 170 GATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGAT F#$"1:(?G,H5354=8,#"@'/='"?%=(G&?+75AGB@68?A/@D2$%8H6/; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7222 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6266 42 44M = 6140 -170 TCCGNGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTT D"8(6E"$;@4).0,)+08G'FCE>)C6D=?4#F3DFA08!-)( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7223 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9320 42 60M = 9491 243 CTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAA 2E3$B*#E*6"6<37.(=/.01H(C+5>2$>"DC,HC32:G>8FE$$+">=(@/05)9C: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7223 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9491 42 72M = 9320 -243 CACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAAC #;"87:<#&C@!&7F";#'D"'H430''*&%1?&0*3>8D$9A(;B):'6C&67;,+?"339463+#88:F3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7224 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4866 42 65M = 4980 162 TGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGANCTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTT :"?:-;B*48#/4=3H'%9DAH>%,?7%G?A5; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G9T23C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37495 42 106M = 37319 -282 TTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACA 0=&2)5DHF."%)&5@87D)&"$#.4>%)?D+:D+*H),4&0&4"HB+,//E%$E2E;-AC.?2!:1BGCF/@B&7E)(82A$7(+<1A7&9&4++.0??D85F9= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7225 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37319 42 154M = 37495 282 TTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAGATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGA @5&'375%.!)831>96<-&6/99$HF;$51:+;52?0?$66)+D(?%=C'*>D4A)226:8%!&%)A9/=F*A0.1A+./87&1@#?'>)%B#%)G9&%%3FA#3(<+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46775 42 42M = 46945 213 GAAGTTCGCAGAATCNTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCT C-*A<669+-!+)A#.1A!F.+--C.$&F0,@37*("A>@90 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7227 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24708 42 96M1I36M = 24915 269 CTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAAAAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGA />A3/.?/5B@$74%>0%3=(F*G!EDCEA#92!0+F<9&6(H1F#.C)47E44(4&67+BH$+)>B0D$(;0=#*82G;:>*8",1H<;,:B-@3CH4$7+@@601.#"4;,@()::6+B="=D2)">AC@8 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:47T10G73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7227 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24915 42 62M = 24708 -269 TGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGA G8,C'0((:)31G68)(CG2%6**@?&F-5G718DC.EG815C?&1$6,G(H;06EB,(EG, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7228 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11021 42 107M = 11157 197 GNGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACCGGTTAAGGCGGGGN /&>3E46:4"8C.GEFD8)+-").G*.93G=&2;2,D5386;GC>*@D9:<=+H,?=;07CD6<-565+=,"5&A6%G4&'AGB+D85CG'<(-3<857-!5++H>-58$(%FDH1-!:,:(>8;A'8134=@AE(7/: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7229 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20699 42 87M = 20565 -221 TGTCGCGCTTGNGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGNGCAGCTCAGCAGTGCAACCATCGGCNNNNCAGNAACANTNGCNGC #'#*&#$'*"%'")$$$'##()+($+##%))&&&!&("!+'&%!!#"%%)$#(+$&&'+)'*""%$$!%!$)$*!#%'%"&"'#!$) AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:11A29T20A1A2A0C0G0T1T1A3G0C1T2T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7229 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20565 42 77M = 20699 221 NCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGA ")(&,*9FD$@>D$)70?.61*77>#3D"A641'00(F1.6$$HG4#*G,%!(:BF><3=3D(2>*4#;#"&-045& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G76 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7230 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41173 42 133M = 41017 -289 ATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGNTTGTCAGGGACGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGT 9:C>?%;#'B,?@"C@@=-3;F09D>401$7-3H(/!=F,3F057F03+')B*:((='3=&C)1E";*#1EF1*<.>E.#&EB)=(=0-/16,35;?77#*@)H/)CA8!1<.6:<9A.8:=!43>F&+C>=! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T45T10A75 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7230 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41017 42 87M = 41173 289 TANGGTGGCCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGAAAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTC ))!$+(&%$&&&*+"')(*%!&#''+%"(#(&#)#%$&%+*&&%!%!+'%)&()$&++'&#*'%!"+((#'$$(($'%"!$(#'&%' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T0A0A4T46C31 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7231 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19520 42 126M = 19749 312 GAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTAATCGTTGGGGTCGGTCATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGNACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGT 1G"3B"9$A5G(%&8/?9CH==A!BB*+!($C?H8!=>53F,9%H$H<*.$,89&*!)2(=?3G;%93>DD#5G4FC;3&>,0*D(><+F!3>+.$#<C00=A'#(@$@1"62:=,3#C",'@6<;25G4%"9G)>--'>";9@-2-=E.5C?9&H: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A19T13G42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7232 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23254 42 60M = 23371 269 GACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCA #8!%%F3+272>AD.&26+.!$H9"F=.9$19G&EH$':49:0>@23.B;&)A54E.)+5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7232 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23371 42 152M = 23254 -269 NGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGANTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTG 4B+E63F:);#5./6GGH("*,-:'6164!A<$(-#7437947&94579-)>)>B46*(225.@#-8@##9*2+?&511/=@1A?2HD(;6>?#!,%80)$0('*"A,/C!F-, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T42T108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7233 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42449 42 78M = 42236 -291 AAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTG D0>-0(,'?<;95BB-8>!*(HFG.8?;C9!''2"F(>'".E73DA=?3H,;&%+?22:17%@2)D4G93,?;=,7;C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7233 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42236 42 69M = 42449 291 CCGGTGGCTACGACGTCGTGCGAAGANAACANGGTGATTGACCANAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGC )?:97"3.!F'2D<*%1C%B)@"12=:BH>:"4&)8#3H7E:+@'>E>H!;+.+*&GB$<%&/%AC(H0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10A12G2A4A12A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7234 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42600 42 69M = 42381 -288 CGACGAGAGGAGCTGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTAN 98B(;5$D7/D:=G;"@99,=@+EC"3G5:9='>$4F'7C1+;)G!1E67"$A:>,2:>2A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58A32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7235 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21660 42 44M = 21414 -290 GTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGNN ,&>*F<-0!2*+B4<8=5;6-2E@-9852C;(F9*!-,E)*/$" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7235 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21414 42 55M = 21660 290 CTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGC :0.("(-H2%@FA1("$@F/B:4A3H"DH0G4&@(%>85-H.6?,+F-B'@=F%4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7236 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11913 40 56M = 11703 -266 AGCGTGAAGGTGNCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCANCNTGCTNTGTG ""$#'&)*+"*'&+$!%$'!!*"#*+&('$"%&*!%%+&!#('&!"!*()***(!' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:12T31T0G0C3C0C2C0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7236 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11703 40 44M = 11913 266 AGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAANATACCGAAGAGGCGCA @33GA@(H)=?/+<.8H!DE%)'F2(&9%C#2"$/2')$B@?A< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T16 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7237 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38458 42 44M = 38278 -224 GGGCGTTGATATGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACNGGA A9$00:H<.28C*#$A3A:?C--<58-;9***A.+)5*5"C9<.>:HDG?95)**<902$?3-G@.)C(<= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7238 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18719 42 121M = 18907 306 CGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATAC CCE<=6(?1;8'$@&;)#E3E3')7$'-+0G6!?&H2F3C6#!3%<14+6@#$.F%5$@66(3HC$>*6)2H&$,;C+3<#3EEC;:H3,!6)0D8,DC37(1=8!3.8'C(&@.>:;D?:;=G713&H>'CED,;7358879"!-?4%E4.3=#?2?2&!&;/%=,@=!0()A*!<))4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7239 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31436 24 104M3I50M = 31619 226 CNCGCCATGTTNTCNNCNTCNNGAANAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACTCGGGTAATAGTTGGCAAAGTAACAGGCATTTATTCGCGTCANCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCNTGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGA (!&()$&)(#!%%!!*(#*'"%('"!)$+"!"'+&'()#"&"(&('*&!$$&+#+***#"&*##)$#+$!#$&("')&$'"$%$&*!)++'$&$$#)!#"$'#&(($&&$!(&)'+%)#"'(!+#%&(&#'*+*(!"++)#)%)!()!*%$&!"')) AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:22 MD:Z:1T8A0C1T0T0T1A2C0C1C0T0C35G5C15C9T9C11A13A24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7239 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31619 24 43M = 31436 -226 CGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCGGTTNCNGTCAC !*!!")%)$+&!)$''*""(&%$#()*%+*(&#'$$(#'&()$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C3G1C5 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r7240 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17494 42 76M = 17318 -252 AGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACA -+6+3D4>:*D,7"+>.BDF5>=)/:?$8$72D<6@+4$1@'='%AEE",':075%A+'9(34,6@8-.4C:<*DF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7240 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17318 42 47M = 17494 252 TTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCATGCCGCCAGCG F.:?E8@H65@G/<+0ED#:CGB"5;6$*'?D=A@DE<>3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7241 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30323 42 151M = 30474 234 CGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGG G.@8,#F;!=?$$==,B1A$B->#!#/?F50@*/'',2D!,3@C"3AE;,F79(F4=&)/H8+#$&321'98*E0C!(?(3@".+%'14&-*%C?03%C,;4!7FG'B7;C-B%4D$1!+*@B,?8G:-CF78.G3%:;@('8%&C64E'' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7241 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30474 42 83M = 30323 -234 CGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTAT 6G*$.!,F1B"7*>H."B1,!596%3382)38?B9;G/E.C7@-D;)%BF4("8F$##'&E&4?C::G!?4@A/23>&"B4?" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7242 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37212 42 112M = 37332 197 AGAAAACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACAGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTNTAGT +EE://CCG<*)6>=@+4=%B.&@9G5<#"6<&($89B8A"(09C,HH%7$:,0%><$-H0"'=96EC,@"8A"20@$?@?.D5=907),..!#0/G77=:C@:*4B%C4"(?=6!;/AHF30%.H3/2"A8'69;@8+97$!;"G12+-=;:3*-:7<=ECE2GC@==,% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T9A31C48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7243 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30579 42 55M = 30729 260 TCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACN ?+B>68AA02>>-0'**H))7.+7/!3GB>2AFGH$3-/*G>E$$.))+-)4,0: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7244 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14560 42 259M = 14500 -319 TGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGNTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGTACCATNTTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGC "B.G7H=<>5)7.?/A&0"403H3";/$6,:;8&(@7+6#;!)<+D-F#F8<5-@6)+!&E&9"##A(9:0G?>$3F+%HGE?&B==6)G:2B#8/01/$7*C)/)+:,63,8,E>#5<+B00A&7&",E1&227=-54286"2B5@67-,3,C!"2":D'2)=C@E167F8FC"+3::FD,+D!DCC1C5C9@H!:4&2.HEA*20(!@G-57#%(94"=G/)D%'B5D""3)7H(8@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7245 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35211 42 64M = 35089 -186 GCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCG %=!BA&EG"23<>F$31HEEA8-18$A=**1'7-0$!"&'&;;=-6=!/,8#BB"8'(865 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7246 77 * 0 0 * * 0 0 TCATGCGCCTTNTCCCTGTACCTGAATCAATGTTAGGTTNCCGCAGAACACTGCGCCGG /&F'F9B(/.1(@'.@8B@+<0%59C(9F:ED8"%6&8D;*(5">79*%2B877%!7D8 YT:Z:UP jpayne@0: r7246 141 * 0 0 * * 0 0 TAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCNGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCACCTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCNTACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATA -@!15?>>3D8EAE"4D$@-8=<@,A#,.1,#=-!G/F'C"8/$/F65;8&.*:-3A#.<*?9>AA=.:D*6D4.68C9&1)#7DCA/7'/A$E("G<&,F)"!+",*:B#A4C+F0(78A*37%22D#*72?=1/>.-A8"/8C-<7A-=B#@$8>86CD31==E-A+:%B8668DF&?+:"FB@7 YT:Z:UP jpayne@0: r7247 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27304 42 200M = 27504 254 TTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCANTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGCCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGGTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCT ."<%"(/>G&3E)+>DFC;#"/G1=-!!=F@&=F3*AH0D5?&2/48"F>$'%$)'<44G*!=#..DG:C*=G!1#G45"/6@+5@%"9E$.(/=*0E'4(03,-AF5(/*==#BA;*":2..'0*0E$=$/5(EA+,'%((3%H4A)H-7B88=/-29:+90>6C+DFF$>G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47C59T24C67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7247 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27504 42 54M = 27304 -254 TTGTGTTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGT '.H:D!1H0->1F>422B25'C;,?E!6<=2516G'#,?0!026-)+6H#GF<% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C47A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40931 42 124M = 41055 262 AATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTNTTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCCTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGG 0($/*E!F?C05C-A=;A:@+B.G@3#<8"@%FF!G=$"7:26?*!>A.8B,A*%4:.2'7D4::7@/<'?*4C1A)+$G? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48A31G43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7248 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41055 42 118M1D19M = 40931 -262 AAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAG !'1!*=*A3?;32@;D9%'E.33H)+D>+EE18-HC:#E24H83(:3:9',",5?(9'6'(A45D1EE>:G1&G!9A'/D,0=5(6+D%$13%7$=?>.D:F)3<.24FB9+79AE?5#)@-0@?6G",;2!(H,-8 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:118^T19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7249 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41396 42 95M = 41240 -251 GTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGAT !8(#A&;87;<3/??75H3AD+?41735<3E>?+B>13>EE&%8/58+1'>)#:F1>C729>@&)A;;@+G3F!$")H>5@HH/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7249 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41240 42 58M = 41396 251 TTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGC (.93,)"62E)3.41(52?479.D.<8D(FF6(./>-FF(B1%72%;28&8!(66B9: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7250 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34543 42 168M = 34317 -394 TGGAGAGAACCATGTANATGATCGTTANCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCNCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCAT <5:05A"E1%*8!("=9F,8$F-'19:"G.?'=H4!=)G551,069>,,F<:"B(E"+&@4F03G.8.7A=,C()@9(D4++"46F:!B*$/.=1<;9B"4#;H;!.6!)6./B>=9D6:3$C7/.*,#(+&4(:7F2+'->;?=.5>->0*+4#$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16T10T108G29T0A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7250 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34317 42 226M = 34543 394 TCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCANGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCCCTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTC 9!;1FG('B4$+=+/;CG%-"F#;)A%>,<%%$&B%.*8,D58G#2B<=2EE%@#51C$9D-D%E)$3?,3<1BH*0E%D80*89/2'D.3@37>10#+1:'>/1B(>(+48B;"6"8-"*34:A/4;>#/40+H<349"E:1;$2B%9"/0A=F#H-G41=17!)5A9"/EA24D=<-#:%G&H4-? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53A47G86A37 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7251 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15540 42 41M = 15342 -239 NGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTN 7!*$A6'&/E35:.+8F(2?BA:2E843<->1,$==7B4<, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C39G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7251 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15342 42 130M = 15540 239 TGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTCCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCT >&B'A(FF359+@3&85!H7B>!:,.(@2B6H3>5'"A6;82+471:&83#?7@.F'#G6!:<014;)14=;;/34*B:639701=.)%4F?-$C3(,?"874#=62A0#G"B4!0>?G$&@0H/@!G'7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T89 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7252 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11488 42 45M = 11344 -189 GTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTN ?49;:'*319E*-6E<3):;'C!8EA)E%,$;'A+>$D:E;?0'+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7252 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11344 42 67M = 11488 189 CATTGCAGGCGGCGAACGANGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAA B9?3&)2/9H9)7+*;*+,#GH2"1%4%!)383(95&/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7254 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44539 42 64M = 44686 263 GAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTC #H#@:7DC?7)"+F!?36(#;'03B!D,=2:/;G"C7BA@'8&#,(5?E9)931*&>(D56D60 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T63 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7254 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44686 42 116M = 44539 -263 TCCAACCATCGNAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATANTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTAGATCTGCACAACAGCTAAGAG 81;A:8625)E.5(,$*6!@703=*B" '8/85&#+1A5$B63&?)>(5..-/&@1;/C0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11C49G33T13G6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7255 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34316 42 57M = 34063 -310 ATCCTGAGGATGCTCTTCGNACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTA +?:0,<(10#HB>FD.7*E4',G@=$*.9/,4#"(7@..@"G*G*<3<%CD#817H( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A34A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7255 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34063 42 60M = 34316 310 TTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCT 4,;(89GA!B4/4+?0AG=A'$C0>:E)=<4>8H<:C)!7D00CH=CEH%6;10))584-C+&9.C;G/(7H,!9H6+22$,)%;CC-5%A#?6;:'!6;=A:''3,;H7@3@40EED$=7?&5"0:&!<<0%6=#A788>25GE-HD-;$9:2#!6:2$&537D$-F!3/85)277FB7F??G)?$<,-),D,<,"1&B,!)B*,<;$>@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:18A48C23A11G9A43C5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7258 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9180 42 54M = 8967 -267 TCTGCAGNAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAG *H5+@.2<@6A0+.6E&0)3"79E:'=!?37!2A/;6)-=<%,)895.;2(B@!9,063?F;;G!B=HCEE(B2;0)E<"AE,("E%?D+/9>";<;*5DB);/'6'AG4;&.E01E.&(%F<+< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85C18 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r7261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14577 42 73M = 14358 -292 GCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGG (;%7!F7=3E:3=3H)598$,HCE1&0-*H-4&A#,H"?%D."80!E86E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14358 42 127M = 14577 292 GGCTGAGTGAGGCCGANCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATNTGCCGTCGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGT 8C"C#E9,%?:F-92;78+E*9;,$GG>9;FG96#G$&H=,D"@9-9H&B7(-+7"7?0"/:B,2!-*2*#:%A.H"(H?8:3?>H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16C24T6G78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7262 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36142 42 145M = 36142 0 CTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAAC ?=6+,?&($*$=@E2:1C;08+/*C:2F1C57(@0,0<"!>C*?5+"7G=A7&.B$B-1)8DFC02#(+8>24DH<3/F)*#:AE;741., AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:145 YT:Z:UP jpayne@0: r7262 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36142 0 * = 36142 0 GTNNGCNTNNNCCANCGNTNNNNGAGCNNTNNGNGCCGAGANNANNNNANNCGCNNNNNNGNNNCNATGTGNAGTNTNNNACGNCGATNANNNANNCTATNNTNANTGANNGCATTGCCGNTCNCNGNTTTACNTACCNTGTNCANNCTNNGGTGTNNANCCANTCNATGGNCNAANAGNTGTNTNCNNGNANNAGTCCNNCTNGCNNCGTTGNTCATCTCCTATTACGCNNNNTTNCCNCNCNGANNTT ##!!$"$"$"$""$!$!"$""$#$#$!!$$"##"$!##"!#""$$#"!$"#$!"!$#"!###!"#!$!"$$!$!#$$!"#$$"!$#$$!$!!$#!!!$!#""#$!"$"#!""#$$"$#"!!#$#"!$!$"$#$$####"##$$$$"$$"!"""$"!$$#!##!!#$$##"$!$!!#!#!#"##"$"$!"$!$$##"#$#!!!""$$#$"!!$#"##!!#!""#"!!$"$"##"$"#!"$"$#!!$$#!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6733 42 148M = 6944 304 TCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTNAAAGACNTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGC @@!59/;/+175:(B579-#.&CB,4(*88770F9CH.E:"33E3"0H-1.)(E'.H*%4:D3!#$!=:?255/A)!54#)@@:8>@/&:C@$>+9!.H3@?#G5(8,#$4?-'*<<9814@GH!;*9FG8+6C)901 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:91A5G6C43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6944 42 93M = 6733 -304 CACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACGGCGCGAAGGCATTAANGCCGC #$%''$+#**#''$%%"!+#"&$+"')$)!)#)+"'!)$+#(((*$#&%(%%"!*#!!)''"%)#()$++!+)!'+%$')$)#%)#'*%"#$+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71A15C3T1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7264 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21814 42 78M = 21928 207 AGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTNATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACA !>+0.0"/'?4:H(F$(1;B9A?&&)G-2*/H184G&">5.(@"2-B"%=)%:08F.D'2,'.'G1;5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7264 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21928 42 93M = 21814 -207 CACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCANAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAGAATTTATAAT 748761=H5-,(42.1?37=G;H@;B,*B/D"#'H<385;-0D.,33DF"2!HD6E/EE?#A#=4.810*)(B%%#;?;?*.<<&5(#5E?5= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G26A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7265 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4600 42 185M = 4555 -230 GGCATTATCNGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGNCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACCACGGCATTATCGCCCGTTTGNAACNGTNNNNCAGCGATTCNGAGG #)"!((#''!"'))'!#%'"%%$(#+""*)(*!'#*$+(%'&#*(*+(%"&*%#*('(""++$*'+$(&"&&"$+"+#*!$'$+&&+'!$$+%"**"!%(++%$%#)&*#!!##+)##)#"&%!*+"#"&%")*)"+!*$**!"+))%%!%+!($*#"+(+(&*&'#$$!$%$%)$&"$$$$)*% AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:9C49G79A17C2C3A1G0C0T0G0C7C1G0A0T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7265 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4555 42 45M = 4600 230 GGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCT FF>;,.CGC+!'?3@+C=!=E53!H8@-,E9H>>,49,=4/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7266 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14086 42 142M = 13947 -281 AACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATCCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAG #E7$G-H'&8(#@@/#)/83AB(04@F3032E9*+>5B1.*?$2"EABG*+@F:C9F.F7DHHEA?;+F77:;*96A7>'$,),;))"1/!!DC3)/%!&8/B*FE>4@F5,F%*D?-/48)(!"%$G@'B"F/2E9C&H6? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T71 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r7266 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13947 42 30M3D61M = 14086 281 NANCTGGANCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCGGGCTGTCGCNGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATGACGAAGGATAAN #+"$%+&"(#$*#'#!&"%!!&$$()+$+#'!$'"%*(%(&)+"%*")(!#'##!%%&#*!$*#**(#++##)*()*%'%&%%)!(%)()) AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:10 MD:Z:0C1C5C21^TTA8C9G29C11A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7267 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16747 42 116M = 16558 -305 GAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTCGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAAA ><,17"@>8115@(9%CA7HD>/+:4<(4?012?'"G&*6D1%!-!>>047-.G*ED4HE53&#<*C(@&7?)C;1C10F&=5?,=F@60!663F2<4;2%6?13(6& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:66G45T0T2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7267 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16558 42 162M = 16747 305 TGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACNGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGAC 3D2+)?2-,++++!--,%6B5/>=38&.%#&0&2*%=EB6%!A,-@1=.DD+C%2-@13G&/+"@!/6*D:+2"-370@6C9F%+E;*F5AHB'H0A#,F.$6&@H(+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:96C32C27T4 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7268 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40003 42 55M = 39728 -330 CGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAANCAAACGCGCACNACTGGCTGGTTACCAA 26<,G,572&6.((D7#3H%E7>2646C33B>%4(5D:93-!!)3G("438;;BD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T11T16 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39728 42 275M = 40003 330 NACTTNCCCGGCGAGGCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATNACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAANNTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGNAGCGAGGCCTGTATC *;@*?%?C/5329!#3$3#F*%'!97(#52"G;.3.).:.1&$0.+(6A:9-3-4%6%;%'E,;5(?7,E/=*8')D2H8D>-5#0?)B3F'0;G4(7F*31'!7F#<'AE>0.E+#)2!H".1*%07FB9E'1?,?CD,(@AHC/:;?4@D973D57/%/0**!$.A;)%$-/2)13"8&#-B+4&8?F6A='!&/:#?/F+%,.?DD:/$(!$=+!!!@@;0>>)A6>HAD,44H:+!F#F-C/G9(H2DC*-B,%&=F/=0*$3-&4>'H#%1G3& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68T1G13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7269 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1170 42 121M = 1011 -280 CGTGGCCTCTNGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCNCTCCGA 71?159B7F>$$--BC*&D;FC<'B'&32$,;A&B2!7:-;:#%04;G(0,>*"FB4'+A#3!FF-5*%HD">41C-$@,F?F<,.#7,4H.EE-H23D4#<'0!6$7+/%>B';4F0G$= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T3G103T6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7270 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45832 42 52M2I68M4D127M = 46083 361 CGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACNGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGANTCACNGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTNAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACNAA 01'")?A@8;<""/$-F)+D$GC#==4?/*5C;@5C#<.F<2BE@*@*;6GG7$<%/87(3836+2>F5'087/-C%B%H-'"%@%;B&;E;.1&+B,(>.F=#%E64"B1%'9E5D77>/;6%"@))%D"A!"C3+A17/?CHD6F)/?":<7+E+;3&$.0++!02D0C#!#@?2A!1AC@2.1C63+1H?((:-:*13(.D$213?C&.<$?4#C&'E%2*GB:+&&7>:CD#G)>C?;;C*'+.> AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:11 MD:Z:40T79^AGAG19G4C53T45A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7270 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46083 42 110M = 45832 -361 AAAGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAANATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAA BF2E#@>0A%#;)3)EG9+.G#0:AC:&,"/>?<*:6D4G,>8?#$%>B*74D;>3!1@',.(EC"<>6E&2;CF$.D3?1#4<,H7)+#D;>9H'6H="$=1G&9C859 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T79A27 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r7271 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44787 42 71M = 44959 248 CANAANAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAAAGTCGGCGAGCCTGGTTAGNCAGTGCTCTTTCCN >3:1#,0!!>4+F:+"%!#2.57>04(FHF%"3=+7')='(<"B:!,F';EF1<#%25$;223<#&!/F=4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2C2C30G19C13G0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7271 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44959 42 76M = 44787 -248 CACTGTCTGTCCTGAATTCATNAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATTACCTTCGTGAAAGCGGATNNGA '+%"(**)!%!'!#!&"'!&(*!#+*%'(%%!'*!&!'&+*+($&$#(("!"'###&+*#)"'")"%(+'"("!'$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:21T31G16G1G0G0C1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17233 42 101M = 17076 -258 CGTGAGAACGACGACGGCACNTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGTG &"*($"""((!)$&'%)(%*""$%'$!($#)#'%($))!!)$('+$#(+)+"+%+*$%!(''(!&$$"+&+'*"#"*%$!'+&)"(""%%"%!+)(%%*+* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G78A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7272 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17076 42 108M = 17233 258 TGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCTGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGA B!=%F7HBH@1-4+.;3?#?/.HA/50D8',!5!(FA3.F=(/$/00&"&;;4.C"FC:@&@@9;9"D'?E-"7G2"7(,#E%$&7)BEB<1+*@;:81=.&%*A1%@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7273 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14253 42 193M = 14499 335 NGTNNGCCGGNGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGNCTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTNGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTTTGCCCTGGCTGAGNGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTG %%#*(#()!)&+"%%*)&##)$#&("$$+"&!'!(*(&%$%)%++!()$+"*&%%&$"+**()&')#(+*(#)$+"#!+&&%+#*#(+**+!+*$&)#&&$#&"&&!!)%%*!*%$#+&*%"+$)()#)*"*%(%!!)('$&+'&%"##+'"$"!$)+('"("+*!#%*#+$#$$*'&)&*"#'&+(%$'!(( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G2G0A5A25A33G27C13T80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7273 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14499 42 89M = 14253 -335 CACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGNATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTC "=/0*%H/,<>/?78+B;(0-??.!?)5/@!*)A%9<*@":F?#$H"7&@".E1H%',CC+(1@5A-D,+#(0?-;'4+6+#+-"@D9C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7274 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44606 42 298M = 44904 475 CGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCANCCATCGCAGGNAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTATTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAAAACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAA -<7.;-7.>5962H%?)6::)1#6&+AEE;F+5G2/,"A:;3H#C$A8.7F(+#CH5$")(#EDE>E>89/+=HFH-G0<92A@:8/!;7;#22?=55=G4>@.,F;F$%.,F!5;-2>D&8(@:#%@33=22/#E&%:B<3E.9%*H#/C60E,;1H*$)F>EC34<#3*(-:)B!"'-D2>:GH06B')1G<$5F=>A?)H=G/$16<1E2:?+CDB#A>=$!6!#6D:%"($A4217#3&9.F8FDC<&%0<37*='4DD;((373!H!9D?>;D67&C2B!!>@4$9.AD;4C1 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:84A10C149C25T26 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7274 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44904 42 177M = 44606 -475 TGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCNACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGACTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGACGTTTTGCCCGTGCATGTCGG =5?:CE02AD9,.15#-')1E.CA;2F656$+:%8A";6G,D3!H%$5@A"%>;E'5(#EE''%<,CAD(0)@(;BH8B-):2$<+;.FF(<)$2)GC=?@20H7:2(C9'2($(5A9*E2@AG/C:ED4!F=:'"!G$8F?>5)'C9'%,-*7G0?-&B&'119B:$65F%>A);= AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27A32T94C16A4 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7275 77 * 0 0 * * 0 0 ATCTTACATTGCNAGAAAATGACATTGAGTTTATTACAAAT E')*)?>C";G''G51#;:2<>&B(A3,=6;EE>H*/6:,> YT:Z:UP jpayne@0: r7275 141 * 0 0 * * 0 0 CNCATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGT #$2BE?C!B:5*C@@>4.=:-1HD">>E!):/.0FH#"'%)9"1)&B1&@)'0**&%;*-)(9C&9=9F6BE=%%+#;$=>>73C@=B YT:Z:UP jpayne@0: r7276 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24044 42 120M = 24198 299 ATNNANNAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTGATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATNGTAGAGCC *($"!'(("%+''+#)%*!'"%*%+%+(&#%(!'''+$"!&+#+"'$*#($##*"+"'%'##"&"$"+&&!&&'+)'"+#$)*()!!+$*"&$#&+&'%*'((%$"*'&(*%**$$!#** AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2A0T1G0T24A79G8 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7276 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24198 42 145M = 24044 -299 GGCTGGGGAACTTCCGATAGTGCGGNTCTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGTACTGCTATGTGCCGG 1:=G@)*F+GFF$/)(4#G3<-%+#9,FH+61D<0*2.3::&@;%=H4$F4F>#.'F-;'D413'-3'9F+%"0B(C#=B/$9(;8@;(30!FF*"FH@680?3%G,F+H42'7&;3/>C:-H6<<'@6H-?,!..-4F7E- AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6T18G1G93G7G15 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7277 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12219 40 122M = 12068 -273 CAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCCTTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGNAANCNACNGTNNANTGTNTNAACGNCTA (+#'**%*(&+$)%#*+&&"%(**&'((&&$%"$)$$#($%&)))$!&&+")#*'"#%)")'!$#)(+'!*+(*)($)$!$"&)#+''(((&$!)#('$')"$###&!!$(!'*##(#$$&' AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:48A44G2G1C2G1A0A0C1G0C1C0C1G2G1A0A0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12068 40 40M = 12219 273 CGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTNTCT D?A74>(6,#CG9C0.5!=C+:F!E:;,-GHCG',3/*'G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36G3 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9036 42 49M = 9190 278 GNGAATCCGCTTTNAGACGTTGACTGGTCGCGTNTGGCAAAAGTTAAAG &!-A$6:F>,6.7/D(=-97>?2*:+),AH57-3!DH*C6!C7AF/3!F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C11C19C15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9190 42 124M = 9036 -278 ATACCAGCNTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTT 8?)D1/%!!&4@"$<>=($,,.;;GD8)F=!38*GE:->4E>=@<4!F50-7=8+=71=-A)E7E@:H-6%EE9-4("9+=22#A2,735"=2?#/",9,F$"!5.@;/H$?=155F*"2;$&C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T115 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7279 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25150 42 59M = 25278 251 TTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCNTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGC )+)"()+!$)'"*%"('##+("$!$&%!(+"'++''(%)%$&(!%*&#')%"('+"$!( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7279 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25278 42 123M = 25150 -251 TTNTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAANATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTNGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATT A415!"&(/GC@4,62-#5<3+E9>#,E0<;+82;:'$B/"-E84.3)C03@6/;<'&8;*?07-;25,131-:&.H?G$4?"=BE96HC,&1.:#G7E0G#G>;41)CH<=!57+@F(?-?'9.=!@:(&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7281 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12167 42 117M = 12311 205 GCCTGNNCTNGGCGACAAGGTTACGNATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCG &!"&$!%!)%+($#$')*!$%&*!&!(+#)"*'!&&!$&%+%!!'!$%*$#"#*$'+*++)+')&+!((&$!#(('!(#$$+'&&"&&$"("'*()"&!$)#"+&*!*"&+"'!!#% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1G3C0A2T15T91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7281 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12311 42 61M = 12167 -205 GGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAAA )9<@)#F//#A4E!#),E;7H5+1:/D$%<(.AHH09+=<+)#%1 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:9G31G59^GG42G4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7282 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30609 42 59M = 30744 285 GANATCTTTCATTAGTCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAA *++&")$)%#%!'+#$*(#$!(%*+!)!)()'!')""!$+%)$#&%#)+%$*)"("#'! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C0C11A44 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7283 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23512 42 50M = 23283 -279 AATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACAT @,@;*G@?@08$:.(FA0B'H0>E2,=45&/:2>-4/&':5;&6C?8-36@$15@'6'@B>H"?-1/E@'>6&@%;3!3AG=&G<79)&*0C=?%";E=B?:2)-A+3,F1.!+(59*#;;53,CE=5,:CB!5;A?2**>)+-:A7024H(9.2B-*,B-6#E,+0!?$65./!2B#95 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37G41T35T9C90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7284 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30850 42 68M = 30663 -255 CTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTCACGGGCAATGCTGCGAAGGNCGTTTTCCTGC /C8$07G20/"*5;+"3?1-CB;,E2A8%),0*4A%--7):D&A>2$B1$%,B.!E0C00BG42H/73 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G19G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7284 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30663 42 62M = 30850 255 AATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTA 42)B>"#;6>E6+/CFF87AG=D<@3/5&2GCD5"H,@=A<>->H1<.2#,)*1,?B+EB1H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26066 42 94M = 26217 242 TTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGA 6(5#/75(<":1-:A>"?G:0A;,)88,GB*0-"D+AH2*-)&:<3=095;61@$*);&0..;&D.B.*$>%;%(45.F3CF/D,@*7=2&:"? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7285 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26217 42 91M = 26066 -242 NAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTANTTTCAGA ?H>=?#>9:DD!-7$>*&>*F7%7:6?55'&."H(93/?764+#*##*D=G@!#&D%G.8'70- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T82T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7286 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28545 42 143M = 28426 -262 TCAGGNAGACCCCTCCTTNTTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCNATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCNC &*%+!!&'*)%#&(#!*#+!)%'$)%('&"'++&&"(()$'(!+&)&$%%'%+)&$#$%+$&"&"#&#+!%*)$$$$)"(&'+"&****"&!)+*!&**&"($!&%(!!&!()!*'#&)(')$+**%$*)()#"("(%++))* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5C12A83C38G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7286 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28426 42 66M = 28545 262 CTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGT -20/:F2@(!<=D=F"G$592&C5#>88C96&5%"#G;>8C4BC+2&$%.##<'@4&6'$+'.*CH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7287 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21825 42 81M = 21596 -310 GTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTA C37AC'0<-*8B$(4("+0,/13H$B6(3)DC'7/.;E3G:1CCE)&C.6A='8?.$2G"ECA=6(%@&+B!#1':72;-: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7287 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21596 42 229M = 21825 310 TCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGANCAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGNTATAGGAACCAGCACACAGGGTANTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACTTGCGCATACAGTTGGTATTG 1*(;??$C+7/.>76<;B*+@"=2"$3.1H5&H(%))4B5B4C@3**),&"89B?#'),*.)),%!?A&,2G"@;&=B-;G9'!105,-FB@9HD7EE/1"AHG3)*+"#9(<<9+/<7.>;#G3>GH)8B.$&D+!$>D*<#,/G%2@C1%$5,.#94,E"F&,6F=>/5+1B+*8&78H#8G&'),&+HA%8,5#5H?1AB:>,E0%"A/&*D..G0!-'39&'H1- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:75A30T2A20T77A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7288 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28267 40 56M = 28374 165 ATNGTTNNANNAAAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATT #&!&'(!"'&$(+&$$%'&++$'!*+)*((*$((*%#!)!$$""*%&+(!$***$# AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C0C0A3C0C1T0T0G0C43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7288 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28374 40 58M = 28267 -165 GCGCGAGTGGCAGCGACATNGTTTGTTGTTAGATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGA G*/)?6.4#-0"B)0#F>%$:%!):-50";/8(5$.>'6#G4<'D4/F?83G>-@)*@'.%%3DC*H!6%@;=F0A78,C==>.3*F1A+?/&%G$3H"20!>D?0EAF AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G48C45T15A13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7289 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14230 42 137M = 14063 -304 ATTTCCCCTNCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTG 46-8+,F7,$#F0%D<->A.*/5%/.,E=/AD;=:=;!6$"*-#+;4C7+9!+8A-+:++(3%,>,26?AF'-B3B9)B5*5A=",#.?:,):/!!5C0=;G0-3@!==E$?1;(H&;B#-*:&)!(.<'( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G127 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7290 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33736 42 165M = 33736 0 TTAATACAGCATTTANTACAGAGCCNTGTNTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTG 7.F3(69C8A>%3B84B9>HEH&9>$+,;4599:'(9=.:<90;6CG68#3A'F,:D%F-+F>/%&B4%.FDCD+".F.>//7#2'5;BD33*/6->CC9?,-)9BG9F#55++&!%)9-4581"9,2:+0#@8D03B<8947/26G,08#==*A5*G.H;EG/8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15A9G3T135 YT:Z:UP jpayne@0: r7290 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33736 0 * = 33736 0 NNNTCTCTTNTANGNGANCCNGNNNCNNNTNATCNNGACNNTCGCANNCNNNCTGNANNNGGTTNNGNCNANGNGNTTNNNNTGCNANGAAGANNTNCCNANNTGG !"!$$#$$""#$"!!$""##!#$!!#!!$"""#"###""#""!$#$"!"#!###""$!!!!#"!!"$$#$#!$#$!#$!"!!$###"!!$"$$!!$!!##""!$"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7291 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39119 42 56M3I95M = 38973 -297 ACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGNGGGNNACACGAANNGNCCT "&#*&!#%"()%)*+*!%%!)(($$&)'&'"+(''#)*)())((##%!$+(&'(%!+&*+%+*"%*%&!*!#(#++'&*'"%+#(!#!"&###'#"'(!$&&('&*$(++)!%&!+%)&#%)$'**#)$*)+'"$%)(*!"'$#)*)"(*$((' AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:12 MD:Z:131T3G0G3G0C1G0A0A1A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7291 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38973 42 146M = 39119 297 GAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTATGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAANGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGG -)@;:@B";!0+:"+10*)'<1+<4.=1E03""$H-2#74)%?@4)=&%7./?4/8A?1E<2;?E$A#$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G2G32 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7293 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32799 42 70M = 32606 -263 TGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAANATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGT &%!)+"+%#*&%%)+!"&$#((**!!+%+%$$')!$+*!)()$)!'*(''")$+&#%+'$'$+)*#$%(+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7293 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32606 42 193M = 32799 263 TATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAG 3'74".*:<'"4@8$"@'.3,70D%/A;:?>0;&3A'7(,?31D*A)F4A,'"3&E8##?=B?='A-+*7-0-15@%)="9?)6F)',*04!E3A.//',=@1@4(!.,@#&H%61*@@H0H/=CG+/EHB':1E"<"&(D183A$2.D?3';">67977'!5!);:+=5((561(-0,(%:3,0CA.4D@4@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:193 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7294 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28708 42 215M = 28572 -351 GTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGNGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGNGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCNCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATT 6D,0?HB&;+26F)H'4FG$2F5,:B.C6G5H;EB(2/:489HE4G0A>3#65!:)=#=B<0>8HB441(.-'F91814?EC?:%#E,@3*F2FFE$!&(:C@,>69:49!&46CE",C28=$'81%6-;@2&&F7'"0+/*,BD?4*($/.1386'-%9G#F#"!9&'D9B,"',F8H5/>!* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6C129 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7295 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12508 42 104M = 12612 280 NAAAGACCTGTGATGGTATTGCACAGAANATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAN &'')&+("%$(*$%(*$$$++!"&#$'*(+$*!%'%+)#'*+$#)&&(&))$#&"!&'')!*!+))(&)(($*%%!%*(+%'+**+$)!"!(&$#+&)+%+(%& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C0G0C6T18T74A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7295 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12612 42 176M = 12508 -280 ATTCTGCTTAAGCAGNCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCCTTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGG ;=#;&3>8*('B?:$-;*!9BG4E;@2*"'34/=?*8?(&9G@A3"6'C)/1.:93;"-!2*!,8-A2=@9,5/>;19>8((24A38:HF(&E8A4,E.46CCF50G2+E"+7C==@/&;4?:'AB(>,7+< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7296 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25058 42 70M = 25287 287 TATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGT 9E-&+4;2A=8@B/09'=@'.B@1A"DA0#5#'9;863''$(8$7?.;.7*8,1D6B@&F.D,<=*'E"2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7297 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43175 42 339M = 43098 -416 GCCATCNTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGANGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGG B!E2D%#E0/:)&+4+!A1810?*7-.(%15+-7E!9('-#?)%?")34()C7,,*$-&A-0A@=30+@B45A)B?%2(-:<)58..BF2BH"B.7B0?1)'?5G01:256!=>C@!>9##E9!D2C@D;?D,.*@7EE4&(@24@!E)6/AF@@8)*EE?B1@#87-;+'<560;G,90B2F),2G+1);#->*E+<)+!>%FFE$03C?6&%),#"$1A%&0:?/-"0#5:'3",!(D2H5-@$'8?$3HG%1"G=H>@'5'B:%A<@'/!4;<<88E9A:%E+.--5>%+)6&(?2+2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G29T94T207 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7297 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43098 42 77M = 43175 416 CAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCAC C,!F87@)A?-=)H)363:@6:>>D8/B: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7298 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18467 42 77M = 18467 0 TGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCGGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTN D4/23<$/1/":0G(G57A0<+>H,E%%(=/:#.D/2;#C0" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54C21G0 YT:Z:UP jpayne@0: r7298 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18467 0 * = 18467 0 NTGNTTNNNNGNNNTTNNGTCNGACNNGNCAGNCANNTTGCCNCGANGNNNTTNNCCNGCANNGGCNANNGNNCNNCGN #"!$"$!#!#$$!"""!!#$#$#$$$!#"$##""$#!"#!$$##$!!"!!""!"$"$!!$$!"$$$!##!!!!!""""# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7299 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47142 40 71M6D62M = 47027 -254 ACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTTACATTTACAACCTTTTTAAGNC E;E"(A,@.!:H).7&;#'8=,1;'#:E,"5&B'D70;/:#D+")4E:FHD*3@!8=C1-3D'9&&0,+2A;$H#G,E1G(9F5@*G!97EB@@&?.*F@.D>>#4!=?>;)/5.DGDD9G*6,76'.F5)/( AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:71^CCTATC39A20T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47027 40 100M = 47142 254 GCCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGNATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGT !>A-(-822;B>AE#<999-(&96G%-85+;8+&80@B5C-@1>A!)0.,$$HF=9AE>=@?H7E)#"82!0<$'H83'-$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A44A54 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r7300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4012 42 63M = 4108 240 TGGGCNTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTNTCTG $""(*"*++**#%(&!*+!"!))#+"%%##(*!+##""+("*(+)#%"("!%'+!(%$*$+"* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G52T4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4108 42 144M = 4012 -240 NTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACNGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGCTGATGCTGATAGAAGCCGGACTG ;F!FE$&G?"&#G:F>9?!H@=949G>&$53;>4><*F=?0CGF,(1&30=1EG'.BD&AG&>@%#5;>!/H0,-!!$8).C0,5@+>@$HA9:@:$,'(D9G.4D9?@B!'(17#=0/G?>1"%8E1$G55>)5!6:D>9#-B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G59T59G23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7301 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29486 42 200M = 29704 290 TCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTACGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTNCATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAACACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTNCTTGCAATGTATGTCGTTTC <1%H"-6+B<#156H%*&@&F<051<3++++>C+'H=,>3F%6H%&"?33;2<%.("((2!445&B-&$>9.",8F?(4-0B89*4#3*5$:*E411;=/!$7A20;H$.'>?'80': AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:38T27A34G77C20 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7301 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29704 42 24M3D45M = 29486 -290 ATGTTTATGTAAAGAAACNGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAG <2B7*?A?*6D03@(C3G8)@#C,&1B38!.C;7CA..A!)7E"C;3993#8HC';C&H64-&!>A#-G AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:18A5^ATA45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7302 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31578 42 221M = 31799 309 TTATGNCNNNGNANNGANCGANCNGNNACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCAGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGNCGTGAATTCTAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGT ""('%%(#!$*!&$!)#!!'%!**'(#"+%!&()($%&%#!(&#"'$%*$!"#!()$+&$$($)("*"'(&(*'')$!%#*)*%''"%+%$(!+#)'$((&#+)")$'($%!))'(')&&"+")"+'((')+*$$#*%%("%+%*%("+*(($)%%"!*!*+((*'#'+*%+)+!)+*&*%#(&!!!!#*$(+!$&#&)+"+'%!'%')'*&)&&"#)+(! AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:5G1C0T0C1A1A0C0C1C3G1C1G0A82G55A0A8A45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7302 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31799 42 88M = 31578 -309 GCTTTAGCGTTAACTTCCGGATCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCT 1&B@2/4$8E4!?D-F.'"8,28>@7(.FE*?+(59$6'!C'%D#DD!*==H7&!D*1<:.HGA8%%7%+:)6G#4>%/4<"1D8:.( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G66 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26557 42 82M = 26337 -302 AAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTTATTTTCANTGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAA 0(!#/3&*(E&@"513=;*'6G:@?<1;5:E*>95G&+$AEC,-3>'7:.#G'';*)A-$H6)C*/73E:4F>19F.#>B!F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C7A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26337 42 49M = 26557 302 TGATTGCACCAATCATTCCATNCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATT 95D,-"@4?B#8HBG4,-%8@)GE1$9% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7304 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32910 42 96M = 33006 193 TCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTNTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTT ,);/32;@-A9##%>G<,3H%8#E:.1CA9057?/G%E"/,E;,35$7BBC1#'##3;(7'&(:-C,"H-:5D97=;G(@+B;#)G#A8#BAG'*D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T62C5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7304 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33006 42 97M = 32910 -193 TCCATGTCGTCTGCCAGTTGTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGGATGTAAT "5&B6G*(.F*:7B#E&FB3>BB)!C?4?76FB%6D(2A!C'='E)1&(2>EF!@4*8%F--C5CG9248D#-D048-695 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19C69A7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7305 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42891 42 173M = 42786 -278 GAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCCTAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATT A+!=@/!,:A4!"':<(1G!HE!=B$A(!01.07.?HC@>H2$B&24,8G6>@0.C$:0E-)?644-,CH:BF&&D'7<>911)7!7)@%F;-1F?!2(G1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7306 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9269 42 102M = 9194 -177 CCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGNGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCG G*-&E:=DEE%F3&81#9>!+#>(=>3!F2$;=*9=F&A+4)#/(52.8*-$AC&7,, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7307 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45650 42 76M = 45484 -242 TCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCG C=#A:;G785&?61#%29CB&?>)8.11=041F?4'D/,/A4*..'7C746*B=B2:#%;E=/;&CD'@;99 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35443 42 140M = 35313 -270 AGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGATGGTCAGTGCGTCCTGCTGAT 3,&*#*A;2)94@"-27CH=0909-#%&#@0;=$G-0A>.$&H0H$G$!B2B/F2E$:5C'"?;=%.-&%96.8(&);)A<>E<@*4-+#>%H,(;468?*@%8/851B>%
?#38(AE3E&:5/>,+-*3",%>G7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118G21 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7308 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35313 42 130M = 35443 270 TGCCTGTTTCTCTGCGCGACGATCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGC "G9/%-='8(%3-$(C/*"=,F0;8D0"5H3(2/2,)F"+$=?>HBG%%)3-0:03-?<2-B)%8-D9@3#6!1.7>'F%2FG<&H8B09(2+H;FB271.5*3..119;*B%+29=H,!?).//8'C5G AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A20T108 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7309 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16092 42 180M = 16012 -260 AACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCNGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCNGACGCGGCANTT ()#($#)(!$"&#*&"%$+&&)%%!(!"(!($+++&&#!%#)&+*))*)!++#")"$(%$)!"%"+$'$+!&)*'%+'%)''!&&!&"+")"#*&%$*$''*%)'"&$"'%%'&#*$)!)&!"+%#"(#*+(*'$)+($'$$(##)"(()#)*)*('$!*%*$&(#$%%+!)$&$++#%' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:140T26A9A1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7309 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16012 42 80M = 16092 260 GGTAACCTGNCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAA 566*3=8$(''3,0$60?@*,:4"6:E)D;=C.("?#%>7;6>"&AG:-/7?;C(9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C70 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7310 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5125 42 127M = 4942 -310 GTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGA ..F>9.B400+=0DEHC9+&&+0?%9D9",$>&0&(&;+22#43F)$&H/D&:E@>1B,*1E)+8H,3E87,+':2%)%4(82.%%;E/E68H@/6@$,;%C#/8@<&<2'F&2C8&&F4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C34G22C25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7311 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43108 42 227M = 43335 312 CAGCAGACTGAAATGTANTCGCGGTACGGTCAGAANATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATNCCGAAATATTTGGGNAGTTGGCGATCTGCACAGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTC !#&**+%"'!!*+!+!#(+)!*%*$+"$'#+)("*"&&!+%()("#"#+*!*+(+(++)+""(#$)#%%'""(%+''"$!!%!((+#)&')(&"$*!+!+"!!'+)+$%"*)"&)'&'*"""*"&##"&$!!)"%'()"%!*+*&%'"'('$&(+"%'**!$(%#&'($$'&!+)&%("'&&+'$$'$%#$()%&%&*&$*!)%#)###%*$!""#*''&$!)$%*) AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0C15G17A114A14T16G15T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7311 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43335 42 85M = 43108 -312 GACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACAT B!@$4>*2H'D2'7=.1(3:59C&/?2?FD5%-=.E"9?"6*D">+?.=94G-7)=-H(CF. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21160 42 83M = 21243 283 GGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGNTGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGN =G:!<5C!8&?$C+$&?>00(,':?E=(&GB*8!)E963*4<"$)B@(1.,5560',:,>=-?5A1'-CAE0877+"&1=50!F"?2;8(:&G)#05B@.E;.#&=3H3H>",BDH+%%8,A%"."0&GE5F;5C9#5G,",,C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C25T143G15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4224 42 42M = 3960 -306 AGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAA /$2?H+5E/'08F1@4;F7A=23=4@$H+1A)/E&7;1;H7" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7313 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3960 42 155M = 4224 306 GAATTACGCTCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGANGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGNTCGGCGCGTGGTGACGT +!#&+$'$*#)*!(+&*$"!!*)'+&!%'+#'&!$!"!'$")*"'$"''"'(%"%&##!%%*!+"+"+(!!+$)+$%!$$'*!!!+)")*$#")%"(!'&&"'&!$&((#*&**'!")'*(#!%""&#)$%!"+!$#$+%*&%"#))#*(!%+&" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C97T29T3C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7314 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23844 42 43M = 23744 -143 AAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCT H9C0B@&?!9-:)3-G:<4'&4$5?AE=G(10;72('-+2@@, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7314 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23744 42 57M = 23844 143 CATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTANTGTTCTTGCGG +B=&-F3H(*,"*H61.&6**?G&%H$5-$'&>&0.+6C%D)G*'81*&>4!A.9#F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7315 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21318 42 283M = 21203 -398 AATCAGCCTACCCAAATCTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGTACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAAN 42"39!G,?2H%+76(!G/@"A'')/;:565>2D+""++D%0'F70-4!1>56H4;266&,3%C)<7F=.0;F7H>7'+DF;$49:73@98<=09/)E+#4<5!02>)GG?&766)--;;B'D0>;881A?,AHB;EH<(7FD1)/!G#?*26=:4701>#)>!9C,7E5A?7309)H?0B996C?=/HF31:)##<68!242G')>E.9#)'<3;<;#F@! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A47G217C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7315 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21203 42 115M = 21318 398 CTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACA C!<$+%=#(F1D@-H-9E7!(>A81E2A?1B5B5.8%06%21)?$C=84EB9?C,&!-4=G/)B4"!6$::+4)!,:9'9#%*3!>+BFD/9,:(H"0'%F3=#-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42811 42 279M = 42736 -354 GATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGNGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGNGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGN +3E79+8!9C"-,$3+*$>'A)*%$-$'C/&;F&&?1HFD9:&H8HC!39$#'5066G)<$=%:)>?"0F"*@#>&448+!;<4.,:"=2@H?4>#F:H9C;2<+H#0D<%30.;'2A1BHB=@>2?-(2@(<"38%>"9&6!GA/,'>!5&1(9@10A568-G4-)E.E=B;$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38T122T116G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42736 42 52M = 42811 354 CTNTGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGAC )'&"'B$;H(,E*0::<9(<>60D+<'EG4#3D&C?A@$D"GC">#8G;'F2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0C0T0C48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7317 77 * 0 0 * * 0 0 CCGGTAANAACNGCCAGTTCCATTGCAAGTCTNAGCCAACA (%&#)%%("(##$$(+'"*"%(#$&'+#)'+%!(+*%#+(! YT:Z:UP jpayne@0: r7317 141 * 0 0 * * 0 0 AGAAATTGCGGCAATGCTCAATGGATACATAGACGAGGGCAAGGCGGCGTCAGCGAAGTTAATCAGATCAACACTGAGCGATGCATTCCGAGAGGCAATAGCTGAAGGCCATATAACAACAAACCATGTCGCTGCCANTCGCGCAGCAAAATCAGAGGTAAGGAGATCAAGACTTACGGCTGACGAATACC EB?&;G#=+-3%.B/:3@>AD5(2G5(&F=#>9'.%'F0+3#+)=$?D'#F@*&71,>21).*00AE"/3AFH!,*@"*(;<6B*:'>-'6?%4;BC;!F(!'-E@E?=?GB.<'F.4;DD(!ED7';G5.!'6$;(0#A#)$B@!?G$;F6CB.@F1%,0A$=.5A92:7H>$,$"?A>>B94?+H;03;G,33>/6+F!F4E/1&"8#F&B4;:AB3>?.3A==%':H:,F:A)HD5?10*!:)/=66#/8A2E$9E+/-H!.C+C+9?HH*$@/C+65$>*&*!,&6+C15"G(F,@<#7) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:81C55T0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7319 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41911 42 51M4I100M = 42062 289 TGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTNTCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACNAACAGGGGTGT *=.HFC$1C=CF:)F)(C=H!+>@)F/1>>C@%1<%DDG=?0E.">B)-5#1>7#.'-0/;,H(FA=*5,:.;%&G23(E;%D(2E0"D,'HC-30GA3!":&*9D4B$#%>.8!1D2G1%C;7<9AD*56 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7322 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46969 42 226M = 46922 -273 GGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATNTTCGCTGTATTGCTGAAATGT HD&,1?,<3*4A#'G4+<&E>+5.%)#.-C.=;.D9EF90B,&H?3C,+G4"(#24AC;'H3E(79EFE@8&&4@!)))=;1C(*68'-+??50/6D=D02D)HAE-A2$B49:4%#@11*<5%,(:+>2+BG))(0:C7="H)G3F?7)@7:(F7@H-@#7=-F(2;C!>834)6>'-H/C&:@.=?$"A2;2>B=($5(=&,@")H$/8;C&$-@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:204T3C17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7323 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31463 42 84M = 31552 195 ATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCAC +*64B8;'3&56"6)?/,%%>00AA&.@#%#0))BDBGF2H:;,(<3:C?1:)8=<)=4)87A3%7"9=9026B179=B%7EA6+:9D++$?EEH5;A/",D4!F@F)&; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45G13T15A30 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7324 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16571 24 141M = 16809 299 CGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGAGGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGNTGATGGCNCGGCGTTCCTCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCNTTGCGGTGAACT :5@FH-H.3E7H".B3&$B<"+C6/,@DG>&6*-)@8D"694)1#03>>F>GA67?,;75A"&%(?4+("%F:BA:9@5@5=65(E>#40,$.D-,?.("7A&7?1>78F%2+,4.82$?2-::D,:6A5EF!93%13AB. AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:36C35A7G2C6G37G3A8 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r7324 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16809 24 61M = 16571 -299 CTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGA G@"C'6G%$&@?*&?=9&0$?/1,;1-2$);A27&6(:C*E5=6EF4(/)-%$+@D)?6*= AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:50T0T1A0A0A1A1A1 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7325 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10842 42 218M = 10627 -433 AAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGC 5"C#0'F9;?H'!+#D:0=%&)6H+0*(35#0'316/$<8DF'8,D!4,$631($+1<&@47F%@&E$B%D(!/)69G+'&%&BB243'5E.60?E(?B,111>3>A><*FD;3'6<55581*5>@)D28H!)0+@80+E8.#,2<%196+B+A,&F!*8;7+41?#3:;A->6!(8486-+B).*,E1B?0"H-;"C>@D(:"B)&-,G'?5HB1>& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:218 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7325 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10627 42 215M = 10842 433 ATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCNCAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCNGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGANCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTG #+%'!'&#!$+!'!)$#)(!'#&!#&)##''(!!)"'%!'"*$!!""")()%"#&"%&&"&+$'#%"*!")!'!$)+*+(!'&!++%!!)$'%#&$$$$)#"#*%%)+&)$!("%+#"%"+!#*&'*!(%+"("*"&*(%"$***#")("!*+$*%)$(!)")$$"$$(*!#&$$&+"!"'*#'&$#%%+!*("%($(""!*)&#')!+(+"()& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:136A29A22T25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20505 42 170M = 20675 459 ACAGCAGCGGAACGGANCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGNGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCCAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAA ?22AAGG*E#D(2+$3<-47?4#?6:+/<--B;"&-?F"+/B(GB/F#CCB98E*=,B$$G>(81H&<*H(1(C!FF):>&-0;$5B9BA&%,;&*..*B7<<=3@,-#9H+3.#5>(*E1((A+5-$@3%-@*@$%99&-G73E!4>4E/52$1*8)(1$E(6"("*H'+7+3$&:"38C*B8"90"9>*7;:912D)ED('#&*9C/4=5!#@4G19)-*+<%%9+5EEGB2"A?.'%$*C@6C4H$9=E5**:::>-D8/D;DA%(35/(CCG&F&5H6*6/#>8,F+="+?20"/<:710B)-"$+H1"0'D%,$:C*3E*!%9E%%<&75-2*%=@)H"1.!7*2<,&@8*82@;7=17"A&$B1(H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7328 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6167 42 56M1I4M = 5933 -294 GGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAG /=($B$"/GB,1,?>6D2;%2;+3(!?4@*48'-$33,26>$<*B AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22T1C11G2C14 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r7329 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16809 23 58M = 16615 -252 CTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCT -!H6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5G1A5C11G15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7330 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12552 42 148M = 12476 -224 ACCGGCAGTGAGTAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAG A$)A<@3/&#C"!,=7,(.*:(08D>42D;+-0>!GH(<57!?EF?8'FAC#(:"&%B9B2H8D7'#F20B1!!#5+H,:1-=$=;#)7=GB:)(;%C';&C*9,DAA+@=9'5!/@/,",0=$=';(1(H,+;,#:(H/)84(DB)> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C135 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7331 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36585 42 134M = 36585 0 CCTNTTNCCNCANNGNCNNTTAATATATCGCNAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTG %'("$*(!&#&!!"'&%##+"$'%%&&'!+"("(#$$"%+)++'%&*&"(##%!(%*'"##$$!**)$!!**'%)+$))#$$)!(*(+"!&()!&!$&)('$(++(+&'(!%''$$!$*+&($'***")&()(( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T2G2G2C1T0A0A1A1C0T12C102 YT:Z:UP jpayne@0: r7331 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36585 0 * = 36585 0 CATTCTGACGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCTCNCTANGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATC :"'#,6)>!>+D#'H'@F2C'C0/11E'C$+644E#"78479=>3*G!#';=H5,-&G.FE;,A/"5GC>;'@"'',!&0E!2'F9"3F64=F","$++;#9%!-8:8=*6E>'<%@96!50":%F5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7334 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6315 42 83M = 6460 250 GAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGACGCATGAAGTGAATCCGCAGAT @&=6!0253&2&)E!'A+"4A:*+%/5:/=!F$5&5/'8"<'>9!HE43-15BE::=5+0?+6,B"G07G1/#;:)HGH7%!2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A21 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7334 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6460 42 105M = 6315 -250 GTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACCAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCG 968%'(43"B*38'0217;4D06%A?:85%++4#9,2BD.HF:CFC*@G//4E%+;&<(2C!<2=3"B4<>.%!;)D,=';?141&'H.D19/)#'%93:93$D6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7335 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37200 40 89M = 37459 339 NATGCTCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTGTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCT !=$1CA"97;#..!*'-7"7?'@4!93-/G10"89%E3&!+E7)2=<+ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T4G2G30C49 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7335 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37459 40 25M1D54M = 37200 -339 AAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGNATCACTGGCTTTNNT +(##$*%+(*"$&++'#)"*)!*%"&+*'')&*)('+&*$!*$+($(*&!(+*$!"(''%)(!%!#!!)+#+(*$&!%% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:25^C38A12T0T1 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38191 40 53M5I82M = 38380 294 NATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGANAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTAGCATACA +40#CEE0>'"+7A/01-(:)H/+>-@?3BF(()F;;8;(4F+-8B36,+2,*';;FDA5%'!!/;;F;(3"#4D>5"9-,E),6!!4,&4!6"705$%'%6*7G@4CC./A))0&.%'>?*6F6(B-!?8@%>?,?%GGG9D20;9"B6*:914',/D:H@##178<>7-$8?G9.=%%!(5<-@A<2EE.2*11*; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44A1A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7337 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46801 42 114M = 46579 -336 AAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCC !$%*(&+%*+$+!$%"%)'*(&&!##++&+&!$$#$&!"$%!*))'%('(&#)!++%+#+!%++"$)"($*!+"&)%)'(%'!"'%)%!+)*+*($#$'%!#+$)$**$+$*+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7338 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20242 42 455M7I13M = 20064 -646 CCACCAGTGCCGGTACGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCNCGGCGGCCACGGAAGCGTCAGAGGCCGCCTCTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAANATCATCACAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACTTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCCCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCANAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTG E)/<1:;5F1>#-B,$D2$+%.,$CH(.(!8.*7B">FC'F?9!%C<>107!3DAAA/*G/&&:&;D&/GE.*:@+%@2G.E72'7!:!0,+%.GH4*>'"'D:'/,+<>B3H+:5+C94%9*:73"D?,)+B;068+*)D,B;)&2B")+"4:B"*6@'+(4&$-;$<7'-?02"DH*%2.4=@#%(@5!3?>&A$A<8>6=D?:C+.2;5C?>3$;EC()$!:?3C5"#H?-!1@8C9C8E.G.79B7)F1:A"5D(7=H"2"-D5/F:35"F'9>()7%8<(%41=3C>&G+#.C'$0!BD$-H8.>1,6<4/=!A<5!@#%DD*(0$58#C1G+D2=DCD#G;<"E>G7490G@4D<+ AS:i:-54 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:17 MD:Z:14G62A1C9A17A39A7G79G54G107G69 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7338 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20064 42 178M = 20242 646 GCTCAGGTCGCGGCCCTTGNGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCNCTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGG :A2'+D.@&#G+67D45C01/@!D-(=><4,)<%-;/4/AA6)B=C--=75';:8<28&=#+9"1!5(C"-"*3$B%4+A15-)<#0!0.!0=.''(74-&8:9!<:7??GF29',-<2#6@.(*#"BA!G8>49B+C@3!>> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T15C90A51 YS:i:-54 YT:Z:CP jpayne@0: r7339 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23109 42 45M = 22909 -245 CTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAA DE!H0!+?$&+F(<-!:'@<+C++8-1(07"<#F"C*'/(*9#"$987;85E-@(??H7;!8!-(-8'/#!*%:8!HB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7341 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18842 42 102M = 19011 233 TTGCCAGCNATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTA F'?#>5,C8-""9$C%:!4AE;@;:EF;3H:-=A6@E),&F@($5%=CA)>62G71'07E67-/9)$&"@C9A*0H6;>C)9;C?.@77!F4+,D#(B,FG3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7341 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19011 42 64M = 18842 -233 TGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGT DB/B=$'.#5D(.G@=2-F,C?C6;B83E,>='2$*D53,(741F>5&A09;2<6B6'<3-,"- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7342 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30761 42 50M = 30919 215 TGAGTCGGTGNGAATCCCATCAGCGTTACCCNTTCGCGGTGCTTCTTCAG D9-C>,5G)G)"F48=F-@@A&G$$!%6$-!,D-7202&966BD&,<)#7/GH,/*%:<(&E5.)96%+; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6892 40 44M2I64M = 7088 241 ANCCCNGNCANTACTNNGAAANCGNCGTCAAAAAGAACTTCCTGGTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTC '$'$$*%!%*)()*$!!(*&#%$&&)+*%"&)+"*(+*!")%"*%+$&*#&($!'(#+)&%+'!("#*%+%+*+&((+&'!""%*&*+!+"+*+')&$'#!'#"%*)+*( AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:13 MD:Z:1T0T2G1A2G3G0T0G4A2G19C63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7343 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7088 40 45M = 6892 -241 CACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGA 53,0.9F!48/*A:"*;;-@*&!;2EH<"/99)D8$5"1'7:D56 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r7344 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38173 42 66M = 37993 -246 AACGCTGATGGAAGCGGTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCA 921BF?A=*115.92$<@7D8'48'H!1);01>16E.:=:%.6.=@%:??B(*#,=(;?<%)41?* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T49 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7344 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37993 42 15M2I165M = 38173 246 TATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTANGGAACAACGCATNACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGAGAGCTAACGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATA &6@#&7420C09$.F/0*74D@/.=D=C-5#+':G%90G=41-F9)C+C)5>$-'73/C-*9!C4<#8*8!&$?26%+,+@)5-!F<>9>E6@"64=E3&!6@"#H:(349B>7ED31DC)+/+/368,$8/3A4347E+F4/+B31)&375",2="EBA@H!64834162=F8!&&--9/" AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:49T12A40C6A61T7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7345 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35899 42 85M = 35719 -265 TGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGCCNCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACANAGCTCCAAGCTCAAC 6$=";.;F#$?C/+/8!)03-7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G37A15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7345 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35719 42 134M = 35899 265 ATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTANGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATAT +=(+'509G/B*!H56=7;4/F"!3'"2;B4.3"C"$1HEGE$F%E1;$$B#.>EC*H$):+%*()H99<=?=C<7"(0A%=9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7346 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1264 42 73M = 1337 332 ATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTC '&.A39.-8'?C-DD9.$)?';12>D9D2*$=@"A><32+:#'20+A8F$1%FF4B&*)=G%*5=7180=#04 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7346 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1337 42 259M = 1264 -332 CATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCCTGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACTCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAACTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGC C"D6!*9?FG2',2%&!77#0164#&>-%88>!6H+/<;)*>6D0;$:.+?26A@F.7.)D,8?>#9-B92%195=5!%/7C.-99.EG%,"1:2#3F45+<-3481."+84A4B/?2H@2;GGD6*C4!,/)?3%<<)E8F&097D4&G*8)H-@3#C#+04G2C0-0>2+?:@CCD?!4)=(=BD#3D$12%&GF;8%;!1E)'$E#++;!/"E.%2>>4AE-=GAB?3#'6=3G@(";#,6#<#473A230!-.5#C5!+6D-B@2H=?2+*19;%1GB00&#'.+EGGH;D?:#;8-;FC. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62C124 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7348 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39999 42 88M = 39796 -291 TATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATNAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCANCCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGC <,$#+@2BD%0',8%)G8539F$#D.$4+>$4E%=F>93--CH)>@,/<9'/@?0G7$6-;+93.>B2(1B7,9!:5E)B.6F;#9B0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C26A29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7349 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5542 42 100M = 5231 -411 ACAGGCACNCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACT 01=7F40E9B/E?$6F$D1-*'(8.4D=@0-&.5DDH:E:!.E39..(<*(,;7%'%6&>.GGF*@>):5)=-"6E!GG6H%3;.?)B"+17+A>H!H%? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7349 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5231 42 45M = 5542 411 CAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGNTGATGAACTTGTTAACAGC ?8/:(>?B'1)*G!=C:G(/"?(E+B4!?#(4*F.((&D7!"E*A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7350 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18261 42 48M = 18007 -302 GGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGC %B#(C&!3E9-4DHAC0D20@C/"'%"F@.$.,6:3.E&C0@5&-063 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7350 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18007 42 43M = 18261 302 GTNGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTT ':C!=;),(8#C00(F=%0%:#9"9"#13&!*,;E:*HCB<$- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7351 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12756 40 59M4D56M = 12947 257 ANGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCNTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTG &&/-%>6(FC-:,>*>)96A+).@0A:7'A,D**,"C@A:CF'!"D%H62H=5>69.!(2)4'995=;+B,7650AF;F@GHAH))/<)4$;'$*6",,;%3CD&344G:(-.8& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:1C37C19^CACG24G30A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7351 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12947 40 66M = 12756 -257 GCAGAATAACCAGGTGGTGATTAAGAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAA (1-F(8&$&AA:#F!C#9-6("H)*5'C9>*C)A/",#/@"D1.%7AE.8#9#1+AFAF.D>90:& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T11C41 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r7352 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47786 42 74M = 47695 -165 GTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGNN ;G4;E=!/6$ABG0E31F8:%DH5473=%1E&/0G1?"-#%081:?>!,:?57$'F31G/%(B4)C'F/7:A*! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72G0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7352 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47695 42 52M = 47786 165 NATTTTAACCGCTANATGAAGAGCAAGCGNATGGAGCGACAAAATGAATAAA #),!+$)D09778AG7;,G&C99;63H>819"8FA;9'G($G=:-)H%AC.< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T13G14C22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7353 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46609 42 81M = 46887 348 CTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATAGGTGATGGTTTCCNTTGNTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAA +@>)+%9!GF!!@//%CD=#E7DE0=6-)%3.C/%,>;-)7/$/#"B(EB'<<(?B)E%C!1?DC#5(-D+B6!10#(57D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G13T3G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7353 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46887 42 70M = 46609 -348 ATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTNTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTNAA 9G-,=C!/99(:*=#C(**919(=(-'@*>;;7%4>;?.5;A-(23<<"/:7E$-%78C,)H?F:DD,'2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C25A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7354 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8572 42 58M = 8424 -206 TGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACTTTTTTTGATGAT %#"'#()&*#"*#'$#%**"(+')+#*)"'$"%$#(#!)'+&#'*#'$*+)&()+%&) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G10G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8424 42 113M = 8572 206 ATGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTCAACAAAATATTGAGCGGATACGNCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGNATCAACTGAG !,0G/B/,=6G)32.A&->>9H)16%,0923*?=#(@)-H@=DD#9#B+!F9+7:85*06<*2./,2,$2;=E'@5#B";67E<>F;+C$2!F.!A-#G<(:BG=.,$427C$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G38A22G39C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7355 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24762 42 42M1I6M = 24882 283 AAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGG H%27),3!#54=2@H,;#H/01#()<'=FE4%7,!D6,C#!"F",63G; AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:4G43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7355 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24882 42 163M = 24762 -283 AAAATGTCCTTGTCGATATAGGGAGGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTNCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACNGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATAN )G2&93%!?8<*8E/8E#(>C:H''/E%EF1+#A<*(.%@/85:9.?#3E42,A:!6/(+4<9%CA"9=A:"/(05EG,G-6BA#5<'C/"2-%,2'$*F!=-AC+&1;6+;AH@=B&D#7EB,"-0;-FE':#C3*06DB*%(>."0F?,329)=267,&*G,EA)21!8@8;7=7(!)0E;&,G14)ACB#E<8((*4B?%2<=+$6,*<*461*B$7#/4$,5,=5;D< AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:83A43G5G0 YS:i:-58 YT:Z:CP jpayne@0: r7357 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47403 42 115M = 47272 -246 TCTTTTCGCACTTNATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGNGGGCGCGTAGTTTGCATTATNGTTTTTATCGTTTCATTCT <8FD:A2/A=7C=E'53=H-8&#+DE5&#H23;E65#>6)1%51>:6(HE;D-H!C)DGE0@$!C+".#1A-C;-)#8.A59;"H,B@$2.>9+E;@;&G>G?9).CE*%#$-)8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13G60A20C15A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7357 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47272 42 128M = 47403 246 NTTTAAGTCCNTTTATTAACACGGTGTTATCGTTNTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCT *7H.A"?-=AGGE4@6-5397%E433G+2:'/=(+/$667&%81FFE*G805(19@$$5"63,G&'@&,E@G7(!-$9(A5$+60(525!G%!1BG(%#H#=D3D)D)C%1)82/69%C-.%)?A>0+G.;(?2FH:DHHF$6$70:,='::CH91:6<%08%*=11D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7358 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32667 42 117M = 32784 248 AAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCNGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCC !F!B"9!7/#2="5%<7@>=0A9G*<+/6$;;AGE@4:(H@G8:/24$E1;1!6.@;G$<0"")*(!>C*9($)3A)C)&DDF+6C60@D5?$18F0,34:3;/7<,@)8$@H)"FE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C25T90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7359 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44429 42 123M = 44580 269 CCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATA >:D;>!EF@DH"&>C!-&EH=$4-):B6A"0$&78;*-FB--'E'8BHH?);29.E=115@27G574D9B.6)">#,D<%=,-E%=<=87=7.%<+C-1A?' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7359 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44580 42 118M = 44429 -269 TTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGC F'$$3H4;F968,1#(<=:7:/.(:@-B0/"=%!8G"0,:58:#F%H9:*++=128G5,(DE9E5+8=,C:EH<""'8-=)F-;/F#A8B/7@!/)F,7(+-*H?)"=3*?*4'";5? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7360 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42968 42 230M = 43237 353 AGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCNTGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCACACTGAAATGTAGTCGCGGTCCGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCNATCGTCAACGNCGTTCTCAT +7@H")?F)F.5"5*<@9%C.G:)F?1$75<.B(8#*@!:,'>@6D#'?,=D-#61+&<74+-1F=%;;-700)4C08@5DCB4GH#3)&<0B#+A'5CF9/H<835/3/#'<8'('C%0?=/:A653/16::B+0G3@!,#-"A! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69T13G0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7361 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2296 42 195M = 2204 -287 TCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGNCGAAAAATGGGTGCATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAAAGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATA E1F>3F5H/:.0A;F4#/2B%:H;B)(&;174AG6##13#&FH11'=:#,A"(98:":F(23/+4,/H@7FC/D>*(%4@;:7'@2:!G,3$:H'/-G6$!*;0C!+<3/92D'*A7A)<);:<* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:111T13G43T24G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7361 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2204 42 56M = 2296 287 NGAGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCG #'#+)*"!(#%'$'#*%#!')$%%(&'!(*!'*$#&+&)(++"#*)*#*(")"#*' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G1T53 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7362 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8160 42 47M = 7964 -243 AAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCG 2/7H5::(/@00.61'=*#EDB<5(G-C.4/1,5GBA':8H!$"@A&$22!7=!G>,-, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7363 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11016 42 132M = 11150 177 CAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGGAAGCGGTGAGGCTCAGATT /+&%%:0,/.)!/E04455G"9!0?G2EGF+C++AG-)H)9*H;37(HD"$<7B%&)EB AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112T19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7363 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11150 42 43M = 11016 -177 GTCCAGCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGC :,::)<1/-G@=.?'@D.C&+"A2E#,&%2@-'=%1)0,37)5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7364 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26292 42 107M = 26494 307 GTCNATNANCNTCTGAGNAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAANA %*&"')%)!#&&%!)'(#+###)*&&+'%&*%()%(!+(&(+)"+"#$!+"**&+'#!""&###!%!)"&%)'!)'%%(#$)'*(*##%("&(+*"'#)'')'($"( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3T2T1T0T0T2A3A87A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7364 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26494 42 105M = 26292 -307 GTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCNCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTC 6-")+=&>0196;"3@!B:2F!+'.+606C3";;!/(B"A2C)$)08?'!"$142#0!.%96'9-('?.3C('8(6D0/489C,05/=*<:A'@)9A!7=./?AH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73C31 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33480 42 167M = 33364 -283 ATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGACTTGATAGTCATATCATCGGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGNGGCCATCCTTCCTGACCATT =EB(C649<&+.0*F$D%<27F1H119'$'<4E9G3)F9#43;><&EE>:AHG AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64C18T27T34A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33364 42 116M = 33480 283 TAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTT C2FC-7(E@*%%!A3+,4)266!#+$<@80++202:FF'6;"A<=AH!6E'7A:'.EE+@A55A>GCD:DE;$2EB=%6;*?G$(#=;E2=H:!$AHH!%B0=;1!E2%-4+F&0H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7366 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43140 42 68M = 43289 212 GAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGC 4+&4F!+5B+G?:*/0:>:EF>8H)>D3-',/0#(4A&41@8%"-'-@(.<<1.98'E!3,=E*9;2H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7366 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43289 42 63M = 43140 -212 CGGATGCTTCACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCT HD2$%23.$;*D/4<,"#//!#9EH!'< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A8T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7367 77 * 0 0 * * 0 0 ATCCTGCTGTTTTAATGNTGCGGTAAACACACACTTCCAG +#*+$#"'"&#%#&"()+'"$+)+)#'*'+)(!'%'&#"% YT:Z:UP jpayne@0: r7367 141 * 0 0 * * 0 0 NCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGGCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCGACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCT #*%!@E01DE<"<.0#/G>-#1477'?/(8AH2/8,*!1"9;>G$/3>@AC>/1E%7'$A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7369 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4469 42 59M = 4214 -314 GAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTNGCAGGCCA -#-;3.)<)%"2+#?5$.$;DG2;@?3G94BH>B)%3<2-"/97G$E2@.+G@4>/(2- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7370 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3677 42 108M2I56M = 3524 -317 CCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCG (A$3);-@%&<*360;"/4&9:C75(<%F=C$)GF;%D5':9H)*3C*93B9B+$0>6?*HE$EAD)?6@(*=,=+./H)6-?$=F/:/"3;!848#,2)2=1!+ACC/B7 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:164 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7370 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3524 42 98M = 3677 317 NCGCCTCATTCATNCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCCAC "'+"&*'*('+$"$!&)%+!%"!)"*((+"&*$!!&$(!!+))"%(""&%"(+((!!**$)+%*)(*+)#"($"!())*#(++''#()&)$&#"'&%' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G6G5T81G2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24463 42 41M = 24504 352 CGTTCACTTCCGAAAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATC >?8")2...%#6A2.(E=";%;94B6C3C<>G6F@40!=&&7,!1>%#@9G'H'8:A2>>;%>C;$)738+.+80.!9.H5(/&-34:A!/0CAB9C#G33G9/@5>8+@E;-A9*A2%66'7?5"'G6":+<%$B=*E@%=C*663&;7*!#8C/><;;*4A,2>6AA?H5> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A1C47A16 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7373 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38428 42 60M = 38138 -350 GCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTG ((/<2%13684&/?+B/:9+-*5/(@(&).9(H64@&(C-!8F281*$.C>F$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r7373 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38138 42 106M5I184M = 38428 350 CCATTCATGCAGGCCGAANGATNTTTACAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCNTCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACNAAATCGCAAT F;$#*0/"??+E6@??7)C/=$:-F.AE*>20B#.-%"5,$6/*HC8!%=/=F9DA,=76)#:@362D:*8H%*)DH,:FGEH@**89G?/!B64$><*.DE!@E1)53@?/!-9G&$-""#+G>.B;-5&A&D=-04F+*887);(>890)=%F(B@!)@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7374 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40508 40 55M3I6M = 40331 -238 AAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGANGAAACGTGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGAT 11-+#)-&<60H/G;8'@4-9+"56.'G+2C3#D!"B="F'AD6A.E01991BG7;4@+"C!B% AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:25T6G28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7375 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19697 42 73M = 19801 236 TGTACNGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCA &$$&$"&>;$D0&=*E6&+6E,.%D'613"5-F;5!4#2G%(*069"&&86/==),(#>9:::A+F,%*;E5A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G4A67 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19801 42 132M = 19697 -236 TGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGCTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTGACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGG AA-+<7D3H-B>E2:?#(GA,E3"%7/B+,FA>CGE9;G$HB+.BEEHFA3'/?#A3)0/?(:A%C@$/*&+;#5<#(57C0=6BD&,3-AC;;G7)!$:H*4+.%B"H@C7"52C%*#2AA$!;'@0';F) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G51C41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7376 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40876 42 101M = 40756 -221 CAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAATCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGTGAATTTGCGGAG (-!&;0:-F92'D(6HC:/-0DH0"C-,E@#7H'?8DFBAD,C!!?>16$?0("*1/@'+D;1.A!2="433(&E%9:")CC@>2F=&+%FE5HC@7H(H. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C56C12 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7376 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40756 42 62M4D54M = 40876 221 AACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGNTGGAAGTGTGTGTTTACCG EG#1+B,2>"45:"<7496H-CF(21C@",*4)B46*-?1&)F==7()H!.*:C!1E5F,1>91$@BD;:(<-EHF5-2-AF;+:?-8(?D'%0-)H/2#6(@E(>3 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:62^CAGG34C19 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7377 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3668 42 91M = 3506 -253 ATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGAC -%*>>.ABD+'41$@B+0#(F8DE*B'>E!.5/C-B80;$,@6<(:=BG6#G7>:D8FDB&#"#>*/.AG+;-%-H2-5G*?%-:<"=6BB0C?H12$#D::;1-C%D0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7378 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11305 42 75M = 11444 193 ATGTNGCACNGNTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGNCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGT '*(%!(%'*'*#(!%$)(+$(&&!+)&('%!'&)((('*"&$)('$'*+&#%$""##)"$))#'"'(()++)(+$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T2T1A1T35G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7378 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11444 42 54M = 11305 -193 TGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGNTGCTGGATATTGGTCGTCCTGA A3D#:E:G?/B;32+;9"2F$?7@GG;5!*=2;)$7G+'%E<@+'E1868BAEH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G22 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7379 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35328 42 47M = 35535 273 GCGACATTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGT @2B!7$A!3(3&-HA(3,D8G*A"<8'"AB8@-%?A:%&G@27?>(' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7379 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35535 42 66M = 35328 -273 TAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCC H4>G3/2%83?@>-.@&3!<$"#2;<>#C/EG+)1B*='HB9EC'B"*#0*=/'/38B#CF.>C5& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7380 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18395 42 53M = 18534 224 NCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAAC %+4'.B1AHF*)/)*!;)E8"4('FFA*;:A"D?6-';)H3:D#/H099C-?D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G52 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7380 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18534 42 85M = 18395 -224 AAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGAGCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCNTCCG H625./":)-G$$""C4G#';@B(*6+4<8@%8:!8:;5042DH70H:..&4C;B(52H>5H?7@-+D8+1F#:$,E2%#"?G61 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44C19C15T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7381 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1098 42 131M = 987 -242 CTGGCGCTGGCCCCCTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGA 'GFD'=&=%6D23D9<#45=F@@,*.=77"4G)F%D07,@2+9C@354".2!;-%",5(CCE#G)906HF5G#>FBE%C,F/)?HH?;'3)6';=A"9%??,&3&G$GC5/&0;5@='35?5600B$DEF/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G116 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7381 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 987 42 111M = 1098 242 TTTNNANAGCATGNGCNNAGCANTACNCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGNACTTTATGANAACCCACGTTGAGGCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTG &%)&$'!(&(')"!'#"$"$&)"!%)!+!)*"$&+)""*!")"')"$#"#"&(*'(("'#(%'"%!"%'"'%"#%"$$$$()#)"(&+**"""#'$)*'"+*&"*)&"'%% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:3A0T1G5A0A2A0G0C3A0C2C33A9A13C7T18 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7382 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41935 24 28M4I19M = 41706 -276 CGGGAGGGAAGCTGCATNATGCGATGTTATCNATCGGTGCGGTGAATGCAA 4$G"?3986(!4*E04)?/+4H*6,,-=4-/C4/;6.F0:3+/,/'!,>$6 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:17G29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7382 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41706 24 45M = 41935 276 AGCGTGTNTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACG 6;=1'<<726-D88>3>12(@(/3;1*!@'H1B!<@18,F.B6!1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T37 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7383 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8043 42 252M = 7749 -546 GGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGANTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTG 3%;*)")#&:9",-+2!))/,5""A>@G*3=A.H329A?BD2,4!HG"9)!-A!*+<5)>B/=>#,G:G/(+0C:/'6G2==6%B%A/=C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:170T81 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7383 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7749 42 294M = 8043 546 TGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGNAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTNCCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCT 4H,+4(1$8-/-B/!*);G"+F38>96C'*+34F5(3.;$??H)1;H4/6:'!F-7G7D,2@A-4=(C7'FC16):&<*;3#9E*77.H)H?#;$'$E#5"G9<5,&-,=;2-/(446.6'>H=4<3/?B96%##&)=D/57D08C=C0:>06%%:53>#3;.G628*1G3#(%'$*2,'18A?>;D7(3*&A-GC@'(E/3%6@.E+<$8728 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:148G9G30A104 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7384 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9939 42 40M = 9717 -262 ATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTN /"!=4+F)C4D8F.716+*7EH2#@G9A703+@G.5A!#- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7384 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9717 42 40M = 9939 262 CTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCA :E8.>5H*GH<%E$$#7H'3B=11!BHE.*4?@-113DH2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7385 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31187 42 62M = 30937 -312 CTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTG C129$=>7=(!>E9")>6+6;0',#@(614-,'?$0H!G0>?!5C.DC$(&9531H,00&H4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30937 42 93M = 31187 312 TCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAGGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCT .&.38H/;==7)#'5)"A&%?9B0#6C9$7GB,";AHC-G)8G3!..@/:(>5++&66;131C1+<$5%G).$"'8EG(6&?8?G6B%4E6C. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7386 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47475 42 150M = 47475 0 CGAGGGCGCGTAGTTTGCANTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGNTGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGA *%!'++%+!)('(#)$!+*)+"(+"+&&($"(#)("))(#+!$'%!'&'($$"""($*!*%)++('($('(!+(&&*"%$"'%'"#("'!'"%($#!%%&+*!+(!*&&$$(%&'&*(#&*%&&"$$+%+)'##+)($##)*&'#)*&*" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T48A81 YT:Z:UP jpayne@0: r7386 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47475 0 * = 47475 0 NNTANCANNNGGNNGATCTTTNNTNNTTTCACNNCTNCATGCGCTTGCTCTTCATCTAGCGGTTAAAATATTACTTCAAATCTTTCTGTATGAAGATT #%$%!''"#$(!!"(""'*%(""(#(#*'!%"#)!"''+(%)'$(%"*$+"%*#''()+)(()&+%+*$*'!'*(!(!"$)&$!'$"""*+(%*!+!' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45758 42 82M = 45634 -206 AAAGTCAGGACGCTGTGGCAATGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCAGNCAGGC (()+$!+**&("!!&)(**((&'!("(*))!$'#%++$(***#%%$#%)"**$$)&+*(+!!**"$!$'&'"'+!)('*((" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20T53C1T5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45634 42 67M = 45758 206 NNNCNCCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTC #!$%"$++*%#)($**##*)*!%%*'&*&)##*!))&$#*!$$$(#"#+%!"("")(#)+(%+%+#+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0A0C1C0T61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7388 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37802 42 46M = 37956 210 CTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAA H!6&&/A,7$*:C""E'F$/%C"C9(9G$G?7:GC0!0C'82<6=9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7388 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37956 42 56M = 37802 -210 CCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGG ,!+,C(")4D0$/(EC71?C+H64%8"/=7(',';+68?;%8F?-(<>B.41DH$2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7389 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11434 42 167M = 11601 257 CAGACAGGANTGCGCGGGCATTCAAATCNATGTGGGATCCGGTGCTGGATATTGGTAGTCCTGATACCGCGCAGGAGANGCTGATTAAGGCANAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGANTCTACGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGTAGCGCGG 08C@;<)4.%GC0*#97,G65+BF%=<:;8G,&F=1D5=01.7AG8/<2<48&'0?+?&*9AH.!&''29%D2EB5=;7E/&8:HB*G@8>B4-107D,:,**++7#*%CF*0=-%*E* AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:9C18C9G17C21T13G33A3G28A7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7389 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11601 42 90M = 11434 -257 GCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGNTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAAT 70#0C#+=(3/!"-;#F(6A:D5C32,9?-C>@%06>?1=;:"G$%&G+@*(&B3&7&.@0=$.&-,3&-3@53387$3'-2!A4"*D=H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61C28 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10147 42 85M = 10262 260 TCTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGANTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTT $1CD?3@/7CB)@8)@B/1H?97G?81';6H&H48*/<00"9%H!G+;.#H!7$867,D>63!B112&1:9GB?"E&;1+%*(AB AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A26C57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10262 42 145M = 10147 -260 CTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACNGTGCTCAGCCTGNTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGG >6%E3!3%D.;*E,15DH(18#5=.6,A3@+"7?F12-7HA4'4*CA)4DH;3(D++$*,?FE-3*#..'A1!D(2(/-"!$G*8@3:/"A1/.8>)A?@C6+,"E0.!&%=/<&@,/5@47.(*4(:!F0G5A-A$4G'9B60#%F=0;#@8,! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7392 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27405 42 79M = 27266 -218 AAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATAACTGCTATCTTCTTCCTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCT 9":A#40G@;!$&*%=30G83H,;H.D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26C14A37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7392 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27266 42 97M = 27405 218 ACTAATAAGCCNATAGATANCCACGGACTTCGTAGCCANTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGG @0)@@),CB185/'./E=,=+>#-8.8?73*9),2B#@4<64?,&F9C>>@1( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G7G18T58 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17721 40 53M = 17400 -374 TTATGCGGTACAGTTTGAGTTCNGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCA &#E#!/-C&!2:='80E$B3$?-?;#5D(1.66:9&#=@?G3#GG*C':"4(:(:A'$H1&"*"%)B0<@,B?A8FC&@/:E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T59A46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7395 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17561 40 45M = 17666 292 NAAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGC %";"H67$%G@#B/+="52>>.CC!(?H"BB*/4$.0BE5$D6*8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G43 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r7395 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17666 40 16M1D37M6D127M = 17561 -292 AGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCA (!AG(;C%D8,13#@241-=B0,EAC@&1>G+6"*/<2G>16&.$/B+5:049314CC:E<=+@@(9BH/?/B=;(5>&)*/4.',,<%>2#(G?*6#D>?30E#3%,4"?.)$+*5?8&1=#@01FD8+<&/ AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:16^T37^ACCCGA127 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7396 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33503 42 53M = 33664 239 GTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTNATAGTCA /,)<)H+/3=,+?'+-;*0+1-.F23"C;9';397<254*.')@;G&!.(CA-D9H=/:98B0C5(362<#+)A5-68"'D8C+-8)/0EE1"C$/)!,D+13 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7397 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7105 42 267M = 7377 327 CACCGCTGATTCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGNCCATTGTTTCTCTGNGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGNCGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACANGGATGAAACTNCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGA (57@"#!$E8D%&E$#?C$C3CA5#A3C>+6"?E"E9<'2)1@/?&).+@H4H)?>6D885CC-$=E'@5?(C>&045>96B/A?/BEH);9@%@@E0=09;09E.B@=29D.6*2'7'74<8B#E(#<'AB.A-+C18)31@!&%)83DGGC'#29+"!7F2#&%"('@+'@49A$+9=,?=0E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A37 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7398 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11465 42 329M = 11794 383 GTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGNTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACAACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTNGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGTTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAANGCGCAGCAGCAGAGCGATANCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCC @D0;CAB5%660G'F5D8E8=*8E@G+:-<@$;)3:+!2/6%@"7E4"H8A<.;=9*C2A";$8A&A-D';:"=>!64%9;4?(+B:1)>:4@@*1&B",+H70;6#/;06)DBE83/65+B@2;<,+&0C&#&;&G,"B&8>-7":'5)$*C9+;#H6"<2*H7<6:":3+#2F&=/5CH:-(E5.-H"6&/9)$F;=*<%1=C5'1,H.+$(H&33;0.@F?,4%3854"E65%EC(CH1#CH8=#3B(C1-G1'6#%CD,)20,!A3H8*-4.,B AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:49C35G31T79C27T19C83 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7398 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11794 42 54M = 11465 -383 GTCAGGAAGAGCTGAACAAGGGACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATN -#(!(++;<@&1)*4H2.-A&$'/;$98*1:0<03?9;="0.8900!(5!%>=" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A10C31T0 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7399 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18636 42 74M = 18499 -211 NAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCNGTGCNTA !$!"'%&*!&'*'&%%"&+'+$+%%+(!+(%+)"'(!*("$"%%%'%*'&$'+#)#%$'+('"!)+")*$"")" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T65G3A0T1T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7399 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18499 42 44M = 18636 211 ANGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGT ''5209<&H17H/D0E.+-//BAB'G06BD3,:6.*?*?D;CG1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38338 42 42M = 38388 235 TTATCTAAGGAAATANTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACG 39%=7?+H&G<7$2!.3HH*3=$&/B*8:=!B')B<18+*8/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7400 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38388 42 185M = 38338 -235 CTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAANTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTAGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCG &DG*+=H240(A0A3+"-,5CC$499,;+5*<;;)C6"'"8*$&H<)@F$+C$FE8.)B,5*+=A:A=5BA(5!C>9D1FH**C%>BG9):6+6,(<223D48 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:121G35C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7401 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17330 42 133M = 17180 -283 AGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGNCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAGGGTGGTGAAGGGCGTGAGCTTCCT :CA20-=#91(>'H;?23"H3-!'@#!2?89-731A7":81(5C2H".GE(=-&3/".!/(-'4,#<*520$3A*./'<5E#")7($25=;,A$&B;$AG?,35$*':CC4B2!$)@->7E-;?;B5,)'#=6 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29C78A18T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7401 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17180 42 144M = 17330 283 GGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACG 2HD073*9,G0H#3)?:>D*<42;>HA7:3;;%>!(46:-6':7H'++@./#-!:8:H93;#H.;($%6&(<0EBD5="2G$"8"(:''AE!@F::54<5+=;B=D@9*;7-!)!=E)-%'65524"BF->.E8A& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7402 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36515 42 91M = 36316 -290 CTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCACTGAGTCAAAAAGCTCCTCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTT !7=!6BH3?"<+%+#+.**463*%14E:"%72,'AF128)6B5A/C(,FGG?7>454<"5>6%0*A3C#7@8B*E) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44A16C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7402 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36316 42 76M = 36515 290 GTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGG F7.06D'E/(<-6B3E2H#1"5G%.2&(*"%,+;>E=C-F!-7/-)A3-4,1;,7&FG9%#>30%7@8G5!55G51 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7403 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41108 42 54M = 41349 300 GGCNAGACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGANGGGCAGGT )*%("#+(*'*(!+#"('"#$&!&'('*'")'*()&'#%'#)$!(!#+%+*'!# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A0G40C8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7403 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41349 42 59M = 41108 -300 TTCAGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGNTGNA !&(&(%%&*)#+*$$!$((*)!(!+&$'+!$"%(&%'$*"*#(&!+(+$)""%)+#%"' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T50G0C1C0G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7404 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4444 42 45M = 4196 -293 GCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACC (),:2$G.D@B)>./2/'/3B)443.@3A,%>(&,F"@3H",*26 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7404 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4196 42 72M = 4444 293 CCNTCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAG 46:3*;D%H!G?6+!55&469+-?3@55=#.449%,H81-D5G,>04E9.48+9&D1!&/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7405 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11287 42 302M = 11246 -343 CGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGAGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGNTGCTGATTAAGGCAGGGGCNGCGTATAAGAAAGCAGACGACNTCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTNANC %%'#))$'+"$'!))&%&#&$#)#%%&++(%+)*'$$$'+'('%*)(#'%*($("%(*)&"*!#)'"%(($"&&"+%#)##&$')#)*!%#+*$)+)!!#*$!)!'"**&*!$+&""#+)##!!!(#+%*&'&!)*(""")&&&++(''''#'&)''!"*"#&'$#'$"+(!"(#%#$!$$%(+)+()&*+*%%&!&+&$!$+$*##'%&&($#%('+(!&(!)$""&!)%"&)((#+'("!$&+%)""'*$"!))!*%#("($%%"(+#+%**)***"$("#$!$"#')"%#'"*#+&%%( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:54G169A15A3T21A31T1A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7405 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11246 42 41M = 11287 343 GTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGT H@8)E;/&0'&F3+#2#B=*;&4(@26#'1..H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7406 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28470 42 76M = 28321 -225 GCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCAT %D'H-F-G./=-9-*!F=,+%6B*(EGF%)'"3F83,#BH0H!8?1!5+(?.=#0<-$A1:&H2D949HD=@<>0, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7406 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28321 42 149M = 28470 225 TTTNCAGGNATTCGTCAGCCGTAAGTCNTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGNTGATCTGATTNACTTGGCTGAC (*($+"%#!!$##*'&()*)#$&&$*"$+'&)$$%)&(()(!)$("$$(%%(!$*#!$(!!**!!*%($)$$"%+)+'%$))%!!%)*(*"&'$$#+*#)+")%!)"()#&!&+)+$$'*&&)%($'%''$%'($+))$%'&&(+#)#& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T4T18T98T10A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7407 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4144 42 149M = 4019 -274 GNAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTTGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAANAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTA B1DD5:>;8-C)-#@B:D:"4'>05-5B"7.6=75.0FE8-:2,F0E,2(&/";2,#%9:$=""$*@FFB,338:!1)=$;0#8C!+H?#7&&(=*%@HEA/**0#50AH2=?.A!CDB";&7<*.'97 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A43C77G25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7407 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4019 42 94M = 4144 274 ACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGNCATCGTTCGCCGCGTGGTGAC G.6:=GC!/9E";@('!4"(>:$&5,=E;E:H)D)@;()H*&'F)$?',/4'82'!5(,81=$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7410 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1800 42 66M = 1866 327 ACNTCGGAGGCGNAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTAT ),F2!%0"0+3!8-,?%),?+B/7@<07+B(&&+&#'<<02&F-H/1'%.G#)4/1'/AH11)@:0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G1G7A53 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r7410 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1866 42 220M5I41M = 1800 -327 TCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTNTCGCCTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGACTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGNTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTNTCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACC )%$("$*)*+&((&#""*+"+"(%*''(%**+*!*&$)'"())#%)!!&'+'"'&(*+$(%$%*+%)$%)*$+!('$#!&(!)%'#!&$'%#"($')'!)*$!'%&""%*+*#!&++$)*%*)*#'&%!)&"!'!#*'+'#+'*(+"%(&('&"*(&+$"!!"*#&#*%%%*$+*&(+#%&##+'#'!$'*%(("'+(%&&"(#'+'%#&*''$&'"!)!"+#%+*%+('(#'')+'&*+"+('$"&*%$"*%$#&%#!#&+$'*' AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:11 MD:Z:42A3A65T43C71A28G3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7411 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24388 42 52M = 24637 312 ATGANCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACA ;31#3(7,;(AF"52/!6%*87F$*"2$4+'<:F5'+'">%73%8),!(4H% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24637 42 63M = 24388 -312 GCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGGAA 6!6)@."#F/(/?)/;1:H: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7412 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46098 42 63M = 46098 0 AAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTNACATGCAGATGNGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCNCGAT /685G.<6H<$<&"1,..F:(83)'*2(+A61DC=?A+4H%?$)6EE#$>2?>#9*'4:H6FE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24G11C21T4 YT:Z:UP jpayne@0: r7412 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46098 0 * = 46098 0 CNGNNNNGTNCNTGCNNGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCAT '(#%!!))(!%!"#*"!$++')+)!&#)&%#"(!#"'+'"#+)!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7413 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19809 42 81M = 19962 238 GAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGAT =,>)740)G?7:827:!!,9=;H+"+HA-,2FD1-E9;D#'8&@@5&-;#;F;.9$D8,*:*:FD$!H0'!>,"&1)-H#:&;C@2&)GE0!409H?,1EC,/=4!@##3;DA=E=:6&DC" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53G30G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7414 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14709 42 356M = 14709 0 GCGACAGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAANCGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTNTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGNTTGCCGGGCGGGACNTCAGCACGTCCGGGTTAANGGCGCAGTTACATGAGANTCTGCCTGATGGCGCTGTAATGCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCA A,<./+"6B7(D%?=,1$G>E*H=5,,+C#0@A$12G,B&::5342/;1E!7,<&,=&$6%G1'C7A+74G@@G=9G-A7",>,C+&7F"4;.7!;$*F:2G=%?H'H845018B0BCF+%*0=-1:)G2.#<,G9.8<$3*3)6"/:63'.">&3&&$.9!6G=+*@"?0C&7E!#0G8?G,(5D#',:0/6"!'F5;GE%@F96*?9H:?H27,G316)=D(>)'4:&$)> AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5G37A171T37A14G18C17C21T28 YT:Z:UP jpayne@0: r7414 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14709 0 * = 14709 0 ACNGCGATAGCNACNAGGNCNNTCTGGAATACGCCACNNGACT *!!&(#$$)')!"&'%%&%(!#++$("!#*$'%&))$+!*+"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7415 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8865 42 136M = 8754 -247 GCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATATGACTTNTGTCATTACCTATGAAATNTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCA E5#!"E'$?7.(%H':''@H@F-G@38,)57D44-548(.A'?&!#')F8,;5:1%2"/159,?/"-H;(+#AEHD*>*:,;32H4$HH4=0G5+&=7@2B'=/,)?G&@:AF8.+09*G76+F-D@D'<+38@,H AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53C6A18G56 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7415 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8754 42 111M = 8865 247 TGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCNTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGTTTACCAGTATGGTGGCCA E257'468F;7!(@3?18-4:%B&1CB>E(),=((E7#,FBH&-*#"12G(9?-1:%*$D<3C84"AB8"@-C<*54@0F>5H=A&0D'/A*3+$,C<8$&8!!6.603@- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34G57A1C16 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7416 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40559 24 4M3I49M7I13M5D105M3I34M = 40769 443 GTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCNTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGNAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAG H:>C&0AD%957%*/,)?>4B6CA;>>*%@D6D*>>E84"!5DF1/95('6>B@F,F6G<"C@@B7!9.+(C9-6!>"9;1(,0'A:#$1E#='7%6(D114H&:4A,!!)5?,B4&H,8F892ABG<)9E70%73:5.(+;F3$?#9&0&@0=F0?D>"8"!-$1+'8 AS:i:-75 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:4 XG:i:18 NM:i:19 MD:Z:66^TTTGG56C82 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7416 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40769 24 49M4D180M = 40559 -443 CTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGNAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGANTGGCTTTGTGGTAATANGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCG >/8=5)$;$+G(?F+2C>?=-7>:EH38(9&A7AHB=EE+*@?"!!&5DCA)#=,6#64"(77$D7=>B&9H,'FEA!9,G4E$04&3>&,8:F#F")D>4&14E2);85(:6:1)&D9&F&42B$;; AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:49^CAGG65C30A16G66 YS:i:-75 YT:Z:CP jpayne@0: r7417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7885 42 148M = 7757 -276 CGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAAC **5'C)29E6D@A?<$E;A)65(4)$$?:!E"5D9'@C-2!HG.7<*".%G8)$3)('>'@"+>9:?(C@%D*0-G@?CD%68"$%D#&+B90))+3#+:H77FD'$"'B;1@1*+0>5*$H&FF)*78'CE AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G135 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7417 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7757 42 102M = 7885 276 TCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTCGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCA >95!E',1-=85%DF#2$.6#H$+(;0F,7:2%G4F;<"170G#6H67G=F=2B=8*%>$*B&6C%?A.*!/&7F)..&6$5<4@"(!(H+(>+*3./AC#2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7418 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5146 42 110M = 5146 0 CCAGATGTTTTCGCAGGAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCNAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGG G3':C$(@.&9$5E8A:2;D!5*.9&F03&.H&2++83"FG''35B?3@,'28@>#):6B5E7HDB0%"G-:?"?:2#CA.G7,GG&HE AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G5A47G45 YT:Z:UP jpayne@0: r7418 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5146 0 * = 5146 0 CGCGTCNNTAANNTNAGACNCCGNAGTANNNGNTNAAACAGTTGTTGATTGAGNCTCTTTGGTCATTCGCC "#$##('!()*#)'$%#!'!%)$%"'"&"!#%%+$*!**&#$)&'++%%)#&$&$$(!(%&+(#"&'%!'! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38867 0 8M1I12M2I11M3I93M = 39100 291 ATCGGCGGCCCGAAAACAGTTTTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACNTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCANACGGTGCAATGAAGCNAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAANATTATCAAGCAGCA 6%($"-<1E/4=HDGG(;&*;0%17&&$C2,3H/+"DGG/-(#68.:H'9$51A$H&G>=*H'*($4C?".-G0A&%A0,@3CH-A@< AS:i:-76 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:3 XG:i:6 NM:i:23 MD:Z:2G2T2A0A0T3C2A1G1A2G2T2C0C10T26A15C23T14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39100 0 58M = 38867 -291 TATTCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATT )2D8D)CF2%DE?)&&0;)66.#0C,: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C54 YS:i:-76 YT:Z:CP jpayne@0: r7420 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5095 42 56M = 4822 -329 TCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCNGN %#'$%"!$#&"#$!(!)!$)(+!&&!%('(()+&%%#&*($))$*"+(&)%+!$$( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53A1A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4822 42 54M = 5095 329 NNAGGCGNNNGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCNGTGTGCGTGACAT !&&*&$("!+%+(#"($)&!(+""'+#'*$$"!%+)*'%!&$$%)$((*!$$$$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0A0T2T1G0C0G30C13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7421 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25046 42 168M = 25214 349 TTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAG +$0H&+%@,-)-.#84.3@%G23:2'(;CE2A3?*;=:=4H@&A+&"H&7<@'9&E..@="#A>%;')..6=F2!0>=B446':=&:?E>@<8"8E3"A-);)/@H72G@3(1H5E(=>%,*'C34G2?6E0;-5H,0,(%4%4; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7421 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25214 42 181M = 25046 -349 AGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTT #/8""@E?#7/E*8#%3+H8.DH=#%D--)/@EE,7337#/F%)5>E+.7D7$'1$3"*'C+#G*%<+83C(59;A#CFAEC%:>D72)EC@/*78A$31)0@=!0H-#(<>$:=B79HBH&8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:181 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11783 42 194M = 11596 -381 ATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACCACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGNAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGNGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGANGCTTC "+&('*%&"'"%$&!+*+&!"!"%*"+(+$%*%'$$()*&&(%"%+$%($"'"!#+("+%')*%&"'&)!)'*+$!'%)&(+%$!+((+&#(&"!%*(&**+)$!+"&'&*$+"'+'!!)**!%&*(((+*!#'%%+(&$++%*#(+#&'&#'"%'(%+(%!!')+*$#"''')&$''"#(+!++*)))*+"(+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:67A44A37C37C5 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11596 42 187M = 11783 381 CNCGNGCCCGTTACGGGGNTTATCNTGAAAAGTCCCNTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGTGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCANCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACAGCTNAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCATACGCCGCTGGAGAA '(*)&)'$%('&'('('(#")$(+!#!('*%'('&"$#%"&!")("%"$)"$#%!+*'&$*!!'('('%!'(#(')(!+&((+!+"#'(''%!$"*!&+!$%%"*'++&(++!*(+#'"#+*"*'+)"&+#"'%%#**%%#*%$)(##"*#&++"!')%$$(("+&&'%)%(+$")%*!'"++%%"* AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:1G2G2G6T3A1G3G7G3G32A30G25G3G41G14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7423 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28074 42 66M = 28232 284 GTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCANGTGTTTCCTNCATTGATATTCCGAGAGCATCA 63(62*,C*":'C/-<+B3%89;G0:F98#2-G1E7CF7183F569)0!-E$D*":H6&*<$D.64 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A9T22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28232 42 126M = 28074 -284 GCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGAAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCT .3@;%1+;G&@B1/$#$:A04$C*5,0.)<(%BC%4%?"&>:-%C18E.)*99C,%646;00.B,!.D3:$4BH AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7424 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2798 42 96M = 2610 -284 ATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTNGGGCCNGACGGCATNACNTNGCNGTNCG (("(#'&&*+$%$)'+**)#$%(+()("'$'&'&+####$!+(#$&$"#'+#%&+")!&++&#('#'$#&*+('&"&$('%##&&#"!#&%*#")$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:67G5G8G2A1C2T1C0G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2610 42 56M = 2798 284 CGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGNCGCNACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGN A58**:<<:FDE&19@++?/48#1:9;%???&9&HG0<:9E?3;B83<=+H-=7/?&E4HB%( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7425 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24487 42 98M = 24694 255 ATTTNCTNTCNNTCTTCANATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTGGGCACTGATACNTAACTCTTTTCCAATAATTTGGGAAGTCA (*))!*"$$(""(&(+")+'"%%$%%%**+&!!&#%$!&('&*&%()()#'%'#%*&#%!$'&#%"++*"*("!&!#%&$!#)&#"!#"(*'$+"(&& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:4T2A2T0T2A3T37A11A19G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7426 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6072 42 146M = 6218 237 TCGTTTAACTTTACCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTT /-@/7G-&%-9FF1">C'5,'8)/B?2?$*%*FA*@;$2/4"!"6H;5+,.-'+2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:146 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7426 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6218 42 5M1I29M1I57M = 6072 -237 CCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTT CD&3>>ED7H77#@9>/!'4H4E/F@@-(CG5"9$=H?*/,3,=A)5$?&&0!))82*8%A50EH%>;>E.5?>=/=G0H9&E685G".#=;< AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7427 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40676 42 50M = 40835 241 AGCACATCAGCAAAACGCTATTNACGCAGTACAGCACATCCTTCCAGACC B*"7A&'5>&@%3G6:!@2$DF0=H>A:3<+H2H7EF&:C8-5/H/B3""=)+!@GHC)+="9%+)E0=297B!.8CB*+H@E?/?1039B+2)4!/@43;739%3G)?)63*2BE7/*0$;6#H0)D()1CD?292?*CFGA&314GF"C>GF374++H,,6.H4E%,903"24.516!G0'5"FF/C<39A.)E23AA%$#/)0?@2>%6D6<;F@,:!(E@<8;6/&+&>3F!5>#';7F!:2.%<;=C$C42*!"@CBG!0)@/(180>1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:210G116 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7428 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10267 42 94M = 9940 -421 TATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGNCTGCTGAACCGGCGC +*(6&3&=E7-";63F.7+.?/+AF6D4D%#!0@;9&DE@@2C;2".D4,#"!:@3+#2#1$G/?#@G/+7,5'/!H?H.$D17A67H&14A4<0'%1;)6+98)!:C?85*&?! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23413 42 76M = 23184 -305 ATTATAGCTAAGNCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAG 5?CF:/(*;/D;!?D=?"/"9,G'4=#80D2GH61FEG,F0,"C6*E!7F@:7",$???#B0!E&24>&C,2<@BA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7430 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23184 42 76M = 23413 305 ATCTACCAGTTTTAGANGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAAT C<'/3B$E0=+BA4%G:9-/&"D?0%>%0<96B00C0";#%'-C&'3G=67>&A,11#:.D06(;7)+"H#<,CA? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7431 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38355 42 117M = 38355 0 TACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGTGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGT 1!.H89!%FA#/759"-85EA.%5DC'A'42%A22#>8:1:C<.(#67*2&6.'$0",;=G(:DD5(13$GE/<*33B#C$,E5>-:A24'>:C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A69 YT:Z:UP jpayne@0: r7431 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38355 0 * = 38355 0 GNNAGNGCNACAAAGNNCNCCNNATNTANNGAGTCGGTACATCNNNNCANNCNNTNNCTCAGNCNTTNTCTNNNCCNANACN #!!#"$""!""#"!!"!"!$!#!"!!###$$"$"$##!$"#$!"#$"##!$"!!$!$""$#""!!"$$"$$#""####!$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7432 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38901 42 178M = 39079 322 TTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGACAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGTGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACA 2'<:@88.,=#!)BG+/?8!%9E(:>/'11-'H1,"C&E.,";-/@2($31+98,9=-";BE*1/GF.!",@#G2&D8C5+$-6100<+!/2%$F=5"+76@C4F@C6&68+3';%&>5.'F.A1!,97":A14%#60F;-.=/,&/)-BB-<;'%CD+3,<% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T115G29 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7432 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39079 42 96M3I48M = 38901 -322 TCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTNACCAGCCAGAAAACGACCTNTCTGTTGTGAAACCG .E@--B=>5=%$A1,=?@1B%G1"+D?'BC7C*$DE4;=91)@50,:9;37(?($G9HH0CFH+8B**%DC7"$%(E@>%F/11!0!'E-+.5=E:388'C)?@F395*'/;:H7D==:3G!<38&56G7/(4;:?*CC=9H3=<2& AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:108G19T5G9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7433 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 803 42 18M2I25M = 887 258 TGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCNCA DG=65?!&+'*),"D.;E.2=?3F&%#2+8<1*0+BH=&+'#,:H AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:40G2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7433 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 887 42 174M = 803 -258 CATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGTAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAAG GF=;/"B>D%B?F:C$8!D8'#8;?G=FF6&%E*$+!0+BD0:A<&?"FHBG9-?95?F&B)&5D4!6E,";8>1?,0(70'A6,G'*=.44CGH'5%.:'7D3!&7'A4G3;7*1626$03H5GA47<1>'E89,!A>.B/E'&+%:7:6!#;F7)8%+=59F7$>',<4"G5(BE#-C8!(CA<0, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7434 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14801 42 49M = 14560 -290 CGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGNTTTACAACGATT ".96C!0+&C1>>;,76>=(&'%*C5/'6/477F-BBH@9&*#>D(D94 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7435 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33965 42 69M = 34034 203 ATCATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTTACNCGTTGGAATG =C2?0'9E"1B@E),D@AF!;.G5+H,:#1,'-22<*=:7-/7576CF1&1G>@#F0"F?2,5>!$61- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A52C2T10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7435 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34034 42 134M = 33965 -203 AATACACAGTNCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCNAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATNT <5-9F,F*.,C17)3G$F/C%!@>8!7*?@6/+3G5+=*>DF.&&'$G7--B1<3G!"CD.4/-''*==0A:&83"DD-5F#-2!6#D&!>9#FC3%0>-3(E+!<#39"(#4)8H9#54:A#!$.35$- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G25A95T1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7436 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46124 42 98M = 46048 -174 CATGCANATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCNCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGGTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGNCG 3>-0:::+,")64D+4@<6$21G=@05;::0.=6C<,/?99&)D'1/FF1#3:%F$D2-5@)$?1@>&:7@$!'<%18E('B,>0:A#0/37#/C"!' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:6G23G40C23A0T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7436 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46048 42 44M = 46124 174 NTAACGCCATTACCTACAAANCCCAGCGCGACNAAAATGCCAGA )*%$!)))*+#%(!(**%##)&'+"#)%)#!'&&'"#(!)+"#* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A19G11A11 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7437 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4668 42 105M = 4561 -212 TGCTGCCGGTGTCCGGCACGNTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGNCTGCANCAGGCTGCAN ($"(*$!"(*+!(+)'$+"#(%'*$+(&*!!"&#&$'+$+*)*"*$"%&$"'+!)#%(&#$'"$+")+"$%'%)"))$()%$(!#&%)'((*(+#'"&(#%#%!" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:20C67T5A8C0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7437 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4561 42 51M = 4668 212 CGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGG .%==+(5@<$"H4>#4@<46).C@:8C6,=>53FB;E=:78-;6'8E*;83 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7438 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45430 42 119M = 45272 -277 TCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGA -)">EB.>D.,"44&><.=@8%>08:'($:+HG5$.<@(!/@1%0BH;*95=1&+, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7438 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45272 42 58M = 45430 277 GGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGTCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCA '&(+))!"#)+)##(!#$%$+#$!'**)'(%*#!')++)*+((!%"")(#&'+(+)!+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7439 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 173 42 116M = 293 239 TNGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGNACAGGNAATACCCGTNCTGCGAGGCGG '%D97#5,-9>H.-;001,2D4D:B1)?#,,%"C37EH:,2E$8!*9"AE%E.?)!.:=$("+#(45H,$,2"G:.1)0E;>8,EH,8-'3>*>D51/4'#"C,(?FB,HD/;C+= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T86A5G3G5T11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7439 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 293 42 119M = 173 -239 AAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCNT "!+)"('&+"**#*%'"'")!'&+(!(#'*#*%'#)$!#%"'(!'"+&"#!("()+&))$$&$$+)!))$+'&$*+$)(''$$#*&'$(%++%$$$*##*!)&#(*)+%)**+*"&#&$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110G6G0A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7440 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36673 42 65M = 36673 0 GCAGAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTT B!8CH?'51!1#5<743(A=*?0;#!B*37H8>@3;'D3"0(<+"*@9=B#H9@;*EE:!EDA%% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T61 YT:Z:UP jpayne@0: r7440 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36673 0 * = 36673 0 TCTGACGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACCGTTTGACAGGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGTCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGAAAGGAAT @<*$@*-*$;?;H."=,6EG!!<3$172)0C6:':;+<8H?C=%-@*##:442AG.F525D!(F1E$8B#5!3&9:&467(,#=0?D86(!$"'"F<9?.-,+H?@HG85??=3B."&'(2C/A9A.HG,H@F9%<(?# YT:Z:UP jpayne@0: r7441 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29498 42 117M = 29626 218 TTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACNTTGATAAC <+%7;*-9'47#?C.69H:G2:7-C$-542(=C-C*7C-(472856=7=!#@8@F9='$8HH)>#1*<)82%&DE.(C9G'8)<"G+!6@81;H9%F"39@),D?"8#?A#H:-#1+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7441 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29626 42 90M = 29498 -218 TTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAA 223)1/:)0"B22+'!5"62 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7442 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45131 42 184M = 45315 300 GTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCNCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAA *<.B&H?4H93.D"%,B7&G#E'@2C>E5!D*.C#.7>E>@G:*?F5((H3C8!4FD6704(#*(/?&+%"E(!#+*5@9G$-'A+G77:@%$:/%4G9-7F/++(HC-0@&==%/,?;%='<"3<6"D+.E5G9;H:-8"+D;/9#47BC!>?;>$,&*, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C147 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7442 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45315 42 116M = 45131 -300 ACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCNTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTNATCGGCTACAT D-FF3@/(&!-0,=+BG8@8-;8&9&E4,G"D*0A&+6);F7**")@6>*0"50EC#=>0(>3$F333&@D8>0H526@??AF@@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52T51T11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7443 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41566 42 72M = 41766 254 TGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCNCGGTAA H)(7.),7(744*;4;C9<:;939E>1"0:1=928F2C=<'%4G/0'1)G:BE)G';3)@(>*4*-,"D.&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7443 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41766 42 54M = 41566 -254 CAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGT ()*$$"+&#$#(*+!"$%&"')&(&&%(#&+*&*+*)*%!!"''(%#+++&%)+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7444 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6177 42 46M1I32M = 6288 184 CAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTA B7*7<55EG+.29*3E>H)0,%:C<(G2>0H2$A!!/-D("4%2%-)%4%##"4/B2*:1)1,?A1E,!5@.?G-"4'A AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:76A0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7444 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6288 42 73M = 6177 -184 CTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGG G$;7E52'&7#?#37H1?+.17"1.%0'$5B=H.4"$9@C59@+7F4#/85:=/>G9+0#AH-+4+'G2; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64C20 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7446 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10779 42 88M = 10167 -700 GCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCC %6?E044,8-<,(.=A,5-.HH,!-:E#"7"<)'AH:E<;:=861=0*0@3'(F5B%$<%H>-A4),G>F$F@*07475#C78H!(B& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7446 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10167 42 612M = 10779 700 GACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCTTCCACGGAGTATGCCGACTGGCTCCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGNTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGNTGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCCTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACNTGACGGAGGATGACGTAATGCTGNTGACAGTATCAGAAGGGANCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCACATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGANGCCTGCACAGTTCNCCGACGTG 636'/288+7#:3??0/&C/B$9>'.0"(&-97/<2+H!F,>B;C=@&*0F(55,7A38',&%?@30%0GB4"7@BG:>F#@3D.9B5%?C<>#.<*A.4&$$G4A,$BA9H11D4*A$EHC/7D%<<%@AC87#$)H"=D$(*B<>&@%=&(#.F*>D'&H1@)9135BE:&@9735.+H.&@B/'.#:2>7G:1A7#-A2*7-H/@($2$68G2!CD>=>.*,'D4-3CE7>84+A6)#-:)3%774C4?2EH*/A)F2'G)(!0)-,7&ED@.EB!!5"1*;/$E'@G.+'C.;<,9>7<8-2!(:$C6*.;#573'(5.&>F6'B0*FG@;<7!;*)/9=%<-5#,=F5:&.;$=(B/-2<-5>6))#%>*%?>>CG/>G@8#-HFB(*/2$5'?E/+E9:34"'4+69C-66>C;D+;GA(B=A'$=$F8+:1H&F<-D@?<.7BF.39#EE+!1$8&->1F09!E7@4:>"D.&-''D,+<)%=6/!@0A2 AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:34A22A37C131A35T50A23A18T69G160C0T13A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7447 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 371 42 131M = 557 260 AAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCNTCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGA &>(./.7<3*)&&*H>9:1<0-8=GC4.9%,12)A43$H%@'.::)<=.<26/D03(9*>(A/A%.8G%#5'B,&&B,$-)"D:"E##*B<5187>@(:DA!(5,%E/G>$.*'/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-88 YT:Z:CP jpayne@0: r7449 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40587 23 25M7I13M5D105M3I81M4D58M = 40878 345 GCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGTGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAANNCCTTCCAGACCCAACCAANCATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGNTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGANGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCNCA 7G&&4<"1"H,')*E/.=+6.!,B-.%67/"AA*<8H71'C;#6"H)3G"18B;8;6)9A38-"#>/=H>0:"(6**6;1#5?".@',6%)G$.#&7>,F4*>!>=$#F80:1#=EF%#;7:CF@D%G?-385H/52628H7;9-D23;8(2.69:6DGG$8>;%DH?00=E(FG71H9#3F>+;AG3=*F'?:&#G%E-('19/,;>,+F'%!DE62(<0,$F5!E)E9.#9?F%0.BAGB2>+.4*0+3>8?;A40@4*#6B;)'=?5C*$E#)>,9#('6E,?/. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7451 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2155 42 150M = 2408 300 GGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGA /*4H%-+&;F/;)/00*8;>=7@A,/+4=F5G8@-/=)?*4B+/3D.-#70?EC940501F=-4*-+C1&G?(!22/*1-'9(C)=7;=;B=?B9(,+/>3-6;336#/>9'9"1F::/<%3@E#6*2BF4+":0-3/(5#5DC%"0358 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7452 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21697 42 60M = 21869 266 CACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGG B+#4H'G<4/GF?1->8=@*BDBH"3A4+?G(6"?F6H15$E985'>0H&(F&! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7452 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21869 42 94M = 21697 -266 TTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGNGN '$+$#((!#+*(%")'"'$$$)'"+'#%'+%!*)$#%)&&'&$)!#(!$$)'%##(%#$%'%$$'&(*()!+$%#)$($''#!$*#"+**$''" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91T1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7453 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5441 42 103M = 5286 -258 GCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAAC 4(D+E&)G4&D3,,=72-1312%;'=&00+-C1:3*/)!GBE2,=*E98.;='356,3-B411B1G8E8;G4-=1*;E<>+9!-7A0"6BDHA"DCEE7:GDC AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G33T27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7453 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5286 42 114M = 5441 258 TCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTCA -CE@0+!<1H"G&CG=A:5*A6,C1,G!,.!!=,2=><,8<4#7!9&+,B72*00A@)A=A"#8>EA1=.H$,;6(,2:8*0;GB#<=(,A+.6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112T1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7454 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42924 42 192M = 42851 -265 GACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGNACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAANCAGACAGAAGTAGCNCGCAGAC H)1=D(09*HB5@+;;>)&G*D=0"-E.$1>8.1=;+!?D85-0G!H)7F23#9,*701/AFE>CCGC,<A'8G#"%,'!75(.@1C9D0C3*/HD+0#4A,F47'+EG*D/GA:86B&6/B+'9AD=-:=+-"%94<#"D7F?>$)D7B206A/#BD/>C7C.@CCC8>>6>?CBG2!.@-*F0H? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:69T99T14A7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7454 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42851 42 73M = 42924 265 CAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATNGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTG 1%17@7D:$*-3-,#7%78F3+!(=#6*D<$&4@,.*=1?F5B&D;62!36%6@C6+DCBA1<-<3B"2.1,7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C37A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7455 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27697 42 357M = 28054 443 TTTATATCATTTTGCGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAANCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTNATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAANTGCGCAACTCGTGAAAGNTAGGCGGNTCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGC .*7'%',$@<#:F"8+661=(,7"67-,-8F%;C/G+;/?E$:.D?<*),6FG;E7)3E5""E2F19>;3F&GG<6:9;;G$*(-?$8+4<#A5;-8(?6CFGB#)D3#<172.1+FEG%;G>+"G%<3$3;#,F'E.HB+.+&;;)*0)!"0FDG>&@##949F#>B0"C3/E9!:>(#!,,,&H1$A9"!.F,=E=@5 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:13A79A18T73T64C17G7A79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7455 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28054 42 86M = 27697 -443 GACGAGNAGATGCAATTANGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCA +/#@%-:)37F.#"'7*2#A"!@7B8AC#9@18..GA>@446?"'2F>/DH/%+H;)B1")*>93.-3C2F? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T11T67 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7456 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33365 42 176M = 33558 326 AAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGNAAAGATTCGGAAGNGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTNCAATGNCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGANAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGNAAAACCGCACTCAGG G<@66'%6#6%"4+C+A=FF4'6D;")#7)+F(F0.',B";A$B(@;G77D!=1)&@<#H,G658F'B%0F?G!@/.'(9-"=7=)8$+-.44A'?++@,(.0@1=:/8-!3E7!:F%D1"2;%8#!B)E>'!1EH?!3@(,,DF$<5#.#B>F"8D.G!&1A6'4!D6%>)E(65 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:45T13G22G5G37A33T15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7456 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33558 42 133M = 33365 -326 TCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTA ,>C/F,*#<(2C1((9<0%%64$DB)2$8B'1)1>5A;%9F0=.6(D'H(06DD)!"H%B0<$>B?9+/2:%5+)2+D@$<"9E3#(3?7"G>)*6)*72F;5<"8.CHA@=/'0!0-?FA!2&5%4<7AA!4/;"F&5,31-=7D'.8&)G) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7457 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26213 42 138M = 26070 -281 GGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTNGACNCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGATGATTGCACCAATC $'!)%($***%"%#+$$#!)%*&++#!+$%+)#(*$*+($!#+#+&()*"''&%'+*!+'+%%*$$'%+%!+)#$*#%!*"()*(%"(&)#'&!*'$'"+("+"*&(%$)#&+'!**+*$%(")%**'((%&"+*"++ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68T3T50G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7458 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9684 42 150M = 9859 224 ACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTTAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATANCGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGGAGCGCATTGAGCATCNCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCA 1750"72$*(;$>*F:FA=)D3?/"-D(D;$/6!AA0.D@12H1<;@A*513'#39=,F(''%71GFE,7,BC3."8+4./>>)G)07!3(9&*+,;#H5C24DHEA@!BF-3,7@:9,+<0F24?1198B,<"2*9=0-"=10F;;.HG AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22C35A37C15T37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7458 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9859 42 49M = 9684 -224 AAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGNA *#(+)#&(*'%$'"###!*"&#"%(!%!$))!&&!*+**(&)))(+%$) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7459 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37998 40 10M2I91M = 37867 -232 TACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACNCATAACCCTGAAAGATTATGCAATCCGCTTTGGGCAAACCNACACGT &''%+)#*+"#(%(&'+)&&!$)%%!*!$+%$'!*"!!%%&+&#!$$&("+)'('"!)!*&++*+())&"&+#"#$)'##!(!(#+(+)+')#*+(!)))*!& AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:53G24G15A1G2A0G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7459 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37867 40 96M = 37998 232 CNTTNATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTNTCNTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAG '%*%%%+'!"&+&)!"+#$$!*+&$)!$+(#*)!*%)(%$%+"'%%")(&")""(&$)&"$+"*""%%))(!+!)*')$!&"**$!"&)$"#+*)" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T0T2C52T2T35 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7460 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44475 40 50M = 44686 273 TCGCANACATCATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCAC +9%CA880<)EF>#8273)5&;91B#'9CC*#4/G$H%"*H2?,2(%??1?EEA9E%D7?0%@@'@$!>FB=G$+4F!/@;=#BC0$@$B(?7.$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23T5A28A2G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7461 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16674 42 46M = 16427 -293 CGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGNGGTGAACTGGAGTGAC B!3'8B28<;E@:5D1B8<0:69A.G'%E:>1=<7B&,6'C;!6BA AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29A11T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7461 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16427 42 40M = 16674 293 GCGACCAGTCAGTGCCNGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCC EF6!7*3"1=0A?F=!9%'+A'0CE!"@1HD%'$1DE=#? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17673 23 9M1D37M1D9M = 17980 359 GCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGT 43*$/,A:BH@,A1D8/#)"$%3'*?.(H=?'DCEA9:7!/2+&&A;G-F#,$93+73FH1>BH>G!4B:7%A+/E'<"7.+"=$10B)(?+,?E*;55D$)6(/215GE/(G8GEA!.E;.,:/<*6,G)+FG&:' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A16T67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7464 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12490 42 79M = 12320 -249 AGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGNAGAA ,20+/-2%%-ED1-ED?4$=2HA&,F&'=52.&#*54FH;0)G2*A9$5&.C%HBH!C)??$D5<9=@!2'D?)A8$F4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7464 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12320 42 125M = 12490 249 GGCANAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGNGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGANGNCAGGCCTGAAGT &$")&+!)"&"*++%(+%#$#&!(&%&*+)*(*#+((+(&#%)")#)'"$((*+%))$''%*')'##&"+$(&'""'(*"((+&#'&)'(!')*(('#'"()+!#&"$((+)))*+("!"('$+& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A1C73G31T1G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7465 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44145 42 110M = 43892 -363 TTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGT ?5;8C&+3<71=:A'?*DA$&CDFE6G>-3D;=6),<:B#)C1@H+=!>HB-/@."B%+):$(-B)A>-@2CCE*'-.;H<7G)5G(?>'C6=95).*<<89:&)>A.9? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7465 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43892 42 253M = 44145 363 CTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAANAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTGGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTNTCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGC ?5'B,FF(G7>'&76-HF:D4E*B.<%<:'6?5B=>44BEA?!.9A8*-@8(2=+:,%A7/%>!:=<1C1+#.;:)F.?">;23F<4DC!%-8?&9&.7>D"$=E0'&-,>EG4566,'67::3#@!;8=682;88@F1&29@!)%5C4;FD7?%5F7#*7!7.=(C(H3E2&::F96',)-8-&1=::E&AAB%:+,=;/3C>)HD(=-?!6)96!9(1>';D8D)B83;#42C)BH>$470:.42#?(C-, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A102C64A53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7466 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24688 42 62M = 24461 -289 TTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCANACGATACCTGTTAGCAAGA ),%;'8!B=6)4:?04=6>524.3?)5H?G'8"8?5"4+-.EG3;%,/2876+;4&<9DB!* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A17T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7466 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24461 42 61M = 24688 289 TTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTG $-DC#8#)1=G<7H7G*'E,&8@!=6+66*$%+="5#&A(G"7?1*<1)17*?0;#6)H#0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7467 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22027 42 111M = 22188 252 GCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGNACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTG 33&3AB*;;B:D#>$G();9B4>'85"C0+9(G;)'B<@-?#AE=>B$E227!E3C82H-%1D8%60#7)BB-"5'$&)33>F<+<9'@D+:?>3)E:6<458A<18G+E$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7467 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22188 42 91M = 22027 -252 GGGNAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCG '#%E:4@(1?G*7/#59'C>."/57*BF*>!0/;*EB;/!@9E#G13>/B(;;'#!FFC#.&F4')@B4/("<@?@E4(+<:/>>#"CG6; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14287 42 79M = 14115 -251 AGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGT <4"A(.";!;#+)?4?<(?C?@,#"34>H1&@C",?81E>>'/0#28?8,500>?A>;38*@5122.H;'6?(*!:+68 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14115 42 110M = 14287 251 ANTTTCCCAGTAAATCNCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGAAAGCACGCCGGAGGGGGA ;-F*DE5$=1)3.?!D=E$B&916%+C1#*2"G@)&3>))%):5G1/D+DG?%<4;")?/AC"?4#B1-<1##?F//6+BBH4(A887D8?6G:#!@B6AC?"&-( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C4G9C74T18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7469 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24374 42 121M = 24569 240 TGCCACNGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTA D$#*A>2)'.9#<<;=A/$'),5=$7,E2B1@$5.<<*F('':1/-B2EF<>-EC.(!?$3G?,$?%8=2$9-)1$90;E;('589B@B6*/16F;-.9(%1&3-&E>=&//%:#24)2C* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7469 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24569 42 45M = 24374 -240 ATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGC ';;:.>G=0(,6:D%/A9!9D"(B<9@*4#'/%B.#*A!0A1A8C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27335 42 72M = 27179 -228 TNATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGNTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAA %$&!*)%'("#+%"$*%!")'*(&$"&#&&&!!')"$!))%(+&$'&)!&&#*'#&"##$#)%+"%'&)++# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C33G36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27179 42 97M = 27335 228 TGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCTTATATAGTANCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGC 0-C;+'-2"D7D;CB!=2<;2419&"2'DGC@A8)3?5D2/)$A-5=1E=$,21.F;A/H9?$03>%E'7-@%'A6>!?'!9/0A)H2=3BG1/#?4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A9T55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7471 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25609 42 116M = 25774 210 AATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCNCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCAT 4?/?"-:>+6"9:G@A%EC;"G,684@'6AF+F*E20=!@49').<2F.B?C@#+=F,H26#6<>-"+4'=<:=,"09D5"!9C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7471 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25774 42 45M = 25609 -210 AGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGA G7D2D=8C++0$-/@";&026D),-F-B' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7472 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44137 42 135M = 44028 -244 GGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGA ,&(.78(/)%'2*2,1030G5@4""CD+B2&G2(G,D?;$.B@E;0;B$(0@&513.:H54#2'2>H%?6H#H(1B"G)!?=@:!EDF$2AH3G/,@"'0;)3;7+7-7$?"DG+(2'C789A9AG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7472 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44028 42 109M = 44137 244 GTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCNTGGTGT '/%#B&3*9!B7A>+!C.A16>3&C@;!%@(0#+,$&)-95$+@;-8<'@3@H3"48'+.699E+?@6D?5-.A,"9B!.:0.1>*1,)C:?(>6#DE%+A28$B9,HF AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:102G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7473 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6387 23 37M2I52M = 6214 -262 AATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGAGCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCA !F#:"DB*!$6+1<#(2<$879)%6++9D'H)+<+*4$7/7G8<%8;*@./61<@&."D#D;B+9!>7#BF//H,=1=7&+4D)!'CAC9; AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:56C32 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r7473 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6214 23 9M1I29M1I20M = 6387 262 NGTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGGCTTATCTCTCACAAATTCCGGN &#E)387B.H'$0-E=&AB-18:>)%B;/>+?"=.B=;?4702%@E"79:H<6379B"+- AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0T0T34T20G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7474 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6003 42 61M = 5806 -258 TGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTNTGCCGGAACGGN .(G';4B6,HD)"?,F=-!74EA/=/F@3/CD<,@" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T11C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7474 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5806 42 64M = 6003 258 GACCGCAGCCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGAC (<1.#"$"-&?52D-G7"3-=7F!:26 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7475 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31128 42 108M = 31331 247 TCCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAANAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGN .7,2G8E9(291=D#5#<"==<456?/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50C56C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7476 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24478 40 68M = 24733 304 NGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTATAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGG "!/&2-C/EA)<"9!+&71EH$0B!#E6;$68<5>1//+B@F30"H++GH6'(C;H<<+9D@9: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A30C36 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7476 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24733 40 49M = 24478 -304 GATACCTGTTAGNAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAANNCCNCNCTN "*'))%)(#)+)#+)%(+(&)(($''($#*)'&$'%"%+!'!%"'&")$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:12C20G5G0A0G1T1T0G1G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7477 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15457 42 107M = 15206 -358 TATGTGAAACCGCNTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGCAGCGAAGGACAACCTGAAGTC H*"EFE2$"-A+=%"F(;'!H5B=4B$=F>>'C>2"EA3.C(22)@$,8)#76G$*=<' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C71A21 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7477 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15206 42 251M = 15457 358 NTATGGTGCTCGNTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTNTACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGAACANCTANTTCTCCNCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGNCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGGGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCNCNGCNGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTT !,G+8DF92-8A"-G3<@C8!5A3E*(6:E$1>)-G0*'8%9A8.@B(>;)!&F0'@=A!)=58$H?!H.B<-&!/?#B@<$46$B*,+<()/)5=0/FG>>#7.029BGH$??"@>#6D,,>&)/=>-0#82-6/;@8/05;4.-"2-50!>>&;BE'=D"/A84;*-6D=*E*2=$/=-0#!1ABBC*7,B+2AC;03/?C@5H0G78F"6!G<7C25:<@"<7E4&.#8=;,--6@%101>20'CA!+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G11G43A30C3T6T35C24T31A1G2A54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7478 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25054 42 192M = 24914 -332 GTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGANGAAACAAGCATGTCATCGTNANATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTCCCAACTATTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTCTGTCCTGTCGTGGGTANNTAGNCGAC $(#(("%!&*!$'+)(!+"&'*$"%(##''+&+'!&*!+#%%#)%))*)!'!%#(&!&)(*+)#$$*%%$+$$'()*((($"#'%#)"!"+%)$'$$'+#&!&%!%##"$!$+("&#&%+!!#!%+++!)#)"%"+')!#')"#%!*&*!&#%"%#"!$#$)*++$)!%(!!%*%*'#+(!'!%($!#!%$( AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:37T19A1T73A7C23G11A4A0A2A0C0T3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7478 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24914 42 140M = 25054 332 TTNGTNTNNCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTNTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCT %)&(**%)(+$)#$+(#!*("%"$+&'*"#)%+&"(#+'()($)+%%$'**'"(**%!(!)%&)"&$!!")+%%+*!)##+)++&'"&&+#*#'"&+*)&)!*++"%#+$'!#+"')%%))'&%("&)*&"!"&%&(+!" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G2G1A0C25T105 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7479 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32196 42 100M = 32309 278 AATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTNTNGACAATGCGCTCGGCTTCATCC /+E';5%,@F56)>-)?9C+>+>+D"D+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75T1C22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7479 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32309 42 165M = 32196 -278 CAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCNGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCANTCGGTAACGCAGATCGGANNTTNAC %!$")''&)$($++()%''$+)*%"$*(!%)((&&"(!&')"(!)*%(%*%+$''&*)($$#!!+#+()$+$#&"&"%%!)$"*$'%('($#+#!###$+!!%*'#%%#+'!)"!)(#+++%*%'+*$)&""'"%+#)'$$+$'#+''#)*)(+'"*(%!!'%'$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:82C56T18T0G0A1T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7480 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8867 42 159M1D226M = 8580 -673 GGCTATGACTACCGGCGCGACGATNATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTANGTCATTACCNATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGGCCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGANGAAGATGCAGACTNGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGNAGGCGCTGCTGGCGTGNT C?$=+;.";-<'+#C9,?;8,E&"(056HGGE,927D%<*&4C&,B&4#H"'/45?.,+F%.H-C?6$C#G5+-.&9&(:3B8*3H5CE63=1A6D/(@B70G0C2$=(52?>93%,%4"FH9')D91%:D@G-;2-33+.C3.40F)BD,$8<:;#>5=##:1/.@,8B*A$3,1*9.'?!(>F'F93=&:06H$**C,'DA"?//.=>9CC"$2;:@-)*-G*)2#6F&9C2$"""D7-<@&!(%,8?&/?A=0G.&9#'D7!>8911;HG74B9)AF=<78(G8.>:C;C0(C/,2&DH++/5D?2G'G=81!5=,' AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:24G34T9T60A28^T113T13G20A58C16G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7480 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8580 42 287M = 8867 673 NNCTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGNTNGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGNGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTNGACAGCGATACCTGGCACGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGNCAGC !("++(&"$'$%**"(""&!+)"!$$)('#)$+&"!'$%#'#))!&''+'&#"+""$#!"&()'#$"'%%)#!$))*(#()&$(+#!$)*''')("!$#)!!++''!"(&$+)+%%*!"(""+$(+'(&'"#%#)*%+*"'$'&$%'*'%&+(+%&"&($$%%&*&&!)$!$'%&*&(")(#&&*)))!)'&$(("+$(!("""+$""#$+%**%*()%&%+"&#+$)"($*!&)))%"&"&*%%&$"*'))%!+"##("!+#$+!('$(&$"!#+%!)*(*&&!#$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T0A46G1C55C23G17G133C4 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7481 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21101 42 82M = 21343 305 ACANATATATTNCCGNATTTTGCGGAAAANGATGNCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGNTATTCTAGCAA %*''*')((!)$)*'$'#"+*$+)+**)!(*%"("$!%+$"!&**('$*($$)""%%!&%&'"%**'!)+**""!)*!!%+! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1A1A3A3A3T13T4C35A6G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7481 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21343 42 63M = 21101 -305 CGCGTATCCANCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGANACCCGCCAG ))#(("$")$*%&(*(%"'"!)*$!!#&)#!!*(!!*%*##"$$%*$"!%('(#!))!"$&$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T42A9 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7482 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17502 42 71M = 17240 -333 GCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCNCTGGGGGCCTACAGGC AAGA6)2=##%6<'A523;!16+3H;/!#,G%?%1E?"'A+F,E);)G.<:E"E()81C1);>7093?'51 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54G6A0A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7482 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17240 42 156M = 17502 333 ACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAG #-2FEB%8?@$-";,?.3$?)&,,;2EA>-9D'878C*14!@%<+1B75=!D+!('"/&35#5BH&FD"0,>8B4C.91E"><06&"E;0E5%<2/&%48:/C:6!4>883AA=!-'"=//A#+F$G@1''-$-,%=HAGB.F)4"!@D)E9:H'/C-073#>/,$06.7C2%,8H$:)4%##8495=,*$0*D==70%.D+:;/*B"CE"*"64+>23/%A;073A-)<'61BE4(A1$6<55&81FF4.*3=??;@A2A:)#,E*-6.@:336>.!)F6A&0/!$?*(C AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:8T11C7G26C16G53A56 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7484 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26101 42 165M = 26032 -234 AATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGNGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTANACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATA A!3?8@>&B/FB-A>AA.@/.:"B<%6F77@@@HA;GC?/@C->87%D94A,,+%-0@:4BE&#H-#>/:H"C>*/@@2,#:G:4"A%=!*+/'=D1%-,+8(7/:81+)B'':H@#"C4.,7-':1?G7H!)"2)+'>8-#.1.G)8(@+'&4",3=%&G*:%9D)+,E#0B;@;%:3!7:<2;GF=C8@-!(A5(&"+2ED/6+@##3E:3:E+G!@H@A$(# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C116T0T34 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7485 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38200 42 44M5I97M = 38044 -297 GAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTN $)%D0:5D+5!G7D&4+;<'(:G,#1A4;D@D@7?':D06-7,9=BC7&&B-*3B;1")%-.:!@=5<#+%-*)H%,8GE<'&2%/(44>49'="?H;>>4%E#.7H)2,E:9?-$''&+F-))/" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:140A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7486 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11886 42 102M = 11728 -260 GCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGANGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTC >!@0<#%-C;9.79-E6'55?3&/9.:,=;*6D7C=6*96&6#1/1($,F@$*AD:9$5!AE/<%:A9=D75"(##F&-)F%#!$!(,F2",2F-9-';'25 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A67 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7486 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11728 42 151M = 11886 260 AATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACTAACGGCTGCAGACGCCGTTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGTATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGA #23>26/')G2=?72(%"CHC-2B.:C,7&BF1"2+EE'A+(G.74$H$H3<,>?<'*1B#)/AA!*@+3;.4E##.5;B3(&!A:D3*$4B"D"$-AFDD'61#!!+;<.EC@=69?&3;#""&5$$:@,':H%D;"1:>>**5-+):48 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29G17C68G34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23358 42 158M = 23168 -348 TGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTAAGTTAAATATGAAGGTAATT .C#/*>C'7=81<<':.BB&)D%/#'*"7>';F?8"'&9$9H1%B--<&',/1D?0)A5&?G.)$E6#$+D(&F"=,8#97-H63EC5A!/664$G%1E?,9?3<$#=4>C0/#F(D#C>D!*D<(9'-<"7.<'>&'4$%,;D3%E2>*,9@8F8(-?A>':9:@:(?28CH(1+5(2'DD04@<=002*!@-&BG)"(HCC<$,$H5!3,4+'A'(G#!FF@.5A6-<3%G"G7D(5*'@2!B%>2-?*(8)3;?7"H9B6)GA#'7'*#F.'4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C55A47 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35692 42 119M = 35554 -257 GCATTGTTTGGTAGGTAAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAAAAAATANAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGANGCAAAGAAAANCCG "*$*+""+"*(*+&"!%+#!)#%**()''%#)#$#"$+&"*(!&$(*&)*+$"(&"%("!#*("&&&'!$&($&(##%%)*$+"))$'++#((!)#+*'$%&+!'#!"'+!&!+$"(&' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:16G49T5C31G10C3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7489 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25845 42 61M = 25952 231 TTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGAT 1#)9)3C%F->#B-#3;:)@;167;B(E0$6(28@%<>98C!/5+.E=0##78D%(DE>*6E.E&-@*/E(A-6#%B2HA(6D5D4E<7&:G1274>":*E>2>("3+;;E4B,8*/E#,4;?5:5'8!=)8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7490 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26152 42 127M = 25805 -474 ATTCTTGAGTCCAATATNAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTGTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATT C7,&GGH3*.!"0;!?8EH0.$/651.B***>GB$F!>G$%F;0&=3>.DD+)">B:?$FFD:,)E/#/':DG"$:,/*H,8B;:37DH-$#8F$"*$DA:1?@'0"/=3=*9HH5D#=.,-42?%& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A37T71 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r7490 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25805 42 347M = 26152 474 AATNNGANNANTGACTTTTCNCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCANAGCTCATTCGAAGCAGATTTTTCTGNATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCAGTACGTNTTAACTCTTCATATTTAGAAANGGGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTCCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATNCAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGC &&)"!'$(#$*'($""*$()!+%'%++$!+#'#%"+&&"((*!+(()$+%&+*"&")&+&!!#*##+#)*(!$''+*'&($#)!*""'"%+#!'$'$%)*#*!"(*%$#%''+&&)+$)&'(#&#&!+#%$+!$(!!('#&%!($)*&$*#&))%++)!+!%+()#)&"!*&%%"("((%+%)%+*+)##''+#!+*$!(%$('#**'$('($'$%%"$+(&!+(*%&#*#))''#!(")&+$")(&!!$!"&%)')*+'$&)"""%$'%+*(&')&!!*)!*"")!%((%'!+&"*%#(*##&!(!#*+#"'*"'#&+&!$#()#*&*#+*+$%#)('&%%$#+&# AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:3A0A0A1C0T1A9G51G18A6G57T5C21T1A29T61A68 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7491 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26782 42 117M = 26950 253 TTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAGGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCAGNCNAACCATC B54=E17""H";=+1@4:A95<2=AE@F11(='.#%69F5&@*)3@E.9@/3,C".!?+0>*#8'$(<38969#>5+).FF3H@"?:--6H>#E?5$"6E68#6($=,A)E1+#4!H AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76A29T0T1C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7491 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26950 42 85M = 26782 -253 TTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCT "8=D;!=<6.3?@@@??C5>@"9,?8#2:).!>+3:.(59B3<3#E'HF,**02@? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20403 42 134M = 20308 -229 AACGCATCATCAAGTGCCGGTGGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGCAAATTTTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCANGTCATCTGAAACANCAGCGGAACGNAGCGCCTCTGCCGGGGC +"$!&#$)#!''*+$)%(&&(#(%*!*$+("(%%$'"#"!#%++"%!"#+'(%#*'*%"")++"'#%"$)&+((&&())!"*&&''(+!#!+%(*""+$"#+%!"$)#)#!*)$!+!&*'&((++"*'+*&$'' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:21C27A5C35G13G10G13C3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20308 42 95M = 20403 229 CGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCGGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCNAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAATG 6CD+:<1A;,DE=00C0E4(-+((8;/)>E2:>8@*E!*D.84'3GE3?0<(C4,517F<3=.A-<=6;?0C+D68(;99.='97#5"1D9A(GD"%/2<3%?4,A&"+AF;&F7#3839A+C4F%.=E<,.686H5?4!G0"% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7493 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10433 42 44M = 10202 -275 GGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGC 7@,CG38!1G)G>$1?"F6!9D1F8;@D%>1F5C"@55$+(F05 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7494 113 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15867 40 356M = 30 -16193 AATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACNCGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGNCGTAATTATCATCTGCGCG >)>(G5"=,F&&$#;3F?24,!=':*'82A"-8D7>-D:%F.$3'6228D47$1+/D8%7)C='!'16'B06??="+5(.-H9&!.EH0F1E(9,-18)!/$1/999!F(E#>+"(,('7*%+E0*+,07EF'+);H,(@3!<24.!:)<:4=CG<:2"&#C1>FE$:>!+9A!@06#B=.C/3>E!DHH,;F&'=6'8&;>#0$2;2%?1$5A!0*>H+,!="H-!#"7F4AD0H/>0BEB@8F96G=B!1*8=67DD="F.H51<,A8:0!9C');@%>-)7$F&%.%6+*+':=@022/BH((H?F(,?$F+9F9C<$+<:948/A9G@?$:7%%C050C/;2E***C AS:i:-56 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:20 MD:Z:0G0G1G1A0A1C0C3T0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A251A55C19 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7494 177 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30 40 73M = 15867 16193 TATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCT /#'=1-9.?6!&2)5CF@D>9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-56 YT:Z:DP jpayne@0: r7495 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22823 42 134M = 23100 317 TCCAGGATATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAANTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAA '''%"'""((('!+")$#'+'&####*""!$&+!!%#%)(*%)""+"%+$'%*)'%(!(++(("%)))*#())'%&(!*!""(!&+#!'"+("*$)!&&&!##'"'!$!$)&)!)!#*)#'%)&")&'+$*!"( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4T2A58T67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7495 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23100 42 40M = 22823 -317 ATAACCGTCNTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCN "8B);/E:E0G!7*@G'!(877;=<*:;/@)C1$E/%G->%G:8D3;9$6G@5C4B!'@&=%2( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49C5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7496 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10024 42 84M = 10192 223 ANCGNCTNNTTNGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCNCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTG ('***"$%$"*&+"*((%%*)*!+*%+')*))"!"%'$##'!(!%(%!$*+%"+"#(*(&+&&%)#&%%$""%(#'$)%"##*! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C2G2G0T0C1G29C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18421 42 294M = 18715 767 CTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGAT GE0F+5=2'C,;*>EEF6?4/'7FE'7/<"-F&/,-6AD&$,7A5'1C/"C,80"5B.%G.BB?+13E0;F>?+:651H8C:-A'G<#7!*"/G?=8!7;6'2'+=>-5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:177C116 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18715 42 473M = 18421 -767 GGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGTAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGNGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCNCTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTANGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTNCCGTCGTTGTCGNGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTT 2C*&5+9GGH&'6B)")B)(9'%C2$7B7B<98CH+/$A.<"H0;>4!3E8276#!9($2,:#%'(%11"/<"!'3!:?D2:"H+G)?5:)='7&@=$"8.2%A?4#7!5GC8'A>+6*H//>95$:9%9B+1,;7()('5-"A:1C&>.F3/>-,*DC)0:-6/%D"2.>>7BB7B(#"?A$%(B?39&B'&&B'/&"84B(''1*#>7)=B9!B5G8'.&F>?E7FGD'F%%)?>($,CD2FH.&/.E"*?>@!=,*$!!4&D?"@@EB#-9!D=G(+0F9"3'-:G:4::3"C7+:416@7&@=4$2/< AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:212G31T43A52C33G12G84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7498 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35373 42 93M = 35240 -226 GTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTAC A2G$F(C"D<0.81%"-')45H@"/76!DB3H1E23(<4#E(693DE0($>+BHAB+.$6)8<-/6GF?95#D7B#6*!";4,.>'6H6#@23 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7498 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35240 42 72M = 35373 226 TCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGNTTTNGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATT 5@%?1:;<<:..*<;#23.246*5=G"CE366GC$,$$A+9$24*#0E#<18'+&8&9DB@=3'6362B"D( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G3T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7499 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41320 42 44M = 41155 -209 ACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCAGTTA =?>1,7CD7@).HA;$#AD"24)D*"0'!'/!E1.A5G8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T3 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41155 42 18M1D104M = 41320 209 GGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCNNTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATAT @#<4+#E+05E+503%/4D!?4G2(G7A:G*H;4'-"61A+9CA:0D=%!(-#)))?H491'!,FE.G)-:F9AF:/)%&-E;%>.7,-*G6"$$)/65 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:18^T43G0G59 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7500 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2043 42 48M5I151M = 1816 -426 ATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCNCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGNACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGNTGTTCCCCATTAAAGGGGCATNCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGG 7&+.#>D8AGH-9B608C9@>/7/3E,#:4+<44;AE*$D>66B$.G@+"=5'E)7@:?H=E%*:9D(0H:D1:-!?!8:#!3,6)A5F>&G#9,D6G7"B3-:@6=.32-68=A*FD38B2=7(18:D93D3/-!8C*#;A),0"1FE&;)G7>),8&?G5+B>2.1=6*..C>%C0#)A4%"%05,4H/2'8B,6"2; AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:80G13A28G2A18C53 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7500 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1816 42 227M = 2043 426 NTGGCGAACGTCCGGATGCAGAAGTAATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCNGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTNTGGGGATGGGGGCNGGGTGAGGAAAGCNGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCC $1&>.-4.5+F56*=58,0.;+D$@>$0H*$6#4;@G!&6#>4>%1;53E!FD4C*$*#+$3#%&/@?:74@-&8C:2@:*>5##C2GD,@2&(!8C.6.7)6+&?93&E*#(C";>1=2>D6/:+0:E3=5(*'D./GF++'/;F!;&F>.HB&)82@/5$%81-/2)>' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7501 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23653 42 90M = 23499 -244 TGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTNATACCAAATG (C89/5$?;=$$,=0%?F2<#01#9<,6A"D!5'F298/,7:<8$4B8HEF<'50,9%0=/)9F0+$A"-C-7>A7<46'3(39)B85+$!0(G&CH@3<#*/-,,7%H$4CH2+=41 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:140T18G26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7503 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24271 42 133M = 24439 243 CGAGAATTTGTACCACCTCCCACCNACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAA #G!B<%@H!;3/#41".91$*277$)4E>-%H!A?-30@3%3>)':F?6&E5>G@!4!3F0.7-"G1<;C:;=>G"-5-1(D:HA# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A23G23G84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7503 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24439 42 75M = 24271 -243 AGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGA !"1@>)CAEH267G"-81&%0E43"()6/GE1E:D;"-C)10*FF@'@:=.<+B9G4-?-'9':C.$9+/!7HDH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7504 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35466 42 50M = 35304 -212 GGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAAT +*CGG9$5"5!48$H#:0$G)&GA":$$<0"2';)&,1%&(&67'/0?"= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7504 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35304 42 50M = 35466 212 TTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTG ')(%%)))#&(+'()%!*!""))+#$#+%!!'&+"'(&#*)!!"+))))' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7505 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47898 42 151M = 47814 -235 TGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAAT @<=FD:6:@.7/3(697(4DE.:@!-.<<8>H5G-:;B6GFD1F"2-*',3FG6=1804GE/$G#)4)/(CG!&%B0-%"C/1$CA1566;D&%8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7505 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47814 42 69M = 47898 235 CTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGNAGCATTCAGAGCAA ,/F?+5>@@!BH;A6),-F@''$>'>;=?;3;'/3"@>7#31.-&C:#!<2+,H5?12B7"B-/-5,?: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7506 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14084 42 181M = 13995 -270 GCATCTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCTGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAG 746:@=+0-"%3/H6><:5*++)5+'G"&5:%#.E%D4&-A";<'/A/=H>$9H@D,G6B$*5**<"<%04/H'H0:C)=6(@?07+>-E@?F,)9=DHGB+9--?G7:*DF08.E+&9;D>05(+DBH#?:;$5C"41@=7F64)<6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A95A81 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7506 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13995 42 60M = 14084 270 CNCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGNCT "*+*&#%)#)%&+*%'"')&$#%&&'#**!&)("&"+!+)!)*+$&!!"*%)"%(*%%!' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G55C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7507 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2247 42 70M = 2475 271 NTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGG &9>E-!$D/! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7508 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4513 42 135M = 4377 -271 TGNGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACANGANCNCCNNGTTCA %(%()+!(*$%+!**(($'+#)%"+"+*"#$&'()')'"(#$'(%!%#+$*+(&$'*!'%%)!!&#%&&$&$+%'+!)#"$%&%)*&*#(#'#+%"('"*%$"*&%)'!("'"!%)&+*'""#!"#"*#"'$&)) AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:2C117G1C0C1G1A0G0T0T0A3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7508 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4377 42 136M = 4513 271 ATTTGAATCCGGGCNGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAAACTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTG G>?3>,'=(?/>&#C3(0FE3)C"98F>&!+).::A:;=+-,48H)3CC2DD+E"9"7:$@!AB#=-%"F4H#75$=%DD+@%!8%HAB-F*6@@/*:>3//@@(6E14.'3222;D/69.GB!&!<8=0#1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A24T30G38 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21134 42 109M = 21005 -238 GCCGCCAGCCTGANTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGNATANTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGTTGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGG 3!?>71%E"'+G@39)/F5CE#.>G4/GH/C3#145.'-4$!:G6>/0F&%/3-C<.!09!A?%.!5>FE.4@4-#<8/G4E;(81%$*.(*3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13C22G3T23A44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7511 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42130 42 132M = 42348 298 NAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACTGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGA "80@%H3+74G-@+D4AG6B%7@!3+-H0=;';1.>'@-:#"F!"7D%G+=<4/@?1AC05-7A>-95672@0E'>=)4)>HC5<%1031*AC9>E62.$4C;6*,;%GB/9G6(=G(E2?3C;?F73<.20 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A87G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7511 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42348 42 80M = 42130 -298 ATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAA E7>=A!>:#%@>#-7G.C93;B4"D,GD?@&5!F&!(<#=+/2-()@"(26AG:-5#,!@.9$-5'DA<3#8>9H'83/G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7512 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5708 42 89M = 5525 -272 GTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGA .'E310+@5/8E;F%27E3.,?9*$0&16@A8;)C'F3,F)/G/0A5A,!"'"B)8FFF21$6(D*>7:>H@114DB*&AD==;::@58 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5525 42 104M = 5708 272 GCNNNCNGACGCGANNAACAGGCACNCNTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGC $$'%!(!*'#%$'%!#)''*(*&)$!#+%*!$%+!$''))#%&$#!%+*"(!"%#)"'!*&"!('(!&)&&('%$'(#'!!(*"*&$'#*#!&&)%*!*$$)'* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2T0C0A1G7A0G9G1G76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7513 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40485 24 78M3I49M7I18M = 40663 295 AGATGAGCACGANCCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATNAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAG 5'2C6"+.8(083;6-%H$@>)5?)?:$B'3;E4@0%C&@7!(E94C=+9"%B@/D"E2,:GH.A>DD&-%A7633E=GB<$5"?/$HEH"<3)10GFAC+DF07@,'(,"%?D*GC($?-�)"< AS:i:-51 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:10 NM:i:16 MD:Z:12A113C13T0T0T0G1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7513 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40663 24 72M3I45M = 40485 -295 AAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAA >DC4.<*%CCG-,D8@H%35>.2*3G.5HF:1H841C$@D:!)62F,>-6H+!1F.GE0$729*C0,ED+>&#:*(?=9,A=FAGE1F1=A:(85F/$2;>;;.>5E%;:H>F82:" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T20G42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7515 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15114 42 84M = 14941 -257 ATCATTCNTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCANCATGGGGGGCAGCCATTGGNGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCT !8$#&;$8:)0:(-=4?6$CD-<20??DEH>59C5G@.@CH-&&#'%&:306=%G<38&'8EB9+!0>=.*.#AG'2D<;/%G<*B:$<,-B*:(<@5A;&F5:$>B3FF612+&>+8!01$2:$%&C?H)+20A4%@17'<.HG;266'1<0,?<:E,*"A#5&$C4<1(0D-(<:> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G94 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7516 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7408 42 169M = 7577 300 ANTNCAGCNGGATACCGTGANTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGGGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAANGACAGAG &)%"&(("+('$&$%#(&#")'#+)"'+)+&%!#)#)&%+!*'"!&&&"+!*)"'#"''#"*%!$+!%)#$(&(((!#&!!$(($(!*'%#"(#$)&')#+")(+!"$$""*+)&(#'")&"!(+#()&)&*$"$#&)%('+$$!$**'"%!&("##%$++*%+)%*%' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G0C0G4C11T83T56T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7516 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7577 42 131M = 7408 -300 CGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGT )@9)(!&3F@%><+A0H860.F"))%)5DA0=D6.(HG9;6,B665%!(<=.0.'!!!!CA@3FC1';'/"@(#>E.F4CF@5@)"&>>*A:350,CC,$*D(.&.DB!@;6@2'B2A662%?8$9'3%<$+8&+E?$3GG73)$?B-?5@/@$:8H%2G;5A=<.#4#.D5!A/4+@&3&1D?18?7/C5@:#-(6&$<3>>5B/"8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7518 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33269 42 185M = 33151 -303 TCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGG /"7@*62-H7'*-+*E@8!;2:+#-5;++5E'--3BE9?&A-.((.H'=9)%?-#7=:94-F)(*2AC,>6?-?G$&A!HB'1>0.>=6>+C.>G>%+8$+8D!B&/GH$:@B6=$H*#58&">0HG01A9@1$24/4E=3097(!C2+?.'D&*?C'*@#8> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:185 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7519 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34411 42 54M = 34465 205 CACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACT B+%0H-)#H2@#814+)$C91!$+2<1"4B8<8AHEF7B1+9E+#E2G%)C8F9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7519 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34465 42 151M = 34411 -205 ATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATA (.'2!H46().+H8CDH8,E/B>BD@.!G26"C.#$"2F7C:!B1':334E%D)-"<425<=$=7<'0&"?CFBE,#&2,$9<;H5B,4139*#6H< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7520 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36256 42 173M = 36524 309 GCATAATTACNCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATCCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCT >6#(:8D:D9/H4E%+HDF70!@=?E$D=*C&:(0-9/H8/=E#$"02*!:4@*+*&5;F3<-@.1*C.E)F#2HCHCH!&8//6.:9A%"#2:,?>)B$"=$0?77+05E%#H#=6>2F0.0#$4&-2E-<-&8&"+BC9'0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T45T116 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7520 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36524 42 41M = 36256 -309 ATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGT $2)-@-"E17!6-'&35+C3F@.)/64=;>B5<, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7521 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13919 42 58M3D110M = 13919 0 CGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTNAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACT C7H%(--FB$H'3,&+B*3DA4-9'701D42<&H3:<)=1)'33.:9/%'+59F=<(65:=FB<';'H#6@E#C/E?A1F'14G!14-8<'<,;;3H)H;!>%,@&=&0#75A?3!"E/:8<-*4@.7"3B!)9.?@:-@<+A?F$0;98G"-6>/;><*G6/57B4-:()-H,?$/:A?,-@("6&8%3#887%?>2H7%<)78*F&/?%5'<)+E8<3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7522 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38578 42 200M = 38778 272 AGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAG 310A?>1B2(3$>82.>'1B132G+)E8F9,217(HA2>)62#)3(!@9/7%#!C36>"0BB#)!(H:E=38,FB#E)%A$&,5%--,.+(+:91%C0$8-D!DD@$5/83=&,&EH@HB'B$@;&:>4$>%=A1D#)%$!()EF1%BC/!"",;:2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:200 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7523 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37222 42 235M = 37457 385 GCCGATCAGCCAAACGTCTNTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCANTNCATAAGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAG $(A2=C)F-CFB*8,&B2FA&BB2C%7)7:&,48(G,'33=$=5:.6>9G22(G9?;-BH>)0AH,1B4B%2:!<*9;G:0A+%>CE(@%@($&6F?1"<#66/!)GB9$?1@BC(=4(84<&-F7@%$'04E.5E$>%*H=++&DG#43:5G,;181=<)8"9D!;=%D(;CCF.6E&"8@(!!6D@GHF(1.D4-B491+:73,$GF(8- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:19C49T1G3G0G158 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7523 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37457 42 27M1D122M = 37222 -385 GAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGCGCTTACCCATCTCTCCNCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCNTG #8&,64D,(?.4;B8%8,#D>-H/.@4A-+2,0-AE4!:=%"H3/H&4/4.*%77C?0)(+7'B61@4(4&*=--EE16-19FA*=&:,"!?>:33"B<48);!HCG8H*%*2-HA@*C%2"&$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:27^C59T16G42C2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7524 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21786 42 112M = 21584 -314 CCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGATACACCAT C'E-)->2.F#C<@)@0(=C11),%'?@>8+D><<;%H?H5%?&514'G"/*=.9G!+6D"6G$CE*>/7'6;8"!4@*'0C.,7GH4%,%A$%)#&7@?'(84)D$*C?6B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104C7 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7524 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21584 42 98M = 21786 314 TATNCGANCGGNTNAACAGNNGCNGCNGNTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCAT '&*((*)$))$$*##''*(#!($$(%!&$+')+!$&'!$&'+%+$&&"*&#+!*!*'&)+&'&*$$#&)(*$+&+&#%**$!!&("")($'!*"'*&# AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A0G1C0T2G3T1C5G0G2C2G1G69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46175 42 69M = 46016 -228 GGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCNNGTCGTTATCGNNT (&+*$*%()"(##!%'"+%"+*+)!#**"$$!*#'(&)$&&''$)#(#%'!%"+&"(&%&(!&%'*%#$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54T0G5C0G3G0T1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46016 42 147M = 46175 228 TNGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAAGGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAANTGCCAGAGAACTGAAGCTGGCNAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGC %)$+)!***!(%"'$+&)&%%'*$$')+!!(&$&"))()!%$)$$()+#*)!'"*&(&#$+")!&&"#$!"&)&*!(#!&&%*'$%)+$(+(")%+#%$*$&*))#'!!*&$(!)**&!!'&#)!%##!*!"#%(!+'%%!#$'&'# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0T34C31A21G56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7526 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38102 40 142M5I15M = 38038 -221 AAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGAGTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAANCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACA 6,EH2)F(BC*6'#!:8GB,<-$3H'4:E.C;"*(6%-3D(GC='D=<>'@<$9&92=/97H098$*'D5C/,B'(D0#2(&4*&3/98,.0499C$!B4G':6=G.H6';**D>*)8,B!$F* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T28 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7528 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5696 42 80M = 5561 -215 GCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGTACACACCAGTGTAGGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTA )$$)&*$$'#%&)$*##)''($'"&+"!#()!&+))(%$!*+"%+%'(!))#*!#*"%!%)&&)"()'%'&$!#+$&)'+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A13A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7528 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5561 42 121M = 5696 215 GAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGG 0&D894>4HD.6='+10E''%1.)HC9)GBHD',7CD1&75@8!37?(D56@#D$$1?G&0E3;7)40A>DA3FB4-+-$7;#(%*2;"$58(;/B?56G&BEG46@67E*7B"-*9;6D? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7529 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16909 42 117M = 17183 334 GCNNGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATCGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCNCCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACNGCCAGACCCGGACGCTGACGCTC (%$%++&$&'*)'+#)+'("&%)$"+'$'!*""'#())""%"'+%!"'+**'*)"*#+*+)%)**#$'+"!(%""!(!))'++($'+!##"(#*$*!)&#!(%&*$"'*'#)"#%!% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A0A0G28T33A26A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7529 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17183 42 60M = 16909 -334 AGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACG 2(2".A*=:5G@.A-3/!/-#+"??!*";E#29 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7530 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38005 42 144M = 38251 308 CGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTTAAAGATTATGCAATGCGCTTTTGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCA %@4&0G>D@F-#+.=3DA-/'<81(A1+6'7/#+5)#EE57%D1E2D8?,*1H3?,1C$C36->%130;78!+$H.E9"F3,+2'.-1=>B)>)%@!F;F<%B'BGA3E1/.D0=+;*&= AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1C53G21G65 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7530 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38251 42 62M = 38005 -308 CTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAANCCACACCTATGGTGTATGCGN BA6!>,0G/%AD4#?A>-1"H&'F2.29>7@10/4+892(8+GF%).AE#BE<8EE#CC-(" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40A19A0T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7531 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32621 42 161M = 32857 284 AAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTNC -;A8/?4)F0G%#4?A944FG#+2><@HH<&E+1)-//'3@+")33%&8-9&9-/G.2)$*#HD;2@:)D9>1'9(B#'7D*>7C&!=39*)8>")A4G,5HF3"2!D'94;56D1#*3%0%&6+6@%"<1G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:159T1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7531 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32857 42 48M = 32621 -284 TTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATCCGNTCCTGAAACTCAN "&()%'!##&##)%)&"(&$&!"$!$*#)'+"'$"(%(*#'$'*)%(! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G2C12A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7532 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30099 42 90M = 29970 -219 TTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGANAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAAC -@E$G-.'0=*>E%8$0-?BG=*3;6F)0A9+#H0F'%&!6G>6<7E+A15!'$?)>D71!$)';4.A9%).9>?6E#+D(?@,-7E=G= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7532 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29970 42 91M = 30099 219 GTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGNCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGA 92&&CC/!8"$>AB4%139GE++D@1*%CG7F9.-8G,'3:#H#=*4.=E45-7519.9'GCF'/+?<;%*DDC-<8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7533 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17057 42 51M = 17057 0 CCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGG #8?%GH;8..9'G=!17#81'+((,2EE/8*BHB8#52(*,.F>/D,#-5) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YT:Z:UP jpayne@0: r7533 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17057 0 * = 17057 0 NNCNNAGNNNNGNNAAGNCNNTCNNNGNACNGNCTGGGGANNGGCANNCNNNGGNTNGCNCTNNNNNNGNNNTCNGGTGNNAGCNGCGCNGNNTTATCANCGTNNNNTCANGAGAGCNTNGNCNNGCACTNNNAAANNTTNTTNNNNTNGGNGNCGATGACCGTNNNCNNNNCNNNACNTANNGTCGNNTNCNGNNNNTNNNCAGCCNCNCNCGGACGCCCCNGNNNNTCNTTATNNNGANGCTANGNTNCANNNNTA $!"!"###!"$$$#$!##$#$$$"#!!#"$""""#$$"$"#$"$###$$!"$$$"$""$""$#!#$$"$#$#$"!"###"!"#$#$$"$!!!"##$#""!##$"$"""$$"!#$!!#!$!#"""#""$$$#"##$"!!!$##$"$"#"!!$!!""$###$$"!"#"#!$"!!###"!!!##$!"$"##"!##$!"$"!$#$"$#!#"$"#$"$$#""##"#$#$#!$#$$#""#""#!"$###"$!$##!"$#!!!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46710 42 124M = 46567 -267 TAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTATAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAACT 11"1#!4-(A?9,1B&A6,C/9?0#%.'5""#.GDG:<&%H7&F29.>=3,&7F77>5..!(%=)D4$F03*A!6<1,<)!?H+4C1@3<%2"0*6+$$0,"(1/D<8=%*%%9)1?9B6('0& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:86G35A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46567 42 72M = 46710 267 TTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATG /D7A*A%?$'7FH-5?,$C=#8#-:'>$=.!2'BH%,<9?<+4F-%,-C?03!$/>=@(;''2-7(+$)+F@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7535 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5099 42 193M = 5292 361 CNGGATGACNNCCGNGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCCGATGTTTGCGCNGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCNGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATTACCG '#%&)#'%)!%(")&&''+*"(#(+$%(+$*$'+*$'*(((+&$)'!)!*#(+&"*)!$!()#+))#""!%'+!%"'+$$)!#*""+"(%!&%)!+%%'*'#!$')")#'*())!+%#!#*)%)()&&(""+$#+!()+$%"'*(%'*&"'"$"%%#*!%&#"##(%&((+#)!)(+$&!!#(&(%(+)(((* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1C7G0T3G34A11A23T102C4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7535 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5292 42 168M = 5099 -361 TCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAANCAACAACTGTTTCAGCCACTGATTCGCATGCTGACGTTACTGACGTGGTNCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACG C!F/H"1?0G@23"%55!)%4E.4*H6)#3A%H7'1$1=2+*5?2B#%?:)'7")EG.?-DG3>36;$%F1@19)173/'&380(#@4>:(#*/+E8"FD8(?%>6.E<402)F2=E>*6@8%-%6)?7+(>(FEF&7HE;<$=,F;A6B/>/<,A"45G?F+4F-?0:C3&G?3!)#B'@6G&+=AAH=GGE75>6D1+)@AD07DF&A0;@A@4&BF?=**13-H2/2CA1HA*%.>@.!+3B4%',""&67 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G160 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7537 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4757 42 140M = 4666 -231 CTGCATCAGGCTGCCAGCGANCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGNGATGGTGGCGGGGGCATTTGNCTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGC )$%''&&%+"'$)$+%$"+*$")($*)&&&'%%("%!(''"+)*!**"&")!(#$+)!$$"*'"!)'*&!&$!'("+($&)+'&)%$*&&#!$&'&$&)!&#"""+!&(*&$'##&('(*+#)'*)&%#%(+'"("%+%) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5A14T43G20A54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7537 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4666 42 91M = 4757 231 CGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGCTGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGT 7=&$,#82;%:G!/8./0ECC-%8(2)BAD93A8=E-*+;;&3;@BG09'H8D;C;G95GFE<1C!:B#@>G#6&6*&;BH8HE'9->4"5H':,7C?1E=G*F7; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7539 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11758 42 65M = 11959 249 AACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAA A4G8,/2:5B.A!"E;G(CA7"7;5819E+#7:!)!72;*H%2'31"3H+B@<-B;8G8=#%D:H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7540 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48238 42 116M = 48015 -339 AATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTT @,0%2?(H,#G44D<=*26@D)EGAE6;*?=&B!4,!DD895644#G7A&50.+2>'E=E&3'48'0BEH!=%2:C/)6.D4C+3:*F=.HF;:+,)1@(H,&ED!EH'H>;!!,B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7540 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48015 42 223M = 48238 339 GAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCNGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTC +3,BB.(:?3',,<"D5'4#0CA$'7-'3>93A3*C59,+=:2?+>9/!G=(>H#"&A83"&<=('+3*AD2HG0BG+)<4-E<3:A7>5#G1?'E.:;5-3G>$EEF;8A"H@29A@!@?(7/!DGD<"658&$/*/5!>E$5H;D?FAH($A&:H=778C;.:H:G$4GB-.D.A9F5#B(-H3C317@H*?3,91(&@@7H2A.;E&<8=;F3H.4:9,6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87G135 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7541 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13263 42 134M = 13263 0 CCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGNCTTATGANTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAG 3@41F-E.GC?%G?2'*C@F6"16';H.9(*A*A=0-ED<'427>>)3=AA<0B,>.6F!)8-8!&.$3%$D//-79B$72:>;2!7H3'76C4?@=7>%2@78(E%905'0,!)<=?8C8!:8$>"DA?BD85 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62C7G63 YT:Z:UP jpayne@0: r7541 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13263 0 * = 13263 0 NTTGNNGNCNGNNCANTNNAANNNCNTTANTNTATNNNTNNCN !$"!#$$"$#$"$$"#!"!!#!!$$$#$!$$#"$$"!!#$"!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7542 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13803 42 108M = 13595 -316 CGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGC &%@3H0A8D'@5E#09$G6?"?G,G#-A#&2$#.*H62.309?4=35%!>4.1D4,D6'44H"1B./'*<.G.(?FH'#'-96,,14D"9(=!7/BD9=-<47=/2H= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7542 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13595 42 208M = 13803 316 NTCAGCCGNATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTTTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGC !,,B87%F?*51;4'7/?=*A=<2435=G9E(GG'E0,!;+#(E<4>>6GG#B>8E2#8"A.347%'2%8"'6BF0( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A7T161C37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7543 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28854 42 60M = 28854 0 CGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCGGTTAC 80@$)B:ED!D)%90GDH37;%#!?(H1G567>5:+D=,97*G5,;%0.&4**&=*@;>9)<67@F?C,H:/0>?2+5:#04D',.(E9EB>1%<=#69/02F8*>016"-$%<@;&/H)DFD0?!4B7$6B')6GC5@#,(/<&0!1"%:+9/#-#1&"0!HE(>2))+C"70F<;86$&2,H;)F&F)(4/.F2CE:8!ED()$=*/#CG7*3$$*&D=0#2;!=149!A/4G):H%34&E&<(&B.3)"4$?"89@C'+60!4A?'>*+'$+8;>E)5>A5G1AD#/8#C*7H""#*,/!)++D:B8ADC*-A6/?2 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:22C18A97C27T10C68C6T138G14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7544 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18742 42 43M = 18785 451 TCCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAANCGTGA 0!C*$FG&7H/"5>G7(7+)D01%H:$8AG'(4&+0'.%A,+&*B98F.;,$433=(.>?6E<8F@C!4*!((>1=#H;.0&2-.%3+(:.H))=6;.+GA$,;":./5.5,B0B38B;/"/:D'4B5H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44559 42 44M = 44419 -184 ATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTN (:?2@*>',,!18//26:'B71D50D<,47;?(9@*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7546 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14184 42 99M = 14372 251 NCGNAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCANGCCGGAGGGGGAAAGATANTTCCCCNGCGTGAATATCTCCGNTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGC !#$!(*&+(!(*%"$'(+!%)%%$($+%%(+%*)("&&+)''((&++*%%&&'+%%%)*$$%")$&!%'&#"+'#!&+)%&$')+")#!&"##)*))+) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G2G24C18T6T15G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7546 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14372 42 63M = 14184 -251 GACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCGT !E>GG8381D7)$@>;6.AB+4<:04G..AA7C&40)B*F-"@@6-!(:C7;G!B"2GD?('5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7547 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44408 42 120M = 44563 289 ACCTGGNCACGCACTGTTAAGCGGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCNCAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGNA ;;+4AB52C2:743A<(D,/2+"8CF*;#*=-.-9($/C/+:;)E71$/B9>*G+;8F#.6+9'@#./&1+*..$=*>/,233%$<,6.H1(5E8*&.EC316CC3&7H)#7*)-,%H-$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T15C29A65G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7547 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44563 42 134M = 44408 -289 AATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCA 8@#=)%F"%D9$'9<22/E@7D7A-/(/@1A(-HD#0)'B&@@4A$)&D+%F24>'/?$$(C,?-?=G!=64#26E(<*F>&'*,G/&25/6+527( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7548 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41145 40 28M1D40M = 41286 233 AAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACAT 6113F?"F5<=(36;;07>-<#+1+6B">B$?6'>AD>90,+HE0B7E73=E5&$" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:28^T40 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7548 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41286 40 92M = 41145 -233 AGCTTGGACAGCCAAATGGTTANACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGATTGCCTGTTCTGAAGCCNTNCANNNNAANGGTAAAN #%'+'%"#&#&*+"#"&!+*(**"*++##++$$#"(#&$(*%!$)#'"*)""%(&)$+#+#%!+$)(#!'"#&+'!"'!$"!"$*&#$$#*( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:22T33A16A1T0T1T0C0G0A0T1T6G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7549 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23726 42 202M = 23928 247 TATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTNTTGAATAATAAATGTTACTGTTCGTGCGGTTTGGAGGAATTGATNCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTCTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTC :)>,H9@!,7H??:,&5;B::-F?68.4@#.H.E&6B;6,;E(2,D8HE8;7((,!/7%%<#7461:@C(?!*)+B/CHBG,*;BF"@G35%/8'*A&(EA=$;'72$"*E!B(3+?H/@#<%,+ED+C<(B785:5C#F+>*%C*H?*E!9>FC:*>9'?1$#H5-B*%3%0=!4.'2387AC9$H,$-.;/":9,#8%"6 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45T23T20T81T29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7549 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23928 42 45M = 23726 -247 CATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTG 8H@'-(H27:+9,>+57A0-"HD1/;&9$1'?+H7>@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6813 42 95M = 6934 205 GAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGN 1@&D89D#1G#4$3A<9@1)D,7.G.;4;"=875-#(!'EB6&'++84*D!==1HE.),(E2>50=D">11775H'%EHA+/E>5#<#&=0G<:1A!H.1CGA$725EA58)E@DD%7.85E6=7($:@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T0G0C81 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7551 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10164 42 271M = 10435 336 GGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATNCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGNGCCCGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCNGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGG <(-,-=+<6+//AG?$(:!;:D<+E"!,!6,8-@+H5+@?F*>-3+@=DH*G<250/?5B;/.+0<@F,1?*>(H2$>C6H7-'DFE.')7$<0;C0(&BF.3%>('C1,DE!G&H6:AE)6-7.,=B)#.-97G92H8>1A#:E:-<#?9A$.E#&,(3$0!1A&&+04A/49,356+2D"",7F?9:=( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7552 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39871 40 237M4D11M = 40123 308 GACCATTTCTGCCATCACCCGGGAAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCNTCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACNACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCAGCCGCAGATG 9&EC3-=(4=%C0;AEF5@9%0!??:D)B0E/30!3C!C9*$7(BD2*5C4*H-*F75HC1$8*;77?2F5:CG=B+2C!379/!6F6>;D@5.'AC0(G>!/))G:(GA=->7115>>;/.91;.6B#H.2GC%H=+005&ED-*'<7#97*:2*&E(*3A),0C:!7(07"+(%6G"D#3*G699.);3="<<%1(#:""03'3(2*2-"##,0B*'FGD*".?#23)=6$?F::D=1,A'+=6'2#<0/"'E.<%+BD.7"F*3/)@+3"C2H410+F1H(B78G,57B8F:8>$)%?;8<6H:6*=H7'BH'6<=$(61>"-!+%6+E2AG7*$7C0H=)&D;AH'>"0.?9'9.8'>%71//4)8.;3$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:60T91A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7553 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37842 42 46M = 37969 280 NGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGG !3*&"'/6;-B/<$:%+G>6#<=G?:(;A,),'!%CFB441@//GH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G45 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7554 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10091 42 111M = 10285 253 CGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGNCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCA 1)5"";(;743(8*<@9G;%?H%!@B:,?97DG;8;*".!H!-=E.F#@9H=E2(.)32?,:)?>?FG1):)(.8"&AB89)@FE60;BE$0?10!<>1=>DE(&!4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G9C18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7556 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46926 42 287M6D13M = 47232 352 TTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAANTAAAACGTTGCACNCAGGGTTTAGCGCGTACACGTATNGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTAAGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGAGNTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCT '+9;"8A43B8,@@385/;A4HFBD4>F.4F<;9="=D+6DD6EF(@''-1'0D'+0H50893:)H6>A7+!2-)=>E,#/8G#A=61($1/*GE!99<&5=?%357E<$7-HA2)!6=19C,2/=!4:&C;@:#C(G8"$0-)E?C?@:&&=).E;)4(9+BG.46@(1=">87=?DE;0!#H;2F?B#HB#>&F"=@A=850=9$BB().=@,9=G5)$:G@!%1%-:"$-,.$%':+'26:@8=G-8*(;)>*=;/6/A&D1??HC$3(4GC=G@&D:(3#F@#.7)4 AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:13 MD:Z:26T7A5A23T133T47T0T39^CCTATC13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7556 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47232 42 46M = 46926 -352 AGAAGATGCGTGTTTCTTGAGNATTTAACATTTACAACCTTTTTAA 0'==.,:1,/&?0;EH%5B7(A,G5:D/@/$H73,@,;893@2.7$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T19A24 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r7557 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4603 42 71M = 4776 293 ATCNTCCGGTAATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCACTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGC $)&%"&)(*'+&)'+(#+)'+"()!&)*!+)#%%*&++$+*'#+'(+%#(#'!'&#*"!$&'##(!$(%!' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T0A6G27G32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7557 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4776 42 120M = 4603 -293 ANCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTGGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTG ?F)++1.A5?'*&7D5.0;+,-AH.*EF1EA;=7)H"37H9;).#*<>G.'B7)7%C7A,,B86BDG%9/,::F1#/78--6')F!!GC&(7BHH AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T23C94 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38801 3 101M4I14M4I2M1I11M = 38689 -240 CTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTGTCGGATCACCGGATAGGACCCGTAAAGTGA 02%'%<%G4:';B#?H@@E+564E;$6(!)HCD@<12!'*$/0+21F6<,&?($$H:813"8*=$;3C!B;B8*6>'*>,FE9) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T190 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7559 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25542 42 106M = 25351 -297 CAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAGCACCTAAGTTCTCACCGAATGNCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCGTGACCG 7A,@H:B08.(=H.H-9&-/,;''(B@/CD+<4AB:'$)3<#HC'"---)0.;@DD!(&G0<1<$7#3@>";')-,!1$=A,HE,H1>-06)G#!.G7F/=0,6"; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41A21T35T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7560 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44532 42 238M = 44338 -432 AACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACANTTCGCAGGTAATAATTAGAGCCTGCATAACGGTTTC 0F=%8:!%G*(;4E747#4B=65)$/D2!#C:.;#5-6D6F+%H=!5C-,!&;+7'C$2D84B'$H#1%-GF-3,#5DC'AE/&6B*,2)><=:F!C!4+'&50;!%>=?H3C,5G=C<(E!'+!0!$&G;8=>5&G!411-E37"5F=7(6B>>F7$2.2G"A13E3'39""?$-9,F.<&%75-1+38*@=67B+@85#8=%H=%(#CE3E+:5$4#8-=-9(!+/DGC+%6"4,;D88)&328!5;A+;*$E$82@'"*A31>@#@H?/=:!-9".='C0##E>;-5.+0D)C.@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:168T25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7561 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17076 42 107M = 17283 309 TGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGG H2&A+,&H.?=62&5"$E"!<*7;#G?!E$)EB(-391G%-(,0*0E3-*2=3C=86G2F,93E*C?141DE8.BC3%2-0F+A&#+A53'=-&@<*@0<&G2*.'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7561 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17283 42 102M = 17076 -309 GGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCANTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACCGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGA @A)EH10'<>$2!(1',!11?1!76@&*=?)71<=5C<4)9@E$G*C!G-7.6<0F1&=BA(@C(C+G2,.A6%"!F;/<4%(;'D1.@'8)A$/19A4B21 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C23G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7562 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37720 42 128M = 37849 223 ACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCNCATGCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGANAA /&%22@9EH745E&5;4202F$(1-#$C8G!0,&B#&6*+-EG;2G'2CBD;D!5)D?6/5G!;5;>1;<85>,C(1#4,$6:,F#4+(@5B8#+,@+/)05679HH?3>C;>F*A<:B-2)-)%>DG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:91C3C29T2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7562 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37849 42 94M = 37720 -223 CCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATNGCTTTAAGGCGAGGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGGTTTNTTTTTTGTGCTCATAC 5D*8*H,*>2F>>'),BH?C2?&7$(+=//?'03F2:B)D$%F5$86#%%F=)5#C36425-'4"$HF'#40;)>=%,>"3*E15>+DA8'1<1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T12C34C16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7563 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18376 42 74M = 18188 -262 AAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTG A9"CF)/>8#9"G00?@B*H6'H+3D48'$,1EGE?F5D24B'%).(F&H:+8ABE*9DF/=+70*0>G:3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7564 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20362 42 152M = 20290 -224 ATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGNCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCG A"/G)C86,,G#=7'+)?>DG:2='08'B4:C*!@9+-F3D*;5653C)5&FDB(%<':;.#F!GEF2)G2<#-*.0,",;-/',7)*%@2*#;9!H-63>/C0,H-#H#A='-!B!(<<=6AB9A!5&,H1FD8D=.B"E7&-"&A6&@8. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7564 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20290 42 72M = 20362 224 CACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAG /)8?*.'21@8=*((FC22E*$,=1"2G7B?@<2>>28>3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7565 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11807 42 148M = 11611 -344 GAACAAGGCACTNAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCNACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCNNGAGNTCATCAGGAAGACAGTGCN &"#&$"")"#%"(%")#"(&*%)'+!"+"(#"!'&*""$&%!"'+'%)')#&$"$"++"+!&'"*!#+&"*'%#%'*%+&+%$''+)*+)!&%#$+&&)"("+()("*#!$#!'"()!++$#+%&%"'!''!**)"#&()%($''%$% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:12G68G41G0G1C1A2G15T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7565 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11611 42 62M = 11807 344 GGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGAAGCAG 3+0;9H"!$%%F!(4B.F87,04#$D%)@3C*#@=#05=C""2!((B'9*)4+;33H)-.(4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C5 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7566 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27844 42 136M = 27646 -334 CTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCC 13,#0#6H7=9&)5!:985%AHA/?<.+4:6-G8G@8(,*%A27>2A2:#&,5#>>.2>AF3A>@+(BH%.@B.0*?=&G2'!>-472DG)F6)E&$&)240/;340;-+@@*#H9?."/(41F0H=18#&EC"8' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7566 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27646 42 198M = 27844 334 CAGTATTATGTAGNCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTNTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAATAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCGATCAGTNAAAATAAAATCATTNTTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGC 63#5:/-#-;!39FCE;;!23/F6:H+"FF-C9*".,@(=0=(,9=9@5(:GB!>1"2A#:A%,'*)$6B.!$'!)*.9;B',A:6*#<,9.CA;#C28%4,."E$B0;+F81+;6E8>:+7.9GD;/?D7%760>?#H59H.F.>B#F41/"$/#&=@",+DF4%2"4)60"#+3"@+$"H?)C@5-@&BF5$;6)0 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:13T67T25A36A1T6C14A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7567 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3831 42 103M = 3985 236 CCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGNTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTG B,H15F%DEH'1F5$($/5!+E>EB>-$#)D,969C=D7=G9!3H,-1@DC)"0)4)#4$E6/&#$2;3F%)-=&;?BE;+-;@%*4+=&$!$G91>6(+'CG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C48 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3985 42 82M = 3831 -236 ACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGAGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGA >H2<'66<@C@"-6"C,D$6,4<=*0(6&91843,$B1/'-!98*>FG3E$F1D=3@D&4B@6*!C70A&1A,7H.*#C$"4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7568 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8492 42 102M = 8287 -307 ACGTCTTCCNAAAGAGCTAGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGNGCAGCCGTACTGGATGCACTG 8+:G&6D=8B-A%A.8HD?"#)B@?0.C$9B'.(A8G"?'CF&H*3.+,6+14).H&7-=A?2&F)90?A4+B@D#*70)7B;>&73A9-!:+1=A)-.B'D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G8G61T21 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7568 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8287 42 13M1I110M = 8492 307 CATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTT %2-0$"9)=7&+%AH4;'?C5<('/*:0+9/2GA+)'.>6B;F$"C$"$@H<8-DF")%1374-3&+6B;437)@3/!/)(A47)C&,A/7@7,)D8''!EC!A<-=,<6&6!+!HD'=AH@"; AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:123 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7569 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41449 42 309M = 41333 -425 CTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCNGGAATCAGANATCTTGCTGAACTGTCNGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAATNAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGGAACTGCATATTCTGCATTAAANAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGNGATCCCATNTGCGTGACGTACNNNG )*)*#*("'&"$*$'#*"))+#&"##)""&&!(&%(#'#+$$!"+#+))&('(&%+)))$+'+(++(%'%%+**$$$'%%!'**$("#%!'(*+"(!%!+&%&!"%($'#)+#()*%"!!&"#+%$*')'!&&")(%(*!(")+%)''+!*((%#)#'')'&"!")")%+(&&#'"%#+)(#%&#'&*"%&$(*&#*&#*!(%#)#%%*''*!'%!&!"(#$($)'%'*!&#"*&!")"*$!%++*'(($%)'*(%+!&)&(+$"!#)%*%("!(&)"!)#'($"&*#+*&+!%'+%(*#)+$&(!""' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:84T9T16A35G0C37T21A74G8G9G2A0T0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7569 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41333 42 116M = 41449 425 CAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGNTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATA 95F.B?78->0H@+;C#+>7?>(450=-E$3F57#@1.9%$98EGG030,/'#6;G?973+(.C619'AAG6$H75>?!>B=8&/0/G@671%E79%,C=!7D0F+HF>>,B/=3, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75T40 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7570 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15079 42 51M = 14856 -274 TTCCAGATTGTCCNGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCC GB/'GE>2?<:7&?CGD?/.F;,7C?)>$%@,1G!&=:<%*B>77$#@'E>E'.12;,5A.6$A4'%'-&HC=6G'BB:'@@559-C#)A=CBEB!6,!$.D/H21BB9<4.(51'%).0(5$(9"!3D=3,:)B4341"'G/44!,?H16G8*00-?-7@2=@GB1-E4B="%%$3.(BA)>"H/5#42(%>7A203,BHDB3/H<5(."A,= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56A69C70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7483 42 304M = 7428 -359 TGCACTTCACGCCACGCGGGNTGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCNCTGTGGNTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTC 45F8A1;,9;#,-6,8@&6&%H47<$)HCAB-7''10#E9(G1@/G2FH&7)88*/0.@8*5E7($"?H%'2),5+!:6'1F.*:4B?(7554;@)9#@2D9B4D#,-&37-)D%4',#9G7A@<0!=/>:DC%C.>BF%61(B%%)#"=+!A#>3>&"=8"1F&3<,:9!,D&9G/C#($AC9E4!9A".#8")=B(5,#E(1,)090;36?,'4,GB)94,,(!BC.H$9>*7D@+;D)#+;"6:0G)3@#!,79GG<*(& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20A105G6C169G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7428 42 55M = 7483 359 TTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCANACTGA 6/E04<68@)E3&8HGG(;00"7<4@60=3F@:4G@@E?<)!/&$)C@'/G(0>1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22847 42 60M = 22914 225 TNTTTGAATNAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCANCTATAATTGGCATTGTATGTATTG )!+*%!*!*%!!#'%#&$"$%*&*#!%#(&!)'*#!#)*'"#%&+&%"'#+$$+"+'++" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A7C25T24 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22914 42 90M1D67M = 22847 -225 GGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGNCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTT $5E&3>%%A"=B+8&/,#/0&;F7-+)B9F005;249)%(A?67:CC0C;*/<8,9$#7>H580,+!C7#F04!G6<@;,!);;.5*/,%2CC4B=E8?/*:'-D!&$97B@&B;H0+#.;0"/E,@08(9..4> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:70G19^C67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7763 42 94M = 7965 276 ATGCCGGACAGGGCGTGCGCCTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGANTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGAC E,"(=!#5<.6B!H/B.+'%>9D71=#*+?E7$GE;"".+6,.G=2/2E<-9>;/B(?210-'D.B**C'*/&(969"23)4+FA,A/? AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G33C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7965 42 74M = 7763 -276 AAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGT .>**4"5A?''&";/H)$*8#)G9%!',$A/E#D9-B#G)8)F&%)=<*;";#96+HE4?C)@A6"(@5@&>7)EF,H')&.A($/H(CE197!D0F4%3E=9"8!(?C25'=:?8%C/)H,D,5,@E7@*;@!$GFAH=H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:111A13G23C24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7574 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28556 42 78M = 28634 252 CCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTCTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTC E2$B9!#E;?8,1%$FD5836*%'24=A#"D?H<4+7(47CE6)&C!90H:1;B-G@))%9./F0&A,3#8(42G"($ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7575 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25028 42 126M = 24889 -265 ANGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAANAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTT %:&E'3<3(9A+4<$'=-E/+71H.%878F=':.%";51*CG57-0:+C'!!+CD-#:6=,*9?)9AE@+#8'DC>4FDD*50BB;)*<#&:5D1AH=44;&&/>-,3:*& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A66C56C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7575 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24889 42 139M = 25028 265 CCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTNTCTCTCCCATATTGCAGNCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGTGCAATAGG 6470E57@A-A&A""7'07-1F:E":;0FBDB:"/"B3#E07@=;214%9:AE9D.,.2'';*61B7H-A2.@+24A:++F,+0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59T17T61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7576 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20894 24 41M = 20630 -305 AACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGC C@HD@9="0@!?D&HD)$3'&C%*A5+H<4D$%B.GH9(BD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7576 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20630 24 67M7I24M = 20894 305 AAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGAC ;#AE@7$>=5>"@"D1+%B@(A6C(*3/?G'$>874%2C@DFG.DE)"56-*=.$A# AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7577 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35183 42 62M = 35053 -192 GCACTGTAAGGTCTNTCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGC 7/69?,#5>91AEE'E$'/7+:#0!3(D@?5)+>*4H.:8EB-C5*E6@1+1+.';$CE.H@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7577 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35053 42 130M = 35183 192 GATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCA )C$527D>$:C8)B.62;;CG$2:/A,,?E75:*94=H$AB%D4?F8#8!8>7@E"#8;B%,3+?;';5C;1:4%)8C2@.;GH/>3F)1G'A3353')7@-<>G6;E*0)CDD14+G!?5,B$GB>(#5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95C34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7578 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45783 40 101M2I68M4D59M = 45673 -342 GCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGTCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCCGTTCGAGCATAAGGCTGACGGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGCGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCG :F3A>5C!:2#.,!:9456>69!=,9D53E8.)%F%)1!F&)<$)?8;G?8E4DG+:DG?<0D===BD3.9+#/B'@-??GGG"F*ED21CD>H9&/1A/FC#0CC7!>*.+="/=-@-+/=,%3BAG2<87#'2DE#*&9, AS:i:-45 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:82G27A19A38^AGAG13A45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7578 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45673 40 110M = 45783 342 NNAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCA #!9<6HE36$BB!8-B$D3A?!:@5E+HC??(&6G489<$A2):D-1>)>8F,H,-7=/7"E2').E1,+')D2').#BH3>,BD@0$-2>GC1;70*&HB"C3)5!!FC AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T0C108 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r7579 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29902 42 49M = 30104 285 NNTNCGTGAACCCATTGACCTCAAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGA %%"&#"+)'*&("(!')$"(%(%&(&&$$$'*%)#+'('*&$('*&$%' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0C0A0T1C16C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7579 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30104 42 83M = 29902 -285 CAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCA %'H'#8;(8?"@3??+&7,5'+8=67(7,4>4;$F*-8D?/<8+(.&96@B#H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41338 42 144M = 41186 -296 GCGAATGCCTGNTCTGAAGCCATTTATCGATNTGGTAAAGAAATATGGNACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTNATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACAC )A?8;=/2H-D2C9=4$!C0F/3#%=F(6")67GE46#@-D-'!=,E@G?4,35"0HE1(A-.'8),=@9E(##CH.(2CH:""96A8,$1391ABG+F:>E#0=.)&-'45?B((H)E,@D0?&BAC,6<"$5BA(G$C?BFD AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11T19A16C66G28 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7580 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41186 42 152M = 41338 296 GATACAGGTTGTAAACATCCAATGACATATAGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGNTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCANATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGAC E';A:CH$(GGEEH)EG(,5(A91,7*DG,C@9:($">G2E-#7G?G@!;G=;;G%@/)$:2:/B'8+H0'/)$E--&<1C#-B@-2B-40+6E/:*F8'<;=="A5)9$.C%E6C.?