Mercurial > repos > rliterman > csp2
view CSP2/CSP2_env/env-d9b9114564458d9d-741b3de822f2aaca6c6caa4325c4afce/lib/python3.8/site-packages/pysam/bcftools.py @ 69:33d812a61356
planemo upload commit 2e9511a184a1ca667c7be0c6321a36dc4e3d116d
author | jpayne |
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date | Tue, 18 Mar 2025 17:55:14 -0400 |
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import pysam.utils annotate = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'annotate') call = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'call') cnv = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'cnv') concat = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'concat') consensus = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'consensus') convert = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'convert') csq = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'csq') filter = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'filter') gtcheck = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'gtcheck') head = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'head') index = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'index') isec = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'isec') merge = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'merge') mpileup = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'mpileup') norm = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'norm') plugin = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'plugin') query = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'query') reheader = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'reheader') roh = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'roh') sort = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'sort') stats = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'stats') view = pysam.utils.PysamDispatcher('bcftools', 'view') __all__ = [ 'annotate', 'call', 'cnv', 'concat', 'consensus', 'convert', 'csq', 'filter', 'gtcheck', 'head', 'index', 'isec', 'merge', 'mpileup', 'norm', 'plugin', 'query', 'reheader', 'roh', 'sort', 'stats', 'view', ]