*@%;:.B:B9B3"'16(1*F='+,)?EB%+G%=-$.99,+$?6+,$0&260#@>,>##58@:/-<3*>FH#.0HBGF$$#A&$#E;@H2@;"8160'>4+( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G2 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7583 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31351 42 189M3I11M = 31573 275 NCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGNCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGT #)'(+$!*+((#$%!(%&!'!#(()$*"*!#+%'"***%#%$'+(*$%*+$$*!)('!%("+(!**!"*)$'#!')#&%)$%&%#(!!*"(!*&%*!)')&'$$++"*#(#))$%)$#("##+%#(#$(")"%)$$'()'($&&$$)+"'!*('$%'+!))+(*)!(")!%&"$+*"+"+!"%+#$!')&(&$"#$$'($&%( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:0T150T48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7583 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31573 42 53M = 31351 -275 TGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGG @./#%>;5/7)95.*,7$54&7H))@40/%?4!.)6#/G$1B($#:DE4B:'A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8463 42 179M = 8684 283 AAACAAAATATTGAGCGGATACGNCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGNGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTNTTTGATGGTCGCCCCGCTGTT 57>G5.<=,#"+=+6!G!?2"'A.9&*5.H?A8=G*2?/+BH'35@A(04,,.!C:)039'DGADGA(/&E%:?$@2'35//-'%G"D#G:7B/9143H;#?8>1;3H51*A31(C:8/8'-9:3!5DC:?9<<-!5FA%"('&6(?CC%B(?*97#-,H@A/2".*)H3/+#E!G)(( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G24G108T21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7584 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8684 42 62M = 8463 -283 GGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGA (-FA@";;99-97H!-B?0.DE5B:3%>31E*,EC?"%**!<2'71@/@8EF:$F>7.=3&) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7585 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41554 42 73M = 41554 0 ACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTNGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAA BHC"0E#(,1DEB7-H'*?,3H(H*C:1< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G34 YT:Z:UP jpayne@0: r7585 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41554 0 * = 41554 0 NGGAGNNCNTNTTNNGANNGTNTTNGNANNTTTAGNANAGNNNNNNNNNTNNTCNTCTANNNGCCNCTNCNNATGCGACNAGGGAATNANCCTNNGTGNNNNCNNCATATNCAGNGATNTANTCTNNGNNNGNTNNGCTATNNNCAANTNNACNCGNATNA ""$$!!!$"$$#!!#$#$"!$!""$$""!!#$""""###"#"""$""#"!#"##$#!$"$!!$$!#"!#"#"##"#$$#"#!!"$""!$#""#!"!#$!!!!"!""#!#$!#$"$$##!#!$"!!!!$#!#$#"""#!"$"#$$$#"!##!$"!"#!$!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41575 42 50M = 41781 299 AGATATCCTCGCATGGTGGAANCAACAACCATTCGANTTGCAAATACCGG 9!76/,E1<&*>B*#+1:G'GD8=2GE.#*9+23E.<&%H<=.4.AE8H= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21G14T13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7586 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41781 42 93M = 41575 -299 ACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAACTAAAAGAT &H)+<@2'(:*?+1B.3H.#!9=*+&8!45$8;H:#E/F"5D9'HFB?.@*B*E905/=((>D&4*?14!*-:()%F?4,?+6E8E10,,F!1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45248 42 51M = 44919 -380 CGCGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGG ,8D"6E2&5A?DH)5C&(D!7(2@&$F*5H/.$63@/*$:E>>FC1A(%!1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44919 42 329M = 45248 380 TCGCCGGCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCAT )D;9D=/8#*+4+1F-!94?>F0D*;+.&&/&:G=!D47DHE*H!(6,'35%@!3;-4)?5F"'A=%:?A;4;>%*A5),;5%D+=+955'@!13$:(?G!:,.E/?H?.A?F?%!4"79"$6C.+!F&+1:-)#!&=D"4C@7/.2E2?&3(#':>G@-"H)+C6=F8>=H!+6H!))(ED=E<:*?61)D+%? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6C322 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7588 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14953 42 116M = 14797 -272 CAGGTACGGATTGCCNGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGGGTCGCCGGGGCCAAGTC +!;B3*747+H>5F=$06C0;?AG18$H8#;;2AHE("03'2CD86:43+;H=320#,@/+=G;06-(.548=2C&0-7CD=1)C@#,F*;B;AB#F+306B!('G1?>1?%8DH(8'C! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38G36G10G16 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7589 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17943 42 68M = 17825 -186 TTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCG D&>HAC)9&-@.0<5.*FE$;#=:F6:2(;"7+BC*7%951!H=H&/C7:D)BH6/68=8'G.* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7589 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17825 42 78M = 17943 186 CCGNCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCAT 7<,B0?(!)13G,.+#++5/EA&&<=;(+%EHF;#,8"84('+@B+)F!@8@@9?<>8>'90FD'G)9/7/"'/;9<1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7590 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39014 42 114M = 39014 0 AAAACATCTGAGAATGGTGCATCNCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGANGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAG ($&&("%++$)+'!#("("*""%%&"$$*))&!+*%$)&%&&%"+++"$&#'&'$'#)$('&*(%"$'%++*#%%'(()(*%'!+&)#!&***$(#$')'))**((*%"&"%+* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C13C30G59 YT:Z:UP jpayne@0: r7590 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39014 0 * = 39014 0 TANAAAATCTGTCAGATCGGCGNCCCGAAAACAGTTCTGGAAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTNGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAANGCGGCATGTTT )?6)@F@H#=8==G3.*83F#*E.>?)@<82D86H/4=!4+!:+$6-B9*72#(2)>!=F$6!87C:#1"25*G#%.64$9%@(G(/4&%C:89>:'6HC='D=2E9>.2=<8##=B)#/7B5-G$,(791G4&33$=/2D'335F2*0/HH7,;$9%&>C<84+83@"&@9@%"/7E+1362(18E)46C*D&=GGG+,9=A5.&#$6(;17?'H!5;,=G=?3F:C'./E%&>$/:,@41?888D;=5H+/7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G37T77 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7593 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36711 42 66M = 36711 0 TCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCC =;6.7',.&5/9GAE<)C+.=2C37B'.2BB@G(75@//3D(0*.#EDFE9")*DF7@>?)3<8,! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G0 YT:Z:UP jpayne@0: r7593 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36711 0 * = 36711 0 CNNCAANNTNNTCNANGNNNNNNCTNNNTNNGTNNNNNAAGNCNTTNANGGATGNNCCNANCNNNANACCNTCAAGNTNTNANGCCNCCNTNGCCNNGANNCAACTNTNNNNNGNNNGTNCCNTNGCGTNNNGNNNNNNNANGGNTNGTCNGATNNNATGACG $$"!$$$$$"!#!$"!!##$#$##$!""$#$"!$$"!#$!#!$####$#!$"$$"#"$$""$$#"#!"$#"#""##$$##"#""!##"#$!#!$$!!#$####$!#"$"!!"$"!#!!$!""!$##$"$"#!"$!!"$!###!##$##$""$$$"$""$$#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7594 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17338 42 47M = 17038 -347 ANGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGA #9,37$@4/GH'#)%DH>>*@'B4$/&,()#4,,?=9$>@096&*G? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7594 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17038 42 174M = 17338 347 ACGCTGCCNTCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGAGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGA 2/"9B$1HFF,8<53.@"?++/A(D,/=$,;>./-#&+(#7-A9E1/:<:"1HF:74CC2%$55F96G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A113T51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7595 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44329 42 71M = 44406 240 AGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTA .,'=-+("')7"2#?5!),&09A;.=90C12;!."<&/-%<='6G+(?%6H9+3<"D!"5>%+H!@=9"=; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7595 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44406 42 163M = 44329 -240 CCACCTGGTCACGCACTGTNAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTNAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAA "*%3:43+)>F5D0="H6F$#B!0,>*HC9'?:98!4!(9E!H6>>7BGA%1B+*&4!#>+*=C)68,+.F'..?EB<=53G:#+,-+G63A=E)2./9;$1$40F2G%'?6,@.9EG&D()D&27&7+6A;ED%>+1(CCA=2G-3/H@)&E(7:*"C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T81T61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7596 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9694 42 88M = 9558 -224 AATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCNTTCTGAACTGTCAGCCCTGCA 1."1.6),!.84*;E,07;.A1<9=.-.D608/&<-(7E$&:->@)*A,)B1,!?+2-!.*B3&F=$5D6BC>68/A#@5<,;)%)H6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7596 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9558 42 136M = 9694 224 AAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTNGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTTCAGAAATTACCGTCACCGCCANTT 8!'<)9>A!117GGE=#*AB0?5=AB(.A-=1'/CB:,-.)82/"'39B.F82A#:@!=-<%)%)?#(72D0.H*3>!/933.59C%9<,B.261742&C.'E%(//#.>6,E6$**?9>6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:53T57G21G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7597 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15600 42 49M = 15649 183 NGGNNNNANTGGAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAAC %%"$)$#&"*%"&('++#$#$+)$!!''(+%+*!!*$!'$#'$'$&')' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A2G0C0C0G1T2A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7597 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15649 42 134M = 15600 -183 AGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGA ?#@E8E7;$H8&-)2@G<$%9.+5B4@@58"A"FE'3#=H769!?=E1"$9>8!%$:H$%5=$AC>>C"=(98A*D4E98"%#/)-:B)4*+8#"9E;C!F50?06ACCB1F8#@.G*%+!(B)<.;3)H2"-?6<66E*?<#;45-G%-8G:>CE2DA;&/@$@(6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7599 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36370 42 67M = 36578 285 CATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAAT /3%":/?&G0E&/8FA?*-#('0$!''-,E>67E94A0!%G81!?.=@G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7599 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36578 42 77M = 36370 -285 TTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTCGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTA $AF.9)@0/5,6-*$=A#>B'9+--.+H=,G>*E<+9A88**!G$0:H&-),8C(E512F*B4"1A53;@%C%79;# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T22C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7600 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19068 42 132M = 19277 265 TTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTNGGGTTCG 0#@H/E;BD9G'-;BAAC?9-<-+F":(.?4/D:&+->C:8A$D0C3%%2!6A$5#,$*>=)H(1?-!2+>6!EE01161D*E-0<%B"33>H/8$H*$9'5/;,<<=<5$AC3A;?0%9D76?"-/1' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7600 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19277 42 56M = 19068 -265 AGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCAT -<5EE#();*8A39#9+45(>29!02"9-D%(?&H;*3B<7."(-&@&*8@3;!!/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46554 42 121M = 46810 305 TTTTAACAACATTTTCTGCGGCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTT 2G0&E4E5+F$9E374D=-0'0<;0!+0CG,&BH+(0"6A$+A1"->9B=C;F&-0,@,)E,'4./7>GC.12(3<&1$(D(*4"D+13D<*@1*;&D>2:&D:%8&EA*..*/3FHF$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T9T6G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7602 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31420 42 126M = 31304 -242 CACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCA -%BG:-GG.8'6=G"'#-";41=#!"F3*>E'-9';,.4#(;1G%9D/$8%3),422F5B,('?;>CF1:E3H>E23>4=/:'*4#DF;+@G)D%AAA%3>4$;A(.G@(01=/200G2&54E0ED,:CG&5!( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G7T59 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7603 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16234 42 109M = 16073 -270 CAGGTTCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCANCAANCTNNCCTGGGGNCGNTAGGATATGN $+&#%$##%$#&(#$!)#(+%*$)')!$!$'++$)#)##&%%")!%%&$)%+#'&"$$*##$#'("$*(&!$&"##+$+"(*#"!*$#$&&$**%"%$!(!#*#***!! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:5G73A3C0A1G0G5T1T1T0G1G7C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7603 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16073 42 161M = 16234 270 CAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTGTG #C+@0B':6*#8"G:1,#01(0%34A12>::8)706;;:;:?&?<$'H<=89@>4<5(G&+:/<3F3!.G)"C+9:B:*03B=)2$D35=3<$A9!DHA4)%(8)'B"F-1F3%50-835>CE(8%,'6E%C1(=),F62E8=*FGC8C/A4=&7,;.B;@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:158C2 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7604 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20869 42 78M4D144M = 21095 281 NGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTNTCC '.9=81#@#<$#;8&8,:3/'%7*?/C%@!'0;1<3H3F%966C?%&$/,+AA$,#974/C@>;>&'4@::"D)+>#?/+89#0D:--0&&&&2D?86%#$AD>A2F/H&=24##H3/2F0#1.&'/88)9(=!=E0'@6>?7:<$8<&7D$-!!"9 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:0A77^TATC140T3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7604 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21095 42 55M = 20869 -281 ACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTG .E6'&H?(&+*6->/&G6&+C+!"&-8'#=9%C,H+@0A.-;3,7G3C?8=#=2, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T39 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7605 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28989 42 89M = 28827 -251 TATCCTGCANTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTNGGACGTCCCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACN 5@/<-+$'B'/)GD?=/@@1?*:754-A68H092G>3;*:,@-,?3@C?G?3*.5G:E;D1$*=<%@-&H/B7EC+.)1D1*)"71$".-H"" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7606 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38832 8 61M2I176M = 39081 303 ACAATCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCNAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAG )%$"*+&#%*!#)#"*&""#'%'&($)(()*"*&*$+("""&$#"#'+)'($#$%$$$!*%)+)&&!*+*""+*%!*''+#'!)$#!'"*$!(+!!&!$$*!##&)%"*()!(+'$()$*"!*%$%#('"!&)#&+##(+!&!(($+")'&%&&%"*)+)#'&"#+(##")!'*!)#&%#(&&*'"$&&'*$''$$""+)&&$(%##'!+')#%)#'"+)#%*'#()+%&')+&"#!*# AS:i:-104 XN:i:0 XM:i:45 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:47 MD:Z:0G0T0T0T0A0A0A0G1G1T0G0C0T1G0C0C1T0T0C1G0C2A1A1C1T0A0T2G0T0G0G2T1A1C0C0A0A3A0C1G2T0C0A0C0C170 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7606 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39081 8 54M = 38832 -303 CCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACNAT -*:@D13D':%B!$."G.(E;*9@@&'$3.?!0(*/+-)FB$32+DD=9?C-*$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T2 YS:i:-104 YT:Z:CP jpayne@0: r7607 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47583 42 73M = 47277 -379 TATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGC :E@=18<,*)3&!DDE0E4<)7B84(;(C1@:-14&):!+%'GG;4%'.?C1(!D5#*4H7F<,A&4C>H7@3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7607 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47277 42 306M = 47583 379 AGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATNTTTTCACTTAATAG <'%&"G80-@D1+#7GGC#A("4;A987:=,@--B;CDBE@;)DCD@6G1;D;74:&7:,)+&5&.E1CD0<,-=E""*4;H==,<#00H+.'E!6"4#+2F7%H1&G'9"FD;8&6%*9>.4G+.G6"".)@E78)3F,4&A7D$-.G9%"726AD5!''9;$$($D*/)D.#$22170FA.9A;(*E5+H;;/?*(;F%2!5G)#@=;:!+':@"3B$4"%$=!DE#07H41CF(+@@>'*@1B%C3,;?=871B$72'<=#8<031H-1C.-4>D@5ED!D'18B0><+(&?>246.;A<&8C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:291G14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7608 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16003 42 54M = 16003 0 GTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATN 9;/7:;A8H6FEB4;5GE36(2F+;2)/#%(7#+G%-,B(F/0'*:,+?8>BF! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G0 YT:Z:UP jpayne@0: r7608 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16003 0 * = 16003 0 GAGGGTATTTTAAATANAAACATTAAGTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAANAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCAATCCGTCGGAAGTCCGCCTG #6E,&)356;=%0A!D#)C&!)CAF!(12G)(5;61860DD+<;(3D;?/A$0"FHG%=(DGG)<,:E;BFD93,!G0%EA8!(%<()C.$%);?#6&:>*;4C6H#(<'3B:,%:!DF4B=) YT:Z:UP jpayne@0: r7609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37975 40 33M2I185M = 38235 346 AACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCANAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTNCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTA 86!.GC'BBB"F/.+F6:1H+E@G-0.)1D8$3:95>,<+C,<+3066"#1#.3$0*(&#,(F6)&7@A&!3+79,#9(7>:7*>&@4#=HE.85$%B6D8BD;#:9%4#'/,H5BE:E/32.B)+'F&?*#0FF:>72%4.;E7HH>=%9,;:(1&3-/5B0+&62@+"A%))5D62'*"C-CD'/%765;03$6,")/D+4'0&//("D'#9A:;1)0 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:79T109T0T27 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7609 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38235 40 9M5I77M = 37975 -346 AGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTANACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCNTCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGC ;%.7G@C#$$DB:/?!?)=B">$(2A'B'4:=E;B"18"%3B+!.)DBC>H=BC/=HH,&9$&'A'<707,D*9A;, YT:Z:UP jpayne@0: r7610 141 * 0 0 * * 0 0 NTTGCCCTGCGGCTGATANTGGGTAAAGGTTTCTTTGCTCGTCATAAACATCCCTTACACTGGTGTGTTCAGCAAATCGTTAACGGCATCAGATGNCGGGTTACCTGCAGCCAGCGGTGCCGGTGCCCCCTGCATCAGACGATCCAGCGCAGTGTCACTGCGCGCCTGTGCACTCTGTGGTGCTGCGGCCAGAATGCGGCGGGCCGTTTTCACGGTCATACCGGGGGTTTCTGCCAGCACGCGTGCCTGTTCTTCGCGTCCGTGAGCCTCCTCACTGTTGAGGATCCCCATAATGCGGCTGTTTTCTGCTG !>9@>,"-(2:?>=5.18>$C>(204B>&0-2@.6C8*B%)?5H88?(<7>;*,E1-)@AH;CD@)6-7-4'+D'721H,:"6'&)A-0?12*##F1"@6.>&3'/4%?/#+D'AHF@-3A3(+44,#&-,41.B3H!@%1HC6!*9380H3G461;,0/77+B00;E@F>:+$C'-47*=H)7('3C+75333-9EE-?&!G"-5+0@232*.(@CCD-)H1@"!#5?%06=*F=A&$>D-()=F&(C&CC><1%B>)1>*B''AE4D-73;0?H"E9E*H:@10@'$>C/@;>)@'D.HH"+2/=50!!):C&#'>D6=>G70'B;$,=9!E@)9$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7612 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44014 42 220M = 44234 333 ACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCCGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCA )>!@'82=;3G>=?EC'?&"2+#3;$8"7F40=)<&C35$012/E>;@">)D@;-9%.%F-;4:'!1&>8D-<=/::96);<,D#8>!*'C)2C'8F4<1%F?71GE3-/*DC'#8+6G4?C;*A,%A/3H+<'78$.H-.@8C4EA+"%G!44)?A)"'4:&>D%0.:C3()2B#!0BCC8#18BD@0E!,%CA1$:%GG"15*:2CC#-D=;B:10;1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T191 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7613 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21881 42 122M = 21707 -296 TCNCACGGANACACCATCACCNTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACCG ?2%:6AC?F:,F6/?F8C#7>=(%-"3:4)H9.89?@73(B<%+7!+%:G;5,/:./!8@&D7+.+@;"6C14!H;1%<@8@C@:C$)(C$:&1.>80G9A4!%6CG61:?<:A!DD=&0G+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A6C11G98G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7613 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21707 42 99M = 21881 296 GGAACAAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTANAGCCGTGAGTGCCGGTGCACAT 51'273G9&./)2/'AGH05&/B04*E#4):B@<%@))1,""G-A+B66;0)=&,!76G2- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C70C22 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7614 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35432 42 85M = 35265 -252 GGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATG &;="$F47(47)(E?G,%8,1>>1@;)"56.H5;(%3<'/@C,;2#51')D%G"22=:?(;8;'&0C'8/;;6&<3+HFC$+,G- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7614 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35265 42 80M = 35432 252 TGTTGTTGCGNTTACCCCAACCAACAGGGGATNTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGC )(%'!%')*)$($)'+(""!+)*+'#%*()%"(%!('+)')!###)%)!))$*%)))&*++!+!!$$'(!""$)#$$#** AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G1T5C21T47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7615 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47902 42 70M = 47902 0 GCACGATAANAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACT 7F&F30E<%1=>)-3$=.!@)-@20373"D>=-&8?&@753D6-96-?6;>*4*(2)45G';7@%,+9DD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T60 YT:Z:UP jpayne@0: r7615 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47902 0 * = 47902 0 CNNGNGNCCNNNNANNNCTGNNNGNNNNGCATNGNTTGGNANCTTNCNNGNACNANNANNACGNNNAANGNTTGNNCCCATGTTNNANNTGGNNNGATNGTCNNTANNANNTCCNNNGNNNNNTNGNNN "#!$$"#"!!!"!$#$"$"$!""##!#"!"!""$!$#$"$$#!!$!!$$"!#$"!$!#####"!!###!$!$"#"!#!#$"$$"!!"!"#$$!"$!"""#!!!!$#"$#$"$#"!#$#!"!!!"!""#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7616 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46944 42 269M6D9M = 47228 415 GGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGNATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAANTTGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTATTATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGT 1;5'>*72(29D$E4)=E#7B:6;,C5;@4=%#A$"10>2)#G#C73-4%BA2!1-,7B,":B.)H:1(HE3!=/9+:52=;?>,'9F5$$0?-!+3AA&HG%C?3B5C>D("*#FEB2<#@@'D$;1F8H"%F.$1HF30@#A*&HF'*.8.#6'<&D"C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r7617 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1209 42 123M = 1332 344 NACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGGGGGTTATGATGNACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGGTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCA "4?0=<<2B';1E@GD#>F<:+0FF9&")83&4.+C.=FFD$%%AF<9-2,&<3>*0D-@6B18,@;5!3-+(<'>$9.07:,'A7C&:*'A/8'22@H:;5;(%,,A!*?6(::910=G$2- AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T24C11A46T38 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7617 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1332 42 221M = 1209 -344 AAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCAT ?B3(%,$F0A:5$03*F!!D(B%60#);+,F$/G*9,F%,=G=$/.9+EG!B!2B:/D=1,&:1@DF&,49+H95*9B4"DA)+!:45F/,<+(1*ADF+/3,D)%B3E(")=*5<5'>7$7C7@1C59"1+(1&<(5H)7%89>8(>:?(E,<2+>"#*@3C3D6:*,50E$7A64A79<892&0*'BC&:53%@$#"@02*C9EF)$?$3G3.6* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7619 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2610 42 41M = 2686 188 CGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAA FC*+->$,!%7A-$,CD;=7!BD,$-'#&?A-7:+14)5(# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2686 42 112M = 2610 -188 GACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGNTTACGGCCACTTCCGTGTCTAACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGNC =#1/??-G@&FC=EC%191/0)<5>)F%130@?(&'371*#8!5D8E<"(8112?($7AA;7!%(-++.6#6C@3H1;9H+#1B'+"421*BE22'&,2:*9/-@BE$!1"% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T20G39G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7620 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37026 42 62M = 36855 -233 AGAGAATTAAGGAAAACAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCACTTTATTTTTGCTGCG &*&H(B#+=)7:EG(+'B.86@A&8"9!2!,HFBA)%:)@<%3*D/3("B:.A1;;C,E278 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7620 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36855 42 85M = 37026 233 GATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTG 0+&0'6C>*HC(:0GAC90H+'6.528:E:(DC6>0=>"7+C'B4@%@=50F7&A:B1*E2*$-$;(0;3++>F#%"&EA0@CF- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7621 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22368 42 43M = 22147 -264 AAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCG D:-.A.HB5?9E:F"DEC;56;?4'73.HD(A1>>::-7*A759H<=A(?HA3+)1<+=GC%)(>H+;-167B@/=.0!G3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7622 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21861 42 119M = 21980 221 CCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCNCCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCAT 3$,421%5!?D16"&)14E>5=8''0!28:'(+70B+B;877506&GC&025"&3$5(>./%EFD.'C9B!2..%+E7#?1@6>%@-!EBG>&84!,4D1+."7B""10/+G5-!,,(C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A80 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7622 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21980 42 102M = 21861 -221 TCAGAATGAGTGAACAACCACAAACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCNGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCG $'..@0::&BG%%B<@FH-719G7"?E9+-5'*"7;.6*&%E8+B'FE!E7802(),$@A&/F&1$65@4*-A/?,A4<&29:%91.A'1B>1*#!43F'F6*?@7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G40A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7625 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37867 42 42M = 38104 286 NTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGC &=GF2<348@/%FC>.(@/,;5*6,!>66%F%G(2.#"D:=> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7625 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38104 42 49M = 37867 -286 GATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGNTCAACAAGGCCATTCATGCAGGCC )&>)BAB9&23C@C+4("$G(8;D1@%)"B1"#>A8F#!D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7626 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 949 42 124M = 1073 392 TCGGTTATTNCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCNGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTANGAAAACCNACGTTGAGCC ?:1((A.:"1"(EF-;9&HGH3#6793!B:;!!@"!F*.%=9B)76G"DAAFE10.54@4E?;<+34,!6G&#&%H%@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C61T33T7C10 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7626 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1073 42 268M = 949 -392 GACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTANGGCAAAAAGCACCGGGATAACACGCTCACCATGAAGCGTTTCACTAATGGGCGTGNCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCNGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGANGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATANTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATC ,3CH"#=5=;2=64-8(<>,,?#45&-DE7=15>6DEFF'G50G)C',/)4C4@-<;8/4$"A0E41,?5-CE=14$G9<;;FC6H-:,5B3G)>EC643.''A=$*37%?&9B)D$'>)8$A#,9A77-9$()3&/8D:A+A%(2+D!<2F)/!')H$6936E7>7#>#(0B#"C0)>?C/#8(:85?1 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:6T38T55G24G44T25T70 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7627 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34773 42 272M1D103M = 35149 484 GTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGA 3B!1#936.&G((/+$-0<>E"D.B5D976#-<(BG,H6)(;"!F9$?.EE4!5H&/"07-%H-.(31;BEFA>2(?H)BGH3D0'7(+(;#@D51E%;H76$(,&<9>&D-EF*5::G()!11E<)74),,(;D.*F.3EA9,/@?#,?:D<2=)?86+G1C<5F#DHB,$.,B.H%B:!83;8!+%4(/,/22G*<0?;'A"(258B*;A='8#(#%>G&-7%D2"HB'E'$>7+*8<81-@2#>0@64H:$BB&F0D/ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:39A107T124^G102C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7627 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35149 42 108M = 34773 -484 AGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCNGCACTNTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGANTCAGCGAGAGAATNAGG +!&*&+***%)!(+&!(*((*+""'&+&%!!'*&&%*!'#)%)'+*'*"*#$)&&)&"%$#$)')&))*"#)*(("#)**""%+'%'(%$#+++!'$$&+*++)$""& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:33A5G50T13A0G2 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7628 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20797 40 55M = 20562 -290 CGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACNCNCGGGNC )"$$(("++$"$"*#&#'(&")"*(&'$$&!"%($!#+$)&!'')+"#)(&)%'! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:46A0G0T1C2C0A0 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r7628 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20562 40 135M7I58M = 20797 290 AGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGNGCGGTATCAGCATCGCAGAGCNAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGNAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTG )-8&7>A897766<3/B4&$=H&1+$$<:)>8CC+/H:2*&%!=,6H"#DC=.BE0*!6-F/F,D>96E,:=719A>$%-AAH@H+4#F+- AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:44T21A100A25 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24098 42 77M = 23923 -252 TGTATTAAAATCAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTN 8#!HA.>-/-5-<9@%98;96CF3B"1B%+4!)4;6B631!6&!::!F84@0.*?AADH5$A%%6'83>&-8CE!F! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T64C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7629 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23923 42 175M = 24098 252 CTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCNTTA -5@!G'?BBC3(G(6E38/#.>.?5=<)C=#%A-17:.@8913C&C@B#*8""7969;HH";6*,9;/@-+,AB$0@H=(:"&=A(2?87!?&+4&?,16%G/DFD6'1('D$,=$!690?24095.*G7%50B74HG%5?.B7,8+(564(+7D8+=D(0C>E-ED1H$0"F%! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:171A3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7630 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15931 42 76M = 15931 0 CGTANCGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCNNNGG *%&'))()'#"*'!%'))%"%(&!&&*%'!'#!('##$#"'*(*&+""'"!&'#'"++)")(+)%$"+!%)('"(* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A66G0G0T2 YT:Z:UP jpayne@0: r7630 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15931 0 * = 15931 0 AGCACCTGTCGTTTCCTTTCTTTTCAGAGGGTATTTTAAATAAAAACATTAAGTTATGACGAAGAAGAACGGAAACGCCTTAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGAT A".?'G6-!!$,%3?(;<'%;;9'F?&:2>48(&+A1&81:4#'+:&0),(/A&+/8 YT:Z:UP jpayne@0: r7631 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17571 42 111M1D10M = 17439 -254 GCTGACAGTCCGGGCGGNAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAA !$!+")!!($$#(+*#$!$)%'"!$+%(#)""$+#!()+!"+)$#)+**&!%+"*+&('+&""*%#+&*'&$)"'%*'$"*()!&++#"(%*$))"#&*+)!)#'#"(*)%*$&"+!')($ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:17T93^T10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7631 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17439 42 94M = 17571 254 NGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTNGTCAGCACGGCCCGGACGACGGANACC $$D1;!@;(>4B)-#$;0;;>+4-'(99>''-:0D8:)AGB9,"7%94<+%H!*4H6C9**A#6D?F,/E<:.6%9FF//>*=>@353": AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G65G23A3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7632 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32526 42 67M = 32219 -374 CATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACNGGAACG 1GA%GG'AF94A*)%+$'3A7,8,6)#"'2,5F$G),>+C0A@,&:%,BH?(0(H7H7;H'=CH1'* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C6 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32219 42 307M = 32526 374 NCGCNGAAANNANNNCGCGTTCCGGCTGACGTNCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGTACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGNGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTC "#")%&#*!!%)$#"**+)($+*$(&%###'%)!(#'%+*(!#&*'&&!$)#''#((#"+##")"$'&!*($*)(+!#"$%%)$)$%#&&!'%'#!+!!)&*!&$%%&'**"!&$$%)"("'&$#&!#+$%+&&'*$$%&##+((#%'%!()$()+"+""+("!(')!&+&)%%&%+'$#)*&&"(*(&#%%!"#"'"((%!)#%$#*$##)"$)%)%%)*$+*!&(#'&&!%'%(&$(*#)$"%#)(&(#)#$)"$%*$($++$*###"")!#")!$)'*'+%'#!)#)%$+(("##$)#)("&+* AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0T0A0A1C1G1G0T0G1T0G0T17T81C59T132 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7633 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45640 42 98M = 45998 399 CGCAAACTTGTCACGCTGAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGG (&C,17&*5=A2.C&/B-=<3/1:!!%-A6$C"@&:;19%(;.B/E3+BG&.04?*?+945#;8CF'"#>1(*;;A5F146G6GG7@3-<;B:6#/E4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7633 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45998 42 41M = 45640 -399 GGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATC DG6B9'=B7B%*$$3E,>&-<(0E5*'1;!;46:.7:54(5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7634 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25560 42 47M = 25674 184 GTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTC ()*++&&*(!('*%%'&$"$#%&*+%$#)"$*!'"!'+%(%*('*&" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7634 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25674 42 70M = 25560 -184 GAACCTCTTGNAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTC -8)./CD3:.G>B1-"032#(*48;"'662#D'.F//?2=:!*:@%C3&2#F,:$#53=8.@&;B<7"+A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7635 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 481 42 88M = 592 182 GGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCC 8$*(?5(>/96B&;=EFA<&>!')41F/&1?@C4EG.+*#"#!?,A:289.)-2E.=?<#,:)5A4@H.38%"0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7635 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 592 42 71M = 481 -182 GTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAG %>H=HH32':++!+!4$B;'>D'4H0!86/:,2,&5B!&@=&C8,*2<00E616BBGC>/"D*)=-;8"#A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7636 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7248 42 87M = 6998 -337 AACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACNGGGACGAAAGAAAAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGG 3)E@"B?HG08;!:$44*,A>DB.5BG312@D&,0335'*.56.0'3/1,;0E*6:0%C+-F,:GA&B=3!@:+G&).1HC&/,97+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G12G48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7636 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6998 42 48M = 7248 337 TCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTA DA);'%?*$,'D#9GF/7>(F:5#*&'.G8/D!G<1F):&(.8D9D(7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26558 42 57M = 26400 -215 AGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACNCTTTCATTTTCAATGTCGGCT *.8BB?2H;D##AD'2)&,E;:4=)6'DB'>(>,&"-47A4#'>/<;;E.D+.2-=B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26400 42 78M = 26558 215 CATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTNACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTT =*/C=,,-+C;(1E.-E>"!*8/7)C(2&"57@+-B8?!">8'E-86;#D,D/D,B2A".=-3H9A$(HF4"@>*<,,!,?+"H2/2.(811$H4%:6,A%AC$3D$*6A#3+;=B:?'@(4%(H0(-2$CB+4!6@D$(,?G45@:0H$5;A%1A95#)<6H44;"'A5=<<19+;?,?;2G"E689*7'5G!@%$H<+9-07.%C3(#0#E3%);0'!ED!A+/;AA/F,;HB"&3?A-@:=4' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T116C64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7639 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5603 42 76M = 5825 272 GCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGC >:,?BB@)-G)-$,5@27D!#?785$B*(GHD/*B,8F*2?,$;!2'7"/F8':*H=%=0B-=>,B3@(8/2!0&E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7639 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5825 42 50M = 5603 -272 GGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACNTN CF*:2;;4(9<.1(7:)$DD%!G)6(F8&C<@>+,D>0/DC#=C=","(! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33276 42 88M = 33097 -267 CAATNAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATACTTTGGGACTACTGGCTGATTAAGTATGTCAA F/BA=9ED=B:D<;;BF&C+/%);-!:7+&*A%07(03:/HC>)9.>+&&>G7#$#$,46B44:/4=!8140+9B27F6)=A>H5+#& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A50T10C19G1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7640 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33097 42 117M = 33276 267 CGNAANTAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAG #$#%#"()(+%"#"#("!(*&+*'"('"$)$$#"#*($+**'!')$""')!$"(+)#%*%'++%+%+&!!&%+#(*!$+"%(+!)*)+("(!$#)&#%&(&'!*!"#%'%"*+$''" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T1T2T0A110 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7641 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5789 42 171M = 5960 295 AACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACC >67%!9(B:96,?38<<&F(0=8A"C?B-;>:D9-*F/6%/(4#E'581"G160%:8A-(!FG/''2'B%/5?&"0);D*/EG2"@/>:"2@/52'!%;!(52?0A@*<7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G159 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7641 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5960 42 124M = 5789 -295 ACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTNCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGNAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTN $CC,9$*)"4(46FF<%H=8F7@:/@.#H9(?6C9>)#(?8!07/1+!"G%,-*@E"-F1<,'AD*8C!%$89<#F"01$-7,@2B?8!(&6="793#'#'7%'1/32.G09."D(%1%*?B9$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29C67G25T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7642 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30345 42 206M = 30211 -340 CATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGACTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATGGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGNGGCGCAT 1<,$D1A=6*64C"?D,A14*;#*F#4760:'0(02'1F@&*,G;)17#62.(&/?!E")@4<(5:GEE-C+,%$GEHD5)#H#,.40,('E0G72?3!-C>#D!C/&41,0)DE/823"G6?.%6=G5C(E?1!0;'+6==>@E#B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G109C51C7 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7642 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30211 42 134M = 30345 340 GCCNTATCCTCNTTCTCGTNNTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGNTGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATG "&&!%#'(#*$!')$"*!''"((+!$!&"+&%!"*+"&%*)&)&%&%+%&(#!*+*)((#%)&!%#(+'('$&!#&()!%##(*'*(*")*)!('"$&#*)'$)$#(!!###)"&&%&+)$#')"#+#&)&(') AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A0A7G5C1G0G61A51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7643 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33103 42 151M = 33022 -232 AAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCT BF$@"3(3%'*?6A86-*A'D<)"218@!,H(E?/<,@B6CB:?3,4>#1"B!+2.5$EF%G;A4%,:(!CHAG8@GE79'*2>)"(/.HA4?B5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:151 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7643 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33022 42 58M = 33103 232 GTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGC 7;A&G@"/"#'>4/C:.&+,-*"&37=HA<2-F2@*-876?<#E,6C3:F&!78;!AC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7644 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42154 42 128M = 42282 297 CTCGCACCAGAAATAAACCCAAGNCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATACCNGGTGNCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAAGAAGGTGATTGACCAAA ";;.=(@0>8C$BC*A8E.="H4&B79#!'D@2=E?*!)(#F5?F:'(/&'A5=9B:D*;4/3AE6E6,0!!)2<+;,CB.*2-(G"?."#75 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A0A21C57T1C4G22C16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7644 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42282 42 169M = 42154 -297 ATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAA CE#,",$)H%>/B/!H$99;9))@),2>8&&)<#;)8G4G#4#3BF(,&8$09033E='&CH9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:157A11 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7645 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46048 42 168M = 45932 -284 ATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCAAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTG #@(G)$<@-B6F*32G9&;C?993E-/3<4*74)#>B2/DE&%//$8%;,7/!"H-?3DB+$HA.87,>D?>F&E67<84;?,#?601GD37A2!(3C.:236GA/D<.F=5!=!;9D,D@(2(0?2-+;#(H:1-+G'G:,+"1-6';>FCC%'<"?-3)492@B7( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C127 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7645 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45932 42 20M4D41M = 46048 284 AAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTC =#=+G!,B?4;/DF(B/%!F+&A)8988F(:2'9$>4C;)(G3:>.6&8))A&$AF5,872 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:20^AGAG41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7646 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9647 42 245M = 9548 -344 TAAAGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCNGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTCACCGCCNCGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGG (%:E*1029A+A2FGD:16A,"@A:E-#@?1H8+A!#D-+A=)%0"G:"314;AD5*8(G&B/2*@G&8'-G9>*'CF?27*+%3',@9!88#3(0;7.:('G3;%/9"#.+$,A+71>5$F121H:H/9@#"$1)D$")9G.$5E;F5577,B05+FBD'=-3&<7F?2129"F?E52@;0F58A2H-'*GB@4#6<,1*8@350('880%A=(GD/B0<<3'@-78960!-@E0B3G3#H63;12AH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G17G67A5 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7647 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6403 40 21M2I42M = 6241 -225 TGCGTCGCCTGCCGGAAGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCA .B+G+58>6CD;"=-F8;$'D@EG;;"7G$7&CHH<'+F9)8'F>#F(39(-4>DG0772B&,@0 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:16T46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7647 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6241 40 11M1I124M = 6403 225 CGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCAGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGA B=(9*E,?9+7(FE4%:#51&+490C&$355'?42$=!;')(4C,@@%/BC:#-E1=3!7:C+*8@EH:-">#3/+@H/,>6.2(83(D!>696-C#A.?32C!FC3$"F@*@A)-(F9<3134%G/A3><@5+1F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:52G0A36G7 YT:Z:UP jpayne@0: r7649 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31247 0 * = 31247 0 NNTTNCCAANTATNATNCAGGTNTNNGNNNGCCANNNGNCANTNNNACNNNNACNNNGCNNNANNNAGCNNTCNNCNGAGANNTTNNNTTNATTNAGGNNGTGNTNNNNGANNCCNANNNGNNCNNATCNNCNTNA "!#"$"#""!$"$##!!""#$$##""!!!$!##!!!$"#$!!#""#"#!"!$$$"!"$#$#"#!$!$"$!#$#!!##$$"#!"#$$$!!"!!$"$!""$!$!!#"!$#!#$#$!"!$"!!"""!#"$#!"!"!$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29882 40 101M = 29716 -267 TCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATT /'A/,@E8(D9==)<0B-3%"6;%,503*9B)E#@<"5573HH?>:('9%7>!E5?,C;!.@DH=F64.!,!?A(50>-,F5'A<"F"-*$$G7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9G91 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7650 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29716 40 12M3D32M = 29882 267 AGAAACAGCAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCA "&G@1=,@/9A0><:;*=(F27 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:8T3^ATA32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7651 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12847 42 26M2D14M = 12889 204 GGAATCTTTACCGGCCGTTGCGCGGCTNCCACCGGCGGTT 5">"'6-%4C1F/'5&(*BG7A=>7@!+66?)+A*?0 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:15T1A8^TA1G12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7651 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12889 42 162M = 12847 -204 ATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATG =>%%*41!/!7/#!&E0EE-E>!"=$D:76E::D0BAG8?*0..$#$C@E==1/$.(35B@7A81<$G!2+4(,,*F6+"AH5144@/&-/!@#!F&:$<8+<+A#15AA0#@;@)E2+0%;@E4'="0H9GD&1!8HA4B$GD9@"CG9@(C) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70T91 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7652 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21230 42 97M = 20992 -335 TCGTCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCANCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAANTCAGCNT :$1BA5/0*>B+@;C>$(>)31$G4))*A(4"9:.@$0?1DD$-F;GF.77ED,',@!2<)5D,8=D@1=1)/**"%F") AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G32T52A5C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7652 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20992 42 59M = 21230 335 CGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTA (H(F:.-%FD'@87>G%!*G%?'B+?&'2(>5+(#-F:"7B8,/53).'<(9@9E,5$#530E7=D&AD.(0G>$/3),5G!4+49*$*FC*E&.50H04*.0/,A70)AD*-H%#@A+#9G-##*A'6#?2?'/<"9(!'*=&"68-7%78+&""268A238+'#($&?$<>4"7B$2,B4#=080&?.>-''H>18F@:HGH#H<9"@$4E/G*G.A%3C&*0%5#.%64.*?/@4*$E5;;'G"0=(5/>F4) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89A171 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7653 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27382 42 88M = 27470 349 GGTATGGGGAAGTNGTNAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTCGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGG '))"++&'')*&+'))+%!#+)#)!'($!(&%"$)(*#$%(!+!$)*$!'*'#&+#+)+&#'#&*!!++#%%$&*++))'!+'*!$(! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G9C2G26T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7654 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6573 42 64M = 6573 0 TTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCA G0/$?ED".=)DC'DF<*7(2(46G2!*!!+E;78C%'H'&A:#?=;E?.!9+3-1'H3"B<5&604E&H(2<)?44#B6(*)9G+FHAA?,9<29*G.2H@<>F(#6@"G/3?0C!A9H642! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A17G4G93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7655 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7720 42 75M = 7506 -289 GCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCC F@)/%7C@;&3?0#:C=*4*!*,>5H<6A@A..*H0#8E'3)0HF7329=/8A.2=D)'4,HC",AB@)A3? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7656 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27649 42 50M = 27408 -291 TATTATATAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATT '!&+*&%(*%$")$("!)')""'$$'*"#)##'*)+(#!*$#"!)&)%"+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7656 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27408 42 124M = 27649 291 AAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATGTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACNAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTTGAGTGCGACAGGTTT :/;?F,;7+$$<+FB3>>'8A90(:<8@",&,*$E??6$515.A>:!?4=0G3A$"964C(*/'D*)4::8;6;4'*65!B@:?.48E)E"-664;*"3-8A6C#/@*2=C4(&+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32C37A37G15 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7657 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12964 42 157M = 12898 -223 TGATNAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCANGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACTTTNNGCTGGAAA #$&'(&%&#(($(!(''))*"((!++'*')&&(!#+#'*!!$!'$!'!+&)##)+%(#+!"%+'%"('+()")%"%!)$!+("'%%)!'("('*#!'+$*)&+*(*+!!&#")(%!"%(#$+(+#(+#(%(%#($&#*$*(*"+!*'"#*(%#(&$$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4T67A71C2C0C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7657 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12898 42 47M = 12964 223 CACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTT */9-;4";#-D6.;='7==)F4H4"GH6824E#-A@G@/6*7,8/@< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7658 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6296 42 77M = 6516 273 TTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTANCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTNAAGC :H>5>#F+/*'!F5"0.#@8FC0D"G3HE&3?-+)H<1?"7;(:#>77EE466FA'7405//'1#?C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T45C4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7658 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6516 42 53M = 6296 -273 GAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGA H"8;,A28=,1CH:=?8A;6C$,E@$GD,&8A'9"%$'>-#:*)1$H&-0-GG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7659 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22666 42 111M = 22531 -246 AATAATGGNANTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTCACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATNTGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGNCTGCTGTT +/1%C$6H<81%A927)2"DH?!%1AC45>0-$$HF5>49>5$@D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8A1G27T40A22T8 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7659 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22531 42 113M = 22666 246 TGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGGTTTGTGAAATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATT 1)04%>#.FE0:7:(F*/07;'!A/'6=+A#(=5-#A7/'=@"7,)8,>',>0#>?("?*>3EH''HE84E6(=4D1"C@!,22G%3,<99$2A<)+6BB(6(=9?H=C101% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T7T74 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7660 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6309 42 80M = 6537 353 NNCGGTGAGGTTATCCGTTCNCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATGTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAA "":3A3#!465/*H8(-$"$A<=!@#'D1"76+#AH*8,?D'1A7C$*AF"4=9)G<&5;;<2"!;!#'*="&6G22G(' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0C18C22T36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7660 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6537 42 125M = 6309 -353 GTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGANATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTC 5AG<*F-=BA9$61+2H;'G<%#&=@F6E$):56&<:1'B/-1@040=@3@9D+:<$G3*&+0B-5/50!=3%1&6<:#?*D&4)14-F$?H>>8.@)H4;,BE#(?%$8+C@7+556/A?-'D3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T68 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9016 40 10M1D51M = 8830 -248 AGGGGAGCGGGACCCCTACGCGANTCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAA H4F2$5=BG#>E@/7B3.$3.47.5C'A."$',&F>B<=GC.6DC+7>05G!93G"0<::? AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:10^T5T7A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8830 40 63M = 9016 248 GGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGNTATGACTACCGGCGCGACGATGA 8/?!?(7!F=?BA'-61%E#4:6,E(5%D@2=E.,H?,?D,:!89?+.G&B19+6!%;?AF-> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C23 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7662 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44341 42 117M = 44578 310 TNCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGNTCTGGTGGTGCNATG %!+%*#+$*(&)(%#'+$"*#+())&+)()#$%%%""++"'%&!((&$)()#'%*'&!"'#&'*++''+$+)$+&("'''%+%$*'("&$+')&#*!+""&**'#")&"!#%$)*') AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T99C11A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7662 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44578 42 73M = 44341 -310 ATTTNACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTC @$$,5.?)A@5=G#=/82C*/,H=+="?+79#<':86>,F2+(D$5>''4$'A?9)8E&1@7.C6"E:3.:14 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G68 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7663 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18621 40 114M = 18848 284 NACGNTCCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTANTCGATGTNNTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGATCGAGGCGGT $''(!'!+**(%%*)%*&*&!&+%'!('*)''+%)"+!*'&*(!(!&!$*)"&$$*&'(*##+((!)!&))+"*!$#+%&*')$&)%(('&(($"))**'$+#$***&*&$'*& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G3T1T38T7G0T49A9 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7663 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18848 40 57M = 18621 -284 NCGANGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGNGTNGNGCTTANGCNACCTCTNAG *&*)&'+)+*+"'++)&)(($#$(+**'"%!+*!'("("#)!#&)')!!#%%&$"#) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:0G3T28C1C0T1G2A1C0A2G0T0G0G3G2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7664 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41200 42 268M = 41131 -337 ACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCNATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGG %-##F)@"2G*7#3F.@D1+3.#-(B#A-+.E'(@+G%0H19E,4/8+HC#A4>2!DE5C:;G"&-8>*3A4*1?A&GB;;D3F6A$70*A'+@E=2(.$A);44#6.$;75A&'#:HCD>H+::"13&E62-@"@>!97G,7A#,-:>52"4.;?*0F,A7(H,E:=$+HC;E(FH"FE:&,*>G.3>)C@,2:C(.E$#++A)F-4G!-9,57A>&2!?*G.1<+!1(B5?1)00#2:1*A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:158C109 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7664 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41131 42 42M1D26M = 41200 337 GTGGCTNATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGA !+!(#)")"#"(#'%(()!#&"*#%*%)$)%!'%+%(!$&+$#'*'#$*&)#)$%%)#&#&&!'!&'* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:0C5A35^T26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7665 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18922 42 156M = 19078 316 TCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAA -$"!+$@57",2%H@'+/))2!F/A+).>!A7(!D9,6E<)!50:+?;$=/&1;7C8F0/3A1"8101"(.875$#AA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:156 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7665 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19078 42 160M = 18922 -316 ACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGNG &"#&/8-(H)'1G.'/D72>02,!?'>7=5'%+57+=;H(*'9&:=E=C@9B3:37$H;C+%:1/!#G$3?++-E"EG3!'>AE.)!0".8,,H$F1&-(F?50%C9%1-)A$:A<<;!:1B",G80G27.EB"!);#9"998$0?/67=.$968!(#98 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:158A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7666 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22482 42 55M = 22678 240 TCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCT 9:8BEB>").D3)48.2E6CB1- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7666 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22678 42 44M = 22482 -240 TCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGTCAATTGC 7:>*%?+-&6/<78G=#A6=C8!6>7$:.&+,@,1!C+4(DA!: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7667 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1555 42 84M = 1774 292 CCAAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAANAGACCGGGATCTGGACCNGTGATGGCATTCTCTGGTTTT (++%'+&"$"+)*(('*($)&')+'$'!+"'%+&(!+(+)()#*#)%+)!)'($"(!$""#+&%($)#$*+++"&)!%%'"$)& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1C41A17C21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7667 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1774 42 73M = 1555 -292 CCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACNTCCGGATGCTGAAGTGATGGN BAG'*;&6CE5C?.=&@-B)5;(%'@==)@*6A9C%DD83+0E'#FD3G29=3F!7!G&3-AH3# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G20G20C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26803 42 116M = 26920 227 ACCAATTTNGACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTANGATAAAACATTGTAACNAAGGAATAGTCGTTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTAT ,&?;H",H,BA2.'H,>6127>A5519&C.E6%9E7;CD-3DF/?=14(5#H2,A%.E<*#('&7&;H0H$$%1@/7F="'$G$D,1:%A%=2 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:8T0A45A16A11A31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7668 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26920 42 110M = 26803 -227 TTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAGCTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGA 9,)&H!8A$=>44G@57$B,14.;;.;/0'B869=8BB2*!F#*2<60D7?"5-H"2G5*%":C+H+<"#?;$;1"-(@9='G;/C$+839+- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A65 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7669 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28716 42 40M = 28502 -254 AATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGA 5%#*:(2(#4-F:).E"%3<:793(B$/9:*'):7(3<4* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7669 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28502 42 126M = 28716 254 CATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGAT *;&AE9!!HB**"6=0-;;'*:/H?G##3?+EF2B="(*AGG7&:D!.478?36>FCA#<=D;*CBFG,899E$3@&4D248D2=7.BH:8D+(B#=H+:17"+'H+E(-.0'?"&;A.&*72(/? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7670 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3436 42 63M = 3311 -188 GCGCTGGGATATTACGTCANCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGG &*@AA4/"3(E5";@DE34H*"C-#1#%*)8G-E):3C,6*)1>" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7670 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3311 42 43M = 3436 188 CCAGTTCGTCGGGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAG ?#D2F'8(G.F88:&H//7%"+@;3 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C28C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7671 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18500 42 77M = 18613 156 TGGCGGCGCGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTG )-6D3/&1)BFG<6E!1H;G".#E,C5=@@:9,'A"-F$'A">4!"+#<%B:;)FHC.013';3#=,"%<&+41/E% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A7A68 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7671 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18613 42 43M = 18500 -156 CTTCCGCTGACGTNTCGCGGAAGTAAGCGTACTNTCANCNNCA "+)$"&#)+!()+*(())")%'+$*+$$&'(!+""%)!#!""& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13T19G3G1G0G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7672 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24882 42 67M = 25051 235 AAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTT =FE),%50D3#HG+@).%DF8E80=FA342E8)%,;DA5*=0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7672 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25051 42 66M = 24882 -235 TCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATG ,99>(DD&@D<@-;,8,",H1A#"9:"E3"B;#A$4:D3$1@2@9-*2@76.,82G-%+> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7673 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11298 42 95M = 11119 -274 ATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGAC H*74F=/7:/6*=#C<2B9469,-=44+!@<("%1A+7>>3D&GC?8+;+?419,'EF#/+$?F1).'/=E0,G5)?/;A8>D-9>E9'?-A?B-/.?A48,/!9=%6<-:@*,=1;-9>C1F2FGF&;>C3G28H=4+>0345/0C?=.2G,6:'E5"CH#$H:"=6739...B#E?>/&8-/?88.A'D@1::+:GG)/.*+!=(&/!9@#6<%4!E&B/?&(8C?21; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:218A11G76 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7674 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41907 42 55M4I96M = 42058 458 TATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGG )C20F9@69B="E(0?+.!"?81'<3G4=>:8G:$6<+=<-(:42*?$AHG'"F'':*E-C1D#28%2<)4@87E07+%E,BCAGH..<63H3H$%>C/-12+"8;&,AFGB@,B#+H0?>#?H@=))$%=6C2"-04F>H$!3D0G0B>22;.<)G+#40>G7-;=CA/2-H7H.93C*;@,@%0"G6<..%57"9=-<:?-8#8HA/71$%2BA28) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35T25C55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47716 42 195M = 47579 -332 AGCAAGCGCATGGAACGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGNAGCACGATAA C$D058?'""7%B6=&8H5,?0.<"<&C)7%)D>H*?HC14.6A%3##4-<++976A!))A!588?4?G8-<$.>>$C9;,+.G:9F5E$,;!FB%/DA535+?<$-9$H<5A1CD7G?(*'*%E2)'6(F@*/D8.!<.*32/3B6#052!7' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14G162G6A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47579 42 137M = 47716 332 ATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTNCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAG +(+#%&$!'(#'"(*&)+()&$&*))"*!+#)&'"(&)*%)'"(%&'&)"#%%)($$**'%+*)$)+(&)#!"!")"%%+)%#!)%*$!*+'$+*!!())"++')#'+)##!!&$)+)%(%%$('$+*"''!"+&%$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G53 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7677 77 * 0 0 * * 0 0 GNGGNANATCTCNATGATGGTTAAGCCAGCCTATCAAATATGCTGCTTGAGGC '&#(!!!(++$!!&('+('"$&'$$)(#'!(+&%'*&+*(&'''+!&)(!&(* YT:Z:UP jpayne@0: r7677 141 * 0 0 * * 0 0 GTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATNCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGT 5F-F5H$1+=!'-.2/1B-):F1.=!":>#GH8B9&GBE@DH#F1G!=*H"A?:"HHA7D#?GG6"A!F("DH7B5-(#$!GD8,83F54>(*7((+F8#HE5.0A;!*/"$!/:7-,0G"!G2#'1'?D@G./@8B$$%-FC8/8@6%A)G#470H7#-542&//"-1B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G3A9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23908 42 159M = 24112 253 TTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGANGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTANATTAGTTACACAGG G6&:.@,-$&@=/3E>9/?<";B#B=?/$E@)D2D,,3,?+B"C95/E(.#-G@?7BE5()H:96?HG/(=H,4()>H>09(:7C91+$=>D6"!A36/B';%+<525*9*@G1// AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44T99A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7679 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11460 42 139M = 11310 -289 TCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGTGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGC G>:-9*H-")8A1;'536(>+%,;:=!%)'!?:H$+9*<445'H"$H,.'7B)!@8?8>*,:'851F2'#'5B?.96&,"5:!7+#(/<#A," AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73C65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7679 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11310 42 150M = 11460 289 GCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAA ;.>6.3-*9$>+B3=5"-(3(?0)?+?5?E:)/,-%)9)GC(25<)A.#AD,.G7H0-/'5B@;-@C/GD+>D/)3EE1@$8B"2/,H&9CH"42)-<$$99B8<%&7&/H)!<#/)G.2E$'B&!*>5.F@=61CE21?2*<-4? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:150 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1383 42 121M = 1592 284 CGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGG 3?G8'H#"H.2H37A9:(+.ABEB9B8$"1((=D&)5'1<7#:>/,!0)*-G1;#4>!,%@H!69580(/49'.7@*.'+,0@)>+1:.6,-A.F8H#2;+=,@H8+61D9?/@(=E23D, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1592 42 75M = 1383 -284 CTGCGAAAGGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATNCTCTGGTTTTTGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACN 7/H3-:(/"--&0,(=6=A:5E;(AA0FH&<-%H<'42,$8+6(DE).3A1&&4?0A,(#@HH5@#=#&D=2-+( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A27T10C26C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7681 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2132 42 46M = 2340 250 GTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCTGGGTGATCCNCATT '>9%;=%='%?+A:>C'!875;E>9-8$*-/(/@@E3>56D8(3F-=$;6@G$($>!#94%".C4",*E23!78=E./H"BC1)G(#-1+:D##@.%*-5'?3=A&$??.).(9C3$;B!-*'-/F2"5?,&:=/)G<8-728(E@:%!AC6+/-(BD)E$%!16H-4*:$4HH'!;#-*<)$+HC;*'B;1B'-/G=1G4)((B8,@%4HH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7683 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20106 42 72M = 19953 -225 CGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGNCN !"'#"((!)&"*$&%)&"$&#$(#'&%)'++%+*%)*'$%###&)#'+%*))*"$%$+*$(*++&(#)#&$! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7683 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19953 42 104M = 20106 225 GTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGC 1'G-++@!+%7,-H8(.56'19D*C7,E*1"=//$13$0?3H#A;3!(/E=09)$2@48C*9/51?+G$A!01C$-6>GE8:>;<'GB1/BBF/1)?$@H'()&!+5D"*80E/<%9D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7684 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33148 42 114M = 33316 285 CGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAA H-""3;78(-:E2(&&D2D35/&@,")$0!"A-E@'-F'<,)4)").-9$E3>H)#@,=2(,G?0<,76*F@89:&,@G66A&6%42;0,#!;5!%&?>%%8"!=)H7>>E>&. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7685 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36244 42 51M = 36420 228 NGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCNGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCA "37?#".FA>5B%)3"83>G+$*BE%81718?#)2G20H5,B/>;1/8D+H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T24T25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7685 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36420 42 52M = 36244 -228 TAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGT $$8%@.D//;+B173D9-<.8!-%="-E44,>D,)E'$(#)H2/42(/8A?B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7686 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4715 42 154M = 5024 363 CCGTACTCNGNNACCACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGNAACAGGCTGCCAGCGANCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGACCGTGTGC $'&#'#)%!#!%&#+"+'&!($&'**'++#)&$!*+($'$!)"##$)!&%+$'$+*+!*!#*"+%#))(*'%"%*"$(*+*'*&%$%'+%)%!*'*#!'%$+*(!(&""'$#*&&++#%(#&&&&#")!%%*+%+&!+($&'))%('!&##*!( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:8G1G0G1T0G30C16T82C8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7686 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5024 42 54M = 4715 -363 GAGAAACANGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCCGCCATAAGGTGGAT 919(=%BG!<('))6C"1D%D+A'7C6F!995.:EG:80+;2@F/$< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G30A14 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7687 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39868 42 85M = 39868 0 ATCNACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAAAGTTAG !!"+"%+%'$'*)%&''+"+(+'+)%''"+)"&%')$$$!(%$#%#)"'!+()%))!#+$&$$)!%+"+"%*('*+*(+"%!%*' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G75C2C2 YT:Z:UP jpayne@0: r7687 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39868 0 * = 39868 0 NTANTNNACGCTANNNNGCANNNANTANANNTCNNANAGNNNNTCTNCGGNNNTTNTTTNCANTNNNTNGCACNGN #"#"!"$$$#$!$!!$"#$!$!#"##!$"!$$#$$!$""$!"####$$"$$"!!#"#!!"$"!$!#$$"###"!$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7688 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34045 42 334M = 33926 -453 CAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGAT ?1=*?D,:/C?+H;3DDCF,8'(@7#:35'8B/.($>&()F3B2>:5=);2:30/>"92'>.E%3.7..1%.!#+8*D.D%)"H@<+/2,8H%0##0F=&(+(#%%>4H)@7*()F?+E"::1914$4*?724$(2F$(@=)13)?2$61(6'/6,E5:D""5C676AB0!B+<2BA%/=6C9":@H.!.D.4%#752<*',D$(7D.$/3'.+4A679)8#G$8.1G)*3E;;E("-GD0*)B':0#6)668=7> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:325A8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7688 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33926 42 119M = 34045 453 AAAAATCGCCCTCACACTGGAGGACAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTT :@?<42>ED&$/H@'5AE/&@8+2<3"H@1((;:;1H2:0+4)#:C/*3G"2C#",C@=0-)9,3HHB0.8@)!D1CC-+=E751H?8>3'G;"@<284F1H0%''91+D)A>2!)E.H AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23G94G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7689 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40048 40 60M4D18M = 39787 -343 TGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCANATGAGCTTGT ?AE8"'20:<'0=-B#:"F0?>-D#0B.G/4&*?3%DB==A/?(@$>?/F6!7H.'7/G31H+:9./>D11(C/?/A: AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:60^GTAA7G10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7689 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39787 40 52M = 40048 343 AGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACAATGGAACAGGTTAA ??E(<10*,#G0FB;;,145,.B8$,&AH-+F2/=5D5HB0B,%4/A&-?-G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G14 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7690 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30747 42 98M2D72M = 30706 -213 TTGCCAGGCTTAACTGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTNCGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTNTGGCTTTTTTTNATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCT .5430B96"B';2C@,!7&%D1H<3+)6=,9?H82-?H?>B&<7D16F%F<637;((&7HCG-=-#,#?#40:,,H/E/?4'$>&1#.$?G">)@H0?F6:&68,"AD71,H$G.;+773E<<<5)&35-G<3!?;+'@+"94-+&:A=;'F##$0E#!0B:G#H85/3$ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:13A56A27^GG10C11G49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30706 42 41M = 30747 213 ACATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGA #:)3C#"<9=%3>2*('5)0;F&$;*!!(9BD+8*E952:' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T40 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7691 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33693 42 154M = 33847 247 TCACTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGNTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTNAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTAATCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTNCGTCATGGTCGATTT '$$+"'("!!*''""+&!&+*+$*&#!"*$#)###""!)(%+**&$%!+*!!(+#""$&$%$$'#&&()%**"#+%&"$%&(!+%))&(")$&"($+%!('%&!&*)!'+!)())$*&+&*$*&&%#*(&#&%'!#("*+)&$)##%('%#&'! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2G26T26T29T51A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7691 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33847 42 93M = 33693 -247 CAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCA *&$!())+()+#!!$!"&&#$)#)*(%*+)%##'+"*"$)+#(#((+'"*$$!&!&+*+$$!#+"+$!!#$(*#('$*)'&!'#"++')%+#* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7692 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36298 42 172M = 36470 277 GCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCNGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAAT GC@(E*8CAH0,7"@&-DF#'$:$.=#21'(>#69/3D82/.2D"'%*1@$'4&-D6,/)A>FD55B%6AG2>7508#'0'-?#7?:)C,'7.F$0,E7/8#?$&.(!627;2BHCC3&A=C"7CF/+4/H<;7!A7#:@*@>4D"6(G6G$1;%:-"@%%3;!*:%-,-.G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:144C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7692 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36470 42 105M = 36298 -277 GTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCNTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTC 0&30#+.*G08G.-);94.GC6(CG45&.-/:".BC"D43:D1(C@CE;(%@65F%B%/=)G?<<;HD,'''G=()7EAG4"3CH1/E?=7/D'6<.2@HC#.38 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73T31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8230 42 70M1I27M = 8485 306 TGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGNAAGGTTGGNGGCAGCGTGCTNGTGGTGGGTAC -9HD(?(*@"HD=&7H>F./?+C?)@C5("0GH(>+1""-E#GG:'B?*+H7-$?*+=9GE?).@AA"2+B$.(4!(*,@6?D!?<@9.5%5.%G65"B6((<;GB$(A&0%2+)AC3+%E)(149 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C39 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45811 42 73M2I77M = 45579 -382 ATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAANGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATG )*C/%10?+1=1:H),@0@.>!G68>&;@)=/;!>@#9F+/52(!H22=+>C*=!7BB/1=G'82)+G>GC+2@6B%!?+!;4F43+2;<>>B"+22C.-F>-F<;=/GBB.8(*&44=?7.)/1-8A+F,AD76,3:&9D?HB7@!/<(B. AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:122A21G0A3T0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45579 42 232M = 45811 382 AAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAANTCAAATCAACAGGCGCCGNACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCNTGGCGCTGTACCT :/C!$3/38D)*$"'#D37("<2(5;@CB.<0:31/!&08#FF;@B7E1<%E):'$-/AD0F,;)6$!B,&;?A,CB/!2C/-.=3;")<5'A3;D5F)"&$=),:7"<8CF916%*=8&G=0)@&"=$!%#*@.F<(?,2B!12D6%!G0,1%F&:H<:>CD6+/#A)B2:D+%?G/#=@30/5'@"2#,9++"++:B6EH:#D32=8'=21$F- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:88C18G110G7T5 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7695 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21267 42 78M = 21433 245 CAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCG #;21-+3F?G)C4A&.E3-;E,":"%H;8>.,'43-&E,4&"'5B'D,H'2*A82&++5B"<9G=&D!+.53/A+=G> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7695 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21433 42 79M = 21267 -245 GGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCNGTGNATCCGGTACGGATTGGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGCT ))"'&%'"%*#)'#*+$(%$()!#&+(%$&+%"*%#(+*!+'#$$!&&)&#'"+*#!((&))")"(&$*"$'"&#+$!( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31A3C14T26A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7696 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3011 42 83M = 3187 229 GCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTC &.!EDD!.?#EGA1AGF=*A+H")@<,0)62G#38,;&9A2;A!;'>)"G$F*C69>B<32:CF)5-,B%'+*GC;:/3#98* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7697 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1693 42 68M = 1865 212 CAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGANAACGAAAGGGGATACG @0)>,@G5C7:2C*$&'<3@B/.<(!!24.6;0CGD*HA3+9>"!:=&:C%"C&CD)2(CD;,B9<1H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7697 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1865 42 40M = 1693 -212 TTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCC #'""+#$&$)#)%"!%(!'$$+#)&#$&((''+(%'%"+) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7698 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6445 42 66M = 6298 -213 CGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTNGCCATTGCTCAGG A<1=(1"'61BG1'.F'&%DB=A7*/DC='E&H'$E?5DB+0%**2/:A)%C=EE'5$?A*'9>@@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G13 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7698 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6298 42 45M = 6445 213 CNGCANCTNTTTCCNGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCA $*"%!!!))))&&(('%(%)+%""%))+"&*%$)%&+((!)*))) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G0C1G0A0T1G5G30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7699 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30853 42 53M = 31090 296 CTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGG 7A6$'E':.=810&G-E5/(C07A5<#@1=D?.6/4AC3A>3;'C6'2C>+B1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7699 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31090 42 59M = 30853 -296 TCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCANAAACCTGATTCCAATTTGAGCAAGGCTATG ??'FBF?(,>=H.+7;,H=-:==G>=3E"&D$C"1:((F&'+<<@BEH$9390>.=7<% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7700 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5257 42 123M = 5092 -288 TGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACNGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGANTCNATCAACAACTGTTTCAGCCAN @B"/*=*D9+*0BD+D4@2#7A@G'#B5B7>*!+=1<1A>9D:97)9H--<$3!1DCC8+&?8/#;*9;FF6/B+G'DCC220""G6G6.AC8;G73>1(.9#5'-!HAB&:;'7A>CE<.G! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:33C64C2A20C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7700 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5092 42 77M = 5257 288 CCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGT .;:$C$=*DA-#HD=5EG6%,/FC&'0B-F82>6,=/!=5/%5E*.862)%8,+<@;?"E#"?E%A7$%G+:A!H?$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7701 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33109 42 45M = 33314 254 TCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAA 7EHF?E$.D$@H*C>?D8/7?#&(6D=25"G?066?8&223=43C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7701 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33314 42 49M = 33109 -254 ATAAGTGTTTGATCCATTCTTGGGGACTCCTGGCTGANTAAGNATGTCT #,:!',:%62/'#,>B+'H;+H<:2/4F5)524A4E%=1*!<.2A9(0* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21T15T4T5G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7702 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2081 40 5M5I36M = 2256 306 GTGGATNTCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGACC F3D!/-7//.(;@99!!51,-4/A&"1B(8)H)/5C<7.HA.@/<<)>+B2#?E*55/*),=>*&.;>,F?*74A49A;#+2":02-D$BG1@G(,-.$A'2-)"3?9="0+19-31,AC./.8+H50>$@HG@D":(01/A:"3,1%+#/42%21#(:8D)G6+<5$$/59!G>7(@;DC)6!B3)1@3*E(;0>2=*;H/15+E.?(+H/E?/#""". AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G106 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7703 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13179 42 114M = 13037 -256 ATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGANAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGACTCGTTTCTGGAAGAGA ?36&';3A8:)==:@7,>8<25?D493E7)C.6A$(=7(:(2;%($==012"%,CFH.D3H?0<,?!G&,G5%9F:6-7$G45<+E"7A5,F7(&5/=7(*!<<%*A9@3>'.$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45A51G15C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7704 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28490 42 42M = 28637 214 GTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATCTC 7C%374B6#>7&<;A+?C+6%A&!+:=#F8''@;)#B?9,)6<('2!3BF#;-=" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25043 42 40M = 24899 -184 ATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTT =5:A),,"=:CE8G5;&?E?F#'F,$C;AFG-G$#643+* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7705 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24899 42 67M = 25043 184 ATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACATTTCTCTCCCATATTGCAG $;?E92*%D#0""B<4#"6C8D3(0+HE*8%+*4:115#>1;-)*"/%)!)<'-C83-+:"!"8?>= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7706 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31258 24 59M = 31516 310 TAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATT *82528G+%8=)4!!7<.7*9-C2)0E,4<%=F$&<1'D(E/7/,5CBD'/!3C+@F84 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31516 24 24M3I28M = 31258 -310 GTAACAGGCATTTTTTCNCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATG :(!('5=D/?9+G$G'AB),- AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:3C13G17A16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13322 42 59M = 13140 -241 CCGCCTTATGNGTGACGGTAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCNNNACAG +"%*'!!+#*$'&'!"%$!$)!##&&#$$%!!+)*"$+*%"*#)%("#$+&"$!!!%*) AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10A3G3C33G0G0G0T3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7707 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13140 42 56M = 13322 241 TGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTNGTGATGNCTATTCTCAGCGA 09)<9?,->>C";#;6C-GCB9$'A1C=/&CD7";>;4F+./:<(&6G1<<=A2"=47=0)<3*C1D'9/A AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G28C9G0A3G13T29 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7708 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39915 42 193M4D104M = 39825 -391 GAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGNTGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGGGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATC !A=42D8<.#4A,@270?HD&$@,%CEDHEF"DA<='D,;E2@8%7.:,83@9>@C6C&32)6.+3A/?H0E:+,HA3B%6,8/9."7$31&9C-D9>3(F5#9@22"?$E=1;F*'*:A=B(=D)0+1@5-A90$7=9G)&D7%%36(9!)B*9=B8)?)7F4C:%&)(';"9+#$%:+,94(:?+2277"H!(9A0)')!/79;*;=4,:<>%7@A7&B-8>-92/<47=D1,E94!05-HE@07);/$+E2,55?<@#B AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:91A77C23^GTAA104 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7709 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27587 42 246M = 27536 -297 ACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGNTATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTC <%27#(+93F<*5>,5#='$EB@9>FF0G*A*+:2D3!/(=6<171&%..+'<>%2CFE0"8<$/+43!9?6@8335&9<3A>A240!-?*)7,9+9)2*.9926',73>,HC-422D+(EB)*!DEE)1*9=CH8F75E@H;+:HB,#>H7!562!9C/8*E%(3-)GE5,/7?8;2+&F32&'>$;,-@6,.#'%F-FCD5"<208@CEB/6E&92#-*:?8D%(&C@$.D<8//#/4A1$A<$-=@/A%0B<9/57)7C&A3/%('%G&4D,"=+7.;B5H6FAF7'@8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A1A48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7710 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16410 42 135M = 16286 -259 TGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCNGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCTCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCG -,&7%D71E/),#'0()2-$F>4BCE)-EA8;6E:0",D%F"'.A'5;058556?;,2,@8$B*83F2#,B*!A,6),19/5)?5+;=22*?E;#E2@19$(?.2.C7,/CGB'0GAE0%C-6)A'<)#B9&D3' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A31G75 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7710 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16286 42 88M = 16410 259 AGGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACG AB.E4/1@.2*24)*H"3897E79#(.8!56@5.273.:(&66+B:B9;G+4D%*,+C05+6E(2,;76:34F2D#";,=!:B*EAH' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C86 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7711 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15198 42 66M = 14812 -452 CGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTAT =?4"(3.7?.8>7B(B#&<50;;H7:+B88=(7/*A340&?35>A9@C:=C(F>'+/<&0)(+!@1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7711 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14812 42 386M = 15198 452 ATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTNAAAACGGGGGCTGAAGCCANCCGGGCACTGGCCACACAGCTCNCGGCGTTTCGTCAGAAACCGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGNACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCNGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTAAGACCGGCATCCTGTTTTCTCT F=?C83HBCF>1D-+19>@1>)0+%+H2=.4@7'?2.)6%<7//(FHG487(;4.-'H&%=@B5:5>=;19."2$//0)*G5DFA!9(#H8(4,3$EDF*#":+>'F,3+44..B"6:1:1/42..&G8+?;1H+B%$53'#+4A&H''8-%5#35A&G9A-*::7#"+-"GEG7>$4$*.H,@<1$;.%!/FA1.6:@AH31=A$;$E//77A89+:=9B;*!"<8-0H!,,+$#>&!+<:#=20C-BG%,5'6H#C1.::F!8.5)%7/':DB4&9#D>-$A*4??<$A6"8,C&BC?6:B#G<,26<++=ACB$8!7.).298BG=9;(/-<0H7@9(*/C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:62G19T22C18T37G155G45T21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7712 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15573 42 50M = 15361 -262 GCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGNNNG $)#$$*"("*""&*!%(%#+&"!!+""%#()&)(($##'"!+'$+$"%)# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46G0T0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15361 42 111M = 15573 262 CGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCT 8D=1%'3#)+1DH?A<>%%,<4)G>@)9C?/(6.;&1221<=')D1D)E?3'!<6"<.;"-@+G9:+)C?0"A2;"1A9!8;D@BB>4933G$+)>";B8?&61A8CC<,6-=?33G$2B+A%CB+F/'?*H"DF<,+'@!F;8?@9D',6#"2)1;&.G=?/9*,?#4:+C;7'E!G5"3/2)E*(GC8=?9H0&1"887D?6@E@$#A+HAFAF."-==67,$.=3.E4$C:+344/:+G?%=)C0-7(B$?93@82C";G-9;&G&?=89'6&,3%,@'A%419)+"2>GE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:126A41C149 YS:i:-61 YT:Z:CP jpayne@0: r7713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40497 40 66M3I54M2I92M = 40179 -530 ACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGANACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTNAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCNTTTTTAGGGNGATNGANGTCATGAAAAAACTAACCTTNGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACN %!""$(&&)"$'!!!*&$*$#+'"**'(%&&")+&*('*+!&***&&!%$)&(&&*))!#$'&*'*"+*+)($&')''!%+"*&$%$"'%+*')%$*&$#$#(''(#'"(%#+((!&+'&''+%$))+$*#)+&(%"(#!(%)'"+'%+&*'!*")(%%)*#+!&'+&#!""*$!)$(((+!)#+'#+%&+(!""#$(*'!))'+&$"!)*#(%+$$ AS:i:-61 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:26 MD:Z:39A25A49G0C0A0G1C1T0T0T0T0T0A3G0G3A2G0G2A20T46A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5703 42 58M = 5761 228 ATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTATAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGA B%&D::$G:B)G9&G3>A/)!$%<##$:40<=,E11!&76$@AD15G,930E0,''#A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G26 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5761 42 170M = 5703 -228 AACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGNGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTC $6E53E;,,#0G773),)3-2<"#?9'/.'$4+2E3EG;F7"*A20589#*>38*E2F.,@")&'C-D%=C39?*38;.&F'-2,?H'?5;.371=&)9,(>;1E00.)<<6%+"G'(*0&-8<+B,3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G16C113 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7715 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18386 42 73M = 18459 635 ATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAA EF3)C;B6+>"4@C/D<)7723?$?2>?+!4("F)D,)A/15$7)A5D#<595261B$3--"51F5%/:F%:( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7715 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18459 42 562M = 18386 -635 CGGTACGCTGAGGGCGGATAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTCACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACNGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGNTGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACNGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCAC C=3!#'=#H7)'3E9H6=D-"?7<;'20+>H-3D3F!,/A)&-:(7E(E9%&-90%E-E(%!'G74&"-$<)=6FA*4H,B=&$F&@3;AA3/(9:$-ABD!#CB<32F/4#9&?'2B9B>$D1;)'6H8#>)(-"?B8AFB&'0;@%%=7).DED-E8(.2&6"22B$$,C7=9<%/)90C+*514="-#6'=3>GBF)4=8)D3+6$',>H8+EF6)5C%%EH"&81&+A,*$15B'!:#?=&AA+'#(6)%%D*3'?.',4@4E@<>@37;)2527-?:0G"@.02#>+9$$'8EH*@GBDE%C@/=0'"(5G2.-"+0;545).B#7"*%'?+<810*G7'2,8'GE$C<257;.;6F(!)).3)FG+:G3"*'?/F.5>C&6?<-4&G4%((A&8)"#G=EEH>)E%F=.)HF?>7!,4D=3G?,4@:C;"-?A6.-%*:'$*D9 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:18A98G21C46T45A186A142 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7716 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46205 40 149M = 46354 328 TGCTCTGCGTGATNATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCC 8",":4.B,H+1+A.>',''A7!?/0CFA)<;73#*?5<"*';+:C)H&(..9#5>?:-4G99+D+1/3@?3+6+(/758>%+6C!+@!(+E#B1F?-B(,0$)+.H11@*!0'%&*0=/C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G18G116 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r7716 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46354 40 179M = 46205 -328 TCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAAGAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGANGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACNCNNTTCCANCNGGGNGTAGNTNNNAAAAGNNNTAAANNCGNCANNGCCATTTN '**%(*!'$&*!*(#)!)#%(#&"(#&'$&!)"(%"!(%$!!(#!'&''(++&"'"!#('!(!+*+&&($")!(#'!#&#$$"($%''$*!%*)%!*()#&!%'#)&%$"'+$*"$("((++"("*+$"%))&(#%#"(&!#'$'!)$!'!%%$''""(*%%'!$'&&!""&'%#%(&$ AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:28 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:28 MD:Z:29C59T35G1G0C5G1G1A1T0A2A0A1G0C0C0T4T0A0A4A0C2A0G0C0A0A0T6A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7717 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40476 40 87M3I22M = 40635 288 NGGAAGGNAAGNNNAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACT #)&$'&#$#*&'!!+$+&&")"&+(+)#')*+#!"((+$'"'$")+)$*$!!&$$)(#'*$#"*"($#!)$)'*)("")'+%!)#+(&!($#(!'+###('$%&"'"'+#+# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:0G6A3A0T0G95 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7717 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40635 40 100M3I29M = 40476 -288 AGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAAC #=;*.8FFC4&5C%).."G.50A.;15E/0&D=,('<7*54+&3-8A.($-A;!H>@873;0%B/+#8=$"A@0AD(6$+3H#C<;0-;4C(9+&%EC:(0$D/8?1&9#-*'0.,2@/HD"%'?C6G.09( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:129 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7718 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31653 40 138M = 31532 -259 TGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGNGGTATGCATACATTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTNCTGGCGTCGTTCTCGTNCANNTATNCAN '"+%*$($$$&)""!"'&"'&"')#$)"#%$''"!*+)+"**%'**+($'&(()*)#+$(+(%##&##!'''*%%$&)&"#&$$"+*""$!"!*'"%+"*&+#%#+&*+)%!$!$$)+&$#**'+%#*!$!*#$!"&& AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:33C4C6T63T16A1T0G0T1T1C1C0C0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7718 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31532 40 8M3I50M = 31653 259 CGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGA 4,;%F;@D'<9?&6D->,?36F6.>99@+(%4-?E(20%"5D+99*><1*"D"$-@"<"5$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:19A38 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7719 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14880 42 76M = 14996 186 GGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAG +'!"*"+*+$)'""%&"&%*#$#!*%'(+("(&'#%$)&%&+"*)$%!)***('"'*"+$#&'!&'$)%('!#"$* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7719 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14996 42 70M = 14880 -186 CGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAA F<*7A3&9<':!5%-#7;13DA00>'%;2(HCH*A(=:@D4%;F"/9H(:3D14+>-E787;,+G93*!3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25122 42 164M = 24958 -328 GCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAA H>-9!$H?)/9C2944)B2H;>(447)F6DGB>3B:@D*%5F3A1+1$!2%77<*/@9D5FF0949H>'1$G=B7'3?7'3'8!,'9.F35$.%"G7.6'?!EGCA)#%<,>#',089-579C8&78(1.@C!-<(2#&%+EAED.E,9'E+"..1F)*)3'=<3&58!8-,429(!%+HD?&*%6$%/3*?C5B(:A!F4G>899=,%6F(<;4+?D9H?@(G##)&%F9-GFE-5*($1.,6&H&/$(25?0-0#>D/:'78=$($'(961>9H#1A;H>'32::H7E>5C@%@'*D@07*"*A6$E)>9F$0+B--,1,-7.>H663&(9,$%E=!E&;:?(1D3*5/#@<7>E4H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T111 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7722 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34026 42 180M = 33901 -305 TTGCAATGACTACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGNCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTNCTGGTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCNTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAA *))!!&'+($+*'+'#&'()(!$$*(#!(%%!()"$+"+'(!'%#!$!!"'(!((')!+"($))+!''++%%&))')%)$*%&)*+'&"%+#"('!'##&&!!"#(("$&"'**#($*&+#&"#(%*(!!&#&+%&$'(''%!#%%!")'!%!+!#")&!&''''$#&&$&**')&$!(+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3G5A32C35T3T27G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7722 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33901 42 125M = 34026 305 ACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCG C/A#99E*@9@.5*8('3H->B=.7D71,$=>,,5)9+#>*(08%98692$)$/E/6.-."'!??0$9100)BF*<(0(BB'H,*570-"<$.78@C.$".+:;>DH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7723 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30533 42 32M2D73M = 30366 -274 GTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGT )")*(0':-:F9;@FF(8)1G#1@*A)#-%H;=@577:@=/@=G(,-F)G>+BFA-F:C/:!/3!38&E.$%-""G464'.'?C#G<6H-6"=A-#1#('C=0&C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:32^TG73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7723 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30366 42 52M = 30533 274 ACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGA 320FC;&?1@.-7>;2H")A$4D"+%'BB"D(2$<=?":&4F1@2?6/-H?5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7724 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39239 42 256M1I16M = 39511 373 GCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAANATCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAANNACCNCGACATGNGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTNCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAACAA %D58H"?D9D=<*$%@4>1##H7=.:>'D033*!7"9H5/G945$$>?3GFDD72B%+<$B.*(D"89-'.&5"()E$2!*10BD!FBFCDD2.E)()*A&9*"9!,0D7E37:B?>?H.3(1'(47-,/C'!@#??55;E259?94BC>*74*%<4><+HD'2BG7$$37<=G2F5<-F77'2D(!,,+!G';B/-1!>0G72+,GC.:280=0??+D-+"10#GG+2A48@B@#'EG0$@%?A(.>56+D@:3)G&1F7=$'=0/*#46$27.?G.C-<=-#%1H'G?A<: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A58 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r7725 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6837 42 100M2I55M = 6720 -272 CTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGANCACNCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGG AA:F=$C(?G4A0>G;;$&$8H>>-D)?D%,42*&*1-)<;7$FH,BF18:D-ADCG3!9$E/GDF!E==D&=2?D-4-0+678E-A9B7>)@0:--C>"+9>66@?0!5E+52)/;;A@C+D+9H>,D&=?H(=;7$0FA814$A?C:0"/E21G@+D+C"1/$?F3FA,@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:70C10T23A27T11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7726 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9027 42 186M = 8881 -332 GACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGAGCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTCG 7/#,#-@,<".GA>$!D/(')70;H4F-A),$32.$>H.."$@':FE)%86+@@:5!$%16G5805B%C"E"6739"G$E2G==;A;%B1,?C#6&B?BH:=3#?8'6CB:>*,>'0C8&!H>%C2/*# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:136C11A35G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7727 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21859 42 70M = 21771 -158 TGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAAN <>+8E,F@%F1/:%G3G@BBC634?2A4*7">4'6)F$'H5%)-%)+?2%%H2;(98@C! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7727 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21771 42 44M = 21859 158 GATTGTCCGGTACAGCCGTGANTGCCGGTGCACATGCGCATACA !F4"/(+09;7:!-0:1-0,)%H:406!B9>-C',';5%D*H!6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C20G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7728 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39531 42 268M = 39799 378 CAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATNCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGAACATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGG #/B>,"?#HH;2(/*;"13>)-E?"H3#B,4E8H=#-2260?D#F$D;A'/5H+@F'2D:D"9H=/4=4-28?C>,)4956,&<>3&=+70$H2>F>*"2;;;<+40>D""1BA(0?> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:98G67T101 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7728 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39799 42 110M = 39531 -378 CTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGACTGCGCGTAGCNCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGG HA+<1C3H-?+EB2H/70*=++5/2H0)8GD#:>?,:/+D.6H>+@(H=B9)=1,3.?>8.+";!9<5."+*@G@B/B"-=)+=$%7)F$:E;!?+>:=1-=<836'#0B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47A10C51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7729 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4678 42 237M = 4678 0 NTTNGGCNCGCCGGTNAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGTTGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTNTGNAACAGGCTGCCAGCGAGCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTCTGCGTGANATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGGCATGAACTGCAG !(!#$*"*()'**%&"+("#)*"&*"**%$+))!"'&'&*)*))+!"!!**($!")$'!+&&+'(##&)'!"(&++&*#'"#"+#'"!'+'&(!(#)!'!"#!%#&&"&'#!!(*""*')*(!(&%(+%!#*)))&$'&(&%**+'"%+*$(%$$!&"&'$$+*+)!&&!%($+#'"*'"#)%"%'%()+$)"'*&+%+#"''***#&("**"**"'&'!"+&*%$$"*!*#&%%"$ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G1C0C3A3T3C33A29C2C16T87G7C28A12 YT:Z:UP jpayne@0: r7729 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4678 0 * = 4678 0 TTNTTCCAGCGNNCCNCNGNAACNNNTGNGGNNCATCATGNNNCNGATGGNGTCTGTCGGGGCGGTCTGCGTGACCAGNCGCCGGGAGACGGCACTGGCAAGCAACTGACCTGCA ''*!()(''%($*$$!*"#!$'"$)'#*$)(!!$'(')*##*%(!'(%)*!#"+(&+"++#$$!""(#+%(!&#)($&!"''"$&(&)*&)+'"(**&!$#+*'!(($$*$$'%$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7730 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7899 42 93M = 7996 253 TGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGCGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATANAAGGT ?$D>A!:>!/>9H!3"'2$,-?=9%=006:G>*H&".#+E&.;0AD%BHH#'<&'FE!4)<75:>D)E.,4@:HG>/7C"4F17+@&27G:8;65C%*?&%-$+C#&)B?G>?;E44&.A-#G3>796D7FC%5H)&:>9"0E;B1?4E0<99;+(9",-)(-//!4,'!E+1=81;CB2/*;,3;/%.HF451" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30G4A119G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2886 42 41M = 2572 -355 GCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGAT EF>(3.95&=C5+#)%7BF#= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7731 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2572 42 314M = 2886 355 GTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCGGGACGGCATGACATC H%-=GG>C#@-572%CH1;)!)%<(+4D,'F.E%6<$>*'.CF62(>F?C<5+<"?<(9!-7><-$,F0;(C4:84DB)?3B-'%':1;!B>69AA/".<24F4%1H8>0$A!8%;8#102.9+D3%#19';)$454@:%H;'#565B%>A2%?HEA3/+E);3,D.%(2.G=5<1&&;5:,D%//1C'$7F29HDHE48C#(;2.7@)25?B"%*C@7?%.4G+B"!'.$F= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:298C15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7732 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26574 24 113M13I107M = 26519 -275 GTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGANTAGCTTTAAGAAGGTTATGNTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGNCTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAANGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTGCTC !+%""'!##)($$$""(!$#(!%*"'&#**+*++)%&!%#$#%*"!"'('$#$((%)%+(!)*()('#!"#$)+%+#+)!(#)+$(%'+$))%()!('('+)!(+'+$&)!+"("(!'+)%!+$)%%"+*#*!(!$*'(""&!&%"#$$%#*(""&*'$)!&(*'+**#(('#$%!"#("%*$("("%*#$$#%+(&&+#)*"')+##"*+#)'*#'(!#)$)&!#"!+#%($ AS:i:-53 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:19 MD:Z:71A19T56G67T0T1G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7732 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26519 24 55M = 26574 275 CCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAA C?#):>3+G&A6,62&A=;&:2&&)8;3/-$%'69./5HH45FB.2,$.()D8#8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-53 YT:Z:CP jpayne@0: r7733 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30890 42 155M = 30760 -285 GGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAANTGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGNTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACC <)"BA0$)**:-.D@!".D>/:!5!2#:,9+(,H-5%,4!>HD#.0A/B4<$;3C=ED(/#,*3*&9C<*+C#'3'4$@?BE8*131+)!(0D=*(,89'D.(C22D/%(2@78B=A,D:;9E5733#5DA&-")H3G7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:99A25T29 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30760 42 85M2D43M = 30890 285 ANGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCACAATTAGCCTGACG %6'56E#)=1/;=H>9(02)& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:1T83^GG29G13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7734 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8530 42 93M = 8381 -242 AACTGAGGATGGTAATAAAGCGATAAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTT 0('8;82.A@=)6C=DGA(@'$@2#"A>D@B9B&;E<1,5D?B.:!%5$F.,;'D$;=C+$"F#G;A?3$0+;A($G'639*C<6E5%,@@3% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7734 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8381 42 63M = 8530 242 CATNCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGT $%##()+#&("'&+)""&&!()*+&!&"#!!"(#%*'"*#$&+(!%"&#$'&&++))$("+"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7735 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8406 42 53M = 8615 272 CNCTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGC "##++&)(''&)()$%&%(%%&+'%*(*!'!""(&$)&#%"%"!+%'#*&")$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G0T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7735 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8615 42 63M = 8406 -272 ACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTAT =DF*?<"(E7*(-.;0;;2'3"*FB<9-&5+)DD&5"/52;>A"2">9)0C<*<"817D4=5H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7736 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37635 42 53M = 37441 -247 ATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGA G40&75&3)+.*F-G=%B!@"%'(?3..689+*?G"0B-<-2715/?3%.B+1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7736 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37441 42 43M1D25M = 37635 247 ATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGAGTCATGGAATTACCTTCAACCTCA E>$*E$/?1%7G+@#(;?08'$)!1G*18 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:43^C0G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7737 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45518 42 43M = 45298 -263 AGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAA #"!!-!%B"7%F5#:#':=AA:9#56@(G*%,'"@A,(CFD"79AC(=(0!?G27,"5EE@D>4:9:)#4$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7738 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37474 42 10M1D124M = 37329 -280 CCNGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACNTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCC +%&*##")*''&"*$!%$(&'&##+!'#$)$)$($%##*'(#**)"))&!%#'$'$')"!!*!)(('#(#"&'++*''"'&('!"!$&!*++&"$&!$+($')$#+*!&%"&(#(!$%*!#*'#&$("*#!%)+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:2T7^C83C40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7738 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37329 42 145M = 37474 280 TAAAAACACCTGACCGCTATCCCCGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAG &)#D6=,47968"28E1D&9!805B2*9C42A@.B1ED-?1-B>GA;+H% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7739 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48027 42 329M = 47961 -395 ACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGCCGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTNCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTT 8<2,3?+G1.(&$.#(D+6)"7"+A<#6$-43'<)4,F*.9>964-<"*,01E7/:76F'6A+>80'B4H5-04C;!<+1FE);(8<5$D($'.?.B78/B@"2''B*D>5&<:$7$=(8,;9?32&/-;6,@'<4*?$G.2$;.B6.,A;@#6G18 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:139A69T119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4829 40 59M = 4605 -283 GCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATG ?%1A%(F*&FF''DG3;/>>A-(,*B5"G?CB.>2);/2=<3@<+.B*2F:,3A8*=''<6C0$*B.D=*$%G$(23@B*7#BFD<$8*D/HA.37@3H!(311#/@&%F#E7D'E?9#=5/5;7%2*H*>'#*-F./!=+7'#&+1:DD4A%?+1!,#!2&7#0<#*!-)'D�%&EB4"BA&C%76'*!7)8A$C@C2*=DG.C=%F*C8A,;-!@=-43B*2<#"#8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7742 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14986 42 95M = 14837 -244 TCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATNGCGCTGTAATTCACATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATT 73?;5:%$(+=/'=?<#B78C!/5817*(8*F.1E?671;0,71H'$4-B8D4B00G:+E=1/03E1).7@0C'??+75:>/-#3&/H93>A@;5 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G13T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7742 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14837 42 149M = 14986 244 ATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACG 4(@1<=09./7&%@1B5A2*7/7+&'!*:,D)(G>&::.1@5"6C5/A>67:,@E<$4($E0%6D%<0931/&(F:D0#A(6-,349G!G:6,'CA&!<@E%"=86$102A!8$?#-H9,D0G*9/-=!6C5H?G429)2C<7.% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:149 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38439 42 273M = 38180 -532 ACAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCNCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGNTCTCAACGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACACCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATGACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCNAAAATACTCAA A)6*/(B:.--A59A-+$(B9+E#?*H%,;;/C6).'>;7'?@@F/""G?1:"+H*A43'>)4,=+>1DD;G-*<1?.&/D174715.6.:B!(25BE0*(.(1D.F4/A%0;'@(C"),<=37<3C2&E0741*HH?'>D?1($89804>,7/)F93(F>>!,<)BHB3@F<4*<7H=#)D78)&9C/-07%;C/8G"6>G<28,.*-6*,%,? AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G32G36T6T89G52T39A11 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38180 42 64M5I195M = 38439 532 ATGGAAGCGTTTATGCGGNAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCNCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTG C6&>3??GG$:H""+D"(!(%@+:@B7$5,F%?#16$C.B&)"+:7!0B"H8%9D*-+3BG'&B@4F)7GCHH"G6;&3+!.*A50):0#:39/H$*=%FE+6&>@99;,)@.DA:,D*928$9=,2,@C1AC&*=/@#C&$C@4D/*4"G'<8=*B!?4//H/EE1;8:B)F*/00+'H3C:*601A7@=4;(@G$!!7$A6D:14/9E"-%G9*.B"<<0C/D@"!2CG75F837>G+H9CCE$/5*++H$>H)$2#)(-9. AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:18A49C190 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7744 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46497 42 170M = 46358 -309 AAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGNCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTACCTTTGGTGCTACTGCT 5+#=/:!-=-7(;H3AH*:(3!:$,091-0CC&>D-$3;2:5>+#(<(0-?"%0G'(?+A0?"4F3,!(/'7@89?H!9%%/F%.H.1$&0/7FA)?F478H)72306D!D8=0,??!9-02++6;D'G@3<4%A7:")H)B40D:.)?D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91A64 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7745 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46381 42 48M = 46468 243 AANAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTNATGAGCAGTGCAGATAGA +"(&'#$""!+&&%%"")'"&%!*((&(#*&''&+#""(#$'(!))%* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C26A18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7746 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44841 42 71M = 44998 243 AGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACA ?G928&>.*&@#!&D*.#8"1,H=9F.3>HA:@)0A.09"?FF5%*E,C64,>>:?(/*1)2;#A=,$@G@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7746 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44998 42 86M = 44841 -243 GGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGTTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCA -?":-@E?C22DF&/B."A+0E$#B!/6:98EC@E:'$+4*#81?9G4B,.2!"C@6*7->!ACH9$F"1>"=G*;+-("1)35H> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7747 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10394 42 86M = 10222 -258 ATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGA .GB"%?D:)=%?-&:1F;D*,-7304H?+2F0%#?2.5?:C<1$"9907AH##<76%''&40A3!?*/=;H<@?!=.4D"+.6$)> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7747 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10222 42 100M = 10394 258 GCACCGCTNTTANAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTNCAGCGATCCG %8'H%D$A=>69966,(1.@3C,851=@@'?'$?$'*:?-*56,CH+:?FD'%H@D3E=<<-,8(;@'98/4(&H52%'?205&/C,G39GD:/EC,DC12?38.,1-;3:(>&''0)+HE&'+">B3@&?3;24BG4/$>"9(,H#+7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G9C84 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7748 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39434 40 61M1I11M = 39262 -244 TCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGANCCCACTCGAGGTAAAACCGTAACA 6H'4?-.67)+8%+E3=!2!>DF?260!+-H5$B,2)5,&/.3:@6D5:8))48/2G,DB:(+.F-<=-: AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:48C2A6A0A1C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7749 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25872 42 188M = 25745 -315 GTCCAGAGCNCATTCGAAGCAGATATTTCTGGNTATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCTCTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGT ))*)>CH?$$C.1G'*(&%3.@>3:0H=#CD%(C($4<#CB+,GGD1*9=5H<&10-GHD!$7'&4:G*$1>8B;H8B)485@1&'E<"<%<(.$)B#0($!E+DE1CF/.=;?6:'4@?/21:H=)$9AB;--.?)D6?8;+)*$B'*6F+FBF455(8?(@$,H0HC"-H&>$DH>E):9*:62HA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T22A38A116 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7749 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25745 42 127M = 25872 315 CTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCANATGAACCTCTGGTTCAACGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCAT 39<+06!*8!:E*D5H5?)7,@.H>650A;$C"*1=2E.@A%F3/@C,3#74*7C.(H>;(6))<53B2*7,H)8&8D(92&D(.29/@:8&!'6F@.378B+/C) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A66 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7751 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9825 42 60M = 9990 250 GCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGNGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTT (%+'$#''*'*$"*($'##+$(!("'"&+%"#*')$!"(#)'!#("&+''!&((()'+#& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7751 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9990 42 85M = 9825 -250 ACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGNGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGA 9F!2/-44DGBEFGDAH82-AH:;7;?CH"*>(3%'!1/8?%D6D03=D6F!?.9=6A!G.=,H"7$G%?6'1-;7E&?#98F0F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8303 42 64M = 8125 -242 CGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGNCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAAN *1<.DB1#9.9*?$CE1@#$/$'<$)%-,5'))H<99G0?6+1);!="E(GF' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38G24T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7752 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8125 42 71M = 8303 242 TACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCNCAGGCNAGAATC :+1D%)H)/E<%HG8G=3?)8G&G"H.9=%H1($0-,=DE47#HA/$/H!:>0;3)C9E9?31&=;3AGA5H&HC1A;/3E9(4'-&*F7%6D1<95890B$;&C$E>$9?#1A'1*8F)3EHFD*7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79T18 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7754 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43070 42 221M = 42991 -300 ATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTNTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACG )@$4*7FB9@/32)=.;CC8,?:7@=G)&AA>B@H6=H%&;2'G9$=)8F51>B&A,&=+71;%;()/;#89;#E0G-4='G>*6C%D#;/%!/723@$%FFD,9@G*(,B#*/%/&/G1<&"H?*9*>>)/:-)8!/GE;#.A6:>*?:4F5;>$(4$?@*05.32>*D@.E')/>6=615=H-:-*F*/3?:&+#1BF$D5.G/7BH39(&5(>5>>E1E+(; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7756 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36583 42 152M = 38918 2375 TATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTG 9AH-2%B(C,#(F(7;;+%:(=.-$4!'8C5DA:A"A9!$39,(G6,?$(=B$B!%'(6;E$%!40*DG&E1F.3)=!@GG2)7=3)<8%64C&G>H@:+(B>"G"41&"/%*$8F)6=9>$F@)6'0696BE(C>,7CD9??!:.@>8/7( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7757 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12306 42 118M = 12226 -198 GAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGACGCTGAATAACGTAATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCCCNTGN &)*)$*&)$!#*+%&"!#&&$!!+%&$*&#$+)($%!+((#))#&!'+!$$+$*&&$$!&#%+)!#!+%#'!$)!+($#)(&&(+"+*%)((')$&**)'#'")$+%!+'!+#'%!!( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54G13C43G1G0G1A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7757 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12226 42 48M = 12306 198 CNNATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATG $"!)+&$"!)"#%+$(($#%($&#"%!'*%*&%%&$++"!"()#*%%* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G0G45 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7758 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24020 42 275M = 23956 -339 TTGNAATGATTCTTATCAGNAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGGTCTGCTAACACGTTGCTCANAGGAGATATGATAGGGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTNCTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGNGAGAATTTGTACCACCTCCCACC H$@@.3>GA=$8H/+#"5-)%FF#821%"*$!1'!/"9'@:+E2DBH7D?,*-,C+CE%(;)<,"!C8/D#-,!!/;GB"H-AA?"7+!@H;+7&);?5D?01970*92)!E?%&'-5$E:,A9HA3"&'&*7D1".!'/#8F;5615=&5D=*41$-$=6>%$=C+CB=57'34$6A<5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3C15A85C19T10G3A28G81A23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7758 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23956 42 64M = 24020 339 GATATATTTTAGAGGTGATAAANTTAACTGCTTAACTGTCAATGNAATACAAGTTGTTTGATCT *+;D">34,E$H;)D+>>DAC+5@F55F>!,4.3886-C*2CE+?/+H8CD&%14>)/@,&/9$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A21T19 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7759 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36772 40 43M = 39015 2316 TCTGTNNTANNCGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAAT ('&)$%#$&!"#)+$%*$()$(%+!((#"'($*''%+&*&()& AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0G0A1C0G0G0A1G0T0G0G0T30 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7759 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39015 40 73M = 36772 -2316 AAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAA 95)0>2)!=B9"9(HG#H8D5*;G->C:+G'+7@(7$&1D&,1(13:D,+&9!5<840,3?(2=3(AB2$/25D*&933!41C$AF0 YT:Z:UP jpayne@0: r7760 141 * 0 0 * * 0 0 TGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTANTCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTACTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGC 6<'+61,:/+H9CF<3A<9DH>+52;HF%-+@0608'7C!9B%E?H:?03@'<+-1B:)#BA8!>F'73=&8?7G:"1C74+79"""&A>-!+<;F+4'#*E;1$=;F#A5.>08%5847AH$;D)9>G<"389C9;$E1"EC1(BE.,G4D'AF)>$( YT:Z:UP jpayne@0: r7761 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12693 24 75M = 12807 255 GCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGC F?@+A88(:6'$(C&E<@+5+$@0&E>C5AH)!BHG='GA(?;$2.-*A=DC=G<<'>23913@?E658&$=?%C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G50 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r7761 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12807 24 8M4D54M2D73M = 12693 -255 TTTGTCTTAAGGAGGCAGCCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGCTTATGTCGGTACACCGGGCAGNATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAA F4371&(8<9-5,5<'&?$/6@;($A#32)0"20*.&$6=121621$@7:1!+B.9<,15%($8F5:/*/#=7H7<7CA6*FA,$F#//,,*.G3>26F-G/#)C/)$?(+2%F7C&*1$6,=@>B8*B7)" AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:8^CACG9A44^TA11G21C38G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7762 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30155 42 135M = 30290 360 CGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCGCGTTCTCCTGGGCGCGGCGTTTGATGTATTGCTNGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAA )1!ACC;D=D-%'&(5D>##"/5"139:!1@!53+74"G,*3A+$*&$@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65T11T21G35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7762 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30290 42 225M = 30155 -360 TCNATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATG 3GC@(="26B/90,HCC,H0:6-D&"E!)!1*;4,EBE1*2@+HC6:"6420B,@2"=;0+FC5=#>02---"=:7-E""FF>9(=51;2;;#2%#;@B<=@@G4F'B%:7C,0//DF#C%.;!+6D"A$=B-6@52AGH>((4E9@:$9H%'&(?6#A')!2(%(#:2+'2065@"8FHG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G222 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7763 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31340 42 94M = 31434 366 AGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAA #A6C+B*!)E8:(6%;GG%#6C98:=@B"5F?/12@1;#5>=.5D@9"AB81*+2*3G?"B=/C0>9(28D9HG,8"5A.-?92-7&B, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r7763 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31434 42 106M3I166M = 31340 -366 AACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTNGCGTCACCCGCCNCATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGNCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTTATGAAATCCNGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCANTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCANAGNTTCGNCG ++#*(+!'&(%*%!*$*&+#%$&%#&(#++$"$)$)#+')#+'''$(%!*))%"+$!*))&*#"#)#*%+#!&"(+''''&'$)&(&#"#)%*(!%(###+'%*+%$)%*)%""(')($'#&('"&$&(#'+"$'+*'+$'''+%&+)$+(%++'#&##!*#$)*(*(!)##%&)+!""$#('('!)*'"*&"+&)&$*"%$(#$%+$%!!"#"+&!*+"!$'#$(%*%%*(*$)+&+$&(!+"&+&(#"*'!#++)*%"%#++"**!)*$)!)) AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:14 MD:Z:98C9A8A31G25C9C41C33T1C0T4T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7764 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24415 42 85M = 24632 258 GTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTT /<0?91;4H1E(>%<%!)%#76E::&8)$3."/<5#5'!+0B6E.%%<4..E&6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7764 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24632 42 41M = 24415 -258 TANCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAN %8596-/:)!1C*2#:'$H=E78.#9+4DCGGH%H/B9;<%G2AC!54;")(/-'F2+4#,!*>8EF;#.6"1=4#?A(E2'.(+'!:+'*0$5"9-3>>0<4$$;G6'+9&D0(H/8DD38$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61T14A45T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7766 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9474 42 108M = 9335 -247 GTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTC :&)25%$4))-01,11!$DE"D7.'/>91D4>0)D=CA=2F6'43,65-2'05*B(C<26C6G!-;/#@7B)?.49?-30=/B<2&BAAC5(3)?!5H7-08'H%7HG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7766 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9335 42 50M5D84M = 9474 247 ANGTNNGGNGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTG #!)%##&)!%+""(+)'%&&)**)!#&&#+*+'"$)'"!'""*+#+)+'%*'"))!+!%"&"#('!%(($)!%*&)$""**(#'#+!$$+()!#&%!(%"#(&()(+(*&)*#'$*'('(##'"+)*+$+)&*( AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:0C0G2A0A2C41^CCAAT84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7767 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33915 42 108M = 33761 -262 CCTCACANATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGNACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGATCGACATTGCTCCGTGTATTCAN 4C&G+7=+#8<1#BE10F7E-/!>68,C(=92$C6((.(48E!5G)<>+;B26E3#&>)7<8G'BA,AD!FC)!(C-,5=*0AF%#/A)&96E$="C@A6*H=7<9;& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7G50A26G21C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7767 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33761 42 68M = 33915 262 GTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTANTNTGGTGAAGTTTTTCCTTTGTCA :G$(!5@E/79?C&A=('A@:*D-':1H$=$0!!"D.6/.&@2,7.178%8,'?0%6?)AHB9&D+F@!;8B456*(-5G8"-">B00#/2*9A*7C>!@)+A5+< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7768 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29271 42 64M = 29438 223 GACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATA 5+D9$(3:.4,'8&5?.=A!@A5/+A9C)8B,@">&@GC#(6?7+E36%=C6F-%;$CD@,<>: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7769 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 203 42 42M = 252 250 AAANNGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACC "*&!+"%*)*"$"&*&#$'$#%#*'"!(*#%$+#)&#*)()& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A0A37 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 252 42 201M = 203 -250 ACTGGNAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCNGCCGTCATAAAATGGTANGNCGAAAGGGATGCTGAAATGGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGGGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATC 3D:%24$"::B/;;,,-C#C"C2?'1+@H%6.0*08>B".6*;D-*0GBE-:D6$-04=*>7(,-=("!H9&!?"'$/,+?6>A.$8="C=0),C)-/=%0&5?C?#">=8,60,#;!?2D9&A..1@G?4"C&;7G>(.@(4CG5!B,%)<>%89%!)+H(&5@133EHA6"=!7)@8*-E6B&1'%85%";#=2%66<: AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5C64C17T1C18T22A18G49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7770 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23580 42 17M1I53M = 23429 -221 CTCAATGTCATTTTCTTGCANTGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCT +.<$B?G>"'%1C(:.-F+').E>++C0.+)7H4&?-#!B549!=)>B04$.0DD.@F,7"E>%0D7)(128EF?7B1,860=77$G50F-<,1..7'!+!:.,3?60;?BH%4($>C-;!*G?9,199GG1,#-87F21F2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T104 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7772 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23766 42 233M = 23661 -338 GTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGANTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCANTGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGNTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAAT 4--2H#B8!;8=/=7(H0A!AE8!5#2G!+7G=?F<<=BH1-&87+9127$"?&?BG-?D):+%";F<8>*07EA!:2>19A;&7;;/?-3?8:-3);HCEF$*4)GD#9!1?,1*>#9(25$9@:A'@&D"@H*4(:1)0,')1B>+#(-#.;A.*2$<=A7<15<&%(!.7&.GF;HC-A@F=!C$-)FE.).#/36%D<=<:@2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7774 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12543 40 58M = 12794 325 GCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGNTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCA 09$0'4DDE$G7+%)(G?$(6!95(;/"&F9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C22 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7774 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12794 40 21M4D49M = 12543 -325 TTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTNCCGGCTGATGC ?-#;9E>C$51.8D10"<<104%D+<):&B'C8-F'3(!@6H&:);4G$%)2!D6,4/&+58>B88&6=E.G<9&."E>362C/'('02/2,2=.?F/<5G#@3*&D32/-/7*3?-(!>0G0+EC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:152 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7776 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42643 42 553M = 42491 -705 AACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAANGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCCGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTNGTGTGCAACCAGNACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATNGCTGGACTATCGAAGAGTGCANGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGNATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGNAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAANATGCACGCCATCGTCAACGACGNTCTC $(#(#))$!&(#++%$%#&'#%#($(*%+#($'*'#'++"*()*$!+(&)#+("(+)&!)+&#&$'+!*()'%)%*%#%#&"!%"#*!#$"*'#&*'!*(!%'*#(+*#$$+"*'+*$'&+#(%'&"($'#!$'%&+%++!'($!)"$+&'+!+&"$'"*")&))#+($%&)!#!&(*$(('#&$"!'!*"%"+(%+#""))+"&#!'('(*!"*)$+)#!#$"*+%#"!"&(#)!#"(#()+)"%#%!!$&+"(#"#+$')(*%##&&(*!%($#(($&+%'()$%'*'$(!"%*$!!#%+)")*("'&)&)$##*"$+!%+'&"+)!)$'(")*'*+(%$($"&$!%(+)(+$**+!*(##"$'$%"&&(+%'!$*%%#"(**%+&!"%))!('""%*$%&$*$%#(*'$+((("!"+&"#%%$)")*'*(+$""!$#!(&&"*#)""$!&('+$%)%")!'(%'%%!)'%"&)&%"""#&%'*#%(%'!+(+!%)$(%$!#%"$%%)&#!(%))'!!&*&#+()*)#(&$#*'%)+"+'"*%#+&&#)*) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:55C85G60G12C95C21A62C61A66A22T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7777 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39118 42 57M3I188M = 39072 -291 GACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGNTGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCT ,?2F1@45.*#>C374#*%2H(.<&<7##8D!324)=/'#(/,,(+.0H7%2F+4>!,;:':#;=>*";3-=8FB.D1H"2"0$C;%56!!36(1F/2H!=D,2H';=)89()G219,B33B&E;&921=D(C@0B:65"!4:$6.!F+H;3@F(!;F!%F($2B678+FCB)+8)"A?/5047-;:-=@3#61BA/7*-<89F(> AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:168A76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7777 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39072 42 46M = 39118 291 TAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGG &%0*+5B&(786"/=8E**(C>+-+3=;$&<"/;2=*:B;$.5-8F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7778 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37029 42 120M = 37149 621 GAATTANGGAAANCAGATAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATNCTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGG $+((%*'(**&'*'$"%%+)!"+"'&)*''(%)+*(++)++&"%%""'+)'((%%+%'!%''&#&#(''$%!$(&"!&)$'$*)#!#+#'()&%++'&&!+#+&(!$&"!&!**&&%*!! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A5A4C61T40 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7778 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37149 42 335M1D165M = 37029 -621 GAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCNTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGAAATCACCTGGCTCAANAGCCTGCTCAGGGTCNACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCNTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGGTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGNTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAG &)(C<45#5)&%6"0&%2<2:1@GF4D;G0)B$59BB*$4;?5%>431&GEF5'G*242)*)<+#=B$86?>&%?$:@19:01@"$&)#,6*>9G=#EB-2+126:%"<$F>#6E'<&$B&1&:)#-<..D521H@A80A<"084*4D99;D/B5=<8.*;'GH>1'*3@5"D'CH00DA2*3&)7'>%,;3')(0HHD$GC"/0>E?E#+"?=A<<9044>/A8(3(7F1*:%D!>:8@;264-)3%5?A81+F+!7('01B#<,!6>5);F&"#76#A7%,-+8)'+(2>",0(A'H6%<68&,.A29,A17@+4>':A4-C1H2$CB-!?A!1=!?#4"@03.@;:$"FA(2$24>.&"2'H;?)%0H327'$3C@"(&?17>'A5?/?>.4=6*G<%!G+%*-'&&B*@45C*!:7#%FG;?;->-=&2E87CAE<&4H$B*.18'4D3H<#, AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:59G154T54C15A49^C15T45C26G76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7779 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47706 42 67M = 47706 0 CTAGATGAAGAGCAAGCGCNTGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCNG +*('"$+)#"'#(*"("$&!*)%)&##%*&*'$$&&&*&')"%('++'*!#($$$&!"#&#)'+("! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A45G0T0 YT:Z:UP jpayne@0: r7779 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47706 0 * = 47706 0 NGNNANACNANNNCNTGNNCGANNNCNNTGTTCCGNNANCCNGCNTATNNNNGGNANTTCGTNTCNNCNNNGGNNCTNATNGNGNNCNTGATNGANATNGNNNGGGANTTCCCCCNNACNTATNTA "$"##!"$"!!!$"##!"#$"""""##!$#!$$!""##!#$$#"###$!"!!""!#!!#$#"$"!"""!#!"!!$##"""#$"$$"#!#!"#$#!!!$!#!$#$$$#!!"#"$$$$$$$#"$$"#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7780 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25479 42 47M = 25241 -285 TTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCNGAATCAACGGACTGCGAN #F3.$CH,0<4)%FHD-<+'5H'F*E/=-0,2AAG7,3*:-B-D)*# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T17T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7780 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25241 42 61M = 25479 285 CTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGA ,(7A'<%8/-@F6*-)CB1=12/)$AA)C.8%?DC*&<6=6A%66%7EF@!4E90,+0EBH3?(6..7'#,($#=(4G/.:848);;*(>7$0.?94?9%$*DC7"/F-$/'-'0"!&$;.?%.<'7)*6&@(F(?285,2+2=E& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T70T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7781 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35649 42 41M = 35828 270 GTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGG 4(%/1E(388G(!B'<7@9+?#?'->5A#>05@+HCH>8D1;05(5B&<1/&:9=A@9@68F#&F=:G).8* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7782 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27742 42 309M = 28051 377 GGCATTATAAAAAAGCATTNCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCGCTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGNGAANANGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTT ,A"@0935"44&H!*595.HA*$"@&#+'15!7!D3?1<&*".B@3-)=,,/&-F-#E*FD<;>><;+:*+#(.%A0-/,:B=%BF.5E5:8+D22A)B%CHE8+*7)>08.10;;:@&&/H7F(10A92H-4,A+%32;'C,16H-42DF)/+E"8'94@0 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19G28A44A55A3G1T153 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-17 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:59T79^GG250C23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7784 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6146 40 77M1I29M1I14M = 6330 226 CACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAAT &-A/(52)&7.?$<<(5:#+"51*G@*%1H.$82>(G+D9%0>:+3<:/%":9G07017C&<6*@@@67#5<*.D696F2:>E?#+;*$4!@0)"7$&;&47%&5?$18D0)6.$C)2%@6" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:120 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7784 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6330 40 42M = 6146 -226 CGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTATGNCGGGATATGTCAAG ,@&+7*3@5E3*E@"!E=GE$=3#E0&.=AH6#7F-,"@0:D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C1C14 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25680 42 111M = 25857 224 CTTGNAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTACATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAGAGGTGGATGCAGATGAA ;=(C1?F,?B=8*$HB&@/G4)4H4%C$.>+A2%7+'BE"#9>2)D#*6<0GH*G&2438E,7G3F"D!@61AD8*46D$)+#D:9#5DF*1AA5+&+)$ED%!;*56&8G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C45G42A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25857 42 47M = 25680 -224 ATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGG $;74E:-5C,0E@4)2$2AB*:")0=FD5F@1,H51?7*.-$$-AA, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7786 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32126 42 78M = 32204 322 GAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCAT 6B=G,0.8;"=17$)):;*?#333!;?2(%*2&%!=,)F8.AE'=:H$4*+<3>"615 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7786 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32204 42 244M = 32126 -322 GCATGGTTTCATCGTTAACCGGNGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGANTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATNCNTCCATNCT *"+#($&%$*"*&+$+($#&")'%%%*$)##$*#%$#+%")'*$!+(*+#'"(+**'$#+")(()!'$#%#'*#*+%'!!&&*"'")('+')*"+")&"(')(&$*$#%*!!("!!*+*'()'*$+$$$)(!%&&)''(+###'($+$+%*!!)")%"%#"!&'#!"+"#)#""**%+"&$(#*$!$&&((*&$(#!(#'#**%%("!)"#&)'"'+*#'!*'+'%+"*"!+*%*!'$)()"&' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:22A169T40T1A5C1A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7787 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23110 42 187M = 23297 252 TTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTATGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTA 9&33::F=G2-3:.+(HDA59%.A'1F8H:98@G=!307.F3-B1:0>,*E&!;1%"'6,41F!00719:=7C#0!%0D-6;!"/H.%@2<)5/74;#>&,*<,-"7<2.7;'C3B?3#;/")F-D+D2<7(.-B"&"B8;/?#C7/F=#&(+,&2-!;!;7;C470$?/!,;&A<'$=GC4///=; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69G117 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7787 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23297 42 65M = 23110 -252 TTCTCCTGGCTTCATCGAATAAANAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATNGGA +"#+*%)++*(*&"#''##'%!!!&""%"$(""#&"!%'$&#(!!")()+)#"")+&**"$+)&( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16A6G37T3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7788 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5441 42 90M = 5576 280 GCGCAGCCGGACGTGAACNCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCAC F6@53+;B2E)9(#BF3"9H"4D2%1($/D<5#H9,"@(*C#)1"-+&H-'5>0+5A"!3?.D=(*+92'#'$-91$6>;CHF*A-E2F= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18G22G33T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7788 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5576 42 145M = 5441 -280 ACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGTCACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCNGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGC !1CC9)*(=1==HD".!.!&G60(97?:<%E62-2E&?G@3#)64:>8'%BAE96*,-<";+)018GB$.G#2;3E6%>*<'EF:0H>!D00'&H!2F55!>+/)"F*5D/9,<60;.D#,=:4!CC$63AF!D7DC?<;)),**;+ AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:8 MD:Z:59^ATTAAAAC18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12874 42 108M = 13001 194 CTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCANACAGCCGGTCGCAGGCGACCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCA 73!+0(,0&@EGG9?%8EA0A616*0E%+@E88B4>/%@#$&((E=H#@!76#B?,4A;<";+9#"<0,0+;,)6@&"C40340*/,:EAA$"A@"1:),AE;19.D' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A40G17T25T22 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13001 42 67M = 12874 -194 GGCTGNTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGNCANAGAAA $"+%+)!*##"!++#$*%$*"!'!#")%)&*$)+''+!***#'#&*')%"$+%)(')+$'&!(#%#) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5C52A2C3T0G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7791 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2109 42 53M = 2329 282 GGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTT AE":%:=29!!)7>?"E899$:-#%7$@-(+3%%,A&FE+3A<:"GG6C2:(D(<.49*G?&C*A@;A,@E9."A1=%.D84C&-G$26+*H@7'F> AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61A4T0G18 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r7793 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48058 42 222M = 47981 -299 ATTAAGTGAATTTACAATATCNTCCTGTTCGNAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCT A87;F5$=(28G5>G!0C0%$6D1;8/(51(!5;+#/D+3$%E$5/(&2%2>1,5#*+G@/01!$G,!B%#:2:H*5&B6GA;6F#EA$A1C!8%?C92<>$.C$)?!"B0&4+'1>,,C940<7'(@=@.:%,* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12118 42 193M = 12030 -281 AATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGANCGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGCCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACG G6@#=.17C!@?$*8-(.3:D,784/*G):66@0?8F=)%;'5B=&9C/6#"%(-%6,282(E;A#(*&$1/41!D9D-%;5;314@4BH#?A;?A(<%>/.H3%%7=+E2)B&9#7*3,F%)A#G=@#-7%@> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:90A43G58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12030 42 88M = 12118 281 CNNNAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGA (&#$&+$"$')#'$'%'"'%"&+#((""#&(!")"!%"""$*#*!("!(%!*())*+$(*$)!&$'((*"!&!"''(!'$")"%&))& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A0G0C84 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7795 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44739 42 199M = 44650 -288 AGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCNGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGANCCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACGACN $%())#%"(!&!&#'($#+"))+%!++)"&&#)'+*$*+"$$'$#%)$%&$&%++*&"$($%***$+(%!'*&$"%$'"%&)&"#($*)#%$+#+"&!+%*+$$#"(")+"(#(&*&#'"%&$((""%*%&!+'$)$'*&(%'++(+%!*%#!'(%'"$&&+(!'"'*$'+**!'"'$"+%)%'$)%#'"&"+)+"$$# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31G119A43A0G1A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7795 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44650 42 69M = 44739 288 NCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTNGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAAT ,C>/GE360$FD?(B10?/-.6GD==->&9A<'B6&)78GD+B%F95!+.0*0C;<"+C6@E<24C<7$*+(F=%( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65T61A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7796 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24243 42 51M = 24008 -286 GCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCAC .G%7=)3$0@&5,C9B>57"H!%C,5/0#4;(8'-,#36#4C>*=8*+5:@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7797 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13485 42 67M = 13638 334 NAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTANTGAG "9*C)?$=;*H""2(#*$6-H=8=;)#8'+6!7D+?G/'=1+2=F17HD:,F7E+'3A17(B!=B'" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C61A4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7797 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13638 42 181M = 13485 -334 CAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATTTGCAGAGTCTGGTCNGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGCNG 4"=*,6@E6&:G,:6;A#5G*9G>14)E.,E3:"83D6"<@1/?)C86#"9!92'==8="&-@+$),!0+9,$3-"536,H=&2<5F661E!=:4AEA0-=(0F-'E8&&A,48#D"A>=!9(=4.=$-5H9>8%9A:'"<?8C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YT:Z:UP jpayne@0: r7798 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33512 0 * = 33512 0 NANGNGNGCANTNNTANNGNTTGNAATNANNCTNGNGNNNTNATTTCNNNNTCNNNANNTNGNNANGTTNNTTNTNNNNNTCANGNNNNAGACNAGTNGNTCNNNNTNN !!!#"$$#!"$!""##"""$""$$##!!#"!$$#$"#!"!$$"$!$$$!!!$!#$#$!#$#$!""""!$!#"!"##!!$#$$"#$$$!#"##$!"""#"###!!"!$"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7799 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14713 42 93M = 14806 322 CGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACANCTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCA 1C,0G&&E)"C;E;5HF.1!0%-1%42&:9+!%?*+:+E'C(.+'=0:.B87;;2-48:3#%F/C672)%<$9@/7-,#':+;3#%H(6.3%GC174H7,7!A)E=+AB0$0<25.3EH8@3:1-';,?36E;.7@.+#*-14,;":7@#)F"(G1H*$B$%6)/D1<*6=>5,4?$7;-#-?B@E2"&4,;GG"(E4.FC.*+,;E'1)0!4F*<=44!*(47>E:!G.(>?'85=H;5"/B+1!.3;?# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C28T156 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7802 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48390 42 72M = 38683 -9779 CTGCGTCATAATTGATTATTGGACGTGGTTTGATGTCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCAT &E>F/?%4*46+4/F3+E2%0%H(%"GD,&&(*G.1F(?H-(*":"(<'%A;6*$!BAG22H7A/,4(*01/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T14G36 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r7802 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38683 42 97M = 48390 9779 ATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGAC E$#E>3/&,C:-2AAF,,D@A&1/;69F3'=@4=5G,B85:G*&%F36&:"-?+<$H9>=G-2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r7803 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39578 42 59M = 39775 262 GCCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGA #&'2+";+1&!'F<@*'16C6-,G976/.')2?:,0$0H2=&H;C+HE6=''3/<7A7' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A0T57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7803 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39775 42 65M = 39578 -262 AAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTGCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAAC 2D(9%<5C%(8$0E#;5%GB:1=0@&CA):6+A$/>#@:0&22&3&+H2',-66G&01+=1/3)> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7804 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45432 42 153M = 45432 0 GGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAANACCAGAAATCA 9%(D?='<2--D1A,">$)!C!E510/)'>'95H:7:A19/H(FB1/0F:+#,G?!#23C&E'AGC,2C)6=.A>#(E##-8G1E"D!3=>.7G'B4/)(+14(>DH6',@0/H9)81%,1H485.'ED2!A!3)&*<",@=033@= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:141A11 YT:Z:UP jpayne@0: r7804 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45432 0 * = 45432 0 NATTCNCNGGNNNNNNGNNGNTNACCTCANGNANNNNNNANGATTANA #!$"$$$$#$!""#"$$$!$!$!!$!$$$##$""##!!!!!$"$$$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45710 24 66M = 45877 264 GANCGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGG &"(#$)+(&%(%'(("')#%((%'*#*##*'!(!'!"*("%'%**$'%$'&+%''%(%&''#%&!( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0T0G62 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r7805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45877 24 74M4D19M = 45710 -264 CGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGNGGAACGGTNAGATTGATGTNTGAGCAG +*"&((&&%+(*('#+&%"!*!!)"&&$)(#"*#(%''%"'%$*#!**")%&)(''%!&"%+"()&(+$%"$'!)%"+)"(%$"$&$+))+"" AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:0G2G0C1G58C8^CAGA0G10A7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7806 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23768 42 380M = 23589 -559 TTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCNAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTNAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTANACAGGAAATTTTTAATATTATTATNATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCCCATAG >46=.:$(.0?$65'2'?"E3@F0$2GC1",@E24&3)>2?B!;$EB122@E9%H51/&4),,?977#=8-C.(D-08,:93A<('92>$H&?+3<.F%=,+24!7)D:>0"85F=E.!-2$)D4G7-7!2DD'0A"-:!06@8<683.13',9@8=9-6#>@FG5785%9!998H2=*7G6'4H9B/"489)662G/G3AA>847C5-:1H46H!301F60"E!+74+@>50/FD8B,);<%$%9!5$8??F%?"G(A7><>56-B.H(8)=>3::+CCBH@B00.89GB0,+2)<'G:A3+05B$$!-4:A)F/&)%$*A<-DB(*H%5GF>-76,&2+F-;>"@E"7$A AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:180T39T72C24T55T5 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7806 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23589 42 8M1I171M = 23768 559 ATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATNTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAANGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGT 22-4!D5H:-#*:8";G>#-+#D(9.;3:A8B4AD*@C*+'(794#F&74.7@G*?$8<6@4D+::: AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:89T62T26 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7807 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24710 42 94M1I26M = 24562 -268 CAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATANTGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGAT !(#%#%)#**%+"')*'%#&)+"%"%(!*%&(#&*!'!&$")"**("%#&+&&*#&(++(%"+)*)'#+'*#%+'$($+**$%#$$*!*%#&+!#'!)#+&'$$!)'+$&'+&+%*(+*'% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:56G0A62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24562 42 148M = 24710 268 TTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAANTCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACT FAG9D(0"4239F84>"6,"-E-GF2!F%%(=@>5(/H&*68C"8('+8>0;,A1)GAA01D0$0<5(/=58+;+E3B5!/D;.@?,3=9".&#?9E:1'!;H)6>>D)1DF!B$;74-"2C37$G!;30(>+24HD08>D&>8>C.G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A119 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8764 42 78M = 8842 356 NGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGA #H7161./5>-H01./8D?4:A2B7(7:>6$:')>8:C//=;FE<"BC=93@15'64*/=(6264G"?&'7+1C".:F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G77 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r7808 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8842 42 184M1D93M = 8764 -356 TTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATNTGAGGACGCAATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGGATCCGCTTTCAGANGNTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTAT @,FB!G'.H2/94(!:G23<=#.7;::#H0%7%)D-191H/@@75D,?-'G>?'94>.H,2+.A2!$/<<5"95':'1F,(;1!,$BC/+5H'7E$-/G?C!*">$=<3'"H36A/9),B8B@3;@*"G1A2@"G%(&)92>?D#61+.('4!7E)C658B*6+3:,A>5D@0136(17?73D2-42#?1C1"&(:+%C<:#C$$/.67:0/E!A8#/F=71D!)2A1,25&7G2)"C!!$3(.'?@:GD AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:102G9T71^T12A13C1T64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7809 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 445 42 47M = 156 -336 ACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGANGA GH&,C?71"C?'4A+=6'1+=5-@(7:B=6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7809 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 156 42 103M = 445 336 GTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCA H=/4/>618:HE=G=!"A<:/2,3>'(4+?>F+<)A)8"H#<9('<60$590;!:G?E33E21@7E#:>H126?DA">'30%#@=1@+!";17D117&C=-HB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7810 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11291 42 169M = 11209 -251 GGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGGAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGANAGGGTTTGATGACAAGACCCGCCGCCTGACAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAA "!64=3'"4?.<#9:>;!)A8>59%+0@6:=0C#+21--+?6A$?$E=#,5F<.7C96B/>4:@:/-817399,2&C(4F-B$H':&A@/4BB?.:7GF3!3@@/G/'*02+@8F$"86%)F-92F>.(?=5G"'7*E+'/-.4&@1D5,.7.C'9#73')(2D7=;9C7G%C#/%$,2D AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T44C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7811 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17924 42 50M = 18100 251 CGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACC 2G,!%C+H?'-;90H6;/.!1%9%/<+7"::*G)H&+46:6F*%.4(%E4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34653 42 57M = 34452 -258 GTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTNCGCTAGCAATTAANGTNCGNCGANNATGAGNN ""*&%)(!($&$$*&$%$'+#*###+$"&*)%%+(**')&'$*"'*&'!"&%!'""& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:24T13T2G1A0T3T0T2C2C0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34452 42 201M = 34653 258 AATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGNTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCAT B8.H$*2A/(%F.7F7')31@D$+>-35*3B69D0F="!"#/E'F9+3,D:=FA"<<00/EF?FDH+"5+.8'.F)EE=);99+%=#=8=22:4C8:5C+2EE61C+8(F5CB4'F?65/BEHAE@)?E1(7@.%H5F@$$9A!8<4%14C6-(6+(EF4(8&'@$G')=2B@@.50&,=3FG7B7D3FEE7>E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:135C65 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7813 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17554 40 128M1D37M6D10M = 17460 -276 GCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCANCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTT 40@;69;;D>&)H1(>6C698-8&EDGH=7@F(25F27)!<-EDC#7=H0:2)7*%/2>@.2>22=?$-"9+B:?B&#%/<#.'?57'.*A@*66*#+#D/(B8H*BEH6B9;E)#;99(E<=->.(&0:9@$$)!=96F#'=@#7%4>#+C!;3D57.D91$08BC)%(:))C?2%+#:)D<+6;%#! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-32 YT:Z:CP jpayne@0: r7814 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7177 42 98M = 7177 0 NCATTGTTTCTCTGTGGAGNAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGNNCCGTGATGTCAGCCTGACGG !E-$G!*6-E*-'(F4,:/F,7*18.H3"*8/6C#/,CEH8*@*H%8,8G"7#E0E"6.53",(E.0@"H)'?>)!2E<+AF;2*/''<,-'1C:A++==6':A/6+9D*+E$,!#/,6@('%1F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T64C7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7816 77 * 0 0 * * 0 0 CAAACANATTGAAAGCAACCTTCAATGTATTGAGCGCAAGAANCAGC ::72"@$7);1).45)EH"D)F,474&?H#5,-F+B0@,(-,;) YT:Z:UP jpayne@0: r7816 141 * 0 0 * * 0 0 CCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAANTTTCTGGCGTCCA ).(F0!DB?4H,09G+=."E@@4EG5!*HG9(1,$&F;-F!175GC-H7/)()23>5>""&+E4E!89/<*5"5E,,$D<76#32&(80B=A=G!/$#*.G46-")0(>9'.$!"@#68 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33C43A19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2368 42 449M = 2817 546 ATCTGACCGAAGNGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGANGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCANTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGNAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGG G4*;:E:!<:752:>>B%>/H2%.')(B/,:9H,22=EHG6C>(602H:99>3?4F2?&0$6G63E'.,14//A9-D0&45F.FG">B)2):,2&?2H1."(7@-F.$>E8;F@42%?4;&/3+*/E5:H#9+8A5;"&,2A),<)DAGD@>10%48/07(E7'?=A-/"::)%,*9228#""1+=95G4$7$1G!"D#0%.!C:,>$9EG% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12C79C51G179T124 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7818 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5292 42 95M = 4776 -611 TCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATNAACAACTGTTTCAGCCACCNNNACG *'$+'#'%#)"*$)#(#"&*(&&#+#($'&"'*!"$*#)!&("##"#!'"#&&'+(*%%*&'&%#$!&+%%($*$&"'+*#!)%$+*+$$#)")* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:69C18T0G0C0T0T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7818 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4776 42 516M = 5292 611 ATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCCACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATNATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAANCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGNATACCGAGGCTGCAGTGNACAGCGGTCAGGAGNCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACANCACCGATGCGATCACCG 291@=C4E1E#'=4=8(!$!*%!40/"@/38B4E<8C@693%/<4C@0(D38B!"H55CC:G$;63C-0=7;5+!8331B5&/G;$3$-%9:($,!<%?!97(9?"7"6<(-E>C*DHDGHF5@/8A1?D9E!8>77<#F0G;!DHB"@%,E(<394&3!*>@CD5A"*38:05<:/A#E?::8)!C??958H5"7-!8-!B4H43@;>7!8*7:'5A&:"55,&A4@@$=!A.A@D2B0C.3E?4:A*6:1"E5().;;H0$/@G7@,4*;2*C,GD&#%1%>@,"-:"54GG*/4F-C6F7C?A/!<27%5-:&;A1/4$E?F-B-6!6:,?0'C&<$H50%")?.=DH$8@??),,66$=C>;52B-'G'+/&/;E$!-)1;3F&CG4E87B(G53/G5>CFEBG8F!<89*)1!>=FE9F7>,*4H-;:29!B!,"71*?@ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:122A78G15G148C61G17T14G36G17 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7819 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46085 42 58M = 46294 333 TGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAANTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGT ;F8,%=*F-#BA-CA2+5@%=&:,.!2*(,"+":'G)D8"D?/:A$.FE?'G%*HCH; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7819 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46294 42 124M = 46085 -333 GCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGNGAGGCTGATCACTNTGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCA )=$&E@;40G;,B&E@6F45>*8'F.'A>:2&,>+(/8,:?1'G',>0)-."%@='(@"!,##;1$2@,)D016>A%*)*&"61?7-.?>=&@=>'8B1*3A'9!"A!'A$'%94*'4#?+#,- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66A13A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7820 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42329 42 93M = 42422 199 ANCTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAG #%74";+'B0.,D"8$(42CD!1B22!*H+6=23@HD<2F5%B+D7GF>:5&D6?B2<'>? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A91 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7820 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42422 42 106M = 42329 -199 GAAGAAGATGATGGCTACACCAGCNCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTNCTCTCCAGATNGN ()!%")$&&&"%((!"($%*++)#*$+#!%$#%$(%)&'$"$%'#&$&)*%%$%*+)!"*+)((*'&%!')&#%%%"&')(#%$)##*!%($''(+&'$#+)'#%$ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:17A6G67G9G0T1T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7821 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7105 42 111M = 7343 282 CACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCNGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGA *00+*A;?:9!D:%2=FC.%C&+)/E@3:(&C$F#-B27/,G/)66@F=.26961H9"2CB!3,%6!,90!;8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7821 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7343 42 44M = 7105 -282 GCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGG 2EAD@/A,93A@:!*95+>.4#("C-%:>-GE#:;9A"0)=?GF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7822 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12293 42 181M = 12169 -305 TGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTGTGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCNGGAACNGGATGGCAGGCCTGAAGACCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGANNNCNTC $*')(*)#!+(")&**+"&%($&!#"'(+"*'*)*%'#+'"$)#!&'*!'()%%+#&&$&!!'++*!%""+$"')*!("#(*!'$&&$+&#!%(+$*#(!'%#+!"'()&'&#%"#&!'$*"'*'+&'**!(*(&(+$*!(%$(%"')&(++#*&(*!!($'&($$''+)('$#+"#!!'* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:50A76G5T17T22G0A0G1G0C1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7822 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12169 42 122M = 12293 305 CCGCNCNNGGCGACAAGGTTANGTATCAGGAGCNCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACNGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTG %"%()(!%+*%**&#)"#$%'$('*'')$$!'+!#$"!*"#*###'*&'&')"**"#!+#$+%%)'""#+'**&'%*"$("'(!$"$)""$*+"#"&&'"&$!#((&'"*'!"&'*+)#&#* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T2A1T0T13C11G38A49 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7823 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28126 42 100M = 28326 308 TCNCTTNANCANCAATANNCAANGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGATATCAGACCACTT "!!*#$"*!'%")'(%'!"#''!+')*+#()(*"&#!#$'"%#+'"&(*')&%!$&$%&%(($$(*##))&"%**)##+#'&"%!!")'*#)*"+##*#% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1T0C1G0A0G1G2T5T0G3T77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7823 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28326 42 108M = 28126 -308 AGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAAT "8$B#%8:!?>(8?8#**4$'CEC&#CDGE.4,5/,,3'B+DF.31$43:'E%#"E);240:(F0.F.:<46CE"&9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7824 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8929 42 97M1D85M = 8851 -261 CATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCAGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTNNCAAAAGTTAAAGACCTTACGCCCNGCGNGNTNANNGNNN +!)+(#%*"!'(+'()#+($$)#!'%+%+$')#&("($+#%*(&("'&"!"*%*")#'**$+(#(!!&!(%#$(*#(#'%$('&'+'$)"&$)'(+'!$*%&"&))"!*"(!%!(##$)+&*+*!)()#!$+!$!**")*(!"#!""#!&'#(%''#!*+)%'#('!#(&(&!#!*%('"(" AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:15 MD:Z:64C32^T44G0G16G6G3A0A0C1G1C0C1C0T0G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7824 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8851 42 78M = 8929 261 CAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCATGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGT %26H#/0F3!(#6D!414$02#)877%*E/C.!75:F9A.,*&!8B$'!B:4;C4'8GE,2G9?3$=6<.!D6D3E/G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49T28 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r7825 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9258 42 61M = 9059 -260 GAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTG 59$>FE-GA6#/6A()$;+@%<3/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7825 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9059 42 60M = 9258 260 CTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTA C,'C,.4@.6+&$6".=9*%49&G"A0@'DC-E:';'F@32D*E7((G;+6B/(59&7:% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7826 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8974 42 52M1D60M = 9177 243 CAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGNGTCTGGCAAAAGTTAAAGAC B/'3!6A%:1D)C7:88!/263/1CH#482$,06>?G"AH/!9*4@+3"054G%#F1F#@$<*:'&;@5%1(,<,!)&<8'440A%C6G1$""-.*G2"87".20)!>D6@A=-H?2;*E='H7#5E"F2D*#6&701H!1'!A&4%+1=.99?.;@.;1H$$?D!.8,D5,"$/8%"HF3+-D6A*;##-8"/5"6-H/C&!3@-6BDB(A@+H<(+3&=;9?G,54F*G AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T45T46 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7828 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12878 42 152M = 12878 0 CNCCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCACTGAAGGCGGTGNATGACATGG #!+*(!$!$%#%%"+()(!+!)"&#'"(&"%(#)!+!!&&)*)"'##$#*'&!""!)!%)#$&('#)#+(!**#!("%)')&*"&#+'(+$**!!"*"&)!'!*'$'+)%%'""+%&)'!%*"#%%$*#$%+!""(+%"#$+$('"$$"(#" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A79T47T12T9 YT:Z:UP jpayne@0: r7828 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12878 0 * = 12878 0 NCATCCATNCCGNNNNNAACTTTCNNCNGNNAGGTNTTNATGGTGCACNTCCG !"$*%*)#!(()$%"%!!(#!)($""!%&"#*)(%"*$$&*!'(!'$$%++)( YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7829 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2515 42 101M = 2357 -259 TTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCC )=A2,@)7&?B>'&,FACF/:1ED!;F-.2'E?<&+@7D4=?DC#:D>F&&,6"F3*$"."?0+1C9?8(+!/9/A97G8='H,=.8H-"'<:)!47<<0> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7829 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2357 42 158M = 2515 259 GGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTA "F&37B4D0C*H@F&%>A"*60H48EC%10.0E&73-$/487)A'@2%900>0;D-04-5+2*1>B7/DC->,/F#(2A,,#);6"@<:=+53!F=F:GE+5-4HG3$DC#,G88C%A(H5'9-;:5.''CCA@@4+@C1E2)$'%/F?73$8@D&8,41%3GFDE96-&$%8<0'%+.?$45E@D?;)/!(D?91-?-F'GA.7=D)<+-9#:6:)G9,=2-.;-=",:#//5&@3!E.8,66>:FB+"=G5 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:22A75A3T7T13G58G12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7830 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24895 42 105M = 25000 301 CGATATAGGGATGAATCGCNTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAGCTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAATTTAATAGGCATCA '<@/8#-G>9/*,F6":;)!D2+"4<84A>8E@,&AE=5B*4#9'7'G+(;40?#.2+E=%975EH4*&-1)A@C%H+%"D'#F:+8C#,E%&5,63;0B#=<:G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19T24A46A13 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21229 42 75M = 21449 265 CTCGGCCTATCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGG !,+%@?,"4<=+"F4$;?&GF!+C<;@&.:>8.!G,67()A/<&8$?;*6(G>,D<)=)$>G7>',AB:9(D$,0 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T7T66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7831 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21449 42 45M = 21229 -265 CACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAA '>"*F2>H">@F?=>!>;C1:A64'*<*"02%C4$."8:'G17C9;=68"A*;0>5/D'3-7"$0'789*H'#4=*,0.6%8+=')F':.''EA#FC"5D)A;)!GA1:/C;08!!+6<;1/66)622C567:8!E#@>!B&D)2C2/72A6!B2-4)C;?B,D,D!!@,F@H>G3;+E"7(&F4$7B6/2=<;><5D$;7D1'*D8+$//5*=9'0A4!@=C-"<3$E-H<6D9CE.D182"(8A4"=)$&17/?+F0EG,;2@;"$*H@4*$0.6H9B9'A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7833 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8240 42 59M1I17M = 8397 273 GCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGCTTGGCGGCAGCGTGCTT *H#3*F0#?C>=C3*D*DA3)+.F8B<'&=7*2:$*D3.5E%,89=$BC-$4A&56$(D5.;!8E:)+4@C'+>*,1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:59G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7834 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36745 8 33M7D34M2I5M = 38987 2327 TTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCA A@-$&C9;@//;(:FED0!?0G?+.:'2C;@%0+16=!:AH@.)4EG8F90#2"/ AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:9 NM:i:11 MD:Z:33^ATGTGGT36G1C0 YS:i:-10 YT:Z:DP jpayne@0: r7834 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38987 8 85M = 36745 -2327 AGCAAGNCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCAACCCTCTANACGAGGGAAAATCCCCTAANACGAGGGA E3-74F,-8+>B'B;@H?8(ED*<<17?4((B,17"G<;>+";&:A70D'.C+GC?4A2!G%E.31(,,$EHF;F!54C1C-"($.%6>GE1E6&6B2'D40G"38+45(@6,%=G(3AC=+5B.%,GDG1.C?1!B4?=7=AG+>5E?9"-6-B..*%4%)!/+/@?;%>?D93C;1&6<+8.:$+F?0'A470=+(65A>7/>C>:2', AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43A26C60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7836 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4074 42 85M = 4221 290 GTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGGTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCC (-)E""'/2&36G$(%+DHF$.&&*>1#!D%A/?G-6-"?.69?873#G41F*7?29C<$'B"G3$D5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7836 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4221 42 143M = 4074 -290 GGANGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCT (*=3/)CD:75&A.FF-<"&1&+88/;8=6C/&>DGFH25=5/8=09)!=F,H1@C.&->+7*;6+6&/G>"98)F$F#*!)F:=8"1&5?)%%FA#$9/*6134DC>,.)=14>'7/+=$>>8*GDHB%7@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A139 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7837 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10251 42 59M = 10067 -243 ATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTT )3<&>90:=;(0&;79'-(6;.;"+>16'D?8;$2<*F+EG-6,D-C<."DA)0%342. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7837 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10067 42 110M = 10251 243 TGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGTCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTG H&8%/;,<=53GH'#0(:$AA-&2,0%)D";11AFE2/4:9@$6%+E':H#*A+<6$"&0A4!7@+D>=F?3GG<>C9;0$%$D@0);%;;+BCA-8."ABC49>F&(5; AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7838 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16544 42 296M = 16495 -345 GCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCCGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACNGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACAGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCTATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCTTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACAC 6F'5#D>1>?&=#&(*#<>;05//@!C'8<0/7D42+3&9(E$-,-:,%7&96=>2H;*7?*;)8(:G84+&;-&>EB-/%22$;C.2E9/7/C#<%>GBHC0$+@0:+&C+HE$'"$1,@!1).D!5AD-6#)H!4;HEF8;#7-3:B$FC;77))=92FHH7@&!*'/3&)5(0.?>A%4560+<9C!>0,7;;54*2CA-:*:33>!8<=E8) AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:109G0C32C27T13G40C38C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7838 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16495 42 49M = 16544 345 ACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGC 3-==3#'G$*A)38HE71>+D>"'+@4B6-+!0D5$6C(8=+'9(45,1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r7839 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 710 42 43M = 420 -333 NGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTT 7(+2%AD=0&:.)%&E"#8)# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47989 42 316M = 47942 -363 GCCAACACGCAGTCTGNCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATNCCTTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGNACGCGGGATGTNCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCAGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGNTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTNAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTAGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATG <#>,)2B7,G=6-9==,,#2/E4E"A!9A3=C=6C($7F!.;*4"1!C&EB+=4;0&G?)@F)6)()G'4<5;-6%;,=(*D.D'"+B,H+4"4B&$#+89@5(BC;0=H,'4!=2-8!1%'C2&9'D-HAA53;'$B'=(+ACH&*233G*B-@0$A".9!6+8A$!9?42:&)=50,-0=?D5/6E59<=93%@&,F)(,3-,6++6#ABA#?8#-F5H-(./?H7>%F%<.+C#%;/?:%C'@EF.F-23G4H>HD>;:/9B34?3B&&>:(CBG::+/)75/;CA1"5#F>3,09FE5-, AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:16T43G2C44A11T41T37C59T21T33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7841 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 104 42 95M = 104 0 TGAAAAGAAAGGAAACNACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGT @(EBD6E'B7E-"#2$8;'?+B"27(1>@*.+:/-+/=?69(*:?#"+<129A&G)4/>&;"A!=9-**?"/:"5*/(A3(3*7= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G78 YT:Z:UP jpayne@0: r7841 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 104 0 * = 104 0 NTAACGTTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGNTTTTCGCTATNTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGNTT #@=7H3:67+"@%C&=HF!=BDC=41>!5%&B/48>A#B1;3;G4&9,=--6>2)>><4088?BH94)5;,%>,<7*D/(-&?48@'D'9?8&7@'7"F@2=>0'0+E$0*7%/HA69BE6:'*%62 YT:Z:UP jpayne@0: r7842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28113 42 46M = 27812 -347 TCCTTCATTGATATTNCGAGAGCATCAATATGCAATGCTGTTGGGA ./%-?1D?EDH&G+%,&9H*#F(/2:&.9$,HD7EC?$F(.F>;,#$895#*E(8!&?D2%4DD%0&>,2,"9,/*--41-(H%;<2)#5(1F!<0A"(A6)A?>,<4$A<')F)!1%+C.0"3*(',()*+GC95 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A37A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45555 42 131M = 45376 -310 TGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGNGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCG @F&H&?8'))?GA5+$;!3'(:9B*G$+0&7B"0/++.5?1%=GBH"C+#7&$.#!-C<73*EC91)E%(?F*!@"1&"B9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7845 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28593 42 69M = 28663 210 AGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAAAGTAACGTA ;H0F36>%E=:<1/*1;'9G/"E'&(;$=A31:4+6:E7$17#67)9',4"3*&'5="+)FFAH(7=%" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7845 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28663 42 140M = 28593 -210 CGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCC 9(>&5B/C?8:=A#4&(C(-6G73B,"+!E=-F0$H;?2C@1/>1<:)FC1H)')?0.9*C34"3/&F&'D12:.%EBH$""C,*=E/8C3#<(,*D&(=H=@4'F%'E=C6#/A?FF'1>*+6"H27&9'F.C*HCA6)F7G)&<@>069CHB+$>*6-?-:=G@;?DH$1?D1A?D/<+0C)B6#*55B)#@17&C2B9"C)E@19<"#%1";!+,/(1D42&1G1GH?97-G8CF:=/0%83A*0!1*09*):C AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:192G5A36A4 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29681 42 47M3D117M = 29441 -407 GTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGANACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTAGAAAACCGATCT 0H,AG!'@B!%08*,5;:+:051$2#3*8;**4?H#7(B-83FG+@*!E)"@%+E#5#C)991D"(A.G(!)@8G8FH&95=&C57&1,>$34@!9*-?8,&/)3A,;!.$7G%D%'3EA'@<7;"E"'D4>93GFC AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:47^ATA1T103C11 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7847 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8445 42 242M = 8687 406 CCNCTGACCACGGCGTTTAAACAAAANATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATANTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGCTGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGC 0H1>44?-(>'EC1@/'!9&6A:+*&&+-:=1'$D.7.G8?9406H93<==$/6/>+/(H,>!$;9C.HA6)6!41.;+0"?(C&@ED%/*(%90$!GA9>:%**B76G*DD,?G/+H%0)+C=''+=1)6"!C79=9,E+%31'"!;%=-0" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G23T90C62A61 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7847 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8687 42 164M = 8445 -406 GCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATATCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTAATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCAC C#@2%#,E#5D@G$)1'HG-3-=%/7)%.)"D1;G9:H02;4>.H?-:8DBH=97)#"$=8DG>!H2"<;!G:5A*66/22C51D:0>2*@9#>3&1,39 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34C85T43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7848 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25302 42 64M = 25141 -225 GTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGNAATTCGN *#++("#)"!#'("(*&!%$&*"#(#%%+!%$#*&'#$&%&$)()$*!%)%%&)+"!&#(*((% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56C1T4C0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7848 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25141 42 161M = 25302 225 GGAGATTAATTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATTTTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGA >+/>,6C>5+%F$82&#&E;98=4+0,%&HA%H4G+>36C'B6/&8'F802*6?=53/%"-6A7E>AHGC5A'GB;G('#8<"7,E%?$- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T110A41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16914 42 95M = 16686 -323 GCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTNAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGA A@;26"'H1&+048"BE%+.#)85=">AAA4C7"1FD-3'A6-+A/->8()#%8+'&*4?-!+FG(3#%38002%/./*)-@)@%)G<"H=54E; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G66 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r7849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16686 42 172M8D48M = 16914 323 CCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGNGGCTGAGAACTGCTGGAAACGAAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGG 0G&0%.)+=9E@51C5!24+5"3H/69=;5>66'4C3D#?-DG<):&,#???@4065F#E;()"$1?@%D631/?0:1+A4:C.G-)-1&*&360'=+<7&!>)+FD5'+*+D&"27@75"5B/+<;'+.H*1*5(>*C=B@@.2>??B.C=?>+6G=E!:-G//&)*8G/,2=B!B-D$6 AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:11 MD:Z:29T136T5^ATTAAAAC16C31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7850 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15799 42 79M = 15560 -318 CCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCA :,+>&HBB)B;?@EED'+$=H3"%+H2B=/:FGC.(3/!.#4#,B:#@;>FC4),@&/0B.(6G(,:4:.-0:H?..9H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7850 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15560 42 54M = 15799 318 AGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATNGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAG +%&")#(&*(!'!%#!'#"""#)$!&"%#"+("'!"$!&#&*("!%%)"#%$%" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7851 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28264 42 469M = 28733 554 CAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATNCGTCANCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGGGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTNATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGACTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATCTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGC 06"E7EF3A&7?:8@86*>>286%F?AA9EE17,G-,.5D>C)*+CD-DD8)?-<4=)HD=/B7F76E?="!6EB24"!F1-**>F3(H=C!E5=2G$H4?'>%61,F*1(!+=@-$;3BB"4$B8";"5%&!&9B;BB5-2)<<->=E-+6FBG7?4-G:?6,F9:)7#=)61$H@@*-193A-%1,!>49$/GAH0=(;(G.667/C<$<=$&'E?#73@D5:"!60.?3"4!,!63<8<9*,F>&.9:8?8)=*98<3>*GF!*5<#1;7!#D%;52!4B+35HE)3/=H%52/:-?5B0F7+6#'C;2(!B@)*A31E2E' AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:68T5G38C148G67G59G78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7851 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28733 42 85M = 28264 -554 CTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATAT HH5#727-/$,5EE2+E?4(<*';08(%<8:CF&%>*-.6'*7B;@%;>7!0H@/%>.9/#*'/6G./BHC)6*<@G;3/C1G-D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22780 42 43M = 22592 -231 ATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTT 0@@+-?+<(&7&3:G'5A.6(2C#).,=)F%>:<%;H?6@25# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22592 42 47M = 22780 231 AATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGT ,G=1:8((*/:@&F::,F=";G,+1$;EH<3*&&#&(,6)%"<.F.#@D@F%C:>C@7E;)0E!*&>)1=9!BD8E9#=+CA6&= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7854 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39082 42 49M = 39305 296 CTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACA 9<4<#-((87?#?,:1'?#%8<@1EFF?FB#A.(+5:08'2"3E%?5?9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7854 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39305 42 73M = 39082 -296 CTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGGGA //7C5F$:0#-HEE'>A7);5*1H&!7(=9;**(0=0D>?**45:*H):=G)$>9"<5#G;EE=8-@-2F=7ECC+/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5657 42 156M = 5447 -366 ANGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTNATGACGAGCAAAGAAACCTTTCCCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCA BFE/1'HE44,,(&@B(;*;C)D'1%+H0??+H($>6&3GFF.=451@865%&(C@FH*3:F#>A4?.:F%5*=DD@8(&(+#!A)!>2;#-E@-$4(-H-561!E"#DAH#$A<*<'2G<1$:,-E?&:70B4>'H'9"!5;0(G=F<,.<&+0D"4D&629/@4?*("FH58@4-=G(-E;;$3495'B9A'8.01>B,61E/F,(/1586D#,E'5D?*B+B=DD'A@==6D0$+%&G"B7>.?7:H@((#@H1F2G5@1%6#9!A>@/8"D1$/#5F&B+2#+H7;3)0!&F8=C!H4>+%C=GB>.HEB$>4)(*+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3G0A30G31A1T33G106 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7629 42 45M = 7818 296 CCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGG #//4H7'/=AB5#7>*D&9>G886?)#,#B;A19)&#)#A%6/;? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7818 42 107M = 7629 -296 TGATGAGGGGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGN 40CG="6)(&:#B25&(C;B*>>7-/6;2H=B5-%'>@=/&'(E98D"65*1>@EE1"'2&0C+#0-&&,9:G%/#=#'6.H8>$2@8=?9B'?*--)%!8:2,)0! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T70G26C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7859 77 * 0 0 * * 0 0 CTCCNGGCANCCACGGCAGCGTGAAGCTGGTATCTCCGGCAGATTCCCGCCCCTGCCCGGTC %"#(!(%&%#$)%)#*+!'"#"#%"%+"$&&"!$*&&&&%$$&"'#$!%)$+)+()$($)!% YT:Z:UP jpayne@0: r7859 141 * 0 0 * * 0 0 GACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCCGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGNGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTCACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGA ;8H/D?-35>B';7E3"A<:B'6-4"+5?7D-;/"1B@'5'%88::D@(6*4+-34ABB;+%6.D5CH#-!B":97D%)A/(;!>(4*1D%5B-&G=+#1+F@6@2=F=&)>%:/3,=@(6>7C<(8=B<*@!&?%?3=,0#9C-;F YT:Z:UP jpayne@0: r7860 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28090 42 48M = 27885 -253 TCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTAATTGATATTCCGAGAGCAT @F+<";9&105.<>/<3@6('A?%@G;.0F1'H%B3,//9:A7)!5"> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7860 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27885 42 129M = 28090 253 TGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACNTGATGCTTTTCGTGCGNGC ?-=?B!6*97F*=9@3/D/",%5-*6HH#*<>/93%#$"%-B=1540=!H8,H'%>.1=A0%27@823F/C7(/;1=9,"*%D1B$9=C;)#+9B/B@FC.4!G$CA=+*H8@.)'C,B?C7,2B67-' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109C16C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7861 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3753 24 32M2I22M = 3753 0 GCTGANCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCG -':".$*>(6<)!7;1)@2#7/=!F$1$3-1G5!H))C;AB/.F(D;6G&36.F@( AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:5C48 YT:Z:UP jpayne@0: r7861 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3753 0 * = 3753 0 TNGCGTGNGCCGTTTNNNAGCTCNTTTNTGNCNNNTNCNNGGATAGCTGCTCATACGAGACACCCAGCCCGGCANCGA #$*)!$%&&**%)"&)$!)%"*%'"!%"!)#*#&!*$%'#&&)#+$')!"#")"$!!"&)*"!)#%""*!++"&*+&* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7862 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21636 42 52M = 21697 175 TAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGTACAGCAACCATTACAGG !,4HD<*$CA30:2D9)3?&6;$C&6,B*9!<=;H=@$%:8G(?-/C,89;& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7862 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21697 42 114M = 21636 -175 CACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCNCTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCA >C.G'DG%H(?:*1&'4&.E"C/50B4B:;D?";67-H;3/4+F%:/&$&/:17!#>0D2B8A=%BA&E63C-8-&$#+!-("EF69A5'-#.+/5&F,/B07G+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7864 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7139 42 120M = 6987 -272 CGTGTCCGTACAACTGACGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGT :=.2<"G.53%%",#&HAC*/<:&H@..FA,?E%B$$1F&+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G103 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6987 42 60M = 7139 272 TATCGCNTCATNCNNGNNGCNGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTAC *)#&#'$&&"&"%!#'#)'*$+)$#()%*(%%*!$+&&$'*(%!(+)#')&+%$(%*$(+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3G2T0G3T1A0G1A0T2G39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7865 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46027 42 98M = 45786 -339 GGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGAC F>B'=D,;(CCB""=&C%9<,&7G-',"%F@2=.!0=%?8!@1:(477B"!:,;1/+$C/0<":D(B@,68=3%#.//=4'@& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7866 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21708 42 53M = 21810 295 GAACNGGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGNCAGTCAGGGCAGC &$(%""%+*%&&)("!!$&+(%+""!())*&+%(%'#*#!%('%!*"%(&)#) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C0A33A13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7866 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21810 42 193M = 21708 -295 ATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGAGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGA *'+)$"!")'!"'$&('$)+*$#!(!&"+!&)!)'&*#'%#"#$%%""**#$%%%"!!(+#!$()+%&+)(*$'$!*("*+$%#$+&"%*"))+$#!#&#+"!(*$&#"'+$&$%!%'())&*($$(%+"#'(*)#)%"(!%##*%*%*&$)(%)'+"#*"#+'&$')&*'(*%''$)$+($**$(&!+*)'! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:111C80G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7867 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39768 42 46M = 39894 273 GTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACG 2HE;3#-/9.885-8;"5A5;G*+<3")?.D$H5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7867 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39894 42 147M = 39768 -273 CAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCTN $"!*'%)')$*$&%#$)(("&$%#&(%*""$!$'")+")'+&%')%"%'#+!""&)(*"'"*"(+'*&$)"'##)(+%"&'**)!%*'#$%"$%(*)*)%+*))*'!+&%+(**&'+'$'&(&'""*)#$#(++"+(*%"&'"+'!! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:145A0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7868 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32025 42 55M1I23M = 31831 -272 TCATGCTGNCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGNCTGTGTCAGTTC ?$.9F2DD<=(5#7;0?GCB$.=:D/0:0&(-E><9%*%)8289=.=$@A3H#<-E8F8?E>E*A82>%E@H+2?9;): AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:8C52T3C12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7868 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31831 42 194M = 32025 272 GCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGNGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTG "9F?<8=#+@%>#:-?&/1AB0D%-#,,#C'E'&?:H2@B1#=<&#H@H9A3/B19@?@272$A&0,8A;5!%%F1@0C;:B0A84:?5-8C/;!$.,*5@>;C!G!)=%600DDC@>+H&36G)$2..167#4+&;.6'E59+)E'@@33, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49T1C18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7869 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4997 42 65M = 5166 239 GCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGG )CE53((=*B7/0%8:4B,-#86F06G003+?'??!>%$B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7870 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22628 42 97M = 22464 -261 TGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGNTTACATCACCGCCAATTGCTTN >:?!H2/,3,-?!,CD*<0/@B;*/+-,#).F*B>)(3,@"6,?B%<;1C;D52%%#@D?.*)B(@+(F5<;&H1+#BG2%GA$!EB2&?*C!-CA! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74T21T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7870 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22464 42 122M = 22628 261 GGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTT '<005*A+H+H23F*$8?9:ED=00A;#E8C;*F+'$2EBD8F.<",/G13)C,".*8D<@*(C6C7#*( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7871 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13007 40 73M = 12755 -325 TCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAACGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGAAGCGTGATGGTGGC 6,:)2++79159*#.?1EC0(H9@%4+%"-G&*.3@"1@(D5(6.1E=G$/8#&3>/-C@#5@&$/H!F5-(2:?:/A*0!;0%;0G1??G.2G%:/@G1+=/3@+A%G)(1&2(?21;)!=%4DG@H%6990H+?<5>*42&;=8G:+B?">F6#$)6A!96!(/H0$FFG"/461$!80?G+6'1(C<@2%216C5B;*:$?A+"73@/+!!14!"D')'8D AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:40C19^CACG14C39^TA20G63T47 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7872 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 751 42 47M = 995 355 TTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACC HBD5A#$/51B@'3C!26>>;/A;.#FA9H>(08=5>#<#H!=FB@) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7872 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 995 42 111M = 751 -355 GCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGNGATATTCCGTNGCTGCTGGCGCT C!::<8GG!<45.HF2$H:3<+<<5GB"(6,*2-;9;9F1=+,$6@>((E<&"4G)3G/&0-)*'7:F4:C!;8--3EEE0!=8?,5G%;>$02,679&4)/HA8@.G,31 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84T2T10C12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7873 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42138 42 64M = 41931 -271 AAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAA 3=%+3+?D)2)?9"5B<7"&$G6B@@ABDF/26=?,>46$(8479'!41F4"1<>9->;2+(-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r7873 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41931 42 31M4I137M = 42138 271 AGTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCNACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGA *#'GAB,.H=:-!>@;-2;"80H6H-C3>,<;-(;,;#-B?G;83A,88'9:6(?,0)8%,$><*@#2A5)(&.',2G0(116,6@2B!+":1/EE$4#AF/:'6G>((C&!22.D,64*'&=%B.?%5)C!37#6.2F+?")1;<4B>#B9@;?H:>EB*83!=E?3-4"3 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:1C66G99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7874 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47442 42 129M = 47628 280 NCCTCAGCCATTGGTAAAACCTTNCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTATTATCGTTTCAATCTGNTCTGACCTNCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTT #6#!883';A",=&<,$$>6E;@@#)"#H2)4,(-7BD=:8)EG3%"=E08"C&'?A.DAH4D/(9+-+A;7BBF%+D#'@?H*85=44&B((%7'0>"%(F8;=(-'C1='2C>7G!.,+3 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A3G18C36T16G8C42 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7874 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47628 42 94M = 47442 -280 AAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCCCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAG #+&#!%#!#*#+"'&"(!")#&+++$"&!*)'')+'%!"(+(+##"!&+**"+&!($+%#'%!+)#)&(&%#!)"'+(*"+$&*%'$"!$(+&% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T57 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20333 42 167M = 20601 329 AGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCNTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCAT B'4(C)A)1)!!))90+"@(/B?6DB0>"D<4E4+3."-/?7)'70$7-G$,G*DB8<@*"?=?HAB&#:%:716/(;:+8-=28%>8C-"*?17?$FE/A)80,*00%%+B?'5?;:%E-7),DD<'"">AF&10DB...,A)$AG(&9A>4#+/GH9!+:$>AD4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99T67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7875 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20601 42 61M = 20333 -329 GGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTACGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAA &22/;$9C%+)"C1A8,1"+0+3"06&?5@H0@AA#B$>"C6>;#.$H:7G?!&CD9G&@- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7876 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48134 42 144M = 47978 -300 GTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTNAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGGTGTTGGT &(*'#+'&#(*)&%&&#%%)&#&)(%(&&!+#'+)#$&+$!)#*(+&#*+'+*")"'%%+)##'!#*'#(!!**!(#)()#'*(""++%($$*)&'(%)&++(%$$)+!#'&$("#&#)+#(%&'"(+%("++&*+%!"!"+!* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:82C53T5T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47978 42 156M = 48134 300 TCTGTGACNGAGCCAACACGCAGTCTGTNACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAACGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGAT ;=A((00-4:+:"$;69-2F3!/"7$AG(D/C0!)-24?8+$<5"3C?9EF:F,.=&9.>0?05A;8$.#.@/=,B?+'&B4./1)1;+=B'2D%-)B"@/44==D'-2$,&$0H$B4.3433F%?:&#>*>4/?(,7BG7C,0E@;)<+#<5"=% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A19C41T85 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10223 42 251M = 10474 359 CCCCGCTTTTACAGTCCCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCGTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGNAGGGCTTGCCGGAGGTGNCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCNCGGATGT '"*+$6(-@H$/.'4)71,7:A%86A>C#(D'+2H7:DH%$1F+71?6*78%>1--%86,6+B(/+'!C5:G')GB!!>078#79!5H1F;D:+A'',*E*:"'/6E7%1/B2?A1984&+,.4!G%#":5@C==D,AE>G;14@#B@+#*,&4;0::>7(5$,2%";$1A>*>'3'D<,2=!8'97!20#,46+,:B#D5=?9=*(1:&:B%E1H-)32B(B"F#8+5:G%":%FC.=>,#G$;''24;' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A13A65C102C17T40C7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10474 42 108M = 10223 -359 GGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCCCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTC E$=C<;EE/)5E9#GG"4C%-/BA>)'7'5.(C.;/&.9.18 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G55 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7878 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24509 42 61M = 24609 233 NNTGATCCNTNCTNAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAA !!'"($&)#)#$$$("%)(()$)+#$"!+'!%(%"*'%!'*%'#*!%')((#%!)&)%($$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0C0T0A5C1C0T0G0A47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7878 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24609 42 133M = 24509 -233 TTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTNGCNGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGT 3G60A345%>)94').;(A1&:CC??=@E8#4?!B>30.$&E0/EH,!'52#:@0-D&4.?A-.$H-$%D8F1%%'>8$6A),=!53-%.+A,.$*$'4:!(FGE$A8*D/#>46754C3,*A(#A!%9?/.66/)A>!'/EG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7879 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18404 42 103M = 18364 -143 ATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACNTTGTAAAGGCGGC ;,10:DH!"CD1-)3E,&65.6-F#;.?B;,;8,$-6,C2CC@8#<-?-=+<715,9795=3>/$-A8F.)0:/C,*FGG<*',/%:@"BHG?#039>!D#<; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7880 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8970 42 56M1D172M = 8907 -292 CCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGAACTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGANTNGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCN #*.A+35?6)-&7D9?@14E&AAGD/.*;>;@6EB57;B@A1&BA>8.A2&&A?3@9-<,(@0@6,6B9H';$@F*,(&(+<.FH"B-4DA9.-3A1%F*>"5%<=C#2.5024-A'3DC?2@>7DD>$&4H&-:&AA/E>1%".$$3E0#+5E.4!5#A-/.:3'E7C3D0C"#=@E5H@2)=:(.->2%G5% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:56^T59C65C1G20A22T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7880 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8907 42 63M = 8970 292 GTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAAT ;8:E34E%,)CC?3)6##=DD)HFE?(1066% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T37G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7881 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41577 42 54M = 41377 -254 ATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATC '7DD;4?,+(+;:$>*-(#&96H0020B#D9&D)@19"&=4!4C!(/,$3-8D4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7882 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2724 42 74M = 2516 -282 GAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGC ,A0*-.74,G1>/4-:1BE64%3=-;&3C:EA+";@5GD@0%;1>$2!C"*-@-;4.;D0(+AH3;.(E<64*> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7882 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2516 42 208M = 2724 282 TTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGATGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACTTGATGACAGGTAAACGNGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGAC >;.$-#!"0!H.)"D93797ED)E10H?;B2#<-%CFD1A@#6>*6A$?*#=-A/D1D$C'2-?@@3$&?";%=>:/@+9=+<..4DF$("9*$E,#');%:-!0%4F696B.%(,@30"27H=?A;'4AB7&B47(+A?&,8%6,-EG6$/5984>)&*D<*'D1D(>7>G/@0(@!F'FA/&73:61*H.6:;,/&!9?H0<;F4E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48A116C16G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7883 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10889 42 105M = 10688 -306 TGCGATCACCCTGCCGATGGTNGGGGNCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAANCCTGTCCGATTTCAACAA EH%5@#7,(?+?!@"90;D7:FB/6((;0G38B+'2AF2#&39>>A.A(->3,,&&/7@/4$?1>-DF,+$@381):F*-0*F$0,:.!?44:/H81@%;94E*< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21G4C59C18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7883 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10688 42 201M = 10889 306 CCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCNGCCTGCACANTTCACCGACGTGGCNACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATCCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGG F*H9@:*%3/>-$D*"80@*?/38"A0(5&8!>AB%5;9,5F;+@<'G!)76,;4HC.CEG)C::!2=>)B#621DH$+F0+1E2)B6"13#A.2:H"41:03!D@#='7G/36%+#CD$!H?"$,G0:&A)09D78"A%9-;7#C3C2'?!AE$E7(%'A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:68T9G14C107 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7884 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7107 42 130M = 6938 -299 CCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGNGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTC $!*+&'&""$$)%$(+%'%)#*#+)(#$%)$(+&%%'#$!#&"%$%'"($'('%#*"&&+)#"!##))!!'*%%!!'$'#!%!#""+)$")%*'"!'+))&(!()#))+"*+##(!&#%"'"'*'"(++( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49C80 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7884 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6938 42 66M = 7107 299 GGACAAGACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCNCGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGNA #675#D9A%B'AB!5*!0521G2*+E#=6-'.A3D":$0';-&.)!>):):/* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C26A30G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7885 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20478 42 219M7I37M = 20734 349 TCCGAGACGAANGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAANACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGG /$/BB.8H>8H6!4#%4E<86-*+,G6+?"G@89=&DEF!C/GC62H.GC4.%!H!H19&<0@)@9(,D7F<)+>)=.>299;=CBE.7#0B'0G>>%B3,#:>.9.F3848#G)!;*:=4*,F!#F(0'F7(;HB?3%3GD3&><.9"3:DBA;(.)E(#A6G+FC@6A?-#-$2+7@/&1C-2)#:!5#82D62"/-;CFH$)!62!3;7/<%;DE,?H,B<@?<>F('-B4'+.9E,.1<4B AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:11T163T80 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20734 42 93M = 20478 -349 GGATAGTGCAGCTCAGCAGTCCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTACAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACA 9C&A9/=3-%!9?3?BHB"FB&-;+,>9HE<5;?@C5"BE-$@=3'+B#5&HGGB*10"'/02.;%#7G0%2> AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G29G42 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r7886 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27646 42 140M = 27862 268 CAATATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACA ''#(!&%+##"&"&&)(#%)%&!*()+&**"*!*))##(#+)'%+!$$$*''+'##&+(#(*#+#!#(#)%')&!(&%&(!$**)$#!(*%(!!+(&!*+!&#")*)&'+&'(%%$*!'#')('"(!#'!("*$$)#%(' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G137 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7886 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27862 42 52M = 27646 -268 GTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAANGNANC !%%$('*!&'*$"'($#+"(#$$)!"$*$)+"&&$&&#+&'"$#)!+#!)#' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46C0T0T1T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7887 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23212 42 191M = 22993 -410 TCTTCAGGAATTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCNTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACAT 6"0'G?:>"7D>43<'E9*+<(F$(8@,4&09@%'"=@3.:->/0>7BC#0?<$8;3:8&2<=B7$53>-,)E,?$;*9';;*C>4'#$G6@>+?0"6/H&0@E;D%DD>FC*(-.*@173H"=% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:95T54T40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7887 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22993 42 11M1D207M = 23212 410 GCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATNTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTCTTTAATA /7/1,&5""$1$E*&,,6"@3:,6'5BE%#C>3(F4A98=D=:4H8-!.2(&.$?'06&%(%>B/-:?8".0,:A6>H=$?9 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:11^C92G114 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2263 42 117M = 2099 -281 CGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAG 8'8(1(D=.BHG#4,'>64$A@%E'3.#*0/47(,A6+H26B?C#=0*)$;4$=G#,9A!CC=G9'609B/H: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2099 42 164M = 2263 281 CTGGGATACNGGCGGGATTGACCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCANTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTA +9";5""A76&4!FC2:#=-+=5H2=/5F)8+3'&:3)6.-!G(+%>*?4H(<8))?<7(-%8#ED=H5=>G%92+*+#9;?H;+&&GF=;7B&:F007000="4(3E*AH'84?,/8)30%<'=(E04"<6D5@8'%G':).&5.>;79$C!F/2F50!()7> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9T14G52T86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7889 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7390 42 61M = 7269 -182 TGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGACGGATACCNTGATTCTGGATANGTCTGAACTGGTC H<.#A%@69C.$59#698FFF;&;=29%6#25@44$',/G7!384$.=,)D#9D2##)%E: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25C8G12C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7889 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7269 42 52M = 7390 182 TGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGN (G?:A&=$#D"C3%GD'!?86>:,2!4C6/>0=19?A0F@E3="6;/$<=@- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7890 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16319 42 294M = 16613 377 TGTCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCNGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCCGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGNTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGNGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGA $-H2CC@0?;3#'#E?6-A;4-:$.2<00*D)"D$4A'47(5F9$'%D8D45?*0:2"0?74#?C-?2%6+9:9:?%8002B@8:A68?47*0#F@?.:(,B;!F('?./><4%&//.==(,1*#*+7A*?>89,'5>G>#(F&531*#G.=G!.0249<>79A&H6+965E*)7)4*42@15&+/'4G:@<*/=;3E>03:+/$7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G9A28C17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18958 42 61M = 18768 -251 GTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTC ?FE4;$4='%923DGE$,!2/7<:79)3/5<."2!?3@&$9<)03?D%E,++=C!B"D:5H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7894 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8440 42 129M = 8569 382 CGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGNTACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAACTGGGCTATGCGCTGNAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATCCTNAACT 75A>100#(0140A$:%,.*8D@0;D2..$%F3)7F4-'24/*%;3ACG"!/HGH6C;)=)-E;)8=(320'G34H;FGGB/%BE8E8:?!,/#')%E3?-D+#-14C4#8;<1+D,,=#B<0B-B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:41A25G15C37A2G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7894 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8569 42 253M = 8440 -382 CCGTGCAGCCGNACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGC CG!.(ABH#7GF.&E:DBC2G#A3!>D17,E=;E-#.%(;?((D:@:%(53F=(DH-,1*C(%)5-"+1-;E-@F@5FG3("1D.3=0<0A/)20'(E8%CB=,=$36+E(/(2(GH.ACFC$'A=6'8:4"$- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9A36C7A57T7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7895 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34185 42 131M = 34316 251 GAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCNTTCCGATTGCAGCTTNCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTANTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCAC 6?3-(GDD)+D(5B,1%?@E1%-+',+&5$$E%;3.DGA*$96#E969G%+/D:#G546E'2#&&@E%9518$@.;:)&=>!$)!B(;,:7!08AHB=.%D=24=;+;<(B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27A15G54G32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7896 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2854 42 45M = 3001 218 CCCACCCTTCTGGGGCCGGNCGGCATGACATCGCTGCGCGAATAT G;5%1(($%C*E"1+8-6-F:/0*6-,36/4!F*@%%0@C*$==1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7896 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3001 42 71M = 2854 -218 GGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTANGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGN ,D''()*F7&F#&:#0EC94.0-6#,3:F"23*F!)-2(:F:;'0%F.+$.H4/@"+')5C;*<3;-/H)% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C42A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7897 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15565 42 190M = 15755 288 CTGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGNGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGNTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCNGAGGGATTTGAATCCT %!+""*"!$$)+%)'*)$'#%#!%$(*#%"*&)(#"+#&'+#%"%%""'&!!)""+$%'"%!&'%*&##'%&+$*&*(%'#'*$'')%"#%)+""((+('!(**+$&$*"!#%++)*()&*#'(*'**$+&")**$%*%%$$&#("!'$'(+*****!&*'#&!)+!"''#'*&")$))%%"&")+!$)* AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0C35G103T31G16 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7897 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15755 42 98M = 15565 -288 CCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCNATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACNCTNTNCNCTNTACCTAA #'*(!!(*%*%&")'%*'%#*($)#+!%%*%$&%'#*!%+%*#&(*+(%%$'%#(%%")""'+!&%$+("+'*$!%#+$'$!)"&$)!%')#$*(*#' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:46G33C0G1C1G1G2T5T0C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7898 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1920 42 96M = 1793 -223 CTGGACCGCTACGAAATGCGCGTANTGAGANGNGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATNGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCNCGACGATGAA =/,4"-,1$FA%+@'="4%$)+HD7$$)")A36>3?&:#6:FC0'(-7;-77)))"4&E9&G%50''8?440E?@:3=C+7'9?9'<4GH#A* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:24T0G1G2T1G26T25A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7898 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1793 42 51M = 1920 223 CGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAANTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGAT $FG?,0G$*-'('0&!;4C&%%(9D@DD:+.@E56*-2:5:,:'*<(HDA2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11G11T27 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10921 42 53M = 10712 -262 CGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCN 6),HBF3,52:,02F?10/F3;DH1#8"E(AF+B?'=:5'!GF9/?D#9:.5! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7899 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10712 42 47M = 10921 262 AGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGC ),)01"5-G57"&C$-H(EE)$9=,A3F06H+"'!%/E7=@77=1(6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7900 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7929 42 126M = 8055 339 ACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCA /F6B-H0D!@+83'%.+7D#AEG@0<@9"2/&5F?3H:4?G@B41:/=F>2=1'@C#7?D9=;*BC@/!"""%D'F/5/=3?D,2$8A9-.)@1'A$!D%(F3@/:!."DB);4=,8H%46'45"8G48<,15-45.2/(D*B,F-A()9@BE/2&3D$#;$-%+((?G!;&B9!*+H.$5.9<%(#21A>6(-,EC#,=$1C:3%=0&D:<(7G#@18>:56D*,%50C&4<5.,>;-.>)2%((. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C46 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r7901 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29809 42 158M = 29670 -297 CAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTAAAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGNACATACTCACCTGCATCCTGAACCCACTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGANGTCGATAGTTACTAA #B"!E.F"FAF$:-44>GA&)8&C.+A?#5;/&E!H$1),+(#8C;(!;4HD1=%5:HCD&#((':'G<19>(-,B5=7G37AHF?4+&%,)575>641/#D+;#BA:0.CE8=7.1A*)E!%8?3$&43"AA!'%)A#@05#;0>;.D<77GB"!A; AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:27C52C1G24T34T15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7902 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40918 40 73M = 41139 313 TGTNGTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTAT "!)%*+$"#$)(%#&#$)!$!'$+'$!)*+(%+++&('*(#("&"*)!#&!%%!)*&+"!$$+("!+&&(&&! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0T0G0G0C68 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7902 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41139 40 34M1D57M = 40918 -313 TGGAGCANAAGCGACGGGCAGGTCAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGCN ")$()""%!(!)(%)!!$%#%$+&((#'(&$(*&#(+&#'*%&!&'))%(!%#$+$$!"!'*)%%)%*"*&)&+%&"#!))$!)#+&"+!! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:7A15A10^T55A0A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7903 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9112 42 104M = 8850 -366 AGTCCTNTGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAGATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGNCGTGGATG 47-#.7&?H?)2;=#*)2%7,G=%@:8?5$!%3(96&""6946C&+$:)-/097'/A,8#"?&G!2?>4&<@)8F5939$H?+D"%2(<9E<%9A5901#$';* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A56A2A28G8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8850 42 176M1D82M = 9112 366 CCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTCTGCCTGTACCAAANCCTACAATGCCGGNGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACNCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGNCGCCCGGCGAACTGACCG ++(%))!$*'++)&*'+&%(+$!+*!)$&'"!(&%%$#'(*%)!!(!$*'+$"()("!'+%++%")$+(++*!('#+'&$"'%"#$'&&!(*!$!+'")#*%)$)'&)*"!$(&$(%))*!)+!("""+#+#'#$%$"!&")"%&%*#)+)"(($$%)'*"""'(&"'()#$"($)($!+#*%&#)!'!#+(%(#)*'+)!&""%++$+$&%!('#$#$(("'(*')+&"!"!+)#"('*')!&%+"(%+#(*))!'+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:105A13T13T42^T3C59A18 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7904 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6901 42 36M2I109M = 7077 224 AGTACGTGGAAAACGGCNTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTA &EG1D(-0)$3D".>(%A$,,@&0+F!BF@F80:E.,?-2)GB0=>8.#3(>+(+;?9?-&?CA).(88'%3&>2##B%#8*:?(?"*401"9/)5H#2?/0B$+6145(=7="DE?0F'4FB(/$4.?1 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:17G127 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7904 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7077 42 48M = 6901 -224 GCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCT '171H88",E:?1G+G660,+8*/@AE#<5,+7"/.FAG#5#@;-+.1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7905 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36198 42 51M = 36198 0 ATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACNAGGCATGATT 4%/"6H,A%=2%E8AC%978+(-)@B&/)@)(;7EE#A.=:8@D"/A1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C57 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7907 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43356 42 72M = 43356 0 GTCTCGGTGGGCNATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGG =FB'/EB-%)!B@*("#0@:0='8H6C5=$62H%4=1,'$H%H@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A11G59 YT:Z:UP jpayne@0: r7907 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43356 0 * = 43356 0 GANNANNNNGCTNNGANNNNNNAAGNNGTNGCCNNCNTTGANCTNANTNTTNANNNCANCNGNNNAGCCANAGANGNNNNNNTNCNTCTCNNATNTTGCG $$"##!"!!#!"""$$!!!#""##$$#$#!$""#!!"""$$!"!"$!""$$!$!#""#!#!$"#!!$$$$$"$"!#"$!#"#$"""!"!$!"!#!!$#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7908 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23528 42 63M = 23621 203 GTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCAT <:?67.68#407(@"5A9;9G>>>H842,F,66?+1"">/-8'%(6-,9>!+G6/'&A@?F86 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23621 42 110M = 23528 -203 CCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTNTTCCATTTTTCAATAACATTATTG 3E&,=GA2F)8"'3?CH:=4@A,6+B2@6#G(,5+2-8$+B5(!6+4>8?':-13,&F2A*(24AD2%&)5&41'@H6;-B1C->8!@@+'7B1#C;'*:=>%!6+B/.C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85T24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30946 42 96M = 30720 -322 GGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCC ;97;*50*$"@?&;?>36H130G7$<.'1.B6:=2+.#D?5:#58*)=-'%954$684H,)(/+1%'F914<%H)B. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r7909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30720 42 92M = 30946 322 CCNANNCNANGCGGTTTAACATGCCGAATGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGT %(!$!&#"'*$"+**($##'$))$&'%&*#&##&*+&%*#""#(&&#"))($%((&'*$&*+%$*'+&+&#'#$#$&"(""$)&((%+((#* AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2T0T0A0A0A0G1C2C14T64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7910 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41788 40 45M = 41928 202 AAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGA F2F$0*<&&+AE/G1?DC52,%3.ABGE5-*/!;H:',HB-/;:- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7910 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41928 40 34M4I28M = 41788 -202 TCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATA /#=E35#>4-G4*8A3<"6"A#'$'G'>F*.>$5CCCCAH%8+/G,0$!#7-+7BCD2$2:)+=68-$77#:;<)CD+8E"$7B04!D;(52*B3A#&7)+%6C.#E<4/-#F,,5$1(8'9)-?E+087,F.1-,#B(91)EB=B@0G5(#0>?'>D-"95AB67 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A172 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7911 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10556 42 107M = 10376 -287 AGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCNGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACNN (*&&%*()(&*'###%''+'"*$+#&"%#+"%')$&+'**$*'&$%!$*!&+%$()!%*%&#&*+)*$!*&)%&+!"&%%#*%$!(#*%#**(&!!%*(*#('+('# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:78T26A0G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14661 42 44M = 14453 -252 TGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTAC &@8(;1C8B'2','8*D:%G1)D;8%2$71&&7>$<2=97FD1=&A!- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C0A0T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7913 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24799 42 107M = 24799 0 NCTNGGNCGGGCATTGAACATAAAANCTGATAGCACCCGGAGTTCCGGANACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGA "'&&('(*+)*$'+"#$')#&!%(&$++($$(*%(%%'#%$#'"&'"!#)(&+'&#()!"$*)*!'"+"$$*$#!!(*&*#***+#*(+&&+()%&$'#"'$#%"$) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0G1T0C1C8C9A23A57 YT:Z:UP jpayne@0: r7913 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24799 0 * = 24799 0 GGGGAGNGCANTCTANNNTCTCNTCCNANTNNTCAGNNNNCATGCNTNNNCNANTAGNGANANANTGTNCNNGATNNGNNGATACNGTANGNNCNAANNNCAGNGNTCNGNNNTNNNTTNNNCNNGTTTATNATATNGTNTCGGNNANGTNTNNANACTNNNTTNCNTCNAGNCGNNNCNGTTNTAANCNTNGNTNCGNGNGNGAATTCGTNNNCGNANANGATNNNNNNNCCCNNNN #$$#"!"""""$"$"##"!##$$"#!!"""$#$"!"#!!""$$$$"#!#$#!#!!"$$"!!#!$$$#""$""!!$#!"!!$$$#!#"$#!##"$$$!$"$"$""#$$#!"!$$!""#$##$#!"!!"$$$#""""!""#"$$##"#$$$!!#"""!"!!##!###$$#"!!$$"$###$$"!!$$$##!!$!"#!!$#""!!"#!!$!#$"!#"$#"#!$"#""!!$"$!!"#"#""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7914 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43466 42 65M = 43365 -166 TGATAGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGTTGGCTGGTTCTTTA )'B'9.%5*D1HFBE*2%7E.#5D>-(=#$118)!;49#"++:#4A@@0618-C7")7#!86E51 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G45G14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7914 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43365 42 50M = 43466 166 GGCGATTTGGTTGATCGTGGTGAAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAAT D?*BE$(?';2DH$H5@?-HB.%'11;1<:-11,CBB$-#815%E5BF,( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C27 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7915 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29069 42 57M = 29389 376 TNNAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGN %$!+**'$!*'"&+$!(*!&!+!*++&'$("'%!+%('$'#(&!$)'+(*$"(+*+! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C0A53G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7915 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29389 42 56M = 29069 -376 TTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGNGATAATAATTTTGCA %F(G0/<*+6,68"!;*780%<<3(46.2%8*&DDB#3G8(=?-B9"1117 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7916 77 * 0 0 * * 0 0 CTCANGNNNGTTACNGGTTGTTGGGCTTGTTTAATCCAGT !)&)$&&"""*((#"!)&&*+%&))"&#+&('$#*%!$%$ YT:Z:UP jpayne@0: r7916 141 * 0 0 * * 0 0 GCTAGAAGTTCACGTGNGTGAGCNCTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGNGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATAAGTGGTNGTGCTCT *(+*)+!%%!#!*"!%''#'+'+#%!!%&'#%&&)*!&"%%&)$(*(#(+'()""($%!*#$'(#!$+$&)'*$("!'!!'%%+'(&&#'%#"%($%&#$(&#%)+('%((""%))#*$+$))%("%"*)"&)'$''#&"+*$')+%)&%+"%&('!$%$*$'#*&( YT:Z:UP jpayne@0: r7917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40627 24 71M = 40399 -299 TTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATN 'C?%A(#5D7(*,78F'#3%85;=.418&@-5;-)<+:7D?-<3@#E7A+CE'"G,D5+'C1&%.#@0'<# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G0G67T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7917 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40399 24 41M = 40627 299 NGCACCGACANNNGNTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGC %&*(#!*!"*"%"!%+$*+%%+&"''')"'"$&"(%)&)+( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G4G1G2G0G0T0C0T26 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7918 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12305 42 92M = 12418 312 AGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCT H+:7FB6E//+H@!G*G#D((C",;F2-*0$"6(01+.;5(%G!9;+A:DH#?D3,!94==8'A5%29$)@40'$H+H@0D9F+4;>%'.G* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7918 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12418 42 199M = 12305 -312 GCGGGAACTCGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGNTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCT 9.'2.2B)?D9(F5@C$8-*,3'!-+E&9-F?#/)(-952#.C3,<@067.'H:)?AC7H;#@61=?*/GHA,.16=/?D,9=:05$)'?6E!<0=8F$7.$H$+&5-%>?*:$$C4"!/H1,/:CGD-E0=+,+"5.6->'@"3367?E0C)!0163'3D0E.'3*BF#68<+.>2&;.@E(*6+C AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G21C167 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7919 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33261 42 55M = 33059 -257 ACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGNCTGGATAGCCNT (5>26H(:D49505B98$H"%"F=7%4C*A0;"B.4(%F#!6HE"?5/#H8E50@(F&6D,C,-:<.2.08"H0;2FDH/:3D3&8>;+;A/C1DEC.&8F&+$%*A1:9G&C1="-:/:3@;6:=&%)2??7(7&>$5*,B*;=B7@86..$4:C2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C35G39G90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7921 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25857 42 125M = 25857 0 ATAAAACAATTGCATGNCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATAT .D>CH.0;)DG4C&"(;4254$#*04D<->#6/6",G=2<#=F9$,H.G+&1F?D3D!FEA,=(<%+97:HD619/D4*8E5-:0.(!71G<54("%5G@#-:.)3C8$""(/G#.!=$:'2>&$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T108 YT:Z:UP jpayne@0: r7921 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25857 0 * = 25857 0 GATTTGCNNNNNNCCGTNGGTCATNCCTGANGCAANNTTNNNGNNCATCTNNCNGTACTNCTNNGGANNTCCTNCCAANTANGNCTGCATNTTGCNATNNANNGAACNAGTGNCNCCNCGNNNNNCNNNNNTAGNANCGNNAAGTNTNGAGGNNNNGNNNATCTNCTNNTNCNGNCTANANTNANTANNGGCTNCGAACGTGNCANNANTANNNTNGNNAANTNN !"!#""#!"!#"!$$$$###"""""""$$"$#"#$!"$#$!#$!"#"$"!$#!$"$##!!$##$"$#""!!!#"###$$#""$#$$""#$!!#"$$#!###$!#$!!##"$$$"!!!$$!$"!#"!"$!!##!!$$#$#!"$$#""""!#$!#"$"$"$#"#""!$"""!$$!!$##!#$#"$$##$!#""!"#$""#$"!#!!"!"!!!!!$!$"$$!!#$#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7922 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1625 42 158M = 1807 277 CATTCTCTGGTTTTCGTCAACCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTNACAGTGTGACCTNTCNCATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCNCCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGANAACGTAAAACCTTCGTAA +()=19'@9H(+/-A0G282G79);BCH;;"B;/+9?2.A;5;<9'&3D4#!&5.@7(DGHHC;!16"448>0'>"H=051:D'D)BF)2977+=G/0@"48@C(DF)?H",.E(,.63$$3F**92G$;0G.F;!0-">B@77C4;'D6G'H/1F=,4%$/:*(79>3/D-+%#( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G18A34 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6473 42 376M = 6849 493 GCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCNGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCNAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCG D+A0.2E:>'(H";B=C$$!/!G!6B2A(F/)H7*FA3/!/*"@/=,F5D8)=3+4H>G.;F";"AFAH:E/B*($?-#93)C;E->.>)6D4$/C@'=!#,E4=CDH"/61-<2E.F#:3'>!7D(4*60%*#(',2!E!2"'.>4F7?GG+,%,;(6@3;C01A*4DG*C?&$.45G2&5750(/=,G"#2,;#>#>3E4!!03.CC,.0H*3=5G103@E>01?(#2*')$0/"7.7*)'>4>H%E!!!?;()-9<8*E65:%>8==?!'BF>-=((!F)4?2C%9'::3HC@-#G.!,"1,&3#<43#1H892 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:127C106C116A24 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r7924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6849 42 88M2I29M = 6473 -493 GTGTCCTATAAGGGGATGTATGGNGATGTGGCCATCGTCGTGTCTTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACT E:G=8E5?C.3!?#"=,!!.>**()"9B6'::AE;A,6>%G$6,.+4*#3>0?:2&B8/0$<#)')+5+>3F(5"8$D$'#=5&;D5;8A9@H52DA';A2*5'(:)>!0D#5(5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:23C19A73 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7925 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46133 42 133M = 46288 213 GCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGGGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAG .%.%7HBFG:6*7(*B7C/+#BD:49*B2(7H"B'.D:$$%@3734C-*;E:-=H4%C>909DDCFCEG,E6%25/,<83A/@H?2@8#-D)/+4.+8'<(44H0.5)?=@$=7;/BB#!@;A0BF6@$3%># AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79C24G28 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46288 42 58M = 46133 -213 CCTNCGGCGTGGANAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTA ;G8!17DA'6=2*B05('D=/>CGE($#CCG2*:&!1'49@0*/!B+H.77")72("D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C9T44 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7926 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32166 42 50M = 31967 -249 TGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCAT &1+<%E>87$.@82%+:"++5$)@A&#D8;C>C>:&.1=(=D79G3>G:8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7926 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31967 42 49M = 32166 249 TCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAA 85B67E$=6&A"A8)*+$8)9C&*981#>$'D:<.;)G4+A*%,B>)=2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7927 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36416 42 191M = 36312 -295 TAGATAATGTNCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTGTGAAAGTTGAGGTGACGGGTTAAAANTAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACGNTTT *'+&(#$!*$(!*#$(+++$(#"+#'*)"!"'&$"+&*&(&**"'&!)+'')!%#!#'!)''*$$+)!++(+*&&(*()!%'!!'&+&#&!+&&#$+!*)*%"+!%()+**"!'%$'+"#!%!(("$#!*&"!))%%"#&+(")((+$#"#$&&#)!+$(*('('#*))#)(!+""'&(##""$$+'!&(# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:10T45C5A19A103C0T2A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36312 42 104M = 36416 295 TCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGA AC=F)0&"EF5(E!(.+F)!&D1F%:'@5F?!BG524BH;:-H+#@&<"'C2C&3*:B06,><*"6!87/?;BC-/=43"F@-G10%@/A>E#3@%6('*3G,3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r7928 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46544 42 80M = 46235 -389 TGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTNCTGCCCAATTCCAGA >AF507)<2%0A?<)(C$E-!;):*7-!.BBG9<01,65>">@@&#!.?H813@2$7??GH2=5G3!7!9;E)F&-&?++ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T15 YS:i:-42 YT:Z:CP jpayne@0: r7928 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46235 42 309M = 46544 389 NTATCNGTTGCANANCNCANNAGTNAGNNGGTCGGTGCCTNGAGCNACCNNTGNCTCCGNCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGANTGNCAGACACCGCTGAACGGGATTATNTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATGGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTTATGCAATTATTGTGAGCAATANACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGC %#**'()'&#)(*$!(%&)&#)&#!$%'*%)($#'(()'&)$&(&()#&$#&*(*$*'%)++*$'"+!**&!*##!()*(%%%"""!$$#$$%*'%$)#(*##%"(+&*'(+*)#(#&#!(&'%+)#"&##%%+'(&+*'&+"")(%$%++#'$)"+$*%+#+%&%**&%(&#%$'')&*(*#*%!('$!#"$")*%'#'%#*"'&+)(&+####%'")+)**&"*+$"!!&"*'%+'#'#!*#&%%*$"%#)&()*%!")#+*")&&'+%"+$!*#+$!%(+&)%!+''#"&+$"%!%+%&(($)"!& AS:i:-42 XN:i:0 XM:i:31 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:31 MD:Z:0T0C0G2G6C1T1A0A1G0C3C0T1T0C0A3A4G1G0A3C3A0C0C1C5G25C2G23T78A25C21C69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7929 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47597 42 107M = 47809 268 CAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAACGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACNGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAAC E@84-3(4&7=2#-F=A*F-/-9@/;..1)"/6C/&D!9B:H:<15F5*;G@H#5A#,&<'F$F%F*H"5*4EG)HFH??+$6+@$CH&-1(?'A;BA'E9'78%(1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56G24A25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7929 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47809 42 56M = 47597 -268 CATTTCTATGAGTTACCCNGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTC #9>=:@*D@7>,C0>54674C)(2&C#,!E"10-9>76%74'9A>00G*;57#0.@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7930 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1452 42 159M = 1452 0 TATCNTAAATTTGCCGACAGAGAGACGACGTNTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGGGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAANNANNGNNATC (!!(+&++%%&'!!"&")+#*%"&$($'!$#+"++)'&"&(!&((+(%(&%(&%&!*($%(%#+)*'+#!%'+!"(+"'%#!)$(*&+$+!$#)'&'&$*&$'"))')*+"+)"+'+*%"$'")"*'##""$(!'+)#&+#'*$+&$%'$($**"$#'% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:4T8G5A7C3T33C22A59A0G1C0C1G0G3 YT:Z:UP jpayne@0: r7930 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1452 0 * = 1452 0 NTNNAACNNGCATGNANTGAAGCCNCGCANTCTAGGCGTTTTCATGTTG #*"%&"%"'&!'%$#$#("))!*&"%'%#%$$))#+!#+)'!()+(+&" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7931 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4338 42 234M = 4572 297 TGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCNTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCC AC#%<68H9F?''4,-3"3@B,+1".F51/A-C24'C-HA?*#?0+54'83B/E;+/E)(-3<3)97B+.>91@.B.-7,.6$:/"A3'@=>=%5-8@5>:>=F9C=&/&46.',%C@.3800"8H@#C%9ED%0>$B*:>..:C/&6?%):;*<,H(;;C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:144T89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7931 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4572 42 63M = 4338 -297 TGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGG F;9',1#+=(*-40&2)%D@C'E&3/&*$1#8;%.+,>,DA$,2,680@7*/$567B!BA2#3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7932 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4044 42 46M = 4252 294 CGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGNTGGCTGGAAGAG +%D:@->A4>126.=C/1@()<$E.D$)@."A@4))?)*DC?F=.9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4252 42 86M = 4044 -294 AGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCG 09<+@B)/C,E27@'3B,E,=0CG=D-:%6@:!8?22$FA&?E!:;CH5=F%A:3(-G>?0,1(;)62C,F5H&%*6#!A!11&9- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7933 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36241 42 122M = 36371 212 GCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCT &1F0-8,E=>?<-EC''&59;+98&@EGG=!D""4G-2ABB<3?0%:-?/6&%ED AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7934 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46332 42 72M = 46523 244 GCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGNAAGANGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAG +%&#(*+!)(!#)'(*$("%&'")'("!$)(#('!'!+"#*!*$+(#+!'*()+'&!&*!$(*#**##*&(( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:26A0G3G40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7935 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36658 3 71M = 38873 2307 CGATGAAATGCATATACATAACATCGNCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCT -9G79,A-=8?7<77/%A:,4%>")07;=;*%-,&FC31@'?%C".F::2H*"C=;0-A4=.%<3*%/'/, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G10T44 YS:i:-57 YT:Z:DP jpayne@0: r7935 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38873 3 24M3I68M = 36658 -2307 CCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGCGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTN G=5E&C14(1*#$.&#&E4+@.C0?#="&(&<.>H2?69?$$99<#*%D)!"!$1?.@*41B*9+=859(C6<(,F-1#$/-7FDB67A?)>";;%"7*:E136' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7937 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42958 42 304M = 43262 358 GGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGTCATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCNGACTGAAATGTAGTCGCGGGACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCG =8F@7EE$0.8*%D%F.6B%7++2:41.!@2@<<*-9B=A?$1H>-%>>(64/9;1B$"('8.>8"?EG+2#=*,83'!%)3!#3!":-C6>=)E=D)'<<=?/@?F>C(4#/G0,,EB49G,*2&.9:"2E5B5A&()/+?.H%F!9(:'#@@,-&+5!!"-/9AGDF942-0$#""*@4;?A7H6.,019#F$3=24>7'&!DB'+.40>$,@FG"E%&1".>3*F5D@)D52BA?:DH5/("1-F AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110A43A19T129 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7937 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43262 42 54M = 42958 -358 AAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAA 7".>D?:)*@$."$9B;>))%7C7%E*<(:6@./F4B"FA4*HH8DF$>F%D#H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T9 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r7938 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22631 42 67M = 22825 285 GTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAANTGTTCAT @C*BA$-($D941#?G#3,G<@13)2*5$+.=A-"-4B16:@5:A4>&)%<3?'3<8@E!G2HEHB! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22825 42 91M = 22631 -285 CATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGG 8:B6)F633E$D>?551'1HFA1<)+!3*(4AC$2:B?*/H'E%H5:DH9$##!+,C,@<3&<>4FF)D%+1EG8!52(71#>B<6#@%4- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7939 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8086 42 79M = 8086 0 TATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACNGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAG .7(D$;0*;4?A83*=,)=1A)6A@,8(E#75"(?GH9D7#$2>69#A()9>A1E?B89)& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T27 YT:Z:UP jpayne@0: r7939 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8086 0 * = 8086 0 ANCAGCCNNACNCNNNNTNACAACCNACCGNNCANTGAGANNTNGCCNNCTTAANGNCNNNCTNNNANGCCGATACNNCNTCCCNATNCNNNTNNNNCNNCNNNTCCNGCTTTGNN !$"$$#$!""$!$""##$$$"#!$$#!$"$#$$#!#"""!!#$!$$"""$$##$!$!$"##!""!!#$#!####!!"#"!!!"$!#$!!##"###"$""!!$#$!!#$"!""$#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7940 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9175 42 184M = 9359 541 GGANATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCNGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTGCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGN ,/?-0,@-!&&'BCBE&H>58G$?A?F4&@;/A@;A(B(")8D)F55H=188#%:#;8*0@*8<*=:$6$%@="4329"6='D'BG3$!'/2A(->?@=%6:F&;?H,(6&.*);4AA0+C=8>798"#,G1281(E):<$3C3$5G"F*H?6G8=34:&:8/@$?.-?/+:E1"9",)+08@C AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A2A53A56T68A0 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r7940 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9359 42 26M5D326M = 9175 -541 AGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGACCGTCGATGGCAGAAGATCGCANCACGGTAACAGCGGCAACNGGCATGACCCTGACGCCTGCCNGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGANAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGNTAAAACAAAAGCCACCGTGTCGNTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTNAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTNACCGNCAGTTAATCCGGAGAGTNAGCGATGTT %*+5$H824')9@?=:@A*&3<;:;:4!$H3A553HC%:+#&.5051)>@'EC-*0-(A(F(5A"A04B6F<8H.:081+,H)&B?)';+A*57$G'89-H3*F62)H72:,EG%E(37">=)'C7,@)7-,6/E!B>#>26E@')*&@%=(4726HC-G2:%;=52D;-0A)FB%(>=04#H=DA27>>D$&%62CDEA9C2)=9@(#1>A,(+:3-;!CG:)@B#)')3F-;41"545DG7=73"=:H21HHA,(2?97-H%5=.2*!G*8&5D75>+6%-3G4,.>3>*8;>C6A0$=$#";&>:,0/";:".#+554EEF'*'3$5*@4()561F@-#0@&&17-6D% AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:17 MD:Z:26^CCAAT8T22G18C9G11A67C25A22G46C56C4C17C9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7941 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 209 24 44M = 1 -252 CAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAA /D(7=$/.#&41&>+5"-A(,F:&=8'@9G5>!#!@D5%D35-E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7941 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1 24 4M3I41M = 209 252 GATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG >%$-E>+3!#<:F*F<00?2D3>D5);=*<19%%(F8@/-HFF*>;>4 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:1G0G0C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7942 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4475 40 49M = 4254 -270 CTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAG #:9(7$7$7G<7CB68H)=/9;04G>G:.8C5#/*C!G/F6CE&%*E=' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r7942 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4254 40 112M = 4475 270 TAACGACGAGCNAAACTGGNCANANNGNGGTGACGACTGTCAGGAAATTTTTNCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGG ))!&!&&$)*%!"&)!&%!!''*%#*)#(+!+"*'!)&&&!*+)(#*+$!&&('$&(!(&'%!!#*#*'*'*''$)$!$&&+*'!!%&'"!##&')$*+)%&)$#&!'%)*$ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:2C1T5A0A1G1G2C0G2A1A0C1C10A13G59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21950 42 100M = 22275 366 AACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGNCCGGAACTAATGAATTTATTGG BH&,*-*?5#$-$&')'9H&H#A'2/A?%GC6<-<@B)>C/0:7C'#)>#8$?9?F3#$#!A;+!/8?0-D-E$?0,H!#>&7(>A2H,F*@&!1,G#+C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G22 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22275 42 41M = 21950 -366 GCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGA $!0D1=G2?!;7=C%+&4D=)>@6A&(CBD%)<0:+<>8C# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7944 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1803 42 72M = 1977 249 NCCGANGCNAANANNCGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCC #%%&&!&'&*'!*%"!%)$+)$+"+#%()%"%+!(*&#"(%*&#')+('%#$&"+'!)("!*(&!!("!#%$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T0G0G2G2G2A1T0T0G56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7944 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1977 42 75M = 1803 -249 ATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAA A3%&D.:.#/.C48+FCF20(D"@B@*#CC,0>83?F2(6C// AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7945 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29301 42 81M = 29413 155 AACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATANTGGGTTTAATCAT 5!0G<1/A7>E/<'$#BC&+"1332DFDE#4@6A"0E&5<.0F<'*/+9$)",>DFG26B*#!$-5H;4A5/;F&H>2C#B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7946 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27749 42 199M = 27644 -304 TAAAAANGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGNCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTNTTTGATTTCAATTTTCTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGNCTTATGCCCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATANAGTCTTGCNGACAAA ++#)!*+%!!)$#%'+!&&(&!#""&%!)+%%()%'&!%##"+"'*&')))#'*&$*+&*$((!!$((&#!+"+)+'%(&()$&*($!&!&#'!#(#*'&*$*&*&'*()*(!$('+*(()*%&((%"+&!)%*#)*!!&$"*+(*%#)!"")'+"''$''#*#%*$%"+&!&)!'&'*%"!"!%'&"&$#)+)&&%)( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:6A32T1A23A15G49A51G8A6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7946 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27644 42 105M = 27749 304 CNCAGTATTATGTAGTCTGTTNTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTNCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTA !!+)%)(#($()%%!$'&$#)%!""'*"+%+(!"*(&#*#)'&$+"*!'"$&!%&)''%&#''#'$'++%+(""'%"*$$)!$"$'*))+$)!&'(!*$"&(&$+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0A19T49T33 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7947 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30503 42 62M2D211M = 30503 0 CANACNANAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATNATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGNTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCATGTAGNTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCC )")$&$$)+&**"('&!+'%+#&"%$++'+$%)%+'($""'+""#+%!)&'"!(*!+'(*")&%&")#(&()'$#$&*$+%#&%*("&"&(("$'#!$("(#%($'*"")#$#"')+%*"&%&!(($#(#++*#$#%#(())$+%&(%++$&+$%#')&*+)$'%*!&%())#$"&')%**++)(#$#&#"""("*"+&(#%&()#$))+)))#+)""""+#+)%%$'!&**&'#")()'%''*'!*&)"$*#$(%!+'($+%#+#+"%'#!+ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:1T0C2A1C54^TG35G35G41C5C91 YT:Z:UP jpayne@0: r7947 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30503 0 * = 30503 0 GNCNNANCCNNTGNTANTTGTCNANTTNNNANGGACANGCNATNCNTAACAANTTNGNTCNGNNCTAGCNNCNNANNATNANGCNCANGANANNTGCTNGNANTANAAGANGNANCNNCTNNANCNANNNANACTTNGGNCNCACANNGAAGNGCTNANNNCNATN #$"#!###!#$$$#""!$$#!!##$$!!!"###"$!"#!$#!$!$#"$##$!!"!"!!$#"$""#"$!$#""!""""$$!##"!!"!###$$$!!$$$"$!$"$$"$#!""!"#!!$""#"!$"#"!"!!"##"$#$$$!"!"$#!!!$##!"#"$!##"$!!"#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7948 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13855 42 59M = 14112 298 CTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGT &:0<)H$4#@'A&01%&00-B?8+(6G<#"!/A7.3:/3;>H=;(*4'"1C&8,,%)21 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14112 42 41M = 13855 -298 NAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCANA 0:GG&=B783EA?B14=,'?*>D!H9!<5'(>:EGF708"& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C38G0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7949 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42195 42 97M = 42381 304 GACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACNTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATAGAAGTTA 68D/B<1.1E3>-G%#!9!5"&#$*9B9D5'$763;@-5.E>>)7*82F,&@6='.7H/=9,7E7.$D4@F?/%H%:=.$6B)HE+'<;30&2<302 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G33C7 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r7949 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42381 42 118M = 42195 -304 GCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGCACGNCGNNNANGGTTTNACACTGCNTTCN #$+&#*%%&%$&"++"(**$++*!!&!'(%%%*&)&+"!*%)(*#($""$""*'*(!%(%"!%("*'+&&""+%&)*&))+##%**&*+&#'$%$!%!'!$)'$#%'#!%*$$")&(! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:58A29A1T1C2G0G0A1T5C2C4A3G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7950 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37513 42 68M = 37332 -249 NAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGAC !!')!+#$#"!*!'#*!'!!)$%$'(*'$$*!"("")'$$+$!'!$#&!")+%%#"'&(*)+#*(+*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C65G0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7950 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37332 42 57M = 37513 249 GAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAG "B>D&7H263&+,<0B5B!0>+1)1:.F0?-HF7(B&/$G1!C;:H?D%+460/=G? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A56 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7951 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13214 42 257M = 13150 -321 GCCAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTNGAAGAGCACGGGGGCTGNAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCNGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGT (%"'#&#*(!&&+%!("")*('()'$*##!)(!%!"*"&!%"+"*&%)&'*'+"!%)#$!#+(#$!+$#&$&+!(')$#$!(&*($*#*+&"#+!#)+$"+%*&"'#!"%!+("*"('&'+'*#'($%('#*!+#"&%!"!"$)"%(%"++*(%'*'$+#!)&%+&''!+(+%#$'#'"+((")''$)#%!##*+&$+'!"#+!''*)'+#"*($'+'++#''#+!)!(""#'&*+"&*"(")%$)%%$%'!!%+() AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:71G17G129A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7951 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13150 42 48M = 13214 321 CCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGC $@?AC+4,C+!=E?-G2%@6H!3%0,?>&*)?,&3)2A2;6H-<@D!. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7952 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24542 42 148M = 24690 188 NAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATNGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTT $G!%70>,?+5GA?$23"+?>(*)#A%'.F:&D3E.F4B'-'?BC1<)+)1.=6:=5=)2!H>8A39&:!'>;-:CD7%*-59H88-B-.E;%"0=*H!5%F'5!0;-)5(E(0-"(;-*9B8$"7'">;&!2B!1D4EE?C9DD"5/3/8%?(%<8,(<*3'4!9@@0"==B#1GD*'"-"63!G"1!343@*?$2=-*4%!%5DG@:-%DF.+A*;<0D'2HE827B3??33F.6.8,@!2B6.';=B0A8&F@E90G5=D785F0<.0D,/5:8:&FH9@"8*D@$(-C'"::603/)&83!0D-:4E"&#/'36FB=$8&@HF:*4!:=02!'"4B"B/BC)A+@?&DG=/HB3311C"6-3:31*3;3G8*,6-A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:187T37G51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36078 42 80M = 36158 357 AAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAA =?&-@-&DD"-$F2<,FB!.%+>.6(?2<2A/&=H=3'"A2/3;@EG2!3C.%4*)/G,G=-&=;#*A=G0;"&<= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7954 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21688 42 320M = 22008 386 NAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGNCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGNGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACNATCNCCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAANCACGGACCAT '0EB2?*6*F=&1120'*'0#;@BA0(!H*F1G"!4#FAC08?@!3B%&53G="<:1E;<$,");<00.25C-9-8CB/-@C=.09#;2B9;=,A?9F'7H?G1C5H-B79D11F8$9:55>884:E>#;-$7=?BH"(2(;?!)C6/;025&9,D=&6F#$-.,E@GE5*HA%/4%++A4G%/1(6D3'?;H)G>BA>-!H!4&+A-$9!>A2(A=DF6?.>2HA$,)-&3@:.,CB%@CH/*")4H8DC:70;9GA,8?B4:5"@F!A*8);"8>>:(9G?39>+)3(@:%!F5DE7('@@5@;A=347!:DF!4#$7 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A71C28T105C3A97C10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7954 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22008 42 66M = 21688 -386 AAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCC 7G8';:!5<#6>73.?#33*B';7@G0)7?9"7@+!6'70,=3E34F'9F;)"6@!:@;6()&6.>+5$#251&-12>9"/E'G@-5A@4BE@0'C# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7955 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3952 42 71M = 4052 221 CTTTCCCGGAATTACGCCCAGATNAGCTACTCCACGGCACGNGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTT ,15'9)9:,.E#-.!--+:G+##$="?)/60D/&/D3A/4G7$/>!2E@C) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7957 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24217 42 60M = 24399 263 NTGCGGGTGTTGAATGATGTCCAGTTGCNACCGATTTTACATATTTTTTGCAGGAGAGAA !+"''(")#)*!+"#*#"*#$$&*)"%"+*$!+%'!!(%*++**&%+(!%'!)($+()&( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G17T9T23T7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7958 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4550 42 125M = 4383 -292 GATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCC /3+66:9,A!%%:+47>$@/15&7C,5;+1))+*7@HG@746BD1/>#3F@=%%'$-;AD)12%5.CH)!?78A'/4A1:4"-4<@92F'D<)9FF6.6F6'G/"5A*F@8C,G;$(A1B8+(.F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:125 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7958 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4383 42 40M = 4550 292 NTNCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGAC ";$@CC&/51AB;8?GH=#!-'&+:!/2?2,)D: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7960 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39866 42 110M = 39773 -203 GAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTNCG ,.CD((",0(H1E?.(/&-986;H2'>#C8131&.>9:6,;G.GE8"FC1-<))"&>)?FG*,'=3*;0?F>."7,F'F;8H%-!5DE<09".&-%$/C'4H@'$7E='A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7960 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39773 42 41M = 39866 203 CGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACG E,36;E;?'8*>A7/(E&4(*<7H*6)8/'HE7<#%,?F4G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7961 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2187 42 63M = 2187 0 TCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAACCAAAAACGGGGTTTACCTT H@/H)3'F74D>8'?847("#)!:H3A!>9<+9"*F#C474"/)0*""#'*5='/<'A'%B4@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A19 YT:Z:UP jpayne@0: r7961 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2187 0 * = 2187 0 AAGAGACGCNNCTGGGTNTGGANGNNCCNATCAATAACNCNAATAGCCNNTGGANGGGGGNAGCNATNTNNGCATGCTANCCCG #(#%)**##!)&)%(&%*$(&*$%!$**#)$))%()$!#($"()(!(("$'&")#((#!#!"$!"&"#&&"(!#*%*#&'+&$+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7962 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35135 42 50M = 35265 213 GCTCAATNCGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGC (,>:'#><.=HC58)6>D$"7/7?+!%5@"091%9"5HA)&D4DF/(0=9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A5C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7962 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35265 42 83M = 35135 -213 TGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTG !C*"8*8GC'@=5+'=<#7%=CGHB@+13.E2;B8;GG;/9@<(,*;-?/!AB-"4,6,0=CD**+):/+F)G0.'+#$$:$E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30496 42 57M = 30679 223 CGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTN 6@86.A%>C7C-+*"8G:+D.;CF:;/0").BGH4D,6G81?,;6E<. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30679 42 40M = 30496 -223 CCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGT 0817-)B;3A2#*9A/8AE%&$6;D"8>3'0:=B<= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7964 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19092 42 76M = 19168 264 CGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGA 7=?EF+:.%1;)!5A;4'6G?,8??"45@-*$B"!)!$#FD$"":8;.+FD0&8/#DHH>6/,3$%E*/4?9B:B= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7964 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19168 42 188M = 19092 -264 CAGTGTGGGGGTGATNGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGNCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACNGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGT G$84;>$D8@H&D:6>/.47$:7DF@&%%*=*72H;1FH)="*.?2C8H8=-.=>*#A(-%7?68/=(9G71&-7@F0'%+7$=<%?(<2>G"F/.$/-3,-@BF)81B,F$F9CB%6G.0"'69)9A?6>@G4;8)&2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G21T25C124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7965 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5017 42 80M = 5281 315 TNCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCANC $)$''5:B80;7@A!)74>"9:/H"0D*/1/=-:/9A.=D.'406=-C4/*0!80>;('H! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G76T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7965 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5281 42 51M = 5017 -315 TGCGATCACCGTCNTGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTNTN >"/?E)9.3*5"%B*H48=%?&A'G1:AFD3#=F*<"244&@:3/3>C%'! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13A34C1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7966 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16740 40 51M = 16800 280 GGCCANGGATCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAA *(%#*"#'$!+#!)!#+)+$#!!+)!*)&*+&((')%!!#(#$(+&&$&"' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G1C0A2G41 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r7966 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16800 40 58M8D154M = 16740 -280 GATGGATGCCTTTGGCTGTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCNATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCCGNCNNGGACNCTG +$&%$%!)"!$((+(%%#&!))*$!#)%**'%%)'*)&*!$&*)$")*+((&)"%*!!$)(&$+#+'%"***+&#+$#$+$%(##%%++%&$%&(#($%+'%+#%&"+"%*((&$&$(&!&(($'+"%'(+*!))$$$+&)$+"(%%&"&"+&'%!'&"(&*%%#*!"###%*!*"+(""))$%(((!($#!&)+&)&!("$!(''$)$'*& AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:14 MD:Z:58^ATTAAAAC55C84A1A1C0C4G3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r7967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44567 42 98M = 44397 -268 AAATTGGGTAANTTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCA F:%/<*C08>>)*)!D:'"#*(BDH63H41#-,-B<,B$#3>55>AG&;B30G$#9F9$+AA(/?:F2%#D)3/,2.7C/!.5C($4<":"!D8@C2D"<77--/F7+%;H3#/H-1=%5!1>=2.!,$5H"25!>/;G;AGA-9"',:+(+C>5B=,&7:'C1.C3:&>E7#<10#3>7A@/'B/F3@1*@4GE'+B=&#-BF370D*4-=1-.+?/D!D@1"@+-G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7969 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28354 42 211M = 28297 -268 TCCTTACCTCTNATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAANTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTAT *-'0<#+%7A&"!H0B:@B4/>%C-=%#'#H8&1>$D177'8.(+H)>F#/,2970">1@2E&$>A19#<$?7F)7H1/.E#3?CB$>E26H/54G!@0<7,4.C4G1)#6&C.!"9.40$-"7*(D/(,4;%F=(>D"6$"*&>)2E%%$%(?6,*'AD%!2/*8-'G*:28'?,,9@$F;.;07$+:8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11G147T51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7969 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28297 42 57M = 28354 268 TTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATC ,2C%10%5H6BFD:>=3G26)()4'G@&*%EB90>89=B#/=<%"?/(E=79A+6%2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7970 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25605 42 49M = 25328 -326 TCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGAC 0;3/&2@F5A@)B,H2:$6;,9%>G)G%@&!!?H3;'>A#9:,:C-)8. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7970 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25328 42 53M = 25605 326 CTGCANNANACNTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTG )#(&*&"%#*(!+(##*"!'(+#$(%$$)+++%()!&$(&$+&#+%$+!!)!' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5T0C1T2C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7971 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25040 42 151M = 25191 212 TATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATANAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCA ,)G+;,.!<72/G)B?/3&C8-,#*/D?4.:H45">'2:2HB578?=:#C59632/?+*B#08C(C<9=$20(F@5C**H.0%8-6!D6=&(E%()2H,>>9+),AH/%*HFH,+%A(A%G@B1#92'3H:E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7971 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25191 42 61M = 25040 -212 ACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCG 21.C<':@:-4(93==0G16!!"6=BG55>#*3>!88%E@B*A!'2=C-&)!;G"(G+>#B-98%B62A:6>@.-.*CF$2+EF77-).*H#C&EGCE+>G*85HHG$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7972 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14077 42 87M = 13850 -314 AACGTCGGCAACTTTGGCNGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATNACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGC ?075=3/D;6H::19D#1H2-!,E/8#,'94:C//51FH!&/A5E#&%470$H3.F%$#'$;5C8)!F#A:--1$).)3;>//:55E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G39G28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7973 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12862 42 10M2D37M = 13014 259 TGATGCGCGGTTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCAT 42,!9E?>H"(*?"".G-F)>;0"F3$9"8/AH9HH67;6C-02@<$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:10^CT0A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7973 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13014 42 107M = 12862 -259 GCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAA =/*+HH:$(-.%?H'5#AH+&.?$A2":'1)=3<625G$-)//(=9EC:>BD(1?$6418@C!!E57&6$&<(06H#AB9097@9*6#"C2-HHC$429D==&7>>* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r7974 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4865 42 56M = 4739 -182 GTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGG 0>&A97/%075HCA27B?>26(?C35<14-4F*80"!+8-0'GH4)1H.+E#!13G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7974 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4739 42 56M = 4865 182 AACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGNTGGTGGACGGCAT >2C46C.D@45E"4*H1>:D*(6G+=?F/%3/16/G*!<%?**'9#$!#57/?BHA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7975 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38582 42 112M = 38438 -256 GCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACNCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATAACTGGATCTATCGACAGGAGTCATTATGACAAA 7"$&>,:6D&<>,>G!$@BD61*>:.,'+H7&3:H08C"-%2H7.F)0.6C/C>($4$ECHB,EG8299C(G"62#34?*?A/-C&4:$,?-#&6%=0+/C>':=B(37<)' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25G52T12A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7975 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38438 42 144M = 38582 256 GAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTT *D$(F6G62?"?2."):41"@(?'7+"7'<20D8%A*",,E7>-F.H&*+$>/)-"8)>&A8@&(G,24@8C)9>>>=55F14.2?E%D@'B22C,C+>;9"?,%:"G'0!H?4+#*=,6&!CB/?:68:)9+9G= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r7976 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4763 42 44M = 5010 319 CNGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATAT (%)*)+++)##''*+"+$!!!##(+$++$+&'")+!((''$#"" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7976 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5010 42 72M = 4763 -319 ACGNTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGGGNGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCA A7>1813?5@6C@<4+4H0-+-'769(92F8$,F0F(24A.69-5#G"+0A2-%.2-;03(>%-2*03%)GD AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G21T1T44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7977 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32980 42 51M = 32980 0 CAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCT 9&,.='6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C30 YT:Z:UP jpayne@0: r7977 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32980 0 * = 32980 0 TNNNCCGCGNNNNTNCANNNNTNCNTTTNNAANNNNNNGCTNC ##$"!$$#$!"!!#"##""""#"$"#!!"!"!"$!!$!$!$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r7978 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40134 42 51M = 39954 -231 ATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAA &8,A&.-1:E#:4+9&-&D:'-*1EAA%CF2;8"!6F@//.759'CCC9%27)-+%A13#H/88@$9F/>(14D1H1:H,A?D)4:B%>4(D>.A5F#=: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7979 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35696 42 132M = 35867 253 TGTTTGGNAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATCGGTTATGTGTTTTGGNGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTA :?>+)820B=F@5);C93A>#E4-<-.,,$/'2(H>11HG%(5.C>*H6)7&$@)>D6F=6E)E-B<0+">3$9:8 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T64T15G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7979 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35867 42 82M = 35696 -253 GATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATANTGGGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGC ?;D*A&)*C40/67?B9*$F/,,GH/)<7*'"?5#,7,754.4-@5@B/$AA')+=/H%-C40C*AFH@@+(8%'E$'>BB, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7980 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29660 42 62M = 29888 321 AAACTCCTTGCAATGTATGTCGTTTCAGCTNAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAAC 0&;581A<6+@H?A)CE,$:3#73)9#@H&0':G)#;BF328F##+$+&2G.@&>D?#,7:! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7980 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29888 42 93M = 29660 -321 GCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGAGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTNTTGTTCGA +%)+$('&"*$%&$)!"(#%")$$(!$'*$%'"'*)$+("#'#%*'!(#)'!*)'*""(+")*#)'*(&*$))$&)%+*!+))%$%#"()()+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3G46C33C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7981 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10563 42 55M = 10333 -285 CTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAG A"79G(/.?494#:<(';"A#!(%G2@A,;$;G=E8G!=C:<=00-,*2B+*)1. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7981 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10333 42 154M = 10563 285 GCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGTCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCNCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACG -@-'$&*1;8'$2&9!<%/0>7C8$*:H3+;C9+B43DAE).H6(?;%>5G48'.-C?C(33F6E6?:.=0G7&0+*A3=36,)F@73.3&&H-",*F#4!@!>F+#.+*+0C(GEC?-500<5!!"642<23.;$>DC$>"%7/1,:25&;+2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43C81C28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7982 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29538 42 82M = 29674 302 CTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCA >CHA4)6*F@&HH87,7:41G)=EC.4A08AE?5.F+B*655/#".8;A/!@15F1;H/;2B9!4B6653?7$$0=945C0?7#-:)7H30!,@A%%.=">C%)-80C.;98A+074*C&-(7"BH+E(7#9-B-5&,.<1#C28=!)*3@6;.=*)B/:C2EE&,8;818/76;D-+0'C370E+ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:25C28^ATA5C102A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7983 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7760 42 71M = 7628 -203 GCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGG 7&58@"D(6%:3-:@E2D5E;$6>=*/0@$3((@@>7>90A1&1@+9(%.&(%<+0&=1E#EBH!/=!3"= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7983 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7628 42 44M = 7760 203 ACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGC @43D=.*@<(48)-75@G=!*7@$#?<'(2!6,6"?19@E11-@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7984 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14348 42 285M = 14633 539 GGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCNGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTG E-%!">&?B/!%9--9)6:G9?=:G<,($G&>6;D:15A=G5;"A'/@22>F28#BA90.@#A>H#7H1&1%C!?AF$?A86$(,3"=,%4CB"#5#EC/E!!/B"-D+:),A@7=$2)('<>="@4)=<1B;C/6(2#3AH<18=-3''#219:1'@(>'8C6+'H#>=0!<&+9<,71?<@@!EC"D:&.2?7:;G,?D)*-B,$,4'1A-B==?<$=97(D5<9<&@06E;,'0A#.B699(/3! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118G166 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7984 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14633 42 254M = 14348 -539 TCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCT ?2202/)&1G!)#8'D<<&81+E?)A$/1$>7:F*4HE.!B3(F%A5-;E""*@113(;'A+.;C2<;C'<+9H<6:3>+<.7(C5G-A3&'?HB/$"@@A,!&3BGE*#.5.#?@,H6D2?@D>1&!$/<>?E2FA,/;,8?%.!1+DAH:?-';57<<%&%,!;B$A6..!A8"!&9%58%%)=):?E14A9#+> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:254 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7985 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12178 42 174M = 12352 350 GCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATA H<66=DD0=42/'1<6"'H+$C5;67B#A/">.@0%'D)CA.7<:!:H&/(:'($H86)<4FC?!HA/!.?;516)%40C<611$=+H.#G2D=G+(+1(?A;'";B=G(B6>!.$1E%@//-@1+:BC670%!2,A?/2>A$C%'A;H@%>G?#F@721:!F5:39@:<8$E0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:174 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7985 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12352 42 176M = 12178 -350 ATCCGCTGGCGCTGATTAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATT $7'850@)&+-=3D=>(?G8.90,<74E3G;%$GBC!,3;--,9-/H@,G(;A>C<>/6?(48"@1+&%1:4.=3(G#(86=F5;0(D!7:B"2>9D?>=.+:>=0./?#82"$85::.'GC7D0@<$!$>!'411C4"##/;'6%0=H?H3!5-AC!,199&2/)!08(&*02%4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A160 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47493 42 71M = 47564 291 ATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAG .2?>>!9%8D$*/C*<*5G%8!-$:3+D9,-B?F:B7=+1.9747D=7'>5#%D"(-,2.8A3&.!+(./F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7986 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47564 42 220M = 47493 -291 GAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTC D'/G?"E!,3&!)"6C0,@!)1"?.++9")0?@*!5(>119.5B9F:,1B!<7!2)?5=+=*7$5,1<%6)!/-7.$+=E-+7$/,;;"1H*,2E33#;(-:.8-='(1A%-G#'8G)@34),59?<0H%++"G@A;>2/>;,B/@:>@-*@36)!=:->1A@DE'3B3:+(/E:%64/'/+%6?%@B&>3-88/B'!F"$+(*0@D#89H57;<3D#=:),H6/!=B3@-(..1>.9CAFHFB3:+4"%B8*'#!0,=C=2?&";,'&%#2.$' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25T35T50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r7988 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15459 42 78M = 15272 -265 TGTGAAACCGCCTCCGGGCGGTTTTGNCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCC 2C1?317?,C.>5'9F"A.,G<%H*F61@E81:F;H339%%%B@#EA:0CBCG<&%<3G'&:D(10G*6:2@97A6*% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G12T51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7989 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2012 40 74M5I26M = 2205 252 TGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGC G7%@#0-((&&:-)2%2-6+'$010!(F,"+G!%&6CD)F.DD?2A05)(,'+$>'":'+3>FE9C7:.@#C9B<%'A53,?*/:;2"@=;1F2$E/,.6D@9,% AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:100 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r7989 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2205 40 59M = 2012 -252 GTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTAC B6#!-EBF.9'"-C<.GHG=(%5*),#-8:H5(80'*C?5*D$:G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r7990 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46234 42 139M = 46553 363 GTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCNTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCAC 945F<-A)CAA+#+2A(HA#&"<060E6"A$84F9!79"""@)+9<3F:A:@*!A-$7>9A50@>G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G72C62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7991 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43946 42 302M = 43900 -348 CCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGACGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTCATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTG 96/,C/+?7.5?=#5E@49?'?@)FB,-,GCA6*?+B7-+1FDEE:5ABF)7@"/!5,82$(G"-:,3.(=BH&4HGE1"/F3E<;;522&<==D>@%H8"D<"E+3G1<0C0@/9F7,)7?C">&/#%.F<0!900A%*>=A2<.<>=*9HD8F-)!1?#?8D3$B0E2(/25B,?.&)/&.:7B+G2)("0$%AD4=-E5':,+"$:/1"(D$H6A"?5@B.1''C0>%D!)?BC117=!<-5F9/43A:+=97$#2)CG;(>#B=6<*C/9$B20B"59FD6"(+!*G;B-.@?8*HG#=)(8G9$C,*4.4'?6#5>.;>B<<1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7993 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25832 42 57M = 25662 -227 ACATCTACTAATCTTGTGATTGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGA B$17)D7:-83.B9AA3>)67D7(?7H=3;#*3=E95!%*E((+&&G7,<4$.$#9B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7993 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25662 42 41M = 25832 227 TGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTANTGGGGAATGA 8-7$A@&3'C?/+,$?2,(H?'%=A)CD%G/0/'C#?:1A9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7994 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32288 42 96M = 31943 -441 CTTCATCCTTGTCATAGATACCAGGAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCNTGGCTTTATGACGTAACATCCGTTGGGGATGCGACTGCC 49C<%#59'1(8=$#3D+89"0:0@'6-(C'+&BF::'&$=5<,H28/,FC@!*,8)6$*-.+++"-<*7'9?B:"F)+?)6*86?1#F<9,?4G6 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24C31A24T14 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r7994 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31943 42 137M1I208M = 32288 441 AGCCGTNATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATNGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGNCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGACGTCGCGTTCNGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGNGCTCGG FE'6#98#%$4,6>B&/4&,,/.<'F491#6"#2*"*(!D;3:?<'-?8@<+1)A%E%4?62:$A!H.H/0)4*1A@,,3$B+(+(14%74"2:?>#%H>(:/GD$D-8@!#8-3))B3-D0%7/.6+9:<",,A8$-/904H?*G02/9CHB0H@2>%56)H!.0618H-/=0*1-,;4/BH-1B/9=7?;<3GC99;0FF1.+(1>B/.=&91@G8"#/>#$A,EB'+F)1DH8&;0(@&C-71+HA'(9('4DD89"$+D+;*/7G8F0%%,8. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10C4G39T6A36C57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7995 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2475 42 53M = 2193 -335 GACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCNCTGGCA %%%"&&+'%($%#'%)%%'+#%+&"%(%+**$+)')''#!++)##+!(!)(%' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7996 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4773 42 206M = 4635 -344 GCGATCCGATGGCGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGNGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCNCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCCACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTNCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGAN C++$-;+"'C-4,+259@B,<("=*5G?89!>#(!F&*!?:%#1&?;:>"CG%"@D/34<#+G=;$?",H=9D=#;G%)=*2$?2F/(.&(C*$+2046G7)-F<9!=H+)E69'&H#05,8!?-#*4F'(!$,D;1":'(=E8C@GE#!47>$"FA$D8+69/@48C(>E1,@0;A;4D?(-$*>*;,'E6"DG'@H?>>62$1! AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:12T35G37G38A32G45G0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4635 42 138M = 4773 344 CCCGCAGTTANCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCA 3%+<<#242293EG>-HH&8E='HDED2+37,:1G>2!-=A5<'E#.6.?93C+:!;.$-0@D6E5$>&7F&)-+B9:D'7H+!63&9C;(?53D2"3!540+7(92::8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10T127 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r7997 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12950 42 71M = 12738 -283 NAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGT 8%?7B?A)=-'>B4#<.)*;-)1B>,<@E06@GD%5$45$>+#$?2():5C8.6C+-B5B;&&$1AA=;=F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G8T61 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r7997 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12738 42 69M = 12950 283 NTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAG &6A8!C.)&B,$A@6#%5B=A&DE2@4'-1*6!)-C"%-H"BB?A=4"%1GD;'H02;H<321$.#>&@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T56C11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r7998 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20014 42 95M = 20137 279 ANAGTACGGNANACGCGNNGANATCANCNGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGC )!&!&)')%!%%''%**!!$&"(*&&$'")$"*)%$+'$(('(+((%$+!!#")+!'#$+%)*(%!#)#(!+#'#'$"'#("!&%")+%#'&(&+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1G7C1G5A0A2A4G1C56C9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r7998 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20137 42 156M = 20014 -279 CANCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCAC 5:$B/&F9?747B%)8=2'&%H&,:;)E$++3,)5'!724?*88/)@#'-G1!F!(%H130@=17"6=:562.6.-+0-*,'EE51*";01/B0F+";7+FC>*7C,.,.@A4)G-A%4?5*.GC<,"1$B6=10';7;G+*E>%:.;FBD5./+& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T153 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r7999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45629 42 103M = 45758 242 TCGTTCAGCCNCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACNCTACCNGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCA #'**$)#((($+"*)%&"'"%"+")*'*""(+$#"+%*!!)*(!#(++%'&(%$*))!!+'+**#%)+$#!$%&*')!&(''#*(#()%()*#&%%&$)%()" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C2A3C2T49G5A36 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r7999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45758 42 113M = 45629 -242 AAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACNTATGANTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCA '&95-&>!9E#&&.8&-92H5?9C7*9$(A-4A2C2.1;34HF$*/59F. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C5T55 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8000 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28779 42 110M = 28922 234 AACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATNTCTGA 0%7%-,/17*<3?"?A&+8*:D94.>5/.)/8B9$H.C=.(D?)$."8-A@7.(@"#1"42>+.&6)D<&'A)%.?(1F2G6(-<)G<#<&"-7@/@<@,6*F%/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104T5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8000 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28922 42 91M = 28779 -234 TTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTTCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCA 0*4?,8;69'.304/.(%B2?%<*@@>**!#$3/#<=$8-A(#$$.9"?%G7! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44C45G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8001 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46140 42 444M = 46584 495 CGTGATGTTGCTGCGNTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGNGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTANTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATNCCTAANGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAA 1"B893,E$?80G2F,%(&";AB/D:A*;077>!4/92'/C(BH7"C'::3%0H1>B+@47/C%GG48)'FH7C?#74-C+!GC+E@D2A,&#A%!".;8,>B&75;.F#GD#G(0+9!,176;2#'"!21.+4&A$2D69>3BC%F02DE!-H=7&=<-%F1F?C)=8F>C;8#HD41:'D6D"<=3-.&#EG222,">.4@"DD,E6,&"%=%H>*=>G:4:55:$G2+>5.5'@%'6*3B9>/#1E(1@??7..@E@B;8F=;(##"87+1-F/ACH;#004+$@EA0*&'!/?E))3'&+90C:=7%##347'#"%$+&%E7C=#42+"!/9A"'"*&('6$2:F("532$+6H13G7$#H<#"C;2,A!.C<%$@;2E=!,DC<6+&$7>5C70)D8)0#?03B%(:!A%FHC)/43:F06>:%AD>*+,6*.8 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:15C81G36T187T38G5A76 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8001 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46584 42 51M = 46140 -495 TTTTTGCTGTATCGACAGTTTTCTTCTTCNCAACGCCACAAANTANGAAAT %#*+!+'#+$$*&!#&&&)'"#$&$+$!%$&')!#(&%!#('$!*#%##'' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:4G4C17G1C3T0T3G3C0G1A5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8002 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35328 42 50M = 35593 306 GCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATNCATCTGGATTCTCCTGTCAG #0.2A!?!#8)675@)%).<%182#A',50(;#3F,$/#1)%E(+1)C.7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8002 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35593 42 41M = 35328 -306 TCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAAN =849+1%*09>-?!&>/G.63>8!5B)/?8%!,9B,;6<9FC-381.8-.E0?A.5%EAC.)A'"%?=D&44?,;0+3!C?F<;A=!D*(#3.(?EB&;9+C0"A2:"H=6.*4B09>;+>#!'B=9G6"G"+=&=1#=37$7G$E8F+?011*-F>*4HDD+D-!+A9.-@74C8(D!":'?4(D%EA0?!2=3E#;,B/7'5"F&)="3G33E-<67H9B84EA2C)!5,!+2C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T30 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1360 42 50M = 1263 -147 TGAAAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTT AB2BAG=('#H;7/7-91;%#'E+FF&E+297;F>7H0-=FCB!G%DF1. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G46 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1263 42 88M = 1360 147 GAANGNNTTTAANNGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCA '*$&#&#!$!"###))+(&++'+"$(("%**$)$#)(*!+%"'!&!*#)+#)')*'+!)#'!!%))%'(#%*!+(**$*$$('(#(") AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2T0G0A0T0A2G2C0A74 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8005 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3570 42 215M2I37M = 3517 -305 GCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAANGCTGACCGGCTGGATNGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAA >18?H)?<7#,#74D$$4G3<8==@;F158C0$'.8*%6>957!?"!$(B?3!;@*6+DD,H$8F@=B%'3G7&();7D)(85ED!;;;%$H?@-9;6#*78)(>#$>#70A5'$$>/$$:0@A''%B470>:41/7EC9-%/?8?"C'-#8=:A@,,5+7(8+9*')?/4=B/6016>0&9<3/<-,0#)*0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8006 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45970 42 142M = 45697 -415 GCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGC B,F45<)>&+'D;)(&@<'E<@$(%=A@'2@69EC/:CG=)*!D29-!0D0:+!$A"G0&&%F-E-0G-<%1//$(G$;502.HF-%>6GG=G.H5=0$F4(H9GB7?G5&E#A<45-9;C5/$C;<-?0;/(FH,37,*(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:142 YS:i:-37 YT:Z:CP jpayne@0: r8006 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45697 42 187M2I68M4D14M = 45970 415 CTTCTTTCCCGTTGGNGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGNGGCATTGCAGCACATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATANGGCTGACAGCCTGATTGCAANATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGA +E(2=E53540#C/(A@2;-8'->GC@55$7-2G//5.'@9EG!.8B3*%B'!0>>'EG&3E4;14@:E/5H:>'-A1A5/6A&'10;8B!@B;B+""8/!9"'A.><:4&9-?EB@FH?B&)2E3!;CD96'H,31@;1;@C!)H0*7!H6ED?E.8769&EHB9G/:F(.$,>:F&DH!6$8B4A.1.;"H!B)*;)17!(2G621:)B$#7?$0'A49:=.<*2A);/15#/:&$E.9=3',<=HE@$;9'#*5=7HBD9=:,>,#)*=F"4C@&42%:)*,,?F?0GF;):$2HC"D!9H-E(7)%!%B=GH,*69%/8%,G(8?)A%>9'H-9G6%.F%0* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:0G2C1G37G3T40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8007 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 89 42 221M = 1 -309 ATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGNAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCT 6G<$&8?961C+?E!-B-142693-%&(DF3G'6AH/2"@,BHE$#5DE#0H"&E56C2),=!G+:3C1.$,6&:D=*CF'&;G<-474->-G0#?0'2/F++9C/@%9@F%+E9::D%557-7C'#+58)H7:@:5&&&1$;:G+@F30<+6!@264E',&+*B+D@:#9&&9$E66D0,/D/6F*'H539'!?9&2#0"<%CBGH243#5H)61=*.GB AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A193 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8008 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5947 42 129M = 6207 306 CCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGGCGGAGGCTGCCAGCGTCGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGT =(<%,"2514?0?6B)'AGDG,,E+G291"CF%3-06G&?<;%-(#.*'$5D3A#7A55AFB%/8A-08:+)3D%<#86%'=8G>7(#+804,<<;C#1699/7@"?-5HG'*5&<9)'(,:79BDF:"1125#&>(&-<0,3D()'D/#:$B?,A@F0;9H.?@@*%/C;6:3+2=5?:;097&6H7,=0D12)+@#8>4AG96+3<2$52"C!203;;%?5;E-#5!.B>6(!.+!?E%)?67(3.'!-)=HGF-/=:44(3#D!?<(<6D@$-'H5;5:).<<@91!C7.A3+8.":$)1E2&A?7%@&21=!2G9=9CCH,D;%-)5-D,.0H@5A&2830(5555-F?9#D&3#C;0?2,EG9EHC"G!9D6)57=/A),CD4(+)*F378?A1C,$!4.$$B@5@#72+!&(066+.;99::7<"5&?%?%$&*'F>1>D#4H!:24$04?E*1<5E64F26:4:',D::<457.@7;E?4.-'>:(3-'(5>'7#"&H=0F(;(9>"7B22-<'C%3@,$1:#(=/7!7'?6'*:G*A67#C?7;+"6*D9#!!#*#1AB"=#/9>'B?A5F*)$2%<%F>"9'';(76!;>9:A$&;HF09*'9$>36-)1'>2:%B-E90*;6,A(!=5#C*G,1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T43C72 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r8011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20473 42 99M = 20322 -250 AAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGCAGACGCAAAAACAGCGGCGGCGGGGAGTGCGTCAA :15G'3B3H;1G6%0A9B*D)/7+@792/;5"/8@")8H!B/8B5"G-GD0)=?)8;,5C4$=?"8.>,;!:24E9@A!??%1.C$HAF*B,+D9:*=) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8011 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20322 42 48M = 20473 250 GCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTG 4.G9!;"C*8E;9.+<6&&"CB>4HB%17F(&(8;C&=7"4B=2'?B0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8012 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20349 42 142M = 20197 -294 ACTTCANCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAANATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATG 9%&=)7E(@HGA$�+FBE#(#?GB3BG5G#!?>!=F>GF:/7>H$(#)6$F?2CD>5:GC7<2>E;F(?%5;#+13A<+2-)"8:1.)!*5E7$)EHH$/E0="$G>$9)-?CEA%9&&2($/<&(%B/8E)+F6;G:31 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G98A36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8012 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20197 42 152M = 20349 294 CGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACNACAATCAGCCGCCGCGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCC @A-0;B"G423$5!A/A64%+..F0C.<#H+!A'H$$>"=@E1/;94C*C-/5E8CA?EE,.4:F6*!("4%D2F/(>3G%:74E!)#8&HFC'8$4:0*"=B8=355!D'GB$EB.9H$":D-E+%G:*5.'-+$EH AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96A13A41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8013 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8998 42 28M1D94M = 8863 -258 CCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTAGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATG !H8%>G'>&-7,=!F?B#--3,$61)/.AF-+48+?63?A-7!5>: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8014 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26214 42 102M = 26131 -185 GAGTAAAAGGATCAAATGCACTAGACGAAACTGAAACAAGNGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAAT %24%@6>.3310%+64%?#BG=EAHG'*G*B'>4##5?2$F4$F-+4+0;#4&''/!7D790',;2%-DH=0(>1=?@!,%@E3$,)C29D4$%.7#)G5-- AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A16C61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8014 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26131 42 50M = 26214 185 TTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTG ((H,!13>.4<.A>28C!-28!A2F01C&)+,C;B0C0F1G<8>53)B&F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8015 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14448 42 62M = 14243 -267 TGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACANANNGTTCCAG )''+#&%)%%$)!&+%'%'()(++)&"+)#"+"'%!)#&##**!")+%&$+!)!#'$)()#& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:51C1C0T5G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8015 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14243 42 75M = 14448 267 GAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAG :0D2<(!B>%#4&3C.F7$(>>A33B09F05#%H)00F1%$90E,0/1:(=FF+:&"5">&)5.661C=;F7C8E@<&@:-:'B$!<$0G>&!2E".2'9=%7@1>HD3"*=1G(?0C@&;8$34>&D"3,#7-2BB/AB)B#""@*?#>AD)A!7#71:26=90FF4==.(#G4E,@,F:C:@.#?),:#%2$.A#>- AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:161^TATC138 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r8016 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20568 42 129M7I89M = 20786 521 TCAACGGCATCCACGAAGGCCACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGNCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCATGTCTGAAACGCTTGCTGC F6A<#/2DBE2G!/1#==AD!#(<;/HC>6;'709/%5F!*!##C2(,1/<6>#B=?=&41!7FG?'@&$20(-=+!'1(E,-G$?"'!%(<:0!*3!1E,<-"%0+HB* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:47G88 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3579 42 55M = 3677 234 GAATGTGNTNTACAGCGTGATGGANCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAAC ""()$)#&)+%#$#!&(+((*(&%+(%$!*%'#)*'%%&#*((#"""'%*#)%(" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A6T1T14G30 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8019 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13674 42 132M = 13806 385 NAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTNTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGA (85H01)/A.#>@:,7,F9=7567A..F2"//,(28'H1(C10E50?4&(>F0HC=A35,@;#@F72'1566)B=@3?2#6@6$)E!'H2%)1!,G%CBC"<6$;B)3BBF1)8>.D+(/33F?>"G?85(" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T87T43 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13806 42 171M3D79M = 13674 -385 TCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATNCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTANCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGANC *&$"#*)!"$$+")!''%('#'$('#&"($$(#)!''+%*(!%%$&%+'&&!'$")'"%$"+++$!(*#('*&++)&'+)*&%"!()$*#"'%&'")$'#$#'%*##+#"#$%$$")%(+*''%$!%#(*('+'&!*+#+"!)$$&%%(#++'##(%!+'!!%&*"*&'*#!%)##($'&+'$(*&$'+&%'(#*'"**'%%)(%!'!&)&&)('$")''!+%&"%%#'!!(!*(#+*(##)#%#'+!&$ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:126G26T17^TTA77G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8020 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5296 42 67M = 5363 286 GCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCA 'E%5&6>:/52)8#6:)/&-7().4F$9FH/0=2)==?8G4;3ACEE>;#*6%?38#8A@68 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8020 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5363 42 219M = 5296 -286 ACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCNGACGTTACTGACGTGGTTCCNGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTG %!&")((+&&*(*$$#)+$'(*&((#*(!'%$)%$!!"&$&%)$*&'!$&#+%('&)!#*&"$)#)"(#!#!$(*"$(!(**#)%)"*+((&+&!&#$$$!&'&*'"+)($%+*(%#!)#%$)$$$*#&((*$#)(**+'!"%#!!"#!%%*#%&*))"#$*!$'%((#$)'(*"*"%($)('+'(**!"**'*$!((&#+&%$(+(+)$!(!&)$)'+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29T17G2A68G33T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8021 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18195 42 111M = 18306 223 TGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGAC 3&GH37E9:C($0B*"8G;%:13H5G(.9F&GFC1-"'$(! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8021 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18306 42 112M = 18195 -223 GGCCCCCACCNTTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGNNCGAGTGTGAANGNANACTGCGGN +("!(+%)*(%%')(#"$*)'(!"&"&%%$&$$(&)+%)$&#*#)*!'""(*'&""&&&+"!+&"&#("#$&*!*)+)"&'!"&*%!+!""')))'$(%#('"!)&*$%%(" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:10A76T0G0G0C8T1C0G0A3C3G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8022 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30372 42 111M = 30255 -228 TGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGT 6=D@>&-43230G3*?,@==-+*CA82"&5'E+;&C//#1C45F8)8%;"5@:*2.D5,/96C@;+5.>A7!&AF(*G:!*=#/1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8023 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47298 42 191M = 47489 324 CTANCTANTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTNTCGCACTTGATCGAATATTCCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCAGGTGATACGAGGGCGCGTAGT #')#$!("+))+#$&&"++#%"#&#*))#)#*()%"%*!$'%&$!&)*'*""**(+#$)!&'#$&'%)&$+$!*"*(*%%%#"*"*$*$%(''%+#**%'%+&+&**!+(!)"#$+'&#!$+'#(&!%*!+!$#)$+''&($%*'&"!")%!%$&+%!***++$!&*%")%&!#+))$$)!))*'"#*)+' AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T2T1G0T0T101T19T40T20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8023 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47489 42 133M = 47298 -324 TTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTNTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTNCTGGCATTCT 5.5/BA13$%%47;/>&(6>)%3A4"$%'FD4D=E(#>*EB+=&1=>AA@@0>8/F#08!4)B.#>@*7?>8*6A9,E8@.4+$5/:<6G@+D:0?.-A/.$67!8F.=40,E@6A/$9-BF(08GF)?9%#6.0'%2<3?$&#"G$<$%BGEA#,+.6"3+GG"HA%C&H&F,*G)72F@5!.A>-,4.E?:HBHG"$G'F$"#*$AB1:?8'E9E-+A1DH(D%;=3#1ABC>$);C"&3)3.)G':)B35&30HG'<)FBB"$6?+7@>4"C!(#"HC'/F/9/-":.5)$C7% YT:Z:UP jpayne@0: r8025 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15152 42 47M = 14944 -255 GGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGAGNGNTATTCTNTTTTCNNTN &&'#"$#!"")%)&+#&"&"()+&#(*+!*%")*("(#("&%(#&&* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:27C0C1G0C2C2G5T0C1C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8025 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14944 42 144M = 15152 255 GGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTACCTGATGGCGCTGTAATNCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATT E4E89";B0&5:@*,$E&+$3@&0-(839%G/%&!G.#G6H!EH0?C2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74G17T51 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8026 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30759 40 79M = 30976 264 AANNAGGCNGNGTGAATGCNATCNGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGAACGCTACGGCAAGTGTCATCGACGTT '(!%%*#*#&$(#"#(%'%($)$%+*!%"+"!*!+*))#&&%"&!)+*%#*$))$&)$*$("%&!&!!&('*#$*$)$! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:2T0G2T1G1T6C1C3A28T12A13 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8026 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30976 40 47M = 30759 -264 CACTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTN +%")!$+$")*!!)%*$(+&("!!$#"++'&*)&+$*+)')('*+"! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G44C0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8027 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25293 42 82M = 25573 321 GGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTC )8D<(+48+8%@*32&"?+8&EH->#G''D6-A7%E&505&2*=H@$399!64"C;=>29('D'H22<93!;2!2HH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8027 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25573 42 41M = 25293 -321 ACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATAT F2/%@@8$7$3*51%190$<%'><6D-HD/3('7B45+C:= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8028 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15289 42 151M = 15476 236 AACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGAACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTC H.;"D:8,21/00G/59E./=%+=#+6*9A;D@)'9+-%"'84>9?A5F#7;E;=H:11&*1@D>+$HH*8'F,D6.&4%1::#0&9%D()D#?.30&0.2G@9>4B/-4(C-6F8G3F%D"@>-+313+EC>AD<#3=6$H=1?$,455F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60T90 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8028 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15476 42 49M = 15289 -236 NCGGTTTTGTCATTTATGGANCGTGAGGAATGGGTAAAGNANGCAGTAA (%!!&'#(('+%(%$#"%!*$")$*#+&&'#'*(%$%+#!*"##%'()# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G19G18G1A7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8029 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43982 42 129M = 43870 -241 GATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCNATTTGCACAC HFH"F>&(H2-;!D@/,H3%%=?758D0EF+?E>,:*<<#=;?)C/&A(D@$(F?00F-)7")E>1(7:7,"60AD#ED*"=E)">G.C(G:-H39B$0%B==26>;>+#&:D./E;#91 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118A10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8029 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43870 42 48M = 43982 241 TACAGGGAGAAGGNGCATGAGACTCGCAAGCGTAGCTAAATTTCATTC F(-82.#FBB%D"0G?/.:$!?!;"'",D-4/;>4:D%B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C12A21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8030 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1383 42 156M = 1616 297 CGCGAAGCCAGTGAATCCCCGCATGTNATGCGTTTTCATGTTGCCTNCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGNGAGCNT ((!*#+%%(++('')#**)+*'%'"+*#"$%(#*%%&+!"*#'$%*+###(#$%)&#'#++*&"$%++!#!#!+'"*&+($$""#+#"'!*'!$&)%&'#*++')"""&!)+%$$)'&$'!$##%')*+"'))**!!(&**#$*!*$(#!*"&#(% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2T1C19T1T19G102C4A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8030 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1616 42 64M = 1383 -297 CCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACN D':F#94>0*D6)D$D,>C1=+FA:=F&H.&A#G7/.(:@F$.D&-95G@)ECG";&=D-1'5$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8031 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35454 42 98M = 35273 -279 AATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTC $%4('982><)646-F"6?'(E@@459,:##*15!4/1>-)(8:44:$/8AC=H)A<=&?$?F#82-5/<7)AH,6C9(F4CCD@"0@==>GH4F/@& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35273 42 181M = 35454 279 CGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCNCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGG @E#48!;90F(H;#/.8%@:#1#H7A0''C)$,>6@.61#$6!,35C"67$&.A:GC(G*.2..79'%A*:&(-6">->*+$#HG6BG=.!/$+2!>)>,99."0+G(G(0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8032 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24940 42 63M = 24720 -283 CTTGACCTTTCTCTCCCATATTCCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCG !!##'%(!)+)+#(#&)'!+(#(!")(%''')'#&)$"$($+(%*&!($!+)(#$!#)'%&+' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G40 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8032 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24720 42 84M1I64M = 24940 283 CCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTNGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCC ;EB>8)3)4G="895EB5<"1/;#!F0:9@2)&B3#<8<5G,7*!H)@,@=3?=@5#<.2(B./7)F83@G#3F?!=CC.*@DC5"47..%;E,&FG%"@#:@5,1 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:40T5G101 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8033 77 * 0 0 * * 0 0 CANNGANAACGAACAANAANNACCGACTTACGAAATATCAACAGCAGACTCAAAACATGACGCAAAACCATATTTCATGCGTGCAGTCTTAAAAGCA ##%!)(!')#%&""$(!*)!')*#*('*'%#+!(%(")%+'$()+(*"&(&('(###'&$%%'&)!($!**)**#+"!+"!$$+'$()"%!"*%+"! YT:Z:UP jpayne@0: r8033 141 * 0 0 * * 0 0 ANCNNTGTTGANACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGNAATAACGTTCTG %$*'&&')&)*!+$"#"!!*"(%#%&'#*&")(*'!!+$*'(+((#!&&"%(&+*#!)!#+"))"%#"$(!#)$#$#)$*"'*#"*%(!+&("%$%#"$"!+##"'#(% YT:Z:UP jpayne@0: r8034 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11451 42 101M = 11281 -271 GCAGTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGNTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTANAAATNAGNAGNCGA &%**""'$)'"!')!(!)$!#*!+'!$%$&#'*++%'$(%(+*%$$$+!)"#$"&+($%)"%&&+#!'++"$+%$&+*(&+&("$'+%$!$$*%$"##&'& AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:3T33G48T2G0A0A2C2A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8034 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11281 42 159M = 11451 271 GCGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACA %A631&G;$&"#H,B2/-"A(5$F.C<;G"F-4#,97'B9//D=">0>0@EA*-@=<@<@;;@E<02-?1$C*6#:8G/&#(+F!9$$"0*590A/D/;?&)5G-G9.B(.:8<*E'%-.287.*$F00*%B74+30D3A:++:H?'4->=?8F@/4-5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A158 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8035 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21121 42 187M = 21023 -285 TGCGGAAAATGATGCCGCCANCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTNGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAG --G<'%,;:)+&<9@A"7:;6+A%'#0C-;2)BB*/<#0CA,2(!.:CA#;$E:"%&;C)3+CD5;-6.%/,662?++,;B(.>.FC7;;-8+,DG3H"G=)/$&+.<4<-7?&;(;8'6>))H:D4&%81$E=@%7@".>=6-84-&1#/C4HA)A4<#89:HGC6=0+-%%1<&1.?1%'CFC:) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G72T93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8035 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21023 42 83M = 21121 285 ACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTNACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAA =5E=&>0'7F,/D;-#E*8$4$3;D5B+A"'&-$%;?F$/')6;?=A56B%A"H,@H%,97$$D:@4H"E$0A6FH54E@/=AD:'='7+:0-!D?$!#9CB+?7?:!%:=A/((6G-?#(0*$7033:94=:32+@>660$,"0"<(37GB@0#-9"(GB27-&>:&18= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6T120G63A30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8036 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18225 42 119M = 18344 341 TGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCT *>=C+GG#H=9(>'+%.B%2$:<.(F(&1"3,"9H?B&@FCEGH'%+C03$4D<20?=(A7&-'7D7&%.8,453 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G118 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8037 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35220 42 85M = 35048 -257 TCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGNCGGTTAACTGGTTNTGCGCTTACCCCAANCAACAGGGGATTTGCTGCT <8@,**2$*">"%&GA;G3(?A5%0H.2H,2-%D%<55)DG0>:80;.'!$0>272$B5?3H/-@FC,#60B8<7$!?"@#%!7? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G13T14C19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8037 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35048 42 40M = 35220 257 CAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGT !*+%#+(+)($"*%(+)"$)#"%'&$"(!"(!&$+'*)%* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8038 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23845 42 74M = 23708 -211 AAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCAT ;51H0?;#5!0:?(5G-5+6>$+6+&;9$?6:34A9DEB<%?>5G5.4'?E!>C@?7.F"B>'4!:AH4(+*8< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8038 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23708 42 137M = 23845 211 TCCANNTTTNAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGNGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCA &#'&!&%#&!'+!&%*$!+&'"+#)*+"+#%&#(+"#!)%!%)&+)#($&(&*+++)&'!#%+!')!$&$#)"*$')*(+*!!)&!+''*"&('("$*$&)%!$("!$%%($%('!!#%'&)&%+)&!!&)$$(#!' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T0T3C88A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8039 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17243 42 74M = 17317 331 ACGACGGCACGTATGCCATCACCGCGGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCAC 1"$%%G>#EB@8='#,-9.H-AG/96=G%%!:&B?/<&A7D1=A!*$&9**0982D2=:6.%+'CG(?4)-E$!H@*()/")-034-32$$(G?,-,*H7+9&/H>#@48>?(*A*#5/1.!<<#8EA%&)AH<9F/2)D59;?F'HH>.20;B-'24(2),5-D@85*%",4@*9$!B">+4+@2%F#F-&6F146#..8D"?!0F4E$#<&5?E=6,2?=#.E/(02BH&9D.B;=?C;/=FA6&1):),A1@58#/F-6;02%=,E<<3D329F@9'+H--/:A$,/,B8>&%! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:125G130T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8040 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35492 42 44M = 35601 218 ANCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTT ,-$1)$(*B;?$E>8>A5C'AFFE7*%"!9H1B,:78&*7/,%<-/.:/ YT:Z:UP jpayne@0: r8041 141 * 0 0 * * 0 0 GATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAANGTAAACTCATCACCCCCNAGTCTGGCTATGCAGAAATCANCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTNACATTCCGTCAGG ?+A93!B%'&=/?742E(+./)21>(7=''0'.AH&=4&E+0,<0-@@/7;+7@;%#0D6!/3B2%941)*A45%$'-+G%1F4"?>G-$-,79?=C;@?')HD7D2+?'CA+56/:AF5&A:&B#F%*@D:?;@7@B1@1>=-.G%=9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8042 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11840 42 213M = 12053 289 GGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAANGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACCGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTNGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAA +*!(&)+""(&+)+#$(%$%&!#(%"!+!+'')+&&))%$'%%('%(*''*&*#%#(!+*%*)(&)%&!')!+!'')$)*'*"!$'#!)'&'$*&%'%!+***+*#'#")+$&"%)+&'##+##"&!'$&(%!"'(*++(%)'('")))&!%+&+))&&'!"+!"$"*&$+*#&$!"&)"$+%""''+#$!")("$*("(!%'*(*'#((+%" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59A49A46G56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8043 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7868 42 76M = 8097 294 AAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCC -93-251E9FG'?63;*@':"7?)9@0AG%15'G0E-!5C)-&E+G-5,(B?(:B)4D&'00$D&3E-$(>8-(>2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8043 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8097 42 65M = 7868 -294 GCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGANAGGGCCAGGCTGAA $E3.5/%4.F"&<*%D;7#H<+29%$6.>@H%+1(;+#!!,/%!*B"%<=,5-H3F'71"+G(3G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8044 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19285 42 130M = 19134 -281 GGCCNGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCNTGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAG <+9**H&<"*1"?+4D2B!;<5%9+#0B7+.1?F%-DB=1#@D076+90'%++"=?D?@(,EDHC*H%:'6?!:C?,1&@)+1-"G9,G6&6)<11-:&/%2>9+!67(*EH0")G6!!#,2D<5A)3>DB#!<;'3;;'7DH;62,.DCB5H$F#8B&.C,=<-A,(5=2&.7>..>8@4793C4H?C340!""!(*(8"&G'F<5H7*4*(& GE(4A5G$,+?B54F$0'3@!G!;94/F(@.#97E2&$4%B%?#&&:C*$+59"/+?6)9B+$"*+>B*?'4@;$6>;;%16E!1GC"4C;! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C93C6 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8049 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29146 42 68M = 29001 -213 TCAATTCGAATATTGGTTCCGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTG F";$3/.)%":')+/0C)2=DDB'D"E<17F%>:8A1G8*%?(3F%?8.DE!37EB3.4.+"3@1C:" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A48C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8050 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12663 42 126M = 12511 -278 ATTGGCGGGGCTGTTGGTGCCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGNGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCNAGCGNNG "#!&'&#%)+#+!()))))")#"')%#%)&+$#'+#!&*('+)#*+#*%+"*'+*'!$%*&'&!'!(!%!#'##+*$&'(&+)#&'")"+%))#'%!%&$%')#!%'*(%+*($!"%*+$*)(""* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19G34G6C56C4G0G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8050 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12511 42 152M = 12663 278 AGACCTTTGATGGTATTGCNCAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCC .*>&",/EG?9CCCD8H'(3)@::02:E@598DC="$0()"35G;,!2*@A9E5E5'=E=$,"#8&+H#H%4,#<>6!='3G.@GFH<$.*"&@=&#C.5%6? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19A132 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8051 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25174 42 68M = 25012 -230 CCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAAC 2%!>=8#,:%'&'7<38F)B62H+0C;GC-A@,08%=AG6:H53B&BA7/,-,G/FB=-;@7;DC?1B?8,+%5A.+D<6:?FDBHH.@;.=G!DE)'+#7=&@+!2<:"10?5@E57.!32C8A> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28747 42 75M = 28982 310 TGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCAT H!B?.+&4'>%$$!@0;"':716C,)&759E22=:9E3F$E422:#@<@D-00B!9!*=>8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8053 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28982 42 75M = 28747 -310 GTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCC B5G0=)C;!,7>.?832'@/EF*;=2C,(&D+$'"8&-G.(!2!F+&+8+A4D//$-*8F3:*.+H,9"%5'F/2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43289 42 43M = 43102 -230 CGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGA .!6*/AF6B:.6-'8A,G1*1AE+E&.(#%,E'!<%H1*1E5, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8054 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43102 42 44M = 43289 230 NGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAAT *3")#/@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8055 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14829 42 188M = 14829 0 TTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCNGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTC >//:F;7G*(7&;8*6;6#9DBA98)'.":66)/G3CHGC9;2D)-<;'DC8,E:>?9#*#'505"%615G29-)8)%89AF,B.5CB3.;*#6')#5)+;&@$//4#+"33D;8AH-+:E6*G-'.C<9?H!'+!')@*B2C)?#3CD*;8.(01D>G$H)0#5$E=-D&@3..DDAG367(A=!376BA05$5A<&D,AH;'+;B.=!(6,'-@!*;+%0EC%,+*?#6#E=>%'<2,1;&:28<%0@*;D0EB?F%$D?/)?HF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YT:Z:UP jpayne@0: r8057 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3305 0 * = 3305 0 GGGTTCNATTNNGTCAANNAACGAGGNGCGTNCNCNNGGTNGCNNACGGNGTATCCATGTCCATTTCTGCGGCATCCAGCCAGGATANCCGT ()")'*%'"!(!))'#)"#'%)#*"&$$((!!(#&!#')(#'&%!%+%"+'#(&&('%*'!&&($+*'%)#!##&$*#""'+'(&"#'*$$& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8058 77 * 0 0 * * 0 0 NGCCGAGGATCANTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAA '%1G7*5/:&''293=:--/D(@+D(84#5!DC1%5;;2B YT:Z:UP jpayne@0: r8058 141 * 0 0 * * 0 0 NGCACACCGGCACGGCAGTTNCGGCTGTCGCCGGTATTGTTCGGGTTGCTGATGCGCTTCGGGCTCACCATCCGGAACTGTGTCCGGAAAAGCCGCGACGAACTGGTATCCCAGGTGGCCTGAACGAACAGTTCACCGTTNAAGGCGTGCA !,7@8!@*468.3'7;!<9(<,,!@G>'-HD!:<1!F&/150<3CH?%!7E*)5-.21G%7?%3?B?D#1$&H$5A!>>D1AF!D,4(6&-G813-'9=E@+4C,+E>$%#,5!?$:0?D3FD/#?>">)-9>%GG!G/4/1;5F#60+8%3/*'*2E$;B!E(FH8340$GH8*.#/G:/:8,>0=*08.+1=:*.%G0,F%#:A97'03)6DA7A'A.>D6+#"!&(7>%!6<8;/(.H,+E?A%0B-;&8>43 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:164G12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8059 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10399 42 67M = 10501 279 GAAAGCGGCAGGGCTTNCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCGCGCTTCC >'$<:8;$0)<8;:)'13&6;(%0;2>%4'B0,:)--H)*H5!F6*H,?.+7.&!G474,*)5,?B@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16G42C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8060 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8739 42 77M = 8544 -272 ATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGNGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTG /%F:;-$/HE%A7HD%2)(@%+C6,+$5A@3C7=F2$3B?;328%//&=).H-)0/7$"&01C$647>7G<97C!H9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A37 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8060 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8544 42 195M = 8739 272 NTAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTNGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGANTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGNGGAGCTGC "C(13.A,&7)&<$"D-2(-0%H!,,'#?=+%H!.F-*&4,E5%"2-26=*#29.!0($H(7-"=*>9(@*1D"'&=57/"0:H@8101&*AB$@%5/4,C<"53":G:$*E?%51FE@>E/8*H$1,7+5:%'5%7385?97!+#5DF(-F.98EE:AD+6&DB)ECH,"<@@+$CE2!C#63E7.!13HF+>2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A48G62T73C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8061 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30920 42 61M = 30728 -253 AGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTG >F76E*090-$4+$;#D"1:%<)D!*<:6(%6EF&$2$,?C%&%'!&>5;5A&;/541A80 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8061 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30728 42 52M = 30920 253 ACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCA >5749338>C;6&>F*,&4H?E??:5@D@:6F+G7:4.FA)@5.6>1<'>88F(:=,,?*!2%#-D*A8$9FCG-9DCA&36B14@F?'.F$1F7H>%1>G/3%'5$($?;D!;#.!@"FCC#%0C0(7"(D?H;=G@99C;&("?39#DA("11'=6A7>AA1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:126A27G48G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8063 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26247 42 129M = 25925 -451 AAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATNCCTNTNAANANTGTTATTTTTC #)'""&!$%")'*'*%!+*)#&#&$#&)&*&*$))!%')*++)"$"$$+#&+"+%$+**(%**!#*+&('"#'()(!("#%*"%)+###&"!!'"&!'!+#$&&&+#%%(#'&$"%*!)"&(!&%%(%$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:106T2A0T1C2A1T4G4A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8063 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25925 42 322M = 26247 451 GTGAATCTCTCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTCGANAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCGAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCNTTAGGAGGAGTAAAAGGATNAAATGCACTAAACGAAACTG &#$)&*%'!(+)*()*!('$+%#+$)+&!)+$&#&%&!#()"$")&(!+'#)&"%)%(#)("$%'!((*(!#!+"$**+$'*'!+"$#!$#(!)%$!&*)"$!(&'(%'&')$!"&++*+!%$"!&%&%*%%)!'#!'""(&)'#"!+#&"'+$("'"'#''#!*+)+%'"!*+&%'!)()(*$&"+(($%)&!#!+%&'#*")#'#"")%&)'++!+'#&+&#$&*))%$$'!#!"#"'**$'$"(*')(&'$(*%)))%&#+#+%"(((#*%"(+'#!&$+%#+$)%''"'!)("'%)*"+(&&)'('**%+)+&'$)&$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:6T1A77T2A39C151T19C20 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18951 42 84M = 18708 -327 GTGAGAGGTGAACGATGCGTNATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGG E#4&?4)/&*'?'"@0(4G>-<,<>--:FH&:6%@92B>0'B<8-!"B?=$3%?$?1F<>.9-GBGE(3F(-7));3?2&4?/F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A63 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18708 42 207M = 18951 327 TTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGAGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGNGGTCTGAGTGTGTCACAG F%$45/$&.H#;G+H6$"C<#ADC6@>1&?.)8!F#=@G'7"5880$"";"<>D(%AB0/CHH@"-63"+9&0*58H.,#!>9B2(&;.6F:"00HF@=(3+8B"A13!<$G:;%(=,!=7./9C4)<08>:%5&8?G;$%(<8-57:*10&BHGA"!"#" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:158T29T13T4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8065 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4050 42 91M = 4210 266 CCNTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTT &$%+'+#'%(#)(#*#!!&$!*%#!&'(''&%&'+""+(&##$+#!%%'$+'#+))+!&('#%%'#!'&!#&%&&#%'&!*&"(%&%'$&' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8065 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4210 42 106M = 4050 -266 AAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGG H2F;$"+(5B/%41D=H&-1&0.)?)#55:AE':0!@)G(<0A6&;8.:(6+;%-A!($60+14!>(D=5GD.:+F/!&B,%HF($E,!=G'C)608%E1B;<< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8066 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8439 42 46M = 8619 247 GNTGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATAC *"$*+!+'('""%"!+$%'"%#()!'!)#)!+"'!"#)$')!($"! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C0G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8067 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47567 42 69M = 47682 180 TGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAATTACAA &C+18@A2E4D>C2>+&*&EF?4&;(.(H4+&G4@@E,,@1"E<#1/.0&,F"D+/48<>1*""54$!! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8067 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47682 42 65M = 47567 -180 AGATTTGAAGTAATATTTTAACCGNTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAA "8@"E**E'$@+2H$BF>5B,/*#*B;FHE'3>.D;>8!.*9*-('5=@6+.61<>#@&2>C>HG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8068 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16351 42 47M = 16514 252 CCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAA H+*)+0,*=:%5!;7/@3:35-H:'-H>(>'"):?@BA/0:6F1H.6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8068 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16514 42 89M = 16351 -252 ATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGAT G8&%42/,DHD).C!#,8;$3<@6*#,:",GG0?+D+0>%.#@6*,9(3$?D;<.<$@8/"=),"-3(E8,>'A'HDFF&3D>.+-5"G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8069 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42692 42 119M = 42828 257 CGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCC 4=37,E'-0.:)7$)?<;C1)CE8F+5*)?/?<$4-)3+$G($#$.>>9<)$D-E#*8;C463CH)B">**G65++D3H'4,F89737<08A%+"D45!+#,C;>)71(":1.3,:0D. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8069 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42828 42 121M = 42692 -257 ATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACC $H0$&!?#)E7?=)#)!>1:G=7>3&9<4:/F?4#=.8)4A2>D;A53)9==D.%,6)&"D=$-;9.?)D+#G1:F&!F%,/,?+CF>HG#D(06.=%;B(;<9(6!!5";42;-54"-:G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8070 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42905 42 50M = 42905 0 CATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATC 5-'HD>85D%377"<&#E(0$DF*#'0@GH&2D%<"(@$%4?2>A6A>". AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YT:Z:UP jpayne@0: r8070 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42905 0 * = 42905 0 ANNCCNNTCNNTNNCNNCNNNTGNNGACTNTCAATGCNNNTCNATNNNCACNTANGGAGTNATTNNAACATNGCNNTTCNCNNNNNNTCAGAANTCCAACNTCNNCNCNNCANANGNNCGNGCTNGTNNNCNGCNANGAACGCNTNNCNNNNNNNNNNATTNCNGN !#"$!#$##""$"$$!###!#$$""$"!#"$#"$!#!#$$$#!$##"!!##!$!#$####"##$#!!$$"#!$!!#$$$""!""""!$#$!!"!##$#!!##$!###"$$!"#!##!#$!##!""#$!#!#"$"$#$#$#"#"#$"!$"!!$"!"!#"!!$$"!$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8071 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34031 42 81M = 33860 -252 ATGAATACANAGTGCAGTGTTTATTCTGNTATTTATGCCACAAATAAAGGCCACTATCAGGCNGCTTTGTTGTTCTGTTTA /2?(A:::B?9G)04'0&H)H6$@BF AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9C18T11A21A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8071 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33860 42 44M = 34031 252 TGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACA %.7HA6%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8072 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11175 42 110M = 11361 231 TTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGT /B"+::%='GD!53.":C.?!3>A58:(F:)B"G36(DBC8,@F5'1";./(03"4"C(%G79;7<3:@'6$F12)(:F2?9HD?"-/$>!:/)+?0C'D<$66-2?*-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8072 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11361 42 45M = 11175 -231 GAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAA #'*0H>4F).8"%6)4F?$+*;)B2>(AHC%0815G.ADD%E,B; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22530 42 127M = 22712 268 GNNNCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGNTATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTTT $"!!+'$"%!!+)#)&"&()(#*&'#)%!()+'($$()#+!)'"#'$*"(%#!)%&)*##"%')))%!(+%)'%$"(+#!#)&#&*!$(#*'")#*()"%%&"#)%)$!"&%$)"%*)+$%)&)%#+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T0G0G34A86A1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8073 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22712 42 86M = 22530 -268 CGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTC %A3.B1./0DGG),&9GA*H$8?"#;7//FHA(&,B7HA&*$H'!:C>5A4B5/8-%D?5C0#$23A9(;$/CFF65!">" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8074 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38581 42 122M = 38703 285 TGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAA ;:1C/"4-G%*'/GB1&DA:*C@-H7C39D#*./)AC!9&D3>-/42$")'))71#$?+C!F0:DHF"%>;0.0#2/(-/A-F5+/:092+8+D+9"<2*6A=-;?>C+64=&6EH=>0/:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8074 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38703 42 163M = 38581 -285 AATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACC .A,;!#58E(&";2,;G4<'5)?.<4>2EB;>%-)FBC96#65H245331H2#37G1E(#B-=62)%4)7#$&!.G>%'F+"*E*H)>D=B%DA2;966%?C12)?%9F=4G083=/!1H(*$E;%;5C*+'D3':#00G-+"&EDDAHG+//-,/2<&='79 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:163 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8075 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28613 42 86M = 28464 -235 TCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATGATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGNT -0090H0-A&*8G*'1F#%8%H6="*>BG@-.$0(3=<:?8'D#20)2HC*$67'*;(18/>8E)B/"?@3='+&*1GD*:D(,!& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56T27C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8075 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28464 42 48M = 28613 235 GCNGNCGNNNNCTTGCCCNCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCA **")"*($!!&#(#('$))*+*&$"#'#&(#$%$()""'(+%'("##& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2T1A2C0C0G0C7T29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8076 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9743 42 107M = 9648 -202 CGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGNGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGT >7<;.=0!+E->=+97@9'D'6$60C7.)!@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8076 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9648 42 71M = 9743 202 AATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCT G>45)4.%+HG'HF?2.<%#A3H9?A+1-*AH*100@"<4H%F,AE;<601,%C1:>319D9(>?EH:E56 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8077 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44976 42 100M = 45208 278 TCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCATTTTGCCCGTGCAT &(&$+*)&!$*+""*('+'+&''#+%#!!")$#!'")++"&"*++!&"$%&#($!'$%""+!*#&+%'#($+*!*&&*!#!&)"'*)+'%)&!$#)"%## AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8077 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45208 42 46M = 44976 -278 ACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAANGAACAAGGCATCGGGGC @H6:-;6D=C-#"E26&1+4#&,!7/3)6712+FG,$5H4:H-F0& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28G17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8078 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26013 42 99M = 26150 226 ANNAGTTNNNATANNTCCTTAGTTNTNTGATAGCTTCAANCCAGAGTTGTCTTTTTCTNTCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTA (#%)'%)!!!!'!"#(#'(%$&#*#*'+!'%)$('''+###%$$$!"%)!"+)!+)(()!$(+#&$$("+&"*%++&*"'#(&+)")$#!&%'+&%%+! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1A0A4T0T0C2C0A0C1A7T1T12G18A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8078 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26150 42 89M = 26013 -226 GCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAA B/4(/A4#<'6::=G;''4=+FCC0C1=#?';GC+6H0="8G'"((#C)@D5%G1C0/$&4C1"?"$3A(%-E)=91E17":E9&=>39 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8079 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14433 42 75M = 14224 -284 ATAAGTTGCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACNCTGTTCC 36-D%;'E&G'B:<).&$B2"7!HB<0,.+,72H((0:BE,/C7!FE/&=!#**)?2+*C-G*.71=4C!(B0A, AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C59A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8079 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14224 42 209M = 14433 284 AAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTC .-8@#)/E%EE$D<6.C<7EBB3"@9@'17%#851EG/?-E"E"3?4@7*163HF4F*;.F@C:H,3+*3#F$.:)GA>=*A7&C8H$(%63?%&+.:3=.*083@F8=%1=@/4'%,=AA(:#G'*76?%7*3C:1F67FH217<0##A9=?8HG,9H%,C68-E2CE8 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:25G13G27C52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8080 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6541 42 187M = 6421 -307 TTAAGGGCAAATACACCATNACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGNGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGNGAATATCAT 7=)B1>C6(/@5)EC5BEHB/!!DHA,06%(BH9B.9&/#.%*B(%9C%E((4$'?2A@@=GF(H/)7194)()G2,,*4F(3H$%3'7A6*8*1/GA4(4B"6.C6+:1G7"A"6>@!B83F%BA:8:)/?0;-BB&1A%C?!(7AF&-E>!6.8=,?@F:A%86?(/C#C&@9@/#AD7@?<)1> AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G84A72T9 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8081 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6455 42 78M = 6237 -296 CCGCCGTCGCATCATCATGCAGAATATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTC C%98?C,1F@=9;4?@8H((&C??1=#2H59#(/>"@='0'D$-"!*?@)=B::!)4E*;.3*@/A.2G%B>"$31B5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C53 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8081 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6237 42 15M1I99M = 6455 296 ACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAANCATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTAACCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAA =C1.(:'DG?*AE1:C/:;H,70(&+?H6-)7()731*4<#>7'6#(7-)G!0:5/-+.A*;;?=634F/98<%4A AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:43A41T28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8082 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26229 42 59M = 26229 0 ATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTNGGATTCTTGNCTGG !%#()*++**'(!''(!""'$*+*!$"&(&!!$*!&'$$!%"'*&##'%!"+*'##($$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G9A2C1 YT:Z:UP jpayne@0: r8082 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26229 0 * = 26229 0 TCACNTTCNCTNNCNNGANATNCNNNNATNNANTCTANGCNNGNNTNGANTANNGTNTTTGA #$#$!"!"#$""!##$""!"!#$"!$!#"$$""$$"#!!#!$"$"#""##$$!!!!!$$$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8083 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45932 24 20M4D30M = 45650 -336 AAGAAGCGGGNGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGAT ,!#721F,$-G5<,E*<,='3&DB&>G*'+?+%G,:H18HC2HGB?,&D,+8(?)$&.6$;->>?!DG/D)B779&.#9@BEF@H!-/-B&1)/?, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8084 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21967 42 98M = 21850 -215 TGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAAACACGGACCATAAAAATTTATANTCTNCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATA =>66<23%*1;9%$G+!@/G)#50C?G6)83.5*1,GBGB1E,-01F(32:6>&(-4FG*0'&'%+.8,2;07)9+HC2D7#')!E/;4'/=/=!/CG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30C21A3G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8085 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11902 42 107M = 12051 318 CGAAACAATCCAGCGTNAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCNGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCC 0-,G:68*C#2%:420"&@G4%$@2H7$=&)),)H?3%,5.?'*<;52/#!4@2<7"//,=69;2E<5))&40.';&E#A"<7(EF1%.%@.',7<1(#",&-9!>F#'$1-0(3*4% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:169 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8086 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3821 42 111M = 3932 234 AAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGC .17!=/?)0%)=+"D.FF4&(&).5$43%.$*$47-F,%:G;E$,6B1:5<@.DE(5$9'<>)2!F3'A$.8FAC31G)&3-'"?E!$)7!#&+1%'&%++)@<#F;1%(@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8086 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3932 42 123M = 3821 -234 TGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTNCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCATACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTC $;)??#(0;>1'%)AG7@E-0G$+B&88H68G;@4D60=#++D1G2=D'+7;G;?&%9!-=@#:F4=F?DE@,/'$G<'(9"=2;(FGB/@$G7C#<3.1<,($)?,!'=B$,*4F(4H E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C60G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8087 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31857 42 134M = 31991 381 AGTANGACCTTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACA 2!958G+B9B'7':'542;4D?5H5$G1.0+1,/?+B!@>8-:'+;;3$/GG3*;F/>@*E.'@0%8>+$;*?-'3C*1)6&<19/E=>4.%0D*4EA7C4#C-,*':3,-6!"78+++3!"4E1,:H#5->+, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G3A125 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8087 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31991 42 89M1I158M = 31857 -381 TCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTNTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTCCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCG 4E+7E,5>6-$ED15''6F&)&@G)6(<04<1.)%$+2.+;;)==@@E<*;,F:1"<"&05B/%D<.9>@B=0)16*0-5;>)17"?F!F?EFD';()H34AA)=*24/<#$G1-#6&-/@*B58$09")>;:>0%2)G5:"B8D6F?=7.:7"E03#0.)=##!5A1F',>::*D<#>-3G)* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:87T7T117G33 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8088 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44067 42 280M = 44021 -326 ACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCNATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTACAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAG )%G#;%<=E8;5-FB$"92><=1%D%27F$85<0=<5EA@994="6#(@A=.C:@77.-;AG1,:%-0#5(?!D8/;4@800H(-;%4,<7;8EC.F<;H0-"8=+?":%8).?@"?B5/>1'A/9/'%*+4F$4B9CE5D+B$1,:/?,<)="8-"7$36(%!/"$>''(86B-D73A'F=)4;6')/+C*G/;&&=#)1$$!8G+C0D?C0+41>(:-1&>"(<"H";3?<55H2H0D,5;(C&!#56H$B/B#-! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33A72G173 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8088 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44021 42 46M = 44067 326 GGATTCGGTATGGCTGCANTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGA 1+/:G#!#)14F(?*F0GF)2/DE=@&C>>6,F(.!)CH?),<.3C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8089 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20623 40 75M7I60M = 20444 -314 AGAGCAAAANTGCGGCAGAAGCGGCNGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGNCTGTCGCGCNTGAGGATGCGGACACNACGAGAAAGGAGATAGTGCAGCTCANCAGTGCAA ''*)&*$"'!!*"#'"!$(*++&*#!!(!$&*%#(*)$!'#*$&($)+*"%#($''+$&%'*"!!+#(#+*+$*"*"#!"*'&#$&)&#'$*$'#($)')(%'!!#++'&*"&(!!&!&)#&*(%!"'))%%+($(+$+(') AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:9G15G58T15A10G14G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8089 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20444 40 61M = 20623 314 GGCGGCAGAAANTTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAA .:B6$-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8090 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22971 42 33M1D177M = 23182 251 ATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGANAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGNTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATAGTTTTAGGC (',B>"F8E<<1"06*2?)"8A/).7G>5>:E;46$-A*-))/9G:B=#,H7B1#+5(E)2/4+F6C1BB?92F(A//B%B&B;8<;=3#F&,<@$-:#9EC.2.11B).1.:4,D.B*9-%&G9&2'8,0?1D$$!)70$!(E3:<&@7GFH-6?.-C(G;F<+:!6(>"1'!880G" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:33^C96T21T49T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8091 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15559 42 70M = 15738 222 AAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCT <>(,(!-D!2+437&B6(-;24+H>:0.33!<)$5(09;A?:11A0-B*D"DE.1C708-58.,)(8;)= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8091 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15738 42 43M = 15559 -222 GGAGGGATNTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGNGTACG "*"%"%"*$)"%$*!#*$')!%+()'$*(&')(+'"+!($&)# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T28G5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8092 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34368 42 45M = 34104 -309 AAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGNGCCTGTCTTTTAACCA ?>F2>#'/>D/8":*68@EB)E!:*#*3@=64.H61$'FD%B5BH AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A25T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8092 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34104 42 105M = 34368 309 TCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCA 4<08-%$)"=1+73%CE3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 669 42 95M = 764 436 ACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGG /3-07B<<7,,!'1G20":(>74>>=0GE6&6>$@=9"#4C=E;=;%6*04:)35;6-;:/:'66,;5F65235A&=0-12=)C)"2>52#$@'@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84G10 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r8093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 764 42 57M2I284M = 669 -436 GCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTANTATCTCCCGAANGAATCCGCATACCAGGAAGGNNGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGNGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCNGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCNNTGATNCNGGNTC %!)#$")%+(#!+#+&(!))%)(+)!'%)")%&+%'!!%'&#%)*()$+!((()'!%(+)#$&)#*&((&%'+*!(**%!&(%$(+!"++!%'&**'$%!#")!''%#"+*$'$)"$)#)+*((#+)")$&)&')$$)*+*)+##+)&((#*!*#"%&#&#)')***!'&!!()'"%&")&%'''+(&**(&('#%++(##%)(&$)"(())()(($#$+$#'*!%%#$)#($%+#*#)##$&!)"+)%&"%#'(#$$$!##&!()&'+(!*!!#&(#"$%'($!#()$"&+*"!***++#+$)')%$(((*&#(*"!'")(("*#)"+!#%)%""(!((#$' AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:17 MD:Z:60C11A20G0C25G66G127T11G0T0C1C1G1T2C0G1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8094 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9497 42 99M = 9404 -192 GACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCAT H3!<"--,D9*)<(:%(H(?H*)22D="FADB2=0+&8B3D)#"=D$)0G94D"08B%AG+!"A%6A:(BGB;A',/>%,&.A%6B'#2"((<96@0>& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8094 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9404 42 93M = 9497 192 NNTGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCT "/9C/&F6C8()FAB?"00GCH'6#>.3&8$)G33<%'46=D,6!:(E8.9$.!,'2@&-*<.%C'")H<+?%!G/'4#H8;3#,>9#7$0+4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0A91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8095 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2480 42 226M = 2706 314 CTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGNTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCNGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACGGGTGGCAA ?D8615"%)!*";%&@>+%?"@7?='C%&FA;@C*=B&2,745(G*C$@>E!$E$)&85,%D219?&2C+;E6F,!0/&H:@#1%+<,2%9*1/";1&.:;;-1)&925$<-$;!F29A;-@5*:#+1"=>$)#5G5(4GCF4>)05,8C#*($*A:/219DBG*C!,"-C*+6E&:"- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42C22T160 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8095 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2706 42 88M = 2480 -314 CAGNACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGAN @C>5E3'HHD>(?0?%'#%;2)(;G-8)AH?@)G.@;*1?,8.+))%0#?>5?&'%E141!9>7$5H/E<6(9&.8:'46/?&?H/*' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T83C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8096 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8174 42 83M = 8257 337 CAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGNGCGNGTTGTCCTTTCGC &D'.79'C>F>%;F%7;4#=$&+D9,!5$6!'(8/2D&,6<6.*&8<>%9:!:".4&+655-0CA+0;77H1,"4-1B/-$=! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65C3G13 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8096 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8257 42 43M1I211M = 8174 -337 GCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCCTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTTTTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAANGAGNTG %)!+!"(((+$(#!)$*+"&!&*)#'!%'"+!+)$+(#(#'(#'!(!'"'#%)!!$'!%(!#!&)(''!%+%+!##)%&'#+&""''%&%"%'$)"+*$$""!**(%("&'+&'(!#*")%#%!&))$))'(%+#*%'(&))"+&!$&!(&%&%')*"+"%&&)+&)"(#'+(($%)#$%'$%*$!'!#(#+#%+*&!($()(!)!#"(#+)&'+(*%)'#+*)*($)%!'+*)")'"*!%$'*'##*+!%*#*$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:27G64A154A3C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8097 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3490 42 113M = 3623 198 TGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTTAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGA 6$"E2%8$<:B3&E<352(';E4,A=FA*!!4,:0E1FEF,,21"9>";'7G5F*5#<"%B&DF9'?5;!1G/,""C$5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57G55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8097 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3623 42 65M = 3490 -198 CGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGT !5#**.3E8@#.?%4@F">/A0$5'%-/4$0:*0C5#E"-).8',H";,/?&!7,HG%7?+H((- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8098 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25913 42 60M = 25650 -323 TAAAACAANTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAAN H7($2D,5#A@='2F."B1#1<0+9.>#6**=9-D-/!,744&,5?:2C"?HF>E?-1>/G?0@G$)77?HC>"?;8G+:.F8?H:3A18$!@BF:2'@9?F';=)E?!"G:F0C*4>7$5'6*$#)&9"H#,3BG0A2)79B&D/(C#&(H!;A,H@-A-E47@=& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:196 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8099 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24726 42 68M = 24846 239 TCCAAACGNTACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTG F*7C?,9%!#AF7?90G<#G<122"@,;21=D9HB1/;%87)H*1%!75?/<.3'5$%"4+%F!16F) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A31G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8099 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24846 42 119M = 24726 -239 GAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCA .59A+-=B+#><)""-F1C$A.B>1%>#,+<2%!&3@=7D!A$9H;%%BD%E;8(G!87E>/,GHA$G:@E73>78*@(3/*E*>6#-0=G%$9F=/G,A$6,)85!)6=3&D'@<4=9E5%C5($3A%%>6=6E!/9H:>-,0<@##F$-?D?)E%'(9(!GC!:-,<*6>8))6<=.1H*5$FH3E, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5057 42 164M = 5221 231 AGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCNGGATGGACGCAANCCGCCAGNTGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGANACCGAGGCTGCAGT );"&/E83<)/E+#+F4#/:=D7%6,:=/:2@6BF3D=AB4).A;546E-'?,>HA0F73FC+7,G$A.E;D>2;62##5B?.3@(<*:5,+A3@3=+>0/H%7$4'>97A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:72C12C7A55T14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5221 42 67M = 5057 -231 GTACAGCGGTGAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATC F8=:8G8C#%;;0-3:B+9."6#-@9-15:!'':=,B99#"++@F=.AE()0;EA'&?=<;B&!FAH AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C56 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8102 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2975 42 48M = 2723 -300 CAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATC +;)G%D6EG'$-%2:*E.$H2)BB'06;8,"!&"2>-7HF;#H>B6(. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8102 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2723 42 196M = 2975 300 CGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCANAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCNCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGG *+#*"&")#%$($!&'$'"*#"!'$%'&*#&+'*%*'&!&$*!&$#&'((+#!+(#%"+'+')("!"""#%*)&'$(*&'#(((*%*'*"!)%!($(*'"+#)%!$#)%(!)&)$&%+$&$#*(&%"#%+*)$)%&+'&%(&$)$'&&"!+)($"!&'&(($%'!'*&$$)(+#)&''&%*%&!*)&$)")+*'&& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54G77C63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8103 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12756 42 44M = 12557 -243 ACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCG :91=>=++52D2H9&A88F!:?'E4-?"A2'6-&#H8%,=#4D2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8103 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12557 42 191M = 12756 243 CAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCG E.?F4#1).,574945>&&(DC/)H#6$,7;*7)86=07*#F/,)A>!'-62:40B0:-=<4$*"H?%;H8E8F@99%HG-5$9',#9$50-,>,8/.2"'C@9)E"D;9$F(7),D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:160G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8104 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19814 42 274M = 19814 0 CGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGNCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTNATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACT +$'!!((&%#!#$'&$&%"'#)##!+#%##)#!(#(()'"&&&%&$&+(++"+#*""'%&)*)"'&()&%+*((!*$&($)"%)#($&(%)%"%!'&&#%+*+(&(*('("(&"+)&+'+#!%%))'+#*'!")"#%*()""#$(!""!("!%+&!#''*%&($#!#'#!(&#"%&'+*'*&#(+($*!"!)&"$#*#&'+##!&%%+)$&#+*+%%!+($!!'!$&%#("("+!(!)"!!#"$!$&"#%()'$#+#$!&!")+*"$"+***+" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:110C48G114 YT:Z:UP jpayne@0: r8104 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19814 0 * = 19814 0 TNNANNNGNANNCGNNNCNNCATGGATNTNGNNAGNGANGTGGNGTT "!$#"$#$$$#$#$#!!#!!"#!"#!""""$#"$!$$#"$$"$!"$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8105 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20892 42 55M4D308M = 20809 -450 CAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCANCTGACGCACTGAATACGCTGAATGANCTGGCCGCAGCGCTCNGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCTACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGNAAATGATGCCGCCAGNCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGANATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCC ,,/-'4&=@CD?9#B1=3;<'B31"$@&D#99B$FA?7-G.AHDE2118-G7'&"1(G#.15-77,F8#/*.&C(F/+9%1;E*:=*&G6D0'2;=4448F07F5'FC?4@*@($)B(ECC3G+?;H3E0D=@&0E<,>0 AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:12 MD:Z:55^TATC9C25A15G91C15T15A15C29T86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8105 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20809 42 83M = 20892 450 TAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAA $1*88?C2"?C%$7/6=/289>E3!E4%'&/602HCH');@1$:F1F6*/:,?39A!721G6"/)*',!C'(&+"B7:C3F%# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8106 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43091 42 69M = 42893 -267 AATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAN /(4E+$("CF#'C1:765?$6-&:3F?'- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8108 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47442 24 56M = 47199 -299 ACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTAT >5>;9*:(?,A::+(1B=2::/@.?@!787H(!",<;+'@$H<*:A101@DF@D!2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r8108 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47199 24 14M6D63M = 47442 299 TCTCTTGANTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGANGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCC 2,*,G0)B9))2;75'*EF)$B8&:0$@$5D.%A2=!F+D"6BD772>;9$@AA%27!9*2F/B961=2&H&F5C%. AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:8 MD:Z:8T5^CCTATC19T43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8109 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35516 42 209M = 35347 -378 GCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGNGCGTCACNTTCATGGTGGTCAGTGCGCCCTGCTGNTGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCNCCAGAGATCATTTATCACCGCAGATGGNTATCTNTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGNGGGGCATTGTTNGGTAGGTGAGANATTTNAATNGNC +"')($"!+&*&%'#((*+')'%($($!!)&%#')&++'"%!$)$'+#$#&$#+*"($"*)#*!)+"%)'!&(&&&#+#"$)""&(')'(&%"%$'$')+%#!++()#%$++#(+)!$*$)%!&!#)++!*%'")"%%+#()#*+"#'$$'+*++#"%)#!*&+#%&'#'&($!""&"!&)(++&$""%"'"''#+$(*'%!&#)!'#$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:30A7C18T7A40G8A18T5G31G11T11G2C1G3T1C0T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8109 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35347 42 169M = 35516 378 GTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAANGCCTTCTGCTTTGAAT >:):,#@H85/FE-").GD=?;A,",!&,4"&HCD"0C9>D83)4>(>2,)(E$3H08$+.=*436C,:)E8H-($;0"3'3(8B-9159@67,+(3'3)'78/5.9@94(&.!#<3#H<,3';@+C.AH.*A<82D,AF<90=:++<8$0:!#.F<#B?,*5GE=(*A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:152A16 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8110 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7758 42 42M = 7946 301 CAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCC 9<=FA'0F)"/;$#B4#&2F#E3==C7@9$1AF?D"*'$;;6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8110 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7946 42 113M = 7758 -301 CCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGG 0C%*6?A@F6/?!)CC-%G;.65&E%H&F?D:D!%)H""(G90=;7A090F,G*"A'?@C#95E.G)F8>.E+09=$0G-=%2)B6, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A39A9 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8113 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33515 42 41M = 33720 296 NGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTNATAGTCA !*&+*"$$$(%!)#**'"$*)#%"$()*+)*+)!#(&$*&% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T32G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8113 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33720 42 91M = 33515 -296 TGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGT .$&&0"$7<4<';8-(;-9#=5E9G5(9.)F!"2C4=;*8CH4.#<>.A"(:B@<=$E5(,6$B71;C49A!(C?;H+B7@.D&%:/?%1:<@8B+F,1.+4C(<9@D$??7!D-=#$)0)?2A96?6/-@%?&!C>&3$1?9+/@+;>-0'C51E-2671#60?+57%> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C3T12 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8115 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20565 42 134M = 20715 294 NTGTAANCGGCACNCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGCGCGGTATCAGCATCGCACAGCANACGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTAGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGA !'*%#$"%+#%++"&"('+#$(%*&!$#%$$!"$(!$(+(**!##'$$%#"')$&%+$#%+#$++$%!(%$)"!!)&")+%&*##+#"(&"$%*!(%("$"+%)*!%'!*#!!"%"%+%$!!#*+!$!&)+++) AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0G0C2C1A5T0C27T17G4A1A36C29C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8115 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20715 42 144M = 20565 -294 GCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCG 593E!H'$28=!:,/+*,)1:.D-A&)')63+@.?3'D&F-:1,4<.-!0&/)94=*+6CB&,1A.><:0-';9>F8BCG&*#A7H*/$:&?:(;B1&CD=3;.G;1-1B#*&F"->6&$32@8?H,BF'+01F'=+;"EH332"3F1"#'21F$+!*4G3+&'G-('C(@86FE0B8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25970 42 308M = 25906 -372 AACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTNAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACACGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGAN 8!A*(39%(F=$86%#%*.!E6C22%#>%0:*&30%+4+/8!/1!;5;&,;,H6H+7199%5<1037A++*"+$BF92"DF,,.E,7112#;%,19)&<"$?D?:E!4H&++/$@A5"3<%;@14B?#8=(?&!@8?=(F16>1(*)2=G?>;D?G@63G2=$HE2<@>473CF,"F=6)=#AE(2&-E2(=*)2+584GC("E:,(4@5&'8*C!4<3;&@'C8=)-!E5<$6$>:>?*7>$,94GHB%"D5#.E81)>! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:165A116A24T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8117 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19624 42 47M = 19367 -304 CCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGA ;A8/'6!'.5=H9%) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8118 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12941 42 54M = 12941 0 GTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGAT #A2D:GC-4::DGF@'!&,G*/?HC>4/02&+@&25"90.*;2$3A-A.B?27A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T35 YT:Z:UP jpayne@0: r8118 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12941 0 * = 12941 0 ANNNCNACNNANAGNGGNTNNTANNNNNTTNNNTGTGNNNNANCCTGACNGNCGTANNNTCNGCTNNGNNNNGNTNNNTCCTTGCNTNNGNGNGNTGNANN "!$""!##"!"!!##"$$"#"$""$""##!"!"$#"$!!#!$!$!$!"$!#$!!#$!#!!$!$#""#!!"!$$#$$$$!""$#$#"!"""#"!""$#!!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8119 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33284 42 40M = 33411 210 NTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTT +)'!%"&!#""+'!+('!&&#$"*++%"'"(%"$#$(%'! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G39 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8119 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33411 42 83M = 33284 -210 AAAGATTCGGAAGGGAAGCCAGCAACAGGCCACCCTGNAATGGCATATTNCATGGTGAGCTCCTTATNTATACATAACGAAAA %!%$&!(!+"!)!)(#"+*#')#'*"#)'$+%'(#)%&!%(#%#"+&#*#'&**)%!*+*#'(+"'$($(*!)&)"'*+*&*+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15C21C11G7T9T15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8120 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34575 42 122M = 34697 292 GTTGGACTTATGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATACGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCA ?C%55''C%'809,5A*,E*<),;(H91-)3$:-10!';?EGD1E.$36)B(005G#'2?==+AH-2D5=H#HA603">=#;+30 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C31T80 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8120 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34697 42 16M2D152M = 34575 -292 TCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATATCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAAC 7E5G:3"5D2G<)G)F1"':4A$-:#+BC0:&58)A6*;6/-2*86H50"10#-:+=",82=9$78@>5;=0"E+>>)-*A-;*2E-6E:!,(!>3H(B.4"H7B3<'.@05)@;3-;H:55%.>E;C3>3@;0-93?"32,FG<@$<.4((2,2>#2G#F4C&.3'*?;7B5)&-&2;>"F&-**9;@2-36G.08@,H'7+.*>* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C46G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8121 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4780 42 58M = 4990 279 CGTGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCA %$0)+G+B3/AF*@4.=3&>&@>#E>6'#ED)?&H4(5@3&&27$%A.%81*015CCB AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0A56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8122 77 * 0 0 * * 0 0 AGACGCGGCAATACAGCGGNATCTGGGACGGAACGTTTANACC ""%"+)*$"&+!#!)+#"!%!+(!')%"(%%%*%&""$"&!+) YT:Z:UP jpayne@0: r8122 141 * 0 0 * * 0 0 CNNGCATNCAGCGCATCGCCGAGCAGAAATCGCTGAGCACATCCCACGCCTTACGCTGTGTGGTCAGGTACGCATTACAGGTGATGCGCGGCTCCGTGCCGCCAAAGCCGTCCGGCACTGACTGGTCGCAG '(!*%*'%(+$+"#((&&"()'$'%(!($#)'&""!*#$'!!+#($$"$%&&&$+%+'&(&%('+!)*#%)"$&#%"'#$%(&"&!!'$%$!&))%+#!#!)&$'(''&!*)+#$+%'%)%$%&+#'!#(" YT:Z:UP jpayne@0: r8123 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23273 42 52M = 23512 291 AATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTC HF-;="3!5;'-/>111;0A#4/+ED"?(!"<=?00?0)%:;2&;D"=D'FC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8123 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23512 42 52M = 23273 -291 AATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATAC /B5?"G3F&*D("(,:=5C:?019HG65:'!9*<)667#9"E:G42HF39(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8124 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29156 42 46M = 29425 327 TANTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTG 0F!'H74.E*0:216#0':5C2C<93(1<-32:0CA7/??>.0"(( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8124 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29425 42 58M = 29156 -327 CTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGAT @28'$/E'+@0$"65#6'4AG9&3G+5,E(E57>)0E8+@%3!!&/5/9&7A89C.5/DA$5/%B=( AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:63T0T1A0A0A1A1A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8125 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16617 24 71M = 16796 253 TAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACC 7&07E*F3D1*,/2:7-$&G>G;@;1HD;E?"21A0A@F2H-CB/.!!-'B=?64/H!$,2>29$A3/*'C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C33 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8126 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41667 42 143M = 41815 244 ANAANATCCGACCTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGNTCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTNTGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATC %#%(#"$(%*)+$%"&(!!")*)'(*&%*!!(&')*"***&!(*%)&'()+'#&)*&''&#!!'*$#+!!*#))'"*$+%'(&"(&*&**!)&(%()(*!''!"%*!+"*+#($*#*$$&$+%&%*)"'&%!#+))!#'&$"' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A2A3G3T54A42A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8126 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41815 42 96M = 41667 -244 AATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGNCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATT B7%F+GE1(GC/#*9?H?:'D1.<<1?":);"@1?*!B5(0$59,GDE-C>D2C1&-'D4-)*.70) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C69 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8127 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11473 42 458M = 11473 0 CNGAGNNGGNNNNTNNTNGTCCTNNTANCNCNCAGGANNTACGNNNNAAGGCAGAGGCTGCGTNTAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTNTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAAGANCTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTTTCTGCG *')(&%!($'!!!%%"*&($%(*&'&*!)")$*%*"((")"$"''('$+)))$(''"+(''###&#'"(%"+')!!!$&$'%*#)&+%(('$*$"$$$*%$!+'%%)%$%+##%%)($*!#!(!+"($!!!$#"!(&&#"((#&%(#&+'%'$+!'$*&%#$*+&!+!&$("$*&''%#!))&''%&%)'+&%)!"%$&%!!!!'"#$#*#"*"#+#("%!)(%&#*&"+'((&+%!##))#+')'&+'+%(&!#!&&$"(#'(*!'*&&&*%%"*$&$'!$+$($#**+%($&((!$$)"'&&*!&%&)*$')!%#%(%((#'+#$!$*'$*'$&&'&'#*"()&&+$%('"*'"!!'**!(*#)*)("#+&)&$!!)$$'&#!#%!'""'$&&+"!+!%"!&'"$"*())&!''%('%&$#)$("+""")&$'%*(#(('(##%$"""+"$)"("( AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:28 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:28 MD:Z:1G1T1C0T2A0T0A0T1G0G1C5G0A2C1G1G5G0A1G1T0G0A0T0T16A46G220A119G6 YT:Z:UP jpayne@0: r8127 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11473 0 * = 11473 0 AGNNCNCNTNANGNTATCTNNCNNTTNNNCATNTATNGGATCGNCNGTNTGANNCANTNNTTCNNNCCGNNNNGNNNATNNGNGCTTNGNTGNNNNNGNCGNACANTNNGANNCNGANCAATAANACTNNNNGTCCGANNCNGNNC $"""$!$!!"$$""$##$#"#$!!"#$!"##!""!$!##$!#""#!#"#!$$!"!!#"###!!"!#""$##"!$#"$$$$#"!!$#$!##!$""$!"!!!$"$#!""##"$#!#"#!"#$$$##$$#"!#$#!###"$#""!"!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35931 42 96M = 35704 -323 CTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAANGGCATAGACAATAACTATCGATGTCATATACCCA 0A%!?D""0C,3$@"3:(A5G0.?!**A<3G9"&H/%E4&3C$6&=%EGED,3:2:B)F%D:1?$%*!G@&#C1A9&@8"?:44H4(1%?3AD+&:>F&=F7B?G*:50#<&+55*?97+%$4-,59081&:7$/?+-7EH(G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G83G77 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8129 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1607 42 47M = 1866 300 NATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAG +$$))!!'&#""!+%%++'+%+'*)"$$&"#(&$%&#%&+&&!!$"% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8129 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1866 42 41M = 1607 -300 TCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGG G.!"%<:,F?G@?69D+4,#="$:E::B7HH+B.&C?6@FD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8130 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41837 42 125M4I42M = 41592 -412 CAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAANAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGANATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTAGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCACTTCCGACCA $%'+&(&#%&""&&%$+"!&"*"!+%+(+%!+((())("(%%%$+&!!'!!#!$)&*)(((+#%*&##%"*#**'"&"!&''#!**%&+"%$#*!$%'$&+)*)%(#%+&'*+'"*)(($$"$%%*%)*#**"&%"()&''(%(#"((&)$*)*+#*!&&%%!&$&"&*+' AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:32A35A23C63G10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8130 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41592 42 245M = 41837 412 GGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTANTCNGAAAATGATTAT A*4)16<955.BF"+3)4(A'6A,@70F,@=5!4E)/0%AH!,%1DD-9)9+.;(.G/4!BBD6@F-5*(?G7F,D@,@D@/$'7*=*F#0%(237=%E.C<<9EH@47(')5&!3!,!3@-!?G",4=<6G2H#G/?;GG+!.3C@/E*?BA%A@>;AHC(%9DEDBB???H31F*?1,;3-B">D7DF>7GF#+(D2.(%$1>A?*( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43T48A13 YT:Z:UP jpayne@0: r8131 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23319 0 * = 23319 0 NTGTNNGCANTANNTTNNNNNCANNNTGCCNNAGNCTNGAGNGNANGATNANTATGNNNTNNTCANNTNATTNNAAANNANTTNNTNANCNNNNA ""!"##$!#!#$"!$"#$""!$$""##"#""#$#!#$#$#$!"!""$!#!$"$$"$!!!"!##$!!""##"##"#"#!"#!#$$""$#!"""$#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8132 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8938 42 62M = 9000 290 TGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGCTGAAAGGTGCCGGGACC 2>%EEF"8!%7D9,6HD/D3%3'0EH0#(;!2: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G17 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8132 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9000 42 26M1D201M = 8938 -290 ACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACGCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGANCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGNCCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAG ":=%3G%+%38(C+D1A&+EBF#='/('A6*6<6:-G-A'CGA>CD#>;()-=,E*'-E4>:;.A'7.>-,#5@2B1.:3&7/>7,,G8=,8E)2?D91@D=D<:,/ED>>(+&0/A&@D:8>#4*?/-G,,C:>#*=)BH'=-8,.>@1-,$5,0=*#..F/!!0&.,C*;:@4@:%5;@'E(-*2:"$),?H),E.'17FA9H,/C0B5+(0,1$DCA<(0A:59#4'+;=BA9=)*-E3&;;G%&F59&0&3DF'8))02"0>2$"4>7!HC".$G6)/)'5H;)%12-'0 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C11G15G69A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8133 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46411 42 41M = 46209 -243 ATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACT D!*589@#:CF@7.*$<71/'2"+8;GFD,:*"12%8"*92 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8134 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29956 42 47M = 30076 236 ATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTC 6>@!B816D8AE)>=<-5)9:/)%GC*3@0'(+83+##8:7/AH+1/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8134 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30076 42 116M = 29956 -236 TCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTGGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACG -;--91/')A47D?31*9$.&%*%$2$9;#$/6!'.2>"!D',!EEG)7(GE%>D;.;9;G+@"$=)?A-+!'444$?0!:+E#(81%AA'+1/A!/"&::%/5=18'H312:D5A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8135 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34524 42 44M = 34725 250 GTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGT /#=04;B,=)-A;>;(1&*2C?$E3&;A$%'1#?;:?%E24,0"2$)B.&/#G,)C<:9"4E:",765;457+.$*##,AG138/;2F,#-B47.&-2#H!2ED,"7,'2F'@=70C&5C@3A@G<5@<68H55;%;&=+3!A-!E##1-&)),>5 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35C11C5G15T17 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8137 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 663 40 158M2I8M = 870 294 CCATGAACAAAGCGGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATC !%7G&:%@/-/5-8FE0D9C31>"<41*D.&*":7,&;G$@6,F18%F53-@*?#3+,AB@$-F&<2F$6".1=';9+C+D39DD))!@7CBG+BA(2')*&7";$6<@4'"7;@B5F>+0/*0?>:?F!7GH<)*4(?G)DD33@3#3"#A-+4(>0:.4&?E%@C%6?;$4,:@$;%8#+8:$&;5/?21F4/">@DAF7..CA35&0(<,0=&/E$'5>"2;='2'=85B2.&B#ABG"E9,B,":2;4!7H:&%'H3GC/.-0.7@4B777:@&1,=?1'G,B51CH#2E= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:153T19A28 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8141 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22307 42 56M = 22363 256 CAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAA (2$C(@/B0'*;818?)$'CC9$:>HGB,C,;BCA4.CC-"#B*B8&#E+--1!F' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8141 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22363 42 200M = 22307 -256 GAAACAAAAANAAGCCTGATGCAGGTAGCCANTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGANACCTCGTTGCTGGNACCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTT '/8<.2%/$F$?*;+D7G$7/&?H1(@F#DH1&':?$8:6?52?++!/>4:)(7+#1:2>>FD!(#B>%"$A4E<9.4:69#<=AE?'6/+).<%H+9#E1<)&42"70H96%F!?F6;)78H,/)2-E(+''&0.6")?H)="6/(.=20'55%4(!3:%+#@*@E(&7&F#:#D'H<&/;A7BDEA4;4F+')+<98D AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10A20G57A13A1G94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8142 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3784 42 224M = 3710 -298 AATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGNCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTNTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAAGTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGA @6$':=G)7.32E:F!1%%#$C$*?,((!8>72"2)+C:A6+!@*/4BEG3$CE6E@C+4,1;AC?1',4)+C%+E4"3:26'(!6E3&4;48H9<<6!;)3F'A$#5#";F#0*2;AG,-;#EH"0":!>(,93:)G*=C-3$.!363>9.(":B$E/8#C+:$:1+(.<520'4-E$6">,&%>=4%$?:2E*'4=,CB@1G2=A!+B2",DA8ABHD:5&4 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T119T32G25T44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8142 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3710 42 76M = 3784 298 NGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTC '461#.F1("&>4:HHG#?@+8@-;?A"?#@1=5-6!#B52,*,B0DEB;5&0%/5>."95G08'G!H7GFH.H/-C5)A1C=.GFA=?A;.FE3?.92H4-.&!?>)'/BE$)13-3)4*5*'?0026+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8144 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43601 42 43M = 43806 281 CGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCC 51:3"F#!"C!D$E&6<@$4)8FE3&&-'-H8%B410-&1<)4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8144 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43806 42 76M = 43601 -281 TTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGNCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGNNCNGNNAGAGG ))&&&$!"!$!*$'#)#'")"%&(&%(+"*!#'$'#')$%('+(+(&')()""$##'&""*+%#!!)!(#!'$#$* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:28G35T0A1A1G0G3A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8145 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21078 24 86M = 20910 -254 CGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGTCTGAACTGACTCAGGTT 6#')(";<'8>.=H4>#=!!<"9@<- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T35A17 YS:i:-46 YT:Z:CP jpayne@0: r8145 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20910 24 37M4D116M = 21078 254 CNNANAGCNNTCNTCTNCTGGCNCCCNTTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGANTGAACTGGCNGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCCCCTTGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAAGGC '"&%"'!"&!)&")*%&%&$$&#**#"+##*++%'##%%"(+*&)$*'!)%*%#!)'#)*"'#+*%+#&(&!)%%&('#"''*+!(!&$*'&!++($'$+!+*+)+)"+$+%+$%))*!)'*'#)$$'%$))#'$)*'&*&"**+)"#&#+(! AS:i:-46 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:23 MD:Z:1G0A1C1C1G0C1T0T1G1A5C0G1G0A10^TATC31A9C33A2A34T2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30304 42 68M = 30081 -291 AATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAG /(D$<6'<6@#E+%G?8/B)?D0>$EB"A%09F)DA&:;-.4';:6AD)7?@G6C%H'B!"2>F-G%= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30081 42 155M = 30304 291 GACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGC /CBD8H+#BE;("'G6>BG;(*46.98E&11A:9=(D(34(*;1G=@(FA>#D@(<*#HB@03)(!>%C580/#(#:/F$HB.)C:6'<>82=9:0.4=BF.&7)(B!8C@2AC3G=#-E+GD3'=2F#(C$C4B'FA+40"@>=7!C08:6>"+A=0:<*5H.F/0H:"*G1<)1E;<92<6F)>C6<"/G*F$$$+.83B>!"#!E>C9E?%C54E085H>AC0E$A,B6$'!,G@!0EBH:$;5E-< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8148 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37149 42 169M = 37149 0 GAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCANTGACTAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGA 2H".$BH!1(&!A'3E1,&#$%(=C87?%2#'D+0-"-4=*&$,*<0.'G/2>E0<8#.F$GF+'!=.+8!(HF5$FBF9=:D<@,4)@83+GF>0F>,*5#27$'-*?!E0<2=04%5<(.4@!G;FD1)&*9-<%0:<0%?<84@+#=AF%D3=.),?5<:%3"?." AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59G42C65G0 YT:Z:UP jpayne@0: r8148 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37149 0 * = 37149 0 AGACGCGTNTNTNNAGCGNTTNTNATNNCNNATATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCAT &&))#'()!"!'"#"%"&%(*!*'$$#!$"')+*$"'")""#$*#$"*#"##$*!#"*&"%(&"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8149 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17561 40 113M = 17674 331 GGAACTANAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCTGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCNGCACCGGCAGCACCGTCGAGGNTTGAGCTGNCG *&+#+""'")&)$)!*%&+)%"(!&!++'()*)'%($&($)#*$$""&)%)&"+%$*)!!#)#&$#%'(%++)"!*$)+)("(&)%$''"!"'!((*'&((!+#&$)'+&#*& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7C46C24C21A8A2 YS:i:-40 YT:Z:CP jpayne@0: r8149 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17674 40 8M1D37M6D166M = 17561 -331 CCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTCCAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTNTTCCTTTTATATCCGCAGTGTGAACANCGCTGG $*('"%"+)'+#(*))#%#&'$$$#)%%%"*(*!$')#"!$#+"+%)&)+&''&!"*)#*)((&&$"!+$!%#(()&!"*"'*#$%(%(%$$$&%'*#%(+#$(%)"#*+!!$)"&*$#)%)#("+%&#!#+*#*#!!(*%&'#("'%)'""+#"&+"*!)#$*#+#"&!#&))*)#'&)&&**#&)'+&(#+%)"$&!"#+)%%&+!*(" AS:i:-40 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:12 MD:Z:8^T37^ACCCGA4A127A2A23C2T3 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8150 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7532 42 166M = 7349 -349 ACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCAT ?"7&4@--0=9@3?+$(B!6&"@'+%@-=,45=>0:.C$$.=5,%/6A'(3.';!,1E4B:E(6,C<23HE/;(8(0<$:08F-&:3H93$A;B*DA4$GG<,&<&1A@"25"':=,2469G:+2851317A,4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:166 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8150 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7349 42 183M = 7532 349 CAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTNACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGCTGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGA 'C64G;A@H!?0?0&(<;+2#:9!*2D,D70AC(:7D2C':98+12D.3<=CEE<48==>>1-H!##@9"%#%9E0E6$@><3@%B'+)'%'49(@<-+0'.5*GECC#6+.8#'%ACA<@509*!#/F9G*. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8153 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17360 42 199M = 17559 281 CAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCT GB/G6:.G;6?/;'&+#&&-=9)7!1;H?C40?=F#D">+-:)&5+,01EE,))$+)5(5GCD.*%G7+3);,!@+1"-%90,&0!8AB=H965#1('G"7C@*?/E;#<378=.F=,01A!AA632-./-/19HF-*#/>7370+EG,D:%1).G;508A%?8''E.5--,FD''.,"C%22**:B?#,=8/,/C+EA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:199 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8153 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17559 42 82M = 17360 -281 GGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCNTCGGTATCGTTCCGGNNTNCT %%%(+$'&#%'+($'&!"$!%*#+$+)'#$("(%$")(+'""#!&&%(&!)*($)*'!&&(#$"+"'$)()##!(+#'*#'! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:60G15A0T1G1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8154 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4680 42 100M = 4523 -257 CCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGNTGCCAGCGATCC A6:.:">(9!":@"-D;29)/*D><4;<-$0*E&E31+2H<4*7$4!$!;7337)&A%F.1G=A1C(>%547@A+)GC45C>+C9#%?A+?55=C)B156-G%4;2A-.!;@@@?;1:3376)-/>@@1;-6&?6,6,>A.AG)!&+!7"( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8155 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19410 42 271M = 19410 0 AAGAGACGACCACTNCCAGGGACGAAAGTGCAATNCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGNTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTAGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAG ;E(6&B1@3"B$,(48&#+3/=0.7-$'2=2D3G8-2=;!0HE*--*5)&)CBH*4/"C(890,%>C$$D;A<#C1#3*,)"/2/)6="1:"+G#/FE,CG2H>$=#-?<;%-3584026A0F#%3*$?/"-6;!'67F;"1=:;:&#'!.-A7'4HC.99,64(1-0.+B*>D*&$')<;=D/*8'6,->3*,42-<@'"2.-9(&H8!F!(5=7(!;-FE.'7EH5>8;3'.B# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14G19G24G98G69T42 YT:Z:UP jpayne@0: r8155 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19410 0 * = 19410 0 NNGTCNNGAGGTTNACNGAANNATGGANATNNNGCNNNCNNATNNNN !!"!!"""#$$""$$$!#$#!!#!"$$$!""""#"!#"!$"$##!!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8156 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18985 42 165M = 18798 -352 CGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACANGNTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTNTCGGGCGGGGATACCGGTGTGTGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGCCNTG $%+'(&&'&*$"(%(&!"$''!(%*'*%""')'&!$&')$!"'#*)"%")"%!*!*+)#&')"(#"+%"$)*!"(+%&%+')+!+('')"$(*'#"&&+!%*(&""%+$+'%+&%!"$"$+))%(*$#$+'+&#&(('!$+*(#+")$&'$#$#'&)*'+!%!%# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:60T1G51G21A23A0A0G1A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8156 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18798 42 187M = 18985 352 GCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTANNGTGATTAAGAAACAGGCGNTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGC +#%#&'##)%+*!'*"*()"#$%($"+&'*%($!'")%$&!#(((&$'#"%)$%%""!+!&#)$$)**+")*"&+('"(%(+&$)!($'+$$+'+'(%+'*&$**))%!$'('$')'$*(**'!$'%+%&!$+#&)*&!&"'*!+)("%#""$&#"+&#%&%"*%!#)$%%''#+$*+(+'&*%#$% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65T0G18C101 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8157 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20748 40 111M = 20633 -226 AGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGATGGTAATGGANGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCG $;&*$&37!)E96-.#,D)E%%%;C+%H2;D#-5)BC6(7?%&96:F:%>>!')FF=ECG)>>F@05'9B8!2-(@"87E$C'*5)3)E%>-2.7>2;A6H6:7B5-:""@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57G10T42 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r8157 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20633 40 64M7I51M = 20748 226 CGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGNACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTC *0A.(&<+.">E@<.C##E+9%2E5*-5C*@$,.A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8158 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3157 42 46M = 3285 176 TCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACT ;>0*8)+("66..?35'##$0$,1G6:B(@/$!FE=+F5&1>33>C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8159 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4922 42 56M = 4978 455 CAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGA 3376:,.99A!5,*%6H?-?5/<-'0;A1"9$<'04+"F$<(A@.2G#:$&($(64 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8159 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4978 42 399M = 4922 -455 CTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCNGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGNGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGANTCAATCAACAACTGTTTCAGC .B#5-+%=4D.'200"46+CG-4>+=):%/=/??;?(DB$'E;?,;9$EHH+@;A<'2)-@D22H?FA*#>?%DF>8-(%A0"EG%67.E#48D%1-+@AC@#5";=D.H3FB"H*F@8'(##B>C7(1%(=B'D'-G584@-7<'->:8*(62A7!8#B<6#&+A/<"#A-,F9:$#@015D0;6D0)20G(,<-E2*0G5@,'=/4$*6H:*>(6F.73=-*=3545%-?#9A9G"#"1?=<5F.D*?/H#'*6=>-7/8(G%?G&>A;$%'<2.(E-F&EF31"-()=+:4>3A?B&'&F7*-)BG)2'8D1*46#30:*329"H"!;=$40%D9>>F%B<%*.H;<5<=-7#-H)?70>=!-1<*6G+768#EC"9(@<"&)-B1H-#?.F>=E* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:133C185C57C21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8160 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8188 42 112M1I27M = 8420 272 CCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAA CG7A:G8<82&4#=='A(9372==981(?4/&@'?>BD7A68:>34>6475&10719G>##A".::6D"?#;CE%"9H+?(2@,(6'*)!:10BF+#-A&9@)H.&31"9&2C6*!D0(0/@.9:8<5(&G1>1C&3/B< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:139 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8160 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8420 42 40M = 8188 -272 TGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCG >&A&1H*E/&D"H*A7FE95;:*3-"8.F+D&C%6G(63/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22027 42 184M = 22211 247 GCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCTTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTNGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGNCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGG &A?;58:(00?/;4&8D3>73:')4#2380*:3*6B9)3D&37C!?G@.14">-!G$E)%C<<2>+=9$1-F"E2/D9.H@:HD<>1?5&+,(9>7%<#$>&!F9/5?@8)&>9&8=8;=-@*!E1?E&.42'+#*B"=8-3/HA((=7/+74G,H@1FHH;F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46C55G37G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22211 42 63M = 22027 -247 CTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTAT <3#;?"03/2C75#:'(4+F)*7GG0E/#(,1H/+1B'6;=;H'$6F$4F;G==E6*0$E,(& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8162 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1074 42 75M = 1149 215 ACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGGGATCACACGCTCACC 59$F4G>82=@0'/9965A4?-6,)"AG?=?CCB:B66D'=7-0,B)=+>0>"(.,.-3242G,#1/8E59DE66 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T57A11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8162 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1149 42 140M = 1074 -215 ATGAAGCGTTTCACTAATGGNCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTAAAGCGGCAAAAAACTNCCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAANTTNCTGCTTTTGATGATGATACTGAACATGAAGGCTCTCC 0CE<">/@6H4&BB&;;>&=>AD29H<(.;-C.&8$9!8!!>!B5!3:-1-#-3:13?>8E5 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:20G40A37C2G18T6G11 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8163 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 601 42 135M = 481 -255 GCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACNTGTTGATTTCCTGAAACGGGACATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGNACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTA /&,:%:D$$(=EB*B*#-%;#$(D.#0E6B*97!#%=8FGA<$H?191,3"$H7G/"$9>F3A56)/%.A1$?&E-+6>7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A21T37A45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8163 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 481 42 98M = 601 255 GGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAANCCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCG DC)%672.(-:>71/2F8?H&&HA%8C)F:$;';D!?>H24=!$?&F3F.*323.$?8A%F?8D+<@;/4=E;152)/AD&3#H457#$:8=7=/<./ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A57 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8164 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29491 42 82M = 29589 240 ATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATNTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAANACCTTCGTGATGT @D*5E54<=$337G858<,*')"9,)D+6#%CG6$:A7H:AB0%274?"$+)C)#$/B38C,+)E=DF$/0A)5!%,$:=1@0/%H(>"*=&80GH!H$42@'2,=78&-B3+=)4? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35T0T15C9C79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34041 42 98M = 34222 248 AGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAANCATTGCCGTC ,F@,<7:;-/6$"22#*A:3$(F2H5157<4E+&5@+GG4'G#BF%1#.G8F>-AE@G;<1)<"!3"2=4<&$/*!,D7$1C,:;*E?8C#(G1/C98 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:87T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34222 42 67M = 34041 -248 CAGCTTGCATCCATTGCNTCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATA 60B5E,6G-3,7/;**;(+?69$8(6$D"CE)=$2-A=$$'E6<&>%-8F>?:A#<%BA3B2/7C:?'+&$C>5+D/?*/-$%B6!/7:?),A7.?G,>$!& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8166 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7659 42 43M = 7438 -264 TGAAACGATACGNGGGTACATGNGAACGTCAGCCACCATNAAA !$#(!)(#)%#$$(+')&(***$%(!'$#)"'&*#'%%+'"#( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12C9G16T1C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8167 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7583 42 55M = 7357 -281 CTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATATCCTGTTCGA H75'.%$*+$$$:'>*2-&1"22>289.C>@*:H/0C!F@1G>D#C,B&G**(FD AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8167 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7357 42 50M = 7583 281 CCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACANGAAAATGAGGTGGGAT &E+(:4.F8($DE%))==F)*+;A,C+6B;3E>6$*%C5=7.>G4.CH(? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T16 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8168 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3830 42 103M = 4013 238 ACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGNAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCT @0/C&)?5*E?$>+F&F*D5AB:?'5EE,&@?E'=&@5<%,F5=1)"?H2!DF-A7/?4G:?#:GC(=1B0H%0&3-44BGB14H&6?%#E'">A1"#9E71,89B:=/8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33315 42 65M = 33402 236 TAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCC E/!$=+.85786@@9@$11((EA$27B..?(>*@$?#:7,,HB2*=.2>$<:1,.="7F,&(%#- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33402 42 149M = 33315 -236 CGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGANGCGTTATTGGTANGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGAT =B5)*6:#66,%'D*5C2>+G-E3,B2>)<05*F&4447:((($:H&-2(A(!A,@CA)>;*(A;:#.#'C>246$?')0&6E<,/'=E515!)"77+=3>=$:7%10"+E+7;B@.#@?+1,D#5(1/$D>#80F8C5D*CF4'1HF- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:105A12T30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8170 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39945 42 42M = 39755 -232 AACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCAA *&*5AH82'GGFH<6E/%H909"=-$!5'&+,5@.)A:+;C97)2;G6-00#E?4=E"F5G$*@2.H&F==E9EC!B$1193#9"=740#/83;7>E#,"56>?&=#H&*G&"%"9G43?.+4;@4(:B,HA'@9/<6+A86'H>+:4.@*2>,A56'93-",9!,C')<+E<*> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48T127 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8171 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40130 42 66M = 39963 -233 CCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGAAAAACAACTTCCTNTCAT 'G0GE@>!54G-H%@$&;"".43)A$EH%AG24-@,=/0G&2*F8@:'C&98A/2#GB5:)=15A?=$)E(B62).&G>H*&B$/+AB0262@;=$EB"6*33!$-5F+C!@B5F<1,4.'>&.EC1F"2;!$>?>++;F!',.AE9#-*H!3D!2(-H5)<&"@?C4E:F'1<-"B1+6@)H,HEB6D>D592;)3FE4B7E;G17/*7*AG>A7#&A1/!5$47G88/38';#;1H1 AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:25^T37^A1C0C0G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8173 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17796 40 169M = 17657 -308 TTNTCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCNTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGC =/'E&B;C3EF8=)57'D+,$9-5$C4@>?58$0$,).:H"3)/-&.@DC5626- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8174 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26183 42 49M = 25970 -262 CCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATG #6E0'"@8=$":0/F2,=*B68$:BB*0C6F4-.D.+#";@. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8175 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33718 42 42M = 33718 0 CATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACACAGC @7F9+?'F=)0!'F&("%1.-='9D&,-@#D);4D1"3)%0B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G3 YT:Z:UP jpayne@0: r8175 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33718 0 * = 33718 0 CNNTNTNNGNNANGNGNNTNNNGCNCNTNNTTNGNNATCNNNNN #""$#"$##!!#$"#$!$#""$#$"""!"##$$$""#$$$!!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8176 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16916 42 122M = 17038 263 TTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATC A9+(8DC0F7E7($">/.%1;*C1H.C9C('<;=G9=6<8;4(5%%3('H'?-9&/-,)E4G(2;@2.>?D/E43E$)3.,9DFH18:$/?"2096.):?"5;/+!DF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8176 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17038 42 141M = 16916 -263 ACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGANCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTA 11!/&8?:"::)')"G!-B!=E23$/(6HF/4:.)3(AH-D<6+FEA3-3=E=*>&9H::9%G#G4%HB664-#"-2-4?$@4B2(E&G-)7."=E&E!G'C=::/C,&6+'(>1.,);#&/&.73'/)"!-5=,7!033A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106G34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8177 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39115 40 60M3I40M = 38956 -259 GGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCNGNNG )>=,$GE7.'G@C*A/5E*75C-4!D;:.,#4?%F:A!!'#%1*9FB3&$?+,*@>;!B>2H,EA/&#GG;!.7='",+-7@54#0+C?2D,G3./'4**&)& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:95T1T0G1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8177 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38956 40 98M = 39115 259 TTAGAACTCNTCAGAATAAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTAGGACCAAATAAAAACATCTAAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAA 6/C<˴F2>$<*8'F*H3E'735.'+=G6?&="0%,,>H;,*+;8G.;4C8%$=FF%(B=3*BB1FGG()B%A@,%.=ACDDF1*E1%)B5@==CB-5?07)"<)7??.8B99$="F/B,>?A8@>-2A3B.74#%3:D?0>/,@A,H#8B!$BH$(A!"5$;$?,3100!/-D)/"8!)E&C9H*=#E%5B)8#DD-$<7//HF+.$";8E=-9/;<&+%2!88;B#)G<*$G(6F<>4:'C!AH'%.:%*&>EG2?61;C(B'02#$:6(7D5")1A)@%!*%2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C239T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8178 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9791 42 287M = 10078 566 GCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAG /-/3!?B>?C6&1#D08++$"-%:D%A-&).D%()775;H8)>:*&(5'!4EG<%?(.,&G)0*/:;3D%'/+8',(C?!,HD%;D;B<7"50*9E@@-'0!22*2*!HG;.EE(7<;;C36?1,!@"?1&D8>,&0;1AF*?2:-,4=,/!9?)"BFHH<,E8DB>%&3?-3.<@E232G=G";0'@.%#&G2B5%G;0B"@&GB6D3834+6'E#3+2FC+E9F#':"@G"! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:287 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8179 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10254 42 42M = 9999 -297 ATGTTCTGCTGGATATGCACTNTTCCGGGCTGACGTACACCG +/&!:C/,=('("=C'A%?!CC''(1?1>#@"<*AC'=(*C: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8179 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9999 42 54M = 10254 297 ATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTG 9DH7C@G:/<&7+0%B+)=5<3$:-6%F/A5<&17!7;E!H@A)(6F.%5."=H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8180 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27566 42 129M = 27435 -260 ACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTANAGTATTATGTNGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGA 1$:9+0@E#40/%##):2:DE19!-"2GH8%:E83HE<9-1+EA=5A6;'!<-)-8,#5A9E"%8E0AEA.!(42<$&;A%?!%%:EE?1D-4$4-609A,"/>>5;:/-3D$F?4!@&346:/C2++/H&B;()/26'=6BHE0D2;7D/H9!C;.".F72F1?AA0#0B4&8!3%' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T94G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8181 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45541 42 48M = 45375 -214 TGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGT 1-;05-"<(!##?9B08)11-,>'A"+C++*GB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8181 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45375 42 71M = 45541 214 TTCGCCNGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGAT E3/!4/4;C4FC+6$CF*GE:5!7+):;$:-:DC0$5F=$-+8$5/4:$DEEG/)GG#2<98'D"7,04@: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8182 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36394 42 86M = 36394 0 CTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTNTTGCCNGCAGGCTAATGTCTGAAANT 8<46-3H1,!%,$G#>#,1')1$&5/#F4/6+GC,"#B("+2H)80;8E84,2D4A$E1.+@0//.5,<"@>,>8:@C5?,3()AE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59T5C18A1 YT:Z:UP jpayne@0: r8182 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36394 0 * = 36394 0 NNNAGCNGANNGNNNATCAACNNNACTCGANCNNGNCAGCANNANTNNNTNNNTNTNNNAGNGGCNTNTNCCNGNCNNNNAANATNANTNNNGTNAANNNGNNCNTGACTTGNCTCNNNNTCNTNGNAGNNAAGNNNNTNATNAGNNAGNTAATNTTNNNTNNNNNCNNTNGCNTNNCNNNTGGTATCNCAGNNTTNGNNACNNA #!#!#"!!#!""#$!$$$#$#$$$!$#$$$"!$$#!""#!#!!#"$!""$!"$####"$!!#"$!!"$#!"##!$$$!"!#!"#$$"$!#"!"""#$##"!"!$"#!"$"$#"$!$#$""!#""#!!#!!!!"!!!$"$$#"""$"""""#$#$$"$!!#"#""$!"#!##!##$#""!!!$"!!"#$!#"#"!!""$$!"""#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8183 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20227 42 92M = 20103 -216 CAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCC FAE=:G/AC'G6.)'*+$7$&.E7F@(6@B5?#B4@!DA-?=4FB2>&93?(>4D%BCC&B+&!,94.FG.7FC.H*:7&,&"B0703;4@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8183 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20103 42 67M = 20227 216 GCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAG -*/:?4H9E@5<(;3'$;(.:#!DD6!6++A34+'5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28601 42 160M = 28761 217 GTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAANCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGC +H':9E"2),7$F7&+9!369/'$:C5G46B:6'.#4:(->)@(!8A2H2C1/DDC/1&A!20,15:4G0E>''<<"&F(C65;@8*B59/6/3&>;FE'>2+.C1'1!3G$(A=;A/1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C43G115 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8184 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28761 42 57M = 28601 -217 CTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCATTAATCT 7;>@&>BG#9<0-G&4!D"E=A#$) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50G4A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8185 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13991 42 42M = 13714 -319 CTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCANGA /6G2'&"!:0#H>G:*DF.9H*A.!&A5/%C+%&G.9G+$46H9=HF10.D:,54F+1>42H8G.+2$5E5>%#/"2"B9=7+$;)HF.BB?"=GED2'<45A+&FH$7)8%4E44&:87$>"*43?$1!)+&F=-8H7=E.CED."CB=,3;H+;(2FCF3C;#G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16T51A51C50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8187 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7443 42 67M = 7226 -284 AACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCNTACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACC +@-=30*9G#6FG(G6E*;C5,AD$0G;.9*-!61!BH'(#7--;.F1@92$BDG>(FAE,E#6?D? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8187 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7226 42 42M = 7443 284 CGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGC >%%-@@AF9;'6(#!5B@'9;&C">/3=D#9;5?:-A&;7*: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12212 42 59M = 12577 417 GNTGGCGCGGCNGGAANNTAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCNAAACGGGGCGCCATTG )!'#*'')"'(!#%%!%!*''&)+"(*+#&"&'!)&)!#'+('$!!)#%#%*&))!%!& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1C6A2A2C0G0G0A24A7C8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12577 42 52M = 12212 -417 GCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGC ?(+%?EE9'&./D.1>-C@8H6=&6CG@;)*3.*AC$9:7$4?>D6*9=7*= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32828 42 148M = 33022 282 ATCAATNTCAACCTGGNGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGCCATCAAACGCGCGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGC #7-#@/7<8(F>-=;:G6F7F='>D3884F!409:1E?B--@$9='@@64:EF8;,A#;1)+=#3G+7@<(F87$1B=C9<6C.%7;'>,$/D?/;;C?81E7;%2E,68E5<-4&9:&@471:'%2@">,<1:HE?D.B2&)$+%*0 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6A9T65T10A54 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8189 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33022 42 88M = 32828 -282 GTTTTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTNGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGNGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAAANAGCGTT ":@!><9DA("'/33>473B!:2,D6;,E+38/:**!!/+'0&"&/=5.@-HD1=-*61'$3$CA3?2'62,!"82A5;;-0(C&%12 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3C29G21A24T0A6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8190 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17735 42 72M = 17735 0 TTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTA H:F>+/-$4@4AHH.CHF3!06!(C).-3?F.:"H(-#:8"7H9E234-+;6A:A92=".0'',H@..-G!)3!':7)-@)F%#076E;6)4!0+'B?:379.F?"-!/.B72;;=,!$'E0>.<36,C+A#H+?C>F#6?#?;0/<,4B"G@6&"),58!1848(E%)62D1)4/3'B*D.36CGC&-/-@=B//CD"/;"=:05 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96T65T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8191 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10518 42 71M = 10230 -359 AAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGNTGC D"B$H>D(E0@#,1!+12$/72-@.F7+)"="5?:<%8*">81:+"&=60>=@17.&-0",B?09"*39H* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8192 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27366 42 61M = 27139 -288 AAAGGTCTGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTN *CEA><@+%!)<#$4-.&7GC9"#?5->29C##(/)*'%<<'G1370$/415.D+#B@>+' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A53G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8192 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27139 42 64M = 27366 288 CTTTGGGATAACCCACTGNTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTA 2?+,E>/@=!0*2F0F<%)8EA/<1(2G>1AHBH4-2#HD,&,-*'A38##E!:'* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T13T45 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8193 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1614 42 199M = 1568 -245 ACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATNCGGTGCAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTGTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGA !A4(DF!1BH-%1&:7/25(=+@53;FG<0GH':D)5BD,*+%!7#564-,D"!!<4A$E2+%#H*0-$%.9;A;(E0D>H*-.90+'8'4@44-/F=1GE>#>&-E@#H+,1D!F8?H+79"H&;:0C4A'3?EA(8(F)01D8=.>H56">-5%.@@AD*E/.#6=*H$5)H:.0-0=3E.7%E4#$(!3=5GH"./ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C5A152G8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8193 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1568 42 44M = 1614 245 NCACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGATCT $$>>&H81&=0@5-F6@*4317(+@.D4@3/01,2;EC@99B@+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8194 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26773 42 379M = 26773 0 AGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTNTTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACC H!/FB7-(.5D/3#A248D1B?H!E#B7"!#@&0(;DB:5H?"723&'&!%F207@21?5<32F2-:1409=":)6D4/D4>H.'22)B$96;4-><@/#)+#:!4G:D8&=>:?'/5"BA>3)-,,!?FH?G'#D=;BF/@;+<49?91)*<4=@G*5'D!<$-%G""&<=&3<")04A'>9.7"A""8;(F+&<+<3%$"@:!$(,89!G0?67F6@H/+090'+&9.4<.2)>:6@!>D?B/#6>9,F/>D@27.)/')&=5$$D*)=3?//!(+*<51#+%H*/%F7CA#8+5,4937H=(,!4%<&5)')"EGFE"@:H$,HDB7.3<'"1FF6."!@#076- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:312A66 YT:Z:UP jpayne@0: r8194 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26773 0 * = 26773 0 TNNNNGNGTTACTANNNANNCATNNTGANCTTATAACGNTGNTATNANCNNNCTNNCNACCACCNNGAGGNAAANTG !#"!#$#$#$##!$!#"$"""$$!!#!$!!##$$$$$""$$!"$$#!"#$##$!#!$##!"####"""#"##!$!"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8195 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27261 42 73M = 27357 294 CAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTNGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCG H4/>+*&7>!HF)>.?A&F104;A@1'42$7..'-=#E+$36)),HA,,*#30A:)*.,@E'CF"*AD23E#> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8195 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27357 42 198M = 27261 -294 TTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTANTGGGTGGTACACAAAGCTTTGCACNGGATTGCGAGGCTTNGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGA G=FA%+#;6)-1F28(4#2/-:DGFD"9$DD@(++1*-,1$G@52*D1>1HB8F='))1$/B1$::24)87&%;H#@;-=B@+#F!A?07-)(?2452'."5'%D@D51'<3D70;5+%0-7==!#'<;AEB;$$1E!1)((F39?ECD;3C5;#G;H1?0B7%%C##/)#,.@G9-C7HA9:DADG/$(+#'(6&1? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:108G7C16T14T49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8196 77 * 0 0 * * 0 0 NAGTTGTTCCGTTGTGGGGAAAGTTATCNCTAGTCAGTGGCCTGGAGNGACGTTC "("+!"&%!$(&())!)'%$"'!*%'#!"&&(*'$#((+'*((!+$&+(()"*## YT:Z:UP jpayne@0: r8196 141 * 0 0 * * 0 0 ATTTTTGCTGCGGTAAGNCNCATAAAAACCATTCTTCNTAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCNTGCCGATCAGNC 5)?EHFD1D:FDA=B5B%@C-*D829E33D)ED9#?99?;-B#9)/*6$%-7=/%%,#/;&7&72);6(H='A-/3C>(=E6H%#>#05<#B6)$;@16(/1475@/&F$@G59H6 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G13A29T12A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28364 42 168M = 28302 -230 TGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTC D%3;9"5+3,0?H0?.9:C)*4A26>:?(B>3$2.0362;>:D;G?=>6'-7(48(1E4"E2.460/H6!5&GDH3A&*G!9H8:/C/9.%&D=$A;$,92>(GF8B?1A%D66B/$(A35;=>)(+4$C'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8198 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9744 42 136M = 9901 199 TGNGNGACCGTCACGCTNTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCG !%!(#$++))'!(+%#)*%&(#(!'+'+)&&%*+')'##(**)&"*)"$+"*+"($$(%!)'%!+*##)##"+#+''%+"!"&$')&"$)*&(%")$+)#&)'!"'")"%&)(#'%#'#")"*++$''+($&#+&$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1T1T12T118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8198 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9901 42 42M = 9744 -199 TGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGA /F&>%#8E++<$;!/655@H3(0D,H$-7& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8199 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18218 42 43M = 18478 330 TTGACCCGGCAAACGGGAATGAAANGCCGATGTTTGTGGCGCA G*E&H8;948G42/<8DB$3&:)<$=5BD1=;H!*;(G8)(:; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8199 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18478 42 70M = 18218 -330 AAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACN )$'*(+")$%"+#)+$!*'#))#&)((%(*"+()&)&''&%%%&&(%$**%%$"+'+#)%$#'+%&($&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23421 42 73M = 23581 210 NAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGAT )F8/$'/D?0@BB(CB*&5-+,3/?$!,G,56>F--; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T72 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23581 42 16M1I34M = 23421 -210 TCAATGTCNTTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTC ?B9?%BD=890+@B(&=G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:8A41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8201 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37583 42 40M = 37823 283 TAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAA F9>(D2DG@,4#H5('-6%=,D/9CC1&96@<1-@7H'H/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8201 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37823 42 43M = 37583 -283 TGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTT 4,/35:)A3(*>'=C""3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8202 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16593 42 76M = 16442 -227 ACCGTCGGATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGC A@204E$D%)@55*'!10(*!/3#+F*CGF:0?G6H4/E>$>?6-HG->74@./993,46$!A7BE?$.''?=8"C;5CFA;677GC.D.1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2831 42 115M = 2696 -250 TATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTC 6?AB<$G#$FD<@G-=9$#5'B@2"C'+7'!%.;*C7<<4".CF/"E-#>/-2+=#,0#+20$:;#G/!+?9BC<+D:6$4&D7"?3CC2>/A3@1A9F0./9HD:D!G%.B@?/E?D,#+$6;/,9)4#).,A@;EGA AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G5A17A35A7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5379 40 59M = 5554 247 CTGCTTCGCAGGCTGACGTTGCTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGC <6.A*5=2>44&BF0%;6@=9%/"H6"<*HC AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A38 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8205 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33943 42 253M = 34196 359 TGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGNCATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATNTATGCCAAAAATAAAGGCNACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTACCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAAGAAACATTTCT >1G00"C42=&-G=5G#)A0.B&F;?7C""3C00/9@>B=#>B7>$-?/6'@0=*+0/-?,&.B%'3;=671'$.CD#D97C&15(%71>=(@0*<&0HE3=76?:!'9;86#87,%D5A)<8=-&%>#!/-+440DH7*.GH83/A6=,*:3HG9#.6DG5'++C@#EA#E3!@E04CE=$=;$A%FC6>F5>(#<3;'D)4GAB1757"3B6GAA@C+"2+!1%:,<1C<)>E/&;F9G?0-B!%*7;B'#GH&4,9:)+A,68H*HDG,'#E.!B7#;/.>D1%20"7.2"4%'4BH*=D5&>",25/)<8'?@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8206 77 * 0 0 * * 0 0 NTNCGGGCTCACCATCCGGAACTGTTTCCGGAAAAGCCGCGACCAACTGGT !'!+$'*%$#(*($$#"#&!!*+%(&%%*($&++)'%%"')%$)(*#"(&' YT:Z:UP jpayne@0: r8206 141 * 0 0 * * 0 0 GCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGNGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCNTGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGAT ('/')#'HCD,;03.2(8.''!<21-(6#*2$@1:,(G=*#456.+F89D=?:!A2-+3"(C.7;1"H8)H:!'4G9,2"#8-/=$<$A;=,#*E:2$D;G=D)6&*3=?5$;7C;#G#:F$H?03(*%>+HH"1H9/<0A5-?78E'0&B;?$-4FEC(2%/*'%34%%(FA:'C(CH<0F3H7/#G6B5+3F7/.,C5<2:14.'5!(1<)*2>;*A,9FD%*5)-!+:%,29,*%6$=0'%:E9&>%DD18,4H8A!>C/B=)#7(6%4G/>&9H?8>G1.E**5.%*3?HH/GAG*DA(?=/;1;;;:=?<75*B(B:->*76)9?::(>:1AA(+/F;"G/16+"=EG2(&6(1"@6D#D3>716?.##?< YT:Z:UP jpayne@0: r8207 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3462 42 65M = 3134 -393 CGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATCGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGNCNCG *+!$&!%(##""*!"%+$(#%*%*"+"%'%"$$&'(%!%(#+##'&&&(&%!(#$(*++'%&$'% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35G24G1G2 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8207 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3134 42 328M = 3462 393 GGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGAAGACTGCTGCTGCATTNACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACANTACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGA =C%,./',4&4:8?+$E1:./<3@>7=8-GFH%B%3;0*6+/.!B:-<6GA2+>F??;*?1:=A6%%A>HF>2G*,@8%>E#G5B490,8&,9!,"#@:9$@19#+)E,@@6C3?-?"@G8E3E&&+(86<(H(.$HB$($=<58:6:G3)%(3G-?G7"($E6B!('.%C<8&0F)5,F)8%;*BCH/A8=224H664E-2'-$-3;*59HEA19-:%)+C?36)14@:#H<56HF)#/0+&3;2%C(A$,;.$2.$G11-?&@.7,-77+5BB195/4%0(&=$H'+F/E,*E>E1$:E0%D@!=#'H1C#B AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T15G136C28A81 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8208 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8817 42 81M = 8616 -282 TGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGG *8B?D)57#.H"$0/='<7'+;.''D7<$%<4?*0-A,?3*7%3!.B=3?=)38F3"5<&915=)$)AE'@C7,CBGE1'3.6A5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8209 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19268 42 98M = 19488 263 CGTTATGTGAGCNTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGNCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAG :D$>$33'-B(1+5##00%0F/&/0+D2GC*E+;"E9"HG(9#&F2F;E"(8+<-*2H(B($"7;4)@92(!05(&51="E"*:7."!E@6/.<#$?8 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G53G31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8210 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29803 42 138M = 29941 198 GAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATANGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCNACCCCGTAATAGCGA H>5<)C:17,0)0+&A3/D#$D2:DG/5E3(>,E3FH4H#E?2:ED)>E04/B7++;+<9%@/B5!F?@C"2/.',9)93%#1H;83&-44/:*(F<->2E'-@#@99#,,+&?G&H=#EDC6+#7(%$7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:84T3G33A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8210 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29941 42 60M = 29803 -198 TGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCT C$+<+<6-CB-#.,>5!-"#A-6;::B0"H?@&:.8?).13*B)2.>A?2"5?0>9=95D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8211 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26423 42 56M = 26231 -248 GAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTT ;,*.:,3B&*.64A#FBE!>'2.9D#E+3'<57")B/HH+F&A*-9#"'%-G(;C3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8211 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26231 42 50M = 26423 248 NCGNTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGANAATATCCCTTTGGGATTCT **)'"'(+"$'!$*&%!$&++)$(%"+&""*)"*'&*&#&'#*("$+)() AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G1A0C26A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8212 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42560 42 241M = 42801 308 AGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCANCAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGANTTACCATGTATCTCGCGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCA 6.7D?-HB0'97@C8)6G':=(6%65D??4)G-(BE&D#D>EG##003;G/66*$6+;5?FB(1!56?>:+$E--6,1$!9B1.%0'"<%D"?.:86&"+@(A'")G31#3*,8ECBA183.67:2('>3@D!8?*4@"A';":28!<#<''$,<:$H#4$,:CB'#)2!A#H8&=C4&#;F;+D/D#*4#7&62+C9A?D3&(A-.@D!310?B(E4%G.2*+79:8A=4?B/<)8) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:126A38C15T59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8212 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42801 42 67M = 42560 -308 CCTCAACTCAGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCG A-98:F4?@>=8<%;HF-1E!)4)G')FE@5F3-G%9F,>0)F'>>E#4BCC3A6-)>D4>775>GF AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C57 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8213 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5587 42 100M = 5411 -276 NGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCA ?#4*6F;::1$#)E!,5.C-&38!&@4<2F71C/$(;F$*@F"B$0"--!92AA90?-<1)&8D52%*'<;=4"8.=F/'5(!AB72=><#9>F+'-$*C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G99 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8213 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5411 42 176M = 5587 276 CCAGCGACGGANGGCTAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTCCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGANCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCNGGCAGAAACCCCCGGTATNACCGCGAAAAC (:@0:>D>C:57&E#!4%2+"<96%<.C(B,94C7F8=E2;6;/%2#+F5+GH6D;1HG<-!64:5!D-;G;+H:05?>>"106005=#E;F86)$<&@!<.-0"< AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:11G3G53G1G25T7T39T18G4T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8214 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45863 42 21M2I68M4D58M = 46014 279 GGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCNAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAGCGGTCAGATTGATGTATGANCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATC CGE.3)5DC,5!3-<19.9>F41CE%1$F9G,=%<$6-BH"E!8@.(+FH4?FE>>15123*7,5$1/:G&.'H#995.4/00E:F9;-7?E%3E3++//%7-8="*H;(/$6>(2AD>!E3$7+$*%::?$-4;/D4/9*6891<&4+31CA1!#.1!@7>,.F7D8F4<@+;8#B%E?!-A20A@G=;1+B>:,-;"!6DG57FC=:.+@<(=('8G!9:$.2F*=/&?8E'#=277B8H60/"A:4D!@D%9)+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12G15G47G67A8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8218 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8038 42 148M = 7885 -301 TGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCNTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAGANACCGGA *+*+"#)'(")%$$+*(&&'#)%+"#%$#+)#+(+*+"$"$&!%%$$"#)'!(#)''%')*(+!#%*%#*")#!(++))'&$$'$(!&$**+)#+$+$)$)%*#%%)#*&)*"*!('&)+"%)""$"$%'$*'''%+'(%$&$&$)%* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:37T101A1A0T3C1 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8219 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32759 42 125M = 32759 0 TGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCACCCATGTACCGGATGTNTTCTG .7!-/#&#,2<-88=G>!ACC>H4?B12;.<;6=F+&5@1E';.'@6HB:2FG6)A81,@=H66%@84#$$<>(0-3.EE<2$.+GF#6H7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:103A15G5 YT:Z:UP jpayne@0: r8219 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32759 0 * = 32759 0 NNNTGGNNANNANCAGANANGCGNNGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTG ('#&($("'%('$'$&#""&*$)+")&"""&&*"&)$$$!%"+#%#*%'*'$%"'!#!!+#%)+$$#$&"+%)!&#+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8220 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18893 42 112M = 19097 282 GCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGACGCAC 58+,G<9(F62"92+55@2=$?1%CA+C=":A),.,E/<3B10@08%.2"C$3/%+?=A77H;A@5!D40')'-D2B5)D:6=C/1!C># AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8221 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21731 42 240M = 21971 479 TATTTATCGCAAACGGACAGTCAGGGCAGCCATAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGNA +#GB#"'$-2)B=6@?BG2/9;&D>&&10'!H3%/B250!&-6;;>$%3"G1AHB-/$06E@3A<-?AA&H#B:G;1D,==FEH86+&/;?3#-16'CFB=4@2(-#1@&:".#E2.#CD-C)H(A53G944,E0!"CA,:%=&*GB$"'?',-37?3='%D05>AB@4>0,0H4.(8.%0?*4-5:*&9?'?!?!20D0>DE-?.>?9@H&D2E(%D39#0*E71=&9.::B6?;HA3;+"A)4:!5H':0&ABF(-$$D.'"DDC01%F%;$(-;C+G=8&0H;!;G%F"=!<<57:2(9%BD@%8$7/?'!"*(F<4B/A"?0:"&1743"$/::**4- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A61 YT:Z:UP jpayne@0: r8223 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27303 0 * = 27303 0 ANTNNATTGTNNNNTNCCATATTTAGCTTTCTGNTTCCTTTTG (*'$!)%)$!$#(")(+#'$(!+%!&*%)(%'*""#$+"*)*! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8224 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35471 42 73M = 35342 -202 ATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTNCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTACTNTTTA $&%&(*!&*(%&(#&"('(%+(%'""%)""&*(!#!**#""*'""#%%(*'&$#'%%!(!%)$&+'))%&#$& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G29A1T4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8224 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35342 42 52M = 35471 202 GGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGT '#*+"#!%++'!&""")$&$)!%*#(+'"&$('!$+!#%%+")$#%+(!##) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8225 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16837 24 21M8D96M = 16692 -270 CACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGANCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTA $*"4C7.F&F0+A"F$/4/+44B$D0B(;5E2$.H::,)FG>D:".3A;,*8EF!8BC:F%0<9=!#(5;%0'2@G;C5)1?61'-245DFB-$7(4?==$)8%7;.<0F!&71C2)'#5,"A('2+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T19G3 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r8226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7911 42 41M = 7777 -175 TTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTA /,C+2<7<"@+$&3F.:HGC('73F046"95/#,5%DG0C# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7777 42 101M = 7911 175 GTGCGCGTTGNAGGCTCCAGCCTGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTG :)=0%)@-=.=?2%<$,6&7?6G?6?(;0@!935C$9=%$<2H$"(0$(B#B-;+;B27*7D"F#>?)!.65B7'@FD0D!,3D@%13"D;%;;47"E/G6 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A11C78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8227 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17955 42 73M = 17806 -222 TNTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAAC A-*6%1@!E/7G!7$54,4*=$"#':708#-E5!%HDF%3E9'E4G*03@H49E$GC"->+$-D6A?;??;%8#C:1%",1%"20&)D'0-,@D6F8<8D?A8B:$'@@!GD&42G("4G!;6.$79)941/%C.8>?>@>0B26%.*8&-!0"6<9=,7$)EF;"5G.51@1+=1G2D-5!"":29D'==?.CO"7(A.8>#,A19G;3)F2?4E;9F54%%+"//(6*"73,E8;8BH!62%&;2(9A-*6"$;80A:1GH26$'+,>CFB66#:DG=-1+EB?EEC!B6EG5:EEB5,9=?#915D4&%)6C*)31!EGF@D# AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:66C0A73G21C78C44T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8229 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6694 42 63M = 6757 358 ACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGT A??08<;;*0E>/1@E+!2?"=,8--#HC$2#!E7A-BBB,9%:,#DD)(0)@<)(#"/7@?+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8230 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47421 42 80M = 47650 303 AATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCNATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGT 6)*.FE=)2?B:EC4./&)334(;3*14;E45%9%EE&*C/9BGA*6*#@,1$B1<*%,0G(7)7D>G8D.96@9H#2C+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8230 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47650 42 74M = 47421 -303 TAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATNAAGAGCAAGCG &*4=1!8(0E2<)F9A.,"=&2.11''+)+5,B%G@B29.5(9C0$,-0"B7$)G#%?0//!B&*7'!56H')C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62G11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8231 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33783 42 78M = 33634 -227 GAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGAT <')%H+A('G./&4$1#%2C==.$$B&!:4:->#HH,(8!2+!?=#3'0*03%*);&:'D.A/C(0=G7;44=@C?#2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8231 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33634 42 148M = 33783 227 ATTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTC '9##GD#9#'B&+!6=!8,0:H99GD&%A*?7G*,G>H!C(.8$+0-<8"/4=4@7B=BD&7?-%D7'*180#');2,C)40G.%7+*&7=/93=@D0">*9(GGA.&?8E.8,/G(0;*#;A$;$+A8+6B*H%-3)2/0BD#-5%D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C147 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13996 42 49M = 13755 -290 GCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATANCACGAAGGATAAATGCA %?*>(3*8D&9A8EH%47!03*-;2G!7)E"7-4&,) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13755 42 199M = 13996 290 CGCCCGTTTTCTGGCTGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGNGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACNCCTGCACCTGG .8*%4G9F,A(7BD8<2"?*#2B:C*E%@(&;'@,.,'A;?2%(B33E!.H9B%/.$8:GB;6)50+/G<):BD2GHC*9"EF1@(5(6:<-2EC@!+.%"(54&.#26;$.!B166+<,%A0&3C$'&@'%?<:@G"1$CF7H(2"$GEGH1C0FC+F5G:A8##0@'>&?6) AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A41A130A11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8233 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32572 42 162M = 32532 -202 NCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGAGGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATC ,G3>"5-=F4",=8@G78(+4AA4-'?+&=%0-.8#.D!5%H.6((6.6'2,1*+''=1.&F>9!1=46F)-G8)@>H#,?76-C?*%81699-?":C8/(G(64BD8#F$$$73&%70<3?5$?!<39)"D#%!&H'?+4#=-#$"B8HB>CG2=H@E7HA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T105T55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8233 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32532 42 40M = 32572 202 ATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCAGGACCAGCCA @!4A&.*2*(+6>A*F'"9)G,AD:5=*%36E-'2F/01$/E!CF#=1>BE/-+E!'$7-7C!4@5&>$A@!'9B955C"4+?668) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G44C48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8235 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3932 42 44M = 3718 -258 TGGGTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGNATTACGCCCAGATG 21>92:+&EB<;)98#>A(?1F#G&2;/AH/$;E:F',C@FA22 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8235 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3718 42 41M = 3932 258 ATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGAC 457+6&E4?C$8HAGF:7+??2@A;'"(;$&5*,(>)*D3&0!6$87%855#+=G>D-0F)",@<6+&C-5#3'G*F#&?.9AG#!94%5088/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r8236 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40105 40 162M = 39983 -284 TTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATANGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCNATCCCTGAACCAGTAAAACAACATCCTGTCATGGGCGGTANACCTCTAAATCGTGCANANTCGCNGGNGANGATCGCAGAAANNNANGCTNAGNTCGNACTCN &)##'#!'"$)$!%"&$*"'&)!&*!'"%&'&""'%&$'"++(&)#("##(&%#&)%)$(!#)')$())+%#+*$)!!)*'*%"**#'#$#%'*&$**!$$''&)()#&"#"%$#("+$"%&%)'*#)&&*(&*#$*#%*&*#$)$**)$)%$#$#(%&*"! AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:27 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:27 MD:Z:0G0C0C0G0T0A0A23T27G22T17G16C1G0G1T1T2C2A11T0C0A1A3A2T3G3G0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8237 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4378 42 76M = 4454 397 TTTGAATCCGGGCTGCGACAAGCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCC A0!&#.2>3-6+3;)%%%:&!8CF9$&&5+!/;H403(>4<;=0*3343=E3G40G!2A0A@;" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T54 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8237 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4454 42 321M = 4378 -397 AGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGNCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGNCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGNAAGGCCCGCAGTAATCAGNTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGC %!)%)*$+$"$&%"'$#*)+#&+"#()#$*#($&%"#'%'*#*(*&*#+!"$#&"#&&#$'&'$%$%"+)$"*#%+#&"%"$'"!&""#"'+)#"$$%!%(%!#'&)$'%*))$&%)%*$'*)$'#"+"!)&(&$&)+!'''*++)**$!%!(&&&&)($())"'!'(#'!$"'#'("()#"+%+"&#!#+*#*%''*$*!#!))%$"&"+%(%""'%(%"#'"#'"##$"*")%"%%&)*'*%+#'!%)"++%&+'+#&#)%))"'$*!"$+'$)+*"%"'!#%'"!#+($#'$)#()"($+!)!&"&%"&'(#+++$*+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:37C94G43A0C11T5G125 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8238 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4598 42 63M = 4472 -189 CTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCNCGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGC )B'7,!+$(ABF0C?*E63,)*&(!@"4D@0-B<::,,DG6F2")#G>H"372:H13#>F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29A33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8238 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4472 42 89M = 4598 189 CCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGACGCGGTGTC <$=*E*6GG.B/*>'8FF.:*@&:>?9=0??1F61@!#;5C1$:1C''=)0/3%?'(-??(&!E+9==E@"4$8<23)C9.&41-?")' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8239 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5749 42 154M = 5540 -363 GACGAGCAAAGAAACCTTTACCCAGTACNAGCCGCAGGGCAACANTGACCCAGCTCATACCGCNACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGC !-*A;'.'8)$659:290?42G&"@.4+=D0CDC,%+**9(5$=?"!9G,7'FD':H,C8>DE$'DHB6/?HD;75D+%'5#$4B#'/#.>2G-&0-.6FDGAC""6$'B(),"-:B;)#>,H"?D:::'6DB&,H"C6@/$-'2C:4-(-2A5 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:24T3C15G6G11A90 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8239 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5540 42 209M = 5749 363 GAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGNACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGATGCAGGTAACCCGGCATCTGATGACCTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTAT ;22F#*@<"C-?=@(,7$5(/#)'%$)%)8=$66A,7E%26;C(AB48"/5-$&>&&-95@49%3?$5!*#06."%04&3D%)F93!0D;?E8&30@+%CC:@/*+"?2$@*59C3F&2*3>%56$=6%H$4-&G7>'?%';H'/!?8(%>>6>A+&7%@0=D43-"D"<$!1.;@@0&$'H?0@+$@9<$-.=C;18!DB/8E AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:82C59C23C1G40 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8240 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 140 42 319M = 24 -435 CTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCNTTCTCTGTTTTTGTCNGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTNGCTGACATTTTCGGTGCGCGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGATGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCATCCAGGAGCTATTGAGTACGAANGCCATCGACTNA H=02$ED2A1>>)3?..(?3;9A=4<)"C">35!(11F@H1$'+D4*>)?5A2.-!6'G.+70,%%2*65"!(('GA?*)G74A32H@>1=D+;D%=(18:?'*&-%9>H:G"!H7+=,H@049@7,B">@>AE'D92+2!<)6$;@3&/"0>D>.@(BH*68FCC&>>E'!8#/&*(A1=A"'%0"9E<)312"%D.7E,=%6'/*:D@?FF(5H4'$(7;A;F4'1*.$$;?%?"<1:,&CE.H0F2?1&A/)*=(.!#C@&&%:E$0=H6;;+4%(H+B(:G.<2.$5:45C*-7!24F=:3/!.B1A2D+G5:#% AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:22T15C35G18A50G118G20G6A14C10T1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8240 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24 42 116M = 140 435 GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCNTAACTTNATGTTTTTATTTTAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGNGAGG -6/;H3;$,0-!4A&8;3$0*(5H3'A,0+01GA@B70&!H.H?+/5(-A./="23?2#-7:-=1:9*6)19?EH3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:49A6A12A41C4 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8241 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43159 42 228M = 43159 0 AGACGGGAAAATGCACGNCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTG 9$767C"A,=F&D.FA('BC(!C>"3.(:28>0C<7$6G$B&F4(6%,+;17#%))>E8,:$8A#"<;B-*AGE<;6.24$FC2)?8==D,&;E5@654@>:-29"C+(')3"&B7D!&04-:@61B(%F'&/75!4?9'-0A"38B<02.A2+$#*,)!"4;$;2,0EED:2"-F<1/*$DHE6>.C=!@)G>8'.9/75750$?BAE;">-FB;(593*/*"4;;1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C129T80 YT:Z:UP jpayne@0: r8241 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43159 0 * = 43159 0 GCNTNCNNCCGNNNNNNNGNGANGNNNNNANANNGNGNANNCCCTNGCNGNGATNNTNNNCTN "!!$"$""#!$"#"!!"!"$$#!"!""$!$$"$$$#$!#"!!$#"$!""##!$$!$$"#!$$" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8242 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19375 42 95M = 19189 -281 TTACCGTAAGACGGAAATCACTGCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCNGTGGCGTGGAGTT 0@"+>AC>+G1.*.5!"")B@3G-)?.,!1!71>)E1>829-GA>D3H?+'B"5/;+"13#5,%=3'1EC--=-5A)7DG9D%2C<)3:=7*8E% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22C58A12G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8242 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19189 42 186M = 19375 281 CCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGGGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGNGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCACGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGA D8<3+$B6&+5G';.5+$".@,.F1*18DE7#;?,"-=%<)BDH9G800C+"53F$C.'8/$8-"-=)%F,8>0$==G$G,D#C8!$6H*;;24B47*<-,62/@<750;B:G%HE:%%GF0=')";%!D7@76EDE. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C0T11A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8244 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32941 42 107M = 33048 254 TGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCG 3+D;$,&"$5G,!&-4(9-*&5'1H(2C=EC)C?A#HF35-E?#D?.".'&5&7::/3;6=AE,4/3C6A0@9634:(@"%9$@>$;?#45*-!8("?;&,6=!/G' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8244 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33048 42 147M = 32941 -254 AGCTGCTGGTAGTGACGCGCCCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGANTANGNAAACAGGTNAANNNGTTNGTNNA +*!"&&)*%(+)$"!"#%&($%$%*+#$&")(&!'*"!'&%()*!+*$%)$&'+)+"(!+(!'$&*&))#(%*+("(*''+)%#)+#&*+&!'#&*%!#$(*'!$"+&!"+&!&%$++%*'%&%('('%'""''%!!!%*'!'#"!% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:118T2G1A7A0A1G0G0G0G3A2G0A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4688 42 51M = 4390 -349 CTCGTCNGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTAN 926&'),7<+E=F;$6(39@"'C4C#7*:C#F>64,#7";#*"47#)*!?" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G3A43C0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4390 42 298M = 4688 349 NTGCTANAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCNCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCNGCCTTACGGATGCGGTNTCCGGCGACAGCCTNACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGNCCGACCACGACNGGCCCGCAGTTATCAGGTCATTAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTNTCCGGCACG )$')'(#+$%#&#%+!$!'+$"'+)&&))#+*"'$"&(+'+*(#$%)(''#$'$&"(+&)!!(**$+(*(('&#+&*")%!)&)%$*(!+'%$)$#"'$)&""(#)&#$*#*)%*$+*(#+'%'(*+#(%#+*&''##$%&'(%)"(&'"!&++(")(*!(*#&&)")&&)%)('$#+%"($%'$+$#&++*#'%&(')*+%)%'+"$!+&!(%)$+)"**(*"$%("(%**$!'&"%!'+'(#*((&&$!+'%%"!)'#'&%+&%!"!*"(&($&)##&("##!'"%!$%!"!#!&& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0C3G1C43T100A4G11G14G46A1G9A21G23G9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42422 42 118M = 42236 -304 GAAGTAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCNGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTNTGGAACCAANNTN $!'"%%)*"+'#'+%'('*"&%%(&(&#!!"#+&++&!%*"*#((#")%!#*#*#&%"%($))'*$"'+!$%%%$%!$!%&&&(($*)%+*#&##)#)!()$&%)($!%()&#+)"*! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4A12A65A20G9G0A1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8246 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42236 42 72M = 42422 304 CCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTC B18>+%038&@D8+?!G,B.2H#AG:&F#?',.HH0G38/A"=;>;#:%4<;:/+@(/-5!$+BE(7'%50/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8247 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28133 42 71M = 28024 -180 AGCNTCAATATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTTTTACGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATC $*+*%:>8DCB90@$D.7<(-01/%G,4=85H:H4("?$<7&/#!5#&FD7C6E9H,'G%(4E4=1@H>9? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A67 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8247 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28024 42 99M = 28133 180 TTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATGAAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTATTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTG <5,9E@#,6(:"!@)(2$GF43AA+F)C)/D4+*DHH.+7CD>$3=)#*,0D@+7,H%:B0B1$3A;G1H6DD7"5E;?@:?).0>H&,,B832D6"A" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42C26C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28057 42 69M = 28167 230 GAGTAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATTTATCAAGTGTTTCCTTCATTGATA G3.>G7!-+.@'HH2?B0$C=5?&*:'=4G6?-F=?!A397$2%)-<%//9A<."/G'3>,='7$5>4?6<5-4-=DA$+C)C8/4*A9HH+CD%0G"''5C)3&"C8,854G%D-.C;!$9<.HG%G;+;.%7.0C2:;3.@9E>;5>+)#4< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G26 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r8249 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12777 24 38M4D57M = 12657 -219 GAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGNTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGACTGGCGTGGGGAATCTTTACNGGCTGATGCCCGGCTGC #%!*"+#%++!'$*''+&$*(&#*+"&&!+)&&"'&!')*&+')"(&'!#"")&+#!*())#$!')("&('%'&)&"&%)""'%'%(&$*#&$%+ AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:18C11T7^CACG19T19C9G5A0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8250 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29152 42 156M = 29074 -234 CGAATATTGGTTACGTCTGCATGTNCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTNGAAAGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACGNAG )&%(!*'&#$$%"+*!&*)$$$%(#+)$#(!%%%(!!*''!!+('"%!!!(%+!$+)('#(*'$"%+(()%%)"+(+('(#'(&"#")("#"(*$%"!!"''(#+(&$')&"%*&#%!)"*!$($()+)$+!$&$)$!(###""!*)$"%"++### AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:24G66T3T56A0A1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8250 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29074 42 78M = 29152 234 NACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATT +&*+$*%*&)$&'"#'!&*$%&$'"$$$%$'"&'''"$&++!)$#"++$$$$%!"*"$!+$"#&$$$("'%*#!)+"+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T77 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8251 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21861 42 78M = 22012 218 CCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGNTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAA 2=9D02E2722B'C21-/3;B?F@:F0F?4E!7)D?@1<+%5=D$>#E'#1'!#H#;*">*H5!*56<)E475*A@0A1!#$E67G7)A?*@;D4H&8!<93,CC"E2GB34=#G%@8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8252 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6389 42 35M2I36M = 6305 -155 TCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCN +D5#/GA08,C;6#!%;7:$C0#AD2030B8HAF""%+0H:$$;,H!C!E/'33>/4H;(<%49)9:@,,4D$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:70C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8252 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6305 42 78M = 6389 155 TGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGA :E>F;'3A%4C084/;A%986GB$%""G->9=;EHFF#'73@C35E)<>6.;*@+6>;($&8"!)DC:C6D"2$/%&A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8253 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23499 42 98M1I46M = 23643 250 TAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCATGTCTAACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTAGCTATACATTTC ;'3,>@G8<=>E*98(;HF@3-!<5%1/CF--'B'F5-180)!3E1H)!7B%;F(96!610B-0;!G!G@2'$'2FE!)165::#4AGG52A9;@+EG/$G(97A:(+=%F3DD!$AF0?5'.%+=H8(9.5=A$4$?5#D)?%C AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:28A4G97C12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8253 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23643 42 106M = 23499 -250 TAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGNGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATAT .DE#<<.9=&=8.64,0&8.982/*!4'&3E').4#"CBFG!4:!<,0===%8/D8@AE#5.6F4F<2B-?;!9#:!7=(7$H9)BC,F98;:*,>D2#$$/&%01 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C77 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8254 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 42 112M = 7916 0 NNCTNTGACTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGC #"(&!''+()+"('$%')&(!#("%"%"$("'!)*%!+%#*##'%(!!*(!+(&"+%)#(")&&(+%!%!"(#!$'"%+&!!'%$+)&#+*(%!$%&&+%"'"%')"'&))+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0T2C2G104 YT:Z:UP jpayne@0: r8254 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7916 0 * = 7916 0 CGNNGCGACTTTTTTCNNCNGGCNNNTNGNNNGNCTACANNCNANGNNACNNNTCNCNGNNNNNCNNTCANTANAGC #$!"""$"$"$$"$"##"!!$##$#$!#!#$##"#"$$#!!#"$#"$!#""!!#!$"$!!"!"!#!#$$##$#$"!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8255 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16858 40 112M = 17042 245 TGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGNGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTATGCCGGTA 178$:%?126>3&%%(-D;=<;>3AC'>#'/'%)--7#/")?2D2++-(>6/&-CBD+7')3)G4821,,=+&&D<0=7=)+BA'3<-3!)H';;9A:;E2<( AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0T1A0A0A0A0C66C37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8255 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17042 40 61M = 16858 -245 TACCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGT 1,6?351;@/##CE7387&C'--6;28H)!H70<0?(%":7%")'CG@'.+D(*A8H%##- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G59 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8256 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 768 42 53M2I40M = 861 204 GGATCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGC !($-2?@/>#7D84287;%;;&?2:G";"$FA"?D6EHD4,>B"6359&F..7'2+AC;*@;60,(%!DC-@F9+CFH*#DF>!"<..62H>5%. AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:0C1C90 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8256 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 861 42 111M = 768 -204 TGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTNAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTC 91>&41$19E3D31$='<"F-8AAF;=4,&?& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74G35G0 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8257 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5215 42 79M = 4795 -499 TGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTC 2=F2"8*-+"5CB29F;F<1,6A1*4B.5(570,@81 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4795 42 420M = 5215 499 TCTGCTCGATATGGACACGCCCGNCGGGATGGTGCCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTTTGGNCGCTTGCCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCNCTGGAGANNCAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTANAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATNTACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGC *#'+/,'F.@)E50<@;0=#0@,?7)$*>?0G6/!"F.&&3AAE:+#&HBA(0B)("C2!A<=D3%A=7A?';7$*%&2G/*"+CDE$:/8B0.1,*>:@0:228!*EE7-?>F=.373="8E,)A+?8*7<)+<2@*D1CF,&'7=;*?.A9E:D>FDF7EF40>4/1C<336922&#=$2*EG@'7%84C;'92#H%'!GBH9(1$=:?:(4(-GA6%"32-0H(*;@%>74)<*0-%/0?%*<17A=4#GG(;0**G6;C:-DF=>E2))=+A%F94GC:++4)4DB3A!#7=F6"A)<.,+'4C19?<"2=#.6'.?-&#/A3/.%>2">$(D0(6-%C19(!>82D@(>66HF%<4";"A<0.83G@A?$#9DF?75=5.+(A50$$7C?<%,)<;.E9?,3/./ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:23G10G55A3G87G42G7A0A59C85A39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8258 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4820 42 162M = 5038 307 GGGTTGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTNTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACTACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGANAGACTCC #"&"+'$&$#&$%%$+++"(""!#*!+&")#&*&((+&$'!'#(#$$'"+&!'$(''$&'#+'%++!!)*"&)%*"&+%"+')&!%)!#+#&%%*%*)%$*'"%'!)(')+)#*#"*$+'"%%%+!%)*$)##&!((!'#%*$)&'!"$+"$#()!)"$)$+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3A41G35G72C2G4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8258 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5038 42 89M = 4820 -307 GGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGCANANACTNNAGT (#(&#&%!%(%+$)%%%!)%&"'+'+$"*!"&"'#%)$&)'*%*'")%')%#&%)#"%)'*&'"*&&%('')")'+"$"*!)&$#")') AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:76G1G1C3G0C3 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8259 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28547 42 47M = 28378 -216 AGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGA )9%((=18)C'=E+)B!&?#88D)'=&#+'5F8?.43,77?'6?:(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8259 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28378 42 169M = 28547 216 TAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGTCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATC !*GD25*3B;H7#B!;$9-B+9B:<-1;*EG"%D)+F+AE,D!F7%38B@C--0*;)61:"0(9-&9"?9#-17(>G2B2D"+F!$3++G,C4%701+@5G*E,%'?)-H:<)B(7,"@1& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G128C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8260 77 * 0 0 * * 0 0 TACNNGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACNGCTACTCCGTGTTTGA $%##(+("#*)'&&)&)$""!#*#+#%$#%#(+!$#$#*'#'&!&)' YT:Z:UP jpayne@0: r8260 141 * 0 0 * * 0 0 TCTTCCAGCCAGCACAGAAACATCTGGCTCGCCTGAAGGGATGCGACGAATTTTCGCCGCCCCATGAAGTACGCCAACGACTCGTTCGCACTGGCCCGTGCCGTGGAGTAGCTCATCTGGGCGTAATTCCGGGAAAGCTGCTCATACGAGACACCCAGCCCGGCAGCGATATACCGCAGCAGTGACTGC 6$>'*<2AE)3)"?*C>F&0+,02C+'>?1-9=/#0*@(>,G494<.*.:?B@84)B>:5:F2<=>/#:2;6$:47)H8A<3>&=2G17CG>A@>+)9%G$@G*>:;<82"9&61.1-*.3D/7GA-">3+'.;4*A,E8(5%@=-FG73GE64.-*"+HH$>6:$<(%:3EG.@2>==;F6!H4@/F< YT:Z:UP jpayne@0: r8261 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48135 42 57M = 48349 283 TATATGCTTTCTTTTCTGCCGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTG ED,77FH:DG%)#F(A3-?DC-$&27!BA:ED/A>E#.E;039B=";,=!D1%:+$0,$,3-39?)(.56&:4%:D;4)B<.,0"6H"'33$+%/C($F)64264?#7BH!5E&&*$9&6#<:--%(.?4A#HG1?@B%1#A+)D=*,=.%-E391,7"$;3; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T174 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33947 42 68M = 34145 241 GGGNAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGT +(*''+"+"(((%$$'!%*%&"'($#&&*!!+$(#"*+!$%$"#+%(!*((%&*$(!('$"%#'+'%% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34145 42 43M = 33947 -241 ATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAA $'#"()!"+#)#(+&%*+("!$$*&(#$#+()%''#()+**$+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8264 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47653 42 82M = 47949 376 GGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGAC ()/H=7:/B(?(3@-*E/GA/3C6><*'8%B0>;9H1C&"0E:=1<8;5(.%. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8264 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47949 42 80M = 47653 -376 CATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAAC A>C>@B*?1)<*4HG!8:2%A#6';3!=@&9*42+6B=-<51$4%H<&%(B$8$.C"BDE&2B!%?-34/-4&7%-0@'. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8265 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28539 42 138M = 28677 213 NGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTTACGGAATTATCACTG "+(+)#$")")++#*"$"%"%(&*)(#'*()$+#*"$&)(""(())%)$!)$++#"*#'%#!+'***%'%*+$$)'!#(!!&$#(("($+*****())%&#(*%((%$)+!%+&%'**"+"$"***'!()!""$!(&& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G121A15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8265 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28677 42 75M = 28539 -213 TTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTTGCCTGTATAGCTTCAGTGATT @%'B.!,F39H<405("$@5&)0'=3<:A#C#1#9/C3:.>$.B2$8,52<$77H!9'$@*8?D0D:&@>$>H@5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8266 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40119 42 111M = 40032 -198 GATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGNATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTG 4-#45?-9G4C35'(2.?%8.(/6B&/;@(<4E%0(=7"'*>?C8)1943("#(%B&-3B/"D;1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8266 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40032 42 46M = 40119 198 AACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGTGGG 2BE42!G#452A%+.4D::@5!+>3-)69=6?6(;E'$+0H=-:/% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8267 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4854 42 59M = 4913 355 NCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACATGAACTGC *0!?4'D0BF!7#0G>&"1:0G6+9&<3B>"F0E/*=4"!8$2@;B8,.,<;3&=;-8. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T58 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8267 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4913 42 296M = 4854 -355 AGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGCAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCGGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATAC 6+F.,:":$=#80G@5=!D/%?..4!00E>96=23707DC+B42G3090D+(!;;'2!7CG)82;EB,5059(5GE?6%?:)3GD&=:>F8==7),01(&A+;6?><8A&-/G.%$E;019%D0&25'@?H;=E5C<:9,@40;4<**501E,D)9+@+5)#01$H2"$='5C!F,)EE!((3G3&F@)1$D51@0A43CG7!C!$9#C2EH-=>3@(20!;@B3&5>0/+1==.;6EE2#4+@;-<+1E'B@0BC(7;%""?28*8%&-97)4+$>@7+6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A40T10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8269 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47197 40 16M6D71M = 47049 -241 TTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATNA 0F=0G5(54@,DB1.!2)301>B*'"?!"8<6/BBF*>3)&3C8%:9:H)!-)<## AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:16^CCTATC69T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8269 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47049 40 102M = 47197 241 GGAAAGATTTGTGTNGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGG G8'/:4DG<.C6F06486A$):5.2(,';74:B6;-DB(=!3AH27AH3D#$.+E8$"$>);<,G"<7!(:6;1)G+"'B//;D.+$>0@:(77F%%F+?;& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A87 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8270 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 632 42 96M = 454 -274 GTTGATTTCATGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGNGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAG #)#%%"'+"$!!))!%$$('*"&(*#%(!"&*"$##*!!!%!$'!*&(")&&&%)&!"*$*$)+&!(('!&(%$&+#+&('#!)+*&+%)&"*'+) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C59G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8270 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 454 42 52M = 632 274 ACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCC .')8B'@5AA&A7;F3B-4>'(,!!12.&-8&?/")A6&7?<0:+C$9C:BE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8271 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14262 42 218M = 14193 -287 GAGGCTATTTCCGNATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGACATTNTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCTTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCNCCGGGCGGCGCTTTGAGCAC 2F<0F%"-4,*CBD0B'+8'3EC+2<>0+=F0>2'@A=252.@%!$G.3#$*D<:D082?G,$83A:*%.07#-F60$("*H??&1%%%&?6;620,?1C>(E+%CF3;:3+'7(1#52@=<7"/2;F3$(.G(3*;',)C/')57F$(>C/%A+@$/E?74..&?&:"6B+1(D0 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:13T41G3G82G54A20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8271 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14193 42 69M = 14262 287 TGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCG 6C?1'7@%=:7&.450%1#;=F1'/@.#G8=F&E+F&;15H"H14H>%B7,0A&1*4,1@86:.2H-CH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8272 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30307 42 53M = 30182 -178 TCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGC B:,&4#:2/+!FG)4"92=(%GF2&/G0AG%19$9):7H+:@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8272 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30182 42 60M = 30307 178 GCTCAACNCGCAGTTTCCCTACTGTNAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTA +)!*#"!&%!"$$((+*%*$"!+&&""()#)$'!++%&'+%'&!(!%&+#&$'"$!!##" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A17T33T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8273 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 206 42 222M = 428 421 AAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATNCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCNGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCA ,0::C%>!F#$=HA";G.="*F171@4"-HFDEG".+HC>$01+4<0#A1G0//CC8!+'6>1F,5B8<.4?/71'-'?2D>,&@3+#/0<;:5*1B46->?C6H)<=+%DG9H(!!<$,335%E<#(#7/*38(HB"HE<@G7$?C(H;CG%;E("69&F=B=*A#+%.);$E163!DAG$G+;H#+F65AG5C5,'->2G""'3;8B'C.85&B&D/9>= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:65G109G21G24 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8273 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 428 42 199M = 206 -421 GGAACTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAAGCGCATTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCNGTGCAGCGGCGTTTTCNGGAACTGGAAAACC H9&$FE8"D9F#G>>>@:=(5C#9DB=E5G4E$:G%-&3C7=)E,52A@?;G)G/.3<)9,>;H?5+),+;4/:+<(+FHF:CC@27H,H:&2H9C$'(E=!8,!)&$8D6=!<@-+'3:7*$@5<28A2+,5@&+F?4;G=2/@B)D="<2A?6G1?9E58&3"E4;EDDHE3!=*E710%F6B*@6EB,0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:94C72G16C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8274 77 * 0 0 * * 0 0 GACGAGTTCTAACTTGGCTTCATTGCACCGTTTGACANGTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGAACTGTTTTCGGGCCGCCGATCTGACAGATTTTTTAATCGGGA 1A?GA9A%+B7(=0<)1D07@<9#&1$2*7%B#BF%E9-)%F(8#2-F6DH'#76(7*;(;;)2*F3/DD-,5%&$))H)&42%A1A">;"<,;"*9-EC/:@&& YT:Z:UP jpayne@0: r8274 141 * 0 0 * * 0 0 ATATCGCCANATACAGGTAGATTGGCTTCTACCTTCACNGTTGTTCGGCC D)<.E)"&)A+G709;<)E3A@FA3?1<&?"6-)-5C0=51,3H-70(%6 YT:Z:UP jpayne@0: r8275 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32334 42 183M = 32229 -288 ACACTGAATCATGGCTCTATGANGTAACNTCCATTTGGGATGCGACTGCCACGGCACCGTNATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCTGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTNCGGTCCTTGCGNTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTG B""DB.&A-2)C-%;00&7.:<;?1(:F@@39BE&DAD50=0/#1=>7!>+4=<:2G1DD)3E33.1AHGAB16%-DA*A)21D?F=#G):H7;HFC(0$:<;%C!41%:<;+<&E4"E$/(/:@0 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:16T5C5A3G22C4G37G39A11G32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8275 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32229 42 105M = 32334 288 GATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCNAATCCGAAGGCCAGACGGGC F!+7*1%;D;=A8/>:D);C?6"!8.+!-FG74A)G0A@9*8",;>)A'-D&7"0")&3#>:69B7D'*G2$)D-(.7.:BBA7C0,>6<)5/876-EEH9*68) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:84A20 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r8276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14234 42 128M = 14000 -362 CCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGNCNGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGNTCCACAGCCACCCCGTTGGTCTGCCCTGTCT 7!<0#&-#*G39EF>?3+,-F,?&8E,C$%4.""A$BA@4)9-'54&-9C++%3H'5-;B+F4D+H9(G180:2C=<$DA6$!2*(,&)&4-:E5'/*(;?9?67+7E37%&E<#?@5!9'C%?+A7D AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:59G1T34G15G12G2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8276 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14000 42 234M = 14234 362 NTGAATATGACCAGCCAACGNCCGATNTCANGAAGGATAAATGCAGCAAATGGCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAANAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTTCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAATCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCCTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTT )+$'*(*#()(($")"*'"#%('!(!%$"*&$+"%&%''$+(#+$#'&'"(%%*%%)"%#!+")*$#("$#"#%(+")&$'*"(&'#$"")'#!%%#%#'&+&*(**&+%$"$'*"&)"%&"&"+&+(%++')"#%)+$)**(%%*'*!)(&+*(&!+('#)%)+*!$+$'(('$"+)&'%!*$%"$%)$%'''$*(&!)"(%!'$#'&$"#)(("'%"#''+#(+))'+$&(+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A19T5A3C21C23T115G41 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8277 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22128 42 98M = 21961 -265 TGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAANCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGT +/27>3;86>CF.':1B/(&,A(%91,G4A6?:38;-':8.+AG-2>7A5739)%&2-<2..E4149*C*9-C76 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8277 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21961 42 137M = 22128 265 GAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAG E?.:C%41:$.0A"%-1A')23.)9)-<9H;!-5+0<$4.&'=7465'>8>,3GE0>6%62#)90-3#!998C?6C.H$!,,'@="$%D);54H3,;"(0D6H4$$AB<1GG&,9A?20<3H3"&HF@38<8&.>21 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:137 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8278 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7128 42 66M = 7290 297 CCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGNGG 4''&9=E3B#508*$BG<:7?2*-%'*-5H,'8,-"AF2%'F@F0+"8)+,)D@51B;?:?./*0D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8278 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7290 42 135M = 7128 -297 TGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCNGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCG 154&(H!=2.'H,@=$-25<0B?3FE+2/B@G9@"8-589!(>D>G$0&F6$!#"4/E6(<50:6+*CG,#?5384E@"!@:;H5<(GBCC4A.0/-EA?:-'49H$9*1;0<-/.#GE=4CE5.=@7:'<=24= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95G39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8279 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19363 42 105M = 19468 228 CAGTACAATGGATTACCGTAAGNCGGANATCNCTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGNG 5GA',E,1'A%#HFGH!'D!(1:?,#B0-<"39!H0*+0'BF)(#C-E+H888C9=B(4*: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22A4A3A71A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8279 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19468 42 123M = 19363 -228 TTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGATGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGTGGCGACTGGCGTACTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGC F"HAC1B@&<(3:%?#AE"",!$4)/A-=DDF5=H#F5-;&,-81:1;%?B8D4452/):?A-AA3@;G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G36T84 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8280 77 * 0 0 * * 0 0 CCTGNCCGTGTGGCTTACGTGANCGCCGGTATCGACTCCCAG <7;7,950'28=:31?%?11(DE%G2'2G:2*83*6;F.#&@ YT:Z:UP jpayne@0: r8280 141 * 0 0 * * 0 0 TTTCGAGCGTTCATACACAATGGTGGGGTCAATCCCGCCAGTATCCCAGCAGATACGGGATAG &87G8E(>28)37'"'/4@C%F+"H4H.;*>))CA.7*!>4!E4,0DC2+>#GG)/(*#6@&6 YT:Z:UP jpayne@0: r8281 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9809 42 122M = 9689 -242 ACGGCAGGCAGAACNGGCGGAGTCAGACAGCAACNGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGA 03126#E,FH$5&5(DC/E#(/C8$H/'AG*5$-<*?.2E(5E;=ACE!!&CDCB')$%;F$H+/G5G@"4F(6C-1G&A3!B3%.')-,1*4@E+#(H/1:&7"96!9A(6GF;2:$0>H+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A19C87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8281 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9689 42 120M = 9809 242 CAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAA ,/=48*3-B70>3#/4-5#?!/6"25H6;+7<,.5/H/=>1E>"+B>A&#,=3/#..D+=&2<4'97-9C4D;*35"%$8-#,&F,3G397?,2EA*E*3<20)5A%H9.HGH3#3%,$G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23836 42 52M = 23996 300 NCAGGGTCAAAATATGTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTT $+#*)+$"#$%%$"+%($*!)%!$%&#$(+'+#'%%"$&!#!&$'''*!%*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23996 42 140M = 23836 -300 AATGTAATACAAGTTGTTTGATCNTTGCAATGATTNTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACA =E.%4?=<;;G)DE,87)87%""+*+"&>/C!25):B:E:$!,B3?//+=1F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T11C104 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8283 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26432 42 82M = 26262 -252 GTCACCTNAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGNAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGAAAATCCTG !"'"(!%"*&"(!"##%)((%#&&%%)*&'%+%&++*&$*$&!)!%"+$'#)!&(&)$$)$(&!&#%""((#+("&"##''' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:7C29G36C3T3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8283 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26262 42 127M = 26432 252 AATATCCCTTNGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACNCATTCCG <,5?G6HC91A,""=3(%3A33:.?(8962$#<%%*50/H9")B+72<)2$AH@?@?G(@&#<9F4H58.#&-'D/(E1-2E=2+13662/25,!.CGC80@"09+>4'781F=D%(5E?8#1113D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T108C7 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8284 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11812 42 58M = 11604 -266 AGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGN H+>F3'80:!6"7(5D:9B98<'G'+76;&$@,+0>)1/=<#"E#87*F-):/05F4! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8284 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11604 42 110M = 11812 266 CGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGNCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCTACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGA ,!"?8$F$%@7-=9D-3H.H;C5GCH87+;2@+66/D:.>G+9@5(3"=:06%9H0$D4'B;C?$@23$E1C")!62F2F.89*&F##@*=&D/:?5;.B-%#3$(%5F* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43C29A36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16130 42 147M = 16333 244 GACAGTGCTACCCGAACAGGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCNTCTGCGCGGGCNTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCNATACAACA "?)7#6))$46?)E+8$1,<4GD08)**1+-7>'-'780"9F<@E$1,(=13/,5"(?&83#92&1**9;@0D0E7E($?EC&(;#D!*B-C@02@2)G=(1E'541C&B@97;/E/#0&G3/7.46(#:53&D;E=%7ED86'G?H<:%$%*%"11:26B87",)2/0<2?A.)>55DE(,9%,?!H$<*+F#7#G-!/6F>-@83E3" AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:22C57T25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8287 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10919 42 350M = 11269 519 CTCGCTGGAGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCNGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCAGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATNCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTC '?.2.*+GH?5='0-<(;,:C.2&3=6/&($19B#*1@G,07$9./%#G):::4+A$F*%/208E14H9GH'$89<'>(/D;2@6'F,H9.-5$2=:::G*'(B)!H;;50%)5EA+A%8F=$C**2-9B+(6A46'B/;65)44$E(:A>&?41FBDC)4901:01A"5'(2(!>)2;F"*(7!>'38"4<%3'9;++G$*?:&20/7)H!/6"!D>'+EH@2-?*)G32%%9%E;C34G>E@2%E046HE'H7-E7'=!>(!@-41;5%$:&6'D-2;)$A3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8C161A98C80 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8287 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11269 42 169M = 10919 -519 GCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGNGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCTCGNTGGANNTGTGGGNNGA %"&%+''(*+$)&*'(&'&"*&$#+))*)+$&%("!"%+!*!#)&%$)*$'"'"&*"&('&#)*"%!'!(%*&&&(!'*"%'!$)(!&*"#'&'("%'!+$%)#&%'&*'"#!(*()'+&'%')$("(%+!*+)#%%(#&)!%!#!%%+'##!%'&#%""#)'%'%(!& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:87C61A2C4G0A0C0C4C0A2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8288 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21072 42 207M = 21279 268 TGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCNTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCAGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTC >0G*=.1'3G!&#*(/(.D+!A.3%C!9,52=8A#DE:,DG08%@:-*(.AH7%"29HG80'DD8+8$/#%>5-:57/=:H##&CC(EC?B%'050+20!5G,&@7:@="#'D=<84F,."E55C9&'GHH$?E$00835$@D:%$02)@F7"27&&**?09#G4E,>>,=$G&D8:;-AF!$-;'(A!:#)1%&E;1*7"'CB5!* AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38T93T35C38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8288 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21279 42 61M = 21072 -268 CGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGC !6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8289 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17318 42 264M = 17582 484 TTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGNATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACNCCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACCGAACTGCCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCC +!%(($!"("($++&*#+')$!'**"#'(*#%$$)*#$+'#*))%*)+"&*'"+!+$+###'%(%(%'!&%$'+'***))%++!)"$""#+$*!!$#%')'"$&*&'#)"+"'%(#&"'"&#*#$"$(+(*"+"""!%()+*"$#"#!+)'*+'"*)$%*&*+#)(+"""$&"!'**++%*)%+&&+"&+#*)!"()''$*)"%(*(&(!&#%*$)(*$&*((!$(%#&!+!*))%#*()((+!!"$#!+"%&#+#(*+"$&"! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:26A88A113G0C5G27 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r8289 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17582 42 100M1D37M6D76M = 17318 -484 GGGCGGTAAATGCGNGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACNCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGAAACCAGGACGCGTTATCA '6.%9802H':2)A5::5A!=(;?H!,D'@'),+9DEB"D28=-,*/!&C&+&C.#"**&$?$#C/?**+:8.5@?+@0(CB4.0<,+?0E3(5?/("C4.C/%H06;#"-724@1A',+ AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:14T85^T17G19^ACCCGA64C10T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8290 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45089 42 142M = 45002 -229 AAATCTGATTACTAAACACNGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTNATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCG 4,&)(%$:2/HF49#(:<%&!@7F>9B?/D6/E<)D>3%6&%0AG325>%**B";+D/D(=HC*:6/9.//H0D)7?2G8;*F&C*-;")!/17*($D3$%3"'46B5->3"G,EB1'4A520=)0DD/*4639"4#H>5*2,D?0+//G6CC,*=8>%E(,#)=:CF"2%3*-%&.C&.96.6F.7?)63"*.+*>7'E0B/86/D-/%H$A=5E!?420:+?,(G$1(;A?>(BA$#:B3.H-4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8292 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24801 42 3M1I66M = 24935 270 TTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATNCCCAT HC=*B4,2+%C7%-*++/1'H9@0#3?B4%A'F(&0(,+G!3$.73.13?8",<+>60G$9.(:<,B&(&*&'@/!EH+%A7B+%92"-.0#A93;/DH/"*-4-691C;90-(,.F1;DA'5,9,76/'8:=FB@"?# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:91G43A0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8293 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24664 42 140M1I123M = 24946 335 TNCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTNAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTNAAATAATGAAGNGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAANGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCA $"51'E'3E-A.0;A9E9CG@>=)DF)$@E!//*!80!35=$A6'(*(%H:B.1A#.#3H%$9F!H%#!'A=&F"9@E-:(H1(%G:/%A!>&"&5)'-1!+3#?-498B0&$#+*F?2==3,G$*D52'.:6%1715F4/"4>,)?9H2DG6$!"98C0(4F%?FH>-/C<.%AF/8#(A7;GB0:A8"HEB')-80$B AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:1C28G66G4G6A76C76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8293 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24946 42 53M = 24664 -335 CTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATC +$)#'("$(*$!!&!)('#'%)#*'#)$!"')!#%&++&!+"%)(+'%*%*+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8294 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31881 42 199M1I84M = 32179 361 ATTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTNGCTATGACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTNATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACGGCTCTCACATCGATCNCGGNACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCGTGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGANTCCAAGAGATTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTNCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCC %+(##(#$&'&'$$*'!$%*$)'*$**))$'&$'%'$&+*$*#!$!"$#$)*#+"!"(##*!)%$&'!'+$)%#%$#$*#((()##'$%*#+"&"&"''"**)!)&"*+(+!!*$($))+#&+'&*!+%(!$)("*($'((#&%"()++!"'#()('++'(%)"!((&&)#+)&!**)")*%'$*'&#$(%%&&*!&&++!)"%$"!+$+)))*(($&)%*$$!#'"$$&)'&%##'"!"("'%!*!)!&%+&')*"#*)$'*)*"$$"#&&$+*)%*"%+*&+ AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:13 MD:Z:1C20T5C23G47A15C3T25A38A8C10T14T62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8294 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32179 42 63M = 31881 -361 GCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCC ;'.8!D$=H:/9$6.!$@1(/5$%:@=<'>(< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r8295 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42900 42 124M = 43061 256 AGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGNATCAAACNATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATA E*?$B?A8#3A900G18F32:'<:83C>,>2(4F:!H,-BA'3CC@B1=&7G9(-FD>5*C'00D=,H90/GB&9,%5>!(727?7$3:2&$610 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40A0A50G10 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8297 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36699 40 79M7D13M = 38995 2380 CTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACA ?8;*,(75)C&&%:",:"595@3"(3?%F?>6@*/'5%,G)/:7EC+,;:8-3436%:-&! AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:79^ATGTGGT13 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r8297 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38995 40 84M = 36699 -2380 GGCATGTTTGGACCAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACA %,G)%F:F@('?E127FF"&91:'%$!0.=14=--EFB?#!%E&%.&",3880GG'H>1+(,,@"@&=A&="$H4@*3<59(3B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-26 YT:Z:DP jpayne@0: r8298 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10008 42 102M = 10164 300 GCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACNGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCG 1//?)F4>?3E&$==0&5+5**C,@-7%3/'E4-)B!2GG0"54@?":/3<-,23@*#9@1G995'#/3$C3)A1D)%,-47"A")C(66;>G3-36F++.*D%9(AF=37*@33)0B>?#7DDB-)6B$=!D79*ED+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8300 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41959 42 77M = 42156 262 ATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTNTCTCCG 3778/B$(3#=*!05"*384@%@<7<5AE5$/>&:*1F)G*6:G-C(++ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0G0T67G6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8301 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38670 42 99M = 38819 236 ATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGG 72*C&,9<9!"3"%,:).3&/&3(AEDD(A.-@.6+#GB)(44:0<-<;>+9+*(371*)%7/+.(7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8301 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38819 42 81M2I6M = 38670 -236 TGACCAAGCGANAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGGTAACCTG =6A7;=&/C+$H0&!?*<..0<%'GF9B*(@(@>CF>9$3B<434A5*7.1-4#9A%10,(7/)36$#6#:<%@8F%8>'?H+-%)5=) AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:11C70T0T2C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8302 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37854 42 154M2I120M = 37766 -362 TTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGNGCGTCCTCAAGCTGCTCTNGTGTTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGNATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACGACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGAG %&9%*BC$C85/)@=(-$?#1A6.6:0>!@84,-CF<)63C=@/)3"="#90<&B>FE#H(6>,*#+/D=+&2@1>EC:=D'G9?:?=H/>=A@:3?!:8249>@:H8+8&GG&B5"31%DE3$D*CA>7',=F!)=?H,CA%'1<$6+;%&9F;%BF#0558"<8!46=E.37".&49*7)3@9GBF5FA9/G1G")HH3&+%A!%H%-.F3;&*# AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:39T18T109C25A77C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8302 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37766 42 88M = 37854 362 TTAATGCANTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAN D"%(;B<:D9>)&#,&%%88588A%>-1-%B=>"B2:-8$8,41,-*?'52A0)"#5=#1!A/)H(,+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T78G0 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r8303 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6383 42 41M2I127M = 6320 -231 AGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCNGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAA 8$?H6?)>H+:@3$H:=*-2=(1%CE*/*@34E9D4-F%8>DCE:,'!"DCGE.+F.E;G!#6G(<:59907@.(F,9:.G;)4C$)>!6#&?-EEF)*>H3= AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:76C91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6320 42 63M = 6383 231 TATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGA 2C$%DC0H"1CGG++@>6A%'H$(.F30C,3(70"9"HBE"A#F7,6!+H+B%%>EGFB-)G+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8304 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40549 40 14M3I46M = 40367 -242 GGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTAGATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTA G?:;H-H*3)$5@A+F@*?1!)*708(;!*!9D#+<,HFC-67A%HF6H,-2AE$)G(?75$(.=02<$BD863;-91/0>:5F53<:-+C14-.-*-@B@?'3/*96@5B,;$35CD'#$@2)E!;D*80=$DH#H5':D5B."8)!40>'%$3-=G<8)-<3.=EB-E*%&H-@+GCG:(#"E,&*E6=,A<4F0E9G=3#.C6BGD,9D3<,-22A$<:'E%4<*5,&(<@>3(6)+#9(=./,G5(.>F"G%5'649'E=A5(,.G/A;& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G189G13 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8305 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24267 42 99M = 24366 348 CATGAGAGAATTTGTACCACGTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTC 308*,3<&A8,*7>>"+/'3;6>*;$"&9"?#",!4"G23,=7D<88)E1,H=$A996C2&-",+:<0@!E4<4,*"F<99*/)65):5,25'DDF?F= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C31G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8306 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34947 42 98M1D23M = 34831 -238 TTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATGAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTN !5*"!C52/;)?@77.9!7&(F.1.B.-2$8&72*0"7--$HB=#,%0'B+F,E;+7*$-@=DB/"?00=6"7;.=>@#G4#+#D/9-8F9GG03E@G($2<,8==7-A'C&$<7:) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:65A32^G22T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8306 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34831 42 61M = 34947 238 TTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACATTANTGAGTTGAT ?31HF7398">2$G,+,D&?@@'5)(*#+!'&B3=$*&/>"-D/4!8;"!"+:!;4H7&?C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51G9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8307 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29063 42 94M = 29177 219 GAGGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCACCATCACGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAAT 0:59'.C#$+>;/96'3HB2;9+7B!#'9*)6-*,%*F&)#,;9;E7>F$>'9%*CA1-7')2:*BE:!E+/B,G#$:5@)#1D0=G$D.@0=8/4&@E31+.-@(+AF/>:6-G27::$,,'+/4/FA52;99C)3@@"A.@*B)G>!H: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G69T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8308 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44729 42 198M = 44932 282 ANCAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCNTAACGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTNATCGCCGCC !)GD@+;$C1)&#G@)=1G:+4%HFCHD/%H0#!H(6.FH*)@$&G>!C5@/E833:C0<"5!61:/*A6B;D872'&9!%)67>/'>B%>56:'<&GFA;(C$A>1#--<&!);C-;:)#%&,?>GA)<::",.+:"9'FHE/*B:-!E4C,=+F+!DF/D!!B//-?C)0)>(C"%?B1AB;+56*5/50#8) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A28A157C9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8308 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44932 42 79M = 44729 -282 ACAGCACAACCCAAACTGAGCCGNAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCANTAGTAATNGTTACGCTGCGGCCTTTTACACA #*)*@4$=+8CH,"=0F24G+9#:2DC#D(-:A037;"!G48@1B+A=1:A93=")6#!H?>@-=>!<4:=!,B=?51? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23T23T7A23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8309 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32480 42 75M = 32693 276 TGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGA @;+!A!*/(6F$16<%5H'=*H0#+D10:>#A,%;')@B!60C7=&%B96-!$7&%%"'+=.?#$6:5>D@CHHH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8309 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32693 42 63M = 32480 -276 TGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGNAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAAT 766>C1($?5+41C"0-99D506.>#@26%735H<0&.F2;&%*2A-,H&3F8FHCG46)%)G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8310 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25459 42 85M = 25619 250 TCCAATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCA +>5;E>(27#B.<.C91G/D94GG107EH$G:(G3&1F#'@'$CA(',-)>FG$7..B>BC)6$B"+0:">+&-D-'$C(4A!(= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8310 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25619 42 90M = 25459 -250 CGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCA $'$3:8,7!/EACG?3'?7)*;(B4B(6,48C$EE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8311 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4607 42 104M = 4452 -259 TCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCAGGTCAGCCNGNCGCNNGNGCG $)++)))"!$#)"'$'(#**)$'*#$!%$*!""'+*)''&+'#&*$&($#%!)($"'$(#"&"(#+%$%"$++%*$+)(*"%&$$(&%"+'#('#)($$&!&*( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:82T8G1A3G0G1C2T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8311 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4452 42 86M = 4607 259 NCAGCATGGCCTTTAATGACCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATC -8)+;/&797804)<:-:A4,"F*H.HH/@077A$9+G=HF2:DB''(A.6-?>8A."(%3.:D+%17D4FF<$4.)C=4"/EE?7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C18G66 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21286 42 66M = 21516 273 CTACGTCCTGATNCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCC >HB(>5D,9H!5%%C0>><0>AE,GG5F%&3@!#62./BB-9E;"*2#>9%+;F,/4?D<5.6F:: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8312 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21516 42 43M = 21286 -273 GGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTNCGGCACCAAATCGAC /8B:H:,DF-+"31,8'?!"?23ACCG84%%:F!('H1$>,B: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8313 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40485 23 78M3I11M = 40588 238 AGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTTTATGGAGTTAAATAAAGATGACCA $-#)$>FA/-'C6D"'=C5A=3=>223*9:4%H)$4E24E5>2-FA8E>E(72?+C(=14C6%!DDD8$D>4'C%77?(5> AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:67A21 YS:i:-51 YT:Z:CP jpayne@0: r8313 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40588 23 24M1I6M1I105M = 40485 -238 CTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTGGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAANTTCGATCNCCAGCACATCAGCAAAACGCTNTTCACGCAGTACAGCAAATCCTACCAG G-6=!#'H9-9;A;#F!(-.BB<54-9&%$&:7G&(%7D'<+0GA$/%+)/?49C'->>C54+-9CG0)'%1=73-#91=C.HBAA<.+?-"$;6 AS:i:-51 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:16 MD:Z:26A1G0C1T0T0T0T0T0A3G36A7T21A22T4 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8314 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11041 42 63M = 11297 301 TGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCAC "*;.9%0'C0<4=94#.BE5AA:986-"/9?B*:-&3G,4@&&"C9.(*1G&&,-F%=D72CH'.5=?C/GB2C6/661E53?'="@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8315 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7731 42 51M = 7474 -308 TNGTGTTTTTGATGACCCTNAAAANATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCG )(%)"#&(%$*(%(*!!#"*"##$%()!%))"$(*$%#(&#())+%&$+%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G17G4T26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8315 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7474 42 75M = 7731 308 GCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTC 7')$#&B%#BF9;:??(8=!7,8/$@$5!F4+:65#6B#9:/=85829D+;.6D@40G37-466A*76,GE!F4. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8316 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16038 24 80M = 15878 -240 TATCCGGNTGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAAAAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAA *',"2#,F6C"AB<$1(,A*ED-E*"',A?"7=,<4%%*6C&C$*.F: AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7A43C28 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8316 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15878 24 60M = 16038 240 NCNGNGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACG #&"%%+"("')#&+&!*)(!*%$!$++!)($#'*((%&%'+"++)$&"*"!**%#+'++& AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C1T0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8317 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16892 42 294M = 16892 0 ATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCATGAACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGNTGATGACTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGC !.>9D19$05;=88BE=2=@@&=2G;0GB>(9H,4!?""2E:?AC/AE./=0"7B)>7'A8#DG?!)1B:"G/,7*9)H=B#G&D/5D..B)'AA5!&7DG2;,F%>(4F0%B.+:6H/07).=9D&/F<@9@@2;8G91#<-<)><%.A,=)-DH0?,.;E$(&5*B5:=?<9E%=.!*=/F>)7;)>CH/-8>@+0:>*3-#)F%=,2<63H$/++242:"CF<)08$E468$B@!,+;"<:3D?'%'BF)."7=48G2):*<>@>=8&(?@9='$&F"F:??EB3,4F'53A;%8>BEC?%5*#:.--#1C3=/$>9GB61/.E,47*>C?D,!*F;9=$>#9% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T41 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25885 42 92M = 25779 -198 TCGAAGCACATATTTCTGGATATTTTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCNCTTGAATCTGTGGTTCATTACNTNAAAANTCTT #$%$+!(("+&)"*"'#"#!+!'"!$$**+(###&('!+$"))(*#")()%)%)*'*+&&!))$''##'!%"$""*++)%$)%*(((#''($ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:8G15G33A21G1C0T0T2C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8319 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12746 42 69M4D26M = 12518 -327 CGGACGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGT (8$(&*,G#-&'8?(1AD/)*+&@.>!FF<.%B/74?A3:4>C@#;+.;>"H=?+@3%CH65*@%C82#*DCE!H$B1"/2H,%6=@;9/8"(3%*$+28$3)EEE$0>G1102!$5/-A.C"5-#$)7+>.>H1%;5)>=E;/62A,7C#& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57C82 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8320 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3394 42 123M = 3517 276 CGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTNTCCTGGCTNGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCC 36GG@37G66B-C42D?637'=!E<#G=$;5E>C3D709&A)(9=2'&1(2-$#FG"6+@:'E#!F5BBC252=<&H;*@6&F<4D)#2-#6>+H),(D4+E?%7:'>'3,-;2< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73A8G40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8320 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3517 42 153M = 3394 -276 GGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTAT HB0F=;-.F6=2)/B!%41*6+F;6*B2!&H*1-/@(!()*,:+-"*BDGB7*+6C#B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8322 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47360 42 108M = 47224 -244 GTTGTGACGTTTGCGTTCANAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATNGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCA (#AH>%')?%E=8%6*"/4(FF)9!",0;D7?!$/4?:7,6=,D!5-G<9"-'C,$9,%',=?);#%5$!$?/8'1#9.?C#75*00 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T0A5G39C48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8322 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47224 42 79M = 47360 244 ACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATC )CFE1.;*(2/9>?A!E:>2AAC+;94-!,C+;9#EA!'H.06!%!BG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8323 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17312 42 117M = 17094 -335 CGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACNGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGNGGGGACTATCATGTGCTGGCGCGATGGG &+CF5BC?B,G-+)DE)E@;%E)'#!>4B;5,43G(A.*,%89@>F97G$B;94G4AA3'1>EA4+"/;'=#F+?5.H"78514%F<2= AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28G59C5A5G16 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8323 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17094 42 116M = 17312 335 CGTCAGCGTGGAGGNTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGNAGGTAAAAGTGAGCCGTGNTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGC 0AA7$9%5.%$/6,H)%7A,2*@=9!.D)D8,-C7'8)'*H8@CF?(4(2H;/D%,%&A7+;!>%(1G;E8$$1@& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G13T22A18T59 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19118 42 147M = 18962 -303 GTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACNTGAAGTACCGTTATGAGCNGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCANAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGTGT ;$"(G134F-=1C$-79@5730()7<#$699;%+;+4)/%(H1@HG$&'E&?)(*2HH=.=E,A1//&-%24=)?;:=()(3;:E5'A-?'%)%)FG4<@E(9"@(,C'FHAG@(?G+3"3:'9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G5A14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8325 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30941 42 56M = 30722 -275 ATGTCGGCANGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTN ,"$@-,C4$?='"BF+*<"GH8A-G3,8&*?E75#!;H,E2$+6/:9%CB<*4?6$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A45C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8325 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30722 42 83M = 30941 275 TTAAAGACGCCGTTTAACANGCCGATTGCCATGCTTAAATGANTCGGTGTGNANCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTT 5F1%D%6)(6&966"?&7)D1:G&.CBB..7)6<033,$4%#?"G0C&-8/(-GC44/-7"D">E@E$+GEC+.!+CD?<2?# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:19T11G10G8A1T29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8326 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47875 42 211M = 47677 -409 CAGAGCAANTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACAATAACTGCTAATCATTCAAACTNTTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTNAATTGCTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCGGT &))+&%!%#%)$)'#%!)&)#("##)!!&%&&'$*)+')(&"##$")#"))&#&)+)#$"'+'(&!%$($+"(&+$*)%'+''(%'%"+!%$+"$&)++"*#'*%)()%!$&#"#+()#'+#"*&++$"(%#(+%$!#*$)+'%$'%!**$(&"!*)%(%'+'('*&+#"&)'*#!+&(*)''%'!**$)*%)'!%"')*)%!$+(+)((* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:8T9G55C22A63C4A41T2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8326 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47677 42 198M = 47875 409 CAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACNGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGNTGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATT $C/70/)>-2@5F0((.@D189$2D!*F.9&H+,$C((D4"-<;+3/EG3:B3)0@*)#"#-B./01$/HF'=B<".--*F9>4C8'%/-:=F@;G.D;0,&7(G$'G,G);G>".*?,:>!&!E?E=H6F?-A4#'.))*>1,88!#<(EB-"CBG:&H/>8H("1<5.0@A?'@,6:2+5?$"%(6E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C124A45 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8327 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26020 42 278M = 25976 -322 TTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGTGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTNNAT *''#("%%!((%%('*(')(($%)$(!##'$*"**&(!!)")#&'#(+!#+'$&+%%&($&#!%)%')!)$!))&!*$%(*&)("!'*&!(%"+!++$%("#'$&#)&"))'$!+'!"(&'$('!''*"%%$+!**!'*('%"""!'#!+!"&&+)%+('%#&'"*&"!"&+!(+&&'"'!*')&&$()%("'%!'%)*%$(##+%#!$"+!!)!)"$$+!*("#&&!($%+#(#!#+!!!'""%&++##!%&*$$+*'($&!&+$$%("#&+'!#"* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:195A78C0T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8327 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25976 42 44M = 26020 322 TCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTT >7'';3A((*?6184>+8@B>B<<*@#,1<*F2/$B25-7H<04&GC9/D@BGE893<;>-"4/C:#:8(!!$,59B"#C-/@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G55A9T5 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8328 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45823 42 61M2I16M = 45973 232 GGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCNA H!E48807#7(+?@C#.A(&##$5/<5'?2E(-@$HDB+%35A8?H@8<@(':G/=#"%,?!:%0,134(414A'<*?+%0C-79D*.1<5CA78++E!";:+-<=42A&56A3!H6/6* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8330 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17813 42 159M = 17731 -241 TGNACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAGCACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAA ','/D#:4*@<.6>A;(!.,:3D9CCE0#+B'<%1)/3'48,0*C6(?H1GE39460()4G">&21H4@)/46:2*/%/;%:FC82:F,'/>.BE6*12"!F'FH%/06,76"BB$%3,/4(C)1836A-@!B'2/$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8331 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44241 24 65M = 44241 0 GCGATANCCNTNNTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCGAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGGC %#$)$!!("&$#+%#+($'(!'*$('*&$%)'+&((!&$((!++*%)$#%")'%#*&+)')$$(& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1A3T0G2A1G0G24C25T1 YT:Z:UP jpayne@0: r8331 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44241 0 * = 44241 0 NAGNTANAATTNNCGTNTGNNNCANTNAAGNNTACTCAANAANNATCAACGNNNNANGCNNNGGNNNNCNTTNNNTNNTTGNCAGTGGNANNCAGNCAGNANNCNGNTNACCGGAGNCNNNNNTTTGGTNGNGCCTCACNTNNNNGNNNTCNNNTNNNTNGANNGNNCGTNANGCANTNACTNANCNGNNCGTNANCAGGNGTGNNGGCGAANNNTNNGGNGNNNANGCCTNGNNTNNNNCATTNCNGCNNTNNCNGGGNNCNTTGANNAGTNNATGNNNGNNNNTNTNCNCCNCNTNTNATG $"$#"!"#"$$!#$#$"""!!"!$$#!$#!##"#$"##$#!$!!###!$"""!!!$!!"!"!#$"!!!""!$!"!#$!"!!!#"##"#!$#!#!""#!""!#"""#$#!!!$$$"!$#$"!"!"$$"#$"$"!$"$#$$#$!#$"#$"!#!!!###!!!!!##$$""!$#$""!"#$"#$""#$#$"$"!$$""#"!"$$#$!$#$$$#$$#!$!$!!$$$"#!#$$!$!$#$#!#$#!!""!"!$"$$!!"!!#"$""!"$!"###$!$###"!"$!!$#"!$!$""!$#$#"$"!!###$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8332 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38115 24 75M = 38190 210 NTATCAAAGCGCGATCAACNAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGNAGCGT "?<:+/:>A:4E=#"C*&BE*B@5E.$?0=.,2>2H43D@B*)@6$1E:&'!-24=#+09..&)@+1A80&0*,H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A18A30T18A5 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r8332 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38190 24 54M5I81M = 38115 -210 TTCTGNGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAANAGCATNAATCATGCAACCCCGATCTTACANATTCCAGCCCTGANAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTNNTCGNCNAC $'#$"*$&')$!#$((*&($)#!&'(%)+##%#"#+$)#%&)*)'$("'"+))'%%%&)!$+'"(*+$!)!!+')&*"'+'*""*'#%#%$*)*'&$#+#&'%(#!('&&'&("***')'#&$*'$!'$+'#'$'""")* AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:18 MD:Z:2A2C38C5A10C7C13A41A0T1T1C0A0T2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8333 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16600 42 48M = 16333 -315 GATAAGACGTGGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGAT GG@=2B44&<"#*5//(C<%:+EB<=5;90H+DB#?7;17BF'H?D7E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8333 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16333 42 241M = 16600 315 TGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGC -H<.(/+8C.2<-(;;;?:/2#=10->&E?ED@&('E0/>D<>04.G@ACE8B#=B7HG'!D@*/<-D&/8A(1.#-,>B-!!D!$9-H>@H'D3031$E8G-03+<%>>-H>;+A-<8D9;<@">:&F333?4H0!-'0$=D'/>D-:/B;+$*HD%=C/=(.C7*4:F"9>H-8>05:F1GH+@",>A.4-,<-%;F!%('+H!8!.;,.8#G+%&8B>#/7,=0&5C4%B4G97"B999DE6*@?.:!==-,'F23?)?+:$8%D,%/$+"E52(.D'2"&CH"+7C'G@.1!?D&),$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:105A4A1 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8334 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23543 42 54M1I154M = 23751 320 NTATACCAATGTTTANCATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACAATATTGTTATACCAAATGTCATATCC !>33.?4F3C7A8,H>BA7:;./B#$$?;6CDH5-B3<3DD4@G34&55)*.G(00);(E5$:)*ABF5$H'2);5&;7;C?#8B7H;A:')7GEFA(3%H)D)%,?@>!(C?G&2%=813@$0@>8?8F5*0(5,7E$9>H:#""C///:9)FE.H0G"96AEE#D>,E2.A)/##8F=2F0(?#(H22>7';BH**BD7<4%&BB<)=B5=5>6..E(3-H2:7"(6.&*2F:CA/;>B:9(GH0F5'+.CD17#F@E(,!&9 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T27G6 YT:Z:UP jpayne@0: r8337 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28490 0 * = 28490 0 ANNNGGCTNNNCGNNNANTCNNNNNNCTNGAGNAANNANGCNNNNNCCGCAGNNTNTGNANACGANNNCNGNNGGTTCNNGANC #"#!$""!!""""$!#$""!!"!$"!#$#"$$"$$!"$$!##$""#$$"$##"!!#$$##""#"$"#!"#$!"!!$$"!""#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8338 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34781 42 202M = 34632 -351 AGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAATTCCCATACGTTAGTGAGTTGATTGAGCTTGGTGTGTTGCACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATANTATTCCCTATTGAGGNTATTTACTGGACTGGNNTGGNG )('!+$$'(+&"'"!'%'+")!)&'''!"(#*)%*!()'(('(+"'&#$"%"$%''$"*"&("$&$")''%*%*"!'$""!&*%)(&(+)%!*)'&'+!$$+&&'#)$"(#!%"&*%*!'+'!))(&(!#*$)!!!$#%'%)$*!)&""!)&'%!))&*%%%*+!$**"""'&+#&*%*($(*!()*$$**$+)!&")'*#$ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:31A65A29A11T23T15A14A0A0T1A1T0T0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8338 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34632 42 81M2D66M = 34781 351 GGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATC (H?;)#H7A+>!,A%-B@"36D-?8,H"?F+'EB=&BH7&G9-B4<*<,?;&%?9#E4B>A@2C8F"12F7H7'?4)CC1=!D".2E/'(4E&"C*F*%@1B@4(0B:F<219"E"=$0'=H(-,.,!.FB.!/G;E#)01F+0#=: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:81^GC66 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8339 77 * 0 0 * * 0 0 CCACTNGGCCGGNAANNTNNGGACCCCGACCAAACTCCGCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACA '&%''$))&(&&")##&$!!$&%!(*(*&#%+%)%&'$*$(#!(+%*'%*&$$(!")'&$$*'*+% YT:Z:UP jpayne@0: r8339 141 * 0 0 * * 0 0 ACCTGCTGTACCTGCGGCTTTTNGTCGTACTGTTCCGGCATGTTNTTGGCGATCCGACGCATCTGCTCACGG <%29//!D,0@>)$$6@66ECEF9BA$CH;-**D"7"4BD#+C9)"-B;,0"E'C+?,-B>ED)!/""0)(2,FE%*H9!3E!3.C&%) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8341 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45165 42 59M = 45224 146 TCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCAT 7A=E.DH-&14?HG*?+4,-754%DG'-29>%B.=>?F(>#H(/5!;;$=83;!!+2F> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8342 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5476 42 115M = 5730 306 GGTTGCAGCAGNAAACAGCCGCATTATGGGGATCTTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCC &*('#)#*)'$$'+$%!'"$+%#'+'!%#%#)!($*"*&&*"$&)#!)##%(*!*+%'#*$#!%!+%'(!!*#"'#("('))&&"(!+'+$"&%(!#%)'!%&)#(#+*'"&$*+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6G4A22C5T74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8342 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5730 42 52M = 5476 -306 CAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCG =G842E2-<>9AH*H/+?A$4>252@!-0H7@*)3(7F05?#B1$D@)%1@# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8343 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38478 42 143M = 38621 247 TNAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCNAAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGCTGCTGCGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAANC &$+"%"*!!$$%%%%&+)*%%*&*"#$!*(%+"'+&((!+*""#%!+$#&$%$(&*("'#&*!&)%(!#')"&()+$*$$"!&)$)"*()&!"!&(%'&%#(''++'#&()$&($$$!!*)!!+%+*'#!''(##&#%"'#(! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C25C74T38C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8343 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38621 42 104M = 38478 -247 GAGCGTTCTGAACAAATCCAGANGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACNTCGGCAGAGGT #))&'%)%"(++$)**+*(*")+!$)%"#(+((#+"'%!*%&!!%!&#%!"+"")*#$+$#(%))'&)"&'#'")'%!!$"$($&#!(+&(*($#%&!%'#(*+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T69T11 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8344 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10654 42 45M = 10825 222 AAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGC <-)$A275=)E235!#980;<"8@931<9C,-/3"*<8'1?.4)39>C606.( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8345 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14891 42 110M = 15164 329 CCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGCTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCG H@%?%8D96/!&BDBD&D9!:'>17;!#F>8+/7@&7D545)1*@;:+)8-(?!'(1>C5;$;-AA7G1@$#<$H"6;!!;#.!037*-2+>5;37+2)+GF9!:F8-4# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8345 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15164 42 56M = 14891 -329 GGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGT *AHD4=C"<@65E5B,9,C1/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8346 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11851 42 207M = 11784 -274 ACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATAGTCAGGAATACAGTGCTCATGCTGCNCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTNGAAGGCGG &4&=!6$0$*CB$4:B!E+&*,BC)C,(+:'H;88200#@=D;)F4/'@G8*.6:C5;0,%?*=)FE>)3@.+B:58+/.>6(@82;H<<)%/#'4!/'2>&">;H@)H?%C=2'D=?.,1%5.-+,;B*-&B$(A-@'@)0?-@<-!@37'>.(;$>?D3@E4B0G,9;B>*GB;B95%,>HHG*=#:#;)7D(.C+E4,:H(354<8C$A4F$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A11G37 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8347 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41475 42 169M = 41294 -350 ATTACACCACGNGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGTTATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGNGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTNGCAAATACCNGAACATCTCGGTAACTGCAT !9A&#,;HHC1<#CH-8F2G!"GH9B'E$6'->.F%96G.6D555H.B5A"D2-221/0(0;H.&><8C":57$2%<6F9)12<406,7#:4!*F$8-=3,.<1#G%')*(1D:1!GC6)HEG!/)4#5"%0?/8,B/"(7G)$#E'+151!90B+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11T55A25A44T9G20 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8347 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41294 42 181M = 41475 350 CAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACNCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGNGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGA ,(5&FB)"'!!?%=386F/G*#471.G"?;)%%::9;A&5H'AH5+C-37<7611DC&41(+",1HG4*A=%C137+'".?%=$)2%1+8/>%!4!!+4;/)24>:(H7",>=F"&$';9,'+CD;+$F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G62C73 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8348 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18508 42 50M = 18384 -174 AGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGG /3-B$3:(;GG>&4-"+C"/;*$5EG?91*;>66=,9+4/,'?:DF:G1H07@?&9'=(/G1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8349 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36880 42 161M = 37041 253 TAATATCTTCAACTGAAGCTTTAGAGCGATTTATCTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCGGCAGAGAATTAAGGAAA (-(=@A#A*"C0*62HD*3<;9@)>F"@A"D)=7776@7*3?4&G.F/9"HGH3@&$=>9,>*',(.FB$( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:143A17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8349 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37041 42 92M = 36880 -253 ACAGACAGGTTNATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATTCTTCATAATTCAATCCATTTACTA FF7.3%B(C/FF(;459E)44C<*:@85:HE?$2C%&/B+F=&83'G#5/D12@H(0A$-+/9E$*21@";,E:1/>-0H'.7&E#9971A$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T80 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8350 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29841 42 153M = 30039 255 CCGATCTCACTCTCCTNTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAG ?H8C=!&;4%DE&9&E6502?F%EA%'6G6%<14*'D=A"4(<1'C5$<8'*%*7@$/?FH%7.%B&**$;37)<>"%+E8+C=CEHE7#,,7/=42AG24.;;A;6!D:+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T33G102 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8350 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30039 42 57M = 29841 -255 CCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGATTTCCGTCTTCACGGACTTCNTNNCTNNC +$((*($'+"*%*%!&&(($)#&%+("'"#*!!'%+%%*+!"$("%$+)("&&!%"% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:27G20G1T0G2T0T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8351 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13057 42 159M = 13216 409 GTACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGNCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGC !!(+*$*($)&%#"$'&(+*+'+((")%#)(""$'")"((*)''*&**)#%!!'+)()%(%)$+)(""(&!+)"!)'*'"&%(#*+")&#%)#*$!")!'&%#(!!!!#(#"#"#%#&%%'$'*#&$*#)+*($)"*)&)%*$*$!'$!(!%''+)!(" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0G123G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8351 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13216 42 250M = 13057 -409 CAACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCNGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGNAAACACTGAATGAATGCA B<%BFG$(5-*0506"G7G?3A(0F!:3$839DH593#.G?+4)>3F@C@E.>?7HC9>2?4=C)?#>B."C@$:9;*53CD--9!G/;<=?H6H+,.B3@/B@$B/2!65*C>9@C('8;,<+$+53;G>3';(H"@#:*=64@5F;86)8;(:*"FB@5;.%8,*7<78%FGA!8)>!"(,4;'$<7AG!>+H28/:1D=%5?095+F2;+$?$B(=/-+/0&G*;//6(6+$'4?'?H<(;/)."-> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:85T145G18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8352 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28567 42 459M = 29026 617 CTTTAATTTTGCTCATGTATTTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAANCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGNCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCNCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCGTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTNCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCA A@:2.!)91&'H$>+'*C4H,$$D+$#>E#;>">48,52'D0F>#6>75-A@DD??"++4-2/%6(E"/2;1126'?GH)+F!F156,"5<#E",GC1'4%73@<1.'GB8)7?G@9D!$((3F6*F/!(&/5/.,,D/D&:=08H),;4!A1H!/4/.7$3+C;0A'H(D7B@:D%3G%)!$9>28><51D151*,4E8&1)=4#=-4#085C#F3!,G28*=F,)F/81(,'+@/?E,,="->G9"H0."E6766;1"--2:9G8.77A8B#F4#/D*"13?%0B.;?<0*4%-*=3@"==;:632.1-781("0<+:6;10"E<:63)E.CB*/(4,.-">:9A&19:G3?.1=@'D(9B$+4@:G4'9?.8#D5;-'E%".!8C/!)##:"'C8F'-*">!8 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:19A58G44T111C69C122G30 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8352 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29026 42 158M = 28567 -617 AGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGCACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCATTTCGANTATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTG 2,#;%H0!9&'@"B+6F3@28>E1;B0'@*F"5"?9?2,=4&9-B!',;.3<9*9E2>8+2C2407/$DEB8'9C+,.C%436=B/*%B#;(0D,8>#1./34-=<7C4?C!H%)@1:?%46=/&1'?"+9')+1&.?F2,:%DB7'%/=+.'G;6)1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48T74A5A28 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8353 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16990 42 59M = 16767 -282 CTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATC E.))6(=H;<%2-%99$&92;@?;,D7)H%A&#,@7)#BG2EF,41!"G39%'+/8;%@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8353 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16767 42 69M = 16990 282 GGCCNTTNNNNGTTACGGCCGTACTGGTNCGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTACCANCCNGGGGCAGGC )$'$!(*)!"()')***("())'")%"#%'&+*(!%+$#&)"&'''(!+"(#)!"''*'**#!#(&$$! AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:4A2G0C0C0C7T4A2T1A27G2G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8354 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36916 42 76M = 37065 205 TTNGGACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCNATTTTATGAATATACAAATAATT )"&%!++"(""$&!*+*)*'"(($$+*%!'!#+)'#!&#*+**"&&%'$+&#%*'&(!"!+)&*$%'%%""$%'"" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C0T1A47G23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8354 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37065 42 56M = 36916 -205 TCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATNCTTCATAATTCN :$3!3&EFD0,)>(A<.#+3!/-@:%-');F@A/!!$F30>'$2"29C1*(/(;3# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43T11A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8355 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25725 42 100M = 25349 -476 TGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGANCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTN 20'>@.+.59!8&C&4@1"E(>)E:/0-<-.;&%(.4>D!&4>"$E=-0G7&:8B#43/FE01@A&--21<.HE0EBB409>%:A:(!)EF8F(8C#F9$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G53C0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8355 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25349 42 376M = 25725 476 ATTATTNAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGNTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGNACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCAT #/*A,3,;B##!%@18CHD702A;C1H471GAC4G))%>-+#1')2<4%2F%7*88("6.2..+311".&!9"&/+&&B)G"#$$87B2A#HCD6-&>A=?54EF&<@=%,"E*;&%/">?6/:0HH=9,HG0!-1B!C$D"0E14G5EG1?G;0:=90!=4?2A6&<&C$(F;#BD@,).-B@65?(08(--:EH1.B*5/,$*00$66G":4C5C:24:'6B>/EE!G6CC+<'77:-0>6<6!>3"::31BF+A62%%8069=9.6=$.+9HAG=:!%2-39"?*-@",=<-796/7/GD-$&714B59!)B2*8/9>>>E'-?E5.F+A#5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T5A35T283A49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8356 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18291 42 214M = 18505 331 NNCGAGNCNCCTTACAGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGACCTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTTAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCG $#!*)!!&!&#*(#$#+)#"*"&+#&#""$!!)"(#%*")*+%)+(#!'!*"(#)!&($!(##!'$#(&%(&+#'#$)$&*(""+%(&&+)""&*)$(!*(%('(%%)))#"#+*!(!$!)'(%)"+('**#!+#$'!!$#&%$'#%'(!*!&)"&+$#*&%%!*&#*)&&*+((+"+%+$*$%#&*(%($)&*#**($'+#'$!$%$"%%('# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0C0C0T2A0G1G3G2G103A57G36 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8356 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18505 42 117M = 18291 -331 GCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACNCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCTGATAGNGGTGCTTCCGCTG (#*,887>+E7)8H)$(F)&)&F)'?@6>AG6)'6!(7;,&&H#H'5&:;A)#37B!*;0,>#3D2>1!72?=8,6+!841.*=32ECDH"+!38*G/-;%4(:(!E89+B/?/9:H>6GBAH9D=>40=G01/:C>@BF$>*5D"8EG9@B1>(&$FH9H3B YT:Z:UP jpayne@0: r8358 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42515 42 66M = 42098 -483 CTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGNACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAA 47,(235!)7D#9%D+581G3%14&?09.$F0G!+:@D<4%<3,>)6!#94@>C5((%<*BG/8D$!BB48H(7@,6)A3>H3A/#0/G74BE=4>+>GC*E:DD/?>(%H4@1?)3/%)>%43$(5<)1:F;2G#C69<#8@(;A';7)#3/6(;%,G:7@>"D5000+-<,-,6#?,D"5&'2<+&#G!#1273!B/-%982%#4':<+&A.G3/44-/E:G3,:7C?64+=26=D;+91!#D95F6>= AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:26T84C4A89C0G47C85A10A27A36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8359 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12342 42 84M = 12478 293 TATGGCGATAATCCGCTGGCGCCGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAANACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAAC E,%"%<7270C=4.>)=,;:H@;B;E<70A84%G'69;2E71+(:+>6.8@A"',:H<1:'/GA%1D%"B.36!DA>14 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T27G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8359 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12478 42 157M = 12342 -293 ACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCAGTGAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGT @GCH2:E!GG8@#C&8G;0?4>#9A.B;.2'6H-=@F;G%/5E91.F;54-98535,"9('/9,G$<=>>,2$1);%<,:G8=)58+)C,7<(2>+8E8")?4@3;3#B@(-A6=G:6("6C"@@04#-B=7F3/2:'G3*H4G$8;>9/3:.?F8+025)#%6?8)7E<=&&H>=F=:@4+50+8),+CFE;29$8F04H42&0"/.6D:/BG!771#?'1( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G33C77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8361 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22156 42 46M = 22375 286 NNGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCT !&&-4)376E!3=:,&3=> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0A44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8361 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22375 42 67M = 22156 -286 AGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCNTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAA '49*/?DD&::7$F,-.*BB:)0H!/E=G@E<$';B/#"GHH>G8?F*'+*3"D%*0)&%!%AB;2: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T29 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8362 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23229 42 108M = 23100 -237 ATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCNAATAAAGAGTCTAATGAGGTTGG G=,FH6%6#123.3>D!D7<':.5:6F1*0310:.!F=$"53%B)9@1@<;1:D(G0H-/&2%2C(3-;9*&D.DGDC<0F9DA$G.>ED'?*@7>"1:E?/6-445DA79?"B><.?4.6.#1C@;+G50*&>#DGE5&$'."<&:'D9+3>"3))43:4#-3')F6/*++3/,65>8#"6?38@@F5C AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C4G37C30C17C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8363 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20195 42 74M = 20055 -214 AGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGT C252@C2*/3(#FD=!$F>=$!A21(+C?#9F(+A%=:383"?D7;;=D);,80#F-F")**246E,?D95#AA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8364 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44709 42 56M = 44501 -264 TCTGNAANATGCAATCCCGAAACANTTCGCAGGTAATAGNTNGAGCCTGCNNAANG !)!&(!'')$"*'#!!+)'!'"$'**+++%%')!($!+*#*#)()*''")$$)*#' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4C2A16G14T1A8A0T2C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8364 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44501 42 44M = 44709 264 ACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACNG 9&9D-45/A)?!8#40?1-5:"D71000/*1#'0;3HF3H0!/+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43238 42 164M = 43126 -276 AAAAATTGATGGCAGCAANTACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACCANAAAAAAGACCTGCTTAGCTCGGTGGGCGATTTNGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAAG E,10(-F2H>C)$6!HG45"9-+?*@9D?DD:%"A/GCA68'0A%#77?++)E>.5A8G;)?B@!#&1ABG6%'*!"*D*89024>5>"$+0HD,8DA33E%%F6.):='2,)=*76>H%24(=A;1@-;5>><6H>H4$9GD:+'-H=:C'G40(9B,:5@D& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:18A49T31A1C16T15G27T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8365 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43126 42 83M = 43238 276 TCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCG ((-&!6A$:?15!)""-!C?,5(07,-!40=88%8D7'A&C#+109D;5G)-&4>'8/%,7:;!4E><-G#&67;G>C11($)=7'5B(."2+.0-%?$@D<;?B"/5):-4' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8366 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22647 42 357M1D39M = 22583 -461 CGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGNCTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCNATTGCTTNTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTNCTCTAACTATTCTCCATGAAATACATTTTTGATTAATATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGNAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGCCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTA 9)0?51/E-""<76D0;F#8>F44?!,3H=43D(5&&+#/4!>0>,!*.G#@%HF>1H6F%0'=/A"?D-*G%9:?@!/G2#3B@">/;=DA%01*",2,1F1#3"E5A.8/**/G=59:7)=&,)5/)2'CH);4@@(=1-,HF-0A(C?9*!&2A=6)(51-<;",H,3:HDE"BBB-AG1F=7&-D>B4@@>"$@F)$.; AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:37A31A7T85T11T23T71T85^C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8367 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22591 42 66M = 22657 284 AAATAACGTNCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTAT 76>,...'D=,4*&%2':5$''%+#29B=,H0E94/H>7F-$A&A::G"C0*:-##6/47<9$(:7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T56 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22657 42 218M = 22591 -284 CTTCAGGAGAATAATGGAAGTACTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTNACATCACCGCCNATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTNGATCTTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTNGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAG .H)A54F>1D<6D./'4&B@BFC0#+(G35G8&9F+3E#4';<8#1'HA/<9;:/*;922)>.H+F$H/6.8";"/7.$C&/&(*C=3)'"7+3$$8A,E1@&?4%5/&<(8#E!&)HAF5C,G1>>D6@7%D"/+2C%=+<0A'(F(-7BA@'&-00C$8;%4!GG= AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8A49C6T11 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8368 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10104 42 406M = 10510 483 TCTGCGGGAACGTGTTCGACNGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGAACCNANTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGNCACCGCTTTTACAGTACCCANTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATNCACTTTTCCGGGCTGACATACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATNCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGANGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGAC D6;74#:)C?<+;;#=4"G20;#:46//<(--:G>,#A>40!%G-;C%,!?%:C2'&259;@BAE*E40;&*28?<33'7'E8#>B/3(C=!D7@E1;:!):/4F!/=/,8$='?#B$5B&:2D%,D#2=4&>.,@0C1?GB46B0/4/(8$:5,8/G$C#BF(HGE9E>6=5!=F<4,?;,@/B1EH?8:1#9G9:C6)<2'."H$,$(6'?*()1)BB,5(@ED-7##A7D$5.B,>=)B#%@&;*E9$0B!+!A<"++C$C4>)A'=*1C8A26)&+B$&9*)-35..9?FB/'.H98/&%0&D?E*99,D@(#%0;272)!6"D AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:10A9G44C2G1C47G20T26G17G30C75T114 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8369 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7887 42 196M = 7809 -274 GGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTNCCGCCTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGNATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCG -F?*::(/8%":7=2++3G(/86F91*71A%4$:!$0F$!:H85-#G+,/$48+-#22$HCE::1$$C&8@$1(9:'5*@0+<&:DB6<:123)0/6)#-:06-@>&C+1$:,&!@9+.9H38#A&+9>.8,+'+/E!@/$-*"*C-F/<9#")GB(9%A&&D+?:&:.E"=<%0A:A*D9:92E'"7&'1E5$12 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G40A33G110 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8369 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7809 42 64M = 7887 274 NGTCCNNACTGANGAGNTGCGGGNNCNGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGNTGAGGAAAAT %&(('$')(!)#")&($%%*"'#"%$''+!!+&%&)%&!$'*$)*"(*$$(#!*+#"()'")#! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0T4G0G5T3G5C0A0G1T26G10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8370 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4820 42 40M = 4981 232 GGAATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCG #*!#+'+%#&)#$$&"))*'!*++)(*'#($$))#"!%+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8370 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4981 42 71M = 4820 -232 CATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGA =4CG%@+'23;=.;-$=>&;$*@41C9!&%*H(:6&580>>GH#G9,&A1/1.(4A+"=%GC';(9/A54H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22639 42 207M = 22846 467 TTATTTGGCGACTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTTCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTA G+6*32$.10=?AA3=BB4FF"&7*=!0+.!G3-!?F2,612#4@CBC)$%4F&;E.;-4#:F&D5'.#GA&6D0>"*B'9?C@?+>@+5#.B;C(1+":D1(+(G-*DG=C*";A:D;;E!G*6H67!96A>@G8C2!3;1,4FB,?)E(;(%/.#1DH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T195 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22846 42 158M1D101M = 22639 -467 TTATTTGGATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTCTGATATCCAAATGAAGNCATAGGCATTTGTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATANNC !1:5B68::"-*;('C047HE(324C):#&7C$@3-@:<#=./B23./F@"1'#@!9H4-<;:"C88@=G->'"(5D44$B%:1A42./%-G,C0"0+A76<"=1).3H&#=/"%=(86#06#G<36"@3+$@*;2AC8*/@1(/A>3),"3'@*G(6(6"2E5-$9G(,+62*2$'( AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:7A109C40^C98A0C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8372 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 753 40 68M2I32M = 953 271 ATTNGCGCCGGGCTTCGCTCANTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGG "(!!+'"&*))(&)%+$$(("**+&("'&)(%+&&!#)*"%("+*))!+#%#(+)'#*""$!(#(&"'+*)#()'!%'!*")%$*)$!$&)"('"#!%*+#& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0G1C0C17C78 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8372 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 953 40 71M = 753 -271 TTATTCCAAAATGCTNCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACACCCTTATCNNGN "$("&'')!%$&&&("%!"#*!&+&++$+#$)""%!($"'#$'"#(&"$"&%(#)*+))%(*#%!'(")*) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15G51T0G1T0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8373 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29070 42 122M = 29288 260 CAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATA =.6-BE*2C*.DC73"'%C51?E+!2(1#C%+C8>76+E52&,;$B(D<;.'$H$%(,;9E7'(&=4FH-E.>#627,,EB"/?,%(-%+G2:G3*>=%23>$90(;DH6G%H+25D2;6)6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8373 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29288 42 42M = 29070 -260 ATCATCTCCATAAAGCAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATA >8FD:=H1"./*$"4G9A!-F;(=,D@0!G49;+>7$1F5,) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8375 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5016 42 338M = 5354 451 CTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGNACGCAAACCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGNAGGGCGAATGACCAAAGAG 26"8/F-;9*"GEH+C'<+92=A"E;3/1#"60/)"$70<9@"#(#%5H%*42)=F2,;4DH5&'8,,>&$+D2>*&(CD'0/489&+0&%.D-83DGG69?'2E3C40"B9.,&:30*$2//&,&0:+F9-=""+/B'7-2:E+$2DD17A'+6H-2)'"6;>0&<13+F1?#<,?7>7,9F;?A9$BB8D!0?D=1C&(?%8DC7AG44F).%3HF76AH:-1&)&'/#5G.=#3(?>#>9*18/,;+-+5(B"'FH5/5E%,.+#%5/B':'?+!315<;9&@+71-%%F5%F@E5C*F*?9&822@H&:/F$D5%%B%94:HC8+$G)?)B-0# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:119G6C191G19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8375 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5354 42 113M = 5016 -451 ACTCAATNAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCNCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGTGAACGCGCANAT 3!'9$"+HD,B!-F*3A75)F>!(=C=C0B*?7G4<$G@A2@7"7'4"A&)#2'$:')765'?CA&,&#$@;;(55G$2A;+7*@8:.0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C24G77G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8376 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23080 42 64M = 23080 0 AAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAANAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTAT F-5,C(5#7BB5F<,2!5DA>A+C-+27(+-D&.'0@+0:8D>&?%G?(C>>6B??"/1F44/!*C/;&$F826&-/=0:3<987,;>+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YT:Z:UP jpayne@0: r8377 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43398 0 * = 43398 0 NANNNNTCANNNNGTCCATCATNANAANANNTCNATGCNCTNAACNNNCACNACCT "#!!!!#!!!#"!!$#"$#$!$!#!$!"##!$!#$$#"""$$!$#!!!#$!"$#$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8378 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21518 42 102M = 21646 323 NCNAAAANAACAGGCAGTTNCGATNACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCTT &*+#(#)"!+$%$'%&#()(+*('*)(+#'&*&*("+"'$'$"'&)#!&"(+)$(+(#&*#""'$%"+"&)+!($$&*(%'&+('%)'+&&$!+&*(#'!)$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A1G4C11T4T75A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8378 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21646 42 195M = 21518 -323 CAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTCTTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCC 3!3G8>:*H*>436"CG":E+/1C6)G37/EF3:#B<,%=9'G=219G"2FG;HGH(5D(B"5#!+/=CD3C85G% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79A115 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8379 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33869 42 75M = 34074 266 GTCGTANTCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACT '+"&"#"%)"!)'+!%)(!+*#$!*'%&*)+!*"'()*#'(&$+"(''%$#(+$(*(!+%(+%)#"$!!%)')*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8379 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34074 42 61M = 33869 -266 ATAAAGGCCACTATNAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGC $;/C-6A063,:?&-%C70?7$#? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T37 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r8381 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27856 40 163M = 28109 303 GTGTCTGTNNNGCNCTCGTTNCCGNCTTATCCTCTNATACNTGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATTGAGTCTTGCAGACAAACNGCGCAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGNAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAA **!&(#"'#$#')!&''$*%$)*&%*&)&!##$*#!"#)$+#!%%'$*'!"'!!#'#!*#'*#'$$+"+*+%+#)#'*#$*&")$(+&+$&$'")(''%(%$))))#&(#&%%($%##"$)#%'#'(*))&$&%$'(*')"'&**&))+"#&''("!&*"))# AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:23 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:23 MD:Z:1A0T0A4G0A0T2C0A1G2G0T3A5G1C1G0A0G0A1G0A34A17T37G31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8382 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7515 42 75M = 7700 242 CATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCA *)8>*79,6GE43@5:@416(3%/7+3("C))<+;@%6G%6=:HG?$A/>&B"8'7BE3.4D"@1.GE31<+9FF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8382 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7700 42 57M = 7515 -242 CATCCGGTGAGCAGNCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATA 2&&/'H>:,;A(4/9:F!9&@*%6#)2B);D.G!:-;$:$>B:,&;9*"*>+369?D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8383 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35021 42 24M1D249M = 35295 362 GCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGNTATTCTGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACNGGGG F;:3&:;;54;85)194&%>"%G&=1&(?;//!)A501&<6B)9?AG3'1(:0HF#D0F6(G1"8@BF#E'=H::G%8<>.+A,;&E4EF;975#$E5A'4)6(<)6,0?!+!(&.%<7&=233B/2;C+@8/1G?B//A1=5'#<%<64%6HE.,*$3+$1F>E(HA=//8.?"?2,FE!2#;A$*@?B>!(9@DA=C:10:G!)B)+'6D3%48!#"$/DAEH+>D&,1AD25H-5>1=<>-82$;?H94E'=9!(*4E,5$#F(>=<5@< AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:24^G102C23G5A111A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8383 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35295 42 88M = 35021 -362 ATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGC 1!H#1H=843@F=?@<*$2AGA7F-2(A00.#568:=3:EC28D+$;=H$GD?2&:1+$3#9$#2:&"<#.:H<867!!1--7E1"2/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:88 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8384 77 * 0 0 * * 0 0 CTAACTTTGTAATCTCGCTAAGTTGAGAATCACCATTGGTTTTGCCAGA &(C?D&'""FF5#H*.:;5F1?5)0$2E'5F+2#CD/&8$>$'6(9G:!)5!!#BDB=@FH40%"D/*(;23C#$6204%"HA2A!3?# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23A13C32T12T26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43062 42 90M = 43223 271 TTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACCGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTG 3/*F&=(53<2G/CCC"7'15+)*-D)7*8E-=)G.6/C4GB$B$E>8>CF639!2C&95#>;)DB#$F)?<.!/?)G-F$AD(83H52= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G63 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8386 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30242 42 202M = 30183 -261 TGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGNTCCAGNACAATCGATGGTGTTACCANTTCATGGAAAAGGTCTGCGACAAATCCCCAGTCGTCATGAATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCNTGGNAAGNN ''*!$(+!&!+!()*!!&"%))%*!#*&&((*$!)&)$&#!$(#$)"*"&#!+'&#$)*"'#""#%%)())+"'&+&!))"$$&(#'*%**"#&%$"(*"'""%$)##"&%"+*%'!&#%!*"$#+%($'"*$'&')')'%(&$&)(())%$"$#*+))#"(!$*)%')%')+!!%!%*#+&(+%'$'+%'*(&&'"&)!)% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:37T5C19A19T19C88C3C2C0T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8386 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30183 42 59M = 30242 261 CTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTT 25-C,%G:/&9?&,268+6G*A1?C<6@FD"<"90%G/45"$?E1E#G!GGG.B7E;>8=/G* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C38 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8388 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29835 42 48M = 29961 188 ACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCNGACAT B3<-/H52(F6(=H.)2%,7'/="A15<4(.1G=H@4&7;!335 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8388 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29961 42 62M = 29835 -188 TACTCACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCT "2::#!11@2)G-)=%EHH8E/!2=#(&E+0@"E7>/<#@26"3$;"&6-*@.<"B+>@A?- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8389 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13915 42 55M = 13648 -322 TTTCCGGGACGTATCATGNTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACG >!)7>E;C5<.65DE:299841F1"0:9%B=4E94GBH!F1-F5-C,B7)2#72BF(=?9B:G2@9?:-%A97A9@C3/G4BC07<5;/);BHE./5$"AE?26;?'"2"F4@B+<9/2B3&-;!2GF)5#E/476!7/'(8!-'6?20$=767%6,.*<)4E204,.(-%>55C%)>7,0FD/<27>@$7A2"@<5!6-48 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:48G9A13C63T130 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8390 77 * 0 0 * * 0 0 CATAATNGAATGGACAGAATCACCGGTAACTTGTCGGATCACC "&$&(*)+'"')$#'!$%#"#*+(+$$%(!$(&!$'("$+!$$ YT:Z:UP jpayne@0: r8390 141 * 0 0 * * 0 0 NGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTAATATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTNATGGCCTCCACGCACNTTGT "2!%1,9H$%=,.5">)$":=">!,EDHC3DHA)>$.B1!67/5?.?&/G?(5*+#AC%(.3<7!:H#H83*&6!EH2D3:!0F'7.-9%#A2DG%(6%-;,B3AF9BE&<,"!EG<5,'FE#%9+$ YT:Z:UP jpayne@0: r8391 77 * 0 0 * * 0 0 TGGAAAACGTATGTAATATAGAGTAACGTAAAAGAGAGATCCTGTGTTG A;6!*,82D>"35,//+%;H$EFBA+>FF#BC9;%#<&GA6D8CA5GA-*"7D%72 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G34 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r8392 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36119 42 79M = 15765 -20433 TGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGANTGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAA A2EB3*#A*;%7%&-#<E>#F""(/76>/E<#E/;*;!;#05A&?&)@/H;"8,#/,C)*3':941D?'9**H=?6(")<= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8393 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19921 42 226M = 20147 292 GTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACNGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGNTTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGC /G=/B:5&E#D<&@>6="..($0>G-=?6A4%1@@1&&2;@1?%2:?C.9$&D;C)G$8$+.A$.:*E:!-&.<"89*7H,*$C4"*9(68=B3.D)*D%H)"0<#<8C+:)@.*7"3"(*%GD1>4>>C7D>?+02"D:%..)(BEE&.?8C04(79FD77#/?.46 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:100G76A0C47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8394 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39068 42 104M = 39068 0 NGGATAAAACATNCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAACCAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAAT *&&CGA;G''3:'EC,(#44991?(A42#,>/!C.2'.;///=0?>H94B))6H3<);3B%"*'=(0*F1,B-B(!#"-"A)=A?H-*$!A)B$CE2)6A"@5"*:4D=9!=A$G$6;4**/!H75.7"HE'%$'H;!$">40C"=.G.<9>F8.G;=* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-10 YT:Z:DP jpayne@0: r8396 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8293 42 7M1I91M = 8510 259 TGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATATCATGCAGCGT 627%9?HC79H&62&$D?)8G441B)9%/-!0;D8:%BA0.GCE:8F=/!#(?=EG!;,>#00B?C<3,(@##"C("7@"'-99-FCG(,H29?8+7"% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:86G11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8396 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8510 42 42M = 8293 -259 GNGCTATGCGCTGCAGCATCAANTGAGGATGGTAATAAAGCG C<;/CB@F.,-.G/"?:,'!+*8!05&<=,*)D4!%GFA/+? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G20C19 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48255 42 54M = 48088 -221 AGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGNTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGT .9;$DH*:'5%5:.!52;D14--2@1A3.+#B.,3$G4;)&4.7-3D-<1!$5@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8397 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48088 42 74M = 48255 221 GGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTC DH$H=HB0(3D6$H/A4=BF>(.60,H50@=?D0C?;0,E>28F"?>16+-,&<%G594?@HDCF#"":6"E0*)7D"!H<;*A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T74T32 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8399 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34398 42 59M = 34505 226 CCTATCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCCCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCG ,"FA8#395C8G=(F4-4FD*<)@+.4F&$1.H4:;EACA50-HB,*F(-7$)5< AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G29T25 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8400 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45857 42 27M2I60M = 45695 -249 ATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCG <5H3,6&!$E<'.HDE/94#:3@?>D800E:-,75?-$"1&='BC>80179;86780B5,-CB/:2<-*&*:B:B;;6+4$6%%(36;H AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:87 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8400 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45695 42 114M = 45857 249 AGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTAC /*-8+&(8*D*/63@A5:8<;%AGG@(4=.?(<#1=4-&3!79<+<6F/<8"?@H"594BA%(9<.068*B@-7G)9(52G6#$,17. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8401 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39259 42 49M = 39095 -213 GCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTA 8)*@D)@,5GG;<83'+/:;)2EB#G>:GH31!3-##@3*C=G;7D8DB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8402 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32791 42 47M = 32648 -190 GTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATNN 5E&1;!*).H,7>4@G$,9CA6#?'#FF3C7#FB%0!?"D8@0";$$',#-+GBHC>D2A:?#2/9)E8D/F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G28T9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8404 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10306 42 158M = 10464 491 GTNNAACAGCGATCGGGATATGNATCCGCTGGATATCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCNGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTT ###!""#(($&%))&((+)&"&)!!#&**$'+*(%*"%#)**+'+&#'%&)"*()(+##&$#)()*'%"#!'#$$+&#(&')%%+##(&#''%(#!#*+)$'$'#))(+%'&+)&**%)!#*##%')*&!%('!$'+%&+)%'*+$*!&+&$&"+'+) AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2T0T0T0T8C7C11T57A65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8404 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10464 42 333M = 10306 -491 CCCCGGATGTGGCGGACATGACGGANGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCGTCATTTTTCNGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACANTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGC .@7C#9&3.H029#'/@/&7%)F$2&%1)(@-(#91!$-D#G-67.$-0&(;E'+@.$5=H3,3G9+EH>/H<8./9FEF$F81AG@)+A3%=$@&BG+-A?G?G?03:30G#A$;9!**2:DAG)"0F)@AA2-:B43FC$&5!%6*%@-=8("+B9(!*G/27./?%!*4/7%$2/>CF!F#GH2&B6!9(G%6/9D61*B)9>@!;('(?C>C!=+B2-F.;8G+C"=:.*+E)9754&A3>/F5@E67(#/'96>D.A9?71>G<' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25G144T44G117 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8405 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20621 40 76M7I74M = 20783 244 GCAGAGCAAAAGTGNGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGNCAGAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTCAGNAGTGCAACCAACAGCACGTC (?2GD!A*3$&3>3=6A*4B7'0@E)A0*11(=-$8C8*2;,0GDEH&H@+0@F'6+&4$B/E!:D0B9$6/C3<8'>;%0-.5F$6.!+H+(>271A/GD0=@?50/*6'">%<4!"*5,,;*G><$$7G"C>A'6;"=G"!F'3; AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:14C34G2A76C20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8405 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20783 40 82M = 20621 -244 TGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACACTCCGGCACTGACCGGAACGC &&:1D8";.,/BH20#F9+?,5;6(B4"3,-=*8&E=,3.%4?A*,#$$):C!,72$-#?56E&=4D/%;&AB&6CF'=!H=$&@9: YT:Z:UP jpayne@0: r8406 141 * 0 0 * * 0 0 CGCTGNATGACATGCCACCGGCCATTTTTCAGTTGCTGAATAAACGCGCCGGGAATACGACGGTTACCCACCACAAGCACGCTGCCGCCAACCTTTCAGGGANGAACGCTGCCCCTTTNTACGACGCCTGCGGCGCGAAACGACAACCCGCGCATTACNCAGCTTGATTACGGGCAAATCCCCCCGGTTANCTTTGATTCTGGCCTGCGGATTTTTGACCGTGGCCCTTTTCAACCTGGCCCTTTCCTTTACCAGTTTCCGGCGTACCTTT *'$'$!%+"+'*#"$*()*$*'('&!"+!$"'**!&'')++$%+!!$($"%*#&+)(%&"!%*##'%*"'&%*+%+%(%(#&$#+#'"(!(#*""*!'))*"!&"'("'+%!(#!(+#!&#&)+("+$#*"''%%%%"+$*!*#$((")*($*!!**&)(&!)$$)"!')(!(#''()"")'&%&$)%%$$!!"+#'#+$!)"')!((%")"$""%&)#'&(%%+'&#!))+$))*!)"&#*("(')!+#$!"%%%$%*%)'!$#+(*+'' YT:Z:UP jpayne@0: r8407 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9664 42 282M = 9946 423 CGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATNCGGAGAGTCAGCGATGTTACTGAAAACCGGATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCNGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATNANTG 62&F/.G+.9?'5)05.$33?)?HC2,=:H,:,8=6:7H30&F)35@+'9E?1%"F&.8"?8$)1"9*D%*&;67'<591.=&DB-&06%F7/=>0C?H'>;G4*;)56@(@((2<'?*7@.&5?B?%C5:7$D"@"@CE8A2G=8=&47C0(;351'8#*84("8CB!-!&71G+*)91#(%A78+"!/DG==GG4459<'>$2.EDE7.A&0C89C!D)(20$(B)!3,@E&:"1598?,/HC+HF'$39F(--1%.2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33C18C10A173T39G1A2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8407 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9946 42 141M = 9664 -423 AAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGGNG $'))($(!#%($%*&(#$&"!%!&$'*&#)%*+#"*"%!#!+$%*("&(+$!$$($'%%+$%')&!%#)&'#)*&+'*"$($'%'&!)&*$"(+$%%'+#((*!#"*)#%)!%('())!+)!&%!'+&+#')'"(**#+'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:138C0C1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8408 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42013 42 200M = 42213 381 TACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAAC 9!%7#!;":E7EG30672HG)#CB638'?3A5'B&HG%/D.&"/+D?=3D+";:+<29A0*A$+D1"DGC,H!+$346B"/@7C(@$AF4:<6C3A;;&;%69'=B:D/9%$8-63<>;16:0-B+;);B1H9-98=<%7A5867)CEG(7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:200 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8408 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42213 42 181M = 42013 -381 TACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGTCCAAAATCGAAGTTACGAACAAGNAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGNGCAGAACTGAT -"H*=+8"%<&-=394=?(-5D&.A>:>'&8,F0E(1G3%.9>='9-11;(CHH"HF8-.-?0/$0+-C>A4B"('#@$-(/EA6+H,<;<91>:E*',./45>-5.ADB:>;E6*% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63A23A81C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8409 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12689 42 126M4D50M = 12599 -270 ATCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTNTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCN GG,1+*1;<(33?,%:BFD$$8BC.+#BF295(2+3!19=:%0":9D"*=G1'F25"+78'G'$,6%45G7/H39@9,0&1&H)06(?;$)88=AH<(H:,82((+G/+<2G=3B;2+43",=+A+.E'&%>D8>=90-G+&(319F!B2/-:/(61"# AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:28G76T0C19^CACG49G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8409 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12599 42 67M = 12689 270 CATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCCGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATT -@=A%'7,+<&'BF7@5F0-!;C<1!!7'<)9:@":=,'=6&;,2.29+.2&72-1#(-(B.),F?@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A40 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r8410 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10295 42 194M = 10489 321 NTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCTGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGA $8"F(>/.1E9!1.<$$"&9-6#!3B5'3&(HHD%;B.?95(D)>)*%-6=$%DG/GG-="7/?668-(D<$,;#E<%G9-C7:(+577&E<.,.#H76(+5$+@-$8H2<:1GF<<23?61:>3:>6*#!E5.5),@8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G193 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8410 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10489 42 127M = 10295 -321 GGATGACGTAATGCTGATGNCAGTATCAGAAGGGATCGCAGGTGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTNATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAG 0==:D@C#.C9,7DG,+)7E';7FC.A5<%9G8HB)>@=FEFEH&68G48*9F--+-%4*E#+#99?A9*>AF18"F.%!;#+.?1D'$H@900G31E%.()E=6E28-B&';53'<6/>29<>4#3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A22A40G43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8411 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4624 42 147M = 4771 218 NCCACGACAGGCCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGC (A;9G3(676G:0="'3,-F7!'E,'$2G"($(?6F*6:7C"F#,DC3:?HEB@8--4-?4+D;D?6'0.&C7:9+33FF2>=<(#E@)?=B:B1:&9C;#7-.4H?,GF'%+92F22!66)C,3>$@.)75H$)>H:%D*;>G8:% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A146 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4771 42 71M = 4624 -218 CAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTG 24!HD(GBC89$E(D@5"E4B6B$?$G/*"96!:-'<'6HDD&;"($C95)1@,BB&;+5./',#>H;G6? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8412 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40399 42 45M = 40205 -239 GGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAAC 9&$533D&:G!(%G>!3+G1)#;)1,H625$!A/)9D0-%D0D,C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8412 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40205 42 65M = 40399 239 ACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAG /&6?1+C41(>64@"!%H/4=4!A+*5D33B1%;C-'(G:GF(F#B5("$.('-93>2/=F!/(; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8413 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39823 42 174M = 39763 -234 CGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCNATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGNGAGGCC ,E>=02*@>&#@07<1D28)0)/:F+%@!6H1HF#*!HFD)H&E&7:46.93;D7HA06>ED=,@#5#D)G.GF*<-%.?F*@)=@#1C(>,H!6?4@!,;#EE3?)6%*%<"))+4+!)818$.%$(8,*E>5A+=6.G+';+":/!<0%5'8EF>C;6<)C3",$7$@.&&. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60C106C6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8413 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39763 42 52M = 39823 234 GCGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGG 73+1#:A2++!=#B(0!?:506':>,(!5563:35'&#F>#32!(:+9@&-( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A51 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8414 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38234 42 10M5I226M = 38470 303 CTGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGNTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAA (#+$*#%#&#('*+'+*($!)'+"'#&!)+)#&%+'"''"#!$#%*)('#+*!#$!!*+'!)'!!(#"*#(#$*$#(")%+"*!)(##)+!!*#"+&*(!($"+'+#($%'+!!*"'$)''*!*(&!()'+&(+%'#!#)#)#!+#*'$!%)(!#)"*#$'%%$(+$'*%+&'+"&#)*&%$##!+'")($%''!)($%%+!%'$)(*&*!$&%"(#!("!!%%)#&)$!*%"*$+(!&+) AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:1A67G166 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8414 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38470 42 67M = 38234 -303 GTCGCAGATCAGCAGGTGNAAGAGGGACTGGATTCCNAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAA &,$:3%<4D%$*&,"8@*F00+=H(>2&/8*3,H>'!G%H#A<6$!6*BFH:A,@<$';./$6+263 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G17A30 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8415 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8163 42 67M = 8262 238 AGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGC 23%1B47/3"C"=B+!72HD9A:0"*?F%(0DD9B8+?;'00=.&(:6.8'>'2C-'.>0/CCE>3,1!;.;:=-1B+E@/ED85+FFC9<=(D/50$C#>*G')B(,).+.2*"(!F!<<*9-&E<)A3A!6E39;!?,3E%?B%D6C:51AF6-9"C(/9?4:*"0>;4'8+,F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8416 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44115 42 120M = 43953 -282 TATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAANACTAAGGCAAAGGTACTGCTAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAA (+*(%+*"')$$%'&)!#$!+$#('#!"+!+&#!*($*%*$%%(%"$+!'("!!!&'%+#!&(&%$")+%!%$$)*)$('')*)(("*)&)#)!)!&#%&$*&&#$"$(+*+##!$"+'( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T19A59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8541 42 94M = 8409 -226 GTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGGATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCC D<9(0C)BD#'+F?53=33+>1!&9",24/AE?BG+5+%1H31,2>=FE@#4@B=FE"%&3:EB&/:&BB(:@G65???**6D$%/@(90-43@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8417 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8409 42 86M = 8541 226 TACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGNGCCTCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACG GH591*3A:?'!=F?0(,D8E>G=7<:)!D"<026*?88)F4BF80C=#%89F"+$>;$G'752;H08C)(FG4C$=C=*D"@#,G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T3G47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8418 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15223 42 61M = 15018 -266 GTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTA #F*00@E91E+>;:-5-,H*@7D5.%8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8418 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15018 42 41M = 15223 266 GCCTGATGGCGCNGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCG (?H:$6%4#3)D!5F#>5'3<5)-;)G6.&H8>7')4B20G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24837 42 93M = 25097 318 NGAGTTCCTGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTNGTGTNCCTCATCT #+#*%!*!++!"++!#+#)&#""!("#!'+"()%!+#&$&+*+""%+$!++('#('+(($+&"$'!(%%"##(#"'!)")$)''*%(!)(((& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G7G70G4A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25097 42 58M = 24837 -318 AAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCA *9FF=EA5":8G5-*.">/916@<<+HD3<9=")G"+,>0?$2GH!6";)",$#?=;: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8420 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9824 42 68M = 9580 -312 GGCGGAGTCAAACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAANNCGCCANAAGAANTNNNGNTNTTCTGGTNG $)%)%%*$&()!++!*$&%$)&")+#!$")"%%+%+#+!&'%((&#*&(*"$*!!%"$**&*)&()'# AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:10G26G0A5T0C4C0C0G0G0C1C0G0T7G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9580 42 244M = 9824 312 TCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGNCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACA .+:D.#D9=GB@.%B;::5'@>5$0/;F+E6%E6.7GFB-(%'/)92/G>A88%C.;6#9(97)A>4!/&%(58'-!C.#8<+*1*D.'G?4%(E@#63-C"43D7-3,=+H"*7+6;E44.>3&?0/!66-/=(DA!H2A#'A73#;G*/C$;<&0C"5;67> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:195C48 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8421 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27975 42 91M = 27975 0 NNCCNTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGNGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGATG '%#)#+&"$(*+*('#"()#%$)$(!*"!"''++*&&'$!$)#$%*%'"&""'*!'$$*&%*%*)'"%$%&&&%'$)#+#+!#*#(()"&" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0C2C53T32 YT:Z:UP jpayne@0: r8421 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27975 0 * = 27975 0 NGGAATTNNGTCNGCGCNTNACNGCNNNNNNNNNTAGNNTGNTNT "#"$##$!#!"$!#$"$"$"!$$$"!!!#"#"!"$$$!$"!$!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8422 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34678 42 35M2D128M = 34589 -254 CGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGANTTAAGCTAAGANAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCNATNAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCNATCTCTGGTTTTNTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCT !+%!++$)!+(#*'&)#!+**"#"(!!(#%%#"$$(*!$##"%$)(%#$&"$"''!%'*)+)((%'%!)$&+$&!!!)'!%+(()'++))&"$*("+$!+("'!("$'$&%!&*$*')+$!%'))&$#+'$#+#"**)#!)%"+#(''*!#(%#"*+#'&(+' AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:35^GC19T11A30G2C26A4A7G21A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8422 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34589 42 50M = 34678 254 TTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTC AH?9&G)$#38))$B+&87=5!*DH3E%,1!!6:G30;);-#;$0?B)D* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8423 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32915 42 71M = 33121 257 TAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATCCATNGCGATTCAAACA '?"!A.5ED!#=F&F'&04$C#<'>>,64!F7+?.+80A80-EC08==:;.HEG>8:-**?$(6%9+F+;, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A53G3A12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8423 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33121 42 51M = 32915 -257 TCCTGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCNGGCTGATTAGGA 01'7+F,E'@&D-2-G%,!;4")@&96:D:*A3($=C+=B<,>(43*D?8G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G12 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8424 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36548 42 183M = 36381 -350 GACTNTATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTANTATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCNCATCAGNGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCC 01:*5BA$.:H,$"54D-C,>G::A.#-FB)'6:)%G9GG@2@+=:71+<.#H?,!84,3+2B&.9!$,D(/3#6@9H!G2*<75?2*-;G("@D#+!/7;.H*C'8&B=&*)<1&;CD%?!!46%:5'6?=:&*;F1#.<6,:+'5??01GG4?-9"82<'>B/45"E)3;A!%D1','$F@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4A54A92T6T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36381 42 131M = 36548 350 TTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATANTATCCTTGGC )#<&*9B5:G$3*FAC(.*:2B.)3,H>3"H0F-0;F;0G%#CC3EA5-,)@1,/B!!79'-1#H#)1G1A:,"/9/9HA#2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:120A10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8425 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30374 42 164M = 30538 319 TCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGNTCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTNCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGT !245<<3/B?76'&?A3!4)!*9;0'4*400GH81:E?3?)04B5#,><-C-4-=E0$*-*=75"2?(8(FC("C&+=C*+9C8A(A>$=)#FC3C9,3" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C53A23C85 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8425 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30538 42 27M2D126M = 30374 -319 TCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGNGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGGTGCNGAATCAATGGTGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACNGTTGGTTAATACGCNTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTG 74-B#<:;7/&G32+;;A+55A$5@"20A6D;;48H*)126BG%4):>/F:00.6.&G+G*B"&$'.*>FF-(,7--#/,>+,8$+FD(-C3,%"(1(&*65>B:,*@#,,64@F);58F1'"F$@!,!="8/>"BA AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:24T2^TG22A3T9A29T14T44 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8426 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20733 40 91M = 20920 233 GGGATAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAANCGCTTGCTGNAACGCCAAAGGCNGTTAAGGTGGTAATGGATGAAACGA E(;-5'/,%4D#7;%8%D%./?(H"*G+:*:>D+<3@?H1'92(37@A9AC<>7B!,/+?@G"0E"1+F@;,EF3@7931'85G7C/B2*)G,4+"*!43H!%+6 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:27^TATC15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8427 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30441 42 65M = 30250 -256 CTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCNTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTC :=H#'DC54/G%%,-.)<0>H8'30/8AC6E?!8,C%@#%+C09"#D"?E547(FB*!12$"BG) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8427 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30250 42 63M = 30441 256 TGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGG +")&&$%"'$&)$'*#+%)%)+&$")+*(*##)$*)'+&+(!)*$+%%##(%%!"$*'%%$$# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8428 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41912 42 50M4I269M = 41855 -376 GGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAANGGAGGACGTGTGGCGANACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGT B0!$43E,7-3F%A*G/)%;*.,5%1(:H4+>?'?83986&B/H36FFC0>%8@#012&*"=.':$F3&G!!/14)FE+6/$GG)?@DD+:@!.F@G,G+)@2"D23;@C386&$?68.G*CA<1@5F4<8G;+=(%3)<==:0*$<;+'"02FD+/:C%%2(G*&C7<)$6+<7H,!=00E5$GG+';!-72A':%B@3;(?GF?#6H+G=5FE"=$-!/H(3F.4;!)A',1#*:E/:&(::A63!H6$D'=8*@F5:C04-!,2:0+H:F::?%.62&*3H4$B35/&<$17&"EC(,2+!09" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:168A16G132G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8428 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41855 42 57M = 41912 376 ATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTT 43D6%(!%63&=/9/*'56CHA6!-CBF8(*A>>19:HA;0B<%,D!3&<+%E/:1@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r8429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45528 42 84M = 45384 -228 CGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGA =@B'4(=$&C%%,B8-729*F4?)$6B?.:?(;A9A;,F?#9!D@AC5+:<(28F@G":(D02!B%87>%>4E%F:0,"55(%)CFH-,5&/4(78;).!D?HC*)&(%G/H>22D(@4%H=6;"2(=&9E@/>H003)?:&/4E'B+D)0=CF2(*)%;GEB8/;+0-&D;>/*F!3;=C'B5:3!@8)(D;G07)15#=!;:7:@=A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G2C134 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8430 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2261 42 92M = 2110 -243 TACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACANTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCNGTGCCGTTCACTTCCCGAATA =;/*G>3H9;462#(3*0.599A=9%?9"+1%=;A-"D"4)&D?2G0*H6!B;EG$FAG6B23)7"F,*7H6=3";5EC%7E32(-!=08-><:(@'#=')$:6<@F;"&&H$80229+"8-A&F#943:-85&(3@88B2H8":(HG)>2AC'CB8&4$:40@1F8@.6$8. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8432 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22631 42 86M = 22462 -255 GTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCA .+7G#!))8#B)3-842,;&?97?'"$6H7$':2;<5+0>$2#?E1=D*G)"/<;!50G3?(-"75&,9E$A.,&'84F?H)-B2* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8432 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22462 42 51M = 22631 255 CTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCA 13'B68-1DB@:<';201)(H2,69H5@#0G#4683$?3;9*-F;G63G4+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8433 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11604 42 63M = 11514 -153 CGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAG 17D;DC,5,!*35-5;%3&*EH&&>.",5'$';7+6"DD%.8($+46<&!#$*@#E4(3A:D+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8433 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11514 42 47M = 11604 153 CTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAA '07$G!+6(,*2:=!?"F/&G%G4?B>,F((2/#;!0(CF+:2&4=4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8434 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31016 42 102M = 30772 -346 TTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGAATGAAATNCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCA ('(+*'%!"#"%(!$(&&$)!))$(*$+'%$%&&("+*+$%+!#&&)(+"'*"%!%#$'+"+!$+(#'"(+')"*%*+!&+&"&++'%")%'$((&%""*$+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T7T27 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8434 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30772 42 73M2D169M = 31016 346 GAATNCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGT ;=*2@CG=F52$3-955'64AG8<&?614"C8#H;%$A#=B!:";:%@C5>>&(:#'?)=$D5!'&9//)A;6FA(%8(#<#G-701C58//-HB&8<2#(F/F'.F-//,>B<-."7/ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:4C68^GG169 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8435 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5710 42 162M = 5872 217 TAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGANCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACANTGACCCAGCTCNTACCGCAACCGCGCCCGGCNGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACAC $:5@+&F!,@?6//D:(8,&84'+5A7%/1%-=@AAD*-!:8/&&+2(.+$F;!9-3AAE4D7%'5D$#E>$1G(/;')+1,8@E58.D?>9"57A0=62.#+8.&H26,;@%A('1!("/*,8>,@E/'.;!"#/%0H&,7./G& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:44G38G6G4A19G46 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8435 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5872 42 55M = 5710 -217 CTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACNACCGACGGTNNTGATNTTTGC ((*'*&$%"*$%+%'!$+%$%"*!)+)&(!(&*"*&*'($#$#!#%(%!$%$"'' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:33C9G0C2C0C0G2G2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8436 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44073 42 40M = 44299 324 AACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAA C)=-AB8?B;3407&&77E:@;63<<*0DFA(+1:".D&" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8436 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44299 42 98M = 44073 -324 AGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTANTCCCATACC $*')*#&'!*%&"%%$'&#'($%+&+)*)&++"(+$$!(!"$%*'&(%((!%&"$(!""%&##(+$#%&'('%"#+#+&)#!%(&*%'!!$)#"+"%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88A5A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8437 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46405 42 129M = 46608 246 TNNTTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATANATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTAC "$+(&)(!#%)&&)*$!%'(!$%$)!%!#(%++)!##$&&%"!%*$$&')!'!!+#++('')#+%""+(*"%)+#*"$#*%)(''&(*%))%'#+!(+*!)(#"$!%+*$$'&(&")%"(%()''&&** AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0T0A90A35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8437 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46608 42 43M = 46405 -246 TCTGCCCAATTCCAGAAACNAAGAAATGATGGGTGATGGTTTC =%%CGD?513"19<'6&B$A!G6+FB*6:8E*(80<5&;/#?A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8438 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5357 42 150M = 5507 239 CAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACNTTACTGACGTGNTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGATGTGTACGNGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCANANAACAGCCGCATTATGGGG )*)(+&(!*")$)'&!+()""**+*')'('+*&%"&$&&$&+'!%+&%%&&%'%+*($"*%''$)'&&+!!""&%!((**#+*%$#$!&%%&%$)('%!&(%$*!!)**'#%%*)#&'#&$*%$)('$##'&$)!*'"!(+'#$!$$%!' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:39G11G43C3A3C21G3G1A18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8438 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5507 42 89M = 5357 -239 ATCCTCAACAGTGAGGAGGCTNACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGNGAAAACGGCCCGCCC BEAB0.=?1C%H5>AB5C'F,#)*0;'H*H.31$$:#A#H+.#+!9D'#79??;,+*@#!"3F.C319"B&8"D0F!))31#F@H*E:9!;H&80609F:6&4B!E7=$!'++(:-+$8'9D+#3'5$205(H=;07($..C;<5G.>>%74,&.A!5=6+=,945+"&?(7;=EE>0%."$;;&!4%HAE#@9*#3EB!62*-:3=,$.6(<5)>4D'&#>(@4('ADB3>,2%@H<*FHCD+GD2>/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G205T5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8439 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28320 42 91M = 28063 -348 ATTTTCAGGTATTCGTCAGNCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGNCNTGGTTTGTTGTTATATGGC "/HBF%!3H5E=&1CGA??E-D%<-./#,:5B88*.=#>9=>A7@AH+E<0<@<*GB%B=&A.&8H?0*B#+*/#/%HF5%"5A-608!3& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C49A1A19 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8440 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 775 42 46M2I9M = 830 111 TGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCT *&"/$@9<6G.-D@7.(.?C&@"B7"29G2C5;&#EGA69,2E>+#G:H9A:$@78+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8440 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 830 42 56M = 775 -111 CCCGAANGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGG $FC223:A963AEG8:%+;#*@&$%-A>9*H@45@<,0G&H*81C.@87;04CA.2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A49 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8441 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4174 42 66M = 4326 255 TGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAANTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATA @+).%F#(5"6'2-"<#'H!F/&*'2B%),#02#$6(%('?<0E;30%BCHC-9'9A'"21-&.3C$3$4DF2)(<)6E@8,/G-#/&=6&@"(,=/01CE'39!F'E@G>+/;;5#,A0"&H-;2H%0;"D)2D@*#(?7A/G28(8G85!'BG>E'*23:?>*?1.$AGC'GD"3"0+DG#*%B?EC-=)'./FD'@<*)2G=;(@D/)*E4)A2C,>GC/9"/!58(%<=">F);.25H1/!$B:!G"#.7;6?)ADH:F(?*GF(BD"HE%B**E05*B"?5!3@1<8AGG-$GD>:D.:%:$?,=8+AF?6<%%%&6DD*-<$$:<)90AG>B;77D-AC!A55%'%>%@?..$G:$?E8G-7#G8<.9-=.8&+49>>=?2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C134T42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8443 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41418 42 47M = 41243 -222 ACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCNCCAAATACTGTGATGACCATTTC 8/>?#;)FA4>,E9/(8?-*$62*HF%F=9:;6!(+5GG9,(F"F98 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8443 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41243 42 175M = 41418 222 TGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAANCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATTGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTG &*+$%)$$'#&*#!$$'!((%+#)!"*$%$')#!&')#)#"$%*+&'$*&+%'!%'"%%#&)!!&$%%("(#())'&(("'&(%#((')"%+$)*'*&&&#*)$+""'#')!&+"$&*"(*!)*%&&''$$%%)"%!((+##))&!'$%%)(%(&#(*(#"))%&&!%(('+)+& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C102G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8444 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13722 42 53M = 13509 -266 GCTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGG 2D!8";A,!.($#D"(.'0@)7@?@//<49;$,7+=E&*3,5B!?@8C-&9'1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8444 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13509 42 78M = 13722 266 CCTGNCAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGG '#%%+*"&!#+!"&+(#!!%"'$*))!)!&&#!*%*(&%&'$#$(+)*(!'##!+*#*%&'$"+#*!$!("()'""*" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A73 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37899 42 71M = 38099 264 GTCAAGCTGCTCTTGTGTTAATGNTTTTTTTTTTGTGCTCATACGTTAAANCTATCACCGCAAGGGATAAA %+((%!+!("%''(%*"+&&*#"#)!!)#+&"'(+$"'+%('$%')')''+!#(#*'+"&'*"$$+&(!+! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C22G3C22T20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38099 42 64M = 37899 -264 CTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTT 12F-"5&.1B">A<8CD0DD+C;B9>CF?.87=1/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8446 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20332 42 67M = 20163 -236 AAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGA /3/?B!'!%F?=5.39)$',"%31F:=9?'=4!$B2(A>=!=;B.!< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8446 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20163 42 65M = 20332 236 GNCGCAGAAGCGGCATCAGCANAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGCGTCCTC ##(#+*"'))'+#'($)#'*)$'$"*$%$%)"**&)"%!!%"'($*("*""))!!*(#)*("&&! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G19A36A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8447 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24630 42 77M = 24391 -316 TGTANCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTC E?!*>;+&"4$"?/B$%417,3.!=B24=7H(<2.%;5FA8!3D!54$/93!)C'5< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8447 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24391 42 89M = 24630 316 ACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAG >-3'.02!C+FB$5=60E2/A,AE+9%9/)F::/C80:-)(A;$53:F*C!$'1"&-)?<"-,D-BGD"(;8+()CF#/*C%!>5:%=> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8448 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28874 42 58M = 28640 -292 TCGTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAAC #>G&;0H9E5?E+0CH6%5A:4H?8'1>6;9D6:GAB9;>B7>''6=;;'#:B/3CB) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28640 42 53M = 28874 292 ATCAAGCCATGAATGTAACGTAANGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCA -G&CF14"!#!?'A%@=>9/;ED@>#4#-C,F'<(94DH:CD*<<'.0"7.;%6)D3'-#9H661E,$##G<8;2G=?,!2'B5'<+<+0A<%B+!#<-:0>:8'2A%6(4!;/G+(F"3=BBE;&/&79)B?9(.5"C:G?F#A1*/"%/DC@C8&1+!6A/0-4!9(!FG@321!.B&$H2"1>/&7A*;.#@F%A55.)>(C3DE'31!9B! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:139C57G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8450 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31836 42 78M = 31683 -231 CCTCAGCAAGCAGGCTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGT F#"1/0*:47$9DC(87E*9.")=4%!+)9+&1<1$62E3;>6259-.5+!)F$/6<;$2%7G743H,('!411,6*#344-G.7C17,;/GF,891B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8452 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47989 42 75M = 48142 197 GCCAACACGCAGTNTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTANTGCAATGCCCTCGTAATTAAG '2D/04G8F.3@D20@871:03)1$E(7!="A).E7'$(?D/':A$83)+@FC*B>';354C=3?F@<,,7<&3, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C39C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8453 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21168 42 96M = 21355 286 GGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGC '8E7.2#**F7(:=5&20.5DBB1;>5/;/@BD#126)1E:@<54")6#E302,6G&.,,0EF?9#<=8H9B>81-F6");,:02H6C4%D!5-!/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8453 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21355 42 99M = 21168 -286 GGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACAC *"'91./G880%1<1",3:*!(>?@?;%E(7C"G32<#FG7A?FG+9(,656<9F?D-E-"13&?/H@=,79-),'$)G0:B,=1#,@H4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8454 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32944 42 68M = 33194 333 NCANGTGGCGTTGNAAATGNTCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATG &(#'+)+&%*#%#'$&*'*!"$&(&!#&*+&%***#&+))())"')*)$+&+#!%'%+#$#))"#%%+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C1C0C9C5A36C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8454 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33194 42 83M = 32944 -333 ATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGANACATCTTTTCATCGCC +&()$'+"+#+*$$'$"&##)'#(*&"&)+$+$#!(")%&)(+&&#"*)$$!%*&&!"#'$"&)+*&($&!$+#%$"'*+"+& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A16 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8455 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33844 42 122M = 33966 260 NTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATNTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAN !?,;/A&*8G+@+=D>'2CH;)/0G'G>(AC*9$D8?29$3!.1-H<,9G2881ED)81B.!%0;+#67+'EE1<%,5C-)F7AC2%%!"BEB17'+4'AC8'G1?.&'4&=3>0D!H9+&0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T39G80A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8455 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33966 42 138M = 33844 -260 TAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTNCGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACNGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGT 0?4+,:156$2G"@=2A5;&0F?;;56AD%BF/GA>'5"B7G;6?HE",5HD6;+<,2:,&-)E2H)>*!=-3@/?<:?-%:E48@?!D8&B;F46DFE(HG9549:6==9E!#-(G**2G)A/'(=5/+#9>'<(7& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A44A62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8456 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14615 42 114M = 14615 0 CTGNATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCAC )%(+&$'+&*+"$*!$%')+$*%)(&*""*+$("#'!%%+&**("#*"(&+&)+$"'(*!!%)$$(&(*(+&*%#*&#"*%&(!(%"*$"*%$*%**#%&'$%*(!($#('(*+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T110 YT:Z:UP jpayne@0: r8456 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14615 0 * = 14615 0 NNGNGNNCANATNGNTNGNNNNNNGCNTAATGNANNNNGNNNNCNTNCCTNNNNNCCANNANAGNN !#"#$!!$$!$$!"$#!$!"$!!$!$"#$$#"#!"$"###"#!$!##!$!!""!$#"!"!$#!$!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8457 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6813 42 96M = 6927 217 GAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTNTTCCGGACAGTACGTG 20#/<&2A-<4"??C*5,%.-9?F2G;/79E3.EC*GG&:$5G:-D62>%'BG1"D!76/CE1B5=2B)&0-C>>;"G-?!AE#10D>#B:=7,-( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A67A16 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8457 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6927 42 10M2I93M = 6813 -217 AACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTC E"83;$GC*$364A4=!G72;(*?(>=&,&$%*@F/&5H4*.=9A4FH;;A0D':2GF8"'44+%&&-'$2>,34>5D122"2H?#188-)60-8-4;-;1/5"("8;;5=-1=1=+>:-49E0G/E!H@-1*F?.C'5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:33A7G53T7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8458 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3966 42 171M = 3829 -308 CGCNCNGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCAGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAG 1/61G$"C8?,2-@69"!#3E:>$)"+C>"GB$G+'H0*+"#-2=*A;G;+DH<6$/-'?',(2$B//%862E9>%4*G1#*,(:.$>81D.'/>+302041;+=&00F?=$+DH6(=904B(7??!-:(":EE/924*2>?,B!?(6DFA!;25=5(?"6")H,!8H+2B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C1A165 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8459 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27624 42 94M = 27458 -260 TGACGGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCT (1%AE#C,0DEF!/7),A=F)C&EH310/2+>>5.."/=76;-8EH4E"B'"8=@2>E5-F+&D'@&*CH4,7)?7+:53G38'(.9E%"/F9. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T89 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8459 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27458 42 166M = 27624 260 GGTNGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGANAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAG ,1$;?B$#(1?A88/5!#+!6+C+A>>$*(B9F)&1'83$/D9"9#9-""G1A(>$9;6A*'*G"!&*'098-44$EC>E$9+:/;5!$6$2.C1G7HE2)7FC!&?(; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C75C86 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8460 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8728 42 260M = 8998 324 GGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCNCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACNAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGAGGGCTTGNGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATNTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAA #2;*GH-@FE2.4C4<;7DB",#%,6,97$7@55-+>"@B>E4@;)8!*0+C+4B/F#5!%.-HA*12D!4D>+(C21);A1ED?F6%5(H+)A'6E<*?B.A-?:E9+3#0#683<7GE@D231="794=6*+%-&'BG20GD(1=5:*16=@2G*).5F?(B9%1$267)E?>;<9>)*#:+&,53?2>661#H7":FF6)8C;>566(=(2D.22?'1@7E-B'D/$!*(DH?8-#+*"37280GDA:C@H>18:#3"+"9E'D)ED$'F!FAE/<($'(4+:EE'DD0/74994F0+$?.#&-$5-%49!=6C)H0A@D0B+0=7-)2? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:88A17G17A54T32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8461 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30853 42 51M = 30921 280 CTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCCGACGGGCAATGCTGCGAA H,>%/G!+"$C79AH,$,9G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46441 42 121M = 46581 220 GATGGGCAACTCATGCAATNATTGTGAGCAATACACACGNGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATATACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACA 8GA?$DG%@?E'+"/@"4<""=.:7'+%4@6A;7F2&1<3'$4-+B927.C2F/='/FC15G'@#<2)1:0$'4>.(;4DD$>ED<+0;>H;"97%)"9"D!59,F8&0E"!";+5@6+3?87"+9>'%?7;FA!-'CC5++34&->G(C!B4?+: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8463 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29922 42 112M = 29758 -276 TCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGAGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGA G')%+1@0#>#*>.&+5'09,)*8,F"/.F0!%'@+$4734#71##*%?=%9H2<3)77&>.E=:$<9$7C5;/,C8>>"'E%4+4@@96"+,8/*F&A<&>F7$39)"*#G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8464 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14773 42 86M = 14937 301 GTGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGTTTTGATCGCCG #'8",CC*$?13?)>-&4-=;@'D;3F(><(@A%G5>8#!/4"<"<@''3*@9=H066/7&(%F'G5@"9CA3=(2:>2#$1*6?& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A73A4G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8464 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14937 42 137M = 14773 -301 GAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTCATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCANAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTA .B",6C*"7B'B%5B#G"#!66?F=$/&F19E!D/>*!8H"A&HB/1<*,@8A3.''0"2' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:85G27G22G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8465 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3112 42 49M = 2997 -164 NGCTGGNGCTGTCTGGGCATCGGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCC !57,8=(:.G%*9D9A4C2$0C49+71%54'+H0&$3#%:*9+!4".D1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A5C3A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8465 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2997 42 85M = 3112 164 CCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTC );!0.((28C$449E<3=/-*;))F.56$35("//:,:E.2F;@D:!!C0?HE?<1&)<-#B,,23$G>0;A/10?#?3&:1.!6>)'1DF+,1=<+D'>?>)",8.F7!+/E-1C'5<50 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8466 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30949 42 67M = 30722 -294 AAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGT :3,=5('9GFHA9GD=2AH=':$H+F;""'DE@$)9:9%>>-A/A"H.+@,$3%#.580?0:+">30 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8467 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 461 42 256M = 717 341 CGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTTCGNGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGNCANTATTCTCGACGGGCTCCCCCTTTCGGTGCAGCGGCGTTTTCCGGAACTGGAAAACCGACATGTTGATTTCCTGAAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTNCTGAGTGAAT BHE8@+&$$-9@.F)%/10$DF7:>BB2"+4CA5)C9-;:2(C072;+/D*@B;233@A2',:C4">"-;D,-?D':@=05H436->3?BA#0>4/$&$1,+$3!,1A*,F,7)CF))#!)%5%C+*>9"A;"=7-6$A(-2!0-)=#*+3!F$9>93>"$8)E7F04$6>&0+3&$%<:@E3"0E/,GB"8@0"%#/%3D.!GD>>4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:79T26C2G21G113G10 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8467 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 717 42 85M = 461 -341 ATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCNGGCTTCGCNCACTGTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCG !%%"&###*##)%)(%))(($++!#"*#'&$!!%%!#!%'!#$&&'%$"*"!)'"'#$&$*%"#*"%'$#%*+!##!%$$+*))) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G8G8T30 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37916 42 53M = 37726 -243 TTAATGGTTTCTTTTTTGTGCTCATACGTTAAATCTATCACCGCAAGGGATAN 1!'C%+%)%6?C*H18;',&B%1FC5G$7#,=3*/CE,B**#.412?BG+$7% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37726 42 49M = 37916 243 TCNTTGAGAATTTTNGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCNTTTAATGCAT #("+$'($"!#"#"(!#"*$)!('(!'"#&("$&"#!+"$*')"#"$#) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A1T11T23A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8469 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15585 42 234M = 15585 0 CGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTAC #41)$8(&7%7$&!F30&*E!6B-(?&@9.<5B8G;#?D9?&'$88(5(,##3D=(>A:3E!4<-G>8&H>6-9)."G@E">1A540=!87,(5*70&F*>!<'=/41D4%CE#(C)FAGD@8:)$-;E'B)418@,B>*)4:C3<&GA,287=;F*-*!:*3#&+-H$2/CB'A'F<";>%HH)"5+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:234 YT:Z:UP jpayne@0: r8469 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15585 0 * = 15585 0 GCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGCAGGAACCATGATTGCAANCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAGACGGTCGATGTTTGCAGAC 431GE5CGGF'D=E*=B15C669(..F*A"A3.6<>3"=G5-&DD=9E7#%,((4'A?>07G,57-57&!-.@!B?42,=55:E:%##F/'254B/;"= YT:Z:UP jpayne@0: r8470 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24788 42 16M1I59M = 24940 197 TTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATA $40&DEC9+36$649$!78F24$,':>$?C+#B6C1)!/7:1$<99>B5%FD8!@70*4E$;.?A2&#$H91#./@ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8470 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24940 42 45M = 24788 -197 CTTGACCTTTCTCTCCCATATTCCAGTCGCGGCACGATGGAACTN !*+%)+%&)#)%*(#(&"$%)"(&&(($"'("#"*'+%'#)+*'# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G21A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8471 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9960 42 319M = 9869 -410 ATTGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACANACAGAGGACGCNGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGNGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCNTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTN B:53,G1BC%(C40/(13A>'#G?$+98-<+4'7%;BD@AB=39961!9/%7%C(BD%2%*D7"F'3-E''B0,<5'.D/F9/?$?G2$<0:.(/&,G.2!CH*<7##&@DFA-;8DG">!E3.'.98D5,<8@8;*7!*$:30066(D:>3C6+?@0?B,C<:#$370-H,7F/:4!@C418HE""2E"9=G*1.=A!;2B6):)/0=C95#F"8";**&E49.E%&#(+HB8!/?F"2:28C0'%4@<"5"0$/30,>5/3+<;F;3G;-/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60G22T7 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8472 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35033 40 12M1D284M = 35330 349 GTAACTTGATAANNNNGTNCCTCTTCCCCTCATTCNCTGGAGNCTAATGCAGGNTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTNTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTNGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTNCTTTCCATTGAGCCTCTTTCTCTGCGC *&')%)"$()#)&'""($$"")"%%'%%$!'()*')*'#*#)")#%$%)###%!*+#)#!*")%'&&&"+)&$!)+"#'#)!'+*#+&("!#''&+%$&$(!(!')%)"&"$)("%'!$+"!!&$%%&"+++)!#+#!()$!)'*%)"&(%!%!**)!+%&%+"!+"#&"(#+(("('"&)&(#+""&+#"+&#*(&%+&!()*)+"#'#(''&(!#')(!###)"*&+(&%+"&#$('*$##!"+!"%(')))$%!&'(%%(*!!+%!$($(*%%))+*$$(+!*+#**+'&"## AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:25 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:26 MD:Z:6A5^G0A0G0G0A0A1C0G0A1T5T1A3T0T4C1T1C1C4T1T42C17C117G35G15G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8472 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35330 40 52M = 35033 -349 GACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAG #(;D7G1'8#-<*H)2+(8/*GB-E8E#/<@4>A0)-A00-'+/FB9618)8/?D<9'D*)""(BB08?H83&4<9D6'&,"# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8474 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9192 42 79M = 9060 -211 ACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCANNCGCTGCNGNCNGNGNTTANTGAANNCGATACTC *#")(%#"(()"#')+++&(%(%%&!#($+)&+%!#)!&*!+'*#!)%)#)!"%"'$!&&#&'#$**#)!!**%))$!) AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:44G0G6T1G1G0T0G1T3A4G0G6C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8474 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9060 42 45M = 9192 211 TGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTG 5EA"A',)@DEB!/9@;*&78;".H=@E6F4CD(D0=&D3',+5" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8475 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7383 42 75M = 7458 299 NCGGACATGNAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCG &<(/,DB7%20C2(4!$5"+=+6(-&33,1F6/)$;(71D$,D(+83@!)*(-"5B<=9-*%9G+9""@*G?<@;.A7?)8!+/*2G,->3$H#6C)'2$<'27$?>GAA*#-#<&">*8!"B0&A.*$/3'3&-=1G4!7C."/2$?$95;0%,'7-*("4A+:E!)&920:%&5&:.*!!1'2F9!!1#'B3/=H=H,7+/!C68.96@!3"+.+*@69("A@EF@6-<#<14C%?21" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10G134G52C17G6G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8476 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15208 42 81M = 15439 279 GTGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAATCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGNTAACGGTAAGCAG #'+(#&'%"$%*$'!#&#*+*'$(#**$&'%'(*%(#'+$+(%'(#"$"*%%!'#+*%'!%'&(")*'&*'$+%&#%#*"+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A38G27A13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8476 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15439 42 48M = 15208 -279 CGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTC ##&#&+'$"'*#+(&!(*"%"$+&!)("$%)%(*%)%%**$&"+#(+& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8477 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15766 42 114M = 15766 0 ACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTNCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGGACAGGCACTGGTGGAAACCACC @&E2$:533-HB-E:E$3C3?C0E+.E6'E6(#%@*'1$2!<8G";C$,/$*F*563':1B-@6+83D#>HB3FG97:;?E+E2;G:34HDD&*2?*-:C&0DF;1&4&8%546<&3BA,!0<*H*:5D;CE'3FE=-H'E!74)E-'HA02;0(+(@!+.6?07>6#+/4=G!=?-5"6(@F'BE(14:E1#C@%/"D(;H<6=!51G>0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A118 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8478 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33225 42 184M = 33409 321 NTATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAA "=?*>EF@3B(7.&4'10$":"A%):>'#<73&245H5?*%"6G&*#A/)'30":0$2!0*1C2@=8=6265F)2'(7FC9:'!4&D1==.H;-(0D#,3&31H'2%H,1?"3+H7*F(:F2%&1!*.?4?&@49=G?-&!#(%2<7$'/64"<)5' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A183 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8479 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20395 42 59M = 20225 -229 CAGAAACGAACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGNA A6'8D(.-",<"-@D("(H:7C,A0/">%@''2H-5%53'G!D*&;<>"7/F&6D.EHA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8479 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20225 42 150M = 20395 229 NTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTC !,4*?H<3=8H21H5BF&7A>).F5A"<""',+*,$-E3E;)/;D/?D78$=.B"E,)-"#DC*6<<:*5F8:,H#(0%;&G7FE%'!%@-'%?3AB1@+++":'1)$F0:36-@*G@,!7:%37**83!/6=/F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C149 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8480 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 657 42 126M = 783 274 TCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGG F,7;'1%:@?@95!8C/%-!FC757,<(!6D-A7&675CF0*A!>!0;9.('=,83?=2*.40#90>55E6E";!BF!:@*75'/H"E6FD%F<"9&"82.DF-.:(CF0G-':!H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96G29 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8480 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 783 42 38M2I110M = 657 -274 CCGGAGCCACAGACCNCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCTGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATG AF1214!"=*2!)2=C&!%(0,47799*9(<2E4!5F1-A0/3+15*>:$42G96(B AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:15G84G47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8481 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5276 42 134M = 5067 -343 ACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACNACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGT *C&@E)02&FF?H#A17)0.'0<6)0":,B<@?.,;*$1*'1%*&3="G!A7;/,"20GD:%"#)/8;;24)<8&5H/$5>+@EDGH475;;;3F90"?E+4;4=<:$@2FF.,81(,%,9C:98!E).@23)=A;0)./DE(E)A4+14)/DA!C%4$@+:B10/G!G5*GA526?-2:)5*4A'-,)/F5+91,:C5C/"4?47>:"8HE>?1.0/<&#*=#7;-AA0E0=*/3$6416-'@HH>F24=-G?;($=&B))")&E05FA& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:182G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8482 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21285 42 211M = 21502 259 GCTACGTCCTGNTGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCNGGTACNGATTTGGGGACGAAAAC ,6CE-2=6>3C=!.!B=1<4B*92B-9><58?+DBED)7#6-%A'%>,G-+46,=5,'HE4.:8!4D'+=>DC*%E0GD&,$1A?+36;*H$H,'@17A6??(:4D6:C46GB7&8G8-DC!C>2FB-4B=0'(>";)'A;8=: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11A175C5G17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8482 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21502 42 42M = 21285 -259 GTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTA ;+%.2,#;H4G-AF66H3F=#&+531$0,?G+"?H*DD# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8483 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8125 40 99M = 8298 214 TGCGCNGCNAACANAGANAGGAANGNNCCAGGCTGAAAAGGGNCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAA &"'*)"##%))''*%#*!%$$"'!$&'+$)!$(+!$#&*$$*+"''&**$'$)(*)!!'*$*$$*)!")+&("'$()$#'&*&%#*+&&%'+'!##!'$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1A3C1G0A3T0G0G0T1A5A1G0G15C56 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8483 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8298 40 41M = 8125 -214 GTTGGCGGCAGCGTGCTAGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCC #5:"C5'70G?E-')3#$@@4#E>&3+59:0.3?67CAH-?G&%.F-,,;B)3C4*#?:65#*GB-$D<5*;*H-+7,&?D>3/2DB-!2=20,38B@=G88>9%-.G=5'6&8.+"B$;E1*(&-936/?"3G)2@C30@GH:@&?**,E<=+<9"!>GH-7%2>=3*E)+#3*.,E3@6?>-=-?#,@>-7G4<;)<;!D0<%6?D6//-H&/:+>.G.%B<'-3'"/F69.4H1F#H*1.07<11$)!;29CE70*:=1@9+!=&?@BB@@8'4/B/8F9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132T97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8485 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37769 42 80M = 37539 -310 ATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAG ;6>&4:'4'26!750$0EHC/:4=5:.A.-!<*B8>H4)243H$B-7/+*:1HH1D:?+D9-;C<3(<>(.<94@!$+H= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8486 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 74 42 223M = 74 0 TAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTNCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTNTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAACT *B6!%9(D93H'?7!AE$1$#9$597A0/=BD(BE2+)"$HBB0,D)74.7743A':"*+35+*#9>:AG,"732E.)+,$*,&62A>.?2(D<">''>/5=5D/5HH:8ED!;#5%DA@!ED7."6/0-.G168!# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:53G43T123G0G0 YT:Z:UP jpayne@0: r8486 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 74 0 * = 74 0 AGCNGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCA 582-4+,.*!BFE=%-0B51?8(7:A58H'EBF)'4="E:-4@;<=D=?'7<)-9;>&EC'H(C9C23-G:.-6>.=*6'E(F11.>0C YT:Z:UP jpayne@0: r8487 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41811 42 151M4I25M = 41601 -386 CGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCNAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCNGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAG :#A(#E9,8#*9%,&%5;G,,FA*0&(DBFFGA3<6"CGDB#E7C0;:(&8DAH:$72F!=%*2E.6'B-C-&%G.F&53$#D55D!D'C>H'6!<"7E)(D)F>$#!2<*$/)+?)'+=6C?%>@08?)%!$=/8;!-:02A(1.<0%*394*34+5C).,6%:(1G-:84B?8*@*$>1;!%!;!4G,%@'9C/DEF'-/)3:)G$6+C#G#0G6(B*);H>6'#2FF1@1).$%!-8)'$..7)E!B)+:*#/E;!++9.+B@0!>@6?B4)@B&?/($?93D*F71)4=)"<$88-5+0'" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T0C202 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8488 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8331 42 95M = 8443 218 CGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCNTGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATATGGT D#*/8*GH3A.A@/$'=/BB%/=08:C!&786'(+B3-$##:%$5DA*%+=,*'.A%>??/#56EA#31 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46A43G4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8443 42 106M = 8331 -218 TGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATNCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAA ?<6@@.%(%"'B0B;180?;)"?BD4E'+9;B3>2&'>%B.A'-H6.HF7/GB=C9?'&/9%,!,A/&$!0"10#"2">5?.8#&#:30,<66'CB48A?=31@4A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74G31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8489 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26678 8 4M1I78M = 26678 0 CCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTAT 2BB%;>@1'A86/./@/8H1;#E%H4E.*$3?79;&D@0@,'!6<1H7D"=G AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:1T0T3T0T0G73 YT:Z:UP jpayne@0: r8489 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26678 0 * = 26678 0 AGTNNGNTTCNNNCNNGNNANNCNNNNGNANNTGNCAAAANNCGN !!$$####"!!"$$!!!##$"!###!""!$$"!!!#$"$$!!#$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8490 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41745 42 218M4I37M = 41636 -364 GTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATNATGTACCGANGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGANATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCNATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCG ,-)E9;02A=,=8!A#'5>.B43H49%"<+D)2/D?"C%7F,7H->.&D34%H+!+G*//096DB66B2518F6@#A:='"?0-30(8(->C6.A%9+,#!#E3=,7*"B4>/;1@E4EF42/=$:$:7>)69,3FB++/DCAH#*'E""/%&4:?:25(/?>6?E)+>>:2FD%5<(7-@ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:31T9G67C145 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8490 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41636 42 109M = 41745 364 AACTGCATATTCTGNATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGANGTCATCACGGGATCCCATGTGC F?+?9%)$$C<:6*@*.FC/H>H95:@%@:")E:83@7&H#?4A:CB-C-$)6!H:79-&27?%6GD*+@!))+&&>581C>4A.-&"6A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8491 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6753 42 67M = 6607 -213 CTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGG -?0898F2C$79>"H,>E@.='GF%5.,=B(;8&2.B==H4,!<9&!2!&/B1:2)/G$-C$11!>3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8492 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28761 42 62M = 28615 -208 CTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATT #<4CA9("'EB&>"E#/B(8%C6.>>G6:&+8#@/%(:)DE3#)=89BB:&A0?8*.%C*3( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8492 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28615 42 59M = 28761 208 TGCTGGCCAGGATTTTTTCGNAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCA 2*!+H%,","%3$57!33>AC+)'<#9+GG*3'%>6A#&.5EH).,=(=%;52AD?"=> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8493 77 * 0 0 * * 0 0 GNNAGACGCGACCAGTCNACGTCTGAAAGCGGATTCGCGTAT *"#*+&+'*('#(*+*!((+%*%&%%"***!%#"#&#%""#& YT:Z:UP jpayne@0: r8493 141 * 0 0 * * 0 0 GTTCCGGTGATGAGCGATATNCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTAC !$+%%+*&*((*&+'*#*!)")'(&!$)!**(%"#"*#$#+&!%$$%&+$!))&'(**&$&'%##'')#&!* YT:Z:UP jpayne@0: r8494 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46015 42 41M = 45838 -218 TCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGANAACGCN 7G>HE,CC&;F=7,@&&!')";*%<9B>=H7=E!*(3/-.( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T5C0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8494 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45838 42 46M2I30M = 46015 218 GCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCNCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACA D*6D6;#()A)/$DD+(*-4%G8=7665.&F"?DA.C8.!3@&?51!25'?"2F.E2%"C;=:"5'"??;@$<8B9E? AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:42G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8495 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33481 42 222M = 33703 338 NNCNNAACGAAAAACGCCTCGAGTGAANCGTTATTGGTANGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTCCCATCNATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATNTCCATAATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAA !!'#+!+)&##(!)#)!&#!"*)+)"'%%(&$"*#&'$$)'"!'$#)#!+$($)+$"+(+!'(*%&!&+*'"(+**$!!"$"#$)+%&$')+"'())(&%##(&!#!#$+"&#%(%!""&*'$&+))&&+('%"&#%++**#+&'#+$!+*&"(!++$!$(%*$!'%+''&"#"#)+"++%'*"#$'*)(!(++$!'+$!#)+##('"!+)!"+()*(%*&" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:0T0A1A0T22G11T70T22A5C25T5C50 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8495 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33703 42 116M = 33481 -338 TTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATATAGCATTTAATACAGAGCNGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTT .B?),',2'4("9!;%<0>*0@<2E)2C2)-C//.)?(CGH&;070>,*7C(5+:9C@C,*%9E4@(76'%/B!,B/=5$"CC!>E5DHF*<.)1":3E;!+?E$%#5:H/2:%41 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39C17C58 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8496 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1908 42 178M = 2147 299 ATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGANGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGNCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGA +8=(7@D7,GF5C.1GD(G$/3:04"/7<1&7$A@::&"4+@>!9@):<=6)<)$>723F$C1$,(+B>E;D=50413:H1@,2CA5.><'975G:4")>=>?@? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T49C85 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8496 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2147 42 60M = 1908 -299 AAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGCGCATCCGTCTAAGGAAAGCCGGT 9'D43;(5;!F7"1...!F=8:!(>88?.C14'$35)G=*F*/!6%+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G11C11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14941 42 40M = 15126 261 NACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCA $C.(60A)H7),A;#;!$+#-;:!G8/G9D%$@)+B%7>3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G39 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8497 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15126 42 76M = 14941 -261 CGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATNGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGT BA5.36+3F0+.5'/>,*7E/*B6$6%"2.GB56D8()!%!89:9/"EA#3A/@1,1G,&"2A"0$:08#-GG#>8$750$C/98*4<<<2$G=@D(8=.?".4D!.98BG:,(7%-(C6;384#?"CE72B-9,F.G;;2BC+BB=!%?;#92.*#+!-;F4#)C!9-81"%'43A81@/,&.:9'>@0H&"*'353#4<9GGG#!>D/.?83-F>/A!H!@15:80*-2A&A7D2'+7(HF)8*&F5:*D#F,91F>6A7>4C/E30.(>7C8F7,((.1$%1--81!E.++E%,!%C=;4!#0-7F3%/>G)@:9?-/$"9/B?;915F AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:98A7G100G7G87G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45392 42 42M = 45434 390 CAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGG ',!6:B3!.<"7#3-'+(F5<../%'!,>B/.'.$%>"#&'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8500 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29941 42 126M = 29846 -221 TGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTTATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGG $92<7@*';<0<0D8.)2F#1?B,$5:0*(3(1,D;GF#92$4"&E.9#'"AE?545#7&=7'7F.,;6CF"$G-".0?3A?%+4@300-9$,)>+8-<38?0*BGD#23C)4H#=<#!##E-0"$@@$&!<";$=/35<*@.+>DD7.6)=F7B&7773?<91<<%?2B)0.D&G797=,'%'(A AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:27C9A8A10T38 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8501 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38028 42 216M = 37932 -312 CTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAATATCTCGGCGTATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAACACCAACAGCATAAAT E7@*@@=+0/8%2'"-+2CC0BF<&*227BG:#?.1757@10D&(A:@121H#>12(7<7"-3+/-1;,B#>C--:+)-<:?'@*%GFB"$8!"G1@9%F,AFH0D16!?6.$#'&"A9B??&77?0C@5D=,<@01)GE@#73?A4A("CH0%@43&'+"H:D'C<>"#/;8FH=3>:&>99F+%8-$89+E);#D'77,$(3%!3/"81=4A37 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:76G60T62A1A13 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8502 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32174 42 92M = 31897 -369 CCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTNTATGCA &*##$"$&%#')&")+"#*&"&*$*)!%#!%%&"%+)!$""!&'%")*!&$("""($"#)*$!&&!(*%+)(')!%("('$*$+&!'$(*'% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85G6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8502 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31897 42 183M1I94M = 32174 369 GGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCANGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTTCGGCCTGTGTCAGTNCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATGCCATGTTTTAT &-$6;B'!;+24AA49AB)!741?;-&"=;8381=3E@G5*)'C7H6'1###.#9)&8/.DEH5/#F91((+.4@GHC#%HHCDH%9G>B78217;)'33&8@B=7"+/>716,27?@.>H"@>*B%4=B>?+':.0-<"3.@@/>7$@)'"@E5=5.4,A3 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:63C140T60C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8503 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38235 40 9M5I137M = 38235 0 AGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAANCCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTANGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAANCGC 32F-2??40*E&1EH#%;$,53!$?!@EH>;%EEAD2$95/B*H)>?,+/B#9+:1C0EHE(F71"%1"D)!F9@$8=C6&0F"/.>C/.H6!"&'2H(? AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:8 MD:Z:56A53A31A3 YT:Z:UP jpayne@0: r8503 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38235 0 * = 38235 0 NANNNNTNGCCTNNGNNNNNTNNNNNTATTNNNNNGCNNGNNNNCNGNNTATNNNANNNNNNAATCNGGATNNGNTNNNNNNCNANCNNNNNNNGTNGNNGATTATGNATNANACNNTGNANAACANNAANCANNTNNNGGTCCNGCNATNGCCCANCNCGCGNNGNNAANAGACANANNTGNGCACAGNCNANTNTNTACNGGTANNANNGCNATCNNTNGNNNNTCCGGCGNCNAGNNNANGNNCNTNACNNCTANNNANNNATCNAN $"!"!""!$!"$!#$"#!#!"$""!"$$$#!!"#!!!#!""!!"$#$$#!$$$#!!""!#!""!!$!"$$!""$#$$!""!""#"$#$""####!$##""#$"!"$#""#$#""#"$"#!$"#"$!$$$##!$!!#"!$$!##!!$"$#$!"$!""#$!#"$$!!$$!##!"##$!$!#"""#$"#"$"!$"#$"!$#$!"!#$$#$#"#"$#!"#"#"""##!!#"#!$##"!"!$$!""!#$!"#!###$!"!!#!"$$!!#$!##$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8504 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31758 42 53M = 31924 250 NGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCNAGGCCAGTGCTTTAGCGTTA &+'!(+"&*)#&*%(#+&*(*)%"#&&(&+$()#)%'&#(*#""#'!#)$*)' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G31C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8504 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31924 42 84M = 31758 -250 TGAAGCGGTGATGACGCNGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTG '/;G,$/2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C66 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8505 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1819 42 58M = 1937 262 GCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGT 7G#6)5(22'@$!4&$-?2?(&%*::,%%/::>3F95=2<"50%A8'3',/6=5,C(> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8505 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1937 42 144M = 1819 -262 GCGCGTATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATACAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAAN C>='-(=;E641F@-!6CE;.,%0D$@6D33)&;G,#199%9?75@>=,#C77C4D.E0!8:2+C*"A:G,++,%C.E#F+6493(7?$+G>0;0(09B2B.)?D'>.,:"!%0C2D#)@3D#,#'/@:FE;$%?/*G)#(*B! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:113A29T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46949 42 46M = 47086 196 TAATTAAAACGATGCACACAGGGTTGAGCGCGTACACGTATTGCAT ++%&"*)"&+&#'("&$)&)((%%&**#""**&))*+$*$!'*'%* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47086 42 59M = 46949 -196 ATAGTAATGAATTATCAACGGTATAGTAATATCTTTTATTTTCAAGGATATTTGTNACC "#!!***+"#)&"$$"$++)+&'%()%($%'!)*$"&%+"&#%)!((%'%'*%*)#"*& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A20G4T10A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8507 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8345 42 45M = 8149 -241 GTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGGG ;"&(C';0!2)40/+0<-F)81603?:9>D/BC&5B9#HF&B0%" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8507 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8149 42 151M1I41M = 8345 241 GGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTCGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCG '2A)#&68'2)4314)@!3)15,=2+:H&F40.BGGD=46/3H19**4<AE1:CG2C3&GCB8@"0A!$+!+82G>9-??"13#"4C0FAH8??)!@)0/'.;C'?CC9C?"/1<%*+3#&F7/.>C*#:EF*H@/)B(9,#/6A++F3!;(0F<(6;$(089%'A3B&F>)*89F$%+>7#'5%+#&. AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:152G39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8508 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36354 42 48M = 36573 285 TCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGA 9D&5A:C7>%3'3A*$88+-$4+;#'.!=*H7D;#EE#7DE-07>$9HE)HGA--A3>%%&-%.<:0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8509 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24883 42 199M = 24818 -264 ANATGTCCTTGTCGATATAGGGATGAATCGCTTGGTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATGGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGAAAATTCAGGATNATGTGCAATAGGAANAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACGNCNAANNNNCCNNNT "&'!((%&&(+$%'+$"+)#(+%(&*+**+#'&*#*+%")"!*&(%+!+'#(%%+)'#(!%%&$&%%"#+)%!++*+'(!)%)*'"""*%(#"%'$#"*+(&'&"(&!(''+$#(&")($%%!$'+*#%!+#&'+*"*+'!+&$)$!+)++(#*)*'%$$'&*%()+'**%+)+*&+$+%)#+$"%"&($"!*!*"'"$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:1A76T53A14G35C0A1A2A0T0G0G0A1A0T0T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8509 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24818 42 53M = 24883 264 ATAAAGACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATANACCCATT 2A)1B=,**=()1G/C.7@'"'''CC*GE3G0D%;.1DA63-7HD$.%0:5=*8GCB>+@H,/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8510 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37155 42 67M = 37336 237 NAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAAGACCTT +(+%$#()%$#)+"%)&+$++#(+""#!#&+$+*++'!*%%&()!")!(&**"&!+)+%&("'&"!+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A52G7C5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8511 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39064 42 80M = 39353 361 NCNANGGATCAAACNTCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGA #$&$')'(('&''(%$)+"&#*%)$("#'+""#%!!*!!"'*$$')(*($%*"!#*"+'%(+!!+"#(!$+''"'(!"!" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1G1G4A4A65 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8511 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39353 42 72M = 39064 -361 ATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTAAGNATGCC !%%+#*)&!#"%'!++%"#%&&$+'"$(&(#!+!++*+)%$!('$!((&!*)#"$*(+'+($+#%$!*))*# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63G0G1C5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8512 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19395 42 69M = 19127 -337 CTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGT DA)D15-9=@%0;)0A8;.051:FH>#83F&H-!6$("+573(956;*&C?:(8%*=>#@'G,0"D$;2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19127 42 103M = 19395 337 CTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTNCGCNGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGA &,;:,,"H!G@C,+GB?,)0"G:",8BB!>3B4+)G)$F=*7C(FG3G'GB2D@D+@>"G.%#$86=1-H#@B?6F2=3! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70T3C28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8513 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21922 42 126M = 21922 0 GGAAAACCCCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGNATGAGTGAACAACCACGGACCANAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATT -4*.=37?>$94=)C>B=E!#@>/#<-DC5,297EC6$'1'H26(:E;5)0&6)"C*BH.>4$88-@B:*4B%27)54EE(D)H<9G#"?(35A;/(@/1(@'G()DB&#.:DH%=D#"%E4D5F34#+;2*;?5A-.1F, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T48 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35836 42 86M = 35721 -201 CTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAATACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGCNGTNATT "&(!"%'*+!+!%!%)%!$(+(')(&#*$#)'#*##+&$*&'!%%!&(()+%+'+##&!)$*'"$%("%''(%*%!$+"!'!&&%" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:25A52T0G1G0T2C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8515 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19080 42 46M = 19333 333 CGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCA H7;%/2H8?=-;#+#CD<:4D'.5=D&@28<$;?:8@%>0G)H#79 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8515 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19333 42 80M = 19080 -333 GGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAANG B'):F1B*AGEGGD-;4G6F8&'4B88E!D4;<%HH;05>A54,*F#E6"$.;HB7?:!>-99=A?$% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8516 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40673 40 62M3I19M = 40855 225 TCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCA @,7+9H555@BG.62=-8->-<:-A04%,21B8G!:@$H;6?A&2+5.2-*&,?6'3H6@$-&?6C=8=F7,5*8<'B<3+&26 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:81 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8516 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40855 40 43M = 40673 -225 GCTGGAAGTGTGTCTTTAGCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGT D2C>EA;F.=1DC$9'&)9)+#$;8BEF."G.H#D<:41!5C+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G4C24 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8517 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9741 42 127M = 9620 -248 AACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCG @C/"(;6-%-<+5B6E"D#;!2&/'#"8B=#-)=)G,8*;'>6948H$,H5-+(H*3G/5/#,@>DH"B,-5E-"EE/>4$19:1BG=8C,7"?<>02,41F806,41755)6B1.49=<1='G->- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:126A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8517 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9620 42 82M = 9741 248 CAAGNTCAACATTCCGGTTCTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGA %;5#G(:E-?*-&%*3/:<%G:*#5)0'F2HH*$;,/H!H/!B,F>H1H6(?)+(=-)D+(;5?H=;*"=E/48:+2#$"*A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G14G62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8518 77 * 0 0 * * 0 0 TGAGGNANNNTNTCATGCTGAAACCGTGGTGTACNGGCTGTCTGGTATGTATGAGTT %)#"*"*%$"*!#!++%(''%!*)*(""+()#+)+!#*#(*!!$$&&')%&!)$(#% YT:Z:UP jpayne@0: r8518 141 * 0 0 * * 0 0 CCAGCAGAACATCATGAAAATAATGGGTACTGTAAAAGCGGTGCCAGTCGGCATACTCCGTGGATGACATCCCNGCAAGCATNGCACGCCAGTCGGGTCGCCCCATCTCACGCGCCAGTTTCA A1E#9>#F:"$B/1(F:'H9'AB97/3.5)F&9D$)B<=&AC#:??-B::C0-G'2$@-/HCE3),(),'!,BB?H/G91C/!90,BFDCA3:8<'?,D:?'BB7<<'*!1E"#C3&7$:?"$ YT:Z:UP jpayne@0: r8519 77 * 0 0 * * 0 0 TGNNCGANNGCACCGGGATAACACGNTCACCATGAAGCGTTTCAC (*'*)"&#""+(!#%!%("$*#"+$+()&!((*#(&')%""%*%( YT:Z:UP jpayne@0: r8519 141 * 0 0 * * 0 0 GGGNATTCACTGGCTGCACGCTCAATCTGACAGGTGCCTCTCACTTTTGGCGTGGAGCCACGGATGGACTTTGGCCAGACCGAGCCTNCAATACGCTTGTCACCCAGG B".E>(7;.CC'BD2#5;6*7(,GA0?<04/5E7"652C*90,C:7$/&94#H(G(4&G*)&AD#GH;@&>:D YT:Z:UP jpayne@0: r8520 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42689 42 160M = 42849 312 AGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGGCATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATCTTCACAAGCAATGCGTGGTG -%97BB*(E(0G**8H,,$=14G;3,;(5+@-2$&?H#B/'%7/G"+@B4A=G+9+)$F-A1CB"@?BCA&B5AHG1>5(!6D)'0$)#4'9%H2*CB7'E#GGH36!*$&G99FD<3E4+CBG.2@6G(/#5E!E>A&>EA-1CE"G,*-7;*6!;208 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87A51A20 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8520 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42849 42 152M = 42689 -312 CGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTCTCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACA !7CH=9G#:F/H)0H1B!@##C-!:8A$+;$.!!BB7095877##'A;!86%>B?6B-B.='A()>+'62>C$,/H?;2'$*(13GF-4(:C@2CE!5#1$"-"((3DF0),29;H.0.&<%&5B94%A#E8-,AF/!-"8#!8'.4'77(?$&5($501!+=HA2:F,)!!#0=4"<9/5)/F)88#"37;(0=/78HH/?#72C149%/'E/#&)C*B$F4:F><<(&+F>7?-FG2+1C@/,#&$;0+0570E2-/H")+)GDAFB,F?<8)4B$5(D36>F#;*2G+D-@FA<":06E/3&=H#>1:4A6+2,96!$+'';,0EB:)++H#& AS:i:-37 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:49G4C53C3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8522 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22859 42 43M = 22859 0 TTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATG ,G7+7HA:!!6*F,=9/9F8*D!2GCD:93%#8B:,8'%CF)1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YT:Z:UP jpayne@0: r8522 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22859 0 * = 22859 0 CATNNGNNNANTNTNCCANANTANNNATNANNCGNAACTNANCCNNGNCNNTACGNNNTANGNCTAAACNNN $$"#""$!!!$""$!#"$!!$##"##$!#!"!$###$!#$!"$##!""$$!$#!!#""#!!$!!!#"$"!#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8523 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18188 42 116M = 18353 209 TTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCGGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTG %/=&*H33:;4-$B57#D.+:-9$E)=.9D"'5B13!B18#?*4B.&G#:2:A0;/5>(C==.5F+.E=*?,'#B,)H!A@=!'04=$F&D9BA>2H58C?;0$;AG#+9F!<<*. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C79 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8523 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18353 42 44M = 18188 -209 CACCGGACGGAAAGCTCACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGC :2-4G!%@'.DG!#0>3)01B#&G4GC6')1$F&>6;";1+52/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8524 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41927 42 35M4I159M = 41814 -307 TTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACA #9,G3,>!:D=34,?1"A6;5B-=G;C>C*HA0*3*%)@:C!7@/4:BD>5@@)?D44/"H/4-3?.EE)'&$/:31-,GB"(GH=12B@.23B0**/<9H<44H#;F/*GA89D9B-@E=DB1)C5(4)?D&C?F-"",:=A;:2@396*F)>(@657!=-B8,%>--*==:>AC<$!&B(4F4F8)G)/C,.H,A/ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:194 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8524 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41814 42 64M = 41927 307 AAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGA HCC297.:4C/21'2D!5'='.15('0=F381B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7996 42 109M = 7777 -328 AGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAANCGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACGGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACA +'E4%$?6.9@.-C-1=&=4?3>E'7&A!$B?3@B3D>)*@&$B">353>1;F*4,C-C"(@&0E'90,D9A?2$-)FG7H++<<+D<,F83:&0DD%"F<<4+H&E,"B+9288@.'F"D45;AB3-EG664?<@/";H'@-*B0(A1C?/9!"H;41'--(,.7#9!89>$96CC18+=B)@@66@G251=$7(25#!0!H$64?7)F= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G50G24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8526 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43740 42 45M = 43508 -277 GTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACG 8:&*+:G4'3D0GA10*5>37$6<+25D')<2D,!FH>15E,/32 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8526 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43508 42 232M = 43740 277 TANTGTCGGNNGCTGGTTATTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATTTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAANGGGATC #$(%'!(&$''*%+')%('!+%)$")+#%'!%&%)'#%%('$)&)"##"&%((+%$*#&+!!#)"("*'!!$$()'('''!#)&%%)&$+#)$'##(%%++#$$#&+&!'"!*$*'(+'*&'#(#$#$)+*)")$")*+#+!'('*#+*"(&")%+'('*!)+(!*''!%))++(&*!!#")+&&%###"+*!+!'$+(('*+!'!)"$#*%#')&**'"!*#))%")(#** AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A2G3T0G7C107C98C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8527 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2419 42 136M = 2337 -218 TGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCNCAGTGCGCTGCTGGCGAG #%)4F;7+,"-G)<+@<5//2G635.EBE'&?<1/(;=)>.?DH)>8@'63G5E#$-9F!=752>D3C')@&F$*!4?73?@!!BG"/,H:?CF*862@.&7=%A$D/:5- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:117T18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2337 42 82M = 2419 218 NCTNACTTCCCGAATAACCCGGATATTTCTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAACAATGGG "#$$%%"))+(($!(%*'&(!!&+*'+*((()*)&*(*#+&""&+$))$'()+&$()&*!*%("#&%)"'+)"!#!++")## AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0T1C24T46A6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8528 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8426 42 80M = 8575 244 GAAAATCCCNATGGCGGTGCCGCTGACCACNGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGANCGTCTTCCGAAAG D@=2(:"7.%5D&)(0FE4@3;54#=)2D.A=><7"G!76&D,#6<:)/A.*'8:>&00.)?$E#5CC=,(($48A&%:4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G20G35A13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8528 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8575 42 95M = 8426 -244 AGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGNGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTGTCAGGCAGTTN !%$*$*&+&(+$+$!'%")&'''+)(#+&$%&'!&")%)$+%&)+($#)+*''(%$&(!*'*%''+(+()+!'%)'%%#+$!+!!+("#+&+)') AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:36G46T2C7G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8529 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26833 40 76M = 26599 -310 TTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGA *"#!(%*(+&+)%#!%$)$)$$'))"+!!&)')$*"$$&+(&)%&*+'+$&$)$("'+*$*#$+#(#")+%$$!+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75G0 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r8529 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26599 40 88M13I146M = 26833 310 NTTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTNAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTNTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTT #=4=8E).4:C7?E0)8'!'<'/-(DA5;"9D4..E33&F='-,G%*,F=.FC(&$(=;-#/08%#G#8=%.>B!%/?-;91<7'><70*?3$4>G;8AE"/.H*E#3$H8)1&3!@B=2&'84':@B#4(.8HG/.?0B8-9:/8,?*/B=#22>.36+)&>B=A:H37*C$>F+67(>6:.@@-A6:8?$!!G4&375>A<.8%.#7$:@#)D<&$8;FG>%1)3<"C"31=/:A6/.G=.(4'B AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:16 MD:Z:0A89G99T43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8530 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30491 42 51M = 30317 -225 CGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAN $+"$)%"('&%(+($+$+$*+!(('***!&+%(#)(!)!"$*$#!*'"++" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8530 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30317 42 97M = 30491 225 NATCNGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTN !"**!+$)&("*%#(#%+()!&()+#&'(+#'!%"(+#)+*+"#'&+""*$("*)$%!%"%%!'+$(&!!$*&#+&*($%!&&&#"+("#(*(*!*! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G2T91A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8531 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44210 42 280M = 44490 435 CGTAGTGNCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGTTATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTGGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGNTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTT ?07%A,5E'05'%8(&A$@;!@8%#'.:H<8"5?6#C7(5-@61=A*>?1G%#HA,@&.#&:C."A<''G+3G#H!/D%)B96@?1BA%6>?DEGAA46)*2%)5E>'B?,?&,"1G7(-5A-CCB2E011,1A;?ED;BCA0&D->"9&/6AH'(9D>#>!>>H?'";*A0"?3$,$/C=0D#6"4720-4+7GB@F-F=#@>*?.FF8471!G$%="ED#>52@'F"7E%!B67D''699-A,@H#*)!<.',3:D(#%:5=D#F85'B=-*=1#>1!%'+@!;CH?H56@E8$AD$=E371/3.42+5;0-=5$(@*A9+(211/$">$)!F-E7B;66$;&3;0?F0>3D+FC&E7#96#<8C8.&D+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:10G19C9A31C4T15A40 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8533 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13589 42 194M = 13783 396 GACAGTATCAGCCGTATCCCNTTCAGGGGAGCGGTTTTGAACNGAATGGCAANGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCNGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTC DHC0,53C47;"4!5-H:/5@+425:%8',!D!A4H?5(-8@7#8+-*:.=9@0''24<;6F,3+831@$E5(5=D3@!);DG19H.!=E3@33>A)&07FA%/!+G%'H-#F.D<9;9"36&3"#:8"1E95AGB947%$6D./7&,D9)"6$H@BEGHH03F0&D332!%'81->9>6G6$=7)@.F49D5!@6@B-.;4:A:/29&9@("$?6(*/+<7:;88)8BF54@,<,<>,1#9*):HC-38C+=/A;5!H")G>26""A>/BD%@$="5.?&=3;4-2A$G6<"7(:%6:(/>4G$6HD;)&*0?D0)EF%: AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:33G71A25T20G41^TTA5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8534 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12031 42 88M = 11856 -263 AGCAGCGCCGGCATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCAGANTGCNCNNGACAN !&+%+("$(%'($+'('%)')"%"+%%+&''$)&""!("%#!)")$#!($*&"(*$""#'''$'"*+#*(%!+($")'')(!!$%$*" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:11G60T1T0C3A1A0G2G1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8534 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11856 42 175M = 12031 263 CTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCC =3EC0,D,>=F(/=H33#0,C<2G1D(;%#?5EEB8&D7.E+='#4?F:<6%8#8D)2"CED;7+!6!5-B?A&(/4#C23C(69;2G(D$.4.;380"!G;%'&HECD*EFG,!&E=!2E57B6G!659%64!#5C!@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8535 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33964 42 72M = 34144 271 NATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAA '%4CA(H+6C<>B0B+<%A#!2>"0H*&821)!$"6)3&2H5")(G2.HH")9+#,B/.--/(E#0#.((,5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28592 42 69M = 28462 -199 GAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTNACGT C=@A=?B/-<1.(64)CE<6C#D$'$7B>/0HGD@@#)-(28("*EH:+;+&(4%%6=?,!C>B/A82@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8536 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28462 42 77M = 28592 199 TGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGT 490:,-C6%$=1,43!C+-E*G@3%08D?1#46!6&0:,'GB/B/B"(A'3%;>E#<'D!984"0<'"G(92/+35F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8537 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6729 42 52M = 6933 258 GTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGG >!A:,7>7(1$1,?A/;597F>/+'H<5%>=BD7)>>(;D/ED53;("!5B? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6933 42 4M2I50M = 6729 -258 CTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACC ""(+'"+%#**&(*)!+%'##&*%"&$!'"+#''*(')&!%&*)("*%+'+&+$"+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8538 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34487 42 140M = 34682 242 NNCNATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTNAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAGCCCAGATAACNGGCCTGAATATGTTAATGAGA #('#*'**!+'(&)"&*%!#%*%$&%%#%$&'(!#*'+($$&$'$")%$()#&&!%$(*($)(*)#*)(%%%"("(%&'#$'))*('*$$$'+(*$**#!!((##"'#(%%"#$+*#!'(!*$#!+)!%+)+(%&#*)!+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G0A0G0T38C75T21 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8538 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34682 42 31M2D14M = 34487 -242 AGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATA )GC.1;>-$"*G(,H#$H8571%"!>#(E#4A0>D@D'<')@0;4 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:31^GC14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8539 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29334 42 79M = 29413 269 AAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATC *GE:$387:3>)F*6D=E.>#H4-C*3G5(1:F.(8(;2=>*B.<",&CH1:/D6)5E#8>E<71;-0+(A$8.2395B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8539 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29413 42 190M = 29334 -269 GTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTTTCAGTCATTTCTCGCACATGGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCAC (&9>(E%=E662('468$G$=!)B=C:2?D--9>*(9?@BC,9%D>3H7<:>D1-60.;!H($)%,&+B2(G<+2E'D'@,%)6;."$A=?8)!!9B9&5H0F-8-7G=:)/;4:?G=F+A=;9)'*;$G9(?1+B-/@8#D)"!9)B.;F3@H2:5DHEG<<%%!;F3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A19T133 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8540 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11047 42 206M = 11253 299 TCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGGGGGTAAGCGGTGAGGCTCAGATTGCGTCCATCNGCCAGAGTGTGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGG <-0)5/B"(2%->@8#./836*D<';!:'6E?2G//"?4<-!"HB->&-=3/'>/*),D6H9<2>3'E3*)*9-G2G%E#G?'?G,0('"#A91>#E6.B)>;)B9D!&G8)$A30(>>?A2"G6HB.#!8',0.2.3D(8F%#,A1F77:0%(?CFE630%E,%997--$C215$44#D'/"=*';3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110A95 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8540 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11253 42 93M = 11047 -299 CTGACGGCGATNGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCA ;HCCH.B%396>("9+(D3-+%($&.)A,@*C#9;-82:)>.H+E1B900AH,'E038CAD6:E#:@&;H/*;'<5H-.D73517#?"&%%*? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8541 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34139 42 72M = 34302 260 GTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATG !C@,51H).$6%"E-A2$?D4,F;'@)##F="4;C*?<=,@E."<$+:;%7,;H!6$+E/&6.G&G5+9:2- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8541 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34302 42 97M = 34139 -260 TATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAAACNTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGC 94@*C@B@9?!89!"C>-E705?B.3@(H='=&2?1=-7-2H#?HE'=HA-,-HE<%H9&3%<49?=+855"63@!#B/E:3DH3?207GH,>&%B3=7;=",A:G.,*8?/FE'397/F9D+1@.(2.E;9D6!,>8+5E7,%)G*B3*&:,0$:H<>#2=/0%>@8+B#707H!>3?G(=("'.$.B<6@"#ED%C4A-4@H029E7$F./5;:2+.4A*;6(:CE(AB!4,75!%,5>G(C)C*+5,&@#..@#C*#7'C@@G?)A%>F%)+5"A-A4!'<.4$21<<*%0-;?(@=.?!GD.#=919H5,29?,*8B4$'E@8">=!6@%.(0'4-17?E,A).&2D#DH);G(<75,GD6-=0#7F'1<1"44B6,!D;:(7D6CHFADACG;%7'D>(>"&*):==F)4/G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T7A309T56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8542 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28879 42 307M = 28504 -682 CCANTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCTACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTCACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCAATTCGAATATTNGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCG D$&5!8B+7-0&E'+F(+!*=7??9!H2?F+9B!1)B<8F;3,.?*9&3=)#=9"+?532D:*"=H;53-@-/+<3G0C#@C5B0A38BC!6)&75H:'B!+"G.!$2A-2D;18=!8;6@C"C"49<,+8G(!1//.<-(4+@.+E'+$&+.$FA6,C..#'<9F88E82F->*'B(A)CGE9/,84%@GB'65*&"(26H?;@ YT:Z:UP jpayne@0: r8544 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1002 42 107M = 1214 277 CAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGC 8:?<230!>F=5<6#?3057@,9@$?,?<$.6C3<==#6.:>;:9461-H@$E)=/5'C&8;.F?=.3%@&5,,480+92=6#(+9'C3/G6,"<):<8F9#!B"@, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77T29 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8544 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1214 42 65M = 1002 -277 TGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTANGATGAACTTGCTGATTTTGATGATGATATTGAACAGG 52A32A24/G-7=C'@6/6&";:.EH=#103G5&&9)=60( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T13C23 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8545 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32317 42 66M = 32489 238 CCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGC @0(/D23G/+A?F@"3.$D2)3$E,*(!64H'B%0H>C13@('7:8*93"9H@G"D/;/77$%9@D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8545 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32489 42 66M = 32317 -238 TCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTNCTCAAAGTCCATGTCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGA :FHC0"9A$;E%27:+"%9%"@..$%;-@$8026H'"D90C8"-B7E68>%@B)"1:46/08;C2&B;1G=7#9@08@,1+:8$->:;@:C39:3+(0#7#C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C27 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8546 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37141 42 61M = 37359 272 TCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATNCTTGCTCAATTGTTATCGGCTA %"?G0C>7(*+=-!*E'&:62AC>C>/G#;)5B("&-,$8FA.4D@;)4HH)&>4C$83+HG%-7G4DB*@,+B7$D:)50E'7-62?E!'H!@%.B>177.%&E@?/80F/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8549 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36914 42 78M = 37100 245 CTTCTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGCTAAAGANAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAATT F#-38&G')E(/E:*.!!&1##AB,G"'4DC7<8.<>5&3!1D?B<)3+A)?=3D)7H4/)-%9%81:2FC%F7/5() AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G6G39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8550 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18056 42 105M = 18213 225 AGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCNANGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGG "G$!/5E2;817?0><=7E'86!)@7E$C>2E.3'2=F6/50%4>-.='@8F.G%2B.,3873C38+B!<(6,2-#7.E:';&1A/D&8-.7="C,;=3B'893& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:59A1A43 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18213 42 68M = 18056 -225 AATNATTGANCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGA 8G3:(%/:=4+9E(@B@#.D<0@",<9@?1CB7/HH7)77/F8;0,4$56&A4:%4C9#'<2#51 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T1T5C58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8551 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32661 42 245M = 32601 -305 AACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACANAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAATACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTNAACCATGTANCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAAC 'H#5&8H?C+B5G05DCH.*$8=).@;-BA.6<3873.'-DB$11&F1;H<5&D-6"-90%G>B$'%04>:;C*F9*,CDG-=>>D=A$>D0/#:DE>8>85:/>(7(E&8E"$:*BA"=FB:@91?2=F4BDD!8A7$9;%.>&>2'G6=H0=E@$2-B&<"FB8?).FE*.AF3#+A2HC33<;03*C#EA&-631$@F2%6#/>)8*9#.(9?0D6/"$AC>F)"%= AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:91G50G56C9C35 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8551 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32601 42 60M = 32661 305 CTGCTTATCAGGAAAAGCNTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGC +#((+)%+#("#"'"#(+&(&!'*$!)"$!+(')(!')+!!!%$#!&&)+!%#)*!!%%& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G2G41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8552 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18047 42 148M = 17929 -266 TTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGT 4)E+-(#:9##'1%(=!;F'71*DA@@/75<&)0@?$%+.8,0&33AE#-@$6(,;A'E1;EB/:?-'+B.35'"45=G7G::=*%5BE88@B@1"G9,B:=;B"5?)2!4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17929 42 59M = 18047 266 NANGATNGGGGAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACNGAATCCCATCTCGG '%!#*&$"*#!+(#"!$%!*)!%&*++)%')(*&$'#"'''$%$!%(&)!)+#*#%)!( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G1T3G0C2A33C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8553 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4782 42 71M = 4987 287 TGGTGGACGGCATTCTGATCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGANTGCGCTGNC ,G;@?$$:;*C1.:0&84@>DB;H@A$#,)&#$63)$582.3;#?;@@9;1='7#!917"CHA::5:243D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17C43C7A1 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8553 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4987 42 82M = 4782 -287 CGTCANGATGGCTCACAGTAATTACGGTGCTACGCTGGAGAAACANGGTGTGGAAATCACGCTGANTTACAGCGGCATCCAT 8&>%@5%&('AH)?ECFC+#E?3B2&)'E,E@FFFA7!:G>C@'A23&@-D&B$G#C5# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T25G13G19T11G4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8554 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9471 42 92M = 9676 281 GTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCNTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCNTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAAC ,=&.&0?"?1)3F<)"=6%"550(0=,+)$="*#4;C#G$7$:,4#*-52*#3B+$AC9#@1F6+?4# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G20G40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8554 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9676 42 76M = 9471 -281 TTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGTGTGAC 8CB%2B4'G(.27BFF0-*')>3%19?)%;;-0B!7$F'E&.G%#B2'.<4@?*--?*:'+A'97(F>C&1BCD9'8E AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:10^TA84T1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12961 42 249M = 12863 -347 TGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGATGANATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGCAANAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTCCCAGNCT $$"#!)$)!&#*#(&!'&&(#$%($)#+"%*+*+(%$+"#%$*$&+(!$')!#$$%"!%((((%$$#*#&%")!!$(#+$("!!&%%$*!%)#$'()"$%$!%!%+""%)%#(+*'!&*"++"'&&)&%'!''&$%#%$$!)&*!+%)!"%(%()$+)%$$$"%#+*!#++)!+!'#'!!+%'&&'!*&#'$(*"&)(#*)"&+!++#"#+'*%%%#"**++('*#%(%!!&**++)$!('#(+*&%#' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:91A105T2G40G2G1G2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8556 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7038 24 48M = 6889 -197 GCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGNTCGGGCGNGTGAC #&''&&)"$#!()'($')$%&&&!+*$"#")(+'"(*$*%)*$&&"$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34A2C4C4G0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8556 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6889 24 48M2I10M = 7038 197 TGTANNCCNGACNTTACGTGGAAACCGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACAC &'&#!())!%%%!$(+('%)$+)!*#(+$"'!&&#*#+%++#)")''")*"$+)"$('$# AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:4T0T2G3A0G10A33 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8557 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5194 42 109M = 5038 -265 GGTTGTGCTGGATACNGNGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCNCCGATGCGATCACCGTCATGCGTGAT EF6.#$/0;3$BF<.!!129!E?=.)7G!4'+,8>#@,#F)D9),+E?G%=?5*0$D/&4+->;"/=**63!,;/!:9-38%-C759E+3E54C<"E:)%&AE+E,G@- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15C1A64A26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8557 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5038 42 65M = 5194 265 NGAAATCACGCTGATTTACAGCGGNAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGG #0D>?84B+!0=,>&7CD1,8E)*%5>63&$81F$@F$+53?H8E=7C>?:-F>B$#70!<#D>0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G23C40 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8558 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13091 42 144M = 12909 -326 AGGTGGACGATGAAGACCTTCCGCTGGAAAGTGAAACCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAACCTGAAAACGTACAGC (D)<-!F8E)@=45)6'2@B98##3!31?@$*)/8076B)@-@CF6@>0'A;C4<(-%DA.<6.B)A*B$<6D"A#60.$55B&(;$.?EA?51&<>A-2<.ACG6<%"A/%0E.5*DD@+"+4'GC6;F3#<8G&1:5/>F:36:,D3B!F0E(,8-,88,0G:03'%E#H%>)D'!4*"48<&*1B4)H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8559 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15139 42 86M = 14959 -266 CTTGCAGCATGGGGNGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGT /1;-G"938%;)80G5F-A("HGE02>AF1@&&A;/%A+!GE.--@'>$6H94(,";@?"=<092>G7=*=A9)4D/@6!:9/2'/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8560 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8328 42 72M = 8400 264 CGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGG 3F&5?=1;1/"$#+@67)*;90C->=A$"!FD0<+%@6D+2H28H)"$;&'6"?91&;9A*8A#>:D<")/7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8560 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8400 42 192M = 8328 -264 AAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCNTACTNGNNACAN ""$$(+&)#&)$!"')!)+#!&!('%$#*"+!"**&()%##"'#+#'%!++)"!*")'($&&$!%"(#(&)!"(&*)*!$$$%'")%&+'(#&)%'%%%)'#%+%!+&&''+&'%&"%!!##'%"#%#!('$+)**&'%*+%"*)+!+*!!)$$"'$(%(&(#"%%"(&'%!!'&*)+#!*((%%#%'"*&! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:179G4G1A0T0G2C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8561 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 305 42 148M = 147 -306 GTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGNGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAACTATTGAGTACGAACGCCATC 1-?-$:*%7F<,)/9?HG-F1921(&#+4?'#%+10,.'/DG&GF(E;)#9%'4=82CHF:.6?44 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A39G49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8561 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 147 42 120M = 305 306 GCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGG ;>2":!7*';HD<#!.AAE/9+&<:++7%=99A-3'D!GD!"??HEFA#?%?3A8)F6%HC;")G-:#&-.(F4'$7#/G$;6/6GDG(F#(6$/#-8?7&5;GF<, @,7A!F4)"72519*&:27H>&-B%>F8((>!,# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G120C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8562 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14425 42 136M = 14281 -280 GACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCANGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGAT FA?1>9550*,>A20+-28D#/'+E>%6!-4;=9+3(!&/+2@668A4D$!=1C#($&C-%-53$#@!DB$-H>);!FD1="&3#!'D<@9'>-)*'5B5!9CD:20,(!A)8>7-!?6+25!9)!A'%75H/+/7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54C81 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8563 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41177 42 79M = 41256 425 GTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGC 9(A*19593=E;E6#'8C7C@*92+H3/32<6<<2=!=E.D'-<18"G0@A67(BE=1#F/+A2719(!9:"0+AHC:- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8563 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41256 42 346M = 41177 -425 TCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAANA ?>#BG/H,+.A4.9-3?'):H1B3EH7B+")H;9?<0:=10+H4'F21$?+;3:C8E9=>C28"!DC;/#"$,-1#/@#79C7D5*%?4*.0C%3H35='92)&*(FE7&88<',6:*0-#"?9)"-C7D'?(2@"G9A5A$>'*/4!<9#1"6$+D:)9?9$-?9<&==79)";6))!>3/=;14E@E1>C'(37!?><"=)1+-1%3072=1!<5$#2/7B/B(!"0H8CD0133/1/)D2'A$/.*,"4F50@7G,CH$H/HC/(::A+-/,-6(A<*/0AA-&1("C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:344C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8564 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45338 42 85M = 45423 216 CGCCATTATCGNCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATC !>#A545-9?)')4#@!7B-;6,4($$6$"#F18@!#>!"@AA&09+F/59(.!)+18H/!<4=(D@.4F#83?H2BG.985*:0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8564 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45423 42 131M = 45338 -216 GGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAA ::9%)%38!++=G9=<$4'"?9B;*:%@C$&4+*5/98C'91;.1.8A0$7)78;@A@?D(6AEA*1$)HDDC$*E1D2<:!F$?854.4)?.H:E&-&#;:1&9B(*+8B-F3)E65)#FD@8F%E!E.9&<)(!B"0!E1.7#E=0*@#0G450<$@1B)(E>4C636!/*BCF@01.>**3-8.A)0$(D8320-=76>"$2;@<)$ED2H1G1@,CCC5HG!47,=##'A7F7@!)0:1F>:.4G:@@G,9;.D2>)49AA%<"E17.B##:()D<#.3,BH!DB;==.(&56.(-4?=-*@>8A"2,*FC-*!'+8)&62+B475/+,F#FF#"3A"'"$3G/7%.4>!*73AB%-&=(:#%29(48C-;8(40+/(B:"$"4 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0T57A74C14G6^TG16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30583 42 152M = 30410 -325 TTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGNTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAANAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGT ?=H=71@9$291;=C?@*<:D"4(+/G'7"G-*8>(GBDB502+'3%0?!$9@E'(('9'@!0GHC1@.>FF!.@DG))+543E5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G29T66 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8568 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46752 42 238M = 46602 -388 TGGTATTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTANACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGNCNTTGTATTCCCGGAATAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGNACTTCTCTGCAGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTAT 7&A5")&(.):43'*B1'0@$A,4G7.3?D0D--#:;%?/G6:AH*F6F=;?!=*!?)A:D2>$HC@7#8+1?,0-B4;911G&):/';=1((F(7@>)"G)E=9;!B>0;%++65F$>;E!$8.B,)64)/G;B6F7H'-"H6&7-:"/"$FC.!'CB'17/ED/(!99$G.D$)2=07''&C,?;!)H->675=,=G(>9!@)A=()4C1<)@3=!195<3A=.E0,.**&&>..+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4G61A61T1A13T26A10G55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8568 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46602 42 150M = 46752 388 TTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCGGTTNGTTTTGAACNGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTANCGAGTAGCATTTTTTTCA $2F=CF9@:&3('7$&+!HC%<4B+:9-)E+;+.7D9)C2HED'4/:D!H1/?@9C89BH!@-,-#5,$*H99<-.=#>+:B62.=?(F?*1!0F49@F98FD!D:"%'+D$-B..F*C16+"5?#/4'(609+%@2,>*@@G>E&0#>G3;E624*9,B,DG7)8=!%8!D&'"D.05;$A69)+>. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92A25 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8569 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44487 42 214M = 44701 332 TTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAGTAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGNGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCNGG /(*8>H,@,>2$588FCB&!3)B1?7.6BG'03G2?5&1;).-!@28>*++=)GB,>-E=H5E.>5=H+>!3$0)D26?.!'C'2@7B@!!&9BD)!('D2B@+*)85F6)B-%;G4D.?H7G;50G.*+G9FD/DGG;@?2;'073G*9HH59G6C>(05;7+D5?&2//9+#07!79/H'&-47"6B/9$A)*'B>F5@%;"?.&F3FG5=H:<:>3H*"(+:62+"*1==2@9D@52!*&;)7>;)'*:4.4D7!C=,-:?9.1)H//'!0C()?-#C;*--6#FG5D.8'&C<7/&64H898'*/>3@?D/>15E606"HA-F!**.G-,7 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:158T26A126A21C9A10A41C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8570 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27351 42 95M = 27446 504 CTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTT @*D#H':!H035.!F/H(?G*,E(D?8:.<&4C7C,"=7+=CA(93D@$?H7,::E87>%A:D,0//(+9+B?7'5EF9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4374 42 53M = 4165 -262 AGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCA <9!8*C&/;F5%%.*/>%A/=%#@A$$<&>?*6$)5,HG@3%9#D/-$H4F-. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4165 42 44M = 4374 262 AACTGCGACTGGNTAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCT DA'%-BG'G#F-:D'F'4(?(6C+<(1-=/34&>D#:H7%*'17 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8572 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33544 42 117M = 33661 184 CCTTGATAGTCATACCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGT 0*71-1>/5D8=+*2%<;''61@DB/,?"<$#G.5;#+((-'73.>=+;;%$%/<:>F-%=="D.2!EH5- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8573 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37196 42 51M = 37325 210 CAGCTCTGCGCCCACCAGAACACCTTGCNGATCAGCCAAACGTCTCTTCAG 5./HE6&-$24",>1)"10*5/70E%0&G2C'2"#4,)A2H*7,0C&210% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A6G15C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8573 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37325 42 81M = 37196 -210 GTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTGAAGGTAAACTCATCACCCCCAAGTCTGGCTATGCAGANAT )%+#*(!+'"*+$(&&%"*!"'+'#)'+'%"#&&)#$*!&'*+&*'#$'!'#**&+*#$)"("("'(!(&"%'!*+$"'') AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78A2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8574 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7195 42 97M = 7305 217 GGAGTCCATGACGAAAGATGNACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTG (7C-<@>F>#%B0'5)C/.#+H5:+#@B4:1@-&)423'09''#895H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A76 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8574 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7305 42 107M = 7195 -217 CAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTNTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCG D;,-35"B*E#9B>&?*+C5:5<)-5&:'A%=C)E@&0#E3-$;:D2/2!G@0E!*G,4(EH9+5-!-(/-13F3H6%1*4"(,C5=F5#!$'F@9@-5@=G35441 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8575 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G156A11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8576 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33963 42 238M = 33793 -408 CAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTCTNTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGG H8=E95%.C,?"52&%/5/1#D51-=9:GC;/=:$2CG5?<-B!)@5!2EH+(;6'#!G4(BA6)<#6"-HD%@!C'G93(,2H=B5G/A6H*4(86@;(F:?E%+.41%F&&G(/%->(#!<2/?A(.%8:+B>G>H#,+#8F/9.>=>*2&GB7=EE;B*%E;C%':4=!04?#+6:G?8/"72,*6:%G6HG/>HE:*(7B-5G&D49DA,+A5"#"F>3/C%$=@(ABF< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:158C79 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8577 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36344 42 83M = 36427 480 ATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTCGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTT 7&9)%"?#326$:B2;H411*%B?E3%9&);F%019D,(G5@?'@+C,9"E#DAD"<'*4D3EA&B;>**G<*/720D1B9$< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T44 YS:i:-43 YT:Z:CP jpayne@0: r8577 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36427 42 351M7D39M = 36344 -480 CTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTNCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCNGGCAAAACCAATGGTGATTCT HC%D(4G!#/!G;))B#*;D)28%6#*#&C32$/6!8,81;E8&)*(!?90%-8%EB,6&#=;'(//?724B*##34G?.GC;20('46")BF5>*:;H:')#?12;0,E1'H(1#"0)F:D#"<1/!,&-17:;?FB7)5)"B0CC=C<+$;?A45&>75E;$G7?=D>B;,:E@'/*4-'+:C.,F6DDG5!'1.G+C4=@02+*45-",(!H3,#6B%&2E,8D6(82./%=9("#/9AF03H#*?*%H?H>"#-'D).:&*C+FA/C1@!)@6(3H):.=):F9DF-8$1#C5.$3*@:B AS:i:-43 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:13 MD:Z:152T198^ATGTGGT17T16T0C0G1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8578 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13049 42 57M = 13228 232 CGAAATTCAGACACAGATGCGTGATGGTGGCCTGTTCTCCGGAGGTGGTCGATGAAG '%D.7=#G+HG';**C8B&9/2.E@#(B654E'A<-4(#686=.$B4;:)?:@*DDH AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T47A8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8578 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13228 42 53M = 13049 -232 GTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGT @77E&=?,%"D(>D=,=2AB'"0/0>70GD$@*?"5#@+4++.+*E,>1!F651?203;G<).?+F%7F5C>:9$.#:;9@8E4$1%39$9<$A(3(=%?(""2(#53::E8>C?-:8C%B:,B'3!/-F3:;&,-%0FH&!8>+!89'G;#H82*<@>A,)E=!>/(&E0=*G8)<*1=F3!070&:F?-C,/)$'D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:163G39G4A33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8580 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9353 40 32M5D61M = 9189 -262 GAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCANCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCN )6);$(6)B!A&,:&,H'>*(D?G$+$,,:22=>,<3'4&?4.B<*4;%&($/D?-7:%4+7:/E!+;<4@D<;<=32"&)6=61";B'11,4=76B?*D)#DC8!#)2=E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8581 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13307 42 143M = 13512 273 TCCTTTCTGTGGACGCCGNCTTATGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGCGGTAAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAN $*+("!!+!$)&+""*+!*!)+*#!")%'&(*!$!"#*&&($"$%*+*(#!%")''&)+'+(!*%'#!#%'#)%#$+''!)##%')*&!+*%&*$!+)"*'$%'*("(+($*!!*$'""'(%*$$))%('+%"(&(%"$$&(* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18C93T3G25A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8581 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13512 42 68M = 13307 -273 GACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCT 7+&"417E3++.E3"'>82/%82:'!>A"/@48A*:";8142%)$&6'.H%"2D869FC2:D8$6*-EB<=/C;,'A0"=E=?;:4F5,2%/=4@&>?)'F=H".5/!$F3DGC!/%*'8")%%)6/A,D!32%F- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8583 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39826 42 76M = 39586 -316 TGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGT 1*@*@56,9?0B>G)?2'A4-.3E).8?7-7=FF!A.;+-<**>GG,>+3?>.G*8=3:3;C=('?BF14-+?7@( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8583 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39586 42 70M = 39826 316 AAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGACGCGTCGGATCGCNAACAACATGCCGGA 3?B9<&="0)#3G2(G5F:+6635$./>H2,4!E7+C'&F:B7&FH6.*1.&E67@G-*&B*"12H>)A3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T12C14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8032 42 71M = 8183 261 CGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCA 4-?101?B<'>?3&7A&9B7DG2=.8#CB$;1GH6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8584 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8183 42 110M = 8032 -261 GCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAAGGGCAGCGTTCATCCC 6E4E&3>H11#$;5-6CCF!.(>&7"">$&?4,:A$H7*;2/38$1/&6D,,7&1CAHB81:#F8:)>9%5%,:->@/;?$,?<,16,,4C05C?'"?&'<62$9$=11= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8585 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36936 42 54M = 36936 0 TTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATACAAATAA G,%28>'@(;,:=2>H>#./D/*#%5:0&<8F2@&7')6)<3><%!>,>+3?%% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YT:Z:UP jpayne@0: r8585 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36936 0 * = 36936 0 GNGNNTAGNTGNNANGANTNNAGCAAGAATCTTCATCGAATTAGGGGAATTTTC &)'&"&*)'*'!%$%%&!'"#()$$+)")"+)'*#"#""+*#'%!!*"'+#"&% YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8586 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26796 42 60M = 26938 184 CTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAG $.+BB-&'EE<-.8%D-D6,#!A(/D$B?*E@;18D='A@,-"-1.G@28:G?92.:;E: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8586 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26938 42 42M = 26796 -184 ATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTA $>+B5"$5H:G;B*+>CAH>0:>>2(/@;G+;#?$':H)C1? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8587 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4207 42 288M = 4127 -368 CTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACNCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTGAAACGATGCAGCNCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCGACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTA 8)!)<&0%550*:HD:E3/=*3D5*%8)=G?=C'&#+9(29D,,B%#=20F45,F;/'&!?**4(:*CA?4C5'3%G"1/144$@&=+8CB*?B/C6>2B!B+G,0.?D,)A,B*&'<&&F$2B)1G5,E3(#@(*6%5.33;C2>#=6!7D%;1/89H7#'F5B37(',.:;27<6)8<@/''2+7A8;(5+@"7G?/%98(96=F'H6&8?D9F,H(+EG:490>2:""00>75G:/45E.-9+D/,0E=1$=:533&-/8*>4-F";,7&87##F-E<*"BE!8< AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73G49G3G66A93 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8587 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4127 42 80M = 4207 368 CGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGGTAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGT 2/(D&5C??H=95*%C9><)C8A#E2.'#G.,<<*"&,,7$*6D2E/+&)3:98D52<#3(/EB'A?4#5H7H9*>:8(3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50A29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8588 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20020 42 91M = 19852 -259 CGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCACAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGGTGCAACTGATTCAGCACGCGC 9*)9A;FC(081.:;(9,H,BE?/"C-;@0H(AG2G&H:./#.#)>HH3.+0DC96C=;/++?2B'<*B"G&H>!2BC+H(.>>B1<*0?F AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46T22A9C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8588 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19852 42 101M = 20020 259 CACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGNGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAG .#BG0'$,@,*:B!)&$&!&EG#G+#E)545.,)#=2CE6&4H?'&*2(G.7'$>A&?@/+D<>.G58&(@4096)<"##A06C)->C!"2!25EG',,,/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G53 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8589 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9538 42 157M = 9444 -251 TTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTANGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATAACCGTCACCGCCAGTTA $25'4;,<#+H2+!D=G&/<"E)D*H+$1*0)4*F4;FE<+BGC.?5G,EEH+93?7(9ED01$@4/E;*%:3&@GF'$@92D!7)FCAF)=%,B4%6@0<6"(-5@-B3"A>>4'(:!<3G@8:;+:!D:-#/)&H01400-;4>=0H8)'2*G2- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51T87T17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8589 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9444 42 93M = 9538 251 ATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCCGAGGGCGTAACCGACAAGAGC 8*0F65!0D-1CAH#H29($0#64B",,&1+<(%(&-!>-2+22<.C<>-E+2-=#&&%G"=*,%$A3C&GFH@3.578&21EHE.)4G#>E6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71G21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8590 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34217 42 57M = 34401 266 CATTCCAGNTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCA "$%(&)&(&+#+!$+&$+!&)&&(+&!$#!)%!'"**('%+%'%*!#&%))'#(!'& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G3G3C48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8590 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34401 42 82M = 34217 -266 GTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTT +*)!(#)++('$'+))!"'+%*!((%(+!%"$)"(%%&&!(&#*'!+&+$($!#)'$*#!*%*))#++(%&)$**(++"!+# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8591 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28682 42 257M = 28533 -406 TCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGNTTGTGTCCTGAAAATANCTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCNTTACCCGTCNTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACC .+BC1=$<)F22G0;#40$;+FF5G&308A7*09BEBF,?8FF3-;B#+0?7!&@7:C?*61&H7F)32E:"D1-C/.D1=2&E'5,E1&F>+9@=@(,#H3B><@A$-17=<'B1!*E4@*3-'.)B-$97$1-D*%.>H?(G?9C?0:GG3")@"@1H-$&E%-(9#E,9"/3*".A7ABAH!7;'BD6'%<"B5%A:7!82$'4#=&$A7+!:4&<=80)$"6!.*!.1H; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21T16A63T9C144 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8591 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28533 42 149M = 28682 406 TCATGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGAT =-/6)&:H+H%5?C%&+8F79E3=@B5;/<@E8H;AD'/6D(+!!>>=*;+6;.+:32F#'3%,DE+;5+#7;(!&%,?CE7:F0:52!+>C7'#BE@E4%;>*.1<38:'*.-$:<<-<9@60B$090E1 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:10 MD:Z:25C13^ATTAAAAC66C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8592 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17029 24 63M = 16819 -273 CGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGNACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAAT )H(!ED='9&8:(!G;G:45G,EAH,H-B@G1;-46&C,*>G&=9%5,214,.&6#%)D=61D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T36 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r8593 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36912 42 197M = 37109 318 TTACTGTGAACCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTNCCATCGATTTTATGAATTTACAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGNGNATTAAGGAAANCAGACAGGTTTATTGAGCGCTTAGCTTNCNCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCATAAAAACCATT )(!"(""(+#(()'('%&'!*&(#"&(&+*&(!*$%$+!+')#(*%'!$#+)"%%$!'*"'(%'')+$!'+%%'$'"&)'"!&!"**%+%++'(#$(%!!*'"#&)+%!$*($$('((!%+*+#+$+(*&$&*"$%$&&&#&+%(!&)+$%')+("+!$%%!'!!'$!#%#+++&#$$$+*%'$$()#$(")&&$(( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0A1C0T1C44T17A47A1A10A23T3T1C37 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8593 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37109 42 121M = 36912 -318 CTTCATAATTCAATCCATTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCGCCCACCAGAACACCCTACCGATCA 7G;2=)48)A/"?,-857-.$=&A>.71>H<9F0&+>#5'F1+C8D1>21'3H&6 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:99G11T1G7 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8594 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16689 42 71M = 16472 -288 CCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAG (;<##/(<,%8&?2DF6((AH,6%-4:'8-C5@;:823%=;A"4%'DB#59.%#E9G9)G6)9;%"=8,7CG-"E(A54,8-7/;H443>#1;=3?H,/C)9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G68 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8595 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38249 42 131M = 38441 279 CGCTCTTACACATTCCAGCCCTGANAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTACGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACG 6-.<(DEG?)6:,+">2G3=)(C;!4)@7/$56B0()=D&,(3?8*@)56A.0"'$&988%& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A34T71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8596 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8870 42 127M = 8697 -300 TATGACNACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGN >/7.*F3C$:**A8/&613%0F4$5C84A$#(",A10#:1#@F'E.G"F.$>H(&1CC%;?$<##9/813.6*#F/2;6)<'5946B&$E"428?*9!45;"4,/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8597 77 * 0 0 * * 0 0 TNNNNNNACNAAGNNTCTCGTNCGNGNGGCANNCNNTTGNNCNNNANGANNNCAAACNNANNCNGCNAANANNTNCNNCACNTCAACCCCCNNN !!"!#!!!$###$"!$!#"$$"####$#"#"!!$!!##$"$#!!!!$"$$#"$"!$$$!$"#$##!#$"!!!!#"#"######$"###"##$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8597 141 * 0 0 * * 0 0 TCTCNNCNATAGNCGAGTNATNNCNCTNNAGGCATNNTNNGNT !##$#!#"!"$"#"#$#!"$#!!$!#!#""$$"!""!"#$"$$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8598 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11852 42 85M = 11665 -272 CACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGNT 372F7'?4"%-@D<3&*41<44%7#B(5*)H,=00E-/4)/!&-..:H2ADGC6E8H==';:.14D=HC1D"=5'BG%)<-E*&* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8598 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11665 42 187M = 11852 272 GGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGANAAATANACCGCCCGTCAGGAAGAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAA #;!B-8>%.25-#F!9598?*CH!;F&=.$CE16'DF0.%@3#*#>1B@DA=,27@;>$6<&@<)D%,)D+-%'#'&-+??B6@61;'>":-E/5G=<)AE-5@!<;0&4C*"&'.0:<;)586!/$8(&=%?7-;94G*C(G8F.+*=8"H$H#7GE6>$*HD::>0>)<-; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A114G5T65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8599 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16390 42 116M = 16306 -200 GTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATACGTACCTGACCACACAGCGTAA )%:2C?44D.<(-@0/774*3?(GE"D4;92FA-36'>=C6G'<&C70G&+:G?%-D#02'C67@7&>/*(/'2>427$(04%'50C$B3'@=1.; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19C51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15098 42 60M = 15158 223 CNTCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAG $&!E2F>1*E@)7-(5&>96C:%)")):(//B"65G?:(A&8%8#B:"A>2=:2A@H(/*#G;A#17H6?$,C6>?"CA<'C4D=9F63>?(!%75'E*',;+;#C/$,;%1@<,4:3!,:FC#$F=+.G*DD/,D%6%?#.:>'A!H,047D>A;!2-"DB82-D?#A1:-;9+AE>%(<8#2&%D86G3#<%9-D%E+%4,,HA09@#*H;.;'F>(0?=@81?1H5.2A9F5"C'12C4.&<2'("7:$82$"/)-81D$$))%.7:2FC$EH;F"6)0;B"-&?#'%<38>!3-G7,B:/,B:-*:#7F(08$+32+0#8GH43;#,E13<0'G=$-8EE,0=F:E&E:F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:40C77G15C72G31T15A41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8602 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18111 42 169M = 18280 466 GACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGANGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATG 9F;8@5+:C&&)C%>F%DF%?"5?AB1BHG@>"FF2>=1-<5A8(2D964(>>!#8/$4C$G3E"7D:$4F&G0>(-+9)G;6(/=?32%$!=&.17$.6!$D>1<:7?56)=:7$:6GBC,E30D>;"*''.:A@0(63+E/B49%0$G5A7H+*'C4$4=GDH19:FDE8(3D#G43@,#-%G$(:$17-+!4+)',7/#91:;7C,"-42$H:*"B0)123>-3:!,FD80"1<)*4?'+CE2F@7$=C+E3E-&?!*"#,)>:6-CB"!)/?"5<,056!1&==857B1H@(?(&D9%E=8AH< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:51C9A82C15T54C67G4C29 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r8603 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13881 42 96M3D15M = 13995 432 ANNGTANNNGCCGCCNNNCNCGNCTNNNNCTNTTTTTCCGGGAGGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGNTCCGGCTGT ((!$$##&&"(%%!%"#"%&('#"&!#"!$&"+''$*+(#)$&+"&'"!*$#!%&)$)%((*%")##$'"$)#"(("#((!'&&$+'&$+&+%'#*#$*&%%+%**$%%(' AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:24 MD:Z:1C0T2C0C0A0C4A1G0G0A0A0A2G0A1G0G0C0G2G11C52^TTA5G9 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8604 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8873 42 97M = 8734 -236 GACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAAT *#";@.?($@CF@'822H*/,-?3F8;B%2$B=B"A5AG1/'3#&G5%=F<=C?2C9!(#&/3-7#%F.<1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8604 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8734 42 139M = 8873 236 NCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGNTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTAT (:((7590>6.H#0G1!4$1GH>A!,=E$81)62B2>"@10*D43/%!6(C&'/;*3EB<531!AA(*BBA./%!,'C%F>E#A@:8+-; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G30G107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8605 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24525 42 72M = 24598 206 AAANCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATA *'%+&'&#++")$!"'$'(%*$!+%#*)"))%)&%%*)%""&*)'&#"&+))'*$*+#$#&+&)$(%+'*') AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3T68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8605 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24598 42 133M = 24525 -206 TAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAA "**H-",2(=;"AF<2G(?;$*.#"G+$A+#E",0&E'A$EBC'49%?;);334$,62#!=86F"=-G76?D1(8#$B"4.@G9(.+;3+6=AD@E#/@73:(8''1&8,0)E%"1/8C1"5D9G,27/#342 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:133 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8606 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40816 42 4M1I162M = 40982 579 CTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGCATGCANAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTNGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATT *AC*2:/='G>G)F9"EC:%4>4-;H!2C8!':(F=&/39;=E(.>G@#E5(.&+$+!0&,6B;:-1':3/1-*"B;5&)6C(;-A355<=4$?9<&H*FE>%/%D55+E$>/57H:5@C=GE0-A<+EE7*%?E=7?'??3C7F7)6;G3=->+6)0#<*$CG>D=08&24.;!G:@6G/$$"9(9H;#',601>=9BEA55"7G9/.4C?%$.#60,)-/#"3/-E8%283@16-C=#H)3?&<)A2,G:0A247,6CGG2$3<@5(17FA5<&8.G*26!:&D>8,E;B0%.3>BE6HF0HFH(1"!/<:""F/G.8>E*8% AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:36T126A27^T8C212 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8607 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32775 42 103M = 33010 281 CAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACNTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTANCGGATGT ,B%H14()/8"D%'>7$)>-A.F*>G'BE2D19A%@2*&9&B.-&CG+&4/'C2;852BA?5E-5/4-G=9$7--3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65C29C7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8607 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33010 42 46M = 32775 -281 TGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCTCTTCACGGGCGAGCTGCTG '$6)?#0/7E@:)B,.&9+=;H/3&B72.@@<+1?7E25-B'B3=) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8608 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29671 42 53M = 29871 240 AATGTATGTCGTTTCAGCTAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAG 6@> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8608 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29871 42 40M = 29671 -240 AGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGA &>5F.404':8F'A/E9FC4+H6F,-;BDH%+2%B-,AF- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8609 77 * 0 0 * * 0 0 AACATATGCAGTCACTACGAATCAACTACTTAGATGGTATTAGTGAACGGTAACAGAGNATTAGCGCAAGGTGATTTTTGTCT D#2HE6+)C/@'">H'@2?4?%*&27F64++B9*G/ED="3%:64=0?2D,'/3-4B"5,56:,->#+=B8!2,@/2%9)%&H YT:Z:UP jpayne@0: r8609 141 * 0 0 * * 0 0 TGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAANAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACACCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGTTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGA +AE5%F58'B(G)"D#3<(4'?=E?085>C'",:-103(82E?+3%5F;(5!@,?%?/;C&C+9D*HAG',())/>)A$+6G05A;(2+"7B,*!5@!(H@:6';8A'++/#"@-A:>%+1#@:<'FBF22H$1%E&*F35A:?&@(C*36"D$43A1*;-2B85H+$5#7B3/CB<@ YT:Z:UP jpayne@0: r8610 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34421 42 72M = 34276 -217 TCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAANCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTNT !(!"%#+&"*%%)!#(("%#$)#)!$(*+&*#&#+#$'$++!&$#('&"#!%("#!(')!+#'%!$"++""* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T36A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8610 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34276 42 62M = 34421 217 AGTCGTAGTCATANGGATAGTCCTGGNATTGTTCCATCACATCCTGAGGATNCTCTTCGAAC ,94=;"*@!A!:-$!$@!2B?F%50!=F23,-F'0,A+5,5#H1$%&&$A,3.6/%-4/%)8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13C12T24G10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24991 42 80M = 25151 230 TAGGCATCACCGAAAATTCAGGATAATGNGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAA D;2$=&H4'+)<;<7G?AG8#$9E7)0#8@."3F'D('?(E7*88,)?&7<7>52$;:B#1)D6(5/)::#H-0A=&,82 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8611 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25151 42 70M = 24991 -230 TTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGT G)BA:%8-0<@H(?<'::F"56B.:0>'9&/@14@:$G9=>7A/.3E=*@9=AF1$/7;-G90<9&3&"? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8612 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6724 42 102M = 6453 -373 TCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTCTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCG /H0F(>D*::,!,9!37;AF8;&C'$1,.>!<&A8&8GFB;3<&&%%86:7=-::!#7DED-+3FG"/5-+%GB%*15.>+E")6+(.9/C66726FC"F+% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G68A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8612 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6453 42 271M = 6724 373 CGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGATGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCTGTTGAGGTGGATATGNGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATA EH(BC@D=!.H3"F&1G0:6""D0.GD%'F0!9+%&$0GH4.)*.G)#(+D*G#$-:";5B/E4C+$0'45@A5)2E:/4%>>#4;=$$)(("(5)=,B><5)"H100(CD865%+90)'5#4?)-=-B:4C'F&#'%C$6:0A7%=HFE4-,44(+G/;;2#=4?!@*518E'F3<33%B165*?)D*.(<$;5+#=/+&&%9-3*9&FB2:/%;*FD<6@<,"<*>>DH@!0?.&D(+39A,G,5D$D;E-9)+64343+4D93+A AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38A89G15G126 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8613 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26580 42 107M13I307M = 26994 574 AGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGNGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGNATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTAT E)5H6.G"0&*"+%=/7'5C.5;@$&601?$8(0$=DE3'D*8@#/-&7&/6!@*@*#-1=<;@B+;&,D=A&*6:C>H)8!()-E-'H>HD4/G;AG(<"5H;EAD:E)8276,*68!4,74B>;""D8E';!5/--G.73!<:):8@?G!>2;5A5/*:G*'8;."29#.%<8@@8;8&%:>7(:HH#-1H<%0,D55,=2,F31";+B5B@<7%/D&B+/BG!%'C362@'DD'/>&A3/%3GG!36%@5F<5;$2:*329(&C9F93A)$9->!&H/5+?5-E3$*%1=!E::A+G<:3( AS:i:-46 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:15 MD:Z:161A86C165 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8613 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26994 42 160M = 26580 -574 TAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCNCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCN (9HB>'3>*E7%FC)%?CC%*&@1#7#'6$8G/*&5/34>E<4(E/0H4!%027A"4;#E5=!')@/,D%!;3>+C2CH=>0%A'D&6'/)&6&EEB#D*8.4:76;0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55T103A0 YS:i:-46 YT:Z:CP jpayne@0: r8614 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8234 42 66M1I175M = 8478 308 TAATGCGCGGGTGGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCNTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAANAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTNTGGCTGGGAAAAACTGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAGAATATT ;&4:D0?!$*9=@$D'CB$1B*"/"*6%A>'("-87:$);19394$7%9308BF%G%E9E'-=8/=;6?*6&D(084+)BD;;#F-*?=67)--C*$74D<6!1AC.%>&1="E/%'?A'D8'8C2&-5;&+#1<2B%5=2B:':,A@&,!>89)1B7GEA%9?3-BB8A&2,8B*=#,7-1&!-$&#.35?$:'.<5:+)39@CDH>5@$C#%<#"7)F/:B00FB7"%.<'F1B@C87%' AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:12T82G33A27G14C61A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8614 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8478 42 64M = 8234 -308 CGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGG 141=%*@B;C07.1039*-5:%:+8@,E:FH&>,.(71=H? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r8615 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37710 42 92M = 37457 -345 AAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGC =@AB2?99H31,AC$)(B0C/B)*.=*-+!<*0-,?<==)#>$)4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8615 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37457 42 27M1D225M = 37710 345 GAAAGNCGCTANNGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACANGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCNTACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCT &*&()#$$"$!!+!")"'(!$&*%)&(&*!*"("%$()$#(('(*&+)%""*)*+"')!%""""#%!$'&++)*""%)(#$"%+#"&*'"&+!'**)&'!"'$%%(&$!&*''!"&!!'!!'%"$"'&"&)$&&#(*"!!&!%"()#&+)#&$$)#*"#&%')"(')#$*#&#)#+(%$!&!'*%&##")($"#&+&&"!"&&*'(#%$'+')!)))(+"(+()*+)!**&%'!#!)%#'*%&!*)*!!"$+ AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:11 MD:Z:5C0T0T0G0G0C0T0T14^C130T58A35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8616 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30157 42 55M = 29965 -247 TTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTNTCCCTACTGTTAGCG D?B=6H"1F5&"?/E,E!?6@):+CA):E>>,@6C6/$@%!AA=$3CB3F7CC06:F2"D1,@)<=%:@;1;<(-4&@8@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A76A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43763 42 108M = 43521 -350 CACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTCAGGC G/<7A,'*E@D439,%''(CB(00'8'A4.GH!"0.@>,),H$<<:(0$D&DG**@!&-@7*GF?@A07%(9DBF3-39*%D8;7.G$>"#D+*5(?%26=5H7G?+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8617 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43521 42 67M = 43763 350 TGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAAC %8G9#F+(%@6=+0:'9E7!C=84(H;BA%5@#5&0F*?.9?.)BH6?;5AC&763(3<.6&,F@#% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8618 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25793 42 311M = 26104 371 TCTGGTTCATCGAATAAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATNGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTNAACTCNTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTNCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTCAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTNTTTCTATCTACTCTCATACAACCNATANATGCTGAAAT D=E><@$/::;,0;+A?4E6H29@!"0=8(2::EF>8!B/:>BG<==!)B+*.*H'+;$,<)@9H3!-BBD03,B.$#>):=D,?E-&EA(A>*+$1=$5?(G&("!!@?C?A6>3,D@+=*)F7BD.:2C>B+!#>!,*!C83$0::A:D91F@569?31?7/2@)E;78H4)>48$A+B+E?%55F#67(;<@("+6*&$F;:2C'!,@C5@(C+7$8,<5B6D%)@".E*)H.$:,(4D(#;$7$(.CG#$$E%A09G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:74T101T5T27T28T32T23A3A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8618 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26104 42 60M = 25793 -371 GAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCC %C=9A(-FD"8H=.75,A=7@$1>DB:-64..:1,)D'3#A4BF&-8!#E2H#."F,$C4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8619 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42925 42 107M = 42737 -295 ACGANATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATGAAGGCAGAGTACCAAGAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGT 0#6F#C6B,G(?=2&88=")3@?$+B-"G.07*$-),82C>5@4"5/&9@7.H7A.0FBDG!6>6064,""66E&AG;;B9<$/*BA6H AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A53C15C32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8619 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42737 42 119M = 42925 295 CTCGTGCGNAACGCTCACGTCNGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACC @5?/8**.FC7C03)/0=%CF>"/0C.)#7G+-$3.27=F'!!*#0E0D726A5+/#3/>E0?<4:,$FE+'$&&4#>58&B@+@.&(A=3E--.<#5>:>E2B:0G,;;D.8*!*9@& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G12T97 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8620 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25922 42 131M = 25922 0 TTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTNAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAG 9D).'4-%=H#%H&24/;!F"CF(!G=$:$;4'1)B&2(2)F7A(E1,3@H%9D?F07:+;?C28F)"G0$+ABE=9@(/G<0522(&*4E.2!$;-<2;@'46HF4C@5+46E4;=34"$;=:+F(C$A& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T83 YT:Z:UP jpayne@0: r8620 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25922 0 * = 25922 0 GGCACANAATNGNNTTNTNNTNNACTNAAGAATGCTGNGANCATTAGTTT '*!$%$&%)#!%!(#$*(%"("!(*'#"*($*%*$(&"#)'*&&$'$%+' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8621 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33392 42 83M = 33475 193 GCGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGNGTGCTCCT ""'"'''%('&+$!$%*%("!(%&'*"'""""("$$)#+"+#+&%)"#)'*!$$"++'()))%'"("%+&$($*$$*&$!#&* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A73T8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8621 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33475 42 110M = 33392 -193 TATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGANGTG (B'=3!?343;=,3ED-C92=HF&>)/.?'&F7056F:8)@*&%%5@40?"F"23$=*2,*(4B2%9(%A4'@&=05%-G=,-C.=$&7!CF&//>C/#D60G?>"@C:' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:106T2A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8622 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43280 42 53M = 43445 279 CGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGAT /(%*..BE5%.%11G"%)$,5"BF*<8AG;<)2EH,D;2!/6"/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8622 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43445 42 114M = 43280 -279 AAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAAAGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTNTGGC +*3/>6#,44'>&&<<+%=-&3+&8E-;%#*%&E/,C9',3<-$1"7/<7"<+C.:FD%/1BEH#1:*+)(#B7).,;)=?@FD7D6/0+/A7.*#>/D:'A6B9E3G#@.F/%:8>,*<"'-C.F+)H)#5' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8623 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25883 42 204M = 25822 -265 ATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCATCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAA ;39@>79C";>E;+-C>?$(-D-%2)G#@$,2D0#GB18,)3C-3'!?!>?C'9:E/=5A%=9@-"F92&<-:"=DGFC"@"*0:(;.'(:942.?6G&=FB"",35F1D86;7*%20H(2%78H!?B+;)41CAF3515:9B%8)G#8!8E8B?3&"4D,,(:*0&C&.G!38<11((/)A'%5*6#;@"? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:164T39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8624 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5036 42 140M = 5176 311 GTNGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGNCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATA *$*"#()")+!$"'*'"+$+#&("!)#"!&+%!"&%#&($!)&')#&"()"&+'"!(*)&&&$"#!)*#'%)!&*+!(*!&+#!"+(!%#*"$(#&*%*)'#+!"*%$($"!#&%&!#+"%$')!&!('"'(''##&''+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2G40G96 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8624 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5176 42 171M = 5036 -311 TACCGGCCTGTCCGTGCAGGTTGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGCANGCCATTGATGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTGTCAGGAGGGCGAATGAT %%")')%%$%&!'"$"((%!')%"&&#&)!#+%!(!!*%)$"#$+')'"!#**+)%"*'&"+)''#*+#%(%!)#&&*%&(!*%)!"&%%%*"!"$"!("%%##*$%$!+&*))!&!*("%#(%%(#)&#'*"*#(*+'"#(($$!'!!%"(("('#!&(**++)%%&'+" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58G1G92C16C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8625 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10662 42 127M = 10789 208 GCGGCAGTCATTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCNTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGC C,,).80E-,*?0-*!-H>A&)&2;9<*;$$"-D5E34$.<4A+!H'=;/5<129F&>$D/7E=>-8);"<91<5&H05%/"A>9&B;#'.A&$D#5AH&$;.$/H>9.5;#$C-@5F7H,2>H/;H.@A"'CF/&(5C,4-1#<5).9=A4B.83B5,)E?7&*CH1";F)3=" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8627 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38382 42 82M = 38593 287 ACGAGGCTCTACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGT 4!9GH-@!!0H@B$87.B+A3,/(6B*@(@;,(8$.0@?DF?7%D"@-(4&3+7?",!0F&&1=56#<;,F,GD)GHG.:>#+@:B.&4?.@15$=9(H$!">?B20=!+=@#,,32&7ECC=6(%@8???G6<+G)C>-2"G3;57%GF8#$-9+2%;?9">13>:A4F9&@'1<4<&>7'D18FDHH?3HAC;%0>C8BB(.EG0:6D;"0',)5354*?(#:A3-);+?*.3HB=-982<$7;" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:13C23C20T0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8629 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19209 42 50M = 19048 -211 AAAAGAGCAGCACNGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGC 676(7D+..A<24<:@E@"G)/924DBA60DE,'G>/3DE-$:<@8"0%( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8629 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19048 42 126M = 19209 211 CACGTTTACGGTGGGCNATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGNGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGT !84'><,D*+,>4A:E-#H6,C7F47(41;,87AD6*04+,:=F:-,54?E0'D40<33HA%G>+*B(''-42,7"8B6C-1=>CD'"&HA9$37+="4!>6D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T15T78T30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8630 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45778 42 48M = 45571 -255 TTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTNTNCCTATGATTGATCGTGGT %&&&!%'$&&%*'!"+#&%*""'%%+*!))+%!#*)'#""#"$!+*"' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T1A18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8630 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45571 42 50M = 45778 255 AAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTAC >>H2@=-,$D%0#4H*34?.G.&45@7C48)89*?!>:7,!/9A4'<7$. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8631 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32541 42 57M = 32679 301 CTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGACATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCC ;+*(8,$&/*%3,-2%''>#!<7#&H1"FB*B8-"*'E%'8/H8.-+'%2%.+. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8631 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32679 42 163M = 32541 -301 GAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATNCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCNAGCTTCCCAGCCANCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCT +&&)$)"**%#)$($"&+!!$+*&%#*&"*'+)##'%%%""#!&('"#%$+$$&%))&%!"'%+"!($(*&(#"*#$$&!)"""!$%$)(++%*!(%)!"+"()#&+#*%(((*$')("$)($#%$!#"!"((!%#$%%(#*+%##*%%*+++('!()"+&(( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31G64C13G52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8632 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29995 42 47M = 30198 248 AACNCTTCCAGGTCACGAGTGCANTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCC ,--76GD+(7:(?1A>%+6AD98:6@-:8.@";B=?7-<5)&F1*AC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T12C6G23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8632 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30198 42 45M = 29995 -248 CCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTT ?'@,71D<8@.&=$:9B6#$5.@/9?)6:C,!+GB11'!@D0-4@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8633 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19848 42 42M = 19617 -273 TTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGNGTATGAAGAT +8#1(B$4'<-*62-7;B3?4.B%-C"'5>%D(4(A(?4*8% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8633 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19617 42 65M = 19848 273 TNCGGNNCCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCANGAGTCCTGAAAGA "!$'&)')*$+('#'%*'&))+#%+'+!%!+*")!!+"$'(+"#$*"%**"%#+*!('(#&'&%* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G0C3A0A44G13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19207 42 96M = 19061 -242 GAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACA =1FAF9C4.49",>$&-C6&2:=3)2..*',B)>FE0-A!C+3*>()'C)"$5%0*D/B?!2/$2(>$/(5?&85%%G5:4,@9"-(9;4.$5)=H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19061 42 146M = 19207 242 GGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTC &40EH.",:@-?D251F/5<-1#?=<9=<(.10EF';296>94>#E#"-<1E42%6&)*F0437961$.#2!,%8$@1#>'./;CF*;".3A/B/:>*5F9?;!5DH6=%A$'75!5F7GG?$;05'+."&#B?"#/,@-0;7<+$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:146 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8635 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31975 42 62M = 31975 0 TTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCAC $920-58(C+@B'06D3+90,>"*@*?&9D1:2,6);9=$5<3/-'(19@'7@F8+>.&!6; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YT:Z:UP jpayne@0: r8635 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31975 0 * = 31975 0 NCGAANNTCGNCANNNNNCCNNAANAANCTGAAACNNTGTNGCNNNTNANNNCGGGGCTNCTCNCNATGNNGATANNANNCNANNNCGNCNTTNCGTNGNNATNTTGNCNANTNTNTNNCNGNNNNNTNNNNGGANGANCANANNTNANGCANNNCNTNGGANACTNGANNNNNNGANNNANNNNAACGGATNGCNANAGNGNNNNAG !#!"""$#$!!$##!!"!$#$!!"$$""#"!##$$!!$#!"#!"$#$!$!#"#"!#"$"!##$"$!#"!!#"!"!!!#$$!$#"$!$$!$##$!$#$""!"!$"$$""$$$!$"""$$"###!"###$"!"!$"#"""#$$!$$#!"!!!##"!""#"!#"""""#!$$"#$!"!#"!$#$"!#"#"""$#!!"$#!#"#"$!"!$"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8636 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42691 40 87M = 42857 246 CCGTAAACGCCTTCATCANAGATAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTCCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGAC F53:<:)%7@C*+GG>.@A>#?8:@/,$-?)6'C7#D*H$!73H5$&4,!CDB<'C2"F>#7CDD!G"A>06#88.*="C53;& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18G3A28G35 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42857 40 80M = 42691 -246 GCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGANGCAGNCNNNNAAATNNGNA """+&*(*(%&+"%'&("*#*(!'!)#")"))+&&%+"*!#%!*$)*'!)$+%"*"#%*)$"'$#%"$'"%')("$"!!" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:60A4T0A0G0A0C0G4C0G0A0A0T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32782 42 96M = 32543 -335 CCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGN 8)GC/!C.0,,6%B71=$-$#!CDF=2#03?-5H@G?7>E:,;3&3"3H/D,-%F88-:$(A6)"+930G,);;&:!!*(<>/FA)4C0776&3=! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:95T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32543 42 46M = 32782 335 GGTTTTCATTNATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGG 4C-%E0:--6@&6G$4$9E8D4&F1=.,0(.9B-;2*"F;#HF<.= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8638 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24238 42 191M = 24100 -329 CAATTGCTACCGATTNTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTNNGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGNTACTACCGGATN =!#15):;@/733C@D,;==*18.76'?E8D-,/9/9-3DA=)$;C+(" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G12T49A0T14G96T11T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8638 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24100 42 138M = 24238 329 TATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGTGCTGCGGCTGGCTGNTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTC 1>;H6@E".@-!FACH@C()4>9H8--DD,F"2+>%4(;,3(/A%.6!2=+3"%=H;=."(7A'A#9E9"6)?D@@&)E,>/%6E:"$$=.-)/+&:+?+-$"-.8.!(2DH>7."0:7:074'>+&=((G*>C>8)> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103G34 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8639 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38437 42 61M = 38278 -220 TGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGNGNGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGAC $."4,C-/&.*:F$DA4"A'%2F;A2.HCB>A8D-7,2<.;%/F%#1!BH''3$5&7!#EG AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G1C36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8639 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38278 42 114M = 38437 220 GGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCNATCAATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGAGGCTCT C4/2%!&+<:&'"=,@D4#3@&*):EBD=:'61!--B@D8$731?,8(%2:1E&0"4?9+F@-@/H"/.42"A:@8C'%/CH6*86=FE$'F?+5*,G;B5!D!%?07;'+-+@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8640 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11633 42 55M = 11453 -235 TCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAN =H#E?984E0/H4'E/'"(6#(2#0)6$/9H+E1!A4!"=0B5;2'%D050>5=!''"E1@%-D8'71B?<"'!<>*9E9; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8641 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41480 42 78M = 41136 -422 ACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTG B-,/0BH"=,@HG)4D/&F-="<..5/4F@)9?2$3=.=+,"3D035+)>D2>FB65D(F:+/D?=9/%$AB?A<=*6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8641 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41136 42 37M1D306M = 41480 422 TAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAAAGNCGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGANATACCGCNCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTNTGAAGCCATCTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGNGCGTTCTGCACTGACANATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTAC &#E856@(F0*/-3.&2157>BG6>1?-:<'#(3992.DD74G:--EA$AD+3(7>72F4,)66BBF>E$*@A"G+27+F>)5@?0A0(5*!>0EF;&9=CG01F6/#!";**D4,?'8!##3@066@4D(#5E35$/=%+'B805/,(9H?350$+0+;?B?=%B*4,(8G42<<94A94/(5=&>,B,::#/%!418E+"GB3FE$$+=H<(#4H;)H;*%#B2*22":F'&E(8>CG<*F<;35DE'HF8@D:2)2AF.,9).%3'824!?%?)E7@;;+!B7>;9F<-*%&$.2?'5+(01B;867-#B>:#=96=3 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:30A6^T74T7T94C9T42C16G58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8642 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12479 42 95M = 12342 -232 CAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCNGCAGTGAGCAGAACTGNN !*$%'$&"($%)*"$""*)$!*)'%)*#&+%#$%&#&&'%$%%)!%("!(%(+%$(#"!+!+"'('#$+%+))")$('"&#)$!#'#+($!(&%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:76G16G0C0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8642 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12342 42 137M = 12479 232 TANGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATTACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGATCGCCACGGA '"!<:5=558!$A/&A-*?C%;285&-;.:>;8<.#;E&;A-'@-"'0@*&:0>66-$GD$0A#8%7.0("H9C?1A?+;H:"98?,",5!@DB@.=EEG:G"()##!"=":B;"=='H664428G%<8:2:C(%%> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T24A99G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8643 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24190 42 50M = 24333 247 CTGCGGCTGGCTGGTGAACTTCCGATAGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCA H&*3G:*9G"-E-'92F=7(=H-&/5A82B3(544>2%2$E&;:=D-4)< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24333 42 104M = 24190 -247 TATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAC 3!0"C@@2'4?C.G&02>F;H-BC$B2-./"G;,B@+AH"D4)17-2"G24H8E%GBG+F%"/-@F,?G?8(62A%:=4(74;90<7B-A! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:103A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8644 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39939 42 71M = 39800 -210 CTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATACGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGTANGG %$!)+&%*&*"(#(#$"#+#)*("++$(*((!!%$%((!"#**$)%"$''$'!)+#%!(+*%+)&$"*$%" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28T37G1T1C0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8644 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39800 42 106M = 39939 210 NTTCCGNGNNANNNGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCNTCGGCAGAATCGACCATTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCA #((!&!"(!'&#$#&$+$%+#!&!'*&"**)*(+)!&%#++"&%(&(%)$%'%(%!$%'*"%""%%!+$+'$##'$$"*#&!)&*+%(#)*+!&"%%%*$")##** AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T2T2G1A0A1A0C0G45G46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8645 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13907 42 70M3D44M = 13671 -353 GCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGCACCTGGACCTATCGCGGTGACGAGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCC @:84"09428BE3=.=,G+'?7,%6&#F#04)4+1&*9/6##G#3>"9?E3F+0',8E-E232A(6)6+GE(D5.D,60)(C2"!F:49852=E/6#ED6'AH3#(..4A!A-& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:70^TTA43G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8645 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13671 42 236M = 13907 353 TTCTAACTTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGAGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACGCCGACGGAAACGGATG AF-!@1E/!-777B0"7HGF?=2+;5DE'2B9C*8A@!8)>7G)0%?-G3C1@3(E,)@<-$E9=?GBB-3<%7B10D77"!*A;"E:>,AF+3=#@,#7+2%("4<""+>HA*10.-C@;,55H#>;)G4F<$(@.)11+A9G8$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C172C55 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8646 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21230 42 71M = 21045 -256 TCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATANCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCA ,985G3G3.G+=02?H<1CE20*)BB,45D:5+.?E%!50DG'C-.:;30)06(D/9-@';@G$,&$G&+8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T27 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8646 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21045 42 185M = 21230 256 CGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAACCTGACTGAACTGACTCAGGTTGNCAGGGATTTNCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAAT '?)?A3.3;@6GC<-$2%E#,>9F'@FA4$1:=&8)E*A5H/'>:)7)&DDD948@H&.D38A/;)@0C-?<66))DF2""10D'>7HC8F+E&$<$@EE!/8!GHA39;/<&D<=C.&=.G:@*?%==4*E"C-1)#*F#608D?@/%E(G@)-A9; AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:65T30G23G7A1T54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8647 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3768 42 17M2I72M = 3426 -431 TGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCNGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACC 8F2?$"=/CE"56"4#+*#+7G+F5;?F8FE.@7*:F!)?%?F=&E!C.H0#)-!,((7(H)'+6@+F,H64@<32F;7!"$59#)B> AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:24C64 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8647 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3426 42 342M = 3768 431 CAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCNGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGANATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGNCAGACTCGCGGTGCAAATGNGTTTTANAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGANCACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGNT 0=7!!?*?C@%?;H#;G!$3+68;&(;&)/A5.&#$8,-!0$9D(0":$;"?&"-G*8("3,EA8!.))$?":,G=G3&C.BB"73?<10+$,:8D:8,>"-H3HB43,(@)$'+6C8!G/&G+?&32G)%+#"D)?:"+B,!#19353%$D4+6AE6*DG-!78#EHD&C*=-5774(=F%B,:4$CF>E,)D*G*,:8>@%HH>.:<"D.2G&/4H=C$18#2C.(A8D;F6B:,0GC#>906)&$1":8!G1A-&F'")#.B(*."G#F8#2?:DD:$0AA(#HFC4A;&H.#C;DH!DC(&D=?B+E26+;@4=E7:'/:CB<5D# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:28A39C69G19T6C40A23T109A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8648 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21793 42 68M = 21604 -257 TGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATC "8<89'#C)=("#77?/G,D5:,(AD9D"4$@@+21,(+&"=+F9G%!A"CA!)6+-)H>4#6=:9D% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8648 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21604 42 40M = 21793 257 GGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATG 8)'+)+(''8+;&&>H(?GA@//?AAH/;4B-F1+E@G9/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8649 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14632 42 109M = 14849 265 GTCAGCGGCACAGCCNGGCGATGTGNTGNTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAA +#*<'G#.#<(BF01C63>02GH,8>4*&-8AD-9&&/#<9=9'"<2'8F#8;'F:E@!,,,3GB-;*!*H'C1'$/5*,<*9=<*B:H,7/E:=-&6G6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G9C2C80 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8649 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14849 42 48M = 14632 -265 TTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAANCCATCN 1(.@(8B?5<*-EBF7"H6(B$,D=/D-G42:+D-/5>1$>/$1/HC# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G5C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8650 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40261 40 302M3I49M7I13M5D105M3I5M = 40740 540 GACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACACATAATAGCTTCTGTGCGNCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTNGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCNTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATC 2F+C#?=0(4GGCFD:B5?$;4!-129(D41,*A)$?,&FE"DB,B??0E<3/6:'FH5(18*E&@2F=.)G"0"FE,CCC5&>.'-9%D.FC$)F%3>41D+7,2"<==1C?$7&3:,1+C=$A($DG39D6A#+1$"E!">?EC(C2+G*38&D%<..<9/H1BF(>=4&6?>FH1D)=$%A-:6=AG&=9833>0G58%@+=$FD;$:2;?"GE2@((+;(,(:2G;7!7+35)/A+!(FDE"$:C#D@553A%;.F)07E;3#834:.@BC3,&EE-@3!E.)2>'CCB%0@.-8!7;F1=>%@-68@"C1$"F?:+#=F*F>F('%.B'>>;!>%&)'C@/0=A&!+:D5';HB;A=$H4GA"H3(-)D.>649FFE%H$<4%8*7CE+E-$&/90.114C/A@@B<,B!G6>F#H2A1.<:8!.8/B!H0,4EC!4>>$+-/G@5;0&%EE70'-9) AS:i:-86 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:4 XG:i:18 NM:i:23 MD:Z:57G18C119T1T159T5^TTTGG110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8650 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40740 40 61M = 40261 -540 GTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCT /=BF>E%EE76=/+7GH?-244.5BG(=F,A-2'H8'-5"=);@5?/D?-G?"6(GC;-<> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-86 YT:Z:CP jpayne@0: r8651 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19368 42 133M = 19316 -185 CAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGANCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGT .*B<7(3.GD(4.3!:23F3F2H-E%,."A:.33#3?8FA*G3G?3H%#"5;5.,0*FC)79#"%"$D3842-F2'$-#A!366A'#?,89!.<070D>5D/-@>8:1DB(7E)=<>BH363')-H)GBG<68 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C49G31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8651 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19316 42 52M = 19368 185 GTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTA .6H66=2<)"@7,61,!'(@(<.F+3*CD('"+>;)58(?;?6H<8F501EG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8652 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32038 42 42M1I29M = 32283 349 TTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGA '3E&%#1+F53).A?@CF?E3B!029$*)F8F,H-30&%E;392$)GBAG($68&8-/%#:@33--5,H<4% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:48T22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8652 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32283 42 104M = 32038 -349 CTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACG 35:?2:D.@%7.40?'&:.-EFF5?'.2#7$0$!2GEAC(F=4<#?,A6-9<5A>.=$=81+)(/&'?!7(BDH';'GF:*C41.'35.'+-G!*#9%+;@E2= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:104 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8653 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20824 42 86M = 20997 267 ACNGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGNAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTG (&!+%(!!*"&)&+#&*#"+!#$#&!($&&('#"''%)"($#($!''$(+)!!%"!"!("$('+*$)&&'&'&'(#+$%#'&$$+! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2A32G50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8653 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20997 42 94M = 20824 -267 CGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGNCGGCGCTGGCAGGGCT B%=82&.F%HG7G+$;<8!?F)$8,1E5?/A+8)E,)$D;)3D"(((AFF),6H"41<@$DB#A-D?/?C0/%0DE,:495C%3-((,1!C2;= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77A16 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8654 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14764 42 82M = 14921 247 CACCGACAAATGGCAGCGATGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGNATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAAC ?GE$D08@!AGGGG%'.;7:3-+4=&$D=*"$F/>@DC+**'>!D"5@F8,(&-1<<@8&%;H%>,0%7HF'6H6118?)'< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19C27C34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8654 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14921 42 90M = 14764 -247 CGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAAGTACGGATTGCCGNGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTNAGATN !&%))()'')'"$+))##*)+&+)"+#+)("$%#'#"&"%'"*#!'%(!)"&&)''%")&*"'!'!(%&)!+#$+!#)+)+$%+$'***$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34G13G35T1C2G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8655 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1344 42 58M = 1612 360 GGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCC -62'0+H4!&/;?'9CA0A=$#8(%'D6?7*;D;"(,+36?5':D&**=@#=A("90' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8655 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1612 42 92M = 1344 -360 GGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTNATCCGGTGAAGAGATTGAGCCACCTGACAGTGTGACCTTTCACATCTGGACAGCGTACAGC $04B&9*2FE-!<./BHH!.EC1840?89<:7E%;$*:6-EG<<<(,#<$?:$/+)H.(*G<89:)H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8656 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5467 42 51M = 5249 -269 CACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACAG 52F3/3895G@4;!AH=%D=9+'BD8=4DG7HCD)+E99?A!)727044>D&8+.28):GG@9*(A2EB+>?' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56G2G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8658 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45709 42 53M = 45885 236 TGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAG C:8-F139/)5.++,2$9?()-=F."%/!H9"'5%;,B2.BE4-!*:@4E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8659 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2952 42 61M = 2738 -275 CCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGC );B(.6A?F(7%+;8GG(F:,@?FD9G,H;;G1;#8F<(?3'E.*"22:;0:!!.0*94&G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8659 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-45 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:11 NM:i:13 MD:Z:266G16^TATC8A38 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8660 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20998 42 164M = 20664 -498 GCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTAAACANCCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGG ?H$:D$;!,)%?+G..F2-'*0:E+84">39$EB;/6G14*+'6/F5=&C2D6"6G5+B+A!>>8CE&<;.4,F.(.D--1/FG+52:B9"E*!@1$%CD&:4E)>10%6*$)H-*#.=3D,;(A;;:E52*0.;.&&9.>*/0:4H<=;(A4&A=?G.<<1DG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57A54T51 YS:i:-45 YT:Z:CP jpayne@0: r8661 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9490 40 47M = 9314 -223 CCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGC &?1G;+*3:(C!G62*EE9CG/&?3?%10,(:C8&C$'"6G!C?#;= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8661 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9314 40 71M5D9M = 9490 223 CCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGT 99DA8<74&?1&HE(@:&%2>AE;829'4?*+''8<)3#!!B0D?1>@8"41',94.B7;DB4364,;G.6!1?4:1,>0 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:71^CCAAT9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8662 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9786 42 171M = 9958 225 ATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAA <"2114G/&E(H4.,1A@+9D&116":$G@(#'1<(;:2>2/&+F$<"4:E!-1=@8?++64C27G!!$H7"&(?+)AD=0+E0=(4/#5&E5A)$&"G64(&<"-(E;F*9"A.7BFB((;C7G16;>"3,'627'=! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:171 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8662 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9958 42 53M = 9786 -225 AGATTGAGCNGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATNCT !$$%$"($'%+!+#'''""&$(##%)'$$%$#+')$"!((!&#*(&')+)&)% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A40G2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8663 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40279 42 101M = 40120 -260 TATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTGACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAA E*H45)69E?25>A3<1#"4:':B&+@)(DF)$D#*A;6<:A634<;43%1@0+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75A25 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8663 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40120 42 62M = 40279 260 NNCCGCTNNTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAA "&*$&$$%#+%##*&++#%($$%(!"#'+#'"#+)(*%%""!+('$$'&&"('&(&%*!*%# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0T0G0A3T0G53 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8664 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31309 42 115M = 31230 -194 AAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAACACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCAATTNNANCCGNCANA "')%'")"*&%'"!"$+&#'"*))'%"(#)$*"#"+"$"*&!!%#+*)%!+((&+&&$*#+%*%&###&"())'$"%"')!'#)(!(%('$'#"!%"$+&*'%#"$"")*"&)#* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:65A33G2G0A0A0C0T3G2C0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8664 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31230 42 50M = 31309 194 AGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATAC %.C;3+-=A1/:<">AFC8*227H6;05@?!$4BF,"&A:8!!+&17-5+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8665 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15103 42 107M = 14970 -240 GCCATTGCCGGATNATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTNTCTCGGTGCCAGTAT $E8-2/0=7';!+&?@86+&#+.<7&:D42/'H(9-8=%497A?G?(*6(0*<7)1>E(1&2A7&*;(%!@6:5#=A+:H08+%7312(H4=:5>(E*EF!0,$9AC6H%-F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G34 YT:Z:UP jpayne@0: r8666 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15714 0 * = 15714 0 AGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGCAGGNACCATGATTGCAATCCTGATTGCNGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTTGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACA ;?48DE"1>*?.HA%!?;CED+.%,HE.F157#7C"8G$5=/F1AB&>6#??:*=G3@FC$F/@!<'.&G81E)C@79H6G:)GBFD'F)'9'55,F=.@6!'(F@"09?1:* YT:Z:UP jpayne@0: r8667 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13569 42 63M = 13374 -258 GCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGNGGAGCNGTTTTGNTCT )'(&&(%%&%(&%*$'#"'*$%+#*+&'&""*+!''$"%$%%&)+'')#("+('(($('$#'" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46G5G6A0A2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8667 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13374 42 59M = 13569 258 GGGTCAGTANGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGC ##$$(+***$&)#!+(&($!&#(((&(%*+!"!*&$$(%#%*"*&##*$*%()"'"(*% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9T49 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8668 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20039 42 157M = 20244 284 AGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCNCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCNAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAA ?948:0%"AA275$>8#,<(0A?&"G$>C#G,'7-&E+C6A&6E23.E0H>$@%A697"!;,7!GB#G6D!<'<.2H%:94#3<+7&%&?!7$$9#)C@B%EA+'?7=?1!%"%2!#3D*$8"AG+77@41;*>(33>$<:%!E*F*91H&&H).%;9GH+($GG6G9D@>%@0!$/F/+*"8A2=,0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A26 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8669 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34598 42 50M = 34911 402 AGNTAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGT '#&+")*)&#"!(++%(*%++!*&*"'"%))&&)*'%*$%+"($&('%$# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34911 42 89M = 34598 -402 AAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTNTTCCCTATTGAGGCTATTTACTGGACTGAATTANTTGCCAGCTATGATCCANA -8;:8>5E+2EE0.F7593+@3@+(H#%2##!689B3"7BF#--BC<*@/7:7.?&9*>!*G(&$=?B0:1#&@>:#2H/7G+@E!A)7 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9T25A13A19G17T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8670 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32699 42 60M = 32759 232 CACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCA ?A102+02;;<-AC682(4E?4(4G(.01=D98)/-'A9/BB-(23,A%>D9.>)$12'5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8670 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32759 42 172M = 32699 -232 TGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGGATCAATATCAACCTNGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATG 78.;97EB<8@-54>$H882$GD0A%!(9FA11BE;/6/;11))FE15@7,/7*(%G+'%+42C;'H$A(&E4+#B?,%5'/C0B#('D5=@D>D5/)D,#5!4;0)0"?A3,1D0?GE-;A+E'F3066?*>G):9);0-9.4/%9$'&(35*(73314&20/@G(.19(@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:68A14G88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8671 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18863 42 241M = 18720 -384 TGGTGATTGAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTANTGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAGACCGGGTACATTGCCCTCGTTGTCGG $!$8HEA+=5",A>-8-D4+D,##1)<:@0.4@C@+148@'>='0G#>BE?$G0"3,/9"::."F1#&>4-2A+>*"D*)/47(1,!EH#)BG9H@F3H(#5D8B>.&<&H&7(,<=F)#!6+%.=*29D"2E+D!C=:;",.40/F.1$G="@=?DE0::BHB&0:*F%,H'B"/%H/B4'+GD(1-,>*>>!><'8(1>10(,B0(;0,;>.FD,G#'<7%8HG(!>F AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A100A104A15G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8671 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18720 42 143M = 18863 384 GGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTA C9"3#:5-.D1:*.C>)/#FAG6@ED(D9.3D'%,!*27+>#(;CHF*=E5?='D9'20A7*H2'H$2:>C3!#(6>*.;F=7H*BA=C&1H89902D/'D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:143 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8672 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42398 42 439M = 42301 -536 GATCCGAATANCTNGATGCACGAGGAAGAACATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATNTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGCATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACNTCAACTCCGATTTAATGAACGCNATATTCACAAG @@9$8*5*&++8*>D:6?'6)@@5B:>787/#CG>#=-F#=D7<(")=!B<"7GD%%&--2*E05;.-%)C%@H3.C3=())G';!+.B*&!$A/G-@(8;A31;@9&/E-$*40$82%"E!3.A4-?)'3#&%3&)9/;@D71C,7H2GC#'#@<'*$8&22/F/:;F+"BA$)42%@.;FG+<'B+&G/&1!!C8;,?01G0&0B#="&';(EEH=0F*13*1+53>(,+;'==,BF0$"E+@1=CH4G4%&0('*3,H8DE4:4(1/0,1F2.+5BED3C>=C>3C(&E68B:*8=G=A!H<36:F;B:#&#>47%G;$C-'0'<.*D6#725+1-/5F?2<43/+.CG5).,@EE4H?H)'=*+-43D#(1%B#9C9%@3:#2=18DB(&:5"B8E!'%?<0*/>/E>%F*2 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:10G2C16G10A17G276T67C22A11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8672 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42301 42 97M = 42398 536 AAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGNGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGC +0$92.(E%!H:/#)FE8<,:@C04:1.,/.(8H5D@$G:;461,+6&8%>99A@3.@$&D@#3H$A.'2.01+D,&DG4B;$B%8@*:(&9D8H$<$5&.F&;8!(-1#,5F@1G%B@149-()-*)/3$C?6*44;5G6>>='$>#61-5D@@=H%,3%+&D@'H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C97G38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8674 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16493 42 58M = 16336 -215 CCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTAT 9""C"&#(E8,-C3-/H*&(3:>0/1""@!':D.)<'H(*2A?&=H/H%!5/E:-3,(:9C0,9?:&@!*=/?B=B(#-!>:*>82,.+G:=$H@!B29@H!?+7(- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51T75A11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8675 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6912 42 25M2I68M = 7005 232 AACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGAN E9,>-DH<'--DG--'),%G)D%$=;9B&1'"'0)'"@-.9&>F0,!2$*$1'BA!F2C;B&H(!C5>-,'6D5CG:20(%?@"/..+/<6 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:92T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24452 42 103M = 24336 -219 TAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATNTTCCGAGTTTGCTAGGCACNNNNAC !%(+'))'()'$((%&(%'%#*'+%$#(+$'!#)!!&&+($*((*#)+!++&**#&*$)%+#""%"')**(#(#"$$+!$*("'+#!(*$*$!(*"+$"!!'$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:77C19T0G0A0T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24336 42 79M = 24452 219 GTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAA A,'$)C?!$+G.#&9=0(!@4/?(49'3.2(&A/B4@=61;9+')C.+#117,2*H1.+G.HECD$;::-.:>:44"+9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8677 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45845 42 39M2I48M = 45653 -279 ACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGNCAGCCTGATTGCAAAATTCA H9F*C9-7'7A:%1-@DA0C078AA3)G!";H'01E7<+03B,68=3)+E:#4'=567+/9)?&*@)$;&6'#.G:4<"++"*++*?30 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:66A20 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8677 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45653 42 171M = 45845 279 TGCNNNNCNCAAAACTCAAATNNNCAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGANGCCTACCGCNAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGNGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTG "*('!!!$&$)!"(**#$*'%"&"+'("&!$*)%*')"#'!'(%*)%#(#)'!*##)#+)!$"#&!%#%()&++")&"'#("+!)'+$$!'()#&+!&#%%)$$(*$)(*&%"!$$"%$"&'&'&'"+%''+++))&"')%%"+)&"('*+*$!+!%($*($&##!")"+" AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0C2T0A0A0A1C12C0A0A40T9A66A29 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5810 42 69M = 5542 -337 GCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGC BB,$!C0H3.H:HF$.!:+&+.;9B??4>5*EBC$/"$B?D?%"'H?4.45,5$&:$9H!)CB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5542 42 80M = 5810 337 ACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTG =.!-A9:!3)))**7;-(#C*2DG,7B"@8$(=E!D/<52..':$;*=%6"?#>9F1:+/G7$G50;H<,!." AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8679 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37565 42 161M = 37471 -255 CACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTA +5<.=$;>3*A!57)%5-C6HHC(H6$DE4>27D?"$9"3G78&6$.0+H(3">>3931F9=29G(+@0/#.(%>'3>>1:+;+#)&:="0?:81'2A@B$"1>?;.(3$59E,#8D%5,)6:)/4;F9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:161 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8679 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37471 42 13M1D31M = 37565 255 GAGCCTGTTGNTGGGTCATGGAATTACCNTCAACCTCAAGCCAG 52>'C!9'/C>D')#)6+?D'%%*FB9>3=:$C;5*33F,;.*; AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:10G2^C15T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8680 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46833 42 147M = 47024 231 TAGGANATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGNGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGC $%!%(%$#&+()'$$%!$*((($%)'***'++()#!"'&()#&&!')(##+"%$%"!'#!++%*%%"'#&&)##&"%$)"#**)($*#*%++'!$'&%*(('&#&!+%'$+)!))#%'%(##+)"!%+(&"$++('$$&"'$%#$"& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T0T0C1T96G44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8680 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47024 42 40M = 46833 -231 GAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTN @!-8=37?:<"'%2<#3##-/%@-'9:=$F>HC.@-1:,+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8681 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39191 42 240M = 39071 -360 AGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAANTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCNGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGAGTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGCTGGGTGGGNTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGGGACGGANGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACA BB8D=D#>6-A#?#G?D;"&./&"8.!10D<=FB(B@E8D"-8.*%:-0:6!@G!,D52,-:6E;/C17+/FH1C7*>FH(6G14/5D96+E=H..B;-E=G#'D'$&.*!*'$+E"C%(?G;G"30;<9F8G@*C("8;B"68%E;C06-5@F,@)"3B25 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:58G26C28C41C27T6C48 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8681 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39071 42 104M3I16M = 39191 360 ATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCCATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACC $"B#3#7DE49#-G7E11(H"-(+1>$5)=1=4;(4=,(-F9&=H;%(0B0$/93A*EB;0D?H=28A;'8&E;!:%$&E:&23D/A-/-&=E#15*#(:-G,DB)@25:3/H#@D?10'$<9 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:29T90 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8682 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41958 42 4M4I368M = 41864 -466 ATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTNCCGACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCGCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAANCCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTA H9>G8E-3)H"9?.GH)/$<18*DC1E9&)--F=45'=@'EG8%A3:4@/'52?E%0!<.9=5/:'(41!,>9G5D1;372FC:"5->2.;5,$-)C&7:0F&2&=92,E65-3#;0A*:;F10-!?;12)FH-+<7?/0G9=+B&GE('!=A(AAB>3@2-+#A!F&-$C0D92%E&$G*A"9?D:/;+"#!81!%8@C7)G/3!D%=3*<<:#6+&@>9&3'?!9#D#(:>!B8=72:-?.E5-=%<:#C<=@5C=< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8683 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30875 42 96M = 30679 -292 AGAATTAGCCTGACGGGCANTGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATN A21<0"">-$"HE6674)"7-*D-7?7E33E6#ED1"-D#::0D'FEA4%0&=2>'!D.BE45+0AC4?)-=9?EE896"F:-)+3)0#7BG&H.$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A75G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8683 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30679 42 113M = 30875 292 CCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTANCG 2'4,?%,D:+)GE,8*1:,F.B,5*"'=2A@6A(::?*A'/&08F?472%F2,:?!!!$9#H7&;F?8;536>98-; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8684 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37671 42 131M = 37852 250 TTCATAAATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATNAAGCACCAACGC 2H.,='G:')EH7!;7.=!!,+GA)H$@"B/,<">AB0:*E#F"F'3D9+F*&C:<$'%"B"?(249"+A=$1.,5@(*.):;427D*@95%@1)G0"6A%")"-:*$$?9?9A1*C1.+)!<2B,D&#$E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C111A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8684 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37852 42 69M = 37671 -250 AGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCGACGTGCGTCCTCAAGCTGCTCTTGTGTTAAT 9&H;A@#CH-H81+;/420)24("1E:9:-F<*C3+)>0*G0>7HD5A02$0!)<96A;/H>-?#10"2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8685 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21282 42 74M = 21432 225 CTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCG <@@CBF-".&"/*>ECE1!?;C!4E@/<=#9HFD@C;,/%858D6G>6--51$<3%%*F'GGG#A2CB*/F78. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8685 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21432 42 75M = 21282 -225 AGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGNCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACNNCATCGN %$')!#"(+!'!*#!")%+"&$*'!&#($"!"++%!*(&!#$"&*$+%!(%$"##(%"&&$%(*'+"+')$&&"! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:30C36A0T1G3T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8686 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8694 42 43M = 8490 -247 ACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCT H>E/H;2559D9D6/?.8).!;:=@=&5+/B$21'A=82<:,; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8686 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8490 42 174M = 8694 247 GAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGNTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCAATGAAACATACTGAACTCGGTGCAGCCGTACTGGATGTACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCNG &%+'&('%)+'%*)%++$'!)%)&!#$"!#&&%*%"'%$&'!(('&(*##(*)&"%)$#))#+%+$#**'+$(+('"%"!((!#+!*%"*+%!+##!(!+%""$#!+!&*'+*&%$$$**)"(!$%%(!)'+"*!%'#!+"""+)#+)$(!%('(#(**!"$!#%&!&($!(!& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23C37G18C18C72G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8687 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28443 42 156M = 28628 273 NGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGNAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTC %3:'F9%/?238:;'1:(G/6H8F=$D4GB@C(,C#+5)>@B+'"@%!;9D"7&326#C;A6&<:(#F-D?&;FH>6-0H/&%2.'<= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A106C48 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8687 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28628 42 88M = 28443 -273 TTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATGCTCGCTGTCAGNGGCGTGTGTTNGTGNCATGAA (!")$%%+(!&"#'"$&+"'('+(!"%###*#+'#"'""!)""**#%)(+!%""*#(%%#$")&*(')"+"%&&$+'%')#!*#&()# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54T11A3T6T3T1C4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8688 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7345 42 366M = 7711 495 GGNTNNNNNNACCNNTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACACGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACCGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGNTGCATACTGATGCACTCCACGCCATGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGNGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTNTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAG (#$)*"&&&%&)!$+'+)&())*(""$($)*$(+!&!&$%))"*+"+$!"'*(*+!'$*!!'%!##*#*+&)"((#$%)%'"#*"%'!*'$'&"!&&$*'##)&&'$))$!"!*+)!!##+(!!)'!'%$!)*(+&#%$+%))*''!("&***&&$+%%!"$(*'#&+%))$%***&!+)'()('!'*!#%$&%*+"&#+')'+*%&'"$"')#)(%#"**"$'%**)#'#+&!&"'+&")%&!#"$#!"*'"()#$$*+)*%&!)"&!"+&&"&#!('*%%"#&'"'("+)"$!!*(*#&!#+)+#'*+(&##(&%#()!$'!*)!!)+%%&'#))"))%%&*'#$$')(!"(*)"(#+#)$*+) AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:0C1G1C0A0G0G0A0C3C0C30T55T25C16T7C105G28G78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8688 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7711 42 129M = 7345 -495 CAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCNGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCNN !(+&(&)&&*(%"+$!#*'!#%#&'+%(+$!"*!#%+*+%&##+)#+#&)%(*&'$*$%%#+*+$&(%+)(%'+#"%"&+$$$##$%*&+")#)$*&+'(+**#&&&#*)&"&'&#*&()+'+++)#$% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:103G23G0G0 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r8689 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8047 42 40M = 8196 252 CCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGAT !/&?&6+@2*6?GF5A0$06(81?F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8690 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6641 42 146M = 6898 305 GTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCNATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTNCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGC +!GD!7<875H-(;4F.<%/<*(00=AD9"H5G3;A?-"-:!0@337&+41"==&&'+9D4=0**G53:4:GE#A3;0H5**.9,(F&$5=02.=G).4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:94G22C28 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8690 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6898 42 39M2I9M = 6641 -305 GACAGTACGTGGAAAACGGCGTCANAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACA F7C6E-9;44BHA:1":3=)G$$.5,@HA+.*C;="$/H%1>@"-1D@&0E%'H:/A(3"62)-4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8691 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36447 42 93M = 36619 283 TCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTT 49?A-B./E'7:.5;8<'2:%*H:7A=4:#(A=!1&#+&7&7)B0H.<$@:&:D#@+7+D?:+,>?A)0'+72-8-H?GH%1!>6E"97@.2F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8692 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37912 42 40M = 37648 -304 TNTGTTAATGGTTTCTTTTTTGNGCTCATACGTTAAATCT 750/'?((.EB@*2#@A3)E,DFA-9'$2:7?->3E)-0+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G20T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8692 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37648 42 67M = 37912 304 AGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACANCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATT ()+4?D1EC4F&6-'D:C,"$?%!FGA&=&;11C+52D$G13H*<9)>D(-H76G5#;2@C%+%1/= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T35 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39651 42 51M = 39705 238 CCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGNAGATCATC );,;HA4;.;95**@!C;),8G")!%2"8.BC@*E7+5-E%G+(#?AHAD> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C8 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39705 42 184M = 39651 -238 GGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGTATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCCGTCNGCAGAATCGACCATTTCTGCNNNNAN (')(#$($)+$*(#"%+*(&*"*!$'&"+"+(&***+&)%#)(+#((*)&)($+'%)**$#$"$))&(*+$!(#%%+#+%$"*&)%*)%"($%!%(((*!#'"&$!'+#+)#+!%)"#%%&'&#)+'!!"%!%*%"'+"(!#("%"&(+*")#&&'%)($%(*!%#+*%&()'$&'%"$"$!)! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:110G46G20C0A0T0C1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8694 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47509 42 141M = 47426 -224 TTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACANAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATG !B$:G?:B$%*(E,96#F:/9?=4+/.H$/!;)6;D=3B!D,"C'=2!*G*8+H.#*?D$9>.'<4BG(H=+A/=FH:'4&45D-C20>:(6E=(4D)4<'-*; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:90A50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8694 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47426 42 83M = 47509 224 TTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGANGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCG G5+)6)$C23:0>A@F5G!&55F0#&$;6#H)#B8!430<943&8<!GF+(D7');4+*)A%8*?/-3H%=45A$,'2&A#3D:6=A-G#!+D(C:FG:"?7F+6F&9?0CAB@C5)E/ECEC@:D70G-$.&!0$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67T43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8696 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29244 42 75M = 29387 254 GAATGGNTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGNAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGC 0,@(+%HA19.F=C%8)$C<+>&".!@,,8"=D79#.D(38'@>(2#0C4.&+)-+2?CG99-3*E%7,E13!7$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C27A40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8697 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37780 42 102M = 37993 290 CCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCTGCGNCAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCT ?F/*0-%08.=0('7:$<,E,0H.'-%%?7!*;0'4))2@@H%,7HC=@(!C..99C:>(::D*)!6=@/(='#:@C4&##8C9,($$A2C)8()+=26C-1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A50 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8697 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37993 42 15M2I62M = 37780 -290 TATTTTACCTCTTGCGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTN D#G014F<:D*0#A:74%76!"F?DH489$G-,#ACGA%137::@3F#;"5$(/G%$#>#+00$+#5A#7#3%G>.C6% AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:12G63A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8698 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6784 42 91M = 6631 -244 AGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCANAGCNGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGTGA 1DG;%>'%@=@)%%,HB@3H/-)-FD/+3*@<89-A$)B;$4-FG6@=?&2#$:$/@H0F*@B'>@>#4'(@7G!B+D&AC<+E@$$& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:40A19A3G23C2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8698 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6631 42 49M = 6784 244 GGGGCANNGAGTGGACCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGA #$%*"'"$*+&%'+&$*+#'+%)!$'!$$"#)($+$'&#(*!#+)&(!& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C4C0G7G33 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8699 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37269 42 97M = 37122 -244 CCCCACAACGGAACAACTCTCATTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAAAAACACCTGACCGCTATCCCTGATCAGTTTCTTG E<+#0EDB84#-DC?'''B;#9,13)$-=<'553.!)0=!);#(+H.019FCE(;62G+.9".=1=H8;1,E?/H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8699 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37122 42 137M = 37269 244 TCCTTTTACTATGTTATGTTCTGAGGGGAGTGAAAATTCCCCTAATTCGATGAAGATTCTTGCTCAATTGTTATCAGCTATGCNCCCACCAGAACACCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAG %E1*@6/:G>"5&-C!:2D!)0$##99"+?>-8*@;%4,+(*#<48,1-'&#?5D409?4A);7"=!)/-.24,6"&29H;!?C/=7:<12!.6G1;080G.H5.;+"*44H0(:5F,*BF&C5%@;.(2./E/H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8700 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4865 42 143M = 4820 -188 GTGCGTGACNTAAAACCGGTTTGGGCGCTTGCCAACGACATGNACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAA 3HAD:'!4A9A&1(6*#6)B"H/2>$&6C%80H;45';!$"31+&$BCB1$BG.@>8:$(D**.D50.+@0'3,B&H==F;).HA6#")&2;=E$246.':&?6#E(>(@):1$54E0"B3/9E($#',8H8@2?"?G6G8&4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:9A10A21A69G30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8701 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6545 42 45M = 6716 234 GGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGT G/"#H?.:6+FE!(E9:1C8',(A*@/1AB<"6D'+2+4G8%')G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8701 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6716 42 63M = 6545 -234 GGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTNCTTCAAAGCCGTCAA +2@7?8@;;(:!6@:0!%H0GD54*)/A!9.<:*%*87,,D@$9.&A=0&@)&=@7DH(1#FCE:%C%!A'C0&-)6%E0-@)9=B%5CDF<1;G-;!82E8(E<%4@$41/=D4&:165E"7D07-6(.D(H;=(#.!C7%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43G83T0 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r8702 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15875 42 189M = 16116 369 AAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCGGAAGTCCGCCTGNTGGTTCAGATACAACGTAACGGTGGCTGGGTGACGGAAAAAGACATCACCATTAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCANGATNACGCCGG +"&(%!&!&'$'&$*%)%))"$*$#*!%)#!##)"*'!&')%)#!(!()*&)'&)&#)))%$#(%"*#!&)"""+"&#+$)"*#$*$%&'"!*%+!*+'%%*()$%&*('$%'*$'*'$"#&&#$&&!$!%#'!%&#((%(%"*%%"%&"$+%&$##'"+*#($**!%'+*&&)'(*#&!&$%!*&"&' AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0C0C3T0C0A0A3G0T1A1A0G0G0A20C135G3G7 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8703 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34103 42 92M = 33985 -210 TTCTGTTTACCAAGTTCTCTGGCAATCATTGCCGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATNTCCCATCTTCCATTACAGGAAACATTTG ;#9(769H04$3-C62+%@/>#1H=)%>,A=371E,?4*2='3GD6?=!!+C'D/6.?*/,#1AG>>?.53BE?8(-36670:(?G>%=B7% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63T27C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8703 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33985 42 118M = 34103 210 CCTGTTTNGTTACNAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGNTG ((+%!(##+&"'%+%!$+*!+%#&&*'$$*!&++)!+$$')$)'+"($"+)$(*%!*%!((*&')!!'+#$+$&$'#%(#$(()"'*+)$+$#*"$(+(%&'#"+($#%!*!#")"#+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A5G101T2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8704 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25028 42 178M = 24941 -265 AAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCANCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTNTTTATCTCGGAGATTATNTTCATAAAGCTTTTCTAATTTANCCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTA ;&6@F<1184/CC("B!9<'#'4;>H1$1)0;#()7!4:();*3(#5B"BA64"/-)+!/3:C)>/>.G8HDE>'5+9,6#91(-G.,5,*B?E%7+)):0(D'B6?F+$D=B%6(::0?&:$:710?G,7A4G7<13723,(!:#<90)&4B8B*@=!7A1)(1** AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:79T24T17T22A32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8704 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24941 42 48M = 25028 265 TAGACCTTTCTCTCCCATATTTCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATT %!+$")''")##%&!))*"*#$+)%+)(%*!*!""!*$$))#%'*)'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T19G26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8705 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2697 42 103M = 2884 228 GGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCAT 8"63?GG%G58G*9'!1#33#C?6:#H1-<700@(H8C8$02:D@$E0@B625H..5H22+79H-,C=87D9;/D&),>%&.D8"?*-,;>/5&>?-?!<./-2.2.+:-(E#(04&F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8706 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26118 42 73M = 25947 -244 GATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGC $/&3':(H7HE;1C=$+C02,5A8>!:1:G9.+?0C1A6:3A40!(#G&&&06@&"*9C;A-C-(G#9D@2?- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8706 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25947 42 171M = 26118 244 GANNCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTNCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCNGAAATGAATTCTAAGCGGA $&$")(+)#!*!"%$!($"&(+!%(%*("&##!'$!&!&&""$*$'%!)&$$#(#&!+*!+""!+)%$)+$$$%!"%'(&"!*#+'*"*''(#*#$!&)%+$&#+&+$$("!'#'%#"$%"$%'#%)($'#)&'+!*%)*($++(##&%+&#$$(""+*$"!++&%%*!*' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A0T117T29T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16462 42 113M = 16310 -265 GAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGGT =:9,%3?H3#"".GE(40:(.*>=E33*!E@+%65C>FA95.:%5A:79!C(,5*6@=<3=-#*0H=E"55FE/>F;$1);6*D+%8E'27=&.)(#A)$2&4@H)@="-.@F7AB6?+*H%@:(H#7G/F:5AA+4.;82/+?&/DH4F0'G$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:64T10C0G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8708 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26638 40 49M3I11M = 26806 294 ATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGAC -G/>A;()/;C/"BB#@E@-1<;">E1-:2B>/>AE'D#%56%">:+(:($4A-28,@1//B5H#913>#A0>?&/%&B?@-(3E" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A101T7 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8709 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23988 42 90M = 24131 232 TAANTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGTTTCTTATNAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTNAT **0627EC@E$F<0C3(%.02C9GH5+,6*:@0>F;2.:--72.F:<#B8BE5&94@++!E9;1C#DA65$CE=!6A;2)%14173+6%)5':+.H:0$>*746F.($:9=4F8A*%?">H4(A/$CG.*%G#*$;09*'?E:<0,1@G'730-/4DG4?/+E-"%!#/8!4'#5@F;1*06+)$:.*$"!28!?;F&'=+6G&:6;G#B998@D<51"%+8?6$)/7?&5)2?:&#?F@*3-"?3C>6E15(080"%AF+$FAB0$;A:*D&%*$(B#H)2B,!&#F?.$CD*@DH@6:@A=2.99EE*-7!:&8+(62A$$2=(+8?3&FH(?4! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:101A113G226G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8711 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31006 42 52M = 31058 495 CATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCT DGE7$:1;+9&-B@B"<+H.?37@.D54($8!%(F:'*$!G:9C4*%DC8)E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8712 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44725 42 60M = 44477 -308 CCGAAACAGTTCGCAGGTAATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGNGATTTTTTATATN #G'6/B#:6?@D@!#.D#)2=0@C2)9#+(89)1'A?6=B(7,#=(A2)+%3=<-;F:=" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G12C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44477 42 248M = 44725 308 GCAGNCAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATC 4&B5!C3#G8<$?A:25.=,%9@7A6:1!%G#-.434?'A8!>0)4(/(;%6C92(0D2:C40DA'9/@!6F*95>-GH'+39&=:@3!H971,EC##:&"<+34=)E9G3)%;/7F/@HA*3/G6,D#3(<(;E=%AEC)?">;.G.8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A243 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8713 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31815 42 62M = 31888 270 CCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTNAGCAAGCAGGGTGTNGAAGTAGGACATTTTCATGTCA DGD?7$6/8;!)=?7>8#3""F#6@$7C%*.&.H(?*)A/*'>HH:0AD>(F8)%7&@F28( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C14G22 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8713 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31888 42 192M1I5M = 31815 -270 TCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAAGTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGTCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACATCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCNGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGC .D-#7670H'.#=):,C$&<$1D<&7"A*@91"C+G;4,A0<9G9.D!2>(D@4&(CF98"(,+<'566$8#'D$9/F/F-)+57-)HHA=,>/9,4#!<<$6#1C5!%!0@3(7('G-$@F$F84+34HF2B9@$)3,26"B* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:32C24C36G66G35 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8714 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38879 24 8M2I12M3I119M = 39077 285 AAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAAGCAGCAAGGCGGCATGTTTGGACCAAATAAAAA B#&2=HFF';+=&1@8,,"<+>0)&7B-96(0%",':*9;<,H+>+<965$H'!'$69(*F@E2DB'982=D;B;+C%F,26-D.8+'GF2(#,/F>3E2A>F,3>)+E30G9.>-$18@H2C0+9)=!DBB/,E-!-D1E AS:i:-51 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:2 XG:i:5 NM:i:13 MD:Z:2C2A1G1A2G2T2C0C119 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8714 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39077 24 87M = 38879 -285 CATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGAGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGT G;A36,67@08>.25014:>3<;216$G0A4.?%7&:8D=;$G) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G47 YS:i:-51 YT:Z:CP jpayne@0: r8715 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29929 42 49M = 29714 -264 CCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTT F+"B02,:4;#,&'?8E!'C"4(6:#-6A5&69BB>@(9@BAG49;C7( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8715 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29714 42 14M3D132M = 29929 264 AAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCACTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATG AE>E&.?33C7.E#D&#=%16&'9C=HF$6%.C>ABA!2<$@C;GB*+D*"%GF5/C5F-%==,H670G!C>#)?A#86G5$18B>7=*2#"AD.3?!F$7GH5#7E-'HC$02!5-A6,!F(=D.6386,1(8."+?EA8:$96% AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:14^ATA83T48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8716 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41639 42 78M = 41493 -224 TGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTT ;"0+;=%%5@?00/%;A%.?4$,#0A4)/-,7?&AG+(4B)8/<0=!<"<)A+-!48E02'1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8716 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41493 42 60M = 41639 224 GCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTG (=;$E$B@D7G)"2$94/?6).+@!),C+4)751;$C=:!?=>E>!+("G#DBH"4)!"' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8717 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27520 42 332M = 27461 -391 TGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGANTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCNAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTNGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCANTTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCA #$&"#)*%$"&!%(***+&)&!'#+*$***+##&)!!!!#&"(!%+$#%!%+!#'#*$'!#%'*("!("()(***&(*!"&'!(!+))*$'!(+$*'&*"*%'&'&&(+&#(%')$&+&&$!*)(('&*++'"#%'"+%'$!+)*)%+!##&''+'!&)!+"##!!%!$"$$(+((!"%$"$+"+*%**!!*##*('+(%%"(%')&)*%$%'"'*($%($$"&++*$$***%'("+)&"+&&#%+(&(#&&&&+"*'((("%%#*+!"!)'%(&&)"'+(%#*%)"$#&!(*$*&!((*&("(!$'#)&'!'$%)*&)%*""%&+"##(+( AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:97T61T95T14A34A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8717 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27461 42 59M = 27520 391 CGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAG 6279'*=,D"3*CF&)?G.?FCH5$G#E>-%0-F$?-?5FB2B#H(4#:B+869)1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8718 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39256 42 84M = 39016 -324 ACAGNAGAAGACCTGACCGCCGCNGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGAATTTTGNT $=6#F#*FDF/@#-'287!<.:G1@/$H5)A%"E58FCF2>C6@:!?$;-!E@;98)GF3/.03=+A?%9(1F+% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C18A58C1 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r8718 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39016 42 159M3I81M = 39256 324 AACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATNCCCTAAATCGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTNTCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGNAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAANCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGG 1<9?A6CA2A:0*1-A8)6B:/?4353<#B;B19A.-?&31"1?>>"D,5F;4#9*9<>?9A@=%@:/8-),2?;?%2%)>+:';4,%H9;D2+*"3*>>#"%*>'!.,*?2!!8+E:/E@!4((B5D<35?H3CH:"HHH96G2+1'#66,$%1+63'54<$'5$-9.-5;G2AE1,6>#68<,1'G40/&4!(;8D5)(515?%@E+3,;(9>E&61'(&!/E@B:"/''H7:'>..C*@BFC1B<-/58@HB>G++;B-;;H21F@CB68>B%,8B@@A?6HE@'HG?95-EG=C:G3$* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:125T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8720 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46109 40 42M = 46205 244 CGCGCCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGC "68@5,0'0">AA?#F?<>&65!B*+'@C94@@G*$8-H$EE AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G37 YS:i:-27 YT:Z:CP jpayne@0: r8720 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46205 40 148M = 46109 -244 TGCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCGGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGTCACCACCACCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGCNAGACTCNGNGAAACGGGTTTATGNCTCN &$&%(+)#%($!')')!+)++'#"%'$&**)&*'"")()$'*"&!#)%("(*$''&$&$%'%&+($)$&*'*+($#'"'&"%"'$**'+!)#(*"&$(+)%%$!&##$+'!*"+(*%+$!&#$%%&'"!!&')*'("#('*&##%""! AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:24T7G41C7G35G0C4A1C1C0T0G6A4T0T1A1C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8721 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35624 42 117M = 35801 233 CAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGT *&//42">8H/"7'%4":%=D?=A/1*(;%!&EB><2F4+B7=%10?3%E$%1)B/$(%5>&=G>(-%/$4.9<7=,02,6$=D2DC8((+9"7;H$)/;555!86G;&09AB@==?&5@5>3?+'3">))458F/6>='>;9&9!5GH3<:7$&5GEG;@5%@,9D89A$>$!>)7%8!/A".E03D>G1(E<9D;22 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C25C6G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8726 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34262 42 113M = 34472 284 TGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGT 9B4HA%+@#4#7D+9E3(/99$'C=F@!)BED>&1>D596>+,@>G)E=8EB"G58A7"%$?<%6'5"#:$,*.1!?A5.H442'6A-HAF8B(@51>(5<' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108A4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8727 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45218 42 147M = 45124 -241 CGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGNCTGGTTCATTCGTGA 19'/2H?4:,8=H%@5&50--9?+2E1#%=??CF$!F4-??1:(3)@&HG"9@&&GG3"9+/;#+/2#>:7:8?G('3?"B&.E@":D!F?=+H,1<2H/;,F60D+!"! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8728 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37950 42 58M2I18M = 38075 171 CTATCACCGCAAGGGATAAATATCTAACACCGTGCGTGTTGACTATTTTACCTCTGGCGGGGTGATAATGGTTGCATG @,<8H,'5">#F=6@E+?5&#/0"E1$C'98!7!8?E74H)5D'@"/'/%'7*B03CG:<$$6/F!@55=5/6$2"-:CF?+=A89,<37$7A6"D>$+D%DB5..9#B8C(G:96=1BDC!E0)BD.%/04.3",' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58G0A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8730 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4442 42 61M = 4565 183 CCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGG @BH7G;,-64)A5=7++++8H?*"<+;%&'<58#,4=>95'37;6>.F%!C%8<=B- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8731 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8782 42 40M = 8701 -121 GGANGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGG ,/*.,EA'4%83!+>, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T35C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8731 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8701 42 81M = 8782 121 CNAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCT *&HF$5*C*@<+G#:;5H;3:%8&>74A@%,&'%.0==;F5&410F'>D&!#%)###/:GF*/*CAA;G4BH,'DE5;;19 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8732 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27626 42 143M = 27492 -277 ACTGCATATGTTGNGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCA 5#$H'"*F=./16F4290+GC>85H,!&DB'%"&!1+&198*?+'7''E;,6=&+D944;/5,2=!CE-% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T129 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8732 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27492 42 60M = 27626 277 GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCA E$.@4?.;;H+%/@A-?'E9DH65%%6.:9"&)=3"/**8*%28<=+>/44G3:@$,3?4$7.C?(>A1#97,78=/$B@1HE<<7#H7G$-&$0B$DF?A:%#0B6%;?=15EC0E85"9;>:-/C>.%?091D/G=*3?)>*&C)&73B*2H47E#7-$<=:8=*1(0AE"16%C?)!A+, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:47G10C9G98G59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8733 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19948 42 78M = 20041 320 CGGAGGTGATGCGTCGNCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAG &""%#&$'#(&(%'#)%"$)++*!%$#+$*&*#'&%##)&*##)"*'#*#')*'+)+')"%'')(#$$"'%()*""'' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C7T61 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8734 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6442 42 144M = 6442 0 NCNCGCATTNCCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTG %*"'"")*(""(+*$'&!(*"%$''&('"#*$%+$*')!"%)*&(!%$"%'&%+(&##*+%!%%%"'%%%(+#$#"!!)&$)"')&+!)($&+%+!#(%+'&"*)$%(*+)*&%$')#'%'(((*"#$"))$#(+"*"%()"&! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A1C2G0C2A134 YT:Z:UP jpayne@0: r8734 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6442 0 * = 6442 0 AGNANTTTNNANNGTANCCNTNTNCAGTAANNNNANNNCNNNTNCTGNTNCCAGNANNNTNNNNNNCGTNCGCCNGNNC $#$!!$#"!!$#"$$$!!$$"""!!!!#"$$#"#$$#"$!#$$!!#$!!##$#!"###"!!#!"!##$#$!$##"$!#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8735 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28443 42 126M = 28569 335 AGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCNCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTNTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCT (*+$%$)'('*)+###%#&(!++#)+''++'!*%'#!'+('%!"'!&*)+&&*"+!"*!'()$$'###&)%"'(!+)#(*)$$!*"%%**$$"%""**)!*)&+)%'$$%*'$&#!'#+&*#*&$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C50C37 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8735 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28569 42 209M = 28443 -335 TTAATTTTGCTNATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGNCAGGATTTTTTCGTAGCGATNAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCNGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGCTGCCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTANTNC $!'#))"''#**""*(&)*!&'&+'%!+)#$#(%+((#*#+")*()*('*#%(""'#!!&*)"'&)*#*)!($+*&&)*$!$)$)$"%#(('$+*!&&&%'*&!)'++*$+&"%&""&&&!%&'!)"$'+'(&##&$%$")$)&($#''))$#"!$*(*)#()!!(*%!+%"*$""$!+'!%&"+%('($+&)(!+(')'#&"(+!"%& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:11C40C20C45T39T2G42A1C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8736 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31283 42 122M = 31129 -276 GNCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGNCATCGCCATTGCTCCCCANANACGAAACTNAGTTCAACCACTGCTTNGTNCATTTT ""+(*#!#%&#$))&$)(+)%)'##*$%)*'!++##)#*!+&*+&+')"')!'+((#'(')(&#$('(#(*(%+#&+!%"*!+(#$*%%#()'%!"###*#!!())#'*($&!&&'$$**'& AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:1C63T18A1T2A4C0A1T4G3G3C1C2C6 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8736 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31129 42 154M = 31283 276 CCAATTTGAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGTCAGCCGCTGTGGTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATACCCA .$)G+ADG;=65A"$"7<:;8@..!-FG"@!<%82915;>C+F<"89!B!DG#D6086&(;?.'4&=;H7,C9*E/#&&H*9''.?82(C2.-/47A3A='$C+A?3A9F0@.;'E7:2>G+:*;7*.E<0@>/@+4;:59'5(H9A+-7;<::1@!B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:78G27T87A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8737 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41073 42 47M = 40862 -258 AGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTNCGGTGGCAGGACGTCA .15+4@*:2:D$CGFA#=>&%+5D/+086;7&$:'E9H:1?E@7/'& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30C16 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8738 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 663 42 158M2I112M = 933 340 CCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATANCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTGTTCAGGCCGGAACCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTG (49F),C0"G=.!!E(*-0A7!$1#GD6$97E;6+#':*@"0<$(GG19/@>6-:3+%-B<(%)*C@)63BB3&B&8*A>->8D8=DB!F3$DH.>38=8)C$!<$&H+@!2*H@3#9G*.).9182;+31G2E%HD9+@,&.38,:=DC)E?7=.%CEF$)3A.=4.-F@EB&.:E2$@#*E-F>1A;,"$>&=E<&.;H7?'4"1#&>23.H.?&!@+=<$-0A!0&"'828F>GG34<,0:A/$:H*)('H//29. AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:35C54G34G144 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8738 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 933 42 70M = 663 -340 GTCAAGTCTGCCCGTGTNGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGCTTAGGCCTACTTTATAGAGCATAAGC '%+*)%%$(%'*&$")+$%#!*%)$$+!!#)%&%'"%!!&#"%$**%+"#%**&%%+$*(*$!"*!+)+' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2G14C25T3T22 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8739 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7679 42 179M = 7632 -226 TGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGATCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACC @C,1$'0C(DA#!.86#-17$/@)(72"#>;H3"5/B>D-3+(690-):?H5@=(D0A7A&6/&@#?-:D(B91/DDB(#B=%G%<4)84-H<=H7D*;954"'D&)'*5)GA=-$ED-=#?A<'4;2!33. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31G147 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8739 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7632 42 47M = 7679 226 GATCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACA *!73<5HF7"3B:6!.F%A!)?9%.#-=#9!:.0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T45 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45649 42 168M = 45553 -264 GTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTNCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATT #,$A>+B;7D7E$-%9/29?"C!8:#';82$A$0;958@DA"0@@#,'9;@77(@F7<'/.:)C0-%?>+'*!>@09?*"5,A@77(&%$8@5%6?(.<;G/?8,3;(!#!)"E!A6"5*6,B9='AG$21!624#7:,5.(G8/2;E&8D+>2(9#:<3;96H@B;C925B+BF@2>DB0*;'GB%)/"HA<"0HG.DD60A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74C21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8741 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36515 42 74M = 36593 259 CTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAGAGCTCCCCTTCAATATCTG F=$H2DH*&*&=%566(<$,"!?$>F-(&>)+%"EG:$)3B0BH*$D1-0<>-291H2!C=?/=D?D,"F2;)5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8741 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36593 42 181M = 36515 -259 CCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGA 32?@:';/>.<)&@B#8'DB(;+,D#G!5CG&,;0%9@6&@9/":B60?4A'E5A--3(#F3H@7,F))1>)9B'A2=A%>51"!#:-E)/A/A-*)%E=9>%!7-D&><)3.:G.@B"*<<#D7<6/<"43AH"'D"G)%0)42:F"7C:/@#:,6*5!B:4$?.3:*&?.AB% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:181 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8742 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19606 42 96M = 19606 0 TATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTAC *':%?50<0.*@:1H.>G-,>..$-)/)D0"=B5$"(4'@D;A1';<%*F/%(*@:0+G.>%GFG'F1%"&*@1.-//,$$.2*7=+! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YT:Z:UP jpayne@0: r8742 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19606 0 * = 19606 0 NNCTCNCNCANANTGNAACNCCCAGNTGCNACNNGATTCTC %#*$%$!!%(!!"#"&$*%"*%$%!!&!)"*&*$++!*$(' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8743 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34596 42 45M = 34831 275 CCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGTGAGAATCGGTATTCCT ::0/FHF(&=)3.H=G!31)2%/>:--FB*!30E=18@&7#84!/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8743 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34831 42 40M = 34596 -275 TTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTACATCAAAACAANT G/*<-2*8:#,6>A/G=2+0//;G4C<#;,1/*7B1%C!* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8744 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47906 42 165M = 47906 0 GATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTT F(15/%3H9#A;89-2?E)'/,4->EF>@&**9@'D#21$D+8GFFB$(494>H#1AF*.E?3&*/A&H.>C+0B"(0=$67;B#;#-=GA+G$?36(7.'FCE.;E2'.5."8$""GB0*+7&HEEH>
G"%(,->19A.:0-4>,*&-410@>+$(#H-99;1/%?.@F!!608103-$?!6G;,:?D=D=*+/#AA$)*%@5)000=6)CG;":>HH564"GH62/%.&?9@0006#273#6+A:2F):3.44$2:050>.%D"=B!;A2:H7C8#+E#@$9>A"79.H)C&57 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48G77 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8746 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1789 42 98M = 1979 245 CGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGTGCCCGTTCCTGACCGT A,8??+4*+=5$!B88E&"6">>8##2=F8"':2AD0DH!,,,)/<41#8.'<;DG'46)F6G=;)/('6'&>',;%&;9F$-<<+*B5+3G;.+9H. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15G65C16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8746 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1979 42 55M = 1789 -245 TGACCGGCAGATNATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTA >D3+?B$"#+$2:@GEA7$926B.3DHB&)4G*7#71%A9)1A6#@+&B&C*1)" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T41G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8747 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19535 42 250M = 19005 -780 GGCTACTNGCGTACTGACGGANTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTNTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCNGGAGTCCTGAAAGACGGCACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTNAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTTNTCANCNACGCNGTGAGTNCANANANTCCNNNTNNA #++$(#&)!$**&*)#!$)+%(%+&%*(++*%(&)!'!((#('$)!)!!)$*(+#&+'!'##))$'%'*+$)#(+$**!#"(#'$($!%+$"%++('''#*!&+)+)!!+++(*)&+$)%#*$*$*&)+!$)"%$)%%&(+$!!!&+"%%)%(%$"$($")"$$&+*%$+&*&%*&%#(+'&+")##$'"#!%+!)*#*#++%$$*'%"(%&+%&%!##%'&)!'(&&'")(""&"**$*$%(!#''&%& AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:26 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:26 MD:Z:3G3G13T79T30A48C31G0G1G0G0T0G0A2A1G3G1C0T2G1G1A3G0G0A1G0A1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8747 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19005 42 530M = 19535 780 TTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCCATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGCGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTGATATTGCTTATGAAGGCTCCGGCAGT 3014GC0DA7GG@>A:44@A=#D,%><@%'(%!G?-@>4G*.&?>27'02F,-2G!;'25B:CA)7/CAGC>A*8F'*#'/A.=%,?.A=(;#(1E%G#GH?'&&GE*0A,<*(;A7C6-0'#4*37$D")06;C2E?C9D2,H*8':35!?3GC+)5>-*65/+8B=0@>:84F0*.!H!:6:&E>(0'32!'A$%8!1;1%*?+CD7CC4>"%41+E7/@%'#E"8+)@E90D,?+=3?G'@:-;=&F<".H1"!)@)=3?E*E1$<8$&3;8<'=65**&.%/,/@(0'/?%3&65?*!-*C*,#'*C;$./!D$D1B5AA'86$=-76A@GHB%8A,?#)9"#;D118)($+B%&%-H,B,E.<5@3E53+12G,;8">7-.?%/1;!::@:5!B/=&B AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:59T212A191G65 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r8748 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25234 42 75M = 25309 294 TAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGA #>4C!)18&*B8-?@&><&D4$BE(').H36-;BB>2?G2:F=2>368EH/*3CH=,705+@A@4%+<1/EG#@0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r8748 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25309 42 219M = 25234 -294 AATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTGCGAGCATTTATTAAGCATCTCGCTATAAGTTCTCGCTGTAAGAGGTAGNTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATNATTTTTTAGANTGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAA ;*0FB")%5?,/#5)2(00?$&,/47@F!"1E9E$(<#:?;=C=H=(CA=;0H!1/H;$$GFBC!#?;F!19-2+4H7CF'>0*-*#E*801;#.(A'01;HG$+@;$-HD@+!/7&$<9F;-+3HHF;+4?)60"C-G"*,.(/8@5;/?=080 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:33C18T19G9T84A10A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8749 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8783 42 106M = 8659 -230 GACGCGNGGATGGAGTCCCGGAGTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACN 88)BGBH?G$>3EG04=$(F<0%BG3CB0)&-5)>6*C+;,$/'#;)(B3-H(-91F3CE0,>!$5&?-'3#:HE337,%1)&$0?7*2E#(@C-&A1&)9/C;G' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T3T15T82G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8749 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8659 42 110M = 8783 230 TCCNGCAGTTGCCGTTTATCNCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGNCAGGCGGAGNTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGC %7?<9BF,(H-, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G16T45G9C33 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7887 42 43M = 7635 -295 NGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGAA E"5'5&:.BAA6*,4(E.64():F<.*F8;".D.A4+D7>3,( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G9G30G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8750 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7635 42 63M = 7887 295 CGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCAT />@270B!,BD6+@A',>2%+F;$$"AD63'/1)5C5A'&'%F@7:@B845%H$'-7;-7B&0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8751 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48016 42 252M = 47906 -362 AAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTAAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTCCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCG 1?%*&@?H5GEG'==4+EGA(?=21E>F6G>1/*-@GG"-F;H".7&.(;BAB2$%0:,1<,C'9H$6G4-H+B/H&+B42.2<16;,*#F#+!@12E27H5

/'D%@=F)A@3'&9@.4,7A%+5$F@";)!'363C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:175G44T31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8751 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47906 42 110M = 48016 362 GATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGCCAGAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGG :C="53,"3*#D#0/&?+G@;?2B"5$A""/<*0;"=3E;9.CF$F&4/@/'@0-8>AC210+@,+7*C'4>A4#&?>@#8"44G'%4*2")2=?@*."6+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78A31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11646 42 136M = 11557 -225 GCCGCCCGAAAGAAGGCTGAGCAGCAGACTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGGCTGCAGACGCCGCTGGAGA 9/#@1(<+3E2.(8"B6:057+;A@F;.6'=!B%'?0&F=B<:(#62D@B:'!-,1%B?'@>>'>E!D,(9;.6E+%):H?';6H-%B?/,EE0)2:9G*+<@=>'<9>6608!BA3<4?&-F>9=@H43>H8"/F+5#$-6(0%:?$;7)$337.,/H@(92;,(6!B?H$"0">;;1,'$D%5?D9GHG4$*4=!$=*/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8754 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18227 42 189M = 18416 272 CAGNCNGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGNCGGCTCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGANGGAAAGCTGGCCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCG &('!%'+$#+""#&!$#+!$$$)#)#$(%#((*'"*+('(''+#+"("$$('!"'!(!!%"%)(+%&!"%+*$"*+&((%$*%(*'$'""$*)$*(#%*"''*%#+'%(%)%"+('$)+""(+")#%$"&()!$++*'($+(+&(''#*("#&$!'""$&**'$!"!!#!'%#%+((')#))()$)""% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A0A1G71A4C50C9A45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8755 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30847 42 143M = 30721 -269 AAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTCCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAANCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAA 5+@>.%@5,1CC@46AE>F6-1@"#;6DB::,@;#,$,D3-9C&&:82.?''(18C&*.<65,/3H<)>C)/00&42+@'4.4+A.+624?C?'4%?:,!)C>.BG3$:30H9;)":-2;),C<@"<<@,)(!BEA6AA'<%: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69G40G32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8755 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30721 42 124M = 30847 269 CTTAAAGANGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAANGTCATCGTCGTTTTTATCC F+@H!,C&1.2-5<87-HB5$51>:F:%)C%!).A5%F9(++9=9.-H+606"2"50@-B1&CA57"+"3@2?D@F8B1>5(*A-%(>+& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C5A22T8G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8757 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26904 42 77M = 27095 231 GTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAA 6*@4=(HH:@E==&7C%+8=0C&=;?=G<11$$,9E$@FB+33H$4,"+9/G+H>6?;>4$3E8D)!A*G&5G4,>; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8758 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13240 42 103M = 13110 -233 GCTTTCTGTCCCCCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGCACGGGGGCTGGAAATCCTTTCTGTGGACGCCGCCTTATGAGTGGCGGCAG 6H."B=?E==*'88+/02@H7''$-790FB@,H'6;1)=E0.C0)&*$.G@,)1>C&@&+2.(=E1C:D*19'<57D,D.(2'"$?>F;1>(0B8/:E9H10- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8758 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13110 42 109M = 13240 233 TCCGCTGGAAAGTGAAANCCGGTATGGATGTGGCTTCGGTCCCTTCTGTAAGAAAGGTGCGCTTTGGTGATGGCTATTCTCAGCGAGCGCCTGCCGGGCTGAATGCCAA 9-C5$3>=#+--5G"(*B!1&%E40#487=2/+2-C)?G;:E7$6F5):?'5!<-"%H'+7'C!6, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8759 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46918 42 43M = 46718 -243 CGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGA ,F1&&A>*9E'*-;G3=?H6'B&FA;D:7.48B)/!C+%=A+4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8759 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46718 42 67M = 46918 243 AGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCA *HH/*;&#%+;2F"571=AH%>2A421+?'A#-$2D%;.3,,2!<$6/@H,>E;D%A;1$%*'>H84 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8760 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14785 42 279M = 14716 -348 CACACACTCCCTCTNGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTNCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAAGGGGGNCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACNGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGNCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGNC %%'>3'4A(A+)(9(H6,-:31E>36',81(;)+B9"A:48**A<;'-A2=G(:!8D&&*;:#.3%>@0:9H#9?*B24!/(G08B#.A$>>"2B/,4#7)H;"+!#-E!0;0HEC!6*2;-;(#.AA-6B&G-A&><'%*1#(B#B:4"3E+E#4B-323+6>9+F6,503=*.>A%&G44))+6<4D02/=GG$'076C@1C?F"*E4D.7%9&0G0%2C0%=,9-2)40/0@2(05-2!'?)2+' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:14G25G53C4G27A106C42C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8760 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14716 42 69M = 14785 348 CGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACG )-F6B+8>=4D4!@2.,G<;)@4HADH3.!&?&ED&##68;',@)<96(:"2F'//(F<1,FH>%5-4: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8761 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3275 42 147M = 3422 479 TTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCAACTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGNGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTA *0')3,AE9?=#F%+E5:2GH*.),,7!D!<109,F'%ECA*(&*A""G?-$'94.#H-%(.2C(9!.(2FF@9;E)2H%B?$:H'>&AG!4#C+4=7AB$+>;=%3F)CD(@(11E#@EH5)A6=@/%H.:2*1($;#?%FD.-#* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C48C9C60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8761 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3422 42 332M = 3275 -479 ATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACNTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATNCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGG #,G,7G@#/!C%2H,$2H#,:;?+::56>,''%H(;"6CE>*F//!/BFB5DB+08(&@3C,)'2B(A,9F4?%8"$:2D68#3"C,<+E(@B00?A8>F"AB-18=)1&%F'&,&.6:7B/8$#;.+AG#/(D64/!,!'@@D.>;%=+FFD"58)EC3))>)E)!&H=6?><1957866=BF#@9+>"G?+7.F+31.!?2"+@((E$+>,32%2E78",=*=4@1+8@@EH!HB&#@HE?FBF6BH).2*81/C#7"8,,&?*(64,HD38A6/D)&,"C54;<5"C9&56;!$H5##C$+8:#=(,:!?6%B$)D/+%$96927$%$7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:119G114T63T33 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8762 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15026 42 41M = 14667 -400 GCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAN 9%F*$(.(D0E23,0$F2A&,(FA&;&61BA'/G.,H'49$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8762 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14667 42 359M = 15026 400 GTTTTAGTTCATCAGTGNCGAATCACGCCGNAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACANATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTTGTGTGAAAACGGGGGCNGAAGCCATCCGGGCNCTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATN +H4"8*@!)9&?0@G@+402E1F5000)/17B@@),%7:9.''&C+6+68:24*DDCA9,+#@E!)?A,F4$7903<"E9G?H073B+:,D.*>>4*78+-,E*@C';G$EGGHAD2@%DG&D/64D:>B:C!H@$+,5?B&:'.67!45"$DHFH<@!!#:&7C11?)7F'1*C<:C56'-"E&6-(+GG;500H>+14;63(4-7'B"70A@6@$,A;@HH9,>>)F+*8$F=%<#A5H29"D=F@$4E>-;08?)7'F1-3*A116F:F0*GB,%/@&&(HD)>40G);,;B@F@C6=&850B01&(-0=C21B+@CED';,1&7!0=F*E#,E0'!1?%;#,G)H,7/%;(6D"9 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:5G11C12C74A96C16T14A123G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8763 77 * 0 0 * * 0 0 CNAGCCAGCGACCATGCCATTCAAACGAGAGACGTCACCTAA ,(FD=&@3<4G(.+6/"+<&2!1%%F%EB:#3;/+GH0>-F5-19;%3"8G@G%($@AAC"@/A'%39)@HD0C<7'A YT:Z:UP jpayne@0: r8764 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42687 42 51M = 42417 -321 CAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGNAAGAGACCGCGACTTACCATGTATC (8!F2&'!8084=C;/!H?A%;1"%#=!),!FD*"HH&#:!760.!@43=%3?$3BA?H5'D&@9A:@!E$@2"@7(-?'"$#$$%B)+)8?3213,-,"5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8765 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11410 42 210M = 11620 271 ACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACNGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAACAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATC '+*&%(')+'$("*#*$##)&#)*)(&("*!!&%*+)#%+)((%$&#'%##%'!&$"*'+(&(#'("'%%))))%'%&+!%)%++"&+&*)*+**)'!&'%($()#*'%#+'(+$%*!#('%###'"(#'!$(&'(')"#))%)!+$!+!)(!!%$('+%*!%*"+&'&'+!("&!#++"+&"$##""#++"(!$*"**%)+%)*(!)"& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T95G79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8765 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11620 42 61M = 11410 -271 GTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCCGAATGAAGGCTGANCAGCAGACTCAACA ;5;)G;--&;#=B0:5+'G7:31CE/<8?(/7>*A7+/&=D$),CF'=.-BD<0<69+5F> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A9G14 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8766 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5697 42 49M = 5746 284 CATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTT A$C3.+$1>%B,3=8)@#:<<0"3G,A(-D$,!!3H?"F$B-@%'H966 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8766 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5746 42 235M = 5697 -284 TATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCCGACGTTCTACAAGTCC ,.&',;>G=%93.9=E"DFD631+C,;H4:%81-ADC$?)=9!*?/"G/04"/8F:B%6.,F2/F'8203+&>E:.:'6(*5>!5*G)=>.2*#C.>B')"%1C&/0@97!1%A9,;:+%),8H4<$6&1>!F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54G163T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8767 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38744 42 99M = 48348 9684 GNAANNTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGC (!(%$!)+#&#"(")%$#"$"'(*#$+)$$+)"'&$*&%(#*$"#!%!(')$+#&$&#*%('(*%!%(!"%%*%"(!%+$!("*%**%!"#&'!"($"* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T2T0G93 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r8767 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48348 42 80M = 38744 -9684 TTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATANGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCC @B.(<4>H*52(5G@B3<2&37+HCF"*(GD*%9H#4*BCA/;23F,2'9B@$A60<29,=$7>@:#0*5>711HE="@4 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32C9 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8768 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19872 42 154M = 20067 237 ACCACCGAGTGNGNAGATTCACAACCGGGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCNTGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAG ("%(&&('')%#"!**%'(())&(+"###"#+"+(!&*!'#"*(&$(+'(+(+$&('$+"(''%&$%)#(%"!!)**!$*+*"++&)&+!&&$&#)*(+(+""(#''#&$$(+%'%!%#)#$''"&!#!($%)!$+!"+$&*+!(#)++'(%%# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T5T2A0T1A57C0C81 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8769 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15214 42 44M = 15370 247 CTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCC H*AG!/:/F>!H0;(/F.)%#F)CA=+A>0$0"6@<2#G;:"A* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15370 42 91M = 15214 -247 TCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATG B5==3F-C?;.G3+11D,??6A=#BH,-)C9?&*F/1$D7'8:??#F)@62ABE=3*8#8<00<<3D2BF?1H716>03&=@#$;$81>38 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8770 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19961 42 57M = 20186 278 TCGTCTTGAACTGATGGTGGNAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAG F?97@-?5:<,BB1G66,G3&F1D&3>:)<<=B*1417%DH;5/&9223"3=986(. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20A36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8770 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20186 42 53M = 19961 -278 GGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGG "<2G;@D*H"H<8:53"#D*+/&H$:!*#*@@++E@3'?*BH=A.&H:5@3,F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8771 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21240 42 40M = 21078 -202 CGGCAGGGGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCC 3-;@$790H'15(.&.F);:+GD'5!&5@5EA?CH34%2$6C8)?94A:/*,!1-4"B8.)A;;?:%$0G3E=(CE!;5,59=G@+<8E2=EGC8)6,%G(C%33*343+4E%569G;#:-"322,D<".7E%7*0#8>F:)2A#'C!E&!"-6D'6 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T0T0A20A32 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36334 40 57M = 36067 -324 TTGCGTAGCAATATGCCATCTCNTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAG G6H6B60F."4*4;DH.6('8:8.499B!'2<#3!8=??*D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22T34 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8774 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30208 42 95M = 30303 332 AGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGNGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAANCGATGGTGTTAC 58)!<+F7)#5DA!G4"<&G:22F"5<70%1$H30FD6@$:6#%?FC"*'A:2+>1$:*:7.*F-149("%9?C02:@8(?."%+,C/&G111FH;?-,B9$8'"3>'-;+DG7'C*+!9@#8"#?=/F=#210*>@>72.<@43==7%A8B:D;F=$("<7"!?7!E6>:3/;;D16(?E6%+,69,*C.=95'?&/3.C!H3A4F#@#,C27"-@A.- AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:39A39T54G4T95T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8775 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31268 42 79M = 31037 -310 GCCGGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGC C/;#6$.?H,-"))9>6H"!"*EG"&A&;8<*EF$==1(:4F1H;/3;5/B?/F1%'?@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8776 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25399 42 49M = 25261 -187 TTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTT /0438,)F0><+/6#3D3";4)G$AG3)6).<>$>F7-##!-:3%%BA1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8776 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25261 42 59M = 25399 187 TTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATCATTTCTA &5)F=62/'9*=?62?H%09DE@A@902$.=<.%HB*GG(C:@;+?33796)/05$0@2 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8777 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34940 42 40M = 35057 254 TATATTATTCCCTATTGAGGATANTTACTGGACTGAATTA ?(.&578)1EA@E@-G<32!H"3:6D?!94="95;)-++% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T16 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35057 42 137M = 34940 -254 TTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTNTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGG @79/=.?"-&FGF(9?3%2*4>7($52?-*:'1-99H@#!+9:7+0B7#E"8#6D41F#!H7@:)!D&4=87C!#$>(H0B%4)1)@G"!8$B&.92E57(*D0/*F6-D?4BG-628)!*BA0;-D0H@A4HB'>(=4=<6C97:1.=,9G1,;1CD>)&.;6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8779 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31183 42 133M = 31004 -312 GATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCCGGAAATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGAT 7&>7B?@"G43"9=)"6.-3G4%8@;-'FCB-A'=B)').&:%/2/*G:-">!G:4!#0:B&1F3>6H.;57E)*E716(2;A>>GE!FBC7B)8/<<48:/$E+4A#<#4/4<8;0(&@!0&),$703@82@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8779 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31004 42 119M = 31183 312 NTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAAC !%C-$B<72)!GC;"8(&49D?@G>/6;+@C>(-:*8;.E3-<-0:@>D$,'A=.%'F4#&D4#!/-5<5CHD>?-B,=&C8/"!D;G;GA@?&@2""H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G118 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8780 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25348 42 58M = 25517 245 ATTTCNTAAGNATTTCGCTATAAGTTCNCGCTGGAAGAGGTAGTTTNTTCANTGTACT $%&*#"#+%)*'*")*%'$"(&*&+!(#"%*$!'&&!$*((&"$#!&#*+(*"+"')! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4A0T4C16T18T4T6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8780 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25517 42 76M = 25348 -245 GACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACATAAGT -6C3)&954<2>/9B446$F1$3/(4(F.C21/!"C:*E/C8H:<.;(6$5B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8781 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14968 42 43M = 14712 -299 GGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATG H=!5?GB<4D<(=+(&$B=4((?-++9;A@:!B3)5G=-9?2;&)30C, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8782 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39682 42 56M = 39478 -260 AGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCG D@E-?<)2;8'25?45&6>@+:$0G$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8782 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39478 42 17M1I187M = 39682 260 TGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTAC 9-=6,->'.7+A>(G'*5E4>8)4!8'5A'(.D15=5F%,5.=*#EA%!39="*;-1?@<:30,9#)&2<.20#E1*;FCD+G:F)%::!#;@5#/%$62:>39H>>G:3:-(%?=A5?H5,6D'8D'&+7)A:*@-=755!G$E#+#*-'%*0:=40B07=73C8#8-7FGF-C0AH1A/;6A'D-5:9>A,-$3.%"CE>#H> AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:7A6A0A188 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42860 42 176M = 43036 308 CAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTANCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCANGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGG -"%"C=.!+.&256;#.%7./FC<8>D#$(##E+9/7/A0?E/A,>$1G0H;D7=;E72-!).9+1;9>HA(D+H<)7G<.?0?'%A"A%7-2:&=,8B??,@=?;4FB#();C@?$C")/"2(@0'>5F+6"'52B3@70AH;A"2D?5)7<2<+3'/+.B*%;?7G&D92CG@? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T91A59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43036 42 132M = 42860 -308 CCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAGGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAA D474":3E'CE(4:?$,=;/.53?F&B%/EF)!;5E7@/>D$)(-7FEC!9#$5!2G8-@*0!D:1,0@.!<6CC&A#2-;$"'GH2$B3A29%5>#90B&D86B7&%H>D+C?3-)6GE5$-*!@C$8%6C AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A65 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8784 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28356 42 462M = 28186 -632 CTTACCTCTGANTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGCCATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTACCCATTGANCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGNGGAGCATCNGGCAGACCCCTCCNTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTANCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGNCCTGTATAGCTTCAGTGATNGCGNTTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATAT 7D*/)?,=.A,7+&#+D(?0;H:/).(2(9+%$B-9D-B?E-*DD(C,>AF(3*#?>B%'C$C6A!H@G*@'*+/"$*42)0+*))"%"B:7#"8:�*+65,G/D5E51)FBD%<+<;'(284B)&D;0#:7G-#3;%2F;$E9B:F>!*><"C37@,51<2-015='(8=<%&"6<&/G&*E$78,-HE)*)'=:E?,-.(3$*;907E".'!E$7ACGB4F?27::*4+B62=B&7?;D&;E)7G'3610>HE#B10"51"@%D%"@#G>!.&51G%!>@'F9-GFB%+A>/$)*"HG,C':<1',DCF:?<3-8,<)CH?BH*'%8"B.E-E$@0:A1'"+?;=4#30-.; AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:11T21A103T7G36T8A13T109T59G19T3A62 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8784 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28186 42 170M = 28356 632 GNTNGACATAAAGATATCCATCNACGATATCAGACCACNTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTTAGCCAANATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTC ($#*)(*+*!"*'"#!*)!*)&(#*##+"#()%+'+#+%(!$'$%&))(%!$+!%"!&'$'(*"(&%$!$'!('%(+*#%"$('$#+!&'(&($($!$##'+)**$%!$"+*#&*('(+*&%$!("&&(!+#!&"(#('($&*$&%##(&%'!(%&(&&*!%"!(%)&(! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1C1C18T15T61G6C62 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25894 40 168M = 26117 325 NTANTCGTTGNNGTNGTGNNGAAACAATTTAGTGCATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAAGCTGATGAGTTCCATATTTGAAAAGTTTTCATCACTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGGTG #")$($%%$)!&#&''&"#&!++"!+$((+)"#&"&)%(++$%%$"(+"&'$')*!&%(''!%'#%$(##&'+&*$$!!)#$#(%")'$!#)"+"'!!*%(*)#"&&#)%$&*'#%!*+)"!$"$!$&)+!(#$$)')%!%($))('!"!'"+)!%!##"'$)"*#!& AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:0A2T1T0C1G1A0T0A1T2C0A0T0A13A63G66T2 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8785 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26117 40 102M = 25894 -325 AGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGNTGGCAGCATTTTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTNCACTAAGAGGCGNG ())(!+!*'##)*"'$''!$!"&!%$'%!#'#)&!)%+&+%*+#""''"'+##)!+$$*!++($"*"+++&(%#!'$++#)$#*'+'&"""$*!($()%)"! AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:27C10C48T1T0T2G4A1T0A0 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r8786 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26066 42 241M = 26307 310 TTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCNATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAG 2>;=075?C75A/+@-H+->F)=89<0>3@%9HE8"(<9DG=/8'D?=3;4C54&;*>-<(:0#;H06559<94"!"GH3%&H;96(6*+<=AC1)F:'>;;%-*83#&5B$"E1@>@=)D?+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98A142 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8786 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26307 42 69M = 26066 -310 AGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGNTGGTGATTGCACCAATCATTCNATTCAAAATTGTTGTTTTAC <&5+<1D9?=<8;G<.3C0@D4:-2BA@%)F;8A38D%6"@8)>8C/:;D87"(D"*$5E&7:.(;?+) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T21C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8787 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32760 42 84M = 32863 191 GCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGG :G=6-)29GFF3C6.<*,(!*@$/8D8/13>?*-:043,:;=!4#("379($,F49C>*&G99/3>.E()1C0.F743!+B'/C!#EG<)$2@&?);#%%D;<-DE&0>2=E+.D&<' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A17G59G7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8788 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1556 42 50M = 1159 -447 CCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATCCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCG ;9:#3'83D<47AAACH?E1E$@53F!@>8/B><@H9C.9@%EG1=@%!4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G24 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8788 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1159 42 397M = 1556 447 TCACTAATGCGCGTGGCTTCTGGTGCCTGGGCGGTGAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGNCGGGTTATNATGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAAGGCTCTCCGACGTTCCTGGGTGACANGCGTATTGAAGGCNNGGTCTGGCCAAAGTCCCTCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATNTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCNGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGNGAGCATAGTGCCTGCGTCANCCG +)"*%*!')$%#!++#%!'*$+*%)#+)&')")""!#%'$'**$"%+#("#$$))($"#%)%'#+%'##)*'&(%+$*'&'("'!$!$!(&*)*$"&+%'(!"&&)'(&**&&$)!%'"'''$(#(%')"+*$(()+((%*""$+&()%#**#)#")*"$#%!&*)###*$#%(+&*+&+#&!('!#&&%(+%*"'+'$$)$+"("&!"*)%))*"&%%#(()&#)**$#"+#(&*!''!'(++(#++*"''#"+')!(+!***$&(+#*$*%%!+(#+'#*!**!+)%%+('+$"&%))(!+&&&"!"*(!*+('&("*)+$#)$!+"&$"+(&(+")'&*#("+*(+#+'%'*%"&&+*()%)#$++#$+(!"&)")&%&%)#)#++%'*('!#* AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:9G25A38G8G63A13T0C16A68T42A81C7A11T3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8789 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16713 42 41M = 16531 -223 GAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTG H?C4&;+A<9?/HHH4$&"6*('.8G):5!4C>18%E<4D> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8789 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16531 42 86M = 16713 223 TGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCGACCGTCGGATAAGACGTGGACCTA =H+F26<5%=A4?2;A$C=/(2).1/F*2'>=-,80098<(<'83&30B-5.46:B7:)(>,;8>2C=@EHB5F1$"*F"BB%FG# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8790 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6754 42 101M = 6855 280 TGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTNCGAGCTGGAGACCGCTGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCC 7"B16A0$=>F+D%BH5#9C,!6&8(H9GFE#EC/">-E!:CG4+1.!EC1C(.@"+2&3';&A!/#/76F>G"044:.+'-DAG6:+">G02%F?H#<7' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:57C12A2G27 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8790 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6855 42 82M2I97M = 6754 -280 TATNAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGNACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGNGCGAAGGCATTAACGC F:0D3:>EFE5+D,)0#/8?"%@*05?26%?0B=&/+D0;1D1$'&9E?,>:6&"*=B'$/GA*2;5"1-3";<6?>4:&#!6EB"H=9'%$,"@$;GC08F):!?F/95(06=4!3#?7=%2,.E$GBB1.5),G*:H$$E;%C=1@0@7A8:=>,,$?E&4E-B77?>'-8>*&(C"+: AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:3A44T113C16 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8791 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15697 42 216M = 15640 -273 ACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCNGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTCCGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACNGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGAAACNTCNNGGNATNANT +(+*!)"(%(%&+#%"&!+&)!'&%&)*'$"(*#+*%+%#&'!&)+'$*()!%(!&%)%*!$'(""%'#"*%#()&+""#*'("%##'')""&+%'###!)"'!#%&+"(*$*#$#)*&$!#!"+'''!**'+$$$"'$(+*'%""'"+!*!'!')($!$"("$"&'%($+&(&"$)+&$&'*#!!"$''&()*!$())'(+!'%$&&&!'"!'"# AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:65C54A48T30T1C0G0T0C0G1A0A0G1C0C0G0C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8791 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15640 42 54M = 15697 273 CTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGT :FH10'GB366'2H'<$4-;$HD"HDGF1<+8G1!E6B25/#$?6/(;,1"/:6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8792 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28510 42 68M = 28722 252 CAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTG H8H31$!=C,;+DB>3-.%.H&@.$,G06%;'"<0/+5?!6DF:H#+G@14! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8792 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28722 42 40M = 28510 -252 TCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCC #2/G*@!;;"/0FG@#A=!>5#=#0./-2,%5)2-G2A*GH"H11A/'(&?#9.?7=;FB>!2*9(D8"CF9@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8C11C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8793 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16100 42 186M = 16009 -277 GGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGG !)!;C4A6"E:"/5/;(>"0'.&#?2ECDG*?9(-0G!,@:@!/A!87&>BD"?!+>14?,F/9!;!A+*-"4(45+%0H:42B+?6,AHA3<9>$4B$6<+01"C&)")!$3#!A.?1>!./#G3&AF1/H@+B;8!E$$4%7+G31.@F7?8&0GB2="??3'G63+29-D=6A=E'0A;*7(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:186 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8794 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26171 42 181M = 26060 -292 AAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCNAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCA /";667-(876E/;F8.70+.>@+#<8)0<7*D!(F.+62BH6#D#''><=A45)6100F?A@5@0)<>9",&><45;ECA),)6!?3F8#3)3"4'6-+34=)HH0907A('2"!65=-<1=@;,.3".6-4C);/A6<&?6*<'.63)%D0&0>)56A2G6A"%D/D/1@7=;<6)(-# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8794 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26060 42 111M = 26171 292 TGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATATTAANCTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAA =814A,C+=7''?:)1##*;>AG,-9+)53=C%B2+89$*D6H3C,:?GH-22#3#B'$<9@A/3!AFA:DH"?,77-9("81#0))$);=G9+9;/HCB(57=(:5$-;495FAC4?B#5"-(!@G6F191$'?>*?2&F%3B!"*&. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:177 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8795 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1546 42 69M = 1615 246 GCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTTATNTCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGA '3+=:+:+00B!;>=:4>"!&%BH#G.3?269A8%+%7B$)/,<-$CE.-4@$H?3&3A"/@D3E22'F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8796 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42214 42 122M = 42069 -267 ACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGCCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCG G5<+2,7F-25*42E3+>)H5*B&7!==.%@B=10&2:$HB0%-)C%273-F2%33(D/6"14.?'9;@/42*H=2EE!1,(6A,5C;H@,A&2.,+@(7A-E9G9+3!=8=)9'E.0@2+. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92T29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8796 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42069 42 145M = 42214 267 NCCGNATGGGAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACT '#''&$#%%+$%+'$"(*&#%'!!!)%*")!#++%"!(%#"&+"#!)(&+"(!"%*$+()#%'*(!$+'$%!)$"')$!'($(&$&)!*&&'!#$++!#%$+(*+!%(%)+)+#)*!'%#)%$"'*)*&($+&"(!%$&!+)"&( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A3C1G1A0A135 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8797 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8890 42 136M1D32M = 8765 -294 TGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGNGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGT ":!+D8>0H>HF>988AB*.1("2"*/4(0E82,$D@5*;1'/ADH=)B@">;$1(<,9@?@0%:),41G!3H:(B%C;@3C;EC;+'H(D30*;DEF(?-,1%)9E/'+0;>&B;!>E.2F23%%@."+>:8'BG2!8$(G)G%+;5)4$0"D%@790/D?!=ED(-:0:H/"5B4F6:/G0HE&1%5-*/22@#D,19H="?7,,--8$(3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G45C8 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8798 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27635 42 124M = 27439 -320 GTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTANTATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCA >'.4H!-G1"*+"%G>/6G#H8H2)B'"7'$%;8*H-944'D.%/68=DG@1)=B+"B%/@!/"@$&*,#&/0=G/41>H-;'5;&4@2H?=0H;-6;?<:=@)"@"E=1.5&(?F"0@0%:&7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8798 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27439 42 95M = 27635 320 TCTTCTNACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAANCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGA =8.@#=+@+&C?8CF8"28*G?D%1"7)46!+B;%HF&&/*!//*!>6B82*ED0##E5*A8#9D'D720!4$01>0!0;"3*34/6(=%$GC4G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T35G52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8799 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16005 42 215M = 16220 368 GGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGCAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGC "93+#&)8?B?C'*&!*?%!,F6"-35%"%+*7?H&5$?G?60C51D.4*'7*BF?,GF&<75#+-'F.;E9$$#=/@<;$&?5?-5C3/;>09$%B*)@D8F">)/G&+%)(.)1),HH$7==1>=!#@,1,/FC-50A5F@55E*G2G5>2?1.=('C6#@%B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:172G42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8799 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16220 42 153M = 16005 -368 GCGGGCGTATTCNGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGACAC !&*)+)"!&&+$%#*)%"(!)&&$$%'%&++*+!+'""*)(%(%+)#*"+'&$"'"&##%"*'++&'%*&%'##''+*()*#'!+%*&+'&'**%'%+&*!!&!"()!+("#!&!#&%!$'(%'"!%$!))!#+#'!&&#$")*++%%'(!#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T137A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45275 42 60M = 45344 276 GTAGCTGCGCGGCAGATATANTGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGAT '*'"'*!+%#'($*&*)"*$'++*"$)"(+$!$!&$(!"%#$##(**$)*%"("*+'#+# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3C2T13A39 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45344 42 207M = 45275 -276 TATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTATCGAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGNAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGNTCCTCAATATGNTGGCGTGGTCGGAGG *H*6DC:3/8('800F(E<7.F"6,?2&845A=6-DB:E"@*D4<+(6'BH?189A,#$?93(;.E-.76GA@E4C!G+,&B.!A!A)/)9D)B2:>.>B*AC5=C?,*;'D;;6B'(D$)5'.7>;0E:'0<@*=A+"1F;B$B-5&.3D9?G0&6H@:G;4>H<0;AE*>!;3F61-9$&F6,>1A,%BD6;4B:='(*$'3C&289%E026CA=1AG%>,+D!D.:A3:D"2?50?<(+G5&1= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:119C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8801 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47308 42 94M = 47402 216 CTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAA <-E*&>"$2=)-/)E9=<+FD8(B,/?1AH4=>"47"?"+20<>-$$CC;4$5%&'/);5%/>;!!'$$.+0-9"!('#BH%@>+*@)?F/22' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8802 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29379 42 62M = 29173 -268 CATCTANATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTT $(8.'3A*%@!8#!06(F,56<1-E;E@A1G.2?&(1>F@+;:!F;;+#74+$,:%".H=>@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8802 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29173 42 87M = 29379 268 TGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTC 2F(C6:=-6F#!E*0/>5!;.1;%C".::4'AF).7<51!H.-A?'931$;%5>.%-+D(9;GH<9AG<)+/*?1)78!6;1G5@"7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8803 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19133 42 257M = 19059 -331 GGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGACACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGGGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACGCCATGGCCGGAGTGGCTCACAGTCGGTGNTCCGACAGTNNNANGAAGNNNCGTTANNNGNA !$')%$'!"!)*&$)("%)"#()"!))#!'#+&&*'"))$!!+'*)%"&+#'%+(+#"$&&))!"$+'(()("!$+)+$'+(#'&"'%'$)$#)"*(%+"'#&!#%*$$&#(&"('"&#($'"##$$"+#&$)!)"'(%'+!%')*#*!+"$'&+)&)$$!(+*!+"(()+((&"!#+*$%+#++"($!!*(")*%*)+("+')"+!$#!*#!(+*'%(()*'%$!+)+%$%%'"'$$"*&)!$(!$)(%)#*)($& AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:18 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:18 MD:Z:107T23T92G4G4A0C0A1T1G1T0T0A0C3A1G0A0C1G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8803 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19059 42 74M = 19133 331 TGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAA 6."?(E1&:*=.6/92=4&C$$'F7!6/*1"A=6?-62=/,(7?>H#B41=(2)$%%<(".A>EC35198%H*2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8804 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43254 42 141M = 43173 -222 AAATACCGAAATATTTNGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTCGTTGATCGTGGTGCAGAGAAC +":H//0F?+=:;$//=9.*,-)FH3A45**D(A"/2,#)"7(:F>DED0%&15D(BD(4<&G6(>:5$-3<.G76.6D'F0!=5EH>5-?1*&FA96FDE'#0#20C"/*255G5%#0?H&DC.EF;$6;3B1HE3:';'?D/0.FB,D9>/?7'1F.-3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8805 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27285 42 80M = 27438 273 GCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACANTCACNACAGTTATGGCG 0B/!!%#9?)="D#)0-;%A&&A6E+E(;3>.."%0.!9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62T4T12 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8805 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27438 42 120M = 27285 -273 ATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGANTGCGTCAGGTTTGATGACAAAAANTTAGCGCAAGAAGA 25721,E??5$F&H0*(!&E+9!DF6.H8;$#:/@!,9%)E#%52"D:/,H!9@:F)&666))(#+AC8G63=;-*F3@1$00BC&9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:81G4A18A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8806 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 42 97M = 36597 0 AAGACCTTTAATATATCNCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTNTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTNG *9%B%//3--!'H$%>+1C2*00/4*$91897$7(,=8-(@>?*,H3D2$(E,,H= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G36G40G1 YT:Z:UP jpayne@0: r8806 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36597 0 * = 36597 0 TCGNTTNNCNGTTNTNNNTNGTGNCGNNNGNACTCNGNNCACNGNANCANNNNNNNNNNCNTNNNTNTNTNTTG $"$"##!"$$$##!""$!!"#!#"""!#$!##!#!!$""!$"!!#!$#$!$!$!!!"!#$!$#$!$$$$#""#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8807 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47446 42 165M = 47446 0 GAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAAAATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCT 3G8!C)<*H*$06C:@6035&B8%9&4B4-*=322&:?8E50@'$"%228$""D$-1"&6C9/)%'9@*'#6)?,/C1&<6,D8/>."+>='1<$5DE$'A)A/F3(3;3G3*7,EE8.("&G*58&FG*07!#.')$G2'/H7:*":)=&H(4DB/6=@F'5.B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112T52 YT:Z:UP jpayne@0: r8807 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47446 0 * = 47446 0 ANATATNACTTCAAATNNNTNTCANTNAANAGTNAAGCAC $%(###"$'%"()'*)"'"'""#$%%!*&!($*"+(!'+# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24270 42 251M = 24521 375 GAGCGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCANGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTNCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCANATTCTAGATCCCTCT ?<,E,)BF2%"+':1!?=5*=2<&78,+/H5/*=?>53.F@*$C36D4/<-%2&%G&**"G5B>E9=+B0:)'-)E5@/A/",G9H2E?1>D))H1B(:,5!$:#2CC71+C&,&*==H8,>'$,>B$&=7)D&:B-A11-6%6B6+.(;&EE"0DC89"9-$7.:.>*F$*F.(+&*;!G0:5;G")$!=A/E$1:.8/,8B+!H!:D85-@,=GD#AG2*%=1-)H89H1-?&$&$"5':$@$&)?@3%87";0&=1=*74,HA>9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108C15 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8809 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 563 42 46M = 563 0 ATTGCCAGTATTCTNGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTN -:@&HE)1#++6'3#8!56),97*8D@B#H?%*B2)!3C8E3$3?% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C30T0 YT:Z:UP jpayne@0: r8809 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 563 0 * = 563 0 NANNNNNNNGTNTNAAAATTCTTTGGCNNNAGAGCNACTGNNANGGNTANGGATAAGNNGCCNCTNTANCTNGGNNNTCTNCNGACAGCCNANGNNNACGTNNGCCGNCNNNCANCTATTANNTAANANCNCTNTTNTCTNANTCATNNNCNNANNTNNGNACAGN #"!!""!$#$#!!##!$"$""$##"!$!$###!$"!##$##"$#$#"!$"!""!!#$##$$!$"$!"#"$$#!"#!#$##!$!"$!#$$$##"$#$#"$"!!""$$#!$#"$!#!!#"$"!!#"$"!$##!$$##"!!##!!!$#"$!!"#!"$!#$$"$"#"$"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8810 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26354 42 148M = 26236 -266 CCATTNAAAATTGTTGTTTAACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATTAAAAGTGGAAAT ?'>.!>8.42F6#4C:?C64E=*3+.27)B/H@H%2-4C:#9HF=4)@#/#&@'@!6;C3$!30>&("@9F/*B9DHD@*#@+:!2&5+@0$$B>(HB''(:9'H@>;+=D=7*H$3&.:F3?)'1E$H=H#2+!%)6:&<2':EAHF AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C13T115G12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8810 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26236 42 118M = 26354 266 AAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGNACCAATCATT H;<>C&!B&))@%9.C%>B1>,##4DH'"H<(@:)>'),C%,8%(!=&6:<::*7#-GB!5D3A=>D65*DE6H8!,C"!$8%8;7B6)25/GD?DCC(.DG9'+D;,A:.%8!=6$E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107C10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8811 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22052 42 281M = 22333 334 NAANNGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGCTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGGATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGNTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCA '##$&$(+"+%#%!"!#$"#+)$+&*)&(!)(&#$!*("'%#(*!(+(+(('%$)#($!!$!'(#!+""$**$%!%%(+!$!$+#')#+($%)))#+*(#')')#(+!'($*"($&$"+!+)*++%)!(#")''(("+!$$$#"!)&'$!*!(!*(*&'!%''"%*$$))(#)(&%'(%*&$#*%(%#%("%*)#&"&##&()""$+)#&*"(!'$+')%%")$!%($%''&("($&*)"%(!'(*+&)"%$*)%"#'#)&%!!&$+'+&*+#*+''%&!& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A1G0G0T85T25C75G88 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8811 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22333 42 53M = 22052 -334 GAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCN ')-&&FG0B9+)+E1A1*)@#,'.94+--!/4(<$44'*354,F#D%D)0D:( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22650 42 273M = 22559 -364 TTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATNTTTNGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTTCGTTTNCTCTAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGAT 4E"134G=:A5@$34$G/*#.(C4:>?B<2%.>&-'/5H04/<+?24FH'$G$!#F5D/03<0)B;CCE-37'33&$!/*"B/-7!+?'.CD>D38!)%-,2.*G.98435"3$1$F%0CG91>;0/E5C&/E&A=!+F<(H+($5/,"D;2*5#4*'B<)0.$4B'025H83<)E%"(E:&/C8A&=@5C/:H:%-1%)B'$C.3C2!19=B"/F%/7,E?$"2&+"C57-'#H?49?";:E#>'.+F:?E%"71/>$&'>H+CG==92@-= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:110G3T45T112 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22559 42 91M = 22650 364 CGTTTTGTGATATGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGNTGAGTATTGGTTTATTTGGCGA 0!?0@(!2/;-FB9=01B9/+BAFC-#?%?+?.G$*C0E9=$0@,?'557(+3-B5-,(;%3F?3(7-'!@#/F&BA6A=>($269B,%90 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8813 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 207 42 76M = 74 -209 AGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAAGGAATGCCCGTTCTGCG (#%G3"?:!G65H)/'E3%@<.9%*:!4=07#G8+&>>6(#"$@$.))"@8G-3(3=2!3$,>:GG;8.:<5*523 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8813 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 74 42 133M = 207 209 TAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGNTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAA 7,9A#AE&E(B=>B*25E949"$F5(D2$="?-$8C;30G?C;21>G#@"#=:)>E/>="6(=:$F2G8C8:9'';-.!61.#:<@0! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83T49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8814 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9204 42 181M5D250M = 9640 492 CTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTANTGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGNTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCCTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGNCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTCTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGTCCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAANGTCAACATTCCGGTTG =50C:-//"1/3%*=(H/7,53D@#'91/B/%A"%G6H.6,..139;**"<@5715)H(B$@$@H$8%A:5"D>3D2!3:>?0?B>E1(&$$#,@+'*F)3FCE$0)6-26E?A:(@'E88?+?.2;3!'2*HD>*7.$-/4-BB,-CE!52!2*5?B*4>;C3+:FC<#%(<03?)D3$5G>F92$719.B$*)A1?A=/HA9*5+=:-+H@&0-@=9B69$83/:!A-.7FA98"A#"@6.2B7DAHB:+A1@5-&9EH+70=90&+GGA!E9H6@;G7"96!2D(<=/79H:*63::C-;C9%:,H!@#:!E&H$6="G544C+=EH?4G4841?7)@:AB(>:>+;4?**C<2G">/,H:?@H<&#(!*#"5).-!A?3&="=G7FD.$E/3(101B&!<#G!'<8C>($H6EBH?"%5/"'.3$0( AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:12 MD:Z:52A88G39^CCAAT11G111C24T52A31G16 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8814 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9640 42 56M = 9204 -492 TATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATNACCGTCACCGCCAGTTAA 1"!=-7"1G+-9&7CB!7.?8%<+,(+3?)=3"G(!0);C*(=4.-C<&8:&-B87 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T18 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r8815 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40827 42 108M = 40965 214 TGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTNTGGTAATA %*+%%#'#+%'"(%$'%'!%*'&)%'(("%%&"!++%"#$)$!&&(#%('+$&+*%+!(%'&"%+*!$#)"!(&)$**!(!)$(#$'+#)'%!'*!!+!)*($$*"&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99G8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8815 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40965 42 76M = 40827 -214 GAATTTGCGGAGCNATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGGGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGAC ==--7DB%F&+=D;?@-,=A2*H%6FE"+.9G0$1"#$A/00#57@8FG>;@*=#571"B AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T36C25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8816 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46011 42 165M = 45646 -530 ATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGNCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCNGCGTGATGNTGCTGCGCTCGATGCAAAANACACGAAG 48=!B?07&>DB-)3":4$&"F4;".9/*C+*<0$.!)6%*3(9?90("*D&33.)HE&..>/**=0:/@14A9>%#(C?#95#<-BB+B)'E?:291:#7;-0DEF!2A%:1>1D1;B&:331C>*$1F,* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:58C68A8T19T8 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r8816 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45646 42 238M2I68M4D55M = 46011 530 CTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCNACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATNAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGNCCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCTGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATC )G<'+&2'G/=;:24+32$7D<6)8="G1C=1:-+/&4%E#D&1=&'%"?A=%?-!AH"722=B+$*@);66)($>%$&.%7=,G/*H$9F!)&!,:9>9E-FDB,'=%(=;*><@2HD>6339$*$@$?C?=F<4F5$3&C2%..C39%*D+:-@-A(8*=*+B"C"D-!5)D.%GC267&9;/>-E!5(=#$&8"B;9<,G%:9#7%4<";E%,7;;9(5;(2>6;;(FF86-(,#G+<@.C5GDA>C%E61))2/)7(%<,7=31@1B.'6&2F)/#"%HB)%;(#H9HED>$G#1.?D21*;+'5B%@G57F9/<0G797-*%54,19A'4*&D6 AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:10 MD:Z:29A113T55A47A58^AGAG55 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8817 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33866 42 155M = 34057 239 CCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACANATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACGAGCGACATTGCTCCGTGTATTC 3D.%?D7=0/&C*<.B-E'&?:E.G;40<02+7/*3@(,#5/%!;@3H%:F2+,%&@+$6:1,"9*3'F>$*3&0?7'?&1G1EA4?'GH;#'#?51H-F6"4%G0/+9/#0H-&6)-F1DG: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56G98 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8817 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34057 42 48M = 33866 -239 TGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCANTATCAGGCAGCTTTGTTGTT #*?)3A"0*$@!714*;33<,!B3@"=*-3$7D;H5><(<-=6%9:$F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8818 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19179 42 150M = 19329 323 TGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGGCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCAGTGCGTACG E7H2%:F0F01*@B+)37D02&@'"=5,3*$(",/GD=-!>C0>?=FG!*A5&49-&98!(A#3.A)04$A2G!E+6/*!>C0"38:2%&$=<5!6G2/%C=+D#?6>1%!(?':!B@D*B=#'(A6E2:;)'5F(>/B#(+@#9!G1C2!)=.(;A&7="=2$,6?G0; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:104G7A15G11G32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8819 77 * 0 0 * * 0 0 CTNGNNAANTCATGNAGGCCGAAAGNTTTGTTCAACTATAAACGCT &&"%"$!!""+)+$%*"("'*"+!"!%#&%"*"%&#!+)""'))&! YT:Z:UP jpayne@0: r8819 141 * 0 0 * * 0 0 GCTTCCGCTGTCTTNTCAGTTCCAAGCATTGCGATTTTGTTAAGCAACGCACTCTCGATTCGTAGAGCCTCGTTGCGTTTGTTTGCACGAACCATATGTAAGTATTTCCTTAGATAACAATTGATTGAATGTATGCAAATAAATGCATACACCATAGGTGTGGTTTAATTTGATGCCCTTTTTCAGGGCTGGAATGTGTAACAGCGGGGTTGCATGATTTATGCTGATGTTTNTTTGTTACTCGGGAAGGGCTTTACCTCTTCCGCATAAACGCTTCCATC 03=G#61D%7"2-=1DE#E!D<8*H+D>EA?E".!/'+5(,$3D=#/>@7.0'>>#/17"<,8+*C2!4H7"5+"1'"-0*">:<>-+$#G22/C1&1#@"F=130$33<:G62-9G.9H3@F4E1;84+;"-,#75;<&6("=2(#B'!H@B/+F$8B*605)2-G!43=4+&7>/A$@2,'5B8/+:C()*C'&@2:"BC9G<% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8820 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5553 42 83M = 5807 296 TGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGAATTCTGGCCGCAGNACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGT ?A&?*#&595<.9>>2/FH2+0@3/,$=-B*:*D@C@=+>2>A)-<+G%/@*F7,"5"80090&3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43C13C25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8821 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25120 42 54M = 25206 218 TAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAA HG)D!4AG98D4E%B4DG11"4>3E!H+H&:>G'2C'?+8219$,27EA#06;: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8821 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25206 42 132M = 25120 -218 GGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATNATNCNTAACATTTATCGCNAGNTCA ('())&$#%"#''))%"%+$$"!*)'%#'(+*%(+#+!++%('(*(#(*'&&$+("$&$)+)+$*+$$*&%)$&&*+$!'#&$(+)'*$!%'"+)(#'("")"*+!+(%"!#''&(!%$"(&!)*"$$!"(! AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:106T2T0T0C11T0G0C1T0C0A0T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8822 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26235 42 47M = 26235 0 TAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTT :)G9+?1289)1(>)93%(*4D$9)28E/92F#'7-%+B1#G+/,D= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YT:Z:UP jpayne@0: r8822 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26235 0 * = 26235 0 NGGCGACACCCNNCNTNTTNNGAAGNNAGGCTNANNGGNCCCATAA $'!#"$!%$$)##*#&%&*(*'('!(!#%%)$#*%&)(""%"#$(! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8823 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48051 42 62M = 48217 286 CCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTNGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCAT 51*>B?>;2BC<%1=H&E$2B3C72@;!"?#7A3+-H6C@E35:C37"58;B@3&GE9CB+C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8823 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C25A39G163 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8824 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22182 42 183M = 22365 440 CCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTNCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGNGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGA -DE!GB<3<%(!:""(@)!8E"FG9:';0.C=;23-.?AGHCHF9&+?+0H'"-H;;*.$:<1C@:86)F-;!B4<6-.@E+,<(<$/"=-<1*'@8=&&;>9D,',+!8,B!"B@&4D,,H0'+H4.9B766-.&H%4"265?1F%<'>6/89!H1&GH?01,2)0F&*7+1..'9% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32C66A83 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26347 40 340M13I43M = 26730 450 AATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAANCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGATTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTNGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTTAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAA 2-A/.0/=<+=&?#7B9$D%&220$#+?8$"!7?,>8#/+1;)F02#E4:+"0*GHC$:(#G>>1*5.>57B4B.G':F60E;*FB&;E/58BCF%4$6<=/1F)D'@G5+D6#)>@E9%>6@.:83(.1E@8..#A'3=8?3(G.9A"4&:%9"?6G-0!':%B18:7*);"E*&,%6;$D1#*3C+FH52969#-/!);H3!81;F4#GG$CF4CD"B4G,%<9';F?6'%H=*(A<&03"(=C,<8A+H47$B3F,1-*36,(A"D.C$,BA?",G!802*/75/8;<2<;!"B'E.D;'FDH::!.5=5%5"2#38(!-E+02%F6%19!>3C;,6)%<<2**@9'1-'F* AS:i:-55 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:13 NM:i:17 MD:Z:83C130G62G43A61 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8825 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26730 40 67M = 26347 -450 AGATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACC '1'H=0B<*:"=2G<4=0(H+G/F,+<;-,81=H9HEGH!EC;!<;G1&1+BA=)D:?+3H*3&0:? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C65 YS:i:-55 YT:Z:CP jpayne@0: r8826 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22029 42 100M = 21809 -320 CGGAACTAATGAATTAATTGGTGAAGGTGNCGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCANATATTCCNGCN '()#%(!(&#&#%*$%"&%'&"+$%*!+#$%&*'$%"%#!%&++#$"(!"!%!+#!%"#&)%()"&"$(#!)!*"$$))(*"$(+'('&"%%("#"#&&" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:15T13A58G7G2T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8826 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21809 42 103M = 22029 320 CATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTG 2=C?*G?6<25CD*+D6%HD&'3:9<*;%G:"+*B7$F@D*C?845FD-82,4C<%%7F-4A>3D0982/CC=($067D3=4*/FH!.?D315E74EB0BC!-F)=%3,/(:C6?=+@=#/$'4FA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G108 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8827 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6595 42 81M = 6423 -253 TGGGCCGCAGTGAGGTGAATAACATAACGCAGTCCGGCGACACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGA ?GH4C%.-&8?G8?6A5#/2"F?"?,=$%)-681"087=;)6;!5EF*6<=.*:@2+!?+*<:,4C3&E7,&54;>5+>*C??:%/,/(&(.=E3E9D&/+H< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T27 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8828 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18771 42 169M = 18712 -228 TCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGNATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTNGGCATCANCGTGGTCTGAGTGTGTTACNGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTT (5FE739$*E'25%C,,!@'9%(9$F,%>!3862;;2?++*<6?A,"):"3C@!4+BD&5'&1E;"2*;0&+);$87B8)'?,#E/!:896>)2&.87HF?"+<9($.:;(.2/CG)4H++&"E<9@5'&;A82?)D%D>)??).&!>?F,!>=H/88:@BB: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T49G7G19A26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47569 42 104M = 47721 280 TTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGANAGATGTATGTAAGGCCAACNTGCTCAAATCTT ?7>0:B)$;7,?G8H2)(H+F9G;,"=G8,*+GCH?=.93&,(+6,C0=;&H'%+'A"A'&>5(<?99(BE%!/?B1C(199!3<:4"BC'1-+BB5E%= AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:71C19G12 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47721 42 128M = 47569 -280 GCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATTGCAGCATTTCTATGAGTTAGNCCTATGTTGNANTTNCNNNTATA "'""#'"*%'&$+&)&'&&$(*'%($"$*$'#+*$"%!!$#+')%(&!+#($!&!+$++)%$'&%%+#$)!&&"!"($$'(%%'+*)**$!!)*)'(!$+$+''&)#!#%**)(#&#')#'#&()&&$ AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:83A3C15C0C1T0G6T1A2G1A0T0G4 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8830 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40173 42 52M = 39867 -358 CCAGTAAAACAACTTNCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGG @C%D>)1,021)C3!G81+$3@.2?.&'%F/D,'C?/6*9>:?48A5*A=&: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15C36 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8830 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39867 42 241M4D61M = 40173 358 AATCGACCAGTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAAAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATNAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAA 70*@1F>7-A)C7*"G0/-"E/@03.A8)H'>%A$3:-5:-(&4F5?2C@,B2;5>&"E)DC;8D>CA*%'G*3;+B:D@7<@A:$(+GB7$4F'C:?2@70G"B(27"B5$'FA48.-)&F+:>D5%25?>0A3)(40" AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:7 MD:Z:9T41G189^GTAA10G50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8831 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18052 42 49M = 18052 0 AAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTNGGCTGTCA G>-F4E>8.H*>#;$&E9!=C7'F$%C+05"BC3.@9+10>6?@"6/-*87C@;$)31D$=&H!'>?-$BDG?FA'H#.&H50G4).>';75"GBDB'D$6&51.-'?9/9G33/>*8>+?%#'-.63(H#.,$D2C%%?;$&@)GA)$,F#A$?.B6!3BHD,?A8@9C>(58+84%&E&H8=FE$6?716B51"%:G'.-="A(;A8#?4C<)G<3?!37:8"*B'@0!C;*)"D(23%@@9+.GG9,;.5#E$@''&D$A63-61")4-D?1+:+18FC=HE"@-<7/2G55C6'DF8?F8C4-)@4$?!/<=<6'D<:!"+!(51?5GFC4;893G1<@GBE?=G AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:9T104G82G124G35A10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8833 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8152 42 40M = 7783 -409 CCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATNCGCAGGCCAG ;"&."*8:2#?B@#5!;+>(=%++/.#7GEG#C<-<#EF0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29C10 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8834 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28540 42 119M = 28784 291 GAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCGTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAAC ,1E:HAH-'=:#DG=6G36+'H>5@2"0.52:C5/:"21=5@$"B#,H*7E"?10H:1'"3'+D=,&C"F>F<8GFA32A1# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8835 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41784 24 61M = 41953 215 GAGGAANAATGTCTCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCT ,(+@.$:5#/E1);1"8F'&*5B@-&@.,581@5H8,%$DH@&C!#7&D76!6#%!=2BBD AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G6G47 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8835 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41953 24 9M4I37M = 41784 -215 ATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCC 5,AA!52%6H2,DC29FB6-?.!&C.3-;&&8(=EG+"5&9@D#=#2H!B AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8836 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17242 42 96M = 17104 -234 GACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTTGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGC 97:3:D.=2&;E?C662@47C-19A2H"4=?-52&9!4B%,42!,7)%,A7:-2B@B422>8!@G;7<-8=11@6D+*<(>834C2B3"G)?E"@# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8836 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17104 42 48M = 17242 234 GAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTT G4)>A+&>2F42-295A28B$;=3"&!*@6;7@47$=$)#78.44$<% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8837 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33304 42 87M = 33115 -276 CTGGANAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATT !1:&FE2@@:92H1"#&HF$H64?)D)B*?E&A"(;!BF7#70E"7-3,7ACE809=3+G41)!85-#<'?F'#A9>)=E&+E6)")C,)@A;(G+93;$GD$@F&7:<6$&.1+5%3?CF/B>:3'B,2(?HB>D+-GA?#=/0-3-F?15AG!!4-H(A30ADFC(D=9A!E744E2;'A3>):4'7G( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:130T58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8838 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32183 42 41M = 32410 320 TCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTNACC .=BAH>H'>C)'9#??@%9,6H1!7.>CH='E(=337$7DE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8838 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32410 42 93M = 32183 -320 CGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAG '0@23*!5",C+92.8?*'13B(BB#%9BF=H<:/<<4A-.6#0%C9&&D+H*B*F'+AAH>101;G:FB8;GF<$7:(#7(,(;3+'G!;8G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8839 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26270 42 102M = 26375 208 TTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGNGTTGGTNATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTT ?*1.-7C&227C61G7C)9#'/A18#?41)B:;'G@;E,+>*.>*,#C,#@?8H3E9CH0*"F+!07"9@@4D-9B)?>023$.A-+.>'3'>.6+$$@+7';:*;31;:?"GC;58@,1058- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71T31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16372 42 82M = 16533 206 CGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTG .;1)D7=HC>0!C0;D62+*=B)H$$"67'HG#*(H6552.1E25),&'#:;F==7" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16533 42 45M = 16372 -206 CTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGAC ,*%H:1A,879<9(CA.$"8@$-%B8(H,H1'E$!%;EBE0%&(: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27331 42 77M = 27516 229 CCGCTCATAACAGACATTNACNACAGNTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAG !(*%*#+'*)($)"#!&*'++%*$''#!!"+('''"%*"'$'%*"''**!)&'$%)(*+)$"!"#$#$$%'&")$)* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T17C2T4T50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8841 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27516 42 44M = 27331 -229 GGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACA 3-03""11(5)E&0:.C>H5*'C*$B9E/"/9$*H/)72;5C$G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44898 42 81M = 44744 -235 ACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCA 80G!"(B7"-HF1*9.@DD42,.2G1/(:&2%&;3G*5'+/92&&(@AF.#8:$C$#)7<'<+B00""BC(8H8.;/*,+> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8842 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44744 42 66M = 44898 235 ATAGTTAGAGCCTGCATAACGGTTTCGGGATTTTATATATCTGCACAACAGGTAAAAGCATTGAGT .%%/*7>+-,A6:()15B#9F4H547-A#;+:9@.*,*+*>GD&97&1,!52G=%-5=(=?0?C2* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34T20G10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8843 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35068 42 358M = 34970 -456 TTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTGGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATNTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGNGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCC G((/620B$%>-H3DECEEH%<6F"?;!1A,FBHD8B@-@7+B8:+=@67!+GAD/=#%H#'E/3FC<27+@(;($E"/57B#,AC$,-'0HBF6E,94$>A)/0F$@3;5F7$?@&%#4399')F'>=5/3;#@"0""7(9"',3@(/:?>:G()A%'<4@(?D*A=D$2?BDHD'G3&;66/EE+%<%C>&DD228E6;"6>*=HG5?F84%+FC+/#(73A2(3.@G#GA+";2!:-1086=)C773$*5&@$9<"!*'%9*08A>9"E*(1%@4CF3!11=+5@>%A;&?A!6@"$;F:A5;/D2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:64T15C14C227T34 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8843 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34970 42 75M1D22M = 35068 456 GACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCCATATCTAAGTAACTAGAGAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATT 12'=)2$A/9!=',<>,"@"C+;"B4*2!9"3%6"3$F/.$FD-/08DG@1?(-?.+)&0@>D;B%1*=!C%1C!/1;E+$C=$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8845 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8033 42 70M = 8033 0 GGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATAGCAGTCGGCGTCA B<3="5(:-6'*:?%'$'4;C*G=*3H-%&A,B!.(<5+.5=8@++#2:<=&0E86+"!-0)17"DE"1" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C13 YT:Z:UP jpayne@0: r8845 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8033 0 * = 8033 0 GGNCNCNAANCNNNGNNNTNTTANCNCANNNCCCGCNCGNNNCGANANC #!$#"#"""!$#!!"#"##!#$##"""""!#""#!$#!""!!""$!!!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22417 42 165M = 22582 295 AATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGNACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCNTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTGATATGCCGCAGAAA #/D=<5D"-,D."B6#9.3F)/F/6=--#2;#!2?!$H02.AB/5%CG%B")CE%*69H>*8A972%67"E7=0$,!3$7>?<)"16-D2H/8@<&'$3>@>D9H/)*379+7/F'?))A-7.;*#&$@!".%+%A:9$**.HD,+!)-#;(@92B2!.AH(%&* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G99C26C37 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22582 42 130M = 22417 -295 NGTTGTANGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTNTAAACCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATNTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCAG ('+$()!&#!%##'!&#($+'$($+$&++(&$"$!('$$)))#%'*')&*($'+&%#''+#%'*&&"#"%)()*#)+%%"(**'#+$&+++(()%**$$+#!%+*%!#"$(""()#"%)$$#(&*(!"+& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C6T31G4G30C53C0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8847 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6981 42 56M = 7197 301 CANACAGNTGGANGCANCCAGNATGCGGACGCNCAGCGCGAAGGCATTAACGCCTC %)#&*!'!#(#"!'&)$"*)&++((''(*(%#&*()!#$!")*!##&$('#"&"*# AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1G0C2C0T0A3C0T3T0T3G10A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8847 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7197 42 85M = 6981 -301 AGTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGCCCGTCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAA +2-20@G'&$>14F<.H;8=6-@@4C10>1>F>%,;!H/1:745D$1*G(4$+4#$<7=:'H&:D/5==;C*+>G,9@"@G1)62$)=E$80:GA%>:#A5%/=+&5.7.":H$;#/BD8.8?ECA*(G%&&9+@)F17#2:(FG*3%EA4';/("#*B$!:@(&*H7+D"4?%7DAF/17:*/.HA0$'56:D#924, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T109 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8849 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15133 42 134M = 14935 -332 GCCACCCTTGCNGCATGGGNGGCAGCNATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTAGGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACTNAANNTNNGTACNNCCNGTATANA $*!*#$+%*+)!&'+)#$+#'"*"#++#+**"++%!&($&#+'!+*(+!'($$(")!#*!!'%%&"$*&$(!%!&+("(#($%&(!*)*"!&+!##"((((')%+%&'%$!#*!"!"'$$(#%"#')!"(()$" AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:11A7G6C49T32C0G2A0G0C0C0A1A2T0C2C5C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8849 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14935 42 129M = 15133 332 CTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGTACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCC .?!!&D52!8#494<#7&9)/,0!-'--+=>7085:8+#D$*$5G4B(&C-8G,$*1/)56?%?&'F;6F'.,<-$H&ED3EA@D)A&C%&B+F8@-%&!4-*,/#:(/,B'H97*5F'2"&A$/#5E; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39G89 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8850 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7348 42 108M = 7155 -301 TCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGT "5<01(/9;F<,:?"**9$87H2'#$G*@<,&2$%'H%1.3-.##:D+A'7<>4C;+C!)7F'?68-*E@-;@+A/8F#28)=3061')#=%F:;C2="$==19!48F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8850 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7155 42 51M = 7348 301 NCGTAATCATGGCCCTNCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGA !);>>+&?15#'!0:D8:F' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T4 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8851 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34016 42 62M = 33788 -290 TATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTGTATTCTGTTATTTATGCCAAAAANAN 69?05@H@#*D9DE,6,>;2C%//10?AEBE'2"!53:EFC@,,-H);==:C$9/?G@3""" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T23T1A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28997 42 50M = 28785 -262 ATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGG 3.C7D$F5@59=.7!;A? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28785 42 77M = 28997 262 TTACCCGTCCTTGNGTCACTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTC 5<@:0F&5.E/A9FD/-)-,' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G3C59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8853 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17276 42 153M = 17431 245 ATGNNCNNNAGNAAGAGGCGAGNTTNNATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGTATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGG '(&#**!$&("#(#)$'(*"(&$!%")*'$(+(!!((##+&*$'+%'!$'"*&*$*!')'*)*"#&!+#%+**"()*$##%*%"*'*)'&'!+#))$&)(+)!+%''&&'!%%*%$($+!*#$&'%'("'+!*'*#"%)#)!'*&&("!!&%% AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:3T0G1C0G0G1A0A7C1T0C0G1G0G41A84 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8853 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17431 42 90M = 17276 -245 ACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCNCCGTCTGACCGTAACNGNGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGG HH;"H.%)+:0!)23(.678'*&%!":7)-4@.'!C7718+=/"=.5D"A"4>5$C>9BE!+54)3!@-<7%D=G>C/F4@&F(=? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34T15A1C37 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r8854 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20555 42 47M = 20420 -182 GGCGGGGAGTGNGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGG C079'2C>?-+:"56=8*"&7!;0;2(AF8+-EF2@?/+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C35 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8854 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20420 42 46M = 20555 182 CGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGG ;3%7)A>A<075*G;:$B+-9#F3#1A?#(0E/3/%42B"H9"@(F@@%,8!#8,D4@#03F3+=?5DDE7H8+7.H"/.G6F585';;9002#0-:,BG%;9 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:38A42T23T10G0A7 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r8855 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38209 42 35M5I95M = 38084 -255 CCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATNAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGT 0!C)93>38#36?D"*3:C$E-B*5$,@15#6EAH;%:'&.4>BG"0')B)E,:33*7C9;7A&"G;7,$91+$<(/7(*61-.4?$D$<$,',*$H.+5"92=(3!'$0*D3;@G+89++1+H79*$96B-<@=='.B4#/4:=,> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24G24C18T2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8856 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46453 42 239M = 46692 310 NTGCAAATNTNGTNAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATANATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGNCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTNGTGCTACTGCTGCCGGTTTGTTTTGAACAGTAAACG "))&%&#"!&!*(#*&+$%%!($''%+*%#!%*#)"$&#('#)$%&*)#"($)"*)'"'!+")*+&+#+%)(!!++)+')*#!()'*%!*%%+!%%##))"+'('('%*'#(#"&%%#&!)!!"(#%(!#*'#&&"$")((*#%*"+"'''*#"(!%!)%"+''#%"')"#*&&#)+$$+)(%!$$'%"(%+'!&'%!+!+&#((')(!#$"$)&$'+*+#'&"'"+$+#+#''&)*&" AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A5T1A1T2G31A78C77G36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8857 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44105 42 126M = 43882 -349 NCACACNAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGNAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGN -+='C4"E,;C*@C!.@%:H&&:CC70*7@1?1H"G:4%&>?*3.*B9D&/0)@,-HC/H4G:.;!5613"$1%%A'(7)7:DH3+(42# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G5A51C66G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8857 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43882 42 218M = 44105 349 GCGCATGAGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGTCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGC C*:3C".(/<0=,D$#@*14&778D/3$+@HH**.)&>B&*-:=@$"#><"=*,FA"C8H"4>4#)E@268+&'1*0AC3AH"HG86+,B3$@$1'77=1+(1'%4)0HG1:D-!$.58##C(=;0F8:.@#$6C-C/C#03>)FD-4F,0FH*,#F%=35!&35?(&E&5=@'=%2:A71F27(-E6-*6@%F1#+,C"E@",C'> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124G93 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8858 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47158 40 55M6D77M = 47071 -225 CTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGG 1C69$;>E,@8/B;G5A2/($D;//&34%1/CG.05GFE)D#'F/$>6G<2$B3'&*?',)D<)92=552B)9!.+(8<(*H(;>(AD0D)&F0*BE+1!>-$-2C&EE#9E'"=*1D>.E9!F):E! AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:6 MD:Z:55^CCTATC77 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8858 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47071 40 43M = 47158 225 GAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTA AE?/;/+&75H!HA?(F/G(F9"@.26D:6G"8'32;$BG,"F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8859 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29461 42 77M = 29341 -197 TCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATAT (.E-$B59>9=4G!*';9:-7=6)0%93'-"+A/:.$=DAA)FG1.1,>D@32(76$4!@@:&G>+.7BA?!F#*<. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8859 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29341 42 69M = 29461 197 CGCGAGTGCNAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTANAGAGAGGGCAAGT A@A:#B55:%1<4E%;5*/,)7*5659>#DF46.-E)$;6A1- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G45C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8860 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47717 42 146M = 47886 229 GCAAGNGCATGGAGCGACAAAAAGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTNTGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTC :!80H24E"C=,2;+H;;5E"A&153>#H.1,H>3#G9"0AG+4&..<302,D#7)/2=H/E1)(+8+H,4'C<0D"AB9<+)2.85F4<#D3&9=-%>"G39;ED9=A><(F/2*C"9- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5C16T76A46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8860 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47886 42 60M = 47717 -229 AGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATNAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGNA A)A2+.0?B4:'B?+B(?9@&+F=70,'(/;B:=0=3;5!A$>.(=:B1+6(@"5AC?4,4F,.B6GHC-&AG$FH.F- YT:Z:UP jpayne@0: r8862 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37242 42 90M = 37442 260 TTCAGGCCACTGACNAGCGATAACTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCANTGCATGGGATCATTGGGTACTGTGGGTTTAGTGGTTGTAA &*/;@/E.'>#,498)E3#E.8&@>D+0B"-648"*/D'80!D+% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T34T40 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8862 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37442 42 42M1D17M = 37242 -260 TTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTT -:!0':4/A50F/B%"555=#-$*4>5D*'>)')#68;-'5H055$+**7C(?(-0964 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:42^C17 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8863 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18271 42 58M = 18074 -255 ATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGNN #4,*<('333"%?,8:=7=G/>);2+1A9H31+()1&4E;DC/)0(?F;8312'.B"& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56C0G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8863 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18074 42 79M = 18271 255 ATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAG C&9,57A$(<>**"A84C55E@E''B(G<4?<6)51)B7D(DC'-"@-B18)F2.63&0%B.8G1"&E1GF-5(9%A(0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8864 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32110 42 87M = 32229 280 GCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCACGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTA 070.(B@-/>E,#&.''7A;#D,=060?008"&#:9=9 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8864 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32229 42 161M = 32110 -280 GATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCNACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTNGGATGCGACTGCCACGGCC 9>*E871!46&51F2=A)5/)<8>C<'/;&;%'!212-?EE5G!DFA;A))7?2%/&('&:>%F(#'6F1A62$822@D:D4E?&G;16:>9CGBG-.@875E1A>H%A%991BE7+8G*B&->=?E9&,G436&,FH-(2D&>:)C((C7&2;!*2FFF@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G95G19 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8865 77 * 0 0 * * 0 0 GCCAGAGGACGCTTCCTGAGCTGANGATGCAGCCTGTCCGGCGG 2'$+<3>:-$F.(')+;20F04=0&370))/*?@C3?944)5G;!>3H5=(F>%D7B3A$1>F1A!$+797@04$'(#D9%(:C3,2EB.=H@(-%'/-7@12F#/<49,$1D3&:749G9%?#*B5<($$=9D?7?7%D>B"+@"+$3!C0,,6)BBC#<92$D,EE((<31E4%07:1(E0E$,;)?494A4/9GG0"71)24,D<;E'&F9H6)$)-*>37 YT:Z:UP jpayne@0: r8866 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35662 42 77M = 35466 -273 TTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTT 1'#3+'-9'A,90#A>'(@(,)7*'#D9%GC%8-@+*9?H$; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:77 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8866 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35466 42 124M = 35662 273 GGCCGATGCATCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCA +-<:A-1:3<'=)7116696*'(;F+B-4%%39-(@D7A/%7(5;BB7H/1?-E#>:/'4C*)!?-2>?#$.6=2(/&)C"".A&B)00?2+3>6..%F6/906@G%+%3D28CH/6%BH AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A4T114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8867 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14685 42 65M = 14481 -269 CGAATCACGCCGNAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGC %+$$&+%$*$)%"""%!#%&&&#"&$"!#*'$'&"#!()**("%#"+&&)#++!'#'"(&$!+"+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8867 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14481 42 82M = 14685 269 GTGTGACGGACNGTTACACACTGTTCCGNGATGCTTATCATCTCGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGA <&+3)!>+3?B;8F+*F1EH>;7&FG??;H".@0EH:2&3,G>2116($.'1D#DG'+!"DC7B-#?&ED3%4+,:),"*)9&@95&05F*E71@.?86:&5A>%!",E)- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8868 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13889 42 76M = 13741 -224 CGCCGACGGAAACGGATGGCGCTGTTTTTCCGGGACGTATCATGCTGGCCAACACCTGTACCTGGACCTATCGCGG <2)28,900=@A,B8"=)&3BGB.7@E1*%03A#0B&G6,=AF.G,.H)5.,)=E7!A!B5308#$'%:)A<'-;F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8869 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20058 42 72M = 20286 296 TCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGA G<&).EH$,;=!,&"./'=;<*D#;21H>8'(GD085B8!?7@;.;5@!'"#'>:0/'2>0#6!3),<$3*E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C30 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8869 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T68 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8872 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22975 42 29M1D17M = 23128 268 NTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATC "/57"'5/*(E<$.?H<"G":?E&&1743E$((*?5925,2:7H<2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:0G28^C17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8873 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43060 42 41M = 43327 315 CATTCCAGACATGCTCGTTGAANCATACGGAAATCAGACAG E>78)F(5C-CAG$:+1<"D@594C9%*,//8-(@'1+=-3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8873 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43327 42 48M = 43060 -315 TTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGG )6)?(5A9A"B+6B<,CF*&)5-+&8:1*69:D2F%>'F.!E$8/$68 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8874 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12248 42 96M = 12080 -264 ACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTA @GD!/0&@/B;D122H00#3>&H:9-.0A"*/#"(1*F>*G6@)A+3@H4"+@#81?,-A5*@G;6@*8*/(H.4#)8G?=89:E%?36!;0((>, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8874 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12080 42 76M = 12248 264 GGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCANAAAGATGAGACGCTGGAGTAC DG:H26<)F&!-.9@('<97;7(-,<901,1-(+$)>>F+7?7!&A.&HCF,)AA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8876 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39407 42 44M = 39621 259 TGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTG 45$2:82"7':/1A3GD2H629 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23920 42 103M = 23718 -305 AAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTG 87"A1)A?+:8D'==)5&4B.,6*.H;!+&1',G6*2?;;&()G(5>:-2;%@(<B!@6.G1)$?<4F'';=82%-62+,>C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8878 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34158 42 122M = 34372 273 NGACAGNTTTCCAAGCNTCCATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGGTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTATTATCAATAGTC !)%*)!(%)#)(*%%#"+(&&(%%%$**+$+)$+"$$!#$!"!"*+'%#!&*&#*$##'))!#'&%%!$+%!%&'!#(%&'$!$)'+)(%$$($)*%(%'$$(*%))'#*))("")#&)"%! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0C4T0A5C1T1T50C41T12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8878 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34372 42 59M = 34158 -273 AGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTC +@@?#G@'H8';"/C,E(4+(&4""E=4=@H6'6>&/A2C!-'*;=?/14)<+C/&A&6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8879 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 199 42 61M = 312 209 CAACAAAAAGCAGCTGGCTGACANTTTCGGTGCNAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCNG ?9HDH1>F&,@A0&C%:=D;&140B)'=439&H<%C&:%(3&0?+-7#>?C:GD'5G,)AE AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23T9G25A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8879 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 312 42 96M = 199 -209 ATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCA <;"FE8-62;<#2,<3'9'-=E$$3,E*38G=4:=4-@=1BAC9F8!23+<%"8:/)453#.4C;A&CF=@,H!C-/0*33%G#37#)."5?8:1> AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:91G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8880 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36020 24 34M1D306M = 36361 457 NTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAANCACNTCAAAGGGTGACGGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCANATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTNGCGGAAAAGGAGATAGCAAATNCTTACGATAACATAAGGAATTATTACGATGTAAACACCAGGCACGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATNCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTANAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCNCTTCAG ')"(+$**'))%&+*+(#&#+)'+!*'&)!*+$%##$""+$%(%*"*!#&&#'($''+#(*#+""!'"'$%'($*(%#&$!)%')+'(%$('($*$)+*%)&'*!((%&+''&!"$*+$#!"(""%$)#%)#+!%$*%"'$)%!$!*"*&)!++%+%+!%"(#$!**'!"$#)+%$$)&&+!+("!&&+""'+&))'+(+&$&**!!#$+%"&)#"'"#!+#(+(&(&"(&%)%)&*$'")(*%!*%)(")+!*'#%!#*$"&+%**("(#+"'%*")'))&%&'#%'!&#&(#(%*!#+!(#($(*'&$$+&($*+))(!#!'!(##""#)"%$+&+"& AS:i:-88 XN:i:0 XM:i:42 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:43 MD:Z:0A4C0A0T0A0C1C1C0T1A0T1T0T0G1C0C0A1T0C0G0G1G1^G0T2T0G0C0T0T0C0C2T0T0A44T63G21G11G14T16T35C25A47T6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8880 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36361 24 116M = 36020 -457 CTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATTATGTTCTGTTAAAATATCTCNGGCCTCTTCTTTTGCCCGCATGCTAATGTCTGAA E&:@FG*&G94/D;;H"%9")%C.500/E>)30(5=0!"(A!>.4%#.:3C%>C$+31'<0=:=7G6-&53>/=7=/6;?+$=#:?6H.9:=8#797+6C@BD11,,H3(,F@8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8882 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39771 42 117M = 39619 -269 AACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATNCGCGTAGCCCGTCGGCAGAATCGACCATTNCTGCCATCA -G7"#4*@&%@=CE9A($2!<&.+743?7@4!095H%4;A>,805B?'1>7D/%H25,=16'+#8"D-C5E.9E(/158(GD1F+-H<0#924*-0DC,#0/#72A77G(&7HA>;F*/8&9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G115 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8883 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11844 42 79M = 11703 -220 GATTACAACAGGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAGCAGTGCCNCGNGNTGG (+%+"+)%&)!)"''&"((!$$$&##!"%$*+%$!(&!'&""$$$&+&%"#)(!#+"$&+&)#)('&!'#''%#)#%** AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:10C51A4C1A0G2T1A0A2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8884 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20104 42 217M = 20321 311 CACGCGCCGCCANCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCNCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGACAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGGCTCCAC ;4-1-E4;'".?4A=G#-=H/>*33EBHD9).#E:(@A(**8DD<-+)5%>!&4,1!>>/##@G,*(G/3+:7.#*(3H#6/(4F3:"'!)09F,8";*BC2:D(76##+61?/6#<6%$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12G94G56T45C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8884 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20321 42 94M = 20104 -311 CGCGGCCACGAAAGCGTCAGAGGCCGCCACTTCAGCACGAGATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGAACGCATCATCA :<;-G789<67!;*BHGG%3&D!..**2+>-?=.BG9*!D.$.1.96#'%<3BF?F=F!/%45/769)77/B349&D(/0,,G?C-4H47")FH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8885 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24087 42 90M = 24213 284 ATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGT 1!+65%8#?F39(3B+F@?EB>''B&6+A22C71C)0%%B=<2*>E>F*/%3B),A827.@G=1.=-8$933;686)&4%E0'&))5/*7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:90 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8885 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24213 42 158M = 24087 -284 GATAGTGCGGGNGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGT 8:<956&2"E=F#0?)&7<8(/?+HA*3(7C44-*5$9$D94?C*F:#94>>?'E)5(87/3($731B"1E,@;%F>-2/4G33F92).6,!-@"BH3%38:$0#G9B176>8@@:A*0/#>%+419=>&-E,?4D89.G.$0@'EH"5CC5((,0EA AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T94G51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8886 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39867 42 80M = 39749 -198 AATCGACCATTTCNGCCATCACCCGGGCACTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTGCCAAA :'(78F,*7)94A&0%$FDHH>)*#3/?+=->/#HA:B.."@2?:&B"$F2HH6804B,#2H,&/FA)'CG(4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T15G50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8886 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39749 42 84M = 39867 198 TAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACA 2CE>.F=?(!67/'>>6'&7?-8%52/#B$.26%A%-A3/H8$/>.9;8)=A1544D'?%HH4@F#@DH.E?)BB>-5.2&"&?B!)7< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A87 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8887 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37724 42 50M = 37584 -190 TAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCANTGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCN #&#((+)&"$"&*"#*(#$)"*((#&&%)'(*+$+(%()("$'+'!*#$+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A24A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8888 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28927 42 178M = 28796 -309 TCAACCTTTACNGCTGATTCGNGGAACAGATACTCTCTTCCAACCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATNGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACATACAG %!&)%+&$()%#")%'""!$*+*!)"!!)$!&+!&**($'$&()#(!")('(")%#$(#$""))+)()&%'$"+#(+(($"+#"'&!%)(&'&+$+"&"!+!$)&))&%$$*'+'(*!+$!'+##&"'()*#'%*)'!&*(#*!''+!+&'*'+#'(%$)$%!#!!(''$"&+)!*#$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:11C9T20T41C88C0G2A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8888 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28796 42 131M = 28927 309 NGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTNTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCNCATGACTTCGCCTTTTTCCCATTTCTGATCCNCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAG !&*)+)*)++"+('(%%%%'&&&!&")!+$)*%+$*"%&$%"'(!(#''""$('#'"("+!""#(!!)('(*+)!%"$+(+(&++%!"$)'*%#'%$+)%"('#'&"++*#+"($('%+)##%#*#''+(# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T28T34T14C16T34 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8889 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6657 42 45M = 6462 -240 AAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTG =C?/F3*AE'&0G)&1@>*2$!?2G3DE!'HEC=.*?'!>A8;E1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8889 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6462 42 136M = 6657 240 CGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGG 4>G*,1-/!0)=>&&?!B!61:G:74D8?;!"D6B&&C,82000E/1D)$..)/%G38:-$E8;:2/3181&5#3.&4/59<=H9AFBC.)#72/&&$;<%7<44;(F;":=,&,#2.,2@=E29:G!0!C8B(D/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8890 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26306 42 52M = 26047 -311 GAGAAAAAANATTCATTGTTTTATGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCAT -A:'4,:66.89-0H*-C2797.2/3A)E6'H0.A,1-1,)@!B?&)6#>7? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T12C29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8890 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26047 42 160M = 26306 311 TTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATANATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCT 7(DEF(/:45H+=7*D.FG#;%$CC*,=E3$D*5*;6HC$39',20=/(%-H*7":$#;)**6C(@"A'36++)**3AC;A0#G#A@";6C/'/@&/29.*!)"-==;@?)-/?5)8&*,(##CC&='@3BB:!.D3.2D%E>:*%#3G:5E2#CF41>3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46A113 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8891 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22874 42 79M = 23026 236 GTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGANCCATAGCTCTGATAT 4E*<=)+(/+:2#4<.07*:%(!!B@C7#0++$'05E/@-28."/6:):D.(.=&*9@A.,5FE=-'/0" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63G15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8891 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23026 42 84M = 22874 -236 TGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATNGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCC B1G$%A(9A=D;8@?;>?;9?&2(DD5=,646HBE>7;D/AG',(#;"6<&F"9+"&'D%3:E!)A50+.$.-.93.=./F64;!HB!0H&+?1(6*=;*B$3F(*)3.)//507!%?0C5(37$D<*75H.E5<%,0H')H-?#0G7#8*$E3A;6:#13$7=#>$+:(4H$)A%@,230A/E(%+#64A:2$5>6ADH1@#2AH89#G%G>"AA9*#/D@<@?&8:(A;D>E7G!CE#%@@8+HFA%B2G9 AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:84C15G49^CAGG31 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8894 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28882 42 110M = 28779 -213 TTTCTGATCCTCTTCAAAANGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATAT -#C>A63"54*9/D%:;'($##;5A*3%@,=;@*7?='B=HE02$<@"+%""'.;6F>-E-FD-B@>6?*)""<#6?=%14G%))(57B>=.2C3/A30"8@$3$@$,%H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G90 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8894 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28779 42 53M = 28882 213 AACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTNTCTTAT F;?1CGF@E,50?05E#4F/50;A$G1')>%$$5&0C(2)4A(8H866!49%) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8895 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5000 42 105M = 5000 0 CACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGNAACAGGGTGTGGAAANCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAACCCCTACAGCCATCTTCCGGAT A,3FEBC>3E./@6?5%HC29<)E.2;2G!!#"/D2@!G&('FA6-9*;9*>5(?+44,#0>##/14BD*+12>0>;4A=9*E(G+2#461 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A15T61 YT:Z:UP jpayne@0: r8895 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5000 0 * = 5000 0 ANACNGNATCNANNGTNGCNAGANCAACCTGNACGNACAGGCCGGTATATGCCGACACCTTCT %!$$!&'#"$$"#$%)#"(!'*&'+$$)($$!&*('()(&'%%)"%$+%"$)%+$(*))(("# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8896 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4427 42 103M = 4354 -176 GAGCTGCGTAANCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGNGCTTGCAGGCCAGC 5!:&.:G78A>=7FH>;4G,C.62>:/#*.459(AB;"C,(.6()6A$B+G)F.!:(HD@+2<#3!E66("@*F/;<2;92'E!>,6%&*A6?/@!B3#7=AE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T76C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8896 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4354 42 46M = 4427 176 CCGCCTGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAAT BA6*G980//,.&9C.@G&H-:.5>(=1+=;A>7&'05/5,3H&C> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8897 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47680 42 99M = 47781 193 NAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTACATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACANAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCT +#)!%+!)&%+*'!"')!*&'!)&"+")#("*)*%)"&$#+!$"'#()")$#'')%))%##%"*((($"!(&'**)!(&$(+"'#"*!$"'*!%$)'() AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A28G26A42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8897 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47781 42 92M = 47680 -193 TTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGNAAGCA @%F<4(=F03%F!)$-/F-GHB(FF=$?40BFG#.=AAH<(GF5*!-=$!B>>=H>-$A1)10#897F"3@!B9.&?/(+/:GGA AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8898 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31781 42 115M = 31971 252 TGTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGTTAACTTCCGGAGCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGC B=F;-=;G%*-H3$E#&+'!/(F:.D>9?4:6@20)5(0'/*9'1>797.5;B$&8-+8<:3@D9=&(56;$%'&1-B9H2C)<,A)6*=0$@-C9('FD=+( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3G58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8899 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23754 42 46M = 23930 319 AATCTGGTTTTTGTTTNTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCG .H<=*)/4:$1&8E"F3HF>)!29&$;434<(1;DD.$@;2?=$)# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8899 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23930 42 143M = 23754 -319 TTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTNCTTAACTGTCAATGTAATACAANTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATANTAAATTAGTTACACAGGAAATTT $')+*"&!+"+#%'#$+*'*%')%'(+++#!'(#'(''""++)$&("+!)'%"*($**&)'+'"+"!$%)%(#""(''*)&*++"+$'*$%"*)')!('(#+'#)$**&&!(+#*%##")$&#!&&$$")*")(+#+&&()++ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55G22G40G23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8900 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30735 42 110M2D125M = 30972 281 TTAACATGCCGATTGCNAGGCTTAAANGAGTCGGTGTGAANCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCNTCGACGTTTTTATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCACACAGAATATGA 7-#)7%5'%&!EG;)6G(0EH+&5?4;!1=)2,-*0F!'D=;<@6FA(@/:3>G&@0&3-HCB;6%>477D""-6=&**F8E?!G%2-H!FA$CDE;)+%F44802'%C#&C@//9#@03">*2GF-G1C:#2-"$AA:#.9!?21?"2=32,3H" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:16C9T13T53A15^GG125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8900 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30972 42 44M = 30735 -281 AGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGT ($?8@,3%545D,/.CB5%%+F3A45;%B7,E=%4FE$4%1')B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8901 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8910 42 119M = 8497 -532 CAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGAC @%6A,7C-(2!B+$A&E37'>G>4EH@B'55(<*B9*%918&--7E76$;-%6#*D)C6.E#;-A;0&>'*/?90H$2HC#H@8(?=H49!%E4&8B:6-?*<>A@G&'0H2=B3<2'> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:116T0G0A0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8901 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8497 42 413M = 8910 532 TTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAANCATACTNAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCNTGACACCGGCGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCNGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCNGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTT 3!2F7#$D:!%@")G&@7!2*>-6"C??1=0;@,H52'3!F4#8D=0<1>%+*E(93A&6?C.G>.4@4:B9"C#/AE5<4!55,B'4"/9F'7=$/(@2+"/G$H4:H.,)%(<$"";+&H1(#.6)/G3:)429B69'53D+.0/>*.'=$H3G<0+17!!*$>24,!H$('=894%@;H,-E69A(7C%C=)/@%;GG'8F=3:"A9E3-C8H?G'%(&E,&(56?%*:H'+G2&1!C&@D;=+?=#6HG*21.$3C4H#8>9"023E<.CH"14#@)"2FB;*>%20)B AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:60A6G36A9G59C59G178 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41934 40 28M4I21M = 41765 -218 TCGGGAGGGAAGCTGCATGATGNGACGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAA -0%56B+D678)44HC(-4(FCHE#&.*<%:;0.(?5B>*2=205E;%9=86@ AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:22C2T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8902 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41765 40 72M = 41934 218 CCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGNTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTAT %)5/4+H:<=5!,=6%!BC5;1H0385.>/3A1>$*-;?)!1E7992?+>F)D226#;G?*(%';%/)@F'" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33C38 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8903 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31769 42 40M = 31600 -209 TCGTTCTCGTACTGTTTNCCCCAGGCCAGTGCTTTAGCGT +&!(&!*&!!%'+*+#$*&*")"''$#*!!%%$&%'$#+% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8903 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31600 42 102M = 31769 209 CCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGANAGCAGGCGGTACGCATACTTTC A'*<3)!F.-H.6!749B;2H>(7HF1'940.5+=+%D86#*#=FA&36A+H@<1-3D)2?&9)==D@D$"0E;!GF@! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79G22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8904 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4135 42 149M = 4135 0 AGTTTAANGGNAGNCGGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTNGATAGNCTCCGGTCGTATNNCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCCGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGG )$''&%"!*(!*)**%+*$#"()*'%+&(*$(*#)*+'#*+"!)*+$%'*'&+$+!(*'("%++&)%$$""+($#)"$"%$!&)"')("*#$)'%"(+*($%**&+%)!#++'#')($%*"##&*(!+**"!!$&''(!)$+"%"$%&+ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:5T0C0A2A2C1C24G5G12G0G50G37 YT:Z:UP jpayne@0: r8904 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4135 0 * = 4135 0 CANNAGCGNNGCNCNTCGCNNANNCCCTNNGNNNGNNNNNNTANNACGNNANNCNGNACGNTNCNACCATTCNNGNANNNNNNNGNCTANANTTNGCNNATTNNTNNCA $"!#"!#$""#$""!"!!$!##!"$$##!!"!!##!!"""#$"!###"!$!""!$!""$$"$!####""$##!"$!"$!""!#$!!#!"#""#"!#"""$##!""!""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8905 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9775 42 196M = 9694 -277 CCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGNCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACNGGAAGTTTACTGTGGTAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCNGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCANTGAATGNAGCCNNNAANNAGANTGAGNAGTA $'*(#+%%###&"*')$!$+%"+)(&!(&!#%#+&+#%&'*!#'(!'!%#&)&$)'&""))+"'%%*$)'**!%)&+($"&&+$*(#*##(%!%(!+!(&"'&"++)'"(!+&"(')'"+$+"(")#'))')"*!(+!+&'+(&'%*%&+"%(&*+!+(+)%(#!$%"*(%!%$&)##%#**%$(*!%&*)"'&!$ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:24C43C15A41T36C0A6A4G0T0T2A0C3T4C2G1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8905 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9694 42 81M = 9775 277 ACTCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCNTTTGAACATATCGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAG @//&.?-/%$84:!$?0>)95/1(2;.!.$2&/>@!F4%;9(E;@=!363!#,C67'0=0"?:H*5DF+ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A35A10A32 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8906 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7505 42 320M = 7399 -426 GAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCNCCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTNTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAG 6*B4C:$"487A544#G?$(%G1E@'3&3)7DDC:*GEA+F##8=$>#A-:%A6H76$C=52A<=$<1.D&@8?A7G6@AA*ED3-%:0B-33B'F>;(4E-C"-+4&F130,)?B>A!H9H9"87:G;B9*E)+DD26"*F853&A+6H;&!H'6#9+$8DA03%7DD4.B;5%*8-=246;:"''.9D7,*E5<'->0C;DAA"18C;+?#)GH-+/G6C,4>,4"$G;!)@?A?C<+,/&=F1!<-;;>.99G&++'!'+0)!B'*D5%5+3,(3-35/'0"F3&;:+)D+=A5";=40":A;7)8,A,<$9&&+EB?/;'%,/92C6(A6+DF7B='7*@B63<3>%E')6,E.:FE>/8&>?D&-8D4:E6D,#!?-*1&G"FE5C"F?< AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41T1A27A14A102 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8907 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43043 42 181M = 42854 -370 ACGTTCTCAGTAAAAACCNTTCCAGACATGCTCGTTGNAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTNTCATGGTTCGTCGCGGATGGAGTGAAAGAG F=7*@%=H0F6*;9.4,-/%BH0,'6)<8($H(+>3*2%B$&1*4:;G!C((1?,$HG:DG0F2'CAD./E?+%@C+8)'G&;(+2%BG)./.?1BE>0E:1=0E!-),>?*?=(B&F>%3%46076#E.2:B7?!CCD%2%.*(<,*4B,;$-,5)5D,-3#/G$*)=09808>>09.:D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18A18A112C9A20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8908 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43316 42 81M = 43512 240 ACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGT 0:>!/!E04!H+>H9&@/AE";(1HF69;%)@G'3DE-!#">'A9)-$"D1F.-;A")7,91+80"F5.1&>;!5!;GG-? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8908 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43512 42 44M = 43316 -240 GGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCT !0#4>2;BE&)$7H@(';6:14-A!E?&/:?/C.&;C!.G2G=4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10084 42 88M = 9799 -373 CCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGGNGAGCTGAGATTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACCC )=@<::D%/;B1H&#F10DBG;(%>+,<,H%%53E$>'E3<&"3!%)*!<98G$(8"1*-$600;'!/9%4C6&';%"3"(:1H25=) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T8T36 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9799 42 285M = 10084 373 NCCTGATGAAANGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGGANGACGCCATCAGAANCGGCGCGTTTCTGGTGGCGCTGTCCCTGTGGCATAACCANCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAAGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTNTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTNAACAGACAGAGGACG "'?5+;02-E)2F7:'=8+F6H30!9>68G3"+&6*?-9=A9>,0-%47H5569=D1?8'9'$$4+$247#020.F-@C-HG!$G?<7H,-?A8<>D/B"*$<6&''!'F;82C@#=88,F%2-7,6>3+/?@-2/HF@-(44,>'62$!AC85495G44@>81A4/7!!C'G("+1:FC+G/4H:;&E,D43DC&/$)%(E:E)*-4B,,8*H%GG$;<*:0>=F=<-D6A$>2@$@<4"D<%2F;D-#2%C)8#<1+G*.-2)):>939F",9:7$$636&BE AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0C10C49A13C19A19T53G53G45G15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8910 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41575 42 131M = 41374 -332 AGATATCCTCGCATGGTGGAAACAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGC .#>=(9.G68F@9&%2$?/1>.;A0;+B@2:D')?$315')D>0)73&6H&3.,@#@<1)"&<5&0@@17,:-AF?41#&?;$9+659<:%/A-">8=8G*/58A$5#)G6F3C./AH/89(<6@!%*E&A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G109 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8910 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41374 42 58M = 41575 332 GACGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTC !##5@<<;=;$""@8"#*$A942;=1,:$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A1A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8911 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9430 42 300M = 9360 -370 CAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGNGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTACCTGAAAACCGAAT !B"3@.7/<335,8;9="&*0@G:)-4!4-05,AH86?F0):(+6..&3A-EB#3&-"EC6:#G0G+B1E9&,-/02*D#:>=%9@6D6=C>50A!%:F<$/(/C%316=ED<0??6+:&,<=D.>-+&9=+9-):.6DB6A4;395='+G3?#'"6>.%))';H$F0<@66D$G)3/?E/#8/-2%<(!3"(;8.,5#E/@F73/'9$&0+70B24<9A17=,*#A*#+8F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:112T172T14 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8911 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9360 42 25M5D40M = 9430 370 CTCANCACCCGCACGNTGAAAGTCAGTGGCACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAA $(!)#(&''"#)*(""+%('%"*+'#$'*%!*))&+('#!!$!*(($#&!%*#&*#&'!%)"((% AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:10 MD:Z:0G1G1T10G9^CCAAT4G35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8912 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33040 42 48M = 32857 -231 CACGGGCGAGCTGCTGGTAGTGACGCGCCNAGCTCTGAGCCNCAANAC !'(+##!*$$(!!")%%(!%+"&&$*!!*%("&!"'#)!!+&"''%&) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29C11T3G2 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8912 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32857 42 183M = 33040 231 TTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGTTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCNTCTTTCTCTT @&A;!58/7B*D4/90-7B%HF23G*;/$'=!?+E,0111>:#7-(4?:33D)+HCH')&+BB7),=7)7(!AF&9/F:&@.$(94,2DA;!./)C<$65=-G+7+'7C(54=,BAC""#%H&:H4%" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:133C9C28C10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8913 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45088 42 62M = 45150 392 CAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTANCAGTAATCGACCTTTTTCNTA ??G*3H2=51,!$;=<"8E%10-:->4:G;+@)A+56(@-:9F+-F0748"$)*129))+H" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40T14A3C2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8913 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45150 42 330M = 45088 -392 ATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGNTATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCNACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTACATCGGTACTGACTCGATTGGTTCGCTTCTCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAA -..4E+*C*-H.H"H0BBC9E#C=!F)':"5!="3>D=<=7#+*B=D;=B@H!E>!<>&B,A;B@D!@:C6'/0"'/C5F.),4EH8'2D.:9F;-')".9$">10GC1G-F=>%+$-84@@*47&4F$+. AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:140A81G83A23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8914 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8325 42 177M = 8275 -227 AACCGTCGTATTCCCNGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAANCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATNCGGCGTGAACGTCTTCCG &G*'>H"7(=7C/8DG:97$!3C0#H"!2@0,'9)5!DF>-)1#AE%3)4;+A$!-A6>D';4'#/4F),(E-;H?#-C)%G-42B3;0)@3@4-1*2H$=$5:2F2#8,),,/392#F/>"?$81- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G90T51A18 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8914 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8275 42 25M1I25M = 8325 227 AGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGNCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGT 0+(G52?8>,23B-%*)&''2D=47C&7D4@!210+*A9C2#&(?@/-+:: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:27G22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8915 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38742 42 107M = 48302 9644 GCGTAATGTGGCAGATCTCGGTGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCCGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTG >!E18,D-%6&B;,3:!9"'54>/.=&B*855*)5EE2B"(CA3H04B9BF++%'9-*E8$8F25("B3,>;2+(0-BEBG"<"'.@B)10909#$0D3#11>@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A29T56 YS:i:-5 YT:Z:DP jpayne@0: r8915 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48302 42 84M = 38742 -9644 ATGAGGTTGCCCCGAATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACG 4#4==H(1!"-8C:E+A6"-)!+-8/G5+!#(8+C4<3,%B*;&9'4#0:C6:3C"AA<--(H"8,+6" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14T69 YS:i:-9 YT:Z:DP jpayne@0: r8916 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47382 42 553M = 47108 -827 TAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCANTCTGGTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGANGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATCCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTNCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATGTGAAGGATTATTCCCTGGT 2F'!"1(;+E3(%5<'G.E75@2%<291?/8/@,@9A=?;G;42:",4:;G;,;++4-H?>6$HA??@#"B;0AE3@3'G:+.!4'A3=0*&)%B!47239-!*878F4)"5'0?(,G4E:F3:9?9(AG#5+99D&/B??C!A5;$$746B.G4DF(8))E.EC-!4(0-03(=@255H&"38GDD!='H67+:#0>;%(A3#3!F96D*FH-4B(*?C7'7080!<2&(.=%H99AB2*AD@)=!74#$G&6<=6FF67@6331)77A;>-2;6E)+!A>"&5D'7CF&CFE5(9A@?BDC%G;C26BGED5;E3F$8"GH7,+A"HG=%02="+C56H.GH62F<1-=*+->29:D,;2*%E&7>)52)36#E6FH AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:132A175A91T57G52G21A19 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r8916 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47108 42 105M6D163M = 47382 827 NTANNNATCTCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTNTTAACACGGTGTTATCGTTTTCTNACACGATGTGAGTATTATCTGTGGCNAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAA "(*$#+"!$(%+!)!+!!#'#%*$"(*%$#+'$#&""%()%%+#&"#+(#+((%%"#&+"!'*#'#!*(+$*(*%'%)!$(#%&+$$)%)(*%!!"+!"(&+!&*"*$'''!%&*!+$)('#+*#"$*'##&!$'"*#+!"#))$)&#)*##!#'))!($###'#!'+)*'!&"'&**'"''#)&)!#(*%*$$)$)()++#!''$#)")+"%#"$*+#!&!(+$""$'%)+%(""+*$(##***&%$&)"&*%"'"%!$%%*&%$*# AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:15 MD:Z:0A2G0T0A2A96^CCTATC67A23A11A13T45 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8917 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7776 42 157M = 7703 -230 CGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGNTGTCATCTCNGGCTTGGACGG 9')&=E#D;/+5("8-8G(45:G*?.F(,,0.$,%')4/7B9F2)'>'5-94/0$$+.B;#%70CC'4E"D'G1/F2E*.2)@)##9-CCB2H:D$<*HG2$;,6#-6F9("4?6&C512ECD,B9:CG4%=1<$%"A!E=5+<7EE=@G";!?4+55*HG&FEG(+6H,($07+$";6GF>DHA,*!HE&:GH5D/"A25&/2E33?;%=9' *0):,GH'H2"4,#$&;6+,:D1?=&-<*:C(57$=+$AB'@)4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G223 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8919 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30397 42 168M2D134M = 30701 344 TCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGAGAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTT -C0F)C17!(F3$9"?8070$%+C<8!1!9?":,+93"7=>B(6>>@275DBD=%,6AF16F#/!.?C4!**H&=E1++@!:*9;A>?B,@A<:&@'H-0$#3E93,DH'4<>75-*0@0<<&FD@3?+%@5601-81>)#CH!?@=73(;&2+-=*F);E=57"21;66C=C7?4"7G)."$80=69+00#.%.4=7A6A.F/(1A+98D'*$-:2/?9?E)6$*6+5#35!(".F,)*E6!7AD=D<%;+#)AA'&2B,"@=-.4=.0*=B'3E AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:59C108^TG134 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8919 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30701 42 40M = 30397 -344 GCTTTTCATGTTCATTGTTCCTTAAAGTCGCCGTTTAACA 3F<,)6/?B-CC&+8:A;H@5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A22 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r8920 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31276 42 264M3I53M = 31593 387 ATACCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGANGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCNGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCAAAACTCGCCATGTACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATANTGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCANTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAAC #$D155>(*0.9324$866C12/)<9'E420D#!DF##G.2&-1=',9)0H<323/?)GA46%!$)E-7'G<9'%%*/+!!-))&-%#5C"4;&7A&*9"<#8#>6!3!D1,E;;.39'-:2:C:2'DD4G6)>6@"F>7CG,?2EA:!)*A50(H':3;4*!G$/FA!,G58#53F>&?F:25((/):EC(/#6@+<*&G%G,;!:+.DH+5486B;'0*/F$9=F<,(!-'8+%G!H47$=:*!.C42F" AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:8 MD:Z:30C81A85A51T24A41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8921 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43295 42 60M = 43404 205 CTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACANCAAAAAAGACCTGCT GF9E(6,//-9,%=C0.F%%'!)0.7()7A@'(/6)9D059;219'4-A-9!E33+A15@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T32A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43404 42 96M = 43295 -205 CTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCAC -A-9D'11654F84;!G(,B;C.-F&H*7AH'/35F(B1C94"8;.C'/>9C-2(3B-$=G%&/$,'8A,D6@>CC#9.D&D".'B>"*@<25@C,D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YT:Z:UP jpayne@0: r8922 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32451 0 * = 32451 0 CNNNGTNTATGNGCNGGGCNTNNNATNCGNCTTNNANNNCCNNTANTCNGNNNANNAGAGNGNNNNNATGNNNANCTGNNANNNNACGNNNCCNCCNNNCNNNNNNATTNTNCC !#!!##$$$$$#$#!""$##$##!!#""#$"$!"!$""#"#"#$##"""##!""$$$##!#$!!!!$$$$"$!"$###$!!!!"$$""#"!#!""#"#!"!!#$"#!!$$$"#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8923 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28919 42 83M = 29002 306 GATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGCGGAACAGNTACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCC G/@&#-0:#'38*0G>@F@E*=H>A"(DAD(0581#4F,-=176-F+4G>%37D3(DE1"9/&G:)/'F5?*<0DF&/"$<0+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29T7A45 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r8923 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29002 42 223M = 28919 -306 CGAACCCATCGACGNACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCNCAAAGTCTCCGCAATTNCACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCTGCTCTTCAATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATGCAGTGGTCGTAGCAGTCGTAGATGTNCT '#+#("%+#%!&(+'&$(+&!!'("+(&%*!#)"*##*%*)*"*!!(#&+'(&%+)*+(&()$$*+"+$!'&$&!(#$!%(%'$")++''"("#'*##&**#'+#+)%+!*!'()!"%'%%)+!'(%(+&%'*!(&!#*$*(&"")!+"'##'*"**)!&$!+%"*(!&(%'+!&))&!(&"%+"$#)#++'*'$(&&*!)"%%+*$#&%&'''&&*+%'$*' AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:14A63G16A42A1T53C19T5T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23547 42 50M1I51M = 23648 265 ACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTNGCAATGTAAGATGNAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAAT C2;A)(F8:-H7(/,,$B0<@EHB=D8B:C<7=F><.H#H,F!21B!)16B'D0::6E0F>'H(."@!@,B%+B$8B@7%<;B9% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:49T12A38 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23648 42 164M = 23547 -265 CGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCNTTTTTCATTAACATTATTGTTATACCAANNGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTTTTGCGGTTTGGAGGAAT .E#7"E49*<<#">=&D&4C(2=0>3$>.')A3=5#>&7D#A<34!1)&)62E,$5$$0F<;:,?;.A%50G1,67F,AH@F'2@)-D(,@&,8&24#H@4(0#7-7=:.7H0DBH:9G5A43,3-?'-@8/+$89=BD4+@4$*$12H55:2%<38",*,#<"6%GB6&%$;CD157;5+0>/,,32DC!EEF!B$<&!@92("-*%;B)?F$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8925 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22213 40 75M = 22043 -245 ACCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCTGNCCGTTACCGGNAAACTTAACGCCGTNATCNCGGGGCNNGGAA (')+$)*)%&++)&)!$!"$$+)##*$+"+!"'&%")&'%)*#"("&$'&&$)"!"''"(%%!'"(*(!"&'$'# AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0T29G1T10A3T2T2C0T0G2T3G1C3A0G0G4 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8926 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17079 42 51M = 16968 -162 CGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGT %"=E>&&6/+71(< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8926 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16968 42 62M = 17079 162 TATCAGCCCCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACC @D,$>2"B/1F(4E4-/>EH7<-1996&"7#0!7?#:<:A$8A($26=3$9<,-"$/A"-C3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8927 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11976 42 41M = 11561 -456 CAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAA 0G!9.;'$<"E;/?*?G/#9DE!@<>*@+:C"BH-!+.>(- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8927 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11561 42 415M = 11976 456 TCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGCCGCCNNAAAGAAGGCTGAGCAGCAGANTCAACAGGACAAAAATGCGCAGCAGCAGAGCGATACCGAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACGAACGNCTGCAGACGCCGCTGGAGAAATATACCGCCCGTCAGGAANAACTGAACAAGGCACTGAAAGACGGGAAAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCCAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGGCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTT ?6-EAF/G76*634#*;(:3*0?G(4,A'HGD8>.1F25B?)8:C#:EF"H'%;'0'F0.%!$:/?'!-?G>*'DDD5$):!-B7$,<(26*6+;-;0BA).G#*!8212@@>4@A6,E1A3&%C!2*F9$-"/3:*A=91!C#B5%<$7?7?H9'@6.&6;<;A3$F"H;'12-&1!:,F&H(<)6-1?9/*F(8G'EC>4.1&6,D0,?<+)C=#$AA5':%(B-;"@$7)@38H@==A@"@09D92.@//AB:C0'A9(;5&E8*:$':5:/";8!'D3,%@7FA AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:91C0G20C87G39G67G39T65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8928 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47431 42 91M = 47623 244 TAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGNTACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTC ,5!2H@4B0(#,"5#=1A.:<8.#;A';2E=-6?8>#+?<9D>#/=.A)=,BB#<#8FA6!&'69+?'*-B2=A,9*G(@9%@,+-F,6+D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8928 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47623 42 52M = 47431 -244 GANGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCA %?"0>,(1@C=;@D3<04G%94(%FB?B/910,<++:(@/H*B-D1&$,+FD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8929 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37330 42 43M = 37561 313 AAAAACACCTGACCGCTATCCNTGATCAGTTTCTTGAAGGTAA )B2(<G>5<6@):%$:A603)02B4-G1/-#;16'EAA$>E1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8930 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10430 42 108M = 10266 -272 TTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTAACCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGATGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGNNATC )!#$*$!')'$+()%*+($)$$*)+#&$)"$%"()*&')))+$*%&(''*&%%!)+)+$#$!)((!*%+*"*&'"&$#*"'*"++$"#)(%&$)%+*!"%$+'#!&"% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25T77G0A0G2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8930 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10266 42 59M = 10430 272 AAATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGAT (#+)"%'&'*+(($((!#&#!")*'%(($")$)&!$+%"(%)#+$+$"''*%+##'&+) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8931 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20552 40 145M7I90M = 20506 -281 GGCGGCGGGGAGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCANCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGNTAGTGCAGCTCAGCAGTGCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCA "F99+!2/H990"?.!4+39@7F&*HDH#--E-'A>)'D,G60=4"6G4..1@C&*+$B>3'#":<:/@%&/(H+8=A/%,.1E8$55#0C=7".-@#&*$7%)E*?3%3EA5F.E5="!BD,0'C6%E,&*'4>+9A+%66?=@=<=F9CE1E$?(35$*;/=,#+)"7.4(/.E#5-<%9/!0H"C(86>239H4(-*C&:EH";.@"DF0>B>A/2=!.G1(!DG90C1BFD'#/?(;C,F;H-A1"&4G-AC+F,:%"=0C20&&>-,#;6C;(69:E;GA#<1'!=H+/?)>!G'%:"5EC!0!G?,4A1@9E%36(C5F#)"#-;#+!*B(F5A-G;(9&C(0.,:>!1*-G4A?.G:*.!:F'!<(D*5@D!$E,(C1-#;(*4$:HD(895?HA+*7;$#H!==?AAD:&3F6AB/5*C:H%.-"(-=?CB2?*<'/C,4H2H9G0<=BD:11>+(24E,7:+E,*181F'?)*70-:3?0*F#D/D;D1!&2G;%@#,/91,)%B4+/EC?@1!8F62E>"4;77*86<&2GF.!E?;E/DBB0'%7G8AG;5C8C=)=E;'1$:26!A'*G".(@F<@'87+H')5"86;::6,1@9DD$1-/16B"D?+-0)46/2D@(,908 AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:29C28A2T59G61A103T59A9G2A16G71G40T164 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44146 42 101M = 43491 -756 TGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGGGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGNGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGNGATT 52E71&?)="H*-F;,G#6&<9D*!%;6$?#9%0%C7-04H$4((8$6B@/=4D/87EC8GD+:.08+>D);D!%)';7H&,;(:=A,5H"+H61B,4(A( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32T36T26A4 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r8933 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38879 8 14M2I92M = 39099 260 NAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCGAGATTACAAAGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGAATGAATATTATCAA ";EBF#6DE-!5$HG:&743<4:&9"7;H;"19-B=;1(@>!"31?.H9==9B&D.%->6&/G$0;B='=,/A?$<7;AFD:((;E@132F*5,C!'3"2.=3CGB'##8,"0>C4H79''-@?:43G8(2;:!7"> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-53 YT:Z:CP jpayne@0: r8934 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37042 42 56M = 37218 251 CAGACAGGTTTATTGAGCGCTTATCTTTCCCTTTATTTTTGCTGCGGTAAGTCGCA ;=.C#9!G544><:B7B"3C&,$E!$G3?BHA4(E##,:6F2H>5?G*.3$"-:-, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8934 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37218 42 75M = 37042 -251 CCTTGCCGATCAGCCAAACGTCTCTTCAGGCCACTGACTAGCGATATCTTTCCCCACAACGGAACAACTCTCAAN ##&%"(""#)"%"'+$*#%)*!!(')(+$"#+")'(#!#!)&+$&!+))*'!!%+!$(""+!!+#*+*$*!+$$" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A26T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8935 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28874 42 92M = 29050 257 CCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGACTCGTGGANCNGATACTCTCTT !C<7>4)B'#3G$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T69T7A1A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8935 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29050 42 81M = 28874 -257 GCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGG 05422C'"G-62D)G61-$D/"G2F6G+9ED@C252A<$9B+'?G0'/(?H#G?&?4")$)E-54!?41*-'+9G?A9+31*!%?-D-3++ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G43 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r8936 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7946 40 85M = 8110 242 CNGCTNANTNTCTCGNNGGAAAGGGGGATGTATGGCCANAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAA $%%((%$)"!#&!&$"'+"%*#()&)(*"""+&+$#!%#""*&+&&+)((%#$#((#('(&+!((")"%((&**&$"&'(*'$#& AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:1C1T1A1C0C0G2G1C0G0C0T20T46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8937 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1867 40 42M = 2000 233 CAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACCTGACCGCCGGTA H=A61/+%F()4"(G6B+(.D<-1?-&?D74)@>F)9G=G,: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8937 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2000 40 86M5I14M = 1867 -233 CCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATGTGC +>-%+H=#8)C#,804H=&D%:%",B0?4=D(D1DDG>6G";C&7(A>'9.EH52'"3",>!',5;8C)$,74#*969/"0#3!4G&+:;)-D5#=::(B680=( AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:96C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8938 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38762 42 112M = 38762 0 ATGATNGTTACGCCAGACTATCAAANATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTG .,)96C2(5F>;>B?EA.-)B49F-9@1&1#'!,7G#,=2A$?@?$9G*',3;A?8(0H,4D8E*E7220A$2@$:.$9"*0?&2<- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G19T86 YT:Z:UP jpayne@0: r8938 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38762 0 * = 38762 0 TAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATTGGTTTATT 8".A42%+0$$('8D&77DC158?0<7EDB?HGB0'>"68!65'-D=5-GB,1:FA$C7-15(6>!=7)18&78DB0D%:07F>)D9*(G/9:&@7#C2(%.9@A8D$#A?>E+#5D8H9C8C>B5D"'#;#?!0"C5<5%=)#CD.3)A8+%-), AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C23G78G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8939 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46321 42 50M = 46134 -237 TGGCAGACACCGCTGAACGGGATTATTTCACCCTCAGAGAGAGGCTGATC E(<;/&>8D4-0<562')!=#@8;!<>!D&G=$6B'1%*=E9(:'$98&612/%)*#.$B$D=2;1++!(A&A%)8GD@9&G(28A#*C#$@$0C,$,68-A?G6F,HC8H!B"&!=+&984F><@8!DBA"$+0/CC@2724)-;89?7;$2D6G"C8!H,'<< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:94T53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8940 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7993 42 42M = 7707 -328 TTGAGCNGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGG 19:#.!#G7@04A"GC'')D#B!4'395*(H@FC!'>2+&'.<=?)A,780;5($986<=E8GE?H9G/(.@C*64(<:<:'EB!4#!C.72H2#*:D1&1$#DC?;)E-E;@%0(74$4B"0F?HGF:?-F'GE=3&,++-;"6;'-/&?4!>&8./>50;46# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:52^T45T69T1G0 YT:Z:UP jpayne@0: r8941 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41121 0 * = 41121 0 CNNNNCCNGNGTTCGNGNNNNNANNCCGNNTTGTNNTNNAN !"#!!!!"$!#!$#"$$#""!##$!$"!!!!!"#$"!#$!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r8942 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35476 42 69M = 35553 304 TNTCGTNTTATCACACNCCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAA )%"&$%!!)&)$&$'&#""&+$%%%"#)&%$*(!!""%%!$+&%(*""'$$'!($(*(''*)(!(")#* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1C0G0T0T1C0G8A52 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8942 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35553 42 227M = 35476 -304 CCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATTGCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGANTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTT G"',3'H1?;F&*D?2"8*<:-4%?1*<''G+'@)5+"".D@>(-'.3/)*!GFA7->3>-!.7"=33(D9"*,(4&BC@#>0):B8&.>#4.:;>+FAE'4:2462@#$(6%"<6F6$FC*D:6.+-.777+8-DCE7(C72(1E!*=DB&"&)D=G@;##"%E204C+#:1=<8>0!#*(EB+9,0B=:+(&*1B.445A"3<'/@>H@GGH@@"7)(#:9$$;& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60G0T121G43 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43253 42 122M = 43375 452 CAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGNGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGGCCTGCTTATCTCGGTGGTCGATTTGG +F5%-?5!9*#!1>49.3;#<<1?;=+'<7').%2E2G;,7H.E;D5""&/>D/)"E2<'!='CD.),H#"@911=-2;82-8.@C(=>"%?D2:%=4/H&'1#D@E.6GH!*25.0=7'(2 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:27C25T41A17G8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43375 42 330M = 43253 -452 TTGANCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGNTGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGA /"*33C.AE7E='2D?,$?F-1!>667E&3)#!=!D&C3=376>.9E,680/1!!'9#.D,<(#>74D)/@9*7+!*<2H=&?2G)14:30(&48%5.@',%,D0-..,--"4EH%?@&G5A,?C6B9('/<-%#:%"(+@%#=(E1#/39<1/6067EE"F95,?*43>D=--3>?%C07!*,#/!-H(@D)6F,.D-*H8>82@$A(3!>!!H?,7&0>0+(31'#AC7.%02#/8G9A$(:A2?/@:0<9?HH=#?=CC;7C>9?>H,G5G4#D%H=D#!F1*&)GE*<(%7&%8:G:=-,<;C"9GB)='>2*@!/B"62A(6+G3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T81A243 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8944 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31822 42 75M = 31897 255 CACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCG 7!)#AGG6*4HA2%$@!:$=/657C#%6A+"+>@9C971A=F@,-@$<$)860E+4/8!#92+'7F?(6%3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8944 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31897 42 180M = 31822 -255 GGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCAGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCANCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCT $"+"'!$)*%'*%*+%(*)#")$*$#&$#$('**"+**#')!+(!#+()'"%&#%+%!!&*'!"&#+(+)#+$%+"%$"+(&#+*#(&))&%((#%$!*+"'!&$*#&)&&#%$%%'$)!*+)$$&$#")##+))'$#')!+#')'"#(%*+)#&'&%!%")#+$%(!!)%)*#*+(+(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44C25T109 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8945 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9400 42 197M = 9597 293 CGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTNACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACNTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATC $(+*%&*+#"&%*&"$)*%++!&%$&$#!""$"#"+)%)!%*'*!&)*#*!)'!"!"!+!")#**+)%#!"*#)!'&"$$("#+"*%""$')+%+#$+*%*%*"#+$)(+'"(''"$+$&'&+"+"+)$%%!#+!+%**+$'($&))'%#*"')&!&(###+('#%"")")$"%)#%!)"'+&"%'#(%#'(+'!#' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A38C129 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8945 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9597 42 96M = 9400 -293 ACCGTGAACGGCGTTGCTNCAGGCAAGGTCAACNTTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCCGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCANT 6&/?"E1,-B*H.&D%00!&5C,"A:;B7!/9(1)13.<;1$/B).5G9H.%8ABA3*+*2FCC+1;$$=@G7-*(4?@2D+0&#&C$7D9)9#(F5?5+=H AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T16C51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8946 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25307 42 104M = 25073 -338 GAAATTATTTNTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTATTTCATTGTACTTTACC :*#+!A-D(-6;((HHF80@61%!,G1B&@#%/>#+17'.:5'G,CE33<.)@*D'.3270F&)@">"5%9(,"+H2<$8*985G;"'@G!;6>?24#9$/@<9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10C75T17 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8947 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46545 42 112M = 46286 -371 GGGTTTCTGTNTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCNGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATTATGGGTGATGGTTTCCTNNGT "#()%&'*)'!%)&+"+%)!''"*$(!""''()$!)%!+"%*'!+((*$&!*&&(#*'%*#"(*#'"&)!(!)##*")#&&$(+"))!&'!$&)&'##++%+$$*$'+$$)& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:10T35T43G17T0T1G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8947 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46286 42 259M = 46545 371 CGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACNGCNGAACGGGATTATTTCACNCTCAGAGAGAGGCTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATNGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCT $H8/0;=3'(55;0F$.%41D5D,$$6CD#0?>@$?#-.+'G2@DD&*.>C,C-+#>99&)-A)D**-:&>#3BG-H6#,@2)DG%-E=5)*@??7$')*@(?0>55/6)!EE?F$';C42F*#B=;?/9@4(E"-)B,H63*5%HG38-(B/3> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45C2T17C87C104 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r8948 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44389 42 164M = 44553 333 CCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATAT H,!E<2-E..9.&3A+86D"3E+:F;D%0#B-?=2=,=9$--&$D)%F/$$E2?C2:<;;33=,C9B!F">$321,A06#,)F,0'13(>*0,49<>H"B'$/#G?#4B5(7<-5F+?F+2@;/".=&'>475=H-+,A&,1G//E9/:2D<.09?7?02#6A6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:164 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8948 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44553 42 169M = 44389 -333 TGANTCATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGNGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCA -(%*?0!G4;EB9@,46%#?*+99$25EA+7A;<9D'&H-G*'8H).:>A."E3@E6C?7E+'F1,1C9?6;,F@GD1"8:/0F.)0A,+&C$8A;H7/!*B#6,B>B8)',='== AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C38G4 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8949 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8915 42 111M1D31M = 8810 -248 GATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTGG A1&%)C.F1239G;A;+=97;H;1$C4>8?##!.;,!!08C(;10:@.;.07:A+B++*?3B77&";>&!" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r8951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20562 42 135M7I25M = 20463 -259 AGTGCGTCAACGGCATCCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCNTCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCANTACGTGCAAAAAATTCGGCAAAACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACA 92F52-FD7@A1&D3=667-B9"B+D*F':%-7?0?;90F5(#*+*1>+$:=@D*#F)*?)-)GAC=D21%;/7!73-3'*;>$1?93D?23G#";G6@8+#-(7!?1)63!7345:);395C&1*,/C"@000 AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:9 MD:Z:56A33A69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35232 42 207M = 35059 -380 TTTGCGATTCAGCGAGAGAATANGGAGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTCGGTGGNGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACAT A9B9-GH=C!H7">0H-A)4H<2H)&%3G91C":@%#G#@A7:$8H>?,?@@/H2E;..11D),<>0!;)623D8:@B%F8<;D;=:"G+H=#222=3'8D093>#FH*'B675,DB9C+0B/5;E.;=#B3?-&!1-"()C9),+H/D:(H3(58? AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:22G2C127T5T47 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35059 42 173M = 35232 380 CCCTTAATNTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCGTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGG &-9:B@C*)=D4.%D>4-5!F:C4G@@/HE45=%&<'/%0;,-'6*F7CE<'@'B@+8B?)'B/?@C54GD64)H77((%D9#@:=%:$-A1!':C571&+HFE9?42A)C@B:5)F7),05!&+9G:=<>&<#@0D3$5'0#$&>0/A8A<+10,:'1,?H!G)H228:%-> AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T39T40C83 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8953 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33565 42 126M = 33731 260 NNTCAAATATTCCTGATGTATCGATAGCGGCAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTA (+;@%3.<%'8<:%1"!?C#69EE:6G'/19#)C!FD2F::;H?.0'3+AE6%.%'@E'7*1@C@6@0;H8;E,.$2/*A6.6;4 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A24T3T95 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8953 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33731 42 94M = 33565 -260 CATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTCTTAATCTGGTNAAGTTTTTCCTCT @.?A53D.4%,>.@,D"1*+,$&8<%&H*=G@@'.*;1=40FH+,G)7'('"619+9?GA/.#"$4)94+6;3,!/#@/%*.$E(BG+!4G!-C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69A10G13 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8954 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2138 40 57M = 1947 -248 ACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCAACCGTCTA HF-BA9<5?!/7=?CD&(#=,+$%#<<5E(:@05/A'"@8F" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A37 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8955 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44865 42 92M = 44675 -282 GAATTAAGCNAATACCGGAAGCAGAACCGGANCACCAAATGNGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTA 99--239BA"7H8)$@=./D!%EB@1C)G/4E6)C'"AA7($B>)&*@/?:D0A1>*AAF4(2='!C7=85A3B"A126368>!(;&A5;#CB2=H<5>&:<).C56#9)=,B1,?%(3#'+H,&2;<;*>04)5'37D5-01$&?D2F6?-F.!GB(0$+(A6&'(+<.@4E)19$H$1E>:88+$G<(+/4@8#C!G8;,@7>F+63"9*;B%B=AD3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98A87 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8956 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12711 42 49M = 12448 -312 ATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGG >G-9'/E$9GG*&FE75-8.A-B<5<>;$94()C5$FF;-9.#6D73E) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8957 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18995 42 64M = 19209 257 TTTGCCGCACTTGCGGNGACAGNCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGG >&#*&*9,25F-#5';,+EA=*!F=C>E8&36'FA>>?DH';:B+ECB!F3'6'2%07;2=<1A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T5T41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8957 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19209 42 43M = 18995 -257 AAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCANTA !$(!$$!##'+*'%#&'($(*)&#*#"$%#&'*%"()(!(+() AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8958 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29727 40 4M1I113M = 29982 360 GTAAGATACTCAACNCGATGTTTGAGTTCGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCG ;8*6F!*1%"0-C8;FF<9&7(@.>?(9.B+C@37)G)%8A3+F&%+*#45#A*C&/#%#3#>1<.H8DB/'4D5?,$F0A/5?E&310,&>;=2"=E1E&!439;)"0?,&!>!9+'C8!<0:GC,84,!<@="!D2#<%D)&@49 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G106 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8959 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9001 42 25M1D280M = 8882 -425 CCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCAGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCNCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCG 6@?"2:<"/E4&.C8D,*1B5!':E*3%"4>"((*&D@'%!!?))3)9,FAF4%:E+"4/#70B?/;=@2/D,3H?=(3AC"A-E%8'98EB414>1&7)F5*A.+;>8255C(0/A"(?=0'A;@9-6$6E%0G9*)6?'$:F4#7",1!$.++=?7E>!"9H6;8.>D5(!*4%>>.+%7&3>$44@"DB69(?GCB2+6E- AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:23G1^T148A41C89 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8960 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11169 42 129M = 10947 -351 GCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGANTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAG (5G,"'?AC@&"52;&."H:6#/6+E22'H0.,*8/.5?4F'02;/5%-*G)5A>=<0%F#C=H094519H624"06B%B#";D AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:83G0C44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r8960 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10947 42 98M = 11169 351 GCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACANAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGNGGGACTGANTGCAGATCGTATGCN /581E1"/;47#%"B,'+$7GC3'9"@>B/+%F#:04F?> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8961 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14610 42 91M = 14838 300 GGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAAT $C8.%"-2:<6,%'"27"',(0F89+##=F6/@0CG38B(.#'H2F.3!")58%D3,2.(>;5$>+A>6A3>:("?=+1HBC(+H8?'>40 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C90 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8962 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15969 42 109M = 15969 0 TAAGGGCAAAACCACCTCGCAGTATCTGGCCTCGGTGGTGATGGGTAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGGACAGCANNACCGNC %(#%"%!')%!*#'$&&"!*!(&'*%!(&&"*&$+'!$!"''*!++!'"%''$%#'!!)++(*%'!%*'(()($*&*%))$%$&($"&#+!)*''&+&#*$+!*&%"!# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:101C0C2A1A1 YT:Z:UP jpayne@0: r8962 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15969 0 * = 15969 0 TAAACCGGAAAATTTTCATAAATAGCGAAAACCCGCGAGGTCGCCGCCCATCCGTCTGAAGTCCGCCTGCTGGTTCAGATACAACGTAACG #.;5#?%7B8779.-@:<.8<6G&=G,F87-;%@0G1G%>)H4C7H+4.FE3E9!?B#+C";,=>".6/%!/EFE95+&1/F;3/'>:"#7 YT:Z:UP jpayne@0: r8963 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38391 40 92M = 38212 -271 TACGAATCGAGAGTGCGTTGCTTAACAAAATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGAAGATCAGC '$283,""#E'E;E/H?:*95=E=.',=@G10+"(9,D"1!,A4%'#4'G9E=(7)62'6E;%2C&=7C()$2(4'D;555#916 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83C8 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r8963 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38212 40 32M5I14M = 38391 271 TTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCAACCCCGCTCTTAC '/0150(-,H@63,?D-.70/+"1"F7<76'"&60140=:-:8/+2=/8C# AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7594 42 184M = 7505 -273 GCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCG G-$DD1'+#/G?&$06:13DF.+2+3+-5=8F,6C8:/%0@=H;*>E!GGHA+C>CD:'<$")%?%=@+%6?7=-.4CE>D8BC(99':4D@+1:487;AH(2'HF2"'.H@,B=/,-0/()+G72D7D/G1$2,=*@%.51#:6*9/?#7(71-"C1"6?H,/+1?*,"AC>;<%;'";H.+?<*'2@-"4@B2*&,AC0#=C,A-E%05G633D?3+06AFA)C8-H*HH>EF2*G2'A/E#F1@,50?H/B2+0H*7F@3B2G*@-7%->B<("AG@B>9/@3+G2/E"A1DH9&?1,:?CB5F;<$?DBH-,61C3-'?$2194=),"37C,&4B(,&:-$E< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93A40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8966 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47827 42 94M = 47933 240 NGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGNAATTGAGGCAGCATTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAG "*2C*"80%@--A:/2A#;#%='9*-;G'0&-3!F1*E0<.@>&&%<@4!:48!&&.%7?3AG(&.!E/*,"0#38(58D,A#20*/3D%4:4# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T52C12G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35033 42 12M1D154M = 34925 -275 GTAACTAGATNAAGGAATCGATTTTCNCTTAATGTTCTGGCGTCCACTGCATGTGATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACNTTGAAGGTTGCTTTCAATCGGTTTGTGGTATTCAGCCAGCAATGNNNGGTCTNTC &'&##%$&&"'!%!"*#++%'+)&)%(+##*"&*"!'&!)*&+*%$#)&!$+$("&&))((")+#+'!)&$#!'*#+!#'++!*$*(&'*+#$!!#)!"*"$$#"!!+#+'%(*)!$%")#*"#)$#()++(%++!$)%$%+('&*$**###)*'+!!'(#$$$!* AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:13 MD:Z:10A1^G14C6T20T55G3C15T21C2T0A0A5A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8967 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34925 42 108M = 35033 275 ATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAA /+39+0&E'?:',@B!!2=&"=$@+))4.;,"H3D#47>0B=*3/D(B9ED+'/5A0.?@30'1:56B"")6(8$@B2%@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r8968 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26352 42 186M = 26287 -251 TTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGA 7/$+=4C:>H(!.$;'+B2'?4A,>'('9)!)!4HHB%;#6@C7%6+$&D,F$,*<+&9,("E:D&3GF5(,@5%"8="F;#((HA28$*!&'''(%754) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:186 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8968 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26287 42 65M = 26352 251 ANNAANTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCA (!*&)#+!'*%%'$%$#*'"(#(##*#$%)&"$"))+#(*&!"+&#+!'''+')$$&''"!("+& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0A0T2G59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8969 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21714 42 346M = 22060 696 GCACACAGGGTACTGCTTNTTTATCGAAAACGNACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCNTGAGTGCCNGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAANCACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGACTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGAC %%)(&+$$*&+$'%#*%'%(!&*$&""'"#&%!#&'''$!*%$#(++&&)%#$*$&())&##'"((&%&'(&!+(*+)!)+&())+"(+*$'%#%$"!''&*&'"!*&*!!&%$$+##*')!*##'+#"*'#*'*&#'"#"'%"&$&%($*"$*$#'#&')+$%**%(%#""$"'$&!*"$#%(*&%$!%*%(#+%*')+'#+#!%**#%!*#%%+%#"##))***((%+'+)%"#&+)%(+(+$$#&+$&$)$&"$('"'&*&()&&"'&)"+&#'&!$&+#$*($(&'+*+%!''#&"!!!#)'!&%$#(&&#$!!('&$&'%&(*!(%$'+!+'(+#($)(#' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:12T5A13G41G8G129A61G70 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r8969 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22060 42 350M = 21714 -696 GCATATATTCCGCCTCATACCNGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATNGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCGTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCNGTCCGTTACCGGAANATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGNAACGGCACAGNNTGGGTGNAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCNGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATNTNGCGNC "&%!"""&"&&!$"($"#(&(%(*+"##)*++&&$)!$'""&$('+"+"#"#&#"##)'%*#+")*))++*+"$!&)"#!%%*()**#%*#"&%&%)$%"#"%$"$&%%+%$#(%)$!!"%!&!*)($%&'#('*"!(!""+$+##+('#*!+*$*$(((+'*&+"%##'((*%%*+%($"&*"*+%$**')#**(&$)")'!!*&))!%(%*'+'!"*"(+#+"'&%))*&'+%!%))$('&!+$&!%+%*'%&+)+!)'""$*$)(%$++!"%$+$('")$"'"*&$&+)*+)#$+"&+'"*''&('("##"+")%#)$&%$)(##!&#'&+!%!$#$%+!)"&&*"* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:21G25T104T30G14A40G10C0C6A27G55A1T3C1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8970 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33432 42 71M = 33318 -185 GCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCNTGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTCGA 4+@5"F285,"./"137&/(E!67F!%?1:89531;B"+=3,9;3(H94'C/0$B@B,B6+"27."%86(8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8970 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33318 42 80M = 33432 185 GTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGT (.B0@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8971 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9904 42 222M = 10196 332 GGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGANGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGAATGAGCAGGAAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGAAAGTGTTCGACGG &?A->+<+F>)&)<"EH,+!&C+FC,-'.(9DG,-<$+162='D'))86/F!&76;64-,*&/:)3/,%D-'2*DH'1:'*0#92DC,%A6F4+/71+$'-?$/#:5E8H<1?)(6A4,#E=#8/#;F:*GH@/CBF1F+$A=..CG'5&6B@F0=E3=9C07(E.4)+D:E@'2' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T29T164 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8971 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10196 42 40M = 9904 -332 ATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACA E>9B6)6EH+9+/F!2G82!:G.!5D%*!%8:8(0F&,'&'+"A*.3F9%7G*)#/-;;D?FB39(BFH;83$&$GE-&/,?/55>%0<;:+=@EF#E(1(04*H+:>2&*'C7(D2).!BGFH37?H?:;%*)5$"1:)&G,FE?4,&(6%&B./B>E,DB7"?'=;A<0:35&,+8GH;DA',)'0)!7'&>EGC*5!&!!6HDG/C64H,//6+G83F! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:166C45G2G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8972 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14156 42 68M = 14237 297 TCTGGCGCACGCCCGGCGANGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGG *6EC7>34(5.45DC)8?>-D;!G778D,%DE2:-3"891AEE,&&G&)F,+0>+;4A-6,$0A#CEH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8973 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22814 42 58M = 22619 -253 TAACTATTTTCCATGAAATACATTTTTGATTATTATTTGAANCAATTCCAATTACCTG F;@%-<%?08D:"+"6;(6#4@5@/8(1546$871+$&"F4GD8F6/B3"C##E<(3E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T16 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8973 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22619 42 87M = 22814 253 CTGNAAAGCTGAGTATTGGTTTATTTGGCGATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGAAGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTA #*(!%'(+#$'%&#$$!$%(+(#"#'(%%($("*"!+&!$)%"(("'+%&+$!)##'"*$#)#(#&')%(*"&&)"#++(+*)"+(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T2T83 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8974 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24628 42 62M = 24433 -257 ACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTT 5>1B..:8?8*)';"0<0)4&5DB$+>*:#G).>2GD,1;'*;76*;6&:88)7F35%78)F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8974 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24433 42 51M = 24628 257 AAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTC C*%64=#=1D8BC,',F7&(!7AE&=@:A-%,E)E?B:,)"H):*'9(F>< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8975 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14409 42 390M = 14369 -430 GGCTGGTCTGCCGGGGGACGATTCATAAATTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGNCGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGGCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCTGGAGGCGACGNGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCANCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGTTCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGTCANANGGCNGTGAGGCACNCACNCNNCNT $$"*$#)))#*#%&")%%("&#$)!&(+#%*+&*&#&(&&&*($($'"&'###%!%)(&+$"""'(#")$*!!&'"$''#'%()&*&#$"%+"&#&$#!(%')**')#&'%$&'!)*!!'%#+#&*(*&%'(%$%(!''&&$(*!'#'#)*$&'(#*$#*#&$!(%#&#+&')'&#$%%&++%(#('#'#&"&'#"&((%*!*))*()')"+&'##)&$$#(+#(#$'(&)%#+'"&!%*&+(")''$$!$"+('!+!!(('!&&&""##%((!)")(%**(%')"!&)+(&!&%')$+&("'$!*'))")#'#((%'#+$#$)'&$#(#""&*!+!'&#"))*%)!&&$)'$+%!)*%++*("*#$$(!'!%(")#*&&'#$!*($(#* AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:17 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:17 MD:Z:28G48A53C71G23G132A2A1T3A1C2C4A3T1C0C0T0C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8975 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14369 42 40M = 14409 430 GCNGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGT #(*$"&+!#*##!)&((+$%&"*('"!(")*'(&'$'%*! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C37 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r8976 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2837 42 138M = 2701 -274 TGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGTGGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATG (00>G%06.01+B@!,"-H.$CA?5;%,??/F0$2&5*7#F4:@D--'94<2$/$GC$!%$C35G/*+1;F&.2'&;.*!G!#BE,$3!62==(F?7H+28(2!F.7@%!D?(4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8976 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2701 42 114M = 2837 274 GGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAGACCGGCATGACACAGCGACGCAG &H(.'.';#<<%AEH&E$B@%(>+1%);*8+03&"-510(4$*4E:E9"%<$68G.-#/7;&.6A:<>+/5#93:@$ECC;(+0G4B9@A143/@$B$,&'B6%A,9@<)3F(, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:114 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8977 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28296 42 121M = 28505 252 GGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATCTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTNTGATTTGGCTGCNCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAG 271(1.@3C2E<>22.G6D;-<)()47B3"?FC.(6,D'$//1<'"60D7($=,+(3'/-5%8,B*%<&*67@..-7;)5"36B7-A4&B+/6*'+.&#@2>.G-6&/&5B63258:6)-)C$'FAC!ABG!BG"+>2(@!C4@C+>45>-"'H2A39#8?B9H;'G+;17A(3?@(=(;G=G"*51)%A)HB+*>.H?,+>#*%EG-6"4"F,.H4A,%=3?/43.*.@-0*-%;$:D&%$G1=)*!3*&E#>C(?#2-95H='DF67%),H.!14:11E9"?&5*+,=25AB@A35E663:/8&%"E=".!?F@'!E&8A45/&.1'*C0%H3D(>B)GBA/%E.=EG$4+<:(3C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:253 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r8978 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44503 42 107M = 44610 360 NNATTATCAGCATGATTGCCACCGATGGCAACATCTTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTT &!)++#&$&##!'"(!#)!*'$)&%((%*(!%#'(%)"+$"!+!!%$"'#$(%#)+'&*")&*'+$%!#(!(#)%'"*%(*+$+++$&"&((+&)*'(!&)+#)!(" AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A0C0G3G15G11A72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8979 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27766 42 110M = 27925 247 NNANNTTGTTGCAACGAACAGGTNNCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATNTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGACGCCATGGTG !$"!&*%&$+))!#&+&)()!)"*)$''$'$)("(!#+')("$#*$&"'%(&$**&&))$*)*(')(%("+'(&'%&*(!$(*&#'($'"))!)'*"+#&&+('#+%")! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0T0C1A0T18C0A30T44T9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8979 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27925 42 88M = 27766 -247 TCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGCAANTCGGGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCNGATGCTTTTCGTGTGCG 9;08G6!@B&=-AEF=%*70E>#:.8>F@/032(5F0'G#'08=BB;"+7*/FH*/<.6/H)9F%--0F$(4!7E81/6%1G.4"/"@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:31C3T34T13C3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8980 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27601 42 289M = 27509 -381 CCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAGAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCC 6F(BD;?+C-/@)<0"D$028424(H@$FG2D&0<1C.*:64/C@)"F9G>8-"6@%(F'7DH&87;1D(FH$;";C144(;.DA"6&A56+FBE,C.?64/G74%HGA/=*#%B!D0&>B5#/0A==$AC&+$+3EG?-3D?!&1)#$%1-@26,:D8-3>;FG5=H!%>+%9,,91->=.")!H5!"+1?(/A3:-CAG*.1;3009&A(C AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:151A37A99 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8980 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27509 42 92M = 27601 381 CTTNTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATA (>@>:"=+732>;.@&7;124,>=E*%6.F# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C88 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8981 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18162 42 219M = 18083 -298 CACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAACCGCCGATGTTTGTGNCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAA 0)0C?G'!)A.:(8.F;+"H8A+F1-"0"@<#+1B='5'1/45<+BE(<7'F>=BF--8%A8)B'"*9=*8BD9,#8-!E.B@@)<;#D5D*B.=40)>3C:<0C"%3B'H5(6'*$E@%DH$.G1./$H:3&236C!!"$;H:@<8+89'-$A7%;)*!C+:53??/.+0G//&87"#7$@20"BFA).-(9<522&:<0/D1!6E)C5,,"$EE9> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T31 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8982 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24891 42 163M = 25054 654 NTGTCGATATATGGATGAATAGCTTGCTGTACCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGNACGATGGAACTAAATTAATAGGCATCACCGNAAATTCAGGATAATGTGCAATAGTAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCT )088,=)!$C74$"<$.,$B,!)(F(;2!#!1*)3?<;(?H/@8.B04H)&(&*45&:%!>>>;/*>:,%@7>#2%+(3D"38%/'A134C;;:<5:-<):!0(HB!-E>H*6D:(AC.*8C@+2H9H5??(/@0E*4?#283<6')!897A#EB*74H9DD?8(:)H42<&@C$3<3F#HE#B'C-A=>&>6:H+)>./2B!&E5'4=>;.!>"59D0EHEC.0CG?&!FD"3;!"".&D:&-)8%:"E>!"G?F8<<9!%'G55&C6=(E(3=1/C89)0'.,&&=.AH0,(>D#.51@)14%+4?<1@0G0F>4''2#8=-2=#F-:'=595G5/".0?1=@E8< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8984 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6649 42 115M = 6571 -193 AGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTC A?&GA4?D7#99#G"2H?(H%.AC9!G%<0%+H7D19)$B.A;?9AB"/'961'A6/;';H4'HFG>5(;,0D:=1%;CD/@D6F??+)3F!%#?##E&F:($?3*E+-AG6;EE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:115 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8985 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12717 40 98M4D47M = 12561 -305 CCCGCTGCGGCGAAATTCCATTTTGNAACCGGAGAATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTNACCGAGGTTAGTTTGTCTTANGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGNT "+!!$"+&&('((!""*(!&#!*%!("!%""$!#('$%(+#$!*%#!%!!&$)#'+)&*()*(!%)!)#'+''%%"&+!!&"$"')$&'%$*("$!+'*('"*!&&+$'%+#!#%)))""""$!(#*'&"')&%)$"+(%$!#$) AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:12 MD:Z:0G24C8G43C4T3G10^CACG1A43A1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8985 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12561 40 74M = 12717 305 GAGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGCT ,?!%+G"5#(96!%H->+2FB>9.!31$CAH:=GAD&:@H*4,$7%:3C;:8A@-#.6/$A://0HHC!90"$:(+7-F%BAG,<0C:$3#B2<8E"@8'@.(2..H9!&;C:<> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43T35G18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8986 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29362 42 130M = 29492 228 GTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATCTGTCTTCA .*1>4.H/,&2C7"<4F8AAH%B<#+7(36)63A@;4.E/*=HD/(H;<3,6=7=GHB;.1#0)HFC9;!E,;C0D<=8*@'(;?3&+A>3C4)=0#F0=:.DA%6D&6(>DH$/D-!1+6(G.))&$57 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:121T8 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8987 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27121 42 66M = 26847 -340 TATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCANTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATA ?$%8-'=A/=&G"2H==#";=3#$37H*))$1=;*(#A$$A;@?&'@F*1=1'/!?H-D302>73;,5;E8:H/+H5#/<3>( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8988 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29955 42 127M = 29763 -319 CATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCNAGGTCACCACTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGG :#"B.1.#7/D4=9587*&FA9!'#"&&F:"%#:BH=1'64BF17"3)-E.0836!*?5$,*=GF";B%5#AD4B91<903-7:5"E89=#?AE0"?<(),(,G=2%E!=83>&!2C9#>D,BE AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G47C9G68 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r8988 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29763 42 166M = 29955 319 TCTGACACTACAGACTCTGNCCTCGCTGTGAAAACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTCTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACC ?C/9;03;EC5<.HA4G'+HF4H,F;5D=8)D/D,($."(<1-6!B5#8?;,1+",+8!#*:9&>:(35B66A/>'EB547C74G$/0D6BG93!F;*%7/,2D&H?@4!55$)66"@;),GD-53.AFC-5C+:?%5.6%%#"7.%1+&8DC4G"0C.(G2?$C' AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:19G1A10G36T58G37 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r8989 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42560 42 59M = 42367 -252 AGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCNGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAAC 2$@640&5;A-AG36)C!A6GHH1E=-9:+!E4G*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A31 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r8989 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42367 42 178M = 42560 252 GTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACN 3)H%#H9D1"6:,;<%)<+"?=B)%;)?HCGGC19*'5?'(GB<5!32D+*'FG"H;"'.'%?#FB3">19D<.2;-0>(G=B.?=H&9-H04"1#1$/1$36C5D=C.1/2H!3C$5CE2.=G>9G81+;@>;+-5#6-?;/-*<-*4;H%2CB""21>>=))4G@=!81?!==1#+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72A104T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8990 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35764 40 101M = 35865 216 CAAGTGGNTATGTGNTNNTTGNGCGATCGTGAGGCANAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGTAAACA %)""$$%$('("'*!)#"$!'&(+$$&)!)$$'+&!$&#(&$*()"++*!&%%''('&())'')!+(!('*))!&$)'*(#&+%"*#%&"*)&))'+"""& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:3T3T6T1T0T0G0G1G14A58A5 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r8990 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35865 40 115M = 35764 -216 AGGATGCATGTATGAATGAACGATGCAGANGCAATGCNGATGGCGATAGTGCGTATCATGTAGCCGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCNGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGNC 5F5+F:;G::H"F/9>2EA5$% AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:9A19G7C13G39C21C0T0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r8991 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25972 42 331M = 25739 -564 CTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGAANAGTTTTCATNACTACTTAGTTTTTTGNTAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCTGAAATGTATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATNTAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGCATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTT A=HA;-B?.A4679=-@0,=6'AC;9-5$$2E8,6:;-CE2!H6A@4#%9?,G,(H%@<<3%=5"E)9=C3&0/;'('G3;E.>&AD1:.H;F=((-9:)-E9?+>..9/#'>2.;.<@F&@F1>5)6C*>?A#47<5)G&*6FAF3%3)="GF*5#C7,7.B.D3D9"AC8&!&1'A1+4',)5F8#<"3>.9D!*;6D2B@9<%+,535%$',F0)%'D">$,+)9C!0?'E<.;(:+,+(+'676(H#>+&-9$$:)78(:#*6D)!@:E$*2&32G7H.121)GH8GH%@3(94+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:43A9C16A62A61A55G79 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r8991 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25739 42 233M = 25972 564 AAGTCGCTTAATGTTCGTANAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATAAAACTAATNACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTNGATATTGTCATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTNGAATCTGTGGTTCATTACGTCTTAA 6A05F&99C"/6C""0.B"5!0$!9$F=C)A-1("B<;!!*=&9C"A';>45?1@4>(%=B4$>+!@%*B+*)>?73'4F2.%@@FH.D-E$FA0!$:'@+A05.'!?*9%."'(4!%4-45E**/E>F=-/'<'60A"A(H)0,!('B$%>F'$E?@8=A@HCE,0B-FF9@3";&G'90@$23/@"=-02,G-FH:()&-16DCB3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19A58G84G43T25 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r8992 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 856 42 107M = 1002 201 GGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGNTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAA -?0&H?3E*-A5H(7+/"*+7G%E=HD48$2B=;DD;2")-;(D/G(>1&3%BE5BB:(!=&%>?2&B0$4&8**&>5;!> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8992 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1002 42 55M = 856 -201 CAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGNATGGTGATGCCGAGAACTTTATGA B5GF%$'7-ED?1H')C(?:(!)-#:F,?'/3<%$-)42!0-3&=@3C+:'D&)F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8993 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4011 42 122M = 3905 -228 GTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGCTGGCTGGNAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCT 4+%BE;>%=E:=8FB%(7>G*54;%9H5',#E9*EE2/*F>;,:>!7G7!7*=D&4#GD%;#2&H.*-03*E8*-DH<7!?86E91-3D/=5"''"3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8993 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3905 42 49M = 4011 228 CACTGCTTCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTATGAGCNGCT 6*:)2EHB*6=;=G9*C5,885;B*/2+;/4&854%8()A'3:86C+C' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7G37A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21566 42 156M = 21760 266 ACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTNTAAGGATGAANAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAG .8D,!0/ABG:63@E9,&H>>;E@F%>$->#H0B5C;=C8*(C+/0/??):;5+5/)=<;841>$!*-)F;H?#29C,:706D+-!!%EEF+%@=E61+41*<<(3G29$'"4.F*=9>(H$7*-0?D..,:>5-ECEH.1GAG1G'@" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:69T10C75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8994 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21760 42 72M = 21566 -266 CCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGNGCATACAGTTGGTATTGGTGCGNA *%&$")%*)%(##%)'%!!+'%)$&#*+#$+!))"#+++(&(&*+"$%+!**&'+'!&'*(!!$!'+*(%!$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47C22C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r8995 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7699 42 106M = 7846 255 ACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGATCCAGCCCGTCCC F9GD4&8>2:+B,;)6.*59697H!4.)'D.B4##1-?$1,1AB@9-@::<-0$:6,%F#=02,D!)BE$>=@>-%88GDE.@:2;4-&=BC-*5!,D)'5;0.8<"5EG*2,)=21#19$8>B8G18+="+;.(730+E45-0**//4F"20+;76:(5B#+-H;7'5- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51G0A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8996 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26439 42 122M = 26249 -312 CAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGA 3/$6A?"B*?$/F*<,""<704+?B.B"';#3-*,0)4),GG1:1++(1-D9.4A&29GE%322F5-F,95;/!H8A9A.86H$8CA06@068G*8C"B%F2C"&(F+33:6%,"D/5$H9G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:122 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26249 42 174M = 26439 312 ACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATA H>$6!;1*4%-D2C*>,)B,/#GC%::B("H2D%F"-F.>;,F;;5AAF1+2E(>E=+?@F+&7+2&!50?D=41D.'<1BG/G9'B+H9#C76F4D=3GD)?-,93.0;4@&1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:174 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8997 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22642 42 105M = 22487 -260 TTTGGCNATTATTATCTTCAGGAGAATAATGGANGTTCTATGACTCAATTGTTCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTTAAGACGGAACGCATGAAATAT 6*2/C?+A'-74$,E/>8BF:(41#&A4E,#G"$!06H#5)?+<7,E;&@E<&5G"5+1!2!:34'B*B@0@/)2/%##CA;<*.'.A86/4-?A3:8G3:11!B AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G26A55T15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8997 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22487 42 155M = 22642 260 TGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGANTAATCGTTTNGTGATNTGCCGCAGAAACGTTGTATGAAATAACGTTCTGCGGTTAGTTAGTATATTGTAAAGCTGAGTATTGGTTTA 5"#1,9-35A$#34"@=HG0E1/:#)+)-5HG;9:=7$24<5"DAFH0+)1=4#-48*DC!:/6<*F03G'5(?//&4E/DHD;B5/+&' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:67G9T5A71 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r8998 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4109 42 123M = 4004 -228 TGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGA 'H&$A:48$%*%4#0*,?(49!B1+.87-C!7<--55#4DB509D!F7@6F$2$A>>A,CA12/"52!G6=,EFE?:A&=4G,F@0"C#%!74$2HAD/@28,+;)%#A!A=CF09E67F0&+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r8998 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4004 42 74M = 4109 228 ACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGAAAATTCGTNGCATCCCGTCAGGCGAGCCAGATGTTTCTGTGC E#7E024(D80<1:6/?@7D5EB32:@?+?)"F3<(5(A09G&$B$0$+,:C*A$.,(G2<(HH,!(CE@:#A@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r8999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17341 42 46M = 17579 285 GTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAG 6/&19&7'4C"9A@!7E1*:*4.E*%2:4DC*?49E(1H;E:CC=@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r8999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17579 42 47M = 17341 -285 TCCGGGCGGTAAATGCGTGAGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTA D0',4DE+FE@0A'3!F?:-!:G@(#6-?5D9@*)%C%HC!!(0)2, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9000 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12293 42 80M = 12134 -239 TGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACG ,$30;E2#5@4#%F!B-<'#4.1A8(=7H>7;!67=&*8#=E<761A(=C:>@#@5C<60(>&;%8;.=;0"HD$'.*,#B.5CB!C>-H!C=(':0%E2"()&<,%,?4C,.GC&;"/#CE;1()!,9G()/H-HH52C=$CE,,C/H&7;B.E&=@?%F!6B+@40;C#"+)2<#92,#-CHA+=1>+6E$1/>.51 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C16A103 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9001 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17182 42 53M = 17371 252 GTGTTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTNCGCTGCGTGAGTATCCG %!*&-63'$;=?9::5/):/?".-GE507-$02%0+,=H@8*=H/>BG/G>*8712&&%91;)04*&#<'!>E=!4?4E:%%,>$%>'G68?4;;-!13/&8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:54A11G15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9002 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40431 42 56M = 40319 -168 AGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAG *.)9=+)8,08?1'?/)G)A-:5()+E4&94/*40979AD9ECH5E/=C?H85B4! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9003 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32939 42 107M = 33105 271 GCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTNCTGCCTCTTTCTCTTCACGGG 64!12@2&1(13"H.8B/=9FB!BA%6"B'<'4/+.<9GA-7&-5-.H:9?E26)@>#*%$/@CF<")23'7?A5<3,&.:4BB+/=F=5C@?7:D>6'2H< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61C23T21 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9003 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33105 42 105M = 32939 -271 GCGTTCATGGCTGAACTNCTGAAATAACTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATC :#<+!96+C2,=?81:?B.H9DA?"G>4C;9+G45+8%-B+<@80..B595(?!D30C*A2/5(*F'A/='<9'>+.7E?<&*DGC*B1=6/9,:<(F<-#5,6@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C8G78 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9004 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22184 42 62M = 22020 -226 ATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAANTCGGT ?A:4=G>GFD8,'0?;==B)7@E0G/*?'%"E#D<80(",A87"0('>?='-5"";&G665? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9004 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22020 42 70M = 22184 226 TNTNCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCANACCGGTCTGCCT *#$!'&+(&$%!())%"!)')$"*!&+#%)'+*&*!"&(#%"#%!%%&"+!((('()(+'#)!+'("+($ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1C1G53T12 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9005 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1517 42 42M = 1222 -337 CGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATNCGCCA ?:*:'7@5(B9+E#.!8;#6;!=7?FF.A!3H7B!:B4D&+9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23A12C5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9005 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1222 42 59M = 1517 337 CGGTGGATGTGGCGGGTTATGGTGAACTTGCTGCTTTTGATGATGATATTGAACAGGAA 5A9C;5"+06>8/:24%E527=6,":@/!F<3=66/';&=<9*;+-5'H9FF3(=E.09;@)?:1<+/*98-@9>.7F.'/1(3=5(665E(BF'0)9,3@H5$>6;2$&;-H02!,;$>7$A>++:?$$%F3&(6)5?F1!B75%G;CHH"!$:72>>8$G!C:*,$-1E$?%6#81E5#;HCA)D,&@?@=!+E%3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T104 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9009 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15134 42 99M = 15255 231 CCACCCTTNCAGNANGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCANCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGA EC;,:H12?-*H(F1=:DHE+)9@D,E-&-+=8H/59%!1$&&8#DHF03 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8G3C1T36T47 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9009 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15255 42 110M = 15134 -231 TCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGGAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATAACATGGTTGCCCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCG >7B58'+1.$B,CD/71FD,&+1)F8'CD%58C'99-7"%EG85$GBE@+&2%91(/9;%9>(3A,E*#+$4:$AD7&C037*)G=5/C$5D'(AF.G45G9;=/"=$)F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T82 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9010 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27459 42 72M = 27676 291 GTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCNCTGGAGTGCGACAGGTT 7,G=@?7C1E<@;9&$-5D<9&/+#29D8@@)3638%DE.6',?>B.C-%F*2.F'0/&/A&FA6AG.%,9139:>08/B/"$0H&/E856?5/1*$%: AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8T6T23T23G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9011 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32471 42 171M = 32375 -267 TACGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTNCAGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTANCAGGATAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGAT FH7+2=0D/":<'G7-(?D0CBH@<*DF5C0'A$$7>@><-2"*?5@E"3'BD$.4:+!$7;(5/??('A@,H2C6B9>AC4/6.#E...!+#46:0(35(;,DCA;0.4/A1H!C)1H1$4#$'16"F81#>;<.9G,A3EE@."?5G6$$/4(4DG?88*"A5CF8%H9 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:42C1T92T5A27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9011 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32375 42 96M = 32471 267 GCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGAT -@4F&8$D+E9A+#<38>(G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9012 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30012 42 196M = 30208 323 ANTGCAGTGCNTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGNCGAANAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCNTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTNCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCNCNACACGCAGTTTCCCTACTGTT %'&++'+#%$+)%#**&(('$+$(+(("+&%'%*%&)&*''")"*+%)$&##)!'(%!&'*+!(('+""'+$+!%$('!*%(#)"")%'#&#+*++'+%+'#%&('"&'+##!&)&"&'!&+$(+#'(*++$#)*)'(*$#%+"!(&"#&!&'%)()&'%#'#+$"#'*'$!&"#!)+&#%!%#(#$+)*+%!'*# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1G8T25G4C38T43T47T1A21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9012 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30208 42 127M = 30012 -323 AGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCC 2/E+FC+.D-'7$<:%3*F9.!D)/E((2EG2$=.D"

C#&>%;>G8=:1(;*8AB%@$>.!9G=FE>B3A,A;6/:(H1<: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:127 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9013 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13420 42 112M = 13563 272 GGTGAACTGATGCAGGATATCCGGNAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAAC (A7HF0=!+/7*$%6D#>05E0.<2>9&GG-0*@*#)+EBB!4H+G+3;B3&F64>>+7!E)%7<4/63&06C:6G70$)D=%?8&8/($2#%@?&0?3D7$#A0E3$(>=E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C87 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9013 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13563 42 129M = 13420 -272 AGGCGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCANGCTGACGGTTTCTAACCTGTANNNNGNGGN *%"&&)%!$'!%))%%'")!!(((!#&(%$!')$)$"!("#%()(+&*)&+#)(''*%#'+&&*#(&'#"('%+%)'%%*+!)+&$')$%"'")%$(%&)((+&*!(**$"*+**)(+(&*&!$*#"'' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:3T94C21C0G0G0T0A0T2T0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9014 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11206 42 95M = 10989 -312 AGGTCGCTGAAGCCTTCGGGAAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTNCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATT :4@1A8*?88D235.H8""AHE.2"0B&%9'F&*09$B"58,,:*?&%/%A>,625$.@=%@E)4,.>H1$G=6G0D/:EC86?0.0!)H&78>. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69T25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9014 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10989 42 94M = 11206 312 AACAAAACGCTGGTCCTTTNCGGCAATCAGGCGGGACTGACGGCANATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCAGCAGGGCTGACGT *>@F)"6,+:+-97@+E3(C7#9G0?02E5%B%E5E/BE4*D'8(H%H&) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C25G34G13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9015 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33563 42 224M = 33440 -347 TGAATCAAATATTCNTGATGTATCGATAGCGGTAATTCTTATTCCTTCGCTACCATCCGTTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGT '/F(,>@7-D<73H1,/+%E=.1@55E2C#=-*A()F1EDBH+,E:56<5DC/75"+=!+4&G(,%6=&#(:69>05%B*@0.<)&7*(783G4'*C48@.$-?1,?/3.@BF$9<#()../F*1.,!1>('*=E"!11A-53%(=(E7E?@00/3>G&1C=A%45CE:6/+>3'383.213@2)+7D0$G;!$E5@(?C!7E95>"'->"C%,0&-/?&6E/,!8+7!E4-:E.7C,=?H:DA178-;F:=/&2-,(C(!2H3>$H+D9?+@=1:DBD AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9016 77 * 0 0 * * 0 0 CATGACATCGNTGCGCGAANATGCCGGTTATCACGGCAGTG ?$4F7*%E>.9*='($D29E1$8@>;&'?@=*,%A3C)>6H YT:Z:UP jpayne@0: r9016 141 * 0 0 * * 0 0 CTCGCGGGAAAAGGCACGGGCTTCTTNCTCCCCGATGCCCAGATAGCGCCANCTTGGGCGATGACTGAGCCGGAAAAAAG ;-;*'@6?B=A,42#&D1+B$GB;'>?,04-'H$$B&!H:,HH*%!>2/A8;!)133,,'EADH/&+*2;:)B;H.5>E& YT:Z:UP jpayne@0: r9017 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18995 42 44M = 18783 -256 TTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGG D9F-78;8>H4%F06/,)HH=3%=!))&;.+@CF;+!,#?B0@4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9017 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18783 42 40M = 18995 256 GATNCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCA ##(!%%+$)"(#%&#$#&')$(#+'"!)$)!&)%)$)$+" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9018 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24611 42 47M = 24477 -181 TGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAAC "G) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9018 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24477 42 90M = 24611 181 AAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCNGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTC 8(#709#=,;9/""20"4#3E*B;-;%5?!-C202D24CF#H@:FH,"C!"-":51807=3++6>/,>)*C,-('??F@<1&'!.'E,="F?#/)0'-5/(C88H"%,/"0&G9$6A12>(=*56) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9019 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10173 42 54M = 9961 -266 ACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGANTGGCACC H#?)C%<0H=HD,4@=7/(;)?60?&F&!H@54A.*2%><.2)=5"/<<51786 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9020 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36317 42 100M = 36071 -346 TNTATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGAT 49#4>!$H0+)E.$##@,8!1)#,*0:=E,0)@$5GH#B>3;/7##<56B6%B;<4#$"!+&(*=-3/F'2:*-C)GEE?65F5(47/10$8)6@0?9'1 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A98 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9020 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36071 42 246M = 36317 346 AAACGTGAAGGCAGCAATCAGNATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGNAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATANTTACTNCTGATAATTAATCCTTAACNTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAG 2?3C:"A1(-A0C76BG)=?2-@):5,/-%*"(?;6@=G@CC5?E.73.+E/!#3-@=,3+A4&47H'<2%4-%(1>!@09G2@55+.9767AG=?#=$?*">0CC78B)6"H:F@=!(),7G0<*G;$"B"5D9CA=2!&:,H.B@CG.F;;>;B7<9,1,DG4)+5#!(7'C!-4&F@7=?9<508*G%8A=/;:H8G5-'#@8D32C$'H7-/4GG.?G&F;H&3)59H-CC0:6*$,.(H8>H2;? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9022 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21135 42 132M = 20991 -276 CCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGGCAAAAAATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCNCGTGGCCAT +H:C5<2B?6989=B0'%BE;'(;6!/358FH9"1-.?9*1G&*G$1,B>1"68-">F4D@G7C08?6,43,>/#(D?E?F28B:<;F&;266'H87->H<6B++"7+B!/H;% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:122C9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9023 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19029 42 89M = 18917 -201 GTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATNGCCGTNGTTGTCGGGCGGGGATACCGGT ''$)%$*&'')$+(('!'%%#&)&)(("'(#((*%&%*%$(+$%(%+()&'(#!#+++"&#($"!'%!&)'&"((&"'(*&++*()$+) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60T5C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9023 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18917 42 108M = 19029 201 GTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTANTNTAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGNCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCG 15/E=$$$C'#1:;A!(,@7FC$F+@<5C71)9>-'B+%B#8H,&*)(-%@(G<(A419&CB28,+FE95#A>"),=@F:!3G*G=";6#C5#)A/#(?&31H)!(BF3@?>%,#>?:D=A$C6@G"/1>(7CC%+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T9T67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9025 77 * 0 0 * * 0 0 NCCGCATTTTTAGCGGTCAGNTTTCCGTCCGGTGTCAGGGAAAAGG !+(1H;)G?,>;DD1A&B5-.6-'H-6)%D.F<8DF"4,5<'*(!C YT:Z:UP jpayne@0: r9025 141 * 0 0 * * 0 0 TGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGTAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGNCAANCGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCNGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGG $:,1=!4>D%")3G3+&0,5-)@?)41=G9F=.;#)'>,0!DC*2,?2::8'@'.6#9=-,:(;7D@98#%$30D0)GF.+#>07#(/>;:63"0="(FFF?0&+/C,:6)""2'(819B=&+*/E'++1CFA9)9>+B,B4;H+3-<,E&;1%0.%C'B*2BA$+GD#C4?FE&-%7H16#94.;E:73/9>@;1+6B7!0/H);)4="$:3+G/9'!'% YT:Z:UP jpayne@0: r9026 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13316 40 62M = 13316 0 AGGACGCCGCCATATGAGTGGCGGCAGNTAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGT ,G6"'>:./:@C9$?';:,BE<@.'>!<14,".+,'-B)2"B:964F2EEA1BH7-4=5(.E AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T10T15A34 YT:Z:UP jpayne@0: r9026 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13316 0 * = 13316 0 TAGNTNTTNCTNNCACTNNNAGNGTNNNNCANCNGCATNTNNNCNANCGNTNANGN "$#!!#$#!#"$""!"!""!""$$"!#!!!$"#$"$!!!#!#"#$$####"!$$!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9027 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20344 42 47M = 20085 -306 CCGCCACTTCAGCACGAGATGCNGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAA ,#=8.@;=C*44A,"=*:F=)#C+8"E"+*.A&!&,#DF)@>F'-+D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G24 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9027 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20085 42 141M = 20344 306 ACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACNGAAGCGGAAAAAANTGCCGCAGCCGCAGAGTCC -!840.@;57:F>@B?2#9D:&H5)FE?8-803<68E)E48C)>8*DE>5HG+8=E''4.C>C>?*!1+FG;-&/#=*7AC82G3)=>028-6'073$C!:C*;A41+B!H0F1,92BA&&(+5B&>35$B"F=81B;/#4 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C92T13G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9028 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24123 42 48M = 24123 0 GGCTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACA A:68=$/B)?#)-!.7*8G>%F+G<@49E(C)-#?.D,(E%.(@&2.3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YT:Z:UP jpayne@0: r9028 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24123 0 * = 24123 0 NAGNNGNGTTAANATTNACTGCTTAACTGNCAANGGAANTNGAGTTGTTTGATCTTTGCAATGAT "*#**(%&$"'*$%)*'((&$('(*')(%!)**#)##%'!"&''+'#!$&$+#)%#+**)*%)'$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9029 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41558 42 74M = 41689 263 TCNNANNGTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTNGGAAATACCGGAANATCT $)!&'*%#+)$("*!(($!'$&)+*'(%))&**&)%$'+''"(%"($"$!#'#(#($+**&'!**")%$%&#&* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2A0G1C0T0T47T1C11C4 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9029 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41689 42 132M = 41558 -263 AGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTNTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTA H-;8:D&G<#$1$103F0C890%!!H4'8C"FD:C7GE-#/=3B'7+9<;/44-'8,8DG?:@!,*F,>;90:H0*=G%#1G:(@G30A&(==#B/+.A">;8>2#5#;&%.HF8.(?5A6=G8D98 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T107 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9030 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26555 42 53M = 26287 -321 GAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAAT (.>G)C=&0,AE')H484)&C&617H1@-1&%.8@/7&EH"<0!&515?5<'C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9030 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26287 42 62M = 26555 321 TATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGNGATTGCACCAA )'-G2##%460!C%B5F(E4@-A*-(%A,!*C&;/+"*%0>A45,&E#<%$1+33*$7.FF, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G49T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9031 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8451 42 132M = 8338 -245 ACCACNGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGNCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTAC ,50,5*?:%0#8<034:;G,;?;8G()$,BE&/66B-1$78DEC8,.3"=.26D&*74,7&#,(&'4%3#G5*#&'A(09=9!26F4#<.;5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G38T87 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9031 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8338 42 113M = 8451 245 CCGGCGCGTTTATTCAGCAANTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTG ;;7;/7"#>9@'DD-$=>DBD1GHAH/%=>H'4.,'>3C4E(G"#H;#/"01+.<+G)/.;F:)&>!6+3&)6E>:%(;*E"E@':E?*B).@9-@".B305; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C92 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9032 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36209 42 161M = 36120 -250 AACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCNGATAATTNATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAG -1E3D<+0?*$D*-7,<2F!!%'-))"1=?0"86(.-7A,355/H:71.-."&9A7-!;8)6!.+%-?!)A<@*>@2@-.>D./D:%.('."&/6()?<56$B*,CA@D3(E**0/C(4#&@&$DH3$#%,H:,-=#8B5#GG%$*(8>$E521A359;B3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60T7A92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9032 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36120 42 43M = 36209 250 GACAATGTCGCCCCAAGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAA 41!H>(<%02;"$AA!5;#"?=E9(-0,$5C@&@'43,(<0!* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9033 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47349 42 70M = 47549 252 TAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGAT 13/H4&(4<05214G8=,!+1E66=$F'=97H/45;D"7G3@DE,>'*6D1-;=@3@F5*H!04:E5-3.%C;F9<:-'(438?<0>00>60H*/25++B# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35A15A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9034 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44602 42 67M = 44380 -289 CGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTC <*4/H#$-#6D0B92=)!,H-*C,:)F:3+9.G,5.,?655,1E8(8>%4.C9...9(%D&=6$:54 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9034 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44380 42 222M = 44602 289 GATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACANAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGNTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACCGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATN 56=AH*7@)+.+@15)/F"B('D%.-%$G@F':.@'*@0G6DG#2:1>6/.#0B:1,2,G@4?8@63!2/!8'=98,C4:':.&E#>3";-=H<""!30?*-48:(#>#F$?B1*=*65D%>.7B"(:='E/5F*31<6>)+"27>8/H4%"&;:)#&G AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:83A34G26G75T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9035 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16963 42 63M = 17074 219 GCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTC 3>*#$(:)8'0$&$E/=H03B(0B;=;94!A9$7?G+D"('1G79407C'A0,71CB.A#1H& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9035 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17074 42 108M = 16963 -219 GTTGACGGAANTGGCAATNCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTTCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAANAGAGCGAANNG *($"$&+'*++%!#*)$'+)$$"%&+#!")'(!+++)&&)"'!&%$)'+%**+)##&$$%"%)((*%!##)$'*(')%('%%"%%#+)#+(%&'&+")!()))!"!"% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:10G7C21C55T1C4T1T0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9036 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36423 42 53M = 36246 -230 TGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGCCNGA +(#$!%'!(&!((&&'%*)!+*')'$*'$#&')$!'%&$($)(""*+#"(!%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T1T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9036 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36246 42 138M = 36423 230 ATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCNATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTG !A:93@)2%-30/05H-9/:43/?)/!+-F:.=9@9C-!B/;?F"()BG/=#&=';':E3/"=>4-*07A=,1?&33+?%/#:D78(;<9>7=C!8.3@:'(41 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104C33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9037 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37678 42 122M = 37614 -186 ATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATNCATTGATGCCATNNAANAANNNNCCAAC ''+!%+%"+'))'!$&!)((**)"#$$#)"%##&(!+)!#%&#!#*"&+')&+"%$!!)$!(*('"!*"*"$)#!!"%#$%)""&'!&+((*)"&)$!""#*&(+)(!#(!)#'*!!')#$( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:93G12T0A2T2A0G0C0A5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9037 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37614 42 64M = 37678 186 ATAAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTNTAAGTGACGGCTGCATACTAANCGCTTCATAC ?(;+B&D4H)(B9A8)@6;B,)1E15?!CA6:D$;-%6;27E'$?$8?@%"!H#D-F@52*)$4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G28C21C10 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9038 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5470 42 40M = 5609 225 CGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATC G?',AF*(0>9$%'-4G1#?)+6:(>&%#B:B?1:><7%C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G27 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9038 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5609 42 86M = 5470 -225 GCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCA E#)EG)+.-,FEA322+C<2EG+7./9E26,9.F:$;47B94?@;-A4&B;G-2723:B7;2%$&(@"$'(BH(EB2<.&.&48 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9039 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8916 42 81M = 8787 -210 ATCTGACTTATGTCTTTACCTTTGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGATNGAAGNTCCNGGG "#'(*"!(((!$(%)'!"+))$(*+(+!(%%+(%&+%"+*&'*#)#+$#('$(*('!##''!')+%$*#%)**#*"&!&(* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:14A6A44G1G0A3G1G1C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9040 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18936 42 45M = 18795 -186 TTTTATTATANAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTA G.?*0&$('+H9)<)1"2&7:7G-E3;"E3B16,-63@$B' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9040 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18795 42 138M = 18936 186 CACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGNCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGG GFB,-3''=.<4>'>#=11=';D&2."?8"C5D#*H6<2E&,,18%&/;>+!)(5,/:8;E2?9%22=,:30(HA/H2HFC>2/$5:2CFE3#.('?H,!;.6"@=%/=;B+3)-B75457?95.@$HDH-(2>>@<9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:92G45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9041 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20964 42 252M = 21244 340 ANNNACGGAATACGCTGAATGAANTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGNTCCAGATTTTGCTACCACCATNACTAACGCGCTTGCGGGTAAACAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCCCGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTTGCGGAAAATGATGCCGCCAGCCTGACTGAACTGACTCAGGTTGGCAGGGATATTCTGNCAAAAAATTCCGTTGCANATGTTCTTGAATACCTTG %&(&!%$)++#))$(+*+"*%!'#!"###+%%+++'$&(&*"!&$%&(*)(%)'(+*(('"&+%#&")#%&")!&''"!&('(#+'%+%!!&(&'+#)+()$&!*&'#'("&%#%%()+)+"'"$$$%$(($+#(##'&+*"'&&%!)+&()%$""&!&')(+&'*+"(#(&")*&%)+(*!""&+)%'+!(&*%+('*&&%'%!"$&"&%)*##*)+$&)$($"+'!!'"+))""'$#()*(#%*&#&#*( AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1C0G0C2T16C21A21G63A14T68G17G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9041 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21244 42 60M = 20964 -340 AGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGG 9)B:D7"=#,41/)$$HB2B%&."B0!4+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12G47C7C13G53 YT:Z:UP jpayne@0: r9042 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10876 0 * = 10876 0 NNANNNNNNNTCNNCGTNNCNNNTTGNCNCNNNNCGGAGTTNNCNCNNCGCTNNNGNACNANNTGGNNTCGTTAAACNNCANAGNNNTGTNNANATCCNCGNTGNNGAGGGTNTNNANNGNNTAGCNNGGCNNCCNNGNNNCNNNG !!!!$!$#!"!"!$!$$!!"$!!"!$!#$!$"$#$$#!"!!!"#$"!$!$$$###!"##"!!"$$$!!$"$$"##$$!#!$$#!"!#!"!#$"#!$"!#$"#$$!!""#$"$!!""$"!"!!"!#!!!$"$!"#!$!#"!"$!"$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9043 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15089 42 160M = 15249 256 TCCTGGGGGCTGCCGCCATTNCCGGATCATTCTTTACCGCCGNAGCCACCCTTGCAGCNTGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGC :"?:D,6A$2;<1>A<6@:6&1A44.30/1F)7'5>.4<&D?',:E@"96.(@,$(;B)F76GGC-C>D#+%+7A3/?(..8#51;C*F03*8C%EH!A).D/,*8(%!0';7!2F/&;5,;$93:8GF6-+H:D! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6T88T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9044 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26314 42 127M = 26474 250 NTATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAGGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCA $73"(<.B#2"7=CD$-F<"=<#?842*#/-/3*4E-"$3A%+9/;!1-$(B)5.8$2;D>?*/:=@4@9-%&%8"C80(&7/:(-@E2'.-E#=+8'EC.A#$=4"6?CC!*&/=8(931"B'9)H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A83A42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9044 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26474 42 90M = 26314 -250 CTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCNGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAANNTCTGCANGNGTT &$%%'%"*"*&+)+("+#()&$*&*("%*('*((&!"**!"$&"*!%&&#!&'""$!)#*!'%&#$+%)$#!(*+)#&')*#")((!%%# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:29T46T0T4A1A1A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9045 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40646 40 89M3I83M4D44M = 40646 0 GAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTATGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGT FF9%32+#),+4@*3H?3HFC+-1-+#?#10..D";E,H(D>B!0=B1?."9&2F%CB6("H+46!9?1@@;=;E.G$=$*1=!AF'>CB6EE;@G"618?07DBED<$>A.914GE6@*<38!)!B83>/"07#FDA#,(E/((G<:A60)+?G0%)3,2@0-#E-#-:>=F<5H;=+6 YT:Z:UP jpayne@0: r9046 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18355 42 291M = 18646 345 TCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAANTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATATACGGTACNCTGAGGGCGGAAAAAATTGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGANCGCNGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCANTGTGGTCTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGNTGGCCAGATANTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACT "@3&6"$,%-=<5)@4?+6+2!:/F1&7*H602!=B.8(@)7/:(=:E%H'B!8C*,65,7C(F9AB8#-*.06.#%%#@9!?A;.>F:GG=7?5'2-G=A@#;7E?B#105("?1;:5=2&>?D#D4C;-.:#E?19+;D,=$4H)G@%:-/:9!/?9E/7$<=C5EH;:3D*B$0<$/(>!(@F>7>0EA7BB25CH<'9F8B42'9$8@'1?D(A#%*8D<>H.D(,+*# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9048 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1331 42 50M = 1559 320 AAAGTCCATCCNTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATCG C-E76/1"-<9.9F183941F?,54D3=;CC;(!7ABD$A2#<9=$6@"(1F91'G-4(69E3,@-=,-B3C=1H+D"44 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9049 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47446 42 88M = 47576 206 GAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCCTTGC ?*',0:9CF:43-*7B$)&"BC&C***1<8*(H0)%!:2G-2#E(($FD4#/E+.D1#C:!?#1)&6113C(<&HC(E"**5#.<#'+-')E(8!9*#%,F2A#*11.!813BHA3)4/6)%634GF$05"":.9('FH9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9050 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28343 42 73M = 28579 290 AAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCA #F5->./B+"E15)02-5D6G?.B%A3">$(>G"4:A<9B+D'7#A7:HA=AB"G8A"2-?#B<'%E)2D64F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9050 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28579 42 54M = 28343 -290 TCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTT 7!0!7E!='8&>.*/DF"%EB?8%<*,7;##>>84 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9051 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39731 42 106M = 39536 -301 TTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTT 3>0#,2,.49&@7E>5?9#9/0$075=E@0:?/=80+05.8%559?)>H(2,B6H(2"$?<"9/"@:$G?H?,C?'4@8)-;+82C52*:."!G>20.A7$/E9#= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9051 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39536 42 74M = 39731 301 CAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGNGGATCTATGAAAAACATCGTCGCACAGATGGTTA ,=?350*(+/53;,.,+4=+!E.F$09'?C*&E7,'E?A48-#)A74B:$,&$)(;=FC#+$!-(.C+9?A,9>(1.689,-A,)?-897#!?"F*#HB'")4?2(&;!&;+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A71T3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9053 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32583 42 116M = 32922 390 CACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGNCAANGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCAT 2D3H+(.;1;B$6*B,B,*-38";!4.!##10,=B'<<2>F$&7'!A,%6=''A(>>3:5&#C%4!A!"+-A@>'/F$>H-?#/)+*&?0C.<'-F27(!7H?4!29F-FA-E%,H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76G3C35 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9053 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32922 42 51M = 32583 -390 CGGGTANTGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCAT :>3%,@!.&EB,/F2<>1%83&1F::0E+(!3.43F+4G3=#"@@FAF@2D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9054 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41247 42 91M = 41096 -242 ATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGNACCAAAGGATATTCAGAC #;<><=#3?-?$)>8'*<0-(9'6.)!49)07*)D-$1")?,F8.EBE&8;-'=32/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32A17 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9055 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9078 40 87M = 8923 -242 NTTAAAGANCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCNGACGANGTNGNNACT %'$##!&&"$"+%)*(%!$()%)*&$%*)%&+$'*(%&(+*%"*%+#%&%)(((+"''++$"!!%$#(+*$+))#!%"#$&$!!$$" AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:0G7C62A3T0G0G0A0C0T1C0G2C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9056 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15617 42 63M = 15745 261 CGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGNGGGGAATA 35,?25&>1)<,%%(A(75)?9<3D3*1F<&';5F@9(GD*=,2@9)."4E6*F!=%!!>C19 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A8 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9056 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15745 42 133M = 15617 -261 NTTGAATCCTCCGGNTCCGAGACGGTGCTGGGTTCGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCN F1B49=D@1>&)G#?@?$AA5>$(1<+$4<=)(+0:?1(A))22 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T13C18A98A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9057 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43595 42 56M = 43749 206 AATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATC 9"C4:G+:!C#A%<49=C$.02=>01.2801#4<2A-D44#!/D-;!0>-=+%CG$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9057 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43749 42 52M = 43595 -206 ATCNAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAAACCAC .,#!9#$B,+!CH/4@%?-<8GEG--1'$*-/%6*)@?(E357-.6#E'!A< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9058 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28283 42 50M = 28333 308 TCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATT 7FF!B.B5F,9=1!626*A< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9058 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28333 42 258M = 28283 -308 CGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATATGGCCTTCAGCTNTTGCCTCTCGGAATGCATCGCCCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCNTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTA :@&3<."&44H+G2@5A+:+C&+F"83%AD"9*:.FA@%!/A0DH026E%"+E>9F9*%B@5/$2.=>:4+56,6)4($-F(GB&;6(%'B0G7<-;@34,?1DD#34-F'$F"A1C0-0;&=AC:5&1EG,2)ED8E)!!'+-4H>2")6<2!/B:05*:A>27'A4;;"<';;>H!:0)H2:>E8B.@A=BB':BB1/A9%!0<7F'*)%7!7FE?2, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G15G58G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9059 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46078 42 120M = 46198 219 ACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGNGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGCTGATGCTAAAGCTG 0BCCH'H2+.82%'1G&H;32@,"*-.:@5+8%@G-082);73F2&/-7#9E"$')>G&=G6")925G<378'-9-C9F2%*7@7+/,0'*AE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9061 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43498 42 129M = 43259 -368 ACNGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACGACAAANAAATTCTGGCTGAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTAAGCAAAGATAAAAAAT -=>F?@?G=A3DH.@3G8)3E<'.*6"$/E;7/>D!5:&,A*$?9.783+<=(&;9"3(')857;4('$E.GEGHHA&>5)H,!37%A6C85*@&+*'"H62@)>)?$$521*$5-B1.57HF%F<<*# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T47G11A49G16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9062 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41932 24 37M1D4M = 42078 210 CTTCGGGAGGGAANCTGTATGATGCGATGTTANCTATCGGT "=8*+H;'6?/%7>$(=*'=*$'<)#*FE@#*),)5DF/<* AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:13G3C14T1G0G1^G4 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9062 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42078 24 64M = 41932 -210 AAAGTAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAAT :&+FFF9>41A>'@?'3#4.)3*GE+8%04095)E!,D:(A'5=4/#=3!GFA(@#%1G.CD8; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4G59 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9063 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23290 42 93M = 23383 274 TAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGNCAAGA $#$(+'$"%%'**$%+()$$**%$&*()'*+"!%)(&!"&#%()+%#($&)"%)"*&$%*#&)&*%$(&&+&%*$%)#)'+)!&+'$()')*# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72T14C5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9063 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23383 42 181M = 23290 -274 GAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATATATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTNTACCAATGTTTAACATAN <8$(?F8>/""!(6A4C.=:1=>@524/D,;A!*:D!"+$=8*=*C3;==6>"1:HH#EA#E4%HH?;6>GC8.5F#;>3D:58)GAH(.'.6"<)E);G3>;5B?.%).>%9H$A$";2!(422F"1?"+8C:.$73C,G;;)3-'70B<:=F?E;@/";&79%H8.%#/C9>)"%.5G$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:105G56A17C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9064 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17012 40 98M = 16827 -283 GGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTT 5-F17G%F4&+<)C($)>;%F1&5./)2D/B7E'+D0"<'-4$5(-/@6';-F@"@'1?0*B:288D(&5A#4/#>)D&=.#DGBGFA%.823*"D=/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r9064 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16827 40 31M8D114M = 17012 283 GGNGCAGGTACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGAGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCCANGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGACTNTGCCGGTATCAGCACCGG 0,B!;',!=020/'*>8C5>,%0$04)@'?C>'&>**@1C2.5D9#+F+"2>31<8H5$!A*G7@.>E'7C=8!&H+*(%;D!9;4?H,+.4"),$G@=%7"A-G#A12:>:;.,@G*4+)6=/A=AD:&">0=)6!2"6"A!%B@F=*'.G!0=A4,65-!=:0)3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17G29A68 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9066 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9579 42 132M = 9433 -278 GTAAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGNGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCG 9!(0*B,1-D-#1?4*14'?"C(G3F!&?*(;H2$=46!%AB%B0$=786"@);;905*>HH8,C!FB7!5$;A568@#$F7+"GH+>&F(8+-$?F:1/0<0!G+>/5*"GA0?!%F:./8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C71T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9066 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9433 42 92M = 9579 278 CGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTA C0=6G/))'6D2!="CEEH%2"&HDH09">":G4#/'AH=;E3F7'0%*A>H2+4$"*3*G!(AH6#@+80=F7)0!+E1@8'7::"6/;(2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9067 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15235 42 55M = 15030 -260 CTGGCACCGAAAGCCAGAACTCCCCGTATACAGACAACGGATAACGGTAAGCAGA B7?08CA-*&&4/B;$G+*7/@;%,7D5;$.&DD>)=A=+'2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9067 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15030 42 205M = 15235 260 TGTANTTTGTANTNTTCNCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGNGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTNTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCGCAGATG )&(**#%"*%$%#)+*"%(&##$!#!%"##)"&*%((+($*+'*$)%)!+%''+#+$+(%")(*!"(+!!**+*$&&!)"+"("#!)%$'+%&*"#)%()%*(&+#*!&&!#"*$+$+&*+'$(&"#)+#!%%&'!*"*)'(#'#'&(*"+$("#(!*&&$$"'!*('*&!)&'(*()&&'$#+!("('!+**)&+*#$%)$'&! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:4A2C0A2T1G3C105G35G45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9068 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18097 42 115M = 17797 -415 GTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGNCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACNNAGCNCCTTTCTNGTANCCGTCNATCGTATGG +($#&$)'%**"''$$&#+!(()+!'%!$)"+((&'**+)!&)&(')"!*$$)$++%''*"$))&(!#'+$($%'$&(+#+"#$"$"!$%(*()'*'&%&&&*!&#(&!'')'") AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:37T44T0G3C0A0G5G2T0G3C1A7C1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9068 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17797 42 300M = 18097 415 TATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCATCTCGGCAAGGAGCTGCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGATGAGTGGAATGCCATGTGGGCT 4E1(%.B;--6EB)C7%H*1=.H4&+,%B@=$1%/59"?D'%-5#0./:,>&1&'-7HF9;9-7F,;#G@'#"$8&,4H/A1@&74$-/(G%":/('3:E'6+AG=DG&%=%D>=-G-*E**,$C;>47*';1(F(-HH693)3E*-HC9(C"8&9>C3E1*3>:2=?#?8?DB'0?@HA@905(08>/:A./:;$F3=+87.2=770@,50/#*HB>?053&:/B?B;H:.E/EED!)*E>=%B*'76%2A59::&%6:%-;A6G<2%+C/;!,"G&+!!91H.(H$>6A=A: $.3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:279A20 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9069 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15610 42 67M = 15753 284 GAAGGTCCGGTGCATGGCTTAAANAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGA +$$(!'$%#)"++&#*)##&'*"*++(#"(#)#!(*%%"()#&+!")))*(+('%$'"&'"(&"*'( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G10A43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9069 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15753 42 141M = 15610 -284 CTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGTCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAG D*E>(H7..B$<53G(.0@"6EE=F'.71+'&1G//-5+),9?AF47@$D<4$H%-&=41(H-$C,.86<)<:&H95@97H@6;2FC%H4C1)%&%E03!9)))*=!7?+D&8B<:G@.F%'!-9)FA$8'.2'&45:'2DG!8%B7B@?;&3BA<%!%.16(G+@A4!B!+=,$5"57C@D@:C"4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9072 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40898 40 202M = 40785 -315 TGTTCCTNACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGAATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTTTTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACNAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTN GF(<6.B-D;9E:9BA<97489$08D/5")D*E-%/1,F.>8G=@C=/?G72.D6209/*><),"#<'&?>$:>+7A7C2%>,<-+88)5<>#&4'@+E>B7**;G1A?2;/'#1D$6GC&78,&G.H7'*37+-:5/,89H29#=E9.C,5H*%9"+41/(/(#8@?'GF<C'.E6:>D,C!+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:7A46G26A51G67T0 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9072 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40785 40 33M4D14M = 40898 315 NANCCANCGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGT "(!$$)%!*)#$)'++#%#*#++)!)!)(*!*)'%!$!!$$)!+)"' AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:9 MD:Z:0A1G1T1T0G25^CAGG14 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9073 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5828 42 41M = 6014 255 TTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGA 9(C0A<=6B9E>A/7*(13!C<)497"AC4"1BC1E4!1)2=+3*!8G.1?@B!B;;?:3E,7.(64%'.<:!"&A2E?&6&@=&3>-D.6::,'@9(F6-,%D@?>5>:=0D6-465E4%?+9(;$@$.6472/>;="H6024-44)"8H1%9+)6?62@GB6'/ADA$(G6%%(4>4:8A AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:16C73G2T14 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9077 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32373 42 105M = 32373 0 ATGCGACTGCCACGGCCCNGTGATTTCNCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTC ;@-7;+E,=@@E25646+C'#@1'7.F<:$$&,/B8#@59(G/#AG7&#%>4(!D10=3$5G5H'',.(?$/G<,0/H=1<8?EE4H16*?6=@%173$<4F8G? AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18C8T77 YT:Z:UP jpayne@0: r9077 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32373 0 * = 32373 0 CANTCAATNCANNNNTNANCCGTGGACGAAAGAAAATTACGCCTTTCCTGATA #""!%*!&!*''%'((%#$*+%+"(##(''"#$(+'&'+""%'%(+$&'#')) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9078 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24474 42 188M = 24474 0 GATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCNCTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCNATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATA 5<<&H&1BG#EB*"&24&C9FA)$1=;<%@>A*)!;/1>,#">:@7,7F+/30F(5'/;(!?EB:/>B;'*<(A2;.'9+&H+#"-,/:G64!./E<#D909:$14:5492/9!831CG9=?,FE;H52:*C!7G"H/"2+33C8H*!"HD;!7CG/(?F5/!@E5.A,/D)?,$3@19CFG=H,E:# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73A69A44 YT:Z:UP jpayne@0: r9078 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24474 0 * = 24474 0 NAAANACNNTGNTCTACANNTNGNNGNNGTANANNCNNTNGTCNANGTNTCGCGANGGNCNGNGGGCTAGCNCNTNNGNNAAGTGNNNNGATANANNNANNTNNNNANNAAAGNNTACACGACG $#"$!$#$!!$"$"#!$$#$$#!"$!"$!"##!!""!!!##"!"#$!$!$#!$$!#!"$!""#"""#"$""!#"$$!""""""###!##!#$#"$""!!!""$!"!$$###!#"$!!!$$$#"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9079 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12860 40 13M2D154M = 12750 -279 GCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGNCAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTGAGCAGAATAACCAGGTGGTGATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGNCGGTGTATGACATG /-51H3@7904D%!5=!5*:/2=+A4C/G*>E7$$#@H5"+%-,3@F6)5;H3>=.75??2B$3B?2(#6&>",=A(:$:$ AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:13^TA41A42T54G14 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9079 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12750 40 65M4D41M = 12860 279 GGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCG 8G2H>78<8##("6<0:=,"=2$9>"*H!39%5G1:5%D3,FE=3$=<*7-9>6)%4-!ADB&,+.5$*C$*.F1/E'G9)H@/281A21C.#?G%&*?0793#(- AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:45C19^CACG41 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9080 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25912 42 46M = 25508 -450 ATAAAACAATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGT =?%*C*?%=(FB!G;B-E:0.*,")<#;D>HFA.E+BH@+?"##'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9080 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25508 42 404M = 25912 450 GAATCAACGGACAGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAAAATTTGTCANTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTANGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTCTTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACCATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGCAGAGAGCAAAGGTGGATGCAGATGAACCTCTGGTTCATCGAATNAAACTAATGACTTTTCGCCAACGACATCTACTAATCTTGTGATAGTAAATAANACAATTGCATATCCAGAGCTCATTCGAACCAGATATTTCTGGATATTGTC 1B#5.-'A$@@2$%@@=A"H#2>(@-6!F0HA@?*=D:?F%&'$(H)8?$,-GA!&G2C='+H75-EA4#GBECAGB%+C"@0?=/B.*A6;0E*/F<:DA>3&'D-!<4AE1&;1><'A>11""!,.=89D(B"2:0'F&*3#H,7$>"-<=66*4BH.5>;9?B,A7G@E61D1):#@+404$/9"5+5-C)*5!!'#:8GH-9(F%32DF5+%A:>9=1:76-$;$$"85/D)85;G."A'<,=G;306$!B("+GAB(:D8$07G+EE>*.B>'+>$#>"4*>487#8-%1=3=H09B*%72C-=C)04=H>',,/2H1>";@F=7*B7()-'#/>0(2<37*@,5,B2,&5E8"%"*;A5)?"02?67(""/>*?7-;7D>0";,=3)=%A2A,72H>> AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:12T23G9C35A217A52A10G17G21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9081 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26460 24 45M = 26584 240 TGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTG C3G&*'>)7*:=48$BH+@%HA?#(3#'?8@;1.>-C69>)4&-$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r9081 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26584 24 103M3I13M = 26460 -240 GTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGANTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAAACCATCGCTTAATTTGTCACCGACATGGACTG =:BF8:C!,!2!"/+F?9&B%%H27GE"B*)=";GBH8'F#6;A1D!;B*=8>&C)G?>22"'A>A>68:=!;D8G@+:1$));>1FG7HC8;693@4>0/+'1;-EA.6"9/FBC#'5 AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:10 MD:Z:37T66T2G2T0A2A0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9082 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16130 42 159M = 16056 -233 AACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGANN E)9>C,<$9<:$%(*-(!;67$./($"<'%!)=!G/%>(03=-;-.D%;3GH24>@*<(;.5/<1635F>BF??-.%4AA@=H:;>5;:8137A*7%(@EE25G+5(+?)+>"/?$G3<1>E=D*1'75#D<*A<$6%A.5(=7H8D(%>9B"" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:157C0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9082 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16056 42 74M = 16130 233 GACGCCGGACNGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGA 0@)70081(0$%%F3+D7,)CF/+/>-3+$2E9!%/GE7FA<9B1;'@6C1HH(E=?/7()6B;'A(B;A,H#' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9083 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41147 42 26M1D74M = 41039 -209 AAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGA !))*"%+')#+%)*+)()"*$)&)'$%+$$'")$*&++#&&**&)$++)$+($(#+!"))%#'((+#!%"(*&+%$'*)*'#%+(!($*+!#%"$)'"+! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:26^T74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9084 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12795 23 20M4D54M2D38M = 12795 0 TACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCGGGCAGCATGG >9G>'-)./3'-.4B.&3D,$H!".8)6;*(G0;B+6EB$!59=D?/B15.83"6F#(8?4?H*-33C.B7.)/57881"!1(E<&&=95<2(7-.E-6D:%D-#7@7HA7> AS:i:-32 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:7 MD:Z:0C19^CACG54^TA38 YT:Z:UP jpayne@0: r9084 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12795 0 * = 12795 0 TNCANNCCGNNTTNCCNANNNTNCNNNNNNGNNTNNNGCNNGNANNTNAGGAGANTNNGCCANAATACCGTNTNACNNATTGGANTTGAGNNGNGNNNNNNGNNCCGNNTNTGAACGANGCNGNATTCAGNGCAGCCGTNCAANTCTGGTNNTCNTNACNANNGATGNNAGNCNGNAANNGNNTNNNNNANNNNNANNTNCGANCNANCGGNTTNNNNCTGACNN ##$##!#$$!!"$$$"!#$"#$!#!!$$"!$!"$!#"!"$"#!"#"#"$###$$$"!$$""$!!$!!#"$"!"#"!!!""$$##"#$$##$!#$$$!$!#!!$#$"#""!"!#$#!!!!$#"#$$$$$"$!"$#"#"!""$#!!$$"$!#!$#!""#"$"##!$!#"##$$$###!#$#!$"!$$!$!##""$!###!#"!!!$#"!!!""!#"$$"#$!#!!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9085 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4345 42 88M = 4495 285 GGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGCTGCGACAATCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTG F!6($'+-!-3($8AG:E=%C#G6(/:6G,:8$@846-7-C:((&@G07F')3B>@582(.C*.3:0G3.B-8%A"!6771?0-'10(*(&)D89#5)>HB'4-:+464?5>;0+27+4FC*6-=?2)A)A=A'$H/F/%F86EA-3-,"*D,>8$.".E#/!:F'E&?&69%7(7+?;/<7DEH3:9F#6H4.!#=GF AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T91A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9086 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32205 42 192M = 32087 -310 CATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGNATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGAAGGCCNGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTNAT 6A2C&&B7HC.D*D(>$%>14;@9(-"7F%FAFEH2CE@.6!7?6(%-D(C5*9;")%"#&F,1/'=1&;'::28>HE/*+&.*F:+49;;1>=#/#DH.0#"#4'6C=$,'C:AB#((F<#F%5%ED6EHC6A>@,E6%DAD29F5<8%+/D$<(?H"FB?7(9,$=$;DB'GF)B,C8%1$;"DE'4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:107T10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9087 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39341 42 108M = 39148 -301 GGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGAAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGNATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACG 2AB'@E7..AH5"?:0=(-7"CF60D):536!)A?G''2GA'-E%;>D)*!15H%=853815;$(;H>@4%*<2F"#G&%:3:G;B,G:43$*+C85+4!728?@$.: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43T34C29 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9087 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39148 42 27M3I153M = 39341 301 AGAAAAGATTATTCGTCNGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCAGAAAACGACCTTTCTGTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAGAAGACCTGACCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAA )H14B:$"H=GG4&>6"#<4'5$G"/357H;).=?#=3#/2?:F&+<@7/4B(&H&D;C482#)<51G8G&7G&1&B%?<049;!CA9,3B=A8&HG+?H19E)6?"=$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:17A162 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9088 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 779 42 42M2I105M = 644 -282 CAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTNCATCCGTGAGGT %8="4!*5.@69)&'6)@0'57B=+@4!C5(FA+?48*&GG*>1B34?&59#(@H*B48-'F++<1%92;!A!/2>=9H9..)B-A9946B8?6%2><3A2C"-%"'H(+"=&7F!10E10"!>*@CB%7,CC;25.6;19)37*#(A9 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:134A12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9088 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 644 42 135M = 779 282 AAACGGGATATCATCAAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATANATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCGCTCACTNTT F$,7C!=$.)?HG<*3';'1=.(E2/.*@)8-2.G#1:046?5"E75;B&2-D!$&/E86;%"%HF%>0/!49*-&3C@BE"55(%8GE+";#6F(,%;14:.6(22>+.1/.7<<3#C(;&6,G#$=D#!:':- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:74T34G22G2 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9089 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42799 42 54M = 42853 227 CACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCA 91.=2'%)&-D$('@2;F,83:@BE))HG9$<@?"E/$.%C2=83"(6B+?"'+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9089 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42853 42 173M = 42799 -227 ACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATNAAGGCAGAGTACNAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGC 0D@'B5(>*86"+*;7&27!F*"/F7*C?%;(;D5-6AFE:#<9#)=#1&4*G'E%<<8.&%9HFB;:B34$$BGE3,#/>!.14<9>B*H"/'"HG;'A5D>2-??=4!!B%%:6;2D'?$:G75>*?+);2=70'EB/-5=?B&&46H&4H:8E*-9B%)5-9B?!!HG78 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:130C12C29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9090 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41623 42 58M = 41763 191 GGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTT C4;B31A,D3%):#F!4EB<8'-2C*G@H9>G.3!>>?"$+/G5!1*6&&)>44">C# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9090 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41763 42 51M = 41623 -191 CGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGA /EF-6"F>?0$='%1*43HH"4)3%7$2%*%994?C&98(&%%-3(G91D> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9091 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45337 42 45M = 45483 191 GCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTAACCTTCTCGACTTCGCCG $C=)H=:D8?$",&=6<>D6E+42H4=E)CH9%9EHD?H.F9C.? AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9091 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45483 42 45M = 45337 -191 GGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCT F72G=/#-(ED455:>4-@+0B64&3GF<7'$@96-H,,'=@*+? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9092 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8800 42 46M = 8656 -190 CCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTG $:@B==7+D.!$%0><2;0DC9<7;77)/58C7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9092 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8656 42 144M = 8800 190 TTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTC 7H%43H10'/=)3*B(9)D1?458*#5>CED7=&24!/5*5/0?F.B(.ABC2<6EA5AF?BF@9G./.:8E*DE%7!0B7G4@5C'GED92037-$5@G<:>%5#*-;E:6E)4BBF?@?A2-&B@G(.=;0)*4.!(3#1"> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9093 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9572 42 96M = 9668 336 CGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGT '9"*5,BH'&H>?=#H8<,BG.@:6E&2A80+5)()@;;EG+2A12;?"1+'H$92<.CF<77**HG7=&39)#.<-!@(2"*EF+);4C8*&.1' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9093 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9668 42 240M = 9572 -336 TGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGGTCCTGAAAACCGAATCATTGGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAANGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAACCGGAAGTTTACTGTGNAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCA *%<18GEC76!-6GE*%$+?9@.%D,C4F!;+8H4"!<+5"G?A-97A+-2F48(*1:'96-.$B.)1>)EE=$7'4*6.";-&)/>44*@>/5(8A/4$H2976B+7"3/0;535C@G>E;(!GB>AFG6986"@+4.F=0*A::9$CE031B9'<1&!/5*1-'0GE55:7AA$<*>BCF:HG+03B86#A%A)"'@--D$H+H##H@8F$,B7DH/G%H!FH?/,)-/A?EBC:)4? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46T19T75C47G49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9094 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9046 42 126M = 9172 278 TTTCAGANGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATNCAGACTGGACTGCGACCGGNCAGG AB$=/.$?"G2G."%;=5920?"-&$,A='=$%$$=@#,'7/18A=:%/F>E?0"$9<%)EG%G77D*.4+=1$%9+&7+7?F9@, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7C93G19G4 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9094 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9172 42 152M = 9046 -278 GGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCNATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGG 6.@#G7!F#H-84!4H/79EA6/.<2@+!F&2H"+&5:=A@<#/97A:#;'+&8%E@&<-))EFD!+A&!:(,D7#&$A(!'@DH3B%89=?>D8"!@6,3G(/8FH%:+@**"(9&E815DB8*!7%#/&G94$464*88?<#,=G&D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3A88G59 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9095 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33501 42 94M = 33206 -389 GNGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATNTGAATCAAATATTCCTGATGTANNGATAANGG (#!!&+*&(*$!+&($##"$*%*%(&+%(###(")++"*"'%(*$**!+%$"(*"&&+'"##"*%$*+&%%'%%"#(*(%$&+#!$*&*)%#() AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1A59C22T0C4T0C2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9095 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33206 42 295M = 33501 389 GATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCNTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGNAATGGCATATTGCATGGTGTNCTCCTTATTTATACATAACGAAAAACGCCTC -C739&?&C8)3H104)?=3!#),6B!D1(15208>F@A*$'/>#A?C568!E0&7::.).<&75/.!$%1*;=?C6.:3F!-;7$G5?"1D8G,G0#.B'!7)G9(A-(D-E&1')7/:4.&H&8,?!1C9;#7=0<5(?!@:'0;;G#*A08"7&/.:D!,@5#H@09F=8H;G,,9@&)7,:A70)@(5GC*+$3)B%12E,FC0+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57G91 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9097 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45951 42 45M = 46055 253 CGGTCAGANTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCT &AG>B9@?><9'G&D93<$#E>BA-+&&3;:)9E'$.@<.<)5G< AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A1A0G3T36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9098 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7006 42 46M = 6742 -310 CNGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAA +/+.C0=7:0E5,7@&;98/D5+3B,59G@7BG*C; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G44 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9098 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6742 42 112M = 7006 310 AAGGCTGGGCGCTGNTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGGATANCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTC 4)'9;.39&%&C@!AC,C2BDG<+%;*-;7&-AG?,".8H+=:<8%D-2$05:"")D%;BH(&3%1<'7*E;@4+"A0*8%5C-51,8=H)!&*33>F54B>37G-#B>247 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T36C30A29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9099 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8409 42 97M = 8516 237 TACCCCATTGATGTGGTGAAAATTCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAG %24=D4DF:A7!:/&==$06)1GGH%2"*9"E<./2>,4%),HB>9(&(8;8-=)>*57H*9(!:--%@$=,83++/&&B=.H"A=-3A@4(GCBF= AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23C73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9099 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8516 42 130M = 8409 -237 TGCGCTGCAGCATCNACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACNGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTG HE!1B85.3"0%B"-58941)E5B"1(<"='%<;E@E/9?9$.H=)!0+%BGF0('C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A32T82 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9100 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25292 42 45M = 25392 155 GGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCAT /4((%5?H4F4@?GD7#@*G6*&'!/:)!./-#%$,==$3EC%*2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9100 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25392 42 55M = 25292 -155 TTTTTCATTGTACTTTANCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGT 6GA6.?>44<1)H7'270&D=DGD0&F;->91A7.3%8/:2?ED-C/@DA+0&2? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9101 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24388 42 99M = 24559 267 ATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTTGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTA A$@@B,?30:,/H41$%)>):*)*>8<#3@."+82@?5DA!9B=.)>@A8.E/:F.%8/H:*"7%=4F38.#5D-/.E5: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:75C23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9101 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24559 42 96M = 24388 -267 CTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGCAGCTGCTGAAACGTTGCNCTTN ")!((**$##$%&%+%!#(%)$#+$(&*+('%"!*%')##$&+%(&%$*(*$##!#!+!%'&!'&(&'%)&+($$"('&!*'%%+('&*&"+!$$! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73T17G0G2G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9102 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19548 42 137M = 19685 322 CTGACGGATTCATCGTTGGGGTCGGTTATAAATTCTGATTAGCCAGGTAACACAGTGTTATGACAGCCCGCCGGAACCGGTGGGCTTTTTTGTGGGGTGAATATGGCAGTAAAGATTTCAGGAGTCCTGAAAGNCGG 8<-62)F)E)2."(A>&@E@'+<$32F!,)8>@B&((+(1/1%FE89*&'$3"%+;)022B0'@@)4,00D4?+&&$@-$!+&1;-$0";+D+17?F86(%,3(G*D2@40 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:133A3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9102 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19685 42 185M = 19548 -322 CACAGGAAAACCGGTACAGAACTGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGACGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCNGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGTCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGA (*($6!B.2"""D1$8&?44?D<6:$><=E6D74G.&&6565/77#&85!(08!7H7/>C@"5D/FFB>*:@-7?,D%%((D7<>D/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9104 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25111 42 77M = 25336 266 AATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCNGGTTA /1!#)<++%5F%A+%G*,<>8?-/GC?F'55"72*30A+A/+/&+E)*C;E80!&%##F''D/H89?&HF=&"9=(? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71A5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9104 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25336 42 41M = 25111 -266 TACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTC 60@*@*473>:5-8:'G$EC!EA""?/%?#*5&*77"%3/$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9105 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43802 42 46M = 43848 281 AAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGC ))+#'$%+'%$$*&"$%)!+!&$*#!$)**"&&"$+')&+!#"#!& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9105 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43848 42 235M = 43802 -281 GGAAACCTAACATTGATNCAGGTACAGGGAGAAGNCGCATGAGACTNGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGC )G9(E5%71!2+.;773!G3'4:27((-"B/G652FE;(;00@,6E3D:1)8&203(.>>&,8)/&3>#&:,3<%)%&B#F4&@1EEH(&"*+48.2!/1/D+7D788C,H)1*@8!G%4>%BA99&'(;8.9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A91 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9106 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41660 42 133M = 41565 -228 TCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTNTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCNTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGANTATGTACCGAGGAANAA '$$)#)*%&(('%)'!&#'#(+))+*()!"#!#)*$*+!+#%+$"((++'!(!*"$$(#*"(%")"(%&%('+$)%))"#!))+""))$!)#&+$"'!%!+'(&"'"(&%"*%(%)+$*$'+(#+)#++(#*) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:55T29G29T14G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9107 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44467 42 53M = 44273 -247 AGAGTCAATCGNANACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATT >8E"):B/,0?60F-09H)D=@=@H'4/08.?(?9@C51686<2'G1#*4#+6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C1G39 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9107 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44273 42 111M = 44467 247 ATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATG <;$FA+7"%C'3<)%8,72H-:B2F&*(":>19=.A(;A"6A-0">$58:C,16>E$1>F0)=30.5"1*."#0?-(-07,7;B!B4-4.?.A:#=GF!;,1.?%C;>G7; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9108 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36251 42 178M = 36429 240 NTTCCGCATAANTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATAACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCT "*@FDFE">G!EG*'-;-;@HE)H8+1.8HEF=F."2;E:924+8+D;'+C((C&.8=2#>A@,D/2F1$"?8<*)=?H';?<-/'=(H;"D5AH7)20838>!-:H.EC"25&$09:GA&%GE$C.8<*0<"@>59H6@BH8$&4$>@/-D9;=29;AHC AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A38A14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9109 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38258 42 71M = 38258 0 ACATTNCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTC A?$!%/7G2/21>9H!>$,G2(079A*">@A7E/39.H.*#E)D"!5)13,0%-7AEE!BGH#863/7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C65 YT:Z:UP jpayne@0: r9109 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38258 0 * = 38258 0 AAGAGANNNCNNTNNNNTGNTNNCNNANNACTNNCNCTGANNANNGNGTNNNNA #$#$$!##!"$$##!""#!####$"!###"""#$#!$"#$$$#!""!!#""#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9110 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30605 40 41M = 30810 247 NNCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATAC "#+"$%#$'+&"%)$%!#&)"#'($("+'*#+"*!!((!'! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0T39 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9110 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30810 40 42M = 30605 -247 GTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCNAACTTN '$"$#(")'%$%!(**)'($'($&"))#'+&+"!#'')+)#' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:35G0G1A0A0C0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9111 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21426 42 263M = 21179 -510 AGTAACAGGATGGAATTAAATCGCACACNCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAANCAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGNCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGNN $'(&!"*&"&#(($)%"$%)#(%'$#(&%)%**!%"*)$'(&##*&!+#%#!*$%*"(*%%!)(*$+*%!#"#("*#'++#''%#*****$"&!)"#%&!$'*)(&)&!*!&)")%)*&(*++*$$!'$*+*"$$'!)#)+%""$)&"!(%'**&&%$$)+'!"&&#(#&!*#*#$)*'%)&$!!%$(&$+%!!')&!#*"%)$'*'""+$)*!%'#!&*!&&'(&&*+&()+%*#''$$&)'('!!#+'$$'+()#($*$!$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G16G8C69A80G81G0A0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9111 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21179 42 247M = 21426 510 GCCGNNNANTNCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAAATCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGNTGTGCTTNCTGATATGCGAGGCTGGACANTCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTC *$%&"###%%#+$(#$'%($'#"$+))+!"*"%((*#)+'$'&&&")#'$!&%$#&*)*"!+#$#*%'$%$$"(""!"+$%()#'+%"!(+#"'$##(&#(**"$%!()+!#!$#$%'%"(*'($'&)&+&!))$!""&%+"!*)+(")%+"(&(+'!(*'&+*+*!+*!)'%$+%"*+%$"$+!!!""'%#"%"!)*"))#%+&&++#+*!$#'%$#++!'')#*)#&)(#'!'+"+'$#+$'")& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:2A0A0A0A0A1T1C39T127G7C20A39 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9112 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29523 42 122M = 29706 231 ATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGANAAGACACCGGATCTGCACAACATNGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCA 7"88'$6HBH&B6);H)G8F%9:."??#;%=B$#!E=119E'H2E%H??C%?E!=FG.?7)F%@9?9HD:$D8%!BE&36%*49535(G/6"0D(!4+H,&%49B<,.99/CG'29FBC,&> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61C23T36 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9112 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29706 42 22M3D23M = 29523 -231 GTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTA !%0<34!34,7<7,"&;F"-D?(!A%0>*2"%H;)%3D9;?&)'> AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:3 MD:Z:22^ATA23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9113 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6523 40 64M = 6389 -198 AGGCNCTTTCTGCCGTGCTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGA ;6833E1F0HDG>;3:=.96-,=%:"1:DG("A!6,D<5<+318CH!+8%B><1>!!8D0$$:4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A0G58 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9113 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6389 40 35M2I90M = 6523 198 TCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGNAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGNTTCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCG D50"C9#?84"?=E9B:,)A620(,@:D%B3H:,?!,70&A0'7!,G7;GG!C)A4A7).>-@B86+0-B:?**7(F=,2%B61+C4#<-1 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:40C34C0A48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9114 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44166 42 156M = 44353 308 AGGTACTGCAAGTGCTNGCAACATTCGCTTATGCGGNTTATTGCCNTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGNGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAA 6F%1%EG06#@0,D)B753/3G9+HG494#'&)=?=?6.#<@D$$-(+-77D?C52B/A=E(D>9D:@BC+=*:$.>1&=B$607@;.C/!C$9<>!'.5H)><2=<:D?11@H(1%E3D=,#(D;*6$$A?%3#- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:16C19A8G53C56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9114 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44353 42 121M = 44166 -308 AGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAANCCTTACCCAANCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCA @+;9,?5H4)B?<3G%6<=37*6;FG-:20232""D5*72='8;#2=C.06:93BH86GG;CH)>0,B:G.3H'A%E;A;,,F0B4>)7!)8!1@A7;*530!G)B=7-%+$55,4%,*<,$9"!F,GG8EAB8(?6?07E5!984-D0$)'1@<4'8A?3@6B6,&DC9C68;(C>374,'#A3F5C14$9C').'H$#'7>>H5):1%#.?? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T9A45C49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9115 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30252 42 79M = 30383 272 CTGGTTTNTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAAT B3/:/7G,-A!,B")G#17):(1.&C;0:)*'-'6H5>3;B.<)0B=/CB*@>7:#3<(F:>A5-5-&+@6H:)8CH!@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C71 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9116 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6793 42 144M2I73M = 7010 322 CCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGACCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGGGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGGAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGNGCTGGGGAACACTCAGGCACGCGGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGA .@B5;<:5C>))%2:-"!19,!)6+E9%=,/>4(?21=F$8F%DB4#F)0,A((G:3?<*<551B*?C-!)7-/30-AG*(>F<()+0=FC<"%9*AF/,#B5+#&;B@D2!0!A5514 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:31A127T57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9116 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7010 42 105M = 6793 -322 CGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGAT !9"299C!4%-=H><>:=4'3*14$B$8B">&-F(,+#-&:$(13*F:19)>"D8"C?$>6-A!CH"A0)0"9:-C">?H;C/9(4>6?20')(2%'?;ED9&EH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9117 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36848 42 56M = 36922 216 TCCCAATGATTCGTCATCTGCGAGGCTGTTCTTAATATCTTCAACTGNAGCTTTAG /)6D7A-00*HC(;+0/(9+G77)9G87#>.?#@4>BGCB&9*G/H<@-2(A'H:5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9117 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36922 42 142M = 36848 -216 CCAGACTCTTGTCATTTGTTTTGGTAAAGAGAAAAGTTTTTCCATCGATTTTATGAATATCCAAATAATTGGAGCCAACCTGCAGGTGATGATTATCAGCCAGCAGAGAATTAAGGAAAACANACAGGTTTATTGAGCGCTT /:'$F>@#:2':+:;B;"E>=C>/,%985F9(5&,!#A3=7<7?0%&7F5*0*7F7H6B7.?86;2BGH>-<:H0#148D&>H,G5C7=%%+@0F#G;$5*=G'&(/3>A<8D,)$=@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60A61G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9118 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44626 42 80M = 44453 -253 AAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAG @'.D:6FD$$@7A1C8;H+(-!!"701,(=8HF'C"27=64&8B531*9-E:55+81F5!@#..%8$$.*(7,G37E8>< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9118 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44453 42 57M = 44626 253 CAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAG G?32H.)-@"-G>+GC81""HD(+F5):!,&#F.GD&$4+$=.+B);>)2#<6=6-! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9119 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7563 42 138M = 7476 -225 CCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGANACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTAC H/CB=(1@E90CAE;3F1%2E495006$H%A"3&7,/060.=9"!FB-?'+$,BH76G7=3<(/'-'68+#%;,,6#1?H@/#!(5+E;+50>>05'8C2)9C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104T33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9119 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7476 42 87M = 7563 225 ATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTTTGCCGGTGTGGCAG 4F<3&+>G3*4@6(9+&#A8!8.+8='"*9E5=-*=D<&8/'1(#C<9'&"D'6$:#%-;)9("B?!B:18*/;=08"";=48=->% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72C14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9120 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 104 42 50M = 296 257 TGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTG 2#-G/%)7?$=&A916F1+*(/1A+BAH!/5C<2!:##6(%B?:&/;B"C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9120 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 296 42 65M = 104 -257 GGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAAT #=>.;E=$GG;>&22+%D'D#)@A3933F;*-B/3>$,3%5F)4@8*+<53(CC>&31*.4!27A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9121 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11165 42 198M = 11363 354 NNNGGCGCGTTTCTCCTCTGCATCCGGCGTGGAGGTGGACAAGGTCGCTGAAGNCTTCGTGAAGCTGACNACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGNTTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCCGCGATGAAGCNGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGA %"$"+&+*&"&*#%&"+)$&&)'')$%)"%')))%$!+#(%+)*!&)'&++!%$($()!*$!##'&&!(!%)&+%'((")!&+(*&+++"((+)(&!)'+!#$#&!*$"!%)&*!!+!#%"'$&'%'%$!$))$#(("("#+"()&"*(*%*$!$'!'''%'#&#%)$!)*))!'$()$''"'!+*$+)#'%*"+!+! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:0T0G0T50C5G9C63A29G10C23 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9121 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11363 42 156M = 11165 -354 GGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGGCCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAANCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATANCGCGCAGGAGATGCTGAT +<'C-7-8/?-$H.,?H.3+/65+?-)-AC'5G.*6$G-3;4*60!C03A2!,CB;26><"&81E.$D(50>.>"%=/837?1+E+.4)//1&14+>4G#!=?7%A.#>6?.*+#G8&7%;3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A73T39C18 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9122 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45282 42 93M = 44763 -612 CGCGGCAGAGATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGNC ,H*-8'*AH!4%&D8H>/<$31./)-)A)(!&@H24-411A97+=8&,11#"!@(2-&4-09&C2;>E8">1*C@1B34':G5D;+(&$B)#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T81A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9122 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44763 42 519M = 45282 612 CGGTTTCGGGATTTTTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCNTTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGGAAGANATGAAGATGCCAAAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATNCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTT )2%B!/<60%5A<8B=:&.7&&,8H428*H93A<%H12E5B3C&:1FH49.221,$&G:?C0):&)/%F?B@93)7'2D:@-8@B""+D>"%)"5B4%660#/E'G$C@4!A4<*0;%960<("6C?.9#6=6.)G/+E!<9$!A3,+B;/5)>>-C&@7)B1%?$$1$+4'65"+C*25$E8H2/-.3*+;(%>*.@4";2578F*+&!&,(@@:*&;6+(=8A*+=0H$82);'8C0)E)5'1."7?B(:@EC7F1?1+/97$55.868D'#6?D&0$5)F?4,**6G%)'0;72@--??14+9.DA84?C@;60A<$657/4G<(A22<4#;(G=#'/D>(#98>BD0C5590E,<@,"B"8D*5+E2#B45&+D'8=/;7F!;(896)";!F4B!1=."4&99'=>˨%3)-FE/=&G4/.-0 AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:8G46^ATA17T9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9123 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29564 40 50M = 29673 194 TCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACANCGGATCTGCACAACATTGATAA :190D1@@#7'9)E7?->(;%9$&6A@@%D@(+05G63;-.83F6D/GC! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C22 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9124 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8546 42 129M = 8445 -230 AAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGNCNTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGTTNCNCNGGCAGCTGCCNCA ""(*''*&"("%($'(%'&+"$$))'$+$#+#'!$&$"*'&+&!!$##''"'")#'+(*)%#"+&**$)'($'$&&&""'""!#%$+(*%+)&(#"(+$%)#++$)#$+)&"#"##&#)$)!*%&'%%& AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:69A1G37A1T0T0T1C5T4G0T0T0 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9124 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8445 42 101M = 8546 230 CGGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTCCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAAT 5?6>))1H7DB?!CB9)(%7&(..D@H)7DF-*AEC&.(?,&D391E4$%1"?:6*5(&$:/<7CE/36=:.0DG#(2GA(,+:<;G21?&E5&'>9>$>?,:**64,BG;.<1C,E#8C383)6(8;9H7?@<5,"C6;H*=D,*33-5A&C$C/<84,"D#<9E5+'?;D743+@;+!95/,GC-/#?*+3,H<43D-A4&98HHH;!=2;3"+&="85:-8:$$923-C:D:8,(6;=1*0>;8E,#E&."*H.:EG6/;C09G0E@$10?;)#BH;:@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T79G10G31 YS:i:-76 YT:Z:DP jpayne@0: r9126 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38730 24 180M3I32M = 48331 9727 TGNCGNACNGGAACGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTANAGTGCTGCTTGCCGTTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACCAATGGACAGAATCACCGATAACCTGTCGGATNACCGGATAGGACCCGTAAAGTGATAATGAT &%&(("''"(+(&)&!###''#""$++'))'+**)%&++*)(#&"'#")))*(###%&'$*+')'')"'%)#%'(#&##+'&"*#$+%(&#++(!&)*(%"!)$#+!%*!#'&"&&$$"&&$!+*(!)&#'!()#)!"$*'+$""""#+)"*+(%"!&%$$*++'*+"%$!%'"##("%"*'++)"""$#*&((*)&+'()&"$&*!#&''%'(+ AS:i:-76 XN:i:0 XM:i:33 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:36 MD:Z:2C2G2A3G94A13A50T0C0T1A0A0C0T1A0G1G0A3T0A0C1A0A0G0T2C0C0T0G0T0C0A2C1G1 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r9127 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5778 42 70M = 5535 -313 AGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACTGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGC BC==<$-G9E+9E86%;C#4-H>$34)(CF*6=7ED,.'D%'A%.G$))7:,HC%@-,81>+?9@".80( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G14C32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9127 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5535 42 48M = 5778 313 GGGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGA &).?F%61@7B)"50=='D80E8F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C46 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9128 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41871 42 91M4I26M = 41511 -477 GATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGNGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGA :,2'57A,H&#E?+)BE5'4A#":,H3*0=D+7&/),/A.3(+BD3*-0;E#'@.&H$@@';8.-?22E9=ACF,1A"8"0=F9H?(D.#@99+>#DD7G*6'9*=--45*&-H>#$@6E/ AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:31C85 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9128 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41511 42 360M = 41871 477 CGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGCATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGNTAAAA D()+7"5*>H@E2+&-<5,=1/D3G,$E;(((H.*&730'977F1!C5G?B$2$&2B>9'/2(G"CA3EF$-.$-<)AE:2(*81>"4/-G%!!(?0$0>+=%(-F!*1(;''D%<#<4HDH6B5A1('0)H+970"4?>*7)()=8E=9%FGF++&=HF33%+:)'C+-!"(80,%%@-%1&;<,:&.?"$#B/$6F'==@F5/:DE>(D4.,$3BG#@'?,94/.B,+E3(FBE6G5$%F250H#<=>'87$.+#%#"%7F.C13E3,/'%%%1-#,HHH9G>53)%(;).&'7*!F1:#9=8,87 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:308T45C5 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9129 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19733 42 130M = 19863 228 CAACAGCACCACGGTGGTGGTGAACACGGTGGGCTCAGAGAATCCGGATGAAGCCGGNCGTTACAGCATGGATGTGGAGTACGGNCAGTACAGTGTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCAC "=H68+,*+$5@8(,8.4@,=2-6B5+"6)94E4*)F"A=/C'B4@C2?&,?*F=G>(D68##/&0.=*,?8D2%-;**B&7&&)"D04";.B/85?"3="E6>!(E&9E;C=H584#6/'$DB90.A-, AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T56G26T45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9129 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19863 42 98M = 19733 -228 GCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGNNGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCG 4')7G8+!+%DB)?F5*A19.@@<&/%9$<-*G$7!,+B.#;5-&H/7(A,"#=:$58D)(,>1@=&9=3&+4:=#>;*FE2#$?E.#C%*/99C-C1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42C0T54 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9130 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23884 42 108M = 23791 -201 TCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAAC .7=28EG":=E)'G(5HA*3,A840-,B-*)61?0BE$?6H6?!H"A8,+-2=9D$15.52.+&.G#39/@B"#51C$3%C/6A!2;#%+=$8DBCD0@7FGA AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9131 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44252 42 109M = 44361 270 GGTACAGGCCGTGNGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCG 7GG4:-@==?30;9B2*!(F,29<-*7AF*(*:*B4D:%G5:0H'1*=C;/>?B?@F**@E@(@C&&84HE$!@F)%-D%!#9*B+$H232?!F+!D#"(>"?;1*0() AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13C95 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9131 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44361 42 161M = 44252 -270 CAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGC /#;73872)GCG.*-/E*E'./";""+F:"'!"7=,.-2G%&3G+@.#,G2,,("8G?@)-"H=-"-/*449=:B'-=BB.-=7)H43%;?/9,0/HE@.!,=:&>/'+7'9*6E+A1;:9"<65AC-D79C"$,&?%F7$.'>H?5.#!.==$"0)C?,< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:161 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9132 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20675 3 22M7I26M = 20550 -173 ACGTGCAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACAC :=4.+$92'D,2>B0:05"-.+3-'<6B@+:0(GB0)A84&242':?AH&&/2$G AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:48 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9132 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20550 3 43M = 20675 173 NCGGCGGCGGGGAGTGCGGCAACGGCATCCACGAAGGCGACTG 'FH";..@/'(F<212=?B*6GE&9H52&E'EE8(#'-.><5$ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G17T22A1 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r9133 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29967 42 145M = 30112 370 CGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGAATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGC B:E#;%291.;-&&(@"=A1G*-752?7%/2,!D6GE*6E)3F$:>6BG25F?#/B&E0$3%!($%/H%**:C#=.8*B+=E:?>;67=)$2<@FD8?;0-4E(=*%@+A'/E#*&A&="45/56A=.$@D)=&$295/;;""$G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77G67 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9133 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30112 42 225M = 29967 -370 TTACTCCCATCCGAGATAACACCTNNGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGTTTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATACCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAG ++#$&#(%'!+$&!(%%$*$+'+'**''+%()%$**+#!)))!#!$++)#!)*$##$#*+!*%)+#)'&+(#(*!(")#&####!$"%#(#%*'$'&"#''#(#(+"(!"$'%!"((%"!&(($+&!!$$+((###)+)%%*$(#%#)$*)#&((!)%""!!'*'+)#(')+&!"(+$$#$%#+()""$+#%!&*((*#($'#!&#$#)!+%!**$)*!"*"!&+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24T0C29A49T119 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9134 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21605 42 121M = 21448 -278 GCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAATGAACCAGCACACAGGGTN ,,&.9E4!59,<5G6C-..'A=3--4(4A8"0.$)BG51-D&)92=4?$&"A%3<*+G9%&08%GE&305,B-@5/510@$('60'$$"E"=(AB2<6+A?@B(+4"!058A)BG',4D<#0DA=*D:52":$HE?E=.C/@8G>,<*H*),0&D4D=F=G,15:=0'?8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9135 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10376 42 69M = 10376 0 CCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGNG #($#%"'!")$$#$"+!!'*)!"!*!(+(+!#$#"#!#*'+$(&(())+##&"$#!!##%$"*+&**%) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G1 YT:Z:UP jpayne@0: r9135 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10376 0 * = 10376 0 TNCNGCCNTGNNCANCNNAGGCNTNGNNCNTNGNNGTNNCTNTNANANCNNNNGNNTGNNCNGGTCNNCCCTGANNTNAANCCNANGGGNCNNNTTTNANAGCGANNNGNGNN $"$""!$#!#!!#$!#""!!!$#""##$#$"!"$!####!"!#"!$$!#!#""!"$$#!#!!!"#$#"!!"#$""""#"#$$!#!"#!"!"$"$$"#!"!#$#"##""$#"!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9136 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44077 42 101M = 43903 -275 AAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTAGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAG ='C06-9(1*3FB8%)20%GD/C+19;< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G40 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9136 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43903 42 97M = 44077 275 AGCTAAATTTCATTNGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGNTGGCTGCTATG =3$&#A+<3=%:/7;C7<.FEG>&;$0#'!E%32+>>&:-1:;B9?'72!52"3EH5#)!$,9-34(-47F@C'1%()+G;".:'>4B&>.!9.+3+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C70A11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9137 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18617 42 98M = 18469 -246 CGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGNACTGATGAACGGTGCGGTNANCNGNGAT ++!"&#%!!#'&+%&+#&+"#+#*&$+'!')(#%&!)%&#&+*%("'*(#$#(&)"$$$&")'+(+$)"*('!*!"+*+"&$$&*$+('$#$#$$*'$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:69T18G1T0T0T0A0T3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9137 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18469 42 42M = 18617 246 AGGGCGGAAAAAATCGTCNGGGNCATTGTAAAGGCGGCGAGC '5'-+,H+46@-#7AF61GHEC6E'7(A7D09)=./8$!'@" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G3A19 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9138 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31464 42 76M3I155M = 31695 332 NCNCGANANGATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGGGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGCACCTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGAGCCGGAACTTCATGAAATCCCGGGAGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCNTTGCCGTCACTGCATAAACCATCGGGAGAGCAGGCGGTACGCA #*"&%&&#!*"+')('*)'"()!)!#%%((%%+#)!*"*!#("%$*%*$'))(&&(!&'+""%$+&!'!))!&'%!(++#+!'+*&*+)'&(*&)%(*(*+$#*('+$%$"'!**!)*%))!#&))$%)%'''&"#)%%*&+)+!(%'%)(#%+)*$+&%&+)"!$!((*%*(+'"'%!%%++'("(%'(")!+#%"'+%(&%&%*$%&(#"'+'!**")&**!'"*#"%$"#( AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:10 MD:Z:0T1A3C1T0A77A99G43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9138 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31695 42 101M = 31464 -332 TACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCC 4BH?B&/.-C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:101 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9139 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18036 42 64M = 18102 171 ACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAACGATGCCAGTGATANGTGGAATGCCATGTGGGCTGTC @="%=6$C:45'E6+-!9=3'(;H'CFF!+8/#C&#*-?=02 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G13A22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9139 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18102 42 105M = 18036 -171 AATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTNAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCC +%)%77#37.'G982C/4/&&-19<&,B*",'1B?!B%6A>*,,#&?";)/?=4%9B.DFC*8!=H9#;"#BA3'<4"&$2#B>?<*F%4>0!/0#5",&$;)A( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78G25G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9140 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16670 42 65M = 16414 -321 TCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGG -$057F$89=686/%;D!+.,<()/71G&51?'D&&*5",6/+9EE%&EC17.C.H9&HHA>/8) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9140 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16414 42 159M = 16670 321 ATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGNAACGGGCAGACG F+54$H"A)!>C2(F>A?'H7>%/5"1B)1@B#H(#3+0B/(7/1;#0/"C/B%.:DDG?."!,#57",;0$=39-6:53H=$(=0&F9+=/)-#7*9$)<#)$(:%$-!8H)H@:&6.<<&&=G79!'DG/*?!@31 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:146G12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9141 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46875 42 94M = 46695 -274 AATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACA =1)+>!C-%H7CC5!:(?9@!F$>E"0.7>($&*07:.=&!6- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9141 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46695 42 63M = 46875 274 GTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGT *7//*@1D&8GFG(&#G6%B0%F"E1:<4#*;!&/-*:EC&C4531?>3@03)>E:?2+AH,G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9142 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46849 42 266M = 47115 330 TTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTNACTATGTCNACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGAGGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTACGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTNAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAANGGTATAGTAA %+'(#('+#*+#&)+'+*!+(%)+!!(*+)*'($$*%(((*"+'"&*++*'((%&(($+$('(%!$$(#'"#()$"&+$#&!($#!('""(*(*%#&$)#$&'&$'!%$+(&$!!%'+!&*+"&&%+*&**(*+$$$((&&!!&+##)$(&%"%$$"*%)&%#%%''%!&#&"!"$%$+!+*"#!#")&%(%++"'&'"&*()*)!'(($&&'&!#*'(*#(+()"++#(*"")+%+")"!(%$&"&+#$(!&"%+(*(!!(#'%# AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:49A8C53T35T73G32A10 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9142 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47115 42 64M = 46849 -330 TATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACNCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGNTNTNGCC )!"((+'"')&)"%))+&&*+)"""&+$$)+(#$*'!*$')##*%&*#**'%!*'+!*&(*%&$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29C26A1T1T0C2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9143 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32590 42 124M = 32491 -223 ACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCG E$-"=&7G%++:5/C-C'<7"C+.?19!!.3((42.9F-&8H/?44,0$61E19.,BB%DE<%-/FHD8<'@3A#@1;(D4'&:44.?9.0(&9D'$624E7(::E29H-;F*2GC.%0>:G1= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9143 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32491 42 40M = 32590 223 CGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGC B(H(AA9";E96;A6%4E@9;<'69,3&,64":C-*FDB/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9144 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46408 42 85M = 46545 216 NTAATNNNTAGTGNCGTTNGAGTTGCCCATATCGNTGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGA !"&$*($!"))#*(('#'$$+%+!"%!#)"")$%'$(+&!(+'+*$+%$"&''$"*)!!##()!+'!&*'$*(*(&&*$'&+"*$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0T4G0A0G0C4C0A1A1A15A50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9144 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46545 42 79M = 46408 -216 GGGNTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCNGCCCAATTCCAGA '#!+*)(&'(+#)!%'+)%)$!"(%+$&(')(+*+#!&*!&!*)!+#!&+(((**'")*)+")(&***#)&)##&(&&+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T61T13 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9145 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30254 42 311M2D75M = 29852 -790 GGTTTCTTTCCCGTTCATCCAGCAGTTCCAGCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAAAAGGTCTGCGTCAAATCCCCAGTCGTCATGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGCGTCTTCGTTCATCTATCGGATCGCCACACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTNCAGGCGGCGCATTGTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCAACTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTA GH6-,"$DHG!)A@"!.:+/BE*57B%;77+H90&-.,>4F:69;/=8),>/@$D@0=,F52@;;.$"3:%3H*?<(B6E%,?A'*9)#HF=5:.5A=,F39H"75@E<'.'*85A9G8:(?3#-;A7(BG',@$<+.A57".*GD:3?#:F4;($/&7$-&(!$A.53G6-EG#*'=#DE#B04B+*))4;@7?B-F*)12$AG!#9E3,+;1A$<3B@#..:H;-"E+26A#C/1)A27D-6=3<)49$>9#273H857*E?&+62,.5&8,'F;9'1+/;,'8&8+-,<&.D+!F!*H!+2(()H!'4:9"46;A50AE8H0C#%FE(5*%'7B2;1B#BC"7:0!@=AA&8A'(#-3B*F<05C/%!0=F.4.+#2 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:284T13T12^TG46T28 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9145 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29852 42 402M = 30254 790 CTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCTTATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTGGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCT FG?$3H.=&/'#7"*#H*0D?,D43:E@(H0<2F7:?=6C7/CB&E,+>#9)/4D$4<4E!E6<.C@B=&*49A3";+&&8BB/;0'EG+19(82@2G8E)6'5:!-@)D:)5>=G:86DE,>)*7&11;"B-E"='4/#*;#*--F?,:!*812>!BH#/2:G8,B=FG,;7/C.A0;%+->*1>!GBF%6.4=9G'B5.7@B<;"#%'1(>81D.2>;*#99$G!(H8#G$6E1>7%C(H'D$+CG#!+<3)-;62'#05$*;;>6CB06A+3C6'=0B(F/;3%45@/5A,/:;C@,&7&8?$."2G*(#84 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32A6G316A45 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9146 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31006 40 65M = 30758 -313 CATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAATGGN )$')%'")('#&$"&"'*)++!$($#!")"+)"**+$$&#!(++!)#"##"%!+&!!'+'""%)! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G2A0 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9146 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30758 40 87M2D8M = 31006 313 AANCGANTTGATGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTGCT %#"#%*"&$'%)+!$%!+('%!"+*($+)*"*%')'"!'!$&%)++((+$'!+%#&%"$)*($&*"(%!%"#!($+%!%$+!'"#"#!%)("!$( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:2A0T2G1C1G76^GG8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9147 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33361 42 72M = 33108 -325 CGATCAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAG A==>D$33!EE3!=32145F'>A3&7(5!BE+D%2675+G7&9/8G@(24&3"5"F/;*HF9!E&%9=?>=% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4A67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9147 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33108 42 67M = 33361 325 TTCATGGCTGAACTCCNGAAATAGCTGTGAAAATATCGCCCGCGAAATGCCGGGCTGATTAGGAAAA &21+5&A.F22+C*B6A?%G1.8/3?*EH/6;999=2A4?E@D-A1"G@,'>F.99+$;;AE>.5"*&!>)0&.),?43*'/=& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45T18A0 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9148 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8041 42 259M1I38M = 8338 362 CTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGNGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAATCTGGTAAAGGACAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGNTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTNGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTC 0,-@6"-.()*81:644')93>B40;G3A,$#;:C*E+1'274"<2=:(97>8,,#&G>?"7(!.0"A4)0$G:&@#:B#"D04@%>$@%3H-:.+)@*9/:@@7&+&72AA$?*!=474&D@=C@$0?#0/F&;;%B;'@1&B817?&/@''0%F:-@$D6E$*>%G*-&F@.!8*@+F<2+CF4E@!>!5=>6599E#87,4+:>/98?;,&(@%+CD6,4038*+@8+2 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:42C51A11A97T22C69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9149 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17018 42 80M = 17238 311 TGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTC B'C$+>+/E?)?6/;G#?%7$D<"!95F4>=0?$B'>(76?;(<+=)&:5'$$=03&;29;3(;"4>AGH;70DB229,9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9149 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17238 42 91M = 17018 -311 GANCGANGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATTTGCCGTAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTTGACGGCGAA 48*78"#,%)/A<<9<*#=:/6: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A3C33G5G44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9150 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26760 42 158M = 26981 275 CTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTNCAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAANACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCNAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTA @D*9*#:A7D91'/2DD(6+?*(F)$89!!7E4=2GD4F$@@C93,C3=9(<688F.:-=D!5=A6/<6;H)/<00$4).&:4@./$F668"!"=#129.4::5= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9151 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38310 42 61M = 38420 287 NATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGNAAATACTTACATATGGTTCGTGC "A'<8C%G.@$6F?002D&;-GF5/4@B#H&,!,#B34)A62D74.67H;/)$794D%%5; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C36G23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9151 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38420 42 177M = 38310 -287 ATCGCAATGCTTGGAACTGAGAAGACAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGNTAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCCAAGTTCTCAATGCTGCTTGCCGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGCGATTCTCACC 4A5.&)(*A7=B<$/,8:5&,(A$$(%)C1,/)*6.FF'A?;83/+42.)A:F=$CADB;F10*7>:@,'E+B4@<,C=.!+5F"@=+9C(-=">$8HFF'+EA*E.3%A*+$"*'1'?F!(&.2G3A$):(+(*%&?(4)60+92>$78(&G6H2?GF:0*.*G1'*&( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:46A39A20T69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9152 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45509 42 188M = 45697 419 ATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACNCCNANCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAG 60$!-?&'8$.!8H4&3"!:>;0C'H-=2"97%0$E20>H1E/.6=:8B;!!#E(%-?*&2-F,#)!@06(@)G!/6C*!(27',FC&G#&/+1)/?3$845*E+>#H=0;)#"-*<<,%>1F:=H1!*0(+;(2;=:;B/G'=/>;B!<;64>F!4&07?B19:<8>.3+E<3E13/5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:119T2G1T63 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9152 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45697 42 187M2I44M = 45509 -419 CTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAA #30C>E'+-+A&55E14&HH5<4E7H>="2=A<5%E$0<<*9-CCG"0:4/9$B.:D80?+,!?%DG&63D,-D!43=(4'=6,DD*>9D02&(;G/C(:451$;6=.@0<>0.&!/261'D1$-%59#G19.5;F"2&G6?E.+2/)AD-6!D.BE3':@,04"80'5*:D*7="8A#1&()H1%&GH0(H?(!BC+6@&.)=(54?#3H"/,HHH3C.2"%/'AF$52G'D7#6B$0<=6$()5#HGG.<<>"D<50G6>FB'C.2*,1#!(4*5A(413&2#F*)C!;9?5A=/;>=)@4C2:0+>&.:AHG)D,6B=;-;+;>"4#=2&#>",?68 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9154 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44568 42 57M = 44304 -321 AATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGA ?270)H?5?'%#361?GE,9".(-2++=!5EB56/.6C&7'2)F4#=,;:7(B1?,9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9155 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6975 42 195M = 6810 -360 GGTCTGCGCACCTATGGCTGCATTCAGGATGCGGACGCACAGCGCGAAGGCATTAACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCC 2$"3D-D(&"%@A+4DE,;&D3@&FD$B)A3,>)H!7'<:"H2*=23$F,&::;3E9=B%E@2$'<=9?:&%G?H30&D@C7B*'9;:H5'+0;34>9C%/",9A<5H0!7G4&G/#@;F8,;/( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:195 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9155 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6810 42 127M2I38M = 6975 360 TCCGAGCTGGAGACCGCGGTGAAAGNCCTGGGCAAAGCGGTGTCCTATAAGNGGATGTATGGCGATGTGGCCATCGTCGTGTATTCCGGACAGTACGTGNAAAACGGCGTCAAAAAGAACTTCCTGCTACGGACAACACGATGGTGCTGGGGAACACTCAGGCACGC +(*")"))&$!%!)!#%(*"$("))$%&+!++"*"+%)+#&)*#***(+(+$(+()")$%)!#$'%#(+(!)$"+!))!%*%!""+!#)(*%'()&(#&'!&"")$"&'!$((!+%$($)*''!($!+&%&'"+&&"#+#&#&%$$'&%('#*#*!+'"&)!!'"!# AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:14A10A25G47G65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9156 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26084 42 87M = 26171 513 CAACCNATAAATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTANTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAA &<41AE@F.>/*$A+D?4@%FGG36,)*F081'321F#02-<01>0*.$)41CH1'1.%(D.-DG%%'H7@@B*GCB:;+'*-AH+. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A37G43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9156 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26171 42 426M = 26084 -513 AANTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAACATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGANAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCATTCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTT =1!2+F?E4#4=2/99=A77?7.F8G638.H$E)7(%'A7@;?=<6;-.(@3+.8;/36,.1E?39-B&6A6,+-3;E56$G2?=8@&&GEH,+,*#&0&<"G5H>/.H4C:G=%,'7?&G)1:"G.(=F#CE3.-<34D12/B)-194&G4<=8<5.H:175);(7*!8G6!(#%>7C643A4+*H;B(C45B:@"C9&;@1&4>/8-7(5!*'F-EH>F:3DDB7+?5C9>!<)297#E1'3/8)4,1'=9B6!/FE!=;&.C)-B.61*GF)/DE)B9#3;0.G.C3%A%$D"FHHEC->:+DC:/663?3F?>&%:$8H7(E"#<-2($);,1&#<&/'(#1.>DE<=;/A?0%F>013(4=@;3;$:H>E>+(C=(&!F!"8##-CH+41?F,;0!C%)=5+#;)>?)4 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G90T45A286 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9157 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30569 42 181M = 30777 257 CTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCAATGATGTCNGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTNACATGCCGATTG 2?F6'/!6D66C&(.10D*(7E$"<=,&?34B;&$3A6A%&+GB9-"E%:6)/.1;4%6-@EF7%!1?0A+!?>=)F*.+8=5'E2:?">;;'<>C0A"5G1F7E18=D!>G'G"0$<-.;8@;DD!/=)(C>3;?GF=HB>6C="CF5& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39T128A12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9157 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30777 42 49M = 30569 -257 CCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAAT <-9)91BF-,='7%2!3B2FH,(0-,$C'FC07-G%/3?44%/'/C$13 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9158 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26450 42 54M = 26450 0 GTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCT 3(8,$<>6G??CD*4<*B?*94.D?9!/<+"7B2;@5H>);!)C3!F><3D>4* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YT:Z:UP jpayne@0: r9158 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26450 0 * = 26450 0 CCNNNNNNGNNAANNGTANCAGTNNGNNNTTNTNTNNTNGNTNCNNTGGNNAGCANNNNNNTANANNTNNTNNNTNANTCNNGTCTNNNNGACTGACNCAANNNCGCNTTNANNCNNTANNGNTNNGCCN !!$"$!!"#$!"#$!$"#$#!!#$#$"#"!$###!!!""#$###!!$!"$#""!!#$!#!!!""#!"##!$#!!!"!!$""!$#"$!#$"$$$!$!$!""$#"##$$!!$"!!#!#!#$$#$$$$"#$#! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9159 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41569 42 217M = 41521 -265 GAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGNTTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATNAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGNACCGA 1-,G.7>7<1G57780.!D,AH5.:$H:)B391D&:9E!=@&1;?/>!G0G0$@0-H3@.?6;,C./>!!5,6,C<+BC(;71";0$>(F-E>@H++>3E(!$;/,8$:#H6A-58G()BA-%5 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41A50C118T5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9159 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41521 42 48M = 41569 265 AAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGA (*(.:=H7F3!%B4@'F;.+5C&!(1F<.24,:(A("*/':@==(;)? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9160 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8423 42 120M = 8543 230 GGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGGTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGT 14!(;5/38@(,!74CC$EF&A=@-2+E.210(E&H20*,+@$"FA0"5;)>3<='7EA46H+.:BGA"@?F!3-,#16-?D/';H!?2C16*);?5$/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9160 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8543 42 110M = 8423 -230 AATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGN 9)#9:#0:E,BA:H)C5%%()+&DC&)3.20>0-:)6;+G+=#.&==)1.$H&*"G*-:8/#>#@9D7=D.+E,6G39#'<-*$/*0'%5.09C?5G!3F=0B?B??#H" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:109C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9161 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32828 42 131M = 32959 210 ATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCA 7(E2@569=%#H'GDD<9/:&47D++B)6D.7&;-)!A.H?3F;$0E4$%@,!A=2,<,FC3$>?'$>(%H3"@.!A@1=%6*=&&EA6<-756C,./?;-*A7> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9161 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32959 42 79M = 32828 -210 AATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCTTTTTCCATGTCGTCTGCCAGTTCTGCCTCTTTCAC )&%*0+1,;)0A-:@*2?%6F7)38.:!E2:=D38BE609-0+,-82?G)4$?C,3>(/G579%+7+,7H*)<(:?6(! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C35T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9162 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16083 42 111M = 16083 0 NCAGAACAAAACGCTCTGGTNGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTACCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCA %2$31;A36F-0/:CD19!'>A>/;8;!280>2'6E:(@1EE4<1H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G19C90 YT:Z:UP jpayne@0: r9162 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16083 0 * = 16083 0 CTTCNNNCGNCNNTANCNAGCNTGNNNAGGNNTNTCNCNCAGANNNNNGGGNNTNATNNCCNNNTATTNCNGTNNANNCNCACACTNNNANCGTNCNNGNCNNAGCNANNCNTNTCNGANA !$$#!#"!"!"$"$"#$$""$""$!##""$"##!$"#""#$"$"#!!"!$##!#!!$#$"!!#!$$!!$"$$#"!####!!!"$"#$""##"#"!$$#$#!$$#$$!#""#!$""#"#!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9163 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30916 42 207M = 31180 359 GCNGAGGTTTCATNGAACAANTNCCNTGGCCNCNNNCATAAGCANACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCATTCCGTGGTTGTCATACCTGGTTTCTCTCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAAC ($%%&%&"$((((#'#*'#'!*$&%%(*$&""#)#!+(&(!!&*!'%#"("$%$&*&$($##$")*""'(%($)+!*#+#"'#$))*&"+"*)%$*)+#$*&!*$#$'(!+')")!$+%'%&%&!'*!$#$'#'%+*#+&*)$'+$*)+%'%($%')'#&(%%!"+&'(&$%'*"!#"&&($""+%)%%'&"'&*)'"$!!!!**'" AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:2T5G4T6G1C2A2T1G0G1A0A0G8C162 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9163 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31180 42 95M = 30916 -359 GAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGA )$84"05%E!3>;"4H?=AEE%8*#%01;(7'4?>&C52@5%*+5G6>7<%="%)4G745-A!04!1#*1/?2*71(%'&"6F4F!3DA-()@@#%!9"+5"%5D AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0A0A0C6G30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9164 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16674 24 40M = 16862 229 CGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTNG F@C%$3F,"/#.;>($?!G)#6>H'=<0D+:B&8A77#F0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38G1 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9165 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35523 42 277M = 35800 392 TTCTTAAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCAAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCA %=-D93$2*+98BH$6$7$B$1@,3A71!D)).;910/;BG:0EH"#<)H8A!%F?/E0H8E?5"@+;F!1B>F0EGD@"%-?>2=D"=06$9>;!(%-@8%>5>#(?E*,@/!2;.E!@B@.:C=%=;3??&@A+E*?0,C,E>3EB&8?G62,HH98+"DG6=62(1<99(C,=F:@#D(1+)*93*E/'/80:=:*.EC01,$G-FCB'@33<6#AHH2*-0??88/@=*4$"H0/33,!9>1%"3C1D#(4+/A03(?)H?"CE!B3',= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C71C199 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9165 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35800 42 115M = 35523 -392 AAGAAAACCCGGCGNTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGANTGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGT /9%C&0&';E7(.;1<@5#3"/"><,!B!6F#1<4%'-01C)H@-120@<#:'HF51?H=1G#925"6C>>?6(D1(21)9/(E6?FG>$7CF=E+.D%42-C@A@4:459!+B3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14C65A34 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9166 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26681 40 52M = 26830 243 CATGGACTGAGATTAACATAGTAGTNAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACA G;79(8F@,870#*>4=@'E83:4@H414-!"$EB;+,E&&,%&2#5;2C>! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A2T0T0G19C26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9166 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26830 40 94M = 26681 -243 TTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAGAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTT E0>H@!-F69GD:0;!8@>E<>&9;AEH#3F&)H<5G9,$/:$%<6:*-/G:6?,"4B("CH0!&*C)?-3-93C$%;:)G(E*A';C7B0<4<*5=>)=&>,)H3D;3?2"AH<=4@" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70A15A0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9167 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45837 42 47M2I22M = 45997 247 GGCAANCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAA 3#7<1;!!8+-E6B!$@"<$<9?;/=59.A.:>CH:EGD(A;:?#!%D:?C5>*E%C!F8$7HD>&)<$:2 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:5T63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9168 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42064 42 40M = 42183 239 CCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCG ?@C,D.)09&F=*CH2?1%":;?;EE%!"+H%#G>!&5+G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9168 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42183 42 120M = 42064 -239 CCAAAAGAATCTGACGTAAAANCCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGCAGTTACGAACAAGATA F%/?93D9!B!61<09(0HA,&5HG'(H9*-+H8#5*%>48!='E/@A)H9'>=<2@04A)'<++!5%GGA!7'D9E.=%F!'&3EB?GB@@3641*@F*2?E,+'5<;H;.*0<,/4%' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A81A14A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9169 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3179 42 47M = 3226 244 GGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGA >A/?)&$"H$"@A+BH0':4B25D+E<5/(%#-<>==0C9:9,#.AC AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9169 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3226 42 197M = 3179 -244 AAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGNACGCATTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTNGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCNGTGCCGGTGTGCAGATTAA .9$?%G2C<)/9:&4>2*"?@H&E-+!1/C3?*!GCF88:;=&;!$BB:B;7B4BE7(D8EH4E!6;8&C61<86-="@7/%<7;C-F#3D-)82'8>C&F@9*,HBH6,>!CB#>1"2$46%',%-'(H')4:69?(3)E7806DA:-6-#&;?=<501;!#(/7#@(C!9?9G.$H,$H%;!51;1B@3.$A)(:"E;H@G=HC<5"&*HC=DG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10G81 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9171 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1312 42 92M = 1312 0 TTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGACCCTGCAGCCAGTGAATCCCCG 06")D=A+9!7.@-:((&3:6G""41D.'$<9)$4%51&D.,EH>.2)0.1:D928,2E%0/<@=<;%CD/'%>'E;":=#A3-:;"E+2"@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:70G1G19 YT:Z:UP jpayne@0: r9171 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1312 0 * = 1312 0 NACANGNTNTGGNANANTNNACCGGGNTGNNCCGATCNATNNTNNAANATNNNTNCTGGNNNGCNCCCNCNGNNTCGTCNNNNGTAAACCGNANTNNAACNNNNNNNNNAANTAGGNGNAGNTCGNNGNGNANGANNNGCNNNNNNATNNNGCTCANACNTTNGNNCTGGNNNGNNCTGCNANGCTNCNGAGTGNCNAANNCA ##!"!#"#!$$!!###!$#"$"!#$!$#!"!#!$!$$!$#"""#!""""$"$""!$$#$"""$!$!###$"$"!!"$!##!""!$!"#!#"$!!"!"#"$!!!#$!!#!""!"!"##"!#!##$"!"#!#!#$$!""$"#"!!!#!""!#!$!$!$""#$$#"##$$!$$##!#$####$!#!"!##$##!$#$!"!#!!!"" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9172 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15627 42 172M = 15799 245 CTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTTGACACTTAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACG ;7)@;3:%;H-G1+*&78FC/"22574.D.$GB6),=/)FB337GGCA&)F/?'AG=+H)17&4:$9&A+6;A.F;99?45?2*!-8#.F..?A,=F5$@FAF'"?562E>-#3'C(724E'HA95$A(8%*.".F%-%?(''- AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G6G128 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9172 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15799 42 73M = 15627 -245 CCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACANCGACCGTCTGCGCTTTACTTTCCGTTTACNGGNNNTAGNGG !)##&#%&(%$!)##(+!$(%"%##"%&(+#*&%(")'$')%(**+$+$&#)(')#%#%))"'%*%!($#'(" AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:31T18C3G2G3A2C0A0C1G1T2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9173 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1222 42 40M = 1222 0 CGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCTCCTTTTGA >6!FG@'&!F<1G!"E3)9(C.91!C057351%A6#=.E* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G7 YT:Z:UP jpayne@0: r9173 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1222 0 * = 1222 0 NTNTANANANNNNCCCNNCNANNANNNANCCNTGAAGCNNGGTCNNACNGNGANNTNNATNNNGTCNTACNTNANTANGNN !"##$"#"$#""!$""!!$#"$!"!"!$#!"$!!$"""!####"####"!"#$!!#!###!#"$!$#$#$#"$#""!"$!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9174 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37751 42 65M = 37595 -221 CGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCGTN $&$(#$$()##$#&")*)("($+&+(+#%#$%%%&)+((*#%'!))$!#!!&""#$(!#'+%!%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:62A1C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9174 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37595 42 156M = 37751 221 AGAACATCCCTGCCTGANCATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATG /C980#!9:"GACF$.++54&F;%.;182=EG<9(.H8A:,1-1.""$6C@='A.78H*&&.,9#"0<5#B,A2%*>6'206<0)<*:F"8:;"#1,A.;2:$;10!"#!,A;F3'@$)C-)-67B"/(A'.F7"45:;578+?=!G3$.;*&1EH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A138 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9175 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11040 42 85M = 10918 -207 ATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCAGGCGGCAGGGCTGACGTTTAACCAGACCAGCGAGTCACTCAGCGCACTGGTTAAGGCGG H4:6$!,'D2'#5;"1+"DF+&F?2"<$9-?B?%%F>A437'%2,(C1D&C$EB)6!"F!H>:=30EG8G2!:0A/,D,C:C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9175 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10918 42 95M = 11040 207 CCTCGCTGGCGGTGGCGANCGGTGCGCTGGCGTATGCCTGGTATCAGGGCAACTCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGC H6577B)&5F;25B"1!6-?-6F&)AF(>$@!D)(G*D+=E/--9*)=:A3#,6(5(;!DF',E2/?3$''#$G379;3%>%3<%#35A8C-1<,-(2!0/&,@3(G.:8:2-2(A0%C,(C()AC85BH3%.176G9+',)G=(+6B"G),*#4,28"!A>31(!!9,);/$G85="4@;D-*4(8F-/-0$61?1!H9@A@-#+54>CG46H*3"01B*3?,!C.&=3;/>3(B?=GG;A&:(@1)19/!H.2..H4BH*.=7&=$=,$79G9?A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30A77G38G61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9177 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41176 42 110M = 41373 265 CGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGGTATCAACNCGG *?:$2""?(:':HC"!?!D<&:0$1#:'"<(E'!D/;8(F#7*'H&BE;";9)2FA&*1/E.4!(,12%C?E7C(/=.E#3$&;C+F>8;:3G7%@/0$E#F*'CE;?E9H*40,($(7AF;=D-2"CAA7;G7)!<% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48T28A39C0 YT:Z:UP jpayne@0: r9178 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 175 0 * = 175 0 GCATCCGGATATTAAACGGCCGCGGCGGCAGGTTACCCATCACCACCGAGGCCAGATACTGCGAGGTGGTTTTGCCCTTAATGGTGATGTCTTTTTCCGTCACCCAGTCACCGTTACGTTGTATCTGAACCAGCAGGCGGACTTCCGACGGATGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGCGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTTTTTATTTAAAATACCCTCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTT &A$@2:%>B,#F/'F2C(5#4<.5832&"'8%8.)2''1;!G5><&3&<>53@%/)=%,)C1CDE59"(<=+5A#HG>3,2(%#%<*:'=?;9C$HFEE@,2*15-9=*2;D;8D/-&!G=*(:?2"=CD".A:1(HBD(@C'=B:0;6#-)4"CA2H26(FF2=+C>E6C50"&+#9;2269#FE%C.(6%6+'"6@6>EB:?(6--@&07=+7CB'H96E!/F3:>78B4-F/?1%C6'F",G71:))C!-5F(#(981A@5(/%!->CB(D*3-+E;G@GA&1%A.49(.=<+CB-"1?*DF'.#?<=(81@(-4?B%>/B90$A@9:4<>"E#*=+08-+13ED61;144$173HD:**28?=-B+:(F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T51A6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9180 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18283 42 127M = 18283 0 GACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGNCCGCTGGAAATGCGNATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGA ")!C@="!4@@EC!38F'%.C18C6)4*!%!:*"HG:&)A!:=/:5.>0>$/"E2@'4*H%39-D&3B;5*<698&>D%;2,*E&&/&.19HH-B:89H'E57>GED!(?0(-F++B87HB'?(%/H AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:87A5A0A7G24 YT:Z:UP jpayne@0: r9180 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18283 0 * = 18283 0 GNNGTAGCGNCNANNTNGAGCNTNNNAAAGNCNTCAAANACTCGGNNGCNAGNANGTNGCTTNCCNTGNNCTCGNNGGCNCAANAGCNANGNNGGNNNNACCNANGTGCCNTGGACTGTNNCGCCNGNNGNCANNCANCGGNNGGTANNNCTAAGNAGNTNCTGGCNCANCAGGTCTNNNNAANATTNNTNATN !!!""!#!###!#!!$!#$#"!""!#"$$!##!"##$#!"#"!#$#""#"$!$$!##"!#!#!!$##$#"!$##$"##$###$!!"!!!!#!$#"#!!!##$$"""#$$"!"""!!""#"$#$$"!#!"$""$##!#$#!""#$!#"##!$!""#$!"##"!$$#"##$"#!!#!$$#!"$"$#!$$#"$"##$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9181 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7568 42 82M = 7650 303 ATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGNCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGC /-.0=G2=%2!8$&==4,-.*,08";(9>E1??FGH6HE$;G$.5,<01=;(8$=,F5D-%4( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G34 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9181 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7650 42 221M = 7568 -303 CCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCNGCTGTGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTAGTCCGGACTNATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGAAGATCGGTGAGGAAA 61>7:56!/-%(1&$#72',/"B./6;&4:E4**C3:.>>@!'(+B>>6<-E%+;.&?/>5,$80$@F?(780HD'*3.G'+":=CDF2"E:<0:=G+0***-"E'$86B;C8$+@!'48H7'1C/F!)(@)E35:%"7$<&53:D$AA/&$B?%.;-?A*0@@(;5!D*G*.A1:F<0H@6B@.H-3=>@$@>38"">.G"#35 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:109A3A45T9G36C0C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9182 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40417 42 46M = 40256 -207 GGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCT (*=!@%<*#;$'E+5;4?#- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T5 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9182 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40256 42 55M = 40417 207 GTNCANACTGAAAGGAGCAAGTGGATGACGGGCAAAGAGGCAATTATTCATTACC $$%*""+"#'&&)+)"$"#*+$+&+)%*$+*+&!(#$++!+#$&*(#$$)#&&+% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T1G0G17T31 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9183 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13365 42 59M = 13560 247 GGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTG F6F7:!>+=$C%/('0):)#55,@#BE;./0F=+<>7)'?/#'=<,EA)",%,"G:52& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9183 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13560 42 52M = 13365 -247 AAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATG ("01>BG;<%HH$?(&$9#5++2(0G>++9!77/F(E%5(0A/G7#)(/0D' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9184 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5731 42 48M = 5781 182 AGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCA ,8D038"@&-7!G#;F+=$+'+!5-EB9H?F/.:#@4@"?CBB/G5FH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9184 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5781 42 132M = 5731 -182 CGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACG E,E".&F51F"#;(;#/6"%-/83#A0B/F0B6?BE?6FB&"0-8-#B"85B:&;!;FC0F/38F;H6D@?&##H-,#*6'8>D?D((5G/D#FA AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G112 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9185 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20817 40 78M = 20895 285 NAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGGCACTGACCGGAACGCCAACAGCACTAACCGCGCTCAGGGGAACAA $?F$%>+6E&;)?1-,)E0G-F6<-9<*E=*815#D!%7H4"93)C%!(@;>%!-1)/)4#!9;,D273&<9,1&-)G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G56C20 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r9185 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20895 40 52M4D151M = 20817 -285 ACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCNGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTAGCGGGTAAACAACCGAAGAANGCGACCCTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCNNNGNTNA '&!#"$%!"%+)('%"$'#&!'(+))#)&(!'"$$*'!*'("++))!#!*)+#!#*'#%$&++*'**%!+&"&$*&)%)&(*%''***"(+!+(!()(("$#*$*'($&+#$*"*"#"#+$)%)"+#%)&(&*"))*$($%#%))&'#($*)!$('**(*#"+*#%#*'#!)'(++$#"&"++)%!"&%(!*+'&%)"%$%"$ AS:i:-30 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:14 MD:Z:52^TATC41C50T20T5A23C0A0C1G0C0G1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9186 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14419 42 104M = 14523 183 CNGGGGNACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATC )%&*')$'+"$"+$'%+!%&!"%+)*(&!))++"&%%$"!(#)%$)*$!*'&+'(!(%)$'!%!()'++('))%&+!)%''&$%&'*'$#*$$&")&)($'#)% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C4G97 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9186 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14523 42 79M = 14419 -183 TGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAGAATCTCTATCTGGATAATCT 2$B@7D+.*D&70G>G)(2#43E3D=:/=@D&295)14??H%$!.1=$8/0'$E,(1)H'$4.5"9+CB?8B@2C(&>2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9187 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3381 42 404M2I132M = 3917 587 TACCGGCGACNGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATACCCCGTNAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACNCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACANCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCGCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACACCGCAGCGCCGGNCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGNGTGACTCACTGAACCTGNAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCGGCGGT 1*0-AFG$-(+"*><@7$3=D80790-8<7!=3.B0:#&"CH=>';).30&!*EB38=?'*1">34G$HA3?C4$2(,&F3%(E&.7B?9-(@7)*8"?*3AH%/C,7#.3?3C@F@A.G6$:"''F;E42H'DA0&:BF*6E8&14.$8@B-6G*F#C0$7)65$6H3617.8''4DE/,>!%@,#&F.H!B).C&6.'2DH>%5F&.FF?4&8>;+#'85$-5917@$D0A=@,(4E8(2,?F,()<4/4/-H"7&38*FDA;4"#*+4?,'1#B1.3G.9$D0#,%55)-B&2/511+@)8F&@62/"(AG5()83=3(23*43&1%*>F>F!:#,E(%%D1=(()H-F5&HAA6?&,8C/G",F!=H%44?3$=0)*440@:) AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:12 MD:Z:10A116G42C41G62T133G12T37G17C51T5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9187 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3917 42 51M = 3381 -587 ATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTNTGAGCAGCTTTCCCGGAATTACG AD-2G**!,=;%5(B<0.H;8)?@/#2?3=8A$F1>>4526A>*!E!&0<& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27A23 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r9188 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21788 42 66M = 21984 238 GTNAANNNCGGTGCATATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGT )#&(!'#'+&#&'('#+$'"("%!+!'#($$!*#$("%+*+('$)*&'$*'&!!!&+!##!&*(&! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G1G0T0G0C7C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9188 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21984 42 42M = 21788 -238 AATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCN 2B+@:>2D-C83!6F;06$'9-!G7FAA9!1))-8"$GFH;' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9189 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39162 40 13M3I157M = 39332 348 TTCAGAGGATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCAGCCANAAAACGACCTTTCTNTGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCCGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGTAGAAGACCTGANCGCCGCAGAGTGGATGTTTGACATGGTGAAGACTATCGCACCATCAGCCAGAAAACCGA #0$EE.4+4,8>3@4.9#H'G?3&(#=&=-+9A?F!EF.G%<1CC?!0"1A&3#52H);G%/:$-!A5E'9/9;$4.?)D0('-E0B74BF)C# AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:10 MD:Z:0G6A26G14G24A23C11C59 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r9189 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39332 40 163M1I15M = 39162 -348 ATTTTGCTGGGTGGGCTAACGATATCCGCCTGATGCGTGAACGTGACGGACGTAACCACCGCGANATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTNTGGTCCGGTAACGNGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAAGTGGACCGCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCA ;3B&(>29)9>784=#)BEE3#,?-'4C9G+=7G9B.H9>1)03:B*6B7G$3,033?A:$(A5H4C9.'39@.-2A?!:B1=*B8;88$"3$)@<98G3FB=$B.-"8F$:EF52/7$%0&C2'D.5%4!D.E28E1?D=7G4(5:B3!39%'EC&8D0GE(B9>(@F.@7=G(70#+ AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:64C38C13T34C0A6A0A16 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r9190 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40351 42 93M = 40351 0 GCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTNTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAAC ;81E(2AHA;D;@:@.C%!(6&(F8:(%*,/B4*(&F/1B8@30*F.FGD2,@6HAC$AH?:1'="%*"06;E<@*B; YT:Z:UP jpayne@0: r9191 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19863 42 43M = 19707 -199 GCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGC 99':6,:?E531&,-B+.$@&%=8G3>!FH23$8HFB!07$<, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9191 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19707 42 51M = 19863 199 TGCACCATTCAGCTGAAAGCCAGAGGTAACAGCACCACGGTGGTGGTGAAC D%?':$C76*6<3?;F9.E.(F>144G75;#E>;#3=+0/0%(+,@*)(7D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9192 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1871 42 215M5I226M = 2312 792 NCCCGTTCCTGACCNTNNGTCTTANCTGNCCGCCGGTANCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATGTGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCNGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAAACCTATACCCGCCGNAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTAGCGGGATTGACCCCACCATTGNGTATGAACGCTCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGCCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAGCCGCTTCACACTGACGCCGGA %#%&&)%)*(*%$)*!&#&!&'%*"$)($&+)'"!*)+(%%&*((%#"'()#)#"*+")!%'"(!)**&)+%%($$")"''&#%*'$($&!!*#*'#'!&*#!#""(#')'()%!"&$!"("&+%%((!'"$!'$'%#*+$!#%$$!!*'&'!)&'!)++$)"*'#+'&)(*%&%(*(*&'"*(!)"&*)$!$((+"(%*$($%""+#(#%""+*'("!((!)()!$+*'%#+($()(+*$#"%!+"(+%)!)&$&&")*"*%'"(#+$%#+*!)#((%("%$"$'(+#()%%($#"+'&%%(%&&+$!#%*#*"%#%%*((#**(!"!&+**!"$*&!!%#$"%$)$$%"""))#%'$+*#!+(#%!'#$+($*!'%'&(++((+&$'%("(#&$$+$()+#'&+'+#("+&##+#)("&)'+#&*"*))+$")+%!&!##+*+% AS:i:-40 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:20 MD:Z:0G13G1G0T1G4C3A9T42G73T39G42G13G7T158A21 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9192 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2312 42 351M = 1871 -792 AGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCAGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAATAAATACTGTGGGACAGCAAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGACTGCTTCGTTTATGCGCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGATTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCC $)#('+&()&%("%'!(%+#$)&+)*#&$*')%("&#+!#&*$'!*$(+$*&'+($!((+$!#!%$#"&*$%+")+"""#(!*###*$'+)&$!*%+*('()"*#)#+)"!#*"!##%$&*(&++%#"*(!()(!)"$'('"(+%&&+%+)'*'#'*!)'$)#&((&&(%%$##$*!"!!$((*$"#%$#*'!"!)!*&&+%)$!#%$(+$#(#('!&%%+&$"&)%#$(+$#''&*&*%&#'&)$+"!'+!!)'!%"!""'"#!!$$)'"%'$)#+$"&)!!!$(!#$($$++&!)")&*($&'+"%*&++$$&*#+$!''&++'"!!'")%!$&$!*#*#!#"(!"$#+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77T43A229 YS:i:-40 YT:Z:CP jpayne@0: r9193 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2544 42 105M = 2397 -252 CTGCTGGCGAGCCTGCAGAAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAACACTGGCAGNTTACGCCCGTGCCTTATCCGGAGAGGATGAATGACGCGACAGGAAG 2/+3>!E>C02?"&1.C2/4;&4764#8#*?;!D;FAG+#C5!&'F:/1&&(0*=%.@*"2#>.#D15>A16$/7AE@7A#0#!=+9E/;:7F9=1A0@&..3@0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G39A46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9193 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2397 42 54M = 2544 252 GANGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGC 2:A*@9>872;-'*G2#0#,6(.GCA+)AG0G+;6H/.8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2A51 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9194 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40585 23 27M7I13M5D48M = 40460 -218 GAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTANGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAG F4-H;-&>%GC!,"7EB*99G6.7)5C+0H>2C.DBE.*D33,&:3>:(>5G1A48-?)B?;B8+FFC-==-)G9E/,@):2:?%46.272F,(B AS:i:-47 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:2 XG:i:12 NM:i:13 MD:Z:40^TTTGG0G47 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9194 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40460 23 111M = 40585 218 NCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGNTGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGA +249F=;>@5#,4>62;645GA"(3E.)*.8>&+(>HA+F3'8!)E'>@.!F,3.$EAA0G*(,7/>.%.)>'!=C-FB67;+G%&,2):"0(;:--2+1G,(:FA1-;@F AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G26A77A0G1T2 YS:i:-47 YT:Z:CP jpayne@0: r9195 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15012 42 96M = 14871 -237 GACTCTGCCTGATGGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCAT 4C).0%5@G.G:119G'+HF)E*H')H;7'$'>:0CA.,1G86A<3-'$B'.-3%+43&4+<1&>-H6""CA7##*!8A7#=F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9195 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14871 42 141M = 15012 237 TGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGAAGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGA #24G!-?86F;)42:%2$F#12).>;0*A6#;H5<*(C#!*&/B005E6+@>>*!F!9DC$G.!BB&&9+3,E@'9:9%;5A9"%.$$>?HD+>6BHCA'%+323H;@@CH3H)*C9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42A17A28C5 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9197 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36559 42 56M = 36357 -258 ATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCG 8B!E=>#2!;B6'A'H;51.$$4,FC>8A3226F)>=9%?E67>3A#*2H7&2,2= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9198 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44662 42 75M = 44515 -222 TCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACAGNNC ?/C">AH;.B?)7"&/0-(!3$@!=1E"4"*B*C83'%F$>87#A,)G++/(H?7!=>G4*(F'"C<1>-;=''$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:72T0T1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9198 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44515 42 147M = 44662 222 NGANTGNCANGGATNGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAANAGAGNCGGCGCTTACTACNGATTCCGNCTTGTTGG "$(%$'&$(+*!$'&))%)()&)$$%!+*")&$)"($"&&$+!")*!"'*%++%!%$!#!!"!'!*#%)*%'*+##+)%%$*')+!'+"$%"#*")$''""$%%""*)'''++)$&*$)!!(*%""%&((")&#!#'"$#((#))$! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0T2T2C2C4G96A4G13C7C2A5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9199 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30266 42 60M = 30049 -277 GTTCATCCAGCAGTTCCANCACAATCGATGGTGTTACCAATTCATGGAANAGGTCTGCGT 97.0E,@6DB.2?=/6,@04@*01&913>74/F-%%< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G30A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9199 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30049 42 217M = 30266 277 CGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAANACCTTCGTAATACTCACGCNGNTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCC )9B<=C@C>(1A;'<.7+1+F65*3AA96%<#7%-1,.B>5766D&:2719*?ED1GE$-2:0C-:?4H*6'>B.7177)%&5+*748*?!B&(=2BF$%A;B(%%+8+(<5>HH%0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:82C19T1C112 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9200 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29075 42 44M = 29186 243 ANATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCAT *"'+"$*#+"&##+$#&)%$'!$#!*&(&!!&+#)'#%'*)+") AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9200 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29186 42 132M = 29075 -243 CCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTNCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAG <(%%;%A7"D(FG!D3@$C=/"9:DDA8(?,+A',9.*64B<#G/#!A1B,F9;H6D'/.'?,6G65G":#:/#E/0;6BE<(.H9A;%@*G5(AD4#:3" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T95 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9201 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43360 42 92M = 43203 -249 CGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGNTGTACGAGGAAACCAT 5B5F(6;,&?08G+/9<9-E>*:?#,-="!!B")!/07.!=H+=;C23@226G;.F=7C6(ED8.F#++#3C,6#!'7$GD3G AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75C6T9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9201 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43203 42 71M = 43360 249 ATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGT @GF):.$4H25B+9212D;;;>A:'+<)A<908"@3A-&98<7G0"0)=9H;39/-A5$'H?>0$#$B8@! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9202 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7036 42 189M = 7036 0 CTGCCCGTTACCCGAAAAACTNGGTCACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGNCATTGTTTCTCTGTGGAGGANTCCATGACGAAAGATGAACTGATTGC ##%*3,BG-%/*89E::"398';5,CE??3-5>B$"-,>1G4%#>7/,29(?@,,.+)B%E)G38=B05C'#"*'88A6F+B$-'H0)@(,,C5="#E,72@#3:D0/4+10'D!9C#8>;%EG1=8DD:>88:;4E&7$,2'=*4<%4541F.9C2&20E-%9A/,;*,B*@6@=EGBF@37))C#F? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21G3G115C20G26 YT:Z:UP jpayne@0: r9202 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7036 0 * = 7036 0 ATCNNGGNGNNNNCNNCTAGNTNCGTNNNCTCCGGNAANNACTTGTTCNNNCTGNTTCNNNNCNCNNNNNNGNGNNGNAAGNANTNTNNNNNTNNTGAANCNNCNNNNTNCNGNGCCNNNCNANCTNTNATTTNNGNGNGNNTNCNGNANAAANGCNNGNAGCNNGTNNCNNNG "#!!""#!$!###$#!#!#"!$#$!#!"!$$$$$#$##!$$$!""!$$"!#$!$!""!$""!!!$##!"$"##"$!$"#"!##$"#"!"##"!$#!#"$$##!$"!"#"!"$"$$!"#!"#!##$$"$#!!$$$""$!#"$#!!""$!$$"#!""#!$$"$""$#!#$#$##!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9203 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36539 42 83M = 36417 -205 TGGCTTAATGACTATATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCANATA +(+)!"!)&)!'"&*&$$%''(')$)&$$#!+#"'"#"!&&!'#()'!$""&)#$+#)#(#*!(!)*'(###*+*('$!++)( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:79A3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9203 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36417 42 53M = 36539 205 AGTTNATNTTCTGTTNAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAAT ()"#%*&!+'"'&!'!*"%)$!!(#$$%%(%*%$)!(*+'#!!"!%#+)&%)% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A1A2G7A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9204 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25356 42 88M = 25163 -281 AGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCNTTATCATCGCTTTTAAAAC B*"">++>BE1?8<9.%F7DF0+09B6)=-6DB+/(8*:*?$F4D2$G),C(03.$.A*C<9A:"62)BG7!-%(+E@*< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68A19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9204 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25163 42 95M = 25356 281 TTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTNTAGGCTCAAGAGGGTGTGTNNTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTA &H(=2E*@>H'<2E+:.)C$E,'./#)C:)"0B-92/:;'9A(B=&+8"A<6>6%08".+0H?%)3E9$136&/)>C*?(@9"A52(.=>>"?-9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:40G19C0C33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9205 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39574 42 275M = 39476 -373 GTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGATGCGTCGGATCGCCAACAACATGCCGGAGCAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTTNTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATG ,1?&&"H=0'?>=H&&("@*/1B.396HCE)*5#8'<%+616A.7'0?5>1@6%>=80A,*)')0H/#-<7C3'/@B#:$)@%HF+4,-B,.AB+0AEA?8D7#'";+!>!H/=&"280H"5CC'H,;!!<0-B1*>;C4?3A(0?(3G#$H@2,E(>$GG&BG,F89(9'.$'<79"0EE05$(=)C2,/9=70C$,1#2G/5<=D".B:<1::+5;%B.'8& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:82A138C53 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9205 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39476 42 19M1I79M = 39574 373 AGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGG 6!#&B.4F?&4*,=C%-&,&FDB6+%&C3&E)3-=G9.>AB%(-*(0/%9G?2@&7"'-D2+5H'?$EC(#AC6#9->)@#(5'H0'!B$<()BD42$6&6-:@E;=9?$.+)#6F*3(1@&(451!H.$F(#*9&7A9+G5$B$;?,+,A?-'0CA0<&=A3A@!++31(7+-1<1)2<94AE1F(0 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42G3T12C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9208 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11006 42 60M = 11201 268 TTCCGGCAATCAGGCGGGACTNACGGCAGATCGTATGCTGGTCCTGTCCAGAGCCGGGCA +'(*)%*&$('$%$)%'!'&('$#*!#"+!++*"!'(#%)!+$'#&'%*(&$*"$)"+(% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G38 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9209 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42930 42 112M = 43042 307 NNCGAATCAAACCATTACCGCCATCGCTGGACGATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAATTAGCAGAAGTGAGGCCGCAT "(2F3"8*E-*.6,H3C!=6C/2(B%+;BH*39GG?>>:'%/2*$;<%$:+$A0C$#,B%',B&8(A>-0A93G3<+19/B6<=?0$<)/G%*!'5+%/=8H%&'$47?&$! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0T13A16T58A20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9209 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43042 42 195M = 42930 -307 GACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTCAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGTTGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCNNNTACG )%+)$()+(&"'#()+$$%&$+*"$('(%'#!$')*'''*++'((!)!*$#%$"'&'*+')+$&&)#(%)()*$$!)!+!+&#&$))%+'+&%(#&**+$###*%!"%#'!%+#)($*$+''**")++*'!)%#+$$*#)$!(%&'!*%'*!#+#))"&('')*%$#'$%$#'""$%'$(+#!!(%!+%!'*%*' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:37G72A77T0A0T4 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9210 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9223 42 107M = 9101 -229 AGCAGGGGCAGCAGNCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGC A.6%@4:AC:H"?:5&!&.1%C#2#1%72C1@1@(8-H=E(/:DH+/*("$1=39!72=@2'07)>A.F%#%1%(7;3)=+,E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9210 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9101 42 68M = 9223 229 ACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGC 1ABH4C%02=C/DH-A).F?94//#>4:)G2@A-?'-*'5<1)GFF5*!8G98F!5*?.*3B5%+*"6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9211 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27386 42 66M = 27236 -216 TGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACTNNT ;G'FG2+7(#%<54F1&+3+*9)/21"BC%@6;(D&>G3%.D0,7BG1+E5!4HBHB9)"001#%$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:63G0G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9211 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27236 42 150M = 27386 216 TCTTCAGGCTTCTGAAGAGGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTG F0'=#1DB&E69<':C,@<56&!39+*G"@>CF7@42"3&GGCH,.A/?*-9?982<;:-?F<;;:D&19,4>G861!!5E8CG$;,!% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A131 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9212 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34969 42 76M1D124M = 34861 -309 GGACTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGNACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTNG #*&+++"%(&&!)'$+*&%"$!"%"%(&!%*#(!'!)$!)))!!+'*$%$)!(#'+%($"(%&!%*&)+'$'&%&#*#$(#&&"!&&"%#%!$(&"!($&"&'*&$)#)%*")%+#*(&+&*!%!#!$"+%$*%+%'!"')"*!""$+*!&"')+(#((!%(&&))"*#&!##")%%)&&#%+)%"#"*'++!"%+)''& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:76^G67T34C19T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9212 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34861 42 108M = 34969 309 CAAAACAATTCCCATACATTAGTGAGTTGATNGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACT 51H73@C7-2>7>5$B'?%HE>HC1(1)@/9C$).-E?5-C>$,##%5)E$A*B?%$B!'.(/"D/>H71:>+!E/)='>@%!A2AA%/!!B-B#30E2)&:><$&=/:=F$FA-F25:F>HG,HCE+7:?B8?BF>--//1"79 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:110 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9213 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17459 42 82M = 17245 -296 TCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCG 0391:=#*%BAH(H5A&B@<1;=%-F7$?1)8H*D+G3!&:E>#9+/357=9<,.2''G%6# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9214 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19946 42 62M = 20254 353 NCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACTGATGGTGGAAGAGGTGNCGCGTAACGCGTCCGTGG &.#B%6E&.&2=:1E)>)C#-A-D/@&9<6!E9>2>*+&F<3>=!+<1!.D0.F2E&*1<-; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G42G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9215 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3589 42 165M = 3475 -279 TACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGGAAGGCGATGTATGCCNCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAANG .&;%-!0@H0-E,*B2&4C@%3(DA;:.4,8=:<$@/8E.B"9:#F6321+!3#$@A)GH7EB6$<:&<-/BH/3+/#"H'E7"6,$;,C<2>A(0$;7@38&&*;1'C.&%*(+1.2=80#,;3>#G,E<07%#+(6F@H=4 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:136A26T4T8C40T36 YT:Z:UP jpayne@0: r9216 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23372 0 * = 23372 0 NTCTTNCNCGTAACNNNNTCNCNNANNAAGNAGNTANNNNNCNNACTNCNNTNGCNTNNGGNAGG $#$##$"#$!!#"!!"!"##!#!!!!"!$""!##"$$#"$!"$!$#""##$!"!""#$##$#$#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9217 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33690 42 80M = 33770 364 AAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATT H!;2/8<@&!FA9(C7%;%--%A56,2A017@!H08'"@*+'.+%D'4E<%@/A,7>?8E/903H*@;?GD38=D,+:72 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9217 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33770 42 284M = 33690 -364 GAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTCTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTNACAGATAAAAAATCGCCCTCACANTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGTTACNAGCGACATTGCTCCGTGTATTCACTCGTTGGAATGAATACACAGTGCAGTGTTTA -4B-*CD.'7(HDC3?63==GF))BFFDA3@2"+?77"#0D"&8:FB5#>B6:@+1+D"/@/'/9;.'2+2?G3-*B;H*9+11HE!*/.'$*%+D,<)'")>6!B">'&2H/-1.2!E7<0#6-E$2A=1%$6(679+6>8(FB-A1&:2&!3(D"H>D2.7>#@!>6":=H+#"<19D4A7+-5/*4F682F&,';-.+>H:00"'8+5+364D/"6.5232>"G;"+A(@5(6%G1'B-+1A5&$'C6#+1<51<>'*7C=& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:47T100C23C55G55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9218 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23533 42 64M1I181M = 23449 -329 ACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACANACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCNCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCNATAANATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCCGGTTTTTGTTNTTTTGAAT )3/=4&>!!F0=A9.,EF$(.0+./?B<26;,$;@D)'&;&05(H)$,5E!>159;H:#B&B%!?@?5FD8E'.G@AA1()$F593&074B9A:<#$ H%/&7)F7?''/=>0@B.<24/32,2&.6+'<>/-=8H=3!+#9$0-05E=A2<"$1&+6/*918@=FF9CBH(<;,D/'?+&D4+D>5:##>)?*))7!!H;-4A13*'&A(7;8&24);/4$$<=7F;("9%=5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:28T67T88A4C34T10T8 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9218 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23449 42 84M = 23533 329 AGCGTATTAGCGACCCATCGTCTTTCTGATTTAATAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTG *#+%&#%%)(!&)%*!(*!$%%!&!&%!)#!+"+%%(!##&!&+!*)')$+)(*$&*'()&!'+")*%+"%"'%&(*($&#))% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9219 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20567 40 130M7I57M = 20754 250 GTCAACGGCATNCACGAAGGCGACAGAGGCTGCGGGAAGTGCGGTATCAGCATCGCAGAGCAAAAGTGCGGCAGAAGCGGCGGCAATACGTGCAAAAAATTCGGCAATACGTGNAGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGAAAGTGCAGCTCAGCAGT 5D35":.*A',;F8;-F,0E4D2$D,;E58=1'-1%,9:5@B,/G'E7%C5%-$E/)5B&+-9?@A??+49GD1'*0-%#!D3C/5&C+/DGA;9%8"7:$#).1"C/D.+G@7H#<#!D(?E$C6,**3,&#;#.9/D,8+FE0%+3)0H8H69;G'B!#/"<86;@.7C6:@6&D&*-C'$9,#(5AA':?> AS:i:-33 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:11 MD:Z:11C95A5C56T16 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9219 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20754 40 63M = 20567 -250 GCAACCAACAGCACGTCTGAAACGCTTGCTGCAACGCCAAAGGCGGTTAAGGTGGTAATGGAT ?4/+'?%F)=$<&E-4@9/7G)#:*9)71*239E='=6.?'>=8)=#9<#*>D3=<9=A1DC$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r9220 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5255 42 47M = 5046 -256 GCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGA 1B)B0+5<@%3*2-:A22694D8%<#&1#",.B07EA-1+E<8F2C5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9220 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5046 42 83M = 5255 256 CGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCANCCCCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCC >4>B@DC0*;'>(*53=9@&:@=99E#)=>;2C=,!!0=G%#29,A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9221 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7597 42 138M = 7597 0 ATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGT F)C$5*E0<($+H/7+<@)%CA-;3=?&$BE.BF-%>39>'BA"#?$.H95!@;+BFC20@(,''F(!?:H028@/;F<*&BH!;4C.+*"@5'C14>$+6(.H06%=6529")G":,347>$H#"D1?'688*%(F# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:138 YT:Z:UP jpayne@0: r9221 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7597 0 * = 7597 0 TNCNANTNNNNGTGCANGNCNTTNTNAGGNCNNNNCTGCANNNGTCAGCNCCNNNNNTTNGNNNCNNNCNCTCCNNCTCNTGNGAGNCANNNNNGCCNNNTTCNNCCNTGNNTNCGNGCGANNCCNTCNNGNCNNNNNTTNNANNCNNNAGNNGNCNGNGTGNCNNCGTNCCGCCGCNTCCGNNCCCGNNCNGTGNNGANNNTNNNGNACNNACANAANNNATNNCCGCNNATNNACNGTNANTTNNANCNNNNNTNNACNTCGATNTCNNANNN "!$$$!#"!""$!"!"!#!$$##"$"#$#!"##"!"$"!!#""!$##$"###!"#!!$"!"#"$""$"$!!$#$#!""#"$#""$#!##"!#!#$!$$#$#""#"#""!"#!$!#!#$"!#"###!#$!"#"$"!"!""$""!"#$"$!#"!!$"$!#"!$$""!!"!!$#"$""#!"$!$$"#!$!#!""!##!""##!!""$##$#$#!"#$!#$#"!####!#$"#"#$!!"##"#$!!"#$"!$"$!!!!!$$!""$$!$!$!#"#"$!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9222 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33246 42 160M = 33406 342 CGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTT @)$5"B@).=)B;C>*$%CF>1D6H6F?5ECD=7&93;$''!DCA0/D:?:/8F".E/($5(%-.CA8$+F9E$9HD2BBE44+($(--"!7D,C>AF'/>0GD2H?=;7&A%:22.@)D*1$75<>?)+1<1H>B/2'EAA9F#D#2.G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:160 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9222 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33406 42 182M = 33246 -342 CAAGTAAAGATTCGGAAGGGCACCCAGCAACAGGCCNCCCTNCAATGGCATATTGCATGGTGTGCTCCTTATTTATACATAACGAAAANCGCCTAGAGTGAAGCGTTANTGGTANGCGGTAAAACCGCNCTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGATGTATCG "8=;87;$7;@DC;'&>H9,DD8"D)4C50@=0#AH7$-#"4*3H5>?787)"=;+@5-CG(#F9C"#F(E,B;9&6!/80>,3'=7C=25)5-&=??6=F<326"69F.@.+=7**6&+%? AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:22G13A4G46A5C13T5T13A53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9223 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32503 42 202M = 32396 -309 GATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGGTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGNCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTAATGCGATGAACTGNGCATCGCTGGCATCACCTT >-(=5H!*@5D(;?5-G!B"DD4"-H;&H&B8>9$C@$C:D-22/?1D2G;@+"0-F@?HDH#,378,>@6")C?.#F%4'0'?H%+.A<3%B$07E=48"<4'@"8+(/=A)7?-F0A:<*0(%?E60"38>,&$E03116&,D<3!G:*%C%&$%B+E'1-D9GE&/"+E"8(%DB0(/(-9>$=FG17GE)A49/'6.5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42T101C37C19 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9223 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32396 42 107M = 32503 309 GTTCTCTGCCTTCGCGAGTTTTGAATGGTTCGCGGCGGCATTCATCCATCCATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTACGGTCCTTGCGGTAAATNCGGCATGTACAG "C%!CD:5+0"A4C,62,&*G10EC$"4@#A:5<.&12#B7A7*7:>!B+0?3&-6D">+*%E6.:D"$8,9F-5>.B'.">)>F&'F>E%96EB7+@9-&0;?0)1 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T93C12 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9224 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45835 42 49M2I74M = 46003 257 CAGGCAATCGACCNTTGNNGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTG 6<5)H.F"3FC>#F-@(3G-:GC;D,<3F?")(2'H:=D?A&.662(HF'?;31'C>*;:BC,H"86&!1&*,=)18+)<#, AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:7 MD:Z:13G3C0A101G0A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9224 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46003 42 89M = 45835 -257 TCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGA :3,77:;!G/(".@,7"'HHF%/DG<;E)%$7FHH)?$/-FEB>>&409%;:"47'8890E>3/7-%.+1=6A4;B?D,CBG<->7;+C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9225 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42085 42 191M = 42276 301 NACGGNTGGNGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTTCAACGAAACGCNCCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCNGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTG )($('#)*%#'+*"#&$)&"*($)'&+(%!%"'+*'!(*$"#"%"!)!#%*#'*)$%+)$*$*%")!#"%##()+'#(&"''(+$''"%)(")&*%'(!'(&#'(%()++"(%$&)()'&'$+$#&"+#(&%!($+!+#")$"*!!#*"++#&+!)")')'&(#*'&("$'+%+%##%)"$#&+*$""%+$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0G3T0G3C52C11A78G37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9225 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42276 42 110M = 42085 -301 ACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGNA !-$E(.$=+$.HG?0+AD-$7>929FF5C,;:4>(,EE3:@6@F-.">%&D,.FF4+&6>'5>FA4-78;@3$/F26%5A*<2C.#;:@==-:E6/1"$%/G(;9:0GF- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:108C1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9226 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32302 42 56M = 32019 -339 TAGATACCAGCANATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGGCTTTATGACG %"%!(*+(#%'%(#*"()"(&*$$%%++(%!+&#$'#"))(*&*)"&'+$"!"+)& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A43 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r9226 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32019 42 61M1I222M = 32302 339 CCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGNGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAACGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCTTGTTTTATCCTGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCA (:D-%C*C..7;A@*G1@:=?-(2G2/!&5$7(DDC&F:296FH2!A"=.8,H:5;;'#5(D0@>>B;DE$.HG+AB*.&$+%BF190FD$,3#A!$*0:$E7@)B:#*/D5E$5!>-6-21C;?C,#;'1(=;/E>)!*6EH7:,6!%8%!81(1B(E1!02+/$F)5@C)@D/!D'#?*8(#=0A<1>D0D30A6-G(17>B0"$'DA&$6HH<=@>%G.'8,%*E,?>9,H/DEB&DA818$2()A>;+/':@/@'15G4B4H;';7%D@;F4&#'EAF-@ AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:29C37T30T47A10A125 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9227 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37782 42 71M = 37548 -305 ATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTGCCCCATCCCNATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGAATAAGCCAA "$+!&&#+!%''&+!!($%+&(!'&%#"#!+&#+%%$($))*'(+*+*"#&)&"+(+)++!!#(')'#'"& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C24G9 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9227 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37548 42 107M = 37782 305 TGCCCATNTTTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCNCAGGTGAGAACATCCCTGNCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACG ,7>;3H"D+%6->E#!*21#.01)<,-F#41D;=*;%-EG?1G+G,*F1#85500=45.8FD8#FC)53D337?=>7/5+7/E99>&2>50E?/GA6$)(H, AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1A5C1C30T18C47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9228 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11380 42 151M = 11226 -305 TTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGAGAACATGGNCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCNTGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGC !;+6CD:C,7,G?D5<;%C*7H#@9A?#D<:G,F*5=%2B'*54C(,"+%C58AD282311!>:.-E#7%;HF9CG.#3!8'8D7).$9%*C)>/HG=)29&9/D7H,F,#)++7AGG/G$B01;"C"";()7:(4:D75#;&;6:/.#:D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G46A67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9228 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11226 42 154M = 11380 305 NAGCTGACCACAGACCCGACGTCGGGGCTGACGGCGATGGCTCGCCAGTTCCATAACGTGTCGGCGGAGCAGATTGCGTATGTTGCTCAGTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGT -*15D)('43@$#@27F5(1>$D!=4D<9,:%#A5G7@A'=7*:>@F98:#!%?.+&&514A3%,3)./0@8&?=?*!>1?@4:0:@#(%8:$@>GHD07:@'9)9;=3&A")-817>?0/1AG(BA7)C4;H#&5?#@#,C8%H#<-A&$4"F>E;$-C4!0@?*#7D&153#H(FB5*>,83*;,"G"@FA3D>=E*GH.>-H,%G&=98"?0:3A>$,';/5@,-(?2''A3?.56=#420C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:111 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9230 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34905 42 140M1D20M = 35066 433 TTNAATANAANTTNNCNTCNTNGGCTTGTAANGCGTATATTATTCCCTATTGAGGNTATTTACTGGACTGAATTANTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCANTATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAA #%$)*%%!)%!(*""#"$*'$#&*!!"*#"'%&*$&)&#%%(*+!('!*&!!'*&#!#!)()$#%&&#'#!%#)(#&&'&&'$%"#"%$#%!!%+%)("&'&#+&!*$%*+#$!)+!$$'!'$)'$#*%!+)+#")%%)(*)'##"&(*$&($)$!!'!( AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:20 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:21 MD:Z:2G2C1A2C2T0T0T0C0C1G0A0T2A0A2G2A2A20A19G44A19^G20 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9230 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35066 42 272M = 34905 -433 TTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTNATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCG /?&"F$0.,@CC2,71'&!,3H$H$7,BF:!<0:3D-H852?1>40%40&2,%"<$5)1&5'D:%73?08@8=#(&61&;$,,6='2%D;22F.9(B6$=!DC3:;G#)"59E74?#">D)/5=(*<'>//@*0$#:"+HH.0C?76?;E@E7-#C?1-4=(,4:=#.H%F+#65?F@<&>;'@1C-<8>'*"(*")0$:C3!D#G6G95H@1:=?CA13H3:2,<17.H#/&@97/GF?<$2G?26'+(C(/BBA&1?')7H&0)GGG$&G AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60G21C189 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r9231 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39957 42 102M = 40059 197 CTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCAGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAAC >'&,A*3&%%/3F;9EB0B&&*>'E-!2H;0F+334.73&1062,5$'+-:'&AA3>H:>)G$-;)-+#/?G@H?$DA@B,5H$*5/F52'C;5"6?@8<><9!&?G&2CB8=1@,?@<(*4<%A?=3/=/,($EE/,-A@@*/@?/7( AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:49^GTAA42 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9232 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45668 42 80M = 45467 -281 TCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGNGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGAC A25:E=5<<0>C'@*@9*:!D2=$DE+/?&%560H?#"DA33%:&;"3!B:,CC)!GD2!20%-<&'E>/1?;#/4> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46G33 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9232 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45467 42 76M = 45668 281 CGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGGTGGCGTG *+3:9&5-$H:7"C8D-""(-GE8<@D9%#9/11B42.:.A0>F@")-%5053-1F)?<"C60)D0<8""H/-662 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9233 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21934 42 102M = 22056 276 CAAAAACATTGCATTTAACTNTATTGTGAGGCTTGNATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGNCGGAACT 09H#57!CEH!2=7@::/'G4,E7:;,@D)4@-(:=+5@7>*EBG?9<@@G&3'5G>'*991,39<6"(;-@,C3AG-0&8:C;'.0+C3AA.=@1)E6E.G?"'D2++6<%7F)3";42-$DH+"72A7F+%G)3+0E>@B3B*C>6H99$)F:E0:)AC/*AEF>E@.'--7D0-.#6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12T59T23T57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9234 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15090 42 97M = 14941 -246 CCTGGGNGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCAGGAGCCACCCTNGCAGCATGGGGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATC C:B-+8#1$!(*?@"7B/3*0<).*/57%?)&"'.7?9$+E-!'!%H-3A3!731@:7?C:=C%,"3(A4"?%A!E3AA)?G?F&;=3(3)2&)G$? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G32C11T45 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9234 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14941 42 88M = 15090 246 GACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACNTCCGGGTTAACGGCCCAGTTACATGAGGCTCTGCCTGATGGCG 1=9;%BC-+?29924<9$4AG/,>+13*",?0=#9-6;HD<..2$1BD!C=:#=84;F30@?D?%E)?$!H208=;2<.1@@=/6FB1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:44G14G12A15 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9235 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1192 42 62M = 1412 346 GTAAAGCGGCAAAAAACTACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGAACTTGCT 7'A5H%8'&8,*2?H;>?C-?)3?/*FDA#6B?'.<791<%961:)+>19'F%/?/("&+41 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9235 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1412 42 126M = 1192 -346 GCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGTCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCN (&#'"&!!(!+#!*(%*#$+"+%+"'+!"$)&)+%""*'!)&(#)%+(#%!$"!&#%&*!###")+"*"+$#+(%"$"'*"(%)%%!+&!!(($)+!$*+)%"%#$&(#'+%!("'+*!!*)*&+" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:75C49A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9236 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14425 42 157M = 14698 314 NACGATTCATAAGTTCCGCTGTGTGCCGCATCTCACCGGGCGGCGCTTTGAGCACGGTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCGGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGNACTTTCATCGTGAGGATGACTGGTGGCGTAACGGCCAG #(*++!"%"+*&)*%($('%+#(+&$($&#*"*$))$'+)%%'**&*&%*!$)**)!*$+&!(#')&)!&%'(#$)")$+#!%&('!&$!+$(*++$%"$$#!(+$)")(!"$*+#')(''&&&*#!((*'!$#()(#)(!)"'%""$!"%)"%&() AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G117G38 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9236 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14698 42 41M = 14425 -314 AATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGNACCATATTCCTG =)77*?4.>?$2<+D>:?H'E?/;:"3EC/FB486C(;C##G6".%H4H?GA4<8D4@?E-.0"AA&@%,6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G35A32 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9237 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27321 42 157M = 27240 -238 CTTCCGNTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGNATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTGCTATCTTCTTANTGGTTATGCAGGTCGTAGTGAGTGGCACAC A/<8524F4?H=B07>&6;565@)F,)!7%77-FH?H$,D?%?=HA#C59H'5/!?F<1&=?5)H?G>/(//##8?9"!G:=#@0B-H>D)0C7+7.#$1/A;<5A&;5';F/D0CC3;FD=C/GBGC;!.3B(&DG5$0@18*C6)B#:2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6C47C71C20G9 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9238 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45021 42 98M = 44814 -305 GAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGA 0H:'/7#@@F+7@H+5-3D0A&/(C#-6:;"$:,C-1><$5B<2709C05'"$%8*7G"":3E"2(E!2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9238 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44814 42 41M = 45021 305 NAACGTGTAGAGNCGNCGAGCCTGGNTAGCCAGTGCTCTTT !%$#**#%%!()""&"+"!'"$!)*!)!#(#&(*#*"(&$" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A1T4A4T2G9T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9239 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31686 42 82M = 31558 -210 CGGTACGCATACTTTCGTCGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGGTTCTGGC $0*'.+D.$$2C7@:*+(0@"D-.:/8#$,G@F(%D>;$D.'E(,;<2#,D5*4+4E0&>1=!A#08C*+2%*8%%"6-*BF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:82 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9239 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31558 42 41M = 31686 210 CTGGGCCATGTAAGCTGACTTTATGGCCTCGAAACCACCGA (5;2C#;@(&A!#*H9$">+!1504"C$/)2>+*$A9)97;*C&>81)+9$1+53/:2&##,<930B7%.+DB7-$39.BA3/9A5/",&"504*:3E@<=H2A!C:;885@A;+:G)(7E..%(!<<1&+(BD,B8-;:A9>C4D5"HB'1@4&,.49G489DC6H#,!/>06H%B0B"2@F?G'==#:'2F4172)5$<:;:D4-,9-&A/'<.%>23!0=4@D7H*AGC0/F,A-25-'8!;7 AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:103G51T11T11T78 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9240 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48159 42 60M = 47901 -318 GTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCACGGACCCTTTTTGCTCAA /7C/-7D.2E++7G!D5F@%@?!8$).8<%8.<9G7>H,(CF.B@D>797&@EG9G+:>#D*@38'/CA*>4&&@H,G'D41(H!5F8,920D,'DD?D7;=@!@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9242 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47590 42 245M = 47835 381 TGNGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAAAACAANCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACNAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTNTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGNTGTTG 3>32D192%D*D)>?$#2"(<#6%&HF)(&,H<#->7@=88DBC!@/$=?=H#=)42?3#4#0:4D/#('D7%#D81$++,%<;-$-%6*3>!5?A"(/F+@0)&!G,1'25A4;/%E;B*+$E86'./'(C8E**6'?'4<&(CC%;D->@D69H;C%00;AAB3=*0)6.&;655 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2C38T4C98A50G42A5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9242 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47835 42 136M = 47590 -381 TAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCANTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAAN A)33984@#.B?"?">8A3:')>.%7*(??(>$",F@7B!+@C1H;&0(A#&4!FCBG3$%-G7/"GB#E%76$*!>&!;,$-!;G@?+&HF??!=%'&($C489$/3>0?0/G//F@0447<'C+E!&=&=)%'# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58G0T75C0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9243 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16763 42 40M = 16763 0 CGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGAT D?:!'@$@+!(.7=$GE@!'0F">-@6%)2<5=7-5$G)% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YT:Z:UP jpayne@0: r9243 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16763 0 * = 16763 0 NNTCGCATGGCGTGGGANGTGCNCAGCGATTNCTGCNCGGNGATCNGNTATATGCCNTTAAGGNNCNGGCAGACGCTGACGTTCG &&#"&(*%%&*(*$%*(&)%'(!'&(*&(()!*)*((%'"#"%'*')!'"*%()&&($&%"%*#"%)+')))"++!!%'))&"'' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9244 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39628 42 160M = 39521 -267 TGCGTCGGCTCGCCAACAACATGCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGCGCAGATCATCAACGGTGTGTTCAGCCAGTTACTGGCAACTTTCCCGGCGAGCCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAATCCGTCGCCA %7,%:.G-6$0%$9&,7A#9*@<#F>&>8B'4H:=.$#?+=#42@:C*H3,B>2'9@/E)(/G%8;HB65=AH*F4;!?FG0*+;9.%#B%@>5=;#:GFF@5/,BB) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8A151 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9244 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39521 42 107M = 39628 267 TGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGAAAAACATCGCCGCACAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGCAGA $42;;4$4147'1(ED$'?;5&@G4<*=A9/285G!9"@+1.%9:%8?"3(;#,45$$H,H;:F9(.AB+62$!/?0A@%%68'HH:%5D5;+,$20@.6$F-)H') AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9245 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9507 40 91M = 9336 -262 TTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTANGACCATCA .4-$5)1B$>5FC)0EH!@3%%1'?@/69/92+<13"7!9$;7A'BG)9+?D6.0'0A/H>&;4''D<$B38B$HGH2-'17"?95H$((, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82T8 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9245 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9336 40 49M5D29M = 9507 262 GGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGNCCGTCGATGGCAGAAGATCG 57,7D:5CH>=,6.<&0=7D%F-A88--*.'917C'<7>?$1'&*2<)/0:7::>H>,GB0F(:='7G4562=#G459 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:6 MD:Z:49^CCAAT8T20 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9246 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12487 40 104M = 12345 -246 CGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGNTGCTGACCGGCAGNNTGNNGAANNGNTNNATNTTTCNCNNCCCN '*"(&(*$*+$*'&!'#((#())(#*+$##")+$)'*%+'#'+*&!##&"(&&#%'$)(#*$&+#$!#!+!+'"$&)!"''#!"('""!'"*'$!!*%&&$*%% AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:22 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:22 MD:Z:59A13T0G0A1C0A3C0T1G0C0G0C1G0C2C0A0C1C0G0T0T1C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9246 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12345 40 71M = 12487 246 GGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCT =*4>&E8>1D/464)''&%/5**>!#2%#D+6=1FH.+!G$(:@%?%29D,=6(2+#8?1"<=B43A0)-> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9247 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7676 42 125M = 7676 0 ACATGGGAACGTCAGCCACCATTNCATCCGGTGAGCAGTCAGGTNCGGTGANACGTCGTGTTTTNGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCG (()*%%)')#*#+&!!''#**)*&'(&++$')%&!(!(""!"!#*&$%+#!+)("%+!*%"!*&&%"('*((#$'$%+"$))(%'"!')#'*&'*%$*%")&#)'&'*"&&'*)&#()!&'#+$( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:23A20G6T4G7T60 YT:Z:UP jpayne@0: r9247 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7676 0 * = 7676 0 NNNNNGNAGNNANTNNTNNNGNCATNNNTNNNNNNNNGNANNNNCAANCGCTNCGNGTGANGTCAATNNTCANNTNNANNNNGANACCNNGCNCNGTNNTNNANNGATNCCANGNT #!#"$$##""!$#!#!!!!##"#!###!""!""!$$!""!#"!###"$$"#!$"#!"#""!"$#"#!"!$$#"!$"$"#$"!$""$$!$#""#$""#!$$"""!!$$#"##"$$!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9248 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15338 42 117M = 15455 305 TGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGT =G2D9>1&.9!A&:&C,%D0#EEE.>:'*=:CC!*&=H3<,(DCC1=H0($00##E07,(CF$*73-'5*>$;-0B@&)'5$,146*##1!<4-+D#C-3%)C(C-43/98C7<*&@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9248 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15455 42 188M = 15338 -305 TTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGNGTGTGATCGATGCCATCAGCGAANGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTG ./%1-#?D*A?$H2+57%F"'G5)%#.CC:6?*.*CE-9C"->>.>@79C,6G76+&$=D;).4H;9,8@FAB)D)+$*D2$6/@4/5(1'%:+5/A3A/"?A*'7,HD?*88FH:/#>A0"(C?G0>1,-,27">4)C4!59),)/,*@FB,F,6F66=9@=0!"*+B&.B$-B/5,E475$&(G37,/=D?24*2*3C?*'4H6C8#7=>=4524=>8;H(40=1=F+97*<4D0>1)7A/)9+HA120C-=D&:E/"364B4C7A2=%D:>$2@E1)'=DF30"?"G+5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9252 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35641 42 42M = 35430 -253 CGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTT .-@-&(/E;=H"G)F3?);,@H7EF7<11H=)?+(/>4G@'/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9252 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35430 42 211M = 35641 253 TTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGNTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGTCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCAC @E+:@,*8-7B%:G+>302#::;->,278+,8=?'@BH=0&E('=%,(7'G@5(3@?%2#/!?%%=8@)=.8HD2D6F%CE'&C=)%#F8.(:'"=9(">92.6(?##<6B.>9*.E;=C+@!7<4@>*<5H*F6$?+*;**80"/5F;GE523@)+E7'+0@G?=C8+)B!&&/"?C#@$3@$9(%H,8D<+;E#2-85C+!F;!#?:"7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44C124C41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9253 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27866 42 210M = 27354 -722 TGCCATGGNGTCCGACTTATGCNCGAGAAGATGTTGAGCAAACTTATCGCTTATCTGCTTCTCATAGAGTCTTGCAGACAAACTGCGNAACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCNANGAGNACNTGCTTNTATAGT "#*#*'"('('#)#&'&"*$'*&(#'))*'*+!%++'"!%!(()+(+"'&)'*%&()!#!+"!!'*#(")'+#+*'))*)'%#)#*)*&)#")&(()")#)'!%(+&#)+$*(&%!&**+#&*$%'&()+("%%(&'&&#(*%'(!!&%!%(*)*')$("($*%+$)%%##)+')+"&)&(#(!+(&("$!%'&**!"'*)!$%"%*#"* AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:8T13C64C100G1C3T1G0A3A0A0T3G2 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r9253 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27354 42 512M = 27866 722 CTGTTANTNCNGAGAGNNATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCNTTTGACATCACTGCTATCTTCTTACCGGTTATGCAGGTCGTAGNGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATNNCGAAGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCANGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTNTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACANGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTACCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGA %)*)%&!"!%%')!*&"")*(+!&!$#!%))$&"")(!()%%$'!&"*"()%&'#!"%!#*)"""#'"$#"#&*"(#*%!+&%##&%$)&+*)()!#+"'!%+!*))#"%&$*&$+'&!#+&!'"(***$$*'))!*$**!'%#&%*"%"!($"##')("(*%*!!'$'(#'$#"$""+$#'%#&)$"#(!"##(#'!("(")+%&&+*+&%$*!"$*)++)!$"$(&)#+&**&''"!')#)($))%+)'("!"$)$(")!$!"+'%"(#(+$)(%*"($)()!$+#"&&()%')''+*'(+*%)#)+'#"%(+#$('&"$"##+"+#%()()')&%!*%(!'*&!"%)"$))"+)!$$&(("&!"(!($"#"!##&++)$!!$!))%!#(%++&$'*#+)("*%'$#!%+')'"*''($$+%##$%"'!'&*$&'(%&#!)')!+++'#%#(($&#+'%*%!'&%!$#$$'&%!$'"++)(%$!"##$+%++'*'#*%*+!!!&&$)%)( AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:19 MD:Z:1A4T0G0G1G2A2G0T50G25T17T28T0G3G51A113T119G3A41C33 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9254 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7245 42 165M = 7149 -261 AACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAG !@8@D!"62F5<;H?EE1"-)"!A."#G:(%8;%7$.5HB<>6@)&C3)9@>E8;/3./;64(.@6&(17:E:6,2@0&"479220)&&!(C6E%6;!2!&*7$50,7G:'!1!536-/':.!4<(GE*H;)%6/:D&F=0(%B9!EAA!4*,>;:!%0-#*5.?:%&45B*,'A1./.FG#72?*-73D-9ED1H(5;F.HB AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YT:Z:UP jpayne@0: r9255 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44148 0 * = 44148 0 NNANNNNNNNTNNCNAGGCNNANGGCNCANNNTGGGGGAATTGNANNNNGTGANCGCGTTANNCAGNNCNTCNCGGNCNCNNTNGNCANNCANCGCGNNNGNNTCNNNNNNNNTNTNNGNNNNNNANTNACTTCCTN $!"!!$#"""$!"$!###"#!#!####"$#!!#""##$!""!#!$#"!""#""!"#$"!$$#"$#$$!#"$!!!"$"#"$""!!!!!!#$#$#"#"!"!!#$!##!#"$###!##""#!!$!!#"##$"$$#$"$$# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9256 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35098 42 291M = 35054 -335 TCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGNTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCANCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGNATTTGCTGCTTNCCATTGAGCNTGTTTCTCTGCGCGACGNTNGCGGCGGCCTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGNTTTGGN 4-F(12;(&%E0//1E@!F&$BFEG(;12##8C;*2*>C$E)>:;B(H(*D4E!665G2/;@(3E0EB3%64*6B$9B5"65E@5/)%B5@&A4>9(+/C%G027/##&E%;1+'7BB73D,*+A4"3AAA-&$>+HHHC'#4#/@@*!&8<.,3403>".-7(FC6F.0!E92.'<56.9?">74)099.01?B+#9E/$A@)*4:8!";#DBF3*/-H)*16B.:)F3960;;18)+'?.4%96D1C!%>;G7C9=F5:/@-H*1(?=!*2:1*F"0GD-4?H&5!.@) AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:26C23C94G50G11T9C17T1C8G36C5T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9256 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35054 42 44M = 35098 335 ATTTCCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTATGCCGCGT 8#H$H+/H5/8%<')?G-;(5!D(#8)0+=+"C!03F,H:C$:4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4T39 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9257 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18508 42 166M = 18408 -266 AGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTNCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGT F"36B0.,,!#G)*5%A%#82+9G,7H!41%9BDG<2<47+D7#5@4/7H6@)9?=(. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:90C17C57 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9257 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18408 42 81M = 18508 266 NAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGG !&EGB%!2"'+-<9B$"B=?9":D"9"A1#9#-."G52-:>6)!='.-DBC.!28#B>4!@;C6-.%7!B93@?<77=B$@7:GB==+;"?(7F#)<1')),(D'6G&H.59?)(#&/'@&@3A*B&7H1#F*.1$8&3!'@.FGB@A)D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:203 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9258 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42490 42 178M = 42668 381 CTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGAGTGGAACCAAGATANCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGNAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAATCCCCGCAGTTA "5A74DB,:;-;<03"0>@/:&!<<1%??11&2C/8C(08>@">$0-DD8(B@A66G8+!AGFG!7'@E3DA352!7(AFC+!5+#G)+0$G(A$0F$68287>.:)#E&4):!?A%*!F7CE/8A=$CE/+)!$71E'D#4=:-EB.7;,"D0/3-A0/+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35T14G71C43G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9259 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26536 42 123M = 26727 241 GAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAG >4'=@67"BGH6,$0">4>F<@=(H:4)1D".;$8"$*:4A7$(@D7D>B&C;'E..A(><)5G,B@#6%"A;$/"=#--34C%88.&84.)9+D5C@>""@3?<59'!?$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9259 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26727 42 50M = 26536 -241 AAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTANTAATGAATAAGTG 0:(3B,32H6,E%C21">-@67%'G5@("D2F55B)5=-:175$>-$"6B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9260 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12965 24 101M = 12774 -292 GATTAACAACGACGGCACGAACGGGCAGATAGGTCCGGCTGCTCTGAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGNGCCTGTNNNGAAANNCAGACACANN '+**'+$$'""&%*$#'*%#))"*'(%+""')*)*%'"($)*$$(&%$(%!(**)#**(&'$$!&%*'*'+&(&'")')'$*"#"))&($!$$'!$&"*## AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:75T3C2G0A0T4T0T8G0A0 YS:i:-36 YT:Z:CP jpayne@0: r9260 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12774 24 41M4D54M2D42M = 12965 292 TATGAGCCAGCGTGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGCGGTTATGTCGGTACACCNGGCAGCATGGCAGA 061(9/'>8..6"!=E>=*%8H3#0)$3@B8AC2=28B-*G.FB93="82+++?GH&C<'%4B#G('./;H@F3;119<$B&<50;/(+7=@1!D!'3+GD@,<,8)&CE!)@*#3"&G14-208&:G#,3'*16+: AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:9 MD:Z:12G8C19^CACG54^TA27G14 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9261 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41112 42 61M1D29M = 40894 -309 GTACGTCAGCATATTTGCTCTGGCTAATGGAGCAAAAGCGACGGGCAGGTAANGACGTGCATACGTTTTCATGGATACAGGTTGTGAACA )9&@1@'=8!8;F7+C7(<*!+@:6AB>+D4=55")0D%A&>4+.>(++4$5A66F$0FD3.1?9.,4B;9(=)":=#>'*,/*2?07"8 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:1G50A8^T29 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9261 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40894 42 218M = 41112 309 ATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGNCATTCGGTACAGAGCGTGGNGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGACACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCA $50/".,'>B4@5<6DE<%6$-5!>>"G#6CD.1#49HE7..AF,1"0(F$:GD&$>=%$:(>;#)=@982*9=5<,?F87(6"H*C)(&E$0>F2B#GFB0%H4E")7*/!/6G9#;%!4FCF4F.9!75)!HE?-076H>?/:/2F2)>$!,<@;CHA2028F>>&*.4/%9;!/;101'*5!*H'8H05F><5C%4740H$$+4:0&<0:EF--# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:101G19C22G73 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9262 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26574 42 51M = 26379 -246 GTAATGAGGTGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGGCTAATCGATTTN E<6<806-3$11/"<4GA1(G!76-B$,87?')$G;D1;#(E7+$6>8.+# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9262 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26379 42 155M = 26574 246 ACCCACTNCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGNGCTGGGCATAGAATTNACCGTCACCTNAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATTTGACAATTCTGACAAACCATTTAACACACGT ?:,!H84??"/7/=@<4)E82#6%$;24E"E41B"A%?1="8#75AB;>6=@8.H$='.E.+7@<1??5.<)2+9E)@*7@#'4BDG&E:5??:$184@@/'!;,&#(B+,2;4>D+,#@)542G5"5%,A1+1F2:%*E;,$0H!G"$&66>%& AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5T1C25T15A10C62C11G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9263 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42411 42 81M = 42572 246 CGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCT "9-)(;@B"??C>D632?-+)&#:$7--.<1C8A%%DEB:;$C(%(!#E8<7,19'8)(?>/#81?@5)=0#4>!C1:#D2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A52 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9263 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42572 42 85M = 42411 -246 AGCGGAAAAAGCAGCAGATAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAG .H,6$3D,E/E0,3*A54'90A.7/7EB:-@2$%8H+.(-H)!%(.$6HH>,.92(58=%.$&6C4<0>,FB4*#88/AA,:>,G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18G66 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9264 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3183 42 304M = 3183 0 AGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCGCGCCTTTAACGGTGAATTGTTCGTTCANGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGGGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTAGCTGGATGCCGCAG :,A./-$,%;2=F5A'+*:&A>B#.B0%9%"=+AFG!*&-/B)?2((2H1'G*7;"8;7+:+3-:%!*$#3+">5*E%"5#3(1@5%9)#D,.E5D"B57CH.)0:*@:2%0D#)-<8FB5B0,:+H0*1+F+.88-1.=*%%-)$54#1#.;%".D0<),85=>GG&@.$.?9C#D=!A14A@)F73B>(;+.95300>6,4F:E5F#:#.$D-9&/7%979@G=!0():1;(*>F>+4'.>0+!7"G'+15)->2$($13D.0A-83>"=-F2:=D62.(-D4(?703>F'A6A:H-?,F;- AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:86A16C10G53C77C42G14 YT:Z:UP jpayne@0: r9264 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3183 0 * = 3183 0 ANGNNCNTCANNCNATANACCANNTCTNNNNCNCNNNNCGNNNCGCNNNCNNNGGNTNAAAAANNGTANTNNNNNNNGNNNCNNNCNNNANNNNANCCNTNNGNTNNCNATNGANNGTC #$!#!"$"$$!$$"!$#"$""$!"$"""!#"$$""#"!#$$!!#$"#$"$""$#"$#""!#$"$$#"#!"!!$"#""##"#$"!!$"$"!!#"""$$$#!""$!"#$$"###!#!#$#$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9265 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23770 42 128M = 23639 -259 TTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATGTATCANTGCTGCATTAGNGCAAGTGCNANAANTCTGCNNNTCTCCT !'(*+((+!)#'&+##))$$$%##&+!!+("(*$*#%**($"$!*"(+(%(#!'*!%)%*)&))+(#"$'+"(##"+$"!"*"&*+%&*)*#*&)$*"*!*)((*"%(%*%*#!%**!#"$)!)(!(% AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:87A3A5T1A8G1T2A3T0T0A0A0G3T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9265 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23639 42 52M = 23770 259 TTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGC 6G?*+1272D#2"5;F!?+#"DBCF6HE+0F6/=;#EG,9-E9>,=F:&+B; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9266 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18827 42 192M = 19019 481 TTCCGCCGTATACGTTNGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTNGCTGTNTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTC 6=H.>=H"FD>)4%:?("B>$865(A<-6&+$!E$A=G7;4D9,,!H8=D48:%*8G;D%/!C@F8HHAC-,*)24"G23>&<2F?9$0F048.0%4<3'G&'"C)79'71;!'=%<:7F)0C)>A'03))#-D.A@<&A09#52=C$6>7(/G="*(3?+%$?B"?"91:)(2!=FG47!#.G4HA8,C%" AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:16T144T5C24 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9266 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19019 42 289M = 18827 -481 ACNCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTGAGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGANCTGACGGACAGTGTGAGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACAATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCAGTTTTACAAATCA H<*0>D>B;8F,'G9HG%0<9$0!B%>-%B#'BF)$"$B%(&46B?:B+D#11$!&#D/-E82&H$,7F>.33H!-.'4F1CB#"").=!$"12934#7)@05<9!4))56:;<<9'&?57!@>$B=%953&.>D7.54+=<=<=1)C/E80#A0'@'A)>@AB+CE#?,8B$AG'1($4D25$@*0@<<4$913=,6=&?&AH13F(!@(' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:49T16G5A52A46G2T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9268 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37544 42 295M = 37484 -355 TGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTCTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATACTCACTTCTAAGTGACGGCTGCANACTAACGGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCANCGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCATGACTGCCCCATCCCCATCTTGTCNGCGACAGATTC +$%$$!!%+('(&!+*#&)$'!+)%'($!*('%!##(+$"&'+%)%'"!!*$$'"'*+#+#"%+"!*)'$$&'$$%)"*&*)%'!!#$'#!%&""+)(&+((&%%&&)$)!&%%"%!"+(&$&*#'*#"++##'$$*&'+(&"+**)&'#)&&#(&*"*&&'!(*!+&+(%!$!&!%'#%#'$!&**)+#&#))*(!'*!#&%"&+'*(##'(#+$$'!$)+++(!$&!#*)")!+)')(%($#$*%$&'&$'""%($)&))+('*#$%$+'"($+#++&"+(#&+*%+"'+#'$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:26T90T6C51A81C24T11 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9268 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37484 42 60M = 37544 355 GGGTCATGGANTTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTG 15-8=112%?$/E1'.C":>.+:9C!1#!*H;"--.?*9=4FG94"=0A5.7:/"?6#57 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C9A49 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9269 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4064 42 54M = 4118 239 AGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGGTAC C8%E32%!E9-G/BC@E7,@D;4@&':>%;,;E/"7>C+2FHH0DB89,DC/(H7F8G8+''6'!&%&5B@&&>4=-C0>H.(#D2C=:3;;=7&7>!#@#A7#C8($G;8@,$29&%$9(A%4.H.<4#.'9D(3'F9DBF)6'0>,;D+8)9#BA=8=$G>=:7!2'3%+)!6D< AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11C17G36C65T52 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9270 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23687 42 118M = 23531 -274 AAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTG 88(&759H,7):HE@9G'.>0*:GD8'+!=C1>:?,!:-(!F'83$,'$4E2408B0CD%?D&29 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:118 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9270 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23531 42 45M = 23687 274 TGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAA C2?B??*.%B4$C'EE/7,;+/&5C'--)/1C'99'E,@,;6D3A%63,51$)!0#3'(8-+:(1@-*EB:E-8*H=$@72'9"*/F-<%;(((A,!A908D72-:891<#!":<@E414=+F/%'::".7%AB2D=&;8'/--.4:82A@H%?AD29=(#:@%" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:153G13A73A155G0G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9272 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42912 42 117M = 43029 366 CAGGAAGCGGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGNAGAGTACCAACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGA 1F2D"BGEG;11F;.50'C;%&4!!1$?%*=$#D#1;B/":!$;:;5G/=(F51<4./A'$27'C(,H!@>E2F%A%H-H690#++2,4"FD>$C):$&*#4&>81"")>(6HH'*. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A67C40 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9272 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43029 42 249M = 42912 -366 AGTGAGGCCGCATGACGTTCCCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAANCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCATGCAGACTGAAATGTAGTCGCGGTACGGTCAGAACATANGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGACGTTCTCATGGTTCATTGCGGATGGANTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTATAT *()&#'"%+)*#'%'$+#!(*)#*%#$#'()!**&(&++#)!(#'*'!$)'))%(*!"&"$*#&+$*+&*+(#"*%'&"++$$!'('$$)"!!$#$(#%&*'&"(')$')*!+!+#&"&"#&$+*!%+#&)*#'&*!$+$&+(%!+'#%!%&!+('&(%*&##*+#$)#**!')#$%)#!*!*%"%&+$+%')(#)*'$$&!%+%&*&"(%##%##&')&*&&+$&"($+#&!(&('&)*)'*+++%)% AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:20T32G26C33A3C57C9G59G0T1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9273 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19972 42 175M = 19899 -248 TGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCTAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCGGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGC (<(0AH8<3G#B!G#-1"*+0;85F3#*$1B$0;'*62/;FH/E&"E.C?/C.)&)B9."==C2@D&10<,5<&0.!C1"(.3)G42 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:79C47C2A44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9273 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19899 42 69M = 19972 248 GGGACGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTT $'$'*+!!'!*$$&")#(&(+#)$#*!)"&'$*!(#&*#("#%*!$)***)#$&&&(*(&&!)%#&"#$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9274 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13736 42 67M = 13528 -275 TGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGGAACAGTTACGC >8@77B=9:0;(#EH=#H&:&1<5:<-)3:$,,,#43>#""9&B!#>4@3-&+5!H7/H$$)G- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55A11 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9274 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13528 42 208M = 13736 275 GAACGTTATTTTTTCTGTAATNAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCNGTATTCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGNCCCACGCTGACGGTTNCTAACCTGTACGGTATGGACACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGG 549",/"?>:533)@27?.1<$'>A281<8*H33!#45;4D@:H-@=:*=)31A-7@4AE5?5.19.$C=1A&?4/3:;A+@=H5(?90)%8,(?-%C.&%E.7CDD>,G*/30C;)B'EBCC!(C#2:8;'!20B0%F'@F:%#6E<6H4< AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:21G51C4C49C15T18T44 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9275 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 209 42 86M = 483 329 CAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAA "('23#344F1E31E/)%+9DGA2@EFFHA.669"&"%E(6HEBC86,&1%BA$@*19+A<#':"622("E2-02*G+.17.@653 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9275 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 483 42 55M = 209 -329 AACTGAAGAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTN )21#H(<0$*'$=D"7(F')8;6(G&@4G62,!0$H!GC)&A+@2#3B'*A%G&" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9276 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37825 42 41M = 37656 -210 TCTGCGGCAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTT +$GD5;$7@F4H<25B6,"BD0(A(@621!9D$B05>./,1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A34 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9276 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37656 42 138M = 37825 210 CTGCATACTAACCGCTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCANCGCTAACTTTGAGAATTGTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGC &+*+#*!()"&$$$#%#"!*!)&'!)!"+##)&(+''"+#'#(##&(&!#&&!!"!##!&+)%%&"**&&!($!!*%!!*(')#*+!*!)#"*$!!#(&$+*))"(*%#'%!'+$)&#+%"('!+$")*#')*&+%(& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64A17T55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9277 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46715 42 57M = 46715 0 AGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTT HE@9%1@/A0HH*"8>&"D#0.%C$0*AH.#5:;#>7'DH948(%%F+%F0<9&-*G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YT:Z:UP jpayne@0: r9277 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46715 0 * = 46715 0 ATNACGAANANNTNNTNCCTNNNNAATGNNCACNCNNNTTANAGCCNCGNGCTNGGNNNTTCNNNNTNNCNCANAGANGTNNCCCGNNGNNGNAGTGNN !$$#!$$!!"!!!!$$##"#""!!#!!#!!##"!#$#!""""##$"!$"!###$!!!#!$"$"$#!$"!"#"#$#"#!!#####$$!""!!##$$$!!! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9278 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1431 42 74M = 1304 -201 CCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGN <=C,D=EF!E3,+&1<"&,+E8-'0")1F,=G1C4B%)%(2'//23)H(+95'HA3/">C9;(E0B75D2(>2! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:73A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9278 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1304 42 116M = 1431 201 CAAGCGTATTGAAGGCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGCCAAAAGTGAGAGGCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTC H06@=#>ECEG&!B-A('=!=.'*>!68!/!59(G>-<530B'@>"/$005GF0=.3#"1:>*"C;3;6E#"#7!11%#F:37#;.%:4D?H@)C.>"""/5-F&9-B8.<$#2,B"C*5-FA;!-H$07FF9E3;A2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9280 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19143 42 63M = 19358 265 TGAAGTACCGTTATGAGCTGNCGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCNCCGCGT G$BA"(;5.6&(*)&>A">@)<9/;#G4G%/0/AF+,01&9&A-& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A35G6 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9281 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14675 42 231M = 14571 -335 TCATCAGTGCCGAATCACGCCGCAATTTACTGCGGCGACGGCGAGCTGCTGCACCATATTCCTGAANAACTGAGCAAANGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGG <%EG,*59)95/.3!G513#B@EFB'.4'4*3DD(H6;%.6&'8#;G:7>,9;D'(!'9/B&<1,H76=9*&A9)D!,>7:7"/?+'*54H%=@'BG=9>'3<&98$12E"9>E&4'E(%*&5E2BC6DC<.6#)/,))"9;6' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66C11C152 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9281 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14571 42 104M = 14675 335 TTAANTGCCAGCATTTCNANCTGGNTANTNTGNCNGCGACGGGGCTGTATCAGGTGCCGTTGTCAGCGGCACAGCCGGGCGATGTGCTGCTGTGCTGTTTTGGT "*&$%!(*$''))'&'&!%**'#"!'($*'(('"!%'&+!"$$&))'*#+#)%(!+!"")(!$'*+)*+!+$%&&')$"')$+)++#%%#+"$"!+')%+$*(! AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G3C0G5A2C2T1T4A2A1C2G0A0G69 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9282 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18863 42 102M = 19071 249 TNGTGGTTAAGAAACAGGCGCTGGGCATNAGCGTGGTCTGAGTTTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACG "$+5>3B?7H4#5HEEC*"(28+(&8BH!EFH<1%/;4!B'&E5!7HF4051-@CG8D/5&:C1)=D*7BC%F)47*9)D5@;D"( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G3A22C14G58 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9282 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19071 42 41M = 18863 -249 AAGTGAAACCGGGAACATTGCCGTCGTTGTCGGGCNGGGAT $29?$7-071D(D!;15-3?1795!>1?&$6/HACD1&>98 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T21G5 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9283 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12074 42 61M = 12233 315 ACTGGAGGACGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCAT 8%$*?/'+<0?#!8HD$0-$.3/@5+&">>/?G:D6$B#'#'2%-.*B!7F::&9< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A84T12 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9284 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21515 42 99M = 21762 305 GNGGCGAAAACANNAGGNANTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGT )&"%&*%($()&"")*$!"#%)+(#(&&!%$'#%*%($(%)"&!''(%!!++)$&(*'$&)$!#*"#!*)%!'$%%"++$"++$+*#(#)+'*)(##!) AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1G1A8A0C3C1G79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9284 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21762 42 58M = 21515 -305 ACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGG 5GE*7!A89+80%8.D<%".@$GH!&634(H@64;>"2*(1G)%"D7/";717B8)8D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9285 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40111 42 77M = 40289 282 CGGCCGCAGATGATCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTT .';+D:=%&52#F6:.36=G@4/C5&&?;4+<94B?FH0*<-3H<)E##3HG5C1%@6@3B)5<;<,;'%>)(D,70 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A12G63 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9285 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40289 42 104M = 40111 -282 AAAGAGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCNCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCANNANCCNCGCCGCCGC #$*+$'%+(!%&)++)*'$'!)&&&+$%('%&''()+*&'&''*!)'%!)(%%!(+&)#$%)*)++$$*)!))"'*"'#!#*&**''%+#)$)%#!%"%&#&&$ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:60G27T0A1A0T1A0G5G2 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9286 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38243 42 89M = 38455 266 CAACCCCGCTCTTANACATTCCAGCCCTGAAAAAGGGCATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAAT D--+DCE5'0"0,(=(2+*>C&"D@!7D";;(:D9$::>H"&64#(BH1;D!F.B-,@3+&2H+#86#D;<8DEG0)*D>/,#F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T13C74 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9286 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38455 42 54M = 38243 -266 TGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGGTGGAAGAGGGACTGGATTCCAAG H;9=/>7+*40#@=;E&$A3DC2?2/,H47H??9D:6BF4H3$-:,C!AG3@4$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9287 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9757 42 186M = 9943 414 CGCTTTCTGAACTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCNCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGNACAGGCGGAGTCAAACAGCAACCGGAAGTTTACTGNGGAAGACGCCATCAGAACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGNCGCAGATGCCGTCCATGA !1";'C6&AHFHH#<2)@@A'EFG<3B1-:48"A-92+GH:%'3=-5?*.;33'H:02-E/G0?#B15>(CHA,(DF;?!:'43A6"*4F57C4.8-!C/G0?BB5)GC*%G*':B<%C<+++B0$&/!;;5#HD5EC$'&"@?0./D7>2F AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:39T23A13G21T67A18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9287 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9943 42 228M = 9757 -414 ATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGNAGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCTGGTATGTATGAGTTTGTGGTGAATAATGCCCCTGAACAGACAGAGGACGCCGGGCCCGCAGAGCCTGTTTCTGCGGGNAAGTGTTCGACGGTGAGCTGAGTTTTGCCCTGAAACTGGCGCGTGAGATGGGGCGACC :DG9=.!GHE.)89??060G4+)";G,@/E/=8F"F&G,<8%=?64&D%B@<6F-&?7("75:1<9&7B=9D<:E56?4!D94==$?1(,D">)7*-1+HDG0:A%,D$!1$>121%B;,?"$7(8>B9H"9-C(!G)%C5GG/H';"C+:"E!B.6)>/<)/>=7C=E-'@A! YT:Z:UP jpayne@0: r9288 141 * 0 0 * * 0 0 ACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGANCGGTGTATTACCGGNTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAA D;F%D&'*1<%#&AB*.+;@D3>714)7*9923AC!?H83BGCB<)7B$=/0>D1!*!6)?=&1.0.H+F4C@- YT:Z:UP jpayne@0: r9289 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46206 42 57M = 46447 288 GCTCTGCGTGATGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGG @2639%98D*HB--AB.@(*&+>@/>)B.5=;;.F:1">G739)5)?3E0CB-#16" AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G24T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9289 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46447 42 47M = 46206 -288 CAACTCATGCAATTATTGTNAGCAANACACACGCGNTTCCAGCGGAG ?)($D-CF448)-+B8*:9EF;7B/&A<<096>>8.&)+"'.@1B0. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G5T9C11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9290 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31693 42 107M = 31859 263 CATACTTTCGTGGCGATAGATGATCGGGGATTCAGTAACATTCACGCCGGAAGTGAATTCAAACAGGTTTCTGGCGTCGTTCTCGTACTGTTTTCCCCAGGCCAGTG @C+80H0"D/+/.;-:4#6.(@)!&4=(4;3E3'BE!1@:=//A))1'0(F@;.)@,:(3$-*@3=%-6CA/?+H.4)(+/&"H?' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:18C1A19A41T7 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9292 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26385 42 157M = 26207 -335 TCCGCCCGATAAAAGCATGAATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCTCAAAAGGTATAGTTAAATCACTGAATCCGGGAGCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGCGAACTG G27EA4#&#+/77.2('H,&!>+08G@,*.7.A*.&:A0C5+/?5%G3FAC+C(1!>)#G@4;F%.C$1/'>$.A&2D('07!8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:157 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9292 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26207 42 178M = 26385 335 TTAGCAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTCTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTCCATTCAAAATTGTTGTTTTACCACACCCAT 0B9%H>7=2G!-3-;%"/+.@542*(&-?4F"?'(;1>,CD!F0=")/3BD>&!&<&E<6C%+/",+1%<78H##.$?9B36#423'"-#70&DEDG94+G+)9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G59T113 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9293 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17319 42 99M = 17058 -360 TGACGGCGAACAGATTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCNGGGAATATCAGGTGCT B81?=5?>%>&0H$=8+2C6#F7#9<*CH3H&)@46;A>$7(&76EB0;0E*E20"F,7H1"!.<77550#0""63H/"5?H4.#)?05C1(##66F&$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G67G16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9293 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17058 42 261M = 17319 360 CGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCGGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCANCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGNCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGACAACGGGGCGCACTT -"1$-D<+=$B;58'/)4(+3;;F7D)F'-D=$2(7$@=7EG,!,D0,3H5F;5AF4"3)9=.@>:8H=>)#;.F5*$0E-*D-?28"#597.&&+-.5,216(?4>;&.C?>415(7&.F(;.1;DH+>D6%'>F1:.-E2?%#&,/687#;"77'H?C(.DC09FC)@;C''(G''",%F7@809$.#69+6*:(B?289/C>H9&-D=0?3:+?C)7!#'BF055G(H57G)B+#-8B AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:35C26C84C98T14 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9294 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35091 42 60M = 35267 261 NCCGCGTTCGCCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAG "E;+B&@(%(-7!C AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G56C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9294 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35267 42 85M = 35091 -261 GTTNTGCGCTTACCCCAANCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTG DD;5+3):**FA?$(5$6."+A:"#+A$EC942$?:A0(-7GE?&<0@4C#)/D1.D,+G'1&?7'1$-(8!=8D?%&*&F?C9F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T14C66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9295 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18714 42 138M = 18544 -308 TGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGT &))*"$''$*$('')$&+'*"%*(!(*()+%$!()("*#)"+#$"*)++$$$"'(*)!")(("*+"+""+$#&%$((*)+&)$##&!(+")")$"("(#))(%*$!()"$)!$)""""***&$(+$&(#!'+$'#'&$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:137A0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9295 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18544 42 170M = 18714 308 TAANGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAAAGTATTCGATCTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGA ")"!(+%"!+*('$*!)&+!(%&+%*")*+%'%)+#((!$**")(&"&'($(*&(#!+$%+)&+)("!$*&(+'&)"$+"*$&')")+'%"'+%&(%%"%$#%!)!&%"("&'*)#"+!#+$!#&&*$&%%##(#$(!)')$!'&$$!'"((%+"%!%''!*)+)$"%$% AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G1C0T50C63C9G41 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9296 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2492 42 53M = 2315 -230 GCTGGCGGCGCTGCGCATCAGTATTTCCCGCTGGCAGCTGGATCTCAGTGCGC -D5C54G>F)3:"2,-D+".?E*=9'(6,?3!?E3;2/?A9EB2A(/7."5-2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9296 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2315 42 126M = 2492 230 NGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACT #;4B".B4&C%;.4G*7H,3;23+8%/3/:6/!:<7&&A&%D##(@#A92C0-64"&D'2><%.AF0"G00$$$31&*$8@.DF80AH>'?<:.A5>H"$F#G4C1@6A@%<%&$EA>H>A6)69? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9297 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17410 42 48M = 17231 -227 CAGGTGCTGGCGCGCTGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGT <<9-6=H07>@(E/,.<5A,<,8.E%E88+(;1'=5*',F=;4E(>"H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9297 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17231 42 54M = 17410 227 TCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGG -F@,-C+)HG9,*2%$F39>.1-/3.,$%5**H/2)A,-=!1?B6H,$##A:B7 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9298 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29616 42 61M = 29403 -274 CCCAATCTTTTTGCTCAGACTATAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAATGTA #B!A79G)A"752?)>,*82E=&8,(17169!2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C39 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9298 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29403 42 213M = 29616 274 NGCAAGTNTCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACG !=;2)%)DD*8&(,!$0>EA6,(7)6/=3-G/;!9)=.*&F@"BB:(:22*9$9#A:A*36'"2@=86.1=(&1H:>$05E;).B;G%-9GH10(>"-""0EH&#$8!-+6&475?;)$8E03"1H;6@$;#D"2@?B!8:$G,&$8*G*H29A+!7E3-=<;H+&.B;74%6H8#64H77*?8?8'B8>24H-'204D@*3?7@51G&"<&G AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G6A205 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9299 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35929 42 73M = 35713 -289 CGCTTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGAC 2.91(@E!!:(%B**%A2'.H!!<='@*7%G.A$:.)&*5$#D/0;075$;<%0%$%*7!+%AH(F% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9299 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35713 42 216M = 35929 289 ATCTGNATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTNATTTTTCAATAAATACAATNGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTCTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATGTAGC A,B'>*8!1?,<5$C87?H57'071%6;?!*/@0$GH6<$;F!H+AFD;031B!F>C9.1E?!&'!)GDF(03?;9BD&)%#E4;B+.+C@5($G<1)/G/94*>!7.5"F>-#A%H/)$$>+1)+C.E6&7;)55+$GH2F9:8':%09*G&B=3E5D(=565B>D,B(:D&(8G#>9!E2;'::@HE&36,-0+%BFG=D':5+4@94$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5A29T19T160 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9300 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29968 42 201M = 30169 313 NCGNCNNGNTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTCGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAGTACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGAT ##%!'""'#('*$+!+++%'%(%##(!+&'!()''+'($(%''%("$$'++!%%%%(+%&!*!)"#$*!'%""'!+(")(#%*''&#(%&!"%))%&)+&(!%(%!'++%%'*%'!($$'#'''+%%#!&"+!$"%'(+)'+$%(("#"&%$')"&"%!%&!$*%($##"+($%'$#+&)'$*'*++#$"+(&($$)'$$$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0G1T1T0T1T46T82A62 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9300 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30169 42 112M = 29968 -313 TTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTATTGCTGGTTTCTTTCCGGTTCATCCGGCAGTT 8$':38D:;($9B:+?E:4&*!99A:"09.<1A/$!-08::=611-<49*D0'-.(=':!.-?/,+@)6=012222!&>B@GB#%$(2'E,=E>5%,>;%*)"1:6@;9(5% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:96C8A6 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9301 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2697 42 54M = 2536 -215 GGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCG ,B=D#28E18C1(-89:(;5*,+A.C3+5H"<20,>#3.".G378D>>&"5'HE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9301 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2536 42 57M = 2697 215 TCAGTGCGCTGCTGGCGAGCCTGCAGGAAGAGGATGGTGCAGCAACCAACAAGAAAA 8.D&1?-&/$G,35>8.5(=F<=#%H3(<)625C':;$29E98!6(D:'#%--'.052:D)G1B#?-@6%2)9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C37G27 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9302 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28866 42 148M = 28769 -245 CTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTNCCATCCTTATCCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGA )<1(&7/8GH15&F*!<=%04F-'(#E.2<&B7C:<.1:+8D;9B;B>/".6A2(8%'<&)6=/#24G<6AAG->+=;#7'%9DBC)C"#@GAB6'(1<+>G$A3B-B1*7,!H9@@,F-5@)"6"9BEEE==)--,>7;=+:(DHH0)!FB:"7@,29!-&C273"0A@CB*E<(F"359G&+036$0?;1')'%79C":!F,=39%"<",73$"B@+E/83-??(712$)+,#<<9GF0B>"$F=!)7''=HDH#26CG,+;:06': AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G2G110A50 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9303 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21710 42 80M = 21809 279 ACCAGCACACAGGGTATGGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGT @D!CG9C-1@*G36.E.4=?0'.F%#4"5'D@2;4:6F3.?H$B*+9"B7/B&-,*)$1/#H@@$"="78E6"@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17T62 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9304 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27164 42 48M = 27237 211 TGTTGCGTGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCAT '**(#(!)++#+&*&)'&"'()%")!%(%+#(*+#%"*)*#'&!"&"% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9304 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27237 42 138M = 27164 -211 CTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGGGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAANNTTTG &&!)+'!%*)!%))!$)($+!'(#!)!+&&(#*!%$$*%$('%!$!""!("')''!")&"'&(&$'$++$&("&$'!"*)")#)$!*('+$%&$$(%)%$!%)"&*)!("*&$'*!++*#(!)%""!+&+%*#")')* AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:78T53G0G1A2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9305 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4441 42 195M = 4224 -412 CCCACATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGTCGGACCACGACAGGC ,?=+21&A).?97'09(?"(#*?;5F7>DEH1B#$"4@50>G*3A;E16"*BB$%<2F!$:<#B7>/&/)/.6"@-3;D!36F6D6,!F!&=D24399=5)E;417G+C4$EC"-3%.3//D=*%C,(0;;H#7,!?2-/240($"?<6G';B+=AHC(8G51"A0/<)HH7(1-?D79,*+42.+0,&+!-!5/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G175A15 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9305 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4224 42 217M = 4441 412 AGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGCAAATTTTTGCCCAGCAGGTCCGTNAAACGATGGAGCGCCGTGCAGCCGGTCTTAAACCGCCCGCCTGGGCGGCTGCAGCATTTGAATCCGGGNTGCGACACTCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCT E8/G=7&2AC699:,9##;D*2.9B1@(31?<(4!D0-=E9@@+".*)E<)!+!D4!6/?&)61#39#9AG??<:0536*:&?E?%&!ECB>("-G)7B04,(DC4"=6B7D$E')6673D#0*@/*=A$;61)6A'G2><$628H$-8>&?%!.)'*+3,#C?#DHH)?(:#+4%630G6B0?EB6=*E1&;,@2.#?H'78@5B#@%GGB AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:73G23G68C7A42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9306 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26471 42 65M = 26312 -224 GCACTTTTTCTATTAAATGAAAAGTGGAAATCTGACAATTCTGGCAAACCATTTAACACACGTGC %G')4H95+2"01-((CC(&@*?A+"$6)<#3-E+C9H=G4..)*/,F)6GAC#G-0(GG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9306 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26312 42 49M = 26471 224 ATATGTGCANNNTTTTCTGGGTTGGTGATTNCACCAATCATTCCATTCA '"#'!*%'#!!#(+$'%&"$%#(%'!(**)*)*!$$*++'+(%!''#!' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A2A1T2T0T0G18G18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9307 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47034 42 65M = 46710 -389 GTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCANTNANTANTANNGTATT %!'!(*$+"$)!##)(!+")*!##("!#!#+$#'(&%'#'**&#%*&+))"#*%'!')$&**)*) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:48G1A1A2G2A0T1A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9307 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46710 42 324M = 47034 389 TAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAANAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGANGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGAC --1*1D*27@,E<"*%$)C(@E:G;=23&,$2'C*'7;G"84G&,8535>4%"CAD,684)1&%/6$F$&381D<:EAF0H46?A@+;=C!'&)$,E,%&<8&:3CG'1539'H)!&1+0!53>,@'?E"51;"2B#!!D**'D>7=C(5@5A#2%<:8"/-'5).69EF.2'-?2>"%-D?$C.6:@4#F=1,/'AG@)-8'3=DGFH?'?@7!(G%><><6@DB%$1(*14(=%,3(E@4#9%C>9:"*G650:112$7%9*"89!74@:762'E41/!A4=,9#A:5%.=(<3'%C'<-9>A9&H5>"3/.D=8$!9!*=3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:99C63T160 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9308 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8395 42 73M = 8035 -433 CTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACA BG<'>'#2:.6!#(2H*+<7'A*1/18($:79,=12F0+$%1?=2%/+!F/H6%B-6B7#:@G=:C$G?>G>> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9308 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8035 42 265M1I95M = 8395 433 GGGGGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGNGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGNTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCAAGNNTCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTGCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGTAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCTTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGG $''$(+(")("$$("#'%+)(*#*%*$#++"%+$)+$"&!+""($)$))&*(&%("*)&&+()"#'!%'+"""!'%%#!$%"%('#'!)*&"'*!!'&+'!*")+'%%!**!'))%%"#"##&!$%&+&$%'#"(("'$((&&%$)(%)&+"!("()+*&(()%)"'+&+#&((&*##*&&$"(+%"(!!(&("))!)))()($)"+(#"+&&*$)$!%!#%#*(&#$'%+(*!**&*$$#)!#)#'!$(+(($#%#"&+&))&*)&&#"&)!%*&(#'#'%%(##(%"(''!$#""'!%&"&)"''&*"'((#"+&&'%&"$!%)%('#''#)###!*'+!"'$"(+'(#+"$&((*(&$ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:11 MD:Z:0C2T44C73C31C2A0A59T41A33G65 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9309 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27624 42 58M = 27744 186 TGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA 2G@"AC.D.?:5D(=".7$?G1>&3&CC3#4H10);BD3*7;,9>7294A24GF8;$= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9309 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27744 42 66M = 27624 -186 CATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAANATAGNAT (2$&%?8!1(">,)5,.@-5''H"!)0*G81(=&$0/2/+E,HG)8"4D#B:(,>%E9"H&=@ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:46A11A3A0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9310 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6546 42 131M = 6344 -333 GGCAAATACACCATGACCGGNGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGAAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTAGGACTNNNC "!(+%)!!)*+%$((*+!"**&%$%!'+#$(+!$)"%&"#&#!!$&#))!''#'#("))!''+'#+&)!*'(+%""*(&$!$$(#'%)#($(!)(*("%&*&"$#+"!'%&+*%#!+)'+'("()%!!''* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:20T35C65T3C0C0G0A1 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9310 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6344 42 80M2I122M = 6546 333 CTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTAAG "/:3D$42%E>:5&,A4?'"&>.0-1%,=GD=92'@8:H3,'@AF3H7$F27--@C)?%.5H*2EA/8*<@>><68,E#!"?(C7F7<0"FA#ACC>BB7GBF$/-3F2C0!HD;"4A0&DE,;D@B-(8/CHE5?@E8C";<$BD6#/EC$!!' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:202 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9311 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46006 23 84M = 45849 -241 GCATCATCGTCTGCCTGNCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGNGACAATCNANACA *$#$(&'!+'###$'*++*")&#"*$+!)+$$&(!)*$#*%!!)($&&))!%!!!'!"#+$%"!+!&!+%"')''"!*(!!(&* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:17T52C5A0A0A0T0G0C2 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9311 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45849 23 35M2I5M = 46006 241 TANNAGTANNATNTGGGCTTNACTGCCGGGCGCTGTAGTTAT ()##''$*(&#*%+&$"'&$%*'!%()"&%$#$!$)'*'++" AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:10 MD:Z:1T0G0C2C1A0T2C7C19 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9312 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22067 42 255M = 22322 325 TTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCNATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTTCCGGCGACGCGTTATTTATTTCTGAACTCGGTCCGTTACCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGG %8-3"/F&.8D#B";#=?F2D;E6&HF<36,>&.#4-&-D9'F=1"$9+'D*;8@#!*>0/29H(F4,6HC.!%:.%(A/48"6$DC*7F#7=/<:2(=H.BB-(;*2)=@!E"+*AE0'(&"(F6!326$%>:BD."-290F$+.%C:3/,584->!792DF=A%5D.#+HA20=B19#A:29>/H9-9+).D9?#/D"D47!!"G.'#>D)B,#(0C5'/E&8'+"A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G219 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9312 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22322 42 70M = 22067 -325 ATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGNGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATNCAGGNANN %)'#$&$(*&*'(*"&*+%"#*"(&("&*%+&%#!$)+(*'!(#'&&&#$")'%(*$%$+!+)"%*+&$% AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:31G29G4T1G0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9313 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38626 42 189M = 38057 -758 TTCTGAACANATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCA 3;:F-G#H2%/"G7478EB6;9:70"*;=CC6:@$16(!-D5!&!#9(=20-=C"-D+1B72E/6&*A,$37FHB&>+(*<+8'(9$&&=>FDF%1$2;4G5H/8)&06/H(>:7!8+@G'#>1!;$?7,B=GG3@9C2E0?2:@GH(.4&?38>1,G@2#31D6/>-96D-1(F@G%?;,(&CB89/;+$5@+B0;B!74-;F(19+1G=GD!2;-=@D91285>(!3=,%6#>0!:;(2G767':<#0$&@"#9;?7#!!FF9%"118#/5.E:.099"+"52C6=H2,<47D)8435B$-<1&*B:6<8+&4<9?2!?&>E8H?A/18#:*,!'!4E%F+C?*"=4C+9%7&.D+<@@$15@$)E510B+!9$6F5*6EF4?844#+?+"85G.'1"C'7$8#1A>,=AHC5&<4F?@)(?G@=+?E2BF)(#*H4/:#9'$%".*%8#3E94+4')-B,*$66.,FF::<+2B#(8F-(?3>9!/;#E&C6#($4$4A%-->-09"$@&4A,74"*710998A2*,70#E-&C6,0"H?=?29%CEB=!EE=-&A#-"%.2#8'G.A2+A&E?'B93A1D*:!4#2)CCAA(404E&+?B#)(7E(0,(<;36'"8"7C0;E(%1EE(+/B$*17%A#;,,C4!$,C?.&(2E763<6D7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:131A72G12T3 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9315 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14064 42 50M = 14064 0 TAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTNCCTTTCCATTAACA A6624"429+#1::=3A4=!(;C%#&?D%G&>>EE55F+@,#%=3HB)?" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T14 YT:Z:UP jpayne@0: r9315 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14064 0 * = 14064 0 ACNGTGGCTNTNTGNGANCNGTGNGNGCCTCCTNTGTACTGTCCACGCCGACGGA &&&(!!$&%&#%*%"(!!("("''+(#%&"!""%!$*%"#(*&#$*$%&$)#"$+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9316 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33052 42 316M = 33368 476 GCCGGTAGTGACGCGCNCAGCTCTGAGCCTCAAGACGATCCTGAATGTAATAAGCGTTCATGGCTGAACTCCTGAAATAGCTGTGAAAATNTCGCCCGCCAAATGCCGNGCTGATTAGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTCACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCAATAGTGAATTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAG #"$(+*)(*+$&!"+"$$#')+)+(&""+'+&*&%*$#%*'&!&#)(&#'''"%+%&!')(#)$&#$!++&#!'+%+&!%$%*%&)#+")'$)$&'%%""$"(+$+#"*"$'$$##+$$("""")$&(+'#$$$+((!(''%#((&#'(!)&")!)()(%))!+&%!'+&+($&)#$(+$$$#)"&#'$$*))%%#)$$*!&)##&'"%%%#((**('"#("(&#!'''!!#&%*!&$'+&&%')&+$"(#('$!#&'*+%#%(&(#%##%''(')&(&%!+'")(#&+'$%)"$'(!#%$&))$#+**')*+)#& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2T13C73A8G8G128G78 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9316 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33368 42 160M = 33052 -476 GCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACNGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGATCCTTATTTANACACAACGAAAAACGCCTCGAGTGAAGCGTTATTGGTATGCGGTCA )&(&*!&"!($$'%++$""'&$+"+#&!))#&'"&()$!'*!$''$#)+$+*%+#!$*+$&"()(#'")+("+#*#)+)!()#&)#&&$%+%(%#"*%"$"%&#'#'+'$!&*!)"+!++(*$%+'*#%*($!##*(+$&'($)!%+'+!"*++)#+"!) AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:69A32C10T3T40A1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9317 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30587 42 116M = 30769 230 TGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGC DF8D52,)24>(31D/+9@:4?#0+F!>ABA?+"579B+,BB<+.$!;$*@$;D<30(8-6(,,06B4=<7".:%.BG&2!//FEA9#'21A<9:")G&,?68G!E+1A;+<(0B< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:116 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9317 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30769 42 48M = 30587 -230 TGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCT ?E@%,8%=4FE=(<7040DE0C4(E-.8@A547=@CH2D8'6(9)B%F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9318 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3589 42 87M = 3812 277 TACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACTCAGCTGCAGANCGCCATTGAGAAGGCGATGTATGCCGCC $4GADE>:H:-+><'+>=-(@+BH2?3B4.96<*H#-=6:(#'AF@G+!&'!@5'5+F2-;$+$8C)(2D,4#,+(G./0H7D%A"/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47G10G8T19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9318 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3812 42 54M = 3589 -277 GAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGG 01';%<*F485H@)<*F/DC18)$=*-##H@=2D%$%2,+0@;*<%9@D%2CB) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9319 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34597 42 69M = 34841 287 CAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTG )+>#2.'C!,'>3C"+'=57D8"%-9:$*#)@+;D@C5#<=4H)@E<;#=,#/78D/#1!&#EB".*;1+B":<1=394'@2319"=;1-/9,E,7782>7H0CA-),:@@1/F7/6-0).2-G,2'=.H)(?@C:CG1>,?-#;7!)H!?$?">":E1>=EF9*CB%.!<@:&B4&$%*/9(+23)::0=0,0C->--98;25*FCC-F=$'8+?'>;"&?C9-,G?3'C*.F@0<>40@'DD/;#GE+.&):53/7.(C52/&#!:"7)(*2D6"G@-(?:*A.8:A*+HC;??#(,3+D&6BAF$C,=!A#-=BHD%6++H*D,B11#08 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:190A153A7 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9320 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27568 42 47M = 27216 -399 CTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTT 6''B5D>E@2H-/=%2"9E(-2)>0G>D4)+,CC*>"@E>;--'$&G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9321 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4533 42 143M = 4676 326 TNATCAGNAGCCTGACGGATGCGGTGTCCGGCGACAGCCTGACTGCCCAGGAGGCACTCGCGACGCTGGCATTATCCGGTGATGATGACGGACCACGACAGGGCCGCAGTTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCG !2"%9(BG(*;1'C;@A"1*#41,H3>6!-8;GD#;?-:F)$6'7GAH.:6H#1@6!?/)<7%4',1"?B?%@E:.C=1?F)7-1;&/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C157 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9322 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4639 42 50M = 4828 275 CAGNTATCAGGTCATGAACGGCATCGCCGTGCTGCCGGGGTCCGGCACGC *2H:4,-5HA1H"800&5<330DED<" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T34T11 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9322 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4828 42 86M = 4639 -275 GGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGCCAACGACNNGAACTGCA *"'&('!""&&&))$+"*$)+!!&+*'"!!)%+**''%&$(""(*+'!"&+#$*&$#&$#!!&$+#!+%'&&&*))%!($&'$$&% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:76A0T8 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9323 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21053 42 69M = 20813 -309 CAACCGAAGAATGCGACACTGACGGCGCTGGCAGGGCTTTCCACGGCGAAAAATAAAGTACCGTATTTN &)%6/>1?D.3#;/0/%>EB54"=B%';!>5?83(<,?''(F+1G8B=>>21.'%0HF;.%'5$:.)0! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57T10T0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9323 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20813 42 134M4D100M = 21053 309 GGATGAAACGAACAGAAAAGCCCACTGGACAGTCCGNCACTGACCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAATGAACTGGCCGCAGCGCTCGGGAATGATCCAGATTTTGCTACCACCATGACTAACGCGCTTGCGGGTA G8C5CEF&C;,E46D7,B>A.C:49B,/535#"47!0G="C8A<-6(0F'G*;5#@/)D=034/*;!HHG6B7648&@2!6&&6.CC!="!E?>15/F('./%&HB+1,=)7943'4 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:36G97^TATC100 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9324 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29471 42 106M = 29257 -320 CAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGC #)&+"""()&)"'!#"&&!##*'))'*($)(("!#&#$'"!$'"&+#+$##*+$"#+(!&!*!+$$+!(#"&))#*!!$"$"#(&!'#+#%%"'&)+&&*))+++) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9324 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29257 42 170M = 29471 320 TTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATTGTTATGTAATCTTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTNCCACCGTACT F=."8:#:E041?7>16%*8,>7$>9&.13H<&5//$2(BE7G(3??3'>237?7@G*%=.62GH7=9:GH8GH@C3&-9D=%?;7-H+H(H&>G5:9#5+A+D-C7! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:110A48T10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9325 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46532 42 138M = 46670 273 ACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGNNATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCC 8!0+/H$D;9B&9&97GA51'4/=/.H-FA(?49C3/=;"A'"15E2#/,)5;5AE-!6;.+3E;+. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109T0G27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9325 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46670 42 135M = 46532 -273 GGTTTGTTTTGAACAGTAAACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAAT 4HDF5A#3%C-F4$G08,!58)G;F9B-DA/B+4'<@F3/6E,A?4)+2@1EG.&+':*=E5=BE#$4#/@++E5H.!!;"4H=+><6F%7)4./+7<78#-%-'($/D1>$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:135 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9326 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18372 42 98M = 18503 226 CGCTAAAAATGCGGATATTAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATCTGACGATAGCTGAAAACTGTACGANAAACGGTACGCTGA %&$+"!("+!'"*#)&)%($%(#)$!+'+#+($#$""+"#+$'#+""&#'###(#)'"$""$("+!%&''$)%+$!!""(#'*#$")!+!++""!(%' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18C39G24T14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9326 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18503 42 95M = 18372 -226 CGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGAT (;?1H+5<6:(B-4?>?+9'1750G6G>BH<4=H%?<=)#4'%H34H$@B*>6)"<5*.)1C,4))#>G,1EB0+6).DBD2C65-140#C5)21C-36$D-71040B+,D<1&&&.5'81(.2$6&!**&5F-F?'65B%D8/)%97=C9A3?#53F/8,*,;?0A943C;A6*@)H=;F=0F=E:7GF@#(7*4;-# AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:58G31C24A29A23G0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9328 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42127 42 87M = 42243 233 GCGAAAACTGCAAATGCCTTCCAACGAAACGGACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACNTAAAAACCTTCAACT +'?68'$(97E@H<=94;>D,:E#*$&$G$4$A#57>/E$6A!"C&"&F,6*0<-A4-"!!F/6/+>+#->'H6+1!A&(6$&(5), AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15A15C39G15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9328 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42243 42 117M = 42127 -233 CTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTNATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTNGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCNGAAGCTGCATGTGCTGGAAG 6B9@+9@8&$D089,B8!##B"&H;'= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:28G35C31A20 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9329 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42066 42 121M = 41639 -548 ACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAA B%)?D*3FG+80:+!,H(3D1B"+9.=0:%0E&F6!+C<2GB#&B?18//4>@6,1G;'"6:44)F(8"1"F?82@50":/*=,4,D4#>1'<#@*81-HG<(0,&4%$/%;/$.='-BCG AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:121 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9329 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41639 42 323M4I104M = 42066 548 TGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATNACNGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAANCGCCNAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATNTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTNCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATGATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCNACCAAATCAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACC ,&=BC1-?8H#?1(;634$&!:+#D&-3$=>9=E?<+;*GFC6,41<6-!!8584A$A$4!-$D&#F5(@C;@)%><35(@E/0!(2=1*940)%5B;)%1#*;DC&6?#.:F/,&<+:%:2F;-,;).)$8DE0=87H%,/$=;FA22"F.%(5/A?7@/:7;*-.@F&)A,87'2?.84,:AD+:AC/>@;>H@!9D&<)C:6@#HG9*,GG$,A";%-'&9:'H=,%0C$7G<4D3("6G#%BAED/%H>55,9B*B'G+36$(-B?BF*7&A9<(-?G8C&?9=>A9G.>->(%4"F54C69)C(2!5&!B4=#-6H.H=)E(-8#0B&:".;$'E4$0#3?472/$C'B,F-GDFD5#E"$&"(.,%D6/!<&)B<2D=$.@A7;>/1&&=D1A5@"A?>(ED66.!;F(B0B'*:G>4**H AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:11 MD:Z:89C2G30A4A26G133T70G66 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9330 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5291 42 48M = 5082 -257 GTCATGCGTGATGCACTGGATGCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGG ,27>."@6?$/*G9+;A@A70=6%#,0<190B1&5@32;'H@%*4;8) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9330 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5082 42 84M = 5291 257 ACCCCTACAGCCNTCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGCAGTCCCGGATGGACGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGG 25)A:-87?B%:&G,$G59*'D8(H#D,'CE-=3(:C$16'>>+'>$-E;?7*'40E$:2E=D)>.+1*<(DF;#4,59G7-/A5.+"#$434:,(56H.;2=@:,*"5$A89#/D>G)B?G0%1.'-9=A:4HH-)"<$/C;%)4$C/A6<'*.H@"#CB/:=):8C8?'51*!"A<,-BA#G;F:E/A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C139G19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9332 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35590 42 83M = 35846 301 GTATCACCGCNAGTGGTATTTATCTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGN F$'G4D%280<.4F;(=626FB#>.+B=8G.90.,/C*'3=5<:,H?10C?<5@5'F'891;.=8#B94D.8/$2F/$2B$'& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C12G58A0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9332 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35846 42 45M = 35590 -301 ATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGG (+(*"&)&#$$%&#(!(""&*!!+)$&$%%$&)%&$##%"!%#+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9333 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38607 42 130M = 38757 271 GCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACTCAACATCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGA '@A2./BG3H7413.%$")+$?&5=61&661@0&4B38-#*F(/:*B-EF86((CHAF6C.)CE,940,+"$3**)6C>%'=684G&+B=>3=$5;?/44?$@;,/C**#A8G)-3>55HDED?A=<+E4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:106T23 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9333 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38757 42 121M = 38607 -271 TCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTNTGCGTAAAACCTATGGGTGGAAT &"&>#&A+9;E)(.$*8)-=F1;HF+/8G+.);@%&!6=8.>D.8@$5?"2@-2BDD1F,B7@?5)D-56H6%$CD8$#HG109!,(/,540<-.,,G!%2,B;299 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97C23 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9334 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29111 42 171M = 28992 -290 ACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTNTNTCAGTTCTTCAATNCGAATANTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCCAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGC AE'8/C&;5GG(@B+9"#)C>2&7+*E=H;H*B%B6C,6;G..3477).AF>=E9B$3:)+&7-<&@6E?;*';706')149:%4,@#+0@+*A7?+85;#GG)AG$0F8F%:BGAA;H64F%DC5,A>8@<"#.!;CC2907F7# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:24C1T13T6T122T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9334 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28992 42 119M = 29111 290 CCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCTCTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAA @272H)7B>0$$D%4B19HG*=.<4E4/)%A+..3/<38B?/?#BB$83FA!B1/00&/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A53 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9335 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36701 40 80M = 38899 2333 CATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAANAAATCTGTCAGATCGGCGG D9/5!-7A>8';<=1:3$3+#23!E+,?/= AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60A16A0T1 YS:i:-24 YT:Z:DP jpayne@0: r9335 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38899 40 135M = 36701 -2333 GATTCTCAACTTAGCGAGATTACAANGTTACCTGTCAAACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCGTCAGANTGAATATTCTCAAGCANCAAGGCGGNNTGTNTGGACCANATNAANNNNTNANATNATNGNGN $#(+$%)'(*$+$+$%'&"&##!(('#$%(%"*"&#+'''"%%*)")%'("%$)%&!%+%&(*")$')%%%'*!&"&%#&#&'#$&(#"'+++%&()+!!*%)%''"#$###'*"*'##&))&("&)""(#&"*$ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:21 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:21 MD:Z:25A46A8A7G8C0A3T7A2A2A0A0C0A1C0T0C1G0A2G1T1C0 YS:i:-9 YT:Z:DP jpayne@0: r9336 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35380 42 79M = 35515 262 AGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTNATCCGGAATCG 4'2H1CE(D+&@/@?.>?:E#?/)>61"92H#'!0(B(@4.B2/'4$A$53$.1.&@6H?1"8-0#4%!(=0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67A11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9336 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35515 42 127M = 35380 -262 TGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACC 6%0,$D'%7<1;#-.F!2(*G&$94,*)>HG:%22EC93%;<1D9:)D;6#(/&B"@+,9(9#3;39.%"F0#3?#4:2&A;<-=72@01<9;AG@>>1,;-,#(3"?)?%13/-*2!=DD/';10F!'5F"4.&4D+5<@'*("&G+1)<@2()GA*9-'(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9338 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42207 42 315M = 42522 369 NTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTANGACGTCGTGCGAGGNAAACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAAGATGATGGCTACACCANCGCGAAGACGATGTAAAAACGATGAATGCNGGGAATGGTTTCANCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCA %="7H?>6->(%68.D2C;9"39'43?84.+/EFB3@3HA?"H+:;-/=%F:..;%6537:=D;G4.?5*":/.<3735FB(:EB7$*801&,1.13/'G#7;;'=5'?F69;5*9G4;?)-H.,":#//%.G6&-17%*".:F:*4*37&E=!HC87,.1<%*48!'$@7!';=1/6FC6>5B:>2#<8?.5/9=!BB4%,@:&-+*'-12:4&A.+17 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0T38A14A177A4G29C13C33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9339 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38937 23 44M = 38937 0 ACGGTGCAATGAAGCCAAGTTAGAACTCATNAGCATNCATANTT ))(+!#+*#%())!$"('*"%("%(#)#+%"''*&%"""&)!(& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:28G1C2A2G0A3T1A0 YT:Z:UP jpayne@0: r9339 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38937 0 * = 38937 0 NTTNCTNACNCGNNNNANAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTG "%#')(!$"'*(!!$(%"'+*#(*&&)!&###'#$&$!+#(&+(&+*'#*)#& YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9340 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41242 42 134M = 41147 -229 CTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAAGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCTTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAA $%6,/A'(53=7$)?C3'0!G(;BGB=;9337EA0''**C@$=E9F!"F6,5@D/&H('/!9-E6="5>:57&,/#0>4%?5B!C.4"AD& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27G76C29 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9340 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41147 42 26M1D20M = 41242 229 AAGCGACGGGCAGGTAAAGACGTGCATACGNTTACATGGATACAGG /2%8;@9;0.;>F,:#7.*2>A.=2G>F6B'C9/?.';"%7.,1)"/GB.!C,/7C*7A-%C"F(),+29:;D.<)DG0,$"7%7?+8"4:(&/B4:649A/,+"7?A.5E+F=!)ECGC+-ACB:(:/8?F?:'B7F3, AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5C39G96T18C57 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9342 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21687 42 70M = 21845 269 GAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGG )D?02(!+A/(8&+>EH/:%%!F$/>?&:(=6"$6/D7<=7""#<:;491BF><+./,0GE("=?%*7%2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9342 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21845 42 111M = 21687 -269 GNTATCGGTNCTCATGCGCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCTTCACCGTTAACGCNGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTAT /<'07<#1)!!!:27"+""<,E,5)6D.$A$-(%6!5'G/*%=G'-3.9=(2=95)3-&G@4+G4&.C>G+,)8:#="("H.#G&/-21(4>?,'1.'$=F#79!0=+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1T7G7C33A13T45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9343 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2142 42 118M = 1999 -261 TCGAAAAAACATGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGGGGCATCCGTCTACGGAAAGTCGGTGGCCAGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGAAATCG E=:2,B$G6B2D(&2&;?=$>)2AG*5F<1,1381.9.'0H>:#G.;5&!"7"7&0%8@-63A=<#/-%4D)*2@#087%38$E>?(&FG';!=3?-1%C"?8'<1'2&1-D<7849A AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9343 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1999 42 53M = 2142 261 TCCGCCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCATCAATAAA %==2)"/?:@".,2.GC;+(&@")+".%<8D"4,7$;$>H1$)4/CB#@==C< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9344 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33885 42 53M = 33966 251 TATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCT $-C7EH#0=C43<1<0E8/'1'5!,02>C&:385*'*<-8++?#58A"%H?(FG&52<'.%4%:A8D=.<<;(5B0<.AH8D)$,=H4&+G:E6/('=H6$1+>1%-3@5B:<+E1:F,%@FA#69.2#6",B1(643G$6>3*%35C6A7/694*; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T148 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9345 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8854 42 172M1D108M = 8548 -587 TATGGTGGCCAGCGGCTATGANTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAANGCCGNTGAAATGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGAACGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTC (*'(!&%'#&#!""&#$#!!'#"&'%'+%&+)&%#!*!(("'!+$(!&%!$#$*#%(%+!"*(*!#((%"+$$)$+*(('$'%+)$!++%'+&&!&''%('$$)#%%'$%%+#!&++("'!*#!(%'$+#&+!#!$*"**%'#%()++'#'$%$)"!)'#%!!#(*%%+#)!#'))*))"*(###*"*"!%))))&*"%)&!%)%'%%&()%(!+!$('+"&"&+%(")()#"*%#*!))!**'&+&"'#%!"!#(*"%+"!(+&&%"!%)*#(+'#$*' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:21C101T4G5G37^T79C28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9345 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8548 42 306M = 8854 587 AGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGNAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAG &'6.=(G1?5H6A0C4F":2(A6+H-%'%:8,?'>0;@!1C0+!&,G$=2/;#G3A#;HH=$;+8?E>7:)'AE3"&#B:/B3D%7D'*8<:7?"=;H.:4/3$H/+)6+!1A+,F-6@'#G5#B2E@$93@8"F5-+!/@@+A=""(AC%F3.B03+%/?)$C1>2='7+4BA##7;:H/1:#%:;#+5@-9=8-.F'"+B=/30=@4=D3)=A"H6':52D7)%0>+53*#)(25?;)AD#"+6;-8@@5'4,771+5B13H3))C:4B2? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27C7A53A25 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9346 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28458 42 156M = 28631 288 AACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCNATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTNTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACNCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTANGAGTGTCTTCTNCTTGATTCCT ?+7?8=>2!D.48%%B1+'5G=6C&=+**+0C,F1G>3/=AB+%ED9*%<$"%#8D.:@"15.,5EGC$.@*,3H6$!4'9ED&6.):6*5,@D8.'/H8.)GBA"=0&&*7F:H2%EC1%?G'$*''/ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:29T30T36C35T11G10 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9347 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3019 42 174M = 3193 375 GATCTGGTACGCAATAACGGCNATGCCGCCAACGCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTATTCCGGCTCAGTCATCGCCCAAGCTGGCGCTATNTGGGCATCNGGGAGGAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGAGTTTGCC -<'%1".G/<-.224!)D587(;1F,5E")-06GFF)F?8(,#AHC39/>AB0=E(5&=:@38%E1CB535?<33GC4$8AF8<.H6>5G572B,7!499<>A$-#44/>=/3H<'E7:F)'2B53'2)00C#+'@F9$8<2F("?H);:0C+C=0".E2!-30" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:21T49T33C8G59 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9347 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3193 42 201M = 3019 -375 GAAGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGCGAACTGTTCGTTCAGGCCACTTGGGATACCAGTTCGTNGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATAGTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGC F/B8?@.F0#38-83?-%D9.'=/+FC9=?6+2:+:+@'=<+2B+@0G9F6&,CECF"?&>.C:H!=2D9B/$3'.@C(6)(),>#BFF5!/4353;CF046?*!H@@9.(G)>#".?+9GE#+<#;/)0>4*A:E.BG(#7>E,%F(>,6$'/-:--B#0.$+FD&4=?.=)6+2:>#=A=&&#F5A!8>1)FA,-%@!6 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:2G86T20C16C27G2C42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9348 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45852 42 32M2I76M = 45710 -250 CAGCAATATCTGGGCTTCACTGCNGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGAT 0@,94&B86:<0>97;!@C>&A1(#<0A1;:=8?-0(0CC#@"/;1C1,844/+(-6=C6+EEHD AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:23C79G0A3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9348 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45710 42 83M = 45852 250 GGTGGGATGCCTACCGCAAGGAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAG !%@F8,/:".H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C62 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9349 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35014 42 31M1D44M = 35090 293 NGCCAACNCCAATATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCCACTGCATGTTA !()(+*!$%%++%*(""(+)$#&&'!!!#%')*"&##%"!(#$()#")#)%&!(+&$&$'!&)""+#*()+*)&# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:0A5G0G23^G44 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9349 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35090 42 217M = 35014 -293 TGCCGCGTTCGNCAGGCTTGCTGTACCATGTGCGCTGATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGGGATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGANTTAGTGCGCTTTCTACTCGNGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGNGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATACGCATNTNT '"&!)*%!%&"!&#&'&%#$$#!*&!!+&')!!!&'(%+!(+#'*$*+&!&*"(*$&&()%)&(&$")+&("#*&"($+()+#+'$'('!")!)!*"&%'"#%#!$''&+++$!#+%("#!+(%*%#%$(+#)!*&*))!#!#($"'!*"!'#+)'(%%%("%$"$%!)(%!"+&!)$&)!$(&**+&!"$+""&'+$('&&("+(%"*))($$'"$ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:12 MD:Z:11C46C24T29T19T31G41T0T2T0G0C1T1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9350 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27260 42 47M = 27487 322 TCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTT !57$'D>/H;DH11=.@2**E556B#972)("&6AD@5,"<5G51!- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9350 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27487 42 95M = 27260 -322 CAATGGGTTGCGAGGCTGTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGANAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCNCTNAANAT +*++#%&+#)*$!'''+*+)$"&!&%&!#+%$$%$*)!')(*&'!)"!'%%+"*(*"*$+(#()&!!$"+'$#')+&(+#!!#'!+$'&%$""!$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2C3A10T32C35G2A1T0G0C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9351 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25522 42 84M = 25274 -332 CGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAACACCTAAGTTCTCACCGAATGT A,.C-6!7"!*,21:A%6&-7"D45/+,F";?,A43420=E0BB1)>(%18)="/14-(C32D@*G:3H!;EBE*, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9351 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25274 42 61M = 25522 332 TTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCNTC D@E(*-.+9$745!3".9-'3:@EG!--GF08FG->A%56!-&B?D-6&,1#-0F$0836: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9352 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27090 42 47M = 27293 310 ACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCT AB**G@E;.4;0/2D(:#(&=&<*;E9)6+9EH*F,5A7?E$7F./1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9352 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27293 42 107M = 27090 -310 CTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGA )>@*5($$&5=;A)7B@D6&*CFF'(:,3=&30AA&64=@C7@?+01<4=%"+H("%E7.F.&B;:=&."H3131%(H<'#1?!G*BAD%6:>7+<'#$/2:*">-1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9353 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17269 42 78M = 17479 283 NNGNACCAANTGCCGGAAAAAGAGGCCNTCGTGGATAACGGGGCGCAGTTTGACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAAT #""!(((%$)*&+'+")&&!(%&!&++!!&(#%#)'"+)%&+)$+#"#'()"(+%'!&&+*"&)(*(!'+&&)!#!** AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G0T1C1G2T0G17A19C30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9353 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17479 42 73M = 17269 -283 ACAGCGGACGACGGCAGTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATANCGCTTCACGCAAC +%%&5.?($30($2CB,%1+,?D./FA"&E<533-'F+6980%/)?)+5G>59+7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C13 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9354 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39509 42 75M = 39367 -217 AACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAACACAGACTGGATTTACGGGNTGGATCTAT F<-(?1>)"EF8,CA=.5:5:<1%4B/;3&+-3,B.4*E:,##/(401;"/B%%(&?H,&".$07405?&8@<@H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65G9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9354 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39367 42 110M = 39509 217 AGTGAANGTGACGGACGTAACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACTTCTGGTCCGGTAACGTGCTGAGCCCGGCCAAACTCCGCGATAA '576,74-4!6%?*39G$=E-2A&0G=B@*B89FDG?>@AB(C)@,,48<9A,BD7,54GA!9?A%FA@2%>0AE:9'%8=.*(5E?)(;)>3D"96&A,*61.#8-A"G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C5C103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9355 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31882 42 61M = 32024 223 CTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCG 4BH!+8%8A1G-*8B90$2C/89%>6,A('.">F1/DA&0G(4ABE<'>'-?,.;=01FC% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9355 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32024 42 56M1I25M = 31882 -223 GTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTTCTACGGCCTGTGTCAGTTCTG "5;%*":7H*'@D$93F)+@<5D#F>E=""3E8,>./6//@:#+F,.-)E8!-?;H1D(F"%F'. AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:59G2T18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9356 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9189 42 162M = 9129 -222 GATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGNCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGAAG +@>C#2A0/ECE@*/)H/CH!75"!E.";D-/*$C+0-D'9;+@E3"%8A:6+D-6A"1:<3);GH%A<"*3F)-=50@',)()C0+*0.E'77G>&1,8343@<2F*+9')A@67H4H%?55&<1 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109G50C1 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9356 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9129 42 60M = 9189 222 NATCTCGATGATGAAGATGCANACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGA #$+'!)#$++$*#&($"*$*(&"!+%!))'&+('!$)'#+*'#&*%+*!('(*$#+'&+) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T20G24A13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9357 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44296 42 153M = 44449 252 GAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTNTATGACGCTCTGGT $4('5?H7&=G84@HH6$@%=,%?5C;;3G#.%:68$"2<-71:4H7'.>4A%7C=$8)/%A,<5=2B2+F3:.%>@;*.;917'#C"93$H9<5A*98?30+(2$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:138G14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9357 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44449 42 99M = 44296 -252 GGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGNCAACATATTAACGGCAT <.7:*D'G4D=%).!-:@ACF*1A(F=%*C">:&D%:(<%&-&C(H(???39!(*/*#*4&E0-85,B#?450HD@A6/>C*38C>><+/E95A>B*C/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81G17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9358 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41501 42 54M = 41334 -221 GCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAA GD+/26E0D-A$:FHD?#H0*D%>,>H36A>;3#0C:CFG+?A8';9"DD0D-= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9358 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41334 42 125M = 41501 221 AGACGCGAATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATANGTCGGCGGCGCGTTCTGCACTGACAGATTAAAACTCGTTCCCTTCACCAAATACTGTGATGAC 7E;!7>E*44B77=F*@2?=C23EB,>)>@$CE7F93+0,.768B)%:#H0)0C125$D*!B!1)D$4B&/).1+*(H7A&G#-A9&:.=4"3"'.1(559.2)78A2"8'F9+>HG6B(/1+;6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61C63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9359 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15079 42 82M = 14866 -295 TTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTTTACCGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAGTAT (+*('"#%&'+&(**(+*#('&("$*"#')(%)%"#&*+'+#")!"'!*&*($("+)'"*&%&*%)+!&'*"$!&%+')"!& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:79C0C0A0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9359 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14866 42 80M = 15079 295 CTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCGGAAACTGAGCGACGG H<&9BB%1/6$->'#-5%7-!!H@0:9385F>/-C06#,31F"H@@7C*=3.%4@HG.C,1186+2-14%2=-!FCB298 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A15 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9360 77 * 0 0 * * 0 0 CCTTCGTGATGTCTGCTTGGAGACAAGACATCGGATCTGCACAACATTGATA %C>B>B0D-/'GF"(@.G+"A202B!3G/B3D&06%:A"<:(/3;.634D<< YT:Z:UP jpayne@0: r9360 141 * 0 0 * * 0 0 ACAGCGATGCCAGAGTCTGTAGTGTCAGATGATGACCGTACTCAAACATCGGGTTGAGTATCTTACTGTTTCTTTACATAAACATTGCTGAT ++%+#)(#&!&)!(%*&"'&(('%(#$*)!(#(+(*"#'+%(())*%"$##*$&(+((#()*$)!"%++*"&+#&$"('"*)$&''*")#(# YT:Z:UP jpayne@0: r9361 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45056 42 40M = 45056 0 CTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAANTCTG &D*B!)%!4DFD!C<)/89>;4#/?+' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A4 YT:Z:UP jpayne@0: r9361 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45056 0 * = 45056 0 GNCGANNGNACNNNNANGCAANCGNCANGNTNTCCCNNNCGCCTTGTTCCTTTGCCGCGAGAATGNCGGCCAACANGTCATGTTTTTCTGGCATCTTCATGTCTTACCCCCAATAAGGGGATTTGC !"&"###*#(%!#$*)$('$&!*&$"'$&)'$')))#)*&')(%+%*#!!%&%""!("$'!'*('(!$%)$#+*&!%("#$%+&#"$""%%+((*$($*!)($#)!'#!&)'++$'*+'))*$*)* YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9362 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32687 42 83M = 32770 233 CATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCGAAGAGNGGTGATCAGTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACACGT 5!&!,7HG0H-*/$87!>F5;/*,:1137#!*:2<+C.A9/;A1"E@@*14++'2:)5+.460F&DD9?"99$9&?$79*FG( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9362 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32770 42 150M = 32687 -233 TCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGNGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAAACTCAACATCGTCATCAAACG F78>A9C*-$+F;9;$88E"=G#69?$1.D:%C60)>C%$2*5-A,EC1'3#'A9"0')/>/)FF:988#1:'>(!+?;32(H=6;A<7+."H4HE+%1/;C38()7.-?C="16@A?33"+EGH-F@3?E3#.1('2?!)%.$#F1A;0!!//"*?>&*9CH14A1!G':BA*;<7$5E50G$?4G7D?$.!27@&.,*G:$#"D'>"**!>+C&$%*,&6,,+4*A/#""73>/A0&B'7@?'HF<3$-39+"%(/C#(4-1$#0#E#C=D%"';5BEB+-E1*,@($<:E($!E'/8:5:4")5F7( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G39A96G80 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9363 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18497 42 206M = 18279 -424 TAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCNGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGANTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTATTCGATGTGTTATCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCG ;-(HD3D22H$E/&1A.#*,"#A*4F=)'-C!G,+/4"0E:,14,>:*"&;3;<3)+F78F..&,G.$<>?A.7%F9$#"!2&B(60:?86)8!A0*-#8C%8F5"$09(5&=(EE'AC5>?E9<,9823FD2+%@<-!6$!./)?;79EG7?7+=#"'==&'EF"->FG+G9?DDF=?;(,H1-8G/C9)E AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24C24C51C104 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9364 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34399 40 102M = 34399 0 CTGTNTTTTAACCACATCAGGCTCNGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAAATCGGATAAAGTATTACAANGCCNACANTTTNCTGAGTNTNGAAANNG &**+#"%"$(#"#&$))++#%('!'%!+)'&"&$)*'$%!)(&'%#&'$%)&"'%()(!)#&!"$!#&#+$))!(()$)()#($&!(&&))&!*#*)))"#( AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:4C19G39C8C0C2T3G3G0A5A1A4T0G1 YT:Z:UP jpayne@0: r9364 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34399 0 * = 34399 0 ATCNCAANNNGCNTNNNNANNCCNNNAGANNCCGNCGTGNTNN #$!"#!$!$"!##!!""$$"##!"!$#$#""!$#"!!$$!""$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9365 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28122 42 46M = 27854 -314 GATATTCCGAGAGCATCAANATGCAATGCTGTTGGGATGGCAATTT 29&"-EH")6,2%1".!!;,D56@AF5(&H)&<062"%@F;+$;4"'#%(-&1%+4%AFE1@2>73FGC:8CB3,!2$C-/F069E%63EA<%/H1H7?F;E5/B13CG90;=0*)< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:140C27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9366 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13310 42 378M = 13688 468 TTTCTTGGGANCNCNNTNNTTGAGTGGCGGCAGATAAAGGTGACCTGCGCAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTATGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTCACCTGGCAGGGGCGAAAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGTTTTGAACTGAATGGCAAAGGCACCAGTACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTA &$%*%!!)'&!!!(!!#)!%+'!$*'""&")"*("*(&$("*$(%$#(""#%#"+)&"+$+&(''#+)*"*!%%$'&!&'!))&)(!+$&#!$'%('#'#()+#%'%$))&*(++&#&&)!&((%*%#!*)%"(#!!+#'!)&!)'!&*"$($%'"*%#))+'!&++!*!+&*!'(*+$'!+')%#&&#(#(())$"!#'#(!(")+((&(&&#$!'*!#(!&#$#)'%#')$+$$)&""!&&&$#"#')#)++)'+'+)*&$(*)$$%"(%'#+$'%"######)&%*(#%'##&%()"%&'#+"$*+)!%&$)(%(*&#!*)+%!!+(+!%$%(!*)'""')*!"**(+##*$$+")''+*))!)*'+#%&*"#*! AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:5G0T3C0G0C1G0C0C0T0T0A80T180C96 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9366 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13688 42 90M = 13310 -468 TGGTCAACGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACNCCCGTTTTCTGGATGCGGTGC "@-&G%G#65>(!+/&-@D7?'83)'=&!+1>34:;)1(=D;H5F22##=:?)=*39A0/*B0=%.(>1E8';'5D>6)B><:87F4B?% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C61G20A0 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9367 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20033 42 117M = 20249 272 GAAATCAGCCGGCGATGGCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCNGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATGGTCAGCTCA 6;'!8D%-B?-68+,68D@&/C?#?71.7:+H77+*%/G AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17C24G23C40C9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9367 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20249 42 56M = 20033 -272 TGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCG /"!+0*E;,,A9951$=4.D@#H*D)6&*9A+"8C52.14&",G?2@A4B5..D)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9368 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25445 42 92M = 25537 287 GTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTG 75@G:63&+*H9/,E7=!?9)-+7!F$$GB750G,G=%651,B"1'"D;<7$42=D"+7(7#2AFC.@!<1#?+4@.<"*%63>!,456$9D%=B%'C8)&46,3G$H!C6)G;?@=)7<;78@6,2($;'65D<9H=C2/G#29B93.:;B2@"B'?E6<@=@-:3:=&G.4! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A105 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9370 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48000 42 119M = 48198 266 GTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATACCCTCGTAATTAAGTAAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATGTTCATTCTTCA B6'541")2/*5"=&4+!,#"9&G''5'D#(;1*@!"AA'A,--H4E#59!D-$>CF5$<41((6F91"3<>"ED2<+=>5H@C>/5&?#=#0-""=C(*"/4"%D@$)8 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G15G53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9370 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48198 42 68M = 48000 -266 TCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAACGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTNGGAAAGCGGATGTTA '*$!#)("!*##+*"#*++!('$)+"+$')'$'!+**"'(#('(**"$"%()")#$)$*$+%)&"+)! AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G28A14G0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9371 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45587 42 86M = 45692 227 GNTATCACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTNGNAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAA (!@;(314AFGA@GG-0!)$8=!65?4,:&!!733(!)1AB%B1%4))3;#&.'9B//HC05.;@(A,%4335;39=#$.)1#G,2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T3G47C1C30 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9371 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45692 42 122M = 45587 -227 ACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATG /6.;@'=!/:0DA/)-;/(.=+?'-!'+3;.83':+2>&@>(&C%2-:ACC!::!,B9(7-$3A;=,2364?8"!+B,+>*$!C"?:4%!H$&!#1@+<:4..?89@#.#6D,$93<>7-)%/CHDC895@G!8G4"@.+2B")%E:)57DG<02>1'(4E4C'$75>':24: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:169 YT:Z:UP jpayne@0: r9372 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16234 0 * = 16234 0 GNCTNGGTANNNNNNNATNCNNGCNNNNNTGNCGNNANNNNTACNCGGCATTTNNNGGNCGCANTGNNNNNNTATNGN $#$!#""$#"$""##$#$!#!#$$!#$!""$"$$"""#"""#$$#"$$"#!#!!"!$#!$#$$"!!##""$!!!#!## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9373 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17516 40 166M1D37M6D33M = 17516 0 CCGGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTANAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCNCGGAAAAGC =F3.0.0=<;?%;-*53?G2)/%:.3'%>%.?;74(:;6'4/+2;-;<8?*>2,&53'$7&$(%.0>(6EF'1'G@+:3>77@9D>>(=-%F%:!1(1/(9,?BF'4.34(@3)<(HBH&:"C:"13C8B/1@)(H89=89&6?#(;&D64/-F)<.#*B74A@0>B-46@8.'6($D'@'"?*6!&=,*!($B*/ AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:7 NM:i:10 MD:Z:2C49C113^T37^ACCCGA23T9 YT:Z:UP jpayne@0: r9373 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17516 0 * = 17516 0 NNAACNTAANGCTNGANGGATTGNANNCCTCNGNTANNCGTCNNNN "$#!!"$""$##!"$#$$"!#$"#$"!!!$#!#$"$"""$"#"!$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9374 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42098 42 211M = 42309 330 ACAGCGACGAAGTATCACCGACATANTCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCANAAATAAACCNAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAANCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAATACAAGGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCG A(E>+:8=C>D=!?:#&@FB%9*.&6D%8$5?'G0?.;=)%$1G@"#4$?F;)@;EA5HC:8=F-A87G16/-!.1/D2>?87=B9+%&8)9.-(5!+):8)132<50AG5=FF3(6*0-E1<$B?)A6C(8,!@G&"'/-8'*G<$>35>F&G.A118DH4C=H'4(A;6#/>(0H&A*<8)E1"7<$ED?753A::>)' AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:25A39G9C31C57A45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9374 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42309 42 119M = 42098 -330 AGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCNCGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGGAAGAA A,G,6C6'D+E<0%,B=";F/&:HB3+;H#0B0F710)()61E:!C<371(A;HFH'-(,C33G-$51+,*>>"(%6/##HF/;E3E*4@3A=6B66*)3*+'8?AE1A(H#E)236=F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54A64 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9375 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28207 42 56M = 27954 -309 CTACGATATCAGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACA ?;105%%!$@$254,70B=3=D&6'?)/(08"A@3,?(8A7D2?*F)"0(*H@G6. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9375 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27954 42 40M = 28207 309 AACTCGTGAAAGGTAGGCGGATCCCCTTCGAAGGAAAGAC )H<"4/,$$4-89>!&+)?E781D@A#-9%"D2&8!-F+8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9376 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23613 42 83M = 23471 -225 AAGAGTAGCCTTTGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCATGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGCCCAAGCCATTA '3,&0B?;$>C'>@;1)HFC7*$E&,!A.F>)8(.71A.C.:@?.G'""3D<5!40$G1-*@EE9!:>9?+>C64&5=0.,B< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39T43 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9376 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23471 42 79M = 23613 225 TNTANNNTTTAATAATAGATGATTCAGCTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACC (#)!%!%"&$)+#+'$'+#$))'&)#&!("*#$!&!'('&%'%&('((!+#!#'*+!%+&(!$$)((*$)!"($'*%$" AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T1C0T0G0A20T51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9377 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 212 42 80M = 212 0 CTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCNTTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGG /%A?954H60.'9=7)>B?=F+!.C.5$6'@#+@,6*E*0.6A=5?DE&G2H?"9%8/4(*C/36"(A5==>2!;+-9-@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33A46 YT:Z:UP jpayne@0: r9377 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 212 0 * = 212 0 TGGAGAANTNCNTNGNTNGGTNACNCNTNTNNGNNANCCTNACNGCTCAGNNTTNCGTTCNCANNGNCNGCCAGCNNTNNTGCCNNNNATGNNNNN #$$#$""$$!##!$#$$!$!#"!#!"$#!$!"!!""#""!!"#"$$$$$#"$$#"##!""##$!#$$""""#"!!!!#!!"$#!"!$$$$$!$!"$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9378 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47088 42 86M = 47088 0 AGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGATAACTCCTGCTTTAGCAAGATT :07-,B)2."G@G"::840+F99CB;A-&44E%:E$("2($572%:)55#-0<241('55;=)7.5@@2-F1$/$<(*>(&,9'D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9380 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34689 40 24M2D144M = 34917 268 AATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGAAAACGCATTAAGATGCAAAACGATAAAGTGCGATCAGTAATTCAAAACCTTACAGAAGAGCAATCTCTGGTTTTGTGCGCAGCCCTTAATGAAGGCAGGAAGTATGTGGTTAC ++%C'183/2H-E#'9?;:5(7=$#9>8>5,C8$;%(;++F(365&E@E#.$AC-A$CH&H*'AG#EHH/;-<"<#888@2)06"69G71+('.CDF57'G#>)(1,%1A5@'/)=GF-*'7C'-05H)/5-&D.,<8<5+'2<8%5(F%+5+;"G;;BD(H14?G07)?#2*,<3&()@B,E(504C81B@!A)26F'<)0##1.0#CE-DD%//.6:@99=EG5(>1%%$A-#401-AA&F//#5:!:2:+DC0G??9>(=&<8+G(H,4D'#5:(>&&50!B?;8$"0<%06>;A<&(/>',">H642>H32$;'(!F19/8/09@C-1$$9=!%4D@D6+;0;$.",EE>'(('G+9=?6:;-@G%F>1.?2$-:H:0GH:E*.(>!H>(%$;EF%E3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:102T55T71C7 YT:Z:UP jpayne@0: r9382 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7111 0 * = 7111 0 NNAATNTATNTCTCCTNGNNNGNTGNTNTCNNCTTTTAANNANGNNCNNGNAGCANNNTTGNNGGNNTGGNCGTNNTGNCNNG #$$$!$!""##"#$$$"$!#$!""#""!!!!#""$!##"#!$!$""#!!#$#""$$$!"#$$$#$$#$$"#$$""$#"#$#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9383 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23004 42 69M = 22831 -242 GCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTT 6,(!.5.+B()2$14#+5@H;!"83:A?;.>"7::0((=7.<;F2%&AEG)1<28F.+;%C<;BFA76+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C68 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9383 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22831 42 50M = 23004 242 ATTNATNNTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTNCCTGAAGTCTTTC "$!")((*#+&&"$%+$((+&(##&")+$%((&$+#'+)*$*(()"&'"+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A0C2T0T28A13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9384 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17782 42 54M = 17885 228 GAAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATC =5,GFF@HAC>6A%DB0%196++,-#,1(-?E,2*(+&D""-(76;10$"8D2:+*49(,D:1@@3'HA'!)#=G!++3>0C7)?&4G?7;) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T27 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9385 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8290 42 10M1I39M = 8436 233 CCGTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCC D"0(7(.;>#&48>#4"5#2A'0'A5,:(8E(?7''H#F*0C$<-(6+(' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:2C46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9386 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9528 42 219M = 9528 0 GACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAANAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACATAACGGT H>13.,(+="5G4FH?0D12C+@(!'2.+EEC!AG&*-@!47-D;'8EG*3,!%9+28.,4&GE/F7>)(09AHF$7)E/7GE+*6/F;D73%B49;C<(-).0@F91*+G"";)5>H!'E%&%D5:C.2'"0=H7?E400H.5><.?1@<98#=)E)E=9(A'(<+.CG6@4A";-,-',B%>/?D2/+)-1=+G5H>"F:):!9:; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A181 YT:Z:UP jpayne@0: r9386 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9528 0 * = 9528 0 CNAGNTNTTCAATGCNNCNCNNNGCTCCCANTTCANNAAGAGTNNNNGTCAC $!*#(')$*))%%%(*)!!$##!()&(!*)('(&$##%($"&#%$!$"*&'+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9387 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5547 42 68M = 5345 -270 CACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCA !'(*&(!'#)!&#"%&&&*'('))(&(+"&*&"+++#%*%(+(')!"'#*!!&%$&#)%#*""$!!+% AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9387 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5345 42 87M = 5547 270 ACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCACGCTGACGTTACTGACGTGGTGNCAGCGACGGAGGGCGAGAAC $*#+'#(*&$!)*!")'*)(#$%(!)+))'&)&$&''+''#!%(#*&&+&+*(#'$"!#('$&"*+&%*!&"*$%*)**'"(#'*)& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G21C20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9388 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12307 42 129M = 12152 -284 AACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCGCGGGAACTGGATGGCAC <=$'=A%<6?'8*>@1;7>.?$.E?'/!G0<,0'C'2H;>)/CD37?:1@==%#&B,:$?(4(G85#<#6C+@#0A<+=;7D;81&H4H!:=H9F*>*:,E43<;3)(!D3&=3*'-+EH'755 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:128G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9388 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12152 42 69M = 12307 284 GTACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCA &#$#9C0;$B/>A!-8'3;H$6?(H%*?$27!"ACB?/,491,%'3@>.:@BG=?G??*=A/=G!63)1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9389 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42504 42 114M = 42361 -257 CAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGTAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAA 1/0>41EF//$67(=18(%,D&&#%'H.9-21:'<'AB*%)2-G/'9/E7!F>4:'5,F&<&"F/;-G@;F%)&5E+15 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9389 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42361 42 47M = 42504 257 TCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATA F3?2A7CC@8CH/3"5F/6!):8,2<=<3@CGGG>-3B;E8?#D7;$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9390 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9390 42 102M = 9646 306 NTNNGACGTCCGCCAAGGNCCGAAGATCGCAGCACGGTAACANCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCNGAGCACC $#!"*&)$"##*!$!&%('%!+++''($!&"!'&!&(#(%("%$!*"%$!+"!%&)+!$$'*&+*"(("++$'*!"%**%%$#%&##$$&*$#"""%$+*"+ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0G1G0G8T1G1T1G1A21G51A7 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9390 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9646 42 50M = 9390 -306 GTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAN %&%)#$#$#&"!*%!)!$$($$*"((+&'#&'+(+*%(""$&)"'!%+%% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49A0 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9391 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G87C106G107A78 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9392 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24800 42 4M1I165M = 24976 262 GNTCGGCCGGGCATTCAACATAAANACTGANAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCANTGCTCACGAAAAAAAATGTCCTTNTCGATATANGGATGAATCGCTTCGTGTACCTNATCTACTNCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCG %(DF8'8023)89B<0!!E&=9F2$5'(0C&2:C&*#B:+<'=&5<"G",)>):9,)1E,/AA$$DBE1*%9%F;.9$F4;?;5$3#'3G6@D:D;(H>@+H1C,E"B:C,=B1GG@0:--)#B">A&/'-(F/;03A'''8=>9F86AFFG%2F<'$(C"1,$:#F*:3 AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:1T21A5T39T23G8G13G8C7G35 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9392 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24976 42 86M = 24800 -262 ATGGAACTAAATNAATAGGCATCACCGAAANTTCAGGATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTCTGTCCCANA !)!$*('&!("""#()*&!&!'+!*%#%%%)!&#!)"!&()!'#%!&!#('")"#*!)""#'&#**%++*&')($!!*&(#+&&)$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12T17A51T1T1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9393 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35354 42 85M = 35154 -285 CATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAANCCCCCCGCGATTGGCACAG ='1+F0G0#7%>323%+GF10?90("D56BD7&$;*)5D;1GF$%65E'8@7($<915253EE(?&:6!&$3+(19%C#A62*%! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65A18T0 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9393 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35154 42 200M = 35354 285 GCTTTCAATCTGTTTGTGGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGTTTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCNCTTACCCCNACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTNGCGGCGGCGTGTTNGTG F6D..=9!&!$57&!3/:.,"&&E7(),7;A?:*G'!A7.7'C$:D9A$"?!?+4A&H"95G;4!(/G=#9G0A@(2H6#1F#%0=->$;A#>H@@8?.8 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:84A35G8A52C13T3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9394 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13627 42 63M = 13754 208 GAACTGAATGGCAAAGGCACCAGAACGCGCCCCACGCTGACGGTTTCTAACCTGTACGGTATG /9$HD4,"?,,<'%"E68(7G304=$(.1@A8*)&5?>A#,314/"&:@1-1DC$/.7;6@E= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23T39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9394 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13754 42 81M = 13627 -208 ACACNCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGNAGGAGGTGATCAGCCGCTGGC #4+!-H<;/!,3"+028*((2G2*AEF2A;'7D#1)=B?>?#%/1&$+'G5+A3/=E:$!'34*D<$%;(#F.,;C=/C52 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2G1C54C21 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9395 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6243 42 9M1I40M = 6329 235 GNGAAAGTCTTATCTCTCNCAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGT &("))D<838E$H3,@$0E$"&/E&'+A+-;!8+@5DBC9-'<'3AE#GF AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:1A15A31 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9395 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6329 42 95M2I54M = 6243 -235 CCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAGA =+HG!?"HHH/)19G5BHA4-($EEB,'5A2G5&:7'B%8":G2+G;#2H%+.&E6H#GEC61(<%)B)6!?"0H5-00<+E,.7$;@873C%4"D&A90C@'&9>FBGE42?8E:'97(,:?BH?8F9B!='75:-,D83#CGGD(5E8C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:149 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9396 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24439 42 111M = 24376 -174 AGCCCTCNTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACT //E)"+!$12C/.,4+<:BFH!*(*"%,,@9"F-E4BG98/:5<>;1:A$$)&!B5):=54.%%EB=GC#='(9"!*=3+++@&D-*C3FC3E7BA1GB0A$H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C103 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9396 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24376 42 63M = 24439 174 CCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACNACCGGATTTTGTAAAAAC 0'<'+7A(<=,2A"7G-E7-DE%"A,>CG*+3>/-B$(.*9644$$0%7FE AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T18 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9397 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23004 42 60M = 22815 -249 GCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTATATTGATTAAATCAATTGGATG 59:?'%"18"!))(=6D'14/.F8FEGH<9==(E(*"'*9;H*,B!G;<-*D9F-C2#<3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C36G22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9397 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22815 42 132M = 23004 249 AACTATTTTCCATGAAATCCATTTTTGATTATTATTTGAATCAATTCCAATTACCTGAAGTCNTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAGATGCTTGCTTTTCTGAGCCATAGCTC A&=:H<=4EG.2"-4FGH%$+#;"0FG1+*A)?1)7E*)."BD%;"B.73"2)A>D5G,D3C3/(=!)F1CB(83<@D?"B0)D)33&7$"+3DB6"!9161F>DC*5EA*8#9.BF0E,9(39&?@0,C:0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18A43T69 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9398 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40652 42 83M3I57M = 40859 247 ACTAACCTTTGAAATTCGATCTCCAGCACATCAGCAAANCGCTATTCACGCAGTACAGCAAATCCTTCCAGACCCAACCCAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGCTTAGACCAAAACAGGAAGCTAT )10H%#.",.B/F<5&3EBG-(28749:%,9#F3B=%)@=@.+$@;F9:C1H"-*??/'D7%#(F15A24-1"DH5(@D6>BE=.78C/"/)"(,?F:G-"35/,5B432==G%6'*+"8D,2!-F$301G$-'/C9#@;D$? AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:38A40A60 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9398 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40859 42 40M = 40652 -247 GAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTT ;+3$6@<<6G&2G9="1)/H&H0;54;7F"FH09?B488B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9399 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21411 42 268M = 21411 0 NTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCNGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACNAATAACACGGGGGCTCATGCTCNCAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGATCAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATTGAACAGCAAC &1*5A+9B*F$G&2"9$;@5-$(?-!+8!0&-09=6F;DFD))-A3%G7<).(3G>!HH8)35";5G%F>GC-44>??8''.&C61)/.FC)655B2(<;#6:26AA?B0CC)+5DE)7C18EG,*H4!6;39(E69"H"'"B3HA3&$49F%&4D-/>79(,5*43#%%B/2"+1=.96@A>*!-*)G(<;?DHH*1DH+%7(+1B3:3"6BA4%=(=%::E!$>H1$3@"D!4,<57.@)GG',$F9$+/;BD; AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G52A94G22A62A22G10 YT:Z:UP jpayne@0: r9399 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21411 0 * = 21411 0 NACCAACNNGATTNGTNNGTGCNNCAGNNNANNCNACNGNNCNNTTGATTGCNNGNCTNNTNCNNNTNTCNNTGTNTNNANACGANANNNNNGNTANANGGCTNGNNNNNGTNTCNNTANCNNGNGNNANCCNNCCCGAAANN ""$"$#$!"!!#$#!"!$$"#"!##!$$"$$"!$$##"##!!!#"!""##!!"$""$"!"!"$""!"$#!!#"$$#"##!!!!#"!"$!#"#!!##$#!$$$#!"##"#$$!$#!#!$$!$!#!"#!$###$#"$"#$"##!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9400 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43733 42 134M = 43889 226 CGGGNTCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGNAACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGAAACCTAACATTGATTC -.G6?/C&57.)<908&37B#+-$5(,$,-48H.::,';H4*@*'6$D>#CE!G7$C(0,1E;#$E7B-5E&.H659A60G+/?D(@DA!;2)<78@E.G;BG$4&/8#/-F6>+G>E(!D10)(""*6>)BH; AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A56A72 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9400 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43889 42 70M = 43733 -226 AGACTCGAAAGCGTAGCTAAATTTCATTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGGCCACGG 5@/69!BE-A&5!B7/:%!A#@1C>!3A517"42!20-BF)HG;8>7+3&E"/$>A0%>*)& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:62A0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9401 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33637 42 54M = 33890 316 CCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTCA A8;2!>(C41?+47-07C'#C;6E/5F:B'2!.%9&=(D6*BB<2<5=B#=0:+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9402 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2245 40 87M = 2028 -304 ACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGGGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCACTTCCCG ('&$$"+#!)*'%)!+!**$%&#!%++(")"+)+$%+'$$%!'''+!(!%''!'%$#'*"!#&!''+%+###%)!""&)#%$*$)*+ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C51G7 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r9402 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2028 40 58M5I120M = 2245 304 CGTGTGGATGAGGCCATCAGTAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATATCCTATCCCGTATCTGCTGGGATACTGGCGGGATTGANCCCACCATTGTGTATGAACGCTCGAAAAAACNTGGGCTGTTCCGGGTGATCCCCATTAAAGNGGCNTCCGTCTACGGAAAGCCGG 5F4D%25":,?195)&.H6%AE88**9E9/D>:1?8*ED5>A@"%@?&AHC:E'2(7C7<,@*2BE"%3B22!,=D31"7H?434=C8H(5-#"2'A@57B:+H.<7;AD1D,>'F#1;1=#6$"8<.*0)G(7+A9(8@%98*'?)@>8<#.F93F*B@5($78D@C4!;6&893:B(F0=)/'C,%(E:(0D(-,E;<72"E","=4"<3F7?0.H))01B=(>27*-274=1E.G&)),1D3!7*-4")@->G%@/4*!EH AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T107 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9404 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20406 24 107M = 20681 317 GCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCGGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAAGAGCAGC <9D$G%B!>@E71=4C<$#5>G,%2C372!:#G+CA523.#->B'*/C=G>/AE%AB$?5.,./?H4A,F467/,;)&64@4.24'8;9G8>;=0C(9%/F');D=. AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:100C6 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9404 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20681 24 16M7I26M = 20406 -317 AGAAGCTATAGCTTCAGATAAGGGCNGTCGCGCTTGAGGATGCGGACAC 81*?/%<$B3/*;8*?0G>.D.2>9"((?>.$(-7<,4")@F2C7'D$.==9=D#'- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G25T32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9405 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35299 42 91M = 35060 -330 GCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTG 9&780?(/4)%=<#$#D?5D);9/C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9406 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14121 42 104M = 14225 307 GNANTAAAGNCNACGACTCANAGNGAATCNGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGCTTCGTGGTAAGCACGCCGGAGGGGGA &!&&)&&$!"("%!$((("$$'%$+#"#$'+%+!!!!($$$)'((+!*+"&''&"%)%((*!"*#'"+*$%"+"*&$)))()"(%""+"!!*#)*)'%*)#+#' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:1C1G4T0C1C1T3A2G1C0A5A74 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9406 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14225 42 203M = 14121 -307 AAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCTATTTCCGTATGTCGCCGGAAGACTGGCTGCAGGCAGAAATGCAGGGTGAGATTGTGGCGCTGGTCCACAGCCACCCCGGTGGTCTGCCCTGGCTGAGTGAGGCCGACCGGCGGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGAC '7?;(G&))"75#>7//:09+,E<;C5F>6BA,&(@%7?(868B9(D)B-<):A;#<0/.0?>5,94@H)-8"F,6?C2"577:*@*'!9*:"<<:=5;-%CG<#'B>;)=H:*-=,<8?:12,$@/$19%92E!8>20H#*B;<827*H3*@/?>5-3(3.AB?15HD1)1$=#:$378*-)C?9/(%3"44;!*'#*.?&2?5?;?&,G*DF:AC)2<+! AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:17T6G64G12G7C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9407 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16471 42 48M = 16698 338 NTCACCTGTAATGCGTACCTGACCACACAGCGTAAGGCGTGGGATGTG &/A)CE7&+B+9B(7G(!9+#G9(+%F=3,EC4?#F;F;>:B1A:6E& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A47 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9408 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17416 42 78M = 17416 0 CTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGC )840-#1$?<'!;*4&2)=!DF7"F.G"4<23!:7&57G2@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YT:Z:UP jpayne@0: r9408 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17416 0 * = 17416 0 NATTNNTGNNAGNANCNTNNTCANNNGTNCTNGNTTCNNCTNGTNTNATNNNCGCANTCNNCCNNGNCTATAANATNANCNNACCCNGNNNNNNATAANGNGCAAGANGNGNCCTNNACTNCGGNNGANGNANNANNGNTTCNGNNNANNCANNNAANCTNCTNGCNNTNCAGCGATNNGNTNCAANNCNGCTNCNTGNNNACNNNTCNGNACCNANNCANTTNCNNTCNTANCTGNNAGNCTGTNCANAGCNACTGNTTNTNGNTNNCNGCGTNNAGNNGNANCCGNCNNCNCGGNCNNGCTGGCANGCCGNNCCCN "!""!$!$$!$$!"$##$$!#$""##$"!#$!###$#!$#!!$!#"""##"#$#$""$##!"""!!!#!#!#""#""""$##$"!##$!!$$!#!"###""$$"#"##"!"$"$$#!$!""!##$"#"$$!!#""##$"""$##!$!$"$#$!#"#!!$#!##""$####"##$!$$$!#!!"!#$!$""$!""#"!#!!$$"!$!"##!""#$#$#!##"!!#$!""#!$!!$"$!##$$###$"!"!!$$!"!#"$#!#####$!!!$"!"!"!!$!"#"!$#!"!"$"!!###!$!#$$"#"#"!#"$!!""$## YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9409 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48231 42 61M = 48312 224 TTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGTGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTT 8*.%7(/,.=%%=E:'!'*8E8.;53)6(<"4#D)AG3A,5>=*.!/@ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C25 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9409 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48312 42 143M = 48231 -224 CCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAGTTAATACGATACCTGCGTCAGAATTGATTATTCGACGTGGTTTGATNGCCTCCACGCACGTTGTNANATGTAGATGA ,'=!6-9!$C-6+$D7C?B99,)"4.CG=)<6-#%0#%3+HA4"7$9:D"*5?70%1(E8D33HB64:0>6!H,16/4:=/*16;4#@%H6=GA08+0 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:65A20T11T13G17G1T10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9410 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25126 42 115M = 24922 -319 GTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATNAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCNTAGGTNGNTAN ($'$!*&#'!#'*"&+#*&$&$*"*$%#"%*+')*'*$"!%!%*#'(('%#$%+&#+#'!!#"'##"!"*)#")$'%$)"((+$(&'(#$)#+)*#+*)%"!$+&')*)"!#('! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:30A72G5A0A0A2A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9410 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24922 42 70M = 25126 319 CCTCATCTACTGCGAAAACTTGACCTTTCTCTCCCATATTGCAGTCGCGGCACGATGGAACTAAATTAAT H4H0=A8D1>,*(/1'G3,;-;?7*8?0)4-H<(3*>6H2&!$A(?A-4:,$%GF4%B$5F9,,2'!$8( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9411 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34397 42 67M = 34464 315 GCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCNCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAGCGAGAATTCGGATAAAC &+(+(!!&#)!#%+&#"+(&$#$)*'*"'#"$&#("$#)$(&%)'%!!!!#(")(')$%!(#!'&&# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24T31A10 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9411 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34464 42 248M = 34397 -315 TATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACTCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTNNCTGGGTTGGACTTATGCTTTTAAGCCCAGATAACTGGCCTGAATATGTTAATGAGAGAATCGGTATTCCTCATGTGTGGCATGTTTTCGTCTTTGCTCTTGCATTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTAT 30:%4HHH2+*!FG186A*75$*E,8,AB$#-@@="AA!=HG5:!)6045?*?$#+E+#@A&+88,7/>"7/1&@FC"&B%&4&E!,D0E'A1<+?..0)&>3B27?6B:#.6?#'+++%$1+(?=6*D?*G3-@2B/88&13 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:105A0T13C127 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9412 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18588 42 73M = 18416 -245 TCCTTTTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACA 661GC+D.D4&"B7C>!=C-+">92B;2>8&%A"?7#$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9413 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36447 42 113M = 36299 -261 TCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGNGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCTTTTAAATTTTGGCTTAATGACTATATCCAA >#)";7*=<>:E&F7F034-"',9,2%G+#&B-H:C&E8F+&E%;?$?;5H=9H!D+F0G4H!6(F((EGGD!$3B;@81+1*$#@&0((&3AC8HH?C.@E=)EH)3"0#'> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G69 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9414 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8110 42 49M = 7901 -258 CCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGCCAGGCT 9CD-03D6"=1)>+"H;>$=E-',3=#&)#=.'-1F8FGE"#A+3FHC/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9414 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7901 42 51M = 8110 258 ATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGTTA D+&%;$+*A::,%#/'0F,4>F-,6#!;%?:5%),8A'93A@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9416 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11509 42 46M = 11615 151 AGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACNT 239;=8=1$9H2(#&3>D-9G"'(--&;##AGG"CF/#"6#8?.?H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9417 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30032 42 70M = 29837 -265 GAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCNGTNT !&&!#%%"*%*%!"&*&()#!+)&&(((')"$&$#**$**'*!$()%"'$*&)%!)#$)+!*&+('($!) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65A2T1 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9417 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29837 42 87M = 30032 265 NNAACCGATCTCACTCTCCTTTGATCCGAATGCCAGCGCCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTC "&%+!+'%+)')*)%(+%+###$*(+$%("+%#+&"*+"))$%(#"&*)%")%+%++!%+)&$!#$$+#$##(!'%+!)!)!'*(*( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A0A23G12T15G32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9418 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3928 42 186M = 4152 265 GCGNTGGNTGTCTCGTATGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCCAGATGAGCTACTCCACGGCACGGGCCGGTGCGAACGAGTCGTGGGCGTACTTTATGGGGCGGCGCAAATTCGTCGCATCCCGTCAGGCGAGCNAGATGTTTCTGTGCTGGCTTGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACG *%'#&*&"(&+'("%&))(+&''+*$!&!(#)+%!'("%")!(!+$%+&)!&*"$%(%+))#$$#)$$#$!#%#(+""(!$)("$$(&(%()!$!!(+!(*$+$%%'$+!(!'#!$!"%*#!!&"+%#+##%+!#+)&)*%"%$"*#'!+%!*%&#")%#)#$"*&&%'))'&%$")'!+$!'%'* AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1G1C3G61A37A27C19G30 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9418 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4152 42 41M = 3928 -265 CAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGTATAGGCTCCGGTCGTA %&"!(&"%=)=E5:(B,;&("'/A8<)2:H3&)%F=C:A01 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24G16 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9419 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5445 42 90M = 5535 206 TGCCGGACGTGAACGCGCAGATCACCGCAGCGGTTGCAGCAGAAAACANCCGCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGAC !"'+"&)!(*)&!&"%+++"!(&#&%')#)%%(%%$%#&&$*%)+'*+#*"!(+$!+#)&!)))$!"%""#%()+!#+!+(++(&'#!&# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A36G10G22T18 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9419 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5535 42 116M = 5445 -206 GCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCTCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGAT G*6,+1&'@2-#<$=;D"0,)*B-5G/F:;!-'3>$)4B7*/BA'$>*0-3<$#5*4HCC+GEC%GBH/E,9G)('H-%BG@,2BH!.H9H60->C8,' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9420 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17150 42 158M = 17409 301 TTCTTGACGGTNTGGCNANANNCNGNGTCANGNAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAAC '$#"&$)$("'")!)$!&!(##"#*!%'&#)%!+)#%)'"&(&"#*"$"%)&+&&""#%)$!!(#$"+("+)')!'#&""!#*('&+%%!%&*!&!&!))&!*"#&(*'!!%)"#!(&*()'*!*+*+&(&%$+"()&%($))"#+*))%$*#+(&+" AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:3C7G1T2T0G0A1T0A1A1C2A0T0G1G125 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9421 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46465 42 91M = 46612 243 TGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAATAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTT @&>GG'>-3*#$@.*:+#519H)?$<$2A4-%<$0-H7&2@%"G1;-=.0:,,1&'619F-5'EGC=41C4D+;467A<%A%D0(0"@=="9#H.:>#(@.#%627@=EB:7/?>#4%#B+=:H--61?E3)>B(59',0-:/>:*D/E1;8&6(H#.25(H-#BH0!C")#E, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:96 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9422 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24376 42 338M = 24714 408 NCACTGTTGCCAATGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAAGTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAG #!28/&(C!",=D$,+3"#A7&!0H"C.30E46,*G?5'80((2#;&*-;%4+>C8G,B#//DE(9&122.E=C,'E"#,G8.E.#/'?H/@E0!=%4B.7,:*H$"632,<%;3,E*D=6$H%:AB"-:D8A1>1",9$9)40))1<64)1G/9)*9-B2A6'#F/(G>7?>-!'H><9124:B3:B"3.)6>850C+(<1D+?E79&%G=@7B>7+9<&6>F1*/"069<%5+/,ED5&G=.>1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C280C56 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9422 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24714 42 70M = 24376 -408 TGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTT <'D'F9?F4,>C>=+9C15D;H.H)&#&.%A&GD('-86=8#*"G4@,<8"9C9D&4<#E1@$%@D=30* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G17 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9423 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18689 42 61M = 18689 0 TGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCNCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCG GB*#("3.#*:A7D;BB6,#=849E;&%;$%*14B$44;?&D=14C%'"?/*D3?G$589C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29G31 YT:Z:UP jpayne@0: r9423 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18689 0 * = 18689 0 NNNNNNGANNCANCNNNAGNNGANTNNGANCGCGCNTNNNNNNANNNCNTNTTTTNTNATCNAGNNNNCCTGNAAANCNNTANNNAANGTATNNNNNNGAAACNC ######!$"!#!!$#"!$!#!!""""!##!$#$!$$#!!""!"#!#""#$!##$"!$"#$#$"!!!"$###!$###$#""""""!#"$#!""!!"#"##"$$""! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9424 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6031 42 53M = 5813 -271 GACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTT *@D/8G-0H72&$=D*D;!1*B/2/658?B#"F$%-571G27$H!7,'GA#F- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9424 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5813 42 55M = 6031 271 ACCGCGCCCGGCGGATTGAGTGCGAAAGCGCCTGNAATGACCCCGCTGATGCTGG DA+E%<*+F5CC971D5'0G9*8',.:5A;02B3F655)06;F1@!.,&300C!- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C20 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9425 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36330 42 48M = 36082 -296 ATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTG 5.'21("8:??8%;0$-&7=$9+0*;42$B)*C556@@8!H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9426 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3357 42 59M = 3357 0 GAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGC ,62>,B9>&(GB<=3:;CGH8<0&C<0G(#>-G=*84A:?'#G"H1@44!5G)4#:A>&@.442FCE("!:EEC'),F25?#H#2='4#F.;D5D4;HD8.G-@.F;;#G5<>;),2G?-D)6<8"D3DA+7)(+98'.2F8B0"B(2E)EG',"/G=4'0DH&5?>*BF53A2E:AG1CF+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A5 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9428 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20436 42 101M = 20272 -265 TCGGCAACGGCAGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCTGAAACAGCAGCGGAACGGAGCGCCTCTGCCGCGGC ?E=.,6F=4=@@)(<:G2A.C*78849(%5:9D2#;49H6/2)"+1")62F;.:A447B@;7>/4!=, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G89 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9429 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34893 42 63M = 34668 -288 GAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGCAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATT FE@,CF905&3/%-=>**>B47"6><#%$/$9:6>6);/B;)7)-:7C-(7*'9(<8A",&/A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T7G27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9429 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34668 42 43M = 34893 288 CTTGCANTTTCGCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTA &F:70?>6(G#?8;@%$/>)%,(//!3>(.!:F*=EG!E$=;@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T36 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9430 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13010 40 40M = 12725 -325 GAAGGCGGTGTATGACATGGCCCGCAAGGGTGCCCGTGAT >A0@0?22=!2.@,GB0-?.4!&-92&1.???&D6;;A&3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-42 YT:Z:CP jpayne@0: r9430 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12725 40 90M4D54M2D71M = 13010 325 GGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTTTGTCTTAAGGAGGCAACCAGCCGGATTGGCGTGGGGAATCTTTACCGGCTGATGCGCGGCTGCCACCGGTGGTTATGGCGGTACACCGGGCAGCATGGCAGACAGCCGGTCGCAGGCGTCCGGGACGTTTG 8001$(((D4F>.''%<4A015",H&,-/>*D'-<64?CCFF;:"<56!<=8"#4"7.E$?A=H47@:E19@42=568-E"G7#67.B)3'6,@+H?H85(=A(/B+!$A):1'0&?@$H)CB67/04655+?))"-G):9+-6+#:@*@2;C@@11!+;5+2*(F<"9/!@$22$BH;'G+@(/<)'*>.(&7G-)2-,0+5@C?/<::.?@"H#;C59HC(G5FC*!H)C@;?=-2$G*CB-;58<$H>;@8))0/;4AB5D8354!!90B(6,*)+6/<3>>'"!$"&<>;D2EDF@2&G.,G$<%'),4 YT:Z:UP jpayne@0: r9432 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7510 42 264M = 7460 -314 TGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCCACCATTACATCCGGTGAGCAGTCAGGTGCGGTGATACGTGGTGTTTTTGATGACCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAG D.*=2>-D4B/)G23A:7G71D1D;=;,98A@-;#AC$>';",008D7G@$)"*1C5B2E5H/HF:@7:BF8&:FD1)A+')C;1;%'A)2*>+!2>=25GG#/+0,+!99#A."*-E+>03:#==HE>?9;/!!+HD4?0?AH!B1E:G008*A(F9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:264 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9432 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7460 42 50M = 7510 314 GCACTGGTGAAGCTGCATACTGAAGCACTTCACGCCACNCGGGATGAACC 6@'C)*:160:6#4,543"#&3'D(#@-!.#F,*$CE'(%;9#)B="30! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T14G11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9433 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10721 42 82M = 10903 282 TTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCNGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAA 2C0>H$FB%))B"=%17'/59F26>:<.&G8(@9",!##%A.+9EAC1F95!/H).>1D9B0DE1'0%9C&%/3$H/G5=>"'!*$FBA(;,,H77F;9*<=9+6EG;A=;((+8*8.-&5;3G<0$A'A8G@4!;&D:<='F2#H<)(0&4&D&-2>>#;F'#?6:;59/EB;D$B5*$A$#35*+C"3!-&%D>%"?>56+,*H5>"3)A9-4$1.7-#2)1E"2E2/0G?@00D23B/C,*),="A+56$(?1C84"C8CG/47E:,F%*$D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72T113 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9434 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3297 42 53M = 3082 -268 GGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGN D>=%3?.D(5@?&B=(61?38"!0'%.?2'&53*A"E"3C+.2>5$4,"3BG" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9435 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33256 42 155M = 33175 -236 ACGAAACATCTTTTCATCGCCAATAAAAGTGGCGATAGTGAANTTAGTCTGGATAGCCATAAGTGTTTGATCCATTCTTTGGGACTCCTGGCTGATTAAGTATGTCGATAAGGCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGT F&8$?#=;#HH'/F0/B=6:AA)/0:F5!@'2@-4%DE=D=,&!.#E0#HF;AH@13G,A"-3!)4-/:=D=,F6:D*>$&&)= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T112 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9435 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33175 42 81M = 33256 236 NAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGNTTTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGTCGACGGCTTC (<.A"/!;'>;;3=:>?;-&A;B&%!?&(66,(+(/D*-3.$B'%?=$34!H7/?'7!0*)0"%"G2"7,08D#,@#3HF+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C21C58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9436 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36388 42 139M = 36280 -247 GAGGCGCTGAGAGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATC 1/9B*<*7?9#&+0E?*7D!A7&;HG6>0//C&70%FB5,:*"+3;:%H%BE)(;E@D)8#EHB>G.*DF$-B.<9.96'76+1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9436 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36280 42 108M = 36388 247 CCTTAACNTNGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTCCAGTATATCACTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCA ?$;G*:=7#69<>5H>D*-9E-1957'?4H-0%#4@1CC367C8D.'EEF><-+%,+<&&.*GDH@!"01%A?$.6$8(C7#6+/)03801//7!=24C'@1(0C>2/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T1T98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9437 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26038 42 61M = 25843 -256 TTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGCT 'F@.&G-=1#7#E*"B<//15!%8B54:0.>D>@,?.'8D--H0F2(<:G>F"#&:G?2.>,)5@DCG#884%83"?/*@)/+/-0$(G))-.+EB))!545=+,?C!;3F9.."39>@9%C:830/!C.?'C2<4267G5=1'@@,":<9;48?6#GC:=7)"6)5)/G,6;CCE.$G&-G;%"&>F"E5)--HF3/$%F4C@054H&=4F!9C!FB$4G)"@0:,CC"3?$H?89C5=>$)=#1H?9$5A'- AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1G181T13A37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9438 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22031 42 164M = 21796 -399 GAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAA .+:%-,B)A.>*3:(-/A>1'831+CBG)-3GB0,$G051CC(/C+>?;A)=/3AC&"262.4&@.="AG3/E>H(5/7C+G=/EE'>*G2'('@;BG,7HE**D363AF??/1G='"-0@;11G60=6=24%":F)6C&"'%?E>#F)&49%5.;2"-4H0&. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:164 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9439 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25112 42 125M = 25006 -231 ATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAG !-+/*@69-"35:"1AA;5$7E2#6$B/+!&.61B8,!6B(@?%8'#C&9&%"8!5ABH'%;42.".#+&1@',H-7":?*FH'4@?1*,6+ED&3!,92&4(C#E'99:=BE*3F..)8#%2=! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124A0 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9439 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25006 42 54M = 25112 231 ATTCAGCATAATGTGCAATAGGAAGAAAATGATCTATATTTTTTGTGTGTCCTA 1"C@;=59,4#+;4''%EDD3)7?F97/93#H?F10=2F-,0%&( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G39C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9440 77 * 0 0 * * 0 0 AGGAACGGAACAGCGCCCNGACTTTCGGATCGAACACGATGNTATTCACCACTCCGCTGGCGTTCAGCGCGTAGG D/2$.+*&.#E<+1003',,,"D%83G'B=;3?G'G11>F=5G1!9.%3>H%D2*"! YT:Z:UP jpayne@0: r9440 141 * 0 0 * * 0 0 NGTGACGAAGAGCTGGCCATTGCTCAGGNCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGCTTNAGGGCAAATACA "E09#("?@'F8+':-1?37A(>D%F2(-<##<%@.&F7!)':F>:6)!-#C'9.+&$C8D>B63"='6)6") YT:Z:UP jpayne@0: r9441 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17658 42 24M1D38M = 17727 307 GAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCANATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGC 7&+'?18)9>*0FA#)2C<7?0;070CH:3D5G2.G;+A;C*7,@42GAGG?,2@'81,+@2 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:24^T5G31A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9441 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17727 42 238M = 17658 -307 GGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCAGATTGCGGATATCAGACAGGTTGNAACCAGCACGCGTTATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTCTCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTTATATCCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGTGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGC /9$#H@+4+0@;*(1%2/(9-C2#;&57?GF577)&)(9A07;0F%&HA0+(@+%8B+;%4F83,A=/43,;;,?!$8<@7@8,-C(,.)-=9-4E2F->>.B6@;A7(:BD/282+3+2!!$2)+5;%($(373C)4'%@7BCA0FG$+.);+@#4/):6H8('(2$6GG'F.H#A3D#A(F3!(5@C25 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:56A49A75A55 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9442 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8108 42 195M = 8030 -273 TGCCCGTGAGANAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAAAGGGNCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAANCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAANAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTG E2+$:7#,07'>AF(*?%E86A""3#.GB2&<$9!HG$*90;D.?B&&E+<=82B@&.&!/9H;,"?7GCB4E'!(D(46"<40'4(2?+*4)+F.C.,7!@"%+8;?B471:2@D5H!4H@!:C#&%+*6!3G&HH(A)%C?#D72"D&3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:11C32C71T49A26G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9442 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8030 42 59M = 8108 273 AACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACNGCGTTGCTTCATCCGCGATAT -E:H7CG(0+(BG)>%3B(BF@+B37,A&/:'B5)%+H2#C2A";+#B$>B7&%1:FB6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37C21 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9443 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38079 42 152M = 38272 246 CTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGNGCGANCAACAAGGCCATTCATGCANGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAA @(02+C:2H3>)D87*-C$<*H;E"=+1@":BC33*)8?%+&=EB(.0)C;H,)?;*A#?"/A!-0?>1'@-F'><@6+*(G06F7;C&H69+'78$)D!&+/1F+AC#/,G3".)&3(-E>+FD530'?CA0B4H94/4(/E9*"%F-2)? AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45C4T19G15T65 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9443 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38272 42 53M = 38079 -246 AAAAAGGGCATCAAATTATACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATAC 12&+50%9(7'%D@CH(69)7D9HA@8#86?EH3G'6&@&F@C/D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9444 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28720 42 72M = 28893 238 ACTCAATGTTGGCCTGTATGGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTANTCCAAACTCTTTACCCG ))()+'"(%*#"#+%($%%$$%#)(%)"#""*'&'&+(')"$+$&*!$(&($*#"!*+(%"*"$&)"&)''( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A34A17 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9444 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28893 42 65M = 28720 -238 CTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAATANGA !!"'+!($"$(+"'!!((!"'*'%+"+('(#'+)#(*+*($#$*&%"'$'"##'*!'"!+!'%(& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60C1G0A0T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9445 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2637 42 41M = 2818 237 CGCGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCAT ?#F?@@)2F(9,&'@32#H@; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9445 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2818 42 56M = 2637 -237 ACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGA C+!!?D!98ED?=$B.8?+E4)".(>G(AF7=:E-%F02?%8D.A3$)7?;:$&*%,3>F%3.E53&G5B3@.5:8.C/D9G49B=9%A=5EA3;A@-1)&CAB53G=.AF31-7A*A#):'E;%$+:F-6887#E+1AG8B26#>?75 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:78T10G18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9447 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41558 42 86M = 41715 265 TCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCAANTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCAT +'$((&)*(&)%!()$%'+)#*!"'#"(($"**#)&$%($#&'%$"#)+%(!*$&"+"*%#&+!(!*'#$+'$"$)+!+&!&!!!# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51G1T32 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9448 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30259 42 54M = 30114 -199 CTTTCCCGTTCATCNNGCAGTTCCAGNACAATCGATGGTGTTACCAATTCTTGT %!)!!&"(!')$+#$")%+*#''%#+&*+!"&&%&$$#+#'%!$&*&!!+!($" AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:14C0A10C23A2G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9448 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30114 42 50M = 30259 199 ACTCCCANCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTT DD;+8:2#7G>HB;34D"%4H;B+&5&/:(-(B5&"+5DD<33=,G/6)> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7T42 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9449 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20227 42 59M = 20053 -233 CAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCANAAACGAATGCTGCA *(*',2D@E&6%ABA8777$G#+5@?<+(AG)!C-D41>A=B-4(1051E'-8)FD"B5 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44G14 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9449 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20053 42 49M = 20227 233 NTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGANGCAACTGATTC +?'6;7A'19)D)E@2($$3.*1":>H2,$)<#3+7%>A>*6#A+6H%0 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G36T8C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9450 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32447 42 274M = 32332 -389 ATTCGGTAACGCAGATCGGATGATTGCGGTCCTTGCGGTAAATCCGGCATGTACAGGATTCATTGTCCTGCTCAAAGTCCATGCCATCAAACTGCTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAAGGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCNACGATCAGTAATGCGATGAACTGCGCATCGCTGGCATCACCTTTAAATGCCGTCTGGCG G.D4(">E&(6A94;:HCF+!2369+E;6D:'1?,-7D6=0H#D#C"D5D:A&<$H49%);//;;=/;8"&A=6:05"''$>!;FDG1(==$H44,#=5%:/BE9$>"$>=(02>:=+;<*DC74+C0)"2F>A%&F4-GD/,,/.B146"8,0"20/459DG1<+,1#944D*F<9'?9@F-0A7(/D">**1:*E7&F2>5(#&E&C?*HE:$1G!#'/.0D%7C2DAH52&1$50G*@*$9E!9:?&FG$,!1$#<2.*/(<2%@,8#>5&F?=*)4A6H%:""88A'6189A'GF&7#B5?"(><%07/5/8=G/;&C':H,A AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:98G16 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9451 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13976 42 223M = 14250 315 GCGGTAGAGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCCAACGTCCGATATCACGAAGGATAAATGCAGCAAATGCCTGAGCGGTTGTAAGTTCCGCAATAACGTCGGCAACTTTGGCGGCTTCCTTNCCATTAACAAACTTTCGCAGTAAACCCCATGACACAGACAGAATCAGCGATTCTGGCGCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGC ;-:'&'C7$G<4?2<*-A-'+;'-1>E@7?;B%...=+CA2+@/%7C)G5>08#/?,7?D>05B!+.$=<4-5D/1>;@.0:#*086ED-&E(3>!?1H:39;2H-A22"7-:>C-?G:*B5(**%:D1DG:>(%7:834F*;&<;+00.-C0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26T20 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9452 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37684 42 138M = 37897 260 AATANTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATNAGCATTTAATGCATTGATGCCATTAAATAAAGCACCAACGCCTGACTTCCCCATCCCCATC #)!+$#)%&'''+$+))!(+'*)+"(#"%$%)"('**+!#*%+#+'+%"%'%&"%&$+$++%*))")%#$&)%*+(%*%(!#)("*+%#)"")('*&&&#$+(&'#"##$!$"&!%*%%*"&!#)$*#!&!$%%)&'+ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T1G1T71A47G13 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9453 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38245 42 103M = 38177 -171 ACCCCGCTCTTACACATTCCAGCCCTGAAAAANGGCATCAAATNAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCAATCAATTGTTATCTAAGG F'"562?;)H0)!>H/A1)//BD+F4%86!<+(G#HF3"6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G10T59 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9453 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38177 42 73M = 38245 171 CTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCGTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCATAAATCATGCA "'*+%&&)#!($&$%*)(+*%!+("!*!""!"#"'*((!&$*%$#&$#!&%!"&#$%(*$"!$!"#*$"$!(( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:35T31A1C0C1C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9454 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17144 42 76M = 17000 -220 GCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCG 0)6)--<3;CDC'"A"$.$>:=C;0'$G5/?F2+54';-1876$A+%,/95@F;C";7:C2G/5#F6>"C,>15+@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9454 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17000 42 143M = 17144 220 ACAGGCNTACGNGNNCGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGATAAGCCTGGTTGACGGAAGTGGCAATCCGGTCAGCGTGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTG %)&#%*$"%)&!'$+*"((+($&(*))#(')&$"*!&$*#'!+*+&!"$''*(&$'&")'&'&%*#'#)%#&#%%"&$)"$"$*+*'!"&+*!+##)#'#((''))!'+)!$'%&&%&(('+$!*"(""+$'%+*!&"(!#*+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:4C1A0G2C0C1G0A128 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9455 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18045 42 87M = 18147 297 GNTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTGAGAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTA ($4%02?5GH$#.F+20GH!"4$0(*?EE*6=)CH-'9G458CC>>@;4@E54"*5&#-H.E;F?C97>0AB$<=)41(HE/%&""F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T28T56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9455 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18147 42 195M = 18045 -297 CCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCTAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGTCCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGNAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGACGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCCGGC #52;0D:)02<))59-"@1>%=/E0/>:AF'6.1G:'EG8"0!%#(;&4&.3>>C??A&-C/@>7?4(@0%@E!%+;-6>%CH70'01%%F;D0.1)6>*7A?>$21?>0*H"A6'D7>GC>!2&E2-1'&("9-4,@6&!-):$*G+#GE$B*%:C6!@*?G3/C6;D2H:C87=''+02)21%#(:8+,A+.;+4,4.?=)17&+;2A2AG1:E5"!#+2(&&<6HF&+2-)5!F%B,$*@!$;-0=;&7CA7DE3,;.7E/82$)A'0<0:9H<-."4@"32!+&FA&@$?5/BE33,6)(0+FG'//1%;B%5&,!4,H&-=!F@B'=7E=D9=!. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123C67 YS:i:-64 YT:Z:DP jpayne@0: r9457 161 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36672 24 106M7D34M2I4M1I8M = 38915 2434 TGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCTATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACTTAGCG >H2">G:+%7(.A*3A8:5!B4.;0*5A)/*682,?8H>"33E1E1933G7($1,7D&4=/4'H&3',G>6&>><5HB,@94*G@>!3=<'0"*>.-1C##"/$;E9+%'D-!+5>8:.2E%9.95CH"='%!B2D6&<#,8-@%0F AS:i:-64 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:3 XG:i:10 NM:i:16 MD:Z:106^ATGTGGT36G1C0T1C1A1A0 YS:i:-3 YT:Z:DP jpayne@0: r9458 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14964 42 137M = 15101 294 TGCCGNGCGGGACNTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCNGCCNGATNGCGCTGTAATTCATATTGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTATTCCANATTGTCCTGGGGGCTG +"(*#'"(+()+$&)"+#"+!)%#!%*")%&!#!%(&)#(*+"'$*+++&")#$*"%#%+(#)#*'!!#&&"+'("%(!!%+)($"(($%&!%"!!&%#(+)''+%(+%'(#+('#++')#)!#+$#!+$%+#$$&$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:5G7G39T3T3G58G16 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9458 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15101 42 157M = 14964 -294 CCGCCATTGCCGGATCATTCTTTNCNGCCGGAGCCACCCTTGCAGCATGGGGGGCAACCCTTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGTGGTGTGGCTCAGATGCTGGCACCGAAAGCCANNTCGCC &$&#$"$$#+(')%$&%*#&*'(*#$&!"$''#(#*%("$!+"+'#'%'+"+$$#'(*!'*!"'%$$&$")#))!(#'!$&!#*%))!!!$*%)$%!'%(*!+*#'&"!"$"*'%$%#%+')!$$""(#*)&%!%)")!*+%$+**+%#)$)!)!() AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:23A1C30G2A67G22G0A0A1T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9459 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11324 42 84M = 11324 0 TTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAGGCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCTGAAAGA =',9-G?%!>+=;"H#>?"<-"/*$D&&,:&?.-6DB0-)()1",9DEF: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YT:Z:UP jpayne@0: r9459 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11324 0 * = 11324 0 TNTTANACNCAGNNNCTNCCTTAATCAGCATCTCCTGCGCGGTA (#('$$'&'"*&##)'$"+("(((#&#((!()!%&*$&*+%(#' YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9460 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8863 42 55M = 9062 255 CAGCGGCTATGACTACCGGCNCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGAT G!E+F(+/66;>%G?+,3H8*>:=1*?8;0:.=>*)7!)4"E,H689B'C>+.F& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G34 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9460 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9062 42 56M = 8863 -255 GTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCAGGGTCCT %&!&(*"!+#(($"+)))#%""*$*&!)+)+'#$"(+&++''#%%&+#!'*)("'' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T1A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9461 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14971 42 49M = 15020 228 CGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGC )-"&=D3$2A*E%2<8&BEB%?-;6)(1(:B";/=,D*?(@EEG14$)B.7>&$6;BA>/;;@38?#?/8$(&??DA?G+*0*1:#!7CC$845EF&&, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C39A35C93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9462 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8205 42 95M1I134M = 8434 461 CGGGNNNATTTNCCCGTAATCANGCTGGGTAATGCGCGGGTNGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCNGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCC ***(""!+(%)$"&'%'$$!'*+(+(#!&&!)'*&#*(++&&+)"#'"%(##%!)'*%'"**+#!!"%#)$'")"+$&%*'(!!"!)"*%%$!&$('+'#*%&&%*#(#'#&&"$'"$!!("&*$&&#*)'$)()%))%$)%+(&*(+%("+#&"()**'"'!!(**)+($%')+(('(+%#$#)'*#(%(#')*(%&!**&%%%&)*%$*##&$%#%)$(#$+'+)%)& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:4G0G0G4G10A18T93G93 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9462 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8434 42 232M = 8205 -461 CGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGATAGAGCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCA :3$G+CB4(01GG$!*=5;()D$>&A+(&D2D3?+-"B=ABFE99B+&"A<0:0'59=H>)'>7.;"F#C10&2B+E#0-(F'*>0;.'65>>H."7=)FD8538F)G5F()G=)+BG=)34;5<%3E-(/'=D%D3&0C19:#F79H9:=;.,5'7=#>-!$'<.;D$-77D%9593&;$9A+-E>+0-,5&8&!FH)H)H,9-&<<9A;4G#&2+1&<*>)(*:H)> AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69A162 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9463 65 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48200 24 299M16I4M = 38802 -9701 NCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTTAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTCCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATNTAGATGATAATCATTATCACTNTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTGTCCATT &#%)+#+'$+(&('%(+!)%&$!&%&%'(*$'%*%!+$'!#$''!(**!%!"(!)'&!!'""&##'%#%+"!*(&)!)"!*&*)"))!$$&&)(*!'+%'#!%+')&%"&'!&%$")%&(##!%%"&)'%*+%&()'$(!%&**#*#$"$'!&*$#)"#'%#*'&**$')()!$!+&))&(!'"%)"#+%$&++''(+$"$$$*(&"(($&+(*)&+$#&&!$(%$"*$#$%($*(&'+&%$$(&#'#(!*#*$)!'+'')&$"#($"*$*(#!+$++%'!%**)%#%&$'&"''$+&%#+()$*)'!#)#+)")#""" AS:i:-69 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:16 NM:i:25 MD:Z:0C119C71G54G21T10T18T1C0G0 YS:i:-13 YT:Z:DP jpayne@0: r9463 129 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38802 24 81M = 48200 9701 TNGTTCGGGCNCTGCCCNGAGCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACC $"$*$'%'""!$(*!#&!**%)%("+%%($*++''!"#!+*!%#()&!#''*!$)&'*!'#'((*+#)*%*+&+""")$(! AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1T0A7G1A1A0T1T2C60 YS:i:-69 YT:Z:DP jpayne@0: r9464 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19097 42 136M = 18976 -257 TTGTCAGGCGGGGAAACCGGTGTGAGTCACCTGAAAGGGATTAACNTGAAGTACCGTTNTGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTNCCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCG +4&.?=$9H%E$%>A@FH$&(=:9,6>:!/.::07&-B,.GA*@'+5/HH&A"8>+%#=/@9$:"2+&F8E?%30("5E>7(=,:6'2#!G@'4)%H($=5743+*$2C=H:HC7+H>+*5/&0-;0E,+1D=&G: AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:5G8T14T15G12A42C0G33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9464 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18976 42 60M = 19097 257 GTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGA E-"3#%(#55$1B:=,53:)$358345>"DD>"?17DC;D#4''6!9#5+(AH1E686 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30G36 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9466 77 * 0 0 * * 0 0 AGNAGGNGNGAGAANCCAGGTATGACAACCACGGAATGNATTTTTCT #%&'%!!(#**#%))+')##*$$#!*$!*+#%)*#%'"(!!#$!##' YT:Z:UP jpayne@0: r9466 141 * 0 0 * * 0 0 NCAGNCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTTCGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTNATCCAAACTGCTGTCTGGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCANACAGAATATGAAGCCCGCTGCC !+&'!#)%()+"'"!("(!&)(%+$")!*++!+*+#!('#%!((+(*(+#+(+*"'%+$)"*+(%+'#+(!&+$*&(#(&)'()"!$*!##*+&%&+#!#"!(+*&+&"&#$$$(&!%!!#%!)&+"%&(")'(!!#*)*(')'+)*#"$'+(')%'*+$((&''"*)$+"#**#$!#"#+*+*"$!%%)&*"&&$"""((+"("(%)#"(*!('(++**&"('((+#%&( YT:Z:UP jpayne@0: r9467 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24544 42 162M = 24706 291 GGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTANAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATNTTTCCTTATAACTTTTAAGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATNACTT ,A%@.6!&'&=!G(E<036/H6DC/5*$H6@0.C&3>*;FA);B7*1@="'.!%>&<().5H1!&DB@$G)H-DD.0?="4!6D=3B-H<3!@?B#495-(/".B&4%'+F'/CH*7$4GD,5A===);>6)7CC*4@1)1H11G/'D.A?+HD7,#H1(@- AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:51T65A17C21C4 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9467 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24706 42 98M1I31M = 24544 -291 CACTCAAGTGCTTCCCTGCNTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTTGAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCANCATAAAAACTGATAGCAC *!%(!'"()+%''++'"%'(+!+&)*&(#*&)*&*(&(&!#($&&&"$!)!!))*$))$!#!+&#%'#&+*+%!!#*%+!(%$'$+%)!+#+"(%*#'(!$#*#(%'$%*$*!)%'"*+&#!+!#")&&+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:19C40G49A18 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9468 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9626 42 113M = 9564 -175 CAACATTCCGGTTGTATCCGGTAATGGTGAGTTTGCTGCGGTTGCAGAAATTACCGNCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAAC 43$584*(5F?.6@9=*H)B37;)*%:F-:$7=6,=)8).1=51DB?"$$:."05B;(.%"#*&*B!*"<&4/:<.A=#+GD3)A3+37>!-=G<@5599E&#A0B7)-A2-C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56T56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9468 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9564 42 55M = 9626 175 AAAGNCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGNCCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAG 7?=*8(F(:G$?*>4C0$7+?F@B$=))?'$>504';HH%76F+6HG=.A< AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:67^ATA16T5A1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9469 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29755 42 147M = 29661 -241 GGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATNTTCACAAGCGTTATCTTTTACAANACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCT >%A&DA+>=%0&=AHHH'>;%'9."4D<:E21C>**-D-@.,5)+#<24'A9/,01<#'6"-<2@#D0:#5!-'*98H522!0%#>%DB8H%$#D4,248AE9/,79)!E:HA@9)(!%$H;;C:"*$40%&>833%: AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:60T23A51G10 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9470 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41028 42 99M = 40901 -226 GACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCCAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTCAGCATATT )2&097;:970F>6F,B+(0810&>1+3A4!&0)80$?9,+?E)C+1.C.C*<8=(%5H9%+A;EDHE-9C!D@?**9<4);!6!+@8*A/+C*$E2&? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G66 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9470 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40901 42 102M = 41028 226 NCNTANCCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGNGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGG !##%)+'%%+"(*$%&')(+)#'*'"&'%$%!*'$#%)+$''($)%$#&&*)%$%"'!*')%"%++!")'%!)"'(($))*+%*"$&"%)$$'$$'&(%($( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T1C2A68A27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9471 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15273 42 41M = 15314 532 GGATAACGGTAAGCAGAACACCTATTTCTCCTCACTGGATA C$-"HE;@F01+:A/2%E?1"%&DBH-/9'?526.H&0B(6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9471 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15314 42 491M = 15273 -532 ACATGGTTGCNCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAATGTTTTATGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCNGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCNATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGNATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATC 38G8562A&/<1$/.19G7.4!=>/-0HD21EC;-8611=97'>4?4G#*3..@=9?>%A@?4A.;$C0+(,>>);$=D$@-E4)G!.D'DED=%0E*E.0H!8=134A.6%B'&31-6>58;22:+78+')D,,*7.-A3EDB(C9!&:-AAH&&*#)A,B0'-$>F0"%8F7;>BA4E9AE&C0D>D0%!=*8G)$C?!8AF(<+2<5>$?E.+5)F$D9DC/7C1?<<@$DFA!F4%>-@C"C<&0G:'!/,0&6&9*.>3.)35?",B'>;12>6;)+00;DC/2>F!7=5.&%BB6,-$32814";";:46A,'&F=E$F0#,'*/;"4<4;+75&#(0@1>B?.#D'B5;8B.E(B2+HE*F AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:10C211C49G89A128 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9472 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14714 42 159M = 14873 215 GGCGAGCTGCTGCACCNTATTCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCGTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTG ).?$6$6H%=GB(#F84:&<'?D#343&6%>@"39&?C;>*<'>!<"6#$C$B5)15!-,HFG*9"98"BE8#?.30=*.$<0>8/)(0$2H1CF'4;B*C4G45(E5#A;/1""):5- AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A142 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9472 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14873 42 56M = 14714 -215 TGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGG HDF=$8C?>(!E5/+=@)))8 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:24T5T62G41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9473 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43215 42 47M = 43017 -245 GTGAAAGAGATGCGCTATTANGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCA HH?485/%&HB7/"E,2E,AA$;',(9*."/C#)6F<%H.27'%)"$50$-%!*?>7?=%F";"2@F?E%"?-F"<"18HE4E:@%0A?F AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A49A3A94 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9476 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48209 42 241M = 48149 -301 TTTTGCTCNAGAGNGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTTGGAAAGCGGATGTTGCGGGTTGTTGTTCTGCGGGTTCTGTTCTTCGTTGACATGAGGTTGCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTT EA8;6G;D%!;<::-GB>2"/85@D1A=@!A1@*"E:6-A0,.6&@%>?3;#9:E11#,G5>3DG=;&B@"@A*1>CF!-@4+57&9A)+593H#@<;&2'4);4=!D:6@>(78()89F4E@"D:645-&4*D>AG!=C)0"=817GC">C>93=)D)*5H-6D0;8-"$H&+:!AE)-1&G)1/1"C&*@>:7B0:B)+C(66*%3E@(A*9<2&%>,2@C>2:5-5=&31D# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8A4C27A198A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9476 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48149 42 60M = 48209 301 TCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGANCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCT %4"D76H&";"18:>:,0H5H0!>!6!<9H56@$#8C0A#/#A8?<6>4!':CA)'=!!9 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C25 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9477 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23212 42 67M = 23044 -235 TCTTCAGGAATTATNTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGNCANTTTGCATNAGNAGTNNNCTT "'+#**%)#$%%$&#*&)##+"((&+#&((*''(#*#*$"(#!&+$)$%"&%!("'(&(*$&*!#"* AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:14T28A2A5T1A0T1G3A0A0T3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9477 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23044 42 139M = 23212 235 TTNANTNAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATGAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTNTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCNTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTNCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCN (#)'!%(+*&#&(#+)'+$+!*()!$)('$+'$&$$&)#*+(*(&(**)($#&&'+!"))%))"++$+*)(*(+$$*)"#*)*%%(+)#&(!"+$#!('$"#'+%!$)"$)(+"!!*+$(''!$*"&&#'&*)$'%!"# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2G1T1A27A32T22T23T23T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9478 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26847 42 112M = 26990 248 CAAAGACAGTAAGAGAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGNAGGAATANACCCGCCTCTTTCAATAAC :3B2!%C0:'9$DD!&11.G$&*.3F&-1!$.$&A>72-G$6"697+1)1HB->53(( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T69C7T19 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9478 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26990 42 105M = 26847 -248 TTATTAAAATAACCGCAATTTNTTTGGCGGCACCACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACNTA 50?0CG?2+:=3=B"B":'*)'#79%"'%62=4%43!9)F<==*G.="8()94-"(A@+=!%9?.-2:C><-7.FG9027?>@,=:-0(?=G;:@8$9=C3:,,' AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A10A69T2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9479 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37442 42 42M1D154M = 37370 -269 TTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTCGAGCCTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACTCATAC /)0#!,B;),!A1-=*&?F=G00AA>FA!%3;%$7(-95"7,1<,"4AHEF!<*/<=%B;!">9+F(F0&,$8(F'908B/77;B-.!&9/.)=8FGC%&0?&0!;>6-0-65/"?BA(*07F@?B>.(-"8*-57#-2GG/:C9EB6:H,6H:#8D+7+8%?3F681876%>H'3B01,B==&',&?"&/>!%%D@H@54C4/E;"C514?1H#"-AG)@6)'5%H=#C5:& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9480 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44260 42 135M = 44169 -226 CCGTGCGGTTGATANTNCCAAAACAGAGCAGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTAATCCCAAA 6(2690546/#=="E>..&08>,?&B*?;?=4%3D'%'5,-;*H<=G9%-(C3/!,C3;#/D4!,3E50"B:7826H(B5"AD)>?>;"H7/F8&?)G1CC?#7%/:7)%A)&B"3A*1'6&85!94$9D7D,+, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T1G12T105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9480 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44169 42 91M = 44260 226 NACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGG &G/3;7,5-!$8>.+2$8%-=F>A&,6AH9@,-<%C06EA/40%5H#538;>G=@"8C$D2@@"=:77/9&D"4E!:H;#$&'"D#<&C?< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T90 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9481 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18739 42 186M = 18739 0 GGGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAAGAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCC B8:":@C*:>D#,<*)$E/1A"EB&2./*('52))#.EF6#.C4CD>C<%=46A.HB+;'67&#?7H@9$2#3",.H&A;%6D9ACF5!-4=-=C20.E32.5.7A$"<9AA=B+F#D?B('1:$HDCE=9E<85/39";!60!;3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T184 YT:Z:UP jpayne@0: r9481 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18739 0 * = 18739 0 NNNNTAANNTNANNNTGTCNNGNANANNANNANCCNNCCNNTCGC !!#"$"!!!"$""#!#!$#""!!!!#""""$$#"$"!#$#$$"!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9482 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38039 42 88M = 37869 -258 GTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCAAAGCGC ?9CFD"1@(-6(22,9?DC%+EE.&??..4/#8+="B7%1)+-FH)#?-BH5*?#F0/#9F@)C,7+1$AHE0=49B1,+*"('?D=$!B#B%G<9#0&8>3;E*!"G(5EDC;'.35E.-(E&>37D95?=5,)%+B;H9="7B2!5;%"'&D9C4E*%-7G,EB7">'H4#A4HH8CG+"-"FGB<@#B$H)G;16:C*A4'5!*/"7; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18T29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9484 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7060 42 42M = 7060 0 TGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGT #"$%'#(#))'&+'$%&!$!#)'%(!+#"+$"'$'%(!#+$* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YT:Z:UP jpayne@0: r9484 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7060 0 * = 7060 0 ATCCANCNNAGGCATNNNNANNTNCTCNNANNNNNNTTAGCGGTACNTNNNNTNANNACCGNACNNTCNANNCGNNGCNNNNANNGNNNTNTNGANCNTATNNNNTATANCGAGGNANGCTTGNNANNCNNCGCCCATNNGNTCTNTNNNATANGGNNTAANNNNNNNTTCTCNGGTNCNANTATACTNNNNNNNTNCGNANNTTNGNCTNNATNGNTGNATCNCCANCACAGNANNACNTNANNNNTGNNTCNGNNNTCNANTNGNAGAACTGGC """!!!!!#!#!$##"$"#"$##""#$"!$$$!!!$!$""#$$#!!$!!"!$$###$#!$$#$$$!"$"$"#""$!"#""!$#!"$!!!$""#$""!"!$##!"#"$$!!$##$!!##!!#"$!!$"!$""!##"!#"#!!#$##""#!!""$$##$!#$!!"!#!!!#!$#!!$$""#"####!$##"$#$$!!$"#$"#"##"!!"$##"#$!##$"!""#"#!$#$$$$###!#$#"!"$"""!""!"#"#$$##""!"$"$$!$!$$$###" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9485 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32348 42 47M = 31958 -437 CTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTG 2?>-1#!'83@H*$)EF::&?H5B0G8>2-!0<5?$8%2/51(H!), AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9485 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31958 42 122M1I268M = 32348 437 CACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAAGAATCNAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCNCTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATNAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTNTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGANACCAGCAAATCCGAAGGCCAGACGGGCACACTGAATCATGG ,*,%37E0%1F="5&:$6?2-48E8-%BA4G1(!6;.A"+9F-D>>;+;4)"618+AE8AAD3.GA@A@=?-:-?62A6;-F<9?!201A>?9G7)/'@;1.9H5#ED==6-69+!,'A8=B?69>D2("&2&$2,*=%84,"E=0#'H.(G938BG3#;@,:7+E:85.;*01B!%8905@;;"!6.83-&<&5;@9?=$1E3E#%>3#->>;,?#5"='!4F2F.@D9<.)H>5@5F+GE7@.E$,G59>9//@2<#G/H'EGC10HDE,B=95H AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:105G5C16T11A0G84C67C53T41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9486 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11352 42 298M = 11269 -381 GCGGCGAACGAGGCCGCAACGAAAGGGTTTGATGACCAGACCCGCCGCCAGAAAGAGAACATGGGCACGNTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGNAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCNGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACNATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGNANNCG "("(&+()*&**''*+#!))$%#")("!()+$!)!($(!&#*$'))')!(%&#!&(((""!&)*%'#!!"(*)''&*&*+"$&+"!)(!'#'%$)**&"$*+)*(***"*#('))#)&'*#'+%$()(#(*")!#!)"#+$)"+())"!*)%!%(*"!)$!)*"!(&&+$$&"!(+&'&$(%$)"#&$"&%$!)&!!(#'$(++&"!'+*"&!!%)$'!!*')'(&$&+&)"!&&'***!)&'($!"""!$'#(*''*')"&(&&'"'&)!*%"%+%&))!*%%&(()%(()+'$#*( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:49T19C86G22T57G54A1G0C2 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9486 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11269 42 83M = 11352 381 NGCCGTGCNATAANNTNNCCGCNGANCNGATTGCGTATGTTGCTTANTTGCAGCGTTCCGGCGATGAAGCCGGGGCATTGCAG $**"(')(()%)##$(*!'$(%"%'!&!'%(+&"(*%$)*%)%$)($$#$'$*!(!)"')#!!#!)&""$%+""((!('+'+( AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:0G0C1A2T1C4C0G1G0T1G2G2G1A16C1G36 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9487 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38995 42 171M = 39212 268 GGTATNTTTGGNCNAAATAAAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAANACAGGGGGACACAAAAGACACNATTCCAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCA )$!#**)(**(%'!+(")%+#+)&)&&')#('(!&"*"%*$+%)*"#'"!&%'"%$&'#)*$#)$"'&)%$%&#!*#*#*&#"!$#&(#&)#"%)"&%$&+((%*!+&*$%%$!$'$+&#$$"+%'$!$+#"#&'#*+"%+'+#*)%+!$+++$$&"%$(%*#)(!!!)() AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2C2G5A1C101A21T3A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9487 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39212 42 51M = 38995 -268 TGGTGAAACCGGATGCTGCAATTCAGAGCGGCAGCAAGTGGGGGACAGCAG 0AE*&AB;#A+/=360?GE,'/;%?$)/"3$H#A427;,A@"(9702:&'0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9488 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29546 42 149M = 29807 305 TCATCTACATACACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACANGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAANCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATTGATACTCATTTATAAACTCCTTGCAANGTATGTCGTTTCAGCTAAACG ?48#".8@<35)#,*34A!%,6CB*G>,>?D>6,AC@5('A0G&*E((A9"=5F%C.//.!5D">&$C@=G,,49'*45(;)?.@@0>9$7@++C7:/$.;@A<*5&*-%D7F78+CAB@0/,77%FC3G(7HD5;#"F<9+0.BA>2E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11A28A34T51T21 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9488 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29807 42 44M = 29546 -305 TTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAANCGATCTCAC 9&'>2=F4H0*H%7H-.B(5A093*G2)2FE>-%&21!-1,;C@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C9 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9489 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30627 42 145M = 30772 226 CTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAATAAAAAAGGAGCCTGTAGCTCCCTGATGATTTTGCTTTTCATGTTCATCGTTCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGT ,(5"?#G63F4,"==/594$1*E48!)9:1#?&"CF2.!@211$,%,H)F5>,)H62=GB1<>B"4BCB#$<1,@CC:)*A<;,$11(=)4G+,48B: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:145 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9489 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30772 42 73M2D6M = 30627 -226 GAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTTTTATCCAAACTG H$:7;A/60?;DD3=7G@("=)6*'D'8(2)G;7,3E)@BE)!.7?%H*$8(7"2"5#:>!6A&<2E:6=(C5:/33F, AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:73^GG6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9490 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44020 42 234M = 44254 288 CGGATTCGGTATGGNTGCATTCTGAGGTAAGCACGAACTCAGCCAGAACGACAAACAAAAGGCTATCAACTATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGCAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCGACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGG 3C.1'G9/"6?/%H73+@*,6':=G!77-;*>6-41AH)>;&3#9*2$?B..C"!-?-,(7F8+@<>6<>52/BA%C/DH@@*3)A6#/*D103'8'8B@'E.)A$/(A'E$1*)#.0/-*0C+(&=:#:=C5)D/0&A>D:-$F1E-#!$,FG*=).,!>'41"+-5G,1?&AC?ADE<"(:GE<@!)H)0C?&")+>;%?>3=49E?<&A9"H=4#@#1#%&/6)*H:$8E! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C9C140A68 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9490 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44254 42 54M = 44020 -288 TACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTNGA ;7+E.7@:(0>7;(/4B7!!@A448CH*C&1"70D=,-#(9+B<'.$)EF./46 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51C2 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9491 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30390 42 65M = 30507 190 GCTCACTTCGAACCTCTCTGTTTACTGATAAGTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCG 4B?+C*2H4&162+,1@(<,?=9@"@73:>5#!03B@'1)>+&GE(:=#=28*E4:@:#+E67(< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9491 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30507 42 58M2D13M = 30390 -190 CACCAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCGGCGCATTTTTATTGNTGTGTCGCTGTAATTCNN +"$#!%))**)#&+("$))&#%&&(#('$*#+&&%$(%&""%)(%!$"'"#"+)+$((*""*"+)&*#)+! AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:2A49C5^TG11T0T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9492 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47145 40 68M6D148M = 47367 304 NNNCCGNGNACTCCTNCTTANGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAGATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAANACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGA &#""')!#)()**$%#'**"#%'(+")$&$+&(%!+!'#%%%%*'')#!*)&'#&"&*%(+!*!&$(&###%+#&!%+'&&'!*)'$&%&""*!'!!)*"")')*$"#)'()!')'$##%)**$%(()'($$%*!'*+'$(%#&!+##&$#'+&(&+!"!'!)!!""!#%*$%)%!*%#)&*($##("*$"!!)*)"!!)(%)"&%%&*!*!!**! AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:12 XO:i:1 XG:i:6 NM:i:18 MD:Z:0C0A0T1G1A0A0A6G3T0A24A22^CCTATC93C54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9492 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47367 40 82M = 47145 -304 CGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGACTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTNTAAAAATGGCAACCTGAG $8'++$/8264)9*>,'*D0(:0:'7G3:;A#,>9G(9(:<;6&4H5C@#?91<$9.+'A?&.<7"2!;+7'4=0-><<2(: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T32T18 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r9493 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8025 42 74M = 7848 -251 AGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGC =<0@.2"E;@!B"$.;,66<+)5D88:<*>&A@A8)4&8GGA6=9H#E&F.H80&;@."1C9,7"7AA=)8/D2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9493 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7848 42 87M = 8025 251 CACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATNTCTNGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGGTGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGG %'51(G+951!&*,@661A&&A"-#A8!4,67'7G*7&F'$&641D61/,"&FB44F!>DC3%A9+;%=889(*&089;F%-83)7, AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25T3G19G3A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9494 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44686 42 45M = 44744 214 TCCAACCATCGCAGGCAGNGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAA F%6E7GA'D;02>!+//C.*?0<+E)H)H/7*:9)1A27;650(B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18A26 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9494 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44744 42 156M = 44686 -214 ATAGNTAGAGCCNGCATAACGGTTTCGGGATTATTTATATCTGCACAACAGGTAAGAGCATTGAGTCGATAATCGTNAAGAGTCGGCGAGCCTGGTGAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGGAGAACCGGATCAC $4=>BAG#3B1$<-;A8G-<:G/"-)A9=*?>-'CG-*7G4B$*8/?<-938"'G'.>31"*,+;#:)4C.D-8&,F<17B@"6D5"(#(:0-H?"?'E!,FCB+<'.4&DC<8=($0C*?C"5):9E+;+2F6 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4T7T19T43G19T45C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9495 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12485 42 145M = 12337 -293 GTCGCAGGTAAAAAGTGCANCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGGCNGTGTGCAGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCA 7A#75,:@(%G-E0-HAC3H#?&#)#:85='=?H(A34:.496E5*H=$<2;!,(>>,5$?:6/&57%$?6%1+537)#F:;3H4#D%0A?FC71$408>'4)1$'G/,C0,(;HDE1H33@CE7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19G53A3A67 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9495 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12337 42 82M = 12485 293 CNCAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATNTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAGCTTCG "$+!""++#(&")&%!+!("("#')%#"#)*$$+#""'*'*&##&"")'%$)'+%""%$)%!'+$*(%!()+!$#*%&+)!% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A0A38G41 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9496 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6116 42 107M1I29M1I12M = 6264 361 TNTNCNATGGNATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCNCAA '")"$"*!%*!$#+&!*'+&!#&!*)"$'"!&$*'+&"#)%"$$$#+*!!$##(&!$$()&#((&%%+&$%*"%'"%$!&&")*(%&%('$*$!$*#!%+$%)&!*!)+%'#$%$'"*"%&)&%%'+''$&"'&"#$$)##&*&)#((%* AS:i:-25 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:9 MD:Z:1T1T0T0T1C2G133A3 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9496 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6264 42 160M2I53M = 6116 -361 ATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCGTCGCATCATCATGCAG D#*!6A$@($174<'A@=HE3>*6#&$!5@E&E09-<,F/$!F34>?>5,>F>#91=HFC7%DE#*%@',6/*G6B6*)0E/3%<5G#<6$%HE%<;5&>,"7#!C7D7A+*@,B$"E>)14F%%*(&E8>%C*.0B8E&F-@//+'1,F3',H$>>23!)0.*4AA AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:213 YS:i:-25 YT:Z:CP jpayne@0: r9497 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19997 42 285M = 20282 340 CGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTTCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACNGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCCGTGCGGCGAAAACGNCAGAAACGAATGC G'*,C>G)HF!%+;>8*>.-"@+"(5E/.#:C@%81:@02!)4?4+&/B=5-=D((*,+-5*3=2;5;##(<;)7#?HE@>1@>B$@>&@H(8H>?$#/-)<4!-8$;,"04#5C#DA0,1C,1CB2/:1HE).??H-$H)-"%0;9.5%E5/9G)E"-=-H>B"99E4$-":*,(*;@%E'&1)>*B(/B'%=?B"136$6")>!&@B>"B-9A9<0=B/B AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G36 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9498 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47981 42 125M = 47885 -221 GNGACAGAGCCAACACGAAGTCTATCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAANTGAACTTACAATATCGNCCTGTTCGGAGGGAAGANCNCNNGA #!$##"()#'($!#%#"!#&&&#)!$+"#*)!#)$#")'$&)(&&##%)"%!*''#&!&*%*)(*&#$#*')$))")$"%)("%*(!&!!*(%('$(#&($"''!%&"*!&)$++)&#''*!$() AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1T15C5G58G4T11T17A1G1G0G2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9499 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3495 42 126M = 3349 -272 ATGGATACCCCGTGAGTTACCCGACGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTTTTACAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTNNA )#&$%+()($*#"##")&"'#&+(%"&*'*"'&)%#"$&%"(#"*$%"')+"!+"")#!+&*('+&"*"'*#$(!'(+!!'*#(&'**!)!(&!'!#&%*$&"+$!!)$%!)"&""$$+*$"&%*# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G99C0G1 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9499 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3349 42 146M = 3495 272 GTGAGCCCGAAGCGCATCAGCAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGNGTATCCTGGCTGGATGCCGCAAAACTGGAC A7!6%H5*+.#+A.'?8B>),%4?E*>H/&<*(3%=61$=B:D,DA@<6C15,1%(6*(*&'@;4'?5/+<7?*/*#;3,1&?.#%01#2)G4798857B847.4A3754(GH;,9B?BE6965B/D,0)1:?+3$8!)&E)959",@D3!D%4D;C<@1H%@-'+3A;;4)9+7/6D1F<2G;2%3#2).*,5,B/2,'E.:("22"+()69)(0E9//+8GED%GA&D38495)&D7DH@7:G28@B7%!D<=<0@&%(E?2GB:9559.8A'F5DCE@@FF0%2).8%00#,C&A);+3;59)81D1/5%H!EF.?C&)*H2"?72G6*>7"+6&6&A08$C,7(@'.0=0G(;3<0?@=$:5F3G4B:;.,$%0(3A0)/&EH6/55-D'.H=!64;0!(@@@FDC) AS:i:-28 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:9 MD:Z:153C5G29C211G0 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9500 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38059 42 181M = 38240 583 CTGAAAGATTATGCAATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGTATATCCAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGNTTTTCTCNACTATNAACGCTGATGGAAGCGTTTATGCGGAAGAGGTAAAGCCCTTCCCGAGTAACAAAAAAACAACAGCAT &G-$./C+*8(C=+:1?"%F.G,G2C*>-EABG+=-AAD0A/C>95A<<5@9-7+2$")8!H873FG2>'/@1!9C=C./*9&H<7'>H@>./(!"9H/*=';0H&?1300>'48F,*+#A;.E87F!CD7&/27A=A2D)3A:023>;0-@6;$+D'3G+--,"FB3)H(8;*@%0C%&F AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:61A37A4T1T0A5A67 YS:i:-28 YT:Z:CP jpayne@0: r9501 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23437 42 160M1I112M = 23709 317 TCGTAATCTTTTAGCGTATTAGNGACCCATCGTCTTTCTGATTTAANAATAGATGATTCAGTTAAATATGAAGGTAATTTCTTTTGTGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCCTTTTCTTGCAATGTANCATGAAATAAGAGTAGCCTTNGCCTCGCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTATTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGNCCAAGCCATCAATGGATCATTTTT 1)#),CA=01D**8D7B4AA,;,7E.G);.D.>37%F*9D$''&0F>6-/14B;$>")1DFH"B/1D")H48.,=43=?B112E&02)1BD;$'-%#?"4%B!!;>46)H;!<.A":/%;D!>$,;=HB8E7#C#&%/2H7;!+*E:$C+,<*3;-7F?+>.F--HB=9"CD:5%%CA?0 AS:i:-31 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:22C23T105A14A0G19T30T27C9T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9501 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23709 42 45M = 23437 -317 CCATTTTTCAATAACATTATTGTTATANCAAANGTCATATCCTAT 5A?H6/C5.3*/<.@=-F6F,."?%=)+&FB*1-6%*6D$0$8;E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C4T12 YS:i:-31 YT:Z:CP jpayne@0: r9502 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15809 42 62M = 36125 20479 GCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTG BA$H+-BCA(?3A5934.CA=*'B%,9B"+'B-@?"*/)'E&(,3.2?4:HG/%5%3#B5,$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-6 YT:Z:DP jpayne@0: r9502 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36125 42 163M = 15809 -20479 TGTCGCCCCAATACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCACGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACT ;>+$%E%?@EC)-8A@''BF+.*?703ACC'")$%7)&H$+/,8#*93?<7(@$A.)!)0*.;(C&)F6E1>5781(G;%=>*0?:B03D*F?G/?(*G53=>C0&,:7F>+!BE:8C(GC;54,31@09;7B'*.=5A1B7!-B2!H=>6>!@$<0A"#:$:@=))!-G>7A/7#6*+4':7#F;=&)-,3>(3@H!E&02$6AB9)D-0-.7=F*>:=$A'A=DD1,4>GC%@,;0$6>(191<@-! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:43A41C14 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9504 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48389 42 86M = 48196 -279 CCTGCGTNATAATTGATTATTTGACGTGGTTNGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATNTGTAGATGATAATCATTATCANTTTACGG D91CB7@624DG&@25:#(HH+#+5$0F!5(-G)$"H$@(H<17B,0@-8F%$GEFD(@7,2>/9?-.92*A4A@,"%G7=;!D;.-3&+3H-.)B>;,5.7:.3607,4E=>(!4*E;60+7,)$,5$#-42E)$&8G+?7-B5'*9-*ACD3#4FF34G123=9-*0'F%H=B(77CE=*%!*,FH?:<0D:=,G9+&59H6!:+/<0"=7.H1.E0E(8'/G"4DC1F-(!.=#D%8B1.6&3H'ED;A&F0C<$,;49$E(%3$7 AS:i:-34 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:8 NM:i:10 MD:Z:54^ATTAAAAC120T87G33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9505 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16750 42 54M = 16804 358 NATGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGTAATGTTACGAAGATG $"@1$2A83H=9G1C*;9,$C>77/3-E$"0)8E#94>FD!59F.8+%G'?@@* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C0T52 YS:i:-34 YT:Z:CP jpayne@0: r9506 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12269 42 145M = 12414 288 TGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGCCTGAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAAAGACCTGGGCGGCTGAAGACCAG >A3;7F:C$3;94&5-E:2-"/90)G-@>E/"*/3%*??C8+82&=)0/A0*&(%=BC99!D1'&",&G&#%F7A="04+5-$:89@!$#<$EE672A44=+>/(>&:2+&"5.))0)CC90@/%0-8)H*!+>,= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:145 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9506 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12414 42 143M = 12269 -288 CTTCGCGGGAACTGGATGGCAGGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGNGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGNAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGNCCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCGGCGATGCTGACCGG !6B-3;=<8C"1-,!:;4$-8>4G>+(-F;1G6:EA)%EBA%..-"26;39?13AH'H2="'/.38FEDF="6=*3*54>B49=%D'2-"FEH/5<)!D(+)B&.;-96<:+1A:C83<,>/2E$>B%F$7H?'B0&(=;G=? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43A31C23A43 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9507 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15853 42 43M = 36228 20425 GGTGTACAGGCACTGGTGGAAACCACCTCAAAGGGTGACAGGA E@$./1+0'48,6(D3C;3#E#-&H0:#:<@4!%?HB+=%=3- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r9507 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36228 42 50M = 15853 -20425 ATGTAAACANCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTA ?2;+!@BA>)>$,@A*61H#=!!1G'-'6'@./-"B7/.E$>;:G-!5;E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C40 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r9508 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21657 42 212M = 21577 -292 GGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCT @,%@G.9G'=#>?:CEE61?,-(D@=4*>,'&6G8EC;4<0*>?G$#:CDH;F1(C3D==13GH7H92?9C2H0G<@@2/>3!86&HD%.#.:/:-0).5E!:A5"9>HECHE*#*+5#;*8CHE!G7+,>592BF4=G7$H,8D&C&37EAE9BD0(0?35C!3(%"*FB%FB9C$)6F7>!:0A3'.?,A7G@:=9>!=6()H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:212 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9508 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21577 42 80M = 21657 292 TGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCT &+$'%$"%%)$'!(!*#*"*%&$#+('*'*%))%#$+)#$"$"*')#+(+*)*$(&''**%')'#)$&'&((*"&+!#&# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9509 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19038 42 60M = 19119 203 GTGGACATGGTACGTTTACNGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGT B!H@0+F@(&1:>F*%@BH7>5F5?"E2)C9!)#/4+9E3D'57-B'3"23&3+&2=*67'3$G;;7)B!A/'4FA!5,@7514@#+E*&8B"1391@ED6';=8/D<.01%*DC:+-;B%<'/HAB!3"1B@!/5 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29T54C11G25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9510 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7952 42 71M = 8171 273 ANCGTCNCCGCCGNAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGNTGAAAACCTCAGCCGTA *!#()&"%%)"'*"&#'+#$"!($*($&*!'*)%$(*(&+&*$&"!'%!"+$"$("$%)*!)'#+&*%&*+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:1C4G4T1A39T17 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9510 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8171 42 54M = 7952 -273 GGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAAT 8?E'>':@37=E'>;D=6H!0G-"?2%*3:*&/4*.'$#<,@E/'9,$7,@G.+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9511 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6496 42 335M = 6333 -498 TGGCCATTGCTCAGGTCGAAGAGATGCAGGCAGTTTCTGCCGTGNTTAAGGGCAAATACACCATGACCGGTGAAGCCTTCGATCCGGTTGAGGTGGATATGGGCCGCAGTGAGGAGAATAACATCACGCAGTCCGGCGGCACGGAGTGGAGCAAGCGTGACAAGTCCACGTATGACCCGACCGACGATATCGAAGCCTACGCGGTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGTTCCTTCAAAGCCGTCAACGAGAAGCTGGATACCCGTCGTGGCTCTAATTCCGAGCTGGAGACCGCGGTG .;?):$%%D!*%C#/7>,8!(.5$-')B/<>49=)(?9A-@@.??&AD8F';5$"F&2<7.HH!)(.6578)>+?-A<'!$E*;,>#;3E;/0%%B1ACC-H'B5/0CA?"&7',09'11,+;-6F7&G8F?8.90:.=,E5H4.0730H+5A&/!E9*.&0E961*-&,;#G$=::5A8$:+5/.1,H;-?*:9D;-01#E,!H5/@95?:2?G2@)/3"?6%8E!78B5"',<2<;23%+(B1&/C@%))C8B'8(HF(-<&<-H:#1<56<>*:@C3,,*)C7A&-. AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:5 MD:Z:0G41A99A20 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9512 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45835 24 49M2I68M4D34M = 45773 -217 CAGGCAATCGACCGTTGCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCANAGAAGCGGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGNAGAGTACCCGCNTTTATA )&!&!$#%!%'+'"((&+*%&')'%+)&)"!(&+&'$)')'%&%&)$$$)$&#!%+'))!*(%!!#%*"#&"#!"+)("%$!&!#*'*+*%))&)&*)+!*)&'##(%&++)$"%"''**$''&%*!!'(###)+*(&'(!!'*%#!&((&#( AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:13 MD:Z:97A19^AGAG15C5C0A4G0A4C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9512 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45773 24 62M = 45835 217 TGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGT /326+E%#2B&B8:G#%$4"$0B9-AH"F8'B4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r9513 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12488 42 55M = 12214 -329 GCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTGCACAGAATATGGCG 1!F2/(252+6'&/5D',$45E=<)@>B#.29E.")1B"BC5$$10!H!F*-'6( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9513 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12214 42 58M = 12488 329 TGGCGCAGCAGGCGGNTAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGA 5G8%G.<3*)(B-:DF.-$@6=EH/*/&G/:#02"(/"<)/'01F*,D2&'0!EBD1< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15A42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9514 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40851 42 218M = 41069 268 GAAAGCTGGAAGTGNGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAGGCGAATTNGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGG G//H-B%3@4H#CE-468=D787/,EF+')-,)$=21)E:6FCB)A>*&8*B4E??D67#-);H@7*49/B;-12&$'%6=/:"@+.;&7>.>CGCD$2#FE2.%;@)-"F#8/4F+7+%8"'"3()&8F#+04D;&9,9,*@C@)&H<1H$'/#E6A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14T104T98 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9514 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41069 42 50M = 40851 -268 AGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGCAGGACGTC 6,#&=**-3-:5&0303D@FHB1%1+A;#10-(@'3D D"55E0+B62 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9515 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35171 42 159M = 35330 303 GGTATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACNAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGC 4*@F/<.-CA=5=??1G7D!!.1A&6+%.0+4&5G4D'10G;/#'.'"4C?>-H'9H3FD9H:,!(D8)(62%HB$D)?,<;F!A",%>*F!F>/0'5"E0BDF2DHH"#6%>%/%!9A-*0B6#D$0.H7HG.(&=%!91=1,:9H,;=/%27=!'/D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:115C43 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9515 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35330 42 144M = 35171 -303 GATGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCANTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCNGCTAATCCGGAATCGCACTTAGNCNCAANG +%%()+*($%("+!$)"%+#&%$"!%)%&!!)(&$#)("+(+)#)&")')(##(!+((&%'!$&''*"'*#&)%!*)+&+($&)%'+####)%+$'$*!('&%$'!+&)+$(""&$'')%%)"))"%"#!$+!#+!)%#&#*") AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2C44G65A21C0G0G0C3T1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9516 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5345 42 49M = 5137 -257 ACCAAAGAGACTCAATCAACAACTNNTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTG !)D?4/1(5'@%-%&543&!26FFH&+58(1F'$C8F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24G0T23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9516 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5137 42 55M = 5345 257 CGCAACCCGCCAGATGTTTGCGCAGAAGGTGTCGGCATATACCGGCCTGTCCGTG *@:,<$9'.'%D07770,*@,2/9=27C*")8'.'(F"81BG+!%&2)FG2B4& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46G7A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9518 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36226 42 134M = 36226 0 CTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTTTAAAACATTNCAGTATATCACTTTTCATTCTTGNGTAGCAATATGCCATCTCTTCA %%H:%0>E/?74'E)%&H%9D?.C!=$=,( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:87C23C22 YT:Z:UP jpayne@0: r9518 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36226 0 * = 36226 0 CCTCAAAGGGTGACAGGAAACGTCAAGGCAGCAATCAGGATTGCAATCATG 8H.'H,=:'5H%#B/B9#,'AC3%63F8H(9(5>=!3&C6G>B0-;+80=, YT:Z:UP jpayne@0: r9519 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21245 42 65M = 21310 262 GGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGC H'%"45B>1$?>'-&7?4H012$20E+>&.8-(5:/"C.3'002=*#DG%..,6+29D2$*E/A$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9519 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21310 42 197M = 21245 -262 GTTTTACAAATCAGCCTACCCAAAACATGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACCGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACATCGTCGC "6$<.<%<8>?(#".%2E0$++8B60A/7E@*6<>FA4A4#/4<=1D$D!EC@#G@57'8:).:)-81<@&-+9'B0C.%F=4F+"8&8)&<#"%B" AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4G21T95A73T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9520 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44663 42 70M = 44396 -337 CACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAATCCCGAAACA @H9B!?,B'!.1B014H/%+#E/#<8*8E?E)6!?/+86-CE6G6D(-/&2&';3H<.>'0!D(FC(+#2 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9520 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44396 42 236M = 44663 337 CTNNCCCCACGCACCTGGTCACGCACTGTNAAGCCCCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAGTGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCTGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTAGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGG #'%#(%&$&&&*+'))"(+$'$'!(%#$*')#!%#)(++")!"'$""*#%&(+&!%+%$"$(*((&+#&*('(##&"$#"&#%+#%$"!+!*'%%#+#)#&!'($(!(!"&'#)"*%&&+"'"+&+&%%$*$)(%%"%"'*%"*$'#'&"$%$#&$$&'(%%%'!('""#$'#("%#%%("+*)($%&'+'*($(*&)'+$%#$*&**#+&$('$"'"(#"$%$%(+*+&&"*"%$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2T0A3A2C18T5G23A41G111T22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9521 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17557 42 49M = 17814 304 NTGGGGAACTACAGGCTGACAGTNCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGC *C''=#+7:*92#C-=7;?E427,!71))D8+6*&D595D2;49?+@+4 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C22C25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9521 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17814 42 47M = 17557 -304 GTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATT D6&G&B+(D=5*E8#9;$')*H/1:F-#FA@7<1E)-#5H18B';(+H,B@6;-1*'91&7#H>:9922A">F9?28:C"C3#@7"B)=5-E!*-,@(&1>)"H6!!1C#1G?4431,B>1.F8;=ED@@,F$9BE6@EE AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:126T8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9522 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43253 42 112M = 43118 -247 CAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTG 1%'2$!*:>9*H$9H>B+D-H'#%-A>F4A2:6B0=H&#$9(6HF;4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53T58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9523 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12440 42 71M = 12196 -315 GAAGTCCGNCTGGAGAGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGC ;*@05;&D6C(066'5%4<3!.2ABD+#+3a&,0F5)@=GBBH:?!%:(0*2;3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G6T55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9523 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12196 42 89M = 12440 315 AGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGG 9+3F:>7'?/#2,0=1F#5.#2?;)89@&9"G46-(D=%*CFD=27"@/G3$5!9+B+#(<5*=176!!61(%,@?,#8HC4FD"H%9A#:B;B7=+'>(8H-.C4?&-&! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:111T0 YT:Z:UP jpayne@0: r9524 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45623 0 * = 45623 0 NNGNTGNNNGANAACANTTATCNGCNNANNNCCGTCNGCTNCCTNCNNTCGTANNNNNNNCGATNTCNTANNGCNTG $$$"##$!"#$!!$$$$$##"$!!#"!#"!!$#"$$$"#$$!""##"$!"$#"!!"!"!#"$#""$"$$$!!"!#!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9525 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7786 42 40M = 7553 -273 GAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGG A*6E22B@%7,.>#-9&H5A*:(+G0?B2>%D;C3"7&4E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9525 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7553 42 140M = 7786 273 NGTGTGGCAGCCGAAATGACANAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCTCGCGCCGATGAAACGATACGCGGGTACATGGGAACGTCAGCC $;<5:5A;E9?CC*24#;&)B>F4HH?'"3+,A-151?,:<6>+-@!F5*1>;EB/.$:D#E8#$&(*/3:,F=#C97B(6+.?711=4./H;-E;>G7,'A.<03;H43=+E@1:<"0#:& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G20G75C42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9526 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27335 42 314M = 27220 -429 TCATAACAGACAGTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGCAGTCAGCTGCGTCGTTTGACANCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTAGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTNTGGAGTGCGACAGGTNTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAG >7*=7(#*/>9')="/*!:1+F02DB$.=9;09B8!;A>$%B@H%,('@731C01'4@*8(74!.G.7),*6)/&=G@E60G)?#%3#.$#4%E,7<3AF1#EE;>%+-9$'61@>H3/@7"6"'6/!HE#:0*%4G(FA*A1$.2A@+05"1&?!F7H,?<;E)3BF=D,.;?.1G%"'?(/7CF<79#+5F$+"599-8<3G,)+55'*D<0,D=;A(*5'16@@1B'("4F!-"2)>55,H;E#/.C1>)F!B>8&'F+7-!22791&'-1?5+2.,/,3 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:12T60A21T60G22C15T118 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9526 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27220 42 115M = 27335 429 TCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTNCATANGTGTTAACTTCCGCTCCTCGC ,)5:7E"36(;',%-+G*4&*;>47#;1@>/;0>95$99C'0FA%-?2C'-+82F:3/AB#9'&9/4,>'7;2B:/?$41@='E0?*/4>?74183>$H=1>9(#3E,;F:G8?@ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:88T4A21 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9527 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31021 42 70M = 30864 -227 TCATCTGCTTCTGCTTTCGCCACCATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATT 834>,.&?<2(>'B.;-CCFF/8=0"0:G)?<>*C?9:(>#&/?DH,&%:9#?&@H;5@#C<<+".*>(D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9527 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30864 42 57M = 31021 227 TTTTTGATTTCAGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTNTTCCTGCTGN D="<@G)08*D$A-?D+%.(?99FB61>H6&*4A8)"D!F,!7<;7"?@350ED=0: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T9A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9528 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29991 42 118M = 30206 258 CAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTNTAGCGATA =>?5/DEA#5<*%-F);<"0.H"$DF;'2G-47=.G6'A86(*)6E#?6$3;5F;AG'A$(@0+;:C7)$22*;>33.):82#4:(B4!%/#>$.,036EF1/;@*:>>%81G57 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:109T4A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9528 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30206 42 43M = 29991 -258 TTAGCGCAATATCCTCGTTCTCCTGGTCGCGGCGTTTGATGTA %.6&A6+H?*%6'D-0?1*3353/1&>5+>*2CGC9>*=0+8- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9529 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38793 42 67M = 38524 -336 GCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGT #'+%.31'F8A)G,?;F00?H:31<6<&"6#2D,6?"8'G,D@4/B$>2@6./+;*$%!2F+8G10G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:67 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9529 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38524 42 131M = 38793 336 TGCTGGTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGTCATGGNTCGATTGGCGCGACAAGTTGCTGAGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGNAGTTCTGAG &@#70$#)'+&EH'$D#3(++7H41?%==.6G717>BD49**$/D3?=?24'G$+F$7/!C:B"B#D*+=8D'+G+=*E5AE.#,7GB(HF&>B-0.'F8)?*)>9$ AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:5T26A5C23C58G9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9530 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41466 42 140M = 41606 375 GGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGANGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCA 1A*H9>8?>BE$$9!G!B@!(8+8:?%H)*4'2-C7#!B++8<%0G!F.?8.%6)F1)"'G<('B236G=G<"6(0&7>'::"HC65/+5>A6:C0(*+C+>H:%A9';1"#+;EG"$.,73.(12"/4=0-2%#=)3B8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40T99 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9530 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41606 42 235M = 41466 -375 TTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTACAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCCAAGATGGGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATNATGTACCGAGGAAGAATGTCGNTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAG >)*-<0+==7;6C4072DA5C(49!;/@(>B:*?("+HC-982882F14(A5;),*2A&8#0-9/>:2D7*39D;@8:,8H)-1,6$F'"F,6%5ABA6.'*H@H#D*DAH,.<5H9?:;$>.5HEH2@GB80&6@4GC$'$#2-CBF+)50B8$=*8DH&!=?*++B!1 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:49A31A6A81T21C42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9531 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18873 42 250M = 18816 -307 GAAACAGGCGCTGGGCATCAGCGTGGTCTGAGTGTGTTACAGAGGTTCGTCCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGGTGACAGTCACTCCGGCCCGTGCGGAAGGTGGACATGGTACGTTTACGGTGGGCTATTTTCAAGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACNGGTGTGAG 8<78>!G->".9!0+H4:03.=DF=)(=8.5/%A9,$G0-HHG&1'/D@=E3790#@A#;#+69$%#2C,:(:)G//A9G#*.-5-';(7:%0C;**H-1#.CD:F7#!#&F.>7B'3+4?;;6$D)5A!-0FAFH?3!GGEE9:B%8F=;6;->D=#:FG"%,H"<;(>68%!2BD<9?93:&#>*-A2(!!8!+=#,@+G1?/H%2%#7$>,DC20(4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:241C8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9531 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18816 42 57M = 18873 307 TNCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGGTGATTAA %)+)'('#+&"%)!!!$*()'(%#(%%+*()$!&(!"#(!$(#''&)'*'*%+"#'# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9532 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43952 42 118M = 44166 259 GCCACGGCTTCNGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCAATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTTCATTCTGCGGTNAGCACGAACTCAGCCNGAACG ;5;@.FBF17>!025*G%/C;=,9-?.*G6#HE>(DF@AB?08HC<7%814E->H3 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:11T72G11A15A5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9532 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44166 42 45M = 43952 -259 AGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCN <@0"F>52@C'$B?1=;:A/$'BE8%)=<.86&$)F><4@>5A5% AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9533 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16140 42 231M = 16014 -357 CCCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCGGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCANCAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGCTGACCCATCCGCGCTACGGCATGGGGAA 7@&9,=-B?.G"38G#9<%&1#)&FF<13)6#)'2@7B8H:G%+.B&:E6&?)')-<&AEDG5@.'.C$>3(1+G+"<"A6!!3)08/30G>;52%2:+#"9E%5<2:#>,"1)D=@($D=E8?*./,4-/D=,G1$(;C88:+23<:/E%.12:@E?B>;/B;9319=&9>A@*,>$&!>5F'+%,<65H=3,6+5'$9B"4DC<" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:173A57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9533 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16014 42 126M = 16140 357 TAACCTGCCGCCGCGCCCGTTTAATATCCGGATGCGCAGGATGACGCCGTACAGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGNTA 7,'*+?<=0!%F81($C7//E*;$&=)A2!%+;:!(C%D/:=+-2D**=@-6DH+C7>:@1G)/E-59!*F'98@+B"8;?76E%F90"-C0H2,"/*.=4H:6<=<"";E2@,A=!&05$CEE,; AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G73C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9534 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36718 23 60M7D34M2I5M = 39025 2383 GAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGATCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAATCCAATGGTGANTCTCA 93(6D#7!*(?*:/(+B=F%1@@28E4"#:(=!>?C19AHC%"51"9'+C%3>-$FC/:3D2B:/H<22C:E:;@875,@5AA-'2G#7'A48CA?)/EGE AS:i:-49 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:2 XG:i:9 NM:i:12 MD:Z:60^ATGTGGT24A11G1C0 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r9534 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39025 23 76M = 36718 -2383 GAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGNGAAAATCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATNCCTCAAATTGGGGGATTGCT +HA.//#(#C-4+:0*;1*@G9>'*"A4%5*&:C3=H&(H)*'87,6="90A%?#.%@7.E%7/@C5F8%F<+D$< AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24G30C20 YS:i:-49 YT:Z:DP jpayne@0: r9535 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26303 42 40M = 26113 -230 TCAGANAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTA BC'+%@:?DD*>%8=H#,#:?*(A;*:&.>&6;H7*$/?$ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G33G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9535 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26113 42 142M = 26303 230 GCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGC HG$'+5&D-H)38#6%-42G?*%6:8C!C)A8A20&8;31;-)&-A',6-.#"#3**1.9-#C9:1?G@-G+)8.+*F*"&?#AG*<'3D+-):#H946,8%9;"17FHA?*%%849A52;/H.B<>#2D&;67 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:142 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9536 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29049 42 53M = 28759 -343 TGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTNGGCNATTNNACN "')%!"&''***!)&(!)*)*#*()"'+"&!()+#&+&"+#!%%"*&(#(#*$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:40C0C2A3A0C2G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9536 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28759 42 114M = 29049 343 NCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGAAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCC !9,E>!9;C$E%>#=.>G?"1D/+@A61@A68";G7%C,G>#%45,4519%466.%/.8H60.94!(2H'62?2;5$;A=/:B?G@%B"H*B=7A=3 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G49C63 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9537 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47822 42 75M = 48022 286 CACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCANTCAGAGCAATTGAGGCAGCATTG !%)&%*+%()()!$+"($!+"$'&!*#)#(("!)#!)$'%&+$)+#*"#&%%%*)"%!)&''!!)*"!(+!"$"" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T50T19G3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9537 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48022 42 86M = 47822 -286 GTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATTAAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGCGGGATG %G',H0D;5/0:HB0A&FC%+"8,/**G-D:F.H!1C06156+D4+",'%.CB&9?&"&("!E=91+0,GG>=H!(FE@'8B%7: AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T79T12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9538 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23015 42 74M = 23150 236 ATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAAT 7G:#'>80-7?3,+G4@110/F."7(4EG@@43C1@9/2)/2!/E)"#B?/A*!-;/76B7H:.>#$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:74 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9539 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7978 42 142M = 7836 -284 TGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATNGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGAC 4+A73*#9090!8,&5=5BH#F#&$)>1E%#81+,&!?-H-$#;6'E37F!H0.-;1;!#%E(@7$H6%'>?."9G#3>H#%:39;*9#"%H95HA2E3E51-$6%&C0%)=G=%+'>*,*3,=A';4F#4@HC@B21=7,'408&G"B73)/?+33E>"=*2-.9!$ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38C24G0T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9540 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7758 42 108M = 7974 281 CAGCTATGCCGGACAGGNCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGNTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGA E,G-;(>35-GB=D;C940;=$E6,-!9.:H3!05D=?8HG40?C';:6/81BE$AA#850CGF(9>%(+!?1*3@&27+/'+-@&6EC#B936'$$16;;-.B3C(B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17G49G40 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9541 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25153 42 161M = 25029 -285 CATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTGCTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTA 0B0D@>!$1473D.BD2=;6H@>>:4HH1*8E(&7!<)3$H&;GC597E!$),2#(87@D5H:F.&4C;#<,*FB'!'6F?*C&H?-"CD"?AC&#=#%E=.99G<,3%"*DEE(C,*D%6&C$!B@<'3G8F<@#:!- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A119 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9541 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25029 42 124M = 25153 285 AGAAAATGATCTATANTTTTTGTCTGTCCGATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGNCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTT +0$FA4*1+3&H-"G=H'#)B0;)+B+.H(HE?E&;HB')@.;.D!27&H AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15T13T45T48 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9542 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26680 42 7M2I49M = 26736 331 GGACATGGACTGAGATTAACATAGTAGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTT -H+/*C6FGE:6?9"9,F>'H6%399>E<(0E67798/C:G5-E'G:.5.6'919E74 AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:0T0A1T0T51 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9542 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26736 42 275M = 26680 -331 CAGGGANTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTATAAAACCATATTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATNAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGNAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTATATTAAAATAACCGCAANNT #$&'$%%('*&'++($!'"")*+#"!#$&%)$*%*)('$&%*&!(()&*'"")"'&"+%)+)'%&)%"#$$&&*$($#%%!'$##+&))&*+$#+"%$(###*%)*#'(!*$%#'+$)))&#(%++'+!#('"++&$%+'$)+'&*"%"''*#)!*(#!&#(++$!'"$)$(!+*('&%!&&$')+#)!!'&#+#)'))%#)'"'!'#+#%"'!$*&!'!%(((**#%*!&$!#$%"($'!"$!""*))*+*)+'#*%)##+!$'''+&+)&%!( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:6G56C7A0T53A45G81T17T0T1 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9543 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27216 42 67M = 27303 264 AGTATNGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGA 3/'4E3,*-8D64&2BF05A%E:+::<)F013%3&F?(&=,2*?C7(3D,+/$(?:3%#)%.G$&E" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C61 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9543 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27303 42 177M = 27216 -264 ATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAGGTATGCATGCTGGGTGTGGGGAAGTCGTGAAAGAAAAGAAGTCAGCTGCGTCGTTTGACATCACTNCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAA 60HG<44?@:0B.:$>B(7!05;G#@C*$;$<4F&DC#2D55'=6,6>&A<:;<'H7)#:H+9:D"E;$406@:9>"5!D4=D)-1<%E,2G0?@%%8+?.15A""C7D%$)C3C8"ED.H>)H"1#DF0/?:B'/4"!6#0+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132G44 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9544 77 * 0 0 * * 0 0 NATGCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAAATCTCGGCGTAT %0+5"<00/'ECFD+@<&D'1,F=-!30)7'@9&,E0E09:AED YT:Z:UP jpayne@0: r9544 141 * 0 0 * * 0 0 CTGGAATGTGTAAGAGCGGGGTTGCATGATTTATGCTGTTGTTTTTTTGTTACTCGGGAAGGG ,3/;HHB'4>9@"+'&!H+5!<:4D';A=9$!#DFE:6-*8'46FE@&-9A!@:548AB4'/A YT:Z:UP jpayne@0: r9545 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17180 42 81M = 17047 -214 GGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCNTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCA 5F@*4=B,5*'$?,)(),G%>/:!:$4DA6>5,&>C1!E3**C7,.E1#':6D#G;%@$'>1G..-H3'+EF79H/9H4D#)"!?:'8. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9546 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48066 42 78M = 47908 -236 AATTTACAATATCGTCCTGTTNGGAGGGAAGAACGCGNGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTC FAB.BG!"/@9.%"(302"8:*D:H"0HH92860(.7G*<:1A':%'2A>6,-3>/$G3"725(G=>*C)()2-F+&D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C15G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9546 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47908 42 93M = 48066 236 NAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAGTCTGTGACAGAGCCAACACGCAG &H74A8&$%2.9/;1!5;73!92&)C-/H''6;)7+3!>!E5F;78233:(14&A22$B37($)03*3!:&D-#1>06!4/@5(/*((026;?&2@1)E46!$.)HG5:=&A!.42=;CAE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T3C54A1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9547 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1765 42 81M = 1567 -279 ANCGTAAAACCTTCGTAAACACCACNCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGG 56"+D/$':*+)BA:!&G<*C@C>#$.2G981-D?),'6=,*$">C*)-=47.B;//)%/:$$;6G.(/2$>2&??5@1G@ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1A23G13G41 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9548 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35637 42 46M = 35833 264 TCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTT 85=$CE1,@:#"??@70=65'&/33@8<+;'4'1,)E?!$)E'C)> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9548 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35833 42 68M = 35637 -264 GTTCTCTGGCCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATATATGAATGAACGATGCAGAGGAAATN 5C+=D#;1*G*-,G'945=$4/E<@/D">"#2&8("C!<9H9C)#.A92/.&F2%:%&F8@&;.9!66/")#E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85C40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9550 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19147 42 173M = 19007 -313 GTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGGGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGATGGCCGGACCGGTTTTACAAATCAGTAAGCAGGTCA '<%,/933@/+83<3>B)341B576G5$7G$0F;9H5!14H'+'61H#'&4A>.=";'"=!,?,A3()4$>%1.D5:6"0!%C)(); AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34G11G12 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9551 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16513 42 245M = 16758 304 GATGTGCTCAGCGATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGNATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTTCGTGCAGGACCAACCGTCGGATAAGACGTGGACNTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGNTGA 6<$F4.A).F%4F@*-=24+DG<4$7@)6*;$+&B7>'/.)(9;*;8/6&?=E5$%/)828D(A-:4C3/'.2?.5"7A&!G"#;)2>AA80844?+B:F@.*<9$$:B;6$F3(+B$&@=A'6!8!4/3,2B0=<=>-*,561H5>""5..F=,HF6(AG28/'G194?517)#3.=>%E1(!.*9#'.+A28&/#4$GBB#,).A'510#8#(*1C01*1?/A1:4?D AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:35T43G21C39C60T38T3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9552 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4145 42 162M = 4064 -243 AAGCCCGCAGTGCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCNGGTCGTATGGCCATCGATGGTCTGAAAGAAGTTCAGGAAGCGGTGATGCTGATAGAAGCCGGACTGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTG ;*0&EH@#*G;""'<+*3#!E+(;;083&EHF;)D%#"+&*#(?5H#E2"%F3=0?>#*?F;+7G1#1/4C6.=!8>)@4H*-F*18H++7"$79<*;$+'9#1<3@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40C121 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9552 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4064 42 81M = 4145 243 AGATGTTTCTGTGCTGGCTGGAAGAGGCCATCGTTCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGC ;83H-:-:0C%375*;G+$-4#18,HA/"3G0D=@EBD?68<9HA:/>0GAE5:=:0.29=@&:!A5034(1/&7G$!G""#A#7:&;7@EH AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C74 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9554 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6168 42 55M1I29M1I172M2I37M = 6106 -355 GCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCTGCGTCTCTTTTTCCGTGTAGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCTCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTNCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCNGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCGGCTTACCGCCGCCG 9@'<=4?5@==#5485C&>9&-(+4H+!8,A8E&8..!?<+(,%H+5%9;7&7'.FH:8C+F>B%@-HH46$++.!3@GEA35%D201-B?!@A4>%,+"450)D5?"4#F8);>A2G80""+0!+:E$>8&-7@085H*7#)=#3'30B;>G0,E-7-,2B&48B4;)G#H.+'2:BH3?."$2G9(#,B@0.!/!A7745CD)!E;!!0:/'F&&=)-H#)%!'$/945.@C/%1-H<'=@D)1(+9D6BC:$!%#""=,:(5/>+(/65,1."D:!;/-CG$47;'B"'9G'F8 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:3 XG:i:4 NM:i:6 MD:Z:129T49T113 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9554 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6106 42 62M = 6168 355 CTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAANTGCTGNCG +$&'(&%))'*!'#*'!+''"&%($(+))#$%$)'%#'"+"'#%*$*)&"*)$$+&(("$'# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C5G2 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9555 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40321 42 84M = 40461 287 TAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTGCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCANG <#3B*2A/7+@#&B3&")A>))+98$+*H!&A9'>7CC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:82C1 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9555 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40461 42 102M3I45M = 40321 -287 CTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTGGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGTGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGNTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGT !G=A%2?C)2-1(>,(G=36H@D,%@H.'-95,3">E='.')8,3&;?*>@2>H639"AH7:+81/-*E?21$=-%>2C2;%#4G><:;!5)FG>&4>03--:5.D,87GD/0)3;1:0D1*BA$+D2?>?%041A79!3-863=*+*7* AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:5 MD:Z:69C29T47 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9556 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32714 42 90M = 32804 297 TNTNGCGAAGAGTGGTGATCATTTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGCCGACNCGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAG &!$$)+!#*)'')!&)#(%"(*("($")+++)#'*&"("&&*%+'"#$"%+&"%$)%"*""+'*)&+$'&$*#((+!!**!+!(#"&!++ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1C1G17G30A37 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9556 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32804 42 207M = 32714 -297 TACTCATTCGTTTTATACCTCTGAATCAATATCAACCTGGTGGTGAGCAATGGTTTCAACCATGTACCGGATGTGTTCTGCCATGCGCTCCTGAANCTCAACATCGTCATCAAACGCACGGGTAATGGATTTTTTGCTGGCCCCGTGGCGTTGCAAATGATCGATGCATAGCGATTCAAACAGGTGCTGGGGCAGGTCNTTTNNCNA $+#%*&&))(+$(#*&!&#!#'')%+(+)%&!)'+*%$+#$$*!'$(%&$)*+"$$%#+)$%*#&%"!)'&#(%)%"'#%$)&'&+#%$(*%&$"&($)%)"&#&!)(#!("*"#!$(&$!+$'#(!"'#)"'#*&%**!+$"*)*&)$$&)"#%'%+(*"+((""$"''!$'!'*"(+'$*++!!'*$!!*'&!(+*!"!#%"("% AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:95A100C1T3T0C1A0T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9557 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5547 42 145M = 5547 0 CACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCGCCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAA '(&0GD'*&"@1@&)-"4EC-(7D4'2A3(5,G=/.#7D%;C,4$+F8:<+1A!2D*@F909A;FF?42!#H"388"('+:%''4@,:&0#2/>0&!=6.,D,D=A@'E(%-?D2+#:(8;251%*$B"%+@),/+C)7#1G?9< AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A80 YT:Z:UP jpayne@0: r9557 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5547 0 * = 5547 0 CANATNGAANAGNTTTCAANNNANNAGANNNACANCGNNAGANNAGNATANTTNCTNGNGAANNTNNGNANNANNANNNAGNNNAAAANGCTNNACANCNNCANNNT "##$!""#"!!####!"#$##$!!"$$!$#$$!##$#"#$$$"!$"#"$#$"#$""""!$$$#!$"$#!!#"$"""!##"!!!"#!#$"#"#"!#"#!$#!#$$$"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9558 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44419 42 76M = 44567 238 CACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGATGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACANCATTTTGAAT $:-#!>-D.3"D3H?/><#G,@)''F;G//@:>'8;"&,F*3$F"2%05;.H+1:2-?).".#(E>;)&;+%B.<4 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G33A10 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9558 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44567 42 90M = 44419 -238 AAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTA %3-D%3!1+8/B#D,.#D)=/:"+(?4='+>H'>7A+3:(E7D2'D@*:(&415<',<,60B<%9659;85DDDE'--A,4B,6>$DA4+*B#8?=:HE0?"2""8:%)-*>((/-1?H-C4?:F;9)1.@;@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:148 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9560 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30571 42 81M = 30719 253 GNAATTCTTCTATNTCTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCANTAATCCCTGAACTGTTGGTNAATACGCTTGA "#6;,<"$34%2D2""78&!"5##3/0H+-=HC274"D6!;B,C/G;D=7GC,E*?@4<,&*$#A=A'#<3+1"$*<(1&6 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T11T35T19T11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9560 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30719 42 105M = 30571 -253 TCCTTAAAGACGCCGTTTAACATGCCGATTGCCAGGCTTAAATGAGTCGGTGTGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAA C.61/:/?$#,#F1;.*/55B;)7+HF2,!5G=$+AC<::#;4"1=!(($;++=7>0909$=G8A84(190G,6%"(&H?#(/HAH#:6;"$!2<.B=&>0,(>/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:105 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9561 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18339 42 127M = 18578 327 GGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGAAAGCTGACCGCTAAAAATGNGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACGGTACG ="5:*7";4F1CG*;=8?F)AC.6C#%+).2D>9.*/'C,16&*5CE82:59%(%HA:*.+864=@.C,5?,F18);%=%7G88;?*59%%<9*EAG-A@H2-$;'5,E.$A) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44C82 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9561 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18578 42 88M = 18339 -327 CCGATGACCATCCTTTTGATGGCCAGATAGTCGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGACAACGTA BB%:5(B(*+?$;!@E88.26=0(H#)2GG&;0<:$A,@;=D"6+5G7/(B#7"F@.G$G<%:4&834F/"2,130F202)751=<,3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C10G56 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9562 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15549 42 159M = 15756 279 GGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGNTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTT C,%40%@6@0%6>;BG;301?<;!++!.7"(AB03;@?#A2(&==/G&&/71CF;53&3=;?-&,!8:<7:2G'0*3*BF=6!6'=1$6?HA@:<7445(?9G%86.D<)-!09$AD/E?;3*423D AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G88 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9562 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15756 42 72M = 15549 -279 CGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCATC -3++8/2&1>9"2A;3@51@5@E5:D9/,0=88?&,2A$+23D>+F>#/+6%-A?,,G!5AD-77E@"'!'*H06B=;520(=BE3&1#>):%,;3(%@H@??;;<8 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9563 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7594 42 47M = 7767 265 GCAATAACGGGAGGCGCTGTGGCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGC 6/A(/<)@1-B.CE!*5E!9#ED#;./*=63?77H94B5<9:#*A+, AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9564 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20856 42 91M4D33M = 20706 -278 CCGGAACGCCAACAGCACCAACCGCGCTCAGGGGAACAAACAATACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACGCACTGAATACGCTGAAT 3G$.G1E/<"28//"?(EG-=685)$.6-EHG=!7>3.--B*?#6'B$>H?):EBCH36)-*;.>:2+-%&+"-6)?C.0*=D"8*>*H.E-H"88E)6C<,(E'D#5:,!80@C;9363G4!? AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:91^TATC33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9564 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20706 42 42M = 20856 278 CTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGTGCAGCTC 71? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9565 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4817 42 266M = 4660 -423 GGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCGCTGACATCATCGCCCGTGTGCGTNACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGACAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCGGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAATTANGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGATATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAA -/6:0@,-DB5''C+4)3>BDC#+@"4>4BD-8#'9F9FA%E*=:7%!E8-7!>B6E=GH&63)6!$)8G,(-:",#./0(*7<9-4F%%%,(5D277D1%B:;8.#;$1F=E1%)/G#,E"F)DH-?19=E32/+:3H?'(3-$H5*<5='9C4G680>BD)D.@H;9&0D1:.D<246 AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:54G24C42C37G33C29A41 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9565 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4660 42 157M = 4817 423 CATCGCCGTGCTGCCGGTGTCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACAACGGCATTATCGCCCGTCTGCAACAGGCTGCCAGCGATCCGATGGTGGACGGCATTCTGTNCGATATGGACACGCCC =8!7:2=5*HG$8:$!;E*.E'$2=39C/;;"5"A=,*&G25482<*0%.0F?>2A6)#&?>D, AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:139C0T16 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9566 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1366 42 204M = 1609 306 GCACCTGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATNTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGNCCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGNGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGG ?7G-"2&8:!5#4HC/.3?6>,8"#3<@F'43<:7>F1,79.:5E:#E*C2%CC3-=@@;6AB#6!AA!AG=+""-;H-*4)B"A2/0--%&C",-!77',HA=8A>:F=!(A1G,B@':<>;F8#GA)=&+%D+H+!'>H9<8A5)'@@,);=F,$E+'/$8!>'"7*6%E+)#;A%,%,,A8# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:41T99A32A6C22 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9566 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1609 42 63M = 1366 -306 TCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGGTTTTCGTCATCCGGTGAAGGGATTGAGCCACCTGACA ?@(C2.82!)/:9.50!42<;5*$//G83A)F/E7<$G:;)D6;G4A!C:D5>2G..6.6 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A17 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9567 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24444 40 110M = 24712 317 TNNGTNNATGANAANTGTACATTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGNAAAANTCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATA &(")"&&)$"('&$')#'!+""&!'+&()+&(')'&&!#&)#&&+!&+!'%'&#*"*&'%(*$&')+))##("#%*'&()$#)"$"+$!&***&+*(#!)*+"#'('##) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:14 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:14 MD:Z:1C0C0T0C0A0T2A1A2G1A1T1G57A4A26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9567 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24712 40 49M = 24444 -317 AGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATTTAATAGCTT DB/+"*&G@*-!>+1'F21*0C9#'"*?9,"9A)=7.;F$16/E!:@73 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9568 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44942 42 254M = 45196 313 GCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAANCACNGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTTAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGC !45?E4<-9H$@H--21;5$8;(/HD,35+4(/4*4>8:7,->1(=FB4C*4C+06G><&?"8%(;..441"(A;/8F@0#A663+7G9=G/:7%7'4?2.E(>+5B%<8CB/H+D22.%7)G!)@$183E2!!?:5D,%52"E=+&<#5(:)63B"G)E162;#!9&F4A(%114>.?5<:>&D=/34&B)5G,.)1,#?:<+%%(.,&G7&AG&F>#3:H9*8=H>7!H038B7E>63/,=%&'0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C161A3A44A42 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9568 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45196 42 59M = 44942 -313 CAGANAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAANNGAACCNCGCATNGGCNNN '%$)#!!%'*&*%$**'$)%%)#$%(%(+!"(''""($!+!"&((!##$%($(&%$$!$ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:4A34A0G4A0A0G4C2G0G0C0A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9569 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45970 42 62M = 45840 -192 GCAGAATCACCGCGATTATCTCCGCTCNGGTTATCTGCATCATCGTCTGCCTGTCATGGGCT 11&+")$>9E(F9HD<2;H-15'=:>6>=EC41)9%/G+47!.>>9+5E0,'<;D5<74,?$>-)0%C+(4*"F73F636>F4=&/82-5!=E@).A+(,,2:?9B3;"/EE6.7C?( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:5T5T81G1T0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9570 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21509 40 40M = 21608 195 CATTCCGGGTNGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCA %6/>52G<4F$-F!8@195#)1HC.$#C!.438@3':6)7 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G3A4A0C29 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9571 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32224 42 54M = 31925 -353 GGAGTGATGTCGCGTTCCGGCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACA #&,+*H=G'6+9$-#74-0*%$<>!(F:/5!H(1#A/H@D4*:E!D2!-@G7)3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9571 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31925 42 155M1I144M = 32224 353 GAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGNCNGGGGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCNTGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACC E15>C/,$!-)8&A'+:$94669+()G"?"9H%7)'E&()%9=22>>(4A"/F?A=8#*@11D.5B+?5--7;C>>=D$@%3+'DBC;=")"?&&+68*@)FA"FD:B'FFFH)-0C(*6@?F#B/:@F@;!D9!-;C&BH)>&(&5<&F"5->?=(A4H#!,"7-*G35#5>%2)A&*".B-;+:,+1G./4!72#8)4E)#6*'-6,86)%@C+).+*, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G80 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9572 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15533 42 85M = 15295 -323 CCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCC C8#A!F+E0-%.BF$F*;$A:8F8G@4#@E@*>?5:%>!A9/,F48B;7*%19&&-B42/36":GD'C*/-)9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9573 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28338 42 268M = 28283 -323 GCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGACATGGATTGTTGTNATATGGCTTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCACCGCTCAGTGNTGATCTGATTAACTTGGCTGACGGCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATNGCTGCAATTTCNTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCT <%>E1H>-6/D9%(CH7=$%'-45D<60:$0HE(2.:E1##1)8,="*9B?*4>6=5$CH5%C08FC:E&&-&"=!%98GG59-.BGE$=77HH%DE8?;<6%=3?#18#/>9)GG*63E49)8-DA-0/7B<(@"=&/C14HH"F2#C13G@B*!28.51:8,":+G':C4G7F>F(1/$F2,:&7!4G=BC79")0@#C9E0;!$9:H/&"2&'/#86+?A0,<0?A-=5&.>2B1904)<#:06-<&;=36-6?) AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:57T7T7C25T9T23C33T2C8T88 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9573 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28283 42 55M = 28338 323 TCNGAGACAANATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCA &&!&(%%%*)"'+($"+!('$$&+(&(**""*"%##"!&)$)%&!#&*%%))$!" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T3C3C44 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9574 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43796 42 55M = 43566 -285 ACCACTCAAGTTTGCCAACCAAATGTATATCGATACCGGCGCAGTGTTCTGCGGA (4F+8;>?>/12.1>+?-H3?<;(57!>D&:>2./53@"A0FDB8!+*30<.8-" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9574 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43566 42 230M = 43796 285 CNTGCCCATAAANCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCNTTTGACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTNGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGANTCANCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGTCACGTTCATCTTTGGTCATACGCCAGCAGTGAA %&0!E':>(-5E47(@@D009+/CH637E!4F@FB.#8)&4@=+"/."@;6>()<6/@?;;&@,!!$>/D930D=%*>(#A6=%1;>,3&6C3;C?15HF14*9G5!D=4D))+?:;*>EA5E>(?E#;F2(20)!+680,8(3%5E:H&@%E,=%=,&A<1B-'*1E1*.@("+;$'7=H"5+?4>F,6H7# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T10G73C29T33A3G41A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9575 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1767 42 48M = 2016 322 CGTAAAACCTTCGTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAA :H/C(&5)FGA5:&>@&*69>==>:EB@&>,>6+EE&;F=*D@3*@1! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G10 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9575 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2016 42 73M = 1767 -322 CAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGCCNTCAATAAAACCTATACCCGCCGGAATGGTGCAGAAATGTCGATAN F,D>:!+?'@?0?;'624%$<83;4+56;>F";&#+E#1,$@CD4,,);?7@3D3+F4F1C*8$" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A44T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9576 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41060 42 51M = 41182 267 NNGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAATGTCGTTAGTTTCTCCGGTGGC &%#+*!#&#+'%$&*!#)"''(!+*+#%)*#"))&(&"*+)$%"(!+)$++ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0A49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9576 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41182 42 145M = 41060 -267 CATGGATACAGGTTGTGAACATCCAATGACATATCGGTTTGTCAGGGAAGTTGTGAAGTTNTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAG $+=F;H<'G&3#;:G$-H)FC9%<)B5"@7-CF!9%'!8(3%C:!+3@4"(/.!?6'..,@+@;>4@>5C&+?(%-)>-(?*/A,H&&?E0#06?>*5)!3A!@F:=/>&1&.-$>B:G6H,A2*7C7"2%>">..7"1$'8"9& AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C84 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9577 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6101 42 69M = 6000 -170 GCCGCCTGTGCGGCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGCTGGCGGC /'51."%+22H3FB%:1*) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9578 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41241 42 111M = 41241 0 TCTGGGATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTTGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTC H!/A(%D96F"HGH4>F1CDG.',!;A89+.<.?<%#/++FBDD*+A9D$0;'*H3).422C//!+41(-0G/&;.0+)-F@:B*=H=)1@G?:"6F:C%2=/%(B65A>E*+61(H"F252H<18BDC*A2!>%'D!%5.$7%H1E>6*C;8<:HC8/D<"D=+*0<4H#>-2&04,86 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:83G27 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9580 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43212 42 106M = 42959 -359 GGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGNAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAAC #C$-.@&;7>&4#%?BC16+1F)@G/0$!B*=(F,0/E%3.">(=C5&1A2/%"+E@?:D:F<@'%7H/1=,8-;H:.B')>824?%CAHA%=$=#>3(-@$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A68T11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9581 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13359 42 136M = 13524 217 CAAAATGGTCGTCGCGGGTCAGTATGCTGCGTGTTGAGTTCAGCGCAGAGTTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTG .*14<:(B(:G*0G9*+:A@.3?6C+@7513(>A'H9C3">9$A-!GA12H1F<,682B7H97F1'"35?=41.2/E)(BC8#<,0>C0'(,F!>8-3)&! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9581 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13524 42 52M = 13359 -217 TGGAGAACGTTATTTTTTCTGTAATGAGCAGAACGAAAAAGGTGAGCCGGTC !3%?3.;&C'F'1G?:!"#G2<+AC:F;<$%#8-&29F(@DF?7.3#!?0"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9582 77 * 0 0 * * 0 0 TGCNANNAGGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTG %*)$)$%)!+*'")*%%$&)"('!!#))#+))#)")#'!(%!$!+ YT:Z:UP jpayne@0: r9582 141 * 0 0 * * 0 0 CAAACTCGTATTCGTCAAAGGGATAATCGGCGTGGCAGATAACATATTTTTTATCTTTGCTCACCAGTTCGATGATTAACGGAAGTTCATCTGCTTTATGAGCAAGAGCTTTAGCCAGAATTTCTTTGTCGTAATCGAGATTAAAGAACCAGCNACCGCCATTAAGCAGCCAGTGATTAACGTTTCCACGCTCTGATAAGCCATCAATCATCATTTACTCATGGTTTCCACGCACAGCTCTGAACCAGGGGAATGTGATTAATTCCAGGCATTCAANGTTCTCTGCACCACGATCAACCAAATCGCCCACCGAGATAAGCAGGTCTTTTTTGTTGTCGAANC D:&D0%,*486+GA7D<6'F?'A'76EF3F.G3(>?:+%EFH*G')>,#9!&FD,-C&6<"+H19H%BEC!B,$G3+HF#,A;&!%%A!78//@@6:9<.#6!G)H%EH9A*0-"-4!H>'F=,)=8*5,4AH+7++&-1(;G#!8/37E@(G:(+2)=.@=>F)3.#DG,+&.=?;'>+@=#11D6!1-H?!(C41H=*DD271&,**E=4-E74@'B%&#(!6A;@"":2?:);?C@:.!38H8&)..=:A$E77>':>187G.%!H:B*(8H>D5B#*C;ABD)2,1&HC*1%**0+%@=+>*,$HC;4$D0GDA+2./3#2>=E=/"%A<2757:-%:-G.H0>-7''=@?H511&91'3*.>;G/6"/.#"FAFE0)BEG",A/>>(5''>H@5H38#3<2 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A27T102 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9584 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7154 42 224M = 7378 292 GGCGTAATCATGGCCCTTCGGGGCCATTGTTTCTCTGTGGAGGAGTCCATGACGAAAGGTGAACTGATTGCCCGCCTCCGCTCGCTGGGTGAACAACTGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGT F?.F:D9BH:A#4!$2%>,#=BEF*<*/6=02%*+@*9/88'+7#"%&(="54;=?#;)A35G7+<-=<,37D"95+;3;B;G59-9D8!((5;B1(AG6=3B('87<)HE'-1)%''.B8HH'1?A)H8)9*D2C'0G;0/(>=9;.:0G=:H6';,7!ED&?;8>>E89))>D<-*0;=8@;5:(E?%0EG0/-&5(8=)(6#(,'43*)0D2=4A'$H1&% AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:58A15T149 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9584 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7378 42 68M = 7154 -292 GCTGANCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAAC -*@*4%;*9;%083B/6&C1*!.E@3"5"-=-69(D/%"9%&1'?6@4H8="G$=)@E#H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C62 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9585 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25253 42 193M = 25446 367 GCTTAATATTCTATATTGTNGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATNCGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCGTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGG :";1#42EE$*!+-HD-B=3"0=6F89')-'*:-?#1+.C<,!+.,@.GH21(7165)BA8+'5$)FD'/417D)(4=<&'"2,/6HCA8'3E,.5@:>F2=*HFH0@FG7?8:D;:,28%(,,$4F9@C3*>!5'>5334DD?*"(<9=(++'F*B;:%7H.85'H*,:,:$2#$?=' AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:19T96A0A40T34 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9585 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25446 42 174M = 25253 -367 TTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCNATAATAAGTGGTGGTANCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAACCACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGAC -FG$5"E-(:3&0AH-26B>%$3?EGF4!?3!,4:/;=?9=&?/*B?7G.+@F*0G2#7FD4/8$E=1FG@09&#>F6-7?G>$5F;5&@;(?#)=(@=3@*!AHGH%;E<21F'-0H$(A!4DH-6&=F9G),.A1:1-3&",(/7G66847/16,A75!'0C7>2>A1746+#7;4/4%*-9;D&)*$8@*"6-(E9>,0"6FC"A-=.)C,$$98;)F>3=+F77@$!=14E7%+D3!(;>"55"%B+8AA;C7@8<+61+2@".+"BC. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A175 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9587 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37490 42 144M = 37490 0 TGGAATTACCTTCAACCTCAAGCCAGAATGCAGAATCACTGGCTTTTTTGGTTGTGCTTACCCATCTCTCCGCATCACCTTTGGTAAAGGTTCTAAGCTCAGGTGAGAACATCCCTGCCTGAACATGAGAAAAAACAGGGTACT ,/B//'."C%>'=#+C/*-+?H=#:F%F0:?263-@<3$>.,B321H:B>29?3E21@?<-<30#@!G">*)5&@;>E#=2=4,D=86.'@3!6"9D7652!!.G"CF-;HA/9-B,H%8"&)H$3+(9>5(0,717:%F6/&& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:144 YT:Z:UP jpayne@0: r9587 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37490 0 * = 37490 0 TNNNNCCGNCCNNNNANTNNNCNNCNGGNTCAACNNNCCNTTNANCNTNGGCNNNTNTTANGNTCCAGTNGNATAAAATTGGTNNNNNNNANG "##!"""$"!$$"#!#$"$$##!!"!!$"$"$##!"#$"!#$!#!#!#"!#$!!#"#$#$$!!#!$#$#$#"!"$##!$$"#"!"!#!!$$"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9588 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1849 42 86M = 1942 235 NGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCTTACNTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGGACCGCTACGAA #+5"6;/F5?4,*!2A;,F76F,2=,2FBE2"B*;B%.*215F-=E+A3&(&A5@=!G72/A&EB>5CG+;(:@+46/6:8A/6&0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0A46C38 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9588 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1942 42 142M = 1849 -235 TATGGGGATGGGGGCCGGGTGAGGAAAGCTGGCTGATTGACCGGCAGATTATTATGGGCCACCACGACGATGAACAGACGCTGCTGCGTGTGGATGAGGNCATCAATAAAACCTATACCCGCCGGAANGGTGCAGAAATGNC *>."4612B?"<&5C*05.D/H&C(ED/E)#A8F%?(-@F-6@-@5;'1$1!!-40;5*$=F.G,+C.3G9HC%G%:D-4%.;BA!"/&1-<89$+0"*@+6'/'EE)2'@=H2:*)?@-;3#6EB.)A6#,G=!( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:60G38C27T12T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9589 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10737 42 221M = 10971 285 AAAGCCGCCNTGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCANCAGGGGGGGCAGGTGAAGGACTCCTTCGGCGGGATGATNCCCATGTTCAGGGGGCTTGCCGGTGCGATCACCCTGCCGATGGTGGGGGCCACCTCGCTGGCGGTGGCGACCGGTGCGCTGGCGTATGCCTG '($+"&(&(!'!#+*%+()%#$!#&#**+#$!"""!#&)*()*$')&&'%"(**&$+&)"((+!)#"+%!%!)#+())%(%$'$)(%$"(('"&*#"*#)(#*+'''&*)%#'("'&($!"()##&#$"*(#"#)&+&)%(*#)")#))'(!%%!)!"'+++$(+()""$$%*(**"&%*!*+$"))%(#((#()")"(#($(+"+'$+!($*(#(+*!%* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A79A38C92 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9589 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10971 42 51M = 10737 -285 TCAACCCTGTCCGATTTCAACAAAACGCTGGTCCTTTCCGGCAATCAGGCN !+:.0>:!/;B&>)5!# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9590 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1779 42 173M = 1693 -259 GTAAACACCACGCTCGGTGAGACGTCGGAGGCGAAAATTGGCGAACGTCCGGATGCTGAAGTGATGGCAGAGCGGAAAGAGCATTATTCAGCGGCCGTTCCTGACCGTGNGGCTTACCTGACCGCCGGTATCGANTCCCAGCTGGACCGCTACGAAATGCGCGTATGGGGATG ;$%"#912">3,F%(6@0#A<,(A=H54G@(,:)"*/##4#?5'4@B%+*%)5,(3=(HG1!:-EC2@-)8=9%*A"9?1F$,A==3.;(.+5(8.7738?))##DCB$+17FH2-87AC#-G,=,);3=("-8><',+2(.%;G7'<1@.;=-59H(57?88,87?=:?H2/ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:25G67C15T24C38 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9590 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1693 42 86M = 1779 259 CAGCGTACAGCCCGTTCACCACCTGGGTGCAGATTTTCAAAGACTGGATGAAAACGAAAGGGGATACGGGAAAACGTAAAACCTTC #<>?<5F*>'=.9/E7G7!=!)(HGEH82&*FG<<7:!&B88@%-/%94?F3:C:;@?<8<).:&EG%DD00@7*"9>50;DH7,7*'4DG8.!9903#?13A:4<1>;B#DH&;@@@6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71C26 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9593 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19399 42 110M = 19333 -176 CGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCCGGCAGCGTCCGTCGTTGTTG F**C7)GA#@7%>B8('7D)850(!E>3&C@>+&BF/9@"C(1&7;7D98C8::;'<+;2%0>8"5D8C..H:)89,/A3D34/8#EHD1#@$ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:33A28G164 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9594 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38005 42 183M = 38188 410 CGGGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTGTATGGAACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATNCGCTTTGGGCAAACCAAGACAGCTAAAGATCTCGGCGAATATCAAAGCGCGATCAACAAGGCCATTCATGCAGGCCGAAAGATTTTTTCAACTATAAACGCTGATGGAAGC -#"H(?C/00:H.@&0@?F>(22DE!'!AHG5.%+?%92&:;GA@"&5<124/,20H-#5,'GBFG4D=D@#HD6(8',*AF(#58B74HHF23D7,5".F02>$2024%<510F2&>0D:!AC(*1;GB;#&:72(;=&H;F63%-$F%G>=>/:-=,&499F:CEA%91'60@/$)G$*A) AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0G1C68G37T50T22 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9595 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29801 42 268M = 29760 -309 GCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTNAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATANTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCGCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGNTAACAGGAGTCTTCCCAGGNTGGCGAACAACAAGAAACTGNNT 9%?$4=AE5)62#)@&;BF6*81.?6/H6>@HGC812D;4!+>3CD/)?939-:G'/>;>E68D&5$73=97,&6><0:@,-EC341#F>E6!&@!F#33&B01%-*G(38-(#058='97$-?&"36)B-"/,-$(<#>D-GB,1C-;4$;*C0/G!>=@D+1F"B6;A@@&H/=8.E:#7C;"6B>9F@#"(>,<@A5"FD&@C85*&!% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:90G17G49G65A19A20G0T1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9595 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29760 42 41M = 29801 309 TCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGAC HA/G>B:>'#25;2&ADHC3&<*168B;#1GC3-=>F;D8>, AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47A46C58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9597 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7251 42 94M = 7055 -290 TGAACCGTGATGTCAGCCTGACGGGGACGAAAGAAGAACTGGCGCTCCGTGTGGCAGAGCTGAAAGAGGAGCTTGATGACATGGATGAAACTGC :4+<8593?2&C<%)3A/7.=1',4(8FB:9@E/H5F40$@F&$(9'0..E(DH$4G-%@/*,8H;F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:81C12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9597 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7055 42 106M = 7251 290 CTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGCTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAA G-"3%0E=G4*-#>;*!H;4G<1=;6-64H1G$('=%,E>2=/C2(95)'G74@#A,65.5GC2!>7>!DHF'/)&BB+,89EH.9!*E4A< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:106 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9598 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44868 42 52M = 44646 -274 TTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAAATGCGTACAGGCGTCAT E:2?/818F'3-:%'9A?.D5HDA)5:B<%'>:'948817'@,F69.$)E@= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9598 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44646 42 59M = 44868 274 GNTTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGA %!#=5(8+C12(7($E.A3/.A+(/;0@GG#@.1:;28;,(6;&B*+E#C&;9=?;&'8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A57 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9599 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5886 42 129M = 6015 371 TGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCNCGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGG D/656)-$:*-*)'C1,GC-<<8F?+@E45E4/@>1!&2;'4"G0&4G#G5&&$9264:F(?5!C&+&-?-""-@=1:$#<++/.=*G7)23@DG1%@28*A3?*$0<93-(?!H1#)A7)8C-430@= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:74A54 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9599 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6015 42 208M1I29M1I5M = 5886 -371 AGGCTGCCAGGGACGAGACGAAAAAACGGACCGCGTTTGCCGGAACGGCAATCAGCATCGTTTAACTTTANCCTTCATCACTAAAGGCCGCCTGTGCGNCTTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAANCGCCCAACTGCTGGCGGCAAATGAGCAGAAATTTAAGTTTGATCCGCTGTTTCNGCGTCTCTTTTTCCGTGTGGAGCTATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCT ><3:4H,;?&#<%&3&,"/:47@%>DA&,"53&;&.?!/'$";@9G8,5,?+:1-1"D(9&1>*6#:&&'E!E>DG(8*3<$*&))E2-:!?G,8,12-?$,'@F2(-B:H9H+4HE$C%>A:D7+!<-*.>*;@C&!4)6/!&!22(0%H),?"()):A'3<0E,)%)7;D82&>(#!?4572%$*/3:BG*.0$:%F$;7%:<&:2F%:BG8".B5>69/0!G5/;(,4=3A=<9E:(()*? AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:8 MD:Z:10C59C27G37C53T17A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9600 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42007 42 80M = 42087 325 CAACCTTACTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACNACTACCGCAGGAAAAGGAGGA '>3C21$>7$-0211ED=2//E5D,=7*(0HG?1=".%F$(4(05;%6%66'B,'#-63/=:6!1-.AA:+$F)#$)#<.B2C,#G7-H7#@@'4(7G*)'H@$:!2-%=4$&%45;1262*B#F0/5*68+F1"G'#<+E&A+H;?=#>C6-8:+%G60;7;+?=1'C',4'"-7C43@2FGF%AG?F,0H(!-*+$3;51#H#E AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4T109A29G85T14 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9601 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7336 42 262M = 7598 322 TGNATCTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGGGAAAATGTGCTGACCCGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCTGGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGCTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCATTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGNGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGACAGAGCGCGGCCTGGCCAGAATGCAA 53EF#@+B56?;)3+B@E*&@C=$@,&D#D7D'"#":%!1+'*;H'-@:.3,+F'!35>&B1BG.B*.2>*B'*$"(,$3+HH=;A<&,,/G52,*F7BHH);:0(@!9:'.,70";9'033=-@"E4@!C/:2H8!<$HE<-%1;B7#(7<>#6A3;+?31%<.)E=D5?G$D$F&*'BECE(&DA%(& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2A1A44G157T54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9601 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7598 42 60M = 7336 -322 TAACGGGAGGCGCTGTGNCTGATTTCGATAACCTGTTCGATGCTGCCATTGCCCGCGCCG 8C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G42 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9602 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11822 42 248M = 12070 391 CNACNGGANAATCCTGCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTTAAGGTNTCTGCNGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGANGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCG &$#)&*!&#+*%%#$%"#***"$#$#(!#'*&'))!%#+$*"#'(#+$&)#!$*'"!(&&)''+)$)$)#!!)!!!*!+(+"$&&%%"*)%&'*%!$%$+&#%&!&"*(!#$"$&+($&*%*''+)*&*+(%+"#(!#++*!&!(*(&!%#++$+"'%*$''+#"$+"()'!&)+#%!#$*##$*'!%+'"*!)(&%&'##'%+!#!&)'$"")''!&*))"((%%#((+#+"$)'#*#$*)&'&+#+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0A0G2G3A87G5G5G40C98 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9602 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12070 42 143M = 11822 -391 CGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCNTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGNACAAACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCG +,>%E+,A2".@F*+'0&3*.<",H592"3B3"783G%=A;8/"&F$2-2&<52+E'4@@H#1>?0;FD;:7=73G4*1<9*E3$41-"1/E05$+/'8@.;@7CB$/!:0C7%B*8<&E=(8#E'D+!%3:5G;&,6"6)3$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53C29T59 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9603 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45968 42 52M = 46154 267 GAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCGCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCTGC F'904*:'EF3@!9<=@3&C'*581?1.'E25,E9#;!D'+31/H4CE/A=F6F5G.CG+8=G;B(+E$+@:@)<@<;F&2%=,(D)+:(,)@,C:$28G*9%=8-#;)$?E&;G;0?G67*@,)<1B>GF/F71D(5'1*,:>G-*>2%<"/679"$4'?1$%<<&9?'>%)7C'<)/6,7,E4"30DFG@@.")+" YT:Z:UP jpayne@0: r9607 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18563 42 97M = 18708 218 NTACTGTCACCGTNACCGATGACCATCCTTCTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAGTAAGCGTACTGTCAGCGGCAGGAC (>274';@"#8,FG;3&;>&;4**4E2%1.8:H720>!F*;!''#(B4CC"%)F'GG-/)$4$#?8@4:37A6#=E6+'&=C02+A.3:,$3B#D5$ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G12G16T4C61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9607 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18708 42 73M = 18563 -218 TTATGATGGCGCGGCGAACGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGTATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAAC 5*2#,=.*=#"7%94B(:;F4((C!*B6%0+3E(0+:6=<730AH;A@9.8022G/'7+'/.0#<35"%=CB- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:73 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9608 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21185 42 219M = 21084 -320 AATTCCGTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCGTTTGACAAATCAGCCTACCCAAANCTTGCTGTGGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCC 4>1/GB+31,<;7F08+-/';"E%6"+"GG#$B%H';C!*6>5AE@CG26*'C!?.%42/;9B@!'=,DG42G97F2807B7+E;?7%A'/%!AH%D7155(*C62(-A)B55-)C!D6E?GA?&(AF?!6*&'0/D/.'??*/EHHH4F/?,-D9%=%D4G0*8/;.//,2&:+' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26T37T36 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9609 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46371 42 149M = 46551 252 ACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGNAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCG 8.-8;@.=#3/2%:761$G++3*!"2"%@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:85C63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9609 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46551 42 72M = 46371 -252 CTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCNCAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAG ##'!C:8+?('25D=5E+.A$97++DF)-23-?C%#3":-!B:/#=3E%+1*!=4<':BHH>8<'!52F-<* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A43 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9610 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17503 42 124M = 17798 340 CTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTNCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGAGAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTAT $:HFE9>+5$<(*(+23+2*;5:4"ED<5FF/3.$8+87">49C9FB?C7@83:B.)B=FD=)!D&/G94$1C'?":)"@;%"(+.582'<3":A>A*34@A@@D%;?@9$A"2.-E#?G$<4/ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40T32C50 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9610 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17798 42 45M = 17503 -340 ATCTTGGTACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATNTCA $*"&$!+'##&*'*#+('")+$$"$*+&$)$'#+'&&$"%)"#*( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9611 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39876 42 183M = 40059 412 TTTCTGCCATCACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGCCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGAACTGCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAAC ?'03H;FC>#/+,G3""*$"83C8%>CAD04G:06-1+/)$2B$1;A(1'&?=<7G&)9,,(28$H:0A#5(8#G9<>*<778(,BC3DF/F$)&&-.B617#6228!D!)-("+".*,5/43(;5$"F.G*#78E5-C2#D$=( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61G121 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r9611 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40059 42 49M4D176M = 39876 -412 CTGTATCNGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGGCTCTGGCGANGATCGCAGAAATCAAAGCTCAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGN H.!=F;53(=25&E367'+7)6*?CFAGH180+,-E+1.50'#C%>'-@'!HE<-?A1D802%BH0"$/%"H9<9(0C=957B:3,0C498D$ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:8 MD:Z:7A41^GTAA122A19A32G0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9612 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22860 42 61M = 22694 -227 TCCAATTACCTGAAGTCTTTCATCTATAATTGGCATTGTATGTATTGGTTTATTGGAGTAN 7?,H:@(%C2F4A!*:<88C%->&=#?40G62!;B574!@0BB+=/7"#)H+0$D#97$3! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9612 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22694 42 111M = 22860 227 TCATAGTGTTTACATCACCGCCAATTGCTTTCAAGACTGAACGCATGAAATATGGTTTTTCGTCATGTTTTGAGTCTGCTGTTGATATTTCTAAAGTCGGTTTTTTTTCTT @6!G8,$F8.4$@+:)04&G.)4-28(7)-,3B-G2.,*?A(#(A%(:.E49%407@3$?2@(,00?@3"-<.9,42902045H8H?H91C?FHGB&:56FE%8&"&):<9 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T79 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9613 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35127 42 46M = 35173 238 ATTCTTGCGCTCAATACGTTGAAGGTTGCTTTCAATCTGTTTGTGG 3:./D'"="!=F/7D@>F-($8/:F%199G*B%:8%3;+E*0H:2- AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9613 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35173 42 192M = 35127 -238 TATTCAGCCAGCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGG +>.9/F#97+="'A92@+.-86=8D/?;(9>1B,2B12$&FH@("&6D2*(:;&,!6-4G3>#8*))C;/3$2>A7D:E"(#=-32>9F#6/2;9;#!$:'?71.*@+A7$:2@D6>$8-CC)CE5&:*$&*9%./F(A&:#7/<*FB;0.+/B'%37984(D:F&83<+)90*#9.(7$F-:87=8C">1G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:192 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9614 77 * 0 0 * * 0 0 TTCAGGCGGCGGGTGNGGTCATCAAANCCTTTCGTTGCGGCCTCGTTC 67#&)BH!7F/-1CG>"1AG<&">EF""*.G48ABH7E%H/3=0*0/+!+9:)'5"0?%=:(&E<=*0746)FE5A<8$!9#2/;6=3:"36+C=!+.,>,&<:A1(,DH? YT:Z:UP jpayne@0: r9615 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26703 42 111M = 26537 -277 AGTCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAC #BF##2+!H0!*B,#85H>/)3!*@2F)ED((GCH9+?:%-&/1H/.&37D+7$GF&B+>(321(D"-A($A,%!#17-07"%6);46#8.,,.7:,5<&+=2-E.#(-8( AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:110A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9615 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26537 42 134M = 26703 277 AACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAATGAGGNGTTAAGGACGCTTTCATTTTCAATGTCGTCTAATCGATTTGGCCATACTACTAAATCCTGAATAGCTTTAAGAAGGTTATGTTTAAA 87:?1(D7G*"?"!B-EH85%-46B,4<6&D#AB$:;AD1BD//<="+641C'2B(F7A?9-3;C'638.2D?1*&60+-8>6=/9$7&%5&+/.2A$EH:+E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46T28G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9616 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44408 42 162M = 44621 313 ACNTGNTCNCNCACTGTGAAGCCGCTNTATGACGCTATGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATNGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAA &%)))#*$!&!%#)('%"*+#%))*+#%%&(%*&+"#$+'$&(("(+#+#$'"(&%"*$*'+*")*%$!*(!'+")#"%!$%+)#"#$&!#+''$"!!(*'*+)''"($"'#%)&(!%"'$'!$!#(($&$&%'$*$%$'#%))*%$)#'%##%$*!#+'(& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:2C2G2A1G6T8G9C31C93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9616 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44621 42 100M = 44408 -313 ATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGC @2@%3#&0%C<:2A%"+'&6D-?=C6'>..FB2:FAC$#8(C/<6H0G)?=4"$0:1G+E3$)E>E:4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:100 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9617 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35609 42 119M = 35478 -250 TTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATG AC"1@H)#>GD<@AED1(?8-H16&3&/G813.-/":<;0)??1A4%.E4;-#C=-9D&>%;BA:047.:#&D. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9617 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35478 42 50M = 35609 250 GTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCGCTTCTT 7B+BD/G?+>:"/D6&::0%>17>"*$>#5;&?6*:6=CG&B1:#,#0C@ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9618 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24137 42 245M = 24137 0 GTTGCTNATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGTCGTATGCAGGAACGNGCTNCGGCTGGCTGGTGAANTTCCGATNGTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTACATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACAGTACGCCACTTTCCCTAGGACNGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTCTCGGTGCATGCCACTG 34A:*E3EBF71.+B?8C#)8,>-0/C)?$)G$C89C'6B;8&*:+4(4%;?747%(C%"G3D3&HC!=6-;+(G-+<(F"$0:/23@4"6#;?F0;9E7HC3D(@4(9$/6>22A<@)2=1& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G83A9G5 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9619 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21492 42 154M = 21381 -265 AAACCACATCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACNGGGGCTCATGCTCCCAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCGTGCCCACACAAGTGGTTTAAGGGTNAA "*&!")(+%#+)%&"%*%"'"(!*)#'&)&""$')(&++$'+'$"#"%+(%+#(%"$"#$+&$(!%*+'*'#&!($")*'$&'!"*&!$($(&(&&#*)!*''#"!#!!$&'$'(+*&&*'))&$($""("%)($""+&)%%**)"(+*"#"#( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:76G13A35A22A1G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9620 77 * 0 0 * * 0 0 NTTGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATNCAAAATACACGAAGGAGTTA %"*)")+#&)(#++"(#$)"!'&#!++!%')%"$#&&$%&""*(($'()"*( YT:Z:UP jpayne@0: r9620 141 * 0 0 * * 0 0 NTCATTAATATACTTCTGGGTTCCTTCCAGTTGTTTTTGCATAGTGANCAGCCTCTCTCTGAGGGTGAAATAA %3G#2B>;-%>?&7B3*1:G23G.2>HB?H"F'61/C0D@*3$.*$!15"%&H46A2H8%".E.E">/$>.E? YT:Z:UP jpayne@0: r9621 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2956 42 45M = 2698 -303 CCGAGTGAAAGNGTGGATGCAGCCCTGTTGCNCAACTTTACCCGT $H,%$7-E;6!D;DA?)'1'1,H'*@F%-CF=;0#G2=A91=2*C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T19C13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9621 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2698 42 94M = 2956 303 GGTGGCAACAGTACAGANAGACGGACGAAGGGTGGAGTTTACGGCCACTTCCGTGTCTGACCTGAAAAAATATATTGCAGAGCTGGAAGTGCAG %D<:H*F!>3)>:79'%A%HD)+C"1;/D$7DH/9-((=8#@$H+&19FHFG#(GD###7H+G9&$EG31D@7HF5F4:A/+713!G?(-3F?#'";%F8.7+':0B<*1;<6G7A9!&>D'62$=>8:%H>B-@=74-=AE!)C++9$2(*1>B1C3E>0*)G#.C'G>(3G,%A%&6!/89(;HG&9"-$&5#4@*B+.&(,B.%*/B7$.4EG5H,131DH/,*:9+0%F&%$=1@:"1.3B2)B?,#+H-3*'0=;0AF$"->>9H:%>1&5<"$?)@.?D"+/&=#D0<*!$F.%E4C(2:50H,6>)G@$F8B80(7/;'-%F#,E=>,H>C@H?+1C.>9=FE6"!7 AS:i:-87 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:4 XG:i:19 NM:i:24 MD:Z:0A60^TTTGG44C82A28A31^CAGG27C79 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9622 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40929 24 83M = 40564 -448 GTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATCCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTGTACAGGCATTCGGTACAGAGCG B)(5')GBF,G)!>0)DAE+%4,A!(.=.9)C;)#4.FD!-BC)*3$H,-E;71;F7G&(A<:5<2?A(:,H6"3;7.!:.5: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26G33A22 YS:i:-87 YT:Z:CP jpayne@0: r9623 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20079 42 196M = 20023 -252 CTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAAGCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAA B09G:(?/#!A3@G-G!#">;>'3'$;:9=,)5."12+4+F$G@87(?&4&;+:#):>E4550'6$*H@'H.8(8.%3G/<,(BH'%!:C1:+>H:='$5%E!12%%&4+>9)0)0.D5B@64?-.'/.'#9=E)##%)4.C=#D$34* AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0C37A12T27G66 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9624 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17539 42 142M = 17393 -288 CGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGNATTNCCGCANCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCT :+0?@<2<">4G4(G#"'#.=**38.)D'!C!)C5F2&%&8H1%C-/)72=<$0!1:+#5H2GH,=F@(B,C89B6;2E6?)2%;.3,;!,")&').C'H*57-.F;?HEG972/=)(;?(>G+.9%HE0E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:95G3G5C36 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9625 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27034 42 57M = 27190 294 TCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAA C1341%?(";&,?C358:889C((#:*1H*8%&5;:BA(G$!':6(37<'D:>8%G$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9625 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27190 42 138M = 27034 -294 ACGATATAGTCTATTAANGCATATATAGTATCGCNGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGN &")*$%*(!$#++(*"$(#'*&$$*'+"##$*"($$&&*%&#)"*)'#"!%#!*")(+!!(!#***##+$"%+&#'$)%%+#+#+*&#%)#!*$&$&(&*(&%"+!&$"#++*&)%#!(+($%!&$&)'"'!*")+$# AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17T16C102C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9626 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3613 42 45M = 3408 -250 ATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTGGG )()#)&$'(&#&"(##*%+$+%"%"#$()**#*%(#&)%*+&+)+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9626 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3408 42 180M = 3613 250 GGGTGTGCAGATTAATGACAGCGGTGCGGCGCTGGGATATTACGTCAGCGAGGACGGGTATCCTGGCTGGATGCCGCAGAAATGGACATGGATANCCCGTGAGTTACCCGGCGGGCGCGCCTCGTTCATTCACGTTTTTGAACCCGTGGAGGACGGGCAGACTCGCGGTGCAAATGTGTT "8+##9-D>0E@>CH,>53&>&??.$"42-E>#G+;%8B&5=02*#F1(>$+:*=;+H?F:(&#:()+8@4"3G*2(<5D)-*#EH=-%,6#4E%(',-,C43)>)6B"$<:1-;?:D=*+D!0)>*(*&'(7891C/,=9&@B0#;)%*#$'(!,/B+&5"H2:2/+5@29$4&:<6'0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C93C85 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9627 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18789 42 75M = 18678 -186 GACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTAT /+80-7HG4:9CB-F',@5<66.->2D&E'9FF)0-H8D:H+$;!+'G&@40;+:-/=6F?,(;;86F64%'H2G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9627 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18678 42 73M = 18789 186 TCTGAAAGTACTGATGAACGGTGCGGTGATTTATGATGGCGCGGCGAAAGAGGCGGTACAGGTGTTCTCCCGT E.++%6C@+15!7HA./4C+?-<00)1=;4>6*-4,1%''6@6*'(+2".7D)/D>(C?#F3$C<:<-1CF:H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9628 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35195 40 57M = 35195 0 CTATCGGATTTAGTCCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGAGTCAGCGAGAGAA ,2?(>!040(D=B"@'(E!7+HA94-$66.6>&)":*F.D3B(31($0FA%,C'"@G AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G29T12 YT:Z:UP jpayne@0: r9628 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35195 0 * = 35195 0 NNCNNGNCNNTNNANNNNTAANTGNNANTGNTTGCCTNNCGNNTNGAGAANCNCGNCACGTN "!$"!!"##$"##$$$!$$$"!#$"#$!"!"$#"$#"##"!#$$"#!!""$$!$##""$!!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9629 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17436 40 54M = 17490 314 NAACGTNNCGANGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGA !(%!'")!!('#%!#+("(#+%$'%$(%&!&#!%#!*"*##*))'$(%%(*$(% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G2G2G0G0T2A42 YS:i:-33 YT:Z:CP jpayne@0: r9629 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17490 40 192M1D37M6D24M = 17436 -314 CGGCANTGAGCGGCTGGTCAGCACGGCCCGGACGACGGAAACCACATACCGCTTCACGCAACTGGCGCTGGGGAACTACAGGCTGACAGTCCGGGCGGTAAATGCGTGGGGGCAGCAGGGCGATCCGGCGTCGGTATCGTTCCGGATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACAGTNTGAGTTCTGGTTCT '8%;?@7@D>1&'14!"'!:=D)6>?>!G797B9.H8!9!:)=D3:<,1G!B0%82.D&:+>0,=%(F6?E1-,$&$78=B5:F/=E?:!4?88@7@A=#(/93G0FB(- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:44G7A15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9631 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15780 42 97M = 36189 20465 GGANGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACTGGTGGAAACC 8A>9/5;=13=#$CBA13+1<&G&HE2>!:.G9)-!'4G.H>;E#7%D1-C,E%BH8E14/%2@B%GE,'F.$D;-'+4&E)A)D#*FD98?52(,A AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3A93 YS:i:0 YT:Z:DP jpayne@0: r9631 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36189 42 56M = 15780 -20465 AGATAGCAAATGCTTACGATAACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCAT ;:!./24;)3.+7>F#F28!A.6FA4>/3&##'@/>7**->76?7BC0*655#(B"$=GB"5,/C3)F!3<"'<-9'/$((G#"D=.)9<0')$613A94D#@F(4"A3"&#%7&'/&2G&!DC!FH4&+HH:(1--.E6<. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9632 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32562 42 50M = 32741 287 GGACCAGCCATCAACGCCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAG D/:@2F%@20>$.C0.#%A"*<,#>07H:?@9$9*?D0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9633 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31510 24 30M3I16M = 31623 165 GGCAAAGTACCAGGCATTTTTTCGCGTCACCCGCCACATGCTGTGCTGC E<$>;"94,;!-9'$'D"/)'8'.B=:FF.G''4<>?D9+1#/*EC?3' AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:41A4 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9633 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31623 24 52M = 31510 -165 AGGTAAACGGGCATTTCAGTTCAAGGCCGTTGCCGTCACTGCATANANCNNC '*##*+"%%"#%'$!!'#+%%%#'&"!(&!!#(#!("('&(&%$+&$!*!&# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45A1C1A0T1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9634 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4769 42 79M = 4679 -169 GCCAGCCATCCGATGGTGGACGGCATTCTGCTCGATATGGACACGCCCGGCGGGATGGTGGCGGGGGCATTTGACTGCG E:DF&/11",<86D.!88C4#99=-@E73)6%63;5/H*EH#43#'&9$.C3!C6D&&EG?%3!A>B4!19>7.D3>,F AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G72 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9634 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4679 42 90M = 4769 169 TCCGGCACGCTGGTCAGCCGGACGCGGGCGCTGCAGCCGTACTCGGGGATGACCGGTTACANCGGCATTATCGCCCGTCTGCATCAGGCN @?#92"7/B(8+/-3:!D>#:!1D"#4@)8/,"%@>/E@3?<%54:1F<73(';+/F'F8#=275&2<>;,*%"9=7?25+ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:61A21A5T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9635 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45035 42 54M = 44798 -291 GGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAAC %$)#($""&)%+*!"(+*("%++('#&#!"*#(%(+((()!"$&*#*&)+)(%' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9635 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44798 42 105M = 45035 291 AGAGCATTGAGTCGATAATCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAA CE$,.):A6C!#0"%ED")=1'F/H60;G@;=-,:@.68F!7',E""6(32;9./;5.7A*'E+:9DF(F<%?FCC70;6E.:6?E:!',G->@B5)G4:878/=.H%2)BA,=@5BF;!HDB:BE"&12#;=F6/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9636 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44514 42 130M = 44449 -195 ATGATTGNCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTNTTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCGCTTACTA +2::.1(?2!#H6DD5?D=(A148-%"<),?D=59'A5"D63#A0(5=B;B6%:;!-!8C+*,0(5:DH"$8!!G/C+(4(5&9!>9A:@-6EA!=6-A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C37A84 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9637 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 642 42 67M = 490 -219 TGAAACGGGATATCATCNAAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCT @0<*B=)H4#D&%-09"@4D<:/$?053D9$7;B'+52%53.,%5(:H,+H";2,E#!00H1F(4-7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9637 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 490 42 56M = 642 219 CAATGCCAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATNCTGTACTTTCGTGCTGT #?:4!2;E;D*&GH1+$1@F.;)0$42.$*71/&8+!;5C'*!0'=FF2;)!D3', AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G37T17 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9638 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25035 42 256M = 25291 390 TGATCTATATTTTTTGTCTGTCCTATATCACCACAAAATGGACATTTTTCACCTGATGAAACAAGCATGTCATCGTAATATGTTCTAGCGGGTTTGTTTTTATCTCGGAGATTATTTTCATAAAGCTTTTCTAATTTAACCTTTGTCAGGTTACCAACTACTAAGGTTGTAGGCTCAAGAGGGTGTGTCCTGTCGTAGGTAAATAACTGACCTGTCGAGCTTAATATTCTATATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAG 2:)57("F<1H-8>D393DE+9H9A6'@-E,'0!@D4H-8HD%B469H:(;+H=5D+-78F>0-)?D&.FE/H>%D10"8<14%7:93E,=0<9.#HEE3+:=2)B(3>,%<8$5B'72C9&:!32!6&3-5/)E;"B82!*2@7G2H8-2"1$*D/&F"E.&?"2GA(&+#(G94;#0+!(6=982$)>F'16/$A?BHB"<0;>=B"?,%2?(#C;+1!HC58C- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:256 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9638 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25291 42 134M = 25035 -390 TGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCA 1"'6,@/A,!.<%50+G:(-9<111.%5-(>9>5@372(F0*3>G(3(H)?GG#=24.G)44=H721C75?./:9/%C%,:E$<=,-:1+A2762#E:/7.1G3EG&(37@*+A0&%64A8"%0%1,7%"?>78 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:134 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9639 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23245 42 161M = 22975 -431 ATGCTAAATGACAATTNGCTTATGGAGTAATCATTTAATTTTAAATAAGTTATTCNCCTGGCTTCATCAAATAAAGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCATTTNTACATTNN &*)$+!'%!"%'!+)*%**&#)&*#&%*(%+!%%#*%"'&'$"(&+'$"+'#%$)()"%$('%%'!*&"$$()))$)%$+(%#+"(**"#!)!""!$+&%)&!*&'(#"&$#&!$!%$!##$+(%!!&&+$"$*&*)'*"$*!!'%(+&(*(((%(&)&## AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:16T15T22T61T31G2A6C0T0 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9639 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22975 42 29M1D240M = 23245 431 GTTATTTTGGCTCTGTCAGCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATNACCGTCNTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCNAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCNAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTACCAGTTTTAGACGCTATTTAATNTCTTCACGAATTATTTTATTGTCATATTGTATC 2553;81+D7#@293-84E1H8$14B+'(:95:A)8./5;HG(+!'H';CF81@&B+-4?2154,GB9&HA89>6#%>!DAAE-6D>$E+>*$<)18+?%=974;>C'&7AE4H8G1;;.?(("8D1!A%52;9=('+CH9<5,E*1&;77/&B0/$+$:&$,F'2:EA"0/&.46GH22.,F8GG1B"B8+9D<:6:2@,?B#3"4D/5%>&G@#;**=B.F4%D45)<&?->(7*&C* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:8 MD:Z:29^C97A6C20A33G39C6A6G26 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9640 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46555 42 43M = 46689 244 TTTNNCAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCCGCATCG &$(%$+!$$#!)+"")*)"'!#***%%&!)())#"(%&+*%"" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3A0A31T6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9640 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46689 42 110M = 46555 -244 ACGTCTGTTGAGCACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTA 5(;5(F9;F.C7?/HC04,.0DEC+2&9%2?'5H#3B<';7)3%=3<10C@>"=F65FG'>!E>+#4%@?":+'44?G/(9C.8C?G-*E*989-40HD07G$'2C839'2'06.<-"/<*,9&D?,G:#2ED*,<#E5B!G6-H:>7C%E+6C)0@-9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:154 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9642 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5749 42 138M = 5887 282 GACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGNGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCT >>?G!%:?.4GH-2!%G=0G$*+B11!*,<+BE9FGE1H.@5.>D@#"-G3$"'-2!=F3$0$7#"+0%@>&0(!9-(A<8(F#A>C+A?.+?9B<-+C':"%".EG@9<('F*G!*B9+%"C3H2;G4F4=0@,+$< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51G30A55 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9642 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5887 42 144M = 5749 -282 GGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCANTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACGAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGGATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGA 1*C&A"AB;@)-?FEF2H"C:4<0C."F(&?'3&0G7"&A=$>4A9E"AD4#/9HF(47A,C9(+8><+@39%9'10#;#?;)-%-@7-9FG"#C-<8F.85!->>8?;2.0@#H!G!#9H(BF5H88$<0?974>0-B9)9E3 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41T46A55 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9643 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21769 42 64M = 22028 366 CTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCAC +$*!")%#!&%!!&"")#)*()+!++"!+($'*+!#$*''(('+%*+$)$&))+'#+&+!)+!" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9643 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22028 42 107M = 21769 -366 CCGGAACTATTGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCNTT 4EG0)C@2E5#!#@$'C"@37&<%-.&.@,G%0"%9AF67?,A.#9)#"&A!F:E7B8.9.$C9?6HB#-H-$B6F1#6&GFB0<-=4/%)/'#(!+;4G+8!*?/9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A94T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9644 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28952 42 60M = 29047 282 ACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATC =!>F9&E&E)D,C?G,&F1569#EA...;AH-@$-/$68F.2+:54D!!-(C!.8G?6'&B5!#EA/E%F:8?+!$<)(,.DH%>,;99(1CHE(,*<1G(%=1,A*%+BE)H<$"2%";F<-.(;)//("AG%?8)7&:C%%<=#=(&=3A;F*BG*7:@EC4,"H@H*:'?2C3/*'BBB&((4,*64C@B22%!(#("$E#&@:%-5CA:2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10A79T27C68 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9645 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40421 8 79M = 40559 252 CNCGNAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTACCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACC !"&+"%$+&("(+%)"'"+$*$#(#!!++%###+#%"!+&(&)&)"+&"#)"+*'+&"$))#%#+)+%!&)#'#$*##! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0T2A31T42 YS:i:-60 YT:Z:CP jpayne@0: r9645 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40559 8 4M3I49M7I13M5D43M = 40421 -252 GTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGCTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGAGGGAAGTCATGAAAAAACTAACCTTTGAAATTCGATC =0(.'C#71*@1;<9,1:/72+/69G:=@:"1)C(+<;;6A-G6"23A3#9(->5.!7G-?(1G3FH".&>B4C!)($.74E1F-214(*7H6>2*0-;)%=A*8$447H,6-#72:(9 AS:i:-60 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:15 MD:Z:66^TTTGG43 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9646 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20007 42 77M = 20129 258 GTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGT $)..(=8-A49F8,D@97-F:>=%G6,ED03<"&H15,5:.CHC*A1D/2.==AF85)$C<:'@,+5"1!5>+G3(9(2B&AF6><-!*(A77>)#2$+<@3%BH)GA060H'>:G!H.*FA9C?4:2-472#6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:136 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9647 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12289 42 40M = 12157 -172 TGACTGACCGGCAGNCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCG )*'%#$%**!*")""%(+")")+!&&!$'')*!"$!'"!+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9647 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12157 42 54M = 12289 172 AACGCCAGCTGGCTGCACTTGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACG &0D+F)-:-@*/19?G(B&&D(#$@A-));=D>E$'E53((F'.:0/7:G3825 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9648 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7029 42 132M = 7253 264 AACGCCTCTGCCCGTTACCCGAAAAACTGGGTGACCACCGGCGATCCGGCGCGTGAGTTCACCATGATTCAGTCAGCACCGCTGATGCTGCTGGNTGACCCTGATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGGCGTAA A;:7B#;!;H6D=,D6%77'(/1$(D#<,4,F'3B75="),@%$$6&3,(,CCC%9#;H6+:+(.&?67.(0,<@96D0>+E$0,!%$-;;)(&'=.3HBBB!D5")##@<:;#7'&34%9F!>'&;E'1 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C27G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9649 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21728 42 108M = 21888 204 GCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGTACATNCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAG F4$9@61>A,<=E$!4<2C+96.60*G0F&:2$)AE@&85;CD/0@C.?,!,)5#:3=F5043$>(A%86&=F6C>"0,=F(=,$*0D@5@&3FE'(@1.D*2#A?8# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:73C4G29 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9649 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21888 42 44M = 21728 -204 GACACACCATCACCGTTNACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACC /,4>3?!1//:1%&2/0#>B#+A/F20/?G6D@9*-6+.=;?+E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9650 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46497 42 174M = 46258 -413 AAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATGTTTGCTGGGTTTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCGCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCAACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGANACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCTACTGCTGCCG #3";.F2<2!0B7-3!:3$$'D9;?/F=&!E0;A?E.%9#?,+A14-/071-.,?FF$F;?BG$--96'!H0",&E5-(.2/%H:5E8:&;'8,"'BAB%*9!+<>!@%A<>+0)*+2D*!+.6E%69$<%*#?76DA%;(=+A85E-HDEG##=98E4;FH,&GH*%F=C;D?A53AD6A56A;A5#%A+C:9@B2(E>F74@6)H>9?-9.*3!F!<(32)H-!?%&%.CF0(>5!:45+4'B#>@!'7C(+6*C4%>6)?71;(,7@*<,-A>)04*E?6EG(>E)G!0:C5"<4<,>;(-55.HD(3<">*8$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:168A41G28 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9651 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13781 40 83M = 13964 235 TCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGCAGGAGGTGATCNGCCGCTGGCGCATTGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCG G9G/E%!78.2!"04EAD>/2>@*#1D!FH#%F?E%1:%=5AG45A%6/9#*E2"!A01"D:=-.-#8515G@3B10*7=)"6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A38 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9651 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13964 40 13M3D36M = 13781 -235 GTGACGGGTGCGGTAGCGGTCCGGCTGTCGCGGATGAATATGACCAGCC '.)FBH)*9:')2@5)H%(A.#572'.08D0?"4B0EE/?8=A9@&1'A AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:4 MD:Z:6A6^TTA36 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9652 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12608 42 111M = 12448 -271 AGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGGTGGCGGCGCATCCACGTCAGGCGGTACAACCATTCAGCG 4#D8**;>"!;+C5;/HC1>H8)HB2F..<1!:4G*+.+9=G.91)(.%H8&%7A3D+#9&(>>5E=-*7&D6./:7;;%,,G#+F6G$A-,!&.0AFF@2@..*(*1C;6H!2C!=520"E3+G%*"C<4<;1'@1?0;4;A4. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G73 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9654 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22284 42 195M = 22210 -269 GGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAC #!8.37B/2:#&2+/6217(<>0.)@(';6/H)BC)?%:.2+)DD>7C>*7-AB397H4//=99$9:*F.;8*3C"3B@4$9:A'1$=,G1G$H=)F"&"*G94:G*$7(#!:*@(65@-@H.0:C/D@"5) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:194A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9655 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13673 42 52M = 13836 221 CTAACCTGTACGGTATGGTCACCGGGATGGCGGAAGATATGCAGAGTCTGGT 0/B5/5'6';61243*)7(2"GC>-F03%'::?<#?)G,*2>5=00H2D(E> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9655 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13836 42 58M = 13673 -221 CATNGAGCAGTGCAGCGAACTGAGCGCGGTGAGTGCCTCCTTTGTACTGTCCACNTCG #"$$&$*"++*)#*%)+'+#("%&%!"$#))(&%%$+#&#!%*+)$#*'"&''+#!!( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T50G0C2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9656 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5009 42 115M = 4860 -264 TACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATAAGGTGGATGGCAANACCTACAGCCATCTTCCGGATGACGTCCGGGAGACACTGC (!!***!#%+$(($&%$*($+$!##%*!"+")##%+"!#%('&"#'*(%+%$$"')&!!()$('#$'))#$)$"'*%$*%"+!(*(%*+")*"*+$$+**+%*$#!%"))"+&+% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:74C0C39 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9656 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4860 42 149M = 5009 264 CCCGTGTGCGTGACATAAAACCGGTATGGGCGCTTGGCAACGACATGAACTGCAGTGCAGGTCAGTTGCTTGCCAGTGCCGCCTCCCGGCGTCTGGTCACGCAGACCGCCCGGACAGACTCCATCGGCGTCATGATGGCTCACAGTAAT H)7/$7:!@,E,6'1*0)%-&6;=<);)=3:/H).!;C(>9$E%8=$"E$/7&=;!/D!"7AD%9=,1(1$(*@=A9F*&:8%+BE?"D<<4=B+"69-,3"#/F. AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36C80G31 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9657 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28377 42 228M = 28377 0 CGAGTGGCAGCGACATGGTTTGTTGTTATNTGGCCTTCAGCTATTGCCTCTCGGAATGCATCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCCTTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCANCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGNCTTCTGC 0+D80.H+A2E)C=!,#&/-@8BB>3"81A3?98+3*15"&HEE6-"#,7C!H/1=6.>C5<<<@DH<':&;$C;/*5(#'G9/-+2!&?05$;.0:G2-:&G-FD>/=>552)/H4%>86(??-%<4-:,H$;!@9%2*/.@-E&=@1;#B42(:A(@/-.8D&B=D(*9,7D%(A2.A!8)%(D32,2-%D<.:H; AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:29A96A41T51T7 YT:Z:UP jpayne@0: r9657 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28377 0 * = 28377 0 NNNNATNTCTNNNCGNTNGANNNAANATAAGAANCNCNTTNNTNTGTATNNNCNNNN #!""#!!"##"#"$!$!!$"##!$""!!$!$!!!!"""#$!$#!"$!"!$""""#!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9658 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41444 42 77M = 41444 0 AAATACTGTGATGACCATTTCGGGCGAGGGAATTACACCNCGTGGATTGGCATCAGAGNTGATGAACCGAAGCGGCT +G>("G(G3C#D:D4"A-H.E$''A;&-&80;30">6@6%C.-%F=,E"(HC(8;:6,D-$(<(G1D65<<)!A",1&E'?3>-&%"3:9<*/&"6:BA!"CA&C!= AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53A14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9659 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7342 42 41M = 7195 -188 TGCCGGTCAGGACNCCCCTCTCAGCCGGGAANATGTGCTGA !+;!'G8>-+A3!AF*'7@=FD=$?D?05#'H8G,*F7HH) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A17A9 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9660 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14726 42 215M = 14941 315 NCCCATATNCCTGAACAACTGAGCAAACGAGAGAGGTACACCGACAAATGGCAGCGACGCACACACTCCCTCTGGCNTCACCGGGCATGGCGCGCATCTGCCTTTACGGGGATTTACAACGATTTGGNCGCCGCATCGACCTTCGTGNGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGAAACTGAGC %)'D>"&/&5134(;8A%#H1;)5F3F&%&.@"B=+8C.(;/*#%)-C.1+-9DC5"25HB8"'&B:GFG=$0E=&0<&.;F60@)E.9*DEF$-%,))7H6"G=>@6"G&E.=!++>)$/8A22B0&; AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C0A6T67G50T19T67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9660 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14941 42 100M = 14726 -315 GACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGACTCTGCCTGATGGNGCTGTAATTCATA 2D6948FB8H6A47=E*'7=)7D6>+B771=66%GDB-(9*C?.&*F<@&$')7#,=!F3!)6(1/$.7?G72380?0C5>%8?F/49DDAD/E'G?(%6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:86C13 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9661 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39014 42 161M3I17M = 39192 520 AAAACATCTCAGAATGGTGCATCCCTCAAAACGAGGGAAAANCCCCTAAAACGAGGGATAAAACATCCCTCAAATTGGGGGATTGCTATCCCTCAAAACAGGGGGACACAAAAGACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTCGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAATCCTCTGACCA F7.%1#35/-:+G!"2>*;1H928B;5H/E&"="%E"G5C/9>.%H?CD:G2F694#8B19$=8#69",+3E?F>4";'C'E%H>4'!9#;'."GG/"&0GD30,5D#H1'3D,:F!>!((5D?1'*1A#"#8>78'4H((-#F4"D2"8(!::.%,@-:C993'7%D,)7DHF,3/=.6(%.!7$G2&(#+:=>9B<@A)<%?E)'8=7=-8!17A60.?GE24D!11A-&2@;3?>).$!:',9)E>;(&$H1BB/:)A?5=42:.0):"$BAB84D%/?+0C:3F:$-@8%(5F$1',,)D=<-D7@H8?6/"+>F(%4'.C<'))!#HC6<5,$-2?%.!01B19G.'%E@AC(!C*':F<$0D(&%8D*<.>G9%%F< AS:i:-27 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:10 MD:Z:6A19A87T125C48A3A6A0A0T39 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9662 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26129 42 120M = 26018 -231 GATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATTGTGTACCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTNAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAA "B%:1F');+7&13%,A8#D''<%'8(G?AB)D+9-=8G@/4F$96.$GCB017"0-+)$B71E(%A3.,6B))$=+>*))@(61%2D5HG0?"B,56)?@+"H1?$6,E$='F>3:5.) AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:89A30 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9662 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26018 42 76M = 26129 231 TTTTCATCANTACTTAGTTTTTTGATAGCTTCAAGCCAGAGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAA ?23+7;*2:!+.%BC/3-@#./$C@&60(E??H)7)(E,-B)D5C<.H39!'&.=;87$:3)95"A%1B&?13A%? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9C66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9663 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42452 42 229M = 42681 417 NCGATGTAAAAACGATGAATGCCGGGAATGGTTTCACCCTGCATTCGCTAATCAGTGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAA "A)2GG??@)9"<9/!H'7;39H+0'FD2"F$(DD?><@:/@1950<407'/+9=/==AC8@<9'4&FG7$)$?!/.=)=8>C:G29C.)'E<+A7@&+$.H4?5G"),)1!@;7:A*G;@@6>"@&'88F-5@8C=*7!HDE*H=)B:BD4&./,@,&DE',E?#!$#>#E&-0+2?6(+!0.9B/F:%50%:+F9<@H%D,%1H*&+E*+!6$A+C67= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A228 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9663 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42681 42 188M = 42452 -417 GCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATNTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCANCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGG ,B#+=G834(,3F;.@C*B9?/1.3EC>(4$;"CA:B7!95(;5!,(:;5(<"-;9-3-892>:&6-2;+2C'BB#A?=C4A4=(@2:+%'F@(=-7B7+4$>*@A-'G?6F?E)&8=.(D/H23G$B;+%&"-9,G(1$9H,A6:;C.;12!$53&7'B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56C63C67 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9664 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33882 42 44M = 33523 -403 ATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATA 4(/5H2>4$3,@3GA0.>?$2*@3+-80G<:?9'G-3A#+4.,4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9664 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33523 42 359M = 33882 403 CGTAAAACCGCACTCAGGCGGCCTTGATAGTCATATCATCTGAATCAAATATTCCTGGTGTATCGATAGCGGTAATGCTTATTCCTTCGCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCATATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATG !4H6B$093;B;9+(=7?B.,$?4*@:8*5(E7*",G-#/@6'!<)5'B7.#47#E?(A0$GF<(+D5,E>**)4=$!'>6??=D.4>$!HF*5A?-6#;&>:#2;,D%*!8/-+0%/B0,;F*7@2=,//AF53A$A)))18:(>+=<,4H1:5>:C8>$0CF=C3,$0@?B7EB$A17-*#/H:1);D69,C*:?%H6D,FA=>9=32E=9;GH:1G7:751&567*<=@D>7@9&#%(873E0:$G5.H(3'@!4+>B;<86@EBDGH<=.(,?DGH257&>EB+%B>4 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G56A10T7T282 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9665 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41599 42 87M = 41740 250 ACAACCATTCGATTTGNAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTG 0!EB4*,=D<*?<97!:-4!,1&@6#6!"*5+C@<8,D*=H:0#43274(200(@DA!-E4<.CC3;+:8266*522@?=CA2=8CG AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16C70 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9665 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41740 42 109M = 41599 -250 TGNGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAAGGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTAT <(D&"G/!G2(8=F$$6=*35(0EC,"7*7&@,FD='C)&B-)05304(*9'4+C!8-4943A)&+#A>)G8D'('!;!#G40$$89037):(2ABDG9$81CG"0/E= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T106 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9666 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41444 42 144M = 41588 230 AAATACTGTGATGACCNTTTCGGGCGAGGGAATTACACCACGTGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACCGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCANACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCA 5?"#@&BA7:!*3$5AEF79-H;;#D59-&3D==4!.=;(/F6/:2%DB-?+!/436D0B$3+3EHE1*'G7!=+47AG4,E,3?BD)-'79<=6;3)$B;E8,HF$E>#./$=E:$&,77"/!+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A100G26 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9666 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41588 42 86M = 41444 -230 TGGTGGAAGCAACAACCATTNGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAAGGCAAAAAAT 9?0E+9F$@A0460<:)(9C@(4,&)?$G&$-?):700(<7B(4%''&%,*H)-:60-@FH75H($$+9<:D<5(H:4#58=4).7 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20C55C9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9667 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1589 42 46M = 1391 -244 TATCTGCGAAAAGACCGGGATCTGGACCCGTGATGGCATTCTCTGG ,7#.5@'?B!$G#5H&##<<)'/%F5$-H@B7G=%>0/ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9667 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1391 42 197M = 1589 244 CAGTGAATCCCCGCATTTTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCCTTTGGCCTCAAATGGACGGCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGGACTTTACTGATGCCCGTT >@32G+A54G.>0#(76D)5/+F#0:6-79/C62::1D!0!+<<8=!#C1%H=<6/;@E?H)7>1"(E3/.;@*H3!(/G/B91:=?CFB>:% AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:90G18C39A47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9668 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21685 42 145M = 21685 0 AGGAAGTTTATCCACAGTTAANGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTNANCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCG 4+=6EA8@.463@H0@50+,+4?04>:-E%9%.1H;(#'&13#/+*+48%"4+/+$+A@>:$.&6*.@A#""12@44C"4,3,3FF!<3%%'(B8>6/62*(;%;-D<)64EF46>!#70BD7D)( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A28T1T92 YT:Z:UP jpayne@0: r9668 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21685 0 * = 21685 0 ANNNNNTCGNGNGAGGTGAGTNCNNTGCNGANNCNAANAACTATNGGNNNNTTNACAGNTCNGNNGACGNNAAANTCNNCNTCGNNTNAATCNNAGACANGGCNNNGNTTTTTNNTNGNNNTGGNNTNNNNACAGNCGNNTGNCTCNTNNNTNNNCGTNCATNNANTNNGTNANNNTNCANGNANCGCNTTTTNNNNACNNCACNNNAATGNAGGNNGCGTGNNNNGTTNTNGGNNGNNTNAGNCNNACANNNNAANCNTGNC $$$"$!#$##$!"#$"$#$!$!"$"!$"!!#"$!!!$!""#"$!!$#"$!!"$!#""$"$"!#""#$###!$#!!#!"!"!""!!!$""$#"!$#"$"!##!$!!!"!$!#""#$#$"#!!$"$$"""#$!$""#!#####!"$#$"!"!!""!"!!!$$$!"#"!$$"!#""!!!"!#$""!"$$#$!#!$""""!$!!##$$!"!!#""$!#$"!#$"$$#$!$"#!!$!$!#"""!#!#$"$!##!"###$$#!#!$""" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9669 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8000 42 101M = 8101 611 NTCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGT &#DECFC?(%$AGC8@D65'E8>#6A<+D06(==:300E,B+66!GBB(=0,83C'C90;0'27C7G/D*$E32"18F*:E&.3!3-$!5&"#7/CG$7#E AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G0G99 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9669 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8101 42 199M1I311M = 8000 -611 CACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGGAANGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTGTCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTNNTCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGNTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCNGCGTGTGGCTGGGAAAANCCGTTACCCCATTGATGTGGTGNAAATCCCGATGGCGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCNCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGNGCAGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACANCGN **$))+'#*$"((%#'""!%"%)*'((%#($)')&)++#+)#)))#&$&")+$!'&''(&'$'&(#$!#&%'&!(*&+$+%#$$&&%"#'&**&!(#"%$#)('("%#*!$)'!&()#(*')#!%)*"$)'!!#(&!$(+%&)$&(%&!*$#*')%++(+((+"$(+&'(&"*+(*((#%%!)%+!%+')!)(%"%&&!&&(&*++)"&&$(%#!$%$&"*()*%(#**%&(#'($''&'(!#!(&)*#'%*'#!'#)#"+%*&'&#($#'$#*"''#"**%"!+*$%%'$%$$+%%+"$#(!'$#%'!+(+"!#*""!!"'&*%"*++"#)"+))&*!!""#""!+++%(#*!(*&##*$%)$%!)%&**"'('+&)+!'"$'#+!"*'"*'#%+(#"+))&&"''+%(')*%!$)#$%"(!)'%")*#*$&(%+&!#(&)+$+"**(&&$"#"#('+!)'&%#+'%+&*+(")')$&!"'$%()(*"%()%)$%(+#$$*($&&+#('( AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:12 MD:Z:47A138C0A30G66A17A22A91G52T34C2G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9670 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 547 42 64M = 660 235 GCGGATCGCAGGTGAAATTGCCAGTNTTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGTGCAGCGGCGTTTT +%$#+!+!(%%$)&'''&$!)%#$&&#*(!!*'$#"!)%(#$""+'+&")'*)()#%'(#&*"$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A38 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9670 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 660 42 122M = 547 -235 AAGCCATGAACAAAGCAGCCGCGCTGGATGAACTGATACCGGGGTTGCTGAGTGAATATATCGAACAGTCAGGTTAACAGGCTGCGGCATTTTATCCGCGCCGGGCTTCNCNNACCGNNCNG #%%$$!"$+$*!+"#&**$&+)')(*"'$()#$*'$*!'+!$)($&+%%#*#$"$*+(*!'&&($)($*&'+$*+(%&"&$#'$&+&+)##(**%""!&*)&+"(*%")%($#$*$$#")$( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:93G15G1T0C2T1T0T1A1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9671 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8588 42 105M = 8693 238 GCACTGGAGAAGCATGACACCGGTGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCAGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCGNCNCTGAA +!!*"!+$'"!)+(&&+(*'"&*'(#(!'$%&))&'(+#)"&!+%#&+"$%%*#*)($*$'*))"$&*+%!%!"'($$'%'#!!'!!!(!(*"())&+*+%#"*$ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:23G23C49G1G5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9671 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8693 42 133M = 8588 -238 TACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGNAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAGAGCTGGATGCGTGGATGGAGTCCCGGATTTATCCGGTGATGAGNGATA DB:3;FC**4#=:77F%HC*3G@E27,&;E@".F>>5E!0'.#'<5EGEBE%',79A",6E0$G"*')A0FE1F;<59"+C"6".!>=H23.58,H=F427HG:1+%'.=A,/%G*/6&)9&"$%=&'(F/40 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:52A75C4 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9672 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15523 42 97M = 15771 344 AAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGTACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGG @2F<%H'BCF?6/--+B/,=;:&,(:+CE"=8%D6(;F.6=./1*H/2E=>3E3"-)2G&1*;..#(08H2$"?!G#&G.+)4>+0"268%,-)GA9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9672 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15771 42 96M = 15523 -344 GCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCANTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACCTTCGGTGTACAGGCACT :G?'157@E4$3%=2"(G$F%,!)&('0((!-*!7?B26D$F6F=:/C)F"#"(&H#-@,,;9F6H1$,)?7=3"G3-3)G#BFB.0GH>86>0H4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T51 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9673 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16862 42 60M = 16598 -324 GCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCAGCGTCGGCGCAGAAGGGCTTCGCC &+#%3(&>*G$'=-,")"%5?"*3:%0,$#!/<19C!:<5<6GE0=6"FE91*AE5A?@; AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A0A0A0C56 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9673 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16598 42 256M = 16862 324 CGGATAAGACGTNGACCTATAACCGCAGTAATGTGGTGATGCCGGATGATGGCGCGGCGTTCCGCTACAGCTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCATAATGCCGTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGGCTGGGAGACGGCGACAGAGCGTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTNGTAATGTTACGAAGATGGATGCCTTTGGCTGTAACAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTG E/A1H'?#72)6:FC8FF11+E72%695%<9''!?%<):<-+G2+4=#6C1@%H/03C%0E:BA)'DH(C"A1)2?&%7!%G%'@B#";@HFF@D@F5GBH-9?.=AE.'D.)+8D28,'BC9%'=CBC03@:5C',GHEH)7,%-/:($$90+>HG@/8D AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:12G43C60T35T34C33C33 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9674 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38444 23 50M = 38200 -294 ANAGCGGAAGCTGTGGGCGTTGATAAGTCGCAGATCAGCAGATGGAAGAG ;#4@:-0!;&=9726<.>;D(=?0/@E:06EDF,'4&:9>03E1#0GC0:H836&70%5(+1G=D(!3;0A&DC9(B)D4?53:<8+'.6@8 AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:43T18T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9675 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12252 42 78M = 12435 301 GCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAGCGC 2!>")-+(?B1-G77"F(GHE$@>/G&B:/!2D'-5<0')+B%9'<2=7,."G**$5B3">E,)!F7A606@"D>H<* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:78 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9675 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12435 42 118M = 12252 -301 GGCCTGAAGTCCGGCTGGAGTGAGTGGGAAGAGAGCGCCACGGACAGTATGTCGCAGGTAAAAAGTGCAGCCACGCAGACCTTTGATGGTATTNCACAGAATATGGCGGCGATGCTGA 80!-8,;0$4?<#@@C0%=D0"*/279>A:!=$97(1B@9A'2BD502>1:%6!$)ADEB!@8!+.56&@?3H)('=152)*4"='D9:HH,==68##!98E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9676 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30105 42 91M = 29887 -309 AATACGCTTACTCCCATGCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGNAGT "0'>?>G46B!BAB'89:&.D'#1.+GF9>@=")!38-F)6'0%05@1$%**;1?%EG%"7!A=:8->/%/4'8FGBEHF9FF.,@&2B65 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C69C3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9676 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29887 42 76M = 30105 309 TGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGNCCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGTCGATAGTTA =,>?6%C>(@:,5*:*G9FD4-*0%G$-,7E(BD2C$!,;-75066D1";'&/4=HC4;E*$&4#A.$5(!8-+D? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4G27A43 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9677 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25416 42 174M = 25355 -235 CTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGTATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAANACCTNNCTGGTTANNNNANCTN *!$#&*#+$'+)&)$##('%&!%""&**&*(#'&*)%*"#(&'&+$"')%$$!%*&+%&(&'))')$"%(&"++)(&)%*+$$%+%'(+#'!$&($+#*")$'%$%!+#(!$&"+)!%$($(($'*""&%(&$!#'*#'!(!)%&+%)"&+"%&#($%*$)'(**!"!&%&(%# AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:151C4C0A1G0A4A0A0A0C1C2A0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9677 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25355 42 61M = 25416 235 AAGCATTTCNCTATAAGTTCTCGCTTGAAGAGGTAGTTTTTTCATTNTACTTTACCTTCAT 5>G#9!H@).CE47(2?((,<4(0$6313-G7.G!8BG/<8):!3!A?.!4!3?'"H2G5! AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G15G20G14 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9678 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17634 42 48M1D28M = 17412 -299 GATTGCCGCACCGGCAGCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTG )7(C>;?!C@8G&9?@/;(.D5A43='-,G;"+*"H15>@>$F>2B-B7-@>=5A/",C AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:48^T28 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9678 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17412 42 50M = 17634 299 GGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAANGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCC 'E5>&$,!#957:8H5HG-.?.#;D:.8HG+"71D1'.)C8*&>0(A;)0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G22 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9679 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31820 42 260M1I81M = 32161 408 GCCACACCGGTGCAAACCTCAGCAAGCAGGGTGTGGAATTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTNGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCCACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTAACTGCTACGGCCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAAAAAGTCTTCA 0:-?&'0&%6/@C#388F(G<9CC$(,'7?H-<+EG>>#7B*6/F@!.C?FD2&AE$;$;DH!AB!A;?E#F9FA+5,;#A!721;B<5A=5=HGC+AB&E:4%;>#2"76;-57=9+8F88EEG>?)A=97F8)A/;:!*(.!"/BD3%AB06">-:+(92H+*-57>AA"1;H/),@3D>*;$&,CA2=:$."'!9B'C#*@G!!!6199%E>H+%?F!!B7>&:"+H!A:E8E7@((5"!#?;3!=<39D45%+'7#A5B=18-#;3C&F2%CH",48B2G.#3)3.*)E7!0'/A(5A<0<+H<4>;*23+<>>C'37/'0>:%>2E'>/2@ AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:38G55T171T64T5G3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9679 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32161 42 67M = 31820 -408 TCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTCTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAG )H2#C*2'?3(;:&)$1A184727@F4,8;'4%.9DD(.&;1->=FE6-*217E%!%/8&,A=G"H, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G34 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9680 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44251 42 75M = 44099 -227 TGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATG ''*,C,2&C7C761#+E.G,()&35F'=%+?,:;@-E>(1!%%6!20>E&5>D,=6+7E",G-5/*+.6&:),+: AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9680 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44099 42 152M = 44251 227 CAATTTTCACACAAGGTATCGGGGAAATACCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAAGGNAAAGGTACTGCAAGTGCTCGCAACATTCGNTTATGCGGATTATTGCCGTAGTCCCGCGACGCCGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCA ;0"@>'=#%&6'E!/+#$=9"6B1H:<%?:@C%,.*#=F$05-/=/,>?!83AG2=400#G?6A1.(?)-$F%871B3;6@@53>F(>D5(=:4,=G9(:D.&>156'$;7!?C.$F.$.B+"#AGB",&51$FA7@"@1#%=8(@/3&18B%GCG8D-"AD#+HE&'F?(&E/&G<"/"@+1!(DF=AE;.&%9!?+;#"3#-3;.77>+:E>H2%'.#%B9%3D'(E4:.%H#@-B+=DD&(0="25&+48(F$99HE,B>@-8!3-&:6;?+(6"*).677'?E?"9:<(5E;A.*6E:%=$9A'+A<=*C58$H4?#57@:7'!"?+G/@"%/8"0G18=!@6$#0C=6:B2.@G@6$,/.DA6$1*B3#E$@59E'9F4=?:"$-39@&?=!G,E;A"))*.C AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:103G0A92C47C45 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9681 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37396 42 88M1D25M = 37105 -405 ATGCAGAAATCACCTGGCTCAACAGCCTGCTCAGGGTCAACGAGAATTAACATTCCGTCAGGAAAGCTTGGCTTGGAGCCTGTTGATGGGTCATGGAATTACCTTCAANTTCT +(("!)+$+(*&*!()"!&'!($#*%*)!&+%*)+)"*&)(%$!&"!##)#'+&$*%""!!&"$*!+*(&!(!&#)%'%)"#)(($!%+')#+&&)&%!*'*!'$+$(+%&*$ AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:5 MD:Z:85G2^C20C0C2A0 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9682 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27127 42 164M = 27127 0 GCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGANATCGACG '#+"%&$&%*&+#&!'+'#%"!)&"+&)$%!%!!#()$$!('"$)!#+%)'#$)#"(&'(&"(+'&+")((!%'%$+(#"$"%*$(*"#$'$$)!"($&&%!+!+'+!*#*%'(!(#$)%)%$**)$+!(*'"#+#'($($"('!($&$$)#$'*&"+!%!$'$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:156T1G1C3 YT:Z:UP jpayne@0: r9682 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27127 0 * = 27127 0 NTNNGNNNNAAATNNNNGTANGAGGGCNCGTNNNNGNAGNNTGNCNNNNNN $$!##!###!$!"!!!"$$#"#""!#"""##""$"$!"$!"!#"!!$#!#" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9683 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 271 42 238M = 509 341 NCNTGNGGTCCGANGCGGTGGCAAGGGTANTGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATAAAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAACTGCGGCAAGCCAGCGAGGCAGATCTCCAGCCAGGAANTATTGAGTACGAACGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGTCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGCCAGAGACTCCNCT &&"#(!*"*#+''(#'"'&%"!##!#'*$('!(&%'!!$*(#!*!&('&*+'$*&#&)++")&)#*%(&+"++)"$+$*&"()'&!'+$)++$%&#+"*!**$+!*!)))%(&!'#*)#(#!'($))+&)#(***%")$+*))#&#(%(*'$#%##%""#%$"+%"#&+)%!#')!+)(++$%&*+**#+#)%$++$$+$#%(&%"*+"")#&&%+!+)+(**!%#*($$$'!')%&+ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:0G1C0C1T0T0C1G3G15A102G28C37G35G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9683 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 509 42 103M = 271 -341 GAAGTGGTGGAAACCGCANTCTGTACTTTCGTGCTGTCGCGGATCGCAGGTGAAATTGCCANTATTCTCGACGGGCTCCCCCTGTCGGNGCAGCGGCGTTTTC 9*E82'<4-*4)+(=H%&H,)=?-7#.C!!27-*(/G3$928'F8!/+!'G?3021/%&A,;%ED=$32E39<,H;"8'-:/B1+H/?5&GB#!63<=+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T42G26T14 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9684 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42020 42 41M = 42020 0 ATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTG A'?%D0?!@*E4-2(F>D('2'H'0$!=)!*(G',90?&BH AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YT:Z:UP jpayne@0: r9684 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42020 0 * = 42020 0 ANTANNGNCGNNNTNNNTNNATCCCCCTNNATACNTNNNANGNNNNNGTANCTNGCTNNNNNNNGGCNNATNACNATTNAGCTTNANGTNNTTTCAGTNNNCTNGCNNTGTNCTTNNNNNNGGTTNNTNNNANNNNCNGNTNACNGNNNGNNATANNCNNNTNTNGCANTTNNTNNCTATNNTACNAANNCTNNNNCNCACCNCNCTNCCTNNNCNNCCTNCGNNAANTGATN #$$"$!!""#!!"$"!!$##$$$!#$!$"!"#!#!$!#!"$!!"!#!"$!"$##!$##!""!$"#!$!!!$"$!#!#"$##!$$!"!"!$""$$"!$$"!$!##$#"!$$!"!$$!#"!!"""$$##$!!"$$""##$!!""$"##"$!#"!$$!$$#""$$!#$!"#$"$!"$$#"$!"$"$##!$!$!$!$!$"$#""$$$$"$""$$$"!$##"!$$!##"###!###!$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9685 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22371 42 189M = 22560 257 AAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGATCTGGAAATTGCAACGAAGGAAGAAACCTCGTTGCTGGAAGCCTGGAAGAAGTATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGNCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATC B$;'!D*#<;H)HHH#>C"@+:#28H7',$-/?-/(#:.A'/F$@)3&"E7%&=H'$GA*#;C)9%-1%+&%,?&E=A(@?8;6#:%A4G7"(EE0?F;!6%=14=&%#(<7EC AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9686 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34524 42 71M = 34282 -313 GTGTTCAGTAATGANCCTCTGGAGAGAACCATGTATATGATCGTTATCTGGGTTGGACTTCTGCTTTTAAG 280$A90E5=65DG$E;&(#8(;@.#*D(%'-3$@3:D>+8HC7F(&&:A.:0(1>92G,,,7=!D''.0F AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9686 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34282 42 64M = 34524 313 AGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAA 8H#2/?3>8)4"D*?!*<(CH+==,0,,-8F"*4=H!87?<)/#$D+8F$B0=4)3A564HC>F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9687 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18019 42 140M = 18173 239 NANGNNGGNGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAAGGATGCCAGTNATAAGTGGAATGCGATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGNCTCAGCATGGA &*$(&!#&#+$&&&)*+'#*'&+$&$$%!#%(#&'#%(""'$)&#*"!!%+*)*!$%)"&%))('%(%%*$+($&"'"!++%%'%)!*#%(''"!"*#+!(%+!%&$!+!&%"()+%&#%"%&(&'%*+'!!&"(&%$!( AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0G1G1A0T0A0A0C45G13C59C11 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9687 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18173 42 85M = 18019 -239 GCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACGGGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGC ??3G@-;,2H+B+,C<10A$G"1!80E5';6*5320A#)D'33@(A8;(;=81)?02(.)'>+"7,D9!5A3D#*63B$>/$$7= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9688 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1189 42 58M = 1422 361 GCGGTCAAGCGGCAAAAAACGACCGTGAAAAGTCGGTGGATGTGGCGGGTTATGATGA 67=D!:"<$)G0$.HC;-C1$)>$&>E@2G'A==;.D=%.3FE.:549H+->86<6&. AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A14T37 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9688 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1422 42 128M = 1189 -361 GTTGCCTGCCCGCATTGCGGAGAGGANCAGTATCTTAAATTTGGCGACAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGCGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCCTGCGT "'$"'!++'(#(#!*'*(*%*$#+$"&%"&"$!#'&'*"(('#!+%'+&$%#&((%)'&*%%(+'($+***"(("*%*(!+#!'!*(*!#&$(##&((+&+*$)+*$(+#&)*!#++$(*+#+#)(!+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G5G91A9 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9689 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42286 42 111M = 42439 244 AAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGCGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATCTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAG $;67A?7+G0=7D;-4%C4-F+EE=7++#5.G?A-3%-5?C'9%$AC#H$A'B6%7B$,;2F4#1!6,,8"9F+5)8A*G67663=27EE>>E1-A(%D,H--$<7*,D4!-55715:B=*'.038>/80+B$/>5#E,((9:$$/075*1D;D AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:34A5G38 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9690 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6665 42 125M = 6790 204 GANNGCCNCGAACGCCGATATCGAAGCCTACGCGCTGAACGCCAGCGGTGTGGTGAATATCATCGTGTTCGATCCGAAAGGCTGGGCGCTGTTCCGNTNCTTCAAAGCCGTCAAGGAGAAGCTGG *%!$)!#$#(%"&&"*%))')+%&"&('*##%&+%)&#"+&)+!!!***&*(&"''&(+&(!(*%'#$'!$%%"(&&*)"''#'+##(((#(%%#+%!'"("$##'&)$#**(!%*("+'+#$$* AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:1T0A0T1A1C3C2A81T1C26 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9691 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5245 42 200M = 5197 -248 TGCCGGACTGGCTGATGAACTTGTTAACAGCACCGATGCGATCACCGTCATGCGTGATGCACTGGATNCACGTAAATCCCGTCTCTCAGGAGGGCGAATGACCAAAGAGACTCAATCAACAACTGTTTCAGCCACTGCTTCGCAGGCTGACGTTACTGACGTGGTGCCAGCGACGGAGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGC .01=/5*A3(;='G0!(3B=*3)678);9"*'$G"F#"'9"9.D=?9!=/-H59<0'#$>7H3/*E*E(=E"EA:?:6#-D>)=!69)837;/D6H>;37H2;2#89'/?:(0&E%>:6.,*.%;1&&8G!B9<(7%G0B9-&:1H),()@" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:67G132 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9691 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5197 42 48M = 5245 248 NGTGCTGGATACCGAGGCTGCAGTGTACAGCGGTCAGGAGGCCATNGA +)+&&%*$&!(*'*%#!!)&$)()%"(&"!!)''***"#(%+!(+(%% AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0T44T2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9692 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8825 42 59M = 8717 -167 ATCCCGGCACTGTCAGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCG 0>/8/?-7:1G<3G=($BE7$14'6<8!,;&H1*1$BE&%#0/E(#+95;@$H")((G* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9692 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8717 42 59M = 8825 167 GATACCTGGCAGGCGGAGCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTC @1"&9H=G.$;5.>"G9/:&1.*;1$<$>$=!=E13C&??1!4B1&A=%@##+F-38+' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9693 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31149 42 297M = 31446 383 TGCCATCTCGATACTCGTTCTTAACTCAACAGAAGATGCTTTGTGCATACAGCCCCTCGTTTATTATTTATCTCCTCAGCCAGCCGCTGTGCTTTCAGTGGATTTCGGATAACAGAAAGGCCGGGAAATNCCCAGCCTCGCTTTGTAACGGAGTAGACGAAAGTGATTGCGCCTACCCGGATATTATCGTGAGGATGCGTCATCGCCATTGCTCCCCAAATACAAAACCAATTTCAGCCAGTGCCTCGTCCATTTTTTCGATGAACTCCGGCACGATCTCGTCNAAACTCGCCATGT AC),=2,'&%6((?!&67+2?/+865D;>D+*):6&2:>$/2:0@BE-,!D0F&-6:7,E52C.10/47/B*F#1H1;C79(21)(0=4;-"4F#7(,,5-F8E94:!=F/0,A.C8;>G-3,&0++9%+&:B"0=%#HFA=4)3E84CD;+;.89H+/A8?=278,37=3%+&@"<0#8%>544ACE,+!D2!*?AA.97#9356D/:'=/A<01<05#"%*H1:8*%,6%ECH4FD$7#2?@'C3>9H#:DG5?*%%!(-$346@?F:'AA43$%G&'#775H0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:129A153A13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9693 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31446 42 86M = 31149 -383 ACTTTTCATCCCGCTCAATCACGACATAATGCAGGCCTTCACGCTTCATACGCGAGTCATAGTTGGCAAAGTACCAGGCATTTTTT !"#$+"")!')+#%+$*"+)$#!'!+$%(!'$!!'$(!%+"**($%%'*")"!%%#'$()!+&!)!'&$)!*+&"*)%%#&$"("+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:54G31 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9694 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38719 42 48M = 38719 0 AGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGTGGCAGANCTCGATGAT 2.A)<.-.#(HH"2($HA0.FH#:4%2("5=@!"?74<6)$HH/"0<3 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T9 YT:Z:UP jpayne@0: r9694 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38719 0 * = 38719 0 ATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATANTTGATTATTTGNCGTGGTTTGATGGCCTCCACGCACGTTGTGATATGTAGATGATAATCATTATCACTTTACGGGTCCTATCCGGTGATCCGACAGGTTACCGGTGATTCTNTCCATTGGTTTATTCCACCCATAGGTTTTANGCAGAATGGCAAGCAGCACTTTAAACTGTCGCTTGGTCAGATCTGCGCCCGAATAAGCCTCAAGCAGCATATTTGATAGTCTGGCGTAACC ,3.?>B6,-@CEG8%*A+D4&FGA@!7>B5)A$'5B3B@-">60C3F:H&*5>=173D30F4(E.(DH*8'!((G/87+!G$@"-8HHF5#B1%6CA:$7B.CA6E3H=:>'7DG?1.6D.*6'G#46A3+.(68;(=@/0'5=A(9:1"$9>$5#880/;8@6!BG6H'A%D"#H%2$%$G&/1GG)A";)A>1#+60G#1?*746+<%&(=/:.AH)$1%!21?(?H/6:>@H'A,,E,1&'&+BD!91/(/52(>D>0.BH5&1$2C,9!&&/9?@0-(%@*:8(142">$#2/!G=A3-(;H,!D"!5C6H)''(.FA#D4/?E+7;2.B5$-8';@@'&=+?,3'&8-'!GG"7!?"#*$,8HG*F;&4=(%+:D&@.)*B2<%(,%'C&$H)/!D2$H&E">5G4/%G=>?6<02?E#6/=")BE/"C6.31 AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:6 MD:Z:82G26C136A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9696 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23573 42 24M1I88M = 23771 255 TTATAAACTCAATGTCATTTTCTTGCAATGTAAGATGAAATAAGAGTAGCCTTTGCCTCGCNATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTCTATCGTATTGCGAGAATTTTTAGC )$E)4$G7.#H:"D7:6-H@(!46,!#G:2#8174;-58106G-4C$+C-3+ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:1A58T51 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9696 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23771 42 57M = 23573 -255 TTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCAAGC E'41'<-7/C03E+/D:2A;<2#=C3C6'.=G02-9E'=1/? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9697 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35421 42 187M = 35618 283 CCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCACTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGNGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTA 2:;,9:H/340!,(,+:-A*5B1E099>$09"9;)<(8#>5!2%F':1'H)<4%.6*0HH;@75C3D-D3,/)'=-FD,+A#8.,%9;-4>1:06GAC5>D0E#G<=3CE.G(1FB@%**3%<@?0$9>)+9%.7GC'B,68%!0=2!;<5;'HC=,A?:>2&2'CEA"E0.8@1> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:127C59 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9697 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35618 42 86M = 35421 -283 CACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGNGGCATTGTTTGGT -7/86:)41A@2*+.3C($.-."49/:D)!:1H8E$G')=50%90B51.9"#%BF0,>(.+#2&D$>,2E5(6,39!8:&+=?B4= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:72G13 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9698 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8101 42 45M = 8295 273 CACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAAACTGGTAAAGG H&-/G/;%6*E7GGBG0A)+.FEAA#!C=)<@(."@370,/1.)1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9698 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8295 42 79M = 8101 -273 AAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTNCCGGCGCGTTTATTCAGCAACTGAAAAATGGCTGGN '$)"&#*!''"*&(*#+%%"(%'!"#(!)!$$#'")""#%#"&(%'*$&$%#''!$%$%()%)'*(+*#!)+%$(()&! AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:2A1G37C32C2T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9699 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26526 42 52M = 26358 -220 ACACACGTGCGAACTGTCCATGAATTTCTGAAAGAGTTACCCCTCTAAGTAA )&(&#@28'."7/A>*'+=2@A/44G75!)=#D0;7#879D>=:8#$4H?&G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9699 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26358 42 81M = 26526 220 TCAAAATTGTTGTTTTACCNCACCCATTCCGCCCGATAAANGCATGGATGTTCGTGCTGGGCATAGAATTAACCGTCACCT :-:E"0,&@6"13;0C=8H8H/>##<*+52+!B..1<'1D!8+1F!+6@087'*G4C7H5!!@=2:)"E#,0F!23DEB"+ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19A20A5A34 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9700 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44669 42 43M = 44669 0 GACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGANNTCN +%$))"(*&%%%$*!$!*'#)+%'*$#%%+&&%$('&!+$%$% AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38G0G2T0 YT:Z:UP jpayne@0: r9700 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44669 0 * = 44669 0 CANNNNANCNGCTGTCNANCNCNNNANGNNCNNANTACNGCNNAGNANGGTTNCTNGNAGANN #$$!""$"""$!"!#"""#$#""#"$""#!!!"""$"#"$#!$#"#$$"#"!!##"#!$##!" YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9701 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9725 42 62M = 9509 -278 CGAATCATTTGAACATAACGGTGTGACCGTCACGCTTTCTGAACTGTCAGCCCNGCAGCNCA +"%&"")'"'!$'$*%($")'&''!((#'!+$'!"((+"'$(&&&"!%%%(!"!!#%(+&)) AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T5G2 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9701 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9509 42 93M = 9725 278 ACAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTNTCTGCGGAAAAAACAAAAGCCACCGTGTCGGTCAGTGGTATGACCATCACCGT #/#0>0#!FGF#)$=%@>1,C=)&D'9+(E7@G2=78F,@85CE+EF-F77G/2G5C0G@#&:CFA%%9,#,!8$0:2;!H;@'@0A$3/714 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C38G8T44 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9702 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44428 42 42M = 44642 275 GCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGA 8/6+?C.)/40*,*>)$@B"D=9F(-?!4AA#9'.B@F/CA) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9702 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44642 42 61M = 44428 -275 TACCGATTCTGCCTAGTTGGTCNCTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCA *+%'!"%$*"#%&'$&*&+"!)(*#%&'%)'((+*($*''#)*%!"!%"$!+(()++#&#' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9C12A38 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9703 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18814 42 56M = 18877 268 GATTCGGCAGATATTCCGCCGTATACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGNTGAT $>37>"1?(?>>=F!9)G8A+%!6*$9?#H>!8HB9G,B*/2:1!B::A)?C%:5!6/2DC1)8B8B&%F-649.=4=8.B8>BEH??%GA:2:A#6FC42>3>C');*C7%<*$2E%!?)E$!/1621D26!,82C2$<#AGF=:$=;7(BD/"1-3*5-GB(B%-6;3-*E;(/*1:,9,@$*C<=5(?0?*F*C%";*>7E3?GCH/#+;/2/8#C1GD5/&<8&G= AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T8G65 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9704 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3306 42 85M = 3103 -288 GGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATTAGCAACCCGAACAATACCGGCGAC 2FBA!(GD98>E4+A/1B920@C3.%$@;$D#.C7G1#H9,";C7/#;4!&<64667')2!,?+6(,?H:0>: AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45C14C24 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9705 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1077 42 57M = 854 -280 ATCCGTGATATNCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGCAAAAAGCACCGN =94961.$'4G<>-,1;?;<%(+:5+2E#7(/*&*G;64!)5-#2D':8+860B93/;!126(@&<&@BB/+#2*BC+- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:50 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9706 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36693 42 63M = 36514 -242 GTTCCCNTCATCNGTGGCTCTANCTGAACGCGCTCNCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCG /'$:@*:G@>:/G05/>;;,7'8A$H'9=/'EE3;!=C."=G.3.<;6C4+:.@"5?3)14,; AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6C5A9T12T27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9707 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9159 42 61M = 8945 -275 GCGACCGGGCAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCN *&$&#!%#$%"++*+$'!&++)!(%$'"##""%!$&"+&!'!)##%&#*!&"(###*"+(' AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A43G0 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9707 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8945 42 81M1D89M = 9159 275 TGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGGCCGCTGAGTC 40??43.5-A5'%C@=E-AH?,2;6&-A7G!$(+485,98H5&10<$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:81^T78A10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9708 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44891 42 243M = 45134 453 CCGGATCNCCAAATGCGTACAGGCGTCATCGCCGCCCAGCAACAGCACAACNCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTNGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTA C0.+8,7BE:'$H'<8.A8$4EBG+H:2+>G#->-G$=2333ADA4-!<0,,H#4+#A@A2+8+G0H1;=3$AG=HG6D'&<+":4E@5A1&%H(#1=0-(,:"%@%(,4=:;@%!&@E4(-9%B+)+H7)0*B&6!) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A43C75C115 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9708 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45134 42 210M = 44891 -453 ATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACNTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCAT @>1@837-C'G>28C(#DFE(<2B)8GEC)>:>C$'->%?66='60%/DE.->!1=:2C@H4(8"268B#!?6&'05D<=52+*$=?1?8"8?5-(2#>E;$F4*-7!9AHFF?G'1,*B;,F'%G#-(0913G"-)82B!. AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:76C133 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9709 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44328 42 190M = 44178 -340 AAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGACGATGCTNATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACNCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGTAGCATGA 5.$=.4!#?<4/)46%D(##/F1%80@52/6H;&'CC%-<#!)3@-!D?/F!E=(@-1+C+,+.1*.=2"=!506+@H1<3E?BBGEG@:9-$'<)/3$10;="*9=%">"$%=>4-2DE>@'=&@%H6F/#0DD.659C/F>(=5;:&B'E9.7/%?(40,D%@*9:EG!442&#'/69)-5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:58A31G91C7 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9709 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44178 42 150M = 44328 340 TGCTCGCAACATTCGCTTATGCGGATTATTGCCGTAGTGCCGCGACGCAGGGGGCAAGATGCAGAGATTGCCATGGTACAGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCA 7.#>BF-0,$3(';=*9C,3)"E(FG$@':D.(/!:5+=27)+(/F(=>1'3EAD$2,!BCA:.<"?(*A)"?*+D?!4!4:17?8G+.>11-E!1="50:0F)D*4+/2,>"+*,:(3930=)93A;B'5'6*AD;;+4(8<;D!7(=. AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C101 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9710 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35637 42 85M = 35722 337 TCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGGGGCATTGTTTGGNAGGTGAGAGATCTGAATT A%<(5.H).+E4?=1,&4(8'?5CA!7D;A(@>;>3?.#-94@/">%"8%,#60;H%*F>G8'714$.5BA.==/-5(1$1/H1G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66T18 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9710 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35722 42 252M = 35637 -337 GCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTGAGGCAAAGAAAACCCGGCGCTGAGGCCGGGTTATTCTTGTTCTTTGGTCAAATTATATAGTTGGAAAACAAGGATGCATNTATGAATGAACGATGCAGAGGCAATGCCGATGGCGATAGTGGGTATCATNTAGCCGCTTATNCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTC '!40D*6-6;*@H+?B("/')=10DA/>.=6?.EE9.6+=FC/802,':F)D46,7$0)F-GE+A4:#*B?*$1-723634'8D%,&;B, AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:116C35A49G11G37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9711 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23363 42 86M = 23510 233 TGNTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAATGCATGTAATAATTCGTAATCTTTT -&2=GCD0,04&.>41"72-E66?F?A/H19@:CB+%541#H&%!3H-A8,(,&;H/4BF(:!E!H'0-3%="83596:C@(32@@ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T58G24 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9711 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23510 42 86M = 23363 -233 GTANTTTNTTTTGNGCAAGTCTGACTAACTTTTTTATACCAATGTTTAACATACTTTCATTTGTAATAAACTCAATGTCATTTTCN /3>E7B4D9!9-4F8G",H,+/6D$$&E;F):7?A<6A-3H%:(81%1769E=B>!;FD,/"00':<-B4@<#,)?+' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3A3C5T71T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9712 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12725 42 84M = 12565 -244 GGCGAAATTCCATTTTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGCGGCAAATATGAGCCAGCGGGGATTGTTTACCGTGGTGAGTT >(*$,"H3./'",@)6*.,'1*8?8DFG%'>AC=1E#*!0E-8>*G#71-A6 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C13 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9712 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12565 42 150M = 12725 244 AGAACTGGCGCAGCTTCACCCGTTCCGTGCTGTCCATGATGACAGAAATTCTGCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTNGTGGCGGCGCNTCCGCGTCAGGCGGTACAGCCATTC 082A<1+0B99B!6'5G/7FE*8E/:E)/4?!"%5?4%,/+B)8<"*<&AG"/<1F$'!5,)9(G2%%0HC>61(1>2(==&E);/31CH:?/&3,#-B4&610;>:";?D="F(?#12&G,#>,25E(2E)DHA3A.$8*8+BH@F;$H AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:113G10A25 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9713 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8628 42 139M = 8507 -260 GTCGCCCCGCTGTTTTTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGCCGTTTATCTCACCNGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGANCTGCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGT 7B@-;#=2(7!1:4#::'4*)H4HB*$0E/)6B!#(;E/!;!=*:!;D;GF85G8<8C'&?#>!:&.7E!?&>#@0<61=>E7C8",!;%0%&DG8DA698@#75@2(=-,<2H*FAH;CH>+)#B"*3 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56G49G32 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9713 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8507 42 68M = 8628 260 GCTGGGCTATGCGCTGCAGCATCAACTGAGGATGGTAATAAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGC >2()(?42/7*1>7($C%AD@*6@"<$7.G,+-.-&F;+9AF@!<>#F+CF5'5A')"'47<9:7?31 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:68 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9714 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11860 42 110M = 11712 -258 TGGCGNCGGNGAAAAAGGATTATGAAGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTG ."!663H!=6#7:!E8*"->1-BH"):8439'9*=<26<(;3;8?<(=F?F>(3;%)FH1H<1:944"=F44+H%E#(=$56(?06%+AC(1@E2AH!+,E'"-/#E#;1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G3C100 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9714 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11712 42 46M = 11860 258 GAAGCGTCACGGCTGAAATATACCGAAGAGGCGCAGAAGGCTTACG -6:GC3:"=G;:"E$'>?>9600+/@3C(0G3-+<+#!3/?+8!'4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9715 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19121 42 164M = 19072 -213 AGTCATCTGAAAGGGATTAACGTGAAGTACCGTTATGAGCTGACGGACAGTGTGGNGGTGATGGCTTCCCTGGGGTTCGCCGCGTCGAAAAAGAGCAGCACAGTGATGACCGGGGAGGATACGTTTCACTATGAGAGCCTGCGTGGACGTTATGTGAGCGTGAT 2*:++)&-+":>95#H>'%H(<=;;A2C&96)5&A-&,EF?9,="*?E#&'&-BD("1.%>3-E*$'C."G;6.(4")'D-F?.AFD<>,065A5"()1?>6?.7H43H"-D.B$7/B982<>)':FH9$D2;6HE/C!A&-3"?.D@013)+#:5245!1+#0 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G108 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9715 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19072 42 49M = 19121 213 AGTGAAACCGGGTACATTGCCGTCGTTGTCGGGCGGGGATACCGGTGTG $@C;3$-<8?AH(8'$3'A"#CDB$+-277%>AH&H9BG82/#$25G*0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9716 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12217 42 93M = 12063 -247 CGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCTAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGGGGCTGACTGACCGGCAGGCAGAAC #8*6&B3=A>4@67#C8G;E466(?>"@63)%/C1)A3+:%6!(:-+)$!;!:G!'/,G"%01<+3!0%?&HD/ AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A55 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9716 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12063 42 81M = 12217 247 CAGTTCGCGGTACTGGANGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAG 3!H7)*@),/F)A(*>8)-"FD";24:?76FF:%16=+!H5"*:2E&(C$B$@(/)/&6/.5B78#$HB(5')G"@F;6H2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G63 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9717 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22970 42 34M1D100M = 22843 -262 CATTTGTTATTTTNGCTCTGTCANCTGCATAACGCAAAAAATATATTTATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATTGNTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATNNC DEB,8-"4"&B$6$2AE!;6#EF$+&(=GD$D=/-F2F?2!E6(G24'*D)3#*F53*?&7(#2;>G5-1'"B3"4&E?C3%0"":$*=@GGA$3E(*9#;+41733$<(49;*()%*D@!E;F!"EA=+9@'/:D/(68<(&A,!>@:$,"!$")H)#58"#0'E:1939'A0&,G%)EF,76H5G,?F4F484.<8(CE>>70#7+)A:">3.4=(6/47;;4<*8:$..$A(<&C&.E%(!#"'<)55EF53<>9?.6>#%28D574<<+?E3B=76:;C3"BA6C>'D"8!;@%)E?2E<<2$+8H+A-G>-2C;/B3$4228<+9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:337 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9719 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9768 42 75M = 9843 412 CTGTCAGCCCTGCAGCGCATTGAGCATCTCGCCCTGATGAAACGGCAGGCAGAACAGGCGGAGTCAGACAGCAAC ,:3G:+1.186$6%6:641/B*2>2&>%!'1*57(#6H=*B5704"1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:75 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9720 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17650 24 32M1D37M1D7M = 17419 -309 GCACCGTCGAGGATTGAGCTGACGCCGGGCTATTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCCGTTTATGCGGTACA 97,"F=DG5*20'E;?<(8.?0A@'H>.A4)7#?C4'84:(/@0!#,*F!AF10>*333>;"6+B7$.'.&@$G*: AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:2 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:32^T37^A1C0C0G2G0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9720 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17419 24 107M = 17650 309 GCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTGAAGGGCGTGAGTTTCCTGCTCCGTCTGACCGTAACAGCGGACGACGGCAGAGAGCGNCTGGTCAGCACGGCCCGGACGAC 5E&D31$4#D5"=98(@/C-!8>0H)DG4458'%+2A*$3@/HC1,1*D#BC4:5.+9,,%5E+H5FA8=0-,.!+/#G;*;@0/.7@,3@G(AG":2 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77T5G23 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9721 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21174 42 55M = 21229 711 TTCTNGGAAAAAGTTTNNTTGCAGATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAA )''%!(!&&&)#"))""%%$+!*$"+$#&+$*"&"*"'%''!!++"#*('+(#'* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4G1C5A2C0C0G37 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9721 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21229 42 656M = 21174 -711 TTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTNCCGTCTGGCTACGTCCTGATGCAGGGGCAGGCTTTNGACAAATCAGCCTACCCAAAACTTGCTGTCGCGTATCCATCGGGTGTGCTTCCTGATATGCGAGGCTGGACAATCAAGGGGAAACCCGCCAGCGGTCGTGCTGTATTGTCTCAGGAACAGGATGGAATTAAGTCGCACACCCACAGTGCCAGTGCATCCGGTACGGATTTGGGGACGAAAACCACNTCGTCGTTTGATTACGGGACGAAAACAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGGGGGCTCATGCTCACAGTCTGNGCGGTTCANCAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACNCAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGTCCGGTACAGCCGTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACNAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCAC %>F8$(:<1!(;%/$8(9#E@G$5C9GG;!2GD8B=/#64+(#*B$0C"):8A(A;<546HGEH2G40(H?H)A'5,:*>2="A/F;(7DCCDH3E4CB*EG>0C41@.E2:@@*%51<#9<%+/&"=$H@E(&4(.CFBH85%+E>+2717"5//:,@?H.;*D8H=D1&D#$G0-:3.$!C'5*<#E,@$!8-!>2).%!)D4D1'E?E;"#/:.3@&*.;(G.10))HG<8)$+3/577:.E.80D2"B#*,(B"!#8+<'=,9=/2>:"G"8@-,D5F)=B3A:@?.H7/#)C3/?>8!;<3%7;(1$<;,&6E<#@4?D"+-)D7;H)F%3%@:@G+<588(%-((B.?":"DD='AB)01,A+!30&4E%B-41)92)-F4CDB"027?;!5'D?!,>D#"GAH:11/02("5D8.8#;#="A("D$)$(;3"-.+E*,*3+DH@6$>:6C"F&5B<966G,$B<6D*4,"A?.3&9;>D9E*#781@<4>.'+$!;E':,>@ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:48T32G2T185A90A8A26A206C51 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9722 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15459 42 64M = 15566 203 TGTGAAACCGCCTGCGGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGT 7%4?9FH#6B9?>)20"0D:?G)4)F*@><<"**=)180@3#3+0$!BB8D'5C<#7;G/C6D# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9722 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15566 42 96M = 15459 -203 CGCNGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCNGGTGGATGGCTTAAATAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGNTC =91%1)+6%'&%9@1>'9.0'1A6@?BDG+(?3<92A9E2B"HCCH3<3.8.,),97<@.<;55AD0->&C18==(5=F1/9;"3&%14C'8B'"( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3A47C15A25T0G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9723 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24556 42 196M = 24752 332 TAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATNATNGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATTCTGACTGTAGCGGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTCCGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCACTTCACTCAAGTGCTTCCCTGCCTCCAAACGATACCTGTTAGCAATATT >&C.E)'1F-(%@A&#;:5%#H9''*5D#<<"9H9/C#-(0AG$#5DB6FF7-2$?B?=+,+:!+30;0H=B4<5H&+;/$.)1"1+-6.G(F@G7A?2(257(7)"0)2G&-D72-9!('&-)9-C&%6!D::)/EGE4!2"D)615-!,+7D(F+%H>$7$:@@)283A+0&AH3&$"%*&B-,6HG"A'"185 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:40A2A36T41A73 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9723 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24752 42 52M1I84M = 24556 -332 TAATAGCTTNAAATAATGAAGAGCTCTGTGTTTGTCTTCCTGCCTCCAGTTCGGCCGGGCATTCAACATAAAAACTGATAGCACCCGGAGTTCCGGAAACGAAATTTGCATATACCCATTGCTCACGAAAAAAAATG ''A$D,*9:H02A$BH+(<%7.@A-D38F(8-D6,9D4"H!>8@"5+-0"-&-+$$6'8*0.2-%A&7!!=%D*&,0.7,F98!1)D6FH2&D?400%EB:B5+8C=C?&9(&"D(.@ AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:9G4G121 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9724 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44637 42 87M = 44257 -467 CTTACTACCGATTCCGCCTAGTTGGTCACTTCGACGTATCGTCTGGAACTCCAACCATCGCAGGCAGAGAGGTCTGCAAAATGCAAT 89>./8#18;$,D8!4(-&,A*+:D'0(">+15,B:"H9/>C57->81'8.9!FE96 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:87 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9724 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44257 42 380M = 44637 467 AGGCCGTGCGGTTGATATTGCCAAAACAGAGTTGTGGGGGAGAGTNGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTCGGCTATTCAAGGATGCCAGCAAGCGCAGCATATCGCGCTGTGATGATGCTAATCCCAAACCTTACCCAACCCACCTGGTCACGCACTGTTAAGCCGCTGTATGACGCTCTGGTGGTGCAATGCCACAAAGAAGAGTCAATCGCAGACAACATTTTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATATTAACGGCATGATATTGACTTATTGAATAAAATTGGGTAAATTTGACTCAACGATGGGTTAATTCGCTCGTTGTGGTAGTGAGATGAAAAGAGGCGGCG 6G1#54H(A?0!-:<.,#/,.?5HD0!1H/,'=985;#@2>D07A77+B&C3EF1$B&991>E1C1GC&)&8.$B;,./=)A5*9/G08!B<)2*G5#';B(+H#=;.+E9?$+60*=(856!<'8!=*!=B'17.!<"557%2)-+2G(1<-A59$$E=C-@38:4+/7*6#F.>.;<40A-=D1-8",/*,H606$'DA#'B/#"*/H5#%+4@981@?DG5%&+G<78E8:>8/9/C0C92!;1E116.&-2#&:F2-7CAA7G54&"'B:BADDF$(H:>'/-D.;>;/.?2)*!869/$41-#AB)#(?78>*"G!;H3/$3;*?=+8CGC;8$0"*%6BA:8FHB:'/E)'G486C)'C+3:&A)12-&G)(6F AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C13T76C257 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9725 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46101 42 46M = 46182 241 CTGGCGAACGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATG $;-$52:0!E31D8>!?#3A/4?$D)A==4%"4+)F66=3;FB-+! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9725 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46182 42 160M = 46101 -241 GCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATGCTCTGCGTGAAGATGTTGCCGCTGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGANAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACACCGCTGAACGGG 5!$86H5#B53&?1,83)1F)&#*=06**2!?+)4-?1C*+<#.5+6,!1">$!6?894AA8'G8:8B4/7E1,01AC:5FF3%GD>4"F9A*C>'5H;F7G<;A#(@#7@.04"C3%B@EG"@;G-1@78-0."054F%E02+6<,@?G/H'>(%694G AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:35T19G63T40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9726 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25359 42 220M = 25591 279 ATTTCGCTATAAGTTCTCGCTGGAAGAGGTAGTTTTTTCATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGNGGTATCCAGNATTTNTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGT F1F:+F&G==26<#B'=/CA@/?7"%%!74'81'.,"451929HH8;B71A&79"FCA'%7.5(D%!9?/0*")5/5C!:3H#69%&@A:@D)?8=3:*0*.0%C20D3'6@&+*,3.EH3.(6$F3AD)'%BB-29%)#0G=@<5AGC)/==E&?%4"7:G9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:92 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9727 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32729 42 88M = 32874 237 TGATCAGCTCCTGTGGGTCGACAGAATCCATGNCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCCAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTT /40),+=9H0*C-,&C8>2;9#7(-+9766=HGHG AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T24C55 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9728 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19878 42 58M = 19878 0 GTGTATGAAGATTCACAACCGGGGACGNTGANTGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGG 4/G%;&B0378DF;'3<<3DC"0+E;&'G$FH)2F!A'1:48:+!$E5C8/0(8!92E AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27C3A26 YT:Z:UP jpayne@0: r9728 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19878 0 * = 19878 0 TATNGTNNTGCNANNNANCATNNCATGCGTGCNGTANGCNGNCNNANCNAGACNNNNNCAAANNTGNAACCAANAACAGNGNACCNNANANATCNACNCGNNGGNGNTGANANCCTNNNGGNNNGAAGANNTANCNNATNNNGN !"$!!#!!$$"!$$##""!$"!!$#!#"$$#$"""$#$!!$"#"#""""$$$"!$!"#$$!"#!"$#$!"!#""#"$""$!$$#!####"!#"$!###""!!"#"$#"$!!!#!##$!!###$#$$$$#$!"!"$!"##!!"!# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9729 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8587 42 44M = 8670 191 TGCACTGGAGAAGCATGACANCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTC :&;5<)B+4AA3$7F.C,/'H&4F:/(%@6B1@(H/C=>?H30= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C23 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9729 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8670 42 108M = 8587 -191 CCGTTTATCTCACCGGCGCTGAATACACGGGCGAAGAGCTGGACAGCGATACCTGGCAGGCGGANCTNCATATCGAAGTTTTCCTGCCTGCTCAGGTGCCGGATTCAG 0;CF,#1("?BB7E8?GD-C&HH*=4H?*09&%>3G0E%8+.+8A#"G@1G*,!B=/,!E"EDG%5:3:)+;6(CCB<"*''F5+:2:?724A=E53)6"D.D+F?#7 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:64G2G40 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9730 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40220 40 71M = 40077 -214 ACAGGCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTNGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAA FH%<)!4&)?-2/).&&5$E#1*&21-(&A)G#)=0;-!(8-=+6.1G(A53-69"*C:%C'B+&H34>#7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C31 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9730 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40077 40 31M4D42M = 40220 214 GCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCNCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCG 8!:8/?!@0F45%<0"+/E'4@'?1:?;1<#)9#=8;.+2.8//%7?HCE0#G5D9='6(:GC.')@.+=E?01C4@<@#-<#:DDDA?'H?!:HEA-(/B*F/7")D#"?:>B0C:F<<(8)9*A&@2D%D2.,AH,A=9FB.1="/B;+:,?!-F@>0-37D;B'+7$*6-4++6<1'HF4))/E," AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47T37A67 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9732 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25934 42 57M = 25695 -296 TCANCGTCCACTTGAATCTGNGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCANATTTAGAAATG F&1.$7*:!+8+EGFB&6?3!142D3;D)A<7,G:D>99/H:*0<,@AG44"C<>B8 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:3T16T24T11 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9733 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43260 42 55M = 43344 207 CGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACA '1.>/C0,CE/558,+B'6?@?2.8$6B@5+/2CF(0.;7-/<-C<)98A*=#A6,&!/0;;D,;?1555;%B@/#)4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G10T103 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9734 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19906 42 82M = 20054 267 TGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTGAACNGATGGTGGAAGNGGT BH'.04";!69&-804=D!ED"@3/0$&8864H,%"/>H*++4+)+(5972(94BC+&>;86F8B.2.;+&62?()?2"'6$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66T11A3 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9734 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20054 42 119M = 19906 -267 TGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGNGCCGCCAGCACGTCNGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCNCAGAAG (!#&(*($)+#+($+&(!+'")&+!!*""#$%)**&(*(!%%)$"$)!+#*%!'+"$#%!*%)'$(&+%+#%**)++++))"&')'+(''+*$)*)&*)(*%%"!$+"(!+%!&&&((( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45C8C14C42G6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9735 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14837 42 168M = 14735 -270 ATTTACAACGATTTGGTCGCCGCATCGACCTTCGTGTGAAAACGGGGGCTGAAGCCATCCGGGCACTGGCCACACAGCTCCCGGCGTTTCGTCAGANACTGAGCGACGGCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGT );8//EFDD9-7G=6+$C<.&;"3B(,3&E%80G+$5@=!)5A8H5"#-7AF-E*#G%6A<-6;5C#G0/,('2/?8.1A%08,F(37$*1-32:=%;F=<)-'/&,!A4"BB!A>7#/5@>')6-$##,#0!$((>7829B0'E3G1$<3>B;A.<<-B?F+,( .F-'-"B'B*,3(C))8):A1<(*,5,,=.%@">.BEDC03E<>"G3B>=/6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9736 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29226 42 131M = 29449 290 CGCTTCGATAACTCTGTTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCTCCATAAAACAAAACCCGCCGTAGCGAGTTCAGATAAAATAAATCCCCGCGAGTGCGAGGATT 1B/<>%E&FH3DD>+A>'2)6CH29,=;(/*8E.B=(H?$("H@&97DG'8E2"14!4/%D3$8>D>H&)+D=G50"/C'<-HA<'%!&1;('.)?'4=(H+C@G?;+6>'E7&E"8D++-)8D=HA6:(+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:131 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9736 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29449 42 67M = 29226 -290 ATCAGTCATTTCTCGCAAATTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTNTAAACCTTCATGGAA =9)<''"(?F?>;5$&9(1;*29A(*4G:G,/A838*A'01C4+B;A%;13BB!:&3+F=E!8#$=- AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C33A15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9737 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40133 42 83M = 39962 -254 TATGACTGCGAGAATTAANCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCANGGGNNNNNNNCNTANAGATC !'!%)+"!$'!#))&*+*#'"&(+&*$'*&)%"())'(+'$#+#!"#'!##$%!)'%')"*+%'%&!!!%!%!%"'#%$!')* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:18C43T3C0G0G0T0A0G0A1C1C0T1A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9737 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39962 42 112M = 40133 254 TGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGCACTACTGGCTGGTTACCAACCTGTATCAGAACATG ->,=)C$D$A+B$.:**FA0EHDG;2$66("/B2=+;'A%D62-5&;?6;$:=)*//=G8+)G+(;6+HE(ED7!BB#"=24!-0?<&*A-.+!)?$0,A&B>?D@1E6?;" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:112 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9738 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1567 42 42M = 1863 357 TGGACTTTACTGATGCCCGTTATATCTGCGAAAAGACCGGGA @!/=E<5/;CE;%*3/;BH3?)9B9%E%27$ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9738 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1863 42 61M = 1567 -357 TATTCAGCGCCCGTTCCTGACCGTGTGGCATACCTGACCGCCGGTATCGACTCCCAGCTGG 3?90-?.=:';$33(:%=%F>G54D:B-B7 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:29T31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9739 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10570 42 65M = 10669 252 TGGCGTNGAGTCTGGATACGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCCGGCGTCATTTTTCT (!*"&)'&*($*$+$!'"+!+!)"*&"!#&"#(*'+"(%$&&$$(%##"&+(&+"!$+&#*##%# AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:1T1A0T1T10G32A14 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9739 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10669 42 153M = 10570 -252 TCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGC 00;=!'))B"!!E?434?(H2H<6"'/F*64A65")5HD9#HC9E$@:C23GFBB.0&!E'&&A4:!8FC2#<@,1%*:B.G=&>A3;1$-G<#C@00:AD41)@GE;7)E#3&C"=!;-/-56%$!8%<;C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:153 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9740 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42973 42 131M = 42851 -253 GCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACANAAACTCAAAGNCCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGTCGCATGACGTTCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACACAAG A,)*4EA'.?D3%?!>84>E<)9C2F6+/@$E?.GF+"7=GC9%1,?;#312+0.C'-2:D>),D7!/6,7?&!)"6#)#*<,?D8@%$<;C28>#*!4-@5#+59DH+2(-8;!:-0"G1@19!.95 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:28G10A23C63G3 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9740 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42851 42 122M = 42973 253 CNAAANGNNCAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATNAGCCGCATCGGGCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGT *#'!)#$#!#(+%+!"("+%#(!%+(!)+))&'&$)!%!('))+**('$*'&!#%&($%#*)!"*&#%$'%"#$""++&%#('#&&*)"!+"('&))&&''"+*&&'*!)%!&&)*"$+"'% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1A1C0C0A1C0A39T73 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9741 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31965 42 54M = 31837 -182 CATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGT &H-'-B95=!&EE%<1:<98:G+14><=G,?- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9741 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31837 42 122M = 31965 182 NTCAGCAAGCAGGGTGTGGAAGTAGGACATTTTCATGTCAGGCCACTTCTTTCCGGAGCGGGGTTTTGCTATCACGTTGTGAACTTCTGAAGCGGTGATGACGCCGAGCCGTAATTTGTGCC #-2DC-%.A9%!:F?":3AAAFC134<1)&&3E&%.%:E1=#F&B2,C/#-1&!F8$""BG56!4E1-36D<(%$#@B<11)6HD.9"F7HB=91:&;412>(!%8BB)(+/<8H/'>:0D2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0C121 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9742 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25950 42 64M = 26094 206 TCTGTGGTTCATTACGTCTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGAGTTCCATATTTGA 9"E4##*31C3A1+A076D-;1?F,"0).0&(@'> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:64 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9742 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26094 42 62M = 25950 -206 ATGCTGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCTAGTGATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTC :2:/(;2:ECE76<-!@"G35@5,;$=B1@;(1810?>@'C+(4;E(H((E-/$':3:)%!A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9743 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45016 42 307M = 44928 -395 TTCGTGAAAGCGGGTGGCAGGAGGTCNCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCCTATCGGTNACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTNATTGGGGGTAAGACATGATGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGNATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATNTAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAAT @8=)&)?@B@A8'>&G(&%?&-4H/6F-"D4.3H:5$*1D572''/)>7A36?>)8"#<$8/";;6FH*(@!'=*#1*FC>/A4DC(4+'0*096!$'7&-<=&C'>/)5,#9;-1:*3*>,8G9?F$;9F8GA0B5"/**C7A0?66;.9<#D+4(EF()1,38/=204&D/>D7.F(*!";#)05@>$7/*D.C',5==5G3HB':46@/6>=96BF1G+B8&8H5A%+1'7@4,G>%*72 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:26G31A7C88T18A54C46A30 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9743 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44928 42 88M = 45016 395 AGCAACNGCACAACCCAAACTGAGCCGTAGCCACTGTCTGTCCTGAATNCATTAGTAATAGTTACNCTGCGGCCTTTTACACATGACC )+("&#""$""'"*!%%!%)($%%+&%%#$&"&)$$#*++'(#++%!&$!))(&%*!&%*'%&*)%(%!""%'&$'!#%!!(()(+'& AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6A41T16G22 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9744 77 * 0 0 * * 0 0 GGATCAGTCCGTCACCGACNGCGTGAAGGTAAAAGTGGGCCGTGTTCCTG +$!($!*))+$!*%(%$(%!!!&&%+#'%%+(*$'#)%#'(+&%+%$+(! YT:Z:UP jpayne@0: r9744 141 * 0 0 * * 0 0 NGTGCCACTCTGTTCGCCGTCAAAGGGCGCCCCGTTATCCACGATGGCCTCTTTTTCCGGCACATGCTGCACNGCGGTGATGGCATAC $>"<5E*('?G?2G,,C9+#A=GB<$9.(1!&B!*B$97#*DD?:@2+F>4?E8((-"&*;@0&D9765'@'36-)G;)5D#E'%.8@ YT:Z:UP jpayne@0: r9745 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34969 42 76M1D33M = 35230 393 GGNCTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAATATTGAGATAAAGCCAAGGCCANTATCTAAGTAACTAGATAAAGGAATCGATTTTCCCTTAATTTTCTGGCGTCC %!"(;C9H>@4>+16?,2:-:?:$?%1/0<&'$0/!(F#<>43)6E'<95=:7(8'9+&39F1B=."0?/876G>",!9D#66;0E1B(C0+?6A#-7<*FE>!A'<*7>1;EA@>49?-)=,+=D"A9AB<);EHBG>E7/D.6E<5(,%3@#")D?9(,E+/1F'F,#&=-*-C@D%#*!F,>.B"G$FH>H;%!-"44BB AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:34C5T10C4C20C54 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9746 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18570 42 66M = 18766 296 CACCGTGACCGATGACCATCCTTNTGATGGCCAGATAGTGGTGCTTCCGCTGACGTTTCGCGGAAG +'!*+"#"#$!%!)#$#+$%+$%$!!%%#&'**+!)#%%)*+)!(("$"'!+!)%*'$!(&%"'!) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T4C37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9746 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18766 42 100M = 18570 -296 GCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACACGGCATTCGGCAGATATTCCGCCGTANACGTTTGCCAGCGATGTGCAGGTTATGG !@GB+(0D0?776=B6#A1F39.>DA8C>>F"EB,6F-%,?#1@(855;&DCBA.G@3(.)+6&FAG9$%*4&1%<*935G/$34=0D=F#E3-9E99'EF5H";8-14FBD AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:88G5 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9749 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42534 42 75M = 42609 333 AAGATAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAAGCGGAAAAAGCAGCAGAGAAGAAACNACGACGAGAG 55"?)>,/36>?H5/!CB1C?C(B$1C4:0:D79"."4352F<"<#)@FG?(G*?F=-46-$*30&D&2??%*== AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64G10 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9749 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42609 42 258M = 42534 -333 GAGCAGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAACTCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACTGGATTAAACAAGCCCAACAAGCCGTAAACGCCTTCTTCAGAGAAAGAGACCGCGACTTACCATGTATCTCGTGCGGAACGCTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGGACATTACCGGACAACTGCTGCGGCACCTCAACTCCGATTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGC 1F>*-)25-#(,G(;9;>!F1)=?GC&6EF(B8H0@3((AF6(:,93.B;9E-DG&?43'6'GG@238D!8;=>/:(H*CA!F*F62+%@:#51;9&>&*!"G515>C*C'F27#B'/B56((&A2%F"0G2-BH!'H>52!*6FFA/7B)(6H$%8!&D&$':-9(;$0)"A8F3!&+;@393",C4!9G:5D(>$D/3E:0=7/%#=288)):?HH0?G'%1;:%D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:96A161 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9750 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33682 42 285M = 33611 -356 ATGCATTTAAGTCGCTTGAAATTGCTATAAGCAGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGNTTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGNCATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAAT ?F5@0G$&'9B%?>".BC%E:E5%7$'(3DA#C6/8?4@6DCC41+A5FH*!4@;.,ED3"-C$26*G50?D"00#FH3"-;GBF$%)!G?,>(->0H!34)4'F$<"#894-1H@G-$@4%74.$/:,;2-==F7<#F+8@904!77+9/@&DG>%>D.26,8C-9$F+C,FH$D@'!A:>1/2$>","'AD6<"*E3;)?3'#HD44&D",>6-*)%6:D8<-(67&94<+FD)?62+4(/ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:161A57A65 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9750 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33611 42 71M = 33682 356 NCTACCATCCATTGGAGGCCATCCTTCCTGACCATTTCCATCATTCCAGTCGAACTCACACACAACACCAT &7D70A<;B(+<9&1&:E+6/E)F?$):C.&(@321%###6@6G9#+"/F>E,A5+H(1@3*;5B>BA&>, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G70 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9751 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39441 40 54M1I26M = 39650 268 CGGTAACGTGCTGAGNCCGGCCAAACTCCNCGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCG @6(96'$3C#&/F<%8F>:6?3CG!=9AC$?%-D?B0;5+G'9GFF%.3<>409=*+24@8@H"1"$5DCG=)(!)5,,G2 AS:i:-21 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:15C13G14A6A0A27 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9751 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39650 40 59M = 39441 -268 GCCGGAACAGTACGACGAAAAGCCGCAGGTACAGCAGGTAGNGCAGATCATCAACGGTG 9<7H+AB(&(EF68CE87G)CF/.(>6)!)H!3'8H/>=">>$7-3:'-;$;$*540G8 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C17 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9752 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15612 42 61M = 15359 -314 AGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAG C$.7*'@?6G2+)2A+$'&8*?C68"C)3@<>4G%FG4)"C9@BEG#2+@3=G2)+D9EB# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:61 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9752 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15359 42 87M = 15612 314 TNCGCNTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGAT *!*')!(*&+"*%$$##)"!+$)()+++'&+"!#"(%*#+$&((*))$#!&)*)%))*%)"'+(%'#)&("+$+%*'+$)'++&"*& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1G3G81 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9753 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29689 42 39M3D414M = 30145 522 TAAACGGTATCAGCAATGTTTATGTAAAGAAACAGTAAGATACTCAACCCGATGTTTGAGTACGGTCATCATCTGACACTACAGACTCTGGCATCGCTGTGAAGACGACGCGAAATTCAGCATTTTCACAAGCGTTATCTTTTACAAAACCGATCTCACTCTCCTTTGATGCGAATGCCAGCGTCAGACATCATATGCACATACTCACCTGCATCCTGAACCCATTGACCTCCAACCCCGTAATAGCGATGCGTAATGATGNCGATAGTTACTAACGGGTCTTGTTCGATTAACTGCCNCAGAAACTCTTCCAGGTCACCAGTGCAGTGCTTGATAACAGGAGTCTTCCCAGGATGGCGAACAACAAGAAACTGGTTTCCGTCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCNGAGATAACACCTTCGTAATAC 43E>"?B-E+!'!.*<@,-;78+1A=!8'*A2#/<-1*?2!$5;;E+!%'0>*$#49%#0<*H=#EC/AFG-+7#+82';++'8/B"F6&GG6*!F/G*H+H8,<-(C>88B7:;:(HG/C5EAG<>94>H?8#B&H1?A=<,@?C?!)?B>1?90E!B&*8F2#H;3,/1G39,7AD=49.+(("E:,8&)2A,6>#>0B<+5E"%04,)6>(AC=/6.C8@(D8&A/?A>H6(CGC+)7$"6:3.!A$4B41&.%*B@"%(,4"!812)B'-1%EF2-4C176D"=H&9=::!&H7C#(2C4.;=>49.3877=<)38@-6G6C.24;04:A=!.9+AF1;4EH"G%?,1,*'#+,&1@ AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:7 MD:Z:39^ATA160G61T36G132C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9753 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30145 42 66M = 29689 -522 TCACGCTGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGC B74')+E?&5$D*:2'F*:6-!;D4(GH$"<88"510.A22%=&6(H1.9+*#%<8AE4$6&@9%B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:66 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9754 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5715 42 154M = 5535 -334 ATTTGCTGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCTCNTACCGCAACCGCGCCCGGCGGGTTGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGNA 1*292;B#0..798C::"E5.+D@678/-/,:9BAE47E,()-/?,9A.1,&-=)E6E@:<7C9+2-G<%08&029G&9H%/ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:85G4A21A39G1 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9754 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5535 42 180M = 5715 334 GCGAAGAACAGGCACGCGNGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCGGGCATCTGATGCCGTTAAAG D#A8207GE.%B>;&>9A5/.6;)>*5#-!@@0*:=;%:E')2.B%7@B.DA4836="(AH86":F@>!D(G<1#@C>85(5>+A/3%@!6#C,"(@;9B1//89H@3.*H0H#67'1H!89E&H%;C<>73&&>G,481=C%%,$.<-?))/->A6$AC(E6*)4"61"F<9A1"D4). AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T140C18C1 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9755 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17871 42 126M = 17997 373 CCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGCGGAAGGTTACCTGGATTTTTTCAAAGGCAAGATAACCGAATCCCANCTCGGCAAGGAGCT H=BDD/38482@5G4:=A,A(C$4H'#(B2G%3-=$-&H28-H?'-3:.G:E>A/;8%5A/H-!A#H=,G;46">A:!(&?&=F00F2,D*+<(,>@GD> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:111T14 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9755 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17997 42 247M = 17871 -373 GCTGGAAAAAGTCGAGCTGACGGAGGATAACGCCAGCAGACTGGAGGAGTTTTCGAAAGAGTGGAANGATGCCAGTGATAAGTGGAATGCCATGTGGGCTGTCAAAATTGAGCAGACCAAAGACGGCAAACATTATGTCGCGGGTATTGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGNCCCGGCAAACGGGAATGAAACG (-"!/4'*7)<(+)BH7C5(4"=+%:10#.)F<-<=AG9.:A,:0->!6/.?<'%++?4DE7EA13/B-'B171=:($G-9(!G3,4-")&3DA0D'6;)#/G=DA)A(&BC>:,9;!>3G7B.%*:E!4!B$&'G'5/6;$)$4+:>9C>#*G299";3+,(>B99HCF5@B;-5:2+D88C4?0?&,9?A)8.CCG:D?0@#G?7B@=)!?87>0H=B=1-.?-=D6)0//D7F.GH.);).1)F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:66G157A22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9756 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30875 42 85M = 31038 299 AGAATTAGCCTGACGGGCAATGCTGCGAAGGGCGTTTTCCTGCTGAGGTGTCATTGAACAAGTCCCATGTCGGCAAGCATAAGCA 61=H"39;4.&&#,C$21D70('E$7D:7<8#8;%<(#>#+3E8C#($-.<&2=+0B5/3>2AE0(%C.=><.(-"<049(58"6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:85 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9756 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31038 42 136M = 30875 -299 CGCCACAATCATTTCCAGCTTTTGTGAAAGGGATGCGGCTAACGTATGAAATTCTTCGTCTGTTTCTACTGGTATTGGCACAAACCTGATTCCAATTTCAGCAAGGCTATGTGCCATCTCGANACTCGTTNTTAAC <:70,H9E@B?7F):G-0$4G<=G!,E1E-;&C9%/)7,.(#!B.4?>,);3HC(91>E4?@;(H!>/4,<2EE8+=B&E#DC+%=,7CE+A%&!'3!#/7$$7"AH%/ED7-A7,3:24"6;AFA AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12T13A73 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9758 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40951 42 139M = 40851 -239 GGATGCGTGTAGGCGAATTTGCGGAGCTATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACGAAGCGAGACTGGCTCTGGAGTGGAAAGCGAGATGGGGAGACAGGGCTGCATGATAAAT ;1AAB8'G2)E6E((8;?&BC.-3+FH7C,<9E<.*&417G/.@)/*D51"#3(8&H&03G+1498$:-F:?!'?2GG>,*)&C<89?::%8GD)$+'+7(AEE<8:-33()!A1+@5<(0==;= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:139 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9759 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41953 42 9M4I275M = 41834 -403 ATGCGATGTTATCTATCGGTGCGGTGAATGCAAAGAAGATAACCGCTTCCGACCAAATCAACCTTANTGGAATCGATGGTGTCTCCGGTGTGAAAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAGGAAAAGGAGGACGTGTGGCGAGACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCTGCGAAAACTGCAAATACCTTCCAACGAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATC *BF@G>DC@?;AH51-E?",C3H$4<)B.3D/%4'+'6#1(*%13@*;D+)G/*(=,3)=<@E$/(>7,@#804/"F/G5F(4/()67@D.;#(>/-8'B#)!=B7.=31,7AB,C*'"C0%9H*#.D"C$>B:&%*$#)2%+79##E>)B=5,C8:>?5E3B=4CB+H3E!>%C@6-E"'$!4/E)56$6)+#9$::7@0*#&==DA'D35&/5-5*F"A3?>6>@-&:60!*1!;*->1>E83- AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:62C221 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9759 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41834 42 119M = 41953 403 TATCAAGCCCTGTATCAGGACATGGTACGAGCTAAAAGATTCGATACCGGCTCTTGTTCTGAGTCATGCGAAATATTTGGAGGGCAGCTTGATTTCGACTTCGGGAGGGAAGCTGCATG (-*H7!&G'!CB!:,2CE%H(H%1%A>*8<,4?277?')!(1"&715()*$G&74.)0/+>GBC$,@4,(!@A8+@F.0.:FE AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:119 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9760 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47669 42 190M = 47219 -640 TCTTCATACAGAAAGATTTGAAGTAATATTTTAACNGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGATAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATNGCACCATTTCTATGAGTTACCATGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGG D))9G*@"A!)%6H!>.:.:(6#%#.1&="HE)B0D+B9DG7)HDE-:=6$?7$@CC<:''=,6B8C?,D=33&>(6/,::"/#,,$)-E(FB8+/?!/7;3#'7&E4F&74:%+<;#<'=0'D@&H));,*.*'73"#0G0D93&E4C81/AD=?'7*/6@/9#F':+F-!#HD6A/*@33)H0>E*582%A AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G42G32 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9761 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7746 42 182M = 7670 -258 CCCTGAAAATATCAGCTATGCCGGACAGGGCGTGCGCGTTGAAGGCTCCAGCCCGTCCCTGTTTGTCCGGACTGATGAGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATTTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCCGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTG E5A)$!?5<-#D14%>>'*$+-7G'#7A+#/1A&60/)0+,-#:A5.8494=3C'+=;3#G!'#:+8C9:$C0F'G3B,A(@GE?.,-4%@%&'@*/1G6-!70-1*++"ECB09'0;9-8F+5)A9&:H-#5&D(%57E&?4&=H4!!)3+809F/@=H.".:?==)'!B3C5)(4@5&:* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:151G30 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9762 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15726 42 74M = 15726 0 GCAGACTCCGCCGGAGGGANTTGAATCCTCCGGCTCCGAGACGGTGCTGGGTACGGAAGTGNAATATGACACGC .6H80BDE(?)G"=/F&(6&5D.'37541$EA#FH00.07!C=!!="EC>H#82B',%E.4.@:'G%"!"D;1C AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19T41A12 YT:Z:UP jpayne@0: r9762 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15726 0 * = 15726 0 CATGCCTGTTGTTTACATAGTAATAATTCCTTACGTTATCGTAAGCATTTGCTATCTCCTTTTCCGCCACTACATTCCTGGTGTTTCTTTTTCAGCTCATAGAGATGGTCTTGGGGCGACATTGTCATCATATGCAGGAACCATGATTGCAATCCTGATTGCTGCCTTGACGTTTCCTGTCACCCTTAGAGGTGGTTTCCACCAGTGCCTGTACACCGAAGGTAAAGCGCAGACGGTCGATGGTTGCAGACGTAATGGTGCGGGTGATCG 38-*$(DG5E!C7799,=G(F36-FH44AB;4A6#)04G<)!E3)9(A!;0('G@H.(<)'>0=G,;"C1(/@*@'4H:9"712B#:);?F!G#028&G.H"8:<#F(@+%?2/88=7/>6E"B(&6(*$G%@-G"02%E//9H)#%6@?H>BB1@/0>@7"3&'#6B);54;03%@.>@>>G(%-8/@,&-G0>,267$E93 YT:Z:UP jpayne@0: r9763 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23319 42 151M = 23191 -279 AGAGTCGAATGATGTTGGCGAAATCACATCGTCACCCATTGGAATGTTTATTTGTATGCCAAGAGAGTTACAGCAGTTATACATTCTGCCATAGATTATAGCTAAGGCATGTAATAATTCGTAATCTTTTAGCGTATTAGCGACCCATCGT B4;E-2A*+$9G6(,E>+)?FF/*$G-27:::F8+53;,+.>3F8D:5&A&%1!B&A*%@,."9-BA"6'5,/C+%@'3185;?4@%A)0<1 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43T107 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9763 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23191 42 128M = 23319 279 AGTTTTAGACGCTCTTTAATATCTTCAGGANTTATTTTATTGTCATATTGTATCATGCTAAATGACAATTTGCTTATGGAGTAATCTTTTAATTTTAAATAAGTTATTCTCCTGGCTTCATCAAATAA F?"&?.062/03%@@26&<";+@(?&A"H5BG$<'2$H1$.4$+3D<+'5A-1@.#5(0@-282@24)21F$+.:+(H*D2DFC82'/<=A2,*<=<.'=1C3!C? AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9764 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9629 42 112M = 9049 -692 CATTCCGGTTGTATCCGGTAATNGTGANTTTGCTGNGGTTGCAGAAATTACCGTCACCGCCAGTTAATCCGGAGAGTCAGCGATGTTCCTGAAAACCGAATCATTTGAACAT =/%9:;9"-(G6C-$0@?;4.9D2854B'H1)EAFE$04?).H(@%($>4H*+=H+5,$E?,(,:/>E*H AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22G4G7C76 YS:i:-41 YT:Z:CP jpayne@0: r9764 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9049 42 336M5D239M = 9629 692 CAGACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAAGTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGNTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGNAGGGGCGGAAATCTGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGNGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGATGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAANGNAGTNATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGNGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCGTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGGCAGAGCACCACGCTGACCGTGGCCTTCCAGCCGGAGGGCGTAACCGACAAGAGCTTTCGTGCGGTGTCTGCGGATAAAACAAAAGCCACCGTGTCGCTCAGTGGTATGACCATCACCGTGAACGGCGTTGCTGCAGGCAAGGTCAA A49=0.C>%7HC"B>8!BF*949)H&9E*+2<'?#8EHA07;AHB8'&(92+"6*D$71'-/>A*#*@,96?&>C($!3%'A$3&%76C8D<)9>==#E.6H=*8!3H(&H6/A>&C<#=D1'F3,>,,-C3;/+-.;/#0*!C<(:98H+87B+9"%B/7='49><)-/&?GBC&;C95<6E1!E7#/DE?H(:'"1+D-45'6@;;3#>5#*651F;-)+*#D@;E+B0-G!6!;@A>?;A9#3@3'H3$5)D#9)'BC3H:$2?5+7:ABA5./D-2#6D9G,B494/)*4D.8.%55=F6#0#7,?)11)2$H48D;?+:A>BA,"42!)G0#H72;">!15)9(;H3$=*6,/(2D'A*76H@>.HD-H$&'!/@$$9A:<.D.'EH&!0E@9!@HDB!/5F.:=G!210(+8*10';8#3-&EE6+-6, AS:i:-41 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:16 MD:Z:60C58C6A34T32C112G1A3G22^CCAAT3G63C121G49 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9765 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35932 42 91M = 35702 -321 TTATGCTGGAAAGAAGCAATAACCCGCAGAAAAACAAAGCTCCAAGCTCAACAAAACTAAGGGCATAGACANNAANNATNCATGTCATATC #%%$+#)'""!##%*#'!'")"%()!&$+!'+)%!(*$!+(%+(+%"(!(+""+++*#)#"('+""+$!+&#)('$!'%!"*)*'$)'&*! AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:71A0T2C0T1C0C0G9A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9765 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35702 42 76M = 35932 321 GTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGAGTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTG E#9/;3*">'!<.'D$32%"?;@H/B.<5-H%?5/1<7>4;-,*1@D:,)'(+C<#-/9!!=2&6>%0>D1,AD?> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:76 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9766 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38615 42 43M = 38758 281 GCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTGAGGTC //)$.-#-H(8%,A"@-)?2,8H9F6B>$&0+09%%'+G1=A* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9766 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38758 42 138M = 38615 -281 CTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATNCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTGCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGGAATAAACNAATGGACAGAATC (D70&&?/AG.F7E&9$H+7@F/73.4*)0E;5757E)=2"<2#<@C"+3:2!1)4E($121385?)3;(C&8E8<8+:8,1C>:-5?&F),4FHE:G>90-,BA:2!#.=0>2/53>#+"&A/*+.4)017&'!$!B AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T75C13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9767 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9311 40 74M5D29M = 9129 -290 GTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACNGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGNAAGTCAGTGGGNCGTCCGTCGATGGCAGAAGATCG B8F.,-B)&9B/4'.?;3-*%>*C%$04:(7HG9=)B@)+?"?E.)D8'#7!5=)'B033A+3':.46@@+0G!G5570-F@?3@5?.1?"8A5G:4-)0=&!)6E5>G4.!1%!#@A*$"A@(%8%HGG;'C*@4AED%<,-*'@B:256?=DGE+5B4@H)$"!E"(3 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0T16T28A5C28T37 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9768 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20361 42 141M = 20272 -230 GATGCGGTGGCCTCAAAAGAGGCAGCAAAATCATCAGAAACGNACGCATCATCAAGTGCCGGTCGTGCAGCTTCCTCGGCAACGGCTGCAGAAAATTCTGCCAGGGCGGCAAAAACGTCCGAGACGAATGCCAGGTCATCT $19',BF4H694)$:D+'")+F&!)8EA$@H46D3=H?F+.,58F#$1@%0BA;"".D%9?;7:$--869*4)7*+*75G>H9H7+*<6/8)'(!>=%5C=-#FB5H(C#6@%51F1G&D/,B+72&"5<;%&99=!?$E2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A43G54 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9768 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20272 42 56M = 20361 230 AAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCC 9?;::#(=!'4;"'359E$EE:4'A(A?B.=99.3!*+$#/G9=8#H/!8#<0C2" AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:56 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9769 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 831 42 124M = 999 291 CCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTT %(0+@=EE.%H=&?8#@#5%*(*29G.&"5%36??5D##+12"H!B/3DCFG)'?C(B4CB2!11.&5$3B:.8E=.6)#CF(2=7(B-4.*.-?./'+(7<=&2=E!E&/"F8;+;) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:124 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9769 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 999 42 123M = 831 -291 AAGCAGCGCAACACCCTTATCTGGTTGCCGACGGATGGTGATGCCGAGAACTTTATGAAAACCCACGTTGAGCCGACTATCCGTGATATTCCGTCGCTGCTGGCGCTGGCCCCGTGGTATGGC +.@2/7;="!1.'"#+*795$D4+5/4E>/EEHE>.*+++7B'DB41,D$>7<-"?,B?(,H)'F6E.CC7CE-HA4-1'>H6);@86H4?6C0C+7E./&<$/D/B7-&&0*%+#F1")'79 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T42 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9770 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46538 42 105M = 46747 268 GTNTGCTGGNTNTCTGTTTTAACAACATTTTCTGCNCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCTGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTG ()!)*"*("%*"((*+"")"#&"#!*&"'!$'+*)+&(%$%()+$&!)")%)+)"')()#$*%)*$**)&&'++!&#+!+*&#'*$(%+$!"$#&(+&(+$!(+& AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2T6G1T23G69 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9770 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46747 42 59M = 46538 -268 TTTCATGGTGTTATTCCCNATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATT ;BA4E$1&#"*C:0C*:#:$,=&.,66<7&6!"/GH">-FF;<#?DB/D4-EHHF?'G=:)931*,8)9'58;$?EA6BBC/6:!"1='+@?@G.8'$0: AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23G41C50T57 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9771 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25652 42 113M = 25765 287 ACTNTNCACATNCAGGGTTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTGGGGAATGAGTTGCAATTATTGCTACACNATTGCGTGCATCGAGTAAGTCGCTTAATGTTCGTAAAAAAGC *)&##!)(*'*%$+')!'#*&'$%*#)))"%+*)#%%&"$(*%%*#"%!)#$)'"*)*"&'%')$&'%*+$)#%$"$$'$$#*+(#++!%!('"*%*+&%!$)&(''%#*%#& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:3T1C5G4A53C42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9772 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9051 42 123M = 8891 -283 GACGTTGACTGGTCGCGTCTGGCAAAANTTAAAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGG "!)6<%78#B'3C+5HFH06&-=?+FA>;/$8A=@471+%F.!078)GF4-=;>>EF6@38+&E4??-<=H+/@/.D=/""C9$E.'=2-@(A+"*(4%=%40E2H6-:B2'7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G95 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9772 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8891 42 135M1D24M = 9051 283 NATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTACCTATGAAATGTGAGGACGCTATGCCTGTACCAAATCCTACAATGCCGGTGAAAGGTGCCGGGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAATCCGCTTTCA !>FCC6!D.6'"+?(ECD74>!;)BB0;2D5,&!$"+%%31?D!BA3*?&D+1-)=$?BE7D7"=:HFC=3@?G:1C"F@&.=D,@)A$A$(*>H:@*4CF/@"A"9(A0*<"42* AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:0G134^T24 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9773 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17206 42 94M = 17355 242 CAGCGANTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACTTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCG 05'H.<5#5<:2#/1'1D8,G(%9$H25"=#:FA:,7=*861"*9+3.(':/E%F/)*.>21:!!,@1;,1&*&*%8:#3F5$%!,1"D&1!6) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6C40G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9773 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17355 42 93M = 17206 -242 GCCGNCAGCGNTGCAACACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTGGTNAA ";/=@$?A-=CG*8-'7"C#H>+:>0=-2?E>2BFH=B+@E=7>+&/A#"-5()):>*993H48D&!06B2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:4C5G4G74G2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9774 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2791 42 126M = 2917 483 GACCGGCATGACACAGCGACGCAGGGGACCTGCAGGATTTTATGTATGAAAACGCCCACCATTCCCACCCTTCTGGGGCCGGACGGCATGACATCGCTGCGCGAATATGCCGGTTATCACGGCGGT &6$3<2->.;/%3-<"10*.A"0+79&A!E7:(0*?40$7%4@4@.)4;@:)%EGE4*#H$H);;=A>&6B*1F12CBE89!0-.+.9'4C4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:126 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9774 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2917 42 357M = 2791 -483 GGCAGCGGATTTGGAGGGCAGTTGCGGTCGTGGAACCCACCGAGTGAAAGTGTGGATGCAGCCCTGTTGCCCAACTTTACCCGTGGCAATGCCCGCGCAGACGATCTGGTACGCAATAACGGCTATGCCGCCAACTCCATCCAGCTGCATCAGGATCATATCGTCGGGTCTTTTTTCCGGCTCAGTCATAGCCCAAGCTGGNGCTATCTGGGCATCGGGGAGNAAGAAGCCCGTGCCTTTTCCCGCGAGGTTGAAGCGGCATGGAAAGTGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCC 5>D:;<#/9)$2<:@74(*8=34*G0=5)C8D>@3F4F0(;3&:0<,@880:"&6<=5+=;@2-=E5BG+4!EBC+3!6@DF7E'@/724";!>9"9B%"F?+4E=0+1"?--&AA1/EE%E=9H9E9%G(H$,$1#$2@7+H%C9*81=#'82'B+F+)!22;$B"6E>;6FE:)B79:4$@((C075*75?!CB':D8(2<=3+=FE*"H;:DB%.5=3?(0G)=67G/B!C)92*&65H%"@:==>9'>FCF-;1#>-3-57+/.+4;&&;!@>%(82;,8$-$@3:G*D'0)=G5-:$<2)*G<,H*.$,*F66;4C/+>0$D'&E*$F?.%5"./,D+ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:135G53C11C20G45A88 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9775 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37670 42 98M = 37455 -313 CTTCATACATCTCGTAGATTTCTCTGGCGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCAATGCGGCGTTATAAGCATTT ,,%)4C$&%/G&=9E;@C1).G-1-4D:5%1#0:DD>6*(1H78C55D=+EH#:+"9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:98 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9775 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37455 42 29M1D18M = 37670 313 AGGAAAGCTTGGCTTGGAGCNTGTTGGTGGGTCATGGAATTACCTTC %5"747:$;6E3;5*E>-7HC3-3:BD/0CD=="D=G0>5#G+,CF% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:20C8^C18 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9776 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3708 42 77M2I136M = 3622 -299 GATGGATTTTATTCTGGGCGCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACCGGCTGGATTGGTGAAATTGCCGCGTCAATTACGCCGCAGCGCCGGTCCGGCTGGGAGGCGCAAAAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATAT 1)ED83"G'-19E#,<8C8%E4A#30%-<&:(%">:7F775D#=(G2//3'2B#DGD>%:CC471?&?DC&750&1;@.)G"@;#31H@*!B;F""BH5'A"0%0"@+D19&";-H/7*6*;@A5&!%G((%*E$*H2+.7F!13;G"2#34#8:+$5!?=3**D!3;&1& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34T3G29G17 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9777 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42750 42 50M = 42997 293 GTCACGTCTGCTCAGTGGGATGCCGNACATTACCGGACAACTGCTGCGGC .2($')%F*-?4;"/G!&)9#D-E2@')',HHH&96!D!<*!G&/3(7E# AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0C24G24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9777 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42997 42 46M = 42750 -293 AACAGAAACTCAAAGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATG )E+2!&G<&=7$=6$C2.D-;@7(65+;,9+.'A.+)<5(605+B> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9778 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7823 42 226M = 8049 312 CGGTGCGGCAGCTGCGGCGTGGAGACACGCTGACCATCGGTGAGGAAAATNTCTGGGTAGATCGGGTTTCGCGGAATGATGGCGGAAGTTGTCATCTCTGGCTTGGACGGGGCGTACCGCCTGCCGNTAACCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAANAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGTGCCTGGTGNC !51)6''4C)$(0;+'+,')32!(;0>:36,&.*2<3A;/9?/5D=32<(#H###65@G0B2H49C32//6/%@9+'(D==A0<697*6%%B@=733$5",?.">-:/?E<1@72EF9H"6GA!/:H/>42%-G3A87F4)@/<,:.$9:!:4(?C'0*;":C%D*$4F)'"$&2,,<,%H7+#1,#7*.4HB%C:#!D!DC6-8460.6E"?(*=:>G23+H?#3 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A49T21C1G51T37A59C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9778 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8049 42 86M = 7823 -312 GCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGNTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCGGAA ?%:C:8+*$7&D?87B"49F4D32,!C-9:;%?8*7-,64-2>DC9A!C)3/E-,58/?C2+9@++C@:99G">,#A;7G>5?77( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57G28 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9779 77 * 0 0 * * 0 0 NNGCNCTTAGATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAA *"&'"$#%!'$"$""&++&'"!%*)"#+#*&""!+'#&)%($$)') YT:Z:UP jpayne@0: r9779 141 * 0 0 * * 0 0 AGCAACCAGATAAGGGTGTTGCGCTGCTTATGCTCTATAAAGTAGGCATANACACCCAGCAGCATTTTGGAATAA $B%47--6(9E2'(B:*41."$@>=E6<.4#*990/>*2D>4*%?)21.0))5':=A&,#''?!/"8<:/9F1D> YT:Z:UP jpayne@0: r9780 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43656 42 140M = 43527 -269 GACGAATACGAGTTTGGAAAGCCAGTTGATCATCAGCAGGTAATCTGGAACCGCGAACGAATCAGCAACTCACAAAACGGGATCGTGAAAGAAATCAAAGGCGCGGACACGTTCATNTTTGGNCATACGCCAGCAGTGAA !352'0,G6=>-$&)00!6C!:'G=@B3#7A8>B*G?*?<=/C!*6>330'6/#@/%-8;&9>5*9*32#E*1.483@5F3DA,#G(A)=G98C9763C!;HE<1!.?E1,%)<* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:116C5T17 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9780 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43527 42 127M = 43656 269 TTNTATCTCGATTACGACAAAGAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCAGATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAAAGATAAAAAATATGTTATCTGCCACGCCGATTATCCCT ($!"'8&5D@6H,25&%"%5A04,+;F8A!:&9H:>79B>B1,));$. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T0A123 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9781 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22058 42 115M = 21816 -357 ACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACNGATATTGCACCGCCAGATATTCCGGCTGGCTTTGTNGCTGTTTTCAACAGNGATGAGGCATCGTGGCATCT ./=/6%2:5G=-0"G6"D/H,4;4;'!%2&5D)*6F"8#,E,,=>704H78/5*$%2,<#"/D-?1<8?9-@/%*H';!3+3FB,&#H#H.H&(02,%C0H1=HD=5-<*#H=%D AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43C35G14T20 YS:i:-22 YT:Z:CP jpayne@0: r9781 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21816 42 232M = 22058 357 TNNNNGTTNGTNCGCGCGAGAATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTACACCCGGACACACNATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGANTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGNCCGGAACTAATGAATTTATT "$#"*!$*$*)"()&"*"$'((&'+#'#"*+!!&%*+'$$'!'*&"()(++"*)$"+!)'((""#+"&%#*+*%'#'"*+#(&"+!*'!(")&&+$%%(#%*$&((')&'')#)"'))"!%'$*'##&(((+''!((*!**"&(!#!(&!%%"*+'*#$$)(!"(*$&+#'#%+*)+")('&%$#'($!$"#%+'(*&!$($#)'!('&&++)+#$+("!)%)&&(+%'$#+ AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:15 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:15 MD:Z:1T0G0G0T0A2G2G3A1C2C44T3A9C93G37G20 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9782 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37819 42 72M = 37697 -194 ATCTTGTCTGCGACAGATTCCTGGGATAAGCCAAGTTCATTTTTCTTTTTTTCATAAATTGCTTTAAGGCNA *%%+#%##('%$&'#+%!+#+"'#*%)!*")(!(("(%()&'(#'&!#)++'$*$(%!*(&#)$+&%"'%'$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70G1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9782 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 37697 42 51M = 37819 194 CGATTGAAGGGCTAAATTCTTCAACGCTAACTTTGAGAATTTTTGCAAGCA BG)-7H)5/,A);&"%4>(6''1<77%+=.5-31F!B4)76.$16,@3H;! AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:51 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9783 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7929 42 216M = 8145 274 ANGGGGCNTNCNGCCTGCCGTTAANCGTCGCCGCTGAAAGGGGGATGTATGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGGCCGTTGAAAACCTCAGCCGTATCAGCAAAACGGCGGNGCCTGGTGCCGCCGCAATGGCCATTAACCGCGTTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACNGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGNCGGAAACTGGTAAAG %%""&$(%"&($$)+&+#%$+&'&$&*$$"'#'#&()%!)&+("&)#'!&%*%+)!%'#*!#'%%&%%%()"$(%'*$"'!+"'!$$#%)"&%#+(&&$#)+'+++)("+$%"()(!*!'(!''%$!%%$&&)#%%&"'#)(')&#+()$(%%*)(''!#*$%%(%!%(($#+$""$(+!'!'"$*&$!&"%"(")+)%*$&("$%$&*#*#"&+( AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:1C5G1A1C12C84T65A24C15 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9783 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8145 42 58M = 7929 -274 GAAAGGGCCAGGCTGAAAAGGGCCACGGTCAAAAATCCGCAGGCCAGAATCAAAGTNG EH4F5F&1=)5H4'1-$2(6"92,>H2+,40B,).!EH/F5D9?",BG2*(32$/,#! AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:56T0A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9784 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21787 42 328M = 22115 447 TNTGAGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATGTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCAAAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTTAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCTGCAAACAGTACCGATATTGCACCGC !"2$BDF7,1@DA3*-:D:=+BDB%EA5F%6"A44!C<+@20F#*;BEE;.?4G(%-B1CE>%,788-3>=F'.-CFD(?51+AD""*5::G&5;=7--6'=)9@>@.51-=','63#F+837G#6A296*F5?<+"2;#0FDBEF%#!>-;F->7!3(7F9"(>E5>A8,5:=HA19B/!',8%>&'0$@(A/FAGBG"$B*))$F3"'CACA5.0@8(1"9D8"BE87+"G@,.?)!:CE2(E%%-%E5$?:1>04A8$>F2?9H,@.++*4)?B4C*&<)8:;CA#/5B&94;7HB:,"(70.?GH9*?FC8/E,>&%6;!%B3" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0C0G159T58T43G63 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9784 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22115 42 119M = 21787 -447 CAGATATTCCGGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGGCATCGTGGCATCTCGTTGAAGACCATCGGGGTAAAACCGTCTATGACGTGGCTGCCGGCGACGCGTTATTNGGT %$$+*+*!!#+((!+!#%++%%")$"$)*)#*'%*!"!+!')$%#"+(!"#*%%"!#'&)(+*$""+*&$'**")+#++)!)&%%'%&'$'%*!(+$%))'%'#!"&%&)")'+('$(% AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:98T16T0A0T1 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9785 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15151 42 46M = 15329 291 GGGGCAGCCATTGGGGCCGGTGGTATGACCGGCATCCTGTTTTCTC 6=!AC;F1G>H5=$7'C'-*84,3":1H1-C$CG(A$+*',"(1#=B#*H+.>!D/('=&F>24"#B;#E,B7G;B")E-3<850";2H/@:?F49%5>!C4C',134B=EA AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:79A5C27 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9786 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12617 40 63M = 12790 249 GCTTAAGCAGGCAATGGTGGGGATTGTCGGGAGTATCGGCAGCGCCATTGGCGGGGCTGTTGG .2,=!?B#!+>%*$;H/=0-)F2/83H(;!=?"A.$(8>3 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9786 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1|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i:-29 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:13 MD:Z:90C23^GTAA39C111C10A11G73C49G46T36C5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9787 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39887 42 107M = 39994 613 ACCCGGGCAGTTTGTTGCATGGTGNCGGGAAGAAGCATCCGTTACCGCCGGACTNCCAAACGTCAGCGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAG ;3F49.:.H$EG'15D3G?(2AH9#%!F84=:E('?,%C3:9(BBED2$H3B-*%'F->BC(%<(*54106#=01!><(3)163 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C29G52 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9788 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3159 42 264M = 3159 0 CCGCGAGGTTGAAGNGGCATGGAAAGAGTTTGCCGAGGATGACTGCTGCTGCATTGACGTTGAGCGAAAACGCACGTTTACCATGATGATTCGGGAAGGTGTGGCCATGCACGCCTTTAACGGTGAACTGTTCGTTCAGGCCACCTGGGATACCAGTTCGTCGCGGCTTTTCCGGACACAGTTCCGGATGGTGAGCCCGAAGCGCATCAGAAACCCGAACAATACCGGCGACAGCCGGAACTGCCGTGCCGGTGTGCAGATTAA :+1'52%5=3%?9,D2C@2)B'6/E%28H-1>-%H<%839;>C)4(@%5?1*2"1:!+%G9!,9!8:6%8E/F/&4D@(!),@-""!HH@#70G)A;G62?1<*=5(C-!5(>;,CF7,1/D.B@,.)1H6!5(%2A>%:8D7&#&-!62-68C96/9*);%;%)F/-?#:5413(5'"E5-8G:$@#B?2HE-<-)<3%B AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14C177C17C53 YT:Z:UP jpayne@0: r9788 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3159 0 * = 3159 0 GNTNNTNGGNCNNTNAANNNGGNGNTCNATCNGNNCCNACCNGNG #!$$!!!#"$#!!"$"$$#$$"!!$#$"!$"$"#$""""!!!#$! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9789 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16141 42 323M = 16066 -398 CCGAACACGGCACTGGTCGGCGTGCAGGTGGACTCCGAGCAGTTCGGCAGCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGNAGGTGCCGTCGAACTATAACCCGCAGACGCGGCAATACAGCGGTATCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTNTGTGGGATATGCTGACCNATCCGCGCTACGGCATGGGGAAACNTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGCCACGGA >#F!*8@F*F&=#!5"351>?"+8DCD4GA2;;A'0+8"2>57):;E@83;!/"?:B&)0"(7>38*'"*$8*40:A0!3B"%B2@%@5$4'279?90;/$$1;G?5/+CH>?H%8$%*10+8-,)=@D!C57-8+<)!C+>;D5!:(AA9BB::)3:.4%+#,@387<)8(A>#@?B*274G-B9B!9-2=!A6D5#;7B=,;$8#-F+4AC<7/G",? AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:35G57C95C17C24G83G6 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9789 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16066 42 75M = 16141 398 NGCACCACAGACCAGCTGCAGAACAAAACGCTCTGGTCGTCATACACTGAAATCATCGATGTGAAACAGTGCTAC "+'%)(*#")!%+%+#'!!+$$)*$!#%!("$!!$'*"'$&#$("+!+)$+%'*%)%#!%*)%"()'(%!!($"' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A74 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9790 77 * 0 0 * * 0 0 AGTATTGTGTAGCTTTTGCTGGGTCAGGTTGTNCTTTAGGNGGAGTAAAAGGA @"0E950C7);GD$(3=%+=/D0$(B%0:!:@;?H:)A.=9>'9"4'22?06- YT:Z:UP jpayne@0: r9790 141 * 0 0 * * 0 0 GCACGNACATTCATGCTTTTATCGGGCGGAATGGGTGTGGTAGAACAACAATTTTGAATGGAATGATTGGTGCAATCACCAACCCAGAAAACAATGAATATT ?BA25B'%%.*2D6&:?-%4,'C=0F">8A*2B2G:A1?6H%0/;<;/B;$.FA,<46('=C%@32-=1"@&,!+0'-9-@@4H)47*'85C8B2EB8D AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9791 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30073 42 140M = 29898 -315 TCTTCACGGACTTCGTTGCTTTCCAGTTTAGCAATACGCTTACTCCCATCCGAGATAACACCTTCGTAATACTCACGCNGCTCGTTGAGTTTTGATTTTGCTGTTTCAAGCTCAACACGCAGTTTCCCTACTGTTAGCGC A+$@/4;6@.56("5<;:2F'0%!:(10'6&)9,>E6/D"07'264*52,/*?3"E!??#3.@&2-B&=579"E90<3H)#>+=,&10,H/BC!(G!,);:'B!+B2?C45)::/'H!*E)7>A$B!.2;-@2-8(D?6C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:78T61 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9792 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28003 42 61M = 28239 387 TNCGGGNGCGCATAAAATACCTTGNTACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGTAGA '&*%$+(($&#!&!''#))&$$+')!#()!!()%!$&)"''#+$%)(")*#%$%)**)%#& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T2T1C17A36 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9792 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28239 42 151M = 28003 -387 TCACNAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCNTTGCAAGTCTGAGCCAACATGGTGATGATTCTGCTGCTTGATAAATTTTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTNCTTACCTCTGATTTTGCTGCGCGAGTGGCAGCGA >/F!53#1B>B-#H(.2%4'>'E8/5#C?D2H77+/"8;F/#!<+DBA:",:$:G#:(F4C9>>D:"@1H/.>-,83.(H(&6'B$!&0&>4"=':0866+9%3C=AH8:3%*-E4'F-HH?4?/6AF#F)<3%A<6?:?,*.'4*$2"F2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C31A79C34 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9793 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36135 42 242M = 36377 437 AGACCATCTCTATGAGCTGAAAAAGAAACACCAGGAATGTAGTGGCGGAAAAGGAGATAGCAAATGCTTACGATNACGTAAGGAATTATTACTATGTAAACACCAGGCATGATTCTGTTCCGCATAATTACTCCTGATAATTAATCCTTAACTTTGCCCACCTGCCTTNTAAAACATTCCAGTATATCNCTTTTCATTCTTGCGTAGCAATATGCCATCNCTTCAGCTATCTCAGCATTGGT :44>)H!"%.>H-'5=3/B0F3('HG663#70#;DH>61?:1"<&!&D699"601D!3B"H4D((67>'"F8$:,'@6;;99H90$6?8HA41C3F"00E$F*F<3&)H9>BE'>H*/0!-;D9*':/=/2)&>9".=5#,?F$->;9;+D)A=.4-,#'*F/;D?F02$64=D%6!E3@%#/063A#%2'-#"B2)G18'-8;D7#9"!F@A-2)8(C$%C0C7@45>?H"@.>55'5/?0 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:74A93T19A30T22 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9793 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36377 42 195M = 36135 -437 GACCTTGTTCAGAGGCGCTGAGNGATGGCCTTTTTCTGATAGATAATGTTCTCTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAACCTTTTTTATATCCCNTTTAAATCTTGGCTTAATGACTATANCCAATGAGTCANNAAG *!"&"(!"####'"!$$$$'#*%""$((#"'#*+"+)!++#(%"%')!"#*#+&$"*'"#)(!%$&+)'&&!#$)*()"!(*"*$))%"*##&"**+!**)()"+%!)'&"#(&"!%))"#(&&(&"!&*$"+)&"'*($+&("$!("(*)"*+$)+&('*!$))((&)(!&%%))*&+$)&)$!)#+++"#)#* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:22A29G99T7T17T11A0A3 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9794 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46268 42 62M = 46414 271 AGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGGCGTGGATAATGCAGCCTCCCCCCGACTGGCAGACA %E*65#95+>4.:C-<1%0F88,74C%2+-@&-:6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:62 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9794 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46414 42 125M = 46268 -271 AGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAATTATTGTGAGCAATACACACGCGCTTCCAGCGGAGTATAAATGCCTAAAGTAATAAAACCGAGCAATCCATTTACGAATC ?%3H8@,BF2<$51/(@7&73F9-B=0,08;:)27=7/.:'+.CA#C#<9+=)4FC2,H$5<=(&-/"15,,"8$7=3CH2$>6&=1&%4>+,E0&3367(%GE5D(-C2!<)3CE@DA=+2>H& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:124G0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9795 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36341 42 58M = 36454 167 GCAATATGCCATCTCTTCAGCTATCTCAGCATTGGTGACCTTGTTCAGAGGCGCTGAG 59?9.'6C%1"*B%3(C"$938;:"479(>>."1(36-2=-D;++?B25G)C-")5=- AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:58 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9795 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36454 42 54M = 36341 -167 TTGCCCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATANTATCCT ;AH7-#1B9)@3<1150)E$#D*/%EED%#%85=!:E5!B44.09(63=?,#6' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A6 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9796 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46877 42 111M = 47060 260 TCGTCATTGTATTACCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACNGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTNCACGT 73,%F+,C//#E@?58:,5%HC'!&(,"24C/G:,(+3%G=!FH7:36#'$"*H(019E3.6$<*@@-A4)B+-@6..&:.&B*18?":(@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9797 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38506 42 72M = 38286 -292 AAAGTTCTCAATGCTGCTTGCTGTTCTTGAATGGGGGGTCGTTGACGACGACATGGCTCGATTGGCGCGACN $41.FDF-E'.).!4+B(!*)?5@,6*2>6>*'!GE<:;@?D'&=2144.<@:3GE>B7A5G2E2*C)0'4" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9798 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36621 42 52M = 36417 -256 ACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTNACCGTTGTTCGGCCGATNAAATGCATAT 4&=.%A$+'G7/(!#6=0E8%61D(H&63)-%3':.5!B@;=?<'780 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C17G10 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9798 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36417 42 98M = 36621 256 AGATAATGTTCTGTTAAAATATCTCCGGCCTCATCTTTTGCNCGCAGGCTAATGTCTGAAAATTGAGGTGACGGGTTAAAAATAATATCCTTGGCAAC B3C@672:=A27)7G6C9F$/"D3/<#DG*#C@G+(&8*9AE(0F61DG%"#C%/0F>4-A:6F#>!3H#AF>>3-7(&@)CBG63$#'?4%CB?(*: AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C56 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9799 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2237 42 172M = 2409 241 CGGGGTTTACCTTACCGAAATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTCCCGAATAACCCGGATATTTTTGATCTGACCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCTGAAGAGCAGGTC '/&@*0ED4E3F/<%C"$/->/@,=71%8-%(='3":@38!.$H<4@4(D&H(DD*+8+F)@%4:#:(:0?@E"7CF63698++"6G2,"=-E=;.566:>*/&@>-:''HH,=8@9?2E@%=F$B2+='>+250?$%@D7F41@+!;F4H''AH"G$&7&H:A>%0"1G4@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:172 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9799 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2409 42 69M = 2237 -241 GAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGGGACAGCNAAAAGCGACGCAATGAGGCACTCGAN H2HAA!'9)66$?36%(9(@9??2BC"%>B;%(-!+A406"?,B,H)/D6EG4$B#=71H)-5(F8!<0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42A25C0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9800 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35523 42 168M = 35691 285 TTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGCCAGAGATAATTTATCACCGCAGATGGTTATCTGTATGTTTTTTATATGAATTTATTTTTTGCAGGGG /CE(<1,D9,15:2)43>5;4(9:'F)F..5C7-=>?C>&?44>B&-;"",@$0)!<8D0:+<1#/'1%5/G$G@6;+-;/@7!?>)(G=,=%:*H#0!#G*B!#,=,.3-:H8/2<>H'4A-'+A@G4B3('7"+G$156.3)58@6+&E!"$(4B=="C9 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:168 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9800 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35691 42 117M = 35523 -285 GGCATTGTTTGGTAGGTGAGAGATCTGAATTGCTATGTTTAGTGANTTGTATCTATTTATTTTTCAATAAATACAATTGGTTATGTGTTTTGGGGGCGATCGTNAGGCAAAGAAAAC >B9$GD+79;H:,@&49EG9%@AFA7GB".0D9/GF;%>HF=1+:B'EC,3G%$9)-)&@-#-/*AH'33=)87->?""EB@@0H(')'/'6"8@(1/-"7934#&--8B=.)B"0& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G57G13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9801 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23826 42 184M = 24019 259 GCGAAATAATTCAGGGTCAAAATATNTATCAATGCAGCATTTGAGCAAGTGCGATAAATCTTTAAGTCTTCTTTCCCATGGTTTTTTAGTCATAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTACATGCTGATATATTTTNGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGT DF$:&A2BB'':A3G!A)61>.$>6C6+@6!$73?G0#CC#''+=D$80>-D8&+08B64BC<;C5">(3D';>"096+E-G,&)GA/0B;$;A076#:#=$/F'!?G!H"?376@,9<>1CAF#)1F=('7()-/+0(0&,C&:)9BF0=E9EA!! AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25G98G15A43 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9801 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24019 42 66M = 23826 -259 TTTGCAATGATTCTTATCAGNAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTNATACTANCNNTA !#%%*"'&)$*%)"()$)*"!%++%*+#'%!+*"&%*#'#&(('+(*%!$*#+$!&*'&$%"(!!( AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:20A32T0T2A2T0T0A0T2 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9802 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43410 42 99M = 42911 -598 TTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAATCACTGGCTGCTT E;"7((F0;-:,)2()5*?:(C"$(%:6%817B!+?-=1#CE162 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:99 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9802 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42911 42 499M = 43410 598 GCAGGAAGCAGTAGACGAAATCGAATCAAACCATAACCGCCATCGCTGGACTATCGAAGAGTGCAAGGCGATCAAGGCAGAGTACCAACAGAAACTCAANGACCTGCGAAATAGCAGAAGTGAGGCCGCATGACGTNCTCAGTAAAAACCATTCCAGACATGCTCGTTGAAGCATACGGAAATCAGACAGAAGTAGCACGCAGACTGAAATGTAGNCGCGGTACGGTCAGAAAATACGTTGATGATAAAGACGGGAAAATGCACGCCATCGTCAACGANGTTCTCATGGTTCATCGCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCGAAATATTTGGGTAGTTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAANAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGNCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGGTGAATGCCTGGAA +("!'*)***$!!+%"("(!!#)*!&+$*))$"#"(#$)*)'*!*%%!&*%)((!('(#'%("&+)(!')(#$*%)(+)(()'""+'('(('"'"&"+&)%)!(!+&"(#**))'!"!#)'$"!'$&(#%)'""#*$$+"+('+'&!"'$(#*$'!+!#("('!&&#+!%(#(!")*('+&!+"+#"&+%#("")""**!+("&+$$'!#$#)%("+$&*"*"&$#!%&+(#$(&(%#(**'%#+%)$+'%)"))#$'%%%+%'''+&!"##&%%*#(%*($*$#%$(#)#+!'"%!&'(+!$''+*++$+&)$(*"%+(+'($(*+$"*&*)'$'!&$)&'$(%*(($"#&'!+$(#!'&$)"+*$&""$#'"&"*')"%$'+*#+%$"'$!"#&+!((**$!&%*$"&#!&&#**%&!!)!$"&(%"%&)"'!&!$'%$$'*%!$$##!&##%")!'#**!!+'"&(+%!%"("'**%#*$%&)%*(#'#'")))&* AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:99A36T78T62C116T33C25G29T13 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9803 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34265 42 180M = 34445 239 TTTTTATCAANAGTCGTAGTCATACGGACAGTCCTGGTATTGTTCCATCACATCCTNAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAATTCTTCTTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAAGATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCAGTGGTTCTCGTGTACCCCTAC G&C?A-/,2<:C!(&3%>)%GC2%"4E4@-,(E(CH9$++$(%)?;;%+H+DF?(>&!A#.A>?&*-/87@7!)=ACG$,#=$+,.,'#5!=.C#15EBA4(6C=(;.=EE.-;@3%"+&0C1?236,;&::A2;0BF4#759+8@@HF4')/*4$F>B'6((9#-/9,@9#%10=D?86 AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:10T17T27G48A52G21 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9803 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34445 42 59M = 34265 -239 AGCGAGAAATCGGATAAANTATTACAACGCCTACAGTTTGATGAGTATAGNAATGGATC 2C$)@D8*;%40+F69/$$#>6&A9HB/F'&A8CDC!F&6<+$;'30,=5'8-HEB3!E AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18C9C21A8 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9804 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14481 42 76M = 14205 -352 GTGTGACGGACTGTTACACACTGTTCCTGGATGCTTATCATCTGGCGGGGATTGAGATGCCGGACTTTCATCGTGA ?H;3G4$D#='6+3:ADD7E97547-1D0B;G+'*$1-ED/34)@1&?E*E.*<#$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27G48 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9804 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14205 42 82M = 14481 352 GGAAGCACGCCGGAGGGGGAAAGATATTTCCCCTGCGTGAATATCTCCGGTGAGCCGGAGGCNATTTCCGTATGTCGCCGGA %$?#!!E7&/36%G0)*:7$68:)-B%'@ADGD"-2D43AGE83,0""D0;=$=DH71,(35+2=F'''H==+)7B*%:$+>&63?GF((A--9C1$@69!"H!7E"!>&C"AC*(E(1D(= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:95 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9806 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30586 42 82M = 30373 -295 CTGATGCTGAATCAATGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTNGGTTAATACGCTTGAGGGTGAATGCGAATAA #&<#*@H4F6A95'GG2?8'%F!(8)C1#>)+G+;A%))$9->*B!3(-9'=#;*1;:D<0=76B+D90)$))@H."+!%&/@A#<9?.30F98)%!;8*D21)4H/:%"*HA6>@#38DH9"+5?&9*73C:>'"$>3<5;26::''+-*-=('(3=?):E#&-!)+"A5)3@5;#"F=3D9D!EGB4<-.&(:+B%&&67;%AE45--,%>-+22/87F.FH"A%=;0H$.;7?B#7"?'2*32 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C133G72 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9807 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18506 42 79M = 18585 299 CGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGNGNGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGA ?86.:%D30E>H.9'3,"&+AAB-4@$=7(;7-@82?#@')0.F+'>><6%3!!3$$3';/@.?A:"<";%;63"G3@A AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C1T53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9808 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13409 42 65M = 13574 223 TTTGAACAGGTGGTGAACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCG B8,0A"%42)>1,?,-2!"$;*#*>D13G7:""3$F."<3056)'4(0H4.F!$AHEE3,,1!C. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9808 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13574 42 58M = 13409 -223 TCACCTGGCAGGGGCGACAGTATCAGCCGTATCCCATTCAGGGGAGCGGNNTTGGACT *(&*)+#("#!$+"%(#++&!))('&*'$)'+%((+$)&!")#&%+'$))"(')$(*( AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:49T0T3A3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9809 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25420 42 83M = 25266 -237 GTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAA ;/=D2$4@.F>"!#;,<(>$)/?42C+39.8'#H;4BE1-*GAH( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:83 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9809 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25266 42 103M = 25420 237 TATTGTTGTTCTTTCTGCAAAAAAGTGGGGAAGTGAGTAATGAAATTATTTCTAACATTTATCTGCATCATACCTTCCGAGCATTTATTAAGCATTTCGNTAT @/FD7?)G%G9,(-A:E:*($3*628D:1B600H<,#CG8,'&1*"D224>+GA%:-6809:1.':G:$FEC33B%E!AF$F4>-DB"&7;.?'A&A*!+:), AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:99C3 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9810 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28163 42 59M = 27970 -252 NATTTTTANGCCTGTTTTGCTTTGCTCGACATAAAGATATCCATCTACGANATCAGACC 9'A>D.@>D%2?>94%D%:(7$&+F)6@"1C;',(E02.6B4B+!$=C;G<;>;,=*B) AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A7C41T8 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9810 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27970 42 175M = 28163 252 ACGGTTCCCCTTCCAAGGAAAGACCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTTCGCGACGAGCAGATGCAATTATGGTTTCTCCGCCAAGAATCTCTTTGCATATATCAAGTGTTTCCTTCATTGATATTCCGAGAGCATCNATATG !$$)#('*)"'&&(++%$&%$!'*'$%)$!!%!#&$%+%&+()*""!$#$#"(%+"+(%##&$$*%$'#"+("'#*&$(*(++"&")*%)(*"($'*!'&%"$(*("'&%'!*("%)#%+'##'&"&#+!$'%##&*%"'##"*+%#&&$%)$*"+"'#'(!+)'"*$*&*)*)' AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0G3A8G76T40T37A5 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9811 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39953 42 86M = 39743 -296 CGAGCTGGTTGATATGGTTTACGAGTATTGCCGGAAGCGAGGCCTGTATCCGGATGCGGAGTCTTATCCGTGGAAATCAAACGCGC ;,5C6-1.-CCF2!9C7<-3>+'C/)*EC?%5F"-:<&CE)D;7A3@@57>"DD!4*'(80/>)6+C),'3!#+"A2G5"?+H=-. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:86 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9811 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39743 42 64M = 39953 296 CCTGGCTAACCGTGACCAGAACGAAGTGAACGAAANCCGTCGCCAGTGGGTTCTGGCTTTTCGG /81C+#3E,/H6-75(DB1:8C3*H#66H/36>E%4B917B$G:;#954@+;#5"3H<(30@!, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35T28 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9812 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46067 42 89M = 45851 -305 AGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGCGAACGCGGCAATTACTGACAAGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGC ;5)!%!+>&#,H1#&.!H:/+#@1''--=23D,H!4$;758?)<,%3DEB'G849/0E01"/)+5-/:"$/9?E;?996*54+/)4!'2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59T29 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9812 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45851 42 33M2I39M = 46067 305 GCAGCAATATCTGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGTAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTG <>B;:7G*1)9D3C>1B?3:C'B6#%7>H;.%C:@@-5())B:&B!(*8(70E2019:4B:G$,&(6)@C0.<= AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:72 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9813 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25850 42 161M = 26011 507 GTAGTAAATAAAACAATTGCATGTCCAGAGCTCATTCGAAGCAGATATTTCTGGATATTGTCATAAAACTATTTAGTGAATTTATCATCGTCCACTTGAATCTGTGGTTCANTACGTNTTAACTCTTCATATTTAGAAATGAGGCTGATGANTTCCATATT '!/>0+<%.3,*88)1CC@95;7A"'C;A6$&%8B,-5E@/D/:GA*89$&:B.4&E!+?&(2(3('"%7C@*%4!?:)?#1G:=AGC2HB524/7<7*7$8E;*72G,32$)GBHD+4& AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:0A68A41T5C33G9 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9813 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26011 42 346M = 25850 -507 TGAAAAGTTTTCNTCACTACTTAGTTTTTTTATAGCTTCAAGCCAGGGTTGTCTTTTTCTATCTACTCTCATACAACCAATAAATGATGAAATGAATTCTAAGCGGAGATCGCCNAGTCATTTTAAACTATTGCTGGCAGCATTCTTGAGTCCAATATAAAAGTATGGTGTACCTTTTGCTGGGNCAGGTTGTTCTTTAGGAGGAGTAAAAGGATCAAATGCACTAAACGAAACTGAAACAAGCGATCGAAAATATCCCTTTGGGATTCTTGACTCGATAAGTCTATTATTTTCAGAGAAAAAATATTCATTGTTTTCTGGGTTGGTGATTGCACCAATCATTANN !$++#(+'+"!#%*+#"))!!$&)'"+$(#+'+%"*!!#$%"+"#%)&!+#%$$''!(+%#"+!&+*$&!%#()+*)%%(*)!*!&("+&))$%##*%+&+%$"+"%+'()")*$!)$*()#$'*%(+$'$%!*##"&#*&&)+((#&)&%&'%%$%+#'+#))$$("'*#''#"&()*$*+!'$"(!*"+)*"+#%*!%$%&"!(#''$+"!#&$#!$'##"&+&'%"*)+&'&+%'!&!$")&#+$(*+#((+'%*$""%(**&+%%%'**#(""'"*!''$"$)%*%&&%+'""#)$*$')!+'$**!%!$#!!%!')!'!'&*#+%#))!''%#(*'+#$!' AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:12A17G15A39C27T3G47T17T158C0C0A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9814 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26955 42 61M = 26795 -221 TAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTT ")#!")!+"*$""*!("+*%%%$%%#)+&*%$"#!*&$(*'(&$'&!'%#("#+$()"!+# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9814 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26795 42 160M = 26955 221 CCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTTTTCACCATGCTCTTCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCNANCCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAA DA;+BF@FHC,:0&1F,E$-.E)+9E4AA88F*G2*,E(&H.>+E<8,C@0+#)13.@E73@=.)D+()'-34!'0#G+B"707<,#-=!8>8G"+H91";%3(1=3:">4,BC"!,#*E5&E$/DD60G7D<&?57>H.*++#?>&2;E.>F0:H!))"5G< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:72 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9815 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16525 42 86M = 16723 270 NATTTCTGCTCGGCGATGCGCTGTATGCCGGTATGGAACGGGCAGACGCTGACGTACGTGCNGGACCGACCGTCGGATAAGACGTG "=&?+*:97.D<"*/D!F#4>(,E&BF0(H,8&'$.8!;-99B>6/=4H4A2338!E7H9/1!"":-$+G0E&9%=>)@-5;5&H> AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G54T5A24 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9816 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23918 42 220M = 24138 331 TAAAACTCTCCATTTTGATAGGTTGCATGCTAGATGCTGATATATTTTAGAGGTGATAAAATTAACTGCTTAACTGTCAATGTAATACAAGTTGTTTGATCTTTGCAATGATTCTTATCAGAAACCATATAGTAAATTAGTTACACAGGAAATTTTTAATATTATTATTATCATTCATTATGTATTAAAATTAGAGTTGTGGCTTGGCTCTGCTAACACG /BB)&3'%+G@0H8A))--;#0>G(1/#$5(.357G'D=.6:F@;+"$#8A.@HHB$>7?=;?@(,303AH;8'H!A)G"#30>;0E?1%C3370A+!-/8G27<&:8#4&E('9+&.D6!E%:75#+5E;15'D-&BE97A941D*5A@$2A@-=F984D=C5D2$5F./3=!<@2@+)"",6E.(?GC#1AB45!8911<-"#4#$>?<3-AH%E>(4<3#9'7CD AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30A29G50 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9817 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42646 42 84M = 42452 -278 TCGCCTTAAAGCCCCGCAGTTACNGGATTAAACAAGCCCANCAAGCCGTAAACGCCTTCATCAGAGAAAGAGACCGCGACTTAC D7C2(:!HF<&/A@2G15#77?:DD=$F;9=-@*)0#?19ACA@B#8(-#$9"6153):>)BH9"1H9.*E463@)F."9F AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T16A43 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9817 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42452 42 194M = 42646 278 ACGATGTAANAACGATGAATGCCGGGANTGGNTTCACCCTGCATTCGCTTATCAGAGGTGGTGCTCTCCAGAGTGTGGAACCAAGNTAGCACTCGAACGACGAAGTAAAGAACGCGAAAAANCGGAANAAGCAGCAGAGAAGAAACGACGACGAGAGGAGCNGAAACAGAAAGATAAACTTAAGATTCGAAAAC ?#-;#:;:ACF$63<,=H%%B+*,"90D@.:FG=:2;0-G3A@-1>D#80.5C*;A$2.D-:AB>F<*77)(*D:,+H?A1E"28(/'.323#!-#F)4;:>91$H:83AB2$$3-':GC".:;>"3("#8%:A9-G:659..B47:-/G-)7C*,E52?DB5$#;;;+2/-DHFG.1E64>G#)>&12=>HA5 AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:9A17A3T17A5T29A35G5A33A32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9818 77 * 0 0 * * 0 0 TGCGGGCCCGGNGTCCTCTGTCTGTTCAGNGGCATTATTCACCACAAACTCAT .(6.79?7,$:6%6310'80>F$(35$57H1:(B=((8FA@17:!H"-6"/&< YT:Z:UP jpayne@0: r9818 141 * 0 0 * * 0 0 AACCGGCGCGTTTCTGGTGGCGATGTCCCTGTGGCATAACCATCCGCAGAAGACGCAGATGCCGTCCATGAATGAAGCCGTTAAACAGATTGAGCAGGANGTGCTTACCACCTGGCCCACGGAGGCAATTTCTCATGCTGAAAACGTGGTGTACCGGCTGTCNGGTATGT F$?&&DCE/)+/E7ECCG;B)-?B9*GD24)D84*+&D67!840A-;&2=($:"?>/>H==F:6',B#,H,7?:>=:0C&H!H8/(0#7,0F-4+;+*9$$&$"(H1"3:C)%!B;%#(=2B<:#)1CC"9B9*9(*3?A*1(/5.(6%8!!(D4!8$2=16'1>=EA+G YT:Z:UP jpayne@0: r9819 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44285 42 51M = 44148 -188 GAGCTGTGGGGGAGAGTTGTCGAGAAAGAGTGCGGAAGATGCAAAGGCGTC !6!6EE-2)3A<,C-(,1#<&*!5.4"3B$%)45C<%7A708?#&!6/21*,=7"A(;H,'ED?%3A@F%?'#1!24:,,?;=+6?&+9+<#@$;""&>G3G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:66A50 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9820 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34035 42 41M = 34138 220 ANACNCCGTNNNGGGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAAT *'*#(%#(&*&!++#""'#!'*#((&")!!*$%*!&$""*& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:1T2A1A2G0C0A1T27 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9821 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19866 42 214M = 19780 -300 GGGACTATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGNCGCTGAATGATTTTCTCTGTGCCATGACGGAGGATGATGCCCGGCCGGAGGTGCTGCGTCGTCTTNAACTGATGGTGGAAGNGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCGCGNCCC 3GE*HE%0EEB6""B;2,!67**+5%A34>&$7D0B27-?2,+(EG/>?,-H.<7FDB@%?CGH?3$97C$2<3B.+$,/D5+A-2*6<6A"'-&(4:CEAH;!H*6B<)18.+0CDB6%;0'%%*FCCH39CE@%#,D@/D<5"D?0>&DD'2/0/$A?5(!"*B7C0"3F+!&;"4)>!/>=B*.DAB1*+:<;'"H&D7=6#(?%17H6):38D$4G3?CF71"'!/.*?/G#%A3#219DE+%9-')C"7+E325)H)0F+-F4">12BEA/".<,,H2*H1-"&4-#"+-(%9!1H'"4+DG3. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:71 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9823 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29501 42 69M = 29345 -225 TAAACCTTCATGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATNTNTACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGA #>(D.!)98CH!>H33;);50";C>120$%*G7,5E>/4%(:F8CG9&58:H@!6=#>F?!?G;)F@A5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C1A29 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9823 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29345 42 128M = 29501 225 AGTGCGAGGATTGTTATGTAATATTGGGTTTAATCATCTATATGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTTGCACGGTATCAGTCATTTCTCGCACATTGCA B-:;G7E$E*.097)F9/3C)=E=?*=5*;=34$A<@0:4492E)E5!G+025,3B.)D6E3=.*1B1$CH0590D*?GB+#C=$F(7C&DA'BEG%;C/>C;:@7F72=29?F0)%8D44&@/E1'5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:128 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9824 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38599 42 276M = 38599 0 AAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTNAACAAATCCATATGGAGTTCTGAGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCATTATGACAAATACAGCAAAAATACCCAACTTCGGCAGAGGTAACTTTGCCGGACAGGAGCGTAATGNGGCAGATCTCGATGATGGTTACGCCAGACTATCAAATATGCTGCTTGAGGCTTATTCGGGCGCAGATCTGACCAAGCGACAGTTTAAAGTGCTNCTTGCCATTCTGCGTAAAACCTATGGGTGG &G7?/#;9:8*&:+H+9/"&.(&6248"D%%!3:-A1.?0<2;/%3!8D56-9$C(H..>F6"";4$H?8-!,H30-+?=/!#!0H=C89>3+9(9C014DH$7:#"#A5)(D;DG30$(6A"=1G&B0H4:HEBEA*=<-HB"7&&=7HD6:2&;1F!:"%EC)'G,-!:A((;>?&*822>!BD'5()DD,=G#-5C*2+8;&?#;>GF66?0))#AB15E(6G>497,@7+<8F;A4.0FH9A%!G;3C19 YT:Z:UP jpayne@0: r9825 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39765 42 94M = 39905 243 GAAGTGAACGAAATCCGTCGCCAGTGGGTCCTGGCTTTTCGGGAAAACGGGATCACCACGATGGAACAGGTTAACGCAGGAATGCGCGTAGCCC B?3:&E5:-;0F)&H5.378'+.C=A==2A70F@='(/0AC52?>?$!.F39(E?"3-D$9B7-;>38*4;-1E,/2',&,6/?@5EH4*:5&::5850:A0+5&)70A0%/..G'A)++/*A#:H!G.'B"3+GE*3H$E?3;9?/F""/1?)#>00789!B$5F;?.%$5B0G=:$2=6899&> AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:117 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9826 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4147 42 43M = 4361 331 GCTCGCACNGCATGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTC ('#$"(%!(*$)+!!&#%*')$**%**+*"(""&#+%$%!'(+ AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:2C4G0T2C31 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9827 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17168 42 93M = 17332 267 GATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGTGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCA ">?#39'%(#8&EC!D$43F;A#*@,F)/0!4';C.""+?=%28@B$E*@E@1&CH#9)'-2?>7/26+?*%. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0A92 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9827 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17332 42 103M = 17168 -267 AGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCNAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACATAC ?D?%D*00,&020*5;*C6:;6C&G$.#B')4E6?*+%4:7!?!(6&@#4.(B6'='+?1<.GHCB.%1!(A!B$B<%:<>D AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C71C2 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9828 73 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34679 40 34M2D39M = 34679 0 GCTAGCAATTAATGTGCATCGATTATCAGCTATTCAGCGCCAGATATAAGCGATTTAAGCTAAGACAACGCAT $H.@80"723!F'3(=,;)/92:0<7"H9FA?'*C.'B*H1>82D22>3G-/8@%31-1!;(H3*'5(&/CG& AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:34^GC31A7 YT:Z:UP jpayne@0: r9828 133 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34679 0 * = 34679 0 AACAGNNNNTNNNANAGTNANNNCANCNNNCCNNNNATAATNNNAAGNNNNNNNNNNNNATCGN ##""#$!$!#$!"$!!!!!"!!""""!"!"#!#"#""!$#"!"""!"#"!!""$"!!!##!### YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9829 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16190 40 50M = 16360 245 GCCAGCAGGTGAGCCGTAATTATCATCTGCGCGGGCGTATTCTGCAGNTG *A@>H@25><$'1E>-A0+%"H%,4(0+.E7=@*&:0%%;4''8B5:)E( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G2 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9829 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16360 40 75M = 16190 -245 GGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGNATGCNGTNGCCNAGNACNGCGNNCNA !"(")##+&*&$!#($*%!(!!'(%)')&&$&$!"&&%''*%#&'#'%%#++!!$%$*(*"&%&*$!"#$&*##& AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:13 MD:Z:48T3T0C0A1C1G1C2T2T3A0C1A0G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9830 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1318 42 53M = 1371 252 GCTCGGTCTGGCCAAAGTCCATCCGTGGCTCCACGNCAAAAGTGAGAGGCACC 7?F<="0'(G:%1-9)/D>=@:)E0.7$:H":@?8BG%C5)19:1C=E5E"F! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C17 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9830 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 1371 42 199M = 1318 -252 TGTCAGATTGAGCGTGCAGCCAGTGAATCCCCGCATTCTATGCGTTTTCATGTTGCCTGCCCGCATTGCGGGGAGGAGCAGTANCTTAAATTTGGCGANAAAGAGACGCCGTTTGGCCTCAAATGGACGCCGGATGACCCCTCCAGGGTGTTTTATCTCTGCGAGCATAGTGCNTGCGTCATCCGCCAGCAGGAGCTGG ,6B''4D)CE,1@,+/C3>(:B-=*4#-#!79=.9<#5+=*"6.B;98GF%B$>B;B&:=FEC'(5*=5A3E0D!4">C;+51&(,1$A8:+>H8-H(A$)G*0&1E818"%'2:!91#7/B/;4!99=&(93/H7-"&9=!5*?12D1%0*6G&=$,C/,&?,H99>C.&(3#0G>155>#*247$52HG@&8:-@., AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:37T45T14C47C22A3C25 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9831 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10544 42 87M = 10631 400 GGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCNGGCGTCATTT 120(12%=G.&)):A4'/>20/@%3E5+28#)"?;*2HF&(E@%$7=H"6@/+H9;H;;G0;H2B73/5"(H!,/:+CE6$EH'E>,5(G!=A'4H<91(',%19A01)0.G;(6EHH8=%H&?B;E1D,95)3-C"D<$!*$,7@H+!B9-):-;+F>F18="&7C54&5!66&4,1!8+D!9,$):1C6,4A#57?5E*GG$2+03>#CD%:&$A!16"$#5184,C88G4)>.CH(@>)"(+1#6'!%G>H@;;)GE)=<,FEF3?2<+,!-$>'7E7@;'5(!%"#E#F-#B65-!1 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:89T48C43T5T29C71C22 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9832 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9362 42 23M5D93M = 9195 -288 GATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCANAAGATCGCAGCACGGTAACAGCGGCAACCGGCATGACCGTGACGCCTGCCAGCACCTCGGTGGTGAAAGGN D,+F-"".,8#4255/5';@1')5BGA*)*:@6>H)@*.?:GA=B+<1H5;D(D,-F<4=A;<GB<<87)>57$D13>7#+;( AS:i:-22 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:7 MD:Z:23^CCAAT21G70G0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9832 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9195 42 167M = 9362 288 AGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCACGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGT *6=-).C=??D)@+2!836A4%/D9(?HD)#C3)/7E9B%F@"(A=3'H*0(D+2G'(;&?C=3D1./'5CCG%=A&+6=G&?A37:"';A#;G$')?.3'&CG(1B/$B8!<%C/)2+&!%E'#<-D!/=%/(4BH/$>1$C&4.,A87-G6--%+D-7"F5>!0.121%B9%5$!G-1%:F>F@6A1+*(&0/3H?7A8(H@))-0F($6!?57(!?)31!4>:70D<74B@=3=37@G";6F,'C1%''#G0**@!2,.<+F$@;)"#E8B30("D%?.E1.!F65.F4?B7+;@B!%5 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:142A23 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9833 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16356 42 120M = 16476 286 CTACGGCATGGGGAAACGTCTTGGTGCGGCGGATGTGGATAAATGGGCGCTGTATGTCATCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTGGCGGCACGGAGCCGCGCATCAC 2&!943<(C%)7D!*&G>:7H11<5;8'B->.;G$5H:A!=&!4*A$8%2C,/.2)BEC+=!A7C$@(('/:-"#F4C:*#+*B*:&B+<56@4C?@5G,,4::BG-%(@A?.?+!'":H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:120 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9834 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4250 42 91M = 4449 320 TGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGCAAAACGCGGTGACGACTATCAGGAAATTTTTGCGCAGCAGGTCCGTGAAACGATGGAGCGCCGTGC :$;F$5(F,6A)/@(0:A21&<%'06"*":7$@(HE)@H%+16%).%FG9B*A@$;?.,#+'3? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C32 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9834 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4449 42 121M = 4250 -320 TTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCNCGGGTTTTCTTTTGTGCGCTTGCAGGCCAGCTTGGGATCAGCAGCCTGACGGATGCGGTNTCCGGCGACAG 2,!&4'D0D0C5&;!))8&&1,6";H)-0F8*F=0A=%;H'1+"C$*8B73$>A-<,9,%7:=0:"?-$&7E9H$27"=-;>3!B%B;+>*A)DAA::@*>27"&)3$EC-B5:9A,"/<, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49G59G11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9835 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27991 42 60M = 28220 271 GNCCTGATGCTTTTCGTGCGCGCATAAAATACCTTGATACTGTGCCGGATGAAAGCGGTT G-3-%&CE-3F8F7HE'=,.&+C?HF/-#AD1#/#->%1)H#7#<90"@(8."*>&8D"G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A58 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9835 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28220 42 42M = 27991 -271 CCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAAC @5EH%*-EC0;D>H@>E5=$)@@&4E;$4EH,?211%!&%.* AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9836 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11417 42 128M = 11545 231 CACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAATCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGTTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAG ;(+@.A79?;&.#)7=##"96'0;+6:"CF<::$B>+B77)/.+9D2DA@1EB0,6%5=1%7FE>2#:=67G1"G)38.G6&8DE%)C%09%<'0<.%#B'%)3@*,*HE/5=(&',(#,55'4=-0? AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:71G56 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9836 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11545 42 103M = 11417 -231 CAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAAGCGCGGGCGCGTTACTGGGATGATCGTGAAAAGGCCCGTCTTGCGCTTGAAGC .$1-<-#AD@FB$4C7?5C&$!-'GGG;=7E1F86,H7"4)$6"=<:#;08!*7!!0H;;!991+?/1$4+%("?B,1%B'?FAE'$#75?=!56%:E6,E!C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:103 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9837 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18751 42 60M = 18923 263 ATTGTTGACATGCCAGCGGGTCGGGGAAACGTGATCCTGACGTTCACGCTTACGTCCACA 4%<.):>=2$*#=1-!+7.*5%D&2$2B,E0;'B-/,3/;)1H6#574@#/'G$A*#-$; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9837 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18923 42 91M = 18751 -263 CCGGGAACGGGCGTTTTATTATAAAACAGTGAGAGGTGAACGATGCGTAATGTGTGTATTGCCGTTGCTGTCTTTGCCGCACTTGCGNGGN ))$''!!"()&$(%((")%""#')!%)#!&**)$$%!%#)")&+"""!)&$+#'(#*(#%**%*&&'(()"((!+*!%$"$&'+#&*+!)% AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:87G0T1A0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9838 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40804 40 14M4D141M = 40963 220 GTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCCCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCAGGATGTTGTTCCTAACCTTGCCGGGAATGGCTTTGTGGTAATAGGCCAGTCAACCAGCAGGATGCGTGTAG 5>!)2;G7F2@$G58))'0*";!;G=1@7$2(#5?,'5886A7<9*;>%.E(2HB?:$6#=)7/#G')?#C;F(&HH:4631DD#.D5D7G!7228G0(2A'>@'3F>=68$&3BHHD@1%HB%2/"H AS:i:-19 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:5 MD:Z:14^CAGG15G125 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9838 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40963 40 61M = 40804 -220 GCGAATTTGCGGAGCNATTAGAGCTTATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTNNCGNTATCNG *%)*%!"$*)+*%)(##(('!)#('%+#%&+"#)&"####$*%"'+!(&*(!('!$%#''% AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:15T34G0G2T2A0G0T1 YS:i:-19 YT:Z:CP jpayne@0: r9839 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8546 42 125M = 8738 248 NAAGCGATGAAACATACTGAACTCCGTGCNGCCGTACTGGATGCACTGGAGAAGCATGACACCGGGGCGACGTTTTTTGATGGTCGCCCCGCTGTTTNTGATGAGGCGGATTTTCCGGCAGTTGC $(+""%"#&"'*%(*&(%+(%&$)!('$#*)##')&!&'#*+*#'&"**#)!$"'!+&$%$)%%(+&(!)()%)&+"**)&(")%')$*$&#*#$!%)++%"!(')%*"!(!%%%'!$%%+!%++ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A28A67T27 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9839 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8738 42 56M = 8546 -248 CATATCGAAGTTTTNCTGNCTGCTCAGGTGCCNGNNTCAGACCTGGATGCGTGGCT $%!''#'(%%$#+%!''*)'$#$#+'"!('(+%%!!*'&)$!''%'*'*&*(&'"& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:14C3C13G1A0T5G12A1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9840 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29387 42 55M = 29442 260 TGTTTTGTACAGAGAGGGCAAGTATCGTTTCCACCGTACTCGTGATAATAATTTT E'ED?08=@E"+G9)475/'"393F<3:*.BD%@94D:G<"C(B+.(*)>+15#' AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:55 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9840 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29442 42 205M = 29387 -260 GCACGGTATGAGTCATTTCTCGCACNTTGCAGAATGGGGATTTGTCTTCATTAGACTTATAAACCTTCAAGGAATATTTGTATGCCGACTCTATATCTATACCTTCATCTACATAAACACCTTCGTGATGTCTGCATGGAGACAAGACACCGGATCTGCACAACATTGATAACGCCCAATCTTTTTGCTCAGACTCTAACTCATT 9;2D3HF('5!#/:,&8+=B+-%D1)>B+<>>'!);C0(!A3"F=:$2(@:.!=9083*0.G/HB>=>.:H3#.868?-8'F>=<>)DH>2,D:8:?E;&>.'?>7=F@B!/(+BD65E7+>:FF=$C=)B,::*5G=<;-B(1??80# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C15A43T135 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9841 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27675 42 105M = 27851 216 AATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCNTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAA 6=/%F!/26CE6(F-<#2=(6%1F+F'2,<"3"@4=0$%;2H4-:F.@7A2/:/.&9/.DE1H0!A7C!61-6)/EG;C4 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51T53 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9841 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27851 42 40M = 27675 -216 ATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCNG 3,<7#93-$4(+AE(G75?>:278B9":A0&2:/0,8!70 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9842 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5829 42 60M = 5640 -249 TGAGTGCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAAGCTGG 5%-5.#&FC-5+'3=9!.<6(:*--:0+6@#6(11&9&60GG*)('.B"'?;F571'+,5"*G?F8-&E=5;3$#G$-@-===$0+D97*22'85%=#GF>AA=F>#"65/E#/8(59-F8/91902E"?5'8>>;!0(6#'*/#,FB?/C5E AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10T23A93 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9843 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45296 40 89M = 45296 0 TGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTNATTCATTNGTNACTTNCTCNAGTTCNCGGGAN #*("!'!")$+)($'#++'!$*%*!*(%#*&*"!&'((("'!*'*!!)"#"#+%*+)*%%#&(%))#'&($*!'&!%*%'(%#&!&()# AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:56G0G6C2G2C1T3G1C3G1C3C0 YT:Z:UP jpayne@0: r9843 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45296 0 * = 45296 0 GNANNNGTTNNNNGTNCGNACGAGNCNNNNNNNGGANTNCNA #"$!$#$$$$$!!$$"$#!"!$"$#$!##!$!!$"#!$#!"# YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9844 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40377 24 87M = 40464 309 TAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAAGGTAAGGTCTGGCGAACGGTGTATTACCGGCTTGCTA #908'1>>%!>$&=@#5C5)(0.(5H""/;5/GAD?":.)#GEBC->1$=;ED:A=7752@1)<=4162(63F*DG;>,?'%'"%51 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:80T6 YS:i:-70 YT:Z:CP jpayne@0: r9844 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40464 24 99M3I49M7I13M5D56M = 40377 -309 CCAGGGAAGAACGGGAAGGAAAGATGAGCACGAACCTAGTTTTTAAGGAGTGTCGCCAGAGTGCCGCGATGAAACGGGTATTGGCGGTATATGGAGTTAAATAAAGATGACCATCTACATTACTGAGCTAATAACAGGCCTGNTGGTAATCAGCCGTAGCAGGCCTTTTTAGGGAGANGGAAGTCATGAACAAACTAACCTTTGAAANTCGATCTCCAGNACATCAG F8A$:%>08-%.53@"&B/&&2>(@&!8#(2$30)!H,D@A>0.);B8'3@+<:$4$5A>"8.(G1'0$F288*GBG?21*>3@$!&!A.2G6'G45@?&G1F/B*8;04%:!6E40;,@:)'AHH#:*B(;C$C-B<:&,)6C1?=20)3;:@B93FBC;E<;.2>."/-:42C1=9!(8%82? AS:i:-70 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:3 XG:i:15 NM:i:21 MD:Z:37G101C21^TTTGG6G12A16T11C7 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9845 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35192 42 109M = 35301 377 NGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTAACTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGC *D;2/;9,>%,2<*?BD*#?=./0E1A38"DA?(A?C,$+*77#8E%/%+CE0!B!93D!C4$8*%,.;>&67E&9#.%&.B*,H?$7,7B%CF>6=E.:$H54?GC1" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G108 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9845 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35301 42 268M = 35192 -377 TGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCGCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGNAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGAATCGCGCTTACGGCCAATGCTTCGTTTCGTATCACACACCCCAAAGCCTTCTGNTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAG B;G-8*2086"4=>5#G9.4'A:.8*0':/8E8%C04G"78()-!.1G=/!9F%'.23%2&G#/<):6=#6;8B>3;/2D(E*0,HE&="D+3%GA9*H20>-!+(*45=88"B@$'6*;?&"64)3&EFH>$'!;6,H$)-750'AE&7H'15?&:?F@.=?,!-"/$@)F=@.;FF$A=0H-?2HFB$992H0F3()%""*5B7A8H'!,F?G3D583>3'*'H;H+>,-;A88=,(9/30!/*/3'6.('";4H@EF2#7C+CBF AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:97C61A47C60 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9846 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27539 42 174M = 27713 357 AAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTNTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACG H>-A,51&.'6?0D0$!6?()135)8=G2ED*.-)#E$.6<41%G(A,:/&"G;G<%3AB+C:A0>GH>-"!2<7?>@=)F'.7B(1173E05":4=4@3?;7+@="(:'C$7/=E(?%**%3=+EB?G21<5(>BD647G)($#0?' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:101G72 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9846 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27713 42 183M = 27539 -357 TTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCTATCAGTCAAAATAAAATCATTATTTGATTTCAATTTTGTCCCACTCCCTGCCTCTGTCATCACGATACTGTGATGCCATGGTGTCCGACTTATGCCCGAGAAG $F!')H7-H8.@3E#(2+8)9":8(,?0E=010E;=:+=2(9"5:)>F?CD&!@8+91B39 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:77A105 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9847 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40981 40 51M = 40791 -241 TNGAGCTNATACAGGCATTCGGTACAGAGCGTGGCGTTAAGTGGTCAGACG 51)),(5B=D/)+'#1B!!BA?.!,.F<",37:8A,"4A=74FG:?:.6H* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A5T43 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9847 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40791 40 27M4D83M = 40981 241 TGGGCCTGCTTAGGTGACGTCTCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGNAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCAGCACGATGTTGTTCCT 11A9!4&:6(2=69E?@=&2!,,C@H@6>/B@!<70>91C$1'#;?68:!$#&-,G)86#F)9=+H.(!D8/H"#E7-9C?>($9@<#A$/H3&)>!#7:5E,"47%#2C2=E(97.G+,H=1C."+?;5%21C>9;B?C6A*2&8C/356G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:135A19 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9849 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28906 42 243M = 29149 330 CCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAATTGTTTCAAGGCTTCTTGGACGTCGCTGGCGTGCGTTCCACTCCTGAAGTGTCAAGTACATCGCAAAGTCTCCGCAATTACACGCAAGAAAAAACCGCCATCAGGCGGCTTGGTGTTCTTTCAGTTCTTCA F870?3.08.)-.)+A(DDE#/-9)-:80FC?5"&CC0@,,',3H@4!9F;=-2&EDG55+0.57@18&F<=F@#,6<(A8EH'3?-H0>C<2C0G:E4)+A3?B#?>=?C**%+-*1,1F!+!AC13:2%/($-25--7=),!B/G4EB)B#794$B.>5C2#)H#+D+0%!$>'=:%4B7=DF+*"!.:0.E.5>-?GG@45#25+&F;.F;+'?6;'D/6-'D8EBH2(2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:112C130 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9849 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29149 42 87M = 28906 -330 ATTCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCTGCGCCCATATCATCNAGTGGTCGTAGCAGTCGTTGATGTNCTCCGCTTCGATA 0>1H>:&-$#G"./1F/<*)C>$(;=$B$G20<8E;%>A1$*"1&..>)<84:47)3=(&1=G AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T100 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9850 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43915 42 151M = 43763 -303 TTCGCCAAAAAGCCCGATGATGAGCGACTCACCACGGACCACGGCTTCTGACTCTCTTTCCGGTACTGATGTGATGGCTGCTATGGGGATGGCGCNATCACAAGCCGGATTCGGTATGGCTGCATTCTGCGGTAAGCACGAACTCAGCCAN &H+@/?6G!@.3C?:,@F.D)*@C5-AF.!=6&:345&1161//.G*6?5(>-?6###EH**99-9=E5AC+8E!,.1A.$"+5G7&?$?H4-95@/<:24'F+"&""9B11();2#*16CB67@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9852 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8067 42 78M = 7943 -202 CGCGNTGCTTCATCCGCGATATCGCAGTCGGCGTCACAGGTTGCCCGTGAGACAAAGGTACGCCNGAAACTGGTAAAG 8!7G%673'G--C?--E<4=(-CH"-8$.E!=86EC@C>5%>-DB=21C8-???BBD9'E)F;(8(:D!*/9593:'5 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T59G13 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9852 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7943 42 62M = 8067 202 CTGCCGTTAACCGTCGCCGCTGAAAGGAGGATGTNTGGCCATAAAAGGTCTTGAGCAGNCCG G1H=*FAH$6G@34'4"6*)5,64;0;5#9!C%4,2+(>E(D5E7%:6A,DHB:9!H:>B1# AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27G6A23G3 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9853 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28666 42 204M = 28870 364 AATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTNAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTNCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTC +>9.EF75'A-&%(D<-F4)2"$4;HF56$49/?7#D@*G'@6@7,H=4&;1C!354HH+=$7/"$-$E!3=G>DA8/G;'.,9AABD-*<'9643'*/AHH4=CA4D!B@8+:H0!1@$;#!-HH+7'7$.E1:(0B"C5!D%(,>!G<7>9,?54D-9*C?B20B"/G(09B(&HA9!DBF(: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57C28G117 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9853 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28870 42 160M = 28666 -364 GCCTTCTTNCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGC %!")*#!&##$#!$)$"'$+""%))#))#"*$%(&&$&*(&&)'!*'!&("))%$+")*!%'(#%%)+'&$)"#)%++))%)$'##)%#'%"*"!")!&$!'%#''%"&%(*+*!'""!"%+(#$#$&+%$)"#*)'*#!#"))!'&)**+(#"*)%(!+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8C151 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9854 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42196 42 72M = 42268 270 ACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACNTNTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAA /F1CH(>*6;)@4$-1&4G4C2'9=5>BF2=#;FA4,1+B/?0B64<6$@+>,@5@0"01,8=9 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C1G40 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9854 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42268 42 198M = 42196 -270 GGTGATTGACCAAAATCGAAGTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGGTCAGAAGCTGCATGTGCTGGAAGTTCACGTGTGTGAGCACTGCTGCGCAGAACTGATGAGCGATCCGAATAGCTCGATGCACGAGNAAGAAGATGATGGCTACACCAGCGCGAAGACGATGTAAAAACG *ECF++&7H)'8#);#G1#F=7?#>.9->4;"7H(-E*A0;H"E/(#72*'45!,&@<;!;CH&'"E-GA@1#E7145&D6E/A7D(-*@/=9GD(09E?G3&<$42(-3;:#C9!;:/<8F=F6F+F&2%!CH#H&:9 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:154G16A26 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9855 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39385 42 71M = 39456 240 AACCACCGCGACATGTGTGTGCTGTTCCGCTGGGCATGCCAGGACAACNTCTGGTCCGGTAACTTGCTGAG A-C,$F;A#@6)?02%BB/:#9=4(#38E2D&+B-733#0&:#2!@";:'C"17(2"@3H2C&9.3*,-C2 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48T14G7 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9855 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39456 42 37M1I132M = 39385 -240 CCCGGCCAAACTCCGNGATAAGTGGACCCCACTCGAGGTACAACCGTAACAAGCAACAGGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGNCAAACACAGACTGGATTTACGGGGTGGATCTATGANAAACATCGCCGCANAGATGGTTAACTTTGACCGTGAGC B*81#8+D&'C,"@BB===/DA+;@9#'?01(1&E",%<8G"6+6:52,5,C1+1A:<@E#1>,-$:GD+C(6;%9:7)$1%6(#'=E<+&/'#@!5D&DH*&+F00-B'(C:A)&,(AG-);6-BA80G5F-6A!C>:2*D"!8&$93"(A,#%-=%<<8"?7,*D AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:9 MD:Z:15C13A6A0A0T55A35A13C24 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9856 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17102 42 218M = 17320 341 TGGAGGTTCAGTCCGTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTGCCGACGCTGCGCCAGCGACTGTTCCGCTGCGAGAGTATCCGTGAGAACGACGACGGCACGTATGCCATCACCGCCGTGCAGCATGTGCCGGAAAAAGAGGCCATCGTGGATAACGGGGCGCACTTT CE:6C!'4C<.,+22:/*+F3&1H6>'&:/*=5)?7F)23-548B>BEF=:A'H";F*(=77&(GH"A)/8'3"6E23!+9!1.;),5)./20/34@6:E.&$=7G#F@4.C'9(6;4(3-)A%;%!;D(+F7#?*6648%'7;(!3'@G"DF&'BA&H*-'B>&:B&$;9#,8&:;2$%;"6CA.::+A-%D$6709:,63/*.0??1&6.:-;@A: AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:123T94 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9856 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17320 42 123M = 17102 -341 GACGGCGAACAGAGTGGCACGGTGAATGGTGTCACGCCGCCAGCGGTGCAGCACCTGACCGCAGAAGTCACTGCAGACAGCGGGGAATATCAGGTGCTGGCGCGATGGGACACACCGAAGGTG (($5$6!'#,.//66G3"G+?"AC3%E>#*E5,%D"(B:,&:?BD0/,*';>2<$2%6B1GH(A*A*!A*(&"'7'F:8=%DD*>9578#:,3"H!AB$%)$=.4"<=GC'C=4)G<0(E,,. AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:123 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9857 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11897 42 127M = 12024 353 AANGCCCAAACNGACCAGCNTGAAGGTGTCTGAGGGCGATCGTCAGGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGCCGGAGCATATGAGAAA ('"&)!!(($"#'&)(*(+*)"+$+%#"(#)&#&$+!))(%#%!'+*&)%()+*""+(((")+*#$+#*#('"$%'(+&$')#!&$****')'#**!"'%%#!'))#!!'++%'#&)$)$%!#%'$# AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2A3G4A1T5G12C85A8 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9857 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12024 42 226M = 11897 -353 ATNAGCCAGCNGCGCCGGGATTTGTGGAANGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACNAACGCCAGCTGGCTGCACTNGGCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTNAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACANCATNAAC (!"(%#"##$)''$''')&)!$*&!%!#"*+$()$&"*""+''&%#$(%&')($")&(!**+")'*+)$(&+"*+'#%!)*##(""!*'$+#"&+'%$%&+#')'%"%""+"*(!!')+!"))"%'$)%"%$$+%$*'"""%((%'!(*%$!!"&(**'*#)*((%#"%++$%$*)%*)&&"#))&!(+)!)!%%!+#"(((&$"')&'%+%""%#'+"#*(#!'& AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:9 MD:Z:2C7A18G102A19T29G35G2G0C3 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9858 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5477 42 40M = 5517 286 GTTGNAGCAGAAAACAGCCGCATTATGGGGATCCTCAACA 1+#5E-5H"%#<'BF:2&.5*):HF*%%9"A3')?--7"- AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C0G33T0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9858 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5517 42 246M = 5477 -286 GTGAGGAGGNTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGAACANACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAA ")1+F&B+&8C/*$2#6312G-+8#7F!(798FAA:.;:#+>#3(=-6DF8:E"((:>.(7>E&-2G70B+@.?B5A$;&&6AG<=;:"$C%D0!D;20#E#A0&G?/&/-!G6.(F,H59%HH6*0!')A.#+;+/:7$F6F5)0F5<#(@0;FD*5+7A'G>.')&9-2=;&;(?,D'@8;8H$8!3$;A92".!.'?*(GD):1<5 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48G5G31 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9859 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24456 42 76M = 24265 -267 AAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCNCTCTGAAAAAATCTT ,.@E0'>A&$96>?9-80+=5?,%4%@):?-"H0:((%5)+4'65==6,AFG82#.@H2DG'<%<%C6E/E:B*G> AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C15 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9860 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26837 40 75M = 26705 -207 CCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACNTTATNACTGAAGNNTGGTCCTTCNAANCATCTGANCGTAGNANT %"%'!$'++&#+'"#$**#+%**''#+*#)!())$"&$%#(&$"%'!#(%"'()"&)#'$&%*$$"&!((!!*#* AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:16 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:16 MD:Z:30A2G1A2A0A1G1A0A1A3A3C2C6C0T5G1A1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9860 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26705 40 57M = 26837 207 TCAATGCTTTCACCTAAGGAAAAAAACATTTCAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCT FB;5&,2"#/-9)11)=B?%C3=1*7:?)8>9'B5EBH"1/,)?<@(,C'B.;(336 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9861 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24217 42 149M = 24111 -255 GTGCGGGTGTTGAATGATTTCCAGTTGCTACCGATTTTACATATTTTTTGCATGAGAGAATTTGTACCACCTCCCACCGACCATCTATGACTGTACGCCACTTTCCCTAGGACTGCTATGTGCCGGAGCGGACATTACAAACGTCCTTA 3(++G0,A8A,H7.-.=209*3$=,/$03*"CBHDC+5#C>3?*/@F:>+&9/B(++.F02!$"9;0$C,72,4+C;9'0&6/F(?@)6G"@@$-9?E:,$GG=>F:28H=H"@)&D/E#%38?.0;/%-( AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:102G45C0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9861 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24111 42 63M = 24217 255 AAGTTGTGGCTTGGNTCTGCTAACACGTTGCTCATAGGAGATATGGTAGAGCCGCAGACACGT '&D$B/>1)89)*/2D#!!"G*C#B9F79G"D(<9<#7(0"0?B'&9!DCD3>?(&;'1*2$0 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G13C48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9862 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27097 42 247M = 26991 -353 GGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTNGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATGGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGAACGATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAG (1(%6(",>+3G6&1%8EC<5G'&,40:B"DF/@%<,7707$*=E2/%:G0DA8-E*.%)G&A=0(2?H99=8-*-C840#DFB*8G)6:&1H6<"(-8C?D!C+>C4E=-1@@9"+'&.9@1@()/0>E/94/-5;'/2"=D$?)/3G$#*DB?@1+E?'*+6*?&54/.(%<+@G-),&5)84*0D<)-5G4F37;*$,9=&)E.'1,.A4(F"@!@:2;?"#,.C$BB#13.B7+14$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G199 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9862 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26991 42 106M = 27097 353 NATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTATTAAGTTACTCTCTATTACATACNNTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAAC &8C;+:=0<8=&"EC5(*.,G&=G>0/56H0EA%5$?B3,ED,/)?0G.>,3;:%>D<18*.;!<6;9>8:B*:0/)F,G)CDG4+"9,C3#EE!-%2=H?$@/1& AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0T45T23G0T34 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9863 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4231 42 44M = 4375 269 ATGCTGATAGAAGNCGGACNGAGTACCTACGAGAAAGAGTGCGC C:G4;95HH(:+<*H@00G?+#)G/3$FA55=@0F@319C>'"D AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13C5T24 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9863 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4375 42 125M = 4231 -269 GCATTNGAATCCGGGCTGCGACATTCAACAGAGGAGGAGAAGAGTGACAGCAGAGCTGCGTAATCTCCCGCATATTGCCAGCATGGCCTTTAATGAGCCGCTGATGCTTGAACCCGCCTATGCGC .@+6B$CAG=D.8-0C/C+G+//AA!!6HF+$#74+FHG>=.D,>6#72(&CH@'&A.3!)1.D3C,1$4-*==F*.A4BEH6-"+305:&%D1%5.>(3"0?8&.)H/A?B$AG364")0G9CD AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5T17A101 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9864 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43497 42 97M = 43276 -318 CACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCGATTACNACAAACAAATTCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCNGATGAACTTCCGC =7;+/>2,"*F?$=>9#&FH#4$=82*!.>:%!G8$(4'#:!.,D(B;)*4'2B1D:0F92"-9!1;'/@$#6?A?'@!#<24D2E'*C, AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:45G5G31A12T0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9864 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43276 42 221M = 43497 318 NTGGCGATCTGCACGGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAATAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGCTTATCAGAGCGTGGAAACGTTAAT !B3HG+E0CE)4B46D&?8-D/G(F:5G90:87<'&9*7/9"A3-B<+0?976>.(*&,A6B(G/,8&1)"2?7?-"+D%=?=28.>9/%,;G:1+2'%>#7)86$&8-=EBH@-3BG!5>/2!$C:./$!-#>$33'G>)#9/":H5=E+6.!-4>(;('.;/:9/34%'F;&E/,'(23.?&>(B:22<":DG(0,E!74>8!-*?G+F-"=>,#(->0>>4E5!3425+.@%AA+<>*G31!8%=:A77F/EA3<)18,@*6D(9@ AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:130 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9867 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6229 42 23M1I124M = 6398 299 ATCCCTTCACCACGGAGAAAGTCTTATCTCNCACAAATTCCGGGACTGGTAAACATGGCGCTGTACGTTTCGCCGATTGTTTCCGGTGAGGTTATCCGTTCCCGTGGCGGCTCCACCTCTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGA 1D""7H/):<2*B67B?@4%*,B=A5D::BA3."79*D.%AF??.9$%1F#FD.%,4<.=D0-##80@&>2GE%G*C8! AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:2 MD:Z:29T117 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9868 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3821 42 114M = 3679 -256 AAGTACCGCACCTGATGCCGGGTGACTCACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTACTCCGTGTTTGAGCAGTCACTGCTGCGGTATATCGCTGCCGGGCTGG 2'D&>5'1B>A7G4E/3,;,47G+<+1;@;@3D=,2@76@F5=-A"-!&-!)&+9B+#=5C7>2#'+=AF&:0B AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17A32 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9869 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29151 42 51M = 28926 -276 TCGAATATTGGTTACGTCTGCATGTGCTATCCGCGCCCATATCATCCAGTG "*+7%A!2E#,$D49452@C-/H6!?H.%F!<@@:DG$*9/B4G74F1DFE AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9870 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30552 42 13M2D74M = 30771 265 TTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCANTGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTT F)E0?EG4A5(4;$6;1B8=?%EE*$&*)!8H>18#"C8C8()*@E-E&$"=4)?&08-)C*D:>=.$9@)6(+)HD>A0&F4$,&C AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:3 MD:Z:13^TG33A40 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9870 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30771 42 46M = 30552 -265 TGAATCCCATCAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCT 3C,:$0C=%=&5@G2C$.$%>+2!H,9/0)-,..;E>'*CB:5'"6 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9871 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15798 42 52M = 15653 -197 GCNGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTACT '0#'.//&8*?C:.C4@?AE+92;@&"(#-EDA7#<&=FH4!="03$:<+8( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2C48C0 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9871 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15653 42 93M = 15798 197 CGCCGGTGCTGGACACTNAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCTGGTGAGCAGGAGCAGANTCCGCCGGAGGCAT 2E%?./;63">G;5+D%(G:*"!6@A,('CD.)7C+-1+58??672H'!+201H1(55;+%.H$B?BED9#(-2-+F1'>)??3,$,4!A<#1 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17G60C11G2 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9872 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45365 42 389M = 45754 480 CCTTCTCGACTTCGCCGGACTAAGTAGCAATCTCGCTTATATAACGAGCGTGTTTATCGGCTANATCGGTACTGACTCGATTGNTTCGCTTATCAAACGCTTCGCTGCTAAAAAAGCCGGAGTAGAAGATGGTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCAGAAATTATGGTTATGACGTCATTGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACAGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGCCTACCGCAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCT %E*7"B7612<#%.(C?>,;'6A>?2E*?6),C2$-D20%F-9+BF'B479$+EA*+=?#('/61:.)-C.*74/H5$8);.D.?5;HEE'%F5-(-*9H2A#3:.1$A6-;?2+8-.>2<->?7>A#)&E-5?8-?+575;8@3H1'0%(10$:C=11"1&-/3?&AH8,'B+=B'.+)8383"8.C23.C.D5A9CA:784;<.?E4C):1G*,,5BC)"$&,<42>$H-B>)5/46"'?H(A/6&58&%/5!2$;1=9AA%!?$/+!+!FA?CC+D=;:8-/H"G-,BECA=.7F1<73BG(>C)C'B0/0BD<@EFH9($6)B0-HH1))"2/385-4)'?!65)9A:5'"!=7/&'&69+5G-D#-E0' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:63C19G134C170 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9872 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45754 42 91M = 45365 -480 CCGAAAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGNCGCTTTACCTATGATTGATCGTGNTGATATCNGTCAGGCAANNG %%!+((!(*$+$&!(&(&&)''#%)*()$$&'%*"$")'"(*"'$+##'$%+))#*%#%&!%"+&"")#"%*%$$+&$"+%'+'*))+$(( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:46G23G7C9T0C1 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9873 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39513 42 42M = 39513 0 GGCAGGCGTGACAGCCAGCAAACCAAAACTCGACCTGACAAA >%6H:=@#8C%=?EH$$H(0F5=,6))!H;5F@<'B1%=*+52G1<1">)'>/'@>7<@)7D8":.=1#G"1@8:)@;2,,H>'*B.CEGC!$+1)&%;637/A6<91*239?.DB9DB+G%-#2)=(8@('6:.>C!+,AE+FB->1A0DA)DC%6!%B:1F"A;.104>H=,5.%96&3@'@DD/$&531=0.798(-18A#,#C*+<:*ECF.;F662-HA=(2(<=?3H&;$6E>2#=9F*:*5<&2/(61.-/--7$B(E8%52*9@87??).,.F>D03D7(-E$@$.6$;-A=:&%*-0:C-&%44724H$H),=G2-$$$!5;51,/C&3!.@<1&!(+.2G./66%"7%G=<1D(-5013F97C641.6:F!A94#H68#C;*@H0BGD1D*;+@>18C&4.AG/ AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:185T0C23C234 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9874 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33851 42 78M = 33406 -523 TTCTATTGATGCTTTCCAGTCNTAATCAATGATGTATTTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAA @"8HFFC8*G>&H%.1)C$*/,D*19%DF;0')7*=9>1&2?,5E0&0;?##:E#0;/D=AD#?4CA$>++"!87;=H AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G56 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9875 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45565 42 297M = 45862 618 CGTCAGAAAACCAGAAATCATGGTTATGACGTCATAGTAGGCGGAGAGCTATTTACTGATTACTCCGATCACCCTCGCAAACTTGTCACGCTAAACCCAAAACTCAAATCAACNGGCGCCGGACGCTACCAGCTTCTTTCCCGTTGGTGGGATGNCTACCACAAGCAGCTTGGCCTGAAAGACTTCTCTCCGATAAGTCAGGACGCTGTGGCATTGCAGCAGATTAAGGAGCGTGGCGCTTTACCTATGATTGATCGTGGTGATATCCGTCAGGCAATNGACCGTTGCAGCAATATC 5@"1+/3/?-@/>7A?1A;%>0"0!&/@)@&4">D<+,0D!=FH<=@>&A6*;@H$#8*BD.F..',A);2+.6EA1A::@.8/?1@(A&'+:D&-9A$*7"!.%@0'=6*,(6(/DC5<=E$=:.0+,0=&-975**@-"#,.17<)'F-31>#(,,6& AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:35T77A40C5G32A84C18 YS:i:-38 YT:Z:CP jpayne@0: r9875 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45862 42 22M2I68M4D227M = 45565 -618 TGGGCTTCACTGCCGGGCGCTGNAGTTATGGTCAGTTCGAGCATAAGGCTGACAGCCTGATTGCAAAATTCAAAGAAGCNGGCGGAACGGTCAGATTGATGTATGAGCAGAGTCACCGCGATTATCTCCNCTCTGGTTATCTGCATCATCGTCNGCCTGTCATGGGCTGTTAATCATTACCGTGATAACGCCATTACCTACAAAGCCCAGCGCGACAAAAATGCCAGAGAACTGAAGCTGGNGAATGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCNGCGCTCGATGCNAAATACACGAAGGAGTTTG (%#*!("*)!!%'$)*'$$$%#%%$(('+!#*('"$)"'(&#*+$'+$&(+'&%$&'*%)$$$(#+$)"'!!!(%'+')%#&*%#")!')&$+!+"!'(+!+#!)"($(!)"+')#$#!+%"!"#*""(#(&*'('#!*#++)'#)$')*''!"#"$+++"#!(*$%!$'$('*!!$%%%$"%!)&&*&%&$*+""##(()"#(!($+#"(%"&*!%*#'+*"$!!''+%'+#!+"'&("%*'(&)#)%")*()#!%++'**)+&*)*'!*$(&+#%#+"#)!'"*(#&("$$!)''*$&*(#$!+(&!#&)+''#&'! AS:i:-38 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:2 XG:i:6 NM:i:14 MD:Z:77G12^AGAG37G23T87C3C41T11A17A1 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9876 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2211 42 44M = 2255 248 AGCATGCCACGTAAGCGAAACAAAAACGGGGTTTACCTTACCGA =;8$76*96+4.2<:='FF1/"?>'H12#*?4$,=*;!5D#.H< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-12 YT:Z:CP jpayne@0: r9876 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2255 42 204M = 2211 -248 AATCGGTACGGATACCGCGAAAGAGCAGATTTATAACCGCTTCACACTGACGCCGGAAGGGGATGAACCGCTTCCCGGTGCCGTTCACTTGCCGAATAACCCGGATATTTTTGACCTGANCGAAGCGCAGCAGCTGACTGCNGAAGAGCAGGTCGAAAAATGGGTGGATGGCAGGAAAAAAATACTGTGAGACAGNNAAAAGNG *%#*('%(%(#*+"&%)+)%(&$'"*(()&&'#(++)$('+$#&+&(%$(%(()*$(*'++%"++"*(*'')*!$*)*%$!+'&($%)(#'("$**$&+++"+&%(*)!#"$'*!()#(!##&%**()"!""!#$++#""%#'*!+()&)'+"#$+(*"*#%+%*%#%'$&"&!)+"%"*&$&#%"#'%+&&*+('#"'*$&&$ AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:90C23T4C21T47G5C0A5C1 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9877 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45040 42 221M = 45261 265 TCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGAACAAATCTGATTACTAAACACAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCTAATTAAATAGAGCAAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTT 92D,D/G+"&C;,5'5#-2((:!;;+F.13.>"!7#&DF5*BD'?(%"4=EE&A8B%G;30:<,3D131/"AC!94-&8H3,D0&-D#!33(+/8"64)&@B.5:994HDF;3/4B6,-,.7.5,<;5+?=6D(9H"0B465?0>9$='=?:*1G?93F"A+!,G0;&)#%>=C*F'E)ECA"35>E*D""<<2""/(.'D!CF0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:221 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9877 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45261 42 44M = 45040 -265 GCGTTTGCAATGGCGTACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGC '8)@-B,:7<%&(*1@-0@&.*20!$0-;7/?A"@:"4E=6/?F AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9878 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10492 42 356M = 10441 -407 TGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAGTCCGGTATGGCTGAACCGGTAGGCGATCTGGTCGTTGATTTGAGTCTGGATGCGGCCAGATTTGACGAGCAGATGGCCAGAGTCAGGCNTCATTTTTCTGGTACGGAAAGTGATGCGAAAAAAACAGCGGCAGTCGTTGAACAGTCGCTGAGCCGACAGGCGCTGGCTGCACAGAAAGCGGGGATTTCCGTCGGGCAGTATAAAGCCGCCATGCGTATGCTGCCTGCACAGTTCACCGACGTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATCCTGCTGCAACAGGGGGGGCAGGTGAAGGAC H!C!$AC//6"4C166,>='/8?7=C(:6?A'D<>*+)@$F9G2#.HB=+7D?2.*>'2?H08.2#;A7..-,?(;&12=@2+5:A(0BF<1;A)HA21,&*#$-F8-3C52*.-)41;:;,#3=#A?:%@C44#!;-!2<9(8C+$D',"'F&1?E>@#'B:@!H)H2(19&'2.;EBCD.%H@40;G06198(8E27,$HDD($2+;A=*/;/:?HG?,<4C&F;!-3/360B@$C447(5+)CD-/)5EBG"(1!A2$(.,EB==;1'FG/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:132G223 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9878 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10441 42 51M = 10492 407 CGGGAATGAAGTTNTCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGA +$*')8@<;F=.'@:%#0*9?5.+84A.EB/;5AD-&)2.8EC7=1!82F6 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A37 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9879 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10157 42 379M = 10536 476 GAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTACAGTACCCATTATTTTCATGATGTTCTGCTGGATATGCACTTTTCCGGGCTGACGTACACCGTGCTCAGCCTGTTTTTCAGCGATCCGGATATGCATCCGCTGGATTTCAGTCTGCNGAACCGGCGCGAGGCTGACGAAGAGCCTGAAGATGATGTGCTGATGCAGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCCGGACGGGAATGAAGTTATCCCCGCTTCCCCGGATGTGGCGGACATGACGGAGGANGACGTAATGCTGATGACAGTATCAGAAGGGATCGCAGGAGGAG .D>G;7.*G@.-CG1'<=:)!C;%@0G0C017@3.%B'2!.87B-7>87(845@(!D8;==;-4C))76EA?)E,:&"2*);'3,<+=#@81E&)H/=?"B).)!D*B.+%$+.;$0BDG.'4,F01H*!&G4%&-#6#=;@F<=8$#H4D+&7.5A"7!9,7-9'%,D21.*%'.90/"1+4E@F0:30)422B'/B:+-F0=$>C;#<00/0C:4C-56E:D<#A"C).=()F+'-B480G:!,62?C!FH4(H-!H*.$E(G@@!=C;@C0+/"G8#6:2HH'$(=1GB4/%'"GGBB=,&H%1E8C;9912G:$@?F2):ED<$A?$<1?.(@#3*&6"?9H+*"9:(/06BB;?13:/<61(G>9E%G)A-5@'7A;6HG4;,"F:<#D*$EG:H'98=>?2-C)CC'5GA"0D$B$>35%/=..7.<325=$!<.08@07@36FE%G37,'3&:BF AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:97 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9880 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34889 42 115M = 34889 0 GATTGAGCTTGGTGTGTTGAACAAAACTTTTCCCCGATGGAATGGAAAGCATATATTATTCCCTATTGAGGATATTTACTGGTCTGAATTAGTTGCCAGCTATGATCCATATAAN 77#)8=/+(%01"!"E+8'A,(7>&,D6FBD0*BAD/9%D>C!0#B(C?.&E,,/E8C.7+B<;/%G@<,;@0':?<*=,@?;;?.'@AAHA85A,>9E>B>41A7'8;%3D-B% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31T50A31T0 YT:Z:UP jpayne@0: r9880 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34889 0 * = 34889 0 GNGCANNCTNGTNTTTCNCGNGNNGCCCTTAATGAAGGCAGNAAGTATNTGGTTACATCAAAACAATTCC &$'$'"!%&'&(")("##&(!%'$+%''!)*)#!(!#*!$*%$!%$'++#&('$'+$*)('#%*'(+"+) YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9881 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17116 42 89M = 16907 -298 GTCACCGACGGCGTGAAGGTAAAAGTGAGCCGTGTTCCTGACGGTGTTGCTGAATACAGCGTATGGGAGCTGAAGCTNCCGANGCTNCG +**&!&"*!(!*%'!&"%+++!)$%!()"'!*#%*#+$'++!"*&#+#)#'&)(&'*$&##&'+*'(&$('))$'*+"()()&*%#$(* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:77G4C3G2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9881 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16907 42 160M = 17116 298 CAGAAGGGCTTCGCCATGTACCGGGCGATGTTATTGAAATCTGCGATGATGNCTATGCCGGTATCAGCACCGGTGGTCGTGTGCTGGCGGTGAACAGCCAGACCCGGACGCTGACGCTCGACCGTGAAATCACGCTGCCATCCTCCGGTACCGCGCTGAT E"8E-70%H>886HH)+"'@0<&AD4D-9<*F(G4H8B6C@5?$>B9A1>"=B>/C53><&F6H8C6/B8>3>'4CD2?++3C4&->H&+'0#@9,<>+/>6!D0G3,,=,+;)=$8C,7('),:,:/":+H0>!;>.:?HD,/&6,0*E-E6A)':52"=,!F!.=&$*@)>%A+:+9:*1),#*%13#"H, AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30G57G37 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9883 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43206 42 70M = 43276 267 GCGGATGGAGTGAAAGAGATGCGCTATTACGAAAAAATTGATGGCAGCAAATACCNAAATATTTGGGTAG +%&"$(("!"+$#'*))*)*%"%!(+*(*'&$"&#$&+$#!!(#+)+++&&*!$&+)*"#"'#&##%&'' AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55G14 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9883 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43276 42 197M = 43206 -267 TTGGCGATCTGCACNGATGCTACACGAACCGGATGAACAAACTGGATACGATTGGATTCGACAACAAAAAAGACCTGCTTATCTCGGTGGGCGATTTGGTTGATCGTGGTGCAGAGAACGTTGAATGCCTGGAATTAATCACATTCCCCTGGTTCAGAGCTGTACGTGGAAACCATGAGCAAATGATGATTGATGGC 540-0@ED7>=1=B/A3"74A?2&+GF9D%D19")&?;,B(B(F:E!GA*A*43H*C;CC0;9/:*-#,&!/+6"26(G(8)):4-5B<33:8*@BC&/9B&-:096!*9)>+/;/D5>A&>B)4,#,*8G3:%**E:&E#6'-9"7E:E9?:A,+)(5B:<.:,7%6@0F#)CAEA%-$D-+1<5-FD*:6%9%#E AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14G15T166 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9884 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5649 42 384M = 5591 -442 ATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACCGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGCCGTTAACGATTTGCTGANCACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATTACCAGCCGCAGGGCAACAGTGACCCAGCGCATACCGCAACCGCGCCCGGCGGATTGAGTCCGAAAGCGCCTGCAATGACCCCGCTGATGCTGGACACCTCCAGCCGTAANCTGGTTGCGTGGGATGGCACCACCGACGGTGCTGCCGTTGGCATTCTTGCGGTTGCTGCTGACCAGACCAGCACCACGCTGACGTTCTACAAGTCCGGCACGTTCCGTTATGAGNATGTGCTCTGGCCGGAGGCTGCCAGCGACGAGA G#2%C'=G(2-50$H&4"E!0>->G#);.(+@*3*<.%'B&):#;'91'(8:4,E"'6.C@7)F/5%97E-6.26"!-46-2%@#;!G1<%"5>355?;H14%8?G?(F++E4@>8.%FH=5$C$D9&A)6=-=.0*8!,1F+D4EB"G,0)H0H/.)D:8.E&A"H!2.80&(>#.B74,(/935B%G%)$#.H+'>HHDD)4"+%D+=08$G0-;*#6G&$6'+H&51-639G9&&A54#CD)9,>;(G-E*?<,#HE=>?-='0C;7C+<+>#;F+=?91&<5<8>C==039014:%(*2*0'06">"/'*;C6<45!?&(3#==@97#C1),3D@$3!<:?47:&+31E AS:i:-14 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:75A75G2T30G49G114G33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9884 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5591 42 58M = 5649 442 CGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGNGCAGTGACACTGCGCTGG =!A6<;?8'5C68)DB0=(/2"+$8?/@FF,6;=8D$$$5*'>6#+3(H3>/>D.).( AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C18 YS:i:-14 YT:Z:CP jpayne@0: r9885 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 423 42 116M = 237 -302 AGCCAGGAACTATTGAGTACGAGCGCCATCGACTTACGCGTGCGCAGGCCGACGCACAGGAACTGAAGAATGACAGAGACTCCGCTGAAGTGGTGGAAACCGCATTCTGTACTTNC C4;74/#D&"B,+G0=%*=-565"D$**E06-931@H4/(>E#@<,6D)(F0A.&0!6#.,5B1F&#=0>#<$(HF6#"4H0-(1&6B6G43142/F&=#EH*?A1%(HB@;?6&! AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:22A49C41T1 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9885 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 237 42 77M = 423 302 CCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTAT !+*#$'+&%$$(+%&!*&'()%&)+*'&!""+#)'&'$#)***()*#$")$'"+($*%&'+!#)%&')"(*)&$*"# AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T76 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9886 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48314 42 102M = 48173 -243 CGTATTCAGTGTCGCTGATTTNTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGT -32#:$D-BH!>=>G$B@E1E>(!E@6:C)$1=2:C=,:8-@"">4F=.F.97B7(F81C)/B?,(4@&85F-<1F%!B@3(+5(8)+"&*/A1>G":83;< AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21G80 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9886 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 48173 42 51M = 48314 243 CCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCG !;*'A+'+;C"2+&?%9%?52@'=A>8=-F?)*.@G78=5':@!-6@>:!>8)*&G<1C-0H+0 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G0G48T11G37 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9888 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44816 42 84M = 44572 -328 TCGTGAAGAGTCGGCGAGCCTGGTTAGCCAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAATACCGGAAGCAGAACCGGATCAC !*#'6G4B'*5,'5@9=%+76%16G#@-"1)&;=#8$!"5!"@%:.&E9('0H1+!DB2D"C8773GA$4>=7=E1A0):;A?H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:84 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9889 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16413 42 41M = 16268 -186 CNTCGGCCAGTACTGCGACCAGTCAGTGCCGGACGGCTTTG !<#;2A7E:#=5H:6H4-A6B)A&!96$;E2.4)(2,39F2 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A39 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9889 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16268 42 75M = 16413 186 NATNCAGCGGTNTCTGGGACGGAACGTTTAAACCGGCATACAGCAACAACATGGCCTGGTGTCTGTGGGATATGC $'#!*+%*%&**+#$+(+'*"&"(%"*!"$)('+'$"+#'&&((*)(!"%!%"$"+%+!)&)#*&%"+*+&#&(+ AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0A2A7A63 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9890 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27024 42 116M = 26762 -378 CCAGGATCTNTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAAAATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTAGTTTTCCATATTTAGCTTNCTGCTTCN -B$'C&'#&DH3?#60A<78+=/4$<%G/%79A(BH#*!.92083&)$"AH'CD=67!-!*D$ AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0A8C97T7C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9890 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26762 42 262M = 27024 378 ATTAATGAATANGTGCTTACTTCTTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGNTATCGCATTTTTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTGCTCGTAGGAATGCCTTATTTTTTTCTACTGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATTAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAAC $76>A#1#8B+:'D25-!2@:?$AA&F/10&>0#-$&5+-3:E<5#;*$68/5D9*A5/E>9('1#?9778D?>5F'3$(5H4@2:B+"3+8>%H-@&E'41D25G/:4))@)9+"F)#+;2F"+3$9#E86?79#9D<,17FG,-!*#F4C30$:HDH?=;0:#*8).H5F#9"&);60+$(?6(H@E.!'#$&+5,E'$D'F?48:C*8)H3+9$$7;,&-9:E.3.%#<>?$9-F28-??*4-FD+>C0'/!&.1--G$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11A48A201 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9891 77 * 0 0 * * 0 0 CAATTTACTGCGGCGACGGCGNGCTGTTGCACCATATTCCTGA 0),$?1F'<$HD%@47D9(')"@D,9/@E8)>.!F/C2G**3- YT:Z:UP jpayne@0: r9891 141 * 0 0 * * 0 0 CCAGCCGTCGCTCAGTTTCTGACGAAACGCCGGGAGCTGTGTGGCCAGTGCCCGGATGGCTTCAGCCCCCGTTTTNACACGAAGGTCAATGCGGCGACCAAATCGTTGTAAA )>3/%7=%8/0E##>.()?>H>A%&1FA*&<0B6@H&//C<'(>H=%B@EC&5$84A&=%>/(4B(#;%D"9#E?8E8'>,?4@5E5,%643@&-+??5>/35A*>#39#A- YT:Z:UP jpayne@0: r9892 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17805 42 140M = 17805 0 TACGGCGCTGTACTGGATAGCCGCCAGTATCAATATCAAACCGGGCCATGATTATTACTTTNATATNCGCAGTGTGAACACCGTTGGCAAATCGGCATTCGTGGAGGCCGTCGGTCGGGCGAGCGATGATGGGGANGGAC #%&*%%!!)%&'%%+"(#(+&%&&)$!+%#*'$!$(+!*#!'(('""#'&#&%+#$)!!#)%"("*$*+%%$!""((")'#'&)))&*'!*&!*&#&!$($'&%%+#)%%*(+++!%%"*!"$*(#"$$#+')"(($$$( AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:61T4C64C3A2T0T0 YT:Z:UP jpayne@0: r9892 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 17805 0 * = 17805 0 TNNNCNCGNNTACAGCTNGCNNTTGNNCNTNNNNTNTANNCNGNNTNCNACNTTNCNCGGTNGNANANNNTTATNNNNGN $""$#$"$!!$!$#"#!!!#!!#""$#!"#!#!"!!$$!!"#!!!"!!"!$$##!$"#""$""#"$#$""!!##$"##"! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9893 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22042 42 125M = 22251 300 TTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATTCCGCCTCATACCGGTCTGCCNGCAAACAGTACCGATATTGCACCGCCAGATATTCCNGCTGGCTTTGTGGCTGTTTTCAACAGTGATGAGNCATCGTG +A?@C?A&=10..*<.=91+!H,6/2G51C!F6"&CDC+A#>(B"244*.#)H:6D>*B=//#74CG%BE.&EG%*7;&(5E8$.$C-(H)G,)9")11/;)F1%***5D7F/"F4>D,8#'&34 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47T35G33G7 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9893 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22251 42 91M = 22042 -300 NCCGGAAAATTTTACCTGGTTATCGCCGGGAGGGGAATATCAGAAGTGGAACGGCACAGCCTGGGTGAAGGATACNANNNCAGAAAATCTG #&)+%#''$+!*!')'!"$!*&!$)")%%+!!$!"#&+*(')$""$"#!*)*$""*"#!"!!*+"+(#)()"%+)#$"%"(&#('#""$%& AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:0A74G0G0A0A0G7A3 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9894 153 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23059 42 130M = 23059 0 GGATGGAATTGTTTATCATAAAAAATTAATGTTTGAATGTGATAACCGTCCTTTAAAAAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATCTA )*4+<'E5*%E4452$:H)+59H;)A3:;5>*#E,&!2<#:"C'BF#;#4,/E5##"D)"1+C7F>;+B11B1!,3''.34(,%AH!<@*%#'<(4G-!E2G$H-(&E/B77666 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:130 YT:Z:UP jpayne@0: r9894 101 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23059 0 * = 23059 0 TGNNATCCAAATGNAGNANNAGGNANTTGTTATTTTGGCTCT )*)!&(%(&!)'#"%'"%#(%*$*$"++(#!%!()()%&&*% YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9895 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35183 42 142M = 35347 257 GCACTGTAAGGTCTATCGGATTTAGTGCGCTTTCTACTCGTGATTTCGGTTTGCGATTCAGCGAGAGAATAGGGCGGTTANCTGGTTTTGCGCTTACCCCAACCAACAGGGGATTTGCTGCTTTCCATTTAGCCTGTTTCTC ''EF7C('%"195->7*').H<$>A&>8C':73%3&,!*F+G3;25F,H+7(@>.!B/,?1@CF79(3*EC%/H&4-), AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:80A48G12 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9895 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35347 42 93M = 35183 -257 GTTTGTGGATCCATCTGGATTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTANTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATT ;8@):0-C1H.#G@1:3*#9:'A$>C6<#)C;9$+)-HC90,3/7+#8.#=$5$F)*B@F'CE#!B8+'@;>&F%7/?C<4&A,5<,3:DC45 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C51G33 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9896 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3579 42 181M = 3490 -270 AAATGTGTTTTANAGCGTGATGGAGCAGATGAAGATGCTCGACACGCTGCAGAACACGCAGCTGCAGAGCGCCATTTGGAAGGCGATGTATGCCNCCACCATTGAGAGTGAGCTGGATACGCAGTCAGCGATGGATTTTATTCTGGGCNCGAACAGTCAGGAGCAGCGGGAAAGGCTGACC %:624>0,A(-D;!>):G>G!77/.BH:A+F*:%=);%B'1 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:53 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9897 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21197 42 90M = 21406 262 GATGTTCTTGAATACCTTGGGGCCGGTGAGAATTCGGCCTTTCCGGCAGGTGCGCCGATCCCGTGGCCATCAGATATCGTTCCGTCTGGC &4!595,+3!'.)B176??=##G:E6#H8'&>H.H7%&B?A2#!=B*"';%D02>F@-'.@=363,;"FG=G%-41&6F#%*:G&7>H@400""B/&:$=.!99&*<94HD/)DC>*1=2F6BB'A4;G@'$E$E2..)#1C6)+D'8E,:=)!D"E786E1/"D9D-)%F+-19*9E=1/+4"CGA#D*=0'6E>DD9>#G"60G#-F@E;*?&7.$:">A$F9F<(<#B5:<-HC0=BF20'77C* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35G196 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9898 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19340 42 149M = 19489 381 GTGGCTCACAGTCGGTGGTCCGGCAGTACAATGGATTACCGTAAGACGGAAATCACTCCCGGGTATATGAAAGAGACGACCACTGCCAGGGACGAAAGTGCAATGCGGCATACCTCAGTGGCGTGGAGTTCAGGTATACAGATTAATCC H4G@.)''7(=<%.C7'DE+A%+.C<)"HD!G2C%-@?-,2A-6;1D/6"@*(HD%G667F2#&@+A&3/(**=259@@?<27F:$+H?*8*E3A%@-@/%*./-+=C#7&A+&D!63A)'=G!@>&&:#( AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:129G19 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9899 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40063 42 45M4D315M = 39833 -594 ATCAGAACATGCGGGCCAATGCGCTTACTGATGCGGAATTACGCCGGCCGCAGATGAGCTTGTCCATATGACTGCGAGAATTAACCGTGGTGAGGCGATCCCTGAACCAGTAAAACAACTTCCTGTCATGGGCGGTAGACCTCTAAATCGTGCACAGCCTCTGGCGAAGATCGCAGAAATCAAAGCTAAGTTCGGACTGAAAGGAGCAAGTGTATGACGGGCAAAGNGGCAATTATTCATTACCTGGGGACGCATAATAGCTTCTGTGCGCCGGACGTTNCCGCGCTAACAGGCGCAACAGTAACCAGCATAAATCAGGCCGCGGCTAAAATGGCACGGGCAGGTCTTCTGGTTATCGAA 55/?%8H3-%=GD@#?&8E?#>A73(F/+:*?!*4'-B5D0=*C72".'=#%$".%/E'05'@#E"57H49,&>4H-E,@4A:(:.5D<.$+"':A,>*1EE@.6GA1C-H2/!#;B6A'>,G),'1CH;0C=3+?+A!1;1>!#4C-8H2,50DD,!A+))0@=-?H682FD9C(((-$@&.(@1*462E);-4)+E3::@AB!;H+90:5>)*%EGG9,2G#!$'$-5#%1%496G1:.G7C7>35G2D),:0/&2=,2G-$/=A!E4$&@7B8!,"37@:+#/*!)!,C+A4#A*:%>0%%G;>;%$2C0#A8@HF+?-E9GE,/,@<',8%$B:0C*1:C@..05;4'3FG.*+FE=<,/D<),%$&F@9=!F(.D,'5"DCD0!&3G.A;%2/1#$D(<8A"%%7:51:/F108;<+H+)!.FB0>;#41?>?2/6.A'@!*E71,ED*($7#*7145.75!(@!D:36*A"7"62E15H3!1%%/&!3 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:26G15A55C99A31 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9900 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34447 42 116M = 34135 -428 CGAGAAATCGGATAAACTATTACAACCCCTACAGTTTGATGAGTATAGAAATGGATCCACNCGTTATTCTCGGACGAGTGTTCAGTAATGAACCTCTGGAGAGAACCATGTATATN #=3<%55?80C5.5H':0AG,$G(A%3(:*1<+?#F$+=0(;2A7)H.->-55DBG0/-.6<;$E11)/3" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:60T54G0 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9900 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34135 42 312M = 34447 428 GGTCGTTCGTATTGCCCATTTATCGACATATTTCCCATCTTACATTACAGGAAACATTTCTTCAGGCTTAACCATGCATTCCGATTGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGNCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATCACNTCCTGAGGATGCTCTTCGAACTCTTCAAANTCTTCNTCCATATATCACCTTAAGTAGTGGATTGCGGTAGTAAANATTGTGCCTGTCTTTTAACCACATCAGGCTCGGTGGTTCTCGTGTACCCCTACAG ":H12H&4A0<-CCC.:'$G,4:+CGG,.3*66F,,$A0.G;$)8""0:!=$&,B!8&!587#/EE??C8?D1'5*?%4/$%B9$%*+6%8A/:'3,.>#0)4+/)C+,FD'&"6+D'G@=+C9#;FD<3(&!;!D62/&=G&=65'79C?=#.@G?!H3&&B,!G3$#&B#,2%>5B4>FB!=H>E+%4F+9<":73?3!.G9+3EFC#D7&>4HE7"785-0#:?.908E<(>CB+1:)8E+69/*2+=8>7><0%3.+#);/C?$&(0:34C(:#&!5&8.;A,G)1''.&GF2B-7!GGC2+#@0;=; AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0C40C101T37A29T5T17A20G55 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9901 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 31959 42 121M1I258M = 32338 452 ACGCATCATCCCCCTGTTCGACAGCTCTCACATCGATCCCGGTACGCTGCAGGATAATGTCCGGTGTCATGCTGCCACCTTCTGCTCTGCGGCTTTCTGTTTCAGGAATCCAAGAGCTTTTGAATGCTACGACCTGTGTCAGTTCTGACGATGCACGAATGTCGCGGCGAAATATCTGGGAACAGAGCGGCAATAAGTCGTCATCCCATGTTTTATCCAGGGCGATCAGCAGAGTGTTAATCTCCTGCATGGTTTCATCGTTAACCGGAGTGATGTCGCGTTCCGNCTGACGTTCTGCAGTGTATGCAGTATTTTCGACAATGCGCTCGGCTTCATCCTTGTCATAGATACCAGCAAATCCGATGGCCGGACGGGCACAC 7HH,=?@9(+9&7=&56A,C!!G6@@F9B+6/?>7$8<.1?G'(60@!(*-#G-(+>2>"E74ECD-082)/97-!EA:37'"H0G6<%"+.!38/3?/H$.2')@$!G(9)4:*81-F:7B"2)8;5)9=DB26,83)/:B:2B3,,C1*H?""+$/?%1-?#--:AB19)5)>%H+*)883",@A;8>(=#7&)*A4)<1$E#133'%0F)-3&>'-5&CC5':(.(9:1@C6F#HGG-G=0G;(=*$9A8)-8/)?=6BC5B/C<)"!1!E51-<*#=G,3C)D>/E-'CDC4'2.A<(,F-D2'500 AS:i:-29 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:7 MD:Z:122C4T2G153G77A4A11 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9901 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32338 42 73M = 31959 -452 TGAATCATGGCTTTATGACGTAACATCCGTTTGGGATGCGACTGCCACGGCCCCGTGATTTCTCTGCCTTAGC +;6'@'6<8843..2@0-C&3&BG09?:G.44? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:70C2 YS:i:-29 YT:Z:CP jpayne@0: r9902 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12709 42 59M = 12474 -294 CNATTCAGCCCGCTGCGGCGAAATTCCATTNTGCAACCGGAGGATTTACGGGAACCGGC .7%+>5#=:4#(:A,)95#+)#01D'CE7*B26)EBA5H..8:1C=*E,1"=,%E:*D!1):@%8E9;.2B8F?.#&C2,E);!E)(:&);D,:=!!).5,.A$>H%=.,F!G*@).B?@%/.,890(/?)<4A3-,'AAD>?HA5+3B2>?)!>A&?=)D69>E0);4FG?+>5$A.C.(2*E! AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:141C67 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9903 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13209 42 84M = 13357 203 TGAATGCCAACCTGAAAACGNACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCGCGTGAGGAGGCCACGGTACTGGAGTCGTTTCTGGAAGAGC A$!:=DF9!?1?@+$01!#7CA+-*&* YT:Z:UP jpayne@0: r9904 141 * 0 0 * * 0 0 NGAACGNTNGTCCGGCGTNAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATG !)()'#%#"+$"'#+#&*&!+!#$$$%$)($)#%($"*&"$+& YT:Z:UP jpayne@0: r9905 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13217 42 44M = 13425 346 AACCTGAAAACGTACAGCGTGACGCTTTCTGTCCCCCNTGAGGA D$*'.2D4/A;7)7=!#1)59#*2?C>-9'B:CH$D,9(9C>>; AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37G6 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9905 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 13425 42 138M = 13217 -346 ACTGATGCAGGATATCCGGCAGGAAACACTGAATGAATGCACCCGTGCGGAGCAGTCGGCCAGCGTGGTGCTCTGGGAAATCGACCTGACAGAGGTCGGTGGAGATAGTTATTTTTTCTGTAATGAGCANAACGAAAA 7C4;;G-=;(H<9)@!GF<:/)*"%0>7@>47G,)89>B&,H+EC(".>*4H.=A*)::$262)"FG5#+G%3?+B:!1?9(F>,.GA6)# AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:105A0C22G8 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9906 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36554 40 220M = 36781 288 ATCCAATGAGTCAAAAAGCTCCCCTTCAATATCTGTTGCCCCTAAGACCTTTAATATATCGCCAAATACAGGTAGCTTGGCTTCTACCTTCACCGTTGTTCGGCCGATGAAATGCATATGCATAACATCGTCTTTGGTGGTTCCCCTCATCAGTGGCTCGATCTGAACGCGCTCTCCACTGCTTAATGACATTCCTTTCCCGATTAAAAAATCTGTCAGA G?%#2"@&45-3H<-380(C3*5#4B-E03B#40;58,4A)6*?@;4D/%A.&?G>86*<992=A*$:0(G:(=*D-H?#G%EBB12$'-0F&?36/H6E9.<'C6H459@)D?D#=1B<'6-A(0$4DBDH7,A./4*E+!%1=$,3<91:%9,FC11E;@(63'7)!HB5E)%?F4 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:159T60 YS:i:-35 YT:Z:CP jpayne@0: r9906 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36781 40 42M2D17M = 36554 -288 TCGGCGGCCCGAAAACAGTTCTGGCAAAACCAATGGTGATTCTCAACNTNNAGAGATTA $%*)#&!*"$+'+)%$&"+'"()())"%%'+(!%"&!(+&')+'()*#'%!!"*%*''( AS:i:-35 XN:i:0 XM:i:13 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:15 MD:Z:1G1T34T0C0G1^CT5A0A0A0C1A1A1A0G1 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9907 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35472 42 164M = 35272 -364 TGCTTCGTTTCGTATNACACACCCCAAAGCCTTCTNCTTTGAATGCTGCCCTTCTTCAGGGCTTAATTTTTAAGAGCGTCACCTTCATGGTGGTCAGTGCGTCCTGCTGATGTGCTCAGTATCACCGCCAGTGGTATTTATGTCAACACCGNCAGAGATAANTT ,!+#"9=8!FA4E%.CH!=+(='C5-H!*<($#0>+A;,22>D$EC*@)B0H1%<6*)4':F>$;%/?4@43#6):!0F.39CB@F5H'0:D768(:%"1FF&-6E//98?D775&,+9:=E$2/%2)?1>HB8ED5)9'6C8!)";)7?;)4?':@H?%9?+2 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:15C19G115C9T2 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9907 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 35272 42 200M = 35472 364 GCGCTTACCCCAACCAACANGGGATTTGCTGCTTTCCATTGAGCCTGTTTCTCTGCNCGACGTTCGCGGCGGCGTGTTTGTGCATCCATCTGGACTCTCCTGTCAGTTAGCTTTGGTGGTGTGTGGCAGTTGTAGTCCTGAACGAAAACCCCCCGCGATTGGCACATTGGCAGCTAATCCGGANTCGCACTTACGGCCAA B$7:;('/61G8#:1<8",+)D),&4&E3%+,9%AB,A"71"G>2"9"+E&324?&;4#")%-+'3441?3D%E##&&6.&()6"<,(7.);A?2&G!#?9F=36A,H/<=9DB218*@+G<"91)7&G,9'E(88)")2&9<0:0&4#E"!94(2%091E+35+?#?G76;$33;?&1"BC*@1-?'%D.1A@EB#2?.0 AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C60 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9908 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6353 42 71M2I23M = 6535 248 TACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATGAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCCGGATGAAGACATCCGCAGAATCTGGCGGACCCG <31+-')"H2G@((;*:8&!.1=97-6+GH.=.=C)@*07?(9=5/(?F!)7@6#"F/%+H481=8,=(9F092E1B/1$)."'":H0:>@4+4:5 AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:2 MD:Z:94 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9909 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15042 42 109M = 14907 -244 TGTTCCCAGAGTCGCCGGGGCCAAGTCAGGTGGCGTANTCCAGATTGTCCTGGGGGCTGCCGCCATTGCCGGATCATTCTNTACCGCTGGAGCCACCCTTNCAGCATGG 5,(GC@<($#$%:.*31?8:9;/9@&*!&40/1"072C@E<8E7)>%7%.-ED1=0.7*?3F"(4E.*3.1C!.5H*'&#.*FH7G@/0$0*.5@E+%7&61G.@?%+' AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:37T42T6C12G8 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9909 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14907 42 107M = 15042 244 NACACAGCTCCCNGCGTTTCGTCAGAAACTGAGCGACGNCTGGTATCAGGTACGGATTGCCGGGCGGGACGTCAGCACGTCCGGGTTAACGGCGCAGTTACATGAGA %.8*""CG8G>E'7..A$"D@A6?=6*8:/BA>=B*G&<79;=..G)BD(H04H.0G5C;2EC)%;-#=>')#-37B(D?)A#/=/G+>58&-<016D.8-HAH=>BHF.B9A AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9910 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43491 42 46M = 43671 239 GTTAATCACTGGCTGCTTAATGGCGGTGGCTGGTTCTTTAATCTCG >E%#)F'?52F:!.+'4D'*@*A&H7%&209G4E'B-@'4$9E(1& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:46 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9911 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27507 42 47M = 27300 -254 TGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAG 24E-1/B5";$6A2@B8854;5!.+72(>BC,B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9911 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27300 42 55M = 27507 254 GCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCGCTCATAACAGACATTCACTAC 3"<./3$?-8&+!:F,CF>#70.=*2.'F4/E@7-(D7!!?4'9#+..4697;.2BD'.137$D7A!?:E!4$1FFC3D@1G27:=6.*7G%%>D/3E* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31T70C13 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9913 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16668 42 131M = 16552 -247 CTTCAGCGCCCTGAAGGACCGCCANAATGCCNTTGAGGTGAACTGGAGTGACCCGAACAACGNCTGGGAGACGGCGACAGAGCTTGTTGAAGATACGCAGGCCATTGCCCGTTACGGTCGNAATGTTNCNN +&$(#!'+#&!'%(*!&"($+!##&')#'$"'**!("&(*!!!$**$)&&)**'(&)&!)&'#$!+)#$("(#"&"#$)("#$""$%$%+**#(#("($%*&)*&)$(+*#$+%+($$)+(***#)$$*#) AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:24T6G15T14G57T6A1G0A0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9914 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3827 42 66M = 3893 281 CGCACCTGANGCCGGGTGACTNACTGAACCTGCAGACGGCTCAGGATACGGATAACGGCTANTCCG (D5@ED=9C6@C4&"/26'7G47B;>>*6<6662?8,""CEC+%(3;.#FE4#A9+2C**#6(*;(@0*>3!C%?11:<5"@>::+D::2/21-@H)+H/%A%,/D/?9>AF'>1A+8A2B3>5*.-:$4.2@9G)/0*28%E-<;C90'-F1B652FC(1#6$&8D6A5D5C0F1#;/F:<7#!$<)*)7G:?/+G;%!.8AD9.!BG,C:C AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T164 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9915 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11507 42 77M = 11270 -314 GGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGGATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTG B)+AB+)CB*0EF#+-23.15D=,EF*8C1##AA"A2*EF:*H''&F'=67066FCC1!+!D=*=9,7A!!,%>FFH AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28T48 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9916 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41342 42 87M = 41470 172 ATGCCTGTTCTGAAGCCATTTATCGATATGGTAAAGAAATATGGCACTCCATACGTCGGCGGCGCGNTCTGCACTGACAGATTAAAA $95B9!#-37!"&&G>;E'3)68D*)84>?+#;!/D;:>>37/G4=+.,'$;(.5+-EC%%B&@$.>=*-$:GBA21--+>,@C5+./2+6;(4<7:6F>=4*<2*EHB$0?H,68:>7*1+9(-/)2''BGE?A)H0$+H&D75/62;5@#6(AEE* AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9918 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30781 42 64M2D38M = 30947 213 CAGCGTTACCGTTTCGCGGTGCTTCTTCAGTACGCTACGGCAAATGTCATCGACGTTNTTATNCAAACNGCTGTCTNGCTTTTTTTGATTTCAGAATTAGCC 09@*$*)-;=)10D=<8"64.-;B&G-D<+41C>7(DF2H+)00G)F:"DG1,.G"C?9)51CB-A'!@?9'B<5BD AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:6 MD:Z:57T4C1^GG4T7G25 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9918 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30947 42 47M = 30781 -213 GCAAGCATAAGCACACAGAATATGAAGCCCGCTGCCAGAAAAATGCA #>6!?/&/'6+'D8#$,164!EGB%GB752$-5,6<')CC53?90D< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9919 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21788 42 41M = 21627 -202 GTGAGTNCCGGTGCACNTGCGCATACAGTTGGTATTGGTGC )(+)"!'+"()##$(")+!*#'("%"'&)#+)%(&$&*'+* AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6G9A24 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9919 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21627 42 104M = 21788 202 NAAGTNGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTANAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCT !;&7%,DG2<:GC6=G7%!D0/GE&6D<2EHF3!C"$7D#1A..3'/7?30;C. AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C4G51C46 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9920 77 * 0 0 * * 0 0 GTCCANAACNGGCAGAACATTGCCCTGTGCAACCATGTTA %%"')"'$&'+*')''!)"''*%)$$)(!%#(%"&%!*++ YT:Z:UP jpayne@0: r9920 141 * 0 0 * * 0 0 TTGTGCTGGNGGCTGCCTCCCTTGCCGTANNNTTCTTTACCGCCNGAGCCACCCTTGC $#!))%"&#!)&%'(&)"&''#(&(()('"&!*+*'#%#)"")$'('"$%%(*)#)%' YT:Z:UP jpayne@0: r9921 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46158 40 71M = 46396 321 GATGCAAAATACACGAAGGANTTCGCTGATGCTAAAGCTGAAAATGATNCTCTGCGTGATGATGTTGCCGC 5>E&4-BD'G9;A37HE-D#=*B/;((-A+123'.5:AB*0:@,8=)B>&&2G35H'8%H&6%>"#3" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20G2A24G22 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9921 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46396 40 83M = 46158 -321 CGCAGAAGTATATTAATAAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATGCAANNATTGTNAGCANNNAAAAC )+')$$!"$!%+#((&')*%'"%%+")*%!&%+&&%#)&*)&#(*#*%%"%$$)(#''%"%#$+#')*&)'"&&)"(#!&"'* AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:1C15G45T0T5G4A0T0A0C1C2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9922 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10149 42 86M = 10320 309 TGGCGCGTGAGATGGGGCGACCCGACTGGCGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACCGCTTTTAC 94H4D#):G%F,#9AC!A=/G?3G#;5-'(F%'!"C*#1*HEH(:4-H%FE(A31%<#%0.15$*"=?@.6=:!9*4"'*/!3F".3C945=/%C+0%90(*&-/@;!'/H'/+:4815*A&#H4*E?$#(@8)!E:(C9+1<&H&'C17!30AC":B:-AC,(58=;$&BH*-;6>C; AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:45 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9923 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44487 42 51M = 44266 -272 TTCTGAATGCGGTCACACGTTAGCAGCATGATTGCCACGGATGGCAACATA #%.7G):H7@>312D@&H25?+.0'F*)9:3>9CH1336$,,#.B$$%07* AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2T48 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9924 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45107 42 42M = 45149 273 CAGTAGCCTGGATTTGTTCTATCAGTAATCGACCTTATTCCT '($*5:"9=57"H2:-B?8B1&!"25*45?,F?<>=>+2B#G AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:42 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9924 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45149 42 231M = 45107 -273 AATTAAATAGAGCCAATCCCCTTATTGGGGGTAAGACATGAAGATGCCAGAAAAACATGACCTGTTGGCCGCCATTCTCGCGGCAAAGGAACAAGGCATCGGGGCAATCCTTGCGTTTGCAATGGCGNACCTTCGCGGCAGATATAATGGCGGTGCGTTTACAAAAACAGTAATCGACGCAACGATGTGCGCCATTATCGCCTGGTTCATTCGTGACCTTCTCGACTTCGC @20E007EF.C.%FB9'C"6/9&"?57%1,;D4*672$B@0$8<&#*F0='90A4*C(!9BE&"(*.1162,6B-7@D2$:"=&0H')HE@H/C"$1%&&#G1-B&299:A*1610!->-.H%;!%''3>0B0&#'(2D#80F-!$=$4;:7%%%9C'.;F><.#3E+?!,-%;$(1;1#D*>?G(?FH6>:83C8<+$'BD-B4".;>B&69"03'C42H12/;'C)!!A AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13A113T103 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9925 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28432 42 203M = 28338 -297 ATGCNTCGCTCAGTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATCAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCAAGGATTTTTTCG *.!E6:D5)81)6*-4CHD/D=F@G!2E1)*?.5C5C#?4<8?H@D-6.*-1)<#$23>30G4GD="4-0.#1'3C5<%?75@-5HE1@H%*1&,+?9B*%C<'B'$+G$8AEB:H;%"!G>@1"=5<3E&E#9("&-GH3>2(#E/A0:(/DF)$-4"6<-8*5!H-&,.A*-+A0:CD*%4D7#="3*A4';59+)!3;<#0A?0-3=-<(1/B7'=+7?G:E6+ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9926 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8248 42 52M1I220M = 8196 -324 TCCTTTCGCGCCGCAGGCGTCGTAAAAAGGGGCAGCGTTCATCCCTGAAAGGTTGGCGGCAGCGTGCTTGTGGTGGGTAACCGTCGTATTCCCGGCGCGTTNATTCAGCAACTGAAAAATGGCCGGTGGCATGTCATGCAGCGTGTGGCTGGGAAAAACCGTTACCCCATTGATGTGGTGAAAATCCCGATGGNGGTGCCGCTGACCACGGCGTTTAAACAAAATATTGAGCGGATACGGCGTGAACGTCTTCCGAAAGAGCTGGGCTATGCG '%*'&%++%)(!%*&!#)*")+##!!"+)&*)$&)()*!($)#'+%)!$'#%(&%&&*##$$+#&**#()+##)+%&"+$"('*%*"'%$&%&'#+)+('!*%('#"#(!("%&$#+(+'&&!+'$'%"$&!%++&)(!!"++)&&%%#%(*(+$"#$%('*##$*!$"(%'$%&"'$$(&$(((!*(!+(%)+)"('"*&*""%$$%&)#%!('!#)&&$$!##)'$(*+!&)!%+(%$$&&*+)*$*!%$))(+$%!#!+'"!$+'!$"*+ AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:3 MD:Z:100T91C79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9926 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8196 42 52M = 8248 324 AAAGTTAACCGGGGGGATTTGCCCGTAATCAAGCTGGGTAATGCGCGGGTTG BB%@34&D6"DE5*=CF-$D?C'18#5G%2@-H;!;=*@:769:3FF,&<-CGEC+3;85$G>%(*;F.'C41$8(95'= AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:44 YS:i:-23 YT:Z:CP jpayne@0: r9928 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 39127 24 48M3I16M = 38905 -286 GACACTATTACAAAAGAAAAAAGAAAAGATTATTNGTCAGAGAATTCTCTAGGCGAANTNNNTNNCC '%()++(+"+#&)(%%'$*+!"'%)++%*&!+!+'%'*!(!&+)()'))*)$*'($"+#!"$)'(&& AS:i:-23 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:11 MD:Z:34C19T0C0C0T0C1G0A2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9929 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22343 42 85M = 22187 -241 TCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCTGATGCAGGTAGCCAGTGAGCATATTGCGCCGCTTCAGGATGCTGCAGA ,7GD1&<)5*--F,(H9$B.)E&?*?F'+4@C3/A7+*(;+G-543HF?7"8>A>5AH20("?@F!'?10+2,98?/2G/2:CB<&-7C8(&#?1*%4/"3H0D@D!:4B402B" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G45 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9930 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20681 8 16M7I44M = 20899 286 AGAAGATATAGCTTCAGATAAGGGCTGTCGCGCTTGAGGATGCGGACACAACGAGAAAGGGGATAGT .#$'DDH3-8%+@!41''+C8,+0>.#,=19A-<==,;(60-1!/(HHE#:@0$1!)05*=;A?@@$ AS:i:-26 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:7 NM:i:7 MD:Z:60 YS:i:-17 YT:Z:CP jpayne@0: r9930 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20899 8 48M4D16M = 20681 -286 TACCCAGATTGCGAACACCGCTTTTGTACTGGCCGCGATTGCAGATGTGACGCGTCACCTGACG >(=7.!54&8)5#<@!#'F!1H1*3&@#GH0G&7E3=-(?(<3%C5!%+,!G&"$3.0%G*"*: AS:i:-17 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:4 NM:i:4 MD:Z:48^TATC16 YS:i:-26 YT:Z:CP jpayne@0: r9931 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 881 42 134M = 776 -239 GCGGGCNATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGGATAAGNNNCGNCACANCC ($!"")"&+!$**'+''"!"&%"$%$"!*'"&+#&%"('(%)'%(*+"&&!%)''%"")!%&*')+*$$+'$'($"!)&+)#'#%$!"$"$*'&')!#&)$)&%+!'%$%+&$+&)%')$"$("#*"&)&*"*' AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:6C108C5C0A0G2C0A3C2 YS:i:-13 YT:Z:CP jpayne@0: r9931 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 776 42 45M2I60M = 881 239 GTTCAGGCCGGAGCCACAGACCGCCGTTGAATGGGCGGATGCTAAATTTACTATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGNGAAACACNGCCCTTTCA A,'H?$?-4(/5..H$8225#F!*8G/!!8>6E#4!2:$G7$)3$,9@245*'=)5%'B.+0?8+*C1E<00$$B9!,1B<13$-/-@/86 AS:i:-13 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:4 MD:Z:87G7T9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9932 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22971 42 33M1D64M = 23111 225 ATTTGTTATTTTGGCTCTGTCTGCTGCATNACGCAAAAAATATATATATCTGCTTGATCTTCAAATGTTGTATTGATTAAATCAATTGGATGGAATT ?%F7**EE)-;:6!78"26*9/C789=<2)(!>83$78@$=%1DB0&##3&+<.HGB=*(?5F;>9->(G:*C>,7"8/C".234<0)"F=4%>1.& AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:21A7A3^C12T51 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9932 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23111 42 85M = 22971 -225 TTNAANAAGTCGTTTCTGCAAGCTTGGCTGTATAGTCAACTAACTCTTCTGTCGAAGTGATATTTTTAGGCTTATNTACCAGTTT +&'@>?D&F#F"@F72,,'.1==39C.<47G.)9=5BF"?FGD9495"$E73=:0#(8B&GEC-,/19>(>1-:6;E9HC$>//? AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A2A69C9 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9933 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15513 42 250M = 15763 336 TGGANNCANGAAGGGGCATACCCCGCGCGAAGCGAAGGACAACCTGAAGTCCACGCAGTTGCTGAGTGTGATCGATGCCATCAGCGAAGGGCCGATTGAAGGTCCGGTGGATGGCTTAAAAAGCGTGCTGCTGAACAGTACGCCGGTGCTGGACACTGAGGGGAATACCAACATATCCGGTGTCACGGTGGTGTTCCGGGCCGGTGAGCAGGAGCAGACTCCGCCGGAGGGATTTGAATCCTCCGGCTCC #*'*!#'#"#+$+*&'&!(&++$!("+&''"#)#$)%'!#('(&"!((()!"%*(#(##&*#+%!#!***(!"()(')%)(*+('#&"$!("'('#+"#(*&!%*!)(%')+")$'"$(+)'&!%&$++)&#$'$*)#$!$&*%$#'*'"""+!!#+!*'#"+)'#)"$%"&#!*$*)!(**$+#%%%%(++'**')((&%("(%!!(!!+!+$"!(&!"%")#*$!(#*#*$+)#"#((&!#+#&++++ AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0A3A0G2G0T191T48 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9933 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15763 42 86M = 15513 -336 GAGAANGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACCCGCACCATTACGTCTGCAAACATCGACCGTCTGCGCTTTAT (?FA%1DCDHC&=;G1*/!,&5?!BH'<3C./43+)G4BFB487?G1@-3$G2BB@10*/G.@$C9''6:)=('@"B64A9A!=9E+-/E;ABFBE0+B6&D"'0 AS:i:-36 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:13 MD:Z:6T13C0G39A38C30T8G1T34C5C107 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9935 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14379 42 48M = 14162 -265 GGCTGCAGGTGCAGAGTGATTTGCCGTGGTGGCTGGTCTGCCGGGGGN 2@3/')-C.?>=5A2!#8@B,&*5506:D!(&H#92B4>?*@@-!*=, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9935 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 14162 42 48M = 14379 265 GCACGCCCGGCGATGTGCGCCAGCGGAGTCGTGCGGNTTCGTGGTAAG %++*&!!%*'*')%*(!#'**&+!)!$%&$!$+$#!()!&(##!+'#$ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C11 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9936 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20020 42 54M = 20074 318 CGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTGCTCAGGTCG ;'9."&.!*%D-H%E9#E0EF:43F*,<>F(*@:C7G&9AD%89G%B;E<=;./ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:54 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9936 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 20074 42 264M = 20020 -318 CGGCCCTTGTGACTGATGCAACTGATTCAGCACGCGCCGCCAGCACGTCCGCCGGACAGGCTGCATCGTCAGCTCAGGAAGCGTCCTCCGGCGCAGAACCGGCATCAGCAAAGGCCACTGAAGCGGAAAAAAGTGCCGCAGCCGCAGAGTCCTCAAAAAACGCGGCGGCCACCAGTGCCGGTGCGGCGAAAACGTCAGAAACGAATGCTGCAGCGTCACAACAATCAGCCGCCACGTCTGCCTCCACCGCGGCCACGAAAGCGT @2*=/#7!9'()'->-,++6;.3804#?@$0H(#4<27)>G85>/6(61026>-0"&D"78)*:A,/,3?%822"1:%28H),26+48@*GH)C,*H-"0/CB>C$;,B0A0>'2+8.1&*.B/532%:B+)%EH85.58F8B%"?%%17@6/+:78795D;GHC993,F"9C+'*'94@@9 AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C72G165 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9937 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47233 40 85M = 47151 -167 TAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGATATCGTTTTCTAACACGAT $(%&!(!#!&!+)&$$!&!"$!+$*%*($(''!"*"%+'&%))!&!(&&!&)'&"&$$#*#+#$(#*$)"%+'&(&*+#$!'(&+ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65T19 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9937 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47151 40 62M1D5M = 47233 167 AAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTGCCCTNTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAAATAGG 509#)%',F<0>*%2"E@)@".6!<6>G=E%7(#:E(24%:61:$A%8;$E='2)3#-,AED6B,8+ AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:6 MD:Z:24T4G32^C0C2T0C0 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9938 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30336 42 139M = 30475 352 GTCGTCANGCATTGCCTGCTCTGCCGCTTCACGCAGTGCCTGAGAGTTAATTTCGCTCACTTCGAACCTCTTTGTTTACTGATAANTTCCAGATCCTCCTGGCAACTTGCACAAGTCCGACAACCCTGAACGACCAGGC +!"&*"%'**'#"#+$"+$!(&#&$**+""+)%$#!+($$)+#)'"()%)$*#$(&!"&&$*(!++%*$!%#)'&+%%$%"!$+$#$+&$"!$!&!"'"#'#*)"%%%(%++*'&$#""&!()$*(*)*%((&&(!""" AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T63C13G53 YS:i:-24 YT:Z:CP jpayne@0: r9938 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 30475 42 90M2D121M = 30336 -352 GTCTTCGTTCANCTATCGGATCGCCNCACTCACAACAATGAGTGGCAGATATAGCCTGGTGGTTCAGGCCGAGCATTTTTATTGCTGTGTCGCTGTAATTCTTCTATTTCTGATGCTGAATCANTGATGTCTGCCATCTTTCATTAATCCCTGAACTGTTGGTTAATACGCTTGAGGGTNAATGCGAATAANAAAAAAGGAGCCTGNAGCN ;E64?+4,1;=C=*6A2?EG+*)*'=090=+@=6AA.8)3/B86&+*8(0@/ED(%/@%G;6'".;,)#(+"7D3#@-266)*/%<9'<*/20;&A/05!<'$E#1.CE&F/#'4%<*6)DBH/:+G:D:@<7+4DH5+9*?%>D$CEE*H#*3-5E%+=;5,33"'D@42:@;;C<0$(" AS:i:-24 XN:i:0 XM:i:9 XO:i:1 XG:i:2 NM:i:11 MD:Z:11T13A43G1C18^TG33A55G11T14T3T0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9939 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 16795 24 63M8D32M = 16596 -302 ACGAAGATGGATGCCTTTGGCTNTACCAGCCGGGGGCAGGCACACCGCGCCGGGCTGTGGCTGAGAACTGCTGGAAACGCAGACCGTGGATTTCA G8CE,/@6F>'&'BH,.;HE$C)9C3"82#$$?<%&=$39:H97/-F*,"9.0/+/'G7.7":E+8C.<8$AC3&14D47H.B97));8*!FC/(DG@G&$BB>>'*1:8E AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:43 YS:i:-30 YT:Z:CP jpayne@0: r9940 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6346 42 79M = 6464 158 CTGAATTTACGCCGGGATATGTCAAGCCGAAGCATNAAGTGAATCCGCAGATGACCCTGCGTCGCCTGCAGGATGAAGA 5'A$;"),"**!?"G-HB%1@.7C5=,-3=:/*'.?A&C!4/7B1':)7'"$78(%4172D44@:$<3(5C4D"0(F/) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G33C9 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9940 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 6464 42 40M = 6346 -158 CATCATCATGCANAACATGCGTGACGAAGAGCTGGCCATN <6888&.76'F$-#>1!?D,E@<)+/,34GGD(##/(/3$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G26T0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9941 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33351 42 126M = 33168 -309 NTAAGTATGTCGATAAGNCGTTTCCATCCGTCACGTAATTTACGGGTGATTCGTTCAAGTAAAGATTCGGAAGGGCAGCCAGCAACAGGCCACCCTGCAATGGCATATTGCATGGTGTGCGCCTTA +..D&H@0'>76B81+8)4A58&!7'E=0#"1,;<6D%;?H-?.).=@G/-"4-)8G/5'&>!0)"<5)A8>.&-.49#96BH8A> AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T16G102T5 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9941 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33168 42 78M = 33351 309 AGGAAAACAGGAAAGGGGGTTAGTGAATGCTCTTGCTTGATCTCAGTTTCAGTATTAATATCCATTTTTTATAAGCGT **?8*)*5'1$$=9F=(+%5G#*(6#E"3+5*<2B2E),&:)$)EGCH$#D&!'A-E3=(C92C<&62F.3%>::%&. AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31T46 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9942 97 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15765 42 43M = 36081 20377 NACGGTGCTGGGTACGGAAGTGAAATATGACACGCCGATCACC "6.@$1:D.6F2*;&H&.-@3?DC AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0G42 YS:i:-2 YT:Z:DP jpayne@0: r9942 145 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 36081 42 61M = 15765 -20377 GCAGCAATCAGGATTGCAATCATGGTTCCTGCATATGATGACAATGTCGCCNCAAGACCAN "+'()#!#&(!%%#"&!%$"+)"$"")%$"*##++"+)&("""*(&)'%*%(&%+&"&+(! AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:51C8T0 YS:i:-1 YT:Z:DP jpayne@0: r9943 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5412 42 43M = 5455 300 NAAAGNNGGNGGGCGAGAACGCCAGCGCGGCGCAGCCGGACGT #$#!*'")$))+')$%'+*'(!"#&!!(()$'$+(&)*"%#$% AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C1G0C1A0C2A33 YS:i:-11 YT:Z:CP jpayne@0: r9943 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 5455 42 257M = 5412 -300 TAACGCGCAGATCACCGCAGCGGNTGCAGCAGAAAACAGCCNCATTATGGGGATCCTCAACAGTGAGGAGGCTCACGGACGCGAAGAACAGGCACGCGTGCTGGCAGAAACCCCCGGTATGACCGTGAAAACGGCCCGCCGCATTCTGGCCGCAGCACCACAGAGTGCACAGGCGCGCAGTGACACTGCGCTGGATCGTCTGATGCAGGGGGCACCGGCACNGCTGGCTGCAGGTAACCCGGCATCTGATGNCGTTN )''(*!+&'"&*(&""$+&!#"+&)))'&&)'$""#&'+("*+%%%((&$'!(+)"!&%"(&'($"!&&+"%*!*$*#%)%+*('')'$#'!&%'#)+'#($&#")%(*""##%!!!&+)!(($+%!#%)%##)#()'"'"#!+&%"$)"#$$#)&"$&%("+*"($&(&%!"&+*&*%%("%'&)$"%#$'+*#%'%$'#*&$!#')""(*!''(&!#+'%')"$$*#!##$!"$$$*+$("$+((!##+(+&&%" AS:i:-11 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:0G22T3G13G19T159C29C4A0 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9944 77 * 0 0 * * 0 0 NGCGATGTCATCCCGTCCGGCCCCAGAAGGGTGGGAATGGT &)+('!!+"#*(%$+%*'((#+"$!(*)&)$'%$&"&&+%" YT:Z:UP jpayne@0: r9944 141 * 0 0 * * 0 0 NGNAGAGGATGAATGACGTGACAGGAAGAACTTGCCGCTGCCCGTGCGGCACTGCATGACCTGATGACAGGTAAACG #$%+#&*!#*(%##&'+"$$%"#(&%'*"*''&"+))!'))!)("+&!!!*#)#'(!'&#%$)"#*%##"#+'"+'% YT:Z:UP jpayne@0: r9945 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19986 42 59M = 19820 -225 GTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCNGACGCGAAGAAATCAGCCGN H#F"$3=F0(A$A:.6*)@G#97">/EB*/$><4!%/';)<78GE06)""4&048+F)" AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38A19G0 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9945 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19820 42 43M = 19986 225 GTACAGTGTCACCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCGTCGCAC ).">)2)#>7.'E>?A"391<(>+*F+6#60:E?E+,"8.7%# AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T24A6 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9946 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21777 42 309M = 21689 -397 CCGGTAGAGCCGTGNGTGCCGGTGCACATGCGCATACAGTTGGTATTGGTGCGCACCAGCATCCGGTTGTTATCGGTGCTCATGCCCATTCTTTCAGTATTGGTTCACACGGACACACCATCACCGTTAACGCTGCGGGTAACGCGGAAAACACCGTCAAAAACATTGCATTTAACTATATTGTGAGGCTTGCATAATGGCATTCAGAATGAGTGAACAACCACGGACCATAAAAATTTATAATCTGCTGGCCGGAACTAATGAATTTATTGGTGAAGGTGACGCATATATNCCGCCTCATACCGGNCT )>B9!;0E@;FFH+4E02(&4+45E(0;2'->62="D?@21(#8B!D?))>6*3,F5':?'3@@13H)!9@>3AE./619&A$9'82@"E*E+.;./EE-(((&F;F448)<=53=?3:HC2D*=D797+!65H':6<32C/'G#@49F4$BH55"/C7&3H$:,B6D#();C#$8>9E;$6%+8!B37#4E4>)E@/;"#:@4+0CE2<.BH7B*647-;)@4"E97%,<;.?#B>*8*@4."23 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6C7A276T14T2 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9946 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21689 42 88M = 21777 397 AGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTATCGAAAACGGACAGTCAGGGCAGCCACAGTCACTCATTGT G2=*6"!,5F@09B5H*"!(,,.,F>8:,)?&95?83:9<$>D*EE7=9)7@;FE%/6//5!8,879,1,GA/@F+9+?$9%-28%$!,3/%%#:9$H283339'E%)GH?5!DB?9<:94C'&$D-,'$H AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r9948 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10730 42 88M = 10893 226 GCAATATNATNCCGCCATGCGTATGNTGCCTGCNCAGTTCACCGACNTGGCCACGCAGCTTGCAGGCGGGCAAAGTCCGTGGCTGATC ")("&&&!'#&+((()+#&)*%&#$!'+&#+&$*&(&('&()%*&!'&!&!)!#+()"'&"$(%#&%&&!#!"+%+%'&%%+%'$+$# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:3G3A1A0G14C7A12G41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9949 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27229 42 141M = 26736 -634 GATTAGCTCTTCAGGCTTCTGAAGAAGCGTTTCAAGTACTAATAAGCCGATAGATAGCCACGGACTTCGTAGCCATTTTTCATAAGTGTTAACTTCCGCTCCTCTCTCATAACAGACATTCACTACAGTTATGGCGGAAAG 9)!!%?:)E=9E(@A&"0(;26<;,C1<@9E(46+<=%?1+%?FC8?/,4;>E)*F?1)>D<& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:104G36 YS:i:-18 YT:Z:CP jpayne@0: r9949 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 26736 42 493M = 27229 634 CAGGGAGTTGACTGAATTTTTTATCTATTAATGAATAAGTGCTTACTTCNTCTTTTTGACCTACAAAACCAATTTTAACATTTCCGATATCGCATTATTCACCATGCTCATCAAAGACAGTAAGATAAAACATTGTAACAAAGGAATAGTCATTCCAACCATCTNCTCGTAGGAATNCCTTATTTTTTTCNACNGCAGGAATATACCCGCCTCTTTCAATAACACTAAACTCCAACATATAGTAACCCTTAATTTTATCAAAATAACCGCAATTTATTTGGCGGCAACACAGGATCTCTCTTTTAAGTTACTCTCTATTACATACGTTTTCCATCTAAANATTAGTAGTATTGAACTTAACGGGGCATCGTATTGTNGTTTTCCATATTTAGCTTTCTGCTTCCTTTTGGATAACCCACTGTTATTCATGTTGCATNGTGCACTGTTTATACCAACGATATAGTCTATTAATGCATATATAGTATCGCCGGAC ;4!0#%F5;82H8B+4$,@8?/'@):$;3&HH9=0*&&1<:H24A/6#?%!*8$$392G!-B?0(BFG2$E(4#"?5#?3B!E-@&>;6$4>+()'9F-E56$D"<58E%H/:4*)4B:5(BDDGG6&HC@7HE7C/!594+')D;;:<$'9/-B%7<%@:D"$8)0)-;5>=#4+8-;?G&<;577@C,D$%D)-%!.F5DC!.56?8-&F0(=6"!9>(G5"*331D=<"?4'-5H#6A/9=G&AD>@1)<,E8;19#!'F?$34<=9;;F6F%2->?9<99(#/$<*1/H,C#H6550E2<+"D%+4>%;102E4:.&$"B:G@-=D8"4@F(H1@H-B98AH3!.B@G":)8'&(G.;05'B"C'D#/(('#9D/''66DG*<;96''+/F-"EHB98E<-$E)>3;D%AH*%>3%"#14%9A@#1*18,.,3,$!++%E= AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:11 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:11 MD:Z:49T46T67G11G13T2T64T80A36A59G53A2 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9950 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2685 42 46M = 2685 0 TGACAGGTAAACGGGTGGCAACAGTACAGAAAGACGGACGGAGGGT C=)H+,.B(A2'-D'39FBA AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A5 YT:Z:UP jpayne@0: r9950 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 2685 0 * = 2685 0 GNNTNNCNGTNNNTCGGTGNGNTCCACNNNTGCGAANNCNCTTNNAANNCNCTNGNNCNGAANTCNTNANNGNCNTAGNNGNTTNGNNNNNTNNANCCGNCCNNNNT !!$!$"""$"$!!$"$$!!!!"$#$$$##"$"###!!$"!$#"#!$#""$"$$""!#$#$#$""!"!#"!!$$""#$"#!"$"#!#"!#$$"!"#$!#!"#$#!##$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9951 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42065 42 62M = 42152 272 NAGTNCNGCAGGAAAANGAGGACGTGTGGCGANACAGCGACGAAGTATCACCGACATAATCT $'"*%)$+(*(#&)(#((%&$+")$#""(&&&+'%(+!*#%&#"$'*$(%&$()!&*(!(*' AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C1C1A1C9G15G29 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9951 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42152 42 185M = 42065 -272 GAAACGCACCAGAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGNGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGGAAAACAAGGTGATTGACCAAAATCNAANTTACGAACAAGAAAGCGTCGAGCGAGCTTTAACGTGCGCTAACTGCGG &A*4.")-$+$'<%&(=!H9F?542.=8B2%82!&,1/,9(&>$-30AG97-*3GG0C,4/<7,'+#=&??+2:*7:A7E(3&5E8&1@7:!4&&".>/>.A1/B<2G5>?C465.0!#C$+5EF&=*!>C3#*='E2,2.>/>+)!D.(3$7D,1%,)@GG<:GHAG AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:76T56G2G48 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9952 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19967 42 124M = 19827 -264 TGAACTGATGGTGGAAGAGGTGGCGCGTAACGCGTCCGTGGTGGCACAGAGTACGGCAGACGCGAAGAAATCAGCCGGCGATGCCAGTGCATCAGCTTCTCAGGTCGCGGCCCTTGTGACTGAT 9!:58(,1')9E#F/H7'EG9*F-50=1<)2H)"?D",+E<(&'1+F'3-%0&(6=,F*-B$BFA*H63#!0%8FC#>$A4=+71%#?:5-D+!E1)3&&&#)"D%BC?6,811#7&+7;5-=2 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97G26 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9952 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 19827 42 77M = 19967 264 GTCATCCTGCAGGTTGACGGTTTTCCACCATCGCACGCCGGGACCATCACCGTGTATGAAGATTCACAACCGGGGAC ='='26:)!.,.19:+5A34%4.9%'G5%#22'2C5:9&%9#5$A%>0-A4=C7<9((C*@317DB!%72#$DGC4FG)6%)=30-A-GF-"91/>""4?+"!@7<>93E)0A/,@@/H7$*DD%8"4B,>D##2195,8"E$DA@F:$C8(%3=@-@'1(05HDG2)%%C.#+;54/F327A)&(EC99 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34T5A41G139A23 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9953 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 47560 42 251M = 47811 497 TTAGGAATGTTTTCACTTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGNAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAATCTTCATACAGAAAGANTTGAAGTAATATTTTAAACGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCA 5C36#A?12$)/<'"4?DA97+!,G78"%%?H.6C;+<:(#,,;+&0(G$=)&;?1*EGC5F%-"3/;D52=9,?4C>"+!;"ECC#&C/69CCB@A>-H>48F/7H+/F:D35BD-:>.'C567-B/<89)>(483&"<+F#D#HB45C%$-DB%!'"?7"9>)?(:7>>,3*.58+%+&.E?8":0%?=266#C(7B$#C<%C9>08"G81(+D+,D=+AEB%H98B&@E06B&5AE7B,A0C6B0BD7!8?#H,'H*C62.$4!F).-?3#!(-08F,0A#A43).A7D8>+!/4H:CA*%A$>/2.197?1C=+:(456-D4"#H"&2G82?>H2GGB'9HH+:72#;E40#%%<$!E/B*?F%1#(0H='$*,"'%,:?."73#5++C/@7FB)/"G.':8GA==)!"8,H.)$:7:+75$%H4;(=C&+H*1&H3:?C)=%3,%,!),9-8"))$1FC,3FD!+D.GA;)H7E'D7.9*80:."H?"2/8B$>881#6?0,!<94H(&&7CH16E7*'@/%2@+/=;A/2B:H)-9?)+,(+!0!:D#2"-5HF5E5.>!4'A!5"8'0H@H4),E;3/=:==C(, AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C60 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9957 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 29218 42 79M = 29042 -255 ATGTTCTCCGCTTCGATAACTCTGNTGAATGGCTCTCCATTCCATTCTCCTGTGACTCGGAAGTGCATTTATCATCNNN !&!)!%+'%%'$"')(!!$+))!$*'&(##!#*#$!+!)*)+(#"!&**"#"+!'(%"*#+!(%)&"'"(+)'+#(%&' AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:24T51T0C0C0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9958 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42008 42 68M = 42163 253 AACCTTACTGGAATCGATGGTGNCTCCGGTGTGACAGAACACCAACAGGGGTGTTACCACTACCGCAG D0E&>B,F9B-G:;.@$.7?5*1:A084%=)!&)1#30*$!F&@@!5E*7.&'-G6(&9F)8F&4&=1 AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22T11A33 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9958 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42163 42 98M = 42008 -253 GAAATAAACCCAAGCCAATCCCAAAAGAATCTGACGTAAAAACCTTCAACTACACGGCTCACCTGTGGGATATCCGGTGGCTAAGACGTCGTGCGAGN **(&%$))'"#%$!'&'(&(+&$(*'$+&&!)!%#%)$((!"*%$&%)'#(&%%($(&*$)&#++&)#)+((!+%')'+($+*'!#(&))''!(+++" AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:97G0 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9959 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28293 42 100M = 28212 -181 CATGGTGATGATTCTGCTGCTTGCTAAATTNTCAGGTATTCGTCAGCCGTAAGTCTTGATCTCCTTACCTCTGATTTTGCNGCGCGAGTGGCANTTANAT ()(#'+*$!$#&#%$'**)))(###''+!#+$!%&"("%"&)"!'(%)(!!)%"(!%&'+$!!%&"+%""#+(("##'$(!&"('#*'*!+&"$%!*!"( AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:23A6T49T12G0C0G1C2 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9959 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28212 42 78M = 28293 181 ATATCNGACCACTTCATTTCGCATAAATCACCAACTCGTTGCCCGGTAACAACAGCCAGTTCCATTGCAAGTCTGAGC G3,51CE(!D)?)6'/$$C4(7)0:1G.B2+)*B9F'30+H5A34&E6FA69?A:?!DF1HE@<7?AE%B&HHAFH,@ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5A72 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9960 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33714 42 174M = 33888 281 AGAGCATGTTGCGCCAGCATGATTAATACAGCATTTAATACAGAGCCGTGTTTATTGAGTCGGTATTCAGAGTCTGACCAGAAATTATTAATCTGGTGAAGTTTTTCCTCTGTCATTACGTCATGGTCGATTTCAATTTCTATTGATGCTTTCCAGTCGTAATCAATGATGTAG 78;27:#8-$-*2E@.1-!;'@.A$F-EG!/?2>9&+&()@3*,*8<2$8=,/15>$,9#78/*"''%;&C6E"$E/<3-4/41"*&%!@%?.2/8*1D.,AE?/5695B>&25057F(042+.9C6@>F<(>GA(;(A(1.2/35>9*$H0*1A>H#C+A*(-?497#-H@>= AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:173T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9960 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 33888 42 107M = 33714 -281 TTTTTGATGTTTGACATCTGTTCATATCCTCACAGATAAAAAATCGCCCTCACACTGGAGGGCAAAGAAGATTTCCAATAATCAGAACAAGTCGGCTCCTGTTTAGT 42A30%)15'DD!8<68B:;19G/1G9"1?892C#(HF:07'56&E=3599GG60(-1+H3#@E,9%>0=7E$590"6?*3$C%.EH0*0+6@'#552AD9657.=%-=!D8:2",6HH4.D"$1-4C$4;C+!%>H029876=A/67164>?B''%6?DFD;*#4)H3H!D1:H/9/?C!/:A0>%%)5,4>*@*G1-?HHE1@7,7@5>7@!F*GA!*H&99>4DDC)#F20#!4B1(2',<**B8HDF0 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:239 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9961 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10398 42 40M = 10159 -279 AGAAAGCGGCAGGGCTTGCCGGAGGTGTCCGCTTTGGCCC ;1-G3;G.!7B5"7+HE@G/%!H9@7C&&6@/!E3C>H7A)E6806",!E%#)6'2+,)),1(2,#);E8)2/,F-+0<#:?AE"90E?*,<2;B>EG4*+C6%H#;H:,D69/(+5&"+H4CEE3D=B",1= AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:135T52 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9962 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11399 42 196M = 11595 384 CCTGAAAGAGAACATGGGCACGCTGGAGACCTGGGCAGACAGGACTGCGCGGGCATTCAAACCCATGTGGGATGCGGTGCTGGATATTGGTCGTCCTGATACCGCGCAGGAGATGCTGATTAAGGCAGAGGCTGCGTATAAGAAAGCAGACGACATCTGGAATCTGCGCAAGGATGATTATTTTGTTAACGATGAA !;-#44D?-.4&"#'E*>B%%7@B$>179?;(&;B,A:B;176?>@#@DA9HE=::/&$)7+/=.GD@*G-G,F%$%<58)H:&2*HD#C=0.5*6 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61T134 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9963 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46365 42 91M = 46573 296 CTGATCACTATGCAAAAACAACTGGAAGGAACCCAGAAGTATATTAATGAGCAGTGCAGATAGAGTTGCCCATATCGATGGGCAACTCATG 6B6A!-?>='?#D)0++5B,67E3D)'4=&41C,43B:H6G$F$.2+@#1@,DEC35#&>8:#62+#)!%/#;?1F+!:%%%,"B?40C@@ AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:91 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9963 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46573 42 88M = 46365 -296 GCCGCCACAAATTTTGGCTGCATCGACAGTTTTCTTCCGCCCAATTCCAGAAACGAAGAAATGATGGGTGATGGTTTCCTTTGGTGCA 9$-;!/GH2H4/3)E(B>4@8:;A08*:)H)4H9$%@0)945#:DA5>-57/-?0*+1>8C%1==9D;9@!#6:@"+16;F<361)$& AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37T49T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9964 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22527 42 41M = 22317 -251 TGAGTGGCCTGCTGTCCCTGTTATGGAGTAATCGTTTTGTG C(32:C!293:0"019B+6&0,8(&=#C<55!B.=!(84!< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:41 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9964 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 22317 42 63M = 22527 251 GAAGGATACGGAAGCAGAAAAACTGTTCCGGATCCGGGAGGCGGAAGAAACAAAAAAAAGCCT F2+<.3FC4;$)D;G&;?%70%:C7292@C=*>:F(1@#!;1-:'>>G'*0E,17'*>>#<:4 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:63 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9965 77 * 0 0 * * 0 0 CATCCGCGACAGCCGGACCNCTACCGCACTCGTCACCGCGATAGGTCC F&*A6B2$1GA)2'1C#(:15ACB?52.@2C',<%*'HA=C%!2+,': YT:Z:UP jpayne@0: r9965 141 * 0 0 * * 0 0 CGGTATGGTCACCGGNATGGCAGAAGATATGCAGAGTCTGGTCGGCGGAACGGTGGTCCGGCGTAAGGTTTACGCCCGTTTTCTGGATGCGGTGAACTTCGTCAACGGAAACAGTTACGCCGATCCGGAGNAGGAGGTGATCAGCCGCTGGCG 5'3GC(#/&$:(::(;FE%9&/4@>"2,F'!D.!D%/#?EB<-+!H,G+HAH*D7-#%B)7C9*!#6H4#,F0:B3F%*-D)<,H##@-8#HH(*"9<63(9@?);5H8:F:%+B9A=C(2&5@=,&(7G>%%?>HE$2G*@<)#/*B>-:,! YT:Z:UP jpayne@0: r9966 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38045 42 56M = 38281 285 AACAACGCATAACCCTGAAAGATTATGCAATGCGNTTTGGGCAAACCAAGACAGCT E*7@0>B?/696,6*/0/';E AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9966 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 38281 42 49M = 38045 -285 ATCAAATTAAACCACACCTATGGTGTATGCATTTATTTGCATACATTCA G)52;!?)@1,3/A*29$E($%;$4D:%1=1E/@,F5">::!%);(.33 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9967 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 45496 42 84M = 45313 -267 GTAGAAATCAATAATCAACGTAAGGCGTTCCTCGATATGCTGGCGTGGTCGGAGGGAACTGATAACGGACGTCAGAAAACCANA /!02'(A!DBHD=A'!B*&8@A6B!"5=5#8.;H,#!8>/A@#FGH*#%*.=.;0E6*;9."+G+#CAG<71A2$19.%1C+E!/>(2"5:1,@(+F!%7HG@G:+B?#E.7.4EH*13*B5"&A8E>&/:EHBD$<<)*8F/>!&'6$#&921/9-$$G0D'*7:0F8",$ AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G35T141 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9968 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32538 42 208M = 32746 301 CTACTGGTTTTCATTGATGATGCGGGACCAGCCATCAACGGCCACCACCGGAACGATGCCATTCTGCTTATCAGGAAANGCGTAAATTTCTTTCGTCCACGGATTAAGGCCGTACTGGTTGGCAACGATCAGTNATGCGATGAACTGCGCATCGCTGNCATCACCTTTAATTGCCGTCTGGCGAAGAGTGGTGACCAGTTCCTGTGGG )5/6A"=E*8,"=@BH",CA,D"90F'.-A2'.239B)%9:&?7.#9,2<4"%B"FA.D'2-"6H37B/*E-E>=H4*@83":E"F"C@EB;'D&/E;5@2&2;4G/E7HB!.1*7)$B8F AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:7 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:7 MD:Z:2G37C37G54A23G12A23T13 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9968 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 32746 42 93M = 32538 -301 TCGACAGAATCCATGCCGACACGTTCAGCCAGCTTCCCAGCNAGCGTTGCGAGTGCAGTACTCATTCGTTTGATACCTCTGAATCAATATCAA ?)=)%8/='?1%C.B1+=E5;79=0,-3E'?'57-D8"(D<@A:&EAFE%78=&A6+H.?(FH'&4$B%=(6!31'*@&%!&=='>8EF(5<* AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41C29T21 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9969 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9082 42 100M = 9182 347 AAGACCTGACGCCCGGCGAACTGACCGCTGAGTCCTATGACGACAGCTATCTCGATGATGAAGATGCAGACTGGACTGCGACCGGGCAGGGGCGGAAATC 0D255&&$00E;6(EC/$!?!;6CG-5742E*313=6'&":;'/F$?"*-=G29#$7A;=+.F,A*=A+$7&G5G.1A:<4*($*:F!<=G/2E-;58;) AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:93A6 YS:i:-20 YT:Z:CP jpayne@0: r9969 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9182 42 203M5D39M = 9082 -347 TGCCGGAGATACCAGCTTCACGCTGGCGTGGATGCCCGGAGAGCAGGGGCAGCAGGCGCTGCTGGCGTGGTTTAATGAAGGCGATACCCGTGCCTATAAAATCCGCTTCCCGAACGGCACGGTCGATGTGTTCCGTGGCTGGGTCAGCAGTATCGGTAAGGCGGTGACGGCGAAGGAAGTGATCACCCGCACGGTGAAAGTCAGTGGGACGTCCGTCGATGGCAGAAGATCGCAGCACGGTA A<&2<=)5"!B0'A*(A+C71!F/&30D1(B7=(!C'7G::1.-A/&1HB@C9@A>3$%B5!6FB2!"-!@*0'*>#9E*:E-H37/GFCCACE.>A;ACCA<16:!&!,(*C?;*F#)D###B615E!@4(1/==D9:G8-B5<,1-8:--G#,";-A>HD7D@-=5C0(45-(?'D2=%H<(F*G1+4;%C/.D.#,A- AS:i:-20 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:5 NM:i:5 MD:Z:203^CCAAT39 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9970 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18144 42 89M = 18233 443 TGGCCTCAGCATGGAGGACACGGAGGAAGGCAAACTGAGCCAGTTTCTGGTTGCCGCCAATCGTATCGCATTTATTGACCCGGCAAACG 8.:&@..;9-G2C,9H>:D41@(<3>,!A0#&D!5EGEE56(F*-515&>.)!$2/2.98/;F(A88<8'094@"84=@9?=$-*9)7) AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:89 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9970 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 18233 42 354M = 18144 -443 GGAATGAAACGCCGATGTTTGTGGCGCAGGGCAACCAGATATTCATGAACGACGTGTTCCTGAAGCGCCTGNCGGCCCCCACCATTACCAGCGGCGGCAATCCTCNGGCCTTTTCCCTGACACCGGACGGNAAGCTGACCGCTAAAAATGCGGATATCAGTGGCAGTGTGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTTAAAACTGTACGATAAACGGTACGCTGAGGGCGGAAAAAATCGTCGGGGACATTGTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCGCGCCAGCGTGAAAGCAGTGTGGACTGGCCGTCAGGTACCCGTACTGTCACCGTGACCGATGACC B41E#+>:67FC9@83HF5E=.FB7'@%)B))8=),D<77+C?)?6H'/"0>7/B'24E-=B5EG1@A?.?(=;"E57B-B,;,+#0@H<:C<24;-19,<;'6;>2G?0)&0//'".D('HE;>:!.1C?2):+).E7=02;C)-B$>);+--G7B)5B?(9#C5&(=%+3H=6&:<74-)/H#"%A;@A0%1<0:D0?+7(?"G@")##H!&'A+?.E'>/;+8$);@%3AG<;:.$,$$75.':8E8B2174,*4!)@HFH9G?E54/?(A)5",73*::(85E("0?/*-FB=+,"3+@6A;#3;1*.,D#)!4')3&%+0-A-8/0(/C%%%<&?#1B$'-)5:F1;30 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:71A33C24A78G144 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9971 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8808 42 126M = 8995 234 ATCCGGTGATGAGCGATATCCCGGCACTGTCNGATTTGATCACCAGTATGGTGGCCAGCGGCTATGACTACCGGCGCGACGATGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATCTGACTTATGTCATTA 25"='*D6'H$&968H7+,G23D!A!E@=(#F(:6%*-0"=+:.D*9:1.*>"?F$,9%A7%!HEG4#8D.*'@,4?,%/48?85G9F"7%7E-)9=5@6$56F7 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31A94 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9971 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 8995 42 31M1D15M = 8808 -234 GGACCACCCTGTGGGTTTATAAGGGGAGCGGGACCCTTACGCGAAT 1(=6;>9&'>=?!356!8D7*#*>F9(EC=18#(;,!."5>;,5$? AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:1 MD:Z:31^T15 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9972 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7432 42 141M = 7309 -264 GGATACGTCTGAACTGGTCACGGTCGTGGCACTGGTGAAGGTGCATACTGATGCACTTCACGCCACGCGGGATGAACCTGTGGCNTTTGTGCTGCCGGGAACGGCGTTTCGTGTCTCTGCCGGTGTGGCAGCCGAAATGAC .:;.;A#),*,9'"&-9)2C>F-9B:@%#;A4307+=,/<*%.1F>64E.*%795F)0EE:DD)/'/5F.*,*2"848);*.1#!6="DC-/E!45(G(2..4E%,"D:(='61!%*:F)1A9-6G79A2>3?*=?&C11: AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C43A56 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9972 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 7309 42 123M = 7432 264 CCTGAAAGAGGAGCTTGATGACACGGATGAAACTGCCGGTCAGGACACCCCTCTCAGCCGAGAAAATGTGCTGACCGGACATGAAAATGAGGTGGGATCAGCGCAGCCGGATACCGTGATTCT &?01?;A(;+B=>:;=>BBA'8F5-@3)?.$9F@+H(;H<7%2)H,?>8);=$G0G2&B)E*4@*)%52?GC3*!2@9(#/H AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G59G62 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9973 89 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23627 42 198M = 23627 0 CCTCTCTATACATTTCTAAATCGCCTTGTTTTTGTGTCGTATTGCGAGAATGTTTAGCCCAAGCCATTAATGGATCATTTTTCCATTTTTCAATAACATTATTGTTATACCAAATGTCATATCCTATAATCTGGTTTTTGTTTTTTTGAATAATAAATGTTACTGTTCTTGCGGTTTGGAGGAATTGATTCAAATTCN )E9=2F:C"FDF61;0@?>57/D$G#'H2;F)HC<>A0#G3&7A2>@233"'<')7B3#D>6,3682AH4-%0.E8/'36+5A4G'G=59>E9(6/+#%-'B4@">8758C7)G6FDC7<"2GCF(?8D"'+G,?2FH&>1G9,2%4*;8?A=>AB?/)D:!-#&=6+<9B)5./*/(?' AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:5 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:5 MD:Z:4G28C1A15T145A0 YT:Z:UP jpayne@0: r9973 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23627 0 * = 23627 0 CACATGNTTAANATNCNANCATNTCNAAGAAACTCNATGTCATTTTCTTGNAAT %)"*)"")%)'!*'!$"#"(*'$((#$%&&$'&&)++"))$$+&(*)!!)+)'! YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9974 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11907 42 60M = 12046 198 NAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCTGGNAGACAGTGCTCATGCTGCCCTG #+%#$&"$(#''"(#+'&+*%)$%)!)#$'#%*!(#'!*('#%##&$)+&"'$$%(*)*) AS:i:-4 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C33A2A22 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9974 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12046 42 59M = 11907 -198 TGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTG B+>%31&=7%3'?@3FA:2%#D?E&(=-'@<.>?/$&7?4/GA+->A$%?',3":(4,C AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:59 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9975 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46229 42 75M = 46108 -196 TGGTCGTCATCGGTTGCACATCAAAGCAGTCTGTCAGTCAGTGCGTGAAGCCACCACCGCCTCCGTCGTGGATAA $0(D6:<-;)A%)2,0C*756"9%8@$/;;46>@C$9EH)>7!+7'B/<668;+,,$:&)CA.A<-7*")<-EC3 AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G56G9 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9975 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 46108 42 76M = 46229 196 NCGCGGCAATTACTGACATGCAGATGCGTCAGCGTGATGTTGCTGCGCTCGATGCAAAATACACGAAGGAGTTAGC !33/'6+?;#-5"?<1%>/'*!B,<=5A2'A34A<<3F>8;?70"6B;2*65B07H5;:5G44*-'H-:AF(++F,8(651#$5:F&.74"4?,*F>H")')@&7E'=-,/=<$&G59H/0#FH1)#5*=F973+$C?855*+D+0>3CG2C/C.,41.<84 AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T168 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9976 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11834 42 42M = 11615 -261 CCTNCAGGCGGATTACAACACGCTGATGGCGGCGGCAAAAAA *'&*)%$*$+&*(&!$#'(''&#)(*!+*$'&+$!*!*'%#( AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G32G5 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9977 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 43553 42 63M = 43312 -304 TCTGGCTAAAGCTCTTGCCCATAAAGCANATGAACTTCCGTTAATCATCGAACTGGTGAGCAN G:F3D95D-0%5((/A%;#!$:+/H"9.#<9=,6B249H.7;*C:%2B1'&A')C>G2>*?/0F96G#B8&:H(,(=7.E#+=":)*)E((:&9;'A(*E(3$>2(-,&.2H'.-6669&;G+!5:?/$"-'"7*C+*<8*+:1+!98)&;,G+/$=4/.0HH8B$-E=,F18,:B)BA<9#AC=46G'$A'E=D)?&99$3GD8(A&6(1&F3!$+H35.,@)6=,*448E0B!3=/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C67 YS:i:-21 YT:Z:CP jpayne@0: r9979 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11942 42 242M = 11885 -299 GGAAGACAGTGCTCATGCTGCCCTGCTGACGCTTCAGGCAGAACTCCGGACGCTGGAGAAGCATGNCGGAGCAAATGAGAAAATCAGCCAGCAGCGCCGGGATTTGTGGAAGGCGGAGAGTCAGTTCGCGGTACTGGAGGAGGCGGCGCAACGTCGCCAGCTGTCTGCACAGGAGAAATCCCTGCTGGCGCATAAAGATGAGACGCTGGAGTACAAACGCCAGCTGGCTNCACTTGGCGACA ":G!7)40,#0,(%%8):#8!!3<4D?,*G8:8%.>.)*+!6)/$>5.-+;4:)G3C8GCB%(*)$!..2E8@4"GA)46:A#1'G.2E"G(0BG5?.,(:G9H@#7,(B5A9/G:A.49:(&7):2"++5A"D+=/0(#"#A>)$*;)+&,',BC+$<1CA3#-*()./&5?E245G,G6#71%$F46.'.42G2,):4B,?#!!*0HB);A/@$%'& AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:65C163G12 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9979 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 11885 42 57M = 11942 299 AGCGACGCTGAAAAAGCCGAAACAGTCCAGCGTGAAGGTGTCTGCGGGCGATCGTCA )*9;<'>.AE!?9&F497B)74695=2(4>7AAD#H/:.1?<)>0*CA)*B36/!32 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:57 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9980 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 4098 42 105M = 3908 -295 TCGCCGCGTGGTGACGTTACCTTCAAAAGCGCGCTTCAGTTTTCAGGAAGCCCGCAGTNCCTGGGGGAACTGCGACTGGATAGGCTCCGGTCGTATGGCCATCGA #4?A)F6(""4$6*)99;97:;.9DH*.)0-.+B."(F'/#>63.("B%F:3&<2!4A(A4A$G'&-CH7$H;C*&1:G7+%A>%?CG&6EA*??8E$9.488)G AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58G46 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9980 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 3908 42 63M = 4098 295 TNCNNCGGTATATCGCTGCCGGGCTGGGTGTCTCGTGTGAGCAGCTTTCCCGGAATTACGCCC '#&&'+)&&!+&(**#*'%("'("&*')%!")'($"!#+#&)($)"*"$"!+"*!%!&$+%)$ AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G1T0G31A26 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9981 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12295 42 96M = 12169 -222 ACCGGCANGCAGAACGGGAAGCCACGGAACAACGCCTAAAGGAACAGTATGGCGATAATCCGCTGGCGCTGAATAACGTCATGTCAGAGCAGAAAA %3?/.&D7F'GAAE%+B;7@>'&.+#+)$.4798-6!#/;843EG">/$!8.2EG$,1 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7G23G5G58 YS:i:-2 YT:Z:CP jpayne@0: r9981 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 12169 42 117M = 12295 222 CNGCACTTGNCGACAAGGTTACGTATCAGGAGCGCCTGAACGCGCTGGCGCAGCAGGCGGATAAATTCGCACAGCAGCAACGGGCAAAACGGGCCGCCATTGATGCGAAAAGCCGGG /#@%-;B2*:08H%4A6=HA8A,G0;6F>50E'-,+3:HFD8F(C3$4/F1#4,A#?14)A:1:*?5H)(!14$<9D6(8H;5;=B)*$,44B!#%F<-2::1''7=5'$9;5*E2: AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:3G7G3C23G12T26A70 YT:Z:UP jpayne@0: r9982 165 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 23802 0 * = 23802 0 CNAATAANCTNATTNTTGTTNTTNAGAATAATNANTGNTNNNGTTCTTGCGGT )!#%$%&!)*#$$)"$$*()'%(&$('$(%*%")"%*%$$"+$('&"()&"'+ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9983 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24625 42 79M = 24389 -315 CTGACTGTAGCTGCTGAAACGTTGCGGTTGAACTATATTTCCTTATAACTTTTACGAAAGAGTTTCTTTGAGTAATCAC B+A#9++1:5*216H0*/,G.!F;<*?!AA!;%F.)+H'65555$8!-B@HHE0G"3@!@8,,>87#$?3&%+825<0? AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:79 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9983 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 24389 42 236M = 24625 315 TGACCTGCCTAGGAATTGGTTAGCAAGTTACTACCGGATTTTGTAAAAACAGCCCTCCTCATATAAAAAGTATTCGTTCACTTCCGATAAGCGTCGTAATTTTCTATCTTTCATCATATTCTAGATCCCTCTGAAAAAATCTTCCGAGTTTGCTAGGCACTGATACATAACTCTTTTCCAATAATTGGGGAAGTCATTCAAATCTATAATAGGTTTCAGATTTGCTTCAATAAATT 3B&$!1B%F?C1&%)4@"2>GD9'7!D+&62E&&.<>//23!A"/>/A252(?5:-B/HA7&32'-A029FE"4D=@2,*$21?7%3#13'F-&8;F?#B5%-';>"@0H1*91FD1+AA<0+F"A::5"=&;0*/HA?CG0>2!53;A=$==54>5)G3%?'+$!8"C7G2=D%D3;-=80H&<:$&37)@/9'+%B1411?)<039#0A**/D.15()D$H5(%6$@244>B'<2>$.>*F<+!+1E>B#3?',?-F(=4B!&,&49"=)"+**7H<9"7AHD5>9E#(:53),);&7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:72A59A4A33 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9985 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27602 42 65M = 27406 -261 CATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTT D,%E-)#B$C"##2G+)$:;78>F/2DF1'5/2G2(!3EB>)1(.0G%CA87>!:(!H92/(#!B AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:65 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9986 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41486 42 284M = 41770 377 TGGATTGGCATCAGAGCTGATGAACNGAAGCGGCTAAAGCCAAAGCCTGGAATCAGATATCTTGCTGAACTGTCAGACTTTGAGAAGGAAGATATCCTCGCATGGTGGAAGCAACAACCATTCGATTTGCAAATACCGGAACATCTCGGTAACTGCATATTCTGCATTAAAAAATCAACGCAAAAAATCGGACTTGCCTGCAAAGATGAGGAGGGATTGCAGCGTGTTTTTAATGAGGTCATCACGGGATCCCATGTGCGTGACGGACATCGGGAAACGCCAAA /H?4E-E<+"=AG"<."D=D$(,'CC2+:&,F01"5G)==EA<)0+1H08!($;"%+89CB>?(A?FG9002;)AA@##8+=")HE3;9'"1+&3'4'=.03C!#.38E/A)D(@C@1CF:$G5>=0C@271E'!9FAD#:E.1$;/-"E'-F=$DE=#.>7G78!'(.4(C3C)/6@B%"*&)7&7"?E*-=(D42>(#<7+/:-,4"+H791@B6G#>10((0)69C8-.E4)2$C?;*;F3A74*%*;8.79".)AG7:;&A0@6CD)62$A#.%))GDF+ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25C258 YS:i:-7 YT:Z:CP jpayne@0: r9986 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41770 42 93M = 41486 -377 GGAGATTATGTACCGAGGAAGAATGTCGCTGGACGGTATCGCGAAAATGTATTCAGAAAATGATTATCAAGCCCTGTCTCAGGACATGGTACC 7<*%)%G+/>&D8B:?%%+9#+$H!,3>='A9A:!B#4'50E&@+-6"?,2,4C"H1+81:A">C4@3"B3C#4;:/?"D?AG+-2/E4+/'& AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:77A14G0 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9987 137 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28656 42 93M = 28656 0 AACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTG *G8FB0"A42%$8;HFC,2->)(&B+#)./(.F9C*3F/6<8=F33@$4H=G;9/H1*<$3=48=!G:!'(5 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:93 YT:Z:UP jpayne@0: r9987 69 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 28656 0 * = 28656 0 CGNTNNNAAGTTNATTTGAANTANGNAGNANGNGAAGNCATNNGCNCCGGNNTTTACCCCCTAACCTTT "$))&"!&('$!$%(!&''$%&"$!"((&)%##$(")"(#)!#)#%')((!(+*%%&#'&*!*!)"!+$ YT:Z:UP YF:Z:NS jpayne@0: r9988 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15334 42 122M = 15176 -280 GTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGGTTTCTCAGGAGATCAGCACGGCAGACGAAGGGGACGGTGGTCAGGTTGTGGTGATTGGTCGCTGATGCAAAANGTT ;H&2/&?&);##1#7$/5FBB0>H0@"B-)F(""B7)1$C9?C'%%9&"8/*C54!4B@6(B'"8G3@54','E0A#8*:5H=;:37),89!2.;':7&"@$8BEG98&)"B.G">?/%5,/ AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:118T3 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9988 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15176 42 82M = 15334 280 TGACCGGCATCCTGTTTTCTCTCGGTGCCAGTATGGTGCTCGGNGGTGTGGCGCAGATGCTGGCACCGAAAGCCAGAACTCC '=>1=9*>;>7;#E50&36)94553/8!+4>=6F.87.24.'7,/<,G*.493>67H:-C77--,BD1*CGHD@+++$4"?=1$B AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T53 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9989 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 41247 42 128M = 41173 -202 ATATACCGCTCACCGTATTGCAGGTCGATATCAACCCGGAGCTTGGACAGCCAAATGGTTATACGGTATGGGAACCAAAGGATATTCAGACGCGAATGCCTGTTCTGAANCCATTTATCGATATGGTA 74CC0<-C#2;;<="@@3:#?/7%$;:FDA*"H!.H"5@8AG2)H&"96.<4$A>GE-3!5"E4%'-H)0+=A%>E!*;$*!D6E$(8G:<70C-C404>:;H$G8C#FB'5'6+=/*(1B:/:40A3 AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25T83G18 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9990 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44090 42 88M = 43933 -245 TATCTGATGCAATTTGCACACAAGGTATCGGGGAANTGCCGTGGTGTGGCAAAGCTTGAAGGAAATACTAANGCAAAGGTACTGCAAG "$'7;&G)42EH&8(%3+A4A>"H':C2"76%!)%@F**-4&B120D-$;84!=E+FD,&,CE-*?H)/;!;@=(!"GA0#B(8F9=7"*0& AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:47 YS:i:-6 YT:Z:CP jpayne@0: r9991 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 27723 42 85M = 27495 -313 AGCTTTTTTATACTAAGTTGGCATTATAAAAAAGCATTGCTTATCAATTTGTTGCAACGAACAGGTCCCNATCAGTCAAAATAAA 1AF==H=@:#9=',A7=BH0%.=48<,/C'CHF0+.1?/9/9#(+(F",:?@<4#?D2$C+G18FC5?5*-9%'F?:/+GD9B?8 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:67A1T15 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9992 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44966 42 163M = 44886 -243 TGTCCTGAATTCATTAGTAATAGTTACGCTGCGGCCTTTTACACATGACCTTCGTGANAGCGGGTGGCAGGAGGTCGCGCTAACAACCTCCTGCCGTTTTGCCCGTGCATATCGGTCACGANCAAATCTGATTACTAAACANAATNGACNGGATTTGTTCTAN ##$&*#)%%(&$'%'+%&%$&'%)'+!)"+)%*&&+$++""$"+$*$+"$!#)$%+*"&*'$+"!)(*$$%""!'%+$$&*!%"#'&+#*+&%&%#)""!'!)+)+%+#%"$!"$&*#)%%#&+!(*'!!)#%#!#''+++#*#&$#"&!(#')("($#%*&# AS:i:-10 XN:i:0 XM:i:8 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:8 MD:Z:57A63A19C1G1A1C1T12T0 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9992 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44886 42 48M = 44966 243 CAGAACCGGANCACCAAATGCGTACAGGCGTCATCGNCNCCCAGCAAC 1:!/7E4).7$>E,?15F?;'.'*.=')-/:/1/DDD@E#/:@-0!A< AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10T25C1G9 YS:i:-10 YT:Z:CP jpayne@0: r9993 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15437 42 108M = 15286 -259 GGCGCTGATNCAAAATGTTTTATGTGAAACCNCCTGCNGGCGGTTTTGTCATTTATGGAGCGTGAGGAATGGGTAAAGGAAGCAGTAAGGGGCATACCCCGCGCGAAG (!"'")(&**$%'!$&%)"*)(!)*!#+$&(***$*")'!#(%"+'"!+#*#!*'&&!*)"%)!%&)'!%*#(!&$'*""%!%%)#&"#"!!+($%$*%&)+&&%++" AS:i:-5 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1T7G21G5G70 YS:i:-3 YT:Z:CP jpayne@0: r9993 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 15286 42 94M = 15437 259 CAGAACACCTATTTCTCCGCACTGGATAACATGGTTGCNCAGGGCAATGTTCTGCCTGTTCTGTACGGGGAAATGCGCGTGGGGTCACGCGTGG 2C0.7B/9D.(1;128D&!@3*!()9,)D)>+B@?$73;20B>'$#*$%?>@F>*'+D3A=GGG&37(=&*?HC9$@@1*7?6&7:#&21A1C7 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T19C55 YS:i:-5 YT:Z:CP jpayne@0: r9994 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40631 23 104M3I42M = 40817 258 TGATNGGGNAGTNATGNAAAAACNAANCTTTGCCNNTTGNTCNCNAGCACATCAGCAAAACGCTATTCACGCAGTANAGCAAATCCTTCCAAACCCAACCAAACATGCAATCGTAGTAACCATTCAGGAACGCAACCGCAGNTTAGACC $*'#&('&#)&&'&&#(#$'*'&"(%!(#)('#"!!*"%&*)%*#'+(%*%%$(*((%*!!$'#%"%(&!*(%&*!($(*(!%*''))%+'%%)"(("%%#$$+$)$"(%')*""+%"")#)'&()#"'+%*)$&+(&+)'$+*")$!+ AS:i:-39 XN:i:0 XM:i:19 XO:i:1 XG:i:3 NM:i:22 MD:Z:0G2G0A3A3C3A6T2C5A0A0A0T1C1A2T1C31C14G46C7 YS:i:-15 YT:Z:CP jpayne@0: r9994 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 40817 23 5M1I67M = 40631 -258 TCTCGTTTGAATGGCATGGTCGCTGGCTGGATGCAGAAAGCTGGAAGTGTGTGTTTACCGCAGCATTAAAGCN H2.0$E5;&>/2)B*>?&*!BDH$!'B9+>;>H#'#>84">B><)FC,1<,E+7G',,/&0,54,)'5@/AD" AS:i:-15 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:1 XG:i:1 NM:i:4 MD:Z:2A0G67A0 YS:i:-39 YT:Z:CP jpayne@0: r9995 83 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 42813 42 93M = 42617 -289 TTTAATGAACGCAATATTCACAAGCAATGCGTGGTGTGCAACCAGCACAAAAGCGGAAATCTCGTTCCGTATCGCGTCGAACTGATTAGCCGC D39&#=GA.D8E6@'=&%.H7;4;0@!%%6C0D/C%<%$<58<9$'#,-2.-GH;<(&&'!&<,-?G115C>D:0'.1)D0CH!8=;A( AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:69 YS:i:-16 YT:Z:CP jpayne@0: r9996 163 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 44827 42 128M = 45019 261 NNGCNTGCCTGGTTAGACAGTGCTCTTTCCGTTGTGCTGAATTAAGCGAANACCGGAAGCAGAACCGGATCACCAGATNCGTACAGGCGTCATCTCCGCCCAGCAACAGCACAACCCANACTGAGCCG #%''"+&('$'$+)+*&#"'$&&(*!#%*!$$$*%()&#$')()&!#$))"!*(##+#(&+!**)&+#%(+!%**+(()#(!"($*#*##*#$('!*&!$*#*&!%+!''*&"!&!#*"#$(#+&!%) AS:i:-16 XN:i:0 XM:i:10 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:10 MD:Z:0C0G2G0A10C33T24A2G15G23A9 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9997 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25398 42 187M = 25585 300 ATTGTACTTTACCTTCATCTCTGTTCATTATCATCGCTTTTAAAACGGTTCGACCTTCTAATCCTATCTGACCATTATAATTTTTTAGAATGGTTTCATAAGAAAGCTCTGAATCAACGGACTGCGATAATAAGTGGTGGNATCCAGAATTTGTCACTTCAAGTAAAAACACCTCACGAGTTAAAAC 4*!":0/7*H45+#3B9GA51?;9"=F>-#*;@"<,2@!#38B--()@=7!'7F8+7,.:;#+%>9G>F#B63F?4;AB-?BA,DH3E?$$<8?4<-!/(=G,@1H0H5'"H7;"G-8H%<):D5,.D%6+D2(E1G8>%8#+(#,#.)4$$$$?090@!/G>AH#G"$G3&D1D'@H5CC(8:/7# AS:i:-1 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:140T46 YS:i:-8 YT:Z:CP jpayne@0: r9997 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 25585 42 113M = 25398 -300 ACCTAAGTTCTCACCGAATGTCTCAATATCCGGACGGATAATATTTATTGCTTCTATTGACCGTAGGACTTTCCACATGCAGGATTTTGGAACCTCTTGCAGTACTACTNGCG BH$.<76.9#4D7+=#*?':(+?>+0.9?,HC4?>>?2"1B+FG.+&G%11$.';1G.6$?!99D,%$##7?)6CE3, AS:i:-8 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:55C53G1G1 YS:i:-1 YT:Z:CP jpayne@0: r9998 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 21525 42 212M = 21737 440 CAACAGGCAGTTTCGATTACGGCACCAAATCGACGAATAACACGAGGGCTCATGCTCACAGTCTGAGCGGTTCAACAGGGGCCGCGGGTGCTCATGCCCACACAAGTGGTTTAAGGATGAACAGTTCTGGCTGGAGTCAGTATGGAACAGCAACCATTACAGGAAGTTTATCCACAGTTAAAGGAACCAGCACACAGGGTATTGCTTATTTA ?$4,#-G@CA)?;GC=(1%)'73(<2$:E%:G)=!3A/0)E@6<=@F'E,4%DB#<,&-/@6A$<,&/"180'(F96&+7+A,-7GH9;1E+-6.(7@:646#@2"#&B?&!,<7=9=>.E&?+D/)<"-5AEG58H@=HA">#,8G5GC7+@H4(-':$?%1CC09%>(F')2=&@=?F)2-;/F!EA"#.#'"-H$-@"%F;C($='@'4789H5#F!;D!!.E>@.*$/&)>H<$!*?-E#/5680"#:2>+*'HB55$H>5:+6D5(427&):E!H9*/A32<$?-;"6<,?G!!F9/G"G0@0- AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T88C102 YS:i:-4 YT:Z:CP jpayne@0: r9999 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 9980 42 64M = 10178 247 NACNTGACCCACGGAGGCAATTTCTCATGCNGAAAACGTGGTGTACCCGCTGTCTGGTATGTAC !)(#(&##$%+&($''#%"&)!*%#)'&'%&"+&$#$##%'*)*++%#$$!))(*+!'%+&*(# AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:0C2C2G23T16G15T0 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r9999 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 10178 42 49M = 9980 -247 CGTGCCATGCTTGCCGGGATGTCATCCACGGAGTATGCCGACTGGCACC /@,9D6%"8"B:#1=C(?6#@&")6(C;H03*+.)/"B;HG6@@!H!<# AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:49 YS:i:-9 YT:Z:CP jpayne@0: r10000 99 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34033 42 108M = 34220 281 GAATNCACAGTGCAGTGTTTATTCTGTTATTTATGCCAAAAATAAAGGCCACTATCAGGCAGCTTTGTTGTTCTGTTTACCAAGTTNTCTGGCAATCATTGCCGTCGT &')&")*+#&!*$%&)*)+'$''*##'"&$!+)&&$"$(*"%("$&#('&)+*"%)$#!!'$)&!%$%+)$"!"!%(#!"*"''%""&"'(*)(%*)&$"*&*&$"#' AS:i:-2 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4A81C21 YS:i:0 YT:Z:CP jpayne@0: r10000 147 gi|9626243|ref|NC_001416.1| 34220 42 94M = 34033 -281 TGCAGCTTGCATCCATTGCATCGCTTGAATTGTCCACACCATTGATTTTTATCAATAGTCGTAGTCATACGGATAGTCCTGGTATTGTTCCATC 0!>/!H,C!2H=#=&-:/F+96?6../);H1(.36".>FH&@,"G5&>.("83H65D3!,G17#*D:6==0H5)9&F3?*5!2)"B@+@9:A:< AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:94 YS:i:-2 YT:Z:CP